lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 111111111 11111
lowQualScore : 1 22 1 1 1 444 33 555 1 111 1 444444 2 1 1 22 11 444444 4 55555 1 111 1 555 2 22 555 2 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 4 444444 33 1 2222 1 2 1 44444444 44444 6666666666666666 1 2 444444 11 1 00000000 2222 33 2 2 1 11 1 44 111111111 00000 222 222 1 3 1 3
lowQualScore : . .. . . . ... .. ... . ... . ...... . . . .. .. ...... . ..... . ... . ... . .. ... . . ....................................................................................................... . . ...... .. . .... . . . ........ ..... ................ . . ...... .. . ........ .... .. . . . .. . .. ......... ..... ... ... . . . .
lowQualScore : 1 77 1 1 1 333 99 000 1 999 1 333333 2 1 1 66 55 888888 4 44444 1 999 1 333 2 66 777 2 2 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 1 000000 33 4 9999 4 8 3 88888888 77777 8888888888888888 4 8 888888 99 4 22222222 7777 11 6 6 3 88 3 44 999999999 22222 555 555 5 0 5 6
consensus : CTTATGTTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-G-TGA-G--AA--AAC---G--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAG-A-----CTT--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-GA-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAGGTGAA--------GGGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
Reference ( gi|16 ) : CTTATGTTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-G-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAG-A-----TTT--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-GA-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAGGTGAA--------AGGCA----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAG
gi|18 : CTTATGTTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TT--AAT---G-C---AAT-A------AGT-G-TGA-G---A--AAC---A--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAG-A-----ATT---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------N-NNN-N------T--T-AC----C-T-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-GA-AAA-----AA--C-AA--------TA----CTCAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAGATGAA--------GGGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGA
gi|11 : ttCTTATGTTGAA-TT--AGAA-C-T-A---TT--AAT---G-C---AAT-A------AGT-G-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAG-A-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT------------C------------G-CAA-T------T--T-AC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GC---C-G--AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CTCAA--T-A-T-C--AGC-TCAGAA--TAGGTGAA--------GGGTG----GCAT---GT---T-TAA-AGA-TAAATCa
gi|21 : tCTTATGTTGAA-TT--AGA----------TC--AAT---G-T---AAT-A------AGT-A-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAA-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAG-A-----ATT--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------G-CAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-GA-AAA-----AA--A-AGA--------G----CTCAA--T-A-T-TAAAGC-TGAGAA--GAGGTGAA--------GTGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAAT
gi|17 : CTTATTTTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TG--AATTA-G-C---AAT-A------AGTTG-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAT-G---A-TTAAA---NN-N--N---NN-NNNN-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------C------------G-CAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-CA-AAA-----AA--A-AAA-------TG----CTCAA--T-ATT-C--AAC-TGAGAA--TAGGTGAA--------GGGCG----GTGT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAcaa
gi|27 : CTTATGTTGAA-TT--AAAAAC-A-A---TA--AAT---G-T---AATTA------AGT-G-TGA-G--AA--AGC---G--A-G-A-----GAG-G---A-TTAAA---TA-T--G---CAACAAG-----------------------TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-GA-AAA-----GA--A-ATA-------TG----CTCAA--C-G-T-C--AGC-TGAGAA--TATGTG-A--------AGGCG----GTAT---GT---T-CAA-TGA-CTAAT
gi|22 : tCTTATTTTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TG--AATAT-G-C---AAT-A------AGTTG-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAT-G---A-TTAAA---NN-N--N---NN-NNNN-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------C------------G-CAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-CA-AAA-----AA--A-AAA-----T--G----CTCAA--T-A-T----AAC-TGAGAA--TAGGTGAA--------GGGCG----GTGT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTcaa
gi|23 : CTAATGTTGAG-TT--AGAA-----A---TG--AAT---G-C---A-T-A-------GT-G-T-A-G--AA--A-C---A--A-----------G-G---A-TTAAAA--CA-T--G---CA-CAAG-AATCANNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-CCA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---T-GA-AAA-----------AAA-----T-TG----CTCAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAAGCGAA--------GGGCG----GCAT---GT---C-CAA-TGA-TAAATCGA
gi|14 : ttCTTATGTTGAA-TT--AGAA---------TA--AG----G-C---AAT-A------GGT-G-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-------AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAG-A-----ATT--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNCAG-CAA-T------T--T-GC----A-A-TT-T--------T-----TAT------------------AG-AAA-----AA--A-AAA-----T-GG----CTTAA--T-A---C--AGC-TGAGAA--TAAGTGAA--------GGGCG----GCAA---TT---T-CAA-TGT-TAAATCGAa
gi|13 : tCTTATGTTGA--TT--AGAA---A-A---TA--AAA---G-C---AAT-A------A-T-G-TGA-G--AA--AAC---G--AAG-A-----AAA-G---A-TTAAA---TA-T--G---TG-CAAG-A-----CTT--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNGT-G-TAA-T------T--G-CC----C-A-GT-T--------T-----TAT-------G---CA---C-GA-AAA-----AA--A-GAG-----C-------CTCAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAAGTGAA--------GGAC-----GCAA---GT---TCCAA-TGA-TAAt
gi|30 : tCTTATGTTGAA-TT--AAAA-C-A-AA--TA--AAT---G-T---AAT-A------AGT-G-TGA-G--AA--AGC---G--AAG-AT----GAG-G---A-T-AAA---TA-T--GG--CA-CAA-------------------------TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------G-TAA-T------T--TTGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C----AGA-----AA--A-GAA-----TATG----CTCAA--C-G---C--AGC-TGAGAA--TA-GTAGA--------AGGC-----GTAT---GT---T-CAA-TGA-tcg
gi|26 : tCTTATGTTAAA-TT--AGAA-C-A---------------------------------GT-G-TAA-G--AA--AAC---A--AAGCATGCTCAAG-A---A-TTNNN---NN-N--N---NN-NNNN-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------C------------G-CAA-T------T--T-AC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-GA-AAA-----AA--A-AAA-----T--A----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAAGTGAA--------GGGAG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGActa
gi|5 : ttcCTTATGCTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-A-TGA-G--AA--AAC---G--AAGAA-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CT-CAAA-A-----CTT--------at
gi|8 : tCTTATGTTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------ATT-G-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAG-A-----CTT--------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaattgttattctcgataaaaaaaaattgctcaacatcagctaagaataggtgaaggggcggcatgttcaatgataaatcgag
gi|6 : tCTTATGT-GAA-TT--AGAA-C-A-AG--TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-T-TTA-TT-AA--AAC---G--AAG-A-----TAG-GTATA-TCAAAAGACT-T--N---NN-NNNN-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------T------------GATAA-TCGTTAAT--T-GC----C-A-TTCT--------T-----TAT-------C---CA---CAGA-AAA-----AA--A-AAAACACCC-TG----CTCAA--C-A-TGC--AGC-TTAGAA--TAGGTTGG--------AGGCA----GCCT---TT---C-CAA-TGATTAAATCGGGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatatcataatttgccatttttatccacgaaaaaaaaaaaaaaattgctcgacatcagctgagaataggagaagggcgtgttcaatgataaatcaag
gi|25 : CTTATGTTGAA-AT--AACA-C-A-A---TA--AAC---G-G---AG--A------GAT-T-TGA-T--TA--AAT---A--TAC-A-----CAA-G---ACTTNNN---NN-N--N---NN-NNNN-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------C------------G-TAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-AT-AAA-----AA--A-A----------G----CTCAA--T-A-A-C--AGC-TGAGAA--TAGATGAA--------GGGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TTAATC
gi|38 : CTTATGCTGAA-TT--AGAT-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-A-TGA-G--AA--AAT---G--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CT-CAAG-A-----CTg
gi|29 : tCTTATGTTTAA-TT--A----C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-G-GGA-G--AA--AAT---G--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---TA-T--G---CA-CAAG-A-----CTT--------
gi|12 : tCTTATGCTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TA--AAT---G-T---CAT-A------A-T-A-TGA-G---A--AAC---G--AAGAA-----AAG-G---A-TAAAA---CA-T--G---CCTCAAG-A-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgccatgctcaacatcagttgaaaataggtgaagggcggcatattcaataattaacc
gi|19 : tCTTA-GCTGAA-TT--AGAA-C-A-A---TA--AAT---G-C----AT-A------A-T-A-TGA-G---A--AAC---G--AAGAA-----AAG-G---A-TAAAA---CA-T--G---CT-CAactcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcgggctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagcgtaagaattagatgaa
gi|10 : ttTTATGTTGAA-TT--AAAA-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-ACATGTAAGT-G-TGA-G--AA--AAC---G--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---TC-T--G---CA-CATG-A-----CTT--------gccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagctaagatcagatgataaatcgagtgg
gi|3 : TTATGTTGAA-TT--AGAG-C-A-A---TA--AAT---G-C---TAT-A------AGT-G-TAA-G---A--AAC---A--AA--C-----AAG-G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaaatttgcaattttcatccacgaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaataggtgaagggcggcatgt
gi|39 : TTATGTTGAA-TT--AGAA-C-A-A---T-----T---G-C---AAT-C------AGT-G-TAA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAG-T---A-TCAAA---TA-T--G---CA-CAAG-A-----taattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatatatcttatcgacgaaaacgattgttcaatatcagctgagaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcg
gi|33 : TTATGTTGAA-TT--AGAA-C-------------------C---AAT-A------AGT-G-TGA-A--AA--AAC---A--AAG-----------G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAA-A-----ATT--------at
gi|35 : ttTTATGTTGAA-TTTTAAAA-C-A-A---TAT-AAA---G-T---AAT-A------AGT-GGTGA-G--AA--AAC---G--AAG-A-----AA--G---A-TTAAA---AA-T--G---------N-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TAAGT------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcaatttgccattttaattg
gi|20 : TTATGTTGAA-TT--A-AA-C-A-AATATA--AAT---G-T---ATT-A------AGT---TGA-G--AA--AACGCGA--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAa
gi|36 : TTATGTTGAA-TT--AGAA-C-A-T---TA--CAT---G-C----GT-A------AGT-G-TGA-GCAAA--AGC---A--AGG-A-----AGG-G---A---AAT---CA-TTAGT--CA-TGAG-A-----CTT--------caaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgccattttacccccccgaccccccccccccccaaatgcctcacgttagcagagatttatgtgaagagggccaatgttcatgattaatcgagc
gi|7 : tatttccttTTATGTTGAA-TTT-AAAA-C-A-A---TATAAACTCCG-CTCAAGT-A------AAG-G-TGA-G--AA--A-C---G--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---AA-T--G---GN-NNNN-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGTCA-------------------------G-TAATT------T--T-GC----C-A-TT-TACCCCCCCC-----CAC-------C---CC---C-CC-CAA---------------------TG----CTCAAGTC-G-T-T--AGC--GAGAA--TATGTGAATAAAAAAGGGGCG----GCAG---GTCTCT-CAGTTGA-GAAATCGAGcaaagagtggattaattctgaaatgctccagagtttcattcgagctgtattttacatttt
gi|24 : TTAT-TTGAA-TT--TAAA-C-A-A---TAT-AAT---GAT---AAT-A-------GT-G-TGA-A--GA--AAC---ACGAAG-A-----AAG-G---A-GTGAA---AA-T--G---TA-t
gi|15 : TATGTTGAA-TT--TGAA-C-A-A---TA--AAT---G----------------------TGA-G--AA--AAC---T--AAG-A-----AAG-G---A-TTAAA---AA-T--G---CA-CAAT-A-----CTT--------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC------------G-TAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----CCC-------C---CA---C-AA-AAA-----AAACA-AAA-----CATG----CTCAA--C-A-T-C--AGG-T---------GGTGAA--------GGGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAGaacatcaccttaatgtccagattctacgttcaatcattctttaattcaaccagtttgtacagacgatcactcgcaatcgccatcccccccccccccatatgtcatagttagcagagattatgtaaagagcgatcagttcaatgattaatcgg
gi|28 : ttaTATGTTGAA-TG--AAAA-CTATA---TA--AAT---G-T---AAT-G------AGT-G-TGA-G--AA--AAC---G--AAA-A-----AAT-G---A-TTAAA---AA-T--G---NN-NNNN-N-----NNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------------G-TAA-T------T--T-GC----C-A--T-T--------T-----TATCACCCCCC---CC---C-CA-AA----------------------TA----CTCAA--C-G-T-T--AGC-TGAGTA--TACCTAAA--------GGACG----GCAT---GT---T-CAG-TGA-TAAATCGA
gi|4 : TATGTTGAA-TT--AGA--C-A-A---TA--A-T---G-C---A-T-AT-----AGT-G-TGATA--AA--AAC---A--AGG-A-----AAG-G---A-T-AAA---CAAT--GGC-TA-CAAA-A-----TTC--------AGAGAATTAAATCATACAGTCCCGAATCACAGTTTAATCTTGACCTTTCTACCATTTTCAGAAAACTAATCAT-C------------G-CAA-T------TC-T-GCGACAC-A-TT-T--------TATGTATAT-------CAG-CAGAAC-GA-AAC-----AA--A-AAA-----T-TG----CTCAA--T-ATT-C--AGC-TAAGAACTTA-GTG-A--------GGGCG----GC-T---GT---T-CAATTGA-TAAATCGA
gi|9 : tctaGTTGAA-AT--AAAA-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-G-TGA-G--AA--AAC---G--AGG-A-----AAG-G---A-TTACA---TA-T--ACGTCA-CAAG-A-----CTT--------at
gi|2 : GTTGAA-TT--AGGA-C-A-A---TA--AAT---G-C---AAT-A------AGT-G-TGA-T--AAGGAAC------AGG-A-----AAGCG---A-TTAAAC--CA-TA-G---CA-TAAGAA-----TTT--------caagattaatacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgccatttttatccaccaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaagaggtgaagggtggcatgttcaatgattaatc
gi|40 : atgTTTAA-TT--AGAA-C-A-T---TA--AAT---G-A---AAC-A------AGT-G-TGA-G--AA--AAT---G--AAG-A-----AAC-A---A-TAAAA---CA-T--G---TA-CAAG-A-----CTtcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcggcaattagtgcccattttgtattggggacaaagaacaaattggcgtttcaagtatcagctaaaaaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcgaa
gi|37 : aTTGGACTT--AGAG-C-A-A---TA--AAT---G-C---TAT-A------AGT-G-TGT-A--AA--AACCAGA--AAG-AGC---AAG-G---A-TTAAAC--CACT--G---CA-CAAG-A-----TT
gi|31 : tAT---G-C---AAT-A------AGT-G-TGA-G--AA--AAC---A--AAG-A-----AAG-T-----TTAAA---CA-C--G---CA-CGAG-A-----ATT--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNT---G-CAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-GA-AAA-----AA--------------TA----CTCAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAGG-GAA--------GGACG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAacaaggagcaataacaatcccaaaggtccgatttca
gi|32 : -G---A-TTAAA---CA-T--G---CA-CAAA-AA----TTT--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--C------------G-CAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-GA-AAA-----TA--A-AA--------------------------------T-TGAGAA--TAGGTGAA--------G---A----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATa
gi|9 : ------------C------------G-TAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-CA-AAA---------A-AAA-----T-TG----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--GAGGTGAA--------GGGTG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TTAATcaaat
gi|5 : gttgaaataaaacaataaatgcaataagtgtgagaaaacgaggaaaggattacatatacgtcacaagacttcaagattaatacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------------C------------G-TAA-T------T--T-GA----A-A-TT-G--------T-----TAT-------T---CT---C-GATAAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TAAGAA--TAGGTGAAG-------GGGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAGc
gi|8 : tcttatgctgaattagaacaataaatgcaataagtatgagaaaacgaagaaaaggattaaacatgctcaaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------------C------------A-TAA-T------T--T-GC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-GA-AAAAAAAAAA--A-AAA-----T-TG----CTCGA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAGGAGAA--------GG-------GCGT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAG
gi|1 : tcttatgttgaattagaacaataaatgcaataattgtgagaaaacaaagaaaggattaaacatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatat------------C------------G-TAATT------T--T-GA----A-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-G--ATA-----AA--A-AAG-----T-TG----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TATGAA--TAGGTGAAG-------GGGCATGCCGCATGCCGT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
gi|12 : cttatgctgaaaccttagaacaatagccattagcaactactagttagtgcagaacaaaccgaagaaggcgacgactatacacgatgctcacaagactgccttcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------------C------------G-TAA-T------T--T-GA----A-AATT-T--------T-----TAT-------CGGGCT---C-GT-ATA-----AA--A-AAA-----T--G----CTCAA--CAA-T-C--AGCGTAAGAAT-TAGATGAA--------
gi|19 : tcttatgctgaattagaacaataaatgtcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgcctcaagaactcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------------C------------G-TAA-T------T--T-GA----A-AATT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-GT-ATA-----AA--A-AAA-------TG----CTCAA--CAA-T-C--AGC-TAAGAT--CAGATGA
gi|41 : ttcttagctgaattagaacaataaatgcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgctcagccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn------------C------------G-TAA-T------T--T-GA----A-A-TT-T--------T------AT-------C---CT---C-GA-TAA-----AA----AAA-----T-TG----CTCAA--C-A-taaatcgagtgg
gi|2 : ------------G-CAA-T------TAGT-GC----CCA-TT-T--------TG----TAT-------T---GG---G-GACAAA-----GA--ACAAA-----T-TGGCGTTTCAAG-T-A-T-C--AGC-TAAAAAA-TAGGTGAA--------GGGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGA
gi|10 : atggttgaattaggacaataaatgcaataagtgtgataaggaacaggaaagcgattaaaccatagcataagaattttcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcgAA-T------T--T-GC----A-A-TT-T--------T-----CAT-------C---CA---C-GA-AAA---------A-AAA-----T-TG----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAGGTGAA--------GGGCG----GCAT---GT---a
gi|3 : ttatgttgaattaaaacaataaatgcaatacatgtaagtgtgagaaaacgaagaaaggattaaatctgcacatgacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaT-C--------T-----TAT-------C---GA---C-GA-AAA-----CG--A---------T-TG----TTCAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--TAGGTGAA--------GGGCG----GCAT---GT---T-CAA-TGA-TAAATC
gi|43 : ttatgttgaattagagcaataaatgctataagtgtaagaaacaaacaaggattaaacatgcacaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatata-----T-TG----CTCAA--C-A-T-C--AGC-TACGAA--TAGGTGAA--------GGG
gi|29 : -TG----CTCAA--C-A-T-C--AGT-TGAAAA--TAGGTGAA--------GGGCG----GCAT---AT---T-CAA-TAA-TTAAg
gi|42 : tcttatgtttaattacaataaatgcaataagtgggagaaaatgaagaaaggattaaatatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgcca--AGC-TGAGAA--TAGGTGAA--------GGGCG----GCAT---GT---T-CAC-TGA-CAAATcc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): TTGATTAAATGTAAATTCAAAGTCAAAGTTTACAATTCATGTCTTACTTTCAACATTATTAGAACTGTATATTGTATATTTGCCATGTTTATCACCGCCCCCCCAATACTTCAACCGTTAGCTGAGTAACTACAGGACGGCATGTTCAGCTG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 333 22 1 1 333 2 33 11 666 1 111 1 1 1 444444 33 1 1 2 22 22 1 11 6666666 4 55555 3333 111 555 2 33 77777 2 333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1 5 333333 33 2222 1 2 1 44444444 44444 4444444 66666666 1 4444444 2 666666 11 1 0000000 2222 1 22 3 2 1 11 1 33 1 55555555 33333 1 11 222 222 1 2 1
lowQualScore : ... .. . . ... . .. .. ... . ... . . . ...... .. . . . .. .. . .. ....... . ..... .... ... ... . .. ..... . ...... ....................................................................................... . . . ...... .. .... . . . ........ ..... ....... ........ . ....... . ...... .. . ....... .... . .. . . . .. . .. . ........ ..... . .. ... ... . . .
lowQualScore : 000 66 1 1 000 2 66 44 222 1 888 1 1 1 555555 66 1 1 1 55 55 1 44 2222222 2 11111 2222 888 000 1 66 00000 1 888888 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 3 2 777777 11 7777 3 6 2 55555555 44444 2222222 33333333 3 2222222 6 333333 88 2 3333333 5555 2 88 5 3 2 66 1 99 1 44444444 00000 2 77 222 222 3 7 3
consensus : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
Reference ( family-1539 ) : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
gi|1 : CTTATGCTGAAACCTT--AGAA-C-A---A-TA--GCCATTA-G-C---A-ACT-ACT----AGTTAG-TGCA-G--AAC-A-AACC---G---AAG-A-----AGGCGACG---ACTATA---CA-C--GATGCTCA-CAAGA-----CT
gi|1 : ------------C------------G-TA-ATT------T--TGA----A-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-G---------ATA-----AA--A-AAG-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TATGAA--T-AGGTGAA--------GGGGCATGCCG-C--ATGCCGT---T-CAA-TGA-TAAATCGAGgccttcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattttgaaatttttatcctcgataaaaaagttgctcaacatcagctatgaataggtgaaggggcatgccgcatgccgttcaatgataaatcgag
gi|10 : cttatgctgaaaccttagaacaatagccattagcaactactagttagtgcagaacaaaccgaagaaggcgacgactatacacgatgctcacaagactgccttcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATGTTGAA---TT--AAAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-ACATGTAAGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---TC-T--G-----CA-CATGA-----CTT
gi|10 : A-A-T------T--TGC----A-A-TT-T--------T-----CAT-------C---CA---C-G-------A-AAA---------A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaaatttgcaattttcatccacgaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaataggtgaagggcggcatgt
gi|11 : ttatgttgaattaaaacaataaatgcaatacatgtaagtgtgagaaaacgaagaaaggattaaatctgcacatgacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaCTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-T---A-TT--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT----C------------G-CA-A-T------T--TAC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GC---C-G-------A-AAA------A--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TCAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GTGG-C--AT---GT---T-TAA-AGA-TAAATCG
gi|12 : tCTTATGCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-T---C-A-T-A------A-T--A-TG-A-G---A--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATAAAA---CA-T--G-----CCTCAAGA-----
gi|12 : t------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-AATT-T--------T-----TAT-------CGGGCT---C-G-------T-ATA-----AA--A-AAA-----T--G----CT-CAA--CAA-T-C--AGCGTAAGAAT-T-AGATGAA--------actcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcgggctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagcgtaagaattagatgaa
gi|13 : tcttatgctgaattagaacaataaatgtcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgcctcaagaactcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGTTGA----TT--AGAA---A---A-TA--A--AA---G-C---A-A-T-A------A-T--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAA----G---ATTAAA---TA-T--G-----TG-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNGT-G-TA-A-T------T--GCC----C-A-GT-T--------T-----TAT-------G---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-GAG-----C-------CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----AC-G-C--AA---GT---TCCAA-TGA-T-AATCG
gi|14 : tCTTATGTTGAA---TT--AGAA---------TA--A--G----G-C---A-A-T-A------GGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-------AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNCAG-CA-A-T------T--TGC----A-A-TT-T--------T-----TAT------------------A-------G-AAA-----AA--A-AAA-----T-GG----CT-TAA--T-A---C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----GCGG-C--AA---TT---T-CAA-TGT-TAAATCGA
gi|15 : tTATGTTGAA---TT--TGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-------------------------TG-A-G--AA--A-A--C---T---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---AA-T--G-----CA-CAATA-----CTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----CCC-------C---CA---C-A-------A-AAA-----AAACA-AAA-----CATG----CT-CAA--C-A-T-C--AGG-T----------GGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAGt
gi|16 : ttaCTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----TTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------AG-----GCAG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAG
gi|17 : CTTATTTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TG--A--ATTA-G-C---A-A-T-A------AGTT-G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAT----G---ATTAAA---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-C-------A-AAA-----AA--A-AAA-------TG----CT-CAA--T-ATT-C--AAC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-T--GT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGA
gi|18 : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TT--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A----C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------N-NN-N-T------T---AC----C-T-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--C-AA--------TA----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGATGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGA
gi|19 : ttCTTA-GCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C-----A-T-A------A-T--A-TG-A-G---A--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATAAAA---CA-T--G-----CT-CAa
gi|19 : tt------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-AATT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-G-------T-ATA-----AA--A-AAA-------TG----CT-CAA--CAA-T-C--AGC-TAAGAT--C-AGATGAgccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagctaagatcagatgataaatcgagtgg
gi|2 : ttcttagctgaattagaacaataaatgcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgctcagccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTGAA---TT--AGGA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-T--AAGGA-A--C-------AGG-A-----AAGC---G---ATTAAAC--CA-TA-G-----CA-TAAGA-----ATTtaaatcgagtgg
gi|2 : atg------------G-CA-A-T------TAGTGC----CCA-TT-T--------TG----TAT-------T---GG---G-G-------ACAAA-----GA--ACAAA-----T-TGGCGTTT-CAAG-T-A-T-C--AGC-TAAAAAA-T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAttcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcggcaattagtgcccattttgtattggggacaaagaacaaattggcgtttcaagtatcagctaaaaaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcgaa
gi|20 : atggttgaattaggacaataaatgcaataagtgtgataaggaacaggaaagcgattaaaccatagcataagaattttcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcgTTATGTTGAA---TT--A-AA-C-AAATA-TA--A--AT---G-T---A-T-T-A------AGT----TG-A-G--AA--A-A--C---GCGAAAG-A-----AAG----G---ATTAAa
gi|20 : -AAA-----T-GC----CT-CA---C-G-T-T--AGC-AGAGAT--TTATGTGAA--------GA-----G-GG-CCAAT---GT---T-CA--TGA-TTAATCGAGcaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgccattttacccccccgaccccccccccccccaaatgcctcacgttagcagagatttatgtgaagagggccaatgttcatgattaatcgagc
gi|21 : ttatgttgaattaaacaaatataaatgtattaagttgagaaaacgcgaaagaaaggattaacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgccattttacccccccgaccccccccccccccCTTATGTTGAA---TT--AGA----------TC--A--AT---G-T---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAA----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AGA--------G----CT-CAA--T-A-T-TAAAGC-TGAGAA--G-AGGTGAA--------GT-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAc
gi|22 : CTTATTTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TG--A--ATAT-G-C---A-A-T-A------AGTT-G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAT----G---ATTAAA---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-C-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T--G----CT-CAA--T-A-T----AAC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-T--GT---GT---T-CAA-TGA-TAAAT
gi|23 : CTAATGTTGAG---TT--AGAA-------A-TG--A--AT---G-C---A---T-A-------GT--G-T--A-G--AA--A----C-----------------AAG----G---ATTAAAA--CA-T--G-----CA-CAAGAATCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-CC-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---T-G-------A-AAA-----------AAA-----T-TG----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGCGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---C-CAA-TGA-TAAATCGAt
gi|24 : ttTTAT-TTGAA---TT--TAAA-C-A---A-TAT-A--AT---GAT---A-A-T-A-------GT--G-TG-AAG--AA--ACA--C---G---AAG-A-----AAG----G---AGTGAA---AA-T--G-----TA-a
gi|24 : -T-T--AGC-AGAGAT--T-ATGTAAA--------GA-----GCGATC--A----GT---T-CAA-TGA-TTAATCGaacatcaccttaatgtccagattctacgttcaatcattctttaattcaaccagtttgtacagacgatcactcgcaatcgccatcccccccccccccatatgtcatagttagcagagattatgtaaagagcgatcagttcaatgattaatcgg
gi|25 : ttatttgaatttaaacaatataatgataatagtgtgaagaaacacgaagaaaggagtgaaaatgtaaacatcaccttaatgtccagattctacgttcaatcattctttaattcaaccagtttgtacagacgatcactcgcaatcgccatcccccccccccccatatgtcatagCTTATGTTGAA---AT--AACA-C-A---A-TA--A--AC---G--------------------------G-A-G--A------------------G-A-----TTT----G---ATTAAA---TA-T--A-----CA-CAAGA-----CTTg
gi|25 : ------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-A-------T-AAA-----AA--A-A----------G----CT-CAA--T-A-A-C--AGC-TGAGAA--T-AGATGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TTAATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgccatttttatccacataaaaaaagctcaataacagctgagaatagatgaagggcggcatgttcaatgattaatcgg
gi|26 : cttatgttgaaataacacaataaacggagagatttgattaaatatacacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGTTAAA---TT--AGAA-C-A-------------------------------------GT--G-TA-A-G--AA--A-A--C---A---AAGCATGCTCAAG----A---ATTNNN---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------C------------G-CA-A-T------T--TAC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-------TA----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----GAGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAg
gi|27 : ttcCTTATGTTGAA---TT--AAAAAC-A---A-TA--A--AT---G-T---A-A-TTA------AGT--G-TG-A-G--AA--A-G--C---G---A-G-A-----GAG----G---ATTAAA---TA-T--G-----CAACAAG--------------TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----GA--A-ATA-------TG----CT-CAA--C-G-T-C--AGC-TGAGAA--T-ATGTGAA---------G-----GCGG-T--AT---GT---T-CAA-TGA-CTAATCAAat
gi|28 : tTATGTTGAA---TG--AAAA-CTAT--A-TA--A--AT---G-T---A-A-T-G------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAA-A-----AAT----G---ATTAAA---AA-T--G-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A--T-T--------T-----TATCACCCCCC---CC---C-C-------A-AA----------------------TA----CT-CAA--C-G-T-T--AGC-TGAGTA--T-ACCTAAA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAG-TGA-TAAATCGA
gi|29 : CTTATGTTTAA---TT--A----C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-GG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---TA-T--G-----CA-CAAGA-----CTT
gi|29 : t-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGT-TGAAAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---AT---T-CAA-TAA-TTAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgccatgctcaacatcagttgaaaataggtgaagggcggcatattcaataattaacc
gi|3 : tcttatgtttaattacaataaatgcaataagtgggagaaaatgaagaaaggattaaatatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgccaTTATGTTGAA---TT--AGAG-C-A---A-TA--A--AT---G-C---T-A-T-A------AGT--G-TA-A-G---A--A-A--C-------AAA-C-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAA
gi|3 : T-C--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----CG--A---------T-TG----TT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGtaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatatatcttatcgacgaaaacgattgttcaatatcagctgagaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcg
gi|30 : ttatgttgaattagagcaataaatgctataagtgtaagaaacaaacaaggattaaacatgcacaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatataCTTATGTTGAA---TT--AAAA-C-A---AATA--A--AT---G-T---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-G--C---G---AAG-AT----GAG----G---A-TAAA---TA-TG-G-----CA-CAATA-----C-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------G-TA-ATT------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-----------AGA-----AA--A-GAA-----TATG----CT-CAA--C-G---C--AGC-TGAGAA--T-A-GTAGA--------AG-----GC-G-T--AT---GT---T-CAA-TGA-
gi|31 : t--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----T----TTAAA---CA-C--G-----CA-CGAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNT---G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--------------TA----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGG-GAA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGActa
gi|32 : ----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAAA-----ATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-G-------A-AAA-----TA--A-AA---------------------------------T-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GA-----GC------AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAa
gi|33 : TTATGTTGAA---TT--AGAA-C---------------------C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-A--AA--A-A--C-----------A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAAA-----ATTat
gi|34 : tt------------G-TATA-T------T--TGC----C-A-TG-T--------T-----TAT-------C---AC---C-GCCCCCCCA-A-----------------------TA----CTTCAA--CCG-T-T--AGC-TGAG----T-AACTACA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcaatttgccattttaattg
gi|35 : ttgattaaatgtaaattcaaagtcaaagtttacaattcatgtcttactttcaacattattagaactgtatattTTATGTTGAA---TTTTAAAA-C-A---A-TAT-A--AA---G-T---A-A-T-A------AGT--GGTG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AA-----G---ATTAAA---AA-T--G-----------NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-AGT------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----gctg
gi|36 : TTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---T-TA--C--AT---G-C-----G-T-A------AGT--G-TG-A-GCAAA--A-G--C---A---AGG-A-----AGG----G---A--AAT---CA-TTAGT----CA-TGAGA-----CTTa
gi|37 : tatttccttTTGGAC--TT--AGAG-C-A---A-TA--A--AT---G-C---T-A-T-A------AGT--G-TG-T-A--AA--A-A--CCAGA---AAG-AGC---AAG----G---ATTAAAC--CACT--G-----CA-CAAGA-----TTcaaagagtggattaattctgaaatgctccagagtttcattcgagctgtattttacatttt
gi|38 : tCTTATGCTGAA---TT--AGAT-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CT-CAAGA-----CTacaaggagcaataacaatcccaaaggtccgatttca
gi|39 : tTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-T-------T---G-C---A-A-T-C------AGT--G-TA-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----T---ATCAAA---TA-T--G-----CA-CAAGA-----
gi|4 : TATGTTGAA---TT--AGA--C-A---A-TA--A---T---G-C---ATA-T-A-------GT--G-TG-ATA--AA--A-A--C---A---AGG-A-----AAG----G---AT-AAA---CAAT--GGC---TA-CAAAA-----TTCAGAGAATTAAATCATACAGTCCCGAATCACAGTTTAATCTTGACCTTTCTACCATTTTCAGAAAACTAATCAT-C------------G-CA-A-T------TC-TGCGACAC-A-TT-T--------TATGTATAT-------CAG-CAGAAC-G-------A-AAC-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--T-ATT-C--AGC-TAAGAACTT-A-GTG-A--------GG-----GCGG-C---T---GT---T-CAATTGA-TAAATCGAat
gi|40 : tctaTTTAA---TT--AGAA-C-A---T-TA--A--AT---G-A---A-A-C-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAC----A---ATAAAA---CA-T--G-----TA-CAAGA-----CTat
gi|41 : a------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-A-TT-T--------T------AT-------C---CT---C-G-------A-TAA-----AA----AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-
gi|42 : --AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAC-TGA-CAAATC
gi|43 : -----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TACGAA--T-AGGTGAA--------GG-----G
gi|5 : CTTATGCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CT-CAAAA-----CTTg
gi|5 : t------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-A-TT-G--------T-----TAT-------T---CT---C-G-------ATAAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TAAGAA--T-AGGTGAAG-------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaattgttattctcgataaaaaaaaattgctcaacatcagctaagaataggtgaaggggcggcatgttcaatgataaatcgag
gi|6 : tcttatgctgaattagaacaataaatgcaataagtatgagaaaacgaagaaaaggattaaacatgctcaaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGT-GAA---TT--AGAA-C-A---AGTA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--T-TT-A-TT-AA--A-A--C---G---AAG-A-----TAG----GTATATCAAAAGACT-T--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------T------------GATA-A-TCGTTAAT--TGC----C-A-TTCT--------T-----TAT-------C---CA---CAG-------A-AAA-----AA--A-AAAACACCC-TG----CT-CAA--C-A-TGC--AGC-TTAGAA--T-AGGTTGG--------AG-----GCAG-C--CT---TT---C-CAA-TGATTAAATCGGG
gi|7 : TTATGTTGAA---TTT-AAAA-C-A---A-TATAA--ACTCCG-CTCAA-G-T-A------AAG--G-TG-A-G--AA--A----C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---AA-T--G-----GN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGTCA-------------------------G-TA-ATT------T--TGC----C-A-TT-TACCCCCCCC-----CAC-------C---CC---C-C-------C-CAA---------------------TG----CT-CAAGTC-G-T-T--AGC--GAGAA--T-ATGTGAATAAAAAAGGG-----GCGG-C--AG---GTCTCT-CAGTTGA-GAAATCGAG
gi|8 : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------ATT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTt
gi|8 : t------------C------------A-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAAAAAAAAA--A-AAA-----T-TG----CT-CGA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGAGAA--------GG-----GCG------T---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatatcataatttgccatttttatccacgaaaaaaaaaaaaaaattgctcgacatcagctgagaataggagaagggcgtgttcaatgataaatcaag
gi|9 : tcttatgttgaattagaacaataaatgcaataattgtgagaaaacaaagaaaggattaaacatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatatGTTGAA---AT--AAAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AGG-A-----AAG----G---ATTACA---TA-T--ACGT--CA-CAAGA-----CTT
gi|9 : ------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-C-------A-AAA---------A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--G-AGGTGAA--------GG-----GTGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TTAATCcaagattaatacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgccatttttatccaccaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaagaggtgaagggtggcatgttcaatgattaatc
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 333 22 1 1 333 2 33 11 666 1 111 1 1 1 444444 33 1 1 2 22 22 1 11 6666666 4 55555 3333 111 555 2 33 77777 2 333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1 5 333333 33 2222 1 2 1 44444444 44444 4444444 66666666 1 4444444 2 666666 11 1 0000000 2222 1 22 3 2 1 11 1 33 1 55555555 33333 1 11 222 222 1 2 1
lowQualScore : ... .. . . ... . .. .. ... . ... . . . ...... .. . . . .. .. . .. ....... . ..... .... ... ... . .. ..... . ...... ....................................................................................... . . . ...... .. .... . . . ........ ..... ....... ........ . ....... . ...... .. . ....... .... . .. . . . .. . .. . ........ ..... . .. ... ... . . .
lowQualScore : 000 66 1 1 000 2 66 44 222 1 888 1 1 1 555555 66 1 1 1 55 55 1 44 2222222 2 11111 2222 888 000 1 66 00000 1 888888 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 3 2 777777 11 7777 3 6 2 55555555 44444 2222222 33333333 3 2222222 6 333333 88 2 3333333 5555 2 88 5 3 2 66 1 99 1 44444444 00000 2 77 222 222 3 7 3
consensus : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
Reference ( family-1539 ) : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
gi|1 : CTTATGCTGAAACCTT--AGAA-C-A---A-TA--GCCATTA-G-C---A-ACT-ACT----AGTTAG-TGCA-G--AAC-A-AACC---G---AAG-A-----AGGCGACG---ACTATA---CA-C--GATGCTCA-CAAGA-----CT
gi|1 : ------------C------------G-TA-ATT------T--TGA----A-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-G---------ATA-----AA--A-AAG-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TATGAA--T-AGGTGAA--------GGGGCATGCCG-C--ATGCCGT---T-CAA-TGA-TAAATCGAGgccttcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattttgaaatttttatcctcgataaaaaagttgctcaacatcagctatgaataggtgaaggggcatgccgcatgccgttcaatgataaatcgag
gi|10 : cttatgctgaaaccttagaacaatagccattagcaactactagttagtgcagaacaaaccgaagaaggcgacgactatacacgatgctcacaagactgccttcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATGTTGAA---TT--AAAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-ACATGTAAGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---TC-T--G-----CA-CATGA-----CTT
gi|10 : A-A-T------T--TGC----A-A-TT-T--------T-----CAT-------C---CA---C-G-------A-AAA---------A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaaatttgcaattttcatccacgaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaataggtgaagggcggcatgt
gi|11 : ttatgttgaattaaaacaataaatgcaatacatgtaagtgtgagaaaacgaagaaaggattaaatctgcacatgacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaCTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-T---A-TT--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT----C------------G-CA-A-T------T--TAC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GC---C-G-------A-AAA------A--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TCAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GTGG-C--AT---GT---T-TAA-AGA-TAAATCG
gi|12 : tCTTATGCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-T---C-A-T-A------A-T--A-TG-A-G---A--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATAAAA---CA-T--G-----CCTCAAGA-----
gi|12 : t------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-AATT-T--------T-----TAT-------CGGGCT---C-G-------T-ATA-----AA--A-AAA-----T--G----CT-CAA--CAA-T-C--AGCGTAAGAAT-T-AGATGAA--------actcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcgggctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagcgtaagaattagatgaa
gi|13 : tcttatgctgaattagaacaataaatgtcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgcctcaagaactcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGTTGA----TT--AGAA---A---A-TA--A--AA---G-C---A-A-T-A------A-T--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAA----G---ATTAAA---TA-T--G-----TG-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNGT-G-TA-A-T------T--GCC----C-A-GT-T--------T-----TAT-------G---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-GAG-----C-------CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----AC-G-C--AA---GT---TCCAA-TGA-T-AATCG
gi|14 : tCTTATGTTGAA---TT--AGAA---------TA--A--G----G-C---A-A-T-A------GGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-------AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNCAG-CA-A-T------T--TGC----A-A-TT-T--------T-----TAT------------------A-------G-AAA-----AA--A-AAA-----T-GG----CT-TAA--T-A---C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----GCGG-C--AA---TT---T-CAA-TGT-TAAATCGA
gi|15 : tTATGTTGAA---TT--TGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-------------------------TG-A-G--AA--A-A--C---T---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---AA-T--G-----CA-CAATA-----CTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----CCC-------C---CA---C-A-------A-AAA-----AAACA-AAA-----CATG----CT-CAA--C-A-T-C--AGG-T----------GGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAGt
gi|16 : ttaCTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----TTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------AG-----GCAG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAG
gi|17 : CTTATTTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TG--A--ATTA-G-C---A-A-T-A------AGTT-G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAT----G---ATTAAA---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-C-------A-AAA-----AA--A-AAA-------TG----CT-CAA--T-ATT-C--AAC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-T--GT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGA
gi|18 : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TT--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A----C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------N-NN-N-T------T---AC----C-T-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--C-AA--------TA----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGATGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGA
gi|19 : ttCTTA-GCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C-----A-T-A------A-T--A-TG-A-G---A--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATAAAA---CA-T--G-----CT-CAa
gi|19 : tt------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-AATT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-G-------T-ATA-----AA--A-AAA-------TG----CT-CAA--CAA-T-C--AGC-TAAGAT--C-AGATGAgccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagctaagatcagatgataaatcgagtgg
gi|2 : ttcttagctgaattagaacaataaatgcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgctcagccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTGAA---TT--AGGA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-T--AAGGA-A--C-------AGG-A-----AAGC---G---ATTAAAC--CA-TA-G-----CA-TAAGA-----ATTtaaatcgagtgg
gi|2 : atg------------G-CA-A-T------TAGTGC----CCA-TT-T--------TG----TAT-------T---GG---G-G-------ACAAA-----GA--ACAAA-----T-TGGCGTTT-CAAG-T-A-T-C--AGC-TAAAAAA-T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAttcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcggcaattagtgcccattttgtattggggacaaagaacaaattggcgtttcaagtatcagctaaaaaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcgaa
gi|20 : atggttgaattaggacaataaatgcaataagtgtgataaggaacaggaaagcgattaaaccatagcataagaattttcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcgTTATGTTGAA---TT--A-AA-C-AAATA-TA--A--AT---G-T---A-T-T-A------AGT----TG-A-G--AA--A-A--C---GCGAAAG-A-----AAG----G---ATTAAa
gi|20 : -AAA-----T-GC----CT-CA---C-G-T-T--AGC-AGAGAT--TTATGTGAA--------GA-----G-GG-CCAAT---GT---T-CA--TGA-TTAATCGAGcaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgccattttacccccccgaccccccccccccccaaatgcctcacgttagcagagatttatgtgaagagggccaatgttcatgattaatcgagc
gi|21 : ttatgttgaattaaacaaatataaatgtattaagttgagaaaacgcgaaagaaaggattaacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgccattttacccccccgaccccccccccccccCTTATGTTGAA---TT--AGA----------TC--A--AT---G-T---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAA----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AGA--------G----CT-CAA--T-A-T-TAAAGC-TGAGAA--G-AGGTGAA--------GT-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAc
gi|22 : CTTATTTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TG--A--ATAT-G-C---A-A-T-A------AGTT-G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAT----G---ATTAAA---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-C-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T--G----CT-CAA--T-A-T----AAC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-T--GT---GT---T-CAA-TGA-TAAAT
gi|23 : CTAATGTTGAG---TT--AGAA-------A-TG--A--AT---G-C---A---T-A-------GT--G-T--A-G--AA--A----C-----------------AAG----G---ATTAAAA--CA-T--G-----CA-CAAGAATCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-CC-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---T-G-------A-AAA-----------AAA-----T-TG----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGCGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---C-CAA-TGA-TAAATCGAt
gi|24 : ttTTAT-TTGAA---TT--TAAA-C-A---A-TAT-A--AT---GAT---A-A-T-A-------GT--G-TG-AAG--AA--ACA--C---G---AAG-A-----AAG----G---AGTGAA---AA-T--G-----TA-a
gi|24 : -T-T--AGC-AGAGAT--T-ATGTAAA--------GA-----GCGATC--A----GT---T-CAA-TGA-TTAATCGaacatcaccttaatgtccagattctacgttcaatcattctttaattcaaccagtttgtacagacgatcactcgcaatcgccatcccccccccccccatatgtcatagttagcagagattatgtaaagagcgatcagttcaatgattaatcgg
gi|25 : ttatttgaatttaaacaatataatgataatagtgtgaagaaacacgaagaaaggagtgaaaatgtaaacatcaccttaatgtccagattctacgttcaatcattctttaattcaaccagtttgtacagacgatcactcgcaatcgccatcccccccccccccatatgtcatagCTTATGTTGAA---AT--AACA-C-A---A-TA--A--AC---G--------------------------G-A-G--A------------------G-A-----TTT----G---ATTAAA---TA-T--A-----CA-CAAGA-----CTTg
gi|25 : ------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-A-------T-AAA-----AA--A-A----------G----CT-CAA--T-A-A-C--AGC-TGAGAA--T-AGATGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TTAATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgccatttttatccacataaaaaaagctcaataacagctgagaatagatgaagggcggcatgttcaatgattaatcgg
gi|26 : cttatgttgaaataacacaataaacggagagatttgattaaatatacacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGTTAAA---TT--AGAA-C-A-------------------------------------GT--G-TA-A-G--AA--A-A--C---A---AAGCATGCTCAAG----A---ATTNNN---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------C------------G-CA-A-T------T--TAC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-------TA----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----GAGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAg
gi|27 : ttcCTTATGTTGAA---TT--AAAAAC-A---A-TA--A--AT---G-T---A-A-TTA------AGT--G-TG-A-G--AA--A-G--C---G---A-G-A-----GAG----G---ATTAAA---TA-T--G-----CAACAAG--------------TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----GA--A-ATA-------TG----CT-CAA--C-G-T-C--AGC-TGAGAA--T-ATGTGAA---------G-----GCGG-T--AT---GT---T-CAA-TGA-CTAATCAAat
gi|28 : tTATGTTGAA---TG--AAAA-CTAT--A-TA--A--AT---G-T---A-A-T-G------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAA-A-----AAT----G---ATTAAA---AA-T--G-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A--T-T--------T-----TATCACCCCCC---CC---C-C-------A-AA----------------------TA----CT-CAA--C-G-T-T--AGC-TGAGTA--T-ACCTAAA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAG-TGA-TAAATCGA
gi|29 : CTTATGTTTAA---TT--A----C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-GG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---TA-T--G-----CA-CAAGA-----CTT
gi|29 : t-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGT-TGAAAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---AT---T-CAA-TAA-TTAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgccatgctcaacatcagttgaaaataggtgaagggcggcatattcaataattaacc
gi|3 : tcttatgtttaattacaataaatgcaataagtgggagaaaatgaagaaaggattaaatatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgccaTTATGTTGAA---TT--AGAG-C-A---A-TA--A--AT---G-C---T-A-T-A------AGT--G-TA-A-G---A--A-A--C-------AAA-C-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAA
gi|3 : T-C--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----CG--A---------T-TG----TT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGtaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatatatcttatcgacgaaaacgattgttcaatatcagctgagaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcg
gi|30 : ttatgttgaattagagcaataaatgctataagtgtaagaaacaaacaaggattaaacatgcacaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatataCTTATGTTGAA---TT--AAAA-C-A---AATA--A--AT---G-T---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-G--C---G---AAG-AT----GAG----G---A-TAAA---TA-TG-G-----CA-CAATA-----C-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------G-TA-ATT------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-----------AGA-----AA--A-GAA-----TATG----CT-CAA--C-G---C--AGC-TGAGAA--T-A-GTAGA--------AG-----GC-G-T--AT---GT---T-CAA-TGA-
gi|31 : t--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----T----TTAAA---CA-C--G-----CA-CGAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNT---G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--------------TA----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGG-GAA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGActa
gi|32 : ----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAAA-----ATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-G-------A-AAA-----TA--A-AA---------------------------------T-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GA-----GC------AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAa
gi|33 : TTATGTTGAA---TT--AGAA-C---------------------C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-A--AA--A-A--C-----------A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAAA-----ATTat
gi|34 : tt------------G-TATA-T------T--TGC----C-A-TG-T--------T-----TAT-------C---AC---C-GCCCCCCCA-A-----------------------TA----CTTCAA--CCG-T-T--AGC-TGAG----T-AACTACA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcaatttgccattttaattg
gi|35 : ttgattaaatgtaaattcaaagtcaaagtttacaattcatgtcttactttcaacattattagaactgtatattTTATGTTGAA---TTTTAAAA-C-A---A-TAT-A--AA---G-T---A-A-T-A------AGT--GGTG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AA-----G---ATTAAA---AA-T--G-----------NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-AGT------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----gctg
gi|36 : TTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---T-TA--C--AT---G-C-----G-T-A------AGT--G-TG-A-GCAAA--A-G--C---A---AGG-A-----AGG----G---A--AAT---CA-TTAGT----CA-TGAGA-----CTTa
gi|37 : tatttccttTTGGAC--TT--AGAG-C-A---A-TA--A--AT---G-C---T-A-T-A------AGT--G-TG-T-A--AA--A-A--CCAGA---AAG-AGC---AAG----G---ATTAAAC--CACT--G-----CA-CAAGA-----TTcaaagagtggattaattctgaaatgctccagagtttcattcgagctgtattttacatttt
gi|38 : tCTTATGCTGAA---TT--AGAT-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CT-CAAGA-----CTacaaggagcaataacaatcccaaaggtccgatttca
gi|39 : tTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-T-------T---G-C---A-A-T-C------AGT--G-TA-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----T---ATCAAA---TA-T--G-----CA-CAAGA-----
gi|4 : TATGTTGAA---TT--AGA--C-A---A-TA--A---T---G-C---ATA-T-A-------GT--G-TG-ATA--AA--A-A--C---A---AGG-A-----AAG----G---AT-AAA---CAAT--GGC---TA-CAAAA-----TTCAGAGAATTAAATCATACAGTCCCGAATCACAGTTTAATCTTGACCTTTCTACCATTTTCAGAAAACTAATCAT-C------------G-CA-A-T------TC-TGCGACAC-A-TT-T--------TATGTATAT-------CAG-CAGAAC-G-------A-AAC-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--T-ATT-C--AGC-TAAGAACTT-A-GTG-A--------GG-----GCGG-C---T---GT---T-CAATTGA-TAAATCGAat
gi|40 : tctaTTTAA---TT--AGAA-C-A---T-TA--A--AT---G-A---A-A-C-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAC----A---ATAAAA---CA-T--G-----TA-CAAGA-----CTat
gi|41 : a------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-A-TT-T--------T------AT-------C---CT---C-G-------A-TAA-----AA----AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-
gi|42 : --AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAC-TGA-CAAATC
gi|43 : -----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TACGAA--T-AGGTGAA--------GG-----G
gi|5 : CTTATGCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CT-CAAAA-----CTTg
gi|5 : t------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-A-TT-G--------T-----TAT-------T---CT---C-G-------ATAAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TAAGAA--T-AGGTGAAG-------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaattgttattctcgataaaaaaaaattgctcaacatcagctaagaataggtgaaggggcggcatgttcaatgataaatcgag
gi|6 : tcttatgctgaattagaacaataaatgcaataagtatgagaaaacgaagaaaaggattaaacatgctcaaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGT-GAA---TT--AGAA-C-A---AGTA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--T-TT-A-TT-AA--A-A--C---G---AAG-A-----TAG----GTATATCAAAAGACT-T--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------T------------GATA-A-TCGTTAAT--TGC----C-A-TTCT--------T-----TAT-------C---CA---CAG-------A-AAA-----AA--A-AAAACACCC-TG----CT-CAA--C-A-TGC--AGC-TTAGAA--T-AGGTTGG--------AG-----GCAG-C--CT---TT---C-CAA-TGATTAAATCGGG
gi|7 : TTATGTTGAA---TTT-AAAA-C-A---A-TATAA--ACTCCG-CTCAA-G-T-A------AAG--G-TG-A-G--AA--A----C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---AA-T--G-----GN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGTCA-------------------------G-TA-ATT------T--TGC----C-A-TT-TACCCCCCCC-----CAC-------C---CC---C-C-------C-CAA---------------------TG----CT-CAAGTC-G-T-T--AGC--GAGAA--T-ATGTGAATAAAAAAGGG-----GCGG-C--AG---GTCTCT-CAGTTGA-GAAATCGAG
gi|8 : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------ATT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTt
gi|8 : t------------C------------A-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAAAAAAAAA--A-AAA-----T-TG----CT-CGA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGAGAA--------GG-----GCG------T---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatatcataatttgccatttttatccacgaaaaaaaaaaaaaaattgctcgacatcagctgagaataggagaagggcgtgttcaatgataaatcaag
gi|9 : tcttatgttgaattagaacaataaatgcaataattgtgagaaaacaaagaaaggattaaacatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatatGTTGAA---AT--AAAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AGG-A-----AAG----G---ATTACA---TA-T--ACGT--CA-CAAGA-----CTT
gi|9 : ------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-C-------A-AAA---------A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--G-AGGTGAA--------GG-----GTGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TTAATCcaagattaatacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgccatttttatccaccaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaagaggtgaagggtggcatgttcaatgattaatc
blockSeqs : C TT A T AAT A TA . TCC A TCA T . T CATGTA T G . A CA GG C . GCGA A TGCTC C TAT AGA C TA CGT T ATCANN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA A T T CGTTAA AG GACA C A C ACCCCCCC ATGTA CACCCCC AGCAGAA A CCCCCCC C AAAAAA AC C ACACCC GCGT T GT A T G AA G CT T TAAAAAAG . T CA . CTC C T T
blockSeqs : . T . . T G T . TA . . . . . . T . . T T . . . CAGA A GC . . C A A GC A C TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . G . C . . A . . G . GGGCT . . T A . . CA . . G A T . . . T . G . . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . T . AT . . . . . . . . . . . . . . G C T . . A . G T . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT . . T . . . . . . . . . CA . . . A . . TA . . . C . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . C . . . . C TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . GC . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A AGAGAATTAAATCATACAGTCCCGAATCACAGTTTAATCTTGACCTTTCTACCATTTTCAGAAAACTAATCATC . . . . . . . . . . . . CA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . CA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . CA . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . . . GA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . GA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . CT . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . GG . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . GA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGTCA . . . . . . . . . . . . GA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . GA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . N NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . CA . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . GA . . . C . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC . . . . . . . . . . . . CA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT . . . . . . . . . . . . CC . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN . . . . . . . . . . . . GA . . . T . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . CA . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . GA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . GA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AC . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . N . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : *** ** *** ****** ** ** ** **** ***** ***** ***
originalCons : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
finalCons : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111
lowQualScore : 333 22 1 1 333 2 33 11 666 1 111 1 1 1 444444 33 1 1 2 22 22 1 11 6666666 4 55555 3333 111 555 2 33 77777 2 333333 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1 5 333333 33 2222 1 2 1 44444444 44444 4444444 66666666 1 4444444 2 666666 11 1 0000000 2222 1 22 3 2 1 11 1 33 1 55555555 33333 1 11 222 222 1 2 1
lowQualScore : ... .. . . ... . .. .. ... . ... . . . ...... .. . . . .. .. . .. ....... . ..... .... ... ... . .. ..... . ...... ....................................................................................... . . . ...... .. .... . . . ........ ..... ....... ........ . ....... . ...... .. . ....... .... . .. . . . .. . .. . ........ ..... . .. ... ... . . .
lowQualScore : 000 66 1 1 000 2 66 44 222 1 888 1 1 1 555555 66 1 1 1 55 55 1 44 2222222 2 11111 2222 888 000 1 66 00000 1 888888 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 3 2 777777 11 7777 3 6 2 55555555 44444 2222222 33333333 3 2222222 6 333333 88 2 3333333 5555 2 88 5 3 2 66 1 99 1 44444444 00000 2 77 222 222 3 7 3
consensus : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
Reference ( family-1539 ) : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAG
gi|1 : CTTATGCTGAAACCTT--AGAA-C-A---A-TA--GCCATTA-G-C---A-ACT-ACT----AGTTAG-TGCA-G--AAC-A-AACC---G---AAG-A-----AGGCGACG---ACTATA---CA-C--GATGCTCA-CAAGA-----CT
gi|1 : ------------C------------G-TA-ATT------T--TGA----A-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-G---------ATA-----AA--A-AAG-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TATGAA--T-AGGTGAA--------GGGGCATGCCG-C--ATGCCGT---T-CAA-TGA-TAAATCGAGgccttcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattttgaaatttttatcctcgataaaaaagttgctcaacatcagctatgaataggtgaaggggcatgccgcatgccgttcaatgataaatcgag
gi|10 : cttatgctgaaaccttagaacaatagccattagcaactactagttagtgcagaacaaaccgaagaaggcgacgactatacacgatgctcacaagactgccttcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTATGTTGAA---TT--AAAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-ACATGTAAGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---TC-T--G-----CA-CATGA-----CTT
gi|10 : A-A-T------T--TGC----A-A-TT-T--------T-----CAT-------C---CA---C-G-------A-AAA---------A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaaatttgcaattttcatccacgaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaataggtgaagggcggcatgt
gi|11 : ttatgttgaattaaaacaataaatgcaatacatgtaagtgtgagaaaacgaagaaaggattaaatctgcacatgacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaattaCTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-T---A-TT--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT----C------------G-CA-A-T------T--TAC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GC---C-G-------A-AAA------A--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TCAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GTGG-C--AT---GT---T-TAA-AGA-TAAATCG
gi|12 : tCTTATGCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-T---C-A-T-A------A-T--A-TG-A-G---A--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATAAAA---CA-T--G-----CCTCAAGA-----
gi|12 : t------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-AATT-T--------T-----TAT-------CGGGCT---C-G-------T-ATA-----AA--A-AAA-----T--G----CT-CAA--CAA-T-C--AGCGTAAGAAT-T-AGATGAA--------actcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcgggctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagcgtaagaattagatgaa
gi|13 : tcttatgctgaattagaacaataaatgtcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgcctcaagaactcttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGTTGA----TT--AGAA---A---A-TA--A--AA---G-C---A-A-T-A------A-T--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AAA----G---ATTAAA---TA-T--G-----TG-CAAGA-----CTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNGT-G-TA-A-T------T--GCC----C-A-GT-T--------T-----TAT-------G---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-GAG-----C-------CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----AC-G-C--AA---GT---TCCAA-TGA-T-AATCG
gi|14 : tCTTATGTTGAA---TT--AGAA---------TA--A--G----G-C---A-A-T-A------GGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-------AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNNNCAG-CA-A-T------T--TGC----A-A-TT-T--------T-----TAT------------------A-------G-AAA-----AA--A-AAA-----T-GG----CT-TAA--T-A---C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----GCGG-C--AA---TT---T-CAA-TGT-TAAATCGA
gi|15 : tTATGTTGAA---TT--TGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-------------------------TG-A-G--AA--A-A--C---T---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---AA-T--G-----CA-CAATA-----CTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----CCC-------C---CA---C-A-------A-AAA-----AAACA-AAA-----CATG----CT-CAA--C-A-T-C--AGG-T----------GGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAGt
gi|16 : ttaCTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----TTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------AG-----GCAG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGAG
gi|17 : CTTATTTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TG--A--ATTA-G-C---A-A-T-A------AGTT-G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAT----G---ATTAAA---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--------------C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-C-------A-AAA-----AA--A-AAA-------TG----CT-CAA--T-ATT-C--AAC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-T--GT---GT---T-CAA-TGA-TAAATTGA
gi|18 : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TT--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A----C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------N-NN-N-T------T---AC----C-T-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--C-AA--------TA----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGATGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGA
gi|19 : ttCTTA-GCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C-----A-T-A------A-T--A-TG-A-G---A--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATAAAA---CA-T--G-----CT-CAa
gi|19 : tt------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-AATT-T--------T-----TAT-------C---CT---C-G-------T-ATA-----AA--A-AAA-------TG----CT-CAA--CAA-T-C--AGC-TAAGAT--C-AGATGAgccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaaatttttatcctcgtataaaaaaatgctcaacaatcagctaagatcagatgataaatcgagtgg
gi|2 : ttcttagctgaattagaacaataaatgcataatatgagaaacgaagaaaaggataaaacatgctcagccttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTTGAA---TT--AGGA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-T--AAGGA-A--C-------AGG-A-----AAGC---G---ATTAAAC--CA-TA-G-----CA-TAAGA-----ATTtaaatcgagtgg
gi|2 : atg------------G-CA-A-T------TAGTGC----CCA-TT-T--------TG----TAT-------T---GG---G-G-------ACAAA-----GA--ACAAA-----T-TGGCGTTT-CAAG-T-A-T-C--AGC-TAAAAAA-T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAttcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcggcaattagtgcccattttgtattggggacaaagaacaaattggcgtttcaagtatcagctaaaaaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcgaa
gi|20 : atggttgaattaggacaataaatgcaataagtgtgataaggaacaggaaagcgattaaaccatagcataagaattttcaagagaataaagtccataagtgccagaattcaagcaagtttatgttcttggacttgtcatcagtttttcaaggaaactaattatcgTTATGTTGAA---TT--A-AA-C-AAATA-TA--A--AT---G-T---A-T-T-A------AGT----TG-A-G--AA--A-A--C---GCGAAAG-A-----AAG----G---ATTAAa
gi|20 : -AAA-----T-GC----CT-CA---C-G-T-T--AGC-AGAGAT--TTATGTGAA--------GA-----G-GG-CCAAT---GT---T-CA--TGA-TTAATCGAGcaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgccattttacccccccgaccccccccccccccaaatgcctcacgttagcagagatttatgtgaagagggccaatgttcatgattaatcgagc
gi|21 : ttatgttgaattaaacaaatataaatgtattaagttgagaaaacgcgaaagaaaggattaacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgccattttacccccccgaccccccccccccccCTTATGTTGAA---TT--AGA----------TC--A--AT---G-T---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAA----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------T---GA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AGA--------G----CT-CAA--T-A-T-TAAAGC-TGAGAA--G-AGGTGAA--------GT-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAc
gi|22 : CTTATTTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TG--A--ATAT-G-C---A-A-T-A------AGTT-G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAT----G---ATTAAA---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------------C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-C-------A-AAA-----AA--A-AAA-----T--G----CT-CAA--T-A-T----AAC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-T--GT---GT---T-CAA-TGA-TAAAT
gi|23 : CTAATGTTGAG---TT--AGAA-------A-TG--A--AT---G-C---A---T-A-------GT--G-T--A-G--AA--A----C-----------------AAG----G---ATTAAAA--CA-T--G-----CA-CAAGAATCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-CC-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---T-G-------A-AAA-----------AAA-----T-TG----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGCGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---C-CAA-TGA-TAAATCGAt
gi|24 : ttTTAT-TTGAA---TT--TAAA-C-A---A-TAT-A--AT---GAT---A-A-T-A-------GT--G-TG-AAG--AA--ACA--C---G---AAG-A-----AAG----G---AGTGAA---AA-T--G-----TA-a
gi|24 : -T-T--AGC-AGAGAT--T-ATGTAAA--------GA-----GCGATC--A----GT---T-CAA-TGA-TTAATCGaacatcaccttaatgtccagattctacgttcaatcattctttaattcaaccagtttgtacagacgatcactcgcaatcgccatcccccccccccccatatgtcatagttagcagagattatgtaaagagcgatcagttcaatgattaatcgg
gi|25 : ttatttgaatttaaacaatataatgataatagtgtgaagaaacacgaagaaaggagtgaaaatgtaaacatcaccttaatgtccagattctacgttcaatcattctttaattcaaccagtttgtacagacgatcactcgcaatcgccatcccccccccccccatatgtcatagCTTATGTTGAA---AT--AACA-C-A---A-TA--A--AC---G--------------------------G-A-G--A------------------G-A-----TTT----G---ATTAAA---TA-T--A-----CA-CAAGA-----CTTg
gi|25 : ------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-A-------T-AAA-----AA--A-A----------G----CT-CAA--T-A-A-C--AGC-TGAGAA--T-AGATGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TTAATCGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgccatttttatccacataaaaaaagctcaataacagctgagaatagatgaagggcggcatgttcaatgattaatcgg
gi|26 : cttatgttgaaataacacaataaacggagagatttgattaaatatacacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGTTAAA---TT--AGAA-C-A-------------------------------------GT--G-TA-A-G--AA--A-A--C---A---AAGCATGCTCAAG----A---ATTNNN---NN-N--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-----------------C------------G-CA-A-T------T--TAC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--A-AAA-------TA----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AAGTGAA--------GG-----GAGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAg
gi|27 : ttcCTTATGTTGAA---TT--AAAAAC-A---A-TA--A--AT---G-T---A-A-TTA------AGT--G-TG-A-G--AA--A-G--C---G---A-G-A-----GAG----G---ATTAAA---TA-T--G-----CAACAAG--------------TACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAA-----GA--A-ATA-------TG----CT-CAA--C-G-T-C--AGC-TGAGAA--T-ATGTGAA---------G-----GCGG-T--AT---GT---T-CAA-TGA-CTAATCAAat
gi|28 : tTATGTTGAA---TG--AAAA-CTAT--A-TA--A--AT---G-T---A-A-T-G------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAA-A-----AAT----G---ATTAAA---AA-T--G-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT-------------------------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A--T-T--------T-----TATCACCCCCC---CC---C-C-------A-AA----------------------TA----CT-CAA--C-G-T-T--AGC-TGAGTA--T-ACCTAAA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAG-TGA-TAAATCGA
gi|29 : CTTATGTTTAA---TT--A----C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-GG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---TA-T--G-----CA-CAAGA-----CTT
gi|29 : t-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGT-TGAAAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---AT---T-CAA-TAA-TTAACCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgccatgctcaacatcagttgaaaataggtgaagggcggcatattcaataattaacc
gi|3 : tcttatgtttaattacaataaatgcaataagtgggagaaaatgaagaaaggattaaatatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaaattgccaTTATGTTGAA---TT--AGAG-C-A---A-TA--A--AT---G-C---T-A-T-A------AGT--G-TA-A-G---A--A-A--C-------AAA-C-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAA
gi|3 : T-C--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----CG--A---------T-TG----TT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGtaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatatatcttatcgacgaaaacgattgttcaatatcagctgagaataggtgaagggcggcatgttcaatgataaatcg
gi|30 : ttatgttgaattagagcaataaatgctataagtgtaagaaacaaacaaggattaaacatgcacaataattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtaagtaagtaatttattatcacatgtgttattcagaactaatataCTTATGTTGAA---TT--AAAA-C-A---AATA--A--AT---G-T---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-G--C---G---AAG-AT----GAG----G---A-TAAA---TA-TG-G-----CA-CAATA-----C-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------N------------G-TA-ATT------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-----------AGA-----AA--A-GAA-----TATG----CT-CAA--C-G---C--AGC-TGAGAA--T-A-GTAGA--------AG-----GC-G-T--AT---GT---T-CAA-TGA-
gi|31 : t--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----T----TTAAA---CA-C--G-----CA-CGAGA-----ATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------NNNNNNNNNT---G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---GA---C-G-------A-AAA-----AA--------------TA----CT-CAA--T-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGG-GAA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGActa
gi|32 : ----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAAA-----ATTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-C------------G-CA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T------AT-------T---GA---C-G-------A-AAA-----TA--A-AA---------------------------------T-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GA-----GC------AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAa
gi|33 : TTATGTTGAA---TT--AGAA-C---------------------C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-A--AA--A-A--C-----------A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAAA-----ATTat
gi|34 : tt------------G-TATA-T------T--TGC----C-A-TG-T--------T-----TAT-------C---AC---C-GCCCCCCCA-A-----------------------TA----CTTCAA--CCG-T-T--AGC-TGAG----T-AACTACA--------GG-----ACGG-C--AT---GT---T-CAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcaatttgccattttaattg
gi|35 : ttgattaaatgtaaattcaaagtcaaagtttacaattcatgtcttactttcaacattattagaactgtatattTTATGTTGAA---TTTTAAAA-C-A---A-TAT-A--AA---G-T---A-A-T-A------AGT--GGTG-A-G--AA--A-A--C---G---AAG-A-----AA-----G---ATTAAA---AA-T--G-----------NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------C------------G-TA-AGT------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----gctg
gi|36 : TTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---T-TA--C--AT---G-C-----G-T-A------AGT--G-TG-A-GCAAA--A-G--C---A---AGG-A-----AGG----G---A--AAT---CA-TTAGT----CA-TGAGA-----CTTa
gi|37 : tatttccttTTGGAC--TT--AGAG-C-A---A-TA--A--AT---G-C---T-A-T-A------AGT--G-TG-T-A--AA--A-A--CCAGA---AAG-AGC---AAG----G---ATTAAAC--CACT--G-----CA-CAAGA-----TTcaaagagtggattaattctgaaatgctccagagtttcattcgagctgtattttacatttt
gi|38 : tCTTATGCTGAA---TT--AGAT-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CT-CAAGA-----CTacaaggagcaataacaatcccaaaggtccgatttca
gi|39 : tTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-T-------T---G-C---A-A-T-C------AGT--G-TA-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----T---ATCAAA---TA-T--G-----CA-CAAGA-----
gi|4 : TATGTTGAA---TT--AGA--C-A---A-TA--A---T---G-C---ATA-T-A-------GT--G-TG-ATA--AA--A-A--C---A---AGG-A-----AAG----G---AT-AAA---CAAT--GGC---TA-CAAAA-----TTCAGAGAATTAAATCATACAGTCCCGAATCACAGTTTAATCTTGACCTTTCTACCATTTTCAGAAAACTAATCAT-C------------G-CA-A-T------TC-TGCGACAC-A-TT-T--------TATGTATAT-------CAG-CAGAAC-G-------A-AAC-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--T-ATT-C--AGC-TAAGAACTT-A-GTG-A--------GG-----GCGG-C---T---GT---T-CAATTGA-TAAATCGAat
gi|40 : tctaTTTAA---TT--AGAA-C-A---T-TA--A--AT---G-A---A-A-C-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--T---G---AAG-A-----AAC----A---ATAAAA---CA-T--G-----TA-CAAGA-----CTat
gi|41 : a------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-A-TT-T--------T------AT-------C---CT---C-G-------A-TAA-----AA----AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-
gi|42 : --AGC-TGAGAA--T-AGGTGAA--------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAC-TGA-CAAATC
gi|43 : -----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TACGAA--T-AGGTGAA--------GG-----G
gi|5 : CTTATGCTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--A-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AAGAA-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CT-CAAAA-----CTTg
gi|5 : t------------C------------G-TA-A-T------T--TGA----A-A-TT-G--------T-----TAT-------T---CT---C-G-------ATAAA-----AA--A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TAAGAA--T-AGGTGAAG-------GG-----GCGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TAAATCGAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgaaattgttattctcgataaaaaaaaattgctcaacatcagctaagaataggtgaaggggcggcatgttcaatgataaatcgag
gi|6 : tcttatgctgaattagaacaataaatgcaataagtatgagaaaacgaagaaaaggattaaacatgctcaaaacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTATGT-GAA---TT--AGAA-C-A---AGTA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--T-TT-A-TT-AA--A-A--C---G---AAG-A-----TAG----GTATATCAAAAGACT-T--N-----NN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------------T------------GATA-A-TCGTTAAT--TGC----C-A-TTCT--------T-----TAT-------C---CA---CAG-------A-AAA-----AA--A-AAAACACCC-TG----CT-CAA--C-A-TGC--AGC-TTAGAA--T-AGGTTGG--------AG-----GCAG-C--CT---TT---C-CAA-TGATTAAATCGGG
gi|7 : TTATGTTGAA---TTT-AAAA-C-A---A-TATAA--ACTCCG-CTCAA-G-T-A------AAG--G-TG-A-G--AA--A----C---G---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---AA-T--G-----GN-NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAGTCA-------------------------G-TA-ATT------T--TGC----C-A-TT-TACCCCCCCC-----CAC-------C---CC---C-C-------C-CAA---------------------TG----CT-CAAGTC-G-T-T--AGC--GAGAA--T-ATGTGAATAAAAAAGGG-----GCGG-C--AG---GTCTCT-CAGTTGA-GAAATCGAG
gi|8 : CTTATGTTGAA---TT--AGAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------ATT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---A---AAG-A-----AAG----G---ATTAAA---CA-T--G-----CA-CAAGA-----CTTt
gi|8 : t------------C------------A-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-G-------A-AAAAAAAAAA--A-AAA-----T-TG----CT-CGA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--T-AGGAGAA--------GG-----GCG------T---GT---T-CAA-TGA-TAAATCAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatatcataatttgccatttttatccacgaaaaaaaaaaaaaaattgctcgacatcagctgagaataggagaagggcgtgttcaatgataaatcaag
gi|9 : tcttatgttgaattagaacaataaatgcaataattgtgagaaaacaaagaaaggattaaacatgcacaagacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatatGTTGAA---AT--AAAA-C-A---A-TA--A--AT---G-C---A-A-T-A------AGT--G-TG-A-G--AA--A-A--C---G---AGG-A-----AAG----G---ATTACA---TA-T--ACGT--CA-CAAGA-----CTT
gi|9 : ------------C------------G-TA-A-T------T--TGC----C-A-TT-T--------T-----TAT-------C---CA---C-C-------A-AAA---------A-AAA-----T-TG----CT-CAA--C-A-T-C--AGC-TGAGAA--G-AGGTGAA--------GG-----GTGG-C--AT---GT---T-CAA-TGA-TTAATCcaagattaatacaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtaatttgccatttttatccaccaaaaaaaattgctcaacatcagctgagaagaggtgaagggtggcatgttcaatgattaatc