lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333333333 111111 333333333333333333333333333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111 111111 1111111111111111111111111 1 22222222 1 3333333333 2222222222
lowQualScore : 1 666666666666666 222 1 22 333333 11 2222 1 11 1 888 1 2222 7 44444 333333333333333333333333333 333 11 44444 222 11 1 1 555 44 4 66 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 00000000000 44444 77777777 2 9 4 0 2 555555 000000 333 22 4444444444444444444444444 1 4444 22 6 3 7777 55 11111111 55 2 22 44 6 1 1 1 1 3 1 2 4444444444 5 3 11 1 33333 1 1 111 1 2 22222 2222 77 2222 1 88888 1 1 11 77 11 1 66 1 111 44444 2222222222
lowQualScore : . ............... ... . .. ...... .. .... . .. . ... . .... . ..... ........................... ... .. ..... ... .. . . ... .. . .. .................................................................................................................... ........... ..... ........ . . . . . ...... ...... ... .. ......................... . .... .. . . .... .. ........ .. . .. .. . . . . . . . . .......... . . .. . ..... . . ... . . ..... .... .. .... . ..... . . .. .. .. . .. . ... ..... ..........
lowQualScore : 1 000000000000000 000 1 77 555555 55 3333 1 55 2 222 2 5555 5 00000 555555555555555555555555555 444 77 44444 222 77 3 3 888 11 0 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00000000000 11111 66666666 1 2 2 1 0 888888 222222 333 66 0000000000000000000000000 9 2222 88 5 0 2222 88 88888888 55 0 66 55 2 8 8 8 8 3 9 0 4444444444 0 3 77 1 88888 1 1 888 1 1 66666 2222 33 1111 0 55555 5 0 44 00 44 1 11 1 999 99999 2222222222
consensus : AGCTGGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCGGCC----CTG-TC--CGC-ACGT--CA-A----AAATTAAA-G---TT-----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--AAAAAA-A--AAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACATAATTTTGACA-----------T---A-AAAAA--------T-GTT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TAC--------TT--------------GT-GTTA----TTTTG--AATCTA---CAC-T--GA----AAGATG--AT-ATATT--C--ATGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAA-CTTTATTGTTCAAA-ATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTTTTTTNA--CCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTAATTT----T-TG----ACGT-GCG--GA-CAGGGCCGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGCT
Reference ( gi|3 ) : AGCTGGGTACGGTA-A--------A------GCA---T-A--GA-AT--A--TCGGCC----CTG-TC--CGC-ACGT--CA-A----AAATTAAA-G---T------T--GT--CA---T-----A--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGA--T--AAAAAA-A--AANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAATTTTGACA-----------T---A-AAAAA--------T-GCT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TAT--------TT--------------GT-GTTA----TTTTG--AGTATA---TAT-T--GT----AAGATG--AT-ATATT--C--ATTAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAA-CTGTATTGTTCAAA-ATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTTTTTTTTTA--CCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTAATTT----T-TG----ACGT-GCG--GA-TAGGGCCGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--A-------TACCGTACCCAGCT
gi|13 : AGCTTGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCGGCC----CTC-TC--CGC-ATGT--AA-AGAAGAAA-TAAA-G---TTA----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGGTTT--AAAAAA-A--
gi|11 : AGCTGGGTACAGTA-A---------------GCA---T-A--GA-AT--A--TCGGCC----CTG-TC--TGC-AAGT--CA-A----AAAGTAAA-G---TTA----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--GAAAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaatataattttgacatcgaaaatgtaaaaatgaccttggccacacctttgtattaaattttgtgttatttccaatgtacacttaaagatgatatattcattaaagtttgatatgcataaatggttgtggccatataggaaactttattta
gi|4 : tattgatatgaaaaatgttaaaattaacttggccacacctttgtatttaattttactggtgttattttgaatctacactgaaaagagatatattcatgaaagtttggtagacataccatggttgtggccatagagaaaaacaatattgaaatgcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaAACTGGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--AC-A---A--TTGGCC----CTG-TC--CAC-AAGT--CA-G----AAAATAAA-G---T------T---T--TA---T-----A--T---TA--T-----AT---T--
gi|16 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccAGCTGGGTATGGTA-C--------G------AAA---A-A--GC-AC--A--TTGGCCTTTTCTG-TA--CGT-GTGT--TA-A----AAA-TAAA-G---TTA----T--GT--TA---T-----C--G---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--c
gi|26 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggAGCTGGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCAGCC----CTG-TC--CAC-ACGTA-AA-A----AAAATAAC-T---TA-----T--GT--AA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--c
gi|17 : tgAGCTGGGTACGGTA-A---------------GCA--------GA---------------------------GC-ACAT--CA-A----AAATTAAA-G---T------T-------A---T-----G--T---TA--T------T---T--T-T-ATTGG--T--CAAA
gi|34 : cataatttttacacaataaattgttcaaaaatgctttgtattaaattttattattttggaaatctacactgaaagatgatatattaatgattgtttggtatacataacatggtcgtggccatagagaaaacttgattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaAGTCGGGTACGGTA-A---------------GCACTTT-A--GC-AC--A--TCGGCC----CTA-TC--CGC-ACGTAGCA-A----TAATc
gi|37 : gAGCTGAGTACGGTG-A---------------GCA---T-A--AC-AC--A--TCGTCC----CTG-TC--CGctgtattttcatcaaatttttt
gi|9 : tggaccaataaaagatcaggtaatataaGCTGGGTACGGTT-T--------A------ACA---T-A--GC-AC--A--TCGGCC----CTG-TC--CAC-ACAT--CA-A----AAATTGAA-G---T------T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--AAAAAA-A--AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAT--TACTTTTGACACAATTTTGACAT---A-ATAAA--------T-GTT-AAAAATGAAT-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TAT--------TT--------------GT-GTTA----TTTTA--AATCTA---CAC-T--GA----AAGATG--AT-ATATT--C--ATGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAA-CTTTATTG
gi|1 : gGCTGGGTACGGTA-ACTTTGGTAA------GCA---T-A--GC-AC--A--TCGGCC----CTG-TC--TGC-A-AT--TA-A----AAACTTAA-G---T------TATGT--TA---TCTTTTA--T---TT--T-----AT---TGGT-C-ATAAA--A--AANNNN-N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACGTAATTTTGACA-----------TTTTA-AAAAA--------T-GTT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---ATTGGATTAAATTT--TAC--------TT--------------GT-GTTA----TTTCG--AATCTA---CAC-T--GA----AAGATG--AT-ATATT--C--GTGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAA-CTTTATTGaaacatag
gi|1 : ggGCTGGGTACGGTA-A---------------GCA---TTA--GC-AC--A--TCGGTC----CTG-TC--CGC-ACGT--AA-A----TAATATAA-G---TTTAATAT--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--aaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|2 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggGCTGGGCACGGTA-A---------------GCA---T-A--TA-A---A--TCGGCC----CTG-TC--CGA-ACGT--TA-A----AAAATAAA-A---TCG----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----GT---T--T-T-ATTGG--T--
gi|5 : actgggtacagtaagcaaatcacattggtcctgtccgtatgtcaaaaatcaaagttgtgttatcttatatttcattggtcaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggGCTGGGTACGG-A-A--------A------GCA---T-A--TA-A---A--TCGACC----CTG-TC--CGA-ACGT--TA-G----AAAATAAA-A---TCG----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--c
gi|5 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcGCTGGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--TA-AC--ACATCGGCC----CTG-AT--CGT-ATGT--CA-A----AAATCAA---------------------------------------A--T-----AT---T--T-T-ACTGG--T--CAACAA-A--Agc
gi|10 : GTTGGTTACGGTA-G--------AAATA--GCA---C-A--AA-AA--A--C-----------A-TC--CGC-ATGT--CA-A----AAACTAAA-G---TTA----T--GT--TA---T-----C--T---TA--C-----AT---T--T-T-ATTGA--T--CAAAAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|30 : GCTGTGGACAGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCGGCC----CTG-TC--CGC-ACGT--C--A----AAATTAAA-----T------T--AT---G---T-----A--TC--TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--AAAAAcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|24 : GCTGGGTACGGTA-A--------AAATGAAGCA---T-ATAGC-AC--A--TCAGCC----CTG-TC--CAC-ACAT--CA-A----AAATCAAA-T---TTA----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTG
gi|32 : gGCTGGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCAGCT----TTG-TC--CGA-ACGT--TA-A----AAA-TAAA-A---TCG----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----GT---T--T-T-ATTGG--T--
gi|25 : ggGCTGGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--GG-AC--A--TCGGCC----CTG-TCCGCGC-ACGTAAAA-A----AAACTAAA-C---T------T--GT--TA---------A--T---T---T-----AT---T--TAT-ATTGG--T--A
gi|6 : GCAGGGTACGGTACA--------C------ATA---T-A--GA-AC--A--TCTG-C----CTG-TC--TGC-ATGT--CA-A----AATCAAAA-GTTTT------T--GT--TAATGT-----T--T---TA--TG----AT---T--T-TCATTGG--TCCAAAAAA-A--AAc
gi|35 : ggGCTGG-TACCATA-A--------A-------CA---T-A--GT-AC--A--TTGGCC----CTG-T---CGC-ATCT-----------AATTAAATA---T------A--GT---G---T-----A--T---GT--T-----AT---T--C-T-ATTGG--T--GAAAAA-atgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|28 : GCTGGGCAAGATA-A---------------GCA---T-A--TA-A---A--TCGACC------G-TC--TGA-ATGTT-CA-A----AAAAAAAA-A---T------T--GT--GT---T-----A--T---CT--T-----GT---T--T-C-ATTGG--T--
gi|45 : tctggGTTGGGTACAGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AT--G--TCAGCC----ATG-TC--
gi|2 : CTGGGTACAGTA-A---------------GCA---A-A--TC-AC--A--TTGGTC----CTG-TC--CGT-ATGT--CA-A----AAATCAAA-G---T------T--GTGTTA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-C-ATTGG--TCAAAAAAAAA--AAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACATAATTTTGACA-----------T---A-AAAAG--------T-GAT--AAAATGAAA-A------TGACCACA------CA---TTTGTAATAAATTT--TAC--------TT--------------GT-AAAA----TTTTG--AATCTA---CAC-T--CA----AAGATG--AT-ATATC--C--ATGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTCAGGCCATATAG-AAAA-TT---TTATCTAAATATGTcc
gi|4 : aCTGGGTACGGTA-A---------------GCG---T-A--GC-AC--A--TTGGCC----CTG-TC--CGC-ACAT--CA-A----AAATTAAA-G---TTA----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGG--T--AAAAAA-A--Aagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggaccaataaaacataagataacacgattttattttttaacgttcggacagggccgatttatatgcttaccgtgcccagcc
gi|36 : ggcCTGGGTGTGGTA-A---------------GCG---A-A--GC-AC--A--TCGGCC----TTG-TC--CGC-ATGT---A-A----AAA--AAA------------------------------A--T---TAAGT-----AT---T--T-T-ATTGG--T--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|8 : gTGGGTGCAGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCGGCT----CTG-AC--CGC-ACGT--AA-A----AAA-TAAA-G---T------T--AT--AA---T-----ATCT---TA--TATTGAAT---T--T-T-ATTGG--T--CAA
gi|29 : taattttggcatcaaaaatgttaaaaatgaacttggccaaacatttgtattaaagtttacttatgttattttgaatctacacttagtctaaaagatgatatatattcatgaaagtttggtatacatacacggttgtggccatagagaaagctttattcaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatcttgacTGGGTATGGTA-A--------G------TCA---T-A--TT-AA--A--TCGGCC----CTG-TC--CGA-ACAT--TA-A----AAAATAAA-A---TTG----T--GT--TA---T-----C--T---TA--C-----GT---T--T-T-ATTGG--T--cc
gi|31 : agTGGGTACTGTA-A--------A------TC----T-A--GC-AT--A--TTGGCC----CTG-TC--GG---CTT--TATA----AAAATAAA-G---TTA----T--GT--TC---T-----C--T---TA--T-----AA---T--T-T-ATTGG--T--AAAA
gi|23 : TGGG-ATGGTA-A---------------GCA---T-AA-GC-AC--A--TCGGCC----CTG-TT--CGCAACGT--CA-A----AAATTAACTG---T------T--AT--CA---T-----
gi|33 : GGGTACGGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCTGCT----CTGCTC--CGC-ACGT--CA-A----AAATTACA-G---TTA----T--GT--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATTGtagcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|14 : ttaaaGGTGCAGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TTGGCC----CTG-T
gi|27 : GGTACAGTA-A---------------GCA---T-A--GC-AC--A--TCGGCT----CTG-CC--CAC-ACGT--CA-T----AAATTAAA-G---TTA----T--GT--TA---T-----C--T---CA--T-----AG---T--T-T-ATTGG--T--CAAAAtatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|6 : ttGATACGGTA-A---------------GCA---T-A--TATATTAA--TCGGCC----CTG-TC--CGA-ACGT--TA-G----AA--TATA-A---T------T--GT---G---T-----A--TCTATA--T-----GT---T--T-T-AT
gi|7 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggacc-A--------A------GTA---T-A--GC-TC--A--TTGGCC----CTG-TC--TAC-AGGT---A-A----AAATTAAA-G---T------TATGT--TA---T-----C--T---TA--T-----ATTTAT--T-T-GTCAA--A--AAACGN-N--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACAAACTTTTTACA-----------T---TTAAAAA--------T-GTT-AAAA--GAAT-G------TTGCTTCA------CC---TT-ATATTAAATTT--CAC--------T---------------------A----TTTTG--AATCTG---CAC-T--AA----AATAT---AT-ATATTATC--ATGAAAGT-TTGGTATA-CAT-G-CATATCTACATACATAGAT-AAAA-CGTTATTG----AA-ATGTt
gi|12 : t--A--TCAGCC----CTG-TT--CGC-A-AT--CA-A----CAATTAAA-G---T------------------T-----A--T---TA-------------T--T-G-GTAAA--A--AAAAAA-ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCCATAATTTTGACA-----------T---A-AAAAG----------GTT-AAAAATGAAT-C------TGGCTACA------CC---TTTGTTATAAATTT--TATGTATTTTCTT--------------GTAATTA----TTTTG--AATCTA---CGTCT--GA----AAGATG--GT-ATATT--TAAATGAAAGT-TGGGTATA-CAT-A-TATAGTTGTGGCCCTAGAG-AAAA-agcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|38 : agcgc--A--TCGGCC----CTG-TC--CGT-ACGT--AG-A----AAAATAAA-G---TTA----T--GC--TA---T-----C--T---TA--T-----AT---T--T-T-ATGGG--T--AAAAAagttttgaaacgtag
gi|5 : CATAGTTTTGACA-----------T---A-AAAAA--------T-GAT-TAAA-TGAAT-T------TGGTCAAA------CC---TTTGTATTAAATTT--CAC--------TT--------------GT-GAAA----TTGTG--ATTCTA---CAC-T--AA----AAGATG--AT-ATATC--C--ATGAAAGG-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGGCATTTAG-AAAA-CTTTA----TCAAA-AAGT
gi|14 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaCATAATTTTGACA-----------T-----AAAAA--------T-GTTAAAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAA-TT--TAC--------TG--------------GT-GTTA----ATTTG--AATGTACACTAT-T--AA----AAAATGATAT-ATATT--A--ATGAAAGT-T----------T-A-CATGGTTTTGGCCATAGAT-AAAA-CTagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|10 : ggtgcagtaagcatagcacattggccctgttatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaCATAATTTTGATC-----------T---A-CAAGA--------T-GTT-AAAATTGAAC-T------TGGGCCCA------CC---TTGTTATGAAAATT--TGA--------TT--------------GC-GTTA----TATTG--AATTTA---CAC-T--GA----ATAATG--AT-ATATT--C--ATGAAAGT-TTCGTATA-AAT-A-CATGGTGGTGGCCATAGAA-Atttaagtttattgaaacata
gi|17 : gttggttacggtagaaatagcacaaaaaacatccgcatgtcaaaaactaaagttatgttatcttacattttattgatcaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaCATAATTTTTACA-----------C---A-ATAAA--------TTGTTCAAAAATG--------------------------C---TTTGTATTAAATTT--TAT--------T---------------------A----TTTTGGAAATCTA---CAC-T--GA----AAGATG--AT-ATATT--A--ATGATTGT-TTGGTATA-CATAA-CATGGTCGTGGCCATAGAG-AAAA-CTTGATTGtgttattgaaacgtt
gi|13 : ATAATTTTGACA-----------T---C-GAAAA--------T-G-T-AAAAATGACC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--T--------------------------GT-GTTA----TTTCC--AATGTA---CAC-T--TA----AAGATG--AT-ATATT--C--ATTAAAGT-TTGATATG-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATATAG-GAAA-CTTTATTaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatttgaccaataaaaataacataactttaatttttgatgtgctctgcttaccgtacccagctc
gi|8 : agcttggtacggtaagcatagcacatcggccctctccgcatgtaaagaagaaataaagttatgttatcttatattttattggtttaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaatTAATTTTGGCA-----------T---C-AAAAA--------T-GTT-AAAAATGAAC-T------TGGCCAAA------CA---TTTGTATTAAAGTT--TAC--------TT--------------AT-GTTA----TTTTG--AATCTA---CAC-TTAGTCTAAAAGATGATAT-ATATT--C--ATGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CACGGTTGTGGCCATAGAG-AAAG-CT---TTATTC-AA-ATGTta
gi|16 : TTTAACA-----------T---A-AAAAA--------T-ATT-AAGAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TATGTTTTAAATTT--TAC--------TT--------------GT-GTTG----TTTTG--AATCTA---CAT-T--AA----AAGATG--ATAATATT--C--AT----------------CTT-A-CATGGTTGTGGCCATGGagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatcttgacttgaccaataaaattcaatataagatattataactttattttttacgtgcggtcagagccgatgtgctatgcttactgcacccacc
gi|39 : TTTGATA-----------T---A-AAAAT--------T-GTT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CT---TT-------AATAT--TAC--------TT--------------GT-Gcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggaccaataaaatatacgataacataactttatttttaacacacgtacagaaaaggccaatgtgctttttcgtaccatacccagctc
gi|11 : atatgTTGATA-----------T---G-AAAAA--------T-GTT-AAAA-TTAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTTAATTT--TAC--------TG--------------GT-GTTA----TTTTG--AATCTA---CAC-T--GA----AAAGAG--AT-ATATT--C--ATGAAAGT-TTGGTAGA-CAT-ACCATGGTTGTGGCCATAGAGAAAAA-CAATATTG----AA-ATG
gi|4 : taTGACA-----------T---A-AAAAT--------T-GTT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACATNTAATCCGGATTTTCAT-AAATTTACTGT--------TTTTTGCCACACCCTTGT-ATTAAAACTTTTG--AATCTA---CAC-T--GA----AAGATG--AT-ATATT--C--ATGAAAGT-TTGGTACA-CAT-A-CATGGATGTGGCC--AGAG-AAAAGCT-TATTGcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattttcaccaataaaatataagataacataactttactttttgacttgcagacagggccgatattctatgcttactgtacccagct
gi|19 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGACA-----------T---A-AAAAA--------A-GTT-TAAAATGAAC-TAAATCTTGGTCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TAT--------TT--------------GT-GATA----TTTTG--AATCTA---CAC-T--GA----AAGATG--AT-ATATT--C--AT--------------A-CAT-A-CATGGTTTTGGTCATAGAG-AAAA-TT---TTCTT-AAA-ACGTaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|20 : ACA-----------T---A-AAA----------T-GTT-AAATATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TAC--------TT--------------GT-GTTA----TTTTG--AATCTA---CAC-T--GA----AAGATG--AT-ATATT--C--AAGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAA-CTTTATTGag
gi|6 : ACA-----------T---A-AAA--------------T-GAAAATGAACCT------TGGCCACAAAACA-CC---TTTGTAT-AAATTT--TAC--------TT--------------GC-GAAA----TTTTG--AATCGC---CAC-T--AA----AAGA-G--AT-ATAAT--CA-ATGAAAGTATTGGTTTA-CA--A-CATGATTGTAG-CATTTAG--AAA-CT-TA----TCTAA-ATGTaaac
gi|15 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaA-----------T---A-AAAAAAGTACATGT-ATC-AAAAATGAAC-T------TGGCTACA------AT---ATAGTATTAAATTT--TGC--------AT--------------GC-GTTA----GTTTG--AATATG---TAC-T--------AAAAT---------TT--C--ATGAAAGT-TTGGTATA-CTT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAC-AAAA-TTTTATT----AAA-ATGTagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|21 : tggca-T------TGGTCACA------CC---TTTGTATTTACTTT--TAC--------TT--------------GT-GTTA----TTTTG--AATCTA---CAC-T--GC----AAGATG--AT-ATGTT--C--CTGAAATT-TTGGTATG-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAAGG-AAAA-CTTTTTTGagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaaatataagataacaaagcttaattttttttttacgtgccatgcatttccgtatacagctc
gi|22 : tACA------AC---TCTATACAAAATTA--TAT--------CT--------------AC-ATTA----TTTCC--AATCTA---TAC-T--AA----AAGATG--AT-ACATT--C--A-------------ATAGCA--A-CATGAGTGTGGCCTTATAG-AAAA-Caaacg
gi|40 : ATT--C--ATGAAAGC-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGGGACCATATAG-AAAA-CTTTATTattagttgagtgtg
gi|41 : AAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGACATAGAG-AACA-CTTTATTGtaaa
gi|2 : tggTTTTTTTTTTTTTGA--CCAAT-GAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----CA----ACTTTGATTT----T-TG----ACAT-ACG--GA-CAGGACCAAT--G-TGA--T-T---TG-----C--T-------TACTGTACCCAGatacga
gi|6 : aTTTTTTTTTTGGA--CCAATGAAAATC----ATA-A-AACATTA-ACAA-----AA----ACTTTTGATT----T-TG----ACAT-GCA--GA-CA-GGCAGAT--G-TTCTAT-A---TG-----T--G-------TACCGTACCCTGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggaccaataaaacataagataacacgattttattttttaacgttcggacagggccgatttatatgcttaccgtgcccagcc
gi|12 : ggTTTTTTTTTTTA--CCAAT-A--------------------------A-----TA----ACTTTAATTG----T-TG----AT-T-GCG--AA-CAGGGCTGAT--G-CGC--T-tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|9 : TTTTTTTTTTA--CCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----------ACTTCAATTT----T-TG----ATGT-GTG--GA-CAGGGCCGAT--G-TGC--T-A---TGT----T--A-------AACCGTACCCAGCtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgccataattttgacataaaaaggttaaaaatgaatctggctacacctttgttataaattttatgtattttcttgtaattattttgaatctacgtctgaaagatggtatatttaaatgaaagttgggtatacatatatagttgtggccctagagaaaaagttttgaaacgtag
gi|1 : gTTTTTTATGA--CCAAT-AAAAT-----AAA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTAAGTTT----T-TA----AT-T-GCA--GA-CAGGGCCGAT--G-TGC--T-A---TG-----CTTACCAAAGTTACCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattacttttgacacaattttgacataataaatgttaaaaatgaatttggccacacctttgtattaaattttatttgtgttattttaaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtatacatacatggttgtagccatagagaaaactttattgaaacatag
gi|5 : ggTTTTGTTGA--CCAGT-AAAAT-----AT------------------------------TTGATTT----T-TG----ACAT-ACG--AT-CAGGGCCGAT--G-TGTTAT-A---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|4 : TTTTTTTTA--CCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTAATTT----T-TG----ATGT-GCG--GA-CAGGGCCAAT--G-TGC--T-A---CG-----C--T-------TACCGTACCCAGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|13 : ggcTTTTTTTAAACCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTA-TTTCTTCT-TT----ACAT-GCG--GA-GAGGGCCGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACCGTACCAAGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|7 : TTTTTTGA--CAAAT-AAA-T-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTAATTT----T-T-----ACCT-GTA--GA-CAGGGCCAAT--G-AGC--T-A---TA-----C--T-------TAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaatataattttgacatcgaaaatgtaaaaatgaccttggccacacctttgtattaaattttgtgttatttccaatgtacacttaaagatgatatattcattaaagtttgatatgcataaatggttgtggccatataggaaactttattta
gi|14 : TTTTTTA--CC------AAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----AC----------------------------------AGGGCCAAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACTGCACCcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacaaactttttacatttaaaaatgttaaaagaatgttgcttcaccttatattaaatttcactattttgaatctgcactaaaatatatatattatcatgaaagtttggtatacatgcatatctacatacatagataaaacgttattgaaatgtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|35 : TTTTTCA--CCAAT-AGA-------ATA-A-CA---TACACTA-----TA------TTTAATT-------------AGAT-GC---GA-CAGGGCCAAT--G-TAC--T-A---TG-----T--T-------TATGGTA-CCAGCtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|11 : TTTTCA--CCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTACTTT----T-TG----ACTT-GCA--GA-CAGGGCCGAT--A-TTC--T-A---TG-----C--T-------TACTGTACCCAGCT
gi|10 : tattgatatgaaaaatgttaaaattaacttggccacacctttgtatttaattttactggtgttattttgaatctacactgaaaagagatatattcatgaaagtttggtagacataccatggttgtggccatagagaaaaacaatattgaaatgcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaTTTTGA--TCAAT-AAAAT-----GTA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTAGTTT----T-TG----ACAT-GCG--GA-T--GTTTTTT--G-TGC--T-A---TT-----T--C-------TACCGTAACCAAC
gi|27 : TTTTGA--CCAAT-AAACT-----ATG-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTTAATTT----A-TG----ACGT-GTG--GG-CAGAGCCGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACTGTACCcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|30 : ttTTTTTA--CCAAT-AAAAT-----ATA---GA---TA--C-A-----TA----A-TTTAATTT----T--G----ACGT-GCG--GA-CAGGGCCGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACTGTCCACAGC
gi|38 : TTTTTA--CCCAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-GC-A-----TA----ACTTTATTTT----T-CT----ACGT-ACG--GA-CAGGGCCGAT--
gi|17 : TTTGA--CCAAT-AAAA-------------A---TA-AC-A-----TA----ACTTTAATTT----T-TG-------------------------AT--G-TGC--T-C---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGCT
gi|31 : cataatttttacacaataaattgttcaaaaatgctttgtattaaattttattattttggaaatctacactgaaagatgatatattaatgattgtttggtatacataacatggtcgtggccatagagaaaacttgattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaTTTTA--CCAAT-AAATT-----ATA-A-GA---GA-AC-A-----TA----ACTTTATTTT----TATA----AA---GCC--GA-CAGGGCCAAT--A-TGC--T-A---GA-----T--T-------TACAGTACCCAc
gi|8 : TTGA--CCAAT-AAAATTCAATATA-A-GA---TA-TT-A-----TA----ACTTTA-TTT----T-TT----ACGT-GCG--GT-CAGAGCCGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACTGCACCCA
gi|25 : taattttggcatcaaaaatgttaaaaatgaacttggccaaacatttgtattaaagtttacttatgttattttgaatctacacttagtctaaaagatgatatatattcatgaaagtttggtatacatacacggttgtggccatagagaaagctttattcaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatcttgacTA--CCAAT-ATAA------ATA-A-AT---TA-AC-A-----------AGTTTAGTTT----T-TTTT--ACGT-GCGCGGA-CAGGGCCGAT--G-TCC--T-A---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGCcc
gi|1 : A--CCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TATTAAACTTATATTA----T-TT----ACGT-GCG--GA-CAGGACCGAT--G-TGC--TAA---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGCc
gi|2 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggA--CCAAT-AAAAC-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----CG----ATTTTATTTT----T-TA----ACGT-TCG--GA-CAGGGCCGAT--T-TA---T-A---TG-----C--T-------TACCGTGCCCAGC
gi|16 : actgggtacagtaagcaaatcacattggtcctgtccgtatgtcaaaaatcaaagttgtgttatcttatatttcattggtcaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggA--CCAAT-AAAAT-----ATA-C-GA---TA-AC-A-----TA----ACTTT-ATTT----T-TAACACACGT-ACA--GA-AAAGGCCAAT--G-TGCT-T-T---TT-----C--G-------TACCATACCCAGCTc
gi|26 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggA--CCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TT-AC-A-----TA----AGTTATTTTT----T-TT----ACGT-GTG--GA-CAGGGCTGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGCTc
gi|32 : tgA--CCAAT-AAAAC-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----CG----ATTTTA-TTT----T-TA----ACGT-TCG--GA-CAAAGCTGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGC
gi|29 : ggA--CCAAT-AAAAC-----GTA-A-GA---TA-AC-A-----CA----ATTTTATTTT----T-TA----ATGT-TCG--GA-CAGGGCCGAT--T-TAA--T-A---TGA----C--T-------TACCATACCCA
gi|6 : agA--CCA-T-AAAAC-----ATATA-GA---TA--C-A-----CA----ATTATA--TT----C-TA----ACGT-TCG--GA-CAGGGCCGATTAA-TATA-T-A---TG-----C--T-------TACCGTATC
gi|36 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggA--CCAAT-AAAAT-----A--------------C-T-----TA----ATTTT--TTT----T-T-----ACAT-GCG--GA-CAAGGCCGAT--G-TGC--T-T---CG-----C--T-------TACCACACCCAGt
gi|37 : gA--CCAAT-AAAAG-----ATC-A-GG---TA-AT-A-----TA----AC---------------------------G--GA-CAGGGACGAT--G-TGT--T-A---TG-----C--T-------CACCGTACTCAGCT
gi|42 : tggA--CCAAT-GAAAT-----GCA-A-GA---CA-AC-A-----TA----AATTTAATCT----T-TG----ACAT-GTG--GA-CAG
gi|28 : tA--CCAAT-GAAAC-----A---A-GA---TA-AC-A-----CA----ATTTTTTTTT----T-TGA---ACAT-TCA--GA-C--GGTCGAT--T-TA---T-A---TG-----C--T-------TATCTTGCCCAGCcca
gi|18 : tctggA--CCAAT-AAA-T-----AT---------TA-A--------TA----AATTT---TT----T-TG----TTGT-G-G--GA-TAGGACCGAT--GTTGC--A-A---TG-----T----------TACCG-ACC
gi|33 : catagagaaaagttattgaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattatcttggCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----ACTGTAATTT----T-TG----ACGT-GCG--GAGCAGAGCAGAT--G-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACCGTACCCagatc
gi|24 : ttaaaCAAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----TA----AATTTGATTT----T-TG----ATGT-GTG--GA-CAGGGCTGAT--G-TGC--T-A---TATGCTTC--ATTTT---TACCGTACCCAGC
gi|15 : gAT-AAAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-AAAGCTTA----ATTTT--TTT----T-TT----ACGT-GC
gi|5 : tggcaataaaaaaagtacatgtatcaaaaatgaacttggctacaatatagtattaaattttgcatgcgttagtttgaatatgtactaaaatttcatgaaagtttggtatacttacatggttgtggccatagacaaaattttattaaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----ATA-A-GA---TA-AC-A-----CG----ATTTTATTTT----C-TA----ACGT-TCG--GA-CAGGGTCGAT--T-TA---T-A---TG-----C--T-------TTCCGTACCCAGCcatgcatttccgtatacagctc
gi|4 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcAAT-----ATA-A-TA---TA-A---------A----ACTTTATTTT----C-TG----ACTT-GTG--GA-CAGGGCCAAT----TGT--T-A---TG-----C--T-------TACCGTACCCAGTTgc
gi|23 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccTA-ATGA---TA-AC-A-----G--------TTAATTT----T-TG----ACGTTGCG--AA-CAGGGCCGAT--G-TGCT-T-A---TG-----C--T-------TACCAT-CCCAc
gi|43 : -A-----TA----ACTTTAATTT----T-CT----GTAT-GC---------------T----TGC--T-A---TG-----C--T-------TACTGTGCCCAGCgcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|34 : ATTA----T-TGCT--ACGT-GCG--GA-TAGGGCCGAT--G-TGC--T-AAAGTG-----C--T-------TACCGTACCCGACTcctt
gi|45 : g--GA-CATGGCTGAC--A-TGC--T-A---TG-----C--T-------TACTGTACCCAACctgtattttcatcaaatttttt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): CCCAGCTCCTTGGAAATATTTCGACAAAGTTATAAGTAATTGCCAGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 111 111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11111111111111 22222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 111111111
lowQualScore : 44 3 555 3 3 44 3 0 88 99999999 66 3 333 000 77 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 44444 77777777 2 2 4 0 1 555555 999999 333 22 77777777777777 1 4444 22 777777 333 55 1 22 1 22 1 1 1 1 1 2 77777 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 3 1 44444 1 222 1 2 2222 88 1 66 1 1 2222 22 99 1 1 000000000
lowQualScore : .. . ... . . .. . . .. ........ .. . ... ... .. ..................................................................................................................... ..... ........ . . . . . ...... ...... ... .. .............. . .... .. ...... ... .. . .. . .. . . . . . . ..... ................................................................................................................... . . . ..... . ... . . .... .. . .. . . .... .. .. . . .........
lowQualScore : 66 3 888 1 1 22 1 2 55 88888888 66 3 999 000 99 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 66666 22222222 0 0 0 9 9 555555 888888 222 55 33333333333333 8 0000 66 444444 333 22 9 55 8 44 7 7 7 7 8 0 44444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 1 4 88888 4 444 4 7 8888 66 3 11 9 4 9999 00 11 5 5 777777777
consensus : AGCTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT---AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATTTTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTG-TCAAAATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTTTTTTTTTGACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATA----ACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
Reference ( family-1434 ) : AGCTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT---AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGTTCAAAATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTT-TTTTTTTTTNACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATA----ACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
gi|1 : TTTTTTATGACCAAT-AAAAT-----AAA-AGA---TA-AC-ATA----ACTTAAGTTTT-TA-AT-TGCAGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-CTTACCAAAGTTACCGTACCCAGC
gi|1 : ggTGACGTAATTTTGACATTTTA-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---ATTGGATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTCG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-G--TGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|1 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATATTAAACTTATATTAT-TT-ACGTGCGGA-CAG----GACCGAT--GTGC--TAATG-C---------TTACCGTACCCAGCaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|10 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggTTTTGATCAAT-AAAAT-----GTA-AGA---TA-AC-ATA----ACTTTAGTTTT-TG-ACATGCGGA-T------GTTTTTT--GTGC--T-ATT-T---------CTACCGTAACCAAC
gi|10 : ACATAATTTTGATCT---A-CAAGA--------T-G-TT-AAAATTGAAC-T------TGGGCCCA------CC---TTGTTATGAAAATT--TG--------------ATTGCG-TTA----TATTG--AATTTACA------C---TGAATAATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTCGTATA-AAT-A-CATGGTGGTGGCCATAG----AAATGTTA-TTGcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|11 : gttggttacggtagaaatagcacaaaaaacatccgcatgtcaaaaactaaagttatgttatcttacattttattgatcaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTTGATAT---G-AAAAA--------T-G-TT-AAAA-TTAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTTAATTT--TA--------------CTGGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAAGAG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTAGA-CAT-ACCATGGTTGTGGCCATAGAGAAAAACAATA-TTG----AAATGaaacgtt
gi|11 : taTTTTCACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATA----ACTTTACTTTT-TG-ACTTGCAGA-CAG----GGCCGAT--ATTC--T-ATG-C---------TTACTGTACCCAGCTcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattttcaccaataaaatataagataacataactttactttttgacttgcagacagggccgatattctatgcttactgtacccagct
gi|12 : tattgatatgaaaaatgttaaaattaacttggccacacctttgtatttaattttactggtgttattttgaatctacactgaaaagagatatattcatgaaagtttggtagacataccatggttgtggccatagagaaaaacaatattgaaatgcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaA-GCG-CATCAGCCCTGTT--CGC-A-AT--CAACAA----T---TAAAGTT-------------ATT--ATTGGT---AAAAAAAA--AAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGCCATAATTTTGACAT---A-AAAAG----------G-TT-AAAAATGAAT-C------TGGCTACA------CC---TTTGTTATAAATTT--TATGTATTTT------CTTGTAATTA----TTTTG--AATCTACGT-----C---TGAAAGATG--GT-ATATT--T-AAATGAAAGT-TGGGTATA-CAT-A-TATAGTTGTGGCCCTAGAG-AAAA
gi|13 : AGCTTGGTACGGT--AA-GCA---TA-GCA-CATCGGCCCTCTC--CGC-ATGT--AAAGAA----GAAATAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT---TTAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATTTTGACA-----TCGA----------AAA--------T-G--T-AAAAATGACC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATT--------------------TTGTG-TTA----TTTCC--AATGTACA------C---TTAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGATATG-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATATAG-GAAACTTTA-TTagttttgaaacgtag
gi|14 : TTTTTTACCAAT-A----------TA-AGA---TA-AC-ATA----AC------------------------AG----GGCCAAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACTGCACCta
gi|14 : GACATAATTTTGACAT-----AAAAA--------T-G-TTAAAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAA-TT--TA--------------CTGGTG-TTA----ATTTG--AATGTACA------CTATTAAAAAATGATAT-ATATT--A-A--TGAAAGT-T----------T-A-CATGGTTTTGGCCATAGAT-AAAACTTTtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|15 : ggtgcagtaagcatagcacattggccctgttatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT---A-AAAAAAGTACATGT-A-TC-AAAAATGAAC-T------TGGCTACA------AT---ATAGTATTAAATTT--TG--------------CATGCG-TTA----GTTTG--AATATGTA------C---TAAAA----------T-TT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CTT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAC-AAAATTTTA-TT----AAAATGTtaagtttattgaaacata
gi|15 : tggcaGC-ACGT--AAAAAAAAAAT---TAAGCTT-TGTTATC-TTATATTTTATagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaaatataagataacaaagcttaattttttttttacgtgccatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : tggcaataaaaaaagtacatgtatcaaaaatgaacttggctacaatatagtattaaattttgcatgcgttagtttgaatatgtactaaaatttcatgaaagtttggtatacttacatggttgtggccatagacaaaattttattaaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAACAT---A-AAAAA--------T-A-TT-AAGAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TATGTTTTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTG----TTTTG--AATCTACA------T---TAAAAGATG--ATAATATT--C-A--T----------------CTT-A-CATGGTTGTGGCCATGGcatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : TTATTTGGACCAAT-AAAAT-----ATA-CGA---TA-AC-ATA----ACTTT-ATTTT-TA-ACACACGTA-CAGAAAAGGCCAAT--GTGCT-T-TTT-C---------GTACCATACCCAGCTcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggaccaataaaatatacgataacataactttatttttaacacacgtacagaaaaggccaatgtgctttttcgtaccatacccagctc
gi|17 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATAATTTTTACAC---A-ATAAA--------TTG-TTCAAAAATG--------------------------C---TTTGTATTAAATTT--TA---------------------TTA----TTTTGGAAATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--A-A--TGATTGT-TTGGTATA-CATAA-CATGGTCGTGGCCATAGAG-AAAACTTGA-TTGc
gi|17 : TTTGACCAAT-AAAA------------A---TA-AC-ATA----ACTTTAATTTT-T-----------------------GAT--GTGC--T-CTG-C---------TTACCGTACCCAGCTaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatttgaccaataaaaataacataactttaatttttgatgtgctctgcttaccgtacccagctc
gi|18 : cataatttttacacaataaattgttcaaaaatgctttgtattaaattttattattttggaaatctacactgaaagatgatatattaatgattgtttggtatacataacatggtcgtggccatagagaaaacttgattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaGGT-CGGT--AA--CA---TT-GCAACATCGGTCCTATC--C-C-ACAA--CAAA-----------AAAATT-TATTA-----ATA-TTTATTGGT---c
gi|19 : catagagaaaagttattgaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattatcttggGACAT---A-AAAAA--------A-G-TT-TAAAATGAAC-TAAATCTTGGTCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-ATA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-----------------ATA-CAT-A-CATGGTTTTGGTCATAGAG-AAAATTTTC-TT----AAAACGTagatc
gi|2 : CTGGGTACAGT--AA-GCA---AA-TCA-CATTGGTCCTGTC--CGT-ATGT--CAAAAA----T---CAAAGTTGTGTTATC-TTATATTTCATTGGTCAAAAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCACATAATTTTGACAT---A-AAAAG--------T-G-AT-AAAA-TGAAA-A------TGACCACA------CA---TTTGTAATAAATTT--TA--------------CTTGTA-AAA----TTTTG--AATCTACA------C---TCAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTCAGGCCATATAG-AAAATTTTA-Tag
gi|2 : aACCAAT-AAAAC-----ATA-AGA---TA-AC-ACG----ATTTTATTTTT-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--TTA---T-ATG-C---------TTACCGTGCCCAGCctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggaccaataaaacataagataacacgattttattttttaacgttcggacagggccgatttatatgcttaccgtgcccagcc
gi|20 : actgggtacagtaagcaaatcacattggtcctgtccgtatgtcaaaaatcaaagttgtgttatcttatatttcattggtcaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggACAT---A-AAA----------T-G-TT-AAATATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--AGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGc
gi|21 : -T------TGGTCACA------CC---TTTGTATTTACTTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGCAAGATG--AT-ATGTT--C-C--TGAAATT-TTGGTATG-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAAGG-AAAACTTTT-TTGaaac
gi|22 : tACA------AC---TCTATACAAAATTA--TA--------------TCTACA-TTA----TTTCC--AATCTATA------C---TAAAAGATG--AT-ACATT--C-A---------------ATAGCA--A-CATGAGTGTGGCCTTATAG-AAAACATTAGTTGaaacg
gi|23 : TGGG-ATGGT--AA-GCA---TAAGCA-CATCGGCCCTGTT--CGCAACGT--CAAAAA----T---TAA---C-TGTTATCATTAagtgtg
gi|24 : CAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATA----AATTTGATTTT-TG-ATGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--GTGCTAT-ATG-CTTCATTT--TTACCGTACCCAGCgcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|25 : gGCTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-GGA-CATCGGCCCTGTCCGCGC-ACGTAAAAAAAA----C---TAAA-CT-TGTTAAT-TTAT-TTATATTGGT---A
gi|26 : TGACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TT-AC-ATA----AGTTATTTTTT-TT-ACGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCTc
gi|27 : TTTTGACCAAT-AAACT-----ATG-AGA---TA-AC-ATA----ACTTTAATTTA-TG-ACGTGTGGG-CAG----AGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACTGTACC
gi|28 : ttACCAAT-GAAAC-----A---AGA---TA-AC-ACA----ATTTTTTTTTT-TGAACATTCAGA-C------GGTCGAT--TTA---T-ATG-C---------TTATCTTGCCCAGC
gi|29 : tctggACCAAT-AAAAC-----GTA-AGA---TA-AC-ACA----ATTTTATTTTT-TA-ATGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--TTAA--T-ATGAC---------TTACCATACCCA
gi|3 : agAGCTGGGTACGGT--AAAGCA---TA-GAA-TATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT--GTCATA-TTATATTTTATTGAT---AAAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-CT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTG--AGTATATA------T---TGTAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAACTGTA-TTGTTCAAAATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTTTTTTTTT-ACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATA----ACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-TAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------ATACCGTACCCAGCT
gi|30 : TTTTTACCAAT-AAAAT-----ATA--GA---TA--C-ATA----A-TTTAATTTT--G-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACTGTCCACAGC
gi|31 : TTTTACCAAT-AAATT-----ATA-AGA---GA-AC-ATA----ACTTTATTTTTATA-AA--GCCGA-CAG----GGCCAAT--ATGC--T-AGA-T---------TTACAGTACCCA
gi|32 : ACCAAT-AAAAC-----ATA-AGA---TA-AC-ACG----ATTTTA-TTTT-TA-ACGTTCGGA-CAA----AGCTGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGC
gi|33 : ggTTAAACAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATA----ACTGTAATTTT-TG-ACGTGCGGAGCAG----AGCAGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCC
gi|34 : AGTCGGGTACGGT--AA-GCACTTTA-GCA-CATCGGCCCTATC--CGC-ACGTAGCAATAA----T---
gi|35 : gTTTTTCACCAAT-AGAAT-----A---ACA---TACACTATA------TTTAATT------AGATGCG-A-CAG----GGCCAAT--GTAC--T-ATG-T---------TTATGGTA-CCAGCctgtattttcatcaaatttttt
gi|36 : ACCAAT-AAAAT-----A-------------C-TTA----ATTTT--TTTT-T--ACATGCGGA-CAA----GGCCGAT--GTGC--T-TCG-C---------TTACCACACCCAG
gi|37 : gACCAAT-AAAAG-----ATC-AGG---TA-AT-ATA----AC-------------------GGA-CAG----GGACGAT--GTGT--T-ATG-C---------TCACCGTACTCAGCT
gi|38 : tggTTTTTACCCAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-GC-ATA----ACTTTATTTTT-CT-ACGTACGGA-CAG----GGCCGAT--
gi|39 : TTTGATAT---A-AAAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CT---TT-------AATAT--TA--------------CTTGTG-
gi|4 : atatgCTGGGTACGGT--AA-GCG---TA-GCA-CATTGGCCCTGTC--CGC-ACAT--CAAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT---AAAA---A--AAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACATAA---------------AAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACATNTAATCCGGATTTTCA-TAAATTTACTGTTTTTTGCCACACCCTTGTA-TTAAAACTTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTACA-CAT-A-CATGGATGTGGCC--AGAG-AAAAGCTTA-TTG
gi|4 : ggcAACTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-ACA--ATTGGCCCTGTC--CAC-AAGT--CAGAAA----A---TAAAGTT---TTATA-TTATATTaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|40 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccATT--C-A--TGAAAGC-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGGGACCATATAG-AAAACTTTA-TTc
gi|41 : --TGGAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGACATAGAG-AACACTTTA-TTGtaaa
gi|42 : ACCAAT-GAAAT-----GCA-AGA---CA-AC-ATA----AATTTAATCTT-TG-ACATGTGGA-CAG----atacga
gi|43 : t-ATA----ACTTTAATTTT-CT-GTATGC-----------------T---TGC--T-ATG-C---------TTACTGTGCCCAGCcca
gi|45 : GTTGGGTACAGT--AA-GCA---TA-GCA-TGTCAGCCATGTC--cctt
gi|5 : TTTTGTTGACCAGT-AAAAT-----AT------------------------TTGATTTT-TG-ACATACGAT-CAG----GGCCGAT--GTGTTAT-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCcc
gi|5 : TGACATAGTTTTGACAT---A-AAAAA--------T-GATT-AAA--TGAAT-T------TGGTCAAA------CC---TTTGTATTAAATTT--CA--------------CTTGTG-AAA----TTGTG--ATTCTACA------C---TAAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGG-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGGCATTTAG-AAAACTTTA-----TCAAAAAGTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|5 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ACG----ATTTTATTTTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGTCGAT--TTA---T-ATG-C---------TTTCCGTACCCAGCagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|6 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcTT-TTTTTTTTGGACCAATGAAAATC----ATA-AAACATTA-ACAAAA----ACTTTTGATTT-TG-ACATGCAGA-CA-----GGCAGAT--GTTCTAT-ATG-T---------GTACCGTACCCTGCgc
gi|6 : ggACAT---A-AAA---------------T-GAAAATGAACCT------TGGCCACAAAACA-CC---TTTGTAT-AAATTT--TA--------------CTTGCG-AAA----TTTTG--AATCGCCA------C---TAAAAGA-G--AT-ATAAT--CAA--TGAAAGTATTGGTTTA-CA--A-CATGATTGTAG-CATTTAG-AAA--CTTA-----TCTAAATGTtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|6 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaTTTGGACCA-T-AAAAC-----ATATAGA---TA--C-ACA----ATTATA--TTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGATTAATATA-T-ATG-C---------TTACCGTATCagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|7 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccaT--AA-GTA---TA-GCT-CATTGGCCCTGTC--TAC-AGGT---AAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTT-ATTTGTCA-AAAA---ACGNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGACAAACTTTTTACAT---TTAAAAA--------T-G-TT-AAAA--GAAT-G------TTGCTTCA------CC---TT-ATATTAAATTT--CA--------------CT-------A----TTTTG--AATCTGCA------C---TAAAATAT---AT-ATATTATC-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-G-CATATCTACATACATAGAT-AAAACGTTA-TTG----AAATGTt
gi|7 : TCTCGACCAAT-ACAAC-----ATA-TGA---TA-GT-ATA----ACTTT-ATTTT-agcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|8 : taagtatagctcattggccctgtctacaggtaaaaattaaagttatgttatcttatatttatttgtcaaaaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacaaactttttacatttaaaaatgttaaaagaatgttgcttcaccttatattaaatttcactattttgaatctgcactaaaatatatatattatcatgaaagtttggtatacatgcatatctacatacatagataaaacgttattgaaatgtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaTAATTTTGGCAT---C-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCAAA------CA---TTTGTATTAAAGTT--TA--------------CTTATG-TTA----TTTTG--AATCTACACTTAGTC---TAAAAGATGATAT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CACGGTTGTGGCCATAGAG-AAAGCTTTA----TTC-AAATGTaa
gi|8 : TTGACCAAT-AAAATTCAATATA-AGA---TA-TT-ATA----ACTTTA-TTTT-TT-ACGTGCGGT-CAG----AGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACTGCACCCAagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatcttgacttgaccaataaaattcaatataagatattataactttattttttacgtgcggtcagagccgatgtgctatgcttactgcacccacc
gi|9 : taattttggcatcaaaaatgttaaaaatgaacttggccaaacatttgtattaaagtttacttatgttattttgaatctacacttagtctaaaagatgatatatattcatgaaagtttggtatacatacacggttgtggccatagagaaagctttattcaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatcttgacGCTGGGTACGGTTTAA--CA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CAC-ACAT--CAAAAA----T---TGAAG-T-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT---AAAA---A--AAA---AAcc
gi|9 : gTGACACAATTTTGACAT---A-ATAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAT-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTA--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattacttttgacacaattttgacataataaatgttaaaaatgaatttggccacacctttgtattaaattttatttgtgttattttaaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtatacatacatggttgtagccatagagaaaactttattgaaacatag
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): CCCAGCTCCTTGGAAATATTTCGACAAAGTTATAAGTAATTGCCAGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111 33333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111
lowQualScore : 44 3 555 2 2 33 2 1 888 88888888 0 88 3 22222 888 66 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444 77777777 2 2 4 0 1 555555 999999 333 22 77777777777777 1 4444 22 777777 333 55 1 22 1 22 1 1 1 1 1 2 77777 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 1 1 55555 1 222 1 2 2222 77 1 55 1 1 3333 22 99 1 1 111111111
lowQualScore : .. . ... . . .. . . ... ........ . .. . ..... ... .. ........................................................................................................................ ..... ........ . . . . . ...... ...... ... .. .............. . .... .. ...... ... .. . .. . .. . . . . . . ..... ................................................................................................................. . . . ..... . ... . . .... .. . .. . . .... .. .. . . .........
lowQualScore : 22 1 444 9 9 99 9 2 666 44444444 8 44 1 55555 888 99 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 22222222 0 0 0 9 9 555555 888888 222 55 33333333333333 8 0000 66 444444 333 22 9 55 8 44 7 7 7 7 8 0 55555 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 5 5 00000 4 555 4 8 9999 99 4 88 4 4 0000 00 44 5 5 222222222
consensus : AGCTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGT--AAAACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTTT-TTTTTTG-ACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
Reference ( family-1434 ) : AGCTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGT-CAAAATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTTT-TTTTTTG-ACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
gi|1 : TT-TTTTATG-ACCAAT-AAAAT-----AAA-AGA---TA-AC-AT----AACTTAAGTTTT-TA-AT-TGCAGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-CTTACCAAAGTTACCGTACCCAGC
gi|1 : ggTGACGTAATTTTGACATTTTA-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---ATTGGATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTCG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-G--TGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTG----AAACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATCTGGACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-ATATTAAACTTATATTAT-TT-ACGTGCGGA-CAG----GACCGAT--GTGC--TAATG-C---------TTACCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|10 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTG-ATCAAT-AAAAT-----GTA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAGTTTT-TG-ACATGCGGA-T------GTTTTTT--GTGC--T-ATT-T---------CTACCGTAACCAAC
gi|10 : ACATAATTTTGATCT---A-CAAGA--------T-G-TT-AAAATTGAAC-T------TGGGCCCA------CC---TTGTTATGAAAATT--TG--------------ATTGCG-TTA----TATTG--AATTTACA------C---TGAATAATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTCGTATA-AAT-A-CATGGTGGTGGCCATAG----AAATGTTA-TTG----AAACGTcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|11 : gttggttacggtagaaatagcacaaaaaacatccgcatgtcaaaaactaaagttatgttatcttacattttattgatcaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTTGATAT---G-AAAAA--------T-G-TT-AAAA-TTAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTTAATTT--TA--------------CTGGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAAGAG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTAGA-CAT-ACCATGGTTGTGGCCATAGAGAAAAACAATA-TTG----AAATGt
gi|11 : taTTTTC-ACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTACTTTT-TG-ACTTGCAGA-CAG----GGCCGAT--ATTC--T-ATG-C---------TTACTGTACCCAGCTcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattttcaccaataaaatataagataacataactttactttttgacttgcagacagggccgatattctatgcttactgtacccagct
gi|12 : tattgatatgaaaaatgttaaaattaacttggccacacctttgtatttaattttactggtgttattttgaatctacactgaaaagagatatattcatgaaagtttggtagacataccatggttgtggccatagagaaaaacaatattgaaatgcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaA-GCG-CATCAGCCCTGTT--CGC-A-AT--CAACAA----T---TAAAGTT-------------ATT--ATTGGT-----AAAAAAAA--AAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGCCATAATTTTGACAT---A-AAAAG----------G-TT-AAAAATGAAT-C------TGGCTACA------CC---TTTGTTATAAATTT--TATGTATTTT------CTTGTAATTA----TTTTG--AATCTACGT-----C---TGAAAGATG--GT-ATATT--T-AAATGAAAGT-TGGGTATA-CAT-A-TATAGTTGTGGCCCTAGAG-AAAA
gi|13 : AGCTTGGTACGGT--AA-GCA---TA-GCA-CATCGGCCCTCTC--CGC-ATGT--AAAGAA----GAAATAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----TTAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACAT--------CG-------AAAA--------T-G-T--AAAAATGACC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--T------------------GTG-TTA----TTTCC--AATGTACA------C---TTAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGATATG-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATATAG-GAAACTTTA-TTagttttgaaacgtag
gi|14 : GGTGCAGT--AA-GCA---TA-GCA-CATTGGCCCTG------------------------T---TA------TGTTATC-TTA-----TATTGGT-----AAAA---A--Ata
gi|14 : GACATAATTTTGACAT-----AAAAA--------T-G-TTAAAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAA-TT--TA--------------CTGGTG-TTA----ATTTG--AATGTACA------CTATTAAAAAATGATAT-ATATT--A-A--TGAAAGT-T----------T-A-CATGGTTTTGGCCATAGAT-AAAACTTTtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|15 : ggtgcagtaagcatagcacattggccctgttatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT---A-AAAAAAGTACATGT-A-TC-AAAAATGAAC-T------TGGCTACA------AT---ATAGTATTAAATTT--TG--------------CATGCG-TTA----GTTTG--AATATGTA------C---TAAAA----------T-TT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CTT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAC-AAAATTTTA-TT----AAAATGTtaagtttattgaaacata
gi|15 : tggcaGC-ACGT--AAAAAAAAAAT---TAAGCTT-TGTTATC-TTATATTTTATagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaaatataagataacaaagcttaattttttttttacgtgccatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : tggcaataaaaaaagtacatgtatcaaaaatgaacttggctacaatatagtattaaattttgcatgcgttagtttgaatatgtactaaaatttcatgaaagtttggtatacttacatggttgtggccatagacaaaattttattaaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAACAT---A-AAAAA--------T-A-TT-AAGAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TATGTTTTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTG----TTTTG--AATCTACA------T---TAAAAGATG--ATAATATT--C-A--T----------------CTT-A-CATGGTTGTGGCCATGGcatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : T-TATTTGG-ACCAAT-AAAAT-----ATA-CGA---TA-AC-AT----AACTTT-ATTTT-TA-ACACACGTA-CAGAAAAGGCCAAT--GTGCT-T-TTT-C---------GTACCATACCCAGCTcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggaccaataaaatatacgataacataactttatttttaacacacgtacagaaaaggccaatgtgctttttcgtaccatacccagctc
gi|17 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATAATTTTTACAC---A-ATAAA--------TTG-TTCAAAAATG--------------------------C---TTTGTATTAAATTT--TA---------------------TTA----TTTTGGAAATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--A-A--TGATTGT-TTGGTATA-CATAA-CATGGTCGTGGCCATAGAG-AAAACTTGA-TTG----AAACGTc
gi|17 : TTTG-ACCAAT-AAAA------------A---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-T-----------------------GAT--GTGC--T-CTG-C---------TTACCGTACCCAGCTagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatttgaccaataaaaataacataactttaatttttgatgtgctctgcttaccgtacccagctc
gi|18 : cataatttttacacaataaattgttcaaaaatgctttgtattaaattttattattttggaaatctacactgaaagatgatatattaatgattgtttggtatacataacatggtcgtggccatagagaaaacttgattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaGGT-CGGT--AA--CA---TT-GCAACATCGGTCCTATC--C-C-ACAA--CAAA-----------AAAATT-TATTA-----ATA-TTTATTGGT-----c
gi|19 : catagagaaaagttattgaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattatcttggGACAT---A-AAAAA--------A-G-TT-TAAAATGAAC-TAAATCTTGGTCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-ATA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-----------------ATA-CAT-A-CATGGTTTTGGTCATAGAG-AAAATTTTC-TT----AAAACGTagatc
gi|2 : CTGGGTACAGT--AA-GCA---AA-TCA-CATTGGTCCTGTC--CGT-ATGT--CAAAAA----T---CAAAGTTGTGTTATC-TTATATTTCATTGGTCAA--AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTCACATAATTTTGACAT---A-AAAAG--------T-G-AT-AAAA-TGAAA-A------TGACCACA------CA---TTTGTAATAAATTT--TA--------------CTTGTA-AAA----TTTTG--AATCTACA------C---TCAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTCAGGCCATATAG-AAAATTTTA-TC-T-AAATATGTag
gi|2 : aG-ACCAAT-AAAAC-----ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTT-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--TTA---T-ATG-C---------TTACCGTGCCCAGCagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggaccaataaaacataagataacacgattttattttttaacgttcggacagggccgatttatatgcttaccgtgcccagcc
gi|20 : actgggtacagtaagcaaatcacattggtcctgtccgtatgtcaaaaatcaaagttgtgttatcttatatttcattggtcaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctgACAT---A-AAA----------T-G-TT-AAATATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--AGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGc
gi|21 : -T------TGGTCACA------CC---TTTGTATTTACTTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGCAAGATG--AT-ATGTT--C-C--TGAAATT-TTGGTATG-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAAGG-AAAACTTTT-TTGaaac
gi|22 : tACA------AC---TCTATACAAAATTA--TA--------------TCTACA-TTA----TTTCC--AATCTATA------C---TAAAAGATG--AT-ACATT--C-A---------------ATAGCA--A-CATGAGTGTGGCCTTATAG-AAAACATTAGTTGaaacg
gi|23 : TGGG-ATGGT--AA-GCA---TAAGCA-CATCGGCCCTGTT--CGCAACGT--CAAAAA----T---TAA---C-TGTTATCATTAagtgtg
gi|24 : CAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-AT----AAATTTGATTTT-TG-ATGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--GTGCTAT-ATG-CTTCATTT--TTACCGTACCCAGCgcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|25 : gGCTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-GGA-CATCGGCCCTGTCCGCGC-ACGTAAAAAAAA----C---TAAA-CT-TGTTAAT-TTAT-TTATATTGGT-----A
gi|26 : TG-ACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TT-AC-AT----AAGTTATTTTTT-TT-ACGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCTc
gi|27 : TTTTG-ACCAAT-AAACT-----ATG-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTA-TG-ACGTGTGGG-CAG----AGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACTGTACC
gi|28 : ttG-ACCAAT-GAAAC-----A---AGA---TA-AC-AC----AATTTTTTTTTT-TGAACATTCAGA-C------GGTCGAT--TTA---T-ATG-C---------TTATCTTGCCCAGC
gi|29 : tctgG-ACCAAT-AAAAC-----GTA-AGA---TA-AC-AC----AATTTTATTTTT-TA-ATGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--TTAA--T-ATGAC---------TTACCATACCCA
gi|3 : aAGCTGGGTACGGT--AAAGCA---TA-GAA-TATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT--GTCATA-TTATATTTTATTGAT-----AAAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNCATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-CT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTG--AGTATATA------T---TGTAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAACTGTA-TTGTTCAAAATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTTT-TTTTTT--ACCAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-TAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------ATACCGTACCCAGCT
gi|30 : TTTTT-ACCAAT-AAAAT-----ATA--GA---TA--C-AT----AA-TTTAATTTT--G-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACTGTCCACAGC
gi|31 : TTTT-ACCAAT-AAATT-----ATA-AGA---GA-AC-AT----AACTTTATTTTTATA-AA--GCCGA-CAG----GGCCAAT--ATGC--T-AGA-T---------TTACAGTACCCA
gi|32 : G-ACCAAT-AAAAC-----ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTA-TTTT-TA-ACGTTCGGA-CAA----AGCTGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGC
gi|33 : gTTA-AACAAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTGTAATTTT-TG-ACGTGCGGAGCAG----AGCAGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCC
gi|34 : AGTCGGGTACGGT--AA-GCACTTTA-GCA-CATCGGCCCTATC--CGC-ACGTAGCAATAA----T---
gi|35 : gTTTTTC-ACCAAT-AGAAT-----A---ACA---TACACTAT----A--TTTAATT------AGATGCG-A-CAG----GGCCAAT--GTAC--T-ATG-T---------TTATGGTA-CCAGCctgtattttcatcaaatttttt
gi|36 : G-ACCAAT-AAAAT-----A-------------C-TT----AATTTT--TTTT-T--ACATGCGGA-CAA----GGCCGAT--GTGC--T-TCG-C---------TTACCACACCCAG
gi|37 : G-ACCAAT-AAAAG-----ATC-AGG---TA-AT-AT----AAC-------------------GGA-CAG----GGACGAT--GTGT--T-ATG-C---------TCACCGTACTCAGCT
gi|38 : tgTTTTT-ACCCAT-AAAAT-----ATA-AGA---TA-GC-AT----AACTTTATTTTT-CT-ACGTACGGA-CAG----GGCCGAT--
gi|39 : TTTGATAT---A-AAAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CT---TT-------AATAT--TA--------------CTTGTG-
gi|4 : atatgCTGGGTACGGT--AA-GCG---TA-GCA-CATTGGCCCTGTC--CGC-ACAT--CAAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACATAA---------------AAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACATNTAATCCGGATTTTCA-TAAATTTACTGTTTTTTGCCACACCCTTGTA-TTAAAACTTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTACA-CAT-A-CATGGATGTGGCC--AGAG-AAAAGCTTA-TTG----AAACGT
gi|4 : ggcAACTGGGTACGGT--AA-GCA---TA-ACA--ATTGGCCCTGTC--CAC-AAGT--CAGAAA----A---TAAAGTT---TTATA-TTATATTagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|40 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccATT--C-A--TGAAAGC-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGGGACCATATAG-AAAACTTTA-TTc
gi|41 : --TGGAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGACATAGAG-AACACTTTA-TTGtaaa
gi|42 : G-ACCAAT-GAAAT-----GCA-AGA---CA-AC-AT----AAATTTAATCTT-TG-ACATGTGGA-CAG----atacga
gi|43 : t-AT----AACTTTAATTTT-CT-GTATGC-----------------T---TGC--T-ATG-C---------TTACTGTGCCCAGCca
gi|45 : GTTGGGTACAGT--AA-GCA---TA-GCA-TGTCAGCCATGTC--cctt
gi|5 : T-TTTGTTG-ACCAGT-AAAAT-----AT------------------------TTGATTTT-TG-ACATACGAT-CAG----GGCCGAT--GTGTTAT-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCcc
gi|5 : TGACATAGTTTTGACAT---A-AAAAA--------T-GATT-AAA--TGAAT-T------TGGTCAAA------CC---TTTGTATTAAATTT--CA--------------CTTGTG-AAA----TTGTG--ATTCTACA------C---TAAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGG-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGGCATTTAG-AAAACTTTA----T-CAAAAAGTtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|5 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAT-----ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGTCGAT--TTA---T-ATG-C---------TTTCCGTACCCAGCagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|6 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcTTTTT-TTTTTGG-ACCAATGAAAATC----ATA-AAACATTA-ACAAA----AACTTTTGATTT-TG-ACATGCAGA-CA-----GGCAGAT--GTTCTAT-ATG-T---------GTACCGTACCCTGCgc
gi|6 : ggACAT---A-AAA---------------T-GAAAATGAACCT------TGGCCACAAAACA-CC---TTTGTAT-AAATTT--TA--------------CTTGCG-AAA----TTTTG--AATCGCCA------C---TAAAAGA-G--AT-ATAAT--CAA--TGAAAGTATTGGTTTA-CA--A-CATGATTGTAG-CATTTAG--AAAC-----TTAT-CTAAATGTtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|6 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaTTTGG-ACCA-T-AAAAC-----ATATAGA---TA--C-AC----AATTATA--TTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGATTAATATA-T-ATG-C---------TTACCGTATCagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|7 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccaT--AA-GTA---TA-GCT-CATTGGCCCTGTC--TAC-AGGT---AAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTT-ATTTGTCA---AAAA---ACGNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACAAACTTTTTACAT---TTAAAAA--------T-G-TT-AAAA--GAAT-G------TTGCTTCA------CC---TT-ATATTAAATTT--CA--------------CT-------A----TTTTG--AATCTGCA------C---TAAAATAT---AT-ATATTATC-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-G-CATATCTACATACATAGAT-AAAACGTTA-TTG----AAATGTt
gi|7 : TCTCG-ACCAAT-ACAAC-----ATA-TGA---TA-GT-AT----AACTTT-ATTTT-agcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|8 : taagtatagctcattggccctgtctacaggtaaaaattaaagttatgttatcttatatttatttgtcaaaaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacaaactttttacatttaaaaatgttaaaagaatgttgcttcaccttatattaaatttcactattttgaatctgcactaaaatatatatattatcatgaaagtttggtatacatgcatatctacatacatagataaaacgttattgaaatgtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaTAATTTTGGCAT---C-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCAAA------CA---TTTGTATTAAAGTT--TA--------------CTTATG-TTA----TTTTG--AATCTACACTTAGTC---TAAAAGATGATAT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CACGGTTGTGGCCATAGAG-AAAGCTTTA-T--T-C-AAATGTaa
gi|8 : TTG-ACCAAT-AAAATTCAATATA-AGA---TA-TT-AT----AACTTTA-TTTT-TT-ACGTGCGGT-CAG----AGCCGAT--GTGC--T-ATG-C---------TTACTGCACCCAagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatcttgacttgaccaataaaattcaatataagatattataactttattttttacgtgcggtcagagccgatgtgctatgcttactgcacccacc
gi|9 : taattttggcatcaaaaatgttaaaaatgaacttggccaaacatttgtattaaagtttacttatgttattttgaatctacacttagtctaaaagatgatatatattcatgaaagtttggtatacatacacggttgtggccatagagaaagctttattcaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatcttgacGCTGGGTACGGTTTAA--CA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CAC-ACAT--CAAAAA----T---TGAAGTT--GTTATC-TTATATTTTATTGGTAAAAAAAAA---A--NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACTTTTGACACAATTTTGACAT---A-ATAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAT-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTA--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAACTTTA-TTGcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): CCCAGCTCCTTGGAAATATTTCGACAAAGTTATAAGTAATTGCCAGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111 333333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 111111111
lowQualScore : 77 555 2 2 33 2 1 888 88888888 0 44 3 22222 888 66 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444 77777777 2 2 4 0 1 555555 999999 333 22 77777777777777 1 4444 22 777777 333 55 1 22 1 22 1 1 1 1 1 5555555 1 555555 2 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77777 33333 1 33333 1 1 222 1 2 2222 0 99 1 55 1 1 2222 22 1 99 1 1 000000000
lowQualScore : .. ... . . .. . . ... ........ . .. . ..... ... .. ........................................................................................................................ ..... ........ . . . . . ...... ...... ... .. .............. . .... .. ...... ... .. . .. . .. . . . . . ....... . ...... . ............................................................................................................. ..... ..... . ..... . . ... . . .... . .. . .. . . .... .. . .. . . .........
lowQualScore : 33 444 9 9 99 9 2 666 44444444 8 66 1 55555 888 99 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 22222222 0 0 0 9 9 555555 888888 222 55 33333333333333 8 0000 66 444444 333 22 9 55 8 44 7 7 7 7 7 7777777 7 111111 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222 66666 4 44444 4 4 444 4 7 8888 4 55 3 33 0 4 9999 00 5 11 5 5 777777777
consensus : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-TTG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
Reference ( family-1434 ) : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-TTGT--AAA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
gi|1 : --T--TTTTTATGAC-----CAAT-AA-----AAT-AAA-AGA---TA-AC-AT----AACTTAAGTTTT-TA-AT-TGCAGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-CTTACCAAAGTTACCGTACCCAGC
gi|1 : ggTGACGTAATTTTGACATTTTA-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---ATTGGATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTCG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-G--TGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-TTG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNATTATCTGGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-ATATTAAACTTATATTAT-TT-ACGTGCGGA-CAG----GACCGAT--G-TGC--TAATG-C---------TTACCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|10 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTGAT-----CAAT-AA-----AAT-GTA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAGTTTT-TG-ACATGCGGA-T------GTTTTTT--G-TGC--T-ATT-T---------CTACCGTAACCAAC
gi|10 : ACATAATTTTGATCT---A-CAAGA--------T-G-TT-AAAATTGAAC-T------TGGGCCCA------CC---TTGTTATGAAAATT--TG--------------ATTGCG-TTA----TATTG--AATTTACA------C---TGAATAATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTCGTATA-AAT-A-CATGGTGGTGGCCATAG----AAAT-------GTTA-TTG----AA-ACGTcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|11 : gttggttacggtagaaatagcacaaaaaacatccgcatgtcaaaaactaaagttatgttatcttacattttattgatcaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTTGATAT---G-AAAAA--------T-G-TT-AAAA-TTAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTTAATTT--TA--------------CTGGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAAGAG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTAGA-CAT-ACCATGGTTGTGGCCATAGAGAAAAAC-------AATA-TTG----AA-ATGCAGCAt
gi|11 : taTTTTCAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTACTTTT-TG-ACTTGCAGA-CAG----GGCCGAT--A-TTC--T-ATG-C---------TTACTGTACCCAGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattttcaccaataaaatataagataacataactttactttttgacttgcagacagggccgatattctatgcttactgtacccagct
gi|12 : tattgatatgaaaaatgttaaaattaacttggccacacctttgtatttaattttactggtgttattttgaatctacactgaaaagagatatattcatgaaagtttggtagacataccatggttgtggccatagagaaaaacaatattgaaatgcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaA-GCG-CATCAGCCCTGTT--CGC-A-AT--CAACAA----T---TAAAGTT-------------ATT--ATTGGT-----AAAAAAAA--AAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGCCATAATTTTGACAT---A-AAAAG----------G-TT-AAAAATGAAT-C------TGGCTACA------CC---TTTGTTATAAATTT--TATGTATTTT------CTTGTAATTA----TTTTG--AATCTACGT-----C---TGAAAGATG--GT-ATATT--T-AAATGAAAGT-TGGGTATA-CAT-A-TATAGTTGTGGCCCTAGAG-AAAAA-------GTT--TTG----AA-ACGTAG
gi|13 : AGCTTGGTACGGT--AAGCA---TA-GCA-CATCGGCCCTCTC--CGC-ATGT--AAAGAA----GAAATAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----TTAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACAT--------CG-------AAAA--------T-G-T--AAAAATGACC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--T------------------GTG-TTA----TTTCC--AATGTACA------C---TTAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGATATG-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATATAG-GAAAC-------TTTA-TT
gi|14 : GGTGCAGT--AAGCA---TA-GCA-CATTGGCCCTG------------------------T---TA------TGTTATC-TTA-----TATTGGT-----AAAA---A--Ata
gi|14 : GACATAATTTTGACAT-----AAAAA--------T-G-TTAAAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAA-TT--TA--------------CTGGTG-TTA----ATTTG--AATGTACA------CTATTAAAAAATGATAT-ATATT--A-A--TGAAAGT-T----------T-A-CATGGTTTTGGCCATAGAT-AAAACTTTTAAGTTTA-TTG----AA-ACATAtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|15 : ggtgcagtaagcatagcacattggccctgttatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT---A-AAAAAAGTACATGT-A-TC-AAAAATGAAC-T------TGGCTACA------AT---ATAGTATTAAATTT--TG--------------CATGCG-TTA----GTTTG--AATATGTA------C---TAAAA----------T-TT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CTT-A-CATGGTTGTGGCCATAGAC-AAAAT-------TTTA-T--T--AAA-ATGTAGCA
gi|15 : tggcaGC-ACGT--AAAAAAAAAAT---TAAGCTT-TGTTATC-TTATATTTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaaatataagataacaaagcttaattttttttttacgtgccatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : tggcaataaaaaaagtacatgtatcaaaaatgaacttggctacaatatagtattaaattttgcatgcgttagtttgaatatgtactaaaatttcatgaaagtttggtatacttacatggttgtggccatagacaaaattttattaaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAACAT---A-AAAAA--------T-A-TT-AAGAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TATGTTTTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTG----TTTTG--AATCTACA------T---TAAAAGATG--ATAATATT--C-A--T----------------CTT-A-CATGGTTGTGGCCATGGcatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : --TTATTTGGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-CGA---TA-AC-AT----AACTTT-ATTTT-TA-ACACACGTA-CAGAAAAGGCCAAT--G-TGCT-T-TTT-C---------GTACCATACCCAGCTcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggaccaataaaatatacgataacataactttatttttaacacacgtacagaaaaggccaatgtgctttttcgtaccatacccagctc
gi|17 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATAATTTTTACAC---A-ATAAA--------TTG-TTCAAAAATG--------------------------C---TTTGTATTAAATTT--TA---------------------TTA----TTTTGGAAATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--A-A--TGATTGT-TTGGTATA-CATAA-CATGGTCGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTGA-TTG----AA-ACGTAGCAc
gi|17 : TTTGAC-----CAAT-AA-----AA--------A---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-T-----------------------GAT--G-TGC--T-CTG-C---------TTACCGTACCCAGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatttgaccaataaaaataacataactttaatttttgatgtgctctgcttaccgtacccagctc
gi|18 : cataatttttacacaataaattgttcaaaaatgctttgtattaaattttattattttggaaatctacactgaaagatgatatattaatgattgtttggtatacataacatggtcgtggccatagagaaaacttgattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaCATAGAG-AAAAG-------TT-A-TTG----AA-ATGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAT--TATCTTGGAC-----CAAT-AA-----A-T-AT--------TA-A---T----AAATTT---TTT-TG-TTGTG-GGA-TAG----GACCGAT--GTTGC--A-ATG-----------TTACCG-ACCc
gi|18 : GGT-CGGT--AA-CA---TT-GCAACATCGGTCCTATC--C-C-ACAA--CAAA-----------AAAATT-TATTA-----ATA-TTTATTGGT-----agatc
gi|19 : catagagaaaagttattgaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntaattatcttggGACAT---A-AAAAA--------A-G-TT-TAAAATGAAC-TAAATCTTGGTCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-ATA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-----------------ATA-CAT-A-CATGGTTTTGGTCATAGAG-AAAAT-------TTTC-T--T--AAA-ACGTAGagatc
gi|2 : CTGGGTACAGT--AAGCA---AA-TCA-CATTGGTCCTGTC--CGT-ATGT--CAAAAA----T---CAAAGTTGTGTTATC-TTATATTTCATTGGTCAA--AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTCACATAATTTTGACAT---A-AAAAG--------T-G-AT-AAAA-TGAAA-A------TGACCACA------CA---TTTGTAATAAATTT--TA--------------CTTGTA-AAA----TTTTG--AATCTACA------C---TCAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAA-A-CATGGTTCAGGCCATATAG-AAAAT-------TTTA-TC-T--AAATATGTAGCA
gi|2 : aGAC-----CAAT-AA-----AAC-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTT-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTACCGTGCCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggaccaataaaacataagataacacgattttattttttaacgttcggacagggccgatttatatgcttaccgtgcccagcc
gi|20 : actgggtacagtaagcaaatcacattggtcctgtccgtatgtcaaaaatcaaagttgtgttatcttatatttcattggtcaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctgACAT---A-AAA----------T-G-TT-AAATATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--AGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-AATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-TTG----AA-ACc
gi|21 : -T------TGGTCACA------CC---TTTGTATTTACTTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGCAAGATG--AT-ATGTT--C-C--TGAAATT-TTGGTATG-CAT-A-CATGGTTGTGGCCATAAGG-AAAAC-------TTTT-TTG----AA-ACG
gi|22 : tACA------AC---TCTATACAAAATTA--TA--------------TCTACA-TTA----TTTCC--AATCTATA------C---TAAAAGATG--AT-ACATT--C-A---------------ATAGCA--A-CATGAGTGTGGCCTTATAG-AAAAC-------ATTAGTTG
gi|23 : TGGG-ATGGT--AAGCA---TAAGCA-CATCGGCCCTGTT--CGCAACGT--CAAAAA----T---TAA---C-TGTTATCATTAagtgtg
gi|24 : -----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AAATTTGATTTT-TG-ATGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGCTAT-ATG-CTTCATTT--TTACCGTACCCAGCgcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|25 : gGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GGA-CATCGGCCCTGTCCGCGC-ACGTAAAAAAAA----C---TAAA-CT-TGTTAAT-TTAT-TTATATTGGT-----A
gi|26 : TGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TT-AC-AT----AAGTTATTTTTT-TT-ACGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCTc
gi|27 : TTTTGAC-----CAAT-AA-----ACT-ATG-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTA-TG-ACGTGTGGG-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTACC
gi|28 : ttGAC-----CAAT-GA-----AAC-A---AGA---TA-AC-AC----AATTTTTTTTTT-TGAACATTCAGA-C------GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTATCTTGCCCAGC
gi|29 : tctgGAC-----CAAT-AA-----AAC-GTA-AGA---TA-AC-AC----AATTTTATTTTT-TA-ATGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TAA--T-ATGAC---------TTACCATACCCA
gi|3 : aAGCTGGGTACGGTA-AAGCA---TA-GAA-TATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAG-T-TGTCATA-TTATATTTTATTGAT-----AAAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNCATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-CT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTG--AGTATATA------T---TGTAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TGTA-TTGTTCAAA-ATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTT-AC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-TAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------ATACCGTACCCAGCT
gi|30 : TTTTTAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA--GA---TA--C-AT----AA-TTTAATTTT--G-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTCCACAGC
gi|31 : TTTTAC-----CAAT-AA-----ATT-ATA-AGA---GA-AC-AT----AACTTTATTTTTATA-AA--GCCGA-CAG----GGCCAAT--A-TGC--T-AGA-T---------TTACAGTACCCA
gi|32 : GAC-----CAAT-AA-----AAC-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTA-TTTT-TA-ACGTTCGGA-CAA----AGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGC
gi|33 : gTTAAA-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTGTAATTTT-TG-ACGTGCGGAGCAG----AGCAGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCC
gi|34 : AGTCGGGTACGGT--AAGCACTTTA-GCA-CATCGGCCCTATC--CGC-ACGTAGCAATAA----T---
gi|35 : gTTTTTCAC-----CAAT-AG-----AAT-A---ACA---TACACTAT----A--TTTAATT------AGATGCG-A-CAG----GGCCAAT--G-TAC--T-ATG-T---------TTATGGTA-CCAGCctgtattttcatcaaatttttt
gi|36 : GAC-----CAAT-AA-----AAT-A-------------C-TT----AATTTT--TTTT-T--ACATGCGGA-CAA----GGCCGAT--G-TGC--T-TCG-C---------TTACCACACCCAG
gi|37 : GAC-----CAAT-AA-----AAG-ATC-AGG---TA-AT-AT----AAC-------------------GGA-CAG----GGACGAT--G-TGT--T-ATG-C---------TCACCGTACTCAGCT
gi|38 : tgTTTTTAC-----CCAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-GC-AT----AACTTTATTTTT-CT-ACGTACGGA-CAG----GGCCGAT--
gi|39 : TTTGATAT---A-AAAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CT---TT-------AATAT--TA--------------CTTGTG-
gi|4 : atatgCTGGGTACGGT--AAGCG---TA-GCA-CATTGGCCCTGTC--CGC-ACAT--CAAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACATAA---------------AAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACATNTAATCCGGATTTTCA-TAAATTTACTGTTTTTTGCCACACCCTTGTA-TTAAAACTTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTACA-CAT-A-CATGGATGTGGCC--AGAG-AAAAG-------CTTA-TTG----AA-ACGTAGCA
gi|4 : ggcAACTGGGTACGGT--AAGCA---TA-ACA--ATTGGCCCTGTC--CAC-AAGT--CAGAAA----A---TAAAGTT---TTATA-TTATATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|40 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccATT--C-A--TGAAAGC-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGGGACCATATAG-AAAAC-------TTTA-TT-T--AAA-c
gi|41 : --TGGAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGACATAGAG-AACAC-------TTTA-TTG
gi|42 : GAC-----CAAT-GA-----AAT-GCA-AGA---CA-AC-AT----AAATTTAATCTT-TG-ACATGTGGA-CAG----atacga
gi|43 : t-AT----AACTTTAATTTT-CT-GTATGC-----------------T----TGC--T-ATG-C---------TTACTGTGCCCAGCca
gi|45 : GTTGGGTACAGT--AAGCA---TA-GCA-TGTCAGCCATGTC--cctt
gi|5 : --TTTTGTTGAC-----CAGT-AA-----AAT-AT------------------------TTGATTTT-TG-ACATACGAT-CAG----GGCCGAT--G-TGTTAT-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCcc
gi|5 : TGACATAGTTTTGACAT---A-AAAAA--------T-GATT-AAA--TGAAT-T------TGGTCAAA------CC---TTTGTATTAAATTT--CA--------------CTTGTG-AAA----TTGTG--ATTCTACA------C---TAAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGG-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTGGGCATTTAG-AAAAC-------TTTA-T--C--AAA-AAGTAGCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|5 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTTCCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|6 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcTTT--T--TTTTTTGGAC-----CAATGAA-----AATCATA-AAACATTA-ACAAA----AACTTTTGATTT-TG-ACATGCAGA-CA-----GGCAGAT--G-TTCTAT-ATG-T---------GTACCGTACCCTGCgc
gi|6 : ggACAT---A-AAA---------------T-GAAAATGAACCT------TGGCCACAAAACA-CC---TTTGTAT-AAATTT--TA--------------CTTGCG-AAA----TTTTG--AATCGCCA------C---TAAAAGA-G--AT-ATAAT--CAA--TGAAAGTATTGGTTTA-CA--A-CATGATTGTAG-CATTTAG-AAA---------CTTA-TC-T---AA-ATGTAGCAtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|6 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaTTTGGAC-----CA-T-AA-----AAC-ATATAGA---TA--C-AC----AATTATA--TTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGATTAA-TATA-T-ATG-C---------TTACCGTATCgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|7 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccaT--AAGTA---TA-GCT-CATTGGCCCTGTC--TAC-AGGT---AAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTT-ATTTGTCA---AAAA---ACGNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACAAACTTTTTACAT---TTAAAAA--------T-G-TT-AAAA--GAAT-G------TTGCTTCA------CC---TT-ATATTAAATTT--CA--------------CT-------A----TTTTG--AATCTGCA------C---TAAAATAT---AT-ATATTATC-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-G-CATATCTACATACATAGAT-AAAAC-------GTTA-TTG----AA-ATGTAGCt
gi|7 : TCTCGAC-----CAAT-AC-----AAC-ATA-TGA---TA-GT-AT----AACTTT-ATTTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|8 : taagtatagctcattggccctgtctacaggtaaaaattaaagttatgttatcttatatttatttgtcaaaaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacaaactttttacatttaaaaatgttaaaagaatgttgcttcaccttatattaaatttcactattttgaatctgcactaaaatatatatattatcatgaaagtttggtatacatgcatatctacatacatagataaaacgttattgaaatgtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaTAATTTTGGCAT---C-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCAAA------CA---TTTGTATTAAAGTT--TA--------------CTTATG-TTA----TTTTG--AATCTACACTTAGTC---TAAAAGATGATAT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CACGGTTGTGGCCATAGAG-AAAGC-------TTTA-T--T--CAA-ATGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNATTATCTTGACTTGACCAAT-AAAATTCAAT-ATA-AGA---TA-TT-AT----AACTTT-ATTTT-TT-ACGTGCGGT-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGCACCCAaa
gi|9 : GCTGGGTACGGTTTAA-CA---TA-GCA-CATCGGCCCTGTC--CAC-ACAT--CAAAAA----T---TGAAGTT--GTTATC-TTATATTTTATTGGTAAAAAAAAA---A--NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACTTTTGACACAATTTTGACAT---A-ATAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAT-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTA--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAT-A-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-TTG----AA-ACATAGcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): CCCAGCTCCTTGGAAATATTTCGACAAAGTTATAAGTAATTGCCAGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 111111111
lowQualScore : 77 555 2 33 2 3 888 88888888 77 3 22222 777 66 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444 77777777 2 2 4 0 1 555555 999999 333 22 77777777777777 1 4444 22 777777 333 55 1 22 1 22 1 1 3 1 5555555 1 1 3333 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77777 33333 1 33333 1 1 222 1 2 2222 0 99 1 55 0 1 3333 22 1 99 1 1 111111111
lowQualScore : .. ... . .. . . ... ........ .. . ..... ... .. ........................................................................................................................ ..... ........ . . . . . ...... ...... ... .. .............. . .... .. ...... ... .. . .. . .. . . . . ....... . . .... . ............................................................................................................. ..... ..... . ..... . . ... . . .... . .. . .. . . .... .. . .. . . .........
lowQualScore : 33 444 9 99 9 0 666 44444444 77 1 55555 888 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 22222222 0 0 0 9 9 555555 888888 222 55 33333333333333 8 0000 66 444444 333 22 9 55 8 44 7 7 5 7 7777777 7 7 9999 9 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222 77777 5 66666 4 4 555 4 8 9999 8 66 4 88 5 4 0000 00 5 44 5 5 222222222
consensus : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
Reference ( family-1434 ) : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
gi|1 : --T--TTTTTATGAC-----CAAT-AA-----AAT-AAA-AGA---TA-AC-AT----AACTTAAGTTTT-TA-AT-TGCAGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-CTTACCAAAGTTACCGTACCCAGC
gi|1 : ggTGACGTAATTTTGACATTTTA-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---ATTGGATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTCG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-G--TGAAAGT-TTGGTATA-CAAA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNATTATCTGGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-ATATTAAACTTATATTAT-TT-ACGTGCGGA-CAG----GACCGAT--G-TGC--TAATG-C---------TTACCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|10 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTGAT-----CAAT-AA-----AAT-GTA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAGTTTT-TG-ACATGCGGA-T------GTTTTTT--G-TGC--T-ATT-T---------CTACCGTAACCAAC
gi|10 : ACATAATTTTGATCT---A-CAAGA--------T-G-TT-AAAATTGAAC-T------TGGGCCCA------CC---TTGTTATGAAAATT--TG--------------ATTGCG-TTA----TATTG--AATTTACA------C---TGAATAATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTCGTATA-AATA-CATGGTGGTGGCCATAG----AAAT-------GTTA-T-TG----AA-ACGTcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|11 : gttggttacggtagaaatagcacaaaaaacatccgcatgtcaaaaactaaagttatgttatcttacattttattgatcaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTTGATAT---G-AAAAA--------T-G-TT-AAAA-TTAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTTAATTT--TA--------------CTGGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAAGAG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTAGA-CATACCATGGTTGTGGCCATAGAGAAAAAC-------AATA-T-TG----AA-ATGCAGCAt
gi|11 : taAGCTGGGTACAGT--AAGCA---TA-GAATATCGGCCCTGTC--TGC-AAGT--CAAAAA----G---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----GAAA---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattttcaccaataaaatataagataacataactttactttttgacttgcagacagggccgatattctatgcttactgtacccagct
gi|12 : tattgatatgaaaaatgttaaaattaacttggccacacctttgtatttaattttactggtgttattttgaatctacactgaaaagagatatattcatgaaagtttggtagacataccatggttgtggccatagagaaaaacaatattgaaatgcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaA-GCGCATCAGCCCTGTT--CGC-A-AT--CAACAA----T---TAAAGTT-------------ATT--ATTGGT-----AAAAAAAA--AAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGCCATAATTTTGACAT---A-AAAAG----------G-TT-AAAAATGAAT-C------TGGCTACA------CC---TTTGTTATAAATTT--TATGTATTTT------CTTGTAATTA----TTTTG--AATCTACGT-----C---TGAAAGATG--GT-ATATT--T-AAATGAAAGT-TGGGTATA-CATA-TATAGTTGTGGCCCTAGAG-AAAAA-------GTT--T-TG----AA-ACGTAG
gi|13 : AGCTTGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTCTC--CGC-ATGT--AAAGAA----GAAATAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----TTAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACAT--------CG-------AAAA--------T-G-T--AAAAATGACC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--T------------------GTG-TTA----TTTCC--AATGTACA------C---TTAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGATATG-CATA-AATGGTTGTGGCCATATAG-GAAAC-------TTTA-T-T
gi|14 : GGTGCAGT--AAGCA---TA-GCACATTGGCCCTG------------------------T---TA------TGTTATC-TTA-----TATTGGT-----AAAA---A--Ata
gi|14 : GACATAATTTTGACAT-----AAAAA--------T-G-TTAAAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAA-TT--TA--------------CTGGTG-TTA----ATTTG--AATGTACA------CTATTAAAAAATGATAT-ATATT--A-A--TGAAAGT-T----------TA-CATGGTTTTGGCCATAGAT-AAAACTTTTAAGTTTA-T-TG----AA-ACATAtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|15 : ggtgcagtaagcatagcacattggccctgttatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT---A-AAAAAAGTACATGT-A-TC-AAAAATGAAC-T------TGGCTACA------AT---ATAGTATTAAATTT--TG--------------CATGCG-TTA----GTTTG--AATATGTA------C---TAAAA----------T-TT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CTTA-CATGGTTGTGGCCATAGAC-AAAAT-------TTTA-T-TA----AA-ATGTAGCA
gi|15 : tggcaGC-ACGT--AAAAAAAAAAT---TAAGCTT-TGTTATC-TTATATTTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaaatataagataacaaagcttaattttttttttacgtgccatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : tggcaataaaaaaagtacatgtatcaaaaatgaacttggctacaatatagtattaaattttgcatgcgttagtttgaatatgtactaaaatttcatgaaagtttggtatacttacatggttgtggccatagacaaaattttattaaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAACAT---A-AAAAA--------T-A-TT-AAGAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TATGTTTTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTG----TTTTG--AATCTACA------T---TAAAAGATG--ATAATATT--C-A--T----------------CTTA-CATGGTTGTGGCCATGGcatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : --TTATTTGGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-CGA---TA-AC-AT----AACTTT-ATTTT-TA-ACACACGTA-CAGAAAAGGCCAAT--G-TGCT-T-TTT-C---------GTACCATACCCAGCTcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggaccaataaaatatacgataacataactttatttttaacacacgtacagaaaaggccaatgtgctttttcgtaccatacccagctc
gi|17 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATAATTTTTACAC---A-ATAAA--------TTG-TTCAAAAATG--------------------------C---TTTGTATTAAATTT--TA---------------------TTA----TTTTGGAAATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--A-A--TGATTGT-TTGGTATA-CATAACATGGTCGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTGA-T-TG----AA-ACGTAGCAc
gi|17 : TTTGAC-----CAAT-AA-----AA--------A---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-T-----------------------GAT--G-TGC--T-CTG-C---------TTACCGTACCCAGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatttgaccaataaaaataacataactttaatttttgatgtgctctgcttaccgtacccagctc
gi|18 : cataatttttacacaataaattgttcaaaaatgctttgtattaaattttattattttggaaatctacactgaaagatgatatattaatgattgtttggtatacataacatggtcgtggccatagagaaaacttgattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaCATAGAG-AAAAG-------TT-A-T-TG----AA-ATGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAT--TATCTTGGAC-----CAAT-AA-----A-T-AT--------TA-A---T----AAATTT---TTT-TG-TTGTG-GGA-TAG----GACCGAT--GTTGC--A-ATG-----------TTACCG-ACCc
gi|19 : GACAT---A-AAAAA--------A-G-TT-TAAAATGAAC-TAAATCTTGGTCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-ATA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-----------------ATA-CATA-CATGGTTTTGGTCATAGAG-AAAAT-------TTTC-T-TA----AA-ACGTAGagatc
gi|2 : CTGGGTACAGT--AAGCA---AA-TCACATTGGTCCTGTC--CGT-ATGT--CAAAAA----T---CAAAGTTGTGTTATC-TTATATTTCATTGGTCAA--AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTCACATAATTTTGACAT---A-AAAAG--------T-G-AT-AAAA-TGAAA-A------TGACCACA------CA---TTTGTAATAAATTT--TA--------------CTTGTA-AAA----TTTTG--AATCTACA------C---TCAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAAA-CATGGTTCAGGCCATATAG-AAAAT-------TTTA-TCTA----AATATGTAGCA
gi|2 : aGAC-----CAAT-AA-----AAC-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTT-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTACCGTGCCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggaccaataaaacataagataacacgattttattttttaacgttcggacagggccgatttatatgcttaccgtgcccagcc
gi|20 : actgggtacagtaagcaaatcacattggtcctgtccgtatgtcaaaaatcaaagttgtgttatcttatatttcattggtcaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctgACAT---A-AAA----------T-G-TT-AAATATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--AGAAAGT-TTGGTATA-CATA-AATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACc
gi|21 : -T------TGGTCACA------CC---TTTGTATTTACTTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGCAAGATG--AT-ATGTT--C-C--TGAAATT-TTGGTATG-CATA-CATGGTTGTGGCCATAAGG-AAAAC-------TTTT-T-TG----AA-ACG
gi|22 : tACA------AC---TCTATACAAAATTA--TA--------------TCTACA-TTA----TTTCC--AATCTATA------C---TAAAAGATG--AT-ACATT--C-A---------------ATAGCA-A-CATGAGTGTGGCCTTATAG-AAAAC-------ATTAGT-TG----A
gi|23 : TGGG-ATGGT--AAGCA---TAAGCACATCGGCCCTGTT--CGCAACGT--CAAAAA----T---TAA---C-TGTTATCATTAgtgtg
gi|24 : -----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AAATTTGATTTT-TG-ATGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGCTAT-ATG-CTTCATTT--TTACCGTACCCAGCgcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|25 : gGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GGACATCGGCCCTGTCCGCGC-ACGTAAAAAAAA----C---TAAA-CT-TGTTAAT-TTAT-TTATATTGGT-----A
gi|26 : TGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TT-AC-AT----AAGTTATTTTTT-TT-ACGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCTc
gi|27 : TTTTGAC-----CAAT-AA-----ACT-ATG-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTA-TG-ACGTGTGGG-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTACC
gi|28 : ttGAC-----CAAT-GA-----AAC-A---AGA---TA-AC-AC----AATTTTTTTTTT-TGAACATTCAGA-C------GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTATCTTGCCCAGC
gi|29 : tctgGAC-----CAAT-AA-----AAC-GTA-AGA---TA-AC-AC----AATTTTATTTTT-TA-ATGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TAA--T-ATGAC---------TTACCATACCCA
gi|3 : aAGCTGGGTACGGTA-AAGCA---TA-GAATATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAG-T-TGTCATA-TTATATTTTATTGAT-----AAAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNCATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-CT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTG--AGTATATA------T---TGTAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TGTA-T-TGTTCAAA-ATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTT-AC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-TAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------ATACCGTACCCAGCT
gi|30 : TTTTTAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA--GA---TA--C-AT----AA-TTTAATTTT--G-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTCCACAGC
gi|31 : TTTTAC-----CAAT-AA-----ATT-ATA-AGA---GA-AC-AT----AACTTTATTTTTATA-AA--GCCGA-CAG----GGCCAAT--A-TGC--T-AGA-T---------TTACAGTACCCA
gi|32 : GAC-----CAAT-AA-----AAC-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTA-TTTT-TA-ACGTTCGGA-CAA----AGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGC
gi|33 : gTTAAA-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTGTAATTTT-TG-ACGTGCGGAGCAG----AGCAGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCC
gi|34 : AGTCGGGTACGGT--AAGCACTTTA-GCACATCGGCCCTATC--CGC-ACGTAGCAATAA----T---
gi|35 : gTTTTTCAC-----CAAT-AG-----AAT-A---ACA---TACACTAT----A--TTTAATT------AGATGCG-A-CAG----GGCCAAT--G-TAC--T-ATG-T---------TTATGGTA-CCAGCctgtattttcatcaaatttttt
gi|36 : GAC-----CAAT-AA-----AAT-A-------------C-TT----AATTTT--TTTT-T--ACATGCGGA-CAA----GGCCGAT--G-TGC--T-TCG-C---------TTACCACACCCAG
gi|37 : GAC-----CAAT-AA-----AAG-ATC-AGG---TA-AT-AT----AAC-------------------GGA-CAG----GGACGAT--G-TGT--T-ATG-C---------TCACCGTACTCAGCT
gi|38 : tgTTTTTAC-----CCAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-GC-AT----AACTTTATTTTT-CT-ACGTACGGA-CAG----GGCCGAT--
gi|39 : TTTGATAT---A-AAAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CT---TT-------AATAT--TA--------------CTTGTG-
gi|4 : atatgCTGGGTACGGT--AAGCG---TA-GCACATTGGCCCTGTC--CGC-ACAT--CAAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACATAA---------------AAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACATNTAATCCGGATTTTCA-TAAATTTACTGTTTTTTGCCACACCCTTGTA-TTAAAACTTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTACA-CATA-CATGGATGTGGCC--AGAG-AAAAG-------CTTA-T-TG----AA-ACGTAGCA
gi|4 : ggcAACTGGGTACGGT--AAGCA---TA-ACA-ATTGGCCCTGTC--CAC-AAGT--CAGAAA----A---TAAAGTT---TTATA-TTATATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|40 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccATT--C-A--TGAAAGC-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGGGACCATATAG-AAAAC-------TTTA-T-TT----AA-Ac
gi|41 : --TGGAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGACATAGAG-AACAC-------TTTA-T-TG----AT-ACG
gi|42 : GAC-----CAAT-GA-----AAT-GCA-AGA---CA-AC-AT----AAATTTAATCTT-TG-ACATGTGGA-CAG----a
gi|43 : t-AT----AACTTTAATTTT-CT-GTATGC-----------------T----TGC--T-ATG-C---------TTACTGTGCCCAGCca
gi|45 : GTTGGGTACAGT--AAGCA---TA-GCATGTCAGCCATGTC--cctt
gi|5 : --TTTTGTTGAC-----CAGT-AA-----AAT-AT------------------------TTGATTTT-TG-ACATACGAT-CAG----GGCCGAT--G-TGTTAT-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCcc
gi|5 : TGACATAGTTTTGACAT---A-AAAAA--------T-GATT-AAA--TGAAT-T------TGGTCAAA------CC---TTTGTATTAAATTT--CA--------------CTTGTG-AAA----TTGTG--ATTCTACA------C---TAAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGG-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGGCATTTAG-AAAAC-------TTTA-T-CA----AA-AAGTAGCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|5 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTTCCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|6 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcTTT--T--TTTTTTGGAC-----CAATGAA-----AATCATA-AAACATTA-ACAAA----AACTTTTGATTT-TG-ACATGCAGA-CA-----GGCAGAT--G-TTCTAT-ATG-T---------GTACCGTACCCTGCgc
gi|6 : ggACAT---A-AAA---------------T-GAAAATGAACCT------TGGCCACAAAACA-CC---TTTGTAT-AAATTT--TA--------------CTTGCG-AAA----TTTTG--AATCGCCA------C---TAAAAGA-G--AT-ATAAT--CAA--TGAAAGTATTGGTTTA-CA-A-CATGATTGTAG-CATTTAG-AAA---------CTTA-T-CT----AA-ATGTAGCAtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|6 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaTTTGGAC-----CA-T-AA-----AAC-ATATAGA---TA--C-AC----AATTATA--TTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGATTAA-TATA-T-ATG-C---------TTACCGTATCgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|7 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccaT--AAGTA---TA-GCTCATTGGCCCTGTC--TAC-AGGT---AAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTT-ATTTGTCA---AAAA---ACGNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACAAACTTTTTACAT---TTAAAAA--------T-G-TT-AAAA--GAAT-G------TTGCTTCA------CC---TT-ATATTAAATTT--CA--------------CT-------A----TTTTG--AATCTGCA------C---TAAAATAT---AT-ATATTATC-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATG-CATATCTACATACATAGAT-AAAAC-------GTTA-T-TG----AA-ATGTAGCt
gi|7 : TCTCGAC-----CAAT-AC-----AAC-ATA-TGA---TA-GT-AT----AACTTT-ATTTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|8 : taagtatagctcattggccctgtctacaggtaaaaattaaagttatgttatcttatatttatttgtcaaaaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacaaactttttacatttaaaaatgttaaaagaatgttgcttcaccttatattaaatttcactattttgaatctgcactaaaatatatatattatcatgaaagtttggtatacatgcatatctacatacatagataaaacgttattgaaatgtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaTAATTTTGGCAT---C-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCAAA------CA---TTTGTATTAAAGTT--TA--------------CTTATG-TTA----TTTTG--AATCTACACTTAGTC---TAAAAGATGATAT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CACGGTTGTGGCCATAGAG-AAAGC-------TTTA-T-TC----AA-ATGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNATTATCTTGACTTGACCAAT-AAAATTCAAT-ATA-AGA---TA-TT-AT----AACTTT-ATTTT-TT-ACGTGCGGT-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGCACCCAaa
gi|9 : GCTGGGTACGGTTTAA-CA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CAC-ACAT--CAAAAA----T---TGAAGTT--GTTATC-TTATATTTTATTGGTAAAAAAAAA---A--NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACTTTTGACACAATTTTGACAT---A-ATAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAT-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTA--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACATAGcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): CCCAGCTCCTTGGAAATATTTCGACAAAGTTATAAGTAATTGCCAGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 22222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111 111111111
lowQualScore : 77 555 2 33 2 3 888 88888888 77 3 22222 777 66 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444 77777777 2 2 4 0 1 555555 999999 333 22 77777777777777 1 4444 22 777777 333 55 1 22 1 22 1 1 3 1 5555555 1 1 3333 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77777 33333 1 33333 1 1 222 1 2 2222 0 99 1 55 0 1 3333 22 1 99 1 1 111111111
lowQualScore : .. ... . .. . . ... ........ .. . ..... ... .. ........................................................................................................................ ..... ........ . . . . . ...... ...... ... .. .............. . .... .. ...... ... .. . .. . .. . . . . ....... . . .... . ............................................................................................................. ..... ..... . ..... . . ... . . .... . .. . .. . . .... .. . .. . . .........
lowQualScore : 33 444 9 99 9 0 666 44444444 77 1 55555 888 11 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 66666 22222222 0 0 0 9 9 555555 888888 222 55 33333333333333 8 0000 66 444444 333 22 9 55 8 44 7 7 5 7 7777777 7 7 9999 9 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 22222 77777 5 66666 4 4 555 4 8 9999 8 66 4 88 5 4 0000 00 5 44 5 5 222222222
consensus : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
Reference ( family-1434 ) : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
gi|1 : --T--TTTTTATGAC-----CAAT-AA-----AAT-AAA-AGA---TA-AC-AT----AACTTAAGTTTT-TA-AT-TGCAGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-CTTACCAAAGTTACCGTACCCAGC
gi|1 : ggTGACGTAATTTTGACATTTTA-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---ATTGGATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTCG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-G--TGAAAGT-TTGGTATA-CAAA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNATTATCTGGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-ATATTAAACTTATATTAT-TT-ACGTGCGGA-CAG----GACCGAT--G-TGC--TAATG-C---------TTACCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|10 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTTGAT-----CAAT-AA-----AAT-GTA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAGTTTT-TG-ACATGCGGA-T------GTTTTTT--G-TGC--T-ATT-T---------CTACCGTAACCAAC
gi|10 : ACATAATTTTGATCT---A-CAAGA--------T-G-TT-AAAATTGAAC-T------TGGGCCCA------CC---TTGTTATGAAAATT--TG--------------ATTGCG-TTA----TATTG--AATTTACA------C---TGAATAATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTCGTATA-AATA-CATGGTGGTGGCCATAG----AAAT-------GTTA-T-TG----AA-ACGTcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|11 : gttggttacggtagaaatagcacaaaaaacatccgcatgtcaaaaactaaagttatgttatcttacattttattgatcaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTTGATAT---G-AAAAA--------T-G-TT-AAAA-TTAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTTAATTT--TA--------------CTGGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAAGAG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTAGA-CATACCATGGTTGTGGCCATAGAGAAAAAC-------AATA-T-TG----AA-ATGCAGCAt
gi|11 : taAGCTGGGTACAGT--AAGCA---TA-GAATATCGGCCCTGTC--TGC-AAGT--CAAAAA----G---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----GAAA---A--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaattttcaccaataaaatataagataacataactttactttttgacttgcagacagggccgatattctatgcttactgtacccagct
gi|12 : tattgatatgaaaaatgttaaaattaacttggccacacctttgtatttaattttactggtgttattttgaatctacactgaaaagagatatattcatgaaagtttggtagacataccatggttgtggccatagagaaaaacaatattgaaatgcagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaA-GCGCATCAGCCCTGTT--CGC-A-AT--CAACAA----T---TAAAGTT-------------ATT--ATTGGT-----AAAAAAAA--AAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGCCATAATTTTGACAT---A-AAAAG----------G-TT-AAAAATGAAT-C------TGGCTACA------CC---TTTGTTATAAATTT--TATGTATTTT------CTTGTAATTA----TTTTG--AATCTACGT-----C---TGAAAGATG--GT-ATATT--T-AAATGAAAGT-TGGGTATA-CATA-TATAGTTGTGGCCCTAGAG-AAAAA-------GTT--T-TG----AA-ACGTAG
gi|13 : AGCTTGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTCTC--CGC-ATGT--AAAGAA----GAAATAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----TTAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACAT--------CG-------AAAA--------T-G-T--AAAAATGACC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--T------------------GTG-TTA----TTTCC--AATGTACA------C---TTAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGATATG-CATA-AATGGTTGTGGCCATATAG-GAAAC-------TTTA-T-T
gi|14 : GGTGCAGT--AAGCA---TA-GCACATTGGCCCTG------------------------T---TA------TGTTATC-TTA-----TATTGGT-----AAAA---A--Ata
gi|14 : GACATAATTTTGACAT-----AAAAA--------T-G-TTAAAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAA-TT--TA--------------CTGGTG-TTA----ATTTG--AATGTACA------CTATTAAAAAATGATAT-ATATT--A-A--TGAAAGT-T----------TA-CATGGTTTTGGCCATAGAT-AAAACTTTTAAGTTTA-T-TG----AA-ACATAtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|15 : ggtgcagtaagcatagcacattggccctgttatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT---A-AAAAAAGTACATGT-A-TC-AAAAATGAAC-T------TGGCTACA------AT---ATAGTATTAAATTT--TG--------------CATGCG-TTA----GTTTG--AATATGTA------C---TAAAA----------T-TT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CTTA-CATGGTTGTGGCCATAGAC-AAAAT-------TTTA-T-TA----AA-ATGTAGCA
gi|15 : tggcaGC-ACGT--AAAAAAAAAAT---TAAGCTT-TGTTATC-TTATATTTTATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaaatataagataacaaagcttaattttttttttacgtgccatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : tggcaataaaaaaagtacatgtatcaaaaatgaacttggctacaatatagtattaaattttgcatgcgttagtttgaatatgtactaaaatttcatgaaagtttggtatacttacatggttgtggccatagacaaaattttattaaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAACAT---A-AAAAA--------T-A-TT-AAGAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TATGTTTTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTG----TTTTG--AATCTACA------T---TAAAAGATG--ATAATATT--C-A--T----------------CTTA-CATGGTTGTGGCCATGGcatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : --TTATTTGGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-CGA---TA-AC-AT----AACTTT-ATTTT-TA-ACACACGTA-CAGAAAAGGCCAAT--G-TGCT-T-TTT-C---------GTACCATACCCAGCTcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggaccaataaaatatacgataacataactttatttttaacacacgtacagaaaaggccaatgtgctttttcgtaccatacccagctc
gi|17 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaCATAATTTTTACAC---A-ATAAA--------TTG-TTCAAAAATG--------------------------C---TTTGTATTAAATTT--TA---------------------TTA----TTTTGGAAATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--A-A--TGATTGT-TTGGTATA-CATAACATGGTCGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTGA-T-TG----AA-ACGTAGCAc
gi|17 : TTTGAC-----CAAT-AA-----AA--------A---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-T-----------------------GAT--G-TGC--T-CTG-C---------TTACCGTACCCAGCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatttgaccaataaaaataacataactttaatttttgatgtgctctgcttaccgtacccagctc
gi|18 : cataatttttacacaataaattgttcaaaaatgctttgtattaaattttattattttggaaatctacactgaaagatgatatattaatgattgtttggtatacataacatggtcgtggccatagagaaaacttgattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaaCATAGAG-AAAAG-------TT-A-T-TG----AA-ATGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAT--TATCTTGGAC-----CAAT-AA-----A-T-AT--------TA-A---T----AAATTT---TTT-TG-TTGTG-GGA-TAG----GACCGAT--GTTGC--A-ATG-----------TTACCG-ACCc
gi|19 : GACAT---A-AAAAA--------A-G-TT-TAAAATGAAC-TAAATCTTGGTCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-ATA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-----------------ATA-CATA-CATGGTTTTGGTCATAGAG-AAAAT-------TTTC-T-TA----AA-ACGTAGagatc
gi|2 : CTGGGTACAGT--AAGCA---AA-TCACATTGGTCCTGTC--CGT-ATGT--CAAAAA----T---CAAAGTTGTGTTATC-TTATATTTCATTGGTCAA--AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTCACATAATTTTGACAT---A-AAAAG--------T-G-AT-AAAA-TGAAA-A------TGACCACA------CA---TTTGTAATAAATTT--TA--------------CTTGTA-AAA----TTTTG--AATCTACA------C---TCAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAAA-CATGGTTCAGGCCATATAG-AAAAT-------TTTA-TCTA----AATATGTAGCA
gi|2 : aGAC-----CAAT-AA-----AAC-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTT-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTACCGTGCCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctggaccaataaaacataagataacacgattttattttttaacgttcggacagggccgatttatatgcttaccgtgcccagcc
gi|20 : actgggtacagtaagcaaatcacattggtcctgtccgtatgtcaaaaatcaaagttgtgttatcttatatttcattggtcaaaaaaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcacataattttgacataaaaagtgataaaatgaaaatgaccacacatttgtaataaattttacttgtaaaattttgaatctacactcaaagatgatatatccatgaaagtttggtatacaaacatggttcaggccatatagaaaattttatctaaatatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctgACAT---A-AAA----------T-G-TT-AAATATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--AGAAAGT-TTGGTATA-CATA-AATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACc
gi|21 : -T------TGGTCACA------CC---TTTGTATTTACTTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGCAAGATG--AT-ATGTT--C-C--TGAAATT-TTGGTATG-CATA-CATGGTTGTGGCCATAAGG-AAAAC-------TTTT-T-TG----AA-ACG
gi|22 : tACA------AC---TCTATACAAAATTA--TA--------------TCTACA-TTA----TTTCC--AATCTATA------C---TAAAAGATG--AT-ACATT--C-A---------------ATAGCA-A-CATGAGTGTGGCCTTATAG-AAAAC-------ATTAGT-TG----A
gi|23 : TGGG-ATGGT--AAGCA---TAAGCACATCGGCCCTGTT--CGCAACGT--CAAAAA----T---TAA---C-TGTTATCATTAgtgtg
gi|24 : -----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AAATTTGATTTT-TG-ATGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGCTAT-ATG-CTTCATTT--TTACCGTACCCAGCgcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|25 : gGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GGACATCGGCCCTGTCCGCGC-ACGTAAAAAAAA----C---TAAA-CT-TGTTAAT-TTAT-TTATATTGGT-----A
gi|26 : TGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TT-AC-AT----AAGTTATTTTTT-TT-ACGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCTc
gi|27 : TTTTGAC-----CAAT-AA-----ACT-ATG-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTA-TG-ACGTGTGGG-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTACC
gi|28 : ttGAC-----CAAT-GA-----AAC-A---AGA---TA-AC-AC----AATTTTTTTTTT-TGAACATTCAGA-C------GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTATCTTGCCCAGC
gi|29 : tctgGAC-----CAAT-AA-----AAC-GTA-AGA---TA-AC-AC----AATTTTATTTTT-TA-ATGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TAA--T-ATGAC---------TTACCATACCCA
gi|3 : aAGCTGGGTACGGTA-AAGCA---TA-GAATATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAG-T-TGTCATA-TTATATTTTATTGAT-----AAAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNCATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-CT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTG--AGTATATA------T---TGTAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TGTA-T-TGTTCAAA-ATGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTT-AC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-TAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------ATACCGTACCCAGCT
gi|30 : TTTTTAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA--GA---TA--C-AT----AA-TTTAATTTT--G-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTCCACAGC
gi|31 : TTTTAC-----CAAT-AA-----ATT-ATA-AGA---GA-AC-AT----AACTTTATTTTTATA-AA--GCCGA-CAG----GGCCAAT--A-TGC--T-AGA-T---------TTACAGTACCCA
gi|32 : GAC-----CAAT-AA-----AAC-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTA-TTTT-TA-ACGTTCGGA-CAA----AGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGC
gi|33 : gTTAAA-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTGTAATTTT-TG-ACGTGCGGAGCAG----AGCAGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCC
gi|34 : AGTCGGGTACGGT--AAGCACTTTA-GCACATCGGCCCTATC--CGC-ACGTAGCAATAA----T---
gi|35 : gTTTTTCAC-----CAAT-AG-----AAT-A---ACA---TACACTAT----A--TTTAATT------AGATGCG-A-CAG----GGCCAAT--G-TAC--T-ATG-T---------TTATGGTA-CCAGCctgtattttcatcaaatttttt
gi|36 : GAC-----CAAT-AA-----AAT-A-------------C-TT----AATTTT--TTTT-T--ACATGCGGA-CAA----GGCCGAT--G-TGC--T-TCG-C---------TTACCACACCCAG
gi|37 : GAC-----CAAT-AA-----AAG-ATC-AGG---TA-AT-AT----AAC-------------------GGA-CAG----GGACGAT--G-TGT--T-ATG-C---------TCACCGTACTCAGCT
gi|38 : tgTTTTTAC-----CCAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-GC-AT----AACTTTATTTTT-CT-ACGTACGGA-CAG----GGCCGAT--
gi|39 : TTTGATAT---A-AAAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CT---TT-------AATAT--TA--------------CTTGTG-
gi|4 : atatgCTGGGTACGGT--AAGCG---TA-GCACATTGGCCCTGTC--CGC-ACAT--CAAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACATAA---------------AAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACATNTAATCCGGATTTTCA-TAAATTTACTGTTTTTTGCCACACCCTTGTA-TTAAAACTTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTACA-CATA-CATGGATGTGGCC--AGAG-AAAAG-------CTTA-T-TG----AA-ACGTAGCA
gi|4 : ggcAACTGGGTACGGT--AAGCA---TA-ACA-ATTGGCCCTGTC--CAC-AAGT--CAGAAA----A---TAAAGTT---TTATA-TTATATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|40 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccATT--C-A--TGAAAGC-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGGGACCATATAG-AAAAC-------TTTA-T-TT----AA-Ac
gi|41 : --TGGAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGACATAGAG-AACAC-------TTTA-T-TG----AT-ACG
gi|42 : GAC-----CAAT-GA-----AAT-GCA-AGA---CA-AC-AT----AAATTTAATCTT-TG-ACATGTGGA-CAG----a
gi|43 : t-AT----AACTTTAATTTT-CT-GTATGC-----------------T----TGC--T-ATG-C---------TTACTGTGCCCAGCca
gi|45 : GTTGGGTACAGT--AAGCA---TA-GCATGTCAGCCATGTC--cctt
gi|5 : --TTTTGTTGAC-----CAGT-AA-----AAT-AT------------------------TTGATTTT-TG-ACATACGAT-CAG----GGCCGAT--G-TGTTAT-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCcc
gi|5 : TGACATAGTTTTGACAT---A-AAAAA--------T-GATT-AAA--TGAAT-T------TGGTCAAA------CC---TTTGTATTAAATTT--CA--------------CTTGTG-AAA----TTGTG--ATTCTACA------C---TAAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGG-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGGCATTTAG-AAAAC-------TTTA-T-CA----AA-AAGTAGCAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|5 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AC----GATTTTATTTTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTTCCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|6 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcTTT--T--TTTTTTGGAC-----CAATGAA-----AATCATA-AAACATTA-ACAAA----AACTTTTGATTT-TG-ACATGCAGA-CA-----GGCAGAT--G-TTCTAT-ATG-T---------GTACCGTACCCTGCgc
gi|6 : ggACAT---A-AAA---------------T-GAAAATGAACCT------TGGCCACAAAACA-CC---TTTGTAT-AAATTT--TA--------------CTTGCG-AAA----TTTTG--AATCGCCA------C---TAAAAGA-G--AT-ATAAT--CAA--TGAAAGTATTGGTTTA-CA-A-CATGATTGTAG-CATTTAG-AAA---------CTTA-T-CT----AA-ATGTAGCAtgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|6 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaTTTGGAC-----CA-T-AA-----AAC-ATATAGA---TA--C-AC----AATTATA--TTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGATTAA-TATA-T-ATG-C---------TTACCGTATCgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|7 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccaT--AAGTA---TA-GCTCATTGGCCCTGTC--TAC-AGGT---AAAAA----T---TAAAGTTATGTTATC-TTATATTT-ATTTGTCA---AAAA---ACGNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACAAACTTTTTACAT---TTAAAAA--------T-G-TT-AAAA--GAAT-G------TTGCTTCA------CC---TT-ATATTAAATTT--CA--------------CT-------A----TTTTG--AATCTGCA------C---TAAAATAT---AT-ATATTATC-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATG-CATATCTACATACATAGAT-AAAAC-------GTTA-T-TG----AA-ATGTAGCt
gi|7 : TCTCGAC-----CAAT-AC-----AAC-ATA-TGA---TA-GT-AT----AACTTT-ATTTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|8 : taagtatagctcattggccctgtctacaggtaaaaattaaagttatgttatcttatatttatttgtcaaaaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacaaactttttacatttaaaaatgttaaaagaatgttgcttcaccttatattaaatttcactattttgaatctgcactaaaatatatatattatcatgaaagtttggtatacatgcatatctacatacatagataaaacgttattgaaatgtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaTAATTTTGGCAT---C-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCAAA------CA---TTTGTATTAAAGTT--TA--------------CTTATG-TTA----TTTTG--AATCTACACTTAGTC---TAAAAGATGATAT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CACGGTTGTGGCCATAGAG-AAAGC-------TTTA-T-TC----AA-ATGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNATTATCTTGACTTGACCAAT-AAAATTCAAT-ATA-AGA---TA-TT-AT----AACTTT-ATTTT-TT-ACGTGCGGT-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGCACCCAaa
gi|9 : GCTGGGTACGGTTTAA-CA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CAC-ACAT--CAAAAA----T---TGAAGTT--GTTATC-TTATATTTTATTGGTAAAAAAAAA---A--NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACTTTTGACACAATTTTGACAT---A-ATAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAT-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTA--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACATAGcc
blockSeqs : TT CTT A CG A T AAA AAAAT AT A AAAAA AAA CG NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACTT TT AGTACATG T A A C AAATCT TNTAAT GGA AC TTTTTTGCCACACC A AAAC GA CTTAGT TAT AT A AT A AA A G C A TTTTAAG G C TTCA T NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNA TTGAC G AATTC C T CAT C T ATTA TA A GA G AAAA TA T TA A A TTCATTT
blockSeqs : A . . . . C AGC GAAA GT . CAA . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A . . . C . . AAACA . . TGTATTTT . . . T . AT . . . . . . A . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN AAT . . . . . . . A . AG . T . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . T C T AT . CA . . ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNA . . . . . . . . . AA . G . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . C A T AT . . . . AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . AT . A . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . C A T T . . . . ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . GA . G . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . C C T T . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C C T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C T T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A C T T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G C T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . A . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . A . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . G . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : T* A**** AAA** *********
originalCons : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-TGTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT--T--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
finalCons : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA-GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTTT-GTTATC-TTATATTTTATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACATA----AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTAAA--TTTTTTTGAC-----CAAT-AA-----AAT-ATA-AGA---TA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): CCCAGCTCCTTGGAAATATTTCGACAAAGTTATAAGTAATTGCCAGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 22222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111
lowQualScore : 77 555 66 33 2 2 888 77777777 8888 555 3 3 3 22222 777 66 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 44444 77777777 2 2 4 0 1 555555 999999 333 22 77777777777777 1 4444 22 777777 333 55 1 22 1 22 1 1 3 1 5555555 1 1 3333 1 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 666 33 33 33333 1 1 1 2222 0 88 1 55 0 1 3333 22 1 77 1 1 111111111
lowQualScore : .. ... .. .. . . ... ........ .... ... . . . ..... ... .. ........................................................................................................................ ..... ........ . . . . . ...... ...... ... .. .............. . .... .. ...... ... .. . .. . .. . . . . ....... . . .... . ............................................................................................................... . ... .. .. ..... . . . .... . .. . .. . . .... .. . .. . . .........
lowQualScore : 33 444 88 99 9 4 666 88888888 8888 444 1 3 6 55555 888 11 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 66666 22222222 0 0 0 9 9 555555 888888 222 55 33333333333333 8 0000 66 444444 333 22 9 55 8 44 7 7 5 7 7777777 7 7 9999 9 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 444 11 44 66666 4 4 4 9999 8 11 4 88 8 4 0000 00 5 33 5 5 222222222
consensus : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA--GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-T--GTTA---TC-TTAT-ATTTT-ATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTAAATT---TT--TT-TGACCAATAA-----AATATA-AGATA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
Reference ( family-1434 ) : AGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA--GCACATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAGTT-T--GTTA---TC-TTAT-ATTTT-ATTGGT-----AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTTAAATT---TT--TT-TGACCAATAA-----AATATA-AGATA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCT
gi|1 : TT---TT--TTATGACCAATAA-----AATAAA-AGATA-AC-AT----AACTTAAGTTTT-TA-AT-TGCAGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-CTTACCAAAGTTACCGTACCCAGC
gi|1 : ggTGACGTAATTTTGACATTTTA-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---ATTGGATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTCG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-G--TGAAAGT-TTGGTATA-CAAA-CATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACGTAGCA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATT---AT--CT-GGACCAATAA-----AATATA-AGATA-AC-ATATTAAACTTATATTAT-TT-ACGTGCGGA-CAG----GACCGAT--G-TGC--TAATG-C---------TTACCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacgtaattttgacattttaaaaaatgttaaaaatgaacttggccacaccattggattaaattttacttgtgttatttcgaatctacactgaaagatgatatattcgtgaaagtttggtatacaaacatggttgtggccatagagaaaactttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatctggaccaataaaatataagataacatattaaacttatattatttacgtgcggacaggaccgatgtgctaatgcttaccgtacccagc
gi|10 : gggctgggtacggtaactttggtaagcatagcacatcggccctgtctgcaattaaaaacttaagttatgttatcttttattttattggtcataaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT--TT-TGATCAATAA-----AATGTA-AGATA-AC-AT----AACTTTAGTTTT-TG-ACATGCGGA-T------GTTTTTT--G-TGC--T-ATT-T---------CTACCGTAACCAAC
gi|10 : ACATAATTTTGATCT---A-CAAGA--------T-G-TT-AAAATTGAAC-T------TGGGCCCA------CC---TTGTTATGAAAATT--TG--------------ATTGCG-TTA----TATTG--AATTTACA------C---TGAATAATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTCGTATA-AATA-CATGGTGGTGGCCATAG----AAAT-------GTTA-T-TG----AA-ACGTcatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncacataattttgatctacaagatgttaaaattgaacttgggcccaccttgttatgaaaatttgattgcgttatattgaatttacactgaataatgatatattcatgaaagtttcgtataaatacatggtggtggccatagaaatgttattgaaacgtt
gi|11 : gttggttacggtagaaatagcacaaaaaacatccgcatgtcaaaaactaaagttatgttatcttacattttattgatcaaaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncTTGATAT---G-AAAAA--------T-G-TT-AAAA-TTAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTTAATTT--TA--------------CTGGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAAGAG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTAGA-CATACCATGGTTGTGGCCATAGAGAAAAAC-------AATA-T-TG----AA-ATGCAGCA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAT---TT--TC---ACCAATAA-----AATATA-AGATA-AC-AT----AACTTTACTTTT-TG-ACTTGCAGA-CAG----GGCCGAT--A-TTC--T-ATG-C---------TTACTGTACCCAGCTt
gi|12 : taA--GCGCATCAGCCCTGTT--CGC-A-AT--CAACAA----T---TAAAGTT-------------------ATT---ATTGGT-----AAAAAAAA--AAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGCCATAATTTTGACAT---A-AAAAG----------G-TT-AAAAATGAAT-C------TGGCTACA------CC---TTTGTTATAAATTT--TATGTATTTT------CTTGTAATTA----TTTTG--AATCTACGT-----C---TGAAAGATG--GT-ATATT--T-AAATGAAAGT-TGGGTATA-CATA-TATAGTTGTGGCCCTAGAG-AAAAA-------GTT--T-TG----AA-ACGTAG
gi|13 : AGCTTGGTACGGT--AAGCA---TA--GCACATCGGCCCTCTC--CGC-ATGT--AAAGAA----GAAATAAAGTTAT--GTTA---TC-TTAT-ATTTT-ATTGGT-----TTAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAATATAATT----TTGACAT--------CG-------AAAA--------T-G-T--AAAAATGACC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--T------------------GTG-TTA----TTTCC--AATGTACA------C---TTAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGATATG-CATA-AATGGTTGTGGCCATATAG-GAAAC-------TTTA-T-T
gi|14 : GGTGCAGT--AAGCA---TA--GCACATTGGCCCTG------------------------T---TA------T--GTTA---TC-TTA------T-ATTGGT-----AAAA---A--Ata
gi|14 : GACATAATTTTGACAT-----AAAAA--------T-G-TTAAAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAA-TT--TA--------------CTGGTG-TTA----ATTTG--AATGTACA------CTATTAAAAAATGATAT-ATATT--A-A--TGAAAGT-T----------TA-CATGGTTTTGGCCATAGAT-AAAACTTTTAAGTTTA-T-TG----AA-ACATAtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngacataattttgacataaaaatgttaaaaaatgaacttggccacacctttgtattaaatttactggtgttaatttgaatgtacactattaaaaaatgatatatattaatgaaagtttacatggttttggccatagataaaacttttaagtttattgaaacata
gi|15 : ggtgcagtaagcatagcacattggccctgttatgttatcttatattggtaaaaaatatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAT---A-AAAAAAGTACATGT-A-TC-AAAAATGAAC-T------TGGCTACA------AT---ATAGTATTAAATTT--TG--------------CATGCG-TTA----GTTTG--AATATGTA------C---TAAAA----------T-TT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CTTA-CATGGTTGTGGCCATAGAC-AAAAT-------TTTA-T-TA----AA-ATGTAGCA--
gi|15 : tggcaGC-ACGT--AAAAAAAAAAT---TAAGCTT-T--GTTA---TC-TTAT-ATTTT-ATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataaaatataagataacaaagcttaattttttttttacgtgccatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : tggcaataaaaaaagtacatgtatcaaaaatgaacttggctacaatatagtattaaattttgcatgcgttagtttgaatatgtactaaaatttcatgaaagtttggtatacttacatggttgtggccatagacaaaattttattaaaatgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTAACAT---A-AAAAA--------T-A-TT-AAGAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TATGTTTTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTG----TTTTG--AATCTACA------T---TAAAAGATG--ATAATATT--C-A--T----------------CTTA-CATGGTTGTGGCCATGGcatgcatttccgtatacagctc
gi|16 : ATT---AT--TT-GGACCAATAA-----AATATA-CGATA-AC-AT----AACTTT-ATTTT-TA-ACACACGTA-CAGAAAAGGCCAAT--G-TGCT-T-TTT-C---------GTACCATACCCAGCTcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnattatttggaccaataaaatatacgataacataactttatttttaacacacgtacagaaaaggccaatgtgctttttcgtaccatacccagctc
gi|17 : tttaacataaaaaatattaagaatgaacttggccacacctatgttttaaattttacttgtgttgttttgaatctacattaaaagatgataatattcatcttacatggttgtggccatggcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCATAATTTTTACAC---A-ATAAA--------TTG-TTCAAAAATG--------------------------C---TTTGTATTAAATTT--TA---------------------TTA----TTTTGGAAATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--A-A--TGATTGT-TTGGTATA-CATAACATGGTCGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTGA-T-TG----AA-ACGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAAT---TT------GACCAATAA-----AA-------ATA-AC-AT----AACTTTAATTTT-T-----------------------GAT--G-TGC--T-CTG-C---------TTACCGTACCCAGCTc
gi|18 : CATAGAG-AAAAG-------TT-A-T-TG----AA-ATGTAGCA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAATTA---TC--TT-GGACCAAT-A-----AATAT-----TA----AT----AAATT---TTTT-TG-TTGTG-GGA-TAG----GACCGAT--GTTGC--A-ATG-----------TTACCG-ACCc
gi|19 : GACAT---A-AAAAA--------A-G-TT-TAAAATGAAC-TAAATCTTGGTCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-ATA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-----------------ATA-CATA-CATGGTTTTGGTCATAGAG-AAAAT-------TTTC-T-TA----AA-ACGTAGagatc
gi|2 : CTGGGTACAGT--AAGCA---AA--TCACATTGGTCCTGTC--CGT-ATGT--CAAAAA----T---CAAAGTTGT--GTTA---TC-TTAT-ATTTC-ATTGGTCAA--AAAA---A--AAA---AAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTCACATAATTTTGACAT---A-AAAAG--------T-G-AT-AAAA-TGAAA-A------TGACCACA------CA---TTTGTAATAAATTT--TA--------------CTTGTA-AAA----TTTTG--AATCTACA------C---TCAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CAAA-CATGGTTCAGGCCATATAG-AAAAT-------TTTA-TCTA----AATATGTAGCA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATC---AT--CT-GGACCAATAA-----AACATA-AGATA-AC-AC----GATTTTATTTTT-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTACCGTGCCCAGC
gi|20 : aACAT---A-AAA----------T-G-TT-AAATATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--AGAAAGT-TTGGTATA-CATA-AATGGTTGTGGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACc
gi|21 : -T------TGGTCACA------CC---TTTGTATTTACTTT--TA--------------CTTGTG-TTA----TTTTG--AATCTACA------C---TGCAAGATG--AT-ATGTT--C-C--TGAAATT-TTGGTATG-CATA-CATGGTTGTGGCCATAAGG-AAAAC-------TTTT-T-TG----AA-ACG
gi|22 : tACA------AC---TCTATACAAAATTA--TA--------------TCTACA-TTA----TTTCC--AATCTATA------C---TAAAAGATG--AT-ACATT--C-A---------------ATAGCA-A-CATGAGTGTGGCCTTATAG-AAAAC-------ATTAGT-TG----A
gi|23 : TGGG-ATGGT--AAGCA---TAA-GCACATCGGCCCTGTT--CGCAACGT--CAAAAA----T---TAA---C-T--GTTA---TCATTAgtgtg
gi|24 : CAATAA-----AATATA-AGATA-AC-AT----AAATTTGATTTT-TG-ATGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGCTAT-ATG-CTTCATTT--TTACCGTACCCAGCgcctaacctctcatcgaatcaatcataaaa
gi|25 : gGCTGGGTACGGT--AAGCA---TA--GGACATCGGCCCTGTCCGCGC-ACGTAAAAAAAA----C---TAAA-CT-T--GTTA---AT-TTAT--TTAT-ATTGGT-----A
gi|26 : -TGACCAATAA-----AATATA-AGATT-AC-AT----AAGTTATTTTTT-TT-ACGTGTGGA-CAG----GGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCTc
gi|27 : T--TT-TGACCAATAA-----ACTATG-AGATA-AC-AT----AACTTTAATTTA-TG-ACGTGTGGG-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTACC
gi|28 : ttGACCAATGA-----AACA---AGATA-AC-AC----AATTTTTTTTTT-TGAACATTCAGA-C------GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTATCTTGCCCAGC
gi|29 : tctgGACCAATAA-----AACGTA-AGATA-AC-AC----AATTTTATTTTT-TA-ATGTTCGGA-CAG----GGCCGAT--T-TAA--T-ATGAC---------TTACCATACCCA
gi|3 : aAGCTGGGTACGGTA-AAGCA---TA--GAATATCGGCCCTGTC--CGC-ACGT--CAAAAA----T---TAAAG-T-T--GTCA---TA-TTAT-ATTTT-ATTGAT-----AAAA---A--AAA---ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNCATAATTTTGACAT---A-AAAAA--------T-G-CT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTG--AGTATATA------T---TGTAAGATG--AT-ATATT--C-A--TTAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TGTA-T-TGTTCAAA-ATGTNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTT---TT---TT--TT-TTACCAATAA-----AATATA-AGATA-AC-AT----AACTTTAATTTT-TG-ACGTGCGGA-TAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------ATACCGTACCCAGCT
gi|30 : T--TT-TTACCAATAA-----AATATA--GATA--C-AT----AA-TTTAATTTT--G-ACGTGCGGA-CAG----GGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGTCCACAGC
gi|31 : --TT-TTACCAATAA-----ATTATA-AGAGA-AC-AT----AACTTTATTTTTATA-AA--GCCGA-CAG----GGCCAAT--A-TGC--T-AGA-T---------TTACAGTACCCA
gi|32 : GACCAATAA-----AACATA-AGATA-AC-AC----GATTTTA-TTTT-TA-ACGTTCGGA-CAA----AGCTGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCCAGC
gi|33 : gT-TAAACAATAA-----AATATA-AGATA-AC-AT----AACTGTAATTTT-TG-ACGTGCGGAGCAG----AGCAGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACCGTACCC
gi|34 : AGTCGGGTACGGT--AAGCACTTTA--GCACATCGGCCCTATC--CGC-ACGTAGCAATAA----T---
gi|35 : g---TT--TT-TCACCAATAG-----AATA---ACATACACTAT----A--TTTAATT------AGATGCG-A-CAG----GGCCAAT--G-TAC--T-ATG-T---------TTATGGTA-CCAGCctgtattttcatcaaatttttt
gi|36 : GACCAATAA-----AATA----------C-TT----AATTTT--TTTT-T--ACATGCGGA-CAA----GGCCGAT--G-TGC--T-TCG-C---------TTACCACACCCAG
gi|37 : GACCAATAA-----AAGATC-AGGTA-AT-AT----AAC-------------------GGA-CAG----GGACGAT--G-TGT--T-ATG-C---------TCACCGTACTCAGCT
gi|38 : tgT--TT-TTACCCATAA-----AATATA-AGATA-GC-AT----AACTTTATTTTT-CT-ACGTACGGA-CAG----GGCCGAT--
gi|39 : TTTGATAT---A-AAAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACA------CT---TT-------AATAT--TA--------------CTTGTG-
gi|4 : atatgCTGGGTACGGT--AAGCG---TA--GCACATTGGCCCTGTC--CGC-ACAT--CAAAAA----T---TAAAGTTAT--GTTA---TC-TTAT-ATTTT-ATTGGT-----AAAA---A--AAANN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACATAA---------------AAAT--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCACATNTAATCCGGATTTTCA-TAAATTTACTGTTTTTTGCCACACCCTTGTA-TTAAAACTTTTG--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTACA-CATA-CATGGATGTGGCC--AGAG-AAAAG-------CTTA-T-TG----AA-ACGTAGCA--
gi|4 : ggcAACTGGGTACGGT--AAGCA---TA--ACA-ATTGGCCCTGTC--CAC-AAGT--CAGAAA----A---TAAAGTT-----TTA---TA-TTAT-ATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccaatataatataaaactttattttctgacttgtggacagggccaattgttatgcttaccgtacccagttc
gi|40 : ggcctgggtacggtaagcgtagcacattggccctgtccgcacatcaaaaattaaagttatgttatcttatattttattggtaaaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacataaaaattgttaaaaatgaacttggccacatntaatccggattttcataaatttactgttttttgccacacccttgtattaaaacttttgaatctacactgaaagatgatatattcatgaaagtttggtacacatacatggatgtggccagagaaaagcttattgaaacgtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgccATT--C-A--TGAAAGC-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGGGACCATATAG-AAAAC-------TTTA-T-TT----AA-Ac
gi|41 : --TGGAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGACATAGAG-AACAC-------TTTA-T-TG----AT-ACG
gi|42 : GACCAATGA-----AATGCA-AGACA-AC-AT----AAATTTAATCTT-TG-ACATGTGGA-CAG----a
gi|43 : t-AT----AACTTTAATTTT-CT-GTATGC-----------------T----TGC--T-ATG-C---------TTACTGTGCCCAGCca
gi|45 : GTTGGGTACAGT--AAGCA---TA--GCATGTCAGCCATGTC--cctt
gi|5 : ATT---TT--GT-TGACCAGTAA-----AATAT---------------------TTGATTTT-TG-ACATACGAT-CAG----GGCCGAT--G-TGTTAT-ATG-C---------TTACCGTACCCAGCcc
gi|5 : TGACATAGTTTTGACAT---A-AAAAA--------T-GATT-AAA--TGAAT-T------TGGTCAAA------CC---TTTGTATTAAATTT--CA--------------CTTGTG-AAA----TTGTG--ATTCTACA------C---TAAAAGATG--AT-ATATC--C-A--TGAAAGG-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTGGGCATTTAG-AAAAC-------TTTA-T-CA----AA-AAGTAGCA--nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|5 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-----AATATA-AGATA-AC-AC----GATTTTATTTTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGTCGAT--T-TA---T-ATG-C---------TTTCCGTACCCAGCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaatataagataacacgattttattttctaacgttcggacagggtcgatttatatgctttccgtacccagcgc
gi|6 : gctgggtacggtaagcatataacacatcggccctgatcgtatgtcaaaaatcaaatattttactggtcaacaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacatagttttgacataaaaaatgattaaatgaatttggtcaaacctttgtattaaatttcacttgtgaaattgtgattctacactaaaagatgatatatccatgaaaggttggtatacatacatggttgtgggcatttagaaaactttatcaaaaagtagcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcGCAGGGTACGGT--ACACA---TATAGAACATCTGCC-TGTC--TGC-ATGT--CAAAAT----C---AAAAGTT-TTTGTTAATGTT-TTATGATTTTCATTGGT-----CCAA---A--AAA---AAAgc
gi|6 : ggACAT---A-AAA---------------T-GAAAATGAACCT------TGGCCACAAAACA-CC---TTTGTAT-AAATTT--TA--------------CTTGCG-AAA----TTTTG--AATCGCCA------C---TAAAAGA-G--AT-ATAAT--CAA--TGAAAGTATTGGTTTA-CA-A-CATGATTGTAG-CATTTAG-AAA---------CTTA-T-CT----AA-ATGTAGCA--atgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|6 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaT--TT-GGACCA-TAA-----AACATATAGATA--C-AC----AATTATA--TTC-TA-ACGTTCGGA-CAG----GGCCGATTAA-TATA-T-ATG-C---------TTACCGTATCgatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccatttggaccataaaacatatagatacacaattatattctaacgttcggacagggccgattaatatatatgcttaccgtatct
gi|7 : gggcagggtacggtacacatatagaacatctgcctgtctgcatgtcaaaatcaaaagtttttgttaatgttttatgattttcattggtccaaaaaaaaaatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaacataaaatgaaaatgaaccttggccacaaaacacctttgtataaattttacttgcgaaattttgaatcgccactaaaagagatataatcaatgaaagtattggtttacaacatgattgtagcatttagaaacttatctaaatgtagcagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaaatccaT--AAGTA---TA--GCTCATTGGCCCTGTC--TAC-AGGT---AAAAA----T---TAAAGTTAT--GTTA---TC-TTAT-ATTT--ATTTGTCA---AAAA---ACGNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NTGACAAACTTTTTACAT---TTAAAAA--------T-G-TT-AAAA--GAAT-G------TTGCTTCA------CC---TT-ATATTAAATTT--CA--------------CT-------A----TTTTG--AATCTGCA------C---TAAAATAT---AT-ATATTATC-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATG-CATATCTACATACATAGAT-AAAAC-------GTTA-T-TG----AA-ATGTAGCt
gi|7 : T--CT-CGACCAATAC-----AACATA-TGATA-GT-AT----AACTTT-ATTTT-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcatctcgaccaatacaacatatgatagtataactttattttaa
gi|8 : taagtatagctcattggccctgtctacaggtaaaaattaaagttatgttatcttatatttatttgtcaaaaaacgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgacaaactttttacatttaaaaatgttaaaagaatgttgcttcaccttatattaaatttcactattttgaatctgcactaaaatatatatattatcatgaaagtttggtatacatgcatatctacatacatagataaaacgttattgaaatgtagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcaTAATTTTGGCAT---C-AAAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAC-T------TGGCCAAA------CA---TTTGTATTAAAGTT--TA--------------CTTATG-TTA----TTTTG--AATCTACACTTAGTC---TAAAAGATGATAT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CACGGTTGTGGCCATAGAG-AAAGC-------TTTA-T-TC----AA-ATGTAGCA--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATCTTGACT-TGACCAATAAAATTCAATATA-AGATA-TT-AT----AACTTT-ATTTT-TT-ACGTGCGGT-CAG----AGCCGAT--G-TGC--T-ATG-C---------TTACTGCACCCAaa
gi|9 : GCTGGGTACGGTTTAA-CA---TA--GCACATCGGCCCTGTC--CAC-ACAT--CAAAAA----T---TGAAGTT----GTTA---TC-TTAT-ATTTT-ATTGGTAAAAAAAAA---A--NNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTACTTTTGACACAATTTTGACAT---A-ATAAA--------T-G-TT-AAAAATGAAT-T------TGGCCACA------CC---TTTGTATTAAATTT--TA--------------TTTGTG-TTA----TTTTA--AATCTACA------C---TGAAAGATG--AT-ATATT--C-A--TGAAAGT-TTGGTATA-CATA-CATGGTTGTAGCCATAGAG-AAAAC-------TTTA-T-TG----AA-ACATAGcc
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|44 ): CCCAGCTCCTTGGAAATATTTCGACAAAGTTATAAGTAATTGCCAGA