lowQualScore : 222 1111 333 111111111111111 1 22 111111 1 444444444444444 1 1111 1 11 1 111 111 11111111 111111111 11 22222222 1 1 4
lowQualScore : 5 2 33 2 2 22 4 22 2 55 555 2 2 8888 2 2 4 2 2 44444 333 333 2 2 33 2 6666 2 2 333 2 22 22 55 2 777777777777777 2 22 22 2 22 22 5 4444 22 55555 2 2 4 66 77 2 2 2 444444 4 2 33 4444 55 99 5 333 99999999999 4444 5 33 2 3 33 2 33 2 2 222222222222222 2 33 0 2 2 33 2 0 0 6666 2 2 33 2 7777 2 1111 4 2 55 66 2 33 77 444 5 2 0 2 2 7 2 2 6 333 33 8 2 8888 2 444 444 33 88888888 555 111111111 555 3 3 2 11 66666 33 33 11111111 44 555 3 3 3 3 5 3 3 44 3 55 3 666 0 55 4 3 0 4
lowQualScore : . . .. . . .. . .. . .. ... . . .... . . . . . ..... ... ... . . .. . .... . . ... . .. .. .. . ............... . .. .. . .. .. . .... .. ..... . . . .. .. . . . ...... . . .. .... .. .. . ... ........... .... . .. . . .. . .. . . ............... . .. . . . .. . . . .... . . .. . .... . .... . . .. .. . .. .. ... . . . . . . . . . ... .. . . .... . ... ... .. ........ ... ......... ... . . . .. ..... .. .. ........ .. ... . . . . . . . .. . .. . ... . .. . . . .
lowQualScore : 3 4 11 1 1 99 2 88 2 33 888 2 2 3333 2 1 2 1 2 00000 999 333 4 4 22 4 9999 2 1 777 1 99 99 00 1 999999999999999 1 99 44 1 99 99 4 7777 66 66666 2 2 4 11 99 2 2 2 222222 2 2 33 7777 33 88 3 999 77777777777 7777 1 22 4 4 44 5 44 5 5 999999999999999 7 22 6 7 7 77 5 2 9 8888 5 5 44 5 9999 5 1111 4 7 55 44 9 99 99 777 3 7 3 5 5 5 5 5 4 555 77 9 7 3333 7 777 444 99 66666666 000 333333333 444 1 1 7 77 77777 77 77 22222222 66 888 3 3 3 3 0 3 3 99 6 00 6 444 9 00 5 6 0 4
consensus : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GA--GTAAA-T--TT--GCA-TGGTG-TGT----AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTTCAC----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCTATTT----GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G--AA-T-T-CA-TGA---T-GGATCT-AG-AC----AAC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCATTTT--A-TTTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-T-ATTGG----TT--GC-C---GA-GAGAAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG---AAAAAAAGTTTTAATG-AT-CAGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAA---AG-A-ACGA-G-GAA-AG-AAANG--TT--TACAT-A----TA-TAT---G-C-AA--C-AG-----A---TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA--G-----G--G--GTC------CA--AGT---TA-TC-AATAC-T-CCTG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-GT--TGTTAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
Reference ( gi|2 ) : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GA--GTAAA-T--T---GCA-TGGTG-TGT----AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAATA--T-T-GC--TATGC-GTTCAC----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCAATTT----GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G--AG-T-T-CA-TGA---T-CGATCT-AG-AC----AAC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCATTTT--A-TGTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-T-ATTGG----TT--G--C---GA-GAGAAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG---AAAAAAAGTGTTAATG-AT-TAGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAA---AG-A-ACGA-G-G-A-AG-AAACG--CT--TACGT-A----TA-TAT---G-T-AA--C-AT-----A---TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA--G-----G--G--ATC------CA--AGT---TA-TC-AATAC-T-CATG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-GT--T-TTAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAAATCTTGCCACATGAACGG-GCTT
gi|3 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-T-ACTCCA--G-GA--GTAAA-T--T---TGA-TGGTG-TGT----AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-AC--TATGC-GTTCAC----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAA--C------------ATATT--GTAA-T-T--T--GTTATTTT----GCA-CACA-----TTT-TCG-GAA-G--AATT-T-CA-TGA---T-CGATTT-AC-AC----AAC--TCCA-TCTTGG---CAGACA----A----ATT----GCCATTTC--ATTTTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-TAATTGGT---TT--GC-C---GA-GAGAAAAAGTGT-CAGTAGAC--CA-TTGTT-AAG--AG-TATGTCT--GGAC-AGAG---A-TTGTGAAAAAAAAAAGTTTTAAAG-AT-CCGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAA---AG-A-ACGA-GAA-A-AG-AAATG--TT--TACAT-A----TA-TAT---G-C-AG--C-AG-----A---TT---A-AT--TTT---GTCAA-A-TGTGACA-AAG-G-----G--G--ATC------CA--AGT---TA-TC-AACAT-T-CCTG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-GT--T-
gi|12 : CCTGTTCAATGT-GCT--------T-TT--TTCA--GAGA--GTAGT-T--T---------------T----A----TTTA-CTC-CCC-T-G---TT---TAA-----------T-T--T--TATGC-GTTCCG----G-T-GG---A-G--ATTATTAAG---------------------TA-T--GTGG-TGT--TAATGCTATTT----GCAC---A-----TGT------------AG-T----G-TG-------GAT-T-AG-AT----AAC--TAC--TCTCG----TAGACA----A---------------TTTA--A-TGT-ATTA--TTG-GTTA------T-ATTGG----TT---------------------TGC------GAT--CA-AAGTTAGGA--TG-TATGT-T--GGAC-A--------------------AAAATAT--ATT-AT-CAGCAATT--TT--A-AA--AA--T--------------A-G-G-A-A--AAATG---T--TACAT-A----TA-TATTTGG-T-CA--T-ATCAGGTA---TT---A-AT--TTG---TTCATAT-GGTGACA-AA--G-----G--GGGATC-------ATTAGT----A-TC-ATTAT-TTCATG-T-GGAGG-AG-G--ACA-TTAG---A-GT--T-T---GTTAgtttgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaattttgccacatgaac
gi|29 : cCCTGCTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GA--GTtgtagttatttactttgcgttcatgtgc
gi|30 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CAT-TTACTCCA--G-GA--GT
gi|14 : CTGTCCA-TGT-GTC--CAA-TCT-TTACTCCA--G-GA--GTAAA-T--TT--GCA-TGGTG-TGT----AA-A-TTCA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTTCAC----G-T-GA---A-A--A--A--A----GAC--C------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCTATTC----ACAC-ACG-----TTT-TCG-GAA-G--AA-T-T-CA-CGA---T------------------AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-C----GCAATTTT--A-TTTGATCA--CAT-GTTA--AAT-T-ATTGG----TTT-G--CC--GA-GAGAAAAGGTTC-CAGTAGAC--CA-ACGTTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG---AAAAAAAGTTTTAATG-GT-CAGCAATGGGTT--GCAA--AA--TTAA---AG-A-ACGA-G-GAA-AG-AAATG--TT--TATAT-A----TA-TAT---
gi|19 : CTGTTCA-TGT-GCC--CAA-TCT-TTACTTCA--G-GT--GTAAATT--T---GCA-TGATG-TGT----AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTTCAC----G-T-GA---A-A--A--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAA-A-T--T--TACTATTT----GCA-CACA-----TT---------------------A-TGT---T-GGATCT-AG-AC----AACTATACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GACATTTT--A-TTTGAGTA--CAA-GTTC--AAT-T-ATT
gi|6 : TGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GA--GTAAA-T--TTT-GCA-TGGTG-TGTG---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTTCAT----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAC---------------ATA-T--GTA--T-T--T--TGCTATTT----GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-T-GA-TGA---TGCGATTT-A---------------C--TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGATTTT--A-TTTGAGCA--CAT-GT-A--AAT-T-ATTGG----TTT-G--CC--GA-GAAGAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG---AAAAAGTATTTTAATG-AT-CAGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAA---CGAA-ACGT-G-GAA-AG-AAAGG--TT--TATAT-A----TA-TAT---G-CAAA--C-GG-----A---TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AG--G-----G--G--GT-------AA--AGT---TA-TC-AATAC-T-CCTG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATGT--TGTTAGGT
gi|5 : TGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GA--GTAAA-T--TTT-GCA-TGGTG-TGTG---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTTCAT----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAC---------------ATA-T--GTA--T-T--T--TGCTATTT----GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-T-GA-TGA---TGCGATTT-A---------------C--TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGATTTT--A-TTTGAGCA--CAT-GT-A--AAT-T-ATTGG----TTT-G--CC--GA-GAAGAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG---AAAAAGTATTTTAATG-AT-CAGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAA---CGAA-ACGT-G-GAA-AG-AAAGG--TT--TATAT-A----TA-TAT---G-CAAA--C-GG-----A---TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AG--G-----G--G--GT-------AA--AGT---TA-TC-AATAC-T-CCTG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATGT--TGTTAGGTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|20 : GTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GA--GT-----------GCA-TGGTA-TGT----AG-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GA--TATGC-GTTCAC----G-T-GG---G-A--A--A--AAGA-TAC--CATATACAACTGTATA-T--GTAA-T-T--T--TGTTATTT----GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G--AA-T-T-CA-TGG---T-GGA--T-AG-AC----AAC--TACG-TCTTCG---AAGATG----A----A-C----GCCATTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|23 : GTTCA-TGTTGCC--CAATCCT-TTACTTCA--G-GT--GTAAA-T--TTG-GCC-TGATG-T-T----AA-A-TTTAACTC-CCC-T-----TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GC--TATCC-GTTCAC----G-T-GA---A-A--A--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAG-T-T--T--T
gi|9 : TTCAGTGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GAGTGTAAA-TG-T---GCA-T-GT--TGT----AA-A-TTTA-CGC-TCC-C-G---TG---TAAAAGCAGAAAGTT-T-GC--TATGCAGTTCAC----GTT-GGGAAA-A--A--A--AAGA-GACG-C------------ATA-T--GTA----T--T--TGC--TTTTCTGGCACCA-G-----GTT-TCG-GAAGG--AA-TGT-CATTGA---T-GGATCT-AG-GCGTGAGAC--TACT-TCTC-G---TAGACAATTGA----A-T----GGCATTGT--A-TTTGA-TA--CAA-GTTA--ACA-T-ATTGT----TT--GC-C---GA-GAGTAAAGGTGCACAGT-GACTGCC-TAGTTAAGGGAAG-TATG--T--GGACGAGAGGA-A-ATGTG---AAAAACAGT-TTAA-G-AT-CAGCAATGGATA--A-AA--AA--TTCA---AA-A-ATGACG-G-A-AG-AATGG--TT--TAACT-A----TA-TAT---G---AA--CAAG-----A---TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA--G-----G--G--
gi|1 : TCA-TGT-GCC--CAA-CCTCTTACTCCA--G-GA--GTAAA-TATT---GCA-TGGTG-TGT----AA---TTTA-CTCTCCC-T-G---TG---TAAAAGCAAATT--T-T-GC--TATGC-GTTCAC----G-TTGG---C-AGGA--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCTATTT----GCAC-ACA-----TTTATCG-GAAAG--AA-T-T-CA-TGA---T-GGATCT-AG-AC----AAC--TACG-TCTTCG---CAGACA----ATTTAACT----GCCATTTT--T-TTGGAGTA--CAA-GTTA--AAT-T-ATTGG----TTT-GTCC---GA-GAAGTAAAGTGC-CAGTAGAC--CACAAGTTAAAA--TG-TATGC-T---GAC-ATAA---A-TTGTG---AAAAAAAGTTTTAATG-AT-CAGCAATGGATT--A-AA--AA--TTAA---AA-A-ATGA-G-A-A-AG-AAATG--TT--TACAT-AT---TA-T-T---G-C-AA--C-AG-----A---TT---A-ATG-TGT---GTCAC-T-TGTGACA-AAG-G-----G--G--GGT------CA--AGT---TA-TC-AATAC-T-CATG-T-GGGAG--A-G--ACC-ATAG---ATGT--T-ggggggagtacaaggttgagcggaacagtactatgatgggaggatacatag
gi|11 : TCA-TGT-GCC--CA--CCT-TTAA-CCT--G-GA--GTAAA-T--T---TGA-TGGTG-CGT----AA-A-ACTAACTT-CCC-T-AGTATG---TAAAAGCAAACT--T-TGGC--T-TGC-GTTCACA---G-T-GG-----A--A--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCTATTT----GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G--AA-T-T-CA-TGA---T--GAGTT-AGAAC----AACT-TACA-TCTTGG---TAGACA----A----ATT----GCGATTTT--A-TTTGAGCA--CAATGTTAACAAT-C-ATTGGGTTCTT--GCCC---GACGAGAAAAGGT-C-TAGTAGAC-----ATGTT-AAG--AG-TATGC-T--GGAC-AGAG---ACTTGTGA--AAAAAAAGTTTTAATG-AT-CAGC-ATGGGTT--G-AA--AA--TAAA---AG-A-ACGA-G-GAA-AG-AAAGG--TT--TATAT-ATATCTA-TAT---G-C-AA--C-AG-----A---TT---ACAT--TTT---GTC-C-T-TGT-ACA-AA--G-----G--G--ggatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|25 : TCA--GT-GCCAACAA-CAT-TTAC-CCA--G-GA--GTAAT-T--T---GCA-TGGTG-TGT----AA-ATTTTA-CTC-CTCGTAA---TGAGTCAAAAGCAAAg
gi|8 : -TGT-GCC--CA--TCT-TCACTCCA--GAGA--G-AAA-T--TTT-GCAATGGTGCTGTTGA-AATA-TTTT-TTC-CCA-C-A---GG---TAAA-GCAAAAA--TCT-TCATTATGC-GT-CACCGTTG-T-CG---ACA--A--AT-AGGATGACT-C------------ATA-CTCGTTA-T-TCTT--TGCTATTT----GCATCACA-----TTC--CGTGAA-G--AA-T-C-TA-TGAGTAT-CAGTC------C----AAC--T-CT-TCTTCACTTTAGGCA----A----T-TTCAAGTCATTTT--A-TTTGAGTAACCAA-GTTA--GATCT-ATTG-----TT--G--CC--GA-GAGTCAAGATAC-CAATAGAC--CA-AAGTTCAAG--AGATATGT-T---GAC-AAAA---A--TGTG------AAAAGTTTAAATGCATCTAGCAATGGATG--A-AATCAT--TCAC---AA-ATATGA-G-C-A-A--AAATG--TT--TTTATCA----TACTAT---G-C-AAACC-AC-----GACTTT---A-CA--TCT---CTCAC-T-TGTGACACAAGCG-----G--G--ATCAAGCTTTA--AGTAAATA--C-AATACTT-CATGTT-GGGAG-
gi|17 : gtcctctgaataccGT-GCC---AA-C-T-TTACTCCA--G-GA--GTAAA-T--TT--GCA-TGGTG-TGTGT--AA-A-TTTA-CTC-CCA-T-A---GG---TAAAAGCAAAT---T-T-GT--TGTGC-GTTCAC----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAT--C------------ATA-T--GTAATT-T--T--TGCTATCT----GCA-CACA-----TTT-TCG-GAA-G--AA-T-T-CA-TGA---T-GGATCT-GG-AC----AAC--TACA-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCATTTT--A-T--------------TT-----T-T-ATTGGT---TT--G--CCGAGA-GAAAAAAAAAGC-CAGTAGAC--CG-TAGTTAAA---AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTATG---Agcgaagaaccttatcagtttacttatgtatgtgtacatgtttactttgcgttcatgtgc
gi|4 : -GCC--CAA-CCT-TTACTCCA--G-GA--GTAAA-T--TT--GCA-TGGT--TGTT---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTTCAC----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCTATTT----GAAC-ACA-----TTT-TCG--AA-G--AA-T-T-CA-TGA---T-CGATTTTAG-AC----GAC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCGATTTT--A-TTTGAGCA--AAT-GTTA--AAT-T-ACTGGT---TT--GC-C---GA-GAGAAAAGGTTC-CA-TAGAA--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAT---A-TTGTG---AAAAAAAGTTTTAATG-AT-CAGCAATGGGTTG-A-AA--AA--TTAA---AG-A-ATGA-G-GAA-AG-AAAGG--TT--TATAT-A----TA-TAT---GCC-AA--C-AG-----A---TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AAG-G-----G--G--ATC------CA--AGT---TA-TC-AACAC-T-CCTG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---A-GT--T-TTAGGT
gi|7 : C--CAA-CCT-TTCTTCCA--G-GA--GTAAA-T--TTT-GCA-TGGTG-TGT----AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---TAAA-GCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTTCAC----G-T-GA---G-A--A--A--ATGA-GAC--C------------ATA----GTAA-T-T--T--TGCTATTT----GCA-CACA-----TTT-T-G-GAA-G--AA-T-T-CA-TGA---T-GGATCT-AG-AC----AA----ACATTCTTCG---TAGACAATTTA----A-T----GCCATTTT--A-TGTGAGTA--CAA-GTTA--AAT-T-ATT------------------------AAAGATGC-CAATAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTGA--AAAAAAAGTTTAAATG-AT-CAGCAATGGAAT--A-AA--AAATTCAA---AA-A-ATGA-G-GAA-AG-AAATG---T--TACAT-A----TA--AT---A-G-CA--C-AG-----A---TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGAAA-AG--G-----G--G--GAT------CA--AGT---TG-TC-AATAC-T-CATG-T-GGGGG-AG-A--ACC-ATAG---A-GT--TGTTATGTagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcacatcttgccacatga
gi|17 : -CTT-TTAC-CTATGG-GA--GTAAA-T--TTACACA-CACCA-TGC----AA-A-TTTA-CTC-Cagtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|10 : gtgccaactttactcca--GTAAA--------GCC-TGTCA-TGTCACGAA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---TAAAAACAAAT-----T-AC--TATG--GTTC-C----A-T-GG---A-A--A--A--AAAA-GAC-----------------A-T--ATAA-G-T--T--T-CTATTT----ACAC---A-----TTT-TCG-GAA-G--AA-T-TTCA-TGA------GAT-T-AG-AC----AAC--TACG-CTTT-----CAGACA----A------T----TTAATTTTTTA-TTTGAGTA--CAA-GTTA--GAT-T-ATTGG----TTTGG--C---GA-G-----AAATTC-CAATAGAC-----AAG-TAAA------TATGT-TCGAGAT-AAAATTCA-TT-TG-----AAAAAGTTTAAATG-AT-CA-CAATGGATA--A-AA--AATTTTAAGTCAG-A-A--A-A-A-T-AG-ACACAATCT--AAC-----------TAT---A-T-AA--C--T-----A---TT---A-GT--TTcaaatttgttgtgcgttcacgtggaaaaaagagatcatatgtaatttttgctatctgcacacattttcggaagaattcatgatggatctggacaactacatcttcgtagacaaatgccattttatttttattggtttgccgagagaaaaaaaaagccagtagaccgtagttaaaagtatgttggacagaaattatga
gi|22 : -TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---CAAAGGCAAAT---T-T-GC--TATGC-GTT--C----T-T-GA---A-A--A--A--AAGA-GACAAT------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCTATTT----GCA-CACATTACTTTT-TTA-GAA-G--AA-T-T-CA-TG--------------------------------TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCAGTTT--G-Tgcaactggaaatggagtggtgtcgcacggatatcaagtacgttacatgttggagattaccgataagttgttatgttaagtaaattgcacttcgttgcattg
gi|13 : TTCAC----G-T-GG---A-A--A--A--AAGA-GAT--C------------ATA-T--GTAA-T-T--G--TGCTATTT----GTAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G--AA-T-T-CA-TGA---T-GGATCT-AG-AC----AAC--TACG-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCATTTT--A-T-TTAGTA--CAA-GTTA--AAT-C-ATCGGTC--TT--C--C---GA-GATAAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATAT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTG---AAAATAAGTTTTATTG-AT-TAGCAAGAGATTA-A-AA--AA--TTAA---AG-A-ACGA-G-G-AGAG-AAACG--TT--TACAT-A----TA-TAT---G-T-AA--C-AG-----A---TT---C-AT--TTT---GTCGC-T-TGCAACG-AA--G-----GGCG--AT-------CA--AGT---TA-TC-AATAC-T-CCTG-T-GGAAG-TA-G--ACT-ATAG---A-GT--T-ca
gi|18 : -GG---A-A--A--A--AAGA-GAC--C------------ATA-T--GTAA-T-T--T--TGCAATTT----GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G--AG-T-T-CA-TGA---T-CGATCT-AG-AC----AAC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCATTTT--A-TGTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-T-ATTGGT---TT--GC-C---GA-GAGAAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG---AAAAAAAGTGTTAATG-AT-TAGCAATGGGTTA-A-AA--AA--TTAA---AG-A-ACGA-G-GAA-AG-AAATG--g
gi|26 : -AAGTTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-GGAA---A-TTGTG----TAAAAAGTTTTAATG-AT-
gi|21 : AA---AA-A-ACGA-G-G-A-AGGAAACG--GTGTTACAT-A----TA-TAT---G-C-AA--C-AG-----A---TTAGGA-GTGGTTTGGGGTCAC-GATGTGACA-GA--GAGGAAG--G--GTT------CA--AGT---TA-TCGAATAC-T-ACTG-TGGGAAG-CA-GGAGCC-ATAGGCAA-GT--T-
gi|24 : aaaaagttggaaaaaaaaaaataagaaaaaaaagcaggaa-G-A-A-AG-AAAGG--TT--TATAT-A----TA-TAT---G-C-AA--C-GG-----A---TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA--G-----G--G--gtct
gi|15 : gcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AG--G-----G--G--GGT------CA--AGT---TAATC-A-TAC-T-CCTG-T-GGA-G-TA-G--ACC-ATAG---A-GT--TGTTAGGTg
gi|16 : caA-AG--G-----G--G--ATC-------A--AGT---TA-TC-AATAT-C-CATG-T-GGAAGATAGG--ACCAACAG---A-GTTGT-CTAGGTgtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccgtaatgcaaatcttgccacatgaacggccgg
gi|4 : ACTCACGTA-TGCACA-TCTTGCCACATGAagtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacgggtg
gi|3 : gcccaacctttactccaggagtaaatttgcatggttgttaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgctatttgaacacattttcgaagaattcatgatcgattttagacgactacatcttggtagacaaatgcgattttatttgagcaaatgttaaattactggtttgccgagagaaaaggttccatagaacaacgttaagagtatgttggacagatattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatgggttgaaaaattaaagaatgaggaaagaaaggtttatatatatatgccaacagattaatttgtcacttgtgacaaaggggatccaagttatcaacactcctgtggaagtagaccacagagttttaggtagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTCACGTA-TGCAAA-TTTTGCCACATGAAC
gi|1 : cctgttcatgtgcccaaccttactccaggagtaaatttgatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttactatgcgttcacgtggaaaaaagagaacatattgtaatttgttattttgcacacattttcggaagaatttcatgatcgatttacacaactccatcttggcagacaaattgccatttcattttgagcacaagttaaattaattggtttgccgagagaaaaagtgtcagtagaccattgttaagagtatgtctggacagagattgtgaaaaaaaaaagttttaaagatccgcaatgggttaaaaattaaagaacgagaaaagaaatgtttacatatatatgcagcagattaattttgtcaaatgtgacaaaggggatccaagttatcaacattcctgtggaagtagaccatagagttgtttgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|6 : tcatgtgcccaacctcttactccaggagtaaatattgcatggtgtgtaatttactctccctgtgtaaaagcaaattttgctatgcgttcacgttggcaggaaaagagaccatatgtaattttgctatttgcacacatttatcggaaagaattcatgatggatctagacaactacgtcttcgcagacaatttaactgccatttttttggagtacaagttaaattattggtttgtccgagaagtaaagtgccagtagaccacaagttaaaatgtatgctgacataaattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatggattaaaaattaaaaaatgagaaagaaatgtttacatattattgcaacagattaatgtgtgtcacttgtgacaaaggggggtcaagttatcaatactcatgtgggagagaccatagatgttggatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|5 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gct
gi|7 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gct
gi|15 : ccaacctttcttccaggagtaaattttgcatggtgtgtaaatttactcccctgtgtaaagcaaatttgctatgcgttcacgtgagaaaatgagaccatagtaattttgctatttgcacacattttggaagaattcatgatggatctagacaaacattcttcgtagacaatttaatgccattttatgtgagtacaagttaaattattaaagatgccaatagaccaaagttaagagtatgttggacagaaattgtgaaaaaaaagtttaaatgatcagcaatggaataaaaaattcaaaaaatgaggaaagaaatgttacatataatagcacagattaatttgtcacttgtgaaaagggggatcaagttgtcaatactcatgtgggggagaaccatagagttgttatgtagtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTC-CGTAATGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|16 : caaaggggggtcaagttaatcatactcctgtggagtagaccatagagttgttaggtgtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-ccgg
gi|27 : aaggggatcaagttatcaatatccatgtggaagataggaccaacagagttgtctaggtagtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGGCGCTTtg
gi|28 : TCTCGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|31 : CGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gct
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 11 1111 2222 1 11 111111 111 111 2222 11111111
lowQualScore : 5 2 22 2 2 4 22 2 7 2 2 2 33 2 888 2 2 4 2 2 2 333 333 8888 2 55 2 6666 44 2 22 22 44 22 2 111111111111111 44 2 2 22 22 555 99 55555 2 2 2 6 2 4 4 2 44 2 5 4 44444 55 66 1 333 4444 3333 4 6666 333 2 33 2 33 2 2 2222 2 666 2 333 1 2 33 2 5 33 2 2 33 2 777 2 55 444 2 2 2 55 2 33 33 5 2 1 2 2 2 5555 2 2 000000 2 5 33 2 2 33 33 000 2 000 555 2 2 2 2 88888 2 0000 44 11111111 3 3 3 6 3 3 33 3 44 3 555 6 3 3 3 3 4
lowQualScore : . . .. . . . .. . . . . . .. . ... . . . . . . ... ... .... . .. . .... .. . .. .. .. .. . ............... .. . . .. .. ... .. ..... . . . . . . . . .. . . . ..... .. .. . ... .... .... . .... ... . .. . .. . . .... . ... . ... . . .. . . .. . . .. . ... . .. ... . . . .. . .. .. . . . . . . .... . . ...... . . .. . . .. .. ... . ... ... . . . . ..... . .... .. ........ . . . . . . .. . .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 0 2 99 1 1 2 99 4 1 4 4 4 22 4 333 2 1 2 1 1 1 777 777 2222 2 33 2 6666 88 0 88 88 88 88 0 555555555555555 88 0 0 88 88 888 00 33333 1 1 1 3 1 2 2 1 77 1 2 2 77777 00 77 8 777 5555 4444 2 6666 777 4 22 4 22 4 4 8888 5 222 5 555 9 5 44 4 5 22 4 4 22 4 444 4 88 444 5 5 7 33 7 77 77 3 7 0 5 7 7 7777 7 7 333333 9 7 99 9 9 99 99 777 9 111 000 9 9 5 5 88888 5 2222 22 22222222 1 1 1 2 1 1 77 3 66 3 888 7 3 6 3 3 0
consensus : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGGT---T-T-G-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-G-N-TCA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
Reference ( family-1657 ) : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG----T-T-G-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-G-T-CCA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
gi|1 : TCA-TGT-GCC--CAA-CCTCTTACTCCAG-GAGT--AAATATT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA---TTTA-CTCTCCC-T-G---TG---TAAAAGCAAA----T-TTT-GCTATGC-GTTCAC----GTT-GGC-AGGA--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCAC-ACA-----TTTATCG-GAAAG-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---CAGACA----ATTTAACT----GCCA---TTTTTTTG-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG----T-TTGTCCGA-GAA--GTAAAGTGC-CAGTAGAC--CACAAGTTAAAA--TG-TATGC-T---GAC-ATAA---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGATT--A-AA--AA--TTAAAA-A-ATGA-GAAAGAAATG-T-TTACAT-A----T--TATT------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-ATG-TGT---GTCAC-T-TGTGACA-AAGG-----GG-G-G-TCA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGAG--A-G--ACC-ATAG---A----TGT-TGGAT
gi|1 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|10 : tcatgtgcccaacctcttactccaggagtaaatattgcatggtgtgtaatttactctccctgtgtaaaagcaaattttgctatgcgttcacgttggcaggaaaagagaccatatgtaattttgctatttgcacacatttatcggaaagaattcatgatggatctagacaactacgtcttcgcagacaatttaactgccatttttttggagtacaagttaaattattggtttgtccgagaagtaaagtgccagtagaccacaagttaaaatgtatgctgacataaattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatggattaaaaattaaaaaatgagaaagaaatgtttacatattattgcaacagattaatgtgtgtcacttgtgacaaaggggggtcaagttatcaatactcatgtgggagagaccatagatgttggatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---TAAAAACAAA----T-T---ACTATG--GTTC-C----AT--GGA-A--A--A--AA--AA-GAC-----------------AT--ATAA-G-T--T--T-CTATTT---ACAC---A-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GA---GA-T-TAG-ACA----AC--TACG-CTTT-----CAGACA----A----T-T------TAATTTTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTA--GAT-TA-TTGGT---T-T-G-GCGA-GAA--A-----TTC-CAATAGAC-----AAG-TAAA------TATGT-TCGAGAT-AAAATTCA-TT-TG---AA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-A-CAATGGATA--A-AA--AA--TT
gi|11 : gtaaagcctgtcatgtcacgTCA-TGT-GCC--CA--CCT-TTAA-CCTG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-C--G-T---AA-A-ACTAACTT-CCC-T-AGTATG---TAAAAGCAAA----C-TTTGGCT-TGC-GTTCACA---GT--GGA-A--A--A--A---GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-AG-T-TAGAACA----ACT-TACA-TCTTGG---TAGACA----A----ATT----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAATGTTAACAAT-CA-TTGGGTTCT-T-GCCCGACGAG--AAAAGGT-C-TAGTAGAC-----ATGTT-AAG--AG-TATGC-T--GGAC-AGAG---ACTTGTGAAAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGC-ATGGGTT--G-AA--AA--TAAAAG-A-ACGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-ATATCTA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---ACAT--TTT---GTC-C-T-TGT-ACA-AA-G-----GG-G-ttaagtcagaaaaatagacacaatctaactatataactattagtttgcaactggaaatggagtggtgtcgcacggatatcaagtacgttacatgttggagattaccgataagttgttatgttaagtaaattgcacttcgttgcattg
gi|12 : CCTGTTCAATGT-GCT--------T-TT--TTCAGAGAGT--AGTT-TT------------------------A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TT---TAA-----------T-TT----TATGC-GTTCCG----GT--GGA-G--ATTATTAA--G---------------------TAT--GTGG-TGT--TAATGCTATTT---GCAC---A-----TGT-------A-G----------T-G-TG-GA-T-TAG-ATA----AC--TAC--TCTCG----TAGACA----ATTTAA-T----G------TATTATT-----------G-GTTA------TA-TTGG----T-T-------------------TGC------GAT--CA-AAGTTAGGA--TG-TATGT-T--GGAC-A-----------------A---AAA----TATATT-ATC-AGCAATT--TT--A-AA--AA--T-----------AGGAAA--AATG-T-T-ACAT-A----TA-TA-TTTGGTCA-T-AT--C-A-GGTA--TT---A-AT--TTG---TTCATAT-GGTGACA-AA-G-----GG-G-GATCATTAG-T--------A-T-C-ATTATTTCATG-T-GGAGG-AG-G--ACA-TTAG---A-GTTTGT-TATGT
gi|13 : cTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAA-T-T--G--TGCTATTT---GTAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--AGTA--CAA-GTTA--AAT-CA-TCGG----TCT-T-CCGA-GAT--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATAT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTG-AAAA---TAAGTTTTA-TTG-ATT-AGCAAGAGATTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAGAGAAACG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-G--A--TT---C-AT--TTT---GTCGC-T-TGCAACG-AA-G-----GGCG-A-TCA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACT-ATAG---A-G-TTGagttatttactttgcgttcatgtgc
gi|14 : CTGTCCA-TGT-GTC--CAA-TCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTCA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--G------A--A--AA--AA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTC---ACA-CACG-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AC-GAT------------------AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-C----GCAA---TTTTATTT-GATCA--CAT-GTTA--AAT-TA-TTGGT---T-T-G-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CAGTAGAC--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-GTC-AGCAATGGGTT--GCAA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------
gi|15 : A-AG-G-----GG-G-G-TCA--AGTT--------AAT-C-A-TACTCC-TG-T-GGA-G-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGT
gi|15 : caACTC-CGTAATGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccgtaatgcaaatcttgccacatgaacggccgg
gi|16 : caaaggggggtcaagttaatcatactcctgtggagtagaccatagagttgttaggtgtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA-G-----GG-G-A-TCA--AGTT--------A-T-C-AATATCCA-TG-T-GGAAGATAGG--ACCAACAG---A-G-TTGTCTAGGTccgg
gi|16 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacgggtg
gi|17 : aaggggatcaagttatcaatatccatgtggaagataggaccaacagagttgtctaggtagtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGT-GCC---AA-C-T-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-TGTG-T---AA-A-TTTA-CTC-CCA-T-A---GG---TAAAAGCAAA----T-TT--GTTGTGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAATT-T--T--TGCTATCT---GCA-CACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTGG-ACA----AC--TACA-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--------------------T-TA-TTGGT---T-T-G-CCGA-GAGAAAAAAAAAGC-CAGTAGAC--CG-TAGTTAAA---AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTATG-Atg
gi|18 : --GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGGT---T-T-G-CCGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-
gi|19 : CTGTTCA-TGT-GCC--CAA-TCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-G-CA-TGATG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-A-T--T--TACTATTT---GCA-CACA-----TT--------------------AT-GTTG-GA-TCTAG-ACA----ACTATACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GACA---TTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTC--AAT-TA-TT
gi|2 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAA--TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----TATT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG----T-T-G--CGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGG-AAGAAACG-C-TTACGT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-T--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-A-T-CCA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TT-T-TAGGTTA
gi|2 : ACTCACGTA-TGCAAAATCTTGCCACATGAACGG-GCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaaatcttgccacatgaacgggctt
gi|20 : cctgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattgcatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatattgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgcaatttgcaccacattttcggaagagttcatgatcgatctagacaactacatcttggtagacaaatgtcattttatgtgagcacaagttaaattattggttgcgagagaaaaagtgccagtagaccaaagttaaagagtatgttggacagagattgtgaaaaaaagtgttaatgattagcaatgggttaaaaattaaagaacgaggaagaaacgcttacgtatatatgtaacatattaattttgtcacttgtgacaaagggatccaagttatcaatactcatgtggaagtagaccatagagttttaggttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT----------G-CA-TGGTA-T--G-T---AG-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GATATGC-GTTCAC----GT--GGG-A--A--A--AA--GA-TAC--CATATACAACTGTATAT--GTAA-T-T--T--TGTTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GGTG-GA---TAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---AAGATG----A----A-C----GCCA---TTT
gi|21 : AAAA-A-ACGAGGAAGGAAACGGTGTTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TTAGGA-GTGGTTTGGGGTCAC-GATGTGACA-GA-GAGGAAGG-G-T-TCA--AGTT--------A-T-CGAATACTAC-TG-TGGGAAG-CA-GGAGCC-ATAGGCAA-G-TTGT-
gi|22 : aaaaagttggaaaaaaaaaaataagaaaaaaaagcaggaa-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---CAAAGGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTT--C----TT--GAA-A--A--A--AA--GA-GACAAT------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACATTACTTTT-TTA-GAA-G-AAT-T-C-AT-----------------------------G-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---GTTTGTct
gi|23 : GTTCA-TGTTGCC--CAATCCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-GGCC-TGATG-T----T---AA-A-TTTAACTC-CCC-T-----TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATCC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAG-T-T--T--Tca
gi|24 : GAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-G-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-G-
gi|25 : gcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--GT-GCCAACAA-CAT-TTAC-CCAG-GAGT--AA-T-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-ATTTTA-CTC-CTCGTAA---TGAGTCAAAAGCAAA----
gi|26 : -AAGTTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-GGAA---A-TTGTG--TAA---AAAGTTTTA-ATG-AT
gi|27 : CTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGGCGCTT
gi|28 : TCTCGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|29 : CCTGCTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--gct
gi|3 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-T-ACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--ACTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAA--C------------ATATT-GTAA-T-T--T---GTTATTTT--GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GATC-GA-TTTAC-ACA----AC--TCCA-TCTTGG---CAGACA----A----A-TT---GCCA---TTTCATTTTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-TAATTGG----T-TTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGT-CAGTAGAC--CA-TTGTTAA-G--AG-TATGTCT--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAAAAAAAAGTTTTA-AAG-ATC-CGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGAAAAGAAATG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AG--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAA-A-TGTGACA-AA-G-----GG-GAT-CCA--AGTT--------A-T-C-AACATTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-T
gi|3 : ACTCACGTA-TGCAAA-TTTTGCCACATGAACtgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaattttgccacatgaac
gi|30 : cctgttcatgtgcccaaccttactccaggagtaaatttgatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttactatgcgttcacgtggaaaaaagagaacatattgtaatttgttattttgcacacattttcggaagaatttcatgatcgatttacacaactccatcttggcagacaaattgccatttcattttgagcacaagttaaattaattggtttgccgagagaaaaagtgtcagtagaccattgttaagagtatgtctggacagagattgtgaaaaaaaaaagttttaaagatccgcaatgggttaaaaattaaagaacgagaaaagaaatgtttacatatatatgcagcagattaattttgtcaaatgtgacaaaggggatccaagttatcaacattcctgtggaagtagaccatagagttgtttgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CAT-TTACTCCAG-GAGT--
gi|31 : CGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|4 : tc-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGT--T--GTT---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---G-AACACA-----TTT-TC--GAA-G-AAT-T-C-AT-GATC-GATTTTAG-ACG----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--AAT-GTTA--AAT-TA-CTGGT---T-T-G-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CA-TAGAA--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAT---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTG-A-AA--AA--TTAAAG-A-ATGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------GCC-AA--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-GAT-CCA--AGTT--------A-T-C-AACACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---A-G-TT-T-TAGGTac
gi|4 : ACTCACGTA-TGCACA-TCTTGCCACATGAagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcacatcttgccacatga
gi|5 : gcccaacctttactccaggagtaaatttgcatggttgttaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgctatttgaacacattttcgaagaattcatgatcgattttagacgactacatcttggtagacaaatgcgattttatttgagcaaatgttaaattactggtttgccgagagaaaaggttccatagaacaacgttaagagtatgttggacagatattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatgggttgaaaaattaaagaatgaggaaagaaaggtttatatatatatgccaacagattaatttgtcacttgtgacaaaggggatccaagttatcaacactcctgtggaagtagaccacagagttttaggtagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGGT---T-T-G-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AG-G-----GG-G-T--AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGT
gi|5 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|6 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGGT---T-T-G-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AG-G-----GG-G-T--AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGTgct
gi|6 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|7 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC--CAA-CCT-TTCTTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---T-AAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAG-A--A--A--AT--GA-GAC--C------------ATA---GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA-----TTT-T-G-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----A----ACATTCTTCG---TAGACAATTTA----A-T----GCCA---TTTTATGT-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TT-----------------------AAAGATGC-CAATAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTGAAAAA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-AGCAATGGAAT--A-AA--AAATTCAAAA-A-ATGAGGAAAGAAATG---TTACAT-A----TA--A-TA-----G-C--A--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGAAA-AG-G-----GG-G-A-TCA--AGTT--------G-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGGG-AG-A--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TATGTgct
gi|7 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|8 : ccaacctttcttccaggagtaaattttgcatggtgtgtaaatttactcccctgtgtaaagcaaatttgctatgcgttcacgtgagaaaatgagaccatagtaattttgctatttgcacacattttggaagaattcatgatggatctagacaaacattcttcgtagacaatttaatgccattttatgtgagtacaagttaaattattaaagatgccaatagaccaaagttaagagtatgttggacagaaattgtgaaaaaaaagtttaaatgatcagcaatggaataaaaaattcaaaaaatgaggaaagaaatgttacatataatagcacagattaatttgtcacttgtgaaaagggggatcaagttgtcaatactcatgtgggggagaaccatagagttgttatgtagtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGT-GCC--CA--TCT-TCACTCCAGAGAGA--AATT-TT-G-CAATGGTGCT--G-TTGAAATA-TTTT-TTC-CCA-C-A---GG---TAAA-GCAAAAATCT-TC--ATTATGC-GT-CACCGTTGT--CGACA--A--AT-AG--GATGACT-C------------ATACTCGTTA-T-TCTT--TGCTATTT---GCATCACA-----TTC--CGTGAA-G-AAT-C-T-AT-GA-G-TA-TC-AGTCCA----AC--T-CT-TCTTCACTTTAGGCA----A----T-TTCAAGTCA---TTTTATTT-GAGTAACCAA-GTTA--GATCTA-TTG-----T-T-G-CCGA-GAG--TCAAGATAC-CAATAGAC--CA-AAGTTCAAG--AGATATGT-T---GAC-AAAA---A--TGTG----A---AAAGTTTAA-ATGCATCTAGCAATGGATG--A-AATCAT--TCACAA-ATATGAGCAA--AAATG-T-TTTTATCA----TACTA-T------G-C-AAACC-ACG--ACTTT---A-CA--TCT---CTCAC-T-TGTGACACAA-GC----GG-G-A-TCA--AGCTTTAAGTAAA-TAC-AATACTTCATGTT-GGGAG-
gi|9 : gtcctctgaataccTTCAGTGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGTGTAAAT-GT-G-CA-TG-T--T--G-T---AA-A-TTTA-CGC-TCC-C-G---TG---TAAAAGCAGAAAG-T-TT--GCTATGCAGTTCAC----GTTGGGA-A--A--A--AAAAGA-GACG-C------------ATAT--GTA----T--T--TGCT-TTTCTGGCACCAGG-----TTT--CG-GAA-GGAATGT-C-ATTGATG-GA-TCTAG-GCGTGAGAC--TACT-TCTCG----TAGACA----ATTGAA-T----GGCA---TTGTATTT-GA-TA--CAA-GTTA--ACA-TA-TTGT----T-T-G-CCGA-GAG--TAAAGGTGCACAGT-GACTGCC-TAGTTAAGGGAAG-TATGT----GGACGAGAGGA-A-ATGTG-AAAA---ACAGTTT-A-A-G-ATC-AGCAATGGATA--A-AA--AA--TTCAAA-A-ATGACGGAAGAATGG-T-TTAACT-A----TA-TA-T------G---AA--CAA-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-G-gcgaagaaccttatcagtttacttatgtatgtgtacatgtttactttgcgttcatgtgc
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 11 1111 1 11 111111 111 111 11111111
lowQualScore : 5 2 22 2 2 4 22 2 7 2 2 2 33 2 888 2 2 4 2 2 2 333 333 8888 2 55 2 6666 44 2 22 22 44 22 2 111111111111111 44 2 2 22 22 555 99 55555 2 2 2 6 2 4 4 2 44 2 5 4 44444 55 66 1 333 4444 3333 4 6666 333 2 33 2 33 2 2 444 5 2 333 3 2 33 2 5 33 2 2 33 2 777 2 55 444 2 2 2 55 2 33 33 5 2 1 2 2 2 5555 2 2 000000 2 5 33 2 2 33 33 000 2 000 555 2 2 2 5 88888 2 1 6 44 11111111 3 3 3 6 3 3 33 3 44 3 555 6 3 3 3 3 4
lowQualScore : . . .. . . . .. . . . . . .. . ... . . . . . . ... ... .... . .. . .... .. . .. .. .. .. . ............... .. . . .. .. ... .. ..... . . . . . . . . .. . . . ..... .. .. . ... .... .... . .... ... . .. . .. . . ... . . ... . . .. . . .. . . .. . ... . .. ... . . . .. . .. .. . . . . . . .... . . ...... . . .. . . .. .. ... . ... ... . . . . ..... . . . .. ........ . . . . . . .. . .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 0 2 99 1 1 2 99 4 1 4 4 4 22 4 333 2 1 2 1 1 1 777 777 2222 2 33 2 6666 88 0 88 88 88 88 0 555555555555555 88 0 0 88 88 888 00 33333 1 1 1 3 1 2 2 1 77 1 2 2 77777 00 77 8 777 5555 4444 2 6666 777 4 22 4 22 4 4 444 0 5 555 5 5 44 4 5 22 4 4 22 4 444 4 88 444 5 5 7 33 7 77 77 3 7 0 5 7 7 7777 7 7 333333 9 7 99 9 9 99 99 777 9 111 000 9 9 5 0 88888 5 0 2 22 22222222 1 1 1 2 1 1 77 3 66 3 888 7 3 6 3 3 0
consensus : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-GAT-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
Reference ( family-1657 ) : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-GNT-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
gi|1 : TCA-TGT-GCC--CAA-CCTCTTACTCCAG-GAGT--AAATATT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA---TTTA-CTCTCCC-T-G---TG---TAAAAGCAAA----T-TTT-GCTATGC-GTTCAC----GTT-GGC-AGGA--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCAC-ACA-----TTTATCG-GAAAG-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---CAGACA----ATTTAACT----GCCA---TTTTTTTG-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTGTCCGA-GAA--GTAAAGTGC-CAGTAGAC--CACAAGTTAAAA--TG-TATGC-T---GAC-ATAA---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGATT--A-AA--AA--TTAAAA-A-ATGA-GAAAGAAATG-T-TTACAT-A----T--TATT------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-ATG-TGT---GTCAC-T-TGTGACA-AAGG-----GG-GGT-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGAG--A-G--ACC-ATAG---A----TGT-TGGAT
gi|1 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|10 : tcatgtgcccaacctcttactccaggagtaaatattgcatggtgtgtaatttactctccctgtgtaaaagcaaattttgctatgcgttcacgttggcaggaaaagagaccatatgtaattttgctatttgcacacatttatcggaaagaattcatgatggatctagacaactacgtcttcgcagacaatttaactgccatttttttggagtacaagttaaattattggtttgtccgagaagtaaagtgccagtagaccacaagttaaaatgtatgctgacataaattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatggattaaaaattaaaaaatgagaaagaaatgtttacatattattgcaacagattaatgtgtgtcacttgtgacaaaggggggtcaagttatcaatactcatgtgggagagaccatagatgttggatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---TAAAAACAAA----T-T---ACTATG--GTTC-C----AT--GGA-A--A--A--AA--AA-GAC-----------------AT--ATAA-G-T--T--T-CTATTT---ACAC---A-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GA---GA-T-TAG-ACA----AC--TACG-CTTT-----CAGACA----A----T-T------TAATTTTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTA--GAT-TA-TTGG---TTTG-GCGA-GAA--A-----TTC-CAATAGAC-----AAG-TAAA------TATGT-TCGAGAT-AAAATTCA-TT-TG---AA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-A-CAATGGATA--A-AA--AA--TT
gi|11 : gtaaagcctgtcatgtcacgTCA-TGT-GCC--CA--CCT-TTAA-CCTG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-C--G-T---AA-A-ACTAACTT-CCC-T-AGTATG---TAAAAGCAAA----C-TTTGGCT-TGC-GTTCACA---GT--GGA-A--A--A--A---GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-AG-T-TAGAACA----ACT-TACA-TCTTGG---TAGACA----A----ATT----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAATGTTAACAAT-CA-TTGGGTTCTTGCCCGACGAG--AAAAGGT-C-TAGTAGAC-----ATGTT-AAG--AG-TATGC-T--GGAC-AGAG---ACTTGTGAAAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGC-ATGGGTT--G-AA--AA--TAAAAG-A-ACGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-ATATCTA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---ACAT--TTT---GTC-C-T-TGT-ACA-AA-G-----GG-Gttaagtcagaaaaatagacacaatctaactatataactattagtttgcaactggaaatggagtggtgtcgcacggatatcaagtacgttacatgttggagattaccgataagttgttatgttaagtaaattgcacttcgttgcattg
gi|12 : CCTGTTCAATGT-GCT--------T-TT--TTCAGAGAGT--AGTT-TT------------------------A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TT---TAA-----------T-TT----TATGC-GTTCCG----GT--GGA-G--ATTATTAA--G---------------------TAT--GTGG-TGT--TAATGCTATTT---GCAC---A-----TGT-------A-G----------T-G-TG-GA-T-TAG-ATA----AC--TAC--TCTCG----TAGACA----ATTTAA-T----G------TATTATT-----------G-GTTA------TA-TTGG---TTTG-C------------------------GAT--CA-AAGTTAGGA--TG-TATGT-T--GGAC-A-----------------A---AAA----TATATT-ATC-AGCAATT--TT--A-AA--AA--T-----------AGGAAA--AATG-T-T-ACAT-A----TA-TA-TTTGGTCA-T-AT--C-A-GGTA--TT---A-AT--TTG---TTCATAT-GGTGACA-AAGG-----GG-GAT-CATTAG-T--------A-T-C-ATTATTTCATG-T-GGAGG-AG-G--ACA-TTAG---A-GTTTGT-TATGT
gi|13 : cTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAA-T-T--G--TGCTATTT---GTAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--AGTA--CAA-GTTA--AAT-CA-TCGG---TCTT-CCGA-GAT--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATAT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTG-AAAA---TAAGTTTTA-TTG-ATT-AGCAAGAGATTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAGAGAAACG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-G--A--TT---C-AT--TTT---GTCGC-T-TGCAACG-AA-G-----GGCGAT-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACT-ATAG---A-G-TTGagttatttactttgcgttcatgtgc
gi|14 : CTGTCCA-TGT-GTC--CAA-TCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTCA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--G------A--A--AA--AA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTC---ACA-CACG-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AC-GAT------------------AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-C----GCAA---TTTTATTT-GATCA--CAT-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CAGTAGAC--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-GTC-AGCAATGGGTT--GCAA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------
gi|15 : A-AG-G-----GG-GGT-CA--AGTT--------AAT-C-A-TACTCC-TG-T-GGA-G-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGT
gi|15 : caACTC-CGTAATGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccgtaatgcaaatcttgccacatgaacggccgg
gi|16 : caaaggggggtcaagttaatcatactcctgtggagtagaccatagagttgttaggtgtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA-G-----GG-GAT-CA--AGTT--------A-T-C-AATATCCA-TG-T-GGAAGATAGG--ACCAACAG---A-G-TTGTCTAGGTccgg
gi|16 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacgggtg
gi|17 : aaggggatcaagttatcaatatccatgtggaagataggaccaacagagttgtctaggtagtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGT-GCC---AA-C-T-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-TGTG-T---AA-A-TTTA-CTC-CCA-T-A---GG---TAAAAGCAAA----T-TT--GTTGTGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAATT-T--T--TGCTATCT---GCA-CACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTGG-ACA----AC--TACA-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--------------------T-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAGAAAAAAAAAGC-CAGTAGAC--CG-TAGTTAAA---AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTATG-Atg
gi|18 : --GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-
gi|19 : CTGTTCA-TGT-GCC--CAA-TCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-G-CA-TGATG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-A-T--T--TACTATTT---GCA-CACA-----TT--------------------AT-GTTG-GA-TCTAG-ACA----ACTATACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GACA---TTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTC--AAT-TA-TT
gi|2 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAA--TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----TATT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG----TTG--CGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGG-AAGAAACG-C-TTACGT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-T--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-ATC-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TT-T-TAGGTTA
gi|2 : ACTCACGTA-TGCAAAATCTTGCCACATGAACGG-GCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaaatcttgccacatgaacgggctt
gi|20 : cctgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattgcatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatattgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgcaatttgcaccacattttcggaagagttcatgatcgatctagacaactacatcttggtagacaaatgtcattttatgtgagcacaagttaaattattggttgcgagagaaaaagtgccagtagaccaaagttaaagagtatgttggacagagattgtgaaaaaaagtgttaatgattagcaatgggttaaaaattaaagaacgaggaagaaacgcttacgtatatatgtaacatattaattttgtcacttgtgacaaagggatccaagttatcaatactcatgtggaagtagaccatagagttttaggttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT----------G-CA-TGGTA-T--G-T---AG-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GATATGC-GTTCAC----GT--GGG-A--A--A--AA--GA-TAC--CATATACAACTGTATAT--GTAA-T-T--T--TGTTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GGTG-GA---TAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---AAGATG----A----A-C----GCCA---TTT
gi|21 : AAAA-A-ACGAGGAAGGAAACGGTGTTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TTAGGA-GTGGTTTGGGGTCAC-GATGTGACA-GA-GAGGAAGG-GTT-CA--AGTT--------A-T-CGAATACTAC-TG-TGGGAAG-CA-GGAGCC-ATAGGCAA-G-TTGT-
gi|22 : aaaaagttggaaaaaaaaaaataagaaaaaaaagcaggaa-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---CAAAGGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTT--C----TT--GAA-A--A--A--AA--GA-GACAAT------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACATTACTTTT-TTA-GAA-G-AAT-T-C-AT-----------------------------G-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---GTTTGTct
gi|23 : GTTCA-TGTTGCC--CAATCCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-GGCC-TGATG-T----T---AA-A-TTTAACTC-CCC-T-----TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATCC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAG-T-T--T--Tca
gi|24 : GAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-G-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-G
gi|25 : gcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--GT-GCCAACAA-CAT-TTAC-CCAG-GAGT--AA-T-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-ATTTTA-CTC-CTCGTAA---TGAGTCAAAAGCAAA----
gi|26 : -AAGTTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-GGAA---A-TTGTG--TAA---AAAGTTTTA-ATG-AT
gi|27 : CTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGGCGCTT
gi|28 : TCTCGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|29 : CCTGCTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--gct
gi|3 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-T-ACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--ACTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAA--C------------ATATT-GTAA-T-T--T---GTTATTTT--GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GATC-GA-TTTAC-ACA----AC--TCCA-TCTTGG---CAGACA----A----A-TT---GCCA---TTTCATTTTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-TAATTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGT-CAGTAGAC--CA-TTGTTAA-G--AG-TATGTCT--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAAAAAAAAGTTTTA-AAG-ATC-CGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGAAAAGAAATG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AG--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAA-A-TGTGACA-AA-G-----GG-GATCCA--AGTT--------A-T-C-AACATTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-T
gi|3 : ACTCACGTA-TGCAAA-TTTTGCCACATGAACtgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaattttgccacatgaac
gi|30 : cctgttcatgtgcccaaccttactccaggagtaaatttgatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttactatgcgttcacgtggaaaaaagagaacatattgtaatttgttattttgcacacattttcggaagaatttcatgatcgatttacacaactccatcttggcagacaaattgccatttcattttgagcacaagttaaattaattggtttgccgagagaaaaagtgtcagtagaccattgttaagagtatgtctggacagagattgtgaaaaaaaaaagttttaaagatccgcaatgggttaaaaattaaagaacgagaaaagaaatgtttacatatatatgcagcagattaattttgtcaaatgtgacaaaggggatccaagttatcaacattcctgtggaagtagaccatagagttgtttgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CAT-TTACTCCAG-GAGT--
gi|31 : CGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|4 : tc-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGT--T--GTT---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---G-AACACA-----TTT-TC--GAA-G-AAT-T-C-AT-GATC-GATTTTAG-ACG----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--AAT-GTTA--AAT-TA-CTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CA-TAGAA--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAT---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTG-A-AA--AA--TTAAAG-A-ATGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------GCC-AA--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-GATCCA--AGTT--------A-T-C-AACACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---A-G-TT-T-TAGGTac
gi|4 : ACTCACGTA-TGCACA-TCTTGCCACATGAagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcacatcttgccacatga
gi|5 : gcccaacctttactccaggagtaaatttgcatggttgttaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgctatttgaacacattttcgaagaattcatgatcgattttagacgactacatcttggtagacaaatgcgattttatttgagcaaatgttaaattactggtttgccgagagaaaaggttccatagaacaacgttaagagtatgttggacagatattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatgggttgaaaaattaaagaatgaggaaagaaaggtttatatatatatgccaacagattaatttgtcacttgtgacaaaggggatccaagttatcaacactcctgtggaagtagaccacagagttttaggtagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-----GG-GGT-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGT
gi|5 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|6 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-----GG-GGT-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGTgct
gi|6 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|7 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC--CAA-CCT-TTCTTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---T-AAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAG-A--A--A--AT--GA-GAC--C------------ATA---GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA-----TTT-T-G-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----A----ACATTCTTCG---TAGACAATTTA----A-T----GCCA---TTTTATGT-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TT---------------------AAAGATGC-CAATAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTGAAAAA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-AGCAATGGAAT--A-AA--AAATTCAAAA-A-ATGAGGAAAGAAATG---TTACAT-A----TA--A-TA-----G-C--A--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGAAA-AG-G-----GG-GAT-CA--AGTT--------G-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGGG-AG-A--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TATGTgct
gi|7 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|8 : ccaacctttcttccaggagtaaattttgcatggtgtgtaaatttactcccctgtgtaaagcaaatttgctatgcgttcacgtgagaaaatgagaccatagtaattttgctatttgcacacattttggaagaattcatgatggatctagacaaacattcttcgtagacaatttaatgccattttatgtgagtacaagttaaattattaaagatgccaatagaccaaagttaagagtatgttggacagaaattgtgaaaaaaaagtttaaatgatcagcaatggaataaaaaattcaaaaaatgaggaaagaaatgttacatataatagcacagattaatttgtcacttgtgaaaagggggatcaagttgtcaatactcatgtgggggagaaccatagagttgttatgtagtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGT-GCC--CA--TCT-TCACTCCAGAGAGA--AATT-TT-G-CAATGGTGCT--G-TTGAAATA-TTTT-TTC-CCA-C-A---GG---TAAA-GCAAAAATCT-TC--ATTATGC-GT-CACCGTTGT--CGACA--A--AT-AG--GATGACT-C------------ATACTCGTTA-T-TCTT--TGCTATTT---GCATCACA-----TTC--CGTGAA-G-AAT-C-T-AT-GA-G-TA-TC-AGTCCA----AC--T-CT-TCTTCACTTTAGGCA----A----T-TTCAAGTCA---TTTTATTT-GAGTAACCAA-GTTA--GATCTA-TTG-----TTG-CCGA-GAG--TCAAGATAC-CAATAGAC--CA-AAGTTCAAG--AGATATGT-T---GAC-AAAA---A--TGTG----A---AAAGTTTAA-ATGCATCTAGCAATGGATG--A-AATCAT--TCACAA-ATATGAGCAA--AAATG-T-TTTTATCA----TACTA-T------G-C-AAACC-ACG--ACTTT---A-CA--TCT---CTCAC-T-TGTGACACAA-GC----GG-GAT-CA--AGCTTTAAGTAAA-TAC-AATACTTCATGTT-GGGAG-
gi|9 : gtcctctgaataccTTCAGTGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGTGTAAAT-GT-G-CA-TG-T--T--G-T---AA-A-TTTA-CGC-TCC-C-G---TG---TAAAAGCAGAAAG-T-TT--GCTATGCAGTTCAC----GTTGGGA-A--A--A--AAAAGA-GACG-C------------ATAT--GTA----T--T--TGCT-TTTCTGGCACCAGG-----TTT--CG-GAA-GGAATGT-C-ATTGATG-GA-TCTAG-GCGTGAGAC--TACT-TCTCG----TAGACA----ATTGAA-T----GGCA---TTGTATTT-GA-TA--CAA-GTTA--ACA-TA-TTG----TTTG-CCGA-GAG--TAAAGGTGCACAGT-GACTGCC-TAGTTAAGGGAAG-TATGT----GGACGAGAGGA-A-ATGTG-AAAA---ACAGTTT-A-A-G-ATC-AGCAATGGATA--A-AA--AA--TTCAAA-A-ATGACGGAAGAATGG-T-TTAACT-A----TA-TA-T------G---AA--CAA-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-----GG-Ggcgaagaaccttatcagtttacttatgtatgtgtacatgtttactttgcgttcatgtgc
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 11 1111 1 11 111111 111 111 11111111
lowQualScore : 5 2 22 2 2 4 22 2 7 2 2 2 33 2 888 2 2 4 2 2 2 333 333 8888 2 55 2 6666 44 2 22 22 44 22 2 111111111111111 44 2 2 22 22 555 99 55555 2 2 2 6 2 4 4 2 44 2 5 4 44444 55 66 1 333 4444 3333 4 6666 333 2 33 2 33 2 2 444 5 2 333 3 2 33 2 5 33 2 2 33 2 777 2 55 444 2 2 2 55 2 33 33 5 2 1 2 2 2 5555 2 2 000000 2 5 33 2 2 33 33 000 2 000 555 2 2 2 5 2 2 77777 6 44 11111111 3 3 3 6 3 3 33 3 44 3 555 6 3 3 3 3 4
lowQualScore : . . .. . . . .. . . . . . .. . ... . . . . . . ... ... .... . .. . .... .. . .. .. .. .. . ............... .. . . .. .. ... .. ..... . . . . . . . . .. . . . ..... .. .. . ... .... .... . .... ... . .. . .. . . ... . . ... . . .. . . .. . . .. . ... . .. ... . . . .. . .. .. . . . . . . .... . . ...... . . .. . . .. .. ... . ... ... . . . . . . ..... . .. ........ . . . . . . .. . .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 0 2 99 1 1 2 99 4 1 4 4 4 22 4 333 2 1 2 1 1 1 777 777 2222 2 33 2 6666 88 0 88 88 88 88 0 555555555555555 88 0 0 88 88 888 00 33333 1 1 1 3 1 2 2 1 77 1 2 2 77777 00 77 8 777 5555 4444 2 6666 777 4 22 4 22 4 4 444 0 5 555 5 5 44 4 5 22 4 4 22 4 444 4 88 444 5 5 7 33 7 77 77 3 7 0 5 7 7 7777 7 7 333333 9 7 99 9 9 99 99 777 9 111 000 9 9 5 0 5 5 77777 2 22 22222222 1 1 1 2 1 1 77 3 66 3 888 7 3 6 3 3 0
consensus : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
Reference ( family-1657 ) : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
gi|1 : TCA-TGT-GCC--CAA-CCTCTTACTCCAG-GAGT--AAATATT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA---TTTA-CTCTCCC-T-G---TG---TAAAAGCAAA----T-TTT-GCTATGC-GTTCAC----GTT-GGC-AGGA--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCAC-ACA-----TTTATCG-GAAAG-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---CAGACA----ATTTAACT----GCCA---TTTTTTTG-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTGTCCGA-GAA--GTAAAGTGC-CAGTAGAC--CACAAGTTAAAA--TG-TATGC-T---GAC-ATAA---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGATT--A-AA--AA--TTAAAA-A-ATGA-GAAAGAAATG-T-TTACAT-A----T--TATT------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-ATG-TGT---GTCAC-T-TGTGACA-AAGG-GG-GG-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGAG--A-G--ACC-ATAG---A----TGT-TGGAT
gi|1 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|10 : tcatgtgcccaacctcttactccaggagtaaatattgcatggtgtgtaatttactctccctgtgtaaaagcaaattttgctatgcgttcacgttggcaggaaaagagaccatatgtaattttgctatttgcacacatttatcggaaagaattcatgatggatctagacaactacgtcttcgcagacaatttaactgccatttttttggagtacaagttaaattattggtttgtccgagaagtaaagtgccagtagaccacaagttaaaatgtatgctgacataaattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatggattaaaaattaaaaaatgagaaagaaatgtttacatattattgcaacagattaatgtgtgtcacttgtgacaaaggggggtcaagttatcaatactcatgtgggagagaccatagatgttggatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---TAAAAACAAA----T-T---ACTATG--GTTC-C----AT--GGA-A--A--A--AA--AA-GAC-----------------AT--ATAA-G-T--T--T-CTATTT---ACAC---A-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GA---GA-T-TAG-ACA----AC--TACG-CTTT-----CAGACA----A----T-T------TAATTTTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTA--GAT-TA-TTGG---TTTG-GCGA-GAA--A-----TTC-CAATAGAC-----AAG-TAAA------TATGT-TCGAGAT-AAAATTCA-TT-TG---AA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-A-CAATGGATA--A-AA--AA--TT
gi|11 : gtaaagcctgtcatgtcacgTCA-TGT-GCC--CA--CCT-TTAA-CCTG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-C--G-T---AA-A-ACTAACTT-CCC-T-AGTATG---TAAAAGCAAA----C-TTTGGCT-TGC-GTTCACA---GT--GGA-A--A--A--A---GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-AG-T-TAGAACA----ACT-TACA-TCTTGG---TAGACA----A----ATT----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAATGTTAACAAT-CA-TTGGGTTCTTGCCCGACGAG--AAAAGGT-C-TAGTAGAC-----ATGTT-AAG--AG-TATGC-T--GGAC-AGAG---ACTTGTGAAAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGC-ATGGGTT--G-AA--AA--TAAAAG-A-ACGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-ATATCTA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---ACAT--TTT---GTC-C-T-TGT-ACA-AA-G-GG-Gttaagtcagaaaaatagacacaatctaactatataactattagtttgcaactggaaatggagtggtgtcgcacggatatcaagtacgttacatgttggagattaccgataagttgttatgttaagtaaattgcacttcgttgcattg
gi|12 : CCTGTTCAATGT-GCT--------T-TT--TTCAGAGAGT--AGTT-TT------------------------A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TT---TAA-----------T-TT----TATGC-GTTCCG----GT--GGA-G--ATTATTAA--G---------------------TAT--GTGG-TGT--TAATGCTATTT---GCAC---A-----TGT-------A-G----------T-G-TG-GA-T-TAG-ATA----AC--TAC--TCTCG----TAGACA----ATTTAA-T----G------TATTATT-----------G-GTTA------TA-TTGG---TTTG-C------------------------GAT--CA-AAGTTAGGA--TG-TATGT-T--GGAC-A-----------------A---AAA----TATATT-ATC-AGCAATT--TT--A-AA--AA--T-----------AGGAAA--AATG-T-T-ACAT-A----TA-TA-TTTGGTCA-T-AT--C-A-GGTA--TT---A-AT--TTG---TTCATAT-GGTGACA-AAGG-GG-GA-----T-CATTAG-T--------A-T-C-ATTATTTCATG-T-GGAGG-AG-G--ACA-TTAG---A-GTTTGT-TATGT
gi|13 : cTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAA-T-T--G--TGCTATTT---GTAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--AGTA--CAA-GTTA--AAT-CA-TCGG---TCTT-CCGA-GAT--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATAT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTG-AAAA---TAAGTTTTA-TTG-ATT-AGCAAGAGATTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAGAGAAACG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-G--A--TT---C-AT--TTT---GTCGC-T-TGCAACG-AA-G-GGCGA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACT-ATAG---A-G-TTGagttatttactttgcgttcatgtgc
gi|14 : CTGTCCA-TGT-GTC--CAA-TCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTCA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--G------A--A--AA--AA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTC---ACA-CACG-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AC-GAT------------------AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-C----GCAA---TTTTATTT-GATCA--CAT-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CAGTAGAC--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-GTC-AGCAATGGGTT--GCAA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------
gi|15 : A-AG-G-GG-GG-----T-CA--AGTT--------AAT-C-A-TACTCC-TG-T-GGA-G-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGT
gi|15 : caACTC-CGTAATGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccgtaatgcaaatcttgccacatgaacggccgg
gi|16 : caaaggggggtcaagttaatcatactcctgtggagtagaccatagagttgttaggtgtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATATCCA-TG-T-GGAAGATAGG--ACCAACAG---A-G-TTGTCTAGGTccgg
gi|16 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacgggtg
gi|17 : aaggggatcaagttatcaatatccatgtggaagataggaccaacagagttgtctaggtagtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGT-GCC---AA-C-T-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-TGTG-T---AA-A-TTTA-CTC-CCA-T-A---GG---TAAAAGCAAA----T-TT--GTTGTGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAATT-T--T--TGCTATCT---GCA-CACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTGG-ACA----AC--TACA-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--------------------T-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAGAAAAAAAAAGC-CAGTAGAC--CG-TAGTTAAA---AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTATG-Atg
gi|18 : --GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-
gi|19 : CTGTTCA-TGT-GCC--CAA-TCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-G-CA-TGATG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-A-T--T--TACTATTT---GCA-CACA-----TT--------------------AT-GTTG-GA-TCTAG-ACA----ACTATACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GACA---TTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTC--AAT-TA-TT
gi|2 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAA--TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----TATT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG----TTG--CGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGG-AAGAAACG-C-TTACGT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-T--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-AT-----C-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TT-T-TAGGTTA
gi|2 : ACTCACGTA-TGCAAAATCTTGCCACATGAACGG-GCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaaatcttgccacatgaacgggctt
gi|20 : cctgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattgcatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatattgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgcaatttgcaccacattttcggaagagttcatgatcgatctagacaactacatcttggtagacaaatgtcattttatgtgagcacaagttaaattattggttgcgagagaaaaagtgccagtagaccaaagttaaagagtatgttggacagagattgtgaaaaaaagtgttaatgattagcaatgggttaaaaattaaagaacgaggaagaaacgcttacgtatatatgtaacatattaattttgtcacttgtgacaaagggatccaagttatcaatactcatgtggaagtagaccatagagttttaggttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT----------G-CA-TGGTA-T--G-T---AG-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GATATGC-GTTCAC----GT--GGG-A--A--A--AA--GA-TAC--CATATACAACTGTATAT--GTAA-T-T--T--TGTTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GGTG-GA---TAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---AAGATG----A----A-C----GCCA---TTT
gi|21 : AAAA-A-ACGAGGAAGGAAACGGTGTTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TTAGGA-GTGGTTTGGGGTCAC-GATGTGACA-GA-G-AG-GAAGGGTT-CA--AGTT--------A-T-CGAATACTAC-TG-TGGGAAG-CA-GGAGCC-ATAGGCAA-G-TTGT-
gi|22 : aaaaagttggaaaaaaaaaaataagaaaaaaaagcaggaa-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---CAAAGGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTT--C----TT--GAA-A--A--A--AA--GA-GACAAT------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACATTACTTTT-TTA-GAA-G-AAT-T-C-AT-----------------------------G-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---GTTTGTct
gi|23 : GTTCA-TGTTGCC--CAATCCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-GGCC-TGATG-T----T---AA-A-TTTAACTC-CCC-T-----TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATCC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAG-T-T--T--Tca
gi|24 : GAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-G-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-G
gi|25 : gcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--GT-GCCAACAA-CAT-TTAC-CCAG-GAGT--AA-T-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-ATTTTA-CTC-CTCGTAA---TGAGTCAAAAGCAAA----
gi|26 : -AAGTTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-GGAA---A-TTGTG--TAA---AAAGTTTTA-ATG-AT
gi|27 : CTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGGCGCTT
gi|28 : TCTCGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|29 : CCTGCTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--gct
gi|3 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-T-ACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--ACTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAA--C------------ATATT-GTAA-T-T--T---GTTATTTT--GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GATC-GA-TTTAC-ACA----AC--TCCA-TCTTGG---CAGACA----A----A-TT---GCCA---TTTCATTTTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-TAATTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGT-CAGTAGAC--CA-TTGTTAA-G--AG-TATGTCT--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAAAAAAAAGTTTTA-AAG-ATC-CGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGAAAAGAAATG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AG--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAA-A-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----TCCA--AGTT--------A-T-C-AACATTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-T
gi|3 : ACTCACGTA-TGCAAA-TTTTGCCACATGAACtgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaattttgccacatgaac
gi|30 : cctgttcatgtgcccaaccttactccaggagtaaatttgatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttactatgcgttcacgtggaaaaaagagaacatattgtaatttgttattttgcacacattttcggaagaatttcatgatcgatttacacaactccatcttggcagacaaattgccatttcattttgagcacaagttaaattaattggtttgccgagagaaaaagtgtcagtagaccattgttaagagtatgtctggacagagattgtgaaaaaaaaaagttttaaagatccgcaatgggttaaaaattaaagaacgagaaaagaaatgtttacatatatatgcagcagattaattttgtcaaatgtgacaaaggggatccaagttatcaacattcctgtggaagtagaccatagagttgtttgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CAT-TTACTCCAG-GAGT--
gi|31 : CGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|4 : tc-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGT--T--GTT---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---G-AACACA-----TTT-TC--GAA-G-AAT-T-C-AT-GATC-GATTTTAG-ACG----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--AAT-GTTA--AAT-TA-CTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CA-TAGAA--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAT---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTG-A-AA--AA--TTAAAG-A-ATGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------GCC-AA--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----TCCA--AGTT--------A-T-C-AACACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---A-G-TT-T-TAGGTac
gi|4 : ACTCACGTA-TGCACA-TCTTGCCACATGAagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcacatcttgccacatga
gi|5 : gcccaacctttactccaggagtaaatttgcatggttgttaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgctatttgaacacattttcgaagaattcatgatcgattttagacgactacatcttggtagacaaatgcgattttatttgagcaaatgttaaattactggtttgccgagagaaaaggttccatagaacaacgttaagagtatgttggacagatattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatgggttgaaaaattaaagaatgaggaaagaaaggtttatatatatatgccaacagattaatttgtcacttgtgacaaaggggatccaagttatcaacactcctgtggaagtagaccacagagttttaggtagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-GG-GG-----T-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGT
gi|5 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|6 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-GG-GG-----T-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGTgct
gi|6 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|7 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC--CAA-CCT-TTCTTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---T-AAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAG-A--A--A--AT--GA-GAC--C------------ATA---GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA-----TTT-T-G-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----A----ACATTCTTCG---TAGACAATTTA----A-T----GCCA---TTTTATGT-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TT---------------------AAAGATGC-CAATAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTGAAAAA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-AGCAATGGAAT--A-AA--AAATTCAAAA-A-ATGAGGAAAGAAATG---TTACAT-A----TA--A-TA-----G-C--A--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGAAA-AG-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------G-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGGG-AG-A--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TATGTgct
gi|7 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|8 : ccaacctttcttccaggagtaaattttgcatggtgtgtaaatttactcccctgtgtaaagcaaatttgctatgcgttcacgtgagaaaatgagaccatagtaattttgctatttgcacacattttggaagaattcatgatggatctagacaaacattcttcgtagacaatttaatgccattttatgtgagtacaagttaaattattaaagatgccaatagaccaaagttaagagtatgttggacagaaattgtgaaaaaaaagtttaaatgatcagcaatggaataaaaaattcaaaaaatgaggaaagaaatgttacatataatagcacagattaatttgtcacttgtgaaaagggggatcaagttgtcaatactcatgtgggggagaaccatagagttgttatgtagtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGT-GCC--CA--TCT-TCACTCCAGAGAGA--AATT-TT-G-CAATGGTGCT--G-TTGAAATA-TTTT-TTC-CCA-C-A---GG---TAAA-GCAAAAATCT-TC--ATTATGC-GT-CACCGTTGT--CGACA--A--AT-AG--GATGACT-C------------ATACTCGTTA-T-TCTT--TGCTATTT---GCATCACA-----TTC--CGTGAA-G-AAT-C-T-AT-GA-G-TA-TC-AGTCCA----AC--T-CT-TCTTCACTTTAGGCA----A----T-TTCAAGTCA---TTTTATTT-GAGTAACCAA-GTTA--GATCTA-TTG-----TTG-CCGA-GAG--TCAAGATAC-CAATAGAC--CA-AAGTTCAAG--AGATATGT-T---GAC-AAAA---A--TGTG----A---AAAGTTTAA-ATGCATCTAGCAATGGATG--A-AATCAT--TCACAA-ATATGAGCAA--AAATG-T-TTTTATCA----TACTA-T------G-C-AAACC-ACG--ACTTT---A-CA--TCT---CTCAC-T-TGTGACACAA-GCGG-GA-----T-CA--AGCTTTAAGTAAA-TAC-AATACTTCATGTT-GGGAG-
gi|9 : gtcctctgaataccTTCAGTGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGTGTAAAT-GT-G-CA-TG-T--T--G-T---AA-A-TTTA-CGC-TCC-C-G---TG---TAAAAGCAGAAAG-T-TT--GCTATGCAGTTCAC----GTTGGGA-A--A--A--AAAAGA-GACG-C------------ATAT--GTA----T--T--TGCT-TTTCTGGCACCAGG-----TTT--CG-GAA-GGAATGT-C-ATTGATG-GA-TCTAG-GCGTGAGAC--TACT-TCTCG----TAGACA----ATTGAA-T----GGCA---TTGTATTT-GA-TA--CAA-GTTA--ACA-TA-TTG----TTTG-CCGA-GAG--TAAAGGTGCACAGT-GACTGCC-TAGTTAAGGGAAG-TATGT----GGACGAGAGGA-A-ATGTG-AAAA---ACAGTTT-A-A-G-ATC-AGCAATGGATA--A-AA--AA--TTCAAA-A-ATGACGGAAGAATGG-T-TTAACT-A----TA-TA-T------G---AA--CAA-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-Ggcgaagaaccttatcagtttacttatgtatgtgtacatgtttactttgcgttcatgtgc
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 11 1111 1 11 111111 111 111 11111111
lowQualScore : 5 2 22 2 2 4 22 2 7 2 2 2 33 2 888 2 2 4 2 2 2 333 333 8888 2 55 2 6666 44 2 22 22 44 22 2 111111111111111 44 2 2 22 22 555 99 55555 2 2 2 6 2 4 4 2 44 2 5 4 44444 55 66 1 333 4444 3333 4 6666 333 2 33 2 33 2 2 444 5 2 333 3 2 33 2 5 33 2 2 33 2 777 2 55 444 2 2 2 55 2 33 33 5 2 1 2 2 2 5555 2 2 000000 2 5 33 2 2 33 33 000 2 000 555 2 2 2 5 2 2 77777 6 44 11111111 3 3 3 6 3 3 33 3 44 3 555 6 3 3 3 3 4
lowQualScore : . . .. . . . .. . . . . . .. . ... . . . . . . ... ... .... . .. . .... .. . .. .. .. .. . ............... .. . . .. .. ... .. ..... . . . . . . . . .. . . . ..... .. .. . ... .... .... . .... ... . .. . .. . . ... . . ... . . .. . . .. . . .. . ... . .. ... . . . .. . .. .. . . . . . . .... . . ...... . . .. . . .. .. ... . ... ... . . . . . . ..... . .. ........ . . . . . . .. . .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 0 2 99 1 1 2 99 4 1 4 4 4 22 4 333 2 1 2 1 1 1 777 777 2222 2 33 2 6666 88 0 88 88 88 88 0 555555555555555 88 0 0 88 88 888 00 33333 1 1 1 3 1 2 2 1 77 1 2 2 77777 00 77 8 777 5555 4444 2 6666 777 4 22 4 22 4 4 444 0 5 555 5 5 44 4 5 22 4 4 22 4 444 4 88 444 5 5 7 33 7 77 77 3 7 0 5 7 7 7777 7 7 333333 9 7 99 9 9 99 99 777 9 111 000 9 9 5 0 5 5 77777 2 22 22222222 1 1 1 2 1 1 77 3 66 3 888 7 3 6 3 3 0
consensus : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
Reference ( family-1657 ) : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
gi|1 : TCA-TGT-GCC--CAA-CCTCTTACTCCAG-GAGT--AAATATT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA---TTTA-CTCTCCC-T-G---TG---TAAAAGCAAA----T-TTT-GCTATGC-GTTCAC----GTT-GGC-AGGA--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCAC-ACA-----TTTATCG-GAAAG-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---CAGACA----ATTTAACT----GCCA---TTTTTTTG-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTGTCCGA-GAA--GTAAAGTGC-CAGTAGAC--CACAAGTTAAAA--TG-TATGC-T---GAC-ATAA---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGATT--A-AA--AA--TTAAAA-A-ATGA-GAAAGAAATG-T-TTACAT-A----T--TATT------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-ATG-TGT---GTCAC-T-TGTGACA-AAGG-GG-GG-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGAG--A-G--ACC-ATAG---A----TGT-TGGAT
gi|1 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|10 : tcatgtgcccaacctcttactccaggagtaaatattgcatggtgtgtaatttactctccctgtgtaaaagcaaattttgctatgcgttcacgttggcaggaaaagagaccatatgtaattttgctatttgcacacatttatcggaaagaattcatgatggatctagacaactacgtcttcgcagacaatttaactgccatttttttggagtacaagttaaattattggtttgtccgagaagtaaagtgccagtagaccacaagttaaaatgtatgctgacataaattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatggattaaaaattaaaaaatgagaaagaaatgtttacatattattgcaacagattaatgtgtgtcacttgtgacaaaggggggtcaagttatcaatactcatgtgggagagaccatagatgttggatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---TAAAAACAAA----T-T---ACTATG--GTTC-C----AT--GGA-A--A--A--AA--AA-GAC-----------------AT--ATAA-G-T--T--T-CTATTT---ACAC---A-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GA---GA-T-TAG-ACA----AC--TACG-CTTT-----CAGACA----A----T-T------TAATTTTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTA--GAT-TA-TTGG---TTTG-GCGA-GAA--A-----TTC-CAATAGAC-----AAG-TAAA------TATGT-TCGAGAT-AAAATTCA-TT-TG---AA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-A-CAATGGATA--A-AA--AA--TT
gi|11 : gtaaagcctgtcatgtcacgTCA-TGT-GCC--CA--CCT-TTAA-CCTG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-C--G-T---AA-A-ACTAACTT-CCC-T-AGTATG---TAAAAGCAAA----C-TTTGGCT-TGC-GTTCACA---GT--GGA-A--A--A--A---GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-AG-T-TAGAACA----ACT-TACA-TCTTGG---TAGACA----A----ATT----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAATGTTAACAAT-CA-TTGGGTTCTTGCCCGACGAG--AAAAGGT-C-TAGTAGAC-----ATGTT-AAG--AG-TATGC-T--GGAC-AGAG---ACTTGTGAAAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGC-ATGGGTT--G-AA--AA--TAAAAG-A-ACGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-ATATCTA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---ACAT--TTT---GTC-C-T-TGT-ACA-AA-G-GG-Gttaagtcagaaaaatagacacaatctaactatataactattagtttgcaactggaaatggagtggtgtcgcacggatatcaagtacgttacatgttggagattaccgataagttgttatgttaagtaaattgcacttcgttgcattg
gi|12 : CCTGTTCAATGT-GCT--------T-TT--TTCAGAGAGT--AGTT-TT------------------------A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TT---TAA-----------T-TT----TATGC-GTTCCG----GT--GGA-G--ATTATTAA--G---------------------TAT--GTGG-TGT--TAATGCTATTT---GCAC---A-----TGT-------A-G----------T-G-TG-GA-T-TAG-ATA----AC--TAC--TCTCG----TAGACA----ATTTAA-T----G------TATTATT-----------G-GTTA------TA-TTGG---TTTG-C------------------------GAT--CA-AAGTTAGGA--TG-TATGT-T--GGAC-A-----------------A---AAA----TATATT-ATC-AGCAATT--TT--A-AA--AA--T-----------AGGAAA--AATG-T-T-ACAT-A----TA-TA-TTTGGTCA-T-AT--C-A-GGTA--TT---A-AT--TTG---TTCATAT-GGTGACA-AAGG-GG-GA-----T-CATTAG-T--------A-T-C-ATTATTTCATG-T-GGAGG-AG-G--ACA-TTAG---A-GTTTGT-TATGT
gi|13 : cTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAA-T-T--G--TGCTATTT---GTAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--AGTA--CAA-GTTA--AAT-CA-TCGG---TCTT-CCGA-GAT--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATAT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTG-AAAA---TAAGTTTTA-TTG-ATT-AGCAAGAGATTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAGAGAAACG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-G--A--TT---C-AT--TTT---GTCGC-T-TGCAACG-AA-G-GGCGA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACT-ATAG---A-G-TTGagttatttactttgcgttcatgtgc
gi|14 : CTGTCCA-TGT-GTC--CAA-TCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTCA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--G------A--A--AA--AA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTC---ACA-CACG-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AC-GAT------------------AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-C----GCAA---TTTTATTT-GATCA--CAT-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CAGTAGAC--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-GTC-AGCAATGGGTT--GCAA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------
gi|15 : A-AG-G-GG-GG-----T-CA--AGTT--------AAT-C-A-TACTCC-TG-T-GGA-G-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGT
gi|15 : caACTC-CGTAATGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccgtaatgcaaatcttgccacatgaacggccgg
gi|16 : caaaggggggtcaagttaatcatactcctgtggagtagaccatagagttgttaggtgtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATATCCA-TG-T-GGAAGATAGG--ACCAACAG---A-G-TTGTCTAGGTccgg
gi|16 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacgggtg
gi|17 : aaggggatcaagttatcaatatccatgtggaagataggaccaacagagttgtctaggtagtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGT-GCC---AA-C-T-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-TGTG-T---AA-A-TTTA-CTC-CCA-T-A---GG---TAAAAGCAAA----T-TT--GTTGTGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAATT-T--T--TGCTATCT---GCA-CACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTGG-ACA----AC--TACA-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--------------------T-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAGAAAAAAAAAGC-CAGTAGAC--CG-TAGTTAAA---AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTATG-Atg
gi|18 : --GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-
gi|19 : CTGTTCA-TGT-GCC--CAA-TCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-G-CA-TGATG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-A-T--T--TACTATTT---GCA-CACA-----TT--------------------AT-GTTG-GA-TCTAG-ACA----ACTATACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GACA---TTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTC--AAT-TA-TT
gi|2 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAA--TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----TATT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG----TTG--CGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGG-AAGAAACG-C-TTACGT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-T--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-AT-----C-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TT-T-TAGGTTA
gi|2 : ACTCACGTA-TGCAAAATCTTGCCACATGAACGG-GCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaaatcttgccacatgaacgggctt
gi|20 : cctgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattgcatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatattgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgcaatttgcaccacattttcggaagagttcatgatcgatctagacaactacatcttggtagacaaatgtcattttatgtgagcacaagttaaattattggttgcgagagaaaaagtgccagtagaccaaagttaaagagtatgttggacagagattgtgaaaaaaagtgttaatgattagcaatgggttaaaaattaaagaacgaggaagaaacgcttacgtatatatgtaacatattaattttgtcacttgtgacaaagggatccaagttatcaatactcatgtggaagtagaccatagagttttaggttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT----------G-CA-TGGTA-T--G-T---AG-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GATATGC-GTTCAC----GT--GGG-A--A--A--AA--GA-TAC--CATATACAACTGTATAT--GTAA-T-T--T--TGTTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GGTG-GA---TAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---AAGATG----A----A-C----GCCA---TTT
gi|21 : AAAA-A-ACGAGGAAGGAAACGGTGTTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TTAGGA-GTGGTTTGGGGTCAC-GATGTGACA-GA-G-AG-GAAGGGTT-CA--AGTT--------A-T-CGAATACTAC-TG-TGGGAAG-CA-GGAGCC-ATAGGCAA-G-TTGT-
gi|22 : aaaaagttggaaaaaaaaaaataagaaaaaaaagcaggaa-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---CAAAGGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTT--C----TT--GAA-A--A--A--AA--GA-GACAAT------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACATTACTTTT-TTA-GAA-G-AAT-T-C-AT-----------------------------G-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---GTTTGTct
gi|23 : GTTCA-TGTTGCC--CAATCCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-GGCC-TGATG-T----T---AA-A-TTTAACTC-CCC-T-----TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATCC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAG-T-T--T--Tca
gi|24 : GAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-G-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-G
gi|25 : gcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--GT-GCCAACAA-CAT-TTAC-CCAG-GAGT--AA-T-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-ATTTTA-CTC-CTCGTAA---TGAGTCAAAAGCAAA----
gi|26 : -AAGTTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-GGAA---A-TTGTG--TAA---AAAGTTTTA-ATG-AT
gi|27 : CTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGGCGCTT
gi|28 : TCTCGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|29 : CCTGCTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--gct
gi|3 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-T-ACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--ACTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAA--C------------ATATT-GTAA-T-T--T---GTTATTTT--GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GATC-GA-TTTAC-ACA----AC--TCCA-TCTTGG---CAGACA----A----A-TT---GCCA---TTTCATTTTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-TAATTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGT-CAGTAGAC--CA-TTGTTAA-G--AG-TATGTCT--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAAAAAAAAGTTTTA-AAG-ATC-CGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGAAAAGAAATG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AG--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAA-A-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----TCCA--AGTT--------A-T-C-AACATTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-T
gi|3 : ACTCACGTA-TGCAAA-TTTTGCCACATGAACtgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaattttgccacatgaac
gi|30 : cctgttcatgtgcccaaccttactccaggagtaaatttgatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttactatgcgttcacgtggaaaaaagagaacatattgtaatttgttattttgcacacattttcggaagaatttcatgatcgatttacacaactccatcttggcagacaaattgccatttcattttgagcacaagttaaattaattggtttgccgagagaaaaagtgtcagtagaccattgttaagagtatgtctggacagagattgtgaaaaaaaaaagttttaaagatccgcaatgggttaaaaattaaagaacgagaaaagaaatgtttacatatatatgcagcagattaattttgtcaaatgtgacaaaggggatccaagttatcaacattcctgtggaagtagaccatagagttgtttgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CAT-TTACTCCAG-GAGT--
gi|31 : CGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|4 : tc-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGT--T--GTT---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---G-AACACA-----TTT-TC--GAA-G-AAT-T-C-AT-GATC-GATTTTAG-ACG----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--AAT-GTTA--AAT-TA-CTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CA-TAGAA--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAT---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTG-A-AA--AA--TTAAAG-A-ATGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------GCC-AA--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----TCCA--AGTT--------A-T-C-AACACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---A-G-TT-T-TAGGTac
gi|4 : ACTCACGTA-TGCACA-TCTTGCCACATGAagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcacatcttgccacatga
gi|5 : gcccaacctttactccaggagtaaatttgcatggttgttaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgctatttgaacacattttcgaagaattcatgatcgattttagacgactacatcttggtagacaaatgcgattttatttgagcaaatgttaaattactggtttgccgagagaaaaggttccatagaacaacgttaagagtatgttggacagatattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatgggttgaaaaattaaagaatgaggaaagaaaggtttatatatatatgccaacagattaatttgtcacttgtgacaaaggggatccaagttatcaacactcctgtggaagtagaccacagagttttaggtagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-GG-GG-----T-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGT
gi|5 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|6 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-GG-GG-----T-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGTgct
gi|6 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|7 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC--CAA-CCT-TTCTTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---T-AAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAG-A--A--A--AT--GA-GAC--C------------ATA---GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA-----TTT-T-G-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----A----ACATTCTTCG---TAGACAATTTA----A-T----GCCA---TTTTATGT-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TT---------------------AAAGATGC-CAATAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTGAAAAA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-AGCAATGGAAT--A-AA--AAATTCAAAA-A-ATGAGGAAAGAAATG---TTACAT-A----TA--A-TA-----G-C--A--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGAAA-AG-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------G-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGGG-AG-A--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TATGTgct
gi|7 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|8 : ccaacctttcttccaggagtaaattttgcatggtgtgtaaatttactcccctgtgtaaagcaaatttgctatgcgttcacgtgagaaaatgagaccatagtaattttgctatttgcacacattttggaagaattcatgatggatctagacaaacattcttcgtagacaatttaatgccattttatgtgagtacaagttaaattattaaagatgccaatagaccaaagttaagagtatgttggacagaaattgtgaaaaaaaagtttaaatgatcagcaatggaataaaaaattcaaaaaatgaggaaagaaatgttacatataatagcacagattaatttgtcacttgtgaaaagggggatcaagttgtcaatactcatgtgggggagaaccatagagttgttatgtagtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGT-GCC--CA--TCT-TCACTCCAGAGAGA--AATT-TT-G-CAATGGTGCT--G-TTGAAATA-TTTT-TTC-CCA-C-A---GG---TAAA-GCAAAAATCT-TC--ATTATGC-GT-CACCGTTGT--CGACA--A--AT-AG--GATGACT-C------------ATACTCGTTA-T-TCTT--TGCTATTT---GCATCACA-----TTC--CGTGAA-G-AAT-C-T-AT-GA-G-TA-TC-AGTCCA----AC--T-CT-TCTTCACTTTAGGCA----A----T-TTCAAGTCA---TTTTATTT-GAGTAACCAA-GTTA--GATCTA-TTG-----TTG-CCGA-GAG--TCAAGATAC-CAATAGAC--CA-AAGTTCAAG--AGATATGT-T---GAC-AAAA---A--TGTG----A---AAAGTTTAA-ATGCATCTAGCAATGGATG--A-AATCAT--TCACAA-ATATGAGCAA--AAATG-T-TTTTATCA----TACTA-T------G-C-AAACC-ACG--ACTTT---A-CA--TCT---CTCAC-T-TGTGACACAA-GCGG-GA-----T-CA--AGCTTTAAGTAAA-TAC-AATACTTCATGTT-GGGAG-
gi|9 : gtcctctgaataccTTCAGTGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGTGTAAAT-GT-G-CA-TG-T--T--G-T---AA-A-TTTA-CGC-TCC-C-G---TG---TAAAAGCAGAAAG-T-TT--GCTATGCAGTTCAC----GTTGGGA-A--A--A--AAAAGA-GACG-C------------ATAT--GTA----T--T--TGCT-TTTCTGGCACCAGG-----TTT--CG-GAA-GGAATGT-C-ATTGATG-GA-TCTAG-GCGTGAGAC--TACT-TCTCG----TAGACA----ATTGAA-T----GGCA---TTGTATTT-GA-TA--CAA-GTTA--ACA-TA-TTG----TTTG-CCGA-GAG--TAAAGGTGCACAGT-GACTGCC-TAGTTAAGGGAAG-TATGT----GGACGAGAGGA-A-ATGTG-AAAA---ACAGTTT-A-A-G-ATC-AGCAATGGATA--A-AA--AA--TTCAAA-A-ATGACGGAAGAATGG-T-TTAACT-A----TA-TA-T------G---AA--CAA-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-Ggcgaagaaccttatcagtttacttatgtatgtgtacatgtttactttgcgttcatgtgc
blockSeqs : A T AA T . A GT . T G A C GT T TGA T T A . G A GTA AGT AATC A TG A CGTT TG C . TT TT AA T CATATACAACTGT TC T G CT AA CTG CC TTACT . T . C G T G T GC T C A GTGAG TA AT G CTT ATTT TTTA T TCAA ATT T AC T AC C A GTT C C AAA T A TG . A GA A C CG G TTC C AA AAA T C T TG C TC AT A T G G G C TATC C . TTGGTC C A AC A C GT CT AGG C TGG GGG A A C G C C AGGGT C TT TTAAGTAA A A G A T G AT G GA A GCA T T C A A C
blockSeqs : G . . . . A . . T . . . . . G . . A . . . . . AAG . . . A . . . . T . . AAT T . . . . T AC . . . . C . T G . GC . C T A T G G . . TTGA . T . . . . . . . . . . A G . . . A . . . . . GA . AA . . . . TG . . . A . T . . . . . . A . A . . . . . A . T . . . . . . . . C . . . . . A . . A . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . AC . . . . G . . . . G . C . A . A C . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . A . . . . . . . A . . . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . AC . . . . . . . . . G . C . A . G G . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A . . . . . . . A . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TC . . . . . . . . . G . C . A . G C . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A . . . . . . . A . . . . G . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . CC . . . . . . . . . G . T . A . A G . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . C . T . A . A G . . . . . . . . . . . . . . . A G . . . C . . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . G . T . A . A G . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . A . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . C . T . A . A C . . . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . G . C . A . G C . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . C . C . A . G G . . . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . C . C . G . A G . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . A . A G . . . . . . . . . . . . . . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . A . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** ** ** **** T** T*
originalCons : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
finalCons : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAGT-A-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 11 1111 1 11 111111 111 111 11111111
lowQualScore : 5 2 22 2 2 4 22 2 7 2 2 2 33 2 888 2 2 4 2 2 2 333 333 8888 2 55 2 6666 44 2 22 22 44 22 2 111111111111111 44 2 2 22 22 555 99 55555 2 2 2 6 2 4 4 2 44 2 5 4 44444 55 66 1 333 4444 3333 4 6666 333 2 33 2 33 2 2 444 5 2 333 3 2 33 2 5 33 2 2 33 2 777 2 55 444 2 2 2 55 2 33 33 5 2 1 2 2 2 5555 2 2 000000 2 5 33 2 2 33 33 000 2 000 555 2 2 2 5 2 2 77777 6 44 11111111 3 3 3 6 3 3 33 3 44 3 555 6 3 3 3 3 4
lowQualScore : . . .. . . . .. . . . . . .. . ... . . . . . . ... ... .... . .. . .... .. . .. .. .. .. . ............... .. . . .. .. ... .. ..... . . . . . . . . .. . . . ..... .. .. . ... .... .... . .... ... . .. . .. . . ... . . ... . . .. . . .. . . .. . ... . .. ... . . . .. . .. .. . . . . . . .... . . ...... . . .. . . .. .. ... . ... ... . . . . . . ..... . .. ........ . . . . . . .. . .. . ... . . . . . .
lowQualScore : 0 2 99 1 1 2 99 4 1 4 4 4 22 4 333 2 1 2 1 1 1 777 777 2222 2 33 2 6666 88 0 88 88 88 88 0 555555555555555 88 0 0 88 88 888 00 33333 1 1 1 3 1 2 2 1 77 1 2 2 77777 00 77 8 777 5555 4444 2 6666 777 4 22 4 22 4 4 444 0 5 555 5 5 44 4 5 22 4 4 22 4 444 4 88 444 5 5 7 33 7 77 77 3 7 0 5 7 7 7777 7 7 333333 9 7 99 9 9 99 99 777 9 111 000 9 9 5 0 5 5 77777 2 22 22222222 1 1 1 2 1 1 77 3 66 3 888 7 3 6 3 3 0
consensus : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
Reference ( family-1657 ) : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAANG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-GCTT
gi|1 : TCA-TGT-GCC--CAA-CCTCTTACTCCAG-GAGT--AAATATT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA---TTTA-CTCTCCC-T-G---TG---TAAAAGCAAA----T-TTT-GCTATGC-GTTCAC----GTT-GGC-AGGA--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCAC-ACA-----TTTATCG-GAAAG-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---CAGACA----ATTTAACT----GCCA---TTTTTTTG-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTGTCCGA-GAA--GTAAAGTGC-CAGTAGAC--CACAAGTTAAAA--TG-TATGC-T---GAC-ATAA---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGATT--A-AA--AA--TTAAAA-A-ATGA-GAAAGAAATG-T-TTACAT-A----T--TATT------G-C-AA--C-A-G--A--TT---A-ATG-TGT---GTCAC-T-TGTGACA-AAGG-GG-GG-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGAG--A-G--ACC-ATAG---A----TGT-TGGAT
gi|1 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|10 : tcatgtgcccaacctcttactccaggagtaaatattgcatggtgtgtaatttactctccctgtgtaaaagcaaattttgctatgcgttcacgttggcaggaaaagagaccatatgtaattttgctatttgcacacatttatcggaaagaattcatgatggatctagacaactacgtcttcgcagacaatttaactgccatttttttggagtacaagttaaattattggtttgtccgagaagtaaagtgccagtagaccacaagttaaaatgtatgctgacataaattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatggattaaaaattaaaaaatgagaaagaaatgtttacatattattgcaacagattaatgtgtgtcacttgtgacaaaggggggtcaagttatcaatactcatgtgggagagaccatagatgttggatgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---TAAAAACAAA----T-T---ACTATG--GTTC-C----AT--GGA-A--A--A--AA--AA-GAC-----------------AT--ATAA-G-T--T--T-CTATTT---ACAC---A-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GA---GA-T-TAG-ACA----AC--TACG-CTTT-----CAGACA----A----T-T------TAATTTTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTA--GAT-TA-TTGG---TTTG-GCGA-GAA--A-----TTC-CAATAGAC-----AAG-TAAA------TATGT-TCGAGAT-AAAATTCA-TT-TG---AA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-A-CAATGGATA--A-AA--AA--TT
gi|11 : gtaaagcctgtcatgtcacgTCA-TGT-GCC--CA--CCT-TTAA-CCTG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-C--G-T---AA-A-ACTAACTT-CCC-T-AGTATG---TAAAAGCAAA----C-TTTGGCT-TGC-GTTCACA---GT--GGA-A--A--A--A---GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-AG-T-TAGAACA----ACT-TACA-TCTTGG---TAGACA----A----ATT----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAATGTTAACAAT-CA-TTGGGTTCTTGCCCGACGAG--AAAAGGT-C-TAGTAGAC-----ATGTT-AAG--AG-TATGC-T--GGAC-AGAG---ACTTGTGAAAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGC-ATGGGTT--G-AA--AA--TAAAAG-A-ACGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-ATATCTA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TT---ACAT--TTT---GTC-C-T-TGT-ACA-AA-G-GG-Gttaagtcagaaaaatagacacaatctaactatataactattagtttgcaactggaaatggagtggtgtcgcacggatatcaagtacgttacatgttggagattaccgataagttgttatgttaagtaaattgcacttcgttgcattg
gi|12 : CCTGTTCAATGT-GCT--------T-TT--TTCAGAGAGT--AGTT-TT------------------------A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TT---TAA-----------T-TT----TATGC-GTTCCG----GT--GGA-G--ATTATTAA--G---------------------TAT--GTGG-TGT--TAATGCTATTT---GCAC---A-----TGT-------A-G----------T-G-TG-GA-T-TAG-ATA----AC--TAC--TCTCG----TAGACA----ATTTAA-T----G------TATTATT-----------G-GTTA------TA-TTGG---TTTG-C------------------------GAT--CA-AAGTTAGGA--TG-TATGT-T--GGAC-A-----------------A---AAA----TATATT-ATC-AGCAATT--TT--A-AA--AA--T-----------AGGAAA--AATG-T-T-ACAT-A----TA-TA-TTTGGTCA-T-AT--C-A-GGTA--TT---A-AT--TTG---TTCATAT-GGTGACA-AAGG-GG-GA-----T-CATTAG-T--------A-T-C-ATTATTTCATG-T-GGAGG-AG-G--ACA-TTAG---A-GTTTGT-TATGT
gi|13 : cTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAA-T-T--G--TGCTATTT---GTAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--AGTA--CAA-GTTA--AAT-CA-TCGG---TCTT-CCGA-GAT--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATAT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTG-AAAA---TAAGTTTTA-TTG-ATT-AGCAAGAGATTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAGAGAAACG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-G--A--TT---C-AT--TTT---GTCGC-T-TGCAACG-AA-G-GGCGA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACT-ATAG---A-G-TTGagttatttactttgcgttcatgtgc
gi|14 : CTGTCCA-TGT-GTC--CAA-TCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTCA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--G------A--A--AA--AA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTC---ACA-CACG-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AC-GAT------------------AC--TACG-TCTTGG---TAGACA----A----A-C----GCAA---TTTTATTT-GATCA--CAT-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CAGTAGAC--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-GTC-AGCAATGGGTT--GCAA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------
gi|15 : A-AG-G-GG-GG-----T-CA--AGTT--------AAT-C-A-TACTCC-TG-T-GGA-G-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TAGGT
gi|15 : caACTC-CGTAATGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-gtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactccgtaatgcaaatcttgccacatgaacggccgg
gi|16 : caaaggggggtcaagttaatcatactcctgtggagtagaccatagagttgttaggtgtaacatttctttggcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-AA-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------A-T-C-AATATCCA-TG-T-GGAAGATAGG--ACCAACAG---A-G-TTGTCTAGGTccgg
gi|16 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacgggtg
gi|17 : aaggggatcaagttatcaatatccatgtggaagataggaccaacagagttgtctaggtagtaactttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGT-GCC---AA-C-T-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGTG-TGTG-T---AA-A-TTTA-CTC-CCA-T-A---GG---TAAAAGCAAA----T-TT--GTTGTGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAT--C------------ATAT--GTAATT-T--T--TGCTATCT---GCA-CACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTGG-ACA----AC--TACA-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---TTTTATTT--------------------T-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAGAAAAAAAAAGC-CAGTAGAC--CG-TAGTTAAA---AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTATG-Atg
gi|18 : --GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTTA-A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGGAAAGAAATG-
gi|19 : CTGTTCA-TGT-GCC--CAA-TCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-G-CA-TGATG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-A-T--T--TACTATTT---GCA-CACA-----TT--------------------AT-GTTG-GA-TCTAG-ACA----ACTATACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GACA---TTTTATTT-GAGTA--CAA-GTTC--AAT-TA-TT
gi|2 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAA--TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----TATT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCAATTT---GCACCACA-----TTT-TCG-GAA-G-AGT-T-C-AT-GATC-GA-TCTAG-ACA----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GTCA---TTTTATGT-GAGCA--CAA-GTTA--AAT-TA-TTGG----TTG--CGA-GAG--AAAAAGTGC-CAGTAGAC--CA-AAGTTAAAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AAAGTGTTA-ATG-ATT-AGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGG-AAGAAACG-C-TTACGT-A----TA-TA-T------G-T-AA--C-A-T--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-AT-----C-CA--AGTT--------A-T-C-AATACTCA-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TT-T-TAGGTTA
gi|2 : ACTCACGTA-TGCAAAATCTTGCCACATGAACGG-GCTTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaaatcttgccacatgaacgggctt
gi|20 : cctgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattgcatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatattgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgcaatttgcaccacattttcggaagagttcatgatcgatctagacaactacatcttggtagacaaatgtcattttatgtgagcacaagttaaattattggttgcgagagaaaaagtgccagtagaccaaagttaaagagtatgttggacagagattgtgaaaaaaagtgttaatgattagcaatgggttaaaaattaaagaacgaggaagaaacgcttacgtatatatgtaacatattaattttgtcacttgtgacaaagggatccaagttatcaatactcatgtggaagtagaccatagagttttaggttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT----------G-CA-TGGTA-T--G-T---AG-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GATATGC-GTTCAC----GT--GGG-A--A--A--AA--GA-TAC--CATATACAACTGTATAT--GTAA-T-T--T--TGTTATTT---GCA-CACA------TT-TCG-GAA-G-AAT-T-C-AT-GGTG-GA---TAG-ACA----AC--TACG-TCTTCG---AAGATG----A----A-C----GCCA---TTT
gi|21 : AAAA-A-ACGAGGAAGGAAACGGTGTTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-A-G--A--TTAGGA-GTGGTTTGGGGTCAC-GATGTGACA-GA-G-AG-GAAGGGTT-CA--AGTT--------A-T-CGAATACTAC-TG-TGGGAAG-CA-GGAGCC-ATAGGCAA-G-TTGT-
gi|22 : aaaaagttggaaaaaaaaaaataagaaaaaaaagcaggaa-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---CAAAGGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTT--C----TT--GAA-A--A--A--AA--GA-GACAAT------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACATTACTTTT-TTA-GAA-G-AAT-T-C-AT-----------------------------G-TCTTCG---TAGACA----A----A-T----GCCA---GTTTGTct
gi|23 : GTTCA-TGTTGCC--CAATCCT-TTACTTCAG-GTGT--AAAT-TT-GGCC-TGATG-T----T---AA-A-TTTAACTC-CCC-T-----TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATCC-GTTCAC----GT--GAA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAG-T-T--T--Tca
gi|24 : GAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-C-AA--C-G-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-G
gi|25 : gcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--GT-GCCAACAA-CAT-TTAC-CCAG-GAGT--AA-T-TT-G-CA-TGGTG-T--G-T---AA-ATTTTA-CTC-CTCGTAA---TGAGTCAAAAGCAAA----
gi|26 : -AAGTTAA-G--AG-TATGT-T--GGAC-GGAA---A-TTGTG--TAA---AAAGTTTTA-ATG-AT
gi|27 : CTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGGCGCTT
gi|28 : TCTCGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|29 : CCTGCTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--gct
gi|3 : CCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-T-ACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G--A-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--ACTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAA--C------------ATATT-GTAA-T-T--T---GTTATTTT--GCAC-ACA-----TTT-TCG-GAA-G-AAT-TTC-AT-GATC-GA-TTTAC-ACA----AC--TCCA-TCTTGG---CAGACA----A----A-TT---GCCA---TTTCATTTTGAGCA--CAA-GTTA--AAT-TAATTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAAGTGT-CAGTAGAC--CA-TTGTTAA-G--AG-TATGTCT--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAAAAAAAAGTTTTA-AAG-ATC-CGCAATGGGTT--A-AA--AA--TTAAAG-A-ACGAGAAAAGAAATG-T-TTACAT-A----TA-TA-T------G-C-AG--C-A-G--A--TT---A-AT--TTT---GTCAA-A-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----TCCA--AGTT--------A-T-C-AACATTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ATAG---A-G-TTGT-T
gi|3 : ACTCACGTA-TGCAAA-TTTTGCCACATGAACtgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaattttgccacatgaac
gi|30 : cctgttcatgtgcccaaccttactccaggagtaaatttgatggtgtgtaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttactatgcgttcacgtggaaaaaagagaacatattgtaatttgttattttgcacacattttcggaagaatttcatgatcgatttacacaactccatcttggcagacaaattgccatttcattttgagcacaagttaaattaattggtttgccgagagaaaaagtgtcagtagaccattgttaagagtatgtctggacagagattgtgaaaaaaaaaagttttaaagatccgcaatgggttaaaaattaaagaacgagaaaagaaatgtttacatatatatgcagcagattaattttgtcaaatgtgacaaaggggatccaagttatcaacattcctgtggaagtagaccatagagttgtttgatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCCTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CAT-TTACTCCAG-GAGT--
gi|31 : CGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-
gi|4 : tc-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TT-G-CA-TGGT--T--GTT---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GAC--C------------ATAT--GTAA-T-T--T--TGCTATTT---G-AACACA-----TTT-TC--GAA-G-AAT-T-C-AT-GATC-GATTTTAG-ACG----AC--TACA-TCTTGG---TAGACA----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--AAT-GTTA--AAT-TA-CTGG---TTTG-CCGA-GAG--AAAAGGTTC-CA-TAGAA--CA-ACGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAT---A-TTGTG-AAAA---AAAGTTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTG-A-AA--AA--TTAAAG-A-ATGAGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------GCC-AA--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-GA-----TCCA--AGTT--------A-T-C-AACACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---A-G-TT-T-TAGGTac
gi|4 : ACTCACGTA-TGCACA-TCTTGCCACATGAagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcacatcttgccacatga
gi|5 : gcccaacctttactccaggagtaaatttgcatggttgttaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcacgtggaaaaaagagaccatatgtaattttgctatttgaacacattttcgaagaattcatgatcgattttagacgactacatcttggtagacaaatgcgattttatttgagcaaatgttaaattactggtttgccgagagaaaaggttccatagaacaacgttaagagtatgttggacagatattgtgaaaaaaagttttaatgatcagcaatgggttgaaaaattaaagaatgaggaaagaaaggtttatatatatatgccaacagattaatttgtcacttgtgacaaaggggatccaagttatcaacactcctgtggaagtagaccacagagttttaggtagtaaatttactttgcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-GG-GG-----T-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGT
gi|5 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|6 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaTGTTCA-TGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-TG--AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-A---TG---TAAAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAT----GT--GGA-A--A--A--AA--GA-GA---C------------ATAT--GT-A-T-T--T--TGCTATTT---GCCACACA-----TTT-TCG-GAA-GCAAT-T-TGAT-GATGCGA-TTT---AC--------------TCTTGG---TAGATC----A----A-T----GCGA---TTTTATTT-GAGCA--CAT-G-TA--AAT-TA-TTGG---TTTG-CCGA-GAA--GAAAGGTTC-CAGTAGAC--AA-ACATT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAG---A-TTGTG-AAAA---AGTATTTTA-ATG-ATC-AGCAATGGGTTTGA-AA--AA--TTAACGAA-ACGTGGAAAGAAAGG-T-TTATAT-A----TA-TA-T------G-CAAA--C-G-G--A--TTA--A-AT--TTT---GTCAC-T-TGTGAC--AA-G-GG-GG-----T-AA--AGTT--------A-T-C-AATACTCC-TG-T-GGAAG-TA-G--ACC-ACAG---ATG-TTGT-TAGGTgct
gi|6 : ACTAACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaactaacgtatgcaaatcttgccacatgaacggggct
gi|7 : tgttcatgtgcccaacctttactccaggagtaaattttgcatggtgtgtgaaatttactcccctatgtaaaagcaaatttgctatgcgttcatgtggaaaaaagagacatatgtattttgctatttgccacacattttcggaagcaatttgatgatgcgatttactcttggtagatcaatgcgattttatttgagcacatgtaaattattggtttgccgagaagaaaggttccagtagacaaacattaagagtatgttggacagagattgtgaaaaagtattttaatgatcagcaatgggtttgaaaaattaacgaaacgtggaaagaaaggtttatatatatatgcaaacggattaaattttgtcacttgtgacaagggggtaaagttatcaatactcctgtggaagtagaccacagatgttgttaggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaC--CAA-CCT-TTCTTCCAG-GAGT--AAAT-TTTG-CA-TGGTG-T--G-T---AA-A-TTTA-CTC-CCC-T-G---TG---T-AAAGCAAA----T-TT--GCTATGC-GTTCAC----GT--GAG-A--A--A--AT--GA-GAC--C------------ATA---GTAA-T-T--T--TGCTATTT---GCA-CACA-----TTT-T-G-GAA-G-AAT-T-C-AT-GATG-GA-TCTAG-ACA----A----ACATTCTTCG---TAGACAATTTA----A-T----GCCA---TTTTATGT-GAGTA--CAA-GTTA--AAT-TA-TT---------------------AAAGATGC-CAATAGAC--CA-AAGTT-AAG--AG-TATGT-T--GGAC-AGAA---A-TTGTGAAAAA---AAAGTTTAA-ATG-ATC-AGCAATGGAAT--A-AA--AAATTCAAAA-A-ATGAGGAAAGAAATG---TTACAT-A----TA--A-TA-----G-C--A--C-A-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGAAA-AG-G-GG-GA-----T-CA--AGTT--------G-T-C-AATACTCA-TG-T-GGGGG-AG-A--ACC-ATAG---A-G-TTGT-TATGTgct
gi|7 : ACTCACGTA-TGCAAA-TCTTGCCACATGAACGG-agtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcacgtatgcaaatcttgccacatgaacggg
gi|8 : ccaacctttcttccaggagtaaattttgcatggtgtgtaaatttactcccctgtgtaaagcaaatttgctatgcgttcacgtgagaaaatgagaccatagtaattttgctatttgcacacattttggaagaattcatgatggatctagacaaacattcttcgtagacaatttaatgccattttatgtgagtacaagttaaattattaaagatgccaatagaccaaagttaagagtatgttggacagaaattgtgaaaaaaaagtttaaatgatcagcaatggaataaaaaattcaaaaaatgaggaaagaaatgttacatataatagcacagattaatttgtcacttgtgaaaagggggatcaagttgtcaatactcatgtgggggagaaccatagagttgttatgtagtaaaaattactttgtcgttcatgtgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGT-GCC--CA--TCT-TCACTCCAGAGAGA--AATT-TT-G-CAATGGTGCT--G-TTGAAATA-TTTT-TTC-CCA-C-A---GG---TAAA-GCAAAAATCT-TC--ATTATGC-GT-CACCGTTGT--CGACA--A--AT-AG--GATGACT-C------------ATACTCGTTA-T-TCTT--TGCTATTT---GCATCACA-----TTC--CGTGAA-G-AAT-C-T-AT-GA-G-TA-TC-AGTCCA----AC--T-CT-TCTTCACTTTAGGCA----A----T-TTCAAGTCA---TTTTATTT-GAGTAACCAA-GTTA--GATCTA-TTG-----TTG-CCGA-GAG--TCAAGATAC-CAATAGAC--CA-AAGTTCAAG--AGATATGT-T---GAC-AAAA---A--TGTG----A---AAAGTTTAA-ATGCATCTAGCAATGGATG--A-AATCAT--TCACAA-ATATGAGCAA--AAATG-T-TTTTATCA----TACTA-T------G-C-AAACC-ACG--ACTTT---A-CA--TCT---CTCAC-T-TGTGACACAA-GCGG-GA-----T-CA--AGCTTTAAGTAAA-TAC-AATACTTCATGTT-GGGAG-
gi|9 : gtcctctgaataccTTCAGTGT-GCC--CAA-CCT-TTACTCCAG-GAGTGTAAAT-GT-G-CA-TG-T--T--G-T---AA-A-TTTA-CGC-TCC-C-G---TG---TAAAAGCAGAAAG-T-TT--GCTATGCAGTTCAC----GTTGGGA-A--A--A--AAAAGA-GACG-C------------ATAT--GTA----T--T--TGCT-TTTCTGGCACCAGG-----TTT--CG-GAA-GGAATGT-C-ATTGATG-GA-TCTAG-GCGTGAGAC--TACT-TCTCG----TAGACA----ATTGAA-T----GGCA---TTGTATTT-GA-TA--CAA-GTTA--ACA-TA-TTG----TTTG-CCGA-GAG--TAAAGGTGCACAGT-GACTGCC-TAGTTAAGGGAAG-TATGT----GGACGAGAGGA-A-ATGTG-AAAA---ACAGTTT-A-A-G-ATC-AGCAATGGATA--A-AA--AA--TTCAAA-A-ATGACGGAAGAATGG-T-TTAACT-A----TA-TA-T------G---AA--CAA-G--A--TT---A-A---TTT---GTCAC-T-TGTGACA-AA-G-GG-Ggcgaagaaccttatcagtttacttatgtatgtgtacatgtttactttgcgttcatgtgc