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Reference ( gi|4 )            :                                                                      TCGAATTCATAACCATATTTTCAAAACTGAA--ATTTATT--AG-ATCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTATC--AA---TATAAAGCCATAAA---TTGTGT---GGT-AA----------GA----------GTG------ATA-TG----T-ATA--C-CCCCTCTATATA-T--AAATA---CA-------------C------T---A---------------TAT--A--GAG---GGGG--TATA----C-AT-AT------CACCCT-T-ACCA-------T---ACA-A----TTTACG--CCCA-GCTTA-TTG--AT---AGAAA-TTCAG-GGG-CCTGTGA-T--------TAG------A---TG-AT--ATATAGTTAAGTAC-AAA
gi|10                         :                                                                         AATTCA-AAC-AT-TTTTGAAAAATAACGCATGTAATCCAA-A-CA-CAGGGCCT-CT-----G-------AA-TTCCTATC--AA---TA---AGCCGTAAA---TTATGT---GGT-AA----------GG----------GTG------ATA-TG----T-ATA--C-CCTCTCTCTATA----AAAAA---CA-------------T------T---A---------------CAG--A--G
gi|9                          :                                                                        tAATTCA-AAC---ATTTTGAAAAATAACGCATGTAATCCAA-ACCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTCCTATC--AA----ATAA-GCCGTAAA---TTATGT---GGT-AA----------GG----------GTG------ATA-TG----T-ATA--C-CCTCTCTCTATA----AAAAA---CA-------------T------T---A---------------CAG--A--Gccctg
gi|3                          :                                                                                              tACTGAA--TTTTAT--------CA-CAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTATC--AA---TA---AGCTGTAAA---TTGTGT---AGC-AA----------GG----------GTG------ATA-TG----T-ATA--T-CTCCTCTATATA-T--GAATAGTGTAT------------T------T---A---------------TAT--ATTGAG---GGGA--TATA----C-AT-AT------CACTCT-T-ACTA-------C---ACA-T----TCTATG-------GCTTA-TTG--AT---AAAAA-TTCAG-AGG-CCTGTGA-T--------Tccctg
gi|12                         :                          aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacataTGAA--ATTTGT--------CA-CAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTATC--AA---T---AAGCCATAAG---ATGTGT---AGC-AA----------GG----------GTG------Aggatggcattggtgacaaggaat
gi|3                          :                                                                                         tataaaatacatcatagaagT--AA-ATCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTTTATC--AA---TA---AGCCATAGA---ATGTGT---AGT-AA----------GA----------GTG------ATA-TG----T-ATA--T-CCCCTCAATATA-T--AAATA---CA-------------CTATTCAT---A---------------TAT--A--GAG---GAGA--TATA----C-AT-AT------CACCCT-T-GCTA-------C---ACA-A----TTTA------CA-GCTTA-TTG--AT---AGAAA-TTCAG-AGG-CCTGTGA-T--------AAA------A---Ttagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|1                          :                                        aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacaT--AGCATCC-CAGG-CCC-CT-----G-------A--TTTCTATC--AA---TA---AGCCGTAAA---T-ACAT-----T-AC----------AG----------GTA------ATA---------A-A--C--------GTATT-T--AA----------------------------T---A---------------TAT--A--GAA---GGG---TATA----C-AT-ATT-----CACCCT-TTACCA-------C---ATA-A----TTTACG-------GCTTA-TTG--ATGATAGAAA-TTCAG-AGG-CCTCTGA-G--------TAC------A---TG--T--ACATCGTtcagtggatggcattggtgacaaggaat
gi|2                          :                                                                     cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacag--AG-ACCAACAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTATC--AA---TAGA---CCGTAAA---ATGTAT---AGT-AA----------GG----------GTG------ATA-----------------CCCTCTATATA-T--AAATA---CA-------------CG-----TAA-A---------------TGT--A---AG---GGGG--TATAAT--T-AT-AT-------ATC---T-AC-------------ACA-T----TTTACG-------GCTTA-TTG--AA---AGAAA-TTCAG-AGG-CC--TGA-----------AG------A---TG-AC--Actgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|5                          :  cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgcca-ACCA-CAGG-CCTGCT-----G-------AA-TT-CTATC--AA-------AAGCCGTAAA---TTATGT---GGT-AA----------GG----------GTG------ATA-TGG---T-ATA--C-CCTCTCT-TA-A-T--AAATA---TA-------------C------AGA-A---------------TAT--A--GAG---AGGA--T-TA----C-ATTATG-----CACCCT-T-ACCA-------G---CTA-A----TTTACG-------GCTTA-TTAGAAT---AGAAATTTCAG-AGGTCCTGTGC-T--------Taac
gi|15                         :                                                                                                         aattgtaac-ATCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTATC--AA---TATacaagtgcattgattggttaagtaattcatta
gi|1                          :                                                                                            catttatatatagagagggtatacTCA-GAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTATC--AT---CAATAAGCCGTAAA---TTATGT---GGTAAA----------GG----------GTGA-----ATA-TG----T-ATA----CCCTTCTATATATT--AAATA---CG-------------T------T--------------------------------------------------T-AT------TACCTG-T-A--A-------T---GT--A----TTTACG-------GCTTA-TTG--AT---AGAAA--TCAG-GGG-CCTGGGA-T--------tat
gi|6                          :                                                                       cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacagtagcTCA-CTGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTGTC--AA---TAAACAG---TAAA---ATCTGT---TGT-AA----------GG----------GTG------ATA-TGTTTTT-GTA--T-CCCCTCTATGTT-T--GAATA---CAATTGTTAGGGTATCTAAA--T---A---------------TAT--A--GAT---GGGA--TACA----C-AC-ATATATTGCATGAT-C-ACCG-------TTGCACA-T----CTGACG-------GCTCA-TTA--AT---AGAAgtacatgtacatcgtctgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|11                         :                                                                                                                    TCA-CTGG-CCT-CT-----G--------------CGTC---------TGAAGCCGTACG---ATGTGT---AGT-AA----------GGCCCACTAAGGGTG------ATA-AG----T-ATA--CCCCCCTCTCTCCA-T--AAATA---CA--------------------T---A---------------TTT--A--acggactgtaagatataaagtactaaaacatcg
gi|5                          :                                                                                        taataataagaatttcatgagcttacttcCA-CAGGACCT-CT-----G-------AAATTTCTATTCTAA---TA---AGCCGTAAA---TTAGCT---GGT-AA----------GG----------GTGC-----ATAATG----T-A-A--T-CCTCTCTATAT--T--CTGTA---TA-------------T------T-------------------TATTAA--GAG---AGGG--TATA----CCAT-AT------CACCCT-T-ACCA-------C---ATA-A----TTTACG-------GCTT--TTG--AT---AG-AA-TTCAGCAGG-CCTGTGG-TA-------CAA------G---TGCATTGAT-TGGTTAAGTAt
gi|8                          :                                                                                                         aattgtaacaagCA-CAGA-CCT-CT-----G-------A---TT--------G---TATAAAGCCGTGAA---TTAGGT---GGT-AA----------GG----------GTG------ATA-TG----T-ATA--A-ACCCTCTATTTA-attcatta
gi|7                          :                                                                                  ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccgCA-GAGG-CCT-TT-----GCCCGGAGGA-TTTCTTTC--AA---TA---AGCCGTAAAAGACTATGT--------A----------GA----------GCA------GAA-GG----CGATA--C-CCCCTCGCTATT-T--CAATA---CA-------------T------T---A---------------C---------C---GGGA--TATA----C-AT-ATC-----CACCCTAT-ACTATAGTTACT---ACACA----TTTTTGTATTCATGCTT--TTG--AT---AT-AA-TTCA--AGG-CCTGgcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|14                         :                                                                                                    aattttaaagcacagctCA-CAGG-TTT-TTAGTTTG-------AA-TTTCCAAC--AA---TA---AGCTGCAAG---ATGTGT---AGT-AA----------TG----------GTG------ATA-TG----T-Actgtgggtttaaatcc
gi|2                          :                                                                                                                     ag-CAGG-CCT-CT-----G-------AA-TTTCTTTC--AA---TA---AGCCGTAAA---ATGTGT--------A----------GA-----------T-------ATA-TAAT--T-ATA--C-CCCCT-TACATT-T--ACGTG---TA-------------T------TTATA---------------TAT--A--GAG---GG---------------T-AT------CACCCT-T-ACTA-------T---ACA-T----TTTACG-------GTCTA-TTG--AT---AGAAA-TTCAG-AGG-CCTGT
gi|7                          : cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgccaagacca-CAGG-CCT--T-----G-------AA-TT-ATATC--AAAAGCATGAATACAAAAA---T-GTGT---AGT-AACTATAGTATAGG----------GTGG-----ATA-TG----T-ATA--T-CCCGGTAATGTA-TTGAAATA----G-------------C----------------------------------GAG---GGGG--TAT------------------CGCCTTCT-GCTC-------T---ACATAGTCTTTTACG-------GCTTA-TTG--AA---AGAAA-TCCaagatgacaaac
gi|16                         :                                                                                                         aattttaaagcacagctGG-CCT-CT-----G-------AC-TATCTATC--AA---TA---AGCCGCAAA---TTGTGT---GGT-Atccgggcaaaggcctctgctgtgggtttaaatcc
gi|6                          :                                                                                                                                                    TTCTATT--AA---TG---AGCCGTCAG---ATGTGCAACGGT-GA----------TC----------ATGCAATATATG-TG----T-GTA--T-CCCATCTATATA-TTTAGATA---CC-------------C------T---AACAATTGTATTCAAACAT--A--GAG---GGGA--TACAAAAAC-AT-AT------CACCCT-T-ACAA-------C---AGA-T----TTTACT-------GTTTA-TTG--AC---AGAAA-TTCAG-AGG-CCAGTGA-A--------CGG------ACTGTA-AG--ATATA---AAGTACTAAA
gi|13                         :                                                                                                                                                       TATC--AA---TA---AGCCATGAA---ATGTGT---AGC-AA----------GG----------GTG------ATA-T-----T-ATATTC-CCTCTCTATATA-T--AAATA---CA-------------acatcg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                           ------ATA-TG----T-ATA--C-CCTCTCTATATA-T--AAATtaaaaatatgaggagt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                           cTATA----AAATA---CA-------------T------C---A---------------TA------GAA---G-------------------T------CACCCT-T-GCTA-------C---ACA-T----CTTATG-------GCTTA-TTG--AT---AGAAA-TTCAG-AGG-CCTGTGA-CAAATTTCATAGCTAATTA---TG-AT--ATCTAGTACAGTGT-AAAtgatagaaattcagaggcctgtgattat
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                               A-T--AAATA---TG-------------TATT---T---A---------------TGG--A--GAGAGGGGGG--TATA----C-TT-AT------CACCCT-T-A
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                taataataagaatttcatgagcttacttctcactggcctctgcgtctgaagccgtacgatgtgtagtaaggcccac------T---A---------------TAG--A--GAG---AGGG--TATA----C-AT-AT------CACCCT-T-ACCA-------C---ATA-A----TTTACG-------GCTTA-TTG--AT---AGGAA-TTCAG-AGGCCCTGTGT-T--------TGG------A---TT-AC--AT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                taattcaaacatttttgaaaaataacgc------T---A---------------TAG--A--GAG---AGGG--TATA----C-AT-AT------CACCCT-T-ACCA-------C---ATA-A----TTTACG-------GCTTATTTG--AT---AGGAA-TTCAG-AGG-CCTGTGGTT--------TGG------A---TT-AC--ATaaaaacattacagagccctg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 taattcaaacattttgaaaaataacgc------T---A---------------AAT--A--GAG---GGTT--TATA----C-AT-AT------CACCCT-T-ACCA-------C---CTA-A----TTCACG-------GCTT--T----AT---ACAA---TCAG-AGG-TCTGTGaaaaacattacagagccctg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                         ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccg------T---A---------------TAT--A--GAG---AGGGAATATA------AT-AT------CACCCT-T-GCTA-------C---ACA-T----TTCATG-------GCTTA-TTG--AT---Agcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                            ------T---A---------------TAT--A--GAG---AGGG--TATA----C-AT-AT------taaatacataaaaatatgaggagt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      catttaTA----C-AT-AT------CACCAT-T-ACTA-------C---ACA-T----CTTGC------A-GCTTA-TTG--TT---GGAAA-TTCAtgatagaaattcagaggcctgtgattat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ag-T-ACCA-------C---ACA-A----TTTGCG-------GCTTA-TTG--AT---AGATA-GTCAG-AGG-CCaactaaaaacctgtg
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TA-TTG--AT---AGAAA-TTCAG-AGG-CCTGTGA-T--------TA





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lowQualScore                  :                                                                                0 0  0  6   0 2 00  0   44444444   0  0 22222 3      1   1  77777 0000000           777 7  777        88888     5555  7 7  7777777777    333333   999    33        222    111  77 7777   888888888888888888888888 6 11 99    3 00000000000  6   9     9999999999  3  6     8888888       1111     22 444444        1        1       77   000  0 2     000      5   
consensus                     :                                                                       NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GAC--GCATGTANT--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------AT------T--------ATATAG--AGGG-GATAT----A--CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATATAGTTAAGTACTAAA
Reference ( family-1537 )     :                                                                       NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TGA--AA-AAT--GAN--GCATNTANT--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------AT------T--------ATATAG--AGGG-GGTAT----A--CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATATAG-TAAGTACTAAA
gi|1                          :                                                                            TTCA-ATAC-ATGTCTATAATAAA-AGTTCGACTTGTGTACAGT--AGCATCCCAGG-CCC-CT-----G-------A-TTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---A-TACAT-----T-A-CA----------GGTA------ATA----A-A--C-------G--TATT--TAA-------------------------T--------ATATAG--AAGG-G-TAT----A--CA-TATTCACCC----------TTTACCACATA-------ATTTACG----GCTTA--TTGAT--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTCTGAGTACA---TGTACAT
gi|1                          :                                                                               c-A-AT-ATATTA-TCA--GACGAT--G-T--ACATGTACT-------CAGAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCATCAA-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGTAA-AG----------GGTGA-----ATAT-GTATA---CCCTTCTA--TATAT-TAA--A----TAC-------GT------T------------------------------------TAT-TACCT----------GT-A--ATGT--------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA--TCAGGGG-CCTGGGATcgtctgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|10                         :                             cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacagtagcAATTCA-A-AC-AT-TTT-TGA--AA-AAT--AAC--GCATGTAATCCAA-A-CACAGGGCCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA---AA--A----AAC-------AT------T--------ACAGAG--acttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|11                         :                                                                                                                             tTCACTGG-CCT-CT-----G-------CGT--CTG---------A---AGCCGTAC---GATGTGT---AGT-A-AGGCCCACTAAGGGTG------ATAA-GTATAC-CCCCCTCTC--TCCA--TAA--A----TAC-------AT------ccctg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                       taataataagaatttcatgagcttacttc--TATA---AA--A----TAC-------AT------C--------ATA--G--AAG-------------------T-CACCC----------TT-GCTACACA-------TCTTATG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGAatttat
gi|12                         :                                                                                                                              TCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCATAA---GATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------Acaaatttcatagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|13                         :                                                                                                                                           tataaaatacatcatagaagTATCA---A-TA---AGCCATGA---AATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------ATAT--TATATTCCCTCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------ATAAA---A--------ATAT-G--AGGA-Gcaaatttcatagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|14                         :                                                                                                                               CACAGG-TTT-TTAGTTTG-------AATTTCCAACA---A-TA---AGCTGCAA---GATGTGT---AGT-A-AT----------GGTG------ATAT-GTAt
gi|15                         :                                                                                                                         agA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA----------------TGTAT----------------------------------------A--CCCTCTCTA--TATA--TAA--A----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        catttatatatagagagggtatacaT-ACCACACA-------ATTTGCG----GCTTA--T---T--GATAGATA-GTCAGAGG-CCt
gi|2                          :                                                                                                                                ACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---GACCGTAA---AATGTAT---AGT-A-AG----------GGTG------ATA-----------CCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------ACG-----TAA------ATGTA---AGGG-GGTAT----AATTA-TAT--AT----------------CTACACA-------TTTTACG----GCTTA--T---T--GAAAGAAA-TTCAGAGG-CC--TGA--AGA---TG-ACA
gi|3                          : cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgccaagaccaT--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTTTATCA---A-TA---AGCCATAG---AATGTGT---AGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--TCCCCTCAA--TATA--TAA--A----TAC-------ACTATTCAT--------ATATAG--AGGA-GATAT----A--CA-TAT-CACCC----------TT-GCTACACA-------ATTTACA----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATAAAA---Taac
gi|4                          :     aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacaAATTCATA-ACCATATTT-TCA--AA-ACT--GAA----ATTTATT--AG-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TATAAAGCCATAA---ATTGTGT---GGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------AC------T--------ATATAG--AGGG-GGTAT----A--CA-TAT-CACCC----------TT-ACCATACA-------ATTTACGCCCAGCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGGGG-CCTGTGATTAGA---TG-ATATATAGTTAAGTAC-AAAtcagtggatggcattggtgacaaggaat
gi|5                          :                                                                                                                         tcg-ACCACAGG-CCTGCT-----G-------AATT-CTATCA---A--A---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATATGGTATA--CCCTCTCT---TA-A--TAAATA----TAC-------AG------A--------ATATAG--AGAG-GAT-T----A--CATTATGCACCC----------TT-ACCAGCTA-------ATTTACG----GCTTA--T---TAGAATAGAAATTTCAGAGGTCCTGTGCTT
gi|6                          :                                                                                                                                                   aattgtaacTTCTATTA---A-TG---AGCCGTCA---GATGTGCAACGGT-G-AT----------CATGCAATATATGT-GTGTA--TCCCATCTA--TATATTTAG--A----TACCCTAACAAT------TGTATTCAAACATAG--AGGG-GATACAAAAA--CA-TAT-CACCC----------TT-ACAACAGA-------TTTTACT----GTTTA--T---T--GACAGAAA-TTCAGAGG-CCAGTGAACGGACTGTA-AGATATA---AAGTACTAAAacaagtgcattgattggttaagtaattcatta
gi|7                          :                                                                                                                               CAGAGG-CCT-TT-----GCCCGGAGGATTTCTTTCA---A-TA---AGCCGTAAAAGACTATGTAG-AGC-AGAA----------GGCG-------------ATA--CCCCCTCGC--TATT--TCA--A----TAC-------AT------T--------AC-------CGG-GATAT----A--CA-TATCCACCCTATACTATAGTT-ACTACACATTTTTGTATTCAT-----GCTT---T---T--GATAT-AA-TTCA-AGG-CCTGacatcg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                             aattttaaagcacagctCCTCTGATTGTA--TAA--AGCCGTGA-------AT------T--------AGGTGGTAAGGGTGATAT----G--TA-TA--AACCC----------T--------CT-------ATTTACG----GCTTAGCT---A--AACAGAAA-TT-AGAGG-ACTGTGctgtgggtttaaatcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                               ggc------T--------AAATAG--AGGG-TTTAT----A--CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACCTA-------ATTCACG----GCTT---T-------ATACAA---TCAGAGG-TCTGTGtctgtggcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|9                          :                                       ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccgAATTCA-A-AC-AT--TT-TGA--AA-AAT--AAC--GCATGTAATCCAA-ACCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---AATA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA---AA--A----AAC-------AT------T--------ACAGAG--gcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa





Alignments
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consensus                     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------AT------T--------ANAT---AG--AGGG-GATA--T----ACA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
Reference ( family-1537 )     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------AT------T--------ATAT---AG--AGGG-GATA--T----ACA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
gi|1                          :                                                                              TTCA-ATAC-ATGTCTATAATAAA-AGTTCGACTTGTGTACAGT--AGCATCCCAGG-CCC-CT-----G-------A-TTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---A-TACAT-----T-A-CA----------GGTA------ATA----A-A--C-------G--TATT--TAA-------------------------T--------ATAT---AG--AAGG-G-TA--T----ACA-TATTCACCC----------TTTACCACATA-------ATTTACG----GCTTA--TTGAT--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTCTGAGTACA---TGTACAT
gi|1                          :                                                                                 c-A-AT-ATATTA-TCA--GACGAT--G-TACATGTAC--T-------CAGAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCATCAA-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGTAA-AG----------GGTGA-----ATAT-GTATA---CCCTTCTA--TATAT-TAA--A----TAC-------GT------T---------------------------------------TAT-TACCT----------GT-A--ATGT--------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA--TCAGGGG-CCTGGGATcgtctgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|10                         :                               cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacagtagcAATTCA-A-AC-AT-TTT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-A-CACAGGGCCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA---AA--A----AAC-------AT------T--------ACAG---AG--acttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|11                         :                                                                                                                               tTCACTGG-CCT-CT-----G-------CGT--CTG---------A---AGCCGTAC---GATGTGT---AGT-A-AGGCCCACTAAGGGTG------ATAA-GTATAC-CCCCCTCTC--TCCA--TAA--A----TAC-------AT------ccctg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                         taataataagaatttcatgagcttacttc--TATA---AA--A----TAC-------AT------C--------ATA-----G--AAG-------------------T-CACCC----------TT-GCTACACA-------TCTTATG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGA-CAAA---TT-TCATAGCTAATTAatttat
gi|12                         :                                                                                                                                TCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCATAA---GATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------Atgatatctagtacagtgtaaa
gi|13                         :                                                                                                                                             tataaaatacatcatagaagTATCA---A-TA---AGCCATGA---AATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------ATAT--TATATTCCCTCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------ATAAA---A--------ATAT----G--AGGA-Gcaaatttcatagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|14                         :                                                                                                                                 CACAGG-TTT-TTAGTTTG-------AATTTCCAACA---A-TA---AGCTGCAA---GATGTGT---AGT-A-AT----------GGTG------ATAT-GTAt
gi|15                         :                                                                                                                           agA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA----------------TGTAT----------------------------------------A--CCCTCTCTA--TATA--TAA--A----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             catttatatatagagagggtatacaT-ACCACACA-------ATTTGCG----GCTTA--T---T--GATAGATA-GTCAGAGG-CCt
gi|2                          :                                                                                                                                  ACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---GACCGTAA---AATGTAT---AGT-A-AG----------GGTG------ATA-----------CCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------ACG-----T--------AAATGTAAG--GGGG-TATAATT----ATA-TAT--------------------CTACACA-------TTTTACG----GCTTA--T---T--GAAAGAAA-TTCAGAGG-CC--TGA--AGA---TG-ACA
gi|3                          : cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgccaagacca--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTTTATCA---A-TA---AGCCATAG---AATGTGT---AGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--TCCCCTCAA--TATA--TAA--A----TAC-------ACTATTCAT--------ATAT---AG--AGGA-GATA--T----ACA-TAT-CACCC----------TT-GCTACACA-------ATTTACA----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATAAAA---Taac
gi|4                          :       aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacaAATTCATA-ACCATATTT-TCA--AA-ACT--GAA--ATTTAT--T--AG-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TATAAAGCCATAA---ATTGTGT---GGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA--TAA--A----TAC-------AC------T--------ATAT---AG--AGGG-GGTA--T----ACA-TAT-CACCC----------TT-ACCATACA-------ATTTACGCCCAGCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGGGG-CCTGTGATTAGA---TG-ATATA--TAGTTAAGTAC-AAAtcagtggatggcattggtgacaaggaat
gi|5                          :                                                                                                                           tcg-ACCACAGG-CCTGCT-----G-------AATT-CTATCA---A--A---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATATGGTATA--CCCTCTCT---TA-A--TAAATA----TAC-------AG------A--------ATAT---AG--AGAG-GAT---T----ACATTATGCACCC----------TT-ACCAGCTA-------ATTTACG----GCTTA--T---TAGAATAGAAATTTCAGAGGTCCTGTGCTT
gi|6                          :                                                                                                                                                     aattgtaacTTCTATTA---A-TG---AGCCGTCA---GATGTGCAACGGT-G-AT----------CATGCAATATATGT-GTGTA--TCCCATCTA--TATATTTAG--A----TACCCTAACAAT------TGTATTCAAACAT---AG--AGGG-GATA--CAAAAACA-TAT-CACCC----------TT-ACAACAGA-------TTTTACT----GTTTA--T---T--GACAGAAA-TTCAGAGG-CCAGTGAACGGACTGTA-AGATA--TA---AAGTACTAAAacaagtgcattgattggttaagtaattcatta
gi|7                          :                                                                                                                                 CAGAGG-CCT-TT-----GCCCGGAGGATTTCTTTCA---A-TA---AGCCGTAAAAGACTATGTAG-AGC-AGAA----------GGCG-------------ATA--CCCCCTCGC--TATT--TCA--A----TAC-------AT------T--------AC----------CGG-GATA--T----ACA-TATCCACCCTATACTATAGTT-ACTACACATTTTTGTATTCAT-----GCTT---T---T--GATAT-AA-TTCA-AGG-CCTGacatcg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                               aattttaaagcacagctCCTCTGATTGTA--TAA--AGCCGTGA-------AT------T--------AGGT---GGTAAGGGTGATA--T----GTA-TA--AACCC----------T--------CT-------ATTTACG----GCTTAGCT---A--AACAGAAA-TT-AGAGG-ACTGTGctgtgggtttaaatcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                 ggc------T--------AAAT---AG--AGGG-TTTA--T----ACA-TAT-CACCC----------TT-ACCACCTA-------ATTCACG----GCTT---T-------ATACAA---TCAGAGG-TCTGTGtctgtggcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|9                          :                                         ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccgAATTCA-A-AC-AT--TT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-ACCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---AATA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA---AA--A----AAC-------AT------T--------ACAG---AG--gcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa





Alignments
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consensus                     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------T---ACAT---A-G--AGGG-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
Reference ( family-1537 )     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------T---ANAT---A-G--AGGG-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
gi|1                          :                                                                              TTCA-ATAC-ATGTCTATAATAAA-AGTTCGACTTGTGTACAGT--AGCATCCCAGG-CCC-CT-----G-------A-TTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---A-TACAT-----T-A-CA----------GGTA------ATA----A-A--C-------G--TATT-T--AA------------------------------T---ATAT---A-G--AAGG-G-TA--TA----CA-TATTCACCC----------TTTACCACATA-------ATTTACG----GCTTA--TTGAT--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTCTGAGTACA---TGTACAT
gi|1                          :                                                                                 c-A-AT-ATATTA-TCA--GACGAT--G-TACATGTAC--T-------CAGAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCATCAA-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGTAA-AG----------GGTGA-----ATAT-GTATA---CCCTTCTA--TATATT--AA--A----TAC------------GT------T-----------------------------------TAT-TACCT----------GT-A--ATGT--------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA--TCAGGGG-CCTGGGATcgtctgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|10                         :                               cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacagtagcAATTCA-A-AC-AT-TTT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-A-CACAGGGCCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---A-G--acttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|11                         :                                                                                                                               tTCACTGG-CCT-CT-----G-------CGT--CTG---------A---AGCCGTAC---GATGTGT---AGT-A-AGGCCCACTAAGGGTG------ATAA-GTATAC-CCCCCTCTC--TCCA-T--AA--A----TAC------------AT------ccctg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                         taataataagaatttcatgagcttacttc--TATA----AA--A----TAC------------AT-----------CAT---A-G--AAG-------------------T-CACCC----------TT-GCTACACA-------TCTTATG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGA-CAAA---TT-TCATAGCTAATTAatttat
gi|12                         :                                                                                                                                TCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCATAA---GATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------Atgatatctagtacagtgtaaa
gi|13                         :                                                                                                                                             tataaaatacatcatagaagTATCA---A-TA---AGCCATGA---AATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------ATAT--TATATTCCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------ATA-----A---AAAT---ATG--AGGA-Gcaaatttcatagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|14                         :                                                                                                                                 CACAGG-TTT-TTAGTTTG-------AATTTCCAACA---A-TA---AGCTGCAA---GATGTGT---AGT-A-AT----------GGTG------ATAT-GTAt
gi|15                         :                                                                                                                           agA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA----------------TGTAT----------------------------------------A--CCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               catttatatatagagagggtatacaT-ACCACACA-------ATTTGCG----GCTTA--T---T--GATAGATA-GTCAGAGG-CCt
gi|2                          :                                                                                                                                  ACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---GACCGTAA---AATGTAT---AGT-A-AG----------GGTG------ATA-----------CCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACG-----T---AAATGTAA-G--GGGG-TATAATTA----TA-TAT--------------------CTACACA-------TTTTACG----GCTTA--T---T--GAAAGAAA-TTCAGAGG-CC--TGA--AGA---TG-ACA
gi|3                          : cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgccaagacca--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTTTATCA---A-TA---AGCCATAG---AATGTGT---AGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--TCCCCTCAA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACTATTCAT---ATAT---A-G--AGGA-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-GCTACACA-------ATTTACA----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATAAAA---Taac
gi|4                          :       aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacaAATTCATA-ACCATATTT-TCA--AA-ACT--GAA--ATTTAT--T--AG-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TATAAAGCCATAA---ATTGTGT---GGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AC------T---ATAT---A-G--AGGG-GGTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCATACA-------ATTTACGCCCAGCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGGGG-CCTGTGATTAGA---TG-ATATA--TAGTTAAGTAC-AAAtcagtggatggcattggtgacaaggaat
gi|5                          :                                                                                                                           tcg-ACCACAGG-CCTGCT-----G-------AATT-CTATCA---A--A---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATATGGTATA--CCCTCTCT---TA-A-T--AAATA----TAC------------AG------A---ATAT---A-G--AGAG-GAT---TA----CATTATGCACCC----------TT-ACCAGCTA-------ATTTACG----GCTTA--T---TAGAATAGAAATTTCAGAGGTCCTGTGCTT
gi|6                          :                                                                                                                                                     aattgtaacTTCTATTA---A-TG---AGCCGTCA---GATGTGCAACGGT-G-AT----------CATGCAATATATGT-GTGTA--TCCCATCTA--TATA-TTTAG--A----TACCCTAACAATTGTAT------TCAAACAT---A-G--AGGG-GATA--CAAAAACA-TAT-CACCC----------TT-ACAACAGA-------TTTTACT----GTTTA--T---T--GACAGAAA-TTCAGAGG-CCAGTGAACGGACTGTA-AGATA--TA---AAGTACTAAAacaagtgcattgattggttaagtaattcatta
gi|7                          :                                                                                                                                 CAGAGG-CCT-TT-----GCCCGGAGGATTTCTTTCA---A-TA---AGCCGTAAAAGACTATGTAG-AGC-AGAA----------GGCG-------------ATA--CCCCCTCGC--TATT-T--CA--A----TAC------------AT------T---AC-----------CGG-GATA--TA----CA-TATCCACCCTATACTATAGTT-ACTACACATTTTTGTATTCAT-----GCTT---T---T--GATAT-AA-TTCA-AGG-CCTGacatcg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                               aattttaaagcacagctCCTCTGATTGTA-T--AA--AGCCGTGA------------AT------T---AGGT---G-GTAAGGGTGATA--TG----TA-TA--AACCC----------T--------CT-------ATTTACG----GCTTAGCT---A--AACAGAAA-TT-AGAGG-ACTGTGctgtgggtttaaatcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggc------T---AAAT---A-G--AGGG-TTTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACCTA-------ATTCACG----GCTT---T-------ATACAA---TCAGAGG-TCTGTGtctgtggcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|9                          :                                         ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccgAATTCA-A-AC-AT--TT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-ACCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---AATA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---A-G--gcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa





Alignments
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consensus                     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------T---ACAT---AG--AGGG-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
Reference ( family-1537 )     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------T---ACAT---AG--AGGG-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
gi|1                          :                                                                              TTCA-ATAC-ATGTCTATAATAAA-AGTTCGACTTGTGTACAGT--AGCATCCCAGG-CCC-CT-----G-------A-TTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---A-TACAT-----T-A-CA----------GGTA------ATA----A-A--C-------G--TATT-T--AA------------------------------T---ATAT---AG--AAGG-G-TA--TA----CA-TATTCACCC----------TTTACCACATA-------ATTTACG----GCTTA--TTGAT--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTCTGAGTACA---TGTACAT
gi|1                          :                                                                                 c-A-AT-ATATTA-TCA--GACGAT--G-TACATGTAC--T-------CAGAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCATCAA-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGTAA-AG----------GGTGA-----ATAT-GTATA---CCCTTCTA--TATATT--AA--A----TAC------------GT------T----------------------------------TAT-TACCT----------GT-A--ATGT--------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA--TCAGGGG-CCTGGGATcgtctgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|10                         :                               cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacagtagcAATTCA-A-AC-AT-TTT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-A-CACAGGGCCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---AG--acttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|11                         :                                                                                                                               tTCACTGG-CCT-CT-----G-------CGT--CTG---------A---AGCCGTAC---GATGTGT---AGT-A-AGGCCCACTAAGGGTG------ATAA-GTATAC-CCCCCTCTC--TCCA-T--AA--A----TAC------------AT------ccctg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                         taataataagaatttcatgagcttacttc--TATA----AA--A----TAC------------AT-----------CAT---AG--AAG-------------------T-CACCC----------TT-GCTACACA-------TCTTATG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGA-CAAA---TT-TCATAGCTAATTAatttat
gi|12                         :                                                                                                                                TCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCATAA---GATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------Atgatatctagtacagtgtaaa
gi|13                         :                                                                                                                                             tataaaatacatcatagaagTATCA---A-TA---AGCCATGA---AATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------ATAT--TATATTCCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------caaatttcatagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|14                         :                                                                                                                                 CACAGG-TTT-TTAGTTTG-------AATTTCCAACA---A-TA---AGCTGCAA---GATGTGT---AGT-A-AT----------GGTG------ATAT-GTAaaaaatatgaggagt
gi|15                         :                                                                                                                           agA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA----------------TGTAT----------------------------------------A--CCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catttatatatagagagggtatacaT-ACCACACA-------ATTTGCG----GCTTA--T---T--GATAGATA-GTCAGAGG-CCt
gi|2                          :                                                                                                                                  ACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---GACCGTAA---AATGTAT---AGT-A-AG----------GGTG------ATA-----------CCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACG-----T---AAATGTAAG--GGGG-TATAATTA----TA-TAT--------------------CTACACA-------TTTTACG----GCTTA--T---T--GAAAGAAA-TTCAGAGG-CC--TGA--AGA---TG-ACA
gi|3                          : cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgccaagacca--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTTTATCA---A-TA---AGCCATAG---AATGTGT---AGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--TCCCCTCAA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACTATTCAT---ATAT---AG--AGGA-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-GCTACACA-------ATTTACA----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATAAAA---Taac
gi|4                          :       aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacaAATTCATA-ACCATATTT-TCA--AA-ACT--GAA--ATTTAT--T--AG-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TATAAAGCCATAA---ATTGTGT---GGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AC------T---ATAT---AG--AGGG-GGTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCATACA-------ATTTACGCCCAGCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGGGG-CCTGTGATTAGA---TG-ATATA--TAGTTAAGTAC-AAAtcagtggatggcattggtgacaaggaat
gi|5                          :                                                                                                                           tcg-ACCACAGG-CCTGCT-----G-------AATT-CTATCA---A--A---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATATGGTATA--CCCTCTCT---TA-A-T--AAATA----TAC------------AG------A---ATAT---AG--AGAG-GAT---TA----CATTATGCACCC----------TT-ACCAGCTA-------ATTTACG----GCTTA--T---TAGAATAGAAATTTCAGAGGTCCTGTGCTT
gi|6                          :                                                                                                                                                     aattgtaacTTCTATTA---A-TG---AGCCGTCA---GATGTGCAACGGT-G-AT----------CATGCAATATATGT-GTGTA--TCCCATCTA--TATA-TTTAG--A----TACCCTAACAATTGTAT------TCAAACAT---AG--AGGG-GATA--CAAAAACA-TAT-CACCC----------TT-ACAACAGA-------TTTTACT----GTTTA--T---T--GACAGAAA-TTCAGAGG-CCAGTGAACGGACTGTA-AGATA--TA---AAGTACTAAAacaagtgcattgattggttaagtaattcatta
gi|7                          :                                                                                                                                 CAGAGG-CCT-TT-----GCCCGGAGGATTTCTTTCA---A-TA---AGCCGTAAAAGACTATGTAG-AGC-AGAA----------GGCG-------------ATA--CCCCCTCGC--TATT-T--CA--A----TAC------------AT------T---AC----------CGG-GATA--TA----CA-TATCCACCCTATACTATAGTT-ACTACACATTTTTGTATTCAT-----GCTT---T---T--GATAT-AA-TTCA-AGG-CCTGacatcg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                               aattttaaagcacagctCCTCTGATTGTA-T--AA--AGCCGTGA------------AT------T---AGGT---GGTAAGGGTGATA--TG----TA-TA--AACCC----------T--------CT-------ATTTACG----GCTTAGCT---A--AACAGAAA-TT-AGAGG-ACTGTGctgtgggtttaaatcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggc------T---AAAT---AG--AGGG-TTTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACCTA-------ATTCACG----GCTT---T-------ATACAA---TCAGAGG-TCTGTGtctgtggcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|9                          :                                         ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccgAATTCA-A-AC-AT--TT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-ACCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---AATA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---AG--gcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa





Alignments
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consensus                     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------T---ACAT---AG--AGGG-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
Reference ( family-1537 )     :                                                                         NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACGCATGTAN--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ANTGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------T---ACAT---AG--AGGG-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
gi|1                          :                                                                              TTCA-ATAC-ATGTCTATAATAAA-AGTTCGACTTGTGTACAGT--AGCATCCCAGG-CCC-CT-----G-------A-TTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---A-TACAT-----T-A-CA----------GGTA------ATA----A-A--C-------G--TATT-T--AA------------------------------T---ATAT---AG--AAGG-G-TA--TA----CA-TATTCACCC----------TTTACCACATA-------ATTTACG----GCTTA--TTGAT--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTCTGAGTACA---TGTACAT
gi|1                          :                                                                                 c-A-AT-ATATTA-TCA--GACGAT--G-TACATGTAC--T-------CAGAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCATCAA-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGTAA-AG----------GGTGA-----ATAT-GTATA---CCCTTCTA--TATATT--AA--A----TAC------------GT------T----------------------------------TAT-TACCT----------GT-A--ATGT--------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA--TCAGGGG-CCTGGGATcgtctgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|10                         :                               cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacagtagcAATTCA-A-AC-AT-TTT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-A-CACAGGGCCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---A-TA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---AG--acttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|11                         :                                                                                                                               tTCACTGG-CCT-CT-----G-------CGT--CTG---------A---AGCCGTAC---GATGTGT---AGT-A-AGGCCCACTAAGGGTG------ATAA-GTATAC-CCCCCTCTC--TCCA-T--AA--A----TAC------------AT------ccctg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                         taataataagaatttcatgagcttacttc--TATA----AA--A----TAC------------AT-----------CAT---AG--AAG-------------------T-CACCC----------TT-GCTACACA-------TCTTATG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGA-CAAA---TT-TCATAGCTAATTAatttat
gi|12                         :                                                                                                                                TCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCATAA---GATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------Atgatatctagtacagtgtaaa
gi|13                         :                                                                                                                                             tataaaatacatcatagaagTATCA---A-TA---AGCCATGA---AATGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------ATAT--TATATTCCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------caaatttcatagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|14                         :                                                                                                                                 CACAGG-TTT-TTAGTTTG-------AATTTCCAACA---A-TA---AGCTGCAA---GATGTGT---AGT-A-AT----------GGTG------ATAT-GTAaaaaatatgaggagt
gi|15                         :                                                                                                                           agA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA----------------TGTAT----------------------------------------A--CCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              catttatatatagagagggtatacaT-ACCACACA-------ATTTGCG----GCTTA--T---T--GATAGATA-GTCAGAGG-CCt
gi|2                          :                                                                                                                                  ACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---GACCGTAA---AATGTAT---AGT-A-AG----------GGTG------ATA-----------CCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACG-----T---AAATGTAAG--GGGG-TATAATTA----TA-TAT--------------------CTACACA-------TTTTACG----GCTTA--T---T--GAAAGAAA-TTCAGAGG-CC--TGA--AGA---TG-ACA
gi|3                          : cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgccaagacca--T--AA-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTTTATCA---A-TA---AGCCATAG---AATGTGT---AGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--TCCCCTCAA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACTATTCAT---ATAT---AG--AGGA-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-GCTACACA-------ATTTACA----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATAAAA---Taac
gi|4                          :       aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacaAATTCATA-ACCATATTT-TCA--AA-ACT--GAA--ATTTAT--T--AG-ATCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TATAAAGCCATAA---ATTGTGT---GGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AC------T---ATAT---AG--AGGG-GGTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCATACA-------ATTTACGCCCAGCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGGGG-CCTGTGATTAGA---TG-ATATA--TAGTTAAGTAC-AAAtcagtggatggcattggtgacaaggaat
gi|5                          :                                                                                                                           tcg-ACCACAGG-CCTGCT-----G-------AATT-CTATCA---A--A---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATATGGTATA--CCCTCTCT---TA-A-T--AAATA----TAC------------AG------A---ATAT---AG--AGAG-GAT---TA----CATTATGCACCC----------TT-ACCAGCTA-------ATTTACG----GCTTA--T---TAGAATAGAAATTTCAGAGGTCCTGTGCTT
gi|6                          :                                                                                                                                                     aattgtaacTTCTATTA---A-TG---AGCCGTCA---GATGTGCAACGGT-G-AT----------CATGCAATATATGT-GTGTA--TCCCATCTA--TATA-TTTAG--A----TACCCTAACAATTGTAT------TCAAACAT---AG--AGGG-GATA--CAAAAACA-TAT-CACCC----------TT-ACAACAGA-------TTTTACT----GTTTA--T---T--GACAGAAA-TTCAGAGG-CCAGTGAACGGACTGTA-AGATA--TA---AAGTACTAAAacaagtgcattgattggttaagtaattcatta
gi|7                          :                                                                                                                                 CAGAGG-CCT-TT-----GCCCGGAGGATTTCTTTCA---A-TA---AGCCGTAAAAGACTATGTAG-AGC-AGAA----------GGCG-------------ATA--CCCCCTCGC--TATT-T--CA--A----TAC------------AT------T---AC----------CGG-GATA--TA----CA-TATCCACCCTATACTATAGTT-ACTACACATTTTTGTATTCAT-----GCTT---T---T--GATAT-AA-TTCA-AGG-CCTGacatcg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                               aattttaaagcacagctCCTCTGATTGTA-T--AA--AGCCGTGA------------AT------T---AGGT---GGTAAGGGTGATA--TG----TA-TA--AACCC----------T--------CT-------ATTTACG----GCTTAGCT---A--AACAGAAA-TT-AGAGG-ACTGTGctgtgggtttaaatcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggc------T---AAAT---AG--AGGG-TTTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACCTA-------ATTCACG----GCTT---T-------ATACAA---TCAGAGG-TCTGTGtctgtggcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|9                          :                                         ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccgAATTCA-A-AC-AT--TT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-ACCACAGG-CCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---AATA---AGCCGTAA---ATTATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---AG--gcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa


blockSeqs                     :                                                                                  T .  C  A   . C .   C   AACG        ATCCAA    T      G   G  AGTTT CCCGGAG           TCA A  TAA        AAGAC     AACG  A G  GCCCACTAAG    CAATAT   TGG    TT        GAT    TTT   AT GCCG   CCTAACAATTGTATTCAAACAT           TA    TATAAT   AAAA  T   G     TATACTATAG  .  T     TTTTTGT       CCCA     GC TAG           T        T       TT   CTG  .     .   G        T
blockSeqs                     :                                                                                  . .  .  A   . G .   .   AACG        ATCCAA    T      .   .  .     .                 .   .  .          AT        AGA   . .  .             A        TG     C         A      TT    .  .      ACTATTCATATAT                    .     TGATA    .     .   C     .           .  C     .             .        .  T             .        .       TA   .    .     .   .         
blockSeqs                     :                                                                                  . .  .  .   . C .   .   GTA         TTAG      T      .   .  .     .                 .   .  .          AT        G     . .  .             .        TG     .         C      T     .  .      ACGTAAATGTA                      .     GATA     .     .   .     .           .  T     .             .        .  T             .        .       TT   .    .                   
blockSeqs                     :                                                                                  . .  .  .   . G .   .   GAA         CT        T      .   .  .     .                 .   .  .          GA        G     . .  .             .        AG     .         C      T     .  .      ATTACAG                          .     GGTA     .     .   .     .           .  T     .             .        .  T             .        .       TT   .    .                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                T      .   .  .     .                 .   .  .          GA        A     . .  .             .        TG     .         A      T     .  .      ACTATAT                          .     GATA     .     .   .     .           .  C     .             .        .  T             .        .       AC   .                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                C      .   .  .     .                 .   .  .          AA        A     . .  .             .        TG     .         A      T     .  .      AGAATAT                          .     GATA     .     .   .     .           .  C     .             .        .  T             .        .       C                             
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Reference ( family-1537 )     :                                                                   NNNAATTCA-A-AC-ATATTT-TNA--AA-AAT--GACACATGTAN--T--AG-ATCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAAAA---TGTGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------T---ACAT---AG--AGGG-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACACA-------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAGA---TG-ACATA--TAGTTAAGTACTAAA
gi|1                          :                                                                        TTCA-ATAC-ATGTCTATAATAAA-AGTTCGACTTGTGTACAGT--AGCATCC-CAGG-CCC-CT-----G-------A-TTTCTATCA---A-TA---AGCCGTAAA----TACAT-----T-A-CA----------GGTA------ATA----A-A--C-------G--TATT-T--AA------------------------------T---ATAT---AG--AAGG-G-TA--TA----CA-TATTCACCC----------TTTACCACATA-------ATTTACG----GCTTA--TTGAT--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTCTGAGTACA---TGTACAT
gi|1                          :                                                                           c-A-AT-ATATTA-TCA--GACGAT--G-TACATGTAC--T-------CA-GAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCATCAA-TA---AGCCGTAAAT---TATGT---GGTAA-AG----------GGTGA-----ATAT-GTATA---CCCTTCTA--TATATT--AA--A----TAC------------GT------T----------------------------------TAT-TACCT----------GT-A--ATGT--------ATTTACG----GCTTA--T---T--GATAGAAA--TCAGGGG-CCTGGGATcgtctgataatatattacttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
gi|10                         :                         cttcaatacatgtctataataaaagttcgacttgtgtacagtagcAATTCA-A-AC-AT-TTT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-A-CA-CAGGGCCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---A-TA---AGCCGTAAAT---TATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---AG--acttactgaccgcttaatacggtgaaataaatttgtttagtcgggcaagctttttggaaagctaaattacttgtt
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                    taataataagaatttcatgagcttacttc--TATA----AA--A----TAC------------AT-----------CAT---AG--AAG-------------------T-CACCC----------TT-GCTACACA-------TCTTATG----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGA-CAAA---TT-TCATAGCTAATTAatttat
gi|12                         :                                                                                                                          TCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---AGCCATAAGA---TGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------Atgatatctagtacagtgtaaa
gi|13                         :                                                                                                                                        tataaaatacatcatagaagTATCA---A-TA---AGCCATGAAA---TGTGT---AGC-A-AG----------GGTG------ATAT--TATATTCCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AT------caaatttcatagctaattatgatatctagtacagtgtaaa
gi|14                         :                                                                                                                           CA-CAGG-TTT-TTAGTTTG-------AATTTCCAACA---A-TA---AGCTGCAAGA---TGTGT---AGT-A-AT----------GGTG------ATAT-GTAaaaaatatgaggagt
gi|15                         :                                                                                                                      ag-ATCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-T-------------A---TGTAT----------------------------------------A--CCCTCTCTA--TATA-T--AA--A----T
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATTAtat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         catttatatatagagagggtatacaT-ACCACACA-------ATTTGCG----GCTTA--T---T--GATAGATA-GTCAGAGG-CCt
gi|2                          :                                                                                                                    --AG-ACCAACAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TA---GACCGTAAAA---TGTAT---AGT-A-AG----------GGTG------ATA-----------CCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACG-----T---AAATGTAAG--GGGG-TATAATTA----TA-TAT--------------------CTACACA-------TTTTACG----GCTTA--T---T--GAAAGAAA-TTCAGAGG-CC--TGA--AGA---TG-ACA
gi|3                          : cagggagcatctaatggcttgtaggtcatgaccatactgggtgttagtcacaaacattcaattcatatcgagatcctgacttaattaattcaacccaattcactgagtgcca--T--AA-ATCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AATTTTTATCA---A-TA---AGCCATAGAA---TGTGT---AGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--TCCCCTCAA--TATA-T--AA--A----TAC------------ACTATTCAT---ATAT---AG--AGGA-GATA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-GCTACACA-------ATTTACA----GCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGAGG-CCTGTGATAAAA---Taac
gi|4                          : aatattgacaccattagtcagactcaaatcaggtaaaatttgataagaataagaccatgagttttaacaAATTCATA-ACCATATTT-TCA--AA-ACT--GA-A-ATTTAT--T--AG-ATCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AATTTCTATCA---A-TATAAAGCCATAAAT---TGTGT---GGT-A-AG----------AGTG------ATAT-GTATA--CCCCCTCTA--TATA-T--AA--A----TAC------------AC------T---ATAT---AG--AGGG-GGTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCATACA-------ATTTACGCCCAGCTTA--T---T--GATAGAAA-TTCAGGGG-CCTGTGATTAGA---TG-ATATA--TAGTTAAGTAC-AAAtcagtggatggcattggtgacaaggaat
gi|5                          :                                                                                             tcg-AAT--G-CACTTGTAC----------CA-CAGG-CCTGCT-----G-------AATT-CTATCA---A--A---AGCCGTAAAT---TATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATATGGTATA--CCCTCTCT---TA-A-T--AAATA----TAC------------AG------A---ATAT---AG--AGAG-GAT---TA----CATTATGCACCC----------TT-ACCAGCTA-------ATTTACG----GCTTA--T---TAGAATAGAAATTTCAGAGGTCCTGTGCTT
gi|6                          :                                                                                                                                                aattgtaacTTCTATTA---A-TG---AGCCGTCAGA---TGTGCAACGGT-G-AT----------CATGCAATATATGT-GTGTA--TCCCATCTA--TATA-TTTAG--A----TACCCTAACAATTGTAT------TCAAACAT---AG--AGGG-GATA--CAAAAACA-TAT-CACCC----------TT-ACAACAGA-------TTTTACT----GTTTA--T---T--GACAGAAA-TTCAGAGG-CCAGTGAACGGACTGTA-AGATA--TA---AAGTACTAAAgattggttaagtaattcatta
gi|7                          :                                                                                                                           CA-GAGG-CCT-TT-----GCCCGGAGGATTTCTTTCA---A-TA---AGCCGTAAAAGACTATGTAG-AGC-AGAA----------GGCG-------------ATA--CCCCCTCGC--TATT-T--CA--A----TAC------------AT------T---AC----------CGG-GATA--TA----CA-TATCCACCCTATACTATAGTT-ACTACACATTTTTGTATTCAT-----GCTT---T---T--GATAT-AA-TTCA-AGG-CCTGacatcg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                          aattttaaagcacagctCCTCTGATTGTA-T--AA--AGCCGTGA------------AT------T---AGGT---GGTAAGGGTGATA--TG----TA-TA--AACCC----------T--------CT-------ATTTACG----GCTTAGCT---A--AACAGAAA-TT-AGAGG-ACTGTGctgtgggtttaaatcc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggc------T---AAAT---AG--AGGG-TTTA--TA----CA-TAT-CACCC----------TT-ACCACCTA-------ATTCACG----GCTT---T-------ATACAA---TCAGAGG-TCTGTGtctgtggcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa
gi|9                          :                                   ggccacagtcctctaatttctgtttagctaagccgAATTCA-A-AC-AT--TT-TGA--AA-AAT--AACGCATGTAA--TCCAA-ACCA-CAGG-CCT-CT-----G-------AATTCCTATCA---AATA---AGCCGTAAAT---TATGT---GGT-A-AG----------GGTG------ATAT-GTATA--CCCTCTCTC--TATA----AA--A----AAC------------AT------T---ACAG---AG--gcaggactctctggctaacaatttatcttgttacaaatatttaaa