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gi|6 : c-ATTTTTG--AGAAA----CAAA-ACC--A-A-GG-AGTT-TAC---TTTA--T-TATAGA--CT-TTTTAAAAGA---ATT-GGCAC-GT-C-C--GAATTT--CT-CAA--TCCT-CCAT-AGAATAAC-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTCG---GT--T-T----CC-GG-TT-C-----AGTATAAATCCGAACAAATCTCG-GTCAGTTTCA--TCGCAAAACTTTCTT-TCAA--AAC---GGC-CA-----CACT-GGAATTAG----A----T-ACTA-TTCGT-GTT-TTG-TAGAATTTTAATC-TCGCTCC-AAC--A-----A-C-----TATCTAAA-TCCT--T-CCGAAATTTAAATGTT--AAA---AAATTCG-CAAAG-GCT-GTCC---GAC--A------------------CTTTCA-ATCTTGCGCTTTTTTGTTTATC-GT--GTACGGTAAGCAA-CCG-ACCGG-TAT-TT-------G-ACGTTATGA--AA-TT--AGAACC-CGA-A-----C-TAA--AT-TAAT--T-GCA-GA----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--A-T--T----TAGCT-A-ATTT--TTA-GAA----A-GG---C-ATT------A--------T-A-C-TG-TTTCC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG--TTT----T----CCGGA--GGC-A-T-T--A--T-AAGTCA-T--T-A-----------T-TTCC-----------------------G-------G--TGTG-A---TT----C-GTC--A-G-TTCT-TT--CT--AGGCGTGA--CA----G-TGTGAAA-A---T-TA----TCAA-AA-TT-TGG-G-ATCATA--TA-G--CAA--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGtta
gi|17 : ac-T-------AA---ATTAG-CTCCGT-C-C--GAATTT--CT-CAA--TCA--CCAT-AGAATAAA-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTTA---AC--TGTTTCCGG-AG---GC-----ATTATAatt
gi|9 : atttttgagaacaggaaacaagaagttttacttcagttaagacattaaa-------AA---ATT-G-CACCGT-C-C--GAATTT--CT-CAA--TCCT-CCAT-AGAAT---------------CCTGAAG-TTCG---GC--CTT----CG-AG-TT-----------CGAATCCG-ACA-----------------------CAAAAC-------------------GGC-CA-----CACT-GGAATTAAT--TA----C-TCTA-TTCGT-A-T-TTG-AAGAATTTT-CTC-TC-CTCC-AAC-AA-----A-T-----TATCTAAA-TCCT--C-C---AATTCAAATG-T--AAA---AA--TCG-CAAAG-ACT-GTCCA--GAC--A----------T-TTTT--TTTTTA-ATCTTGCGCTTTAGTGTTTA-C-GT--GTAC-GT-AGCAA-CCG-AC--G-T-T-TT-------G-ACGTTATGA--AT-TT--CGAACC-CGA-A-----C-T-A--AT-TAAT-AT-GCA-GA----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--A-T--T----TAGCT-G-A-TT--TTA-G-A----A-GG---C-ATT------A--T-----A-A-C-TG-TTTCC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG--TTT----C----C-GGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC-----------------------G-------G--TGTG-A---TT----C-GTC--A-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----G-TGA--AA-A---T-TA----TC-A-AA-TT-TGT-G-A-CATA--TA-G--C-A--A-AA--ACT-AT-A-C--AAA-ctgtttcggttgtgattcgtcagtttttctgggcgtacagtgaacattatc
gi|8 : acattttgagaacagaaccaaggagtttacttcatcaagacattaaa-------AA---ATT-G-CATCGT-C-C--GAATTT--CT-CAT---CCT-ACAT-AGAATAGC-TTT-TGAATTTC-TGA-G-TTCG---CC--TC------G-AG-TTGC-----AGT-TAAATCCG-AAAAAT-------------------GCAAAACTT--CTGTTAA--AAC---GGC-CAA----CACT-GGATGAAAG--CA----C-TCTA-TTCGT-G-T-T-G-TAGAA--TT-CTC-TC-CATC-A-C-AA-------T-----TACCTAAA-TC-T--C-C--GA--TTCAATG-T--AAA---GA--TCG-CAAAG-GCT-GTCCA--GAC--A---------TTATTTTTATTTTTA-A-----CA----ATGGTTTA-C-GTGT-TAC-GT-AGCAA-CCG-AC--GTT-T-TT-------G-ACGTTATGA--TT-TT--CGAACC-CG------------A--AC-TAA--A--GC---A----ATC-----G-TATGCAA--CGCGA---GGA-A-T-G--A-T--T----TAGTG-G-T-TT--TTA-G-AG---A-GTGGGC-ATTG-----A--T-----A-A-C-TG-TTTCC--G-------G-TG--T--G--A--C----CAT-A-A-C--TG--TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TT-C-----------------------G-------T--TG-A-A---TT----T-GTC--T-G-TG-T-GT--CT--AGGCGT-A--CA----G-TGA--AA-A---T-TA----TC---AA-TT-TGT-G-A--ATA--TA-GCAC-A--A-AA--ACTAAT-A-C---AA-AATGTtggtta
gi|10 : tacatttttgagagaataaaaccaagggtctacttttattgagacattg-------AA---ATT-G-CAT-GT-C-C--GAATTT--C--CAA--TCCT-CCAT-AAA-TAAC-TTT-AGAATTTCCTGA-G-TTCG---GC--GTT----CG-A---T-C-----AGTATAA-TCCG-ACAAA-CTCGCGTCAGTTTCA--TCGCAAAAACT--CT-TCAA--AAC---GGCACAT----CACTGGAAATT-AT--TA----C-TGTA-TTC-T-G-T-TCG--AGAA--TT-CTC-TC---TC-AAC-AA-----A-G-----CA-CT-AA-TCCT--C-C--GAA-TTAAATG-T--GAA---AA--TCG-CAAAGCAAT-GTCCA--GAC--A--------------CT--TTTTCAGATCTTGC-CTTT-TTG-TTA-CTGTAC---C-GT-AGCAACCCG-AC--G-T-T-TT-------ACCCGTTA-GA-----TT--CGAACC-CGA-A-----C-T-A--AT-TAAT-AG-GCA-AA----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA----GA-A-T-G--A-T--T----TAAGC-A-A-TT--TTA-G-A----AGGC---C-ATT------A--------T-A-C-TG-TTTCC--G-------G-TG-----A--A--C-----A--A-A-C--TG--TTT----C----CGG
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gi|15 : ttgctcgtcttT-ACA-G-A----ATCCA---G-T-GGC-A--TGCGA---GGG-A-T-A--AT--C----TA---T-G-A-TT--TTA-G-A----GGG-C-ATT-AA------TAACTGT------TT-C---A-------G-TG--T--G--A-------TAT-A-A-C--TG--TTTT---C----CGGGA--GGC-A-T-A--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--GGAGACCATTATAACTATTTCCTGG--TGTG-A---TT----C-AG-CA-G-T--T-TTTCCT--TTGCGT-A--CACTACGT-GGAAA-GAT--TA-TT-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ACT--TAGG--C-G--A-AACGACT-AT-ACC--AAA-AATGTta
gi|16 : TTTT-CAT-C-TAC-G-TA-GAAA-AA-GA-T--A-T-T-TT-------GA-----------AT-TT--TGAACC-CG-A----GCT-A-AT-TGAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGTGA---GGG-A-T-G--AT--T----TA-GCC-G-A-TT--TTA-G-A----AGA-A-ATT-A-------TAAATGT------TT-CC--G-------G-TA--T--G--A-------TAT-A-A-C--TG--TTT----C----CTGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-A--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------A--TTTG-A---TT----C-GG-CA-G-T--T-TT--CT--GAGCGT-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC-A-AT-TT-TGT-G-A-C-ATA--Ttta
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gi|17 : T-------AA---ATTAG-CTCCGT-C-C--GAATTT--CT-CAATCA---CCAT-AGAA-TAAA-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTTA---ACTGTTTCCG--G-AG---GC--ATTATAttcctgaagtttaactgtttccggaggcattatactgtttcggttgtgattcgtcagtttttctgggcgtacagtgaacattatc
gi|17 : atttttgagaacaggaaacaagaagttttacttcagttaagacattaaa--A-A-C--TG--TTT----C----CGG-A--GGC-A-T-T--A--T-A------C--T-G-----------T-TTCG--G-----------------------T--TGTG-A---TT----C-GT-CA-G-T--T-TTT-CT--GGGCGT-A--CA----GT-G--AA-CAT--TA-TC-ctgtttcggttgtgattcgtcagtttttctgggcgtacagtgaacattatc
gi|18 : atttttgagaacaggaaacaagaagttttacttcagttaagacattaaataaattagctccgtccgaatttctcaatcaccatagaataaatttagaatttcctgaagttt-TG--T--G--A--T----AA--A-A-C--TG--TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--C-A-----------------------T-TCCC--G-----------------------G--TG---A---TT----C-AA-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCAT-A--CG----GT-G--AA-AGT--TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--G-G--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
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gi|2 : gtGCCTAGAAGTT-ATGTAATATATGT-TA---TA-TAACATTT-TTGAG-A--ACA-AAA-CCA-AG--TAG-TTTA--C-TTTA--TT-AAG-A-CATTTATT-ATATT-T-TTGGA--AACACAATGGC-T-CGC---G-TTC--ACGACTG-ATTTTTT-AAT--AAAGTCAT-CGCA-A--AA-TT-TA-AAATA-TAAA-TC-------ATT--GAC--A-A--TA-T-CGATTT---TTCTCTTTTTTAAAAAAA-ATTTTTG-GAAG----TCATA---CCT--A-ATGG-AGAT-TATG--TTTCT-TTT--AG---CGT-------AA---ATT-G-CACCGT-C-C--GAATTT--CT-CAAACTT--CCAT-AAAA-TAAC-TTT-AAAATTTCCTGAAG-TTCG---GCTAT----G--G-AGTT-GC--AGTATAAATCCGA-CATATCTCG-GTC-AGTTTCAT--CGCAAAACTTC--T-TCAA--AAC---GGT-CA-----CACTGAA-ATTAAT--TA----T-TCTA-TTCGT-G-T-TT-G-TAGAAA-TTTC--TC-TC-CTTCAA-C-AA-----AT-----T-ATCTAAAT-CCT--C-CAAA-TTTAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGGA--T-GTCCA--GAC--A---------TT-TTTT--TTTTTA-ATCTTGCGCTTTATTGTTTA-CGTACGTAC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--AT-TT--CGAACC-CG------ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGT-C-ATT-A-------TTACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----TA--A-A-C--TG--TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GT-AA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----GT-G---A-AAT--TA-TC-A-AA-TC-TGT-G-A-C-ATATCTA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
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Reference ( family-1461 ) : NNNNGCCTAGAAGTTCATGTAATATATGT-TA---TA-TAACATTT-TTGAG-A--ACA-AAA-CCA-AG--GAG-TTTA--C-TTTA--TT-AAG-A-CATTTATT-ATATT-T-TTTGA--AACACAATGGC-T-CGC---G-TTC--ACGAATG-ATTTTTT-AAT--AAAGTCAT-CGCA-A--AA-TT-TA-AAATA-TAAAGTC-------ATT--GAC--A-A--TA-T-CGATTT---TTCTCTCTTTTAAAAAAA-ATTTTTG-GAGG----CCATA---CCT--A-ATGG-AGNT-CACG--TTTCT-TTT--AG---CGT-------AA---ATT-G-CACCGT-C-C--GAATTT--CT-CAATCCT--CCAT-AGAA-TAAC-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTCG---GCTNT----G--G-AGTT-GC--GGTATAAATCCGA-CAAATCTCG-GTC-AGTTTCAT--CGCAAAACTTC--T-TCAA--AAC---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAAT--TA----C-TCTA-TTCGT-G-T-TT-G-TAG-AA-TTTC--TC-TC-CTTCAA-C-AA-----AT-----T-ATCTAAAT-CCT--C-CGAA-TTTAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGGC--T-GTCCA--GAC--A---------TT-TTTT--TTTTTA-ATCTTGCGCTTTATTGTTTA-CGT-CGTAC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--AT-TT--CGAACC-CG-A----ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----TA--A-A-C--TG--TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GT-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
gi|1 : -TA---TA-CCACAGTTGTTGAGGA--ACA-AAAACCA-AGAGGAG-TTTA--CATTTA--TTTAAG-AACATTCATT-ATATT-AATTTGA--ACAACAATGGC-T-CGCTTAG-TTCTCACGAATATATTTTTT-AATGTAAACTCAT-CGCA-ATTAA-TTATATAAGTA-TAAAGCCCCAATGCACTTGGACTTA-AGGTA-TGCGATTTCTTTTCTCTCTCTAAATATAATATTTTTG-GAGGTTGCCCATAA--CCTTTA-A-GA-AGGTACATG--TTTCAATTT--AGTGCCGA-------AA---ATTTG-CTACGT-C-CCCGAATTTATCTACAATCTT--CCAC-A--A-TA-----------TTTCCTGAAG-TTCGCCGGCTAT----G--G-AGTT-GCCCGGTAT---T---A-TAAATC-CG-GTCCAGCTTCAT--CGCAAAACTTC--T-TCCA--AACCTCGGC-CAACACCCATCGGA-ATTAATATTAGCGGT-TCTA-CTCGT-G-T-TT-G-TAG-AA-TT-C--TC-TC-CT-CAA-CTAA-----ATATAAAT-ATTAGAAT-CCT--C-CGAA-TTTAAATGA--ATA---AA-T-CG-CAAAGGA--T-GTCCATGGGC---------------------TATTTC-AT-----GTTTTTTTCTTCA-CG--CGTACAG-TA-GCA--CC-GAAC--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--AT-TT--CGACCC-CG-AAT--ACT-A-TA-TAAT-AT-GCA-G-A----ATCTCCTTGCT-TGC-A--CGCGA---GGACA-T-GTTAT--T----TT-GCTAG-A-TT--TTAGG-A----AGG-CAATT----AT-TA---ACTG-------TT-CC--G-------G-TG--TCGA--A--C----TA--CTA-C--TGTTTTT----C----CGGGAGGGGC-A-TGTA-A--T-A----A-C--TGG-----------T-TGCC--G-----------------------T--TGTG-ACCTTT----C-GT-CATG-T--TATT--CCTAGGGCGT-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC-A-AA-TT-TGTGG-A-CAATA--TA-G--C-AACA-AA--ACTAAT---CTTAAA-AAT
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gi|11 : taacttttgagaaaaaatcaagagtttactttattaagacattaagTTTAT-GTTTA-CGT-CA-----------AG-CC-GA-C--G-T-T-T----------------TGA--AT-TT--C------------------A-AT-TAAT-AA-GCA-G-A----CTC-----A-A-TGC-A--CGAAA---GG--A-T-A--AT--A----AA-GCA-GCA-TT--TTA---A----GGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-AC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG--TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TACT--G-----------------------G--TTTA-T---TT----T-AA-CA-G-T--T-TT--AT--GGGGAT-A--CG----GT-T--AA-AAA--TA-TC-A-AA-GT-TGT-G-A-T-ATA--TA-G--C-G--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGTa
gi|12 : tttttttgaacagccacactctttctagatttagattttccaaatcctcggcattaaacggattgaggatgatgcccgtcta-CC-GA-CCCG-T-T-TTTGCGAGGGAC-GTTATGATAAT-CTTGCGAACT-CG-ATCTTACT-AGAT-TAAT-ATCGCA-G-AGAT-ATC-----G-T-TGC-AGGCGCGACTTAGA-ACT-G--ATGGT----TA-GCT-G-A-TTATTCA-G-A----AGG-C-ATTGATTA--TATTCACTGT------TT-CCCCG-------G-TGATC--G--A--CA---TA--A-AAC--TG--TATATAAC----CAGGA--GGCCA-T-TTAA--TTA----A-C--T-G-----------T-TTCCACG-----------------------A--TGTGTA---TTTATGC-GT-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-AAGCA----GT-G--AA-AATAATATTC-A-AA-TTGTGT-G-AGC-ATA--TATG--C-A--ACAA--ACTAATCA-C--AGATAATGTtata
gi|13 : -AT-GCA-G-G----ACC-----A-C-TGC-A--TGCGA---GGG-A-T-G--AT--A----GA-ACC-G-A-TT--TTG-G-A----GCG-C-ACC----A--TA---CCTATACCTAATT-CC--GAGGACGAG-TG--T--GGTA--CAGTGTA--C-A-CC-TG--TTT----TGAGATGGGA--GGC-A-A-T--A--T-A----A-C--A-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TTTG-A---TT----C-AA-CA-GTT--T-TT--CT--GGGTATAA--CA----AT-G--AA-AAta
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gi|14 : atgcaggaccactgcatgcgagggatgatagaaccgattttggagcgcaccatacctatacctaattccgaggacgagtgtggtacagtgtacacTTCA-CAT-TG-AC-G-TA-GAAA-CC-AA-T--G-T-T-TT-------G-C----------AT-TT--CG--CC-CG-A----GGT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-ATCGAATT-----A-A-TGC-A--TGCGA---GGG-A-T-G--AT--CGATACA-ACA-A-A-TT--TTG-G-A----GGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-CT--G-------G-TG--T--G--A-------TAT-A-A-C--TG--TTT----C----CAGGA--GGC-A-T-T--A--T-ATT--A-C--T-G-----------T-GTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-AA-CA-G-T--T-TT--CT--GGGTAT-A--TG----GT-G--AA-AAA--TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGTtata
gi|15 : ttgctcgtcttT-ACA-G-A----ATCCA---G-T-GGC-A--TGCGA---GGG-A-T-A--AT--C----TA---T-G-A-TT--TTA-G-A----GGG-C-ATT----AA-TA---ACTGT------TT--C--A-------G-TG--T--G--A-------TAT-A-A-C--TGT-TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-A--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--GGAGACCATTATAACTATTTCCTGG--TGTG-A---TT----C-AG-CA-G-T--T-TTTCCT--TTGCGT-A--CACTACGT-GGAAA-GAT--TA-TT-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ACT--TAGG--C-G--A-AACGACT-AT-ACC--AAA-AATGTta
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gi|4 : caGCCTAGAA--TCATGTAATAT-TGT-TA---TAATAACATTT-T-GAG-A---CA-AAA-CTA-AG--GAG-TTTAACT-TTTA--TT-A-G-A-CATTTATTTATATTCT-TTTGA--CACACCAAGGC-TTCGC---G-TTC--A--GATG-AACTTTT-AA---ATAGTCAT-CGCA-A--A--TT-TA-AAATA-TAAA-TC--------TT--GAC--CCA--TA-T-TGATTT---TTGTCTCTTTTAAAAAAA----TTTG-GAGG----C-ATA---CCT--CCATGG-AGAT-CATGGTTTTTT-TTT--AG---CGT-------AA---ATT-G-CATCGT-CGC--GAATTT--CT-CACTCTTT-CCATTAAAA-TACT-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTCG----CTAT----G--G-AGTTTGC--GGTATAAATCCGA-CAA-TCTCG-GTC-AGTTTCAT--CGCAAAACTTC--T-TCAA--CAC---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAAT--TA----A-TCTA-TTCGT-G-T-TT-G-TAG-AA-TTTC--TC-TC-CTTCAAAC-AA-----AT-----TTAT-TAAATTCCT--C-CGAA-TTTAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGG---------------------------TT-TTTT--TTTTAA-ATCT-GC-CCTTATTGTTCA-CTG-CG-AC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTAT-A--AT-TT--CGAACCGCGGA----ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T--GC-A--CGCGA---GGATA-T-G--AT--T----TTTGCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-CCATT----AACTA---ACTGT------TTTCC--G-------G-TG--T--G--A--C----T---A-A-C--TG--TTTC---C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GC-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGTGA--CA----GT-G--AA-AA---TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACCAAT-A-C--AAA-t
gi|5 : cCCTAGAAATTCATGTACTATATGTCTAACGTA-TAACATTT-TTGAG-A-----------CATAG-------TTA--C-TTTATTTT-AAG-A-CATTTATT-ATATT-T-TTTGA--CACACAATGGC-TGCGC---GTTTC--ACGAATG-A-CTTTT-AAT--AAAGTCAT-CGCA-A--AA-TT-TT-AAAAA-TAAAG-C-------ATT--GAC----A--TA-T-TGATTT---GTC---CTTTTAAAAAAA----TTTG-GAGC----CCATA---CCT--A-CTGGAAGAT-CATG--TTTCT-TTT--A----CGT-------AA---ATT-G--ACCGT-C-C--AAA-TT--CT-CAATCTT--CC-T-ATAA-TAACTTTT-AGAATTT-CTGAAGTTTCG---GCTAT----G--G-AGTT-GC--GGTAAAAATCCGA--ATATCTCG-GTC-AG-TTCAT--CGACCAACTTC--T-TC-C--AAC---GGC-CA------ACTGGAGATTGATA-TA----CGTCTA-TTCGT-GTT-TT-G-TAG-AA-TTTC--TC-T--CTTCAA-C-AA-----AT-----T-ATTTAAAT-CCT----CGAA-TTTAAATGT--AAATTTAATT-CGCCAAAGG---------------------------TT-TATT--TTT----ATCTTGCGCCTTATTGTTCA-CG--CGTAA-G-TA-GCA------A-C--G-T-TATT-------GA--------A--AT-TT--CGAACC-CGAA----ACT-C-ATGTAAT-AT-GCA---A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-TGG--AT--T----TT-GCT-G-A-TT--TTC-G-G----AGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------GCTG--T--G--ATGT----CAGTA-A-C--TG--TT----------CGGGA--GCG-A-T-T--AGCT-A----AGC--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------AGTTGTG-A---TT----CGGC-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----ATAG--AACACT--TA-TC-ACAACTT-TGT-G-A---ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
gi|6 : agtcgc-ATTTTTGAGAAA----CAAAA---CC---A-A-GG-AGTT-TAC---TTTAT-TAT--AGA--CTTTTTAAAAGA---ATT-GGCAC-GT-C-C--GAATTT--CT-CAATCCT--CCAT-AGAA-TAAC-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTCG---GTTTC----C--G--GTT--C--AGTATAAATCCGAACAAATCTCG-GTC-AGTTTCAT--CGCAAAACTTTCTT-TCAA--AAC---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAGA--TA----C-T--A-TTCGT-G-T-TTTG-TAG-AA-TTTTAATC-TCGCTCCAA-C-AA------C-----T-ATCTAAAT-CCTT-C-CGAAATTTAAATGTTAAAA---AA-TTCG-CAAAGGC--T-GTCC---GAC--A---------CT-TTC--------A-ATCTTGCGCTTTTTTGTTTATCGT--GTAC-GGTAAGCAA-CC-GA-CCGG-TAT-TT-------GAC-GTTATGA--AA-TT--AGAACC-CG-A----ACTAA-AT-TAAT--T-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-A-ATTT--TTA-GAA----AGG-C-ATT----A--T----ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG--TTT----T----CCGGA--GGC-A-T-T--A--T-AAGTCA-T--T-A-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GT-CA-G-TTCT-TT--CT--AGGCGTGA--CAGT--GT-G--AA-AAT--TA-TCAA-AA-TT-TGG-G-ATC-ATA--TA-G--CAA--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATG
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gi|9 : tacatttttgagagaataaaaccaagggtctacttttattgagacattg-ATTTT---GAGA----ACAGA---ACC--A-A-GG-AGTT-TAC----TTCA-TCA--AGA--CATTAAA---AA---ATT-G-CACCGT-C-C--GAATTT--CT-CAATCCT--CCAT-AGAA----------------TCCTGAAG-TTCG---GCCTT----C--G-AGTT--C--G-----AATCCGA-CA------------------------CAAAA----------------C---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAAT--TA----C-TCTA-TTCGT-A-T-TT-G-AAG-AATTTTC--TC-TC-CTCCAA-C-AA-----AT-----T-ATCTAAAT-CCT--C-C-AA-TTCAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGAC--T-GTCCA--GAC--A----------T-TTTT--TTTTTA-ATCTTGCGCTTTAGTGTTTA-CGT--GTAC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--AT-TT--CGAACC-CG-A----ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG--TTT----C----C-GGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GT-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACT-AT-A-C--AAA-
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gi|19 : TG-A---TT----C-GT-CA-G-T--T-T---CT--AGGCGT-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC-A-AA-T----T-G-A-C-A-A--TA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-T--AAA-AATGTta
gi|2 : gtGCCTAGAAGTT-ATGTAATATATGT-TA---TA-TAACATTT-TTGAG-A--ACA-AAA-CCA-AG--TAG-TTTA--C-TTTA--TT-AAG-A-CATTTATT-ATATT-T-TTGGA--AACACAATGGC-T-CGC---G-TTC--ACGACTG-ATTTTTT-AAT--AAAGTCAT-CGCA-A--AA-TT-TA-AAATA-TAAA-TC-------ATT--GAC--A-A--TA-T-CGATTT---TTCTCTTTTTTAAAAAAA-ATTTTTG-GAAG----TCATA---CCT--A-ATGG-AGAT-TATG--TTTCT-TTT--AG---CGT-------AA---ATT-G-CACCGT-C-C--GAATTT--CT-CAAACTT--CCAT-AAAA-TAAC-TTT-AAAATTTCCTGAAG-TTCG---GCTAT----G--G-AGTT-GC--AGTATAAATCCGA-CATATCTCG-GTC-AGTTTCAT--CGCAAAACTTC--T-TCAA--AAC---GGT-CA-----CACTGAA-ATTAAT--TA----T-TCTA-TTCGT-G-T-TT-G-TAGAAA-TTTC--TC-TC-CTTCAA-C-AA-----AT-----T-ATCTAAAT-CCT--C-CAAA-TTTAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGGA--T-GTCCA--GAC--A---------TT-TTTT--TTTTTA-ATCTTGCGCTTTATTGTTTA-CGTACGTAC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--AT-TT--CGAACC-CG------ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGT-C-ATT----A--TT---ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----TA--A-A-C--TG--TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GT-AA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----GT-G---A-AAT--TA-TC-A-AA-TC-TGT-G-A-C-ATATCTA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
gi|3 : caagTT-TTGAG-A--ACA-AAA-CCA-AG--GAA-TTTA--C-TTTA--TT-AAGGA-CATTT-TT-ATATT-T-T--GACCAACACAATGGCAT-CGCC--G-TT---ACGAATA-ATTTTTTTAAT--AAAGTCATGCGCA-A--AAATT-TA-AAATAATAAAATC-------ATT--GAC--A-AAATACT-CGATTT---T---CTCTTTTAAAAAAA-TTTTTCG-GAGG----CCATA---CCT--A-CTGG-AGAT-CATG--TTTCT-TTTTTAG---CATT------AA---ATT-G-CACCGTAC-C--GAATTT--CT-CAATTCTTTCTAT-AAAAATAAC-TTT-AGAATTTC-TGAAG-TTCG---GCTTT----GTGGCAGTT-GC--G-TATAAATCCGA-CA--------------TTTCATTTCGCAAAATTCT--T-TCAAGGAAC---GGC-CA-----CACTGGA-A-TAAT--TA----C-TCCAGTTTGTAG-TCTT-GATAG-AA-TTTC--TCATC-CTTCAA-C-AGAATATAT-----T-CTCTAAAT-CCTGGCACGAA-TTCAAAGGTTAAAA---AA-T-CG-CAAAGGA--TCGTCCA--GACA-A---------TT-TTTT--TTTTT-----TT----TTTAATCTTTA-CAG-CGTACGG-TA-GCAACCC-AA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--ATGTT--TGAACC-CG-A----ACT-A-AT-CAATAAT-GCAGG-A----ATC-----GTT-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TT-GCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-C-ATT----A--TA---A-TG-------TT-CC--G-------GTTG--T--GC-A--CA---TA--A------TG--TTT----C----CGGGA---GC-ATT-T--A--TGA----A-C--T-G-----------TATTCC--GGTGTGCT----------------G--TGTG-A---TT----C-GTACA-G-T--T-TT--CT--GAGCGT-A--CA----GT-GA-AA-AAT--TA-TC-A-AA-TT-TGT-GAA-C-ATA--TA-G--CAA--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
gi|4 : caGCCTAGAA--TCATGTAATAT-TGT-TA---TAATAACATTT-T-GAG-A---CA-AAA-CTA-AG--GAG-TTTAACT-TTTA--TT-A-G-A-CATTTATTTATATTCT-TTTGA--CACACCAAGGC-TTCGC---G-TTC--A--GATG-AACTTTT-AA---ATAGTCAT-CGCA-A--A--TT-TA-AAATA-TAAA-TC--------TT--GAC--CCA--TA-T-TGATTT---TTGTCTCTTTTAAAAAAA----TTTG-GAGG----C-ATA---CCT--CCATGG-AGAT-CATGGTTTTTT-TTT--AG---CGT-------AA---ATT-G-CATCGT-CGC--GAATTT--CT-CACTCTTT-CCATTAAAA-TACT-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTCG----CTAT----G--G-AGTTTGC--GGTATAAATCCGA-CAA-TCTCG-GTC-AGTTTCAT--CGCAAAACTTC--T-TCAA--CAC---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAAT--TA----A-TCTA-TTCGT-G-T-TT-G-TAG-AA-TTTC--TC-TC-CTTCAAAC-AA-----AT-----TTAT-TAAATTCCT--C-CGAA-TTTAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGG---------------------------TT-TTTT--TTTTAA-ATCT-GC-CCTTATTGTTCA-CTG-CG-AC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTAT-A--AT-TT--CGAACCGCGGA----ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T--GC-A--CGCGA---GGATA-T-G--AT--T----TTTGCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-CCATT----AACTA---ACTGT------TTTCC--G-------G-TG--T--G--A--C----T---A-A-C--TG--TTTC---C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GC-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGTGA--CA----GT-G--AA-AA---TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACCAAT-A-C--AAA-t
gi|5 : cCCTAGAAATTCATGTACTATATGTCTAACGTA-TAACATTT-TTGAG-A-----------CATAG-------TTA--C-TTTATTTT-AAG-A-CATTTATT-ATATT-T-TTTGA--CACACAATGGC-TGCGC---GTTTC--ACGAATG-A-CTTTT-AAT--AAAGTCAT-CGCA-A--AA-TT-TT-AAAAA-TAAAG-C-------ATT--GAC----A--TA-T-TGATTT---GTC---CTTTTAAAAAAA----TTTG-GAGC----CCATA---CCT--A-CTGGAAGAT-CATG--TTTCT-TTT--A----CGT-------AA---ATT-G--ACCGT-C-C--AAA-TT--CT-CAATCTT--CC-T-ATAA-TAACTTTT-AGAATTT-CTGAAGTTTCG---GCTAT----G--G-AGTT-GC--GGTAAAAATCCGA--ATATCTCG-GTC-AG-TTCAT--CGACCAACTTC--T-TC-C--AAC---GGC-CA------ACTGGAGATTGATA-TA----CGTCTA-TTCGT-GTT-TT-G-TAG-AA-TTTC--TC-T--CTTCAA-C-AA-----AT-----T-ATTTAAAT-CCT----CGAA-TTTAAATGT--AAATTTAATT-CGCCAAAGG---------------------------TT-TATT--TTT----ATCTTGCGCCTTATTGTTCA-CG--CGTAA-G-TA-GCA------A-C--G-T-TATT-------GA--------A--AT-TT--CGAACC-CGAA----ACT-C-ATGTAAT-AT-GCA---A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-TGG--AT--T----TT-GCT-G-A-TT--TTC-G-G----AGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------GCTG--T--G--ATGT----CAGTA-A-C--TG--TT----------CGGGA--GCG-A-T-T--AGCT-A----AGC--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------AGTTGTG-A---TT----CGGC-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----ATAG--AACACT--TA-TC-ACAACTT-TGT-G-A---ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
gi|6 : agtcgc-ATTTTTGAGAAA----CAAAA---CC---A-A-GG-AGTT-TAC---TTTAT-TAT--AGA--CTTTTTAAAAGA---ATT-GGCAC-GT-C-C--GAATTT--CT-CAATCCT--CCAT-AGAA-TAAC-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTCG---GTTTC----C--G--GTT--C--AGTATAAATCCGAACAAATCTCG-GTC-AGTTTCAT--CGCAAAACTTTCTT-TCAA--AAC---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAGA--TA----C-T--A-TTCGT-G-T-TTTG-TAG-AA-TTTTAATC-TCGCTCCAA-C-AA------C-----T-ATCTAAAT-CCTT-C-CGAAATTTAAATGTTAAAA---AA-TTCG-CAAAGGC--T-GTCC---GAC--A---------CT-TTC--------A-ATCTTGCGCTTTTTTGTTTATCGT--GTAC-GGTAAGCAA-CC-GA-CCGG-TAT-TT-------GAC-GTTATGA--AA-TT--AGAACC-CG-A----ACTAA-AT-TAAT--T-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-A-ATTT--TTA-GAA----AGG-C-ATT----A--T----ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG--TTT----T----CCGGA--GGC-A-T-T--A--T-AAGTCA-T--T-A-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GT-CA-G-TTCT-TT--CT--AGGCGTGA--CAGT--GT-G--AA-AAT--TA-TCAA-AA-TT-TGG-G-ATC-ATA--TA-G--CAA--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATG
gi|7 : ac-ATTTTTG-AAGA----A-ATAAAACC---A-A-GG-AGTT-TAC----TTTA-TTG--AGA--CAT-------AAGAAATT-G-CATCGT-C-C--GAATTT--CC-CA-TCCT--CCAT-AGAA--AAC-TTTTAGAATTTCCTGAAG-TTCG---GCCTT----C--G-AGTT-GC--AGTATAA-TCCGA-CAAA----------------AT--CGCAAAACTTC--T-TCAA--AAC---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAAA--T-----C-TCTA-TTGTT-G-T-TT-G-TAG-A--TTTT--TC-TC-CTCCAA-C-AA-----AT-----T-ACCTAAAT-CCT--C-CGAA-TTTCAATGT----A---AA-T-CG-CAAAGGC--T-GTCCA--GACTTACTTTTTTTTTT-TTTT--TTTTTA-ATCTTGCGCTTTATTCTTTA-CGT--GTAC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--AT-TT--CGAACC-CG-A----ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-CAATT----A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG---TT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----C-A--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-AT--TT----T-GT-CT-G-T--T-TT--CT--AGGCGC-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGTatt
gi|8 : cACATTT-TTGAG-AGAATA-AAA-CCA-AG--G-G-TCTA--CTTTTA--TT-GAG-A-CATTtta
gi|8 : t-------AA---ATT-G-CATCGT-C-C--GAATTT--CT-CA-TCCT--ACAT-AGAA-TAGC-TTT-TGAATTTC-TGA-G-TTCG---CCTC--------G-AGTT-GC--AGT-TAAATCCGA-AAAAT--------------------GCAAAACTTC--TGTTAA--AAC---GGC-CAA----CACTGGA-TGAAAG--CA----C-TCTA-TTCGT-G-T-T--G-TAG-AA-TT-C--TC-TC-CATCA--C-AA------T-----T-ACCTAAAT-C-T--C-CGA---TTCAATGT--AAA---GA-T-CG-CAAAGGC--T-GTCCA--GAC--A---------TTATTTTTATTTTTA-A-----CA----ATGGTTTA-CGT-GTTAC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--GTT-T-TT-------GAC-GTTATGA--TT-TT--CGAACC-CG-A----ACT-A-A------------A-GCA----ATC-----G-TATGCAA--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GTG-G-T-TT--TTA-G-AGAGTGGG-C-ATTG---A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----CAT-A-A-C--TG--TTT----C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TT-C--G-----------------------T--TG-A-A---TT----T-GT-CT-G-TG-T-GT--CT--AGGCGT-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC---AA-TT-TGT-G-A---ATA--TA-GCAC-A--A-AA--ACTAAT-A-C---AA-AATGTgaaattgcatcgtccgaatttctcatcctacatagaatagcttttgaatttctgagttcgcctcgagttgcagttaaatccgaaaaatgcaaaacttctgttaaaacggccaacactggatgaaagcactctattcgtgttgtagaattctctccatcacaattacctaaatctccgattcaatgtaaagatcgcaaaggctgtccagacattatttttatttttaacaatggtttacgtgttacgtagcaaccgacgtttttgacgttatgattttcgaacccgaactaaagcaatcgtatgcaacgcgaggaatgatttagtggtttttagagagtgggcattgataactgtttccggtgtgaccataactgtttccgggaggcattataactgtttcgttgaatttgtctgtgtgtctaggcgtacagtgaaaattatcaatttgtgaatatagcacaaaaactaatacaaaatgt
gi|9 : tacatttttgagagaataaaaccaagggtctacttttattgagacattg-ATTTT---GAGA----ACAGA---ACC--A-A-GG-AGTT-TAC----TTCA-TCA--AGA--CATTAAA---AA---ATT-G-CACCGT-C-C--GAATTT--CT-CAATCCT--CCAT-AGAA----------------TCCTGAAG-TTCG---GCCTT----C--G-AGTT--C--G-----AATCCGA-CA------------------------CAAAA----------------C---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAAT--TA----C-TCTA-TTCGT-A-T-TT-G-AAG-AATTTTC--TC-TC-CTCCAA-C-AA-----AT-----T-ATCTAAAT-CCT--C-C-AA-TTCAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGAC--T-GTCCA--GAC--A----------T-TTTT--TTTTTA-ATCTTGCGCTTTAGTGTTTA-CGT--GTAC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTATGA--AT-TT--CGAACC-CG-A----ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-T-G--AT--T----TA-GCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------G-TG--T--G--A--C----AT--A-A-C--TG--TTT----C----C-GGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GT-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----GT-G--AA-AAT--TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACT-AT-A-C--AAA-
blockSeqs : A C A C ACG A . . GAAT G . T AAGT AC T TT . G . TA T CTTTT CC A T C T C C . T T . G T . A . . A ATCATTGACAAAA C . TTCT A A TC AAA TCCAT A A . GGT T TT ACTTTTTAAAA GAA A G A G . . . A TT T G A A T T T . T TTCCG C TG AG A A AACTCGCGTCAGT TT CT G GG . A T G A . G G A T C T A A T T AA A G A . AATATAT T T GG A A TA TTT T T C CAA C A TTACTTTTTTTTT A TA TTA G T TAC T C G A C C . CC T A A TGCGAGG C TA G TG G ATCTT A G G A C G C TCGA CA T A A GG CTT T C G . GG GATA T . C T AT . A TGGG C C GATT AC TTC ACCTAA T CC AGGACGA T AT . GT CAGTGTA . A AG T ATAA GAGA . C T . TA GC T AGTC G AA . AAAAACACAAT A AC GAGACCATTATAACTATTTCCTGG T T TATG G TA . T TC . TC . A AG CTAC A GA C AA T A C C G . A G . TC T CA A . C CG C C . T
blockSeqs : . C . . . . . . AC . . . TAG . . G . . . TA . TTTG . . G . . C A . T . . . . . . . . . TCATTGACAA . . TTGT T . CC . TAAT . A . G T . ACATTAAA . . . . . . . . A T . A . A . . . . G GTG . G AT A . TATCTCGGTCAGT . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . AG . . T . . TA . . . . A . A AAT . . TAA G . TC T G . . . . . CG . . . . . . . . . GA . . . . . . . GAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAGT . A G A . . . . . C . . C TGTCAGT . . C . C . . . . . . . G TT . . . . . . GTGTGCTG . . . . A . . G . T . G A GT . A . . . . . . . . . T . . G . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . AC . . . GAA . . . . . . TA . TTTT . . . . . C A . T . . . . . . . . . TCTTGACCCA . . GTC A . CC . TACT . A . G T . CATT . . . . . . . . A . . A . A . . . . A C . G AG A . AATCTCGGTCAGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AT . . . . . . . . . . A . A AC . . TTA G . TT T . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GGT . . . . T . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . AC . . . GAG . . . . . . T . TT . . . . . . A . A . . . . . . . . . GCATTGACA . . T A . CA . TACT . A . G T . ACAT . . . . . . . . A . . A . A . . . . T G . G GG A . ATCTCGGTCAGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AT . . . . . . . . . . C . A AT . . TTA G . TC T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGT . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . AC . CAA . T . . T . CGT . . . . . . . . C . . T . C . . . . A G . G GG A . TATCTCGGTCAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AT . . . . . . . . . . C . A AC . . TTA A . GC T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . GG . . . . . . . . C . AA . T . . A . CGT . . . . . . . . A . . G . A . . . . A G . G AG A . AAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AT . . . . . . . . . . C . A AT . . AG G . GC T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . AA . T . . A . CGT . . . . . . . . A . . G . A . . . . T C . G AG A . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AT . . . . . . . . . . C . . T . . TT . . TG T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . G . A . . . . T C . . AG . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . A . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . G . . . . C C . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : GAG*** TTTT** *** C** ** ** TCATTGACA**************** TT***** A* CC**** *** TAAT*** G** T* CGT********** ** ** *** AG** *** ***** ** **** AT********** A** AT*********** TC* A***** ***** ** ** ** ** ** ** *** ** ** **
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gi|17 : -T-------AA---ATTAG-CTCCGT-C-C--GAATTT--CT-CAATCA----CCAT-AGAATAAA-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTTA---ACTGTTTCCG-G--AG---GC--ATTATAttcctgaagtttaactgtttccggaggcattatactgtttcggttgtgattcgtcagtttttctgggcgtacagtgaacattatc
gi|17 : atttttgagaacaggaaacaagaagttttacttcagttaagacattaaa--A-A-C--TG--TTT----C----CGG-A--GGC-A-T-T--A--T-A------C--T-G-----------T-TTCG--G-----------------------T--TGTG-A---TT----C-GT-CA-G-T--T-TTT-CT--GGGCGT-A--CA----GT-G--AA-CAT--TA-TC-ctgtttcggttgtgattcgtcagtttttctgggcgtacagtgaacattatc
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gi|4 : caGCCTAGAA--TCATGTAATAT-TGT-TA---TAATAACATTT-T-GAG-A---CA-AAA-CTA-AG--GAG-TTTAACT-TTTA--TT-A-G-A-CATTTATTTATATTCT-TTTGA--CACACCAAGGC-TTCGC---G-TTC--A--GATG-AACTTTT-AA---ATAGTCAT-CGCA-A--A--TT-TA-AAATA-TAAA-------T-C-TT--GACCC---A---TA-T-TGATTT---TTGTCTCTTT-T--AAAAA-AA----TTTG-GAGG----C-ATA---CCT--CCATGG-AGAT-CATGGTTTTT--T-TTTAG---CG-T-------AA---ATT-G-CATCGT-CGC--GAATTT--CT-CACTCT--TTCCATTAAAATACT-TTT-AGAATTTCCTGAAG-TTCG----CTAT----G-G--AGTTTGC--GGTATAAATCCGA-CAA-TCTCG-GTC-AGTTTCA--TCGCAAAACTTC--T-TCAA--CAC---GGC-CA-----CACTGGA-ATTAAT--TA----A-TCTA-TTCGT-G-T-TT-G-TAG-AA-TTTC--TC-TC-CTTCAAAC-AA-----AT-----TTAT-TAAATTCCT--C-CGAA-TTTAAATGT--AAA---AA-T-CG-CAAAGG---------------------------TT-TTTT--TTTTAA-ATCT-GC-CCTTATTGTTCA-CTG-CG-AC-G-TA-GCAA-CC-GA-C--G-T-T-TT-------GAC-GTTAT-A--AT-TT--CGAACCGCGGA----ACT-A-AT-TAAT-AT-GCA-G-A----ATC-----G-T--GC-A--CGCGA---GGATA-T-G--AT--T----TTTGCT-G-A-TT--TTA-G-A----AGG-CCATT----AACTA---ACTGT------TTTCC--G-------G-TG--T--G--A--C----T---A-A-C--TG--TTTC---C----CGGGA--GGC-A-T-T--A--T-A----A-C--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------G--TGTG-A---TT----C-GC-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGTGA--CA----GT-G--AA-AA---TA-TC-A-AA-TT-TGT-G-A-C-ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACCAAT-A-C--AAA-t
gi|5 : cCCTAGAAATTCATGTACTATATGTCTAACGTA-TAACATTT-TTGAG-A-----------CATAG-------TTA--C-TTTATTTT-AAG-A-CATTTATT-ATATT-T-TTTGA--CACACAATGGC-TGCGC---GTTTC--ACGAATG-A-CTTTT-AAT--AAAGTCAT-CGCA-A--AA-TT-TT-AAAAA-TAAA-------G-CATT--GAC-----A---TA-T-TGATTT---GT--C-CTTT-T--AAAAA-AA----TTTG-GAGC----CCATA---CCT--A-CTGGAAGAT-CATG--TTTC--T-TTTA----CG-T-------AA---ATT-G--ACCGT-C-C--AAA-TT--CT-CAATCT--T-CC-T-ATAATAACTTTT-AGAATTT-CTGAAGTTTCG---GCTAT----G-G--AGTT-GC--GGTAAAAATCCGA--ATATCTCG-GTC-AG-TTCA--TCGACCAACTTC--T-TC-C--AAC---GGC-CA------ACTGGAGATTGATA-TA----CGTCTA-TTCGT-GTT-TT-G-TAG-AA-TTTC--TC-T--CTTCAA-C-AA-----AT-----T-ATTTAAAT-CCT----CGAA-TTTAAATGT--AAATTTAATT-CGCCAAAGG---------------------------TT-TATT--TTT----ATCTTGCGCCTTATTGTTCA-CG--CGTAA-G-TA-GCA------A-C--G-T-TATT-------GA--------A--AT-TT--CGAACC-CGAA----ACT-C-ATGTAAT-AT-GCA---A----ATC-----G-T-TGC-A--CGCGA---GGA-A-TGG--AT--T----TT-GCT-G-A-TT--TTC-G-G----AGG-C-ATT----A--TA---ACTGT------TT-CC--G-------GCTG--T--G--ATGT----CAGTA-A-C--TG--TT----------CGGGA--GCG-A-T-T--AGCT-A----AGC--T-G-----------T-TTCC--G-----------------------AGTTGTG-A---TT----CGGC-CA-G-T--T-TT--CT--GGGCGT-A--CA----ATAG--AACACT--TA-TC-ACAACTT-TGT-G-A---ATA--TA-G--C-A--A-AA--ACTAAT-A-C--AAA-AATGT
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