lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 1 55555555 111 4 2222 22222 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 999999999999999999999999 1 3 1 2 666666666666666666666666666666 3 4 7777777777777777777777777777777777 3 2 3333333333333333 111 1111 888888888888888888888888888888 1111 222 44444444 11 2 3333333333333 1 11111111111111 444444444444444444444 111 6666666666666666666666666 1 1111 4444444 55555555555555555555555555 2222222222 1 222222222222222222 11 7777777777777777777777777777 22 22222222222222222222222222222222222222222222222 11 1 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 1 4444444444444 11111 11 222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 333 22222 333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 55555555555555555555 1111 5555555555555555555555555555555 22 2 1111 11 33333
lowQualScore : 6 5 11111111 222 0 0 6666 6 66666 7 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 999999999999999999999999 1 3 1 4 0 1 333333333333333333333333333333 0 0 3 0 22 6666666666666666666666666666666666 1 1 6 99 2222222222222222 111 4 0000 444444444444444444444444444444 5 9999999 3333 000 7 3 3 66666666 11 0 3 6 3 1111111111111 2 0 55555555555555 2 333 3 3 1 3 888888888888888888888 000 3 555 7 0000000000000000000000000 7 3 0 2222 3 9999999 3 3 3 44 8 99999999999999999999999999 6 66 2 2222222222 2 1 444 2 111111111111111111 3 11 6 3 4444444444444444444444444444 3 11 77777777777777777777777777777777777777777777777 4 4 77 5 5 3 99999 55 1 3 3 7 1 4 4 4 44 4 4 888 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 5 1 1 5 5 9999999999999 3 11111 88 555 777 3 6 3 3 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66 2 6666 5 222 11111 3 2 2 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 3 3 3 3 11111111111111111111 55 3 7777 9999 5 6666666666666666666666666666666 3 99 3 3 3 3 0000 3 44 11 22222
lowQualScore : . . ........ ... . . .... . ..... . .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . ........................ . . . . . . .............................. . . . . .. .................................. . . . .. ................ ... . .... .............................. . ....... .... ... . . . ........ .. . . . . ............. . . .............. . ... . . . . ..................... ... . ... . ......................... . . . .... . ....... . . . .. . .......................... . .. . .......... . . ... . .................. . .. . . ............................ . .. ............................................... . . .. . . . ..... .. . . . . . . . . .. . . ... ....................................................................................... . . ...................................................... . . . . . . ............. . ..... .. ... ... . . . . ............................................................................................................................................................................................ .. . .... . ... ..... . . . . ................................................... . . . . . .................... .. . .... .... . ............................... . .. . . . . .... . .. .. .....
lowQualScore : 0 0 00000000 555 0 7 0000 7 00000 3 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 555555555555555555555555 0 3 7 7 0 2 888888888888888888888888888888 8 2 2 0 44 0000000000000000000000000000000000 8 0 2 22 5555555555555555 444 2 6666 999999999999999999999999999999 7 6666666 9999 666 3 6 6 33333333 22 0 3 2 1 4444444444444 9 7 33333333333333 7 555 5 1 2 3 333333333333333333333 444 3 888 3 7777777777777777777777777 3 6 6 7777 6 4444444 1 1 1 22 8 77777777777777777777777777 6 88 9 0000000000 9 4 777 7 111111111111111111 1 66 2 1 4444444444444444444444444444 1 00 00000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 99 5 7 6 77777 55 1 6 6 4 8 4 4 4 88 4 4 888 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 4 111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 7 4 4 0 0 1111111111111 6 88888 88 888 333 3 7 3 3 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33 7 1111 5 222 77777 1 0 9 9 222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 3 3 3 3 00000000000000000000 00 3 1111 6666 9 4444444444444444444444444444444 1 33 1 2 1 1 4444 3 66 22 66666
consensus : NATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGCNGCNGNAAACATGTCAAGCTTACGTAAGCTATTACGACGACGAT-AATTCGTTGTTG-AGC-------CT-ATTGTCT-ACGAA-TG-T-----GAGA-TATTC-AACC-GCAG-ATTG--AAT-AATGATTTAACATA-GACTTG-AC--GTG-GTC-CGC-TCAATGGTTA---TTGAATNTTCAATCCCTTCGNCACAACNAAGAGCNGTCTATTTCTTGAGTACAACACGAAGAAAATATGCAAT-CTACCTTGTTTAGAAGATTCCCANANACTGCNTTACNTGGATTTCGTGCCCNAGTCTCCCACACGACAACACTATTTGCNGCNNTCACNNTTCCCACACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGANCCAATTATTNGCGCCGANTGCTTATA---AAAAACG-GGA-TTGCTNAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTG-C-AAAACTTT--AT-C-A-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG--GCCGTCGC-TA--G-AATATGCATC-TGAGG-TATGGG-GTGGGTGTT-CAAA--TCA---CAAGA--TTAAG-AAAAA--CTAGAAA----AAT---T-ACAGCATT--A---GCAGCCGC--GAGGAT-AGT--C----ACA----GGTCTTA--ACTTCCTTGG-CAT-CGCG-AGACTC-CTC-T-CTATTTCG--AAAC-TGGG-TGGGAACC-GCTTATT-GTT----GAAG-AA-GGAC-AA---A-T-T------A-AAAA-C-AATT-ATGTACAAAATTTAT-CATA--ATA-T--G-G-TACC---AGATTATCTTCA---AA-A---TATT-TCT-C---CA-AG---T-TAT-ACGGTCACANGAA-TCAA----AT-TAT-GCC--CCACCAG-AC-A-ATCGC--AAAA--ATTTACAA-GC-A-T-C-CCA---AATG--TAG-ATTAAA-A-CA--T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA--ATAG---GCG--------------CAAT-GGAATTCAG--TACC---C-----A---T-GA------TAA----GA-----TC-A-C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-A-CCTCCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-----A-----TACATACAAGA-T-AAGGCNTA-ATTG--TGTACTAAA-A-AACGTG----ACT-TATTCAG--ATGT-A-CAT-TATTG-ATAGTCC--C--T--GT-TCTTG-TG-GT----AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCCA-T-ACTT-TTTCT-C-TGCCNCGA--G-TACTCTG-CT-C-C-AGAAATTGAT---TTAT-TTA-A-T-GCTATTTTT-AG-GAT-GGA-TAATT---GTATACA----TAGTG-GACACTCGTNG-GT-TTACT-AT-G-G-GGAG-ATGACTCTATT--A-TA-T-T--A--CTG----AC-------AAT-------G--AA------------AA-TT--TTT---C-------------T------------A-----C-----A--A-TTGTTTATAAAA----A-GATC---TGGTC-G-T-T-TTNAGTTTA-T-TT--TTGT-ATA-TAG---A--AT---AGC--A-TATC-GATAA--CTGT-A-AA-TT-C-AAG-A-AG----------------TA--TA--T-TTACA----G---AAATNTTC---AT----AA-NTA--TG-------TTT-AAAATG-ACCT-TT-GAT-ATCAT-TGT-A----G-T--TAGA--TTT--NN-TATCATCTATTGC
Reference ( gi|1 ) : TATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTA-AGC-------CT-ATTGTCTTACAAA-TG-T-----GAAACTATTC-AAC--ACACTATTGTAAAT-AATGATTTAACATA-GACTTGGACATGTGCGTC-CAC-TCAATG--TA---TTGAA-GTTTAATCCTT-CAACA-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTAC-A-----AGAAAA-ATGCAATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGTT--ACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGA--A-ACT--TTGGCGCTTTC-TTTTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-AT-AGCACCAATTGTTTATAGAAAAAAATG-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-G-C-AAAA--TT--AT-C-AGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAG-CGCCGTCGCATA--GCAATAGACATCGTGAGGGTATGGGAGTGGGTGTTTCAAA--TCA---CAAGA--TCAAGCAAAAA--CTGAAAA----AAT---TGACAGCATT--A---GCAGCCGCCTGAGGAT-AGT--C----ACA----GGTCTTA--ACTTCCTTGG-CAT-CGCG-AGACTC-CTC-A-CTATTTCG--AA-C-TGGG-TGGGAACC-GCTTATT-TTT----GAAGCAA-GGAC-AA---A-T-T------A-AAAA-C-AATT-ATGTACAAAATTTAT-CAT---ATA-TA-G-G-TA-C---AGATTATCTTCA---AA-A---TATT-TCT-----CG-AG---T-TAT-A-GGTCACAAGAA-TAAA----AT-TAT-GCCGCCCACCAG-AC-A-ATCGC--AAGA--ATTTACAA-GC-A-T-C-CCAC--AGTG--TAG-ATTAAA-A-CA--T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA--ATAG---CCG--------------CAAT-GGAATTCAG-ATACC---T-----A---T---------TA-----GA-----TC-A-C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-A-CTTCCTTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-----A-----TACATATAAGA-T-AAGGCTTA-ATTGCTTGTA-TAAA-A-AACATGC---ACTCTATTCAG-CATGT-A-CATCTATTG-ATAGTCC-TC--T--GT-TCTTG-TGAGT----AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATTCA-T-ACTT-TTTCT-C-TGCCCCTA--GCTACTCTG-CT-C-C-AGAAATTGAT---TT-T-TTA-A-T-GCTATTTTT-AGCGAT-GAATTAATT--GGTATACA----TGCTG-GACACTCCTTG-GT-TCACT-AT-GCG-GGAGAATGACTCTATT--A-TA-T-T--A--CTG----AC-------AAT-------G--AA------------CA-----------C-------------T------------A-----C-----A--A-TTGTTTATAAAA----AGGATCT--TGGTC-G-C-T-TTAAGTTTA-T-TTACTTGT-ATACTAG---A--AT---AGC--A-TACT-GATAA--CTGT-C-AA-TT-C-AAG-A-AG----------------CT--TA--T-TTACA----G---AAATGTTCA--AT----AG-CTA--TG-------CTTAAAAATG-ACCTCTT-GATAATCAT-TGT-A----G-T--TAGA--TTT--GC-TATCATCTATTGC
gi|31 : ATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAAT-AATTC--T-TTACAGC----------ATTGTTCTACAAG-TGTT-----GAAAATATCC-TACT-ACA--ATTG--AAT-AGTGATTT-ACAGA-GACTT-GACATGTG-GTC-CGC-TCAATGGTTA---TT
gi|6 : ATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTG-AGTTATTCAACT-ATTATCT-ATGAA-TG-T-----A-------TC-AAT--GCAG-ACTG--GAT-AATAATTTAA-ATG-AACTTGTA---GTG-GTCGTAA--CAGTGGTTG---TTGAA-TTTCAATTCCT-CGA-A-AACAAA-AGCGGT----TTCTTGAGTACAA-----AGAAAA-ATACA----TATC--------------CCCATAAATTGCA--ATATGGATTTCGTGT-CAA------CACACAA--ACACT--T---AGTTATCATTGTTCCCACACGATCTCAtta
gi|4 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtacttatCTTATATAAG--ATCAGGACTAC----AATTCGTTAC---AGC-------CTTATT-TCTAAAAAAATG-TTGAGAGAGA-TATTCCAACCAACAAT-TTG-AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG-ACTAGTGT-TC-CACGTTAATG--TACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTAC-ACACGAAAAAAATATGCAAT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGTTTTACT-AGATT---TGCCCTAGTCTCCCAC-CGACAA-ACTATTTGCCGCATTT-CATTTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGAT-GCTTATA---AAAACTG-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAAT-AAC-AAAA--CTTGAT-C-A-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG--GCCGTCGC-TA--G-AGTATGCATCTTA--GGTATGGG-GTGGGTGTT-CAAA--TCA-----AGA--TTCAG-AAAAA--CTAGAAA----AAT---T-ACAG--TT--A---GCAGCCGC--GAGGAT-AGT--C----ACA----GGTCTTA---CTTCCTTGG-CAT-CGCG-AGACT--CTC-T-CTATTTCGA-AA-C-TGGG-TGGGAATC-GCTTATT-GTTA---GAAG-AA-GGACAAA---A-T-T------A-AAAA-T-AATT-ATGTACAAAATTTAT-CATA--ATA-T--G-G-TACC---AGATTATCTTCA---AA-A---TATT-CTT-----CC-AA---A-TAT-ACAGTCACAAGAA-TCAA----AT-TAT-G----CCACCAG-AC-A-GTCGC--AAAA----TTAC-A-GC-ATT-C-CCA---AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-ATA---A-GTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T---ATAG---GC---------------CAGT-GGAATTC-G-GTACC---C-----A---T---------tatgtcatcctacctatgaaaaacgtggacttattaaaataaattagagttcaaggtcagttctaaaactttatctattctatactttacttttattagacctctgctggaatatgcgtctgaagtgtggggtggaagttcaaatcaagcctttaaaagattttaaaaaatttacagcttgctgcag
gi|2 : TACATTGACCCAATTAT-TACGCTGAATGCT-ATA----AGAACT-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAG-TTAAG--GTCAATTG-C-AAAACTTT--ATGC-A-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG--GCCGTCGC-TA--G-AATGCAC----TGAGC-TATGGG-GTGG---TTTCAAAGATT----CAAGA--TTCAGAAAAAA---TAGAAA----AAT---T-ACAG--TT--A---GCAGCCGC-TGGAGAT-AGT--C----ACAA---GGTCTTA---CTTCCTTTGTCATTCGCGGAGACTC--TC-GTCTATTTCG--AAAC---GG-TGGGAACCCGCTTATT-TGTCTAGAAAGCAACGGAC-AA---A-AAT------A-AAAA-CCAATTTATGTACAAAATTTAT-CAT---A-A-TA-TTG-TA-CCCAGGATTATCTTCA---AA-AGATTATT-GCTTCCAACGTAT---T-TAC---GGTCACAAGAAATCAA-------TATAGCCACCCA---G-ACCA-ATCGC--AAAA----TTACA--GC-A-T-C-CCA---AATGCTTAG-ACTAAA---CAATT-T-ATA---AAGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA--TAAGGAAC----------------CAAT-GGAATTCAT-A-ACCAAGA-----A---C---------TAACGACAA-----TCAA-C----TTC-T-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACA----TA-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT--GAGA-CG-CATACT---GGAATGT------A-----TACATACAAGA-T-AAG--CAA-ATTG--TGTACTAAA-A-AA-GTG----ATTTAATTCA---ATGTAA-CA--TATTGAATAG--------T--GT-T-------A------AA-A---CA-GGAG-GACGC--GCT--TA-TCA-T-ACTT-TTTTC-C-TGCCACAA--G-TACTC-G-CTCC-C-AGAAGATCAT---TTAT-TTA-A-T-GCTAATTTT-AG-GAT-GGA--AAT-----TATACAAGAGTGC---GACACTC---G-GTGTTAAT-AT-GAGCGGAG-ATGACTCTATTA-A-TA-T-A--A--ATGTTTTCC-------TAT-------GT-GA------------C---------------------------------------------C-----A--A-TTGTTTATAAAA----A-GATC---TGGTC-T-T-T-TTAAGTTTA-T-TT--TT-T-ATA-TAG---A--AT---AG---A-TATC-GATAA--C-GTAA-AA-TTGCAAAG-A-AG----------------A---TA--T-TTACA----G---AAATGTTC---AT----A---TA--TA-------TTTTAAAATG-AC--CTT-GAT-ATCATCTGT-A----G----TACAT-TTT--GT-GATCATCTATTGa
gi|6 : acaAAAAACGTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGT-T-CTAAAACTTT--AT-CTA--TTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG--ACCTCTGC-TG--G-AATATGCGTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGAAGTT-CAAA--TCA-----AGCCTTTAA--AAGAT--TTTAAAA----AAT---TTACAGCtaa
gi|36 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtacttatatgtcaatgatgccgctaaaaacatgtcaagcttatgtaaactttacgatgatgataattcattgttgagttattcaactattatctatgaatgtatcaatgcagactggataataatttaaatgaacttgtagtggtcgtaacagtggttgttgaatttcaattcctcgaaaacaaaagcggtttcttgagtacaaagaaaaatacatatccccataaattgcaatatggatttcgtgtcaacacacaaacacttagttatcattgttcccacacgatctcatatgtcatcctacctatgAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCC-T-G-A-AACT--TT--AT-C-A-CTTTTATA-CAGTACT-TTTAAAAGTCTTCCTTTAATGTTGGAATATGCATC-TGAAG-TATGGGA-TGGGTGTTC--AA--TCATTTCAAAT--TTAA--AAAAA-----AAAA----Attgctgcag
gi|10 : ttTTAAG--GTCAATTG-C-AAAACTTT--AT-C-A-CTTTTA-AACACCACT-TTTATAAG--GCGGCCGC-TA--G-AATATGCATC-TGAGG-TATGGG-GTGGGTGTT-CAAA--TCA---CAGG
gi|14 : TATGGG-GTGGGTGTT-CAAA--TCA-----AGA--TTCTGCTGAAA--CTAGAAA----AA-------------------------CGC--GAGGAT-AGT--C----ACA----GGTCTT---ACTTCCTTGACCAT-CAAG-AGACT--------CTACTTCG--AA-C-AGGG-TGGGAACA-CCTTATT-GTTA---GAAG-AA-GG-----------------------------------GT-----ATTTCT-AAT---AT-----G-GTTATC---AGACTATCTCCA---AA-A---TA-T-TCTAC---CA-AG---TATATCA-G--CACATATA-TAGAGG--AT-TA---CTGTCCCCCAGTTC-A-A-CGCCAAAGA----TTAC---GC-ATT-C-CCA---AATGC-TAGCAGTA------A--C-T-A-A---A-ATCATCC-TTGT------------------C-TCC-ATACGC-GA--TTGA---TCGACTTGATGACAGACCAAT-GGAAATAAG-ACAC----------A---T---------CA---------------A-C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--tcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : GA--TCAAATAAAAATTCTGAAAACTTTAATCTCTGCTTGCATT--A---G---------GAAGATTAAT--C----ATT----GGACT-A--ACTTCAATGA-CGT-CACG-GAAATC-TTT----CATTTCA--AAAC-TGGA-TGGAAATC-ACTTATT-GTTA---GAAGAAT-GGTA-AA---A-T-TTAAAAAA-AAAA-T-AACT-ATGTACAAACTTTAT-CACA--ACA-T--G-T-TACC---CGAATATC-TCAAATAA-A---TA-T-TAT-----CA-AACATT-TGT-----TTACATGAA-TAAATTGCAT-TAT----------TAG-AC-A-ATCGC--AA-A--ATT---AATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATTCAATATCA--A-T-ATA---A-
gi|21 : atgctgaaaaactaagagtatcaaagaaatcacagttctagatcacgtgtaaactttagctcttctacaaggtgtcctttgagatatccctcagatatatggggtggttA--TCAAAACGAAT--CTGAAAA----A-T---T-ACA--ATT--AAACGCAGC-----AAGAAT-AGT--T----ACGTACTGG-ATTA--ACTTTAATAG-CAT-CAAG-GGAATCACTT----TATTTGG--AA-A-CGGGCTGGGAACC-A--------TT----AAATCAT-AGGC-GG--------------A-AAAA-C-GA-T-GTATATAAAGTTGA--CAA---ATATTT-G-A-TACC---AAACTACCTTAG---TG-A---CATT-TTT-----C
gi|23 : at--CTAGAAA----AAC---T-ACAACATTTTA---G-AGCTGCACGAATCT-AGTACCGGTAACC----GGTCGTATCGCTTTAATAG-CAT-CACG-TGATTC-TGAGA-CTATA-CGGAAA-C-TGGG----AAACC-GCTTATT-GAT----AGACAAA-GGAC-CATATG-T-T------ACCAGA-C-AG-----GCACAAAATTcgtataaaacttctagttacaatacgagaaacacattaaattatgatgtaccaacatgcaaact
gi|10 : tttatacaatactttcatatgacctcatttggaatatatatgcatccaaagcatgggtggtcatttgaagt-AAT--C----ACA----GGTCTTA---CTTCCTTGG-CAT-CACG-AGACT--CTC-T-CTATTTCGA-AA-C-TGGG-TGGGAACC-GCTTATTATTA----GAAG-AA-GTACAAA---A-T-T------A-AAAA-C-AATT-ATGTATAAAATTTAT-CATA--ATA-T--G-G-TACC---AGATTATCTTCA---AA-A---TA-T-TCTAC---CA-AG-----TAC-ACGGTCACAAGAA-TCAA----AT-TAT-G----CCACCAG-AC-A-ATCGC--AAAA----TTAC-A-GC-ATT-C-CCA---AATG--TAT-AT--AA-A-CAT-T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G---ATAG---GTG---------------AAT-GGAATTCAG--TACC---CATAGAA---T---------TAAGAC-AA-----TCAA-C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-A-CCTCGATCTT-atagtgtcgttccag
gi|5 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttca----ACA----GGTCTTA--A-TTCCTTGG-CAT-CGCG-AGACTC--TC-T-CTATTTCA--AAAC-TGGGGTGGGAACC-GCTTATT-GTTA---GAAAGAA-GGAC-AA---AAT-T------A-AAAA-A-GATT-ATGTA-AAAATT-ATGCAT---A-A-TATG-G-TA-CC--AGATTATCT-CA---AA-A---TATT--CTAC---CA-AG---T--AT-ACGGTCACA-GAA-TCAA-----T-TAT-GCC----ACCAG-AC-A-ATCGC--AAAA-----TACA--GC-A-T-T-CCA---AATG--TAG-ATTAAA---CA--T-TTATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---TAG---GTG---------------AAT-GGAATTCAGTACACCA--T-----AGAAT---------TA-----GACAA--TC-A-C----TTC-TGCTGAA-ACTT-CAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-A-CCTCCTTA----T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|26 : ----ACA----AGTCTTA---CGTCCTTGG-CAT-CGCG-AGACTCTCTC-T-CTATTTCG--AAAC-TGGG-TGGGAATC-GCTTATT-GTTA---GAAG-AA-GGACAAA---A-T-T------A-AAAA-T-AATT-ATGTACAAAATT--T-CATA--ATA-T--G-G-TACC---AGATTATCTTCA---AATA---TATC-TAC-----CA-AG-----TAT-A-CGTCACAAGAA-TCAA----AT-TAT-G----CCACCAG-AC-A-A-CGC--AAAA----TTAC-A-GC-ATT-C-CCA---AATG--TAG-ATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|43 : aTCCTTGG-CAT-CACG-AGACTC--------TATTTCG--AAAC-TGGA-TGGGGACC-GCTTATT-GTT------AG-AA-GGACAAA---A-T-T------A-AAAA-C-AA
gi|3 : -CAT-TGCG-AGACTC--TC-T-CTATTTCG--AAACATGCG--GGGAACC-GCTT-TT-GTT----GAAG-AA-GGAC-AA---AAT-T------A-AAAAAC-AATT-A-GTACAAAATTTTA-CATTTAATA-TG-A-G-TA-CC--AGATT--CTTCA---AG-----TATT-CTT-----CC-AA---G-TATCACGGTCACAAGAA-TCAA----ATCTAT-GTC----ACCAG-AC-A-ATCGC--AAAA----TTACAG-CC-A-TTC-CCA---AATG--TAG-ATTAAG-A-CT--T-T-ATA-----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA---TAG---CC----------------AATTGGAATTCAG--TACC---------A---TAGACAAAGACA-----AA-----TCGA-A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-A-CCTCCTTCTG-AT-TTTCGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCAGACA-----TACATAT-----T-AAGGC--ACACTGCTCGTACTAAA-T-AAAA-G----ACT-TATCCAGACGTGT-AACAT-TATTG-ATAGTCT-AT--T--GT-TCTTGCTGTGTGGTAAA-A---CACG--A-GACG---CGT--TAT-CA-TTACTT-TTTCT-CCTGCAC-TAATGTTACTCTG-CT-C---AGAAAT-GAT---TTAT-TTA-A-TTGCTATTTTT-AG-GAT-GGAT-AAT---AGTATACA----TAGTGCGA-ACTCGTGT-GT-T-ACT-AT-G-G-GGAAGATGACTCTATTA-A-TATT-T--A--CTG-----C-------AA--------G--AA------------AAATTTGTTTTCTC-------------T------------A-----CTGT--AACA-TTGTTTATAATA----A-GATC---TGGCCTT-T-T-TTAAATTTA-TATT--TTGT-ATAGTAGTCAG--AT---A-C--A-TATC-GATAA--CTGA-T-AA-TT-C-AAG-A-AG----------------TA--TA--T-TTACA----G---AAATG-TCA--TG----AA-TTA--TG-------TT--AAAATGCACCT-TT-GATTAT--T-TGT-A----G-T--TAGA--TTT---T-TGTGATTTATTACatttggtattacaactatataata
gi|29 : --AA-C-TGGA-TGGGAACC--CTTATT---------AAACAA---AC-AA---A-C-----------AAA-C-AAtt
gi|19 : agtaacagggtcacctagtatatctatgaaagaatatttatatttatagaGG-TGGGAACC-ACTTCCT-GTT----AAAAGAA-TGGC-AA---A-T-T------A-AGAA-C-GATT-ATGTAT-AGATTTAT-CACA--ATA-T--G-G-TACC---CGAGTATCAAAAAG-AA-A---TATT-AC------CA-AA---C-ATT-C-GTTCACATGAA-TCAA----AT-TAC-G----TTATTAT-AC-A-ATCGC--AAAATTATT------GC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-A-TA--TCT-GTG---T-ATCACCTTTTGT------------------gaaaagaaagaaaaaacctcgtaactatgtatagaatgcacaataatcttgttcccatacccgtgtcaccttttcaagacacatcacaccaaatacc
gi|25 : atgt-TTA----GAAG-AA-GGAC-AA---AAT-T------A-AAAA-G-GATT-GTGTACAAAATTTAT-CAT---A-A-TATG-G-TA-CC--AGATTATCTTCA---AA-A---TATTCTAT-----TA-AG---T--AT-ATGGTCTCATGAT-TCAA----AT-TAT-GCC----ACCAG-AC-A-ATCGC--AAAA----TTACAA--C-A-TTC-CCA---AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G---ATAG-----GT-------------CAAT-GGAATTCA--ATACC---C-----A---T---------aacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|7 : ttg-AA---G-T-T------A-AAAC-C-AAAT-ATGCACAAAATTTAT-CAT---G-A-TA-T-G-TACC---ACATCATCTTCA---AA-A---TA-T-TCTGC---CT-AG-----CAT-G-CGTCACATGAT-TCAA----AT-TAC-G----TCACCAG-AC-A-ATCGC--AA-A--AT-------G--A-T-C-CCA---AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-ATA---A-ATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G---ATAG---ATG---------------AAT-GGAATTCAG--TACC---------A---TGAAAA----TAAG---GA-----CA-A-CAATTTTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-A-CCTCCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGggaa
gi|30 : aatcaGCCCTTCAG-AC-AGATCGT--GTAAT-ATTTACAG-TCTA-T-TACCACTAATTG---AG-ATTAA----CG--T-TTATATTTA-GTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATCATTG---AC---------------CAAT-GGAATTCAG--TACC---gaagactaagacatgatgtaaagacttattcagattgatcaacataattgatgctccttctatgttttacattttttgcagtaagtgcattcactctgagaaatgatttattaaatgctattttttagaaggataattaggcatagtgaacacttgtgttttggcatcgaggagatgactccattttgtgaaactgcccatgcaaatagtttccgtactcgtacaattgtttataaaacgatctggtcgtttttagtttactttgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : agtatacgcgggtcactgaatcatttcatttttaatCACCAG-AC-A-ATCGC--A-GA--ATT---------A-T-C-CCA---AATG--TAG-ATTAAG---CA--T-TTATA---A-ATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G---ATAG---ATA---------------AAT-GGAATTCAG-TTCCCA--TGAAA-A---T---------AA-----GA-----CA-A-CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-A-CCTCCTTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAGAA-G----ACT---AAGACATG-----A-----TGTA----------AAGGCTTA-ac
gi|22 : aatttacgt--AATG--TTG-ATTAAA---CA--T-TTATA---A-ATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA---TAG---ATA---------------AAT-GAAATTCAC--TACC---T-----A---TGGAAA----TA-----AAAACAATC-AAC----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-A-C--CC--CTTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG-------------------TAGGA-C-A-----CA-ATTA--TGTA-TTAG-ATAACGTA----------------------A-CAT-TATTG-ATAATCC-TCTGT--GT-TCTTG-CG-GT----AA-A---CA-GA-G-GACttcagaagtaaacattatttatgctccactatgttttacaattttttgcagtaagtgcattcactctgaaaattgatttatgaaatgctatttttagaatggataatttaggtatagtgaacactcgtgtgttagcatgaggagataactccatttgtgaaactgcccatctaaaatagtttccgtactcgtacaattgtttataaaattatctggtcggtttttttttagtttactttgattttgtatctgcacataaaatgggaacaaacttttgagttttatcaagtacaattt
gi|8 : t--T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---TAG---ATG---------------AAT-GGAATTCAA-GTACC---C-----A---TAGAA-----TA-----AAACAA-TA-A-C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-A-CATC-TTCTA-TT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-----A-----TA-ATACAAGA-TCAAGGCATA-AT-----------AA-A-GAC-----------TATTCAG--ATGT-AACAT-TATTG-AT-----------------CTTG-TG-GT----AA-AA--CA-G--ATGACG----CT--TAT-CA-TTACTT-TTTCTCC-TGCACGAA--G-TACTCTG-CTCC-C-AGAAA-TGAT---TT-GATTA-A-T-GC-ATTATT-AG-GAT-GGA-TAATT----TATACA----TAGTG-GACACTCGTGT-GT-T-ACTAAT-----GGAG-GTGA--CTATTA-A-TA-T-T--A--CTG----AC-------AAT-------G--AA------------AA-----------TTGTTTCCTATG--T------------A-----C-----A--A-TTGTT--TAAAA----AAGATAT----GTC-GTT-T-TTAAGTTTA-T-T---TTGT-ATA-TAG---A--A----AACATA-TACG-AATAA--CTG--A-AA-TT-C-AAA-A-AG----------------CTAATATTT-TTACA----G----AATTTTC---AT----AA-GTA--TG-------TT--AAAATG-ACC---A-GAT-ATCAT-TGT-A----G-T--TAGAT-TTT--GTGTATCATatcac
gi|39 : tA---A-ATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA---TAG---GTG---------------AAT-GGAATTCAG--TACC---C-----A---TGGAAT----TAA----GA-----CA-A-T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-A-CCGCCTTCCT-tg
gi|13 : -TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACG-TTTCCTTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-----AATAACTAGACA-AATG-T-AAGGCTTA-ATTG--TGTC-T-------ACTTACAGGACT-TATTCAA-GAGAC-A-CAT-TATTG-ATAGTCCATG--T--GTCTCTTG-TGGGT----AA-AAATTA-G--T-GTCGGATGCTTCTATCCA-T-A--T-TTTCC-C-TG-CACTA--G-TA-TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATT-T-TTAGA-A-ACTATTTTA-A--GAT-GGAT--ATT--TATAT-CA----AAGT--GACACTCGTGT-GT-T-ACT-AT-GGG-GG---ATGA---TATT--A--A-T-T--AT-CTGA---AC-------AAT-------G--AA-------------A-----------T-------------G------------A-----T-----A--ATTTGTTT
gi|44 : CACC-A-CCTCCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAAGA-C-TAtccttatgtattcatagtatctgtttttttactt
gi|46 : aGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTGA----A-----TACATACAGGATT-AAGGCATA-ATT--TTGTACTAAAGA-AAAACG--------TATTCAG--ATGTAA-CAT-TATTG-ATAGTCagacatgatgtaaagacttattcagatgtaaacataattgatgctcctctatgtttt
gi|27 : TAATG-ACAGTCC-CC--TATGT-TCTCG-TG-GT----AATA---CA-G--G---TT---GTA--TATCAA-T-ATTTCTTTCT-C-TTGCACTA--ACCACGCTG-CT-C-CCAGAAAT-AAT---TTGT-TTA-A-T-GATATTTTT-AG-GAT-GGA-CAATT----TATACA----TAATG-GACA---CTTG--------T-AT-GT--------TG-CATTATT--AGTA-T-T--A--CTG----AC-------AAT-------G--AA------------AA-----------T-------------TGTTCCCCTAAACA-----C-----A--A-TTGTTTATAAAA----AG
gi|20 : taacgtT-CCTTA-TG-GTG---AA-A---CA-G--A-GGAA---ACT--TAT-CACT-ACGT-TTTCT-CGTGCACTGA--G-TACTCTA-CA-CAC-AGACATT-AT---TTAT-TTA-A-T-GCTATTTTT-AG-AAT-AGA-TAATT----TACATA----TGATG-GACACT-CTTG----TTACT-AT-A-G-GGAG-ATGAACCCATTG-G-TA-T-C--A--CTG----AC-------AAT-------G--AAAAGTTATTTTTCCAAT---------G-------------T------------A-----C-----A--A-ATGATAATAAAA----A-GATC---TGGTC-G-TGT-TTTAGTTTA-T-TT--TTGT-ATAACA----A--ATCTGAAC--A-TCTC-AACAAATCTTT-T-AATTT-C-AGG-A-Aa
gi|15 : ---GCA--TATCTC-T-AGTT-TTTCT-CCTGCC--------TACTCT-------C-AGTAAT-GAT---TTAT-TTA-A-T-GCTATTCTT-AG-GATCGA--TAATT----TACATA----GAGTG-GACATTCGTAC-GT-T-ACA-AC-G-G-GGAG-ATAACTCTATT--AGTA-T-T--A--CTG----AC-------AAG-------G--AA------------AG-----------CTTATTTTCCTATGT------------A-----C-----A--A-ATCTTTATAAAA----ATG-TC---TGGTC-C-T-T-TTGAGTTTA-T-TT--TAAT-ATCC--G---A--ATAC-AAC--A-TATC-AA-AT--CTTT-T-AATTT-C-AGG-A-AGTATATACACGGTTTAACT--TA--T-TTTCA----T---TAATATTGT--ATATAAAG-C-A--TG-------TTC--AATTG-ACC-ATT-GACAA-CAT-TGC-G----T-T--TAGA--TT
gi|17 : aaaagagataatCTT-TTTCT-C-TTGTGTGA--AATATTCCGGTT-C-C-AGAAA-TGAT---TTGT-TCA-A-T-GCCATATTT-AG-AATAGAA--AATT----TACACA----TAGTT-GATAC-CCGTG-TT-TTACT-TT-G-G-GGAG-ACAAATCCATT--AGTA-T-T--A--AAG----AA-------AAC-------G--AA------------AATTTATTTT---C-------------T------------A-----TAGTAAA--A-TTTTTTCTAAAG----A-GATC---TGGTA-G-T-T-TTTAGTTCA-A-TT-CTTaaaaaatcattttatgtcatcaattgta
gi|16 : cattgcagatgcataccacttcTACTCTG-CT-C-CCAGAAAT-GAT---TTAT-TTA-A-T-GCTATTTTT-AG-GTT-GGAT-AATT----TATACA----TAGTG-G-CACATCGTGTGT-T-ACT-AT-GTG-G-AGA-TGACTCTATTTAA-TA-T-T--A--CTG----AC-------AAT-------G--AA------------AAATTGTTTTTC-C-------------T------------ATTGTAC-----A--A-TTGTTTATAAAA----AGGATC---TGGTC-GTT-T-TTAAGTTTA-T-TT--TTGT-ATA-TAG---A--AT---AGT--A-TATTCGATAA--CTGTAA-AA-TT-C-AAGAA-AG--------------------TA--TATTACA----G----AATTTCTG--TT----AA-GTA--TG-------TT--AAAATG-ACCT-TT-GAT-ATCAT-TGT-A----G-T--TAGA--TTT--TG-TGTCATCTATTGttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|7 : ACTCTG--------AGAAAT-GAT---TT-A-TTA-AAT-GCTATTTTTTAG-AAG-GA--TAATT--AG---GCA----TAGTG-AACACTTGT-G-TT-TTGGC-AT--CGAGGAGA-TGACTCCATT--T-TG-T-G--AAACTG----CC-------CAT-------GCAAA------------TAGTTTCCGTACTCG------------T------------A-----C-----A--A-TTGTTTAT-AAA----ACGATC---TGGTC-G-T-T-TTTAGTTTA-C-TTtaa
gi|9 : aatcaaagttaaaaccaaatatgcacaaaatttatcatgatatgtaccacatcatcttcaaaatattctgcctagcatgcgtcacatgattcaaattacgtcaccagacaatcgcaaaatgatcccaaatgtagattaaacatttataaatcttccttgtttccattagcgatagatgaatggaattcagtaccatgaaaataaggacaacaattttcttctaaattctttcaaaaacagtctacgttccaggaacaccacctccttcttatttttcgcatggaggaagactaagacatgatgtaaagacttattcagattgatcaacataattgatgctccttctatgttttacattttttgcagtaagtgcattc-CT-C-T-GAAAATTGAT---TT-A-TGA-AAT-GCTATTTTT-AG-AAT-GGA-TAATTTAGGTATA-------G-TG-AACACTCGTGT-GT-TAGC--AT-G-A-GGAG-ATAACTCCATT----TG-T-GAAA--CTG----CCCATCTAAAATAGTTTCCG--TA------------CT-----------CG------------T------------A-----C-----A--A-TTGTTTAT-AAA----ATTATC---TGGTC-G-G-T-TTTTTTTTAGT-TTACTTtgatagtgccattctgtacatacc
gi|18 : aatttacgtcaccagacaatcgcagaattatcccaaatgtagattaagcatttataaatcttcctttgtcccattagcgatagataaatggaattcagttcccatgaaaataagacaacaattttctctaaattctttcaaaaacagtttacattcccaggaacaccacctccttcttatttttcgtacggagaagactaagacatgatgtaaaggcttattcagaagtaaacattatttatgctccactatgttttacaattttttgcagtaagtgcattca-C-C-AGAAAT-GAT---TTAT-TTA-A-T-GCTA-TTTT-AG-AAT-GGA-TAATT--TGT-----------CTG----------------TTACT-ATAGCA-AG---ATGACTC-ATT--AGTA-T-T--A--CTG----AC-------AAT-------G--AA------------AA-----------TTTATCTTCCTGTGT------------A-----C-----A--A-TTGTTTATAAAACGATAGGG-----TAGT----T-T-TTCGGTTTA-T-TT--TTGT-AT-CTGT---ACCAT---TGC--A-TATC-AACAATTCTGT-G-AATTT-C-AAG-A-AG----------------TA--TA--T-TTTTAATCTG---AATCTTTCATTAT----AATCTA--TGTAATATATTTTAAAATG-ACCT-TT-GAT-ATCAT-TAT-tgattttgtatctgcacataaaatgggaacaaacttttgagttttatcaagtacaattt
gi|24 : TATT--A--A-TAT--A--CTG----AC-------AAT-------G--AAAA----------CATTGTTTTC---C-------------T------------ATGTAGC-----AC-A-TTGTTTATAAAA----TAGATTC--TGGTC-G-T-TCTTAAGTTTA-T-TTTCTGCTCACACATG---A--A----AGC--AGTATC-GATAA--CTGT-AGAA-AT-A-AAG-ACAG-----------------T--TA--T-TTACA----G---AAATGTTCC--AT----AA-TTGATTG-------ATT-AAAATG-ACTTTGTAGATAGT-AT-AGTAA----G-CTATAGACTTTT--G--TATCATCTATTGtttgtgacatcaatattattgtaa
gi|28 : g--A-TA-T-T--A--CTG----AC-------A-T-------G--AA------------AAATTGTTTTC--CGATG---------T------------A-----C-----A--A-TTGTTTATAAAA----AG--TCTGGTAGTT-T-T-T-TTAAGTTTA-T-TTCC--GT-ATA-TAG---A-------AAC--A-TATC-GATAA--CTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-AG----------------TA--TA--T-TTTCA----G----AAT-TTTA------------TT--TG-------TT--AAAATG-ACCT-TT-GAT-ATCAT-TGT-A----GTT--TAGA--TTT--TG-TATCATCTATTGt
gi|35 : a-TA-T-T--A--CTG----AC-------AAC-------G--AA------------CAATTGTTTTC--CGATG---------T------------A-----C-----A--A-TTGTTTATAAAA----A-GATC---TGATC-GTT-T-TTAAGTTTA-T-TT--TTGT-ATA-TAG------AT---G---------T-GA------------AA-TT-C-AAA-A-AG----------------TA--TA--T-CTACA----G---AAATGTTC---AT----AA-GTA--TG--------TTAAAta
gi|37 : TTA-T-TT-TTTGT-ATA-TAG---A--AT---AGA--A-TA-T-GATAA--CTGT---AA-TT-C-AAG-A-AG----------------TA--TA--T-TTACA----G---AAATGTT----AT----AA-TTA--TG-------TT--AAAATG-AC--TTT-GAT-ATCAT-TGT-AG---G-T--TAGA--TTT--TG-TATCATCTATTG
gi|33 : T-ATA-TAG---A--AT---AAC--A-TATC-GATAACTCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-AG----------------TA--TA--T-TTACA----GTCCGAATTTTTC--AT----AA-GTA--TG-------TT--AAAATG-ACCT-TT-GAT-ATCAT-TGG-G----A-T--TAGT--TTT--ta
gi|42 : -TTACA----GTCCGAATTTTTC--AC----AA-ATA--TG-------TT--AAAATG-ACCT-TT-GAT-ATAAT-TGC-ACATTG-T--TAGT--TTTTAGCATAT-ATCTATTGatattcagattattttgtgtcatatattgtaac
gi|38 : agtcaataaatctgtgaaaTA--TG-------TTTAAA--TG-ACCT--T-GATA-TCAT-TGT-G----G-T--TAGA--TTT--t
gi|48 : caaaaagtattttgtaatatagtccgaatttttcattagcattctatgtaaaa-ACCT-TT-GATA-TCAT-TGT-A----G-T--TAGA--TTT--TG-TGTCATCTATTtaacagattattttgtgtcatttattgtaac
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): AATGTAGAAACTGGGTTGCCGAAAAAGTTAAACTTTGTTCTTGGAAGAAATACTCAATCAAATATGTATCTTACTTTTATTAGATCACTTTTAGAATATGCCTCTGGGGTATGGAATGCATTTTTTTTAAATTGATCTATTAGAAAAATTCCAGTTATACATGCAGCCAAAATAGTAATGGGTTCCTATATAGTATGTCTCATAAAGAATCATTATATTTAAAATTGGGTTTGGGAACCCTATCAAATAAGAGACAATAAAAAAAATCTCACAGCTGTTTACAATTCACAATGCTCTTTTCAAAATATCCGTGGTATTTTTTCTAGATACACCACCCGAAATATCCAAGACTATACGATATTCCAAAATGTAGACT
Unaligned ( gi|32 ): TAAGGAAACTTGAATTCACTGTTATCTAAATTATACATAACTTTTGTTAGATCTGTACTAGAGTATGCTTCATTTGTATGGGATGGTTGCTCTGCTGCAGAAATTGCAAAGTTAGAAAAAGTACAGTCCCATGCTGCTAGAATTGCAACAGGACTGCCAATTTGAT
Unaligned ( gi|34 ): ATATCAACAATTCTGTGAATTTCAAGAAACCTACATGTAATTTGTCATTAATTTCTATATTAAATATGTTTTAAATTTACCTTTGATATCATTGCGGTTACGGTAGATTAAAAAGATTATTTTGTGTCATTAATTGTAA
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|41 ): TCCTAGACATGATTTATTTAGTGTCATCTTTAGAATGGAAAATTTACACAATTATCGTCTACTATTTTAGGGAGACAAATCCAATTAGTAGTACCCTGAGAAAATAAAAGTT
Unaligned ( gi|45 ): GACACGCATGTTTATCATGAGGTGATAACTCAATCGGCATCACAGAGAATGAAAACTTATTTTATTAAAAAAATATCTGGTCGTTCCTGAGT
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Unaligned ( gi|49 ): CAGTTAAAGGTCAATTGCAAAACTTTATCACTTTTA
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 44444444444444444444 11 1 11 55555555555555555555555555 11 111 1 4444444 1 11111 111 22 11 11111 2 222 55555 2 2222 5555555555555555 222 1 6666666666666666 333333333 2222 555555555 111 1 11 33333333333333 111 1111 11111111111 1111 1111 3333333333333333333333 33333333333333333 11 11111111 1111 111 222222222 1111 11111111111111 111111111 1111 222222 2222222 555555555555555 1111111111 111111111111111111 33333333333333 888888888888888888888888888888888888888888 1 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 1 111111 11 22 3333 2222 7777777777777777777777777777777 11111111111111111 11111 1111 111 1 11111111 1111 11111 222222222 11111111111 11111111111 11111
lowQualScore : 3 3 44 1 1 7 2 4444 3 6 0 44444444444444444444 66 0 22 33 44444444444444444444444444 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 11 0 99 99999 1 3 1 111 0 99999 3 3333 1111111111111111 1 1 555 4 0 4444444444444444 7 111111111 44 22 6666 11 222222222 777 0 55 88888888888888 3 111 8888 6 3 2 66 22 1 9999 4 4 4 2 4 1 4 55 55555555555 4 2222 777 4 3 3 2222 3 55 3333333333333333333333 1 1 4 55555555555555555 00 88888888 0000 3 777 555 3 3 44 3 555 3 666666666 3 66 2 33 2 2 9999 2 2 2 99999 0 7 44444444444444 2 444 111111111 2 5555 66666 5555 22 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 888 555 7777 888888 444444 2 2 444 555 3 9999999 2 444 33 2 5555 2 2 4444444 2 2 2 222222222222222 2 2 5 66 66 2 9999999999 2 8 444 2 999999999999999999 5 2 2 2 88888888888888 2 2 2 2 111111111111111111111111111111111111111111 3 3 22 4 3 3 99999 55 0 3 77 4 4 4 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 555 55 333 88 33 3 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22 2 3 3 0 3 777777 3 6 3 6 3 88888 77 6666 2 2 2 99 0 66 2 4444 444 555555 2 2 3 22 2222 999 2 4444 2 2 2 9999999999999999999999999999999 66666666666666666 2 5 2 2 77777 2 5 5555 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 2222 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 00000000 6666 2 6666 7777 6666 1 00000 555 2 33 66 222222222 33 2 33333333333 2 2 2 2 2 2 2 2 8888 2 33 33333333333 2 00000 3 0 44
lowQualScore : . . .. . . . . .... . . . .................... .. . .. .. .......................... .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. . .. ..... . . . ... . ..... . .... ................ . . ... . . ................ . ......... .. .. .... .. ......... ... . .. .............. . ... .... . . . .. .. . .... . . . . . . . .. ........... . .... ... . . . .... . .. ...................... . . . ................. .. ........ .... . ... ... . . .. . ... . ......... . .. . .. . . .... . . . ..... . . .............. . ... ......... . .... ..... .... .. . .. .... . . . ...... .. . . ... ... .... ...... ...... . . ... ... . ....... . ... .. . .... . . ....... . . . ............... . . . .. .. . .......... . . ... . .................. . . . . .............. . . . . .......................................... . . .. . . . ..... .. . . .. . . . ...................................................................................... . ... .. ... .. .. . . ....................................................... .. . . . . . ...... . . . . . ..... .. .... . . . .. . .. . .... ... ...... . . . .. .... ... . .... . . . ............................... ................. . . . . ..... . . .... . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... . .... .... .... . ..... ... . .. .. ......... .. . ........... . . . . . . . . .... . .. ........... . ..... . . ..
lowQualScore : 3 7 77 0 0 3 0 0000 0 5 0 00000000000000000000 55 0 22 88 00000000000000000000000000 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 33 7 33 00000 0 3 0 000 7 00000 7 3333 0000000000000000 0 0 000 0 7 7777777777777777 3 000000000 77 00 3333 33 333333333 000 0 00 00000000000000 2 777 5555 7 3 7 11 66 9 4444 4 4 0 4 0 4 0 66 66666666666 0 5555 000 0 6 6 9999 6 00 7777777777777777777777 5 3 0 99999999999999999 66 55555555 4444 5 444 888 1 1 22 1 444 1 222222222 1 88 9 99 7 7 5555 7 7 7 33333 3 5 11111111111111 5 222 999999999 5 3333 22222 3333 00 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 999 000 6666 222222 777777 7 7 777 000 8 3333333 9 777 77 7 7777 7 7 5555555 7 7 7 222222222222222 9 9 7 33 33 7 3333333333 7 0 444 5 777777777777777777 7 9 9 9 66666666666666 9 9 9 9 444444444444444444444444444444444444444444 6 6 00 4 3 3 44444 00 2 3 99 0 0 0 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0 555 55 666 66 88 6 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 55 8 6 6 9 6 555555 6 7 3 7 3 88888 11 1111 9 9 9 11 4 00 7 2222 777 999999 7 7 3 99 9999 111 2 7777 2 2 2 1111111111111111111111111111111 66666666666666666 5 0 7 7 33333 7 3 7777 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 1111 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 7 9 9 9 44444444 5555 9 1111 1111 9999 0 88888 000 7 77 33 444444444 55 7 66666666666 7 7 7 7 7 7 7 7 3333 7 77 66666666666 9 00000 1 4 66
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCCTTCG-CA-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA-----AAGAAAA-ATGCAAT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TTAC-TAGATTT-GTGCNCTA------CACACGA-AACACT-TTTGNCGCTTTC-TTTTTTTCACACGATCTCA-----G-TGGTCGGC-A-TACAT-TGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-TGCTTATA---AAAAAC-GGGA-TTGCCGAAAAAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAAA----CTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------G-C-TAG-A----ATATGC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAAA--T-CA---CAAGA--T-TNAG-A-AAAACTAGAAAAATT-ACA-G-----CA--TTAGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTTA--ACTTCCT---TGG-C-A--T-CGC---G-AGACTC--TCT----CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-G-TTAG--AA-G-AA-G-----GAC-AA---A-T-T------A-AAAA-C-AAT--------T-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TATTCTN-CC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANGA-------A-TCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-AC-A-ATCGCAAAA----TTACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATTAAA-A-CA--T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT--G---A---TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTA---AA--AAACG-G-ACT-TA-TTCA-G-AT--GT---A--CAT-TATTGA-TAGTCC-C---TGT---TCTTG-----T-G-GT-AA-A---CA-G-G--GACG---GCT--TATCNNTACTT-TTTCT-C-T-GCNNCG-A-G-T-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAATT--TATACATAGTG-GACAC-TCGTNTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-ATT--AGTATT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T--T--T---TTCC-AT---TA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATTTA-CA----G----AA---ATTTT-C---A---T-AA-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGT-A----G-T--TAG-----------A-TTT---TGT-GTCATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGCNGCNGNAAACATGTCAAGCTTACGTAAGCTATTACGACGACGATAA-TTCGTTGTTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGT-----GAGA-TATTC-AAC-CG-CAGATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATNTTCAATCCCTTCGNCACAACNAAGAGCNGTCTATTTCTTGAGTACAACACGAAGAAAATATGCAAT-CTACCTTGTTTAGAAGATTCCCANANACTGCNTTACNTGGATTTCGTGCCCNAGTCTCCCACACGACAACACTATTTGCNGCNNTCACNNTTCCCACACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACAT-TGANCCAATTATTNGCGCCGANTGCTTATA---AAAAAC-GGGA-TTGCTNAAAAAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAAA----CTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------G-C-TAG-A----ATATGC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAAA--T-CA---CAAGA--T-TAAG-A-AAAACTAGAAAAATT-ACA-G-----CA--TTAGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTTA--ACTTCCT---TGG-C-A--T-CGC---G-AGACTC-CTCT----CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-G-TT-G--AA-G-AA-G-----GAC-AA---A-T-T------A-AAAA-C-AAT--------T-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TATTTCT-CC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANGA-------A-TCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-AC-A-ATCGCAAAA--ATTTACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATTAAA-A-CA--T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT--G---A---TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCNTAATTG--T--GT--ACTA---AA--AAACGTG-ACT-TA-TTCA-G-AT--GT---A--CAT-TATTGA-TAGTCC-C---TGT---TCTTG-----T-G-GT-AA-A---CA-G-G--GACG---GCT--TATCCATACTT-TTTCT-C-T-GCCNCG-A-G-T-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAATT-GTATACATAGTG-GACAC-TCGTNGGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-ATT--A-TATT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T--T--T---TTC-------TA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATTTA-CA----G----AA---ATNTT-C---A---T-AA-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGT-A----G-T--TAG-----------A-TTT---NNT-ATCATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCC-TTCAACA-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTACAA------GAAAA-ATGCAATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TTACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGA-AAC----TTTGGCGCTTTC-TTTTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACAT-TGACTCAAT-AT-AGCACCAATTGTTTATAGAAAAAAAT-GGGAGTTGCTAAAAAAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-GCAAAA------TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCGCC-GTC-------G-CATAGCA----ATAGAC---ATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAAA--T-CA---CAAGA--T-CAAGCA-AAAACTGAAAAAATTGACA-G-----CA--TTAGCAGCCGCCTGAGGAT--------AGTCACA----GGTCTTA--ACTTCCT---TGG-C-A--T-CGC---G-AGACTC-CTCA----CTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-T-TT-G--AA-GCAA-G-----GAC-AA---A-T-T------A-AAAA-C-AAT--------T-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-GT-A-------C--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TATTTCT--C------GA-G-T-TAT-A--G---GTCAC---AAGA-------A-TAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCACCAG-AC-A-ATCGCAAGA--ATTTACAAGC-A-T-C-CC-AC-AGTG--TAG-ATTAAA-A-CA--T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---ATAGC--CGCAAT-GGAATTCA-GATAC-CTAT----------T-A----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACTTCC-TTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATATAAG-A-T-AAGGCTTAATTGCTT--GT--A-TA---AA--AAACATGCACTCTA-TTCA-GCAT--GT---A--CATCTATTGA-TAGTCCTC---TGT---TCTTG-----T-GAGT-AA-A---CA-G-G--GACG---GCT--TATTCATACTT-TTTCT-C-T-GCCCCT-A-GCT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAATTGGTATACATGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTA---T-GCG--GGA-GAATGACTCT-ATT--A-TATT--A-CT----G-ACAAT-GAA-C----A------------------C-------TA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-AGGAT-CTTGGTCG-----C-T-TTA---AG-TTT-AT-----TTACT-T-GT--A--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATTTA-CA----G----AA---ATGTT-CA--A---T-AG-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TGT-A----G-T--TAG-----------A-TTT---GCT-ATCATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAAA----CTTTAT-CA-CTTTTAAA-CACCACT-TTTATAAG-GCG-GCC-------G-C-TAG-A----ATATGC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAAA--T-CA---CAGG
gi|10 : --------AATCACA----GGTCTTA---CTTCCT---TGG-C-A--T-CAC---G-AGACTC--TCT----CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-A-TTAG--AA-G-AA-G-----TAC-AA---AAT-T------A-AAAA-C-AAT--------T-ATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TATTCTA-CC------AA-G---TAC-A-CG---GTCAC---AAGA-------A-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-AC-A-ATCGCAAAA----TTAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAT-AT--AA-A-CAT-T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATA-G---AAT-TAA----GACA--A----TCAA-----C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCTCG-ATCTTtcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaTG---AAAAACTAAGA-GTATCAAAGAAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-GT--GTC-------C-T-TTG-AG---ATATCC---CTC-AGATA-TATGGG-GTGGT---TGAT-CAAA--T--A----AAAA--T-TCTG-A-AAA-CTTTAATCTCT-GCTTG-----CA--TTAG---------GAAGATT-------AATCATT----GGACT-A--ACTTCAA---TGA-C-G--T-CAC---G-GAAATC-TT-T----C-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAATC-ACTT--ATT-G-TTAG--AA-G-AATG-----GTA-AA---A-T-TTAAAAAA-AAAA-T-AAC--------T-ATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-TT-A------CC--CGAA-TATC--TCAAATAAA---TA-TTAT-CA------AA-----CAT-T-TG---TTTAC---ATGA-------A-T-A---A--AT--------T-GC--ATTATTAG-AC-A-ATCGCAAAA----TTA-ATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATTCAATATCA--A-T-ATA---A-
gi|12 : atgc---AGAAAC-TGGG-TTGCCGAAAAAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGTA-TCTTACT-TTTATTAG-ATC-ACT-------T-T-TAG-A----ATATGC---CTC-TGGGG-TATGGA-ATGCATTTTTTT-TAAA--T-T-------GA--TCT---------ATTAGAAAAATT-CCA-GTTATACA--T--GCAGCC-----AAAAT--------AGTAATG----GG---------TTCCTATATAG-T-ATGT-CTCATAA-AGAATC-AT-T----ATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAACC--------CT-A-TC-A--AA-T-AA-GA----GAC-AA-------T------A-AAAA-A-AATCTCACAGCT-GTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-GT-ATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---AAA---TA----T-CC------AA-GAC-TAT-A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACGTTTCC-TTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-AATAACTAGACAAATG-T-AAGGCTTAATTG--T--GTCTACTT---A------CAGG-ACT-TA-TTCAAG-AG--AC---A--CAT-TATTGA-TAGTCC-A---TGTGTCTCTTG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G-T--GTCGGATGCTTCTATCCATA--T-TTTCC-C-T-G-CACT-A-G-T-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-TATTT-ATAT-CAAAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTA---T-G-G--GG--G-ATGA---T-ATT--A--ATT--ATCT----GAACAAT-GAA-A----attccaaaatgtagact
gi|14 : -TATGGG-GTGGG---TGTT-CAAA--T-CA-----AGA--T-TCTG-CTGAAACTAGAAAAA-------------------------CGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTTA---CTTCCT---TGA-CCA--T-CAA---G-AGACTC----------TACTTCGAA-C-AGGG--TGGGAACA-CCTT--ATT-G-TTAG--AA-G-AA-G-----G-------------------------------------------G----TA---------------TT-T-C-T--AATA----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---AAA---TATTCTA-CC------AA-G---TAT-ATCA---G-CAC---ATAT-------A-TAG---AGGAT-T----ACT-GT--CCC-CCAGTTC-A-A-CGCCAAA--GATTAC--GC-ATT-C-CC-A--AATGC-TAGCAGTA------A--C-T-A-A---A-ATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-GATTGATCGA--CTTGAT-GA----CA-G--AC-CAAT--GGAAA---TAA----GACAC-A----TCAA-----C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--tgataatttgttttccttatgtattcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAGTT-TTTCT-CCT-GCC--------T-AC-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAATT--TACATAGAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAA---C-G-G--GGA-G-ATAACTCT-ATT--AGTATT--A-CT----G-ACAAG-GAA-AGCTTA------T--T--T---TCCTATG---TA------C----A-----AATCTTTATAAAA-A-TGT-C-TGGTCC-----T-T-TTG---AG-TTT-AT-----TT--T-A-AT--A--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATACA-CG----GTTT-AACTTATTTT-C---A---T-TA-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TGC-G----T-T--TAGATTAAAAAATCA-TTT---TAT-GTCATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataat-T-AC-TCTG-CTCC-C-AGAAA-TGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAATT--TATACATAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTA---T-G-T--GGA-G-ATGACTCT-ATTTAA-TATT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----AATTG--T--T--T---TTCCTATTG-TA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-AGGAT-C-TGGTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-TTA-CA----G----AA---TTTCT-G---T---T-AA-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGT-A----G-T--TAG-----------A-TTT---TGT-GTCATC--TATTGta
gi|17 : CTT-TTTCT-C-T-TGTGTG-A-AAT-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAATT--TACACATAGTT-GATAC-CCGT-GTTTTACTT---T-G-G--GGA-G-ACAAATCC-ATT--AGTATT--A-AA----G-AAAAC-GAA-A----A------T--T--TATTTTC-------TA------T----AGTAAAATTTTTTCTAAAG-A-GAT-C-TGGTAG-----T-T-TTT---AG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAATT---------------------TGTCTGTT-ACTA---T-A-G--CAA-G-ATGACTC--ATT--AGTATT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T--T--TATCTTCCTGTG--TA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-C-GAT-A-GGGTAGT----T-T-TTC---GG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--ATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATTTT-TAATCTG----AA---TCTTT-CATTA---T-AATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T---------------------------A-TTT---TGT-GACATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAACC-ACTT--CCT-G-TT-A--AAAG-AA-T-----GGC-AA---A-T-T------A-AGAA-C-GAT--------T-ATG----TAT-A-----GAT----TTAT-CAC--AATA----T-G-GT-A------CC--CGAG-TATC-AAAAAG-AAA---TATT--A-CC------AA-A---CAT-T-CG---TTCAC---ATGA-------A-TCA---A--AT-T----A-C-G----TTATTAT-AC-A-ATCGCAAAATTATT-----GC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-A-TA--TCT-GTG---T-ATCACCTTTTGT------------------attgtaa
gi|2 : atgtC-A-TACAT-TGACCCAATTATTA-CGCTGAATGCT-ATA---AGAA-C-TAGA-TTGCTGAAAAAATTACAGTT-AAG--GTCAATTGCAAAA----CTTTATGCA-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG-GCC-GTC-------G-C-TAG-A----AT--GC---A-C-TGAGC-TATGGG-GTGG----T-TT-CAAAGAT-T----CAAGA--T-TCAG-A-AAAAATAGAAAAATT-ACA-G---------TTAGCAGCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA---GGTCTTA---CTTCCT---TTGTC-A--TTCGC---GGAGACTC-TCGT----CTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTG-TC-T--AG-A-AA-GCAACGGAC-AA---A-AAT------A-AAAA-CCAAT--------TTATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-GT-A------CCCAGGAT-TATC-TTCA---AAAGATTATTGCTTCC------AACG-TATTT-A-CG---GTCAC---AAGA-------AATCA---A-----T----A-TAGC--CAC-CCAG-ACCA-ATCGCAAAA----TTACA-GC-A-T-C-CC-A--AATGCTTAG-ACTAAA---CAATT-T-ATA---AAGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---TAAGGAAC-CAAT-GGAATTCA---TAA-CCAA--G---AAC-TAACGACA-----A----TC-AA----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACAT----A-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT-G-AGA-CG-CATACT---GGAATGT--A-TA--CATACAAG-A-T-AAG-CA-AATTG--T--GT--ACTA---AA--AAA-GTG-ATT-TAATTCA---AT--GT---AA-CAT--ATTGAATAGT--------GT---TA---------------AA-A---CA-G-GAGGACGC--GCT--TATC-ATACTT-TTTTC-C-T-GCCACA-A-G-T-AC-TC-G-CT-C-CCAGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AATT-ATACA-AGAGTGCGACAC-TCGGTG--TTAATA---T-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-ATT--A--AT----------------AT-AAA-T----G------T--T--T---TCC-------TATGTGACC----A-----ATTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCT-----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T--T--A--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATTTA-CA----G----AA---ATGTT-C---A---T-AT-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTGT-A----G----TAC-----------A-TTT---TGTGATCATC--TATTGaacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|20 : aT---CCTTA-----T-G-GTGAA-A---CA-G-A--GGAA---ACT--TATCACTACGT-TTTCT-CGT-GCACTG-A-G-T-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAATT--TACATATGATG-GACAC-TC-TTG--TTACTA---T-A-G--GGA-G-ATGAACCC-ATTG-G-TATC--A-CT----G-ACAAT-GAA-AAGTTA------T--T--T---TTCCAATG--TA------C----A-----AATGATAATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----TGT-TTT---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : A--T-CAAA-A-CGAATCTGAAAAATT-ACA--------A--TTAAACGCAGC--AAGAAT--------AGTTACGTACTGG-ATTA--ACTTTAA---TAG-C-A--T-CAA---G-GGAATC-A-CT----TTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAACC-A-TTAAATC-A-T------A-G-GC-G-----G-------------------A-AAAA-C-GA---------T-GTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-AT-A------CC--AAAC-TACC-TTAG---TGA---CATTTTT-CCGTATAAAA-C-T-TCT-A------GTTACAATACGAGAAACACA-TTA---A--AT-T----A-T-GA--TGTACCA--AC-A---TGCAAA
gi|22 : at--AATG--TTG-ATTAAA---CA--T-TTATA---A-ATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GAAATTCA-C-TAC-CTAT--GGAAA---TAA----A-----AACAATC-AA----C----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-ACCCC-----TTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG--------------------T-AGGACACAATTA--T--GT--ATTA---GA--TAACGTA------------------------A--CAT-TATTGA-TAATCC-TCTGTGT---TCTTG-----C-G-GT-AA-A---CA-GAG--GACct
gi|23 : tTTTATA-CAATACT-TTCATATG-ACC--TC-------ATT-TGG-AATATATATGC---ATC-CAAAG-CAT-GG-GTGG---------------T-CA---T------T-T----G-AAGTCTAGAAAAACT-ACA-A-----CATTTTAG-AGCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAACC----GGTCGTATCGCTTTAA---TAG-C-A--T-CAC---G-TGA----TTCTGAGACTATACGGAAAC-TG-----GGAAACC-GCTT--ATT-GATA-G--AC-A-AA-G-----GAC-CATATG-T-T------ACCAGA-C-AG-------------G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-GT-T------CC--AGatcac
gi|24 : T-ATT--AATAT---A-CT----G-ACAAT-GAA-A----ACATTG-T--T--T---TCC-------TATGTAG-C----AC----ATTGTTTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTA---AG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATTTA-CA----G----AA---ATGTTCC---A---T-AA-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AGTAA----G-CTATAG-----------ACTTT---TGT-ATCATC--TATTG
gi|25 : gTT-G-TTAG--AA-G-AA-G-----GAC-AA---AAT-T------A-AAAA-G-GAT--------T-GTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TATTCTA-TT------AA-G---TAT-A-TG---GTCTC---ATGA-------T-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-AC-A-ATCGCAAAA----TTACAA-C-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--T-CAAT-GGAATTCA-A-TAC-CCAT--G---t
gi|26 : ACA----AGTCTTA---CGTCCT---TGG-C-A--T-CGC---G-AGACTCTCTCT----CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAATC-GCTT--ATT-G-TTAG--AA-G-AA-G-----GACAAA---A-T-T------A-AAAA-T-AAT--------T-ATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTC----AAA---TATATCTACC------AA-G---TAT-A-C----GTCAC---AAGA-------A-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-AC-A-A-CGCAAAA----TTAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATTgaa
gi|27 : a---A--CGT-TAATGA-CAGTCC-CCTATGT---TCTCG-----T-G-GT-AATA---CA-G-G----TT---GTA--TATCAATATTTCTTTCT-C-TTGCACTA-A-C-C-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAATT--TATACATAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-A---T-------------------T-ATT--AGTATT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T--T--G---TTCCCCTAAACA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-A-GA
gi|28 : ta--A-TATT--A-CT----G-ACA-T-GAA-A----AATTG--T--T--T---TCCGATG---TA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-A-G-T-C-TGGTAG-----T-T-TTTTTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-GT--A--T------A-TA-G---AA-----ACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATTTT-CA----G----AA----TTTT------------A-TT---TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGT-A----GTT--TAG-----------A-TTT---TGT-ATCATC--TATTG
gi|3 : a-C-A--T-TGC---G-AGACTC--TCT----CTATTTCGAAACATGCG---GGGAACC-GCTT---TT-G-TT-G--AA-G-AA-G-----GAC-AA---AAT-T------A-AAAAAC-AAT--------T-A-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAGT-A------CC--AGAT-T--C-TTCA---AG----TATTCTT-CC------AA-G-T--ATCA-CG---GTCAC---AAGA-------A-TCA---A--ATCT----A-T-GT--C--ACCAG-AC-A-ATCGCAAAA----TTACAGCC-A-TTC-CC-A--AATG--TAG-ATTAAG-A-CT--T-T-ATA-----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA----TAG---C-CAATTGGAATTCA-G-TAC-C-ATA-G---A---CAA----AGACAAA----TCGA-----A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-ACCTCC-TTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCA-GA--CATACATA-T-T-AAGGCACA-CTG--CTCGT--ACTA---AATAAAA---G-ACT-TA-TCCA-G-AC--GTGTAA--CAT-TATTGA-TAGTCTAT---TGT---TCTTGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG-A--GACG---CGT--TATCATTACTT-TTTCT-CCT-GCACTA-ATG-TTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATA-GTATACATAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTA---T-G-G--GGAAG-ATGACTCT-ATT--AATATTT-A-CT----G--CAA--GAA-A----AATTTGTT--T--T---CTC-------TA------CTGTAAC----ATTGTTTATAATA-A-GAT-C-TGGCCT-----T-T-TTT---AAATTT-ATA----TT--T-T-GT--A--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATTTA-CA----G----AA---ATG-T-C---A---TGAA-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TGT-A----G-T--TAG-----------A-TTT----TT-GTGATT--TATTACta
gi|30 : -TAT-A-CGCGGGTCAC----TGA-------A-TCATTTC--AT-TTTTAA-T-GC--CCT-TCAG-AC-AGATCGTGTAAT-ATTTACAGTCTA-T-TACC-ACTAATT--GAG-ATTAA----CG--T-TTATATTTA-GTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATC-ATTGA--C-CAAT-GGAATTCA-G-TAC-Ctt
gi|31 : agATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTATA-CATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------A-C-TAG-A----GTATGCTTCATT-TG----TATGGG-ATGGT---TGCT-CTGC--TGCA---GAA-A--T-T--G-C-AAAGTTAGAAAAAGT-ACA-GTCC--CA--T-----GCTGC--TAGAAT--------TGCAACA----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaaT--A--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATTTA-CA----GTCCGAA---TTTTT-C---A---T-AA-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGG-G----A-T--TAG-------------TTT---TAT-ATgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATTTGTCA----T----TA---ATTTC-T---ATATT-AA-ATA--TGT-------TTT-A-AAT-----------TT-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGC-G----G-T--TAtcagattattttgtgtcatatattgtaac
gi|35 : -TATT--A-CT----G-ACAAC-GAACA----A------T--TGTT---TTCCGATG--TA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGATCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATCTA-CA----G----AA---ATGTT-C---A---T-AA-GTA--TG---------TT-A-AAcggtagattaaaaagattattttgtgtcattaattgtaa
gi|36 : AAAAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AAA----CTTTAT-CA-CTTTTATA-CAGTACT-TTTA-AAA-GTC-TTCCTTTAATG-T-TGG-A----ATATGC---ATC-TGAAG-TATGGG-ATGGG---TGTT-C-AA--T-CATTTCAAAT--T-TAAA-A-AAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTGT--A--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATTTA-CA----G----AA---ATGTT-----A---T-AA-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TGT-AG---G-T--TAG-----------A-TTT---TGT-ATCATC--TATTGaaaa
gi|38 : -AA-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TGT-G----G-T--TAG-----------A-TTT---ta
gi|39 : caaaaagtattttgtaatatagtccgaatttttcattagcattctatgtaA---A-ATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA----TAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT--G---GAATTAA----G-----A----CA-A-----T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCGCC-TTCCTtaacagattattttgtgtcatttattgtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACA-CACGAAAAAAATATGCAAT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGTTTTAC-TAGATTT---GCCCTAGTCTCCCAC-CGACAA-ACTATTTGCCGCATTT-CATTTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACAT-TGAATCAAT-ATTAGC--CGA-TGCTTATA---AAAACT-GGGA-TTGCTTAAAAAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAAA----CTTGAT-CA-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG-GCC-GTC-------G-C-TAG-A----GTATGC---ATC-TTAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAAA--T------CAAGA--T-TCAG-A-AAAACTAGAAAAATT-ACA-G---------TTAGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTT---ACTTCCT---TGG-C-A--T-CGC---G-AGACT--CTCT----CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAATC-GCTT--ATT-G-TTAG--AA-G-AA-G-----GACAAA---A-T-T------A-AAAA-T-AAT--------T-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TATTCTT-CC------AA-A---TAT-A-CA---GTCAC---AAGA-------A-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-AC-A-GTCGCAAAA----TTAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-ATA---A-GTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T----ATAGG--C-CAGT-GGAATTCG-G-TAC-CCAT--
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAATT----TACACAAT----TA--TCGTC----TACTATTTT-A-G--GGA-G-ACAAATCCAATT--AGTAGT--A-CCCTGAG-AAAAT-AAA-A----G------T--T--a
gi|42 : tcTTA-CA----GTCCGAA---TTTTT-C---A---C-AA-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TGC-ACATTG-T--TAG-----------T-TTTTAGCAT-AT-ATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCCT---TGG-C-A--T-CAC---G-AGACTC----------TATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGACC-GCTT--ATT-G-TT-----A-G-AA-G-----GACAAA---A-T-T------A-AAAA-C-AAA--------T-TTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T-------------AA--AGAC------T-TA-TTCA-G-AT--GTAA-A--CAT-AATTGA-TGCTCC-
gi|45 : a-GACAC-GCAT--GTTTATCA---T-G-A--GGT-G-ATAACTCA-ATC--GGCATC--A-CA----G-AGAAT-GAA-A----A------C--T--TA--TTT-------TA----------------------TTAAAAAA-A-TAT-C-TGGTCG-----T-TCCTG---AG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTGAA-TA--CATACAGG-ATT-AAGGCATAATTT--T--GT--ACTAAAGAA--AAACG-------TA-TTCA-G-AT--GTA--A--CAT-TATTGA-TAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGT-A----G-T--TAG-----------A-TTT---TGT-GTCATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAAA----CTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : ACA----GGTCTTA--A-TTCCT---TGG-C-A--T-CGC---G-AGACTC--TCT----CTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAACC-GCTT--ATT-G-TT-AGAAA-G-AA-G-----GAC-AA---AAT-T------A-AAAA-A-GAT--------T-ATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-T-CA---AAA---TATTCTA-CC------AA-G-T--AT-A-CG---GTCAC---A-GA-------A-TCA---A---T-T----A-T-GC--C--ACCAG-AC-A-ATCGCAAAA-----TACA-GC-A-T-T-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TACACCATAGA---A---TTA----GACA--A----TC-A-----C----TTC-TGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCTC----CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT-----A-------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTCC-TCG--AAAACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA-----AAGAAAA-ATACA----TATC--------------CCCATAAATTGCA--ATATGGATTTCGTG-TCAA------CACACA--AACACT-----TAGTTATCATTGTTCCCACACGATCTCA-----TAT-GTCATC-C-TACCTATGA---AA-----AACGTGGA---CTTATT---AAA-------A-T--------AAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAAA----CTTTAT-CT-ATTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG-ACC-TCT-------G-C-TGG-A----ATATGC---GTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGA---AGTT-CAAA--T------CAAGCCTT-TAAA-A-GATTTTAAAAAATTT-ACA-G-----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtactta-AA---G-T-T------A-AAAC-C-AAA--------T-ATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G--T-A------CC--ACAT-CATC-TTCA---AAA---TATTCTG-CC------TA-G-C--AT-G-CG----TCAC---ATGA-------T-TCA---A--AT-T----A-C-GT--C--ACCAG-AC-A-ATCGCAAAA-----TG------A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-ATA---A-ATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TG-AAT-GGAATTCA-G-TA--CCAT--GAAAA---TAA----G-----G----AC-AACAATT----TTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGG---------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-----T--GT--A--A---A---------G-ACT-TA-TTCA-G-ATTGATCA-A--CAT-AATTGA-TGCTCC-------T---TCT------------------------------ATG---TTT--TA--CAT--TT-TT------T-GCAGTA-A-G-T-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAAT---TAGGCATAGTG-AACAC-TTGT-GTTTTGGCA---TCG-A--GGA-G-ATGACTCC-ATT--T-TGTGAAA-CT----G-CCCAT-GCA-A----A------TAGT--T---TCCGTACTCGTA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-C-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTT---AG-TTT-AC-----TT--T-ttgctgcag
gi|8 : aatca--T-T-ATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TG-AAT-GGAATTCAAG-TAC-CCAT--AGA-A---TAA----A-----ACAA-TA-A-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-ACATC--TTCT-ATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA---ATACAAG-A-TCAAGGCATAAT------------------AA--AGAC--------TA-TTCA-G-AT--GTA--A--CAT-TATTGA------------------TCTTG-----T-G-GTAAA-A---CA-G-AT-GAC----GCT--TATCATTACTT-TTTCTCC-T-G-CACGAA-G-T-AC-TCTG-CTCC-C-AGAAA-TGATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAATT--TATACATAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA-----A-T--GGA-G-GTGA--CT-ATTA-A-TATT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T--TG-T---TTCCTATG--TA------C----A-----ATTGTTTA-AAAA-A-GAT-A-T-GTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-A------TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTTTA-CA----G-----A---ATTTT-C---A---T-AA-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TGT-A----G-T--TAG-----------A-TTT---TGT-GT-ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : t---A--AT-T------T-AC--GTCACCAG-AC-A-ATCGCAGAA----TTA--------T-C-CC-A--AATG--TAG-ATTAAG---CA--T-TTATA---A-ATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GGAATTCA-G-TTC-CCAT--G---AAAATAA----G-----A----CA-A-----CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTCAAAAA-CAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGAT-------GT--A-----------AA---G-GCT-TA-TTCA-G-AA--GT---AAACAT-TATTTA-TGCTCCAC---TATG--TTTT----------------A---CA-A-------------------------TT-TTT-----T-GCAGTA-A-G-T-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAATT--TAGGTATAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCA---T-G-A--GGA-G-ATAACTCC-ATT----TGTGAAA-CT----G-CCCATCTAA-A----A------TAGT--T---TCCGTACTCGTA------C----A-----ATTGTTTATAAAA-T-TAT-C-TGGTCGGTTTTT-T-TTT---AG-TTT-ACTTTGATT--T-T-GT--A--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 1 22 4444444444 11 1 11 4444444444 1 11111111 11 111 1 4444444 1 11111 111 11 111111111 1 111 2222 1 1 111 4444444444444 333333333 4444444444444444 2222222 11111 6666666666 111 1 22222222222222222222 111 1 1111111 2222222222222222222 33333333333333333 11 11111111 1111 1111111 11111111 1111111111 2222 2222222 22222222 2222222222 111111111111111111 33333333333333 888888888888888888888888888888888888888888 1 5555555555555555555555555555555555555555 55555555555555555555555555 333 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 2222 11 2 5555555555555555555555555555555555 11111 1111 111 1 2222 11111111111111 111111111 11111111111 1111 5555555555555555555555555555
lowQualScore : 3 3 1 1 7 0000 1 6 0 2 22 2222222222 66 0 22 33 0000000000 0 99999999 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 44 999999999 3 3 999 8888 7 3 3 666 1111111111111 111111111 8888888888888888 7 6 7777777 1 66666 6666666666 111 2 55 3 0 3 88888888888888888888 3 444 3 22 5 0 66 22 1 9999 4 4 4 2 4 1 4 55 3333333 4 4 4 4 8888 777 4 3 3 8888 3 55 7777777777777777777 777 1 4 55555555555555555 00 88888888 888888 3 5555 66666 3 77 888 3 2222222 3 66 2 33 2 2 4 2 66 5 2 0 22222222 777777 2 5 4444444444 5555 66666 5555 22 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 888 555 3333 4 888888 2 5555 2 2 444 555 3 2 9999999 444 33 2 5555 2 2 4444444 2 2 2 33 33 555 55555555 2 2 5 66 66 2 2222222222 2 5 2 444 999999999999999999 5 2 2 2 88888888888888 2 2 2 2 000000000000000000000000000000000000000000 3 3 22 3 4 3 77777 55 0 3 3 4 4 4 4 2222222222222222222222222222222222222222 4 11111111111111111111111111 4 4 555 55 222 3 3 0 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 88 3 3 3 0 7 0000 3 3 3 6 0 3 88888 77 6666 2 2 2 2 33 0 2 2 33 5 2 1 0 555555 2 2 3 22 5 1 2 2 4444 2 2 2 4444444444444444444444444444444444 7777777 2 33 2 5 2 2 77777 2 5 5555 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 2222 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 99999999 6666 5555 2 5555 1111 7777 2 777 88888888888888 444 33 66 999999999 33 2 33333333333 5 2 2 2 2 2 2 5555 1111 2 1111111111111111111111111111 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. .......... .. . .. .. .......... . ........ .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. ......... . . ... .... . . . ... ............. ......... ................ . . ....... . ..... .......... ... . .. . . . .................... . ... . .. . . .. .. . .... . . . . . . . .. ....... . . . . .... ... . . . .... . .. ................... ... . . ................. .. ........ ...... . .... ..... . .. ... . ....... . .. . .. . . . . .. . . . ........ ...... . . .......... .... ..... .... .. . .. .... . . . ...... .. . . ... ... .... . ...... . .... . . ... ... . . ....... ... .. . .... . . ....... . . . .. .. ... ........ . . . .. .. . .......... . . . ... .................. . . . . .............. . . . . .......................................... . . .. . . . ..... .. . . . . . . . ........................................ . .......................... . . ... .. ... . . . ........................................................ .. . . . . . .... . . . . . . ..... .. .... . . . . .. . . . .. . . . . ...... . . . .. . . . . .... . . . .................................. ....... . .. . . . . ..... . . .... . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... .... . .... .... .... . ... .............. ... .. .. ......... .. . ........... . . . . . . . .... .... . ............................ . . . . ..
lowQualScore : 3 7 0 0 3 5555 0 5 0 8 00 0000000000 55 0 22 88 8888888888 0 22222222 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 00 000000000 3 7 000 3333 3 3 3 000 3333333333333 333333333 3333333333333333 3 7 3333333 0 00000 0000000000 000 5 88 2 0 2 66666666666666666666 2 333 3 88 7 1 11 66 9 4444 4 4 0 4 0 4 0 66 0000000 0 0 0 0 5555 000 0 6 6 4444 6 00 9999999999999999999 888 3 0 99999999999999999 66 55555555 111111 5 0000 77777 1 33 555 1 3333333 1 88 9 99 7 7 0 7 33 3 7 3 88888888 222222 5 0 4444444444 3333 22222 3333 00 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 999 000 8888 8 222222 9 7777 7 7 777 000 8 9 3333333 777 77 7 7777 7 7 5555555 7 7 7 77 99 000 11111111 9 9 7 33 33 7 0000000000 7 3 5 444 777777777777777777 7 9 9 9 66666666666666 9 9 9 9 999999999999999999999999999999999999999999 6 6 00 3 4 3 22222 00 2 3 3 6 0 0 0 4444444444444444444444444444444444444444 0 88888888888888888888888888 0 0 555 55 333 6 6 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111 77 6 6 6 9 3 2222 6 3 3 7 7 3 88888 11 1111 9 9 9 9 99 4 9 9 99 3 7 0 4 999999 7 7 3 99 0 5 2 2 7777 2 2 2 6666666666666666666666666666666666 2222222 5 44 5 0 7 7 33333 7 3 7777 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 1111 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 3 7 7 7 77777777 1111 7777 7 7777 7777 6666 7 333 33333333333333 777 77 33 777777777 55 7 66666666666 3 7 7 7 7 7 7 7777 0000 7 6666666666666666666666666666 7 7 7 7 77
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC-TTCTTTTTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-AAAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-AT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT--G-A-A---TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAAAAA---GGACT-T-ATTCA-G-AT--GTA--ACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCT-C-T-GCACTAA-G-T-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTAT-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T---T--T---TTCC-ATG----T----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCCTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGCTTTCTTTTTTTCACACGATCTCA-----G-TGGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTNAG-A-AAAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATTAAA-A-CA--T-T-AT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT--G---A---TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAAAAAC--GGACT-T-ATTCA-G-AT--GT---ACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCT-C-T-GCNNCGA-G-T-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTNTGTTTACTAT-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T---T--T---TTCC-AT-----T----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCCTTCAAC-A-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTACA----A-GAAAA-ATGCA-ATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TT-ACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGAAAC----T--TTGGCGCTTTCTTTTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-AT-AGCACCAA-TTGTTTATAGAAAAAAAT-G-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-GCAAA----A--TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCGCC-GTC-------GCAT-AGCA-ATAG----AC---ATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAA--AT-CA---CAAGATCAAGCA-AAAA--CTGAAAAAATTGACA-G-----CATT--AGCAGCCGCCTGAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACTCCT--C-A--CTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTTT-T-GAA-GC-AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-GT-A-------C--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T--TCTC------GA-G-T-TAT-A--G---GTCAC---AAG-A-------ATAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAGAATT---TACAAGC-A-T-C-CC-AC-AGTG--TAG-ATTAAA-A-CA--T-T-AT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---ATAGC--CGCAAT-GGAATTCA-GATAC-CTAT----------T-A----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACTT-CCTTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATATAAG-A-T-AAGGCTTAATTGCTT--GT--A-TAAAAAACATGCACTCT-ATTCA-GCAT--GT---ACATCTATTG-ATAGTCCTC---TGT---TCT-TG-----T-GAGT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATTCATAC-TT-TTTCT-C-T-GCCCCTA-GCT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAAT-TGGTATA-C-A--TGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTAT-GCG--GGA-GAATGACTCT-A-TTA-TATT-A-CT----G-ACAAT-GAA---------------------------C-AC-----T----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-AGGAT-CTTGGTCG-----C-T-TTA---AG-TTT-AT-----TTACT-T-GT--A--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTCA--AT--------------A---G-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTG-CTA-T-CATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAAA-CACCACT-TTTATAAG-GCG-GCC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAGG
gi|10 : --------AATCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTAT-TAGAA-G--AA-G-TACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAC-A-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAT-AT--AA-A-CAT-T-T-AT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATA-G---AAT-TAA----GACA--A----TCAA-----C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CGATCTTtcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaA-T-GCT---G---AAAAACTA-AGA-GTATCAAAG-AAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-GT--GTC-------CT-T-TG-AGATAT----CC---CTC-AGATA-TATGGG-GTGGT---TGAT-CAA--AT--A----AAAATTCTG-A-AAA---CTTTAATCTCT-GCTTG-----CATT--AG---------GAAGATT-------AATCAT-T----GGACT-A--ACTTCA-A---TGAC-G--TCAC---GGAAAT-CT--T-T--C-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAA-TCACTT--A-TTGT-TAGAA-G--AATG-GTA-AA---A-TTTAAAAAA-AAAA-TAA-C--------TATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-TT-A------CC--CGAA-TATC--TCAAATAAA---TAT-T-AT--C------AA-A---CAT-T-TG---TTTAC---ATG-A-------AT-A---A--AT--------T-GC--ATTATTAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TA-ATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATTCAATATCA--A-T-AT-A---A
gi|12 : ---AGAAAC-T-GGG-TTGCCGAAA-AAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGTA-TCTTACT-TTTATTAG-ATC-ACT-------TT-T-AG-A-ATAT----GC---CTC-TGGGG-TATGGA-ATGCATTTTTTT-TAA--AT-T-------GATCT--------A--TTAGAAAAATT-CCA-GTTATACAT----GCAGCC-----AAAAT--------AGTAAT-G----GG---------TTCC-TATATAGT-ATGTCTCATAAAGAAT-CA--T-T--ATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAA-C--CCT--A-TC-----AAA-T--AA-GAGAC-AA------T------A-AAAA-AAA-TCTCACAGCTGTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-GT-ATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---AAA---TAT------CC------AA-GAC-TAT-A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACGTTT-CCTTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-AATAACTAGACAAATG-T-AAGGCTTAATTG--T--GTCTACTTACA-----GGACT-T-ATTCAAG-AG--AC---ACAT-TATTG-ATAGTCC-A---TGTGTCTCT-TG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G--T-GTCGGATGCTTCTATCCATA---T-TTTCC-C-T-GC-ACTA-G-T-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-T-AT-T--TATATC-A--AAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTAT-G-G--GG--G-ATGA---T-A-TTA--ATT-ATCT----GAACAAT-GAA-A----attccaaaatgtagact
gi|14 : -TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA-----AGATTCTG-CTGAAA--CTAGAAAAA-------------------------CGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGACCA--TCAA---GAGACT-CT---------ACTTCGAA-C-AGGG--TGGGAA-CACCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-G-----------------------------------------G----TA---------------TT-T-C-T--AATA----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAT-ATCA---G-CAC---ATA-T-------ATAG---AGGAT-T----ACT-GT--CCC-CCAGTT-CA-A-CGCCAAAGA--T---TAC--GC-ATT-C-CC-A--AATGC-TAGCAGTA------A--C-T-A--A---AATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-GATTGATCGA--CTTGAT-GA----CA-G--AC-CAAT--GGAAA---TAA----GACAC-A----TCAA-----C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--tgataatttgttttccttatgtattcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAG-TT-TTTCT-CCT-GCC-------T-AC-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAAT-T--TACA-T-A--GAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAAC-G-G--GGA-G-ATAACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAG-GAA-AGCTTA------T---T--T---TCCT-ATG----T----A--CA-A--ATCTTTATAAAA-A-TGT-C-TGGTCC-----T-T-TTG---AG-TTT-AT-----TT--T-A-AT--A--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATA----CA-CG----GTTT-AACTTAT-TTTC---AT--------------T---A-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TG----CG----T-TT--------A--GATTAAAAAATC-----A-TTTT-ATG-T-CATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataat-T-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTAT-G-T--GGA-G-ATGACTCT-ATTTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----AATTG--T---T--T---TTCCTATTG---T----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-AGGAT-C-TGGTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-T----TA-CA----G----AA---TT-TCTG---TT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGta
gi|17 : C-TT-TTTCT-C-TTGTGTGAA-A-T-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAAT-T--TACA-C-A--TAGTT-GATAC-CCGTGT-TTTACTTT-G-G--GGA-G-ACAAATCC-A-TTAGTATT-A-AA----G-AAAAC-GAA-A----A------TTTAT--T---TTCT-ATAG---T----A--AA-A--TTTTTTCTAAAG-A-GAT-C-TGGTAG-----T-T-TTT---AG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAAT-T--T-----------------------GTCTGTT-ACTAT-A-G--CAA-G-ATGACTC--A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T---T--TATCTTCCTGTG----T----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-C-GAT-A-GGGTAGT----T-T-TTC---GG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--ATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TT-TAATCTG----AA---TC-TTTCATTAT--------------A---ATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T-------------------------------------------A-TTTT-GTG-A-CATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAA-CCACTT--C-CTGT-TAAAA-G--AA-T-GGC-AA---A-TT------A-AGAA-CGA-T--------TATG----TAT-A-----GAT----TTAT-CAC--AATA----T-G-GT-A------CC--CGAG-TATC-AAAAAG-AAA---TAT----TACC------AA-A---CAT-T-CG---TTCAC---ATG-A-------ATCA---A--AT-T----A-C-G----TTATTAT-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAT-TGC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-A-TA--TCT-GT-G---TATCACCTTTTGT------------------attgtaa
gi|2 : atgtC-A-TACATTGACCCAATTATTA-CGCTGAAT-GCT-ATA---AGAA-C-T-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAG-TTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTATGCA-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A---AT----GC---A-C-TGAGC-TATGGG-GT-GG---T-TT-CAAAGAT-T----CAAGATTCAG-A-AAAA--ATAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA----GGTCTT---ACTTCCTT---TGTC-AT-TCGCG--GAGACT-CT--CGT--CTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTGTCTAGAA-AGCAACG-GACAAA---A-AT------A-AAAACCAATT--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-GT-A------CCCAGGAT-TATC-TTCA---AAAGATTAT-TGCTTCC------AACG-TATTT-A-CG---GTCAC---AAGAA-------ATCA---A-----T----A-TAGC--CAC-CCAG-ACCA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-A-T-C-CC-A--AATGCTTAG-ACT-AA-A-CAATT-T-ATAA---AGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---TAAGGAAC-CAAT-GGAATTCA---TAA-CCAA--G---AAC-TAACGACA-----A----TCAA-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACA----TA-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT--GAGA-CG-CATACT---GGAATGT--A-TA--CATACAAG-A-T-AA-GCA-AATTG--T--GT--ACTAAAAAAG--TGATT-TAATTCA---AT--GTA--ACA--TATTGAATAG--------TGT---TA----------------AA-A---CA-GGAG-GACGC--GCT--TATC-ATAC-TT-TTTTC-C-T-GCCACAA-G-T-AC-T-CG-CTCC-C-AGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AA--T--TATA-CAA--GAGTGCGACAC-TCG-GTG-TTAATAT-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-A-TTAATA-T-A-----------AAT-G---------------T---T--T---TCCT-ATG----T----GACCA-A--TTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCT-----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T--T--A--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---T-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTG----TA----G--T--------A--C----------------A-TTTT-GTGAT-CATC--TATTGaacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|20 : aT---CCT-TA-----T-G-GTGAA-A---CA-G--A-GGAA---ACT--TATCACTAC-GT-TTTCT-CGT-GCACTGA-G-T-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAAT-T--TACA-T-A--TGATG-GACAC-TC--TTG-TTACTAT-A-G--GGA-G-ATGAACCC-A-TTGGTATC-A-CT----G-ACAAT-GAA-AAGTTA------T---T--T---TTCCAATG----T----A--CA-A--ATGATAATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----TGT-TTT---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : GAAAAATT-ACA--------ATT--AAACGCAGC--AAGAAT--------AGTTAC-GTACTGG-ATTA--ACTTTA-A---TAGC-A--TCAA---GGGAAT-CA--C-T--TTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAA-CCA-TTAAA-TCAT-----A-G--GC-G-G------------------A-AAAA-CGA----------TGTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-AT-A------CC--AAAC-TACC-TTAG---TGA---CAT-T-TTTCCGTATAAAA-C-T-TCT-A------GTTACAATACG-AGAAACACATTA---A--AT-T----A-T-GA--TGTACCA--A-CA---TGC--AAA
gi|22 : atatcaaaacgaatct--AATG--TTG-ATTAAA---CA--T-TTAT-A---AATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GAAATTCA-C-TAC-CTAT--GGAAA---TAA----A-----AACAATC-AA----C----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-ACCC-C----TTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG--------------------T-AGGACACAATTA--T--GT--ATTAGATAAC--G-----T-A----------------ACAT-TATTG-ATAATCC-TCTGTGT---TCT-TG-----C-G-GT-AA-A---CA-GA-G-GACct
gi|23 : tTTTATA-CAATACT-TTCATATG-ACC--TC-------AT-TTGG-A-ATATATATGC---ATC-CAAAG-CATGGG--TGG---------------T-CA---T----TTGA-----AGT--CTAGAAAAACT-ACA-A-----CATTTTAG-AGCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAAC-C----GGTCGTATCGCTTTA-A---TAGC-A--TCAC---GTGATT-CT--G-AGACTATACGGAAAC-TG-----GGAAA-CCGCTT--A-TTGA-TAGAC-A--AA-G-GAC-CATATG-TT------ACCAGA-CAG-------------G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-GT-T------CC--AGatcac
gi|24 : T-A-TTAATAT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----ACATTG-T---T--T---TCCT-ATG----T----AG-CACA--TTGTTTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTA---AG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATT----TA-CA----G----AA---ATGTTCC---AT--------------A---A-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AG----TAA---G-CT--------ATAG----------------ACTTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|25 : g-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-GGA-T--------TGTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTATT------AA-G-T--AT-A-TG---GTCTC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAA-C-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-AT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--T-CAAT-GGAATTCA-A-TAC-CCAT--G---t
gi|26 : AC-A----AGTCTTA---CGTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CTCTC-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTC----AAA---TATAT-CTACC------AA-G---TAT-A-C----GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-A-CGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATTgaa
gi|27 : a---ACGT-TAATG-ACAGTCC-CCTATGT---TCT-CG-----T-G-GT-AATA---CA-G--G---TT---GTA--TATCAATAT-TTCTTTCT-C-TTGCACTAA-C-C-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAAT-T--TATA-C-A--TAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-AT-------------------T-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T---T--G---TTCC-CC-----TAAACA--CA-A--TTGTTTATAAAA-A-GA
gi|28 : taAATATT-A-CT----G-ACA-T-GAA-A----AATTG--T---T--T---TCCG-ATG----T----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-A-G-T-C-TGGTAG-----T-T-TTTTTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-GT--A--T------A-TA-G---AA-----ACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TT-CA----G----AA----T-TTT------------------------A-TT---TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----GTTT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|3 : C-A--TTGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAACATGCG---GGGAA-CCGCTT----TTGT-T-GAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAAACAA-T--------TA-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAGT-A------CC--AGAT-T--C-TTCA---AG----TAT-T-CTTCC------AA-G-T--ATCA-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--ATCT----A-T-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAGCC-A-TTC-CC-A--AATG--TAG-ATTAAG-A-CT--T-T-AT-A----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA----TAG---C-CAATTGGAATTCA-G-TAC-C-ATA-G---A---CAA----AGACAAA----TCGA-----A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-ACCT-CCTTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCA-GA--CATACATA-T-T-AAGGCACA-CTG--CTCGT--ACTAAATAAA--AGACT-T-ATCCA-G-AC--GTGTAACAT-TATTG-ATAGTCTAT---TGT---TCT-TGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG--A-GACG---CGT--TATCATTAC-TT-TTTCT-CCT-GCACTAATG-TTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATAG--TATA-C-A--TAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTAT-G-G--GGAAG-ATGACTCT-A-TTAATATTTA-CT----G--CAA--GAA-A----AATTTGTT---T--T---CTCT-AC-----T----G--TA-ACATTGTTTATAATA-A-GAT-C-TGGCCT-----T-T-TTT---AAATTT-ATA----TT--T-T-GT--A--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---A--TGTC---ATG-------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT--TG-T-GATT--TATTACta
gi|30 : -TAT-A-CGCGGGTCAC----TG-A-------ATCATTTC--AT-TTTTAA-T-GC--CCT-TCAG-A-CAGATCGT--GTAA--TATTTACAGTCTA-T-TACC-ACTAATT--GAG-ATTAA----CG--T-TTAT-ATTTAGTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATC-ATTGA--C-CAAT-GGAATTCA-G-TAC-Ctt
gi|31 : agATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTATA-CATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------AC-T-AG-A-GTAT----GCTTCATT-TG----TATGGG-ATGGT---TGCT-CTG--CTGCA---GAA-ATT--G-C-AAAG--TTAGAAAAAGT-ACA-GTCC--CAT-------GCTGC--TAGAAT--------TGCAAC-A----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaaT--A--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGGGATTA----G-TTTTATATTCA--GATT-------------A-TTTT-GTG-T-CATA--TATTGgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATT----TGTCA----T----TA---AT-TTCT---AT--------------ATTAA-ATA--TG--------TTT-T-AAA-----------TTTACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----CG----G-TT--------AC-GGTAGATTAAAAAGATTA-TTTT-GTG-T-CATT--AATTGtaac
gi|35 : TATT-A-CT----G-ACAAC-GAACA----A------T---TGTT---TTCCGATG----T----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-A-GAT-C-TGATCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATC----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAtaa
gi|36 : AA-AAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CAGTACT-TTTA-AAA-GTC-TTCCTTTAATGT-T-GG-A-ATAT----GC---ATC-TGAAG-TATGGG-ATGGG---TGTT-C-A--AT-CATTTCAA-ATTTAA-A-AAAA------AAAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTGT--A--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTT----AT--------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TAG---G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|38 : -C-AAA-A-A--------G----TATTTTGTAATA-TA----GTCCGAA---TT-TTTC---ATTAGCATTCTATGTAA---A-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TG----TG----G-TT--------A--GATTTTAACAGATT---A-TTTT-GTG-T-CATT--TATTGta
gi|39 : -A---AATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA----TAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT--G---GAATTAA----G-----A----CA-A-----T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCG-CCTTCCTtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACACACGAAAAAAATATGCA-AT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGT-TTTACT-AGATTT-G--CCCTAGTCTCCCAC-CGACAAACTAT--TTGCCGCATTTCATTTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGA-T-GCTTATA---AAAACT-G-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAA----ACTTGAT-CA-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-GTAT----GC---ATC-TTAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT------CAAGATTCAG-A-AAAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTT---ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTTCC------AA-A---TAT-A-CA---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-GTCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-AT-A---AGTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T----ATAGG--C-CAGT-GGAATTCG-G-TAC-CCAT--
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAAT-T--TACA-C-AATTA----------TCGTCTA-CTATTTT-A-G--GGA-G-ACAAATCCAA-TTAGTAGT-A-CCCTGAG-AAAAT-AAA-A----G------T---T--a
gi|42 : tcT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AC--------------A---A-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TG----CACATTG-TT--------A--G----------------T-TTTTAGCA-TATATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT---------ATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGA-CCGCTT--A-TTGT-T---A-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-A--------TTTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-----T--GT--A--AA--------GACT-T-ATTCA-G-AT--GTAA-ACAT-AATTG-ATGCTCC-
gi|45 : a-GACAC---GCATGTTTATCAT-G-A--GGT-G-ATAACTCA-A-TCGGCATC-A-CA----G-AGAAT-GAA-A----A------C---T--T--------AT-----T-------------TTA-TTAAAAAA-A-TAT-C-TGGTCG-----T-TCCTG---AG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTGAA-TA--CATACAGG-ATT-AAGGCATAATTT--T--GT--ACTAAAGAA---AAACG-T-ATTCA-G-AT--GTA--ACAT-TATTG-ATAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : AC-A----GGTCTTA--A-TTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAAAG--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-AGA-T--------TATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-T-CA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G-T--AT-A-CG---GTCAC---A-G-A-------ATCA---A---T-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T----ACA-GC-A-T-T-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-AT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TACACCATAGA---A---TTA----GACA--A----TC-A-----C----TTC-TGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-C---CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT------A------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTCC-TCGA-A-AACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA----AAGAAAA-ATACATAT-C--CC----------------CATAAATTGCAAT-A-T-GGATTTCGTG-TCAA------CACAC-AAACACT-TAGTTATCA-----TTGTTCCCACACGATCT----------------C-A-TA---TG--TC-AT-CCTA---CCTA-T-G---------AAAAAC-GTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAA----ACTTTAT-CT-ATTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG-ACC-TCT-------GC-T-GG-A-ATAT----GC---GTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGA---AGTT-CAA--AT------CAAGCCTTTA-A-AAGATTTTAAAAAATTT-ACA-G-----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtactta-AA---G-TT------A-AAAC-CAA-A--------TATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G--T-A------CC--ACAT-CATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTGCC------TA-G-C--AT-G-CG----TCAC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-C-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T--------G--A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-A-CAT-T-T-AT-A---AATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TG-AAT-GGAATTCA-G-TA--CCAT--GAAAA---TAA----G-----G----AC-AACAATT----TTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGG---------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-----T--GT--A--AA--------GACT-T-ATTCA-G-ATTGATCA-ACAT-AATTG-ATGCTCC-------T---TCTATG-----T-------------------------------------TTTACATT-TTT-----T-GCAGTAA-G-T-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAA--T--TAGG-C-A--TAGTG-AACAC-TTGTGT-TTTGGCATCG-A--GGA-G-ATGACTCC-ATTTTGTGAA-A-CT----G-CCCAT-GCA-A----A------TA--G--T---TTCC-GTACTCGT----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-C-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTT---AG-TTT-AC-----TT--T-ttgctgcag
gi|8 : aatca--T-T-AT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TG-AAT-GGAATTCAAG-TAC-CCAT--AGA-A---TAA----A-----ACAA-TA-A-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-ACAT-C-TTCT-ATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA---ATACAAG-A-TCAAGGCATAAT---------------AAAGAC--------T-ATTCA-G-AT--GTA--ACAT-TATTG-A-----------------TCT-TG-----T-G-GTAAA-A---CA-G--ATGAC----GCT--TATCATTAC-TT-TTTCTCC-T-GCACGAA-G-T-AC-TCTG-CTCC-C-AGAAA-TGATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA--A-T--GGA-G-GTGA--CT-A-TTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T---TG-T---TTCCTATG----T----A--CA-A--TTGTTTA-AAAA-A-GAT-A-T-GTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-A------TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTT----TA-CA----G-----A---AT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T--ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : t---A--AT-T------T-AC--GTCACCAG-A-CA-ATCGC--AGAA--T---TA--------T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-G-CAT-T-T-AT-A---AATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TA-AAT-GGAATTCA-G-TTC-CCAT--GAAAA---TAA----G-----A----CA-A-----CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-----T--GT--A--AA--------GGCT-T-ATTCA-G-AA--GTAA-ACAT-TATTT-ATGCTCCAC---TATG--TTT-T----------------A---CA-------------------------AT-TT-TT------T-GCAGTAA-G-T-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAAT-T--TAGG-T-A--TAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCAT-G-A--GGA-G-ATAACTCC-A-TTTGTGAA-A-CT----G-CCCATCTAA-A----A------TA--G--T---TTCC-GTACTCGT----A--CA-A--TTGTTTATAAAA-T-TAT-C-TGGTCGGTTTTT-T-TTT---AG-TTT-ACTTTGATT--T-T-GT--A--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 1 22 4444444444 11 1 11 4444444444 1 11111111 11 111 1 4444444 1 11111 111 11 111 1 111 2222 1 1 111 4444444444444 333333333 4444444444444444 2222222 33333333 5555555555 111 3333333333333 1 111 111 1 1111111 2222222 111111 33333333333333333 11 11111111 1111 1111111 11111111 1111111111 2222 2222222 22222222 111111111111111111 33333333333333 5555555555555555555555555555555555555555 1 4444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 1 444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 111 1 2222 11111111111111 111111111 11111111111 1111 5555555555555555555555555555
lowQualScore : 3 3 1 1 7 0000 1 6 0 2 22 2222222222 66 0 22 33 0000000000 0 99999999 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 44 7 0 777 3 3 999 8888 7 3 3 666 1111111111111 111111111 8888888888888888 7 6 7777777 1 00000000 5555555555 111 2 55 3 4444444444444 8 0 111 3 444 3 22 5 0 66 22 1 9999 4 4 4 2 4 1 4 55 3333333 4 4 4 4 8888 777 4 3 3 8888 3 55 5555555 2 777777 55 7777 1 1 4 55555555555555555 00 88888888 888888 3 5555 66666 3 77 888 3 2222222 3 66 2 33 2 2 4 2 66 5 2 0 22222222 777777 2 5 4444444444 5555 66666 5555 22 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 888 555 3333 4 888888 2 5555 2 2 444 555 3 2 9999999 444 33 2 5555 2 2 4444444 2 2 2 33 33 555 55555555 2 2 5 66 66 2 2 2 2 33 2 444 999999999999999999 5 2 2 2 88888888888888 2 2 2 2 8888888888888888888888888888888888888888 3 3 22 3 4 3 77777 55 0 3 3 4 4 4 4 8888888888888888888888888888888888888888 8 7 999999999999999999999999 4 4 4 99 55 7 3 3 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 3 3 4 7 7 3 3 6 0 3 5 2 1 9 6666 2 2 2 2 33 0 2 2 33 5 2 5 444 555555 2 2 3 22 5 1 2 2 4444 2 2 2 444444444444444444444444444444444444444 55 2 2 2 5 2 2 77777 2 5 5555 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 2222 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 99999999 6666 5555 2 5555 1111 7777 2 777 88888888888888 444 33 66 999999999 33 2 33333333333 5 2 2 2 2 2 2 5555 1111 2 1111111111111111111111111111 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. .......... .. . .. .. .......... . ........ .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. . . ... . . ... .... . . . ... ............. ......... ................ . . ....... . ........ .......... ... . .. . ............. . . ... . ... . .. . . .. .. . .... . . . . . . . .. ....... . . . . .... ... . . . .... . .. ....... . ...... .. .... . . . ................. .. ........ ...... . .... ..... . .. ... . ....... . .. . .. . . . . .. . . . ........ ...... . . .......... .... ..... .... .. . .. .... . . . ...... .. . . ... ... .... . ...... . .... . . ... ... . . ....... ... .. . .... . . ....... . . . .. .. ... ........ . . . .. .. . . . . .. . ... .................. . . . . .............. . . . . ........................................ . . .. . . . ..... .. . . . . . . . ........................................ . . ........................ . . . .. .. . . . . ........................................................ .. . . . . . . . . . . . . . . .... . . . . .. . . . .. . . . ... ...... . . . .. . . . . .... . . . ....................................... .. . . . . . . ..... . . .... . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... .... . .... .... .... . ... .............. ... .. .. ......... .. . ........... . . . . . . . .... .... . ............................ . . . . ..
lowQualScore : 3 7 0 0 3 5555 0 5 0 8 00 0000000000 55 0 22 88 8888888888 0 22222222 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 00 3 7 777 3 7 000 3333 3 3 3 000 3333333333333 333333333 3333333333333333 3 7 3333333 0 77777777 7777777777 000 5 88 2 8888888888888 0 6 777 2 333 3 88 7 1 11 66 9 4444 4 4 0 4 0 4 0 66 0000000 0 0 0 0 5555 000 0 6 6 4444 6 00 9999999 8 777777 00 7777 4 3 0 99999999999999999 66 55555555 111111 5 0000 77777 1 33 555 1 3333333 1 88 9 99 7 7 0 7 33 3 7 3 88888888 222222 5 0 4444444444 3333 22222 3333 00 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 999 000 8888 8 222222 9 7777 7 7 777 000 8 9 3333333 777 77 7 7777 7 7 5555555 7 7 7 77 99 000 11111111 9 9 7 33 33 7 7 9 9 77 5 444 777777777777777777 7 9 9 9 66666666666666 9 9 9 9 9999999999999999999999999999999999999999 6 6 00 3 4 3 22222 00 2 3 3 6 0 0 0 4444444444444444444444444444444444444444 0 2 888888888888888888888888 0 0 0 55 00 3 6 6 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 6 6 5 3 3 6 3 7 7 3 7 9 4 0 1111 9 9 9 9 99 4 9 9 99 3 7 5 777 999999 7 7 3 99 0 5 2 2 7777 2 2 2 777777777777777777777777777777777777777 66 5 5 5 0 7 7 33333 7 3 7777 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 1111 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 3 7 7 7 77777777 1111 7777 7 7777 7777 6666 7 333 33333333333333 777 77 33 777777777 55 7 66666666666 3 7 7 7 7 7 7 7777 0000 7 6666666666666666666666666666 7 7 7 7 77
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC-T-CTT-TTTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGCTT-CTT-TTTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCCTTCAAC-A-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTACA----A-GAAAA-ATGCA-ATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TT-ACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGAAAC----T--TTGGCGCTTTCTT-TTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-AT-AGCACCAA-TTGTTTATAGAAAAAAAT-G-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-GCAAA----A--TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCGCC-GTC-------GCAT-AGCA-ATAG----AC---ATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAA--AT-CA---CAAGATCAAGCA-A--AAA--CTGAAAAAATTGACA-G-----CATT--AGCAGCCGCCTGAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACTCCT--C-A--CTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTTT-T-GAA-GC-AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-GT-A-------C--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T--TCTC------GA-G-T-TAT-A--G---GTCAC---AAG-A-------ATAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAGAATT---TACAAGC-A-T-C-CC-AC-AGTG--TAG-ATTAAA-AC-A-T--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---ATAGC--CGCAAT-GGAATTCA-GATAC-CTAT--------T-A----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACTT-CCTTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATATAAG-A-T-AAGGCTTAATTGCTT--GT--A-TAAA-AAACATG-CACTCT-ATTCAGCA--TG--T--ACATCTATTG-ATAGTCCTC---TGT---TCT-TG-----T-GAGT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATTCATAC-TT-TTTCTC-T-GCCCCTAG-CT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAAT-TGGTATA-C-A--TGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTA---T-GCG--GGA-GAATGACTCT-A-TTA-TATT-A-CT----G-ACAAT-GAA------------------------------C---A-C-----TA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-CTTGGTCG-----C-T-TTA---AG-TTT-AT-----TTACT-T-GT--A--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTCA--AT--------------A---G-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTG-CTA-T-CATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAAA-CACCACT-TTTATAAG-GCG-GCC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAGG
gi|10 : --------AATCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTAT-TAGAA-G--AA-G-TACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAC-A-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAT-A-T-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATAG--AAT-TAA----GACA--A----TCAA-----C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CGATCTTtcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaA-T-GCT---G---AAAAACTA-AGA-GTATCAAAG-AAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-GT--GTC-------CT-T-TG-AGATAT----CC---CTC-AGATA-TATGGG-GTGGT---TGAT-CAA--AT--A----AAAATTCTG-A-A--AA---CTTTAATCTCT-GCTTG-----CATT--AG---------GAAGATT-------AATCAT-T----GGACT-A--ACTTCA-A---TGAC-G--TCAC---GGAAAT-CT--T-T--C-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAA-TCACTT--A-TTGT-TAGAA-G--AATG-GTA-AA---A-TTTAAAAAA-AAAA-TAA-C--------TATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-TT-A------CC--CGAA-TATC--TCAAATAAA---TAT-T-AT--C------AA-A---CAT-T-TG---TTTAC---ATG-A-------AT-A---A--AT--------T-GC--ATTATTAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TA-ATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATT-CA-AT-ATCAATAT-A---A
gi|12 : ---AGAAAC-T-GGG-TTGCCGAAA-AAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGTA-TCTTACT-TTTATTAG-ATC-ACT-------TT-T-AG-A-ATAT----GC---CTC-TGGGG-TATGGA-ATGCATTTTTTT-TAA--AT-T-------GATCT----------A--TTAGAAAAATT-CCA-GTTATACAT----GCAGCC-----AAAAT--------AGTAAT-G----GG---------TTCC-TATATAGT-ATGTCTCATAAAGAAT-CA--T-T--ATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAA-C--CCT--A-TC-----AAA-T--AA-GAGAC-AA------T------A-AAAA-AAA-TCTCACAGCTGTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-GT-ATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---AAA---TAT------CC------AA-GAC-TAT-A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACGTTT-CCTTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-AATAACTAGACAAATG-T-AAGGCTTAATTG--T--GTCTACTTAC-A-----G-GACT-T-ATTCAA-G--AG--A-CACAT-TATTG-ATAGTCC-A---TGTGTCTCT-TG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G--T-GTCGGATGCTTCTATCCATA---T-TTTCCC-T-G-CACT-A-GT-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-T-AT-T--TATATC-A--AAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTA---T-G-G--GG--G-ATGA---T-A-TTA--ATT-ATCT----GAACAAT-GAA-ATG--A------TAATTTGT--T---TTCCTT-A-T----GTA--attccaaaatgtagact
gi|14 : -TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA-----AGATTCTG-CTG--AAA--CTAGAAAAA-------------------------CGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGACCA--TCAA---GAGACT-CT---------ACTTCGAA-C-AGGG--TGGGAA-CACCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-G-----------------------------------------G----TA---------------TT-T-C-T--AATA----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAT-ATCA---G-CAC---ATA-T-------ATAG---AGGAT-T----ACT-GT--CCC-CCAGTT-CA-A-CGCCAAAGA--T---TAC--GC-ATT-C-CC-A--AATGC-TAGCAGT-AA------C--TA--A---AATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-GATTGATCGA--CTTGAT-GA----CA-G--AC-CAAT-GGAAA--TAA----GACAC-A----TCAA-----C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--ttcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAG-TT-TTTCTCCT-G-C-CTA------C-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAAT-T--TACA-T-A--GAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAA---C-G-G--GGA-G-ATAACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAG-GAA-AGCTTA------T------T--T---TCCT---A-T----GTA--CA-AATCT-TTATAAAA-A-TGT-C-TGGTCC-----T-T-TTG---AG-TTT-AT-----TT--T-A-AT--A--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATA----CA-CG----GTTT-AACTTAT-TTTC---AT--------------T---A-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TG----CG----T-TT--------A--GATTAAAAAATC-----A-TTTT-ATG-T-CATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataatT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTA---T-G-T--GGA-G-ATGACTCT-ATTTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----AATTG--T------T--T---TTCCT--ATT----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-C-TGGTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-T----TA-CA----G----AA---TT-TCTG---TT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGta
gi|17 : C-TT-TTTCTC-TTG-TGTGAA-AT-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAAT-T--TACA-C-A--TAGTT-GATAC-CCGTGT-TTTACTT---T-G-G--GGA-G-ACAAATCC-A-TTAGTATT-A-AA----G-AAAAC-GAA-A----A------TTTA---T--T---TTCT---A-TA---GTA--AA-ATTTT-TTCTAAAG-A-GAT-C-TGGTAG-----T-T-TTT---AG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAAT-T--T-----------------------GTCTGTT-ACTA---T-A-G--CAA-G-ATGACTC--A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--TATCTTCCT--G-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-A-GGGTAGT----T-T-TTC---GG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--ATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TT-TAATCTG----AA---TC-TTTCATTAT--------------A---ATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T-------------------------------------------A-TTTT-GTG-A-CATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAA-CCACTT--C-CTGT-TAAAA-G--AA-T-GGC-AA---A-TT------A-AGAA-CGA-T--------TATG----TAT-A-----GAT----TTAT-CAC--AATA----T-G-GT-A------CC--CGAG-TATC-AAAAAG-AAA---TAT----TACC------AA-A---CAT-T-CG---TTCAC---ATG-A-------ATCA---A--AT-T----A-C-G----TTATTAT-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAT-TGC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-AT-ATC--TGT-G---TATCACCTTTTGT------------------attgtaa
gi|2 : atgtC-A-TACATTGACCCAATTATTA-CGCTGAAT-GCT-ATA---AGAA-C-T-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAG-TTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTATGCA-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A---AT----GC---A-C-TGAGC-TATGGG-GT-GG---T-TT-CAAAGAT-T----CAAGATTCAG-A-A--AAA--ATAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA----GGTCTT---ACTTCCTT---TGTC-AT-TCGCG--GAGACT-CT--CGT--CTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTGTCTAGAA-AGCAACG-GACAAA---A-AT------A-AAAACCAATT--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-GT-A------CCCAGGAT-TATC-TTCA---AAAGATTAT-TGCTTCC------AACG-TATTT-A-CG---GTCAC---AAGAA-------ATCA---A-----T----A-TAGC--CAC-CCAG-ACCA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-A-T-C-CC-A--AATGCTTAG-ACT-AA-ACAATT--TATAA---AGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---TAAGGAAC-CAAT-GGAATTCA---TAA-CCAA-G--AAC-TAACGACA-----A----TCAA-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACA----TA-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT--GAGA-CG-CATACT---GGAATGT--A-TA--CATACAAG-A-T-AA-GCA-AATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---GTGATT-TAATTCA--A--TG--T-AACA--TATTGAATAG--------TGT---TA----------------AA-A---CA-GGAG-GACGC--GCT--TATC-ATAC-TT-TTTTCC-T-GCCAC-AA-GT-AC-T-CG-CTCC-C-AGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AA--T--TATA-CAA--GAGTGCGACAC-TCG-GTG-TTAATA---T-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-A-TTAATA-T-A-----------AAT-G---------------T------T--T---TCCT---A-T----GTGACCA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCT-----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T--T--A--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---T-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTG----TA----G--T--------A--C----------------A-TTTT-GTGAT-CATC--TATTGaacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|20 : aT---CCT-TA-----T-G-GTGAA-A---CA-G--A-GGAA---ACT--TATCACTAC-GT-TTTCTCGT-G-CACTGA-GT-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAAT-T--TACA-T-A--TGATG-GACAC-TCTTG---TTACTA---T-A-G--GGA-G-ATGAACCC-A-TTGGTATC-A-CT----G-ACAAT-GAA-AAGTTA------T------T--T---TTCCA--A-T----GTA--CA-AATGA-TAATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----TGT-TTT---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : TCAA-A-ACGAAT--CT-GAAAAATT-ACA--------ATT--AAACGCAGC--AAGAAT--------AGTTAC-GTACTGG-ATTA--ACTTTA-A---TAGC-A--TCAA---GGGAAT-CA--C-T--TTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAA-CCA-TTAAA-TCAT-----A-G--GC-G-G------------------A-AAAA-CGA----------TGTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-AT-A------CC--AAAC-TACC-TTAG---TGA---CAT-T-TTTCCGTATAAAA-C-T-TCT-A------GTTACAATACG-AGAAACACATTA---A--AT-T----A-T-GA--TGTACCA--A-CA---TGC--AAA
gi|22 : ata--AATG--TTG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GAAATTCA-C-TAC-CTAT-GGAAA--TAA----A-----AACAATC-AA----C----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-ACCC-C----TTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG--------------------T-AGGACACAATTA--T--GT--ATTAGA--------------T-A------A--CG--T-AACAT-TATTG-ATAATCC-TCTGTGT---TCT-TG-----C-G-GT-AA-A---CA-GA-G-GACct
gi|23 : tTTTATA-CAATACT-TTCATATG-ACC--TC-------AT-TTGG-A-ATATATATGC---ATC-CAAAG-CATGGG--TGG---------------T-CA---T----TT----G-A--AGT--CTAGAAAAACT-ACA-A-----CATTTTAG-AGCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAAC-C----GGTCGTATCGCTTTA-A---TAGC-A--TCAC---GTGATT-CT--G-AGACTATACGGAAAC-TG-----GGAAA-CCGCTT--A-TTGA-TAGAC-A--AA-G-GAC-CATATG-TT------ACCAGA-CAG-------------G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-GT-T------CC--AGatcac
gi|24 : T-A-TTAATAT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----ACATTG-T------T--T---TCCT---A-T----GTAG-CACATTGT-TTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTA---AG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATT----TA-CA----G----AA---ATGTTCC---AT--------------A---A-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AG----TAA---G-CT--------ATAG----------------ACTTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|25 : g-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-GGA-T--------TGTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTATT------AA-G-T--AT-A-TG---GTCTC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAA-C-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--T-CAAT-GGAATTCA-A-TAC-CCAT-G--GA--t
gi|26 : AC-A----AGTCTTA---CGTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CTCTC-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTC----AAA---TATAT-CTACC------AA-G---TAT-A-C----GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-A-CGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-a
gi|27 : a--T-AACGT-TAATG-ACAGTCC-CCTATGT---TCT-CG-----T-G-GT-AATA---CA-G--G---TT---GTA--TATCAATAT-TTCTTTCTC-TTG-CACTAA-CC-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAAT-T--TATA-C-A--TAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-A---T-------------------T-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--G---TTCCCCTA-A----ACA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GA
gi|28 : AATATT-A-CT----G-ACA-T-GAA-A----AATTG--T------T--T---TCCG---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-G-T-C-TGGTAG-----T-T-TTTTTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-GT--A--T------A-TA-G---AA-----ACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TT-CA----G----AA----T-TTT------------------------A-TT---TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----GTTT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|3 : C-A--TTGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAACATGCG---GGGAA-CCGCTT----TTGT-T-GAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAAACAA-T--------TA-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAGT-A------CC--AGAT-T--C-TTCA---AG----TAT-T-CTTCC------AA-G-T--ATCA-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--ATCT----A-T-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAGCC-A-TTC-CC-A--AATG--TAG-ATT-AAGAC--TT--TAT-A----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA----TAG---C-CAATTGGAATTCA-G-TAC-C-AT-A--GA--CAA----AGACAAA----TCGA-----A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-ACCT-CCTTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCA-GA--CATACATA-T-T-AAGGCACA-CTG--CTCGT--ACTAAATAAA---A-GACT-T-ATCCAG-ACGTG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCTAT---TGT---TCT-TGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG--A-GACG---CGT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACTAATGTTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATAG--TATA-C-A--TAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTA---T-G-G--GGAAG-ATGACTCT-A-TTAATATTTA-CT----G--CAA--GAA-A----AATTTGTT------T--T---CTCT---ACT----GTA--AC-ATTGT-TTATAATA-A-GAT-C-TGGCCT-----T-T-TTT---AAATTT-ATA----TT--T-T-GT--A--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---A--TGTC---ATG-------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT--TG-T-GATT--TATTACta
gi|30 : -TAT-A-CGCGGGTCAC----TG-A-------ATCATTTC--AT-TTTTAA-T-GC--CCT-TCAG-A-CAGATCGT--GTAA--TATTTACAGTCTA-T-TACC-ACTAATT--GAG-ATT-AA--C-GTT--TAT-ATTTAGTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATC-ATTGA--C-CAAT-GGAATTCA-G-TAC-Ctt
gi|31 : agATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTATA-CATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------AC-T-AG-A-GTAT----GCTTCATT-TG----TATGGG-ATGGT---TGCT-CTG--CTGCA---GAA-ATT--G-C-A--AAG--TTAGAAAAAGT-ACA-GTCC--CAT-------GCTGC--TAGAAT--------TGCAAC-A----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaaT--A--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGGGATTA----G-TTTTATATTCA--GATT-------------A-TTTT-GTG-T-CATA--TATTGgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATT----TGTCA----T----TA---AT-TTCT---AT--------------ATTAA-ATA--TG--------TTT-T-AAA-----------TTTACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----CG----G-TT--------AC-GGTAGATTAAAAAGATTA-TTTT-GTG-T-CATT--AATTGtaac
gi|35 : TATT-A-CT----G-ACAAC-GAACA----A------T------TGTT---TTCCG--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGATCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATC----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAtaa
gi|36 : AA-AAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CAGTACT-TTTA-AAA-GTC-TTCCTTTAATGT-T-GG-A-ATAT----GC---ATC-TGAAG-TATGGG-ATGGG---TGTT-C-A--AT-CATTTCAA-ATTTAA-A-A--AAA------AAAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTGT--A--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTT----AT--------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TAG---G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|38 : -C-AAA-A-A--------G----TATTTTGTAATA-TA----GTCCGAA---TT-TTTC---ATTAGCATTCTATGTAA---A-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TG----TG----G-TT--------A--GATTTTAACAGATT---A-TTTT-GTG-T-CATT--TATTGta
gi|39 : -A---AATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA----TAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--GAATTAA----G-----A----CA-A-----T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCG-CCTTCCTtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACACACGAAAAAAATATGCA-AT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGT-TTTACT-AGATTT-G--CCCTAGTCTCCCAC-CGACAAACTAT--TTGCCGCAT-TTCATTTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGA-T-GCTTATA---AAAACT-G-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAA----ACTTGAT-CA-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-GTAT----GC---ATC-TTAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT------CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTT---ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTTCC------AA-A---TAT-A-CA---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-GTCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T----ATAGG--C-CAGT-GGAATTCG-G-TAC-CCAT-
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAAT-T--TACA-C-AATTA----------TC----GTCTACTATTTT-A-G--GGA-G-ACAAATCCAA-TTAGTAGT-A-CCCTGAG-AAAAT-AAA-A----G------T------T--a
gi|42 : tcT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AC--------------A---A-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TG----CACATTG-TT--------A--G----------------T-TTTTAGCA-TATATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT---------ATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGA-CCGCTT--A-TTGT-T---A-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-A--------TTTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-A--TG--TAAACAT-AATTG-ATGCTCC-
gi|45 : a-GACAC---GCATGTTTATCA---T-G-A--GGT-G-ATAACTCA-A-TCGGCATC-A-CA----G-AGAAT-GAA-A----A------C------T--T-------------------------ATTTTATTAAAAAA-A-TAT-C-TGGTCG-----T-TCCTG---AG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-AATA--CATACAGG-A-TTAAGGCATAATTT--T--GT--ACTAAA-GAA---A-AACG-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : AC-A----GGTCTTA--A-TTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAAAG--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-AGA-T--------TATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-T-CA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G-T--AT-A-CG---GTCAC---A-G-A-------ATCA---A---T-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T----ACA-GC-A-T-T-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TACACCATAG--AA--TTA----GACA--A----TC-A-----C----TTC-TGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-C---CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT------A------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTC-CTCGA-A-AACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA----AAGAAAA-ATACATAT-C--CC----------------CATAAATTGCAAT-A-T-GGATTTCGTG-TCAA------CACAC-AAACACT-TAGTTATCA-----TT-GTTCCCACACGATCT----------------C-A-TA---TG--TC-AT--------CC---T-ACCTATG---AAAAAC-GTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAA----ACTTTAT-CT-ATTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG-ACC-TCT-------GC-T-GG-A-ATAT----GC---GTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGA---AGTT-CAA--AT------CAAGCCTTTA-A-A--AGATTTTAAAAAATTT-ACA-G-----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtactta-AA---G-TT------A-AAAC-CAA-A--------TATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G--T-A------CC--ACAT-CATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTGCC------TA-G-C--AT-G-CG----TCAC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-C-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T--------G--A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TG-AAT-GGAATTCA-G-TA--CCAT-GAAAA--TAA----G-----G----AC-AACAATT----TTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGG---------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-AT-TGATC-AACAT-AATTG-ATGCTCC-------T---TCTATG-----T-------------------------------------TTTACATT-TTT----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAA--T--TAGG-C-A--TAGTG-AACAC-TTGTGT-TTTGGCA---TCG-A--GGA-G-ATGACTCC-ATTTTGTGAA-A-CT----G-CCCAT-GCA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTT---AG-TTT-AC-----TT--T-ttgctgcag
gi|8 : aatcaTT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TG-AAT-GGAATTCAAG-TAC-CCATAG--AA--TAA----A-----ACAA-TA-A-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-ACAT-C-TTCT-ATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA---ATACAAG-A-TCAAGGCATAAT-------------------AA---A-GACT---ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-AT-----------------CT-TG-----T-G-GT-AA-AA--CA-G--ATGACG----CT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACGAA-GT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA-----A-T--GGA-G-GTGA--CT-A-TTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------TG-T---TTCCT--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTA-AAAA-A-GAT-A-T-GTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-A------TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTT----TA-CA----G-----A---AT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T--ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : ---A--AT-T------T-AC--GTCACCAG-A-CA-ATCGC--AGAA--T---TA--------T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-GC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TA-AAT-GGAATTCA-G-TTC-CCAT-GAAAA--TAA----G-----A----CA-A-----CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T-------------AAA---G-G-CT-T-ATTCAG-A--AG--TAAACAT-TATTT-ATGCTCCAC---TATG--TTT-T----------------A---CA-------------------------AT-TT-TT-----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAAT-T--TAGG-T-A--TAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCA---T-G-A--GGA-G-ATAACTCC-A-TTTGTGAA-A-CT----G-CCCATCTAA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-T-TAT-C-TGGTCGGTTTTT-T-TTT---AG-TTT-ACTTTGATT--T-T-GT--A--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 1 22 4444444444 11 1 11 4444444444 1 11111111 11 111 1 4444444 1 11111 111 11 111 1 111 2222 1 1 111 4444444444444 333333333 4444444444444444 2222222 333333333 5555555555 111 3333333333333 1 111 111 1 1111111 2222222 111111 33333333333333333 11 11111111 1111 1111111 11111111 1111111111 2222 2222222 22222222 111111111111111111 33333333333333 5555555555555555555555555555555555555555 1 4444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 1 444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 111 1 2222 11111111111111 111111111 11111111111 1111 5555555555555555555555555555
lowQualScore : 3 3 1 1 7 0000 1 6 0 2 22 2222222222 66 0 22 33 0000000000 0 99999999 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 44 7 0 777 3 3 999 8888 7 3 3 666 1111111111111 111111111 8888888888888888 7 6 7777777 1 666666666 5555555555 111 2 55 3 4444444444444 8 0 111 3 444 3 22 5 0 66 22 1 9999 4 4 4 2 4 1 4 55 3333333 4 4 4 4 8888 777 4 3 3 8888 3 55 5555555 2 777777 55 7777 1 1 4 55555555555555555 00 88888888 888888 3 5555 66666 3 77 888 3 2222222 3 66 2 33 2 2 4 2 66 5 2 0 22222222 777777 2 5 4444444444 5555 66666 5555 22 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 888 555 3333 4 888888 2 5555 2 2 444 555 3 2 9999999 444 33 2 5555 2 2 4444444 2 2 2 33 33 555 55555555 2 2 5 66 66 2 2 2 2 33 2 444 999999999999999999 5 2 2 2 88888888888888 2 2 2 2 8888888888888888888888888888888888888888 3 3 22 3 4 3 77777 55 0 3 3 4 4 4 4 8888888888888888888888888888888888888888 8 7 999999999999999999999999 4 4 4 99 55 7 3 3 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 3 3 4 7 7 3 3 6 0 3 5 2 1 9 6666 2 2 2 2 33 0 2 2 33 5 2 5 444 555555 2 2 3 22 5 1 2 2 4444 2 2 2 444444444444444444444444444444444444444 55 2 2 2 5 2 2 77777 2 5 5555 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 2222 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 99999999 6666 5555 2 5555 1111 7777 2 777 88888888888888 444 33 66 999999999 33 2 33333333333 5 2 2 2 2 2 2 5555 1111 2 1111111111111111111111111111 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. .......... .. . .. .. .......... . ........ .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. . . ... . . ... .... . . . ... ............. ......... ................ . . ....... . ......... .......... ... . .. . ............. . . ... . ... . .. . . .. .. . .... . . . . . . . .. ....... . . . . .... ... . . . .... . .. ....... . ...... .. .... . . . ................. .. ........ ...... . .... ..... . .. ... . ....... . .. . .. . . . . .. . . . ........ ...... . . .......... .... ..... .... .. . .. .... . . . ...... .. . . ... ... .... . ...... . .... . . ... ... . . ....... ... .. . .... . . ....... . . . .. .. ... ........ . . . .. .. . . . . .. . ... .................. . . . . .............. . . . . ........................................ . . .. . . . ..... .. . . . . . . . ........................................ . . ........................ . . . .. .. . . . . ........................................................ .. . . . . . . . . . . . . . . .... . . . . .. . . . .. . . . ... ...... . . . .. . . . . .... . . . ....................................... .. . . . . . . ..... . . .... . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... .... . .... .... .... . ... .............. ... .. .. ......... .. . ........... . . . . . . . .... .... . ............................ . . . . ..
lowQualScore : 3 7 0 0 3 5555 0 5 0 8 00 0000000000 55 0 22 88 8888888888 0 22222222 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 00 3 7 777 3 7 000 3333 3 3 3 000 3333333333333 333333333 3333333333333333 3 7 3333333 0 777777777 7777777777 000 5 88 2 8888888888888 0 6 777 2 333 3 88 7 1 11 66 9 4444 4 4 0 4 0 4 0 66 0000000 0 0 0 0 5555 000 0 6 6 4444 6 00 9999999 8 777777 00 7777 4 3 0 99999999999999999 66 55555555 111111 5 0000 77777 1 33 555 1 3333333 1 88 9 99 7 7 0 7 33 3 7 3 88888888 222222 5 0 4444444444 3333 22222 3333 00 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 999 000 8888 8 222222 9 7777 7 7 777 000 8 9 3333333 777 77 7 7777 7 7 5555555 7 7 7 77 99 000 11111111 9 9 7 33 33 7 7 9 9 77 5 444 777777777777777777 7 9 9 9 66666666666666 9 9 9 9 9999999999999999999999999999999999999999 6 6 00 3 4 3 22222 00 2 3 3 6 0 0 0 4444444444444444444444444444444444444444 0 2 888888888888888888888888 0 0 0 55 00 3 6 6 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 6 6 5 3 3 6 3 7 7 3 7 9 4 0 1111 9 9 9 9 99 4 9 9 99 3 7 5 777 999999 7 7 3 99 0 5 2 2 7777 2 2 2 777777777777777777777777777777777777777 66 5 5 5 0 7 7 33333 7 3 7777 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 1111 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 3 7 7 7 77777777 1111 7777 7 7777 7777 6666 7 333 33333333333333 777 77 33 777777777 55 7 66666666666 3 7 7 7 7 7 7 7777 0000 7 6666666666666666666666666666 7 7 7 7 77
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC---CTT--TTTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGCT--CTT--TTTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCCTTCAAC-A-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTACA----A-GAAAA-ATGCA-ATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TT-ACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGAAAC----T--TTGGCGCTTTCTT--TTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-AT-AGCACCAA-TTGTTTATAGAAAAAAAT-G-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-GCAAA----A--TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCGCC-GTC-------GCAT-AGCA-ATAG----AC---ATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAA--AT-CA---CAAGATCAAGCA-A--AAA--CTGAAAAAATTGACA-G-----CATT--AGCAGCCGCCTGAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACTCCT--C-A--CTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTTT-T-GAA-GC-AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-GT-A-------C--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T--TCTC------GA-G-T-TAT-A--G---GTCAC---AAG-A-------ATAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAGAATT---TACAAGC-A-T-C-CC-AC-AGTG--TAG-ATTAAA-AC-A-T--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---ATAGC--CGCAAT-GGAATTCA-GATAC-CTAT--------T-A----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACTT-CCTTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATATAAG-A-T-AAGGCTTAATTGCTT--GT--A-TAAA-AAACATG-CACTCT-ATTCAGCA--TG--T--ACATCTATTG-ATAGTCCTC---TGT---TCT-TG-----T-GAGT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATTCATAC-TT-TTTCTC-T-GCCCCTAG-CT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAAT-TGGTATA-C-A--TGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTA---T-GCG--GGA-GAATGACTCT-A-TTA-TATT-A-CT----G-ACAAT-GAA------------------------------C---A-C-----TA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-CTTGGTCG-----C-T-TTA---AG-TTT-AT-----TTACT-T-GT--A--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTCA--AT--------------A---G-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTG-CTA-T-CATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAAA-CACCACT-TTTATAAG-GCG-GCC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAGG
gi|10 : --------AATCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTAT-TAGAA-G--AA-G-TACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAC-A-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAT-A-T-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATAG--AAT-TAA----GACA--A----TCAA-----C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CGATCTTtcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaA-T-GCT---G---AAAAACTA-AGA-GTATCAAAG-AAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-GT--GTC-------CT-T-TG-AGATAT----CC---CTC-AGATA-TATGGG-GTGGT---TGAT-CAA--AT--A----AAAATTCTG-A-A--AA---CTTTAATCTCT-GCTTG-----CATT--AG---------GAAGATT-------AATCAT-T----GGACT-A--ACTTCA-A---TGAC-G--TCAC---GGAAAT-CT--T-T--C-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAA-TCACTT--A-TTGT-TAGAA-G--AATG-GTA-AA---A-TTTAAAAAA-AAAA-TAA-C--------TATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-TT-A------CC--CGAA-TATC--TCAAATAAA---TAT-T-AT--C------AA-A---CAT-T-TG---TTTAC---ATG-A-------AT-A---A--AT--------T-GC--ATTATTAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TA-ATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATT-CA-AT-ATCAATAT-A---A
gi|12 : ---AGAAAC-T-GGG-TTGCCGAAA-AAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGTA-TCTTACT-TTTATTAG-ATC-ACT-------TT-T-AG-A-ATAT----GC---CTC-TGGGG-TATGGA-ATGCATTTTTTT-TAA--AT-T-------GATCT----------A--TTAGAAAAATT-CCA-GTTATACAT----GCAGCC-----AAAAT--------AGTAAT-G----GG---------TTCC-TATATAGT-ATGTCTCATAAAGAAT-CA--T-T--ATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAA-C--CCT--A-TC-----AAA-T--AA-GAGAC-AA------T------A-AAAA-AAA-TCTCACAGCTGTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-GT-ATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---AAA---TAT------CC------AA-GAC-TAT-A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACGTTT-CCTTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-AATAACTAGACAAATG-T-AAGGCTTAATTG--T--GTCTACTTAC-A-----G-GACT-T-ATTCAA-G--AG--A-CACAT-TATTG-ATAGTCC-A---TGTGTCTCT-TG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G--T-GTCGGATGCTTCTATCCATA---T-TTTCCC-T-G-CACT-A-GT-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-T-AT-T--TATATC-A--AAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTA---T-G-G--GG--G-ATGA---T-A-TTA--ATT-ATCT----GAACAAT-GAA-ATG--A------TAATTTGT--T---TTCCTT-A-T----GTA--attccaaaatgtagact
gi|14 : -TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA-----AGATTCTG-CTG--AAA--CTAGAAAAA-------------------------CGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGACCA--TCAA---GAGACT-CT---------ACTTCGAA-C-AGGG--TGGGAA-CACCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-G-----------------------------------------G----TA---------------TT-T-C-T--AATA----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAT-ATCA---G-CAC---ATA-T-------ATAG---AGGAT-T----ACT-GT--CCC-CCAGTT-CA-A-CGCCAAAGA--T---TAC--GC-ATT-C-CC-A--AATGC-TAGCAGT-AA------C--TA--A---AATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-GATTGATCGA--CTTGAT-GA----CA-G--AC-CAAT-GGAAA--TAA----GACAC-A----TCAA-----C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--ttcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAG-TT-TTTCTCCT-G-C-CTA------C-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAAT-T--TACA-T-A--GAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAA---C-G-G--GGA-G-ATAACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAG-GAA-AGCTTA------T------T--T---TCCT---A-T----GTA--CA-AATCT-TTATAAAA-A-TGT-C-TGGTCC-----T-T-TTG---AG-TTT-AT-----TT--T-A-AT--A--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATA----CA-CG----GTTT-AACTTAT-TTTC---AT--------------T---A-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TG----CG----T-TT--------A--GATTAAAAAATC-----A-TTTT-ATG-T-CATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataatT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTA---T-G-T--GGA-G-ATGACTCT-ATTTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----AATTG--T------T--T---TTCCT--ATT----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-C-TGGTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-T----TA-CA----G----AA---TT-TCTG---TT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGta
gi|17 : C-TT-TTTCTC-TTG-TGTGAA-AT-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAAT-T--TACA-C-A--TAGTT-GATAC-CCGTGT-TTTACTT---T-G-G--GGA-G-ACAAATCC-A-TTAGTATT-A-AA----G-AAAAC-GAA-A----A------TTTA---T--T---TTCT---A-TA---GTA--AA-ATTTT-TTCTAAAG-A-GAT-C-TGGTAG-----T-T-TTT---AG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAAT-T--T-----------------------GTCTGTT-ACTA---T-A-G--CAA-G-ATGACTC--A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--TATCTTCCT--G-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-A-GGGTAGT----T-T-TTC---GG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--ATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TT-TAATCTG----AA---TC-TTTCATTAT--------------A---ATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T-------------------------------------------A-TTTT-GTG-A-CATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAA-CCACTT--C-CTGT-TAAAA-G--AA-T-GGC-AA---A-TT------A-AGAA-CGA-T--------TATG----TAT-A-----GAT----TTAT-CAC--AATA----T-G-GT-A------CC--CGAG-TATC-AAAAAG-AAA---TAT----TACC------AA-A---CAT-T-CG---TTCAC---ATG-A-------ATCA---A--AT-T----A-C-G----TTATTAT-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAT-TGC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-AT-ATC--TGT-G---TATCACCTTTTGT------------------attgtaa
gi|2 : atgtC-A-TACATTGACCCAATTATTA-CGCTGAAT-GCT-ATA---AGAA-C-T-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAG-TTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTATGCA-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A---AT----GC---A-C-TGAGC-TATGGG-GT-GG---T-TT-CAAAGAT-T----CAAGATTCAG-A-A--AAA--ATAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA----GGTCTT---ACTTCCTT---TGTC-AT-TCGCG--GAGACT-CT--CGT--CTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTGTCTAGAA-AGCAACG-GACAAA---A-AT------A-AAAACCAATT--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-GT-A------CCCAGGAT-TATC-TTCA---AAAGATTAT-TGCTTCC------AACG-TATTT-A-CG---GTCAC---AAGAA-------ATCA---A-----T----A-TAGC--CAC-CCAG-ACCA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-A-T-C-CC-A--AATGCTTAG-ACT-AA-ACAATT--TATAA---AGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---TAAGGAAC-CAAT-GGAATTCA---TAA-CCAA-G--AAC-TAACGACA-----A----TCAA-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACA----TA-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT--GAGA-CG-CATACT---GGAATGT--A-TA--CATACAAG-A-T-AA-GCA-AATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---GTGATT-TAATTCA--A--TG--T-AACA--TATTGAATAG--------TGT---TA----------------AA-A---CA-GGAG-GACGC--GCT--TATC-ATAC-TT-TTTTCC-T-GCCAC-AA-GT-AC-T-CG-CTCC-C-AGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AA--T--TATA-CAA--GAGTGCGACAC-TCG-GTG-TTAATA---T-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-A-TTAATA-T-A-----------AAT-G---------------T------T--T---TCCT---A-T----GTGACCA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCT-----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T--T--A--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---T-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTG----TA----G--T--------A--C----------------A-TTTT-GTGAT-CATC--TATTGaacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|20 : aT---CCT-TA-----T-G-GTGAA-A---CA-G--A-GGAA---ACT--TATCACTAC-GT-TTTCTCGT-G-CACTGA-GT-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAAT-T--TACA-T-A--TGATG-GACAC-TCTTG---TTACTA---T-A-G--GGA-G-ATGAACCC-A-TTGGTATC-A-CT----G-ACAAT-GAA-AAGTTA------T------T--T---TTCCA--A-T----GTA--CA-AATGA-TAATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----TGT-TTT---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : TCAA-A-ACGAAT--CT-GAAAAATT-ACA--------ATT--AAACGCAGC--AAGAAT--------AGTTAC-GTACTGG-ATTA--ACTTTA-A---TAGC-A--TCAA---GGGAAT-CA--C-T--TTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAA-CCA-TTAAA-TCAT-----A-G--GC-G-G------------------A-AAAA-CGA----------TGTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-AT-A------CC--AAAC-TACC-TTAG---TGA---CAT-T-TTTCCGTATAAAA-C-T-TCT-A------GTTACAATACG-AGAAACACATTA---A--AT-T----A-T-GA--TGTACCA--A-CA---TGC--AAA
gi|22 : ata--AATG--TTG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GAAATTCA-C-TAC-CTAT-GGAAA--TAA----A-----AACAATC-AA----C----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-ACCC-C----TTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG--------------------T-AGGACACAATTA--T--GT--ATTAGA--------------T-A------A--CG--T-AACAT-TATTG-ATAATCC-TCTGTGT---TCT-TG-----C-G-GT-AA-A---CA-GA-G-GACct
gi|23 : tTTTATA-CAATACT-TTCATATG-ACC--TC-------AT-TTGG-A-ATATATATGC---ATC-CAAAG-CATGGG--TGG---------------T-CA---T----TT----G-A--AGT--CTAGAAAAACT-ACA-A-----CATTTTAG-AGCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAAC-C----GGTCGTATCGCTTTA-A---TAGC-A--TCAC---GTGATT-CT--G-AGACTATACGGAAAC-TG-----GGAAA-CCGCTT--A-TTGA-TAGAC-A--AA-G-GAC-CATATG-TT------ACCAGA-CAG-------------G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-GT-T------CC--AGatcac
gi|24 : T-A-TTAATAT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----ACATTG-T------T--T---TCCT---A-T----GTAG-CACATTGT-TTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTA---AG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATT----TA-CA----G----AA---ATGTTCC---AT--------------A---A-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AG----TAA---G-CT--------ATAG----------------ACTTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|25 : g-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-GGA-T--------TGTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTATT------AA-G-T--AT-A-TG---GTCTC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAA-C-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--T-CAAT-GGAATTCA-A-TAC-CCAT-G--GA--t
gi|26 : AC-A----AGTCTTA---CGTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CTCTC-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTC----AAA---TATAT-CTACC------AA-G---TAT-A-C----GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-A-CGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-a
gi|27 : a--T-AACGT-TAATG-ACAGTCC-CCTATGT---TCT-CG-----T-G-GT-AATA---CA-G--G---TT---GTA--TATCAATAT-TTCTTTCTC-TTG-CACTAA-CC-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAAT-T--TATA-C-A--TAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-A---T-------------------T-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--G---TTCCCCTA-A----ACA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GA
gi|28 : AATATT-A-CT----G-ACA-T-GAA-A----AATTG--T------T--T---TCCG---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-G-T-C-TGGTAG-----T-T-TTTTTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-GT--A--T------A-TA-G---AA-----ACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TT-CA----G----AA----T-TTT------------------------A-TT---TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----GTTT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|3 : C-A--TTGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAACATGCG---GGGAA-CCGCTT----TTGT-T-GAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAAACAA-T--------TA-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAGT-A------CC--AGAT-T--C-TTCA---AG----TAT-T-CTTCC------AA-G-T--ATCA-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--ATCT----A-T-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAGCC-A-TTC-CC-A--AATG--TAG-ATT-AAGAC--TT--TAT-A----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA----TAG---C-CAATTGGAATTCA-G-TAC-C-AT-A--GA--CAA----AGACAAA----TCGA-----A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-ACCT-CCTTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCA-GA--CATACATA-T-T-AAGGCACA-CTG--CTCGT--ACTAAATAAA---A-GACT-T-ATCCAG-ACGTG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCTAT---TGT---TCT-TGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG--A-GACG---CGT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACTAATGTTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATAG--TATA-C-A--TAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTA---T-G-G--GGAAG-ATGACTCT-A-TTAATATTTA-CT----G--CAA--GAA-A----AATTTGTT------T--T---CTCT---ACT----GTA--AC-ATTGT-TTATAATA-A-GAT-C-TGGCCT-----T-T-TTT---AAATTT-ATA----TT--T-T-GT--A--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---A--TGTC---ATG-------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT--TG-T-GATT--TATTACta
gi|30 : -TAT-A-CGCGGGTCAC----TG-A-------ATCATTTC--AT-TTTTAA-T-GC--CCT-TCAG-A-CAGATCGT--GTAA--TATTTACAGTCTA-T-TACC-ACTAATT--GAG-ATT-AA--C-GTT--TAT-ATTTAGTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATC-ATTGA--C-CAAT-GGAATTCA-G-TAC-Ctt
gi|31 : agATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTATA-CATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------AC-T-AG-A-GTAT----GCTTCATT-TG----TATGGG-ATGGT---TGCT-CTG--CTGCA---GAA-ATT--G-C-A--AAG--TTAGAAAAAGT-ACA-GTCC--CAT-------GCTGC--TAGAAT--------TGCAAC-A----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaaT--A--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGGGATTA----G-TTTTATATTCA--GATT-------------A-TTTT-GTG-T-CATA--TATTGgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATT----TGTCA----T----TA---AT-TTCT---AT--------------ATTAA-ATA--TG--------TTT-T-AAA-----------TTTACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----CG----G-TT--------AC-GGTAGATTAAAAAGATTA-TTTT-GTG-T-CATT--AATTGtaac
gi|35 : TATT-A-CT----G-ACAAC-GAACA----A------T------TGTT---TTCCG--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGATCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATC----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAtaa
gi|36 : AA-AAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CAGTACT-TTTA-AAA-GTC-TTCCTTTAATGT-T-GG-A-ATAT----GC---ATC-TGAAG-TATGGG-ATGGG---TGTT-C-A--AT-CATTTCAA-ATTTAA-A-A--AAA------AAAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTGT--A--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTT----AT--------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TAG---G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|38 : -C-AAA-A-A--------G----TATTTTGTAATA-TA----GTCCGAA---TT-TTTC---ATTAGCATTCTATGTAA---A-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TG----TG----G-TT--------A--GATTTTAACAGATT---A-TTTT-GTG-T-CATT--TATTGta
gi|39 : -A---AATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA----TAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--GAATTAA----G-----A----CA-A-----T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCG-CCTTCCTtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACACACGAAAAAAATATGCA-AT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGT-TTTACT-AGATTT-G--CCCTAGTCTCCCAC-CGACAAACTAT--TTGCCGCA--TTTCATTTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGA-T-GCTTATA---AAAACT-G-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAA----ACTTGAT-CA-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-GTAT----GC---ATC-TTAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT------CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTT---ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTTCC------AA-A---TAT-A-CA---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-GTCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T----ATAGG--C-CAGT-GGAATTCG-G-TAC-CCAT-
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAAT-T--TACA-C-AATTA----------TC----GTCTACTATTTT-A-G--GGA-G-ACAAATCCAA-TTAGTAGT-A-CCCTGAG-AAAAT-AAA-A----G------T------T--a
gi|42 : tcT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AC--------------A---A-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TG----CACATTG-TT--------A--G----------------T-TTTTAGCA-TATATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT---------ATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGA-CCGCTT--A-TTGT-T---A-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-A--------TTTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-A--TG--TAAACAT-AATTG-ATGCTCC-
gi|45 : a-GACAC---GCATGTTTATCA---T-G-A--GGT-G-ATAACTCA-A-TCGGCATC-A-CA----G-AGAAT-GAA-A----A------C------T--T-------------------------ATTTTATTAAAAAA-A-TAT-C-TGGTCG-----T-TCCTG---AG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-AATA--CATACAGG-A-TTAAGGCATAATTT--T--GT--ACTAAA-GAA---A-AACG-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : AC-A----GGTCTTA--A-TTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAAAG--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-AGA-T--------TATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-T-CA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G-T--AT-A-CG---GTCAC---A-G-A-------ATCA---A---T-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T----ACA-GC-A-T-T-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TACACCATAG--AA--TTA----GACA--A----TC-A-----C----TTC-TGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-C---CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT------A------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTC-CTCGA-A-AACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA----AAGAAAA-ATACATAT-C--CC----------------CATAAATTGCAAT-A-T-GGATTTCGTG-TCAA------CACAC-AAACACT-TAGTTATCA-----TT--GTTCCCACACGATCT----------------C-A-TA---TG--TC-AT--------CC---T-ACCTATG---AAAAAC-GTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAA----ACTTTAT-CT-ATTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG-ACC-TCT-------GC-T-GG-A-ATAT----GC---GTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGA---AGTT-CAA--AT------CAAGCCTTTA-A-A--AGATTTTAAAAAATTT-ACA-G-----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtactta-AA---G-TT------A-AAAC-CAA-A--------TATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G--T-A------CC--ACAT-CATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTGCC------TA-G-C--AT-G-CG----TCAC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-C-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T--------G--A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TG-AAT-GGAATTCA-G-TA--CCAT-GAAAA--TAA----G-----G----AC-AACAATT----TTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGG---------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-AT-TGATC-AACAT-AATTG-ATGCTCC-------T---TCTATG-----T-------------------------------------TTTACATT-TTT----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAA--T--TAGG-C-A--TAGTG-AACAC-TTGTGT-TTTGGCA---TCG-A--GGA-G-ATGACTCC-ATTTTGTGAA-A-CT----G-CCCAT-GCA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTT---AG-TTT-AC-----TT--T-ttgctgcag
gi|8 : aatcaTT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TG-AAT-GGAATTCAAG-TAC-CCATAG--AA--TAA----A-----ACAA-TA-A-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-ACAT-C-TTCT-ATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA---ATACAAG-A-TCAAGGCATAAT-------------------AA---A-GACT---ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-AT-----------------CT-TG-----T-G-GT-AA-AA--CA-G--ATGACG----CT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACGAA-GT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA-----A-T--GGA-G-GTGA--CT-A-TTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------TG-T---TTCCT--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTA-AAAA-A-GAT-A-T-GTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-A------TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTT----TA-CA----G-----A---AT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T--ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : ---A--AT-T------T-AC--GTCACCAG-A-CA-ATCGC--AGAA--T---TA--------T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-GC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TA-AAT-GGAATTCA-G-TTC-CCAT-GAAAA--TAA----G-----A----CA-A-----CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T-------------AAA---G-G-CT-T-ATTCAG-A--AG--TAAACAT-TATTT-ATGCTCCAC---TATG--TTT-T----------------A---CA-------------------------AT-TT-TT-----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAAT-T--TAGG-T-A--TAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCA---T-G-A--GGA-G-ATAACTCC-A-TTTGTGAA-A-CT----G-CCCATCTAA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-T-TAT-C-TGGTCGGTTTTT-T-TTT---AG-TTT-ACTTTGATT--T-T-GT--A--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 1 22 4444444444 11 1 11 4444444444 1 11111111 11 111 1 4444444 1 11111 111 11 111 1 111 2222 1 1 111 4444444444444 333333333 4444444444444444 2222222 44444444444 5555555555 111 3333333333333 1 111 111 1 1111111 2222222 111111 33333333333333333 11 11111111 1111 1111111 11111111 1111111111 2222 2222222 22222222 111111111111111111 33333333333333 5555555555555555555555555555555555555555 1 4444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 1 444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 111 1 2222 11111111111111 111111111 11111111111 1111 5555555555555555555555555555
lowQualScore : 3 3 1 1 7 0000 1 6 0 2 22 2222222222 66 0 22 33 0000000000 0 99999999 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 44 7 0 777 3 3 999 8888 7 3 3 666 1111111111111 111111111 8888888888888888 7 6 7777777 1 11111111111 5555555555 111 2 55 3 4444444444444 8 0 111 3 444 3 22 5 0 66 22 1 9999 4 4 4 2 4 1 4 55 3333333 4 4 4 4 8888 777 4 3 3 8888 3 55 5555555 2 777777 55 7777 1 1 4 55555555555555555 00 88888888 888888 3 5555 66666 3 77 888 3 2222222 3 66 2 33 2 2 4 2 66 5 2 0 22222222 777777 2 5 4444444444 5555 66666 5555 22 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 888 555 3333 4 888888 2 5555 2 2 444 555 3 2 9999999 444 33 2 5555 2 2 4444444 2 2 2 33 33 555 55555555 2 2 5 66 66 2 2 2 2 33 2 444 999999999999999999 5 2 2 2 88888888888888 2 2 2 2 8888888888888888888888888888888888888888 3 3 22 3 4 3 77777 55 0 3 3 4 4 4 4 8888888888888888888888888888888888888888 8 7 999999999999999999999999 4 4 4 99 55 7 3 3 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 3 3 4 7 7 3 3 6 0 3 5 2 1 9 6666 2 2 2 2 33 0 2 2 33 5 2 5 444 555555 2 2 3 22 5 1 2 2 4444 2 2 2 444444444444444444444444444444444444444 55 2 2 2 5 2 2 77777 2 5 5555 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 2222 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 99999999 6666 5555 2 5555 1111 7777 2 777 88888888888888 444 33 66 999999999 33 2 33333333333 5 2 2 2 2 2 2 5555 1111 2 1111111111111111111111111111 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. .......... .. . .. .. .......... . ........ .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. . . ... . . ... .... . . . ... ............. ......... ................ . . ....... . ........... .......... ... . .. . ............. . . ... . ... . .. . . .. .. . .... . . . . . . . .. ....... . . . . .... ... . . . .... . .. ....... . ...... .. .... . . . ................. .. ........ ...... . .... ..... . .. ... . ....... . .. . .. . . . . .. . . . ........ ...... . . .......... .... ..... .... .. . .. .... . . . ...... .. . . ... ... .... . ...... . .... . . ... ... . . ....... ... .. . .... . . ....... . . . .. .. ... ........ . . . .. .. . . . . .. . ... .................. . . . . .............. . . . . ........................................ . . .. . . . ..... .. . . . . . . . ........................................ . . ........................ . . . .. .. . . . . ........................................................ .. . . . . . . . . . . . . . . .... . . . . .. . . . .. . . . ... ...... . . . .. . . . . .... . . . ....................................... .. . . . . . . ..... . . .... . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... .... . .... .... .... . ... .............. ... .. .. ......... .. . ........... . . . . . . . .... .... . ............................ . . . . ..
lowQualScore : 3 7 0 0 3 5555 0 5 0 8 00 0000000000 55 0 22 88 8888888888 0 22222222 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 00 3 7 777 3 7 000 3333 3 3 3 000 3333333333333 333333333 3333333333333333 3 7 3333333 0 00000000000 7777777777 000 5 88 2 8888888888888 0 6 777 2 333 3 88 7 1 11 66 9 4444 4 4 0 4 0 4 0 66 0000000 0 0 0 0 5555 000 0 6 6 4444 6 00 9999999 8 777777 00 7777 4 3 0 99999999999999999 66 55555555 111111 5 0000 77777 1 33 555 1 3333333 1 88 9 99 7 7 0 7 33 3 7 3 88888888 222222 5 0 4444444444 3333 22222 3333 00 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 999 000 8888 8 222222 9 7777 7 7 777 000 8 9 3333333 777 77 7 7777 7 7 5555555 7 7 7 77 99 000 11111111 9 9 7 33 33 7 7 9 9 77 5 444 777777777777777777 7 9 9 9 66666666666666 9 9 9 9 9999999999999999999999999999999999999999 6 6 00 3 4 3 22222 00 2 3 3 6 0 0 0 4444444444444444444444444444444444444444 0 2 888888888888888888888888 0 0 0 55 00 3 6 6 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 6 6 5 3 3 6 3 7 7 3 7 9 4 0 1111 9 9 9 9 99 4 9 9 99 3 7 5 777 999999 7 7 3 99 0 5 2 2 7777 2 2 2 777777777777777777777777777777777777777 66 5 5 5 0 7 7 33333 7 3 7777 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 1111 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 3 7 7 7 77777777 1111 7777 7 7777 7777 6666 7 333 33333333333333 777 77 33 777777777 55 7 66666666666 3 7 7 7 7 7 7 7777 0000 7 6666666666666666666666666666 7 7 7 7 77
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC----TTT---TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC---CTTT---TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCCTTCAAC-A-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTACA----A-GAAAA-ATGCA-ATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TT-ACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGAAAC----T--TTGGCGCTTTCTTT---TTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-AT-AGCACCAA-TTGTTTATAGAAAAAAAT-G-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-GCAAA----A--TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCGCC-GTC-------GCAT-AGCA-ATAG----AC---ATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAA--AT-CA---CAAGATCAAGCA-A--AAA--CTGAAAAAATTGACA-G-----CATT--AGCAGCCGCCTGAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACTCCT--C-A--CTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTTT-T-GAA-GC-AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-GT-A-------C--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T--TCTC------GA-G-T-TAT-A--G---GTCAC---AAG-A-------ATAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAGAATT---TACAAGC-A-T-C-CC-AC-AGTG--TAG-ATTAAA-AC-A-T--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---ATAGC--CGCAAT-GGAATTCA-GATAC-CTAT--------T-A----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACTT-CCTTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATATAAG-A-T-AAGGCTTAATTGCTT--GT--A-TAAA-AAACATG-CACTCT-ATTCAGCA--TG--T--ACATCTATTG-ATAGTCCTC---TGT---TCT-TG-----T-GAGT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATTCATAC-TT-TTTCTC-T-GCCCCTAG-CT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAAT-TGGTATA-C-A--TGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTA---T-GCG--GGA-GAATGACTCT-A-TTA-TATT-A-CT----G-ACAAT-GAA------------------------------C---A-C-----TA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-CTTGGTCG-----C-T-TTA---AG-TTT-AT-----TTACT-T-GT--A--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTCA--AT--------------A---G-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTG-CTA-T-CATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAAA-CACCACT-TTTATAAG-GCG-GCC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAGG
gi|10 : --------AATCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTAT-TAGAA-G--AA-G-TACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAC-A-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAT-A-T-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATAG--AAT-TAA----GACA--A----TCAA-----C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CGATCTTtcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaA-T-GCT---G---AAAAACTA-AGA-GTATCAAAG-AAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-GT--GTC-------CT-T-TG-AGATAT----CC---CTC-AGATA-TATGGG-GTGGT---TGAT-CAA--AT--A----AAAATTCTG-A-A--AA---CTTTAATCTCT-GCTTG-----CATT--AG---------GAAGATT-------AATCAT-T----GGACT-A--ACTTCA-A---TGAC-G--TCAC---GGAAAT-CT--T-T--C-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAA-TCACTT--A-TTGT-TAGAA-G--AATG-GTA-AA---A-TTTAAAAAA-AAAA-TAA-C--------TATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-TT-A------CC--CGAA-TATC--TCAAATAAA---TAT-T-AT--C------AA-A---CAT-T-TG---TTTAC---ATG-A-------AT-A---A--AT--------T-GC--ATTATTAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TA-ATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATT-CA-AT-ATCAATAT-A---A
gi|12 : ---AGAAAC-T-GGG-TTGCCGAAA-AAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGTA-TCTTACT-TTTATTAG-ATC-ACT-------TT-T-AG-A-ATAT----GC---CTC-TGGGG-TATGGA-ATGCATTTTTTT-TAA--AT-T-------GATCT----------A--TTAGAAAAATT-CCA-GTTATACAT----GCAGCC-----AAAAT--------AGTAAT-G----GG---------TTCC-TATATAGT-ATGTCTCATAAAGAAT-CA--T-T--ATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAA-C--CCT--A-TC-----AAA-T--AA-GAGAC-AA------T------A-AAAA-AAA-TCTCACAGCTGTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-GT-ATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---AAA---TAT------CC------AA-GAC-TAT-A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACGTTT-CCTTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-AATAACTAGACAAATG-T-AAGGCTTAATTG--T--GTCTACTTAC-A-----G-GACT-T-ATTCAA-G--AG--A-CACAT-TATTG-ATAGTCC-A---TGTGTCTCT-TG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G--T-GTCGGATGCTTCTATCCATA---T-TTTCCC-T-G-CACT-A-GT-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-T-AT-T--TATATC-A--AAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTA---T-G-G--GG--G-ATGA---T-A-TTA--ATT-ATCT----GAACAAT-GAA-ATG--A------TAATTTGT--T---TTCCTT-A-T----GTA--attccaaaatgtagact
gi|14 : -TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA-----AGATTCTG-CTG--AAA--CTAGAAAAA-------------------------CGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGACCA--TCAA---GAGACT-CT---------ACTTCGAA-C-AGGG--TGGGAA-CACCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-G-----------------------------------------G----TA---------------TT-T-C-T--AATA----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAT-ATCA---G-CAC---ATA-T-------ATAG---AGGAT-T----ACT-GT--CCC-CCAGTT-CA-A-CGCCAAAGA--T---TAC--GC-ATT-C-CC-A--AATGC-TAGCAGT-AA------C--TA--A---AATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-GATTGATCGA--CTTGAT-GA----CA-G--AC-CAAT-GGAAA--TAA----GACAC-A----TCAA-----C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--ttcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAG-TT-TTTCTCCT-G-C-CTA------C-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAAT-T--TACA-T-A--GAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAA---C-G-G--GGA-G-ATAACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAG-GAA-AGCTTA------T------T--T---TCCT---A-T----GTA--CA-AATCT-TTATAAAA-A-TGT-C-TGGTCC-----T-T-TTG---AG-TTT-AT-----TT--T-A-AT--A--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATA----CA-CG----GTTT-AACTTAT-TTTC---AT--------------T---A-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TG----CG----T-TT--------A--GATTAAAAAATC-----A-TTTT-ATG-T-CATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataatT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTA---T-G-T--GGA-G-ATGACTCT-ATTTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----AATTG--T------T--T---TTCCT--ATT----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-C-TGGTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-T----TA-CA----G----AA---TT-TCTG---TT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGta
gi|17 : C-TT-TTTCTC-TTG-TGTGAA-AT-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAAT-T--TACA-C-A--TAGTT-GATAC-CCGTGT-TTTACTT---T-G-G--GGA-G-ACAAATCC-A-TTAGTATT-A-AA----G-AAAAC-GAA-A----A------TTTA---T--T---TTCT---A-TA---GTA--AA-ATTTT-TTCTAAAG-A-GAT-C-TGGTAG-----T-T-TTT---AG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAAT-T--T-----------------------GTCTGTT-ACTA---T-A-G--CAA-G-ATGACTC--A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--TATCTTCCT--G-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-A-GGGTAGT----T-T-TTC---GG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--ATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TT-TAATCTG----AA---TC-TTTCATTAT--------------A---ATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T-------------------------------------------A-TTTT-GTG-A-CATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAA-CCACTT--C-CTGT-TAAAA-G--AA-T-GGC-AA---A-TT------A-AGAA-CGA-T--------TATG----TAT-A-----GAT----TTAT-CAC--AATA----T-G-GT-A------CC--CGAG-TATC-AAAAAG-AAA---TAT----TACC------AA-A---CAT-T-CG---TTCAC---ATG-A-------ATCA---A--AT-T----A-C-G----TTATTAT-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAT-TGC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-AT-ATC--TGT-G---TATCACCTTTTGT------------------attgtaa
gi|2 : atgtC-A-TACATTGACCCAATTATTA-CGCTGAAT-GCT-ATA---AGAA-C-T-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAG-TTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTATGCA-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A---AT----GC---A-C-TGAGC-TATGGG-GT-GG---T-TT-CAAAGAT-T----CAAGATTCAG-A-A--AAA--ATAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA----GGTCTT---ACTTCCTT---TGTC-AT-TCGCG--GAGACT-CT--CGT--CTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTGTCTAGAA-AGCAACG-GACAAA---A-AT------A-AAAACCAATT--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-GT-A------CCCAGGAT-TATC-TTCA---AAAGATTAT-TGCTTCC------AACG-TATTT-A-CG---GTCAC---AAGAA-------ATCA---A-----T----A-TAGC--CAC-CCAG-ACCA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-A-T-C-CC-A--AATGCTTAG-ACT-AA-ACAATT--TATAA---AGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---TAAGGAAC-CAAT-GGAATTCA---TAA-CCAA-G--AAC-TAACGACA-----A----TCAA-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACA----TA-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT--GAGA-CG-CATACT---GGAATGT--A-TA--CATACAAG-A-T-AA-GCA-AATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---GTGATT-TAATTCA--A--TG--T-AACA--TATTGAATAG--------TGT---TA----------------AA-A---CA-GGAG-GACGC--GCT--TATC-ATAC-TT-TTTTCC-T-GCCAC-AA-GT-AC-T-CG-CTCC-C-AGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AA--T--TATA-CAA--GAGTGCGACAC-TCG-GTG-TTAATA---T-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-A-TTAATA-T-A-----------AAT-G---------------T------T--T---TCCT---A-T----GTGACCA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCT-----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T--T--A--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---T-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTG----TA----G--T--------A--C----------------A-TTTT-GTGAT-CATC--TATTGaacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|20 : aT---CCT-TA-----T-G-GTGAA-A---CA-G--A-GGAA---ACT--TATCACTAC-GT-TTTCTCGT-G-CACTGA-GT-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAAT-T--TACA-T-A--TGATG-GACAC-TCTTG---TTACTA---T-A-G--GGA-G-ATGAACCC-A-TTGGTATC-A-CT----G-ACAAT-GAA-AAGTTA------T------T--T---TTCCA--A-T----GTA--CA-AATGA-TAATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----TGT-TTT---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : TCAA-A-ACGAAT--CT-GAAAAATT-ACA--------ATT--AAACGCAGC--AAGAAT--------AGTTAC-GTACTGG-ATTA--ACTTTA-A---TAGC-A--TCAA---GGGAAT-CA--C-T--TTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAA-CCA-TTAAA-TCAT-----A-G--GC-G-G------------------A-AAAA-CGA----------TGTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-AT-A------CC--AAAC-TACC-TTAG---TGA---CAT-T-TTTCCGTATAAAA-C-T-TCT-A------GTTACAATACG-AGAAACACATTA---A--AT-T----A-T-GA--TGTACCA--A-CA---TGC--AAA
gi|22 : ata--AATG--TTG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GAAATTCA-C-TAC-CTAT-GGAAA--TAA----A-----AACAATC-AA----C----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-ACCC-C----TTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG--------------------T-AGGACACAATTA--T--GT--ATTAGA--------------T-A------A--CG--T-AACAT-TATTG-ATAATCC-TCTGTGT---TCT-TG-----C-G-GT-AA-A---CA-GA-G-GACct
gi|23 : tTTTATA-CAATACT-TTCATATG-ACC--TC-------AT-TTGG-A-ATATATATGC---ATC-CAAAG-CATGGG--TGG---------------T-CA---T----TT----G-A--AGT--CTAGAAAAACT-ACA-A-----CATTTTAG-AGCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAAC-C----GGTCGTATCGCTTTA-A---TAGC-A--TCAC---GTGATT-CT--G-AGACTATACGGAAAC-TG-----GGAAA-CCGCTT--A-TTGA-TAGAC-A--AA-G-GAC-CATATG-TT------ACCAGA-CAG-------------G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-GT-T------CC--AGatcac
gi|24 : T-A-TTAATAT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----ACATTG-T------T--T---TCCT---A-T----GTAG-CACATTGT-TTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTA---AG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATT----TA-CA----G----AA---ATGTTCC---AT--------------A---A-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AG----TAA---G-CT--------ATAG----------------ACTTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|25 : g-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-GGA-T--------TGTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTATT------AA-G-T--AT-A-TG---GTCTC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAA-C-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--T-CAAT-GGAATTCA-A-TAC-CCAT-G--GA--t
gi|26 : AC-A----AGTCTTA---CGTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CTCTC-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTC----AAA---TATAT-CTACC------AA-G---TAT-A-C----GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-A-CGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-a
gi|27 : a--T-AACGT-TAATG-ACAGTCC-CCTATGT---TCT-CG-----T-G-GT-AATA---CA-G--G---TT---GTA--TATCAATAT-TTCTTTCTC-TTG-CACTAA-CC-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAAT-T--TATA-C-A--TAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-A---T-------------------T-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--G---TTCCCCTA-A----ACA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GA
gi|28 : AATATT-A-CT----G-ACA-T-GAA-A----AATTG--T------T--T---TCCG---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-G-T-C-TGGTAG-----T-T-TTTTTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-GT--A--T------A-TA-G---AA-----ACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TT-CA----G----AA----T-TTT------------------------A-TT---TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----GTTT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|3 : C-A--TTGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAACATGCG---GGGAA-CCGCTT----TTGT-T-GAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAAACAA-T--------TA-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAGT-A------CC--AGAT-T--C-TTCA---AG----TAT-T-CTTCC------AA-G-T--ATCA-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--ATCT----A-T-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAGCC-A-TTC-CC-A--AATG--TAG-ATT-AAGAC--TT--TAT-A----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA----TAG---C-CAATTGGAATTCA-G-TAC-C-AT-A--GA--CAA----AGACAAA----TCGA-----A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-ACCT-CCTTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCA-GA--CATACATA-T-T-AAGGCACA-CTG--CTCGT--ACTAAATAAA---A-GACT-T-ATCCAG-ACGTG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCTAT---TGT---TCT-TGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG--A-GACG---CGT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACTAATGTTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATAG--TATA-C-A--TAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTA---T-G-G--GGAAG-ATGACTCT-A-TTAATATTTA-CT----G--CAA--GAA-A----AATTTGTT------T--T---CTCT---ACT----GTA--AC-ATTGT-TTATAATA-A-GAT-C-TGGCCT-----T-T-TTT---AAATTT-ATA----TT--T-T-GT--A--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---A--TGTC---ATG-------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT--TG-T-GATT--TATTACta
gi|30 : -TAT-A-CGCGGGTCAC----TG-A-------ATCATTTC--AT-TTTTAA-T-GC--CCT-TCAG-A-CAGATCGT--GTAA--TATTTACAGTCTA-T-TACC-ACTAATT--GAG-ATT-AA--C-GTT--TAT-ATTTAGTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATC-ATTGA--C-CAAT-GGAATTCA-G-TAC-Ctt
gi|31 : agATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTATA-CATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------AC-T-AG-A-GTAT----GCTTCATT-TG----TATGGG-ATGGT---TGCT-CTG--CTGCA---GAA-ATT--G-C-A--AAG--TTAGAAAAAGT-ACA-GTCC--CAT-------GCTGC--TAGAAT--------TGCAAC-A----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaaT--A--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGGGATTA----G-TTTTATATTCA--GATT-------------A-TTTT-GTG-T-CATA--TATTGgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATT----TGTCA----T----TA---AT-TTCT---AT--------------ATTAA-ATA--TG--------TTT-T-AAA-----------TTTACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----CG----G-TT--------AC-GGTAGATTAAAAAGATTA-TTTT-GTG-T-CATT--AATTGtaac
gi|35 : TATT-A-CT----G-ACAAC-GAACA----A------T------TGTT---TTCCG--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGATCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATC----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAtaa
gi|36 : AA-AAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CAGTACT-TTTA-AAA-GTC-TTCCTTTAATGT-T-GG-A-ATAT----GC---ATC-TGAAG-TATGGG-ATGGG---TGTT-C-A--AT-CATTTCAA-ATTTAA-A-A--AAA------AAAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTGT--A--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTT----AT--------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TAG---G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|38 : -C-AAA-A-A--------G----TATTTTGTAATA-TA----GTCCGAA---TT-TTTC---ATTAGCATTCTATGTAA---A-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TG----TG----G-TT--------A--GATTTTAACAGATT---A-TTTT-GTG-T-CATT--TATTGta
gi|39 : -A---AATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA----TAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--GAATTAA----G-----A----CA-A-----T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCG-CCTTCCTtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACACACGAAAAAAATATGCA-AT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGT-TTTACT-AGATTT-G--CCCTAGTCTCCCAC-CGACAAACTAT--TTGCCGC---ATTTCATTTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGA-T-GCTTATA---AAAACT-G-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAA----ACTTGAT-CA-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-GTAT----GC---ATC-TTAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT------CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTT---ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTTCC------AA-A---TAT-A-CA---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-GTCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T----ATAGG--C-CAGT-GGAATTCG-G-TAC-CCAT-
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAAT-T--TACA-C-AATTA----------TC----GTCTACTATTTT-A-G--GGA-G-ACAAATCCAA-TTAGTAGT-A-CCCTGAG-AAAAT-AAA-A----G------T------T--a
gi|42 : tcT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AC--------------A---A-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TG----CACATTG-TT--------A--G----------------T-TTTTAGCA-TATATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT---------ATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGA-CCGCTT--A-TTGT-T---A-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-A--------TTTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-A--TG--TAAACAT-AATTG-ATGCTCC-
gi|45 : a-GACAC---GCATGTTTATCA---T-G-A--GGT-G-ATAACTCA-A-TCGGCATC-A-CA----G-AGAAT-GAA-A----A------C------T--T-------------------------ATTTTATTAAAAAA-A-TAT-C-TGGTCG-----T-TCCTG---AG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-AATA--CATACAGG-A-TTAAGGCATAATTT--T--GT--ACTAAA-GAA---A-AACG-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : AC-A----GGTCTTA--A-TTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAAAG--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-AGA-T--------TATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-T-CA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G-T--AT-A-CG---GTCAC---A-G-A-------ATCA---A---T-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T----ACA-GC-A-T-T-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TACACCATAG--AA--TTA----GACA--A----TC-A-----C----TTC-TGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-C---CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT------A------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTC-CTCGA-A-AACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA----AAGAAAA-ATACATAT-C--CC----------------CATAAATTGCAAT-A-T-GGATTTCGTG-TCAA------CACAC-AAACACT-TAGTTATCA-----TTG---TTCCCACACGATCT----------------C-A-TA---TG--TC-AT--------CC---T-ACCTATG---AAAAAC-GTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAA----ACTTTAT-CT-ATTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG-ACC-TCT-------GC-T-GG-A-ATAT----GC---GTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGA---AGTT-CAA--AT------CAAGCCTTTA-A-A--AGATTTTAAAAAATTT-ACA-G-----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtactta-AA---G-TT------A-AAAC-CAA-A--------TATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G--T-A------CC--ACAT-CATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTGCC------TA-G-C--AT-G-CG----TCAC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-C-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T--------G--A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TG-AAT-GGAATTCA-G-TA--CCAT-GAAAA--TAA----G-----G----AC-AACAATT----TTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGG---------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-AT-TGATC-AACAT-AATTG-ATGCTCC-------T---TCTATG-----T-------------------------------------TTTACATT-TTT----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAA--T--TAGG-C-A--TAGTG-AACAC-TTGTGT-TTTGGCA---TCG-A--GGA-G-ATGACTCC-ATTTTGTGAA-A-CT----G-CCCAT-GCA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTT---AG-TTT-AC-----TT--T-ttgctgcag
gi|8 : aatcaTT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TG-AAT-GGAATTCAAG-TAC-CCATAG--AA--TAA----A-----ACAA-TA-A-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-ACAT-C-TTCT-ATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA---ATACAAG-A-TCAAGGCATAAT-------------------AA---A-GACT---ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-AT-----------------CT-TG-----T-G-GT-AA-AA--CA-G--ATGACG----CT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACGAA-GT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA-----A-T--GGA-G-GTGA--CT-A-TTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------TG-T---TTCCT--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTA-AAAA-A-GAT-A-T-GTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-A------TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTT----TA-CA----G-----A---AT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T--ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : ---A--AT-T------T-AC--GTCACCAG-A-CA-ATCGC--AGAA--T---TA--------T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-GC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TA-AAT-GGAATTCA-G-TTC-CCAT-GAAAA--TAA----G-----A----CA-A-----CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T-------------AAA---G-G-CT-T-ATTCAG-A--AG--TAAACAT-TATTT-ATGCTCCAC---TATG--TTT-T----------------A---CA-------------------------AT-TT-TT-----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAAT-T--TAGG-T-A--TAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCA---T-G-A--GGA-G-ATAACTCC-A-TTTGTGAA-A-CT----G-CCCATCTAA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-T-TAT-C-TGGTCGGTTTTT-T-TTT---AG-TTT-ACTTTGATT--T-T-GT--A--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 1 22 4444444444 11 1 11 4444444444 1 11111111 11 111 1 4444444 1 11111 111 11 111 1 111 2222 1 1 111 4444444444444 333333333 4444444444444444 2222222 555555555555 5555555555 111 3333333333333 1 111 111 1 1111111 2222222 111111 33333333333333333 11 11111111 1111 1111111 11111111 1111111111 2222 2222222 22222222 111111111111111111 33333333333333 5555555555555555555555555555555555555555 1 4444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 1 444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 111 1 2222 11111111111111 111111111 11111111111 1111 5555555555555555555555555555
lowQualScore : 3 3 1 1 7 0000 1 6 0 2 22 2222222222 66 0 22 33 0000000000 0 99999999 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 44 7 0 777 3 3 999 8888 7 3 3 666 1111111111111 111111111 8888888888888888 7 6 7777777 1 222222222222 5555555555 111 2 55 3 4444444444444 8 0 111 3 444 3 22 5 0 66 22 1 9999 4 4 4 2 4 1 4 55 3333333 4 4 4 4 8888 777 4 3 3 8888 3 55 5555555 2 777777 55 7777 1 1 4 55555555555555555 00 88888888 888888 3 5555 66666 3 77 888 3 2222222 3 66 2 33 2 2 4 2 66 5 2 0 22222222 777777 2 5 4444444444 5555 66666 5555 22 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 888 555 3333 4 888888 2 5555 2 2 444 555 3 2 9999999 444 33 2 5555 2 2 4444444 2 2 2 33 33 555 55555555 2 2 5 66 66 2 2 2 2 33 2 444 999999999999999999 5 2 2 2 88888888888888 2 2 2 2 8888888888888888888888888888888888888888 3 3 22 3 4 3 77777 55 0 3 3 4 4 4 4 8888888888888888888888888888888888888888 8 7 999999999999999999999999 4 4 4 99 55 7 3 3 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 3 3 4 7 7 3 3 6 0 3 5 2 1 9 6666 2 2 2 2 33 0 2 2 33 5 2 5 444 555555 2 2 3 22 5 1 2 2 4444 2 2 2 444444444444444444444444444444444444444 55 2 2 2 5 2 2 77777 2 5 5555 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 2222 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 99999999 6666 5555 2 5555 1111 7777 2 777 88888888888888 444 33 66 999999999 33 2 33333333333 5 2 2 2 2 2 2 5555 1111 2 1111111111111111111111111111 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. .......... .. . .. .. .......... . ........ .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. . . ... . . ... .... . . . ... ............. ......... ................ . . ....... . ............ .......... ... . .. . ............. . . ... . ... . .. . . .. .. . .... . . . . . . . .. ....... . . . . .... ... . . . .... . .. ....... . ...... .. .... . . . ................. .. ........ ...... . .... ..... . .. ... . ....... . .. . .. . . . . .. . . . ........ ...... . . .......... .... ..... .... .. . .. .... . . . ...... .. . . ... ... .... . ...... . .... . . ... ... . . ....... ... .. . .... . . ....... . . . .. .. ... ........ . . . .. .. . . . . .. . ... .................. . . . . .............. . . . . ........................................ . . .. . . . ..... .. . . . . . . . ........................................ . . ........................ . . . .. .. . . . . ........................................................ .. . . . . . . . . . . . . . . .... . . . . .. . . . .. . . . ... ...... . . . .. . . . . .... . . . ....................................... .. . . . . . . ..... . . .... . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... .... . .... .... .... . ... .............. ... .. .. ......... .. . ........... . . . . . . . .... .... . ............................ . . . . ..
lowQualScore : 3 7 0 0 3 5555 0 5 0 8 00 0000000000 55 0 22 88 8888888888 0 22222222 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 00 3 7 777 3 7 000 3333 3 3 3 000 3333333333333 333333333 3333333333333333 3 7 3333333 0 777777777777 7777777777 000 5 88 2 8888888888888 0 6 777 2 333 3 88 7 1 11 66 9 4444 4 4 0 4 0 4 0 66 0000000 0 0 0 0 5555 000 0 6 6 4444 6 00 9999999 8 777777 00 7777 4 3 0 99999999999999999 66 55555555 111111 5 0000 77777 1 33 555 1 3333333 1 88 9 99 7 7 0 7 33 3 7 3 88888888 222222 5 0 4444444444 3333 22222 3333 00 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 999 000 8888 8 222222 9 7777 7 7 777 000 8 9 3333333 777 77 7 7777 7 7 5555555 7 7 7 77 99 000 11111111 9 9 7 33 33 7 7 9 9 77 5 444 777777777777777777 7 9 9 9 66666666666666 9 9 9 9 9999999999999999999999999999999999999999 6 6 00 3 4 3 22222 00 2 3 3 6 0 0 0 4444444444444444444444444444444444444444 0 2 888888888888888888888888 0 0 0 55 00 3 6 6 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 6 6 5 3 3 6 3 7 7 3 7 9 4 0 1111 9 9 9 9 99 4 9 9 99 3 7 5 777 999999 7 7 3 99 0 5 2 2 7777 2 2 2 777777777777777777777777777777777777777 66 5 5 5 0 7 7 33333 7 3 7777 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 1111 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 3 7 7 7 77777777 1111 7777 7 7777 7777 6666 7 333 33333333333333 777 77 33 777777777 55 7 66666666666 3 7 7 7 7 7 7 7777 0000 7 6666666666666666666666666666 7 7 7 7 77
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC--TT--T----TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC--TT--T----TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCCTTCAAC-A-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTACA----A-GAAAA-ATGCA-ATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TT-ACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGAAAC----T--TTGGCGC--TT--TCTTTTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-AT-AGCACCAA-TTGTTTATAGAAAAAAAT-G-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-GCAAA----A--TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCGCC-GTC-------GCAT-AGCA-ATAG----AC---ATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAA--AT-CA---CAAGATCAAGCA-A--AAA--CTGAAAAAATTGACA-G-----CATT--AGCAGCCGCCTGAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACTCCT--C-A--CTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTTT-T-GAA-GC-AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-GT-A-------C--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T--TCTC------GA-G-T-TAT-A--G---GTCAC---AAG-A-------ATAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAGAATT---TACAAGC-A-T-C-CC-AC-AGTG--TAG-ATTAAA-AC-A-T--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---ATAGC--CGCAAT-GGAATTCA-GATAC-CTAT--------T-A----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACTT-CCTTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATATAAG-A-T-AAGGCTTAATTGCTT--GT--A-TAAA-AAACATG-CACTCT-ATTCAGCA--TG--T--ACATCTATTG-ATAGTCCTC---TGT---TCT-TG-----T-GAGT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATTCATAC-TT-TTTCTC-T-GCCCCTAG-CT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAAT-TGGTATA-C-A--TGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTA---T-GCG--GGA-GAATGACTCT-A-TTA-TATT-A-CT----G-ACAAT-GAA------------------------------C---A-C-----TA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-CTTGGTCG-----C-T-TTA---AG-TTT-AT-----TTACT-T-GT--A--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTCA--AT--------------A---G-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTG-CTA-T-CATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAAA-CACCACT-TTTATAAG-GCG-GCC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAGG
gi|10 : --------AATCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTAT-TAGAA-G--AA-G-TACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAC-A-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAT-A-T-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATAG--AAT-TAA----GACA--A----TCAA-----C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CGATCTTtcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaA-T-GCT---G---AAAAACTA-AGA-GTATCAAAG-AAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-GT--GTC-------CT-T-TG-AGATAT----CC---CTC-AGATA-TATGGG-GTGGT---TGAT-CAA--AT--A----AAAATTCTG-A-A--AA---CTTTAATCTCT-GCTTG-----CATT--AG---------GAAGATT-------AATCAT-T----GGACT-A--ACTTCA-A---TGAC-G--TCAC---GGAAAT-CT--T-T--C-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAA-TCACTT--A-TTGT-TAGAA-G--AATG-GTA-AA---A-TTTAAAAAA-AAAA-TAA-C--------TATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-TT-A------CC--CGAA-TATC--TCAAATAAA---TAT-T-AT--C------AA-A---CAT-T-TG---TTTAC---ATG-A-------AT-A---A--AT--------T-GC--ATTATTAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TA-ATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATT-CA-AT-ATCAATAT-A---A
gi|12 : ---AGAAAC-T-GGG-TTGCCGAAA-AAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGTA-TCTTACT-TTTATTAG-ATC-ACT-------TT-T-AG-A-ATAT----GC---CTC-TGGGG-TATGGA-ATGCATTTTTTT-TAA--AT-T-------GATCT----------A--TTAGAAAAATT-CCA-GTTATACAT----GCAGCC-----AAAAT--------AGTAAT-G----GG---------TTCC-TATATAGT-ATGTCTCATAAAGAAT-CA--T-T--ATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAA-C--CCT--A-TC-----AAA-T--AA-GAGAC-AA------T------A-AAAA-AAA-TCTCACAGCTGTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-GT-ATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---AAA---TAT------CC------AA-GAC-TAT-A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACGTTT-CCTTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-AATAACTAGACAAATG-T-AAGGCTTAATTG--T--GTCTACTTAC-A-----G-GACT-T-ATTCAA-G--AG--A-CACAT-TATTG-ATAGTCC-A---TGTGTCTCT-TG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G--T-GTCGGATGCTTCTATCCATA---T-TTTCCC-T-G-CACT-A-GT-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-T-AT-T--TATATC-A--AAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTA---T-G-G--GG--G-ATGA---T-A-TTA--ATT-ATCT----GAACAAT-GAA-ATG--A------TAATTTGT--T---TTCCTT-A-T----GTA--attccaaaatgtagact
gi|14 : -TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA-----AGATTCTG-CTG--AAA--CTAGAAAAA-------------------------CGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGACCA--TCAA---GAGACT-CT---------ACTTCGAA-C-AGGG--TGGGAA-CACCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-G-----------------------------------------G----TA---------------TT-T-C-T--AATA----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAT-ATCA---G-CAC---ATA-T-------ATAG---AGGAT-T----ACT-GT--CCC-CCAGTT-CA-A-CGCCAAAGA--T---TAC--GC-ATT-C-CC-A--AATGC-TAGCAGT-AA------C--TA--A---AATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-GATTGATCGA--CTTGAT-GA----CA-G--AC-CAAT-GGAAA--TAA----GACAC-A----TCAA-----C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--ttcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAG-TT-TTTCTCCT-G-C-CTA------C-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAAT-T--TACA-T-A--GAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAA---C-G-G--GGA-G-ATAACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAG-GAA-AGCTTA------T------T--T---TCCT---A-T----GTA--CA-AATCT-TTATAAAA-A-TGT-C-TGGTCC-----T-T-TTG---AG-TTT-AT-----TT--T-A-AT--A--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATA----CA-CG----GTTT-AACTTAT-TTTC---AT--------------T---A-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TG----CG----T-TT--------A--GATTAAAAAATC-----A-TTTT-ATG-T-CATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataatT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTA---T-G-T--GGA-G-ATGACTCT-ATTTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----AATTG--T------T--T---TTCCT--ATT----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-C-TGGTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-T----TA-CA----G----AA---TT-TCTG---TT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGta
gi|17 : C-TT-TTTCTC-TTG-TGTGAA-AT-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAAT-T--TACA-C-A--TAGTT-GATAC-CCGTGT-TTTACTT---T-G-G--GGA-G-ACAAATCC-A-TTAGTATT-A-AA----G-AAAAC-GAA-A----A------TTTA---T--T---TTCT---A-TA---GTA--AA-ATTTT-TTCTAAAG-A-GAT-C-TGGTAG-----T-T-TTT---AG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAAT-T--T-----------------------GTCTGTT-ACTA---T-A-G--CAA-G-ATGACTC--A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--TATCTTCCT--G-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-A-GGGTAGT----T-T-TTC---GG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--ATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TT-TAATCTG----AA---TC-TTTCATTAT--------------A---ATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T-------------------------------------------A-TTTT-GTG-A-CATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAA-CCACTT--C-CTGT-TAAAA-G--AA-T-GGC-AA---A-TT------A-AGAA-CGA-T--------TATG----TAT-A-----GAT----TTAT-CAC--AATA----T-G-GT-A------CC--CGAG-TATC-AAAAAG-AAA---TAT----TACC------AA-A---CAT-T-CG---TTCAC---ATG-A-------ATCA---A--AT-T----A-C-G----TTATTAT-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAT-TGC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-AT-ATC--TGT-G---TATCACCTTTTGT------------------attgtaa
gi|2 : atgtC-A-TACATTGACCCAATTATTA-CGCTGAAT-GCT-ATA---AGAA-C-T-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAG-TTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTATGCA-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A---AT----GC---A-C-TGAGC-TATGGG-GT-GG---T-TT-CAAAGAT-T----CAAGATTCAG-A-A--AAA--ATAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA----GGTCTT---ACTTCCTT---TGTC-AT-TCGCG--GAGACT-CT--CGT--CTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTGTCTAGAA-AGCAACG-GACAAA---A-AT------A-AAAACCAATT--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-GT-A------CCCAGGAT-TATC-TTCA---AAAGATTAT-TGCTTCC------AACG-TATTT-A-CG---GTCAC---AAGAA-------ATCA---A-----T----A-TAGC--CAC-CCAG-ACCA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-A-T-C-CC-A--AATGCTTAG-ACT-AA-ACAATT--TATAA---AGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---TAAGGAAC-CAAT-GGAATTCA---TAA-CCAA-G--AAC-TAACGACA-----A----TCAA-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACA----TA-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT--GAGA-CG-CATACT---GGAATGT--A-TA--CATACAAG-A-T-AA-GCA-AATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---GTGATT-TAATTCA--A--TG--T-AACA--TATTGAATAG--------TGT---TA----------------AA-A---CA-GGAG-GACGC--GCT--TATC-ATAC-TT-TTTTCC-T-GCCAC-AA-GT-AC-T-CG-CTCC-C-AGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AA--T--TATA-CAA--GAGTGCGACAC-TCG-GTG-TTAATA---T-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-A-TTAATA-T-A-----------AAT-G---------------T------T--T---TCCT---A-T----GTGACCA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCT-----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T--T--A--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---T-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTG----TA----G--T--------A--C----------------A-TTTT-GTGAT-CATC--TATTGaacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|20 : aT---CCT-TA-----T-G-GTGAA-A---CA-G--A-GGAA---ACT--TATCACTAC-GT-TTTCTCGT-G-CACTGA-GT-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAAT-T--TACA-T-A--TGATG-GACAC-TCTTG---TTACTA---T-A-G--GGA-G-ATGAACCC-A-TTGGTATC-A-CT----G-ACAAT-GAA-AAGTTA------T------T--T---TTCCA--A-T----GTA--CA-AATGA-TAATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----TGT-TTT---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : TCAA-A-ACGAAT--CT-GAAAAATT-ACA--------ATT--AAACGCAGC--AAGAAT--------AGTTAC-GTACTGG-ATTA--ACTTTA-A---TAGC-A--TCAA---GGGAAT-CA--C-T--TTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAA-CCA-TTAAA-TCAT-----A-G--GC-G-G------------------A-AAAA-CGA----------TGTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-AT-A------CC--AAAC-TACC-TTAG---TGA---CAT-T-TTTCCGTATAAAA-C-T-TCT-A------GTTACAATACG-AGAAACACATTA---A--AT-T----A-T-GA--TGTACCA--A-CA---TGC--AAA
gi|22 : ata--AATG--TTG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GAAATTCA-C-TAC-CTAT-GGAAA--TAA----A-----AACAATC-AA----C----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-ACCC-C----TTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG--------------------T-AGGACACAATTA--T--GT--ATTAGA--------------T-A------A--CG--T-AACAT-TATTG-ATAATCC-TCTGTGT---TCT-TG-----C-G-GT-AA-A---CA-GA-G-GACct
gi|23 : tTTTATA-CAATACT-TTCATATG-ACC--TC-------AT-TTGG-A-ATATATATGC---ATC-CAAAG-CATGGG--TGG---------------T-CA---T----TT----G-A--AGT--CTAGAAAAACT-ACA-A-----CATTTTAG-AGCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAAC-C----GGTCGTATCGCTTTA-A---TAGC-A--TCAC---GTGATT-CT--G-AGACTATACGGAAAC-TG-----GGAAA-CCGCTT--A-TTGA-TAGAC-A--AA-G-GAC-CATATG-TT------ACCAGA-CAG-------------G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-GT-T------CC--AGatcac
gi|24 : T-A-TTAATAT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----ACATTG-T------T--T---TCCT---A-T----GTAG-CACATTGT-TTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTA---AG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATT----TA-CA----G----AA---ATGTTCC---AT--------------A---A-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AG----TAA---G-CT--------ATAG----------------ACTTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|25 : g-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-GGA-T--------TGTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTATT------AA-G-T--AT-A-TG---GTCTC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAA-C-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--T-CAAT-GGAATTCA-A-TAC-CCAT-G--GA--t
gi|26 : AC-A----AGTCTTA---CGTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CTCTC-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTC----AAA---TATAT-CTACC------AA-G---TAT-A-C----GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-A-CGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-a
gi|27 : a--T-AACGT-TAATG-ACAGTCC-CCTATGT---TCT-CG-----T-G-GT-AATA---CA-G--G---TT---GTA--TATCAATAT-TTCTTTCTC-TTG-CACTAA-CC-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAAT-T--TATA-C-A--TAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-A---T-------------------T-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--G---TTCCCCTA-A----ACA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GA
gi|28 : AATATT-A-CT----G-ACA-T-GAA-A----AATTG--T------T--T---TCCG---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-G-T-C-TGGTAG-----T-T-TTTTTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-GT--A--T------A-TA-G---AA-----ACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TT-CA----G----AA----T-TTT------------------------A-TT---TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----GTTT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|3 : C-A--TTGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAACATGCG---GGGAA-CCGCTT----TTGT-T-GAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAAACAA-T--------TA-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAGT-A------CC--AGAT-T--C-TTCA---AG----TAT-T-CTTCC------AA-G-T--ATCA-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--ATCT----A-T-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAGCC-A-TTC-CC-A--AATG--TAG-ATT-AAGAC--TT--TAT-A----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA----TAG---C-CAATTGGAATTCA-G-TAC-C-AT-A--GA--CAA----AGACAAA----TCGA-----A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-ACCT-CCTTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCA-GA--CATACATA-T-T-AAGGCACA-CTG--CTCGT--ACTAAATAAA---A-GACT-T-ATCCAG-ACGTG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCTAT---TGT---TCT-TGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG--A-GACG---CGT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACTAATGTTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATAG--TATA-C-A--TAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTA---T-G-G--GGAAG-ATGACTCT-A-TTAATATTTA-CT----G--CAA--GAA-A----AATTTGTT------T--T---CTCT---ACT----GTA--AC-ATTGT-TTATAATA-A-GAT-C-TGGCCT-----T-T-TTT---AAATTT-ATA----TT--T-T-GT--A--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---A--TGTC---ATG-------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT--TG-T-GATT--TATTACta
gi|30 : -TAT-A-CGCGGGTCAC----TG-A-------ATCATTTC--AT-TTTTAA-T-GC--CCT-TCAG-A-CAGATCGT--GTAA--TATTTACAGTCTA-T-TACC-ACTAATT--GAG-ATT-AA--C-GTT--TAT-ATTTAGTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATC-ATTGA--C-CAAT-GGAATTCA-G-TAC-Ctt
gi|31 : agATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTATA-CATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------AC-T-AG-A-GTAT----GCTTCATT-TG----TATGGG-ATGGT---TGCT-CTG--CTGCA---GAA-ATT--G-C-A--AAG--TTAGAAAAAGT-ACA-GTCC--CAT-------GCTGC--TAGAAT--------TGCAAC-A----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaaT--A--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGGGATTA----G-TTTTATATTCA--GATT-------------A-TTTT-GTG-T-CATA--TATTGgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATT----TGTCA----T----TA---AT-TTCT---AT--------------ATTAA-ATA--TG--------TTT-T-AAA-----------TTTACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----CG----G-TT--------AC-GGTAGATTAAAAAGATTA-TTTT-GTG-T-CATT--AATTGtaac
gi|35 : TATT-A-CT----G-ACAAC-GAACA----A------T------TGTT---TTCCG--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGATCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATC----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAtaa
gi|36 : AA-AAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CAGTACT-TTTA-AAA-GTC-TTCCTTTAATGT-T-GG-A-ATAT----GC---ATC-TGAAG-TATGGG-ATGGG---TGTT-C-A--AT-CATTTCAA-ATTTAA-A-A--AAA------AAAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTGT--A--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTT----AT--------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TAG---G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|38 : -C-AAA-A-A--------G----TATTTTGTAATA-TA----GTCCGAA---TT-TTTC---ATTAGCATTCTATGTAA---A-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TG----TG----G-TT--------A--GATTTTAACAGATT---A-TTTT-GTG-T-CATT--TATTGta
gi|39 : -A---AATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA----TAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--GAATTAA----G-----A----CA-A-----T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCG-CCTTCCTtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACACACGAAAAAAATATGCA-AT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGT-TTTACT-AGATTT-G--CCCTAGTCTCCCAC-CGACAAACTAT--TTGCCGCATTTCAT----TTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGA-T-GCTTATA---AAAACT-G-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAA----ACTTGAT-CA-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-GTAT----GC---ATC-TTAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT------CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTT---ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTTCC------AA-A---TAT-A-CA---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-GTCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T----ATAGG--C-CAGT-GGAATTCG-G-TAC-CCAT-
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAAT-T--TACA-C-AATTA----------TC----GTCTACTATTTT-A-G--GGA-G-ACAAATCCAA-TTAGTAGT-A-CCCTGAG-AAAAT-AAA-A----G------T------T--a
gi|42 : tcT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AC--------------A---A-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TG----CACATTG-TT--------A--G----------------T-TTTTAGCA-TATATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT---------ATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGA-CCGCTT--A-TTGT-T---A-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-A--------TTTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-A--TG--TAAACAT-AATTG-ATGCTCC-
gi|45 : a-GACAC---GCATGTTTATCA---T-G-A--GGT-G-ATAACTCA-A-TCGGCATC-A-CA----G-AGAAT-GAA-A----A------C------T--T-------------------------ATTTTATTAAAAAA-A-TAT-C-TGGTCG-----T-TCCTG---AG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-AATA--CATACAGG-A-TTAAGGCATAATTT--T--GT--ACTAAA-GAA---A-AACG-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : AC-A----GGTCTTA--A-TTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAAAG--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-AGA-T--------TATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-T-CA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G-T--AT-A-CG---GTCAC---A-G-A-------ATCA---A---T-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T----ACA-GC-A-T-T-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TACACCATAG--AA--TTA----GACA--A----TC-A-----C----TTC-TGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-C---CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT------A------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTC-CTCGA-A-AACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA----AAGAAAA-ATACATAT-C--CC----------------CATAAATTGCAAT-A-T-GGATTTCGTG-TCAA------CACAC-AAACACT-TAGTTATCA---TT--G----TTCCCACACGATCT----------------C-A-TA---TG--TC-AT--------CC---T-ACCTATG---AAAAAC-GTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAA----ACTTTAT-CT-ATTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG-ACC-TCT-------GC-T-GG-A-ATAT----GC---GTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGA---AGTT-CAA--AT------CAAGCCTTTA-A-A--AGATTTTAAAAAATTT-ACA-G-----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtactta-AA---G-TT------A-AAAC-CAA-A--------TATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G--T-A------CC--ACAT-CATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTGCC------TA-G-C--AT-G-CG----TCAC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-C-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T--------G--A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TG-AAT-GGAATTCA-G-TA--CCAT-GAAAA--TAA----G-----G----AC-AACAATT----TTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGG---------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-AT-TGATC-AACAT-AATTG-ATGCTCC-------T---TCTATG-----T-------------------------------------TTTACATT-TTT----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAA--T--TAGG-C-A--TAGTG-AACAC-TTGTGT-TTTGGCA---TCG-A--GGA-G-ATGACTCC-ATTTTGTGAA-A-CT----G-CCCAT-GCA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTT---AG-TTT-AC-----TT--T-ttgctgcag
gi|8 : aatcaTT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TG-AAT-GGAATTCAAG-TAC-CCATAG--AA--TAA----A-----ACAA-TA-A-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-ACAT-C-TTCT-ATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA---ATACAAG-A-TCAAGGCATAAT-------------------AA---A-GACT---ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-AT-----------------CT-TG-----T-G-GT-AA-AA--CA-G--ATGACG----CT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACGAA-GT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA-----A-T--GGA-G-GTGA--CT-A-TTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------TG-T---TTCCT--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTA-AAAA-A-GAT-A-T-GTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-A------TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTT----TA-CA----G-----A---AT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T--ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : ---A--AT-T------T-AC--GTCACCAG-A-CA-ATCGC--AGAA--T---TA--------T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-GC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TA-AAT-GGAATTCA-G-TTC-CCAT-GAAAA--TAA----G-----A----CA-A-----CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T-------------AAA---G-G-CT-T-ATTCAG-A--AG--TAAACAT-TATTT-ATGCTCCAC---TATG--TTT-T----------------A---CA-------------------------AT-TT-TT-----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAAT-T--TAGG-T-A--TAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCA---T-G-A--GGA-G-ATAACTCC-A-TTTGTGAA-A-CT----G-CCCATCTAA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-T-TAT-C-TGGTCGGTTTTT-T-TTT---AG-TTT-ACTTTGATT--T-T-GT--A--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 1 22 4444444444 11 1 11 4444444444 1 11111111 11 111 1 4444444 1 11111 111 11 111 1 111 2222 1 1 111 4444444444444 333333333 4444444444444444 2222222 555555555555 5555555555 111 3333333333333 1 111 111 1 1111111 2222222 111111 33333333333333333 11 11111111 1111 1111111 11111111 1111111111 2222 2222222 22222222 111111111111111111 33333333333333 5555555555555555555555555555555555555555 1 4444444444444444444444444444444444444444 444444444444444444444444 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 1 1 444444444444444444444444444444444444444 11111 1111 111 1 2222 11111111111111 111111111 11111111111 1111 5555555555555555555555555555
lowQualScore : 3 3 1 1 7 0000 1 6 0 2 22 2222222222 66 0 22 33 0000000000 0 99999999 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 44 7 0 777 3 3 999 8888 7 3 3 666 1111111111111 111111111 8888888888888888 7 6 7777777 1 222222222222 5555555555 111 2 55 3 4444444444444 8 0 111 3 444 3 22 5 0 66 22 1 9999 4 4 4 2 4 1 4 55 3333333 4 4 4 4 8888 777 4 3 3 8888 3 55 5555555 2 777777 55 7777 1 1 4 55555555555555555 00 88888888 888888 3 5555 66666 3 77 888 3 2222222 3 66 2 33 2 2 4 2 66 5 2 0 22222222 777777 2 5 4444444444 5555 66666 5555 22 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 888 555 3333 4 888888 2 5555 2 2 444 555 3 2 9999999 444 33 2 5555 2 2 4444444 2 2 2 33 33 555 55555555 2 2 5 66 66 2 2 2 2 33 2 444 999999999999999999 5 2 2 2 88888888888888 2 2 2 2 8888888888888888888888888888888888888888 3 3 22 3 4 3 77777 55 0 3 3 4 4 4 4 8888888888888888888888888888888888888888 8 7 999999999999999999999999 4 4 4 99 55 7 3 3 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 3 3 4 7 7 3 3 6 0 3 5 2 1 9 6666 2 2 2 2 33 0 2 2 33 5 2 5 444 555555 2 2 3 22 5 1 2 2 4444 2 2 2 444444444444444444444444444444444444444 55 2 2 2 5 2 2 77777 2 5 5555 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 2222 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 99999999 6666 5555 2 5555 1111 7777 2 777 88888888888888 444 33 66 999999999 33 2 33333333333 5 2 2 2 2 2 2 5555 1111 2 1111111111111111111111111111 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. .......... .. . .. .. .......... . ........ .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. . . ... . . ... .... . . . ... ............. ......... ................ . . ....... . ............ .......... ... . .. . ............. . . ... . ... . .. . . .. .. . .... . . . . . . . .. ....... . . . . .... ... . . . .... . .. ....... . ...... .. .... . . . ................. .. ........ ...... . .... ..... . .. ... . ....... . .. . .. . . . . .. . . . ........ ...... . . .......... .... ..... .... .. . .. .... . . . ...... .. . . ... ... .... . ...... . .... . . ... ... . . ....... ... .. . .... . . ....... . . . .. .. ... ........ . . . .. .. . . . . .. . ... .................. . . . . .............. . . . . ........................................ . . .. . . . ..... .. . . . . . . . ........................................ . . ........................ . . . .. .. . . . . ........................................................ .. . . . . . . . . . . . . . . .... . . . . .. . . . .. . . . ... ...... . . . .. . . . . .... . . . ....................................... .. . . . . . . ..... . . .... . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... .... . .... .... .... . ... .............. ... .. .. ......... .. . ........... . . . . . . . .... .... . ............................ . . . . ..
lowQualScore : 3 7 0 0 3 5555 0 5 0 8 00 0000000000 55 0 22 88 8888888888 0 22222222 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 00 3 7 777 3 7 000 3333 3 3 3 000 3333333333333 333333333 3333333333333333 3 7 3333333 0 777777777777 7777777777 000 5 88 2 8888888888888 0 6 777 2 333 3 88 7 1 11 66 9 4444 4 4 0 4 0 4 0 66 0000000 0 0 0 0 5555 000 0 6 6 4444 6 00 9999999 8 777777 00 7777 4 3 0 99999999999999999 66 55555555 111111 5 0000 77777 1 33 555 1 3333333 1 88 9 99 7 7 0 7 33 3 7 3 88888888 222222 5 0 4444444444 3333 22222 3333 00 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 999 000 8888 8 222222 9 7777 7 7 777 000 8 9 3333333 777 77 7 7777 7 7 5555555 7 7 7 77 99 000 11111111 9 9 7 33 33 7 7 9 9 77 5 444 777777777777777777 7 9 9 9 66666666666666 9 9 9 9 9999999999999999999999999999999999999999 6 6 00 3 4 3 22222 00 2 3 3 6 0 0 0 4444444444444444444444444444444444444444 0 2 888888888888888888888888 0 0 0 55 00 3 6 6 5 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000 77 6 6 5 3 3 6 3 7 7 3 7 9 4 0 1111 9 9 9 9 99 4 9 9 99 3 7 5 777 999999 7 7 3 99 0 5 2 2 7777 2 2 2 777777777777777777777777777777777777777 66 5 5 5 0 7 7 33333 7 3 7777 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 1111 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 3 7 7 7 77777777 1111 7777 7 7777 7777 6666 7 333 33333333333333 777 77 33 777777777 55 7 66666666666 3 7 7 7 7 7 7 7777 0000 7 6666666666666666666666666666 7 7 7 7 77
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC--TT--T----TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC--TT--T----TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCCTTCAAC-A-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTACA----A-GAAAA-ATGCA-ATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TT-ACTTAGATT--GTGTACTA------CACACGAAAC----T--TTGGCGC--TT--TCTTTTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-AT-AGCACCAA-TTGTTTATAGAAAAAAAT-G-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAAT-GCAAA----A--TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCGCC-GTC-------GCAT-AGCA-ATAG----AC---ATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAA--AT-CA---CAAGATCAAGCA-A--AAA--CTGAAAAAATTGACA-G-----CATT--AGCAGCCGCCTGAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACTCCT--C-A--CTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTTT-T-GAA-GC-AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-GT-A-------C--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T--TCTC------GA-G-T-TAT-A--G---GTCAC---AAG-A-------ATAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAGAATT---TACAAGC-A-T-C-CC-AC-AGTG--TAG-ATTAAA-AC-A-T--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---ATAGC--CGCAAT-GGAATTCA-GATAC-CTAT--------T-A----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACTT-CCTTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATATAAG-A-T-AAGGCTTAATTGCTT--GT--A-TAAA-AAACATG-CACTCT-ATTCAGCA--TG--T--ACATCTATTG-ATAGTCCTC---TGT---TCT-TG-----T-GAGT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATTCATAC-TT-TTTCTC-T-GCCCCTAG-CT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAAT-TGGTATA-C-A--TGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTA---T-GCG--GGA-GAATGACTCT-A-TTA-TATT-A-CT----G-ACAAT-GAA------------------------------C---A-C-----TA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-CTTGGTCG-----C-T-TTA---AG-TTT-AT-----TTACT-T-GT--A--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTCA--AT--------------A---G-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTG-CTA-T-CATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAAA-CACCACT-TTTATAAG-GCG-GCC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAGG
gi|10 : --------AATCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTAT-TAGAA-G--AA-G-TACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAC-A-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAT-A-T-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATAG--AAT-TAA----GACA--A----TCAA-----C----TTC-T-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CGATCTTtcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaA-T-GCT---G---AAAAACTA-AGA-GTATCAAAG-AAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-GT--GTC-------CT-T-TG-AGATAT----CC---CTC-AGATA-TATGGG-GTGGT---TGAT-CAA--AT--A----AAAATTCTG-A-A--AA---CTTTAATCTCT-GCTTG-----CATT--AG---------GAAGATT-------AATCAT-T----GGACT-A--ACTTCA-A---TGAC-G--TCAC---GGAAAT-CT--T-T--C-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAA-TCACTT--A-TTGT-TAGAA-G--AATG-GTA-AA---A-TTTAAAAAA-AAAA-TAA-C--------TATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-TT-A------CC--CGAA-TATC--TCAAATAAA---TAT-T-AT--C------AA-A---CAT-T-TG---TTTAC---ATG-A-------AT-A---A--AT--------T-GC--ATTATTAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TA-ATGC-A-T-C-CCTA--AAT---CAG-ATT-CA-AT-ATCAATAT-A---A
gi|12 : ---AGAAAC-T-GGG-TTGCCGAAA-AAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGTA-TCTTACT-TTTATTAG-ATC-ACT-------TT-T-AG-A-ATAT----GC---CTC-TGGGG-TATGGA-ATGCATTTTTTT-TAA--AT-T-------GATCT----------A--TTAGAAAAATT-CCA-GTTATACAT----GCAGCC-----AAAAT--------AGTAAT-G----GG---------TTCC-TATATAGT-ATGTCTCATAAAGAAT-CA--T-T--ATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAA-C--CCT--A-TC-----AAA-T--AA-GAGAC-AA------T------A-AAAA-AAA-TCTCACAGCTGTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-GT-ATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---AAA---TAT------CC------AA-GAC-TAT-A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTA-CCCAAAAATCACACGTTT-CCTTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTG-AATAACTAGACAAATG-T-AAGGCTTAATTG--T--GTCTACTTAC-A-----G-GACT-T-ATTCAA-G--AG--A-CACAT-TATTG-ATAGTCC-A---TGTGTCTCT-TG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G--T-GTCGGATGCTTCTATCCATA---T-TTTCCC-T-G-CACT-A-GT-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-T-AT-T--TATATC-A--AAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTA---T-G-G--GG--G-ATGA---T-A-TTA--ATT-ATCT----GAACAAT-GAA-ATG--A------TAATTTGT--T---TTCCTT-A-T----GTA--attccaaaatgtagact
gi|14 : -TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA-----AGATTCTG-CTG--AAA--CTAGAAAAA-------------------------CGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGACCA--TCAA---GAGACT-CT---------ACTTCGAA-C-AGGG--TGGGAA-CACCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-G-----------------------------------------G----TA---------------TT-T-C-T--AATA----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G---TAT-ATCA---G-CAC---ATA-T-------ATAG---AGGAT-T----ACT-GT--CCC-CCAGTT-CA-A-CGCCAAAGA--T---TAC--GC-ATT-C-CC-A--AATGC-TAGCAGT-AA------C--TA--A---AATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-GATTGATCGA--CTTGAT-GA----CA-G--AC-CAAT-GGAAA--TAA----GACAC-A----TCAA-----C----TTC-T-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--ttcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAG-TT-TTTCTCCT-G-C-CTA------C-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAAT-T--TACA-T-A--GAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAA---C-G-G--GGA-G-ATAACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAG-GAA-AGCTTA------T------T--T---TCCT---A-T----GTA--CA-AATCT-TTATAAAA-A-TGT-C-TGGTCC-----T-T-TTG---AG-TTT-AT-----TT--T-A-AT--A--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATA----CA-CG----GTTT-AACTTAT-TTTC---AT--------------T---A-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TG----CG----T-TT--------A--GATTAAAAAATC-----A-TTTT-ATG-T-CATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataatT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTA---T-G-T--GGA-G-ATGACTCT-ATTTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----AATTG--T------T--T---TTCCT--ATT----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-AGGAT-C-TGGTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-T----TA-CA----G----AA---TT-TCTG---TT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGta
gi|17 : C-TT-TTTCTC-TTG-TGTGAA-AT-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAAT-T--TACA-C-A--TAGTT-GATAC-CCGTGT-TTTACTT---T-G-G--GGA-G-ACAAATCC-A-TTAGTATT-A-AA----G-AAAAC-GAA-A----A------TTTA---T--T---TTCT---A-TA---GTA--AA-ATTTT-TTCTAAAG-A-GAT-C-TGGTAG-----T-T-TTT---AG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAAT-T--T-----------------------GTCTGTT-ACTA---T-A-G--CAA-G-ATGACTC--A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--TATCTTCCT--G-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-A-GGGTAGT----T-T-TTC---GG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--ATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TT-TAATCTG----AA---TC-TTTCATTAT--------------A---ATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T-------------------------------------------A-TTTT-GTG-A-CATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAA-CCACTT--C-CTGT-TAAAA-G--AA-T-GGC-AA---A-TT------A-AGAA-CGA-T--------TATG----TAT-A-----GAT----TTAT-CAC--AATA----T-G-GT-A------CC--CGAG-TATC-AAAAAG-AAA---TAT----TACC------AA-A---CAT-T-CG---TTCAC---ATG-A-------ATCA---A--AT-T----A-C-G----TTATTAT-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TAT-TGC-A-T-C-CCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-AT-ATC--TGT-G---TATCACCTTTTGT------------------attgtaa
gi|2 : atgtC-A-TACATTGACCCAATTATTA-CGCTGAAT-GCT-ATA---AGAA-C-T-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAG-TTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTATGCA-CTTGTATA-CACTACT-TTTAGAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A---AT----GC---A-C-TGAGC-TATGGG-GT-GG---T-TT-CAAAGAT-T----CAAGATTCAG-A-A--AAA--ATAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA----GGTCTT---ACTTCCTT---TGTC-AT-TCGCG--GAGACT-CT--CGT--CTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTGTCTAGAA-AGCAACG-GACAAA---A-AT------A-AAAACCAATT--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-GT-A------CCCAGGAT-TATC-TTCA---AAAGATTAT-TGCTTCC------AACG-TATTT-A-CG---GTCAC---AAGAA-------ATCA---A-----T----A-TAGC--CAC-CCAG-ACCA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC-A-T-C-CC-A--AATGCTTAG-ACT-AA-ACAATT--TATAA---AGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GA---TAAGGAAC-CAAT-GGAATTCA---TAA-CCAA-G--AAC-TAACGACA-----A----TCAA-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACA----TA-CC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT--GAGA-CG-CATACT---GGAATGT--A-TA--CATACAAG-A-T-AA-GCA-AATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---GTGATT-TAATTCA--A--TG--T-AACA--TATTGAATAG--------TGT---TA----------------AA-A---CA-GGAG-GACGC--GCT--TATC-ATAC-TT-TTTTCC-T-GCCAC-AA-GT-AC-T-CG-CTCC-C-AGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AA--T--TATA-CAA--GAGTGCGACAC-TCG-GTG-TTAATA---T-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-A-TTAATA-T-A-----------AAT-G---------------T------T--T---TCCT---A-T----GTGACCA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCT-----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T--T--A--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---T-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTG----TA----G--T--------A--C----------------A-TTTT-GTGAT-CATC--TATTGaacaagggcggtacatgattggaactctttgtccctcagagataagacaatgtacgtcactaagctcgttaaaaattgct
gi|20 : aT---CCT-TA-----T-G-GTGAA-A---CA-G--A-GGAA---ACT--TATCACTAC-GT-TTTCTCGT-G-CACTGA-GT-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAAT-T--TACA-T-A--TGATG-GACAC-TCTTG---TTACTA---T-A-G--GGA-G-ATGAACCC-A-TTGGTATC-A-CT----G-ACAAT-GAA-AAGTTA------T------T--T---TTCCA--A-T----GTA--CA-AATGA-TAATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----TGT-TTT---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : TCAA-A-ACGAAT--CT-GAAAAATT-ACA--------ATT--AAACGCAGC--AAGAAT--------AGTTAC-GTACTGG-ATTA--ACTTTA-A---TAGC-A--TCAA---GGGAAT-CA--C-T--TTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAA-CCA-TTAAA-TCAT-----A-G--GC-G-G------------------A-AAAA-CGA----------TGTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-AT-A------CC--AAAC-TACC-TTAG---TGA---CAT-T-TTTCCGTATAAAA-C-T-TCT-A------GTTACAATACG-AGAAACACATTA---A--AT-T----A-T-GA--TGTACCA--A-CA---TGC--AAA
gi|22 : ata--AATG--TTG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-GA----TAGA--TA-AAT-GAAATTCA-C-TAC-CTAT-GGAAA--TAA----A-----AACAATC-AA----C----TTT-T-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TC-CC--AAAA-CACA-ACCC-C----TTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG--------------------T-AGGACACAATTA--T--GT--ATTAGA--------------T-A------A--CG--T-AACAT-TATTG-ATAATCC-TCTGTGT---TCT-TG-----C-G-GT-AA-A---CA-GA-G-GACct
gi|23 : tTTTATA-CAATACT-TTCATATG-ACC--TC-------AT-TTGG-A-ATATATATGC---ATC-CAAAG-CATGGG--TGG---------------T-CA---T----TT----G-A--AGT--CTAGAAAAACT-ACA-A-----CATTTTAG-AGCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAAC-C----GGTCGTATCGCTTTA-A---TAGC-A--TCAC---GTGATT-CT--G-AGACTATACGGAAAC-TG-----GGAAA-CCGCTT--A-TTGA-TAGAC-A--AA-G-GAC-CATATG-TT------ACCAGA-CAG-------------G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-GT-T------CC--AGatcac
gi|24 : T-A-TTAATAT--A-CT----G-ACAAT-GAA-A----ACATTG-T------T--T---TCCT---A-T----GTAG-CACATTGT-TTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTA---AG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATT----TA-CA----G----AA---ATGTTCC---AT--------------A---A-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AG----TAA---G-CT--------ATAG----------------ACTTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|25 : g-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-GGA-T--------TGTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTATT------AA-G-T--AT-A-TG---GTCTC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAA-C-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--T-CAAT-GGAATTCA-A-TAC-CCAT-G--GA--t
gi|26 : AC-A----AGTCTTA---CGTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CTCTC-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTC----AAA---TATAT-CTACC------AA-G---TAT-A-C----GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-A-CGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-a
gi|27 : a--T-AACGT-TAATG-ACAGTCC-CCTATGT---TCT-CG-----T-G-GT-AATA---CA-G--G---TT---GTA--TATCAATAT-TTCTTTCTC-TTG-CACTAA-CC-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAAT-T--TATA-C-A--TAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-A---T-------------------T-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--G---TTCCCCTA-A----ACA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GA
gi|28 : AATATT-A-CT----G-ACA-T-GAA-A----AATTG--T------T--T---TCCG---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-G-T-C-TGGTAG-----T-T-TTTTTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-GT--A--T------A-TA-G---AA-----ACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TT-CA----G----AA----T-TTT------------------------A-TT---TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----GTTT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|3 : C-A--TTGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAACATGCG---GGGAA-CCGCTT----TTGT-T-GAA-G--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAAACAA-T--------TA-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAGT-A------CC--AGAT-T--C-TTCA---AG----TAT-T-CTTCC------AA-G-T--ATCA-CG---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--ATCT----A-T-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAGCC-A-TTC-CC-A--AATG--TAG-ATT-AAGAC--TT--TAT-A----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-GA----TAG---C-CAATTGGAATTCA-G-TAC-C-AT-A--GA--CAA----AGACAAA----TCGA-----A----TTC-T-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TA-CC--AAA-TCACA-ACCT-CCTTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCA-GA--CATACATA-T-T-AAGGCACA-CTG--CTCGT--ACTAAATAAA---A-GACT-T-ATCCAG-ACGTG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCTAT---TGT---TCT-TGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG--A-GACG---CGT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACTAATGTTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATAG--TATA-C-A--TAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTA---T-G-G--GGAAG-ATGACTCT-A-TTAATATTTA-CT----G--CAA--GAA-A----AATTTGTT------T--T---CTCT---ACT----GTA--AC-ATTGT-TTATAATA-A-GAT-C-TGGCCT-----T-T-TTT---AAATTT-ATA----TT--T-T-GT--A--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---A--TGTC---ATG-------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT--TG-T-GATT--TATTACta
gi|30 : -TAT-A-CGCGGGTCAC----TG-A-------ATCATTTC--AT-TTTTAA-T-GC--CCT-TCAG-A-CAGATCGT--GTAA--TATTTACAGTCTA-T-TACC-ACTAATT--GAG-ATT-AA--C-GTT--TAT-ATTTAGTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTGATC-ATTGA--C-CAAT-GGAATTCA-G-TAC-Ctt
gi|31 : agATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTATA-CATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------AC-T-AG-A-GTAT----GCTTCATT-TG----TATGGG-ATGGT---TGCT-CTG--CTGCA---GAA-ATT--G-C-A--AAG--TTAGAAAAAGT-ACA-GTCC--CAT-------GCTGC--TAGAAT--------TGCAAC-A----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaaT--A--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGGGATTA----G-TTTTATATTCA--GATT-------------A-TTTT-GTG-T-CATA--TATTGgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATT----TGTCA----T----TA---AT-TTCT---AT--------------ATTAA-ATA--TG--------TTT-T-AAA-----------TTTACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----CG----G-TT--------AC-GGTAGATTAAAAAGATTA-TTTT-GTG-T-CATT--AATTGtaac
gi|35 : TATT-A-CT----G-ACAAC-GAACA----A------T------TGTT---TTCCG--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGATCGT----T-T-TTA---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATC----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAtaa
gi|36 : AA-AAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CAGTACT-TTTA-AAA-GTC-TTCCTTTAATGT-T-GG-A-ATAT----GC---ATC-TGAAG-TATGGG-ATGGG---TGTT-C-A--AT-CATTTCAA-ATTTAA-A-A--AAA------AAAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTGT--A--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTT----AT--------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TAG---G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|38 : -C-AAA-A-A--------G----TATTTTGTAATA-TA----GTCCGAA---TT-TTTC---ATTAGCATTCTATGTAA---A-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TG----TG----G-TT--------A--GATTTTAACAGATT---A-TTTT-GTG-T-CATT--TATTGta
gi|39 : -A---AATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-GA----TAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--GAATTAA----G-----A----CA-A-----T----TTC-T-CTAAAATCTTTCAAAA-ACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCG-CCTTCCTtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACACACGAAAAAAATATGCA-AT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGT-TTTACT-AGATTT-G--CCCTAGTCTCCCAC-CGACAAACTAT--TTGCCGCATTTCAT----TTTTCATACGATCTCA-----GCTGGTCGGC-A-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGA-T-GCTTATA---AAAACT-G-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAA----ACTTGAT-CA-CTTTTATA-CAATACT-TTTATTAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-GTAT----GC---ATC-TTAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT------CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-------TT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTT---ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-TCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-TAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTTCC------AA-A---TAT-A-CA---GTCAC---AAG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-G----CCACCAG-A-CA-GTCGC--AAAA--T---TAC-AGC-ATT-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T----ATAGG--C-CAGT-GGAATTCG-G-TAC-CCAT-
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAAT-T--TACA-C-AATTA----------TC----GTCTACTATTTT-A-G--GGA-G-ACAAATCCAA-TTAGTAGT-A-CCCTGAG-AAAAT-AAA-A----G------T------T--a
gi|42 : tcT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AC--------------A---A-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TG----CACATTG-TT--------A--G----------------T-TTTTAGCA-TATATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCC-T---TGGC-A--TCAC---GAGACT-CT---------ATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGA-CCGCTT--A-TTGT-T---A-G--AA-G-GACAAA---A-TT------A-AAAA-CAA-A--------TTTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-A--TG--TAAACAT-AATTG-ATGCTCC-
gi|45 : a-GACAC---GCATGTTTATCA---T-G-A--GGT-G-ATAACTCA-A-TCGGCATC-A-CA----G-AGAAT-GAA-A----A------C------T--T-------------------------ATTTTATTAAAAAA-A-TAT-C-TGGTCG-----T-TCCTG---AG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-AATA--CATACAGG-A-TTAAGGCATAATTT--T--GT--ACTAAA-GAA---A-AACG-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : AC-A----GGTCTTA--A-TTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAAAG--AA-G-GAC-AA---AATT------A-AAAA-AGA-T--------TATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-T-CA---AAA---TAT-T-CTACC------AA-G-T--AT-A-CG---GTCAC---A-G-A-------ATCA---A---T-T----A-T-GC--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T----ACA-GC-A-T-T-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGG--TG-AAT-GGAATTCA-G-TACACCATAG--AA--TTA----GACA--A----TC-A-----C----TTC-TGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-C---CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT------A------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTC-CTCGA-A-AACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA----AAGAAAA-ATACATAT-C--CC----------------CATAAATTGCAAT-A-T-GGATTTCGTG-TCAA------CACAC-AAACACT-TAGTTATCA---TT--G----TTCCCACACGATCT----------------C-A-TA---TG--TC-AT--------CC---T-ACCTATG---AAAAAC-GTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAA----ACTTTAT-CT-ATTCTATA-CTTTACT-TTTATTAG-ACC-TCT-------GC-T-GG-A-ATAT----GC---GTC-TGAAG-TGTGGG-GTGGA---AGTT-CAA--AT------CAAGCCTTTA-A-A--AGATTTTAAAAAATTT-ACA-G-----Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtactta-AA---G-TT------A-AAAC-CAA-A--------TATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G--T-A------CC--ACAT-CATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTGCC------TA-G-C--AT-G-CG----TCAC---ATG-A-------TTCA---A--AT-T----A-C-GT--C--ACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T--------G--A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TG-AAT-GGAATTCA-G-TA--CCAT-GAAAA--TAA----G-----G----AC-AACAATT----TTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT-----CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGG---------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T--------------AA---A-GACT-T-ATTCAG-AT-TGATC-AACAT-AATTG-ATGCTCC-------T---TCTATG-----T-------------------------------------TTTACATT-TTT----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAA--T--TAGG-C-A--TAGTG-AACAC-TTGTGT-TTTGGCA---TCG-A--GGA-G-ATGACTCC-ATTTTGTGAA-A-CT----G-CCCAT-GCA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-C-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTT---AG-TTT-AC-----TT--T-ttgctgcag
gi|8 : aatcaTT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA----TAGA--TG-AAT-GGAATTCAAG-TAC-CCATAG--AA--TAA----A-----ACAA-TA-A-----C----TTC-T-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACATT--AAACC--AAAATCACA-ACAT-C-TTCT-ATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA---ATACAAG-A-TCAAGGCATAAT-------------------AA---A-GACT---ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-AT-----------------CT-TG-----T-G-GT-AA-AA--CA-G--ATGACG----CT--TATCATTAC-TT-TTTCTCCT-G-CACGAA-GT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA-----A-T--GGA-G-GTGA--CT-A-TTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------TG-T---TTCCT--A-T----GTA--CA-ATTGT-TTA-AAAA-A-GAT-A-T-GTCGT----T-T-TTA---AG-TTT-A------TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTT----TA-CA----G-----A---AT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T--ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : ---A--AT-T------T-AC--GTCACCAG-A-CA-ATCGC--AGAA--T---TA--------T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-GC-ATT--TAT-A---AATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G----ATAGA--TA-AAT-GGAATTCA-G-TTC-CCAT-GAAAA--TAA----G-----A----CA-A-----CAATTTTC-T-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C--CC--AGGAACACC-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAG----------------------------------AAG-ACT-AAGACATGA-TG--T-------------AAA---G-G-CT-T-ATTCAG-A--AG--TAAACAT-TATTT-ATGCTCCAC---TATG--TTT-T----------------A---CA-------------------------AT-TT-TT-----T-G-CAGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAAT-T--TAGG-T-A--TAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCA---T-G-A--GGA-G-ATAACTCC-A-TTTGTGAA-A-CT----G-CCCATCTAA-A----A------TA-----G--T---TTCC---G-TACTCGTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-T-TAT-C-TGGTCGGTTTTT-T-TTT---AG-TTT-ACTTTGATT--T-T-GT--A--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
blockSeqs : . C T A T TTA C A . T TG TATTCAACT GT . CA AA TGAGAGAGA C CCAACAA . ATG TA C C ACAT . C CGT TAC A TG T CAC G C TCT CACG A T T CT TTGTTTAGAAGAT TTTTACT TGCCCTAGTCTCC A G ACTTAG C CATTTCAT CAGCT A C AC A TATTACGCTGAA . T . A TA C CA T . AA C AAAT G . . C . A . TG CTTTAAT . T . G ATAT TTC . . . ATTT . AG CATTTC G CTGCT CG ATTT T C . GTTATACATGCA T CTAGTACC GTACT T ATCG TATA C TG ATA . GAGA A TT C AA T C A A GC T A CATATG TAAAAA C C TCTCACAGC GTAT TTCAC GCTC TA G TT TCCG . A T TTTTTT CA A A AAT GAT TGC A GTATAA C ACT C T CGG AAT A A GAAACAC TTT GG C TTTA C A CATTA T C G CA . ATT CAGTCTA T A T CT CT C . G A AA A TTT TTCCCCTGCCCCTCCCTC T C A T ATTGATCGACTT T A . A GGAAATAAGACACATCAAC T G AA A A T CTTA CA C C G A G G AGGCTACTTCTGGAATGTGAATAACTAGACAAATG T T CTCGTACTAAATAAAA . A . CG AT A . A ATGTGTCTCTTGTGGGTAAAAATTAGTGTCGGATGCTTC CA A C C T C T T A G C A C T TTAG T . . A . T A AT C A T TTT GAGC A . C CA T G T T CTGA A C C TGATAATTTGTTTTCCTTAT AC C A T G T . GTTTT G C TTTA A A TTTGA . C T TC TC CTGCACA T TCA TCTG A G T A A ATC T CT A G T G A A C ACCTACAT CTAA GTAA T ATCT TCCG CTTA G ATT TAGCATTCTATGTA TTA TC AT TAATATATT T T GCATGTTCAAT C . G A T . C GGAT CATT T ACGGTAGATTAAAAAGATT C A A A AA
blockSeqs : . T C T T CTT A G . G . CTT A . AA . TGAAAA . CTACA . T T C . ACTA . C TAA GT T T . A . G . . A . . C . CAATAT TCGTGTCAA . . ACTAT T TTG . A C AA A ATTAGCCGA . T . A GT . CG . . AC T . . . . T . A . G . . . . . . . . . . G . . GCAG A CTGA . AT A T . ACATTTTAGA . T AA A AA TT . T G . CTCT . G . . . . A . . C . AAAA . . A TT . . . TA . . TT . . . . . . . AG . ATC A . . TAT . . . . T . . . . . . . . ATGTA . . . . . . CAGCAT . . T . C . . . . . . . . G . . . ATAAGGAACC . . . . GGAAATAAAAACAATCAAC . . TT A A . AAA . . . C . . . AGCGCTACTGGAATGTGAATACATACAGGA C T TGTACTAAAAAAGT . . . T . A . . ATTGTTCTTGCTGTGTGGTAAAACACGAGACGCGT TC . . G T . . . A . C . C T . . . . . . . . . C . T . CGA . . C T T A . . . . . . AATTTGTTTTCTCTACT G . . . . . . T . C G . . A . . . . . AG . . TAC G . . . . TT . . A . . T . . . . . . . . TCCG T . . G . A T T T . . T . . . . . . . A . AGATTTTAACAGATT . . . . .
blockSeqs : AT A . . A . . . . TG . A . TGCAG . T A . . TA . . CT GT G A . . . CC . . . C T . TG . . AA G . . . . C . T . G . . . . . . . . . . T . . CAC G CAGA . AC A T . TGCATTAG . . A T AA T . . . . CGT . . . . . . A . . . . AAAA . . . T . . . TT . . . . . . . . . . . . TC A . . TT . . . . T . . . . . . . . CGTCA . . . . . . CAACAT . . . . . . . . . . . . . . . . . ATCATTGACC . . . . GAAAATAAGGACAACAATT . . AA A A . TA . . . C . . . ACGCATACTGGAATGTATACATACAAGA . T TGTCTACTTACAG . . . . . . . . CCTATGTTCTCGTGGTAATACAGGTTGTA AC . . C . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . T . GG . . A T . G . . . . . . AATTGTTTTTCCTATT . . . . . . . T . . A . . . . . . . . A . . T G . . . . TT . . G . . . . . . . . . . . TCCG T . . . . G . T T . . . . . . . . . . G . AGATTAAAAAATC . . . . .
blockSeqs : . . . A T . TT . . AA C . . . . A . A . A . . . . . . . . . . G . . CAT G CAAA . AA A T . GTTAGCA . . T T AA A . . . . CT . . . . . . A . . . . AAAA . . . C . . . TA . . . . . . . . . . . . TA T . . T . . . . T . . . . . . . . TCCC . . . . . . CAGCAT . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGTG . . . . AGAATTAAGACAATCAAC . . TT A A . TA . . . C . . . GCGGCTTCTGATGTGCAGACATACATAT . C TGTACTAAAGAAA . . . . . . . . CTTGTGGTAAAACAGATGACGCT AA . . C . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . . T . GG . . C T . G . . . . . . AGTTATTTTTCCAAT . . . . . . . T . . T . . . . . . . . G . . T G . . . . . . . G . . . . . . . . . . . TTT A . . . . A . A T . . . . . . . . . . . . TTATATTCAGATT . . . . .
blockSeqs : . . G . TA . . AA C . . . . T . A . G . . . . . . . . . . G . . CA G TAAA . TC A C . ATTAAAC . . G T A T . . . . TT . . . . . . A . . . . AAAA . . . T . . . TA . . . . . . . . . . . . TC T . . C . . . . A . . . . . . . . CCAC . . . . . . CAGCCA . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGATA . . . . GAACTAACGACAATCAAC . . AA A A . TC . . . C . . . AGCGCTACTGGAATGTGATAATACAAGA . T TGTATTAGA . . . . . . . . TGTTAAAACAGGAGGACGCGCT AT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . T . GT . . C C . A . . . . . . ACATTGTTTTCCTAT . . . . . . . T . . C . . . . . . . . A . . T A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A . . . . T . T T . . . . . . . . . . . . ATAG . . . . .
blockSeqs : . . AG C . . . . G . T . T . . . . . . . . . . T . . TC G CAGA . TC A G . GTCCCAT . . A T A A . . . . TT . . . . . . A . . . . AAAA . . . T . . . GA . . . . . . . . . . . . TT A . . T . . . . C . . . . . . . . CCCT . . . . . . CAGCAT . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGTC . . . . AGACAAAGACAAATCGAA . . AT . A . TA . . . C . . . AACGCTACTGGAATG . T TAAAG . . . . . . . . ACTATGTTTTACA TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . GG . . A T . G . . . . . . ATAGTTTCCGTACTC . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . T . T T . . . . . . . . . . . . AG . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . A . A . G . . . . . . . . . . G . . A G TTAA . GT A T . GTTAGCA . . C A A A . . . . CT . . . . . . A . . . . AAAA . . . T . . . TA . . . . . . . . . . . . TC A . . C . . . . T . . . . . . . . CCA . . . . . . ATGCA . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGTG . . . . GAAAATAAGACAACAATT . . AC . A . TA . . . C . . . GAAGAC . . TAAA . . . . . . . . TTCTATGT AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . C C . A . . . . . . ATAGTTTCCGTACTC . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . T T . . . . . . . . . . . . AC . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . T . T . . . . . . . . . . G . . T . GC . AC A T . . . . A T A T . . . . CT . . . . . . A . . . . AAAA . . . T . . . TT . . . . . . . . . . . . TC T . . T . . . . A . . . . . . . . TTA . . . . . . CGCAT . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGCC . . . . AGAATTAGACAATCAC . . TT . . . TA . . . C . . . AAGAC . . TAAA . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . A T . G . . . . . . GCTTATTTTCCTAT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . T T . . . . . . . . . . . . AG . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . A . . C . T . C . . . . A T A T . . . . CT . . . . . . A . . . . AAAA . . . T . . . TA . . . . . . . . . . . . TC T . . T . . . . A . . . . . . . . CCA . . . . . . TTGCA . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGGTG . . . . AGAATAAAACAATAAC . . AA . . . C . . . . . . . AAGAC . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . C T . A . . . . . . ATTTATTTTCTATA . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . T T . . . . . . . . . . . . AG . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . G . A . A . . T . . . . CT . . . . . . A . . . . AAA . . . A . . . TA . . . . . . . . . . . . TC A . . T . . . . T . . . . . . . . CCA . . . . . . CAGCA . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGATG . . . . GGAATTAAGACAAT . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . C T . A . . . . . . ATTTATCTTCCTGT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . AG . . . . .
blockSeqs : A . T . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . T . . . TA . . . . . . . . . . . . TC G . . T . . . . A . . . . . . . . TCA . . . . . . CAGCA . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . C A . G . . . . . . AATTGTTTTCCGAT . . . . . . . . . . G . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . T . . . . . . . . . . . . AG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . CCA . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . C . G . . . . . . ATTGTTCCCCTAA . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . CCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATAGCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . T . G . . . . . . ATTGTTTTCCGAT . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . ATTGTTTCCTAT . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . TTTTCCTAT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . ACTT .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : *** ** CA***** CAGA** GTTAGCA********** ** A*** ** AAAA**** TC** T*** CCA**** ** CAGCAT** ** ATAGGTG******* GGAANTAAGACAATCAAC********************** AGCGCTACTGGAATGTGAATACATACAAAN********** TGTACTAAAGAAA*********** ** GG**** ATTGTTTTCCTAT************************** ** A******* *** T*
originalCons : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC--TT--T----TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--AT-CA---CAAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACA-G-----CATT--AGCAGCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA--ACTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GAC-AA---A-TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TAT-T-CTNCC------AA-G-T-TAT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GC--CCCACCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAAGC-A-T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GA---ATAGG--CGCAAT-GGAATTCA-G-TAC-CCAT-G--AA--TAA----G-----A----TC-A-----C----TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-A-TA--CATACAAG-A-T-AAGGCATAATTG--T--GT--ACTAAA-AAA---G-GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-G--GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-A----A------T------T--T---TTCC---A-T----GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
finalCons : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-ACT-AGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCGC--TT--T----TTTTCACACGATCTCA-----G--GGTCGGC-A-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-T-GCTTATA---AAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTATA-CANTACT-TTTATAAG-GCC-GTC-------GC-T-AG-A-ATAT----GC---ATC-TGAGG-TATGGG-GTGGG---TGTT-CAA--ATCA-----AAGATTCAGA--A--AAA--CTAGAAAAATT-ACAGTTAGCA----------GCCGC--GAGGAT--------AGTCAC-A----GGTCTTA---CTTCC-T---TGGC-A--TCGC---GAGACT-CT--C-T--CTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAA-CCGCTT--A-TTGT-TAGAA-G--AA-G-GACAAAA----TT------A-AAAA-CAA-T--------TATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-GT-A------CC--AGAT-TATC-TTCA---AAA---TATTC--TNCC------AA-GT---AT-A-CG---GTCAC---ANG-A-------ATCA---A--AT-T----A-T-GCCA----CCAG-A-CA-ATCGC--AAAA--T---TACAGCAT--T-C-CC-A--AATG--TAG-ATT-AA-AC-ATT--TAT-A---AGTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-GATAGGTG-------AAT-GGAATTCA-G-TAC-CCATGGAANTAAGACAATCAAC----------------------TTC-T-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TA-CC--AAAATCACA-ACCT-CCTTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCGCTACTGGAATGTGAATACATACAAAN----------T-AAGGCATAATTGTGTACTAAAGAAA-----------GACT-T-ATTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTG-ATAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G--G-GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCTC-T-G-CACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-C-A--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---TGG----GGA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-GAA-AATTGTTTTCCTAT--------------------------GTA--CA-ATTGT-TTATAAAA-A-GAT-C-TGGTCG-----T-T-TTN---AG-TTT-AT-----TT--T-T-GT--A--TA-------TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----TA----G-TT--------A--G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1 1 22 4444444444 11 1 11 4444444444 1 11111111 11 111 1 4444444 1 11111 111 11 111 1 111 33333 1 1 111 4444444444444 44444444 444444444444444 2222222 55555555555 55555555555555555 1 4444444444444 111111 111 1 11111111111 1111 1111 11111 111111 11 11111111 1111 111111111111111111 1 55555555555555555555555555555555555555 5555555555555555555555555 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 1 11 1 1111 1111 22222 1111 111 1 2222 11111111111111 222222222 11111111111 4444444444444444
lowQualScore : 3 3 1 1 7 0000 1 6 0 2 22 2222222222 66 0 22 33 0000000000 0 99999999 33 111 66 2 0 2222222 0 2 77777 777 1 44 7 0 777 3 3 999 55555 3 3 666 1111111111111 00000000 7 111111111111111 7 6 7777777 1 33333333333 66666666666666666 0 2 55 3 2222222222222 666666 3 444 3 22 5 2 66 333 1 9999 4 4 4 2 4 1 444 1 55555555555 4 2222 777 4 4 3 2222 3 2 666 3 66666 999999 55 777 55 77 55 333333 4 00 88888888 0000 1 3 666 555 6 44 3 555 3 0 3 9999 3 66 2 33 2 2 4 2 66 2 2 2 33 777777 2 5555 222 3 2 5555 66666 5555 1 2 33 8888 2 2 2 777777 33 2 2 555 33 555 2 44 4 2 66 66 2 555 4 3 555 33 2 6666 2 2 8888 33 2 2 2 2 33 33 555 444 66 66 66 2 2 2 2 33 444 2 999999999999999999 5 2 2 2 2 1 2 777 5555 66 2 2 1 5 6 3 3 7777 3 44 3 22 5 4 3 999 55 0 3 3 4 4 4 11111111111111111111111111111111111111 1 7 4444444444444444444444444 44 4 4 99 55 7 33 3 0 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 88 3 3 3 0 7 3 3 3 3 6 666 5 2 1 77 6666 2 2 2 2 33 0 2 66 5 2 2 1 444 222 33 2 2 3 22 5 1 33 2 4444 2 2 4 2 33 9999 4 2 2 2222 55 2 2 5 2 2 22222 2 5 1 2 2 99999 33 2 2 33 33 99999999 2 555 0000 1 2 2 2 2 222 2 33 4 2 2 5 2 2 2 99999999 6666 5555 2 5555 1111 444 2 777 88888888888888 444 33 66 333333333 2 2 33333333333 5 2 2 2 2 2 2 5555 2 8888 2 33 99999999 2 9999999999999999 2 2 2 2 33
lowQualScore : . . . . . .... . . . . .. .......... .. . .. .. .......... . ........ .. ... .. . . ....... . . ..... ... . .. . . ... . . ... ..... . . ... ............. ........ . ............... . . ....... . ........... ................. . . .. . ............. ...... . ... . .. . . .. ... . .... . . . . . . ... . ........... . .... ... . . . .... . . ... . ..... ...... .. ... .. .. .. ...... . .. ........ .... . . ... ... . .. . ... . . . .... . .. . .. . . . . .. . . . .. ...... . .... ... . . .... ..... .... . . .. .... . . . ...... .. . . ... .. ... . .. . . .. .. . ... . . ... .. . .... . . .... .. . . . . .. .. ... ... .. .. .. . . . . .. ... . .................. . . . . . . . ... .... .. . . . . . . . .... . .. . .. . . . ... .. . . . . . . ...................................... . . ......................... .. . . .. .. . .. . . ........................................................ .. . . . . . . . . . . ... . . . .. .... . . . . .. . . .. . . . . ... ... .. . . . .. . . .. . .... . . . . .. .... . . . .... .. . . . . . ..... . . . . . ..... .. . . .. .. ........ . ... .... . . . . . ... . .. . . . . . . . ........ .... .... . .... .... ... . ... .............. ... .. .. ......... . . ........... . . . . . . . .... . .... . .. ........ . ................ . . . . ..
lowQualScore : 3 7 0 0 3 5555 0 5 0 8 00 0000000000 55 0 22 88 8888888888 0 22222222 88 000 55 5 0 8888888 0 5 22222 222 2 00 3 7 777 3 7 000 77777 3 3 000 3333333333333 33333333 3 000000000000000 3 7 3333333 0 77777777777 33333333333333333 0 5 88 2 8888888888888 222222 2 333 3 88 7 7 11 333 9 4444 4 4 0 4 0 4 444 6 66666666666 0 5555 000 0 0 6 9999 6 3 444 6 88888 555555 00 666 66 33 55 555555 0 66 55555555 4444 6 6 444 888 2 22 1 444 1 8 1 8888 1 88 9 99 7 7 0 7 33 7 7 5 44 222222 5 3333 777 8 5 3333 22222 3333 7 5 44 8888 7 7 7 777777 77 9 9 000 99 000 9 77 8 7 33 33 7 000 0 1 000 99 9 1111 9 9 9999 99 9 9 9 9 99 99 000 666 88 33 33 7 7 9 7 77 444 5 777777777777777777 3 7 7 7 7 4 7 333 7777 33 7 7 2 4 7 3 3 5555 3 66 3 00 5 4 3 333 00 2 3 3 0 0 0 77777777777777777777777777777777777777 4 2 7777777777777777777777777 77 0 0 55 00 3 88 6 5 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888 77 6 6 6 9 3 6 6 6 3 7 333 7 9 4 11 1111 9 9 9 9 99 4 9 88 3 7 2 8 777 999 77 7 7 3 99 0 5 22 2 7777 2 2 4 2 11 7777 7 4 4 1111 66 5 5 0 5 7 00000 7 3 0 7 7 33333 77 7 9 99 99 55555555 9 000 4444 1 9 9 9 9 999 9 99 3 9 9 3 7 7 7 77777777 1111 7777 7 7777 7777 777 7 333 33333333333333 777 77 33 000000000 7 7 66666666666 3 7 7 7 7 7 7 7777 7 3333 7 77 77777777 7 7777777777777777 7 7 7 7 77
consensus : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-AC-TAGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCG----C--TT--TTTTTCACACGATCT-----CAG--GGTCGG-CA-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-TGCTTAT---AAAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAT-ACANTACT-TTTATAAG-G-CCGTC-------G-C-TAG-A----ATATG---CATC-TGA-GGTATGGG-GTGGG---TG-TTCAAA---T-CA---AAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACAG--TTA-----GCA-GCCGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTT-A---CTTCCT---TGG-CA--T-CGC---G-AGACT-CT--C-TCTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-GT-TAGAA-G--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----A-C-AATT-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-G-TA------CC--AGAT-TATC-TTCA---A--AA---TAT-T-CTNCCAA-G--TAT--A-CG---GTCACANGAA-TCA---A--AT-T----A-C-G----CCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC--ATTCCCA--AATG--TAG-ATT-AA-ACA-TT--TATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G-ATAGGT-G---AA----TGGAATTC--AG-TAC-CCATGGAAATAA-GA-CA-A-TCAA-CTT--CT-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TACC--AAAATCACA-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-ATA--CATACAG-AT-TAAGGCATAATTG--T--GT--ACT-AAA--AA---A-GACT-TA-TTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTGA-TAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G-G--GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCT-C-T-G-C-ACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-CA--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-GG--GA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-G-AA-A--A----TTG-TTTTC-C-TA--T-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-A-GA-TC-TGGTCG-----T-T-TTNAG-TTT-AT-----TT--T-T-G--TA--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----T-A----G-T--T--------A-G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
Reference ( family-150 ) : NATTATTCCTGATTTATGTCAA-TGACGNAGCNGAAAACATGTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGNCGACGATAA-TTCGTTACTGAGC-------CT-ATTG-TCT-ACGAA--TGTTG---GAAA-TATTC-AAC-CA-CANATTG--AA-T-AATGATTTAACATA-GACTTG---AC--GTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTGAATGTTTAATCCTTTCGC-A-AACTAA-AGCCGTC-ATTTTTTGAGTACA----AAGAAAA-ATGCA-AT-CTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTGC-TT-AC-TAGATTT-GTGCNCTA------CACACGAAACACT-T--TTGNCG----C--TT--TTTTTCACACGATCT-----CAG--GGTCGG-CA-TACATTGACTCAAT-ATTAGCGCCGA-TGCTTAT---AAAAAAC-G-GGA-TTGCCGAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAT-ACANTACT-TTTATAAG-G-CCGTC-------G-C-TAG-A----ATATG---CATC-TGA-GGTATGGG-GTGGG---TG-TTCAAA---T-CA---AAGATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACAG--TTA-----GCA-GCCGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTT-A---CTTCCT---TGG-CA--T-CGC---G-AGACT-CT--C-TCTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-GT-TAGAA-G--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----A-C-AATT-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-G-TA------CC--AGAT-TATC-TTCA---A--AA---TAT-T-CTNCCAA-G--TAT--A-CG---GTCACANGAA-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC--ATTCCCA--AATG--TAG-ATT-AA-ACA-TT--TATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G-ATAGGT-G---AA----TGGAATTC--AG-TAC-CCATGGAANTAA-GA-CA-A-TCAA-CTT--CT-CTGAANNCTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TACC--AAAATCACA-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTGAATA--CATACAA-AN-TAAGGCATAATTG--T--GT--ACT-AAA-GAA---A-GACT-TA-TTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTGA-TAGTCC-C---TGT---TCT-TG-----T-G-GT-AA-A---CA-G-G--GACG---GCT--TATCNNTAC-TT-TTTCT-C-T-G-C-ACTAA-GT-AC-TCCG-CT-C-C-AGAAATTGATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-CA--TAGTG-GACAC-TCGTGTGTTTACTA---T-G-GG--GA-G-ATGACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-G-AA-A--A----TTG-TTTTC-C-TA--T-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-A-GA-TC-TGGTCG-----T-T-TTNAG-TTT-AT-----TT--T-T-G--TA--T------A-TA-G---AAT---AGCA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GT-A-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-TTTC---AT--------------A---A-NTA--TG--------TTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----T-A----G-T--T--------A-G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGC
gi|1 : ATTATTCCTGATTGATGTCAAATGGAGGAGCCGAAAACA-GTCAAGCTTATGTAGGTTATTACGCCGACGATAAATTC--TACTAAGC-------CT-ATTG-TCTTACAAA--TGT-----GAAACTATTC-AACACA-C-TATTGTAAA-T-AATGATTTAACATA-GACTTGGACAT--GTGCGTCCAC-T--CAATG---TATTGAA-GTTTAATCCTTCAAC-A-AACTAA-AGCTGTC-ATTTTTTGAGTAC-----AAGAAAA-ATGCA-ATGTTACCTT--TTAGAA---TTTCAGAAACTG--TT-ACTTAGA-TT-GTGTACTA------CACACGAAAC----T--TTGGCGCTTTC--TT--TTTTTCACACGATCTCAAGACAG--GGTCGGCCACTACATTGACTCAAT-A-TAGCACCAATTGTTTATAGAAAAAAAT-G-GGAGTTGCTAAAA-AAATTACAGGTTAAGCCGTCAA-TGCAAA----A--TTAT-CAGCTTTTATAACACTACTCTTTATAAGCG-CCGTC-------G-CATAGCA----ATAGA---CATCGTGAGGGTATGGGAGTGGG---TGTTTCAAA---T-CAC--AAGATCAAGCA-A--AAA--CTGAAAAAATTGACAGCATTA-----GCA-GCCGCCTGAGGAT--------AGTCACA----GGTCTTAA---CTTCCT---TGG-CA--T-CGC---G-AGACTCCT--C-ACTATTTCG-AAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-TT-T-GAA-GC-AA-G-GAC-A-AA--TT------A-AAA----A-C-AATT-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT---ATA----TAG-G-TA-------C--AGAT-TATC-TTCA---A--AA---TAT-T--TCTCGA-GT-TAT--A--G---GTCACAAGAA-TAA---A--AT-T----A-T-GCCGCCCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAGAATT---TACAAGC--A-TCCCAC-AGTG--TAG-ATTAAA-ACA--T--TATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-GAATAGCC-GC--AA----TGGAATTC--AGATAC-CTAT-----TA------G-A-TC-A-CTT--CT-CTGAACACTTTCAAAAAACAA-TTTACATT--TACC--AAAATCACA-ACTTCC-TTCTT-TT-TTTCGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-ATA--CATATAA-GA-TAAGGCTTAATTGCTT--GT--A-T-AAA-AAACATG-CACTCTA-TTCAGCA--TG--T--ACATCTATTGA-TAGTCCTC---TGT---TCT-TG-----T-GAGT-AA-A---CA-G-G--GACG---GCT--TATTCATAC-TT-TTTCT-C-T-GCC-CCTAG-CT-AC-TCTG-CT-C-C-AGAAATTGATTT-TTT----AAT-GCTATTTTTAGCGATGAATTAAT-TGGTATA-CA--TGCTG-GACAC-TCCTTGGTTCACTA---T-GCGG--GA-GAATGACTCT-A-TTA-TATT-A-CT----G-ACAAT-G-AA-C--A----C------------------TA--CA-ATTGTTTATAAAA-AGGA-TCTTGGTCG-----C-T-TTAAG-TTT-AT-----TTACT-T-G--TA--T------ACTA-G---AAT---AGCA-TA-C-TG-ATAA---C-T--GT-C-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----CTTATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTCA--AT--------------A---G-CTA--TG--------CTTAA-AAA-----------TG-ACCTCT-T-GA-TAATCAT-TG----T-A----G-T--T--------A-G----------------A-TTTG-CTA-T-CATC--TATTGC
gi|10 : tTTAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTAA-ACACCACT-TTTATAAG-G-CGGCC-------G-C-TAG-A----ATATG---CATC-TGA-GGTATGGG-GTGGG---TG-TTCAAA---T-CA---CAGGT
gi|10 : --------AATCACA----GGTCTT-A---CTTCCT---TGG-CA--T-CAC---G-AGACT-CT--C-TCTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAACC-GCTT--ATT-AT-TAGAA-G--AA-G-TACAA-AA--TT------A-AAA----A-C-AATT-ATG----TATAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-G-TA------CC--AGAT-TATC-TTCA---A--AA---TAT-T-CTACCAA-G--TAC--A-CG---GTCACAAGAA-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC--ATTCCCA--AATG--TAT-A-T-AA-ACA-TT--TATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G-ATAGGT-G---AA----TGGAATTC--AG-TAC-CCATAGAATTAA-GA-CA-A-TCAA-CTT--CT-TTGAAAACTTTC-AAAGACAA-TTTACATT--TACC--AAAATCACA-ACCTCG-ATCTTcttacttccttggcatcacgagactctctctatttcgaaactgggtgggaaccgcttattattagaagaagtacaaaattaaaaacaattatgtataaaatttatcataatatggtaccagattatcttcaaaatattctaccaagtacacggtcacaagaatcaaattatgccaccagacaatcgcaaaattacagcattcccaaatgtatataaacatttataagtcatcctttgtcccattagcgataggtgaatggaattcagtacccatagaattaagacaatcaacttctttgaaaactttcaaagacaatttacatttaccaaaatcacaacctcgatctt
gi|11 : ttaaggtcaattgcaaaactttatcacttttaaacaccacttttataaggcggccgctagaatatgcatctgaggtatggggtgggtgttcaA-TGCT------GAAAAACTA-AGA-GTATCAAAG-AAATCACAGTTCTAG--ATCACGTGTAAA-----CTTTA---G-CT------------CT-TCTACAAG-G-T-GTC-------C-T-TTG-AG---ATATC---CCTC-AGA-TATATGGG-GTGGT---TG-ATCAAA---T--A---AAAATTCTG-A-A--AAC--TTT----AATC-TCTG--CTT-----GCA-TTAG---GAAGATT-------AATCATT----GGACTA-A---CTTCAA---TGA-CG--T-CAC---G-GAAAT-CT--T-TC-ATTTCAAAAC-TGGA--TGGAAATC-ACTT--ATT-GT-TAGAA-G--AA-T-GGTAA-AA--TTTAAAAAA-AAA----A-T-AACT-ATG----TACAA-----ACT----TTAT-CAC--AACA----T-G-T-TA------CC--CGAA-TATC--TCAAATA--AA---TAT-T-AT--CAA-A--CAT--T-TG---TTTACATGAA-T-A---A--AT-T----G-C-A----TTAT--T-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T---TAA-TGC--ATCCCTA--AAT---CAG-ATT-CA-ATA-TCAATATA---A-
gi|12 : AGAAAC-T-GGG-TTGCCGAAA-AAGTTAAACTTT--G--TTC--TTGGAAGAAATACTCAAT-CA-AATATGT-ATCTTACT-TTTATTAG-A-TCACT-------T-T-TAG-A----ATATG---CCTC-TGG-GGTATGGA-ATGCATTTTT-TTTAAA---T-T------GATCT----------A--TTAGAAAAATT-CCAG--TTATACATGCA-GCC-----AAAAT--------AGTAATG----GG----------TTCCTATATAG-TATGT-CTCATAA-AGAAT-CA--T-TATATTT-AAAAT-TGGGTTTGGGAAC---CCT--ATC------AAA-T--AA-GAGACAATAA--AA------A-AAATCTCA-C-AGCT-GTT----TACAATTCACAATGCTCTTTT-CAA--AATATCCGT-G-G-TATTTTTTCT--AGATACACCACCCG---A--AA---TAT------CCAA-GACTAT--A-CG---AT
gi|13 : aatgt-TTTTCATTCTTACCCAAAAATCACACGTTTCC-TTTGTATT-TTTCG--AT-GGAGAG-G-C-TACTTCTGGAATGTGAATAACTAGACAA-ATGTAAGGCTTAATTG--T--GTCTACTTACA-G-------GACT-TA-TTCAA-G--AG--A-CACAT-TATTGA-TAGTCC-A---TGTGTCTCT-TG-----TGG-GT-AA-AAATTA-G-T--GTCGGATGCTTCTATCCATA---T-TTTCC-C-T-G-C-ACT-A-GT-A--TCTG-CTCC-C-AGAA--TGATGTATTTTTAGAA--ACTA-TTTTAA-GATGGA-T-AT-T--TATATCA--AAGT--GACAC-TCGTGTG-TTACTA---T-G-GG--G--G-ATGA---T-A-TTA--ATT-ATCT----GAACAAT-G-AA-ATGATAATTTG-TTTTC-CTTA--T-GTA--attccaaaatgtagact
gi|14 : TATGGG-GTGGG---TG-TTCAAA---T-CA---A-GATTCTG-CTG--AAA--CTAGAAAAA-----------------------CGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTT-A---CTTCCT---TGACCA--T-CAA---G-AGA-------C-TCTACTTCG-AAC-AGGG--TGGGAACA-CCTT--ATT-GT-TAGAA-G--AA-G-G-------------------------------------G----T----------AT----TTCT-AAT-----A----T-G-GTTA------TC--AGAC-TATC-TCCA---A--AA---TAT-T-CTACCAA-G--TAT--ATCA---G-CACATATA-TAG---AGGAT-T----ACT-GT---CCCC--C-AGTTC-A-A-CGCCAAAGA--T---TAC--GC--ATTCCCA--AATGC-TAGCAGT-AA------C--TA-A---A-ATCATCC-TTGT------------------CTCCA-TAC-GC-G-ATTGATCG---AC----TTGATGAC--AG--AC-CAATGGAAATAA-GA-CACA-TCAA-CTT--CT-CTAAATTGTTTC-AAAAACAATTTTACATT--ttcatagtatctgtttttttactt
gi|15 : ---GCA--TATCTCTAG-TT-TTTCT-CCT-G-C--CTA------C-TCT-------C-AGTAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTCTTAG-GATCGA-TAAT-T--TACA-TA--GAGTG-GACAT-TCGTACG-TTACAA---C-G-GG--GA-G-ATAACTCT-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAG-G-AA-A--GC---TTA-TTTTC-C-TA--T-GTA--CA-AATCTTTATAAAA-A-TG-TC-TGGTCC-----T-T-TTGAG-TTT-AT-----TT--T-A-A--TA--T--------CC-G---AATAC-AACA-TA-T-CA-A-AT---CTT--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------G----TATATA----CA-CG----GTTT-AACTTAT-TTTC---AT--------------T---A-ATAT-TG--------TAT-ATAAAGCATGTTCAATTG-ACCA-T-T-GA-C-AACAT-TG----C-G----T-T--T--------A-GATTAAAAAATC-----A-TTTT-ATG-T-CATC--AATTG
gi|16 : aaaagagataatT-AC-TCTG-CT-C-CCAGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-GTTGGA-TAAT-T--TATA-CA--TAGTG-G-CACATCGTGTG-TTACTA---T-G-TG--GA-G-ATGACTCT-ATTTAATATT-A-CT----G-ACAAT-GAAA-A--A----TTGTTTTTC-C-TAT-T-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-AGGA-TC-TGGTCGT----T-T-TTAAG-TTT-AT-----TT--T-T-G--TA--T------A-TA-G---AAT---AGTA-TATT-CG-ATAA---C-T--GTAA-AA-TT-C-AAGAA-A--------G----TATA-T----TA-CA----G----AA---TT-TCTG---TT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----T-A----G-T--T--------A-G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATTGta
gi|17 : C-TT-TTTCT-C-TTG-T-GTGAA-AT-AT-TCCGGTT-C-C-AGAAAT-GATTTGTTC----AAT-GCCATATTTAG-AATAGA-AAAT-T--TACA-CA--TAGTT-GATAC-CCGTGT-TTTACTT---T-G-GG--GA-G-ACAAATCC-A-TTAGTATT-A-AA----G-AAAAC-G-AA-A--A----TTT-ATTTT-C-TA--TAGTA--AA-ATTTTTTCTAAAG-A-GA-TC-TGGTAG-----T-T-TTTAG-TTCAAT-----TC--T-T-taa
gi|18 : cattgcagatgcataccacttc-C-C-AGAAAT-GATTTATTT----AAT-GCTATTTT-AG-AATGGA-TAAT-T--T----------------------GTCTGTT-ACTA---T-A-GC--AA-G-ATGACTC--A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-G-AA-A--AT---TTA-TCTTC-C-TG--T-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-C-GA-TA-GGGTAGT----T-T-TTCGG-TTT-AT-----TT--T-T-G--TATCT------G-TA-C---CAT---TGCA-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AATTT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TT-TAATCTG----AA---TC-TTTCATTAT--------------A---ATCTA--TGTAATATATTTT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-T---------------------------------------------A-TTTT-GTG-A-CATCAATATTttgatttttatgttttatagattatccaatatatgcattgtatttgtactcatgcaatatttatttatgcaaaat
gi|19 : GG--TGGGAACC-ACTT--CCT-GT-TAAAA-G--AA-T-GGCAA-A---TT------A-AGA----A-C-GATT-ATG----TATAG-----A-T----TTAT-CAC--AATA----T-G-G-TA------CC--CGAG-TATC-AAAA---AGAAA---TAT-T---ACCAA-A--CAT--T-CG---TTCACATGAA-TCA---A--AT-T----A-C-G----TTAT--T-AT-AC-A-ATCGC--AAAA--T---TAT-TGC--ATCCCTA--AAAG--CAG-ATT-AA-ATA-TC--TGTG---T-ATCACCTTTTGT------------------A-ACA-AGG-GC-G-GTACAT-G---AT----TGGAACTCTTTG-T-C-CCTCAGAGATAA-GA-CA-A-TGTA-CGT--CA-CTAAGCTCGTTAAAAAattgtaa
gi|2 : atgt-CA-TACATTGACCCAATTATTA-CGCTGAATGCT-AT---AAGAA-C-T-AGA-TTGCTGAAA-AAATTACAGTT-AAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTATGCA-CTTGTAT-ACACTACT-TTTAGAAG-G-CCGTC-------G-C-TAG-A----AT--G---CA-C-TGA-GCTATGGG-GTGG----T--TTCAAAGATT-CA---A-GATTCAG-A-A--AAA--ATAGAAAAATT-ACAG--TTA-----GCA-GCCGCT-GGAGAT--------AGTCACAA---GGTCTT-A---CTTCCT---TTGTCA--TTCGC---GGAGACT-CT--CGTCTATTTCGAAAC---GG--TGGGAACCCGCTT--ATTTGTCTAGAA-AGCAACG-GACAA-AA--AT------A-AAA----A-CCAATTTATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-T-G-TA------CCCAGGAT-TATC-TTCA---A--AAGATTAT-TGCTTCCAACG--TATTTA-CG---GTCACAAGAAATCA---A-----T----A-TAG----CCAC--CCAG-ACCA-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGC--AT-CCCA--AATGCTTAG-ACT-AA-ACAATT--TATA---AAGTCAGCCTTTGT------------------C-CCA-GTA-GC-G-ATAAG--G---AACCAATGGAATTC--A--TAA-CCA-AGAACTAACGA-CA-A-TCAA-CTT--CT-CTGAAAACTTTCAAAAA-CAA-TTTACAT----ACC--AAAATCACA-ACCTCCCTTCTTATTATTTCGCGAT-G-AGA-CG-CATACT---GGAATGT--ATA--CATACAA-GA-TAAG-CA-AATTG--T--GT--ACT-AAA-AAA---GTGATT-TAATTCA--A--TG--T-AACAT--ATTGAATAGT--------GT---TA----------------AA-A---CA-G-GAGGACGC--GCT--TATCA-TAC-TT-TTTTC-C-T-G-CCAC-AA-GT-AC-TC-G-CT-C-CCAGAAGATCATTTATTT----AAT-GCTAATTTTAG-GATGGA--AAT-T---ATA-CAA-GAGTGCGACAC-TCG-GTGTT-AATA---T-G-AGCGGA-G-ATGACTCT-A-TTAATAT---------------------A-A--A----T-G-TTTTC-C-TA--T-GTGACCA-ATTGTTTATAAAA-A-GA-TC-TGGTCT-----T-T-TTAAG-TTT-AT-----TT--T-T----TA--T------A-TA-G---AAT---AG-A-TA-T-CG-ATAA---C----GTAA-AA-TTGCAAAG-A-A--------G-----ATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---T-ATA--T---------TTT-A-AAA-----------TG-ACC--T-T-GA-T-ATCATCTG----T-A----G----T--------A-C----------------A-TTTT-GTGAT-CATC--TATTGttgct
gi|20 : aT---CCT-TA-----T-G-GTGAA-A---CA-G-A--GGAA---ACT--TATCACTAC-GT-TTTCT-CGT-G-C-ACTGA-GT-AC-TCTA-CA-CAC-AGACATT-ATTTATTT----AAT-GCTATTTTTAG-AATAGA-TAAT-T--TACA-TA--TGATG-GACAC-TCTTG---TTACTA---T-A-GG--GA-G-ATGAACCC-A-TTGGTATC-A-CT----G-ACAAT-G-AA-A--AG---TTATTTTTC-C-AA--T-GTA--CA-AATGATAATAAAA-A-GA-TC-TGGTCG-----TGT-TTTAG-TTT-AT-----TT--T-T-G--TA--T------A-AC-A---AATCTGAACA-TC-T-CA-ACAAATCT-T--TT-A-AT-TT-C-AGG-A-A--------taa
gi|21 : TCAA-A-ACGAAT--CT-GAAAAATT-ACAA--TTA-----AAC-GCAGC--AAGAAT--------AGTTACGTACTGGATTA-A---CTTTAA---TAG-CA--T-CAA---G-GGAAT-CA--C-TTTATTTGGAAAC-GGGC--TGGGAACC-A-TTAAATC-AT-----A-G--GC-G-G-----------------A-AAA----A-C-GA-T-GTA----TATAA-----AGT----TGA--CA---AATATT--T-G-A-TA------CC--AAAC-TACC-TTAG---T--GA---CAT-T-TTTCC---G--TAT--A-
gi|22 : ata--AATG--TTG-ATT-AA-ACA-TT--TATA---A-ATCACCCTTT-T------------------C-CAA-TTG-GC-G-ATAGAT-A---AA----TGAAATTC--AC-TAC-CTATGGAAATAA-AAACA-A-TCAA-CTT--TT-CTAATTTCCTTCAAAAA-CAA-TTCAATTT--TCCC--AAAA-CACA-ACC-----CCTTATT-TTTCGC-AT-GGAAAACG-C-TACT---GGAATG-------------------TAGGACACAATTA--T--GT--ATT-AGA--------------TA-------A--CG--T-AACAT-TATTGA-TAATCC-TCTGTGT---TCT-TG-----C-G-GT-AA-A---CA-GAG--GACaaacttctagttacaatacgagaaacacattaaattatgatgtaccaacatgcaaact
gi|23 : tTTTAT-ACAATACT-TTCATATG-A-CC-TC-------ATT-TGG-AATATATATG---CATC-CAA-AGCAT-GG-GTGG--------TC-AT---T-TG---AAG-TCTAG-A-A--AAA--CTA-CAACATT-------TTA-----G-A-GCTGC--ACGAATCTAGTACCGGTAACC----GGTCGT-ATCGCTTTAA---TAG-CA--T-CAC---G-TGATT-CTGAG-ACTATACGGAAAC-TG-----GGAAACC-GCTT--ATT-GA-TAGAC-A--AA-G-GACCA-TATGTT------ACCAG----A-C-AG-----G----CACAA-----AAT----T-----AT--AGTG----T-C-G-TT------CC--AGatcac
gi|24 : T-A-TTAATAT--A-CT----G-ACAAT-G-AA-A--ACA--TTG-TTTTC-C-TA--T-GTAG-CACATTGTTTATAAAATA-GATTC-TGGTCG-----T-TCTTAAG-TTT-AT-----TT--TCT-GCTCA--C------A-CATG---AA----AGCAGTA-T-CG-ATAA---C-T--GT-AGAA-AT-A-AAG-ACA--------G----T-TATT----TA-CA----G----AA---ATGTTCC---AT--------------A---A-TTGATTG--------ATT-A-AAA-----------TG-ACTT-TGTAGA-T-AGTAT-AG----TAA----G-CTAT--------A-G----------------ACTTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|25 : gTT-GT-TAGAA-G--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----A-G-GATT-GTG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-G-TA------CC--AGAT-TATC-TTCA---A--AA---TAT-T-CTATTAA-G--TAT--A-TG---GTCTCATGAT-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T---TAC-AAC--ATTCCCA--AATG--TAG-ATT-AA-ACA-TT--TATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G-ATAGGT-C---AA----TGGAATTC--AA-TAC-CCATGGAAt
gi|26 : ACA----AGTCTT-A---CGTCCT---TGG-CA--T-CGC---G-AGACT-CTCTC-TCTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAATC-GCTT--ATT-GT-TAGAA-G--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----A-T-AATT-ATG----TACAA-----AAT----T--T-CAT--AATA----T-G-G-TA------CC--AGAT-TATC-TTC----A--AA---TATAT-CTACCAA-G--TAT--A-C----GTCACAAGAA-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCAC--C-AG-AC-A-A-CGC--AAAA--T---TAC-AGC--ATTCCCA--AATG--TAG-ATT-
gi|27 : a--T-AACGT-TAATGA-CAGTCC-CCTATGT---TCT-CG-----T-G-GT-AATA---CA-G-G----TT---GTA--TATCAATAT-TTCTTTCT-C-TTG-C-ACTAA-CC-AC-GCTG-CT-C-CCAGAAAT-AATTTGTTT----AAT-GATATTTTTAG-GATGGA-CAAT-T--TATA-CA--TAATG-GACAC-TTGTATG-TTGC-A---T-------------------T-A-TTAGTATT-A-CT----G-ACAAT-G-AA-A--A----TTG-TTCCC-C-TA--A-ACA--CA-ATTGTTTATAAAA-A-GA-
gi|28 : AATATT-A-CT----G-AC-AT-GAAA-A--A----TTG-TTTTC-C-GA--T-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-A-G--TC-TGGTAGTTT--T-T-TTAAG-TTT-AT-----TT--C-C-G--TA--T------A-TA-G---A-----AACA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TT-CA----G-----A---AT-TTT------------------------A-TT---TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----T-A----GTT--T--------A-G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|3 : -CA--T-TGC---G-AGACT-CT--C-TCTATTTCGAAACATGCG---GGGAACC-GCTT---TT-GT-T-GAA-G--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----AAC-AATT-A-G----TACAA-----AAT----TTTA-CATTTAATA----T-GAG-TA------CC--AGAT-T--C-TTCA---A--G----TAT-T-CTTCCAA-G--TATC-A-CG---GTCACAAGAA-TCA---A--ATCT----A-T-G----TCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T---TAC-AGCC-ATTCCCA--AATG--TAG-ATT-AAGAC--TT--TATA-----GTCATCCTTTGT------------------CGCCA-GTAAGC-G-ATAGCC-A---AT----TGGAATTC--AG-TAC-C-ATAGACA-AA-GA-CA-AATCGA-ATT--CT-CTGAAAACTTTTAACAA-CA--TTTACATT--TACC--AAA-TCACA-ACCTCC-TTCTGATT-TT-CGC-AT-GAAG-GCGGC-TTCT---G--ATGTGCAGA--CATACAT-AT-TAAGGCACA-CTG--CTCGT--ACT-AAATAAA---A-GACT-TA-TCCAG-ACGTG--T-AACAT-TATTGA-TAGTCTAT---TGT---TCT-TGCTGTGT-G-GT-AA-AA--CACG-A--GACG---CGT--TATCATTAC-TT-TTTCT-CCT-G-C-ACTAATGTTAC-TCTG-CT-C---AGAAAT-GATTTATTT----AATTGCTATTTTTAG-GATGGA-TAATAG--TATA-CA--TAGTGCGA-AC-TCGTGTGTT-ACTA---T-G-GG--GAAG-ATGACTCT-A-TTAATATTTA-CT----G--CAA--G-AA-A--AAT--TTG-TTTTCTC-TAC-T-GTA--AC-ATTGTTTATAATA-A-GA-TC-TGGCCT-----T-T-TTTAAATTT-ATA----TT--T-T-G--TA--T------AGTA-GTCAGAT---A-CA-TA-T-CG-ATAA---C-T--GA-T-AA-TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---A--TGTC---ATG-------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TGCACCT-T-T-GATT-AT--T-TG----T-A----G-T--T--------A-G----------------A-TTTT--TG-T-GATT--TATTACta
gi|30 : A-G--TAT--A-CGCGGGTCAC-TGAA-TCATTTC--AT-TTTTAA-T-G----CC-CTTC-AG-AC-AGATCGT--GTAA--TATTTAC-AGTCTATTACCACTAATT--GAG-ATT-AA--CG-TT--TATATTTA-GTCATCCTCTGTTTCCCCTGCCCCTCCCTCC-CCACTTA-GCTG-ATCATT-GACCAA----TGGAATTC--AG-TAC-Ctt
gi|31 : ATTATTTCTGATTTATGTCAA-TGACGTAGCAGTAAACATGTCAAGCCTACGTAGGTTA-TACACCGATAATAA-TTCTTTAC--AGC----------ATTGTTCT-ACAAG--TGTTG---AAAA-TATCC-TAC-TA-CA-ATTG--AA-T-AGTGATTT-ACAGA-GACTTG---ACATGTG-GTCCGC-T--CAATG-GTTATTac
gi|32 : TTAT-ACATAACT-TTTGTTAG-ATCTGT--------A-C-TAG-A----GTATGCTTCATT-T----GTATGGG-ATGGT---TG-CTCTGC---TGCA---GAAATT--G-C-A--AAG--TTAGAAAAAGT-ACAG--TC------CCATGCTGC--TAGAAT--------TGCAACA----GGACTtta
gi|33 : taaggaaacttgaattcactgttatctaaa--TA--T------A-TA-G---AAT---AACA-TA-T-CG-ATAA---C-TCTGTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TGGGATT-A----G-T--TTTATATTCA-GATT-------------A-TTTT-GTG-T-CATA--TATTGgccaatttgat
gi|34 : A-TA-T-CA-ACAATT-C-T--GT-G-AA-TTTC-AAG-A-AACCTACATG----TA-ATT----TGTCA----T----TA---AT-TTCT---AT--------------ATTAA-ATA--TG--------TTT-T-AAA-----------TTTACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----C-G----G-T--T--------ACGGTAGATTAAAAAGATTA-TTTT-GTG-T-CATT--AATTGtaac
gi|35 : TATT-A-CT----G-ACAAC-G-AACA--A----TTG-TTTTC-C-GA--T-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-A-GA-TC-TGATCGT----T-T-TTAAG-TTT-AT-----TT--T-T-G--TA--T------A-TA-G---A---------------------------T--GTGA-AA-TT-C-AAA-A-A--------G----TATATC----TA-CA----G----AA---AT-GTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAtaa
gi|36 : AA-AAATTACAGTTTAAG--GTC--CTG--AA----ACTTTAT-CA-CTTTTAT-ACAGTACT-TTTA-AAA-G-TCTTCCTTTAATG-T-TGG-A----ATATG---CATC-TGA-AGTATGGG-ATGGG---TG-TTC-AA---T-CATTTCAAATTTAA-A-A--AAA------AAAAA
gi|37 : ttTT-AT-----TT--T-TTG--TA--T------A-TA-G---AAT---AGAA-TA-T--G-ATAA---C-T--GT-A-A--TT-C-AAG-A-A--------G----TATATT----TA-CA----G----AA---AT-GTT----AT--------------A---A-TTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-A-CT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----T-AG---G-T--T--------A-G----------------A-TTTT-GTA-T-CATC--TATTG
gi|38 : -C-AAA-A-A--------G----TATTTTGTAATA-TA----GTCCGAA---TT-TTTC---ATTAGCATTCTATGTAA---A-ATA--TG--------TTT-A-AA------------TG-ACCT-T---GA-T-ATCAT-TG----T-G----G-T--T--------A-GATTTTAACAGATT---A-TTTT-GTG-T-CATT--TATTGta
gi|39 : A---A-ATCATCCTTTGT------------------C-CCG-TTA-GC-G-ATAGGT-G---AA----TGGAATTC--AG-TAC-CCATGGAATTAA-GA-CA-A-T-----TT--CT-CTAAAATCTTTC-AAAAACAA-TTTACATT--TACC--AAAATCACA-ACCGCC-TTCCTtaac
gi|4 : CTTATATAAG--ATCAGGACTAC---AA-TTCGTTAC--AGC-------CTTATT--TCT-AAAAAAATGTTGAGAGAGA-TATTCCAAC-CAACAATTTG--AAATGAATGATT-ACCATACGACGTG---ACTAGTG-TTCCACGT--TAATGTACTTTTGAATGTTTAATCCTTTCACCACAATTAAGAGCCGTCTATTTTTTAAGTACACACGAAAAAAATATGCA-AT-CTACCTTGTTTAGAAGATTTTCAGACACTGT-TTTAC-TAGATTT-G--CCCTAGTCTCCCAC-CGACAAACTAT--TTGCCG----CATTTCATTTTTCATACGATCT-----CAGCTGGTCGG-CA-TACATTGAATCAAT-ATTAGC--CGA-TGCTTAT---AAAAACT-G-GGA-TTGCTTAAA-AAATTACAGTTTAAG--GTCAATAACAAA----ACTTGAT-CA-CTTTTAT-ACAATACT-TTTATTAG-G-CCGTC-------G-C-TAG-A----GTATG---CATC-TTA-GGTATGGG-GTGGG---TG-TTCAAA---T-CA---A-GATTCAG-A-A--AAA--CTAGAAAAATT-ACAG--TTA-----GCA-GCCGC--GAGGAT--------AGTCACA----GGTCTT-A---CTTCCT---TGG-CA--T-CGC---G-AGACT-CT--C-TCTATTTCGAAAC-TGGG--TGGGAATC-GCTT--ATT-GT-TAGAA-G--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----A-T-AATT-ATG----TACAA-----AAT----TTAT-CAT--AATA----T-G-G-TA------CC--AGAT-TATC-TTCA---A--AA---TAT-T-CTTCCAA-A--TAT--A-CA---GTCACAAGAA-TCA---A--AT-T----A-T-G----CCAC--C-AG-AC-A-GTCGC--AAAA--T---TAC-AGC--ATTCCCA--AATG--TAG-ATT-AA-ACA-TT--TATA---A-GTCATCCTTTAT------------------C-CCA-GTA-GC-T-ATAGGC-C---AG----TGGAATTC--GG-TAC-CCAT
gi|41 : -C-T-AGACAT-GATTTATTT----AGT-GTCATCTTTAG-AATGGA-AAAT-T--TACA-CAATTA----------TC----GTCTACTATTTT-A-GG--GA-G-ACAAATCCAA-TTAGTAGT-A-CCCTGAG-AAAAT-A-AA-A--G----TTa
gi|42 : tcT----TA-CA----GTCCGAA---TT-TTTC---AC--------------A---A-ATA--TG--------TT--A-AAA-----------TG-ACCT-T-T-GA-T-ATAAT-TG----C-ACATTG-T--T--------A-G----------------T-TTTTAGCA-TATATC--TATTG
gi|43 : agtcaataaatctgtgaaaTCCT---TGG-CA--T-CAC---G-AGACT-CT-------ATTTCGAAAC-TGGA--TGGGGACC-GCTT--ATT-GT-T---A-G--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----A-C-AAAT-TTGGTATTACAA------------CTAT--AT--AATA----t
gi|44 : CACC-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAGA--------------------------------AG-AC-TAAGACATGA-TG--T---------------AA---A-GACT-TA-TTCAG-A--TG--TAAACAT-AATTGA-TGCTCC-
gi|45 : a-GACAC---GCATGTTTATCA---T-G-AG--GT-G-ATAACTCA-A-TCGGCATC-A-CA----G-AGAAT-G-AA-A--AC---TTA-TTT-----TA-----------------TTAAAAAA-A-TA-TC-TGGTCG-----T-TCCTGAG-Ttctatgtttt
gi|46 : GAGAGCG-C-TACT---GGAATGTGAATA--CATACAGGAT-TAAGGCATAATTT--T--GT--ACT-AAA-GAA---A-AACG-TA-TTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTGA-TAGTC
gi|48 : -ACCT-T-T-GA-T-ATCAT-TG----T-A----G-T--T--------A-G----------------A-TTTT-GTG-T-CATC--TATT
gi|49 : CAGTTAAAG--GTCAATTGCAAA----ACTTTAT-CA-CTTTTActaa
gi|5 : ACA----GGTCTT-A---ATTCCT---TGG-CA--T-CGC---G-AGACT-CT--C-TCTATTTCAAAAC-TGGGG-TGGGAACC-GCTT--ATT-GT-TAGAAAG--AA-G-GACAA-AA--TT------A-AAA----A-A-GATT-ATG----TA-AA-----AAT----T-ATGCAT--AATA----T-G-G-TA------CC--AGAT-TATC-T-CA---A--AA---TAT-T-CTACCAA-G--TAT--A-CG---GTCACA-GAA-TCA---A---T-T----A-T-G----CCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T----AC-AGC--ATTCC-A--AATG--TAG-ATT-AA-ACA-TT--TATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G-ATAGGT-G---AA----TGGAATTC--AG-TACACCATAGAATT-A-GA-CA-A-TC-A-CTT--CTGCTGAAAC--TTCAAAAAACAA-TTTACATT--TACC--AAAATCACA-ACCTC----CTTA-T-TTTCGC-ATGGGAAAGCG-C-TACG---GG
gi|6 : TATGTCAA-TGATGCCGCTAAAAACATGTCAAGCTTATGTAAACT-TTACGATGATGATAA-TTCATTGTTGAGTTATTCAACT-ATTA-TCT-ATGAA--TGT------A------TC-AA--TG-CAGACTG--GA-T-AATAATTTAA-ATG-AACTTG---TA--GTG-GT-CG--TAACAGTG-GTTGTTGAAT-TTCAATTC-CTCGA-A-AACAAA-AGCGG----TTTCTTGAGTACA----AAGAAAA-ATACATAT-C--CC----------------CATAAATTGCAAT-A--TGGATTTCGTG-TCAA------CACAC-AAACACT-TAGTTATCA-------TT--GTTCCCACACGATCT-----------------CA-TA---TG--TC-AT--------CC---TACCTAT---GAAAAAC-GTGGACTTATTAAAATAAATTAGAGTTCAAG--GTCAGTTCTAAA----ACTTTAT-CT-ATTCTAT-ACTTTACT-TTTATTAG-A-CCTCT-------G-C-TGG-A----ATATG---CGTC-TGA-AGTGTGGG-GTGGA---AG-TTCAAA---T-CA---AGCCTTTA--A-A--AGATTTTAAAAAATTT-ACAG--CTT-----GCT-GCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnna
gi|7 : tggtttcaaagttatctaaatttccaaactcaaagattttgtacagaaacataatgtctttaacctttatatgttggagtttctcaaaagtctgtattacatgtaggtacttaCAA-AG--TT------A-AAA----C-C-AAAT-ATG----CACAA-----AAT----TTAT-CAT--GATA----T-G---TA------CC--ACAT-CATC-TTCA---A--AA---TAT-T-CTGCCTA-G--CAT--G-CG----TCACATGAT-TCA---A--AT-T----A-C-G----TCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AAAA--T---GA---------TCCCA--AATG--TAG-ATT-AA-ACA-TT--TATA---A-ATCTTCCTTGTT------------------T-CCA-TTA-GC-G-ATAGAT-G---AA----TGGAATTC--AG-TA--CCATGAAAATAAGGA-CA-A--CAA-TTTTCTT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TCTACGTT----CC--AGGAACACC-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGC-AT-GGAG---------------------GAAGA--C----------TAAGACATGA-TG--T---------------AA---A-GACT-TA-TTCAG-AT-TGATC-AACAT-AATTGA-TGCTCC-------T---TCTATG-----T-------------------------------------TTTACATT-TTT-----T-G-C-AGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-TGAGAAA-TGATTTATTA----AAT-GCTATTTTTTA-GAAGGA-TAA--T--TAGG-CA--TAGTG-AACAC-TTGTGT-TTTGGCA---TCG-AG--GA-G-ATGACTCC-ATTTTGTGAA-A-CT----G-CCCAT-G-CA-A--A----TAG-TTTCC-G-TACTC-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-C-GA-TC-TGGTCG-----T-T-TTTAG-TTT-AC-----TT--T-ag
gi|8 : aat-TT--TATA---A-GTCATCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G-ATAGAT-G---AA----TGGAATTCA-AG-TAC-CCATAGAA-TAA-AA-CA-A-T-AA-CTT--CT-CTGAAAACTTTC-AAAAACAA-TTTACATTA-AACC--AAAATCACA-ACAT-C-TTC-TATT-TTTTGC-AT-GGAGAGCG-C-TACT---GGAATGTG-ATA---ATACAAGAT-CAAGGCATAAT--------------------AA---A-GAC--TA-TTCAG-A--TG--T-AACAT-TATTGA------------------TCT-TG-----T-G-GTAAA-A---CA-G-AT-GAC----GCT--TATCATTAC-TT-TTTCTCC-T-G-C-ACGAA-GT-AC-TCTG-CTCC-C-AGAAA-TGATTTGATT----AAT-GC-ATTATTAG-GATGGA-TAAT-T--TATA-CA--TAGTG-GACAC-TCGTGTG-TTACTA-----A-TG--GA-G-GTGA--CT-A-TTAATATT-A-CT----G-ACAAT-G-AA-A--A----TTG--TTTC-C-TA--T-GTA--CA-ATTGTTTA-AAAA-A-GA-TA-T-GTCGT----T-T-TTAAG-TTT-A------TT--T-T-G--TA--T------A-TA-G---AA----AACA-TA-TACGAATAA---C-T--G--A-AA-TT-C-AAA-A-A--------GCTAATATTTT----TA-CA----G-----A---AT-TTTC---AT--------------A---A-GTA--TG---------TT-A-AAA-----------TG-ACC----A-GA-T-ATCAT-TG----T-A----G-T--T--------A-G----------------A-TTTT-GTG-T--ATC---ATTGgatagtgccattctgtacatacc
gi|9 : A---A--TT-T----A-C-G----TCAC--C-AG-AC-A-ATCGC--AGAA--T---TA---------TCCCA--AATG--TAG-ATT-AA-GCA-TT--TATA---A-ATCTTCCTTTGT------------------C-CCA-TTA-GC-G-ATAGAT-A---AA----TGGAATTC--AG-TTC-CCATGAAAATAA-GA-CA-A--CAATTTT--CT-CTAAATTCTTTC-AAAAACAG-TTTACATT--C-CC--AGGAACACC-ACCTCC-TTCTTATT-TTTCGT-AC-GGAGA--------------------------------AG-AC-TAAGACATGA-TG--T---------------AA---A-GGCT-TA-TTCAG-A--AG--TAAACAT-TATTTA-TGCTCCAC---TATG--TTT-T----------------A---CA-------------------------AT-TT-TT------T-G-C-AGTAA-GT-GCATTCA-CT-C-T-GAAAATTGATTTATGA----AAT-GCTATTTTTAG-AATGGA-TAAT-T--TAGG-TA--TAGTG-AACAC-TCGTGTG-TTAGCA---T-G-AG--GA-G-ATAACTCC-A-TTTGTGAA-A-CT----G-CCCATCT-AA-A--A----TAG-TTTCC-G-TACTC-GTA--CA-ATTGTTTATAAAA-T-TA-TC-TGGTCGGTTTTT-T-TTTAG-TTT-ACTTTGATT--T-T-G--TA--TCTGCACA-TA-A---AAT---GG
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): AGTAACAGGGTCACCTAGTATATCTATGAAAGAATATTTATATTTATAGAAACTGGATGGGAACCCTTATTAAACAAACAAACAAACAAGAAAAGAAAGAAAAAACCTCGTAACTATGTATAGAATGCACAATAATCTTGTTCCCATACCCGTGTCACCTTTTCAAGACACATCACACCAAATACC
Unaligned ( gi|40 ): AAAAACAATGTATAATGTGGACAAACATTTGATACCAAAGTATCTTAGAGACATTTCCGTGTGAAACTTCTATTTACAATACGAGAAACACATTGAATTTACAACGTAAAGTTGCAA
Unaligned ( gi|47 ): CGTTTGAAACTTGAAGTCTTTACATGCCCAATATACATGTATAAACGTACGTTT