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gi|24 : GTATAA--T-GGT----T-TTT--T-TTT---C----G--C-G-A-T-A-A--TC-T--A-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--GTA--TT-T-TTG---A--ATCG-C-AAA---C---A-A-TT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--AAC-AACTG-T-GTT----CCA--T-A-T--C---TC-A---TTC----------T---------CAG----A--T-A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC---------AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT----GGG--C--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A----------------C-TG--TTATACG
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gi|19 : gtTATA------GG----T-TTT--TCTTT---C----G--C-G-A-T-A-C--TC-T--A-A--T--T-----G---T--TT-A--T-T-T------G-C--GA---TA--TT-TCTTG---A--ATCG-C-AAA---C---A-A-TT-GAAT-T------CG---CTTA--A-AA-TTT----ACGAACA-GACTT-T-GTT----CCA--T-A-T------TT-A---TTC----------T---C-----AGA---------A--ATGAC----CAA-GAAA-T-CGC-AAAAAGCAAA----GTGAA-CGACG--AATT--A-AAG--AATAGC-A---A---GTTTG-G--GAG--C--A-G-A-T-T-CG--C--AAAT-----T--TTTG--TGACGT-ACG---C----------A-AATA-----A--A----C--------C-CG--TTAc
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Reference ( family-1087 ) : CCGTATAAC-GGG-T-TTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--GTA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-A-TT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-A-T--C---TT-ACGC-G-A------T---A---C---GA----ANAAT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGG--C--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
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gi|21 : GTATAAC-GGT-T-TTT-T-TTT---CC---G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTC--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--GTA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-A-TT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-A-T--C---TT-ACGC-G-A------T---A---C---G-------AAT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTCTT--GAGG--C--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TTA--T-ACG---C----------A-AAAA-----A--C----C--------C-CG--TTATA-
gi|22 : CGTATAAC-GGG-T-TTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--GTA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-A-TT-GAAT-T------CC---CATA--T-AA-TTT-------------AC------TG-T-GTTCCA--T-A-T--C---TT-ACGC-G-A------T---A---C---AA----ATAAG-GT------A-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTG--GGGA--C--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A-------------C-CG--TTATA-CGG
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gi|26 : gt-T-TTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--GTA-TT-T-TCA---AAA---GG-C-AAA---C---A-A-TT-GAAT-G------CG---CATA--A-AA-TTG----AC--ACA-AAC---------T-GTTTCA--T---T--T---TT-G----A-A------TTTCT---C---GG----ATAAT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAG-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGG--C--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------c
gi|27 : cgtt-GGG-TTTTT-T-TTT---C----G--C-G--T-A-A--TTCA-A--T--GTT--CG-C-T--TT-A--T-TAT------G-C--GAG-GTA-TT-T-TTT---TAA---CG----AA---C---A-ATTT-GAATGT------CG---CAT-----AA-TTT----AC--AC---AC------TG-T-GTTCCA--T-ATT--C---TT-TTTC----------T---C---A---GA----TTAAT-GA----CA----GA-T-CAC-AAA---CAAG----G-CAA-C-GC------T--A-ACA--AATG-----------ATTTT--GGGG-----A-------T-CG--CG-AAA------A--TTTG--TGA--T--CG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTAT--CGGTgt
gi|28 : GTATGAT-GGG-T-TAT-T-TCT--------G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--A--TTT--CA-C-T--TT-C--T-T-T------G-T--GA--ATC-TT-T-TTG---AAT---CA-C-AAA---C---A-T-AT-ATAT-TTGGCAACG---CATA--A-AA-ATT----AC--ACG-AAT------CA-----ACCA--T-A-T--T---TA-ACTA-T-A------T---AAT-T---GA----AC-AT-GC------A-G-AATT-TGT-ACA---CTAA----A-GAC-A-ATGT-AAAT-----AA--AACAAC-A---G--TGCTCT--TGGG--T--A-T-T-T-T-CA--C--AAA------A--TCTG--TGA--
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gi|3 : T-AC----CAAAG-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-GCGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---GGTTGTTTC--GGGG--C--A-G-A-T-TCCG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---CA-A-----A-A-AAAA-----A--A----A--------C-CG--TTATagacagtgagtagatactcatcacctcgggtgtagtactaattacatgtaccaaagaatcgcaaacaaaggaacgcgcaaataaaaaatagcaggttgtttcggggcagattccgcaaaatttgtgatacgcaaaaaaaaaaaccgttat
gi|30 : tttcgcttttatttgcgagtatttttgaatcgtaaacaattgaatcgcataaaatttacaccaactgtgttccatatcgtacgcgatcgaaaaataagacagtgagtagatactcatcacctcgggtgtagtactaattacatgCCATATAAT-GAG-T-TAT-T-TTT--------G--C-TA-T-A-A--TTAA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-G--T-T-T------G-C--GAGTGTA-TT-T-TTGAATAAT---CG-C-AAA---C---A-A-TT-AAAT-C------CA---CATA--A-AA-TGT----AC--CTC-AA
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gi|34 : tttttcattttcattattggaatttctcagCCATATAAC-GAG-T-TAT-T-TTT---G----G----AA-T-A-A--TCCA-A--T--TTT--CA-A-T--TT-G--T-T-T------G-A--GA--GTA-T--T-TTG---AAT----------------------TT-AAAT-A------CA---CTTC--A-AA-AAT----AC--CCC-AAT------TG-A-ATACC---T-A-T--C---TT-A
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Reference ( family-1087 ) : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CGG--A-T-A--AT--AC----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
gi|1 : CGTATAG--GGG-TTTT-T-TTTTGTC----G--C-GAAT-A-AAATATA-GAGT--TTT--CG-C-T--TTTA--T-T-T------G-C--GA--G-TA-CTAT-TTG---AAT---CG----AA---CTTCA-ATG-AAAT-T------CGTTTCATA--A-AA-CTT----AGG-ACCGAAC------TGGT-ATTTCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CGAGAA-T-AGAAT--AC----CA---G-----T-C-GC-AAA---CAGAAATCG-GAAGC-ACGC-AAAT--A-AAA--AAT-GCAA---G--TGTTTG--GGTGC--AGG-A-T-T-CG--C--GAATATTATG--TTGG--TGA--TAACGGGCC--A-----GTG-AAAA-----ATTA----C--------CTCG--TTATAGCGGT
gi|10 : CATATAAC-GGG-TTTT---TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------AT-T-GTACCA--T-AC--C---TT----T-T-T------T---T-----CTG--A-T-A--AT--AC----CT---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAC--C-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAAACCCCA--A----C--------C-CG--TTATA-CG
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gi|27 : cgtt-GGT-TTTT-T-TTT---C----G--C-G--T-A-A--TTCA-A--T--GTT--CG-C-T--TT-A--T-TAT------G-C--GA--GGTA-TT-T-TTT---TAA---CG----AA---C---A-ATTTGAATGT------CG---CATA--A----TTT----AC--AC---AC------TG-T-GTTCCA--T-ATT-C---TT-TTTC----------T---------CAG--A-TTA--AT--GA----CA---G----AT-C-AC-AAA---CAAG----G-CAA-C-GC------T--A-ACA--AATGA-----------TTTT--GGGG-------A-T---CG--CG-AAA------A--TTTG--TGA--T--CG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTAT--CGGTgt
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Reference ( family-1087 ) : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CGG--A-T-A--AT--AC----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
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gi|5 : tatacattcgtCCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTA---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CGA--A-G-A--AT--AC----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--AGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CAGT
gi|6 : GTATAACAGGG-TTTT-G-TTT---T----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--TG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-T-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CGA--A-T-A--AT--AC----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----C-GAG-C-AGGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---CAAA-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGa
gi|7 : tCCGTATAAC-GTT-TTTT-T-TTTT--C----G--C-GA-T-A-A--TCTT-A--T--TTG--CG-C-T--T--A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-T-G---AATGGTCG-C-AA----C---A-ATT-GA-T-T------CG---CATA--A-A--TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCTA--TTAT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CGA--A-T-A--A---------CA---A-G-AAT-C-GC-CA----CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAAATAATAGC-A---G--TGTTT----GGGCAGA-G-A-T-T-C---C--AAA------A---TTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--AAAAGC--------C-CG--TTATA-CGG
gi|8 : GTATAAA-GG---TTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---G-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-ATT----AC--AGC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CG-------A--AT--AT----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAATTAA-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--AAAAATA-A-AAAA-----A--A----A--------A-CG--TTATA-CGG
gi|9 : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TT----C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AATATATAATG-T-A----A--T-AT--A---AT-ATAC-A-A----------------CAG--A-T-G--AT--AC----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------T--TTTG--TGA--T-ACG---C--G-----A-A-AA-A-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
blockSeqs : A GC A C CAGCT GC C . G C . G . AT TT C T GG T CT G A AGGTTA A TA GT G A . C AAT GGT G A AAC C C T G TGGCAA . AT T T GTCA GA . ATATAA . G AG T TG GAA C TTTAAATTTCTCA TG G T . TG CTTG TGC A A C T A AAG . T . G T TG T AT . GTG GT AA AG T C T C C CT GC T AT AT CG A . AAAAAT . C ACCCC . CCAAAAAAA . TT .
blockSeqs : . G . . GAGC . . . . . . . . . . . . . . . . G . A . A . . . A . T . . T . . T . . . . . . . . . ATATAA . . . . T CA . TTTGAATTTCT AG . . . G . . . . . . . A . . . . T TA . . . . . GG . . . . . . . G . T . . . . AAA . . . . AAAGC . . .
blockSeqs : . G . . CC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCTGTATA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . AC . . . . ACC . . .
blockSeqs : . G . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AATTTCT AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . .
blockSeqs : . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATTTCT GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . .
blockSeqs : . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGATA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ATATCT AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CGCGAT GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTTT AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TACAA AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTCT GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTCT AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . C . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTCT AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . T . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTTCT GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . .
blockSeqs : . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGCAA GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TACAA GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCT AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCT G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCT G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TTCT G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTA G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : C******* ** ** *** *** ** AG** ** **** ****** *** **
originalCons : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CGG--A-T-A--AT--AC----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
finalCons : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTTC-------G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGC-G-A------T---A-----CAG--A-T-A--AT--AC----CA---A-G-AAT-C-GC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333 11111111
lowQualScore : 1 44 1 1 66666666 11 1 1 1 1 11 1 11 11 11 1 1 11 2 11 1 2 333333 2 11 22 1 1 1 2 222 333 1 1 333 333 1 2 1 333333 222 11 1 1 2222 22 1 777777 1 1 11 1 444444 1 99999999999999999999 1 2 2 33 33 1 2222 1 1 1 1 1 333 2222 1 1 1 2 44 1 11 1 222 11 55 11 2 1 1 1 1 11 22 444444 22 11 11 2 222 33333333 1 1 33333 11 9999999999999 1 11 1
lowQualScore : . .. . . ........ .. . . . . .. . .. .. .. . . .. . .. . . ...... . .. .. . . . . ... ... . . ... ... . . . ...... ... .. . . .... .. . ...... . . .. . ...... . .................... . . . .. .. . .... . . . . . ... .... . . . . .. . .. . ... .. .. .. . . . . . .. .. ...... .. .. .. . ... ........ . . ..... .. ............. . .. .
lowQualScore : 4 22 3 3 00000000 88 3 3 3 3 88 3 77 77 77 2 2 77 5 77 2 5 666666 5 77 99 2 2 2 4 111 333 2 2 333 333 2 4 2 555555 111 77 2 2 6666 88 2 000000 2 2 77 2 333333 2 44444444444444444444 3 3 6 11 11 2 7777 3 2 2 2 2 333 6666 2 2 2 4 55 2 77 2 111 77 88 66 4 2 2 2 2 66 88 666666 88 66 66 4 111 88888888 2 2 00000 77 7777777777777 3 88 5
consensus : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
Reference ( family-1087 ) : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
gi|1 : CGTATAG--GGG-TTTT-T-TTTTGTC----G--C-GAAT-A-AAATATA-GAGT--TTT--CG-C-T--TTTA--T-T-T------G-C--GA--G-TA-CTAT-TTG---AAT---CG----AA---CTTCA-ATG-AAAT-T------CGTTTCATA--A-AA-CTT----AGG-ACCGAAC------TGGT-ATTTCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----CGAGAAT--AGAAT-AC----CAG------T-CGC-AAA---CAGAAATCG-GAAGC-ACGC-AAAT--A-AAA--AAT-GCAA---G--TGTTTG--GGTGC--AGG-A-T-T-CG--C--GAATATTATG--TTGG--TGA--TAACGGGCC--A-----GTG-AAAA-----ATTA----C--------CTCG--TTATAGCGGT
gi|10 : CATATAAC-GGG-TTTT---TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------AT-T-GTACCA--T-AC--C---TT----TTT-----T---T-----C-TGA-T--A--AT-AC----CTA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAC--C-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAAACCCCA--A----C--------C-CG--TTATA-CG
gi|11 : CGTATAAC-GG--TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AATATATAATG-T-A----A--T-AT--A---AT-ATACAA---------------C-AGA-T--G--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAAC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------T--TTTG--TGA--T-ACG---C--G-----A-A-AA-A-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGG
gi|12 : CCGTATAAC-GT--TTTT-T-TTC---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--TG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ATTT-------C---T-----C-AGA-T--A--AT-AC----TAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-AGG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A-------------A-CG--CTATA-CGGT
gi|13 : CGTATAAC-GGG-TTTT-T-TT----C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-TAAT-T------CG---CATA--A-A--TTT---------------------TG-T-TTTTCA--T-TT--TCA-TT-ATTTAAATTTCT---------C-ACA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-TGC-AAA---AAAA----G-GTA-T-ACGA-TAAT--T-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--------A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT
gi|14 : GTATAAC-GG--TTTT-T-TTT---C----G--C-AA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ATTT-------C---T-----C-AGA-T--A--AT-AT----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--AGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGG
gi|15 : CGTATAAC-----TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-G------A--AT-ACCTTGCAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ATGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GAGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--------A-A-AAAA-----C--A----C--------C-CG--TTATA-CG
gi|16 : CGTATAAC-GGG-TTTT-T-TC----C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ATTT-------C---T-----C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-TAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTGG--CGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CA--TTATA-
gi|17 : CGTATAAC-GGG-TTTT-T-T-----C----G--C-GA-T-A-A--TCTAGA--T--TT----G-C-T--T--A--T-T--------G-C--GA--G-GA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AGAT--C---A-ATG-GAAT--------CG---CATA--ATAA-TTT----AC--AC---AG------TG-T-GTT--A--T-AT--C---T-------A-----T---ATCT--C-AGA-T--A--AT-AC-----AA-G-AA-T-CGC-AAAA--CAAA----G-GAA-C-ACGCTAAAT--A-AAA--AATAGC-C---G--TGTTTTT-GGGGC--A-C-A-T-T-CG--CGCAAA------A--TTTG--TGA--T-AGG---C--A-----A-A-AAAA-----A--AAC--C--------C-CG--TTATA-CGG
gi|18 : GTATAAC-GGG-TTTT-T-T-----C----G--C-GA-T-A-A--TCTT-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-T-G---AATT--CG-C-AAA---CC--A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A----TTT---------------------TG-T--TTTCA--T-TTTGC---TT-ATTTGAATTTCT---------C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-TAAT--A-AAA--AA-AGC-A---G--TG-TTG--GGGGC--A-GCATT-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TTA--T-ACG---C--------A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CGTTTTATA-CGG
gi|19 : TATA----GG-TTTT-TCTTT---C----G--C-GA-T-A-C--TCTA-A--T--T-----G---T--TT-A--T-T-T------G-C--GA----TA-TT-TCTTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CTTA--A-AA-TTT----ACGAACA-GAC------TT-T-GTTCCA--T-AT------TT-ATTC-------T---------C-AGA----A--ATGAC----CAA-GAAA-T-CGC-AAAAAGCAAA----GTGAA-CGACG--AATT--A-AAG--AATAGC-A---A---GTTTG--GGAGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAAT-----T--TTTG--TGACGT-ACG---C----------A-AATA-----A--A----C--------C-CG--TTA
gi|2 : CCGTATAAC-GTGCTTTT-T-TTT---C----AGCC-AA-TGA-A--TCTA-A--T--TTTTTCG-T-C--TT-T--T-T-TAGGTTAG-C--GA--G-TAATT-T-TTG---A-T---CA-G-AAA---A---ACATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCC---T-AT--C---TTCACGCTG-----T---A-----T-ACG-T--CT-AT-AC----CAA-A-AA-TCCGC-AAA---CAAT----G-GAA-C-ACGCTAAAT--ATAAA--AATAGC-AGTGG--TGTTTT--GGGAC--ATG-A-TCT-CGCTC--AAA------AATTTTG--TTG--T-ACG---C--AC----A-A-AAAA-----A--A----A--------C-CG--TTcgg
gi|20 : CGTATAAC-GG--TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAG------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ATTT-------C---T-----C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CG--------CAAA----G-GAA-C-ACGC-ATAT--A-AAA--AATAGC-C---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGtattac
gi|21 : GTATAAC-GGT-TTTT-T-TTT---CC---G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTC--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-G------A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTCTT--GAGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TTA--T-ACG---C----------A-AAAA-----A--C----C--------C-CG--TTATA-
gi|22 : CGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CC---CATA--T-AA-TTT-------------AC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-AAA-T--A--AG-GT------A-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTG--GGGAC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A-------------C-CG--TTATA-CGG
gi|23 : CGTATAAC-GGG-TTTT-T-T-----C----G--CCGA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T--------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TT------G--ACC-AAC---------T-GTTTCA--T-AT--TGAATT-TCTCG-------------------GA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGCAAAA---CAAG----G-AAA-C-ACGC-AAAT----AAA--AATAGC-A---G--TG-TTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A---TTG--TGA--T-ACG---C----------A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGG
gi|24 : GTATAAT-GGT-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--AAC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TC-ATTC-------T---------C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC---------AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT---GGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A----------------C-TG--TTATA-CGG
gi|25 : TATAAC-GGG-TTTT----TT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-CTT--TT-A--TGT-C------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AA----CG-CAAAA---C---A-AT---AAT-T------CG---CATA--A-AATTTT----AC--ACC-AA-------TA-T-AT---AAGT-AT--A---TA-AAGCA----------A-----C-AGA-T--G--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC--AA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAATA-A-AAA--AATAGC-A---A---GTTTTAAGGGGC--A-G-A-T-T-CG--C----A------A--TTTAATTGA--TAACG---C--G-----A-A-AAAA-----A--
gi|26 : gt-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TCA---AAA---GG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-G------CG---CATA--A-AA-TTG----AC--ACA-AAC---------T-GTTTCA--T--T--T---TT-G---AA-----TTTCT-----C-GGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAG-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------c
gi|27 : cgtt-GGT-TTTT-T-TTT---C----G--C-G--T-A-A--TTCA-A--T--GTT--CG-C-T--TT-A--T-TAT------G-C--GA--GGTA-TT-T-TTT---TAA---CG----AA---C---A-ATTTGAATGT------CG---CATA--A----TTT----AC--AC---AC------TG-T-GTTCCA--T-ATT-C---TT-TTTC-------T---------C-AGA-TT-A--AT-GA----CAG----A-T-CAC-AAA---CAAG----G-CAA-C-GC------T--A-ACA--AATGA-----------TTTT--GGGG-------A-T---CG--CG-AAA------A--TTTG--TGA--T--CG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTAT--CGGTgt
gi|28 : gGTATGAT-GGG-TTAT-T-TCT--------G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--A--TTT--CA-C-T--TT-C--T-T-T------G-T--GA--A-TC-TT-T-TTG---AAT---CA-C-AAA---C---A-TAT-ATAT-TTGGCAACG---CATA--A-AA-ATT----AC--ACG-AAT------CA-----ACCA--T-AT------TT-A-ACTA-----T---A-----T-A-A-TTGA--AC-AT----GCA-G-AATT-TGT-ACA---CTAA----A-GAC-A-ATGT-AAAT-----AA--AACAAC-A---G--TGCTCT--TGGGT--A-T-T-T-T-CA--C--AAA------A--TCTG--TGA--
gi|29 : A--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-AAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--AAC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TC-ATTC-------T---------C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---CA-A-----A-A-AAAA-----A--A----CCAAAAAAAC-CG--TTATA-CG
gi|3 : --TTT--CG-C-T--TTTA--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-T-AAA---C---A-ATT-GAA--T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---GT-ACGCGA-----TCG-A-----A-AAA-T--A--AG-AC----
gi|3 : T-AC----CAAAG-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-GCGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---GGTTGTTTC--GGGGC--A-G-A-T-TCCG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---CA-A-----A-A-AAAA-----A--A----A--------C-CG--TTATagtgagtagatactcatcacctcgggtgtagtactaattacatgtaccaaagaatcgcaaacaaaggaacgcgcaaataaaaaatagcaggttgtttcggggcagattccgcaaaatttgtgatacgcaaaaaaaaaaaccgttat
gi|30 : tttcgcttttatttgcgagtatttttgaatcgtaaacaattgaatcgcataaaatttacaccaactgtgttccatatcgtacgcgatcgaaaaataagacagtgagtagatactcatcacctcgggtgtagtactaattacatgCCATATAAT-GAG-TTAT-T-TTT--------G--C-TA-T-A-A--TTAA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-G--T-T-T------G-C--GAGTG-TA-TT-T-TTGAATAAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-AAAT-C------CA---CATA--A-AA-TGT----AC--CTC-AA
gi|31 : -TTTT-T-TTT---CAGCTG--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CGCC-T--TT-ACTT-T-T------GACTAGG--G-TA-TT-C-TTT---GAT---CG-C-AGAAACC---A-GTA-GAA--T------CG---CACGATA-AA-TTTGTCAAC--AC---AC------TG-TGGTTCCA--C-Ataacttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacatgcaaaaatcaac
gi|32 : ttC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-G------A--AT-AC----CAC-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTTG-GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------GT-TTTG--TGA--T-ACG---C----------A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGTataatctcttattatttctc
gi|33 : -----C-AGA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGT-AAA---CAAA----G-GAA-C-ATGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--G-----A-A-AAAA-----A--A-------------C-CG--TTATA-CG
gi|34 : tttttcattttcattattggaatttctCCATATAAC-GAG-TTAT-T-TTT---G----G----AA-T-A-A--TCCA-A--T--TTT--CA-A-T--TT-G--T-T-T------G-A--GA--G-TA-T--T-TTG---AAT---------------------TT-AAAT-A------CA---CTTC--A-AA-AAT----AC--CCC-AAT------TG-A-ATACC---T-AT--C---TT-A
gi|35 : -AA-T--GC-AAC---GAGA----G-GA-----CGC-AAATTGA-CAA--AACAAC-A---C--TGTCTG--GGGGC--A-T-T-T-T-CA--T--AGA------A--ATTG--TGA--T-TCG---C--C-----A-A-GCAA-----A--A-------------C-CG--TTGTA-CGGTt
gi|36 : tgattactctac-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT---GGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------T--TTTG--TGA--T-ACG---C--------G-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CG
gi|37 : --T--TTT--TG-C-TGGTT-G--T-A-T------G-C--AA----------T-TT------T---CA-C-AAA---T---G-ATT-AAAT-C------CG---CATA--A-TA-TGT----AC--ACC-GAT------TG-T-GTACCA--T-AC--T---TT-AC
gi|38 : cttgctc--A-N-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-ATAA-----A--ata
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gi|4 : ataGG-TTTCAT-TTTGAGC----A--T-GA-T-ACA--TCTA-A--TATTTT--CG-C-T--T--A--T-TGT------GAC--GAA-G-TA-TT-TATTG---A-T---CGGC-AAA---C---A-ATTTGAAT-T------CG----ATA--A-AA-TTT----AC--ACA-ACC------TG-T-GTTCCG--T-AT--C---AT-A----------T---ATTTCTC-AGAGT--A--AT-AC----TA--G-AA-A-CGC-AAA---CAAA----T-GAG-C-AAGC-AAAT--A-AAA--ATTAGC-A---G--TGTTTTGGGGGGC--A-G-A-T-T-CG--C---AA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-ACAAAA-----A--A----A--------C-CG--TTATA-CGG
gi|5 : tatacattcgtCCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTA---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-GAA-G--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--AGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CAGT
gi|6 : GTATAACAGGG-TTTT-G-TTT---T----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--TG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-T-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-GAA-T--A--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----C-GAG-C-AGGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---CAAA-----A-A-AAAA-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGa
gi|7 : tCCGTATAAC-GTT-TTTT-T-TTTT--C----G--C-GA-T-A-A--TCTT-A--T--TTG--CG-C-T--T--A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-T-G---AATGGTCG-C-AA----C---A-ATT-GA-T-T------CG---CATA--A-A--TTT----AC--ACC-AAC------TG-T-GTTCTA--TTAT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-GAA-T--A--A--------CAA-G-AA-T-CGC-CA----CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAAATAATAGC-A---G--TGTTT----GGGCAGA-G-A-T-T-C---C--AAA------A---TTG--TGA--T-ACG---C--A-----A-A-AAAA-----A--AAAAGC--------C-CG--TTATA-CGG
gi|8 : GTATAAA-GG---TTT-T-TTT---C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---G-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-ATT----AC--AGC-AAC------TG-T-GTTCCA--T-AT--C---TT-ACGCGA-----T---A-----C-G------A--AT-AT----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAATTAA-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------A--TTTG--TGA--T-ACG---C--AAAAATA-A-AAAA-----A--A----A--------A-CG--TTATA-CGG
gi|9 : CCGTATAAC-GGG-TTTT-T-TT----C----G--C-GA-T-A-A--TCTA-A--T--TTT--CG-C-T--TT-A--T-T-T------G-C--GA--G-TA-TT-T-TTG---AAT---CG-C-AAA---C---A-ATT-GAAT-T------CG---CATA--A-AA-TTT----AC--ACC-AATATATAATG-T-A----A--T-AT--A---AT-ATACAA---------------C-AGA-T--G--AT-AC----CAA-G-AA-T-CGC-AAA---CAAA----G-GAA-C-ACGC-AAAT--A-AAA--AATAGC-A---G--TGTTTT--GGGGC--A-G-A-T-T-CG--C--AAA------T--TTTG--TGA--T-ACG---C--G-----A-A-AA-A-----A--A----C--------C-CG--TTATA-CGGT