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Reference ( gi|3 )            : TAAACACAAGGTCATGGTCATACAGAAATA-----TATATATT--GATA-AT-----G---AATATAT--GACT-GACAAAAAAGTTT--A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAAATA-TACTATATAAGAAACAAAAGAAAAAAAATAAAAAAATTAATAAGTTGGT--TCT-GTACTTGATTCATA-------TACTAGTGTGAA-G-A-TTT---AAAAAAAAATT-AA-CAAATCT--ATTTGTA-------GA-AAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAATATTGCAA-CATTTTGTTTATA-ACTAAGATTATTGTC-CCATACAAA--TAA-GTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTTTTGT----AT-CAGTATTTGTC-TTTGT-GTACA-ATAT--TTTG-G----ACACTTAAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAT-TCACAATCTGGATT-----TTC---T------CTAA-------GAA--AGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATTACTAGCTTTATTTCGCAATTGCCAATGCAATATATTAGCTTTTCGATTGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTTAATGGAATATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCTTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCG
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gtacTCGAT-GCCATAGTATTTAAAATAAT-TTTTAGGTTTACTGTA-TATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCCTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aTCGATTGCCA-AGTG--TAAAATAA---TTTATGTTTAATGGCATATATACCTTTTAGATGGCAACGC-TTGAAAGA-ACTAGTGTTAGGAATACTTCaatattcaaggtaggtcattccacaattttatagtcaagggtaaagctatttctatacgagttgttttcactaacgggaatattaaatttttagagtcagtcctggtttcttaaagaataaggttatgaggccaaagtacatggccgaagtaagtcctgaaattttgggggacttaatccatgaactatttgtaattgaacacacagtttcatgaatttttccttcttattgctaaggttatcccatccaagtcagttataaagtgtcgatcttgatgatttaccctataaactgaagatattaacgtgctgctgctatctggaacatctttcaattaatatgagcaatctctttctgtacaattatcccaaacaacatttgaatattccaaagatgggtcgaacattaagaaaaataattttatcaatgatcccttttaagttgatacttaacattcttaagacatttaatcgttgacatgctttgttattggattggatgtattgtttttccaacatccatctctctggaatattattcctcaagttgcagtatgagtgtcaacatttgaataaatgtccatttgtgaacaattttacccatgataaagaatattttttctactaaatccatatttaatgtttttgattggattaaaatatcaatcactgcccctttattaggaccactgatgatatgtattcttttactcaattcatacattagtcaatgaatttgcagaattgacaatgatccattcatttgacatactataaagagaaagtaatccaatcgcaaagagtcttatggattttctaatgttaggtagagattgtcaatttaataaacaatagaaaagaaagggtcctaaaactgccattgagggaacttcctgaattggttatatctacggggttgatgaaaaacatccaacactaccttttgagttctatcagacaaataattttcaattcaccttaatcaatcttctgaataccataatgctttaattatcgagtaaaaactacccatatgccatctcgttatcaaatgcttgttggagatacagaaacaaatctaacatcgttgtttgtgcaagacagaataatttgtatgatatatttcaaagtaactgattgttgtagaatcacctggttaaaaccccagattgaatatttgttaattatattcatttcttgaccaagtaatgtgttacataagtttaatcataatacatttttcctaagat
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taTCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTaatattaaggtaggtcaaatgccacaatttaatagtcgaatggataagagatatctcataacgaagttgtttttcactaagggaaatattaaaattttagaggtatccctggtttcttaaagacatgcatgagtatagagcaaagtacatggctcaacagtaagtctgcaaatattgggacttatccattagactatttgctaaacatcacaagttttatgattttccttcttattgctaacgatatcctcatccaagtatcgattataaagtgggatcgaacttgagtgaattcttaacgccttaaatcctgaaaattaatacgtgcttgctgcatctgaacatcttcgattaatattatcagttctttctgtacattatcgcaacaacatttacatattcaagtggtgatcagaaactaagaaaattaaaatcctttatcaatgatcccttattgaaaggttgatacttttaacattattacagacatttaatcggtgacatgcttttgatggaatgatgtatatgtttttcctcacatccatcactctggaatatctggattccaattgagtgatggagatgtcaacagttttgtatcatataacattgtcaatgttggaaccaaattttacccatggataagaaatatttttctactaaaaccatataactgtcttttgttggattaaatttcaacttgccatttttattaaacctgatgatgtttttcaagatcattagtcaatgaatttgccagaattgacaatgtcataattgactatatctataaatgagaagtatcatctgcaaagagtcttaaaggatttctatgtctatatgagacgtcattaataaacaaaaggaaaggaaagggtcctaaacagacccttgaaggggactctgaatgtggtatgtctagggttgatgaacaaaccatccaaccacctttttgaattctaatcagacaaataattttcaatcacagtatcattgttctgaatatacacacagtgctttaatttatgtaaaaccctgtgccaactcctatcaatgctttggagatatcacagaaattacaaacgtctaacatcgttgctgtttgtcagacaaattaatatgtatttagatatatttcaataagaactgattagtgtagaatcagcctgtttaaacccagaattgatatttgttaattatatcattttgcttgacgaataatgtacatatgttaaatatatttttttctaagat
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-122 )      :                    TAAACACAAGGTCANGGTCATACGGAAATA-----TATATACT--GATA-AT-----G---AATGTAT--GACT-GACAAAAATGTTT--A-GGTAT-GG-ATA-TA-GAAATA-TACTACACAGAACAC-----AAAA----AA-AATAAAAAAATTAACAAGNTG-GT--TCTTGTACTTG------GTA-----------CAAGAATGAAAGATTT-----T--------A----A---ATT-AA-CAAANCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTT-TAT-AACTGAGATTA-TTGT-CACCATACAAAGTTAAAGTTCTACAAGAATTAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAACTTTGGTGATCATGCAGTATTTGT-CTTCGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTCAGAAAAA------AGT----GAAGC-GTGG----TTTCA--AGACNACTCTAGCAGAGACTAAAACGTCACAATCNGGATTGAAACTTCATATAGAGAGCTNATGGAACTGAACAAGTCTGCTTAAATAAANCTGGCAAGCATNAGTAGATTGGTAGCTNTATTTCGCAATTGACAATGCAATATATTNGCTTNTCGATTGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTTAATGGAATATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGC-TTGAAAGATACTATTG-TAGGAANACTTCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATCGATTGCCA-AGTG--TAAAATAA---TTTATGTTTAATGGCATATATACCTTTTAGATGGCAACGC-TTGAAAGA-ACTAGTGTTAGGAATACTTC
gi|10                         :                                                  -----TATACACT--AGTA-AT-----TT--AAGCTATTAGACTCGACAAAAATATTTTAA-GGTAT-G--ATA-TAAGAAATA-TACAACACA--ACAC-----AAA----------TA------TTAACA--GTGTGT--TCTTGTA-TTG------GTA-----------CAAGAATGA--GATTT-----T--------A----A---ATT-AA-CAA-CCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTT-TATAAACTGTCACTA--TGTGAACAATATAAAGaatattaaggtaggtcaaatgccacaatttaatagtcgaatggataagagatatctcataacgaagttgtttttcactaagggaaatattaaaattttagaggtatccctggtttcttaaagacatgcatgagtatagagcaaagtacatggctcaacagtaagtctgcaaatattgggacttatccattagactatttgctaaacatcacaagttttatgattttccttcttattgctaacgatatcctcatccaagtatcgattataaagtgggatcgaacttgagtgaattcttaacgccttaaatcctgaaaattaatacgtgcttgctgcatctgaacatcttcgattaatattatcagttctttctgtacattatcgcaacaacatttacatattcaagtggtgatcagaaactaagaaaattaaaatcctttatcaatgatcccttattgaaaggttgatacttttaacattattacagacatttaatcggtgacatgcttttgatggaatgatgtatatgtttttcctcacatccatcactctggaatatctggattccaattgagtgatggagatgtcaacagttttgtatcatataacattgtcaatgttggaaccaaattttacccatggataagaaatatttttctactaaaaccatataactgtcttttgttggattaaatttcaacttgccatttttattaaacctgatgatgtttttcaagatcattagtcaatgaatttgccagaattgacaatgtcataattgactatatctataaatgagaagtatcatctgcaaagagtcttaaaggatttctatgtctatatgagacgtcattaataaacaaaaggaaaggaaagggtcctaaacagacccttgaaggggactctgaatgtggtatgtctagggttgatgaacaaaccatccaaccacctttttgaattctaatcagacaaataattttcaatcacagtatcattgttctgaatatacacacagtgctttaatttatgtaaaaccctgtgccaactcctatcaatgctttggagatatcacagaaattacaaacgtctaacatcgttgctgtttgtcagacaaattaatatgtatttagatatatttcaataagaactgattagtgtagaatcagcctgtttaaacccagaattgatatttgttaattatatcattttgcttgacgaataatgtacatatgttaaatatatttttttctaagat
gi|11                         :                                                      accTATACTA-GATA-ATTTACAGCT-AAT-TA---GACT-GACAAAAATATTT--A-GGTAT-GGGATA-TA-AAAATA-TAC-ACACA--ACAC-----AAAA-----------------TTAACAAAGTG-GTGTTCTTGTACTTG------GTA-----------CAAGAATGAAAGATTT-----T--------A----A----TT-AA-CAACACT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGT-A-CATTTTGTT-TATAAACTG---TCACTTGT-GACAATATAAAg
gi|12                         :                                                                                        --GACT-GACAAAAATATTT--A-GGTAT-GGGATA-TA-AAAATA-TAC-ACA-ACAACAC-----AAA----------TA------TTAACAAAGTG-TT--TCTTGTACTTG------GTA-----------CAAGAATGAAAGATTT-----T--------A----A----TT-AA-CAACACT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTT-TATAAACTG---TCA-CTTT-GACAATATAA
gi|14                         :                                                         tactagataatttacagcttaattaATGTAT--AACT-GACAAAAA-------A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAAAGA-TATTACACAGGAAGT-----GAAA----AACAATTAACAAGTTAACAAGATG-GT--TCT-GTACTTG------GTA-----------AAAGAATGAAAGATTT-----T--------A----AGATATT-AA-
gi|16                         : ctatgataatttacagcttgAAACACAAGGTCAAGGTCATACAGAAATAGTTTCTATATATT--GATA-AT-----G---AATGTAT--GACT-GACAAAAAactac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         -AA-AAAATCT--------ATTTGTA-GACAAAATCT------ATTCACGTA-CAATTacatagaatat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aTCGAT-GCCATAGTATTTAAAATAAT-TTTTAGGTTTACTGTA-TATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCCTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCG
gi|3                          :                   aTAAACACAAGGTCATGGTCATACAGAAATA-----TATATATT--GATA-AT-----G---AATATAT--GACT-GACAAAAAAGTTT--A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAAATA-TACTATATAAGAAACAAAAGAAAA----AA-AATAAAAAAATTAATAAGTTG-GT--TC-TGTACTTGATTCATATA-----------CTAGTGTG-AAGATTTAAAAAA--------A----A---ATT-AA-CAAATCT--------ATTTGTA-GA-AAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAATATTGCAA-CATTTTGTT-TAT-AACTAAGATTA-TTGT-C-CCATACAAA-T--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTTTTGT-AT----CAGTATTTGT-CTTTGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTAAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAT-TCACAATCTGGATT-----TTC-TCTA-AGA----------------AAGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATTACTAGCTTTATTTCGCAATTGCCAATGCAATATATTAGCTTTTCGATTGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTTAATGGAATATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCTTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCGaatattcaaggtaggtcattccacaattttatagtcaagggtaaagctatttctatacgagttgttttcactaacgggaatattaaatttttagagtcagtcctggtttcttaaagaataaggttatgaggccaaagtacatggccgaagtaagtcctgaaattttgggggacttaatccatgaactatttgtaattgaacacacagtttcatgaatttttccttcttattgctaaggttatcccatccaagtcagttataaagtgtcgatcttgatgatttaccctataaactgaagatattaacgtgctgctgctatctggaacatctttcaattaatatgagcaatctctttctgtacaattatcccaaacaacatttgaatattccaaagatgggtcgaacattaagaaaaataattttatcaatgatcccttttaagttgatacttaacattcttaagacatttaatcgttgacatgctttgttattggattggatgtattgtttttccaacatccatctctctggaatattattcctcaagttgcagtatgagtgtcaacatttgaataaatgtccatttgtgaacaattttacccatgataaagaatattttttctactaaatccatatttaatgtttttgattggattaaaatatcaatcactgcccctttattaggaccactgatgatatgtattcttttactcaattcatacattagtcaatgaatttgcagaattgacaatgatccattcatttgacatactataaagagaaagtaatccaatcgcaaagagtcttatggattttctaatgttaggtagagattgtcaatttaataaacaatagaaaagaaagggtcctaaaactgccattgagggaacttcctgaattggttatatctacggggttgatgaaaaacatccaacactaccttttgagttctatcagacaaataattttcaattcaccttaatcaatcttctgaataccataatgctttaattatcgagtaaaaactacccatatgccatctcgttatcaaatgcttgttggagatacagaaacaaatctaacatcgttgtttgtgcaagacagaataatttgtatgatatatttcaaagtaactgattgttgtagaatcacctggttaaaaccccagattgaatatttgttaattatattcatttcttgaccaagtaatgtgttacataagtttaatcataatacatttttcctaagat
gi|4                          :                    TAAACACAAGGTCATGGTCATACGAAAATA-----TATATATT--GATATAT-----G---ATAATAT--GACT-GACAAAAA-GTTT--A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAA-TA-TACTATATAAGAAAC-----AAAAGAAAAA-AATAAAAAAATTAACAAGTTG-GT--TCT-GTACTTATTCAT-ATA-----------CTAGTGTGAAAGATTT-----TTAAAAAAAA----A---ATT-AAACAAATCT--------ATTTGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAATATTGCAA-CATTTTGTT-TAT-AACTAAGATTA-TTGT-CACCATACAAA-T--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTT--GT-AT----CAGTATTTGT-CTTCGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTAAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAC-TCACAATCTGGATT-----TTCTCTTAGA------------------AAGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATT-ATAGCTTTATTTCGCAATTGACAATGCAATATATTAGCTTTTCGATTGCCATAGT---TAAAATAACTTTTTAGGTTTAATGGAATATATA--TTTTA-ATGG--ACGC-TTGAAAGATACTATTG-TAGGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|7                          :                                                                       T-----G---AATGTAAA-GACT-GACAAAAA-GTTT--AAGGTATCGG-ATAATA-GAAATAATACTACACAGGG----------GA----AA-AGTAAACAAGTT-------TG-GT--TCT-GTACTTG------GTAAAAAAAAAAAATAAAAATGAAAGAGTT-----T--------AGAGAA---ATTGAA-TAAATCTTTATTTGTATTCATAAGACAAAGCATTGGCCTATTCATGTAACAATTCTTAAAAATTGCAAGCATTTGGTTATAT-A-CTG-GATTA-TTGT-CACCATACAAAGTTAAAGTTCTACAAGAATTAAAGGTAATTGTA--------------AAACTTTGGTGATCATGCAGTATTTGTCCTTTGT-GTACA-ATATGTTTTAAG----ATACTTCAGAAAAA------CGG----GAAGT-GTAG----TATCA--AGAgtgaggattgcagaagagaagaccgagggtattagcgggcaacggatctgaagagcatatctaaatgtagaaagacctttcagaatgactcaaattggtagcgctccaacctccaccacacctttctcatagctccctgaaggccgcataaagctagtcattgtaccaacagaagatatatcgtttcatctactttctgcgaatgattacattttagagtacctggtttcttaaagaataagagttatgaggcaaggtacatggccaaagtaaggcctgcacaatcatgaactattttgtagaacagcacatgcaagtttatgaattttcctttttattgctaaggtatcccatccaagttcattataaagtgtcgatcttgatgaatttacccttaaacctga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatgatactttacagcctacagccGT-TTTGGTAGTACAGATAC-TTT--GGGTTGACACTTCATGAAAATAATATAGTATGAGAAGCCGTGGCTAATTCCATTAGACAATTCTAGCAGAGACTAAAACGTCACAA-CAGGATTGAAACTTCATATAGAGAGCTAATGGAACTGAACAAGTCTGCTTAAATAAAGCTGGCAAGCATGAGTAGATTGGTAACTATA----GC--TT-------TAATAT-TTCGCTTATCGA-TGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|9                          :                                          gtacAATAC----TATATACTATGATA-ATTTACAGCTTAATGTAT--GACT-GACAAAAATATTT--A-GGTAT-GG-ATA-TA-GAAATA-TACCACAC---ACAC--------------------ACAAAATTAACAAGTTG-GT--TC-TGTACTTG------GTA-----------CAAGAATGAAGGATTT-----T-------------A---ATT-AA-CAAACCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTT-TAT-AACTG---TCACTTGT-GACAATATAAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|10                         :                                                  -----TATACACT--AGTA-AT-----TT--AAGCTATTAGACTCGACAAAAATATTTTAA-GGTAT-G--ATA-TAAGAAATA-TACAACACA--ACACAA--A------------T------------------A------TTAACA--GTGT-GTTCTTGTA-TTG-----GTACA------AGAATGA--GATTTT--------AA---A-----TT-AA-CAA-CC--TATTCGT-------AGACAAAATA------TATTCATGT-ACAATTC-TGAAAATTGTAA-CATTTTGTTTATAAACTG---TCA-CTATGTGAACAATATAAAGaatattaaggtaggtcaaatgccacaatttaatagtcgaatggataagagatatctcataacgaagttgtttttcactaagggaaatattaaaattttagaggtatccctggtttcttaaagacatgcatgagtatagagcaaagtacatggctcaacagtaagtctgcaaatattgggacttatccattagactatttgctaaacatcacaagttttatgattttccttcttattgctaacgatatcctcatccaagtatcgattataaagtgggatcgaacttgagtgaattcttaacgccttaaatcctgaaaattaatacgtgcttgctgcatctgaacatcttcgattaatattatcagttctttctgtacattatcgcaacaacatttacatattcaagtggtgatcagaaactaagaaaattaaaatcctttatcaatgatcccttattgaaaggttgatacttttaacattattacagacatttaatcggtgacatgcttttgatggaatgatgtatatgtttttcctcacatccatcactctggaatatctggattccaattgagtgatggagatgtcaacagttttgtatcatataacattgtcaatgttggaaccaaattttacccatggataagaaatatttttctactaaaaccatataactgtcttttgttggattaaatttcaacttgccatttttattaaacctgatgatgtttttcaagatcattagtcaatgaatttgccagaattgacaatgtcataattgactatatctataaatgagaagtatcatctgcaaagagtcttaaaggatttctatgtctatatgagacgtcattaataaacaaaaggaaaggaaagggtcctaaacagacccttgaaggggactctgaatgtggtatgtctagggttgatgaacaaaccatccaaccacctttttgaattctaatcagacaaataattttcaatcacagtatcattgttctgaatatacacacagtgctttaatttatgtaaaaccctgtgccaactcctatcaatgctttggagatatcacagaaattacaaacgtctaacatcgttgctgtttgtcagacaaattaatatgtatttagatatatttcaataagaactgattagtgtagaatcagcctgtttaaacccagaattgatatttgttaattatatcattttgcttgacgaataatgtacatatgttaaatatatttttttctaagat
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Reference ( family-122 )      :                    TAAACACAAGGTCATGGTCATACGGAAATA-----TATATACT--GATA-AT-----G---AATGTAT--GACT-GACAAAAATGTTT--A-GGTAT-GG-ATA-TA-GAAATA-TACTACACAGGANACAAAA-----AA-AATAAAAAAATTAACAAGNTG--GTTCTTGTACTTG-----GTA-----------CA------AGAATGAAAGATTTT--------A----A---A-----TT-AA-CAAATCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGCAA-CATTTTGTTTATAAACTG-GATCA-TTGT---NACAATACAAAGT--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTT--G-----TAT-CAGTATTTGT-CTTCGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTNAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAC-TCACAATCTGGATT-----TTC---T------CTAA-------GAA--AGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATTGNTAGCTTTATTTCGCAATTG-CAATGCAATATATTAGCTTATCGATTGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTTAATGGAATATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCCTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCG
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gi|10                         :                                                  -----TATACACT--AGTA-AT-----TT--AAGCTATTAGACTCGACAAAAATATTTTAA-GGTAT-G--ATA-TAAGAAATA-TACAACACA--ACACAAA-----------TA------TTAACA--GTGT-GTTCTTGTA-TTG-----GTA-----------CA------AGAATGA--GATTTT--------A----A---A-----TT-AA-CAA-CCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTTTATAAACTG---TCA-CTATGTGAACAATATAAAGaatattaaggtaggtcaaatgccacaatttaatagtcgaatggataagagatatctcataacgaagttgtttttcactaagggaaatattaaaattttagaggtatccctggtttcttaaagacatgcatgagtatagagcaaagtacatggctcaacagtaagtctgcaaatattgggacttatccattagactatttgctaaacatcacaagttttatgattttccttcttattgctaacgatatcctcatccaagtatcgattataaagtgggatcgaacttgagtgaattcttaacgccttaaatcctgaaaattaatacgtgcttgctgcatctgaacatcttcgattaatattatcagttctttctgtacattatcgcaacaacatttacatattcaagtggtgatcagaaactaagaaaattaaaatcctttatcaatgatcccttattgaaaggttgatacttttaacattattacagacatttaatcggtgacatgcttttgatggaatgatgtatatgtttttcctcacatccatcactctggaatatctggattccaattgagtgatggagatgtcaacagttttgtatcatataacattgtcaatgttggaaccaaattttacccatggataagaaatatttttctactaaaaccatataactgtcttttgttggattaaatttcaacttgccatttttattaaacctgatgatgtttttcaagatcattagtcaatgaatttgccagaattgacaatgtcataattgactatatctataaatgagaagtatcatctgcaaagagtcttaaaggatttctatgtctatatgagacgtcattaataaacaaaaggaaaggaaagggtcctaaacagacccttgaaggggactctgaatgtggtatgtctagggttgatgaacaaaccatccaaccacctttttgaattctaatcagacaaataattttcaatcacagtatcattgttctgaatatacacacagtgctttaatttatgtaaaaccctgtgccaactcctatcaatgctttggagatatcacagaaattacaaacgtctaacatcgttgctgtttgtcagacaaattaatatgtatttagatatatttcaataagaactgattagtgtagaatcagcctgtttaaacccagaattgatatttgttaattatatcattttgcttgacgaataatgtacatatgttaaatatatttttttctaagat
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gi|12                         :                                                                                        --GACT-GACAAAAATATTT--A-GGTAT-GGGATA-TA-AAAATA-TAC---ACA----ACAACA-----CA-AATA------TTAACAAAGTG--TTTCTTGTACTTG-----GTA-----------CA------AGAATGAAAGATTTT--------A----A---------TT-AA-CAACACT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTTTATAAACTG---TCA-CTTT---GACAATATAA
gi|14                         :                                                         tactagataatttacagcttaattaATGTAT--AACT-GACAAAAA-------A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAAAGA-TATTACACAGGAAGTGAAA-----AACAATTAACAAGTTAACAAGATG--GTTCT-GTACTTG-----GTA-----------AA------AGAATGAAAGATTTT--------A----AGATA-----TT-AA-
gi|16                         : ctatgataatttacagcttgAAACACAAGGTCAAGGTCATACAGAAATAGTTTCTATATATT--GATA-AT-----G---AATGTAT--GACT-GACAAAAAactac
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         -AA-AAAATCT--------ATTTGTA-GACAAAATCT------ATTCACGTA-CAATTacatagaatat
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aATCGAT-GCCATAGTATTTAAAATAAT-TTTTAGGTTTACTGTA-TATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCCTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCG
gi|3                          :                    TAAACACAAGGTCATGGTCATACAGAAATA-----TATATATT--GATA-AT-----G---AATATAT--GACT-GACAAAAAAGTTT--A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAAATA-TACTATATAAGAAACAAAAGAAAAAA-AATAAAAAAATTAATAAGTTG--GTTCT-GTACTTG-----ATT-----------CATATACTAGTGTGAA-GATTTA--------A----A---AAAAAATT-AA-CAAATCT--------ATTTGTA-GA-AAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAATATTGCAA-CATTTTGTTTATAA-CTAAGATTA-TTGT---CCCA-TACAAA-T--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTTTTG-----TAT-CAGTATTTGT-CTTTGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTAAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAT-TCACAATCTGGATT-----TTC---T------CTAA-------GAA--AGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATTACTAGCTTTATTTCGCAATTGCCAATGCAATATATTAGCTTTTCGATTGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTTAATGGAATATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCTTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCGaatattcaaggtaggtcattccacaattttatagtcaagggtaaagctatttctatacgagttgttttcactaacgggaatattaaatttttagagtcagtcctggtttcttaaagaataaggttatgaggccaaagtacatggccgaagtaagtcctgaaattttgggggacttaatccatgaactatttgtaattgaacacacagtttcatgaatttttccttcttattgctaaggttatcccatccaagtcagttataaagtgtcgatcttgatgatttaccctataaactgaagatattaacgtgctgctgctatctggaacatctttcaattaatatgagcaatctctttctgtacaattatcccaaacaacatttgaatattccaaagatgggtcgaacattaagaaaaataattttatcaatgatcccttttaagttgatacttaacattcttaagacatttaatcgttgacatgctttgttattggattggatgtattgtttttccaacatccatctctctggaatattattcctcaagttgcagtatgagtgtcaacatttgaataaatgtccatttgtgaacaattttacccatgataaagaatattttttctactaaatccatatttaatgtttttgattggattaaaatatcaatcactgcccctttattaggaccactgatgatatgtattcttttactcaattcatacattagtcaatgaatttgcagaattgacaatgatccattcatttgacatactataaagagaaagtaatccaatcgcaaagagtcttatggattttctaatgttaggtagagattgtcaatttaataaacaatagaaaagaaagggtcctaaaactgccattgagggaacttcctgaattggttatatctacggggttgatgaaaaacatccaacactaccttttgagttctatcagacaaataattttcaattcaccttaatcaatcttctgaataccataatgctttaattatcgagtaaaaactacccatatgccatctcgttatcaaatgcttgttggagatacagaaacaaatctaacatcgttgtttgtgcaagacagaataatttgtatgatatatttcaaagtaactgattgttgtagaatcacctggttaaaaccccagattgaatatttgttaattatattcatttcttgaccaagtaatgtgttacataagtttaatcataatacatttttcctaagat
gi|4                          :                    TAAACACAAGGTCATGGTCATACGAAAATA-----TATATATT--GATATAT-----G---ATAATAT--GACT-GACAAAAA-GTTT--A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAA-TA-TACTATATAAGAAACAAAAGAAA-AA-AATAAAAAAATTAACAAGTTG--GTTCT-GTACTTATTCATATA-----------CT------AGTGTGAAAGATTTTTAAAAAAAA----A---A-----TT-AAACAAATCT--------ATTTGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAATATTGCAA-CATTTTGTTTATAA-CTAAGATTA-TTGT---CACCATACAAA-T--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTT--G-----TAT-CAGTATTTGT-CTTCGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTAAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAC-TCACAATCTGGATT-----TTC---T------CTTA-------GAA--AGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATT-ATAGCTTTATTTCGCAATTGACAATGCAATATATTAGCTTTTCGATTGCCATAGT---TAAAATAACTTTTTAGGTTTAATGGAATATATA--TTTTA-ATGG--ACG-CTTGAAAGATACTATTG-TAGGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|7                          :                                                                       T-----G---AATGTAAA-GACT-GACAAAAA-GTTT--AAGGTATCGG-ATAATA-GAAATAATACTACACAGGGGA----------AA-AGTAAACAAGTT-------TG--GTTCT-GTACTTG-----GTAAAAAAAAAAAATA------AAAATGAAAGAGTTT--------AGAGAA---A-----TTGAA-TAAATCTTTATTTGTATTCATAAGACAAAGCATTGGCCTATTCATGTAACAATTCTTAAAAATTGCAAGCA-TTTGGTTATATACTG-GATTA-TTGT---CACCATACAAAGTTAAAGTTCTACAAGAATTAAAGGTAATTGTA-------------AAACTTT--GGTGATCATGCAGTATTTGTCCTTTGT-GTACA-ATATGTTTTAAG----ATACTTCAGAAAAA------CGG----GAAGT-GTAG----TATCA--AGAgtgaggattgcagaagagaagaccgagggtattagcgggcaacggatctgaagagcatatctaaatgtagaaagacctttcagaatgactcaaattggtagcgctccaacctccaccacacctttctcatagctccctgaaggccgcataaagctagtcattgtaccaacagaagatatatcgtttcatctactttctgcgaatgattacattttagagtacctggtttcttaaagaataagagttatgaggcaaggtacatggccaaagtaaggcctgcacaatcatgaactattttgtagaacagcacatgcaagtttatgaattttcctttttattgctaaggtatcccatccaagttcattataaagtgtcgatcttgatgaatttacccttaaacctga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgatactttacagcctacagccGT-TTTGGTAGTACAGATAC-TTT--GGGTTGACACTTCATGAAAATAATATAGTATGAGAAGCCGTGGCTAATTCCATTAGACAATTCTAGCAGAGACTAAAACGTCACAA-CAGGATTGAAACTTCATATAGAGAGCTAATGGAACTGAACAAGTCTGCTTAAATAAAGCTGGCAAGCATGAGTAGATTGGTAACTATA----GC--TT-------TAATAT-TTCGCTTATCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|9                          :                                          gtacAATAC----TATATACTATGATA-ATTTACAGCTTAATGTAT--GACT-GACAAAAATATTT--A-GGTAT-GG-ATA-TA-GAAATA-TACCACAC---ACAC----------------ACAAAATTAACAAGTTG--GTTC-TGTACTTG-----GTA-----------CA------AGAATGAAGGATTTT-------------A---A-----TT-AA-CAAACCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTTTAT-AACTG---TCACTTGT---GACAATATAAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CAATTTTGTCATTGTCTGCAATAACAAATAATGATGTATCATTCACAAAAGGTCAGATCTGTTGTTATGTCATTAATGTACAACACAGACAGAAAAGGACCTAATACTAAACCTTGGGGAACTCCTGCATCACCGCAAATAAATGTTGATGAATAACCATCAAGAACAACTTTTTGTGTTCTTATACTAATAAACTTTTAATTTCGACTAAGCTATAGATATTCCCCTTGATCAATATCACAGTGCTTTTGCTTAAACAGTCCTATATATCCTAATTAATTAATATATCAATTAAAGGCTTTGCAGATATCAAAAAACACAAATCTAATTTCCTTTTTAAACTTTTCCCTTACATTGAATTACATTATTCTAATAAGTTGATTGACACAGATGAATCACCCTGAAATTTGCAATTGG
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aATCGAT-GCCATAGTATTTAAAATAAT-TTTTAGGTTTACTGTA-TATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCCTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCG
gi|3                          :                    TAAACACAAGGTCATGGTCATACAGAAATA-----TATATATT--GATA-AT-----G---AATATAT--GACT-GACAAAAAAGTTT--A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAAATA-TACTATATAAGAAACAAAAGAAAAAA-AATAAAAAAATTAATAAGTTG--GTTCT-GTACTTG-----ATT-----------CATATACTAGTGTGAA-GATTTA--------A----A---AAAAAATT-AA-CAAATCT--------ATTTGTA-GA-AAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAATATTGCAA-CATTTTGTTTATAA-CTAAGATTA-TTGT---CCCA-TACAAA-T--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTTTTG-----TAT-CAGTATTTGT-CTTTGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTAAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAT-TCACAATCTGGATT-----TTC---T------CTAA-------GAA--AGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATTACTAGCTTTATTTCGCAATTGCCAATGCAATATATTAGCTTTTCGATTGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTTAATGGAATATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCTTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCGaatattcaaggtaggtcattccacaattttatagtcaagggtaaagctatttctatacgagttgttttcactaacgggaatattaaatttttagagtcagtcctggtttcttaaagaataaggttatgaggccaaagtacatggccgaagtaagtcctgaaattttgggggacttaatccatgaactatttgtaattgaacacacagtttcatgaatttttccttcttattgctaaggttatcccatccaagtcagttataaagtgtcgatcttgatgatttaccctataaactgaagatattaacgtgctgctgctatctggaacatctttcaattaatatgagcaatctctttctgtacaattatcccaaacaacatttgaatattccaaagatgggtcgaacattaagaaaaataattttatcaatgatcccttttaagttgatacttaacattcttaagacatttaatcgttgacatgctttgttattggattggatgtattgtttttccaacatccatctctctggaatattattcctcaagttgcagtatgagtgtcaacatttgaataaatgtccatttgtgaacaattttacccatgataaagaatattttttctactaaatccatatttaatgtttttgattggattaaaatatcaatcactgcccctttattaggaccactgatgatatgtattcttttactcaattcatacattagtcaatgaatttgcagaattgacaatgatccattcatttgacatactataaagagaaagtaatccaatcgcaaagagtcttatggattttctaatgttaggtagagattgtcaatttaataaacaatagaaaagaaagggtcctaaaactgccattgagggaacttcctgaattggttatatctacggggttgatgaaaaacatccaacactaccttttgagttctatcagacaaataattttcaattcaccttaatcaatcttctgaataccataatgctttaattatcgagtaaaaactacccatatgccatctcgttatcaaatgcttgttggagatacagaaacaaatctaacatcgttgtttgtgcaagacagaataatttgtatgatatatttcaaagtaactgattgttgtagaatcacctggttaaaaccccagattgaatatttgttaattatattcatttcttgaccaagtaatgtgttacataagtttaatcataatacatttttcctaagat
gi|4                          :                    TAAACACAAGGTCATGGTCATACGAAAATA-----TATATATT--GATATAT-----G---ATAATAT--GACT-GACAAAAA-GTTT--A-GGTAT-GA-ATA-TA-GAA-TA-TACTATATAAGAAACAAAAGAAA-AA-AATAAAAAAATTAACAAGTTG--GTTCT-GTACTTATTCATATA-----------CT------AGTGTGAAAGATTTTTAAAAAAAA----A---A-----TT-AAACAAATCT--------ATTTGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAATATTGCAA-CATTTTGTTTATAA-CTAAGATTA-TTGT---CACCATACAAA-T--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTT--G-----TAT-CAGTATTTGT-CTTCGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTAAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAC-TCACAATCTGGATT-----TTC---T------CTTA-------GAA--AGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATT-ATAGCTTTATTTCGCAATTGACAATGCAATATATTAGCTTTTCGATTGCCATAGT---TAAAATAACTTTTTAGGTTTAATGGAATATATA--TTTTA-ATGG--ACG-CTTGAAAGATACTATTG-TAGGAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|7                          :                                                                       T-----G---AATGTAAA-GACT-GACAAAAA-GTTT--AAGGTATCGG-ATAATA-GAAATAATACTACACAGGGGA----------AA-AGTAAACAAGTT-------TG--GTTCT-GTACTTG-----GTAAAAAAAAAAAATA------AAAATGAAAGAGTTT--------AGAGAA---A-----TTGAA-TAAATCTTTATTTGTATTCATAAGACAAAGCATTGGCCTATTCATGTAACAATTCTTAAAAATTGCAAGCA-TTTGGTTATATACTG-GATTA-TTGT---CACCATACAAAGTTAAAGTTCTACAAGAATTAAAGGTAATTGTA-------------AAACTTT--GGTGATCATGCAGTATTTGTCCTTTGT-GTACA-ATATGTTTTAAG----ATACTTCAGAAAAA------CGG----GAAGT-GTAG----TATCA--AGAgtgaggattgcagaagagaagaccgagggtattagcgggcaacggatctgaagagcatatctaaatgtagaaagacctttcagaatgactcaaattggtagcgctccaacctccaccacacctttctcatagctccctgaaggccgcataaagctagtcattgtaccaacagaagatatatcgtttcatctactttctgcgaatgattacattttagagtacctggtttcttaaagaataagagttatgaggcaaggtacatggccaaagtaaggcctgcacaatcatgaactattttgtagaacagcacatgcaagtttatgaattttcctttttattgctaaggtatcccatccaagttcattataaagtgtcgatcttgatgaatttacccttaaacctga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgatactttacagcctacagccGT-TTTGGTAGTACAGATAC-TTT--GGGTTGACACTTCATGAAAATAATATAGTATGAGAAGCCGTGGCTAATTCCATTAGACAATTCTAGCAGAGACTAAAACGTCACAA-CAGGATTGAAACTTCATATAGAGAGCTAATGGAACTGAACAAGTCTGCTTAAATAAAGCTGGCAAGCATGAGTAGATTGGTAACTATA----GC--TT-------TAATAT-TTCGCTTATCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|9                          :                                          gtacAATAC----TATATACTATGATA-ATTTACAGCTTAATGTAT--GACT-GACAAAAATATTT--A-GGTAT-GG-ATA-TA-GAAATA-TACCACAC---ACAC----------------ACAAAATTAACAAGTTG--GTTC-TGTACTTG-----GTA-----------CA------AGAATGAAGGATTTT-------------A---A-----TT-AA-CAAACCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTTTAT-AACTG---TCACTTGT---GACAATATAAA


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blockSeqs                     :                                                  C            A     .  TTACAGCT    G  T      .        TA   .  .     C G    .  .      .   T     AGAAACAAAAGAAAAAAATAAAA           AAG  .      T       .       CATATACT                   A      AAAAAAAA                 .  .   CA  .              .          .              .       .           .              A   AGA   C    G             T           .    .               .                   G          .          .   T  .     .    .   .   .         C       AGT               .    .        .           .        .     .      .       TTCTCTTA                        .     .             .           .      A         .     .   .            .             T        .          T                 A      C      .    C    C         T       .
blockSeqs                     :                                                  .            .     .  G           A  T      .        AG   .  .     . A    .  .      .   T     GGAAGTGAAAAACAATTAAC              AGA  .      T       .       CA                         A      AGAGAAA                  .  .   AT  .              .          .              .       .           .              A   GA    .    C                                                                                        .   G  .     .    .   .   .         C       CGG               .    .        .                                                                                                                                                               .        .          C                 .      .      .    .    .         T       .
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Reference ( family-122 )      :                    TAAACACAAGGTCATGGTCATACGGAAATA-----TATATACT--GATA-AT-----G---AATGTAT--GACT-GACAAAAATGTTT--A-GGTAT-GG-ATA-TA-GAAATA-TACTACACAANAA-ACGAAA-------AA----TAAAAAA-TTAACAAGNT-G-GT--TCTTGTACTTG-----GTA-----------CA------AGAATGAAAGATTTT------AAA--A-A---TT-AA-CAAATCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGCAA-CATTTTGTTTATAAACTG-GATCA-TTGT---NACAATACAAAGT--AAGTTCTA-AAGA--TAAAGGTAATTGTAGTTGTAGATTATTAAAATTT--G-----TAT-CAGTATTTGT-CTTCGT-GTACA-ATAT-TTT--GG----ACACTTNAGAAAAA------AGT----GAAGT-GTGG----TTTCA--AGACTACTCT------GAC-AAAAC-TCACAATCTGGATT-----TTC---T------CTAA-------GAA--AGTC--CTTAAATAAATC-----AGCATTA--AGATTGNTAGCTTTATTTCGCAATTG-CAATGCAATATATTAGCTTATCGATTGCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTTTAATGGAATATATA-CTTTTA-ATGGC-ACGCCTTGAAAGATACTATTG-TAGGAAGACTTCG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCGATTGCCA-AGTG--TAAAATAA---TTTATGTTTAATGGCATATATACCTTTTAGATGGCAACG-CTTGAAAGA-ACTAGTGTTAGGAATACTTC
gi|10                         :                                                  -----TATACACT--AGTA-AT-----TT--AAGCTATTAGACTCGACAAAAATATTTTAA-GGTAT-G--ATA-TAAGAAATA-TACAACACAACA---C---A-------AA----TA------TTAACA--GT-GTGT--TCTTGTA-TTG-----GTA-----------CA------AGAATGA--GATTTT------AAA--------TT-AA-CAA-CCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTTTATAAACTG---TCA-CTATGTGAACAATATAAAGaatattaaggtaggtcaaatgccacaatttaatagtcgaatggataagagatatctcataacgaagttgtttttcactaagggaaatattaaaattttagaggtatccctggtttcttaaagacatgcatgagtatagagcaaagtacatggctcaacagtaagtctgcaaatattgggacttatccattagactatttgctaaacatcacaagttttatgattttccttcttattgctaacgatatcctcatccaagtatcgattataaagtgggatcgaacttgagtgaattcttaacgccttaaatcctgaaaattaatacgtgcttgctgcatctgaacatcttcgattaatattatcagttctttctgtacattatcgcaacaacatttacatattcaagtggtgatcagaaactaagaaaattaaaatcctttatcaatgatcccttattgaaaggttgatacttttaacattattacagacatttaatcggtgacatgcttttgatggaatgatgtatatgtttttcctcacatccatcactctggaatatctggattccaattgagtgatggagatgtcaacagttttgtatcatataacattgtcaatgttggaaccaaattttacccatggataagaaatatttttctactaaaaccatataactgtcttttgttggattaaatttcaacttgccatttttattaaacctgatgatgtttttcaagatcattagtcaatgaatttgccagaattgacaatgtcataattgactatatctataaatgagaagtatcatctgcaaagagtcttaaaggatttctatgtctatatgagacgtcattaataaacaaaaggaaaggaaagggtcctaaacagacccttgaaggggactctgaatgtggtatgtctagggttgatgaacaaaccatccaaccacctttttgaattctaatcagacaaataattttcaatcacagtatcattgttctgaatatacacacagtgctttaatttatgtaaaaccctgtgccaactcctatcaatgctttggagatatcacagaaattacaaacgtctaacatcgttgctgtttgtcagacaaattaatatgtatttagatatatttcaataagaactgattagtgtagaatcagcctgtttaaacccagaattgatatttgttaattatatcattttgcttgacgaataatgtacatatgttaaatatatttttttctaagat
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                         -AA-AAAATCT--------ATTTGTA-GACAAAATCT------ATTCACGTA-CAATTacatagaatat
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|7                          :                                                                       T-----G---AATGTAAA-GACT-GACAAAAA-GTTT--AAGGTATCGG-ATAATA-GAAATAATACTACACAGGG----GAAA-------AG----TAAA--------CAAGTTTG-GT--TCT-GTACTTG-----GTAAAAAAAAAAAATA------AAAATGAAAGAGTTT------AGAGAA-A---TTGAA-TAAATCTTTATTTGTATTCATAAGACAAAGCATTGGCCTATTCATGTAACAATTCTTAAAAATTGCAAGCA-TTTGGTTATATACTG-GATTA-TTGT---CACCATACAAAGTTAAAGTTCTACAAGAATTAAAGGTAATTGTA-------------AAACTTT--GGTGATCATGCAGTATTTGTCCTTTGT-GTACA-ATATGTTTTAAG----ATACTTCAGAAAAA------CGG----GAAGT-GTAG----TATCA--AGAgtgaggattgcagaagagaagaccgagggtattagcgggcaacggatctgaagagcatatctaaatgtagaaagacctttcagaatgactcaaattggtagcgctccaacctccaccacacctttctcatagctccctgaaggccgcataaagctagtcattgtaccaacagaagatatatcgtttcatctactttctgcgaatgattacattttagagtacctggtttcttaaagaataagagttatgaggcaaggtacatggccaaagtaaggcctgcacaatcatgaactattttgtagaacagcacatgcaagtttatgaattttcctttttattgctaaggtatcccatccaagttcattataaagtgtcgatcttgatgaatttacccttaaacctga
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatgatactttacagcctacagccGT-TTTGGTAGTACAGATAC-TTT--GGGTTGACACTTCATGAAAATAATATAGTATGAGAAGCCGTGGCTAATTCCATTAGACAATTCTAGCAGAGACTAAAACGTCACAA-CAGGATTGAAACTTCATATAGAGAGCTAATGGAACTGAACAAGTCTGCTTAAATAAAGCTGGCAAGCATGAGTAGATTGGTAACTATA----GC--TT-------TAATAT-TTCGCTTATCGAT-GCCATAGT---TAAAATAAC-TTTTAGGTT
gi|9                          :                                          gtacAATAC----TATATACTATGATA-ATTTACAGCTTAATGTAT--GACT-GACAAAAATATTT--A-GGTAT-GG-ATA-TA-GAAATA-TACCACACA-CAC-AC--------------------AAAA-TTAACAAGTT-G-GT--TCT-GTACTTG-----GTA-----------CA------AGAATGAAGGATTTT------AA---------TT-AA-CAAACCT--------ATTCGTA-GACAAAATAT------ATTCATGTA-CAATTCT-GAAAATTGTAA-CATTTTGTTTAT-AACTG---TCACTTGT---GACAATATAAA
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): AACAGCACAAGTTTATGAATTTTCCTTCTTTAAAATATTGCTAAGGTATCCCATCCAAGCTCATTATAAAGTGTCGATCTTGATGAAATTATACGTGCTGCTGATATTTGACATCTTCAATTAAATTAGGCATCTTCTTCTGTACAATATCCAAAACACATTCTTGAATATATTCAAAGATGATCGAACACTAAGAAAA
Unaligned ( gi|15 ): TCATGGACCAATTTGTGAAAACAAAACAAGTTTATGAATCTCCTCTCTCTGTCTGATAGGGCTTTGCATCCTAGTTCAGCGTATAAACTAACCCGCGGTGAATGAACTCTGCAACCT