lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                     
lowQualScore                  :                                                                            11111111111111111111111                                                                                                                   4444444444444444444444444                                                                           11111111111                                            111111111111111          111111111                           111111111111     33333333                                                                                                                                                                                                                                                                           11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111          11      22222                              
lowQualScore                  :       1  1  44  1 555 6666 444 1 3 22 6666 33 1 111  555 2 33 3333  5555 2 22222222222222222222222  1 1 3 111  4444 33 22 33333 1 777777 1 333 666666 1 444444 11  22 1 1  3 33 111 1 1 2  111 77777777 1 2 22 1  22 1111111111111111111111111 444444  44444 1 33333 3 1 33 3333 555555 444 11 555 44 333  77777 3 4444  33333333333 22222 3 11 11 22 3333 33 22 5555 333 111 1 111111111111111 1 33 666 333333333 55 2 333  444 1 555 1  3  333333333333 1 1 00000000 11 55555555 2  111  555555 1 1 444 2 333 3333 666 1 1 3333 11 333 7777777 44  11  777 22 4 444 1  99999 3 444  999  44 22  3  44  44 444  22 444  66666666 22222  111 11 555  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 77 1 2  33 333 7777777777777 55  333 88888 777 1  1 11    3333 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555    2     66  22  44444  2 2 4      2 4  99  2   2   
lowQualScore                  :       .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. ....  .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  .. . .  . .. ... . . .  ... ........ . . .. .  .. ......................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. .. .... .. .. .... ... ... . ............... . .. ... ......... .. . ...  ... . ... .  .  ............ . . ........ .. ........ .  ...  ...... . . ... . ... .... ... . . .... .. ... ....... ..  ..  ... .. . ... .  ..... . ...  ...  .. ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....  ... .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . .  .. ... ............. ..  ... ..... ... .  . ..    .... ...............................................................................................................................................................................................    .     ..  ..  .....  . . .      . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :       2  2  00  1 111 3333 666 1 3 66 1111 88 1 999  333 1 33 0000  7777 0 11111111111111111111111  0 0 9 777  9999 22 33 33333 0 333333 0 999 444444 0 999999 44  44 0 0  0 44 888 0 0 0  888 55555555 1 1 99 1  55 4444444444444444444444444 111111  99999 0 55555 0 0 88 1111 999999 111 44 111 55 222  66666 1 0000  44444444444 77777 7 44 44 55 3333 66 55 4444 000 999 1 777777777777777 1 11 777 777777777 00 3 111  333 1 111 1  2  111111111111 1 1 33333333 55 88888888 2  999  777777 1 1 555 2 444 4444 666 1 1 4444 55 888 2222222 66  44  555 55 2 777 1  77777 2 555  222  99 66  3  22  22 666  66 666  77777777 88888  999 55 000  1 4 2   55 1 2 99 2 3 1 66 2 11 1 2  99 111 6666666666666 66  333 00000 000 2  2 77    1111 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000    0     00  88  00000  0 0 0      0 0  55  0   4   
consensus                     :   AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCGT----T-------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTC--CG--T-TTAT-C-AGGTT-----T----TTGNNNNNTCTNNCGTATNGCNNTNNCNNNATCGTTCGCGGNANNNTCNNNTCNTANTNCCGNNTNGTNTNNNTGTTTNT------ATCG-TGTATC-CA--TGT--T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( gi|15 )           :   AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-A--------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-G---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCGT----T-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTC--CG--T-TAAT-C-AGGTT-----T----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT------ATCG-TGTATC-CA--TGT--T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|27                         :   AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A---T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA----T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T--CCGT----TNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTT--CG--T-TTAT-C-AGTTT-----T----
gi|13                         :   AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--A-------------------------G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-C--------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AAT--TT--T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT-----CGT----TTANNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCGTCG--T-TTAT-C-AGGTT-----TTG--GCGTTTATCCTATCGTATCGGTCTGACTACGTGCTTCGTGGCGTGATCCTATCTCAATCGTGCGTGTTCGTGTTCTTACT------CTCG-TGTAT--CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-
gi|33                         :   AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A----------T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--------A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--CCGT----
gi|17                         :   AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T--T-T-CA-AAAT---T-A-G-AA---A--------T-TCT--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A-------A--T--T----T---G---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-A-------------------------------------------------C----AT--A-C-T----T--T---A-------G--TT--GTG--A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-TC--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---CGT----T-------TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTC--CGT-T-TTAT-C-AGGTT-----TTTG-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCGTGTAT------ATCG-TGTAT--CA--TGTCAT-AA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TA
gi|20                         :   AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-TCC--A----T--T-A-G-TTA--A-T--GC---CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GTA---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T----------------------------A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A---------------C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A--T-TT------------C-A-AC-------A--TAAA-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---CAA---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CGGT----T-------
gi|16                         :   AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-AT--T------T-C------C--TT--T-TCCA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-G-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------CTG-C--------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----C---A-A-T----T--T---A-------G--TT--GT---AC-G-T---T-GT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---G-----------TT-T--TCGT----TNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTC--CG--T-TTAT-C-AGGGG-----T----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------GTTG-T-TAT--CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC-T-TT--GC-GGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|22                         :   AGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----CA----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT--C-T-CATA--T---T-A-G-AATTTA--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--T----T--T--T----G---ATAAA-A-------------C-C-C--A---T---------T--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-AC----A------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---ATAG-----A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-TC--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T--CCGT----T---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTC--C---T-T-AT-C-AGGTT-----T----act
gi|26                         :   AGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----TA----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-TCT--C-AT--TGA-----------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG-----T---A-TT-TT------------C-A-ACACTTTAGA--C--A-----A-GA---GC------A-C-GTA-T-G---C----ACCCA---T----T--T---A-------G--TT--GTA--A--G-T---T-AT-A---C-A---AA---TT--CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCGTNNNNN-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCTC--CG--TCTTAT-C-AGGTT-----tcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccttctgcgtgttatcgtgttctatcgtgtat
gi|8                          :   AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G-----A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT--C-C-AG-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-TATT-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--TGTTTA--------G--A-AACATA---T-TTA-G-TT-TT------------C-A-T--------A--T--A-----A-AA-----------A-T-G---TTG---C----A---A-T-T----T--T---GTGTTGTTG--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TC--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T--CCGT----
gi|40                         :  cAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--T-TC--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G-------A-A-------------C-C-C--TTG-T---------G--A-A---TG-----T---A-TTATT------------C-C-A--------A--C--A-----T-A---------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-Agtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|1                          :   AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----AA----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT--T-T-CA-AA-T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--T----A--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-C-C--T---TTTGTAGGGGA--A-A---TGTTTT-T---A-TT-TT------------C-A-AACCC----A--T--A-----AGAA---GA------A-T-GGTTT-GGCAC----A---T-T-T----T--T---AAG-----G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AATT-TT--T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TT---T--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-TC--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T--CCGT----T-------ga
gi|32                         :   AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----CA----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA------------T-T-T--C-TT--T-------------------------AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--T----A--T-------G---A---A-A-------------CAC-C--T---T---------C--A-A---TG---T-T---A-TT-TG------------C-A-A--------ACAT--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---TT---A---A-T-T----T--T---T-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TT---G--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-TC--T---tatcagtgaaagatcgtttatcgggttttttgcgttttttatcagcggcttgccgtggaaacattcgttttttaatcaaaattttgttttccgttttatttttcagggtttttggcgttaatctattcgtatctgcggtgtatttccttaatttcgtctcgtgcatgaaatccatatatcctttaatcgtttgcgtgtactcgtgtccttaaatgtgataatcatgtccaaggaattaaaaacgttgcaggg
gi|31                         :   AGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----CA------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A---AA---A--------T-T-T--T-TT--TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-------A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--T----A--T--T----G---A---A-----------------C-A--T---T---------G--A-AT--TG---T-T---A-TT-TT----------------A--------A--C--C-----T-AA---GAT-----A-T-GT--T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------GT-TT--GT------G-TTC-A-AT-A---A-A---AA---TT--A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TT---G--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T--Cg
gi|36                         :   AGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----CA----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----gt
gi|7                          :    GAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----CA----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT--T-T-CA-T--T---C-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------G------G--------T-----A-T-A--C-----------T---G--T---TT-A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--T----AA-T--T----G---A---A-G-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG-----T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----ATAA---CA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-TCA-A-AT-A---C-C---AA---TTG-T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-TC--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T--CCGT----TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTTTTCC--CG--T-TTAT-C-AGGTT-----N----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTTCTAGAATCG-TGTAT--CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-CGG-GACatgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|19                         :    GAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT------CA-A--T-----A-G-AA------------T-T-T--C-TT--T-------------------------TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---C---A---------------C-C-C--TA--G---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-ACA------A--T--G-----A-AG-----------A-T-G---T-G---C----AG--A-T-TA---T--T---A-------G--T---GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-TC--T--------------------CA---G-----GA--T-TT-T--CC------T-------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTT---CG--T-TTAT-C-AGGTT-----T-----TGCGTTTATCTATGTAGTGCGTGTATCCTATCGTTGTCGTGAATTCCAATTCCTATCGCTGGTTCGTGTATCGTGTTCT------ATAG-TGTAT--CA--TGT-----A-A-G-AATAAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :    GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AC---ATTTTTATGT-T-T--T-TT--T-------------------------A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|11                         :     AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--TTTTTTTTTTTTTTTTTT--------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--T-----G-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCGT----TN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTC--CG--T-TTAT-C-A-GTT-----T----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTTCTA------ATCG-TGTAT--CA--TG---G-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TACgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|14                         :   gaAA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---TAA-G-AA---A--------T-G-T--C-TTTCT-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A---------------C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A--T-TT------------C-A-C--------A--T--------A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-GT-A---C-A---AA---TT--T--CGCTT--CC--G---TC--TA--AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--CCGT----T-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTC--CG--T-T-AT-C-AGGTTTTGCGT----TTATCATATCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNG-TGTAT--CA--TG---T-CA-A-G--ATAAC-G-TT--GC--GG-TACtg
gi|34                         :     AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA----T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A---------------C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-AA---CA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--CCGt
gi|12                         :     AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---T--------T-T-T--T-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----T-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--A---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-TC--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T--CCGT----TNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTC--CGT-T-TATT-C-AGGTT-----TN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN------NNNN-NGTGTT-CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC---TTAGGC-GG
gi|24                         :  agaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-AA------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCGT----TNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCC--CG--T-TTAT-C-AGGTT-----T----ta
gi|3                          :  agaAA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----CA----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-TC-A--T---T-A-GAAA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TGTTA--A-A----TA-----------A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-C-T--T---T---------GGAA-A---TG---T-TTA-A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--------A-AA---GA------A-T-G-----G---C----A---A-T-T----T--TTAAA-------G--TT--GTA--A--G-T---A-AT-A---CAA---AA---TT--T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTT---G--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-TCCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T--CCGT----T-------
gi|25                         :    aAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----CG----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-GAAA---A--------T-T-T--G-CT--T-------------------------A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-T----A--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-C-CGGG---T---------G--A-A---TG---T-T---G-AG-TTGGGCAA------C-A-A--------A-----A-----A-GA---GA------G-T-G---T-G---C----C---A-T-T----T--T---A-------G--GTGGGT---A--GTT---A-AT-A---C-A---AAT--TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------T---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-TCG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T--CCGtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttatctagtttttttccgttttattaagttttttttttggcgcgtttatccctatcgtatttcgtggccgtgtttatctatccgtattcgtggcggtgaattccgctatcctatcggtggccggtgtaatcgtgttctatatcggtgtattcatgttcaatgaaaaacgttggcgggttac
gi|10                         :    aAG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGCA------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--G---T-A-G-AA---A--------TGT-TGCT-TT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T-------T--C----G---A---A-A-------------T-C-C--T---TTG-------A--A-A---TG---T-T---A-TTGTTG-----------C-A-ACG------A--T--A-----A-GAAGGGA------A-T-G---T-G---C----AAT-A-T-T----T--T---AG------G--TC--GT---A--GCT---AGAT-A---C-A---AAAT-TT--T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TT---G--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGTC--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T--CCGT----T-------ggtttacgtgaggagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|35                         :     AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT--T---CA-A--A---T-A-G-AA---A--------A-T-T--T-CT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--T----A--T--T----G---A---AGA-------------C-C-C--T---TTA-------GC-A-A---TG---TAT---A-TT-TTTTTTTTTCCCCCC-A-AC-------A--T--C-----A-AA---GA------A-T-A---T-G---C----A---A-TTT----T--T---A-------G--TT--GT---T--A-T---A-AT-T---T-A---AA---Ttatgtgggaaagatcgtttagtcgtcggttttgtgcggtttatcaggtctcatcgtgtaaacatcgttgtattgcagttttctccgtttatcaggttttgcgtgttatctgtaatcgtatcgggcgtgtaagtgctatcatgatgcggcgtgaatcactatcctaagtcgtgtcgtgtatcgtgttcttactcgg
gi|5                          :  agaAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CAA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT--TGT-CA-T--T---A-A-G-AA---A------------T--C-TT--T--------------------------------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--C----A--C--T----
gi|52                         : cagcAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----CA------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT--G-T-TA-A--T---C-A-G-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|18                         :   agaA-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--CTTT--T-------------------------A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGTTA--T-A----TA-----------A-----AGG--G--A--T-------T--T----G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TGT--T-T---A-TT-TT------------C-A-AAC------A--T--A-----A-AA---GACCCACTA-T-G---C-----C----A---A-T-T----T--T---A-------GT-TT--GT---A--A-T---A-AT-A---C-C---AA---TT--C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--CCGT----N-------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--TTTCC--CGTCT-TAATGC-AGGT------------------GTTTTGCGTGTATCCATATCGTAATCGTGCGTTGAATCCTATCCTTATCGTACCGTCGTGTATTCGTGGTTTT------ATCG-TGTAT--CA--TG---T-CATA-GAAATAACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|9                          :     gA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----CAC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT--T-T-CA-T--T---T-A-A-AA---AATT-----T-T-T--C-TT--TA------------------------A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------CGC-CCAT---T---------GT-A-A---TT---T-C---A-TTATT------------C-A-AC-------A--TA-A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C--------A-T-T----T--T---A-------GA-AT--GT---A--G-T---A-AT-AC--C-A---AAT--TT--T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T--CCGT----TTAN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTCA-CGT-T-TTAT-CAAGGTT-----TTGCGTTTATCCCTATCAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTTT------ATCG-TGTATC-CA--TGT-----A-A-G-AATAAC-G-TT--GG-GGG-TAC
gi|6                          :     gA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----TAGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T--T-C-CA-A--T---T-A-G-AA---A----------T-T--C-TT--A-------------------------G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--T----A--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-C-C--TGTCT---------G----A---TG---T-T---A-TT-TT------------T-C-ACC------A--T--A-----A-AA---GA------AGT-T---T-G---C----AG--A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--GTT---A-AT-A---C-A---AA---TTA-T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T--C
gi|44                         :     gA-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----CA----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT--C-T-CATA--T---T-A-G-AA---ATAT-----T-C-T--C-TT--T-------------------------A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---gctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttttccgtatattctaggttattgtcgtttattttctatatctgttatcgtgctgtgtatctattcgtatcgtgactgtgaaatatcctatcgctgcttgcttcgtcttttcttatcgtgttcagctgtcaaggataacgttgcggggtact
gi|4                          :    cag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA--T-A-CA-AA-T---T-A-G-AA---A--------T-C-T--C-TT--TTTCAAATTGTATATTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--T----AATT--T----G---A---A-C-------------C-C-A--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-C-A--------A--C--A-----A-AA---AG------A-TAA---TAG---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GTGA-G--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TTA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---GAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-TC------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCGT----T-------
gi|21                         :             --GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----CA----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTA-T-T-CA-A--T-----A-T-GA---A--------T-T-T--C-TTG-T-------------------------A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGT----A--CGAT----GT--A---C-A-------------T-C-C--T---T---------CT-A-A---TG---T-TTCAA-TT-TT------------G-A-A--------C--T--ATT---A-AA---TA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--TCTGAT------G--TT--GTG--A--G-TGAGG-AT-GGATC-A---AAG--TTGAT--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TT---G--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-GA--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T---CGT----T-------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattattgtgccgtttatcaggtgttgtcgttttatcctattcgtatcgtggtgcgtgtattcaacataatcgtatcgtgcgttgaatcctatcctatcgtgtcgtgctaatcgtgtttctatcgtgtattcctcctcaagaataacgttcggcgggctact
gi|23                         :             atcT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----CAATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TTTAT-T-TA-A--TATGT-G-G-AA---A--------A-T-T--C-TT--TTAG----------------------A------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--CTG-T--A---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TA---A--T--TG---G---A---A-A-------------C-C-C--T---T---------G--A-A---TG---T-T---ATTT-TT------------C-A-AGC------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---ATT-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--GTT---A-AT-A---C-ACAGAATTGTT--T--CG-TT--CCG-G---TA--TAA-AA--------A-----TTGCGG--C---TT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGTC--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-T--TCGC----T-------atggtgacaaagatcgtatcgtgttttgcgttatatcagattgctatggacgatgactatcgatgtgtgtatacaggttttccgtttatcaggttttgcgttattattcaggtttatatatatcactatcgcttcgtgccctgtatctaatcctagcgtgccgtgctagtc
gi|47                         :              agaaataagctgga---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT--T-T-CA-A--T---C-A-G-Agtttatcagtatggtgttatatctggtctgatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttttccgtgatcaggttttgcg
gi|51                         :                                                   -TT---A-T--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA---A--------T-T-T--C-TT--T-------------------------A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--ttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|11                         :                                                      ---A-T--G----CA----T-G-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---T------
gi|36                         :                           gaaaaaatatatcgtcattatatgcac---A-T--A----CA----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---T------tccttttcaattagaaatttcttttttttttttttttttttaggatatacgtgttatgtatatacatgtaaaggatattgaaacccttgaatgttattttcaacattgaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttccgtttatcagtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttctaatcgtgtatcatggcaagaataacgttgcgggtactg
gi|46                         :                               agtaaaatgtatcgataataagtatgcat--G----CA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT--T-T-CA-A--T---C-A-G------A--------T-T-T--T-TT--TA------------------------A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--T----A--T--T----G---A---tgcctttcaattagaaatttctttaggatatatgatttaatgtaaatatgtatataatgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|30                         :                                                         aaa--G----CA----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT--T-T-CATA--T---T-ATG-AA---A--------T-T-T--C-TT--TC------------------------A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--T----A--T--T----G---G---A-A-------------A-C-C--T---TCTTTG----G--AGA---TG---T-T---A-TT-TTGTT---------C-ACACC------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---CACTTA---A-T-TATTGT--T---A-------GGATT--GTCAAG--G-T---A-AT-A---CTACT-AA---TT--T---G-TT------A---TC--T---GA---------------T---G-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-Tg
gi|50                         :                                                                                                            tcaa----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT--T-T-CA-A--T---T-A-G-AA------------T-T-T--T-TT--A-------------------------A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--T----A--T--T----G---A---A-A-------------gatgtctcaaatttac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                        -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--T----AC-T--T----G---A---A-A-------------AAC-C--T---T---------G--A-A---TGG--T-T---A-TT-TTTA----------C-A-G--------A--C--ATAAACA-AA---TA------G-T-G---T-GGC-T----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----AT---G--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTCCCGT----T-------
gi|36                         :                                                                                                                           gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaac-----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A-----TTG--C--C--TTTCAA--T--TA---G---A---A-A-------------T-TTC--T---TTAG------G--ATA---TA---T-G---A-TT-T-----------------A--------A--T--G-----T-AA---AT------A-T-G---T-A---T----A---------------T---A-------A--TG--AT---A--A-A---A-A--------A---AA---AT--G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-TCT-T---A-------------T--Ctatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--C----G--T--T----G---A---A-A-------------T-C----------------------------G---T-T---A-TT-GT------------C-A-A-----------C--G-----A-AA---TATT----G-T-G---T-G---C----A-----T-T----TGCT---A----------TT--GT---A--G-C---G-TT-G---G-A---AA---TG--T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TC---G--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A-------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T--CCAT----T-------
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacgG--A--A--T----A--T--T----G---A---A-A-------------C-C-A--T---T---------G--A-A---TG---T-T---A-TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-TA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---T-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TT-TT------------C-A-A--------A--C--ATT---A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---A-T-T----T--T---A-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-A---AA---TT--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---T--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCGT----TN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTC--CG--T-TA---T-AGGTT-----T----
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TT-TT------------C-A-AC-------A--T--A-----A-AA---GA------A-T-G---T-G---C----A---G-T-T----T--T---T-------G--TT--GT---A--G-T---A-AT-A---C-G---AA---TT--T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TT---G--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--CCTT----T-------ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatatattcgtgtat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  --TT--GT---A--T-T---A-AT-A---C-AT--AA---TT--TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TT---G--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-AT-T-T-TC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT--CCGtatcgtgaacatcgttaatcaggttttccgtttattaggttttgcgttattatcccatcattccgtgccgtgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcgtgtatcatgtcacaaaataacgttggctggtactg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtataT------ATCG-TGTATC--A--TGT----CA-A-G-AATAAC-GTTT--GC-GGG-TACgtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttcT------ATCG-TGTATT-CC--TCC--T-CA-A-G-AATAAC-G-TTCGGC-GGGCTACt
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaatataatcgtcatcctattatgcacatacatgtacatgcatcctatacaaattagaaatctctttttcaaattgtatatttttttttaggatatatacgttgttatgtatatacatgtaaaaggataatttgaacccattgaatgttattttccaacaaaaagataatagcaattttagttgtgaggtaatacaaattatcgttccgtctaaattgaacatattctaaaattttacagcgatttcatcaggttttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattattgtgccgtttatcaggtgttgtcgttttatcctattcgtatcgtggtgcgtgtattcaacataatcgtatcgtgcgttgaatcctatcctatcgtgtcgtgctaatcgtgtttcT------ATCG-TGT--T-CAGCTGT----CA-A-G-GATAAC-G-TT--GCGGGG-TACt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaaaatgtatcgtcattaattagtgtagttcatacatgtacagcattccttccaattagaaattcttaggggttataagttatggaggtatctaaaggatatatgtaaaaaccctgtctgatgttatttttcaccataaaagaagtttgcagattttagttgtagttaatacaaattatcgcttccgtcttaaattgcttctaaaatattcaacattttctatcagccactgttttcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcttttccgtatattctaggttattgtcgtttattttctatatctgttatcgtgctgtgtatctattcgtatcgtgactgtgaaatatcctatcgctgcttgcttcgtcttttctT------ATCGGTGTATT-CA--TGT--T-CA-ATG-AAAAAC-G-TTG-GC-GGG-t
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaaaaatgtatccggttcatttagttttgattggcaccatacatgtaagcatgcattcctttttcattagaaaatttctttaggatattacgttgttttatgttaaataaaaggatattgaaaaaacgcctttggaaatgtttaattttcaacataaagaatggcaatttttaaagttgtaagtaatacaaaatttcgttccgcgtttcaaattggcttgtttcctaatttaccaactttccttatcaggtttttttccgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttatctagtttttttccgttttattaagttttttttttggcgcgtttatccctatcgtatttcgtggccgtgtttatctatccgtattcgtggcggtgaattccgctatcctatcggtggccggtgtaatcgtgttctaT------ATCG-TTT-TT-CA--TGT----CA-A-G-AATAAC-G-TT--GT-GGG-TACtac
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgttttgcgttattttgttgtatcctaacgtatcgtgcgggcatcgtgttcT------ATCG-TGT--CACA--TGT--C-AA-A-G-AATAAC-G-TT--CA-GGG-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tggttgtatcgtgttc------ATCG-TGTATC--A--TGT--CACA-A---AATAAC-G-TTG-GC-TGG-TACtac
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttcaacataaaagaatgtgcagtttttgttgtagtaatacgaatttcattccatctgaattgattacataaattcacaacatttcaatcaggttttccttttatcgtgaacatcgttaatcaggttttccgtttattaggttttgcgttattatcccatcattccgtgccgtgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagTCG-TGTATC--A--TGT--C-CA-A-G-AATAAC-GTTT--GC-GGG-TAtg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttcG-TGTATC-CA--T----T-CA-A-GGAATAAC-G-TT-----GGG-TAC
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-TGTATC--A--TGT----CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-tg
6 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|38 ): CGCACATCGTTTATTCAGTTTTTTCCGTTTATCAGGTTTTGCTTTATCCTATCGCATTGTGCGTGTATCTATCGATTCGGGCGTGATCCTATCCGTTCCTATGTGCGTGTTATGCTGATGATGTCAGATAAACGTTTGCGGGTACTG
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|42 ): TTTATCAGATTTATCATTTATCCTATCGTATTGAGTGTATCATATCATGCTTGTATCCTATCCTGTTCGTGCGAATACTGTGTTTTATCATTTATAAAGTCACCAATAATGTCGCGGGCAAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC
Unaligned ( gi|49 ): TATTGTGTGTGTATCGTGCGCTATCGTTTATCATGTCAAGATTTATATCGTAACGTGGCAGGAACTGT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                               8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                                           111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                 11      22222                              
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33 1 33 3333 11 333 7777777 44  11 11 555 22 4 444 1 1  222 3 444  888 111 44 22  3  44  44 444  22 333  66666666 33333  111 11 444  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 66 1 2  444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 11 44444444   2222 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666  22    1  44  66 1  44 1 66     3 77777 3 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333 555   1     88  22  00000  1 1 3      1 5  88  1   2   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... .. . .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  ... ... .. ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....  ... .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . .  ...... ............. ..  ... ..... ... .  . .. ........   .... .........................................................................  ..    .  ..  .. .  .. . ..     . ..... . .............................................................................................................................................................................. ... ...   .     ..  ..  .....  . . .      . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66 1 66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  999 888 77 66  2  11  11 555  66 444  55555555 88888  999 55 999  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 99 1 2  777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 66 33333333   9999 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333  66    9  33  11 8  33 8 11     6 00000 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222 000   7     22  55  99999  8 8 6      8 5  66  8   1   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------T------NTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT--TTTT-TC--CG--T-TT--A-T--CAGGT-T-----T-T--C------G---TTTTNT-----C---T---AT--C-GT-ATC-----GC---CGTNN----------C-------TNT--ATC---G-T-TC---G---CG--GCGNNNT--CCNNT------------CCTANTNCCGNNTCGTGTNCG--T---G---------T-T-TCT---A---TCG-TGTATC-CA--TGT--T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------T------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT--TTTT-TC--CG--T-TT--A-T--CAGGT-T-----T-T--T------G---NNNNNT-----C---T---NN--C-GT-ATN-----GC---NNTNN----------C-------NNN--ATC---G-T-TC---G---CG--GNANNNT--CNNNT------------CNTANTNCCGNNTNGTNTNNN--T---G---------T-T-TNT---A---TCG-TGTATC-CA--TGT--T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--T-T--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATT-T---T--T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TT---T--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-TC--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------CGT----T-------T------
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATA-T--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAAT-T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TT---G--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGTC--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T--C--------CGT----T-------T------atcagtgaaagatcgtttatcgggttttttgcgttttttatcagcggcttgccgtggaaacattcgttttttaatcaaaattttgttttccgttttatttttcagggtttttggcgttaatctattcgtatctgcggtgtatttccttaatttcgtctcgtgcatgaaatccatatatcctttaatcgtttgcgtgtactcgtgtccttaaatgtgataatcatgtccaaggaattaaaaacgttgcaggg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T--TTTC-TC--CG--T-TT--A-T--CAGGT-T-----T-TG-C------G---TGTTAT-----C---TGTAAT--C-GT-ATC-----Gatgtgggaaagatcgtttagtcgtcggttttgtgcggtttatcaggtctcatcgtgtaaacatcgttgtattgcagttttctccgtttatcaggttttgcgtgttatctgtaatcgtatcgggcgtgtaagtgctatcatgatgcggcgtgaatcactatcctaagtcgtgtcgtgtatcgtgttcttactcgg
gi|11                         :                                                                                        agaaatgatcgtcagattagtatgagggcaatacatgtagcatgtgcattccttttcaagtagaaatgttgcttttaggatatagtgtgtatgtatgatagaaggatgattcgaaatcctttgaaatgttattgttgcaacgataagaagggaatgtgcaatattttaggtcgtagctagatacaaaattttcgttccgtctagaagattgcgttctaaattacaaattgtctatccagggttgttctccgtttatgtgggaaagatcgtttagtcgtcggttttgtgcggtttatcaggtctcatcgtgtaaacatcgttgtattgcagAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----TN------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTT-TC--CG--T-TT--A-T--CA-GT-T-----T-N--N------N---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--T---G---------T-T-CTA---A---TCG-TGTAT--CA--TG---G-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TACggcgtgtaagtgctatcatgatgcggcgtgaatcactatcctaagtcgtgtcgtgtatcgtgttcttactcgg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-TC--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T--C--------CGT----TNNN----N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTT-TC--CG--T-TT--ATT--CAGGT-T-----TNN--N------N---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---N---------N-N-NNN---N---NNN-NGTGTT-CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT-------------CGT----T-------TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTT-TCGTCG--T-TT--A-T--CAGGT-T-----T-TGGC------G---TTTATC-----C---T---AT--C-GT-ATC-----GG---TCTGA----------C-------TAC--GTG---C-T-TC---G---TG--GCGTGAT--CCTAT------------CTCAAT--CGTG-CGTGTTCG--T---G---------T-T-CTT---ACTCTCG-TGTAT--CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------CGT----T-------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--TTTT-TC--CG----TT--A-T--CAGGT-TTTGCGT-T--T------A---TCATAT-----C---G---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---N---------N-N-NNN---N---NNG-TGTAT--CA--TG---T-CA-A-G--ATAAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTT-TC--CG--T-TA--A-T--CAGGT-T-----T-N--N------N---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---N---------N-N-NNT---A---TCG-TGTATC-CA--TGT--T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--A-A--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---G-----------TT-T--T--------CGT----T-------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTT-TC--CG--T-TT--A-T--CAGGG-G-----T-T--N------N---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---N---------N-N-NNN---G---TTG-T-TAT--CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------A-C--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-TC--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T-----------CGT----T-------T------ATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTT-TC--CGT-T-TT--A-T--CAGGT-T-----T-T--T------G---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NATCG---------T-G-TAT---A---TCG-TGTAT--CA--TGTCAT-AA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------CG-------------T------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GTTT-CC--CG--T-CTTAA-TG-CAGGTGT-----T-T--T------G--------------------------C-GT-GTA-----TC---CATAT----------C-------GTA--ATC---G-T-GC---G---TT--GAATCCT--ATCCT------------TATCGTACCGTCGTGTATTCG--T---G---------G-T-TTT---A---TCG-TGTAT--CA--TG---T-CATA-GAAATAACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-A-T--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-TC--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T--C--------C--------------T------TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTT--TTTT-TT--CG--T-TT--A-T--CAGGT-T-----T-T--G------C---GTTTAT-----C---T---AT----GT-AGT-----GC---GTGTA----------T-------CCT--ATC---G-T-TG---T---CG--TGAATTC--CAATT------------CCTATCGCTGGTTCGTGTATC------G---------TGT-TCT---A---TAG-TGTAT--CA--TGT-----A-A-G-AATAAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----AT---G--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTCC--------CGT----T-------TATC---GTGAGATTGTATTATACAGAGGTTTTTGCGTTTTTCACAAGGCTTCTAGCTCGTGAACCTT--GTTTATC--AGTAT-TT--A-TA-GGGGT-T-----T-C--C------G---TTTAAT-----CAGGT---TT--T-GT-G-C-----GCTATTATTC----------C-------TAT--ATC---G-TATCAGTG---CGTTGTATCCT--TCGTTATGTGCGTGAATCCTATTCCTAATTCGTGTGCG--T---GTAATTCGTTT-T-CTT---C---TCG-TGTAT--CA--TGT--C-CA-A-G-AATAAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------GGT----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTGTACG--T---G---------T-T--CT---A---TCG-TGTATC--A--TGT----CA-A-G-AATAAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                   agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgc--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG--T---TGAT--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TT---G--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-GA--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T-----------CGT----T-------t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-TC--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T---------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NTTT-TC--C-----TT--A-T--CAGGT-T-----T-T--C------N---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNC-CTTCTG---CGTGTTAT--C---G---------TGT-TCT---A---TCG-TGTATatggtgacaaagatcgtatcgtgttttgcgttatatcagattgctatggacgatgactatcgatgtgtgtatacaggttttccgtttatcaggttttgcgttattattcaggtttatatatatcactatcgcttcgtgccctgtatctaatcctagcgtgccgtgctagtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--ATT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-ACAGAATTGT---T--T--CG-TT--CCG-G---TA--TAA-AA--------A-----TTGCGG--C---TT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGTC--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-T--T--------CGC----T-------
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----TNNNNNN-N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT--TTTT-CC--CG--T-TT--A-T--CAGGT-T-----T-gtttatcagtatggtgttatatctggtctgatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttttccgtgatcaggttttgcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--A-T--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------T---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-TCG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--C-CCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA---T---T--CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGTNNNNN-------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT--TTTC-TC--CG--TCTT--A-T--CAGGT-T-----ggtttacgtgaggagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A----T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA-------T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGT----TNN-----N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NTTT-TT--CG--T-TT--A-T--CAGTT-T-----T-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--G-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA---T---T--T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TT---G--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CTT----T-------T------
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ---A---TCG-TGTATC--A--TGT--CACA-A---AATAAC-G-TTG-GC-TGG-TACatcgtgaacatcgttaatcaggttttccgtttattaggttttgcgttattatcccatcattccgtgccgtgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcgtgtatcatgtcacaaaataacgttggctggtactg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttttcaacataaaagaatgtgcagtttttgttgtagtaatacgaatttcattccatctgaattgattacataaattcacaacatttcaatcaggttttccttttatcgtgaacatcgttaatcaggttttccgtttattaggttttgcgttattatcccatcattccgtgccgtgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntag-T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---T--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----TN------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--TTTT-TC--CG----TT--A-T---AGGT-T-----T-T--T------N---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--T---G---------T-A-TAT---AT--TCG-TGTATtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--A-T--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTT---G--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-TCCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T--C--------CGT----T-------T------
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                aTT--TTTT-TC--CG--T-TTT-A-T--TAAGT-T-----T-T--TTTTTTGG---CGCGTTTATCCC---T---AT--C-GT-ATTTCGTGGC---CGTGT----------T-------TATCTATCCGTA-T-TC---GTGGCG--GTGAATT--CCGCTAT----------CCTATCGGTGGCCGGTGTAATCGT---G---------T-TCTAT---A---TCGGTGTATT-CA--TGT--T-CA-ATG-AAAAAC-G-TTG-GC-GGG-ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttatctagtttttttccgttttattaagttttttttttggcgcgtttatccctatcgtatttcgtggccgtgtttatctatccgtattcgtggcggtgaattccgctatcctatcggtggccggtgtaatcgtgttctatatcggtgtattcatgttcaatgaaaaacgttggcgggttac
gi|30                         :                                                                                                                                aaaaaatgtatccggttcatttagttttgattggcaccatacatgtaagcatgcattcctttttcattagaaaatttctttaggatattacgttgttttatgttaaataaaaggatattgaaaaaacgcctttggaaatgtttaattttcaacataaagaatggcaatttttaaagttgtaagtaatacaaaatttcgttccgcgtttcaaattggcttgtttcctaatttaccaactttccttatcaggtttttttccgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttatctag--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--A-T--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA---T---T--T---G-TT------A---TC--T---GA---------------T---G-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-Ttac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA---T---T--A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TT---G--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T--C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TT---G--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-TC--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------CGT----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------CG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--A-TT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA---T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--A-TA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA---AAAAT--G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-TCT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A----T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA---T---G--T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TC---G--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A-------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T--C--------CAT----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacgT--TTTT-TC--CG--T-TT--A-T--CAGG--T-----T-T--T------G---CTTTATC----C---T---AT--C-GC-ATT-----GTG--CGTGT----------A-------TCT--ATC---GAT-TC---G----G--GCGTGAT--CCTAT------------CC--GTTCC----TATGTGCG--T---G---------T-----T---A---TGC-TG-AT--GA--TGT--C----A-G-ATAAAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---GAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-TC------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------tg
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C--CG--T-TT--A-T--CAGGTGT-----TGT--C------G---TTTTAT-----C---C---TATTC-GT-ATC-----GT---GGTGCGTGTATTCAAC-------ATA--ATC---G-TATC---G---TGC-GTTGAAT--CCTAT------------CCTAT---CGTGTCGTGCTAA--TCGTG---------T-T-TCT---A---TCG-TGTATT-CC--TCC--T-CA-A-G-AATAAC-G-TTCGGC-GGGCTACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattattgtgccgtttatcaggtgttgtcgttttatcctattcgtatcgtggtgcgtgtattcaacataatcgtatcgtgcgttgaatcctatcctatcgtgtcgtgctaatcgtgtttctatcgtgtattcctcctcaagaataacgttcggcgggctact
gi|40                         :                                                                      aaatataatcgtcatcctattatgcacatacatgtacatgcatcctatacaaattagaaatctctttttcaaattgtatatttttttttaggatatatacgttgttatgtatatacatgtaaaaggataatttgaacccattgaatgttattttccaacaaaaagataatagcaattttagttgtgaggtaatacaaattatcgttccgtctaaattgaacatattctaaaattttacagcgatttcatcaggttttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaattattgtgAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A----------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------Cga
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cag-T-TCT---A---TCG-TTT-TT-CA--TGT----CA-A-G-AATAAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tgttttgcgttattttgttgtatcctaacgtatcgtgcgggcatcgtg--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----ttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA---T---T--TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TT---G--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-AT-T-T-TC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT--C--------CGatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------gtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agaTTGTATCG---T---G---------T-T--CT---A---TCG-TGT--CACA--TGT--C-AA-A-G-AATAAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tgg-TGTATC--A--TGT----CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T--CGCTNNNNNNNN----N-------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT--CTTT-TC--CG--T-AT--A-TTCTAGGT-T-----A-T--T------G---TCGTTT-----A---T---TT--T-CT-ATA-----TC---TGTTA----------TCGTGCTGTGT--ATCT--A-T-TC---GTATCG--TGACTGTGAAATAT------------CCTATCGCTGCTTGCTTCGTC--T---T---------T-T-CTT---A---TCG-TG--TT-CAGCTG---T-CA-A-G-GATAAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA---T---TG-T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-TC--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T--C--------CGT----TNNNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTT--TTTT-CC--CG--T-TT--A-T--CAGGT-TNN---N-N--N------N---NNNNNN-----N---N---NN--N-NN-NNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---G---------TGT-TCTAGAA---TCG-TGTAT--CA--TG---T-CA-A-G-AATAAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--A-T--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TC--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGT----
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cG-TGTATC-CA--T----T-CA-A-GGAATAAC-G-TT-----GGG-TACgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------A-T--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT--T---T--T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------TANN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NTTT-TCA-CGT-T-TT--A-T--CAAGG-T-----T-T--T------GCGTTTATCC-----C---T---AT--CAGTNNNN-----NN---NNNNN----------N-------NNN--NNN---N-N-NN---N---NN--NNNNNNN--NNNNN------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---G---------T-G-TTT---A---TCG-TGTATC-CA--TGT-----A-A-G-AATAAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|42 ): TTTATCAGATTTATCATTTATCCTATCGTATTGAGTGTATCATATCATGCTTGTATCCTATCCTGTTCGTGCGAATACTGTGTTTTATCATTTATAAAGTCACCAATAATGTCGCGGGCAAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC
Unaligned ( gi|49 ): TATTGTGTGTGTATCGTGCGCTATCGTTTATCATGTCAAGATTTATATCGTAACGTGGCAGGAACTGT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                               22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222      111111111          1111111111111111                  22      11111                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33 1 33 3333 11 333 7777777 44  11 11 555 22 4 444 1 1  222 3 444  888 111 44 22  3  44  44 444  22 333  66666666 33333  111 11 444  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 66 1 2  444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 11 44444444   2222 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  1   666666666 33  444  6666666666666666 222 777   1  1   00  22  99999  1 33 4  1 3333   1 6  77  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... .. . .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  ... ... .. ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....  ... .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . .  ...... ............. ..  ... ..... ... .  . .. ........   .... ............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................  .   ......... ..  ...  ................ ... ...   .  .   ..  ..  .....  . .. .  . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66 1 66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  999 888 77 66  2  11  11 555  66 444  55555555 88888  999 55 999  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 99 1 2  777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 66 33333333   9999 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000  4   444444444 77  888  2222222222222222 666 666   4  4   88  11  77777  6 88 8  6 4444   6 4  66  6   8   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------T------AT------NNGANNGTNNNNTNNNNGGNTTTNTGCGNTTTNNNNNNNNNNNNNGNNNNGNNANCNTT---TT----TT-TC--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--T----------C--GTT--T-TA-T----C----T---A---T---C------G----T---ATC-----G--C---CGTGN----C-T-NT--A---T----C---G-T--T-C-G---TG---GCG--GNA---T----C-C---------------NA---T--CC-TA--NTN--CCGTNT-CG-TGT---N-----C--GT---GT--T--T--C-------T---A---TCG-TG-TAT--CA--TGT--T-CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------T------NT------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT---TT----TT-TC--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--T----------C--GTT--T-TN-T----C----T---A---T---C------G----T---ATC-----G--C---CGTNN----C-T-NT--A---T----C---G-T--T-C-G---CG---GCG--NNN---T----C-C---------------NN---T--CC-TA--NTN--CCGNNT-CG-TGT---N-----C--GT---GT--T--T--C-------T---A---TCG-TG-TATC-CA--TGT--T-CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--T-T--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATT-T---T--T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TT---T--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-TC--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------CGT----T-------T------ATCAG---TGAAAGATCGTTTATCGGGTTTTTTGCGTTTTTTATCAGCGGCTTGCCGTGGAAACATT---CG----TT-T------------T-----TTA-A-T----C-A-AAATTTTG--TT----T--TC---------C--GTT--T-TA-T----T----T---T---T---C------AGGGTT---TTT-----G--G---CGTTA----A-T-CT--AT--T----C---G-TA-T-CTG---CG---GTG--TAT---T----T-C-----------------------CT-TA--ATT--TCGTCT-CG-TG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TT---GT----TT-TC--C---G----T-----TTT-A-TTTTTC-A-G------GGTTT----T--T----------G--GCG--T-TAAT----C----T---A---TT--C------G----T---ATCT----G--C---GGTGTATTTC-C-TT--AATTT----C---G-TC-T-C-G---TGC--ATG--AAA---T----C-C---------------ATATAT--CC-TT--TAA--TCGTTTGCG-TGT---A-----CTCGT---GT--C--C--T-------T---AAA-T-G-TGATAAT-CA--TGT--C-CA-A--GGAA-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-catgaaatccatatatcctttaatcgtttgcgtgtactcgtgtccttaaatgtgataatcatgtccaaggaattaaaaacgttgcaggg
gi|10                         :                                       agaaaaatcgtattcgtcaattagttaatgaattttcaatgtttaaaatttgcattccctttttcaaattagaaatttctttaggaatatacgtgtatgtattataaggatattagaaaaatttttatttaccccttttgtaggggaaatgtttttattttcaaacccataagaagaatggtttggcacatttttaaggttgtagtaatacaaatttttcgttccgggtctaatggtttctttttctaaatttacccacatttttctaatttttttttttttcaggtttttccgtttatcagtgaaagatcgtttatcgggttttttgcgttttttatcagcggcttgccgtggaaacattcgttttttaatcaaaattAG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATA-T--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAAT-T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TT---G--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGTC--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T--C--------CGT----T-------T------ATGTGGGAAAGATCGTTTAGTCGTCGGTTTTGTGCGGTTTATCAGGTCTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGTT-TT--CTCCG----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--TG---------C--GTG--T-TA-T----C----TGTAA---T---C------G----T---ATCGG---G--CG--TGTAA----G-TGCT--A---T----C---A-T--GAT-G---CG---GCGT-GAA---T----CAC---------------TA---T--CC-TA--A-G--TCGTGT-CG-TGTA--T-----C--GT---GT--T--C--T-------T---AC--TCG-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----TN------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TT----TT-TC--C---G----T-----TT--A-T----C-A--------G--TT----T--N----------N--NNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--GT---GT--T--C--T-------A---A---TCG-TG-TAT--CA--TG---G-CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-TC--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T--C--------CGT----TNNN----N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TT----TT-TC--C---G----T-----TT--ATT----C-A-G------G--TT----TN-N----------N--NNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--NN---NN--N--N--N-------N---N---NNN-NG-TGTT-CA--TG---T-CA-A--G-AA-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT-------------CGT----T-------TANNNNNNN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TT----TT-TCGTC---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--TGG--------C--GTT--T-AT-C----C----T---A---T---C------G----T---ATC-----G--G---TCTGA----C-T-AC--G---T----G---C-T--T-C-G---TG---GCG--TGA---T----C-C---------------TA---T--CT-CA--AT----CGTG--CG-TGT---T-----C--GT---GT--T--C--T-------T---ACTCTCG-TG-TAT--CA--TG---T-CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------CGT----T-------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---TT----TT-TC--C---G----------TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--TG---------C--G-T--T-TA-T----CA---T---A---T---C------GNNNNN---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--NN---NN--N--N--N-------N---N---NNG-TG-TAT--CA--TG---T-CA-A--G--A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TT----TT-TC--C---G----T-----TA--A-T----C-A-G------G--TT----T--N----------N--NNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--NN---NN--N--N--N-------T---A---TCG-TG-TATC-CA--TGT--T-CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--A-A--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---G-----------TT-T--T--------CGT----T-------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA-TT----TT-TC--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--GG----T--T----------N--NNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--NN---NN--N--N--N-------N---G---TTG-T--TAT--CA--TG---T-CA-A--G-AA-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------A-C--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-TC--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T-----------CGT----T-------T------AT------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TT----TT-TC--C---GT---T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--T----------T--GNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--NNATCGT--G--T--A-------T---A---TCG-TG-TAT--CA--TGTCAT-AA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------CG-------------T------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---GT----TT-CC--C---G----T-----CTTAA-TG---C-A-G------G--T----------------------GTT--T-TG-----------------------C------G----T-------------------GTAT----C-C-AT--A---T----C---G-TAAT-C-G---T----GCGTTGAA---T----C-C---------------TA---T--CCTTATCGTA--CCGTCG-TG-TAT---T-----C--GT---GG--T--T--T-------T---A---TCG-TG-TAT--CA--TG---T-CATA--GAAA-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-A-T--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-TC--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T--C--------C--------------T------TN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTT---TT----TT-TT--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--TG---------C--G-T--T-TA-T----C----T---A---T----------G----T---AGT-----G--CG--TGTAT----C---CT--A---T----C---G-T--T---G---TC---GTG--AAT---T----C-CA--------------AT---T--CC-TA--TCG--CTGGTT-CG-TGTA--T-----C--GT---G---T--T--C-------T---A---TAG-TG-TAT--CA--TGT-----A-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----AT---G--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTCC--------CGT----T-------TATC---GT------GAGATTGTATTATACAGAGGTTTTTGCGTTTTTCACAAGGCTTCTAGCTCGTGAACCTT---GT----TTATC--A---GTA--T-----TT--A-TA---G-G-G------G--TT----T--C----------C--GTT--T-AA-T----CAGG-T---T---T---T------G----T---G-C-----G--CTATTATTC----C-T-AT--A---T----C---G-TA-T-C-A---GT---GCGTTGTA---T----C-CTTCGTTATGTGCGTGAA---T--CC-TA--TTC--CTAATT-CG-TGT---G-----C--GT---GTAAT--T--CGTTTTCTT---C---TCG-TG-TAT--CA--TGT--C-CA-A--G-AA-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------GGT----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CG-TGT---A-----C--GT---GT--T-----C-------T---A---TCG-TG-TAT--CA--TG---T-CA-A--G-AA-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                    agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtg--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG--T---TGAT--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TT---G--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-GA--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T-----------CGT----T-------t
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atcT----TT-TC--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--TG---------C--GTTA-T-TA-T----T----C---AGGTT---T------A----T---AT--------------ATAT----C-A-CT--A---T----C---GCT--T-C-G---TGC--CCT--GTA---T----C-T---------------AA---T--CC-TA--G-----CGTGC-CG-TGatggtgacaaagatcgtatcgtgttttgcgttatatcagattgctatggacgatgactatcgatgtgtgtatacaggttttccgtttatcaggttttgcgttattattcaggtttatatatatcactatcgcttcgtgccctgtatctaatcctagcgtgccgtgctagtc
gi|22                         :                                                                                                        atcgtatcgtcatctagtttacaccacatacaattaccttattcaatatgaatttcttgtaggattttgcgctgttatgtagtataaggggggtacgatgtacatccttctaatgtttcaattttgaactattaaataatgtgcaattttctgatgttgtgagtgaggatggatcaaagttgatcgttccgtctaacattgcttaaaatttaacattgatattaacgttttcgttatggtgacaaagatcgtatcgtgttttgcgttatatcagattgctatggacgatgactatcgatgtgtgtatacaggAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-TC--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T---------------N------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NT----TT-TC--C--------------TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--T----------C--NNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-C---CTT--CTG----CG-TGTTA-T-----C--GT---G---T--T--C-------T---A---TCG-TG-TATctagtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--ATT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-ACAGAATTGT---T--T--CG-TT--CCG-G---TA--TAA-AA--------A-----TTGCGG--C---TT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGTC--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-T--T--------CGC----T-------
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agaaataagctggaTT---TT----TT-TC--C---G----T-----G---A-T----C-A-G------G--TT----T--T----------gtttatcagtatggtgttatatctggtctgatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttttccgtgatcaggttttgcg
gi|24                         :                                                                      agaaataagctggatatcgtcattagttgtatgcaatgacaggagtacatgtacatgcattcctttatttaatatgtggaaaattcttttagagactatactgctgtatgtatgataaaggaataattggaaacccttgaatgttatttttcaagcataaaagaatgtgcaatttttagttgtagttaatacacagaattgtttcgttccggtataaaaattgcggcttcaaatttacaacatatgtctattgcaaggggtttttcgctgtttatcagtatggtgttatatctggtctgatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----TNNNNNN-N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT---TT----TT-CC--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--A-T--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------T---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-TCG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CG
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--C-CCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA---T---T--CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGTNNNNN-------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT---TT----TC-TC--C---G----TC----TT--A-T----C-A-G------G--TT----ggtttacgtgaggagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A----T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA-------T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGT----TNN-----N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NT----TT-TT--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------T--TT----T--
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--G-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA---T---T--T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TT---G--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CTT----T-------T------AT------
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T----TT-TC--C---G----T-----TT--A-T----T-A-G------G--TT----T--TG---------C--GTT--A-T------------T---A---T---C------C----C---ATC-----ATTC---CGTGC----CGT-GT--A---T----cgtgaacatcgttaatcaggttttccgtttattaggttttgcgttattatcccatcattccgtgccgtgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcgtgtatcatgtcacaaaataacgttggctggtactg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ttttcaacataaaagaatgtgcagtttttgttgtagtaatacgaatttcattccatctgaattgattacataaattcacaacatttcaatcaggttttccttttatcgtgaacatcgttaatcagg---A---TCG-TG-TATC--A--TGT--CACA-A----AA-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TACgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntagatcgtgtatcatgtcacaaaataacgttggctggtactg
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttttcaacataaaagaatgtgcagtttttgttgtagtaatacgaatttcattccatctgaattgattacataaattcacaacatttcaatcaggttttccttttatcgtgaacatcgttaatcaggttttccgtttattaggttttgcgttattatcccatcattccgtgccgtgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntag-T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---T--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----TN------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---TT----TT-TC--C---G----------TT--A-T------A-G------G--TT----T--T----------T--NNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--GT---GT--A--T--A-------T---AT--TCG-TG-TATtg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--A-T--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTT---G--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-TCCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T--C--------CGT----T-------T------TT------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NN----NN-NN--N---NNNGTT-----TT--A-T----C-T-A------G--TT----T--TTTTC------C--GTT--T-TA-T---------T---A-----------------------A---------------GTTT----T-T-TT-----------------T--T-------TG---GCG--CGT---TTATCC-C---------------TA---T--CG-TA--TT--------T-CG-TGG---C-----C--GT---GT--TTAT--C-------T---A---TC--CG-TATT-CG--TG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aTT---TT----TT-TC--C---G----T-----TTT-A-T----T-A-A------G--TT----T--TTTTTTTGGCGC--GTT--TATC-C----C----T---A---T---C------G----T---ATTTCGTGG--C---CGTGT----T-T-ATCTA---T----CCGTA-T--T-C-G---TG---GCG--GTGAATT----C-C---------------GC---TATCC-TA--TCG--GTGGCC-GG-TGT---AAT---C--GT---GT--TC-T--A-------T---A---TCGGTG-TATT-CA--TGT--T-CA-AT-G-AA-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-gcggtgaattccgctatcctatcggtggccggtgtaatcgtgttctatatcggtgtattcatgttcaatgaaaaacgttggcgggttac
gi|30                         :                                                                                                                                aaaaaatgtatccggttcatttagttttgattggcaccatacatgtaagcatgcattcctttttcattagaaaatttctttaggatattacgttgttttatgttaaataaaaggatattgaaaaaacgcctttggaaatgtttaattttcaacataaagaatggcaatttttaaagttgtaagtaatacaaaatttcgttccgcgtttcaaattggcttgtttcctaatttaccaactttccttatcaggtttttttccgtttttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttttatctag--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--A-T--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA---T---T--T---G-TT------A---TC--T---GA---------------T---G-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-Ttac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA---T---T--A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TT---G--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T--C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TT---G--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-TC--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------CGT----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------CG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--A-TT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA---T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--A-TA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA---AAAAT--G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-TCT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A----T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA---T---G--T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TC---G--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A-------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T--C--------CAT----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacgT---TT----TT-TC--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TT----T--T-------------GCT--T-TA-TC---C----T---A---T---C------G----C---ATT-----G--TG--CGTGT----A-T-CT--A---T----C---GAT--T-C-G----G---GCG--TGA---T----C-C---------------TA---T--CC-----GTT--CC-----TA-TGT---G-----C--GT---GT----------------T---A---TGC-TG--AT--GA--TGT--C----A--G-AT-A----AAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---GAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-TC------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NN----NN-NN--N---N----NNNNAATT--A-T----T-GTGCC----G--TT----TA-T----------CAGGTG--T-TG-T----CGTTTT---A---T---CCTATTCG----T---ATC-----G--T---GGTGC----G-T-GT--A---TTCAAC---A-TAAT-C-GTATCGT--GCGTTGAA---T----C-C---------------TA---T--CC-TA--T-----CGTGT-CG-TGCTAAT-----C--GT---GT--T--T--C-------T---A---TCG-TG-TATT-CC--TCC--T-CA-A--G-AA-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A----------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ----T-----TT--A-T----C-A-G------A--TT----TA-T----------C--ATT--T-AT-C----C----T---A---T---C------G----T---AT---------------TGA----G-T-GT--A---T----C---A-TA-T-C-A---TG---CTT--GTA---T----C-C---------------TA---T--CC-TG--TT----CGTG--CG-AAT---A-----CT-GT---GT--T--T----------T---A---TCA-TT-TAT---A--AAG--T-CA-C--C-AA-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------Cac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cag---T--CC-TA--A-----CGTAT-CG-TGC---GGGCATC--GT---GT--T-----C-------T---A---TCG-TT-T-TT-CA--TGT----CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgttttgcgttattttgttgta--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----ttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA---T---T--TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TT---G--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-AT-T-T-TC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT--C--------CGatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata--C---G----T-----TT--A-T----C-A-GC-----GCCTT----T--TG---------C--GTT--A-TA-TTGCCC----T---A---TA--C------G----T---ATC-----G--TAG-CGTAC----C---CT--A---T----C---G-T--T--------------A--TAA---T----T-T---------------ATC--T--CC-TA--ATTAGTCGCGT-GGGTGT---A-----T--GTTG-GT--A--T--C-------T---A---TCG-T--TAT--CA--TG---T-CA-ACGG-AACT----AAC-GTTT--GC-GGG-gtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                   cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatg----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aga-TGT---AT----C--GT---GT--T-----C-------T---A---TCG-TG-T--CACA--TGT--C-AA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tggt-TG-TATC--A--TGT----CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T--CGCTNNNNNNNN----N-------N------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT---CT----TT-TC--C---G----T-----AT--A-TTC--T-A-G------G--TTA---TTGT----------C--GTTTAT-TT-T----C----T---A---TATCT------GT---T---ATCGT---G--C---TGTGT----A-T-CT--AT--T----C---G-TA-T-C-G---TGACTGTG--AAA---T-----------------------A---T--CC-TA--TCG--CTGCTT--G-C-T---T-----C--GT---CT--T--TTCT-------T---A---TCG-TG---TT-CAGCTG---T-CA-A--G-GA-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA---T---TG-T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-TC--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T--C--------CGT----TNNNNNNNN------NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTT---TT----TT-CC--C---G----T-----TT--A-T----C-A-G------G--TTNNNNN--N----------N--NNN--N-NN-N----N----N---N---N---N------N----N---NNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--GT---G---T--T--C-------TAGAA---TCG-TG-TAT--CA--TG---T-CA-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--A-T--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TC--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGT----G-------T------AT------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cG-TG-TATC-CA--T----T-CA-A--GGAA-T----AAC-G-TT-----GGG-TACgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------A-T--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT--T---T--T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T--C--------CGT----T-------TANN---NN------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---NT----TT-TCA-C---GT---T-----TT--A-T----CAA-G------G--TT----T--TG---------C--GTT--TATC-C----C----T---A---T---CA-----G----TNNNNNN-----N--N---NNNNN----N-N-NN--N---N----N---N-N--N-N-N---NN---NNN--NNN---N----N-N---------------NN---N--NN-NN--NNN--NNNNNN-NN-NNN---N-----N--GT---GT--T-------------T---A---TCG-TG-TATC-CA--TGT-----A-A--G-AA-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC
Unaligned ( gi|49 ): TATTGTGTGTGTATCGTGCGCTATCGTTTATCATGTCAAGATTTATATCGTAACGTGGCAGGAACTGT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                                   2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222         11111111                                 2222222222                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33 1 33 3333 11 333 7777777 44  11 11 555 22 4 22 1 222  222 3 444  888 111 44 22  3  44  44 444  22 333  66666666 33333  111 11 444  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 66 1 2  444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 333 44444444 11  2222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1  444  55555555 444 555  1   3333 3333 1 2  22  5555555555  3 55 3 55555555 1 3333   1 6  77  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... .. . .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . .. . ...  ... . ...  ... ... .. ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....  ... .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . .  ...... ............. ..  ... ..... ... .  . ... ........ ..  .... .................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... .  ...  ........ ... ...  .   .... .... . .  ..  ..........  . .. . ........ . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66 1 66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 88 0 888  999 2 333  999 888 77 66  2  11  11 555  66 444  55555555 88888  999 55 999  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 99 1 2  777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 777 33333333 77  7777 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 5  666  22222222 111 666  4   0000 0000 4 9  11  0000000000  1 22 1 66666666 5 3333   5 2  33  5   7   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------T------GN-------G---ATCGTNNNNT----NNNNGGTTT---------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNNNNNNNTG--------NNNNNNNANCNT----------T----------T--------------------T------------------TTTC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-A---------------------T----C----T---A---T-C--G----TATC--G----N-CGT----G----NC----T-NTA---TC-------G-T--T-CG---TG---GCG---GNA---TC--C---TA-TCC-TA--NT--NCCGTGT-C--GT-G---T----------------T-----C-GT---GT--T-T--CT---A---TC-GTG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------T------NN-------G---ANNGTNNNNT----NNNNGGNTT---------------TNT-GCGNTT-TNNNNNNNNNNNNNG--------NNNNGNNANCNT----------T----------T--------------------T------------------TTTC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-A---------------------T----C----T---A---T-C--G----TATC--G----C-CGT----G----NC----T-NTA---TC-------G-T--T-CG---TG---GCG---GNA---TC--C---NA-TCC-TA--NT--NCCGTNT-C--GT-G---T----------------N-----C-GT---GT--T-T--CT---A---TC-GTG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--T-T--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AATT-T---T--T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TT---T--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-TC--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------T------CA-------GTGAAAGATCGTTT----ATCGGGTTT---------------TTT-GCGTTT-TTTATCAGCGGCTTG--------CCGTGGAAACAT----------T----------CGTTTTTTAATCAAAATTTTGT------------------TTTC--CGT---T-TT--ATTTTT--C-AG-GGTTT----T---T----GGCG-T--------TAA---------------------T----C----T---AT--T-C--G----TATCT-G----C-GGT----GTATTTC----C-TTAATTTC-------G-TC-T-CG---TGC--ATG---AAA---TC--CATATA-TCC-TT--TA--ATCGTTTGC--GT-G---TAC--------------T-----C-GT---GT--C-C--TT---A----A-ATG----TGATAA-T-CA--TGT--------CCA-AG-G-A--------A-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATA-T--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT--AGA---TA---C-A---AAAT-T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TT---G--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGTC--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T---C--------C--GT----T-------TA------TGTGGGAAA-------G---ATCGTTTAGT----CGTCGGTTT---------------TGT-GCGGTT-TATCAGGTCTCATCG--------TGTAAACATCGTTGTATTGCAGT----------T--------------------T------------------TCTC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTG-T--------T-A---------------------T----C----TGTAA---T-C--G----TATCG-G----G-CGT----GTAA-GT----G-CTA---TC-------A-T--GATG---CG---GCGT--GAA---TCA-C---TA-TCC-TA--A---GTCGTGT-C--GT-G---TA---------------T-----C-GT---GT--T-C--TT---AC--TC-Gg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TN------NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------T--------------------T------------------TTTC--CG----T-TT--A----T--C-A--G--TT----T---N----NNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-GT---GT--T-C--TA---A---TC-GTG----T----A-T-CA--TG---------GCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-TC--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T---C--------C--GT----TNNN----NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------T--------------------T------------------TTTC--CG----T-TT--AT---T--C-AG-G--TT----TNNNN----NNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-NN---NN--N-N--NN---N---NN-GTG----T------T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT--------------C--GT----T-------TANNNNNNN------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------T--------------------T------------------TTTCGTCG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TGG--CG-T-T--------T-A---------------------TC---C----T---A---T-C--G----TATC--G----G-TCT----G----AC----T-ACG---TG-------C-T--T-CG---TG---GCG---TGA---TC--C---TA-TCT-CA--AT----CGTG--C--GT-G---T----------------T-----C-GT---GT--T-C--TT---ACTCTC-GTG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-G---TA---C-A---AA---T---T--T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--GT----T-------NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------T----------T--------------------T------------------TTTC--CG------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-A---------------------T----CA---T---A---T-C--GNNNNNNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-NN---NN--N-N--NN---N---NN-GTG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G----------A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TG---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------T--------------------T------------------TTTC--CG----T-TA--A----T--C-AG-G--TT----T---N----NNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-NN---NN--N-N--NT---A---TC-GTG----T----A-TCCA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--A-A--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T--T-G---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---G-----------TT-T---T--------C--GT----T-------NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------NCA--------T--------------------T------------------TTTC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--GG----T---T----NNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-NN---NN--N-N--NN---G---TT-GT-----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------A-C--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-TC--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T------------C--GT----T-------TA------T------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------T--------------------T------------------TTTC--CGT---T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----TGNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-NNATCGT--G-T--AT---A---TC-GTG----T----A-T-CA--TGTCA------TAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T--A-A---TA---C-C---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--G-------------TN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------G--------------------T------------------TTCC--CG----T-CTTAA----TG-C-AG-G--T---------------GTT-T--------T-G-----------------------------------------C--G----T-------------GT----A----TC----C-ATA---TC-------G-TAAT-CG---T----GCGTT-GAA---TC--C---TA-TCCTTATCGT--ACCGTCG-T--GT-A---T----------------T-----C-GT---GG--T-T--TT---A---TC-GTG----T----A-T-CA--TG---------TCATA--GAA--------A-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-A-T--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-TC--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T---C--------C---T----T---------------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNTT----------T----------T--------------------T------------------TTTT--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-A---------------------T----C----T---A---T----G----TAGT--G------CGT----G----TA----TCCTA---TC-------G-T--T--G---TC---GTG---AAT---TC--C---AATTCC-TA--TC--GCTGGTT-C--GT-G---TA---------------T-----C-GT---G---T-T--CT---A---TA-GTG----T----A-T-CA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----AT---G--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTC-C--------C--GT----T-------TATCG---T------GA-------G---ATTGTATTAT----ACAGAGGTT---------------TTT-GCGTTT-TTCACAAGGCTTCTA--------GCTCGTGAACCT----------TG---------T--------------------TTATCAGTATTTATAGGGGTTTC--CG----T-TTA-A----T--C-AG-G--TT----T---TGTG-CGCTAT--------T-A---------------------T----TCCTAT---A---T-C--G----TATC--A-------GT----GC---GT----T-GTA---TC-------C-T--T-CGTTATGT--GCGT--GAA---TC--C---TATTCC-TA--AT--T-CGTGTGC--GT-GTAAT----------------T-----C-GT---TT--T-C--TT---C---TC-GTG----T----A-T-CA--TGT--------CCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------G--GT----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T--ATCGTG--C--GT-G---T----------------A-----C-GT---GT--T----CT---A---TC-GTG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                           agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-T--G-AGGATGGATC-A---AAG--T---TGAT--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TT---G--C---TT-A---AAA--T-T-T--A-----A--C-A--T-T-GA--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T---C-----------GT----T--------A------T------GGTGACAAAG---ATCGTATCGT----G-------T---------------TTT-GCGTTA-TATCAGATTGCTATG--------GACGATGACTAT----------CGATGTGTGTATACAGG---------------T------------------TTTC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTTAT--------T-A---------------------T----T----C---AGGTT-T--A----TAT-----------AT----A----TC----A-CTA---TC-------GCT--T-CG---TGC--CCT---GTA---TC--T---AA-TCC-TA--G-----CGTGC-C--GT-G---t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G----A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-TC--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T---------------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------N--------------------T------------------TTTC--C-------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-C---CT--TCTG----C--GT-G---TTA--------------T-----C-GT---G---T-T--CT---A---TC-GTG----T----A-T-ctagtc
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--ATT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT--A-A---TA---C-ACAGAATTGT---T--T--CG-TT--CCG-G---TA--TAA-AA--------A-----TTGCGG--C---TT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGTC--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-TTCGC--------T--GT----T-------TA------T------CA-------GT--ATGGTGTTAT----ATCTGGTCTGATCNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNT----------T----------T--------------------T------------------TTTC--CG------TG--A----T--C-AG-G--TT----T---T----
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-AT--TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TNNNNNN-NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNT----------T----------T--------------------T------------------TTCC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--A-T--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT--A-A---TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------T---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-TCG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T---C--------CGGGT----T-------TA------C------GT-------G---A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--C-CCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T--T-A---TA---C-A---AA---T---T--CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GTNNNNN-------NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNT----------T----------T--------------------T------------------TCTC--CG----TCTT--A----T--C-AG-G--TT----ggagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A----T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA-------T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T---C--------C--GT----TNN-----NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------N--------------------T------------------TTTT--CG----T-TT--A----T--C-AG-T--TT----T---
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--G-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-G---AA---T---T--T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TT---G--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--TT----T-------TA------TC-----GT-------G---AACATCGTTA----ATCAGGTTT---------------TC---CGTTTATTAGGTTTTGCGTTA--------TTATCCCATCAT----------T----------C--------------------C------------------GTGC--CG----T-GT--A----T-----G-N--NN----N---N----NNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NTAG---A----------------T-----C-GT---GT-------------------------------A-T-CA--TG---------TCACA--A-A--------A-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---T--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TN------NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------T--------------------T------------------TTTC--CG------TT--A----T----AG-G--TT----T---T----TNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-GT---GT--A-T--AT---AT--TC-GTG----T----A-T-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--A-T--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T--A-A---TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTT---G--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-TCCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T---C--------C--GT----T-------TT------T------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------N--------------------N------------------NNNN--NNNNGTT-TT--A----T--C-TA-G--TT----T---TTTTCCGTT-T--------T-ATTAAGTTTTTTTTTTGGCGCGT----T----T---A---TCC--C----TATC--GTATTT-CGT----G----GCCGTGT-TTA---TCTATCCGTA-T--T-CG---TG---GCG---GTGAATTCCGC---TA-TCC-TA------TCGGTGG-CCGGT-G---TAA--------------T-----C-GT---GT--TCT--AT---A---TCGGTG----T----ATT-CA--TGT--------TCA-AT-G-A--------A-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--A-T--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T--A-A---TA---CTACT-AA---T---T--T---G-TT------A---TC--T---GA---------------T---G-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-Ttac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTCA-A---TA---A-A---AA---T---T--A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TT---G--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TT--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T---C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TT---G--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-TC--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A-------A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T---C--------C--GT----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T---C--------C--G
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--A-TT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T--A-A---TT---T-A---AA---T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--A-TA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T--G-A---TA---A-A---AA---AAAAT--G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-TCT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A----T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C--G-T---TG---G-A---AA---T---G--T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TC---G--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A-------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T---C--------C--AT----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacg----------T----------T--------------------T------------------TTTC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T-----GCT-T--------T-A---------------------TC---C----T---A---T-C--G----CATT--G----TGCGT----G----TA----T-CTA---TC-------GAT--T-CG----G---GCG---TGA---TC--C---TA-TCC-----GT--TCC-----T--AT-G---T----------------G-----C-GT---GT--------T---A---TG-CTG---------A-T-GA--TGT--------C---A--G-A--------T-A----AAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T--A-A---TA---C-A---AA---T---TA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---GAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-TC------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT--------------------T------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------N--------------------N------------------NNNN--NN----N-NN--N----N--N-NA-A--TT----A---T----TGTG-C--------C-G---------------------T----T----T---A---T-CAGG----TGTT--G----T-CGTTTTAT----CC----T-AT----TC-------G-TA-T-CG---TG---GTGCGTGTA---TT--C---AA--CA-TA--AT----CGTAT-C--GT-G---CGTTGAATCCTATCCTAT-----C-GT---GTCGT-G--CTA--A---TC-GTGTTTCT----A-T-CG--TGTATTCCTCCTCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A----------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----T-TT--A----T--C-AG-A--TT----TA--T----CA-T-T--------T-A---------------------TC---C----T---A---T-C--G----TAT------------T----G----AG----T-GTA---TC-------A-TA-T-CA---TG---CTT---GTA---TC--C---TA-TCC-TG--TT----CGTG--C--GA-A---T----------------A-----CTGT---GT--T-T---T---A---TC-ATT----T----A-T-AA--AG---------TCA-C--C-A--------A-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--ac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagA-TCC-TA--A-----CGTAT-C--GT-G---C----------------GGGCATC-GT---GT--T----CT---A---TC-GTT----T----T-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tgttttgcgttattttgttgt--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTAT-C--GT-G--------------------------C-G-------------CT---A---TC-GTT----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-ATTTATATCG-T----AAC-G-TG--GC-AGG-AACttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tattgtgtgtAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----tgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagc--TT--G--T---A--T-T--A-A---TA---C-AT--AA---T---T--TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TT---G--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-AT-T-T-TC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT---C--------C--G-----G-------TG------T------CA-------GAT-ATCGCGCATTTGAAGATTGACTT---------------TATCGTGTTT-TGCTTCTTAATCAGGTAGTTATCAGATGTGAACA----------------------------------------------------------------TG--CG----T-TT--A----T--C-AGCGCCTT----T---TG---CGTT-A--------T-A---------------------TTGCCC----T---A---TAC--G----TATC--G----T-AGC----GT---AC----C-CTA---TC-------G-T--T--A---TA---AT----TTA---TC---------TCC-TA--ATTAGTCGCGTGG--GT-G---T----------------A-----T-GTTG-GT--A-T--CT---A---TC-GT-----T----A-T-CA--TG---------TCA-ACGG-A--------ACT----AAC-GTTT--GC-GGG-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                agaT-G---T----------------AT----C-GT---GT--T----CT---A---TC-GTG----T----C-A-CA--TGT--------CAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tggtTG----T----A-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT--A-A---TA---C-A---AA---T---TA-T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-TC--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T---CGCTNNNNNN--NN----N-------NN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------T----------C--------------------T------------------TTTC--CG----T-AT--A----TTCT-AG-G--TTA---TTG-T----CGTT-TATTTTCTAT-A---------------------T----C----T---G---T---------TATCGTG----C-TGT----G----TA----T-CTAT--TC-------G-TA-T-CG---TGACTGTG---AAA---T--------A-TCC-TA--TC--GCTG-CT-T--GC-----T----------------T-----C-GT---CT--T-TTCTT---A---TC-GTG----T------T-CAGCTG---------TCA-A--G-G--------A-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCAA-A---TA---C-C---AA---T---TG-T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-TC--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T---C--------C--GT----TNNNNNNNNN------N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNGT----------T----------T--------------------T------------------TTCC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TTNNNNN---N----NNNN-N--------N-N---------------------N----N----N---N---N-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-GT---G---T-T--CTAGAA---TC-GTG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--A-T--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T--A-A---TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-TC--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T---C--------C--GT----G-------TA------T------GC-------G---
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          c-GTG----T----A-T-C---CAT--------TCA-A--GGA--------A-T----AAC-G-TT-----GGG-TACtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------A-T--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T--A-A---TAC--C-A---AAT--T---T--T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-TC--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TANNN---N------NN-------N---NNNNNNNNNN----NNNNNNNNN---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNN----------N----------N--------------------T------------------TTTCA-CGT---T-TT--A----T--CAAG-G--TT----T---TG---CGTT-TATCCC---T-A---------------------T----C----A---G---T-N--N----NNNN--N----N-NNN----N----NN----N-NNN---NN-------N-N--N-NN---NN---NNN---NNN---NN--N---NN-NNN-NN--NN--NNNNNNN-N--NN-N---N----------------N-----N-GT---GT--T-----T---A---TC-GTG----T----A-TCCA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                                   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                 2222222222                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33 1 33 3333 11 333 7777777 44  11 11 555 22 4 444 1 1  222 3 444  888 111 44 22  3  44  44 444  22 333  66666666 33333  111 11 444  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 55 1 2 1 444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 333 44444444 11  2222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 444 777   1  3333 3333 1 2  22  5555555555  3 55 3 55555555 1 3333   1 6  77  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... .. . .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  ... ... .. ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....  ... .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . . . ...... ............. ..  ... ..... ... .  . ... ........ ..  .... ....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... ... ...   .  .... .... . .  ..  ..........  . .. . ........ . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66 1 66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  999 888 77 66  2  11  11 555  66 444  55555555 88888  999 55 999  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 88 1 2 1 777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 777 33333333 77  7777 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111 666   4  0000 0000 4 9  11  0000000000  1 22 1 66666666 5 3333   5 2  33  5   7   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T---------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TATC--G-NCGT----G----TCT-CTA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------T------G-------NG-ATCGTNNNNTNNNNGGTT----T---------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TATC--G-NCGT----G----NCT-NTA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--T-T--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATT-T---T--T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TT---T--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-T-C--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------TCAGTGAA-------AG-ATCGT---TTATCGGGTT----T---------------TTT-GCGTTT-TTTATCAGCGGCTTGCCGTGGAAACAT----------T--CGTTTTTTAATCAAAATTTTGT------------------TT----TC--CGT---T-TT--ATTTTT--C-AG-GGTTT----T---T----GGCG-T--------TAAT----C----T---AT----T-C--G----TATCT-G-CGGT----GTATTTCC-TTAATTTCG---TC-T-CG---TGC--ATG---AAAT---C-CATATA-TCC-TTTA--ATCGT---TTGC-GT-G---TAC--------------TC--------------------GT--GT-------CC--TT---A----AA-TG----TGATAA-T-CA--TGT--------CCA-AG-G-A--------A-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATA-T--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAAT-T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TT---G--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGT-C--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T---C--------C--GT----T-------TA------T------GTGGGAA-AG-ATCGTTTAGTCGTCGGTT----T---------------TGT-GCGGTT-TATCAGGTCTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGT--T--------------------T------------------TC----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTG-T--------T-AT----C----TGTAA-----T-C--G----TATCG-G-GCGT----GTAA-GTG-CTA---TCA---T--GATG---CG---GCGT--GAAT---CAC---TA-TCC-TAA---GTCGT---GT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---AC--TCG-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-A--G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------TC--TA---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------GCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T---C--------C--GT----TNNN----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--AT---T--C-AG-G--TT----TNNNN----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T------T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT--------------C--GT----T-------TANNNNNNN------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TCGTCG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TGG--CG-T-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----TATC--G-GTCT----G----ACT-ACG---TGC---T--T-CG---TG---GCG---TGAT---C-C---TA-TCT-CAAT----CGT---G--C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---ACTCTCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--GT----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----CA---T---A-----T-C--GNNNNNNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G----------A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TA--A----T--C-AG-G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NT---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--A-A--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---G-----------TT-T---T--------C--GT----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NCAT--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--GG----T---T----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---G---TTG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------A-C--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-T-C--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T------------C--GT----T-------TA------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CGT---T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----TGNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---NNNNNA-----------TC--------------------GT--G---------T--AT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGTCA------TAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--G-------------TN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--G--------------------T------------------TT----CC--CG----T-CTTAA----TG-C-AG-G--T---------------GTT-T--------T-G----------------------C--G----T---------GT----A----TCC-ATA---TCG---TAAT-CG---T----GCGTT-GAAT---C-C---TA-TCC-T--T--ATCGTACCGT-C-GT-GTA-T----------------TC--------------------GT--GG-------TT--TT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCATA--GAA--------A-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-A-T--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-T-C--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T---C--------C---T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT----------T--T--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----C----T---A-----T----G----TAGT--G--CGT----G----TATCCTA---TCG---T--T--G---TC---GTG---AATT---C-C---AATTCC-TATC--GCTGG---TT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TAG-TG----T----A-T-CA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----AT---G--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTC-C--------C--GT----T-------TATCG---T------G-------AG-ATTGTATTATACAGAGGT----T---------------TTT-GCGTTT-TTCACAAGGCTTCTAGCTCGTGAACCT----------TG-T--------------------TTATCAGTATTTATAGGGGTT----TC--CG----T-TTA-A----T--C-AG-G--TT----T---TGTG-CGCTAT--------T-AT----TCCTAT---A-----T-C--G----TATC--A-GTGC----G----T-T-GTA---TCC---T--T-CGTTATGT--GCGT--GAAT---C-C---TATTCC-TAAT--T-CGT---GTGC-GT-GTAAT----------------TC--------------------GT--TT-------TC--TT---C---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------CCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------G--GT----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T--ATCGT---G--C-GT-G---T----------------AC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                           agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG--T---TGAT--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TT---G--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-G-A--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T------------C--G-----T-------TA------T------GGTGACAAAG-ATCGTATCGT-----GTT----T-----------------T-GCGTTA-TATCAGATTGCTATGGACGATGACTAT----------CGATGTGTGTATACAGG-------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTTAT--------T-AT----T----C---AGGT--T-T--A----TAT-------AT----A----TCA-CTA---TCGC--T--T-CG---TGC--CCT---GTAT---C-T---AA-TCC-TAG-----CGT---GC-C-GT-G---C----------------TA--------------------GT--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-T-C--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TC--C-------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-C-CT--TCTG-------C-GT-G---TTA--------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-c
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--ATT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-ACAGAATTGT---T--T--CG-TT--CCG-G---TA--TAA-AA--------A-----TTGCGG--C---TT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGT-C--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-TTCGC--------T--GT----T-------TA------T------C-------AGTATGGTGTTATATCTGGTC----TGATCNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TG--A----T--C-AG-G--TT----T---T----
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TNNNNNN-NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--A-T--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------T---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-T-CG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T---C--------CGGGT----T-------TA------C------G-------TG-A
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--C-CCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA---T---T--CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GTNNNNN-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TC----TC--CG----TCTT--A----T--C-AG-G--TT----ggagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A----T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA-------T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T---C--------C--GT----TNN-----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-T--TT----T---
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--G-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA---T---T--T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TT---G--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--TT----T-------TA------TC-----G-------TG-AACATCGTTAATCAGGTT----T---------------TC---CGTTTATTAGGTTTTGCGTTATTATCCCATCAT----------T--C--------------------C------------------GT----GC--CG----T-GT--A----T-----G-N--NN----N---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NTAG---A----------------TC--------------------GT--G-------------------------------T----A-T-CA--TG---------TCACA--A-A--------A-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---T--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T----AG-G--TT----T---T----TNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------AT--AT---AT--TCG-TG----T----A-T-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--A-T--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTT---G--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-T-CCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T---C--------C--GT----T-------TT------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NNNNGTT-TT--A----T--C-TA-G--TT----T---TTTTCCGTT-T--------T-AT---------T---AAGTTTT-T--T----TTTT--G-GCGC----GTTTATCC-CTA---TCGTATT--T-CG---TG---GCC---GTGTTTAT-C---TA-TCCGTATT----CGT---GG-CGGT-GAA-T----------------TCCGCTATCCTATCGGTGGCCGGT--GTAATCGTGTT--CT---ATA-TCGGTG----T----ATT-CA--TGT--------TCA-AT-G-A--------A-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--A-T--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA---T---T--T---G-TT------A---TC--T---GA---------------T---G-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-T-tac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA---T---T--A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TT---G--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T---C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TT---G--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-T-C--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T---C--------C--GT----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T---C--------C--G
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--A-TT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA---T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--A-TA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA---AAAAT--G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-T-CT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A----T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA---T---G--T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TC---G--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T---C--------C--AT----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacg----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T-----GCT-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----CATT--GTGCGT----G----TAT-CTA---TCGA--T--T-CG----G---GCG---TGAT---C-C---TA-TCC---GT--TCC--------T-AT-G---T----------------GC--------------------GT--GT------------T---A---TGC-TG---------A-T-GA--TGT--------C---A--G-A--------T-A----AAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---GAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-T-C------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT--------------------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NN----N-NN--N----N--N-NA-A--TT----A---T----TGTG-C--------C-GT----T----T---A-----T-CAGG----TGTT--G-TCGTTTTAT----CCT-AT----TCG---TA-T-CG---TG---GTGCGTGTAT---T-C----A-ACA-TAAT----CGT---AT-C-GT-G---CGTTGAATCCTATCCTATC--------------------GT--GTCG-----TG--CTA--A---TCG-TGTTTCT----A-T-CG--TGTATTCCTCCTCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A----------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----T-TT--A----T--C-AG-A--TT----TA--T----CATT-T----------AT----CC---T---A-----T-C--G----TATT--G-A-GT----G---------TA---TCA---TA-T-CA---TG---CTT---GTAT---C-C---TA-TCC-TGTT----CGT---G--C-GA-A---T----------------ACT-------------------GT--GT-------TT---T---A---TCA-TT----T----A-T-AA--AG---------TCA-C--C-A--------A-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--ac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cag---TA-TCC-TAA-----CGT---AT-C-GT-G---CGGGCA-----------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TT----T----T-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgttttgcgttattttgttg--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GT---GT---GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GC-------G---CT---A---TCG-TT----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-ATTTATATCG-T----AAC-G-TG--GC-AGG-AACttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----tgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA---T---T--TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TT---G--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-A--T-T-TTC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT---C--------C--GG----TG------TC------A------G-------AT-ATCGCGCATTTGAAGATTGACTT---------------TATCGTGTTT-TGCTTCTTAATCA--GGTAGTTATCAG----------A--T--------------------G------------------TGAACATG--CG----T-TT--A----T--C-AGCGCCTT----T---TG---CGTT-A--------T-ATTGCCC----T---A-----TAC--G----TATC--G-TAGC----GT---ACC-CTA---TCG---T--T--A---TA---AT----TTAT---C--------TCC-TAATTAGTCGC---GTGG-GT-G---T----------------AT--------------------GTTGGT-------AT--CT---A---TCG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-ACGG-A--------ACT----AAC-GTTT--GC-GGG-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 agaT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----C-A-CA--TGT--------CAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tggt-TG----T----A-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T---CGCTNNNNNN--NN----N-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--C--------------------T------------------TT----TC--CG----T-AT--A----TTCT-AG-G--TTA---TTG-T----CGTT-TATTTTCTAT-AT----C----T---G-----T---------TATCGTG-CTGT----G----TAT-CTAT--TCG---TA-T-CG---TGACTGTG---AAA----------TA-TCC-TATC--GCTG-------C-TT-GC--T----------------TC--------------------GT--CT-------TTTCTT---A---TCG-TG----T------T-CAGCTG---------TCA-A--G-G--------A-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA---T---TG-T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-T-C--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T---C--------C--GT----TNNNNNNNNN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TTNNNNN---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--G--------TT--CTAGAA---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--A-T--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T---C--------C--GT----G-------TA------T------G-------CG-
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cG-TG----T----A-T-C---CAT--------TCA-A--GGA--------A-T----AAC-G-TT-----GGG-TACtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------A-T--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT--T---T--T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TANNN---N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TCA-CGT---T-TT--A----T--CAAG-G--TT----T---TG---CGTT-TATCCC---T-AT----C----A---G-----T-N--N----NNNN--N-NNNN----N----NNN-NNN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------T----T---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                                 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111     1111111111111                             2222                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33  33 3333 11 444 7777777 44  11 11 555 22 3 555 1 1  222 3 444  77 111 666 22  3  44  33 555  22 111  66666666 55555   11 666  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 55 1 2 1 444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 11 44444444 11 222 2222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  22 7777777777777 222 777   1   3333 2 2  22  0000  3 55 3 55555555 1 3333   1 6  77  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... ..  .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  .. ... ... ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....   .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . . . ...... ............. ..  ... ..... ... .  . .. ........ .. ... .... .....................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................  .. ............. ... ...   .   .... . .  ..  ....  . .. . ........ . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66  66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  11 888 666 66  2  11  00 555  66 999  55555555 33333   55 888  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 88 1 2 1 777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 66 33333333 77 222 7777 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777  00 7777777777777 666 666   4   0000 9 9  11  0000  1 22 1 66666666 5 3333   5 2  33  5   7   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C--G-GCG---TG----T---CT--C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C----------TA-TCC-T------ANT--NC---CGT---GT-C-GT-G---T--------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TGT----A-T-CA--TGT--TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C--G-NCG---TG----T---CT--C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C----------TA-TCC-T------ANT--NC---CGT---GT-C-GT-G---T--------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TGT----A-T-CA--TGT--TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--TT--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATTT---T---T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TTT--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-T-C--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------TCAGTGAA-------AG-ATCGT---TTATCGGGTT----T------------TTT-GCGTTT-TTTATCAG---CGGCTTGCCGTGGAAACAT----------T--CGTTTTTTAATCAAAATTTTGT------------------TT----TC--CGT---T-TT--ATTTTT--C-AG-GGTTT----T---T----GGCG-T--------TAAT----C----T---AT----T-C--G----TATCTGC--G-GTG---TA----T---TT--CCTTAATTTCG---TC-T-CG---TGC--ATG---AAAT---C-CATA-------TA-TCC-T------TTA--AT---CGT---TTGC-GT-G---TAC------TC--------------------GT--GT-------CC--TT---A----AA-TGTGATAA-T-CA--TGT--CCA-AG-G-A--------A-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATAT--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAATT---T---T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TTG--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGT-C--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------GTGGGAA-AG-ATCGTTTAGTCGTCGGTT----T------------TGT-GCGGTT-TATCAGGT---CTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGT--T--------------------T------------------TC----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTG-T--------T-AT----C----TGTAA-----T-C--G----TAT---CG-G-GCG---TG----TAAGTG--C--TA---TCA---T--GATG---CG---GCGT--GAAT---CAC----------TA-TCC-T------AA---GT---CGT---GT-C-GT-G---TA-------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---AC--TCG-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-A--G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------GT--GT-------TC--TA---A---TCG-TGT----A-T-CA--TG---GCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T--C--------C--G---T----TNNN----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--AT---T--C-AG-G--TT----TNNNN----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TGT------T-CA--TG---TCA-A--G-A--------A-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT-------------C--G---T----T-------TANNNNNNN------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TCGTCG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TGG--CG-T-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----TAT---C--G--------G----T---CTGAC--TA----CGTGCT--T-CG---TG---GCG---TGAT---C-C----------TA-TCT-C------AAT-------CGT---G--C-GT-G---T--------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---ACTCTCG-TGT----A-T-CA--TG---TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----CA---T---A-----T-C--GNNNNNNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TGT----A-T-CA--TG---TCA-A--G----------A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TA--A----T--C-AG-G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------NN--NN-------NN--NT---A---TCG-TGT----A-TCCA--TGT--TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--AA--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---G-----------TT-T--T--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NCAT--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--GG----T---T----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---G---TTG-T-T----A-T-CA--TG---TCA-A--G-A--------A-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------AC--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-T-C--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T-----------C--G---T----T-------TA------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CGT---T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----TGNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---NNNNNA---TC--------------------GT--G---------T--AT---A---TCG-TGT----A-T-CA--TGTCATAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G----------------TN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--G--------------------T------------------TT----CC--CG----T-CTTAA----TG-C-AG-G--T---------------GTT-T--------T-G----------------------C--G----T------------G---TA----T---CC--A--TA---TCG---TAAT-CG---T----GCGTT-GAAT---C-C----------TA-TCC-T--------T--AT---CGTACCGT-C-GT-GTA-T--------TC--------------------GT--GG-------TT--TT---A---TCG-TGT----A-T-CA--TG---TCATA--GAA--------A-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-AT--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-T-C--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T--C--------C------T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNTT----------T--T--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----C----T---A-----T----G----TAG---T--G--CG---TG----T---ATC-C--TA---TCG---T--T--G---TC---GTG---AATT---C-C----------AATTCC-T------ATC--GC---TGG---TT-C-GT-G---TA-------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TAG-TGT----A-T-CA--TGT----A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----ATG--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTCC--------C--G---T----T-------TATCG---T------G-------AG-ATTGTATTATACAGAGGT----T------------TTT-GCGTTT-TTCACAAG---GCTTCTAGCTCGTGAACCT----------TG-T--------------------TTATCAGTATTTATAGGGGTT----TC--CG----T-TTA-A----T--C-AG-G--TT----T---TGTG-CGCTAT--------T-AT----TCCTAT---A-----T-C--G----TAT---C--A-GTG---CG----T----T--G--TA---TCC---T--T-CGTTATGT--GCGT--GAAT---C-C----------TATTCC-T------AAT--T----CGT---GTGC-GT-GTAAT--------TC--------------------GT--TT-------TC--TT---C---TCG-TGT----A-T-CA--TGT--CCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------G--G---T----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T--AT---CGT---G--C-GT-G---T--------AC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TGT----A-T-CA--TG---TCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                           agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG-T---TGA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TTG--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-G-A--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T-----------C--G--------T-------TA------T------GGTGACAAAG-ATCGTATCGT-----GTT----T--------------T-GCGTTA-TATCAGAT---TGCTATGGACGATGACTAT----------CGATGTGTGTATACAGG-------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTTAT--------T-AT----T----C---AGGT--T-T--A----TAT----------A---TA----T---CA--C--TA---TCGC--T--T-CG---TGC--CCT---GTAT---C-T----------AA-TCC-T------AG--------CGT---GC-C-GT-G---C--------TA--------------------GT--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-T-C--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TC--C-------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-C-------CT--TC---TG-------C-GT-G---TTA------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TCG-TGT----A-T-c
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TT--A-------G--TT--G--T---A--G-TT--A-A-TA---C-ACAGAA--T---TGTTT--CG-TT--CC--GG--TA--T---AA--------AAA---TTG--CGGCTT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGT-C--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-T--T--------C--GCTGT----T-------TA------T------C-------AGTATGGTGTTATATCTGGTC----TGATCNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TG--A----T--C-AG-G--TT----T---T----
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TNNNNNN-NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--AT--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------TG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-T-CG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGGG---T----T-------TACG----T------G-------AG-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--CCCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA--T---T---CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---TNNNNN-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TC----TC--CG----TCTT--A----T--C-AG-G--TT----gagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A---T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA------T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----TNN-----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-T--TT----T---
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--GT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA--T---T---T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TTG--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--T---T----T-------TATCG---T------G-------AACATCGT-TAAT--CAGGTT----T------------TC---CGTTTATTAGGTTT---TGCGTTATTATCCCATCAT----------T--C--------------------C------------------GT----GC--CG----T-GT--A----T-----G-N--NN----N---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NTAG---A--------TC--------------------GT--G---------------------------T----A-T-CA--TG---TCACA--A-A--------A-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTT--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T----AG-G--TT----T---T----TNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------GT--GT-------AT--AT---AT--TCG-TGT----A-T-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--AT--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTTG--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-T-CCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T--C--------C--G---T----T-------TT------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NNNNGTT-TT--A----T--C-TA-G--TT----T---TTTTCCGTT-T--------T-AT---------T---AAGTTTT-T--T----TTT---T--G-GCG---CGTTTAT---CC--C--TA---TCGTATT--T-CG---TG---GCC---GTGTTTAT-C----------TA-TCCGT------ATT-------CGT---GG-CGGT-GAA-T--------TCCGCTATCCTATCGGTGGCCGGT--GTAATCGTGTT--CT---ATA-TCGGTGT----ATT-CA--TGT--TCA-AT-G-A--------A-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--AT--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA--T---T---T---G-TT------A---TC--T---GA---------------TG-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-T-tac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA--T---T---A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TTG--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T--C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TTG--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-T-C--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---T----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--ATT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA--T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--ATA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA--AAAAT---G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-T-CT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A---T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA--T---G---T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TCG--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T--C--------C--A---T----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacg----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T-----GCT-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----CAT---T--GTGCG---TG----T---AT--C--TA---TCGA--T--T-CG----G---GCG---TGAT---C-C----------TA-TCC---------GT--TC---C--------T-AT-G---T--------GC--------------------GT--GT------------T---A---TGC-TG-----A-T-GA--TGT--C---A--G-A--------T-A----AAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTGAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-T-C------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T--------------------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NN----N-NN--N----N--N-NA-A--TT----A---T----TGTG-C--------C-GT----T----T---A-----T-CAGG----TGT---T--G-TCGTTTTA----T---C---C--TAT--TCG---TA-T-CG---TG---GTGCGTGTAT---T-CAACATAATCGTA-TCG-TGCGTTGAAT--CCTATCCT---AT-C-GT-G---TCGTGCTAATC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TGT----ATT-CC--TCC--TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A---------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----T-TT--A----T--C-AG-A--TT----TA--T----CATT-T----------AT----CC---T---A-----T-C--G----TAT---T--G-A-G---TG----T---AT--CA-TA---TCA---T--G-CT---TG----------TAT---C-C----------TA-TCC-T------GTT-------CGT---G--C-GA-A---T--------ACT-------------------GT--GT-------TT---T---A---TCA-TTT----A-T-AA--AG---TCA-C--C-A--------A-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--ac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cag----------TA-TCC-T------AA--------CGT---AT-C-GT-G---CGGGCA---TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TTT----T-T-CA--TGT---CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgttttgcgttattttgttg--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GT---GT---GT-G---TA-------TC--------------------GT--GC-------G---CT---A---TCG-TTT----A-T-CA--TG---TCA-A--G-ATTTATATCG-T----AAC-G-TG--GC-AGG-AACttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----tgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA--T---T---TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TTG--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-A--T-T-TTC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT--C--------C--G---G----TG------TC------A------G-------AT-ATCGCGCATTTGAAGATTGACTT------------TATCGTGTTT-TGCTTCTT---AATCA--GGTAGTTATCAG----------A--T--------------------G------------------TGAACATG--CG----T-TT--A----T--C-AGCGCCTT----T---TG---CGTT-A--------T-ATTGCCC----T---A-----TAC--G----TAT---C--G-TAG---CG----TA--CC--C--TA---TCG---T--T--A---TA---AT----TTAT---C---------------TCC-T------AATTAGT---CGC---GTGG-GT-G---T--------AT--------------------GTTGGT-------AT--CT---A---TCG-T-T----A-T-CA--TG---TCA-ACGG-A--------ACT----AAC-GTTT--GC-GGG-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaT-G---TA-------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TGT----C-A-CA--TGT--CAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tggt-TGT----A-T-CA--TGT---CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T--CGCTNNNNNN--N---N----N-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--C--------------------T------------------TT----TC--CG----T-AT--A----TTCT-AG-G--TTA---TTG-T----CGTT-TATTTTCTAT-AT----C----T---G-----T---------TAT---CGTG-CTG---TG----T---AT--C--TAT--TCG---TA-T-CG---TGACTGTG---AAA-----------------TA-TCC-T------ATC--GC---TG-------C-TT-GC--T--------TC--------------------GT--CT-------TTTCTT---A---TCG-TGT------T-CAGCTG---TCA-A--G-G--------A-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA--T---TG--T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-T-C--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T--C--------C--G---T----TNNNNNNNNN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNGT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TTNNNNN---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------GT--G--------TT--CTAGAA---TCG-TGT----A-T-CA--TG---TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--AT--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----G-------TA------T------G-------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          cG-TGT----A-T-C---CAT--TCA-A--GGA--------A-T----AAC-G-TT-----GGG-TACcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------AT--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT-T---T---T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TANNN---N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TCA-CGT---T-TT--A----T--CAAG-G--TT----T---TG---CGTT-TATCCC---T-AT----C----A---G-----T-N--N----NNN---N--N-NNN---NN----N---NN--N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N----------NN-NNN-N------NNN--NN---NNN---NN-N-NN-N---N--------NN--------------------GT--GT-------T----T---A---TCG-TGT----A-TCCA--TGT----A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                         
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                                 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000     222222222222222222222                         2222222222                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33  33 3333 11 444 7777777 44  11 11 555 22 3 555 1 1  222 3 444  77 111 666 22  3  44  33 555  22 111  66666666 55555   11 666  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 55 1 2 1 444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 11 44444444 11 222 2222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999  22 000000000000000000000   1  3333 3333 1 2  22  5555555555  3 55 3 55555555 1 3333   1 4  88  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... ..  .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  .. ... ... ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....   .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . . . ...... ............. ..  ... ..... ... .  . .. ........ .. ... .... .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................  .. .....................   .  .... .... . .  ..  ..........  . .. . ........ . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66  66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  11 888 666 66  2  11  00 555  66 999  55555555 33333   55 888  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 88 1 2 1 777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 66 33333333 77 222 7777 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555  00 333333333333333333333   4  0000 0000 4 9  11  0000000000  1 22 1 66666666 5 3333   5 6  88  5   7   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-G---TG----T---NT-C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-G---TG----T---CT-C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--TT--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATTT---T---T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TTT--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-T-C--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------TCAGTGAA-------AG-ATCGT---TTATCGGGTT----T------------TTT-GCGTTT-TTTATCAG---CGGCTTGCCGTGGAAACAT----------T--CGTTTTTTAATCAAAATTTTGT------------------TT----TC--CGT---T-TT--ATTTTT--C-AG-GGTTT----T---T----GGCG-T--------TAAT----C----T---AT----T-C--G----TATCTGC-G--GT-G---TA----T---TT-CCTTAATTTCG---TC-T-CG---TGC--ATG---AAAT---C-CATATA-TCC-TTTA--ATCGT---TTGC-GT-G---TAC--------------TC--------------------GT--GT-------CC--TT---A----AA-TG----TGATAA-T-CA--TGT--------CCA-AG-G-A--------A-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATAT--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAATT---T---T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TTG--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGT-C--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------GTGGGAA-AG-ATCGTTTAGTCGTCGGTT----T------------TGT-GCGGTT-TATCAGGT---CTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGT--T--------------------T------------------TC----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTG-T--------T-AT----C----TGTAA-----T-C--G----TAT---CGG--GC-G---TG----TAAGTG-C--TA---TCA---T--GATG---CG---GCGT--GAAT---CAC---TA-TCC-TAA---GTCGT---GT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---AC--TCG-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-A--G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------TC--TA---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------GCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T--C--------C--G---T----TNNN----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--AT---T--C-AG-G--TT----TNNNN----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T------T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT-------------C--G---T----T-------TANNNNNNN------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TCGTCG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TGG--CG-T-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GT-C---TG----A---CT-A--CG---TGC---T--T-CG---TG---GCG---TGAT---C-C---TA-TCT-CAAT----CGT---G--C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---ACTCTCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----CA---T---A-----T-C--GNNNNNNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G----------A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TA--A----T--C-AG-G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NT---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--AA--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---G-----------TT-T--T--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NCAT--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--GG----T---T----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---G---TTG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------AC--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-T-C--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T-----------C--G---T----T-------TA------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CGT---T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----TGNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---NNNNNA-----------TC--------------------GT--G---------T--AT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGTCA------TAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G----------------TN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--G--------------------T------------------TT----CC--CG----T-CTTAA----TG-C-AG-G--T---------------GTT-T--------T-------------------------------------------GC-G---TG----T---AT-CCATA---TCG---TAAT-CG---T----GCGTT-GAAT---C-C---TA-TCC-T--T--ATCGTACCGT-C-GT-GTA-T----------------TC--------------------GT--GG-------TT--TT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCATA--GAA--------A-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-AT--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-T-C--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T--C--------C------T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNTT----------T--T--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----C----T---A-----T----G----TA------GT-GC-G---TG----T---ATCC--TA---TCG---T--T--G---TC---GTG---AATT---C-C---AATTCC-TATC--GCTGG---TT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TAG-TG----T----A-T-CA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----ATG--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTCC--------C--G---T----T-------TATCG---T------G-------AG-ATTGTATTATACAGAGGT----T------------TTT-GCGTTT-TTCACAAG---GCTTCTAGCTCGTGAACCT----------TG-T--------------------TTATCAGTATTTATAGGGGTT----TC--CG----T-TTA-A----T--C-AG-G--TT----T---TGTG-CGCTAT--------T-AT----TCCTAT---A-----T-C--G----TAT---C-A--GT-G---CG----T----T-G--TA---TCC---T--T-CGTTATGT--GCGT--GAAT---C-C---TATTCC-TAAT--T-CGT---GTGC-GT-GTAAT----------------TC--------------------GT--TT-------TC--TT---C---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------CCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------G--G---T----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         T--ATCGT---G--C-GT-G---T----------------AC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                           agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG-T---TGA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TTG--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-G-A--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T-----------C--G--------T-------TA------T------GGTGACAAAG-ATCGTATCGT-----GTT----T--------------T-GCGTTA-TATCAGAT---TGCTATGGACGATGACTAT----------CGATGTGTGTATACAGG-------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTTAT--------T-AT----T----C---AGGT--T-T--A----TAT-----------A---TA----T---CA-C--TA---TCGC--T--T-CG---TGC--CCT---GTAT---C-T---AA-TCC-TAG-----CGT---GC-C-GT-G---C----------------TA--------------------GT--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-T-C--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TC--C-------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-C-CT--TCTG-------C-GT-G---TTA--------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-c
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TT--A-------G--TT--G--T---A--G-TT--A-A-TA---C-ACAGAA--T---TGTTT--CG-TT--CC--GG--TA--T---AA--------AAA---TTG--CGGCTT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGT-C--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-T--T--------C--GCTGT----T-------TA------T------C-------AGTATGGTGTTATATCTGGTC----TGATCNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TG--A----T--C-AG-G--TT----T---T----
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TNNNNNN-NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--AT--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------TG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-T-CG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGGG---T----T-------TACG----T------G-------AG-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--CCCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA--T---T---CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---TNNNNN-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TC----TC--CG----TCTT--A----T--C-AG-G--TT----gagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A---T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA------T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----TNN-----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-T--TT----T---
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--GT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA--T---T---T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TTG--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--T---T----T-------TATCG---T------G-------AACATCGT-TAAT--CAGGTT----T------------TC---CGTTTATTAGGTTT---TGCGTTATTATCCCATCAT----------T--C--------------------C------------------GT----GC--CG----T-GT--A----T-----G-N--NN----N---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NTAG---A----------------TC--------------------GT--G-------------------------------T----A-T-CA--TG---------TCACA--A-A--------A-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTT--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T----AG-G--TT----T---T----TNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------AT--AT---AT--TCG-TG----T----A-T-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--AT--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTTG--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-T-CCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T--C--------C--G---T----T-------TT------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NNNNGTT-TT--A----T--C-TA-G--TT----T---TTTTCCGTT-T--------T-AT---------T---AAGTTTT-T--T----TTT---T-G--GC-G---CGTTTAT---CC-C--TA---TCGTATT--T-CG---TG---GCC---GTGTTTAT-C---TA-TCCGTATT----CGT---GG-CGGT-GAA-T----------------TCCGCTATCCTATCGGTGGCCGGT--GTAATCGTGTT--CT---ATA-TCGGTG----T----ATT-CA--TGT--------TCA-AT-G-A--------A-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--AT--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA--T---T---T---G-TT------A---TC--T---GA---------------TG-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-T-tac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA--T---T---A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TTG--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T--C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TTG--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-T-C--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---T----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--ATT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA--T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--ATA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA--AAAAT---G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-T-CT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A---T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA--T---G---T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TCG--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T--C--------C--A---T----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacg----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T-----GCT-T--------T-AT----CC---T---A-----T-C--G----CAT---T-GT-GC-G---TG----T---AT-C--TA---TCGA--T--T-CG----G---GCG---TGAT---C-C---TA-TCC---GT--TCC--------T-AT-G---T----------------GC--------------------GT--GT-------T--------A---TGC-TG---------A-T-GA--TGT--------C---A--G-A--------T-A----AAC-G-TTT-GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTGAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-T-C------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T--------------------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NN----N-NN--N----N--N-NA-A--TT----A---T----TGTG-C--------C-GT----T----T---A-----T-CAGG----TGT---T-G--TC-GTTTTA----T---C--C--TAT--TCG---TA-T-CG---TG---GTGCGTGTAT---T-C----A-ACA-TAAT----CGT---AT-C-GT-G---CGTTGAATCCTATCCTATC--------------------GT--GTCG-----TG--CTA--A---TCG-TGTTTCT----A-T-CG--TGTATTCCTCCTCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A---------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----T-TT--A----T--C-AG-A--TT----TA--T----CATT-T----------AT----CC---T---A-----T-C--G----TAT---T-G--A--G---TG----T---AT-CA-TA---TCA---T--G-CT---TG----------TAT---C-C---TA-TCC-TGTT----CGT---G--C-GA-A---T----------------ACT-------------------GT--GT-------TT---T---A---TCA-TT----T----A-T-AA--AG---------TCA-C--C-A--------A-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--ac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         cag---TA-TCC-TAA-----CGT---AT-C-GT-G---CGGGCA-----------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TT----T----T-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgttttgcgttattttgttg--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GT---GT---GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GC-------G---CT---A---TCG-TT----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-ATTTATATCG-T----AAC-G-TG--GC-AGG-AACttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----tgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA--T---T---TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TTG--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-A--T-T-TTC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT--C--------C--G---G----TG------TC------A------G-------AT-ATCGCGCATTTGAAGATTGACTT------------TATCGTGTTT-TGCTTCTT---AATCA--GGTAGTTATCAG----------A--T--------------------G------------------TGAACATG--CG----T-TT--A----T--C-AGCGCCTT----T---TG---CGTT-A--------T-ATTGCCC----T---A-----TAC--G----TAT---C-GTAGC-G---TA--------CC-C--TA---TCG---T--T--A---TA---AT----TTAT---C--------TCC-TAATTAGTCGC---GTGG-GT-G---T----------------AT--------------------GTTGGT-------AT--CT---A---TCG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-ACGG-A--------ACT----AAC-GTTT--GC-GGG-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       agaT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----C-A-CA--TGT--------CAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tggt-TG----T----A-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T--CGCTNNNNNN--N---N----N-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--C--------------------T------------------TT----TC--CG----T-AT--A----TTCT-AG-G--TTA---TTG-T----CGTT-TATTTTCTAT-AT----C----T---G-----T---------TAT---C-GT-GCTG---TG----T---AT-C--TAT--TCG---TA-T-CG---TGACTGTG---AAA----------TA-TCC-TATC--GCTG-------C-TT-GC--T----------------TC--------------------GT--CT-------TTTCTT---A---TCG-TG----T------T-CAGCTG---------TCA-A--G-G--------A-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA--T---TG--T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-T-C--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T--C--------C--G---T----TNNNNNNNNN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNGT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TTNNNNN---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--G--------TT--CTAGAA---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--AT--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----G-------TA------T------G-------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cG-TG----T----A-T-C---CAT--------TCA-A--GGA--------A-T----AAC-G-TT-----GGG-TACcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------AT--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT-T---T---T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TANNN---N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TCA-CGT---T-TT--A----T--CAAG-G--TT----T---TG---CGTT-TATCCC---T-AT----C----A---G-----T-N--N----NNN---N-N--NN-N---NN----N---NN-N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------T----T---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                                 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000                                 2222222222                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33  33 3333 11 444 7777777 44  11 11 555 22 3 555 1 1  222 3 444  77 111 666 22  3  44  33 555  22 111  66666666 55555   11 666  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 55 1 2 1 444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 11 44444444 11 222 2222 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 444 777   1  3333 3333 1 2  22  5555555555  3 55 3 55555555 1 3333   1 6  77  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... ..  .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  .. ... ... ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....   .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . . . ...... ............. ..  ... ..... ... .  . .. ........ .. ... .... .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... ... ...   .  .... .... . .  ..  ..........  . .. . ........ . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66  66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  11 888 666 66  2  11  00 555  66 999  55555555 33333   55 888  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 88 1 2 1 777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 66 33333333 77 222 7777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 666   4  0000 0000 4 9  11  0000000000  1 22 1 66666666 5 3333   5 2  33  5   7   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--TT--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATTT---T---T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TTT--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-T-C--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------TCAGTGAA-------AG-ATCGT---TTATCGGGTT----T------------TTT-GCGTTT-TTTATCAG---CGGCTTGCCGTGGAAACAT----------T--CGTTTTTTAATCAAAATTTTGT------------------TT----TC--CGT---T-TT--ATTTTT--C-AG-GGTTT----T---T----GGCG-T--------TAAT----C----T---AT----T-C--G----TATCTGC-G--GT-GTAT--TT----CCTTAATTTCG---TC-T-CG---TGC--ATG---AAAT---C-CATATA-TCC-TTTA--ATCGT---TTGC-GT-G---TAC--------------TC--------------------GT--GT-------CC--TT---A----AA-TG----TGATAA-T-CA--TGT--------CCA-AG-G-A--------A-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATAT--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAATT---T---T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TTG--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGT-C--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------GTGGGAA-AG-ATCGTTTAGTCGTCGGTT----T------------TGT-GCGGTT-TATCAGGT---CTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGT--T--------------------T------------------TC----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTG-T--------T-AT----C----TGTAA-----T-C--G----TAT---CGG--GC-GTGTAAGTG---C--TA---TCA---T--GATG---CG---GCGT--GAAT---CAC---TA-TCC-TAA---GTCGT---GT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---AC--TCG-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-A--G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------TC--TA---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------GCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T--C--------C--G---T----TNNN----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--AT---T--C-AG-G--TT----TNNNN----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T------T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT-------------C--G---T----T-------TANNNNNNN------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TCGTCG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TGG--CG-T-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G-----GTCT--GA----C--TA----CGTGCT--T-CG---TG---GCG---TGAT---C-C---TA-TCT-CAAT----CGT---G--C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---ACTCTCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----CA---T---A-----T-C--GNNNNNNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G----------A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TA--A----T--C-AG-G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NT---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--AA--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---G-----------TT-T--T--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NCAT--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--GG----T---T----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---G---TTG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------AC--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-T-C--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T-----------C--G---T----T-------TA------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CGT---T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----TGNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---NNNNNA-----------TC--------------------GT--G---------T--AT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGTCA------TAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G----------------TN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--G--------------------T------------------TT----CC--CG----T-CTTAA----TG-C-AG-G--T---------------GTT-T--------T-------------------------------------------GC-GTGT--AT----CCATA---TCG---TAAT-CG---T----GCGTT-GAAT---C-C---TA-TCC-T--T--ATCGTACCGT-C-GT-GTA-T----------------TC--------------------GT--GG-------TT--TT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCATA--GAA--------A-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-AT--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-T-C--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T--C--------C------T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNTT----------T--T--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----C----T---A-----T----G----TA------GT-GC-GTGT--ATC---C--TA---TCG---T--T--G---TC---GTG---AATT---C-C---AATTCC-TATC--GCTGG---TT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TAG-TG----T----A-T-CA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----ATG--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTCC--------C--G---T----T-------TATCG---T------G-------AG-ATTGTATTATACAGAGGT----T------------TTT-GCGTTT-TTCACAAG---GCTTCTAGCTCGTGAACCT----------TG-T--------------------TTATCAGTATTTATAGGGGTT----TC--CG----T-TTA-A----T--C-AG-G--TT----T---TGTG-CGCTAT--------T-AT----TCCTAT---A-----T-C--G----TAT---C-A--GT-GCGT---T----G--TA---TCC---T--T-CGTTATGT--GCGT--GAAT---C-C---TATTCC-TAAT--T-CGT---GTGC-GT-GTAAT----------------TC--------------------GT--TT-------TC--TT---C---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------CCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------G--G---T----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T--ATCGT---G--C-GT-G---T----------------AC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                           agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG-T---TGA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TTG--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-G-A--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T-----------C--G--------T-------TA------T------GGTGACAAAG-ATCGTATCGT-----GTT----T--------------T-GCGTTA-TATCAGAT---TGCTATGGACGATGACTAT----------CGATGTGTGTATACAGG-------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTTAT--------T-AT----T----C---AGGT--T-T--A----TAT-----------ATAT--CA----C--TA---TCGC--T--T-CG---TGC--CCT---GTAT---C-T---AA-TCC-TAG-----CGT---GC-C-GT-G---C----------------TA--------------------GT--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-T-C--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TC--C-------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-C-CT--TCTG-------C-GT-G---TTA--------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-c
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TT--A-------G--TT--G--T---A--G-TT--A-A-TA---C-ACAGAA--T---TGTTT--CG-TT--CC--GG--TA--T---AA--------AAA---TTG--CGGCTT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGT-C--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-T--T--------C--GCTGT----T-------TA------T------C-------AGTATGGTGTTATATCTGGTC----TGATCNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TG--A----T--C-AG-G--TT----T---T----
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TNNNNNN-NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--AT--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------TG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-T-CG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGGG---T----T-------TACG----T------G-------AG-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--CCCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA--T---T---CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---TNNNNN-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TC----TC--CG----TCTT--A----T--C-AG-G--TT----gagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A---T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA------T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----TNN-----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-T--TT----T---
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--GT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA--T---T---T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TTG--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--T---T----T-------TATCG---T------G-------AACATCGT-TAAT--CAGGTT----T------------TC---CGTTTATTAGGTTT---TGCGTTATTATCCCATCAT----------T--C--------------------C------------------GT----GC--CG----T-GT--A----T-----G-N--NN----N---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NTAG---A----------------TC--------------------GT--G-------------------------------T----A-T-CA--TG---------TCACA--A-A--------A-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTT--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T----AG-G--TT----T---T----TNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------AT--AT---AT--TCG-TG----T----A-T-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--AT--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTTG--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-T-CCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T--C--------C--G---T----T-------TT------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NNNNGTT-TT--A----T--C-TA-G--TT----T---TTTTCCGTT-T--------T-AT---------T---AAGTTTT-T--T----TTT---T-G--GC-GCGT--TTATCCC--TA---TCGTATT--T-CG---TG---GCC---GTGTTTAT-C---TA-TCCGTATT----CGT---GG-CGGT-GAA-T----------------TCCGCTATCCTATCGGTGGCCGGT--GTAATCGTGTT--CT---ATA-TCGGTG----T----ATT-CA--TGT--------TCA-AT-G-A--------A-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--AT--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA--T---T---T---G-TT------A---TC--T---GA---------------TG-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-T-tac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA--T---T---A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TTG--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T--C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TTG--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-T-C--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---T----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--ATT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA--T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--ATA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA--AAAAT---G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-T-CT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A---T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA--T---G---T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TCG--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T--C--------C--A---T----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacg----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T-----GCT-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----CAT---T-GT-GC-GTGT--AT----C--TA---TCGA--T--T-CG----G---GCG---TGAT---C-C---TA-TCC---GT--TCC--------T-AT-G---T----------------GC--------------------GT--GT------------T---A---TGC-TG---------A-T-GA--TGT--------C---A--G-A--------T-A----AAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTGAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-T-C------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T--------------------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NN----N-NN--N----N--N-NA-A--TT----A---T----TGTG-C--------C-GT----T----T---A-----T-CAGG----TGT---T-G--TC-GTTTTATC----C--TAT--TCG---TA-T-CG---TG---GTGCGTGTAT---T-C----A-ACA-TAAT----CGT---AT-C-GT-G---CGTTGAATCCTATCCTATC--------------------GT--GTCG-----TG--CTA--A---TCG-TGTTTCT----A-T-CG--TGTATTCCTCCTCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A---------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----T-TT--A----T--C-AG-A--TT----TA--T----CATT-T----------AT----CC---T---A-----T-C--G----TAT---T-G--A--GTGT--AT----CA-TA---TCA---T--G-CT---TG----------TAT---C-C---TA-TCC-TGTT----CGT---G--C-GA-A---T----------------ACT-------------------GT--GT-------TT---T---A---TCA-TT----T----A-T-AA--AG---------TCA-C--C-A--------A-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--ac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cag---TA-TCC-TAA-----CGT---AT-C-GT-G---CGGGCA-----------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TT----T----T-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgttttgcgttattttgttg--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GT---GT---GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GC-------G---CT---A---TCG-TT----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-ATTTATATCG-T----AAC-G-TG--GC-AGG-AACttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----tgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA--T---T---TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TTG--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-A--T-T-TTC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT--C--------C--G---G----TG------TC------A------G-------AT-ATCGCGCATTTGAAGATTGACTT------------TATCGTGTTT-TGCTTCTT---AATCA--GGTAGTTATCAG----------A--T--------------------G------------------TGAACATG--CG----T-TT--A----T--C-AGCGCCTT----T---TG---CGTT-A--------T-ATTGCCC----T---A-----TAC--G----TAT---C-GTAGC-GTA---CC----C--TA---TCG---T--T--A---TA---AT----TTAT---C--------TCC-TAATTAGTCGC---GTGG-GT-G---T----------------AT--------------------GTTGGT-------AT--CT---A---TCG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-ACGG-A--------ACT----AAC-GTTT--GC-GGG-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----C-A-CA--TGT--------CAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tggt-TG----T----A-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T--CGCTNNNNNN--N---N----N-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--C--------------------T------------------TT----TC--CG----T-AT--A----TTCT-AG-G--TTA---TTG-T----CGTT-TATTTTCTAT-AT----C----T---G-----T---------TAT---C-GT-GCTGTGT--AT----C--TAT--TCG---TA-T-CG---TGACTGTG---AAA----------TA-TCC-TATC--GCTG-------C-TT-GC--T----------------TC--------------------GT--CT-------TTTCTT---A---TCG-TG----T------T-CAGCTG---------TCA-A--G-G--------A-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA--T---TG--T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-T-C--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T--C--------C--G---T----TNNNNNNNNN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNGT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TTNNNNN---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--G--------TT--CTAGAA---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--AT--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----G-------TA------T------G-------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cG-TG----T----A-T-C---CAT--------TCA-A--GGA--------A-T----AAC-G-TT-----GGG-TACcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------AT--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT-T---T---T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TANNN---N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TCA-CGT---T-TT--A----T--CAAG-G--TT----T---TG---CGTT-TATCCC---T-AT----C----A---G-----T-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------T----T---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                       
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                                 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000                                 2222222222                                            
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33  33 3333 11 444 7777777 44  11 11 555 22 3 555 1 1  222 3 444  77 111 666 22  3  44  33 555  22 111  66666666 55555   11 666  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 55 1 2 1 444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 11 44444444 11 222 2222 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 444 777   1  3333 3333 1 2  22  5555555555  3 55 3 55555555 1 3333   1 6  77  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... ..  .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  .. ... ... ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....   .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . . . ...... ............. ..  ... ..... ... .  . .. ........ .. ... .... .......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... ... ...   .  .... .... . .  ..  ..........  . .. . ........ . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66  66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  11 888 666 66  2  11  00 555  66 999  55555555 33333   55 888  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 88 1 2 1 777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 66 33333333 77 222 7777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111 666   4  0000 0000 4 9  11  0000000000  1 22 1 66666666 5 3333   5 2  33  5   7   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--TT--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATTT---T---T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TTT--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-T-C--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------TCAGTGAA-------AG-ATCGT---TTATCGGGTT----T------------TTT-GCGTTT-TTTATCAG---CGGCTTGCCGTGGAAACAT----------T--CGTTTTTTAATCAAAATTTTGT------------------TT----TC--CGT---T-TT--ATTTTT--C-AG-GGTTT----T---T----GGCG-T--------TAAT----C----T---AT----T-C--G----TATCTGC-G--GT-GTAT--TT----CCTTAATTTCG---TC-T-CG---TGC--ATG---AAAT---C-CATATA-TCC-TTTA--ATCGT---TTGC-GT-G---TAC--------------TC--------------------GT--GT-------CC--TT---A----AA-TG----TGATAA-T-CA--TGT--------CCA-AG-G-A--------A-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATAT--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAATT---T---T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TTG--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGT-C--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------GTGGGAA-AG-ATCGTTTAGTCGTCGGTT----T------------TGT-GCGGTT-TATCAGGT---CTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGT--T--------------------T------------------TC----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTG-T--------T-AT----C----TGTAA-----T-C--G----TAT---CGG--GC-GTGTAAGTG---C--TA---TCA---T--GATG---CG---GCGT--GAAT---CAC---TA-TCC-TAA---GTCGT---GT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---AC--TCG-g
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-A--G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------TC--TA---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------GCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T--C--------C--G---T----TNNN----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--AT---T--C-AG-G--TT----TNNNN----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T------T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT-------------C--G---T----T-------TANNNNNNN------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TCGTCG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TGG--CG-T-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G-----GTCT--GA----C--TA----CGTGCT--T-CG---TG---GCG---TGAT---C-C---TA-TCT-CAAT----CGT---G--C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---ACTCTCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----CA---T---A-----T-C--GNNNNNNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NNG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G----------A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TA--A----T--C-AG-G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NT---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--AA--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---G-----------TT-T--T--------C--G---T----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NCAT--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--GG----T---T----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---G---TTG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------AC--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-T-C--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T-----------C--G---T----T-------TA------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CGT---T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----TGNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---NNNNNA-----------TC--------------------GT--G---------T--AT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGTCA------TAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T--C--------C--G----------------TN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--G--------------------T------------------TT----CC--CG----T-CTTAA----TG-C-AG-G--T---------------GTT-T--------T-------------------------------------------GC-GTGT--AT----CCATA---TCG---TAAT-CG---T----GCGTT-GAAT---C-C---TA-TCC-T--T--ATCGTACCGT-C-GT-GTA-T----------------TC--------------------GT--GG-------TT--TT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCATA--GAA--------A-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-AT--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-T-C--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T--C--------C------T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNTT----------T--T--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----C----T---A-----T----G----TA------GT-GC-GTGT--ATC---C--TA---TCG---T--T--G---TC---GTG---AATT---C-C---AATTCC-TATC--GCTGG---TT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TAG-TG----T----A-T-CA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----ATG--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTCC--------C--G---T----T-------TATCG---T------G-------AG-ATTGTATTATACAGAGGT----T------------TTT-GCGTTT-TTCACAAG---GCTTCTAGCTCGTGAACCT----------TG-T--------------------TTATCAGTATTTATAGGGGTT----TC--CG----T-TTA-A----T--C-AG-G--TT----T---TGTG-CGCTAT--------T-AT----TCCTAT---A-----T-C--G----TAT---C-A--GT-GCGT---T----G--TA---TCC---T--T-CGTTATGT--GCGT--GAAT---C-C---TATTCC-TAAT--T-CGT---GTGC-GT-GTAAT----------------TC--------------------GT--TT-------TC--TT---C---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------CCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------G--G---T----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T--ATCGT---G--C-GT-G---T----------------AC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                           agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG-T---TGA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TTG--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-G-A--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T-----------C--G--------T-------TA------T------GGTGACAAAG-ATCGTATCGT-----GTT----T--------------T-GCGTTA-TATCAGAT---TGCTATGGACGATGACTAT----------CGATGTGTGTATACAGG-------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTTAT--------T-AT----T----C---AGGT--T-T--A----TAT-----------ATAT--CA----C--TA---TCGC--T--T-CG---TGC--CCT---GTAT---C-T---AA-TCC-TAG-----CGT---GC-C-GT-G---C----------------TA--------------------GT--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-T-C--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TC--C-------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-C-CT--TCTG-------C-GT-G---TTA--------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-c
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--TT--A-------G--TT--G--T---A--G-TT--A-A-TA---C-ACAGAA--T---TGTTT--CG-TT--CC--GG--TA--T---AA--------AAA---TTG--CGGCTT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGT-C--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-T--T--------C--GCTGT----T-------TA------T------C-------AGTATGGTGTTATATCTGGTC----TGATCNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TG--A----T--C-AG-G--TT----T---T----
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TNNNNNN-NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--AT--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT-T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------TG--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-T-CG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------CGGG---T----T-------TACG----T------G-------AG-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--CCCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA--T---T---CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---TNNNNN-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TC----TC--CG----TCTT--A----T--C-AG-G--TT----gagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A---T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA------T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----TNN-----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-T--TT----T---
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--GT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA--T---T---T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TTG--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--T---T----T-------TATCG---T------G-------AACATCGT-TAAT--CAGGTT----T------------TC---CGTTTATTAGGTTT---TGCGTTATTATCCCATCAT----------T--C--------------------C------------------GT----GC--CG----T-GT--A----T-----G-N--NN----N---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NTAG---A----------------TC--------------------GT--G-------------------------------T----A-T-CA--TG---------TCACA--A-A--------A-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTT--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T----AG-G--TT----T---T----TNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------AT--AT---AT--TCG-TG----T----A-T-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--AT--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA--T---T---T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTTG--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-T-CCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T--C--------C--G---T----T-------TT------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NNNNGTT-TT--A----T--C-TA-G--TT----T---TTTTCCGTT-T--------T-AT---------T---AAGTTTT-T--T----TTT---T-G--GC-GCGT--TTATCCC--TA---TCGTATT--T-CG---TG---GCC---GTGTTTAT-C---TA-TCCGTATT----CGT---GG-CGGT-GAA-T----------------TCCGCTATCCTATCGGTGGCCGGT--GTAATCGTGTT--CT---ATA-TCGGTG----T----ATT-CA--TGT--------TCA-AT-G-A--------A-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--AT--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA--T---T---T---G-TT------A---TC--T---GA---------------TG-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-T-tac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA--T---T---A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TTG--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T--C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TTG--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-T-C--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---T----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T--C--------C--G---
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--ATT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA--T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--ATA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA--AAAAT---G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-T-CT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A---T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA--T---G---T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TCG--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T--C--------C--A---T----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacg----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T-----GCT-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----CAT---T-GT-GC-GTGT--AT----C--TA---TCGA--T--T-CG----G---GCG---TGAT---C-C---TA-TCC---GT--TCC--------T-AT-G---T----------------GC--------------------GT--GT------------T---A---TGC-TG---------A-T-GA--TGT--------C---A--G-A--------T-A----AAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTGAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-T-C------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T--------------------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NN----N-NN--N----N--N-NA-A--TT----A---T----TGTG-C--------C-GT----T----T---A-----T-CAGG----TGT---T-G--TC-GTTTTATC----C--TAT--TCG---TA-T-CG---TG---GTGCGTGTAT---T-C----A-ACA-TAAT----CGT---AT-C-GT-G---CGTTGAATCCTATCCTATC--------------------GT--GTCG-----TG--CTA--A---TCG-TGTTTCT----A-T-CG--TGTATTCCTCCTCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A---------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----T-TT--A----T--C-AG-A--TT----TA--T----CATT-T----------AT----CC---T---A-----T-C--G----TAT---T-G--A--GTGT--AT----CA-TA---TCA---T--G-CT---TG----------TAT---C-C---TA-TCC-TGTT----CGT---G--C-GA-A---T----------------ACT-------------------GT--GT-------TT---T---A---TCA-TT----T----A-T-AA--AG---------TCA-C--C-A--------A-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--ac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    cag---TA-TCC-TAA-----CGT---AT-C-GT-G---CGGGCA-----------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TT----T----T-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgttttgcgttattttgttg--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GT---GT---GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GC-------G---CT---A---TCG-TT----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-ATTTATATCG-T----AAC-G-TG--GC-AGG-AACttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----tgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA--T---T---TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TTG--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-A--T-T-TTC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT--C--------C--G---G----TG------TC------A------G-------AT-ATCGCGCATTTGAAGATTGACTT------------TATCGTGTTT-TGCTTCTT---AATCA--GGTAGTTATCAG----------A--T--------------------G------------------TGAACATG--CG----T-TT--A----T--C-AGCGCCTT----T---TG---CGTT-A--------T-ATTGCCC----T---A-----TAC--G----TAT---C-GTAGC-GTA---CC----C--TA---TCG---T--T--A---TA---AT----TTAT---C--------TCC-TAATTAGTCGC---GTGG-GT-G---T----------------AT--------------------GTTGGT-------AT--CT---A---TCG-T-----T----A-T-CA--TG---------TCA-ACGG-A--------ACT----AAC-GTTT--GC-GGG-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  agaT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TCG-TG----T----C-A-CA--TGT--------CAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tggt-TG----T----A-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA--T---TA--T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T--CGCTNNNNNN--N---N----N-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--C--------------------T------------------TT----TC--CG----T-AT--A----TTCT-AG-G--TTA---TTG-T----CGTT-TATTTTCTAT-AT----C----T---G-----T---------TAT---C-GT-GCTGTGT--AT----C--TAT--TCG---TA-T-CG---TGACTGTG---AAA----------TA-TCC-TATC--GCTG-------C-TT-GC--T----------------TC--------------------GT--CT-------TTTCTT---A---TCG-TG----T------T-CAGCTG---------TCA-A--G-G--------A-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA--T---TG--T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-T-C--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T--C--------C--G---T----TNNNNNNNNN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNGT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TTNNNNN---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--G--------TT--CTAGAA---TCG-TG----T----A-T-CA--TG---------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--AT--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T--C--------C--G---T----G-------TA------T------G-------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cG-TG----T----A-T-C---CAT--------TCA-A--GGA--------A-T----AAC-G-TT-----GGG-TACcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------AT--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT-T---T---T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TANNN---N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNN---NNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TCA-CGT---T-TT--A----T--CAAG-G--TT----T---TG---CGTT-TATCCC---T-AT----C----A---G-----T-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------T----T---A---TCG-TG----T----A-TCCA--TGT----------A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    T  T  AT  T GAG TCAA TTG C G CA GCAT CC T AG   TTG A TG AGGG C ATGA C CTGTACATGCATTCCTTTCAAAT  A T C GTA  GGTA AG CA A       TACATG   ATG ATGTAT T TCCGCT .     AT    T AA ATG  A A  TTT TTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT G C GC T  TTTTTTTTTTTTTTTTTTT    TTTTTT  TCATT   GTTAA G   TA CGTA ATTTAA TTT TT AAA TA TTT  GAGG  G CGCT  ACATGT      TGTAA G AT CA GG  AT GA GTGA TAA TAA G AAACG         A  GG GTC CTTTG     GA G ACA TAGAA T   A TCA T TA G  TTTTTTTCCCCC A CAG G   G CTT AA  AC G AGG  CCCACT G AGT T   T GC  ACTT AT  CA ATTG GC CTG TGTTGTT GA  GG TA CAA AG C GAG G T  GAT A CAG  AT AAA GTT AG  T  TC  CG CGT  AA AGA  AATTATGC TTGGC   AA GGC  A G A   AT A C TA C A G GG A T  A G T TGAC   G             TG  AGG CCACT TTT A  A TC GCTNNNNN GG CTG NNNN TTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTTATCTAGTTTTTTTCCGTTTTATTAAGTTTTTTTTTTGGCGCGTTTATCCCTATCGTATTTCGTGGCCGTGTTTATCTATCCGTATTCGTGGCGGTGAATTCCGCTATCCTATCGGTGGCCGGTGTAATCGTGTTC                                                                                                                                                                                                                       AGA CTC   G  TTTC .    T C  GC  TATTCCTCCT  T CG A TTTATATC C .      A T  AG  G   C
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  C   . AAT AG   CG  . T C  GA   C  . GC   GT  G T  .    . GTT  G GGAG                     . . C .    T    G  T  .       TG       TT  TACCGA A G      .     G     T A  .    T A  .   TCTCTTTTTCAAATTGTATATT    . C AT .  TTTTTTTTTTTTTTTTTT     T       CC      T     G   TA C    C      AA  .  G   GT TC   AAAG  T AAT   TGGCGC      .     A .  .  G   C  A  .    T   .   . A             A  CA GTT TG        T  . T   .     G   . TA  . .  A  GTTCA        C .   A   T .   A   T  . .    GCAC   . .   .   . .   T    G   T  A    .  TAA G       T   .  .  G   C  T TC  . .  C   A CT   T  .   GA  T   C  TT  .  TT   T  .    C        AA      .  ATA  . A A   .  . A C  . A . C  G T  . G . CTT    .             CA  G   GGTT  T   .  . .  .        .  .   .    TATCGTGAGATTGTATTATACAGAGGTTTTTGCGTTTTTCACAAGGCTTCTAGCTCGTGAACCTTGTTTATCAGTATTTATAGGGGTTTCCGTTTAATCAGGTTTTGTGCGCTATTATTCCTATATCGTATCAGTGCGTTGTATCCTTCGTTATGTGCGTGAATCCTATTCCTAATTCGTGTGCGTGTAATTCGTTTTCT                                                                                                                                                                                                                                   A   TA    .  .    .    . C  .   TCAT        C T  G .        . .      . T  CG  .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . A   G    T   . . C  G    C  . G    T   . T  .    . A    . A                        . . G .    G    A  .  .       GT       .   A      . A      .     .     T .  .    . .  .   TTTTTATG                  . . .  .  TTAG                   .       .       .     T   A  T    T      T   .  A   G  .    ACG   G .     AGTTTT      .     A .  .  .   A  .  .    G   .   . .             G  .  TG  TA        C  . .   .     .   . TA  . .  .  GGG          . .   A   . .   .   .  . .    TTTA   . .   .   . .   .    G   A  .    .  T   T       T   .  .  G   .  T CA  . .  .   T T    G  .   A   .   C  C   .  G    .  .    .        A       .  G    . T .   .  . . C  . A . .  . C  . . . TA     .             C   .   C     T   .  . .  .        .  .   .    TATGTGGGAAAGATCGTTTAGTCGTCGGTTTTGTGCGGTTTATCAGGTCTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGTTTTCTCCGTTTATCAGGTTTTGCGTGTTATCTGTAATCGTATCGGGCGTGTAAGTGCTATCATGATGCGGCGTGAATCACTATCCTAAGTCGTGTCGTGTATCGTGTTCT                                                                                                                                                                                                                                               .   C     .  .    .    . .  .   TT          . .  . .        . .      . T  G   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . C    . .                        . . . .    .    T  .  .       T        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   TAT                       . . .  .  TCT                    .       .       .     .   .  .    A      .   .  .   A  .    TA    . .     CATGT       .     G .  .  .   A  .  .    .   .   . .             .  .  A   A         T  . .   .     .   . .   . .  .  G            . .   .   . .   .   .  . .    TA     . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       A   .  .  A   .  . T   . .  .   . .    T  .   A   .   .  .   .  C    .  .    .        .       .  .    . G .   .  . . G  . . . .  . T  . . . GT     .             A   .   T     A   .  . .  .        .  .   .    TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATTATTGTGCCGTTTATCAGGTGTTGTCGTTTTATCCTATTCGTATCGTGGTGCGTGTATTCAACATAATCGTATCGTGCGTTGAATCCTATCCTATCGTGTCGTGC                                                                                                                                                                                                                                                    .   T     .  .    .    . .  .   TC          . .  . .        . .      . T  G   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       A        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   ATT                       . . .  .  TGA                    .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     CATGT       .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  T            . .   .   . .   .   .  . .    T      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  A   .  . .   . .  .   . .    T  .   G   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . TT     .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    GTCAGATATCGCGCATTTGAAGATTGACTTTATCGTGTTTTGCTTCTTAATCAGGTAGTTATCAGATGTGAACATGCGTTTATCAGCGCCTTTTGCGTTATATTGCCCTATACGTATCGTAGCGTACCCTATCGTTATAATTTATCTCCTAATTAGTCGCGTGGGTGTATGTTGGTATC                                                                                                                                                                                                                                                        .   .     .  .    .    . .  .   TT          . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  GT                     .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     CATT        .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTTTCCGTATATTCTAGGTTATTGTCGTTTATTTTCTATATCTGTTATCGTGCTGTGTATCTATTCGTATCGTGACTGTGAAATATCCTATCGCTGCTTGCTTCGTCTTTTCT                                                                                                                                                                                                                                                           .   .     .  .    .    . .  .   TC          . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  TC                     .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     TA          .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTTTTCCCGTTTATCAGGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                .   .     .  .    .    . .  .   TC          . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  TA                     .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     TA          .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTCACGTTTTATCAAGGTTTTGCGTTTATCCCTATCAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                .   .     .  .    .    . .  .   TT          . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  TA                     .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     G           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCCGTTTATTCAGGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN                                                                                                                                                                                                                                                                   .   .     .  .    .    . .  .   G           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TG    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    TANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCGTCGTTTATCAGGTTTTGGCGTTTATCCTATCGTATCGGTCTGACTACGTGCTTCGTGGCGTGATCCTATCTCAATCGTGCGTGTTCGTGTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                   .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTATCAGGTTTTGCGTTTATCATATCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN                                                                                                                                                                                                                                                                      .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  A                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TT    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    TATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCCGTTTTATCAGGTTTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCGTGTA                                                                                                                                                                                                                                                                      .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . A    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATTTTTCCGTTTATCAGGGGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN                                                                                                                                                                                                                                                                        .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCCGTTTATCAGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCCGTTAATCAGGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTCCGTTATAGGTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTATA                                                                                                                                                                                                                                                                           .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTTTTCGTTTATCAGGTTTTGCGTTTATCTATGTAGTGCGTGTATCCTATCGTTGTCGTGAATTCCAATTCCTATCGCTGGTTCGTGTATCGTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                             .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    GA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    TATCGTGAACATCGTTAATCAGGTTTTCCGTTTATTAGGTTTTGCGTTATTATCCCATCATTCCGTGCCGTGTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGATCGTG                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTTTCCCGTCTTAATGCAGGTGTTTTGCGTGTATCCATATCGTAATCGTGCGTTGAATCCTATCCTTATCGTACCGTCGTGTATTCGTGGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .    NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTCCTTATCAGGTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTTCTGCGTGTTATCGTGTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                 .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . A      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    GC    . .     C           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . A    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    CA    . .     C           .     C .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .     .  .    .    . .  .   T           . .  . .        . .      . .  .   .    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . A      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .   .     .  .    .    . .                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . A    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .    .    . .                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     T .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .                                                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . G    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    TA    . .     T           .     T .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . .    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    T     . .     T           .     A .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . T      .             .   .   .     .   .  . .  .        .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . .    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    T     . .     T           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . .      .             .   .   .     .   .  . .  .        .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  .   . .   .    .   . . .  .    .  . .    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    A     . .     A           .     T .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . .      .             .   .   .     .   .  . .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   . .   .    .   . . .  .    .  . .    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  A                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    T     . .     .           .     G .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . .      .             .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              . .   .    .   . . .  .    .  . .    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    .     . .     .           .     . .  .  .   .  .  .    .   .   . .             .  .  .   .         .  . .   .     .   . .   . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .   . . .  .    .  . .    .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  A                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    .     . .     .           .     . .  .  .   .  .  .    .   .   . .                                                          . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .   .   .   .  .   .  .    .  .    .        .       .  .    . . .   .  . . .  . . . .  . .  . . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   .   . .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    .     . .     .           .     . .  .  .   .  .  .    .   .                                                                . .  .  .            . .   .   . .   .   .  . .    .      . .   .   . .   .    .   .  .    .  .   .       .   .  .  .   .  . .   . .  .   . .    .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .  .   .                         . . .  .  T                      .       .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    .     . .     .                   .  .  .   .  .  .                                                                                                                                                                                   .   .  .  .   .  . .   . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .    . .    . .                        . . . .    .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .                                                                         .       .     .   .  .    .      .   .  .   .  .    .     . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .    .  .  .       .        .   .      . .      .     .     . .  .    . .                                                                         .       .     .   .  .    .      .   .  .           .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          **        ****            ****                                                                                 *****                                **            **                                                                                  *****                                                                                                 ****           *************           *********                ***                                  ***           **                     ***   ***                         *******                                        **                    **              ********            ***                               **              *************               ***                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ****          T*********    **              ****
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT--------TCA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--AT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA--T---T---T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TTG--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T--C--------C--G---T----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNN---NNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TCG-TG----T----A-T-CA--TGT---------CA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          11111111111111111111111                                                                                            2222222222222222222222222           1111111111111111111111                                                                           11111111111                                                                111111111                                  111111111111                               111111                                                                                                                                                                                                                                                                   0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000                                                                                        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    1  1  33  1 555 6666 444 1 2 33 5555 33 1 111  444 3 33 2222 1 5555 2 22222222222222222222222  1 1 4 111  4444 44 22 33333 1 777777 1 333 666666 2 444444 11  1 22  1 2 33 111  2 2  111 6666666666666666666666666 1 2 22 1  6666666666666666666666 444444  44444 1 33333 2 1 33 4444 555555 444 11 333 44 333  55555 3 3333  33333333333 22222 3 11 11 22  44 22 3333 333 111 1 9999999999999 3  33 666 111111111 44 1 333 22222 444 1 555 1 11 2  222222222222 2 111 555 2 111 22  33 1 111  000000 1 111 222 1 333 3333 33 1 33 3333 11 333 7777777 44  11 11 555 22 4 444 1 1  222 3 444  888 111 44 22  3  44  44 444  22 333  66666666 33333  111 11 444  1 4 2   11 1 2 44 2 3 1 22 2 55 1 2 1 444444 7777777777777 55  333 77777 666 1  1 333 44444444 11  2222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 555  1   3333 3333 1 2 1 22  999999999 1 666 3 33 3 55555555 1 3333   1 6  77  1   1   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .  ..  . ... .... ... . . .. .... .. . ...  ... . .. .... . .... . .......................  . . . ...  .... .. .. ..... . ...... . ... ...... . ...... ..  . ..  . . .. ...  . .  ... ......................... . . .. .  ...................... ......  ..... . ..... . . .. .... ...... ... .. ... .. ...  ..... . ....  ........... ..... . .. .. ..  .. .. .... ... ... . ............. .  .. ... ......... .. . ... ..... ... . ... . .. .  ............ . ... ... . ... ..  .. . ...  ...... . ... ... . ... .... .. . .. .... .. ... ....... ..  .. .. ... .. . ... . .  ... . ...  ... ... .. ..  .  ..  .. ...  .. ...  ........ .....  ... .. ...  . . .   .. . . .. . . . .. . .. . . . ...... ............. ..  ... ..... ... .  . ... ........ ..  .... .............................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................. ...  .   .... .... . . . ..  ......... . ... . .. . ........ . ....   . .  ..  .   .   
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2  2  99  1 000 1111 555 1 2 66 9999 66 1 555  333 2 44 1111 0 9999 0 44444444444444444444444  0 0 0 888  0000 33 33 44444 0 444444 0 000 666666 0 888888 33  0 33  0 9 33 777  0 0  888 7777777777777777777777777 0 1 88 0  5555555555555555555555 000000  88888 0 44444 9 0 77 0000 777777 000 33 777 88 111  66666 0 9999  77777777777 66666 3 44 44 44  55 44 2222 999 888 1 7777777777777 3  11 555 444444444 99 1 111 88888 222 1 000 1 44 1  000000000000 1 888 000 1 888 55  66 1 888  000000 1 888 999 1 333 3333 66 1 66 3333 44 777 0000000 55  44 44 999 44 1 666 0 0  999 2 333  999 888 77 66  2  11  11 555  66 444  55555555 88888  999 55 999  1 3 2   55 1 2 77 2 2 1 66 2 88 1 2 1 777777 4444444444444 44  222 88888 888 2  2 777 33333333 77  7777 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 666  4   0000 0000 4 9 5 11  222222222 5 333 1 77 1 66666666 5 3333   5 2  33  5   7   
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T---------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
Reference ( family-1267 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------T------G-------AG-ATCGTNTNNTNNNNGGTT----T---------------TNT-GCGTTT-TNNNNNNNNNNNNTGNNNNNNNANCNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CGTT-T--------T-AT----C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G--GC-GTGT--NT----C--TA---TCG---T--T-CG---TG---GCG---GNAT---C-C---TA-TCC-TANT--NCCGT---GT-C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TT--CT---A---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-ATC-GT-A---TT---C---G-T-C--AA---T--T-A-G-TT---AAT--G----A-A----T-T-----------------------TT-C-AAT---GT----T--T--AAAATTT-G------C-A---T------T-C------CCTTT-T--TC-A-AA-T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GGA----A-T-----A-T-A--C----G------T---G------T--A---TG-TA--T------TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--TA---G---A---A-AAATTTTTATTTACC-CC--T---TTTGTAGGGGA--A-A---T-----GTTTT-T---A-T--T-TT------------C-A---AACCC-A---T--AAG-A-A---GA------A-T---GGTTT-GGCAC----A--T-T--T----T--T---AAG-----G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AATT-T---T--T--CG-TT--CCGGG---TC--T---AATG------G-----TT---T--CTTTTT-C-T-AAA--T-T-T--ACC-C-A--C-ATTT-T-T-C--T---AATTTTTTTTTTTTT--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--GT----T-------TA------TCAGTGAA-------AG-ATCGT---TTATCGGGTT----T---------------TTT-GCGTTT-TTTATCAGCGGCTTGCCGTGGAAACAT----------T--CGTTTTTTAATCAAAATTTTGT------------------TT----TC--CGT---T-TT--ATTTTT--C-AG-GGTTT----T---T----GGCG-T--------TAAT----C----T---AT----T-C--G----TATCTGC-G--GT-GTAT--TT----CCTTAATTTCG---TC-T-CG---TGC--ATG---AAAT---C-CATATA-TCC-TTTA--ATCGT---TTGC-GT-G---TAC--------------TC--------------------GT--GT-------CC--TT---A----A-ATG----TGATAA-T-C-A--TG---------T-CCA-A-G--G-A--------A-TTAAAAAC-G-TT--GC-AGG-
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AG-AA-AT--G--A---T----C---G-T-C--AGA--T--T-A-G-T----A-T--GAGGGC-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----AG-C--A-----T-GTG----C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--G---TA-G-AA---A-------------------------TGT-TGCT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--TG--T--A---TG-TA--TGA----TA-----G-----A-----AGGATG--A--T---T--C----G---A---A-A-------------T-CC--T---TTG-------A--A-A---T-----G---T-T---A-T--TGTTG-----------C-A---A---CGA---T--AA--G-AAGGGA------A-T---G---T-G---C----AATA-T--T----T--T---AG------G--TC--G--T---A--GCT---AGA-TA---C-A---AAAT-T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--TAGAAG--------A-----TT---G--CG--TT-C-T-AAA----T-T--A-C-A-A----A--T-TGT-C--T---A-------------TC-CA---GGGTT-G---T-TC-T---C--------C--GT----T-------TA------T------GTGGGAA-AG-ATCGTTTAGTCGTCGGTT----T---------------TGT-GCGGTT-TATCAGGTCTCATCGTGTAAACATCGTTGTATTGCAGT--T--------------------T------------------TC----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTG-T--------T-AT----C----TGTAA-----T-C--G----TAT---CGG--GC-GTGTAAGTG---C--TA---TCA---T--GATG---CG---GCGT--GAAT---CAC---TA-TCC-TAA---GTCGT---GT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---AC--TC-Gg
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GTACATGC-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--TG--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-A--G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------TC--TA---A---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------G-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A---TA---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT-------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---T-------------------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TAACATGT-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AT--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--A---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CGTTT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-T-T--A-C-A-A--CAA--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---T-----G---G-TT-T---C--------C--GT----TNNN----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--AT---T--C-AG-G--TT----TNNNN----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NN-GTG----T------T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC---TTAGGC-GGtg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---C------T-CG-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------A---G------GA-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----T------T-----A-----AGG-----A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A-------C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT---C--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T--AA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------TA-CG---A-----G---T-TT--------------C--GT----T-------TANNNNNNN------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TCGTCG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TGG--CG-T-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----TAT---C-G-----GTCT--GA----C--TA----CGTGCT--T-CG---TG---GCG---TGAT---C-C---TA-TCT-CAAT----CGT---G--C-GT-G---T----------------TC--------------------GT--GT-------TC--TT---ACTCTC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-ta
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AATAT--GT-----T----C---G-T-TCAA----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TAAG-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------TCT-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A-----------------A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TC------------------A---C-A---T--AA--A-----GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CGCTT--CC--G---TC--T---AA--------AA----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--GT----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----CA---T---A-----T-C--GNNNNNNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---N---NN-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G----------A-T----AAC-G-TT--GC--GG-TAC
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----T-----A-----AGG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A-----A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TG---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TA--A----T--C-AG-G--TT----T---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NT---A---TC-GTG----T----A-TCC-A--TGT--------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TACt
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-ACT---GT----A-----A-----T-G------C-A---T------TTC------C--TT-T--TCCA-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-G-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------T---G--T---TG-A---T--TG--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-T---G---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----C--A-A--T----T--T---A-------G--TT--G--T---AC-G-T---T-G-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GTT-TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---G-----------TT-T---T--------C--GT----T-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------NCAT--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--GG----T---T----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------NN--NN-------NN--NN---G---TT-GT-----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-T-TT--GC-GG
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GTTA---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT-----T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--T--A-----T-G------C-A---T------C-C----------T-T--TC-A-AAAT---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---A--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AGG--C--A---A--T--T----T---G---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--------------------------------------------A-C--T----T--T---A-------G--TT--G--TG--A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTCCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-C-AGA--C-A--T-T-T-C--TA--A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T------------C--GT----T-------TA------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CGT---T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----TGNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---NNNNNA-----------TC--------------------GT--G---------T--AT---A---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-CATAA-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-TAact
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AG--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA---A-T---G-----A--C--A-----T-T------C-A---T------A-C----------T-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--CTTT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-T---T-A----TA-----TA----A-----AGG--G--A--T---T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----GT--T-T---A-T--T-TT------------CAA---A---C-A---T--AA--A-A---GACCCACTA-T---G---C-----C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T---A--A-T---A-A-TA---C-C---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A---A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----GT--T-TT-T---C--------C--G-------------TN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--G--------------------T------------------TT----CC--CG----T-CTTAA----TG-C-AG-G--T---------------GTT-T--------T-------------------------------------------GC-GTGT--AT----CCATA---TCG---TAAT-CG---T----GCGTT-GAAT---C-C---TA-TCC-T--T--ATCGTACCGT-C-GT-GTA-T----------------TC--------------------GT--GG-------TT--TT---A---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---ATA--GAA--------A-T----AACAG-TT--GC-GGG-TA
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--AT-----T----C---G-T-G--A----T--T-A-G-TTT--A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C---T---GT----A--C--A-------G------C-A---A------T-C------C--TT-----C-A-A--T----A-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---TTTTTTTGG-----A-T-----A---A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACAT--T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---C---A---------------C-CC--TA--G---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---A--TG--A-A---G-------A-T---G---T-G---C----AG-A-T--TA---T--T---A-------G---T--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--C--CG-TT--CC--G---GTAAT---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TC-A-T-A-A--T----T-T-T-C--------------------T--CA---G-----GA--T-TT-T---C--------C---T----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT----------T--T--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CG-T-T--------T-AT----C----T---A-----T----G----TA------GT-GC-GTGT--ATC---C--TA---TCG---T--T--G---TC---GTG---AATT---C-C---AATTCC-TATC--GCTGG---TT-C-GT-G---TA---------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TA-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-----A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-AG
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAA-AA-AT--AT-A---T----CT--G-TGC--AG---T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-GT-----C-ATT-T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AC---ATTTTTATG-----------------T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----G-TGTTAAA-T-A--T----G------C---G--T---T--ATC-TG-TT--T-A----TA-----T-----
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----AGT-A--C----A------T---G--T---T--A---T-------------TA-----T-----A-----AGG-----A--TAC-T--T----G---A---A-A-------------AACC--T---T---------G--A-A---T-----GG--T-T---A-T--T-TT------------T-ACAGA---C-A---T--AA--A-C---AA------A-TAGTG---T-GGC-T----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--TCCGG---TC--T---AA--------T-----AT---G--C---TT-C-T-ACA--C-T-TTAA-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CC---G-----G---T-TT-TTC-C--------C--GT----T-------TATCG---T------G-------AG-ATTGTATTATACAGAGGT----T---------------TTT-GCGTTT-TTCACAAGGCTTCTAGCTCGTGAACCT----------TG-T--------------------TTATCAGTATTTATAGGGGTT----TC--CG----T-TTA-A----T--C-AG-G--TT----T---TGTG-CGCTAT--------T-AT----TCCTAT---A-----T-C--G----TAT---C-A--GT-GCGT---T----G--TA---TCC---T--T-CGTTATGT--GCGT--GAAT---C-C---TATTCC-TAAT--T-CGT---GTGC-GT-GTAAT----------------TC--------------------GT--TT-------TC--TT---C---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------TCC---A-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TAgttactagtacaacatagtacatgttattataaggatacttgaaaaaccttgaatggttatttttacagacataaacaaatagtgtggctaattttagttgtagtaatacaaatttcgtttccggtctaatatgcttctacactttaacaacatttctatccggtttttcccgtttatcgtgagattgtattatacagaggtttttgcgtttttcacaaggcttctagctcgtgaaccttgtttatcagtatttataggggtttccgtttaatcaggttttgtgcgctattattcctatatcgtatcagtgcgttgtatccttcgttatgtgcgtgaatcctattcctaattcgtgtgcgtgtaattcgttttcttctcgtgtatcatgtccaagaataacgtttgcgggta
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   gaaaaatatatctgtgcagttatatgcacatacatgtacatgtcattttctttttcaattagacatttttatgtttttttagggtgttaaatatgcgttatctgtttatatgttactagtacaacAGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-CC-A----T--T-A-G-TT---AAT--G----CCA----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----AA-C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--T---------------------------A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T------TG-TA----A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A---------------CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A----T-TT------------C-A---A---C-A---TAAAA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T----A--------A-----CT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------G--GT----T-------
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      T--ATCGT---G--C-GT-G---T----------------AC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-GTTT--GC-GGG-TACnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatcgtgcgtgtacgtgttctatcgtgtatcatgtcaagaataacgtttgcgggtact
gi|21                         :                                                                           agaaaaatgtatcgtccattagttaatgccacatacatgtaacatgcattcctatttctttaggatatacgtgtttgtaatataaaggatattgaaaccttgaatgttatttcaacataaaaaagaatgtgcaattttagttgtagtaatacaaaatttcgttccgtctaactgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcggttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT-----T--A----C-A----C----------------------------C-A-C---AT----A--C--A----------------A---T------TAC------C--TTAT--TC-A-A--T----A-T-GA---A-------------------------T-T-T--C-TTG-----------------T---A------GG-----A-T-----T-TTG--C----GC-----T---G--T---T--A---TG-TA----G----TA-----T-----A-----AGG--G--GGGTA--CGAT----GT--A---C-A-------------T-CC--T---T---------CT-A-A---T-----G---T-TTCAA-T--T-TT------------G-A---A---CTA---T--TA--A-A---TA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--TCTGAT------G--TT--G--TG--A--G-TGAGG-A-TGGATC-A---AAG--T---TGAT--CG-TT--CC--G---TC--T---AAC-------A-----TT---G--C---TT-A---AAA--T-T-T------A-A--C-A--T-T-G-A--T---A-------------T--TA---AC----G---T-TT-T------------C--G-----T-------TA------T------GGTGACAAAG-ATCGTATCGT-----GTT----T-----------------T-GCGTTA-TATCAGATTGCTATGGACGATGACTAT----------CGATGTGTGTATACAGG-------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---TG---CGTTAT--------T-AT----T----C---AGGT--T-T--A----TAT-----------ATAT--CA----C--TA---TCGC--T--T-CG---TGC--CCT---GTAT---C-T---AA-TCC-TAG-----CGT---GC-C-GT-G---C----------------TA--------------------GT--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcAGAATAA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T----A-A-TT---A-TT-G----C-A----C-A-----------------------TG-T-A-----------A--C--A-----T-GGT----C-A---T------T-TTCCGCTC--TT-C--TC-ATA--T---TA-G-AATTTA-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-TT----A-T-A--C----A------T---G--C---TTAA---TC-TA--TTA----TA-----T-----A-----AGA--T--A--TT--T--T----G---ATAAA-A-------------C-CC--A---T---------T--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--GTAT---A--G-----A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-AT-T-T-T-C--T---A----------------CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T---------------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TC--C-------TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T----CNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-C-CT--TCTG-------C-GT-G---TTA--------------TC--------------------GT--G--------TT--CT---A---TC-GTG----T----A-T-c
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TTGT-A-T--G----C-AATGAC-AGGAG-------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-TATTT-A-A--TATGTG-G-AA---A-------------------------A-T-T--C-TT------------------TTAGA------GA-----C-T-----A-T-A--C-----------T---G--C---TGTA---TG-TA--TGA----TA-----------A-----AGG--A--A--TAA-T--T----GG--A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TTT-----------C-A---AG--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--ATT--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-ACAGAATTGT---T--T--CG-TT--CCG-G---TA--TAA-AA--------A-----TTGCGG--C---TT-C---AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--TATGT-C--T---A-------------TTGCAAGGG-----G---T-TT-TTCGC--------T--GT----T-------TA------T------C-------AGTATGGTGTTATATCTGGTC----TGATCNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TG--A----T--C-AG-G--TT----T---T----
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaaataagctggaAA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----TTG------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---ATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-AA-C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TACATG-T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AA------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-ATTA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA----T-T--A-CAA-A--T-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TNNNNNN-NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---gcg
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agaAA-AG-AT--GT-GGAGTG---C---G-T-C--A----T--T-A-G-T----A-T--A----C-G----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--G-CT------------------T---A-------G-----A-T-----AGT-A--C----G------T---G------T--A----G-GA--T-A-----G-----T-----A-----AGA--G--AG-TA--G--TGTGAG---G---A-A-------------C-CCGGG---T---------G--A-A---T-----G---T-T---G-A--G-TTGGG---------C-A---A---C-A---A--AA--AGA---GA------G-T---G---T-G---C----C--A-T--T----T--T---A-------G--GTGGG--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AAT--T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A------T---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-TG-A-C-A-AGGA-G--T-T-T-CG-T---AG------------T--CA---G-----G-----TT-T---C--------CGGGT----T-------TACG----T------G-------AG-
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aAGAA-AA-ATATGT-A---TTCAAC---G-T-C--AGCATC--T-A-G-TT---A-T--G----T-A----C---------------------------------------------C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-TCT--C-AT------------------TGA-A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TGACG--T-A----TA-----T-----A-----A-G--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G-----T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-ACTTT--AGACA-A---GAGCAC--G-T---A---T-G---C----A--C-CCAT----T--T---A-------G--TT--G--TA--A--G-T---T-A-TA---C-A---AA---T---T--CAGCG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CGT-AAA--T-TCT--A-C-A-AC-C-AC-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GTNNNNN-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNT----------T--T--------------------T------------------TC----TC--CG----TCTT--A----T--C-AG-G--TT----gagtcggggtgtatcggtgtgtgagtcagtcgtatgcgggtagagaagtcggtttatcagtgtccgtacaggttgcgtggt
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------T--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A----T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA-------T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G-----TT-T---C--------C--GT----TNN-----NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TT--CG----T-TT--A----T--C-AG-T--TT----T---
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--G-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-G---AA---T---T--T--CA-TT--CC--A---TC--T---GA--------A-----TT---G--A---TTACAT-AAA--T-T-C--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--A---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--TT----T-------TATCG---T------G-------AACATCGT-TAAT--CAGGTT----T---------------TC---CGTTTATTAGGTTTTGCGTTATTATCCCATCAT----------T--C--------------------C------------------GT----GC--CG----T-GT--A----T-----G-N--NN----N---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NTAG---A----------------TC--------------------GT--G-------------------------------T----A-T-C-A--TG---------T-C---ACA--A-A--------A-T----AAC-G-TTG-GC-TGG-TAC
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -T--T-TT------------C-A---AA--C-A---T--TA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---T--C---TT---T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----TN------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--T--------------------T------------------TT----TC--CG------TT--A----T----AG-G--TT----T---T----TNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------AT--AT---AT--TC-GTG----T----A-T-tg
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----CCG-G-TTC--A----T--TTA-G-TTTTGA-TTGG----C-A----CCA-----------------------TA-C-A-T---GT----AAGC--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TT-C-A--T---TA-GAAA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----ATT-A--C----GT-----T---GTTT---T--A---TG-T---T-A----AA-----TA----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-AAAACG--------C-CT--T---T---------GGAA-A---T-----G---T-TTA-A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T---A--A-A---GA------A-T---G-----G---C----A--A-T--T----T--TTAAA-------G--TT--G--TA--A--G-T---A-A-TA---CAA---AA---T---T--T--CG-TT--CC--GCGTTT--C---AA--------ATTGGCTT---G--T---TT-C-C-TAA--T-T-T--ACC-A-A--C----T-T-T-CCTT---A-------------T--CA---G-----GTTTT-TT-T---C--------C--GT----T-------TT------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NNNNGTT-TT--A----T--C-TA-G--TT----T---TTTTCCGTT-T--------T-AT---------T---AAGTTTT-T--T----TTT---T-G--GC-GCGT--TTATCCC--TA---TCGTATT--T-CG---TG---GCC---GTGTTTAT-C---TA-TCCGTATT----CGT---GG-CGGT-GAA-T----------------TCCGCTATCCTATCGGTGGCCGGT--GTAATCGTGTT--CTAT-A---TCGGTG----T----ATT-C-A--TGT--------T-C---A-AT-G-A--------A-A----AAC-G-TTG-GC-GGG-
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        a--G----C-A----CGA-----------------------TA-T-G-T---GT----TT-C--A-----T-G------G-A---T------C-C------A--TT-T--TC-ATA--T---TATG-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------TC--A------GGCC---A-T-----C-T-A--C----GA-----T---G--T---T--C---TG--A--T-A----AA-----TGGCGCA-----AGG--GCAG--TA--T--T----G---G---A-A-------------A-CC--T---TCTTTG----G--AGA---T-----G---T-T---A-T--T-TTGTTCA-------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---CACTTA--A-T--TATTGT--T---A-------GGATT--G--TCAAG--G-T---A-A-TA---CTACT-AA---T---T--T---G-TT------A---TC--T---GA---------------T---G-------T-C-T-CAG--T-C-T------A-A--C-A--T-T-T-tac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcaaAGAA-CA-AT--AT-A---T----C---GCT-C--A----T--T-A----T---A-T--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--AA----T-G------T-AATGC------T-T------C--TT-T--TC-A-A--T---TA---AA---A-------------------------T-T-T--T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---A------GG-----A-T-----A-T-A-------G------TTTTG--T---T--A---TG-TA--T-A----------------------------G--A--TA--T--T----G---A---A-----------------CA--T---T---------G--A-AT--T-----G---T-T---A-T--T-TT--------------A---A---C-C---T------A-A---GAT-----A-T---GT--T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------GT-TT--G--T------G-TTC-A-A-TA---A-A---AA---T---T--A--TG-TT--CC--G---TT-------A--------A-----TT---G--C---TT---T-AAA----T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-T--------------------T--CA---GT----G---T-TT-T---C--------gatgtctcaaatttac
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-A---GT-AAATT----T---G-T-CC-A----T--T-A-G-CT---T-T--G----C-A----C-A-----------------------CA-T-ACT---GT----A--TCAA-----T-A------C-A---T------A-CA-----C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--C-TT------------------T---AT-----GG-----A-C-----A-T-G--CC---A------T---G--T---T--A---CG-T---T-A----TA-----C-----C-----AAT--A--G--TA--T-------G---A---A-A-------------CACC--T---T---------C--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TG------------C-A---AA--C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---TT---A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--C------CA--A---TG--T---AAAATTATGCA-----TT---G--G---TG-C-T-AGA--T-T-T----T-A-A----A--T-T-T-C--T---gt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T----C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G----------G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----------------AAG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--------A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-CTT-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T---C--------C--GT----g
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T--------G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------T----------GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A----T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA------------------AG--G--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-C---T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---------G---T-TT-T---C--------C--G
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----TC-T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TAAC-A-T---GTT---A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--TT-T---C-A-A--A---TA-G-AA---A-------------------------A-T-T--T-CT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TAA-G--T---T--A---TT-GC--T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G---A---AGA-------------C-CC--T---TTA-------GC-A-A---T-----G---TAT---A-T--T-TTTTTTTTTCCCCCC-A---A---C-A---T--CA--A-A---GA------A-T---A---T-G---C----A--A-TT-T----T--T---A-------G--TT--G--T---T--A-T---A-A-TT---T-A---AA---T---
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             agaAGTA-AA-AT--GT-A---T----C---G-A-T--A----A--T-A-A-GT---A-T--G----C-A----T-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------T-A---TATGTATT-G------C--CT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-A--T----GATTTAAT---G--TAAAT--A---TG-TA--T-A----TA-----
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -----A-T-----A-T-A--C----A------T---G--TA--C--A---TG-TA--T-A----TG-----T-----A--------------------T--T----G-----------------------C-CT--T---T---------C--A-A---TTAGAAA---T-T-----T--C-TT------------T-A---G---G-A---T--AT--A-T---GATTTA--A-T---G---T-A--------A--A-TA-T----G--T---A-----------T--A--T---A--A-T---G-A-TA---A-A---AA---AAAAT--G--CG-TT--TC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---CT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-C-A--T-A--T-T-T-CT-T---A-------------T--Catgataaaaaaaaatgcgtttcgtctaaattgcctctaaatttaccatatttcttatc
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        agtaaaatgtatcgataataagtatgcG-CA--T-A----TAAGTTTT-----A-----ACG--G--A--CG--T--T----G---A---A-A-------------T-C--------------------------------G---T-T---A-T--T-GT------------C-A---A---C-G---A--AA--T-A---TT------G-T---G---T-G---C----A----T--T----TGCT---A----------TT--G--T---A--G-C---G-T-TG---G-A---AA---T---G--T--CG-TT--TT--G---TC--T---AA--------A-----TC---G--C---TT-CGG-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--------C--A---A-------------T--TA---G-----G---T-TT-T---C--------C--AT----T-------
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttttgtttatgcctcttaggtaccgtacg----------T--T--------------------T------------------TT----TC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TT----T---T-----GCT-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----CAT---T-GT-GC-GTGT--AT----C--TA---TCGA--T--T-CG----G---GCG---TGAT---C-C---TA-TCC---GT--TCC--------T-AT-G---T----------------GC--------------------GT--GT------------T---A---TG-CTG---------A-T-G-A--TG---------T-C-----A--G-A--------T-A----AAC-GTTT--GC-GGG-TAC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcacatcgtttattcag-AA-AT--AT-AA--T----C---G-T-C--A----TCCT-A---TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T--------C------C--TA-T--AC-A-AA-T---TA-G-AA---ATCTCTTTTTCAAATTGTATATT---T-T-T--T-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-ATAC----G------TT--G--T---T--A---TG-TA--T-A----TA-----C-----ATGTAAAAG--G--A--TAATT--T----G---A---A-C-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------CCA---A---C-A------AA--A-A---GATA----A-T---A-----G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---GAGG-T---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CG-TT--CC--G---TC--T---AA--------A-----TT---GAACATATT-C-T-AAAATT-T-T--A-C-A-G--CGA--T-T-T-C------A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--GT--------------------T------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------N------------------NN----NN--NN----N-NN--N----N--N-NA-A--TT----A---T----TGTG-C--------C-GT----T----T---A-----T-CAGG----TGT---T-G--TC-GTTTTATC----C--TAT--TCG---TA-T-CG---TG---GTGCGTGTAT---T-C----A-ACA-TAAT----CGT---AT-C-GT-G---CGTTGAATCCTATCCTATC--------------------GT--GTCG-----TG--CTA--A---TC-GTGTTTCT----A-T-C-G--TGTATTCCTCCT-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TTCGGC-GGGCTACtg
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-----------------------T-G------C-A---T------T-C------C--AT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--T-TC------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----AAG--G--A--TA--T--T----G-------A-A-------------C-CC--TTG-T---------G--A-A---T-----G-----T---A-TTAT-TC------------C-A---A---C-A---T--A----------------------------------------------T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-t
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----T-TT--A----T--C-AG-A--TT----TA--T----CA-T-T--------T-ATC---C----T---A-----T-C--G----TAT---T-G--A--GTGT--AT----CA-TA---TCA---T--G-CT---T----------GTAT---C-C---TA-TCC-TGTT----CGT---G--C-GA-A---T----------------ACT-------------------GT--GT-------TT---T---A---TC-ATT----T----A-T-A-A--AG---------T-C---A-C--C-A--------A-T----AAT-G-TC--GC-GGG-CAga
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--A--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CA--T---T---------G--A-A---T-----G---T-T---A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AA--T-A---GA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---T-------G--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TT--CT--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C-A-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CA---G-----G---T-TT-T---C--------C--ac
gi|44                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---TAG--CTTGG-T-C--A----T--T-AAG-TT---A-TT-A----C-A----C-A-----------------------TA-C-G-A---GT----A--CT-A-----T-G------C-A---TTACCGAT-C------T--CT-C--TC-ATA--T---TA-G-AA---ATAT----------------------T-C-T--C-TT------------------T---A------GGTCATTA-T-----A---A--C----G------T---G--T---
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cag---TA-TCC-TAA-----CGT---AT-C-GT-G---CGGGCA-----------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TC-GTT----T----T-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GT-GGG-TAC
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgttttgcgttattttgttg--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GC----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G------A-------------------------T-T-T--T-TT------------------TA--A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATG--A--A--TA--T--T----G---A---
gi|47                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaa---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-A--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-TGTAGT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-C------C--CT-T--TC-A-A--T---CA-G-Ag
gi|49                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GT---GT---GT-G---TA---------------TC--------------------GT--GC-------G---CT---A---TC-GTT----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-ATTTATATCG-T----AAC-G-TG--GC-AGG-AACttaatggtgccgatgttgcttaaat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tattAA-AA-GTC-GT-----T----C---C-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AA---C-AA----------------------GA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---T------T-T------C--TT-TG-TC-A-T--T---AA-G-AA---A-----------------------------T--C-TT------------------T----------GG-----T-T-----A-T-G--CCGTAG------T---A--T---TA-A---TG-TA--T-ACGCTTA-----T-----A-----GGT--G--A--CA--C--T----tgt
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       cagc--TT--G--T---A--T-T---A-A-TA---C-AT--AA---T---T--TT-CG-TT--TC--G----C--T---AA--------A-----TT---G--T---TA-C-T-AAA--TATAT--A-C-A-A--C-A--T-T-TTC--TGACA-------------C--AA---G-----A---T-TTAT---C--------C--GG----TG------TC------A------G-------AT-ATCGCGCATTTGAAGATTGACTT---------------TATCGTGTTT-TGCTTCTTAATCA--GGTAGTTATCAG----------A--T--------------------G------------------TGAACATG--CG----T-TT--A----T--C-AGCGCCTT----T---TG---CGTT-A--------T-ATTGCCC----T---A-----TAC--G----TAT---C-GTAGC-GTA---CC----C--TA---TCG---T--T--A---TA---AT----TTAT---C--------TCC-TAATTAGTCGC---GTGG-GT-G---T----------------AT--------------------GTTGGT-------AT--CT---A---TC-GT-----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-ACGG-A--------ACT----AAC-GTTT--GC-GGG-atcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtatattgtattaatacataattttcgtttcgctaaattgttactaaatatatacaacattttctgacacaagatttatccggtgtcagatatcgcgcatttgaagattgactttatcgtgttttgcttcttaatcaggtagttatcagatgtgaacatgcgtttatcagcgccttttgcgttatattgccctatacgtatcgtagcgtaccctatcgttataatttatctcctaattagtcgcgtgggtgtatgttggtatctatcgttatcatgtcaacggaactaacgtttgcgggggggt
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              cagcaaaagtcgttcctcattagttatgcaacaagacatgtacatgcatttctttgtcattaagaaatctttggttatgccgtagtattaatgtatacgcttataggtgacactatcttttagctcacccttgcttcatgaatgtcttcgtgtgtgcgtatactcttagacacgtgtgtttgcagaagtata----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA-----------------------------T-T-T--T-TT------------------A---A------GG-----A-T-----G-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-----T-A----TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------ggggt
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TT---A-T--G----C-A----C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-----T-A------C-A---T------T-C------C--TT-T--TC-A-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---A------AG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-TA--
gi|52                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AA-AA-AT--AT-A---T----C---G-T-C--A----C--T-A-GCTT---A-A--G----C-A------A-----------------------TA-C-A-T---GTG---G--T--A-----T-T------G-A---T------T-C------C--CT-G--TT-A-A--T---CA-G-
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    agaT-G---TA---------------TC--------------------GT--GT-------T---CT---A---TC-GTG----T----C-A-C-A--TG---------T-CA--A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--CA-GGG-
gi|54                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tggtTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-GGG-tac
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-A-TT---AGT--G----T-AGTT-C-A-----------------------TA-C-A-T---GT----A--C--A-------G------C-A---T------T-C------C---T-T--CC-A-A--T---TA-G-AA---A---------------------------T-T--C-TT------------------A---G------GG-----G-T-------T-A--T----A------A---G--T---T--A---TG-GAGGT-A----TC-----T-----A-----AAG--G--A--TA--TA-T----GTAAA---A-A-------------C-CC--TGTCT---------G----A---T-----G---T-T---ATT--T-TT------------C-A---C---C-A---T--AA--A-A---GA------AGT---T---T-G---C----AG-A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--GTT---A-A-TA---C-A---AA---T---TA-T--CGCTT--CC--G---TCT-T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-TAAAA--T-A-T--T-C-A-A--C-AT-T-T-T-C--T---A-------------T--CA---GCCACTG---T-TT-T---CGCTNNNNNN--NN----N-------NN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------T--C--------------------T------------------TT----TC--CG----T-AT--A----TTCT-AG-G--TTA---TTG-T----CGTT-TATTTTCTAT-AT----C----T---G-----T---------TAT---C-GT-GCTGTGT--AT----C--TAT--TCG---TA-T-CG---TGACTGTG---AAA----------TA-TCC-TATC--GCTG-------C-TT-GC--T----------------TC--------------------GT--CT-------TTTCTT---A---TC-GTG----T------T-C-AGCTG---------T-C---A-A--G-G--------A-T----AAC-G-TT--GCGGGG-TACta
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gGAA-AA-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--C----C-A----C-ACTGTACATGCATTCCTTTCAAATTA-C-AGT---GT----A--C--A-----T-G------CCA---T------T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---CA-G-AA---A-------------------------T-T-T--C-TT------------------T---G------G--------T-----A-T-A--CT---G------T------T---T--A---TG-TA--T-A----GA-----T-----A-----AGG-----A--TAA-T--T----G---A---A-G-------------C-CC--T---T---------G--A-A---T-----G---T-----A-T--T-TT------------C-A---A---C-A---T--AAT-A-A---CA------A-T---G---T-G---C----A--A-T--T----T--T---A-------G--TT--G--T---A--G-TCA-A-A-TA---C-C---AA---T---TG-T--CG-TT--CC--G---TC------AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A----T-T-C--T---A-------------TCACA---G-----G---TATT-T---C--------C--GT----TNNNNNNNNN------N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGT----------T--T--------------------T------------------TT----CC--CG----T-TT--A----T--C-AG-G--TTNNNNN---N----NNNN-N--------N-NN----N----N---N-----N-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--G--------TT--CTAGAA---TC-GTG----T----A-T-C-A--TG---------T-C---A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GC-CGG-GACt
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGAA-AA-AT--GT-A---T----T---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G------A----C-T-----------------------CA-C-A-----GTGGTAA--C--A-----T-AA-----C-A---T------T-C------C--TT-C--CA-G-A--T---TA-G-AA---A-------------------------T-T-TATT-TT------------------T---A------GG-----A-T-----A-T-G--C----G------T---G--T---T--A---TG-AAAGC-AAAT-TA-----T-----A-----ATT--G--G--TA--T--T----G---A---A-A-------------C-CC--TGTTTA--------G--A-AACAT-----A---T-TTA-G-T--T-TT------------C-A-------T-A---T--AA--A-A-----------A-T---G---TTG---C----A--A-T--T----T--T---GTGTTGTTG--TT--G--T---A--G-T---A-A-TA---C-A---AA---T---T--T--CG-TTTTCC--G---TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-C-T-AAA--T-T-T--A-C---A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------C--CA---G-----G-----TT-T---C--------C--GT----G-------TA------T------G-------
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               c-GTG----T----A-T-CCA--T----------T-C---A-A--GGA--------A-T----AAC-G-TT-----GGG-TACcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgtatccattcaaggaataacgttgggtactg
gi|9                          : cagaaaaatgtattgtcattagttatgactcacagtggtaacataacattccttccagattagaaatttatttttaggatatgcgtgttatgaaagcaaattataattggtattgaaaccctgtttagaaacatatttagttttcatataaaaatgttgcaattttgtgttgttgttgtagtaatacaaatttcgttttccgtctaaattgcttctaaatttacacatttctaccaggtttccgtgtatgcgtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-AT-AT--GT-A---T----C---G-T-C--A----T--T-A-G-TT---A-T--G----C-AC---C-A-----------------------TA-CTA-T---GT----A--C--A-----T-G------C-A---TA-----T-C------C--TT-T--TC-A-T--T---TA-A-AA---AATT----------------------T-T-T--C-TT------------------TA--A------GG-----ATT-----A-T-A--C----G------T---G--T---T--ATTTTG-TA--T-A----TA-----A-----A-----TGG--T--A--TA--T--T----G---A---A-A-------------CGCCCAT---T---------GT-A-A---T-----T---T-C---A-T--TATT------------C-A---A---C-A---TA-AA--A-A---GA------A-T---G---T-G---C-------A-T--T----T--T---A-------GA-AT--G--T---A--G-T---A-A-TAC--C-A---AAT--T---T--T--CG-TTC-CC--GC--TC--T---AA--------A-----TT---G--C---TT-T-T-AAA--T-T-T--A-CAA-A--C-A--T-T-T-C--T---A-------------T--CAG--G-----G---T-TT-T---C--------C--GT----T-------TANNN---N------N-------NN-NNNNNNNNNNNNNNNNNN----N---------------NNN-NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----------N--N--------------------T------------------TT----TCA-CGT---T-TT--A----T--CAAG-G--TT----T---TG---CGTT-TATCCC---T-AT----C----A---G-----T-N--N----NNN---N-N--NN-NNNN--NN----N--NN---NNN---N--N-NN---NN---NNN---NNNN---N-N---NN-NNN-NNNN--NNNNN---NN-N-NN-N---N----------------NN--------------------GT--GT-------T----T---A---TC-GTG----T----A-TCC-A--TG---------T-----A-A--G-A--------A-T----AAC-G-TT--GG-GGG-TACtg
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|39 ): TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAGTTACAATCCGCGGTTAACCTTCCTATCGTGCTTCTTATCGCATGTTCTATCAGTGTTCATGTCTACGCAATAACGGTCGGTACTGCT
Unaligned ( gi|41 ): AGAAAATGAATATGATCGTCTAGTATATGGCACTACTGTTATCACTTGTAACAGGCTCATTCTTACTTCTAAATTAGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGATATAACGATGTTATATATTAC
Unaligned ( gi|48 ): ATATGTGATCAGTTTTCCGTTTTCTATCGTTGTTTGCGTTTATCAGGTTCTATCGTGTATCGTGTTCTGC