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gi|11 : agaggtttagcaaT-A-CGTGTACT-T--T--A-CA--------------------C-GT-TT-------GTGGAT-A--CTGTA-----GAA----ATA---TG-T--CA-TC-AAC-G-------------AA-A-CTTATGACG---T---AAT-G-CCA-TATTT--CT---A-aagtaacaacgtgtagcttatagtttcttattttttgcttaattctgtgaccgtgtgcatttttctgaaagctgaggatctttagcatatattgatgcaaaggtataaaaatt
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Reference ( family-1503 ) : GAGGTTTAGCAANT-CAA-CG-TGT-A-CGCGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TAT--A-AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GTGTC--TAAAAAC---------C--ACGT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--C-AAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
gi|1 : TTTAGCAATTTCAAGCG-TGT-AACGTGTACTTCGT--AGCGA-------------------T-GT-ATC-AGGAGAGTTAACCCTACGGGAAAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCAGGGCTAC-G-TTT-TGAAATT--GAT-GACACTAGTT--CTTAGATCA--AG-TTTATTTAAC--CAGCA------AAC-GT-------G-T-------A-------ATAG-------TGCGATAATGTCAC-----C------CG--TAC--A-GGGATGGCGCGAGCGAAT-A----------ACA-AA--C--GTG--------TA--G--C-TATCCATAGAATTTTCTT----------A-------------T--------------T---TTCTTG-TTT------A-----A-G-TCCTGGTGTAAC--CATG-TG--C--GTT---TCT-CTGTAAAG--CTGGGTAA-----ATTTTATAGCAAACCATATCCT-GATTGC-A--A---A---GGA---AA-T-AAA-CA-AT--T--TGGTGGG-AAATG-ACAGAAGATC-TGTATAGG-GAGTC--TAAAAAT---------C--ACAT--GTCTTTATT-TATT---C-A-AAAAGCCGGGTG-A-TTTT-A-C---AGAGGTACACGCGTA-----C--------ACCGT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-G-G-TGGGA-ACTG-ACACAGCGTA--G-AAGT-A-C-GCG
gi|10 : gccT-AC-G-TCG----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------TGCAAAGT----AC-----A------CG--TA-----AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------TCATAGTTCTTTTTTT---T----T-TTT------ATATCAA-T-TC----TGTGAC--TGTG-TG--T--GTT---T-T-CTG-AA-G--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AA--CA-TT--T--TTAGGA--AAA-G-A---AATATC-T-T-TAGG-GTGT---TAAAAAC---------T--ACAT--GTCTACATT-T--T---C-A-AAA--CAT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------ACACATAGCAA--GTGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-GAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-GCACA-CGTA--C-AAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTAG-TT-TGCTA-gta
gi|11 : tgTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG---GCA-TT-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA---G-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TATT-A-AG---------------T-A----------A-A-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC---GTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--T--GGGG-AAA-A-G---AAAATC-T-T-TAGG-GAGTC--TAAAAAC---------C--A--T--GTCTTTATT-T--T---CAA-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GT------C--------AC-GT--------A------ACAA--AGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA----GTG-----A-ACTG-ACACA-TGTA--A-AAGT-A-C-GCGT-ACAAATT-G-TG-TGCTA-A-A--CCTCTC
gi|12 : TAGCAAAT-CAA-CG-TGT-A-CGCGCACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CTATA-----GAG----ATA---TG-T-GCA-TA-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CA---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------C-----------GCAGAGTA------CA--TGT--T-AG---------------T-T----------A-A-A---T--GTGGCTCACAATT--T--C-T----------------T----------A-------------T--------------TTGAT----G-TTT------A-----A-T-TA----TGTGAC--CATG-TG--C--GTT---TTT-CTG-AAAA--ATGAA--A-----ATT-------------TAT--T-G-C-GT-A--A---A---G-A----------------------------------------AAAATC-T-T-TAAG-GTGTC--TAAAAA----------G--ACGT--GTCTTCATT-T--T---C-A-AAA--CAT--TT-G-TTAT-A-C---AA----------GCA-----C--------AC-GT--------A------GCAC--GTGT-AA----A-AC--AA-GGAA--T-GTA---A--T----GT--G---------TA--C-GTG-T---G-AATG-
gi|13 : GAGGTTTAGCGATT-CAA-AG-TGT-A-CGTGTACTN-NN--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCT-GT-ATC-AGGGGATT---CCCGA-----GAA----ATA---TGTT-GCA-TT-AC-GATCA----
gi|13 : agaGGG--G-----ATTCC-CGAGAAA---TAT----GTT-GC-ATTA---C---G-ATCAAA-T-AAAACA-TT--A--TGGAGGG-GGG-G-G---GA--TC-T-T-TAGGTGTGTCC-TAAAAAC---------CCAACGT----CTTTATT-T--TGGCC-ATAAA--CCT--TTTG-TTTT-A-C---AA----------GTA--------------A--GT--------AG-----GCAA--GGGC-TT----A-AC--GA-GAAA--T-GTA---A--T----GT--G---------GAACC-GTG-TATCA-ACT--ACACT-TGTA--C-AAGTGA-C-GCGTAACAAG-TGA-TTGTGCTA-A-A--aataaaacattatggagggggggggatctttaggtgtgtcctaaaaacccaacgtctttattttggccataaaccttttgttttacaagtaagtaggcaagggcttaacgagaaatgtaatgtggaaccgtgtatcaactacacttgtacaagtgacgcgtaacaagtgattgtgctaaacat
gi|14 : agagaggtttagcgattcaaagtgtacgtgtactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtatca-CG--------------------T-GC-ATC-AGGGGATTC--CTCTA-----AAA----ATA---TG-T-GTA-TT-TC-G-TAA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAC-GGCA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AGCACAGAGT-----------AC-----A------CG--TA-----AG---------------T-A----------ACA-A---CTTGTA--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------TAATTTCTTATTTT-T---T----G-TTT------C-----A-T-CC----TCTGGC--CGTG-TG--C--GAT---TTT-CTG-AAAG--C------------AT----------A---TAC--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--CGGGGGG-TAA-G-A---ACAATC-T-T-TAGG-GTGTT--CAAATAC---------at
gi|15 : agaggtttggcaaaaccgggggcaaaacgGAGGTTTAGCAATT-TAA-CG-TGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATG---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAG-G-CTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AA-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-TAAAGTGCA-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG----T--A-AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------ATAGTTTCTTATTTT--------------T---T----G-CTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--ATT---TTT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATCTT-TAGCATA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-G---TA-T-AAA-AA-TT--a
gi|16 : aGAGTTTTAACAAAC-CAA-CG-TGT-G-CGTGTATTT-TTT-A-CG--------------------T-GT-TGC-AGGGGATGT--TCCCA-----GAA----A-A---TG-T-GCA-TT----G-TCA----TAATA-TTA-AG---TT-------------TTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------CAC-GT-------G-T-------C-------A-AG-------T-----------GC-----A-------GAACAT--A-CG---------------T-A----------AAA-ATATC--TTGACAC----TA--A--C-A----------------T------------------------T--------------T---T----T-TTT------A-----ATT-TC----TG-G-----GT--TT--T--TTT---TTT-CTT-AACT--CTGAA--G-----ATTTA-TAG
gi|17 : CA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------TAGTTTCTTATTTT-T---T----G-CTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--ATT---TTT-CTG-AAAG--CTGAG--A-----ATTTC-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---TA-T-AAA--A-TT--T--AGGGGGG-----G-G---GGATTC-T-T-TAGT-GTGTC--TAAAAAC---------C--ACAT--GTCTTTATT-T--T---C-C-AAA--CCT--T
gi|18 : gcaatt--CCCTA-----GAA----ATG---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAC-G-TTT-CG---TT--GAT-GAAA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-AT-------G-C-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG----T--A-AG---------------T-A----------AGA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A----------------------------T---A----G-TTT------C-----T-T-TT----TGTGAC--C-TGTTG--C--GTT---TTT-CTG-AAAG--CTGAC--G-----ATATT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-ctatgag
gi|19 : GCTAA---TAT--T---T-GT-A--ATTTA-----A---AA-G-AAA-CA-TT--T--TTCAATG-AAA-A-AC--AAAATC-T-G-TAGG-GTTTC--TAAAAA----------C--AC--------TAATC-T--------A-AG--------TT-C-TTTT-A-C---AT----------GTA-----C--------AA-GT--------A-------CA------C-AA----A-AC--AA-GATA--TGTAATGTA--T----AT--GTTTGATACTAA--C-CTG-T---A-ATTT-ACACA---TA--C-AAGT-A-C-GC
gi|2 : gAGCAATT-CAC-CG-TGTTA-CGTGTACTT-GTGTA-CG--------------------TTGTCATC-GGGGGATCC--CC--------GAA----TCACTTTG-T-GCA-TT-AC-G-TGG----TAA-GCTTT-CG---TT--GAAAGACA-TATTTACCA---A-CATAAG-T--ATGGC-T--CA-CGTGTATCAAA-GT-------GGC-------A-------A-AG-------T-----------A------A------CG--TG---A-AG---------------TTA----------ACATA---TCTGTG--------TA--GGCT-T----------------T----------A-------------TAGTTTCGTTATTT-T---T----G-TTT------ACAGAAG-TGTC----TGT-----CGCG-TG--GAAGCTAAATCT-TTC-GAAG--CGTAG--GCGTTCATTTT-TAGCAAA---TAT--TTGAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAG-CA-TTGGT--TGGGGGG-CAA-A-G---AAAATC-T-T-TAGG-GGGTC--TAGAAAC---------C--ATGT--GTCTTTATT-T--T---A-A-AAA--GCT--TT-G-TTTC-A-CAATAA----------GCAGCTACC--------AC-GT--------A------GCAA--AGGG-TA----A-ACCGGA-GAAA--T-TAA---A--CTCGAAT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-CAACA-CGTA--G-AAGT-A-C-GCGT---AAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
gi|20 : C-GT--------A------GCAA--GGGC-TA-------C--GA---AA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA----GTG-T---A-AATG-A-ACA-CGTAT-C-AAGT-A-C--TGT-ACAAGTTGG--T-TGCT--A-A--CCTCT
gi|21 : atctagaagtacatgcattgtgataataagT-G-TTTT-A-C---AA----------GCA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TATTGAA-AC--AA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-ATG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--G-AAGT-A-C-GCGT-ACACGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTCtctaatataatatgta
gi|22 : AGGTTTAGCAAAT-CGA-TG-TGT-A-CA------------------------------------T-GT-ATC-AGGGAATTC--CCCCA-----TAA-----------------A-CT-AC-A-TCA----TGC-A-TTT-TG---TC--AAC-AACA-TATAT--CT---A-
gi|23 : aCACA-CGTA--C-AAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGGCTT-TGCTA-A-AACCTTCTC
gi|24 : -A-C-GTGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
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gi|4 : cgGAGGTTTAGCAAAT-CAA-CG-TGT-A-CGTGTACTT-GT--G-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TTA----T-A-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------CAT-GT-------G-T-------A-------A-AG-------C-----------AT-----A------GA--TCT--AGAG---------------T-ACGCGTACGATACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------ATAGTTTCATATTTT--------------C---T----G-TTT------A-----A-T-AC----CGTGAC--CATC-TG--T--CTT---TTT-CTG-CAAG--TTGAA--G-----ATTTA-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-TAAAA-CGTTT--T--TTTGGAG-AAG-A-A---AAAATG-T-G-TAGG-ATTTC--TAAAAA----------C--ACGT--ATCTTTATT-T--T---C-A-CAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------ACACGTTGCGA--GTGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-ATA---A--T----GT--G---------TA--C-ATG-T---G-ACTA-ATACA-GGTA--CTTAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGGTA-A-A--CCTC
gi|5 : GTTTAGCAATT-CAA-CG-TGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG----------------------GT-ATC-GGGGGAGTC--CC-TA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AA-C-TCA----TAA-G-TTTTCG---TT--GA--GACA-TATTT--CT---A-CA--AG----AT----C--CA-CA------AAC-GTTGTAAGTG-C-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TA-----AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG---------A--G--C-T----------------TTATGTTTCTTA-------------TGTTT----------T---T----G-TTT------A-----A-T-T------GTGACGGCGGG-TGAGC--GTT---TTTTCTG-AAAG--CTGAG--G-----A-TTT-TAGCAAA---TAT--TGGAT-GCAA--A---A---G-A---AA-A-TAA-CA-TT--A--AAGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-G-GTC--TAAAAAC---------C--ATGT--GTCTTTA-T-T--T---C-A-AAA--GCT--TT-G-TTTC-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------ACACGT-ACAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---AAGT----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACT--ACACA-CGTATGT-AAGT-A-CGGCGT-ACAAGTTGGTTT-TGCTACACA--CCTCT
gi|6 : GAGGTTTAGCAATT-CAA-CG-TGT-A-TGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TATTAA-AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGT-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GAGTC--TAAAAAC---------C--ACAT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-GTTTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------ACAA--AGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-TGTA--A-AAGT-A-C-GCGT-ACAAATTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
gi|7 : GAGGTATAGCAATT-CAA-CG-TGT-A-CATGTACTT-GT--A-----------------------------TC-AGGGGATTC--CCGTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAT-GT-------G-T-------ATAGTGCAA-AG-------T-----------AC-----A------C----AT--A-AG---------------T-A----------ACA-A---T--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------TAGTTTCTTATTT--T---T----GGTTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--ATT---TCT-CTA-AAAG--CTGAT--G-----ATTTT-TGGCA------------------------------G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AGA-G-A---AAA-TC-T-T-TAGG-GAGTC--TAAAAAC---------C--ACAT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----CACGTAC--AC-GT--------A------GCAA--AGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-TGTA--G-AAGT-A-T-GCGT-ACAAGTTGC-TT-TGCTA-A-A--CATC
gi|8 : GTTTCGCAAGT-TCA-CGGTTT-A-CGTGTACTT-GT--A-------------------------AT-TTC-AGG--ATTC--CTC--------AG----ATG---TG-T-GCA-TT-ACCG-TAT----TAA-G-TTT-CAGTTTT--GAT-AACA-TGTTT--C----A-CA--AGGT--AT----C--CAACA------AGC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------GC-----AGGTTACCG--T-T--A-AG---------------T-A----------GT----------TGTTC-----TAT-G--T-T----------------T------------------------T--------------T---T----G--TT------A-----A-T-TT----TGT-AC--T-TG-TG--C--GTT-----T-CTG-AAAGATCTGAG--GTT---TTTTT-TAGC-AA---T-T--T-GAT-GCAA--A---A---G-A---AC-T-AAC-CA-TT--T--TTGGAGG-AAAGG-A---AAAATT-G-C-T--G-GTGTC--TAAAGAC---------CATACG---GTCTTCATTAT--T---C-A-A------T--CT-A-TTAT-A-C---AAAGTACCC---GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GTGC-TA----ATGC--GA-GAAA--T-GAA---A--T----GT--G---------TA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CATA--C-AAGT-A-C-TCGT-ACAAGTTG
gi|9 : gaTAGCAATT-CAA-CG-TGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT--TC-AGGAGATTC--CCCTA-----GAA-----TA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----CAC-G-TTT-TG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A--A--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------GC-----AAAGTT-CA--CGT--A-AG---------------T-A----------AC--A---C--GTG--------TA--G--CTT----------------T----------AGTTCTTTATTT--T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-CC----TGTA----CATG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTG-G--G-----ATTTT---GC-AA---TAA--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AA----A---AAAATC-T-T-TAGG-GAGTC---AAAA-----------T--ACAT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G--TTT-A-C---AA----------GTA-----CACGCGTTAAC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AG--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GTA-G---------GA--C-GTGTT---A-ACTG-A-ACA-CGTA--G-AAGT-A-C-GCGT-ACAA
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Reference ( family-1503 ) : GAGGTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--A-GT--AT----C--C-A-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TAT--A-AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GTGTC--TAAAAAC---------C--ACGT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--NAAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
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Reference ( family-1503 ) : GAGGTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--A-GT--AT----C--C-A-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TAT--A-AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GTGTC--TAAAAAC---------C--ACGT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--NAAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
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gi|4 : cgGAGGTTTAGCAA-AT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--G-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TTA----T-A-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--A-GT--AT----C--C-A-CA------CAT-GT-------G-T-------A-------A-AG-------C-----------AT-----A------GA--TCT--AGAG---------------T-ACGCGTACGATACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------ATAGTTTCATATTTT--------------C---T----G-TTT------A-----A-T-AC----CGTGAC--CATC-TG--T--CTT---TTT-CTG-CAAG--TTGAA--G-----ATTTA-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-TAAAA-CGTTT--T--TTTGGAG-AAG-A-A---AAAATG-T-G-TAGG-ATTTC--TAAAAA----------C--ACGT--ATCTTTATT-T--T---C-A-CAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------ACACGTTGCGA--GTGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-ATA---A--T----GT--G---------TA--C-ATG-T---G-ACTA-ATACA-GGTAC-TTAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGGTA-A-A--CCTC
gi|5 : GTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG----------------------GT-ATC-GGGGGAGTC--CC-TA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-AC-TCA----TAA-G-TTTTCG---TT--GA--GACA-TATTT--CT---A-CA--A-G---AT----C--C-A-CA------AAC-GTTGTAAGTG-C-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TA-----AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG---------A--G--C-T----------------TTATGTTTCTTA-------------TGTTT----------T---T----G-TTT------A-----A-T-T------GTGACGGCGGG-TGAGC--GTT---TTTTCTG-AAAG--CTGAG--G-----A-TTT-TAGCAAA---TAT--TGGAT-GCAA--A---A---G-A---AA-A-TAA-CA-TT--A--AAGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-G-GTC--TAAAAAC---------C--ATGT--GTCTTTA-T-T--T---C-A-AAA--GCT--TT-G-TTTC-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------ACACGT-ACAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---AAGT----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACT--ACACA-CGTATGTAAGT-A-CGGCGT-ACAAGTTGGTTT-TGCTACACA--CCTCT
gi|6 : GAGGTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-TGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--A-GT--AT----C--C-A-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TATTAA-AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGT-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GAGTC--TAAAAAC---------C--ACAT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-GTTTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------ACAA--AGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-TGTA--AAAGT-A-C-GCGT-ACAAATTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
gi|7 : GAGGTATAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CATGTACTT-GT--A-----------------------------TC-AGGGGATTC--CCGTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--A-GT--AT----C--C-A-CA------AAT-GT-------G-T-------ATAGTGCAA-AG-------T-----------AC-----A------C----AT--A-AG---------------T-A----------ACA-A---T--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------TAGTTTCTTATTT--T---T----GGTTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--ATT---TCT-CTA-AAAG--CTGAT--G-----ATTTT-TGGCA------------------------------G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AGA-G-A---AAA-TC-T-T-TAGG-GAGTC--TAAAAAC---------C--ACAT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----CACGTAC--AC-GT--------A------GCAA--AGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-TGTA--GAAGT-A-T-GCGT-ACAAGTTGC-TT-TGCTA-A-A--CATC
gi|8 : GTTTCGCAAGTT-CAC-GGTTT-A-CGTGTACTT-GT--A-------------------------AT-TTC-A--GGATTC--CTC--------AG----ATG---TG-T-GCA-TT-ACCG-TAT----TAA-G-TTT-CAGTTTT--GAT-AACA-TGTTT--C----A-CA--AGGT--AT----C--CAA-CA------AGC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------GC-----AGGTTACCG--T-T--A-AG---------------T-A----------GT----------TGTTC-----TAT-G--T-T----------------T------------------------T--------------T---T----G--TT------A-----A-T-TT----TGT-AC--T-TG-TG--C--GTT-----T-CTG-AAAGATCTGAG--GTT---TTTTT-TAGC-AA---T-T--T-GAT-GCAA--A---A---G-A---AC-T-AAC-CA-TT--T--TTGGAGG-AAAGG-A---AAAATT-G-C-T--G-GTGTC--TAAAGAC---------CATACG---GTCTTCATTAT--T---C-A-A------T--CT-A-TTAT-A-C---AAAGTACCC---GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GTGC-TA----ATGC--GA-GAAA--T-GAA---A--T----GT--G---------TA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CATA--CAAGT-A-C-TCGT-ACAAGTTG
gi|9 : gaTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT--TC-AGGAGATTC--CCCTA-----GAA-----TA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TCA----CAC-G-TTT-TG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A--A--A-GT--AT----C--C-A-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------GC-----AAAGTT-CA--CGT--A-AG---------------T-A----------AC--A---C--GTG--------TA--G--CTT----------------T----------AGTTCTTTATTT--T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-CC----TGTA----CATG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTG-G--G-----ATTTT---GC-AA---TAA--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AA----A---AAAATC-T-T-TAGG-GAGTC---AAAA-----------T--ACAT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G--TTT-A-C---AA----------GTA-----CACGCGTTAAC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AG--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GTA-G---------GA--C-GTGTT---A-ACTG-A-ACA-CGTA--GAAGT-A-C-GCGT-ACAA
blockSeqs : G . . T . . GT . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCT CA T . A CACT CTT T T G G C A . T C T GTT TC A . AC . . TA G . GGC AT A . TGTATC T TGTAAGT G AAAGTGCA . TGCAAAGTACACGTA . T CGCGTACGAT T TATC GCTCACAA TT GC T TATCATAGTTCTTTTTT TGA CTTA G TCTCTTA T G . GG T AG AA AAA C T . AT . CGTTC . . . T . A TT TTT ACA . TCA G A A T GG AC T T AAC C . . T T CG CAAAAGAGCGC A TA A . GGC A T . A T T T T AAT AGTACCC CACGCGTTA . CCCACACTAC AT G TTGA C CG T GC G TGT AG TCGA TG TTTGATACT AC C T ATC C T . TGT G T G A C G C C AC
blockSeqs : . . . . . . T . TT A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTAAA . ATAGTGCA . CGCAGAGTACATGTT . . . . CTT ACAC T . . TTATGTTTCTTATGTTT . . . ATATCA . . . . . . . . T . . . . TT . . . G . A . . . . . . . . . . . G . GCA . . . . A C CCCA G . . . . . . . . . . . . . . CACGTAC . ACACATA . . . T . . . . . A . A . . . . . . . . TC . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . CACAGAGTACACGTA . . . . TCT TTC . . . TATAATTTCTTATTTT . . . ACAGAA . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . GGA . . . . T . CCAT G . . . . . . . . . . . . . . GCTACC . ACACGTT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TGCAGGTTACCGTTA . . . . C . . . . TATAGTTTCTTATTTT . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . T . CT A . . . . . . . . . . . . . . C . ACACGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TGCAAAGTTCACGTA . . . . C . . . . TATAGTTTCTTATTTT . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . AG . . . . T . CC G . . . . . . . . . . . . . . C . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TACACGTATTAA . . . . T . . . . TATAGTTTCGTTATTT . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . GG . . . . T . CC A . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TACACGTATTA . . . . C . . . . TATAGTTTCATATTTT . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . T . CC G . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . TGCAGAACATA . . . . C . . . . TATAGTTTCTTATTT . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GG . . . . G . CC G . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . CATAGATCTAG . . . . C . . . . TAGTTCTTTATTTT . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . AG . . . . T . CC A . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TACACGTAG . . . . T . . . . TAAGTAGT . . . C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . AA . . . . T . CC A . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TACACGTA . . . . C . . . . TAT . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . A . G G . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TACACGTA . . . . C . . . . TAT . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GA . . . . A . C A . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TAACGTGA . . . . C . . . . TAT . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TACACGTA . . . . T . . . . TT . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . TACACATA . . . . C . . . . TA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : T********************* ** ***** **** *** *** ** **** TACACGTA************************************ *************** C***** **** **** ** *** ** GA***** ** ** ** ********** ***
originalCons : GAGGTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--A-GT--AT----C--C-A-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AG-------T-----------AC-----A------CG--TAT--A-AG---------------T-A----------ACA-A---C--GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GTGTC--TAAAAAC---------C--ACGT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--NAAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
finalCons : GAGGTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CGT---------------------GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-A-CG-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--A-GT--AT----C--C-A-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-AGTACACGTA------------------------------------AG---------------T-A----------ACA-AC-----GTG--------TA--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-TAGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AAAGA-----AAAATC-T-T-TAGG-GTGTC--TAAAAAC---------C--ACGT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--NAAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
Alignments
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consensus : GAGGTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-------AG-------------T-----------A-------C---A------CGT-A-----------------AGT-AACA-A---C--GTG--------T---A--G--C-T----------------T----------A-------------T--T-----------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-T--AGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GTGTC--TAAAAAC---------C--A--CGT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--NAAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
Reference ( family-1503 ) : GAGGTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-------AG-------------T-----------A-------C---A------CGT-A-----------------AGT-AACA-A---C--GTG--------T---A--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-T--AGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--TGGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-GTGTC--TAAAAAC---------C--A--CGT--GTCTTTATT-T--T---C-A-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACTG-ACACA-CGTA--NAAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
gi|1 : TTTAGCAA-TTTCAAGCGTGT-AACGTGTACTTCGT--AGCGA-------------------T-GT-ATC-AGGAGAGTTAACCCTACGGGAAAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCAGGGCTAC-G-TTT-TGAAATT--GAT-GACACTAGTT--CTTAGATCA--AG-TTTATTTAAC--CAGCA------AAC-GT-------G-T-------A-------AT------AG-------------TGCGATAATGTCA-------C---C------CGT-ACAGGGATGGCGCGAGCGAAT-AACA-AA--C--GTG--------T---A--G--C-TATCCATAGAATTTTCTT----------A-------------T--------------T---TTCTTG-TTT------A-----A-G-TCCTGGTGTAAC--CATG-TG--C--GTT---TCT-CTGTAAAG--CTGGGTAA-----ATTTTAT--AGCAAACCATATCCT-GATTGC-A--A---A---GGA---AA-T-AAA-CA-AT--T--TGGTGGG-AAATG-ACAGAAGATC-TGTATAGG-GAGTC--TAAAAAT---------C--A--CAT--GTCTTTATT-TATT---C-A-AAAAGCCGGGTG-A-TTTT-A-C---AGAGGTACACGCGTA-----C--------ACCGT--------A------GCAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA--C-G-G-TGGGA-ACTG-ACACAGCGTA--GAAGT-A-C-GCG
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gi|11 : tgTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG---GCA-TT-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA---G-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-------AG-------------T-----------A-------C---A------CGT-ATTA--------------AGT-AA-A-A---C--GTG--------T---A--G--C-T----------------T----------A-------------T--------------T---T----G-TTT------A-----A-T-TC----TGTGAC---GTG-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATTTT-T--AGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--T--GGGG-AAA-A-G---AAAATC-T-T-TAGG-GAGTC--TAAAAAC---------C--A----T--GTCTTTATT-T--T---CAA-AAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GT------C--------AC-GT--------A------ACAA--AGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---A--T----GT--G---------GA----GTG-----A-ACTG-ACACA-TGTA--AAAGT-A-C-GCGT-ACAAATT-G-TG-TGCTA-A-A--CCTCTC
gi|12 : TAGCAA-AT-CAA-CGTGT-A-CGCGCACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CTATA-----GAG----ATA---TG-T-GCA-TA-AC-G-TCA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CA---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------AAGCGCAGAG-------------T-----------A-------C---A------TGT-T-----------------AGT-TA-A-A---T--GTGGCTCACAAT---T--T--C-T----------------T----------A-------------T--------------TTGAT----G-TTT------A-----A-T-TA----TGTGAC--CATG-TG--C--GTT---TTT-CTG-AAAA--ATGAA--A-----ATT---------------TAT--T-G-C-GT-A--A---A---G-A----------------------------------------AAAATC-T-T-TAAG-GTGTC--TAAAAA----------G--A--CGT--GTCTTCATT-T--T---C-A-AAA--CAT--TT-G-TTAT-A-C---AA----------GCA-----C--------AC-GT--------A------GCAC--GTGT-AA----A-AC--AA-GGAA--T-GTA---A--T----GT--G---------TA--C-GTG-T---G-AATG-
gi|13 : GAGGTTTAGCGA-TT-CAA-AGTGT-A-CGTGTACTN-NN--N-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCT-GT-ATC-AGGGGATT---CCCGA-----GAA----ATA---TGTT-GCA-TT-AC-GATCA----
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gi|14 : agagaggtttagcgattcaaagtgtacgtgtactnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctgtatca-CG--------------------T-GC-ATC-AGGGGATTC--CTCTA-----AAA----ATA---TG-T-GTA-TT-TC-G-TAA----TAA-G-TTT-CG---TT--GAC-GGCA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-T-------A-------A-------AGCACAGAG------T-----------A-------C---A------CGT-A-----------------AGT-AACA-A---CTTGTA--------T---A--G--C-T----------------T----------A-------------TAATTTCTTATTTT-T---T----G-TTT------C-----A-T-CC----TCTGGC--CGTG-TG--C--GAT---TTT-CTG-AAAG--C------------AT------------A---TAC--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-T-AAA-CA-TT--T--CGGGGGG-TAA-G-A---ACAATC-T-T-TAGG-GTGTT--CAAATAC---------at
gi|15 : agaggtttggcaaaaccgggggcaaaacgGAGGTTTAGCAA-TT-TAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATG---TG-T-GCA-TT-AC-G-TCA----TAG-G-CTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AA-T--AT----C--CA-CA------AAC-GT-------G-TAAAGTGCA-------A-------AG-------------T-----------A-------C---A------CGT-A-----------------AGT-AACA-A---C--GTG--------T---A--G--C-T----------------T----------ATAGTTTCTTATTTT--------------T---T----G-CTT------A-----A-T-TC----TGTGAC--CGTG-TG--C--ATT---TTT-CTG-AAAG--CTGAG--G-----ATCTT-T--AGCATA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-G---TA-T-AAA-AA-TT--a
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gi|22 : AGGTTTAGCAA-AT-CGA-TGTGT-A-CATGTA--------------------------------------TC-AGGGAATTC--CCCCA-----TAA-----------------A-CT-AC-A-TCA----TGC-A-TTT-TG---TC--AAC-AACA-TATAT--CT---A-
gi|23 : aCACA-CGTA--CAAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGGCTT-TGCTA-A-AACCTTCTC
gi|24 : -A-C-GTGT-ACAAGTTGG-TT-TGCTA-A-A--CCTCTC
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gi|3 : T-GT--A-CG--------------------C-GT-ATCTAAGGGATTC--CCCCAA----GAACACTATA---TG-TTGCAGTTGAC-G-TCA----TAATG-TTT-CG---TTTCGAT-AACA-T-TTT--CT---A-CA--GG-T--AT----CATCA--A------AACTGTTTAAA--G-TC------A-------A-------AG-------------T-----------A-------C---A------CGT-AG----------------AGT-AACA-A---T--GTG--------T---ATTG--C-G----------------T----------AAGTAG--------T--------------T---TCTTAG-TTTTCTCTTA-----A-T-TC----T-TGAA--CGTA-TG--C--GTT---TCT-CTG-AAAG--ATGAG--A-----ATTTT-T--AGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---AACAG-A---AAGT-AAA-CA-TT--TACTGGGGAGTACA-GCA---AAAATCCT-T-TAAG-ATGTTCGTACAAGCAAAAGAGCGC--A--CATTAATCTTTATT-T--T---C-A------CCTA-TT-G-TTTTTATC---AA----------GTG-----A--------AC-GTCCCACACTAC-----GCAAATGGGCGTA----ACAC--GATGAAAGCT-TAA---AA-T----GCTGG---------GA--CCGTG-T---ACACAGTACACA-CGTAG-AAAGT-ATC-GCTT-AC-AGTTGG-TT-CCTTA-A-A--ta
gi|4 : cgGAGGTTTAGCAA-AT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--G-CG--------------------T-GT-ATC-AGGGGATTC--CCCTA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AC-G-TTA----TA--G-TTT-CG---TT--GAT-GACA-TATTT--CT---A-CA--AG-T--AT----C--CA-CA------CAT-GT-------G-T-------A-------A-------AGCATAGATCTAGAGT-----------A-------C---G------CGT-A-----------------CGA-TACA-A---C--GTG--------T---A--G--C-T----------------T----------A-------------TAGTTTCATATTTT-C---T----G-TTT------A-----A-T-AC----CGTGAC--CATC-TG--T--CTT---TTT-CTG-CAAG--TTGAA--G-----ATTTA-T--AGCAAA---TAT--T-GAT-GC-A--A---A---G-A---AA-TAAAA-CGTTT--T--TTTGGAG-AAG-A-A---AAAATG-T-G-TAGG-ATTTC--TAAAAA----------C--A--CGT--ATCTTTATT-T--T---C-A-CAA--CCT--TT-G-TTTT-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------ACACGTTGCGA--GTGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-ATA---A--T----GT--G---------TA--C-ATG-T---G-ACTA-ATACA-GGTAC-TTAGT-A-C-GCGT-ACAAGTTGG-TT-TGGTA-A-A--CCTC
gi|5 : GTTTAGCAA-TT-CAA-CGTGT-A-CGTGTACTT-GT--A-CG----------------------GT-ATC-GGGGGAGTC--CC-TA-----GAA----ATA---TG-T-GCA-TT-AA-C-TCA----TAA-G-TTTTCG---TT--GA--GACA-TATTT--CT---A-CA--AG----AT----C--CA-CA------AAC-GTTGTAAGTG-C-------A-------A-------AG-------------T-----------A-------C---A------CGT-A-----------------AGT-AACA-A---C--GTG------------A--G--C-T----------------TTATGTTTCTTA-------------TGTTT----------T---T----G-TTT------A-----A-T-T------GTGACGGCGGG-TGAGC--GTT---TTTTCTG-AAAG--CTGAG--G-----A-TTT-T--AGCAAA---TAT--TGGAT-GCAA--A---A---G-A---AA-A-TAA-CA-TT--A--AAGGGGG-AAA-G-A---AAAATC-T-T-TAGG-G-GTC--TAAAAAC---------C--A--TGT--GTCTTTA-T-T--T---C-A-AAA--GCT--TT-G-TTTC-A-C---AA----------GTA-----C--------AC-GT--------ACACGT-ACAA--GGGC-TA----A-AC--GA-GAAA--T-TAA---AAGT----GT--G---------GA--C-GTG-T---A-ACT--ACACA-CGTATGTAAGT-A-CGGCGT-ACAAGTTGGTTT-TGCTACACA--CCTCT
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