lowQualScore                  :         1                          1111111111111                                          11                                                       
lowQualScore                  :         7   66666       33    2 2  5555555555555 33 2     777  777777 33 55 22 555  2   2 11    2 2 33   2     2  5555   2 5555  2 7   55          
lowQualScore                  :         .   .....       ..    . .  ............. .. .     ...  ...... .. .. .. ...  .   . ..    . . ..   .     .  ....   . ....  . .   ..          
lowQualScore                  :         6   22222       22    4 4  7777777777777 22 4     000  222222 44 66 00 444  4   4 44    4 4 22   4     4  0000   4 0000  4 7   99          
consensus                     :  TGTTTATTTTT----ACTTAGTC--ACCG-T-TA-NC----------A--T-GACAT-C-GG------A--A--CGCTCG-TC-GAA-GT-ATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-AAGCA--TTTTAAAGAC
Reference ( gi|9 )            :  TGTTTATATTT----ACTTAGTC--ACCG-T-TA-TC----------A--T-GACAT-T-GG------A--A--CATTTA-TC-AAA-GA-ATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-AGGCA--TTTTAAAAAC
gi|4                          :  TGTTTATTTTT----ACTTCGTC--ACCG-T-TA-TC----------A--T-GACAT-C-AG------A--A--CTTTTA-TC-AAA-GA-ATTA-A-A--ATA-GAGTT-ACTGCATGA-C----TG-AAGCA--TTTTAAAAAC
gi|12                         : gTGTTTATTTTT----ATTTAGTC--AATG-T-TA-TC----------A--T-GACAT-C-GG------A--A--CATTTA-TC-AAA-GA-ATGA-A-A----A-GAGTC-AC----TGA-C----TG-AAGCA--TTTCAAAAt
gi|1                          :  TGTTTATTTCT----ACTTAGTC--ACCG-T-TA-TCTGTACTTATCA--T-GACAT-T-GGTCCTGTA--A--CGTTTA-TC-AAA-GA-ATTA-A-A--ATA-GAGTC-GC----TGA-C----TG-AAGCG--TTTTAAAAACct
gi|8                          : gTGTTTATTTTT----ACTTAGGC--ACCA-T-TA-AT----------A--T-GACAT-C-GG------A--T--CGTTTG-TC-AAA-GT-ATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-ACGCA--TTTTAAAGACt
gi|13                         :  TGTTTGTTTTT-----CTTAGTC--ACCG-T-TA-TC----------A--T-GACAT-T-GA------A--A--CGTT-A-TC-GA--GA-GTTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-AATCA--TTTTTAAAACt
gi|7                          :  TGTTTATTTTT----ACTAAGTC--ACCG-T-TA-GC----------A--T-ATCAT-CAGG------AGGA--CACTTG-TC-AAA-GT-ATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-AAGTG--TTTTAAAGACt
gi|11                         :  TGTTTAT--TT------TTAGTC--ATCG-T-TA-AT----------A--T-GACAT-C-AG------A--A--CACTCA-TC-TAA-AT-ATCA-A-A--ATA-GAGTT-AC----TAA-C----TG-AAGCA--TTTTAAAGACtt
gi|5                          : tTGTTAATTCTT----ACTTAGTC--ACTG-C-TA-AC----------A--C-GACAT-T-GA------A--AATCGTTCATTC-GAA-GT-ATTA-A-A--ATA-AAGCT-CT----TGA-C----CG-AAGCAT-TTTTAAAGACt
gi|2                          : gTGTTTATTTTTTATCATTGGGTCCTACTG-T-TA-TC----------A--TGGACAT-T-GG---------A--CACTCA-TC-ACA-GA-ATTATA-G--ATATAAGTC-AC----TGA-C----TA-AAGCATCTCTTAAAAAt
gi|16                         :  TGTTTAATTTT----TCTTAGTC--ACCG-T-GA-TC----------A--T-GACAT-C-AG------A--A--CACTCG-TC-GAA-G---T---------------TC-AC----TGA-C----TG-AAGCA--TTacttc
gi|19                         :  TGTTTATTTTT----ACTTAGTC--ACCA-T-TA-TC----------A--T-GACAT-
gi|18                         : gTGATTATTTTT----ACTTAGCC--ACCA-T-TG-AT----------A--T-GAC--------------------------------------TA-A-A--ATA-G--TC-AC----TGA-C----TG-AAGCA--GTTTAAAGAC
gi|3                          :  TGTTT---TCT----ACTTAGTC--ACCA-T-TA-AT----------A--T-GACATAT-GG------A--A--CGCGCC-TT-CGA-GATATAA-A-A--ATA--AGTC-AT----TAACC----TG-A
gi|14                         :  tGTTTATTCTT----ACTAAGTC--GCTG-T-TA-------------------ATAT----G------A--A--TGCTTG-TC-AAA-GT-ATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-AAGCA--TTTTAAAGACaatactgtgatgtgaaacttc
gi|15                         :   GTTTATTTTT----ACTTAGTC--ACCG-T-TA-AT----------A--T-GACA--T-GG------A--A--CGCTCT-TC-GAA-GT-ATTA-A-A--AT---AGTC-AT----TAA-CCGCATG-AAGCA--TTtt
gi|6                          :   GCTTATGTTT-------TAGTC--ATCGATGTA-TA----------AGAT-GACAT-C-AG------A--A--CACTCA-TCTAAA-AT-ATCA-ACAACATA-GAGTTAAC----TAA-C----TGAAGGCA--TTTTAAAc
gi|10                         :     TTATTTTT----ACTTAGTC--ATTA-T-TACTT----------A--T-GA-AT-T-GG------A--AA-CTCTCG-TC-AGATGT-ATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-A-TCA--GTTTAAGAgc
gi|17                         :                                                                          --CATTCA-TA-GAA-GT-ATTG-A-A--A-A-GAGTC-AC----TGA-C----TG-AAGCA--TTTTAAAGACcttt





Alignments
lowQualScore                  :                                         1111111111                                                                                                 
lowQualScore                  :            2 4444        22    333 2  1 1111111111   2    88888888888888888 333 33 2 55 2       2 2 33   2     2  4444   2 4444    2   55          
lowQualScore                  :            . ....        ..    ... .  . ..........   .    ................. ... .. . .. .       . . ..   .     .  ....   . ....    .   ..          
lowQualScore                  :            1 5555        99    777 1  0 3333333333   1    77777777777777777 000 44 2 22 2       2 2 11   2     2  7777   2 7777    2   66          
consensus                     :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
Reference ( family-1198 )     :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
gi|1                          :  TGTTTATTTC-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TATCTGTACTTATCATG-ACAT-T-GGTCCTGTA--A--CGT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTC-GC----TGA-C----TGAA-GCG--TTTTAAAAAC
gi|10                         :    gTTATTTT-T----ACTTAGTC--ATTA---T-TACTT---------ATG-A-AT-T-GG------A--AA-CTC-TCGT-CAGA-TGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-A-TCA--GTTT-AAGACt
gi|11                         :  TGTTTATTTT-T----A----GTC--ATCG---T-TAAT----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCAT-C-TA-AATATCA-A-A--ATA-GAGTT-AC----TAA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGACttt
gi|12                         : tTGTTTATTTT-T----ATTTAGTC--AATG---T-TATC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CAT-TTAT-C-AA-AGAATGA-A-A----A-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTCAAAt
gi|13                         :  TGTTTGTTTT-T-----CTTAGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-T-GA------A--A--CGT-T-AT-C-GAGAGT--TA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-TCA--TTTTTAAAACact
gi|14                         :   GTTTATTCT-T----ACTAAGTC--GCTG---T-TAAT----------ATG-A-----------------A--TGC-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGACt
gi|15                         :   GTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TAAT----------ATG-ACAT---GG------A--A--CGC-TCTT-C-GA-AGTATTA-A-A--AT---AGTC-AT----TAA-CCGCATGAA-GCA--TTtt
gi|16                         :  TGTTTAATTT-T----TCTTAGTC--ACCG---T-GATC----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCGT-C-GA-AGT-----------------TC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTc
gi|17                         :  TGTTTATTTT-T----ACTT-------CC--------CC----------AT---------------------------TCAT-A-GA-AGTATTG-A-A--A-A-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
gi|18                         :  TGATTATTTT-T----ACTTAGCC--ACCA---T-TGAT----------ATG-AC--------------------------------------TA-A-A--ATA-G--TC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--GTTTAAAGACt
gi|19                         :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCA---T-TATC----------ATG-ACAT-
gi|2                          : gTGTTTATTTT-TTATCATTGGGTCCTACTG---T-TATC----------ATGGACAT-T-GG------A-----CAC-TCAT-C-AC-AGAATTATA-G--ATATAAGTC-AC----TGA-C----TAAA-GCATCTCTTAAAAA
gi|3                          :     TTGTTTTCT----ACTTAGTC--ACCA---T-TAAT----------ATG-ACATAT-GG------A--A--CGCGCCTT-C-GA-GATATAA-A-A--ATA--AGTC-AT----TAACC----TGAA-acttc
gi|4                          :  TGTTTATTTT-T----ACTTCGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CTT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTT-ACTGCATGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAAACatactgtgatgtgaaacttc
gi|5                          : gTGTTAATTCT-T----ACTTAGTC--ACTG---C-TAAC----------ACG-ACAT-T-GA------A--AATCGT-TCATTC-GA-AGTATTA-A-A--ATA-AAGCT-CT----TGA-C----CGAA-GCAT-TTTTAAAGACt
gi|6                          :  gGCTTATGTT-T-------TAGTC--ATCGATGTATAAG----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCAT-CTAA-AATATCA-ACAACATA-GAGTTAAC----TAA-C----TGAAGGCA--TTTTAAAGt
gi|7                          :  TGTTTATTTT-T----ACTAAGTC--ACCG---T-TAGC----------ATA-TCAT-CAGG------AGGA--CAC-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GTG--TTTTAAAGACc
gi|8                          :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGGC--ACCA---T-TAAT----------ATG-ACAT-C-GG------A--T--CGT-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAC-GCA--TTTTAAAGACtt
gi|9                          :  TGTTTATATT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-T-GG------A--A--CAT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAG-GCA--TTTTAAAAACt





Alignments
lowQualScore                  :                                         1111111111                                                                                                 
lowQualScore                  :            2 4444        22    333 2  1 1111111111   2    88888888888888888 333 33 2 55 2       2 2 33   2     2  4444   2 4444    2   55          
lowQualScore                  :            . ....        ..    ... .  . ..........   .    ................. ... .. . .. .       . . ..   .     .  ....   . ....    .   ..          
lowQualScore                  :            1 5555        99    777 1  0 3333333333   1    77777777777777777 000 44 2 22 2       2 2 11   2     2  7777   2 7777    2   66          
consensus                     :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
Reference ( family-1198 )     :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
gi|1                          :  TGTTTATTTC-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TATCTGTACTTATCATG-ACAT-T-GGTCCTGTA--A--CGT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTC-GC----TGA-C----TGAA-GCG--TTTTAAAAAC
gi|10                         :    gTTATTTT-T----ACTTAGTC--ATTA---T-TACTT---------ATG-A-AT-T-GG------A--AA-CTC-TCGT-CAGA-TGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-A-TCA--GTTT-AAGACt
gi|11                         :  TGTTTATTTT-T----A----GTC--ATCG---T-TAAT----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCAT-C-TA-AATATCA-A-A--ATA-GAGTT-AC----TAA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGACttt
gi|12                         : tTGTTTATTTT-T----ATTTAGTC--AATG---T-TATC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CAT-TTAT-C-AA-AGAATGA-A-A----A-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTCAAAt
gi|13                         :  TGTTTGTTTT-T-----CTTAGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-T-GA------A--A--CGT-T-AT-C-GAGAGT--TA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-TCA--TTTTTAAAACact
gi|14                         :   GTTTATTCT-T----ACTAAGTC--GCTG---T-TAAT----------ATG-A-----------------A--TGC-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGACt
gi|15                         :   GTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TAAT----------ATG-ACAT---GG------A--A--CGC-TCTT-C-GA-AGTATTA-A-A--AT---AGTC-AT----TAA-CCGCATGAA-GCA--TTtt
gi|16                         :  TGTTTAATTT-T----TCTTAGTC--ACCG---T-GATC----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCGT-C-GA-AGT-----------------TC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTc
gi|17                         :  TGTTTATTTT-T----ACTT-------CC--------CC----------AT---------------------------TCAT-A-GA-AGTATTG-A-A--A-A-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
gi|18                         :  TGATTATTTT-T----ACTTAGCC--ACCA---T-TGAT----------ATG-AC--------------------------------------TA-A-A--ATA-G--TC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--GTTTAAAGACt
gi|19                         :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCA---T-TATC----------ATG-ACAT-
gi|2                          : gTGTTTATTTT-TTATCATTGGGTCCTACTG---T-TATC----------ATGGACAT-T-GG------A-----CAC-TCAT-C-AC-AGAATTATA-G--ATATAAGTC-AC----TGA-C----TAAA-GCATCTCTTAAAAA
gi|3                          :     TTGTTTTCT----ACTTAGTC--ACCA---T-TAAT----------ATG-ACATAT-GG------A--A--CGCGCCTT-C-GA-GATATAA-A-A--ATA--AGTC-AT----TAACC----TGAA-acttc
gi|4                          :  TGTTTATTTT-T----ACTTCGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CTT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTT-ACTGCATGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAAACatactgtgatgtgaaacttc
gi|5                          : gTGTTAATTCT-T----ACTTAGTC--ACTG---C-TAAC----------ACG-ACAT-T-GA------A--AATCGT-TCATTC-GA-AGTATTA-A-A--ATA-AAGCT-CT----TGA-C----CGAA-GCAT-TTTTAAAGACt
gi|6                          :  gGCTTATGTT-T-------TAGTC--ATCGATGTATAAG----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCAT-CTAA-AATATCA-ACAACATA-GAGTTAAC----TAA-C----TGAAGGCA--TTTTAAAGt
gi|7                          :  TGTTTATTTT-T----ACTAAGTC--ACCG---T-TAGC----------ATA-TCAT-CAGG------AGGA--CAC-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GTG--TTTTAAAGACc
gi|8                          :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGGC--ACCA---T-TAAT----------ATG-ACAT-C-GG------A--T--CGT-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAC-GCA--TTTTAAAGACtt
gi|9                          :  TGTTTATATT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-T-GG------A--A--CAT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAG-GCA--TTTTAAAAACt


blockSeqs                     :            C TATC        CT    ATG A  C T            G    CAGGAGGA          GCG CG T AG G       T C AC   T     A  TGCA   C CGCA    G   TC
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    TGAAAAT           TC  CA . TA .       . . .    .     .  .      . .       .   T 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  T .            .    TGGAAA            AC  TA . T  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  T .            .    ATGGAA            AT  TG . A  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    CAGAA             GT  CT . G  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    CGGAA             GC  CG . A  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  T .            .    TGAAA             GC  CA . G  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  C .            .    CAGAA             AC  CA . G  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    CAGAA             AC  CT . G  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  T .            .    CAGAA             TT  TA . A  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  T .            .    CGGAT             GT  CA . G  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    TGGAA             AC  CA . A  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  T .            .    GGAA              AC  TG . G  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    TGGA              GT  TG . A  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    A                 AT  TA . A  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  G .            .    .                 .   A  . A  .       . . .    .     .  .      . .       .   . 
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  A .            .    .                 .   .  . .  .       . . .    .     .  .      . .       .     
blockSeqs                     :            . .           .     .   .  T .            .                                                                                   


blockSeqCons                  :                                         **********        CGGAA************
originalCons                  :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
finalCons                     :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACATCGGAA------------CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC





Alignments
lowQualScore                  :                                         1111111111                                                                                                 
lowQualScore                  :            2 4444        22    333 2  1 1111111111   2    88888888888888888 333 33 2 55 2       2 2 33   2     2  4444   2 4444    2   55          
lowQualScore                  :            . ....        ..    ... .  . ..........   .    ................. ... .. . .. .       . . ..   .     .  ....   . ....    .   ..          
lowQualScore                  :            1 5555        99    777 1  0 3333333333   1    77777777777777777 000 44 2 22 2       2 2 11   2     2  7777   2 7777    2   66          
consensus                     :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
Reference ( family-1198 )     :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TANC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CGC-TCGT-C-GA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
gi|1                          :  TGTTTATTTC-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TATCTGTACTTATCATG-ACAT-T-GGTCCTGTA--A--CGT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTC-GC----TGA-C----TGAA-GCG--TTTTAAAAAC
gi|10                         :    gTTATTTT-T----ACTTAGTC--ATTA---T-TACTT---------ATG-A-AT-T-GG------A--AA-CTC-TCGT-CAGA-TGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TG-A-TCA--GTTT-AAGACt
gi|11                         :  TGTTTATTTT-T----A----GTC--ATCG---T-TAAT----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCAT-C-TA-AATATCA-A-A--ATA-GAGTT-AC----TAA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGACttt
gi|12                         : tTGTTTATTTT-T----ATTTAGTC--AATG---T-TATC----------ATG-ACAT-C-GG------A--A--CAT-TTAT-C-AA-AGAATGA-A-A----A-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTCAAAt
gi|13                         :  TGTTTGTTTT-T-----CTTAGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-T-GA------A--A--CGT-T-AT-C-GAGAGT--TA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-TCA--TTTTTAAAACact
gi|14                         :   GTTTATTCT-T----ACTAAGTC--GCTG---T-TAAT----------ATG-A-----------------A--TGC-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGACt
gi|15                         :   GTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TAAT----------ATG-ACAT---GG------A--A--CGC-TCTT-C-GA-AGTATTA-A-A--AT---AGTC-AT----TAA-CCGCATGAA-GCA--TTtt
gi|16                         :  TGTTTAATTT-T----TCTTAGTC--ACCG---T-GATC----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCGT-C-GA-AGT-----------------TC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTc
gi|17                         :  TGTTTATTTT-T----ACTT-------CC--------CC----------AT---------------------------TCAT-A-GA-AGTATTG-A-A--A-A-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAGAC
gi|18                         :  TGATTATTTT-T----ACTTAGCC--ACCA---T-TGAT----------ATG-AC--------------------------------------TA-A-A--ATA-G--TC-AC----TGA-C----TGAA-GCA--GTTTAAAGACt
gi|19                         :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGTC--ACCA---T-TATC----------ATG-ACAT-
gi|2                          : gTGTTTATTTT-TTATCATTGGGTCCTACTG---T-TATC----------ATGGACAT-T-GG------A-----CAC-TCAT-C-AC-AGAATTATA-G--ATATAAGTC-AC----TGA-C----TAAA-GCATCTCTTAAAAA
gi|3                          :     TTGTTTTCT----ACTTAGTC--ACCA---T-TAAT----------ATG-ACATAT-GG------A--A--CGCGCCTT-C-GA-GATATAA-A-A--ATA--AGTC-AT----TAACC----TGAA-acttc
gi|4                          :  TGTTTATTTT-T----ACTTCGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CTT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTT-ACTGCATGA-C----TGAA-GCA--TTTTAAAAACatactgtgatgtgaaacttc
gi|5                          : gTGTTAATTCT-T----ACTTAGTC--ACTG---C-TAAC----------ACG-ACAT-T-GA------A--AATCGT-TCATTC-GA-AGTATTA-A-A--ATA-AAGCT-CT----TGA-C----CGAA-GCAT-TTTTAAAGACt
gi|6                          :  gGCTTATGTT-T-------TAGTC--ATCGATGTATAAG----------ATG-ACAT-C-AG------A--A--CAC-TCAT-CTAA-AATATCA-ACAACATA-GAGTTAAC----TAA-C----TGAAGGCA--TTTTAAAGt
gi|7                          :  TGTTTATTTT-T----ACTAAGTC--ACCG---T-TAGC----------ATA-TCAT-CAGG------AGGA--CAC-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAA-GTG--TTTTAAAGACc
gi|8                          :  TGTTTATTTT-T----ACTTAGGC--ACCA---T-TAAT----------ATG-ACAT-C-GG------A--T--CGT-TTGT-C-AA-AGTATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAC-GCA--TTTTAAAGACtt
gi|9                          :  TGTTTATATT-T----ACTTAGTC--ACCG---T-TATC----------ATG-ACAT-T-GG------A--A--CAT-TTAT-C-AA-AGAATTA-A-A--ATA-GAGTC-AC----TGA-C----TGAG-GCA--TTTTAAAAACt