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gi|18                         :                                                                                     gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcGCAAAAG-ATTGCA-ATTA---A-A--C-A--A---A-G-A----T-T-----A-T-T-GC--G---TTT-------AAA--C-GC-AA---------A-----A--G------
gi|3                          :                                                                                                                                                    acggaagcccattgaggTAAAAT-ATTGCG-ATTA---A-A--C-GCAA---AAG-A----T-T-----A-T-T-GC--T---TTT-------AAA--C-GC-AA---------T--------G------ACTT---T----T------G-T--G---T-----TTAA-A----CG-A---A--------A----TAA----TA--T----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAT-A-GC----A-------------A---T-C-----G-T------------------T-C-----A--G-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--T----A----A--T--AT-------T-T-----G-C--G----T--T---A---A-A-----------T------G--C-------A-----------A---T--A-CTTTTTGCGT--T--A-------T-TG-C--A--T---T-TA----A----AAGC---A--A-A--A----A--C-------A-------T-C-AC--G-TT---T--------AATT-G-C-A--A----A--C----T-------------T-----------------------TT--G--T-----G----TT----T-------AA-A----C---GTA-A-G----------C---A------AT-T-T---GC-GTT---------T-------T---------AACGCAAT----------T-------T--------A----------------T---TG-------CG--------A--AT-A--------AAC-GC------------G-A---TAA-T-T----G------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----gtttaaacgcaataaaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|17                         :                                                                                                                           acggaagcctattgaggacactacttagagatatttttttcaTGAAAT-AT-TGG-TTTA---A-A--C-GCAA--------------T-----A-T-T-AC--T---TTTGCTT---AAA--C-GC-AA---------T-----A--TT-----A------T----T------G-C--G---C-----TTAA-T----CG-C---A--------A----T------C---T----T-----------T--TT--GC------G----TT-----------AA-C-GC----A--------atatcaattatttttgtgt
gi|5                          :                                                                                                                          gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttggtAAAAA-AT-GTG-TTTA---A-A--C-GCAA---A-T-T----T-G-----C-T-T-GC--G---TTT--------GA--C-GC-AA---------A-----A--G------A------T----T------G-C--G---A-----TTAA-A----TG-C---A--------A----A-G----A---T----T-----------A--AT--GC------G----TT--T-------AAA-T-GC----A-------------A---T-A-----T-T-------A----------T-T-----G--C-G-----T---T-A--------A-A-------------T--G--C----AA--A----AGTATA--C--A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-T-----------C------G--T-----------------------A--A-T--------T--T--A-------C-TA-----------T-TG----T----A--A---A-TA-A--A----A--A-------G-------T-T--C--A-AT---TGCAG----AAAT-G-ttgcacgcttaagaag
gi|10                         :                                                                                                          gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaaAAAAA-AT-TCG-TTTA---G-A--CGATAA---A--------C-T-----T-T-T-GC--A---ATT-------AA---C-GC-AA--------------------------------------------A-C--T---T-----TTAG-A----T-------------------------------T----A-----------T--TT--GTCAAACAG----TT--T-------AAA-C-AC----A--------ATA--A---G-A-----A---------A----------T-T-----GG-C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--A--C----AA--A----A----G-----A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---tgggattaaacgcaataacgcaatacttattgcgtt
gi|5                          :                                                                                                                              tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagatttttttaAAA-TT-ACG-ATTA---A-A--C-GCAATGTA-T-A----C-T-----T-T-T-GC--A---TTT-------AA---C-GC-AA---------T-----A--AT-----A------T----T------G-C--A---T-----TTAA-A----CG-C---A--------T----T-A----A---T----C-----------T--TT--GC------A----TT--T-------AAT-C-GC----A-------------A---T-C-----T-T------------------T-T-----G--C-G-----T---C-A--------A-A-------------C--G--C----AAGCA----A----A--T-----------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------A--C-------A-----------------------------T--T---------------------T---T-T-------------------------------------------------T-T-GG--G-AT---T--------AAAC-G-C-AATA----A--CGCAAT-----------ACT--T---------------A----TT--G--C-----G----TT----ttttgcgaattaatgcaataattattgcttttaaacgcaataaaaaatatctatgtactgg
gi|14                         :                                                                             gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaatagt-AT-GGG-TATA---T-A--C-ACAA---A-T-A----T-T-----T-G-T-GT--T---TTT-------AAG--TGGC-AAT--------C-----AT-G------T------T----T------A-C--G---T-----TTAA-A----AG-C---A---------------G----T---TTAAAT-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----G--------ATA--AT--T-A-----T-T-------T----------T-T-----G--C-G--G--T---TGA--------A-A-------------C--G--C----AA--
gi|16                         :                                                                                                                                                                           -AT-CCG-TTTATGTA-A--C-GCAT---A-T-C----T-T-------T-T-GC--G---TTT-------AAA--C-GC-GA---------CTATTGA--T------A------T----T------G-CGTT---T-----TTAA-C----TG-C---C--------A------A----T---C----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------agcaatgagcctttttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
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gi|9                          :                                                                                                                              acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggttttttttttttaT-GCG-TTTA---A-A--C-GCAA---ACG-A----T-T-----G-C-G-A--------TT-------AAA--C-GC-AA---------A-----G--A------A------T----TATGC--G-C--T-----------GA-A----CG-C---A--------A-----------T---C----T-----------T--TT---C------G----TT--TT------AAA-C-GC----A--------T-A--A---T---------C-------C----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-AAATAACCTTGCGTCA-G--C----AA--T----A----A--T--C--------TAT-----GTC--G--T-T--TT--A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---T--A-A--------T--C--C-------T-TG-C--G--T---T-AA----C----A--C---GCTA-A--------------------------T-T-G------T---T--------AA---G-C-A--A----A---------------------T--G---------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----ataatcatttaaagcaaaattatttcatatttaatccgcaaacaaagttgcggttttaaaaacgcaagttttttgcgtttaaacg
gi|17                         :                                                                                                                                                                        attgcT-GCG-TT-----A-A--C-GCAA---A-A-A----G-------A-T-T-GC--G---ATT-------AAG--C-GC-AA---------T-----A--AT-----A------T----T------G-C--G---T-----TTAA-------G-C---A--------A----A-A----G---TAA--T-----------A--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C--C----A-------------A---T-A-----T-TTC-----A----------T-T-----GCAC-G--C--T---T-A--------A-ataaaaaatatctttctataaactggcctcaatgggcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                 gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttggtT-GCG-TTTA---A-A--C-GCAA---A-A-G------------A-T-T-GC--A---ATT-------AAA-----C-AA---------------A--GATT---A------T----T------G-C--G---T-----TTAA-A----CG-C---A--------A----gaag
gi|8                          :                                                                                                                                                         acggaagcccattgaggcttT-GCG-TTAA---A-T--C-AAAA---A-A-AAAATT-T-----T-T-T-TG--C---GTT-------AAA--C-GC-AAAATCT----C-----A--A------AAACGTCT----T------G-C--G---T-----T-AA-A-------C---A--------A----C-G----C---T----C-----------T--TT--GT------GAGTTTT--T-------AAA-C-GC----AAACAGTCCTTT--ACTGT-G-----G-C-------AGAAT------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A---------------C--G--C----AA--AC---A----A--T--T--------T-T-----G-CA-G--TGT--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-ataaaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|8                          :                                                                                                                                tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttcaT-GCG-TTTA---ACA--CTGCAA---A---A----T-T-----G-T-T-TG--C---GTT-------AAA--C-GC-AAATTCTGCCAC-----A--GTAAAGGACTGT--T----T------G-C--G---T-----TTAA-AAACTCA-C---A--------AAGAGC-G----T---T-------------------------------G----TT--T-------AA--C-GC----AAGACGTTTTTG--A---G-A-----T-T------------------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A---------------C--G--C----AA--A----A----A--A--A--------T-T-----T-T--T--T-T--TTTGATTTA-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-T--------T--T--A-------C-TG-CT-A--T---T-TA----A----A--C---G-TA-C--A----A--C-------A-------T-------G-AT---T--------aaatttactgctatttaaacgtacaacatgattgc
gi|20                         :                                                                                                                             tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttcatttT-GCG-TTTA---A-A--C-A-AA---A-A-A----T-TA----A-T-T-GC--G---TTT-------AAA--C-AC-AA---------T-----A---------A------T----------------A---T-----TTAA-A----CG-C---A--------A----A-G----A---T----T-----------A--TT--Ggc
gi|7                          :                                                                                                                                                cattattgcatttaaaaataaaatattacT-GCA-TTTA---A-A--C-ACAA---A-G-G----A-T-----A-T----C--G---TTT-------AAT--T-GC-AAG--------C-----C--G-------------T----T------G-C--G---T-----TTAA-A----CG-T---A--------A----A-G----A---T----C-----------A--TT--GT------G----TA--T-------AAA-C-Gt
gi|26                         : cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattatT-GCG-ATTA---A-A--C-GCAA---A-TTA----T-T-----A-T-T-GC--G---CTT-------AAA--C-GC-AA---------T-----AATG------A------T----T------G-C--
gi|9                          :                                                                                                                                                                        agatat-GCG-TGTT---A-A--C-GCAA---G-G-A----T-T-----A-T-T-GC--G---TTTA------AAA--C-GA-CA---------T-----A--G------A------T----T------A-T--T---G-----CT-G-A----CG-C---A--------A----G-G----T---T----A-----------T--T----------------TT--T-------AAA-C-GC----A--------AGG--A---T---------T-------A------------T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A----------------A--C----GA--A----A----A--G--A--------T-T-----G-C--G--T-T--C-------A-G-----------C------G--C-------A-----------T---A--A-T--------T--C--T-------T-TG-C--G--T---T-TA----A----T--C---G-CA-AT-C----G--T---------------T-T-GC--G-TT---T--------AAAC-G-C-A--A----
gi|13                         :                                                                                                                                            attgctttaaacgcaatcatttgcttaacaatta-GCGATTTA---ATG--C-GCAA---A-A-A------------A-T-T-GCG-T---TTT-------AAA--C-GC-AA-------------------------A------T----T------G--------T-----TTG--------G-C---A--------A------A----C---T----T-----------T--TT--GC------G----TT--TTGTTTAAAAA-C-GC----A--------taaaaaatatctttctataaactggcctcaatgggcttccgt
gi|6                          :                                                                                                            caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatatttttttttttaattgtgattaaacgcattattgCG-TTTA---A-A--C-GCAA---A-A-A------------ACT-T-GCGTT---TTT-------AAAACC-GC-AA---------C-----T----------------T----T------G-T--T---TGCGGATTAA-A----TA-T---G--------A----A-A----T---AA---T-----------T--TT--GC-----------TT--T-------AAA-------------------TG--A---T---------T-------A----------T-T-----G--A-G--T--T---T-A--------A-A-------------A--G--C----AT--A----A-------T--A--------TCT-----G-C--G--T-T--T---A---A-AGCCAATCTTTGC------GTTT-------A-----------A---A--A-C--------T--C--AATGATCTT-TG-C--G--T---T-TA----A----T--C---G-CA-A--C----G--T---------------T-T-GC--G-AT---T---------AAC-G-C-A--A----A-------------------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----TT----TAC-----AA-A----CGCAATA-A-A----------A---A------A--aacaaactttgcgttccaaagta
gi|7                          :                                                                                                                                        acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggttttttCG-TTTA---T-A--C-ACAA---T-G-A----T-C-----T-T-T-AC--G---TTT-------AAA--C-GC-AA---------C-----G--G------C------T----T------G-C--A---A-----TTAA-A-------C---G--------A----T-A----T---C----C-----------T--TT--GT------G----TT--T-------AAA-T-GC----A--------ATA--A---T-
gi|2                          :          cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgG-TTTA---A-A--C-ACGC---A-T-A----C-TTC---A-TGT-GC--C---GTT-------TAA--C-GC-AA---------T-----A--A------A------T----TCTATTGG-C--G---T-----TTAA-A----CG-C---A--------A----T-T----T---T----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GCG---A--------GT---A---T-A-----G-T-------C----------T-T-----G--C-T--T--T---T-G--------A-A-------------C--G--C----GA--A----C----A----------------T-----G-C-----C-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---T--A-------------T--A-------T-TG-T--G--T---T-TA---------G--C---A--A-A--A----A--TTG-----A-------T-T-G---G-TT---T--------AAAT-G-C-A--
gi|10                         : gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttG-TTTA--------T-AGAA---A-G-A----T-TTTTTTA-T-T-GC--G---TTT-------AAA--C-GC-AA---------T-----C--T------T------T----T------G-T--G---T-----TTAA-A----CGCC---A--------A----T-T----T---C----T-----------TA-TT--GT------G----TT--T-------AAA-CTGT-------------TTG--A---CAA-----A-T-------AATCTAAAAGTT-T-----G--C-G-----T---T-A--------A-T-------------T--G--C----AA--A----A----G--T-----------T-T-----ATC--G--T-C--T---A---A-A-----------C------G--------------------------A--A-T--------T--T----------T-T--------T---T-T-------------------------------------------------T-T-GC--G-AA---T--------TAAT-G-C-A--AT---A-------------------A-T--T---------------A----TT--G--C-----T----TT----T-------AA-A----CGCAATA-A-A----------A---A------A--T-
gi|12                         :                                                                                                                                                             tacggaggcccattgaggcta-TTTA---A----C-GCAA-----T-A----T-T-----AAT-T-GC--A---TTT-------AAC--A-GC-AA---------A-----G--A------A------T----T------G-C--G---T-----TTAA-A----CG-C---A--------A----T-G----T---T----T-----------T--T---GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A--------AAG--A-----A-----A-TGCTAAAGA----------T-C-----G--C-G--A--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--A----AT---A--TC-A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-A--------T--T--A-------atctatgtactgg
gi|9                          :                                                                                                                                                                                  -TTTA---A-A--C-GCAA---G-G-A----T-T-----A-T---GC--G---TTT-------AAAA-C-GA-AA---------------A--G------A------T----T------G-C--G---T-----TCAG------CG-C---A--------T----A-A----T---T----C-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAT-C-GC----A-------------A---T-C-----G-T------------------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--CAATAAA--A----A----A--T--A--------T-tatataagacttctgcttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|13                         :                                                                                      attgctttaaacgcaatcatttgcttaacaattagcgtgttaacgcaaggattattgcgtttaaaacgacatagattattgctgacgcaaggttatt---A-A--C-GCAA---A-G-T----T-T-----G-T-TTGC--G---TTTTTAAACAAAA--C-GC-AA---------A-----AA-G------T------T----T------G-C--C-----------AA-A-------C---A--------A--------------------------------T--TT--GC------G----TT--T-------AAAAC-GC----AA-------TT-----------------T-------T----------T-T-----G--C-G--CA-T---T-A--------A-AT------------C--G--C----CA--A------------T--A--------A-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-T-----------C------A--C-------A-----------A---ctttctataaactggcctcaatgggcttccgt
gi|7                          :                                                                                                                                                          caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatatttttttttttaa-G-A----T-T-----A-T-T-GC--A---TTT-------AAA--C-AC-AA---------A-----G--G------A------T----A------T-C--G---T-----TTAA-T----TG-C---A--------AGC--C-G----------------------------TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GT----A--------AAG--A---T---------C-------A----------T-T-----G--T-G--T--A---T-A--------A-A-------------C--G--ccaaagta
gi|20                         :                                     cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt-A----T-T-----A-T-T-GC--A---TTT-------AAA--A-AT-AA---------A-----A--T------A------T----T------A-C--TGCGT-----TTAA-A----CA-A---A--------A----A-A----T---T----A-----------A--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-AC----A-------------A---T-A-----A-T-------A----------T------------------T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--A----G----AT-T--A--------T-T-----G-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                          c-A----T-T-----A-T-T-GC------TTT-------AAA--C-G---A---------C-----G--GGT----A------T----T------A-C--G---A-----TTAA------TG-C---A--------A----A-A----A---T----T-----------A--TT--GC------G----ATGGT-------AAA-C-GC----A-------------A---A-A-----G---------A----------TCT-----G--C-A--CG-T---T-T--------A-A-------------C--G--C----AA--G----A----T--T--A--------T-------G-T--A--T-T--T---A---A-AA----------C------G--C-------A-----------A---AT-T-C--------T--T--A-------T-Tt
gi|18                         :                                                                                                                                                                       ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaattttt----T-T-----A-T-T-GC--G---TTT-------AAA--C-GC-AA---------A-----A--G------A------T----T------G-C--A---A-----TTAA-A-------C---A--------A----A-G----A---T----T-----------A--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A--------tggttttaaa
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                     acggaagcccattgaggcttt-T-T-GC--G---TTT-------AAA--C-GC-AA---------T-----A---------A------T----C------T-T--TG--T-----TTAA-T----TG-C---A--------A-----------T---C----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A--------aaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                acggaagcccattgaggctt---TTT-------AAA--C-GC-AA---------T-----A--ATA----A------T----T------G-T--C---T-----TTAA-T----TG-C---A--------AA---C-A----A---T----T------------------GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A----------A--A---N-N-----N-N-------N----------N-N-----N--N-N--N--N---N-N--------N-N-------------N--N--N----NN--N----N----N--N--N--------N-N-----N-N--N--N-N--N---N---N-N-----------C------G--C-------A-----------A---A--C-A--------T--C--A-------T-TG-C--A--C---T-TA----A----A--T---A-CA-A--ATTATA--T-------A-------T-T-GT--G-TA---T--------AAAataaaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                    ---TTT-------ATA--C-AC-AA---------T-----A--T------A------TAATTT------G-T--A---T-----TTAA-G----TG-C---A--------A----T-G----A---T----G-----------T--TT--GC------G----NN--N-------NNN-N-NN----N--------NNN--N---N-N-----N-N-------N----------N-N-----N--N-N--N--N---N-N--------N-N-------------N--N--N----NN--N----N-------T-----------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A-------------------------------T-TG-T-------------------------------------------------------------T-T-GC--A-AT---T--------AAAG-A-C-A--A-------T----T-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----ctcatagcaacgaaccttcttctcaaagtacgcacaccacaaccctatttctacttta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                          -------AAA--C-GC-AA---------A-----A--G------A------T----T------GGC--A---G-----TTAA-AAA--CG-C---A--------A----T-A----TCAAT----A-----------G--TC--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A-------------A---A-A-----GAT-------A------------T-----G--C-G--T--TACAT-A--------A-A-------------C--G--ctcatagcaacgaaccttcttctcaaagtacgcacaccacaaccctatttctacttta
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                 gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataa------A------T----T------G-C------T-----TTAA-A----CG-C---A--------A-----------T---C----A-----------T--TT--GC------------T--T-------AA-----C----A-----------------------------------A----------T-TA----G--C-G--T--G---T-T--------A-A-------------C--G--C----AA--G----G----AT-T--A--------T-T-----G-C--G--T-T--TA--A---A-A-----------C------GA-C-------A-----------T---A--G-A--------T--T--A-------T-TG-C---------T-GA----C----G--C---A--A-G--G----T--T-------A-------T-T-T------T---T--------AAAC-G-C-A--A----G-------G-----------A-T--T---------------A-----T--G--C-----G----TT----T-------AA-A----A---CGA-A-A----------A---G------A--T-T---GC-G-T---------TCAGCGCAT---------AAT---------------T-------C--------T----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------ATC-GC------------A-A---TCG-T-------------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----gat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                ------A------T----T------G-C--G---A-----TTAA-A----CG-C---A--------A----A-T----T---A----T-----------TA-TT--GC------G----CT--T-------AAA-C-GC----A-------------A---T-A-----A-TG------A----------T-T-----G--C-taaaaaatatctttctataaactggcctcaatgggcttccgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   agat------T----T------G-CG-T---T-----TCAA-C----CG-C---A--------AAAA-T-A----A---T----T-----------A--TC--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----AAAAT----TTA--A---------------------A----------C-T-----G--C-T--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--T----AA--A----C----A--TG-A--------T-T-----GCC--A--C-T--TAA-A---A-A-----------C------A--C-------A-----------A---AT-A-T--------T--T--G---------TG-T--A--T---A-TA----C----C--C---A-TA-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                       ------T----T------G-C--G---T-----TTAA-A----CG-C---A--------A----T-G----A---TA---T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAT-C-GCG---A--------TCT--T---T-A-----G-C-------A----------T-TTCTTTG--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--A----A----A--C--A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---T--T-C--------T-------------T-TG-C--T--G---T-TA----A----A--T---G-CA-ATTA----A--T-------A-------T-T-GC--G--T---T--------AAAT-gcaatgagcctttttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                 taattt------T----T------G-C--G---T-----TTAACAC---TG-C---A--------A----A-A----T---T----G-----------T--TT--GC------G----TT----------AAA-C-GC----AAATT----CTGCCA---C-A-----G-T-------AAAGGACTGT-T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-AAACT---------C--A--C----AA--A----G----A----------------------G-C--G--T-TGTT---T---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---G--A-CGTTT----T--T--GAGATT--T-TG-C--G--T---T-TA---------A--C---G-CA-A--A----A--A-------AATTTTTTT-T-TT--G-AT---T--------TAAC-G-C-A--A----A--A----T-------------T--T---------------A----CT--G--CT----A----TT----T-------AA-A----C---GTA-C-A----------ACATG------A--T-T---Gatataagacttctgcttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                        tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttcatt------T----T------G-C--G---T-----TTAA-A----TA------------------------------T----T-----------A--TT--GT------G----TT--T-------AAA-C-GC----A--------AT-------T-A-----A-T-------T----------T-T-----T--T-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AG--T----A----A--T--ATT------T-T-----A-T--T--T-T--T---A---A-A-----------T------G--C-------A-----------A---c
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                         catta----T------G-T--T---T-----TTAA-G----TGGC---A--------A----T-C----A---T----G-----------T--TT--AC------G----TT--T-------AAA-A-GC----AG-------TTT--A-----A-----A-T-------T----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----GAT-A----A----T--T--ATTT-----T-T-----G-CG-G--T-T--G---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---agattattgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---T-----TTAA-A----CG-C---A--------A----T-A----T---TAC--T-----------T--TT--GC------------T--T-------AAA-C-GC----A-------------A---T-A-----T-T-------A----------T-T-----G--C-G--C--T---T-A--------A-T-------------C--G--C----AA--T----C----T--T--T--------T-T-----G-C--G--T-T----------A-A-----------C------G--CAACCAAAA-----------A---A--A-C--------T--T--A-------T-caaatatttgtgtatatacccatagcaatgagcctttttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               gggagccccattgaaggcagtttatagac-A----TG-T---A--------A----C-GCATAT---C----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GCGACTA--------TTG--A-------------T-------A----------T-T-----G--C-GTTT--T---T-A--------A-C-------------T--G--C----CA--A----T----C--T--T--------T-T-----G-C--G--T-T--T---ccaatatttcattgcacgcttaagaag
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                    gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataaG-C---A--------AT---C-A----T---G----T-----------T--GT--AC------G----TT--T-------AAA-TAGC----A--------GTA--A-----------A-T-------T----------T-T-----G--C-G-----T---T-A--------A-A-------------T-----C----AA--A----A----A--A--AAAATTTTTT-T-----G-C--G--T-T------A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-T--------C--T---------------C--A-----------------------------A-A--A----ACGT-------C-------T-T-GC--G--T---T--------AAA----C-A--AC---G--C----T-----------C-T-----------------------TT--G--T-----GAGTTTT----T-------AA-A----C---GCA-A-AC---------A---GTCCTTTA--C-T---GT-G-G---------CA------G---------AA----------------T---------------------------------T---TG-------CG--------T--TT----------AAC-GCA----AAC----A-A---TT----------------TT-G-CAG-TGTT-------AA-ACG-C-A---A----A--AT--aaacggat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttc-G----T---C----T-----------T--AT--AT------A----TT--T-------AA--C-GC----A-------------A---T-A-----T-T-------AA---------T-T-----G--C-A--T--T---T-A--------A-C-------------A--G--C----AA--A----G----A-----A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---T--G-T--------T--T----------T-TG-C--G--T---T-TA----A----A--C---G-CA-A--AGAA-A--TGCTAAAGA-------T-C-GC--G-AT---T--------AAAC-G-C-A--A----A--A----T-----------A-T--C---------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-A----------A----------A--T-T---
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t----T---T----T-----------TA-TT--GC------G----TT--TGT-----AAA-C-GC----A-------------A---T-A-----A-T-------T----------T-T-----G--C-G-----T---T-A--------A-T-------------C--G--C----AA--A------------C--G--------T-T-----G-C--G--A-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--G-A--------T--C--A-------T-TG----AGTT---T-TA----A----A--C---G-CA-A--A----G----------A-------T-T-GG--C-TT---T--------AAAC-G-C-A--G----A-------T-----------A-T--T---------------A-----T--G--C-----T----TT----T-------AA-A----C---TCA-A-------------------------------------------------------T---------AA----------------T-------C--------A----------------T-------------------------TT-A--------AA--GCA----A------A-A---TTA-T-T-----------TC-A-T-A-T-TT-------AATCCG-C-AAACA----A--AG--T--T----G--C-GG--------------T-TTTAAAAAC------GC-A--AG--T-----TTT----T--T-GC-----------GT------TT---AA--AC------ttctgcttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggtttttttt----T---T----T-----------TA-TT--GC------G----TT--T-------AAA-A-GC----A--------ATA--A---T---------T-------A----------T-T-----G--C-A-----T---T-A--------ATT-------------C--G--CAAA-AA--A----A----A--A--A--------T-T-------C--G--T-T--T---A---G-A-----------C------G--A-------T-----------A---A--A-C--------T--T----------T-TG-C--A--A---T-TA---------A--C---G-CA-A--A----C--T-------T-------T-T-A---G-AT---T--------ATTT-GTC-A--A----A--C----A-----------G-T--TTAAACACAATAAGAAA----TTG-G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---ACA-A-A----------A---G------A--T-T---GC-G-T---------T-------T---------AA----------------g
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagatttttttattgcgt----T---T----T-----------TA-TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A-------------A---T-C-----T-T------------------T-T-----G--T-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----CA--ATTT-C----T--T--A--------T-T-----G-T--G--T-T--T---A---A-A-----------CTGTTTGA--C-------A-----------A---A----------------T--A---------------A--T---C-TA-------------------A-A--A----G--T---------------T-T-GC--G--T---T--------AATT-G-C-A--A----A--A----G-----------T-T--T---------------A----T------C-----G----TC----T-------AA-A----C--------------------G---A------A--T-T---TT-T-T---------T-------T-------------------------------------------------------------T---TG-------CG--------A--AT-T--------AAT-GC------------A-A---TAA-T-T----A------TT-G-C-T-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----aatatctatgtactgg
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagattt----T---T----T-----------TGGTT--GC------G----TT-----------AA-C-GC----A----------A--A---A-A-----G---------A----------T-T-----G--C-G--A--T---T-A--------A-G-------------C--G--C----AA--T----A----A--T--A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A--------------------G--C-------A-----------A---A--A-G--------TAAT--A-------T-TG-C--G--T---T-TA----A----A--C--------C--A----A--T-------A-------T-T-taaaaaatatctatgtactgg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gggagccccattgaaggcagtttatagacataagttt----T---T----T-----------TA-TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A-------------A---A-A-----G---------A----------T-T-----G--C-A--A--T---T-A--------A-A-------------C----------AA--A----G----A--TT-A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-tcattgcacgcttaagaag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acggaagcccattgaggc----T---T----T-----------TAATT--GT------G----AT--T-------AAA-C-GC----A--------T------------------T-------A----------T-TG----G--C-GA-T--T---T-A--------ATG-------------C--G--C----AA--A----A----A-----A--------T-T-----G-C--GT-T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------AAATTGTTTGGCA---A--A-C--------T--T--T-------T-TG-C--G--T---T-T-----T----G--T---T-TA-A--A----A----------------------AC--G------C--------AAA----C-A--A----A--C----T-------------------------------------TT--G--C-----G----TT----aaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatattttttt---T----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A--------ATG--A---T-A-----T-T------------------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-T-------------C--G--C----GA--TCTTTA----G--C--A--------T-TTCTTTG-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--AAC--------------A-------T-TG-C--G--T---T-TA----A----A--C---G-CA-A--T----T--C-------T-------T-T-GC--T-GT---T--------AAAT-G-C----A----A--T----T-----------A-A--T---------------A----TT--G--C-----G-----T----T-------AA-A----T---ATA-T-A----------A---G------AC-T-T---CT-G-C---------T-------T---------ccaaagta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taa---T----C-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAA---------------------------T-A-----T-T-------A----------T-T-----G--T-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AAT-T----A----A--T--T--------T-T-----T-T--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------GT--A--A-------------T--A-------T-TT-T--A--T---T-TT----T----A--A---A-TG-C--A----A--T-------A-------A-T-Gcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ---T----T-----------A--TT--GC------A----TT--T-------AAA-C-AC----A----------A--A---G-G-----A-T-------A----------T----------C-G--T--T---T-A--------A-T-------------T--G--C----AA--G----C-------C--G--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--T-------A-----------A---A--G-A--------T--C--A-------T-TG-ttattgt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                       cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntga---T----T-----------A--TT--GC------G----TT--T-------AAG-C-GC----A--------ATA--A---T-A-----A-T------------------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-T-------------C--G--C----AA--tgtataaacg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              agata----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAA-C-GC----A-------------A---T-A-----A-T-------C----------T-T--------T-G--T--T---T-A--------A-T-------------T--G--C-----A--A----T----C--T--T--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---tgattgc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acggaagcccattgaggc----T-----------T--TT--GC------G----TT--T-------AAT-C-GC-------------T----A---T-C-----G-T------------------T-T-----G--C-G--T--T---G-A--------A-A-------------C--A--C----AA--taaaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tg-----------T--TT--GC------GT---TT--T-------AAA-T-AC------------------A---T-A-----A-T-------C----------T-T-----G--C-G-----T---T-A--------A-A-------------CGTG--C----AG--A----T----C--T--T--------T-T-----G-C--G--T-T--T---ACC-A-T-----------C------G--C-------A-----------AT--A--A-T--------T--T----------T-TG-C--A--T---T-AA----T-------C---G-TA-A--ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaatttttattattgctttaaacgacgggta--TT--GC------G----TT--T-------CAA-CCGC----A--------AAA--A---T-A-----A-TT------A----------T-C-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--A----ATTT-A--A--A--------C-T-----G-C--T--T-T--T---A---A-A-----------C------G--T-------A-----------A---A--C-A--------T--G--A-------T-TGCC--A--C---T-TA----A----A--A---A-CACA--A----A--T-------A-------T-T-ttcttatttggttttaaa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TT--AC------G----AT--T-------AAA-C-GC----A--------ATGT-A---T-A-----C-T-------T----------T-T-----G--C-A--T--T---T-A--------A---------------C--G--C----AA--T----A----A--T--A--------T-T-----G-C--A--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------ATT---------A---A--T-C--------T-------------T-TG-C--A--T---T-TA----A----T--C---G-CA-A--T----C--T-------T-------T-T-GC--G--T---C--------AAAC-G-C-A--A----G--C----A-----------A-A--T--------------------TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---AC--------------------------A--T-T--------T---------T-------T-------------------------------------------------------------T---TG-------GG--------A--TT-A--------AAC-GCA----ATAACGCA-A---TAC-T-T----A------TT-G-C-G-T-Ttgtgtatatacccatagcaatgagcctttttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                   gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaatagtaaa--TT--GC------G----AT--T-------AAA-C-GC----A----------A--A---TTA-----T-T-------A----------T-T-----G--C-G--C--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--T----A----A--TG-A--------T-T-----G-C--
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agataT--GC------G----TT----------AAA-C-GC----AAAC-----TTA--A---T-A-----G-T-------G-----------------------G--T--TA--T-A--------A-G-------------C--G--C----AA--A----A----A--T--A--------T-------G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C-----------------A-----------A---A--A-G--------T--T--A-------T-TG-C--G--A---T-TA----A----A--C---G-CA-A--A----A--T-------A-------T-T-ATCGG-AT---T--------AAAA-G-C-A--A----A--AA---T-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----GT----T-------TA-A----C---GCA-A-T----------A---T---------T-T---TT-G-T---------T-------T---------AA----------------A-------C--------ACGCATACT--------T---CATGTGC--CG--------T--TT-A--------A-C-GCA----ATA----A-A---TT--C-T----A------TT-GGC-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----T--TT--T--T----T--TTGC--------------G-TTT--AAAC------GC-G--AG--T-A---TAG----TCTT-GCTTTTGAACGCGAACATGCCTT---AA--AC------GCAA-T---A-T---ATT--GT-
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggC------G----TT--T-------ATA-C-AC----A--------ATG--A---T---------C-------T----------T-T-----A--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--C----G----G--C-----------T-T-----G-C--A--A-T--T---A---A-A-----------C------G--gtttagcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                 cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgattattgcatttaaacacaaaggatat----TT--T-------AAA-C-GC----A--------ATA--A---T-A---------------A----------T-T-----G--T-C--T--T---T-A--------A-T-------------T--G--C----AA--A----C----A-----A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--N-N--------N--N--N-------N-NN-N--N--N---N-NN----N----N--N---N-NN-N--N----N--N-------N-------N-N-NN--N-NN---N--------NNNNCG-C-A--A----A--C----------------A-T--C---------------A----TT--G--C-----A----CT----T-------AA-A----T---ACA-A-ATTAT------A---T------A--T-T---GT-G-T---------A-------T---------AAAC--------------T-------C--------A----------------T---
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -------AAG-C-CC----A--------TTG--A---G-G-----C-T-------T----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--T----A----A--T--C--------T-T-------T--G--T-T--T---A---A-T-----------T------G--C-------------------A---A--T-C--------T--T----------T-TG-C--G--T---T-TA----A----A--CGCAA-TA-A--A----A--agcaacgaaccttcttctcaaagtacgcacaccacaaccctatttctacttta
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acgg-------AAA-C-GC----A-------------A---A-A-----G---------A----------T-T-----G----G--CAGT---T-A--------A-AAA-----------C--G--C----AAT-ATC--A----A--T--AG-------T-C-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-G--------A--T--A---------TG-C--G--T-----------T----A--C---A-TA-A--A----aaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acggaagcctattgaggacactacttagagatatttttttcattgcgtttaaacgcaacaattatcgcgtttattcg-T-------A----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-T-------------C--C--C----AA--A----A----A--A--A--------T-------G-T--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--T-T--------T--G--C-------T-TG-C--G--T---T-TG---------A--C---G-CA-A--A----A--G-------A-------T-T-GC--G-AT---T--------AAAT-G-C-A--A----A-------G-----------A-T--T---------------A----AT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----T---GCA-------------------------A--T---------------------------------------A----------------T-------T--------A----------------T---TG-------CG-----------TT-A--------AAT-GCA----A------A-A---GTA-TAC----A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-TCG-T----------A--AT--T--T----A--CTA---------------T-TGT--AAAT------AA-A--AA----------G----T--T--C-----------AA------TT-------GC------AGAAAT---G-T----TT--AT-TT-tatttttgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaagg-T-------A----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--A----C----G-----A--------T-T-----G-C--G--A-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---AG-A-A--------T--T--A---------TG-C--G--C---T-GA---------A--C---G-CA-A--T----C--T---------------T-T-TC--GTTT---T--------AAAC-G-C-A--T----A-------------------A-T--C---------------C----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----A---AT----A----------A---C------C--T-T---GC-G-T---------CAGCAA--T---------AA----------------T-------CT-------A----------------T---GT-------CGT-------T--TT-A--------AAC-GC------------A-A---TAA-T-C----C------TT-G-C-G-T-TA-------AC-ACG-C-----------------T--A----A--TTG------------------TT--AA--------GC-A--A-----A---TGA----T--T-GC-----------GT------TT---AA--Aacgcaatacttattgcgtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     attgc-T-------A----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--A----A----G-----A--------T-T-----G-C--A--A-T--T---A---A-A-----------C-----------------A-----------A---A--G-A--------T--T--A-------T-TG-C--G--T---T-TA----A----A--C---G-CA-A--A----A--aaaaatatctttctataaactggcctcaatgggcttccgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acggaagcccattgaggc-T-------A----------T-T-----G--C-A--T--T---T-A--------A-A-------------A--A--T----AA--A----AT---A--TT-A--------C-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------A--A-------A-----------A---A--A-T--------T--A--A-------T-TG-C--G--T---T-TA----A----A--C---A-CA-AT-A----A--T-------A-------T----------T---T--------AAAC-G-C-A--A----A-------G-----------A-T--T---------------A----TT--G--aaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cat-T-------A----------T-T-----G--C-G--A--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--ATT--A----T--T--A--------T-T-----G-C--G--C-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---T--A-A--------T--G--A-------T-TG-C--t
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aga-T-------A----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-G-------------C--G--C----AA--T----A----A--T--AAT------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-T-----------C------G--C-------A-----------A---
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     agata-T-------A----------T-T-----G--T-G--T--T---T-C--------A-A-------------C--G--C----AA--AC---G----A--T--A----------------G-C--G--A-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-C--------atgattgc
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         t-T-------A----------T-T-----G--CCG--A--T---T-A--------A-A-------------C--G--A----AA--ATC--A----T--T--A--------T-TC----G-C--G--T-T--TTA-A---A-A-----------C------G--C-------A-----------AT--A--A-A--------T--T--T-------T-TG-C--G--T---
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ga-T-------A----------T-T-----G--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atag----------T-T-----G--C-G--T--T---T-C--------A-A-------------CC-G--C----AA--A----A----A--T--AATTA----T-C-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-T--------T--TAAA-------C-TG-C--T--T---T-TA----A----A--C---G-TA-A--AC---A--TG------A-------T-T-GC--C-AC---TTAA-----AAAC-A-C-A--A----A-------T-----------A-T-----------------------TT--G--T-----G----TA----T-------AT-A----C---aaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ----------T-T-----G--C-G--T--T--------------A-A-------------C--G--C----AA--A----A----A--G--A--------T-T-----G-C--G--A-T--T---A---A-G-----------C------G--C-------A-----------AT--A--A-------------T--A-------T-TG-C--G--T---T-TA----A----G--C---A-AA-AGTA----A--T-------A-------T-T-GC--G-TT---T--------AAAC---C-A--A------------T-----------A-T--TTC-------------A----TT--GCAC-----G----CT----T-------AA-ccatagcaatgagcctttttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttgg--C-G--T--T---T-A--------A-A-------------C--G--C----AA--A----A----A--A--C--------T-T-----G-C--GTTT-T--T---A---A-AAC---------C------G--C-----------------------A--A-C--------T--TTGT-------T-TG-CGGA------T-TA----A----A--T---A-TG-A--A----A--T-------AATT----T-T-GC--T--T---T--------AAAT-G-------------------------------A-T--T---------------A----TT--G--A-----G----TT----T-------AA-AAG--C---AT----A----------A---T------A--TCT---GC-G-T---------T-------TAAAGCC---AA----------------T-------C--------T----------------T---TG-------CG--------T--TTAA--------AAC-TC------------A-A---TGA-T-C----T------TT-G-C-G-T-TT-------AA-TCG-C-A---A----C--GT--T-----------TGC--------------G-ATT--AA-C------GC-A--AA----A---TTA----T--T-GC-----------GT------TTAC-AA--AC------GCAAgaag
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggtttttttttttta--C-G--T--T---T-A--------T-A-------------C--A--C----AA--T----G----A--T--C--------T-TT----A-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------AC--G--G-C----------------------T-TG-C--A--A---T-TA----A----A--C-----------G----A--T-------ATCCT---T-T-GT--G-TT---T--------AAAT-G-C-A--A----
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatta--C--T---T-A--------A-G-------------C--GTGC----AATGA----A----A--T--A--------T-T-----G----G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------AT--ATTA-C--------T--T----------T-TG-C---------T-TA----A----A--C---G-CA-AT-A----T--T-------A-------T-T-GC--G-CT---T--------AATC-G-C-A--A----T--C----T-------------T--T--------------------TT--G--C-----G----TTAACGC-------AA-C----C---AAA-A-A----------A---A------C--T-T---AT-G-T---------C-------T---------A
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gggagccccattgaaggcagttta-A-------------C--G--C----AA--A----A----A--TTTA--------T-T-----G-C--G--T-T--TTA-A---A-A-----------C------G--C-------G-----------A---A--aag
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     gatattgccgattaaacgaaaatcatta--G--C----AG--A----A----G--T--C--------T-T-----A-T--A--TAT--T---T---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---T--A-T--------T--A--A-------T-TG-C--A--T---T-TA---------A--C---AGCA-A--A----G--A-------A-------T-T-GC--G-TT---T--------AAAC-G-C-A--A------------T-----------G-T--T---------------T----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-A----------G---A------A--A-T---GC---------------------T---------AA----------------A-------G--------A----------------T---CG-------CG--------A--TT-A--------AAC-GCA----A------A-A---T-A-T-C----A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----A--AA--T--T----A--
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --A----G----A--T--A--------T-T-----G-C--G--A-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---ATTA----------T--T--A-------T-TG-C--G--C---T-TA----A----A--C---G-CA-AT-A----A--TG------A-------T-T-GC--ttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ----A--T--T--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---ACA-----------CT-----G--C-------A-----------A---A--A-T--------T--G--T-------T-TG-C--G--T---T-AA---------A--C---G-CA-A--A----T--T---------------C-T-GC--C-ACAG-T--------AAAG-G-----------A--C----T-----------G-T--T---------------------T--G--C-----G----TT----T-------AA-AAACTC---ACA-A-A--------------G------A--G-C---GTTG-T---------T-------T---------AA----------------CG------C--------AAGACGTTTTTGAGATTT---TG-------CG--------T--TT-A--------A-C-GCA----A------A-AAAATTT-T-T----T------TT-T-T-G-A-TT-------TA-ACG-C-A---A----A--AT--T--T----A--CTGC--------------TATTT--AAAC------GT-AC-AA--C-A---TGA----T--T-GC-----------
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttc--T--A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------A------G--C-------A-----------A---T--A-A--------T--T--A-------T-TG-C--A--T---T-AA----TTCGCA--A---A-AA-A--A----A--A-------A-------T-T--C--G-TT---T--------AGAC-GAT-A--A----A--C----T-------------T-----------------------TT--G--C-----A----AT----T--------A-A----C---GCA-A-ACTTTT-----A---G------A--T-T---AT-T-TG--------T-------C---------AA----------------A-------C--------A------------------------------G--------T--TT-A--------AAC-ACA----AT-----A-A---GAA--------A------TTGG-C-G-T-TT-------AA-ACA-C-A---A----A--A------G----A--TTGC--------------G-TTT--AAAC------GC-A--A
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagattttttta--T--A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---aaaaatatctatgtactgg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atag--A--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------A---C--A-A--------T--T--A-------T-CG-C--G--T---T-TA----T----T--C---G-CA-A--T----A--A-------A-------T-T-GC--G-TT---A--------AAAC-G-C-A--A----A--T----T-----------G-C-----------------------TT--A--C-----G----TT----T-------AA-A----C---ACA-A-A----------A---G------T--T-T---GC-A-A---------T-------T---------AA----------------A-------C--------G----------------T---GA-------TGTTTTTGCTT--TT-AAATGCAATAAC-GCA----A------A-A-----A-G-T----A------TT-G-C-A-T-TT--------A-ACG-C-A---A----A--TA--T--T----A--TTGC--------------G-TTT--AAAC------CT-G--A-----A---CGA----T--T-GC-----------TA------TT---AA--AC------GCAAAA---A-T---ATT--AT-TTCGTTTAAACACAAAA---GTCA---TTGCGTT---TAAAAGCAaaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acggaagcctattgaggacactacttagagatatttttttc--A--------T-T-----G-T--G--A-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------------------------T--T--A-------T-TGGCG-A--T---T-TAA---T----G--C---G-CA-A--A----A--A-------A-------T-T-GC--G-TT---TT-------AAAC-G-C-A--A----A--T----T-----------G-T--TTGGCAA---------ACTTTTT--G--C-----G----TT----TTGTTTAAAA-A----C---GCA-A-AC---------A---A------ACTT-T---GC-G-T---------T-------ataatcttttgcgtttaatcgcaatattttaatatcaattatttttgtgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatattttttttttta--------T-T-----G-C--G--T-T--T---A---A-A-----------C------G--C-------A-----------AT--G--A-T--------A--T--T-------T-TG-C--G--T---T-TA----------------------------------------A-------T-C-GC--G-ATCTTT--------A----G-C-A---------------T-----------T-T--C---------------T----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-A----------A---AC-----A--T-T---GC-G-T---------T-------T---------AAACGCAAT---------T-------C--------T----------------T---TG-------CT--------G--TT-A--------AAT-GC------------A-A---TTA-A-T----A------TT-G-C-G-T-TA-------AATATA-T-A---A----G--AC--T--T-------CTGC--------------T-TCT--ccaaagta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taattt--------T-T-----G-C--G--T-T----------A-A-----------C------G--C-------A-----------A---A--A-A--------G-----A-------T-TG-C--G--A---T-TA----A----G--C---G-CA-AT-A----A--T-------A-------T-T-GC--G-TT---T--------AA---G-C-A--A----A--AG---T-----------A-A--T---------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C----CA-A---------------------------------T-A-T---------T-------T---------CA----------------T-------T--------G--------------------CA-------CG--------C--TT-A--------Atttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttgg------G--C-------A-----------ATTGA--A-C--------T--T--T-------T-T-----A--T---T-TA----C----A------A-TA-G--T----A--A-------A-------T-T-AC--G-AT---T--------AAAC-G-C-A--A----T--G----T-----------A-TACT---------------T----TT--G--C-----A----TT----T--------A-A----C---GCA-ATA----------A---T------A--T-T---GC-A-TTTAAACGCAT-------T---------AA----------------T-------C--------T----------------T---TG-------CA--------T--TT-A--------ATC-GCA----A-------------TC-T-T-----------TT-G-C-G---TC-------AA-ACG-C-AAGCA----A--AT--T-----------TGC--------------G-TTT--AAAC------AC-----A--T-T---TTT----T--T-GG-----------GA------TT---AA--AC------GCAAgaag
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttct-------A-----------A---G--G-C--------T--C--A-------T-TG-CT-A--TGGGTATA----T----A--C---A-CA-A--A-------T-------A-------T-TTGT--G-TT---TTT------AAGT-G-G-C--A----A--T----C-----------A-T--G---------------T----TT--A--C-----G----TT----T-------AA-A----A---GCA-------------------------------------G-T---------T-------T---------AA----------------A-------T--------T----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------AAC-GCG----AT-----A-A---TTA-T-T----T------TT-G-CGG-T-TG-------AA-ACG-C-A---A----taacgcaatacttattgcgtt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --------T--T--A-------T-TG-C--G--T---T-TA----A----A--C---G-CA-A--A----A--G-------A-------T-T-GC--A-AT---T--------AAA----C-A--A----A-------G-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-A----------A---G------tttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acggaagcccattgagg--------T--T--A-------T-TG-C--A--T---T-TA----A----A--C---A-CA-A--AGG--A--T-------A-------T----C--G-TT---T--------AATT-G-C-A--A----G--C---------------------C---------------G----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GTA-A-A----------G---ATC----A--T-T---GT-G-T---------A-------T---------AA----------------aaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntga--------T--T--A-------T-TG-C-----T---T-TA----A----A--C---G-AC-G--G----G--T-------A-------T-T-AC--G-AT---T--------AA-T-G-C-A--A----A--A----------------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----ATGG--T-------AA-A----C---GCA-A-A----------A---G------A--T-C----T-G-------------------------------------------------------------------------------------CA-------CG--------T--TT-A--------A-C-GCA----A------G-A---TTA-TGT----A------T--------T-TA-------AA-ACG-C-A---A----A--TTC-T--T----AT-TTGG--------------T-TTT--AAacg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaattttta--T---T-TA----A----A--C---G-CA-AT-A----A--T-------AA------T-T-GT--C-TT---T--------AATT-G-C-A--A----A--C----------------A--------------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-ANNNNNNNNNNN---N------N--N-N---NN-N-N---------N-------N---------NN----------------N-------N--------N----------------N---NN-------NN--------N--NN-N--------NNC-GCA----A------A------CA-T-C----A------TT-G-C-A-C-TT-------AA-ATA-C-A---A----ATTAT--A--T----A--TTGT--------------G-TAT--AAAC------TC-A--a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -A--G----A--T-------A-------T-T-GC--G-AT---T--------AAAC-G-C-A--A----A--T----T-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----CT----T-------AA-A----C---GCA-ATA----------AT--G------A--T-T---Gtagcaacgaaccttcttctcaaagtacgcacaccacaaccctatttctacttta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ----A--T-------A-------T-T-GCC-G-AT---T--------AAAC-G-A-A--A----A--T----C-----------A-T--T---------------A----TTC-G--C-----G----TT----TTA-----AA-A----C---GCA-A-T----------A---A------A--T-T---c
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 g--T-------A-------T-T-GC--A-TT---T--------AAAA-A-T-A--A----A--A----T-----------A-T--T---------------A----CT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---AAA-A-A----------ATT-A------A--T-T---GC-G-T---------T-------T---------AA----------------A-------CACA-----A----------------T---AA-------TA--------T--TT-A--------AAC-GCA----A------AGA---TTA-T-T----G------Ttttgcgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cat-------A-------T-T-GT--G-AT---T--------AAAC-G-C-----------------------------A-T--T---------------A----TTG-G--C-----GA---TT----T-------AATG----C---GCA-A-A----------A---A------A--T-T---GC-G-T---------T-----------------------------------------------------------------------------------------------TT-A--------AAC-GC-----A------A-A---TTG-T-TTGGCAAACTTTTT-G-C-G-T-TTTGTTTAAAA-ACG-C-A---A----A--
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gagatattttttttc-------T-T-GC--G-TT---T--------CAACCG-C-A--A----AAAT----A-----------A-T--T---------------A----TC--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-A----------A------------------------T---------T-------T---------AA---------------------------------A----------------C---TG-------CT--------T--TT-A--------AAC-GTA----A------A------CA-T-G----A------TT-GCC-A-C-TTAA-----AA-ACA-C-A---A----AT-AT--T--T----gatatgcgttacataaacggat
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -------T-T-GC--G-TT---T--------AAAT---------------------------------A-T--T---------------A----TT--G--T-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-----------------------------------------------T-------T---------AA----------------T-------T-------------------------T---TT-------TG--------T--TT-A--------AAC-GCAGT--A------ATA---TT--T-T----A------TT-------T-TT-------AA-ATG-C-A---AT---A--AT--gtgtatatacccatagcaatgagcctttttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    c-T-GC--G-AT---TT-------AAAT-G-C-A--A----A--A----A-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----agattattgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    accgtacga-AT---T--------TAAC-G-C-A--A------------T-----------A-T--T---------------AA---TT--G--C-----A----TT----T-------AA------C---AGC-A-A----------A---G------A----------------------------------------------------------------------------A----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------AAC-GCA----A-------------TG-T-T----T------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-AAAGA----A--ATG-C--TAAAGA--TCGC--------------G-ATT--AAAC------GCAA--AA--T-A---TCA----T--T-GC-----------GT------TT---AA--AC------GCAAAA---A-T---a
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ta--A----A--T----C-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-G----CGCAATA-A-T----------A---A------T--T-T---GC-G-T---------T-------T---------AA----------------T-------C--------atataagacttctgcttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agatattgc-----------A-T--T---------------T----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-ATG----------A---T------A--T-TTT-GC-G-T---------T-------T---------AA----------------T-------C--------G----------------C---GA-------TC--------T--TT-A------------GCA-----------------TTT-C-T-----------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----A--A---A--C----A--TTGC--------------G-TTT--AAAC------GC-A--AT--T-C---T------T--T-GC-----------TG------TT---AA--AT------GCAATTA--A-T---ATT--GCGTT-AAATA--TATAAGACTTCTGC---TT-CTTT---T---AGTAgc
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ta-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----A----TT----T-------AA-A----A---ATA-A-A----------A---T------A--T-T-----------------------------------------------------------------------A----------------C---TG-------CG--------T--TT-A--------AAC-AAA----A------A-A---TTA--------A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACA-C-A---AT---A--A------T----A----------------------TTT--AAAC------GC-A--AA--G-A---TTA----T--T-Gtcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     c-----------A-T--T---------------A----TT--G--C-----A----TT----T-------AA-A----C---ACA-A-A----------G---G------A--T-A---TC-G-T---------T-------T---------AA----------------TTGCAAGCC--------G----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------AAC-GTA----A------A-G-----A-T-C----A------TT-G-T-G-T-AT-------AA-ACG-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg-T--C---------------A----TT--G--CTATGGG----TA----T-------AT-A----C---ACA-A-A----------T---A------T--T-T---GT-G-T---------T-------TTTAAGTGGCAA----------------T-------C--------A----------------TGTTTA-------CG--------T--TT-A--------AAA-GCAGTTTA------A-A---TT----------------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-G---AT---A--ATTAT--T----T--TTGCG-------------G-TTG--AAAC------GC-A--A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -T--T---------------A----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-A----------A---G------A--T-T---G----------------------C---------AA----------------------------------------------------------------------------TT-A--------AAC-A-A----A------G-A---TTA---------------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----A--Agcctttttctcatagaggaacaccgcaaccctatttgttacta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  acggaagcccattgaggc--T---------------A----TT--G--------G----TT----T-------AA-A----C---GC----A----------A---T------A--T-T---AC-T-T---------T-------T---------------------------------------------------------------------------G--------C--TT-A--------AAC-GCA----A-------------TA-T-T----A------TT-G-C-G-C-TT-------AA-TCG-C-A---A----T--CT--T--T-------TTGC--------------G-TT----AAC------GC-A--Aaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttgg--T---------------A----TT--G--C-----G----AT----T-------AA-A----C---GCA-A-A---------------------------------------------T-------T---------A-----------------T-------T--------A----------------T---TG-------CG--------C--TT-A--------AAC-GCA----AT-----A-A---TGA-T-T----tttcattgcacgcttaagaag
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    aga---------------A----TT--G--C----------TT----T-------AA-A----C---GCA-A-T----------C----------A--T-T----T-G-C---------T-------T---------AA----------------C-------A--------A----------------T---TAG------CG--------T--GT-T--------AAC-GCA----A------G-G-----A-T-T----A------TT-G-C-G-T-TTA------AA-ACGAC-A---T----A--GA--T--T----A--TTGCTGACGCAAGGTTATT-TTT--AAAC------GC-A--AG--G-A---TTA-------T-GC-----------GT------TT---AA--A-------ACGAAA---A-G---ATT--Ggc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----TT--G--C-----G----TT----A-------AC-G----C---A-A-A-A----------A---G------A--T-T---GC-G-A---------T-------T---------AA----------------G-------CGCAATAATA----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------A---GCA----A------A-A---GTA-A-T----A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-AC--C-A---A----T--AT--T--TC---A--TTGC--------------cgttcagcgcataattctttgcgtttaatcgcaatcgtttgcgtttaaacgcaataaaaaatatctttctataaactggcctcaatgggcttccgt
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttgg----TT--G--C-----G----TT----T-------AA-A----C---GCA-A-------------------------------------------------------T---------AA----------------T-------C--------T----------------T------------TG--------T--TT-A--------ATT-GCA----A-------------TC-T-T-----------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----acgcttaagaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acggaagcccattgaggctt----TT----T-------AA-A----C---GCA-ATA----------AT--A------A--T-T---GT-C-T---------T-------T---------AA----------------T-------TGCAAACA-A----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------AAC-GCA----A------A-N---NNN-N-N----N------NN-N-N-N-N-NN-------NN-NNN-N-N---N----N--NN--N--N----N--NNNN--------------N-NNN-----C------GC-A--AA--C-A---TCA----T--T-GC-----------AC------TT---AA--AT------ACAAATTATA-T---ATT--GT-GT-ATAAACTCATAGCA---ACGAACCTT-CTTC---TCAAAGTACGCACACCACAACCCTATTTC-TACTtaaaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ---ATAGA-A----------A---G------A--T-T--------T---------T-------T---------------------------T-------T--------A----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------AAC-GCA----A-------------TC-T-T-----------TT-G-T-G-T-TT-------AA-ACG-C-C---A----A--TTTCT--T----A--TTGT--------------G-TTT--AAACTGTTTGAC-A--AA--T-AATCTAAAAGTT--T-GC------------G------TT---AATTGC------AAAAGT---T-T---ATC--GT-CT-Atta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tacggaggcccattgaggctagttt-T---------T-------T---------AA----------------T-------T--------G----------------T-------------G--------A--TT-A--------AAC-GCA-----------------TTA-T-T----G---------G-C-GAT-TT-------AATGCG-C-A---A----A--AA----------A--TTGCG-------------T-TTT--AAAC------GC-A--AA--T-----TGT----T--TGGC-----------AA------aacgaattttttttttgcgaattaatgcaataattattgcttttaaacgcaataaaaaatatctatgtactgg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatatttttttt-------T---------AA----------------T-------C--------T----------------T---TG-------CG--------T--TT-A--------AA-----------------------TA-T-T----A------TT-G-T-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---ATT--A--AT--T--T----T--TTG-----------------TTT--AAAC------GC-AGTAA--T-A---Tactttttgcgttttgtttaaaaacgcaaacaaactttgcgttccaaagta
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cattattgcatttaaaaataaa---------AA----------------T-------C--------A----------------T---TATTG----CG--------T--TT-A--------AGC-GCA----AT-----A-A---TAA-T-T------------T-G-C-G-T-TT-------AA-TCG-C-A---A----T--AT--C--T----ttgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              A----------------T-------T--------A----------------T---TG-------CA--------T--TT-A--------AAA-ATA----A------A-A---T-A-T-T----A------CT-G-C-G-T-TT-------AA-ACA-A-A---A----A--AT--T--A----A--TTGC--------------G-TTT--AAAC------AC-AATAA--T-A---T--------------------------------TT---AA--AC------GCAAAG---ATT---ATT--GT-gc
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       c--------A----------------T---TG-------CG--------A--TT-A--------AAC-GCA----A------A-----TTA-T-T----A------TT-G-C-G-C-TT-------AA-ACG-C-A---AT---A--AT--
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agat--------A----------------T---C--------CG--------T--TT-ATGT-----AAC-GCA------------------TA-TCT----T------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-G---A----CT-AT--TGAT----A--TTGCGT------------T-TTT--AACT------GC-C--AA--T-gattgc
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataaaaacgcaaaag-------CG--------T--TT-C--------AACCGCA----A------A-A---ATAAT-T----A------TC-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----A--AT--T--T----AAACTGC--------------T-TTT--AAAC------GT-A--AA--C-A---TGA----T--T-GC-----------CA------CTTAAAA--AC------ACAAAT---A-T----TT--GT-GT-ATATACCCATAGCA---ATGAGCCTT-TTTC---TCATAG-AGGAACACCGCAACCCTATTTGTTACT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttg-------CG--------A--TT-A--------AAC-G-A----A------A-A---TCA-T-T----A------TTCG-C-G-T-TTTA-----AA-ACG-C-AAT-A----A--AT--T--T----a
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gatattgc--------AAC-GCA----A------A-A-----A-G------A------TT-G-C-G-A-TT-------AA-GCG-C-A---AT---A--AT----------A--TTGC--------------G-TTT--AAGC------AA-A--AG--T-A---ATA----T--T-GC-----------GT------TT---AA--AC-------C-AAT---A-TTTCATT--Gttgcgt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttggttgcgttAC-GCA----A------A-A---AT--T-T----A------TT-G-C-G-T-TTTA-----AA-ACG-C-G---A----A---------T----A--ATGA--------------T-TTT--cacgcttaagaag
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gatattgccgattaaacg------A-A---TCA-T-T----A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-GCG-C-A---ATAATA--AT--T-----------TGC--------------G-TTT--AATC------GC----AA--T-A---T
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ag-A---TT--T-T----A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----gc
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        atag---TTT-T-T----A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----T--CT--T--T--------TGT--------------G-TTT--AAAC------GC-C--AATTT-C---TTA----T--T-GT-----------GT------TT---AA--ACTGTTTGACAAAT---A-aaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagatt---TTT-T-T----A------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C-A---A----A--A------G----A--TTGC--------------A-ATT--AA--------AC-A--AA--G-A---TTA----T--T-GC-----------GT------TT---AA--AC------GCAAAatctaaaagtttgcgttaattgcaaaagtttatcgtctaaacgaattttttttttgcgaattaatgcaataattattgcttttaaacgcaataaaaaatatctatgtactgg
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acggaagcccattgaggctA-T-T----A------TT-G-C-A-T-TT-------AA-ACA-C-A---A----A--GG--A--T----A--TCG-----------------TTT--AATT------GC-A--AG--C-----CG-----T--T-GC-----------GT------TT---AA--AC------GTAAAG---A-TC--ATT--GT-GT-ATAAACaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntg-T----A------TT-G-C-G-A-TT-------AA-ACG-C-A---A----A--AGA-T--T----A--TTGC--------------T-TTT--AAAC------GC-A--------A---TGACTT-T--T-GT-----------GT------TT---AA--AC------G-AAATA--A-T---ATT---T-TT-GCGT-TTAATAGCA---ATCG---TT-Cg
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acggaagcctattgaggacactacttagagatatttttttcattgcgtttaaacgcaacaattatcgcgtttattcgcaataaattgcgttaaaacgcaaattgcttacgtttaaacacaaaagtttgcaattaaacgtgatgtttttgcttttaaatgcaataacgcaaaaagtattgcatttaacgcaaatattattgcgtttaaacct-T----A------TT-G-C-G-A-TT-------AA-ACG-C-A---A----A--TTA-T--T----A--TTGC--------------G-CTT--AAAC------GC-A--AT--A-A---TGA----T--T-GC-----------ttttaatatcaattatttttgtgt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aga------TT-G-C-G-T-TT-------AA-ACG-C----------A--AT--T--G----T--TTGC--------------A-ATT--AAAG------AC-A--AT--T-A---TTA----T--T-GC-----------GT------TT---AA--A
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -C-G-T-TT-------AT-ACA-C-A---AT---G--AT--C--T-------TTAC--------------G-TTT--AAAC------GC-A--A---------CGGC---T--T-GC-----------AA------TT---AA--AC------annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcaaacatcattgcacttaaatacaaattatatattgtgtataaactcatagcaacgaaccttcttctcaaagtacgcacaccacaaccctatttctacttta
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gatattgccgattaaacgaaT--T--T----A--TTGC--------------G-TTT--AAAC------GC-A--AA----A----GA----T--T-GC-----------AA------TT---AA--AC------AAAGAT-----T---ATTGCGT-TT-A
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               acggaagcccattgaggcttttgcgttTGC--------------G-TTT--AAAC------GC-A--AT--T-G---T------T--T-GC-----------AA------TT---AA--AG------ACAATT---ATT---ATTGCGT-TT-Aaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tt--AA--C-A---TGA----T--T-GC-----------AC------TT---AA--AA------ACAAAT---A-T---AGT--GT-GT-ATATTCTCATAGCA---ACGA---TC-CTTTTTCTCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACTaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgcaaacatcattgcacttaaatacaaattatatattgtgtataaactcatagcaacgaaccttcttctcaaagtacgcacaccacaaccctatttctacttta
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-ATACATTCATAGCA---GCGAGCTTT-CTTT---TCAGAGTAata
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|28 ): AATAAAAAATATCTCTTTATGTACTGGTCTCAATGGGCTTCCGTAT
Unaligned ( gi|30 ): AAAATATCTTTCTTTATACTGGCCTCAATGGGCTTCCATA
Unaligned ( gi|31 ): TACGGAAGCCCATTGAGGCCAGTACATAGAGAGATCTTT
Unaligned ( gi|32 ): AAAAATATCTTTCTATACAAAGGCCTCAATGGGCTTCCG
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consensus                     :                                       GCAAAAGTTAATGCG-TTTAAACGCAAA-G-A-TT-----ATTGCGTTTAAACGCAAAAAT---AT--T---GCGTTTAAACGCAA-CG---TT-TT-TTGCG-TTT--AAACGC--AN--A--TANT--AT-TGC-GTT-TAA-AC------GC--AA-A---A-A--T---A-----TT---G-CGT-TTAAACGCAA-AA-NTTATTGCG-TT--TAAACGCAA--A-----A------T-A----T-TG--C--GNTT--------AA-A----CGCAA-A--T-A-TT--A----TT--G--CG-TT-T-AA-A--CGCAA-A--A-G----A--T-TG-C------GT----TT---------A-A-----------TC-------AT-TGC-GTTTAAAC-G--CAA--AA---TTA-T-TA-TTG-CGTTTA--A-ACGCA---A-AA-TTTA--TTGC-GTT---T-------AAACGCA--AAC-ATGA--TTG-C-GTTTAAA--CGC-------A--AAT---ATATTGTNTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCAA----AGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
Reference ( family-1494 )     :                                       GCAAAA---AATGCG-TTTAAACGCAAA-G-A-TT-----ATTGCGTTTAAACGCAANAG----AT--T---GCGTTTAAACGCAA-CG---TT-TT-TTGCG-TTT--AAACGC--AT--A--TANT--AT-TGC-GTT-TAA-AC------GC--AA-A---A-A--T---A-----TT---G-CGT-TTAAACGCAA-AA-NTTATTGCG-TT--TAAACGCAA--A-----A------T-A----T-TG--C--GNTT--------AA-A----CGCAA-A--T-A-TT--A----TT--G--CG-TT-T-AA-A--CGCAA-A--A-G----A--T-TG-C------GT----TT---------A-A-----------TC-------AT-TGC-GTTTAAAC-G--CAA--AA---TTA-T-TA-TTG-CGTTTA--A-ACGCA---A-AA-TTTA--TTGC-GTT---T-------AAACGCA--AAT-ATGA--TTG-C-GNTTAAA--CGC-------A--AAT---ATATTGTTTATATACTCATAGCAACGA--CTTCTTTTCAA----AGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
gi|1                          :                                       GTAAAA---AATGCG-TTTAAACACAAA-G-A-TT-----ATTACCTTTAAACGCAACAG----AT--T---GCTTTTAAATGCAA-CG---TT-TT-TTGCG-TTT--AAACGC--ATTGA--TAGT--AT-TGC-GCT-TAA-AC------GC--AA-A---A-A--T---A-----TT---G-CGT-TTAAACGCAA-AA-CTTATTGCA-TT--TATACATAA--A-----A------T-A----T-TG--C--GATT--------AA-A----TGCAA-AC-T-A-TT--A----TT--G--CG-TT-T-AA-A--CATAA-A--A-G----A--T-TG-T------GT----TT---------A-A-----------TC-------AT-CAC-GCTTAAAC-G--CAA--AA---TTA-T-TA-TTG-CGTTTA--A-ACGCA---A-AA-TTTA--CTGC-TTT---T-------AAGCGCA--AAT-ATGA--TTG-C-AATTAAA--CAC-------A--AAT---ATATTGTTTATATACTCATAACAGTGA---TTCTTTTCAA----AGTAGGAACACCACAACTCTCTTTG-TACT
gi|10                         :                                                                AAA-G-A-TTTTTTTATTGCGTTTAAACGCAA
gi|10                         :                                                                      tacggaggcccattgaggctagtttatag----AT--T---GCGTTTAAACGCAA------TC-TT-TTGTG-TTT--AAACGCCAAT--T--TCTT--AT-TGT-GTT-TAA-ACTGTTTGAC--AA-AT--A-ATCT---AAAAGTTT---G-CG--TTAATTGCAA-AAGTTTAT--CG-TC--TAAACG-----A-----ATTTTTTT-T----T-TG--C--GAAT--------TA-A----TGCAA-T--A-A-TT--A----TT--G--CT-TT-T-AA-A--CGCAA-tcttttgtgtttaaacgccaatttcttattgtgtttaaactgtttgacaaataatctaaaagtttgcgttaattgcaaaagtttatcgtctaaacgaattttttttttgcgaattaatgcaataattattgcttttaaacgcaataaaaaatatctatgtactgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagattttttt-TT-T-AA-A--CGCAATA--ATA----A--T-TG-T------CT----TT---------A-A-----------TTGCAAACAAT-TGC-GTTTAAAC-G--CAA--AN---NNN-N-NN-NNN-NNNNNN--N-NNNNN---N-NN-NNNN--NNNN-NNN---N----------CGCA--AAC-ATCA--TTG-C-ACTTAAA--TAC-------A--AATTATATATTGTGTATAAACTCATAGCAACGAACCTTCTTCTCAA----AGTACGCACACCACAACCCTATTTC-TACTtaaaaaatatctatgtactgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                          ------GC--AG-A---A-G--T---C-----TT---A-TATATTTAACGCAA-TA-TTAATTGCA-TT--TAACAGCAA--A-----G------A-A----T-TG--C--GTTT--------AA-A----CGC-A-A--T-G-TT--T----TT--G--CG-TT-T-AA-A--CGCAA-A--G-A----A--A-TG-C-------------T---------A-A-----------AG-------AT-CGC-GATTAAAC-G--CAA--AA----TA-T-CA-TTG-CGTTTA--A-ACGCA---A-AA-ATTA--tta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                          -A----T-TG--T--GATT--------AA-A----CGCA---------TT--A----TT--GG-CGATT-T-AATG--CGCAA-A--A-A----A--T-TG-C------GT----------------------------------------------TTTAAAC-G--C-A--AA---TTG-T----TTG-------------GCA---A-AC-TTT---TTGC-GTT---TTGTTTAAAAACGCA--AAC-A-AACTTTG-C-GTTttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatatttttttttttaT-TGC-GTTTCAACCG--CAA--AA---ATAAT-TA-TCG-CGTTTA--A-ACGCA---A-AA-TTTAAACTGC-TTT---T-------AAACGTA--AAC-ATGA--TTG-CCACTTAAAAACAC-------A--AAT---AT-TTGTGTATATACCCATAGCAATGAGCCTTTTTCTCAT----AG-AGGAACACCGCAACCCTATTTGTTACTccaaagta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -TT-T-AA-A--ACCAA-ATAA-G----AATT-TG-C------GT----TTTAAATACATA-A-----------TC--------T-TGC-GTT-AAAC-GTGCAG--A-----TC-T-T--TTG-CGTTTACCA-TCGCA---ATAA-TTT---TTGC-A-T---T-------AATCGT---AAT-AC----CCGTC-GTTTAAA---GC-------AATAATAA-AAATTTTTCATAAACa
gi|15                         :                                                                                                                                            ctacggaagcccattgagccg--TATT--AT-TGC--TT-TAA-AC------G---AC-G---G-G--T---A-----TT---A-CGA-TTAA-TGCAA-AA-ATTATTGCG-ATGGTAAACGCAA--A-----A------G-A----TCTGCAC--GTTT---------A-A----CGCAA-G----A-TT--A-----T--G--TA-TT-TAAA-A--CGCAA-A--
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                     ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaatttt-A----T-TG--C--GATTGGTATAAAAA-A----CGCAG-A--T-AATT--AAAT-CTAGG--CG-ATAT-AA-AAACGCAA-A--A-G----A--T-TGGC------AG----TT---------A-A-------------------------------AAAC-G--CAA--TA---TCA-A-TAGTCG-CGTTTA--A-ACGCA---A-AA-GATA---TGC-GTTACAT-------AAACGttcttatttggttttaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                   gagatattttttttcAAACGCAA--A-----A------G-A----T-TGG-C--AGTT--------AA-AAA--CGCAA----T-A-TC--AATAGTC--G--CG-TT-T-AA-A--CGCAA-A--A-G----A--TATG-C------GT----Tgat
gi|17                         :                                                                                                           gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataaT-TGC-GTT---A-AC------GC--AA-A---A-A--G---A-----TT---G-CGA-TTAAGCGCAA-TA-AT-ATTGCG-TT--TAAGCAAAAGTA-----A------T-A----T-TG--C--GTTT--------AA-A----C-C-A-A--T-A-TTTCA----TT--GCACG-CT-T-AA-acataaacggat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                         gggagccccattgaaggcagtttatagacataagtttttttggTTATTGCG-TT--TAAACGCAA--A-----A------G-A----T-TG--C--AATT--------AA-A------CAA-A--G-A-TT--A----TT--G--CG-TT-T-AA-A--CGCAA-A--A-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acggaagcccattgagg-TTG-CGTTTA--A-ACGCA---ATAA-TCT---TTG---TT---T-------AATTGCA--ATC-TT----TTG-C-GTTTAAA--CGCAATAAAAA--AAT---ATCTT-TCTATAAACTGACCTCAATGAG-CTTCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acggaagcccattgaggctt--AAC-ATGA--TTG-C-ACTTAAA--AAC-------A--AAT---ATAGTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTCTCAA----AGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACTc
gi|2                          :                                                                                        AACCGCAAAAGTG--GT--TTATGCGTTTAAAACCAAATGAAATA-TG-GTGCG-TT---AAACGC--AA--ACTTAAT--AG-TG--GTTATAA-GC------GC--AA-A---A-A--T---A-----T----G-CGT-TTAAAC--AA-AA-GTTATTGCG-AT--TAAACGCAA--A-----A------T-A----T-TA--TCGGATT--------AA-A----AGCAA-AAAT-A-TT--A----TT--G--CG-GT-T-TA-A--CGCAA-T--A-T-------T-TT-T------GT----TT---------A-AACACGCATACTTC-------ATGTGCCGTTTAA-C-G--CAATAAA---TT--C-TA-TTGGCGTTTA--A-ACGCA---A-TT-TTTT--TTGC-GTT---T-------AAACGCG--AGT-ATAGTCTTG-C-TTTTGAA--CGC-------G--AAC---ATata
gi|2                          :                                       gCAAAAGTTATTGCG-ATTAAACGCAAA-ATA-TT-----ATCG-GATTAAAAGCAAAAATATTAT--T---GCGGTTTAACGCAA-TA---TT-TT-T---G-TTT--AAACAC--GC--A--TACTTCATGTGCCGTT-TAA--C------GC--AATA---A-A--TTCTA-----TT---GGCGT-TTAAACGCAA-TT-TTTTTTGCG-TT--TAAACGCGA--GT----A------T-AGTC-T-TG--C--TTTT--------GA-A----CGCGA-A--C-A-----------T--G--C--CT-T-AA-A--CGCAA-T--A-T----A--T-TG-T------GT----TTAGCAAA---A-A-----------TTG------AT-TG--GTTTAAAT-G--CAgccttaaacgcaatatattgtgtttagcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         :                                                                  gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaaATT--AT-TGC-ATT-TAA-AA------AT--AA-A---ATA--TT--A-----CT---G-CGT-TTAAACAAAA-AA-TTAATTGCG-TT--TAAACACAAT-A-----A------T-A----T----------TT--------AA-A----CGCAA-A--G-A-TT--A----TT--G--
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              c-TTTA--TTGC-GTT---T-------AAACGCA--ACT-ATt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -ACGCA---A-AAATTTA--TTGC-GTT---TTA-----AAACGCG--AATAATGAT-TTT-C-GTTTAAT--CGG-------C--AAT---ATata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                        gA--G-----A------T-A----T-TG--C--GATT--------AA-A----CGCAA-A--TTA-TT--A----TT--G--CG-CT-T-AA-A--CGCAATA--ATG----A--T-TG-C------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTTTCAG----AGTACG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttctgTA--TTGT-GTT---T-------CAACGCA--AAC---GA--TAG-C-GATTAAA--CGC-------A--AAttcacta
gi|3                          :                                               tgtTGCG-TTTAAACGCAAC-A-A-TT-----ATCGCGTTTATTCGCAATAA----AT--T---GCGTTAAAACGCAA--A---TT-GC-TTACG-TTT--AAACAC--AA--A---AGT---T-TGC-AAT-TAA-AC------GT--GA-T---G-T--T---T-----TT---G-CTT-TTAAATGCAA------------------TAA-CGCAA--A-----AAG----T-A----T-TG--C--ATTT--------AA------CGCAA-A--T-A-TT--A----TT--G--CG-TT-T-AA-A--CCTGA-A--C-G----A--T-TG-C-------------T---------A-------------------------------TTAAAC-G--CAA--AA---ATA-T-TA-TTT-CGTTTA--A-ACACA---A-AA-GTCA--TTGC-GTT---T-------AAAAGCAATAAT-CTT---TTG-C-GTTTAAT--CGC-------A--------ATATT-TTAATAT
gi|34                         :      acggaagcctattgaggacactacttagagatatttttttcatATGCGATTTAAATGCAAA-A-AATT-----ATTGCGcaattatttttgtgt
gi|4                          :                                                               accgtacg-TT-----ATTGCGTTTAAACGCAATAATC--AT--C---GCAATTAAACGCAAACA---TCATT-CGGTT-TTT--AAAAGC--GC--A--AAAG--AT-TGT-ATT-TAA-AC------GTTTAA-ATGCA-A--T---C-----TTTTTG-CGC-TTAATCGTAA-AA-ATATTTGCG-TT--TAAATGCAA--A-----A------C-A----T-TG--C--GTTT--------AA-A----CACAA----T-G-TT--T----TT--G--CG-TT-T-AA-C--CGCAATG--A-T----A--T-TA-T------ATATTATT---------G-A-----------TT-------AT-TGC-GCTTAAAC-G--CAA--AA---T------A-TTG-CTATTA--A-ACGCA---A-AA-ATTA--TTGC-GTT---T-------AAACGCAATAAT-ATT---TTG-C-GTTTAAa
gi|5                          :                                   tgaaacccattgaggccagttgatagacaatatttt-TT-----ATTGCGTTTAATCCCAAAAA----AA--T---GTGTTTAAACGCAA-AT---TT-GC-TTGCG-TTT---GACGC--A---A---AAG--AT-TGC-GAT-TAA-AT------GC--AA-A---G-AT-T---A-----AT---G-CGT-TTAAATGCAA-TA--TTATTGCG--T--TAAATGCAA--AAGTATA------C-A----T-TG--C--GTTT--------AA-T----CGTAATT--T-A-CT--A----TT--G--------T-AA-A--TA-AA-A--A-GTTCAA--T-TG-CAGAAATGT----TT---------ATT-----------TC-------CT-TTC-GTTTtc
gi|5                          :                                                                                                                           gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgT--AT-TGC-GTT-TAA-TC------CC--AA-A---A-A--A---A-----T----G-TGT-TTAAACGCAA-AT-TTGCTTGCG-TT--TGA-CGCAA--A-----A------G-A----T-TG--C--GATT--------AA-A----TGCAA-A--G-A-TT--A----AT--G--CG-TT-T-AA-A--TGCA------------A--T------------------------------A-----------TT-------AT-TGC-G-TTAAAT-G--CAA--AA---GTA-TACA-TTG-CGTTTA--A-TCGT------AA-TTTA--CTcgcaatacttattgcgtt
gi|6                          :                                     gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaat---TT-TTATTGCG-TTTGTAAACGC--A---A--TAAT--TT-TGC-GTT--AA-TC------GC--AA-A--------C---G-----TT---G-CGA-TTAAACGCAA-AG-ATCATTGAGTTT--TAAACGCAA--A-----G--------A----T-TG--G--CTTT--------AA-A----CGCAG-A--T-A-TT--A-----T--G--CT-TT-T-AA-A--CTCAA---------------------------------T---------A-A-----------TC-------A-------TTTAAA--G--CAA--AA---TTA-T-T--TCA-TATTTA--ATCCGCAAACA-AA----G--TTGCGGTT---TTAA----AAACGCA--AGT--TTT--TTG-C-GTTTAAA--CGacgcaatacttattgcgtt
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gi|8                          : cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatT-TGC-GTT-TAACACT-----GC--AA-A---A-T--T---G-----TTT--G-CGT-T-AAACGCAA-A---TT-CTGC------CACA-GTAA--A-----G------G-ACTGTT-TG--C--GTTT--------AA-AAACTCACAA-A--G-A-GC--G----TT--G-----TT-T-AA----CGCAA-G--A--------------C------GT----TTTTGA-----G-A-----------TT--------T-TGC-GTTTAA-C-G--CAA--AAAAATTT-T-TT-TTT-TGATTT--A-ACGCA---A-AA-TTTA--CTGCTATT---T-------AAACGTAC-AAC-ATGA--TTG-C-
gi|9                          :   tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttcattTGCG-TTTAAACGCAAACG----------ATTGCGATTAAACGCAAAGA----ATTAT---GCG-CTGAACGCAA------TC-TT-TT-CGTTTT--AAACGC--AT--A---ATC--CT-TGC-GTT-TAA-A-----------AA-T---A-A--C---C-----TT---G-CG--TCA---GCAATAA-TCTATGTCGTTT--TAAACGCAAT-A-----A------TCC----T-TG--C--G-TT--------AACA----CGC------T-A-----A----TT--G------T-T-AA-----GCAA-A--T-G----A--T-TG-C------GT----TT---------A-A-----------
gi|9                          :                                                                                                                          attgct---TT-TTATTGCG-TTT--AAACGC--Aataaaaaatatctttctataaactggcctcaatgggcttccgt
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|31 ): TACGGAAGCCCATTGAGGCCAGTACATAGAGAGATCTTT
Unaligned ( gi|32 ): AAAAATATCTTTCTATACAAAGGCCTCAATGGGCTTCCG
Unaligned ( gi|33 ): AAATATCTTTCTATAAACTGGCCTCAATGGGCTTCTGTA
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Reference ( family-1494 )     :                                  GCAAAAGTTAATGCG-TTTAAACGCAAAG-A-TTATTGC--------GTTT-AAACG-C------A-AAA-A---T-A---T-TGCGTTTAAACGC--AA-CG---TTTT-TT-----GCGTTT--AAACGCAN--A--T------ANT--AT-T------G-C-GTT-TAAACGCAA--AA-A---T-----------------ATT-G-CGT-TTAA-AC-GCAAAANT--TATTGCG-TT--TAAA----CGCAA-A-------A--T---A------------T-TG--C--GNTT--------AAA----CGCAA-A--TA-TTA----TT--G-CG-TT-T-AA-A--CGC-AA-AA-G----AT-TG-C------GTTT------A-A-----------TC-------AT-TGC-GTTTAAA-C-GC---AA--AATTA-T-TA-TT-G-CG--TTT--A--A-A---CGCA---A-AATTTA--TTGC-GTT---T-------AAACGCA-A-ACATGA----TTGC-GTTTAAA--CGC-------A--A---AT--ATATTGTNTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
gi|1                          :                                  GTAAAA---AATGCG-TTTAAACACAAAG-A-TTATTAC--------CTTT-AAACG-C------A-ACA-G-----A---T-TGCTTTTAAATGC--AA-CG---TTTT-TT-----GCGTTT--AAACGCATTGA--T------AGT--AT-T------G-C-GCT-TAAACGCAA--AA-A---T-----------------ATT-G-CGT-TTAA-AC-GCAAAACT--TATTGCA-TT--TATA----CATAA-A-------A--T---A------------T-TG--C--GATT--------AAA----TGCAA-AC-TA-TTA----TT--G-CG-TT-T-AA-A--CAT-AA-AA-G----AT-TG-T------GTTT------A-A-----------TC-------AT-CAC-GCTTAAA-C-GC---AA--AATTA-T-TA-TT-G-CG--TTT--A--A-A---CGCA---A-AATTTA--CTGC-TTT---T-------AAGCGCA-A-ATATGA----TTGC-AATTAAA--CAC-------A--A---AT--ATATTGTTTATATACTCATAACAGTGA---TTCTTT----TCAAAGTAGGAACACCACAACTCTCTTTG-TACT
gi|10                         :                                         TTATTGCG-TTTAAAAGCAATA-A-TTATTGC--------ATTA-ATTCG-C------A-AAA-A---A-AAAAT-T-CGTTTAGACGATAAA-C------TT-TT-----GCAATT--AA-CGCAA--A--CTTTTAGATT--AT-TTGTCAAA-CAGTT-TAAACACAATAAG-A---A-----------------ATT-GGCGT-TTAA-AC-ACAAAAG----ATTGCG-TT--TAAA----CGCAA-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagattttttta-TT-T-AA-A--CGC-AATAATA----AT-TG-T------CTTT------A-A-----------TTGCAAACAAT-TGC-GTTTAAA-C-GC---AA--A---N-N-NN-NN-N-NN--NNN--N--N-N---NNNN---N-NNNNNN--NNNN-NNN---N-------NNNCGCA-A-ACATCA----TTGC-ACTTAAA--TAC-------A--AATTAT--ATATTGTGTATAAACTCATAGCAACGAACCTTCTTC----TCAAAGTACGCACACCACAACCCTATTTC-TACTaaaatatctatgtactgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                GCAG--AA-G---T-----------------CTT-A-TATATTTA-AC-GCAATATT--AATTGCA-TT--TAAC----AGCAA-A-------G--A---A------------T-TG--C--GTTT--------AAA----CGC-A-A--TG-TTT----TT--G-CG-TT-T-AA-A--CGC-AA-AG-A----AA-TG-C---------T------A-A-----------AG-------AT-CGC-GATTAAA-C-GC---AA--AA-TA-T-CA-TT-G-CG--TTT--A--A-A---CGCA---A-AAATTA--tta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ---A------------T-TG--T--GATT--------AAA----CGCA--------TTA----TT--GGCGATT-T-AATG--CGC-AA-AA-A----AT-TG-C------GT---------------------------------------TTTAAA-C-GC----A--AATTG-T----TT-G--------------------GCA---A-ACTTT---TTGC-GTT---TTGTTTAAAAACGCA-A-ACA-AACT--TTGC-GTTttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT--------AAA----ACCAA-A--TA-AGAAT--TT--G-CG-TT-TTAA-A--TAC-AT-AA-T----CT-TG-C------GTTA------A-A-------------------------C-GT--------GC---AG--A--TC-T-T--TT-G-CG--TTT--ACCA-T---CGCA---ATAATTT---TTGC-A-T---T-------AATCGTA-ATACCCG-----T--C-GTTTAAA---GC-------AATA---ATAAAAATTTTTCATAAACa
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaatttt---A------------T-TG--C--GATTGGTATAAAAAA----CGCAG-A--TAATTAAAT-CTAGG-CG-ATAT-AA-AAACGC-AA-AA-G----AT-TGGC------AGTT------A-A-------------------------------AAA-C-GC---AA--TATCA-A-TAGTC-G-CG--TTT--A--A-A---CGCA---A-AAGATA---TGC-GTTACAT-------AAACGttcttatttggttttaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         gagatattttttttcAAA----CGCAA-A-------A--G---A------------T-TGG-C--AGTT--------AAAAA--CGCAA----TA-TCAATAGTC--G-CG-TT-T-AA-A--CGC-AA-AA-G----ATATG-C------GTTgat
gi|17                         :                                                            gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataaTAGACAT--AA--G---TTTT-TTTGGTTGCGTT----AACGCAA--A---------AAG--AT-T------G-C-GAT-TAAGCGCAA--TA-A---T-----------------ATT-G-CGT-TTAA----GCAAAAGTAATATTGCG-TT--TAAA----C-CAA-T-------A--TTTCA------------T-TGCAC--GCTT--------AAacataaacggat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                gggagccccattgaaggcagtttaT--TATTGCG-TT--TAAA----CGCAA-A-------A--G---A------------T-TG--C--AATT--------AAA------CAA-A--GA-TTA----TT--G-CG-TT-T-AA-A--CGC-AA-AA-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acggaagcccattgagg-TT-G-CG--TTT--A--A-A---CGCA---ATAATCT---TTG---TT---T-------AATTGCA-A-TCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAA--A---AT--ATCTT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acggaagcccattgaggctt-A-ACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------A--A---AT--ATAGTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                                                                                     -AACCG-C------A-AAA-G---T-GGTTTATGCGTTTAAAACC--AAATGAAATATG-GT-----GCGTT---AAACGCAA--ACTT------AAT--AG-T------G---GTTATAAGCGCAA--AA-A---T-----------------AT--G-CGT-TTAA-AC---AAAAGT--TATTGCG-AT--TAAA----CGCAA-A-------A--T---A------------T-TA--TCGGATT--------AAA----AGCAA-AAATA-TTA----TT--G-CG-GT-T-TA-A--CGC-AA-TA-T-----T-TT-T------GTTT------A-AACACGCATACTTC-------ATGTGCCGTTTAA--C-GC---AATAAATT--C-TA-TT-GGCG--TTT--A--A-A---CGCA---A-TTTTTT--TTGC-GTT---T-------AAACGCG-A-GTATAGTC--TTGC-TTTTGAA--CGC-------G--A---AC--ATata
gi|2                          :                                  gCAAAAGTTATTGCG-ATTAAACGCAAAATA-TTATCG---------GATT-AAAAG-C------A-AAA-ATATT-A---T-TGCGGTTTAACGC--AA-TA---TTTT-T--------GTTT--AAACACGC--A--T------ACTTCATGT------GCC-GTT-T-AACGCAAT-AA-ATTCT-----------------ATTGG-CGT-TTAA-AC-GCAATTTT--TTTTGCG-TT--TAAA----CGCGA-GT------A--T---AGTC---------T-TG--C--TTTT--------GAA----CGCGA-A--CA---------T--G-C--CT-T-AA-A--CGC-AA-TA-T----AT-TG-T------GTTTAGCAAAA-A-----------TTG------AT-TG--GTTTAAA-T-GC---Agccttaaacgcaatatattgtgtttagcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         :                                                                            gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaa------ATT--AT-T------G-C-ATT-TAAAAATAA--AATA---TT----------------ACT-G-CGT-TTAA-AC-AAAAAATT--AATTGCG-TT--TAAA----CACAATA-------A--T---A------------T----------TT--------AAA----CGCAA-A--GA-TTA----TT--G-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cATAG----TTGC-GTTTAAA--CGC-------A--A---t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTA--TTGC-GTT---T-------AAACGCA-A-taaaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -------AT-TGCCGATTAAA-C-G----AA--AATCA-T-TA-TTCG-CG--TTTTAA--A-A---CGCAAT-A-AATTT---TTGC-GTata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                gatA-G-------A--T---A------------T-TG--C--GATT--------AAA----CGCAA-AT-TA-TTA----TT--G-CG-CT-T-AA-A--CGC-AATAATG----AT-TG-C------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCTGTATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTT----TCAGAGTACG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TA--TTGT-GTT---T-------CAACGCA-A-AC--GA----TAGC-GATTAAA--CGC-------A--A---Attcacta
gi|3                          :                                   tgtAATTTATTGCG-AATAAACGCGATA-A-TTGTTGC--------GTTT-AAACG-CAATGAAA-AAA-A---T-A---T-
gi|3                          :               acggaagcctattgaggacactacttagagTGCG-TTTAAACGCAACA-A-TTATCGC--------GTTT-ATTCG-C------A-ATA-A-----A---T-TGCGTTAAAACGC--AA--A---TTGC-TT-----ACGTTT--AAACACAA--A---------AGT---T-T------G-C-AAT-TAAACGTGA--TG-T---T-----------------TTT-G-CTT-TTAA-AT-GCAA------------------TAA-----CGCAA-A-------AAGT---A------------T-TG--C--ATTT--------AA-----CGCAA-A--TA-TTA----TT--G-CG-TT-T-AA-A--CCT-GA-AC-G----AT-TG-C---------T------A-------------------------------TTAAA-C-GC---AA--AAATA-T-TA-TT-T-CG--TTT--A--A-A---CACA---A-AAGTCA--TTGC-GTT---T-------AAAAGCA-----ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC----------A---AT--ATTTTgcgttaaaacgcaaattgcttacgtttaaacacaaaagtttgcaattaaacgtgatgtttttgcttttaaatgcaataacgcaaaaagtattgcatttaacgcaaatattattgcgtttaaacctgaacgattgctattaaacgcaaaaatattatttcgtttaaacacaaaagtcattgcgtttaaaagcaataatcttttgcgtttaatcgcaatattttaatatcaattatttttgtgt
gi|34                         : acggaagcctattgaggacactacttagagatatttttttcatATGCGATTTAAATGCAAAA-AATTATTGC--------Gaatatcaattatttttgtgt
gi|4                          :                                                                           accgtacgTT-AAACG-C------A-AAATA---TTA---T-TGCGTTTAAACGC--AA-TA---ATTT-TT-----GCGTTT--AATAGCA---A--T------ATT---T-T------G-C-GTT-TAAGCGCAA--TA-A---TCAATAATATATAATATCATT-G-CGG-TTAA-AC-GCAAAAAC---ATTGTG-TT--TAAA----CGCAA-T-------G--T---T------------T-TG--C--ATTT--------AAA----CGCAA-A--TA-TTT----TT--A-CG-AT-T-AA-G--CGCAAA-AA-G----AT-TG-C------ATTT------A-A------------------------AC-GTTTAAA-T-AC---AA-----TC-T-T--TT-G-CGCTTTT--A--A-AAACCGAA---T-GATGT---TTGC-GTT---T-------AATTGCG-A-TGATTA----TTGC-GTTTAAA--CGCAATA---A--A---AA--ATATTGTCTATCAACTa
gi|5                          :                                     tgaaacccattgaggccAACGCAATA-A-GTATTGCGTTATTGCGTTT-AATCC-C------A-AAA-A-----A---A-TGTGTTTAAACGC--AA-AT---TTGC-TT-----GCGTTT---GACGCAA--A---------AG---AT-T------G-C-GAT-TAAATGCAA--AG-AT--T-----------------AAT-G-CGT-TTAA-AT-GCAATA-T--TATTGCG--T--TAAA----TGCAA-AAGTAT--A--C---A------------T-TG--C--GTTT--------AAT----CGTAATT--TA-CTA----TT--G-------T-AA-A--TA--AA-AA-GTTCAAT-TG-CAGAAATGTTT------ATT-----------TC-------CT-TTC-GTTTtc
gi|5                          :                                                                                                                                           gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgT--AT-T------G-C-GTT-TAATCCCAA--AA-A---A-----------------AT--G-TGT-TTAA-AC-GCAAATTT--GCTTGCG-TT--TGA-----CGCAA-A-------A--G---A------------T-TG--C--GATT--------AAA----TGCAA-A--GA-TTA----AT--G-CG-TT-T-AA-A--TGC-A----------AT-----------------------A-----------TT-------AT-TGC-G-TTAAA-T-GC---AA--AAGTA-TACA-TT-G-CG--TTT--A--A-T---CGT------AATTTA--CT
gi|6                          :                                              gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaat---TTTTATT-----GCGTTTGTAAACGCA---A--T------AAT--TT-T------G-C-GTT--AATCGCAA--A------C-----------------GTT-G-CGA-TTAA-AC-GCAAAGAT--CATTGAGTTT--TAAA----CGCAA-A-------G------A------------T-TG--G--CTTT--------AAA----CGCAG-A--TA-TTA-----T--G-CT-TT-T-AA-A--CTC-AA-------------------------T------A-A-----------TC-------A-------TTTAAA---GC---AA--AATTA-T-T--TC-A-TA--TTT--A--ATC---CGCAAACA-AA---G--TTGCGGTT---TTAA----AAACGCA-A-GT-TTT----TTGC-GTTTAAA--CGacgcaatacttattgcgtt
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gi|8                          :                                               cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgat-A---T-----------------TTT-G-CGT-TTAACACTGCAAAATT--GTTTGCG--T--TAAA----CGCAA-ATTCTGCCA--C---AGTAAAGGACTGTT-TG--C--GTTT--------AAAAACTCACAA-A--GA-GCG----TT-----G-TT-T--A-A--CGC-AA-GA------------C------GTTTTTGA--G-A-----------TT--------T-TGC-GTTT-AA-C-GCAAAAA--AATTT-T-TT-TT-T-TG--ATT--T--A-A---CGCA---A-AATTTA--CTGCTATT---T-------AAACGTACA-ACATGA----TTGC-
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9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1494 )     :                                                                                                             GCAAAANT---TANTGCG-TTTAAACGCAAN--AA-TTAT--TGC--------GTTTAAN-CG-CAAA---AAT-A---TTGCGTT-TAAACGC--AA-CGTTTT-TT-----GCGTTT----AAACGCA--AA---T------ANTATT---GCGTTTAAACGCAAAA-A-T-ATT-GC--GT-TTAA-AC-GCAA-AANT--TATTG-CG-TT--TAAA----CGCAA-A-------A--T---A------------T-TG--CGNTT--------AAA----CGCAA-A-TA-TT--A----T-T--G-C-G-TT-T-AA-A--CGCAA-AA-G----AT-TG-C------GT----TT----A-ATC-------ATTG-C-GTTTAAA-C-GC---AA--AATTA-T-TA-TT-GCGTTT--A--A-ACGCA---A-AATTTA---TTGC-GTT---T-------AAACGCA--A-ACATGA----TTGC-GTTTAAA--CGC-------A--A---A--T--ATA-TTGTNTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatatttttttttttaTTG-C-GTTTCAA-CCGC---AA--AAATAAT-TA-TC-GCGTTT--A--A-ACGCA---A-AATTTAAA-CTGC-TTT---T-------AAACGTA--A-ACATGA----TTGCCACTTAAAAACAC-------A--A---A--T--AT--TTGTGTATATACCCATAGCAATGAGCCTTTTTC----TCATAG-AGGAACACCGCAACCCTATTTGTTACTccaaagta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT--------AAA----ACCAA-A-TA-AG--AAT--T-T--G-C-G-TT-TTAA-A--TACAT-AA-T----CT-TG-C------GT----TA----A-A--------------C-GT--------GC---AG--A--TC-T-T--TT-GCGTTT--ACCA-TCGCA---ATAATTT----TTGC-A-T---T-------AATCGTA--ATACCCG-----T--C-GTTTAAA---GC-------AATA---A--TAAAAA-TTTTTCATAAACa
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                              ctacggaagcccattgagccg---T------ATTATT---GC-TTTAAACG-ACGG-G-T-ATT-AC--GA-TTAA--T-GCAA-AAAT--TATTG-CG-ATGGTAAA----CGCAA-A-------A--G---A------------TCTGCACGTTT---------AA----CGCAA-G--A-TT--A------T--G-T-A-TT-TAAA-A--CGCAA-Aa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaatttt---A------------T-TG--CGATTGGTATAAAAAA----CGCAG-A-TAATT--AAAT-C-TAGG-C-G-ATAT-AA-AAACGCAA-AA-G----AT-TGGC------AG----TT----A-A--------------------AAA-C-GC---AA--TATCA-A-TAGTC-GCGTTT--A--A-ACGCA---A-AAGATA----TGC-GTTACAT-------AAACGttcttatttggttttaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gagatattttttttcAAA----CGCAA-A-------A--G---A------------T-TGG-CAGTT--------AAAAA--CGCAA---TA-TC--AATAGT-C--G-C-G-TT-T-AA-A--CGCAA-AA-G----ATATG-C------GT----Tgat
gi|17                         :                                                                                                                                    gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataa-TAGACAT--AA--GTTTT-TTTGGTTGCGTT------AACGCA--AA----------AAGATT---GCGATTAAGCGCAATA-A-T-ATT-GC--GT-TTAA----GCAA-AAGTAATATTG-CG-TT--TAAA----C-CAA-T-------A--TTTCA------------T-TGCACGCTT--------AAacataaacggat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                              gggagccccattgaaggcagtttaT--TATTG-CG-TT--TAAA----CGCAA-A-------A--G---A------------T-TG--CAATT--------AAA------CAA-A-GA-TT--A----T-T--G-C-G-TT-T-AA-A--CGCAA-AA-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          acggaagcccattgagg-TT-GCGTTT--A--A-ACGCA---ATAATCT----TTG---TT---T-------AATTGCA--A-TCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAA--A---A--T--ATC-TT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     acggaagcccattgaggctt--A-ACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------A--A---A--T--ATA-GTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                                                                                                             GCAAAAGTGGTTTATGCG-TTTAAAACCAAATGAA-ATATGGTGC--------GTT-AAA-CG-CAAACTTAAT-A---GTG-GTTATAAGCGC--AA-AAATAT--------GCGTTT----AAAC--A--AA---A------GTTATT---GCGATTAAACGCAAAA---T-ATT-ATCGGA-TTAA-AA-GCAA-AAATATTATTG-CG-GT--TTAA----CGCAA-T-------A--T----------------T-TT--TGTTT--------AAA----CACGC-A-TA-CTTCA----TGT--G-CCG-TT-T-AA----CGCAA-TA-A----AT-T------------------------CT-------ATTGGC-GTTTAAA-C-GC---AA----TTT-T-TT-TT-GCGTTT--A--A-ACGCG---A-G-TATAGTCTTGC-TTT---T-------GAACGCG--A-ACATG--------C--CTTAAA--CGC-------A--A------T--ATA-TTGTGTTTAata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gaaccTG-C-ATTTAAA-C--C---AATCAATT----T--TT-GC---T--A--A-ACACA---A-TAT--A---TTGC-GTT---T-------A-----A--G-GCATGT----TCGC-GTTCAAA--AGC-------A--A---GACT--ATACTCGCGTTTAAACGCAgcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         : gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttgtttaaacacgcatacttcatgtgccgtttaacgcaataaattctattggcgtttaaacgcaattttttt------ATTATT---GCATTTAAAAATAAAATA-TTACT-GC--GT-TTAA-AC-AAAA-AATT--AATTG-CG-TT--TAAA----CACAATA-------A--T---A------------T--------TT--------AAA----CGCAA-A-GA-TT--A----T-T--G-
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cATAG----TTGC-GTTTAAA--CGC-------A--A---t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTA---TTGC-GTT---T-------AAACGCA--A-taaaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
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gi|3                          :                                                                                                                 tgtT---CATTGCG-TTTAAACGCAAC--AA-TTAT--CGC--------GTTTATT-CG-CAAT---AA--A---TTGCGTT-AAAACGC--AA--ATTGC-TT-----ACGTTT----AAACACA--AA----------AGT-TT---GCAATTAAACGTGATG-T-T-TTT-GC--TT-TTAA-AT-GCAA--------------------TAA-----CGCAA-A-------AAGT---A------------T-TG--CATTT--------AA-----CGCAA-A-TA-TT--A----T-T--G-C-G-TT-T-AA-A--CCTGA-AC-G----AT-TG-C-------------T----A--------------------TTAAA-C-GC---AA--AAATA-T-TA-TT-TCGTTT--A--A-ACACA---A-AAGTCA---TTGC-GTT---T-------AAAAGCA------ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC----------A---A--T--ATT-TT
gi|34                         :                                                                                    acggaagcctattgaggacactacttagagatattttttTGCGATTTAAATGCAAA--AAATTAT--TGC--------Gaatatcaattatttttgtgt
gi|4                          :                                                                                                                                       accgtacga-TTAT--TGC--------GTTTAAA-CG-CAAT---AATCA---TCGCAAT-TAAACGC--AAACATCAT-TC-----G-GTTTTTAAAAGCGCA--AAAGAT------TGTATTTAAACGTTTAAATGCAATC-T-T-TTT-GC--GC-TTAA-TC-GTAA-AAAT--ATTTG-CG-TT--TAAA----TGCAA-A-------A--C---A------------T-TG--CGTTT--------AAA----CACAA---TG-TT--T----T-T--G-C-G-TT-T-AA-C--CGCAATGA-T----AT-TA-T------ATATTATT----G-ATT-------ATTG-C-GCTTAAA-C-GC---AA--AAT------A-TT-GCTATT--A--A-ACGCA---A-AAATTA---TTGC-GTT---T-------AAACGCAATA-ATATT-----TTGC-GTTTAAa
gi|5                          :                                                                                                tgaaacccattgaggccagttgatagacaatattttAACGCAAT--AA-GTAT--TGCGTTATTGCGTTTAAT-CC-CAAA---AA--A---ATGTGTT-TAAACGC--AA-ATTTGC-TT-----GCGTTT-----GACGCA--AA----------AG-ATT---GCGATTAAATGCAAAG-ATT-AAT-GC--GT-TTAA-AT-GCAA-TA-T--TATTG-CG--T--TAAA----TGCAA-AAGTAT--A--C---A------------T-TG--CGTTT--------AAT----CGTAATT-TA-CT--A----T-T--G--------T-AA-A--TA-AA-AA-GTTCAAT-TG-CAGAAATGT----TT----ATTTC-------CTTT-C-GTTTtc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                    gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgTATT---GCGTTTAATCCCAAAA-A-A-AT--GT--GT-TTAA-AC-GCAA-ATTT--GCTTG-CG-TT--TGA-----CGCAA-A-------A--G---A------------T-TG--CGATT--------AAA----TGCAA-A-GA-TT--A----A-T--G-C-G-TT-T-AA-A--TGCA----------AT-------------------------ATT-------ATTG-C-G-TTAAA-T-GC---AA--AAGTA-TACA-TT-GCGTTT--A--A-TCGT------AATTTA---CT
gi|6                          :                                                                                                                       gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaatTTTTATT-----GCGTTTGT--AAACGCA--A----T------AATTTT---GCGTT-AATCGCAAA----C-GTT-GC--GA-TTAA-AC-GCAA-AGAT--CATTG-AGTTT--TAAA----CGCAA-A-------G------A------------T-TG--GCTTT--------AAA----CGCAG-A-TA-TT--A------T--G-C-T-TT-T-AA-A--CTCAA-----------------------------T----A-ATC-------A-------TTTAAA---GC---AA--AATTA-T-T--TC-ATATTT--A--ATCCGCAAACA-AA---G---TTGCGGTT---TTAA----AAACGCA--A-GT-TTT----TTGC-GTTTAAA--CGacgcaatacttattgcgtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                              acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggtttttttt-T-ATT-GC--AT-TTAA-AC-ACAA-AGGA--TAT---CG-TT--TAAT----TGCAA-G-------C--C---G------------T-TG--CGTTT--------AAA----CGTAA-A-GA-TC--A----T-T--G-T-G-TA-T-AA-A--CG
gi|8                          :                                                                                                             cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgat-A-T-TTT-GC--GT-TTAACACTGCAA-AATT--GTTTG-CG-TT---AAA----CGCAA-ATTCTGCCA--C---AGTAAAGGACTGTT-TG--CGTTT--------AAAAACTCACAA-A-GA-GC--G----T-T------G-TT-T--A-A--CGCAA-GA------------C------GT----TTTTGAG-ATT--------TTG-C-GTTT-AA-C-GCAAAAA--AATTT-T-TT-TT-TTGATT--T--A-ACGCA---A-AATTTA---CTGCTATT---T-------AAACGTAC-A-ACATGA----TTGC-
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gi|9                          :                                                                                                              aAACAAT---TAGCGTG-TT--AACGCAAG--GA-TTAT--TGC--------GTTTAAAACGACATA---GATTA---TTGC----TGA-CGC--AA-GGTTAT-TT---------TT----AAACGCA--AG---G------ATTAT----GCGTTTAAA-ACGAAA-A-G-ATT-GC--GT-TCAG--C-GCAT-AATT--CTTTG-CG-TT--TAAT----CGCAATC-------G--T----------------T-TG--CGTTT--------AAA----CGCAA-ggcctcaatgggcttccgt
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Alignments
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lowQualScore                  :                                .....  .    .           ...  .    .. .  ........ .  .  ...  .   ....  .. ...    ..  .       ..  ...  . .  ..... ..   ....       ..  .......... . .  ......  . .  .......  .  .    ........  . . ..  .    .       . ......     .. ..    ....     . .......... .... .  ..  .  ........   ....     ..... .  .. ...... ..  .   . .   ..     ..............................................   . . .     . .  ...  ..  ...... ..  .      ..  .     ... .  ..  ...    .   ... ...  .    .. . . ......    .       ..   .......   ...... . ...  .      .              .        ....        . .                  .    
lowQualScore                  :                                88888  0    7           666  4    11 4  11111111 4  4  000  0   2222  88 888    44  4       11  999  0 6  11111 99   7777       00  6666666666 0 5  222222  9 2  3333333  9  7    77777777  3 7 77  7    4       8 000000     77 44    0000     2 3333333333 5555 2  33  0  11111111   2222     55555 7  77 333333 77  7   5 5   44     5555555555555555555555555555555555555555555555   4 4 5     5 5  444  44  888888 44  4      22  4     444 4  99  999    0   777 777  4    33 4 3 000000    7       22   4444444   777777 6 222  4      0              0        2222        0 6                  0    
consensus                     :                          GCAAAAGT---TANTGCG-TTTAAACGCAAN--AA-TTAT--T-GC--------G-TTTAA-N-CG-CAAA---AA--A---TTGCG-TT-TAAACGC--AA--GTTNT-TT-----GCGTTT----AAACGCA--AA---C------ANTATT------GC-GTTT-------AA-AC-GCAA--AAA-TATT-G-C--GT-TTAAACGCAAAANT--N--ATTGCG-TT--TAAA----CGCAA-A-----A---NA----T-TG--CGNTT--------AAA----CGCAA-A-T-A-TT--A----T-T--GC-GTT-T-AAA--CGCAA-AA-G----AT-TG-C------GT----TT----AATT-------ATTG-C-GTTTAAA-C-GC---AA--AATTA-T-TA-TT-GCGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--AACATGA----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAA--T---A-T-A-TTGTGTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
Reference ( family-1494 )     :                          GCAAAAGT---TANTGCG-TTTAAACGCAAN--AA-TTAT--T-GC--------G-TTTAA-N-CG-CAAA---AAT-A---TTGCG-TT-TAAACGC--AA-CGTTNT-TT-----GCGTTT----AAACGCA--AA---T------ANTATT------GC-GTTT-------AA-AC-GCAA--AAA-TATT-G-C--GT-TTAAACGCAAAANT--N--ATTGCG-TT--TAAA----CGCAA-A-----A---NA----T-TG--CGNTT--------AAA----CGCAA-A-T-A-TT--A----T-T--GC-GTT-T-AAA--CGCAA-AA-G----AT-TG-C------GT----TT----AATT-------ATTG-C-GTTTAAA-C-GC---AA--AATTA-T-TA-TT-GCGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--AACATGA----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAA--T---A-T-A-TTGTGTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
gi|1                          :                          GTAAAA------AATGCG-TTTAAACACAAA--GA-TTAT--T-AC--------C-TTTAA-A-CG-CAAC---AG--A---TTGCT-TT-TAAATGC--AA-CGTTTT-TT-----GCGTTT----AAACGCATTGA---T------AGTATT------GC-GCTT-------AA-AC-GCAA--AAA-TATT-G-C--GT-TTAAACGCAAAACT--T--ATTGCA-TT--TATA----CATAA-A-----A---TA----T-TG--CGATT--------AAA----TGCAA-ACT-A-TT--A----T-T--GC-GTT-T-AAA--CATAA-AA-G----AT-TG-T------GT----TT----AATC-------ATCA-C-GCTTAAA-C-GC---AA--AATTA-T-TA-TT-GCGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTA---CTGC-TTT---T---AAGCGCA--AATATGA----TTGC-AATTAAA--CAC-------AAA--T---A-T-A-TTGTTTATATACTCATAACAGTGA---TTCTTT----TCAAAGTAGGAACACCACAACTCTCTTTG-TACT
gi|10                         :                                 T---TATTGCG-TTTAAAAGCAAT--AA-TTAT--T-GC--------A-TTAAT-T-CG-CAAA---AAA-AAAATT-CG-TT-TAGACGATAAA-C---TT-TT-----GCAATT----AA-CGCA--AA---CTTTTAGATTATTTGTCAAACAGTTT-------AA-AC-ACAATAAGA-AATT-GGC--GT-TTAAACACAAAAG------ATTGCG-TT--TAAA----CGCAATA-----A---AA----
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                     gagatattttttttcAAA----CGCAA-A-----A---GA----T-TGG-CAGTT--------AAAAA--CGCAA---T-A-TC--AATAGT-C--GC-GTT-T-AAA--CGCAA-AA-G----ATATG-C------GT----Tgat
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                          gggagccccattgaaggcagtttaT--T--ATTGCG-TT--TAAA----CGCAA-A-----A---GA----T-TG--CAATT--------AAA------CAA-A-G-A-TT--A----T-T--GC-GTT-T-AAA--CGCAA-AA-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acggaagcccattgagg-TT-GCGTTT--AA-ACGCA---ATAATCT----TTG---TT---T---AATTGCA--ATCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAAAA--T---A-T-C-TT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acggaagcccattgaggctt--AACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------AAA--T---A-T-A-GTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                          GCAAAAGTGGTTTATGCG-TTTAAAACCAAATGAA-ATATGGT-GC--------G-TT-AA-A-CG-CAAACTTAAT-A---GTG-G-TTATAAGCGC--AA-AAATAT--------GCGTTT----AAAC--A--AA---A------GTTATT------GC-GATT-------AA-AC-GCAA--AA--TATT-A-TCGGA-TTAAAAGCAAAAAT--ATTATTGCG-GT--TTAA----CGCAA-T-----A---T-----T-TT--TGTTT--------AAA----CACGC-A-T-A-CTTCA----TGT--GCCGTT-T-AA---CGCAA-TA-A----AT-T-----------------------CT-------ATTGGC-GTTTAAA-C-GC---AA----TTT-T-TT-TT-GCGTTT--AA-ACGCG---A-G-TATAGTCTTGC-TTT---T---GAACGCG--AACATG--------C--CTTAAA--CGC-------AA---T---A-T-A-TTGTGTTTAata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  gaaccTG-C-ATTTAAA-C--C---AATCAATT----T--TT-GC---T--AA-ACACA---A-TAT--A---TTGC-GTT---T---A-----A--GGCATGT----TCGC-GTTCAAA--AGC-------AAGACT---A-T-ACTCGCGTTTAAACGCAgcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         :                                                                                                                                                     gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttgtttaaacacgcatacttcatgtgccgtttaacgcaataaattctattggcgtttaaacgcaatttttttATT-------ATTG-C-ATTTAAA-A-AT---AA--AAT-A-T-TA-CT-GCGTTT--AA-ACAAA---A-AATTAA---TTGC-GTT---T---AAACACA-----ATAA----T----ATTTAAA--CGC-------AAA--G---ATT-A-TTGT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cATAG----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AA
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--Ataaaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atagAA-GA-G----AT-----------AT----TT----ATTTT------ATTG-C-GTTTAAA-C-GC---AA--ataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-------ATTG-CCGATTAAA-C-G----AA--AATCA-T-TA-TTCGCGTTTTAAA-ACGCAAT-A-AATTT----TTGC-GTata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             gaA-G-----A---TA----T-TG--CGATT--------AAA----CGCAA-A-TTA-TT--A----T-T--GC-GCT-T-AAA--CGCAATAATG----AT-TG-C------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -TTCTGTATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTT----TCAGAGTACG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                      --ATTGTG-TT--TCAA----CGCAA-A-----C---GA----T-AG--CGATT--------AAA----CGCAA-A-ttcacta
gi|3                          :                              tgtT---CATTGCG-TTTAAACGCAAC--AA-TTAT--C-GC--------G-TTTAT-T-CG-CAAT---AA--A---TTGCG-TT-AAAACGC--AA--ATTGC-TT-----ACGTTT----AAACACA--AA----------AGT-TT------GC-AATT-------AA-AC-GTGA--TGT-TTTT-G-C--TT-TTAAATGCAA---T------------------AA----CGCAA-A-----AAG-TA----T-TG--CATTT---------AA----CGCAA-A-T-A-TT--A----T-T--GC-GTT-T-AAA--CCTGA-AC-G----AT-TG-C-------------T----A-------------------TTAAA-C-GC---AA--AAATA-T-TA-TT-TCGTTT--AA-ACACA---A-AAGTCA---TTGC-GTT---T---AAAAGCA-----ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC--------AA--T---A-T-T-TTa
gi|34                         : acggaagcctattgaggacactacttagagatattttttTGCGATTTAAATGCAAA--AAATTAT--T-GC--------G-aatatcaattatttttgtgt
gi|4                          :                                                    accgtacga-TTAT--T-GC--------G-TTTAA-A-CG-CAAT---AATCA---TCGCA-AT-TAAACGC--AAACATCAT-TC-----G-GTTTTTAAAAGCGCA--AAAGAT------TGTATTTAA---AC-GTTT-------AA-AT-GCAA--TCT-TTTT-G-C--GC-TTAATCGTAAAAAT--A--TTTGCG-TT--TAAA----TGCAA-A-----A---CA----T-TG--CGTTT--------AAA----CACAA---T-G-TT--T----T-T--GC-GTT-T-AAC--CGCAATGA-T----AT-TA-T------ATATTATT----GATT-------ATTG-C-GCTTAAA-C-GC---AA--AAT------A-TT-GCTATT--AA-ACGCA---A-AAATTA---TTGC-GTT---T---AAACGCAATAATATT-----TTGC-GTTTAAa
gi|5                          :             tgaaacccattgaggccagttgatagacaatattttAACGCAAT--AA-GTAT--T-GCGTTATTGCG-TTTAA-T-CC-CAAA---AA--A---ATGTG-TT-TAAACGC--AA-ATTTGC-TT-----GCGTTT-----GACGCA--AA----------AG-ATT------GC-GATT-------AA-AT-GCAA--AGATTAAT-G-C--GT-TTAAATGCAATA-T--T--ATTGCG--T--TAAA----TGCAA-AAGTATA---CA----T-TG--CGTTT--------AAT----CGTAATT-T-A-CT--A----T-T--G------T-AAA--TA-AA-AA-GTTCAAT-TG-CAGAAATGT----TT----ATTTC------CTTT-C-GTTTtc
gi|5                          :                                                                                                                                     gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgTATT------GC-GTTT-------AA-TC-CCAA--AAA-AAT--G-T--GT-TTAAACGCAAATTT--G--CTTGCG-TT--TGA-----CGCAA-A-----A---GA----T-TG--CGATT--------AAA----TGCAA-A-G-A-TT--A----A-T--GC-GTT-T-AAA--TGCA----------AT------------------------ATT-------ATTG-C-G-TTAAA-T-GC---AA--AAGTA-TACA-TT-GCGTTT--AA-TCGT------AATTTA---CT
gi|6                          :                                        gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaatTTTTATT-----GCGTTTGT--AAACGCA--A----T------AATTTT------GC-GTT--------AA-TC-GCAA--A---CGTT-G-C--GA-TTAAACGCAAAGAT--C--ATTGAGTTT--TAAA----CGC-A-A-----A---GA----T-TG--GCTTT--------AAA----CGCAG-A-T-A-TT--A------T--GC-TTT-T-AAA--CTCAA-----------------------------T----AAT-------------C-ATTTAAA---GC---AA--AATTA-T-T--TC-ATATTT--AATCCGCAAACA-AA---G---TTGCGGTT---TTAAAAACGCA--AGT-TTT----TTGC-GTTTAAA--CGacgcaatacttattgcgtt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggttttttttA-T-TA-TT-GCATTT--AA-ACACA---A-AGGATA---T--C-GTT---T---AATTGCA--AGC-CG-----TTGC-GTTTAAA--CGT-------AAA--G---A-TCA-TTGTGTATAAAC
gi|8                          :           cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgTT------GC-GTTT-------AACACTGCAA--AAT-TGTTTG-C--GT-T-AAACGC-AAATT--C----TGC------CACA-----GTAA-A-----G---GACTGTT-TG--CGTTT--------AAAAACTCACAA-A-G-A-GC--G----T-T-----GTT-T--AA--CGCAA-GA------------C------GT----TTTTGAGATT--------TTG-C-GTTT-AA-C-GCAAAAA--AATTT-T-TT-TT-TTGATT--TA-ACGCA---A-AATTTA---CTGCTATT---T---AAACGTAC-AACATGA----TTGC-g
gi|9                          :                                                                                        tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttcatt-TT-----GC-TTT----AAACGCA--AT---C------ATT--T------GC---TT-------AA-----CAA--------TTAG-C--GT-GTTAACGCAAGGAT--T--ATTGCG-TT--TAAAACGACATAG-A-----T---TA----T-TG--CTG------------A----CGCAA-G---G-TT--A----T-T------TT-T-AAA--CGCAA-G--G----AT-TA---------------------------------TG-C-GTTTAAAAC-GA---AA--AG-------A-TT-GCGTTC--AG--CGCA---T-AATTCT---TTGC-GTT---T---AATCGCA--ATCGT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAA-AAA--T---A-T-C-TT-TCTATAAACT
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Reference ( family-1494 )     :                                                                                                           GCAAAAGT---TANTGCG-TTTAAACGCAAN--AA-TTAT--TG-C--------G-TTTAAN-CG-CAAAA--A--A----T--TGCG---TT-TAAA--CG-CAA-G-TTNT-TT-----GCGTTT--AAACGCA--AAC------ANTATT------GC-GTTT-------AA-AC-GCAA----------AA-A-T-ATT-G-C--GT-TTAAACGCAAAANT--N--ATTGCG-TT--TAA----ACGCAA-A-----A---NA----T-TG--CGNTT--------AAA----CGCAA-A-T-ATT--A----T-T---GC-G-TTT--AAACGCAA-AA-G----AT-T-GC------GT----TT----AATT-------ATTG-C-GTTT-AAAC-GCAA--AA---TTA-T-TA-TT-GCGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--AACATGA----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAA--T---ATA-TTGTGTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                        ------ATTATT------GC--TTT-------AA-AC-G-AC----------GG-G-T-ATT-A-C--GA-TTAA-TGCAAAAAT--T--ATTGCG-ATGGTAA----ACGCAA-A-----A---GA----TCTGCACGTTT---------AA----CGCAA-G---ATT--A------T---GT-A-TTTA-AAACGCAA-Aa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaatttttA----T-TG--CGATTGGTATAAAAAA----CGCAG-A-TAATTAAA----T-CTAGGC-GATATAAAAACGCAA-AA-G----AT-TGGC------AG----TT----AA---------------------AAAC-GCAA--TA---TCA-A-TAGTC-GCGTTT--AA-ACGCA---A-AAGATA----TGC-GTTACAT---AAACGttcttatttggttttaaa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gagatattttttttcAA----ACGCAA-A-----A---GA----T-TGG-CAGTT--------AAAAA--CGCAA---T-ATC--AATAGT-C---GC-G-TTT--AAACGCAA-AA-G----ATAT-GC------GT----Tgat
gi|17                         :                                                                                                                                         gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataa-TAGA--CA-TAA-G-TTTT-TTTGGTTGCGTT----AACGCA--AAA------AG-ATT------GC-GATT-------AA-GC-GCAA----------TA-A-T-ATT-G-C--GT-TTAA--GCAAAAGTAAT--ATTGCG-TT--TAA----AC-CAA-T-----ATTTCA----T-TGCACGCTT--------AAacataaacggat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gggagccccattgaaggcagtttaT--T--ATTGCG-TT--TAA----ACGCAA-A-----A---GA----T-TG--CAATT--------AAA------CAA-A-G-ATT--A----T-T---GC-G-TTT--AAACGCAA-AA-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acggaagcccattgagg-TT-GCGTTT--AA-ACGCA---ATAATCT----TTG---TT---T---AATTGCA--ATCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAAAA--T---ATC-TT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      acggaagcccattgaggctt--AACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------AAA--T---ATA-GTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                                                                                                           GCAAAAGTGGTTTATGCG-TTTAAAACCAAATGAA-ATATGGTG-C--------G-TT-AAA-CG-CAAACTTA--A----TAGTG-G---TTATAAG--CG-CAA-A-A-AT-AT-----GCGTTT--AAAC--A--AAA------GTTATT------GC-GATT-------AA-AC-GCAA----------AA---T-ATT-A-TCGGA-TTAAAAGCAAAAAT--ATTATTGCG-GT--TTA----ACGCAA-T-----A---T-----T-TT--TGTTT--------AAA----CACGC-A-T-ACTTCA----TGT---GCCG-TTT--AA-CGCAA-TA-A----AT-T-----------------------CT-------ATTGGC-GTTT-AAAC-GCAA-------TTT-T-TT-TT-GCGTTT--AA-ACGCG---A-G-TATAGTCTTGC-TTT---T---GAACGCG--AACATG--------C--CTTAAA--CGC-------AA---T---ATA-TTGTGTTTAata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaaccTG-C-ATTT-AAAC--CAATCAA---TT----T--TT-GC---T--AA-ACACA---A-TAT--A---TTGC-GTT---T---A-----A--GGCATGT----TCGC-GTTCAAA--AGC-------AAGACT---ATACTCGCGTTTAAACGCAgcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         : gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttgtttaaacacgcatacttcatgtgccgtttaacgcaataaattctattggcgtttaaacgcaatttttttC------ATTATT------GC-ATTT-------AA-AA-ATAA----------AATA-TTACT-G-C--GT-TTAAACAAAAAATT--A--ATTGCG-TT--TAA----ACACAATA-----A---TA----T--------TT--------AAA----CGCAA-A-G-ATT--A----T-T---G
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATAG----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--Ataaaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atagAA-GA-G----AT-----------AT----TT----ATTTT------ATTG-C-GTTT-AAAC-GCAA--ataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-------ATTG-CCGATT-AAAC-G-AA--AA---TCA-T-TA-TTCGCGTTTTAAA-ACGCAAT-A-AATTT----TTGC-GTata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gaA-G-----A---TA----T-TG--CGATT--------AAA----CGCAA-A-TTATT--A----T-T---GC-G-CTT--AAACGCAATAATG----AT-T-GC------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TTCTGTATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTT----TCAGAGTACG
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gi|3                          :                                                                                                               tgtT---CATTGCG-TTTAAACGCAAC--AA-TTAT--CG-C--------G-TTTATT-CG-CAATA--A--A----T--TGCG---TT-AAAA--CG-CAA-A-TTGC-TT-----ACGTTT--AAACACA--AA-------AGT-TT------GC-AATT-------AA-AC-GTGA----------TG-T-T-TTT-G-C--TT-TTAAATGCAA---T------------------A----ACGCAA-A-----AAG-TA----T-TG--CATTT---------AA----CGCAA-A-T-ATT--A----T-T---GC-G-TTT--AAACCTGA-AC-G----AT-T-GC-------------T----A-------------------TT-AAAC-GCAA--AA---ATA-T-TA-TT-TCGTTT--AA-ACACA---A-AAGTCA---TTGC-GTT---T---AAAAGCA-----ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC--------AA--T---ATT-TTa
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gi|4                          :                                                                                                         accgtacgaT---TATTGCG-TTTAAACGCAAT--AA-TCAT--CG-C--------A-ATTAAA-CG-CAAAC--ATCA----T--T-CGGTTTT-TAAAAGCG-CAA-A-AGAT-T------GTATTT--AAACG-----------------------------TTT-------AA-AT-GCAA----------TC-T-T-TTT-G-C--GC-TTAATCGTAAAAAT--A--TTTGCG-TT--TAA----ATGCAA-A-----A---CA----T-TG--CGTTT--------AAA----CACAA---T-GTT--T----T-T---GC-G-TTT--AACCGCAATGA-T----AT-T-AT------ATATTATT----GATT-------ATTG-C-GCTT-AAAC-GCAA--AA---T------A-TT-GCTATT--AA-ACGCA---A-AAATTA---TTGC-GTT---T---AAACGCAATAATATT-----TTGC-GTTTAAa
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9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1494 )     :                                     GCAAAAGTTATTGCG-TTTAAACGCAANA-A--------TTATTG-CG-TTTAAN-CGC----AAAA--A----AT---TGCG---TTT-AAA--CG-CAA-A-T----TGT-TTGCG-TTT--AA--ACGCA--AAC------ATTAT-TG-CGTT-T-------AA-AC-GCAA--AA-A---T-ATT-GCGT-TTAAACGCAA-AANTNATT-GCG-TT--TAAACGCAA-A-----A--N-A----T-TG-C--GNTT--------AA-A----CGC--AA-A-TA-TTA----TT--GCGTT-TAAA--CGCAA-AA-G----AT-TG-C------GT----TT------AA-----------TT-------AT-TG-C-GTTTAAAC-GCA--AAA---TTA-T-TA-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTA--TTGC-GTT---T---AAACGCA--AACATGA----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAAT---ATATTGTGTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
gi|1                          :                                                TGCG-TTTAAACACAAAG-A--------TTATTA-CC-TTTAAA-CGC----AACA--G----AT---TGCT---TTT-AAA--TG-CAACG-T----TTT-TTGCG-TTT--AA--ACGCATTGAT------AGTAT-TG-CGCT-T-------AA-AC-GCAA--AA-A---T-ATT-GCGT-TTAAACGCAA-AACTTATT-GCA-TT--TATACATAA-A-----A--T-A----T-TG-C--GATT--------AA-A----TGC--AA-ACTA-TTA----TT--GCGTT-TAAA--CATAA-AA-G----AT-TG-T------GT----TT------AA-----------TC-------AT-CA-C-GCTTAAAC-GCA--AAA---TTA-T-TA-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTA--CTGC-TTT---T---AAGCGCA--AATATGA----TTGC-AATTAAA--CAC-------AAAT---ATATTGTTTATATACTCATAACAGTGA---TTCTTT----TCAAAGTAGGAACACCACAACTCTCTTTG-TACT
gi|10                         :                                    gtaaaaaaTTATTGCG-TTTAAAAGCAATA-A--------TTATTG-CA-TTAATT-CGCAAAAAAAA--A----AT---T-CG---TTT-AGA--CGATAA-A-C----T-T-TTGCA-ATT---A--ACGCA--AACTTTTAGATTAT-T--TGT-----------------CAA--AC-A-----------GT-TTAAACACAATAAGAAATTGGCG-TT--TAAACACAA-A-----A--G-A----T-TG-C--GTTT--------AA-A----CGC--AA-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagatttttttaTT-TAAA--CGCAATAATA----AT-TG-T------CT----TT------AA-----------TTGCAAACAAT-TG-C-GTTTAAAC-GCA--AAN---NNN-N-NN-NN-N--NNNNN--NN-NNNNN---N-NNNNNN--NNNN-NNN---N------CGCA--AACATCA----TTGC-ACTTAAA--TAC-------AAATTATATATTGTGTATAAACTCATAGCAACGAACCTTCTTC----TCAAAGTACGCACACCACAACCCTATTTC-TACTaaaatatctatgtactgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                -GCAG--AA-G---T-CTT-ATATATTTAACGCAA-TATTAATT-GCA-TT--TAACAGCAA-A-----G--A-A----T-TG-C--GTTT--------AA-A----CGC---A-A-TG-TTT----TT--GCGTT-TAAA--CGCAA-AG-A----AA-TG-C-------------T------AA-----------AG-------AT-CG-C-GATTAAAC-GCA--AAA----TA-T-CA-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AAATTA--tta
gi|13                         :                                              ATTGTG-ATTAAACGCA-------------TTATTGGCGATTTAATGCGC----AAAA--A----AT---TGCG---TTTTAAA--CG-CAA-A-T----TGT-TTG--------------GCA--AAC-------TTTT-TG-CGTT-TTGTTTAAAA-AC-GCAAACAA-A---C-TTT-GCGT-Tttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatatttttttttttaT-TG-C-GTTTCAACCGCA--AAA---ATAAT-TA-TC-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTAAACTGC-TTT---T---AAACGTA--AACATGA----TTGCCACTTAAAAACAC-------AAAT---AT-TTGTGTATATACCCATAGCAATGAGCCTTTTTC----TCATAG-AGGAACACCGCAACCCTATTTGTTACTccaaagta
gi|15                         :                                                                                                                                                                               ------ATTAT-TG-C-TT-T-------AA-AC-G-AC--GG-G---T-ATT-ACGA-TTAA-TGCAA-AAATTATT-GCG-ATGGTAAACGCAA-A-----A--G-A----TCTG-CACGTTT--------AA------CGC--AA-G--A-TTA----T---GTATT-TAAAA-CGCAA-Aa
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                       gagatattttttttcAAACGCAA-A-----A--G-A----T-TGGC--AGTT--------AA-AAA--CGC--AA---TA-TCAATAGTC--GCGTT-TAAA--CGCAA-AA-G----ATATG-C------GT----Tgat
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acggaagcccattgagg-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---ATAATCT---TTG---TT---T---AATTGCA--ATCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAAAAT---ATCTT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       acggaagcccattgaggctt--AACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------AAAT---ATAGTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                                                                                         AAC-CGC----AAAAGTG----GTTTATGCG---TTT-AAA--AC-CAA-A-TGAAATATGGTGCG--TT--AA--ACGCA--AACTT----AATAG-TG--GTTAT-------AA-GC-GCAA--AA-A---T-A-T-GCGT-TTAAA--CAA-AAGTTATT-GCG-AT--TAAACGCAA-A-----A--T-A----T-TA-TCGGATT--------AA-A----AGCAAAA-A-TA-TTA----TT--GCGGT-TTAA--CGCAA-TA-T-----T-TT-T------GT----TT------AAACACGCATACTTC-------ATGTGCC-GTTT-AAC-GCAATAAA---TT--C-TA-TTGG--CGTTT--AA-ACGCA---A-TTTTTT--TTGC-GTT---T---AAACGCG--AGTATAGTC--TTGC-TTTTGAA--CGC-------GAAC---ATata
gi|2                          :                                     gCAAAAGTTATTGCG-ATTAAACGCAAAATA--------TTATCG--G-ATTAAA-AGC----AAAA--ATATTAT---TGCG---GTT-TAA--CG-CAA--------TAT-TTTTG-TTT--AAACACGCA--TAC------TTCATGTGCCGTT-T--------A-AC-GCAAT-AA-ATTCT-ATTGGCGT-TTAAACGCAA-TTTTTTTT-GCG-TT--TAAACGCGA-GT----A--T-AGTC-T-TG-C--TTTT--------GA-A----CGC--GA-A-CA---------T--GC-CT-TAAA--CGCAA-TA-T----AT-TG-T------GT----TTAGCAAAAA-----------TTG------AT-TG---GTTTAAAT-GCA--gccttaaacgcaatatattgtgtttagcaaaaattgattggtttaaatgca
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gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATAG----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTTA--TTGC-GTT---T---AAACGCA--Ataaaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atagAA-GA-G----AT-----------AT----TT------AT-----------TTT------AT-TG-C-GTTTAAAC-GCA--Aataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T-------AT-TG-CCGATTAAAC-G-A--AAA---TCA-T-TA-TTCG--CGTTTTAAA-ACGCAAT-A-AATTT---TTGC-GTata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                           gaA-G-----A--T-A----T-TG-C--GATT--------AA-A----CGC--AA-ATTA-TTA----TT--GCGCT-TAAA--CGCAATAATG----AT-TG-C------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTCTGTATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTT----TCAGAGTACG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                         ATT-GTG-TT--TCAACGCAA-A-----C--G-A----T-AG-C--GATT--------AA-A----CGC--AA-A-ttcacta
gi|3                          :                                         tgtTCATTGCG-TTTAAACGCAACA-A--------TTATCG-CG-TTTATT-CGC----AATA--A----AT---TGCG---TTA-AAA--CG-CAA-A-T----TGC-TTACG-TTT--AA--ACACA--AAA------GT--T-TG-CAAT-T-------AA-AC-GTGA--TG-T---T-TTT-GCTT-TTAAATGCAA----T---------------AACGCAA-A-----AAGT-A----T-TG-C--ATTT---------A-A----CGC--AA-A-TA-TTA----TT--GCGTT-TAAA--CCTGA-AC-G----AT-TG-C-------------T------A-------------------------------TTAAAC-GCA--AAA---ATA-T-TA-TT-T--CGTTT--AA-ACACA---A-AAGTCA--TTGC-GTT---T---AAAAGCA-----ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC--------AAT---ATTTTa
gi|34                         :         acggaagcctattgaggacactacttagagatattttttTGCGATTTAAATGCAAAA-AA-------TTATTG-CG-aatatcaattatttttgtgt
gi|4                          :                                   accgtacgaTTATTGCG-TTTAAACGCAATA-A--------TCATCG-CA-ATTAAA-CGC----AAAC--ATC--AT---T-CGGTTTTT-AAAAGCG-CAA-A-A-----GA-TTGTA-TTT--AA--ACG------------------------TT-T-------AA-AT-GCAA--TC-T---T-TTT-GCGC-TTAATCGTAA-AAATATTT-GCG-TT--TAAATGCAA-A-----A--C-A----T-TG-C--GTTT--------AA-A----CAC--AA---TG-TTT----TT--GCGTT-TAAC--CGCAATGA-T----AT-TA-T------ATATTATT------GA-----------TT-------AT-TG-C-GCTTAAAC-GCA--AAA---T------A-TT-G--CTATT--AA-ACGCA---A-AAATTA--TTGC-GTT---T---AAACGCAATAATATT-----TTGC-GTTTAAa
gi|5                          :                     tgaaacccattgaggccagttgatagacaatattttAACGCAATA-AGTATTGCGTTATTG-CG-TTTAAT-CCC----AAAA--A----AA---TGTG---TTT-AAA--CG-CAA-ATT----TGC-TTGCG-TTT---G--ACGCA--AAA------G--AT-TG-CGAT-T-------AA-AT-GCAA--AG-AT--T-AAT-GCGT-TTAAATGCAA-TA-TTATT-GCG--T--TAAATGCAA-AAGTATA--C-A----T-TG-C--GTTT--------AA-T----CGT--AATT-TA-CTA----TT--G-----TAAA--TA-AA-AA-GTTCAAT-TG-CAGAAATGT----TT------AT-----------TTC------CT-TT-C-GTTTtc
gi|5                          :                                                                                                                                   gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgC------GTTAT-TG-CGTT-T-------AA-TC-CCAA--AA-A---A-AT--GTGT-TTAAACGCAA-ATTTGCTT-GCG-TT--TGA-CGCAA-A-----A--G-A----T-TG-C--GATT--------AA-A----TGC--AA-A-GA-TTA----AT--GCGTT-TAAA--TGCA----------AT--------------------------A-----------TT-------AT-TG-C-G-TTAAAT-GCA--AAA---GTA-TACA-TT-G--CGTTT--AA-TCGT------AATTTA--CT
gi|6                          :                                                          gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaat-TTGCG-TTTGTAA--ACGCA--ATA------ATT-T-TG-CGTT---------AA-TC-GCAA--A------C-GTT-GCGA-TTAAACGCAA-AGATCATT-GAGTTT--TAAACGC-A-A-----A--G-A----T-TG-G--CTTT--------AA-A----CGC--AG-A-TA-TTA-----T--GCTTT-TAAA--CTCAA-----------------------------T------AA-----------T--------------C-ATTTAAA--GCA--AAA---TTA-T-T--TC-A--TATTT--AATCCGCAAACA-AA---G--TTGCGGTT---TTAAAAACGCA--AGT-TTT----TTGC-GTTTAAA--CGcaatacttattgcgtt
gi|7                          :                   acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggtttttttttttta-A--------TTATTG-CA-TTTAAA-CAC----AAAG--G----AT---ATCG---TTT-AAT--TG-CAA-G-C----CGT-T-GCG-TTT--AA--ACGTA--AAG------ATCAT-TG-TGTA-T-------AA-AC-G
gi|8                          :       cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgC------ATT-T-TG-CGTT-T-------AACACTGCAA--AA-T---T-GTTTGCGT-T-AAACGCAA-A-TTC--T-GC------CACA-GTAA-A-----G--G-ACTGTT-TG-C--GTTT--------AA-AAACTCAC--AA-A-GA-GCG----TT--G--TT-TAA---CGCAA-GA------------C------GT----TTTTGA--GA-----------TT--------T-TG-C-GTTTAA-C-GCA--AAAAAATTT-T-TT-TT-T--TGATT--TA-ACGCA---A-AATTTA--CTGCTATT---T---AAACGTAC-AACATGA----TTGC-
gi|9                          : tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttTTATTGCG-TTTAAACGCA--A-A--------CGATTG-CG-ATTAAA-CGC----AAAG--A----ATTA-TGCG----CT-GAA--CG-CAA--------TCT-TTTCGTTTT--AA--ACGCA--TA-------ATCCT-TG-CGTT-T-------AA-A----AA--TA-A---C-CTT-GCG--TCA---GCAATAATCTATG-TCGTTT--TAAACGCAATA-----AT-C-C----T-TG-C--G-TT--------AACA----CGC-------TA---A----TT--G---T-TAA----GCAA-AT-G----AT-TG-C------GT----TT------AA-----------
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|21 ): TATTCGTGTATATTAGGAAAAAAATCACTACTTCTCATTATATAGTCAAACCAATTNAAGCCTCAATGGGCTTCCGTAA
Unaligned ( gi|24 ): ATTCGTTTATACGTTACTAATTGCATTTGCAAAAATAAATCTAATTGAAAATGAAACATA
Unaligned ( gi|28 ): AATAAAAAATATCTCTTTATGTACTGGTCTCAATGGGCTTCCGTAT
Unaligned ( gi|30 ): AAAATATCTTTCTTTATACTGGCCTCAATGGGCTTCCATA
Unaligned ( gi|31 ): TACGGAAGCCCATTGAGGCCAGTACATAGAGAGATCTTT
Unaligned ( gi|32 ): AAAAATATCTTTCTATACAAAGGCCTCAATGGGCTTCCG
Unaligned ( gi|33 ): AAATATCTTTCTATAAACTGGCCTCAATGGGCTTCTGTA
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Reference ( family-1494 )     :                                                                              NCAAAAGTTATT---G-CGTT--TAAACGCAAN--A-A--------TTAT--CG-CG-TTTAAN-CGC----AAAA--A--AT--TGCG---T-T-T--AAA--CG-CAA--A---TTGT-TTGCG-TTT--AAACGCA--AAC------ATTATTGCGTTT-------AAACGCAA--AA-A-TN-TTGC--GT-TTAA-AC-GC-AA-AANTN--ATT-GCG-TT--TAAACGCAA-A-------A--N-A------------T-TG-C--GNTT--------AA-A----CGCAA-A-T-ATT--A----T-T---GC-G-TTT--AAA-CGCAA-AA-G----AT-T-GC------GT----TT----AATT-------ATTG-C-GTTTAAAC-GC---AAAATTA-T-TA-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AATTTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--AACATGA----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAAT---ATATTGTGTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                    gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataaTG--GTT-GCG-TT----AACGCAA-A-------A--AGA------------T-TG-C--GATT--------AA-G----CGC-A-A-T-AAT--A----T-T---GC-G-TTT--AA---GCAA-AA-G------------------------T----AA-T-------ATTG-C-GTTTAAAC--C---AATATT--T-CA-TT-GCACGCTT--AA-acataaacggat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                           gggagccccattgaaggcagtttatagacataagttttttTT--ATT-GCG-TT--TAAACGCAA-A-------A--G-A------------T-TG-C--AATT--------AA-A------CAA-A-G-ATT--A----T-T---GC-G-TTT--AAA-CGCAA-AA-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             acggaagcccattgagg-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---ATAATCT----TTG---TT---T---AATTGCA--ATCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAAAAT---ATCTT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acggaagcccattgaggctt--AACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------AAAT---ATAGTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                                                                               CAAAAGTGGTTTATG-CGTT--TAAAACCAAATGA-A--------ATATGGTG-CG-TT-AAA-CGC----AAACTTA--ATAGTG-G---T-TAT--AAG--CG-CAA--A---A-AT-ATGCG-TTT--AAAC--A--AAA------GTTATTGCGATT-------AAACGCAA--AA---TA-TTATCGGA-TTAA-AA-GC-AA-AAATATTATT-GCG-GT--TTAACGCAA-T-------A--T--------------T-TT-T--GTTT--------AA-A----CACGC-A-T-ACTTCA----TGT---GCCG-TTT--AA--CGCAA-TA-A----AT-T-----------------------CT-------ATTGGC-GTTTAAAC-GC---AA--TTT-T-TT-TT-G--CGTTT--AA-ACGCG---A-G-TATAGTCTTGC-TTT---T---GAACGCG--AACATG--------C--CTTAAA--CGC-------AA-T---ATATTGTGTTTAata
gi|2                          :                                                                                gaaccgTATT---GGCGTT--TAAACGCAAT-------------TT----------TTT---------------------T--TGCG---T-T-T--AAA--CG-CGAGTA---TAGTCTTGCT-TTT--GAACGCG--AAC------A----TGC-CTT-------AAACGC-A--AT-A-TA-TTGT--GT-TTA-----GCAAA-AATTG--ATT-G-G-TT--TAAATGCAgcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         : gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttgtttaaacacgcatacttcatgtgccgtttaacgcaataaattcC------ATTATTGCATTT-------AAAAATAA--AATA-TTACTGC--GT-TTAA-AC-AA-AA-AATTA--ATT-GCG-TT--TAAACACAATA-------A--T-A------------T---------TT--------AA-A----CGCAA-A-G-ATT--A----T-T---G
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATAG----TTGC-GTTTAAA--CGC-------AAt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--Ataaaataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atagAA-GA-G----AT-----------AT----TT----ATTTT------ATTG-C-GTTTAAAC-GC---AAataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-------ATTG-CCGATTAAAC-G----AAAATCA-T-TA-TTCG--CGTTTTAAA-ACGCAAT-A-AATTT----TTGC-GTata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaA-G-------A--T-A------------T-TG-C--GATT--------AA-A----CGCAA-A-TTATT--A----T-T---GC-G-CTT--AAA-CGCAATAATG----AT-T-GC------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCTGTATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTT----TCAGAGTACG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --ATT-GTG-TT--TCAACGCAA-A-------C--G-A------------T-AG-C--GATT--------AA-A----CGCAA-A-ttcacta
gi|3                          :                                                                                  tgtTCATT---G-CGTT--TAAACGCAAC--A-A--------TTAT--CG-CG-TTTATT-CGC----AATA--A--AT--TGCG---T-T-A--AAA--CG-CAA--A---TTGC-TTACG-TTT--AAACACA--AAA------GT--TTGCAATT-------AAACGTGA--TG-T-TT-TTGC--TT-TTAA-AT-GC-AA----T-----------------AACGCAA-A-------AAGT-A------------T-TG-C--ATTT---------A-A----CGCAA-A-T-ATT--A----T-T---GC-G-TTT--AAA-CCTGA-AC-G----AT-T-GC-------------T----A-------------------TTAAAC-GC---AAAAATA-T-TA-TT-T--CGTTT--AA-ACACA---A-AAGTCA---TTGC-GTT---T---AAAAGCA-----ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC--------AAT---ATTTTa
gi|4                          :                                              acggaagcctattgaggacactacttagagatattttttTTATT---G-CGTT--TAAACGCAAT--A-A--------TCAT--CG-CA-ATTAAA-CGC----AAAC--ATCAT--T-CGGTTT-T-T--AAAAGCG-CAA--A---A-GA-TTGTA-TTT--AAACG----------------------TTT-------AAATGCAA--TC-T-TT-TTGC--GC-TTAA-TC-GT-AA-AAATA--TTT-GCG-TT--TAAATGCAA-A-------A--C-A------------T-TG-C--GTTT--------AA-A----CACAA---T-GTT--T----T-T---GC-G-TTT--AAC-CGCAATGA-T----AT-T-AT------ATATTATT----GATT-------ATTG-C-GCTTAAAC-GC---AAAAT------A-TT-G--CTATT--AA-ACGCA---A-AAATTA---TTGC-GTT---T---AAACGCAATAATATT-----TTGC-GTTTAAaatatcaattatttttgtgt
gi|5                          :                                                                   tgaaacccattgaggccagttgatagacaatattttAACGCAAT--A-AGTATTGCGTTAT--TG-CG-TTTAAT-CCC----AAAA--A--AA--TGTG---T-T-T--AAA--CG-CAA--AT--TTGC-TTGCG-TTT---GACGCA--AAA------G--ATTGCGATT-------AAATGCAA--AG-ATTA-ATGC--GT-TTAA-AT-GC-AA-TA-TT--ATT-GCG--T--TAAATGCAA-AAGTAT--A--C-A------------T-TG-C--GTTT--------AA-T----CGTAATT-T-ACT--A----T-T---G------T--AAA-TA-AA-AA-GTTCAAT-T-GCAGAAATGT----TT----ATTTC------CTTT-C-GTTTtc
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Reference ( family-1494 )     :                                                                                     NCAAAAGTTATT---G-CGTTTAAACGCAAN--AA--------TTAT--CG-CG-TTTAAN-CGCAAAA--A--A----T--TGCG---TT-T-AAA--CG-CAA--A-TTGT-TTGCG-TTT--AAACGCA--AAC------GTTATT------GC-GTTT-------AAACGCAA----AA-A-TN-TTGC--GT-TTAA-AC-GC-AA-AANTN--ATTGCG-TTTAAACGCAA-A-------A--N-A------------TTG-CGNTT--------AA-A----CGCAA-A-T-ATT--A----T-T---GC-G-TT--T--AAACGCAA-AA-G----AT-T-GC------GT----TT----AATT-------ATTG-C-GTTTAAAC-GC---AAAATTA-T-TA-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AAT-TTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--AACATGA----TTGC-GCTTAAA--CGC-------AAAT---ATATTGTGTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
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gi|13                         :                                                                                              ATT---G-TGATTAAACGCA--------------TTAT--TGGCGATTTAATGCGCAAAA--A--A----T--TGCG---TT-TTAAA--CG-CAA--A-TTGT-TTG------------GCA--AAC------TTT-TT------GC-GTTTTGTTTAAAAACGCAAAC--AA-A-CT-TTGC--GT-Tttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    caggaaaccattgaggccaagtacaatagaaatatttttttttttaTTG-C-GTTTCAACCGC---AAAAATAAT-TA-TC-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AAT-TTAAA-CTGC-TTT---T---AAACGTA--AACATGA----TTGCCACTTAAAAACAC-------AAAT---AT-TTGTGTATATACCCATAGCAATGAGCCTTTTTC----TCATAG-AGGAACACCGCAACCCTATTTGTTACTccaaagta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TT--ATTGC--TTTAAACGACG-G-------G--T-A------------TTA-CGATT--------AA------TGCAA-A-A-ATT--A----T-T---GC-G-ATGGT--AAACGCAA-AA-G----ATCT-GC--------------------------------A-C-GTTT-AAC-GC---AAGATTA-TGTA-T-------TTA--AA-ACGCA---A-ATTCTTAT--TTGG-TTT---T---AAAa
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctacggaagcccattgagccggtttatgaaaaattttta-A------------TTG-CGATTGGTATAAAAA-A----CGCAG-A-TAATTAAA----T-CTAGGC-GATA--TAAAAACGCAA-AA-G----AT-TGGC------AG----TT----AA--------------------AAAC-GC---AATATCA-A-TAGTC-G--CGTTT--AA-ACGCA---A-AAG-ATA----TGC-GTTACAT---AAACG
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gagatattttttttcAAACGCAA-A-------A--G-A------------TTGGCAGTT--------AA-AAA--CGCAA---T-ATC--AATAGT-C---GC-G-TT--T--AAACGCAA-AA-G----ATAT-GC------GT----Tgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                             gagatattttttttcattgcgattggtataaaaaacgcagataattaaatctaggcgatataaTG--GTTGCG-TT--AACGCAA-A-------A--AGA------------TTG-CGATT--------AA-G----CGCAA---T-AAT--A----T-T---GC-G-TT--T--AA--GCAA-AA-G------------------------T----AAT--------ATTG-C-GTTTAAAC--C---AATATT--T-CA-TT-GCACGCTT--AA-acataaacggat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                    gggagccccattgaaggcagtttatagacataagttttttTT--ATTGCG-TTTAAACGCAA-A-------A--G-A------------TTG-CAATT--------AA-A------CAA-A-G-ATT--A----T-T---GC-G-TT--T--AAACGCAA-AA-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 acggaagcccattgagg-TT-G--CGTTT--AA-ACGCA---ATAAT-CT----TTG---TT---T---AATTGCA--ATCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAAAAT---ATCTT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acggaagcccattgaggctt--AACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------AAAT---ATAGTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                                                                                      CAAAAGTGGTTTATG-CGTTTAAAACCAAATGAA--------ATATGGTG-CG-TT-AAA-CGCAAACTTA--A----TAGTG-G---TTAT-AAG--CG-CAA--A-A-AT-ATGCG-TTT--AAAC--A--AAA------GTTATT------GC-GATT-------AAACGCAA----AA---TA-TTATCGGA-TTAA-AA-GC-AA-AAATATTATTGCG-GTTTAACGCAA-T-------A--T--------------TTT-TGTTT--------AA-A----CACGC-A-T-ACTTCA----TGT---GCCG-TT--T--AA-CGCAA-TA-A----AT-T-----------------------CT-------ATTGGC-GTTTAAAC-GC---AA--TTT-T-TT-TT-G--CGTTT--AA-ACGCG---A-G-T-ATAGTCTTGC-TTT---T---GAACGCG--AACATG--------C--CTTAAA--CGC-------AA-T---ATATTGTGTTTAata
gi|2                          :                                                                                       gaaccgTATT---GGCGTTTAAACGCAAT------------TT----------TTT---------------------T--TGCG---TT-T-AAA--CG-CGAGTA-TAGTCTTGCT-TTT--GAACGCG--AAC------A----T------GC--CTT-------AAACGC-A----AT-A-TA-TTGT--GT-TTA-----GCAAA-AATTG--ATTG-G-TTTAAATGCAgcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         : gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttgtttaaacacgcatacttcatgtgccgtttaacgcaataaattcC------ATTATT------GC-ATTT-------AAAAATAA----AATA-TTACTGC--GT-TTAA-AC-AA-AA-AATTA--ATTGCG-TTTAAACACAATA-------A--T-A------------T------TT--------AA-A----CGCAA-A-G-ATT--A----T-T---G
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               T-TTA---TTGC-GTT---T---AAACGCA--At
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atagAA-GA-G----AT-----------AT----TT----ATTTT------ATTG-C-GTTTAAAC-GC---AAataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T-------ATTG-CCGATTAAAC-G----AAAATCA-T-TA-TTCG--CGTTTTAAA-ACGCAAT-A-AAT-TT----TTGC-GTata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaA-G-------A--T-A------------TTG-CGATT--------AA-A----CGCAA-A-TTATT--A----T-T---GC-G-CT--T--AAACGCAATAATG----AT-T-GC------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTCTGTATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTT----TCAGAGTACG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TA---TTGT-GTT---T---CAACGCA--AAC--GA----TAGC-GATTAAA--CGC-------AAAttcacta
gi|3                          :                                                                                         tgtTCATT---G-CGTTTAAACGCAAC--AA--------TTAT--CG-CG-TTTATT-CGCAATA--A--A----T--TGCG---TT-A-AAA--CG-CAA--A-TTGC-TTACG-TTT--AAACACA--AAA------GT--TT------GC-AATT-------AAACGTGA----TG-T-TT-TTGC--TT-TTAA-AT-GC-AA----T--------------AACGCAA-A-------AAGT-A------------TTG-CATTT---------A-A----CGCAA-A-T-ATT--A----T-T---GC-G-TT--T--AAACCTGA-AC-G----AT-T-GC-------------T----A-------------------TTAAAC-GC---AAAAATA-T-TA-TT-T--CGTTT--AA-ACACA---A-AAG-TCA---TTGC-GTT---T---AAAAGCA-----ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC--------AAT---ATTTT
gi|4                          :                                                     acggaagcctattgaggacactacttagagatattttttTTATT---G-CGTTTAAACGCAAT--AA--------TCAT--CG-CA-ATTAAA-CGCAAAC--ATCA----T--T-CGGTTTT-T-AAAAGCG-CAA--A-A-GA-TTGTA-TTT--AAACG-----------------------------TTT-------AAATGCAA----TC-T-TT-TTGC--GC-TTAA-TC-GT-AA-AAATA--TTTGCG-TTTAAATGCAA-A-------A--C-A------------TTG-CGTTT--------AA-A----CACAA---T-GTT--T----T-T---GC-G-TT--T--AACCGCAATGA-T----AT-T-AT------ATATTATT----GATT-------ATTG-C-GCTTAAAC-GC---AAAAT------A-TT-G--CTATT--AA-ACGCA---A-AAA-TTA---TTGC-GTT---T---AAACGCAATAATATT-----TTGC-GTTTAAaatatcaattatttttgtgt
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10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-1494 )     :                                                                                     NCAAAAGTTATT---G-CGTTT--AAACGCAA-T-AA--------TTAT--TG-CG-TTTAAN-CGC----AAAA--A--AT--TGCG---TT-T-AAA--CG-CAA--A-TTGT-TTGCG-TTTAAACGCA--AACGTT---ATTGCGTTT-------AA-AC-G-CAA--AA-A-TN-TT-GC--GT-TTAAACGC-AA-A--A-T-TN-----ATT----GCG-TT-T--------AAA--CGCAA-A-----A--N-A----TTG-C--GNTTAA-A----CGCAA-A-TATT--A----T-TGC-GTT--T---AAACGCAA-AA-G----AT-TG-C------GT----TT----AATT-------ATTG-C-GTTTAAAC-GC---AAAATTA-T-TA-TT-G--CGTTT--AAACGCA--A-AAT-TTA---TTGC-GTT---TAAACGCA--AACATGA----TTGC-GCTTAAA--CGC-------AAAT---ATATTGTGTATANACTCATAGCAACGAGCCTTCTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
gi|1                          :                                                                                                T---G-CGTTT--AAACACAA-A-GA--------TTAT--TA-CC-TTTAAA-CGC----AACA--G--AT--TGCT---TT-T-AAA--TG-CAAC-G-TTTT-TTGCG-TTTAAACGCATTGATAGT---ATTGCGCTT-------AA-AC-G-CAA--AA-A-TA-TT-GC--GT-TTAAACGC-AA-A--A-C-TT-----ATT----GCA-TT-T--------ATA--CATAA-A-----A--T-A----TTG-C--GATTAA-A----TGCAA-ACTATT--A----T-TGC-GTT--T---AAACATAA-AA-G----AT-TG-T------GT----TT----AATC-------ATCA-C-GCTTAAAC-GC---AAAATTA-T-TA-TT-G--CGTTT--AAACGCA--A-AAT-TTA---CTGC-TTT---TAAGCGCA--AATATGA----TTGC-AATTAAA--CAC-------AAAT---ATATTGTTTATATACTCATAACAGTGA---TTCTTT----TCAAAGTAGGAACACCACAACTCTCTTTG-TACT
gi|10                         :                                                                                    gtaaaaaaTTATT---G-CGTTT--AAAAGCAA-T-AA--------TTAT--TG-CA-TTAATT-CGCAAAAAAAA--A--AT--T-CG---TT-T-AGA--CGATAA--A-CT-T-TTGCA-ATT-AACGCA--AACTTTTAGATT--ATTT-------------GTCAA--AC-A-----------GT-TTAAACAC-AATA--A-G-AA-----ATTG---GCG-TT-T--------AAA--CACAA-A-----A--G-A----TTG-C--GTTTAA-A----CGCAA-
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tacggaggcccattgaggctagtttatagaaagatttttttaTT--T---AAACGCAATAATA----AT-TG-T------CT----TT----AATTGCAAACAATTG-C-GTTTAAAC-GC---AAANNNN-N-NN-NN-N--NNNNN--NNNNNNN--N-NNN-NNN---NNNN-NNN---N---CGCA--AACATCA----TTGC-ACTTAAA--TAC-------AAATTATATATTGTGTATAAACTCATAGCAACGAACCTTCTTC----TCAAAGTACGCACACCACAACCCTATTTC-TACTaaaatatctatgtactgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                         -G-CAG--AA-G-TC-TT-AT--ATATTTAACGC-AA-T--A-T-TA-----ATT----GCA-TT-T--------AAC--AGCAA-A-----G--A-A----TTG-C--GTTTAA-A----CGC-A-A-TGTT--T----T-TGC-GTT--T---AAACGCAA-AG-A----AA-TG-C-------------T----AAAG-------ATCG-C-GATTAAAC-GC---AAAA-TA-T-CA-TT-G--CGTTT--AAACGCA--A-AAA-TTA---tta
gi|13                         :                                                                                              ATT---G-TGATT--AAACGCA--------------TTAT--TGGCGATTTAATGCGC----AAAA--A--AT--TGCG---TT-TTAAA--CG-CAA--A-TTGT-TTG----------GCA--AACTTT----TTGCGTTTTGTTTAAAA-AC-G-CAAACAA-A-CT-TT-GC--GT-Tttcttttagtatcaattacatgtgacaggtcgtgaatgat
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         gagatattttttAAACGC-AG-ATAA-T-TA-----AATCTAGGCG-ATAT--------AAAAACGCAA-A-----A--G-A----TTGGC--AGTTAA-AAA--CGCAA---TATC--AATAGT-CGC-GTT--T---AAACGCAA-AA-G----ATATG-C------GT----Tgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gagatattttttttcattgcgattggtataaa-T-TG-----GTT----GCG-TT-----------AA--CGCAA-A-----A--AGA----TTG-C--GATTAA-G----CGCAA---TAAT--A----T-TGC-GTT--T---AA--GCAA-AA-G------------------------T----AAT--------ATTG-C-GTTTAAAC--C---AATATT--T-CA-TT-GCACGCTT--AAacataaacggat
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                            gggagccccattgaaggcagtttatagacataagttttt-T-TT-----ATT----GCG-TT-T--------AAA--CGCAA-A-----A--G-A----TTG-C--AATTAA-A------CAA-A-GATT--A----T-TGC-GTT--T---AAACGCAA-AA-G----gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         acggaagcccattgagg-TT-G--CGTTT--AAACGCA--ATAAT-CT----TTG---TT---TAATTGCA--ATCTT------TTGC-GTTTAAA--CGCAATAAAAAAAT---ATCTT-TCTATAAACTGACCTCAATGAGCTTCCaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            acggaagcccattgaggctt--AACATGA----TTGC-ACTTAAA--AAC-------AAAT---ATAGTGTGTATATTCTCATAGCAACGATCCTTTTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACT
gi|2                          :                                                                                      CAAAAGTGGTTTATG-CGTTT--AAAACCAAATGAA--------ATATGGTG-CG-TT-AAA-CGC----AAACTTA--ATAGTG-G---TTAT-AAG--CG-CAA--A-A-AT-ATGCG-TTTAAAC--A--AAAGTT---ATTGCGATT-------AA-AC-G-CAA--AA---TA-TT-ATCGGA-TTAAAAGC-AA-A--AATATT-----ATT----GCG-GT-T--------TAA--CGCAA-T-----A--T------TTT-T--GTTTAA-A----CACGC-A-TACTTCA----TGTGCCGTT--T---AA-CGCAA-TA-A----AT-T-----------------------CT-------ATTGGC-GTTTAAAC-GC---AA--TTT-T-TT-TT-G--CGTTT--AAACGCG--A-G-T-ATAGTCTTGC-TTT---TGAACGCG--AACATG--------C--CTTAAA--CGC-------AA-T---ATATTGTGTTTAata
gi|2                          :                                                                                       gaaccgTATT---GGCGTTT--AAACGCAA-T-----------TT----------TTT---------------------T--TGCG---TT-T-AAA--CG-CGAGTA-TAGTCTTGCT-TTTGAACGCG--AACA-------TGC-CTT-------AA-AC-G-C-A--AT-A-TA-TT-GT--GT-TTA---GCAAA-A--A-T-TG-----ATT----G-G-TT-T--------AAA--TGCAgcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         : gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttgtttaaacacgcatacttcatgtgccgtttaacgcaataaattcCATT---ATTGCATTT-------AA-AA-A-TAA--AATA-TTACT-GC--GT-TTAAACAA-AA-A--A-T-TA-----ATT----GCG-TT-T--------AAA--CACAATA-----A--T-A----T--------TTAA-A----CGCAA-A-GATT--A----T-TG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-TTA---TTGC-GTT---TAAACGCA--At
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atagAA-GA-G----AT-----------AT----TT----ATTTT------ATTG-C-GTTTAAAC-GC---AAataaatatctcttcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atagCTCATAGCAACGAGCCTTCTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-------ATTG-CCGATTAAAC-G----AAAATCA-T-TA-TTCG--CGTTTTAAAACGCAATA-AAT-TT----TTGC-GTata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaA-G-----A--T-A----TTG-C--GATTAA-A----CGCAA-ATTATT--A----T-TGC-GCT--T---AAACGCAATAATG----AT-TG-C------
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCTGTATACATTCATAGCAGCGAGCTTTCTTT----TCAGAGTACG
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TA---TTGT-GTT---TCAACGCA--AAC--GA----TAGC-GATTAAA--CGC-------AAAttcacta
gi|3                          :                                                                                         tgtTCATT---G-CGTTT--AAACGCAA-C-AA--------TTAT--CG-CG-TTTATT-CGC----AATA--A--AT--TGCG---TT-A-AAA--CG-CAA--A-TTGC-TTACG-TTTAAACACA--AAAGT-----TTGCAATT-------AA-AC-G-TGA--TG-T-TT-TT-GC--TT-TTAAATGC----A--A-T--------------------------------AA--CGCAA-A-----AAGT-A----TTG-C--ATTT-A-A----CGCAA-A-TATT--A----T-TGC-GTT--T---AAACCTGA-AC-G----AT-TG-C-------------T----A-------------------TTAAAC-GC---AAAAATA-T-TA-TT-T--CGTTT--AAACACA--A-AAG-TCA---TTGC-GTT---TAAAAGCA-----ATAATCTTTTGC-GTTTAAT--CGC--------AAT---ATTTT
gi|4                          :                                                     acggaagcctattgaggacactacttagagatattttttTTATT---G-CGTTT--AAACGCAA-T-AA--------TCAT--CG-CA-ATTAAA-CGC----AAAC--ATCAT--T-CGGTTTT-T-AAAAGCG-CAA--A-A-GA-TTGTA-TTTAAACG-------------------TTT-------AA-AT-G-CAA--TC-T-TT-TT-GC--GC-TTAATCGT-AA-A--A-A-TA-----TTT----GCG-TT-T--------AAA--TGCAA-A-----A--C-A----TTG-C--GTTTAA-A----CACAA---TGTT--T----T-TGC-GTT--T---AACCGCAATGA-T----AT-TA-T------ATATTATT----GATT-------ATTG-C-GCTTAAAC-GC---AAAAT------A-TT-G--CTATT--AAACGCA--A-AAA-TTA---TTGC-GTT---TAAACGCAATAATATT-----TTGC-GTTTAAaatatcaattatttttgtgt
gi|5                          :                                                                          tgaaacccattgaggccagttgatagacaatattttAACGCAA-T-AAGTATTGCGTTAT--TG-CG-TTTAAT-CCC----AAAA--A--AA--TGTG---TT-T-AAA--CG-CAA--ATTTGC-TTGCG-TTT-GACGCA--AAAG-----ATTGCGATT-------AA-AT-G-CAA--AG-ATTA-AT-GC--GT-TTAAATGC-AA-T--A-T-T------ATT----GCG--T-T--------AAA--TGCAA-AAGTATA--C-A----TTG-C--GTTTAA-T----CGTAATT-TACT--A----T-TG-------T---AAATA-AA-AA-GTTCAAT-TG-CAGAAATGT----TT----ATTTC------CTTT-C-GTTTtc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                  gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgCGTT---ATTGCGTTT-------AA-TC-C-CAA--AA-A-AA-T--GT--GT-TTAAACGC-AA-A--T-T-TG-----CTT----GCG-TT-T--------GA---CGCAA-A-----A--G-A----TTG-C--GATTAA-A----TGCAA-A-GATT--A----A-TGC-GTT--T---AAATGCA----------AT------------------------ATT-------ATTG-C-G-TTAAAT-GC---AAAAGTA-TACA-TT-G--CGTTT--AATCGT-----AAT-TTA---CT
gi|6                          : gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaatTTATT---G-CGTTTGTAAACGCAA-T-AA--------TT-T--TG-CG-TT-AAT-CGC----AAAC--G---T--TGCG---AT-T-AAA--CG-CAAAGA-TCA--TTGAGTTTTAAACGCA--AA-G-----ATTGGCTTT-------AA-AC-G-CAG--AT-A-TT-AT-GC--TT-TTAAACTC-AA--------TA-----AT------CA-TT-T--------AAA---GCAA-A-----AT-T-A----TTT-CATATTTAATC----CGCAA-A-CAAA--G----T-TGCGGTT--TTAAAAACGCAA----------------------GT----TT------T---------TTG-C-GTTTAAAC-Gcaatacttattgcgtt
gi|7                          :                                                                         acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggtttttttttt-T-GA--------TTAT--TG-CA-TTTAAA-CAC----AAAG--G--AT--ATCG---TT-T-AAT--TG-CAA--G-CCGT-T-GCG-TTTAAACGTA--AAGATC---ATTGTGTAT-------AA-AC-G-
gi|8                          :                                                                cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGCGTTT-------AACACTG-CAA--AA-T-TG-TTTGC--GT-T-AAACGC--A-A--A-T-TC-------T----GC-----C--------ACA---GTAA-A-----G--G-ACTGTTTG-C--GTTTAA-AAACTCACAA-A-GAGC--G----T-T---GTT--T----AACGCAA-GA------------C------GT----TTTTGAGATT--------TTG-C-GTTT-AAC-GCAAAAAAATTT-T-TT-TT-T--TGATT--TAACGCA--A-AAT-TTA---CTGCTATT---TAAACGTAC-AACATGA----TTGC-
gi|9                          :                                             tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttcattTTATT---G-CGTTT--AAACGCA----AA--------CGAT--TG-CG-ATTAAA-CGC----AAAG--A--ATTATGCG----C-T-GAA--CG-CAA-----TCT-TTTCGTTTTAAACGCAT-AA--TC---CTTGCGTTT-------AA-A-----AA--TA-A-CC-TT-GC--G--TCA---GC-AATA--A-T-CT-----ATG----TCGTTT-T--------AAA--CGCAATA-----AT-C-C----TTG-C--G-TTAACA----CGC-----TA----A----T-TG----T--T---AA--GCAA-AT-G----AT-TG-C------GT----TT----AA


blockSeqs                     :                                                                                                 TAT G     GT       ATAAGTATTGCG      GG  G  A  A  TG   AAAA   CTTAATAG   G  GTT  A T   AG  A   GTATAGTC      T   A      T   CTTTTAGA        TGTTTAA  C  T T   ACAAACT     T  CG  A        A  ATA  A A TTTATT   CTAG   TT A GGTATAAA   AA     T AGTATAC    CTGT   G AT T    AAACT      AT     TC ATAG G   C   GG TAA  A     AAGTTCAATTGCAGAAATGTTTATTTCC                     G C T      C  AAA    N AAT   G  C CA     TA       AT T   C   GTC    TA  ACA        AT     AATCTT    CAC     AA   AATAAAA    TAT  A         A              A        TCGA        C                    T
blockSeqs                     :                                                                                                 .   .     .        AATGAA            .   .  .  T  T    .      CATCAT     G  .    . .   .   .   ATTTGC        T   G      .   AGTTA           .        .  . .   AATATTA     .  .   .        .  TA   . . A        G      T  . .          .      T AAGT       .      . .  T    AAA        TT     .  .    .   G   .  .    A     TAATAATTGTCTTTAATTGCAAACAA                       . . A      .  .      A ATG   .  . .      .        .  .   .   AA     N   .          C      CA        AC      .    .          .    C         T              G        .           G                    .
blockSeqs                     :                                                                                                 .   .     .        ATAA              .   .  .  T  A    .      GAATTA     G  .    . .   .   .   AGATCA        .   A      .   CATTA           .        .  . .   AGATTA      .  .   .        .  TA   . . A        .      T  . .          .      . AAG        .      . .  A    TC         A      .  .    .   .   .  .    A     TGATATTATATATTATTGATTA                           . . T      .  .      T ATA   .  . .      .        .  .   .   T      T   .          .      GA        GT      .    .          .    A         A              G        .           A                    .
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Reference ( family-1494 )     :                                                                                     NCAAAAGTTATT---G-CGTTT--AAACGCAA-T-AA--------TTAT--TG-CG-TTTAAN-CGC----AAA-A--A--A---T--TGCG---TT-T-AAA--CG-CAA--A-TCGTTTGCG-TTTAAACGCA--AACGT-T---ATTGCGTTT-------AAACG--CAA--AA-A-T--N-TTGC--GT-TTAA-A--C-GCAA-A--A-T-TN-----AT---T----GCG-TT-TAAA--CGCAA-A-------A--N-A------------T-TG-C--GNT---TAA-A----CGCAA-A-T----------ATT--A----T-TGC---------GTT--T---AAACGC-----A-ANA--GA-------T--------T-T-----AT-T--T-----T-A----T----TG-C-GTT---T--------AA-AC-GC---AAA--ATTA---T-TATT-G--CG-TT-T--AA-A--CGCA--AAAT-TTA---TTG-C-G-TTTAAA--CGCA--A-AC--ATGA----TTGC-GCTTAAA----C-----GCAAAT---ATAT-TGTGT---ATANACTCATAGCAACGAGCCTT-CTTC----TCAAAGTANGAACACCGCAACCCTATTTG-TACT
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                 gagatattttttttcattgcgattggtataaa-------AAACG--CAA--AA-G-A--T-TGGC--AG-TTAA-AAAC-GCAA-T--A-T-CA-----ATAGTC----GCG-TT-TAAA--CGCAA-A-------A--G-A------------TATG-C--GTTACATAA-A----CGgat
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                gggagcccca-T-TG-----GT---T----GCG-TT---AA--CGCAA-A-------A--AGA------------T-TG-C--GAT---TAA-G----CGC-A-A-T----------AAT--A----T-TGC---------GTT--T---AA--GC-----A-AAA--G-------------------T-----A-----A-----T-A----T----TG-C-GTT---T--------AA-AC--C---AAT--ATT----T-CATT-GCACG-CT-T--AA-gaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                   gggagccccattgaaggcagtttatagacataagttttt-T-TT-----AT---T----GCG-TT-TAAA--CGCAA-A-------A--G-A------------T-TG-C--AAT---TAA-A------CAA-A-G----------ATT--A----T-TGC---------GTT--T---AAACGC-----A-AAA--Ggaag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   acggaagcccattgagg---------GTT--T---ATA-GA-----A-AGA--TA-------T--------T-T------T-T--T-----T-A----T----TG-C-GTT---T--------AA-AC-GC---AAA--A--------GATT-G--CA-AT-T--AA-A----CA--AAGA-TTA---TTG-C-G-TTTAAA--CGCA--A-Aaaaatatctttctataaactgacctcaatgagcttcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                acggaagcccattgaggct--A-AC--ATGA----TTGC-ACTTAAA----A-----ACAAAT---ATAG-TGTGT---ATATTCTCATAGCAACGATCCTT-TTTC----TCAAAGTAAGAACACCGAAACCCTATTTG-TACTtgacctcaatgagcttcc
gi|2                          :                                                                                      CAAAAGTGGTTTATG-CGTTT--AAAACCAAATGAA--------ATATGGTG-CG-TT-AAA-CGC----AAA-CTTA--A---TAGTG-G---TTAT-AAG--CG-CAA--A--AATATGCG-TTTAAAC--A--AAAGT-T---ATTGCGATT-------AAACG--CAA--AA---T--A-TTATCGGA-TTAA-A--A-GCAA-A--AATATT-----AT---T----GCG-GT-TTAA--CGCAA-T-------A--T--------------T-TT-T--GTT---TAA-A----CACGC-A-T----------ACTTCA----TGTGCC--------GTT--T---AA-CGC-----A-ATA--AA-------T--------T-C-----------------T-A----T----TGGC-GTT---T--------AA-AC-GC---AA----TTT---T-TTTT-G--CG-TT-T--AA-A--CGCG--AG-T-ATAGTCTTG-C-T-TTTGAA--CGCG--A-AC--ATG--------C--CTTAAA----C-----GCAA-T---ATAT-TGTGT---TTAata
gi|2                          :                                                                                       gaaccgTATT---GGCGTTT--AAACGCAA-T-TT--------TTTT--TG-CG-TTTAAA-CGC----GAGTA--T--AGTCT--TGCT---TT-T-GAA--CG-CGA--A--CA--TGC--CTTAAACGCA--A---TAT---ATTGTGTTT-------A---G--CAA--AA-A-TTGA-TTG---GT-TTAA-A--T-GCAgcaaaaattgattggtttaaatgca
gi|20                         :    gaaccgcaaaagtggtttatgcgtttaaaaccaaatgaaatatggtgcgttaaacgcaaacttaatagtggttataagcgcaaaaatatgcgtttaaacaaaagttattgcgattaaacgcaaaatattatcggattaaaagcaaaaatattattgcggtttaacgcaatatttttgtttaaacacgcatacttcatgtgccgtttaacgcaataaattcCAT-T---ATTGCATTT-------AAAAA--TAA--AATA-T--TACTGC--GT-TTAA-A--C-AAAA-A--A-T-TA-----AT---T----GCG-TT-TAAA--CACAATA-------A--T-A------------T---------T---TAA-A----CGCAA-A-G----------ATT--A----T-TG
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -----A-AGA--GA-------TAT------T-T-----AT-T--T-----T-A----T----TG-C-GTT---T--------AA-AC-GC---AAt
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                atagCTCATAGCAACGAGCCTT-CTTCTCGATCGAAGTACGCACACCGCAGCCCTATTTG-CACTcatgtactggccccaatgggcttccgtat
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -----T-A----T----TG-CCGAT---T--------AA-AC-G----AAA--ATCA---T-TATTCG--CG-TT-TTAAA-A--CGCAATAAAT-TT----TTG-C-G-Tata
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             gaA-G-------A--T-A------------T-TG-C--GAT---TAA-A----CGCAA-ATT----------ATT--A----T-TGC---------GCT--T---AAACGC-----A-ATAATGA-------T--------T-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-TCTGT---ATACATTCATAGCAGCGAGCTTT-CTTT----TCAGAGTACGgc
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TA---TTG-T-G-TTTCAA--CGCA--A-AC----GA----TAGC-GATTAAA----C-----GCAAAttcacta
gi|3                          :                                                                                         tgtTCATT---G-CGTTT--AAACGCAA-C-AA--------TTAT--CG-CG-TTTATT-CGC----AAT-A--A--A---T--TGCG---TT-A-AAA--CG-CAA--A-TTGCTTACG-TTTAAACACA--AAAGT------TTGCAATT-------AAACG--TGA--TG-T-T--T-TTGC--TT-TTAA-A--T-GC---A--A-T---------------------------AA--CGCAA-A-------AAGT-A------------T-TG-C--ATT---T-A-A----CGCAA-A-T----------ATT--A----T-TGC---------GTT--T---AAACCT-----G-AAC--G---------------------------------------A----T----TG-C-TAT---T--------AA-AC-GC---AAA--AATA---T-TATT-T--CG-TT-T--AA-A--CACA--AAAG-TCA---TTG-C-G-TTTAAA--AGCA--------ATAATCTTTTGC-GTTTAAT----C-----GC-AAT---ATTT-T
gi|4                          :                                                     acggaagcctattgaggacactacttagagatattttttTTATT---G-CGTTT--AAACGCAA-T-AA--------TCAT--CG-CA-ATTAAA-CGC----AAA-C--ATCA---T--T-CGGTTTT-T-AAAAGCG-CAA--A--AGATTGTA-TTTAAACG--------------------TTT-------AAATG--CAA--TC-T-T--T-TTGC--GC-TTAA-T--C-GTAA-A--A-A-TA-----TT---T----GCG-TT-TAAA--TGCAA-A-------A--C-A------------T-TG-C--GTT---TAA-A----CAC-A-A-T----------GTT--T----T-TGC---------GTT--T---AACCGC-----A-AT---GA-------TATTATATAT-T-----AT-TGAT-----T-A----T----TG-C-GCT---T--------AA-AC-GC---AAA--A--------TATT-G--CT-AT-T--AA-A--CGCA--AAAA-TTA---TTG-C-G-TTTAAA--CGCAATA-AT--ATT-----TTGC-GTTTAAaatatcaattatttttgtgt
gi|5                          :                                                                          tgaaacccattgaggccagttgatagacaatattttAACGCAA-T-AAGTATTGCGTTAT--TG-CG-TTTAAT-CCC----AAA-A--A--A---A--TGTG---TT-T-AAA--CG-CAA--ATTTGCTTGCG-TTT-GACGCA--AAAG------ATTGCGATT-------AAATG--CAA--AG-ATT--A-ATGC--GT-TTAA-A--T-GCAA-T--A-T-T------AT---T----GCG--T-TAAA--TGCAA-AAGTAT--A--C-A------------T-TG-C--GTT---TAA-T----CGTAATT-T----------ACT--A----T-TGTAAATAAAAAGTT--C---AATTGC-----AGAAA--TG-------T--------T-T-----AT-T--T-----C-C----T----TT-C-GTT---T--------tc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                     gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgCGT-T---ATTGCGTTT-------AATCC--CAA--AA-A-A--A-T-GT--GT-TTAA-A--C-GCAA-A--T-T-TG-----CT---T----GCG-TT-TGA---CGCAA-A-------A--G-A------------T-TG-C--GAT---TAA-A----TGCAA-A-G----------ATT--A----A-TGC---------GTT--T---AAATGC-----A-ATA----------------------------------T-----T-A----T----TG-C-G-T---T--------AA-AT-GC---AAA--AGTA---TACATT-G--CG-TT-T--AA-T--CGT----AAT-TTA---CT
gi|6                          : gatacctgtaacgagcgaaatgaaatcgaaacgaaatctaccgaaacgaaaggaaataaacatttctgcaattgaactttttatttacaatTTATT---G-CGTTTGTAAACGCAA-T-AA--------TT-T--TG-CG-TT-AAT-CGC----AAA-C--G------T--TGCG---AT-T-AAA--CG-CAAAGA-TCA-TTGAGTTTTAAACGCA--AA-G------ATTGGCTTT-------AAACG--CAG--AT-A-T--T-ATGC--TT-TTAA-A--C-TCAA--------TA-----AT---------CA-TT-TAAA---GCAA-A-------AT-T-A------------T-TT-CATATT---TAATC----CGCAA-A-C----------AAA--G----T-TGCG--------GTT--TTAAAAACGC-----A-AG------------------------------T-T--T-----T------T----TG-C-GTT---T--------AA-AC-Gcaatacttattgcgtt
gi|7                          :                                                                         acggaagcccgtgaggccagttacattggagaggtttttttttt-T-GA--------TTAT--TG-CA-TTTAAA-CAC----AAA-G--G--A---T--ATCG---TT-T-AAT--TG-CAA--G-CCG-TTGCG-TTTAAACGTA--AAGAT-C---ATTGTGTAT-------AAACG--
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                   cgtacggaagcccattgaggccagtacataaatagagttttttaattgcgttttatggcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--A----T-TGA---------GGT--C---AAGTAC-----ATAGA--GA-------G--------T-T-----TT-T--TCTTCAT-T----T----TG-C-GTT---T--------AACACTGC---AAA--ATTG---T---TT-G--CG--T-T--AA-A--CGCA--AATT-CTG---CCA-CAG---TAAA--GG------AC---TGT----TTGC-GTTTAAAAACTC-----ACAAA
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                           tacggaagccc-A-T--T-TTGC--GT-TTAACA--CTGCAA-A--A-T-TG-----TT---T----GCG--T-TAAA--CGCAA-ATTCTGCCA--C-AGTAAAGGACTGTT-TG-C--GTT---TAA-AAACTCACAA-A-G----------AGC--G----T-T-----------GTT--T----AACGC-----A-AGA--CG-------T--------T-TTTGAGAT-T---------------T----TG-C-GTT---T---------A-AC-GCAAAAAA--ATTT---T-TTTT-T--TG-AT-T--TA-A--CGCA--AAAT-TTA---CTG-CTA-TTTAAA--CGTAC-A-AC--ATGA----TTGC-gagcgttgtttaacgcaagacgtttttgagattttgcgtttaacgcaaaaaaattttttttttgatttaacgcaaaatttactgctatttaaacgtacaacatgattgc
gi|9                          :                                                tacggaagcccattgaggtcaagtacatagagagttttttcttcTTATT---G-CGTTT--AAACGCA----AA--------CGAT--TG-CG-ATTAAA-CGC----AAA-G--A--A---TTATGCG----C-T-GAA--CG-C-A--A-TC-TTTTCGTTTTAAACGCAT-AA--T-C---CTTGCGTTT-------AAA-----AA--TA-A-C--C-TTGC--G--TCA-------GCAATA--A-T-CT-----AT---G----TCGTTT-TAAA--CGCAATA-------AT-C-C------------T-TG-C--G-T---TAACA----CGCTA-A-TTGTTAAGCAAATG--A----T-TGC---------GTT--T---AAA-GC-----A-A
10 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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