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lowQualScore                  :    .   .     . ...  ..  ... .  ..  . . .  .         .  .    ..   .. .  . ..  ..... .  .  . ........ .   ..   .. .   ...  ... ....  .....  ......... .. ..... .. .   ......   .... ..    .... .. . ... .   ..... .    .. .  . . . ..    . . .. . .....  .. . . ..  .  .    .  .   .  ..  . . . . ...  .... .. .. . ..  .  .  ....................  ... ........ .  .....   ....... . ...  ... .. .  . ....   .. ...   .. .  . .    . ...  .   ..    ... . .. .  .. . ..  . . ..  ... ..... .. . ..  .  ..  .. .. ...  ...  ........................ .  . .  .. . . .   ....... .. ... . ..   .................   .. .. .  .....   .. ........................    .... . . .. ..   . .. .. . ..  .  ..........  . ... .... . ..... .........  ... ...  .  . .. .. . . .  .  ........................................ .  . . ........... .  .. .. . . ... . .  . .. . .. .. . .  . .... .  . ..  ....... ...  .. .  .  . ......   ....  .. ....................... ..... ..   ...  ... .. .. ... ....  . ..  . . .. .. . . . ..      
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Reference ( gi|6 )            : TCG-TTG-CGATT-A---GC--AC---AGCC--AG-T-A-AT-TCAGAACGC-GG-TAAA-TAGT--A-GA-A--GT--TG-T-GA-TA-C--------C-TGG--CGC--T-CGG---AA---A-T--TA-----TG---------T--A--A--A--G-ACA-G----GTT----T--GTTA----A--A-G--CT-TTT-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AACT-G-A--A-G-----TA--T-TAA--AC-AATGGAA-GA-CTT-CAT-CG-G-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AC-AC--------TC-G--T-GC--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--C-CG-G----TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGG-G---CG-CAA-GTCTT---A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--T--T---TT---AGAGC--------AA--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------C--T---T-T--GCT--A-T-GAT----TA--TTT--T--A-AAG----AAAC-A-TA-------------T----ATATCCT----T-A-AC-T--TTT-C--A--G-T--GA-AG--T--T----AT-A---G----T-A-----A---------TT---G---AC-CG-A--T--A-A-G-GG-GG-----------T-AT-AC---AT-GTACA--TG---T---T-AC-A-G-----------A-AG--C--T-G-T---A-C-AA-A--G-A--A--ACA-AA-GA---C-AG-T--AA-------A---GT--G-CT-AT-A------TTTC---TT--AT-------------T--TT----T-----T--TTC---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-A-T--G--T-A-A-A--TCTAAT
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gi|17                         : TCA-TTG-CGATT-A---GC--AC---ATCC--AG-T-A-AT-GCAGAACGC-GG-TAAA-CAGT--A-GA-A--GT--CA-T--A-TA-T--------C-TGGG-CAC--T-CAGGCGAA---A-CCGTA-----TG---------T--A--T--A--G-ACAAG----GTT----T--GTTA----ACAA-G--TT-TTC-----A-GATT--C-A--G-C-A--AACT-G-A--A-G-----TA--T-TGG--AC-AAAGG----------CA-------------------A-G--A--C-G--TT--C-AC---------C-G----GA--AA---G--------T-TC-----GAT-------G-T---TT---A--C----------AC--T---CTT--A-AG-T-TATG-G---CG-CAA-TTCTT---A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--TTAT---TT---AG------------A--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------C--T---T-T--GCT--A-T-TAT----T---TTT--T--A-AAAC---AAAC-A-CA-------------T-----T-TCCT----T-A-AA-T--TTT-C--A--G-T--AA-AGT-T--T----AT-A---G----T-A-----A---------TT---G---AC-CG-A--C--A-A-G-GG-GG-----------T--T-AT---A------A--TA---A---T-AC-A-A-----------A-AG--C--T-G-T---A-C-AA-A--G-A--A--AAA-AA-GC---C-AG-c
gi|4                          : TCG-TTG-CGATT-C---GCCCAC---ATCCCGAG-T-A--T-TCAGAACAT-GG--AAA-CA-T--A-GA-A--GT--CGAC-GA-TG-C--------C-TGG---GC--T-CGG---AA---A-T--TA-----TG---------TTTA--A--A--A-ACA-G----GTT----T---TTA----A--A-G--CT-TTTT----A-GACT--T-A--G-C-A--AGTT---A--A-G-----TAC-T-TGA--AC-AA--------------A---G-G-A-A-A---GT--A-A--A--T-G--TT-AC-ACC-------TC-G--T-G--------A--------TTGT-----AGA-------G-T---GTT--A--C-CG-G----TAT--A---GTT--A-AG-TATGGG-G---TGACAA-TTCTT---A-A--A-TG--T-A--AA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC--C--TT--T--T---TA---AGAACAA------AA--A--------CAAA-A-TA--C-A-GTTTA-------C--T---TAT--GCT-------AT----TA--TTT--C--A-AAT----AAGC-A-TA-------------C-------TTCTAAA-A-A-ACAT--TTT-C--A--GATCGGATAG--C--TTCG-AT-A---G----T-A-----AG--------TT---ATATAC-CG-G--TTGA-A-G-GG-GG-----------T-TT-A--------TTCA--TG---------GC-A-G-----------ACAG--CTAT-G-T---A-C-AATA--G-AGTA--ACA-AACGC---C-AGTT--AAAT-----A---GT--G-CT-AT-ACT----TTTT---TT--AT-------------C--TT----T-----T--AT----AA---A--T--G---CA---AA-C--AG-A-TTGG--T-A-A-AATTCTA
gi|2                          : TCA-TTG-CGCTT-----GC--ACTCCAGTT--AC-T-A-AT--CAGAACGC-GGGTAAAACAGT--C-GA-A--AT--CA-T-GA-TA-T----------TGG--CAC--T-CGG---AA---A-G--GA-----TG---------T--ATAACCA--G-ACA-GTG--GTT----T--GTTA----A--A-G--TT-TTT-----A-GACT--T-GA-G-C----AACT-G-A--A-G-----TA--T-TGC--AC-AAAGGAA-GA-CTT-CACACG-G-A-A-A---GTTCG-G--A--TGG--TTAACAAC--------T-----T-GC--AG---AAAACTCGCT-GCTCGAGAGA-------G-TGTAGT---A--C-CG-GTA--TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGT-G---CG-CAT-TTCTT---ATT--A-TG--T-A--CA-T-GT-TACTTT-----T--T-AACGC-TC--TTTAT--T---TT---AG------------A--A--------C-AA-A-TAGCC-A-T-TCA-------CT-T---T-T--GCT--ATT-CAT----TT--TTT--T--A-AAAAC--AAAC---TA-------------C----ATGGTCA----T-ATAT-T--ATT-C--A--G-T--G--AG--TA-T----AT-AT--G----TAA-----A---------TT---G---CC-AG-AC-T--A-A-G-GG-GC-----------T-ATAAC---AT-G-------G---T---TGAC-AGG-----------A-AGACC--TAG-TA--A-C-AA-A--GAA--A--AAA-AA-GC---C-AGAT--AA-------AGAGGT--G-TC-AT-A------TT-----AT--AC-------------T--TT----T-----T--CCA---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-A-T--G--T-A-A-A--TCTA
gi|5                          : TCGATTG-C-ATT-A---GC--AT-----CC--AGAT-A-TT-CCAAAAACT-GG-TAAAGTGGT--A-GA----GT--CG-T-GG-AA-T--------TATTG--TGCA-T-CGA---AA---A-C--TA-----TG---------T--A--A--AACG-ACA-A----GTTATGAT--GTAA----A--A-G--TTATTT-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AA-T-G-A--A-G-----TA--T-TGA--AT-AAAGGAA-AACCTT-CAC-CG-T-A-A-A---GT--A-G--AATT-G--TA-AC-ACATGTACA-TT-G--T-GG--AG---A--------T-GC-----GAG-------G-T---AC---A--T-C--G----TAT--A---TTT--A-AG---TGGG-G---CG-C-A-TTCTTA--A-T--A--G--TAA--CA-G-T--TC---T-----C--T-A--GC-CT--CT--T--T---TT---AGAAC--------AA--A--------A-TA-A-TA----A-T-TGA-------CATT---T-T--GC---A-T-AATC---TA--ATT--T--A-AAG----AAAC-A-TA-------------T-------TTCT----T-A-------TTT-C--A--G-T--GA-A---T--T----ATCA---G----T-A-----AC--------TT---GA--AC-CGCA--T--A-A-G-GG-GG-------------AT-A-------GC-----TA---T---T-AC-A-G-----------A-AG--C--T-GTT---A-C-AA-A--T-A--A--A-A-AA-GC---C-AG-T---A-------A---GT--G-CT-AT-A------TTTC----T--AT-------------A--TA----C-----T--TTC---AA---A--T--G--------AA-C--AA-G-T--G--T-A-A-A--TCTAA
gi|28                         : TCG-TTG-TGATT-A---GC--AC---ATCC--AG-T-A-AT-TCAGAAAGC-GG-TAAA-TAGT--A-GA-A--GT--------A-AA-C--------T-AGG--CGC--T-CGA---AA---G-C--TA-----TG---------T--A--A--A--G-ACA-A----GTT----T--GTTA----A--A-G--CT-TTT-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AACT-G-A--A-G-----TA--T-TGA--AC-AAAGAAA-GA-CTT-CAC-CA-G-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AG-AC--------AT-GT-T-AC--AT------------T-GT-----AGA-------GAT---GA---A--C-CG-G----TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGC-A---CG-CAA-TTCc
gi|30                         : TCG-TTG-CGATT-A---TC--AC---ATCC--AGCT-A-AT-TCAGAACGT-GG--AAA-CAGT--A-GA-A--GT--TG-C-GA-TGTC--------C-TGGAACAC--T-C-G---AA---A-T--T------CG---------T--A--G--A--G-ACT-GCACCGTT----T---TTA----A--A-G---T-TTT-----ATGACT--C--A-G-C-A--AATTGG-A--A-G-----TA--T-TGA--AC-AAAGGAA-TA-GAT-CAC-CA-G-A-G-G---GT---------------TT-AC-AC--------TC-G--TAGA--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--C-TG-G----TAT--AT--GTT--ATAG-T-TGGG-
gi|37                         : TCG-TTG-CGATA-A---GC--AC---ACCC--AG-T-A-AT-TCAGAACGT-GG-TAAA-CATT--C-GA-A--GT--CG-C-GA-TG-C--------C-TGG--CGC--T-CGG---AA---A-T--TA-----TG---------C--A--A--A--G-ACA-G----ATT----A--ATTT----A--A-G--CT-TTT-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AATT-G-A--ca
gi|36                         : TCG-TTG-CAATT-A---GC--AC---ATCT--GG-C-A-AA-TTGGAAGGC-AG-TAAA-CAGTTCA--A-A--GT--CG-T-GA-TG-C--------C-TGG--CGC--T-CGG---AA---A-T--TA-----TA---------T--A--A--A--G-ACA-A----GTT----T--GTAA----A--A-G--TG-TTG-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AATT-G-A--A-G-----CA--T-TGA--AC-AA
gi|41                         : TCA-TTG-CGATT-A---GC--AC---ATCC--AG-T-T-AT-TCAGAACGC-GG-TAAA-TAGT--A-GA-A--GT--CA-T-GA-TA-CTATAGTATC-TGG--CAC--T-CGG---AA---A-T--GA-----TG---------T--A--T--A--G-ACA-agaa
gi|42                         : TCA-TTG-CGATT-A---GC--AC---AACC--AA-T-T-AT-TCAGAACGC-GG-TAAA-CAGT--A-GA-A--GT--CA-T-GA-TA-CATGTAT--C-TGG--CAC--T-CGG---AA---A-C--GA-----TG---------C--A--T--A--G-ACA-
gi|3                          :  CA-TTG-CGATC-ATCAGC--AC---AACC--GG-TTA-AT-TCAGAA-GC-GG-TAGA-CAGT--AAGT-ATCGT--CA-T-GA-TA-A--------TATGG--CAC--TGCGG---AA---A-C--GA-----TG---------T--CT-A--A--G-ACA-G----GTT----TTTGTTA----A--A-G--TT-TTTTTGGTA-GACT--C-AA-G-C-A--AACT-G-A--A-G-----TA--T-TGA--AC-AAAGGAA-GA-CTT-CAC-CG-G-AGA-A---GTC-C-G--A--T-G--TT-ACAACGG------TC-G--T-AG--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GTC--A--C-CG-G----TAT--AAGCGTT--A-AGTT-TGGG-G---CG-CAATCTCTT---A-T--A-TG--T-A--CA-TAG--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--T--TATATT---AG------------A--A--------C-AA-A-T---C---G-TTA-------C--T---T-T--GCT--A-T---T----TATTTTT--T--A-AAA----CAAC-A-CA------------------AT-TCCT----T-A-AA-T--TTT-C--A--G-T--GA-AG--TTCT----AT-A---G----T-A-----A---------TT---GA--ACGCG-A--T--A-A-G-GGCGG-----------T-AT-AC---------CAATTG---TC--T-TC-A-G-------------AG--C--T-G-T---A-C-AA-A--G-G--A--AAA-AA-GC---C-AG-T--AA-------A---GTTGA-AT-AT-A------TTTT---TT---T-------------T--TTCTACT-----T--TTC---AAT--AC-T--GC--C----AA-C--AG-ATT--G--T-A-A-A--TCT
gi|24                         :  CA-TTG-CGATT-A---GC--AC---ATCT--AG-T-T-AT-TCAGAACGC-GG-TAAA-CAGT--A-GA-A--GT--CA-T-GA-TA-T--------C-TGG--CAC--T-CGG---AA---A-C--GA-----TG---------T--A--T--A--G-ACA-G----GTT----T--GTTA----A--A-G--TT-TTT-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AACT-G-A--A-G-----TA--T-TGA--AC-AAAGGAA-TA-CTT-CAC-CG-G-A-A-A---GT--C-G--A--T-G--TT-AC-AC--------TC-G--T-CG--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--C-CG-G----TAT--A---GTT--A-AG-C-TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--TTAT---CT---AG------------A--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------
gi|31                         :  CG-TTG--GATT-A---GC--CC---A-TC--A--T-A-AT-TCAGAACGC-GG-TAAA-TAGT--A-GA-AAGGT--CG-T-GA-TA-C--------C-TGG--CGC--T-CGG---AA---ACT--TA-----TG---------T--A--A--A--G-ACA-G----GTT----T--GTTA----A--A-G--CT-TTT-----A-GACT--C-AA-G-C----AACT-G-A--A-G-----TA--T-TGT--GC-AAAGGAA-GA-CTT-CAC-CGCG-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AC-AC--------TC-G--T-CG--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--C-CG-G----TAT--A---GTT----AG-T-T
gi|15                         :  CA-TTG-CGATTGA---GC--AC---ATC----G-T-T-ATGTCAGAACGCTGG-TAA--CAGTT-A-GA-A--GTCATA-T-GA-TA-TA-------T-TGG--CAT--C-CAG---AA---A-A--CG-----AG---------T--AT-A--A--G-ACA-G-----CT----T--GTTA----A--A-GT-CT-TTT-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AACT-G----A-G-----TA--TCTGA--AC-AA-GGAA-GAGCTT-CAC-CG-G---A-A---GT--C-G--A--T-G--TT-AA-CC--------TC-G--T-GA--AG---A--------T-GT-----AGA-------G-T---GT---A--C-ctggg
gi|9                          :    -TTG-CGATT-A---GC--AC---A-CC--AG-T-A-AT-TCAGAAAGT-GG-TAAA-TAGT--A-GAGA--GT--CG-T-GA-TA-C--------C-TGG--CGC--T-CGA---AA---A-C--TAG----TG---------T--A--A--A--G-ACA-A----GTT----T--GTTA----A--A-G--TT-TTT-----A-GACT--C-AAAG-C-A--AACT-GAA--A-G-----TA--T-TGA--AT-AAAGGAA--A-CTT-CAC-CG-G-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AC-A---------TT-G--T-GG--AC---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--C-CGAA----TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---C-T--A-TG--T-A--CA-A-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC---T--T--T---TT---AGAAC--------AA--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------C--T---T-T--GCTAAA-T--AT----TA--TTT--T--A-AAA----AAA--A-CA-------------T----AT-TCCT----T-A-AC-T--TTT-C--A--G-T--GA-AG--T--T----AT-A---G----T-A-----A---------TT---G---ACGCG-A--T--A-A-G-GG-GG-----------T-A-----------TACA--TG---T---T-AC-A-G-----------A-AG--C--T-G-T---A-C-AA-A--G-A--A--A-A-AA-GC---C-AG-T--AA-------A---GT--A-CT-AT-A------TTCT---TT--A-----------------TA----C-----T--TTC---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-T-T--G--T---A-A--TCTAAatttaattatctcttttatttgaacgatagttactgttgctatttttttttataaaaacaagacacatttctaatttgtcagtgaagtttatgtcaattgaccgaataagggggtatcatcttagaagtgtacaaaaaaaagccagtaaagtgctattatttttagtactttcaaactgccacaatta
gi|19                         :  gt-TTG-CGATT-A---GC--AC---ATCC--AG-T-A-AT-TCAGAAAGC-GGATAAA-TTGT--A-GA-A--GT--CT-T-GA-TA-C--------T-TGG--CGC--T-CGA---AA---A-C--TA-----TG---------C--A--A--A--G-ACA-A----GTT----T--G-TA----A--A-G---T-TTT-----A--ACTGCC-AA-G-C-A--AACT-G-A--ATG-----TA--T-TGA--AT-AAAGGAA-AA-TTT-CAC-CG-GAA-A-A---GT--A-G--A--T-GT-TT-AC-ACCTGTTACATT-G--T-GG--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--T-C--G----TATCCA---GTT--A-AG-T-TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---A-T--ACTG--T-A--CA-A-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC---T--T--T---TT---AG------------A--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------C--T---T-T--GCT--G-T-AAT----AT--TTT--T--A-AAG----CAAC-AGTA-------------T-----TTTCCT----T-A-AG-T--TTC-T--A--G-TTGGA-AG--T--------T-A---G----T-A-----A---------T
gi|11                         :       G-CGATT-A---GC--A----ATCC--AT-T-A--T-TCAGAACG--GG-TAA--CAG---A-GA-A--GT--AA-T-GA-TA-T--------C-TGG--CACCCT-CGG---AC---G-----A-----TG---------T--A--T--A--G-ACA-G----GTT----T--GTTA----A--A-G--TTCTTT-----A-GACT--C-AA-G-CCA--AACT-G-A--A-G-----TA--A-TGA---C-AAGGG---GA-CTT-CAC-CA-G-A-A-A---GT--C-------T-A--TT-AC-AC--------TC-G--T-CG--AG---A--------T-GCC----AGA-------G-T---GT---A--C-TG------TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---A-T--A-TG--TCA--CA-T-G--TA---------T--T-A--GC-TC--TT--TTAT---TT---AGA----------AA-------------AA-A-TG--C-A-GATTA-------C--T---T-T--GCT--A-T---C----CA--TTT--TTAA-AAC----AAAC-A-CA-------------T-----TCTCCT----T-A-A--T--TTT-C--A--G-T--GA-AGT-T--T----AT-A---G----T-A-----A---------TT---G---AC-CG-A--T--A-A----G-GG-----------T-AT-AC---------CA--TG---T---T-AC-A-G-----------A-AA--C--T-G-T---A-CAAA-A--G-A--A--AAA-AA-GC---C-AG-TC-AA-------A---GT--G-CT-AT-A------TTTT---TT--A-----------------TA----C-----T--TTC---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-A-T--G--T-A-A-ACTTCTA
gi|25                         :    cgattaGATT-A---GCT-AC---ATCC--AG-T-TTAT-TCAGAACGC-GGGTAAA-CAGT--A--A-A--GT--CA-T-GA-TA-T--------C-TGG--CGC--T-CGG---AA---A-C--GA-----TG---------T--A--T--G--A-GCG-G------T----T--GTTAT---A--A-G--TT-TTTT----A-GACT--C-AA-G-C-A--AACT-G-A--A-G-----TAC-T-TGA--AC-AAAGGAA--A-CTT-CAC-CG-G-A-A-A---GT--C-G--A--T-G--TT-AC-AC--------TC-G--T-CG--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--A-CG-G----TAT--A---GTT--A------T----------------TTTT---A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--T--T---
gi|23                         :                               cattcgg-A-GT-TCCGAACGC-TG-GAAA-CAGT--A--A-A--GTA-CA-TCGA-TA-T--------A-TTG--GAC--T-CGG---AA---A-----AACGATTG---------T--A--ATAA--G-ACA-------TT----T--ACTT----A--A-G--AC-TTC-----A--ACG--C-AA-A-C-A--GA---A-A--A-G-----TAAATATGA--AC-AAAGGAATGA-CTC-C---CG-GCA-ACA---GT--C-G--AACT-G--TT-AC-AC--------TC-G--G-TCAGAG---A--------T-CT-----AGACCGAGACA-T---GTA--A--C-CA-GAAAATATG-A---GATAAA-AG-T-TGGG-AGATTG-CAA-TTCTT---A-T--A-TG--TCA--CA-T-A--GA---TACATAT--A-A--GC-TC--TT--at
gi|21                         :                              attgcaattc-AT-TCAGAACGC-GG-TAAA-CAGT--A-GA-A--GT--CG-T-GA-TA-C--------C-TGG--CGC--T-CAG---AA---A-C--TA-----TG---------T--A--A--A--G-ACT-T----GTT----T--GTTA----A--A-G--AT-TTT-----A-GACT--C-AA-G-C-A--AAAT-G-G--A-G-----TA--T-TGA--AC-GAAGGAA-GA-CTT-CAC-CG-G-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AC-GC--------TC-GA-T-G---AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---G--C-TG-G----TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGG-G---TG-CAA-TTCTTA--A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TT---T-----T--T-A--GC-TC--TT--T--T---TT---AAAAC--------AA--A--------T-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------C--T---T-T--GCT-------AT----TA--TTT--T--A-AAG----AAA-----------------------------CT----T-A-AC-T--TTT-C--A--G-T--GA-CGT-T--T----AT-C---G----T-A-----G---------TT---G---AC-CG-A--ata
gi|13                         :                                  gcgatt-AT-TCAGAA-GC-GG-TAA--CAGT--A-GA-A--GT--CG-T-GA-TA-C--------C-TGG--CGC--T--AG---AA---A-C--TA-----TG---------C--T--A--A--G-ACCTT----GTT----T--GTTA----A--A-GGATT-TTT-----AGGACT--C-AA-G---A--AAAT-G-G--A-G-----TT--T-TGA--ACGAAT-GAA-GA-CTT-CAC-CG-G-A-A-A---GT--AGG--A--T-GTTTT-AC-GCA-------TC-GAAT-G---AG---AC-------T-GC-----AGA-------G-T---GT---G--CTTG-G----TAT--T---GTT--A-AG-T-TGGG-G---TG-CAA--TCTTAA-A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--T----T-----T--T-A--GC-TC--TTA-T--T---TT---A------------AA--A--------C----------------TTA-------C--T---T-T--GCT--A-T-TA------A--TTT--T--A-AAG----AAA-----------------------------CT----T-A-AC-T--TTC-A--A--G-T--GA-CGTTT--T----AT-C---G----T-A-----G---------TTG--G---GA-CG-A--T--ATG-G-GG-GG-----------T-AT-TC---A--G---------------T-AC-A-G-----------A-AG--C--T-G-T---A-C--A-A--G-A--A--AAA-AA-GC---C-AG-TA-AA-------A---GT--G-CT-ATGA------TTTT---TT--TA-------------T--AC----T-----T--TGC---AA---ATTT--G---T----AA-T--AG-A-T--G--T-A-A-A--TCTAAT
gi|20                         :                                         tt-TCAGAACTC-GG-TAAA-CAGT--A-GA-A--GT--AA-C-GA-TG-C--------C-TGG--CGC--T-CGG---AA---A-T--TA-----TG---------T--A--A--A--G-ACA-G----GTT----T--GTTA----A--A-G--CT-TTT-----A-GACT--C-AA-A-C-A--AATT-G-A--A-G-----TA--T-TGA--AC-AAAGGAA-GA-CTT-TAC-CG-G-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AC-AC--------TT-G--T-GG--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T---GT---A--C-CG-G----TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--T--T---TT---AGAAC--------AA--AAAAAAAT-A-AA-A-TA--C-A-G-TTG-------C--C---T-T--TC--------------TA--TTC--T--A-AA-------------------------------------CT----T-A-AC-T--TTT-C--A--G-T--GA-AGC-T--T----AT-A---G----T-A-----A---------TT---G---AT-CG-A--T--A-A-G-GG-GG-----------T-AT-
gi|14                         :                                           -TCAGAACTC-GG-TAAA-CAGT--A-GA-A--GT--AA-C-GAGCG-C--------C-TGG--CGC--TTCGG---AA---A-A--TA-----TG---------T--A--A-----G-ACA-C----GGT----T--GTCA----A--A-G--CT-GT------A-GACT--C-AA-AAC-A--AATT-G-A----G-----TA--T--GA--AC-AAAGGAA-GA-CTT-TAC-CG-G-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AC-AC--------TT-G--T-GG--AG---A--------T-GC-----AGA-------G-T----T---A--C-CG-G----TAT--A---ATT--A-A--T---GG-G---C--CCA-TTCTT---A-T--A-TG--T-A--CA-A-G--TA---T-----T--T-A--GC-TCTTTT--T--T---TT---AGAAC--------AA--AAAAAAAATA-AA-A-TA--C-A-G-TTG-------C--C---T-T--TCT--A---------------TC--T--A-AA-------------------------------------CT----T-A-AC-T--TTT-C-----G-T--GA-AG--C--TTA--AT-A---GA---T-A-----A---------TT---G---AT-CG-A--T--A-A-G-GG-GG-----------T-AT------------CA--TG---T---T-ACAA-G-----------A-AG--C--T-G-T---G-C-AA-A--G-A--A--AAA-AA-GC---CAAG-T--AA-------C---GT--G-CTCATAA------TTTT---TT--AT-------------A--CT----T-----T--C------A---A--T--G---C----AA-C--AGAA-T--GTTT-A-A-A--TCTAA
gi|39                         :                                           -TCAGACTCC-GG-TAAA-CAGT--A-GA-A--GT--AA-C-GA-GG-C--------C-TGG--CGC--TCCGG---AA---A-TTATA-----TG---------T--A--A--A--G-ACACG----GTT----T--G-TA----A--A-G--C--TTT-----A-GACT--CAAA-A-C-A--AATT-G-AC-A-GC----TA--T-TGC--AC-Ac
gi|1                          :                                                                          --GC--TA-T-GA-TAAT--------C-TGGT-CAC--T-CGG---CAGACA-TA-TA-----TGACGGATGTAT--A--T--A--GTACA-G----GTT----T--GTTATAAAA--A-G--TT-TTT-----A-AAC---C-AA-G-C-ATAGACT-G-ACCA-G-----TA--T-GAACCAC-AA-GGAA-GA-CTT-CAC-CG-G-A-A-A-------A-GTCA--T-G--TT--C-AC--------TC-A--T-CC--AACGCA--------T-GC-----AGA---------T---GT---AACC-TG-G----TAT--A---GTT--A-AG-T-TGGGCG---CG-CAA--TC-T---A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----TTGT-G--GC-TC--TTG-TA-T---TT---AG------------A--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-ATA-------TA-TCGAT-T--GCT--AGT-TATTAGATA--CTT--T--ACGAG----AAGCGA-TACAAACCACAATTCT----ACATCGT----TCA-AC-TCATTT-C--A--G-T--GA-AG--T--TTCTAAT-A---GGGCAT-A-----AGTTAGCACGTC---G---GT-CG-A--T--A-G-A-CG-GACACGAATGCCCT-AT-AC---ATGGTTCA--CGACCC---T-AC-A-GCAGTGAAGTACA-AG--A--T-G-C---AGC-AATA--G-A--A--AGAGAA-GC---C-AG-T--AAAAACTTGA---GT--GACT-AT-AATTTGTTTTT---CT--AT-------------TAACT----T-----TAATTCTGAAA---A--T--G---C----AACC--AG-A-T--G--T-A-A-A--
gi|16                         :                                                                                                          agtC--T-CGG---AA---AAC--GA-----TG---------T--A--T--A--G-ACA-G----GTT----T--GTTA----A--A-G--TT-TTCC----A-GACT--C-AA-G-C-A--AACT-G-A--A-G-----TAC-T-TGA--AC-AAAGGAA-GA-CTT-CAC-CG-G-A-A-----GT--C-G--A--T-G--TT-AC-AA--------TCCG--T-CG--AG---A--------T-AC-----AGA---------T---GT---A--C-CG-G----TAT--A----TT--A-AG-T-TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---A-A--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--TTAT---TT---AG------------A--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------C--T---T-T--G-T--A-T-TAT----T---TTT--A--A-AAC----AAAC-A-CA-------------T----CT-TCTT----A-A-AT-T--TTC-C--A--G-T--GA-GT--T--T----AT-A---G----TAA-----A---------TT---G---AC-CGAA--T--A-A-G-GG-GG------------------------ATACA--TG---T---T-AC-A-GA----------A-AG--C--T-G-TTCAA-C-AG-A--A-A--A--AAA-AA-GC---C-AG-T--AAC------A---GT--G-CT-AT-AC-----TTTT---TT--AT-------------A--CT----T-----T--TCCA--AA---A--TGAG---C----AA-C--AG-A-T--GC-T-ACA-A--TCTAATac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                               a-A--AACT-C-A--C-G-----TAA-T-TGA--A---A-GGAA-GA-CTTTCAC-CG-G-A-A-AAGCGT--A-G--A--T-G--TT-CA-AC--------TT-G--T-GA--AG---------------C-----AGA-------A-T---GTGATA--C-TG-G----ATT--A---GTTT-A-AG-T-TTGG-GT--CG-AAT-GTCTT---AAT--A-TCACT-A--CT-G-G--TA---T-----TG-T-A--GC-TC--TT--T--T---TTTTGAGA-C--------AAT-A--------C-AACA-TA--A-ATG-TTA-------C--T---C-TATGCT--A-TCGAT----TG--ATTGGT--A-AAA----CAAC-A-TA-------------T----TTTTTCTG---T-A-AC-T--TTTTC--AT-G-T--GA-AG--T--T----ATGA---G----T-A-----A---------TT---G---AC-CG-A--T--A-A-G-GG-GG-----------T-TT-AC---A----------G---T---T-AC-T-G-----------A-AG--C----G-T---A-C-AA-A--G-A--A--AAA-AA-AAACCC-AA-T---A-------A---GT--G-CT-AT-AT-----TTTT---TT--AT-------------A--CT----T-----T--CTC---AA---A--T--G---CG---AA-C--AG-A-T--G--T-ATA-A--TCTAAT
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         AA-GA-CTT-AAC-TG-G-A-A-A---GT--A-T--A--T-G--TT-AC-GC--------AC-G--A-GG--AG---A--------A-AC-------A-------G-T---GT---A--C-CG-G----TAT--G---G
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    aaagc-G-A-A-A---GT--A-G--A--T-G--TT-AC-AC--------TT-G--T-GG--AG---A--------T-GC-----AAA-------G-T---AT---A--C-CG-G----T--------------------TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---A-T--A-TG--T-A--CA-T-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--TTCTT--T---TT---AAA-C--------AA--A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TTA-------C--T---T-T--GCT--A-T--------TA--TTT--T--A-AAG----AAAC-A-TA-------------T-----T-TCCT----T-A-TC-T--TTT-C--A--G-T--GA-AG--T--TT---AT-A---G----T-A-----A---------TT---G---AC-CG-A--T--A-A-G-GG-GA-----------T-AT-AC---AC-GC--------------T-AC-A-G-----------A-AG--C--T-T-T---A-C-AA-A--G-A--A--GAA-AA-GC---C-AG-T--CA-------A---GT--G-CT-AT-A------TTTT---TT--G--------------T--AC----T-----T--TTC---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-A-T--A--T-A-A-A--TTTAAgaactcaatcataattaca
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AT--AC--GTT--A-AG-T-TGGG-----CA-CAA-TTTTTTAAA-T--A-TG--T-AA-CG-T-G--TA---T-----T--TAA--GC-AC---T--T--T---TT---AGAAA--------AAAGA--------C-AA-AGTA--CAA-G-TTAATATTGTC--T---C-T--GCT--A-T-
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TT--A-AG-T-TGGG-G---CG-CAA-TTCTT---A-T--A-TG--T-ATTTA-T----TA---T-----T--T-A--GC-TC--TT--T--T---TT---AGAAC--------AA--A--------T-AA-A-Tt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             A-GTCTA---A-TC-A-TG--A-A--TA-T-GAAGA---C-----T--T-----C-TA--TT--T--C---AT---AAAGC--------TAT-A--------C-AA-T-TA--T---G-TTA-------T--T---T-T--GCT--A-T---T----T---TTC--T--G-AAG----AGAT-A-TA-------------TTTCCATACCAT----T------T--TTT-C--AC-G-TT-GA-AG--G--T-----T-A---G----T-G-----A---------T--------A---A-A--T--A-T-T-GG-GA-----------T-AG-AC---------C---TA---T---T-AC-A-T-----------A-AT--T--C-T-T---A-C-AA-A--G-A--A--A-A-TA-GT---C-TG-T--GA-------C---GT--G-CG-AT-T------TTTT---TT--AC-------------T--TT----T----------C---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-C-T--G--T-A-A-A--TTTAAT
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TG--T-A--CA-T-T--TA---A-----T--T-A--TC-TC--TT--T--TA--TT---TGAAC--------GA----------------------T-A-G-TTA-------C--TG--T-T--GCT--A-T-TTT----T---TTT--T--A-TAA----AAAC-AAGA-------------C----ACATTTC----T-A-AT-T--TGT-C--A--G-T--GA-AG--T--TT---AT-G---T----C-A-----A---------TT---G---AC-CG-AA-T--A-A-G-GG-GG-----------T-AT------------CA--TC---T---T-A----G-----------A-AG-----T-G-T---A-C-AA-A--A-A--A--A----A-GC---C-AG-T--AA-------A---GT--G-CT-A----------------TT--AT-------------T--TT----TAGTACT--TTC---AA---AC-T--G---C----CA-C--Aatc
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    cattgcgattgagcacatcgttatgtcagaacgctggtaacagttagaagtcatatgatatattggcatccagaaaacgagtataagacagcttgttaaagtcttttagactcaagcaaactgagtatctgaacaaggaagagcttcaccggaagtcgatgttaacctcgtgaagatgtagag-G--TA---T-----T--T-A--GC-TC--CT--T--TAT-TT---AGA--------------A--------C-AA-A-TA--C-C-A-TTA-------C--T---T-T--GCT--A-T-TAT----T---TTT--T--A-AAA----ACAA-A-CA-------------C----ATTTCCT----T-A-TA-T--TTT-C--A--G-T--atta
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -A--GC-TC--TT--T--TAT-TT---AGA--------------A--------C-AA-A-TA--C-A-G-TT-----------T---T-T--GCT--A-
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              --------AA--A--------A-AA-A-TATGC-A-G-TCA-------C--T---T-A--GCT--A-T---T----TT--TCT--G--A-AAG----AATC-A-TA-------------T----A-ACATT----T------T--TTT-C--AAAG-T--GA-GG--T--T----AC-----G----T-G-----A---------TTTCCG---AT-C--A--T--G-A-GTGG-GG-----------TTAT-ACCTAAT-GTA---------T---T-AC-A-G-----------ATAGTAC--T-G-TCGTA-C-AA-A--G-A--AGAAGA-AA-AT---C-TG-TTTAA-------A---GT--G-CG-AT-A------TTGC---TTTAAC-------------T--TT----T--------------AA---T--T--T---C----AA-C--AGAA-T--A--T-A-ATA--T-TAATatattt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aa--------AA--A--------C-AT-A-AA--A-A-G-CTA-------T--T---T-T--AC---A-T-CAT----TA----------A-AAACCACAAAC-A-CA-------------C----A-ATCTTCCTAT-A-AT-C--TTC-C--C--G-T--AA-GA--T--T----AG-ACCCG----T-ATAGGTA---------TT---G---AC-CG-AAAT--A-A-G-GG-GA-----------T--T-A---------ACA--TG---T---T-AC---G-----------A-AG--CA-T-G-TA--A-C-AA-G--A-A--A--AC--AA-GC---C-GC-T--AA-------A----T--G-CT-AT-A------TT-----TT--ATA------------A--CT----T-----A--TTC---AAAACA--T--GCACC----AA-CCAAG-A-T--G--T-A-attctaag
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaaacaaaaaaaaaaaa--TTT--T--A-AAAC---AAAC-A-CA-------------T-----T-TCCT----T-A-AA-T--TTT-C--A--G-T--GA-AT--T--T----AT-A---G----T-A-----A---------TT---G---AC-CG-A--T--A-AAG-GG-GG-----------T-AT----------TACA--TG---T---T-AC-A-G-----------A-AG--C--T-G-T---A-C-AA-A--A-G--A--AAA-AA-GC---C-AG-T--GA-------A---GT--G-CT-AT-T------TTTT---TT--A-----------------TC----T-----T--TTC---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-A-T--G--T-A-A-A--TCTAAcaaatgta
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tTCCT----T-A-AC-T--TTT-C--A--G-T--GA-AGT-T--T----AT-G---A----T-A-----A---------TT---G---AC-CG-A--T--A-A---GG-GG-----------T-AT-AC---AT-GTACA--TC---T---T-AC-A-G-----------A-AG--C--T-G-T---A-C-AA-A--G-A--A--A-A-AA-GC---C-AG-T--AA-------A---GT--G-CT-AT-A------TTTT---TC--A--------------T--AC----T-----T--TTC---AA---A--T--G---C----AA-C--AG-A-T--G--T-A-A-A--TCTAA
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