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Reference ( gi|1 )            : AGGCCCGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAA----------G--------------AGTAGGCC-ACACCTCC------AT-GCTGATAAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGAT-------------ATC-----------CACGTGTTA-CATAGA---------------CTTTGGTTTTGAATACAC-ATTTTTT-ATATAGTATAGGGTCCAT-GT-AAATATTATTTCTAAAATTGAATGTGTAATAATT-CTTTTTTT--CCTATTTGTCTACTGGGAGCTTTTAGGTCAGCAACAAAGTTTAATTGTTGTTAACGTCTTACAATTAAATATTACTCAATGGCTTCATAAATGTTAAAAATTTTCTTTGAAGAATAAAAC----------TTAGTTCC-TAATTTCCCCTTTTTGTAGAAATCAGATTTAATAGGCCAGTTACAATGAAACAA---------CTTTGAAGCTGTATGGTGTCCCGGTGTCCCTCCAATTAATTAAATGTCAATACTTCTTCTCCCTCAGCACATTCC--TGGGATGGGCGTTCAGG--GATCAAA-A---TATATTTG-G-TTTGGAGGG-TTCGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GCTAGTTA-GTGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGA-TTATAAAAATTATAAAATGAGATGC-AACGTGCCCAT--AATTCTCCTTTA-GTACCCCATGC-CCT--AAAACGTTCCCTCC-AATT-CTGC-A-TGACAACATTTC----TTGTT-TCAAAACGGAGG-AAA-TGAGG-ATG-A-AGTATAA-TTCTTT----G-GAATGCCATG-CAGACTAAAGGGATGACAATAATCCAGCTC-----TATAA-TCTTATTTGTGAGATG-AACACC--CAG--TGCAACTAGGCATACGTCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTA-TA-ATTAAT-GTTTCATC-TATGCTGTTAGCAGCGTGTCAA--GTGATAAAGA-TCTGCGCACAGCAGGACA----C-ACGCACTCAT----AGGCAGTTGTGTGTTC-TTTAAAACTAATACAAC-GGAATTAATGGACATTA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-TAATTATAT--AGCAGCCCATGGTA-A--ATGCGTCC-ATGGGAGATTA-TG-GTCTCCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATC-AAAA-CT-GGCAAATTTTTGAAAAATCAGTGTCACTTCAGAAATTTGA----ATTAGATA-AATACTT-CC-TTTTTAGATACA-TTTGAAGATAT---CTTCTTTGTATTTT--CAAAATGCGCAGAAT-A-CTAAGATTTATTAA-CATAACGAAAGTATGTTT-------AAGTA----ATACTTT-GATGATAT--TAGTT-ATAA-ATTCAAAAATATA-TCATTCTGAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA-TTTCCTCCATTTT-CCCTGATTGG-GTGCTATTTAT---ACCCCA
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gi|9                          :       GATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAGCATATTAGGG--------------AGTAGGCC-ACACCTCCATGCTGAT-GCTGATAAGGCTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATC-----------CACGTGTTA-CACAGAT--------------CTTTGGTTTTGAATACACAATTTTTT-ATATAGTACAGGGTCCAT-GT-AAATACTATTTCTAAAATTGAATGTGTGATAATT-CTTTTTTT--CCTGTTTGTCTACTGGGGGCTTTTGGGTCAGCAACAAAGTTTAATTGTTGTTAACATCTTGCAATTAG--ATTACTCAATGGCTTCATAAATGTTGAATTTTTTCTTTGATGAATAAAACATAATATTATTTAGTTCT-TAATTTCCCATTTTTGTAGAAATCAGATTTAATAGGCCAGTTACAATGAAACAA---------CTTTGAAGtct
gi|18                         :                                                                                                                 cgGT---GAAACTATTAATAGAT-------------ACC-----------TGCATAGCA-CATt
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                A-G---TATATTTG-G-TTTGGGGGG-CTCGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCATGTACATGTA------GCTAGTTA-GTGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGA-TTATAAAAATTATAAAATAAGATGC-AACGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCT--ACAACTTTCCCTCC-AATT-CTGC-A-TGACCACATTTCTTAATTGCT-TCAAAATGGAGG-AAAGTGAGG-ATG-CTAATATAA-TTTTTTTTG-A-GAATG-AATG-CAGACCAAAGGGAT-ACATTAATTCAGCT------TATAATTCTTATTTGTGAGGTG-AACACCG-CAG--TGCAACTAGGCATGCA-------TATTGAA------GCTGGTGTATTA-ATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTCT--GCACAGCAGGACA----C-ATACAC-CAT----AGGCAG-TGTGTGTTC-TTTAAAACTAATG-AAC-GGAATTAATGGACATTA--CCTCCA-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-Tgaatactaagatttattaa
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACCAACAG--TGCAACTAGG-ATACATCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTA-ATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGacc
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG-GAATTATATTAAGCAACC-ATG-TA-AGAATGCGTCCCATTG-AGATTAGTGCGT-TCCG-TGTAAATGTAAA--TAACTTGGTTTGTTCAGCTTT--GCTGTCCAATC-AAAAACT-GGCAA--TTTTGAAAA-TCAGTGTCACTTCATGAATTTGA----AT-AGATA-A-TACTTTCC-TTTTTAGATACA-TTTGA-GATAT---CTTCTTTGTATTTTTTCAAA---TGCAGAAT-AGCTAAGATTTATTAAACATAAC---AGTATTTCT-------AGATATTAAATAATT--GATGATAT--TA-----TAATATTCAAAAATATA-TC-CTC-GAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAATTTTCCTCCATTTTCCCCTGATTGG-CTGCTATTTATTCAACCCCAaggtctcgtggaattatattaagcaaccatgtaagaatgcgtcccattgagattagtgcgttccgtgtaaatgtaaataacttggtttgttcagctttgctgtccaatcaaaaactggcaattttgaaaatcagtgtcacttcatgaatttgaatagataatactttcctttttagatacatttgagatatcttctttgtattttttcaaatgcagaatagctaagatttattaaacataacagtatttctagatattaaataattgatgatattataatattcaaaaatatatcctcgaggtgaagagtggcaagaaaattgaaattttcctccattttcccctgattggctgctatttattcaaccccagtacccgg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  caccaacagtgcaactaggatacatcttatctattgaagctggtgtattaattaatagtttgatcttatgctgttagcagaggtctcg--AGCAACC-ATG-TAGA--ATGCGTCC-ATGGGAGACTAGTG-CTTTCCGGTGTAAATGTAAAACTAACTTG--TTGT--AGTTTTTTGCTGTC-AATC-AAAA-CT-GGCAAATTTTTG-AAATTCACTGACACTTCAG-AATTTGA----A-TAGATA-AATATTT-CCTTTTTTAGATACA-TTTGAA-ATAT---CTTCTTTGTATTTT--CAAA---TGCAGAAT-A-CTAAGATTTATTAA-CATAAC--AAGTATTTCT-------AGATA----ATAA-TT-GATGATAT--TAG-T-ATAA-ATTAAAAAATATA-TC-CTCTGAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-gtacccgg
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaTTTTGAAAA-TCAGTGTCACTTCAG--ATTTCA----A-TAGATACAATACTG-TC-TTTTTAAATACAGTTTGACAATATTTCTTTCTTTATATTTT--GAAAA--CGCAGAAT-A-CTAA-ATTTATTAA-CATAAC-ATAACATATC---------AACA----TCACTCCAGATGATAA--GATTTGATGA---TTGACGAT-TA-TC-CTCTGAAGTGAAGGGTGGCAACAAAATTG-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAGAAT-A-CTAAGATTTATTAA-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acattttctctatcatcacattcctgggatgggcctttagggatcaaaatacatttggtttggagggctcgggtgattaattgttttgatgtcatagttagttagtgaaaatattatcttatgtttcaaaagtaaattaaaaatgattataaaaattataaaataagatgcaacgtgcccataattctcctttggtaccccatgccctaaaactttccctccaattctgcatgaccacatttcttgtttcaaaatggaggaaagtgaggatgctagtataatttctttgagaatgaatgcagaccaaagggataaactaattcagcttataattcttctttgtgagatgaaacaccacgtatgcatagatagtcttatctataagctgtgtattacttaatagttgatttagtgttagcgcggtcaagtgataaagagtccgcaccagcagaacggaaccacaccttatgttaaggcagtggtgtgttcttttgaaactcaataacggaattaatggactttaaccttacttctgcgaggtaagggaattagacattgctaaccatttgaatgcgtccatggagattagtgcttccggtttaaatgtaaacataacttgttgttagctttgctgtcaatcaaaactggcaaattttgaaaatcagtgtcacttcagaatttgaatctattagataaatactttcaaataAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA--TTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGCTTGCTATATAA---ACC
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaTAAAATAT----TTATTTAAAATTCTGTAATTCCCCCTTTTT--AGAAATC-GATGGAATAGGCCAGTTACAATGAAACAATTGGTGAGCCTTTGAAATTG---GAAGTCCCGA--------CAATT--TT-AATGTCAATACATC--CTCACTTGATACACTCTCATGGAATGGGCCATCACGCAAATCAAA-ATATTATATTTGCGTTTT-GGAGGTTT-CAAGTGA-TAATTGTTTTCATTGTCAT--------A------GCTGG-------------TTATTCTAATATTTTCATAAAGTGAATT-AAGGAAATACTC-ATA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaaattTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G--ATTTCAA-TAGATACAATACTG-TCTTTT-TAAATACAGTTTGACA-ATATTTCTTTCTTTATATTTTG-AAAA---CGCAGAAT-A-CTAA-ATTTATT-AACATAAC-ATAACA----TATCAACATCACTCCA--GAT----GATAAGATTTGATGAT-T--GA-C-GAT--------------TATC-CTCTGAAGTGAAGGGTGGCAACAAAATTG-
gi|15                         :   GCCCGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAG--------------AGTAGGCC-ACACCTCCAT-GCTGAT------AAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTTA-CATAGA-CT--------------TTGGTTTTGAATGCACA-TGTTTT-ATATAGTATTGGGTCCAT-GT-AAATATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA--TTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGCTTGCTATA-TA---AACCtct
gi|18                         :                                                                                                         GT---GAAACTATTAATAGATACCTGCATAGCACATCC
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATGAGATGCAA-CGTGCCCAT--AGTTCTCCTTTG-CTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCAAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACAATAATTCAGCT-TATA------ATTCTTTTTTGTGAGATGAA-CACC-A-CA-GTGCAACTGGGCATACGTCTTATCTATTGGA------GTTGGTGTATCTATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGG-----AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATA-AAC-GGAAGTAATGGACATCA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGACAAGGGAATTAGACATAG-TAATTATATA-AGCAA-CCATG-TAAAATGCGTCC-AT-GGAGA-TAAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAA-TTTTG-AAAGTCAGTGTCACTTTT-G-AATTTGAA-TAGATA-AATACTT-CC-TTT-TAGATACA-TTTGA-A-ATAT---AATTCTTGTATTTC--C-AA---TGCAGAAT-A-CTAAGATC--TT-AA-GTAAT-A-AA-AAATTTTT--------TTCTATGGAG----AATA--A-TTGATGATACAGTA-G-TAT-A-ATTAAAAAGT-------TTCGAGGTGGA---TGGCGA-AAAATTGAAAA-TTTCCTCCATTTT--TCTGA-TGGC-T--TATTATAA--AACCCCAa
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           --AGCAACC-ATGT-AGAATGCGTCC-ATGGGAGACTAGTGC-TTTCCGGTGTAAATGTAAAACTAACTTG--TTGT--AGTTTTTTGCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAATTTTTG-AAATTCACTGACACTTCA-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAT-TTCCTTTTTTAGATACA-TTTGA-A-ATAT---CTTCTTTGTA--TTTT-CAAA---TGCAGAAT-A-CTAAGATTTATT-AACATAAC-A-A--G----TAT--------TTCTA--GAT----AATAA---TTGATGATAT--TA-G-TATAA-ATTAAAAAATATATC-CTCTGAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCATGT-AGAATGCGTCC-ATGG-AGACTAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTT--TTGTT-AGTTTT--GCTGTC-AATCAAAAACTGGGCAAATTTTTG-AAATTCAGTGACACTTCA-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAT-TTCCTTTTT-AGATACA-TTTGA-A-ATAT---CTTCTTTGTA--TTTT-CAAA---TGCAGAATAA-CTAAGATTTATT-AACATAAC---AA-G----TAT--------TTCTA--GAT----AATAA---TTGATGATAT--TAGG-TATAA-ATTAAAAAA-ATAGT-CTCTGAGGTGAAGAGTGGC-AGAAAATT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaTAAAATAT----TTATTTAAAATTCTGTAATTCCCCCTTTTT--AGAAATC-GATGGAATAGGCCAGTTACAATGAAACAATTGGTGAGCCTTTGAAATTG-G-AA-GTCCCGA--------CAATT--TT-AATGTCAATACATC--CTCACTTGATACACTCTCATGGAATGGGCCATCACGCAAATCAAA-ATATTATATTTGCGTTTT-GGAGGTTT-CAAGTGA-TAATTGTTTTCATTGTCAT--------A------GCTGG-------------TTATTCTAATATTTTCATAAAGTGAATT-AAGGAAATACTC-ATA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taaaattTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G--ATTTCAA-TAGATACAATAC-TGTCTTTTT-AAATACAGTTTGACA-ATATTTCTTTCTTTATA--TTTTGAAAA---CGCAGAAT-A-CTAA-ATTTATT-AACATAAC-ATAACA----TATCAACATCACTCCA--GAT----GATAAGATTTGATGAT-T--GA-C-GAT--------------TATC-CTCTGAAGTGAAGGGTGGCAACAAAATTG-
gi|15                         :   GCCCGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAG----------AGTAGGC-----CACACCTCCAT-GC------TGATAAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTTA-CATAGA-CT--------------TTGGTTTTGAATGCAC-ATGTTTT-ATATAGTATTGGGTCCAT-GT-AAATATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA--TTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGCTTGCTATA-TA---AACCtct
gi|18                         :                                                                                                         GT---GAAACTATTAATAGATACCTGCATAGCACATCCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATGAGATGCAA-CGTGCCCAT--AGTTCTCCTTTG-CTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCAAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACAATAATTCAGCT-TATA------ATTCTTTTTTGTGAGATGAA-CACC-A-CA-GTGCAACTGGGCATACGTCTTATCTATTGGA------GTTGGTGTATCTATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGG-----AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATA-AAC-GGAAGTAATGGACATCA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGACAAGGGAATTAGACATAG-TAATTATATA-AGCAA-CCATG-TAAAATGCGTCC-AT-GGAGATAAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAA-TTTTG-AAAGTCAGTGTCACTTTT-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAC-TTCC-TTTT-AGATACA-TTTGA-A-ATAT---AATTCTTGTA--TTTC-C-AA---TGCAGAAT-A-CTAAGATC--TT-AA-GTAAT-A-AA-AAATTTTT--------TTCTATGGAG----AATAA---TTGATGATACAGTA-G-TAT-A-ATTAAAAAGT-------TTCGAGGTGGA---TGGCGA-AAAATTGAAAA-TTTCCTCCATTTT--TCTGA-TGGC-T--TATTATAA--AACCCCA
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Reference ( family-1287 )     : AGGCCGGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAGCATATTAGGGAGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGAT------AAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACATAGAT--------------CTTTGGTTTTGAATGCACA-TTTTTTATATAGTACAGGGTCCA-TG-TAAATATTATTTCTAAAATTGAATGTGTAATAA-TTCTTTTTTT--CCTGTTTGTCTACCGGGGGCTTTTGGGTCAGCAACAAAGTTTAATTGTTGTTAACGTCTTGCAATTAGATATTACTCAATGGCTTCATAAATGTTGAANNTTTTCTTTGANGAATAAAACAT----TTATTTAG--TTCT-TAATTTCCCCTTTTTGTAGAAATCAGATTTAATAGGCCAGTTACAATGAAACAA---------CTTTGAAGCTG---AGGGTCCCGGTGTCCCCCCAATTAATT-AATGTCAATACATCTTCTCNCTCAGCACATTCC--TGGGATGGGCCTTCAGG--GATCAAA-A---TATATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GCTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACANTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATTTGTGAGATGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATACGTCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--CGCAC-AGCAGGAC---AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATATAAC-GGAATTAATGGACATTA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-TAATTATAT--AGCAACCCATGTTAGAATGCGTCC-ATGGGAGATTAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAATTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAC-TTCCTTTTT-AGATACA-TTTGA-A-ATAT---CTTCTTTGTA--TTTT-CAAA---TGCAGAAT-A-CTAAGATTTATT-AACATAAC-A-AA-G----TAT--------TTCTA--GAT----AATAA---TTGATGATAT--TA-G-TATAA-ATTAAAAAATATATC-CTCTGAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA-TTTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGC-TGCTATT-TAT--AACCCCA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaaattTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G--ATTTCAA-TAGATACAATAC-TGTCTTTTT-AAATACAGTTTGACA-ATATTTCTTTCTTTATA--TTTTGAAAA---CGCAGAAT-A-CTAA-ATTTATT-AACATAAC-ATAACA----TATCAACATCACTCCA--GAT----GATAAGATTTGATGAT-T--GA-C-GAT--------------TATC-CTCTGAAGTGAAGGGTGGCAACAAAATTG-
gi|15                         :   GCCCGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAG----------AGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGAT------AAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACATAGA---------------CTTTGGTTTTGAATGCACA-TGTTTTATATAGTATTGGGTCCA-TG-TAAATATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA--TTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGCTTGCTATA-TA---AACCtct
gi|18                         :                                                                                                         GT---GAAACTATTAATAGATACCTGCATAGCACATCCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGAGATGCAA-CGTGCCCAT--AGTTCTCCTTTG-CTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCAAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACAATAATTCAGCT-TATA------ATTCTTTTTTGTGAGATGAA-CACC-A-CA-GTGCAACTGGGCATACGTCTTATCTATTGGA------GTTGGTGTATCTATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGG-----AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATA-AAC-GGAAGTAATGGACATCA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGACAAGGGAATTAGACATAG-TAATTATATA-AGCAA-CCATG-TAAAATGCGTCC-AT-GGAGATAAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAA-TTTTG-AAAGTCAGTGTCACTTTT-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAC-TTCC-TTTT-AGATACA-TTTGA-A-ATAT---AATTCTTGTA--TTTC-C-AA---TGCAGAAT-A-CTAAGATC--TT-AA-GTAAT-A-AA-AAATTTTT--------TTCTATGGAG----AATAA---TTGATGATACAGTA-G-TAT-A-ATTAAAAAGT-------TTCGAGGTGGA---TGGCGA-AAAATTGAAAA-TTTCCTCCATTTT--TCTGA-TGGC-T--TATTATAA--AACCCCA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACATTTTCTCTATCATCACATTCC--TGGGATGGGCCTTTAGG--GATCAAA-A---TACATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GTTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTA-TG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-AAACTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTCTTTGTGAGATGAAACACC-A-CGTATGCA--TAG--ATA-GTCTTATCTAT--AA------GCTG-TGTATTACTTAATAGTT-GAT-TTA-G-TGTTAGC-GCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--CGCACCAGCAGAACGGAAC--CACAC-CTTATGTTAAGGCAG-TGGTGTGTTCTTTTGAAACTCA-ATAAC-GGAATTAATGGACTTTAACCTT--A-CTT-CTGC-GAGGTAAGGGAATTAGACATTGCTAA--------------CCAT-TT-GAATGCGTCC-ATGG-AGATTAGTGC-TT-CCGGTTTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAATTTT-G-AAAATCAGTGTCACTTCA-G-AATTTGAA---------------TC--TATT-AGATA---------A-ATAC----------------TTT-CAAA---TACAGAAT-A-CTAAGATTTATT-AAacc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-G---TATATTTG-G-TTT-GGGGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCATGTACATGTA------GCTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTACAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTCTTAATT----GCT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAATATAATTTTTTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACATTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATTTGTGAGGTGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATGCA-------TATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGGAC---AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATG-AAC-GGAATTAATGGACATTA--CCTCCA-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-T
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATGAAACTA----------TATGAAGC-----AGAAT----GTATCTCCCCAATTAA----ATGTCAATACATCTTCTTACTCAGCACACTCC--TGGGATGGACCTTCAGT--GATCAAA-A---TATATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CAAGTGAT-AATTGTTTTGT-TGTCAT--------ACATGAAGCTAACTAG-TGAAAATATTATTCTAATG-TTTCA-AAAGTATATT-TA--AAATGATT-ACAAAAATTACAAAATAATATGCAA-AATGTCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-TCTAAAA--ATCTCCCTCCAATTC------T-GACCACCTTTC----TT----TTT-TCAAAATGGAGGTAAGTGAGG-ATGATAGATTAA-TTTCTTT--GAGAACG-AATGC-ATA-CAAAAGGAT-ACAATACTTCAAAT-TA-A------A-----ATTT-TGA---------------------AACTACACATACGTCTTATCTATTGTATCTGGTGCTGGTATATTAATCAATAGTGTGATCTTATGCTGGTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAA
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Reference ( family-1287 )     : AGGCCGGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAGCATATTAGGGAGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGAT------AAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACATAGAT--------------CTTTGGTTTTGAATGCACA-TTTTTTATATAGTACAGGGTCCA-TG-TAAATATTATTTCTAAAATTGAATGTGTAATAA-TTCTTTTTTT--CCTGTTTGTCTACCGGGGGCTTTTGGGTCAGCAACAAAGTTTAATTGTTGTTAACGTCTTGCAATTAGATATTACTCAATGGCTTCATAAATGTTGAANNTTTTCTTTGANGAATAAAACAT----TTATTTAG--TTCT-TAATTTCCCCTTTTTGTAGAAATCAGATTTAATAGGCCAGTTACAATGAAACAA---------CTTTGAAGCTG---GGAGTCCCGGTGTCCCCCCAATTAATT-AATGTCAATACATCTTCTCNCTCAGCACATTCC--TGGGATGGGCCTTCAGG--GATCAAA-A---TATATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GCTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACANTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATTTGTGAGATGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATACGTCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--CGCAC-AGCAGGAC---AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATATAAC-GGAATTAATGGACATTA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-TAATTATAT--AGCAACCCATGTTAGAATGCGTCC-ATGGGAGATTAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAATTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAC-TTCCTTTTT-AGATACA-TTTGA-A-ATAT---CTTCTTTGTA--TTTT-CAAA---TGCAGAAT-A-CTAAGATTTATT-AACATAAC-A-AA-G----TAT--------TTCTA--GAT----AATAA---TTGATGATAT--TA-G-TATAA-ATTAAAAAATATATC-CTCTGAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA-TTTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGC-TGCTATT-TAT--AACCCCA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaaattTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G--ATTTCAA-TAGATACAATAC-TGTCTTTTT-AAATACAGTTTGACA-ATATTTCTTTCTTTATA--TTTTGAAAA---CGCAGAAT-A-CTAA-ATTTATT-AACATAAC-ATAACA----TATCAACATCACTCCA--GAT----GATAAGATTTGATGAT-T--GA-C-GAT--------------TATC-CTCTGAAGTGAAGGGTGGCAACAAAATTG-
gi|15                         :   GCCCGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAG----------AGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGAT------AAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACATAGA---------------CTTTGGTTTTGAATGCACA-TGTTTTATATAGTATTGGGTCCA-TG-TAAATATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA--TTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGCTTGCTATA-TA---AACCtct
gi|18                         :                                                                                                         GT---GAAACTATTAATAGATACCTGCATAGCACATCCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGAGATGCAA-CGTGCCCAT--AGTTCTCCTTTG-CTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCAAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACAATAATTCAGCT-TATA------ATTCTTTTTTGTGAGATGAA-CACC-A-CA-GTGCAACTGGGCATACGTCTTATCTATTGGA------GTTGGTGTATCTATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGG-----AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATA-AAC-GGAAGTAATGGACATCA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGACAAGGGAATTAGACATAG-TAATTATATA-AGCAA-CCATG-TAAAATGCGTCC-AT-GGAGATAAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAA-TTTTG-AAAGTCAGTGTCACTTTT-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAC-TTCC-TTTT-AGATACA-TTTGA-A-ATAT---AATTCTTGTA--TTTC-C-AA---TGCAGAAT-A-CTAAGATC--TT-AA-GTAAT-A-AA-AAATTTTT--------TTCTATGGAG----AATAA---TTGATGATACAGTA-G-TAT-A-ATTAAAAAGT-------TTCGAGGTGGA---TGGCGA-AAAATTGAAAA-TTTCCTCCATTTT--TCTGA-TGGC-T--TATTATAA--AACCCCA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACATTTTCTCTATCATCACATTCC--TGGGATGGGCCTTTAGG--GATCAAA-A---TACATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GTTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTA-TG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-AAACTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTCTTTGTGAGATGAAACACC-A-CGTATGCA--TAG--ATA-GTCTTATCTAT--AA------GCTG-TGTATTACTTAATAGTT-GAT-TTA-G-TGTTAGC-GCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--CGCACCAGCAGAACGGAAC--CACAC-CTTATGTTAAGGCAG-TGGTGTGTTCTTTTGAAACTCA-ATAAC-GGAATTAATGGACTTTAACCTT--A-CTT-CTGC-GAGGTAAGGGAATTAGACATTGCTAA--------------CCAT-TT-GAATGCGTCC-ATGG-AGATTAGTGC-TT-CCGGTTTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAATTTT-G-AAAATCAGTGTCACTTCA-G-AATTTGAA---------------TC--TATT-AGATA---------A-ATAC----------------TTT-CAAA---TACAGAAT-A-CTAAGATTTATT-AAacc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-G---TATATTTG-G-TTT-GGGGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCATGTACATGTA------GCTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTACAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTCTTAATT----GCT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAATATAATTTTTTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACATTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATTTGTGAGGTGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATGCA-------TATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGGAC---AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAATG-AAC-GGAATTAATGGACATTA--CCTCCA-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-T
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-G---TATATTTG-G-TT--GGGGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCATGTACATGTA------GCTAGTTAG-TGAAAAATTTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAAA--AA--AAATGATT-ATAAAA-TTATAAAATAAGATGCA--CGTGCC-AT--AATTCTCCTTTGCGT-CCCCATGC-CCTACAA--CTTTCCTCCAAATTC-TGCA-TTGACCACATTTC----TTAATTGCT-TCAAA-TGAGGGAAAGTGAGG-ATGCTAATATAA-TTTTTTTTTGAGAATG-AATGC-AGAC-AAAGGGAT-TCATTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATGTG-GAGGTGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATGCAT---AT---TTGAA------GCTGTTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAAGTGTGAT-AAGAGTC--TGCAC-AGCAGGAC---ACAATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAA-ATGACGGGAATTAATGGACATTA--CCC--AGCTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-T
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATGAAACTA----------TATGAAGC-----AGAAT----GTATCTCCCCAATTAA----ATGTCAATACATCTTCTTACTCAGCACACTCC--TGGGATGGACCTTCAGT--GATCAAA-A---TATATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CAAGTGAT-AATTGTTTTGT-TGTCAT--------ACATGAAGCTAACTAG-TGAAAATATTATTCTAATG-TTTCA-AAAGTATATT-TA--AAATGATT-ACAAAAATTACAAAATAATATGCAA-AATGTCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-TCTAAAA--ATCTCCCTCCAATTC------T-GACCACCTTTC----TT----TTT-TCAAAATGGAGGTAAGTGAGG-ATGATAGATTAA-TTTCTTT--GAGAACG-AATGC-ATA-CAAAAGGAT-ACAATACTTCAAAT-TA-A------A-----ATTT-TGA---------------------AACTACACATACGTCTTATCTATTGTATCTGGTGCTGGTATATTAATCAATAGTGTGATCTTATGCTGGTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -CACC-AACA-GTGCAACTAGG-ATACATCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGAG-GTCca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG-GAATTATATTAAGCAACC-ATGTAAGAATGCGTCCCATTG-AGATTAGTGCGTT-CCG-TGTAAATGTAAA--TAACTTGGTTTGTTCAGCTTT--GCTGTCCAATCAAAAACTGG-CAA--TTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCATG-AATTTGAA-TAGAT--AATACTTTCCTTTTT-AGATACA-TTTGA-G-ATAT---CTTCTTTGTATTTTTT-CAAA---TGCAGAAT-AGCTAAGATTTATTAAACATAAC----A-G----TAT--------TTCTA--GATATTAAATAA---TTGATGATAT-------TATAATATTCAAAAATATATC-CTC-GAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAATTTTCCTCCATTTTCCCCTGATTGGC-TGCTATT-TATTCAACCCCAtcgtggaattatattaagcaaccatgtaagaatgcgtcccattgagattagtgcgttccgtgtaaatgtaaataacttggtttgttcagctttgctgtccaatcaaaaactggcaattttgaaaatcagtgtcacttcatgaatttgaatagataatactttcctttttagatacatttgagatatcttctttgtattttttcaaatgcagaatagctaagatttattaaacataacagtatttctagatattaaataattgatgatattataatattcaaaaatatatcctcgaggtgaagagtggcaagaaaattgaaattttcctccattttcccctgattggctgctatttattcaaccccagtacccgg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caccaacagtgcaactaggatacatcttatctattgaagctggtgtattaattaatagtttgatcttatgctgttagcagaggtctcgCAATACAATCTCTCCCTCAGCACATTCC--TGGATTGGGCCTTCAGG---ATCAAATA---TAT-TTTG-G-TTTTGGAGGGCTTCGGGTGATTA-TTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GCTAGTTAGGTGAAAATATTATCTTAATG-TTCAA-AAAGTAAATTGAA--AAATGATTTATAAAAATTATAAAATAAGATGCAAACGTGCCCATCAAATTCTCCTTTG--TACCC-ATGCGCCTAAAAAACTTTCCCTTCCATTCCTGCAAT-GACCACATTTC----TT----GTTATCAAAATGGAGGAAAGTGAGGCATGCTAGT-TAA-TTTCCT---GAGAATG-AATGCCAGACGCAAGGGAT-ACAT--ATTCGGCT-TATACATGTAATTCT-ATTTGTGAGATGAA-CACCAA-CA-GTGCAACTAGG-ATACATCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGAG-Ggtacccgg
gi|9                          :     CGGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAGCATATTAGGGAGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGATGCTGATAAGGCTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACACAGAT--------------CTTTGGTTTTGAATACACAATTTTTTATATAGTACAGGGTCCA-TG-TAAATACTATTTCTAAAATTGAATGTGTGATAA-TTCTTTTTTT--CCTGTTTGTCTACTGGGGGCTTTTGGGTCAGCAACAAAGTTTAATTGTTGTTAACATCTTGCAATTAG--ATTACTCAATGGCTTCATAAATGTTGAATTTTTTCTTTGATGAATAAAACATAATATTATTTAG--TTCT-TAATTTCCCATTTTTGTAGAAATCAGATTTAATAGGCCAGTTACAATGAAACAA---------CTTTGAAG


blockSeqs                     :      G         C    T    A                     CATATTAGGG      CAGGC            C      GCTGAT             TTG                      TTA               A       TCTCAAGTTTTCATA                   T                       T  T              A                  T          TC                                                                    .                             TT          T         ATAATA        AA    G               G        A                             TTGGTGAGCC        TG        C    TATCTCC      TT                 T    A             CA                 CAA      ATAT         C T   T        T                    T      GTACATGTA               G                   T     T          G  GG        T                         A         CA            CG          G       AA               C    A T           TTAA  AATT   A                     C    A   A   T       TT       .     C    C        .   A          .    CATGTA T   T              A    AA   T           C                   TCTGGT                                            .     GT             .      C        GGA  AA     . TT  GTTA      .  G          T        TA    G                 AC   CC G                               C   T     TA     C C   TAAG         C  G G          G  T                A        GT     C      TT      C        A    G    T     .                  T .        .     AC     T    T    T       G     C .    TTCT         TT    G    .          A G            A        ATAACATATCAACATCA          TG   ATTA     GAT          AGTAG     AAT   A     TA    .   T                         A   TT            CC     T    T G     A  TTCA
blockSeqs                     :      C         .    T    A                     CATATTAGGG      .                .      .                  .                        ATA               .       T                                 A                       .  .              .                  .          .                                                                                                                         AT            .     .               .        .                             C                 .         .    .            AA                 T    T             .                  G        TA           . .   .        .                    .      GTACATGTA               .                   .     .          .  .         .                         .         .             C           .       .                .    . .           .     .      .                     .    T   A   .       .        .     .    C        .   C          .    .      T   T              .    AA   .           C                   .                                                 .     .              .      .        .    A      . .   .         .  .          .        AT    .                 .    .  .                               .   T     A      C C   TAG          .  G G          .  .                C        .      .      .       .        A    .    T     .                  . .        .     A      .    T    .       .     . .    C            .     .    .          . .            .        AAAAAATTTTT                .    .        .            TAGG      AA    A     TA    .   T                         .   T             C      T    . G     .  AA  
blockSeqs                     :      G         .    .    .                     .               .                .      .                  .                        TTA               .       .                                 .                       .  .                                                                                                                                                                                                                                                 .                                                                C    A             .                  G        A            . .   .        .                    .      ACATGAA                 .                   .     .          .  .         .                         .         .             G           .       .                .    . .           .     .      .                     .    T   A   .       .        .     .    C        .   T          .    .      T   T              .    A    .           C                   .                                                 .     .              .      .        .    A      . .   .         .  .          .        TG    .                 .    .  .                               .   .     .      . C   TAG          .  G .          .  .                C        .      .      .       .        .    .    T     .                  . .        .     A      .    T    .       .     . .    C            .     .    .          . .            .        AAGTAT                     .    .        .            TAG       AA    A     A     .   T                         .   .             .      .    . .     .  A   
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Reference ( family-1287 )     : AGGCCGGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAGCATATTAGGGAGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGAT------AAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACATAGAT--------------CTTTGGTTTTGAATGCACA-TTTTTTATATAGTACAGGGTCCA-TG-TAAATATTATTTCTAAAATTGAATGTGTAATAA-TTCTTTTTTT--CCTGTTTGTCTACCGGGGGCTTTTGGGTCAGCAACAAAGTTTAATTGTTGTTAACGTCTTGCAATTAGATATTACTCAATGGCTTCATAAATGTTGAANNTTTTCTTTGANGAATAAAACAT----TTATTTAG--TTCT-TAATTTCCCCTTTTTGTAGAAATCAGATTTAATAGGCCAGTTACAATGAAACAA---------CTTTGAAGCTG---GGAGTCCCGGTGTCCCCCCAATTAATT-AATGTCAATACATCTTCTCNCTCAGCACATTCC--TGGGATGGGCCTTCAGG--GATCAAA-A---TATATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GCTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACANTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATTTGTGAGATGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATACGTCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--CGCAC-AGCAGGAC---AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAA-NNAAC-GGAATTAATGGACATTA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-TAATTATAT--AGCAACCCATGTTAGAATGCGTCC-ATGGGAGATTAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAATTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAC-TTCCTTTT-TAGATACA-TTTGA-A-ATAT---CTTCTTTGTA--TTTT-CAAA---TGCAGAAT-A-CTAAGATTT--ATT-AACATAAC--A-AGTAT----------TTCTA--GAT----AATAA---TTGATGATAT--TA-G-TATAA-ATTAAAAAATATATC-CTCTGAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA-TTTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGC-TGCTATT-TAT--AACCCCA
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaaattTTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCA-G--ATTTCAA-TAGATACAATAC-TGTCTTTT-TAAATACAGTTTGACA-ATATTTCTTTCTTTATA--TTTTGAAAA---CGCAGAAT-A-CTAA-ATTT--ATT-AACATAAC--ATAACATATCAACATCACTCCA--GAT----GATAAGATTTGATGAT-T--GA-C-GAT--------------TATC-CTCTGAAGTGAAGGGTGGCAACAAAATTG-
gi|15                         :   GCCCGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAG----------AGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGAT------AAGACTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACATAGA---------------CTTTGGTTTTGAATGCACA-TGTTTTATATAGTATTGGGTCCA-TG-TAAATATT
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAA--TTCCTCCATTTT-CCCTGATTGGCTTGCTATA-TA---AACCtct
gi|18                         :                                                                                                         GT---GAAACTATTAATAGATACCTGCATAGCACATCCA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AATGAGATGCAA-CGTGCCCAT--AGTTCTCCTTTG-CTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCAAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACAATAATTCAGCT-TATA------ATTCTTTTTTGTGAGATGAA-CACC-A-CA-GTGCAACTGGGCATACGTCTTATCTATTGGA------GTTGGTGTATCTATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGG-----AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAA-TAAAC-GGAAGTAATGGACATCA--CCT--A-CTTTCTGCTGAGACAAGGGAATTAGACATAG-TAATTATATA-AGCAA-CCATG-TAAAATGCGTCC-AT-GGAGATAAGTGC-TT-CCGGTGTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAA-TTTTG-AAAGTCAGTGTCACTTTT-G-AATTTGAA-TAGATA-AATAC-TTCC-TTT-TAGATACA-TTTGA-A-ATAT---AATTCTTGTA--TTTC-C-AA---TGCAGAAT-A-CTAAGATCTTAAGT-AATAAAAA--A-TTTTT----------TTCTATGGAG----AATAA---TTGATGATACAGTA-G-TAT-A-ATTAAAAAGT-------TTCGAGGTGGA---TGGCGA-AAAATTGAAAA-TTTCCTCCATTTT--TCTGA-TGGC-T--TATTATAA--AACCCCA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACATTTTCTCTATCATCACATTCC--TGGGATGGGCCTTTAGG--GATCAAA-A---TACATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GTTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTA-TG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTAAAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTC----TT----GTT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAGTATAA-TTTCTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-AAACTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTCTTTGTGAGATGAAACACC-A-CGTATGCA--TAG--ATA-GTCTTATCTAT--AA------GCTG-TGTATTACTTAATAGTT-GAT-TTA-G-TGTTAGC-GCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--CGCACCAGCAGAACGGAAC--CACAC-CTTATGTTAAGGCAG-TGGTGTGTTCTTTTGAAACTCA-ATAAC-GGAATTAATGGACTTTAACCTT--A-CTT-CTGC-GAGGTAAGGGAATTAGACATTGCTAA--------------CCAT-TT-GAATGCGTCC-ATGG-AGATTAGTGC-TT-CCGGTTTAAATGTAAACATAACTTG--TTGTT-AGCTTT--GCTGTC-AATCAAAA-CTGG-CAAATTTT-G-AAAATCAGTGTCACTTCA-G-AATTTGAA---------------TC--TAT-TAGATA---------A-ATAC----------------TTT-CAAA---TACAGAAT-A-CTAAGATTT--ATT-AAacc
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-G---TATATTTG-G-TTT-GGGGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCATGTACATGTA------GCTAGTTAG-TGAAAATATTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAATT-AA--AAATGATT-ATAAAAATTATAAAATAAGATGCAA-CGTGCCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-CCTACAA--CTTTCCCTCCAATTC-TGCA-T-GACCACATTTCTTAATT----GCT-TCAAAATGGAGGAAAGTGAGG-ATGCTAATATAATTTTTTTT--GAGAATG-AATGC-AGACCAAAGGGAT-ACATTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATTTGTGAGGTGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATGCA-------TATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAAAGAGTC--TGCAC-AGCAGGAC---AC-ATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAA-TGAAC-GGAATTAATGGACATTA--CCTCCA-CTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-T
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            A-G---TATATTTG-G-TT--GGGGGGCT-CGGGTGATTAATTGTTTTGA-TGTCATGTACATGTA------GCTAGTTAG-TGAAAAATTTATCTTAATG-TTTCA-AAAGTAAAA--AA--AAATGATT-ATAAAA-TTATAAAATAAGATGCA--CGTGCC-AT--AATTCTCCTTTGCGT-CCCCATGC-CCTACAA--CTTTCCTCCAAATTC-TGCA-TTGACCACATTTC----TTAATTGCT-TCAAA-TGAGGGAAAGTGAGG-ATGCTAATATAA-TTTTTTTTTGAGAATG-AATGC-AGAC-AAAGGGAT-TCATTAATTCAGCT-TATA------ATTCTTATGTG-GAGGTGAA-CACC-G-CA-GTGCAACTAGGCATGCAT---AT---TTGAA------GCTGTTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGCG-GTCAAGTGTGAT-AAGAGTC--TGCAC-AGCAGGAC---ACAATACAC-C--AT----AGGCAG-TG-TGTGTTCTTT-AAAACTAA-ATGACGGGAATTAATGGACATTA--CCC--AGCTTTCTGCTGAGGTAAGGGAATTAGACATTG-T
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATGAAACTA----------TATGAAGC-----AGAAT----GTATCTCCCCAATTAA----ATGTCAATACATCTTCTTACTCAGCACACTCC--TGGGATGGACCTTCAGT--GATCAAA-A---TATATTTG-G-TTT-GGAGGGCT-CAAGTGAT-AATTGTTTTGT-TGTCAT--------ACATGAAGCTAACTAG-TGAAAATATTATTCTAATG-TTTCA-AAAGTATATT-TA--AAATGATT-ACAAAAATTACAAAATAATATGCAA-AATGTCCAT--AATTCTCCTTTG-GTACCCCATGC-TCTAAAA--ATCTCCCTCCAATTC------T-GACCACCTTTC----TT----TTT-TCAAAATGGAGGTAAGTGAGG-ATGATAGATTAA-TTTCTTT--GAGAACG-AATGC-ATA-CAAAAGGAT-ACAATACTTCAAAT-TA-A------A-----ATTT-TGA---------------------AACTACACATACGTCTTATCTATTGTATCTGGTGCTGGTATATTAATCAATAGTGTGATCTTATGCTGGTAGCAGCG-GTCAA--GTGATAA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            -CACC-AACA-GTGCAACTAGG-ATACATCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGAG-GTCca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TG-GAATTATATTAAGCAACC-ATGTAAGAATGCGTCCCATTG-AGATTAGTGCGTT-CCG-TGTAAATGTAAA--TAACTTGGTTTGTTCAGCTTT--GCTGTCCAATCAAAAACTGG-CAA--TTTTG-AAAATCAGTGTCACTTCATG-AATTTGAA-TAGAT--AATACTTTCCTTTT-TAGATACA-TTTGA-G-ATAT---CTTCTTTGTATTTTTT-CAAA---TGCAGAAT-AGCTAAGATTT--ATTAAACATAAC----AGTAT----------TTCTA--GATATTAAATAA---TTGATGATAT-------TATAATATTCAAAAATATATC-CTC-GAGGTGAAGAGTGGCAAGAAAATTG-AAATTTTCCTCCATTTTCCCCTGATTGGC-TGCTATT-TATTCAACCCCAtcgtggaattatattaagcaaccatgtaagaatgcgtcccattgagattagtgcgttccgtgtaaatgtaaataacttggtttgttcagctttgctgtccaatcaaaaactggcaattttgaaaatcagtgtcacttcatgaatttgaatagataatactttcctttttagatacatttgagatatcttctttgtattttttcaaatgcagaatagctaagatttattaaacataacagtatttctagatattaaataattgatgatattataatattcaaaaatatatcctcgaggtgaagagtggcaagaaaattgaaattttcctccattttcccctgattggctgctatttattcaaccccagtacccgg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             caccaacagtgcaactaggatacatcttatctattgaagctggtgtattaattaatagtttgatcttatgctgttagcagaggtctcgCAATACAATCTCTCCCTCAGCACATTCC--TGGATTGGGCCTTCAGG---ATCAAATA---TAT-TTTG-G-TTTTGGAGGGCTTCGGGTGATTA-TTGTTTTGA-TGTCAT--------A------GCTAGTTAGGTGAAAATATTATCTTAATG-TTCAA-AAAGTAAATTGAA--AAATGATTTATAAAAATTATAAAATAAGATGCAAACGTGCCCATCAAATTCTCCTTTG--TACCC-ATGCGCCTAAAAAACTTTCCCTTCCATTCCTGCAAT-GACCACATTTC----TT----GTTATCAAAATGGAGGAAAGTGAGGCATGCTAGT-TAA-TTTCCT---GAGAATG-AATGCCAGACGCAAGGGAT-ACAT--ATTCGGCT-TATACATGTAATTCT-ATTTGTGAGATGAA-CACCAA-CA-GTGCAACTAGG-ATACATCTTATCTATTGAA------GCTGGTGTATTAATTAATAGTTTGATCTTATGCTGTTAGCAGAG-Ggtacccgg
gi|9                          :     CGGATCTGACC-TTGCTCAATATCCACACGGACGGCAATTAAGCATATTAGGGAGTAGG-----CCACACCTCCAT-GCTGATGCTGATAAGGCTGCACAGT---GGAGCTATTAATAGATATCTGCTTAGCACATCCACGTGTT-ACACAGAT--------------CTTTGGTTTTGAATACACAATTTTTTATATAGTACAGGGTCCA-TG-TAAATACTATTTCTAAAATTGAATGTGTGATAA-TTCTTTTTTT--CCTGTTTGTCTACTGGGGGCTTTTGGGTCAGCAACAAAGTTTAATTGTTGTTAACATCTTGCAATTAG--ATTACTCAATGGCTTCATAAATGTTGAATTTTTTCTTTGATGAATAAAACATAATATTATTTAG--TTCT-TAATTTCCCATTTTTGTAGAAATCAGATTTAATAGGCCAGTTACAATGAAACAA---------CTTTGAAG
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Unaligned ( gi|16 ): CCTTCGGTTCAGGTGAGCTAAAAAAGCATATACCAAAGTGATGGTCATATTTTGATGACCCAACGTCAAACTCCAATT