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lowQualScore                  :                 ..........    ........  .   . ...... ..  .  .    ..... ........... .   .................  ...   .   .           .  .. .....  ..  .. ...      ...........................................      ....  .  ................    ...........    .....   .. .   .   .....    . ..........   ....   ..   .  .   .   ............ .      ........ . .. .    .............      ........ . .  .......   .  ...   ...    ... ..         . .    ..    . .     .   ......        ..  .   . ...................................................               .     .      .......    .       ...    
lowQualScore                  :                 4444444444    22222222  1   7 777777 77  7  7    77777 55555555555 7   88888888888888888  000   0   9           1  33 00000  00  33 222      5555555555555555555555555555555555555555555      8888  0  5555555555555555    88888888888    44444   00 6   6   55555    0 9999999999   5555   55   0  0   0   222222222222 0      77777777 0 55 0    7777777777777      11111111 0 0  0000000   0  555   444    000 00         0 0    99    0 0     6   000000        33  7   7 888888888888888888888888888888888888888888888888888               0     0      0000000    0       000    
consensus                     :      CTGGTGTAAAGCC-G------ATGT--------AC-GTA-C------C--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACA------NCCC--A--ACAT---GGCGACA-GAGGAAAACGGTTC--G--AA-TG--TT--TA-CATCCTT---------------------TNA--TAT-------C--NG--TTAAAC---AAC-CA---NT-T--AA-----TGTT-----T--CAATTTT----TCTT--T-CAA-CTTA----AAGA-T-----A----ATG----TAT--GTC-TT-AAT-GCT-C-G---C----T-GCGACA-CA-----A-A--T-TAAT---A--N-A-A--GAACGT-GAA----A-T-AA-------ACAGTA---TAT-TTGATA-TAA--TAAAAATGAAG-ATGA--TGTG-G-GTACCAGCAT-AA--GTTTGATG--TACGTACC-----------AGTTGTACGTACATGTACAATGNTCCGATAAGCCAAAAATAAATCGGATGTACGTACCAGTCAAAAGAT------GTACATACCATG-AGTAAC
Reference ( gi|3 )            :      CTGGTGTAAAGGC-G------ATGT--------AC-GTA-C------C--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACA------GCCC--A--ATAT---GGCAACA-GAGGAAAACGGCTC--G--AA-TG--TT--TA-CATCCTT---------------------CTA--TAT-------C--TG--TTAAAT---AAC-CA---AT-T--AA-----TGTT-----T--CAGTTTT----TCTT--T-CAA-CTTG----AAGA-T-----A----ATG----TAT--GTC-TT-AAT-GCT-T-G---C----T-GCGACA-GA-----A-A--T-TAAT---A--A-A-A--GAACGT-GAA----A-T-AA-------ACACTA---TAT-TCGATA-TGA--TAAAAATGACG-ATGA--TGTA-G-GTACCGGCA--GA--GTTTGATG--TACGTACC-----------A--TG-------------AA--ATCC--T-AGCCA-----AAATCGGATGTACGTTCCAGTAAAAAGACATCACGGTACCTACCATGTACTAAC
gi|12                         :      CTGGTGTAAAGCC-G------ATGTACACATGTAC-GTA-C------C--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACA------GCCC--A--ACAT---GACAACA-GAGGAAAACGGCTC--G--AA-TG--AT--TA-CATCCTT----------------------TAC-TAT-------C--AG--TTAAACTGGAAT-AG---AT-T--AA-----T
gi|5                          :    ctCTGTTGTAAAACT-G------ATGC--------AC-ATA-C------C--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACG--------------------------ACA-GGCGATACCGGTTT--GTGAT-TT--TT--TT-TATCCTT---------------------TAA--TAT-------AAGTT--TTAAAC-----C-CA---TT-T--AC-----TGTT-----T--GAATTTT----GTTT--T-CAA-CTTA----TACA-TTGTGTAC---ATG----TAT--GTC-TT-GAT-GCT-C-ATCAC----T-GCG-CA-GATCTAGA-A--T--GAT---A--T-A-T--GAGTAT-GAA----G-T-AA-------GTAGTA---T-T-TCTCTA-CAAATCAAAAACGACG-ATGA--TGTA-G-GTACC-GCATTAATTGTTTGATG--TAGGTTCC-----------
gi|19                         :   tcaCTGGTGTAAACGC-G------ATGT--------AC-GTA-C------C--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACA------GCtg
gi|18                         :     tCTGGTGTAAAGCC-A------ATGT--------AC-GTA-CATGTACC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-A-------------------------GCAACA-GAGGAAAACGGCTC--
gi|16                         :      CTGGTGTAAAGCT-G------ATGC--------AC-GTA--------T--GT-CG-AGTA-----C---------G-T-ACA------TCCA--A--ACAT---GG-GACA-GGTGATAATGGCTC--G--
gi|9                          :    caCTGGTGTAAAGCT-A------ATGC--------AT-GTA-C------C--A--------A-----C-----------T-A-------------------AT---GGCGACA-GGTGATACTGGTCCATG--AG-TT--TT--T--TATCCTT---------------------AT---TGT-------C--AGGTTTAAAC-----C-CATCCAC-T--AGC----TGTT-----T--GAATTTT----ACTC--T-TAA-CTTA----TTCA-T-----T----TTG----TAT--ATC-TT-AAT-ACT-T-G---T----C-ACTATG-CA-----G-A--T-TGAT---A--ATA-T--GAGTAT-G-G----A-T-AA-------GCGACA---TTTCTCGACA--AA--TCAAAAtcag
gi|4                          :  gatcaTGGTGTTAAAGCAG------ACATG-------AC-GTA-C------C--ATTCG---TA-----C---------G-TTACA------GCCC--A--ACAT---GGCGA-A-GAGGAAAACGGCTC--G--AA-TG--TT--TACCATCCTT---------------------TAA--TAG-------C---A--TTAAAC---AAC-CA---TT-T---------TGTTATATAT--TATTTTTTTTCTTTT--T-CAACCTTA----AAGA-T-----A----ATG----TAT--GAC--A-AAT-GCT-TCG---CG---T-GCAACA-CC-----ATA--T-AAAT---A--A-A-----AACGA-AGA----A-TAAA-------ACAATA---TAT-TTGATA-TAA--ATAAATTGAAG-ATGA---GTACA-GTACCAG
gi|7                          :       TGGCGTAAAGCC-G------GTGT--------AG-GTAAC------CTAAT-GT-GTTA-----C---------A-T-ATA------TTC------GCAT---GACAACA-GAGGAAAGCGGTTC--G--AG-TG--TTGTTA--ATCCGT---------------------TTA----------------G--TCAAAG---AGTGCT---TT-T--AAAAAGATGTG-----T--CATTTTT----TCTTTAT-CAC-TTTA----AAGA-C----------ATG----TAT--GTTATTAAAT-GCT-C-G---C----TGGCGAAA-GA-----A-AATT-TAATCGGA--G-G-A--GAACGTAGAA----A-T--C-------GCCCTAGT-TAT-TTAATAGCAA--TAAAtccacacgcgtttaaattcagtc
gi|11                         :       TGGTGTAAAGCT-G------ATGC--------AC-GAA-C------C--AT------TT-----T---------G-T-AC-----------------T-T---GTCGACA-GGAAACACCGATTC--G-----TGAATT--TA-TATCCCA---------------------CAA--CAT-------C--------AACTTCAAAC-CC---ATCT--AC-----TGAT-----T--GAATTTT----ACTC--T-TAA-CTT
gi|8                          : ttgtcatGGTGTAAAGCC-GGTGTCCATGT--------AC-GTA-C------C--AT-CG-GGTA-----TCTACAATATG-C-ACA------TCCC--A--ACAT---GGCAACG-AAGGAAAATGGatttattttgta
gi|1                          :          TGTAAAGCC-G------ATGT--------AC-GTA-T------C--AT-CG-AATA-----C---------C-T-ACA------GTCC--A--ACAT---GGCGAGC-GAGGAAAACGGTTC--G--TA-TG--TT--TA-CATCCTT---------------------TAA--TAT-------C--AG--TTAAAT---AAC-CA---TT-T--AA-----T---------------TTT----TTTT--T-CAA-CTTA----AAGA-T-----A----ATA----CAT--GTC-TT-AAT-GCT-C-G---C----T-GCGACT-CA-----A-A--T-TAAT---A--T-G-A--GAACGT-ACA----A-T-AA-------ACAGTA---TAT-TTGATG-CAA--CAAAAATGAAG-ATGA--TGTA-G-GTACCGGCA--TA--GTTTGATG--TACGTACCGGCATAGTTTGA--TGTACGTACATGTACAATGATCCGAT-AGCCA-----AAATCGGATGTACGTACCAGTCAAAAGAT------GTACATACCATG-AGTAACttttcttttcaacttaaatatcatgtatcagtcttaatgctcgatgcaacaccaattaataaaagaacgtagaataagcagtatatttgatataataaaaaaagatgatgtgggtaccagttcacacgctttaca
gi|2                          :                  C-G------A-GT--------ATTGTA-C------C--AT-CGAGGTAATCTGC---------A-T-ACATGTAACATCC--GGGACATTTCGGCAACA-GAGGAAAACGGTTAA-G--AACTG--TTA-TA-CTCCCTTTTCAAACTACCATGGTAATTACTA--TAA-------CA-TG--TAAAGT---AAC-CA---AT-TTTAA-----TGTT-----TTTC-GTTTT----TCTT--TTCAA-CTTATTTAAAGA-TT----A----ATG----GGT--ACC-TT-AATTGCT-T-G---C----T-GCAAGA-GA-----A-A--TCTAATTGGATCG-A-G--AAACGTAGAA----ATT-TG-------ATACCA---TGT-----TA-TTA--T---AATGA---ATCA--T----G-ATACCAACAT-AA--GTTTGATGTATATGTA-C-----------AGTTG-------------AA--TTCC--TAAACCAAAAATAAATCGGATGTA
gi|13                         :                              c--------AC-GTA-A------A--AT-AT-GGTA-----C---------C-T-ACA------TTCT--A--CCAC---GGCGACA-GGCGCAACCGATTC--G--TG-AG--TT--TT-TATCCTT---------------------CAA--TAT-------C--aaac
gi|6                          :                                      tgttacA-C------C--AT-CA-GGTA-----C---------TCT-ACA------TCCCCAA--ACAT---GGCTACAAGAAGAACACAGTTC--G--AA-TG--TTC-TA-CACCATT---------------------TTGATTATCAAATTAC--TG--ATAAAT---AAC-CA------T--A-------GTT-----T--CGATTCT----CCTT--T-CAT-CTTA----AACAGT-----A----A-GCAGCTAA--ATA-AT-AAT-GCTGC-G---CAT--T-GCGACATCA-----A-A--T-TGAT---A--C-G-A--AACCG----A----A-T-AATCTTAATACAGTAAAGGAT-T--ATA-TAA--TAAAAATGAAGCATAATCTATA-GAGTACCAGaattttaatctgtttgaatatttaatttgtacgt
gi|10                         :                                             -C------C--AC-TG-GGTA-----C---------C-A-ACA------TCCC--A--ACAT---GGCAACA-GAGGAAAACGGTTC--G--AA-TG--TT--TA-CACCCTG---------------------TAA--TAT-------C--AA--TTAAAT---AAC-CA---TT-T--AA-----TGTT-----T--CAACTTT----TCTT--T-CAA-CTTA----AAGA-T-----GATACATG----TAT--GTC-TT-AAT-GCT-C-G---C----T-GCAACA-GA-----A-A--T-TAAT---A--A-AGA--GACCGTAGAATATTA-T-AA-------ACGGTA---CAT-TTGATA-TAA--TAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                   -----TGTT-----T--CAATTTT----TCTT--T-CAC-CTTA----AAGA-T-----A----GGA----TAT--GTC-TT-AAT-GCT-C-G---CTGAAT-GTGATA---------------TAAT---A--A-A-AATGAAGAT-GA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                      GTTTT----CTTT--T-CAA-CTTA----AATA-T-----C----ATG----TATCAGTC-TT-AAT-GCT-C-G---A----T-GCAACA-CC-----A-A--T-TAAT---A--A-A-A--GAACGT-AGA----A-T-AA-------GCAGTA---TAT-TTGATA-TAA--TAAAAA--AAG-ATGA--TGTG-G-GTACCAGtgtgggt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggtgtaaagccggtgtccatgtacgtaccatcgggtatctacaatatgcacatcccaacatggcaacgaaggaaaatg-T-AA-------ACAGTA---TAT-GTGATA-TAA--TAGAAATGAAG-ATGA--TGTG-G-GTACCAGttcacacgctttaca
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tGATA-TAA--TAAAAATGAAG-ATGA--TGTG-G-GTtctacacgcgtcacattc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|14 ): TGCGCATCCAGATTGATATATGAGTATAAAACAAGCAGAATTTCTCGAGAATCAAAAACGATGAGGATGCAACTACCAGCATTGGTTGATGTCACTACCGGCAT






Alignments
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Reference ( family-156 )      :                                                                                CTGGTGT-AAAGCCG------ATGT--------AC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACAN------CCC--A--ACAT---GGCGACA-GAGGAAAACGGTT--C--GAA-TG--TT--TA-CATC-CTTTN---------------------A-TAT-------CN-G--TTAAAC--AAC-CANTT--AA-----TGTTT--CA----ATTTT-----TCTT--TCAA-C----TTAAAGA-----TA----ATG----TAT--GTC-TT-AA-TGC---T-CGC--T-GCGACA--CAA-A--T------TAAT---ANA-AGAACGT-GAA----AT-AA-------AC--AGTA---TAT-TT-GATA-----TAA--T-AAAAATGAAG-ATGATGT---G-GGTACCAGCA-TAA--GTTTGATGT-ACGTACC-----AGT----TGTACGTACATGTACAATGNTCCGATAAGCCAAAAATAAATCGGATGTACGTACCAGTCAAAAGAT------GTACATACCATG-AGTAAC
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Reference ( family-156 )      :                                                                                CTGGTGT-AAAGCCG------ATGT--------AC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACAT------CCC--A--ACAT---GGCGACA-GAGGAAAACGGTTC--G--AA-TG--T--T-TA-CATCCTTT---AA-TATCA-------G--TTA----AAC--A---------AC-CA--TTT-A-----ATGTTT--CA----ATTTT-----TCTT--TCAA-C----TTAAAGA-----TA----ATG----TAT--GTC-TT-AA-TGC---T-CGC--T-GCGACA--CAA-A--T------TAAT---ANA-AGAACGT-GAA----AT-AA-------GC---AGTA---TAT-TT-GATA-----TAA--T-AAAAATGAAG-ATGATGT---G-GGTACCAGCA-TAA--GTTTGATGT-ACGTACCGG----------TGTACGTACA-GT--AAT-ATCC--T-AGCCA-----AAATCGGATGTACGTNCCAGTNAAAAGACATCACGGTACNTACCATGTANTAAC
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgttac--T-GCG-CATCCAG-A--T------TGAT---ATA-TGAGTAT-AAA----AC-AA-------GC---AGAA---TTT-CTCGAGA-------A--TCAAAAACGATG-AGGATGC---A-ACTACCAGCA-TTG--G-TTGATGTCAC-TACCGG----------gtacgt
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gi|16                         :                                                                                CTGGTGT-AAAGCTG------ATGC--------AC------GTA-T---GT-CG-AGTA-----C---------G-T-ACAT------CCA--A--ACAT---GG-GACA-GGTGATAATGGCTC--G--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   caT-AA-------AC---AGTA---TAT-GT-GATA-----TAA--T-AGAAATGAAG-ATGATGT---G-GGTACCAGtcag
gi|18                         :                                                                               tCTGGTGT-AAAGCCA------ATGT--------ACGTACATGTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-A-------------------------GCAACA-GAGGAAAACGGCTC--tctacacgcgtcacattc
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gi|2                          :                                                                                           tCCG------A-GT--------ATT-----GTA-CC--AT-CGAGGTAATCTGC---------A-T-ACATGTAACATCC--GGGACATTTCGGCAACA-GAGGAAAACGGTTAA-G--AACTG--T--TATA-CTCCCTTTTCAAACTACCATGGTA--A--TTACTATAAC--ATGTAAAGTAAC-CAATTTT-A-----ATGTTTTTCG----TTTTT-----CTTT--TCAA-CTTATTTAAAGAT----TA----ATG----GGT--ACC-TT-AATTGC---T-TGC--T-GCAAGA--GAA-A--TC-----TAAT---TG---GATCGA-GAA----AC----------GT---AG-A---AAT-TT-GATACCATGTTA--T-TATAATGA---ATCAT-------GATACCAACA-TAA--GTTTGATGT-A--------------------TATGTACA-GTTGAAT--TCC--TAAACCAAAAATAAATCGGATGTAgc
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Reference ( family-156 )      :                                                                                CTGGTGT-AAAGCCG------ATGT--------AC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACAT------CCC--A--ACAT---GGCGACA-GAGGAAAACGGTTC--G--AA-TG--T--T-TA-CATCCTTT---AA-TATCA-------G--TTA----AAC--A---------AC-CA--TTT-A-----ATGTTT--CA----ATTTT-----TCTT--TCAA-C----TTAAAGA-----TA----ATG----TAT--GTC-TT-AA-TGC---T-CGC--T-GCGACA--CAA-A--T------TAAT---ANA-AGAACGT-GAA----AT-AA-------GC---AGTA---TAT-TT-GATA-----TAA--T-AAAAATGAAG-ATGATGT---G-GGTACCAGCA-TAA--GTTTGATGT-ACGTACCGG----------TGTACGTACA-GT--AAT-ATCC--T-AGCCA-----AAATCGGATGTACGTNCCAGTNAAAAGACATCACGGTACNTACCATGTANTAAC
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gi|6                          :                                                                                                                        tcaA-CC--AT-CA-GGTA-----C---------TCT-ACAT------CCCCAA--ACAT---GGCTACAAGAAGAACACAGTTC--G--AA-TG--T--TCTA-CACCATTTTG-AT-TATCAAATTACTG--ATA----AAT--A---------AC-CA----T-A-------GTTT--CG----ATTCT-----CCTT--TCAT-C----TTAAACAG----TA----A-GCAGCTAA--ATA-AT-AA-TGC---TGCGCATT-GCGACAT-CAA-A--T------TGAT---ACG-AAACCG----A----AT-AATCTTAATAC---AGTAAAGGAT-T---ATA-----TAA--T-AAAAATGAAGCATAATCTATAG-AGTACCAGtg
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTT-----CTTT--TCAA-C----TTAAATA-----TC----ATG----TATCAGTC-TT-AA-TGC---T-CGA--T-GCAACA--CCA-A--T------TAAT---AAA-AGAACGT-AGA----AT-AA-------GC---AGTA---TAT-TT-GATA-----TAA--T-AAAAA--AAG-ATGATGT---G-GGTACCAGcgatgcaacaccaattaataaaagaacgtagaataagcagtatatttgatataataaaaaaagatgatgtgggtaccagttcacacgctttaca
gi|9                          : ggtgtaaagccggtgtccatgtacgtaccatcgggtatctacaatatgcacatcccaacatggcaacgaaggaaaatggCTGGTGT-AAAGCTA------ATGC--------AT------GTA-CC--A--------A-----C-----------T-A-------------------AT---GGCGACA-GGTGATACTGGTCCATG--AG-TT--T--T-T--TATCCTT----AT-TGTCA-------GGTTTA----AACCCA---------TC-CA--CTA-G-----CTGTTT--GA----ATTTT-----ACTC--TTAA-C----TTATTCA-----TT----TTG----TAT--ATC-TT-AA-TAC---T-TGT--C-ACTATG--CAG-A--T------TGATA--ATA-TGAGTAT-G-G----AT-AA-------GC---GACA---TTTCTC-GACA------AA--T-CAAAAttcacacgctttaca


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blockSeqs                     :                                                                                       .       .         G         T        .  .   .  .    .     TC          .  ATCCCCAA            .         .              A  AAC    .  .  C A        TTG   .     TGGTAA       .     CCCAT          .  T    . A          TTCG         T        .     . .          TGATAC        .      .    .  .  .   T   .   G  .   A  TC   . .  C         AAAGA         AGAA      A  .        .      .     . T     GC      TC          A .       AC             TTG            . GG A  ATGAAA                             T        .                                                      
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Reference ( family-156 )      :                                                                                CTGGTGT-AAAGCCG------ATGT--------AC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACAT------CCC--A--ACAT---GGCGACA-GAGGAAAACGGTTC--G--AA-TG--T--T-TA-CATCCTTT---AA-TATCA-------G--TTA----AAC--A---------AC-CA--TTT-A-----ATGTTT--CA----ATTTT-----TCTT--TCAA-C----TTAAAGA-----TA----ATG----TAT--GTC-TT-AA-TGC---T-CGC--T-GCGACA--CAA-A--T------TAAT---ANA-AGAACGT-GAA----AT-AA-------GC---AGTA---TAT-TT-GATA-----TAA--T-AAAAATGAAG-ATGATGT---G-GGTACCAGCATNA---GTTTGATGT-ACGTACCGG----------TGTACGTACA-GT--AAT-ATCC--T-AGCCA-----AAATCGGATGTACGTNCCAGTNAAAAGACATCACGGTACNTACCATGTANTAAC
gi|1                          :                                                                                    TGT-AAAGCCG------ATGT--------AC------GTA-TC--AT-CG-AATA-----C---------C-T-ACAG------TCC--A--ACAT---GGCGAGC-GAGGAAAACGGTTC--G--TA-TG--T--T-TA-CATCCTTT---AA-TATCA-------G--TTA----AAT--A---------AC-CA--TTT-A-----AT--------------TTT-----TTTT--TCAA-C----TTAAAGA-----TA----ATA----CAT--GTC-TT-AA-TGC---T-CGC--T-GCGACT--CAA-A--T------TAAT---ATG-AGAACGT-ACA----AT-AA-------AC---AGTA---TAT-TT-GATG-----CAA--C-AAAAATGAAG-ATGATGT---A-GGTACCGGCAT-A---GTTTGATGT-ACGTACCGGCATAGTTTGATGTACGTACATGTACAATGATCCGAT-AGCCA-----AAATCGGATGTACGTACCAGTCAAAAGAT------GTACATACCATG-AGTAAC
gi|10                         :                                                                                                                            -CC--AC-TG-GGTA-----C---------C-A-ACAT------CCC--A--ACAT---GGCAACA-GAGGAAAACGGTTC--G--AA-TG--T--T-TA-CACCCTGT---AA-TATCA-------A--TTA----AAT--A---------AC-CA--TTT-A-----ATGTTT--CA----ACTTT-----TCTT--TCAA-C----TTAAAGA-----TGATACATG----TAT--GTC-TT-AA-TGC---T-CGC--T-GCAACA--GAA-A--T------TAAT---AAAGAGACCGTAGAATATTAT-AA-------AC---GGTA---CAT-TT-GATA-----TAA--T-AA
gi|11                         :                                                                                 TGGTGT-AAAGCTG------ATGC--------AC------GAA-CC--AT------TT-----T---------G-T-AC-T-----------------T---GTCGACA-GGAAACACCGATTC--G-----TGAAT--T-TA-TATCCCAC---AA-CATCA-------ACTTCA----AAC-------------C-CA--TCT-A-----CTGATT--GA----ATTTT-----ACTC--TTAA-C----TTA
gi|12                         :                                                                         ttgtcatCTGGTGT-AAAGCCG------ATGTACACATGTAC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACAG------CCC--A--ACAT---GACAACA-GAGGAAAACGGCTC--G--AA-TG--A--T-TA-CATCCTTT---AC-TATCA-------G--TTA----AAC--tttattttgta
gi|13                         :                                                                                                       ct--------AC------GTA-AA--AT-AT-GGTA-----C---------C-T-ACAT------TCT--A--CCAC---GGCGACA-GGCGCAACCGATTC--G--TG-AG--T--T-TT-TATCCTTC---AA-TATCA-------A--TTT----TA---A---------TC-TG--TTTGA-----ATATTT---A----ATTTtggaatagattaat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tgttac--T-GCG-CATCCAG-A--T------TGAT---ATA-TGAGTAT-AAA----AC-AA-------GC---AGAA---TTT-CTCGAGA-------A--TCAAAAACGATG-AGGATGC---A-ACTACCAGCATTG---G-TTGATGTCAC-TACCGG----------gtacgt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGTTT--CA----ATTTT-----TCTT--TCAC-C----TTAAAGA-----TA----GGA----TAT--GTC-TT-AA-TGC---T-CGC--T-----------------------------------GAATGT-GA------------------------TA---TA--------A-----TAA------AAATGAAG-ATGATGT---G-GGTcat
gi|16                         :                                                                                CTGGTGT-AAAGCTG------ATGC--------AC------GTA-T---GT-CG-AGTA-----C---------G-T-ACAT------CCA--A--ACAT---GG-GACA-GGTGATAATGGCTC--G--
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   caT-AA-------AC---AGTA---TAT-GT-GATA-----TAA--T-AGAAATGAAG-ATGATGT---G-GGTACCAGtcag
gi|18                         :                                                                               tCTGGTGT-AAAGCCA------ATGT--------ACGTACATGTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-A-------------------------GCAACA-GAGGAAAACGGCTC--tctacacgcgtcacattc
gi|19                         :                                                                                CTGGTGT-AAACGCG------ATGT--------AC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACA
gi|2                          :                                                                                           tCCG------A-GT--------ATT-----GTA-CC--AT-CGAGGTAATCTGC---------A-T-ACATGTAACATCC--GGGACATTTCGGCAACA-GAGGAAAACGGTTAA-G--AACTG--T--TATA-CTCCCTTTTCAAACTACCATGGTA--A--TTACTATAAC--ATGTAAAGTAAC-CAATTTT-A-----ATGTTTTTCG----TTTTT-----CTTT--TCAA-CTTATTTAAAGAT----TA----ATG----GGT--ACC-TT-AATTGC---T-TGC--T-GCAAGA--GAA-A--TC-----TAAT---TG---GATCGA-GAA----AC----------GT---AG-A---AAT-TT-GATACCATGTTA--T-TATAATGA---ATCAT-------GATACCAACATAA---GTTTGATGT-A--------------------TATGTACA-GTTGAAT--TCC--TAAACCAAAAATAAATCGGATGTAgc
gi|3                          :                                                                                CTGGTGT-AAAGGCG------ATGT--------AC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-ACAG------CCC--A--ATAT---GGCAACA-GAGGAAAACGGCTC--G--AA-TG--T--T-TA-CATCCTTC---TA-TATCT-------G--TTA----AAT--A---------AC-CA--ATT-A-----ATGTTT--CA----GTTTT-----TCTT--TCAA-C----TTGAAGA-----TA----ATG----TAT--GTC-TT-AA-TGC---T-TGC--T-GCGACA--GAA-A--T------TAAT---AAA-AGAACGT-GAA----AT-AA-------AC---ACTA---TAT-TC-GATA-----TGA--T-AAAAATGACG-ATGATGT---A-GGTACCGGCA-GA---GTTTGATGT-ACGTACC-A----------TG-------------AA--ATCC--T-AGCCA-----AAATCGGATGTACGTTCCAGTAAAAAGACATCACGGTACCTACCATGTACTAACaaac
gi|4                          :                                                                                 TGGTGTTAAAGCAG------ACATG-------AC------GTA-CC--ATTCG---TA-----C---------G-TTACAG------CCC--A--ACAT---GGCGA-A-GAGGAAAACGGCTC--G--AA-TG--T--T-TACCATCCTTT---AA-TAGCA----------TTA----AAC--A---------AC-CA--TTT--------TGTTA--TATATTATTTTTTTTCTTTT--TCAACC----TTAAAGA-----TA----ATG----TAT--GAC--A-AA-TGCT--T-CGCG-T-GCAACA--CCATA--T------AAAT---AAA---AACGA-AGA----ATAAA-------AC---AATA---TAT-TT-GATA-----TAA--A-TAAATTGAAG-ATGA-GT---ACAGTACCAG
gi|5                          :                                                                                CTGTTGT-AAAACTG------ATGC--------AC------ATA-CC--AT-CG-GGTA-----C---------G-T-AC--------------------------GACA-GGCGATACCGGTTT--GTGAT-TT--T--T-TT-TATCCTTT---AA-TATAA-------GTTTTA----AAC-------------C-CA--TTT-A-----CTGTTT--GA----ATTTT-----GTTT--TCAA-C----TTATACATTGTGTAC---ATG----TAT--GTC-TT-GA-TGCTCAT-CAC--T-GCG-----CAG-A--TCTAGAATGAT---ATA-TGAGTAT-GAA----GT-AA-------GT---AGTA---T-T-TC-TCTA-----CAAATC-AAAAACGACG-ATGATGT---A-GGTACC-GCATTAATTGTTTGATGT-AGGTTCCtccacacgcgtttaaattcagtc
gi|6                          :                                                                                                                        tcaA-CC--AT-CA-GGTA-----C---------TCT-ACAT------CCCCAA--ACAT---GGCTACAAGAAGAACACAGTTC--G--AA-TG--T--TCTA-CACCATTTTG-AT-TATCAAATTACTG--ATA----AAT--A---------AC-CA----T-A-------GTTT--CG----ATTCT-----CCTT--TCAT-C----TTAAACAG----TA----A-GCAGCTAA--ATA-AT-AA-TGC---TGCGCATT-GCGACAT-CAA-A--T------TGAT---ACG-AAACCG----A----AT-AATCTTAATAC---AGTAAAGGAT-T---ATA-----TAA--T-AAAAATGAAGCATAATCTATAG-AGTACCAGtg
gi|7                          :                                                                                 TGGCGT-AAAGCCG------GTGT--------AG------GTAACCTAAT-GT-GTTA-----C---------A-T-ATAT------TC------GCAT---GACAACA-GAGGAAAGCGGTTC--G--AG-TG--TTGT-TA--ATCCGT---------TTA-------G--TCA----AAG--A---------GTGCT--TTT-AAAAAGATGTGT--CA----TTTTT-----TCTTTATCAC-T----TTAAAGA-----C-----ATG----TAT--GTTATTAAA-TGC---T-CGC--TGGCGAAA--GAA-AATT------TAATCGGAGG-AGAACGTAGAA----AT--C-------GCCCTAGT----TAT-TT-AATAG----CAA--T-AAA
gi|8                          :                                                                                  GGTGT-AAAGCCGGTGTCCATGT--------AC------GTA-CC--AT-CG-GGTA-----TCTACAATATG-C-ACAT------CCC--A--ACAT---GGCAACG-AAGGAAAATGGTTT--------TC--T--T-TT-CA-ACTTA---AA-TATCAT------G--T------ATC--A---------GT-C----TT-A-----ATGCT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTT-----CTTT--TCAA-C----TTAAATA-----TC----ATG----TATCAGTC-TT-AA-TGC---T-CGA--T-GCAACA--CCA-A--T------TAAT---AAA-AGAACGT-AGA----AT-AA-------GC---AGTA---TAT-TT-GATA-----TAA--T-AAAAA--AAG-ATGATGT---G-GGTACCAGcgatgcaacaccaattaataaaagaacgtagaataagcagtatatttgatataataaaaaaagatgatgtgggtaccagttcacacgctttaca
gi|9                          : ggtgtaaagccggtgtccatgtacgtaccatcgggtatctacaatatgcacatcccaacatggcaacgaaggaaaatggCTGGTGT-AAAGCTA------ATGC--------AT------GTA-CC--A--------A-----C-----------T-A-------------------AT---GGCGACA-GGTGATACTGGTCCATG--AG-TT--T--T-T--TATCCTT----AT-TGTCA-------GGTTTA----AACCCA---------TC-CA--CTA-G-----CTGTTT--GA----ATTTT-----ACTC--TTAA-C----TTATTCA-----TT----TTG----TAT--ATC-TT-AA-TAC---T-TGT--C-ACTATG--CAG-A--T------TGATA--ATA-TGAGTAT-G-G----AT-AA-------GC---GACA---TTTCTC-GACA------AA--T-CAAAAttcacacgctttaca