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Reference ( gi|1 ) : AAATACCTA-T--TTA---C-T-GGC--TATGA--GG-ACA--ATA-GCAAGTTT----A-T------------------TGT--C-CCCC--------------GA---GAT-------A-CAG--------CA---A----------------C-----------T----------C------G------------G------GAAA-T------A----G-TT---GCTG--TCG--AGG----GG-GA-CAA-T----AAACT-TG--TTA--TTGTCC--GA-ATTGC-CA-G---TAA--AC-----A--------G----GT-AT--TTT-AT----T---ATA---CCAAAGTTAAACCAAAAAAAATATACC-TTTC-C---AT----ACTAT--GTAAA--AAA--AATA-----AATTAAAAC-----GCTT-TTGGGCTTCAAAA---TGACGT-----A-----------T-----AA-CA------AGA-GA-CA---CTTC--AA-AA-AGT--AAAC---GCGG----GAAA-AT-TTAGCAA----C--CG-GT-ATATAG----T----TTT-C--A---GA--C--TA-T--T--T--CC--CTAG-GGC-AA--ATAG----T-T--------C-A---------------CAA-----------A------------CTA--T-------TT-CATG-AG-TA--GCG--T-TAT-TC------AGGGGA--AAT-G---GCAAATTTAT--TC--ACTTAAC-ATTAAATTTTATACA--T--TAAAAACAGTCTGAGGTA
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gi|4 : atagtatAGATACCTA-T--TTA---C-A-GGC--AATTC--GG-ACA--ATA-TCAAGTTT----A-T--------------------------------------------A---GCT-----------G--------CG---G----------------C-----------T----------C------G------------G------GAAA-T------A----G-TT---G-TC--TC----GG----GG-AA-CAA-T----AAACT-TT--CTA--TTGTCC--TC-ATGAT-CA-G---TAtcattataccaaagtgaaaacaagaaagatagcttttcatggtaaattacaggtaattagaatgatcggactttgacgtaacatatttgataacactagagatatctctccaaaaaaacacgggaaaacatagcaaccggtaaatagtttccagactatttcccttgggcaaatagttcacaaactatttcacgagtaacgttatccaaaggaaatagcaaatttattcacctatcatttatacagc
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gi|2 : aatttgatttgaagaaactttaccctagaaacaggtctttgtccttttcatttgatatgttaagtaatgcaatATACCTA-T--TTA---C-T-GGC--TATGA--GG-ACT--ATA-GTAAGTGT----A-T------------------TGT--A-CCC---------------GA---GA----------CAG--------CA---A----------------T-----------T----------------------------------------A-TTTCCAAA----G-GC---ACAG--CCA--AGG----GG-GA-CAA-T----AAACC-TG--CTA--TTGTCCTCGC-A--GC-CT-G---TAA--AT-----A--------G----GT-TT--TTTCAT----T---ATA---CCAAAGTGAAAACAAGAAAGATAG--C-TTTT-C---AT----G------GTAAATTACA--GGTA-----A-TTAGAAT-----GATC---GGACTTTGACG---TAACAT-----A-----------TTTGATAA-CACT----AGA-GA-TATCTCTCC--AA-AA-A-----AAC---ACGG----GAAA-AC-ATAGCAA----C--CG-GT-AAATAG----T----TTC-C--A---GA--C--TA-T--T--T--CC--CTTG-GGC-AA--ATAG----T-T--------C-A---------------CAA-----------A------------CTA--T-------TT-CACG-AG-TA--ACG--T-TAT-CC------AAAGGA--AAT-A---GCAAATTTAT--TC--ACCTATC-A------TTTATACA--
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gi|24 : ttacaggttacgaaA--ATAAGCCAGGCT----A-T------------------TGT--C-CCTT--------------CACCTGAC-------G-CAG--------AA---A----------------C-----------CATTTCC----C------A------------G------GCAA-T------A----AATT---GCTG--GTG--TTG----AG-GA-CAA-T----ACTCT-TG--ATA--TTGTAT--GA-ATAGC-CA-T---TAG--AG-----G--------G----GT-AT--TTC-AT----T---Atcaaacagccttgaatttcattacacccaatataattgaaattcaaactaagtactgtaaaacaagaatatttgg
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gi|8 : aaatttgatctgtgcaaggtccaaggaagcagccga------G------------G------GAAA-C------A----G-TC---GCTG--TCA--A---------------------------TG--T------GTTT--GA-ATAGC-CA-G---TAA--AT-----A--------A----GT-AT--TTT-AT----T---GT------GAAGTGAAACCAAGAAAG--ATAGC-TTTT-T---ATTGTCGTTAG--GTAAA--CGACCAGT------AATCAGA-------GTTA-TCGGACTT--------TGGCGT-----A---------------------A------AGA-A------------------------AAAC---A----------------TAGCAA----C--TG-GT-AAATAG----T----TTC-C--A---GA--G--TA-C--T--T--CC--TTAA-AGG-AA--ATAG----T-T--------T-A---------------CAA-----------A------------CTA--T-------AT-AACG-AG-TA--GCA--T-TAT-CCAGAT--AGAGGA--AAT-A---GAACAATTAT--TC--ACACAAC-A------TCTATACA--G--TAAAAACAGTCTG
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gi|15 : CCTAATTTA---CT-GGCTATGA--GG-ACAATAG-GAGTTTTAATAT------------------TGTCCTT---GA---------GA---CA-----------G-TA---A-------CATAT---------------------TAGACGAG--G------GAAG-T-----A----GCTGCTGTCG--AGA----GGGA-CAA-TAAACA-TA--C-TA--TTGTTC--CA-ATTTCCA-GTAAATACATAA--------AGTAAT--A------TT-ATT----ATACCCAAGTGAAACC-AA-GAAAGAT
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gi|17 : aatttgatttgaagaaactttaccctagaaacaggAATAT-TA-TTTA---CT-GGCTATGA--GG-ATGATAGCAAGGTT----AT------------------TGTCCCTC--GA---------GA---CA-----------G-CA---A-------C---TATATATTTCCCGAGGTGCAGCC------GA-G------GAAA-TCTTCAA----GCTGCCGTCG--AGG----GGAA-CAA-TAAACT-TG--C-TG--TTGTCC--GA-ATt
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gi|18 : CAGAGTGAAAGT-TA-G---GGCATATATTTC-CAT--------TTTAAACTA----CC--GATA-----A--TTAG-G--GTTA-TAGAACTTTG-ACGTAAC------AT-T-----------TTTGCGAA-CACTA----GT-GA--TAT---TCC--AA-Agcgcgacagagtgaaagttagggcatatatttccattttaaactaccgataattagggttatagaactttgacgtaacatttttgcgaacactagtgatattccaaactattaatagcaaattcattcacccaacatttacacagtaaaaatagtctgaggtgt
gi|18 : acaatagcaagtttttgtcccctgaaacagaaactatttccagaggcgcga-------TTT--------------------------TGCG-AACACTA--GTG--A-TATTC-C----AAACTATTAA--------T-AGCAAATTCAT--TC--AC----CCAAC-A------TTT--ACAC-AG----TAAAAATAGTCTGAGGTctattaatagcaaattcattcacccaacatttacacagtaaaaatagtctgaggtgt
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gi|20 : atagtatTTA---CA-GGTTACGA--AG-ACAATATTAAGTTT----ATCACCATGGAGACTTGAACTGTCTCCT--GA---------GA-AGCA-----------GTCG---A-------C-----------------------------------G------GAAA-T-----T----GCTGCTGTCA--ATG----GAGA-CTA-TAAACT-TG--C-TA--T--TTC--AA-ACAGCC--TTGA--------------------AT--T------TC-ATT----ACACCCAAc
gi|21 : CTA-TTTA---CC-AGCAATGT--GGAAAAATTGCAAA-TT----AT------------------TATTCCCC--GA---------G--A-CA-----------G-CAAATA-------C---TTTCCAAGCA------------C------A--G------GAAA-------G----GTTGCTTTC---AAG----GTAA-CAA-TGAACA-TG--C-TG--TTATTT--GA-ATAGCCA-TTAGTT-----A--------TGC-AC--T------TT-GTT----tataattgaaattcaaactaagtactgtaaaacaagaatatttgg
gi|22 : AAATACCTA-GTTA---CT-GTC-ACCC--G---CCACAGCAA--TT----AT------------------T---TCCC--GA---------GG---C------------G-CAC--A-------C---T---------------------T------G--G------GAAC-T-----A----GTTGTTGTCG--AGG----GGAA-CAT-TACACT-TC--C-TA--ATGTAC--GA-ATCGCCA-GTAAAT-----G--------GGT-AT--C------TT-ATA----ATAGCAAAGCGAAAAC-AA-GAACGATA-GCTTTTC-cagtataattttaactttaaaaaacaaaaagtgtatctt
gi|23 : acattAAATACCTA-GTTA---CT-GTC-ACCC------CA-CAGCAA--TT----AT------------------T-TCCC-----A---------GG---C------------G-CAC--A-------C---T---------------------T------G--G------GA---T-----A----TTTGTTGTCG--AGG----GGAA-CAT-TACACT-TC--C-TA--ATGTAC--GA-ATCGCCA-GTAAAT-----G--------GGT-AT--C------TT-ATA----ATAGCAAAGCGAAAAC-AA-GAACGATA-GCTTTTC-g
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gi|26 : taAAATATCAA-GTTA---TT----TATTC--A--ATAGCAGCAAATTT----CT------------------TGT-------------------A-A-C--------------CA---A----------------------------------------G--G------GAAA-T------------TGTTGTCA--AGG----AGGA-CAA-TGAACT-TG--C-TA--TTGCC
gi|27 : tattcagtatgtaaatgaaatatttttaatagttattttaaaaA-GA--TAT---TCC--GA-AA-A-A---------------------GAAA---ACG-TAG----CAT--------C--C---G-GTAAA-TAG------------------------------TT--TCC--CT--AGGGCAAAT-A--G---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTA--------------------------CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGGA--AA--------G-AGTAAATTTGT--TC--AC----CTAAC-A------TTT--GTAC-AG----TAAAAACAGTCTttcatactcacta
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4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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consensus : AAATACCTA-TTTA---CT-GGCTATGC--GG-ACAATAGCAAGTTT----AT------------------TGTCCCCC--GA---------GA-A-CA-----------G-CA---A-------C---T----------C------G------------G------GAAA-T-----A----GTTGCTGTCG--AGG----GGGA-CAA-TAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--GA-ATNGCCA-GTAAAT-----A--------GGT-AT--T------TT-ATT----ATACCAAAGTGAAACC-AA-GAAAGATATACCTTTC-CAT----GCTATGTAAA--A----AA--AATA-----A-ATTAG-AA-GTTATCGGACTTCG-ACGTAAC------GTA--T----G--------A--ACACTA----GA-GA--TAT---TCC--GA-AA-A-G--AA-AA-C--G------CGGGAAA---ACA-TAG----CAA--------C--C---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---C--T-ATT--TCC--CTAGGGCAA--AT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--AC----CTAAC-A------TTT--ATAC-AG----TAAAAACAGTCTGAGGTA
Reference ( family-1572 ) : AAATACCTA-TTTA---CT-GGCTATGC--GG-ACAATAGCAAGTTT----AT------------------TGTCCCCC--GA---------GA-A-CA-----------G-CA---A-------C---T----------C------G------------G------GAAA-T-----A----GTTGCTGTCG--AGG----GGGA-CAA-TAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--GA-ATNGCCA-GTAAAT-----A--------GGT-AT--T------TT-ATT----ATACCAAAGTGAAACC-AA-GAAAGATATACCTTTC-CAT----GCTATGTAAA--A----AA--AATA-----A-ATTAG-AA-GTTATCGGACTTCG-ACGTGAC------GTA--T----G--------A--ACACTA----GA-GA--TAT---TCC--GA-AA-A-G--AA-AA-C--G------CGGGAAA---ACA-TAG----CAA--------C--C---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---C--T-ATT--TCC--CTAGGGCAA--AT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--AC----CTAAC-A------TTT--ATAC-AG----TAAAAACAGTCTGAGGTA
gi|1 : AAATACCTA-TTTA---CT-GGCTATGA--GG-ACAATAGCAAGTTT----AT------------------TGTCCCCC--GA---------GATA-CA-----------G-CA---A-------C---T----------C------G------------G------GAAA-T-----A----GTTGCTGTCG--AGG----GGGA-CAA-TAAACT-TG--T-TA--TTGTCC--GA-ATTGCCA-GTAAAC-----A--------GGT-AT--T------TT-ATT----ATACCAAAGTTAAACC-AA-AAAAAATATACCTTTC-CAT----ACTATGTAAA--A----AA--AATA-----A-ATTAA-AACGCTTTTGGGCTTCA-AAATGAC------GTA--T-------------A--ACA--A----GA-GA--CAC---TTC--AA-AA-A-G--TA-AA-C--G------CGGGAAA---ATT-TAG----CAA--------C--C---G-GTATA-TAG-T----TTT----CA---GA---C--T-ATT--TCC--CTAGGGCAA--AT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CATG-AG---TA--GCG--T-TAT-T-C----AGGGGA--AA--------T-GGCAAATTTAT--TC--AC----TTAAC-ATTAAATTTT--ATAC-AT----TAAAAACAGTCTGAGGTA
gi|10 : AAACC-AA-GAAAGATA--CCTTTCACAT----ACTATGTAAA--A----AA--AAT----------TAA-AA-GCTTTCGGGCTTCA-GAATGAC------GTA-------------------ACA--A----GA-GA--AAC---GCG--GG-AA-A-T--AATAG-C--AATTTTCCGGTAAA-------TAGTTTTCAGACTATTTCC--CTAGG-GCAAAATAG-T----TTT----CA---GA---C----ATT--TCC--CTATGGCAA--ATTAG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CATG-AG---TA--GCG--T-TAT-T-C----AGGGGA--AA--------T-AGCAATTTTAT--TC--AC----GTAAC-A------TTT--ATAT-AG----TAAAAACAGTCTGAG
gi|11 : ttGTTAAACC-AA----AG---TACCTTTC-C-------TTATGTAAA--A----AA--AA-A-----A-ATTAACAA-GCTTTTGGGCTTCA-GAATGAC------GTA-------------------ACA--A----AA-GA--CAC---TCC--GT-AA-A-G--TA-AA----G------CCGGGAA---ATA-TAG----CAA--------C--C---GTGTAAA-TAG-T----TTTT---CA---GA---C--T-ATT--TCC--TTAGAGCAA--GT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------ATT--------------------------CATG-AG---TA--GCG--T-TAT-T-C----AGGGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--ACTTAATTAAC-A------TAT--ATGT-AG----TAAAAACAGTCTGAGGTA
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gi|13 : AAACC-AA-GAAAAATA-GTTTTTC--------GCTAACTACA--A----GA--AAT----------TAG-A--GTTATCGGACTTTG-ACATA---------TT--T----G--------ATAACACTA----GA-GA--TAT---TCC--GAGAA-A-G--AA-AA-C--G------CGGGAAA---ACG-T--------A--------C--C---A-GTAA------T----TTC----CA---GA---C--TAATT--TCC--CTAAGGCAA--AT-AG---T--T--------CA-CAGA----CTATACGTATTTT--------------------------CACA-AA---TA--GCA--T-TAT-T-C----AGAGGA--AA--------T-GGCAAATTCAT--TC--AC----CTAAC-A------TTT--ATAC-AG----TAAAAAC
gi|14 : gaA-GAAA--TATAGTTTTT-CAT----G----GTAAACTA----CC--GGTA-----A--TTAG-A--GTTATCGGACTTCA-ACGTAAC------TTA--TTT--G--------ATAACACTA----GA-TA--TAT---TCC--GA-AA-AAG--AA-AA-CAAG------GGGGGGA---A-A-TAG----CAA--------C--C---G-GTAAA-TAA-T----TTT----CG---AA---C--T-ATT--TCC--CTTAGGCAA--AT-AG---T--T--------CA-CGAA----CTA-------TTT--------------------------CACG-AG---TA--GCG--T-TAA-C-C----AGAGGA--AA------------------TAT--CC--AC----CTAAC-A------TTT--ATAC-AG----TGAAAACAGTCTGA
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gi|17 : ttcagaaATTC--GG-ACAACAGCAAGTTT----AT------------------TGTTCCCCTCGACGGCAGCTTGA-A-GATTTCCTCGGCTG-CA---C-------C---T----------C------G------------G------GAAA-T-----ATATAGTTGCTGTCT--CGA----GGGA-CAA-TAACCT-TG--C-TA--TCATCC--TC-ATAGCCA-GTAAAT-----A---------AT-AT--TATTGCATT-ACTTAACATATCAAA-TGAAAAG-GA-CAAAGA
gi|17 : aatttgatttgaagaaactttaccctagaaacaggAATAT-TA-TTTA---CT-GGCTATGA--GG-ATGATAGCAAGGTT----AT------------------TGTCCCTC--GA---------G--A-CA-----------G-CA---A-------C---TATATATTTCCC------GAGGTGCAGCCGAG------GAAA-TCTTCAA----GCTGCCGTCG--AGG----GGAA-CAA-TAAACT-TG--C-TG--TTGTCC--GA-ATt
gi|18 : aatttgatttgaagaaactttaccctagaaacaggtctttgtccttttcatttgatatgttaagtaatgcaat-------C---T----------C------T------------G------GAAA-T-----A----GTTTCTGTTT--CAG----GGGA-CAA--AAACT-TG--C-TA--TTGTt
gi|18 : CAGAGTGAAAGT-TA-G---GGCATATATTTC-CAT--------TTTAAACTA----CC--GATA-----A--TTAG-G--GTTATAGAACTTTG-ACGTAAC------ATT--TTTGCG--------A--ACACTA----GT-GA--TAT---TCC--AA-Agcgcgacagagtgaaagttagggcatatatttccattttaaactaccgataattagggttatagaactttgacgtaacatttttgcgaacactagtgatattccaaactattaatagcaaattcattcacccaacatttacacagtaaaaatagtctgaggtgt
gi|18 : acaatagcaagtttttgtcccctgaaacagaaactatttccagaggcgcga-------TTT--------------------------TGCG-AACACTA--GTG--A-TATTC-C----AAACTATTAA--------T-AGCAAATTCAT--TC--AC----CCAAC-A------TTT--ACAC-AG----TAAAAATAGTCTGAGGTctattaatagcaaattcattcacccaacatttacacagtaaaaatagtctgaggtgt
gi|19 : acaatagcaagtttttgtcccctgaaacagaaactatttccagaggcgcgacagagtgaaagttagggcatatatttccattttaaactaccgataattagggttatagaactttgacgtaacatC--AG-ACAATA--AA--CT----AT------------------T-TTTCTT--GG---------CA-C-CA-----------C-CA---A-----------------------------G------------G------GAAA-T-----A----GTTGTTGTCAT-AGG----AGTA-C-A-TAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--GAGAATGCCAGGTAAAC-----A--------GGT-ATGCT------CG-ATT----ATgt
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gi|20 : atagtatTTA---CA-GGTTACGA--AG-ACAATATTAAGTTT----ATCACCATGGAGACTTGAACTGTCTCCT--GA---------GA-AGCA-----------GTCG---A-------C----------------------------------G------GAAA-T-----T----GCTGCTGTCA--ATG----GAGA-CTA-TAAACT-TG--C-TA--T--TTC--AA-ACAGCC--TTGA--------------------AT--T------TC-ATT----ACACCCAAc
gi|21 : CTA-TTTA---CC-AGCAATGT--GGAAAAATTGCAAA-TT----AT------------------TATTCCCC--GA---------G--A-CA-----------G-CAAATA-------C---TTTCCAAGCA-C------A------------G------GAAA-------G----GTTGCTTTC---AAG----GTAA-CAA-TGAACA-TG--C-TG--TTATTT--GA-ATAGCCA-TTAGTT-----A--------TGC-AC--T------TT-GTT----tataattgaaattcaaactaagtactgtaaaacaagaatatttgg
gi|22 : AAATACCTA-GTTA---CT-GTC-ACCC--G---CCACAGCAA--TT----AT------------------T---TCCC--GA---------GG---C------------G-CAC--A-------C---T----------T------G------------G------GAAC-T-----A----GTTGTTGTCG--AGG----GGAA-CAT-TACACT-TC--C-TA--ATGTAC--GA-ATCGCCA-GTAAAT-----G--------GGT-AT--C------TT-ATA----ATAGCAAAGCGAAAAC-AA-GAACGATA-GCTTTTC-cagtataattttaactttaaaaaacaaaaagtgtatctt
gi|23 : acattAAATACCTA-GTTA---CT-GTC-ACCC------CA-CAGCAA--TT----AT------------------T-TCCC-----A---------GG---C------------G-CAC--A-------C---T----------T------G------------G------GA---T-----A----TTTGTTGTCG--AGG----GGAA-CAT-TACACT-TC--C-TA--ATGTAC--GA-ATCGCCA-GTAAAT-----G--------GGT-AT--C------TT-ATA----ATAGCAAAGCGAAAAC-AA-GAACGATA-GCTTTTC-g
gi|24 : aacattAAATACCCC-TCTA---AT-GGCTATTC--AT-ACAATATCAAGAGT----AT------------------TGT-CCTC--AA---------CA-C-CA-----------G-CA---ATTTATTGC---C----------T------G------------G------GAAA-T-----G----GTTTCTG-CGTCAGGTGAAGGGA-CAA-TAGCCT-GG--CTTA--TTg
gi|25 : aatgtttctttatacttagtagttgaattactctatctaatgTT----ATACCAAAGTGAAACCCAA-GTAGGATA-ACTTTT--------------GAAGA--T----AA--ACTATCAATA-ATTAG-G--GTTATCAGACTTTG-ACGTAAC------ATA--TTTG-A--------A--ATACTA----GA-AA--TGT---TCC--GA-AATG-G--AA-AA-C--G------CGGGGAA---A-A-TAG----
gi|26 : catatatagtatatactTA---GT-GAGTATGA--AG-GCAATAGCAAGTTC----AT------------------TGTCCTCC--TT---------G--A-CA-----------A-CA---ATTTCC--C---T----------T------G------------GTTACAAGAAATT-----T----GCTGCTATTG--A---------A-TAA-ATAACT-TG--A-TA--TTTTTTTAAA-ATAACTA-TTAAAA-----A----------T-AT--T------TC-ATTTAC-ATACTGAAtgt
gi|26 : taAAATATCAA-GTTA---TT----TATTC--A--ATAGCAGCAAATTT----CT------------------TGT-------------------A-A-C--------------CA---A-----------------------------G------------G------GAAA-T------------TGTTGTCA--AGG----AGGA-CAA-TGAACT-TG--C-TA--TTGCC
gi|27 : tattcagtatgtaaatgaaatatttttaatagttattttaaaaA-GA--TAT---TCC--GA-AA-A-A---------------------GAAA---ACG-TAG----CAT--------C--C---G-GTAAA-TAG-T----TTC--------------------------C--CTAGGGCAA--AT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTA--------------------------CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGGA--AA--------G-AGTAAATTTGT--TC--AC----CTAAC-A------TTT--GTAC-AG----TAAAAACAGTCTttcatactcacta
gi|28 : GAGA---GTA-TAG----CAC--------C--G---G-GTAAA-TAG-T-----------CA---GA---C--T-ATT--TCC--C--GGTCAA--AT-AG---G--TGGAGGTGCCA--GAA----CTA--------TT--------------------------CATG-AG---TA--GCG--T-C-T-C-------GGGAA--AG--------T-GGCAAATT--T--TC--AC------GAA-A------ATT--ATATGAG----TAAAAACAGT-TGAGGT
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gi|30 : aaatttgatctgtgcaaggtGGA--AA-TAAACTGTGAAT-TA--TTATCT--GA-AT-GCCA-GTAATA-----A--------GGTTAT--T------TT-ATT----ATACCAAAGTGAAACC-AA-GAAA-AGATAGCTTTT-CAG----G-------GA--ACCCTAA--GGTA-----C-TTAAG-AG-GTTATCGGACTTTG-ACAT
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gi|32 : ttattgtcgttgataaactactagt---GA---C--T-ATT--TCC--ATAGGGCTG---T-AGAA-T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTTC-------------------------CACGCAGT--TA--GCG--TCTAT-CTT----AGAAG-------------T-AGCAAAT-----------------------------TTT--ATAC-AG----TGAAA
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gi|34 : gttgataaactactagtaatgAG----TAA--------C--C---A-GAAAA-TAG-T----TTC----AA---GA---C--T-ATT--TCCCTCTAGGGCAAATAT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CAC-----------GCG----TGT-C-C----AGAGGA--AA--------T-AGCAAGTTTAC--TC--AC-----------------TTT--ATAC-AG----TGAAA
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gi|37 : aatttga-T-----A----GGTGCTGTCG--AGG----GGGA-TGA-TAAACT-TG--C-TA--TTGTCT--GA-ATTAC
gi|38 : -----A-ATTA--AA-GTTATAGAACTTTG-ACGTAAC------ATATTT----GAT------A--ACACTA----Gaccaaactaaaacaaaaaaaaaata
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gi|40 : ATACCTA-TTTA---CT-GGCTATATAAGG-ACACTTGCAAGTTT----AT------------------T
gi|5 : gacaaaatatTTGCTGCCT--CTG----GGGA-CAA-TAAACT-TG--C-TA--TTGCAC--GA-ATTGCCA-GTGA-T-----A--------GGT-AT--T------CC-ATT----ATACCAAAGTGAAACC-AA-GAAAGATA-GCATTTC-------------------------GG--GATA-----A-ACTAG-----TCATTGGACTTTG-ATGTAAC------GTA--TTT--G--------ATAACACCATGCAGA-GA--TAT---CAC--GA-AA-A-A--AA-AAAC--G------CGGCAAA---ACG-TAG----AAA--------C--C---G-GTAAA-ATG-T----TTT----CA---GA---C--T-ATT--TCC--CTAGGGCAT--AT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CACG-AA---TA--GCA--T-TAT-C-C----AAAGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--AC----GTAGC-A------TTT--ATAC-AG----TAAAAACAGTCTGAGGTA
gi|6 : GGA-CAA-TAAACT-TG--C-TAATTTGAAT--GA-AATGCTA-GTAAAT-----ACTAATGTAGGC-AT--T------TC-ATTTT--ATGCCAAAGTGAAAC--AG-GGAAACTTTAGCTTTT-CA-------------GA--G----CA--GATA-----ATATTTA-AG-ATTATCGGATTTTGTACGTAACTTTGTTGCA--T----A--------A--TCA-TA----GATGA--TAT---TTCTGAA-AA-A-G--AA-AA-C--A------CGGGAAA---ACA-TAG----CAA--------C--C---G-ATAAA-GAATT----TTC----CA---AAACGT--T-ATT--TCT--CTAGGGCAA--AT-AG------T--------CA-TAAA----CTACT-----TTT--------------------------CACC-AG---TA--GCGT-T-TTT-C-C----AGGGGG--GGGGGGGTGTT-AGCAAA-TAAT--TT--AC----TTAAC-t
gi|7 : TGCCTA-TTTAATACT-GGCTATGA--GG-ACAATGGCAAGTTT----AT------------------TGTTCCCC--GA---------GA-caa
gi|7 : ----GAGA-CAAATAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--TC-ATAGCCA-GTAAAT-----ATA------GGT-AT--T------TT-ATA----ATGCCAAAATGAAACC-AA-GAACGATA-ACTGTTC--AT----GTTA--------------A--ACTATCGGTA-ATTAG-A--GTTATCGGACTTTG-ACGC----------------------------A--ACA-TA----GA-GA--TAT---TCC--AA-AA-AAG--AA-AA-C--G------C-GGGAA---------------AA--------C------------G-TAG-------------CA----A---C--C-A--------------GTAA--AT-AG---T--T--------AC-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGAA-----------------------AT--TC--AC----GTAAT-A------TTT--ATAC-AG----T-AAAACAATCTGAcaaataaacttgctattgtcctcatagccagtaaatataggtattttataatgccaaaatgaaaccaagaacgataactgttcatgttaaactatcggtaattagagttatcggactttgacgcaacatagagatattccaaaaaagaaaacgcgggaaaacgtagcaaccagtaaatagttaccaaactatttcacgagtagcgttatccagagaaattcacgtaatatttatacagtaaaacaatctga
gi|8 : tgcctatttaatactggctatgaggacaatggcaagtttattgttcccc------G------------G------GAAA-C-----A----GTCGCTGTCA--A----------------------TG---------TGTTT--GA-ATAGCCA-GTAAAT-----A--------AGT-AT--T------TT-ATT----GT---GAAGTGAAACC-AA-GAAAG--ATAGCTTTT-TATTGTCGTTAGGTAAA--C----GACCAGT------A-ATCAG--A-GTTATCGGACTTTG-GCGTAA
gi|8 : ccaaGAAAA---ACA-TAG----CAA--------C--T---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---G--T-ACT--TCC--TTAAAGGAA--AT-AG---T--T--------TA-CAAA----CTA-------TAT--------------------------AACG-AG---TA--GCA--T-TAT-C-CAGATAGAGGA--AA--------T-AGAACAATTAT--TC--AC----ACAAC-A------TCT--ATAC-AG----TAAAAACAGTCTGagaaaaacatagcaactggtaaatagtttccagagtacttccttaaaggaaatagtttacaaactatataacgagtagcattatccagatagaggaaatagaacaattattcacacaacatctatacagtaaaaacagtctg
gi|9 : ccaagggaaacagtcgctgtcaatgtgtttgaatagccagtaaataagtattttattgtgaagtgaaaccaagaaagatagctttttattgtcgttaggtaaacgaccagtaatcagagttatcggactttggcgtaaaGTTAAACC-AA-GAAAGATA--CCTTTC-CAT----ACTATGTAAA--A----AA--AATT-----A-AC----AA-GCTTTCGGGCTTCA-GAATGAC------GT--------------------ACA--A----GA-G----------------------G--AA-AC-C--G------GAGGAGAAATATA-TAG----CAATTT-----C--C---A-GTAAA-TAG-TATAGTTT----CA---GA---TA-C-ATT--TCTCACTA-GGCAA--AT-AG---TGAT--------TT-CAGA----CTA-------TTTATAGGCAAATAGTTCACAAACTATTTCATG-AG---TA--GCG--T-TAT-T-C----AGGGGA--AA--------T-AGCAATTTTAT--TC--AC----GTAAC-A------TTT--ATAT-AG----T-AAAACAGTCT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1572 ) : AAATACCTA-TTTA---CT-GGCTATGC--GG-ACAATAGCAAGTTT----AT------------------TGTCCCCC--GA---------GA-A-CA-----------G-CA---A-------C---T----------C------G------------G------GAAA-T-----A----GTTGCTGTCG--AGG----GGGA-CAA-TAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--GA-ATNGCCA-GTAAAT-----A--------GGT-AT--T------TT-ATT----ATACCAAAGTGAAACC-AA-GAAAGATATACCTTTC-CAT----GCTATGTAAA--A----AA--AATA-----A-ATTAG-AA-GTTATCGGACTTCG-ACGTAAC------GTA--T----G--------A--ACACTA----GA-GA--TAT---TCC--GA-AA-A-G--AA-AA-C--G------CGGGAAA---ACA-TAG----CAA--------C--C---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---C--T-ATT--TCC--CTAGGGCAA--AT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--AC----CTAAC-A------TTT--ATAC-AG----TAAAAACAGTCTGAGGTA
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gi|34 : gttgataaactactagtaatgAG----TAA--------C--C---A-GAAAA-TAG-T----TTC----AA---GA---C--T-ATT--TCCCTCTAGGGCAAATAT-AG---T--T--------CA-CAAA----CTA-------TTT--------------------------CAC-----------GCG----TGT-C-C----AGAGGA--AA--------T-AGCAAGTTTAC--TC--AC-----------------TTT--ATAC-AG----TGAAA
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gi|15 : CCTAATTTA---CT-GGCTATGA--GG-ACAATAG-GAGTTTTAATAT------------------TGTCCTT---GA---------GA---CA-----------G-TA---A-------CATAT----------TAGACGAG------------G------GAAG-T-----A----GCTGCTGTCG--AGA----GGGA-CAA-TAAACA-TA--C-TA--TTGTTC--CA-ATTTCCA-GTAAATACATAA--------AGTAAT--A------TT-ATT----ATACCCAAGTGAAA-CCAA-GAAAGATG-GCT-TTT---------TATAA--AC------------------------TTATCAGA-TTTG-ATGTAAC------ATATCT----GAAT-----A--ACACTA----
gi|16 : TGAC------GTA----------------A--ACA-------GA-GGACCAC---TCC--GT-AA-A-GTGAA-AA-C--A------CGGGAAAA---TATTAG----CAA--------CCGC---G-GTAAA-TAG-G----TTCTTTACA---GA---CTTT-ATTAATCC--CTA-GGCAA--AT-AAGATTT--------CATCAAATAACTTA-------TTC-CATGAAG---TAATACGGTT-TAT-T-C----AGCGGAAGAA--------TAAGCAAAGTTATTGTCAAAC----TTAACTA------TTTTCATAT-AGGTGATACAAACAG
gi|17 : ttcagaaATTC--GG-ACAACAGCAAGTTT----AT------------------TGTTCCCCTCGACGGCAGCTTGA-A-GATTTCCTCGGCTG-CA---C-------C---T----------C------G------------G------GAAA-T-----ATATAGTTGCTGTCT--CGA----GGGA-CAA-TAACCT-TG--C-TA--TCATCC--TC-ATAGCCA-GTAAAT-----A---------AT-AT--TATTGCATT-ACTTAACATATCAAA-TGAAA-AGGA-CAAAGACCTG---TTTC-TA-G---GGTAA--A
gi|17 : aatttgatttgaagaaacAATAT-TA-TTTA---CT-GGCTATGA--GG-ATGATAGCAAGGTT----AT------------------TGTCCCTC--GA---------G--A-CA-----------G-CA---A-------C---TATATATTTCCC------GAGGTGCAGCCGAG------GAAA-TCTTCAA----GCTGCCGTCG--AGG----GGAA-CAA-TAAACT-TG--C-TG--TTGTCC--GA-ATt
gi|18 : aatttgatttgaagaaactttaccctagaaacaggtctttgtccttttcatttgatatgttaagtaatgcaat-------C---T----------C------T------------G------GAAA-T-----A----GTTTCTGTTT--CAG----GGGA-CAA--AAACT-TG--C-TA--TTGTt
gi|18 : CAGAGTGAAA-GTTA-G---GGCATATA-TTTC-CATT---T-TAA--AC---TACCGATAA--TTAG-G---GTTATAGAACTTTG-ACGTAAC------ATT--TTTGCG--------A--ACACTA----GT-GA--TAT---TCC--AA-Agcgcgacagagtgaaagttagggcatatatttccattttaaactaccgataattagggttatagaactttgacgtaacatttttgcgaacactagtgatattccaaactattaatagcaaattcattcacccaacatttacacagtaaaaatagtctgaggtgt
gi|18 : acaatagcaagtttttgtcccctgaaacagaaactatttccagaggcgcga-------TTT-TGCG-AACACTA--GTG--A-TATTC-C----AAACTATTAA--------T-AGCAAATTCAT--TC--AC----CCAAC-A------TTT--ACAC-AG----TAAAAATAGTCTGAGGTctattaatagcaaattcattcacccaacatttacacagtaaaaatagtctgaggtgt
gi|19 : acaatagcaagtttttgtcccctgaaacagaaactatttccagaggcgcgacagagtgaaagttagggcatatatttccattttaaactaccgataattagggttatagaactttgacgtaacatC--AG-ACAATA--AA--CT----AT------------------T-TTTCTT--GG---------CA-C-CA-----------C-CA---A-----------------------------G------------G------GAAA-T-----A----GTTGTTGTCAT-AGG----AGTA-C-A-TAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--GAGAATGCCAGGTAAAC-----A--------GGT-ATGCT------CG-ATT----ATgt
gi|2 : tacagtgattagtagtatacATACCTA-TTTA---CT-GGCTATGA--GG-ACTATAGTAAGTGT----AT------------------TGTACCC---GA---------GA---CA-----------G-CA---A-------T---TATTTC-----C----------------------------AA-------A----GGCACAGCCA--AGG----GGGA-CAA-TAAACC-TG--C-TA--TTGTCC--TC-GCAGCCT-GTAAAT-----A--------GGT-TT--T------TTCATT----ATACCAAAGTGAAA-ACAA-GAAAGATAG--C-TTTT-CATG----GTAA--AT---TACAGGTAA--TTAG-A-A--TGATCGGACTTTG-ACGTAAC------ATA--TTT--G--------ATAACACTA----GA-GA--TATCTCTCC------A-A-A--AA-AA-C--A------CGGGAAAA---CA-TAG----CAA--------C--C---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---C--T-ATT--TCC--CTTGGGCAA--AT-AG---TT--------CA-CAAA----CTA-------TTT-CACG-AG---TA--ACG--T-TAT-C-C----AAAGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--AC----CTATC-A------TTT--ATAC-AG----ctatacagaatagccgtttggttaacctaccgaataattaggttttcgtactttgagcgtaacattttgatag
gi|20 : atagtatTTA---CA-GGTTACGA--AG-ACAATATTAAGTTT----ATCACCATGGAGACTTGAACTGTCTCCT--GA---------GA-AGCA-----------GTCG---A-------C----------------------------------G------GAAA-T-----T----GCTGCTGTCA--ATG----GAGA-CTA-TAAACT-TG--C-TA--T--TTC--AA-ACAGCC--TTGA--------------------AT--T------TC-ATT----ACACCCAAc
gi|21 : CTA-TTTA---CC-AGCAATGT--GGAAAAATTGCAAA-TT----AT------------------TATTCCCC--GA---------G--A-CA-----------G-CAAATA-------C---TTTCCAAGCA-C------A------------G------GAAA-------G----GTTGCTTTC---AAG----GTAA-CAA-TGAACA-TG--C-TG--TTATTT--GA-ATAGCCA-TTAGTT-----A--------TGC-AC--T------TT-GTT----tataattgaaattcaaactaagtactgtaaaacaagaatatttgg
gi|22 : AAATACCTA-GTTA---CT-GTC-ACCC--G---CCACAGCAA--TT----AT------------------T---TCCC--GA---------GG---C------------G-CAC--A-------C---T----------T------G------------G------GAAC-T-----A----GTTGTTGTCG--AGG----GGAA-CAT-TACACT-TC--C-TA--ATGTAC--GA-ATCGCCA-GTAAAT-----G--------GGT-AT--C------TT-ATA----ATAGCAAAGCGAAA-ACAA-GAACGATA-GCT-TTTC-cagtataattttaactttaaaaaacaaaaagtgtatctt
gi|23 : acattAAATACCTA-GTTA---CT-GTC-ACCC------CA-CAGCAA--TT----AT------------------T-TCCC-----A---------GG---C------------G-CAC--A-------C---T----------T------G------------G------GA---T-----A----TTTGTTGTCG--AGG----GGAA-CAT-TACACT-TC--C-TA--ATGTAC--GA-ATCGCCA-GTAAAT-----G--------GGT-AT--C------TT-ATA----ATAGCAAAGCGAAA-ACAA-GAACGATA-GCT-TTTC-g
gi|24 : aacattAAATACCCC-TCTA---AT-GGCTATTC--AT-ACAATATCAAGAGT----AT------------------TGT-CCTC--AA---------CA-C-CA-----------G-CA---ATTTATTGC---C----------T------G------------G------GAAA-T-----G----GTTTCTG-CGTCAGGTGAAGGGA-CAA-TAGCCT-GG--CTTA--TTg
gi|25 : aatgtttctttatacttagtagttgaattactctatctaatgTT----ATACCAAAGTGAAACCCAA-GTAGGATA-ACT-TTTG-AA-G----ATAA--AC---TATCAAT-A-ATTAG---G-GTTATCAGACTTTG-ACGTAAC------ATA--TTTG-A--------A--ATACTA----GA-AA--TGT---TCC--GA-AATG-G--AA-AA-C--G------CGGGGAAA----A-TAG----
gi|26 : catatatagtatatactTA---GT-GAGTATGA--AG-GCAATAGCAAGTTC----AT------------------TGTCCTCC--TT---------G--A-CA-----------A-CA---ATTTCC--C---T----------T------G------------GTTACAAGAAATT-----T----GCTGCTATTG--A---------A-TAA-ATAACT-TG--A-TA--TTTTTTTAAA-ATAACTA-TTAAAA-----A----------T-AT--T------TC-ATTTAC-ATACTGAAtgt
gi|26 : taAAATATCAA-GTTA---TT----TATTC--A--ATAGCAGCAAATTT----CT------------------TGT-------------------A-A-C--------------CA---A-----------------------------G------------G------GAAA-T------------TGTTGTCA--AGG----AGGA-CAA-TGAACT-TG--C-TA--TTGCC
gi|27 : tattcagtatgtaaatgaaatatttttaatagttattttaaaaA-GA--TAT---TCC--GA-AA-A-A---------------------GAAAA---CG-TAG----CAT--------C--C---G-GTAAA-TAG-T----TTC--------------------------C--CTAGGGCAA--AT-AG---TT--------CA-CAAA----CTA-------TTA-CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGGA--AA--------G-AGTAAATTTGT--TC--AC----CTAAC-A------TTT--GTAC-AG----TAAAAACAGTCTttcatactcacta
gi|28 : GAGAG---TA-TAG----CAC--------C--G---G-GTAAA-TAG-T-----------CA---GA---C--T-ATT--TCC--C--GGTCAA--AT-AG---GTGGAGGTGCCA--GAA----CTA--------TT-CATG-AG---TA--GCG--T-C-T-C-------GGGAA--AG--------T-GGCAAATT--T--TC--AC------GAA-A------ATT--ATATGAG----TAAAAACAGT-TGAGGT
gi|29 : ACT-TT--C-TA--TTGCAG--GA-ATTGCCA-GTAAAT-----A--------GGT-AT--T------TT-ATT----ACATTTAAGTGAAA-TCAA-GAAAGATtaa
gi|3 : CC--AA---------GG-A--A-----------G-CA---G-------C--------------C------GAG----------G------GAAA-T-----A----GTTGCTGTCG--AGA----GGGA-CAA-TAAACT-TC--T-TA--TTGTCC--GA-ATTGCCA-GTAAAT-----A--------GGT-AT--T------TT-ATT----ATACCGAAGTTAAA-CCAA-GA------TACC-TTTC-CTTA---TGTAA--AA---AA--AA-AA-ATTAACA-A-GCTATTGGGCTTCA-GAATGAC------GTG-------------------ACA--A----AA-GA--CAC---TCC--GT-AA-A-G--TA-AA-C--G------CGGGAAAA---TA-TAG----CAA--------C--C---G-GTGAA-TAG-T----TTTT---CA---AA---C--T-ATT--TCC--CTAGGGCAA--AT-AG---AT--------CA-CAAA----CTA-------TTT-CATG-AG---TA--GCG--T-TAT-T-C----AGGGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--AC----TTAAC-A------TTT--ATAT-AG----TAAAAACAGTCTGAGGtgtcgtttggcaactacgggtaactcaggcttttccgaatgtgtcgtagtatatttgataacactaaa
gi|30 : aaatttgatctgtgcaaggtGGA--AA-TAAACTGTGAAT-TA--TTATCT--GA-AT-GCCA-GTAATA-----A--------GGTTAT--T------TT-ATT----ATACCAAAGTGAAA-CCAA-GAAA-AGATAGC-TTTT-CA------GGGA--ACCCTAA--GGTAC-TTAAG-A-G-GTTATCGGACTTTG-ACATA
gi|31 : TAA--AC---TACTAGTAA--TTAG-A---GTTATCAGACTTTG-ATGGAAC------ATA--TTT--G--------ATAACACTA----AA-GT--TAT---TCT--GG-AATA-G--AA-AA-T--G------AGGAAAAA---CA-TAG----CAA--------G--T---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---C--T-ca
gi|32 : ttattgtcgttga---GA---C--T-ATT--TCC--ATAGGGCTG---T-AGAA-TT--------CA-CAAA----CTA-------TTTCCACGCAGT--TA--GCG--TCTAT-CTT----AGAAG-------------T-AGCAAAT-----------------------------TTT--ATAC-AG----TGAAA
gi|33 : atagcggcctg-A-GTTATCAGACTTTG-ATGGAA-------ATA--TTT--G--------ATAACACTA----AA-GT--TAT---TCT--GG-AATA-G--AA-AA-T--G------AGGAAAAA---CA-TAG----CAA--------G--T---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---C--T-Agtttcatagagaggttgctgagtgatat
gi|34 : gttgataaactactagtaatgAG----TAA--------C--C---A-GAAAA-TAG-T----TTC----AA---GA---C--T-ATT--TCCCTCTAGGGCAAATAT-AG---TT--------CA-CAAA----CTA-------TTT-CAC-----------GCG----TGT-C-C----AGAGGA--AA--------T-AGCAAGTTTAC--TC--AC-----------------TTT--ATAC-AG----TGAAA
gi|35 : ------G------------G------GAAA-T-----A----GTTGTTGTCT--CGC----TGGA-CAA-AAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--GC-GTAGCCA-GTAAAT-----A--------GGT-A-----------T-ATA----ATAT----GTACAT-CCAG-CAA--ATATACC-TTgtc
gi|36 : cgaggcgcagttgaCTA-TTTA---CCAAGCAATGT--GGAAAAATTGCAAA--T----AT------------------TATTCCCC--GA---------G--A-CA-----------G-CAAATA-------C---TTTCCAAGCA-C------A------------G------GAAA-------G----GTTGCT-TCA--ACG----GTAA-CAA-TGAACA-TG--C-TG--Tgaatt
gi|37 : aatttga-T-----A----GGTGCTGTCG--AGG----GGGA-TGA-TAAACT-TG--C-TA--TTGTCT--GA-ATTAC
gi|38 : TAA--AC---TACCGGTAA--TTA--A-A-GTTATAGAACTTTG-ACGTAAC------ATATTT----GAT------A--ACACTA----Gaccaaactaaaacaaaaaaaaaata
gi|4 : aaTA---CT-GATCATGA--GG-ACAATAGAAAGTTT----AT------------------TGTTCCCC--GA---------GA------------------CA---A-------C---T----------------------------------------A-T-----------TTCC---CG--AGC----CGCAGCTA-TAAACT-TG--A-TA--TTGTCC--GA-ATTGCCT-GTAAAT-----A--------GGT-AT--C------TG-TTC----ATACCAAAGTGAAA-CCTATGAA-----TACCGTCTC-T------TGGAA--AC---TACCGGTAT--TTAG-A---GTTATCTGACTTAG-ACGTAAC------ATAGTT----GTT------A--ACACTA----GA-AA--TAT---TCC--GA-AA-A-----A-GA-G--G------CGGGAAAA---GA-TAT----CAA--------C--A---G-GTGAA-TAT-T----TTC----CAATTGAAC-C--C-ATT--TCT--TTAGGGTGA--AC-AG---AT--------CG-CAAG----CAA-------TTT-CACA-AG---TA--GCG--T-TAT-C-T----AGAGGA--AA--------T-AGCTAATTTAT--TC--AC----CTA
gi|40 : ATACCTA-TTTA---CT-GGCTATATAAGG-ACACTTGCAAGTTT----AT------------------T
gi|5 : gacaaaatatTTGCTGCCT--CTG----GGGA-CAA-TAAACT-TG--C-TA--TTGCAC--GA-ATTGCCA-GTGA-T-----A--------GGT-AT--T------CC-ATT----ATACCAAAGTGAAA-CCAA-GAAAGATA-GCA-TTTC--------------------GG--GATAA-ACTAG------TCATTGGACTTTG-ATGTAAC------GTA--TTT--G--------ATAACACCATGCAGA-GA--TAT---CAC--GA-AA-A-A--AA-AAAC--G------CGGCAAAA---CG-TAG----AAA--------C--C---G-GTAAA-ATG-T----TTT----CA---GA---C--T-ATT--TCC--CTAGGGCAT--AT-AG---TT--------CA-CAAA----CTA-------TTT-CACG-AA---TA--GCA--T-TAT-C-C----AAAGGA--AA--------T-AGCAAATTTAT--TC--AC----GTAGC-A------TTT--ATAC-AG----TAAAAACAGTCTGAGGTA
gi|6 : GGA-CAA-TAAACT-TG--C-TAATTTGAAT--GA-AATGCTA-GTAAAT-----ACTAATGTAGGC-AT--T------TC-ATTTT--ATGCCAAAGTGAAA-C-AG-GGAAACTTTAGC-TTTT-CA---------G--AG---CA--GATAATATTTA-A-G-ATTATCGGATTTTGTACGTAACTTTGTTGCA--T----A--------A--TCA-TA----GATGA--TAT---TTCTGAA-AA-A-G--AA-AA-C--A------CGGGAAAA---CA-TAG----CAA--------C--C---G-ATAAA-GAATT----TTC----CA---AAACGT--T-ATT--TCT--CTAGGGCAA--AT-AG----T--------CA-TAAA----CTACT-----TTT-CACC-AG---TA--GCGT-T-TTT-C-C----AGGGGG--GGGGGGGTGTT-AGCAAA-TAAT--TT--AC----TTAAC-t
gi|7 : TGCCTA-TTTAATACT-GGCTATGA--GG-ACAATGGCAAGTTT----AT------------------TGTTCCCC--GA---------GA-caa
gi|7 : ----GAGA-CAAATAAACT-TG--C-TA--TTGTCC--TC-ATAGCCA-GTAAAT-----ATA------GGT-AT--T------TT-ATA----ATGCCAAAATGAAA-CCAA-GAACGATA-ACT-GTTC--ATG---T-TAA--AC---TATCGGTAA--TTAG-A---GTTATCGGACTTTG-ACGCAAC------ATA-----------------------------GA-GA--TAT---TCC--AA-AA-AAG--AA-AA-C--G------C-GGGAA---------------AA--------C------------G-TAG-------------CA----A---C--C-A--------------GTAA--AT-AG---TT--------AC-CAAA----CTA-------TTT-CACG-AG---TA--GCG--T-TAT-C-C----AGAGAA-----------------------AT--TC--AC----GTAAT-A------TTT--ATAC-AG----T-AAAACAATCTGAcaaataaacttgctattgtcctcatagccagtaaatataggtattttataatgccaaaatgaaaccaagaacgataactgttcatgttaaactatcggtaattagagttatcggactttgacgcaacatagagatattccaaaaaagaaaacgcgggaaaacgtagcaaccagtaaatagttaccaaactatttcacgagtagcgttatccagagaaattcacgtaatatttatacagtaaaacaatctga
gi|8 : tgcctatttaatactggctatgaggacaatggcaagtttattgttcccc------G------------G------GAAA-C-----A----GTCGCTGTCA--A----------------------TG---------TGTTT--GA-ATAGCCA-GTAAAT-----A--------AGT-AT--T------TT-ATT----GTG---AAGTGAAA-CCAA-GAAAGATAG--C-TTTT-TAT----TGTCG---T---TA--GGTAA-ACGAC-C-A-GTAATCAGA--------GT----------TA--TC---G--------G--ACTTTG----G--------------C--GT-AA-A-G--AA-AA------------------A---CA-TAG----CAA--------C--T---G-GTAAA-TAG-T----TTC----CA---GA---G--T-ACT--TCC--TTAAAGGAA--AT-AG---TT--------TA-CAAA----CTA-------TAT-AACG-AG---TA--GCA--T-TAT-C-CAGATAGAGGA--AA--------T-AGAACAATTAT--TC--AC----ACAAC-A------TCT--ATAC-AG----TAAAAACAGTCTG
gi|9 : ccaaGTTAAA-CCAA-GAAAGATA--CC-TTTC-CATACTATGTAA--A----AA-----AA-ATTAACA-A-GCTTTCGGGCTTCA-GAATGAC------GTA--------------------CA--A----GA-G----------------------G--AA-AC-C--G------GAGGAGAAATATA-TAG----CAATTT-----C--C---A-GTAAA-TAG-TATAGTTT----CA---GA---TA-C-ATT--TC
gi|9 : ---G-GCAAA-TAG-TGA--TTT----CA---GA---C--T-ATT--TA----TAGG-CAA--AT-AG---TT--------CA-CAAA----CTA-------TTT-CATG-AG---TA--GCG--T-TAT-T-C----AGGGGA--AA--------T-AGCAATTTTAT--TC--AC----GTAAC-A------TTT--ATAT-AG----T-AAAACAGTCTtcactaggcaaatagtgatttcagactatttataggcaaatagttcacaaactatttcatgagtagcgttattcaggggaaatagcaattttattcacgtaacatttatatagtaaaacagtct
blockSeqs : A ATA A T TAAGG GT TAAT CACCATGGAGACTTGAAC G C CTC GACAGCAACTATATATTTCCCGAGGTGCAGCCGA TTACAA TCTTCAA GTC TGAA G A G AA T AT TA G T G ACATA CTAATGTA A GC ATTGCA C TAAC C T A TACCG ACATACTATGTAAAAAAAATTAAAA C T TTTGTTG CATGTATTAGATA CC TGCA T AC CTC TG AT T A TG T CAATTTTC ATAT T TTTT ACTATTTC CTAG T A T ATAG TTTA ATT ACG TT A AA CT AT T GAT GGAGGTGC T TAAC TACGTAT C A CAC AT GT C T T AGAT AG GGGGGTGT A TG AA TTAAT T . TC G GTGA
blockSeqs : . . . T TGGA GT . . G T C CGGCAGCTTGAAGATTTCCTCGGCTGCACCTCG . TATATA AT . . . . . . . . . A . . TA T . . . TAC . . A TACC CTTATGTAAAAAAAAAAATTAACAA C . G TCTGAATA CT . . . . . AG T A . . CAAG T . . TTT CGC . . . GA T . AC A . . . . . AA . . . CT . C T . T . . . . TT . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . T TGGA GG . . G C T GACAGCAAATACTTTCCAAGCACA . TTT G . . . . . . . . . T . . . . . . . TT . . A TAGT CATGGTAAATTACAGGTAATTAGAA T . G TTTGATA CT . . . . . G T . . . ACG C . . . C . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . T AGG GT . . G T T GACAGCAAATACTTTCCAAGCACA . TA T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A TATA CTTATGTAAAAAAAAAAATTAACAA T . A TTTGCGA CT . . . . . T . . . . CG C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . A CGG GT . . G A C GACAGTAACATATTAGACGAG . TA G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A TACC CAGGGAACCCTAAGGTACTTAAGAG C . T TTTGATA CT . . . . . A . . . . CG T . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . T AGG GA . . A C C CACCAGCAATTTATTGCCTG . TA T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A TAGC CATACTATGTAAAAAAAATTAACAA T . A TTTGATA CT . . . . . T . . . . CA C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . T CAG GT . . G T C GACAACAATTTCCCTTG . TT A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A TACC CATGGTAAACTACCGGTAATTAGA T . G TTTGATA CT . . . . . A . . . . CA C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . T AGG AT . . G C C GACAGCAATTATTTCC . TA A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . A TAGC CATTTTAAACTACCGATAATTAGG T . A TTTGATA CT . . . . . A . . . . CG T . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . A AAG GT . . G C C GGAAGCAGCCGAG . TA G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . C GCT AAGATAAACTATCAATAATTAGG T . A GTTGTTA CT . . . . . A . . . . CG T . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . C CAT GT . . A T C GAAGCAGTCGAC . TG G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C GTT ATGTTAAACTATCGGTAATTAGA C . A TTTGATA CT . . . . . T . . . . TG C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . T AAG GT . . G T C GGCGCACACTTG . TA G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . G GCT TATTGTCGTTAGGTAAACGACCA T . G TTTGAA CT . . . . . G . . . . TG C . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . T AGG A . . G T C GGCGCACACTTG . TA A . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A GCT TTGGAAACTACCGGTATTTAGA T . A TGATA CC . . . . . G . . . . GG G . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . AGG A . . . . . CACCACCAAG . TA G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A GCT GCTAACTACAAGAAATTAGA T . A TCGG TT . . . . . A . . . . CA C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . CG . . . . . . AACCAAG . CA T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A ACT CAGAGCAGATAATATTTAAG T . A TAA T . . . . . A . . . . CG C . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : CA . . . . . . GACAACT . A A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A GCA TATTGTCGTTTGTTACAGA A . A A . . . . . . A . . . . CG C . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : C . . . . . G G . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C ACT GGGATAAACTAG T . G . . . . . . . A . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . T G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A CC TATAAAC T . A . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G T . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A TG T . G . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T A . . . . . . . . . . . . . . GC C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . CC . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
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blockSeqCons : TGCC* CATGGTAAACTACCGGTAATTAGA**************** TTTGATA************ CT ******
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|38 : -TAAACTACC---G-GT-AA-TT--AA--A--GTTATAGAACTTTG-A-CGTAAC------ATATTTG-ATAA-CAC----TAGaccaaactaaaacaaaaaaaaaata
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