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Reference ( gi|2 ) : ATATA-TAACGATCG-CTTTT-CATA--CAA-ATCCTTAAAA-T--TCA--CCATT----AAATTT--TT-GA---CAAAAA-TATTT-A-C-A-----AG-C-AAC-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-T--CA--AGGTG-C--AA-----AG--T-GT-TTATTCTTT-A---CTGCT--TAA-ACA--CA-GATA----AAAGTG--AA------C---CCTAAAG-G----ACA--CAGT--CGAGGG-TT-G-CCG-AATGA--TTTCATGCTGAAAAGGATGTA--CGGTACGTACCTGA--AT-A-TAAAA-AAT----G--CT--TTTA--ATCTATGTG-G---A-A---GTC-TC-A-------G--T-A--CA-CAGATT-CTTT--------------CATCTCCCCCTTTTTTTAAAAC-TCG-TATTTTG---AAAG---T-GTT-AGT-A--C--AAAAAA-AAAATG-----GATCTCGATCT-GCAG-T-GCTGTA--T--A-CGCCAAG--C-CG------TT--G-C--A-----------CA---TC-------TA-A--TT--AT----A--G-AG--T-G-CA---AT---GC---GT-TA-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-TAA--AC-AC--ATGTA--CCCAGGGCCTGT-ACC-----TCATTTCCATATG--TTTA-----GTGTTAGC-TTT-----------------ATGACG-C-----G----------A--C-CTC-------TAT-A-T-AT----A---------GA-AT---------GATT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C-A--A--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTT--TAAC--TCGCAACAAATG
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gi|6 : ttaaatatctaatgctacTCTCAATC--ATAGCT-GTTATC--T----TGCCAAG--T-CGCGTTAATT--T-C--A-----------CAA--TC-------TA-AGTTT--AC----A--G-AGCGT-G-CA---CC---GC---GT-TT-AT-T-GA------TTTT-C--TTG-TAA--AC-AC--A--------CAG----TGT-AGC-----CCG---------------------GTGTTACC-TTT-----------------GTGACGGC-----G----------A--C-TTTGTTT---TAT-A-T-AT----ATT-------GA-AT---------GATT--T-TT-A-CC---CA-G--------GTATTCGC--CAATTTCT-AGGTT-G-C-A--AT-G-CG-CA-TTG-GAA---A-G-GTT--TAAC--TCAC-ACAAATGtatagtcatgccgccaggtctgacata
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Reference ( family-1463 ) : ATATA-TAACGATCG-CTTT-GCATA--CAGACCCTT--AAAA-T--TAA-CCTTT---AAATTT--TCG---ACAAAAA-TATTT-AC-A-----AG-C-AAT-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-T--CA--AGGTG-C--AA-----AG--T-GT-TTA-TTCTTTA---CTGCT--TAA-ACA--CA----GG-TAAAGGT-G-A-A---TC-----CCTAAAG-G----ACA--CAG--CCGA-GG-TTTG-CCGAATG--AT-CT-AATGCTAAA-AAAGA-TGTAC----C---TACCCG-A-TTATAGAA-AA--------TTTA-ATCT-ATGT--G-G---A-A---GTC-TC-A-------G--T-A--CA-CATATT-CTTT--------------CACCCCCCCCTTTTCTT---A--C-TCG-TATTTTG---AAAG---T-GTT-AGT-A--C---AAAAAA--A------AAAC--GATCTNGA--TCT-GCAGC-GCTG--T----A-----CG-CCAAG--C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--TT--AT----A--G-A--GC-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-TAA--A-C-ACGT-GTA-C-CCGG----TGTACCC-----CG----T-------------GT--G-TTANC--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----CT------------T-------TAT-A-T-AT----A---------GA-A--T---------GATT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCACAACAAATG
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Reference ( family-1463 ) : ATATA-TAACGATCG-CTTT-GCATA--CAGACCCTT--AAAA-T--TAA-CCTTT---AAATTT--TCG---ACAAAAA-TATTT-AC-A-----AG-C-AAT-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-T--CA--AGGTG-C--AA-----AG--T-GT-TTA-TTCTTTA---CTGCT--TAA-ACA--CA----GG-TAAAGGT-G-A-A---TC-----CCTAAAG-G----ACA--CAG--CCGA-GG-TTTG-CCGAATG--AT-CT-AATGCTAAA-AAAGA-TGTAC----C---TACCCG-A-TTATAGAA-AA--------TTTA-ATCT-ATGT--G-G---A-A---GTC-TC-A-------G--T-A--CA-CATATT-CTTT--------------CACCCCCCCCTTTTCT--T---AC-TC-GTATTTTG---AAA---GT-G-TTAG-TA--CAAAAAA--A------AA-AC--GATCTNGA--TCTCG--CA-NN-GC-TG--T-A-----C---G-CC-AAG--C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GC-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-TAA--A-C-A-CGT-GTA-C-CCGG----TGTACCC-----CG----T-------------GT--G-TTANC--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----CT------------T-------TAT-A-T-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCACAACAAATG
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gi|13 : atactttgcatacagcccttaaTCA--CA-TA-GC-TG--T-A-----C---G-CC-AAG--C-CG--TT--A-------A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GT-C--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-TAA--A-C-AACGT-CTA-C-CCGG----TGT------------------------------------TACC--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----TT------------T-------TAT-A---A-T----A-----------------------------------A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCTAA---C-G-C----AT-T--G-CG-CACTTG-G-A---A-G-G-TTAA---TAACAACAAATcatagctgtacgccaagccgttaacatctaattatagagtccaccgcgtttattgattttctgtaaacaacgtctacccggtgttaccttgatgacgcgacttttataataacccaggattccaatctaacgcattgcgcacttggaaggttaataacaacaaatagtcagtacccggcactgaac
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gi|14 : ttaa--TCTCA--CA-TA-GC-TG--T-A-----C---G-CC-AAG--C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GC-G--CCAC---CGCTG-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-TAA--A-C-A-CGT-GTA-C-CC------------------CG------------------GT--G-TTACC--TTG--A-TGAT-GC-----G----------A--C----TT------------T-------TAT-A-T-A-T----A---------GA--T---------GA-TT--T-TTTA-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---G-G---TTAAC--TCACAACAAcatagctgtacgccaagccgttacacatctaattatagagcgccaccgctgttattgattttctgtaaacacgtgtaccccggtgttaccttgatgatgcgacttttatatatagatgattttttacccaggattccaatctacgcatgcgcattggaggttaactcacaacaatagttcagtgccggtgggcactgacaa
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gi|15 : tta-TA--CAAAAGA--T------GT-ACCCGATTTATA--TCTCA--CA-TA-GC-TG--T-A-----C---G-CC-AAG--C-CG--TTTAA----CA-A-----------CG-T--C-------TA-A--TTAT--AT----A-G-A--GC-G--CGAC---CG-GT-TAT-AT-T-GA------TTTT-CGTC-G-TAA--A-C---CA--------CTGA----TG-ACCC-----CG------------------G---G-TTACCA-TTG--C-T-AC-GC-----A----------A--C----TT------------T-------TAT-A-T-ATT----A---------TG-AT---------GATTT--T-TT-A-CC---C--G--------G-A-T--C--CAA--TTT-A---C-G-C----G--TCAG-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCATCACAAtctcacatagctgtacgccaagccgtttaacaacgtctaattatatagagcgcgaccggttatattgattttcgtcgtaaaccactgatgaccccgggttaccattgctacgcaacttttatatattatgatgattttttacccggatccaatttacgcgtcagcgcattggaaggtttaactcatcacaatatagtcatgccgccaggtctgacata
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Reference ( family-1463 ) : ATATA-TAACGATCG-CTTT-GCATA--CAGACCCTT--AAAA-T--TAA-CCTTT---AAATTT--TCG---ACAAAAA-TATTT-AC-A-----AG-C-AAT-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-T--CA--AGGTG-C--AA-----AG--T-GT-TTA-TTCTTTA---CTGCT--TAA-ACA--CA----GG-TAAAGGT-G-A-A---TC-----CCTAAAG-G----ACA--CAG--CCGA-GG-TTTG-CCGAATG--AT-CT-AATGCTAAA-AAAGA-TGTAC----C---TACCCG-A-TTATAGAA-AA--------TTTA-ATCT-ATGT---G-GA-A---GT-C-TC-A-------G--T-A--CA-CATATT-CTTT--------------CACCCCCCCCTTTTCT--T---AC-TC-GTATTTTG---AAA---GT-G-TTAG-TA--CAAAAAA--A------AA-AC--GATCTNGA--TCT-CA--C-ATA--GC-T------G--T-AC---G-CC-AAG--C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GC-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-T-AA--AC-A-CGT-GTA-C-CCGG----TGTACCC-----CG----T-------------GT--GTTANC--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----CT------------T-------TAT-A-T-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCACAACAAATG
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Reference ( family-1463 ) : ATATA-TAACGATCG-CTTT-GCATA--CAGACCCTT--AAAA-T--TAA-CCTTT---AAATTT--TCG---ACAAAAA-TATTT-AC-A-----AG-C-AAT-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-T--CA--AGGTG-C--AA-----AG--T-GT-TTA-TTCTTTA---CTGCT--TAA-ACA--CA----GG-TAAAGGT-G-A-A---TC-----CCTAAAG-G----ACA--CAG--CCGA-GG-TTTG-CCGAATG--AT-CT-AATGCTAAA-AAAGA-TGTAC----C---TACCCG-A-TTATAGAA-AA--------TTTA-ATCT-ATGT---G-GA-A---GT-C-TC-A-------G--T-A--CA-CATATT-CTTT--------------CACCCCCCCCTTTTCT--T---AC-TC-GTATTTTG---AAA---GT-G-TTAG-TA--CAAAAAA--A------AA-AC--GATCTNGA--TCT-CA--C-ATA--GC-T------G--T-AC---G-CC-AAG--C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GC-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-T-AA--AC-A-CGT-GTA-C-CCGG----TGTACCC-----CG----T-------------GT--GTTANC--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----CT------------T-------TAT-A-T-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCACAACAAATG
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gi|14 : ttaa--TCT-CA--C-ATA--GC-T------G--T-AC---G-CC-AAG--C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GC-G--CCAC---CGCTG-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-T-AA--AC-A-CGT-GTA-C-CC------------------CG------------------GT--GTTACC--TTG--A-TGAT-GC-----G----------A--C----TT------------T-------TAT-A-T-A-T----A---------GA--T---------GA-TT--T-TTTA-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---G-G---TTAAC--TCACAACAAcatagctgtacgccaagccgttacacatctaattatagagcgccaccgctgttattgattttctgtaaacacgtgtaccccggtgttaccttgatgatgcgacttttatatatagatgattttttacccaggattccaatctacgcatgcgcattggaggttaactcacaacaatagttcagtgccggtgggcactgacaa
gi|15 : ttaaaataatctgaatgctaaaagatgtaccgatatagaatctatgtggaagAAT---AT-CT-AATGCTACA-AAAGA-TG-----------TACCCG-ATTTATAtagttcagtgccggtgggcactgacaa
gi|15 : tta-TA--CAAAAGA--T------GT-ACCCGATTTATA--TCT-CA--C-ATA--GC-T------G--T-AC---G-CC-AAG--C-CG--TTTAA----CA-A-----------CG-T--C-------TA-A--TTAT--AT----A-G-A--GC-G--CGAC---CG-GT-TAT-AT-T-GA------TTTT-CGTC-G-T-AA--AC---CA--------CTGA----TG-ACCC-----CG------------------G---GTTACCA-TTG--C-T-AC-GC-----A----------A--C----TT------------T-------TAT-A-T-ATT----A---------TG-AT---------GATTT--T-TT-A-CC---C--G--------G-A-T--C--CAA--TTT-A---C-G-C----G--TCAG-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCATCACAAtctcacatagctgtacgccaagccgtttaacaacgtctaattatatagagcgcgaccggttatattgattttcgtcgtaaaccactgatgaccccgggttaccattgctacgcaacttttatatattatgatgattttttacccggatccaatttacgcgtcagcgcattggaaggtttaactcatcacaatatagtcatgccgccaggtctgacata
gi|16 : ttaaatatctaatgc--AA-----AT--T-GT-TT---TCTTC----CTGCT--TAA-A-A--CA-------TAGAAGT-G-G-A---TCAATTCCCTA----G----ACAATCAC--CCGA-GG-TTTG-CTGG-----------AATG--------AAA-TGTAT----CCGGTTCCC--A-TTATAA----------------G-ATCT-ATGTGGGG-GA-G---GTAA-TC-A-------A--T-AT-CATCATATT-CTTTGAATGCTTTAGGTCCACCTCCCCCTTTTCGAAA---ACATCGGTATTTTGGCTAAAGGGGT-GTTTAGTTACCCAAAAAA--A------AATGG--GATCTCGA--TTTGCA----GTG--GC-T------G--tatagtcatgccgccaggtctgacata
gi|17 : tcaa---G-CC-AAG--C-CG--TT--ATG--C--A-----------CA-T--C-------GA-A--C--T--GTCATTA-G-A--AT-G--C-GC---CACGT-T-T-ATCT-AACCCCCTTCTT-C--T-G-T-AACAGC-A-C-T-GTA-A-CCTGCGCTTGTACCCGTACTCA----T-------------TTCCATTA----TGG--A-TGAC-GCCG---G----------A--TT---CT------------C-------TAT-AAT-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--TCTT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--A--GCCG-CA-TTG-G-A---A-GAGTTTAAC--TCACAACAAAT
gi|18 : ---G-CC-AGG--C--G--TT--G----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--C--TTCATTCA-G-G-AATGC-G--C-GC---CACGT-T-T-ATAT-AA------TTTT-C--T-G-T-AA--AC-A-CAT-GTA-C-CTGGCT--TGTACCT-----CA----T-------------TT---CCATA--TGG--A-TGAC-GC-----G----------A--T----CT------------C-------TAT-A-T-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--C-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--A--G-CG-CA-TTG-G-A---A---GTTTAAC--TCACAACAAATtgcagtgccgcgc
gi|19 : ATAGTAACCATCG-CTTT-GCATA--CAGACACTA--ATAA-TA-TAC-TGTTTTAAAAATTT--TCG---ACAAAAA-TATTT-AC-ATTATTGA-C-AATAC---A-ATTGTTTACAT-ATTTACAAGGTCCA-TACA-A--CACTAGGTG-C---A-----AG--TGGT-TTA-TTCTTTC---AAGCA--TAA-ACA--CA----GG-TAAACGC-A-ACAGGTTC-----TCTTGAG-G----ACA--tgtcagtgccgcggcactga
gi|2 : taATATA-TAACGATCG-CTTT-TCATA--CAAATCCTT--AAAA-T--TCA-CCATT---AAATTT--TTG---ACAAAAA-TATTT-AC-A-----AG-C-AAC-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-T--CA--AGGTG-C--AA-----AG--T-GT-TTA-TTCTTTA---CTGCT--TAA-ACA--CA----GA-TAAAAGT-G-A-A----C-----CCTAAAG-G----ACA--CAG--TCGA-GG-GTTG-CCGAATG--AT-TT-CATGCTGAA-AAGGA-TGTACGGTACG--TACCTG-A-ATATAAAA-AATGCT----TTTA-ATCT-ATGT---G-GA-A---GT-C-TC-A-------G--T-A--CA-CAGATT-CTTT--------------CATCTCCCCCTTTTTT--TAAAAC-TC-GTATTTTG---AAA---GT-G-TTAG-TA--CAAAAAA--A------AA-ATG-GATCTCGA--TCT--G--C-AGT--GC-T------GTAT-AC---G-CC-AAG--C-CG--TT--G----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GT-G--C-AA---TGCGT-T-A-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-T-AA--AC-A-CAT-GTA-C-CCAGGGCCTGTACCT-----CA----TTTCCATATGTTTAGT--GTTAGC--TTT--A-TGAC-GC-----G----------A--C----CT------------C-------TAT-A-T-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--A--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCGCAACAAATG
gi|20 : ---CGCGT-T-TCAT-TTGC------GTTT-C----G-T-AA--A----------A-C-C-------TGT-TCC-----GG----T-------------GT--GTTACCCTTTG--A--GAC-GC-----G----------A--T----CT------------T-------TAT-A-TAA-T----ATTAC-----GATAT---------GA-----T-TT-A-CCTTTCA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-AT--C-G-C----A--TC-G-CG-CA-TTG-G-ATTCA-G-GTT--AC--TAACAACAAAT
gi|21 : -A-----AG-C-AAT-C---A-GTGG-----AT-A----------CCA-TATAAT--CA--AGGCA-C--AA-----AC--T-GT-TTA-TTATTTA---CTGCT--TAA-ACA--TATATAGG-TTAAAGT-G-ATA---AC-----CCTAAAG-G----ACA--TAG--CCGA-GG-TTTG-CTGAATG--Aagccagtgccgcggcactgactaaacaggataaaact
gi|22 : --T-AC---G-CC-AAG--C-CC--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-T--T--T--AT----C-G-A--GT-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-T-AA--TC-A-CAT-GTA-C-CCaa
gi|23 : --C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GT-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-T-AA--AC-A-AAT-GTACC-CCGGGCT-TGTACCT-----CA----T-------------cggactagtgttagttt
gi|24 : atG-TA--CAAAAA-----------A-AT--GATCTTGA--TCT-------GTAGTGC-T------GTAT-AC---G-CC-AAG--C-CG--T
gi|25 : CT-ATGT---G-GA-A---GA-T-TC-A-------G--T-A--CA-CATATT-CTTT--------------CACCCCCACCT
gi|3 : ATA-TAACTATCG-CTTT-GCATAAATAGATCTTT--AAAA-T--AAA-ACTTT---AAATTTC-TCG---ACAAAAA-TATTT-AT-A-----AG-C-AAT-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-TATCA---TGTG-C--ATTT---AG--T-GT-TTA-T-----A---ATG----TAA-ACAA-CA----GG-CA--------------------------------------------TCGA-GG-TTTGACCGAATG--AT-TT-AATATTAAA-AGAAA-TGTAC----C-----CCCG-A-T-ATAAAA-AAAAAAAGTTTTTA-ATCT-ATAT---ATGA-A---GT---TA-A-------G--TTA--CAACAGAT--CTTT--------------CACCCCCTTTTTTTCT--T---AC-TC-GTATTTTG---AAA---GTAG-TTAG-TA--CAAAAAA--C------AA-GC-------AG-------CA--C--T---GCGT------G--A-AT---G-CC-AAC--C-CC--CT--A----T--A-----------CA-A--C--------A-A--------------A-G-A--GT-G--C-AT---CGAGT-T-T-AT-TCGA------TTTT-C--T-GAT-AA--AA-A-CAT-GTAGG-CCGG----CCTACCC-----CGGAATT-------------AG--GTTAGCT-TTG--A-TGAC--C-----GAAA-------A--C----CTACATGATGCACCT-------CAT---T-A-T----G---------AA-AT---------GA-CTTGT-CT-A-AC---CACG--------G-ATT--C--CAG--TCT-A---C-G-A----A--T----CG-CA-AT--G-A---A-A-GTTTAATAATCACAACA
gi|4 : ATATA-TAACGAACG-CTTTTGCATA--CAGACCCTTA-AAAA-TAATAA-CTTTT---AAAATTGCTCGATTACAAAAA-TATTTAACGA-----AGAC-AAT-CCAAA-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA----------GTG-C--AA-----AG--C-GT-TTATTTTTTTA---TAGCT--TAA-ACGACCA----GG-TAAAGGT-GAA-A---TC-----CCTAAAA-GCGAAACA---AG--CCGAGGG-TTTG-CCAAATGACAT-TT-AATGCT--A-AAAGACTGT----------TACCCG-A-TTATAGAA-AAAAAGTT--TTTA-ATCT-ATGT---G-GA-A---GT-C-TC-ACAGTGCTG--T-A--CA-Ccaaaattgtcagtgcctctctcggcaac
gi|4 : -TTA--TA--GAAAAAA--AGTTTTTAA-TC--TATGTGGAAGTCT-CA--C-AGT--GC-T------G--T-AC---A-CC-AAG--C-C-----------------------------------------------------AT----A-T-A--GT-G--C-AC---CACAT-T-T-AT-T-GA------TTTT----------------------------------------ACCC-----CG------------------GT--GTTAGC--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----CT------------C-------TAT-A-T-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--A--G-TG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCGCAACAcaagccatatagtgcaccacatttattgattttaccccggtgttagcttgatgacgcgacctctatatatagaatgatttttacccaggattccaatctacgcaagtgcattggaaggtttaactcgcaacatggcactga
gi|5 : atatataacgaacgcttttgcatacagacccttaaaaataataacttttaaaattgctcgattacaaaaatatttaacgaagacaatccaaagtcgataccatatagtgcaaagcgtttatttttttatagcttaaacgaccaggtaaaggtgaaatccctaaaagcgaaacaagccgagggtttgccaaatgacatttaatgctaaaagactgttacccgaCCCG-A-TTATA-----A--------TGTATATCT-ATGTTT-G-GA-A---GT-C-T------------------CA-CATAGC-CTTA--------------CACCCtggcactga
gi|5 : atactggttgcatagaagacctctcgttagaatatacgattctattaggtgctacaatattgtatgatatt--TCT-CA--C-ATA--GC-C------T--T-AC---A-CCCAAGTTC-CG--TT--A----C--ATGTGGTTCTTACC-T--C-------TACA--T--T--AG----A-GTA--GT-GA-C-ACTCACGCGT-T---AT-T-GA------TTTT-CGCT-G-T-TA--A--------GTA-CACCGT----TAT-CTT-----CG------------------GT--GTTAAC--TTGGGA-TGAC-GCTGGATGTTTTTATATTA--C----CT------------T-------TAC-A-A-A-TTGTTA---------GA-ATCCTTTTATGGA-TT--A-TT-A-TTTT-CA-GCTTTTATAG-ATT--C--CAA--TCT-AA--CAG-C----A--T--G-CG-CA-CTG-G-A---A-G-GTTTAACA-TCACAACAAATGaagttccgttacatgtggttcttacctctacattagagtagtgacactcacgcgttattgattttcgctgttaagtacaccgttatcttcggtgttaacttgggatgacgctggatgtttttatattacctttacaaattgttagaatccttttatggattattattttcagcttttatagattccaatctaacagcatgcgcactggaaggtttaacatcacaacaaatgaggtcatagttgcgcgtactggactaa
gi|6 : atactggttgcatagaagacctctcgttagaatatacgattctattaggtgctacaatattgtatgatattcccgattataatgtatatctatgtttggaag-CTTT-GCATA--CAGACCCTTGCAAAA----TAA-TCTaggtcatagttgcgcgtactggactaa
gi|6 : ataATTTAG---TCT-CAATC-ATA--GC-T------G--TTATCTTG-CC-AAG--T-CGCGTT--AATTTC--A-----------CAAT--C-------TA-AGTT--T--AC----A-G-A--GC-GTGC-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-CT-T-G-T-AA--AC-A-CA---------CAG----TGTAGCC-----CG------------------GT--GTTACC--TTT--G-TGACGGC-----G----------A--CTTTGTT------------T-------TAT-A-T-A-T----ATT-------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------GTATTCGC--CAATTTCT-AGGTT-G-CA---A--T--G-CG-CA-TTG-GAA---A-G-GTTTAAC--TCAC-ACAAATGaatgcttctatagagactgtacccgaattatttagtctcaatcatagctgttatcttgccaagtcgcgttaatttcacaatctaagtttacagagcgtgcaccgcgtttattgattttcttgtaaacacacagtgtagcccggtgttacctttgtgacggcgactttgttttatatatattgaatgatttttacccaggtattcgccaatttctaggttgcaatgcgcattggaaaggtttaactcacacaaatgtccagtgccggcactgac
gi|7 : atactttgcatacagacccttgcaaaataatctaatgcttctatagagactgtacccgaattAAT---AT-CT-AA-GCTCAACAAAGA-C-TAG----C---TACCCG-A-TTATAGAA-AA---------------CTGATGT---G-GA-A---GT-C-TC-ACATAGCTG--T-A--CA-Ctccagtgccggcactgac
gi|7 : taatttgcatataagacccttaaAG--A------AA-ACT-GATGTGGAAGTCT-CA--C-ATA--GC-T------G--T-AC---A-CC-AAG--C-CGGTTT--A----CCCA-----------CA-T--C-------TA----T--T--AGCAA-A-G-A--GC-G--C-AC---CGCGTGT-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G----A--ACTA-CGT-GTA-C-CCGG----TGT-----------------------------------TAAC--T-G--ACTGAC-GC-----G----------ATAC----TT------------T-------TAT-A-T-A-T----AAGA------GA-AT---------G--TT--A-TT-A-CC---CA-G--------GGATT--CACCAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CGACA-CTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCACAACAAATcaagccggtttacccacatctattagcaaagagcgcaccgcgtgttattgattttctgaactacgtgtacccggtgttaactgactgacgcgatacttttatatataagagaatgttattacccagggattcaccaatctacgcatgcgacactggaaggtttaactcacaacaaattagtcagttgccgcgtaaacctgacc
gi|8 : taatttgcatataagacccttaaaatatctaagctcaacaaagactagctacccgattatCT-CA--C-ATAA-GC-T------G--T-AC-----CC-AAG--CACG--CT--A----C--AAA---------CA-A--CAAACCAATA-A--T--T--AC----A-G-A--GC-G--C-AC---CG-GT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-T-AA--AC-A-CTT-GTAGC-CCGG----------------------------------------GTTAACCTTTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----TT------------TAAAAAGGTAT-A-TTA-T----A---------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATTG-C--CAA--TCT-A---C-G-CACCAA--T--G-CG-CA-TTG-G-----A-G-GTTTAAC--TC-CCACAAAtagtcagttgccgcgtaaacctgacc
gi|9 : atacttgcatacaggacccttcaaaaacaatataatctaaattctacaaagagtatacccgactttataggtaAATA--AT-CT-AATGCT-AA-AAAGA-TG-----------TACCCG-A-TTATAG----------------A-ATCT-ATGT---G-GATA---GT-C-TC-A-------caatagtaaacagtgccgcggcacg
gi|9 : atacttctgcatacagacctcttaa--TCT-CA--C-ATA--AC-T------G--T-AC---GGCC-AAG--C-CG--TT--AT---C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----AAG-A--GC-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTTTC--T-G-T-AA---C-A-CGTTGT--------------TACCC-----CG----T-------------GT--GTTA-C--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----TT------------T-------TATTA-T-A-T----ACAATGTAGAGA-ATT--------GA-TT--T-GT-AGCC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-GGC----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCACAACAAATcataactgtacggccaagccgttatcacatctaattataagagcgcaccgcgtttattgatttttctgtaacacgttgttaccccgtgtgttacttgatgacgcgacttttattatatacaatgtagagaattgatttgtagcccaggattccaatctacggcatgcgcattggaaggtttaactcacaacaaatagtcagtgc
blockSeqs : G . T AA GC TAA A TTTAA GCTCGATT . A G TTATT A T A CAA A TTTAC T TTTACAAGGT . ACACTA G . CTTTA . G . T CAA . . AC TATA . G GGATCAATTC TA T CGAAACAAG G A C C GAC . G A C C TACGGTACGT . T AAAAAAAAAAGTTTTTA G GGG T T G CT . CAGTGCTGTA T T T GAATGCTTTAGGTC GAAAACATCG A GCT GGGGTGT T CC AGTTTTTAATCT T A AAG G AT . GT G . TA T CTT G C TT A CG TA CATGTGGTTCTTA A . AAACCAA C GT TA TC CATT A T AT C TG C TCA G A T C T CCCCCT T GTC A . CA C A ATGTACCCAGGGCCTGTACCTCATTTCCATATGTTTAGT C CT GG C G TGGATGTTTTTATATT TA TTTG ACATGATGCACCT T A A T ACAATGTAGA T CCTTTTATG T TG C T G TTT C CTTTTATA T CG AC TT A GGT A G ACCAAT C A C . A TTC . A AA
blockSeqs : . . . . A TA T TT CTCG . . . . . . . . . . . . . TTATA . . TT . . . . ACT . . A . . A AACAGGTTC TG . ACAATCAC . . A T G . . A . . TATCCGGT . . GAAAAAAAGTTTTTA . TT . . . AA . CATAGCTGTA A T T A TTAAAACTC A . GTAG . . TGTACCCG C C AAG . . . A . . TA . . . . . . GT . ATTTCA . . . . . . . TCA . . . . A G . . . C A C . . GCT . . . T . TGTAACCTGCGCTTGTACCCGTACTCATTTCC C CT . . . GAAA . T TAAAAAGG . . T . ATTAC . TT . . . . . TT . . G G . . . T . . GATT . A . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . T T TT TCG . . . . . . . . . . . . . ATCAA . . . . . . . ACT . . . . . C CAAATC AA . AACAGTT . . . C A . . A . . TACCCGT . . AAAAATGCTTTTA . . . . . C . GATTA . G T . TTACTC A . GTG . . AAATGGG C C A . . . . . . . . . . . . . . . TGCA . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . ATGTAGGCCGGCCTACCCCGGAATTAG C A . . . CGG . . G . . . . TGTTA . T . . . . . . . . . . . . . A . . GTCA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T T TT TTG . . . . . . . . . . . . . TATCA . . . . . . . AAT . . . . . A GATAAC AA . ACACAG . . . T A . . G . . TAGCT . . GGAAAT . . . . . C . ATAT . T T . . . AAAATGG C T A . . . . . . . . . . . . . . . CCCA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . ATGTACCTGGCTTGTACCTCATTT C T . . . G . . T . . . . AAGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T C TT CG . . . . . . . . . . . . . TCAA . . . . . . . ATA . . . . . A GAAATC AA . ACATAG . . . C G . . A . . TACC . . ATGTAT . . . . . C . GTTA . G C . . . AAAACTG G A A . . . . . . . . . . . . . . . CAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GTACACCGTTATCTTCGGT C . . . . G . . T . . . . ATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . . G GAAC A . . . . . C G . . C . . TACC . . TATTT . . . . . T . GTA . T . . . . CAAGC T G A . . . . . . . . . . . . . . . CAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . ACAGTGTAGCCCGGT T . . . . G . . T . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . G . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . G . . . . . TACC . . GAAAA . . . . . C . GTA . AATG G A . . . . . . . . . . . . . . . . TCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GTTGTTACCCCGTGT G . . . . G . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . A . . . . . TT . . GAA . . . . . C . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . ACTGATGACCCCGG C . . . . A . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . ACCTGTTCCGGTGT G . . . . G . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . AG . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GTCTACCCGGTGT G . . . . G . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GTGTACCCGGTGT A . . . . G . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GTGTACCCCAGT C . . . . G . . C . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GTGTACCCCGGT A . . . . G . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . GTGTAACCCGT A . . . . G . . T . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . TTGTAGCCCGG . . . . . G . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACCCCGGT . . . . . G . . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** T*** T* TCG***** TCAA***** ** ** ANT*** ** GAAATC********** TACC******** GAAAA************** *** GTA************ T* ** AAANCNG********** A** ****** *** ** *** T*** A************* AT******** **
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Reference ( family-1463 ) : ATATA-TAACGATCG-CTTT-GCATA--CAGACC-CTT--AAAA-T-TAAT--CTTT---AAATT-T-TCGA---CAAAAA-TATTT-A-C-A-----AG-C-AAT-C---A-GTCG-----AT-A----------CCA-TATA-T--CA--AGGTG-C--AA-----AG--T-GT-TTATTCTTTAN---T-GCT--TAA-ACA--CA----GG-TAAAGGTG----AAA---TC-CCTAAAG-G----ACA--CAG--CCGA-GG-TTTG-CCGAATG--AT-CT-AATGCTAAA-AAAGA-TGTA-C------CA---CCCG-------A-TTATAGAA-A----------A--------A------------TC-T-A-TGT--G-G---A-A---GTC-TC-A-------G--T-A--CA-CATATT-CTTT--------------CACCCCCCCCTTTTCTT---A--C-TCG-TATTTTG---AAAG---T-GTT-AGT-A--C--AAAAAA--A------A-ANCNGA---TCTNGA--T-CT-CA--C-ATA-G--C-T------G--T-A--C---G-CC-AAG--C-CG--TT--A----C--A-----------CA-T--C-------TA-A--T--T--AT----A-G-A--GC-G--C-AC---CGCGT-T-T-AT-T-GA------TTTT-C--T-G-TAA--A-C-A-CGT-GTA-C-CCGG----TGTACCC-----CG----T-------------GT--G-TTANC--TTG--A-TGAC-GC-----G----------A--C----CT------------T-------TAT-A-T-A-T----A---------GA-AT---------GA-TT--T-TT-A-CC---CA-G--------G-ATT--C--CAA--TCT-A---C-G-C----A--T--G-CG-CA-TTG-G-A---A-G-GTTTAAC--TCACAACAAATG
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gi|11 : ataAATA--AT-CT-AATTCT-AA-AAAGA-TGTA-C------C----C----------A-TTAT-----A----------A--------A------------TCTT-A-T-T--GCG---A-A---G-C-TC-AC------G--T-A--ccattataaatcttattgcgaagctcacgtagctgtacgccgatcgttacacatctaattattagagccgcatcgcgttttatttactttcgtaaaccacgtgtaacccgtgttaccttgatgacgcgacttgaagatatgagattgattttacccagaattcaatctacgcgattgcgacattgaaggttttaactcacaacacatcgcagcactggacta
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gi|19 : ATAGTAACCATCG-CTTT-GCATA--CAGACA-CTA--ATAA-TATACT--GTTTTAAAAATT-T-TCGA---CAAAAA-TATTT-A-C-ATTATTGA-C-AATAC---A-ATTGTTTACAT-ATTTACAAGGTCCA-TACA-A--CACTAGGTG-C---A-----AG--TGGT-TTATTCTTTCA---A-GCA--TAA-ACA--CA----GG-TAAACGCA----ACAGGTTC-TCTTGAG-G----ACA--tgtcagtgccgcggcactga
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