lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111 111 222222222222 222222222 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2222222222 111111 33333333333333333333333333333333333 222222222222 1111111 11111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2222222 111111111111111 11111 11 1 8888888888888888888888888
lowQualScore : 22 777 0 1 1 222 22 1 1 1111 2 111 2 555555 555555555555 2 2 111111111 2 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333 22 2 555555 2 666 88888888 1 555555 1 333 1 22 1 1 5 1 5555555555 1 000000 222 22 3333 55555555555555555555555555555555555 22 1 3 5555 33 22 1 1 1 444 1 111111111111 1 1 888888 0 1 2 11 1 2 999999 1 333 3333333 1 6 11111 222 1 2 2 2 3 1 2 2222 5555 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 2222 11 2 1 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 3 1 666666666 333333 888888888888 22222 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 666 2 2 0000000 22 33 1 1 22 4 333 1 999999999999999 666 333 33 00000 33 55 33 33 5555555555 666666 1 222 11 33 11 2 77777777777 111 1 1 11 1 4444444 2 1 22 88888888 11 2 22222 2 2 2 555 1111111111111111111111111 1
lowQualScore : .. ... . . . ... .. . . .... . ... . ...... ............ . . ......... . ........................................................................................... ... .. . ...... . ... ........ . ...... . ... . .. . . . . .......... . ...... ... .. .... ................................... .. . . .... .. .. . . . ... . ............ . . ...... . . . .. . . ...... . ... ....... . . ..... ... . . . . . . . .... .... ............................................................................................................................................................... . .... .. . . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . ......... ...... ............ ..... .. . ... . . .... . .... . ... . . ....... .. .. . . .. . ... . ............... ... ... .. ..... .. .. .. .. .......... ...... . ... .. .. .. . ........... ... . . .. . ....... . . .. ........ .. . ..... . . . ... ......................... .
lowQualScore : 22 222 3 5 5 777 11 5 5 7777 2 666 0 555555 444444444444 0 0 888888888 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 000 88 0 888888 0 777 88888888 9 222222 7 000 7 44 7 7 2 7 9999999999 7 666666 888 11 3333 77777777777777777777777777777777777 00 5 0 7777 88 22 8 4 4 333 4 777777777777 3 3 777777 4 3 6 88 3 6 777777 3 888 5555555 3 5 22222 333 3 6 6 6 9 5 6 7777 5555 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 4 6666 66 3 1 3 444444 99999 1 55 222222 8888888 66 1 1 3 1 000000000 333333 000000000000 99999 66 1 111 1 2 4444 1 8888 1 666 2 2 5555555 66 11 1 1 77 4 222 2 444444444444444 666 888 33 44444 44 55 22 11 5555555555 555555 3 333 88 22 77 8 99999999999 999 1 1 44 1 5555555 1 1 55 33333333 55 4 55555 4 2 9 888 3333333333333333333333333 0
consensus : AAAAAA--AAA-T-AGGTGT-GTTTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC--GAAAATAAT-GTA------GGGTNTGNGGTTCCGAT-T-ACATCTCG-----AAAATAATGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------AA-----T---------TT-TT---TTTTT--GC--T-TT------T-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----C-----TC-G---C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTAT-TC-A---TA-AT---A---A---A-T-A--C-G-TTTGTG-TGT-A--CT-G-A----C-AT-GTA--A-C-----A-T-C---G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----AAA--A--A--T-AA---A----A--A--A---AAT--A--A-----A--AACGAAA-T--AAAGC-----AAAA----AANNTTNNNNTNNNNCNACTNAATNNNNNNNNNAGNNNNNNNANANNNNGNNNNTNNNNANNNNNNNNAANNNTNNC--GGA-A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-A---T---A--A--G-G-ACT--GGA---AT-TGA---T---T-----TAAAA---A---AA-TT---AGG--GTCGG--G--A----------G------A-A---AAT--TT--TA-GGGTC-GGT-----------CGG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-A------C--C-TATT---TTTT-TTT-TTT-TT---TGGCCTAA-ACA------TCAGGTTACACCAAATGTCA
Reference ( gi|3 ) : AAAAAA--AAA-T-AGGTGT-GTTTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC--AAAAATAAT-GTA------GAGNNNNNNNNNNCGAT-T-ACATCTCC-----AAAATAATGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------AA-----T---------TT-TC---TTTTT--GC--T-TT------T-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----C-----TC-G---C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-AGTGTAT-TC-A---TA-AC---G---A---A-T-A--T-G-TTTGTG-TGT-A--CT-G-A----T-AT-GTG--A-T-----A-T-C---A-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----AAA--T--A--TGAA---A----A--A--A---AAT-GA--A-----A--AATGAAA-T--AAAGC-----AAAA----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GGA-A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--GG-A-A---T---A--A--G-G-ACT--GAA---AT-TGA---T---T-----TAAAA---A---AA-TT---AAG--GTCTG--G--A----------G------A-A---AAT--TT--TA-GGGTC-GGT-----------CGG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-G------C--C-TATT---TTTTATTT-TTT-TT---TGGTCTAA-ACA------TCAGTTCAT-CTAAATGTCATAAAAATATCTAGAATTGGTATTAATTTATTAACAACTTGATACTTA
gi|10 : AAAAAA--AAA-TTAGGTGT-GTTTCC-G---AT--T-A-C
gi|7 : aaaaaaaggatgtgattccgattacatctcaaaataatgtagggtttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttggAAAAAA--AAA---AGGTGT-G--TCC-G---AT--T-A-Cggct
gi|15 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaaaaaataatgtagggtcgggggtcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccggAAAAAA--AAA-T-A-GCGT-GTTTCC-G---AT--T-A-CATAGTCC-TC---GAAATAAT-ATA------GGGTCGGGGGTCCGGA-----------------AAAAAAA---------------------------------------------------A-----AA---A-------GA-----T---------TT-TT---TTTTT--GC--T-TT------T-ATTTTTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-TGCC---T---TG--C----C-----TC-GC--C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-AG-GT-T-TC-A---TA-AC---A---A---A-T-A--T-G-TTTGTG-TGT-A--GT-G-------------G--A-TA----A-T-C---G-A---GT-GTTT-CAG-TA-T-GGA-T----T----AAA----------AA---A----A--T--G---AAT-AA--AGTT--A--NNNNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--GGA-A-ATTT----T--ATA-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-A-A---------G------AT---C-G------AG-----A--A-A---CG-A-AG-----G-TCAAAA-CG--GGAA-A---T---G--A--G-G-ACggccttacactaaatgtct
gi|14 : AAAAAA--AAA-T-AG-CGT-GTTTCC-G---AT--T-A-CATAGTCC-TC---GAAATAAT-ATA------GGGTCGGGGGTCCGGA-----------------AAAAAAA---------------------------------------------------A-----AA---A-------GA-----T---------TT-TT---TTTTT--GC--T-TT------T-ATTTTTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-TGCC---T---TG--C----C-----TC-GC--C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-AG-GT-T-TC-A---TA-AC---A---A---A-T-A--T-G-TTTGTG-TGT-A--GT-G-------------G--A-TA----A-T-C---G-A---GT-GTTT-CAG-TA-T-GGA-T----T----AAA----------AA---A----A--T--G---AAT-AA--AGTT--A--NNNNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--GGA-A-ATTT----T--ATA-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-A-A---------G------AT---C-G------AG-----A--A-A---CG-A-AG-----G-TCAAAA-CG--GGAA-A---T---G--A--G-G-A
gi|19 : aaAAATAA--AAG-T-AGTTGT-CTTTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC--GAAAATAAT-GTA------G
gi|29 : AAAAAA--AAA-G-AAG-GT-GTTTCC-G---AT--T-A-Cgcttttattttttattcagtaaagatttgccttgcattaccaggaacgatcgataaatacgtttgtgtaacatgtaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaaaatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttcgctaatttgaatatcgagcccgaacttattagagattgaaaaatgaagtgtacgagaattaaggactggaattgattttttaaaaaatagggtcggga
gi|13 : gggattaaaaatagattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatatcgagacagaacttattagagatcgaaaaaggaagtgtacgagaattactgactggaattgattttaaaaaatgagggtcgggagaaaattttagggtcggtcagAAACAA--AAA-C-A--TGC-GTTTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC--AAAAATAggcc
gi|6 : aAAAAAA--AAA-A-AGG-AT-GTTTTC-C---AT--T-A-CAT----A-TC--GAAAAAAAT-GTA------GAggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|8 : AAAAAA--AAA-T-AGGT-T-GTTTCCAG---AT--T-A-tcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|51 : aaaaacaaattagggttgtggtttcgatatacatatgaaaaaaaatgtattttattttttaacttttatttgtattcactataattcggtaacgaatttgccttagcatcacgcaggaaacgggaagtatttcacaataaattacgctttgtgtgtactgacatgtgacatcgaagtgtgttcagctatggattaaaaataaatcaaaagcaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatttgtaatatatcgacaccgaacttatataagatgaatcgaaaaacaagtgtacgagaaattaaaaggacttggaatgactaatgaaagttagggccggcgagaaatttttacggcggtcgggtAAAACA--ATA-T-AGATGT-GTTTTC-G---AT--T-A-Ctttttggcttatat
gi|47 : atcgggagaaaattttagagtcggtgggAAGAAA--AGA-T---GTGT-GTTTCC-G---AT--T-A-C-T----C-Tgg
gi|46 : tggaattgattaaaaatttttagggacggtAAAAAA--AAATT-AGTTAT-GTTTCT-G---AT--T-A-TAT----A-TA--AAAAATAAT-GTA------GGGcttggcc
gi|24 : aaAAAAA--ACA-T-AGGCGT-GTTTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC--GAAAATAAT-GTA------GGGtcgaggtctgaaattc
gi|11 : aaaccAAAAATCAAT-T-AGTTGT-GTTTCC-G---AT--TAA-CAT----C-TC----GAATGAT-GTACGGTCGGGGTCGGAAAATTTTAT-T-ATAT----------AAATTAT-TA-------------------------------T-------T---------------------------------T---------TT-TT---TTTTT--TT--T-TT------T-T---TTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A--------T---TG--C----A-----TT-GTAAT------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-AACATGT-CC-A---TA----------T---A-T-A--C-A-TTTGGG-T-------T-GAA----C-AT-GTA--A-C-----A-T-C---G-A---G--G-TT-CAG-TA-TTGGAGT----T----AAA--A--A--T-AA---A----T--T--A---AAC-CA--A-----A--AGCGAtcaggattttttattcagtaaatatttgccttgcctcaccgggaacgaagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtgatatcgagtgttcagtatgtgattaaaagtaaattgaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatattgagcctgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgggaatgaggactgaaatt
gi|54 : AAAAA--AAA---AGGTGT-GTTTCC-G---AT--T-A-Cnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaatttctggtatatgatatctaactgaacttattaagagattgaaaaagcgaagtggtacgagaattatgtgcggaattgattctaaaaaatagggttggagattttagggtcagtcgaaacacacttttttttttt
gi|10 : gAAAA--AAA---GGATGT-GATTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC---AAAATAAT-GTA------GGGggcttgagt
gi|20 : AAAA--AAA---AGGTGT-GTTTCT-T---AT--T-A-Ctttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|12 : tattcagtaaatatttgccttgcctcaccaggaacgaagtgtattgataataaatatgtttgtgtgtattgatatgtactattgtctatcgaatgttcagaatgggattaaaaataaattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatatcgagccagaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtaaaaactaaaattgattaaaaaaataagggttgggaagaaattttagggtgggttggAAAA--AAA-T-AGGTGT-GTTT-C-G---AT--T-A-CAT----A-TC--GAAAAAAAA-GTA------G-GTGTGGGTAGGCAAT-T-
gi|18 : AAAA--AAA---AGCCGT-GTTTCC-G---AT--T-A-CAC----C-TT--GAAAATAAT-GTG------GGGgttatatttttaccgttgatgttttattcacgataaatcgtactaatctgccgcatcaccaggaacaagagtattcacaataaataactgggattgacacgtgaacatcgaggttcagtatgggagtaaaaataaaagtttaagcaaaaaaaagaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacccaatcctttggtttgaaatatcgagccgaacttattagagatcgaacacgaatgaaggactggaattgagtaaaagttagggtcgggagaaaaattttagggtcgggtcgggataattggaattaaccccattatttttttttt
gi|32 : tAAAA--AAA-C--GCTGC-GTTTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC--GAAAATAAT-TTG------GGGtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|4 : acAAA--AAA-T-AGGTGT-GTTTCC-G---AT--T-A-CAT----C-TC--AAAAATAAT-GTA------GGGtcggaaagcgtctttagtttttatttattttttttttcttttttattttgttattgcagtaatacttgcattacaatcaccaatctgaactagaacgaacaatattcatgattatatatattttgtgtgtaattgacatgcgcattgagtattcagtattgggcttaaaaaataattttaagcaaa
gi|50 : AAA--AAA-T-AGTTGT-GTTTCC-A---AT--T-A-CAT----T-TT--GAAAATAAT-GTA------Gttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|7 : AA--AAA-T-AGGTGT-GTTT-T-GAAAATAAT-A-CATA---A-TCA-AAAAATAAT-GTA------GGGgatcaggggttgaaa
gi|36 : acAA--ATA-T-AGGCGT-GTTTTC-G---AT--T-A-Ctcgggggtcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccgggtaatcggacacaccttttttttttggccttacactaaatgtct
gi|2 : tgaatatcgagccctaaactttattaggattgaaaaaaaacaaagtacacgagaattgagggactggaacatgattaaaaattcagggtcggccagtcaatttgttagggtaggttggA--AAA-T-AGGTGTAGTTTCC-G---AT--T-AACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTA------GAGTGCGGGGAAG-G----------TCC-----GAAAAAAAAT-----------------------------------------GG-----A-----AA---A------------------------TT-TT---TTTTT--GC--T-GT------A-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--GATAA-AA-T----------A-TTTGCCCT---TG--C----C-----TC-G---C------C-----A------------GA-A-C-A--AGAGTGTATGTC-A---CATAC---AT--G---A-T-A--TCG-TTGGTGTTGT-A---T-GTA----T--T-GTG--A-T-----A-T-CGCGG-A---GT-G-TT-CAGATA-TGGGA------A----AAA--A--A--TGAGCT-A----A--A--AGCTAA--GA--AGCACCA--AAAGAAA-C--AAGAT-----AAAA----at
gi|23 : TGT-GTTTCA-G---AT--T-A-CAT----C-TT--GAAAATAAT-TTA------GGG--TCGGGGGTCGA-----------------AAAATA--------------------------------------------C---------------------------A-----T---------T-------TTTTT--GG--T-TT------T-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----CTTGCATC-A---C------C-----A---------G--GA-A-C-A----------------------------------------------TTTGTG-TTT-A--CT-G-A----C-AT-ATA--A-C-----A-T-C---G-G---GT-G-TT-TAG-TA-GTGGA-T----T----AAA--T--A--TAAA---gannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|24 : aatC--AAAAA--AC-ATA------G---GCGTGTTTCCGAT-T-ACATCTCG-----AAAATAATGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A----------------------------------------------------------------TTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----C-----TT-G---C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTAT-TC-A---TA-AT---A---A---A-T-A--T-G-TTTGTG-TGT-A--CT-G-A----T-AT-GTG--A-T-----A-T-C---G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGTGA-T----T---------------------------A--A--A---AGT-----------A--AAT-----T--GAAGC-----AAAA-----------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GGA-A-ATTT----G--A-A-T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--GG-A-A---T---G--A--G-G-ACT--GAA---AT-Tttaaaccacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaatatttgaatatcgagcccaaacttattagagattaaaaaacgaagtgtacgaggatgaaggattggaattga
gi|8 : aaac--AAAAACAAA-TTA------G-GGTTGTGGTTTCGATAT-ACATATGA-----AAAAAAATGTA-------------------------------------------------------------------------T---------TT-TA---TTTTTTAAC--T-TT------T-A---TTT--------G-T--------A---TT-CA--C-T-ATAA-TTCGGTAACGAA-T------T---TG--C----C-----TTAG---CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-AGTAT-T-TC-A---CA-AT---A---A---A-TTA--C-GCTTTGTG-TGT-A--CT-G-A----C-AT-GTG--A-C-----A-T-C---G-AAGTGT-G-TT-CAGCTA-TGG-A-T----T----AAA--A--A--TAAA---T----C--A--A---AAG-CA--A-----A--AANNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATT--TGT-A-AT-----------A-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATATAAG-ATG-------A------AT---C-G------AA-----A--A-A---C--A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-AAT-T---A--AAAG-G-ACTT-GGA---AT--GA---C---T-----AATGA---A---AG-TT---AGG--GCCGGC-G--A----------G------A-A---ATT--TT--TA-CGG-C-GGT-----------CGG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-C-A----A------C--C-TATT---TTT--TTT-TTT-TT---TGGCTTA
gi|46 : --AAAAAAAAT--TA------G---TTATGTTTCTGAT-T-ATATATAA-----AAAATAATGTA--------G----G---------G-------T-------CGtat
gi|19 : aaaAAATAAAAGTA------G---TTGTCTTTCCGAT-T-ACATCTCG-----AAAATAATGTA--------G----G-------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-G----------A-T------T---TG--C----C-----TT-G---CATTAC-C-----A---------G--GA-A-C-G--A---------TCGA---TA-A------------A-T-A--C-G-TTTGTG-TA----------A----C-AT-GTA--A-C-----A-T-CC--G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----AAA--A--A--TAAATTAA----AGCA--A---AAT-NN--N-----N--NNNNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAATTTCGCT------A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---T-G------AA-----A--A-A---TG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-AT--T---A--A--G-G-ACT--GGA---AT-TGATTTT---T-----TAAAA---A---A---T---AGG--GTCGG--G--A----------aggtctgaaattc
gi|10 : A------AAGGATGTGATTCCGAT-T-ACATCTC------AAAATAATGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------AT-----T---------TC-TT---TTTTT--GC--T-TT------A-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--A-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----CTTGCATC-A---C------C-----A---------G--GACACC-G--A-AGTGTAT-TC-A---GA-AT---A---A---A-T-A--T-G-TTTATG--GT-A--CT-G-A----T-AT-GTA--A-C-----A-T-C---G-A---GT-G-TC-CAG-TA-TGGGA-T----T----GAAATT--A--TTAA---A----T--T--A---AAG-GA---------------AAA-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GGG-A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------ATAAAA-A------AA-----A--A-A---C--A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-AT--T---A--A--G-G-ACT--TGA---AT-TGA---C---T-----AAAAA---A---AA-TT---AGG--GTCAG--G--A----------G------A-A---AAT--TT--TA-GGGTA-GGT-----------TGG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-A------C--C-TA---------ATTT-TTT-TT---TGG
gi|13 : aaaaCGAT-T-ACATCTCA-----AAAATAG-GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG------------------------------------------TT-TT---TTTTT--GT--G-TT------T-T---TTT--------T-T------T-A---T--CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--T----C-----TT-G---C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-AGTGTAT-TC-A---TA-AT---A---A---A-T-A--T-G-TGTG-G-TGT-G--AT-G-G----A-AT-GTG--A-------A-A-C---ACG---GT-G-----AG-CA--AGGA-T----T---------------------------A--A--A---AAT-----A-----A--GAT-----T--AAAGC-----AAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GGA-A-A-TT----GATA-A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--TA-G-A---------G-------T---G-A------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-TG--GG-A-A---T---G--A--G-G-ACT--GGA---A--TGA---T---T-----T-----------TG-TT---A------C----A--A----------G------A-A---AA----T--TA-GGTTC-GGT-----------CGG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-A------C--ct
gi|12 : aaaacaaaaacatgcgtttcCGAT-T-ACATATCG-----AAAAAAAAGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------AA-----T---------TG-TTATATTTTT--AC--C-GT------TGA---TGT--------T-T------T-A---TT-CACGA-T-A-AA-TCGTACTA---A-T------C---TG--C----CGCA--TC-A---C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A--GAGTAT-TC-A---CA-AT---A---A---A-T-AACT-G---------GG-A--TT-G-A----C-AC-GTG--AAC-----A-T-C---G-A---G--G-TT-CAG-TA-TGGGA-G----T----AAA--A--A--TAAA---AGTTTA--AGCA---AA---A--A-----A--AA-GAAA-T--AGNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCCAATCCTTT--GG-----TTT----G--A-AAT-AT------CGA-----G-C--C--------------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G-------A-----A--C-A---CG-A-A-----TG-------------------------A--A--G-G-ACT--GGA---AT-TGA---G---T--------AA---A---AG-TT---AGG--GTCGG--G--A----------GA-----A-A---AAT--TT--TA-GGGTCGGGT-----------CGG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-T-A--A-C------C--C-CA-------TTATTT-TTT-TT---T
gi|4 : aaaaaaataggtgtgtttCGAT-T-ACATCTCA-----AAAATAATGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------TT-----T---------TT-TT---TTTTT--AC--T-TT------T-A---TTTC-------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----C-----TT-G---C------t
gi|9 : aaaaaataggtgtgtttcCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATA-TGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA----------------------------TT-TT---TTTTT--AC--TGTT------T-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--C-T-ATAA-T----------GCC------T---TG--C----A-----TC-A----------C-----A---------G--GA-A-CGA--A-AGT-TAT-TC-A---CA-AT---A---A---A-T-G--C-G-TTTG-G-TGTAA--CT-G-A----CAAT-GTG--A-C-----A-TCC---G-A---GT-G-TT-CAG-TACTAGGA-T----TTAAAAAA--T--AATTTAA---A----G--C--A---AA---A--A-----A--AA-GNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG----ATTG----G--A-A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-TA-GAA---------G------ATA--C-G------AA-----A--A-A---TC-G-AG----TA-CG---A-CG--AG-A-ACT-T---A--A--G-G-AC---GGG---AT-TGA---G---T-------AAA---C---AA-TTTA-AAG--GTCGG--G--GACATTAGGTCG------A-A---AAT--T------AGATC-G-------------CGG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-C-AT-C-A------C--CATATT---TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|18 : aaaaaaaatacggtggtgttcCGAT-T-ACACCTTG-----AAAATAATGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------AA-----T---------TT-TT---GTTTT--GC--------------------T--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-C------T---TG--C----C-----TT-A---C--------------------------A-T-C-A---------CT-TC------A-AC---GATAA---A-T-A--A-A-TTTGGG-TGT-A--CC-G-G----C-AT-ATA--C-C-----A-T-C---A-A---GT-G-TT-TAA-TA-TTGGG-T----T---------------------------A--A--A---AAT-----------A--AAT-----T--AAAGC-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATGCT--CGATA-ATTT----G--A-A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------GT---T-G------AA-----A--A-A---T----------T-------------GG-A-A---T---------G-G-ATT--AAACATAT-TTA---G---TGTCAGTAAAA---A---AA-T-----AG--G--TG--G--A----------A------ACACCTAAT--TT--T
gi|32 : taaaaaaaagccgtgtttcCGAT-T-ACATCTCG-----AAAATAATTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTAG-----TTTTTATTTATT-TT---TTTTT--TCTTT-TT------T-A---TTT--------TGT------T-A---TTGCA--G-T---AA-T----------A-C------T---TG--CATTACAA---TC-A---C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-ACAATAT-TC-A---TG-AT---T---AT--A-T-A--T-ATTTTGTG-TGTAA--TT-G-A----C-AT-GCG----C-----A-T-T---G-A---GT-A-TT-CAG-TATTGGGC-T----T----AAA--
gi|50 : acaaaaaaacgctgcgtttcCAAT-T-ACATTTTG-----AAAATAATGTA--------G----G---------A-------T-------CAG-----aaataattttaagcaaa
gi|23 : aaaaaatagttgtgtttcGAT-T-ACATCTTG-----AAAATAATTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------AA-----T---------ACATT---TTTTT--GG--T-TT------T-A---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----C-----TT-G---CATCAC-C-----A---------G--GA-A-C-A----------------------------------------------TTTGTG-TTT-A--CT-G-A----C-AT-ATA--A-C-----A-T-C---G-G---GT-G-TT-TAG-TA-GTGGA-T----T----A--------------------------------AAT---------------ATAAAT-T--AAACC-----ACAN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--AAA-ATATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---T-A------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-G-A---TG--A--A--G-G-ATT--GGA---AT-TGA---gggttgaaa
gi|6 : aattgtgtttcaAT-T-ACATATCG-----AAAAAAATGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------AAAATTTT---------TT-TT---TTTTT--GC--T-TT------T-A---TTT--------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T-A-AA------------A-T------TGCCTG--C----A-----TC-A---C------C-----A---------T---A-A-C-A--A--GTGTAT-TC-A---CA-AT---A---A---A-T-A--C-G-TTTGTG-TGT-A--CTTG-A----T-A--GTG--AAC-----A-T-CC--G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----AAA--A--A--TAAA---
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttcc-----AAAATAATGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------AA-----T---------TT-TT---TTTTT--TT--T-TTGTTAATT-A---TTT--------T-T------TTA---TT-CA--G-T-A-AAAT----------A-T------T---TGGCC----C-----TT-G---CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A--GTGTAT-TC-A---TA-AT---A---A---A-T-A--T-G-TTTGTG-TGT-A--CT-G-A----T-AT-GTA--A-T-----A-T-C---G-A---GT-G-TTTCAG-TA-TGA-A-T----T----AA----------GAA---A----T--A--A---ATT-AA--AGC---A--AANNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT--G-A-A-TTTT----G--A-A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TT-A-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--GG-A-AT--T---A--A--G-A-ACT--AAA---AT-TGA---T---T-----TAAAAC--A---AA-TT---AGG--GTGGG--A--G----------G------A-A---AAT--TT--TA--GGTC-GATC----------CGG---G-T-AA--TC-G-------G--A-C-A--C-A------C--C-T-----------TTT-TTT-TT---TGGCCT-T-ACA----------------CTAAATGTCttaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|16 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaa-------AA-----T---------CT-TT---TTTTT--AC--A-TT------T-A---TTT--------T----------A---TT-CA--C-G-A-AA-TTCGACA----A-T------T---TG--C----C-----TT-A---CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-AGT-TAT-TC-ACAGTA-A--------A---A-T-A--C-G-ACTG----AT-A--CT-G-A----C-AT-GTA--A-C-----A---C---G-A---GT-G-TT-CAG-AA-TGGGA-T----T----AAA-----------------------A--A---GAT-----------A--AAT-----T--ACAGC-----AAAA----AAAATTAACATTTGACGACTGAATGTTACTCCAAGTAACTTAATACACGGCTTTTCTTGAAAGCACGAAGACACATCTTGGA----TTT----G--A-A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-ACAG----TG-T----A-TG--AG-A-A---T---T--A--G-G-ACT--GGA---AT-TGGT--T---T-----TAAAAT--A---AACTT---AGG--GTCGGACG--A----------G------A-A---AAT--CTG-TA--GGTC--GT-----------CGG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-t
gi|11 : cggagcgg-----T---------TT-TT---TTTTT--GC--T-TT------T-A---TTT-------------------A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T----G--C----A-----TT-G---TAAT---C-----AAAA------G--GA-A-C-G--A-AACATGT-CC-A---TA-T------------A-T-A--C-A-TTTGGG-T-------T-G-AA---C-AT-GTA--A-C-----A-T-C---G-A---G--G-TT-CAG-TA-TTGGAGT----T----AAA------------------------------AAT-----------A--AATTAAA-CCAAAAGC-----GANN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATTTCTGGT--------ATAT----G--A---T-AT------CTA-----A-C--T--------------GAA--CTT-AT-TAAG-A---------G------AT---T-G------AA-----A--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG--AG-A-A---T---T--A--T-G-TGC--GGA---AT-TGA---T---TC----TAAAA---A---A---T---AGG--GT-TG--G--A----------G-------------AT--TT--TA-GGGTC-AGT-----------C------------------------GAAA-C-A--C-A------C--T-TTTT---TTTTa
gi|25 : aaaaatcaattagttgtgtttccgattaacatctcgaatgatgtacggtcggggtcggaaaattttattatataaattattattttttttttttt---TTT--------T-T------T-A---TT-CA--C-T-ATAA-TTCGGTACCAAA-T------T---TG--C----CTTGTATC-A---C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTGT-TC-A---CA-AT---A---A---A-T-A--C-G-TTTGTG-TGT-A--CA-G-A----C-AT-GTG--A-C-----A-TCC---G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----A------------AA---A----A--T--A---AAT-T---A-----A--AGCAAAA-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG----ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CA--AG-A-ATATT---A--A--G-G-ACT--GGA---AT-Ttt
gi|20 : ------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-T------T---TG--C----C-----TT-G---C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTAT-TG-A---TA-AT---A---A---A-T-A--T-G-TTTGTG-TGT-A--TT-G-A----T-AT-GTACTA-TTGTCTA-T-C---G-A---AT-G-TT-CAG-AA-TGGGA-T----T----AAA--A--A--T-----------------A---AAT-TA--A-----A--G-CAAAA-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GGA-A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A---------------------A--A-A-ACT--AAA---AT-TGA---T---T------AAAA---A---AA-TA---AGG--GTTGG--G--A----------A------G-A---AAT--TT--TA-GGGTG-GGT-----------TGG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-C-A--C-A------C--C-TTTT---TTTT
gi|35 : -A---TT-CG--G-T-A-CA-A----------A-T------T---TG--C----C-----TT-G---CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTAT-TC-A---CA-AT---A---A---A-T-A--C-G-TTTGTG-TGT-A--CT-G-A----C-AT-GTA--A-C-----A-TCC---G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----AAA--A--A--TAAA---T----T--A--A---AGC-AAG-A-----A--AATGACA-T--
gi|31 : ata-T------T---TG--T----C-----TT-G---TAT----C-----ATG-------G--GG-A-C-AG-A-AACTTGT-CC-A---TG-AT---A---T---A-T-A--C-A-TTTGTG-AGT-A--TT-G-A----C-AT-GTA--G-C-----A-T-C---A-A---GT-G-T---AA-TG-TTGGG-T----A----AAA--A--A--Ttttgacaactgattttacccta
gi|27 : tt---TG--C----A-----TC-A---C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTAT-TC-A---CA-AT---A---A---A-T-A--T-G-TTTGTG-TGT-A--CT-G-A----C-AT-GTA--A-C-----A-TCC---G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----AAA--A--A--TAAATTTA----AGCA--A---AA---N--N-----N--NNNNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAGATTTC--GGT-A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---G-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-C---TTA-A--A--G-G-ACT--tgcaatctttttaaatcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaatgatttgaatattgagcatgaact
gi|30 : tttgtcaG--C----A-----TC-A---C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTAT-TC-AGT-TC-ACATTA---A---G-T-A----G-TTTGTG-TGT-A--CC-G-A----C-ATGGTA--A-C-----A-TCC---G-C---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TATAAT----AAA--TTAA--TTAA---A----A--A--G---GNN-NN--N-----N--NNNNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATATCGAATATTAG------A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-G-A---------
gi|28 : -----TC-A---C------C-----A---------G--CT-A-C-A--A--GTG-AT-TC-A---CA-AT---A---AC--A-T-AA-C-G-TTT----TGT-A--CT-G-A----T-----TA--A-------A-T-C---C-A---GTTG-TTTCA---A-TGGGG-T----T----AA------------A---A----A--T--A---AAT-TA--C-----AGCAA-GANN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG--G-----ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-TA-G-A---------G------AT---C-GA-----AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-A---TG--A--A--G-G-ACT--GGA---AT-
gi|4 : tgtcacaaattgcttca------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-AGTGTAT-TC-A---TA-AT---A---A---AGT-A--C-GCTTTGTA-TGT-AAGTT-G-AAA--C-AT-GTA--A-C-----ACT-G---G-A---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T----T----AAA--A--A--T-----------------------T-GATTA-----A--AGCAAAA-G--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GGA-A-ATTT----G--A-A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-TACA-A---------G------AT---C-A------AA-----A--A-A---GG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-ACA---TTG-A--ACCT-G-ACT--GGA---AT-TGAATTT---T-----TAAAA---A---A---T---GAG--GT-GG--G--A----------G------A-A---A----TT--TA-GGGTC-GGT-----------C-A---G-T--A--TC-G-------GAAACC-A--C-A------C--CTTACT---TCT--CTT-TTT-TT---TG
gi|26 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--A-AACGTAT-TT-G---CG-AT---G---A---A-T-ACAT-GATTTGTG-TGT-A--CC-G-A----C-AT-GTA--A-G-----A-T-C---T-T---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGG-T----T----AAA--T-----TAAA---A----A--A--A---AAG-AA--A-----A--AAAAAAA-A--GAAGN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAATTTCC--AGC-A-ATTT----G--A-------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-TA-G-A---------G------AT---T-G------AA-----A--A-A---CA-A-AG----TG-T----A-TG--AG-A-AT--T---A--A--C-G-ATT--GGA---AT-TGA-------T-----TAAAA---A---GT-TT---AGG--GTC-G--G--A----------
gi|1 : atg-TC-A---TC-AC---G---ATAAA-T-A--C-A-TT-GTG-T-T-A--C--G-A----C-AT-GT---A-C-----A---C---ACG---GT-A-TT-CAG-TAGTTGGA-T----TGAGAAAA--T--AA-TTAA---ACC--A--A--A---AAN-NN--N-----N--NNNNNNN-N--NNNNN-----NNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAACAATTCC--GGTTA-ATTTAATTG--A-A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-TA-G-A---------A------AT-----A------AA-----A--G-A---CG-A-AG----TG-T----A-TG--AG-A-A---TG--A--A--G-G-ATT--G-A---AT-TGA---T---T-----AATAA---A---AA-TT---TAGCAGTCGA--T--A----------G------A-A---AAT--TT-----AGGTC--GT-----------C-G---G-T-AA--TC-A-------GAAA-C-A--C-A------C-----A---------ATTG-TTT-TT---TGTCCTAA-TTAAGTGTGTCAGATTACACCAAATGTCAcacacacctaatatttcttttt
gi|22 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcata-T-A--T-A-TTTACA--GT-A--CT-A-A----T-AC------A-C-----A-T-----A-A---GT-G-TT-GAG-TA-TTGGG-T-----------------------A---A----A--A--A---AAT-TA--A-----A----TAAACCT--AAAACCACCTAAAA----AACTTTTTTTTGGTCCTACTTAATACATGATTCAGGCTTCGGAAAGCATGGCCATTGCTATTTTGAAAATTTCAGAT------A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-TT-G-A---------G------A--------------------A--A-A----G-A-AG----TG-T----A-TG-----------T---A-----------T--GTA----------------T-----CAAAC---A---AA-TT---AGC--AT-TG--G--A----------ATAATTTA-A---AAC--TT--TA-CAGTC-GAT-----------CAA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-C-A--C-A------C--C-TA-----------TT-TTT-TT---TGGCCTAA-GCA------actgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|21 : gttc-A--CT-G-ACAATT-AT-GTT--G-T-----A-C-C---A-----GT-G-TT-CAG-TA-TTGGG-T----A----AAA--A--A--CTAA---A----A--T--A---AATCCC--A-----A--AATGACA-T--GAcactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|29 : agta--GGA-A-ATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---GG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-A---TT--A--C--T-G-ACT--GGA---AT-TGA---T---T-----TTAAA---A---AA-TG---AGG--GTCGG--G--A----------G------A-A---AAT--TT--TA-GGGTC-GGT-----------CAG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C---------------------CTTCTTT-TTT-TT---TGGCCttcgacaattgatttcacccccatttaatacataaattctggcttcagagagcacgaccccatattgaagagtcccaataataccagtacatgtatgattataaagctcaaacttacaagatttttttatatgagaaatgaagtgtgcataaattataaggactggaatttgtccaaaaaattagggccgggaggaaattatagggacggacgggtcccaggaaatcatagggcatcctattttgattttttttttggcc
gi|6 : gggattaaaaatagattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--GGT-A-ATTT----T--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-ATG---T---A--A--G-G-ACT--G-A---AT-TGA-------T-----TAAAA---A---AA-TT---AGG--GTC-G--G--A----------G------A-A---TAT--TT--TA--GGTCGGGT-----------CAG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-C-C--C-A------C--C-TATT---TT
gi|33 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcA-A-ATT-----G--A-T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AG-----A--A-A---CA-A-------TG-T----A-CG--TA-A-A---TT--A--A--G-G-ATT--GGA---AT-AGA--------------------------------------GTCGG--G--A----------G------A-A---TAT--TT---A-GGGTC-GGC-----------TGG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-C-A--C-
gi|37 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattgaaaatatccgat-A-ATTT----G--G-A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-TA-G-A---------G------AT---T-T------AA-----A--A-A---CA-A-AG----TG-T----A-CG--AG-G-A---TG--A--A--G-G-ATT--GAA---AT-TGA---TAAAT-----T-AAA---A---AA-TT---AAGC-GT-TG--GT-A----------G------A-A---AAT--TT--TA-GGATT-GGT-----------CAG---G-T-AA--TC-T-------GAA----A--T-G------C--A-TATT---Ta
gi|39 : gt-A-GTTT----G--A---T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-TA---A---------G------AT---T-G------AA-----A--AAA---CG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-AT--T---A--A--G-G-AAT--GAA---A--TGA---T---C-----TAAAA---AT--AA-TA---GCG--G--TG--A--G----------G------C-A---CAT--TT--TA-GGGT--GGT-----------CAT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-C-A--CAA------C--C-TA
gi|55 : -A-ATTT----G--A-A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GA
gi|17 : acactaatTT----G--A-A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-TA-G-A---------A------AT---T--------AA-----A--A-G---CG-A-AG----TG-T----A-TG--AG-A-A---TG--A--A--G-G-A-T--GGA----T-TGA---T---T-------------A---AA-TTTAAAAG--GTCGG--T--A----------T------A-A---AAT--TT--TA-GGGTC-GGT-----------CGG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-C-A--C-A------CAAT-TGTT---TTTTGTCC-TAA-TTAAGTGGT-------G------TCAGGTTACACCAAATGTCtgtattac
gi|36 : ttcacgatacaacttttgtgtgtactgacatgtataacaaagagatataatattagaaaataaccacccaaaaaaaatgaaatttctgatactaaaattgttatatgagtgaattactaagccaattgtaaacttcgagtctgtttcggaaagtatgaaggaccgccatgattttgaaaattcggttattctaT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-TA-G-----------G------AT---T-G------AA-----A--A-AAAACA-A-AG----TA-C----A-CG--AG-A-A---TTG-A--G--G-G-ACT--GGA---ACATGA---T---T--------AA---A---AA-TTC--AGG--GTC-G--GCCA----------G------T-C---AAT--TTGTTA-GGGTA-GGT-----------TGG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-C-A--C-G------C--C-TATA---TTTg
gi|21 : T----G--A-T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-AA-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AG-----A--A-A---TG-A-AG----TG-T----G-CA--TA-A-A---TTATA--A--G-G-ACT--GGA---AT-TTG---T---C-----CAAAA---A---A--TT---AGG--GCCGG--G--A----------G------G-A---AAT--TA--TA-GGGAC-GGA-----------CGG---G-T-CC--CA-G-------GAAATC-A--T-AGGGCATC--C-TATT---TTGATTTT-TTT-TT---TGGCCat
gi|2 : agtaactgacaattatgttgtaccagtgttcagtattgggtaaaaaactaaaataaatcccaaaatgacatgattcgacaattgatttcacccccatttaatacataaattctggcttcagagagcacgaccccatattgaagagtcccaataataccagtacatgta----G--A-A-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-TT-A-A---------G------AT---C-G------AA-----A--C-A---CG-AGAGGAGATG-G----AGCG--AG-A-A---T---AG-A--G-G-AC---GAA---AT-TGATT-T---T-----TAAAA---A---AA-TT---
gi|40 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttga--A-A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-TA-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAATTATGA--A-A---CA-A-GG----T---------C--------A---T---A--A--GTGTACT--AGA---AT-TAA---C----------AAAA---GTAGAA-TT---G-G--GTCAG--G--A----------G------A-T---AAT--TG--TA-GGGTC-AGT-----------AGG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-G-A--C-A------C--C-tcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|5 : --A-A-T-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----TA-G-A---------G------AT---T-AT-----AC-----ATTA-A---CGTA-AG----TG-T----A-AGTAGT-T-A---T---ATTA--G-G-ACTTGGAAC--AT-CGA---T---T-----AGAGAT--A---AA-TTTT-AGG--GCCAG--G--A----------GG-----A-A---AAT--TT--TAAGGGTC-GGTTCCGTTGCTCCCAGAGTA-T-AA--TC---------GATA-C-A--C-A------T--C-T-TT---TTTT-TTT-TTct
gi|38 : ttttctttttctcggacttttaattttctttattcacttaaaaatacgagttagcagagggaatattgagtccttgcgtctaacaggataaagtgttatatatcacatagatagacgtttttgctgtacgtacctctgacatatgttcacgtccattgggatttaataaaataatacctcaaaacgcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaggaagatttcggtaattatggggtgaA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---T-G------AA-----A--A-T---CG-A-AG----TA-T----A-CG--AG-A-A---TG--A--G--G-G-ACC--GGA---AA-TGA-------T-----TAAAA---A---AT-TT---AGG--GTAGG--C--A----------G------A-A---AAT--TT--TA-GGGTC-GGT-----------AGG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-C-A--T-G------C--C-TATA---TTTT-TTT-TTT-
gi|53 : AA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AA---T-G------AA-----A--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG--AG-A-AT--T---A--A--G-G-ACT--GGA---AT-TGA---
gi|43 : a-AG----TG-T----A-CA--AG-A-A---TT--A--A--G-G-ACT--GGA---AT-TGA---T---T-----TAAAA---A---AA-TT---AGG--GTCGA--G--A----------C------A-A---AA---GT--TA-AGGTC-GGT-----------CGA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-A------C--
gi|44 : CT--GAA---AT-TAA---T---A-----TCGAGCTTG---AA-CT---G-G--ATCAG--G--A----------G------A-A---AAT--TT--GT-GGGTC-GGT-----------CGG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-T-A--C-A------C--C-T
gi|51 : tTCGG--G--A----------G------A-A---AAT--TT--TA-GAGTC-GGT-----------GGG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-C-A--C-A------T--C-TA--------TATTG-TTT-T
gi|2 : a--G--A----------A------A-A---AAT--TT--TA--GGTC-GGT------------GG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-C-AGCC-A------C--C-GATT---TTTTTTCTATTG-TT---TGGCCTAAGACA------gg
gi|47 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagat--A----------A------A-A---ATT--TT--TA-GGGAC-GGT-----------AGA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-A------C-----ATC---TTTTCTTC-TTca
gi|23 : tggaattgatt----------G------A-A---AATAATT--TA-GGGTC-GG-------------GG---G-------TC-GA------AAAA-T-A--C-A------T--T-TTTTTGGTTTTATTT-TTTATT---CAG--TAA-ATA------Tggcc
gi|54 : aattgtgtttcagattacatcttG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-A------C--C-TTTT---TTTTttgccttgcatcaccaggaacatttgtgtttactgacatataacatcgggtgtttagtagtggattaaatataaattaaaccacannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaaaatatttgaatatcgagcccaaacttattagagattaaaaaacgaagtgtacgaggatgaaggattggaattga
gi|24 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-G------C--C-TATG---TTTTtggcttgagt
gi|15 : aaaccaa---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-G---------C-TATT---TTTT-TTT-atctcgaaaataatgtagggtcaggattttttattcagtaaatatttgccttgcctcaccgggaacgaagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtgatatcgagtgttcagtatgtgattaaaagtaaattgaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatattgagcctgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgggaatgaggactgaaatt
gi|14 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-G---------C-TATT---TTTT-TTT-TTatagtcctcgaaataatatagggtcgggggtccggaaaaaaaaaaaagattttttttttgcttttatttttttttattcagtaaatatgccttgcctcgcccaggaacaaaggtttcataacaaatatgtttgtgtgtagtggataatcgagtgtttcagtatggattaaaaaaatgaataaagttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaaattttatatatcgagcccaaacttattaaagatcgagaaacgaaggtcaaaacgggaaatgaggac
gi|12 : ---G-T-AA--TC-G--------AAA-C-A--C-A------C--C-TATT---TTTTatagtcctcgaaataatatagggtcgggggtccggaaaaaaaaaaaagattttttttttgcttttatttttttttattcagtaaatatgccttgcctcgcccaggaacaaaggtttcataacaaatatgtttgtgtgtagtggataatcgagtgtttcagtatggattaaaaaaatgaataaagttannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaaattttatatatcgagcccaaacttattaaagatcgagaaacgaaggtcaaaacgggaaatgagga
gi|4 : a---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-A------C--C-TATT---TTTTatatcgaaaaaaaagtaggtgtgggtaggcaattgttatatttttaccgttgatgttttattcacgataaatcgtactaatctgccgcatcaccaggaacaagagtattcacaataaataactgggattgacacgtgaacatcgaggttcagtatgggagtaaaaataaaagtttaagcaaaaaaaagaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacccaatcctttggtttgaaatatcgagccgaacttattagagatcgaacacgaatgaaggactggaattgagtaaaagttagggtcgggagaaaaattttagggtcgggtcgggataattggaattaaccccattatttttttttt
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-C-A--C-G------G--C-TTTT---TTTTAatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|50 : ---G-T-AA--TT-G-------GAAA-C-A--C-A------A--C-TATT---TTTTaccttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : -T-AA--TC-G-------GAAA-CTA--C-A------C--C-TATT---TTattttgaaaataatgtaggatcaggggttgaaa
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 111111 111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1111111111 2222222222 111111 3333333333333333333333333333 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111 111111111111 1111111111 44444444444
lowQualScore : 44 3 0 3 3 3 555555 33 2 111111111 0 0 2 2 2222 1 4444 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2 2 333 22 22 2 555555 2 666 0000000000 1 555555 1 333 1 22 1 1 5 1 5555555555 222222 222 22 3333 88888 22 1 5555555555555555555555555555 22 1 2 6666 1 1 444444 1 1 1 1 1 1 1 2 1 4 4 222 1 2 11 1 1 33 1 5555 1 11 44444 33333 1 6 444 222 1 2 2 2 3 0 2 66 1 22 11 22 22 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 999999999 2222 33 3 2 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 3 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 7777777777 1 2 66 777777 22 33 1 1 2 11 1 555555555555 4 222 22 3333333333 1 1 1 44 1 8888888888 2 1 33 333 88888888888888 2 66666666666 333 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 66666 1 2 2 2 77777777777 6 3
lowQualScore : .. . . . . . ...... .. . ......... . . . . .... . .... ........................................................................................ . . ... .. .. . ...... . ... .......... . ...... . ... . .. . . . . .......... ...... ... .. .... ..... .. . ............................ .. . . .... . . ...... . . . . . . . . . . . ... . . .. . . .. . .... . .. ..... ..... . . ... ... . . . . . . . .. . .. .. .. .. ........................................................................................................................................................... . ......... .... .. . . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . .......... . . .. ...... .. .. . . . .. . ............ . ... .. .......... . . . .. . .......... . . .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... ..... . . . . ........... . .
lowQualScore : 66 3 1 3 3 3 111111 22 5 444444444 5 5 2 2 5555 1 5555 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0 555 22 88 0 888888 0 777 2222222222 9 222222 7 000 7 44 7 7 2 7 9999999999 333333 888 11 3333 33333 00 5 4444444444444444444444444444 00 4 9 8888 4 1 444444 3 3 7 3 3 3 3 7 3 0 0 333 3 5 77 2 2 00 2 2222 2 77 33333 11111 2 2 777 222 2 5 5 5 8 5 4 22 2 99 77 99 88 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2 333333333 4444 11 3 2 2 333333 88888 1 55 111111 7777777 66 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 1111111111 1 2 44 999999 66 11 1 1 3 66 2 555555555555 1 444 00 6666666666 3 3 3 44 3 7777777777 8 4 33 888 11111111111111 8 66666666666 888 333 3 3 88 3 2222222 6 11 3 777777 88888 9 0 4 9 22222222222 5 2
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGATT-A-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGGGTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A-----A-----T---------TT-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-G--T--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AA-------A--------A---A--AAT-N--A--------AAGCG-AAATAAAGCAAAA----AANNTTNNNNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNNNNNANANNNNGNNNN--TNNNNANNNNNNGNAAANATTTC--GG-A------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCCTAA-NCA-------TCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGATT-A-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGGGTNTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A-----A-----T---------TT-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-G--T--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AA-------A---A----A---A--AAT-A--A--------AAACG-AAATAAAGCAAAA----AANNTTNNNNTNNNNCN-ACTNAATNNNNNNNNNA-GNNNNNNNANANNNNGNNNN--TNNNNANNNNNNNNAANNNTNNC--GG-A------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCCTAA-ACA-------TCAGGTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TC-ACG-A-TA-A-A-T-A-CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-G--T--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CAG-TAGTTGGA-TT--G-AGAA--AA--T-AATTAAACCA---A----A---A--ANN-N--N--------NNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNGAACAATTCC--GG-TT-----AAT-T---------TAATTG--A-A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-TA-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----TG-T----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ATT--GAA--T-TGA---T---T-AATAAA-A---AT-TT----------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-AAATTT-------AGG--------------TC--GT-----------C----G---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCCTAA-TTAAGTGTG-TCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAAAA--AAA--GGATGT-GATTCCGATT-A-CAT----C-TC-AAAA--TAAT-GTAGGGTactgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|10 : TGTG---ATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------A-----T-----T---------TC-T-T---TTTTTG-C--T-TT------A-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--A-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----CTTGCAT--C-A-----C------C-----A---------G--GACACC-G--A-AGTGTA-----T-TC-AGA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-G--T--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CAG-TA-TGGGA-TT--G-A--A--AT--T----------A---T----T---A--AAT-T--A--------AAGGA-AAANNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG-G------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-TGAA--T-TGA---C---T-AA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-ttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|11 : aaaaaaaggaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGATTAA-CAT----C-TCG--AA--TGAT-GTACGGTC-GGG---GT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----TA---A-------ATTATTA-----T---------TT-T-T---TTTTTT-T--T-TT------T-T---TTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-------T---TG--C----A-----T--T-GTAA--T------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-AACATG-----T-CC-AT--A-T----A-T-A-CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-G--T--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CAG-TA-TTGGAGTT--A-A--A--AA--T-AA-------AT--T----A---A--ACC-A--A--------AAGCG-Aggct
gi|11 : -----T---------TT-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT---------------------A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T----G--C----A-----T--T-G-----TAAT---C-----AAAA------G--GA-A-C-G--A-AACATG-----T-CC-ATA---TA-----T-A-CA-T---TTGGG-T-------T-G-AA-C-A----T-G--T--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CAG-TA-TTGGAGTT--A-A--A--AA--T-AA-------A-----------------T-T--A--------AACCA-AAA----GCGANN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNTGAA----TTTC--TG-G------TAT-A---------T----G--A---T-AT------CTA-----A-C--T--------------GAA--CTT-AT-TAAG-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG----------A-G-A--A---T--T--A--T-G-TGC-GGAA--T-TGA---T---TCTA-AAA-A---A---T----------AG-G-GTT-GG-------------------AGATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgaatttctggtatatgatatctaactgaacttattaagagattgaaaaagcgaagtggtacgagaattatgtgcggaattgattctaaaaaatagggttggagattttagggtcagtcgaaacacacttttttttttt
gi|12 : aaaaatcaattagttgtgtttccgattaacatctcgaatgatgtacggtcggggtcggaaaattttattatataaattattatttttttttttttAAAA--AAAT-A---GGTGTG------TTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------A-----A-----T---------TG-T-TATATTTTTA-C--C-GT------TGA---TGT----------T-T------T-A---TT-CACGA-T-A-AA-TCGTACTA---AT------C---TG--C----CGCA--T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C----A-AGAGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-AAC---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-G--TG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CAG-TA-TGGGA-GT--A-A--A--AA--T-AA-------A---AGTTTA---AGCAA--A--A--------AAAAG-AAATAGNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNACCCAATCCTTT--GG----------T-T---------T----G--A-AAT-AT------CGA-----G-C--C--------------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAC--A-----CG-A-A-----TG----------------------------------A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---G---T-----AA-A---AG-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-AAATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-T
gi|13 : AAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGATT-A-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : aTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG-----------------------------------------------TT-T-T---TTTTTG-T--G-TT------T-T---TTT----------T-T------T-A----T-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--T----C-----T--T-G-----C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-AGTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-G--TGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----AG-CA--AGGA-TT--A-A--A--AA--T-------------------A---A--GAT----------------------TAAAGCAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG-A------AA--T---------T----GATA-A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--TA-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-TG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GGAA----TGA---T---T-T-------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-AAA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacaAAAAAA--AAA-TAG-CGT-GTTTCCGATT-A-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGGGTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G-----A-----T---------TT-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-ATTTTTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------ATGCC---T---TG--C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-AG-GT------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A---------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CAG-TA-T-GGA-TTAAA-A--A--AA--T-GA-------A---T----A---A--AGT-T--A--------NNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG---GG-A------AAT-T---------T----T--ATA-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG-----G-TCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAG-CGT-GTTTCCGATT-A-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGGGTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G-----A-----T---------TT-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-ATTTTTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------ATGCC---T---TG--C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-AG-GT------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A---------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CAG-TA-T-GGA-TTAAA-A--A--AA--T-GA-------A---T----A---A--AGT-T--A--------NNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG---GG-A------AAT-T---------T----T--ATA-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG-----G-TCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-AC
gi|16 : -------A-----A-----T---------CT-T-T---TTTTTA-C--A-TT------T-A---TTT----------T----------A---TT-CA--C-G-A-AA-TTCGACA----AT------T---TG--C----C-----T--T-A-----CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-AGT-TA-----T-TC-ACA-G-TA-A-AAT-A-CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-G--T--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CAG-AA-TGGGA-TT--A-A--A--AA-----------------------------GAT-A--A--------AT-------TACAGCAAAA----AAAATTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACTCCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCTTGAAAGCACGAAGACACATCTTGG-A--------T-T---------T----G--A-A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----TG-T----A-TG----------A-G-A--A---T--T--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGGT--T---T-TA-AAATA---AACTT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-AAATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TC-ACG-A-TA-C-A---A-CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GTAT--A--AC-----A-A-A---GA---G---------A-TA-TAATA-TT--AGA--A--AA--T-AA-------C---C----ACCCA--AA--A--A--------AAATG-AAAT
gi|17 : -T---------T----G--A-A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-TA-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----TG-T----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-A-T-GGA---T-TGA---T---T--------A---AA-TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--ATTGTT-T-TT--------TGTCCTAA-TTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTCttctgatactaaaattgttatatgagtgaattactaagccaattgtaaacttcgagtctgtttcggaaagtatgaaggaccgccatgattttgaaaattcggttattctattgaatatactactcgaaagaatatattagaaattaaaagcgaagtgtatgagaatgaaggatggattgattaaatttaaaaggtcggtataaaattttagggtcggtcgggtaatcagaaacacacaattgttttttgtcctaattaagtggtgtcaggttacaccaaatgtcg
gi|18 : ttcacgatacaacttttgtgtgtactgacatgtataacaaagagatataatattagaaaataaccacccaaaaaaaatgaaatttctgatactaaaattgttatatgagtgaattactaagccaattgtaaacttcgagtctgtttcggaaagtatgaaggaccgccatgattttgaaaattcggttattcta---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tGTG---TTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------A-----A-----T---------TT-T-T---GTTTTG-C--------------------T----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AC------T---TG--C----C-----TTAC-A-----T------C---------------------A-C-----------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A-AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-A--T--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TAA-TA-TTGGG-TT--A-A--A--AA--T-----------------------A--AAT----------------------TAAAGCNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNAAAATGCT--CG-AT-----AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaagccAAA--TAAAAGTAG---TTGTC---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G------------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-G----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----CATTAC-C-----A---------G--GA-A-C-G--A--------------TC-G---A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TA----------A--C-A----T-G--T--A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AA-------A-----------------T-T--A--------AAGCA-AAATNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG-A------AAT-TTCGCTAATTT----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGATTTT---T-TA-AAA-A---A---T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGATT-AACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAGAGTGCGGGGAAGGTCCGA-------------AAAAAAA---T-------------------------------------------GG-----A-----AA---A-----------------------------TT-T-T---TTTTTG-C--T-GT------A-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--GATAA-AA-T----------ATTTGCCCT---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A------------GA-A-C-A--AGAGTGTA-----TGTC-ACATA-CATG-A-T-ATCG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-G--T--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CAGATA-TGGGA--A--A-A--A--AA--T-GAGCT----A---A----A---A--GCT-A--AGAAGCACCAAAAG-AAACAAGATAAAA----GA
gi|2 : ----G--A-A-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-TT-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGATG-G----AGCG----------A-G-A--A---T--AG-A--G-G-AC--GAAA--T-TGATT-T---T-TA-AAA-A---AA-TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-GAATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCCTAAGACA-------nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttga------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTA-----T-TG-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-G--T--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CAG-AA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AA-------A-----------------T-T--A--------AAGCA-AAANNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG-A------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-------------------------------T--A--A--A-A-ACT-AAAA--T-TGA-------T-TA-AAA-A---AA-TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-AAATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-G--T--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CAG-TA-TTGGG-TA--A-A--A--AAC-T-AA-------A---A----T---A--AAT-CCCA--------AAATG-ACATGATTCGACA----A---TTGATTTCACCCCCATTTAATACATAAATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATATTGAAGAGTCCCAATAATACC--AGTA------CATGTA--------T----G--A-T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-AA-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----TG-T----G-CAT---------A-A-ATTA---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TTG---T---C-CA-AAA-----AA-TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-AAATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C----------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GAG-TA-TTGGG-TA--A-A--A--AAATT-AA-------A---T----A---A--ACC-T--A--------AAACC-ACCTAAA-----A----AACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGATTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTGCTATTTTGAAAA----TTTC--AG-AT-----AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-TT-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----TG-T----A-TGTATGTATCAAACA-A--A---T--T--A--G-C-ATT-GGAA--T--AA---T---T-TA------------------------------------------------------AAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCCTAA-GCA-------
gi|23 : gttctatatttacaTGTG---TTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------A-----A-----T---------ACAT-T---TTTTTG-G--T-TT------T-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----CATCAC-C-----A---------G--GA-A-C-A----------------------------------------T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-A--T--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TAG-TA-GTGGA-TT--A-A--A--TA--T-----------------------A--AAT-T--A--------AACCA-CANNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNGAAAAT------------------AT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GGAA--T-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aatAAAA---AAC-ATAGG---CGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A---------------------------------------------------------------------TTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-G--T--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGTGA-TT--A-A--A--AG--T-AA------------------------AT----------------------TGAAGCAAAA----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNN---------GG-A------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GAAA--T-T
gi|25 : aaacc---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--C-T-ATAA-TTCGGTACCAAAT------T---TG--C----C-----T--T-GTATCAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTG-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-G--T--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-----------------------A--AAT-T--A--------AAGCA-AAANNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG---------AT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CA----------A-G-A--ATATT--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-T
gi|26 : -A-T-G--A-AACGTA-----T-TT-GCG-A-TG-A-A-T-A-CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-G--T--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGG-TT--A-A--ATTAA--A-AA-------A---A----A---A--GAA-A--A--------AAAAA-AAA-GAAGNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNGAAAATTTCC--AG-C------AAT-T---------T----G--A-------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-TA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----TG-T----A-TG----------A-G-A--A---TT-A--A--C-G-ATT-GGAA--T-TGA---T---T--A-AAA-A---GT-TT----------AG-G-GTC-GG--
gi|27 : ---TG--C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-G--T--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AA-------ATTTAAGC-A---A--AAN-N--N--------NNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNGGAA-GATTTC--GG-T------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--C---TTAA--A--G-G-ACT-acacacacctaatatttcttttt
gi|28 : tttgtca-----T--C-A-----C------C-----A---------G--CT-A-C----A-AGTG-A-----T-TC-ACA-A-TA-ACA-T-AACG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T-----------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA---A-TGGGG-TT--A-A--A--AA--T-AA-------A-----------------T-T--A--------CAGCA-AGANNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NG-G------A-T-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-TA-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-
gi|29 : tgtcacaaattgcttcaGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AG-------A-----------------T-T--A--------AAGCA-AAA-GNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG-A------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--A---TT-A--C--T-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TT-AAA-A---AA-TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGATT-A-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGAGNNNNNN---NNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A-----A-----T---------TT-T-C---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-AGTGTA-----T-TC-ATA-A-CG-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-G--T--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--TA--TGAA-------A---A----A---A--AATGA--A--------AAATG-AAATAAAGCAAAA----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG-A------AAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------G-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GAAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTCTAA-ACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : G--C----A-----T--C-A-----C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTATTCAGT-TC-ACA-T-TA-A-G-T-A--G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGG--T--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-T-----A--T--AA--T-AA-------A---T----T---A--ATT-A--A--------AAAGGNNNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNGAATATC--GA-ATATTAGAAT-T---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-TA-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : T------T---TG--T----C-----T--T-G-----TAT----C-----ATG-------G--GG-A-CAG--A-AACTTG-----T-CC-ATG-A-TA-T-A-T-A-CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-G--T--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---AA-TG-TTGGG-TA--A-A--A--AA--T-
gi|32 : ttAAAA--AAA-C-GCTGC-GTTTCCGATT-A-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-TTGGGGTtgcaatctttttaaatcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgaatgatttgaatattgagcatgaact
gi|32 : acTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTA-----G-----TTTTTATTTATT-T-T---TTTTTT-CTTT-TT------T-A---TTT----------TGT------T-A---TTGCA--G-T---AA-T----------AC------T---TG--CATTACAA---T--C-A-----C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-ACAATA-----T-TC-ATG-ATTA-T-A-T-A-TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-G--C-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CAG-TATTGGGC-TTA-A-A--A--AA--T-AA-------cggaaagcgtctttagtttttatttattttttttttcttttttattttgttattgcagtaatacttgcattacaatcaccaatctgaactagaacgaacaatattcatgattatatatattttgtgtgtaattgacatgcgcattgagtattcagtattgggcttaaaaaataattttaagcaaa
gi|33 : acaaaaaaacgcAAAATATC--CG-AT-----AAA-T---------T----G--A-T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------TG-T----A-CG----------T-A-A--A---TT-A--A--G-G-ATT-GGAA--T---------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-ATATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------ttttaagcaaa
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattg-A---TT-CG--G-T-A-CA-A----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-AGTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-G--T--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AA-------ATT-A----A---AGCAAG-A--A--------AA
gi|36 : ata---------T----G--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-TA-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----TA-C----A-CG----------A-G-A--A---TTGA--G--G-G-ACT-GGAA--CATGA---T---T-----AA-A---AA-TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-CAATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------AAT-T---------T----G--G-A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-TA-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GAAA--T-TGA---TAAAT-T--AAA-A---AA-TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-AAATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----TA-T----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--G--G-G-ACC-GGAA--A-TGA-------T-TA-AAA-A---AT-TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------AGT-T---------T----G--A---T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-TA---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-AAT-GAAA----TGA---T---C-TA-AAA-A---TA-AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCACATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : AAAA--TA-------GGTGTGT-----TTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------T-----T-----T---------TT-T-T---TTTTTA-C--T-TT------T-A---TTTC---------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----C------
gi|4 : aa------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-AGTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-AGT-A-CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-G--T--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-TG-------A-----------------T-T--A--------AAGCA-AAAGNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG-A------AAT-T---------T----G--A-A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-TACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-AC-A---TTGA--ACCT-G-ACT-GGAA--T-TGAAT-T---T-TT-AAA-A---AA-TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-AA--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|40 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--A-A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-TA-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA----------A-G-GTCA---T--A--A--GTGTACT-AGAA--T-TAA---C------A-AAA-GTAGAA-TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-TAATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----TG-T----A-CA----------A-G-A--A---TT-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-AAA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGATT-A-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAGGGTC-GAG---GT
gi|47 : aaT-GGAA--T-TGA---T---T-----AA-A---AA-TT--------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCCctgaaattc
gi|5 : AAGATTTC--GG-T------AAT-TATGGGG---T----G--A-AAT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----TA-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----TG-T----A-AGT---------A-G-TT-A---T--ATTA--G-G-ACTTGGAACAT-CGA---T---T-AG-AGATA---AA-TTTT--------AG-G-GCC-AG--G-A----------GGA-AAATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-T
gi|50 : ttttctttttctcggacttttaattttctttattcacttaaaaatacgagttagcagagggaatattgagtccttgcgtctaacaggataaagtgttatatatcacatagatagacgtttttgctgtacgtacctctgacatatgttcacgtccattgggatttaataaaataatacctcaaaacgcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaggAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAATT-A-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAGGATCAGGG---GTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCTTGA-
gi|55 : ------AAT-T---------T----G--A-A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GAgt
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AAGG-AT-GTTTTCCATT-A-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTAGtgtattac
gi|6 : TTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A-----AAATTTT---------TT-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT----------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T-A-AA------------AT------TGCCTG--C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------T---A-A-C----A-AGTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G-----A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGA-TT--A-A--A--AA--T-AA-------A---atcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgttAAGATTTC--GG-T------AAT-T---------T----T--A-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TA-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-AT-G---T--A--A--G-G-ACT--GAA--T-TGA-------T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-ATATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTttaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT-------------------GAAAA--TAAT-ACA---------------------T-A-ATC--AAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------A-----A-----T---------TT-T-T---TTTTTT-T--T-TTGTTAATT-A---TTT----------T-T------TTA---TT-CA--G-T-A-AAAT----------AT------T---TGGCC----C-----T--T-G-----CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A--GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-G--T--A--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TTTCAG-TA-TGA-A-TT--A-AG-A--AA--T-AA-------A---TT---A---A--AGC-A--A--------ANNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNTT-----G-A------ATT-T---------T----G--A-A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-TT-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----TG-T----A-CG----------G-G-A--A---TT-A--A--G-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T-TA-AAACA---AA-TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-AAATTT--T---AGG---------------TC-GAT-----------CC--GG---G-T-AA--TC-G-------GA---CA--C-A------CC-T---------TTTT-TT-TTTGGCC-------------------TTACACTAAATGTC
gi|8 : acAAAA--CAAA-TTAGGGT-TGTG---GTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA------------------------------------------------------------------------------T---------TT-TAT---TTTTTAAC--T-TT------T-A---TTT----------G-T--------A---TT-CA--C-T-ATAA-TTCGGTAACGAAT------T---TG--C----C-----T--TAG-----CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-AGTAT------T-TC-ACA-A-TA-A-A-TTA-CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-G--T--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CAGCTA-TGG-A-TT--A-A--A--AA--T-AA-------ATC-A----A---A--AGC-A--A--------AAANN-NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNN-------GG-A--------T-T---------T----GTAATA-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATATAAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----TG-T----A-CG----------A-G-A--AAT-T--A--AAAG-G-ACTTGGAA--T--GA---C---T-AA-TGA-A---AG-TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-AATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCTTAt
gi|9 : aTGGT---GTTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA---------------------------------TT-T-T---TTTTTA-C--TGTT------T-A---TTT----------T-T------T-A---TT-CA--C-T-ATAA-T----------GCC-----T---TG--C----A-----T--C-A-----C------------A---------G--GA-A-C-GA-A-AGT-TA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-G-CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-G--T--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TACTAGGA-TTTAA-A--A--AA--T-AATTT----A---A----A---G--CAA-A--A--------AAAAG-NNNNNNNNNNNNN----NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--GG---------AT-T---------G----G--A-A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-TA-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----TA-CG---A-CG----------A-G-A--ACT-T--A--A--G-G-AC--GGGA--T-TGA---G---T----AAA-C---AA-TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-AAATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111111 2222222222 111111 3333333333333333333333333333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111 111111111 111111111111 1111111111 5555555555
lowQualScore : 55 3 66 3 666 55 7 111111 0 66 2 66666 1 6666 2 2 1 2 1 4444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 2 333 22 3333 777777777777 222222222222 2 555555 1 333 1 22 1 1 5 1 7777777777 222222 222 22 3333 88888 22 1 0000000000000000000000000000 22 1 3 6666 1 1 0 444444 1 1 1 1 1 1 2 1 4 4 222 1 2 11 1 1 11 1 5555 1 66666 33333 1 6 444 222 1 2 2 2 3 1 1 44 1 33 11 2 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 2 000000000000 2222 44 44 1 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 1 2 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 2 2 888888888 22 33 1 1 2 11 1 666666666666 4 222 1 3333333333 1 1 1 44 1 8888888888 2 1 33333 33 333 88888888888888 2 66666666666 333 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 99999 222 2 2 0000000000 4 3
lowQualScore : .. . .. . ... .. . ...... . .. . ..... . .... . . . . . .... ..................................................................................... . . . ... .. .... ............ ............ . ...... . ... . .. . . . . .......... ...... ... .. .... ..... .. . ............................ .. . . .... . . . ...... . . . . . . . . . . ... . . .. . . .. . .... . ..... ..... . . ... ... . . . . . . . .. . .. .. . ........................................................................................................................................................................................................... . ............ .... .. .. . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . . . ......... .. .. . . . .. . ............ . ... . .......... . . . .. . .......... . . ..... .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... ..... ... . . .......... . .
lowQualScore : 00 6 66 6 444 00 3 000000 4 33 9 55555 7 9999 4 4 8 4 1 5555 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 1 777 99 3333 777777777777 222222222222 0 555555 8 222 8 55 8 8 5 8 0000000000 888888 999 22 4444 77777 11 5 2222222222222222222222222222 11 5 0 3333 5 5 9 333333 4 4 4 4 4 4 8 4 1 1 444 4 6 88 3 3 88 3 3333 3 55555 22222 3 5 888 333 3 6 6 6 9 2 2 77 2 00 77 5 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 000000000000 4444 11 77 1 2 222222 77777 1 44 000000 5555555 55 1 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 2 2 444444444 66 11 1 1 3 66 2 888888888888 1 444 4 6666666666 3 3 3 44 3 7777777777 8 4 44444 33 888 11111111111111 8 66666666666 888 333 3 3 88 3 2222222 6 11 3 777777 88888 444 4 9 0000000000 5 2
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A-------A-------AAAT--T--A--AAGC-------AAAA----NAAAGC-----AA-----AAAANNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---ANNNNNCGGA--------A---------ANA--T-TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCCTAANCAAGTG---TCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A-------A-------AAAT--N--A--AAGC-------GAAA----TAAAGC-----AA-----AAAANNTTNNNNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNNNNNANANNNNGNNNN--TNNNN---ANNNNNNGNA--------A---------ANA--T-TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCCTAANCA-------TCAGNTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TC-ACG-A-TA-A-A-T-A-CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-GT--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CAG-TAGT-TGGA-TT--G-AGAA--AA-T--AATTAAACCAA-------A-------AANN--N--N--NNNN-------NNNN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNGA--------A---------CAA--T-TCCG---G-TT-----A------AT-T------------TAATTG--A--A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-T-A-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG-AG-A--A---TG-A--A--G-G-ATT--GAA--T-TGA---T---T-AATAAA-A---AT-TT----------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-A-----AATTT-------AGG--------------TC--GT-----------C----G---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCCTAATTAAGTGTG-TCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAAAA--AAA--GGATGT-GATTCCGA---T--TA-CAT----C-TC-AAAA--TAAT-GTAGG-GTactgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|10 : TGTG---ATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------A--T-----T---------T-C-T-T---TTTTTG-C--T-TT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--A-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----CTTGCAT--C-A-----C------C-----A---------G--GACACC-G--A-A-GTGTA-----T-TC-AGA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CAG-TA-T-GGGA-TT----G--A--AA-T--TA--------T-------T-------AAAT--T--A--AAGG-------AAAA----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G-G------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-TGAA--T-TGA---C---T-AA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-ttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|11 : aaaaaaaggaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGA---T--TAACAT----C-TCGAA----TGAT-GTACG-GTC-GGG---GT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----TA---A-------ATTA-----T---------TAT-T-T---TTTTTT-T--T-TT------T-T---TTTTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------A-------T---TG--C----A-----T--T-GTAA--T------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-A-ACATG-----T-CC-----A-TA-T-A-T-A-CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CAG-TA-T-TGGAGTT--A-A--A--AA-T----------------------------AAAT--T--A--AACC-------A--------AAAGC-----GA-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNTG---------------------AA--T-TTCT---G-G------T------AT-A------------T----G-----A-T-AT------CTA-----A----C------T-------GAA--CTT-AT-TAA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG-AG-A--A---T--T--A--T-G-TGC-GGAA--T-TGA---T---TCTA-AAA-A---A---T----------AG-G-GTT-GG-------------------A-----GATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tggct
gi|12 : AAAA--AAAT---AGG----TGTG----TTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------A--A-----T---------T-G-T-TATATTTTTA-C--C-GT------TGA---TGT------------T-T------T-A---TT-CACGA-T-A-AA-TCGTACTA---AT------C---TG--C----CGCA--T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C----A-A-GAGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-AAC---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-GTG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CAG-TA-T-GGGA-GT--A-A--A--AA-T------------A-------A-------AAGT--T--T--AAGC-------AAAA----AAAAGA-----AATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNACCC-----A---------ATC--C-TTTG---G----------------T-T------------T----GA-A--A-T-AT------CGA-----G----C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G-------AA--C-A---CG-A-A-----T-G-----------------------A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---G---T-----AA-A---AG-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-A-----AATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-T
gi|13 : AAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : aTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG--------------------------------------------T-T-T-T---TTTTTG-T--G-TT------T-T---TTT------------T-T------T-A----T-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--T----C-----T--T-G-----C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-A-GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-GTGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----AG-CA---AGGA-TT--A-A--A--AA-T--------------------A-------AGAT--T--A--AAGC-------AAAA---------------NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G-A------A------A--T------------T----GATA--A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--T-A-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG-GG-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GGAA----TGA---T---T-T-------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-A-----AA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------ATGCC---T---TG--C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CAG-TA-T--GGA-TTAAA-A--A--AA-T--GA--------AT------A-------AAGT--T-----ANNN-------NNNN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG-GGAA--A---T--G--A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------ATGCC---T---TG--C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CAG-TA-T--GGA-TTAAA-A--A--AA-T--GA--------AT------A-------AAGT--T-----ANNN-------NNNN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG-GGAA--A---T--G--A--G-G-AC
gi|16 : -------A--A-----T---------C-T-T-T---TTTTTA-C--A-TT------T-A---TTT------------T----------A---TT-CA--C-G-A-AA-TTCGACA----AT------T---TG--C----C-----T--T-A-----CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-A-GT-TA-----T-TC-ACA-G-TA-A-AAT-A-CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CAG-AA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-----G--------A-------T-------AAAT---------------------------TACAGC-----AA-----AAAAAATTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACTCCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCTTG---AAAGCACGAA--------G---------ACACAT-CTTG---G-A--------------T-T------------T----G--A--A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----T-GT----A-TG-AG-A--A---T--T--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGGT--T---T-TA-AAATA---AACTT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-A-----AATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TC-ACG-A-TA-C-A---A-CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--ATAAC-----A-A-A---GA---G---------A-TA-T-AATA-TT--AGA--A--AA-T--AACCACCC--A-------A-------AAA---------AAAT-------GAAATTTCTGATAC-----TA-----AAA---TTGTTATATG----AGTGAATTACTAAGCCA----ATTGTAAACTTCGAGTC--TGTTTCGGAAAGTATGAAGGACCGCCA---------TGA--T-TTTG---A-A------A------AT-TCGGTTATTCTATT----G--A--A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-T-A-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----T-GT----A-TG-AG-A--A---TG-A--A--G-G-A-T-GGA---T-TGA---T---T--------A---AA-TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCCTAATTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTC
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tCCGTG---TTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------A--A-----T---------T-T-T-T---GTTTTG-C--------------------T------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AC------T---TG--C----C-----TTAC-A-----T------C---------------------A-C------------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A-AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-AT--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TAA-TA-T-TGGG-TT--A-A--A--AA-T----------------------------AAAT---------------------------TAAAGC-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------A---------AAA--TGCTCG---A-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaagAAA--TAAAAGTAGTTGTCT-------TTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G----------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-G----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----CATTAC-C-----A---------G--GA-A-C-G--A---------------TC-G---A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TA----------A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A------------------T--T--A--AAGC-------AAAA----TNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------NNNNNNNNGGAAA--T-TTCG---C-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGATTTT---T-TA-AAA-A---A---T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGA---T--TAACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAGA-GTGCGGGGAAGGTCCGA-------------AAAAAAA---T-------------------------------------------GG-----A-----AA---A--------------------------T-T-T-T---TTTTTG-C--T-GT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--GATAA-AA-T----------ATTTGCCCT---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A------------GA-A-C-A--AGA-GTGTA-----TGTC-ACATA-CATG-A-T-ATCG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-GT--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CAGATA-T-GGGA--A--A-A--A--AA-T--GAGCT-----A-------A-------AAGC--T--AAGAAGCACCAAAAGAAA----CAAGAT-----AA-----AAGA
gi|2 : --T-TTGG---G-AC-----A------ATGT------------T----G--AGAA-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGAT-GG----AGCG-AG-A--A---T--AG-A--G-G-AC--GAAA--T-TGATT-T---T-TA-AAA-A---AA-TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-G-----AATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCCTAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcag------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TG-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-GT--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CAG-AA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A------------------T--T--A--AAGC-------AAAA----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-G--------------------T--A--A--A-A-ACT-AAAA--T-TGA-------T-TA-AAA-A---AA-TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-A-----AATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tgacaca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-GT--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CAG-TA-T-TGGG-TA--A-A--A--AACT--AA--------A-------AT------AAAT--CCCA--AAAT-------GACA----TGATTC-----GA-----CAA---TTGATTTCACCCCCATTTAATACATAAATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATATTG---AAGAGTCCCA--------A---------TAA--T-ACCA---GTA------C------ATGTA-----------T----G--A--T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-A-A-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----T-GT----G-CATAA-ATTA---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TTG---T---C-CA-AAA-----AA-TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-A-----AATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C--------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GAG-TA-TTGGG-----------------T--AA--------A-------A-------AAAT--T--A--AAT---------AAACC--TAAAACCACCTAA-----AAAACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGATTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTGCT---ATTTTG------------A---------AAA--T-TTCA---G-AT-----A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-T-T-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----T-GT----A-TG-----------T--A-----------T-GTA---------------T-CA-AAC-A---AA-TT----------AG-C-ATT-GG--A-A----------T-A-ATTTAAAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCCTAAGCA-------
gi|23 : gttctatatttacaTGTG---TTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------A--A-----T---------A-CAT-T---TTTTTG-G--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G------------C-----A--------------------------------------TC-ACC-A-GG-A-----A-CA-T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-AT--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TAG-TA-G-TGGA-TT--A-A--A--TA-T----------------------------AAAT--T--A--AACC-------ACAN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNGAA--------A---------AT----------------------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GGAA--T-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aatAAAA---AAC-ATAGG----CGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A-------------------------------------------------------------------TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GTGA-TT--A-A--A--AG-T----------------------------AAAT--T--G--AAGC-------AAAA---------------NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNGGA--------A-----------A--T-TT-----G-A------A-----------------------------------T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-GG-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GAAA--T-T
gi|25 : aaacc---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T-ATAA-TTCGGTACCAAAT------T---TG--C----C-----T--T-GTATCAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTG-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------------------AAAT--T--A--AAGC-------AAAA----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G---------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CA-AG-A--ATATT--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-T
gi|26 : -A-T-G--A-A-ACGTA-----T-TT-GCG-A-TG-A-A-T-A-CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-GT--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGG-TT--A-A--ATTAA-A--AA--------A-------A-------AAGA--A--A--AAAA-------AAAA----AGAAGN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNGA--------A---------AAT--T-TCCA---G-C------A------AT-T------------T----G--A--------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-TG-AG-A--A---TT-A--A--C-G-ATT-GGAA--T-TGA---T---T--A-AAA-A---GT-TT----------AG-G-GTC-GG--
gi|27 : ---TG--C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------ATTTAAGCA-------AAAN--N--N--NNNN-------NNNN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNGG---------A---------AGA--T-TTCG---G-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--C---TTAA--A--G-G-ACT-acacacacctaatatttcttttt
gi|28 : tttgtca-----T--C-A-----C------C-----A---------G--CT-A-C----A-A-GTG-A-----T-TC-ACA-A-TA-ACA-T-AACG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T---------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA---A-T-GGGG-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A------------------T--T--A--CAGC-------AAGA----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNN---G-G------A-------T-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-T-A-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--A---TG-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-
gi|29 : tgtcacaaattgcttca-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AG--------A------------------T--T--A--AAGC-------AAAA-----GNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--A---TT-A--C--T-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TT-AAA-A---AA-TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGA-GNNNNNN---NNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-C---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-GTGTA-----T-TC-ATA-A-CG-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--TA-TGAAA--------A-------A-------AAATG-A--A--AAAT-------GAAA----TAAAGC-----AA-----AANNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-GG-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GAAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTCTAAACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : G--C----A-----T--C-A-----C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTATTCAGT-TC-ACA-T-TA-A-G-T-A--G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGGT--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-T-----A--T--AA-T--AA--------A-------T-------TAATTAA--A--AAGG-------NNNN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------GAA--T-ATCG---A-ATATTAGA------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : T------T---TG--T----C-----T--T-G-----TAT----C-----ATG-------G--GG-A-CAG--A-A-ACTTG-----T-CC-ATG-A-TA-T-A-T-A-CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-GT--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---AA-TG-T-TGGG-TA--A-A--A--AATT--GC--------A-------ATCTTTTTAAAT--C--A--AA-N-------NNNN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNCG---A-AT-----G------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--A------T-------GAA--CT
gi|32 : ttCTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTA--G-----TTTTTATTTAT-T-T-T---TTTTTT-CTTT-TT------T-A---TTT------------TGT------T-A---TTGCA--G-T---AA-T----------AC------T---TG--CATTACAA---T--C-A-----C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-A-CAATA-----T-TC-ATG-ATTA-T-A-T-A-TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-GC-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CAG-TATT-GGGC-TTA-A-A--A--AA-T--AA--------
gi|33 : acaaaaaaacgGAA--------A---------ATA--T-C-CG---A-T------A------AA-T------------T----G--A--T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------T-GT----A-CG-TA-A--A---TT-A--A--G-G-ATT-GGAA--T---------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----TATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------ttttaagcaaa
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatatt-A---TT-CG--G-T-A-CA-A----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------------------AAAT--T--A--AAGC-------AAGA-----AAA
gi|36 : ata------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-T-A-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----T-AC----A-CG-AG-A--A---TTGA--G--G-G-ACT-GGAA--CATGA---T---T-----AA-A---AA-TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-C-----AATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------A------AT-T------------T----G--G--A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-CG-AG-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GAAA--T-TGA---TAAAT-T--AAA-A---AA-TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----T-AT----A-CG-AG-A--A---TG-A--G--G-G-ACC-GGAA--A-TGA-------T-TA-AAA-A---AT-TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------A------GT-T------------T----G--A----T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-T-A---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--AT--T--A--A--G-G-AAT-GAAA----TGA---T---C-TA-AAA-A---TA-AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCA-----CATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : TAGG----TGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------T--T-----T---------T-T-T-T---TTTTTA-C--T-TT------T-A---TTTC-----------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A-AA-T----------AT------T---TG--C----C-----T--T-G-----C------
gi|4 : aaaaaa------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-AGT-A-CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-GT--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--TG--------A------------------T--T--A--AAGC-------AAAA----GNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-T-ACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-AC-A---TTGA--ACCT-G-ACT-GGAA--T-TGAAT-T---T-TT-AAA-A---AA-TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-A-----A--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|40 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--A--A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-T-A-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA-AG-GTCA---T--A--A--GTGTACT-AGAA--T-TAA---C------A-AAA-GTAGAA-TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-T-----AATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----T-GT----A-CA-AG-A--A---TT-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-A-----AA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-A-----AATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGA---T--TA-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAGG-GTC-GAG---GT
gi|47 : aaT-GGAA--T-TGA---T---T-----AA-A---AA-TT-------------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCCctgaaattc
gi|5 : --------A---------AGA--T-TTCG---G-T------A------AT-TATGGGG------T----G--A--AAT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----T-A-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----T-GT----A-AGTAG-TT-A---T--ATTA--G-G-ACTTGGAACAT-CGA---T---T-AG-AGATA---AA-TTTT--------AG-G-GCC-AG--G-A----------GGA-A-----AATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-T
gi|50 : ttttctttttctcggacttttaattttctttattcacttaaaaatacgagttagcagagggaatattgagtccttgcgtctaacaggataaagtgttatatatcacatagatagacgtttttgctgtacgtacctctgacatatgttcacgtccattgggatttaataaaataatacctcaaaacgcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaggAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAA---T--TA-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAGG-ATCAGGG---GTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCTTGA
gi|55 : ------A------AT-T------------T----G--A--A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GAgt
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AAGG-AT-GTTTTCCA---T--TA-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTAGtgtattac
gi|6 : TTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--AAATTTT---------T-T-T-T---TTTTTG-C--T-TT------T-A---TTT------------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T-A-AA------------AT------TGCCTG--C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------T---A-A-C----A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G---A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CAG-TA-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------------------AAAT--T--A--AAGC-------AAatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgtt--------A---------AGA--T-TTCG---G-T------A------AT-T------------T----T--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG-AT-G---T--A--A--G-G-ACT--GAA--T-TGA-------T-TA-AAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-A-----TATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT-GAAAATAATA-CAT----AATCAAAAAA-TAAT-GTAGG-GTCGGGG---GT
gi|7 : acAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTT-T--T-TTGTTAATT-A---TTT------------T-T------TTA---TT-CA--G-T-A-AAAT----------AT------T---TGGCC----C-----T--T-G-----CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A---GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TTTCAG-TA-T-GA-A-TT--A-AG-A--AA-T--AA--------A------------------T--T--A--AAGC-------AAAN----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNNNTTG-A------A------TT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-GG-A--A---TT-A--A--G-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T-TA-AAACA---AA-TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-A-----AATTT--T---AGG---------------TC-GAT-----------CC--GG---G-T-AA--TC-G-------GA---CA--C-A------CC-T---------TTTT-TT-TTTGGCC------------------TTACACTAAATGTCcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccgggtaatcggacacaccttttttttttggccttacactaaatgtct
gi|8 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaaAAAA--CAAA-TTAGG-GT-TGTG---GTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA---------------------------------------------------------------------------T---------T-T-TAT---TTTTTAAC--T-TT------T-A---TTT------------G-T--------A---TT-CA--C-T-ATAA-TTCGGTAACGAAT------T---TG--C----C-----T--TAG-----CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-A-GTAT------T-TC-ACA-A-TA-A-A-TTA-CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CAGCTA-T-GG-A-TT--A-A--A--AA-T--AA--------ATC-----A-------AAAG--C--A--AA-----------AA----NNNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNG---G-A--------------T-T------------T----GTAAT-A-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATAT-AAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG-AG-A--AAT-T--A--AAAG-G-ACTTGGAA--T--GA---C---T-AA-TGA-A---AG-TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-A-----ATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCTTAt
gi|9 : aTGGT---GTTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA------------------------------T-T-T-T---TTTTTA-C--TGTT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T-ATAA-T----------GCC-----T---TG--C----A-----T--C-A-----C------------A---------G--GA-A-C-G--A-AAGT-TA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-G-CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TACT-AGGA-TT--T-A--A--A-----AA--------A-------T-------AATT--T--A--AAGC-------AAAA----AAAAGN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNNNN--------N---------NNN--N-NNNN---N-N------NNNNNGGAT-T------------G----G--A--A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-T-A-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----T-ACG---A-CG-AG-A--ACT-T--A--A--G-G-AC--GGGA--T-TGA---G---T----AAA-C---AA-TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-A-----AATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111111111 333333333333333333333333333333 333333333333333333 3333333333333333 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111 111111111111 1111111111 1111111111 11111 33333
lowQualScore : 55 3 2 3 666 55 7 111111 0 66 2 66666 1 6666 2 2 1 2 1 4444 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 2 2 333 555 22 2 555555 2 000 111111111111 1 555555 1 333 1 22 1 444 5 1 777777777777777777777777777777 222 444 3333 88888 1 222222222222222222 888888888888 1 2 6666 1 1 666666666 2 1 1 1 1 1 2 1 55 4 222 2 2 11 1 1 11 1 5555 1 66666 33333 1 7 333 222 1 3 1 1 2 11 3 33 1 33 1 22 11 1 7777777777777777 222 44444 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 777777777777 2222 777777 44 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 1 2 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 2 33 999999999 1 33 1 1 1 1 11 1 666666666666 4 222 33 1111111111 1 1 1 44 1 0000000000 1 1 33333 33 333 88888888888888 2 77777777777 222 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 00000 1 2 2 2 3 5 1 44444 1 7
lowQualScore : .. . . . ... .. . ...... . .. . ..... . .... . . . . . .... .......................................................................................... . . . ... ... .. . ...... . ... ............ . ...... . ... . .. . ... . . .............................. ... ... .... ..... . .................. ............ . . .... . . ......... . . . . . . . . .. . ... . . .. . . .. . .... . ..... ..... . . ... ... . . . . . .. . .. . .. . .. .. . ................ ... ..... .. .................................................................................................................................................................... . ............ .... ...... .. . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . . .. ......... . .. . . . . .. . ............ . ... .. .......... . . . .. . .......... . . ..... .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... ..... . . . . . . . ..... . .
lowQualScore : 00 6 3 6 444 00 3 000000 4 33 9 55555 7 9999 4 4 8 4 1 5555 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 555 000 88 0 888888 0 000 777777777777 9 222222 7 000 7 44 7 888 2 7 666666666666666666666666666666 888 888 3333 33333 5 333333333333333333 000000000000 4 9 3333 4 4 444444444 7 3 3 3 3 3 7 3 88 0 333 7 5 77 2 2 77 2 2222 2 55555 11111 2 5 444 222 2 8 2 2 5 77 8 00 2 33 2 99 77 2 4444444444444444 111 88888 77 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 999999999999 4444 222222 77 2 222222 77777 1 44 000000 5555555 55 1 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 2 88 111111111 1 11 1 1 1 1 66 2 888888888888 1 444 33 7777777777 3 3 3 44 3 0000000000 4 4 44444 33 888 11111111111111 8 99999999999 444 333 3 3 88 3 2222222 6 11 3 777777 77777 9 0 4 9 6 0 0 88888 0 3
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----A-----A---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----TC-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A-A-AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------N----AAAGC-----AA-----NAANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNN----NNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN-----------AANNNNCG--GA---A---------ANATTTCG---G-A------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--A---T--A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA--TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----A-----A---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----TC-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A-A-AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------N----AAAGC-----AA-----AAAANNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNN----NNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN-----------ANNNNNCG--GA---A---------ANATTTCG---G-A------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--A---T--A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA--TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANCAA---GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TCA-CG-A-TA-A-A-T-A--CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-GT--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CA-G-T--AGT-TGGA-TT--G-AGAA--AA-T--AATTAAACCAA-A-AAN---NN--N--NNNNN--NNN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--GA---A---------CAATTCCG---G-TT-----A------AT-T------------TAATTG------A--AT-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-T-A-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG-AG--A--A---TG-A-A--G-G-AT-T--GA--AT-TGA---T---T-AATAAA-A---AT--TT----------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-A-----AATTT-------AGG--------------TC--GT-----------C----G---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCC-TA-ATTAAGT-GTGTCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAAAA--AAA--GGATGT-GATTCCGA---T--TA-CAT----C-TC-AAAA--TAAT-GTAGG-GTactgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|10 : TGTG---ATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----A-----A---A-------A--T-----T---------T-C-T-T---TTTTTG--C--T-TT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--A-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----CTTGCATC-A-----C------C-----A---------G--GACACC-G--A-A-GTGT---A-----T-TCA-GA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CA-G-T--A-T-GGGA-TT----G--A--AA-T--TA--------T-T-AAA---TT--A--AAGGA--AAA----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNG---G-G------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--AT--T--A-A--G-G-AC-T-TGA--AT-TGA---C---T-AA-AAA-A---AA--TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-ttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|11 : aaaaaaaggaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGA---T--TAACAT----C-TCGAA----TGAT-GTACG-GTC-GGG---GT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----T-----A---A-------ATTA-----T---------TAT-T-T---TTTTTT--T--T-TT------T-T---TTTTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------A-------------------T---TG---C----A-----TT-GTAA--T------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-A-ACAT---G-----T-CC-----A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-TGGAGTT--A-A--A--AA-T----------------AAA---TT--A--AACCA--------------------AAAGC-----GA-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNTG------------------AATTTCT---G-G------T------AT-A------------T----G---------AT-AT------CTA-----A----C------T-------GAA--CTT-AT-TAA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG-AG--A--A---T--T-A--T-G-TG-C-GGA--AT-TGA---T---TCTA-AAA-A---A----T----------AG-G-GTT-GG-------------------A-----GATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tggct
gi|12 : AAAA--AAAT---AGG----TGTG----TTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----G-----G---C-------A--A-----T---------T-G-T-TATATTTTTA--C--C-GT------TGA---TGT------------T-T------T-A---TT-CACGA-T---A-AA-TCGTACTA---AT------------------C---TG---C----CGCA--TC-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C----A-A-GAGT---A-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-AA-C---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-GTG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-GT--A-A--A--AA-T------------A-A-AAG---TT--T--AAGCA--AAA----------A----AAAGA-----AATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NACCCA---------ATCCTTTG---G----------------T-T------------T----GA-----A--AT-AT------CGA-----G----C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G-------AA--C-A---CG-A-A-----T-G------------------------A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TGA---G---T-----AA-A---AG--TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-A-----AATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-T
gi|13 : AAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : aTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG-------------------------------------------------T-T-T-T---TTTTTG--T--G-TT------T-T---TTT------------T-T------T-A----T-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---T----C-----TT-G-----C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-A-GTGT---A-----T-TCA-TA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-GTGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----A-G-C--A---AGGA-TT--A-A--A--AA-T--------------A-AGA---TT--A--AAGCA--AAA-------------------------NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNG---G-A------A------A--T------------T----GAT----A--AT-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--T-A-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG-GG--A--A---T--G-A--G-G-AC-T-GGA--A--TGA---T---T-T--------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-A-----AA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----A-----A---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C-----TC-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TCA-TA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-TTAAA-A--A--AA-T--GA--------ATA-AAG---TT-----ANNNN--NNN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNGG---G-A------A------AT-T------------T----T------AT-AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG-GGA-A--A---T--G-A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----A-----A---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C-----TC-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TCA-TA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-TTAAA-A--A--AA-T--GA--------ATA-AAG---TT-----ANNNN--NNN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNGG---G-A------A------AT-T------------T----T------AT-AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG-GGA-A--A---T--G-A--G-G-AC-
gi|16 : -------A--A-----T---------C-T-T-T---TTTTTA--C--A-TT------T-A---TTT------------T----------A---TT-CA--C-G---A-AA-TTCGACA----AT------------------T---TG---C----C-----TT-A-----CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-A-GT-T---A-----T-TCA-CA-G-TA-A-AAT-A--CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-----G--------A-T-AAA---TT--A--CAGCA--AAA----------A----AAA--------------------TTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACT----CCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCTTG-----------AAAGCACGAAGA---C---------ACATCTTG---G-A--------------T-T------------T----G------A--AGGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----T-GT----A-TG-AG--A--A---T--T-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TGGT--T---T-TA-AAATA---AAC-TT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-A-----AATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TCA-CG-A-TA-C-A---A--CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--ATAAC-----A-A-A---GA---G----------A-T--A-T-AATA-TT--AGA--A--AA-T--AACCACCC--A-A-AAA----------AAATG--AAA----------TTTCTGATAC-----TA-----AAA---TTGTTATATG----AGTGAATTACTAA----GCCA----ATTGTAAACTTCGAGTC--TGTTTCGGAAAGTATGAAGGACCG--CC---A---------TGATTTTG---A-A------A------AT-TCGGTTATTCTATT----G------A--AT-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-T-A-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----T-GT----A-TG-AG--A--A---TG-A-A--G-G-A--T-GGA---T-TGA---T---T--------A---AA--TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCC-TA-ATTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTC
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tCCGTG---TTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----G-----GGGTTGA---G-------A--A-----T---------T-T-T-T---GTTTTG--C--T-TT------T-A---TT-------------------------------CA--G-T---A-AA-T----------AC------------------T---TG---C----C-----TT-A-----CAT----C-----A-----------------C---------------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A--AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-AT--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TA-A-T--A-T-TGGG-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A---------TT--A--AAGCN--NNN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------AAAATGC-----------------------TCG---A-T------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaagAAA--TAAAAGTAGTTGTCT-------TTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G----------------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-G----------AT------------------T---TG---C----C-----TT-GCATTAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A----T-----------------CG-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG---------T-A-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------T----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---NNNNNNNNGGAAATTTCG---C-T------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--AT--T--A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TGATTTT---T-TA-AAA-A---A----T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGA---T--TAACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAGA-GTGCGGGGAAGGTCCGA-------------AAAAAAA---T-------------------------------------------GG-----A-----A-----A---A--------------------------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-GT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--GATA--A-AA-T----------ATTTGCCC------------T---TG---C----C-----TC-G-----C------C-----A------------GA-A-C-A--AGA-GTGT---A-----TGTCA-CATA-CATG-A-T-AT-CG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-GT--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CA-GAT--A-T-GGGA--A--A-A--A--AA-T--GAGCT-----A-A-AAG---CT--AAGAAGCACCAAA----------A----GAAAC-----AA-----GA
gi|2 : TTTGG---G-AC-----A------ATGT------------T----G------AGAAT-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGAT-GG----AGCG-AG--A--A---T--AGA--G-G-AC---GAA--AT-TGATT-T---T-TA-AAA-A---AA--TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-G-----AATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCC-TA-Ataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcag------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----TT-G-----C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TGA-TA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-GT--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNG---G-A------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A--------------------A--A-A-AC-T-AAA--AT-TGA---T---T--A-AAA-A---AA--TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-A-----AATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tgacaca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-GT--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-TGGG-TA--A-A--A--AACT--AA--------A-ATAAA---TCCCA--AAATG--ACA----------T----GATTC-----GA-----CAA---TTGATTTCACCCCCATTTAATACATAA----ATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATATTG-----------AAGAGTCC--CA---A---------TAATACCA---GTA------C------ATGTA-----------T----G------A--TT-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-A-A-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----T-GT----G-CATAA--ATTA---T--A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TTG---T---C-CA-AAA-----AA--TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-A-----AATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C--------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GA-G-T--A-TTGGG-----------------T--AA--------A-A-AAA---TT--A--AATAA--ACC----------T----AAAACCACCTAA-----AAAACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGA----TTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTGCT-----------ATTTT-----GA---A---------A-ATTTCA---G-AT-----A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-T-T-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----T-GT----A-TG------------T--A-----------T-GTA---------------T-CA-AAC-A---AA--TT----------AG-C-ATT-GG--A-A----------T-A-ATTTAAAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCC-TA-AGCA
gi|23 : gttctatatttacaTGTG---TTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGA-----A---A-------A--A-----T---------A-CAT-T---TTTTTG--G--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----TT-G------------C-----A-----------------------------------------TCA-CC-A-GG-A-----A--CA-T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-AT--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TA-G-T--A-G-TGGA-TT--A-A--A--TA-T----------------AAA---TT--A--AACCA--CAN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNG--AA---A---------AT-------------------------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--G--A---TG-A-A--G-G-AT-T-GGA--AT-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aatAAAA---AAC-ATAGG----CGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A-------------------------------------------------------------------------TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----TT-G-----C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TCA-TA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GTGA-TT--A-A--A--AG-T----------------AAA---TT--G--AAGCA--AAA-------------------------NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNG--GA---A---------A---------------------------T-T------------T----G------A--AT-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-GG--A--A---T--G-A--G-G-AC-T-GAA--AT-T
gi|25 : aaacc---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTACCAAAT------------------T---TG---C----C-----TT-GTATCAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---G-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNG---G---------------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CA-AG--A--ATATT--A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-T
gi|26 : -A-T-G--A-A-ACGT---A-----T-TTG-CG-A-TG-A-A-T-A--CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-GT--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGG-TT--A-A--ATTAA----AA--------A-A-AAA---GA--A--AA--A--AAA----------A----AAAG------AA-----GNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--GA---A---------AATTTCCA---G-C------A------AT-T------------T----G------A-------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-TG-AG--A--AT--T--A-A--C-G-AT-T-GGA--AT-TGA-------T-TA-AAA-A---GT--TT----------AG-G-GTC-GG--
gi|27 : ---TG---C----A-----TC-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------AAA---TT--T--AAGCA--AAANNNNNNNNNNN----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--GG---A---------AGATTTCG---G-T------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--C---TTAA-A--G-G-AC-T-acacacacctaatatttcttttt
gi|28 : tttgtca-----TC-A-----C------C-----A---------G--CT-A-C----A-A-GTG----A-----T-TCA-CA-A-TA-ACA-T-AA-CG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T---------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA------A-T-GGGG-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A---------TT--A--CAGCA--AGA----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNN---G-G------A-------T-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-T-A-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--A---TG-A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-
gi|29 : tgtcacaaattgcttca-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--AG--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------G----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNN-G---G-A------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--A---TT-A-C--T-G-AC-T-GGA--AT-TGA---T---T-TT-AAA-A---AA--TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGA-GNNNNNN---NNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----A-----A---A-------A--A-----T---------T-T-T-C---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----TC-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-GTGT---A-----T-TCA-TA-A-CG-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--TA-TGAAA--------A-A-AAA---TGA-A--AAATG--AAA----------T----AAAGC-----AA-----AANNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNG---G-A------A------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-GG--A--A---T--A-A--G-G-AC-T-GAA--AT-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA--TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTC-TA-AACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : G---C----A-----TC-A-----C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---ATTCAGT-TCA-CA-T-TA-A-G-T-A---G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGGT--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T-----A--T--AA-T--AA--------A-T-TAA---TTAAA--AAGGN--NNN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------GAATATCG---A-ATATTAGA------AT-T------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : T------------------T---TG---T----C-----TT-G-----TAT----C-----ATG-------G--GG-A-CAG--A-A-ACTT---G-----T-CCA-TG-A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-GT--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---A-A-T--G-T-TGGG-TA--A-A--A--AA-T--TG--------C-A-ATCTTTTT--A--AATCA--AAN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNNNNCG-A------ATG----AT-T------------T----G------A--AT-AT------TGA-----G-C--A------T-------GAA--CT
gi|32 : ttCTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----A-----A---GCGTCTTTA--G-----TTTTTATTTAT-T-T-T---TTTTTT--CTTT-TT------T-A---TTT------------TGT------T-A---TTGCA--G-T-----AA-T----------AC------------------T---TG---CATTACAA---TC-A-----C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-A-CAAT---A-----T-TCA-TG-ATTA-T-A-T-A--TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-GC-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CA-G-T--ATT-GGGC-TT--A-A--A--------AA--------A-T-AAT---TT--T--AAGCA--AA
gi|33 : acaaaaaaacg---A---------AAATATCC---G-AT-----A------AA-T------------T----G------A--TT-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------T-GT----A-CG-TA--A--A---TT-A-A--G-G-AT-T-GGA--AT----------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-A-----TATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattg-A---TT-CG--G-T---A-CA-A----------AT------------------T---TG---C----C-----TT-G-----CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------AAA---TT--A--AAGCA--AGA----------A----AA
gi|36 : ata------------T----G------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-T-A-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----T-AC----A-CG-AG--A--A---TTGA-G--G-G-AC-T-GGA--ACATGA---T---T-----AA-A---AA--TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-C-----AATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------A------AT-T------------T----G------G--AT-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-CG-AG--G--A---TG-A-A--G-G-AT-T-GAA--AT-TGA---TAAAT-T--AAA-A---AA--TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----T-AT----A-CG-AG--A--A---TG-A-G--G-G-AC-C-GGA--AA-TGA-------T-TA-AAA-A---AT--TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------A------GT-T------------T----G------A---T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-T-A---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--AT--T--A-A--G-G-AA-T-GAA--A--TGA---T---C-TA-AAA-A---TA--AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCA-----CATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : TAGG----TGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----G-----A---A-------T--T-----T---------T-T-T-T---TTTTTA--C--T-TT------T-A---TTTC-----------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----TT-G-----C------
gi|4 : aaaaaa------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-A-GTGT---A-----T-TCA-TA-A-TA-A-AGT-A--CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-GT--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T--TG--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------G----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNG---G-A------A------AT-T------------T----G------A--ATGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-T-ACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--AC-A---TTGA-ACCT-G-AC-T-GGA--AT-TGAAT-T---T-TT-AAA-A---AA--TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-A-----A--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|40 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt------A--AT-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-T-A-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA-AG--GTCA---T--A-A--GTGTAC-T-AGA--AT-TAA---C------A-AAA-GTAGAA--TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-T-----AATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----T-GT----A-CA-AG--A--A---TT-A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TGA---T---T-TA-AAA-A---AA--TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-A-----AA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-A-----AATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGA---T--TA-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAGG-GTC-GAG---GT
gi|47 : aa-T-GGA--AT-TGA---T---T-----AA-A---AA--TT-------------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCC-ctgaaattc
gi|5 : -----T---------C-T-T-T---TTCTCGGAC--T-TT------T-AATTTTC------------T-T------T-A---TT-CA--C-TTAAA-AA-T----------ACGAGTTAGCAGAGGGAATAT---TGAGTC----C-----TT-G-----CGTCTAAC-----A---------G--GA---T-A--A-A-GTGTTATA-----TATCA-CA---TA-G-A-T-AGACG-T---TTTTGCTGT-A--CG-T-A--C-C----T-CT--G--AC-----A-T----------AT-G-TT-CACG-TCCA-TTGGGA-TT--T-A--A-----T--AA--------A-A-TAA---T---A--CCTCA--AAA----------C-------GC-----AA-----AAAA
gi|5 : ttt--GG---A---------AGATTTCG---G-T------A------AT-TA-----------T----GGGGTGAA--AT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CT---T-T-A-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----T-GT----A-AGTAGTTAT-A---T--T-A--G-G-ACTT-GGAACAT-CGA---T---T-AG-AGATA---AATTTT----------AG-G-GCC-AG--G-AG---------G-A-A-----AATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaggaagatttcggtaattatggggtgaaatatcgatgtcctctggaggagctttagagattatacattaacgtaagtgtaagtagttatattaggacttggaacatcgattagagataaattttagggccaggaggaaaattttaagggtcggttccgttgctcccagagtataatcgatacacatctttttttttttt
gi|50 : ttttctttttctcggacttttaattttctttattcacttaaaaatacgagttagcagagggaatattgagtccttgcgtctaacaggataaagtgttatatatcacatagatagacgtttttgctgtacgtacctctgacatatgttcacgtccattgggatttaataaaataatacctcaaaacgcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAA---T--TA-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAGG-ATCAGGG---GTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-A-----AATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--AT--T--A-A--G-G-AC-T-GGA--AT-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCT-TG-A
gi|55 : ------A------AT-T------------T----G------A--AC-GT------CGA-----G-C--C------C-------GAgt
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AGGATGT--TTTCC-A---T--TA-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTAGtgtattac
gi|6 : aTTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----A-----A---A-------A--AAATTTT---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T---A-AA------------AT------------------TGCCTG---C----A-----TC-A-----C------C-----A---------T---A-A-C----A-A-GTGT---A-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G---A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA-T----------------AAA---TT--A--AAGCA--Aatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgtt--GG---A---------AGATTTCG---G-T------A------AT-T------------T----T------A--AT-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-AG--AT-G---T--A-A--G-G-AC-T--GA--AT-TGA-------T-TA-AAA-A---AA--TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-A-----TATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT-GAAAATAATA-CAT----AATCAAAAAA-TAAT-GTAGG-GTCGGGG---GT
gi|7 : acAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----G-----GTCGG-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTT--T--T-TTGTTAATT-A---TTT------------T-T------TTA---TT-CA--G-T---A-AAAT----------AT------------------T---TGGC-C----C-----TT-G-----CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A---GTGT---A-----T-TCA-TA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AT-----A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GAA-TT--A-AG-A--AA-T----------------AAA---TT--A--AAGCA--AAN----------N----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNNNTTG-A------A------TT-T------------T----G------A--AT-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG-GG--A--AT--T--A-A--G-A-AC-T-AAA--AT-TGA---T---T-TA-AAACA---AA--TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-A-----AATTT--T---A-GG--------------TC-GATC----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------G--A-CA--C-A------CC---------T-TTTT-TT-TTTGGCCTTACACTAA---ATGTCcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccgggtaatcggacacaccttttttttttggccttacactaaatgtct
gi|8 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaaAAAA--CAAA-TTAGG-GT-TGTG---GTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA--------------------------------------------------------------------------------T---------T-T-TAT---TTTTTAA-C--T-TT------T-A---TTT------------G-T--------A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTAACGAAT------------------T---TG---C----C-----TTAG-----CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-A-GTAT---------T-TCA-CA-A-TA-A-A-TTA--CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CA-GCT--A-T-GG-A-TT--A-A--A--AA-T--AA--------A-T-CAA----------AAGCA--AAA----------A----NNNNN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNN---G-G------A-------T-T------------T----GTA----AT-AT-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATAT-AAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG-AG--A--AAT-T--A-AAAG-G-AC-TTGGA--AT--GA---C---T-AA-TGA-A---AG--TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-A-----ATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCT-TA-t
gi|9 : aTGGT---GTTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----A-----A------------------------------T-T-T-T---TTTTTA--C--TGTT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-T----------GCC-----------------T---TG---C----A-----TC-A-----C------------A---------G--GA-A-C-G--A-AAGT-T---A-----T-TCA-CA-A-TA-A-A-T-G--CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--ACT-AGGA-TT--T-A--A--A-----AA--------A-T-AAT---TT--A--AAGCA--AAA----------A----AAAGN-----NN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN-----------NNNNNNNN--NN---N---------NNNNNNNN---N-N------NNNNNGGAT-T------------G----G------A--AT-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-T-A-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----T-ACG---A-CG-AG--A--ACT-T--A-A--G-G-AC---GGG--AT-TGA---G---T----AAA-C---AA--TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-A-----AATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111111111 333333333333333333333333333333 3333333333333333333333333333 444444444444444444444444444 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111 111111 11111111111 1111111111 1111
lowQualScore : 55 3 2 3 666 55 7 111111 0 66 2 66666 1 3 1 1 2 2 1 2 1 5555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 2 2 333 555 22 2 555555 2 000 111111111111 1 555555 1 333 1 22 1 444 5 1 777777777777777777777777777777 222 444 3333 88888 22 1 2222222222222222222222222222 22 1 2 6666 1 1 0 666666666 2 1 1 1 1 1 2 1 55 4 222 2 2 11 1 1 11 1 5555 1 66666 33333 1 6 444 222 1 3 1 1 2 11 3 33 1 2222 33 1 22 33 1 333333333333333333333333333 222 55555 11 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 000000000000 2222 44 44 1 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 1 2 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 7777777777 1 2 66 888888 22 33 1 1 2 11 1 44444444444 4 222 1 5555555555 1 1 1 44 1 8888888888 2 1 33 333 88888888888888 2 77777777777 222 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 77777 1 2 2 2 3 5 1 0000 1 7
lowQualScore : .. . . . ... .. . ...... . .. . ..... . . . . . . . . . .... ..................................................................................... . . . ... ... .. . ...... . ... ............ . ...... . ... . .. . ... . . .............................. ... ... .... ..... .. . ............................ .. . . .... . . . ......... . . . . . . . . .. . ... . . .. . . .. . .... . ..... ..... . . ... ... . . . . . .. . .. . .... .. . .. .. . ........................... ... ..... .. ....................................................................................................................................................................... . ............ .... .. .. . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . .......... . . .. ...... .. .. . . . .. . ........... . ... . .......... . . . .. . .......... . . .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... ..... . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 00 6 3 6 444 00 3 000000 4 33 9 55555 7 3 1 1 4 4 8 4 0 8888 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 555 000 88 0 888888 0 000 777777777777 9 222222 7 000 7 44 7 888 2 7 666666666666666666666666666666 888 888 3333 33333 00 5 1111111111111111111111111111 00 4 9 3333 4 4 5 444444444 7 3 3 3 3 3 7 3 88 0 333 7 5 77 2 2 77 2 2222 2 55555 11111 2 2 777 222 2 8 2 2 5 77 8 00 2 6666 33 2 99 33 2 222222222222222222222222222 111 11111 77 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 000000000000 4444 11 77 1 2 222222 77777 1 44 000000 5555555 55 1 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 1111111111 1 2 44 666666 66 11 1 1 3 66 2 11111111111 1 444 4 0000000000 3 3 3 44 3 7777777777 8 4 33 888 11111111111111 8 99999999999 444 333 3 3 88 3 2222222 6 11 3 777777 77777 9 0 4 9 6 0 0 5555 0 3
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNGGTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A-A-AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------N----AAAGC-----AANAANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNN----NNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNN---TN-----------AANNNNCG--GA--------A---------AAATTTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNGGTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A-A-AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------N----AAAGC-----AANAANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNN----NNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNN---TN-----------AANNNNCG--GA--------A---------ANATTTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TC-ACG-A-TA-A-A-T-A--CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-GT--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CA-G-T--AGT-TGGA-T----T--G-AGAA--AA-T--A-----------ATTAAACCAA-A-AAN---NN--N--NNNNN--NNN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--GA--------A---------CAATTCCG---G-TT-----A------AT-T------------TAATTG--A--A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-T-A-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ATT-G-AA--T-TGA---T---T-AATAA-A---AA-TTT---------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-AAATTT-------AGG--------------TC-G-T-----------C---GG-----T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--ATTGTT-T-TTT--------GTCC-TA-ATTAAGT-GTGTCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAAAA--AAA--GGATGT-GATTCCGA---T--TA-CAT----C-TC-AAAA--TAAT-GTAGG-GTactgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|10 : TGTGATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------A--T-----T---------T-C-T-T---TTTTTG--C--T-TT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--A-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----CTTGCAT--C-A-----C------C-----A---------G--GACACC-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-AGA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T----G--A--AA-T--T-----------A--------T-T-AAA---TT--A--AAGGA--AAA----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNG---G-G------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-TGAA--T-TGA---C---T-AAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-ttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|11 : aaaaaaaggaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGA---T--TAACAT----C-TCGAA----TGAT-GTACG-GTC-GGGGT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----TA---A-------ATTA-----T---------TAT-T-T---TTTTTT--T--T-TT------T-T---TTTTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------A-------------------T---TG---C----A-----T--T-GTAA--T------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-A-ACAT---G-----T-CC-----A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-TGGAGT----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AACCA--------------------AAAGC-----GANNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNTG-----------------------AATTTCT---G-G------T------AT-A------------T----G-----A-T-AT------CTA-----A----C------T-------GAA--CTT-AT-TAA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG----------A-G-A--A---T--T--A--T-G-TGC-GGAA--T-TGA---T---TCTAAAA-A---A---T----------AG-G-GTT-GG-------------------AGATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tggct
gi|12 : AAAA--AAAT---AGG----TGTG-TTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------A--A-----T---------T-G-T-TATATTTTTA--C--C-GT------TGA---TGT------------T-T------T-A---TT-CACGA-T---A-AA-TCGTACTA---AT------------------C---TG---C----CGCA--T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C----A-A-GAGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-AA-C---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-GTG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-G----T--A-A--A--AA-T-----------------------A-A-AAG---TT--T--AAGCA--AAA----------A----AAAGA-----AATAGNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NNNNNNACCCA---------ATCCTTTG---G----------------T-T------------T----GA-A--A-T-AT------CGA-----G----C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G-------AA--C-A---CG-A-A-----T-G---------------------------------A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---G---T----AA-A---AG-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-AAATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-T
gi|13 : AAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : aTGCGTTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG--------------------------------------------T-T-T-T---TTTTTG--T--G-TT------T-T---TTT------------T-T------T-A----T-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---T----C-----T--T-G-----C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-GTGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----A-G-C--A---AGGA-T----T--A-A--A--AA-T-------------------------A-AGA---TT--A--AAGCA--AAA-------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNG---G-A------A------A--T------------T----GATA--A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--T-A-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GGAA----TGA---T---T-T------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-AAA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGGGT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-T----TAAA-A--A--AA-T--G-----------A--------ATA-AAG---TT-----ANNNN--NNN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGGGT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-T----TAAA-A--A--AA-T--G-----------A--------ATA-AAG---TT-----ANNNN--NNN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-AC
gi|16 : -------A--A-----T---------C-T-T-T---TTTTTA--C--A-TT------T-A---TTT------------T----------A---TT-CA--C-G---A-AA-TTCGACA----AT------------------T---TG---C----C-----T--T-A-----CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-A-GT-T---A-----T-TC-ACA-G-TA-A-AAT-A--CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA----------------G--------A-T-AAA---TT--A--CAGCA--AAA----------A----AAA---------------TTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACT----CCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCT---TG-----------AAAGCACGAAGA--------C---------ACATCTTG---G-A--------------T-T------------T----G--A--A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---T--T--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGGT--T---T-TAAAATA---AACTT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-AAATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TC-ACG-A-TA-C-A---A--CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--ATAAC-----A-A-A---GA---G----------A-T--A-T-AATA-T----T--AGA--A--AA-T--A-----------ACCACCC--A-A-AAA----------AAATG--AAA----------TTTCTGATAC-----TAAAATTGTTA-TATG------AGTGAATTACTAA----GCCA----ATTGTAAACTTCGAGTC--TGT---TTCGGAAAGTATGAAGGACCG--CC--------A---------TGATTTTG---A-A------A------AT-TCGGTTATTCTATT----G--A--A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-T-A-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-A-T-GGA---T-TGA---T---T-------A---AA-TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCC-TA-ATTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTC
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tCCGTGTTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------A--A-----T---------T-T-T-T---GTTTTG--C--------------------T------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AC------------------T---TG---C----C-----TTAC-A-----T------C---------------------A-C---------------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A--AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-AT--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TA-A-T--A-T-TGGG-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCN--NNN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------AAAATGC----------------------------TCG---A-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaagAAA--TAAAAGTAGTTGTCT----TTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G-----------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-G----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----CATTAC-C-----A---------G--GA-A-C-G--A------------------TC-G---A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TA----------A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------T----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------NNNNNNNNGGAAATTTCG---C-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGATTTT---T-TAAAA-A---A---T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGA---T--TAACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAGA-GTGCGGGG--------------------------------A--------A----G---------G-------T-------CCG-----A-----AA---AAA-----A--A-----TGGAAAA---T-T-T-T---TTTTTG--C--T-GT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--GATA--A-AA-T----------ATTTGCCC------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A------------GA-A-C-A--AGA-GTGT---A-----TGTC-ACATA-CATG-A-T-AT-CG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-GT--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CA-GAT--A-T-GGGA------A--A-A--A--AA-T--G-----------AGCT-----A-A-AAG---CT--AAGAAGCACCAAA----------A----GAAAC-----AAGA
gi|2 : TTTGG---G-AC-----A------ATGT------------T----G--AGAA-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGAT-GG----AGCG----------A-G-A--A---T--AG-A--G-G-AC--GAAA--T-TGATT-T---T-TAAAA-A---AA-TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-GAATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCC-TA-Ataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcag------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TG-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-GT--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A------------------------------A--A-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T--AAAA-A---AA-TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-AAATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tgacaca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-GT--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-TGGG-T----A--A-A--A--AACT--A-----------A--------A-ATAAA---TCCCA--AAATG--ACA----------T----GATTC-----GACAA---TTGATTTCACCCCCATTTAATACATAA----ATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATAT---TG-----------AAGAGTCC--CA--------A---------TAATACCA---GTA------C------ATGTA-----------T----G--A--T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-A-A-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----T-GT----G-CAT---------A-A-ATTA---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TTG---T---C-CAAAA-----AA-TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-AAATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C--------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GA-G-T--A-TTGGG---------------------T--A-----------A--------A-A-AAA---TT--A--AATAA--ACC----------T----AAAACCACCTAAAAAACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGA----TTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTG---CT-----------A--TTTTG------------A---------AAATTTCA---G-AT-----A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-T-T-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----T-GT----A-TGTATGTATCAAACA-A--A---T--T--A--G-C-ATT-GGAA--T--AA---T---T-TA-----------------------------------------------------AAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCC-TA-AGCA
gi|23 : gttctatatttacaTGTGTTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------A--A-----T---------A-CAT-T---TTTTTG--G--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G------------C-----A-----------------------------------------TC-ACC-A-GG-A-----A--CA-T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-AT--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TA-G-T--A-G-TGGA-T----T--A-A--A--TA-T---------------------------AAA---TT--A--AACCA--CAN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNG--AA--------A---------AT-------------------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GGAA--T-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aatAAAA---AAC-ATAGG----CGTGTTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A--------------------------------------------------------------------TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GTGA-T----T--A-A--A--AG-T---------------------------AAA---TT--G--AAGCA--AAA-------------------------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNG--GA--------A---------A---------------------------T-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GAAA--T-T
gi|25 : aaacc---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTACCAAAT------------------T---TG---C----C-----T--T-GTATCAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---G-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNG---G---------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--ATATT--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-T
gi|26 : -A-T-G--A-A-ACGT---A-----T-TT-GCG-A-TG-A-A-T-A--CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-GT--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGG-T----T--A-A--ATTAA----A-----------A--------A-A-AAA---GA--A--AA--A--AAA----------A----AAAG------AAGNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--GA--------A---------AATTTCCA---G-C------A------AT-T------------T----G--A--------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--AT--T--A--A--C-G-ATT-GGAA--T-TGA-------T-TAAAA-A---GT-TT----------AG-G-GTC-GG--
gi|27 : ---TG---C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--T--AAGCA--AAANNNNNNNNNNN----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--GG--------A---------AGATTTCG---G-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--C---TTAA--A--G-G-ACT-acacacacctaatatttcttttt
gi|28 : tttgtca-----T--C-A-----C------C-----A---------G--CT-A-C----A-A-GTG----A-----T-TC-ACA-A-TA-ACA-T-AA-CG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T---------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA------A-T-GGGG-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A---------TT--A--CAGCA--AGA----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNN---G-G------A-------T-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-T-A-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-
gi|29 : tgtcacaaattgcttca-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------G--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------G----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNN-G---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TT-A--C--T-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGA-GNNNNNNNNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-C---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-CG-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--TA-TGAA-----------A--------A-A-AAA---TGA-A--AAATG--AAA----------T----AAAGC-----AAAANNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GAAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTC-TA-AACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : G---C----A-----T--C-A-----C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---ATTCAGT-TC-ACA-T-TA-A-G-T-A---G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGGT--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T---------A--T--AA-T--A-----------A--------A-T-TAA---TTAAA--AAGGN--NNN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------GAATATCG---A-ATATTAGA------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : T------------------T---TG---T----C-----T--T-G-----TAT----C-----ATG-------G--GG-A-CAG--A-A-ACTT---G-----T-CC-ATG-A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-GT--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---A-A-T--G-T-TGGG-T----A--A-A--A--AA-T--T-----------G--------C-A-ATCTTTTT--A--AATCA--AAN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNNNNCG-A------ATG----AT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--A------T-------GAA--CT
gi|32 : ttCTGCGTTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTA--G-----TTTTTATTTAT-T-T-T---TTTTTT--CTTT-TT------T-A---TTT------------TGT------T-A---TTGCA--G-T-----AA-T----------AC------------------T---TG---CATTACAA---T--C-A-----C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-A-CAAT---A-----T-TC-ATG-ATTA-T-A-T-A--TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-GC-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CA-G-T--ATT-GGGC-T----T--A-A--A--------A-----------A--------A-T-AAT---TT--T--AAGCA--AA
gi|33 : acaaaaaaacg--------A---------AAATATCC---G-AT-----A------AA-T------------T----G--A--T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------T-GT----A-CG----------T-A-A--A---TT-A--A--G-G-ATT-GGAA--T--------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-ATATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattg-A---TT-CG--G-T---A-CA-A----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCA--AGA----------A----AA
gi|36 : ata------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-T-A-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----T-AC----A-CG----------A-G-A--A---TTGA--G--G-G-ACT-GGAA--CATGA---T---T----AA-A---AA-TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-CAATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------A------AT-T------------T----G--G--A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GAAA--T-TGA---TAAAT-T-AAA-A---AA-TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-AAATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----T-AT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--G--G-G-ACC-GGAA--A-TGA-------T-TAAAA-A---AT-TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------A------GT-T------------T----G--A----T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-T-A---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-AAT-GAAA----TGA---T---C-TAAAA-A---TA-AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCACATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : TAGG----TGTGTTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------T--T-----T---------T-T-T-T---TTTTTA--C--T-TT------T-A---TTTC-----------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----C------
gi|4 : aaaaaa------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-AGT-A--CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-GT--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--T-----------G--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------G----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-T-ACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AC-A---TTGA--ACCT-G-ACT-GGAA--T-TGAAT-T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-AA--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|40 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--A--A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-T-A-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA----------A-G-GTCA---T--A--A--GTGTACT-AGAA--T-TAA---C------AAAA-GTAGAA-TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-TAATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--A---TT-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-AAA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGA---T--TA-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAGG-GTC-GAGGT
gi|47 : aaT-GGAA--T-TGA---T---T----AA-A---AA-TT--------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCC-ctgaaattc
gi|5 : -----T---------C-T-T-T---TTCTCGGAC--T-TT------T-AATTTTC------------T-T------T-A---TT-CA--C-TTAAA-AA-T----------ACGAGTTAGCAGAGGGAATAT---TGAGTC----C-----T--T-G-----CGTCTAAC-----A---------G--GA---T-A--A-A-GTGTTATA-----TATC-ACA---TA-G-A-T-AGACG-T---TTTTGCTGT-A--CG-T-A--C-C----T-CT--G--AC-----A-T----------AT-G-TT-CACG-TCCA-TTGGGA-TTTAAT--A-A--AATAA-T--ACCTCAAAACGCA--------A-A-AAA---NN--N--NNNNN--NNN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGAGGTC-----------CATCCTTA--GG--------A---------AGATTTCG---G-T------A------AT-TATGGGG------T----G--A--AAT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----T-A-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----T-GT----A-AGT---------A-G-TT-A---T--ATTA--G-G-ACTTGGAACAT-CGA---T---T-AGAGATA---AA-TTTT--------AG-G-GCC-AG--G-A----------GGA-AAATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-T
gi|50 : tttAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAA---T--TA-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAGG-ATCAGGGGTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCT-TG-AGT
gi|55 : ------A------AT-T------------T----G--A--A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GA
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AGGATGT--TTTCC-A---T--TA-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTAGtgtattac
gi|6 : aTTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--AAATTTT---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T---A-AA------------AT------------------TGCCTG---C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------T---A-A-C----A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G---A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCA--Aatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgtt--GG--------A---------AGATTTCG---G-T------A------AT-T------------T----T--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AT-G---T--A--A--G-G-ACT--GAA--T-TGA-------T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-ATATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT-GAAAATAATA-CAT----AATCAAAAAA-TAAT-GTAGG-GTCGGGGGT
gi|7 : acAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTT--T--T-TTGTTAATT-A---TTT------------T-T------TTA---TT-CA--G-T---A-AAAT----------AT------------------T---TGGC-C----C-----T--T-G-----CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A---GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AT-----A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GAA-T----T--A-AG-A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCA--AAN----------N----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNNNTTG-A------A------TT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--AT--T--A--A--G-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T-TAAAACA---AA-TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-AAATTT--T---A-GG--------------TC-GATC----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------G--A-CA--C-A------CC---------T-TTTT-TT-TTTGGCCTTACACTAAAT-GTcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccgggtaatcggacacaccttttttttttggccttacactaaatgtct
gi|8 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaaAAAA--CAAA-TTAGG-GT-TGTGGTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA---------------------------------------------------------------------------T---------T-T-TAT---TTTTTAA-C--T-TT------T-A---TTT------------G-T--------A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTAACGAAT------------------T---TG---C----C-----T--TAG-----CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-A-GTAT---------T-TC-ACA-A-TA-A-A-TTA--CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CA-GCT--A-T-GG-A-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A-T-CAA----------AAGCA--AAA----------A----NNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNN---G-G------A-------T-T------------T----GTAAT-A-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATAT-AAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AAT-T--A--AAAG-G-ACTTGGAA--T--GA---C---T-AATGA-A---AG-TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-AATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCT-TA-ct
gi|9 : aTGGTGTTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA------------------------------T-T-T-T---TTTTTA--C--TGTT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-T----------GCC-----------------T---TG---C----A-----T--C-A-----C------------A---------G--GA-A-C-G--A-AAGT-T---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-G--CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--ACT-AGGA-T----T--T-A--A--A-----A-----------A--------A-T-AAT---TT--A--AAGCA--AAA----------A----AAAGN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN-----------NNNNNNNN--NN--------N---------NNNNNNNN---N-N------NNNNNGGAT-T------------G----G--A--A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-T-A-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----T-ACG---A-CG----------A-G-A--ACT-T--A--A--G-G-AC--GGGA--T-TGA---G---T---AAA-C---AA-TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-AAATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111111111 333333333333333333333333333333 3333333333333333333333333333 333333333333333333333333333 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111111 111111 11111111111 1111111111 1111
lowQualScore : 55 3 2 3 666 55 7 111111 0 66 2 66666 1 3 1 1 2 2 1 2 1 5555 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 2 2 333 555 22 2 555555 2 000 111111111111 1 555555 1 333 1 22 1 444 5 1 777777777777777777777777777777 222 444 3333 88888 22 1 2222222222222222222222222222 22 1 2 6666 1 1 0 666666666 2 1 1 1 1 1 2 1 55 4 222 2 2 11 1 1 11 1 5555 1 66666 33333 1 6 444 222 1 2 2 1 2 11 3 2 1 2222 33 1 22 33 1 999999999999999999999999999 2222 44 11 11 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 000000000000 2222 44 44 1 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 1 2 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 7777777777 1 2 66 888888 22 33 1 1 2 11 1 44444444444 4 222 1 5555555555 1 1 1 44 1 8888888888 2 1 33 333 88888888888888 2 77777777777 222 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 77777 1 2 2 2 3 5 1 0000 1 7
lowQualScore : .. . . . ... .. . ...... . .. . ..... . . . . . . . . . .... ..................................................................................... . . . ... ... .. . ...... . ... ............ . ...... . ... . .. . ... . . .............................. ... ... .... ..... .. . ............................ .. . . .... . . . ......... . . . . . . . . .. . ... . . .. . . .. . .... . ..... ..... . . ... ... . . . . . .. . . . .... .. . .. .. . ........................... .... .. .. .. ..................................................................................................................................................................... . ............ .... .. .. . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . .......... . . .. ...... .. .. . . . .. . ........... . ... . .......... . . . .. . .......... . . .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... ..... . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 00 6 3 6 444 00 3 000000 4 33 9 55555 7 3 1 1 4 4 8 4 0 8888 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 555 000 88 0 888888 0 000 777777777777 9 222222 7 000 7 44 7 888 2 7 666666666666666666666666666666 888 888 3333 33333 00 5 1111111111111111111111111111 00 4 9 3333 4 4 5 444444444 7 3 3 3 3 3 7 3 88 0 333 7 5 77 2 2 77 2 2222 2 55555 11111 2 2 777 222 2 5 5 2 5 77 8 4 2 6666 33 2 99 33 2 777777777777777777777777777 6666 55 77 77 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 000000000000 4444 11 77 1 2 222222 77777 1 44 000000 5555555 55 1 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 1111111111 1 2 44 666666 66 11 1 1 3 66 2 11111111111 1 444 4 0000000000 3 3 3 44 3 7777777777 8 4 33 888 11111111111111 8 99999999999 444 333 3 3 88 3 2222222 6 11 3 777777 77777 9 0 4 9 6 0 0 5555 0 3
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNGGTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A---AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------NAAAGC-----GANA--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNN----NNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNN---TN---AANNNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNGGTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A-A-AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------NAAAGC-----AANA--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNN----NNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNN---TN---AANNNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TC-ACG-A-TA-A-A-T-A--CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-GT--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CA-G-T--AGT-TGGA-T----T--G-AGAA--AA-T--A-----------ATTAAACCAA-A-AAN---NN--N--NNNNN--NNN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--GAA---------C------A--------AT--TCCG---G-TT-----A------AT-T------------TAATTG--A--A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-T-A-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ATT-G-AA--T-TGA---T---T-AATAA-A---AA-TTT---------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-AAATTT-------AGG--------------TC-G-T-----------C---GG-----T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--ATTGTT-T-TTT--------GTCC-TA-ATTAAGT-GTGTCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAAAA--AAA--GGATGT-GATTCCGA---T--TA-CAT----C-TC-AAAA--TAAT-GTAGG-GTactgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|10 : TGTGATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------A--T-----T---------T-C-T-T---TTTTTG--C--T-TT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--A-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----CTTGCAT--C-A-----C------C-----A---------G--GACACC-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-AGA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T----G--A--AA-T--T-----------A--------T-T-AAA---TT--A--AAGGA--AAA----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-G------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-TGAA--T-TGA---C---T-AAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-ttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|11 : aaaaaaaggaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGA---T--TAACAT----C-TCGAA----TGAT-GTACG-GTC-GGGGT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----TA---A-------ATTA-----T---------TAT-T-T---TTTTTT--T--T-TT------T-T---TTTTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------A-------------------T---TG---C----A-----T--T-GTAA--T------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-A-ACAT---G-----T-CC-----A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-TGGAGT----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AACCA----------------AAAGC-----GANN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNTG---------------------A--------AT--TTCT---G-G------T------AT-A------------T----G-----A-T-AT------CTA-----A----C------T-------GAA--CTT-AT-TAA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG----------A-G-A--A---T--T--A--T-G-TGC-GGAA--T-TGA---T---TCTAAAA-A---A---T----------AG-G-GTT-GG-------------------AGATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tggct
gi|12 : AAAA--AAAT---AGG----TGTG-TTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------A--A-----T---------T-G-T-TATATTTTTA--C--C-GT------TGA---TGT------------T-T------T-A---TT-CACGA-T---A-AA-TCGTACTA---AT------------------C---TG---C----CGCA--T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C----A-A-GAGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-AA-C---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-GTG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-G----T--A-A--A--AA-T-----------------------A-A-AAG---TT--T--AAGCA--AAA----------AAAAGA-----AATA--GNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------NNNACCCA--------ATCCTTTG---G----------------T-T------------T----GA-A--A-T-AT------CGA-----G----C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G-------AA--C-A---CG-A-A-----T-G---------------------------------A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---G---T----AA-A---AG-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-AAATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-T
gi|13 : AAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : aTGCGTTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG--------------------------------------------T-T-T-T---TTTTTG--T--G-TT------T-T---TTT------------T-T------T-A----T-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---T----C-----T--T-G-----C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-GTGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----A-G-C--A---AGGA-T----T--A-A--A--AA-T-------------------------A-AGA---TT--A--AAGCA--AAA---------------------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------A--T------------T----GATA--A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--T-A-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GGAA----TGA---T---T-T------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-AAA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGGGT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-T----TAAA-A--A--AA-T--G-----------A--------ATA-AAG---TT-----ANNNN--NNN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGGGT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C-----T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-T----TAAA-A--A--AA-T--G-----------A--------ATA-AAG---TT-----ANNNN--NNN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-AC
gi|16 : -------A--A-----T---------C-T-T-T---TTTTTA--C--A-TT------T-A---TTT------------T----------A---TT-CA--C-G---A-AA-TTCGACA----AT------------------T---TG---C----C-----T--T-A-----CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-A-GT-T---A-----T-TC-ACA-G-TA-A-AAT-A--CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA----------------G--------A-T-AAA---TT--A--CAGCA--AAA----------AAAA-----------------TTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACT----CCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCT---TG---AAAGCACGAAGAC---------A------C--------AT--CTTG---G-A--------------T-T------------T----G--A--A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---T--T--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGGT--T---T-TAAAATA---AACTT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-AAATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TC-ACG-A-TA-C-A---A--CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--ATAAC-----A-A-A---GA---G----------A-T--A-T-AATA-T----T--AGA--A--AA-T--A--------------------A-C-CAC---CC--A--AAA-A--AAA----------TGAAATTTCT-GATACTAAAATTGTTATATG----AGTGAATTACTAA----GCCA----ATTGTAAACTTCGAGTC--TGT---TTCGGAAAGTATG--AAG---------G------ACCGCCATGAT--TTTG---A-A------A------AT-TCGGTTATTCTATT----G--A--A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-T-A-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-A-T-GGA---T-TGA---T---T-------A---AA-TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCC-TA-ATTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTC
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tCCGTGTTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------A--A-----T---------T-T-T-T---GTTTTG--C--------------------T------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AC------------------T---TG---C----C-----TTAC-A-----T------C---------------------A-C---------------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A--AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-AT--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TA-A-T--A-T-TGGG-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCN--NNN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---AAAATGC------------------------------------TCG---A-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaagAAA--TAAAAGTAGTTGTCT----TTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G-----------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-G----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----CATTAC-C-----A---------G--GA-A-C-G--A------------------TC-G---A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TA----------A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------TNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNNNNNNNNNGGA------A--------AT--TTCG---C-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGATTTT---T-TAAAA-A---A---T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGA---T--TAACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAGA-GTGCGGGG--------------------------------A--------A----G---------G-------T-------CCG-----A-----AA---AAA-----A--A-----TGGAAAA---T-T-T-T---TTTTTG--C--T-GT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--GATA--A-AA-T----------ATTTGCCC------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A------------GA-A-C-A--AGA-GTGT---A-----TGTC-ACATA-CATG-A-T-AT-CG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-GT--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CA-GAT--A-T-GGGA------A--A-A--A--AA-T--G-----------AGCT-----A-A-AAG---CT--AAGAAGCACCAAA----------AGAAAC-----AAGA--
gi|2 : ------A--------GT--TTGG---G-AC-----A------ATGT------------T----G--AGAA-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGAT-GG----AGCG----------A-G-A--A---T--AG-A--G-G-AC--GAAA--T-TGATT-T---T-TAAAA-A---AA-TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-GAATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCC-TA-Ataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgc------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TG-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-GT--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A------------------------------A--A-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T--AAAA-A---AA-TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-AAATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tgacaca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-GT--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-TGGG-T----A--A-A--A--AACT--A-----------A--------A-ATAAA---TCCCA--AAATG--ACA----------TGATTC-----GACA--A---TTGATTTCACCCCCATTTAATACATAA----ATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATAT---TG---AAGAGTCC--CAA---------T------A--------AT--ACCA---GTA------C------ATGTA-----------T----G--A--T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-A-A-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----T-GT----G-CAT---------A-A-ATTA---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TTG---T---C-CAAAA-----AA-TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-AAATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C--------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GA-G-T--A-TTGGG---------------------T--A-----------A--------A-A-AAA---TT--A--AATAA--ACC----------TAAAACCACCTAAAA--AACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGA----TTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTG---CT---A--TTTTG----A---------A------A--------AT--TTCA---G-AT-----A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-T-T-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----T-GT----A-TGTATGTATCAAACA-A--A---T--T--A--G-C-ATT-GGAA--T--AA---T---T-TA-----------------------------------------------------AAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCC-TA-AGCA
gi|23 : gttctatatttacaTGTGTTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------A--A-----T---------A-CAT-T---TTTTTG--G--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G------------C-----A-----------------------------------------TC-ACC-A-GG-A-----A--CA-T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-AT--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TA-G-T--A-G-TGGA-T----T--A-A--A--TA-T---------------------------AAA---TT--A--AACCA--CAN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNG----A---------A------A--------AT-------------------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GGAA--T-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aatAAAA---AAC-ATAGG----CGTGTTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A--------------------------------------------------------------------TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GTGA-T----T--A-A--A--AG-T---------------------------AAA---TT--G--AAGCA--AAA---------------------NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNG--GAA---------A-------------------------------------------T-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GAAA--T-T
gi|25 : aaacc---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTACCAAAT------------------T---TG---C----C-----T--T-GTATCAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---G-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCA--AAA----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G---------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--ATATT--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-T
gi|26 : -A-T-G--A-A-ACGT---A-----T-TT-GCG-A-TG-A-A-T-A--CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-GT--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGG-T----T--A-A--ATTAA----A-----------A--------A-A-AAA---GA--A--AA--A--AAA----------AAAAG------AAGN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--GAA---------A------A--------TT--TCCA---G-C------A------AT-T------------T----G--A--------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--AT--T--A--A--C-G-ATT-GGAA--T-TGA-------T-TAAAA-A---GT-TT----------AG-G-GTC-GG--
gi|27 : ---TG---C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--T--AAGCA--AAANNNNNNNNNNNNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--C---TTAA--A--G-G-ACT-acacacacctaatatttcttttt
gi|28 : tttgtca-----T--C-A-----C------C-----A---------G--CT-A-C----A-A-GTG----A-----T-TC-ACA-A-TA-ACA-T-AA-CG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T---------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA------A-T-GGGG-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A---------TT--A--CAGCA--AGA----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-T-A-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-
gi|29 : tgtcacaaattgcttca-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------G--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------GNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NN-G---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TT-A--C--T-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGA-GNNNNNNNNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-C---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-CG-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--TA-TGAA-----------A--------A-A-AAA---TGA-A--AAATG--AAA----------TAAAGC-----AAAA--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GAAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTC-TA-AACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : G---C----A-----T--C-A-----C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---ATTCAGT-TC-ACA-T-TA-A-G-T-A---G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGGT--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T---------A--T--AA-T--A-----------A--------A-T-TAA---TTAAA--AAGGN--NNN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------G------A--------AT--ATCG---A-ATATTAGA------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : T------------------T---TG---T----C-----T--T-G-----TAT----C-----ATG-------G--GG-A-CAG--A-A-ACTT---G-----T-CC-ATG-A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-GT--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---A-A-T--G-T-TGGG-T----A--A-A--A--AA-T--T-----------G--------C-A-ATCTTTTT--A--AATCA--AAN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNNCG-A------ATG----AT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--A------T-------GAA--CT
gi|32 : ttCTGCGTTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTA--G-----TTTTTATTTAT-T-T-T---TTTTTT--CTTT-TT------T-A---TTT------------TGT------T-A---TTGCA--G-T-----AA-T----------AC------------------T---TG---CATTACAA---T--C-A-----C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-A-CAAT---A-----T-TC-ATG-ATTA-T-A-T-A--TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-GC-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CA-G-T--ATT-GGGC-T----T--A-A--A--------A-----------A--------A-T-AAT---TT--T--AAGCA--AA
gi|33 : acaaaaaaacgA---------A------A--------AT--ATCC---G-AT-----A------AA-T------------T----G--A--T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------T-GT----A-CG----------T-A-A--A---TT-A--A--G-G-ATT-GGAA--T--------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-ATATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattg-A---TT-CG--G-T---A-CA-A----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCA--AGA----------AAA
gi|36 : ata------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-T-A-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----T-AC----A-CG----------A-G-A--A---TTGA--G--G-G-ACT-GGAA--CATGA---T---T----AA-A---AA-TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-CAATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------A------AT-T------------T----G--G--A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GAAA--T-TGA---TAAAT-T-AAA-A---AA-TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-AAATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----T-AT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--G--G-G-ACC-GGAA--A-TGA-------T-TAAAA-A---AT-TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------A------GT-T------------T----G--A----T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-T-A---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-AAT-GAAA----TGA---T---C-TAAAA-A---TA-AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCACATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : TAGG----TGTGTTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------T--T-----T---------T-T-T-T---TTTTTA--C--T-TT------T-A---TTTC-----------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C-----T--T-G-----C------
gi|4 : aaaaaa------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-AGT-A--CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-GT--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T--T-----------G--------A---------TT--A--AAGCA--AAA----------GNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-T-ACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AC-A---TTGA--ACCT-G-ACT-GGAA--T-TGAAT-T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-AA--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|40 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--A--A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-T-A-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA----------A-G-GTCA---T--A--A--GTGTACT-AGAA--T-TAA---C------AAAA-GTAGAA-TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-TAATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--A---TT-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-AAA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGA---T--TA-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAGG-GTC-GAGGT
gi|47 : aaT-GGAA--T-TGA---T---T----AA-A---AA-TT--------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCC-ctgaaattc
gi|5 : -----T---------C-T-T-T---TTCTCGGAC--T-TT------T-AATTTTC------------T-T------T-A---TT-CA--C-TTAAA-AA-T----------ACGAGTTAGCAGAGGGAATAT---TGAGTC----C-----T--T-G-----CGTCTAAC-----A---------G--GA---T-A--A-A-GTGTTATA-----TATC-ACA---TA-G-A-T-AGACG-T---TTTTGCTGT-A--CG-T-A--C-C----T-CT--G--AC-----A-T----------AT-G-TT-CACG-TCCA-TTGGGA-TTTAAT--A-A--AATAA-T--ACCTCAAAACGCA--------A-A-AAA---NN--N--NNNNN--NNN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNGAGGTC---CATCCTTA--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-TATGGGG------T----G--A--AAT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----T-A-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----T-GT----A-AGT---------A-G-TT-A---T--ATTA--G-G-ACTTGGAACAT-CGA---T---T-AGAGATA---AA-TTTT--------AG-G-GCC-AG--G-A----------GGA-AAATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-T
gi|50 : tttAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAA---T--TA-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAGG-ATCAGGGGTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCT-TG-AGT
gi|55 : ------A------AT-T------------T----G--A--A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GA
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AGGATGT--TTTCC-A---T--TA-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTAGtgtattac
gi|6 : aTTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--AAATTTT---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T---A-AA------------AT------------------TGCCTG---C----A-----T--C-A-----C------C-----A---------T---A-A-C----A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G---A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T----T--A-A--A--AA-T---------------------------AAA---TT--A--AAGCA--Aatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgtt--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----T--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AT-G---T--A--A--G-G-ACT--GAA--T-TGA-------T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-ATATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT-GAAAATAATA-CAT----AATCAAAAAA-TAAT-GTAGG-GTCGGGGGT
gi|7 : acAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTT--T--T-TTGTTAATT-A---TTT------------T-T------TTA---TT-CA--G-T---A-AAAT----------AT------------------T---TGGC-C----C-----T--T-G-----CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A---GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TTTCA-G-T--A-T-GA-A-T----T--A-AG-A--AA-T--A-----------A--------A---------TT--A--AAGCA--AAN----------NNNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNTTG-A------A------TT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---TT-A--A--G-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T-TAAAACA---AA-TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-AAATTT--T---A-GG--------------TC-GATC----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------G--A-CA--C-A------CC---------T-TTTT-TT-TTTGGCCTTACACTAAAT-GTcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccgggtaatcggacacaccttttttttttggccttacactaaatgtct
gi|8 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaaAAAA--CAAA-TTAGG-GT-TGTGGTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA---------------------------------------------------------------------------T---------T-T-TAT---TTTTTAA-C--T-TT------T-A---TTT------------G-T--------A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTAACGAAT------------------T---TG---C----C-----T--TAG-----CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-A-GTAT---------T-TC-ACA-A-TA-A-A-TTA--CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CA-GCT--A-T-GG-A-T----T--A-A--A--AA-T--A-----------A--------A-T-CAA----------AAGCA--AAA----------ANNNNN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----GTAAT-A-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATAT-AAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AAT-T--A--AAAG-G-ACTTGGAA--T--GA---C---T-AATGA-A---AG-TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-AATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCT-TA-ct
gi|9 : aTGGTGTTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA------------------------------T-T-T-T---TTTTTA--C--TGTT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-T----------GCC-----------------T---TG---C----A-----T--C-A-----C------------A---------G--GA-A-C-G--A-AAGT-T---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-G--CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--ACT-AGGA-T----T--T-A--A--A-----A-----------A--------A-T-AAT---TT--A--AAGCA--AAA----------AAAAGN-----NNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNN----NNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNN---NN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---N-N------NNNNNGGAT-T------------G----G--A--A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-T-A-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----T-ACG---A-CG----------A-G-A--ACT-T--A--A--G-G-AC--GGGA--T-TGA---G---T---AAA-C---AA-TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-AAATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111111111 333333333333333333333333333333 3333333333333333333333333333 333333333333333333333333333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111111 111111 11111111111 1111111111 1111
lowQualScore : 55 3 2 3 666 55 7 111111 0 66 2 66666 1 6666 2 2 1 2 1 4444 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 2 2 333 555 22 2 555555 2 000 111111111111 1 555555 1 333 1 22 1 444 5 1 777777777777777777777777777777 222 444 3333 444 2222 5555555555555555555555555555 22 1 1 7777 1 1 0 666666666 2 1 1 1 1 1 2 1 55 4 222 2 2 11 1 1 11 1 5555 1 66666 33333 1 6 444 222 1 3 1 1 2 11 3 22 1 55 2 22 11 22 111111111111111111111111111 22 11 11 22 11 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 000000000000 2222 44 44 1 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 1 2 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 7777777777 1 2 66 888888 22 33 1 1 2 11 1 44444444444 4 222 1 5555555555 1 1 1 4444 8888888888 2 1 33 333 77777777777777 2 77777777777 222 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 7777 1 1 2 2 3 5 1 0000 1 7
lowQualScore : .. . . . ... .. . ...... . .. . ..... . .... . . . . . .... ..................................................................................... . . . ... ... .. . ...... . ... ............ . ...... . ... . .. . ... . . .............................. ... ... .... ... .... ............................ .. . . .... . . . ......... . . . . . . . . .. . ... . . .. . . .. . .... . ..... ..... . . ... ... . . . . . .. . .. . .. . .. .. .. ........................... .. .. .. .. .. ................................................................................................................................................................ . ............ .... .. .. . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . .......... . . .. ...... .. .. . . . .. . ........... . ... . .......... . . . .... .......... . . .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... .... . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 00 6 3 6 444 00 3 000000 4 33 9 55555 7 9999 4 4 8 4 1 5555 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 555 000 88 0 888888 0 000 777777777777 9 222222 7 000 7 44 7 888 2 7 666666666666666666666666666666 888 888 3333 666 4444 7777777777777777777777777777 00 4 4 7777 4 4 5 444444444 7 3 3 3 3 3 7 3 88 0 333 7 5 77 2 2 77 2 2222 2 55555 11111 2 2 777 222 2 8 2 2 5 77 8 55 2 00 4 99 77 99 999999999999999999999999999 99 77 77 99 77 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 000000000000 4444 11 77 1 2 222222 77777 1 44 000000 5555555 55 1 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 1111111111 1 2 44 666666 66 11 1 1 3 66 2 99999999999 1 444 4 0000000000 3 3 3 7777 4444444444 7 3 22 777 88888888888888 7 77777777777 333 222 2 2 77 2 1111111 5 00 2 666666 2222 8 9 2 7 6 0 0 5555 0 3
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A-AA----ATT--A--AA--GC--A--AAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AAANNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A-AA----ATT--A--AA--GC--A--AAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AANNNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TC-ACG-A-TA-A-A-T-A--CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-GT--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CA-G-T--AGT-TGGA-TT--G-AGAA--AA--T---A----ATTAAACCAAA-AA----NNN--N--NN--NN--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GAA---------C------A--------AT--TCCG---G-TT-----A------AT-T------------TAATTG--A--A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-T-A-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ATT-G-AA--T-TGA---T---T-AATAA-A---AA-TTT---------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-AAATTT-------AGG--------------TC-G-T-----------C---GG-----T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--ATTGTT-T-TTT--------GTCC-TA-ATTAAGT-GTGTCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAAAA--AAA--GGATGT-GATTCCGA---T--TA-CAT----C-TC-AAAA--TAAT-GTAGG-GTactgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|10 : TGTG---ATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------A--T-----T---------T-C-T-T---TTTTTG--C--T-TT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--A-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----CATCAC-C-----A---------G--GACA-CCG--A-A-GTGT---A-----T-TC-AGA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--G-A--A--AT--T---A----T---------T-AA----ATT--A--AA--GG--A--AAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-G------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-TGAA--T-TGA---C---T-AAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-ttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|11 : aaaaaaaggaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGA---T--TAACAT----C-TCGAA----TGAT-GTACG-GTC-GGG---GT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----TA---A-------ATTA-----T---------TAT-T-T---TTTTTT--T--T-TT------T-T---TTTTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------A-------------------T---TG---C----A---T--T-GTAA--T------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-A-ACAT---G-----T-CC-----A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-TGGAGTT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--CC--A----------------A-AAGC----GAN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNTG---------------------A--------AT--TTCT---G-G------T------AT-A------------T----G-----A-T-AT------CTA-----A----C------T-------GAA--CTT-AT-TAA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG----------A-G-A--A---T--T--A--T-G-TGC-GGAA--T-TGA---T---TCTAAAA-A---A---T----------AG-G-GTT-GG-------------------AGATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tggct
gi|12 : AAAA--AAAT---AGG----TGTG----TTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------A--A-----T---------T-G-T-TATATTTTTA--C--C-GT------TGA---TGT------------T-T------T-A---TT-CACGA-T---A-AA-TCGTACTA---AT------------------C---TG---C----CGCAT--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C----A-A-GAGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-AA-C---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-GTG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-GT--A-A--A--AA--T--------A---------A-AA----GTT--T--AA--GC--A--AAA----------AA-AAGA----AAT--A--GNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------NNNACCCA--------ATCCTTTG---G----------------T-T------------T----GA-A--A-T-AT------CGA-----G----C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G-------AA--C-A---CG-A-A-----T-G---------------------------------A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---G---T----AA-A---AG-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-AAATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-T
gi|13 : AAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : aTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG--------------------------------------------T-T-T-T---TTTTTG--T--G-TT------T-T---TTT------------T-T------T-A----T-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---T----C---T--T-G-----C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-GTGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----A-G-C--A---AGGA-TT--A-A--A--AA--T------------------A-AG----ATT--A--AA--GC--A--AAA---------------------NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------A--T------------T----GATA--A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--T-A-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GGAA----TGA---T---T-T------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-AAA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C---T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-TTAAA-A--A--AA--T---G----A---------ATAA----AGT--T--AN--NN--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C---T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-TTAAA-A--A--AA--T---G----A---------ATAA----AGT--T--AN--NN--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-AC
gi|16 : -------A--A-----T---------C-T-T-T---TTTTTA--C--A-TT------T-A---TTT------------T----------A---TT-CA--C-G---A-AA-TTCGACA----AT------------------T---TG---C----C---T--T-A-----CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-A-GT-T---A-----T-TC-ACA-G-TA-A-AAT-A--CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA------G----A---------T-AA----ATT--A--CA--GC--A--AAA----------AA-AA------------------TTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACTCCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCTTG---AAAGCACGAAGAC---------A------C--------AT--CTTG---G-A--------------T-T------------T----G--A--A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---T--T--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGGT--T---T-TAAAATA---AACTT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-AAATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TC-ACG-A-TA-C-A---A--CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--ATAAC-----A-A-A---GA---G----------A-T--A-T-AATA-TT--AGA--A--AA--T---A----A---------C-CA----CCC--A--AA--A---A--AAA----------TG-AAATTTCTGAT--ACTAAAATTGTTATATG----AGTGAATTACTAAGCCA----ATTGTAAACTTCGAGTC--TGTTTCGGAAAGTATG--AAG---------G------ACCGCCATGAT--TTTG---A-A------A------AT-TCGGTTATTCTATT----G--A--A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-T-A-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-A-T-GGA---T-TGA---T---T-------A---AA-TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCC-TA-ATTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTC
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tCCGTG---TTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------A--A-----T---------T-T-T-T---GTTTTG--C--------------------T------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AC------------------T---TG---C----C---TTAC-A-----T------C---------------------A-C---------------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A--AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-AT--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TA-A-T--A-T-TGGG-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---AAAATGC------------------------------------TCG---A-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaagAAA--TAAAAGTAGTTGTCT-------TTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G-----------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-G----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----CATTAC-C-----A---------G--GA-A-C-G--A------------------TC-G---A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TA----------A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------TN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNNNNNNNNNGGA------A--------AT--TTCG---C-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGATTTT---T-TAAAA-A---A---T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGA---T--TAACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAGA-GTGCGGGGAAGGTCCGA-------------AAAAAAA---T-------------------------------------------GG-----A-----AA---A--------------------------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-GT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--GATA--A-AA-T----------ATTTGCCC------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A------------GA-A-C-A--AGA-GTGT---A-----TGTC-ACATA-CATG-A-T-AT-CG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-GT--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CA-GAT--A-T-GGGA--A--A-A--A--AA--T---GAGCTA---------A-AA----GCT--AAGAA--GC--ACCAAA----------AG-AAAC----AAG--A--
gi|2 : ------A--------GT--TTGG---G-AC-----A------ATGT------------T----G--AGAA-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGAT-GG----AGCG----------A-G-A--A---T--AG-A--G-G-AC--GAAA--T-TGATT-T---T-TAAAA-A---AA-TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-GAATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCC-TA-Ataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgc------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TG-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-GT--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A------------------------------A--A-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T--AAAA-A---AA-TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-AAATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tgacaca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-GT--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-TGGG-TA--A-A--A--AAC-T---A----A---------A-A-------T--A--AA--TCCCA--AAA----------TG-ACAT----GATTCG--ACAATTGATTTCACCCCCATTTAATACATAAATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATATTG---AAGAGTCC--CAA---------T------A--------AT--ACCA---GTA------C------ATGTA-----------T----G--A--T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-A-A-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----T-GT----G-CAT---------A-A-ATTA---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TTG---T---C-CAAAA-----AA-TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-AAATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C--------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GA-G-T--A-T-TGGG-TA--A-A--A--AAATT---A----A---------A---------T--A--AA--CCT-A--AAA----------CC-ACCT----AAA--A--AACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGATTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTGCT---A--TTTTG----A---------A------A--------AT--TTCA---G-AT-----A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-T-T-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----T-GT----A-TGTATGTATCAAACA-A--A---T--T--A--G-C-ATT-GGAA--T--AA---T---T-TA-----------------------------------------------------AAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCC-TA-AGCA
gi|23 : gttctatatttacaTGTG---TTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------A--A-----T---------A-CAT-T---TTTTTG--G--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G------------C-----A-----------------------------------------TC-ACC-A-GG-A-----A--CA-T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-AT--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TA-G-T--A-G-TGGA-TT--A-A--A--TA--T--------------------AA----ATT--A--AA--CC--A--CAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNG----A---------A------A--------AT-------------------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GGAA--T-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aatAAAA---AAC-ATAGG----CGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A--------------------------------------------------------------------TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GTGA-TT--A-A--A--AG--T--------------------AA----ATT--G--AA--GC--A--AAA---------------------NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNG--GAA---------A-------------------------------------------T-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GAAA--T-T
gi|25 : aaacc---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTACCAAAT------------------T---TG---C----C---T--T-GTATCAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---G-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--AAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G---------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--ATATT--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-T
gi|26 : -A-T-G--A-A-ACGT---A-----T-TT-GCG-A-TG-A-A-T-A--CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-GT--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGG-TT--A-A--ATTAA--A---A----A---------A-AA----AGA--A--AA--AA--A--AAA----------AAGAAGN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GAA---------A------A--------TT--TCCA---G-C------A------AT-T------------T----G--A--------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TT-A--A--C-G-ATT-GGAA--T-TGA---T---T---AAA-A---AG-TT------------------------------------------------T---AGGG--------------TC-GG-----------------------------------------ACA-CA--C-A------CC-TAATATT-T-CTTT-TT-
gi|27 : ---TG---C----A---T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--T--AA--GC--A--AAANNNNNNNNNNNN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--C---TTAA--A--G-G-ACT-
gi|28 : tttgtca---T--C-A-----C------C-----A---------G--CT-A-C----A-A-GTG----A-----T-TC-ACA-A-TA-ACA-T-AA-CG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T---------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA------A-T-GGGG-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A--------TT--A--CA--GC--A--AGA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-T-A-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-
gi|29 : tgtcacaaattgcttca-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----G---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------GN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NN-G---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TT-A--C--T-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGA-GNNNNNN---NNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-C---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-CG-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--TA--TGAAA----A---------A-AA----ATGA-A--AA--AT--G--AAA----------TA-AAGC----AAA--A--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GAAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTC-TA-AACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : G---C----A---T--C-A-----C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---ATTCAGT-TC-ACA-T-TA-A-G-T-A---G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGGT--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T-----A--T--AA--T---A----A---------ATTA----ATTAAA--AA--GG--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------G------A--------AT--ATCG---A-ATATTAGA------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : T------------------T---TG---T----C---T--T-G-----TAT----C-----ATG-------G--GG-A-CAG--A-A-ACTT---G-----T-CC-ATG-A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-GT--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---A-A-T--G-T-TGGG-TA--A-A--A--AA--T---T----G---------C-AATCTTTTT--A--AA--TC--A--AAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNNCG-A------ATG----AT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--A------T-------GAA--CT
gi|32 : ttCTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTA--G-----TTTTTATTTAT-T-T-T---TTTTTT--CTTT-TT------T-A---TTT------------TGT------T-A---TTGCA--G-T-----AA-T----------AC------------------T---TG---CATTACAA-T--C-A-----C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-A-CAAT---A-----T-TC-ATG-ATTA-T-A-T-A--TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-GC-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CA-G-T--ATT-GGGC-TT--A-A--A--A-------A----A---------T-AA----TTT--T--AA--GC--A--AA
gi|33 : acaaaaaaacgA---------A------A--------AT--ATCC---G-AT-----A------AA-T------------T----G--A--T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------T-GT----A-CG----------T-A-A--A---TT-A--A--G-G-ATT-GGAA--T--------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-ATATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattg-A---TT-CG--G-T---A-CA-A----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--AGA----------AA-A
gi|36 : ata------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-T-A-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----T-AC----A-CG----------A-G-A--A---TTGA--G--G-G-ACT-GGAA--CATGA---T---T----AA-A---AA-TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-CAATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------A------AT-T------------T----G--G--A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GAAA--T-TGA---TAAAT-T-AAA-A---AA-TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-AAATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----T-AT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--G--G-G-ACC-GGAA--A-TGA-------T-TAAAA-A---AT-TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------A------GT-T------------T----G--A----T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-T-A---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-AAT-GAAA----TGA---T---C-TAAAA-A---TA-AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCACATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : TAGG----TGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------T--T-----T---------T-T-T-T---TTTTTA--C--T-TT------T-A---TTTC-----------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----C------
gi|4 : aaaaaa------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-AGT-A--CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-GT--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---T----G---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------GN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-T-ACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AC-A---TTGA--ACCT-G-ACT-GGAA--T-TGAAT-T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-AA--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|40 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--A--A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-T-A-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA----------A-G-GTCA---T--A--A--GTGTACT-AGAA--T-TAA---C------AAAA-GTAGAA-TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-TAATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--A---TT-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-AAA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGA---T--TA-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAGG-GTC-GAG---GT
gi|47 : aaT-GGAA--T-TGA---T---T----AA-A---AA-TT--------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCC-ctgaaattc
gi|5 : -----T---------C-T-T-T---TTCTCGGAC--T-TT------T-AATTTTC------------T-T------T-A---TT-CA--C-TTAAA-AA-T----------ACGAGTTAGCAGAGGGAATAT---TGAGTC----C---T--T-G-----CGTCTAAC-----A---------G--GA---T-A--A-A-GTGTTATA-----TATC-ACA---TA-G-A-T-AGACG-T---TTTTGCTGT-A--CG-T-A--C-C----T-CT--G--AC-----A-T----------AT-G-TT-CACG-TCCA-TTGGGA-TTTAATA--A--AA--T---A----A---------T-AC----CTC--A--AAACGC--A--AAA----------AA-
gi|5 : ttt--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-TATGGGG------T----G--A--AAT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----T-A-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----T-GT----A-AGT---------A-G-TT-A---T--ATTA--G-G-ACTTGGAACAT-CGA---T---T-AGAGATA---AA-TTTT--------AG-G-GCC-AG--G-A----------GGA-AAATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaggaagatttcggtaattatggggtgaaatatcgatgtcctctggaggagctttagagattatacattaacgtaagtgtaagtagttatattaggacttggaacatcgattagagataaattttagggccaggaggaaaattttaagggtcggttccgttgctcccagagtataatcgatacacatctttttttttttt
gi|50 : ttttctttttctcggacttttaattttctttattcacttaaaaatacgagttagcagagggaatattgagtccttgcgtctaacaggataaagtgttatatatcacatagatagacgtttttgctgtacgtacctctgacatatgttcacgtccattgggatttaataaaataatacctcaaaacgcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAA---T--TA-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAGG-ATCAGGG---GTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCT-TG-AGT
gi|55 : ------A------AT-T------------T----G--A--A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GA
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AGGATGT--TTTCC-A---T--TA-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTAGtgtattac
gi|6 : aTTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--AAATTTT---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T---A-AA------------AT------------------TGCCTG---C----A---T--C-A-----C------C-----A---------T---A-A-C----A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G---A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--Aatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgtt--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----T--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AT-G---T--A--A--G-G-ACT--GAA--T-TGA-------T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-ATATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT-GAAAATAATA-CAT----AATCAAAAAA-TAAT-GTAGG-GTCGGGG---GT
gi|7 : acAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTT--T--T-TTGTTAATT-A---TTT------------T-T------TTA---TT-CA--G-T---A-AAAT----------AT------------------T---TGGC-C----C---T--T-G-----CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A---GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AT-----A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GAA-TT--A-AG-A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--AAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNTTG-A------A------TT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--AT--T--A--A--G-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T-TAAAACA---AA-TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-AAATTT--T---A-GG--------------TC-GATC----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------G--A-CA--C-A------CC---------T-TTTT-TT-TTTGGCCTTACACTAAAT-GTcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccgggtaatcggacacaccttttttttttggccttacactaaatgtct
gi|8 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaaAAAA--CAAA-TTAGG-GT-TGTG---GTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA---------------------------------------------------------------------------T---------T-T-TAT---TTTTTAA-C--T-TT------T-A---TTT------------G-T--------A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTAACGAAT------------------T---TG---C----C---T--TAG-----CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-A-GTAT---------T-TC-ACA-A-TA-A-A-TTA--CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CA-GCT--A-T-GG-A-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A-TC----A----A--AA--GC--A--AAA----------AN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----GTAAT-A-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATAT-AAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AAT-T--A--AAAG-G-ACTTGGAA--T--GA---C---T-AATGA-A---AG-TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-AATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCT-TA-ct
gi|9 : aTGGT---GTTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA------------------------------T-T-T-T---TTTTTA--C--TGTT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-T----------GCC-----------------T---TG---C----A---T--C-A-----C------------A---------G--GA-A-C-G--A-AAGT-T---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-G--CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--ACT-AGGA-TT--T-A--A--AA------A----A---------T-AA----TTT--A--AA--GC--A--AAA----------AA-AAGN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---N-N------NNNNNGGAT-T------------G----G--A--A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-T-A-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----T-ACG---A-CG----------A-G-A--ACT-T--A--A--G-G-AC--GGGA--T-TGA---G---T---AAA-C---AA-TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-AAATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111 111111111111 333333333333333333333333333333 3333333333333333333333333333 333333333333333333333333333 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111111 111111 11111111111 1111111111 1111
lowQualScore : 55 3 2 3 666 55 7 111111 0 66 2 66666 1 6666 2 2 1 2 1 4444 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2 2 2 333 555 22 2 555555 2 000 111111111111 1 555555 1 333 1 22 1 444 5 1 777777777777777777777777777777 222 444 3333 444 2222 5555555555555555555555555555 22 1 1 7777 1 1 0 666666666 2 1 1 1 1 1 2 1 55 4 222 2 2 11 1 1 11 1 5555 1 66666 33333 1 6 444 222 1 3 1 1 2 11 3 22 1 55 2 22 11 22 111111111111111111111111111 22 11 11 22 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2 000000000000 2222 44 44 1 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 1 2 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 7777777777 1 2 66 888888 22 33 1 1 2 11 1 44444444444 4 222 1 5555555555 1 1 1 4444 8888888888 2 1 33 333 77777777777777 2 77777777777 222 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 7777 1 1 2 2 3 5 1 0000 1 7
lowQualScore : .. . . . ... .. . ...... . .. . ..... . .... . . . . . .... ..................................................................................... . . . ... ... .. . ...... . ... ............ . ...... . ... . .. . ... . . .............................. ... ... .... ... .... ............................ .. . . .... . . . ......... . . . . . . . . .. . ... . . .. . . .. . .... . ..... ..... . . ... ... . . . . . .. . .. . .. . .. .. .. ........................... .. .. .. .. .. ................................................................................................................................................................ . ............ .... .. .. . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . .......... . . .. ...... .. .. . . . .. . ........... . ... . .......... . . . .... .......... . . .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... .... . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 00 6 3 6 444 00 3 000000 4 33 9 55555 7 9999 4 4 8 4 1 5555 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0 0 555 000 88 0 888888 0 000 777777777777 9 222222 7 000 7 44 7 888 2 7 666666666666666666666666666666 888 888 3333 666 4444 7777777777777777777777777777 00 4 4 7777 4 4 5 444444444 7 3 3 3 3 3 7 3 88 0 333 7 5 77 2 2 77 2 2222 2 55555 11111 2 2 777 222 2 8 2 2 5 77 8 55 2 00 4 99 77 99 999999999999999999999999999 99 77 77 99 77 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 000000000000 4444 11 77 1 2 222222 77777 1 44 000000 5555555 55 1 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 1111111111 1 2 44 666666 66 11 1 1 3 66 2 99999999999 1 444 4 0000000000 3 3 3 7777 4444444444 7 3 22 777 88888888888888 7 77777777777 333 222 2 2 77 2 1111111 5 00 2 666666 2222 8 9 2 7 6 0 0 5555 0 3
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A-AA----ATT--A--AA--GC--A--AAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AAANNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A-AA----ATT--A--AA--GC--A--AAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AAANNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TC-ACG-A-TA-A-A-T-A--CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-GT--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CA-G-T--AGT-TGGA-TT--G-AGAA--AA--T---A----ATTAAACCAAA-AA----NNN--N--NN--NN--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GAA---------C------A--------AT--TCCG---G-TT-----A------AT-T------------TAATTG--A--A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-T-A-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ATT-G-AA--T-TGA---T---T-AATAA-A---AA-TTT---------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-AAATTT-------AGG--------------TC-G-T-----------C---GG-----T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--ATTGTT-T-TTT--------GTCC-TA-ATTAAGT-GTGTCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAAAA--AAA--GGATGT-GATTCCGA---T--TA-CAT----C-TC-AAAA--TAAT-GTAGG-GTactgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|10 : TGTG---ATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------A--T-----T---------T-C-T-T---TTTTTG--C--T-TT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--A-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----CATCAC-C-----A---------G--GACA-CCG--A-A-GTGT---A-----T-TC-AGA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--G-A--A--AT--T---A----T---------T-AA----ATT--A--AA--GG--A--AAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-G------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-TGAA--T-TGA---C---T-AAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-ttggggtcggaaaaatttctttttttgctttaattttttattcaataaatatttgccttgcatcaccaggacaccgaagtgtattcagaataaatatgtttatggtactgatatgtaacatcgagtgtccagtatgggattgaaattattaaattaaaggaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngggaatttgaatatcgagcccgaacttattagagataaaaaaaaaacaagtgtacgagaattaaggacttgaattgactaaaaaaaattagggtcaggagaaaattttagggtaggttgggtaatcggaaacacacctaatttttttttggct
gi|11 : aaaaaaaggaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGA---T--TAACAT----C-TCGAA----TGAT-GTACG-GTC-GGG---GT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----TA---A-------ATTA-----T---------TAT-T-T---TTTTTT--T--T-TT------T-T---TTTTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------A-------------------T---TG---C----A---T--T-GTAA--T------CAAA--A---------G--GA-A-C-G--A-A-ACAT---G-----T-CC-----A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-TGGAGTT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--CC--A----------------A-AAGC----GAN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNTG---------------------A--------AT--TTCT---G-G------T------AT-A------------T----G-----A-T-AT------CTA-----A----C------T-------GAA--CTT-AT-TAA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG----------A-G-A--A---T--T--A--T-G-TGC-GGAA--T-TGA---T---TCTAAAA-A---A---T----------AG-G-GTT-GG-------------------AGATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tggct
gi|12 : AAAA--AAAT---AGG----TGTG----TTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------A--A-----T---------T-G-T-TATATTTTTA--C--C-GT------TGA---TGT------------T-T------T-A---TT-CACGA-T---A-AA-TCGTACTA---AT------------------C---TG---C----CGCAT--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C----A-A-GAGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-AA-C---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-GTG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-GT--A-A--A--AA--T--------A---------A-AA----GTT--T--AA--GC--A--AAA----------AA-AAGA----AAT--A--GNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------NNNACCCA--------ATCCTTTG---G----------------T-T------------T----GA-A--A-T-AT------CGA-----G----C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G-------AA--C-A---CG-A-A-----T-G---------------------------------A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---G---T----AA-A---AG-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-AAATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-T
gi|13 : AAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : aTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG--------------------------------------------T-T-T-T---TTTTTG--T--G-TT------T-T---TTT------------T-T------T-A----T-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---T----C---T--T-G-----C------CTCA--A---------G--AA-A-CAA--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-GTGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----A-G-C--A---AGGA-TT--A-A--A--AA--T------------------A-AG----ATT--A--AA--GC--A--AAA---------------------NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------A--T------------T----GATA--A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--T-A-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GGAA----TGA---T---T-T------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-AAA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C---T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-TTAAA-A--A--AA--T---G----A---------ATAA----AGT--T--AN--NN--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGA---T--TA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAGG-GTCGGGG---GT-CCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------ATGCC---------------T---TG---C----C---T--C-GC----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-G-GT---------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GGA-TTAAA-A--A--AA--T---G----A---------ATAA----AGT--T--AN--NN--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-AC
gi|16 : -------A--A-----T---------C-T-T-T---TTTTTA--C--A-TT------T-A---TTT------------T----------A---TT-CA--C-G---A-AA-TTCGACA----AT------------------T---TG---C----C---T--T-A-----CATT---C-----A---------CCCGA-A-C-G--A-A-GT-T---A-----T-TC-ACA-G-TA-A-AAT-A--CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA------G----A---------T-AA----ATT--A--CA--GC--A--AAA----------AA-AA------------------TTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACTCCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCTTG---AAAGCACGAAGAC---------A------C--------AT--CTTG---G-A--------------T-T------------T----G--A--A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---T--T--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGGT--T---T-TAAAATA---AACTT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-AAATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TC-ACG-A-TA-C-A---A--CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--ATAAC-----A-A-A---GA---G----------A-T--A-T-AATA-TT--AGA--A--AA--T---A----A---------C-CA----CCC--A--AA--A---A--AAA----------TG-AAATTTCTGAT--ACTAAAATTGTTATATG----AGTGAATTACTAAGCCA----ATTGTAAACTTCGAGTC--TGTTTCGGAAAGTATG--AAG---------G------ACCGCCATGAT--TTTG---A-A------A------AT-TCGGTTATTCTATT----G--A--A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-T-A-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-A-T-GGA---T-TGA---T---T-------A---AA-TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCC-TA-ATTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTC
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tCCGTG---TTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------A--A-----T---------T-T-T-T---GTTTTG--C--------------------T------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AC------------------T---TG---C----C---TTAC-A-----T------C---------------------A-C---------------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A--AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-AT--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TA-A-T--A-T-TGGG-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---AAAATGC------------------------------------TCG---A-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaagAAA--TAAAAGTAGTTGTCT-------TTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G-----------------------------------------------------------------------------------------C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-G----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----CATTAC-C-----A---------G--GA-A-C-G--A------------------TC-G---A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TA----------A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------TN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNNNNNNNNNGGA------A--------AT--TTCG---C-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGATTTT---T-TAAAA-A---A---T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGA---T--TAACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAGA-GTGCGGGGAAGGTCCGA-------------AAAAAAA---T-------------------------------------------GG-----A-----AA---A--------------------------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-GT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--GATA--A-AA-T----------ATTTGCCC------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A------------GA-A-C-A--AGA-GTGT---A-----TGTC-ACATA-CATG-A-T-AT-CG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-GT--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CA-GAT--A-T-GGGA--A--A-A--A--AA--T---GAGCTA---------A-AA----GCT--AAGAA--GC--ACCAAA----------AG-AAAC----AAG--A--
gi|2 : ------A--------GT--TTGG---G-AC-----A------ATGT------------T----G--AGAA-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGAT-GG----AGCG----------A-G-A--A---T--AG-A--G-G-AC--GAAA--T-TGATT-T---T-TAAAA-A---AA-TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-GAATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCC-TA-Ataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgc------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----C------CTCACCA---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TG-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-GT--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CA-G-A--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A------------------------------A--A-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T--AAAA-A---AA-TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-AAATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tgacaca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-GT--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-TGGG-TA--A-A--A--AAC-T---A----A---------A-A-------T--A--AA--TCCCA--AAA----------TG-ACAT----GATTCG--ACAATTGATTTCACCCCCATTTAATACATAAATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATATTG---AAGAGTCC--CAA---------T------A--------AT--ACCA---GTA------C------ATGTA-----------T----G--A--T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-A-A-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----T-GT----G-CAT---------A-A-ATTA---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TTG---T---C-CAAAA-----AA-TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-AAATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C--------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GA-G-T--A-T-TGGG-TA--A-A--A--AAATT---A----A---------A---------T--A--AA--CCT-A--AAA----------CC-ACCT----AAA--A--AACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGATTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTGCT---A--TTTTG----A---------A------A--------AT--TTCA---G-AT-----A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-T-T-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----T-GT----A-TGTATGTATCAAACA-A--A---T--T--A--G-C-ATT-GGAA--T--AA---T---T-TA-----------------------------------------------------AAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCC-TA-AGCA
gi|23 : gttctatatttacaTGTG---TTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------A--A-----T---------A-CAT-T---TTTTTG--G--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G------------C-----A-----------------------------------------TC-ACC-A-GG-A-----A--CA-T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-AT--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TA-G-T--A-G-TGGA-TT--A-A--A--TA--T--------------------AA----ATT--A--AA--CC--A--CAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNG----A---------A------A--------AT-------------------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GGAA--T-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aatAAAA---AAC-ATAGG----CGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A--------------------------------------------------------------------TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----C------CTCACCG---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GTGA-TT--A-A--A--AG--T--------------------AA----ATT--G--AA--GC--A--AAA---------------------NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNG--GAA---------A-------------------------------------------T-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GAAA--T-T
gi|25 : aaacc---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTACCAAAT------------------T---TG---C----C---T--T-GTATCAC------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---G-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--AAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G---------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--ATATT--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-T
gi|26 : -A-T-G--A-A-ACGT---A-----T-TT-GCG-A-TG-A-A-T-A--CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-GT--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGG-TT--A-A--ATTAA--A---A----A---------A-AA----AGA--A--AA--AA--A--AAA----------AAGAAGN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GAA---------A------A--------TT--TCCA---G-C------A------AT-T------------T----G--A--------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TT-A--A--C-G-ATT-GGAA--T-TGA---T---T---AAA-A---AG-TT------------------------------------------------T---AGGG--------------TC-GG-----------------------------------------ACA-CA--C-A------CC-TAATATT-T-CTTT-TT-
gi|27 : ---TG---C----A---T--C-A-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--T--AA--GC--A--AAANNNNNNNNNNNN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--C---TTAA--A--G-G-ACT-
gi|28 : tttgtca---T--C-A-----C------C-----A---------G--CT-A-C----A-A-GTG----A-----T-TC-ACA-A-TA-ACA-T-AA-CG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T---------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA------A-T-GGGG-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A--------TT--A--CA--GC--A--AGA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-T-A-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-
gi|29 : tgtcacaaattgcttca-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----G---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------GN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NN-G---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TT-A--C--T-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGA-GNNNNNN---NNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-C---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-A--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-CG-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--TA--TGAAA----A---------A-AA----ATGA-A--AA--AT--G--AAA----------TA-AAGC----AAA--A--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GAAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTC-TA-AACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : G---C----A---T--C-A-----C------T-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---ATTCAGT-TC-ACA-T-TA-A-G-T-A---G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGGT--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-T-----A--T--AA--T---A----A---------ATTA----ATTAAA--AA--GG--N--NNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------G------A--------AT--ATCG---A-ATATTAGA------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : T------------------T---TG---T----C---T--T-G-----TAT----C-----ATG-------G--GG-A-CAG--A-A-ACTT---G-----T-CC-ATG-A-TA-T-A-T-A--CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-GT--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---A-A-T--G-T-TGGG-TA--A-A--A--AA--T---T----G---------C-AATCTTTTT--A--AA--TC--A--AAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNNCG-A------ATG----AT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--A------T-------GAA--CT
gi|32 : ttCTGCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTA--G-----TTTTTATTTAT-T-T-T---TTTTTT--CTTT-TT------T-A---TTT------------TGT------T-A---TTGCA--G-T-----AA-T----------AC------------------T---TG---CATTACAA-T--C-A-----C------C-----AATCTGAACTA--GA-A-C-G--A-A-CAAT---A-----T-TC-ATG-ATTA-T-A-T-A--TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-GC-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CA-G-T--ATT-GGGC-TT--A-A--A--A-------A----A---------T-AA----TTT--T--AA--GC--A--AA
gi|33 : acaaaaaaacgA---------A------A--------AT--ATCC---G-AT-----A------AA-T------------T----G--A--T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------T-GT----A-CG----------T-A-A--A---TT-A--A--G-G-ATT-GGAA--T--------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-ATATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattg-A---TT-CG--G-T---A-CA-A----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----CTTCAT-C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--AGA----------AA-A
gi|36 : ata------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-T-A-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----T-AC----A-CG----------A-G-A--A---TTGA--G--G-G-ACT-GGAA--CATGA---T---T----AA-A---AA-TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-CAATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------A------AT-T------------T----G--G--A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GAAA--T-TGA---TAAAT-T-AAA-A---AA-TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-AAATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----T-AT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--G--G-G-ACC-GGAA--A-TGA-------T-TAAAA-A---AT-TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------A------GT-T------------T----G--A----T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-T-A---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-AAT-GAAA----TGA---T---C-TAAAA-A---TA-AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCACATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : TAGG----TGTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------T--T-----T---------T-T-T-T---TTTTTA--C--T-TT------T-A---TTTC-----------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--T-G-----C------
gi|4 : aaaaaa------C-----A---------G--GA-A-A-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-AGT-A--CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-GT--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---T----G---------A--------TT--A--AA--GC--A--AAA----------GN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-T-ACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AC-A---TTGA--ACCT-G-ACT-GGAA--T-TGAAT-T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-AA--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TTaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcaggaaagaagtgtattcataataaagtacgctttgtatgtaagttgaaacatgtaacactggagtgttcagtatgggattaaaaattgattaaagcaaaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaatttgaatgatgcgagaccagaacttattacaagatcaaaaaaggaagtgtacgagacattgaacctgactggaattgaatttttaaaaaatgaggtgggagaaatttagggtcggtcagtatcggaaaccacaccttacttctcttttttttg
gi|40 : aaaaaataggtgtgtttccgattacatctcaaaaataatgtagggttgggtgtcagaattttttttttttacttttatttctttattcagtaaatatttgccttgcaacatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnt--A--A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-T-A-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA----------A-G-GTCA---T--A--A--GTGTACT-AGAA--T-TAA---C------AAAA-GTAGAA-TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-TAATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--A---TT-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-AAA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGA---T--TA-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAGG-GTC-GAG---GT
gi|47 : aaT-GGAA--T-TGA---T---T----AA-A---AA-TT--------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCC-ctgaaattc
gi|5 : -----T---------C-T-T-T---TTCTCGGAC--T-TT------T-AATTTTC------------T-T------T-A---TT-CA--C-TTAAA-AA-T----------ACGAGTTAGCAGAGGGAATAT---TGAGTC----C---T--T-G-----CGTCTAAC-----A---------G--GA---T-A--A-A-GTGTTATA-----TATC-ACA---TA-G-A-T-AGACG-T---TTTTGCTGT-A--CG-T-A--C-C----T-CT--G--AC-----A-T----------AT-G-TT-CACG-TCCA-TTGGGA-TTTAATA--A--AA--T---A----A---------T-AC----CTC--A--AAACGC--A--AAA----------AA-
gi|5 : ttt--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-TATGGGG------T----G--A--AAT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----T-A-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----T-GT----A-AGT---------A-G-TT-A---T--ATTA--G-G-ACTTGGAACAT-CGA---T---T-AGAGATA---AA-TTTT--------AG-G-GCC-AG--G-A----------GGA-AAATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-Tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaggaagatttcggtaattatggggtgaaatatcgatgtcctctggaggagctttagagattatacattaacgtaagtgtaagtagttatattaggacttggaacatcgattagagataaattttagggccaggaggaaaattttaagggtcggttccgttgctcccagagtataatcgatacacatctttttttttttt
gi|50 : ttttctttttctcggacttttaattttctttattcacttaaaaatacgagttagcagagggaatattgagtccttgcgtctaacaggataaagtgttatatatcacatagatagacgtttttgctgtacgtacctctgacatatgttcacgtccattgggatttaataaaataatacctcaaaacgcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAA---T--TA-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAGG-ATCAGGG---GTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCT-TG-AGT
gi|55 : ------A------AT-T------------T----G--A--A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GA
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AGGATGT--TTTCC-A---T--TA-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTAGtgtattac
gi|6 : aTTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--AAATTTT---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T---A-AA------------AT------------------TGCCTG---C----A---T--C-A-----C------C-----A---------T---A-A-C----A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G---A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--Aatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgtt--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----T--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AT-G---T--A--A--G-G-ACT--GAA--T-TGA-------T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-ATATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT-GAAAATAATA-CAT----AATCAAAAAA-TAAT-GTAGG-GTCGGGG---GT
gi|7 : acAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTT--T--T-TTGTTAATT-A---TTT------------T-T------TTA---TT-CA--G-T---A-AAAT----------AT------------------T---TGGC-C----C---T--T-G-----CATCA--C-----A---------G--GA-A-C-G--A---GTGT---A-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A--TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AT-----A-T-C---GA---GT-GTTT-CA-G-T--A-T--GAA-TT--A-AG-A--AA--T--------------------AA----ATT--A--AA--GC--A--AAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNTTG-A------A------TT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--AT--T--A--A--G-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T-TAAAACA---AA-TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-AAATTT--T---A-GG--------------TC-GATC----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------G--A-CA--C-A------CC---------T-TTTT-TT-TTTGGCCTTACACTAAAT-GTcggaatttttttttttttttgttaattatttttttattcagtaaaatatttggcccttgcatcacaggaacgagtgtattcataataaatatgtttgtgtgtactgatatgtaatatcgagtgtttcagtatgaattaagaaataaattaaagcaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttgaattttgaatattgagcccgaacttatttaagatcgaaaaacgaagtgtacgggaattaagaactaaaattgatttaaaacaaattagggtgggaggaaaattttaggtcgatccgggtaatcggacacaccttttttttttggccttacactaaatgtct
gi|8 : acaaaaataggtgtgttttgaaaataatacataatcaaAAAA--CAAA-TTAGG-GT-TGTG---GTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA---------------------------------------------------------------------------T---------T-T-TAT---TTTTTAA-C--T-TT------T-A---TTT------------G-T--------A---TT-CA--C-T---ATAA-TTCGGTAACGAAT------------------T---TG---C----C---T--TAG-----CATCACGC-----A---------G--GA-AAC-GGGA-A-GTAT---------T-TC-ACA-A-TA-A-A-TTA--CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CA-GCT--A-T-GG-A-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A-TC----A----A--AA--GC--A--AAA----------AN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----GTAAT-A-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATAT-AAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AAT-T--A--AAAG-G-ACTTGGAA--T--GA---C---T-AATGA-A---AG-TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-AATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCT-TA-ct
gi|9 : aTGGT---GTTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA------------------------------T-T-T-T---TTTTTA--C--TGTT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T---ATAA-T----------GCC-----------------T---TG---C----A---T--C-A-----C------------A---------G--GA-A-C-G--A-AAGT-T---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-G--CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CA-G-T--ACT-AGGA-TT--T-A--A--AA------A----A---------T-AA----TTT--A--AA--GC--A--AAA----------AA-AAGN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---N-N------NNNNNGGAT-T------------G----G--A--A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-T-A-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----T-ACG---A-CG----------A-G-A--ACT-T--A--A--G-G-AC--GGGA--T-TGA---G---T---AAA-C---AA-TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-AAATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
blockSeqs : TC T T A AAA AA A AGTCC AA A TGTCT G GAAG A T A A T ATAT GGGTCGGAAAGCGTCTTTAGTTTTTATTTA A A A ATA GGA TT G GTTAAT G TTT TTTTTGCTTTTA G ATTCAC T CAA G CG A TAA T A ACGAGTTAGCAGAGGGAATA GCC AGT ATTA GCA TAC CCAATCTGAACT CC . A GGG G A ATTCAG G A T T T C A T GA T GAT T A AG T A AA A ATTA G GAA TGTCT C C GCG AGT T T T C A CC T TG G AA G G TT AT GAGCTAAAAG AA AG AC CC CC TGAAATTTCTGATACTAAAATTGTTATATGAGTGAATTACTAAGCCAATTGTAAACTTCGAGTCTGTTTCGGAAAGTATGAAGGACCGCCATGATTTTGAAA G CGGTTATTCTAT . AT GA A G ACTACT CTTTC G GC GCATGA TCTGGAG AA T A A C A TTTTATTTT TTTTTT CCTTTTTT TT A AAA T C GAGA G CAAA G TATGTATCAA C A TT TATT TT CC T T T CA A TTTTTTA T TAG C TCAATCAAGC . C A ACG ACATTAGGTC A C GT TTC AGATGAAAAAATTT G TCCGTTGCTCC GGT AGT A T TG T GAACTTT T GC A GGGCAT TTAC A A A G T C T AGTG G A
blockSeqs : . . C . . . A AGTCC A . GTCG T G . . C . A T ATTTTTTTGGTTTTTTTGTGTTG . . . . AA . . . . TTT C . . . . . . . A T . TCGGTACCAAAT . GC . AA TA TAATCAAAA . . . AA . . TATA A . . . . . G . A C . C A . . . . . T . ATA . . C C . . T . . C . C G . AA T . . C TGCAATCTTT A . . T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAGATTTCGGTA G ATGGGG . TA T . G G T . . . T C . . . A . TG . AAAAA . . G . G . . CAAA . T . A TC TTA G AA . . T . . TTTTTA T . . TAA . . . CC TGCC G . G A . G C . . . . . . . C T . . ATAT . . . . . . G AAT T .
blockSeqs : . . C . . . . CA . . GTCG C T . . C . T A GATCGGGTCGGAAAAAAAATTTT . . . . T . . . . ATT . . . . . . . . . T . TCGGTAACGAAT . . . . T CGTCTAACA . . . AG . . G . . . . . . . . T C . . . . . . . . G . ACT . . C C . . T . . . . . T . TA . . . . GAAAAAAAA . . . . . TNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAATTTCGCTA . A . A T . . . . . . . A . . . . . . . . ATG . . . . . . . G . T . . C TTG . . . . . . . TAAATT C . . TT . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . . A .
blockSeqs : . . G . . . . AA . . GTGC G G . . C . A T GGGTCGAGGGGTTGAGAAT . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . CGTACTAAT . . . . C CATCACGCA . . . G . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . GA . . C . . . . . . . . . G . . . . . . GAATAAA . . . . . TGACATGATTCGACAATTGATTTCACCCCCATTTAATACATAAATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATATTGAAGAGTCCCAATAATACCAGTAC . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . CGA . . . . . . . . . . . . T TTG . . . . . . . ATTTTT . . . TA . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . . . G
blockSeqs : . . G . . . . C . . GNNN G G . . C . A T GGGTCGGGGGTCGAAAAAT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . TCGACAAT . . . . T CATTACCA . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . A . . . . . . GAATAAA . . . . . AAAAGAAATAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCCAATCCTTTGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . . . . . . T ATT . . . . . . . TTCTA . . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . . . . C
blockSeqs : . . T . . . . C . . ATCA T T . . C . T T GGGTTGGGTGTCAGAATTT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . ATTTGCCC . . . . C CCTCACCA . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAATTAA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAATATCGAATATTAGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . . . . . . . . . CTT . . . . . . . TTTTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . C . . GTCG G T . . C . T T GGGTCGGGGGTCGGAAT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . ATGCC . . . . C CCTCACCG . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . ATTAAA . . . . . AAAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . CTAA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAA . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . A . . GTC T T . . C . A T GGGGTGGGGGTCGGCAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . ATGCC . . . . T TATCACCA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . GATAAA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGAATG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . TCCA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . T . . GTT T N . . C . T T GGTGTGGGTAGGCAAT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . GCC . . . . T CTTCATCA . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AACCAC . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . T N T . . A . T T GGGTCGGAAAAAAT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . C TATCATG . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAAAAA . . . . . AAGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAATTTCCAGCA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . TTTT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . . .
blockSeqs : . . C C T . . A . T T TTATATAAATTAT . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . T CATCACA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AATAAT . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . .
blockSeqs : . . T T G . . A . T T GGGTCAGGA . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . T CCTCAA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . . . . . . AATACC . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . TCTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . .
blockSeqs : . . A G . . . . T T AAAAAGAT . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . T CATTCA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . AAATCA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . .
blockSeqs : . G G . . . . A T AAAAAGAT . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . T CCCA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . AATAAT . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTAG . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TAT . . . .
blockSeqs : G G . . . . T . GGAAAA . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . C CCCA . . . A . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAAAG . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . TTTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . .
blockSeqs : T G . . . . A . GG . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . C CCA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAGA . . . . . TAAAGCAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . CTAA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . .
blockSeqs : G . A . T . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . C CCA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAAA . . . . . GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTT . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . C CCA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . ANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . T CCA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . AT . . . . C CCA . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . TTA . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AT . . . . T CTA . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . CCACCTAAAAAACTTTTTTTTGGTCCTACTTAATACATGATTCAGGCTTCGGAAAGCATGGCCATTGCTATTTTGAAAATTTCAGATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . GT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . T CCA . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . AAAGCGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATTTCTGGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . TT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . T TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . . . . . . AAA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . TT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . AAAATTAACATTTGACGACTGAATGTTACTCCAAGTAACTTAATACACGGCTTTTCTTGAAAGCACGAAGACACATCTTGGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . TT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATGCTCGATA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . CA . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . TT . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AAA . . . . . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGAAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : GTC** CTCACA********************** G*** A**** ** AAA************************ **** CG********** ********** TAT*
originalCons : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGG-GTCTGNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-G-----C------C-----A---------G--GA-A-C-G--A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--T---A----A---------A-AA----ATT--A--AA--GC--A--AAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AAANNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
finalCons : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGA---T--TA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAGGGTC--GNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T-T---TTTTTG--C--T-TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T---A-AA-T----------AT------------------T---TG---C----C---T--C-GCTCACA----------------------G--GA-A-CG---A-A-GTGT---A-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A--CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GTA----AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CA-G-T--A-T-GGGA-TT--A-A--A--AA--TAAA------------------------TT--A--AA--GC--A--AAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AAANNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATCG----------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CCTAT-TTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111111111 1111111111 2222222222 4444444444444444444444444444444444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 111111111111 111111 11111111111 1111111111 1111
lowQualScore : 44 3 2 3 6 777777 33 44 2 444 1 8888 0 2 2 2 22 1 4444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 2 6666 333 22 7777777 888888888888 222222222222 2 555555 1 333 1 22 1 1 3333333333 1 7777777777 555 33 66 1 3333333333333333333333333333333333 1 3 3333 1 3 0 444444 1 1 1 1 1 1 2 1 4 4 222 1 2 11 1 1 11 1 5555 1 66666 33333 1 6 444 222 1 3 1 2 3 1 33333 1 1 33 444444 2 777777 11 999999 11 33 44444 33 55555555 33 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2 000000000000 2222 44 44 1 2 444444 33333 1 11 333333 5555555 22 1 1 1 2 1 555555555 333333 777777777777 11 1 333 1 2 2222 1 5555 1 7777777777 1 2 66 888888 22 33 1 1 2 11 1 44444444444 4 222 1 5555555555 1 1 1 4444 8888888888 2 1 33 333 77777777777777 2 77777777777 222 222 1 1 11 1 4444444 2 33 1 333333 7777 1 1 2 2 3 5 1 0000 1 7
lowQualScore : .. . . . . ...... .. .. . ... . .... . . . . .. . .... ..................................................................................... . . .... ... .. ....... ............ ............ . ...... . ... . .. . . .......... . .......... ... .. .. . .................................. . . .... . . . ...... . . . . . . . . . . ... . . .. . . .. . .... . ..... ..... . . ... ... . . . . . . ..... . . .. ...... . ...... .. ...... .. .. ..... .. ........ .. ................................................................................................................................................................ . ............ .... .. .. . . ...... ..... . .. ...... ....... .. . . . . . ......... ...... ............ .. . ... . . .... . .... . .......... . . .. ...... .. .. . . . .. . ........... . ... . .......... . . . .... .......... . . .. ... .............. . ........... ... ... . . .. . ....... . .. . ...... .... . . . . . . . .... . .
lowQualScore : 66 3 2 3 7 222222 22 33 4 444 0 1111 5 2 2 5 33 1 5555 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 6666 777 99 7777777 999999999999 222222222222 0 555555 8 222 8 55 8 8 4444444444 8 0000000000 666 88 66 6 6666666666666666666666666666666666 5 0 9999 5 0 9 333333 4 4 4 4 4 4 8 4 1 1 444 4 6 88 3 3 88 3 3333 3 55555 22222 3 5 888 333 3 9 3 6 9 7 11111 2 2 00 888888 5 222222 77 555555 77 00 88888 00 88888888 11 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3 000000000000 4444 11 77 1 2 222222 77777 1 44 000000 5555555 55 1 1 1 2 1 888888888 222222 222222222222 55 1 111 1 2 4444 1 8888 1 1111111111 1 2 44 666666 66 11 1 1 3 66 2 99999999999 1 444 4 0000000000 3 3 3 7777 4444444444 7 3 22 777 88888888888888 7 77777777777 333 222 2 2 77 2 1111111 5 00 2 666666 2222 8 9 2 7 6 0 0 5555 0 3
consensus : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGATTA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAG-GGT-C-GNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T----T---TTTTTG-C--T----TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------AT---TTG--CCTT-G-CA-T-C-A--------------C--A---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AAANNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
Reference ( family-1157 ) : AAAAAA--AAA-TAGNTGT-GTTTCCGATTA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-GTAG-GGT-C-GNG---GTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-T----T---TTTTTG-C--T----TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------AT---TTG--CCTC-G-C--T-C-A--------------C--A---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAAA----------NA-AAGC----GAN--A--ANNNTTNNTNTNNNNCN-ANTNAATNNNNNNNNNN-GNNNTNNNANANNNNGNNNN--TNNTN---AAANNNCG--GAA---------A------A--------AT--TTCG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TATTTTT-T-TTTT-TT-TTTGGCC-TA-ANTAAGT-GTGTCAGNTTACACCAAATGTCA
gi|1 : -TC-ACG-A-TA-A-A-T-A-CA-T---T-GTG-T-T-A--C--G-A--C-A----T-GT--AC-AC-----A---C---G----GT-A-TT-CAG-TAGTTGG-----A-T-T--G------A-G------A--AAATAATT--AA--A-----CC--AAAAANNNNNNNN--NNNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GAA---------C------A--------AT--TCCG---G-TT-----A------AT-T------------TAATTG--A--A-T-AT------CTA-----T-C--C------C-------GAA--CT--AT-T-A-G-A---------A------AT-----A------AAA--G-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ATT-G-AA--T-TGA---T---T-AATAA-A---AA-TTT---------AGCA-GTC-GA--T-A----------G-A-AAATTT-------AGG--------------TC-G-T-----------C---GG-----T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--ATTGTT-T-TTT--------GTCC-TA-ATTAAGT-GTGTCAGATTACACCAAATGTCA
gi|10 : tagggtgaggcgaatctttctttctttttcttttattttatcatatcaAG-GAT---GTG---ATTCCGAT-T-ACATCT-C-AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------TTTGGGGTCGG-----A-----AA---A-------A--T-----T---------T-C-T----T---TTTTTG-C--T----TT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--A-T-A----------AA-T----------AT---TTG--CCTT-G-CA-T-C-AC-------------C--A---------GGACACC-G--A-A-GTGTA-----T-TC-AGA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTATG--GT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---GT-G-TC-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--G------A-A------ATTAT-----T--AA--A-----TT--AAA--------GG--AAAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-G------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------ATAAAA-A------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-TGAA--T-TGA---C---T-AAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-TAATTTT-T-TTTT-actgcaggtgcaaacatttttaaaggggggggggagtaacacgcatacgtggtggaaatttccttccagcacaaaacacatcacgtatgctctaagattcaattacctaccttacacttaaatgcataaagcatcaaaatctgacgatttttggtttgacacaacaattatatccaggtgagaggatcgctaattatcttgtcaaatgtcctttcagaacacgtt
gi|11 : aaaaaaAAAAATCAAT-TAGTTGT-GTTTCCGATTAACAT----C-TCGAA----TGAT-GTAC-GGT-C-GGG---GT--CG-------------GAAAAT-----TTTA-------------------------------T-------TAT-----A-----TA---A-------ATTA-----T---------TAT-T----T---TTTTTT-T--T----TT------T-T---TTTTTTTTGCTTTTAT-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------A----TTG--CATT-G-TAAT-CAA--------------A--A---------GGA-A-C-G--A-A-ACATG-----T-CC-----A-TA-T-A-T-A-CA-T---TTGGG-T-------T-GAA--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CAG-TA-TTGG-----AGT-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------CC--A--------------A-AAGC----GAN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNTG---------------------A--------AT--TTCT---G-G------T------AT-A------------T----G-----A-T-AT------CTA-----A----C------T-------GAA--CTT-AT-TAA-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-AG--CG-A-AG----TGGT----A-CG----------A-G-A--A---T--T--A--T-G-TGC-GGAA--T-TGA---T---TCTAAAA-A---A---T----------AG-G-GTT-GG-------------------AGATTT--T---AGGG--------------TC-AGT-----------C---------------------------GAAA-CA--C-A------C----TTTTT-T-TTTT-Tggct
gi|12 : AAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTC-GATTA-CAT----A-TCGAAAA--AAAA-GTAG-G
gi|12 : ---GTTTCGAT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---AGTA--------G----GT--------G-------T-------GGGT----A-----GG---C-------A--A-----T---------T-G-T----TATATTTTTA-C--C----GT------TGA---TGT------------T-T------T-A---TT-CACGA-T-A----------AA-TCGTACTA---AT---CTG--CC---G-CA-T-C-A--------------CC-A---------GGA-A-C----A-A-GAGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-AAC---------TG-GG--A--TT-G-A--C-A----C-GTG-A--AC-----A-T-C---GA---G--G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-G-T--A------A-A------A--A------T--AA--AAG---TT--TAA--------GC--AAAA----------AA-AAGA----AAT--A--GNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------NNNACCCA--------ATCCTTTG---G----------------T-T------------T----GA-A--A-T-AT------CGA-----G----C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G-------AA--C-A---CG-A-A-----T-G---------------------------------A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---G---T----AA-A---AG-TT----------AG-G-GTC-GG--G-A----------GAA-AAATTT--T---AGGG--------------TCGGGT-----------C---GG---GAT-AA--TT-G-------GAAT-TA--A-C------CC-CATTATT-T-TTTT-TT-Ttgtgggtaggcaattgttatatttttaccgttgatgttttattcacgataaatcgtactaatctgccgcatcaccaggaacaagagtattcacaataaataactgggattgacacgtgaacatcgaggttcagtatgggagtaaaaataaaagtttaagcaaaaaaaagaaatagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacccaatcctttggtttgaaatatcgagccgaacttattagagatcgaacacgaatgaaggactggaattgagtaaaagttagggtcgggagaaaaattttagggtcgggtcgggataattggaattaaccccattatttttttttt
gi|13 : aaaaaaataggtgtAAACAA--AAA-CA--TGC-GTTTCCGATTA-CAT----C-TCAAAAA--TA
gi|13 : a-GCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAG----GTAATTTTTTTG----GTTTTTTTGTG-------T-------TG--------------------------------------------T-T-T----T---TTTTTG-T--G----TT------T-T---TTT------------T-T------T-A---T--CA--G-T-A----------AA-T----------AT---TTG--TCTT-G-CC-T-C-A-----------------A---------GAA-A-C-A--A-AAGTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---GTG-G-TGT-G--AT-G-G--A-A----T-GTGAA--AC-----A---C---G----GT-G-----AG-CA--AGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AAG-A-----TT--AAA--------GC--AAAA---------------------NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------A--T------------T----GATA--A-T-AT-------GA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-A--T-A-G-A---------G-------T---G-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GGAA----TGA---T---T-T------------T----------------GTT-AC--A-A----------G-A-AAA--T--T---AGGT--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cggtaatttttttggtttttttgtgttgtttttttttgtgttttttttttatcagtaaatatttgtcttgcctcaagaaacaaaagtgtattcataataaatatgtgtggtgtgatggaatgtgaaacacggtgagcaaggattaaaaataagattaaagcaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaaattgataatatgagcccgaacttatagagtgaaaaaacgaagtgtatgggaatgaggactggaatgattttgttacaagaaaattaggttcggtcgggtaatcggaaacacac
gi|14 : aaaacaaaaacatAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGATTA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAG-GGT-C-GGG---GGTCCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T----T---TTTTTG-C--T----TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------ATGCCTTG--CCTC-G-C--C------------------C--A---------GGA-A-C-A--A-A-G-GT------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CAG-TA-T-GG-----A-T-T--A------A-AAAAATGA--A------T--AA--A-----GT--TAN--------NN--NNNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-A
gi|15 : aaAAAAAA--AAA-TAGC-GT-GTTTCCGATTA-CATAGTCC-TCGAAA---TAAT-ATAG-GGT-C-GGG---GGTCCG-------------GAAAAAAA------------------------------------------------A-----A-----AA---A-------G--A-----T---------T-T-T----T---TTTTTG-C--T----TT------T-ATTTTTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------ATGCCTTG--CCTC-G-C--C------------------C--A---------GGA-A-C-A--A-A-G-GT------T-TC-ATA-A-CA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--GT-G-G----A----T-A-------------A-T-C---GA---GT-GTTT-CAG-TA-T-GG-----A-T-T--A------A-AAAAATGA--A------T--AA--A-----GT--TAN--------NN--NNNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNGG---G-A------A------AT-T------------T----T--AT-A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-A-A---------G------AT---C-G------AGA--A-A---CG-A-AG------GTCAAAA-CG----------G-GAA--A---T--G--A--G-G-AC
gi|16 : -------A--A-----T---------C-T-T----T---TTTTTA-C--A----TT------T-A---TTT------------T----------A---TT-CA--C-G-A----------AA-TTCGACA----AT---TTG--CCTT-A-CATT-C-A--------------C--C---------CGA-A-C-G--A-A-GT-TA-----T-TC-ACA-G-TA-A-AAT-A-CG-A---CTG----AT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A---C---GA---GT-G-TT-CAG-AA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--AGA----T--AA--A-----TT--ACA--------GC--AAAA----------AA-AA------------------TTAACATTTGACG-ACTGAATGTTACTCCAA-GTAACTTAATACACGGCTTT--TCTTG---AAAGCACGAAGAC---------A------C--------AT--CTTG---G-A--------------T-T------------T----G--A--A-GGAT------C-A-----G-C--C------C-------GA---CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-ACAG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---T--T--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGGT--T---T-TAAAATA---AACTT----------AG-G-GTC-GGACG-A----------G-A-AAATCTG-T---A-GG--------------TC--GT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------
gi|17 : cggagcgg-----T-TC-ACG-A-TA-C-A---A-CT-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--ATAAC-----A-A-A---GA---G---------A-TA-TAAT-----A-T-T--AG-----A-A------A--A------T--AACCA-----CC--CAA--------AA--AAAA----------TG-AAATTTCTGAT--ACTAAAATTGTTATATG----AGTGAATTACTAAGCCA----ATTGTAAACTTCGAGTC--TGTTTCGGAAAGTATG--AAG---------G------ACCGCCATGAT--TTTG---A-A------A------AT-TCGGTTATTCTATT----G--A--A-T-ATACTACTCGA-----A-A-----------------GAA--TAT-AT-T-A-G-A---------A------AT---T--------AAA--A-G---CG-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-A-T-GGA---T-TGA---T---T-------A---AA-TTTAA-------AA-G-GTC-GG--T-A----------T-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-A-------GAAA-CA--C-A------CA--A--------TTGT-TT-TTTGTCC-TA-ATTAAGTGGTGTCAGGTTACACCAAATGTC
gi|18 : ---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------GC-T-TTTTT-T-Tg
gi|18 : tGC-C-GTG---TTTCCGAT-T-ACACCT-TGAAAATAA---TGTG--------G----G---------G-------T-------CGA-----GGGGTTGA---G-------A--A-----T---------T-T-T----T---GTTTTG-C-----------------------T------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------AC---TTG--CCTT-A-CA-T-C-A--------------C-------------------------------------T-TCAACG-A-TA-A-A-T-A-AA-T---TTGGG-TGT-A--CC-G-G--C-A----T-AT--A--CC-----A-T-C---AA---GT-G-TT-TAA-TA-TTGG-----G-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--NNNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---AAAATGC------------------------------------TCG---A-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------GAA-----G-T--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------GT---T-G------AAA--A-A---accttgaaaataatgtggggtcgaggggttgagaatttttgttttgcttttattcagtaaatacttgccttacatcacttcaacgataaataaatttgggtgtaccggcatataccatcaagtgtttaatattgggttaaaaataaattaaagcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaaatgctcgataatttgaatatgaagtctgaacttattagaggttgaaaaattggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|19 : taaaaaaaaAAA--TAAAAGTAG---T-T-GTC---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G-------------------------------------------------------------------------------------------C--T----TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-G----------AT---TTG--CCTT-G-CA-T-T-A--------------CC-A---------GGA-A-C-G--A---------------TC-G---A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TA----------A--C-A----T-GT--A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAAA----------TN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNNNNNNNNNGGA------A--------AT--TTCG---C-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---TG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGATTTT---T-TAAAA-A---A---T----------AG-G-GTC-GG--G-A----------ttggaatggattaaacatatttagtgtcagtaaaaaaataggtggaaacacctaatttt
gi|2 : A--AAA-TAGGTGTAGTTTCCGATTAACAT----CATCGAAAAAATAAT-GTAG-AGTGC-GGGGAAGGTCCGA-------------AAAAAAA---T-------------------------------------------GG-----A-----AA---A--------------------------T-T-T----T---TTTTTG-C--T----GT------A-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--GATAA----------AA-T----------AT---TTGC-CCTT-GCC--T-C-G--------------C--C---------AGA-A-C-A--AGA-GTGTA-----TGTC-ACATA-CATG-A-T-ATCG-T---TGGTGTTGT-A---T-G----T-AT---T-GT--G--AT-----A-T-CGCGGA---GT-G-TT-CAGATA-TGGG-----A---A--A------A-A------A--A------T--GA--G-----CT--AAA--------
gi|2 : ------A--------GT--TTGG---G-AC-----A------ATGT------------T----G--AGAA-T-AT------CGA-----G-CGCC------C-------GAAAACTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--C-A---CG-AGAGGAGAT-GG----AGCG----------A-G-A--A---T--AG-A--G-G-AC--GAAA--T-TGATT-T---T-TAAAA-A---AA-TTTCAATCAAGCGG-G-GACAGG--G-ATGCC------G-G-GAATTT--TTTCCGGGAGATGAAAAAATTTTA-GGT-----------CGGTGG---A-T-AA--TC-G-------G-AA-CAGCC-A------CC-GATTTTT-T-TTCTATTGTTTGGCC-TA-Aagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgcagtttgggacaatgttgagaatatcgagcgcccgaaaacttatttaagatcgaaacacgagaggagatggagcgagaatagaggacgaaattgatttttaaaaaaatttcaatcaagcggggacagggatgccgggaattttttccgggagatgaaaaaattttaggtcggtggataatcggaacagccaccgattttttttctattgtttggcctaagacaca
gi|20 : aaaataggtgtagtttccgattaacatcatcgaaaaaataatgtagagtgcggggaaggtccgaaaaaaaatggaaaatttttttttgctgtaattttttattcagataaaatatttgcccttgcctcgccagaacaagagtgtatgtcacatacatgatatcgttggtgttgtatgtattgtgatatcgcggagtgttcagatatgggaaaaaaatgagctaaaagctaagaagcaccaaaagaaacaagataaaagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnagtacaaagcaccgc------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------AT---TTG--CCTT-G-CC-T-C-A--------------CC-A---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TG-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--TT-G-A--T-A----T-GT--ACTATTGTCTA-T-C---GA---AT-G-TT-CAG-AA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A------------------------------A--A-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T--AAAA-A---AA-TA----------AG-G-GTT-GG--G-A----------A-G-AAATTT--T---AGGG--------------TG-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TA-A-------GAAA-CA--C-A------CC-T-TTTTT-T-Tgacaca
gi|21 : -A--CT-G-A--C-AATTAT-GT--T--GT-----A-C-C----A---GT-G-TT-CAG-TA-TTGG-----G-T-A--A------A-A------A--AC-----T--AA--A-----AT--AAA--------TCCCAAAA----------TG-ACAT----GATTCG--ACAATTGATTTCACCCCCATTTAATACATAAATTCTGGCTTCAGAGAGCACGACCCCATATTG---AAGAGTCC--CAA---------T------A--------AT--ACCA---GTA------C------ATGTA-----------T----G--A--T-T-AT------AAA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AC-A-A-G-A---------TTTTTTTATA--T-G------AGA--A-A---TG-A-AG----T-GT----G-CAT---------A-A-ATTA---T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TTG---T---C-CAAAA-----AA-TT----------AG-G-GCC-GG--G-A----------G-G-AAATTA--T---AGGG--------------AC-GGA-----------C---GG---G-T-CC--CA-G-------GAAATCA--T-AGGGCATCC-TATTTTGAT-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|22 : agtaGT-A--CT-A-A--T-A----C--------AC-----A-T-----AA---GT-G-TT-GAG-TA-TTGG-----G-T-A--A------A-A------A--AAT----T--AA--A-----T---AAA--------CCT-AAAA----------CC-ACCT----AAA--A--AACTTTTTTTTGGTCCT-ACTTAATACATGATTCA-GGCTTCGGAAAGCATGGCCA--TTGCT---A--TTTTG----A---------A------A--------AT--TTCA---G-AT-----A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--T------C-------AAA--CTT-AT-T-T-G-A---------G------A---------------A--A-A----G-A-AG----T-GT----A-TGTATGTATCAAACA-A--A---T--T--A--G-C-ATT-GGAA--T--AA---T---T-TA-----------------------------------------------------AAACTT--T---ACAG--------------TC-GAT-----------C---AA---G-T-AT--CT-G-------CAAA-CA--C-A------CC-TA---------TTT-TT-TTTGGCC-TA-AGCA
gi|23 : gttctatatttacaT-T-GTG---TTTCAGAT-T-ACATCT-TGAAAATAA---TTTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----GGGTCGAA---A-------A--A-----T---------A-CAT----T---TTTTTG-G--T----TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------AT---TTG--CCTT-G-CA-T-C-AC-------------C--A---------GGA------------------------------------------A-CA-T---TTGTG-TTT-A--CT-G-A--C-A----T-AT--A--AC-----A-T-C---GG---GT-G-TT-TAG-TA-GTGG-----A-T-T--A------A-A------T--A------T--AA--A-----TT--AAA--------CC--ACAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNG----A---------A------A--------AT-------------------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-A------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GGAA--T-TGA---cactatcatgtggagaaatttttctaatgtaggaatagt
gi|24 : aaAAAA---AAC-ATAG-G---C-GTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CAG-----G-----A-------------------------------------------------------------------------TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------AT---TTG--CCTT-G-CC-T-C-A--------------CC-G---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGTG-----A-T-T--A------A-A------A--G------T--AA--A-----TT--GAA--------GC--AAAA---------------------NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNG--GAA---------A-------------------------------------------T-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------T-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--G--A--G-G-ACT-GAAA--T-T
gi|25 : aaacc---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T-AT---------AA-TTCGGTACCAAAT---TTG--CCTT-G-TA-T-C-A--------------CC-A---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTG-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CA-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAAA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G---------------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--ATATT--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-T
gi|26 : -A-T-G--A-A-ACGTA-----T-TT-GCG-A-TG-A-A-T-A-CA-TGATTTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----T-GT--A--AG-----A-T-C---TT---GT-G-TT-CAG-TA-TGGGGTTAAA-T-T--A------A-A------A--A------A--AA--A-----GA--AAA--------AA--AAAA----------AAGAAGN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GAA---------A------A--------TT--TCCA---G-C------A------AT-T------------T----G--A--------------CAC-----T-C--C------C-------AAA--CTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-TG----------A-G-A--A---TT-A--A--C-G-ATT-GGAA--T-TGA---T---T---AAA-A---AG-TT------------------------------------------------T---AGGG--------------TC-GG-----------------------------------------ACA-CA--C-A------CC-TAATATT-T-CTTT-TT-
gi|27 : T---TTG--TCAT-G-CA-T-C-A--------------CC-A---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--TAA--------GC--AAAANNNNNNNNNNNN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---G-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--C---TTAA--A--G-G-ACT-
gi|28 : ---TTG--CTTC-A----T-C-A--------------CC-A---------GCT-A-C----A-A-GTG-A-----T-TC-ACA-A-TA-ACA-T-AACG-T---TT----TGT-A--CT-G-A--T---------T--A--A------A-T-C---CA---GTTG-TTTCA---A-TGGG-----G-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--ACA--------GC--AAGA----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-GA-T-A-G-A---------G------AT---C-GA-----AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-
gi|29 : tgtcacaaaGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AG--A-----TT--AAA--------GC--AAAA----------GN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NN-G---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-A--C------A-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--A---TT-A--C--T-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G-GTC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C---------------CTT-C-TTTT-TT-TTTGGCC-
gi|3 : AAAAAA--AAA-TAGGTGT-GTTTCCGATTA-CAT----C-TCAAAAA--TAAT-GTAGAGNN-N-NNN---NNNNCGAT-T-ACATCT-CCAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--A-----T---------T-T-TCTTTT-------TG-C--T----TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--G-T-A----------AA-T----------AT---TTG--CCTC-G-C---------------------C--A---------GGA-A-C-A--A-A-GTGTA-----T-TC-ATA-A-CG-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--G--AT-----A-T-C---AA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--AAATATGA-A------A--A------A--AA--A-----TGA-AAA--------AT--GAAA----------TA-AAGC----AAA--A--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--A---T--A--A--G-G-ACT-GAAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AA-G-GTC-TG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-G------CC-TATTTTT-TATTTT-TT-TTTGGTC-TA-AACA-------TCAGTTCAT-CTAAATGTCA
gi|30 : --T-C-A--------------CT-A---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTATTCAGT-TC-ACA-T-TA-A-G-T-A--G-T---TTGTG-TGT-A--CC-G-A--C-A----TGGT--A--AC-----A-TCC---GC---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-TAT--A------ATA------A--A------T--TA--A-----TTAAAAA--------GG--NNNN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------G------A--------AT--ATCG---A-ATATTAGA------AT-T------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------AAA--CTT-AT-T-A-G-A---------taaaaatatctagaattggtattaatttattaacaacttgatactta
gi|31 : gcaT---TTG--TCTT-G-TA-T-C-A--------------T--G---------GGG-A-CAG--A-A-ACTTG-----T-CC-ATG-A-TA-T-A-T-A-CA-T---TTGTG-AGT-A--TT-G-A--C-A----T-GT--A--GC-----A-T-C---AA---GT-G-T---AA-TG-TTGG-----G-T-A--A------A-A------A--A------TTGCA--ATCTTTTT--AAA--------TC--AAAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNNCG-A------ATG----AT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--A------T-------GAA--CT
gi|32 : ttAAAA--AAA-C-GCTGC-GTTTCCGATTA-CAT----C-TCGAAAA--TAAT-TTGG-GGT-C-G
gi|32 : ac-GCG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CGAAAATAA---TTTG--------G----G---------G-------T-------CGG-----A-----AA---GCGTCTTTA--G-----TTTTTATTTAT-T-T----T---TTTTTT-CTTT----TT------T-A---TTT------------TGT------T-A---TTGCA--G-T------------AA-T----------AC---TTG--CATT-A-CAAT-C-AC-------------C--AATCTGAACTAGA-A-C-G--A-A-CAATA-----T-TC-ATG-ATTA-T-A-T-A-TATT---TTGTG-TGTAA--TT-G-A--C-A----T-GC-----GC-----A-T-T---GA---GT-A-TT-CAG-TATTGGG-----C-T-TA-A------A-A------A--A------T--AA--T-----TT--TAA--------GC--AAAgaaagcgtctttagtttttatttattttttttttcttttttattttgttattgcagtaatacttgcattacaatcaccaatctgaactagaacgaacaatattcatgattatatatattttgtgtgtaattgacatgcgcattgagtattcagtattgggcttaaaaaataattttaagcaaa
gi|33 : acaaaaaaacgctA---------A------A--------AT--ATCC---G-AT-----A------AA-T------------T----G--A--T-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-ATTTTATTTTA------AT---TTG------AGA--A-A---CA-A-------T-GT----A-CG----------T-A-A--A---TT-A--A--G-G-ATT-GGAA--T--------------------------------------AG-A-GTC-GG--G-A----------G-A-ATATTT------AGGG--------------TC-GGC-----------T---GG---G-T-TA--CC-A-------GAAA-CA--C-A------
gi|35 : caagcgttcaatattgggtaatcctgttgatgtcgacattgttttaatcctcatcttgatagctaacacactgtccgcagcatggatgccgccatattg-A---TT-CG--G-T-A----------CA-A----------AT---TTG--CCTT-G-C--TTC-AT-------------C--A---------GGA-A-C-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--A--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAGA----------AA-A
gi|36 : ata------------T----G--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------CT------AAA--CTTTAT-T-A-G-----------G------AT---T-G------AAA--A-AAAACA-A-AG----T-AC----A-CG----------A-G-A--A---TTGA--G--G-G-ACT-GGAA--CATGA---T---T----AA-A---AA-TTC---------AG-G-GTC-GG--CCA----------G-T-CAATTTGTT---AGGG--------------TA-GGT-----------T---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-G------CC-TATATTT-tgacattttgacaactgattttacccta
gi|37 : ------A------AT-T------------T----G--G--A-T-AT------TGA-----A-C--C------C-------GAA--TTT-GT-T-A-G-A---------G------AT---T-T------AAA--A-A---CA-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-G--A---TG-A--A--G-G-ATT-GAAA--T-TGA---TAAAT-T-AAA-A---AA-TT----------AA-GCGTT-GG--T-A----------G-A-AAATTT--T---AGGA--------------TT-GGT-----------C---AG---G-T-AA--TC-T-------GAAA-TG--C-A---------TATTTat
gi|38 : gtA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---T-G------AAA--A-T---CG-A-AG----T-AT----A-CG----------A-G-A--A---TG-A--G--G-G-ACC-GGAA--A-TGA-------T-TAAAA-A---AT-TT----------AG-G-GTA-GG--C-A----------G-A-AAATTT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------A---GG---G-T-AA--TA-GGAACTTTGAAA-CA--T-G------CC-TATATTT-T-TTTT-TT-
gi|39 : ------A------GT-T------------T----G--A----T-AT------CGA-----GGC--C------C-------AAA--ATT-AT-T-A---A---------G------AT---T-G------AAA--AAA---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-AAT-GAAA----TGA---T---C-TAAAA-A---TA-AT----------AG-----C-GGT-G-A----------G-GCACATTT--T---AGGG--------------T--GGT-----------C---AT---G-T-AATGTG-G-------GAAG-CA--CAA------CC-TA
gi|4 : AAAA--TA--------GGT---GTG---TTTCCGAT-T-ACATCT-CAAAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------TGGGTGTCA-----GA---A-------T--T-----T---------T-T-T----T---TTTTTA-C--TTTTATT------T-C---TTTA-----------T-T------C-A---GT-AA--A-T-ATTTGCCTTGCAA-C----------AT---NNN--NNNN-N-N--N-N-NNNNNNNNNNNNNNTC--A---------GGA-A-A-G--A-A-GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-AGT-A-CGCT---TTGTA-TGT-AAGTT-G-AAAC-A----T-GT--A--AC-----ACT-G---GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--TG--A-----TT--AAA--------GC--AAAA----------GN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNG---G-A------A------AT-T------------T----G--A--A-TGATG-----CGA-----G-A--C------CA------GAA--CTT-AT-T-ACA-A---------G------AT---C-A------AAA--A-A---GG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AC-A---TTGA--ACCT-G-ACT-GGAA--T-TGAAT-T---T-TTAAA-A---AA-TG----------AG-G---T-GG--G-A----------G-A-AA--TT--T---AGGG--------------TC-GGT-----------C----A---G-T--A--TC-G-------GAAACCA--C-A------CCTTACTTCT-C-TTTT-TT-TT
gi|40 : aa--A--A-T-GT------CAA-----G-C--T------C-------CAA--ATT-AA-T-A-G-A---------G------AT---C-CTTTTTTAAT--T-A---TG-A-A-------------A-CA----------A-G-GTCA---T--A--A--GTGTACT-AGAA--T-TAA---C------AAAA-GTAGAA-TT-----------G-G-GTC-AG--G-A----------G-A-TAATTG--T---AGGG--------------TC-AGT-----------A---GG---G-T-AA--TT-G-------AAAA-GA--C-A------CC-g
gi|43 : -AG----T-GT----A-CA----------A-G-A--A---TT-A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---T---T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC-GA--G-A----------C-A-AAA-GT--T---AAGG--------------TC-GGT-----------C---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------Cct
gi|44 : G-G-ATC-AG--G-A----------G-A-AAATTT--G---TGGG--------------TC-GGT-----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-TA--C-A------CC-T
gi|46 : tctgaaattaatatcgagcttgaactAAAAAA--AAATTAGTTAT-GTTTCTGATTA-TAT----A-TAAAAAA--TAAT-GTAG-GGT-C-GAG---GT
gi|47 : aaT-GGAA--T-TGA---T---T----AA-A---AA-TT--------------------------------------------TT--T---AGGG--------------AC-GGT-----------A---GA---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------C---A---TC-T-TTTC-TT-CTTGGCC-ctgaaattc
gi|5 : --GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-TATGGGG------T----G--A--AAT-AT------CGAT----G-T--C------CTCTGGAGGAG--CTT----T-A-G-A---------G------AT---T-AT-----ACATTA-A---CGTA-AG----T-GT----A-AGT---------A-G-TT-A---T--ATTA--G-G-ACTTGGAACAT-CGA---T---T-AGAGATA---AA-TTTT--------AG-G-GCC-AG--G-A----------GGA-AAATTT--TA--AGGG--------------TC-GGTTCCGTTGCTCCC---AGAGTA-T-AA--TC---------GATA-CA--C-A------TC-T-TTTTT-T-TTTT-T
gi|50 : ttttctttttctcggacttttaattttctttattcacttaaaaatacgagttagcagagggaatattgagtccttgcgtctaacaggataaagtgttatatatcacatagatagacgtttttgctgtacgtacctctgacatatgttcacgtccattgggatttaataaaataatacctcaaaacgcaaaaaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngaggtccatccttaAAA--AAA-TAGTTGT-GTTTCCAATTA-CAT----T-TTGAAAA--TAAT-GTAG-GAT-CAGGG---GTT
gi|51 : TC-GG--G-A----------G-A-AAATTT--T---AGAG--------------TC-GGT-----------G---GG---G-T-AA--TC-G-------AAAA-CA--C-A------TC-TATATTG-T-TTTgaaa
gi|53 : aAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AA---T-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AT--T--A--A--G-G-ACT-GGAA--T-TGA---gg
gi|54 : aG---G-T-AA--TC-G-------GAAA-CA--C-A------CC-T----------TTT-TT-TTTGGCT-TG-AGT
gi|55 : ------A------AT-T------------T----G--A--A-C-GT------CGA-----G-C--C------C-------GA
gi|6 : acactaatAAAAAA--AAA-AGGATGT--TTTCC-ATTA-CAT----A-TCGAAAA--AAAT-GTA--GAT-C-GGG---tgtattac
gi|6 : aTTCC-AT-T-ACATAT-CGAAAAAAA---TGTA--------GATCGG---------G-------T-------CGG-----A-----AA---A-------A--AAATTTT---------T-T-T----T---TTTTTG-C--T----TT------T-A---TTT------------T-TATTCACT-ACAATT-CA--G-T-A----------AA------------AT---T-G--CCT--G-CA-T-C-A--------------C--C---------ATA-A-C----A-A-GTGTA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-A-CG-T---TTGTG-TGT-A--CTTG-A--T-AG---T-G---A--AC-----A-T-CC--GA---GT-G-TT-CAG-TA-TGGG-----A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|6 : aaaaaaaaaaaggatgtt--GGA---------A------G--------AT--TTCG---G-T------A------AT-T------------T----T--A--A-T-AT------CGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-A-G-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-AT-G---T--A--A--G-G-ACT--GAA--T-TGA-------T-TAAAA-A---AA-TT----------AG-G-GTC--G--G-A----------G-A-ATATTT--T---A-GG--------------TCGGGT-----------C---AG---G-T-AG--AC-G-------GAAA-CC--C-A------CC-TATTTTcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggaagatttcggtaattttaatatcgagcccgaacttattagagatcgaaaaacgaagtgtacgagatgtaaggactgaattgattaaaaaaattagggtcggagaatattttaggtcgggtcaggtagacggaaacccacctatttt
gi|7 : aaaaaaaaaaaggatgttttccattacatatcgaaaaaaatgtagatcgggtcggaaaaaaaatttttttttttttgcttttatttttattcactacaattcagtaaaattgcctgcatcaccataacaagtgtattcacaataaatacgtttgtgtgtacttgatagtgaacatccgagtgttcagtatgggattaaaaataaattaaagcaacaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAA--AAA-TAGGTGT-GTTTT------------------GAAAA--TAAT-ACAT-AAT-C-AA------------------------AAAATAA---TGTA--------G----G---------G-------T-------CGG-----G-----GGTCGG-------A--A-----T---------T-T-T----T---TTTTTT-T--T----TTGTTAATT-A---TTT------------T-T------TTA---TT-CA--G-T-A----------AAAT----------AT---TTGGCCCTT-G-CA-T-C-A--------------C--A---------GGA-A-C-G--A---GTGTA-----T-TC-ATA-A-TA-A-A-T-A-TG-T---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--T-A----T-GT--A--AT-----A-T-C---GA---GT-GTTT-CAG-TA-T-GA-----A-T-T--A------AGA------A--A------T--AA--A-----TT--AAA--------GC--AAAN----------NN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNNNTTG-A------A------TT-T------------T----G--A--A-T-AT------TGA-----G-C--C------C-------GAA--CTT-AT-T-T-A-A---------G------AT---C-G------AAA--A-A---CG-A-AG----T-GT----A-CG----------G-G-A--AT--T--A--A--G-A-ACT-AAAA--T-TGA---T---T-TAAAACA---AA-TT----------AG-G-GTG-GG--A-G----------G-A-AAATTT--T---A-GG--------------TC-GATC----------C---GG---G-T-AA--TC-G-------G--A-CA--C-A------CC---------T-TTTT-TT-TTTGGCCTTACACTAAAT-GT
gi|8 : acAAAA--CAAA-TTAG-GGT-T-GTG---GTTTCGATAT-ACATAT-GAAAAAAAA---TGTA---------------------------------------------------------------------------T---------T-T-TA---T---TTTTTAAC--T----TT------T-A---TTT------------G-T--------A---TT-CA--C-T-AT---------AA-TTCGGTAACGAAT---TTG--CCTTAG-CA-T-C-A--------------CGCA---------GGA-AAC-GGGA-A-GTAT------T-TC-ACA-A-TA-A-A-TTA-CGCT---TTGTG-TGT-A--CT-G-A--C-A----T-GT--G--AC-----A-T-C---GAAGTGT-G-TT-CAGCTA-TGG------A-T-T--A------A-A------A--A------T--AA--A-----TC--AAAA-------GC--AAAA----------AN-NNNN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---G-G------A-------T-T------------T----GTAAT-A-T-AT------CGA-----C-A--C------C-------GAA--CTT-ATAT-AAG-ATG-------A------AT---C-G------AAA--A-A---C--A-AG----T-GT----A-CG----------A-G-A--AAT-T--A--AAAG-G-ACTTGGAA--T--GA---C---T-AATGA-A---AG-TT----------AG-G-GCC-GGC-G-A----------G-A-AATTTT--T---ACGG---------------C-GGT-----------C---GG---G-TTAA--TCTG-------GAAA-CA----A------CC-TATTTTT-T-TTT--TT-TTTGGCT-TA-ct
gi|9 : aAAAA--AAAT---AC-GGT-G-GTG----TTCCGAT-TTACATATACGAAAAAAAATATGTA--------G----G---------GGTGGGGGT-------CGG-----C-----AA------------------------------T-T-T----T---TTTTTA-C--TG---TT------T-A---TTT------------T-T------T-A---TT-CA--C-T-AT---------AA-T-----------------G--CCTT-G-CA-T-C-A--------------C--A---------GGA-A-C-G--A-AAGT-TA-----T-TC-ACA-A-TA-A-A-T-G-CG-T---TTG-G-TGTAA--CT-G-A--CAA----T-GT--G--AC-----A-TCC---GA---GT-G-TT-CAG-TACTAGG-----A-T-TTAA------A-A------A--A------T--AA--T-----TT--AAA--------GC--AAAA----------AA-AAGN----NNN--N--NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNN---NNNNNNNN--NNN---------N------N--------NN--NNNN---N-N------NNNNNGGAT-T------------G----G--A--A-T-AT------CCACTTTCG-T--CGCATGAC-------GAAC-CTT-AT-T-A-GAA---------G------ATA--C-G------AAA--A-A---TC-G-AG----T-ACG---A-CG----------A-G-A--ACT-T--A--A--G-G-AC--GGGA--T-TGA---G---T---AAA-C---AA-TTTA--------AA-G-GTC-GG--G-GACATTAGGTCG-A-AAATT--------AGA--------------TC-G-------------C---GG---C-T-AA--TC-G-------GAAA-CAT-C-A------CCATATTTTtat
8 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|34 ): ATATCCCGGTGATGAGAGATCGCTAATTAGCTTGTCAAATGTCTTTTTCCCTTCAAGAAGCACGTTGAAATTCAATATCATTGAACCATACAAAGACAAAGTCAACCCGCCAACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTACGGTAGTCAAAATGCATG
Unaligned ( gi|41 ): TACTTTCAATGTCTCAGTCCCTTTGAATTCCAGATATTAACAAGGTTTGAATGTATTACAGTAATACACTGGTGGAAATTTGCTTATTTTCAATACAATAC
Unaligned ( gi|42 ): CAAGTTTAAGTTCGATAATATCTTGGCAACATACAAACACAAAGTCAACTCGCCAAATTAACTGAAGCTATGAAATCAAAATAGGTAGTCAAAAA
Unaligned ( gi|45 ): TATCTACTTTCAATTTCATGTAGAAACTAACAAAATTTTTATTTTTAACACTTTAAAGATTCTTATTAT
Unaligned ( gi|48 ): CATTGTCCCGGTAATGAGAGATCGCTGAAGTTTGTTAAGGGTCTCTTTTCCTTTAACGAACTACGT
Unaligned ( gi|49 ): TCCCGGTAATGAGAGCTCACTGAAGCTTGTTAAATGTCTTTGTTTTTTCCTGTCAAGAAAT
Unaligned ( gi|52 ): AACTTACCTGAAGCTATGAAATCAAACTACATGTAGGTAGTCAAAATCCGTGCACA
Unaligned ( gi|56 ): CACTATAATTCGGTACAAATTTGCCTTGCATCACC