lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333333 11111 666666666 11111 111 1111 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222 111111111 3333333333 11 222 33333333 333 888888888888888888888888888888888888888888888888 1 22222 22 222222 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222 333 1111 44 222222 2 5555555555555555555 333333333 11 111 11 222 111 99999999999999999999999999999999999999 2 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 222 444444444444444444444 111111111111111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111 111111 3333333333333333333333333333 222222222222222222222222222 2222222 111 1 1111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333 222222222222222222 11 44444444 11 44444444444444444444444 1 22 55555 888888888888888888888888888 2 1 444444444444 2222 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 111 11 2222 1 44444444444444 11 11 44 2222 111111 1111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 444444444444 3333333333333 11 22 111 111 4444444444 1 11 11 111 111 4444444 111 4 2 1111 111 2222 1
lowQualScore : 333333333333 00000 333333333 5 4 666 3 3 7 44 11111 888 6666 999 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 66 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 4 2 2 33 4 22 2 2 6666666 33 000000000 2222222222 3 3 55 4 1 8 777 5555 11111111 444 111111111111111111111111111111111111111111111111 3 00000 7 11 777777 3 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 555 666 1111 6 22 6 6 6 888888 0 3333333333333333333 44 555555555 3 55 99 222 11 555 5 444 8 0 6 1 22222222222222222222222222222222222222 4 66 99 2 555 44 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 444 3 111 22 66666 1 88 3 555555555555555555555 1 1 5 7 1 1 666666666666666 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 0 3333 5 111111 4444444444444444444444444444 1 3 1 222 2 222222222222222222222222222 222 2 2 88888 11 1 22 1 0000000 22 33333 000 22 88888 222 4 555 22 1111 1 44 1 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000 7 777777777777777777 4 00 5 3 55555555 6 6 6 99 2 22 0 0 55555555555555555555555 0 55 44444 888888888888888888888888888 0 0 3 7 777777777777 1111 0 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111 11 1111 88 8 6 8 0 99999999999999 11 11 22 6 1111 99 999999 1 8 3 4444 8 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 111111111111 5 77 1 5 99 9999999999999 77 88 0 5 000 6 111 99 6 99 8888888888 6 3 00 99 6 55 6 111 99 6 6 777 6666666 1 111 6 0 7 6 3 6 99 6 6 2222 5 5 5 000 5 5 0000 1 9 2
lowQualScore : ............ ..... ......... . . ... . . . .. ..... ... .... ... .............................................................. . .. . ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . . . . .. . .. . . ....... .. ......... .......... . . .. . . . ... .... ........ ... ................................................ . ..... . .. ...... . .................................................................................... ... ... .... . .. . . . ...... . ................... .. ......... . .. .. ... .. ... . ... . . . . ...................................... . .. .. . ... .. ......................................................................................... . ... . ... .. ..... . .. . ..................... . . . . . . ............... ............................................................................................. . . .... . ...... ............................ . . . ... . ........................... ... . . ..... .. . .. . ....... .. ..... ... .. ..... ... . ... .. .... . .. . ........................................................ ... . .................. . .. . . ........ . . . .. . .. . . ....................... . .. ..... ........................... . . . . ............ .... . ................................................................................................... ... .. .... .. . . . . .............. .. .. .. . .... .. ...... . . . .... . .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ............ . .. . . .. ............. .. .. . . ... . ... .. . .. .......... . . .. .. . .. . ... .. . . ... ....... . ... . . . . . . .. . . .... . . . ... . . .... . . .
lowQualScore : 222222222222 88888 333333333 7 3 444 3 3 0 66 99999 111 2222 666 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 44 1 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 2 1 1 88 2 99 1 4 1111111 77 777777777 9999999999 3 3 11 4 4 8 000 5555 00000000 000 000000000000000000000000000000000000000000000000 3 00000 3 77 000000 3 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 222 8888 7 55 7 7 7 333333 0 2222222222222222222 66 888888888 5 88 22 333 00 000 6 222 0 8 7 7 55555555555555555555555555555555555555 4 88 22 2 444 22 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 666 2 222 22 88888 6 99 2 333333333333333333333 7 7 0 0 7 7 222222222222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 9 1111 0 666666 8888888888888888888888888888 6 1 4 555 9 777777777777777777777777777 444 8 8 33333 99 5 00 4 1111111 00 88888 444 22 00000 888 3 666 22 0000 7 88 7 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 444 3 333333333333333333 4 11 0 2 00000000 7 7 7 22 5 55 2 2 55555555555555555555555 0 00 88888 888888888888888888888888888 0 0 2 0 555555555555 2222 0 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 00 8888 88 0 0 0 8 00000000000000 00 00 88 7 5555 22 222222 0 0 2 8888 2 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 4 999999999999 7 99 4 7 44 0000000000000 00 77 7 7 000 7 777 22 7 22 5555555555 7 3 22 22 7 88 7 777 22 7 7 777 8888888 7 777 7 0 3 7 5 7 22 7 7 1111 7 7 7 000 7 7 8888 0 2 5
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAAAAN-NT-GTC----AA--TTT-TATCAATAA---A-ATCT-GGG--TACG--AGTT---CT----GG---AGAA--NNA---CTTTG--TC-AA--TT-T----AT-C--A-A-T---A--AA--T-CT-------G-GG-TACGAGT-TCTCC-TGGA-AAAAA-AAAC-AT-TGT-C----TTTTTT--TTC--T-T---TT-TATCA-A----TA-AAA-TCTGGGTATACGAG-NT---C-TCCT--G-----GA--G--------AA--AATTT-GCTT-A-GT--CA-TTTCT---GT-C--------------A-T-G---AAGATA----TCTG---GG-T--A-C--G--T--TCT-CCTG--G-----AGA-AG-GAAA-----------C-------TC---GTC-A--------A-T-T-TT-A-T------C--A-------------------TA---AAAA-----T-C-T------GGGTA-CG--A---G--T-TC---T---CC---GG-------AGA---------------A-A-----------------T--T--AC--------T----CA-----A----AT----AG-A--A-T-CTGG-G-TA-CG-A--GTTC-TCC-TAAA--A-GAA--A---------AAA---AA-T-NTGT-CA-TTTCATATCA-TATTTCT-GAGAAAAAAACCGTTGTGNTGCTGGAATTCAAAATTTTGACACGAGTTAAT-T-TGATT--AAAAT-TTAT--CATAAGAAT-TTCGAT---AAT-CTCG--AACATGATAATTTA-GCTT-A-A--TTAT-CTT--CTAC-AAAT-ACA--ATGTAT-CG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTG---TTGT--TTTTATGTG--AGATCA---TGTT---CTCACAG--TAT-TGT-AAT-TA-TT-G------CAAACAAAAC-ACA-ATTAATTAC-N---GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A-TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TAAT--A--CTATTCGATATC--------AA-A------AGATTTTTCN-CCGGGAGA-ACTCGT---AC--CCAG-GAT-----TT-----AT----A-----GA--A---A------CG---G---------A----AAG-T---T--TTTGTTT---TCT-CTCCAG-G-AGAA-CTCG-GTAC--C-----C-A-GAT-TT--TA--T--A--C--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCC-TTTC-C----A-------G----AAC-T-C--GTA--C---C---ANAT-TTCTACATGTAC--TTAATAA--ACTG--CAG--AAAAAAAAAAT----CTC-C------AG---A-------------A----CT-C--GTACC-CAG-A-T---TT-T------------------AT---T--TG---A-T-A-----AA--ATT-GA--C-AA---AG--TT--T-----T---C--T-----C---CAGGAGAAC---T--CG---TAC-C--C-AGATTTTT-------------A-ATATATTGATAAA-A-T----N-GACG---T-----TCTCC---GG-AGAA----C--T----------T-TCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCT-T-GTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGACAAATGAGACTAAT---ATTAATNAA-NA-N---TTT-TGA-GCAGGACG-AGT-TTTGTAATCCT--G-A-AATC--G-GTGNT--AC--CAGTATAGAAAA-GTAAAAT---TGGTTTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACT----TCATACACAGTTACTTTTTAAAAGAC-TGAAACA--AGGG-TCT-NGCTGCATTATA----GCTA-C-T---ACT--ATTGA--TGAGTGTGA-A-ACCGTTTTA-CAA-AATGG-TGA-TTAGCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGA---TGTGCGG--TCATTTA-----ATTTTATC--TCGAACGGNTAAAA----TAT-TN-GGTCA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TT-TC-C-----ACTT--C-TGAT---CAGTGTCCTTT-AG-AT-T-TAT--TGTC-TA--AA-TGT-G-TA-AAG--T----GTAAAT-----GTAT------AT-CA-ATGT-AGTT-CT-TC---GTATTTTTCG-TC--CTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTT---AC--TCNA-GT-------A--CATTATA-TT---TTT-A---A-A----T-GTTTT---AAG--ATACTGGGT----T-AAAAAAAAT----TCAAC-ATAAT-C-TT-TA--G-AAGATA-----T-A-ATCTTAT-GG----T--TTG---TAA-T-------TATATTATTTG----GTACACGT-GTAC------CACG-GTA-CA--AACA-T-TCCCAANCCTGACTTAAAAATAACAAAT-CTCTCTT-A---TAAAGCG-CACA---GCGC--AGAG-AGAA--AGAACAT-GTG---C-TGTACG-T-CAC-AAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CAT-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACG---TCGGAA-ACGCTGGC
Reference ( gi|2 ) : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAAAAA-AT-GTT----AAGCTTT-TATAAATAA---A-ATCT-GTG--TACA--AATT---CT----GG---AGAA--TTA---CTTTA--TC-AA--TT-C----AT-C--A-A-T---A--CA--T-CA-------G-GG-CACGAGT-TCTCCATGGATAAAAA-AAACGAT-TGT-CC--TTTTTTT--TTC--T-T---TT-TATCA-A----TA-AAA-TCTGGATATACGAG-ATG-GCATCCT--G-----G---G--------AA--AATTT-GCTT-A-GT--CA-TTTCT---GC-C--------------A-T-G---AAGATA----TCTG---GG-T--A-C--A--T--TCT-CCTG--G-----ACA-AG-GAAA-----------C-------TG---GTC-A--------A-T-T-TC-A-T------C--A-------------------TA---AAAAC----T-C-T------GAGTA-CG--A---G--T-TC---T---C----GG-------AGA---------------A-A-----------------T--T--AC--------T----CA-----A----AT----AG-A--A-T-CTGG-G-TA-TG-A--GTTC-TCC-TAAA--A-GAA--A---------AAA---AA-T-AAGT-CA-TTTCATATCA-TATTTCTTGAGAAAAAAACCGTTGT-CTGCTGGAATTCAAAATTTTGACACGACTTA---T-TGATTTAAAAAT-TCATGCCATAACAAT-TTCGATTTGAAT-CTTG--AACATGATAATTTT-GCTT-A-A--TTAT-CTTTAATACAAAAT-ATA--ATATAT-CGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTG---CTGT--TCTTATGTG--AGATCA---TGTTT--CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G------CAA-CAAAAC-ACA-ATTAATTAC-T---GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT---TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TAATTAG--CTATTCGA-ATC--------AA-A------AGATTTGTCA-CTGGGAAT-ACTTGT---AC--CCAAGGGT-----TT-----AT----A-----GA--A---A------CG---G---------A----AAG-T---T--TTTGTTT---TCTGCTCCAG-T-AGAA-CTCG-GTAC--C-----C-A-CAT-TT--TA-CT--A--C--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAG----TTTTT-ACTCC-TTTT-C----A-------G----AAT-T-C--ATA--C---C---ACAT-TTCTACATGTAC--TTAGTAA--ACTG--CAG--AAAAAAAAAAT----CTC-C------AG---A-------------A----CT-CA-GTACC-CAG-A-T---TT-T------------------AT---T--TG---A-T-A-----AA--ATT-GA--C-AA---AG--TT--T-----T---C--T-----C---CAGGACAAC---T--CG---CAC-C--C-AGAGTTCT-------------GCATATATTGATAAA-A-T----A-GACG---------TCTCC---GG-AGAA----C--T----------T-TCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC--T-GTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGACAAATGAGACTAA----ATTAATTAA-AA-A---TTT-TGA-CCAGGACGCAG--TTTGTAATCCT--G-A-ACTC--G-GTGTT--AC--CAGTATAG-AAA-GTAAAAT---TGATTTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACT----TATTACACAGTTACTTCTTAAAAGAC-TGAAACA--AGGGATC--AGCTGC--TATAC---GCT--C-T---GCT--ATTGA--TGATTGTGA-A-AC-GTTTTA-CAACGATGGCTGA-TACGCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGA---TGTGCAGGTTCATTCG----CATTTTATTCATCGAACGGGTAA------TAT-TG-GGTCA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TT-TC-C-----ACTT--CGTGAT---CAGTGTCCTTT-AG-AT-TGTAT--TGT--TA--AA-TGT-G-TA-AAG--T----GTAAAT---TGGTATTC----AT-CA-ATGT-AGTT-CT-TC---GTATTTTTTG-TC--CTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTT---AC--TCAA-GCTTA----A--CATTATA-TT---TT--A---A-A----T-GTTTT---AAGG-ATACTGGGT----T-AAAAAAAAT--CATCAACAATAAT-C-TT-TA--G-AAGATA-----TGA-ATCTTAT-GG----T-GTTG---TAA-T-------TATATTATTTGT---GTACACGT-GTAC------CATA-GTA-CA--AACA-T-CCC--ATCTTGACTTAAAAATAACAAATCCTCTCTT-A---TAAAGCG-CACA---GCGC--AGAG-AGAA--AGAACA--GTG---C-TGTACG-T-CAT-AAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CATCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACG---GCGAAACACGCTGGCGC
gi|5 : TAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAA-ATTGTC----AA--TTT-TATAA-TAA---A-ATCT-GTG--TACA--A-TT---CT----GA---GAAA--TTAACTTTTTA--TC-AA--TT-C----AT-C--A-A-T---AAACA--T-CA-------G-G--CACGAGT-TCTCC-TGGATAAAAA-A----------------CTTTGT--TTC--T------------A-A----TA-AA--TCTGGTTATACGAG-AT---TCTCCT--G-----G-------------A--AATTT-GTTTTA-GT--CAATTTCT---GG-C--------------A-T-G---AAGATA----TCTG---GG-T--ACC--A--G--TTT-CCTG--G-----AAT-AG-GCA--------------------TC---GTCTA--------A-TATATC-A-T------C--A-------------------T-----TAAC----TCC-T------AA--A-CG--A---G--T-TT---TCTCC----GG-------AGG---------------A-A-----------------T--T--A---------T----CA-----A----A-----AGTAC-A-T-CTGA-G----------ATTC--CC-TAGAGTA-TAATTA---------AAA---AA-T--GGT-CT-ATTC-TATCA-TAATT-TTGAG-----AACTGTTATGCTA-TGGA--TCAAAATTTTGACACG--TTAATCT-AGATT--AAAATCTTATTTC-TAAATAT-TTCG-T---AAT-CTTGTTACCATGAT-ATTTA-GCTT-ATAGTTTATACT----TACTAAAT-------TATATACGGTT--ATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTG---TTGT----TTAT-TG--A-ATCAGT-TACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-GCATAACCAA-C-AAAC-ACA-AT---TTACAT---GTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT---TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGATA---CTA-TCGATATTAAATATGAAA-A------AGATTTTTAC-CTCG--AT-ACTTGTGTAAC--CCAGG---------T-----ATG---A-----GA--A---AGACTACCGAGAG---------A----AAC-T---A--TATATTT---TC-ATTCCAG-T-AGAA-CTCGTGTAC--C-----CAA-CAT-TGAATG-AT--A--C--------GAA-TA-AATTG-ACAAA------A-GAG----TTTTT-CCTTT-TTCC-C----A-------G----AAT-T-TCGATA--CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC--TTA-TAAC-ACTGA-CAG-----AAAAAAAT----CTC-C------AG---ACGTCGCCCCCCCCC----CT-TA---ACC-CAG-A-T---TT-T------------------TT---T--TG---A-T-A-----AA--A
gi|1 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacAGTTT-TCCTGGAA-GAAAAAAATGT-GTC----AA--TTTGTATAAATGACAGA-ATCT-GTG--TACAGCAATC---TT----GG---A-AA--TT----CTTTA--TCTAA--TT-TCA--AT-C--A-AAT---AAACA--T-CA-------G-GGGCACGAGT-TCTTCCTGGACTAAAA-AACT--T-CGTACC--GTTTTT--------------------CA-A-----A-AAA--CTGGG-ATACCAA-GT---TCTTCT--GA----G---G--------AA--AATTT-G-TT-A-GTTTCA-TTTCT---GC-C--------------A-TAG---AAGATA----TCTG---GG----A-C--GAGT--TCTTCCTG--G-----ACA-AG-GAA--------------------TG----TC-A--------A-T-T-TC-A-----------A-------------------TC---AAAAT----T-C-T------GAGT--CA--C---A--T-TC---C---C----CG-------GGA---------------A-A-----------------T--T--AT--------C----CA-----A----AT----AG-ACAA-T-CTGGTA-TA-TG-A--TTCT-TCC-TGAA--ACGAA--A---------AAA----------GT-CA-TTTC-TATCACTATTTCT---GAGAAAAACCGT-GT-ATGCTGGAAT-CAAAATTTGGACACGAGTAA---TCTGATT-AAAAAT-TTAT--CATATGAATGTTCGAT---AATACTTG--AA--TGATAATTTA-GCTTTA-A--TTAT-CTTACCTACAAAATTATATTATGTAT-T---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGG---TT------TTAT-TG--A-ATCA---TGTT---CTCACAG--TAT-TGT-AAT-TA-TT-GGG----CAAACATAACGACACATTAA---------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TAA---TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTAAT--A--CTATTCGATATCTAAATG--AA-A------AGATTT-TCA-CTGGGAATCACGTGT---AC--CCA---GT-----TTTTC--AT----G-----GA--A---AA-----CGA--G---------A----AAG-T---T--TT-GTTT----CTCTTCCAG-TTAGAAACTCG--TAC--C-----C-G-CAA-TT--TA--T--A--CATTAAGTAG-A-TAGAA-----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCC-TTTTTC----A-------G----AAT-TTC--AAA--C---C----CAGATTCTACATGTAC--TTA-TAA---CTGAACAG--AAAAAAACA-T----CTCAC------AG---AT------------A----CT-C--GTACCACAG-A-T---TT-T------------------AT-------G---A-A-T-----AA--ATT-GA--C-AA---AT--TT--T-----TT--C--T-----C---CAGGA-AAC---T---G---CAC-C--CCAGATTT--------------------TATTGATAAA-A-T----T-GACG---------TCTTCCG-GG-AGAA----CGAC----------T-TCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGC--TTGTT-GCG-AG--GAG-GAAATG-ATCAATGAAACTAATTATATTAATAGA-CA-T---TTT-TGA-GCAGGACG-AG--TTTGTAATCCT--G-AGAATC--GTGTGT---AC---AGTATAG-AAAAGTAAA-T---TG--TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA---------ATTAACT----T--CAGACACGTACTTT---AAAG-C-TGAA-CA--AGGGTTCT-AGCTGCA-TATAG---CCTAAC-T---ACTTCATTGA--TGAGT-TGA-A-ACCGTTTTA-CAA---TGG-TGA-TTAGCT--ACAGAAC--TGGGAT--G-GGGT----CTG--CA------ACTAAAA-TCGCGA---TGTGCGG--TCATTTA-----ATTTTATC--TCGAAACGGTAA------TAT-TG-G-TCA-CTGC------A-A--AAC-A-----------AAA--------AT-AT-C-----ACTT--C-TGATG--CAGTGCCCTTTTAG-AT-TTAAA--TGTC-TA--AA-TGT-G-GT-AAG--T----GTAAAT---GCGTATCA----GT-TC-ATGT-AGTT-CTGTC---G-ATTTGTCG-TC--CTA----TCCATATAA-AA-AA--GTTG----CTT---AC--TCAA-GTATATCGTA--CATTATA-TT---TTTTA---A-A----T-GTTTT---GAAG-ATACTGGGT----T---AAAAAAT----TCAATCATAATGC-TT-TATGA-AAGATA-----T-A-ATCTTAT------------------A-T-------TGTATT-TTTG----GT-CACGT-GTAC------CACG-GTA-CACTAACA-T-TCCCAATC-TGAAT--AAAAT-ACAAAT--TCTCTT-A---TAAAG-G-CACA---GCGC--AGAGAAGAA--AGAACAT-GTGC--C-TGT-CG-TCCAC-AAA--CATG-AAAAATAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCATGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCCGCGAAACGC
gi|3 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgAGT-TCTCCCGGAG-GAAAAAAT-CT-GTCTGTCAA--TTT-TATCAATAA---A-ATAT-GGG--TGCG--AGTT---CTCCTGGA---AAAA--AAA---CGATG--TC-AATTTT-T----AT-C--A-A-TA--A--AA--T-CT-------G-GA-TACGAGT-TC----TGGA-----------GAT---------TTTTTTT--TTC--TGTCAGTT-TATAA-A----GT-ATA-TGTAGAAATGTGGGTATG-A-ATTCT--GAAAAAG---GAAAAAA--AA--AACCT--CTT-T-GT--CA-ATTCT---AT-C--------------G-T-ATTTAA---A----TGTG---GG-T--A-CGAG--T--TCTAATTG--G-----A-G-AG-AAAA-----------CAAAACT-TT---CTC----------G-T-T-TT-G-T------C--A-------------------TA---TAAAC------C-T------GGGTA-CA--A---GTAT-TC---C---T----AG-------TGA---------------A-A-----------------t
gi|8 : attttgacacgagttaatctgattaaaatctatcataaaatttcgatatatctctgacatgataattttagcttaattatctttaccaacacaatcaacgtacatcgattgtgttgttttatggagatcatgttctcacagtattgtaattattgcaaacaaaacataattacagtctacacacgattccgacccgatcgggtgcttctttctataattatcatatgagcacttcattacgtttgatactacgtAGTCTCCT-------GGAGAAAA-AT-CTTTGT-AAA-TTC-TATCATAAA---A-ATCT-GGG--TACG--AGTTCTCCT----GGAA-AAAA--TAA------TA--CC-CACTTT-T----AT-C--ATA-G---A--AA--T-C--------T-GG-TATGACT-TCTCC-TGG--AAAGA-AAACT-T-TGT-CA--TTTTcggtagaagcttcacttccagtgtaggaaaaggcacgcttgttgcgaggagtgaaatggacaattaatattaaaacatttttgagcaggacgagttttgtaatccgagatggtacagtatagaaaagtaaattgttgatttttcactgcctatgacatttaacttcatacacgttacttttaaagactggaacaagggtctgctgcatatagctactactattgatgatgtgaacgttttacaaaatggtgattagctacagaactgggatgggggtctgcaactaaaatgggatgtgcggtcatttaattttatctcgaacggtaaatattggtcactgcagaaacaaaatatcacttctgagtgtaatggtataatcaatgtaacatagttcttcgtattttcgtcctatcatataaaaaagttgcttactatagtacattatatttttaactgttttgaagttactggttaaaaaaaaattcaacataatctttagaagatatattttggtacacgtgtacacggtacaaacattcccaatctgattaaaatacaaatctctcttataaagcgcacagcgcagagagaaagaacatgtgcctgtacgtcacaaacatgaaaaataacgttgatcaaggcaaacgtcataaaatttcttacgtcaaatttttgacgttgcaattttggcaatttgaaaatttacgtcggaaacgctggcagcg
gi|12 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgTCTCCTGGA--GAAAAACT-TT-GTC----AA-TTTT-TATCAATAA---A-ATTT-GGG--TACG--AGTT---CT----GG---AGAT--TTT---TTTTATGTC-AG--TT-T----AT-A--A-AGT---A--CA--TGTAGAAATGTG-GG-TATGAAT-TCT-----GAAAAAGG-AAAGAA-----------CTCTTT--GTCA-A-T---TC-TATCGTA----T--AAA-TGTGG--GTACGAG-TT---C-TACT--G-----G---AGAGAAAACAA--AACTT-TCTC---GT-----TTTCT------C--------------A-T-A---AAA--A----CCTG---GG-T--A-C--A--atcaaa
gi|1 : accctatcgggtgcttctatatatataattatgagcacttcattacgtttaatactattcgatattaaatgaaaaagattttcactgggaatactAAG-AC-GTC----AA--TTT-TATCAATAA---A-ATCTGGGG--TGCA--GTTTC--CT----GG---AGAA--AAA---ATTTG--TC-AA--TT-T----AT-T--C-A-TA--A--AA--T-CT-------GTGG-TACGAGTATCTagtcgcaccaagaaattgacgtctccgggagaacttcac
gi|14 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgagttttcctggaagaaaaaaatgtgtcaatttgtataaatgacagaatctgtgtacagcaatcttggaaattctttatctaatttcaatcaaataaacatcaggggcacgagttcttcctggactaaaaaacttcgtaccgtttttcaaaaaactgggataccaagttcttctgaggaaaatttgttagtttcatttctgccatagaagatatctgggacgagttcttcctggacaaggaatgtcaatttcaatcaaaattctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacTTT-TATCAATAA---A-ATCT-GTGTATACG--AGTT---CTCC--TG---AAAATTTTG---TTTCAG-TC-AT--TT-CTGCAAT-G--A-A-G---A--TA--T-CT-------G-GG-TACTAGT-TCTCC-TGGAGACAAG-AAccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|13 : aactttgtccgACAAATAG---AGATTT-GGA--TTCG--AGTT---CT----GG---AGAA--AAA---CTTTG--TC--A--TT-T----AT-CAAA-A-T---A--GA--T--G-------G-GG-TACGAGC-TCTCCCAGTAAAGAAATAAACTATATGT-Cctgtatttcaattcattcatgcaattctgcgggagggtacgagttaaaattatcaaagagaaatgctgggttaccgagtgttctccttaaaagaaaaaaaaaagtcattttcctatcaatttctggcgaagaagctgagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|20 : tactcctggacaaaAAATAG---G-ATAC-ATG--TTC-----TC---CT----GG---AGAA--GT-----CGTA--CC--------C----AT-C--A-G-T---A------T-CT-------G-GG-TACGAGT-TCTCC-TGG---AGAA-AAACT-T-TGT-TC--TTACAGT--TTC--T-T---Tagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaagtagccatttctgtcattaaaatctgagtggtacagttggagagagagaaacaaaaactttgtcttttatcaaatagaaaacatgatcgtgataccgagttctcccggcgaaaatcaaagggtattatttcattctcaaag
gi|8 : attgctcATAA---T-ATAT-GGG--TATG--AGTCTC-CT----GG---AGAA--AAAT--CTTTG--TA-AA--TT-CT---AT-C--ATA-A---A--AA--T-CT-------G-GG-TACGAGT-TCTCC-TGGA-AAAAA-TAA-----TAC-CC-------------A--C-T---TT-TATC--A----TAGAAA-TCTGG-TAT----G-ACT-TC-TCCT--G-----GAAAG--------AA--AA-----CTT-T-GT--CA-TTTtctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|22 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatAA---A-ATCT-GGA--TACG--AATT---CTCCC-GG---AGAA--AAA---ACTCG--TC--A--TT-T----AT-C--A-A-CTAGA--AA--T-CT-------G-GG-TACGAAT-TCTCtatcaaa
gi|17 : ttatcata-ATCT-GGG--TACG--AGTTGTCCT----GGGCAAGGA----A---CT--G--TC-AA--TTTC----AT-C--A---T---A--AAATT-CT-------G-GG-TACGAGT-TCTCC-CGGAGAAAA
gi|8 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctacatgatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataa---CT----GA---AGAA--AAG---CCTT---TC-AA--TT-TT---AT-C--A-AAT---A--GAAAT-CC-------G-AG-TACAATT-TCTTC-TGGA-------GAAC-AT-TGT-CAAATTTTATCAATTG--T-G---TTGTGTTA-AGTCCTA-AAAATCTGGGTACGTCAC-GTG-TTCTCCTCAA-----G---A--------AA--AATTT----T-A-GT--CA---------------------------A-T-A---A---------TCTG---GT-T--A-C--GAGC--TCT-CCTA--A-----AGA-A---AAA-----------C-------TAT--GTC-A--------CCT-T-TT-A-T------C--A-------------------TA---AAAA-----T-C-T------GGTTA-GG--A---G--A-TC---TTC-C----AA-------AGA---------------A-A--------------------T--ACATTG----T----TA-----ATTTTATCATAAA-A--A-T-CTTG-G-T--CA-A--GTTC-TCC-TGAA-----GA--T---------AAA---CA-T-TTGT-CA-TTTTATaattatcttcatggcagaaatgacta
gi|16 : ccctgatttcagtcag--TTA---CTTTA--TC-A------T----ATGC--A-A-T----------T-CT-------A-GG-TTCAAAT-TCTCCA-GGAGAAAAA-AAAgggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|18 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggtacgagttctcccggttaaaaaaaaaacttttgA---CTTTG--TC-AT--TT-TT---AT-T--ATA-A---A--AA--T-CT-------G-GG-TACGAGT-TCTCC-CGG---AGAA-AAAC---------------TTTG--TTG--A-T---TT-TATTA-C----AA-AAA-TCTGG--GTACGAG--------TTCT--G-----GA--G--------AA--TTTTT-TTTT-T-GT--CAGTTTATAAAGTAC--------------A-T-G---TGGAAA----TGTG---GA----A-T--A--T--TAT-CTTG--GGGAAAACA-AA-ACAA-----------C-------TC---TTT-ATAATTATCA-T-T-TCTA-T------C--G-------------------TA---TAAA-----T-T-T------GTGTA-CG--A---G--T-TC---TC--C----GG-------AGA---------------G-A-----------------acgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|3 : tcTCTG--TC-AA--TT-TT---AT-C--A-A-T---A--AA--A-TAT------G-GG-TGCGAGT-TCTCC-TGG--AAAAA-AAACGA--TGT-CA-------------A--T-T---TT-TATCA-A----TA-AAA-TCTGG--ATACGAG--------TTCT--G-----G-------------A--GATTT-TTTT----------TTTCT---GT-CAGTTTATAAAGTATA-T-G---TAGAAA----TGTG---GG-T--A-TGAA--T--T----CTG--A-----AAA-AG-GAAAAAAAAAACCTCT-------TT---GTC-A--------A-T-T-CT-A-T------C--G-------------------TATTTAAA------T-G-T------GGGTA-CG--A---G--T-TCTAAT---T----GG-------AGA---------------G-AAAACAAAAC--------T--T--TCTCGTTTTGT----CA-----T----AT----A--A--A-C-CTGG-G-TA-CA-A--GTAT-TCC-TAGT--G-AAA--ACGTAGTATCAAACGTAA-TGAAGTGC----TCATATGA-TAATTAT--AGAAAGAAGCtt
gi|8 : attttgacacgagttaatctgattaaaatctatcataaaatttcgatatatctctgacatgataattttagcttaattatctttaccaacacaatcaacgtacatcgattgtgttgttttatggagatcatgttctcacagtattgtaattattgcaaacaaaacataattacagtctacacacgattccgacccgatcgggt-AA--CT-C----ATAT--A-A-T---A--TA--T----------G-GG-TATGAGT--CTCC-TGGAGAAAAA------------------TCTTTG--TAA--A-T---TC-TATCA-T----AA-AAA-TCTGGGTA--CGAG-TT---C-TCCT--G-----G---A--------AA--AAATA-A--T-A-CC--CA-CTTTT---AT-C--------------A-T------AGAAA----TCTG---G--T--A-T--GACT--TCT-CCTG--G-----A-A-AG-AAAA-----------CT------TT---GTC----------A-T-T-TT-A-T------C--A-------------------cagattttttcctccgggagaactcggtagaagcttcacttccagtgtaggaaaaggcacgcttgttgcgaggagtgaaatggacaattaatattaaaacatttttgagcaggacgagttttgtaatccgagatggtacagtatagaaaagtaaattgttgatttttcactgcctatgacatttaacttcatacacgttacttttaaagactggaacaagggtctgctgcatatagctactactattgatgatgtgaacgttttacaaaatggtgattagctacagaactgggatgggggtctgcaactaaaatgggatgtgcggtcatttaattttatctcgaacggtaaatattggtcactgcagaaacaaaatatcacttctgagtgtaatggtataatcaatgtaacatagttcttcgtattttcgtcctatcatataaaaaagttgcttactatagtacattatatttttaactgttttgaagttactggttaaaaaaaaattcaacataatctttagaagatatattttggtacacgtgtacacggtacaaacattcccaatctgattaaaatacaaatctctcttataaagcgcacagcgcagagagaaagaacatgtgcctgtacgtcacaaacatgaaaaataacgttgatcaaggcaaacgtcataaaatttcttacgtcaaatttttgacgttgcaattttggcaatttgaaaatttacgtcggaaacgctggcagcg
gi|20 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcagggg--T-CT-------G-GG-TACGAGT-TCTCC-TGGGTAAGAaa
gi|12 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacttctccaggagaacatgtatcctattt-GG-TGCGACT-TCTCC-TGGA---GAA-AAAC----------------TTT--GTCAAT-T---TT-TATCA-A----TA-AAA-TTTGG--GTACGAG--------TTCT--------G---G--------AG--ATTTT-TTTT-ATGT--CAGTTTATAAAGTAC--------------A-T-G---TAGAAA----TGTG---GG-T--A-TGAA--T--T----CTG--A-----AAA-AG-GAAAGAACTC-----T-------TT---GTC-A--------A-T-T-CT-A-T------C--G-------------------TA---TAAA-----T-G-T------GGGTA-CG--A---G--T-TC---TAC-T----GG-------AGA---------------G-AAAACAAAACTTTCTCGTT--T--TC--------T----CA-----T----A-----AA-A--A-C-CTGG-G-TA-CA-A--GTAT-TCC-C-----A-GTG--A---------AAA---TC-T-TTTT-CA-TTTAATATCgttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|14 : accctatcgggtgcttctatatatataattatgagcacttcattacgtttaatactattcTTTG--TCC--G-T---TT-TATCA-A----TA-AAA-TCTGTGTATACGAG-TT---C-TCCT--G------------------AA--AATTTTGTTTCA-GT--CA-TTTCT---GC-A--------------A-T-G---AAGATA----TCTG---GG-T--A-CTAG--T--TCT-CCTGGAG-----ACA-AG---AA-----------C-------TGTATTTC-A--------A---T-TC-ATT------C--A-------------------T----GCAAT----T-C-TGCGGGAGGGTA-CG--A---G--T-T-----------------------AA---------------A-A-----------------T--T--A---------T----CA-----A----AG----AGAA--A-TGCTGG-GTTACCG-AGTGTTC-TCCTTAAA--A-GAA--A---------AAA---AA---AAGT-CATTTTCCTATCA--ATTTCTGGCGAAGAAaagaaattgacgtctccgggagaacttcac
gi|1 : aac-T---TT-TATCA-A----TA-AAA-TCTGGG-GTGC-AG-TT-----TCCT--G-----GAGAA--------AA--AATTT-G-TC-A------A-TTTAT----T-C--------------A-T-A---AA---A----TCTGT--GG-T--A-C--gctgagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|22 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgagttttcctggaagaaaaaaatgtgtcaatttgtataaatgacagaatctgtgtacagcaatcttggaaattctttatctaatttcaatcaaataaacatcaggggcacgagttcttcctggactaaaaaacttcgtaccgtttttcaaaaaactgggataccaagttcttctgaggaaaatttgttagtttcatttctgccatagaagatatctgggacgagttcttcctggacaaggaatgtcaatttcaatcaaaattctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcT-TATCA-T----AA-AAA-TCTGG--ATACGA--AT---TCTCCC--G-----GA--G--------AA--AA--A-ACTC---GT--CA-TTTAT------C--------------A-A-C---TAGAAA----TCTG---GG-T--A-CGAA--T--TCT-Cttgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|17 : A-TCTGGGTA--CGAG-TTG----TCCT--G-----G---GC-------AAGGAACT---------GT--CA-ATTTC---AT-C--------------A-T-A---AA-AT-----TCTG---GG-T--A-CGAG--T--TCT-CCCG--G-----A------GAAA-----------A-------TT---ATC-A--------A-
gi|8 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctacatgatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatATATATGGGTATGAGTCTCCT--G-----GA--G--------AA--AAAT---CTT-T-GT--AA-ATTCT---AT-C--------------A-T-A---AAAAT------CTG---GG-T--A-C--GAGT--TCT-CCTG--G-----A-A-AA-AATA-----------A-------TA---CCC-A--------C-T-T-TT-A-T------C--A-------------------TA---GAAA-----T-C-T------G-GTA-TG--A---C--T-TC---T---CCT--GGAA-----AGA---------------A-A-----------------aattatcttcatggcagaaatgacta
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataCCT--G-----AA--G--------AA--AA----GCCT---TT--CA-ATTTT---AT-C--------------A-A-A---TAGAAA----TCCG---AG-T--A-C--AATT--TCT-TCTG--G-----A------GAAC-----------A-------TT---GTC-A--------AAT-T-TT-A-T------C--AATTGTGTTGTGTTAAGTCCTA---AAAA-----T-C-T------GGGTA-CGTCACGTG--T-TC---T---CCTCAAG-------AAA---------------A-A-----------------T--TTTAG--------T----CA-----A-----T----A-----A-T-CTGG-T-TA-CG-A--GCTC-TCC-TAA------AG--A---------AAA---AC-T-ATGT-CA-CCTTTTATCA-TAactttgtcattttatcaaa
gi|18 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagattttCTT-T-GT--CA-TTTTT---AT-T--------------A-T-A---AAAAT------CTG---GG-T--A-C--GAGT--TCT-CCCG--G-----AGA-A---AAA-----------C-------TTT--GTT-G--------A-T-T-TT-A-T------T--A-------------------CA---AAAA-----T-C-T------GGGTA-CG--A---G--T-TC---T--------GG-------AGA---------------A-T-----------------T--T--ggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|17 : tctctctccggagaactcgtacacaaatttatacgatagaaatgataattataaagagttgttttgttttccccaagataatattccacatttccacatgtactttataaactgacaaaaaaaT-A-GT--CA-TTTCT---GC-C--------------A-T-G---AAGATAATTATCTG---GG-T--A-C--GAGT--TGT-CCTG--G-----GCA-AG-GAA------------C-------TG----TC-A--------A-T-T-TC-A-T------C--A-------------------TA---AAA-T----T-C-T------GGGTA-CG--A---G--T-TC---T---CCC--GG-------AGA---------------A-AA----------------T--T--A---------T----CA-----A----AT----AG-A--A-----------A-TG-A--TTTC-TCC-TAAA--A-GAA--A---------AAA---AG-T-A-----A-TTTC-TATCA-TGTttt
gi|13 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctT-A-GC--CA-TTTCT---GT-C--------------A-T-T---AAA--A----TCTGAGTGG-T--A-C--A--G--T-----TG--G-----AGAGAGAGAAA-----------CAAAAACTTT---GTC------------T-T-TT-A-T------CAAA-------------------TAG--AAAACATGAT-CGT------GA-TACCG--A---G--T-TC---TCC-C----GG-------CGA---------------A-A-----------------------A---------T----CA-----A----A-----------------GG-G-TA-TT-A--TTTCATTC-TCAA--A-G
gi|1 : tactcctggacaaaacaaatagagatttggattcgagttctggagaaaaactttgtcatttatcaaaatagatggggtacgagctctcccagtaaagaaataaactatatgtcagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaag-GT--CA-ATTTT---AT-C--------------AAT-A---AA---A----TCTG---GGGT--G-C--A--G--TTT-CCTG--G-----AGA-A--AAAA-----------T-------TT---GTC-A--------A-T-T-TA-T-T------C--A-------------------TA---AAATC----T-G-T------G-GTA-CG--A---G--TATC---T---G----TG-------AGATGTTTTTTTCTGTTCA-G-----------------T--T--ATAAG-----TA---CA-----T----GT----AG-A--A-T-CTGG-G-TT-TGAA--ATTC-TGA-AAAA--G-GAG--G---------AAA---AA-
gi|20 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgagttttcctggaagaaaaaaatgtgtcaatttgtataaatgacagaatctgtgtacagcaatcttggaaattctttatctaatttcaatcaaataaacatcaggggcacgagttcttcctggactaaaaaacttcgtaccgtttttcaaaaaactgggataccaagttcttctgaggaaaatttgttagtttcatttctgccatagaagatatctgggacgagttcttcctggacaaggaatgtcaatttcaatcaaaattctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagtC-C--------------A---G---AAAATA-------G---GA-T--A-C--A--TGTTCT-CCTG--G-----A------GAA-------------------------GTC-G--------T-A-C-CC-A-T------C--AG------------------TA------------T-C-T------GGGTA-CG--A---G--T-TC---T---CCT--GG-------AGA---------------A-A-----------------gtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|22 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtt-C--------------A-T-A---AAAAT------CTG---GA-T--A-CGAA--T--TCT-CCCG--G-----AGA-A--AAAA-----------C-------TC---GTC-A------------T-TT-A-T------C--AAC-----------------TA---GAAA-----T-C-T------GGGTA-CG--A---A--T-TC---T---C----gtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|8 : ttatATA----TATG---GG-T--A-TG-A--G--TCT-CCTG--G-----AGA-A---AAA-----------TCT-----TT---GTA-A--------A-T-T-CT-A-T------C--A-------------------TA---AAAA-----T-C-T------GGGTA-CG--A---G--T-TC---T---CCTG-GA-------AAA---------------A-A-----------------TAAT--AC--------C----CACTTTTATC--AT----AGAA--A-T-CT-G-G-TA-TG-A--CTTC-TCC-T-----G-GAA--A---------GAA---AACT-TTGT-CA-TTT--TATCA-
gi|20 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatata----TCTG---GG-T--A-C--GAGT--TCT-CCTG--G-----GTA-AG-aa
gi|16 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacttctccaggagaacatgtatcctattt----TCTA---GG-TTCA-A--A--T--TCT-CCAG--G-----AGA-AA-AAAA-----------A-------AC---GTC-A----------T-T-TT-A-A------A--A-------------------TA---AAAAC----C-C-A------GAGTA-Cagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|29 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggtacgagttctcccggttaaaaaaaaaacttttgttactttatcatatgcaatG---GG-C--A-C--A--T--TCT-CCTG--G-----AGA-Acataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|25 : G-T--A-C--AAGT--TGT-CCAG--G-----A----G-TAAA-------------------TGTT-GTC-A--------A-T-T-TT-A-TATGTATC--A-------------------TT---AAAA-----T-C-T------GAGTA-TG--A---G--cactttctgggcacaagtttccct
gi|19 : -T--A-C--AC-T--TCT-CCCG--G-----AGA-AA-AAAA-----------A-------TGT--GTC-A--------A-A-T-TT-A-T------T--A-------------------TA---AAAA-----T-A-T------AGGTA-CG--A---G--
gi|18 : ttgaataaaattgacgaaaatttttAAA-----------C-------TTT--GTC-A--------T-T-T-TT-A-T------T--A-------------------TA---AAAA-----T-C-T------GGGTA-CG--A---G--T-TC---TCC-C----GG-------AGA---------------A-AAACTTTGTTGATT----T--T--AT--------TA---CA-----A----A--------A--A-T-CTGG-G-TA-CG-A--GTTC-Tggaaaaggccgccttgttcgcgaaggagtgttccaagacaataagtagacctgaattcttgataaaaaaaaaaagacatgtattagcagacgatcagtttttgttacctgagat
gi|28 : tctctctccggagaactcgtacacaaatttatacgatagaaatgataattataaagagttgttttgttttccccaagataatattccacatttccacatgtactttataaactgacaaaaaaaaaattctcc---GTC-A--------A-T-T-TT-A-T------G--A-------------------TA---AAAAC------C-T------AGGTA-CA--A---G--T-TC---T---C----
gi|22 : ttccgg-TT-A-T------C--A-------------------TA---AAAA-----T-C-T------GGATA-CG--A---A--T-TC---T---CCC--GG-------AGA---------------A-AAAACTCGTCAT------T--T--A---------T----CA-----A----CT----AG-A--AAT-CTGG-G-TA-CG-A--ATTC-TCgaa
gi|20 : -T------GGGTA-CG--A---C--T-TC---T---CCA--GG-------AGA---------------ACA-----------------TG-T--AT--------C----C------------T----AT-T--T-T-CTGG-G-TA-CG-A--GTTC-TCC-T
gi|16 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgaGTA-CG--A---G--T-TC---T---CCC--GGTTAAAAAAAA---------------A-ACTTTTG-----------T--T--AC--------TTTATCA-----T----AT----GC-A--A-TTCTAG-G-TT-CA-A--ATTC-TCC-AGGA--G-AAA--A---------AAA---AA-C---GT-CA-TTTTAgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|20 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttagTA-CA--T---G--T-TC---T---CCT--GG-------AGA---------------A-G-----------------TCGT--AC--------C----CA-----------TC---AG-T--A-T-CTGG-G-TA-CG-A--GTTC-TCC-T-GG--A-GAA--A---------AAaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|1 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaag---G--T-TC---T---CCCG-GA-------AGACGTC-----------A-A-----------------T--T------------T----TATC---A----AT----AA-A--A-T-CTGG-G--G-TGCA--GTT--TCC-TG------GAG--A---------AAA---AA-T-TTGT-CA-ATTTAT-TCA-TAtcctattttctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|18 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgagttttcctggaagaaaaaaatgtgtcaatttgtataaatgacagaatctgtgtacagcaatcttggaaattctttatctaatttcaatcaaataaacatcaggggcacgagttcttcctggactaaaaaacttcgtaccgtttttcaaaaaactgggataccaagttcttctgaggaaaatttgttagtttcatttctgccatagaagatatctgggacgagttcttcctggacaaggaatgtcaatttcaatcaaaattctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattt----AA-A--A-T-CTGG-G-TA-CG-A--GTTC-TCC-C-GG--A-GAA--A---------AAgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|22 : tctctctccggagaactcgtacacaaatttatacgatagaaatgataattataaagagttgttttgttttccccaagataatattccacatttccacatgtactttataaactgacaaaaaaaaaattctccagaactcgtacccagatttttgtaataaaatcaacaaag----AA-A--A-T-CTGG-A-TA-CG-A--ATTC-TCC-C-----G-GAG--A---------AAA---AA-C-TCGT-CA-TT---TATCA-tataataaaaatgacaaagttt
gi|3 : ttatcataATTTTGACACGAGTTAAT-C-TGATT--AAAAT-CTAT--CATAA-AAT-TTCGATAT--AT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTTTACCA----AC-ACA--AT-CAA-CG--TACATCGAT--TGT------------------G---TTGT--T-TTATG-G--AGATCA---TGTT---CTCACAG--TAT-TGT-AAT-TA-TT-G------CAAACAAAAC-A-----TAATTAC-A---GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA-TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TGAT--A--CTA--CG--------------------------TTT-TCA-CTAGGAAT-ACTTGT---AC--CCA--GGT-----TT-----AT----ATGAC-AA--A---A------CGA--G---------A----AAG-T---T--TT-GTTT---TCT-CTCCAA-TTAGAA-CTCG--TAC--C-----C-A-CAT-TT--AA-AT--A--C--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAGGTT-TTTTT-TTTCC-TTTTTC----A-------G----AAT-T-C--ATA--C---CC--ACAT-TTCTACATATAC--TTTATAA--ACTGA-CAG--AAAAAAAAAAT----CTC-C------AG---A-------------A----CT-C--GTATC-CAG-A-T---TT-T------------------A----T--TG---A-TAA-----AA--ATT-GA--C-AT---CGTTTT--T-----T---T--T-----C---CAGGAGAAC---T--CG---CAC-C--C-ATATTT--------------------TATTGATAAA-A-TTGACA-GACAGATTTTTT-CCTCCG--GG-AGAA----C--TCGGTAGAAGCT-TCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGG-CACGCT-T-GTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGACA------ATTAAT---ATTAA--AA-CA-T---TTT-TGA-GCAGGACG-AGT-TTTGTAATCC---G-A-------G-ATGGT--A---CAGTATAGAAAA-GT-AAAT---TG-TTGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACT----TCATACAC-GTTACTTTT--AAAGAC-TGGAACA--AGGG-TC--TGCTGCA-TATA----GCTA-C-T---ACT--ATTGA--TGA-TGTG--A-AC-GTTTTA-CAA-AATGG-TGA-TTAGCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACTAAAA-TGG-GA---TGTGCGG--TCATTTA-----ATTTTATC--TCGAACGGTAAA------TAT-T--GGTCA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TA-T--C-----ACTT--C-TG------AGTGT-------A-AT-GGTAT-----------AA-T-----CA-A----T----GTAA------------C----A--------T-AGTT-CT-TC---GTA-TTTTCG-TC--CTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTT---AC--TATA-GT-------A--CATTATATTT---TT--A---A-C----T-GTTTT---GAAG-TTACTGGTT----A-AAAAAAAAT----TCAAC-ATAAT-C-TT-TA--G-AAGATA-----T---AT----------------------------------------TTTG----GTACACGT-GTA-------CACG-GTA-CA--AACA-T-TCCCAATC-TGATT--AAAAT-ACAAAT-CTCTCTT-A---TAAAGCG-CACA---GCGC--AGAG-AGAA--AGAACAT-GTGC--C-TGTACG-T-CAC-AAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CATAA--AA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACG---TCGGAA-ACGCTGGCactagaaatctgggtacgaattctc
gi|21 : AT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCATG-G--AGATCA---TATTG---TCACAG--TAT-TGT-AAT-TA-TT-G------CAA-AAAAAagcg
gi|17 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtG---TTGT--TTTGAT-TGCCAGATCAAAATGTT---CTCAC-GCCTATCTGT-AAT-TA-TTTG------CAAACAAAA------ATCAATTAC-A---GTCTACAT---GAT---AGAAATTA---------CTT--TT---TTTC--TTT---TAGGAGAA-----A-T--CATT-T--------CTATTTG--AT--------------------AATTT-TCT-CCGGGAGA-ACTCGT---AC--CCAGAATT-----TT-----AT----GAT---GA--A---A------TT---G---------A----CAG-T---T--CCT---------TGC-CCAG-G-ACAA-CTC--GTAC--C-----C-A-GATAAT--TATCTTCA--T--------G-G-CAGAAATG-AC-acttagtggtaagtct
gi|23 : AT-TGT-AAT-CA-AT-G------CAA-CAAAAC-ACC-ATGGG--GC-TCAAGTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATAta
gi|12 : ACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TATAATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TAAT--A--CTATTCGATATT--------AA-ATGAAAAAGATTT-TCA-CTGGGAAT-ACTTGT---AC--CCAGGTTT-----TT-----ATG---A-----GA--A---AA-----CGA--G---------A----AAG-T---T--TT-GTTT---TCT-CTCCAG-T-AGAA-CTCG--TAC--C-----C-A-CAT-TT---A--T--A--C--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAG----TTCTT---TCCTTTTT-C----A-------G----AAT-T-C--ATAC-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC--TTTATAA--ACTG---AC--ATAAAAAAAAT----CTC-C------AG---A-------------A----CT-C--GTACC-CAA-A-T---TT-T------------------A----T--TG---A-TAA-----AA--ATT-GA--C-AA---AGT-TT--T-----T---C--T-----C---CAGGAGAAG---T--CG---CAC-C--A-AG--------------------------------AA-A-T----T-GACG---------TCTCCG--GG-AGAA----C--T----------T-
gi|5 : CGTA-TAACCAGATTTATTAGA-AAC--------AA-A------G--TTTTTTATCCAGGAGA-ACTCGT---GC--CTGATG-T-----TT-----AT----T-----GATGA---A------TT---G---------ATAAAAAG-T---T-----AATT---TCT--------C-AGAA-TT---GTAC--A-----C-A-GAT-TT--TA-TT--A---------------TAAAATTG-AC-AA---------------TTTGT--TTTC-TTTC-C----A-------G----GAcac
gi|18 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaactagttcA-ATC--------AACA------AAGTTTTTCT-CCGGGAGA-ACTCGT---AC--CCA--GAT-----TTTTATAAT----A-----AA--A---A------TG---AC--------A----AAG-T---T--Tagattctcctggaaatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|14 : tctctctccggagaactcgtacacaaatttatacgatagaaatgataattataaagagttgttttgttttccccaagataatattccacatttccacatgtactttataaactgacaaaaaaaaaattctccagaactcgtacccagatttttgtaataaTTGTCT-CCAGGAGA-ACTAGT---AC--CCAGATATCTTCATT-----GC----A-----GA--A---A------TG---ACTGAAAC--A----AAA-T---T--TT---------------CAG-G-AGAA-CTCGTATAC--A-----C-A-GAT-TT--TA-TT--------------G-A-TAAAACGG-AC-AA------A-G
gi|13 : aaTTA-CTGGGAGA-GCTCGT---AC--CCCA---T-----CT-----ATTTTGA-----TA--A---A------TG---AC--------A----AAG-T---T--TTT-----------CTCC-----AGAA-CTCG-A-AT--C-----C-A-AAT-CT--gaactgtatttcaattcattcatgcaattctgcgggagggtacgagttaaaattatcaaagagaaatgctgggttaccgagtgttctccttaaaagaaaaaaaaaagtcattttcctatcaatttctggcgaagaagctgagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|5 : tactcctggacaaaacaaatagGAGAAT--CTCGT---ATAACCA--GAT-----TT-----ATT---A-----GA--A---A------C--------------A----AAG-T---T--TTT---------TA-TCCAG-G-AGAA-CTC--GTGC--C-----T-G--ATGTT--TA-TT--------------G-A-T-GAATTG-AT-AA------A-AAG-------TT-AAT---TTCT-C----A-------G----AAT-T----GTA--CA--C---AGAT-TTagaaataaactatatgtcagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaagtagccatttctgtcattaaaatctgagtggtacagttggagagagagaaacaaaaactttgtcttttatcaaatagaaaacatgatcgtgataccgagttctcccggcgaaaatcaaagggtattatttcattctcaaag
gi|18 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaactagttctcctggaaagaaaacaaattgtcaattttataataGGAGA-ACTCGT---AC--ACAAA--T-----TT-----AT----ACGATAGA--A---A------TG---ATAATTATAAA----GAG-T---TGTTTTGTTT---TC--CCCAAGAT-AATA-TTCC-ACATTTC-----C-A-CAT-GT---A-CT-----T--------T-A-TA-AACTG-AC-AA------A-AAAAAAATT-----CTCC-----------A-------G----AAC-T-C--GTA--C---CC--AGAT-TTTTG----------TAATAA--AAT---CA-------ACAAAGTTTTTCTC-CGGG---AG---A-------------A----CT-C--GTACC-CAG-A-T---TT-T-------------------T---A--TA---A-T-A-----AA--AAT-GA--C-AA---AG--TT--T-----ctggaaatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|8 : tctctctccGGAGA-ACTCGT---AC--CCA--GAT-----TTTTATGAT----A-----GA--ATTTA------C--------------A----AAGAT---T--TTT-----------CTCCAG-G-AG-A-CTC--ATAC--C-----C-A-TAT-AT--TA--T--A--T--------G-A-
gi|18 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaac-ACTCGT---AC--CCA--GAT-----TTTTGTAAT----A-----AA--A---T------CA---AC--------A----AAG-T---T--TTT-----------CTCCGG-G-AGAA-CTC--GTAC--C-----C-A-GAT-TT--T---T--A--T--------A-A-TAAAAATG-AC-AA------A-Gtggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|16 : tctctctccggagaactcgtacacaaatttatacgatagaaatgataattataaagagttgttttgttttccccaagataatattccacatttccacatgtactttataaactgacaaaaaaaaaattctccagaGGGT-----TT-----TT----ATTTT-AA--A---A------TG------------------ACG-T---T--TTT-TTT---TCTCCT---G-G-AGAA-TTTG-A-AC--C-----T-A-GAA-TT--GC-AT--A--T--------G-A-TA-AAGTA-AC-AA------A--AG----TTTTT-------TTTT-T----AACCGGGAG----AAC-T-C--GTA--C--------------CTA-----ACCGTTA--------TC--CGG--GAAAA----------CTC---------G---C-------------A----CA-CG-GTCTT-CAT---T---TC-T------------------AT---C--TG---G-T-A-----AA--ATT--A--C-AA---AGTTTT--T-----T---C--T-----C---CGG---AAT---T--CG---TAC-C--C-ttt
gi|13 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgaT-----TG-----AT----A-----AA--AG--A------C--------------A----AAG-T---T--TTTGTTTCTCTCT-CTCC-------AA-CT---GTAC--CACT--C-A-GAT-TT--TA-----A--T--------G-A-CAGAAATG-GC-agagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|20 : tactcctggacaaaacaaatagagatttggattcgagttctggagaaaaactttgtcatttatcaaaatagatggggtacgagctctcccagtaaagaaataaactatatgtcagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaagtaT-----GT----A-----AG--A---A------C--------------A----AAG-T---T--TTT-----------CTCCAG-G-AGAA-CTC--GTAC--C-----C-A-GAT-atagaaaacatgatcgtgataccgagttctcccggcgaaaatcaaagggtattatttcattctcaaag
gi|8 : attgctcaaagaaac---------A----AAG-TGGGT--ATTATTT---TTT---CCAG-G-AGAA-CTCG--TAC--C-----C-A-GAT-TT--T---T--A--T--------G-A-TAGAATTT-AC-AA------A-GA-----TTTTT--CTC-------C----A-------GGA--GAC-T-C--ATA--C---C----CATATATTATATGactgatgggtacgacttctccaggagaacatgtatcctattttctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|13 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactAG-T---T--TAT-TTC---TTTACT--GG-G-AGAG-CTCG--TAC--C-----C---CAT-CT---A-TT--T--T--------G-A-TAAA--TG-AC-AA---------AG----TTTTT--CTC-------C----A-------G----AAC-T-CGAAT---C---C---AAAT-CTCTATTTGTtatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|13 : tactcctggacaaa--TTTGATT---TTCGC--CGG-G-AGAA-CTCG-GTAT--CACGATC-A-TGT-TT--T--CT--ATTT--------G-A-TAAAA--G-AC-AA---------AG----TTTTT-GTTTC-TCTatatgtcagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaagtagccatttctgtcattaaaatctgagtggtacagttggagagagagaaacaaaaactttgtcttttatcaaatagaaaacatgatcgtgataccgagttctcccggcgaaaatcaaagggtattatttcattctcaaag
gi|1 : tactcctggacaaaacaaatagagatttggattcgagttctggagaaaaactttgtcatttatcaaaatagatggggtacgagctctcccagtaaagaaataaactatatgtcagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaagtagccatttctgtcattaaaatctgagtggtacagttggagagTTT---TC--CTC-AG-A-AGAA-CTTG-GTAT--C-----C---CAG-TT--TT-TT--------------G-A--AAAACGGTAC-GA------A-G-T----TTTTT-AGTCC-----------A-------GGAAGAAC-T-C--GTG--C---C---------CCTG-ATGT----TTATTTG--ATTG--AAATTAGATAAAGAAT----TTC-C------AA---G-------------A----TTGCT-GTACA-CAG-A-T---TC-T------------------GTCA-T--TT---A-T-AC----AA--ATT-GA--C-AC---AT--TT--T-----T---T--T-----CTTCCAGGAAAAC---T--CGGATTACTC--C-TGATTTTT-------------G-AT-TAT--AAAAA-A-T----G-GAgggtattatttcattctcaaag
gi|4 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgtTTT---TC-ATTCCAG-T-AGAA-CTCGTGTAC--C-----C-AACAT-TGAATG-AT--A--C--------G-AATA-AATTG-AC-AA------AAGAG----TTTTT-CCTTT-TTCC-C----A-------G----AAT-T-TCGATA--C---CCACACAT-TTCTACATGTAC--TTA-TAAC-ACTGA-CAG-----AAAAAAAT----CTC-C------AG---ACGTCGCCCCCCCCC----CT-TA---ACC-CAG-A-T---TT-T------------------TT---T--TG---A-T-A-----AA--ATtttgttagtttcatttctgccatagaagatatctgggacgagttcttcctggacaaggaatgtcaatttcaatcaaaattctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|18 : TC---TCT-CTCCGG---AGAA-CTCG--TAC--A-----C-A-AAT-TT---A--T--A--C--------G-A-TAGAAATG-AT-AATTATAAA-GAG----TTGTT---TTG-TTTT-CCCCAA-------G----A---T-A--ATATTC---C---ACAT-TTCCACATGTAC--TTTATAA--ACTG---AC--AAAAAAAAAATT---CTC-C------AG---A-------------A----CT-C--GTACC-CAG-A-T---TT-T-------------------T---G--TA---A-T-A-----AA--ATC-AA--C-AA---AGT-TT--T-----T---C--T-----C---CGGGAGAAC---T--CG---TAC-C--C-AGA-TTTT----------------TATA---ATAAA-A-ctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|8 : CTTCAG-G-AGAA-CTTG---AC--C-----A-A-GAT-TT--T---T--A--T--------G-A-TAAAATTA-AC-AA-----------------TGT-ATTTC-TTTG-G----A-------A----GATCT-C--CTAA-C---C---AGAT-TTTTA----------TGATAA--A------AG--GTGACATAGTT----TTT-CTTTAGGAG---A-------------G----CT-C--GTAAC-CAG-A-T---T---------------------AT---T---G---ACT-A-----AA--ATT-----------------T--T-----T---C--T-----T---GAGGAGAACACGTGACG---TAC-C--C-AGATTTTTAGGACTTAACACAACACA-ATTGATAAA-ATT----T-GACAATGT-----TCTCCA--GA-AGAA----A--T----------T-atgacaaagttt
gi|5 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatTCCAG-G-AGAATCTCGTATAA--C-----C-A-GAT-TT---------A--T------------TAGAA----AC-AA------A-G-T----TTTTT-A-------TC-C----A-------GGAG-AAC-T-C--GTG--C---C---TGAT-GTTTA---------TTGATGA--ATTG---AT--AAAAAGTTAAT----TTCTC------AG---A-------------A----TT----GTACA-CAG-A-T---TT-T------------------AT---T-------A-T-A-----AA--ATT-GA--C-AATT-TG--TT--T-----T---CTTT-----C---CAGGAGAACTAGT--TG---TAC-T--C-TGAATTTT-------------AAATA-----ACAAATA-T------TTCT---------TCTCA---GG-AGAA----C--T----------CGTAAACT-Cgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|28 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcaTCCGG-G-AGAA-CTTG--TAC--C-----T-A-GGT-TT--T---T--A--T--------C-A-TAAAATTG-AC-GA------A-aatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|22 : t-AGAA-TTCG--TAC--C-----C-A-GAT-TT-----CT--AGTT--------G-A-TAAA--TG-AC-----------GAG----TTTTT-TCTCC---GG-G----A-------G----AAT-T-C--GTAT-C---C---AGAT-TTTTA
gi|14 : ttatcaGAATTG-AA-AT------A-CAG----TTCTT-G-----TCTC-C----A-------GGAG-AAC-T-A--GTA--C---CC--AGAT-ATCTTCAT-TGC----AGAAATGACTG---------AAACAAAAT----TTT-C------AGGAGA-------------A----CT-CGTATACA-CAG-A-T---TT-T------------------AT---T---G---A-T-A-----AA--ACG-GA--C-AA---AG--TT--c
gi|20 : AA--ACTG--TA----AGAACAAAGTTTTTCTC-C------AGGAGA-------------A----CT-C--GTACC-CAG-A-T---AC-T------------------GA---T--GG---G-T-A-----------C-GA--C--------------T-----T---C--T-----C---CAGGAGAAC---A--TG---TAT-C--C-attcatgcaattctgcgggagggtacgagttaaaattatcaaagagaaatgctgggttaccgagtgttctccttaaaagaaaaaaaaaagtcattttcctatcaatttctggcgaagaagctgagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|17 : attgctcaaagT----CTC-CGGG---AG---A-------------A----CT-C--GTACC-CAG-AAT---TT-T------------------AT-------G---A-T-G-----AA--ATT-GA--C-A-----G--TTCCT-----T---G--C-----C---CAGGACAAC---T--CG---TAC-C--C-AGAtattttctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|14 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctacatgatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataatttT----CTC-C------AGGAGA-------------A----CT--A-GTACC-CAG-A-TATCTT-C------------------AT---T--GC---A-G-A-----AATGACT-GAAAC-AA---AA--TT--T-----T---C-------------AGGAGAAC---T--CG---TAT-A--C-ACAGATTT------------------TATTGATAAA-A-C----G-GACtaattatcttcatggcagaaatgacta
gi|8 : aactttT----CTC-C------AG---A-------------AGAAATT----GTACT-CGG-A-T---TTCT------------------AT---T--TG---A-T-A-----AA--ATT-GA----AA---GGC-TT--T-----T---C--T-----T---CAGGGGAAC---T--Ccaagaactgtatttcaattcattcatgcaattctgcgggagggtacgagttaaaattatcaaagagaaatgctgggttaccgagtgttctccttaaaagaaaaaaaaaagtcattttcctatcaatttctggcgaagaagctgagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|5 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgt------AG---A-------------A----CT-CGTGTACC-CAACA-T---TG-A------------------AT-------G---A-T-ACGAATAA--ATT-GA--C-AAAAGAG--TT--T-----TTC-C--TTTTTCC---CAGAAT--T---T--CGA--TAC-CCAC-ACATTTCT-------------ACATGTACTTATAAatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|4 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaactagttctcctggaaagaaaacaaattgtcaattttataataaaatctgtgtacaattctgagaaattaactttttatcaattcatcaataaacatcaggcacgagttctcctggataaaaaactttgtttctaataaatctggttatacgagattctcctggaaatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagt------AG---A-------------A----CT-CGTGTACC-CAACA-T---TG-A------------------AT-------G---A-T-ACGAATAA--ATT-GA--C-AAAAGAG--TT--T-----TTC-C--TTTTTCC---CAGAAT--T---T--CGA--TAC-CCAC-ACATTTCT-------------ACATGTACTTATAAcactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|8 : ttttcattccagt------AG---A-------------A----CT-C--GTACC-CAG-A-T---TT-T-------------------T---A--TG---A-T-A-----GA--ATT-TA--C-AA---AGATTT--T-----T---C--T-----C---CAGGA-GAC---T--CA---TAC-C--------------------------CATATATT-------A-T----ATGAGT---------TCCCCT--GA-AGAAAAGCC--T----------T-TCAATT-cactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|22 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataa------AG---A-------------A----TT-C--GTACC-CAG-A-T---TTCT------------------AG---T--TG---A-T-A-----AA----T-GA--C--G---AGTTTT--T-----T---C--T-----C---CGGGAGAAT---T--CG---TAT-C--C-AGATTTTT-------------cctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|13 : ttatcat------AG---A-------------G----CT-C--GTACC-CC--A-T---CT-A------------------TT---T--TG---A-T-A-----AA----T-GA--C-AA---AGT-TT--T-----T---C--T-----C---CAG---AAC---T--CG---AAT-C--C-AAATCTCT-------------c
gi|28 : tactcctggacaaaacaaat------AG---A-------------A----CT-T--GTACC-TAG-G-T---TT-T-------------------T---A--TC---A-T-A-----AA--ATT-GA--C-GA---Acccagtaaagaaataaactatatgtcagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaagtagccatttctgtcattaaaatctgagtggtacagttggagagagagaaacaaaaactttgtcttttatcaaatagaaaacatgatcgtgataccgagttctcccggcgaaaatcaaagggtattatttcattctcaaag
gi|25 : ttccggg----CT-CA--TACT-CAG-A-T---TT-T------------------AA---TGATACATA-T-A-----AA--ATT-GA--C-AA---CA--TT--T-----A---C--T-----C---CTGGACAAC---T--TG---TAC-
gi|19 : ----CT-C--GTACC-TAT-A-T---TT-T-------------------T---A--TA---A-T-A-----AA--TTT-GA--C-AC---AT--TT--T-----TTTTC--T-----C---CGGGAGAA
gi|8 : ttgaataaaattgacgaaaattttt-GTACC-CAG-A-T---TT-TTAGGACTTAACACAACACAA---T--TG---A-T-A-----AA--ATTTGA--C-AA-------TG--T-----T---C--T-----C---CAGAAGAAA---T--TG---TAC-T--C-GGATTTCT---------------AT---TTGATAAA-A-TTGAAA-GGCT---------TTTCTTCAGG-GGAA----C--T----------gtgtaggaaaaggccgccttgttcgcgaaggagtgttccaagacaataagtagacctgaattcttgataaaaaaaaaaagacatgtattagcagacgatcagtttttgttacctgagat
gi|18 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgac-A-C---TT-T------------------ATAAAC--TG---A-C-A-----AA--A----A--A-AA---AA--TT------------C--T-----C---CAG---AAC---T--CG---TAC-C--C-AGATTTTT-------------GTA-------ATAAA-A-T----C-AACAAAGTTTT--TCTCC---GGGAGAA----C--T----------catataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|17 : tctctctccggagaactcgtacacaaatttatacgatagaaatgataattataaagagttgttttgttttccccaagataatattccacatttccacatgt-T---TC-T------------------AT---T--TG---A-T-A-----A----------------------TT--T-----T---C--T-----C---CGGGAGAAC---T--CG---TAC-C--C-AGAATTTT-------------A-------TGATGAA-A-T----T-GACA---------GTTCC---cgtacccagatttttataataaaaatgacaaagttt
gi|16 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctacatgatagaaattactttttttcttttaggagaaatcat-T---TT-T------------------AT---T--T------T-A-----AA--AT--GA--C-------G--TT--TTTTTTT---C--T-----C---CTGGAGAAT---T--TG---AAC-C--T-AGAAT--T-------------GCATA---TGATAAA-G-T----A-ttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|19 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggtacgagttctcccggttaaaaaaaaaacttttgt---T--TG---AAT-A-----AA--ATT-GA--CGAA---AA--TT--T-----T---T--------------------C---T--CG---TAC-C--T-ATA-TTTT----------------TATA---ATAAA-T-T----T-GACACATTTTTTTTCTCC---GGGAGAA------------------------------GTGTAGGAAAAGGCC--GCCTT-GTTCGCGAAG--GAGTGacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|20 : A--C-AA---AG--TT--T-----TT--C--T-----C---CAGGAGAAC---T--CG---TAC-C--C-AG-----------------------ATACTGAT-GG-G-T----ACGACT---------TCTCCA--GG-AGAA----C--ttccaagacaataagtagacctgaattcttgataaaaaaaaaaagacatgtattagcagacgatcagtttttgttacctgagat
gi|22 : attgctcaaagaaactgtaagaGAGAAT---T--CG---TAC-C--C-AGATTTCT-------------A-----GTTGATAAA---T------GACGAGTTTTT--TCTCCG--GG-AGAA------------------T-TCGTAT-CCAGatgtatcctattttctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|7 : ttatcataaaaat----------T-TCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCT-T-GTT-GCG-AC--AATTGAGA
gi|15 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcT-CCAGTATAGGAAAAGG-CACTCT-T-GTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGAC-AATGAGACT-A----ATT-ATTAA-AACA---TTTCTGA-GTAGGACG-AGT-TTTGTTATCTT--GAA-AATC--T-GTA-T--A---CAGTATAGAAAA-GTAAAAT-----GTTTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTTAAATATTGTATA--TATGCGTTAA------------------GGTC--TGCTGCA-TATA---------C-T---ACT--ATTGA--TGA-TGTGATATAC-GTTTTA-TAA--ATGGC-GA-TTAACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCTcccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|4 : --T-GTT-GCG-AGCGGAGTGAAATGGACAAATAAGACAAT----ATT-ATGAACAA-ACATTTT-TGAGGCAGGACG-AGTTTTTGTAATCCTGAG-A-AATCAGG-ATGCTCCACAGTAGTATGA-AAA-GTAAAGTGTATGA--TA--TTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACT----TCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGG-TCGAGGCTGCATTACATAAAGCTA-CGT---ACT--ATTGATTTGAGTGTGA-A-AC-GTTTTA-C-ATAATGG-TGATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-TAAAA-TGGCGATTGTATGCGG--TCATTTAAATTAATTTTATC--TCGAAC-GGTAA------CATATT-GGTCA-ACGC------AGA--AACAA-----------AAA--------TA-TCGC-----GTTT--C-TTATACCCAGTGTCCTTTGAG-A-----AT--T-T--TAATAA-TG-------AAG--T----GTGAAcactgcagaa
gi|6 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgctTACAC-GTTAC--CTTTAAAGAC-TGAA-CA--AGC--TCT-AGCTGCATTATA----GCTA-C-TCGCACT---TTGA--TGAT-G-GA-A-ACCGTTTTAACAA--ATGG-TGA-TTAGCT--ACAGAAA--TGGA---TG-GGGT----CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGA---TGTGCGG--TCATTAA----T-TTTTATC--TCGAACGG-TAAAA----TAT-TG-GTCCA-CGGCGCCAGAAGA--AAC-A-----------AAA--------ATATC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG-GTCTTTA-GG-AT-T-TATAATGTCCTA--AA-TGTTG-CA-AAG--TT---GTAAAT---GGATAT---------CA-ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCGTCTA----TTTTCATAT-AA-AAG-GTG-----CTT---AC--TCAAAGCAGT----G--CATTATA-TT---TTTGA---A-A----TCGTTTTTTGAAG---TACTGGGT----TTAAAAAAAAT----TCCACAAT--C-T-TT-TA--T-AAGATA-----T-A-ATCTTATTGG----T-GTTACTATAA-CATGTATATATATTATT-G----GTACACGTTGTACTTA---CACATGTA-CA--AACA-T-TCCCAATCT-GACTTAAAAATA-CAAATC-TCT-TT-A---TAA-GCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCC-TGTACG-TTCACCAAA--CATG-AAAAAT--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGTA-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACG---acaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|9 : taattcaGGGAT--G-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGGTT-----G---------TAATC-TCGAACGGTCAAAATTTGTAT-TTTGGTCAGCTGC------AGAGAAAC-ACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTT-TC-CTACACACTT--CTTGAG---CC-TGACCTTT-AGCATCTGTAA---GTC-TA--AACTGT-G-TATGAG--CTTAGGTAAACATATAGTATACTTGGGT-CAGATGT-AGTT-CT-TCCACGTATTTTGCGATC--CTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTGCTTTCTTCACACAGTCCA-CCCTA----TTTCATT-TA-CTAGGTT--ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AAGTCATGC-GGGTAGCTT-GAAAAAAA----AACAAC-ATAAT-CTTT-TA--G-AAGATATATGGTGA-AGA-TAT-GGCATAT-CTTG---TA----------TAT----TTTG----GTACACGTGGTA-------CACG-GTACCA--AACA-T-TCC--AATCTGACTC-AAAAT-ACAAAT-CTCTCTTAA---TAAAtctcggacggaaaaccggctgg
gi|10 : GTGTCCTTT-AG-AT-T-TATAATGTC-TA--AA-TGT-G-TA-A-G--T----GTAAAT----GGTAT------AT-CA-ATGT-AGTT-TT-TC---GTATTTTC-G-TC--CTA----TCAT-ATAA-AA-AA--GTTA----CTT---AC--TCAA-GT-------A--CATTATA-TT---TTT-A---ACA----T-GTTTG---AAG--ATA--GGGT----T-AAAAAGAAT----TCAACACTGAA-C-TGGTA--G-AAGGTA-----TAATACCTTAT-GG----TTGTTG---TAAGT-------TATATTATTTTTTTGGTAC-CGT-GTAC------ACTAAGTA-CA--A-CA-T-TCC--ACACTGA-TTACAAATA-CAAATC-TCTCTT-AATACACAGCG-CACA---GCGC--AGAT-AGAA---GAACAT-GTGG--C-TGTACGGT-CAC-AAA--CATG-AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGCAA-CGAT-CATAAC--ATTT-CTT---AC-GTC--AATTT-T-T-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACG---TCGAAACagacaggca
gi|11 : T--TA--GA-TGT-G-TA-A-G--T----GTAAAT--------------------------AGTT-CT-TA---GT-CTTTTCG-TC--CTA----TCAT-ATAA-AA-A-----TATTGC-TA---AA--TCGA-GT-------G--CAT-ATA-CT---TT-------------------T---AA------CTGGGC----T-AAAAATATTTTCATCA----TAAT-C-TT-GA--TTAAGATA-----T---AT----T-GG----T-TTTG---TA---------------TATTTGG---ATACAAG--GTAC------CA-----A-C-----CT-T-CCC--AATCTGATT-------AACA----------T-A---TACAACG-CACC---ACAC--AGAC-AGAA--AGAACAT-GTG---CCTGTACG-T-CAT-AAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CAT-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATG---TCGGAA-ACGCTGGCgttgcagcgaaa
gi|4 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacgtA--AA-TGT-GGTA-AAAGCT----GTAAAT-----ATATAT----ATTCA-ATGT-AGTT-CT-TC---GTA--TTTTG-TC--CTA----TCA-TATAATAATAAA-GTagcgaaa
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagTGG---GTACACGT-GTACACGGTACACG-GTA-CA--AACAATATCC--AAATCGA-TTAAAAATAACAAGATCGCACTT-A---TAAAGCGACACA---GCGC--AGAG-AGAG--AAGACAT-GTG---CCTGTACG-T-CAC-AAAAACATGTAAAAATT-AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACAT--TCAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTGA-ATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACG---TCGGAAAAC-CTGgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|27 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACG---TCGGAA-ACGCTGGC
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|26 ): CTATTTTCTGGGTACCCAGTTTTCTCCTGGGTACGAGTTTCCTGGATAACTAAATG
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1111 1 11 111 11111 11111 2222222222 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111111111 222222222 33333 2222222222222222222222222 111 11111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222 2222222 11 22 22 22 1 22 1 11111 1 1 11111 1 1111 1 1 1111 1 444444 2 22222222 1 11111 11 3333333333333333333333333 222 111 111111 11 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 555555555555555555 222 1111111 1 555555555555555555555555555555 111 1111111 11111 111 11 222222 11111111 111111 2222222 222 11 1111111111 1 1 2222222 333333333333 2222 7777777777777777777 4444444444444 33333 3333333333333 1 111 222222 11111 111 111 222222222222222222 22222 1111 222222222 1 111 11 1 2222222222222 111111 1 111111 22222 222222 1111 1 11111 222222222222222222222 1 222222 33333333333333333333333333333333333 111111 2222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 11 1111 2 111 222 11 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 5555 0 22 6 33 8 000 00000 5 44444 3 4 66 55 0 666 1111111111 3 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 555 555 3 3 999 3 4444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 6 3 1111 3 3 1111111111111 0 666 77 3 44 555 555 3 222222222 666666 44 6 4444 3 3 0 6666 33 555 2 77777 2 5 555 666666 6666666666666666666666666 2 2 33 222 5 888888888888 4444 5 66 2 22222 0 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 3 6666 44 6 3 3333333 3 55 1111111 4 4 88 66 8 22 0 7 44 6 22 2 3 3 2 0 33 0 88888 3 2 0 3 88888 0 2 7777 3 0 0 4444 0 333333 0 77777777 0 77777 3 33 0000000000000000000000000 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 33 44444 666666666666666666 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 999999999999999999 1 77 11 33 888 3333333 888 5 3 111111111111111111111111111111 000 8888888 999999 4 4 77777 888 55 4 555555 8 66666666 4 4 8 4 222222 4 9999 3333333 9999 000 777 22 4 99 9999999999 1 3 9 0 0 8888888 4 4 3 3 444444444444 3 77777 6 777777 555 2 2 66 88888888 3 0000 3 3 44 2 3 0 3 5555555555555555555 1 9999999999999 33333 8 8888888888888 6 0 0 5 5 77 1 2 3 3 1 111 88 99 222222 1 55555 111 6 6 111 7 6 0 8 666666666666666666 8 8 0 0 3 77777 0 1 7777 8 8 222222222 2 8 444 4 5 0 5 77 00 2 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 666666 5 6 99 77 66 5 00000 66 888888 88 1 5555 1 77 4 44444 5 5 77 5 777777777777777777777 1 444444 77 55555555555555555555555555555555555 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 4 4 777777777 9999999999999999999999999999999 5 5 5 888 66666 5 0000 44 6 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 8 66 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 5 777 5 5 5 5 5 77 5 33 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . .... . .. . .. . ... ..... . ..... . . .. .. . ... .......... . ........................................................... . ... ... . . ... . .................................................... . . . .... . . ............. . ... .. . .. ... ... . ......... ...... .. . .... . . . .... .. ... . ..... . . ... ...... ......................... . . .. ... . ............ .... . .. . ..... . . ................................................................ . . .... .. . . ....... . .. ....... . . .. .. . .. . . .. . .. . . . . . .. . ..... . . . . ..... . . .... . . . .... . ...... . ........ . ..... . .. ......................... . . ... . ... . ...... .. . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . .. .. .. ... ....... ... . . .............................. ... ....... ...... . . ..... ... .. . ...... . ........ . . . . ...... . .... ....... .... ... ... .. . .. .......... . . . . . ....... . . . . ............ . ..... . ...... ... . . .. ........ . .... . . .. . . . . ................... . ............. ..... . ............. . . . . . .. . . . . . ... .. .. ...... . ..... ... . . ... . . . . .................. . . . . . ..... . . .... . . ......... . . ... . . . . .. .. . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . ...... . . .. .. .. . ..... .. ...... .. . .... . .. . ..... . . .. . ..................... . ...... .. ................................... .. . ...... .. . . .... ............. . . . . . ......... ............................... . . . ... ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . . ... . . . . . .. . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 2222 0 00 5 88 0 777 11111 7 33333 9 5 11 55 7 444 9999999999 6 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 6 888 888 3 3 222 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 2 1 9999 1 1 4444444444444 7 444 33 1 22 888 444 1 222222222 888888 22 2 2222 3 7 8 5555 55 000 9 55555 9 7 000 000000 2222222222222222222222222 9 9 99 999 7 888888888888 4444 7 88 7 44444 7 9 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 1 3333 22 2 1 8888888 6 00 9999999 0 0 55 22 0 22 8 3 33 7 77 5 2 2 2 0 88 0 55555 2 8 0 2 55555 0 0 8888 2 0 0 8888 0 555555 0 22222222 5 88888 2 88 0000000000000000000000000 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 66 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 222222222222222222 4 99 77 11 111 7777777 888 0 5 999999999999999999999999999999 000 6666666 222222 4 4 99999 444 33 4 444444 9 11111111 4 4 4 4 888888 4 4444 7777777 4444 000 888 33 4 66 6666666666 0 2 1 1 0 7777777 4 4 6 3 222222222222 1 77777 2 777777 000 9 9 88 00000000 1 9999 1 1 22 9 1 8 1 9999999999999999999 0 3333333333333 33333 9 5555555555555 7 8 7 7 7 99 4 5 2 5 7 777 33 22 555555 0 22222 777 7 7 777 3 7 8 0 222222222222222222 0 0 8 8 8 66666 6 4 0000 0 0 888888888 5 0 999 9 7 1 0 99 00 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 000000 7 7 22 99 99 0 44444 99 888888 22 7 0000 4 99 3 33333 7 0 99 7 000000000000000000000 4 333333 99 77777777777777777777777777777777777 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 4 4 222222222 2222222222222222222222222222222 0 0 0 888 99999 0 6666 66 2 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 8 99 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 7 111 7 7 7 7 7 99 7 66 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-G-AAAA-AANNTGTCAA--TTT-TATNA-AT---A-AA-AT-----CTGNGT--ACG--AGTT---C----T-----GGA-GAANN--ACTTT--GT-C------AA-T-T--T------ATC--AA-TA--AA--T-CN---GG-GTA---CGA---GTTC-TCC-TGG---A-AAA-----AA--AA-AC-AT-TGT-C---CTTTN--T---TTCT-TTTT------ATCA-A-T----A-AAA-TCTGG---GTA---TA-CGA-GTT--C-TCCT--GG--AGAA---A-A--TTTG--CTT-AG--TC--A-TTTCTGCCAT-GAAGATA----TC-TG---GGTACGA---G-TTC-TCCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-CG----T-C-A-AT-T-TTATC--ATA--AAAA-TCT------G-----G--G-TA-CGAG--TTC-T-CC--GGAG-AAA------T--T------------A--C----TCA-------A--------AT----AG--A----AT-CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TGAA--A-GA-A--AAAA-AA-TNTGTC-A-TTTC-TATCA-TATTTC-TGAGGAAAAAACCGTTGT-CTGCTGGAA-TCAAAATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAAT-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGC-TTA-A--TTAT-CTT--C--TAC-AAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAA-TC--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT--GCA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTAC-AGTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCT--TCT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC-AA-----AAA------AGATTT--TTCACCGGGAA-NAC---T--CGT---ACCC-AGGNTTT-AT-A----G-AA----A------CGA--GAA---AGTT-------TTTGTT--TTCT-C-TCCAG---T-AGAACTCG-GTACCCAN-A-TT---T-NA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCC-TTT--C-C---A---GAA-TT-CG-TA--C---C---ACATTTCTACATGTACTT-ATAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAAT-CTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAG-----ATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA--TT----G---AC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGG-AGAACTCGTA-CCCAGATTTTTA----TA-----TTGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-----GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGACAAATGAGACTA---A-TA--TTA---AT-AACA----TTT---TTGAG-CAGGACG-A---GTTTT-GTAATCCTG-AG-AATCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----AC-TGCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGG-TCTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGG-CGATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AACGGTTAAAA----T----A-TT--GGTCA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TNTC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACATT-CCCAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGT-GC--C-TGTAC-G-T-CA-CAAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-G-AAAA-AANNTGTCAA--TTT-TATCA-AT---A-AA-AT-----CTGGGT--ACG--AGTT---C----T-----GGA-GAANN--ACTTT--GT-C------AA-T-T--T------ATC--AA-TA--AA--T-CT---GG-GTA---CGA---GTTC-TCC-TGG---A-AAA-----AA--AA-AC-AT-TGT-C---TTTTT--T---TTCT-TTTT------ATCA-A-T----A-AAA-TCTGG---GTA---TA-CGA-GNT--C-TCCT--GG--AGAA---A-A--TTTG--CTT-AG--TC--A-TTTCTGTCAT-GAAGATA----TC-TG---GGTAC-----G-TTC-TCCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-CG----T-C-A-AT-T-TTATC--ATA--AAAA-TCT------G-----G--G-TA-CGAG--TTC-T-CC--GGAG-AAA------T--T------------A--C----TCA-------A--------AT----AG--A----AT-CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TAAA--A-GA-A--AAAA-AA-TNTGTC-A-TTTCATATCA-TATTTC-TGAGAAAAAAACCGTTGTGNTGCTGGAATTCAAAATTTTGACACGAGTTAATTT-GATT--AAAAT-TTA--T--CATAAGAAT-TTCGAT---A-AT-CTCG--AACATGATAATTT-AGC-TTA-A--TTAT-CTT--C--TAC-AAA--TACA--ATGTATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAA-TC--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT--GCA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTAC-NGTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCT--TCT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--------AAA------AGATTT--TTCNCCGGGAG-AAC---T--CGT---ACCC-AGGATTT-AT-A----G-AA----A------CG---GAA---AGTT-------TTTGTT--TTCT-C-TCCAG---G-AGAACTCG-GTACCCAG-A-TT---T-TA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCC-TTT--C-C---A---GAA-CT-CG-TA--C---C---ANATTTCTACATGTACTTAATAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAAT-CTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAG-----ATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA--TT----G---AC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGG-AGAACTCGTA-CCCAGATTTTTA-ATATA-----TTGATAAAATNGACG-----------TTCTCC-----GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGACAAATGAGACTA---A-TA--TTA---ATNAANA----NTT---TTGAG-CAGGACG-A---GTTTT-GTAATCCTG-A--AATCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----AC-TGCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGG-TCTNG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGG-TGATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AACGGNTAAAA----T----A-TTN-GGTCA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TTTC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACATT-CCCAANCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGT-G---C-TGTAC-G-T-CA-CAAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : GGGT--AAG--AGTT---CCTCCT-----GGAAGAAAA--TCGTT--GTTC------CA-T-T--TTTTATAATC--AA--A--AA--T-CA---GGAGTAATCCGA---GTTT-TCC-TGG---A-AGA-----AA--AA-A--ATGTGT-C---------------AAT-TTGT------ATAA-A-TGAC-A-GAA-TCTGT---GTA---CAGCAA--------TCTT--GG-----A---A-A--TT----CTT-TA--TCTAA-TTTCAATCAA-ATAAACA----TCAGG---GGCACGA---G-TTCTTCCTGG---ACT-AA-AAAA--CT------T-CG----TAC-C-GT-T-TT-TC--A-A--AAAA--CT------G-----G--GATACCAAG--TTC-T-TC--TGAG-GAAAATTTGT--T------------AGTT----TCATTTCTGCC--------AT----AG--AAGATAT-CTGG-G--A-CGA--GTTCTTCC-T-----G-GA-C--AAGG-AA---TGTCAA-TTTCA-ATCA-AAATTC-TGAG
gi|1 : aatatcagAGTTT-TCCTGGAA-GAAAAA-AATGTGTCAA--TTTGTATAA-ATGACA-GA-AT-----CTGTGT--ACAGCAATC---T----T-----GGA--AATT---CTTT--AT-CT-----AA-T-T--TCA----ATCA-AA-TA--AA--C-ATCAGGG-GCA---CGA---GTTCTTCC-TGG---A-CTA-----AA--AA-AC-TT-CGTAC---CGTTT--T-------------------TCA-A------A-AAA--CTGG---G-A---TACCAA-GTT--C-TTCT--GA--GGAA---A-A--TTTG---TT-AGTTTC--A-TTTCTGCCATAGAAGATA----TC-TG---GG-ACGA---G-TTCTTCCTGG---ACA-AG-GAA-------------TG----T-C-A-AT-T-TCA----ATC--AAAATTCT------G-----A--G-T--CACA--TTC-C-CC--GG-G-AAA------T--T------------A--T----CCA-------A--------AT----AGACA----AT-CTGGTA-TA-TGA--TTCT-TCC-TGAA--ACGA-A--AAAA-------GTC-A-TTTC-TATCACTATTTC-TGAG--AAAAACCG-TGT-ATGCTGGAA-TCAAAATTTGGACACGAG-TAATCT-GATTA-AAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--A--ATGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAA---------TGGTTTTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TTGGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAAATG--AAA------AGA-TT--TTCACTGGGAATCAC---G--TGT---ACCC-AGTTTTTCAT-G----GAAA----A------CGA--GAA---AG-T-------TTTG-T--TTCT-CTTCCAGTTAG-A-AACTC--GTACCCGC-A-AT---T-TA-TACATTAAGTAG-A-TAGA----AC-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTT--T-C---A---GAATTT-CA-AAC-C---C---AGA-TTCTACATGTACTT-AT-A-ACTGAACAG-AAAAAAACAT-CTCACAGATACTC-GT------------ACCACAG-----ATTT-TA----T-G---A-A-TAAA--TT----G---AC-AAATT--TTT-T-CT--CCAGG-A-AACT-GCACCCCAGATTT-------TA-----TTGATAAAATTGACG-----------TCTTCCG----GG-AGAACGAC----------TTCACCT-CCA--GTAGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-GAAAT-GATCAATGAAACTAATTA-TA--TTA---ATAGACA----TTT---TTGAG-CAGGACG-A---G-TTT-GTAATCCTG-AG-AATCGTG--TG-TA--CAGTA-TA-GAAAAGT-AAATTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------A---TTAACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-G-AACA--AGGGTTCTAG-CTGCA-----TATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--C---AATGG-TGATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGG-T---CTG--CA------ACT-AAAATCGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCGAAACGGT---AA----T----A-TT--GGTCA-CTGC------A-A--AAC-A-----------AAA--------ATAT-C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--G-CGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACATT-CCCAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGT-GC--C-TGT-C-G-TCCA-CAAA--CATG-AAAAATAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT--GGTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTATTTT-----CG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-AA--GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACATT-CC--ACACTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTGG---C-TGTACGG-T-CA-CAAA--CATG--AAAAT--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT------------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACCTT-CCCAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGT-GC--C-TGTAC-G-T-CA-TAAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCT--TCT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--------AAATGAAAAAGATTT--T-CACTGGGAA-TAC---T--TGT---ACCC-AGGTTTTTATGA----G-AA----AA-----CGA--GAA---AGTT-------TT-GTT--TTCT-C-TCCAG---T-AGAACTCG--TACCCAC-A-TT---T--A-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCT-TTT--T-C---A---GAA-TT-CA-TAC-C---C---ACATTTCTACATGTACTTTATAA-ACTG---ACATAAAAAAAAT-CTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAA-----ATTT-TA-T--T-G---A-TAAAAA--TT----G---AC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCAGG-AGAAGTCGCA-CCAAG------------------------AAATTGACG------------TCTCCG----GG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : C-T-CCT-GGAC-AAA----------------------A--C------A-------A--------AT----AG--AG---AT-TTGG-A-TT-CGA--GTTC-T---------G-GA-G--AAAA-AC-TTTGTC-A-TT---TATCA-
gi|13 : taA-AT---A-GAGAT-----TTGGAT--TCG--AGTT---C----T-----GGA-GAAAA--ACTTT--GT-C-------A-T-T--T------ATCAAAA-TA--GA--T--G---GG-GTA---CGA---GCTC-TCC-CAGT--A-AAG-----AAATAA-ACTATATGT-C-----------------------AGAGGAATTG-G-T----A-CGA-TCTAC---ATA---CA-CCA---T--C-T-CT--GGACAGAA---A-G----------T-AG--CC--A-TTTCTGTCAT-TAAA--A----TC-TGAGTGGTACA----G-T------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-TG----T-C----T-T-TTATCAAATAG-AAAA-CAT------GATCGTG--A-TACCGAG--TTC-TCCC--GGCG-AAA----------------------A-------TCA-------A--------A-------------------GG-G-TA-TTA--TTTCATTC-TCAA--A-Gaaatagatggggtacgagctctcccagtaaagaaataaactatatgtcagaggaattggtacgatctacatacaccatctctggacagaaagtagccatttctgtcattaaaatctgagtggtacagttggagagagagaaacaaaaactttgtcttttatcaaatagaaaacatgatcgtgataccgagttctcccggcgaaaatcaaagggtattatttcattctcaaag
gi|14 : tactcctggacaaaacaTTT--G---TCCG-TTTT------ATCA-A-T----A-AAA-TCTGT---GTA---TA-CGA-GTT--C-TCCT-------GAA---A-AT-TTTG--TTTCAG--TC--A-TTTCTGCAAT-GAAGATA----TC-TG---GGTACTA---G-TTC-TCCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T--GTATTT-C-A-AT-T-CATTC--ATG--CAAT-TCTGCGGGAG-----G--G-TA-CGAG--TT-----------A-AAA------T--T------------A-------TCA-------A--------AG----AGA-A----ATGCTGG-GTTACCGAGTGTTC-TCCTTAAA--A-GA-A--AAAA-AA--AAGTC-ATTTTCCTATCA--ATTTC-TGGCGAAGAAGCTG
gi|15 : aacT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGAC-AATGAGACTA---ATTA--TTA---A--AACA----TTT---CTGAG-TAGGACG-A---GTTTT-GTTATCTTGAA--AATCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATAC-TGCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GG-TCT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGG-CGATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCT-agaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : AAA-ACTC-GC------------ACA-CGGTCTTCATTTCTATC--T-G---G-T-AAAA--TT--------AC-AAA-GTTTTT-T-CT--CC----GGAATTCGTA-CCC----TCATA-ACAT------TTGACATAGTGG-C------------TTCTCTA----GA-AGAAcactgcagaa
gi|16 : cgctTT---C----T-----AGA-GAAGCC-ACTAT--GT-C------AAATGT--T------ATG--A-----------------GG-GTA---CGA---ATTC-C-----G---G-AGA-----AA--AA-AC---------------TT--T---GTAA-TTTT------ACCAGA-T----AGAAA-TGAAGACCGTG---TG-CGA-GTT--T-TCCC--GG--ATAA----------CG--GTT-AG-------------GT-AC-GA---------------------------G-TTC-TCCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-TG----T-T---AC-T-TTATC--ATATGCAAT-TCT------A-----G--G-TT-CAAA--TTC-T-CCA-GGAG-AAA------cccggataacggttaggtacgagttctcccggttaaaaaaaaaacttttgttactttatcatatgcaattctaggttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcTTCCGGAG-A-AAAA-ACTTTGT-AA--TTT-TACCAGAT---AGAA-ATGAAGACCGTGT--GCG--AGTTTTCC----C-----GGA-TAACG---------GT-T------A--------------------------------------G-GTA---CGA---GTTC-TCC-CGGTTAA-AAA-----AA--AA-A---------C---TTTTG--T---TAC---TTT------ATCATA-T----G-CAATTCTAG---GT----T--CAA-ATT--C-TCCA--GG--AGAA---A-A--aaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaaGT---ACTC-TGGGTTT-TT-ATTTTA-AA----A------TG-----A---CGTT-------TTT-----TTTT-C-TCCTG---G-AGAATTTG-A-ACCTAG-AATT---G-CA-TAT--------G-A-TA-AAGTAAC-AA------A--AG----TTTTT--TT---TTTAAC-CGGGA---GAA-CT-CG-TA--C---C---aaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTT-GCA-----AACAAAA------ATCAA--TTAC-AGTCTACATcataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : T-AG--TC--A-TTTCTGCCAT-GAAGATAATTATC-TG---GGTACGA---G-TTG-TCCTGG---GCA-AG-G-AA--C-------T--G----T-C-A-AT-T-TCATC--ATA--AAAT-TCT------G-----G--G-TA-CGAG--TTC-TCCC--GGAGAAAA------T--T------------A-------TCA-------A--------AT----AG--A----A----------A-TGA--TTTC-TCC-TAAA--A-GA-A--AAAA-A-----GTA-A-TTTC-TATCA-TGTgatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctT--CTCT-C-TCC-G---G-AGAACTCG--TACACAA-A-TT---T--A-TAC--------G-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGT-TTT--C-CCCAA---GA---T-AA-TATTC---C---ACATTTCCACATGTACTTTATAA-ACTG---ACAAAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAG-----ATTT-T-TG--T-A---A-T-AAAA--TC----A---AC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCGGG-AGAACTCGTA-CCCAGATTTTTA------------TAATAAAAATGAC
gi|19 : T--T-G---AAT-AAAA--TT----G---ACGAAA-A--TTT-T-T-------------CTCGTA-CCTATATTTTTA------------TAATAAATTTGACACATTTTTT---TTCTCC-----GGGAGAA-------------------------GTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-G-AAAA-AAAATGTTAAGCTTT-TATAA-AT---A-AA-AT-----CTGTGT--ACA--AATT---C----T-----GGA-GAATT--ACTTT--AT-C------AA-T-T--C------ATC--AA-TA--CA--T-CA---GG-GCA---CGA---GTTC-TCCATGG---ATAAA-----AA--AA-ACGAT-TGT-CCT-TTTTT--T---TTCT-TTTT------ATCA-A-T----A-AAA-TCTGG---ATA---TA-CGA-GATGGCATCCT--GG---GAA---A-A--TTTG--CTT-AG--TC--A-TTTCTGCCAT-GAAGATA----TC-TG---GGTAC-----A-TTC-TCCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-GG----T-C-A-AT-T-TCATC--ATA--AAAACTCT------G-----A--G-TA-CGAG--TTC-T--C--GGAG-AAA------T--T------------A--C----TCA-------A--------AT----AG--A----AT-CTGG-G-TA-TGA--GTTC-TCC-TAAA--A-GA-A--AAAA-AA-TAAGTC-A-TTTCATATCA-TATTTCTTGAGAAAAAAACCGTTGT-CTGCTGGAATTCAAAATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAAT-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGC-TTA-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAA-TC--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT--GC------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTAC-TGTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCT--TCT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC--------AAA------AGATTT--GTCACTGGGAA-TAC---T--TGT---ACCCAAGGGTTT-AT-A----G-AA----A------CG---GAA---AGTT-------TTTGTT--TTCTGC-TCCAG---T-AGAACTCG-GTACCCAC-A-TT---T-TACTAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCC-TTT--T-C---A---GAA-TT-CA-TA--C---C---ACATTTCTACATGTACTTAGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAAT-CTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAG-----ATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA--TT----G---AC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGG-ACAACTCGCA-CCCAGAGTTCTGCATATA-----TTGATAAAATAGACG------------TCTCC-----GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGACAAATGAGACTA---A--A--TTA---ATTAAAA----ATT---TTGAC-CAGGACGCA---G-TTT-GTAATCCTG-A--ACTCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----AC-TGCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGG-ATCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGA---TGTGC-AGGTTCAT-----TCGCATTTTATTCATCG-AACGGGT--AA----T----A-TTG-GGTCA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TTTC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGG-TATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACATC-CC--ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GT-G---C-TGTAC-G-T-CA-TAAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCttccaagacaataagtagacctgaattcttgataaaaaaaaaaagacatgtattagcagacgatcagtttttgttacctgagat
gi|20 : -TACCC-AG---A-AA-AT-----A-GGAT--ACA--TGTT---C----TCCT--GGA-GAAG------TC--GT---------A-C-C--C------ATC--AG-TA------T-CT---GG-GTA---CGA---GTTC-TCC-TGG------AG-----AA--AA-AC-TT-TGT-T---CTTACAGT---TTCT-TTgc
gi|20 : attgctcG--ATTT---C----T-----GGA-GAACT----CTT--AC-CCAGGAGAA-C-TCGT------ACC--CA-GA--AA--A-TA---GG-ATA---CAT---GTTC-TCC-TGG---A-GAA-------------------GT-C---GTACC--C------------------ATCA-G-T----A-----TCTGG---GTA------CGA-GTT--C-TCCT--GG--AGAA---A-AACTTTGTTCTT-A----C--AGTTTCTcgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|20 : attgctcaa---AC-AAA-G--TTT-TTCT--CCAGG-AGAACTCGTA-CCCAG----------ATA-----CTGATGGGTACGAC------------TTCTCCA----GG-AGAAC--cgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagaAGAAAAGAAA------C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAA-----ACC---ATT--C-G---G------A--TTTCTGG---A--GAA-C--TCT-T-AC--CCAGG-AGAACTCGTA-CCCAGA-----A-A------------ATAGGATACATG-----------TTCTCCT----GG-AGAAatgtatcctattttctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacA-TCG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT--GCA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtAGA-ATTC-GT------------ACC-CAG-----ATTTCTAGT--T-G---A-T-AAA----T----G---AC--GA-GTTTTT-T-CT--CCGGG-AGAATTCGTA-TCCAGATTTTTA------------TGATAAttagtggtaagtct
gi|23 : AT-TG-TAAT-CA-AT--GCA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA--AGTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCT--TCT--ATAc
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAG-----ATTT-TAATGAT-ACATA-T-AAAA--TT----G---AC-AAC-A--TTT-A-CT--CCTGG-ACAACTTGTA-C
gi|26 : ATTTAGTTATCCAGGA--AAC---T--CGT---ACCC-AGGA
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCg
gi|28 : -------T-CG----T-C-A-AT-T-TTATG--ATA--AAAA-CCT------A-----G--G-TA-CAAG--TTC-TCCC--GGAagcgaaagg
gi|29 : tG---GGCAC-----A-TTC-TCCTGG---AGA-Aa
gi|3 : ATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAAT-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGC-TTA-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT--GCA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTAC-AGTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCT--TCTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG--------------------------TT--TTCACTAGGAA-TAC---T--TGT---ACCC-AGG-TTT-AT-ATGACA-AA----A------CGA--GAA---AGTT-------TT-GTT--TTCT-C-TCCAA---TTAGAACTCG--TACCCAC-A-TT---T-AAATAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCC-TTT--TTC---A---GAA-TT-CA-TA--C---CC--ACATTTCTACATATACTTTATAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAAT-CTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAG-----ATTT-TATT----G---A-T-AAAAA-TT----G---AC-ATC-G--TTT-T-TTTTCCAGG-AGAACTCGCA-CCCATATTTT-------A-----TTGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-----GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTGAAATGGACAA------TTA---A-TA--TTA---A--AACA----TTT---TTGAG-CAGGACG-A---GTTTT-GTAATCC-G-A------G-A--TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----AC-TGCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGG-TCT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGG-TGATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACT-AAAATGG-GA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AACGGT--AAA----T----A-TT--GGTCA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TAT--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--G-T---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACATT-CCCAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGT-GC--C-TGTAC-G-T-CA-CAAA--CATG-AAAAAT--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcactttctgggcacaagtttccct
gi|4 : TT--TTCA-T-TCCAG---T-AGAACTCGTGTACCCAACA-TTGAAT-GA-TAC--------G-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTT-TTT--C-CC--A---GAA-TTTCGATA--C---CCACACATTTCTACATGTACTT-ATAACACTGA-CAG---AAAAAAAT-CTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAG-----ATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA--Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTGAAATGGACAAATAAGAC-A---A-TA--TTATGAACAAACA----TTT---TTGAGGCAGGACG-A---GTTTTTGTAATCCTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----AC-TGAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGG-TCGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGG-TGATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-T-AAAATGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTAAATTA-ATTTTATC--TCG-AACGG-TAACA----T----A-TT--GGTCA-ACGC------AGA--AACAA-----------AAA--------TATCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--A-TAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCCAAATC-GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGT-G---CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT-AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgA---CAA---GTTC-TC--TGG---A-AAATTAGTNN--NN-NN-NN-NNN-N---NNNNN--N---NNNN-NNNG------GTGC-A-T----C-AAA-TCAGA---GTT---TA-CGA-GTT--C-TCCTGAGA--AGAA---ATA--TTT--------G--TT--A-TTT---------AAAAT-----TC-AG---AGTACAACTAG-TTC-TCCTGG---A-A-AG-AAAA--CAAA----T-TG----T-C-A-AT-T-TTATA--AT---AAAA-TCT------G-----T--G-TA-C-AA--TTC-T------GAG-AAA------T--TAACTTTTTATCAA--T----TCATC-----A--------AT----AA--AC---AT-C-AG-G-CA-CGA--GTTC-TCC-T-----G-GATA--AAAA-AC-TTTGTacctg
gi|5 : -AT---C-AA-AT-----CAGAGTTTACG--AGTT---C----TCCTGAGAA-GAAAT--A-TTT--GT-T------A--T-T--T------A--------A--AA--TTCA---GA-GTA---CAACTAGTTC-TCC-TGG---A-AAG-----AA--AACAA-AT-TGT-C----------------AA-TTTT------AT-A-A-T----A-AAA-TCT-----GTG---TA-C-A-ATT--C-T------G--AGAAATTA-A--CTT---TTT-A---TC--A-ATTC-ATCAA-TAA-ACA----TC--A---GGCACGA---G-TTC-TCCTGG---ATA-AA-AAAC--T-------T-TG----T------T-T-CTA----AT----AAA-TCT------G-----GTTA-TA-CGAGA-TTC-T-CC--TG-G-AAATTTGTTT--T------------A--G----TCA-------ATTTCTGGCATGA--AG--AT---AT-CTGG-G-TA-CCA--GTT--TCC-TGGA--A-ttctaataaatctggttatacgagattctcctggaaatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|5 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcTAGT-TCTCCTGGAAAG-AAAACAAATTGTCAA--TTT-TAT-A-AT---A-AA-AT-----CTGTGT--ACA--A-TT---C----T-----G-A-GAAATTAACTTTTTAT-C------AA-T-T--C------ATC--AA-TA--AACAT-C----AG-GCA---CGA---GTTC-TCC-TGG---A-TAA-----AA--AA---------------CTTTG--T---TTCT--------------A-A-T----A-AA--TCTGG---TTA---TA-CGA-GATT-C-TCCT--GG--A------A-A--TTTG--TTTTAG--TC--AATTTCTGGCAT-GAAGATA----TC-TG---GGTACCA---G-TT--TCCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-CG----T-CTA-ATATATCATC--ATT--AACT-CCT------A-----A-----A-CGAGTTTTC-T-CC--GGAG-GAA------T--T------------A-------TCA-------A--------A-----AGT-AC---AT-CTGA-G---------ATTC--CC-TAGAGTA-TA-ATTAAAA-AA-TG-GTC-T-ATTC-TATCA-TAATTT-TGAG-----AACTGTTATGCTA-TGGA--TCAAAATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAATCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGC-TTATAGTTTATACT------TACTAAA--T--T--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAA-TCTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT--GCATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC---TCT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATTAAATATGAAAA------AGATTT--TT-ACCTCGAT--AC---T--TGTGTAACCC-AGG---T-ATGA----G-AA----AGACTACCGAGAGAA---ACTA-------TATATT--TTCA-T-TCCAG---T-AGAACTCGTGTACCCAACA-TTGAAT-GA-TAC--------GAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTT-TTC--C-C---A---GAATTT-CGATA--CCCAC---ACATTTCTACATGTACTT-ATAACACTGA-CAG---AAAAAAAT-CTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAG-----ATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA--taggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC--TCTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGG-TGATTA-GCT--ACAGAAA--T-GGA--TG-GGG-T---CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TAA-TTTTTATC--TCG-AACGG-TAAAA----T----A-TTG-GTCCA-CGGCGCCAGAAGA--AACAA-----------AAA--------TATC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--G-GAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACATT-CCCAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGT-GGCCC-TGTAC-GTT-CACCAAA--CATG-AAAAAT--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC----------------GACAATTGAGACCC---A-CACTCTA---TTTAAAACAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA-ACGTGTTTT-GTATTC
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG--TCTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGG-CGaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--T-----GTA-AT-----C--TCG-AACGGTCAAAATTTGT----ATTTT-GGTCAGCTGCAG----AGA--AAC-A-----------gaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTG-----ATTT-CAGT--CAG---A-T-AAAA--T-----G---AC-AAATG--TTTAT-CT--TCAGG-AGAACTTG-A-CCAAGATTTTTA------------TGATAAAATTAACca
gi|8 : T--ATG--AGTT---CCCC-T-----GAA-GAAAA--GCCTT---T-C------AA-T-T--TT-----ATC--AAATAGAAA--T-CC---GA-GTA---CAA---TTTC-TTC-TGG---A-GAA-------------C-AT-TGT-CAAATTTTA--TCAATTGTGTTGT------GTTA-AGTCCTAA-AAA-TCTGG---GTACGTCA-CGT-GTT--C-TCCT--CA--AGAA---A-A--ATT----TT-AG--TC--A---------AT-A-----A----TC-TG---GTTACGA---G-CTC-TCCTAA---AGA-A---AAA--C-------TATG----T-C-ACCT-T-TTATC--ATA--AAAA-TCT------G-----G--T-TA-GGAG--ATCTT-CC--AAAG-AAA---------T------------A--CATTGTTA-------ATTTT----ATCATAAA--A----AT-CTTG-G-T--CAA--GTTC-TCC-TGAA-----G-A--TAAA-CA-TTTGTC-A-TTTTATaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagA------AAATTT--TTCTTGAGGAG-AACACGTGACGT---ACCC-AG-ATTT-TT-A----G-GACTTAA------CA---CAACACAATTGATAAAATTTGACAATGTT-C-TCCAG---A-AGAAATT--GTACTCGG-A-TT---TCTA-TTT--------G-A-TAAAATTG---AA------A-G-G----CTTTT--C------T--T-C---AGGGGAA-CT-CA-TA--T---A---ATA----TATGGGTA-TGAGTCT-CCTG--GAG-----AAAAAT-CT---------TT-GT-----------------AA-----ATTC-TATC--------A-T-AAAAATCT----GGGTAC-GAG------T-T-CT--CCTGGAAAAAATAATA-CCC--ACTTTTA-TCATAGAAATCTGGTA----TGAC------------TTCTCCTGGAAAG-AAAAC--T----------TTtaatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgact------ATTG-A-T----A-AAA-TTTG-----------A-CAATGTT--C-TCCA--GA--AGAA---A-T--TGTA--CTC-GG------A-TTTCTATT-T-GATAAAA----T--TG---AA-AG-----G-CTT-TTCTTC---AG---G-GGAA--C-------T-CA----------------TATA--AT------A-TAT------G-----G--G-TA-TGAG---TC-T-CCT-GGAG-AAAAATC--T--TTGTAA-------A--T----TCT-------ATC------ATA---AA--A----AT-CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-T-----G-GA-A--AAAATAA-TAC-CC-A-CTTT-TATCA-TAgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaATA----TA-TG---GGTAT-----GAGTC-TCCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-TG----T-A-A-AT-T-CTATC--ATA--AAAA-TCT------G-----G--G-TA-CGAG--TTC-T-CCTGGAAA-AAA------TAAT------------A--C----CCACTTTT--ATC------AT----AGA-A----AT-CT-G-G-TA-TGA--CTTC-TCC-T-----G-GA-A--AGAA-AACTTTGTC-A-TTT--TATCA-gaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--T-----GTA-AT-----C--TCG-AACGGTCAAAA----TTTGTA-TTTTGGTCAGCTGC------AGAGAAAC-ACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--A-TAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACATT-CC--AATCTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 1 111 11 1 1 11111 2222 11111 111 333333 2222222222222 11111111111 999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111111 11111111 222222 11111111 2222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111 11111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2222222 2222222 1111 11111111 11 11 33333333 1 1 1 11 111 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 222222222 22222222 2 1 33 2222222 22222222 111111 1111 11 11111 1111 222222222222222 1 1 444444444444 1111 4444444444 666666666666 2 1 4444444444444 1 1111 11 5555555555555555555555555555555 111 1111111 22222222222222222 3333333 1111 22222 11 1 111 1 2222222222222 111111 1 22222 222222 1111 1 11111 222 111111111 11 1 222222 33333333333333333333333333333333333 111111 2222222222222 1111111 444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 22 1111 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 3 3 555 88 3 0 88888 1 99 3 2222 5 99999 111 5 77 5 5 000000 2222222222222 33 888 888 5 5 66666666666 444444444444444444444444444444444444444444444444444 4 2222222222 3 3 666 44 3 44 88888888 3 222222 99 66666 3 4 0 55555555 3 0 0 888888 2 444 5555 66 666 444 3 2 9999999999999999999999999999999 2 2 0 66 55 8888888888888888888888888888888888 2 2 4 33 2 33333 33 2 33 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 2 4444 33 5 2 4444444 555 3 44 1111111 3 3333 33333333 5 88 1 11 00000000 0 0 2 3 3 0 33 111 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 33 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 222222222222222222 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 555555555555555555 0 2 0 99 6 444 8 8 111111111 99999999 0 0 5 5 1 5 00 5 66 5555555 00000000 5 5 4 1 5 666666 5 2222 99 77777 2222 5 666666666666666 5 5 1 5 1 5 9 3 5 4 4 111111111111 3 3 22 7777 555 333 3 8888 4 5555 4 4 55 2 1 4 4 5555555555 333333333333 0 3 8888888888888 6 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 44 5 5 0 0000000000000000000000000000000 5 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 5 22222222222222222 8 8 0 2222222 0 1 7777 8 8 00000 11 1 2 8 444 4 5 2 77 4 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 77 1 55 5 6 99 77 66 5 00000 66 888888 88 1 5555 1 77 4 44444 5 5 77 5 222 555555555 77 33 5 1 444444 77 55555555555555555555555555555555555 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 8888 1 5555555 999999999999999999999999999999 5 5 5 888 5 00000 5 0000 44 2 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . ... .. . . ..... . .. . .... . ..... ... . .. . . ...... ............. .. ... ... . . ........... ................................................... . .......... . . ... .. . .. ........ . ...... .. ..... . . . ........ . . . ...... . ... .... .. ... ... . . ............................... . . . .. .. .................................. . . . .. . ..... .. . .. .................................................................... . . .... .. . . ....... ... . .. ....... . .... ........ . .. . .. ........ . . . . . . .. ... ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . . .. . ... . . ......... ........ . . . . . . .. . .. ....... ........ . . . . . ...... . .... .. ..... .... . ............... . . . . . . . . . . . ............ . . .. .... ... ... . .... . .... . . .. . . . . .......... ............ . . ............. . . . . . . .. . .... . .. . . . ............................... . ... .. . . ....... . . . . . ................. . . . ....... . . .... . . ..... .. . . . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . .. . .. . . .. .. .. . ..... .. ...... .. . .... . .. . ..... . . .. . ... ......... .. .. . . ...... .. ................................... .. . ...... .. . . .... ............. . . . .... . ....... .............................. . . . ... . ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 3 3 333 33 3 8 55555 0 22 7 1111 7 44444 999 7 11 7 7 000000 1111111111111 77 666 888 0 0 88888888888 000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 0000000000 3 3 333 66 3 66 33333333 6 555555 33 00000 3 6 7 44444444 1 5 7 555555 5 111 8888 00 555 111 6 4 4444444444444444444444444444444 4 4 3 55 66 1111111111111111111111111111111111 4 4 7 22 4 33333 22 5 44 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 9 6666 99 7 9 6666666 000 1 22 9999999 3 3333 22222222 0 99 8 00 55555555 0 0 5 2 2 0 88 000 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 55 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 444444444444444444 6 8 8 00 0 000 0 8 888888888 00000000 8 4 7 7 4 7 00 7 77 6666666 77777777 7 7 3 7 7 444444 7 1111 33 11111 1111 7 777777777777777 7 7 4 7 4 7 4 4 0 4 0 000000000000 6 6 44 5555 888 999 3 5555 0 7777 0 0 55 5 9 4 4 3333333333 222222222222 0 3 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 44 7 7 1 6666666666666666666666666666666 7 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 7 44444444444444444 0 0 8 2222222 6 4 0000 0 0 00000 00 7 5 0 999 9 7 0 99 3 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 99 4 99 7 7 22 99 99 0 44444 99 888888 22 7 0000 4 99 3 33333 7 0 99 7 666 333333333 99 66 7 4 333333 99 55555555555555555555555555555555555 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 9999 9 3333333 222222222222222222222222222222 0 0 0 888 1 88888 0 6666 66 4 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TATAAATAA---A-ATCTGTGTACG--AGTTC----TGGA-GAAAN--ACTTT--GT-C-AA-T-TT------ATC--AA-T--AAA--TCAGG-G-CA---CGAGTTCT-CC-TGG-A-AAA-----AAAAAC-AT-TGTC---CTTTGT---TT--CT-TTTT------ATCA-A-T----A-AAATCTGG---GTA---TA-C-GA-G-TT--C-TCCT--GG------AGAAA-ATTT-GCTT-AGT--C--A-TTTCTGCC--------AT-GAAGATA----TC-TG---GGTACG---AGTTC-T---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-CG----T-C-A-AT-T-TTATC--ATA--AAAA-T-----CT------G-----G------------G-T-A-CGAG--TTC-T-CC--GG--AG-AA--A-----------T--T------------A--C----TCA-------A----AT----AG-A----A-T-CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---A-A--AAAA-AA-TNTGTC-ATTT--C-TATCA-TAT----TTC-TGAGGAAGAAACC--GT-TG---TCTGCTG-GAA-TCAAAATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTT-AT-A----GAAAAC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-AC-ATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGA-TTTT---TA-A-TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AACGGTTAAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--AACAA-----------AAA--------TATC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--GTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AANN-TGTCAA--TTT-TATNAATAA---A-ATCTGNGTACG--AGTTC----TGGA-GAANN--ACTTT--GT-C-AA-T-TT------ATC--AA-T--AAA--TCNGG-G-TA---CGAGTTCT-CC-TGG-A-AAA-----AAAAAC-AT-TGTC---CTTTNT---TT--CT-TTTT------ATCA-A-T----A-AAATCTGG---GTA---TA-C-GA-G-TT--C-TCCT--GG------AGAAA-ATTT-GCTT-AGT--C--A-TTTCTGCC--------AT-GAAGATA----TC-TG---GGTACG---AGTTC-T---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-CG----T-C-A-AT-T-TTATC--ATA--AAAA-T-----CT------G-----G------------G-T-A-CGAG--TTC-T-CC--GG--AG-AA--A-----------T--T------------A--C----TCA-------A----AT----AG-A----A-T-CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---A-A--AAAA-AA-TNTGTC-ATTT--C-TATCA-TAT----TTC-TGAGGAAAAAACC--GT-TG---TCTGCTG-GAA-TCAAAATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-AAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACCGGGAAN-ACTCGT---ACCC-AGGNTTT-AT-A----GAAA-C------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-AN-ATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA-TTTT---TATATTGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AACGGTTAAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TNTC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--GTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : GGGTAAG--AGTTCCTCCTGGAAGAAAA--TCGTT--GTTC-CA-T-TTTTTATAATC--AA----AAA--TCAGGAG-TAATCCGAGTTTT-CC-TGG-A-AGA-----AAAAA--ATGTGTC---A------------AT-TTGT------ATAA-A-TGAC-A-GAATCTGT---GTA---CAGC-AA---------TCTT--GG---------AA-ATT---CTT-TAT--CTAA-TTTCAATC--------AA-ATAAACA----TCAGG---GGCACG---AGTTCTT---CCTGG---ACT-AA-AAAA--CT------T-CG----TAC-C-GT-T-TT-TC--A-A--AAAA-------CT------G-----G------------GAT-ACCAAG--TTC-T-TC--TG--AG-GA--AAATTTG-----T--T------------AGTT----TCATTTCTGCC----AT----AG-AAGATA-T-CTGG-G--A-CGA--GTTCTTCC-TG-------G---A-C--AAGG-AA---TGTCAATTT--C-AATCA-AAA----TTC-TGAG
gi|1 : aatatcagAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTATAAATGACAGA-ATCTGTGTACAGCAATCT----TGGA--AATT---CTTT--AT-CTAA-T-TTCA----ATC--AAAT--AAACATCAGG-GGCA---CGAGTTCTTCC-TGG-A-CTA-----AAAAAC-TT-CGTA---C------------CG-TTTT-------TCA-A------A-AAA-CTGG---G-A---TA-CCAA-G-TT--C-TTCT--GA------GGAAA-ATTT-G-TT-AGTTTC--A-TTTCTGCC--------ATAGAAGATA----TC-TG---GG-ACG---AGTTC-TT--CCTGG---ACA-AG-GAA-------------TG----T-C-A-AT-T-TCA----ATC--AAAA-TT----CT------G-----A------------G-TCA-CA----TTC-C-CC--GG---G-AA--A-----------T--T------------A--T----CCA-------A----AT----AG-ACA--A-T-CTGGTA-TA-TGA--TTCT-TCC-TG---AAACG---A-A--AAAA-------GTC-ATTT--C-TATCACTAT----TTC-TGAG--AAAAACC--GT--G---TATGCTG-GAA-TCAAAATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAA------ATGA----AAAGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTTTCAT-G----GAAAAC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-GC-AAT---TTA-TACATTAAGTAG-A-TAGAA----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTTTC---AGA----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAAAAAACA-TCTCACAGATACTC-GT------------ACCACAGATTT-TAT-----G---A-A-TAAA-TT----GAC-AAA-T--TTT-TTCT--CCAGGA-AACT-GCACCCCAGA-TTTT------ATTGATAAAATTGACG-----------TCTTCC-GGGAGAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAA-CTAA-----TTATATTA---A-TAG----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG-AGAA-TCGTG--TG-TAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--CAA---TGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACT-AAAATCGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCGAAACGGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--AACAA-----------AAA--------TAT--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--GCGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-T--AAG--T----GTAAATG-GTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT-----------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--A------A--ATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTTTATGA----GAAAAC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-AC-ATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--AAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAAATTT-TA-T--T-G---A-TAAAAA-TT----GAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCAGGAGAAGTCGCACCA-AG-------------------AAATTGACG------------TCTCCGGG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : ACAAATAG---AGATTTGGATTCG--AGTTC----TGGA-GAAAA--ACTTT--GT-C--A-T-TT------ATCAAAA-T--AGA--T-GGG-G-TA---CGAGCTCT-CC-CAGTA-AAG-----AAATAA-A---------CTATAT---GT--C------AGAGGAATTG-G-T----A-CGATCTAC---ATA---CA-C-CA----T--C-T-CT--GGAC----AGAAA-G-------T-AGC--C--A-TTTCTGTC--------AT-TAAA--A----TC-TGAGTGGTAC----AGT---------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-TG----T-C----T-T-TTATCAAATAG-AAAA-C-----AT------GATCGTG------------A-T-ACCGAG--TTC-TCCC--GG--CG-AA--A---------------------------A-------TCA-------A----A-------------------GG-G-TA-TTA--TTTCATTC-TC---AAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaa---CTTTGT---C---CG-TTTT------ATCA-A-T----A-AAATCTGT---GTA---TA-C-GA-G-TT--C-TCCT--G---------AAA-ATTTTGTTTCAGT--C--A-TTTCTGCA--------AT-GAAGATA----TC-TG---GGTACT---AGTTC-T---CCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T--GTATTT-C-A-AT-T-CATTC--ATG--CAAT-T-----CTGCGGGAG-----G------------G-T-A-CGAG--TT-------------A-AA--A-----------T--T------------A-------TCA-------A----AG----AGAA----A-TGCTGG-GTTACCGAGTGTTC-TCCTTA---AAA-G---A-A--AAAA-AA--AAGTC-ATTTTCC-TATCA--AT----TTC-TGGCGAAGAAGCT--G
gi|15 : aaT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--TG-AGA-CTAAT----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTG-AAAA-TCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGGC-GATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCT-agaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : TTC----TAGA-GAAGCC-ACTAT--GT-C-AAATGTT------ATG--A-------------GG-G-TA---CGAATT----C-CGG-A-GAA-----AAAA-------------CTTTG-----T--AA-TTTT------ACCAGA-T----AGAAATGAAGACCGTG---TG-C-GA-G-TT--T-TCCC--GG------ATAAcactgcagaa
gi|16 : cgctttcTGA---GGG---TA-C-GA-A-TT--C-C-----GG------AGAAA-A--A-ACTT-TGT--A--A-TTT-TACCAGATAGAAAT-GAAGA-------C-CG---TGTGCG---AGTTT-T---CCCGG---ATA-AC-G----------------G----T-T-A-------------------------------------------G------------G-T-A-CGAG--TTC-TCCC--GGTTAA-AA--AAAAAACTTTTGT--T------------A--CTTTATCA-------T----AT----GC-A----ATT-CTAG-G-TT-CAA--ATTC-TCC-AG----GA-G---A-A--AAAA-AA--ACGTC-ATTT--cggttaggtacgagttctcccggttaaaaaaaaaacttttgttactttatcatatgcaattctaggttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttaG---GGTACG---AATT-------CCGG---AGA-AA-AAAC--T-------T-TG----T---A-AT-T-TTACCAGATA--GAAA-TGAAGACC------G-----T------------G-T-G-CGAG--TTT-TCCC--GG--AT-AACGG-----------T--T------------A-------------------------------------------G-G-TA-CGA--GTTC-TCC-CGGTTAAA-A---A-A--AAAA-CT-TTTGTT-ACTT----TATCA-TATGCAATTC-T-AGGtaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatga-TA---GGTACG---AGTTC-T---CCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-TG----T-T---AC-T-TTATC--ATATGCAAT-T-----CT------A-----G------------G-T-T-CAAA--TTC-T-CCA-GG--AG-AA--A-----------ttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggt---TA-C-GA-G-TT--C-TCCC--GGTTAAAAAAAAA-ACTT---TT--GT--T--A-CTT-TATCAT------AT-GCA-AT-----TC-TA---GGTTCA---AATTC-T---CCAGG---AGA-AA-AAAA--A-------A-CG----T-C---AT-T-TTAAA--ATA--AAAA-C-----CC------A-----GAGTACCATAAAAA-T-A-CGAG--CTC-T-CC--AG--TA-AA--A-----------aaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAA------ATCAA--TTACA-GTCTACAT
gi|17 : T-AGT--C--A-TTTCTGCC--------AT-GAAGATAATTATC-TG---GGTACG---AGTTG-T---CCTGG---GCA-AG-GAA---C-------T--G----T-C-A-AT-T-TCATC--ATA--AAAT-T-----CT------G-----G------------G-T-A-CGAG--TTC-TCCC--GG--AGAAA--A-----------T--T------------A-------TCA-------A----AT----AG-A----A-----------A-TGA--TTTC-TCC-TA---AAA-G---A-A--AAAA-A-----GTA-ATTT--C-TATCA-TGT----gatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-AA-ATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTTTC-CCCAAGATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-T-TG--T-A---A-T-AAAA-TC----AAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGA-TTTT---TATA---ATAAAAATGAC
gi|19 : T--T-G---AAT-AAAA-TT----GACGAAA-A--TTT-T-T------------CTCGTACCT-ATA-TTTT---TATA---ATAAATTTGACACATTTTTT---TTCTCCGGG-AGA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAAT---T---CTTG---A-TAAAAAAAAAAAGA-CA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG-AGAaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TATAAATAA---A-ATCTGTGTACA--AATTC----TGGA-GAATT--ACTTT--AT-C-AA-T-TC------ATC--AA-T--ACA--TCAGG-G-CA---CGAGTTCT-CCATGG-ATAAA-----AAAAACGAT-TGTC---CTTTTT---TTTTCT-TTTT------ATCA-A-T----A-AAATCTGG---ATA---TA-C-GA-G-ATGGCATCCT--GG-------GAAA-ATTT-GCTT-AGT--C--A-TTTCTGCC--------AT-GAAGATA----TC-TG---GGTAC-----ATTC-T---CCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-GG----T-C-A-AT-T-TCATC--ATA--AAAACT-----CT------G-----A------------G-T-A-CGAG--TTC-T--C--GG--AG-AA--A-----------T--T------------A--C----TCA-------A----AT----AG-A----A-T-CTGG-G-TA-TGA--GTTC-TCC-TA---AAA-G---A-A--AAAA-AA-TAAGTC-ATTT--CATATCA-TAT----TTCTTGAGAAAAAAACC--GT-TG---TCTGCTG-GAATTCAAAATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC------------A----AAAGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTTT-AT-A----GAAA-C------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-AC-ATT---TTACTAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGACAACTCGCACCC-AGAGTTCTGCATATATTGATAAAATAGACG------------TCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA---------ATTA---ATTA-----------A-AA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG-A-AC-TCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGA---TGTGC-AGGTTCAT-----TCGCATTTTATTCATCG-AACGGGT--AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TTTC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGGTATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCt
gi|20 : CC--------AT-TCGGATT----TC-TG---GA---G---AACTC-TTACCCAGG---AGA-A--------C-------T-CG----T------------ACC--CAG--AAAA-T-----A-------G-----G------------A-T-A-CATG--TTC-T-CCT-GG--AG-AA--G-----------TCGT------------A--C----CCA-------------TC---AG-T----A-T-CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TG-------G---A-G--AAAA-AC-TTTGTgc
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagaAGAAAAGAAA-----C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAAACC---ATT--C-G---G------A-TTTCTGGA--GAA-C--TCT-T-AC--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA---------A----AATAGGATACATG-----------TTCTCCTGG-AGAAtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtAGA-ATTC-GT------------ACC-CAGATTTCTAGT--T-G---A-T-AAA---T----GAC--GA-GTTTTT-T-CT--CCGGGAGAATTCGTATCC-AGA-TTTT---TA---TGATAAttagtggtaagtct
gi|23 : AT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA-A-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATAc
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAGATTT-TAATGAT-ACATA-T-AAAA-TT----GAC-AAC-A--TTT-A-CT--CCTGGACAACTTGTAC
gi|26 : C-TG---GGTACG---AGTT--T---CCTGG---ATA-A
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : -------T-CG----T-C-A-AT-T-TTATG--ATA--AAAA-C-----CT------A-----G------------G-T-A-CAAG--TTC-TCCC--GG--Aagcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG----------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGG-TTT-AT-ATGACAAAA-C------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-AC-ATT---TAAATAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTTTTTC---AGA----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAGATTT-TATT----G---A-T-AAAAATT----GAC-ATC-G--TTT-T-TTTTCCAGGAGAACTCGCACCC-ATA-TTTT------ATTGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA---------TTAA-----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G-AGA---------TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACT-AAAATGG-GA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AACGGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--AAC-A-----------AAA--------TAT--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--GT---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACATTGAATGA-TAC--------G-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTTTC-CC--AGA----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGA-C-AA-----T---ATTATGAA-CA-----------AACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-T-AAAATGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTAAATTA-ATTTTATC--TCG-AACGG-TAACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--AACAA-----------AAA--------TATCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--ATAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgA---CAAGTTCT-C--TGG-A-AAATTAGTNNNNNN-NN-NNNN---NNNNNN---NN--NN-NNNG------GTGC-A-T----C-AAATCAGA---GTT---TA-C-GA-G-TT--C-TCCTGAGA------AGAAATATTT-------GT--T--A-TTT-----------------AAAAT-----TC-AG---AGTACAACTAGTTC-T---CCTGG---A-A-AG-AAAA--CAAA----T-TG----T-C-A-AT-T-TTATA--AT---AAAA-T-----CT------G-----T------------G-T-A-C-AA--TTC-T------G--AG-AA--A-----------T--TAACTTTTTATCAA--T----TCATC-----A----AT----AA-AC---A-T-C-AG-G-CA-CGA--GTTC-TCC-TG-------G---ATA--AAAA-AC-TTTG----TTT--C-TA--A-TAA----ATC-TGacctg
gi|5 : TAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TAT-AATAA---A-ATCTGTGTACA--A-TTC----TG-A-GAAATTAACTTTTTAT-C-AA-T-TC------ATC--AA-T--AAACATCAGG---CA---CGAGTTCT-CC-TGG-A-TAA-----AAAA-------------CTTTGT---TT--CT--------------A-A-T----A-AA-TCTGG---TTA---TA-C-GA-GATT--C-TCCT--GG------A---A-ATTT-GTTTTAGT--C--AATTTCTGGC--------AT-GAAGATA----TC-TG---GGTACC---AGTT--T---CCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-CG----T-CTA-ATATATCATC--ATT--AACT-C-----CT------A-----A----------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GG--AG-GA--A-----------T--T------------A-------TCA-------A----A-----AGTAC---A-T-CTGA-G---------ATTC--CC-T----AGA-GTATA-ATTAAAA-AA-TG-GTC-TATT--C-TATCA-TAA----TTT-TGAG-----AACT--GT-TA-----TGCTATGGA-TCAAAATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATT--AAATATGA--A----AAAGATTTTT-ACCTCG-AT-ACTTGTGTAACCC-AGGTATG-AG-A----AAGA-CTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAAC-ATTGAATGA-TAC--------GAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTTCC-C---AGA----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-gttatacgagattctcctggaaatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAA--T-GGA--TG-GGG-T---CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TAA-TTTTTATC--TCG-AACGG-TAAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--AACAA-----------AAA--------TATC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--GGAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGA-CCCACACTCT---ATTT---A-AA-----------A-CAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAA-
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG-T-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-Ggagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--T-----GTA-AT-----C--TCG-AACGGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--AAC-A-----------gaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTGATTT-CAGT--CAG---A-T-AAAA-T-----GAC-AAATG--TTTAT-CT--TCAGGAGAACTTG-ACCA-AGA-TTTT---TA---TGATAAAATTAACca
gi|8 : TATG--AGTTCCCC-TGAA-GAAAA--GCCTT---T-C-AA-T-TTT-----ATCA-AA-TAGAAA--TCCGA-G-TA---CAATTTCT-TC-TGG------------AGAAC-AT-TGTCAAATTTTATCAATT--GTGTTGT------GTTA-AGTCCTAA-AAATCTGG---GTACGTCA-C-GT-G-TT--C-TCCT--CA------AGAAA-AATT---TT-AGT--C--A-----------------AT-A-----A----TC-TG---GTTACG---AGCTC-T---CCTAA---AGA-A---AAA--C-------TATG----T-C-ACCT-T-TTATC--ATA--AAAA-T-----CT------G-----G------------T-T-A-GGAG--ATCTT-CC--AA--AG-AA--A--------------T------------A--CATTGTTA-------ATTTTATCATAAA-A----A-T-CTTG-G-T--CAA--GTTC-TCC-TG---AA------G-A--TAAA-CA-TTTGTC-ATTT----TATCaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtca------ATTG-A-T----A-AAATTTG-----------A-C-AATG-TT--C-TCCA--GA------AGAAA-TTGT-ACTC-GG------A-TTTCTATT---------T-GATAAAA----T--TG------AAA---GGCTT-T---TCTTC---AG---G-GGAA--C-------T-CA----T------------ATA--ATA-------T-----AT------G-----G------------G-T-A-TGAG--T-C-T-CCT-GG--AG-AA--AAATCT------T--TGTAA--------A--T----TCT-------ATC--AT----AA-A----AAT-CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TG-------G---A-A--AAAATAA-TAC-CC-ACTT--T-TATCA-T----------------AGAAATCTGGTATGACTTCTCCTG-GAA-AGAAAACTTTGTCAtaatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaATA----TA-TG---GGTATG---AGT-C-T---CCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-TG----T-A-A-AT-T-CTATC--ATA--AAAA-T-----CT------G-----G------------G-T-A-CGAG--TTC-T-CCTGGA--AA-AA--A-----------TAAT------------A--C----CCACTTTT--ATC--AT----AGAA----A-T-CT-G-G-TA-TGA--CTTC-TCC-TG-------G---A-A--AGAA-AACTTTGTC-ATTT----TATCA-ttttatcaaa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--T-----GTA-AT-----C--TCG-AACGGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAAC-ACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--ATAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 11 1 11 111 1111 111 333333333333 1111 3333333333333 11 1 222222 999999999999999999999999999999999999999999999 11111 11111111 333333 11111111 11111 3333333333333333333 11111 11111111111111111111111111111111 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 22222 1111 1111 11111 1111 1 1 1 11 111 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 1 2 222222 2 11 22 2222222 11111111 111111 1111 111 1 111 111111111 1 22222222222222 1 11 1111111 444444444444 1111111111111 111 1111 3333333333 666666666666 22 1 3333333333333 1 1111 11 5555555555555555555555555555555 111 1111111 22222222222222222 3333333 1111 22222 11 1 111 1 2222222222222 111111 1 22222 222222 1111 1 1111111 222 111111111 11 1 33333333333333333333333 111 222222222222 111111 2222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 22 1111 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 0 0 0 33 0 11 0 444 8 3 5555 5 99 111 333333333333 0000 5555555555555 55 6 99 3 000000 88 6 5 5 5 88 999999999999999999999999999999999999999999999 0 11111 5 777 4 4 55 4 1 55 77777777 4 000000 7 55 3 7 0 55555555 555 11111 444 4444 666 333 4 2 4444444444444444444 4444 00000 2 2 33 999999 2 88888888888888888888888888888888 2 2 33 2 9 00 33 2 33 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 33 3 3333 444 3 3 5555555 555 3 55 11111 6666 5 2222 6 66666 6666 3 3 2 3 3 0 33 111 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 11 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 222222222222222222 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 555555555555555555 0 8 444 8 5 8 6 4 0 8 333333 0 0 5 5 00 5 55 999 3333333 88888888 5 5 4 2 5 5 444444 5 0000 999 11 66 0 333 222222222 5 0 11111111111111 5 5 0 5 00 5 2222222 4 2 4 4 55 4 111111111111 3 1111111111111 333 3 3 8888 4 222 4 4 55 777 4 0000 4 4 4 3333333333 66 9999 222222222222 55 1 5 9999999999999 5 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 44 5 5 0 0000000000000000000000000000000 5 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 5 22222222222222222 8 8 0 2222222 0 1 7777 8 8 00000 11 1 2 8 444 4 5 2 77 4 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 77 1 55 5 6 99 77 66 5 00000 66 888888 88 1 5555 1 77 4 4444444 5 77 5 222 555555555 77 33 5 1 77777777777777777777777 5 111 222222222222 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 4 4 777777777 9999999999999999999999999999999 5 5 5 888 66666 5 0000 44 6 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . . .. . .. . ... . . .... . .. ... ............ .... ............. .. . .. . ...... .. . . . . .. ............................................. . ..... . ... . . .. . . .. ........ . ...... . .. . . . ........ ... ..... ... .... ... ... . . ................... .... ..... . . .. ...... . ................................ . . .. . . .. .. . .. .................................................................... .. . .... ... . . ....... ... . .. ..... .... . .... . ..... .... . . . . . . .. ... ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . ... . . . . . . . ...... . . . . .. . .. ... ....... ........ . . . . . . ...... . .... ... .. .. . ... ......... . . .............. . . . . .. . ....... . . . . .. . ............ . ............. ... . . .... . ... . . .. ... . .... . . . .......... .. .... ............ .. . . ............. . . . . . . .. . .... . .. . . . ............................... . ... .. . . ....... . . . . . ................. . . . ....... . . .... . . ..... .. . . . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . .. . .. . . .. .. .. . ..... .. ...... .. . .... . .. . ....... . .. . ... ......... .. .. . . ....................... . ... ............ .. . ...... .. . . .... ............. . . . . . ......... ............................... . . . ... ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 0 0 0 88 0 00 8 000 0 2 3333 2 22 777 555555555555 5555 7777777777777 88 7 22 3 333333 22 7 7 7 7 11 111111111111111111111111111111111111111111111 2 00000 0 000 0 0 55 0 6 55 55555555 0 333333 3 00 6 4 2 44444444 555 11111 111 8888 111 999 3 2 7777777777777777777 7777 33333 2 2 11 999999 4 33333333333333333333333333333333 4 4 22 4 4 99 44 7 77 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 55 1 7777 444 1 1 9999999 888 6 00 77777 6666 0 1111 7 11111 7777 3 3 5 2 2 0 88 000 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 00 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 444444444444444444 6 0 000 0 6 0 0 0 8 0 000000 8 4 0 0 44 0 00 000 5555555 11111111 0 0 5 2 0 0 444444 0 6666 111 44 99 0 888 222222222 0 0 22222222222222 0 0 0 0 11 0 1111111 4 0 4 4 55 0 000000000000 6 3333333333333 999 3 3 5555 0 777 0 0 55 000 1 0000 0 4 4 3333333333 11 4444 999999999999 00 4 7 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 44 7 7 1 6666666666666666666666666666666 7 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 7 44444444444444444 0 0 8 2222222 6 4 0000 0 0 00000 00 7 5 0 999 9 7 0 99 3 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 99 4 99 7 7 22 99 99 0 44444 99 888888 22 7 0000 4 99 3 7777777 0 99 7 666 333333333 99 66 7 4 00000000000000000000000 0 777 777777777777 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 4 4 222222222 2222222222222222222222222222222 0 0 0 888 99999 0 6666 66 2 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTGTGTAC---GAGT--TC---TG---GA-------GAAAN--ACTTT--ATC--------AATTC--AT-C--AA-TA--NA--TCAGGG-CACGAGTTCT-CC-TGG-A-NAA-----AA--AAAC-AT-TGTC---CTTTGT---TT--CTTTT-TATCAA----TAAAA-TCTGGGTAT---AC-GAG-TT--C-TCCT--GG------AGAAA-ATTT-G-TT-AGT--CA-TTTCTGCC--------AT-GAAGATA----TCTG---GGTACG---AGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-CG----TC-A-A-T-T-TTATC--A--TA--AAAA-T-----CT------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GG--AG-AA--A-------------T--T------------AC----TCA-----A----AT----AG-A--A-T-----CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---A-A--AAAAAA-TNTGTCATTT--C-TATCA-TAT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAAAATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTT--TC-C---AG----A----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAA----A-AAAAAATCTC-CAGA-ACT--C-GT------------ACC-CAGATTTTAT--T--T-G---A-T-A-AAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--C---CAGGAGAACTCG---CAC-CC-AGA-TTTT-----TAATGAT--AAAATTG----ACG-----------TTCTCC--GG-A-GAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AACGGTCAAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTGTGTAC---GAGT--TC---TG---GA-------GAAAN--ACTTT--GTC--------AATTT--AT-C--AA-TA--AA--TCAGGG-CACGAGTTCT-CC-TGG-A-AAA-----AA--AAAC-AT-TGTC---CTTTGT---TT--CTTTT-TATCAA----TAAAA-TCTGGGTAT---AC-GAG-TT--C-TCCT--GG------AGAAA-ATTT-GCTT-AGT--CA-TTTCTGCC--------AT-GAAGATA----TCTG---GGTACG---AGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-CG----TC-A-A-T-T-TTATC--A--TA--AAAA-T-----CT------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GG--AG-AA--A-------------T--T------------AC----TCA-----A----AT----AG-A--A-T-----CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---A-A--AAAAAA-TNTGTCATTT--C-TATCA-TAT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGTCTGCTG-GAA-TCAAAATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-AT-AGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTT--TC-C---AG----A----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAA----A-AAAAAATCTC-CAGA-ACT--C-GT------------ACC-CAGATTTTAT--T--T-G---A-T-A-AAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--C---CAGGAGAACTCG---CAC-CC-AGA-TTTT-----TAATGAT--AAAATTG----ACG-----------TTCTCC--GG-A-GAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AACGGTTAAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : TTTT-CC-TCAGA-AGAA-CTTG-GTATCC---CAGT---TTT-T-T--------G-A--AAAACGGTAC-GA------A-G-------TTTT------TTAGTC-C---AGGAAGA----A-CT-CG-TG-C---C---------CCTG-ATGT---TT-A-T----TTGA-TTGAAATTAGATAAAGAATTTC-CAAG-ATTGCT-GT------------ACA-CAGATTCTGTCAT--T-T---A-T-ACAAA-TT----GAC-ACA-T-TTT-T-TT--CTTCCAGGAAAACTCGGATTACTCC-TGA-TTTT-----TGATTATAAAAAATGGAACAACGATT--------TTCTTCCAGG-AGGAAC--T----------CTTACCC-C
gi|1 : aatatcaAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTAT--AAATGACAGA-ATCTGTGTAC----AGCAATC---TT---G--------GAAAT--TCTTT--ATCT-------AATTTCAAT-C--AAATA--AACATCAGGGGCACGAGTTCTTCC-TGG-A-CTA-----AA--AAAC------------TTCGT---AC--CGTTT-T-TCAA-----AAAA--CTGGG-AT---ACCAAG-TT--C-TTCT--GA------GGAAA-ATTT-G-TT-AGTTTCA-TTTCTGCC--------ATAGAAGATA----TCTG---GG-ACG---AGTTCTT--CCTGG---ACA-AG-GAA-------------TG----TC-A-A-T-T-TCA----A--TC--AAAA-TT----CT------G-----A------------GTCA-CA----TTC-C-CC--GG---G-AA--A-------------T--T------------AT----CCA-----A----AT----AG-ACAA-T-----CTGGTA-TA-TGA--TTCT-TCC-TG---AAACG---A-A--AAAA------GTCATTT--C-TATCACTAT----TTC-TGAGAAA--AACCGT-GTATGCTG-GAA-TCAAAATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAA------ATGA----AAAGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTT-TCAT-GGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-G-CAAT---TTA-TACATTAAGTAG-A-TAGAA-----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTT--TTTC---AG----A----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAA----A-AAACA-TCTCACAGATACT--C-GT------------ACCACAGATTTTAT-------G---A-A-T-AAA-TT----GAC-AAA-T-TTT-TTCT--C---CAGGA-AACT-G---CAC-CCCAGA-TTTT------ATTGAT--AAAATTG----ACG-----------TCTTCC--GGGA-GAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAA-CTAA-----TTATATTA---A-TAG----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG-AGAA-TCGTG--TG-TAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--CAA---TGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACT-AAAATCGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCGAAACGGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--------------AACAAA---AATA---T--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--G-CGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTtttgttagtttcatttctgccatagaagatatctgggacgagttcttcctggacaaggaatgtcaatttcaatcaaaattctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT--GGTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTATTTT-----CG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-AA--GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT------------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--A------A--ATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-TTATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTT--TT-C---AG----A----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--A----A-AAAAAATCTC-CAGA-ACT--C-GT------------ACC-CAAATTTTA---T--T-G---A-TAA-AAA-TT----GAC-AAA-GTTTT-T-CT--C---CAGGAGAAGTCG---CAC-CA-AG---------------------AAATTG----ACG------------TCTCCG-GG-A-GAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : AC--AAATAG---AGATTTGGATTC---GAGT--TC---TG---GA-------GAAAA--ACTTT--GTC---------ATTT--AT-CAAAA-TA--GA--T-GGGG-TACGAGCTCT-CC-CAGTA-AAG-----AAATAAACTATATGTC---AGAGG--------------AATTGG----TACGA-TCTACATAC---AC-CA---T--C-T-CT--GGAC----AGAAA-G-------T-AGC--CA-TTTCTGTC--------AT-TAAA--A----TCTGAGTGGTAC----AGT--------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-TG----TC-----T-T-TTATCAAA--TAG-AAAA-C-----AT------GATCGTG------------AT-ACCGAG--TTC-TCCC--GG--CG-AA--A-----------------------------A-----TCA-----A----A---------------------GG-G-TA-TTA--TTTCATTC-TC---AAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaa---CTTTGT---C---CGTTT-TATCAA----TAAAA-TCTGTGTAT---AC-GAG-TT--C-TCCT--G---------AAA-ATTTTGTTTCAGT--CA-TTTCTGCA--------AT-GAAGATA----TCTG---GGTACT---AGTTCT---CCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T--GTATTTC-A-A-T-T-CATTC--A--TG--CAAT-T-----CTGCGGGAG-----G------------GT-A-CGAG--TT-------------A-AA--A-------------T--T------------A-----TCA-----A----AG----AGAA--A-TG----CTGG-GTTACCGAGTGTTC-TCCTTA---AAA-G---A-A--AAAAAA--AAGTCATTTTCC-TATCA--AT----TTC-TGGCGAAGAAGCTG
gi|15 : aaT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--TG-AGA-CTAAT----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTG-AAAA-TCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGGC-GATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCT-agaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : TTCT---TCTAG---AGA-AG-CCA---C-------TATG----TC-A-AAT-G-TTATG--A-------------------------G-----G------------GT-A-CGAA--T---T-CC--GG--AG-AA--AAAACTTTGTAATTT--T------------AC-----CA-----G----AT----AGAA--A-TGAAGACCGT-G-TG-CGA--GTTT-TCC-CG---GAcactgcagaa
gi|16 : cgctTGAGGGT---AC-GAA-TT--C-C-----GG------AGAAA-A--A-ACTT-TGT--AA-TTT-TACCAGATAGAAAT-GAAGA-------CCG---TGTGCG---AGTTTT---CCCGG---ATA-AC-G----------------G----TT-A----------------------------------------------G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GGTTAA-AA--AAAAAACTTTTG--T--T------------ACTTTATCA-----T----AT----GC-A--ATT-----CTAG-G-TT-CAA--ATTC-TCC-AG----GA-G---A-A--AAAAAA--ACGTCATTT--taacggttaggtacgagttctcccggttaaaaaaaaaacttttgttactttatcatatgcaattctaggttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttaG---GGTACG---AATTCC------GG---AGA-AA-AAAC--T-------T-TG----T--A-A-T-T-TTACC--AGATA--GAAA-TGAAGACC------G-----T------------GT-G-CGAG--TTT-T-CCC-GG--AT-AACGG-------------T--T------------A-----------------------------------------G-G-TA-CGA--GTTC-TCC-CGGTTAAA-A---A-A--AAAACT-TTTGTTACTT----TATCA-TATGCAATTC-T-AGGtaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgaTA---GGTACG---AGTTCT---CCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-TG----TT---A-C-T-TTATC--A--TATGCAAT-T-----CT------A-----G------------GT-T-CAAA--TTC-T-CCA-GG--AG-AA--A-------------ttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggtT---AC-GAG-TT--C-TCCC--GGTTAAAAAAAAA-ACTT---TT--GT--TA-CTT-TATCAT------AT-GCA-AT-----TCTA---GGTTCA---AATTCT---CCAGG---AGA-AA-AAAA--A-------A-CG----TC---A-T-T-TTAAA--A--TA--AAAA-C-----CC------A-----GAGTACCATAAAAAT-A-CGAG--CTC-T-CC--AG--TA-AA--A-------------aaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAA------ATCAA--TTACA-GTCTACAT
gi|17 : T-AGT--CA-TTTCTGCC--------AT-GAAGATAATTATCTG---GGTACG---AGTTGT---CCTGG---GCA-AG-GAA---C-------T--G----TC-A-A-T-T-TCATC--A--TA--AAAT-T-----CT------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GG--AGAAA--A-------------T--T------------A-----TCA-----A----AT----AG-A--A---------------A-TGA--TTTC-TCC-TA---AAA-G---A-A--AAAAA-----GTAATTT--C-TATCA-TGT----gatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-A-AATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAAATG-AT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTT--TC-CCCAAG----ATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAA----A-AAAAATTCTC-CAGA-ACT--C-GT------------ACC-CAGATTTT-T--G--T-A---A-T-A-AAA-TC----AAC-AAA-GTTTT-T-CT--C---CGGGAGAACTCG---TAC-CC-AGA-TTTT-----T-ATAAT--AAAAATG----AC
gi|19 : --T--T-G---AAT-A-AAA-TT----GACGAAA-A-TTT-T-T---------------CTCG---TAC-CT-ATA-TTTT-----T-ATAAT--AAATTTG----ACACATTTTTT---TTCTCCG-GG-A-GA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAAT---T---CTTG---A-TAAAAAAAAAAAGA-CA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG-AGAaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TAT--AAATAA---A-ATCTGTGTAC---AAAT--TC---TG---GA-------GAATT--ACTTT--ATC--------AATTC--AT-C--AA-TA--CA--TCAGGG-CACGAGTTCT-CCATGG-ATAAA-----AA--AAACGAT-TGTC---CTTTTT---TTTTCTTTT-TATCAA----TAAAA-TCTGGATAT---AC-GAG-ATGGCATCCT--GG-------GAAA-ATTT-GCTT-AGT--CA-TTTCTGCC--------AT-GAAGATA----TCTG---GGTAC-----ATTCT---CCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-GG----TC-A-A-T-T-TCATC--A--TA--AAAACT-----CT------G-----A------------GT-A-CGAG--TTC-T--C--GG--AG-AA--A-------------T--T------------AC----TCA-----A----AT----AG-A--A-T-----CTGG-G-TA-TGA--GTTC-TCC-TA---AAA-G---A-A--AAAAAA-TAAGTCATTT--CATATCA-TAT----TTCTTGAGAAAAAAACCGTTGTCTGCTG-GAATTCAAAATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC------------A----AAAGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTT-T-AT-AG-AA-AC------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TTACTAC--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTT--TT-C---AG----A----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAA----A-AAAAAATCTC-CAGA-ACT--CAGT------------ACC-CAGATTTTAT--T--T-G---A-T-A-AAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--C---CAGGACAACTCG---CAC-CC-AGAGTTCTGCATATATTGAT--AAAATAG----ACG------------TCTCC--GG-A-GAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA---------ATTA---ATTA-----------A-AA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG-A-AC-TCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGAT---GTGC-AGGTTCATTCGCA-----TTTTATTCATCG-AACGGGT--AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATT---TC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGG-TATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCt
gi|20 : CC--------AT-TCGGATT----TCTG---GA---G---AACTCTTACCCAGG---AGA-A--------C-------T-CG----T------------ACC--C--AG--AAAA-T-----A-------G-----G------------AT-A-CATG--TTC-T-CCT-GG--AG-AA--G-------------TCGT------------AC----CCA-----------TC---AG-T--A-T-----CTGG-G-TA-CGA--GTTC-TCC-TG-------G---A-G--AAAAAC-TTTGTgc
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagaAGAAA----A-GAAA-----C-AAGG-ACT--T-GT------------ATC-CAAACC--AT--T--C-G---G-------A-TTTCTGGA--GAA-C-TCT-T-AC--C---CAGGAGAACTCG---TAC-CC-AGA-----------AA--AT--AGGATAC----ATG-----------TTCTCCT-GG-A-GAAtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtC--------AT-AAAAAT------CTG---GATACG---AATTCT---CCCGG---AGA-AA--AAA--C-------T-CG----TC-A-----T-TTATC--AACTA--GAAA-T-----CT------G-----G------------GT-A-CGAA--TTC-T-Cttagtggtaagtct
gi|23 : ttatAT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA-A-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATA
gi|25 : CT--C-AT------------ACT-CAGATTTTAA--TGAT-ACATA-T-A-AAA-TT----GAC-AAC-A-TTT-A-CT--C---CTGGACAACTTG---TAC-
gi|26 : CTG---GGTACG---AGTT-T---CCTGG---ATA-A
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : -------T-CG----TC-A-A-T-T-TTATG--A--TA--AAAA-C-----CT------A-----G------------GT-A-CAAG--TTC-TCCC--GG--Aagcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG----------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTAT-ATGACAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---TAAATAC--------G-A-TAGAATTG-AC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTT--TTTC---AG----A----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAA----A-AAAAAATCTC-CAGA-ACT--C-GT------------ATC-CAGATTTTAT--T----G---A-T-A-AAAATT----GAC-ATC-G-TTT-T-TTTTC---CAGGAGAACTCG---CAC-CC-ATA-TTTT------ATTGAT--AAAATTG----ACAGACAGATTTTTTCCTCC--GGGA-GAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA---------TTAA-----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G-AGA---------TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACT-AAAATGG-GAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AACGGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATA---T--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--G-T---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACATTGAATGA-TAC--------G-AATA-AATTG-AC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTT--TC-CC--AG----A----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG-------A-AAAAAATCTC-CAGA-CGT--C-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTTTTT--T--T-G---A-T-A-AAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGA-C-AA-----T---ATTATGAA-CA-----------AACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-T-AAAATGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTA-AATTAATTTTATC--TCG-AACGGT-AACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--A-TAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgACAAGTTCT-C--TGG-A-AAATTAGTNN--NNNN-NN-NNNN---NNNNNN---NN--NNNNN-GGTGCA----TCAAA-TCAGAGTTT---AC-GAG-TT--C-TCCTGAGA------AGAAATATTT-------GT--TA-TTT-----------------AAAAT-----TCAG---AGTACAACTAGTTCT---CCTGG---A-A-AG-AAAA--CAAA----T-TG----TC-A-A-T-T-TTATA--A--T---AAAA-T-----CT------G-----T------------GT-A-C-AA--TTC-T------G--AG-AA--A-------------T--TAACTTTTTATCAAT----TCATC---A----AT----AA-AC-A-T-----C-AG-G-CA-CGA--GTTC-TCC-TG-------G---ATA--AAAAAC-TTTG---TTT--C-TA--A-TAA----ATC-TGacctg
gi|5 : TAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AA-TAA---A-ATCTGTGTAC---AA-T--TC---TG----A-------GAAATTAACTTTTTATC--------AATTC--AT-C--AA-TA--AACATCAGG--CACGAGTTCT-CC-TGG-A-TAA-----AA--AA-------------CTTTGT---TT--CT--------AA----TAAA--TCTGGTTAT---AC-GAGATT--C-TCCT--GG------A---A-ATTT-GTTTTAGT--CAATTTCTGGC--------AT-GAAGATA----TCTG---GGTACC---AGTT-T---CCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-CG----TCTA-A-TATATCATC--A--TT--AACT-C-----CT------A-----A---------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GG--AG-GA--A-------------T--T------------A-----TCA-----A----A-----AGTAC-A-T-----CTGA-G---------ATTC--CC-T----AGA-GTATA-ATTAAAAAA-TG-GTCTATT--C-TATCA-TAA----TTT-TGAG-----AACTGTTA--TGCTATGGA-TCAAAATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATT--AAATATGA--A----AAAGATTTTTACCTCG--AT-ACTTGTGTAACCC-AGG----T-ATGAGAAAGACTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAA-CATTGAATGA-TAC--------GAA-TA-AATTG-ACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTT--CC-C---AG----A----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG-------A-AAAAAATCTC-CAGA-CGT--C-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTTTTT--T--T-G---A-T-A-AAA-gttatacgagattctcctggaaatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAA--T-GGA--TG-GGG-T---CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTAA-T-----TTTTATC--TCG-AACGG-TAAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--G-GAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGA-CCCACACTCT---ATTT---A-AA-----------A-CAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAA-
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG-T-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-Ggagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AACGGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--------------AACAgaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTGATTTCAG--T--CAG---A-T-A-AAA-T-----GAC-AAATG-TTTAT-CT--T---CAGGAGAACTTG----AC-CA-AGA-TTTT-----T-ATGAT--AAAATTA----ACca
gi|8 : TATAT---GAGT--TCCCCTG---AA-------GAAAA--GCCTT---TC--------AATTTT-AT-C--AAATAGAAA--TCCGAG-TACAATTTCT-TC-TGG-A-GAA------------C-AT-TGTCAAATTTTATCAATT--GTGTTGTGTTAAGTCCTAAAAATCTGGGTACGTCAC-GTG-TT--C-TCCT--CA------AGAAA-AATT---TT-AGT--CA-----------------AT-A-----A----TCTG---GTTACG---AGCTCT---CCTAA---AGA-A---AAA--C-------TATG----TC-ACC-T-T-TTATC--A--TA--AAAA-T-----CT------G-----G------------TT-A-GGAG--ATCTT-CC--AA--AG-AA--A----------------T------------ACATTGTTA-----ATTTTATCATAAA-A--A-T-----CTTG-G-T--CAA--GTTC-TCC-TG---AA------G-A--TAAACA-TTTGTCATTT----TATCaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtca-GATAA-AATT-TGACAA--TGT-TCTCCAGAAGA---A-AT---TGTACTCGGATT--TC---TATTTGATAAAATTGAAAG--GCTTT---TCTTCAGGGGAACTC--ATAT--AA-TA--TA--T--GGG-TATGAGT-CT-CC-TGG-A-GAA-----AA--A----------T---CTTTGTAAATT--CT-----ATCAT----AAAAA-TCTGGGTA-----C-GAG-TT--C-TCCT--GG------AAAAA-AT----AAT-ACC--CA-CTTTTATC--------AT---AGAAA----TCT----GGTATG---ACTTCT---CCTGG---A-A-AG-AAAA--CT------T-TG----TC---A-T-T-TTATC--A--atatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattATA----TATG---GGTATG---AGT-CT---CCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-TG----TA-A-A-T-T-CTATC--A--TA--AAAA-T-----CT------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CCTGGA--AA-AA--A-------------TAAT------------AC----CCACTTTTATC--AT----AGAA--A-T-----CT-G-G-TA-TGA--CTTC-TCC-TG-------G---A-A--AGAAAACTTTGTCATTT----TATCA-aa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AACGGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAACACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--A-TAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 11 1 11 111 1111 333333333333333333 111 111 2222222222222222222222222222222 99999999999999999999999999999999999 11111 11111 11111111 1111111 1111 22222222222222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 1 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111111 111111 111111 1111 1111111 1111 1111 2222 1 11 11 1 11 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 1 222222 2 1 33 2222222 22222222 111111 1111 11 11111 1111 222222222222222 1 1 444444444444 111 3333333333 666666666666 2 1 4444444444444 1 1111 11 5555555555555555555555555555555 111 1111111 22222222222222222 3333333 1111 22222 11 1 111 1 2222222222222 111111 1 22222 222222 1111 1 1111111 22 111111111 11 1 33333333333333333333333 111 222222222222 111111 2222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 22 1111 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 0 0 0 33 0 11 111 6 1 77 1111 3 66 888 222222222222222222 222 555 9999999999999999999999999999999 3 99 777 4 4 4 777 5 44444444444444444444444444444444444 0 4 11111 44 4 00000 44 44 55 3 2 55555555 666 7777777 44 99 6666 3 1 33 2 1111 888888 444 0 3 666 444 5 2 99999999999999999999999999999999 2 2 22 66 66 55 2 000000000000000000000000000000000 2 2 55 2 0 22 88888 2 33 222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 0 3 6 555 44 3 3 222222222222 55 888888 111111 7777 7777777 2222 6 1 3 0000 1 6666 0 33 33 0 0 55 3 0 6 11 8 8 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 11 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 222222222222222222 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 555555555555555555 0 8 444 8 5 8 6 0 0 8 333333 0 0 5 5 1 5 00 5 5 5555555 00000000 5 5 4 1 5 666666 5 2222 99 77777 2222 5 666666666666666 5 5 1 5 1 5 9 3 5 5 4 555555555555 4 22 9999 666 555 3 9999 4 222 4 4 66 3 2 5 55 8888888888 333333333333 0 3 8888888888888 6 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 44 5 5 0 0000000000000000000000000000000 5 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 5 22222222222222222 8 8 0 2222222 0 1 7777 8 8 00000 11 1 2 8 444 4 5 2 77 4 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 77 1 55 5 6 99 77 66 5 00000 66 888888 88 1 5555 1 77 4 4444444 5 77 5 5 77 555555555 77 33 5 1 77777777777777777777777 5 111 222222222222 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 4 4 777777777 9999999999999999999999999999999 5 5 5 888 66666 5 0000 44 6 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . . .. . .. ... . . .. .... . .. ... .................. ... ... ............................... . .. ... . . . ... . ................................... . . ..... .. . ..... .. .. .. . . ........ ... ....... .. .. .... . . .. . .... ...... ... . . ... ... . . ................................ . . .. .. .. .. . ................................. . . .. . . .. ..... . .. ................................................... .. . . . ... .. . . ............ .. ...... ...... .... ....... .... . . . .... . .... . .. .. . . .. . . . .. . . ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . ... . . . . . . . ...... . . . . . . .. . . ....... ........ . . . . . ...... . .... .. ..... .... . ............... . . . . . . . . . . . ............ . .. .... ... ... . .... . ... . . .. . . . .. .......... ............ . . ............. . . . . . . .. . .... . .. . . . ............................... . ... .. . . ....... . . . . . ................. . . . ....... . . .... . . ..... .. . . . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . .. . .. . . .. .. .. . ..... .. ...... .. . .... . .. . ....... . .. . . .. ......... .. .. . . ....................... . ... ............ .. . ...... .. . . .... ............. . . . . . ......... ............................... . . . ... ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 0 0 0 88 0 00 777 7 0 99 7777 0 99 888 000000000000000000 999 888 0000000000000000000000000000000 9 66 888 4 4 4 888 3 11111111111111111111111111111111111 7 0 99999 88 0 44444 22 22 00 6 8 66666666 444 7777777 22 22 7777 3 0 99 9 2222 444444 111 7 2 555 111 1 4 77777777777777777777777777777777 4 4 44 55 55 99 5 111111111111111111111111111111111 5 5 99 5 0 77 11111 9 99 444444444444444444444444444444444444444444444444444 66 4 3 7 444 66 3 3 333333333333 55 444444 555555 2222 3333333 1111 7 7 7 2222 4 8888 0 22 88 8 6 66 8 8 0 00 0 0 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 00 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 444444444444444444 6 0 000 0 6 0 0 8 8 0 000000 8 4 7 7 4 7 00 7 7 6666666 77777777 7 7 3 7 7 444444 7 1111 33 11111 1111 7 777777777777777 7 7 4 7 4 7 4 4 0 0 4 666666666666 0 00 0000 444 111 6 4444 4 444 4 4 11 9 7 0 11 2222222222 222222222222 0 3 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 44 7 7 1 6666666666666666666666666666666 7 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 7 44444444444444444 0 0 8 2222222 6 4 0000 0 0 00000 00 7 5 0 999 9 7 0 99 3 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 99 4 99 7 7 22 99 99 0 44444 99 888888 22 7 0000 4 99 3 7777777 0 99 7 7 00 333333333 99 66 7 4 00000000000000000000000 0 777 777777777777 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 4 4 222222222 2222222222222222222222222222222 0 0 0 888 99999 0 6666 66 2 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACTTT--GTC--------AATTC--AT-C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACGA---GTTC-T-CC-TGG---AGAAAAAA-A-C-AT-TGTC---CTTTGT---TT--CNTTT-TATCA-A----TAAAA-TCTGG-GTA-T---AC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTTTATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGA-TTTT-----TANTGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACTTT--ATC--------AATTC--AT-C--AA-TAN-A--TCAGGG-CACGA---GTTC-T-CC-TGG---ANAAAAAA-A-C-AT-TGTC---CTTTGT---TT--CTTTT-TATCA-A----TAAAA-TCTGG-GTA-T---AC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TNTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTTTATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGA-TTTT-----TAATGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGTCAAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : AT-A--TCAGGGGTAAGA---GTTCCT-CC-TGG---A-AGAAAA-T-C-GT-TGTT---CC--AT---TT--TTTAT-AATCA-A------AAA-TCAGGAGTAAT---CC-GAG-TT--T-TCCTGG--AAGAAAAA---AA------TGTG-TC--A-----A-TTTGTATA--AAT-GACAGA-A----TCTG---TGTAC-AGCAAT---CTTGG---A--------AA--T-------T-CTTTA----TCTA-AT-T-TCAATC--AAATA--AACA-T-----CAG------G-----G------------GC-A-CGAG--TTC-T-TCCTGGACTAAA-AA--A------C--TTCGTACCGTTTTTCA-----A--------A--------A--AA-CTGG-GATA-CCAA--GTTC-TTC-TG---AGG-----------AAAA-TTTGTTAGTTTCATTT--C-TGCCA-TAGAAGAT----ATC-TG-GGACGA----GTTCT-TCCTG-GA---CAAGGAAT----------GTCAATTTCAATC--AAAA-T-T
gi|1 : aAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTAT--AAATGACAGA-ATCTG--TGTAC----AGCAATC---T-----T---G--------GAAAT--TCTTT--ATCT-------AATTTCAAT-C--AAATAA-ACATCAGGGGCACGA---GTTC-TTCC-TGG---ACTAAAAA-A-C------------TTCGT---AC--CGTTT-T-TCA-A-----AAAA--CTGG-G-A-T---ACCAAG-TT--C-TTCTGA--GG----AA---AA------TTTG-TT--AGTTTCA-TTTCTGCC--A-TAGA-AGATA----TCTG---GG-ACGAGTTCTT--CCTGG---ACA-AG-GAA-------------T---G----TC-A-AT-T-TCA-----A--TC--AAAA-TT----C-T------G-----A------------GTCA-CA----TTC-C-CC--GG-----G-AA--A------T--T----AT------CCA-----A--------AT----AG-ACAAT-CTGGTA-TA-T-GA--TTCT-TCC-TG---AAACG---AA--AAAA------GT------CATTT--C-TATCACT-----AT----TTC-TGAGAAA--AACCGT-GTATGCTG-GAA-TCAA--AATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAA------ATGA----AAAGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTT-TCATG-GAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-G-CAAT---TTA-TACATTAAGTAG-A-TAGAA----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTTTC---AGA----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAAAAAACA-TCTCACAGATACTC-GT------------ACCACAGATTTTAT-----G---A-A-TAAA-TT----GAC-AAA-T-TTT-TTCT--CCAGGA-AACT-GCACCCCAGA-TTTT------ATTGATAAAATTGACG-----------TCTTCC-GGGAGAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAA-CTAA-----TTATATTA---A-TAG----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG-AGAA-TCGTG--TG-TAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--CAA---TGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACT-AAAATCGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCGAAAC-GGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--------------AACAAA---AATA---T--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--G-CGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT--GGTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTATTTT-----CG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-AA--GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT------------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--A------A--ATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-TTATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--AAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAAATTTTA-T--T-G---A-TAAAAA-TT----GAC-AAA-GTTTT-T-CT--CCAGGAGAAGTCGCACCA-AG-------------------AAATTGACG------------TCTCCGGG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : AC--AAATAG---AGATTTG--GATTC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAA--ACTTT--GTC---------ATTT--AT-CAAAA-TAG-A--T-GGGG-TACGA---GCTC-T-CC-CAGTAAAGAAATAA-A-CTATATGTC---AGAGG--------------AATTG-G----TACGA-TCTAC-ATA-C---AC-CA---T--C-T-CTGGACAG----AA---AG------------T--AGC--CA-TTTCTGTC--A-T-TA-AA--A----TCTGAGTGGTAC-AGT--------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-T---G----TC----T-T-TTA-TCAAA--TAG-AAAA-C-----A-T------GATCGTG------------AT-ACCGAG--TTC-TCCC--GGC----G-AA--A--------------A-------TCA-----A--------A----------------GG-G-TA-T-TA--TTTCATTC-TC---AAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaa---CTTTGT---C---CGTTT-TATCA-A----TAAAA-TCTGT-GTA-T---AC-GAG-TT--C-TCCT-----G----AA---AAT-----TTTG-TTTCAGT--CA-TTTCTGCA--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACTAGTTCT---CCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T-----GTATTTC-A-AT-T-CAT-TC--A--TG--CAAT-T-----C-TGCGGGAG-----G------------GT-A-CGAG--TT---------------A-AA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AG----AGAA--ATGCTGG-GTTACC-GAGTGTTC-TCCTTA---AAA-G---AA--AAAAAA--AAGT------CATTTTCC-TATCA-------AT----TTC-TGGCGAAGAAGCTG
gi|15 : aaT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--TG-AGA-CTAAT----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTG-AAAA-TCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGGC-GATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCT-agaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : T--TC---T-----A---GA-------GAAGCC-ACTAT--GTC--------AA------------A-TGTTA--TGAGGG-TACGA---ATTC-C-----GG---AGAAAAAA---------------CTTTGT-------AATTT-TACCAGA----TAGAA-------------------A-----------TGA--AG----AC---CG------TGTG-CG--AGT-----TTTC--CCGGA-T-AA-CGGT-------TA---GGTACGAGTTCT---CCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-T---G----TT---AC-T-TTA-TC--A--TATGCAAT-T-----C-T------A-----G------------GT-T-CAAA--TTC-T-CCA-GGA----G-AA--A------cactgcagaa
gi|16 : cgctttcG---GGTACGAATT------CCGG---AGA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T--A-AT-T-TTA-CCAGA--TA--GAAA-TGAAGAC-C------G-----T------------GT-G-CGAG--TTT-TCCC--GGA----T-AACGG------T--T----A------------------------------------------G-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-CGGTTAAA-A---AA--AAAACT-TTTGT------TACTT----TATCA-T-----ATGCAATTC-T-AGGaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatga-T---AC-GAG-TT--C-TCCCGGTTAA----AA---AAAAAACTTTTG-TT--A----C--TTTATCAT--A-T-GC-A-AT-----TCTA---GGTTCAAATTCT---CCAGG---AGA-AA-AAAA--A-------A-C---G----TC---AT-T-TTA-AA--A--TA--AAAA-C-----C-C------A-----GAGTACCATAAAAAT-A-CGAG--CTC-T-CC--AGT----A-AA--A------ttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAA------ATCAA--TTACA-GTCTACAT
gi|17 : T--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATAATTATCTG---GGTACGAGTTGT---CCTGG---GCA-AG-GAA---C-------T-----G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAT-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GGA----GAAA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AT----AG-A--A----------A-T-GA--TTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAA-----GT------AATTT--C-TATCA-T-----GT----gatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-A-AATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTTTC-CCCAAGATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTTT-TG--T-A---A-T-AAAA-TC----AAC-AAA-GTTTT-T-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGA-TTTT-----T-ATAATAAAAATGAC
gi|19 : T--T-G---AAT-AAAA-TT----GACGAAA-A-TTT-T-T------------CTCGTACCT-ATA-TTTT-----T-ATAATAAATTTGACACATTTTTT---TTCTCCGGG-AGA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAAT---T---CTTG---A-TAAAAAAAAAAAGA-CA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG-AGAaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---AAAT--TC---T-----G---GA-------GAATT--ACTTT--ATC--------AATTC--AT-C--AA-TAC-A--TCAGGG-CACGA---GTTC-T-CCATGG---ATAAAAAA-AACGAT-TGTC---CTTTTT---TTTTCTTTT-TATCA-A----TAAAA-TCTGG-ATA-T---AC-GAG-ATGGCATCCTGG---G----AA---AA------TTTGCTT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACA--TTCT---CCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-G---G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAACT-----C-T------G-----A------------GT-A-CGAG--TTC-T-C---GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-T-GA--GTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAAA-TAAGT------CATTT--CATATCA-T-----AT----TTCTTGAGAAAAAAACCGTTGTCTGCTG-GAATTCAA--AATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC------------A----AAAGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTT-T-AT-AG-AA-AC------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TTACTAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAGATTTTATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--CCAGGACAACTCGCACCC-AGAGTTCTGCATATATTGATAAAATAGACG------------TCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA---------ATTA---ATTA-----------A-AA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG-A-AC-TCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACT-AAAATGGCGAT---GTGC-AGGTTCATTCGCA-----TTTTATTCATCG-AACGGGT---AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATT---TC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGG-TATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCt
gi|20 : CC--A-T-TC-GGATT----TCTG---GA---GAACTCTTACCCAGG---AGA-A--------C-------T-C---G----T-----------A-CC--C--AG--AAAA-T-----A--------G-----G------------AT-A-CATG--TTC-T-CCT-GGA----G-AA--G------TCGT----AC------CCA---------------TC---AG-T--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG-------G---AG--AAAAAC-TTTGT------gc
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagaAGAAAAGAAA-----C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAAACC--ATT--C-G---G------A-TTTCTGGA--GAA-C-TCT-T-AC--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA-----------AA--ATAGGATACATG-----------TTCTCCTGG-AGAAtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtC--A-T-AA-AAAT------CTG---GATACGAATTCT---CCCGG---AGA-AA--AAA--C-------T-C---G----TC-A----T-TTA-TC--AACTA--GAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAA--TTC-T-Cttagtggtaagtct
gi|23 : ttatAT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA-A-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATA
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAGATTTTAATGAT-ACATA-T-AAAA-TT----GAC-AAC-A-TTT-A-CT--CCTGGACAACTTGTAC
gi|26 : CTG---GGTACGAGTT-T---CCTGG---ATA-A
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : -------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TG--A--TA--AAAA-C-----C-T------A-----G------------GT-A-CAAG--TTC-TCCC--GGA----agcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG----------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTAT-ATGACAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---TAAATAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTTTTTC---AGA----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAGATTTTATT----G---A-T-AAAAATT----GAC-ATC-G-TTT-T-TTTTCCAGGAGAACTCGCACCC-ATA-TTTT------ATTGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA---------TTAA-----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G-AGA---------TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACT-AAAATGG-GAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATA---T--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--G-T---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACATTGAATGA-TAC--------G-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTTTC-CC--AGA----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTTTTTT--T-G---A-T-AAAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGA-C-AA-----T---ATTATGAA-CA-----------AACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-T-AAAATGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTA-AATTAATTTTATC--TCG-AAC-GGT-AACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--A-TAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgATCA---A-ATCAGAGTTTAC---GAGT--TC---TCCTGAG---AA-------GAAAT--A-TTT--GTT--------ATTTA--A-----AA-T------TCAGAG-TACAACTAGTTC-T-CC-TGG---AAAGAAAACA-A-AT-TGTC----------------AATTT-TAT-A-A----TAAAA-TCT---GTG-T---AC--AA-TT--C-T----G--AG----AAATTAA------CTTT-TT--A-T--CA-ATTCATCA--A-T----AAACA----TC-A---GGCACGAGTTCT---CCTGG---ATA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T-----T-T-CTA-----A--T----AAA-T-----C-T------G-----GTT----------AT-A-CGAGA-TTC-T-CC--TG-----G-AA--ATTTGTTT--T----AG------TCA-----ATTTCTGGCATGA--AG-AT-AT-CTGG-G-TA-C-CA--GTT--TCC-TG---GAA-acctg
gi|5 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcTAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AA-TAA---A-ATCTG--TGTAC---AA-T--TC---T-----G----A-------GAAATTAACTTTTTATC--------AATTC--AT-C--AA-TAA-ACATCAGG--CACGA---GTTC-T-CC-TGG---ATAAAAAA---------------CTTTGT---TT--CT--------A-A----TAAA--TCTGG-TTA-T---AC-GAGATT--C-TCCTGG--A----------AA------TTTG-TTTTAGT--CAATTTCTGGC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACCAGTT-T---CCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-C---G----TCTA-ATATATCA-TC--A--TT--AACT-C-----C-T------A-----A---------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GGA----G-GA--A------T--T----A-------TCA-----A--------A-----AGTAC-AT-CTGA-G----------ATTC--CC-T----AGA-GTATAATTAAAAAA-TG-GT------CTATT--C-TATCA-T-----AA----TTT-TGAG-----AACTGTTA--TGCTATGGA-TCAA--AATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATT--AAATATGA--A----AAAGATTTTTACCTCG--AT-ACTTGTGTAACCC-AGG----T-ATGAGAAAGACTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAA-CATTGAATGA-TAC--------GAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTTCC-C---AGA----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTTTTTT--T-G---A-T-AAAA-taggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAA--T-GGA--TG-GGG-T---CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTAA-T-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--G-GAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGA-CCCACACTCT---ATTT---A-AA-----------A-CAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAA-
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG-T-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-Ggagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--------------AACAgaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTGATTTCAGT--CAG---A-T-AAAA-T-----GAC-AAATG-TTTAT-CT--TCAGGAGAACTTG-ACCA-AGA-TTTT-----T-ATGATAAAATTAACca
gi|8 : --TATAT---GAGT--TCCCCT-----G---AA-------GAAAA--GCCTT---TC--------AATTTT-AT-C--AAATAG-AAATCCGAG-TACAA---TTTC-T-TC-TGG---AGAA-------C-AT-TGTCAAATTTTATCAATT--GTGTTGTGTTA-AGTCCTAAAAATCTGG-GTA-CGTCAC-GTG-TT--C-TCCTCA--AG----AA---AA------ATT--TT--AGT--CA-----------A-T-A------A----TCTG---GTTACGAGCTCT---CCTAA---AGA-A---AAA--C-------TAT---G----TC-ACCT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------TT-A-GGAG--ATCTT-CC--AAA----G-AA--A---------T----ACATTG--TTA-----ATTTT----ATCATAAA-A--AT-CTTG-G-T--C-AA--GTTC-TCC-TG---AA------GA--TAAACA-TTTGT------CATTT----TATCaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtca-GATAA-AATT-TGACAA--TGT-TCTCCAGAAGA---A-AT-----TGTACTCGGATT--TC---T-----ATTTGATAAAATTGAAAG--GCTTT---TCTTCAGGGGAACTC--ATAT--AA-TAT-A--T--GGG-TATGA---GT-C-T-CC-TGG---AGAAAAA------------T---CTTTGTAAATT--CT-----ATCA-T----AAAAA-TCTGG-GTA------C-GAG-TT--C-TCCTGG--AA----AA---AA--------TA-AT--ACC--CA-CTTTTATC--A-T----AGAAA----TCT----GGTATGACTTCT---CCTGG---A-A-AG-AAAA--CT------T-T---G----TC---AT-T-TTA-TC--A--atatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattATA----TATG---GGTATGAGT-CT---CCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-T---G----TA-A-AT-T-CTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CCTGGAA----A-AA--A------TAAT----AC------CCACTTTTATC------AT----AGAA--AT-CT-G-G-TA-T-GA--CTTC-TCC-TG-------G---AA--AGAAAACTTTGT------CATTT----TATCA-aa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC---AAATGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAACACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--A-TAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 11 1 111 1111 222222222222222222 111 222222222222222222222222222222222222 11 11111 6666666666666666666666666 11111 11111 11111111 1111111 1111 22222222222222222222222222222222 222222222222222222222222222222222 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111111 111111 111111 1111 1111111 1111 1111 2222 1 11 11 1 11 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 1 222222 2 1 33 2222222 22222222 111111 1111 11 11111 1111 222222222222222 1 1 444444444444 111 3333333333 666666666666 2 1 4444444444444 1 1111 11 5555555555555555555555555555555 111 1111111 22222222222222222 3333333 1111 22222 11 1 111 1 2222222222222 111111 1 2222 222222 1111 1 1111111 22 111111111 11 1 33333333333333333333333 111 222222222222 111111 2222222222222 1111111 444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 22 1111 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 0 0 0 33 0 99 000 5 33 66 5555 4 66 777 555555555555555555 555 777777777777777777777777777777777777 2 8 777 4 4 4 777 00 00000 7777777777777777777777777 0 11 3 00000 0 4 00000 44 44 55 3 2 55555555 666 7777777 44 99 6666 3 1 33 2 1111 888888 444 0 0 666 444 5 2 99999999999999999999999999999999 2 2 22 33 99 55 2 000000000000000000000000000000000 2 2 55 2 7 55 88888 2 33 222222222222222222222222222222222222222222222222222 44 0 3 6 555 44 3 3 222222222222 55 888888 111111 7777 7777777 2222 6 1 3 0000 1 6666 0 33 33 0 0 55 3 0 6 11 8 8 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 11 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 222222222222222222 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 555555555555555555 0 8 444 8 5 8 6 0 0 8 333333 0 0 5 5 1 5 00 5 5 5555555 00000000 5 5 4 1 5 666666 5 2222 99 77777 2222 5 666666666666666 5 5 1 5 1 5 9 3 5 5 4 555555555555 4 22 9999 666 555 3 9999 4 222 4 4 66 3 2 5 55 3333333333 333333333333 0 3 8888888888888 6 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 44 5 5 0 0000000000000000000000000000000 5 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 5 22222222222222222 8 8 0 2222222 0 1 7777 8 8 00000 11 1 2 8 444 4 5 2 77 4 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 77 1 55 5 6 99 77 66 5 2222 66 888888 3 5 1 5555 1 77 4 4444444 5 77 5 5 33 555555555 77 33 5 1 77777777777777777777777 5 111 222222222222 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 8888 1 5555555 999999999999999999999999999999 5 5 5 888 5 00000 5 0000 44 2 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . . .. . .. ... . .. .. .... . .. ... .................. ... .................................... . . ... . . . ... .. ..... ......................... . .. . ..... . . ..... .. .. .. . . ........ ... ....... .. .. .... . . .. . .... ...... ... . . ... ... . . ................................ . . .. .. .. .. . ................................. . . .. . . .. ..... . .. ................................................... .. . . . ... .. . . ............ .. ...... ...... .... ....... .... . . . .... . .... . .. .. . . .. . . . .. . . ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . ... . . . . . . . ...... . . . . . . .. . . ....... ........ . . . . . ...... . .... .. ..... .... . ............... . . . . . . . . . . . ............ . .. .... ... ... . .... . ... . . .. . . . .. .......... ............ . . ............. . . . . . . .. . .... . .. . . . ............................... . ... .. . . ....... . . . . . ................. . . . ....... . . .... . . ..... .. . . . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . .. . .. . . .. .. .. . .... .. ...... . . . .... . .. . ....... . .. . . .. ......... .. .. . . ....................... . ... ............ .. . ...... .. . . .... ............. . . . .... . ....... .............................. . . . ... . ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 0 0 0 88 0 22 000 7 33 99 2222 5 11 888 222222222222222222 999 999999999999999999999999999999999999 5 0 000 0 0 0 000 66 00000 0000000000000000000000000 1 77 6 00000 8 0 44444 22 22 00 6 8 66666666 444 7777777 22 22 7777 3 0 99 9 2222 444444 111 7 3 555 111 1 4 77777777777777777777777777777777 4 4 44 22 77 99 5 111111111111111111111111111111111 5 5 99 5 5 33 11111 9 99 444444444444444444444444444444444444444444444444444 66 4 3 7 444 66 3 3 333333333333 55 000000 555555 2222 3333333 1111 7 7 7 2222 4 8888 0 22 88 8 6 66 8 8 0 00 0 0 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 00 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 444444444444444444 6 0 000 0 6 0 0 8 8 0 000000 8 4 7 7 4 7 00 7 7 6666666 77777777 7 7 3 7 7 444444 7 1111 33 11111 1111 7 777777777777777 7 7 4 7 4 7 4 4 0 0 4 666666666666 0 00 0000 444 111 6 4444 4 444 4 4 11 9 7 0 11 5555555555 222222222222 0 3 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 44 7 7 1 6666666666666666666666666666666 7 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 7 44444444444444444 0 0 8 2222222 6 4 0000 0 0 00000 00 7 5 0 999 9 7 0 99 3 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 99 4 99 7 7 22 99 99 0 6666 99 888888 2 7 7 0000 4 99 3 7777777 0 99 7 7 44 333333333 99 66 7 4 00000000000000000000000 0 777 777777777777 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 9999 9 3333333 222222222222222222222222222222 0 0 0 888 1 88888 0 6666 66 4 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACTTT--GTC--------AATTC--AT-C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACGA---GTTC-T-CC-TGG---A-GAAAA-----AAAC---T-TGTCCTT--TGTNT--CGTTTTATCA-AT----AAAATCTGG-GTA-T---AC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTTTATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGA-TTTT-----TA-TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--GTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACTTT--GTC--------AATTC--AT-C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACGA---GTTC-T-CC-TGG---A-GAAAA-----AAAC--AT-TGTCCTT--TGTTT--CNTTTTATCA-AT----AAAATCTGG-GTA-T---AC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTTTATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGA-TTTT-----TANTGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--GTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : AT-A--TCAGGGGTAAGA---GTTCCT-CC-TGG---A--AGAA-----AATC--GT-TGTTCC----ATTT--TTTATAATCA-A------AAATCAGGAGTAAT---CC-GAG-TT--T-TCCTGG--AAGAAAAA---AA------TGTG-TC--A-----A-TTTGTATA--AAT-GACAGA-A----TCTG---TGTAC-AGCAAT---CTTGG---A--------AA--T-------T-CTTTA----TCTA-AT-T-TCAATC--AAATA--AACA-T-----CAG------G-----G------------GC-A-CGAG--TTC-T-TCCTGGACTAAA-AA--A------C--TTCGTACCGTTTTTCA-----A--------A--------A--AA-CTGG-GATA-CCAA--GTTC-TTC-TG---AGG-----------AAAA-TTTGTTAGTTTCATTT--C-TGCCA-TAGAAGAT----ATC-TG-GGACGA----GTTCT-TCCTG-GA---CAAGGAAT----------GTCAATTTCAATC--AAAA-T-T
gi|1 : aAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTAT--AAATGACAGA-ATCTG--TGTAC----AGCAATC---T-----T---G--------GAAAT--TCTTT--ATCT-------AATTTCAAT-C--AAATAA-ACATCAGGGGCACGA---GTTC-TTCC-TGG---A-CTAAA-----AAAC----------TT--CGTAC--CGTTTT-TCA-A-----AAAA-CTGG-G-A-T---ACCAAG-TT--C-TTCTGA--GG----AA---AA------TTTG-TT--AGTTTCA-TTTCTGCC--A-TAGA-AGATA----TCTG---GG-ACGAGTTCTT--CCTGG---ACA-AG-GAA-------------T---G----TC-A-AT-T-TCA-----A--TC--AAAA-TT----C-T------G-----A------------GTCA-CA----TTC-C-CC--GG-----G-AA--A------T--T----AT------CCA-----A--------AT----AG-ACAAT-CTGGTA-TA-T-GA--TTCT-TCC-TG---AAACG---AA--AAAA------GT------CATTT--C-TATCACT-----AT----TTC-TGAGAAA--AACCGT-GTATGCTG-GAA-TCAA--AATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAA------ATGA----AAAGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTT-TCATG-GAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-G-CAAT---TTA-TACATTAAGTAG-A-TAGAA----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTTTC---AGA----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAAAAAACA-TCTCACAGATACTC-GT------------ACCACAGATTTTAT-----G---A-A-TAAA-TT----GAC-AAA-T-TTT-TTCT--CCAGGA-AACT-GCACCCCAGA-TTTT------ATTGATAAAATTGACG-----------TCTTCC-GGGAGAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAA-CTAA-----TTATATTA---A-TAG----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG-AGAA-TCGTG--TG-TAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--CAA---TGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACTAAAA-TCGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCGAAAC-GGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--------------AACAAA---AATA---T--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--GCGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-T--AAG--T----GTAAATG-GTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT-----------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--A------A--ATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-TTATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--AAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAAATTTTA-T--T-G---A-TAAAAA-TT----GAC-AAA-GTTTT-T-CT--CCAGGAGAAGTCGCACCA-AG-------------------AAATTGACG------------TCTCCGGG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : AC--AAATAG---AGATTTG--GATTC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAA--ACTTT--GTC---------ATTT--AT-CAAAA-TAG-A--T-GGGG-TACGA---GCTC-T-CC-CAGTAAA-GAAAT-----AAACT-ATATGTCAGA--GG----------AATTG-GT----ACGATCTAC-ATA-C---AC-CA---T--C-T-CTGGACAG----AA---AG------------T--AGC--CA-TTTCTGTC--A-T-TA-AA--A----TCTGAGTGGTAC-AGT--------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-T---G----TC----T-T-TTA-TCAAA--TAG-AAAA-C-----A-T------GATCGTG------------AT-ACCGAG--TTC-TCCC--GGC----G-AA--A--------------A-------TCA-----A--------A----------------GG-G-TA-T-TA--TTTCATTC-TC---AAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaaCTT--TGTC---CGTTTTATCA-AT----AAAATCTGT-GTA-T---AC-GAG-TT--C-TCCT-----G----AA---AAT-----TTTG-TTTCAGT--CA-TTTCTGCA--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACTAGTTCT---CCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T-----GTATTTC-A-AT-T-CAT-TC--A--TG--CAAT-T-----C-TGCGGGAG-----G------------GT-A-CGAG--TT---------------A-AA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AG----AGAA--ATGCTGG-GTTACC-GAGTGTTC-TCCTTA---AAA-G---AA--AAAAAA--AAGT------CATTTTCC-TATCA-------AT----TTC-TGGCGAAGAAGCTG
gi|15 : aaT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--TG-AGA-CTAAT----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTG-AAAA-TCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGGC-GATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCTagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : T--TC---T-----A---GA-------GAAGCC-ACTAT--GTC--------AA------------A-TGTTA--TGAGGG-TACGA---ATTC-C-----GG---A-GAAAA-----AA-----------CTT--TGT----AATTTTACCAGAT----AGAA------------------A-----------TGA--AG----AC---CG------TGTG-CG--AGT-----TTTC--CCGGA-T-AA-CGGT-------TA---GGTACGAGTTCT---CCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-T---G----TT---AC-T-TTA-TC--A--TATGCAAT-T-----C-T------A-----G------------GT-T-CAAA--TTC-T-CCA-GGA----G-AA--A------cactgcagaa
gi|16 : cgctttcG---GGTACGAATTCC------GG---AGA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T--A-AT-T-TTA-CC--AGATA--GAAA-TGAAGAC-C------G-----T------------GT-G-CGAG--TTT-T-CCC-GGA----T-AACGG------T--T----A------------------------------------------G-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-CGGTTAAA-A---AA--AAAACT-TTTGT------TACTT----TATCA-T-----ATGCAATTC-T-AGGaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatga-T---AC-GAG-TT--C-TCCCGGTTAA----AA---AAAAAACTTTTG-TT--A----C--TTTATCAT--A-T-GC-A-AT-----TCTA---GGTTCAAATTCT---CCAGG---AGA-AA-AAAA--A-------A-C---G----TC---AT-T-TTA-AA--A--TA--AAAA-C-----C-C------A-----GAGTACCATAAAAAT-A-CGAG--CTC-T-CC--AGT----A-AA--A------ttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAA------ATCAA--TTACA-GTCTACAT
gi|17 : T--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATAATTATCTG---GGTACGAGTTGT---CCTGG---GCA-AG-GAA---C-------T-----G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAT-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GGA----GAAA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AT----AG-A--A----------A-T-GA--TTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAA-----GT------AATTT--C-TATCA-T-----GT----gatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-A-AATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTTTC-CCCAAGATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTTT-TG--T-A---A-T-AAAA-TC----AAC-AAA-GTTTT-T-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGA-TTTT-----TA-TAATAAAAATGAC
gi|19 : T--T-G---AAT-AAAA-TT----GACGAAA-A-TTT-T-T------------CTCGTACCT-ATA-TTTT-----TA-TAATAAATTTGACACATTTTTT---TTCTCCGGG-AGA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAAT---T---CTTG---A-TAAAAAAAAAAAGA-CA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG-AGAaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---AAAT--TC---T-----G---GA-------GAATT--ACTTT--ATC--------AATTC--AT-C--AA-TAC-A--TCAGGG-CACGA---GTTC-T-CCATGG---ATAAAAA-----AAACG-AT-TGTCCTT--TTTTTTTCTTTTTATCA-AT----AAAATCTGG-ATA-T---AC-GAG-ATGGCATCCTGG---G----AA---AA------TTTGCTT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACA--TTCT---CCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-G---G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAACT-----C-T------G-----A------------GT-A-CGAG--TTC-T-C---GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-T-GA--GTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAAA-TAAGT------CATTT--CATATCA-T-----AT----TTCTTGAGAAAAAAACCGTTGTCTGCTG-GAATTCAA--AATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC------------A----AAAGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTT-T-AT-AG-AA-AC------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TTACTAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAGATTTTATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G-TTT-T-CT--CCAGGACAACTCGCACCC-AGAGTTCTGCATATATTGATAAAATAGACG------------TCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA---------ATTA---ATTA-----------A-AA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG-A-AC-TCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-AGGTTCATTCGCA-----TTTTATTCATCG-AACGGGT---AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATT---TC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGGTATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCt
gi|20 : --AAATAG---G-ATACA--TGTTC------T--CC---T-----G---GA-------GAAG------TC--GT----------ACCC--AT-C--AG-TA-----TCTGGG-TACGA---GTTC-T-CC-TGG---A-G--AA-----AAAC--TT-TGTTCTTACAGTTT--C-TTTGAGCA-AT----gc
gi|20 : CC--A-T-TC-GGATT----TCTG---GA---GAACTCTTACCCAGG---AGA-A--------C-------T-C---G----T-----------A-CC--C--AG--AAAA-T-----A--------G-----G------------AT-A-CATG--TTC-T-CCT-GGA----G-AA--G------TCGT----AC------CCA---------------TC---AG-T--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG-------G---AG--AAAAAC-TTTGT------tctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagaAGAAAAGAAA-----C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAAACC--ATT--C-G---G------A-TTTCTGGA--GAA-C-TCT-T-AC--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA-----------AA--ATAGGATACATG-----------TTCTCCTGG-AGAAtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtC--A-T-AA-AAAT------CTG---GATACGAATTCT---CCCGG---AGA-AA--AAA--C-------T-C---G----TC-A----T-TTA-TC--AACTA--GAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAA--TTC-T-Cttagtggtaagtct
gi|23 : ttatAT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA-A-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATA
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAGATTTTAATGAT-ACATA-T-AAAA-TT----GAC-AAC-A-TTT-A-CT--CCTGGACAACTTGTAC
gi|26 : CTG---GGTACGAGTT-T---CCTGG---ATA-A
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : -------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TG--A--TA--AAAA-C-----C-T------A-----G------------GT-A-CAAG--TTC-TCCC--GGA----agcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG----------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTAT-ATGACAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---TAAATAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTTTTTC---AGA----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAGATTTTATT----G---A-T-AAAAATT----GAC-ATC-G-TTT-T-TTTTCCAGGAGAACTCGCACCC-ATA-TTTT------ATTGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA---------TTAA-----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G-AGA---------TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACTAAAA-TGG-GAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATA---T--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--GT---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACATTGAATGA-TAC--------G-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTTTC-CC--AGA----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTTTTTT--T-G---A-T-AAAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGA-C-AA-----T---ATTATGAA-CA-----------AACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-TAAAA-TGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTA-AATTAATTTTATC--TCG-AAC-GGT-AACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--ATAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgATCA---A-ATCAGAGTTTAC---GAGT--TC---TCCTGAG---AA-------GAAAT--A-TTT--GTT--------ATTTA--A-----AA-T------TCAGAG-TACAACTAGTTC-T-CC-TGG---A--AAGA-----AAACAAAT-TGTC------------AATTTTAT-A-AT----AAAATCT---GTG-T---AC--AA-TT--C-T----G--AG----AAATTAA------CTTT-TT--A-T--CA-ATTCATCA--A-T----AAACA----TC-A---GGCACGAGTTCT---CCTGG---ATA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T-----T-T-CTA-----A--T----AAA-T-----C-T------G-----GTT----------AT-A-CGAGA-TTC-T-CC--TG-----G-AA--ATTTGTTT--T----AG------TCA-----ATTTCTGGCATGA--AG-AT-AT-CTGG-G-TA-C-CA--GTT--TCC-TG---GAA-acctg
gi|5 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcTAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AA-TAA---A-ATCTG--TGTAC---AA-T--TC---T-----G----A-------GAAATTAACTTTTTATC--------AATTC--AT-C--AA-TAA-ACATCAGG--CACGA---GTTC-T-CC-TGG---A-TAAAA-----AA-----------CTT--TGTTT--CT-------A-AT----AAA-TCTGG-TTA-T---AC-GAGATT--C-TCCTGG--A----------AA------TTTG-TTTTAGT--CAATTTCTGGC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACCAGTT-T---CCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-C---G----TCTA-ATATATCA-TC--A--TT--AACT-C-----C-T------A-----A---------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GGA----G-GA--A------T--T----A-------TCA-----A--------A-----AGTAC-AT-CTGA-G----------ATTC--CC-T----AGA-GTATAATTAAAAAA--TGGT------CTATT--C-TATCA-T-----AA----TTT-TGAG-----AACTGTTA--TGCTATGGA-TCAA--AATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATT--AAATATGA--A----AAAGATTTTTACCTCG--AT-ACTTGTGTAACCC-AGG----T-ATGAGAAAGACTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAA-CATTGAATGA-TAC--------GAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTTCC-C---AGA----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTTTTTT--T-G---A-T-AAAA-taggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAA--TGG-A--TG-GGGT----CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTAA-T-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--GGAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGA-CCCACACTCT---ATTT---A-AA-----------A-CAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAA-
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG-T-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-Ggagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--------------AACAgaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTGATTTCAGT--CAG---A-T-AAAA-T-----GAC-AAATG-TTTAT-CT--TCAGGAGAACTTG-ACCA-AGA-TTTT-----TA-TGATAAAATTAACca
gi|8 : --TATAT---GAGT--TCCCCT-----G---AA-------GAAAA--GCCTT---TC--------AATTTT-AT-C--AAATAG-AAATCCGAG-TACAA---TTTC-T-TC-TGG---A-GAACATTGTCAAAT--TT-TATCAAT--TGTGT--TGTGTTA--A-GTCCTAAAAATCTGG-GTA-CGTCAC-GTG-TT--C-TCCTCA--AG----AA---AA------ATT--TT--AGT--CA-----------A-T-A------A----TCTG---GTTACGAGCTCT---CCTAA---AGA-A---AAA--C-------TAT---G----TC-ACCT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------TT-A-GGAG--ATCTT-CC--AAA----G-AA--A---------T----ACATTG--TTA-----ATTTT----ATCATAAA-A--AT-CTTG-G-T--C-AA--GTTC-TCC-TG---AA------GA--TAAACA-TTTGT------CATTT----TATCaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtca-GATAA-AATT-TGACAA--TGT-TCTCCAGAAGA---A-AT-----TGTACTCGGATT--TC---T-----ATTTGATAAAATTGAAAG--GCTTT---TCTTCAGGGGAACTC--ATAT--AA-TAT-A--T--GGG-TATGA---GT-C-T-CC-TGG---A-GAAAA-----A-----------TCTT--TGTA---AATTCTATCA-TA----AAAATCTGG-GTA------C-GAG-TT--C-TCCTGG--AA----AA---AA--------TA-AT--ACC--CA-CTTTTATC--A-T----AGAAA----TCT----GGTATGACTTCT---CCTGG---A-A-AG-AAAA--CT------T-T---G----TC---AT-T-TTA-TC--A--atatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattATA----TATG---GGTATGAGT-CT---CCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-T---G----TA-A-AT-T-CTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CCTGGAA----A-AA--A------TAAT----AC------CCACTTTTATC------AT----AGAA--AT-CT-G-G-TA-T-GA--CTTC-TCC-TG-------G---AA--AGAAAACTTTGT------CATTT----TATCA-aa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAACACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--ATAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 11 1 111 1111 222222222222222222 111 222222222222222222222222222222222222 77777777777777777777777777777777 11111 111111111 11111111 11111111111 1111111111111 33333333333333333333333333333333 222222222222222222222222222222222 11 88888888888888888888888888888888888888888888888 111111111111 111111 111111 1111 1111111 1111 1111 2222 1 11 11 1 11 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 1 222222 2 1 33 2222222 22222222 111111 1111 11 11111 1111 222222222222222 1 1 444444444444 1111 111111111 666666666666 2 1 4444444444444 1 1111 11 5555555555555555555555555555555 111 1111111 22222222222222222 3333333 1111 22222 11 1 111 1 2222222222222 111111 1 2222 222222 1111 1 1111111 22 111111111 11 1 33333333333333333333333 111 222222222222 111111 2222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 22 1111 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 0 0 0 33 0 99 000 5 33 66 5555 4 66 777 555555555555555555 555 777777777777777777777777777777777777 2 8 777 4 4 4 777 99 00000000000000000000000000000000 99999 1 3 00000 0 000000000 3 77 55 3 2 55555555 77777777777 44 99 6666 3 1 44 3 0000000000000 444 1 0 666 444 6 2 44444444444444444444444444444444 2 2 33 33 66 66 2 444444444444444444444444444444444 2 2 66 2 8 55 88888 2 33 33333333333333333333333333333333333333333333333 44 0 3 6 555 44 3 3 222222222222 55 888888 111111 7777 7777777 2222 6 1 3 0000 1 6666 0 33 33 0 0 55 3 0 6 11 8 8 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 11 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 222222222222222222 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 555555555555555555 0 8 444 8 5 8 6 0 0 8 333333 0 0 5 5 1 5 00 5 5 5555555 00000000 5 5 4 1 5 666666 5 2222 99 77777 2222 5 666666666666666 5 5 1 5 1 5 9 3 5 4 4 111111111111 3 3 22 7777 555 333 3 8888 4 5555 4 4 55 2 3 4 1 777777777 333333333333 0 3 8888888888888 6 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 44 5 5 0 0000000000000000000000000000000 5 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 5 22222222222222222 8 8 0 2222222 0 1 7777 8 8 00000 11 1 2 8 444 4 5 2 77 4 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 77 1 55 5 6 99 77 66 5 2222 66 888888 3 5 1 5555 1 77 4 4444444 5 77 5 5 33 555555555 77 33 5 1 77777777777777777777777 5 111 222222222222 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 4 4 777777777 9999999999999999999999999999999 5 5 5 888 66666 5 0000 44 6 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . . .. . .. ... . .. .. .... . .. ... .................. ... .................................... . . ... . . . ... .. ................................ ..... . . ..... . ......... . .. .. . . ........ ........... .. .. .... . . .. . ............. ... . . ... ... . . ................................ . . .. .. .. .. . ................................. . . .. . . .. ..... . .. ............................................... .. . . . ... .. . . ............ .. ...... ...... .... ....... .... . . . .... . .... . .. .. . . .. . . . .. . . ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . ... . . . . . . . ...... . . . . . . .. . . ....... ........ . . . . . ...... . .... .. ..... .... . ............... . . . . . . . . . . . ............ . . .. .... ... ... . .... . .... . . .. . . . . ......... ............ . . ............. . . . . . . .. . .... . .. . . . ............................... . ... .. . . ....... . . . . . ................. . . . ....... . . .... . . ..... .. . . . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . .. . .. . . .. .. .. . .... .. ...... . . . .... . .. . ....... . .. . . .. ......... .. .. . . ....................... . ... ............ .. . ...... .. . . .... ............. . . . . . ......... ............................... . . . ... ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 0 0 0 88 0 22 000 7 33 99 2222 5 11 888 222222222222222222 999 999999999999999999999999999999999999 5 0 000 0 0 0 000 55 88888888888888888888888888888888 11111 2 6 00000 8 888888888 6 33 00 6 8 66666666 88888888888 22 22 7777 3 0 22 1 3333333333333 444 4 9 999 444 1 5 55555555555555555555555555555555 5 5 11 44 99 33 7 000000000000000000000000000000000 7 7 33 7 0 33 11111 9 99 88888888888888888888888888888888888888888888888 66 4 3 7 444 66 3 3 333333333333 55 000000 555555 2222 3333333 1111 7 7 7 2222 4 8888 0 22 88 8 6 66 8 8 0 00 0 0 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 00 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 444444444444444444 6 0 000 0 6 0 0 8 8 0 000000 8 4 7 7 4 7 00 7 7 6666666 77777777 7 7 3 7 7 444444 7 1111 33 11111 1111 7 777777777777777 7 7 4 7 4 7 4 4 0 4 0 000000000000 6 6 44 5555 888 999 3 5555 0 7777 0 0 55 5 0 4 8 777777777 222222222222 0 3 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 44 7 7 1 6666666666666666666666666666666 7 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 7 44444444444444444 0 0 8 2222222 6 4 0000 0 0 00000 00 7 5 0 999 9 7 0 99 3 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 99 4 99 7 7 22 99 99 0 6666 99 888888 2 7 7 0000 4 99 3 7777777 0 99 7 7 44 333333333 99 66 7 4 00000000000000000000000 0 777 777777777777 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 4 4 222222222 2222222222222222222222222222222 0 0 0 888 99999 0 6666 66 2 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACTTT--GTC--------AATTC--AT-C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACGA---GTTC-T-CC-TGG---A--GAAAA-----AAA----TTGTCCTT--TGTNT--C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AAA---A------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--AT--T------AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACTTT--GTC--------AATTC--AT-C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACGA---GTTC-T-CC-TGG---A--GAAAA-----AAA-C--TTGTCCTT--TGTNT--C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AAA---A------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT---CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--AT--T------AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : AT-A--TCAGGGGTAAGA---GTTCCT-CC-TGG---A--AGAAA-----A------TCGT------TGTTC--C-ATTTTTTATAATCA-A------AAATCAGGAGTAA--TCC-GAG-TT--T-TCCTGG--AAGAAAAAA---A------TGTG-TC--A-----A-TTTGTATA--AAT-GACAGA-A----TCTG---TGTAC-AGCAAT---CTTGG---A--------AA--T-------T-CTTTA----TCTA-AT-T-TCAATC--AAATA--AACA-T-----CAG------G-----G------------GC-A-CGAG--TTC-T-TCCTGGACTAAA-AA--AC--TTCGT--ACCGTTTTTCA-----A--------A--------A--AA-CTGG-GATA-CCAA--GTTC-TTC-TG---AGG-----------AAAA-TTTGTTAGTTTCATTT--C-TGCCA-TAGAAGAT----ATC-TG-GGACGA----GTTCT-TCCTG-GA---CAAGGAAT----------GTCAATTTCAATC--AAAA-T-T
gi|1 : aAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTAT--AAATGACAGA-ATCTG--TGTAC----AGCAATC---T-----T---G--------GAAAT--TCTTT--ATCT-------AATTTCAAT-C--AAATAA-ACATCAGGGGCACGA---GTTC-TTCC-TGG---A--CTAAA-----AAA-C--TT--------CGTAC--C-GTTTT------TCA-A-----AAAA-CTGG-G-A---TACCAAG-TT--C-TTCTGA--GG----AAA---A------TTTG-TT--AGTTTCA-TTTCTGCC--A-TAGA-AGATA----TCTG---GG-ACGAGTTCTT--CCTGG---ACA-AG-GAA-------------T---G----TC-A-AT-T-TCA-----A--TC--AAAA-TT----C-T------G-----A------------GTCA-CA----TTC-C-CC--GG-----G-AA--AT--T------AT------CCA-----A--------AT----AG-ACAAT-CTGGTA-TA-T-GA--TTCT-TCC-TG---AAACG---AA--AAAA------GT------CATTT--C-TATCACT-----AT----TTC-TGAGAAA--AACCGT-GTATGCTG-GAA-TCAA--AATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAA------ATGA----AAAGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTT-TCATG-GAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-G-CAAT---TTA-TACATTAAGTAG-A-TAGAA----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTTTC---AGA----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAAAAAACA-TCTCACAGATACTC-GT------------ACCACAGATTT-TAT-----G---A-A-TAAA-TT----GAC-AAA-T--TTT-TTCT--CCAGGA-AACT-GCACCCCAGATTTTAT-------TGATAAAATTGACG-----------TCTTCC-GGGAGAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAA-CTAA-----TTATATTA---A-TAG----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG-AGAA-TCGTG--TG-TAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--CAA---TGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACTAAAA-TCGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCGAAAC-GGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--------------AACAAA---AATA---T--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--G-CGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT--GGTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTATTTT-----CG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-AA--GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT------------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--A------A--ATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-TTATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--AAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAAATTT-TA-T--T-G---A-TAAAAA-TT----GAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCAGGAGAAGTCGCACCA-AG-------------------AAATTGACG------------TCTCCGGG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : AC--AAATAG---AGATTTG--GATTC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAA--ACTTT--GTC---------ATTT--AT-CAAAA-TAG-A--T-GGGG-TACGA---GCTC-T-CC-CAGTAAA--GAAAT-----AAA---------CTA--TATGT--CAGAGGA-----ATTG-GT----ACGATCTAC-ATA---CAC-CA---T--C-T-CTGGACAG----AAA---G------------T--AGC--CA-TTTCTGTC--A-T-TA-AA--A----TCTGAGTGGTAC-AGT--------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-T---G----TC----T-T-TTA-TCAAA--TAG-AAAA-C-----A-T------GATCGTG------------AT-ACCGAG--TTC-TCCC--GGC----G-AA--A----------A-------TCA-----A--------A----------------GG-G-TA-T-TA--TTTCATTC-TC---AAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaaCTT--TGTC---C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGT-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCT-----G----AAA---AT-----TTTG-TTTCAGT--CA-TTTCTGCA--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACTAGTTCT---CCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T-----GTATTTC-A-AT-T-CAT-TC--A--TG--CAAT-T-----C-TGCGGGAG-----G------------GT-A-CGAG--TT---------------A-AA--AT--T------A-------TCA-----A--------AG----AGAA--ATGCTGG-GTTACC-GAGTGTTC-TCCTTA---AAA-G---AA--AAAAAA--AAGT------CATTTTCC-TATCA-------AT----TTC-TGGCGAAGAAGCTG
gi|15 : aaT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--TG-AGA-CTAAT----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTG-AAAA-TCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGGC-GATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCTagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : T--TC---T-----A---GA-------GAAGCC-ACTAT--GTC--------AA------------A-TGTTA--TGAGGG-TACGA---ATTC-C-----GG---A--GAAAA-----AA----------CTT--TGTA-----ATTTT-----ACCAGAT----AGAA-----------------A-----------TGA--AG----ACC---G------TGTG-CG--AGT-----TTTC--CCGGA-T-AA-CGGT-------TA---GGTACGAGTTCT---CCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-T---G----TT---AC-T-TTA-TC--A--TATGCAAT-T-----C-T------A-----G------------GT-T-CAAA--TTC-T-CCA-GGA----G-AA--Acactgcagaa
gi|16 : cgctttcG---GGTACGAATTCC------GG---AGA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T--A-AT-T-TTA-CC--AGATA--GAAA-TGAAGAC-C------G-----T------------GT-G-CGAG--TTT-T-CCC-GGA----T-AACGGT--T------A------------------------------------------G-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-CGGTTAAA-A---AA--AAAACT-TTTGT------TACTT----TATCA-T-----ATGCAATTC-T-AGGaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatga---TAC-GAG-TT--C-TCCCGGTTAA----AAA---AAAAACTTTTG-TT--A----C--TTTATCAT--A-T-GC-A-AT-----TCTA---GGTTCAAATTCT---CCAGG---AGA-AA-AAAA--A-------A-C---G----TC---AT-T-TTA-AA--A--TA--AAAA-C-----C-C------A-----GAGTACCATAAAAAT-A-CGAG--CTC-T-CC--AGT----A-AA--Attcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAA------ATCAA--TTACA-GTCTACAT
gi|17 : T--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATAATTATCTG---GGTACGAGTTGT---CCTGG---GCA-AG-GAA---C-------T-----G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAT-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GGA----GAAA--AT--T------A-------TCA-----A--------AT----AG-A--A----------A-T-GA--TTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAA-----GT------AATTT--C-TATCA-T-----GT----gatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-A-AATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTTTC-CCCAAGATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-T-TG--T-A---A-T-AAAA-TC----AAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGATTTTTA-------TAATAAAAATGAC
gi|19 : T--T-G---AAT-AAAA-TT----GACGAAA-A--TTT-T-T------------CTCGTACCT-ATATTTTTA-------TAATAAATTTGACACATTTTTT---TTCTCCGGG-AGA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAAT---T---CTTG---A-TAAAAAAAAAAAGA-CA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG-AGAaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---AAAT--TC---T-----G---GA-------GAATT--ACTTT--ATC--------AATTC--AT-C--AA-TAC-A--TCAGGG-CACGA---GTTC-T-CCATGG---AT-AAAAA-----AAA-CGATTGTCCTT--TTTTTTTC-TTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-ATA---TAC-GAG-ATGGCATCCTGG---G----AAA---A------TTTGCTT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACA--TTCT---CCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-G---G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAACT-----C-T------G-----A------------GT-A-CGAG--TTC-T-C---GGA----G-AA--AT--T------AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-T-GA--GTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAAA-TAAGT------CATTT--CATATCA-T-----AT----TTCTTGAGAAAAAAACCGTTGTCTGCTG-GAATTCAA--AATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC------------A----AAAGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTT-T-AT-AG-AA-AC------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TTACTAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGACAACTCGCACCC-AGAGTTCTGCATATATTGATAAAATAGACG------------TCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA---------ATTA---ATTA-----------A-AA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG-A-AC-TCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-AGGTTCATTCGCA-----TTTTATTCATCG-AACGGGT---AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATT---TC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGG-TATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCt
gi|20 : --AAATAG---G-ATACA--TGTTC------T--CC---T-----G---GA-------GAAG------TC--GT----------ACCC--AT-C--AG-TA-----TCTGGG-TACGA---GTTC-T-CC-TGG---A--G--AA-----AAA-CT-TTGTTCTTACAGTTT--C--TTTG-----AGCA-AT----gc
gi|20 : CC--A-T-TC-GGATT----TCTG---GA---GAACTCTTACCCAGG---AGA-A--------C-------T-C---G----T-----------A-CC--C--AG--AAAA-T-----A--------G-----G------------AT-A-CATG--TTC-T-CCT-GGA----G-AA--GTCGT------AC------CCA---------------TC---AG-T--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG-------G---AG--AAAAAC-TTTGT------tctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagaAGAAAAGAAA-----C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAAACC---ATT--C-G---G------A-TTTCTGGA--GAA-C--TCT-T-AC--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA-----A--------AATAGGATACATG-----------TTCTCCTGG-AGAAtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtAGA-ATTC-GT------------ACC-CAGATTTCTAGT--T-G---A-T-AAA---T----GAC--GA-GTTTTT-T-CT--CCGGGAGAATTCGTATCC-AGATTTTTA-------TGATAAttagtggtaagtct
gi|23 : AT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA-A-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATAc
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAGATTT-TAATGAT-ACATA-T-AAAA-TT----GAC-AAC-A--TTT-A-CT--CCTGGACAACTTGTAC
gi|26 : CTG---GGTACGAGTT-T---CCTGG---ATA-A
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : -------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TG--A--TA--AAAA-C-----C-T------A-----G------------GT-A-CAAG--TTC-TCCC--GGA----agcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG----------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTAT-ATGACAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---TAAATAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTTTTTC---AGA----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAGATTT-TATT----G---A-T-AAAAATT----GAC-ATC-G--TTT-T-TTTTCCAGGAGAACTCGCACCC-ATATTTTAT-------TGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA---------TTAA-----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G-AGA---------TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACTAAAA-TGG-GAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATA---T--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--G-T---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACATTGAATGA-TAC--------G-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTTTC-CC--AGA----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGA-C-AA-----T---ATTATGAA-CA-----------AACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-TAAAA-TGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTA-AATTAATTTTATC--TCG-AAC-GGT-AACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--A-TAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgATCA---A-ATCAGAGTTTAC---GAGT--TC---TCCTGAG---AA-------GAAAT--A-TTT--GTT--------ATTTA--A-----AA-T------TCAGAG-TACAACTAGTTC-T-CC-TGG---AAAGAAAA-----CAA-A--TTGTCA-------------ATTTT-----AT-A-AT----AAAATCTG---TG---TAC-AA--TT--C-T----G--AG----AAATTAA------CTTT-TT--A-T--CA-ATTCATCA--A-T-AA-A--CA----TC-A---GGCACGAGTTCT---CCTGG---ATA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T-----T-T-CTA-----A--TA--AA---T-----C-T------G-----GTT----------AT-A-CGAGA-TTC-T-CC--TG-----G-AA--AT--TTGTTTTAG------TCA-----ATTTCTGGCATGA--AG-AT-AT-CTGG-G-TA-C-CA--GTT--TCC-TG---GAA-acctg
gi|5 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcTAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AA-TAA---A-ATCTG--TGTAC---AA-T--TC---T-----G----A-------GAAATTAACTTTTTATC--------AATTC--AT-C--AA-TAA-ACATCAGG--CACGA---GTTC-T-CC-TGG---A--TAAAA-----AA----------CTT--TGTTT--C-------------TA-AT----AAA-TCTGG-TTA---TAC-GAGATT--C-TCCTGG--A-------A---A------TTTG-TTTTAGT--CAATTTCTGGC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACCAGTT-T---CCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-C---G----TCTA-ATATATCA-TC--A--TT--AACT-C-----C-T------A-----A---------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GGA----G-GA--AT--T------A-------TCA-----A--------A-----AGTAC-AT-CTGA-G----------ATTC--CC-T----AGA-GTATAATTAAAAAA--TGGT------CTATT--C-TATCA-T-----AA----TTT-TGAG-----AACTGTTA--TGCTATGGA-TCAA--AATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATT--AAATATGA--A----AAAGATTTTTACCTCG--AT-ACTTGTGTAACCC-AGG----T-ATGAGAAAGACTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAA-CATTGAATGA-TAC--------GAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTTCC-C---AGA----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-taggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAA--TGG-A--TG-GGGT----CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTAA-T-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--G-GAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGA-CCCACACTCT---ATTT---A-AA-----------A-CAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAA-
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG-T-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-Ggagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--------------AACAgaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTGATTT-CAGT--CAG---A-T-AAAA-T-----GAC-AAATG--TTTAT-CT--TCAGGAGAACTTG-ACCA-AGATTTTTA-------TGATAAAATTAACca
gi|8 : --TATAT---GAGT--TCCCCT-----G---AA-------GAAAA--GCCTT---TC--------AATTTT-AT-C--AAATAG-AAATCCGAG-TACAA---TTTC-T-TC-TGG---A--GAACATTGTCAAATT--TTATCAAT--TGTGT--T-GTGTT-----A--A-GTCCTAAAAATCTGG-GTACGTCAC-GTG-TT--C-TCCTCA--AG----AAA---A------ATT--TT--AGT--CA-----------A-T-A------A----TCTG---GTTACGAGCTCT---CCTAA---AGA-A---AAA--C-------TAT---G----TC-ACCT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------TT-A-GGAG--ATCTT-CC--AAA----G-AA--A---T------ACATTG--TTA-----ATTTT----ATCATAAA-A--AT-CTTG-G-T--C-AA--GTTC-TCC-TG---AA------GA--TAAACA-TTTGT------CATTT----TATCaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtca-GATAA-AATT-TGACAA--TGT-TCTCCAGAAGA---A-AT-----TGTACTCGGATT--TC---T-----ATTTGATAAAATTGAAAG--GCTTT---TCTTCAGGGGAACTC--ATAT--AA-TAT-A--T--GGG-TATGA---GT-C-T-CC-TGG---A--GAAAA-----A----------TCTT--TGTA---A-ATTCT-----ATCA-TA----AAAATCTGG-GTA-----C-GAG-TT--C-TCCTGG--AA----AAA---A--------TA-AT--ACC--CA-CTTTTATC--A-T----AGAAA----TCT----GGTATGACTTCT---CCTGG---A-A-AG-AAAA--CT------T-T---G----TC---AT-T-TTA-TC--A--atatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattATA----TATG---GGTATGAGT-CT---CCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-T---G----TA-A-AT-T-CTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CCTGGAA----A-AA--ATAAT------AC------CCACTTTTATC------AT----AGAA--AT-CT-G-G-TA-T-GA--CTTC-TCC-TG-------G---AA--AGAAAACTTTGT------CATTT----TATCA-aa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAACACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--A-TAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 11 1 111 1111 111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 111 77777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111 2222222 1111 333333333333333333333333333 11111 2222222222222222222222222 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222 111111 1111 1111111 1111 1111 2222 1 11 11 1 11 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 1 222222 2 1 33 2222222 22222222 111111 1111 11 11111 1111 222222222222222 1 1 444444444444 1111 111111111 666666666666 2 1 4444444444444 1 1111 11 5555555555555555555555555555555 111 1111111 22222222222222222 3333333 1111 22222 11 1 111 1 2222222222222 111111 1 2222 222222 1111 1 1111111 22 111111111 11 1 33333333333333333333333 111 222222222222 111111 2222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 22 1111 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 0 0 0 33 0 99 000 5 33 66 2222 5 55 777 999999999999999999 000000000000000000000000000000000000000000000000 5 7 666 3 3 3 111 1 00000000000000000000000000000000000000000 0 8888888 3 2222 3 3 44 3 1 22222222 555 0000000 3 88 6666 3 55555 3 0000 666666 444 2 1 2 444 7 2 999 333333333333333333333333333 2 2 22 33 77 66 2 00000 2 3333333333333333333333333 2 2 66 2 8 33 99999 3 44 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 3 999999 555 3 3 7777 99999 66 222222 222222 7777 7777777 2222 6 1 3 0000 1 6666 0 33 33 0 0 55 3 0 6 11 8 8 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 11 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 222222222222222222 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 555555555555555555 0 8 444 8 5 8 6 0 0 8 333333 0 0 5 5 1 5 00 5 5 5555555 00000000 5 5 4 1 5 666666 5 2222 99 77777 2222 5 666666666666666 5 5 1 5 1 5 9 3 5 4 4 111111111111 3 3 22 7777 555 333 3 8888 4 5555 4 4 55 2 3 4 1 777777777 333333333333 0 3 8888888888888 6 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 44 5 5 0 0000000000000000000000000000000 5 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 5 22222222222222222 8 8 0 2222222 0 1 7777 8 8 00000 11 1 2 8 444 4 5 2 77 4 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 77 1 55 5 6 99 77 66 5 2222 66 888888 3 5 1 5555 1 77 4 4444444 5 77 5 5 33 555555555 77 33 5 1 77777777777777777777777 5 111 222222222222 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 4 4 777777777 9999999999999999999999999999999 5 5 5 888 66666 5 0000 44 6 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . . .. . .. ... . .. .. .... . .. ... .................. ................................................ . . ... . . . ... . ......................................... . ....... . .... . . .. . . ........ ... ....... . .. .... . ..... . .... ...... ... . . . ... . . ... ........................... . . .. .. .. .. . ..... . ......................... . . .. . . .. ..... . .. ...................................................... . . ...... ... . . .... ..... .. ...... ...... .... ....... .... . . . .... . .... . .. .. . . .. . . . .. . . ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . ... . . . . . . . ...... . . . . . . .. . . ....... ........ . . . . . ...... . .... .. ..... .... . ............... . . . . . . . . . . . ............ . . .. .... ... ... . .... . .... . . .. . . . . ......... ............ . . ............. . . . . . . .. . .... . .. . . . ............................... . ... .. . . ....... . . . . . ................. . . . ....... . . .... . . ..... .. . . . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . .. . .. . . .. .. .. . .... .. ...... . . . .... . .. . ....... . .. . . .. ......... .. .. . . ....................... . ... ............ .. . ...... .. . . .... ............. . . . . . ......... ............................... . . . ... ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 0 0 0 88 0 22 000 7 33 99 4444 7 55 000 888888888888888888 666666666666666666666666666666666666666666666666 9 3 444 6 6 6 444 4 55555555555555555555555555555555555555555 3 7777777 6 8888 3 3 66 3 8 88888888 888 1111111 3 55 7777 3 55555 3 8888 777777 777 1 7 7 777 1 7 777 111111111111111111111111111 7 7 99 77 33 88 9 00000 9 7777777777777777777777777 9 9 88 9 6 66 44444 1 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 6 444444 555 6 6 5555 77777 11 333333 888888 2222 3333333 1111 7 7 7 2222 4 8888 0 22 88 8 6 66 8 8 0 00 0 0 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 00 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 444444444444444444 6 0 000 0 6 0 0 8 8 0 000000 8 4 7 7 4 7 00 7 7 6666666 77777777 7 7 3 7 7 444444 7 1111 33 11111 1111 7 777777777777777 7 7 4 7 4 7 4 4 0 4 0 000000000000 6 6 44 5555 888 999 3 5555 0 7777 0 0 55 5 0 4 8 777777777 222222222222 0 3 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 44 7 7 1 6666666666666666666666666666666 7 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 7 44444444444444444 0 0 8 2222222 6 4 0000 0 0 00000 00 7 5 0 999 9 7 0 99 3 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 99 4 99 7 7 22 99 99 0 6666 99 888888 2 7 7 0000 4 99 3 7777777 0 99 7 7 44 333333333 99 66 7 4 00000000000000000000000 0 777 777777777777 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 4 4 222222222 2222222222222222222222222222222 0 0 0 888 99999 0 6666 66 2 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACT-TT--GTC--------AATTC--AT---C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAA-----AAA----TTGTCCTT--TGTNT--C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT-CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACT-TT--GTC--------AATTC--AT---C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAA-----AAA----TTGTCCTT--TGTNT--C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT-CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : AT-A--TCAGGGGTAAG---AGTTCCT-CC-TGG---A--AGA-----AAA----TCGT------TGTTC--C-ATTTTTTATAATCA-A------AAATCAGGAGTAA--TCC-GAG-TT--T-TCCTGG--AAGAAAAA---AA------TGTG-TC--A-----A-TTTGTATA--AAT-GACAGA-A----TCTG---TGTAC-AGCAAT-CTTGG---A--------AA--T-------T-CTTTA----TCTA-AT-T-TCAATC--AAATA--AACA-T-----CAG------G-----G------------GC-A-CGAG--TTC-T-TCCTGGACTAAA-AA--A------C--TTCGTACCGTTTTTCA-----A--------A--------A--AA-CTGG-GATA-CCAA--GTTC-TTC-TG---AGG-----------AAAA-TTTGTTAGTTTCATTT--C-TGCCA-TAGAAGAT----ATC-TG-GGACGA----GTTCT-TCCTG-GA---CAAGGAAT----------GTCAATTTCAATC--AAAA-T-T
gi|1 : aAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTAT--AAATGACAGA-ATCTG--TGTAC----AGCAATC---T-----T---G--------GAAAT--TCT-TT--ATCT-------AATTTCAAT---C--AAATAA-ACATCAGGGGCACG---AGTTC-TTCC-TGG---ACTAAA-----AAA---------CTT--CGTAC--C-GTTTT------TCA-A-----AAAA-CTGG-G-A---TACCAAG-TT--C-TTCTGA--GG----AA---AA------TTTG-TT--AGTTTCA-TTTCTGCC--A-TAGA-AGATA----TCTG---GG-ACGAGTTCTTCCTGG---ACA-AG-GAA-------------T---G----TC-A-AT-T-TCA-----A--TC--AAAA-TT----C-T------G-----A------------GTCA-CA----TTC-C-CC--GG-----G-AA--A------T--T----AT------CCA-----A--------AT----AG-ACAAT-CTGGTA-TA-T-GA--TTCT-TCC-TG---AAACG---AA--AAAA------GT------CATTT--C-TATCACT-----AT----TTC-TGAGAAA--AACCGT-GTATGCTG-GAA-TCAA--AATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAA------ATGA----AAAGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTT-TCATG-GAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-G-CAAT---TTA-TACATTAAGTAG-A-TAGAA----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTTTC---AGA----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAAAAAACA-TCTCACAGATACTC-GT------------ACCACAGATTT-TAT-----G---A-A-TAAA-TT----GAC-AAA-T--TTT-TTCT--CCAGGA-AACT-GCACCCCAGATTTTAT-------TGATAAAATTGACG-----------TCTTCC-GGGAGAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAA-CTAA-----TTATATTA---A-TAG----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG-AGAA-TCGTG--TG-TAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--CAA---TGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACTAAAA-TCGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCGAAAC-GGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--------------AACAAA---AATA---T--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--G-CGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT--GGTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTATTTT-----CG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-AA--GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT------------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--A------A--ATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-TTATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--AAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAAATTT-TA-T--T-G---A-TAAAAA-TT----GAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCAGGAGAAGTCGCACCA-AG-------------------AAATTGACG------------TCTCCGGG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : AC--AAATAG---AGATTTG--GATTC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAA--ACT-TT--GTC---------ATTT--AT---CAAAA-TAG-A--T-GGGG-TACG---AGCTC-T-CC-CAGTAAAGAAAT-----AAA---------CTA--TATGT--CAGAGGA-----ATTG-GT----ACGATCTAC-ATA---CAC-CA---T--C-T-CTGGACAG----AA---AG------------T--AGC--CA-TTTCTGTC--A-T-TA-AA--A----TCTGAGTGGTAC-AGT------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-T---G----TC----T-T-TTA-TCAAA--TAG-AAAA-C-----A-T------GATCGTG------------AT-ACCGAG--TTC-TCCC--GGC----G-AA--A--------------A-------TCA-----A--------A----------------GG-G-TA-T-TA--TTTCATTC-TC---AAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaaCTT--TGTC---C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGT-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCT-----G----AA---AAT-----TTTG-TTTCAGT--CA-TTTCTGCA--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACTAGTTCT-CCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T-----GTATTTC-A-AT-T-CAT-TC--A--TG--CAAT-T-----C-TGCGGGAG-----G------------GT-A-CGAG--TT---------------A-AA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AG----AGAA--ATGCTGG-GTTACC-GAGTGTTC-TCCTTA---AAA-G---AA--AAAAAA--AAGT------CATTTTCC-TATCA-------AT----TTC-TGGCGAAGAAGCTG
gi|15 : aaT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--TG-AGA-CTAAT----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTG-AAAA-TCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGGC-GATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCTagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : T--TC---T-----A---GA-------GAAGCC-ACT-AT--GTC--------AA--------------A-TGTTA--TGAGGG-TACG---AATTC-C-----GG---AGAAAA-----AA----------CTT--TGTA-----ATTTT-----ACCAGAT----AGAA-----------------A-----------TGA--AG----AC---CG------TGTG-CG--AGT-----TTTC--CCGGA-T-AA-CGGT-------TA---GGTACGAGTTCT-CCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-T---G----TT---AC-T-TTA-TC--A--TATGCAAT-T-----C-T------A-----G------------GT-T-CAAA--TTC-T-CCA-GGA----G-AA--A------cactgcagaa
gi|16 : cgctttcG---GGTACGAATTCC----GG---AGA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T--A-AT-T-TTA-CC--AGATA--GAAA-TGAAGAC-C------G-----T------------GT-G-CGAG--TTT-T-CCC-GGA----T-AACGG------T--T----A------------------------------------------G-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-CGGTTAAA-A---AA--AAAACT-TTTGT------TACTT----TATCA-T-----ATGCAATTC-T-AGGaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatga---TAC-GAG-TT--C-TCCCGGTTAA----AA---AAAAAACTTTTG-TT--A----C--TTTATCAT--A-T-GC-A-AT-----TCTA---GGTTCAAATTCT-CCAGG---AGA-AA-AAAA--A-------A-C---G----TC---AT-T-TTA-AA--A--TA--AAAA-C-----C-C------A-----GAGTACCATAAAAAT-A-CGAG--CTC-T-CC--AGT----A-AA--A------ttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAA------ATCAA--TTACA-GTCTACAT
gi|17 : T--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATAATTATCTG---GGTACGAGTTGT-CCTGG---GCA-AG-GAA---C-------T-----G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAT-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GGA----GAAA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AT----AG-A--A----------A-T-GA--TTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAA-----GT------AATTT--C-TATCA-T-----GT----gatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-A-AATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTTTC-CCCAAGATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-T-TG--T-A---A-T-AAAA-TC----AAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGATTTTTA-------TAATAAAAATGAC
gi|19 : T--T-G---AAT-AAAA-TT----GACGAAA-A--TTT-T-T------------CTCGTACCT-ATATTTTTA-------TAATAAATTTGACACATTTTTT---TTCTCCGGG-AGA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAAT---T---CTTG---A-TAAAAAAAAAAAGA-CA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG-AGAaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---AAAT--TC---T-----G---GA-------GAATT--ACT-TT--ATC--------AATTC--AT---C--AA-TAC-A--TCAGGG-CACG---AGTTC-T-CCATGG---ATAAAA-----AAAACGATTGTCCTT--TTTTTTTC-TTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-ATA---TAC-GAG-ATGGCATCCTGG---G----AA---AA------TTTGCTT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACA--TTCT-CCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-G---G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAACT-----C-T------G-----A------------GT-A-CGAG--TTC-T-C---GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-T-GA--GTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAAA-TAAGT------CATTT--CATATCA-T-----AT----TTCTTGAGAAAAAAACCGTTGTCTGCTG-GAATTCAA--AATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC------------A----AAAGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTT-T-AT-AG-AA-AC------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TTACTAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGACAACTCGCACCC-AGAGTTCTGCATATATTGATAAAATAGACG------------TCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA---------ATTA---ATTA-----------A-AA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG-A-AC-TCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-AGGTTCATTCGCA-----TTTTATTCATCG-AACGGGT---AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATT---TC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGG-TATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCt
gi|20 : --AAATAG---G-ATACA--TGTTC------T--CC---T-----G---GA-------GAAG-------TC--GT----------ACCC--AT---C--AG-TA-----TCTGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAA-----ACT----TTGTTCTTACAGTTT--C--TTTG-----AGCA-AT----gc
gi|20 : ---GATT--TC---T-----G---GA-------GAA-----CTCTT--ACCCAGGAG--AACTC--GTACCC--AG-AAA-A--T-AGGA-TACA---TGTTC-T-CC-TGG---AGAA----------------GTC------GTAC--C-----C-----ATCA-GT----A---TCTGG-GTA-----C-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AAAC----TTTG-TT--tctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagAGAAAAGAAA-----C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAAACC---ATT--C-G---G------A-TTTCTGGA--GAA-C--TCT-T-AC--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA-----A--------AATAGGATACATG-----------TTCTCCTGG-AGAAcgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtAGA-ATTC-GT------------ACC-CAGATTTCTAGT--T-G---A-T-AAA---T----GAC--GA-GTTTTT-T-CT--CCGGGAGAATTCGTATCC-AGATTTTTA-------TGATAAttagtggtaagtct
gi|23 : AT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA-A-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATAc
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAGATTT-TAATGAT-ACATA-T-AAAA-TT----GAC-AAC-A--TTT-A-CT--CCTGGACAACTTGTAC
gi|26 : CTG---GGTACGAGTT-T-CCTGG---ATA-A
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : -------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TG--A--TA--AAAA-C-----C-T------A-----G------------GT-A-CAAG--TTC-TCCC--GGA----agcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG----------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTAT-ATGACAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---TAAATAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTTTTTC---AGA----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAGATTT-TATT----G---A-T-AAAAATT----GAC-ATC-G--TTT-T-TTTTCCAGGAGAACTCGCACCC-ATATTTTAT-------TGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA---------TTAA-----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G-AGA---------TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACTAAAA-TGG-GAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATA---T--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--G-T---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACATTGAATGA-TAC--------G-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTTTC-CC--AGA----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGA-C-AA-----T---ATTATGAA-CA-----------AACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-TAAAA-TGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTA-AATTAATTTTATC--TCG-AAC-GGT-AACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--A-TAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgATCA---A-ATCAGAGTTTAC---GAGT--TC---TCCTGAG---AA-------GAAAT--A-T-TT--GTT--------ATTTA--A-------AA-T------TCAGAG-TACAACTAGTTC-T-CC-TGGAA-AGAAAAC----AAA----TTGTC------------A-ATTTT-----AT-A-AT----AAAATCT---GTG---TAC--AA-TT--C-T----G--AG----AAATTAA------CTTT-TT--A-T--CA-ATTCATCA--A-T----AAACA----TC-A---GGCACGAGTTCT-CCTGG---ATA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T-----T-T-CTA-----A--T----AAA-T-----C-T------G-----GTT----------AT-A-CGAGA-TTC-T-CC--TG-----G-AA--ATTTGTTT--T----AG------TCA-----ATTTCTGGCATGA--AG-AT-AT-CTGG-G-TA-C-CA--GTT--TCC-TG---GAA-acctg
gi|5 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcTAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AA-TAA---A-ATCTG--TGTAC---AA-T--TC---T-----G----A-------GAAATTAACT-TTTTATC--------AATTC--AT---C--AA-TAA-ACATCAGG--CACG---AGTTC-T-CC-TGG---ATAAAA-----AA----------CTT--TGTTT--C-------------TA-AT----AAA-TCTGG-TTA---TAC-GAGATT--C-TCCTGG--A----------AA------TTTG-TTTTAGT--CAATTTCTGGC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACCAGTT-T-CCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-C---G----TCTA-ATATATCA-TC--A--TT--AACT-C-----C-T------A-----A---------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GGA----G-GA--A------T--T----A-------TCA-----A--------A-----AGTAC-AT-CTGA-G----------ATTC--CC-T----AGA-GTATAATTAAAAAA--TGGT------CTATT--C-TATCA-T-----AA----TTT-TGAG-----AACTGTTA--TGCTATGGA-TCAA--AATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATT--AAATATGA--A----AAAGATTTTTACCTCG--AT-ACTTGTGTAACCC-AGG----T-ATGAGAAAGACTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAA-CATTGAATGA-TAC--------GAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTTCC-C---AGA----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-taggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAA--TGG-A--TG-GGGT----CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTAA-T-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--G-GAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGA-CCCACACTCT---ATTT---A-AA-----------A-CAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAA-
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG-T-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-Ggagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--------------AACAgaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTGATTT-CAGT--CAG---A-T-AAAA-T-----GAC-AAATG--TTTAT-CT--TCAGGAGAACTTG-ACCA-AGATTTTTA-------TGATAAAATTAACca
gi|8 : --TATAT---GAGT--TCCCCT-----G---AA-------GAAAA--GCC-TT---TC--------AATTTT-AT---C--AAATAG-AAATCCGAG-TACA---ATTTC-T-TC-TGG---AGAACATTGTCAAATT--TTATCAAT--TGTGT--T-GTGTT-----A--A-GTCCTAAAAATCTGG-GTACGTCAC-GTG-TT--C-TCCTCA--AG----AA---AA------ATT--TT--AGT--CA-----------A-T-A------A----TCTG---GTTACGAGCTCT-CCTAA---AGA-A---AAA--C-------TAT---G----TC-ACCT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------TT-A-GGAG--ATCTT-CC--AAA----G-AA--A---------T----ACATTG--TTA-----ATTTT----ATCATAAA-A--AT-CTTG-G-T--C-AA--GTTC-TCC-TG---AA------GA--TAAACA-TTTGT------CATTT----TATCaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtca-GATAA-AATT-TGACAA--TGT-TCTCCAGAAGA---A-AT-----TGTACTCGGATT--TC---T-----ATTTGATAAAATTGAAAG--GCT-TT---TCTTCAGGGGAACTC--ATA--T--AA-TAT-A--T--GGG-TATG---AGT-C-T-CC-TGG---AGAAAA-----A----------TCTT--TGTA---A-ATTCT-----ATCA-TA----AAAATCTGG-GTA-----C-GAG-TT--C-TCCTGG--AA----AA---AA--------TA-AT--ACC--CA-CTTTTATC--A-T----AGAAA----TCT----GGTATGACTTCT-CCTGG---A-A-AG-AAAA--CT------T-T---G----TC---AT-T-TTA-TC--A--atatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattATA----TATG---GGTATGAGT-CT-CCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-T---G----TA-A-AT-T-CTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CCTGGAA----A-AA--A------TAAT----AC------CCACTTTTATC------AT----AGAA--AT-CT-G-G-TA-T-GA--CTTC-TCC-TG-------G---AA--AGAAAACTTTGT------CATTT----TATCA-aa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAACACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--A-TAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 11 1 111 1111 111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444 111 77777777777777777777777777777777777777777 1111 11111111 2222222 1111 333333333333333333333333333 11111 2222222222222222222222222 11 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 222222 111111 1111 1111111 1111 1111 2222 1 11 11 1 11 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 111111111111111111 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 1 222222 2 1 33 2222222 22222222 111111 1111 11 11111 1111 222222222222222 1 1 444444444444 1111 111111111 666666666666 2 1 4444444444444 1 1111 11 5555555555555555555555555555555 111 1111111 22222222222222222 3333333 1111 22222 11 1 111 1 2222222222222 111111 1 2222 222222 1111 1 1111111 22 111111111 11 1 33333333333333333333333 111 222222222222 111111 2222222222222 111111111 4444444444444444444444444444444 11111 1111 11 1111 3333333333333 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 999999999999999999999999999999999999999 2222222 3333333 1111 22 1111 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 0 0 0 33 0 99 000 5 33 66 2222 5 55 777 999999999999999999 000000000000000000000000000000000000000000000000 5 7 666 3 3 3 111 1 00000000000000000000000000000000000000000 0 8888888 3 2222 3 3 44 3 1 22222222 555 0000000 3 88 6666 3 55555 3 0000 666666 444 2 1 2 444 7 2 999 333333333333333333333333333 2 2 22 33 77 66 2 00000 2 3333333333333333333333333 2 2 66 2 8 33 99999 3 44 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 3 999999 555 3 3 7777 99999 66 222222 222222 7777 7777777 2222 6 1 3 0000 1 6666 0 33 33 0 0 55 3 0 6 11 8 8 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 11 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 222222222222222222 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 555555555555555555 0 8 444 8 5 8 6 0 0 8 333333 0 0 5 5 1 5 00 5 5 5555555 00000000 5 5 4 1 5 666666 5 2222 99 77777 2222 5 666666666666666 5 5 1 5 1 5 9 3 5 4 4 111111111111 3 3 22 7777 555 333 3 8888 4 5555 4 4 55 2 3 4 1 777777777 333333333333 0 3 8888888888888 6 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 44 5 5 0 0000000000000000000000000000000 5 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 5 22222222222222222 8 8 0 2222222 0 1 7777 8 8 00000 11 1 2 8 444 4 5 2 77 4 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 5 5 999 5 77 1 55 5 6 99 77 66 5 2222 66 888888 3 5 1 5555 1 77 4 4444444 5 77 5 5 33 555555555 77 33 5 1 77777777777777777777777 5 111 222222222222 99 6 999999 77 5 5 8888 9999999999999 4 4 4 4 4 777777777 9999999999999999999999999999999 5 5 5 888 66666 5 0000 44 6 5 5 5 3 0000 4444444444444 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 5 5 5 3333 555555555555555555555555555555555555555 3333333 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 8888 1 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . . .. . .. ... . .. .. .... . .. ... .................. ................................................ . . ... . . . ... . ......................................... . ....... . .... . . .. . . ........ ... ....... . .. .... . ..... . .... ...... ... . . . ... . . ... ........................... . . .. .. .. .. . ..... . ......................... . . .. . . .. ..... . .. ...................................................... . . ...... ... . . .... ..... .. ...... ...... .... ....... .... . . . .... . .... . .. .. . . .. . . . .. . . ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... .................. . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . ... . . . . . . . ...... . . . . . . .. . . ....... ........ . . . . . ...... . .... .. ..... .... . ............... . . . . . . . . . . . ............ . . .. .... ... ... . .... . .... . . .. . . . . ......... ............ . . ............. . . . . . . .. . .... . .. . . . ............................... . ... .. . . ....... . . . . . ................. . . . ....... . . .... . . ..... .. . . . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . . ... . .. . .. . . .. .. .. . .... .. ...... . . . .... . .. . ....... . .. . . .. ......... .. .. . . ....................... . ... ............ .. . ...... .. . . .... ............. . . . . . ......... ............................... . . . ... ..... . .... .. . . . . . .... ............. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . . .... ....................................... ....... . . ... ....... .... . ... . . . .. .... . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 0 0 0 88 0 22 000 7 33 99 4444 7 55 000 888888888888888888 666666666666666666666666666666666666666666666666 9 3 444 6 6 6 444 4 55555555555555555555555555555555555555555 3 7777777 6 8888 3 3 66 3 8 88888888 888 1111111 3 55 7777 3 55555 3 8888 777777 777 1 7 7 777 1 7 777 111111111111111111111111111 7 7 99 77 33 88 9 00000 9 7777777777777777777777777 9 9 88 9 6 66 44444 1 22 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 4 6 444444 555 6 6 5555 77777 11 333333 888888 2222 3333333 1111 7 7 7 2222 4 8888 0 22 88 8 6 66 8 8 0 00 0 0 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 00 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 999999999999999999 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 444444444444444444 6 0 000 0 6 0 0 8 8 0 000000 8 4 7 7 4 7 00 7 7 6666666 77777777 7 7 3 7 7 444444 7 1111 33 11111 1111 7 777777777777777 7 7 4 7 4 7 4 4 0 4 0 000000000000 6 6 44 5555 888 999 3 5555 0 7777 0 0 55 5 0 4 8 777777777 222222222222 0 3 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 44 7 7 1 6666666666666666666666666666666 7 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 7 44444444444444444 0 0 8 2222222 6 4 0000 0 0 00000 00 7 5 0 999 9 7 0 99 3 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 0 0 444 7 99 4 99 7 7 22 99 99 0 6666 99 888888 2 7 7 0000 4 99 3 7777777 0 99 7 7 44 333333333 99 66 7 4 00000000000000000000000 0 777 777777777777 22 7 000000 99 7 7 0000 0000000000000 4 4 4 4 4 222222222 2222222222222222222222222222222 0 0 0 888 99999 0 6666 66 2 0 0 0 2 6666 9999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 7 7 7 0000 111111111111111111111111111111111111111 4444444 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0000 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACT-TT--GTC--------AATTC--AT---C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAA-----AAA----TTGTCCTT--TGTNT--C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT-CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACT-TT--GTC--------AATTC--AT---C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAA-----AAA----TTGTCCTT--TGTNT--C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT-CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : AT-A--TCAGGGGTAAG---AGTTCCT-CC-TGG---A--AGA-----AAA----TCGT------TGTTC--C-ATTTTTTATAATCA-A------AAATCAGGAGTAA--TCC-GAG-TT--T-TCCTGG--AAGAAAAA---AA------TGTG-TC--A-----A-TTTGTATA--AAT-GACAGA-A----TCTG---TGTAC-AGCAAT-CTTGG---A--------AA--T-------T-CTTTA----TCTA-AT-T-TCAATC--AAATA--AACA-T-----CAG------G-----G------------GC-A-CGAG--TTC-T-TCCTGGACTAAA-AA--A------C--TTCGTACCGTTTTTCA-----A--------A--------A--AA-CTGG-GATA-CCAA--GTTC-TTC-TG---AGG-----------AAAA-TTTGTTAGTTTCATTT--C-TGCCA-TAGAAGAT----ATC-TG-GGACGA----GTTCT-TCCTG-GA---CAAGGAAT----------GTCAATTTCAATC--AAAA-T-T
gi|1 : aAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTAT--AAATGACAGA-ATCTG--TGTAC----AGCAATC---T-----T---G--------GAAAT--TCT-TT--ATCT-------AATTTCAAT---C--AAATAA-ACATCAGGGGCACG---AGTTC-TTCC-TGG---ACTAAA-----AAA---------CTT--CGTAC--C-GTTTT------TCA-A-----AAAA-CTGG-G-A---TACCAAG-TT--C-TTCTGA--GG----AA---AA------TTTG-TT--AGTTTCA-TTTCTGCC--A-TAGA-AGATA----TCTG---GG-ACGAGTTCTTCCTGG---ACA-AG-GAA-------------T---G----TC-A-AT-T-TCA-----A--TC--AAAA-TT----C-T------G-----A------------GTCA-CA----TTC-C-CC--GG-----G-AA--A------T--T----AT------CCA-----A--------AT----AG-ACAAT-CTGGTA-TA-T-GA--TTCT-TCC-TG---AAACG---AA--AAAA------GT------CATTT--C-TATCACT-----AT----TTC-TGAGAAA--AACCGT-GTATGCTG-GAA-TCAA--AATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGACACATTAA--------GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAA------ATGA----AAAGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTT-TCATG-GAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-G-CAAT---TTA-TACATTAAGTAG-A-TAGAA----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTTTC---AGA----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAAAAAACA-TCTCACAGATACTC-GT------------ACCACAGATTT-TAT-----G---A-A-TAAA-TT----GAC-AAA-T--TTT-TTCT--CCAGGA-AACT-GCACCCCAGATTTTAT-------TGATAAAATTGACG-----------TCTTCC-GGGAGAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAA-CTAA-----TTATATTA---A-TAG----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG-AGAA-TCGTG--TG-TAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG---TTGATTTTC----ACTTGCC-TATAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGAAAC-CGTT-TTA--CAA---TGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACTAAAA-TCGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCGAAAC-GGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--------------AACAAA---AATA---T--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-A--TT-TAAA--T-GT-CTAAA-T-G-TG-GT-AAG--T----GTAAAT--G-CGT--A-----------T---CAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-ATTTG----TCG-TCCTA----TCCATAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----AAGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TT-ATGA-AAGATAT-AAT--CT-----TA-T------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGAAT--AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-ATAAT-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT--GGTAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTATTTT-----CG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-AA--GTTA----CTTACTC----AA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGT-A--G-AAGGTAT-AATACCT-----TA-TGGTTG--TTGTAAGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : -GT-TTAGA-T-G-TG-TA-A-G--T----GTAAAT------------------------------------AG-TTCT-TA---GT-CTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAATC----GA-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TG-A--TTAAGATAT-A-----------T--TGGT----TT-------------TGTAT-A----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGATT-------AACA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagtgacACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--A------A--ATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-TTATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--AAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAAATTT-TA-T--T-G---A-TAAAAA-TT----GAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCAGGAGAAGTCGCACCA-AG-------------------AAATTGACG------------TCTCCGGG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : AC--AAATAG---AGATTTG--GATTC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAA--ACT-TT--GTC---------ATTT--AT---CAAAA-TAG-A--T-GGGG-TACG---AGCTC-T-CC-CAGTAAAGAAAT-----AAA---------CTA--TATGT--CAGAGGA-----ATTG-GT----ACGATCTAC-ATA---CAC-CA---T--C-T-CTGGACAG----AA---AG------------T--AGC--CA-TTTCTGTC--A-T-TA-AA--A----TCTGAGTGGTAC-AGT------TGG---AGAGAGAGAAA--CAAAAACTT-T---G----TC----T-T-TTA-TCAAA--TAG-AAAA-C-----A-T------GATCGTG------------AT-ACCGAG--TTC-TCCC--GGC----G-AA--A--------------A-------TCA-----A--------A----------------GG-G-TA-T-TA--TTTCATTC-TC---AAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaaCTT--TGTC---C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGT-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCT-----G----AA---AAT-----TTTG-TTTCAGT--CA-TTTCTGCA--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACTAGTTCT-CCTGG---AGA-CA-AGAA--C-------T-----GTATTTC-A-AT-T-CAT-TC--A--TG--CAAT-T-----C-TGCGGGAG-----G------------GT-A-CGAG--TT---------------A-AA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AG----AGAA--ATGCTGG-GTTACC-GAGTGTTC-TCCTTA---AAA-G---AA--AAAAAA--AAGT------CATTTTCC-TATCA-------AT----TTC-TGGCGAAGAAGCTG
gi|15 : aaT-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--TG-AGA-CTAAT----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTG-AAAA-TCT-G--T-ATA--CAGTA-TA-GAAAAGTAAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TCTGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATACGTT-TTA--T-A-AATGGC-GATTA-ACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCTagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : T--TC---T-----A---GA-------GAAGCC-ACT-AT--GTC--------AA--------------A-TGTTA--TGAGGG-TACG---AATTC-C-----GG---AGAAAA-----AA----------CTT--TGTA-----ATTTT-----ACCAGAT----AGAA-----------------A-----------TGA--AG----AC---CG------TGTG-CG--AGT-----TTTC--CCGGA-T-AA-CGGT-------TA---GGTACGAGTTCT-CCCGGTTAAAA-AA-AAAA--CTT-----T-T---G----TT---AC-T-TTA-TC--A--TATGCAAT-T-----C-T------A-----G------------GT-T-CAAA--TTC-T-CCA-GGA----G-AA--A------cactgcagaa
gi|16 : cgctttcG---GGTACGAATTCC----GG---AGA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T--A-AT-T-TTA-CC--AGATA--GAAA-TGAAGAC-C------G-----T------------GT-G-CGAG--TTT-T-CCC-GGA----T-AACGG------T--T----A------------------------------------------G-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-CGGTTAAA-A---AA--AAAACT-TTTGT------TACTT----TATCA-T-----ATGCAATTC-T-AGGaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|16 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatga---TAC-GAG-TT--C-TCCCGGTTAA----AA---AAAAAACTTTTG-TT--A----C--TTTATCAT--A-T-GC-A-AT-----TCTA---GGTTCAAATTCT-CCAGG---AGA-AA-AAAA--A-------A-C---G----TC---AT-T-TTA-AA--A--TA--AAAA-C-----C-C------A-----GAGTACCATAAAAAT-A-CGAG--CTC-T-CC--AGT----A-AA--A------ttcaaattctccaggagaaaaaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgagggtacgaattccggagaaaaaactttgtaattttaccagatagaaatgaagaccgtgtgcgagttttcccggataacggttaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAA------ATCAA--TTACA-GTCTACAT
gi|17 : T--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATAATTATCTG---GGTACGAGTTGT-CCTGG---GCA-AG-GAA---C-------T-----G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAT-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GGA----GAAA--A------T--T----A-------TCA-----A--------AT----AG-A--A----------A-T-GA--TTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAA-----GT------AATTT--C-TATCA-T-----GT----gatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-A-AATT---T-A-TAC--------G-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTTTC-CCCAAGATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-T-TG--T-A---A-T-AAAA-TC----AAC-AAA-GT-TTT-T-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGATTTTTA-------TAATAAAAATGAC
gi|19 : T--T-G---AAT-AAAA-TT----GACGAAA-A--TTT-T-T------------CTCGTACCT-ATATTTTTA-------TAATAAATTTGACACATTTTTT---TTCTCCGGG-AGA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAAT---T---CTTG---A-TAAAAAAAAAAAGA-CA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG-AGAaaagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---AAAT--TC---T-----G---GA-------GAATT--ACT-TT--ATC--------AATTC--AT---C--AA-TAC-A--TCAGGG-CACG---AGTTC-T-CCATGG---ATAAAA-----AAAACGATTGTCCTT--TTTTTTTC-TTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-ATA---TAC-GAG-ATGGCATCCTGG---G----AA---AA------TTTGCTT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACA--TTCT-CCTGG---ACA-AG-GAAA--C-------T-G---G----TC-A-AT-T-TCA-TC--A--TA--AAAACT-----C-T------G-----A------------GT-A-CGAG--TTC-T-C---GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-T-GA--GTTC-TCC-TA---AAA-G---AA--AAAAAA-TAAGT------CATTT--CATATCA-T-----AT----TTCTTGAGAAAAAAACCGTTGTCTGCTG-GAATTCAA--AATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC------------A----AAAGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTT-T-AT-AG-AA-AC------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TTACTAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGACAACTCGCACCC-AGAGTTCTGCATATATTGATAAAATAGACG------------TCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA---------ATTA---ATTA-----------A-AA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG-A-AC-TCG-G--TGTTAC-CAGTA-TA-G-AAAGTAAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTATGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGAAA--CGTT-TTA--CAACGATGGCTGATAC-GCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-AGGTTCATTCGCA-----TTTTATTCATCG-AACGGGT---AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATT---TC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTGT-AT--T-GT--TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATTGG-TATTCA-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TTG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACTC----AA-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATATGAAT--CT-----TA-TGGTG---TTGTAA-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGCt
gi|20 : --AAATAG---G-ATACA--TGTTC------T--CC---T-----G---GA-------GAAG-------TC--GT----------ACCC--AT---C--AG-TA-----TCTGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAA-----ACT----TTGTTCTTACAGTTT--C--TTTG-----AGCA-AT----gc
gi|20 : ---GATT--TC---T-----G---GA-------GAA-----CTCTT--ACCCAGGAG--AACTC--GTACCC--AG-AAA-A--T-AGGA-TACA---TGTTC-T-CC-TGG---AGAA----------------GTC------GTAC--C-----C-----ATCA-GT----A---TCTGG-GTA-----C-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AAAC----TTTG-TT--tctgggtacgagttctcctgggtaagagttctccagaaatccgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagAGAAAAGAAA-----C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAAACC---ATT--C-G---G------A-TTTCTGGA--GAA-C--TCT-T-AC--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA-----A--------AATAGGATACATG-----------TTCTCCTGG-AGAAcgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtAGA-ATTC-GT------------ACC-CAGATTTCTAGT--T-G---A-T-AAA---T----GAC--GA-GTTTTT-T-CT--CCGGGAGAATTCGTATCC-AGATTTTTA-------TGATAAttagtggtaagtct
gi|23 : AT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-ACC-ATGGGGCTCA-A-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATAc
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAGATTT-TAATGAT-ACATA-T-AAAA-TT----GAC-AAC-A--TTT-A-CT--CCTGGACAACTTGTAC
gi|26 : CTG---GGTACGAGTT-T-CCTGG---ATA-A
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : -------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TG--A--TA--AAAA-C-----C-T------A-----G------------GT-A-CAAG--TTC-TCCC--GGA----agcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-A-----TAA--TTACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG----------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTAT-ATGACAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-A-CATT---TAAATAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTTTTTC---AGA----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAGATTT-TATT----G---A-T-AAAAATT----GAC-ATC-G--TTT-T-TTTTCCAGGAGAACTCGCACCC-ATATTTTAT-------TGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA---------TTAA-----T---ATTA---A--A-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G-AGA---------TGGTAC--AGTA-TA-GAAAAGTAAA-TTG-T-TGATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCAT-----ATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGAA---CGTT-TTA--CAA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACTAAAA-TGG-GAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATA---T--C-----AC--TTC-TG------AG--TGT------------------------------AA-TGG-TA-TA-A----------TCAAT--G-T---------------------A----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA-TTT----TCG-TCCTA----TCA-TAT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACTA----TA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT--AT----------------------------------------------TTTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGATT--AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACATTGAATGA-TAC--------G-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTTTC-CC--AGA----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGA-C-AA-----T---ATTATGAA-CA-----------AACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG-AGAAATCA-GGATGCTCCACAGTAGTATGAAAAGTAAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TATGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-TAAAA-TGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTA-AATTAATTTTATC--TCG-AAC-GGT-AACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAG-AATTT-T-AA--T-------AA-T-G-------AAG--T----GTGAActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgAAA-T-G-TGGTA-AAAGCT----GTAAAT--A-TAT--A-----------TATTCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT------G-TCCTA----TCA-TATAATAATAAA-G-TG----CTTAacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgATCA---A-ATCAGAGTTTAC---GAGT--TC---TCCTGAG---AA-------GAAAT--A-T-TT--GTT--------ATTTA--A-------AA-T------TCAGAG-TACAACTAGTTC-T-CC-TGGAA-AGAAAAC----AAA----TTGTC------------A-ATTTT-----AT-A-AT----AAAATCT---GTG---TAC--AA-TT--C-T----G--AG----AAATTAA------CTTT-TT--A-T--CA-ATTCATCA--A-T----AAACA----TC-A---GGCACGAGTTCT-CCTGG---ATA-AA-AAAC--T-------T-T---G----T-----T-T-CTA-----A--T----AAA-T-----C-T------G-----GTT----------AT-A-CGAGA-TTC-T-CC--TG-----G-AA--ATTTGTTT--T----AG------TCA-----ATTTCTGGCATGA--AG-AT-AT-CTGG-G-TA-C-CA--GTT--TCC-TG---GAA-acctg
gi|5 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcTAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AA-TAA---A-ATCTG--TGTAC---AA-T--TC---T-----G----A-------GAAATTAACT-TTTTATC--------AATTC--AT---C--AA-TAA-ACATCAGG--CACG---AGTTC-T-CC-TGG---ATAAAA-----AA----------CTT--TGTTT--C-------------TA-AT----AAA-TCTGG-TTA---TAC-GAGATT--C-TCCTGG--A----------AA------TTTG-TTTTAGT--CAATTTCTGGC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACCAGTT-T-CCTGG---AAT-AG-GCA-----------T-C---G----TCTA-ATATATCA-TC--A--TT--AACT-C-----C-T------A-----A---------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GGA----G-GA--A------T--T----A-------TCA-----A--------A-----AGTAC-AT-CTGA-G----------ATTC--CC-T----AGA-GTATAATTAAAAAA--TGGT------CTATT--C-TATCA-T-----AA----TTT-TGAG-----AACTGTTA--TGCTATGGA-TCAA--AATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-ACA-AT-----TTACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATT--AAATATGA--A----AAAGATTTTTACCTCG--AT-ACTTGTGTAACCC-AGG----T-ATGAGAAAGACTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAA-CATTGAATGA-TAC--------GAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTTCC-C---AGA----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--T-G---A-T-AAAA-taggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GAAAC-CGTT-TTA--ACA-AATGGT-GATTA-GCT--ACAGAAA--TGG-A--TG-GGGT----CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGAT---GTGC-GG--TCATTAA-T-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-A--TT-T-ATAAT-GTCCTAAA-T-GTTG-CA-AAGT-T----GTAAAT--G-GAT--A-----------T---CA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTATTTTCTGCTCG-T-CTA----TTTTCATAT-AA-AAG-G-TG----CTTACTCAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TT-A--T-AAGATAT-AAT--CT-----TATTGGTGTTACTATAA-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGA-CCCACACTCT---ATTT---A-AA-----------A-CAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAA-
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcGTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--AGG-T-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AAGTG--ATAC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-Ggagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgtt--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--------------AACAgaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtCC-CTGATTT-CAGT--CAG---A-T-AAAA-T-----GAC-AAATG--TTTAT-CT--TCAGGAGAACTTG-ACCA-AGATTTTTA-------TGATAAAATTAACca
gi|8 : --TATAT---GAGT--TCCCCT-----G---AA-------GAAAA--GCC-TT---TC--------AATTTT-AT---C--AAATAG-AAATCCGAG-TACA---ATTTC-T-TC-TGG---AGAACATTGTCAAATT--TTATCAAT--TGTGT--T-GTGTT-----A--A-GTCCTAAAAATCTGG-GTACGTCAC-GTG-TT--C-TCCTCA--AG----AA---AA------ATT--TT--AGT--CA-----------A-T-A------A----TCTG---GTTACGAGCTCT-CCTAA---AGA-A---AAA--C-------TAT---G----TC-ACCT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------TT-A-GGAG--ATCTT-CC--AAA----G-AA--A---------T----ACATTG--TTA-----ATTTT----ATCATAAA-A--AT-CTTG-G-T--C-AA--GTTC-TCC-TG---AA------GA--TAAACA-TTTGT------CATTT----TATCaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtca-GATAA-AATT-TGACAA--TGT-TCTCCAGAAGA---A-AT-----TGTACTCGGATT--TC---T-----ATTTGATAAAATTGAAAG--GCT-TT---TCTTCAGGGGAACTC--ATA--T--AA-TAT-A--T--GGG-TATG---AGT-C-T-CC-TGG---AGAAAA-----A----------TCTT--TGTA---A-ATTCT-----ATCA-TA----AAAATCTGG-GTA-----C-GAG-TT--C-TCCTGG--AA----AA---AA--------TA-AT--ACC--CA-CTTTTATC--A-T----AGAAA----TCT----GGTATGACTTCT-CCTGG---A-A-AG-AAAA--CT------T-T---G----TC---AT-T-TTA-TC--A--atatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattATA----TATG---GGTATGAGT-CT-CCTGG---AGA-A---AAATCT-------T-T---G----TA-A-AT-T-CTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CCTGGAA----A-AA--A------TAAT----AC------CCACTTTTATC------AT----AGAA--AT-CT-G-G-TA-T-GA--CTTC-TCC-TG-------G---AA--AGAAAACTTTGT------CATTT----TATCA-aa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggaactcatataGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--TGTA-A-----T-----C--TCG-AAC-GGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAACACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCA--TC-T-GT--AAGT-CTAAACT-G-TG-TATGAG--CTTAGGTAAAC--A-TAT--AGTATACTTGGGT---CAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTATTTT----GCGATCCTAAAAGTCATGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTT----CACACA---GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTTA--G-AAGATAT-ATG--GTGAAGATA-TGGC----ATATCT-TG------TATATT------TTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGACTC-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
blockSeqs : C C A C . GC . CC . G TT AG TCGG G . CCC ATTTGATAAAATT AGGCTTTTCTTCAGGGGAACTCATATAATATA C G ACT . T A TAA C TTGTCAAATTTTATCAATTGTGTTGTGTT GTCCTA . CGTC C A GG A T ACAG ATT AAAACTT C TC GTTT A CCGG . AGA TAATTA AGT G C T TTA C G GAG ACAAAAACTTTGTC A A T AA GA TG C GAAGA . AGAGTACCATAAAA C C TT T C TG C A CG TTTGTTTTAGTCAATTTCTGGCATGAAGATAT G T TTACC GTG A T GGTT GTAT TT AACTTT . TCC CT GCAA T A A AGAA C TGTC T AT . GA T A TA A C TGC A C . A TTGA . TT C A T ATAGT A TTAA AA T . A TCGGA A GA TATAAGAATCTG CACCG T G TGC G AAA T ACTTCA CC C T C T T . TAACC ACCATGGGGCTCAA T A G TT . TT AT TAAT TT T . G TA T AT TAAATATGAA T . GTA A T A T G TACCGA T G . T . TG A A GAATGA . A A G T A TTATAA A GTTT A CCCA TAAT T TCGATACCCAC . T T G C . A A . . A CCCCCCCCCTTA . C AT GAT CAT TA A TCTG G GTT A . TT G C . T TGCATATAT GACAGATTTTTT G G TCGGTAGAAGC T A C C A CG T TTCC A TA T C ATTCTTGATAAAAAAAAAAAG A GTC GG G ATCA T T A T AATCAGGATGCTCCAC G T ATTGAT A AAAT . G TGACA TA T A A ATA C T A TT G . A G TTACATAAA . G CGCA . TT T T TAC A AA A CG T A TA GT TT C TACA GC GGATAA T A C TTGT T GT C AATTAA T CA . G CA TTTGT TT TT C G AGAGAAACACAAGGAGC A CTG GTTTCCTACAC TT G TATACC CC . G AAT TATAATGTCC C G T G T AGCTTAG ATATAGTATACTTGGGTCAG T T . CAC CTGCT A AAAG TT A T T T T TTCC AAAGCA TTA T CATTTACTAGGTTATATAACATCTGTTTTTGAAGTCA T T AGCT CAT . A C . T G T TT AATCTTATTGGTGTTACTATAACATGTATA TATTTTT T A TT CACGGTA TAA C A A A A CT CTTA A G C TAA A A ATC CC . CC T GCC G T . CAA T T . C AAT TC A . A ATA G CAC T TTA A T T A A AC G A GGCC A A . GTT T . . TCGGACGG C CG
blockSeqs : . C . . . . . . . . CT . G A . . CCTGAGAA CTCTTACCCAGGAGAACTCGTACCCAGAAAA G . . . . . AA G AAAACGATTGTCCTTTTTTTTTCTTTTT GAT . T . . . . C TTAA . ACT . TT GC . GCC . TA TA . T C . . G . GG ACTGTATTTCA . . T . . G . T . GCGGGAGG . . A . C A A . . TACATTGTTAATTTTATCATAAAAAT G . TAT T . . G CG . CTTTT . CA T . . G G AAAA T GTA . A . GA T . . . . TTT A A . A AT . . C A . AA . T C C . A ACG A . TTAGAATC . T T GT G . . . . . . . . . . . ACAATTAATTACT T . . A . . . TCA T . . . . T AT TAAATGAA T . . . G . . . . T . . . . TG . . GAATGA . . . G A . . . . C TC . . CGATACCCAC . . T . C . A T . . . CCCCCCCCCTTA . . AT CA . AT . . . GT . . . G T . T TA CATTTTTTT G . T . G C . . . T . A A . . CACTCTATTTAAA . . . . ACGT . . . . CTCGGTGTTACC . . GTGTA T . . . . . C C A TTA A . A . G . A . TAGACCATA . . GAC . . G T CC . . A A . . . . . . TACA . GGATAA T . C T T . C CA T . . . CA TTTGT . G . G GCCAGAAGA A . TCGC . . GAT . . . CA TATAATGTC . . . . . AAGCT TGGTATTCATCA . . . . T . . TC A . . . T . CACACA . C TTGAAATCGTTTTTTGAAG T . . TT . . . . . . . G ATGGTGAAGATATGGCATATCTTG TAT . . TG CTTA AT . A . . . C CTTA A . . . . . . . . . . G . . . CC . . . . . . . . A AT . AA T . . . T . . . . A . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . AC . A T . . GGA ATTAACTTTTTATCAATTCATCAATAAACA C . . . . . . G ACTTTGTTCTTACAGTTTCTTTG GT . C . . . . C GG . TT . . GT . GTC . GA TA . G C . . G . AA ACTATGTCAC . . T . . . . . . GATCGTG . . . . C C A . . TAATACCCACTTTTATCATAGAAAT G . TAT T . . C G . AATAA . C T . . A G AA C TA . A . GA T . . . . T . . . . A . . C . . AA . . T . . . CGG . . . . G C G G . . . . . . . . . . . ACAATTTACAT C . . . . . . T T . . . . . A CA T . . . T . . . . . . . . . G . . TTAC . . . G T . . . . . CC . . CATACCC . . . . . . A A . . . . . . AG T . T . . . GT . . . C T . G TA T T . . . G C . . . T . A A . . TATTATGAACA . . . . CA . . . . ATCTGTATAC . . ATGT T . . . . . T C . TTA A . A . G . A . TATAC . . A . . G T CG . . A A . . . . . . T . . T . C T . . C A T . . . A T . . . . AGAGA A . TCC . . GAT . . . A TGTAAGTC . . . . . AGTT ATATATATTCA . . . . T . . TG A . . . T . AA . T TTAACATGTTTGAAGA T . . T . . . . . . . G AATACCTTATGGTTGTTGTAAGT AT . . T C A . A . . . C TTA A . . . . . . . . . . C . . . C . . . . . . . . A T . A T . . . T . . . . A . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . CA . G G . . AGA AAGCCTTTCAATTTTATCAAATAGAAA C . . . . . . T AAACTATATGTCAGAGGA AT . T . . . . C AG . T . . GT . GCA . AA TA . G C . . A . AA ATCTTTGTAA . . C . . . . . . GGTT . . . . . . T . . TTATCCAAATAGACAAT G . TAC G . . A G . CATTT . C T . . A A A T . . . . . . . T T G G . . . . . . . . . . . ATCAATTACA T . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAAA . . . G T . . . . . C . . CATACCC . . . . . . A A . . . . . . AA T . T . . . TG . . . G C . T TA . . . . . G . . . . T . A T . . TTATTAAA . . . . A . . . . TGGTAC . . TTGT A . . . . . T C . TTC A . A . G . G . TTATA . . G . . . T C . . C A . . . . . . T . . T . T T . . C T T . . . A T . . . . AGA A . TCC . . G . . . A GTATTGT . . . . . AGT GGTATATCA . . . . T . . T A . . . T . GA . T TTAAATGTTTTAAGGA T . . T . . . . . . . G GAATCTTATGGTGTTGTAAT TA . . T C G . A . . . C TTA . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . A T . A . . . . T . . . . A . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . CT . G G . . GGA AAACTTTGTCATTTATCAAAATAGA C . . . . . . G AAACTTCGTACCGTTTT AT . T . . . . C AG . T . . GT . CAT . GC CA . A C . . G . AA ACTTTTGTT . . A . . . . . . GA . . . . . . A . . TTATCAAAGAGAAATG G . TAT T . . A A . AAAA . C T . . A . . . . T . . . . . . . . . . . . ATAATTACA . . . . . . . . . . . TA . . . . T . . . . . C . . CATACC . . . . . . . A . . . . . . AT T . T . . . A . . . G T . T AT . . . . G . . . . T . . . . . ATTAATTA . . . . A . . . . T . . T A . . . . . . . TATA . . A . . . . C . . A A . . . . . . T . . T . T . . . . A . . . . . T . . . . AGA . . TC . . T . . . A TAAT . . . . . AGT GGATATCA . . . . G . . T A . . . T . AA . T TTAACTGTTTTGAAGT . . . T . . . . . . . T ATTGGTTT T . . T . G . A . . . C CTC . . . . . . . . . . . C . . . T . . . . . . . . . T . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . . . . A T . . GGA TTACTTTATCAATTCATCAATACA C . . . . . . G CAAATTGTCAATTTT AT . T . . . . C AG . T . . GT . GCC . GA TA . G G . . G . AA ACTGGTCA . . T . . . . . . AG . . . . . . A . . TTACTCAAATAGAAT G . TAC G . . A G . AATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . T . . . . . C . . CC . . . . . . . A . . . . . . TT T . T . . . G . . . C T . T TA . . . . . . . . . TATTAAA . . . . A . . . . T . . . . . . . . TA . . A . . . . C . . . A . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . AGA . . . . . . . . . . . GT GTA . . . . . . . T C . . . . . TA . . TTAA . . . A . . . . . . . G AT T . . T . G . . . . . C TT . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . T . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . .
blockSeqs : . G . . . GGA GCCACTATGTCAAATGTTA C . . . . . . G ATCTTTGTAAATTCT GT . T . . . . C AG . C . . GT . GCC . GA AA . A C . . C . GG ACTTTGTC . . T . . . . . . GT . . . . . . A . . TTATCAAAAGTACAT T . TAT G . . G G . A . . . . . . . . . . TT C . T . . . C . . . G T . . A . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C TT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GAA ATATTTGTTATTTAAAAT . . . . . . . T AACTTTGTAATTTT AT . T . . . . C AA . T . . GT . TCA . GA TA . G C . . C . GG CTTTGTA . . T . . . . . . GG . . . . . . A . . TTATCAAATAGAA . . AT A . . G G . . . . . . . . . AG T . T . . . A . . . G C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GA GTCGTACCCATCAGTA . . . . . . . G AACTTTGTTTC AT . . . . . . . G . A . . CC . GGC . A A . G C . . T . AA AAACGTC . . T . . . . . . GA . . . . . . A . . ATCAAA . . TC G . . G . . . . . A T . T . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G GTCGTACCC TA . . . . . . . G . . . . T . ATC . . T . C C . . T . GG TCGTCTA . . T . . . . . . AG . . . . . . A . . TTA . . . C . . . . . T T . T .
blockSeqs : A . . . . . . A . . . . . . . . . T . G C . . A . GA CTGTCA . . T . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . G . . . G . . CTTTGT . . T . . . . . . GG . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . G . . TGTCA . . . . . . . . . GG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : *** G*** ** GGA*************** AACTTTGTCAATTCATCAAAATANA*********************** AACTTTGTAATTTC*************************** AT***** T*** AG****** GT** GA** TA**** GA* ACTTTGTC******************* T* ** ** A**** TAT*** G**** ****** T****** AA** GA ** ACAATTACA********* ** T* CA**************** TAATGA* ******** ** C**** T*** ACTTT******* T************ TATTAAA************************ TCGGGTAC********* NTGT*** TTA TTATA******** ** ** C** A* T*** CA AGA******************** TCC********* GAT*** TATAATGTC**** GGTATATCA********************** T* AA*********** T* G*** AATCTTATGGTGTTGTAAT******************** TAT**** C****** A** TTA* ** T** A** G********
originalCons : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTAC---GAGT--TC---T-----G---GA-------GAAAN--ACT-TT--GTC--------AATTC--AT---C--AA-TAN-A--TCAGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAA-----AAA----TTGTCCTT--TGTNT--C-GTTTT-----ATCA-AT----AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCTGG--AG----AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT-CCTGG---AGA-AG-GAAA--C-------T-C---G----TC-A-AT-T-TTA-TC--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG---AAA-G---AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----AT----TTC-TGAGGAAGAAACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-ACA-ATTAA--TTACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--A------A--A----AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATT---TNA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--T-G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACG-----------TTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAA-----T---ATTA---A-TA-----------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGAA-TCG-G--TGNTAC-CAGTA-TA-GAAAAGTAAAATTGGT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC-CGTT-TTA--CAA-AATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TT-T-AT--T-GT-CTAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAAT--G-TAT--A-----------T---CA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCATTATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTC----NA-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-A--G-AAGATAT-AAT--CT-----TA-TGGT----TTGTAA-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGACTTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
finalCons : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TAT--AAATAA---A-ATCTG--TGTACG---AGT--TC---TGGA---------------GAAAACTTTGTCAATTCATCAAAATANA-----------------------TCAGGG-TACG---AGTTC-T-CC-TGG---AGAAAAAACTTTGTAATTTC---------------------------ATCAAT-----AAAATCTGG-GTAT---AC-GAG-TT--C-TCCTGGAG------AA---AA------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-TGA--AGATA----TCTG---GGTACGAGTTCT-CCTGG---AGA-AGA-AAACTTTGTC-------------------AT-T-TTAT-C--A--TA--AAAA-T-----C-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AA--A------T--T----AC------TCA-----A--------AT----AG-A--AT-CTGG-GTAT---GA--GTTC-TCC-TG---AAAG----AA--AAAAAA-TTTGT------CATTT--C-TATCAT------AT----TTC-TGAGGAAA--ACCGTTGT-TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAACACAATTACA---------GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCACT-TCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATCA----------------AAAGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CATTTAATGA-TAC--------G-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTCC----AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATTT---G---A-T-AAAA-TT----GAC-AAA-G--TTT-T-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGACGACTTT-------TCTCC-GG-AGAACT------------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGA-CTAATATTAAA------------------------A-CA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG-AGATCGGGTAC---------AGTA-TA-GAAAAGTAAANTGT---TTATTTTTC----ACT-GCC-TATGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCATTATA--------GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGAAAC--GTT-TTA--CAAA-ATGGC-GATTA-GCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGAT---GTGC-GG--TCATTTA-A-----TTTTATC--TCG-AAC-GGTCAAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGCAGA--------------------AACAAA---AATATCC---------AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-A--TTTATAATGTC----TAAA-T-G-TG-TA-AAG--T----GTAAATGGTATATCA----------------------ATG-TAG-TTCT-TC---GTATTTT----TCG-TCCTA----TCAT-ATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACTCAA-----------GT---ACATTATAT-TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TT-AG---AAGATATAATCTTATGGTGTTGTAAT--------------------TATATTAT----TTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGATTA-AAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGT--CA-TA--CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-CG--------GAA-AC--GCTGGC
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 1 11 1 11111 222222 111 22222222222222222222222222222222 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 11111111 111111 1111111111 111111 1111111 22222222222222222222222222222222222222222 1111111 2222222222222222222222222 11111 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 111111111 33333333333333 1111111 1111111 444444444 11 1 11 11111 1 1 11111 1 11 1 111111 1 444444 11 222 11 11111 11 2222222222222 11111 222 111 111111 11111 22222222222222 1 1 11 11 33333 11 1 666666666666666666 1 111 1 222222 2 1 33 333333333 111111 1111 11 11111 1111 222222222222222 1 1 444444444444 11 111111111 666666666666 2 4444444444444 1 1111 111 4444444444444444444444444444444444 111 1111111 1111 8888888888888888888888888888888888 111 1111 111111 1 111 1 2222222222222 111111 2 1 2222 222222 1111 1 11111 22 111111111 11 1 33333333333333333333333 111 222222222222 111111 1 111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 11 1111 1111111 1111 1 1111 22222222222222222 111 333333333333333333333333333333333333333333 1111 1 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 3333333 1111 22 1 2 111 111 111 111 1 111 1111 111111111
lowQualScore : 2 6 3 3 3 88 3 3 88888 77 7 888 5 66 888888 5 111 66666666666666666666666666666666 55 99 8 4 4 4 777 2222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 1 3 4444 3 3 44 3 44 22222222 3 666666 0 3 1111111111 0 88888 3 4444 111111 555 4444444 2 2 555 66666666666666666666666666666666666666666 44 6666666 44 44 888 888 3 5555555555555555555555555 3 3 44 3 33333 88888 3 55555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 4 555555 55 4 4 222222222 4 66 00000000000000 7777 4444444 55 3333333 1 222222222 8 999 11 55 3 0 6 11 8 8 88888 3 0 0 3 88888 0 33 2 3 0 555555 0 333333 11 000 33 7 77777 3 33 8888888888888 0 66666 7 5 333 6 111 6 999999 99 5 5 5 5 5 77 44444 5 11111111111111 2 6 1 6 5 55 99 99 11 00000 0 88 8 8 8 11 0 66 333333333333333333 0 8 444 8 5 8 6 0 0 8 333333 0 0 5 5 1 5 00 5 5 5 999999999 5 5 4 1 5 666666 5 2222 99 77777 2222 5 666666666666666 5 5 1 5 1 5 9 3 5 4 4 111111111111 4 4 22 55 666 555 3 9999 4 55 4 55 0 2 4 1 777777777 0 0 777777777777 0 6 8888888888888 6 1 0 0 5 5 77 1 2222 1 1 77 5 000 9999999999999999999999999999999999 000 77 5 0 6666666 5 5 5 0 7777 9999999999999999999999999999999999 6 6 6 6 6 111 1 99 6 7 4 4444 6 6 6 999999 99 7 0 777 7 444 4 5 2 77 3 5 7 5 4444444444444 77 5 333333 77 77 2 666 1 77 77 1 55 5 6 99 77 66 5 2222 66 888888 3 5 1 5555 1 77 4 44444 5 5 77 5 5 77 555555555 77 33 5 1 77777777777777777777777 5 111 222222222222 99 6 999999 77 3 5 5 1 8888 222 5 5 2 5 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 5 5 777 00 0000 6666666 5 9999 5 5 5 8 5 5 5 0 0000 77777777777777777 000 0 55 111111111111111111111111111111111111111111 1 5 2222 0 8888 5 5 5 5 1 5 3333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5 5 777 1111111 1111 5 777 5 5 5 22 0 6 4 5 5 888 5 5 000 77 5 77 5 888 5 5 5 8888 5 5 77 5 000 77 5 5 5 333 5 777 5 000 5 5 8 5 5 77 5 5 0000 5 5 5 888 5 5 5 777777777 5 77
lowQualScore : . . . . . .. . . ..... .. . ... . .. ...... . ... ................................ .. .. . . . . ... .... ................................................................ . . . .... . . .. . .. ........ . ...... . . .......... . ..... . .... ...... ... ....... . . ... ......................................... .. ....... .. .. ... ... . ......................... . . .. . ..... ..... . ..................................................... . . ...... .. . . ......... . .. .............. .... ....... .. ....... . ......... . ... .. .. . . . .. . . ..... . . . . ..... . .. . . . ...... . ...... .. ... .. . ..... . .. ............. . ..... . . ... . ... . ...... .. . . . . . .. ..... . .............. . . . . . .. .. .. .. ..... . .. . . . .. . .. .................. . . ... . . . . . . . ...... . . . . . . .. . . . ......... . . . . . ...... . .... .. ..... .... . ............... . . . . . . . . . . . ............ . . .. .. ... ... . .... . .. . .. . . . . ......... . . ............ . . ............. . . . . . . .. . .... . . .. . ... .................................. ... .. . . ....... . . . . .... .................................. . . . . . ... . .. . . . .... . . . ...... .. . . ... . ... . . . .. . . . . ............. .. . ...... .. .. . ... . .. .. . .. . . .. .. .. . .... .. ...... . . . .... . .. . ..... . . .. . . .. ......... .. .. . . ....................... . ... ............ .. . ...... .. . . . . .... ... . . . . ............................................................. . . . ... .. .... ....... . .... . . . . . . . . .... ................. ... . .. .......................................... . . .... . .... . . . . . . .... ...................................................... . . ... ....... .... . ... . . . .. . . . . . ... . . ... .. . .. . ... . . . .... . . .. . ... .. . . . ... . ... . ... . . . . . .. . . .... . . . ... . . . ......... . ..
lowQualScore : 0 7 3 3 3 33 3 2 55555 99 6 888 0 99 444444 0 111 22222222222222222222222222222222 00 77 0 0 0 0 000 7777 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 2 3 8888 3 3 66 3 66 22222222 1 222222 3 1 5555555555 8 55555 1 8888 333333 000 1111111 5 9 000 22222222222222222222222222222222222222222 22 2222222 22 22 444 555 3 1111111111111111111111111 3 3 66 3 88888 33333 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999 7 0 000000 55 0 0 666666666 4 11 44444444444444 9999 6666666 55 9999999 4 000000000 0 888 00 66 8 8 0 00 0 0 55555 2 8 0 2 55555 0 88 5 2 0 888888 0 555555 00 888 88 0 88888 2 88 1111111111111 6 77777 2 7 222 7 777 7 222222 22 7 7 7 7 7 99 33333 7 22222222222222 5 7 7 0 0 88 22 22 00 44444 8 88 0 0 0 00 6 44 888888888888888888 6 0 000 0 6 0 0 8 8 0 000000 8 4 7 7 4 7 00 7 7 7 000000000 7 7 3 7 7 444444 7 1111 33 11111 1111 7 777777777777777 7 7 4 7 4 7 4 4 0 4 0 000000000000 0 0 00 00 444 111 6 4444 4 00 4 55 5 5 4 8 777777777 9 4 888888888888 0 7 8888888888888 7 0 8 7 7 7 99 4 1111 4 4 44 7 111 1111111111111111111111111111111111 000 99 7 7 7777777 7 7 7 1 9999 3333333333333333333333333333333333 7 7 7 7 7 777 0 22 7 0 0 2222 7 7 7 222222 22 1 7 111 6 999 9 7 0 99 0 7 1 7 1111111111111 99 7 111111 99 99 1 111 4 99 99 4 99 7 7 22 99 99 0 6666 99 888888 2 7 7 0000 4 99 3 33333 7 0 99 7 7 00 333333333 99 66 7 4 00000000000000000000000 0 777 777777777777 22 7 000000 99 9 7 7 4 0000 888 0 0 0 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 0 0 555 11 6666 2222222 0 4444 0 0 0 5 0 0 0 1 6666 99999999999999999 000 1 99 444444444444444444444444444444444444444444 4 7 1111 1 3333 7 7 7 7 4 7 0000 333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 0 111 9999999 0000 0 000 0 0 0 66 0 2 6 0 0 888 0 7 000 99 7 99 7 666 7 7 7 1111 7 7 99 7 000 99 7 7 0 999 7 666 4 000 7 7 4 7 7 99 7 0 6666 0 0 0 888 0 0 0 555555555 0 99
consensus : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TATAAATAA---A-ATCTGTGTACG--AATTC---TGGAG-A--AA---A-CT-TT--GTC------AATTC--AT---CA-----AA-AT--AN-ATCAGGG-TACGAGTTC-T-CC-TGG---A--G-AAA-AAAC------------TTTGT--A--ATTTT------ATCA-AT-------------------AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCT--GG--AG----AAA-A------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTAC---G---AGTTCT-CCTGG---AN--A-A----G-------AAAA-C--TTTG--TC----A--TTTC--A-------TC--A--TA--AAA-A-TC-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AAA-----TT------------AC------TCA--A----AT----AG-A--A-T-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TGAAA-G---A-A--AAAA-AATNNGT------CATTT--C-TATCA-T-----ATTTCT---GAGGAAAACCGTTGT------TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-AC----A-A-T-----TACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC-AA-----AAA------AGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CA-TTTA---AT-A--TACG-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--TG---A-T-AAAA-TT----GAC-AAAG--TTTT-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGAC-GA-------TTTTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGACT--AA-T-----A------TTA-----A--A--------ACA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG----AGA--TC-G-G-G------T-----------------A-CAGTA-T-A-GA-AAAGT---AAANT--GT-TGATNTTTC----ACT-GCC-TA-TGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGA-A-AC-G--TTTT--ACAA-AATGGC-GATT-AGCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-ATT-T--ATAATGT-CTAAA-TG-TGTA-AA------G-T----G-----------TAAA----TGGTA-----T--A------TCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTA-TTTT----TC-------G-TCCTA----T-CA-T-ATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACT---CA----A-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTA--G-AAGATAT-AAT--CTTA-TGG-TG------T---TGTA-A-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGA-TTAAAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
Reference ( family-1576 ) : TAGTCTCTCCTGGAA-GAAAA-AAAT-TGTCAA--TTT-TATAAATAA---A-ATCTGTGTACG--AGTTC---TGGAG-A--AA---A-CT-TT--GTC------AATTC--AT---CA-----AA-AT--AN-ATCAGGG-TACGAGTTC-T-CC-TGG---A--G-AAA-AAAC------------TTTGT--A--ATTTC------ATCA-AT-------------------AAAATCTGG-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCT--GG--AG----AAA-A------TTTG-TT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTAC---G---AGTTCT-CCTGG---AG--A-A----G-------AAAA-C--TTTG--TC----A--TTTT--A-------TC--A--TA--AAA-A-TC-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-T-CC--GGA----G-AAA-----TT------------AC------TCA--A----AT----AG-A--A-T-CTGG-G-TA-T-GA--GTTC-TCC-TGAAA-G---A-A--AAAA-AATTTGT------CATTT--C-TATCA-T-----ATTTCT---GAGGAAAACCGTTGT------TGCTG-GAA-TCAA--AATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-TTA--T--CATAANAAT-TTCGAT---A-AT-CTTG--AACATGATAATTT-AGCTT-A-A--TTAT-CTT--C--TAC-NAA--TATA--ATATATCG--TACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGT-----TGTTTTTAT-GTGAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-AC----A-A-T-----TACA-GTCTACATAC-GATTCCGGACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-A--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATC--------AAA------AGATTTTTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-T-ATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTTTGTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CA-TTTA---ATGA--TACG-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTT--CTCCTTTC-C---AGA----A-TT-CG-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-TATT--TG---A-T-AAAA-TT----GAC-AAAG--TTTT-CT--CCAGGAGAACTCGCACCC-AGATTTTTA-------TGATAAAATTGAC-GAC------TTTTCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCACCT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGACT--AA-T-----A------TTA-----A--A--------ACA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-CTG----AGA--TC-G-G-G------T-----------------A-CAGTA-T-A-GA-AAAGT---AAANT--GT-TTATTTTTC----ACT-GCC-TA-TGAC-----AT--TTAACTTCATACACAGTTACTTTTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGT-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GAGTGTGA-A-AC-G--TTTT--ACAA-AATGGC-GATT-AGCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AAC-GGTCAAAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----AC--TTC-TGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-ATT-T--ATAATGT-CTAAA-TG-TGTA-AA------G-T----G-----------TAAA----TGGTA-----T--A------TCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTA-TTTT----TC-------G-TCCTA----T-CA-T-ATAA-AA-AAA-GTTG----CTTACT---CA----A-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AA-G--ATACTGGG-T----TAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTA--G-AAGATAT-AAT--CTTA-TGG-TG------T---TGTA-A-T-------TATATTA----TTTG-G-TACACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAATCCTGA-TTAAAAATAACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-CAATTTTCTT---AC-GTC-AAATTT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGC
gi|1 : --AT-ATCAGGGGTAAGAGTTCCT-CC-TGG---A--A-GAA-AATC------------GTTGTTCC--ATTTTTTATA-ATCA-A---------------------AAATCAGGAGTAA--TCC-GAG-TT--T-TCCT--GG--AAGAAAAAA-A------TGTG-TC--A-----A-TTTGTATA--AAT-GACAGA-A----TCTG---TGTAC-------AGCAAT-CTTGG---A------------------AATT-C--TTTA--TCTA--A--TTTC--AA------TC--AAATA--AAC-A-TCAG------G-----G------------GC-A-CGAG--TTC-T-TCCTGGACTAAA-AAA-----CTTCGT--------ACCGTTTTTCA--A----A--------A--A-A-CTGG-GATA-CCAA--GTTC-TTC-TGAGG------------AA-AATTTGTTAGTTTCATTT--C-TGCCA-TAGAAGATATCT---G-GGACGA--GTTCT------TCCTG-GA---CAAGGAAT----------GTCAATTTCAATC--AAAA-T-T
gi|1 : aAGTTT-TCCTGGAA-GAAAA-AAATGTGTCAA--TTTGTATAAATGACAGA-ATCTGTGTACAGCAATCT---TGGA--A--AT---T-CT-TT--ATCT-----AATTTCAAT---CA-----AATAA--AC-ATCAGGGGCACGAGTTC-TTCC-TGG---A--CTAAA-AAAC------------TTCGT--ACCGTTTT-------TCA-A--------------------AAAA-CTGG-G-A---TACCAAG-TT--C-TTCT--GA--GG----AAA-A------TTTG-TT--AGTTTCA-TTTCTGCC--A-TAGA-AGATA----TCTG---GG-AC---G---AGTTCTTCCTGG---AC--A-A----G-------GAA-------TG--TC----A--ATTTCAA-------TC--A------AAA-T-TC-T------G-----A------------GTCA-CA----TTC-C-CC--GG-----G-AAA-----TT------------AT------CCA--A----AT----AG-ACAA-T-CTGGTA-TA-T-GA--TTCT-TCC-TGAAACG---A-A--AAAA------GT------CATTT--C-TATCACT-----ATTTCT---GAGAAAAACCGT-GTA-----TGCTG-GAA-TCAA--AATTTGGACACGAGT-AATCT-GATT--AAAAAT-TTA--T--CATATGAATGTTCGAT---A-ATACTTG--AA--TGATAATTT-AGCTTTA-A--TTAT-CTTACC--TAC-AAAATTATATTATGTATT---TACATCGAT--TGTT-T-AAAATTC--AAATGGT-----T----TTAT--TGA-ATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-GGGCA-----AACATAACGAC----ACA-T-----TA-A-GTCTACATACTGATTCCAGAGCCTATC--GGGTGCTTATCT--ATATA--TA--A--TA-GAGCAC---CA-TTACGTTCTA-AT--ACTATTCGATATCTAAATG--AAA------AGATTTT-CACTGGGAATCACGTGT---ACCC-AGTTTT-TCATG-GAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTT-CT-CTTCCAGTTAGAAACTCG--TACCC-G-CAATTTATACATTAAGTA-G-A-TAGAA----C-AA------A-GAG----TTTTTTCCTCCTTTTTC---AGA----A-TTTCA-AA-C---C----CAGATTCTACATGTAC-TT-A-TAA--CTGAACAGAAAAAAACA-TCTCACAGATACTC-GT------------ACCACAGATTT-TAT----G---A-A-TAAA-TT----GAC-AAAT--TTTTTCT--CCAGGA-AACT-GCACCCCAGATTTTAT-------TGATAAAATTGAC-G--------TCTTC-CG-GG-AGAACGAC----------TTCACCT-CCAGT--AGGAAAAGGCAACGCTTGTT-GCG-AG--GAG-G----AAATG-ATCA-ATG-AAACT--AA-TTAT--A------TTA-----ATAG--------ACA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTT--GTAATC-CTG----AGAA-TC-GTGTG------T-----------------A-CAGTA-T-A-GA-AAAGT---AAATT--GT-TGATTTT-C----ACTTGCC-TA-TAA------AT--T-AACTTCAGACACG--TACTTT---AAAG-CT-GAA-CA--AGGGTTCTAG-CTGCAT-----ATA----GCCTAAC-T---A--CTTCATTGAT--GAGT-TGA-A-ACCG--TTTT--ACAA---TGGT-GATT-AGCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGT----CTG--CA------ACTAAAA-TCGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCGAAAC-GGT---AA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------A-A--------------AACAAA---AATA---T--C-----AC--TTC-TGATG--CAG--TGCCCTTTT-AG-ATT-T--A-AATGT-CTAAA-TG-TGGT-AA------G-T----G-----------TAAA----T-GCG-----T--A------TCAGTTCATG-TAG-TTCTGTC---G-A-TTTG----TC-------G-TCCTA----TCCA-T-AT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACT---CA----AGTATATCGT---ACATTATATTTT-----------TT-A---A-A----T-GTTTTG--AA-G--ATACTGGG-T----T--AAAAAAT--T-CAATC-A-TAATGC-T-TTATGA-AAGATAT-AAT--CTTA-T--------------------A-T-------TGTATT-----TTTG-G-T-CACG-T-GTAC------CAC--G-GTA-CACTAACA-T-TCC-CAAT-CTGA-AT-AAAAT-ACAA-AT--TCTCT---T-ATAAAG-G-CACA---GCG--CAGAGAAGAA--AGAACA-TGTG--CCTGT-C-G-TCCA-C--AAACATG-AAAAA-TAAAA-CG---TT--GAGC-AATGGCAAACG-TCCA-TGA-CAA--TTCTT----C-GTC-AAA--T-TTT-GA--CGT-GGCAATTTT----G-GC-ACA---TTTGAAAA-TTTAACGTCC-------GCGAA-AC--GCTctgagtcacattccccgggaaattatccaaatagacaatctggtatatgattcttcctgaaacgaaaaaagtcatttctatcactatttctgagaaaaaccgtgtatgctggaatcaaaatttggacacgagtaatctgattaaaaatttatcatatgaatgttcgataatacttgaatgataatttagctttaattatcttacctacaaaattatattatgtatttacatcgattgtttaaaattcaaatggttttattgaatcatgttctcacagtattgtaattattgggcaaacataacgacacattaagtctacatactgattccagagcctatcgggtgcttatctatatataatagagcaccattacgttctaatactattcgatatctaaatgaaaagattttcactgggaatcacgtgtacccagtttttcatggaaaacgagaaagttttgtttctcttccagttagaaactcgtacccgcaatttatacattaagtagatagaacaaagagttttttcctcctttttcagaatttcaaacccagattctacatgtacttataactgaacagaaaaaaacatctcacagatactcgtaccacagattttatgaataaattgacaaattttttctccaggaaactgcaccccagattttattgataaaattgacgtcttccgggagaacgacttcacctccagtaggaaaaggcaacgcttgttgcgaggaggaaatgatcaatgaaactaattatattaatagacatttttgagcaggacgagtttgtaatcctgagaatcgtgtgtacagtatagaaaagtaaattgttgattttcacttgcctataaattaacttcagacacgtactttaaagctgaacaagggttctagctgcatatagcctaactacttcattgatgagttgaaaccgttttacaatggtgattagctacagaactgggatggggtctgcaactaaaatcgcgatgtgcggtcatttaattttatctcgaaacggtaatattggtcactgcaaaacaaaaatatcacttctgatgcagtgcccttttagatttaaatgtctaaatgtggtaagtgtaaatgcgtatcagttcatgtagttctgtcgatttgtcgtcctatccatataaaaaagttgcttactcaagtatatcgtacattatattttttaaatgttttgaagatactgggttaaaaaattcaatcataatgctttatgaaagatataatcttatattgtatttttggtcacgtgtaccacggtacactaacattcccaatctgaataaaatacaaattctcttataaaggcacagcgcagagaagaaagaacatgtgcctgtcgtccacaaacatgaaaaataaaacgttgagcaatggcaaacgtccatgacaattcttcgtcaaattttgacgtggcaattttggcacatttgaaaatttaacgtccgcgaaacgct
gi|10 : aatatcaggggtaagagttcctcctggaagaaaatcgttgttccattttttataatcaaaaatcaggagtaatccgG--TGTCC-TTT-AG-ATT-T--ATAATGT-CTAAA-TG-TGTA-A-------G-T----G-----------TAAA----TGGTA-----T--A------TCA----ATG-TAG-TTTT-TC---GTA--TTT----TC-------G-TCCTA----T-CA-T-AT-A-AA-AAA-GTTA----CTTACT---CA----A-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---ACA----T-GTTTG---AA-G--ATA--GGG-T----TAAAAAGAAT--T-CAA-C-ACTGAA-C-TGGTA--G-AAGGTAT-AATACCTTA-TGGTTG------T---TGTA-AGT-------TATATTATTTTTTTG-G-TAC-CG-T-GTA-------CACTAA-GTA-C---AACA-T-TCCACA---CTGA-TTACAAAT-ACAA-AT-CTCTCTTAAT-ACACAGCG-CACA---GCG--CAGAT-AG-A--AGAACA-TGTG--GCTGTACGG-T-CA-C--AAACATG--AAAA-T--AA-CG---TTTCGAG--AA-GGC-AACGAT-CA-TAA-CA--TTTCTT---AC-GTC-AA--TT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TT-------TTT-ACGT-C---------GAA-AC--GTTG
gi|11 : TGACGT-TTAGA-TG-TGTA-A-------G-T----G-----------TAAA----T-------------------------------AG-TTCT-TA---GT--CTTT----TC-------G-TCCTA----T-CA-T-ATAA-AA-ATA--TTG----CTAAAT---CG----A-------GT---GCAT-ATA-CTT-----------TT-A---A-------------------------CTGGG-C----TAAAAATATT--TTCAT-C-A-TAAT-C-T-TGA--TTAAGATAT-A------T--TGG-TT------T---TGTA----------------TA----TTTG-GATACAAG---GTAC------CA--------------ACC-T-TCC-CAATC-TGA-TTAA------CA--------------T-ATACAACG-CACC---ACA--CAGAC-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TC--GAGC-AA-GGC-AACG-T-CA-T-A-CAA-TCTCTT---AC-GTC-AAATTGATTT-GA--CGT-TGCAATATT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ATGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCcagcgaaa
gi|12 : taaatgtcttggtgttgcgtgatacacttttgagACCCTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT-AATTATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-AT--ACTATTCGATATT--------AAATGAAAAAGATTTT-CACTGGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTT-TTATGAGAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAGT-AGAA-CTCG--TACCC-A-CA-TTTA---------TACG-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTCTT--TCCTTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TACC---C---ACAT-TTCTACATGTACTTT-A-TAA-ACTGA-CAT--AAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAAATTT-TA-T--TG---A-TAAAAA-TT----GAC-AAAGT-TTTT-CT--CCAGGAGAAGTCGCACCA-AG-------------------AAATTGAC-G-----------TCTCCGGG-AGAAC-------------TTCACagcgaaa
gi|13 : ACAAATAG---AGATTTGGATTCG--AGTTC---TGGAGAA--AA---A-CT-TT--GTC-------ATTT--AT---CA-----AA-AT--AG-AT-GGGG-TACGAGCTC-T-CC-CAGTAAA--G-AAATAAAC------------TAT-------ATGTCAGAGGAATTG-GT-------------------ACGATCTAC-ATA---CAC-CA---T--C-T-CT--GGACAG----AAA-G------------T--AGC--CA-TTTCTGTC--A-T-TA-AA--A----TCTGAGTGGTAC-------AGT------TGG---AG--AGA----GAGAAACAAAAA-C--TTTG--TC-------TTTT--A-------TCAAA--TAG-AAA-A-CA-T------GATCGTG------------AT-ACCGAG--TTC-TCCC--GGC----G-AAA-------------------A-------TCA--A----A-----------------GG-G-TA-T-TA--TTTCATTC-TCAAA-G---
gi|14 : tactcctggacaaaAAC------------TTTGT--CC-GTTTT------ATCA-AT-------------------AAAATCTGT-GTA---TAC-GAG-TT--C-TCCT-------G----AAA-AT-----TTTG-TTTCAGT--CA-TTTCTGCA--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTAC---T---AGTTCT-CCTGG---AG--A-C----A-------AGAA-C--TGTATTTC----A--ATTC--AT------TC--A--TG--CAA-T-TC-TGCGGGAG-----G------------GT-A-CGAG--TT---------------A-AAA-----TT------------A-------TCA--A----AG----AGAA--A-TGCTGG-GTTACC-GAGTGTTC-TCCTTAAAA-G---A-A--AAAA-AA-AAGT------CATTTTCC-TATCA-------ATTTCT---GGCGAAGA
gi|15 : T-CCAGTATAGGAAAAGGC-ACTCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGAC-A-ATG-AGACT--AATT-----A------TTA-----A--A--------ACA---TTT--CTGAG-TAGGACG---A---G-TTTT-GTTATC-TTGA---AAA--TCTG-T-A------T-----------------A-CAGTA-T-A-GA-AAAGT---AAAAT--GT-TTATATTTCAAATACT-GCC-TC-TGAC-----AT--TTAGCTT-------AAATATTGTATATATGCGT-TAA-------GGT-CT-G-CTGCA-----TA--------T--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTGATATAC-G--TTTT--AT-A-AATGGC-GATT-AACT--GCA-AACGTTGGGA--TGCGGGTT---CTG--CA------GCTagctgagaagagaaaaggatcagggaaaaaccgtgtcatgctgtggaaa
gi|16 : TTC---TAGAG-A--AGCC-A-CT-AT--GTC------AA--------------------AT--GTTATGAGGG-TACGAATTC-C-----GG---A--G-AAA-AAAC------------TTTGT--A--ATTTT------ACCAGAT-------------------AGAA-----------------A-----------T--GA--AG----ACC-G------TGTG-CG--AGT-----TTTC--CCGGA-T-AA-CGGT-------TA---GGTAC---G---AGTTCT-CCCGGTTAAA--A-A----A-------AAAA-CT-TTTG--TT----A--CTTT--A-------TC--A--TATGCAA-T-TC-T------A-----G------------GT-T-CAAA--TTC-T-CCA-GGA----G-AAA-----cactgcagaa
gi|16 : cgctttcGTACG--AATTC---CGGAG-AAAAA---A-CT-TT--GTA------ATTTT--AC---CAGATAGAA-ATGAAG-ACC-GTG-TGCGAGTTT-T-CC-CGG---A----------------------------T--A--A------------CG-GT-------------------------TAG-GT-----AC-GAG-TT--C-TCCC--GGTTAA----AAA-AAAAACTTTTG-TT--A----C--TTTATCAT--A-T-GC-A-AT-----TCTA---GGTTC---A---AATTCT-CCAGG---AGAAA-A----A-------AAAA-C-----G--TC----A--TTTT--A-------AA--A--TA--AAA-A-CC-C------A-----GAGTACCATAAAAAT-A-CGAG--CTC-T-CC--AGT----A-AAA-----aaaaaacgtcattttaaaataaaaacccagagtaccataaaaatacgagctctccagtaaaa
gi|17 : cgctttcttctagagaagccactatgtcaaatgttatgaggGT-----TGTTTTGATTGCCAGATCAAAATG-TT------CTCAC-GCCTATCTG-TAAT-TA-TTTG--CA-----AACAAAAA-TC----A-A-T-----TACA-GTCTACAT
gi|17 : T--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATAATTATCTG---GGTAC---G---AGTTGT-CCTGG---GC--A-A----G-------GAA------CTG--TC----AA-TTTC--A-------TC--A--TA--AAA-T-TC-T------G-----G------------GT-A-CGAG--TTC-TCCC--GGA----GAAAA-----TT------------A-------TCA--A----AT----AG-A--A-----------A-T-GA--TTTC-TCC-TAAAA-G---A-A--AAAA-A----GT------AATTT--C-TATCA-T-----GTgatagaaattactttttttcttttaggagaaatcatttctatttgataattttctccgggagaactcgtacccagaattttatgatgaaattgacagttccttgcccaggacaactcgtacccagataattatcttcatggcagaaatgacta
gi|18 : gttgttttgattgccagatcaaaatgttctcacgcctatctgtaattatttgcaaacaaaaatcaattacagtctTCTCT-CT-CCGG--AGAA-CTCG--TACAC-A-AA-TTTA---------TACG-A-TAGAAATGAT-AATTATAAA-GAG----TTGTT--TTGTTTTC-CCCAAGATAATA-TT-C---------C---ACAT-TTCCACATGTAC-TTTA-TAA-ACTGA-CA-AAAAAAAAATTCTC-CAGA-ACTC-GT------------ACC-CAGATTT-T-TG--TA---A-T-AAAA-TC----AAC-AAAGT-TTTT-CT--CCGGGAGAACTCGTACCC-AGATTTTTA-------TAATAAAAATGAC-AA
gi|19 : T--TG---AAT-AAAA-TT----GACGAAAA--TTTT-T------------CTCGTACCT-ATATTTTTA-------TAATAAATTTGAC--ACATTTT-TTTTCTCCGGG-AGA-------------------------AGTGTAGGAAAAGGCCGC-CTTGTTCGCGAAG--GAGTGTTCCAA---GACAATAAGTAGACCTGAA-TTCTTGA------TAA-----A--AAAAAAAAGACA---TGT--ATTAG-CA-GACGATCA---GTTTTT-GTTA-C-CTG----AGA--Tagttt
gi|2 : TAGTCTCTTCTAGAT-GAAAA-AAAA-TGTTAAGCTTT-TATAAATAA---A-ATCTGTGTACA--AATTC---TGGAG-A--ATT--A-CT-TT--ATC------AATTC--AT---CA-----A---T--AC-ATCAGGG-CACGAGTTC-T-CCATGG---ATAA-AAA-AAACGATTGTCCTTTTTTTTT--C--TTTTT------ATCA-AT-------------------AAAATCTGG-ATA---TAC-GAG-ATGGCATCCT--GG---G----AAA-A------TTTGCTT--AGT--CA-TTTCTGCC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTAC---A-----TTCT-CCTGG---AC--A-A----G-------GAAA-C--TG-G--TC----AA-TTTC--A-------TC--A--TA--AAA-ACTC-T------G-----A------------GT-A-CGAG--TTC-T-C---GGA----G-AAA-----TT------------AC------TCA--A----AT----AG-A--A-T-CTGG-G-TA-T-GA--GTTC-TCC-TAAAA-G---A-A--AAAA-AATAAGT------CATTT--CATATCA-T-----ATTTCTTGAGAAAAAAACCGTTGTC-----TGCTG-GAATTCAA--AATTTTGACACGACTTA--TT-GATTTAAAAA-T-TCA--TGCCATAACAAT-TTCGATTTGA-AT-CTTG--AACATGATAATTT-TGCTT-A-A--TTAT-CTT--TAATACAAAA--TATA--ATATATCGGATACATCGAT--TGTT-T-AGAAT-C--AAATTGC-----TGTTCTTAT-GTGAGATCA---TGTTT------CTCACAG--TAT-TG--AAT-TA-TT-G--C------AACAAAAC-ACAATTA-A-T-----TACT-GTCTACATAC-GATTCCGGACCTTATC--GGGTGCTT--CT--ATATA--TAT----TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TA-ATTAGCTATTCGA-ATC--------AAA------AGATTTGTCACTGGGAAT-ACTTGT---ACCCAAGGGTT-T-AT-AG-AA-AC------G-GAAAGTTTTTGTTTTCTGCT-CCAGT-AGAA-CTCG-GTACCC-A-CA-TTT-----TAC--TACG-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAG----TTTTTA-CTCCTTTT-C---AGA----A-TT-CA-TA-C---C---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-AGTAA-ACTG--CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTCAGT------------ACC-CAGATTT-TATT--TG---A-T-AAAA-TT----GAC-AAAG--TTTT-CT--CCAGGACAACTCGCACCC-AGAGTTCTGCATATATTGATAAAATAGAC-G-----------TCTCC-GG-AGAAC--T----------TTCAACT-CCAGTGTAGGAAAAGGCCAAGC-TGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA-ATG-AGACT--AA-------A------TTA-----ATTA--------AAA---ATT--TTGAC-CAGGACGC--A---G--TTT-GTAATC-CTG----AAC--TC-G-GTGT-----T-----------------ACCAGTA-T-A-G--AAAGT---AAAATTGAT-TTATTTTTC----ACT-GCCGTA-TGAC-----ATTATCAACTTATTACACAGTTACTTCTTAAAAGACT-GAAACA--AGGGA-TCAG-CTGC------TATAC---GCT---C-T---G--CT--ATTGAT--GATTGTGA-A-AC-G--TTTT--ACAACGATGGCTGATA-CGCT--ACAGAAC--TGGGATTTG-GGGTT---CTG--CA------ACTAAAA-TGGCGA---TGTGC-AGGTTCAT-----TCGCATTTTATTCATCG-AACGGGT---AA----T----A--TTG-GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATT---TC-C-----AC--TTCGTGAT---CAG--TGTCC-TTT-AG-ATTGT--AT--TGT--TAAA-TG-TGTA-AA------G-T----G-----------TAAAT---TGGTA-----TTCA------TCA----ATG-TAG-TTCT-TC---GTA-TTTT----TT-------G-TCCTA----T-CATT-ATAA-AA-AAA-GTTATTCCCTTACT---CA----A-------GCTTAACATTATA--TT-----------TT-A---A-A----T-GTTTT---AAGG--ATACTGGG-T----TAAAAAAAATCAT-CAA-CAA-TAAT-C-T-TTA--G-AAGATATGAAT--CTTA-TGG-TG------T---TGTA-A-T-------TATATTA----TTTGTG-TACACG-T-GTAC------CAT--A-GTA-CA--AACA-T-CCC---ATCTTGACTTAAAAATAACAA-ATCCTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA--GTG---CTGTAC-G-T-CA-T--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACG-T-CA-TCACCAATTTTCTT---AC-GTCTAAATTT-TTT-GA--CGT-TGC-ATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGG-C-------G-AAACAC--GCTGGC
gi|20 : G--ATTTC---TGGAG-A--A------CTCTT--ACCCAGGAGAACTC--GTACCCA-----GA-A----A-AT-AGGA-TACATGTTC-T-CC-TGG---A--G-AAG------------------TCGT--A----CCC------ATCA-GT-------------------A---TCTGG-GTA-----C-GAG-TT--C-TCCT--GG--AG----AAA-AAC----TTTG-TT--gc
gi|20 : attgctcaaagaaactgtaagAGAAAAGAAA-----C-AAGG-ACTT-GT------------ATC-CAAACC---ATT--CG---G------A-TTTCTGGA--GAAC--TCTT-AC--CCAGGAGAACTCGTACCC-AGA-----A--------AATAGGAT--AC-A--------TGTTCTCCTGG-AGAAcgaatggtttggatacaagtccttgtttcttttctaaacattagaat
gi|21 : attgctcaaagaaactgtaagaacaaagtttttctccaggagaactcgtacccagatactgatgggtacgacAT-CG-AAATTGTCACCGTGGTTTCAT-G-GAGATCA---TA-TT------GTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AAAAAAAC-aaacattagaat
gi|22 : aatattgcatttatagtataacaattctaattaaatacttgttctaaaattttaacgtAGA-ATTC-GT------------ACC-CAGATTTCTAGT--TG---A-T-AAA---T----GAC--GAGTTTTTT-CT--CCGGGAGAATTCGTATCC-AGATTTTTA-------TGATAAttagtggtaagtct
gi|23 : AT-TG-TAAT-CA-AT-G--CA-----A-CAAAAC-AC----C-A-TGGGGCTCAA-GTCTACA-ACAGACTCTG-ACCCTATCTTGGGTGCTT--CT--ATAc
gi|25 : CTC-AT------------ACT-CAGATTT-TAATGATACATA-T-AAAA-TT----GAC-AACA--TTTA-CT--CCTGGACAACTTGTAC
gi|26 : CTG---GGTAC---G---AGTT-T-CCTGG---AT--A-A----
gi|27 : ctattttctgggtacccagttttctcTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCctaaatg
gi|28 : T--CCGGGAGAACTTGTACCT-AGGTTTTTA-------TCATAAAATTGAC-GAagcgaaagg
gi|3 : tATTTTGACACGAGTTAATCT-GATT--AAAA-T-CTA--T--CATAA-AAT-TTCGAT---ATAT-CTCT--GACATGATAATTTTAGCTT-A-A--TTAT-CTT-----TAC-CAA--CACA--AT-CAACG--TACATCGAT--TGT------------------GT-----TGTTTT-AT-G-GAGATCA---TG-TT------CTCACAG--TAT-TG-TAAT-TA-TT-G--CA-----AACAAAAC-AT----A-A-T-----TACA-GTCTACACAC-GATTCCG-ACCCGATC--GGGTGCTT--CTTTCTATAATTATCA--TATGAGCAC-TTCA-TTACGTT-TG-AT--ACTA--CG--------------------------TTTTCACTAGGAAT-ACTTGT---ACCC-AGGTTTAT-ATGACAAA-AC------GAGAAAGTTTT-GTTTTCT-CT-CCAATTAGAA-CTCG--TACCC-A-CA-TTTA---A--A--TACG-A-TAGAATTGAC-AA------A-GAGGTTTTTTTT--TTCCTTTTTC---AGA----A-TT-CA-TA-C---CC--ACAT-TTCTACATATAC-TTTA-TAA-ACTGA-CAGAAAAAAAAAATCTC-CAGA-ACTC-GT------------ATC-CAGATTT-TATT---G---A-T-AAAAATT----GAC-ATCG--TTTT-TTTTCCAGGAGAACTCGCACCC-ATATTTTAT-------TGATAAAATTGACAGACAGATTTTTTCCTCC-GGGAGAAC--TCGGTAGAAGCTTCACTT-CCAGTGTAGGAAAAGGC-ACGCTTGTT-GCG-AG--GAGTG----AAATGGACAA--------TT--AA-T-----A------TTA-----A--A--------ACA---TTT--TTGAG-CAGGACG---A---G-TTTT-GTAATC-C-G----AGA--T----G-G------T-----------------A-CAGTA-T-A-GA-AAAGT---AAATT--GT-TGATTTTTC----ACT-GCC-TA-TGAC-----AT--TTAACTTCATACAC-GTTACTTTT--AAAGACT-GGAACA--AGGGT-CT-G-CTGCA-----TATA----GCT--AC-T---A--CT--ATTGAT--GA-TGTG--A-AC-G--TTTT--ACAA-AATGGT-GATT-AGCT--ACAGAAC--TGGGA--TG-GGGGT---CTG--CA------ACTAAAA-TGG-GA---TGTGC-GG--TCAT-----TTA-ATTTTATC--TCG-AAC-GGT--AAA----T----A--TT--GGT-CA-CTGC------AGA--------------AAC-AA---AATA---T--C-----AC--TTC-TG------AG--TG-------------------TAATG---------G-TATA-A--------------------------TCAA----TG-------------------TA----ACA-TAG-TTCT-TC---GTA--TTT----TC-------G-TCCTA----T-CA-T-AT-A-AA-AAA-GTTG----CTTACT---AT----A-------GT---ACATTATA-TTT-----------TT-A---A-C----T-GTTTTG--AA-G--TTACTGGT-T----AAAAAAAAAT--T-CAA-C-A-TAAT-C-T-TTA--G-AAGATAT-A-----TT---------------------------------------------TTG-G-TACACG-T-GTA-------CAC--G-GTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGA-TT-AAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---T-ATAAAGCG-CACA---GCG--CAGAG-AGAA--AGAACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-C--AAACATG-AAAAA-T--AA-CG---TT--GATC-AA-GGCAAACG-T-CA-T-A-AAA-TTTCTT---AC-GTC-AAA-TT-TTT-GA--CGT-TGCAATTTT----G-GC-A-A---TTTGAAAA-TTT-ACGT-C-------G-GAA-AC--GCTGGCa
gi|4 : TTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCC-AACA-TTGA---ATGA--TACG-AATA-AATTGAC-AA------AAGAG----TTTTT--CCTTTTTC-CC--AGA----A-TTTCGATA-C---CCACACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--TG---A-T-AAAA-Tagcg
gi|4 : ACGCTTGTT-GCG-AGCGGAGTG----AAATGGACAA-ATA-AGAC---AA-T-----A------TTATGAACA--A--------ACA---TTT--TTGAGGCAGGACG---A---G-TTTTTGTAATC-CTG----AGAAATC-A-G-GATGCTCC-----------------A-CAGTAGT-ATGA-AAAGT---AAAGT--GTATGATATTTC----ACT-GAC-TA-TGACTGACAAT--TTAACTTCATACAC-GTGA--TTTTATAAGACTTGAAACATTAAGGT-CGAGGCTGCAT----TACATAAAGCT--ACGT---A--CT--ATTGATTTGAGTGTGA-A-AC-G--TTTT--ACAT-AATGGT-GATTAAGCTTAACAGAAC--TGGGA--TG-GGGTC---CTG--CA------A-TAAAA-TGGCGATTGTATGC-GG--TCATTTAAATTA-ATTTTATC--TCG-AAC-GGT-AACA----T----A--TT--GGT-CA-ACGC------AGA--------------AACAAA---AATA---TCGC-----GT--TTC-TTATACCCAG--TGTCC-TTTGAGAATT-TTAATAATG----AAG-TG-TG-A-AACAAGACG-T----GATTGGGAAGCTTAGAAATGTGGTAAAAGCT--G------TAA----ATA-TAT-ATAT-TCAATGTAGTTCT----TCGTATTTTG-TCCTA----T-CA-T-ATAATAATAAA-G-TG----CTTActctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|4 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgG-G-TACACG-T-GTACACGGTACAC--G-GTA-CA--AACAATATCC-AAATC--GA-TTAAAAATAACAAGAT-CGCACT---T-ATAAAGCGACACA---GCG--CAGAG-AGAG--AAGACA-TGTG--CCTGTAC-G-T-CA-CAAAAACATGTAAAAATT--AA-CG---TT--GAGC-AA-GGCAAACGATACA-T-T-CAATTATCTTTTAACAGTC-AAATTT-TTTAGA--CGTGTG-AATTTT----GAGCAA-A---TTTGAAGATTTT-ACGT-C-------G-GAA-Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtgggtacacgtgtacacggtacacggtacaaacaatatccaaatcgattaaaaataacaagatcgcacttataaagcgacacagcgcagagagagaagacatgtgcctgtacgtcacaaaaacatgtaaaaattaacgttgagcaaggcaaacgatacattcaattatcttttaacagtcaaattttttagacgtgtgaattttgagcaaatttgaagattttacgtcggaaaacctg
gi|5 : ttttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaatctctcgacgcttgttgcgagcggagtgaaatggacaaataagacaatattatgaacaaacatttttgaggcaggacgagtttttgtaatcctgagaaatcaggatgctccacagtagtatgaaaagtaaagtgtatgatatttcactgactatgactgacaatttaacttcatacacgtgattttataagacttgaaacattaaggtcgaggctgcattacataaagctacgtactattgatttgagtgtgaaacgttttacataatggtgattaagcttaacagaactgggatggggtcctgcaataaaatggcgattgtatgcggtcatttaaattaattttatctcgaacggtaacatattggtcaacgcagaaacaaaaatatcgcgtttcttatacccagtgtcctttgagaattttaataatgaagtgtgaaacaagacgtgattgggaagcttagaaatgtggtaaaagctgtaaatatatatattcaatgtagttcttcgtattttgtcctatcatataataataaagtgcttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtg-AT-------------------CAAATCAGA-GTT---TAC-GAG-TT--C-TCCTGAGA--AG----AAATA------TTTG-TT--------A-TTT------------A-AAAT-----TCAG---AGTAC---AACTAGTTCT-CCTGG---A---A-A----G-------AAAA-CAAATTG--TCA---A--TTTT--A-------TA--A--T---AAA-A-TC-T------G-----T------------GT-A-C-AA--TTC-T------GA----G-AAA-----TTAACTTTTTATCAAT------TCATCA----AT----AA-AC-A-T-C-AG-G-CA-C-GA--GTTC-TCC-TG----G---ATA--AAAA-ACTTTG---------TTT--C-TA--A-T-----AAATCT---Gacctg
gi|5 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcTAGT-TCTCCTGGAAAGAAAACAAAT-TGTCAA--TTT-TATAA-TAA---A-ATCTGTGTACA--A-TTC---TG-AG-A--AATTAA-CT-TTTTATC------AATTC--AT---CA-----AT-AA--AC-ATCAGG--CACGAGTTC-T-CC-TGG---A--T-AAA-AAAC------------TTTGT-------TTC--------TA-AT-------------------AAA-TCTGG-TTA---TAC-GAGATT--C-TCCT--GG--A-------A-A------TTTG-TTTTAGT--CAATTTCTGGC--A-T-GA-AGATA----TCTG---GGTAC---C---AGTT-T-CCTGG---AA--T-A----G-------GCA------TCG--TCTAATA--TATC--A-------TC--A--TT--AAC-T-CC-T------A-----A---------------A-CGAGTTTTC-T-CC--GGA----G-GAA-----TT------------A-------TCA--A----A-----AGTAC-A-T-CTGA-G----------ATTC--CC-T-AGA-GTATA-ATTAAAA-AA-TGGT------CTATT--C-TATCA-T-----AATTTT---GAG---AACTGTTA-------TGCTATGGA-TCAA--AATTTTGACAC--GTTAATCTAGATT--AAAA-TCTTATTT--C-TAAATAT-TTCG-T---A-AT-CTTGTTACCATGAT-ATTT-AGCTT-ATAGTTTATACT------TAC-TAA---ATT--ATATACGG--T-TATCGATGATGTTATAAGAAT-CTGAAATTGT-----TG--TTTAT--TGA-ATCA----G-TTACTTCACTCGTA---TAT-TGTTAATCTATTT-G--CATAACCAAC-AAAC-AC----A-ATT-----TACATGTTTATCTAC----------CCCTATCA-GGATGC-T--CT--ATATA--TAT----TATGAGCACTTTCATTTACGAT-TAGAT--ACTA-TCGATATTAAATATGAAAA------AGATTTTTACCTCG--AT-ACTTGTGTAACCC-AGG----T-ATGAGAAAGACTACCGAGAGAAACTATATATTTTCA-TT-CCAGT-AGAA-CTCGTGTACCCAA-CA-TTGA---ATGA--TACGAA-TA-AATTGACAAA------A-GAG----TTTTTC-CTTTTTCC-C---AGA----ATTT-CGATA-CCCAC---ACAT-TTCTACATGTAC-TT-A-TAACACTGA-CAG---AAAAAAATCTC-CAGA-CGTC-GCCCCCCCCCCTTAACC-CAGATTT-TTTT--TG---A-T-AAAA-gttatacgagattctcctggaaatttgttttagtcaatttctggcatgaagatatctgggtaccagtttcctggaataggcatcgtctaatatatcatcattaactcctaaacgagttttctccggaggaattatcaaaagtacatctgagattccctagagtataattaaaaaatggtctattctatcataattttgagaactgttatgctatggatcaaaattttgacacgttaatctagattaaaatcttatttctaaatatttcgtaatcttgttaccatgatatttagcttatagtttatacttactaaattatatacggttatcgatgatgttataagaatctgaaattgttgtttattgaatcagttacttcactcgtatattgttaatctatttgcataaccaacaaacacaatttacatgtttatctacccctatcaggatgctctatatatattatgagcactttcatttacgattagatactatcgatattaaatatgaaaaagatttttacctcgatacttgtgtaacccaggtatgagaaagactaccgagagaaactatatattttcattccagtagaactcgtgtacccaacattgaatgatacgaataaattgacaaaagagtttttcctttttcccagaatttcgatacccacacatttctacatgtacttataacactgacagaaaaaaatctccagacgtcgccccccccccttaacccagattttttttgataaaa
gi|6 : acaagttctctggaaaattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtgcatcaaatcagagtttacgagttctcctgagaagaaatatttgttatttaaaattcagagtacaacTAA-TTCATACAC-GTTACCTTT--AAAGACT-GAA-CA--AGC-T-CTAG-CTGCAT----TATA----GCT--AC-TCGCA--CT---TTGAT--GA-TG-GA-A-ACCG--TTTT--AACA-AATGGT-GATT-AGCT--ACAGAAA--TGG-A--TG-GGGT----CTGGCCA------ATTAAAAATGGCGA---TGTGC-GG--TCAT-----TAA-TTTTTATC--TCG-AAC-GGT-AAAA----T----A--TT--GGTCCA-CGGCGCCAGAAGA--------------AACAAA---AATA---TC-C-----ACTTTTC-TGAT---CAG---GTCT-TTA-GG-ATT-T--ATAATGTCCTAAA-TGTTGCA-AA------GTT----G-----------TAAA----TGG-A-----T--A------TCA----ATGTTAGTTTCT-TC---GTA-TTTTCTGCTC-------G-T-CTATTT-T-CA-T-AT----A-AAA-GGTG----CTTACT---CAAAGCA-------GT---GCATTATA-TTT-----------TTGA---A-A----TCGTTTTTTGAA-G---TACTGGGTT----TAAAAAAAAT--T-C---C-A-CAAT-CTT-TTA--T-AAGATAT-AAT--CTTATTGG-TG------TTACTATA-A-CATGTATATATATTA-----TTG-G-TACACGTT-GTACTTA---CAC--ATGTA-CA--AACA-T-TCC-CAAT-CTGACTTAAAAAT-ACAA-AT-CTCT-T---T-AT-AAGCG-CACAATCGCGCCCAG-G-AGAACCAGAACATTGTGGCCCTGTAC-GTT-CACC--AAACATG-AAAAA-T--AACCGAATTT--GAGCAAA-GGCAAACG-T-CAGT-A-CAATTTCTTT---AC--TC-AAATTT-TAT-GGACCGT-TGCAATTTTGGCCG-GC-A-AGTTCTTGAAAA--TT-ACGT-CTCGGACGG-AAA-ACCGGCTGG
gi|7 : ----------TTCACCTTCCAGTGTAGAAAAAGG-CACGCTTGTT-GC--------------------GACAA-TTG-AGACC--CA-C-----ACTCTATTTA-----A--A--------ACAGTCTTTGGTTGAG-TACGACA---ACGTG-TTTT-GTATTCACCGTAGAAGA--GC-GAG-G------TATGAGACAAAGCAAGTCA-CAGTA-TCA-GATAAAGTTAAAAGAT--GT-TGATATTT------CC-GCG-TAGTG--------T--T--------------GTTGCTTATTCAGA---T-AACACA--A-GGT-CTGA-CTGCATAGACCATA----TCT--AT-T---GACCT--A--GAT--AA--GTGA-T-AC-GGCTATTAAACAA-AATGGC-G
gi|7 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagc--TGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--T-----GTA-AT-----C--TCG-AAC-GGTCAAAATTTGT----ATTTT--GGT-CAGCTGCAG----AGA--------------AACAgaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgttgggatggggctacactgcaggataaacaaatggtgagctggttgtaatctcgaacggtcaaaatttgtattttggtcagctgcagagaaacaca
gi|8 : attttgatgtatataaatttagagcacaaaagttatgttctcacaccagggacgaactcgcgtgacagcaagcttcaccttccagtgtagaaaaaggcacgcttgttgcgacaattgagacccacactctatttaaaacagtctttggttgagtacgacaacgtgttttgtattcaccgtagaagagcgaggtatgagacaaagcaagtcacagtatcagataaagttaaaagatgttgatatttccgcgtagtgttgttgcttattcagataacacaaggtctgactgcatagaccatatctattgacctagataagtgatacggctattaaacaaaatggcggaatacctggcacgagacgtgatataaggctcacactctcgtcttaataacgtTATATG--AGTTCCCCTGAAG-A--AA---AGCC-TT---TC------AATTTT-AT---CA-----AATAG--AA-ATCCGAG-TACAATTTC-T-TC-TGG---A--G-AAC-A----------------TTGTCAA--ATTTT------ATCA-ATTGTGTTGTGTTAAGTCCTAAAAATCTGG-GTACGTCAC-GTG-TT--C-TCCT--CA--AG----AAA-A------ATT--TT--AGT--CA-----------A-T-A------A----TCTG---GTTAC---G---AGCTCT-CCTAA---AG--A--------------AAAA-C--TATG--TC----ACCTTTT--A-------TC--A--TA--AAA-A-TC-T------G-----G------------TT-A-GGAG--ATCTT-CC--AAA----G-AAA------T------------ACATTG--TTA--ATTTTATCATAAA-A--A-T-CTTG-G-T--C-AA--GTTC-TCC-TGAA------G-A--TAAA-CATTTGT------CATTT----TATCca
gi|8 : ccctgatttcagtcaG--AT----AAA-A------TTTG-AC--AAT--G---TTCT-CC--A---GA-AGAAA----TT------GTACTCGG---ATTTCT-ATTTG---AT--A-AAATTG-------AAAGGC--TTT---TC--------TTC--AGGGGAACTC--A--TA--TAATA-TA-T------G-----G------------GT-A-TGAG--T-C-T-CCT-GGA----G-AAAAATCTTTGTAA--------AT------TCT--ATC--AT----AA-A--AAT-CTGG-G-TA-C-GA--GTTC-TCC-TG----G---A-A--AAAATAATAC-C------CACTT--T-TATCA-T-----A-----------GAAATCTGGTATGACTTCTCCTG-GAA-AGAA--AACTTTGTCAatatatgggtatgagtctcctggagaaaaatctttgtaaattctatcataaaaatctgggtacgagttctcctggaaaaaataatacccacttttatcatagaaatctggtatgacttctcctggaaagaaaactttgtcattttatcaaa
gi|8 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaatt------AACTC--AT----A-----TA-AT--AT-AT--GGG-TATGAGT-C-T-CC-TGG---A--G-AAA-AATC------------TTTGT--A--AATTCT-----ATCA-TA-------------------AAAATCTGG-GTA-----C-GAG-TT--C-TCCT--GG--AA----AAA-A------T--A-AT--ACC--CA-CTTTTATC--A-T----AGAAA----TCTG---G-TAT---G---ACTTCT-CCTGG---A---A-A----G-------AAAA-C--TTTG--TC----A--TTTT--A-------TC--A--ttttatcaaa
gi|9 : ccctgatttcagtcagataaaatgacaaatgtttatcttcaggagaacttgaccaagatttttatgataaaattaacaatgtatttctttggaagatctcctaaccagatttttatgataaaaggtgacatagtttttctttaggagagctcgtaaccagattattgactaaaatttttcttgaggagaacacgtgacgtacccagatttttaggacttaacacaacacaattgataaaatttgacaatgttctccagaagaaattgtactcggatttctatttgataaaattgaaaggcttttcttcaggggGGGA--TG-GGGCTACACTG--CAGGATAAAC--AAA-TGGTGA------GCTGG--T--T-----GTA-AT-----C--TCG-AAC-GGTCAAAA----TTTGTA--TTTTGGT-CAGCTGC------AGAGAAACACAAGGAGCAATAAACTGAATAGTTTC-CTACACAC--TTC-T--T---GAGCCTGACC-TTT-AGCATC-T--GTAA-GT-CTAAACTG-TGTATGA------G-CTTAGG-----------TAAACATATAGTA-----T--ACTTGGGTCAG---ATG-TAG-TTCT-TCCACGTA-TTTT----GC-------GATCCTAAAAGT-CA-TGATCA-AA-AGATGTTG----CTTTCTTCACAC---A-------GT---CCACCCTA-TTTCATTTACTAGGTT-ATATA-ACATCT-GTTTTTG-AA-GTCATGC-GGG-TAGCTTGAAAAAAAA--A-CAA-C-A-TAAT-CTT-TTA--G-AAGATA---------TA-TGG-TGAAGATAT---GGCATA-TCTTG---TATAT------TTTG-G-TACACG-TGGTA-------CAC--G-GTACCA--AACA-T-T-C-CAAT-CTGA-CTCAAAAT-ACAA-AT-CTCTCT---TAATAAAaa
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|24 ): AAAGAGAGTACCAAACCCCCTGACTTGTGACCCGGACGAGGTTTACCCCAATATTGAGCAGAGG
Unaligned ( gi|29 ): TTCTCCAGGAGAATGTGCCCCACTTTCTGGGCACAAGTTTCCCT