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Reference ( gi|4 )            : AAACATTTAGCAAATTTCTAGCTCAACTCCCACCAATTTTTCTTAAGAAATCTTAAACTGACCACATGTACCATTCACCTGTTTGTCAATC--------T-ATTCATAAACACCCCTTTCTATTGTT-AATGCCC-----CAA-AAAAC-T-TA-C-TTGT-C-CA--A--ATTTTT-TTTAA--CT-G-T-A--T-A--AAA-GA-----------AT-A--A-A--AA-------C---AAA---A----A--T-G---CA--T-CT---AA---A-G-TG-TG-AA-C--A--AA-TTG--------GG------TA----TT--A-T-T---CA--ATTCC-----TC-AT----AAAAAATG-TT---CCTAG-A-TG---T---T--TT--TAA-T--TC-------G-G--T---AA-T-TC-GT-TT--TAC--A---G--GT---AA-GA----AA-AG---AC---A---A-A-GT--G-----CC-G----G------C---A-G----------C-G--A-T---------AG----------C-------------C--CT-TA-CGC--TG-AA---TTT-T--C--A-C--AAA-A--T-CTA-C----AT-G-T--ACA------TT---TA-ACAAAG-CACAGC-CCT-G----G-GC-----------C-T-AA-G-G---T-A-AAA--G----C-AA-ATT--AATTAAG--CC---G---T-AAA--T-TTGTATT-G----T-C-AT----C-CAC-C-TG----A-A-ACT-CGT-G-TT-----TT-------A----T-T----------T---T----T------G-A-T-TGG----G-AT----T-T------C---T--T-A-T-CATT-CT-C-T--ACA-TTT-C-C---GTT-TT----T---T--CT---A--T------C-GT--C---T----T-----------------CTT-T-C-GAAACG-TTTTC---C-T---C---A--------TG--T--GAAG--CTGCC--A-T--T--T-----T-TC-ACT---AAA-CA----C----TAG----A-TA---AG--TC------GT-ACG--T--CA-------AG--A----AA--T--T-A-TTG-AAC-GAAAT-AAAG----TATG-GT--AT--------TGG-CT-TC-T---AGAA--T--T----T--G--A-T-C----------AAC-AAAAACTAA-GC-----AG-T--C-G-A----C-----AGT-C-AG-----A--CTT-A-TTTTC-----G-CAT-A-T-T-----CAAAA--TC-TA-TC-----AAAC-AA---TT---A--AAATAG
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gi|3                          :                                                                     gacattaactttattattccactcgtgatcaatctcgccaaggtttatactaaaacttatcactgtaccgaataA-AAAAC-TGTA-C-TTTT-----------TTTTT-TTAAA--CTAG-T-AA-T-A--AAA-GA-----------AT-A--A-A--AA-------T---AAA---A-------C-A---CG--T-CT---AA---AAG-TGATG-AA-C--A--AAATTG--------GGGTCCTCTAAAAATT--A-A-C---AA--ATTCCAACAATC-CA----AAAAAATG-TT---CCTAGTG-TG---TAAATAATT--CAA-TATTC-------GAG--TCA-AG-T-TCTGT-TTCGTAC--T---G--TA---AA-GA----AA-AAGACAC---A---A-A-GT--G-----CC-G----G------CC--A-G----------C-G--A-T---------AGGCAAATAAAGC-------------C--CT-TA-CGC--TG-AA---TTT-T--C--A-C--AAA-A--T-CTA-C----AT-G-T--ACG------TT---T--ATAAAG-CAAAGC-CCT-G----T-GC-----------C-TAAA-G-G---TAA-AAA--G----CAAA-ATT--AATTAAAGCCC---G---TAAAA--T-TTTTATT-GAAAAT-C-ATG---C-CAC-C-TG----A-A-ACT-CGT-G-TT-----TT-------A----GAT----------T---T----T------GCA-T-TAGC---G-AA----T-T------CTCTT--T-A-T-CCTT--T-C-T--ACA-TTT-C-C---GCT-TT----T---T--CT---A--T------C-GT--C---T----T-----------------CTTAT-T-GATACG--TTTC---C-T---CG--A--------TG--T--GCAG--C-ACC--A----T--T-----T-TC-ACT---AAA-CA----C----T-------------AA--TT------G-----------------------------------T-A-TTG-AATAGAAAT-AAAG----TACG-GT--GA--------TGGCCT-TC-T---AGAACTT--T----T--G--A-T------------AAC-AAAAACTAC-GC-----AG-T--C-G-A----C-----AGTCC-AG-----AACTTT-A-TTTTCTCTCTG-C-T-A-T-TACTTACAAAA--TT-AA-TC-----AAAC-AACCTCT---AACAAATAGgtactttgagtgtcttttggtctctactatcattctctacatttccgtttgtcctcatttggaagccgccatttcacgtaacacgagatatattgtatgtcaaggtaatttagaatataataatataataattttatggccttctcataacgttgataaacaaaaaaaacgaccagacgaacaaggcggacttaaattacgtatattcaaaaattcatttcaaacaatta
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gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -G----G-GC-----------C-T-AA-G-G---T-G-AAA--G----C-AA-ATT--AAT-AAG--CCC--G---T-AAA--T-TTGTATT-G----T-C-ATG---C-CAC-C-TG----A-A-GGT-CGT-G-TT-----TT-------A----T-T----------T---T----TT-----G-A-T-TGG----A-AT----T-TT-----C---T--T-A-T-CATT-CT-C-T--ACA-TTT-C-C---G-T-TT----T---T--CT---A---------C-GT--C---T----T-----------------CTT-T-C-GAAACG-TTTTC---C-T---C---ATG------TG--T--GAAG--CCGCC--A-T--T--T-----T-TC-ACT---AAA-CA----C----TAG----A-TA---AG--TC------GT-ACG--T--CA-------AG--T----AA--T--T-A-TTT-AAT-G--AT--AAG----TACG-GT--AT--------GGC-CT-TC-T---AGAAC-T--T----T--G--A-T-G----------AACAAAAAACTAACGC-----AG-T--C-A-A----C-----AGT-C-AG-----A--CTTAA-TTTTC-----A-TAT-ATT-T-----CAAAA--TT-CA-TCA----AAAC-AA---TT---A--AAATA
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    C-----------C-T-AA-G-G---T-A-AAT--G----C-AA-ATT--AATTAAG--CCT--G---T-AAA--T-TTGTATT-G----T-C-TTG---C-CAC-C-TG----A-A-ACT-CGT-G-TT-----TT-------A----T-T----------T---T----T------T-A-T-TGG----G-AT----T-T------C---T--T-A-T-CATT-CT-C-T--ATA-TTT-C-C---GCT-TT----T---T--CT---A--T------C-GC--C---T----T-----------------CTT-T-C-GAAACG-ATTTC---C-T---A---A--------TG--T--GAAG--TCGCC--A-T--T--T-----T-TC-ACT---AAA-CA----C----TAG----A-TA---AG--TT------GT-ACG--T--CA-------AGT-A----AT--T--T-A-TTC-AAT-AGAAT-AAAG----TATG-GT--AT--------GGC-CC-TC-T---AGAAC-T--T----T--G--A-T-A----------AAC-AAAAACTAC-GC-----AG-T--T-G-A----C-----AGT-C-AG-----A--CTT-CTTTTTC-----G-TAA-A-T-T-----CAAAA--TT-CA-TC-----CAAC-AG---TT---A--AAATAG
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-C-TG----A-G-GC--CGT-A-CT-----TT-------GAGTGT-C----------T---T----T------------TGG-------T----C-T------C---TACT-A-T-CATT-CT-C-T--ACA-TTT-C-C---GTT-T-----------------------------GT--C---C----T-----------------CAT-T-T-G----------------------------------------GAAG--CCGCC--A-------T-----T-TC-ACG---TAA-CA----C----GAG----A-TA---TA--TT------GT-ATG--T--CA-------AG--GT---AA--T--T---TAG-AAT-ATAAT-AA------TATA-ATA-ATTTTA----TGGCCT-TC-TC--ATAA--CG-T----T--G--A-T-A----------AAC-AAAAA--AA-AC-----GA-C--CAG-A----CGAACAAGG-C-GG-----A--CTTAA-ATTAC-----G-TAT-A-T-T-----CAAAAATTCATT-TC-----AAAC-AA---TT---A--t
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gacattaactttattattccactcgtgatcaatctcgccaaggtttatactaaaacttatcactgtaccgaataaaaaaacttaacttgtccaaaaagttaacgttcaaaaaaagaaaaataaatctaattattcaaatgtctgaacaaagtggttatttagcaaatccacaaagatgattgtcagatctccgggttaatcgtttacctagtagtaaaatgataacaaataaactgacagattatatagcaaataagcctatacgcgttatattttcacataaaatctacatagttagcgttttctaccaaacaccT-G-TT-----TT-------A----T-T----------T---T----C------T-A-A-TGG----G-AT----T-T------C---T--T-A-T----T-CT-T-T--ACA-TTT-C-C---GTT-TT----T---T--CT---A--T------T-GT--C---T----T-----------------CTT-T-C-GAAACG-TTTTC---C-T---C---A--------CG--T--GAAG--CCGCC--A-T--T--T-----T-TC-ACT---AAA-CA----C----TTA----A-TA---AG--TCGTAGATGT-ACG--T--CA-------GGT-A----AT--T--T-A-CTG-GAT-AGAAT-AAAG----TACG-GT--GT--------GAC-CT-TC-T---AAAAC-T--T----T--G--A-T-A----------AAC-AAAAACTAC-GC-----AG-T--C-G-A----C-----
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     actgtataaaagaataaaaataaaaacgcatctaaagtgtgaacaaattgggttttattcaatttctttaaaaaatgttcacagatgctgtcaattcggtaattcgttttaccggtaagaaaagacacagtgccgatgcagcgatagcaaataaaggccttgcgctgaattttgacaaaatttatgtctaaaaggcatagccctgggtctaacgaaatgcaaattaattaagtccgtaaatttgtattttcatgccgcctgngtggaatattcccgtttgaagagcggaataatttggagtttgtaacacaataataccccccna----T------G-A-T-TGG----G-AT----T-T------C---C--T-AAT-CATT-CT-C-T--ACA--TT-C-C---GTT-TT----T---T--CT---A--T------T-GT--C---T----gcgaggtcgactagtccaaataaacttcacattttccgccctatactctaacaaataatcacaacaa
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -C---ATT-TT----T---T--CT---G--T------T-GT--C---T----T-----------------TT------GGAAC--TTTTC---C-T---C---A--------TG--T--GACG--CTGCC--A-T--
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -TT----T---T--CT---A--T------C-GT--C---T----T-----------------CTT-T-T-GATACG-TTTTC---C-T---C---A--------TG--T--GCAG--CCACC--A----T--T-----T-TC-ACT---AAA-CA----C----TA-----A-T-------------------------------------------------T--T-A-TTG-AAT-AGAAT-AAAG----TACG-GT--A
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --A-T--T--T-----T-CT-AC----AAA-CA----T----TAATTACA-TA---AT--GC------GT-ACG--T--CG-------AC--T----AA--TC-T-A-CTT-GAT-AGAAT-GACA----TACG-GT--AT--------GAC-CT-TC-T---AGAA--
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tttattttttcaatcatataccgttataacgttggaattgccgcaatatgtatA----C----TAG----A-TA---AG--TC------GT-ACG--T--CA-------AGT-A----AC--T--T-A-TTT-AAT-AGAAT-CAAG----TACG-GT--AT--------GGC-CT-TC-T---AGAAC-T--T----T--G--A-T-A----------AAC-AAAAACTAA-GC-----AG-T--C-G-A----C-----AGT-C-AG-----A--CTTAA-TTTTC-----G-TAC-A-T-T-----CAAAA--TT-CA-TC-----AAAC-AA---TT---A--AAATagggcctctactagtaaaccatagtttgaaaataaaaactccgaagtcagactttagttagtaaagcataatgtccatcaaacatcgaaaaaaaaat
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           att----TAG----A-TA---AG--TC------GT-GCG--T--CA-------AGT-A----AA--T--T-A-TTG-AAT-AGAAT-AAAT----TACG-GT--GT--------GGC-CC-TC-T---AGAGC-T--T----T--G--A-T-A----------AAC-AAAAACTAC-GC-----AG-T--C-T-ACATGC-----AGT-C-AG-----A--CTT-A--------------AT-T-T-T-----CAAAA--TT-CA-TC-----AA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cgcatctaaagtgtgaacaaattgggttttattcaattcctcataaaaatgttcccagatgttttcaattcggtaattcgttttaccggtaagacagagacaaagtgccgacagcgatagcaaataaagcccttacgctgaatttttacaaaatctacatgtacgtttacaaagcacagccctgggcctaaggtaaaagcaaattaattaagcccgtaaatttgtattgtcatgccacctgaaactcgtgttttatttcttatcattctctacatttccgtttAG----A-TG---A---TC------GT-ACA--TGGTA-------GG--ATTATGA--G--T-A-CTG-GAT-AGAAT-AAAGAGTGTGTG-TT--AT--------GAC-CTGTC-T---AGAA--C--T----TCTG--CCT-A----------AAC-AAAAACT-A-GCGACGGAG-T--T-GTA----C-----AGT-TAAG-----A--CAT-A-TTATC-----G-TCT-A-T-T--------AA--TT-TG-TA-----AGAT-AA---T
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tagacattggaactttttaattccacgtgtgctccgtggtgtacgggacagttataataggcgtgccatattttcgcacattgtccgaatggaaagaagctttgcattgtccagaaatgaaaaaaaagtaacagtataaaagatataaaaataaaaaaagcatctaaagtgtgaacaaatttggtttttagttcaatgtgttcacaatgcgttcaattcggtgattgttttacatcgggtgtgaagaaaaacatataagttcccggtgcaagcgataggcaaacaaagtgccttgtgctgaaactttgacaaaatgtaggtgtaacaaggtacagctctaggtctaaggaaatgctaaattaatttagtcgccttaaatttgtattttcatgccgcctgaaactcttgttgttgcgcagaattgtatctactatgtggtgtaaaatcaattctgtattattctctgtagtttccgtttttcgtcgtgcttcttttgaatgttttctcgctcacagatttttgttggttgtagagggttccgggctcgacggctagagttatagttttgtacgtcaactcggaggcT-AAAT----TATA-AT--A----------GG-TT-TC-C---GTAA----------------A-G-C----------AAA-AAAAACTAC-GC-----AG-T--C-A-A----C-----AGT-C-AG-----A--CCT-A-CTTTC-----T-TATAA-T-T-----AAAAA--TT-CA-TC-----AAga
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ttttgaatgtaacaaaatgcgtcaaaagtgtgaataaatcggtttttattcaattcctcataaaaatgttcacagataacactatcaattcggtaatttcttttaccggtaagaaaagacaaagtgccggtgcagcgaaagcaaataatggcctagacctgaatttctgacacaaggtacatgtacaaaccacaggggcctcacatcaataaaacccgtaaatttggattgacctgccgcttgaaactgtgtttcatttttgattgatatttcttatcattctcttcattgccatttttttttttgtcttcttttggaactttttcctcatgtgaagctgccatttttcacttaacacttcttagataagtcgtatgtcagttaatgtactggatagaatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgatcttgctgagcacccggcataaagacatattgacattttcttagccagatccacgcggctgttctagat--T--T----T--G--AAT-A----------AAC-AAAAAGTCG-CC-----AG-T--C-G-A----C-----AGT-C-AGA----A--CTTAA-TTTTC-----G-TA--A-T-T-----CAAAT--TC--A-TCA----AAAC-AA----T---A--AAATAtcgaagtaatttttaataatga
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aac-GC-----AG-T--A-G-A----C-----AGT-C-AGTATCTA--ATT-A-ATATC-----G-TAT-A-TAT-----CAAAA--TT-CA-TC-----AAAC-AA----T---G--AAATAGact
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cc--C-G-A----C-----AGT-C-AG-----A--CTTAA-TTTTC-----G-TAT-A-T-T-----Ctac