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lowQualScore                  :                            1  2222222222222222222 22 22222 7777777 1 44444 1 33   99 11 22  1  22  1 5555555555555  2 44444444444444 1  1 2 2222 11 1 111 2222 2  22  22  22 11 1 22 1 1 22 2  1 33 3333  3   2 1  1 66  1 1 11 2222  666 11  1 1 11     2 2 11 1 1 11 5555555555555555555555555555 1 1 3333 3 555555555 33 11 6666 1 11 1  555   1   1  2 555555555  555 1 1  2 2 5555 111  2 2 2 333333 55 1 33333 444   1  2 1  1       
lowQualScore                  :                            .  ................... .. ..... ....... . ..... . ..   .. .. ..  .  ..  . .............  . .............. .  . . .... .. . ... .... .  ..  ..  .. .. . .. . . .. .  . .. ....  .   . .  . ..  . . .. ....  ... ..  . . ..     . . .. . . .. ............................ . . .... . ......... .. .. .... . .. .  ...   .   .  . .........  ... . .  . . .... ...  . . . ...... .. . ..... ...   .  . .  .       
lowQualScore                  :                            3  7777777777777777777 88 99999 3333333 1 00000 1 88   33 55 66  1  55  1 8888888888888  1 99999999999999 1  1 1 2222 44 1 888 2222 1  55  55  55 44 1 55 1 1 55 1  1 99 3333  2   1 1  1 77  1 1 55 4444  444 55  1 1 55     3 3 66 1 1 66 2222222222222222222222222222 1 1 5555 3 666666666 88 55 5555 1 55 1  666   1   1  2 444444444  111 1 1  2 2 5555 999  2 2 2 111111 11 1 88888 555   1  2 1  1       
consensus                     :           GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
Reference ( gi|19 )           :           GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|15                         :           GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--ACA--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CA-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-AAT--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|26                         :           GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-ATT--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-ACA-C------AG-T-G-----C---A-T-CA-C-AA-
gi|2                          :           GGAGTACCAATTTTGTG-AATATTTTTAGTCAGAAAAA-T--A-----TTTTTGTTG-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-ATACTTTGGAAAGAAA-AA-T-C----C--A-A---A------TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----GA-TTT-T-TT-TCATG-C-T--T----TT---C--CG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-CCTAGAGGTAT--A--G----A-A--T-TG---TTT-GGG-T--T---------AA---T-TATG-A-TGAACA---TG-C-A-T------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AAta
gi|38                         :           GGAGTACCAGTTAGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----C-G--TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-Tata
gi|20                         :           tGAGTACCAGTTCGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-GT-TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TT-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CACC-AA-AATAGGTcatg
gi|29                         :            GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-T--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AAT
gi|25                         :            GAATACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----TT------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TC---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T------------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGg
gi|21                         :            GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GAAG-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CA-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GG--TG-T---------TA---A-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--C-G-----CG--AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|14                         :            GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----TCATG---A-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TTT-C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-TCATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------C-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--C-TATT-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAG
gi|27                         :            GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--G-----T-------G-G-----T-GT-TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA---T--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A----A---------------T-----A------A-G-A------T---------T--A--GA---A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A------A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|30                         :            GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AG--AA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TC---ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT--GG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--C-------C---GAT-CA-C-AA-AATGG
gi|17                         :            GAGT-CCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--AGCCTAT-------G-G-----T-G--TTTTTC--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TG-----A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CA-TG-C-T--T----T----C--TG-T----AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------TT-A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGTt
gi|13                         :            GAGTACCAGTTCGGTG-AA-----------------AAT--A-----T-------G-G-----G-T--TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TTC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TTC--C--TG-T-T--AATTA-T-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G------G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-TGG-TG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------ATTT-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAG
gi|12                         :            GAGTACCAGTTCGGTG-AA-----------------AAT--A-----T-------G-G-----G-T--TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TTC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TTC--C--TG-T-T--AATTA-T-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G------G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-TGG-TG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------ATTT-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGtt
gi|23                         :            GAGTACCAGGTTTGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-GG----T-G--TTTT-C--A--GC-AGAGGA-G-------------GT-A--------------A-AA-A-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CA-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----C------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-A-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-ATT----A---T--A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-tt
gi|34                         :            GAGTACCAGTTTGGTG-AA-------------------T--A-----T-------G-G-----TTG--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TC---ATG-C----T----TT---C--TG-T-T--AA-TG-A-T--A-A-C--A-------------------------------------------------------------------TA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CC-C-AA-AATAGGTtaa
gi|28                         :             AGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTT--C--A--GC-A---GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C----T----TT---C--TG-T-T--AATTG---T--A-A-C--AT--------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--T----AGA--T-TA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGG
gi|11                         :             AGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------AGT--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-GA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--ATACTTG---------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT--GG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-ATTA
gi|18                         :           gtAGTACCAGTTTTGTG-AA-------------------T--A-----T-------C-G-----T-G--TTTT-C--AC-AC-AA--GA-G-------------GTTA--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----AATA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--CGGG-A--C----AATTTT-T-TT-C--TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TT-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CACC-AA-AATAAGTaaa
gi|22                         :             AGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTT--T--C--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA---A----C--A-A---A----A-TA--TT--TA--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C-----A-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----AAGTCT-A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGGTTG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A--------A--T-A-----T---GGT-CA-C-AA-AATAGG
gi|9                          :             AGAACCAGTTTGGTG-AA-----------------AAT--A-----T-------G-GGTACCT-T--TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AAAT-C----C--A-A---A----AATA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-AATT----GA-TTTGT-TT-C-ATG-G-C--T----TT---C---G-T-T--ATTTG-A-T----A-C--A---------------T-----A------A-G-A----GTT---------T--A--G----A-A--T-TA-A-ATT-GGA--G-T---------AA---T-T-TG-ATT----A---T--A-A-C------A--T-G-----A---GAT-CA-CAAA-AATAG
gi|31                         :             cGTAC-AGTTTGG-G-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----T--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AA-TG-A-T--ATA-C--A---------------A-----A------G-A-A----G-T---------T--A--G----A-A--TATA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA-----T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---A-T-CA-C-AA-AATAGGT
gi|7                          :              GTACCAGTTTGGTG-AATA---------------G-T--A-----T-------G-T-----T-G--TTTT-C--A--GC-GA--GA-G-------------TT-AC-------------A-AA-T-C----C--A-A---C----A-AA--TG--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-CCGA---------------T-----ACATTGTA-G-A------T---------T--A--GA---A-A--T-TA-T-TTT--GG-TG-T---------AA---TAT-TG-A-T----A---TG---A-C------A--T-G-----TCTAAGT-CA-C-AA-ATTA
gi|32                         :               TACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-------T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G--------------T-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AA-TG-G-T--A-A-C--A---------------TA----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTT-GGG-TG-----------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGTGCA-C-AA-AATAG
gi|16                         :             caTACCAATTTGGTG-AA-----------------AAT--A-----T-------G-G-----T-G--TT---C--AAAGC-AAT-GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-T----T--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-C----ATG-C-T--T----TTT--C--TG-T-TGAAATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------ATG-A----G-T---------TT-A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TG-----------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|8                          :             agaACCAGTTTG-TG-GA-----------------A-T--A-----T-------C-G-----C-G--TTT--C--A--GC-AA---A-G-------------GT-ATCTGA---------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TAA-TT--TT--C--A-AA-C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-TCATG-C-G--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-ACC--A---------------T------------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-AAGT-T--T-GTT-GGG-TG-T---------AATTTT-T-TG-A-T----ATCTTG-ACA-C------AT-T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGt
gi|24                         :                  CAGTTTGGT---A-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTT--T--G--AG-AA--GA-G----------------A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--CTAA-A--C-A-TTTC-GG-AACC----AA-TTT-T-CT---ATG-CGT--T----TT---C--TGAT-T--AAT-G-A-T--A-A-C------------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--GCTAGA-A--T-TA-T-TTT-GG---G-T---------AA---T-T-TG-A-TA---A---TGAA-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATTGGT
gi|10                         :                taCAGTTTGGTGGAA-----------------A-TCCA-----T-------G-G-----T-G--TTT--TCAA--GC-AG--AG-G-------------GT-A--------------A-A--T-C----C--ACA---A----A-TAGCTTA-TT--C--A-A--CCA-T--C-GT----C----AT-TTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TTT--C--TG-T-T--AATTGCA-T--A-A-T--A---------------------A------A-G-A----G-T---------T--C--G----A-A--T-TA---TTT-GGG-TG-TG--------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------C--A-G-----CAA-AGT-CA-C-AA-AAT
gi|37                         :             agtcaCAGTTAGGTG-AA-----------------A-TG-A-----T-------GCG-----T-T--TTC--T--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TT--AT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--CA---AA-TTT-T-TT-C-ATG-C----T----TT---C--TG-T-T--AATg
gi|39                         :            agtaacgAGTTTG-TG-AA-----------------A-T--A-----T-------G-G-----T-G--TTT--T--C--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--C-A---A----T-AA--TT--TT--G--A-A--C-A-T--CGGG-A--C----AA-TTT-T-TC-CAc
gi|33                         :                       TGGTG-AA-----------------AAT--T-----T-------T-G-----T-G--TTTT-C--A--GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C----A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CAATGCC-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----GTT---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-C-A------A--T-GC----C---AGT-CA-C-AA-AATAGt
gi|3                          :                                                 -T--G-----T-------G-G-----T-G--TTT--C--A--GC-AA--GA-GTATACTTTGGAAAGA-A--------------A-AA-T-C----C--A-A---A----A-AA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----GA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--CG-T-T--AA-TG-A-T----A-C--A---------------T-----AAAGCCTA-G-AG---G-TA--------T--A--G----A-A--T-TG-T-TTT-GGG-T--T---------AA-----T-TG-A-T----A---TA-A-A-CAGGCATA--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGtt
gi|5                          :      agtaccaattttgtgaaatatttatgtcagaaaaaattatttt-T--G-----T-------G-G-----T-AGTTTT--C--A--GCCAA--GA-G-------------GT-ATTACTGGAAAG---A-AA-C-CATCCC--A-A---A----A-TA--TT--TTTTC--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----GA-TTT-T-TT-CA-TG-T-T--T----TTTTCC--CG-T-T--AAT-G-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-G---------T--A--G----A-A--T--A-T-TT--GAG-TG-T---------AA---T-T-T--A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AAT-CA-C-AA-AATAG
gi|4                          :       agcaaccaacctttggtgaaacactttatagtgagaaaatatct--A-----T-------G-A-----T----TTT--C--A--GC-AT--GA---------------GT-A--------------AGAA-T-C----T--A-A---ACATTA-TA---T--TT--C--A-A--C-ATT--C-GG-A--C----GA-TTTGT-TT-CATAG-C----T----TT---C--AG-TGT--AATAGTA-T--A-A-C--A---------------TATAAAA------A-G-A----GAT---------T--ATGA----A-A--T-TA---TTT-GGG-TG-----------AA---T-T-TGAA-A----A---TG-A-ACC------A--T-G-----C---AGT----C-AA-AAT
gi|35                         : taccaaagtttagctgtgaaatatttatagtcagaataaaatttttatgttga-----T-------A-G-----T-G--TTT--C--A--GC-AA--GA-G-------------GTTA--------------A-AA-T-C----C--A-ATTAA----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GGGA--C----GA-TTT-G-TT-CA--G-C-T--T----TG---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------TTAG--G----A-A--T-TA-T-TTT-GGG-TGTT---------AA---T-T-TG-A-T----A---AGAA-A-C------A--T-A-----C---AGT-AA-C-AA-AATAtata
gi|6                          :                                                                             g--TTT--G--A--GG-AA--G--G-------------GT-A--------------A----T-C----A--A-A---G----A-TA--TT--T---C--A-A--C-A-TC-C-GG-A--CTTTTAA-TTT-TATT-GTATG-T-T--TTGTGTT---CGTTG-T-T----TTG-C-T--A-A-C--ATTATTTTTAGATGTTT-----A------G-G-AGATGG-T---------T--T--G----G-A--T-TA----TT-GGG-TG-TGTTATTTAGAC---T-T-TG-A-TG---A---TG-A-AGC------A--T-AATTGTC---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|36                         :                                                                                        t--GC-AA--GA------------------A--------------A-AA-T-C----CTAA-A---A----A-TC--TT--TT--G--A-A--C-A-T--C-TA-A--T----AA-TTT-T-TT--AATT-T-C--C----CT---C--TG-C-T--AACTG-G-T--A-A-C--A---------------A-----C------A-G-A----G-G---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GTT-TG-T---------A-----------A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----T---GGT-CA-
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Reference ( family-1587 )     :                                                                                    GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
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gi|11                         :                                                                                 agtcaAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------AGT--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-GA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--ATACTTG---------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-ATTAg
gi|12                         :                                                                                   gtGAGTACCAGTTCGGTGAAA-----------------A-T--A-----T-------GG---G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AATTC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TTC--C--TG-T-T--AATTA-T-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G------G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTTGG-TG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------ATTT-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGaaa
gi|13                         :                                                                                     GAGTACCAGTTCGGTGAAA-----------------A-T--A-----T-------GG---G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AATTC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TTC--C--TG-T-T--AATTA-T-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G------G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTTGG-TG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------ATTT-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGtt
gi|14                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----TCATG---AG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TTT-C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-TCATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------C-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--C-TATT-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGtt
gi|15                         :                                                                                    GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--ACA--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTGAA-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TATT-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|16                         :                                                                                        TACCAATTTGGTG-AA-----------------AAT--A-----T-------GG-T-G---TTCA-A-A-GC-AAT-G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-T----T--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-C----ATG-C-T--T----TTT--C--TG-T-TGAAATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------ATG-A----G-T---------TT-A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-----------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|17                         :                                                                                  agaGAGT-CCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--AGCCTAT-------GG-T-G---TTTTTC-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TG-----A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CA-TG-C-T--T----T----C--TG-T----AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------TT-A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGTt
gi|18                         :                                                                                      AGTACCAGTTTTGTG-AA-------------------T--A-----T-------CG-T-G---TTTT-C-ACAC-AA--G-AG-------------GTTA--------------A-AA-TC----C--A-A---A----AATA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--CGGG-A--C----AATTTT-T-TT-C--TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TT-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CACC-AA-AATAAGT
gi|19                         :                                                                                    GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTT--C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CAATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|2                          :                                                                                    GGAGTACCAATTTTGTG-AATATTTTTAGTCAGAAAAA-T--A-----TTTTTGTTGG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-ATACTTTGGAAAGAAA-AA-TC----C--A-A---A------TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----GA-TTT-T-TT-TCATG-C-T--T----TT---C--CG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-CCTAGAGGTAT--A--G----A-A--T-TG---TTTGGG-T--T---------AA---T-TATG-A-TGAACA---TG-C-A-T------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AA
gi|20                         :                                                                                     GAGTACCAGTTCGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TT-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CACC-AA-AATAGGTata
gi|21                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GAAG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GG-TG-T---------TA---A-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--C-G-----CG--AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|22                         :                                                                                      AGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C---GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA--A----C--A-A---A----A-TA--TT--TA--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----A--TTT-T-TT-CA-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----AAGTCT-A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGGTTG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A--------A--T-A-----T---GGT-CA-C-AA-AATAGG
gi|23                         :                                                                                     GAGTACCAGGTTTGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GGGT-G---TTTT-C-A-GC-AGAGG-AG-------------GT-A--------------A-AA-AC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CA-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----C------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-A-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-ATT----A---T--A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-
gi|24                         :                                                                                           CAGTTTGGT---A-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-G-A-G--AA--G-AG----------------A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--CTAA-A--C-A-TTTC-GG-AACC----AA-TTT-T-CT---ATG-CGT--T----TT---C--TGAT-T--AAT-G-A-T--A-A-C------------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--GCTAGA-A--T-TA-T-TTTGG---G-T---------AA---T-T-TG-A-TA---A---TGAA-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATTGGTtaa
gi|25                         :                                                                                   taGAATACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----TT------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TC---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T------------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGG
gi|26                         :                                                                                    GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-ATT--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-ACA-C------AG-T-G-----C---A-T-CA-C-AA-
gi|27                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--G-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA---T--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A----A---------------T-----A------A-G-A------T---------T--A--GA---A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A------A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGTta
gi|28                         :                                                                                      AGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTT--C-A-GC-A---G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C----T----TT---C--TG-T-T--AATTG---T--A-A-C--AT--------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--T----AGA--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGG
gi|29                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-T--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AAT
gi|3                          :                                                                                      AGTACCAATTTTGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------g
gi|3                          :                                                                                                                          -T--G-----T-------GG-T-G---TTT--C-A-GC-AA--G-AGTATACTTTGGAAAGA-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-AA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----GA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--CG-T-T--AA-TG-A-T----A-C--A---------------T-----AAAGCCTA-G-AG---G-TA--------T--A--G----A-A--T-TG-T-TTTGGG-T--T---------AA-----T-TG-A-T----A---TA-A-A-CAGGCATA--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGttatgtcagaaaaaattatttttgtggtgtttcagcaagagtatactttggaaagaaaaatccaaaaaattttcaacatcggacgattttttcatgcttttccgttaatgatacataaagcctagaggtatagaattgttttgggttaattgatataaacaggcatatgcagtcacaaaatag
gi|30                         :                                          agtaccaattttgtgaaatatttatgtcagaaaaaattattttGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AG--A-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TC---ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--C-------C---GAT-CA-C-AA-AATGG
gi|31                         :                                                                                       GTAC-AGTTTGG-G-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----T--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-C-ATG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AA-TG-A-T--ATA-C--A---------------A-----A------G-A-A----G-T---------T--A--G----A-A--TATA-T-TTTGGG-TG-T---------AA-----T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---A-T-CA-C-AA-AATAGGTt
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gi|33                         :                                                                                              caTGGTG-AA-----------------AAT--T-----T-------TG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--G-AG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C----A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TTT-T-TT-CAATGCC-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----GTT---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-C-A------A--T-GC----C---AGT-CA-C-AA-AATAG
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Reference ( family-1587 )     :                                                                                    GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
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gi|11                         :                                                                                 agtcaAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------AGT--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-GA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--ATACTTG---------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-ATTAg
gi|12                         :                                                                                   gtGAGTACCAGTTCGGTGAAA-----------------A-T--A-----T-------GG---G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AATTC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-TCAA-TG-C-T--T----TTC--C--TG-T-T--AATTA-T-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G------G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTTGG-TG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------ATTT-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGaaa
gi|13                         :                                                                                     GAGTACCAGTTCGGTGAAA-----------------A-T--A-----T-------GG---G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AATTC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-TCAA-TG-C-T--T----TTC--C--TG-T-T--AATTA-T-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G------G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTTGG-TG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------ATTT-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGtt
gi|14                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----TCATG---AG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TTT-C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-TTTT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------C-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--C-TATT-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGtt
gi|15                         :                                                                                    GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--ACA--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTGAA-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TATT-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|16                         :                                                                                        TACCAATTTGGTG-AA-----------------AAT--A-----T-------GG-T-G---TTCA-A-A-GC-AAT-GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-T----T--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T----C--A-TG-C-T--T----TTT--C--TG-T-TGAAATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------ATG-A----G-T---------TT-A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-----------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|17                         :                                                                                  agaGAGT-CCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--AGCCTAT-------GG-T-G---TTTTTC-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TG-----A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----T----C--TG-T----AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------TT-A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGTt
gi|18                         :                                                                                      AGTACCAGTTTTGTG-AA-------------------T--A-----T-------CG-T-G---TTTT-C-ACAC-AA--GA-G-------------GTTA--------------A-AA-TC----C--A-A---A----AATA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GGGA--C----AATTT-T-TT-T--C-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TT-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CACC-AA-AATAAGT
gi|19                         :                                                                                    GGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G----TTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-CA-A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|2                          :                                                                                    GGAGTACCAATTTTGTG-AATATTTTTAGTCAGAAAAA-T--A-----TTTTTGTTGG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-ATACTTTGGAAAGAAA-AA-TC----C--A-A---A------TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----GATTT-T-TTTC--A-TG-C-T--T----TT---C--CG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-CCTAGAGGTAT--A--G----A-A--T-TG---TTTGGG-T--T---------AA---T-TATG-A-TGAACA---TG-C-A-T------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AA
gi|20                         :                                                                                     GAGTACCAGTTCGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TT-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CACC-AA-AATAGGTata
gi|21                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GAAG-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GG-TG-T---------TA---A-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--C-G-----CG--AGT-CA-C-AA-AATAGGT
gi|22                         :                                                                                      AGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C---GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA--A----C--A-A---A----A-TA--TT--TA--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----A-TTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----AAGTCT-A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGGTTG-T---------AAT--T-T-TG-A-T----A---TG-A-A--------A--T-A-----T---GGT-CA-C-AA-AATAGG
gi|23                         :                                                                                     GAGTACCAGGTTTGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GGGT-G---TTTT-C-A-GC-AGAGGA-G-------------GT-A--------------A-AA-AC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----C------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-A-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-ATT----A---T--A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-
gi|24                         :                                                                                           CAGTTTGGT---A-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-G-A-G--AA--GA-G----------------A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--CTAA-A--C-A-TTTC-GG-AACC----AATTT-T-CT----A-TG-CGT--T----TT---C--TGAT-T--AAT-G-A-T--A-A-C------------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--GCTAGA-A--T-TA-T-TTTGG---G-T---------AA---T-T-TG-A-TA---A---TGAA-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATTGGTtaa
gi|25                         :                                                                                   taGAATACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----TT------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TC---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T------------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGG
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gi|27                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--G-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA---T--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A----A---------------T-----A------A-G-A------T---------T--A--GA---A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A------A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGGTta
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gi|30                         :                                          agtaccaattttgtgaaatatttatgtcagaaaaaattattttGAGTACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AG--AA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTT-GG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--C-------C---GAT-CA-C-AA-AATGG
gi|31                         :                                                                                       GTAC-AGTTTGG-G-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----T--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AA-TG-A-T--ATA-C--A---------------A-----A------G-A-A----G-T---------T--A--G----A-A--TATA-T-TTTGGG-TG-T---------AA-----T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---A-T-CA-C-AA-AATAGGTt
gi|32                         :                                                                                        TACCAGTTTGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------G--T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G--------------T-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-C--A-TG-C-T--T----TT---C--TG-T-T--AA-TG-G-T--A-A-C--A---------------TA----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T-TA---TTTGGG-TG-----------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGTGCA-C-AA-AATAG
gi|33                         :                                                                                              caTGGTG-AA-----------------AAT--T-----T-------TG-T-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C----A--C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-T-TT-CA-A-TGCC-T--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----GTT---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-C-A------A--T-GC----C---AGT-CA-C-AA-AATAG
gi|34                         :                                                                                     GAGTACCAGTTTGGTG--A-----------------A-T--A-----T-------GGTT-G---TTTT-C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TT-T-TT-C--A-TG-C----T----TT---C--TG-T-T--AA-TG-A-T--A-A-C--A-------------------------------------------------------------------TA-T-TTTGGG-TG-T---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CC-C-AA-AATAGGTtt
gi|35                         :                                                                                                                               -----T-------AG-T-G---TTT--C-A-GC-AA--GA-G-------------GTTA--------------A-AA-TC----C--A-ATTAA----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--CGGG-A--C----GATTT-G-TT-C--A--G-C-T--T----TG---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-A-C--A---------------T-----A------A-G-A----G-T---------TTAG--G----A-A--T-TA-T-TTTGGG-TGTT---------AA---T-T-TG-A-T----A---AGAA-A-C------A--T-A-----C---AGT-AA-C-AA-AATA
gi|36                         :                                                                                                                                                            g-GC-AA--GA------------------A--------------A-AA-TC----CTAA-A---A----A-TC--TT--TT--G--A-A--C-A-T--C-TA-A--T----AATTT-T-TT-A--A-TT-T-C--C----CT---C--TG-C-T--AACTG-G-T--A-A-C--A---------------A-----C------A-G-A----G-G---------T--A--G----A-A--T-TA-T-TTTGTT-TG-T---------A-----------A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----T---GGT-CA-
gi|37                         :                                                               tggtaatttcagcaagaaggaaactgtgCAGTTAGGTG-AA-----------------A-TG-A-----T-------G--C-G---TTTT-CTA-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TT--AT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--CA---AATTT-T-TT-C--A-TG-C----T----TT---C--TG-T-T--AATttaa
gi|38                         :                                                                             agtaacgGGAGTACCAGTTAGGTG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-C-G---TTT--C-A-GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TA--TT--TT--C--A-A--C-A-T--C-GG-A--C----AA-TT-T-TT-C--A-TG-c
gi|39                         :                                                                                           tAGTTTG-TG-AA-----------------A-T--A-----T-------GG-T-G---TTTT-C---GC-AA--GA-G-------------GT-A--------------A-AA-TC----C--C-A---A----T-AA--TT--TT--G--A-A--C-A-T--CGGG-A--C----AATTT-T-TC-C--A-T
gi|4                          :                                                                                                                                                  ---TTTT-C-A-GC-AT--GA---------------GT-A--------------AGAA-TC----T--A-A---ACATTA-TA---T--TT--C--A-A--C-ATT--C-GG-A--C----GATTTGT-TT-C--A-TA-G-C--T----TT---C--AG-TGT--AATAGTA-T--A-A-C--A---------------TATAAAA------A-G-A----GAT---------T--ATGA----A-A--T-TA---TTTGGG-TG-----------AA---T-T-TGAA-A----A---TG-A-ACC------A--T-G-----C---AGT----C-AA-AAT
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                  taccaaagtttagctgtgaaatatttatagtcagaataaaatttttatgttgaatga---------------T-----A------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-A--T----T-TTTGGG-TG-----------GA---T-T-TG------------TT-G-A-C------A----G-----C---GGT-CA-C-AA-TATtata
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataacatacattgGG-TGCT---------AA---T-T-TG-A-T----A---TG-A-A-C------A--T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAGttaaatgg
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gi|8                          :                                                                                         ACCAGTTTG-TG-GA-----------------A-T--A-----T-------CG-C-G---TTT--C-A-GC-AA---A-G-------------GT-ATCTGA---------A-AA-TC----C--A-A---A----A-TAA-TT--TT--C--A-AA-C-A-T--C-GG-A--C----AATTT-TTTT-C--A-TG-C-G--T----TT---C--TG-T-T--AATTG-A-T--A-ACC--A---------------T------------A-G-A----G-T---------T--A--G----A-AAGT-T--T-GTTGGG-TG-T---------AATTTT-T-TG-A-T----ATCTTG-ACA-C------AT-T-G-----C---AGT-CA-C-AA-AATAG
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