lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333 11111111111111 111 1111111111 1111111111111 111 222222222222 1 2 1111111111111111111111111111 111111 2222222222222 2 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111 3333333333333 1 111111 1111111 111111 1111 1111111111111 2222222222 11 11 1111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 11 66666666666666666666 4444 11 111 111 777777777777777777777777 1 7777777777777777 44444444444444444444444444444444444 66666666666666 1111 111 1 22222 555555555555555555 111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222222 55555555555555 111111 44444444 22222222 1 33 11 8888888888888888888888888 1 1 1 11 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111 1 1 11 1 111 1 222222222 11111111111 33 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 1 3 1 1 11 333 33 33 11111 1111 44444444 11 111 1111111 222222222222222 11 11111111111111 22222222222222 55555555555555555555555555555555555555555555 33333333333333333 11 1111111 11 1 1111111 111 4444444444444444444444444 2222222222 1 111
lowQualScore : 44 44 3 000000 77777777777777 88 77 444 1 44 6 6 0 44 3333333333 3 3 3 6666666666666 3 3 44 44 44 0 44 9 55 2 2 66 0 2 777 4 777777777777 3 5 7777 555 3 6 7 3 1 666 3333333333333333333333333333 777 666666 4 555 2 3 3 3 3 3 6 66 66 2222222222222 4 6 4 66 4 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 1111111 5 2 1111111111111 0 3 1 000000 66 5 5 1111111 8888 66 999999 4 5 5 0000 0 5 5555555555555 1 8888888888 66 00 8 5 7777 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 44 8 3 8 0 3 22222222222222222222 8 8 6 0000 2 0 11 0 5 666 777 4 6 2 666666666666666666666666 0 2 0 3333333333333333 1 1 88888888888888888888888888888888888 5 22222222222222 1111 111 2 2 3 6 11111 222222222222222222 6 000000 6 777777777777777777777777777777777777777777777777777 0 999 777 333333333 6 1 44444444444444 7 999999 11111111 1 5 0 7 44444444 5 1 6 6 00 44 2222222222222222222222222 0 7 3 1 4 33 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222 5 77 5 4 5 888 0 5 55 11 3 5 66 1 55 222 3 666 1 1 3 222222222 999 66666666666 2 66 777 55 2 5 888 5 5 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 44 1 2 8 88 0 5 9999 8 2 7 0 5 11 111 3 11 00 9 88888 3333 66666666 77 44 555 5 2222222 2 4 3 3 555 1 666666666666666 2 33 44444 33 2 2 2 0 33 5 22 555 3 77777777777777 0 1 44444444444444 99999 11111111111111111111111111111111111111111111 55 3 3 1 55 3 4 4 3 99999999999999999 44 66 66 6666666 66 00 3 5 1111111 000 4444444444444444444444444 0000000000 888 5 66 0 66 5 222
lowQualScore : .. .. . ...... .............. .. .. ... . .. . . . .. .......... . . . ............. . . .. .. .. . .. . .. . . .. . . ... . ............ . . .... ... . . . . . ... ............................ ... ...... . ... . . . . . . . .. .. ............. . . . .. . . ............................................................................................................................................ . ....... . . ............. . . . ...... .. . . ....... .... .. ...... . . . .... . . ............. . .......... .. .. . . .... .................................................................................................................. . .. . . . . . .................... . . . .... . . .. . . ... ... . . . ........................ . . . ................ . . ................................... . .............. .... ... . . . . ..... .................. . ...... . ................................................... . ... ... ......... . . .............. . ...... ........ . . . . ........ . . . . .. .. ......................... . . . . . .. ......................................................................... .... . .. . . . ... . . .. .. . . .. . .. ... . ... . . . ......... ... ........... . .. ... .. . . ... . . ............................................................................................................. .. . . . .. . . .... . . . . . .. ... . .. .. . ..... .... ........ .. .. ... . ....... . . . . ... . ............... . .. ..... .. . . . . .. . .. ... . .............. . . .............. ..... ............................................ .. . . . .. . . . . ................. .. .. .. ....... .. .. . . ....... ... ......................... .......... ... . .. . .. . ...
lowQualScore : 22 22 1 777777 99999999999999 99 11 999 5 22 6 8 7 22 0000000000 3 3 3 2222222222222 3 1 22 22 22 2 22 8 00 9 9 77 6 9 333 4 666666666666 3 3 1111 000 8 5 3 6 8 444 9999999999999999999999999999 000 666666 0 888 6 6 6 6 6 6 0 11 11 6666666666666 4 7 4 33 4 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 5555555 0 5 8888888888888 0 4 4 999999 99 0 0 6666666 4444 99 555555 1 0 0 6666 4 0 8888888888888 4 6666666666 88 44 0 0 0000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7 22 0 2 0 8 2 88888888888888888888 0 0 0 5555 5 8 00 8 0 222 555 0 0 5 000000000000000000000000 8 2 8 0000000000000000 0 0 88888888888888888888888888888888888 0 55555555555555 2222 777 5 2 3 7 77777 000000000000000000 7 333333 7 333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 333 000 888888888 7 0 00000000000000 8 222222 66666666 3 1 7 9 11111111 7 4 7 7 00 00 7777777777777777777777777 7 3 3 2 5 88 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1111 0 99 1 3 7 888 2 0 44 99 4 0 99 4 11 999 2 444 4 4 9 999999999 111 00000000000 5 11 111 22 5 0 888 7 7 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 00 4 0 0 88 8 0 8888 0 8 8 8 6 44 000 2 00 00 0 66666 4444 11111111 99 66 777 0 3333333 0 3 6 6 555 2 888888888888888 9 99 55555 77 4 4 4 3 22 1 33 666 1 99999999999999 3 8 33333333333333 11111 00000000000000000000000000000000000000000000 55 6 6 4 00 6 0 0 4 88888888888888888 00 99 99 2222222 99 11 8 0 8888888 666 9999999999999999999999999 4444444444 888 0 99 0 99 0 111
consensus : AAGGTCAT--AT--GAAACA-AAT--C-CCGAAGAA----A--TT---N-AGTTC-TG-CATGCG-AATTCATTAATCAA--GGTTTATTGAACAAGA--ATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TC-NCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AA--CGACCCACCGTGA-TGTAAAC-AAAACAGTT---TGTAT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCA---TAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATTT-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGG-AT-CCCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACAG-TACGTGT------C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGT-----------C------CTC-T--T--------GTTATC-GA--C----A-ATCA---G---------AT-CCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCAN-----TCCG-A-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGANATAATAACTAA-TCAGTCC----CGTA----CGNNG----G----GGGG-------GGG---G-------T----A-TT--GNA---------GNA-GAATTCC-C---TT--TCCTGCA-AAAAGCAA---AC-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTT-GACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT--ATNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGA--CGAAAATTTGCTGTTCNTGCAAAACG-----------CA-----------TTTCATTCATCNGTGTCT---GTTA--ATTAAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGTA-------------CACAG-CATGGT-GGG-G----TGCGTTCGCA--CA--------CCCCTNC--AAA---AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG---------ATTCCACTCTGTA-TAT--T--GAT-TATTAATT-------A---TA--------A-T-----------CG----CA-C--CC--TTCAC-AAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTTC-ATA-ATATACGCTGAAC------GTA-CGTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGC--GGGGACG-TTATTTAAAGAACTA--ATGT-------------AAAG-AATTACCTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATA-ACCTACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACATG-----C-CCC--CC--CCCC-ATTAAAACA-----AANAACGATTTGTGAACT----TCAGACA--TTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAAN-ACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-ACATA---------TTTTATTAC--GATT------A----ATCANAAAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTAAG-TTCG-TGAGTACGCCNAATACGGCTTCATCGTCGGAATTCACGGNTTTCNTCCCNNCANNNCCGNNTCCGNNNNAANAATCCACGANTTCCGACGATGATACGNCTTTTAATCCTTAAAA----TAATCGTN-AGTATTTGGTAGCTAGGGGTCGTGATTCGTTA-GCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGAT-CATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTGGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT--ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAAT-TA-CA--CTATTTTCTATTG--C-GTT---GTT-T--TCAT--C--G--ATG-GGT-C-TTTGTGACGTCA--CAAGC-AC--CCA-C---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GCT-----TTAT--T-T-CTTAACAA--TG-C-AAA-GACAAT---A-TTTTT-------TTTTN-TTTTATGCAAT--T--TAA-------C--TTT-CATTC-ATAC----T--AATCTT--TATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACC---A-ATGTT--AG-AA--ATTG-TTTCANN-TGAC
Reference ( gi|1 ) : AAGGTCAT--AT--GAAACA-A-T--C-CCGAAGAA----A--TT---T-AGTTC-TG-CATGTA-AATTCATTAATCAA--GGTTTGTTGAACAAGA--ATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TC-TCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGTTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AA--CGACCCACAGTGA-TGTAAAC-AAAAC-GTT---TGTAT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCA---TATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATTT-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCT-GGG-AT-CCCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACAGTTACATGT------CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGT-----------G------ATC-------------GTTATC-GA--C----A-ATCA---G---------AT-CCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCAA-----TCTG-A-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAA-TCAGTCC----CGTA----CCTCG----G----GTAG-------GGG---G-------T----A-TT--GTA---------GAA-GAATTCCTCA-GTT--TCCTGCA-AAAAGCAA--CATAGCACCCTTAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTT-GACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGA--CGAAAATTTGTGGTTTATACAAAACG-----------CA-----------TTTCATTCATCTGTGTCT---TTTA--ATTCAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGTA-------------CACAGCCATGGT-GGG-G----TGCGTTTG----C---------CCCCTGC--AAA---AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTC-G---------ATTCCACTCTGTA-TAT--T--AAT-TATTAATT-------A-------------A-T-----------CG----CA-C--CC--TTCAC-AAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTTCAATA-ATGTACACTGAAC------GTA-AATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGGACA-TTATTTAAAGAACT---ATGT-------------AAAG-AATTGCTTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAAT-ACAA-AATATTAACACGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATTAAAACACTTTCAAGAACGATTTGTGAACT----TCCGACA--TTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAAT-ACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-ATATA---------TTTTATTAT--GATT------A----ATCAGAAAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTAAG-TTCG-TGAGTACGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAATCGTA-AGTATTTGGTTGCTAGGGGTCATGATTCGT-A-GCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGAT-CGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-T-ATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATA-ATAGAACCA--TTAAA-GTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAAT-TA-CA--CTATTTTCTATTG--C-GTT---GTT-T--TCAT--C--G--ATG-GGT-C-TTTGTGACGTCA--CCAGA-AT--CCA-C---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GCT-----TTAT--T-T-CTTAACAA--TA-C-AAA-GACAAT---ATTTTTT-------TTTTT-TTTTATGCAAT--T--TAA-------C--TTC-CAATC-ATAC----T--AATCTT--CATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACC---A-ATGTT--AG-AA--ATTG-TTTCAAT-TGACT
gi|9 : AAGGTCAT--AT--GAAAAA-AAT--C-CCGAAGAA----AA-TT---T-AGTTTATG-TATGCA-AATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AATTTT-G-TT----------CT-CAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATC-AAAGTAGCTCCGA-TC-TCG-AAA-TGATTTTC--TTATT-GCGGCTGCCTC--T--C--CCTTTGCATGATGACGTCAA----AA--CG-CCCACCGTGATTGCAAAT-AACAG-TTT---TGTGA---TAAC--A
gi|43 : acttccgtcccttaAAGGTCAT--AT--GAAACA-AAT--G-CCGAAGAA----A--TT---A-AGTTC-TG-CATGCG-AATTttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
gi|37 : ttaAAGGTAAT--AT--GAAACG-A-TATT-CTGAAGAAGCCGA--GT---T-AATT--TG----GGG-AATTCATTAATCAA--GTTGTGCTACACAAAA--GT
gi|3 : tAGGTCAT--AT--GAAACA-AAT--C-CCGAAGAA----A--TT---T-AGTTC-TG-CATGCA-AATTCATTAATCCA--GGTTTACTGAACAAGA--ATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TC-ACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAA--CGACC-ACAGTGAATGTAAACTAAAAC-GTT---TGCAT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCA---TAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATTT-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---CCTT----T-TT-TCCT-GGGGAT-TCCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGT-----------C------CTCATTATTTCTT---GTTATC-GACTC----A-ATCA---G---------ATCCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCCA-----TGCG-A-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAA-TCAGTCC----CGCA----CGGGG----G----GGGG-------GGG---G-------T----A-TTGGGTATTGGGTATTGTA-GAATTCC-----TT--TCCTGCA-AAAAGCAA--AAT-GCACCTTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTT-GACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-CATGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGA--CGAAAATTTGCTATTCATGCAAAACG-----------CA-----------TTTCAATCATCAATGTCT---GTTA--ATTT-----TATCATCAAGTCAGGTCCGTA-------------CACAGCCCTGGT-GGGAG----CACGTTCGCA--C---------CCCCTGC--AAA---AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGG---------ATTCCACTCTCTA-TTT--T--GAT-TATCAATT-------A-------------ATT-----------TG---------------TC-T-AAAAT-ATCG-----CACCCCTCCTAT-AGAAATAACTTATATTCC-----ATATACGCTGAAC------GTA-CA-TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGC--GGGGACG-TTATTTAAAGAACTA--ATGT-------------AAAG-AATTAGCTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATA-ACCTACTAGTACTATT-ACAA-AATAT----ATG------------CCCACCCTCAATCAAACACTT----GAACGATTTGTGAACT----TCAGACA--TTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAAT-ACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-ACATA---------TTCCATTAC--GATT------A----A
gi|2 : AAGTCAT--A---GAAACA-A-A--T-CCGAAAA---------T---T-AGTTCGTGGCATGCA-AATTCATTA-TCAA--G--TTATTGAAGCAGA--ATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTC-TCGAAAAATGATTT--GATGATCAGCG-CTG---A--T--C--TCTT-GC-TGATGAAGTCAG----AAACCGACC-ACAATGA-T-TAA-C-AAA-C-ATT---GTTAT---TAAC--AAATTAT--TCACGGCTGTGCA---TAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATTTTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TA--TGT----C--T----T-TA-TCCT-GG--AT-C--AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACAGT-AGGTGTAAT---CTTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGT-----------CCTTATTATTTTCTT--------GTTATCTGA--C----A-AT-A---A---------AT-C-AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCAA-----TC-G-C-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCGTA-TAATAAC-AA-TCAGTGCATGTCGTA----CGGGG----G----GGGG-------GGG---GGGGGGGTT----AAGT--GTAT--------GTA-GAATC--------T--TCCTGCA-AAAAGCA------------CTTTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTA-GA----A---------------T-CTATCAGCATATTTG-ATGTAT-GA--TTCTC-TTGAATCCGGCCCGAAAATTGCTG--TTATGCAAAA-G-----------CA-----------TTTCATTCA-AAATGTCT---GTTACGGGTAATGTGTATCATTAAGTCAGG-CCGTA--------------ACAG-CATGGT-GGA-G----TGCGTTCG----CA--------CCCCTGG--AAA---AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTC-GGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAG--TGAAAT-TATTAATT-------A-------------A-TTGTCTAAATAATG----CA-C--C----TCACAAAAAT-TTGGGTGTGGGGC--TCATCTAAGAATTAACTTA-ATTTCCATA-A--TACGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT------------GAGTT-GG-TGGGTGTGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGC--GGGGACG-TTATTTAAAGAACT---AAGT-------------AA---AACGGC-TGCAGATAGATGAAAACGCACCATTA-ACCTCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT--ATACG
gi|16 : AGGTCAT------GAAATA-A-T--A-AAAAAAAA----AAATG---C-A-TTA-TA-TATGGGGAACTCCTTTATCAA--AATTTATTTAACAAGA--ATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TC-ACAATAA-TGATCTTCGATGA-TCGCGACTT---ATCT--C--CCTTGGC-TGATGACGTCAA----AA--AGACCCCTCGTGA-TGTAACC-AAAACAGTT---TGTA--------------TAT--TTCC-----TGCA---TAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGCaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|20 : AGGTCAT--AT--GAAACA-A-T---------------------------ATTC-TG--AGG-A-AATT--------AA--G--TTGT-GCATGGAA--ATTCACTT----ATC-AAGGTT-T-AT----------T---AA--ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TC-ACGAAAA-TGATCTTCGATGAT------------A---------CTTGGC-TGATAACGTCAA----AA--AGATCTGTCGAGA-TGTAAAC-AAAACAGCT---TGTAT----AAC--AAAGAAT--TTAC-----TGCA---T-------GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATTT-AGTCGTA-GTA-GTAGGCc
gi|4 : GGTCAT--AT--GAAACA-AAT--T-CCGAAGAA----A--TT---G-AGTCC-TG-CATGCC-AGTTCATTAATCAA--GGCTTATTGAACAAGA--ATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TT-TCCAAAA-TGATTTTCGA-GGGTCGCGGCTG---ATCT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AA--CGACCCAC
gi|12 : GGTCATTAATTTGAAACA-AAT--C-CCGAAGAA----A--TT---T-AGTTC-TG-CATGCA-AATTCATTAATCAA--GGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TC-TCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AA--CGACC-ACAGTGA-TGTAAAC-AAAAC-AGTAAATGTATAATTAAC--AAAT---------------GC----TAT-----GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATTT-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TA--TGTA---CA-T----T-TT-TCCTGGGG-AT-CCCATA-TTCAG-AAG------AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGCtacaatttagctttgaaaaatgccacagtgtgctacatttaattgtagtagtaggtcgcagaaggttttgactatatgtacctctttcctggggatccaaaagctacatgggtttcaaatatccgtatttaaactaagtacatgtctctacactcatactcattttcttgctattgacaatcaaatcaagctaattaaatcaatattgtaaatattgtatattaaaaagtatcattcagaaataataattaatcagtcttatattttctttagagaagtagacaggcaagggttataattgaacgagaattccgccttaaagtcagatttgactctggattttgactattaattaggattctaggatttgttgtactttctacaacaaatatttataaattctcttttaatttaaaaaaaaattgctgttcttgcaaaacgcaattaacactcattctattcatccgtgtaaattgttacatcaagtcaggcctgcgttcgcacccccagcaaaaaaccaaatcgcaatattaaagtctgtattattgattattaattaatgtgtctaaaatatcgcacccctccacaaaattctgggtatgggctttcatctagaattaacctatatttcatatactcttaacttttatgtatgtcagtcgtgtttacaccagggtgggggttggagtataaaataatagtcgatcatgacagcgtggacgtttatttaaagaactaaaatgttttttttttaaaaaaagaaattacctgctatataattaacgcaaataacttactattaaaaaaacatacccccccccgcccccaatcaaaacacgatttgggaacttcggacattgtgggctcgaaagaaaacactgactggttatgaaaaccgtgcgtcctgtgaaattattcgtatcaaaatagaaataagattatcattacagtttttagacatattttattacgattaatcataaatagcatgccacggtcaatctatatacttttaagttcgcgagtacgccta
gi|14 : GGTCAT--AT--GAAACG-A-TATT-TTGGAGAA----A--TT---G-GGTTA-TG-GATGGG-AATTCATTAGT-AA--G-----------AAGC--ATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TC-ACAAAAA-TGATCTTCGATGACCCCAGATTAC--A------------TGC-TGATAACGTCAA----AA--AGACCC------------AAC-----T-GTT---TG-----------------AC--TC-------TGCG---TAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AACT-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CA--TGTG---C--G----TATT-TCCTAGGG-AT-TCCGAA-TTTAG-AAAGA----AAc
gi|30 : GGTCAT--AT--GAACTATA-T----TCAAAGAA----G--TG---A-AGTTA-TG-AATGGA-TACTCATTA--TAC--GGCTTATTAAACCAGA--ATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---C-AC-AAAA-TGAATTTC--TGA-TCGCAGTTcatacgggtacaaaatcta
gi|11 : atGTAAT--AT--GAAACG-A-T--TTCCAAAGAA----A--AT---G-AGTTA-TG-CATAGG-AATTCATTTATCAA--GTTTTATTAAACAAGA--ATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TC-ACGACAA-TG-----------CTCGCGGCTT---A--T--C------TGG-TGATGAAGTCAA----AA--AGACTCACCGTGA-TTTAAAC-AAAACAGTT---TGTAC---CTAC--G---CAT--TTAC-----TGCA---TAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATTC-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CA--TGCA---C--C----T-CTATCCTAGGA-AT-ACCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATA
gi|6 : aAC--AT--GAAAAA-AAT--C-CCGAAGAA----A--CTGCATGAGTTC-CG-CATGCG-AATTCATTAATCAA--GGTTTATTGAATAAGA--ATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT-----------TTCAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TC-TCGAAAA-TGAATTTCGATGA-ACGCGGCTG---AACT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AA--CGACCCACTGTGA-TGTAAAC-AAAACAGTG---TGTAT---TAAC--AAATT------------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATTT-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTA---C--TACCCT-TT-TCCT-GGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CTG-TACATTT------C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGT-----------C------CTCATTTTTTTGTCTTGTTATC-AA--C----A-ATAA---G---------AT-CCAGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCAT-----TCAC-A-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|24 : AATCAC--GGTTTATCAAACAAGA--ATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT------------------A-TGATCTTCGTTGATT-GCAGCTT---A--TTTC--CCTTTCC-TGATGACGTTAA----CA--AGACCCACCATGA-CGTCATC-AAATCAGCT---TGTA----TAACTTTAAGTAT--TTAC-----nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|19 : GCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TC-TCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AA--CGATCCACAGTGA-TGTAAAC-AAAACAGTT---TGTAT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCA---TAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATTT-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TA--TGTA---C--C----TGTT-TCCTGGGG-AT-CCCAAA-TTgtc
gi|12 : -CGA-TCATCGAAAA-TCATTTTCGA-GAT
gi|4 : ggtcattaatttgaaacaaatcccgaagaaatttagttctgcatgcaaattcattaatcaaggtttgttaattttttttctcaaatgcaagataacgtcaatacacagctgatcaaaagttctcg--AAACGAC--CCAC-----TACAATTTAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATTT-AATTGTA-GTA-GTAGGTCGCAGAAGGTTTTGACTATA--TGTAC--C--T----C-TT-TCCTGGGG-AT-CCAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---AG-------------TACATGT------C-TC----TA-CAC-TCATACT-CATTT-----------T------CTT-------------GCTATT-GA--C----A-ATCA---A---------AT-CAAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-------------------TTGTA-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATT--------------CAGAAATAATAATTAA-TCAGTCT----TATATTTTCTTTA----GAGAAGTAGACAGGCAAGG---G-------TTATAA-TT--GAA---------CGA-GAATTCCGC--------CTT-----AAAG---------------TCAGATTTG------ACTCTGGATTTT-GACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACAAAT----ATTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAA--AAAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCAATTAACACTCA-----------TTCTATTCATCCGTG--------TA--A---AT-TGTTACATCAAGTCAGGCC---------------------------------------TGCGTTCGCA--C---------CCCCAGC--AAA---AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG--------------------TCTGTATTAT--T--GAT-TATTAATT-------AATGTGTCTAAAATA-T-----------CG----CACC--CC--TCCAC-AAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTTC-----ATATACTCTTAACTTTTATGTA-TGTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGT-TG-G-AGTAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGC--GTGGACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTACCTGC-TATATAATTAA-CGCA--AATA-----ACT--TACTATT-A-AA-AA----AACATA-----CCCCCCCCCGCCCCCAATCAAAAC----------ACGATTTGGGAACT----TCGGACA--TTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-ACATA---------TTTTATTAC--GATT------A----ATCATAAAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTAAG-TTCG-CGAGTACGCCcggctgatctgcctttgctgatgacgtcaaaacgaccacagtgatgtaaacaaaacagtaaatgtataattaacaaatgctatgaaaaatgccacagtgctgcatttaatcgtagtagtaggccacagaaggttttggctatgtacatttttcctggggatcccatattcagaagaacaaggtatagtataagctagcc
gi|9 : ggtcatatgaaacaaattccgaagaaattgagtcctgcatgccagttcattaatcaaggcttattgaacaagaattcctttgttaatttttttctcaatgcgtcaatacaactgatgaaaagtgctcgatttccaaaatgattttcgagggtcgcggctgatctccctttgctgatgacgtcaACAGTTTTGTGATAAC-ATTC-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTAACCT--T----T-TT-TCCTGGGG-ATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATA--TAAGTGTGGACTATGTC--TCTA-CAC-TCGTATT-CGCGTCC---------T------ATT-------------ATTATC-TA--TGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CCAGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCAT-----TCCG-A-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GT----------AACC--CGTTCAGA--------------CAGT-C----CGTA-------CG----GAA--GGGG-------GGG---G-------TA---A-TT--GAA---------AAAGGAATT--TCA--TTAATCATGC--AAAAGCAA--TAta
gi|41 : acttccgtcccttaaaggtcatatgaaaaaaatcccgaagaaaatttagtttatgtatgcaaattcattaatcaataggtttattgaacaagataatctatgttaattttgttctcaatgcaagataacgtcaataagctgatcaaagtagctccgatctcgaaatgattttcttattgcggctgcctctccctttgcatgatgacgtcaaaacgcccaccgtgattgcaaataGT---GTGCTA-C-ATCT-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|26 : aacgacaactctgtgcaagagaatgACATGA------C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCCTCATTATAGG------TTCT------------GTTATC-GA--C----TTATCA---GG--------ATGCCAGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTG-AGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTA
gi|35 : aaggcgttccttatataatagcagcataTT-------------GTCATC-AA--T----A-ATAA---A---------AT-CTAGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCAT-----TTTG-A-AA-----TAAAAAA-AA
gi|11 : ctcacttcctcaaaagtatataacattcattttcTTATT-GC--C----A-ATCATAAA---------AT-CTCG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCAT-----TCTG-A-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATgaaa
gi|13 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcATCAAGTCAGGCC----TGTA----CATAGCTATG----GTGG-------GGGTGCG-------T------TT--GCA----------------TT--TCATATC--CCCTTTACAAAACCAAACCACAATA---TTAAAGTTGGATTTCACTCTGTACATT-GATT-ATTAATTAG----------------------T-CTA-AAATAT
gi|6 : gtaaaccttctctttgaatctgaaggaaatttgctgtttttgcaaaacgcaattaacaggcatttcattcatccgtgtctgcatgttattaattgtgtcG----G----GGGG-------GGG---G-------TGTT-A-TT--GTA---------GAA-GAATTTC-----TT--TCTTGC---AAAGCAA--AAT-GCTCCCTTAAATTCGGATTcgcatcacctacacaacattctgggtatggacctatacgctgaatgtacgtgtgtgtttaaatcggggtgagagtatgaaaatatatttgatcatgacagcggggacgttatt
gi|39 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggAATTCGGATTTTATTCTGGATTTT-GA-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT--ATTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGA--AGGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACG-----------CAATTAACAGGCATTTCATTCATCCGTGTCTGCATGTT--ATTAAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGTA-------------CATAGCTATGGTGGGG-G----TGCGTTTG----CATTTCATATCCCCTTT--ACA---AAACCAAACCACAA-TATT----AAAGTTGG---------ATTTCACTCTGTA-CAT--T--GAT-TATTAATT-------AGTCTAAAAT----A-T-----------CG----CA-TCACC--TACAC-AACAT-TCTGGGTATGG------------------ACCTA--------------TACGCTGAAT------GTA-CG-TG--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG--------AGTATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGC--GGGGACG-TTATT
gi|25 : gTTCATTCATCGGTGTCT-------------GT-TGTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAGGGG-GGG-GGGGTTGCATTCG----CA--------CTTCTCT--GAA---AA---------C-A-TATT----CAAGTC-GG--------AT---GTTCTGTA-TTTGAT--AATGCATTAATT-------GCGCTAAAAAT---A-T-----------TG----CA-C--CCCCTCCAC-AAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCT-AG
gi|18 : TCAAGTCAGACCCGTA-------------CAAAGGCAT--T-GAA-G----TGCATTGGCAACC---------CCCCTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAG---------AGTTTACTTTGTT-CAT--T--GAT-TATTAATTTTCCTAAA-------------A-T-----------TGTGTACA-T--CC--TTC-T-AAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAg
gi|31 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttTTCATCT-AGAATTAACCTATA-TTCAATATATATACGCTGAAC------GTA-CG-TA--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GGAT-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAAGGGGa
gi|40 : TATACGCTGAAT------GTA-CGT-A--CGTGTTTACACTGGG----AGG-------GGTAT-------------GTTCAT-GAT-AGCGG--GGACG-TTATTTcaaatgtaattgaatgataaaaataata
gi|46 : TA--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATA
gi|5 : ATTAAATGCA--AATAACC-------TACTATT-AAAA-AACAT----ATACCCCCCGCCC--------------AAATCA-----AACAACGATTTGTGAACT----TCAGACA--TTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAAA-ACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-ACATACATTTCATATTTTATTAC--GATT------ATTAAATCATAAAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA---CTTG-TTAGTACGCCGAATACGGCTTCATCGTCGGAATTCAGGGTTTTCTTTCTATCACACTCTATTCAGTACAAATAATTCACAATTTCCGACAATGATATGCCTTTTAATCCTTAAAA----TAATCGTT-AGTATTTGGTAGCTAGGGGTCATGATTCGTTA-GCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGAT-CATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCATT-ATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT--ATATAACCG--ATAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAAT-TA-CA--CTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTT-T--TCAT--C--G--ATG-GGT-C-TTTGTGACGTCA--CAAGA-AC--CCA-C---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----TACG--------CACAAGTTTAC--------A--------GCT-----ATAT--T-T-CTTAACAA--TA-C-AAA-GACACT---A---CTT-------TTTTA-TATTATGCAAT--T--TAA-------C--TTT-CATTC-ATAC----T--AATCTT--TATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCC---A-ATGTT--AA-GA--TTTG-TTTCATA-TGAC
gi|22 : TTAAAA-A---TCAAACAAGACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGCGA-G-GA---AAA-ACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTTcttta
gi|2 : AACGATTTGTGA-CTAAAGTCAGACA--TTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AAT-ACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAACATA---------CTTGTTTATACGATT------A----AT-AGAAAT--A---CAT-CC-------------------ACGTGCAAGTTTCGATGAGTATGCacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|7 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaAACGATTTGTGAACC----TCAGACA--TTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAAA-ACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTATTA---CAGTTTTTAG-ACATA---------TTTTATTAC--AATT------A----ATCATAAAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTAAG-TTCG-TGAGTACGCCTAATACGGCTTCATCATCGGAATTCACAGGTTTTATCTCTATAACACTGCATTCAGTACAAAAATCCACGAGTTCTGACGATGATACGGCTTTTAATCCTTAAAA----TAATCGTT-GGTATGTGGTAGCTAGGGGTCATGATTCGTTA-CCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGAT-CATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCATT-ATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT--ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAAT-TA-CA--CTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATT-T--TCAT--C--G--ATG-GGT-C-TTTGTG-CATCA--CAAGC-AT--CAA-C---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------AAG------GTT-----TTaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACA--TTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAAT-ACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-GCATA---------TTTTATTAC--GATT------A----ATCATAAAT--ta
gi|10 : GA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAGA-ACCGTAC-----GTA--GTTATTCGTATC--AAA-A-GAGATATG--CAATATT----TTTTTAGAATATA---------TATTGTGAT--AACTCATGACA----ATGAGAAATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CA
gi|28 : cccccccccacgaagcaacattaacatttcgggcacccccTTTATTAC--GCCT------A----ATCAGAAAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTAAG-TTCG-CGAGTACGCCtatacggcttcatcgtcggaactcatgggttgggaaaatccgtgggttccgattatgatacggcttttaatcattttgaaatactcattaaactttgacacctgatggctaggggacgtgatttctaagctccttgtcaaaatcatcctcttattctcttgtcgtcattattgactagttcaaactgatatggctatactacgggacaaaaaccaagaaaaaaaaaggaatcgtccatatcaatgaaatgactgagatatttcgttaattacactgttttcatggatgggcctttgtgacgtcacaagcatccacaatcaagaacggtaagcggattgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|44 : CAGAAAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTAAG-TTCG-Ttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatacagcatttaatccttaaaataatcgtaagcattgtt
gi|8 : AAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTAAG-TTTG-TGAATACG
gi|2 : cgattactcatattattTAATCGTA-AGTATTT-GTAGCTA-GGGTCATGATTCGTAA-GCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGATAC----TCTTTT-AT-AATCGTCATgctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaaattctgtgagttccaatgatgatacggcttttaatccttaaaataatcatatagcatttgattgctaggtgttgtgattctttagctcctcttcagaagctaggtcatcctctgttaataaatcgtcatttgcttgccgtcattaattctggatagttcgaactaatatggctgtactacaaaatcaggcaattcatcagaaaacaaagactcatgtatatccattaaaacaatgagagatttcttttgttagagtgtaaattacactattttctatgcattgttttcattaatgggtctttgcgacatcacaagcacccacaatcaagaacgatgagcgggtaataaatttgatccatgaacaagtttacagctttatttcttaacaatgcaaggacaatatttttttctatattatgccatttaactttcattcaatactaattaatctttatgtttataaagttaaataccaatgttacaaatcgtttcagtatgacctttaag
gi|8 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaaTAATCATATAGCATTTGATTGCTAGGTGTTGTGATTCTTTA-GCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---T-CATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCA-TTAATTCTGGATAGTTCGAACT-AATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCATG--TATATCCA--TTAAA-ACAA---TGAGAGATTTCT-TTTGTTAGA---GTGTAAAT-TA-CA--CTATTTTCTAT-G--C-ATT---GTT-T--TCAT--T--A--ATG-GGT-C-TTTGCGACATCA--CAAGC-AC--CCA-C---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAA---TTTGATC-----CATGAACAAGTTT--------AC--------A--------GCT-----TTAT--T-T-CTTAACAA--TG-C-AAG-GACAAT---A-TTTTT-------TTCTA-TATTATGCCAT--T--TAA-------C--TTT-CATTCAATACTAATT--AATCTT--TATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACC---A-ATGTT--AC-AA--ATCG-TTTCAGTATGACaaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|10 : cgattactcatattattaaatgacatgccatggtaaatttatacggtacttgtaagtttgtgaatacggctttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtacaaaattctgtgagttccaatgatgatacggcttttaatccttaaaaTGATGGCTAGGGGACGTGATTTCT-AAGCTCCTTGTCA-AAA----------T-CATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCA-TTATT---GACTAGTTCAAACT-GATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGTCCATA---TCA--ATGAA-ATGAC--TGAGATATTTCG-TTA---------------AT-TA-CA--CT---------------------GTT-T--TCAT--G--G--ATG-GGC-C-TTTGTGACGTCA--CAAGC-AT--CCA-C---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--ctttaag
gi|2 : cccccccccacgaagcaacattaacatttcgggcacccccgaaaacactaactgattaagaagaaccgtacgtagttattcgtatcaaaagagatatgcaatatttttttagaatatatattgtgataactcatgacaatgagaaattaagcgccacggcatctacacatatacggcttcatcgtcggaactcatgggttgggaaaatccgtgggttccgattatgatacggcttttaatcattttgaaatactcattaaactttgacaccGAAAAAAGGCAATTTTGAGTCA--AAACAAAA--TATTATA-A-----CCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATTAAA----ACAGTGTAAAT-TATCA--CTATTT-CTAAT---C-GGT---GTT-TGTTCAT--C--G--ATT-GGT-CGTTTGGTACGTCA--CCAGG-AC--C-------A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATT-AA------ATTCAAAAAAATA--------C--------A-------------------TT-----TTAT--TGT-TTTAA-AA--TA-CAAAA-GAC-AT---A-----T-------TTTTA-TTTTATGCAAT--T--TAA-------C--TTC-TATTC-ATAC----T--A-------------------------------------TAAA----------GCC---A-ATGTT--AGAAA--ATTGAATTCAAT-TGACtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|17 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaaAAGCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAAT-TA-CA--CTAGTTTCTATTG------------------------------TG-GGT-G-TTTGTGACGACG--CAAGC-AC--TCA-C---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----CATG--------C--------ACAAGTTTAAA--------GCT-----TTAT--T-T-CTTAACGA--TG-C-AAA-GACAAT---A----------------TT-TTTTATGGAAT--T--TAA-------C--TTT-CATTC-ACAC----T--AATCTT--CATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACC---A-ATGTT--AG-AA--TTGG-TTTCcttga
gi|36 : A--TTCAA-TTAA---TGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA----TA-CA-----------GTTC--C-ACT---GTT-T--TCAT--G--G--ATG-GGT-C-CTTGTGACGTCA--Ctta
gi|16 : TTTTT-TTAAGCTATGCAG-G-AAATATA-CAAACTGTTTT----------------GGT-T--ACAT--CACG--AGG-GGT-C-TTTTTGACGTCA--TCAGaaacaccc
gi|33 : aggtcatgaaataataaaaaaaaaaaatgcattatatatggggaactcctttatcaaaatttatttaacaagaattcatttttgggttgttgttttttaatgcaagataacgtcaattcaactgatgaaatgtactcgatcacaataatgatcttcgatgatcgcgacttatctcccttggAGGGTGCAT-TC-CA---TATTTTC-ATTG--CTGCT---GTT-T--TCAT--C--G--AT--GGT-C-TT--TGACGTAA--AC----AC--CCA-C-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CAAG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTAAACAA--TG-C-AAA-GGCAaaccatcgtgtgcc
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--T-TC-CA--TTATTTTC-ATTG--C-GCT---GTT-T--TCAT--C--G--ATG-GAT-C-TTT-TGACGCCA--CAAAC-AC--CCA-C-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CATG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTAAACAA--TG-C-AAA-GGCA
gi|12 : tgTGTTAAT-TA-TA--C-ATTTACTGTT------TT---GTT-T--ACAT--C--A--CTGTGGT-C-GTTTTGACGTCA--TCAG
gi|15 : ggtcattaatttgaaacaaatcccgaagaaatttagttctgcatgcaaattcattaatcaaggtttgttaattttttttctcaaatgcaagataacgtcaatacacagctgatcaaaagttctcgatctcgaaaatgattttcgatgatcgcggctgatctgcctttgTTTTCTAT-GAAC-GTTTAGATG-T--TTATTCC--G--ATG-GGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCA-C---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAAT-AA---TCAGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GTTACAGTTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAAC-AAAAGACAAT---A--TTTT-------TTTTT-ATTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTA-CAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTT---A-TTGTT--AGTAAATATTG-TTT-AAT-aatgctatgaaaaatgccacagtgctgcatttaatcgtagtagtaggccacagaaggttttggctatgtacatttttcctggggatcccatattcagaagaacaaggtatagtataagctagcc
gi|6 : ACTG--T-TTT---GTT-T--ACAT--C--ACAGTG-GGT-C-GTTTTGACGTCA--TCAG
gi|5 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgTC---GTTCT--TGAT--T--G---TG-GGT-T-CTTGTGACGTCA--CAAAG-AC--CCATC---G---A------TGAA-AACAAgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|21 : attaaatgcaaataacctactattaaaaaacatataccccccgcccaaatcaaacaacgatttgtgaacttcagacattgccggctcgaaagaaaacactgactggttatgaaaaaccgtgtgtctctgattattcatatcaaaaaagaaataggattattattacagtttttagacatacatttcatattttattacgattattaaatcataaatatagtatgccatggtcaatctatatacatgtacttgttagtacgccgaatacggcttcatcgtcggaattcagggttttctttctatcacactctattcagtacaaataattcacaatttccgacaatgatatgccttttaatccttaaaataatcgttagtatttggtagctaggggtcatgattcgttagctcctcttcaagaagctagcagatcatcctcttttaatacatcgtcattcgcttgccgtcattatttctggctggttcaaactaatatggctgtactacgaaaccagtcaattggttagaaaacaaaaattcatatataaccgataaattaatgagaaatttctttaaacaaaacagtgtaaattacactattttctatgcg--C--A--ATG-GGA-C-TTTGTGACGTCA--CAAGC-AC--CCA-CTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AAC-AAATATTCATTC-----CATT--------C--------AC--------AAGTTTAAAGGT-----TTAT--T-T-TTTAAAAA--TG-C-ATC-GGCA-------TTTTT-------TTTAA-TTTTAAGCAAT--T--TAA-------C--TTT-CATTA-GTAT----A--AATCTT--TACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACC---A-ACGCT--AG-AA--ATGG-TTTCATA-TGACtaagcgagtaataaatttgttctacgcacaagtttacagctatatttcttaacaatacaaagacactacttttttatattatgcaatttaactttcattcatactaatctttatgtttattaagtaaaattccaatgttaagatttgtttcatatgaccttta
gi|14 : TG-GGT-C-TTTTTGACGTTA--TCAGC-AT--
gi|36 : ggtcatatgaaacgatattttggagaaattgggttatggatgggaattcattagtaagaagcattgtttttatcatattttcttccaatgcaagataacgtggatcggtcaaatgtacttggtcacaaaaatgatcttcgatgaccccagattacG-GGT-G-TTTGTGACGTCA--CAAGG-AC--CCA-actgtttgactctgcgtagatttgggaaataacacattttcctacaactaattgttataaaggtcgcagaaggttgcgaccatgtgcgtatttcctagggattccgaatttagaaagaaacatacgggtacaaaatcta
gi|23 : attcaattaatgagaggtttaaacaaaactatacagttccactgttttcatggaCA-C---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AAC-AAA--TTCATTC-----GATG--------C--------AC--------ATGTTTACAACT-----TTAT--T-TTCTCAACAA--TG-C-AAA-GGCATTTTTATTTATTATCATTATCTTTATTTTATACAAT--T--TAA-------C--TTTTCATTC-ACAC----T--AATCTC--TATGT--------TTGTATAG---------TAAA------A---ACCTTTATATGGTGAGG-AA--ATT--TTGCAAT-
gi|20 : gcactGATAAGTG---------AA---TT---TC-----CATG--------C--------AC--------A--------ACT-----TAAT--T-T-CCTCAGAA--TA-
gi|42 : aggtcatatgaaacaa-T-CTTAACAA--TA-C-AAA-GACAAT---ATTTTTT-------TTTTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------C--TTT-CATTC-ATGC----T--AATaaggtttattaaacaagatataacgttaatatagctgcaagtactcaatcacgaaaatgatcttcgatgatacttggctgataacgtcaaaaagatctgtcgagatgtaaacaaaacagcttgtataacaaagaatttactgcatgaaaaaagtcacaataagctgcatttagtcgtagtagtaggc
gi|45 : --------TAAA------A--TACC---A-ATGTT--AG-AC--ATTG-TTTCATA-TGAC
5 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|27 ): AATACGCTTTATTCGGCTCCATCGTTTGAACTCCCAGCTTTATTCTCCACCAAAGCGTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTTTTAAATTAATTGTAAAACTTTAGTATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTCAATATCATCAAC
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 1111111111 111 11111111 1111 111111111111111 1111111111111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 66666666666666666666666666666666 1111 2222222222222 1111 11111 11 1111 3333333333333333333 444444444444444444444444444444 44444444 33333333333 555555555555555555555555 2222222 11 33333333333 1111 44444444444444444 44444444444444444 222 44444444 11111 1 1111 22222222222 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000 1 33333 111111 111 11111 111 44444444444444444444 11 11 1 11 11 1111 555555555555555555555555555555555555555 1111 111 2222222222222 111111 111111 11111 333333333333333333333333333 11111 1111 222222222222222 222 1 22 11111 1111 11 1111111111111 11111111111111 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 111111111 1111111 1111111 11111111 333333333 111111 1
lowQualScore : 888 33 2 8 0 2 2 77777 11111 2 555 2 0 33 3 1 33 8888888888 3 3 3 3 3333333333 11 3 2 33 33 33 33 7 33 2 2 2 0 2 555 555 77777777 3 6666 3 0 2 6 3 3 0 3 44 3 3 2222 44 555555555555555 1 1 2 3 3 0 55555 3 3 3 3 3 3 55 55 7777777777777 4 44 4 4 6666666 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0000 5 5 5 00000000000000000000000000000000 4 5555 4 1 7777777777777 4 66 0 4 9999 66 4 4 4 9999 0 55 66 8888 2222 4 9999 4 555 999999 0 22222 33 77 5 7777 4444444444444444444 999999999999999999999999999999 1 6 3 00000000 1 7 3 66666666666 3 6 6 444444444444444444444444 6 1 4444444 1 888 1 11 0 77 88888888888 99 55 4444 44444444444444444 6 00000000000000000 0 000 0 5 5 5 11111111 44444 77 0 5 1 2222 3 11111111111 3 5 1 77 2222 1111111111111111111111111111111111111111111111 5 1 4 0 3 5 77777 1 666666 999 66 2 00000 5 3 5 5 77 000 5 0 88888888888888888888 33 33 0 0 11 8 11 00 8 8 3 3333 6 000000000000000000000000000000000000000 0000 4 777 4 4 99 4 66 0 4 555 33 0 5 5 0000000000000 111111 8888 1 111111 55 66 1 4 777 0 55 4 4 3 0 2 22222 66 777 5 555555555555555555555555555 777 1 00000 5 1 0 1 66 0000 66 444444444444444 0 0 5 2 6 44 3 7 222 0 11 6 22222 1111 22 66 55 888 5 66666 4 5 4 1 4 1111111111111 55 44 3 3 44 3 44 66666666666666 0 44 777777777 99999 4444444444444444444444444444444444444444444 55 3 3 55 3 7 2 777 66 0 777777777 2 66 66 66 4444444 4 8 4 4444444 66 88888888 1 222222222 222222 66 0 0 66 5 888
lowQualScore : ... .. . . . . . ..... ..... . ... . . .. . . .. .......... . . . . .......... .. . . .. .. .. .. . .. . . . . . ... ... ........ . .... . . . . . . . . .. . . .... .. ............... . . . . . . ..... . . . . . . .. .. ............. . .. . . ....... . ......................................................................... . .... . . . ................................ . .... . . ............. . .. . . .... .. . . . .... . .. .. .... .... . .... . ... ...... . ..... .. .. . .... ................... .............................. . . . ........ . . . ........... . . . ........................ . . ....... . ... . .. . .. ........... .. .. .... ................. . ................. . ... . . . . ........ ..... .. . . . .... . ........... . . . .. .... .............................................. . . . . . . ..... . ...... ... .. . ..... . . . . .. ... . . .................... .. .. . . .. . .. .. . . . .... . ....................................... .... . ... . . .. . .. . . ... .. . . . ............. ...... .... . ...... .. .. . . ... . .. . . . . . ..... .. ... . ........................... ... . ..... . . . . .. .... .. ............... . . . . . .. . . ... . .. . ..... .... .. .. .. ... . ..... . . . . . ............. .. .. . . .. . .. .............. . .. ......... ..... ........................................... .. . . .. . . . ... .. . ......... . .. .. .. ....... . . . ....... .. ........ . ......... ...... .. . . .. . ...
lowQualScore : 999 99 9 6 4 4 9 11111 99999 9 111 9 8 99 6 7 99 4444444444 1 5 1 1 5555555555 55 1 9 99 99 99 99 6 99 9 9 0 6 9 111 444 55555555 1 5555 5 8 1 2 1 1 5 1 22 1 1 0000 22 777777777777777 2 4 2 6 6 5 99999 3 3 3 3 3 3 55 55 5555555555555 0 77 0 4 7777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 1111 7 7 7 00000000000000000000000000000000 4 6666 4 1 1111111111111 4 33 1 6 4444 11 4 4 4 4444 8 66 11 8888 7777 4 4444 4 444 666666 4 33333 00 00 0 0000 7777777777777777777 333333333333333333333333333333 0 7 7 88888888 0 3 2 00000000000 2 7 7 222222222222222222222222 7 5 7777777 0 000 0 00 8 44 00000000000 22 88 2222 77777777777777777 6 00000000000000000 7 000 7 7 7 7 99999999 00000 99 4 7 4 1111 0 77777777777 0 7 7 99 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000 0 4 3 7 1 7 33333 4 444444 333 99 5 88888 0 2 7 7 99 000 7 8 22222222222222222222 00 88 0 8 00 0 44 66 0 0 8 2222 8 111111111111111111111111111111111111111 6666 4 888 4 4 88 4 11 8 4 999 99 1 0 0 7777777777777 555555 5555 0 555555 55 11 1 4 000 9 55 0 0 2 8 5 33333 11 111 3 222222222222222222222222222 999 0 00000 0 0 4 4 99 6666 00 555555555555555 7 6 7 1 7 77 2 5 222 6 22 0 22222 7777 33 99 22 888 0 99999 6 6 0 6 3 9999999999999 00 66 3 3 66 1 22 77777777777777 3 66 555555555 11111 2222222222222222222222222222222222222222222 55 6 6 00 6 3 0 888 33 8 888888888 6 11 11 11 4444444 4 9 4 9999999 99 11111111 0 333333333 888888 11 5 0 99 0 777
consensus : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---G-TACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC----------GGGG-----GGGGGGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC----TT--TCCTGCAAAAAGCAA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT--ATNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA---C----CCCCTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGGA--------TTCCACTCTGTA-TATTGA--T----TATTAAT-----TA-T--------TA----A-----TCG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCTA-GAATTAACCTATATTTC-ATA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-TGG-TATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGC--GGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATA-ACCTACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCC-----------CCCCCC-CATCAAAN--CA-----A-ANAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTCTTT-CCATCANANCCGCATCCGGTNNAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGTA-A-------G-------TATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTTTT---------TTTAT--TTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTG-TTTCA-TATGAC
Reference ( family-1000 ) : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---G-TACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGANATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC----------GNNG-----GGGGGGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCCC---TT--TCCTGCAAAAAGCAA-A-C-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT--ATNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCNTGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA---CA---CCCCTNC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGGA--------TTCCACTCTGTA-TATTGA--T----TATTAAT-----TA----------TA----A-----TCG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCTA-GAATTAACCTATATTTC-ATA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-TGG-TATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGC--GGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATA-ACCTACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACATGCCC-----------CCCCCC-CATTAAAA--CA-----A-ANAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-C-GGNTTTCNTC-CCNNCANNNCCGNNTCCGNNNNAAN--AATCCACGANTTCCGACGATGATAC-GNCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGTN-A-------G-------TATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTGGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTTTT---------TTTNT--TTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTG-TTTCA-NNTGAC
gi|1 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA--TCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGTA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTGTTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGTTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AACGACCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAAC-G-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCT-GGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GTTACA-----TGT----CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTGA-----------T---------C------------GTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---ATCT--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAATCAGTCC----CGTAC----------CTCG-----GGTAGGGGG-------T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTCCTCAGTT--TCCTGCAAAAAGCAACA-TAGCACCCTTAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGAC--GAAAATTTGTGGTTTATACAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCTGTGTCTT----TTA--ATT------CAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAGCC-ATGGTGGG-G-T-GCGTTTGC---------CCCCTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTC-GA--------TTCCACTCTGTA-TATTAA--T----TATTAAT-----------------TA----A-----TCG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCTA-GAATTAACCTATATTTCAATA-ATGTACACTGAAC------GTAA-ATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGT-GG-TGG-TATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGG---ACA-TTATTTAAAGAACT---ATGT-------------AAAG-AATTGC--TTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAAT-ACAA-AATATTAACACGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC-CATTAAAA--CACTTTCA-AGAACGATTTGTGAACT----TCCGACATTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAA-TACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-TATA---------T---TTTATTATGATT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNATTAATCGTA-A-------G-------TATTTGGTTGCTA-GGGGTCATGATTCG-TAGCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGATCGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA--TATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATAATAGAACCA--TTAAA-GTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACC--AG-AA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---ATTTTTTT---------TTTTT--TTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-CAATC-ATAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTG-TTTCA-ATTGAC
gi|10 : ACATTTCGGGCACCC-CCGA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAG-AACCGTACGT-----A--GTTATTCGTATC-AAAA---GAGATATG--CAATATT----TTTTTAG-AATATA---------T---ATTGTGATAACTCATGACA----ATGAGA------AATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CAT-------------------------------ATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-T-GG--------------------------GTTGGGAA--AATCCGTGGGTTCCGATTATGATAC-GGCTTTTAATCATTTTGAAA----TACTCATT-A-------AACTTTGACACCTGATGGCTA-GGGGACGTGATTTCTAAGCTCCTTGTCA-AAA----------TCATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCATT-ATT---GACTAGTTCAAACT-GATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGT-CCATATCAA--TGAAA-TGAC---TGAGATATTTCG-TTAA---------------TTA-CACT---------------------GTTT--TCAT--GGATGGGC-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--t
gi|11 : cccccccccacgaagcaacattaGTAAT---AT--GA-AACGA-TTTCCAAAG-AAAATG----AGTT---A-TG-CATAGG-A-ATTCATTTATCA--AGTTTTATTAAACAAG--AATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TCACGACAA-TG-----------CTCGCGGCTT---A--T--C------TGG-TGATGAAGTCAA----AAAGACTCACCGTGA-TT-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AC---CTAC--G---CAT--TTAC-----TGCATAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATT-C-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CA--TGCA---C--C----T-CTATCCTAGGAATA-CCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATAtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|11 : a-----------T---------T----------TTCTTATT-GCC----A-ATCATAAA---------AT-CT-CG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCA---TTCT--GA-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|12 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttaGGTCATTA-ATTTGA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACC-ACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TAAAT-GT-ATAATTAAC--AAAT--------------------GCTAT-GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TA--TGTA---CA-T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCATA-TTCAG-AA--G----AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGC
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGAA--GGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACGCAATTAACAGGCATTT--CATTCATCCGTGTCTGCATGTTA---TT------AAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGT-----------------ACATAG-CTATGGTGGG-GGT-GCGTTTGCATTTCATATCCCCTTT---ACA--AAACCAAACCAC-AATATT----AAAGTTGGA--------TTTCACTCTGTA-CATTGA--T----TATTAAT-----TAGTC-------TAAAATA-----TCG----CA-TCACC--TACACAACAT-TCTGGGTATGG------------------ACCTATA--------------CGCTGAAT------GTAC-G-TG--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG-------AG-TATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGC--GGGG---ACG-TTATTc
gi|14 : gGGTCAT---AT--GA-AACGATATTTTGGAG-AAATTG----GGTT---A-TG-GATGGG-A-ATTCATTAGT-A--AG-----------AAG--CATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TCACAAAAA-TGATCTTCGATGACCC----CAG---A--T--T--AC-ATGC-TGATAACGTCAA----AAAGACCC-------------------AACTG-TT--T-G--AC---T-----------------C-----TGCGTAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AAC-T-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CA--TGTG---C--G----TATT-TCCTAGGGATT-CCGAA-TTTAG-AAAGA----AA
gi|15 : TTTTCTAT-GAAC-GTTTAGATGT--TTATTCCGATGGGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCAC---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAAT-AA---TCAGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GTTACAGTTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAACAAAAGACAAT---A-TTTTTT---------TTTA---TTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTACAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTTATTGTTAGTAAATATTG-TTTcatacgggtacaaaatcta
gi|16 : AGGTCATGAAAT--AATAAAAA-A-----AAA-AAATGC----A-TT---A-TA-TATGGGGA-ACTCCTTTATCA--AAATTTATTTAACAAG--AATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TCACAATAA-TGATCTTCGATGA-TCGCGACTT---ATCT--C--CCTTGGC-TGATGACGTCAA----AAAGACCCCTCGTGA-TG-TAACC-AAAACAG-TT--T-GT-A--------------TAT--TTCC-----TGCATAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGCaat
gi|17 : AAGCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAATTA-CACTAGTTTCTATTG-------------------------TGGGT-G-TTTGTGACGACGCA--AG-CA--CTCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----CATG--------C--------ACAAGTTTAAA--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACGAT-GC-AAAGACAAT---A-TT-----------------T--TTTATGGAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ACAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACCAATGTTAG-AA--TTGG-TTTCc
gi|18 : A-A-T-GCACAAATAAAGTTGGATTT-GCTCTGAATATTC-ACT-ATTAATTAG------------------------------------------TTATAAA--TTCTCTTTCAATCtta
gi|18 : catacagTCAAGTCAGACCCGT-----------------ACAAAGGC-AT--TGAA-G-T-GCATTGGCAA--CC---CCCCTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAGA--------GTTTACTTTGTT-CATTGA--T----TATTAATTTTCCTA----------AA----A-----TTGTGTACA-T--CC--TTC-TAAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAtcaaaacgcaattttttcaagtcagacccgtacaaaggcattgaagtgcattggcaacccccctcccgaaaagcaaaataaattgcactatcaaagtcagagtttactttgttcattgattattaattttcctaaaattgtgtacatccttctaaaacatctgggtatgggcctgcaa
gi|19 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TCTCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AACGATCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TA--TGTA---C--C----TGTT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTa
gi|2 : AAGTCAT---A---GA-AACAA-ATCC----G-AAAATT----AGTT---CGTGGCATGCA-A-ATTCATTA-TCA--AG--TTATTGAAGCAG--AATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTCTCGAAAAATGATTT--GATGATCAGCG-CTG---A--T--C--TCTT-GC-TGATGAAGTCAG----AA--ACCGACCACAA-TGATTAAC-AAA-CA---T--T-GTTAT---TAAC--AAATTAT--TCACGGCTGTGCATAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATT-TTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TA--TGT----C--T----T-TA-TCCTGG--ATC---AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACA---G-TAGG-----TGTAATCT-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------TTATTATTTTC----------TTGTTATCTGAC----A-AT-A---A---------AT-C--AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCA---ATC---GC-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCG-TATAATAAC-AATCAGTGCATGTCGTAC----------GGGG-----GGGGGGGGGGGGGGGTT----AAGTGTAT----------GTA-GAATC-------T--TCCTGCAAAAAGCA-----------CTTTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTAG-A----A---------------T-CTATCAGCATATTTG-ATGTATGA---TTCTCTT-GAATCCGGCCCGAAAATT-GCTGTT-ATGCAAAA-GCA-----------TTT--CATTCA-AAATGTCTG----TTACGGGT------AATGTGTATCATTAAGTCAGGCC-GT-----------------A-ACAG-C-ATGGTGGA-G-T-GCGTTCGCA---C-----CCCTGG---AAA--AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTCGGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAGTGAAAT----TATTAAT-----TAATTGTCTAAATA----A-----T-G----CA-C--C----TCACAAAAA-TTTGGGTGTGGGGCT-CATCTAAGAATTAACTTA-ATTTCCATA-ATA--CGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT------------GAGTT-GG-TGGGTGTGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGC--GGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AA-GT-------------AAA------ACGGCTGCAGATAGATGAAAACGCACCATTA-ACCTCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT--ATACG-------------------------AAAC--CG-----A---AACGATTTGTG-ACTAAAGTCAGACATTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AA-TACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAA-CATA---------CTTGTTTA-TACGATT------A----AT-AGA------AAT--A---CAT-CCACG-------------------TGCA--AGTTTCGATGAGTATG-CA----AATA-GGCTTTCAATCGTCGGAATTCATC-GGGTTGTCTT-CTATCACACTTGCATTCAGTTGCAA--AATCTACGAGTTC-------GAGAC-GG-----AA-C--CTTTAAA----TAATCGTA-A-------G-------TATTT-GTAGCTA--GGGTCATGATTCGTAAGCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGAT-A--CTCTTTT-AT-AATCGTCAT
gi|2 : GAAAAAAGGCAATTTTGAGTCA--AAACAAAA-----TAT--TATAACCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATTAAA----ACAGTGTAAATTATCACTATTT-CTAAT---C-GGT---GTTTGTTCAT--CGATTGGT-CGTTTGGTACGTCACC--AG-GA--CC------A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATT-AA------ATTCAAAAAAATA--------C--------A-------------------T-----TTTAT--TGT-TTT--AA-AAT-ACAAAAGAC-AT---A-----TT---------TTTAT--TTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-TATTC-ATAC-----------------------------TATAAAG------------------------CCAATGTTAGAAA--ATTGAATTCA-ATTGACaaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|20 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaaAGGTCAT---AT--GA-AACAATATTCTGAGG-AAATTA----AGTT---G-TG-CATGGA-A-ATTCACT------------TAT----CAAG--G-----TTT----ATT-AA---------------------------ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TCACGAAAA-TGATCTTCGATGAT------------A---------CTTGGC-TGATAACGTCAA----AAAGATCTGTCGAGA-TG-TAAAC-AAAACAG-CT--T-GT-A----TAAC--AAAGAAT--TTAC-----TGCA------T-GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATT-T-AGTCGTA-GTA-GTAGGCcttga
gi|21 : --CAATGGGA-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCACTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AAC-AAATATTCATTC-----CATT--------C--------AC--------AAGTTTAAAGG-----TTTAT--T-T-TTT--AAAAAT-GC-ATCGGCA-------TTTTTT---------TTAAT--TTTAAGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTA-GTAT----A--AATCTTT--ACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACCAACGCTAG-AA--ATGG-TTTCA-TATGAC
gi|22 : TTAAAAATCA-----A-ACAA-GACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGC-GAGG---AAAAACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTT
gi|22 : CTGTA---GATTTGCACAAG-TTCA-TGAATTCGCCTTTATAATACAGCTTC--ATAGTCAGAACTCG-CTGGCTTTCTCT-CCATCAacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|23 : ttaaaaatcaaacaagacttgtgaactttaggcaggtcgggcgcgcgaggaaaaactaccgtattatgaaataactgtgcgtctgtggttaaaggaaaaggattttcttatatttacttcgG-CA--CTCAC---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AAC-AAA--TTCATTC-----GATG--------C--------AC--------ATGTTTACAAC-----TTTAT--T-TTCTC--AACAAT-GC-AAAGGCATTTTTA-TTTATTATCATTATCTTTAT--TTTATACAAT--T--TAA-------CT-TTTCATTC-ACAC----T--AATCTCT--ATGT--------TTGTATAGT--------AAAA------A--ttcattcaat
gi|24 : AATCA--CGGTTTATCAAACAAG--AATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT-----------------A-TGATCTTCGTTGATT-GCAGCTT---A--TTTC--CCTTTCC-TGATGACGTTAA----CAAGACCCACCATGA-CG-TCATC-AAATCAG-CT--T-GT-A----TAACTTTAAGTAT--TTAC-----cctttatatggtgaggaaattttgcaat
gi|25 : TT--CATTCATCGGTGTCTG----TT-----------------GTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAG-G-GGGGGGGG-G-TTGCATTCGCA---CT---TCTCTG------A--AAAC---------A-TATT----CAAGTCGGA--------T---GTTCTGTA-T-TTGA--TAATGCATTAAT-----TGCGC-------TA----AAAATATTG----CA-C--CCCCTCCACAAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCTA-Ggtc
gi|26 : T---T-AT---ATAA-----T---------AGC-AGCATA-------------ACA-----TGA----C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCC-----------T---------CATTATAGGTTCTGTTATC-GAC----TTATCA---GG--------ATGCC-AGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTGAGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTAg
gi|27 : aaggcgttccAATACGCTT----TATTCGGCTCC--ATCGTTTGAACTCC-C-AGCTTTATTCTCCACCAAAGC-GTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTT-------TTAAAT----TAATTGTA-AAACTTTAG-------TATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTC
gi|28 : ---TTTATTACGCCT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG----------CG----AGTACGCCTNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN---------ATAC-AGCATTTAATC--CTTAAAA----TAATCGTA-A-------G-------CATTaatatcatcaac
gi|3 : AGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCC--AGGTTTACTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TCACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAACGACC-ACAGTGAATG-TAAACTAAAAC-G-TT--T-GC-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATT-T-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---CCTT----T-TT-TCCTGGGGATT-CCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGTCC-----------T---------CATTATTTC--TTGTTATC-GACTC--A-ATCA---G---------AT-CCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCC---ATGC--GA-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGCAC----------GGGG-----GGGGGGGGG-------T----A-TTGGGTATTGGGTATTGTA-GAATTCC----TT--TCCTGCAAAAAGCAA-AAT-GCACCTTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTC-ATGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGAC--GAAAATTTGCTATTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CAATCATCAATGTCTG----TTA--ATT--------T---TATCATCAAGTCAGGTCCGT-----------------ACACAGCC-CTGGTGGGAG-C-ACGTTCGCA---C----CCCCTGC---AAA--AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGGA--------TTCCACTCTCTA-TTTTGA--T----TATCAAT-----TA-----------A----T-----TTG---------------TC-TAAAATATC---GCAC---CCCTCCTATA-GAAATAACTTATATTCC-----ATATACGCTGAAC------GTAC-A-TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGG-TGG-TATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGC--GGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAG--CTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATA-ACCTACTAGTACTATT-ACAA-AATAT----ATGCCC-----------ACCCTC-AATC-AAA--CA-----CTTGAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TCCATTACGATT------A----Agtt
gi|30 : GGTCAT---AT--GA-ACTAT-ATTC-AAAG-AAGTGA----AGTT---A-TG-AATG-G-ATACTCATTA--TA--CGGCTTATTAAACCAG--AATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---CAC-AAAA-TGAATTTC--TGA-TCGCAGTT
gi|31 : atTTCATCTA-GAATTAACCTATATTCA-ATATATATACGCTGAAC------GTAC-G-TA--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GGATGG-TATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAA--GGGGCAAATG-TAATTGAATGA--T--AA----------------AAAT-AAT
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-G-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--a
gi|33 : AGGGTGCATTC-CA-TATTTTC-ATTG--CTGCT---GTTT--TCAT--CGAT-GGT-C-TT--TGACGT---A--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CAAG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--TTC-CATTATTTTC-ATTG--C-GCT---GTTT--TCAT--CGATGGAT-C-TTT-TGACGCCACA--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CATG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|35 : tgCATTT-----------T---------C----------TTGTCATC-AAT----A-ATAA---A---------AT-CT-AGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCA---TTTT--GA-AA-----TAAAAAA-AA
gi|36 : ctcacttcctcaaaagtatataacattA--TTCAA-TTAA---TGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA---TA-CA---------GTTC--C-ACT---GTTT--TCAT--GGATGGGT-C-CTTGTGACGTCACA--AA-CA--CCCgaaa
gi|37 : AAGGTAAT---AT--GA-AACGATATTCTGAAG-AAGCCG----AGTTAATT-TG----GGG-A-ATTCATTAATCA--AGTTGTGCTACACAAA--AGT
gi|39 : tAATTCGGATTTTATTCTGGATTTTG-A-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT--ATTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|4 : GGTCAT---AT--GA-AACAA-ATTCCGAAG-AAATTG----AGTC---C-TG-CATGCC-A-GTTCATTAATCA--AGGCTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TTTCCAAAA-TGATTTTCGA-GGGTCGCGGCTG---ATCT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACT-----------------ACAA-TT--TAGC-TT---TGAA--AAAT-------GC-------CACAG---T-G-----T-GCTACATT-------TA---ATTGT-AGTAGTA-G-------GTCGCAGAAGGTTTTGACTATA--TGTAC--C--T----C-TT-TCCTGGGGATC-CAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---------------A---G-TACA-----TGT----C-TC----TA-CAC-TCATACT---CATTT-----------T---------C----------TTGCTATT-GAC----A-ATCA---A---------AT-CA-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-----TT--------GT-----A-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATTCAGAA--------------ATAATAATTAATCAGTCT----TATATTTTCTTTAGAGAAGTAGACAGGCAAGGG-------TTATAA-TTGAA-----------CGA-GAATTCC------------GC-------------------CTTAAAGTCAGATTTGACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACAAA--T--ATTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAAA--AAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCA-----------ATTAACACTCAT-----TCTA----TTC--ATCCGTGTAAAT-TGTTACATCAAGTCAGGCC----------------------------------------T-GCGTTCGCA---C----CCCCAGC---AAA--AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG-------------------TCTGTATTATTGA--T----TATTAAT-----TAATGTGTC---TAAAATA-----TCG----CACC--CC--TCCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCTA-GAATTAACCTATATTTC-----ATATACTCTTAACTTTTATGTAT-GTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGT-TG-GAG-TAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGC--GTGG---ACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTAC--CTGC-TATATAATT-AACGCA--AATA-ACT------TACTATT-AAAA-AA-----ACATACCC-----------CCCCCCGCCCCCAAT--CA-----A-AACACGATTTGGGAACT----TCGGACATTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTA--AG-TTCG-CGAGTACGCCT----A
gi|40 : TATACGCTGAAT------GTAC-G-TA--CGTGTTTACACTG----GGAGG------GG-TATG----T---------TCAT-GAT-AGC--GGGG---ACG-TTATTT
gi|41 : GT---GTGCTA-C-ATC-T-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|42 : aacgacaactctgtgcaagagaatg-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---A-TTTTTT---------TTTTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATGC----T--AAT
gi|43 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATGCCGAAG-AAATTA----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATT
gi|44 : ttaCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTA--AG-TTCG-T
gi|45 : --------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AC--ATTG-TTTCA-TATGAC
gi|46 : gTA--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGG-TGG-TATGAAAATActttaatac
gi|5 : ATTAAATGCA--AATA-ACCTACTA------TT-AAAA-AACAT--ATA--CCC-----------CCCGCC-CA---AAT--CA-----A-ACAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-AACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATACATTTCATAT---TTTATTACGATT------ATTAAATCATA------AAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA-----CTTG-TTAGTACGCCG----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-G-GGTTTTCTTT-CTATCACACTCTATTCAGTACAAAT--AATTCACAATTTCCGACAATGATAT-GCCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGTT-A-------G-------TATTTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGATCATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-TTATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT-ATATAACCG--ATAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-AA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----TACG--------CACAAGTTTAC--------A--------GC-----TATAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACACT---A---CTTT---------TTTAT--ATTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCCAATGTTAA-GA--TTTG-TTTCA-TATGAC
gi|6 : AC---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAG-AAACTGCATGAGTT---C-CG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAATAAG--AATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT----------TT-CAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGAATTTCGATGAA-CGCGGCTG---AACT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACTGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TG--T-GT-AT---TAAC--AAATT---------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTA---C--TACCCT-TT-TCCTGGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CT---G-TACA-----TTT----C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGTCCTCATTTTTTTGT---------C----------TTGTTATC-AAC----A-ATAA---G---------AT-CC-AGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---TTCA--CA-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcttta
gi|6 : ----------GGGG-----GGGGGGGGG-------TGTT-A-TTGTA-----------GAA-GAATTTC----TT--TCTTGCAAA--GCAA-AAT-GCTCCCTTAAATTCGGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|7 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagggAACGATTTGTGAACC----TCAGACATTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAA-AACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTA---TTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACAATT------A----ATCATA------AAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCATCGGAATTCA-C-AGGTTTTATC-TCTATAACACTGCATTCAGTACAAA--AATCCACGAGTTCTGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGTT-G-------G-------TATGTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTACCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCA-TTATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTG-CATCACA--AG-CA--TCAAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------AAG------GT-----TTT
gi|8 : CGATT------A----CTCATATTATTAAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTA--AG-TTTG-TGA-------------ATACGGCTTT--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA--ATTCTGTGAGTTCCAATGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCATATA-------G-------CATTTGATTGCTA-GGTGTTGTGATTCTTTAGCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---TCATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCATTAATT-CTGGATAGTTCGAACT-AATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCAT-GTATATCCA--TTAAA-ACAA---TGAGAGATTTCT-TTTGTTAG---AGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-ATT---GTTT--TCAT--TAATGGGT-C-TTTGCGACATCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAA---TTTGATC-----CATGAACAAGTTT--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAGGACAAT---A-TTTTTT---------TCTAT--ATTATGCCAT--T--TAA-------CT-TT-CATTCAATACTAATT--AATCTTT--ATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACCAATGTTAC-AA--ATCG-TTTCAGTATGACta
gi|9 : AAGGTCAT---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAGAAAATTT----AGTT---TATG-TATGCA-A-ATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AA-TTT-T-GT----------TCTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATCAAA-GTAGCTCCGA-TCTCG-AAA-TGATTTTC--TTATT-GCGGCTGCCTC--T--C--CCTTTGCATGATGACGTCAA----AACG-CCCACCGTGATTG-CAAAT---AACAGTTT--T-GT-GA---TAAC--Actttaag
gi|9 : acttccgtcccttaACAGTTTTGTGATAAC-ATT-C-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTAACCT--T----T-TT-TCCTGGGGATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATATAAG-TGTGGACTATGT----C-TC--T--A-CAC-TCGTATT-CGCGTCC-----------T---------A----------TTATTATC-TATGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CC-AGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCA---TTCC--GA-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GTAAC------------CCGTTCAGA-------------CAGT-C----CGTAC----------GGAA-----GGGGGGGGT-------A----A-TTGAA-----------AAAGGAATTTCA---TTAATCATGC-AAAAGCAA-ttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 1111111111 111 11111111 1111 111111111111111 1111111111111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 66666666666666666666666666666666 1111 2222222222222 1111 11111 11 1111 22222222 111111 444444444444444444444444444444 222222222 1 222222222222 555555555555555555555555 111111111 11 33333333333 1111 44444444444444444 44444444444444444 222 2222222222 1111 1 1111 222222222 1111 0000000000000000000000000000000000000000000000000 1 33333333 111111 111 1111111 111 44444444444444444444 11 11 1 11 111111111 1111 11 5555555555555555555555555555555555 111 2222222222222 111111 111111 111111 111 222222222222 11 11111 1111 1111111111111111111 222 1 22 11111 1111 11 1111111111111 11111111111111 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 11111111111 111111111 1111111 1111111 11111111 333333333 111111 1
lowQualScore : 888 33 2 8 0 2 2 77777 11111 2 555 2 0 33 3 1 33 8888888888 3 3 3 3 3333333333 11 3 2 33 33 33 33 7 33 2 2 2 0 2 555 555 77777777 3 6666 3 0 2 6 3 3 0 3 44 3 3 2222 44 555555555555555 1 1 2 3 3 0 55555 3 3 3 3 3 3 55 55 7777777777777 4 4 44 4 4 6666666 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0000 5 5 5 00000000000000000000000000000000 4 5555 4 1 7777777777777 4 66 0 4 9999 66 4 4 4 9999 0 55 66 8888 2222 4 9999 4 555 999999 0 22222 00 77 5 7777 44444444 999999 6 999999999999999999999999999999 1 6 3 888888888 1 5 111111111111 3 6 6 444444444444444444444444 6 1 999999999 1 888 1 11 0 77 88888888888 99 55 4444 44444444444444444 6 00000000000000000 0 000 0 5 5 5 9999999999 5 3333 77 0 5 1 2222 111111111 33 3 5 1 77 2222 8888888888888888888888888888888888888888888888888 1 1 4 0 2 5 88888888 666666 999 66 2 5555555 3 5 5 777 5 0 88888888888888888888 33 33 0 0 11 8 777777777 8 3333 00 6 0000000000000000000000000000000000 9999 4 777 4 4 99 4 66 0 4 555 33 0 5 5 0000000000000 111111 8888 1 111111 55 66 1 4 777 0 55 4 4 3 0 666666 66 111 1 7777 1 222222222222 22 11 0 00000 5 0 1 66 0000 8888888888888888888 0 0 5 6 6 44 3 7 222 0 11 6 22222 1111 22 66 55 888 5 44 0 7 5 4 1 4 1111111111111 55 44 3 3 44 3 44 66666666666666 0 44 777777777 99999 4444444444444444444444444444444444444444444 55 3 3 55 3 7 2 00000000000 777777777 66 66 4444444 4 8 4 4444444 66 88888888 1 222222222 222222 66 0 0 66 5
lowQualScore : ... .. . . . . . ..... ..... . ... . . .. . . .. .......... . . . . .......... .. . . .. .. .. .. . .. . . . . . ... ... ........ . .... . . . . . . . . .. . . .... .. ............... . . . . . . ..... . . . . . . .. .. ............. . . .. . . ....... . ......................................................................... . .... . . . ................................ . .... . . ............. . .. . . .... .. . . . .... . .. .. .... .... . .... . ... ...... . ..... .. .. . .... ........ ...... . .............................. . . . ......... . . ............ . . . ........................ . . ......... . ... . .. . .. ........... .. .. .... ................. . ................. . ... . . . . .......... . .... .. . . . .... ......... .. . . . .. .... ................................................. . . . . . . ........ ...... ... .. . ....... . . . ... . . .................... .. .. . . .. . ......... . .... .. . .................................. .... . ... . . .. . .. . . ... .. . . . ............. ...... .... . ...... .. .. . . ... . .. . . . . ...... .. ... . .... . ............ .. .. . ..... . . . .. .... ................... . . . . . .. . . ... . .. . ..... .... .. .. .. ... . .. . . . . . . ............. .. .. . . .. . .. .............. . .. ......... ..... ........................................... .. . . .. . . . ........... ......... .. .. ....... . . . ....... .. ........ . ......... ...... .. . . .. .
lowQualScore : 999 99 9 6 4 4 9 11111 99999 9 111 9 8 99 6 7 99 4444444444 1 5 1 1 5555555555 55 1 9 99 99 99 99 6 99 9 9 0 6 9 111 444 55555555 1 5555 5 8 1 2 1 1 5 1 22 1 1 0000 22 777777777777777 2 4 2 6 6 5 99999 3 3 3 3 3 3 55 55 5555555555555 0 1 77 0 4 7777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 1111 7 7 7 00000000000000000000000000000000 4 6666 4 1 1111111111111 4 33 1 6 4444 11 4 4 4 4444 8 66 11 8888 7777 4 4444 4 444 666666 4 33333 77 00 0 0000 22222222 222222 7 333333333333333333333333333333 0 7 7 222222222 0 5 000000000000 2 7 7 222222222222222222222222 7 5 777777777 0 000 0 00 8 88 00000000000 22 88 2222 77777777777777777 6 00000000000000000 7 000 7 7 7 7 4444444444 7 0000 99 4 7 4 1111 444444444 11 0 7 7 99 1111 1111111111111111111111111111111111111111111111111 4 4 3 7 0 7 88888888 444444 333 99 5 8888888 2 7 7 999 7 8 22222222222222222222 00 88 0 8 00 0 444444444 0 2222 00 7 7777777777777777777777777777777777 4444 4 888 4 4 88 4 11 8 4 999 99 1 0 0 7777777777777 555555 5555 0 555555 55 11 1 4 000 9 55 0 0 2 8 666666 11 666 0 2222 8 999999999999 00 99 8 00000 0 4 4 99 6666 9999999999999999999 7 6 7 6 7 77 2 5 222 6 22 0 22222 7777 33 99 22 888 0 99 1 2 6 0 6 3 9999999999999 00 66 3 3 66 1 22 77777777777777 3 66 555555555 11111 2222222222222222222222222222222222222222222 55 6 6 00 6 3 0 22222222222 888888888 11 11 4444444 4 9 4 9999999 99 11111111 0 333333333 888888 11 5 0 99 7
consensus : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-AT-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--AT----TATTAATT-A------C--T-----A----A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCC-CC-----------CCCA-CAAANCA-----AA---NAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
Reference ( family-1000 ) : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-AT-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--AT----TATTAATT-A------T--T-----A----A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCC-CC-----------CCCATCAAANCA-----AA---NAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTCTT-TCCATCANANCCGCATCCGGTNNAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|1 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA--TCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGTA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTGTTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGTTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AACGACCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAAC-G-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGG-ATC-CCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GTTACA-----TGT----CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTGA-----------T---------C------------GTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---ATCT--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAATCAGTCC----CGTAC--------CTCGGG------TA-GGGGG-------T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTCC-TCAGTT--TCCTGCAAAAAGC-AACATAGCACCCTTAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-ACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGAC--GAAAATTTGTGGTTTATACAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCTGTGTCTT----TTA--ATT------CAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-CCATGGTGGG-G-T-GCGTTTGC-----------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTCG---------ATTCCACTCTGTA-TATTA--AT----TATTAATT-A--------------------A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CAATA-ATGTACACTGAAC------GTAA-ATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGG-ACA-TTATTTAAAGAACT--A-TGT-------------AAAG-AATTGC--TTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAAT-ACAA-AATATTAACACGCCCCC-CCCCCCCCCCCCCCCCATTAAAACACTTTCAA---GAACGATTTGTGAACT----TCCGACATTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAA-TACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-TATA---------T---TTTATTATGATT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNATTAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTTGCTA-GGGGTCATGATTCGT-AGCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGATCGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA--TATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATAATAGAACCA--TTAAA-GTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACC--AG-AA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---ATTTTT--TT---------TTTTTTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-CAATC-ATAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-ATTGAC
gi|10 : CCCC-CC-----------CCCA-CGAAGCA-----A-------C-ATT---------------AACATTTCGGGCACCC-CCGA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAG-AACCGTACGT-----A--GTTATTCGTATC-AAAA---GAGATATG--CAATATT----TTTTTAG-AATATA---------T---ATTGTGATAACTCATGACA----ATGAGA------AATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CAT-------------------------------ATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-T-GGGT--------------------------TGGGAA--AATCCGTGGGTTCCGATTATGATAC-GGCTTTTAATCATTTTGAAA----TACTCATTAA-A-------CTTTGACACCTGATGGCTA-GGGGACGTGATTTCTAAGCTCCTTGTCA-AAA----------TCATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCATT-ATT---GACTAGTTCAAACT-GATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGT-CCATATCAA--TGAAA-TGAC---TGAGATATTTCG-TTAA---------------TTA-CACT---------------------GTTT--TCAT--GGATGGGC-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--t
gi|11 : GTAAT---AT--GA-AACGA-TTTCCAAAG-AAAATG----AGTT---A-TG-CATAGG-A-ATTCATTTATCA--AGTTTTATTAAACAAG--AATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TCACGACAA-TG-----------CTCGCGGCTT---A--T--C------TGG-TGATGAAGTCAA----AAAGACTCACCGTGA-TT-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AC---CTAC--G---CAT--TTAC-----TGCATAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATT-C-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CA--TGCA---C--C----T-CTATCCTAGGAATA-CCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATAtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|11 : a-----------T---------T----------TTCTTATT-GCC----A-ATCATAAA---------AT-CT-CG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCA---TTCT--GA-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|12 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttaGGTCATTA-ATTTGA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACC-ACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TAAAT-GT-ATAATTAAC--AAAT--------------------GCTAT-GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TA--TGTA---CA-T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCATA-TTCAG-AA--G----AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGC
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGAA--GGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACGCAATTAACAGGCATTT--CATTCATCCGTGTCTGCATGTTA---TT------AAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGT-----------------ACATAG-CTATGGTGGG-GGT-GCGTTTGCA--TTTCATATCCC-CTTT---ACA--AAACCAAACCAC-AATATT----AAAGTTGG--------ATTTCACTCTGTA-CATTG--AT----TATTAATT-AGT----C--T-----AAAATA-----T--CG----CA-TCACC--TACACAACAT-TCTGGGTATGG------------------ACCTATA---------------CGCTGAAT------GTAC-G-TG--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG--------AGTATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTc
gi|14 : gGGTCAT---AT--GA-AACGATATTTTGGAG-AAATTG----GGTT---A-TG-GATGGG-A-ATTCATTAGT-A--AG-----------AAG--CATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TCACAAAAA-TGATCTTCGATGACCC----CAG---A--T--T--AC-ATGC-TGATAACGTCAA----AAAGACCC-------------------AACTG-TT--T-G--AC---T-----------------C-----TGCGTAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AAC-T-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CA--TGTG---C--G----TATT-TCCTAGGGATT-CCGAA-TTTAG-AAAGA----AA
gi|15 : TTTTCTAT-GAAC-GTTTAGATGT--TTATTCCGATGGGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCAC---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAAT-AA---TCAGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GTTACAGTTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAACAAAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTA-TTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTACAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTTATTGTTAGTAAATATTGTTTAA-catacgggtacaaaatcta
gi|16 : AGGTCATGAAAT--AATAAAAA-A-----AAA-AAATGC----A-TT---A-TA-TATGGGGA-ACTCCTTTATCA--AAATTTATTTAACAAG--AATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TCACAATAA-TGATCTTCGATGA-TCGCGACTT---ATCT--C--CCTTGGC-TGATGACGTCAA----AAAGACCCCTCGTGA-TG-TAACC-AAAACAG-TT--T-GT-A--------------TAT--TTCC-----TGCATAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGC
gi|17 : AAGCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAATTA-CACTAGTTTCTATTG-------------------------TGGGT-G-TTTGTGACGACGCA--AG-CA--CTCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----CATG--------C--------ACAAGTTTAAA--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACGAT-GC-AAAGACAAT---A-TT-------------------TTTTATGGAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ACAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACCAATGTTAG-AA--TTGGTTTCT-TAc
gi|18 : A-AT-GCACAAATAAAGTTGGATTT-GCTCTGAATATTC-ACT-ATTAATTAG-------------------------------------------TTATAAA--TTCTCTTTCAATC
gi|18 : catacagTCAAGTCAGACCCGT-----------------ACAAAGGC-AT--TGAA-G-T-GCATTGGCAACC-------CCC-CTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAG--------AGTTTACTTTGTT-CATTG--AT----TATTAATT--------T--TCCTAAA----A-----T--TGTGTACA-T--CC--TTC-TAAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAtcaaaacgcaattttttcaagtcagacccgtacaaaggcattgaagtgcattggcaacccccctcccgaaaagcaaaataaattgcactatcaaagtcagagtttactttgttcattgattattaattttcctaaaattgtgtacatccttctaaaacatctgggtatgggcctgcaa
gi|19 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TCTCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AACGATCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TA--TGTA---C--C----TGTT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTa
gi|2 : AAGTCAT---A---GA-AACAA-ATCC----G-AAAATT----AGTT---CGTGGCATGCA-A-ATTCATTA-TCA--AG--TTATTGAAGCAG--AATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTCTCGAAAAATGATTT--GATGATCAGCG-CTG---A--T--C--TCTT-GC-TGATGAAGTCAG----AA--ACCGACCACAA-TGATTAAC-AAA-CA---T--T-GTTAT---TAAC--AAATTAT--TCACGGCTGTGCATAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATT-TTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TA--TGT----C--T----T-TA-TCCTGG--ATC---AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACA---GT-AGG-----TGTAATCT-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------TTATTATTTTC----------TTGTTATCTGAC----A-AT-A---A---------AT-C--AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCA---ATC---GC-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCG-TATAATAAC-AATCAGTGCATGTCGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGGGGGGGGTT----AAGTGTAT----------GTA-GAATC--------T--TCCTGCAAAAAGC-A----------CTTTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTAG-A----A---------------T-CTATCAGCATATTTGA--TGTATGA---TTCTCTT-GAATCCGGCCCGAAAATT-GCTGTT-ATGCAAAA-GCA-----------TTT--CATTCA-AAATGTCTG----TTACGGGT------AATGTGTATCATTAAGTCAGGCC-GT-----------------A-ACAG-C-ATGGTGGA-G-T-GCGTTCGCA----------CCC-CTGG---AAA--AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTCGGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAGTGAAAT----TATTAATTAA------T--TGTCTAA----A-----TAATG----CA-C--C----TCACAAAAA-TTTGGGTGTGGGGC-TCATCTAAGAATTAACTTA-ATTTCCA-TA---ATACGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT------------GAGTT-GG-TGGGTGTGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AA-GT-------------AAA------ACGGCTGCAGATAGATGAAAACGCACCATTAACC-TCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT--ATACG-------------------------AAACCG-----A-----AACGATTTGTG-ACTAAAGTCAGACATTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AA-TACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAA-CATA---------CTTGTTTA-TACGATT------A----AT-AGA------AAT--A---CAT-CCACG-------------------TGCA--AGTTTCGATGAGTATGCA-----AATA-GGCTTTCAATCGTCGGAATTCATC-GGGTTGTCT-TCTATCACACTTGCATTCAGTTGCAA--AATCTACGAGTTC-------GAGAC-GG-----AA-C--CTTTAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTT-GTAGCTA--GGGTCATGATTCGTAAGCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGAT-A--CTCTTTT-AT-AATCGTCAT
gi|2 : GAAAAAAGGCAATTTTGAGTCA--AAACAAAA-----TAT--TATAACCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATTAAA----ACAGTGTAAATTATCACTATTT-CTAAT---C-GGT---GTTTGTTCAT--CGATTGGT-CGTTTGGTACGTCACC--AG-GA--CC------A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATT-AA------ATTCAAAAAAATA--------C--------A-------------------T-----TTTAT--TGT-TTT--AA-AAT-ACAAAAGAC-AT---A-------TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-TATTC-ATAC-----------------------------TATAAAG------------------------CCAATGTTAGAAA--ATTGaaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|20 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaaAGGTCAT---AT--GA-AACAATATTCTGAGG-AAATTA----AGTT---G-TG-CATGGA-A-ATTCACT------------TAT----CAAG--G-----TTT----ATT-AA---------------------------ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TCACGAAAA-TGATCTTCGATGAT------------A---------CTTGGC-TGATAACGTCAA----AAAGATCTGTCGAGA-TG-TAAAC-AAAACAG-CT--T-GT-A----TAAC--AAAGAAT--TTAC-----TGCA------T-GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATT-T-AGTCGTA-GTA-GTAGGCaattcaattgaccttga
gi|21 : --CAATGGGA-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCACTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AAC-AAATATTCATTC-----CATT--------C--------AC--------AAGTTTAAAGG-----TTTAT--T-T-TTT--AAAAAT-GC-ATCGGCA-------TTTT--TT---------TTAATTTTAAGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTA-GTAT----A--AATCTTT--ACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACCAACGCTAG-AA--ATGGTTTCA-TATGAC
gi|22 : AAATCA-----AA---CAA-GACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGC-GAGG---AAAAACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTT
gi|22 : ttaaCTGTA---GATTTGCACAAG-TTCA-TGAATTCGCCTTTATAATACAGCTTC--ATAGTCAGAACTCG-CTGGCTTTCTC-TCCATCAacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|23 : ttaaaaatcaaacaagacttgtgaactttaggcaggtcgggcgcgcgaggaaaaactaccgtattatgaaataactgtgcgtctgtggttaaaggaaaaggattttcttatatttacttcgG-CA--CTCAC---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AAC-AAA--TTCATTC-----GATG--------C--------AC--------ATGTTTACAAC-----TTTAT--T-TTCTC--AACAAT-GC-AAAGGCATTTTTA-TTTA--TTATCATTATCTTTATTTTATACAAT--T--TAA-------CT-TTTCATTC-ACAC----T--AATCTCT--ATGT--------TTGTATAGT--------AAAA------A--ttcattcaat
gi|24 : AATCA--CGGTTTATCAAACAAG--AATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT-----------------A-TGATCTTCGTTGATT-GCAGCTT---A--TTTC--CCTTTCC-TGATGACGTTAA----CAAGACCCACCATGA-CG-TCATC-AAATCAG-CT--T-GT-A----TAACTTTAAGTAT--TTAC-----cctttatatggtgaggaaattttgcaat
gi|25 : TT--CATTCATCGGTGTCTG----TT-----------------GTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAG-G-GGGGGGGG-G-TTGCATTCGCA--C-------TTCTCTG------A--AAAC---------A-TATT----CAAGTCGG--------AT---GTTCTGTA-T-TTG--ATAATGCATTAATT-G------CGCT-----A----AAAATAT--TG----CA-C--CCCCTCCACAAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCT-AGgtc
gi|26 : T---T-AT---ATAA-----T---------AGC-AGCATA-------------ACA-----TGA----C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCC-----------T---------CATTATAGGTTCTGTTATC-GAC----TTATCA---GG--------ATGCC-AGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTGAGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTAg
gi|27 : aaggcgttccAATACGCTT----TATTCGGCTCC--ATCGTTTGAACTCC-C-AGCTTTATTCTCCACCAAAGC-GTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTT-------TTAAAT----TAATTGT--A-AAACTTTAGT-----ATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTC
gi|28 : ---TTTATTACGCCT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-CG-------------AGTACGCCTNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN---------ATAC-AGCATTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GC-----ATTaatatcatcaac
gi|3 : AGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCC--AGGTTTACTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TCACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAACGACC-ACAGTGAATG-TAAACTAAAAC-G-TT--T-GC-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATT-T-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---CCTT----T-TT-TCCTGGGGATT-CCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGTCC-----------T---------CATTATTTC--TTGTTATC-GACTC--A-ATCA---G---------AT-CCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCC---ATGC--GA-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGCAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGGGTATTGGGTATTGTA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGCAAA-AT-GCACCTTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTCA--TGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGAC--GAAAATTTGCTATTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CAATCATCAATGTCTG----TTA--ATT--------T---TATCATCAAGTCAGGTCCGT-----------------ACACAGCC-CTGGTGGGAG-C-ACGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTCTA-TTTTG--AT----TATCAATTAA------T--T-----T----G-----T--C-------------------TAAAATATC---GCAC---CCCTCCTAT-AGAAATAACTTATATTC-C-----ATATACGCTGAAC------GTAC-A-TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAG--CTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT----ATGCCCAC-CC-----------TCAATCAAAC--------ACTTGAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TCCATTACGATT------A----Agtt
gi|30 : GGTCAT---AT--GA-ACTAT-ATTC-AAAG-AAGTGA----AGTT---A-TG-AATG-G-ATACTCATTA--TA--CGGCTTATTAAACCAG--AATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---CAC-AAAA-TGAATTTC--TGA-TCGCAGTT
gi|31 : atTTCATCT-AGAATTAACCTATATTC-AA-TATATATACGCTGAAC------GTAC-G-TA--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GGAT-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAAGGGGCAAATG-TAATTGAATGA--T--AA----------------AAAT-AAT
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-G-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--a
gi|33 : AGGGTGCATTC-CA-TATTTTC-ATTG--CTGCT---GTTT--TCAT--CGAT-GGT-C-TT--TGACGT---A--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CAAG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--TTC-CATTATTTTC-ATTG--C-GCT---GTTT--TCAT--CGATGGAT-C-TTT-TGACGCCACA--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CATG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|35 : tgCATTT-----------T---------C----------TTGTCATC-AAT----A-ATAA---A---------AT-CT-AGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCA---TTTT--GA-AA-----TAAAAAA-AA
gi|36 : ctcacttcctcaaaagtatataacattA--TTCAA-TTAA---TGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA---TA-CA---------GTTC--C-ACT---GTTT--TCAT--GGATGGGT-C-CTTGTGACGTCACA--AA-CA--CCCgaaa
gi|37 : AAGGTAAT---AT--GA-AACGATATTCTGAAG-AAGCCG----AGTTAATT-TG----GGG-A-ATTCATTAATCA--AGTTGTGCTACACAAA--AGT
gi|39 : tAATTCGGATTTTATTCTGGATTTTG-A-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT-A--TTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|4 : GGTCAT---AT--GA-AACAA-ATTCCGAAG-AAATTG----AGTC---C-TG-CATGCC-A-GTTCATTAATCA--AGGCTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TTTCCAAAA-TGATTTTCGA-GGGTCGCGGCTG---ATCT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACT-----------------ACAA-TT--TAGC-TT---TGAA--AAAT-------GC-------CACAG---T-G-----T-GCTACATT-------TA---ATTGT-AGTAGTA-G-------GTCGCAGAAGGTTTTGACTATA--TGTAC--C--T----C-TT-TCCTGGGGATC-CAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---------------A---GT-ACA-----TGT----C-TC----TA-CAC-TCATACT---CATTT-----------T---------C----------TTGCTATT-GAC----A-ATCA---A---------AT-CA-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-----TT--------GT-----A-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATTCAGAA--------------ATAATAATTAATCAGTCT----TATATTTTCTTTAGAGAAGTAGACAGGCAAGGG-------TTATAA-TTGAA-----------CGA-GAATTCC-------------GC-------------------CTTAAAGTCAGATTTGACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACAAA--T-A--TTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAAA--AAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCA-----------ATTAACACTCAT-----TCTA----TTC--ATCCGTGTAAAT-TGTTACATCAAGTCAGGCC----------------------------------------T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CAGC---AAA--AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG-------------------TCTGTATTATTG--AT----TATTAATT-AATGTGTC--T-----AAAATA-----T--CG----CACC--CC--TCCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-C-----ATATACTCTTAACTTTTATGTAT-GTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGT-TG-G-AGTAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGCGTGG---ACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTAC--CTGC-TATATAATT-AACGCA--AATAACT-TACTATTA------AAAA-AACAT--ACCCCCCCCCGCC-----------CCC----AATCA-----AA---ACACGATTTGGGAACT----TCGGACATTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTA--AG-TTCG-CGAGTACGCCT----A
gi|40 : TATACGCTGAAT------GTAC-G-TA--CGTGTTTACACTG----GGAGG-------GGTATG----T---------TCAT-GAT-AGCGGGG---ACG-TTATTT
gi|41 : GT---GTGCTA-C-ATC-T-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|42 : aacgacaactctgtgcaagagaatg-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---A-TTTTTTTT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATGC----T--AAT
gi|43 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATGCCGAAG-AAATTA----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATT
gi|44 : ttaCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTA--AG-TTCG-T
gi|45 : --------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AC--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|46 : gTA--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATActttaatac
gi|5 : ATTAAATGCA--AATAACC-TACTA------TT-AAAA-AACAT--ATAC---CCC-CC-----------GCC--CAAATCA-----AA---CAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-AACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATACATTTCATAT---TTTATTACGATT------ATTAAATCATA------AAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA-----CTTG-TTAGTACGCCG----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-G-GGTTTTCTT-TCTATCACACTC-TATTCAGTACAAAT-AATTCACAATTTCCGACAATGATAT-GCCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGATCATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-TTATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT-ATATAACCG--ATAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-AA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----TACG--------CACAAGTTTAC--------A--------GC-----TATAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACACT---A---CT--TT---------TTTATATTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCCAATGTTAA-GA--TTTGTTTCA-TATGAC
gi|6 : AC---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAG-AAACTGCATGAGTT---C-CG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAATAAG--AATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT----------TT-CAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGAATTTCGATGAA-CGCGGCTG---AACT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACTGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TG--T-GT-AT---TAAC--AAATT---------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTA---C--TACCCT-TT-TCCTGGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CT---GT-ACA-----TTT----C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGTCCTCATTTTTTTGT---------C----------TTGTTATC-AAC----A-ATAA---G---------AT-CC-AGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---TTCA--CA-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcttta
gi|6 : --------GGGGGG------GG-GGGGGTGT----T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTTC-T----T--TCTTGC--AAAGCAAA-AT-GCTCCCTTAAATTCGGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|7 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagggAACGATTTGTGAACC----TCAGACATTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAA-AACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTA---TTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACAATT------A----ATCATA------AAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCATCGGAATTCA-CAGGTTTTATC-TCTATAACA-CTGCATTCAGTACAAA--AATCCACGAGTTCTGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-G-------GT-----ATGTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTACCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCA-TTATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTG-CATCACA--AG-CA--TCAAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------AAG------GT-----TTT
gi|8 : CGATT------A----CTCATATTATTAAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTA--AG-TTTG-TGA-------------ATACGGCTTT--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA--ATTCTGTGAGTTCCAATGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCAT--ATA-------GC-----ATTTGATTGCTA-GGTGTTGTGATTCTTTAGCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---TCATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCATTAATT-CTGGATAGTTCGAACT-AATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCAT-GTATATCCA--TTAAA-ACAA---TGAGAGATTTCT-TTTGTTAGA---GTGTAAATTA-CACTATTTTCTAT-G--C-ATT---GTTT--TCAT--TAATGGGT-C-TTTGCGACATCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAA---TTTGATC-----CATGAACAAGTTT--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAGGACAAT---A-TTTT--TT---------TCTATATTATGCCAT--T--TAA-------CT-TT-CATTCAATACTAATT--AATCTTT--ATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACCAATGTTAC-AA--ATCGTTTCAGTATGACta
gi|9 : AAGGTCAT---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAGAAAATTT----AGTT---TATG-TATGCA-A-ATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AA-TTT-T-GT----------TCTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATCAAA-GTAGCTCCGA-TCTCG-AAA-TGATTTTC--TTATT-GCGGCTGCCTC--T--C--CCTTTGCATGATGACGTCAA----AACG-CCCACCGTGATTG-CAAAT---AACAGTTT--T-GT-GA---TAAC--Actttaag
gi|9 : acttccgtcccttaACAGTTTTGTGATAAC-ATT-C-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTAACCT--T----T-TT-TCCTGGGGATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATATAAGT-GTGGACTATGT----C-TC--T--A-CAC-TCGTATT-CGCGTCC-----------T---------A----------TTATTATC-TATGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CC-AGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCA---TTCC--GA-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GTAAC------------CCGTTCAGA-------------CAGT-C----CGTAC--------GGAAGG------GG-GGGGT-------A----A-TTGAA-----------AAAGGAATTTCAT----TAATCATGC-AAAAGC-AA-ttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 11111 1111111111 111 11111111 1111 111111111111111 1111111111111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 66666666666666666666666666666666 1111 2222222222222 1111 11111 11 1111 22222222 111111 444444444444444444444444444444 222222222 1 2222222222222 555555555555555555555555 111111111 11 33333333333 1111 44444444444444444 44444444444444444 222 2222222222 1111 1 1111 222222222 1111 999999999999999999999999999999999999999999 1 33333333 111111 111 1111111 111 44444444444444444444 11 11 1 11 111111111 22222222 555555555555555555 2222222222222 111 2222222222222 111111 111111 111111 111 22222 11 11111 1111 1111111111111111111 222 1 22 11111 1111 11 1111111111111 11111111111111 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 11111111111 111111111 1111111 1111111 11111111 333333333 111111 1
lowQualScore : 888 33 2 8 0 2 2 77777 11111 2 555 2 0 33 3 1 33 8888888888 3 3 3 3 3333333333 11 3 2 33 33 33 33 7 33 2 2 2 0 2 555 555 77777777 3 6666 3 0 2 6 3 3 0 3 44 3 3 2222 44 555555555555555 1 1 2 3 3 0 55555 3 3 3 3 3 3 55 55 7777777777777 4 4 44 4 4 6666666 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0000 5 5 5 00000000000000000000000000000000 4 5555 4 1 7777777777777 4 66 0 4 9999 66 4 4 4 9999 0 55 66 8888 2222 4 9999 4 555 999999 0 22222 00 77 5 7777 44444444 999999 6 999999999999999999999999999999 1 6 3 888888888 1 5 1111111111111 3 6 6 444444444444444444444444 6 1 999999999 1 888 1 11 0 77 88888888888 99 55 4444 44444444444444444 6 00000000000000000 0 000 0 5 5 5 9999999999 5 3333 77 0 5 1 2222 111111111 33 3 5 1 77 2222 77 555555555555555555555555555555555555555555 5 1 4 0 2 5 88888888 666666 999 66 2 5555555 3 5 5 777 5 0 88888888888888888888 33 33 0 0 11 8 777777777 8 22222222 333333333333333333 1 9999999999999 9999 4 777 4 4 99 4 66 0 4 555 33 0 5 5 0000000000000 111111 8888 1 111111 55 66 1 4 777 0 55 4 4 3 0 666666 66 111 1 6666 0 0 00000 11 11 0 00000 5 0 1 66 0000 8888888888888888888 0 0 5 6 6 44 3 7 222 0 11 6 22222 1111 22 66 55 888 5 44 0 7 5 4 1 4 1111111111111 55 44 3 3 44 3 44 66666666666666 0 44 777777777 99999 4444444444444444444444444444444444444444444 55 3 3 55 3 7 2 00000000000 777777777 66 66 4444444 4 8 4 4444444 66 88888888 1 222222222 222222 66 0 0 66 5
lowQualScore : ... .. . . . . . ..... ..... . ... . . .. . . .. .......... . . . . .......... .. . . .. .. .. .. . .. . . . . . ... ... ........ . .... . . . . . . . . .. . . .... .. ............... . . . . . . ..... . . . . . . .. .. ............. . . .. . . ....... . ......................................................................... . .... . . . ................................ . .... . . ............. . .. . . .... .. . . . .... . .. .. .... .... . .... . ... ...... . ..... .. .. . .... ........ ...... . .............................. . . . ......... . . ............. . . . ........................ . . ......... . ... . .. . .. ........... .. .. .... ................. . ................. . ... . . . . .......... . .... .. . . . .... ......... .. . . . .. .... .. .......................................... . . . . . . ........ ...... ... .. . ....... . . . ... . . .................... .. .. . . .. . ......... . ........ .................. . ............. .... . ... . . .. . .. . . ... .. . . . ............. ...... .... . ...... .. .. . . ... . .. . . . . ...... .. ... . .... . . ..... .. .. . ..... . . . .. .... ................... . . . . . .. . . ... . .. . ..... .... .. .. .. ... . .. . . . . . . ............. .. .. . . .. . .. .............. . .. ......... ..... ........................................... .. . . .. . . . ........... ......... .. .. ....... . . . ....... .. ........ . ......... ...... .. . . .. .
lowQualScore : 999 99 9 6 4 4 9 11111 99999 9 111 9 8 99 6 7 99 4444444444 1 5 1 1 5555555555 55 1 9 99 99 99 99 6 99 9 9 0 6 9 111 444 55555555 1 5555 5 8 1 2 1 1 5 1 22 1 1 0000 22 777777777777777 2 4 2 6 6 5 99999 3 3 3 3 3 3 55 55 5555555555555 0 1 77 0 4 7777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 1111 7 7 7 00000000000000000000000000000000 4 6666 4 1 1111111111111 4 33 1 6 4444 11 4 4 4 4444 8 66 11 8888 7777 4 4444 4 444 666666 4 33333 77 00 0 0000 22222222 222222 7 333333333333333333333333333333 0 7 7 222222222 0 5 0000000000000 2 7 7 222222222222222222222222 7 5 777777777 0 000 0 00 8 88 00000000000 22 88 2222 77777777777777777 6 00000000000000000 7 000 7 7 7 7 4444444444 7 0000 99 4 7 4 1111 444444444 11 0 7 7 99 1111 99 111111111111111111111111111111111111111111 0 4 3 7 0 7 88888888 444444 333 99 5 8888888 2 7 7 999 7 8 22222222222222222222 00 88 0 8 00 0 444444444 0 22222222 999999999999999999 0 6666666666666 4444 4 888 4 4 88 4 11 8 4 999 99 1 0 0 7777777777777 555555 5555 0 555555 55 11 1 4 000 9 55 0 0 2 8 666666 11 666 0 0000 3 4 11111 55 99 8 00000 0 4 4 99 6666 9999999999999999999 7 6 7 6 7 77 2 5 222 6 22 0 22222 7777 33 99 22 888 0 99 1 2 6 0 6 3 9999999999999 00 66 3 3 66 1 22 77777777777777 3 66 555555555 11111 2222222222222222222222222222222222222222222 55 6 6 00 6 3 0 22222222222 888888888 11 11 4444444 4 9 4 9999999 99 11111111 0 333333333 888888 11 5 0 99 7
consensus : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--AT----TATTAA--TTA-T----C--T--A----A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCC-----------C-CC-C-AAATCA-----AA-----NAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
Reference ( family-1000 ) : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--AT----TATTAA--TTA------C--T--A----A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCC-----------C-CCAC-AAANCA-----AA-----NAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|1 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA--TCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGTA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTGTTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGTTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AACGACCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAAC-G-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGG-ATC-CCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GTTACA-----TGT----CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTGA-----------T---------C------------GTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---ATCT--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAATCAGTCC----CGTAC--------CTCGGG------TA-GGGGG-------T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTCC-TCAGTT--TCCTGCAAAAAGC-AACA-TAGCACCCTTAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-ACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGAC--GAAAATTTGTGGTTTATACAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCTGTGTCTT----TTA--ATT------CAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-CCATGGTGGG-G-T-GCGTTTGC-----------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTCG---------ATTCCACTCTGTA-TATTA--AT----TATTAA--TTA-----------------A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CAATA-ATGTACACTGAAC------GTAA-ATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGG-ACA-TTATTTAAAGAACT--A-TGT-------------AAAG-AATTGC--TTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAAT-ACAA-AATATTAACACGCCCCCCCCCCCCCCCCCCC-CCATTAAAACACTTTCAA-----GAACGATTTGTGAACT----TCCGACATTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAA-TACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-TATA---------T---TTTATTATGATT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNATTAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTTGCTA-GGGGTCATGATTCGT-AGCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGATCGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA--TATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATAATAGAACCA--TTAAA-GTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACC--AG-AA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---ATTTTT--TT---------TTTTTTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-CAATC-ATAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-ATTGAC
gi|10 : CCCCCC-----------C-CCAC-GAAGCA-----A---------C-ATT---------------AACATTTCGGGCACCC-CCGA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAG-AACCGTACGT-----A--GTTATTCGTATC-AAAA---GAGATATG--CAATATT----TTTTTAG-AATATA---------T---ATTGTGATAACTCATGACA----ATGAGA------AATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CAT-------------------------------ATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-T-GGGT--------------------------TGGGAA--AATCCGTGGGTTCCGATTATGATAC-GGCTTTTAATCATTTTGAAA----TACTCATTAA-A-------CTTTGACACCTGATGGCTA-GGGGACGTGATTTCTAAGCTCCTTGTCA-AAA----------TCATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCATT-ATT---GACTAGTTCAAACT-GATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGT-CCATATCAA--TGAAA-TGAC---TGAGATATTTCG-TTAA---------------TTA-CACT---------------------GTTT--TCAT--GGATGGGC-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--t
gi|11 : GTAAT---AT--GA-AACGA-TTTCCAAAG-AAAATG----AGTT---A-TG-CATAGG-A-ATTCATTTATCA--AGTTTTATTAAACAAG--AATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TCACGACAA-TG-----------CTCGCGGCTT---A--T--C------TGG-TGATGAAGTCAA----AAAGACTCACCGTGA-TT-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AC---CTAC--G---CAT--TTAC-----TGCATAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATT-C-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CA--TGCA---C--C----T-CTATCCTAGGAATA-CCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATAtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|11 : a-----------T---------T----------TTCTTATT-GCC----A-ATCATAAA---------AT-CT-CG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCA---TTCT--GA-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|12 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttaGGTCATTA-ATTTGA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACC-ACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TAAAT-GT-ATAATTAAC--AAAT--------------------GCTAT-GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TA--TGTA---CA-T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCATA-TTCAG-AA--G----AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGC
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGAA--GGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACGCAATTAACAGGCATTT--CATTCATCCGTGTCTGCATGTTA---TT------AAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGT-----------------ACATAG-CTATGGTGGG-GGT-GCGTTTGCA--TTTCATATCCC-CTTT---ACA--AAACCAAACCAC-AATATT----AAAGTTGG--------ATTTCACTCTGTA-CATTG--AT----TATTAA--TTAGT----C--T--AAAATA-----T--CG----CA-TCACC--TACACAACAT-TCTGGGTATGG------------------ACCTATA---------------CGCTGAAT------GTAC-G-TG--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG--------AGTATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTc
gi|14 : gGGTCAT---AT--GA-AACGATATTTTGGAG-AAATTG----GGTT---A-TG-GATGGG-A-ATTCATTAGT-A--AG-----------AAG--CATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TCACAAAAA-TGATCTTCGATGACCC----CAG---A--T--T--AC-ATGC-TGATAACGTCAA----AAAGACCC-------------------AACTG-TT--T-G--AC---T-----------------C-----TGCGTAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AAC-T-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CA--TGTG---C--G----TATT-TCCTAGGGATT-CCGAA-TTTAG-AAAGA----AA
gi|15 : TTTTCTAT-GAAC-GTTTAGATGT--TTATTCCGATGGGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCAC---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAAT-AA---TCAGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GTTACAGTTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAACAAAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTA-TTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTACAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTTATTGTTAGTAAATATTGTTTAA-catacgggtacaaaatcta
gi|16 : AGGTCATGAAAT--AATAAAAA-A-----AAA-AAATGC----A-TT---A-TA-TATGGGGA-ACTCCTTTATCA--AAATTTATTTAACAAG--AATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TCACAATAA-TGATCTTCGATGA-TCGCGACTT---ATCT--C--CCTTGGC-TGATGACGTCAA----AAAGACCCCTCGTGA-TG-TAACC-AAAACAG-TT--T-GT-A--------------TAT--TTCC-----TGCATAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGC
gi|17 : AAGCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAATTA-CACTAGTTTCTATTG-------------------------TGGGT-G-TTTGTGACGACGCA--AG-CA--CTCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----CATG--------C--------ACAAGTTTAAA--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACGAT-GC-AAAGACAAT---A-TT-------------------TTTTATGGAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ACAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACCAATGTTAG-AA--TTGGTTTCT-TAc
gi|18 : A-A-T-GCACAAATAAAGTTGGATTT-GCTCTGAATATTC-ACT-ATTAATTAG-------------------------------------------TTATAAA--TTCTCTTTCAATC
gi|18 : catacagTCAAGTCAGACCCGT-----------------ACAAAGGC-AT--TGAA-G-T-GCATTGGCAACC-------CCC-CTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAG--------AGTTTACTTTGTT-CATTG--AT----TATTAATTTTC------C--TAAA----A-----T--TGTGTACA-T--CC--TTC-TAAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAtcaaaacgcaattttttcaagtcagacccgtacaaaggcattgaagtgcattggcaacccccctcccgaaaagcaaaataaattgcactatcaaagtcagagtttactttgttcattgattattaattttcctaaaattgtgtacatccttctaaaacatctgggtatgggcctgcaa
gi|19 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TCTCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AACGATCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TA--TGTA---C--C----TGTT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTa
gi|2 : AAGTCAT---A---GA-AACAA-ATCC----G-AAAATT----AGTT---CGTGGCATGCA-A-ATTCATTA-TCA--AG--TTATTGAAGCAG--AATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTCTCGAAAAATGATTT--GATGATCAGCG-CTG---A--T--C--TCTT-GC-TGATGAAGTCAG----AA--ACCGACCACAA-TGATTAAC-AAA-CA---T--T-GTTAT---TAAC--AAATTAT--TCACGGCTGTGCATAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATT-TTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TA--TGT----C--T----T-TA-TCCTGG--ATC---AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACA---GT-AGG-----TGTAATCT-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------TTATTATTTTC----------TTGTTATCTGAC----A-AT-A---A---------AT-C--AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCA---ATC---GC-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCG-TATAATAAC-AATCAGTGCATGTCGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGGGGGGGGTT----AAGTGTAT----------GTA-GAATC--------T--TCCTGCAAAAAGC-A-----------CTTTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTAG-A----A---------------T-CTATCAGCATATTTGA--TGTATGA---TTCTCTT-GAATCCGGCCCGAAAATT-GCTGTT-ATGCAAAA-GCA-----------TTT--CATTCA-AAATGTCTG----TTACGGGT------AATGTGTATCATTAAGTCAGGCC-GT-----------------A-ACAG-C-ATGGTGGA-G-T-GCGTTCGCA----------CCC-CTGG---AAA--AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTCGGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAGTGAAAT----TATTAA--TTAATTGT-C--TA-A----A-----TAATG----CA-C--C----TCACAAAAA-TTTGGGTGTGGGGC-TCATCTAAGAATTAACTTA-ATTTCCA-TA---ATACGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT------------GAGTT-GG-TGGGTGTGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AA-GT-------------AAA------ACGGCTGCAGATAGATGAAAACGCACCATTAACC-TCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT--ATACG-------------------------AAACCG-----A-------AACGATTTGTG-ACTAAAGTCAGACATTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AA-TACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAA-CATA---------CTTGTTTA-TACGATT------A----AT-AGA------AAT--A---CAT-CCACG-------------------TGCA--AGTTTCGATGAGTATGCA-----AATA-GGCTTTCAATCGTCGGAATTCATC-GGGTTGTCT-TCTATCACACTTGCATTCAGTTGCAA--AATCTACGAGTTC-------GAGAC-GG-----AA-C--CTTTAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTT-GTAGCTA--GGGTCATGATTCGTAAGCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGAT-A--CTCTTTT-AT-AATCGTCAT
gi|2 : GAAAAAAGGCAATTTTGAGTCA--AAACAAAA-----TAT--TATAACCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATTAAA----ACAGTGTAAATTATCACTATTT-CTAAT---C-GGT---GTTTGTTCAT--CGATTGGT-CGTTTGGTACGTCACC--AG-GA--CC------A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATT-AA------ATTCAAAAAAATA--------C--------A-------------------T-----TTTAT--TGT-TTT--AA-AAT-ACAAAAGAC-AT---A-------TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-TATTC-ATAC-----------------------------TATAAAG------------------------CCAATGTTAGAAA--ATTGaaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|20 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaaAGGTCAT---AT--GA-AACAATATTCTGAGG-AAATTA----AGTT---G-TG-CATGGA-A-ATTCACT------------TAT----CAAG--G-----TTT----ATT-AA---------------------------ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TCACGAAAA-TGATCTTCGATGAT------------A---------CTTGGC-TGATAACGTCAA----AAAGATCTGTCGAGA-TG-TAAAC-AAAACAG-CT--T-GT-A----TAAC--AAAGAAT--TTAC-----TGCA------T-GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATT-T-AGTCGTA-GTA-GTAGGCaattcaattgaccttga
gi|21 : --CAATGGGA-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCACTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AAC-AAATATTCATTC-----CATT--------C--------AC--------AAGTTTAAAGG-----TTTAT--T-T-TTT--AAAAAT-GC-ATCGGCA-------TTTT--TT---------TTAATTTTAAGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTA-GTAT----A--AATCTTT--ACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACCAACGCTAG-AA--ATGGTTTCA-TATGAC
gi|22 : -AAATCA-----AA-----CAA-GACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGC-GAGG---AAAAACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTT
gi|22 : ttaaCTGTA---GATTTGCACAAG-TTCA-TGAATTCGCCTTTATAATACAGCTTC--ATAGTCAGAACTCG-CTGGCTTTCTC-TCCATCAacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|23 : ttaaaaatcaaacaagacttgtgaactttaggcaggtcgggcgcgcgaggaaaaactaccgtattatgaaataactgtgcgtctgtggttaaaggaaaaggattttcttatatttacttcgG-CA--CTCAC---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AAC-AAA--TTCATTC-----GATG--------C--------AC--------ATGTTTACAAC-----TTTAT--T-TTCTC--AACAAT-GC-AAAGGCATTTTTA-TTTA--TTATCATTATCTTTATTTTATACAAT--T--TAA-------CT-TTTCATTC-ACAC----T--AATCTCT--ATGT--------TTGTATAGT--------AAAA------A--ttcattcaat
gi|24 : AATCA--CGGTTTATCAAACAAG--AATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT-----------------A-TGATCTTCGTTGATT-GCAGCTT---A--TTTC--CCTTTCC-TGATGACGTTAA----CAAGACCCACCATGA-CG-TCATC-AAATCAG-CT--T-GT-A----TAACTTTAAGTAT--TTAC-----cctttatatggtgaggaaattttgcaat
gi|25 : TT--CATTCATCGGTGTCTG----TT-----------------GTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAG-G-GGGGGGGG-G-TTGCATTCGCA--C-------TTCTCTG------A--AAAC---------A-TATT----CAAGTCGG--------AT---GTTCTGTA-T-TTG--ATAATGCATTAA--TTG------CGCT--A----AAAATAT--TG----CA-C--CCCCTCCACAAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCT-AGgtc
gi|26 : T---T-AT---ATAA-----T---------AGC-AGCATA-------------ACA-----TGA----C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCC-----------T---------CATTATAGGTTCTGTTATC-GAC----TTATCA---GG--------ATGCC-AGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTGAGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTAg
gi|27 : aaggcgttccAATACGCTT----TATTCGGCTCC--ATCGTTTGAACTCC-C-AGCTTTATTCTCCACCAAAGC-GTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTT-------TTAAAT----TAATTGT--A-AAACTTTAGT-----ATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTC
gi|28 : ---TTTATTACGCCT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-CG-------------AGTACGCCTNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN---------ATAC-AGCATTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GC-----ATTaatatcatcaac
gi|3 : AGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCC--AGGTTTACTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TCACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAACGACC-ACAGTGAATG-TAAACTAAAAC-G-TT--T-GC-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATT-T-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---CCTT----T-TT-TCCTGGGGATT-CCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGTCC-----------T---------CATTATTTC--TTGTTATC-GACTC--A-ATCA---G---------AT-CCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCC---ATGC--GA-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGCAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGGGTATTGGGTATTGTA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-AAT-GCACCTTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTCA--TGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGAC--GAAAATTTGCTATTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CAATCATCAATGTCTG----TTA--ATT--------T---TATCATCAAGTCAGGTCCGT-----------------ACACAGCC-CTGGTGGGAG-C-ACGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTCTA-TTTTG--AT----TATCAA--TTA------A--T-------------T--TG---------------TC-TAAAATATC---GCAC---CCCTCCTAT-AGAAATAACTTATATTC-C-----ATATACGCTGAAC------GTAC-A-TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAG--CTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT----ATGCCCACCC-----------T-C-----AATCA-----AACACTTGAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TCCATTACGATT------A----Agtt
gi|30 : GGTCAT---AT--GA-ACTAT-ATTC-AAAG-AAGTGA----AGTT---A-TG-AATG-G-ATACTCATTA--TA--CGGCTTATTAAACCAG--AATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---CAC-AAAA-TGAATTTC--TGA-TCGCAGTT
gi|31 : atTTCATCT-AGAATTAACCTATATTC-AA-TATATATACGCTGAAC------GTAC-G-TA--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GGAT-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAAGGGGCAAATG-TAATTGAATGA--T--AA----------------AAAT-AAT
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-G-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--a
gi|33 : AGGGTGCATTC-CA-TATTTTC-ATTG--CTGCT---GTTT--TCAT--CGAT-GGT-C-TT--TGACGT---A--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CAAG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--TTC-CATTATTTTC-ATTG--C-GCT---GTTT--TCAT--CGATGGAT-C-TTT-TGACGCCACA--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CATG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|35 : tgCATTT-----------T---------C----------TTGTCATC-AAT----A-ATAA---A---------AT-CT-AGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCA---TTTT--GA-AA-----TAAAAAA-AA
gi|36 : ctcacttcctcaaaagtatataacattA--TTCAA-TTAA---TGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA---TA-CA---------GTTC--C-ACT---GTTT--TCAT--GGATGGGT-C-CTTGTGACGTCACA--AA-CA--CCCgaaa
gi|37 : AAGGTAAT---AT--GA-AACGATATTCTGAAG-AAGCCG----AGTTAATT-TG----GGG-A-ATTCATTAATCA--AGTTGTGCTACACAAA--AGT
gi|39 : tAATTCGGATTTTATTCTGGATTTTG-A-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT-A--TTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|4 : GGTCAT---AT--GA-AACAA-ATTCCGAAG-AAATTG----AGTC---C-TG-CATGCC-A-GTTCATTAATCA--AGGCTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TTTCCAAAA-TGATTTTCGA-GGGTCGCGGCTG---ATCT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACT-----------------ACAA-TT--TAGC-TT---TGAA--AAAT-------GC-------CACAG---T-G-----T-GCTACATT-------TA---ATTGT-AGTAGTA-G-------GTCGCAGAAGGTTTTGACTATA--TGTAC--C--T----C-TT-TCCTGGGGATC-CAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---------------A---GT-ACA-----TGT----C-TC----TA-CAC-TCATACT---CATTT-----------T---------C----------TTGCTATT-GAC----A-ATCA---A---------AT-CA-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-----TT--------GT-----A-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATTCAGAA--------------ATAATAATTAATCAGTCT----TATATTTTCTTTAGAGAAGTAGACAGGCAAGGG-------TTATAA-TTGAA-----------CGA-GAATTCC-------------GC--------------------CTTAAAGTCAGATTTGACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACAAA--T-A--TTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAAA--AAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCA-----------ATTAACACTCAT-----TCTA----TTC--ATCCGTGTAAAT-TGTTACATCAAGTCAGGCC----------------------------------------T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CAGC---AAA--AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG-------------------TCTGTATTATTG--AT----TATTAA--TTAATGTGTC--T--AAAATA-----T--CG----CACC--CC--TCCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-C-----ATATACTCTTAACTTTTATGTAT-GTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGT-TG-G-AGTAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGCGTGG---ACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTAC--CTGC-TATATAATT-AACGCA--AATAACT-TACTATTA------AAAA-AACAT--AC---CCCCCCC-----------CGCCCC-CAATCA-----AA-----ACACGATTTGGGAACT----TCGGACATTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTA--AG-TTCG-CGAGTACGCCT----A
gi|40 : TATACGCTGAAT------GTAC-G-TA--CGTGTTTACACTG----GGAGG-------GGTATG----T---------TCAT-GAT-AGCGGGG---ACG-TTATTT
gi|41 : GT---GTGCTA-C-ATC-T-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|42 : aacgacaactctgtgcaagagaatg-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---A-TTTTTTTT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATGC----T--AAT
gi|43 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATGCCGAAG-AAATTA----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATT
gi|44 : ttaCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTA--AG-TTCG-T
gi|45 : --------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AC--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|46 : gTA--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATActttaatac
gi|5 : ATTAAATGCA--AATAACC-TACTA------TT-AAAA-AACAT--ATAC---CCCCC-----------G-CC-C-AAATCA-----AA-----CAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-AACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATACATTTCATAT---TTTATTACGATT------ATTAAATCATA------AAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA-----CTTG-TTAGTACGCCG----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-G-GGTTTTCTT-TCTATCACACTC-TATTCAGTACAAAT-AATTCACAATTTCCGACAATGATAT-GCCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGATCATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-TTATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT-ATATAACCG--ATAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-AA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----TACG--------CACAAGTTTAC--------A--------GC-----TATAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACACT---A---CT--TT---------TTTATATTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCCAATGTTAA-GA--TTTGTTTCA-TATGAC
gi|6 : AC---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAG-AAACTGCATGAGTT---C-CG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAATAAG--AATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT----------TT-CAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGAATTTCGATGAA-CGCGGCTG---AACT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACTGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TG--T-GT-AT---TAAC--AAATT---------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTA---C--TACCCT-TT-TCCTGGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CT---GT-ACA-----TTT----C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGTCCTCATTTTTTTGT---------C----------TTGTTATC-AAC----A-ATAA---G---------AT-CC-AGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---TTCA--CA-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcttta
gi|6 : --------GGGGGG------GG-GGGGGTGT----T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTTC-T----T--TCTTGC--AAAGCAAA-A-T-GCTCCCTTAAATTCGGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|7 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagggAACGATTTGTGAACC----TCAGACATTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAA-AACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTA---TTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACAATT------A----ATCATA------AAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCATCGGAATTCA-CAGGTTTTATC-TCTATAACA-CTGCATTCAGTACAAA--AATCCACGAGTTCTGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-G-------GT-----ATGTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTACCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCA-TTATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTG-CATCACA--AG-CA--TCAAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------AAG------GT-----TTT
gi|8 : CGATT------A----CTCATATTATTAAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTA--AG-TTTG-TGA-------------ATACGGCTTT--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA--ATTCTGTGAGTTCCAATGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCAT--ATA-------GC-----ATTTGATTGCTA-GGTGTTGTGATTCTTTAGCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---TCATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCATTAATT-CTGGATAGTTCGAACT-AATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCAT-GTATATCCA--TTAAA-ACAA---TGAGAGATTTCT-TTTGTTAGA---GTGTAAATTA-CACTATTTTCTAT-G--C-ATT---GTTT--TCAT--TAATGGGT-C-TTTGCGACATCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAA---TTTGATC-----CATGAACAAGTTT--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAGGACAAT---A-TTTT--TT---------TCTATATTATGCCAT--T--TAA-------CT-TT-CATTCAATACTAATT--AATCTTT--ATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACCAATGTTAC-AA--ATCGTTTCAGTATGACta
gi|9 : AAGGTCAT---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAGAAAATTT----AGTT---TATG-TATGCA-A-ATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AA-TTT-T-GT----------TCTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATCAAA-GTAGCTCCGA-TCTCG-AAA-TGATTTTC--TTATT-GCGGCTGCCTC--T--C--CCTTTGCATGATGACGTCAA----AACG-CCCACCGTGATTG-CAAAT---AACAGTTT--T-GT-GA---TAAC--Actttaag
gi|9 : acttccgtcccttaACAGTTTTGTGATAAC-ATT-C-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTAACCT--T----T-TT-TCCTGGGGATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATATAAGT-GTGGACTATGT----C-TC--T--A-CAC-TCGTATT-CGCGTCC-----------T---------A----------TTATTATC-TATGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CC-AGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCA---TTCC--GA-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GTAAC------------CCGTTCAGA-------------CAGT-C----CGTAC--------GGAAGG------GG-GGGGT-------A----A-TTGAA-----------AAAGGAATTTCAT----TAATCATGC-AAAAGC-AA-ttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 11111 1111111111 111 11111111 1111 111111111111111 1111111111111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 66666666666666666666666666666666 1111 2222222222222 1111 11111 11 1111 22222222 111111 444444444444444444444444444444 222222222 1 2222222222222 555555555555555555555555 111111111 11 33333333333 1111 44444444444444444 44444444444444444 222 2222222222 1111 1 1111 222222222 1111 99999999999999999999999 1111 33333333 111111 111 1111111 111 44444444444444444444 11 11 1 11 111111111 11111111 33333333333333333333333333333333333 111 2222222222222 111111 111111 111111 111 22222 11 11111 1111 1111111111111111111 222 1 22 11111 1111 11 1111111111111 11111111111111 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 11111111111 111111111 1111111 1111111 11111111 333333333 111111 1
lowQualScore : 888 33 2 8 0 2 2 77777 11111 2 555 2 0 33 3 1 33 8888888888 3 3 3 3 3333333333 11 3 2 33 33 33 33 7 33 2 2 2 0 2 555 555 77777777 3 6666 3 0 2 6 3 3 0 3 44 3 3 2222 44 555555555555555 1 1 2 3 3 0 55555 3 3 3 3 3 3 55 55 7777777777777 4 4 44 4 4 6666666 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0000 5 5 5 00000000000000000000000000000000 4 5555 4 1 7777777777777 4 66 0 4 9999 66 4 4 4 9999 0 55 66 8888 2222 4 9999 4 555 999999 0 22222 00 77 5 7777 44444444 999999 6 999999999999999999999999999999 1 6 3 888888888 1 5 1111111111111 3 6 6 444444444444444444444444 6 1 999999999 1 888 1 11 0 77 88888888888 99 55 4444 44444444444444444 6 00000000000000000 0 000 0 5 5 5 9999999999 5 3333 77 0 5 1 2222 111111111 33 3 5 1 77 2222 44444444444444444444444 77 2222 8888 77 5 66 0 0 6666 1 5 88888888 666666 999 66 2 5555555 3 5 5 777 5 0 88888888888888888888 33 33 0 0 11 8 777777777 8 77777777 1 33333333333333333333333333333333333 9999 4 777 4 4 99 4 66 0 4 555 33 0 5 5 0000000000000 111111 8888 1 111111 55 66 1 4 777 0 55 4 4 3 0 666666 66 111 1 6666 0 0 00000 11 11 0 00000 5 0 1 66 0000 8888888888888888888 0 0 5 6 6 44 3 7 222 0 11 6 22222 1111 22 66 55 888 5 66666 4 5 4 1 4 1111111111111 55 44 3 3 44 3 44 66666666666666 0 44 777777777 99999 4444444444444444444444444444444444444444444 55 3 3 55 3 7 2 00000000000 777777777 66 66 4444444 4 8 4 4444444 66 88888888 1 222222222 222222 66 0 0 66 5
lowQualScore : ... .. . . . . . ..... ..... . ... . . .. . . .. .......... . . . . .......... .. . . .. .. .. .. . .. . . . . . ... ... ........ . .... . . . . . . . . .. . . .... .. ............... . . . . . . ..... . . . . . . .. .. ............. . . .. . . ....... . ......................................................................... . .... . . . ................................ . .... . . ............. . .. . . .... .. . . . .... . .. .. .... .... . .... . ... ...... . ..... .. .. . .... ........ ...... . .............................. . . . ......... . . ............. . . . ........................ . . ......... . ... . .. . .. ........... .. .. .... ................. . ................. . ... . . . . .......... . .... .. . . . .... ......... .. . . . .. .... ....................... .. .... .... .. . .. . . .... . . ........ ...... ... .. . ....... . . . ... . . .................... .. .. . . .. . ......... . ........ . ................................... .... . ... . . .. . .. . . ... .. . . . ............. ...... .... . ...... .. .. . . ... . .. . . . . ...... .. ... . .... . . ..... .. .. . ..... . . . .. .... ................... . . . . . .. . . ... . .. . ..... .... .. .. .. ... . ..... . . . . . ............. .. .. . . .. . .. .............. . .. ......... ..... ........................................... .. . . .. . . . ........... ......... .. .. ....... . . . ....... .. ........ . ......... ...... .. . . .. .
lowQualScore : 999 99 9 6 4 4 9 11111 99999 9 111 9 8 99 6 7 99 4444444444 1 5 1 1 5555555555 55 1 9 99 99 99 99 6 99 9 9 0 6 9 111 444 55555555 1 5555 5 8 1 2 1 1 5 1 22 1 1 0000 22 777777777777777 2 4 2 6 6 5 99999 3 3 3 3 3 3 55 55 5555555555555 0 1 77 0 4 7777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 1111 7 7 7 00000000000000000000000000000000 4 6666 4 1 1111111111111 4 33 1 6 4444 11 4 4 4 4444 8 66 11 8888 7777 4 4444 4 444 666666 4 33333 77 00 0 0000 22222222 222222 7 333333333333333333333333333333 0 7 7 222222222 0 5 0000000000000 2 7 7 222222222222222222222222 7 5 777777777 0 000 0 00 8 88 00000000000 22 88 2222 77777777777777777 6 00000000000000000 7 000 7 7 7 7 4444444444 7 0000 99 4 7 4 1111 444444444 11 0 7 7 99 1111 33333333333333333333333 99 1111 1111 99 0 00 3 7 3333 3 7 88888888 444444 333 99 5 8888888 2 7 7 999 7 8 22222222222222222222 00 88 0 8 00 0 444444444 0 22222222 0 77777777777777777777777777777777777 4444 4 888 4 4 88 4 11 8 4 999 99 1 0 0 7777777777777 555555 5555 0 555555 55 11 1 4 000 9 55 0 0 2 8 666666 11 666 0 0000 3 4 11111 55 99 8 00000 0 4 4 99 6666 9999999999999999999 7 6 7 6 7 77 2 5 222 6 22 0 22222 7777 33 99 22 888 0 99999 6 6 0 6 3 9999999999999 00 66 3 3 66 1 22 77777777777777 3 66 555555555 11111 2222222222222222222222222222222222222222222 55 6 6 00 6 3 0 22222222222 888888888 11 11 4444444 4 9 4 9999999 99 11111111 0 333333333 888888 11 5 0 99 7
consensus : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--AT----TATTAATTAAT---T-CT---AAAATA-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCCCCCC-------------AAATCG-----AA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
Reference ( family-1000 ) : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--AT----TATTAATTA-----T-CT---A----A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCCCCCC-------------AAATCA-----AA-----N-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|1 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA--TCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGTA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTGTTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGTTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AACGACCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAAC-G-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGG-ATC-CCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GTTACA-----TGT----CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTGA-----------T---------C------------GTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---ATCT--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAATCAGTCC----CGTAC--------CTCGGG------TA-GGGGG-------T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTCC-TCAGTT--TCCTGCAAAAAGC-AACA-TAGCACCCTTAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-ACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGAC--GAAAATTTGTGGTTTATACAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCTGTGTCTT----TTA--ATT------CAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-CCATGGTGGG-G-T-GCGTTTGC-----------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTCG---------ATTCCACTCTGTA-TATTA--AT----TATTAATTA-----------------A-----T--CG----CA-C--CC--TTCACAAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CAATA-ATGTACACTGAAC------GTAA-ATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGG-ACA-TTATTTAAAGAACT--A-TGT-------------AAAG-AATTGC--TTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAAT-ACAA-AATATTAACACGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATTAAAACACTTTCAA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCCGACATTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAA-TACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-TATA---------T---TTTATTATGATT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNATTAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTTGCTA-GGGGTCATGATTCGT-AGCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGATCGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA--TATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATAATAGAACCA--TTAAA-GTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACC--AG-AA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---ATTTTT--TT---------TTTTTTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-CAATC-ATAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-ATTGAC
gi|10 : CCCCCCCCC-------------A---CG-----AA-----GCAAC-ATT---------------AACATTTCGGGCACCC-CCGA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAG-AACCGTACGT-----A--GTTATTCGTATC-AAAA---GAGATATG--CAATATT----TTTTTAG-AATATA---------T---ATTGTGATAACTCATGACA----ATGAGA------AATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CAT-------------------------------ATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-T-GGGT--------------------------TGGGAA--AATCCGTGGGTTCCGATTATGATAC-GGCTTTTAATCATTTTGAAA----TACTCATTAA-A-------CTTTGACACCTGATGGCTA-GGGGACGTGATTTCTAAGCTCCTTGTCA-AAA----------TCATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCATT-ATT---GACTAGTTCAAACT-GATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGT-CCATATCAA--TGAAA-TGAC---TGAGATATTTCG-TTAA---------------TTA-CACT---------------------GTTT--TCAT--GGATGGGC-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--t
gi|11 : GTAAT---AT--GA-AACGA-TTTCCAAAG-AAAATG----AGTT---A-TG-CATAGG-A-ATTCATTTATCA--AGTTTTATTAAACAAG--AATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TCACGACAA-TG-----------CTCGCGGCTT---A--T--C------TGG-TGATGAAGTCAA----AAAGACTCACCGTGA-TT-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AC---CTAC--G---CAT--TTAC-----TGCATAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATT-C-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CA--TGCA---C--C----T-CTATCCTAGGAATA-CCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATAtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|11 : a-----------T---------T----------TTCTTATT-GCC----A-ATCATAAA---------AT-CT-CG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCA---TTCT--GA-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|12 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttaGGTCATTA-ATTTGA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACC-ACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TAAAT-GT-ATAATTAAC--AAAT--------------------GCTAT-GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TA--TGTA---CA-T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCATA-TTCAG-AA--G----AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGC
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGAA--GGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACGCAATTAACAGGCATTT--CATTCATCCGTGTCTGCATGTTA---TT------AAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGT-----------------ACATAG-CTATGGTGGG-GGT-GCGTTTGCA--TTTCATATCCC-CTTT---ACA--AAACCAAACCAC-AATATT----AAAGTTGG--------ATTTCACTCTGTA-CATTG--AT----TATTAATTAG----T-CT---AAAATA-----T--CG----CA-TCACC--TACACAACAT-TCTGGGTATGG------------------ACCTATA---------------CGCTGAAT------GTAC-G-TG--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG--------AGTATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTc
gi|14 : gGGTCAT---AT--GA-AACGATATTTTGGAG-AAATTG----GGTT---A-TG-GATGGG-A-ATTCATTAGT-A--AG-----------AAG--CATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TCACAAAAA-TGATCTTCGATGACCC----CAG---A--T--T--AC-ATGC-TGATAACGTCAA----AAAGACCC-------------------AACTG-TT--T-G--AC---T-----------------C-----TGCGTAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AAC-T-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CA--TGTG---C--G----TATT-TCCTAGGGATT-CCGAA-TTTAG-AAAGA----AA
gi|15 : TTTTCTAT-GAAC-GTTTAGATGT--TTATTCCGATGGGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCAC---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAAT-AA---TCAGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GTTACAGTTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAACAAAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTA-TTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTACAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTTATTGTTAGTAAATATTGTTTAA-catacgggtacaaaatcta
gi|16 : AGGTCATGAAAT--AATAAAAA-A-----AAA-AAATGC----A-TT---A-TA-TATGGGGA-ACTCCTTTATCA--AAATTTATTTAACAAG--AATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TCACAATAA-TGATCTTCGATGA-TCGCGACTT---ATCT--C--CCTTGGC-TGATGACGTCAA----AAAGACCCCTCGTGA-TG-TAACC-AAAACAG-TT--T-GT-A--------------TAT--TTCC-----TGCATAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGC
gi|17 : AAGCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAATTA-CACTAGTTTCTATTG-------------------------TGGGT-G-TTTGTGACGACGCA--AG-CA--CTCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----CATG--------C--------ACAAGTTTAAA--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACGAT-GC-AAAGACAAT---A-TT-------------------TTTTATGGAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ACAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACCAATGTTAG-AA--TTGGTTTCT-TAc
gi|18 : A-A-T-GCACAAATAAAGTTGGATTT-GCTCTGAATATTC-ACT-ATTAATTAG-------------------------------------------TTATAAA--TTCTCTTTCAATC
gi|18 : catacagTCAAGTCAGACCCGT-----------------ACAAAGGC-AT--TGAA-G-T-GCATTGGCAACC-------CCC-CTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAG--------AGTTTACTTTGTT-CATTG--AT----TATTAATTT-----T-CCTAAA----A-----T--TGTGTACA-T--CC--TTC-TAAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAtcaaaacgcaattttttcaagtcagacccgtacaaaggcattgaagtgcattggcaacccccctcccgaaaagcaaaataaattgcactatcaaagtcagagtttactttgttcattgattattaattttcctaaaattgtgtacatccttctaaaacatctgggtatgggcctgcaa
gi|19 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TCTCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AACGATCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TA--TGTA---C--C----TGTT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTa
gi|2 : AAGTCAT---A---GA-AACAA-ATCC----G-AAAATT----AGTT---CGTGGCATGCA-A-ATTCATTA-TCA--AG--TTATTGAAGCAG--AATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTCTCGAAAAATGATTT--GATGATCAGCG-CTG---A--T--C--TCTT-GC-TGATGAAGTCAG----AA--ACCGACCACAA-TGATTAAC-AAA-CA---T--T-GTTAT---TAAC--AAATTAT--TCACGGCTGTGCATAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATT-TTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TA--TGT----C--T----T-TA-TCCTGG--ATC---AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACA---GT-AGG-----TGTAATCT-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------TTATTATTTTC----------TTGTTATCTGAC----A-AT-A---A---------AT-C--AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCA---ATC---GC-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCG-TATAATAAC-AATCAGTGCATGTCGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGGGGGGGGTT----AAGTGTAT----------GTA-GAATC--------T--TCCTGCAAAAAGC-A-----------CTTTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTAG-A----A---------------T-CTATCAGCATATTTGA--TGTATGA---TTCTCTT-GAATCCGGCCCGAAAATT-GCTGTT-ATGCAAAA-GCA-----------TTT--CATTCA-AAATGTCTG----TTACGGGT------AATGTGTATCATTAAGTCAGGCC-GT-----------------A-ACAG-C-ATGGTGGA-G-T-GCGTTCGCA----------CCC-CTGG---AAA--AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTCGGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAGTGAAAT----TATTAATTAATTG-T-CTA--A----A-----TAATG----CA-C--C----TCACAAAAA-TTTGGGTGTGGGGC-TCATCTAAGAATTAACTTA-ATTTCCA-TA---ATACGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT------------GAGTT-GG-TGGGTGTGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AA-GT-------------AAA------ACGGCTGCAGATAGATGAAAACGCACCATTAACC-TCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT--ATACG------------------------AAACCG-----A--------AACGATTTGTG-ACTAAAGTCAGACATTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AA-TACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAA-CATA---------CTTGTTTA-TACGATT------A----AT-AGA------AAT--A---CAT-CCACG-------------------TGCA--AGTTTCGATGAGTATGCA-----AATA-GGCTTTCAATCGTCGGAATTCATC-GGGTTGTCT-TCTATCACACTTGCATTCAGTTGCAA--AATCTACGAGTTC-------GAGAC-GG-----AA-C--CTTTAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTT-GTAGCTA--GGGTCATGATTCGTAAGCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGAT-A--CTCTTTT-AT-AATCGTCAT
gi|2 : GAAAAAAGGCAATTTTGAGTCA--AAACAAAA-----TAT--TATAACCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATTAAA----ACAGTGTAAATTATCACTATTT-CTAAT---C-GGT---GTTTGTTCAT--CGATTGGT-CGTTTGGTACGTCACC--AG-GA--CC------A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATT-AA------ATTCAAAAAAATA--------C--------A-------------------T-----TTTAT--TGT-TTT--AA-AAT-ACAAAAGAC-AT---A-------TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-TATTC-ATAC-----------------------------TATAAAG------------------------CCAATGTTAGAAA--ATTGaaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|20 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaaAGGTCAT---AT--GA-AACAATATTCTGAGG-AAATTA----AGTT---G-TG-CATGGA-A-ATTCACT------------TAT----CAAG--G-----TTT----ATT-AA---------------------------ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TCACGAAAA-TGATCTTCGATGAT------------A---------CTTGGC-TGATAACGTCAA----AAAGATCTGTCGAGA-TG-TAAAC-AAAACAG-CT--T-GT-A----TAAC--AAAGAAT--TTAC-----TGCA------T-GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATT-T-AGTCGTA-GTA-GTAGGCaattcaattgaccttga
gi|21 : --CAATGGGA-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCACTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AAC-AAATATTCATTC-----CATT--------C--------AC--------AAGTTTAAAGG-----TTTAT--T-T-TTT--AAAAAT-GC-ATCGGCA-------TTTT--TT---------TTAATTTTAAGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTA-GTAT----A--AATCTTT--ACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACCAACGCTAG-AA--ATGGTTTCA-TATGAC
gi|22 : -------------AAATCA-----AA-----C-AA-GACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGC-GAGG---AAAAACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTT
gi|22 : ttaaCTGTA---GATTTGCACAAG-TTCA-TGAATTCGCCTTTATAATACAGCTTC--ATAGTCAGAACTCG-CTGGCTTTCTC-TCCATCAacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|23 : ttaaaaatcaaacaagacttgtgaactttaggcaggtcgggcgcgcgaggaaaaactaccgtattatgaaataactgtgcgtctgtggttaaaggaaaaggattttcttatatttacttcgG-CA--CTCAC---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AAC-AAA--TTCATTC-----GATG--------C--------AC--------ATGTTTACAAC-----TTTAT--T-TTCTC--AACAAT-GC-AAAGGCATTTTTA-TTTA--TTATCATTATCTTTATTTTATACAAT--T--TAA-------CT-TTTCATTC-ACAC----T--AATCTCT--ATGT--------TTGTATAGT--------AAAA------A--ttcattcaat
gi|24 : AATCA--CGGTTTATCAAACAAG--AATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT-----------------A-TGATCTTCGTTGATT-GCAGCTT---A--TTTC--CCTTTCC-TGATGACGTTAA----CAAGACCCACCATGA-CG-TCATC-AAATCAG-CT--T-GT-A----TAACTTTAAGTAT--TTAC-----cctttatatggtgaggaaattttgcaat
gi|25 : TT--CATTCATCGGTGTCTG----TT-----------------GTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAG-G-GGGGGGGG-G-TTGCATTCGCA--C-------TTCTCTG------A--AAAC---------A-TATT----CAAGTCGG--------AT---GTTCTGTA-T-TTG--ATAATGCATTAATTG-----CGCT---A----AAAATAT--TG----CA-C--CCCCTCCACAAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCT-AGgtc
gi|26 : T---T-AT---ATAA-----T---------AGC-AGCATA-------------ACA-----TGA----C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCC-----------T---------CATTATAGGTTCTGTTATC-GAC----TTATCA---GG--------ATGCC-AGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTGAGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTAg
gi|27 : aaggcgttccAATACGCTT----TATTCGGCTCC--ATCGTTTGAACTCC-C-AGCTTTATTCTCCACCAAAGC-GTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTT-------TTAAAT----TAATTGT--A-AAACTTTAGT-----ATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTC
gi|28 : ---TTTATTACGCCT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-CG-------------AGTACGCCTNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN---------ATAC-AGCATTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GC-----ATTaatatcatcaac
gi|3 : AGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCC--AGGTTTACTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TCACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAACGACC-ACAGTGAATG-TAAACTAAAAC-G-TT--T-GC-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATT-T-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---CCTT----T-TT-TCCTGGGGATT-CCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGTCC-----------T---------CATTATTTC--TTGTTATC-GACTC--A-ATCA---G---------AT-CCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCC---ATGC--GA-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGCAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGGGTATTGGGTATTGTA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-AAT-GCACCTTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTCA--TGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGAC--GAAAATTTGCTATTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CAATCATCAATGTCTG----TTA--ATT--------T---TATCATCAAGTCAGGTCCGT-----------------ACACAGCC-CTGGTGGGAG-C-ACGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTCTA-TTTTG--AT----TATCAATTAATTTGT-CT---AAAATA-----T--CG----CA-C--CC--CTC---------CTA----------------T-AGAAATAACTTATATTC-C-----ATATACGCTGAAC------GTAC-A-TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAG--CTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT----ATGCCCACCCTC----------------AATCA-----AACACTTG-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TCCATTACGATT------A----Agtt
gi|30 : GGTCAT---AT--GA-ACTAT-ATTC-AAAG-AAGTGA----AGTT---A-TG-AATG-G-ATACTCATTA--TA--CGGCTTATTAAACCAG--AATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---CAC-AAAA-TGAATTTC--TGA-TCGCAGTT
gi|31 : atTTCATCT-AGAATTAACCTATATTC-AA-TATATATACGCTGAAC------GTAC-G-TA--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GGAT-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAAGGGGCAAATG-TAATTGAATGA--T--AA----------------AAAT-AAT
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-G-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--a
gi|33 : AGGGTGCATTC-CA-TATTTTC-ATTG--CTGCT---GTTT--TCAT--CGAT-GGT-C-TT--TGACGT---A--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CAAG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--TTC-CATTATTTTC-ATTG--C-GCT---GTTT--TCAT--CGATGGAT-C-TTT-TGACGCCACA--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CATG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|35 : tgCATTT-----------T---------C----------TTGTCATC-AAT----A-ATAA---A---------AT-CT-AGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCA---TTTT--GA-AA-----TAAAAAA-AA
gi|36 : ctcacttcctcaaaagtatataacattA--TTCAA-TTAA---TGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA---TA-CA---------GTTC--C-ACT---GTTT--TCAT--GGATGGGT-C-CTTGTGACGTCACA--AA-CA--CCCgaaa
gi|37 : AAGGTAAT---AT--GA-AACGATATTCTGAAG-AAGCCG----AGTTAATT-TG----GGG-A-ATTCATTAATCA--AGTTGTGCTACACAAA--AGT
gi|39 : tAATTCGGATTTTATTCTGGATTTTG-A-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT-A--TTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|4 : GGTCAT---AT--GA-AACAA-ATTCCGAAG-AAATTG----AGTC---C-TG-CATGCC-A-GTTCATTAATCA--AGGCTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TTTCCAAAA-TGATTTTCGA-GGGTCGCGGCTG---ATCT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACT-----------------ACAA-TT--TAGC-TT---TGAA--AAAT-------GC-------CACAG---T-G-----T-GCTACATT-------TA---ATTGT-AGTAGTA-G-------GTCGCAGAAGGTTTTGACTATA--TGTAC--C--T----C-TT-TCCTGGGGATC-CAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---------------A---GT-ACA-----TGT----C-TC----TA-CAC-TCATACT---CATTT-----------T---------C----------TTGCTATT-GAC----A-ATCA---A---------AT-CA-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-----TT--------GT-----A-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATTCAGAA--------------ATAATAATTAATCAGTCT----TATATTTTCTTTAGAGAAGTAGACAGGCAAGGG-------TTATAA-TTGAA-----------CGA-GAATTCC-------------GC--------------------CTTAAAGTCAGATTTGACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACAAA--T-A--TTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAAA--AAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCA-----------ATTAACACTCAT-----TCTA----TTC--ATCCGTGTAAAT-TGTTACATCAAGTCAGGCC----------------------------------------T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CAGC---AAA--AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG-------------------TCTGTATTATTG--AT----TATTAATTAATGTGT-CT---AAAATA-----T--CG----CACC--CC--TCCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-C-----ATATACTCTTAACTTTTATGTAT-GTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGT-TG-G-AGTAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGCGTGG---ACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTAC--CTGC-TATATAATT-AACGCA--AATAACT-TACTATTA------AAAA-AACAT--AC-CCCCCCCCGCCCC-------------CAATCA-----AA-----A-CACGATTTGGGAACT----TCGGACATTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTA--AG-TTCG-CGAGTACGCCT----A
gi|40 : TATACGCTGAAT------GTAC-G-TA--CGTGTTTACACTG----GGAGG-------GGTATG----T---------TCAT-GAT-AGCGGGG---ACG-TTATTT
gi|41 : GT---GTGCTA-C-ATC-T-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|42 : aacgacaactctgtgcaagagaatg-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---A-TTTTTTTT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATGC----T--AAT
gi|43 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATGCCGAAG-AAATTA----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATT
gi|44 : ttaCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTA--AG-TTCG-T
gi|45 : --------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AC--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|46 : gTA--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATActttaatac
gi|5 : ATTAAATGCA--AATAACC-TACTA------TT-AAAA-AACAT--ATAC---CCCCCGCCC-------------AAATCA-----AA-----C-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-AACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATACATTTCATAT---TTTATTACGATT------ATTAAATCATA------AAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA-----CTTG-TTAGTACGCCG----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-G-GGTTTTCTT-TCTATCACACTC-TATTCAGTACAAAT-AATTCACAATTTCCGACAATGATAT-GCCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGATCATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-TTATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT-ATATAACCG--ATAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-AA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----TACG--------CACAAGTTTAC--------A--------GC-----TATAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACACT---A---CT--TT---------TTTATATTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCCAATGTTAA-GA--TTTGTTTCA-TATGAC
gi|6 : AC---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAG-AAACTGCATGAGTT---C-CG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAATAAG--AATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT----------TT-CAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGAATTTCGATGAA-CGCGGCTG---AACT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACTGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TG--T-GT-AT---TAAC--AAATT---------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTA---C--TACCCT-TT-TCCTGGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CT---GT-ACA-----TTT----C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGTCCTCATTTTTTTGT---------C----------TTGTTATC-AAC----A-ATAA---G---------AT-CC-AGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---TTCA--CA-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcttta
gi|6 : --------GGGGGG------GG-GGGGGTGT----T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTTC-T----T--TCTTGC--AAAGCAAA-A-T-GCTCCCTTAAATTCGGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|7 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggg-AACGATTTGTGAACC----TCAGACATTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAA-AACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTA---TTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACAATT------A----ATCATA------AAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCATCGGAATTCA-CAGGTTTTATC-TCTATAACA-CTGCATTCAGTACAAA--AATCCACGAGTTCTGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-G-------GT-----ATGTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTACCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCA-TTATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTG-CATCACA--AG-CA--TCAAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------AAG------GT-----TTT
gi|8 : CGATT------A----CTCATATTATTAAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTA--AG-TTTG-TGA-------------ATACGGCTTT--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA--ATTCTGTGAGTTCCAATGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCAT--ATA-------GC-----ATTTGATTGCTA-GGTGTTGTGATTCTTTAGCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---TCATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCATTAATT-CTGGATAGTTCGAACT-AATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCAT-GTATATCCA--TTAAA-ACAA---TGAGAGATTTCT-TTTGTTAG---AGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-ATT---GTTT--TCAT--TAATGGGT-C-TTTGCGACATCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAA---TTTGATC-----CATGAACAAGTTT--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAGGACAAT---A-TTTT--TT---------TCTATATTATGCCAT--T--TAA-------CT-TT-CATTCAATACTAATT--AATCTTT--ATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACCAATGTTAC-AA--ATCGTTTCAGTATGACta
gi|9 : AAGGTCAT---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAGAAAATTT----AGTT---TATG-TATGCA-A-ATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AA-TTT-T-GT----------TCTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATCAAA-GTAGCTCCGA-TCTCG-AAA-TGATTTTC--TTATT-GCGGCTGCCTC--T--C--CCTTTGCATGATGACGTCAA----AACG-CCCACCGTGATTG-CAAAT---AACAGTTT--T-GT-GA---TAAC--Actttaag
gi|9 : acttccgtcccttaACAGTTTTGTGATAAC-ATT-C-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTAACCT--T----T-TT-TCCTGGGGATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATATAAGT-GTGGACTATGT----C-TC--T--A-CAC-TCGTATT-CGCGTCC-----------T---------A----------TTATTATC-TATGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CC-AGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCA---TTCC--GA-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GTAAC------------CCGTTCAGA-------------CAGT-C----CGTAC--------GGAAGG------GG-GGGGT-------A----A-TTGAA-----------AAAGGAATTTCAT----TAATCATGC-AAAAGC-AA-ttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 11111 1111111111 111 11111111 1111 111111111111111 1111111111111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 66666666666666666666666666666666 1111 2222222222222 1111 11111 11 1111 22222222 111111 444444444444444444444444444444 222222222 1 2222222222222 555555555555555555555555 111111111 11 33333333333 1111 44444444444444444 44444444444444444 222 2222222222 1111 1 1111 222222222 4444444 33333333 111111 111 1111111 111 44444444444444444444 11 11 1 11 111111111 11111111 444444444444444444444444444444444444 111 2222222222222 111111 111111 111111 111 22222 11 11111 1111 1111111111111111111 222 1 22 11111 1111 11 1111111111111 11111111111111 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 11111111111 111111111 1111111 1111111 11111111 333333333 111111 1
lowQualScore : 888 33 2 8 0 2 2 77777 11111 2 555 2 0 33 3 1 33 8888888888 3 3 3 3 3333333333 11 3 2 33 33 33 33 7 33 2 2 2 0 2 555 555 77777777 3 6666 3 0 2 6 3 3 0 3 44 3 3 2222 44 555555555555555 1 1 2 3 3 0 55555 3 3 3 3 3 3 55 55 7777777777777 4 4 44 4 4 6666666 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0000 5 5 5 00000000000000000000000000000000 4 5555 4 1 7777777777777 4 66 0 4 9999 66 4 4 4 9999 0 55 66 8888 2222 4 9999 4 555 999999 0 22222 00 77 5 7777 44444444 999999 6 999999999999999999999999999999 1 6 3 888888888 1 5 1111111111111 3 6 6 444444444444444444444444 6 1 999999999 1 888 1 11 0 77 88888888888 99 55 4444 44444444444444444 6 00000000000000000 0 000 0 5 5 5 9999999999 5 3333 77 0 5 1 2222 111111111 33 3 5 1 77 1111111 1 5 1 77 8888 77 5 66 0 0 6666 1 5 88888888 666666 999 66 2 5555555 3 5 5 777 5 0 88888888888888888888 33 33 0 0 11 8 777777777 8 77777777 1 333333333333333333333333333333333333 9999 4 777 4 4 99 4 66 0 4 555 33 0 5 5 0000000000000 111111 8888 1 111111 55 66 1 4 777 0 55 4 4 3 0 666666 66 111 1 6666 0 0 00000 11 11 0 00000 5 0 1 66 0000 8888888888888888888 0 0 5 6 6 44 3 7 222 0 11 6 22222 1111 22 66 55 888 5 44 0 7 5 4 1 4 1111111111111 55 44 3 3 44 3 44 66666666666666 0 44 777777777 99999 4444444444444444444444444444444444444444444 55 3 3 55 3 7 2 00000000000 777777777 66 66 4444444 4 8 4 4444444 66 88888888 1 222222222 222222 66 0 0 66 5
lowQualScore : ... .. . . . . . ..... ..... . ... . . .. . . .. .......... . . . . .......... .. . . .. .. .. .. . .. . . . . . ... ... ........ . .... . . . . . . . . .. . . .... .. ............... . . . . . . ..... . . . . . . .. .. ............. . . .. . . ....... . ......................................................................... . .... . . . ................................ . .... . . ............. . .. . . .... .. . . . .... . .. .. .... .... . .... . ... ...... . ..... .. .. . .... ........ ...... . .............................. . . . ......... . . ............. . . . ........................ . . ......... . ... . .. . .. ........... .. .. .... ................. . ................. . ... . . . . .......... . .... .. . . . .... ......... .. . . . .. ....... . . . .. .... .. . .. . . .... . . ........ ...... ... .. . ....... . . . ... . . .................... .. .. . . .. . ......... . ........ . .................................... .... . ... . . .. . .. . . ... .. . . . ............. ...... .... . ...... .. .. . . ... . .. . . . . ...... .. ... . .... . . ..... .. .. . ..... . . . .. .... ................... . . . . . .. . . ... . .. . ..... .... .. .. .. ... . .. . . . . . . ............. .. .. . . .. . .. .............. . .. ......... ..... ........................................... .. . . .. . . . ........... ......... .. .. ....... . . . ....... .. ........ . ......... ...... .. . . .. .
lowQualScore : 999 99 9 6 4 4 9 11111 99999 9 111 9 8 99 6 7 99 4444444444 1 5 1 1 5555555555 55 1 9 99 99 99 99 6 99 9 9 0 6 9 111 444 55555555 1 5555 5 8 1 2 1 1 5 1 22 1 1 0000 22 777777777777777 2 4 2 6 6 5 99999 3 3 3 3 3 3 55 55 5555555555555 0 1 77 0 4 7777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 1111 7 7 7 00000000000000000000000000000000 4 6666 4 1 1111111111111 4 33 1 6 4444 11 4 4 4 4444 8 66 11 8888 7777 4 4444 4 444 666666 4 33333 77 00 0 0000 22222222 222222 7 333333333333333333333333333333 0 7 7 222222222 0 5 0000000000000 2 7 7 222222222222222222222222 7 5 777777777 0 000 0 00 8 88 00000000000 22 88 2222 77777777777777777 6 00000000000000000 7 000 7 7 7 7 4444444444 7 0000 99 4 7 4 1111 444444444 11 0 7 7 99 6666666 4 7 6 99 1111 99 0 00 3 7 3333 3 7 88888888 444444 333 99 5 8888888 2 7 7 999 7 8 22222222222222222222 00 88 0 8 00 0 444444444 0 22222222 0 111111111111111111111111111111111111 4444 4 888 4 4 88 4 11 8 4 999 99 1 0 0 7777777777777 555555 5555 0 555555 55 11 1 4 000 9 55 0 0 2 8 666666 11 666 0 0000 3 4 11111 55 99 8 00000 0 4 4 99 6666 9999999999999999999 7 6 7 6 7 77 2 5 222 6 22 0 22222 7777 33 99 22 888 0 99 1 2 6 0 6 3 9999999999999 00 66 3 3 66 1 22 77777777777777 3 66 555555555 11111 2222222222222222222222222222222222222222222 55 6 6 00 6 3 0 22222222222 888888888 11 11 4444444 4 9 4 9999999 99 11111111 0 333333333 888888 11 5 0 99 7
consensus : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--ATTATTAATTAAT---T---CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCCCCCC--------------AAA-----TCGAA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
Reference ( family-1000 ) : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--ATTATTAATTAAT---T---CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCCCCCC--------------AAA-----TCGAA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|1 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA--TCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGTA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTGTTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGTTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AACGACCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAAC-G-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGG-ATC-CCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GTTACA-----TGT----CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTGA-----------T---------C------------GTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---ATCT--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAATCAGTCC----CGTAC--------CTCGGG------TA-GGGGG-------T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTCC-TCAGTT--TCCTGCAAAAAGC-AACA-TAGCACCCTTAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-ACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGAC--GAAAATTTGTGGTTTATACAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCTGTGTCTT----TTA--ATT------CAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-CCATGGTGGG-G-T-GCGTTTGC-----------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTCG---------ATTCCACTCTGTA-TATTA--ATTATTAATTAAT-----------------CG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CAATA-ATGTACACTGAAC------GTAA-ATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGG-ACA-TTATTTAAAGAACT--A-TGT-------------AAAG-AATTGC--TTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAAT-ACAA-AATATTAACACGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATTAAAACACTTTC-AA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCCGACATTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAA-TACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-TATA---------T---TTTATTATGATT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNATTAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTTGCTA-GGGGTCATGATTCGT-AGCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGATCGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA--TATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATAATAGAACCA--TTAAA-GTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACC--AG-AA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---ATTTTT--TT---------TTTTTTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-CAATC-ATAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-ATTGAC
gi|10 : CCCCCCCCC--------------A--------CGAA-----GCAAC-ATT---------------AACATTTCGGGCACCC-CCGA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAG-AACCGTACGT-----A--GTTATTCGTATC-AAAA---GAGATATG--CAATATT----TTTTTAG-AATATA---------T---ATTGTGATAACTCATGACA----ATGAGA------AATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CAT-------------------------------ATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-T-GGGT--------------------------TGGGAA--AATCCGTGGGTTCCGATTATGATAC-GGCTTTTAATCATTTTGAAA----TACTCATTAA-A-------CTTTGACACCTGATGGCTA-GGGGACGTGATTTCTAAGCTCCTTGTCA-AAA----------TCATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCATT-ATT---GACTAGTTCAAACT-GATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGT-CCATATCAA--TGAAA-TGAC---TGAGATATTTCG-TTAA---------------TTA-CACT---------------------GTTT--TCAT--GGATGGGC-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--t
gi|11 : GTAAT---AT--GA-AACGA-TTTCCAAAG-AAAATG----AGTT---A-TG-CATAGG-A-ATTCATTTATCA--AGTTTTATTAAACAAG--AATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TCACGACAA-TG-----------CTCGCGGCTT---A--T--C------TGG-TGATGAAGTCAA----AAAGACTCACCGTGA-TT-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AC---CTAC--G---CAT--TTAC-----TGCATAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATT-C-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CA--TGCA---C--C----T-CTATCCTAGGAATA-CCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATAtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|11 : a-----------T---------T----------TTCTTATT-GCC----A-ATCATAAA---------AT-CT-CG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCA---TTCT--GA-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|12 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttaGGTCATTA-ATTTGA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACC-ACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TAAAT-GT-ATAATTAAC--AAAT--------------------GCTAT-GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TA--TGTA---CA-T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCATA-TTCAG-AA--G----AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGC
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGAA--GGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACGCAATTAACAGGCATTT--CATTCATCCGTGTCTGCATGTTA---TT------AAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGT-----------------ACATAG-CTATGGTGGG-GGT-GCGTTTGCA--TTTCATATCCC-CTTT---ACA--AAACCAAACCAC-AATATT----AAAGTTGG--------ATTTCACTCTGTA-CATTG--ATTATTAATTAG----T---CTAAAA-TATCG--CA-TCACC--TACACAACAT-TCTGGGTATGG------------------ACCTATA---------------CGCTGAAT------GTAC-G-TG--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG--------AGTATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTc
gi|14 : gGGTCAT---AT--GA-AACGATATTTTGGAG-AAATTG----GGTT---A-TG-GATGGG-A-ATTCATTAGT-A--AG-----------AAG--CATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TCACAAAAA-TGATCTTCGATGACCC----CAG---A--T--T--AC-ATGC-TGATAACGTCAA----AAAGACCC-------------------AACTG-TT--T-G--AC---T-----------------C-----TGCGTAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AAC-T-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CA--TGTG---C--G----TATT-TCCTAGGGATT-CCGAA-TTTAG-AAAGA----AA
gi|15 : TTTTCTAT-GAAC-GTTTAGATGT--TTATTCCGATGGGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCAC---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAAT-AA---TCAGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GTTACAGTTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAACAAAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTA-TTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTACAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTTATTGTTAGTAAATATTGTTTAA-catacgggtacaaaatcta
gi|16 : AGGTCATGAAAT--AATAAAAA-A-----AAA-AAATGC----A-TT---A-TA-TATGGGGA-ACTCCTTTATCA--AAATTTATTTAACAAG--AATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TCACAATAA-TGATCTTCGATGA-TCGCGACTT---ATCT--C--CCTTGGC-TGATGACGTCAA----AAAGACCCCTCGTGA-TG-TAACC-AAAACAG-TT--T-GT-A--------------TAT--TTCC-----TGCATAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGC
gi|17 : AAGCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAATTA-CACTAGTTTCTATTG-------------------------TGGGT-G-TTTGTGACGACGCA--AG-CA--CTCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----CATG--------C--------ACAAGTTTAAA--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACGAT-GC-AAAGACAAT---A-TT-------------------TTTTATGGAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ACAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACCAATGTTAG-AA--TTGGTTTCT-TAc
gi|18 : A-A-T-GCACAAATAAAGTTGGATTT-GCTCTGAATATTC-ACT-ATTAATTAG-------------------------------------------TTATAAA--TTCTCTTTCAATC
gi|18 : catacagTCAAGTCAGACCCGT-----------------ACAAAGGC-AT--TGAA-G-T-GCATTGGCAACC-------CCC-CTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAG--------AGTTTACTTTGTT-CATTG--ATTATTAATT--T---TC--CTAAAA-TTGTGTACA-T--CC--TTC-TAAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAtcaaaacgcaattttttcaagtcagacccgtacaaaggcattgaagtgcattggcaacccccctcccgaaaagcaaaataaattgcactatcaaagtcagagtttactttgttcattgattattaattttcctaaaattgtgtacatccttctaaaacatctgggtatgggcctgcaa
gi|19 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TCTCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AACGATCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TA--TGTA---C--C----TGTT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTa
gi|2 : AAGTCAT---A---GA-AACAA-ATCC----G-AAAATT----AGTT---CGTGGCATGCA-A-ATTCATTA-TCA--AG--TTATTGAAGCAG--AATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTCTCGAAAAATGATTT--GATGATCAGCG-CTG---A--T--C--TCTT-GC-TGATGAAGTCAG----AA--ACCGACCACAA-TGATTAAC-AAA-CA---T--T-GTTAT---TAAC--AAATTAT--TCACGGCTGTGCATAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATT-TTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TA--TGT----C--T----T-TA-TCCTGG--ATC---AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACA---GT-AGG-----TGTAATCT-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------TTATTATTTTC----------TTGTTATCTGAC----A-AT-A---A---------AT-C--AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCA---ATC---GC-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCG-TATAATAAC-AATCAGTGCATGTCGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGGGGGGGGTT----AAGTGTAT----------GTA-GAATC--------T--TCCTGCAAAAAGC-A-----------CTTTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTAG-A----A---------------T-CTATCAGCATATTTGA--TGTATGA---TTCTCTT-GAATCCGGCCCGAAAATT-GCTGTT-ATGCAAAA-GCA-----------TTT--CATTCA-AAATGTCTG----TTACGGGT------AATGTGTATCATTAAGTCAGGCC-GT-----------------A-ACAG-C-ATGGTGGA-G-T-GCGTTCGCA----------CCC-CTGG---AAA--AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTCGGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAGTGAAATTATTAATTAATTG-T---CT-AAA-TAATG--CA-C--C----TCACAAAAA-TTTGGGTGTGGGGC-TCATCTAAGAATTAACTTA-ATTTCCA-TA---ATACGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT------------GAGTT-GG-TGGGTGTGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AA-GT-------------AAA------ACGGCTGCAGATAGATGAAAACGCACCATTAACC-TCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT--ATACG-------------------------AAA-----CCGA--------AACGATTTGTG-ACTAAAGTCAGACATTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AA-TACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAA-CATA---------CTTGTTTA-TACGATT------A----AT-AGA------AAT--A---CAT-CCACG-------------------TGCA--AGTTTCGATGAGTATGCA-----AATA-GGCTTTCAATCGTCGGAATTCATC-GGGTTGTCT-TCTATCACACTTGCATTCAGTTGCAA--AATCTACGAGTTC-------GAGAC-GG-----AA-C--CTTTAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTT-GTAGCTA--GGGTCATGATTCGTAAGCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGAT-A--CTCTTTT-AT-AATCGTCAT
gi|2 : GAAAAAAGGCAATTTTGAGTCA--AAACAAAA-----TAT--TATAACCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATTAAA----ACAGTGTAAATTATCACTATTT-CTAAT---C-GGT---GTTTGTTCAT--CGATTGGT-CGTTTGGTACGTCACC--AG-GA--CC------A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATT-AA------ATTCAAAAAAATA--------C--------A-------------------T-----TTTAT--TGT-TTT--AA-AAT-ACAAAAGAC-AT---A-------TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-TATTC-ATAC-----------------------------TATAAAG------------------------CCAATGTTAGAAA--ATTGaaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|20 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaaAGGTCAT---AT--GA-AACAATATTCTGAGG-AAATTA----AGTT---G-TG-CATGGA-A-ATTCACT------------TAT----CAAG--G-----TTT----ATT-AA---------------------------ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TCACGAAAA-TGATCTTCGATGAT------------A---------CTTGGC-TGATAACGTCAA----AAAGATCTGTCGAGA-TG-TAAAC-AAAACAG-CT--T-GT-A----TAAC--AAAGAAT--TTAC-----TGCA------T-GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATT-T-AGTCGTA-GTA-GTAGGCaattcaattgaccttga
gi|21 : --CAATGGGA-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCACTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AAC-AAATATTCATTC-----CATT--------C--------AC--------AAGTTTAAAGG-----TTTAT--T-T-TTT--AAAAAT-GC-ATCGGCA-------TTTT--TT---------TTAATTTTAAGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTA-GTAT----A--AATCTTT--ACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACCAACGCTAG-AA--ATGGTTTCA-TATGAC
gi|22 : --------------AAA-----TCAAA-----C-AA-GACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGC-GAGG---AAAAACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTT
gi|22 : ttaaCTGTA---GATTTGCACAAG-TTCA-TGAATTCGCCTTTATAATACAGCTTC--ATAGTCAGAACTCG-CTGGCTTTCTC-TCCATCAacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|23 : ttaaaaatcaaacaagacttgtgaactttaggcaggtcgggcgcgcgaggaaaaactaccgtattatgaaataactgtgcgtctgtggttaaaggaaaaggattttcttatatttacttcgG-CA--CTCAC---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AAC-AAA--TTCATTC-----GATG--------C--------AC--------ATGTTTACAAC-----TTTAT--T-TTCTC--AACAAT-GC-AAAGGCATTTTTA-TTTA--TTATCATTATCTTTATTTTATACAAT--T--TAA-------CT-TTTCATTC-ACAC----T--AATCTCT--ATGT--------TTGTATAGT--------AAAA------A--ttcattcaat
gi|24 : AATCA--CGGTTTATCAAACAAG--AATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT-----------------A-TGATCTTCGTTGATT-GCAGCTT---A--TTTC--CCTTTCC-TGATGACGTTAA----CAAGACCCACCATGA-CG-TCATC-AAATCAG-CT--T-GT-A----TAACTTTAAGTAT--TTAC-----cctttatatggtgaggaaattttgcaat
gi|25 : TT--CATTCATCGGTGTCTG----TT-----------------GTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAG-G-GGGGGGGG-G-TTGCATTCGCA--C-------TTCTCTG------A--AAAC---------A-TATT----CAAGTCGG--------AT---GTTCTGTA-T-TTG--ATAATGCATTAAT---TGCGCTAAAAATATTG--CA-C--CCCCTCCACAAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCT-AGgtc
gi|26 : T---T-AT---ATAA-----T---------AGC-AGCATA-------------ACA-----TGA----C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCC-----------T---------CATTATAGGTTCTGTTATC-GAC----TTATCA---GG--------ATGCC-AGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTGAGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTAg
gi|27 : aaggcgttccAATACGCTT----TATTCGGCTCC--ATCGTTTGAACTCC-C-AGCTTTATTCTCCACCAAAGC-GTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTT-------TTAAAT----TAATTGT--A-AAACTTTAGT-----ATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTC
gi|28 : ---TTTATTACGCCT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-CG-------------AGTACGCCTNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN---------ATAC-AGCATTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GC-----ATTaatatcatcaac
gi|3 : AGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCC--AGGTTTACTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TCACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAACGACC-ACAGTGAATG-TAAACTAAAAC-G-TT--T-GC-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATT-T-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---CCTT----T-TT-TCCTGGGGATT-CCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGTCC-----------T---------CATTATTTC--TTGTTATC-GACTC--A-ATCA---G---------AT-CCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCC---ATGC--GA-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGCAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGGGTATTGGGTATTGTA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-AAT-GCACCTTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTCA--TGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGAC--GAAAATTTGCTATTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CAATCATCAATGTCTG----TTA--ATT--------T---TATCATCAAGTCAGGTCCGT-----------------ACACAGCC-CTGGTGGGAG-C-ACGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTCTA-TTTTG--ATTATCAATTAATTTGT---CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--CTC---------CTA----------------T-AGAAATAACTTATATTC-C-----ATATACGCTGAAC------GTAC-A-TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAG--CTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT----ATGCCCACCCTC-----------------AA-----TCAAACACTTG-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TCCATTACGATT------A----Agtt
gi|30 : GGTCAT---AT--GA-ACTAT-ATTC-AAAG-AAGTGA----AGTT---A-TG-AATG-G-ATACTCATTA--TA--CGGCTTATTAAACCAG--AATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---CAC-AAAA-TGAATTTC--TGA-TCGCAGTT
gi|31 : atTTCATCT-AGAATTAACCTATATTC-AA-TATATATACGCTGAAC------GTAC-G-TA--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GGAT-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAAGGGGCAAATG-TAATTGAATGA--T--AA----------------AAAT-AAT
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-G-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--a
gi|33 : AGGGTGCATTC-CA-TATTTTC-ATTG--CTGCT---GTTT--TCAT--CGAT-GGT-C-TT--TGACGT---A--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CAAG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--TTC-CATTATTTTC-ATTG--C-GCT---GTTT--TCAT--CGATGGAT-C-TTT-TGACGCCACA--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CATG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|35 : tgCATTT-----------T---------C----------TTGTCATC-AAT----A-ATAA---A---------AT-CT-AGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCA---TTTT--GA-AA-----TAAAAAA-AA
gi|36 : ctcacttcctcaaaagtatataacattA--TTCAA-TTAA---TGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA---TA-CA---------GTTC--C-ACT---GTTT--TCAT--GGATGGGT-C-CTTGTGACGTCACA--AA-CA--CCCgaaa
gi|37 : AAGGTAAT---AT--GA-AACGATATTCTGAAG-AAGCCG----AGTTAATT-TG----GGG-A-ATTCATTAATCA--AGTTGTGCTACACAAA--AGT
gi|39 : tAATTCGGATTTTATTCTGGATTTTG-A-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT-A--TTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|4 : GGTCAT---AT--GA-AACAA-ATTCCGAAG-AAATTG----AGTC---C-TG-CATGCC-A-GTTCATTAATCA--AGGCTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TTTCCAAAA-TGATTTTCGA-GGGTCGCGGCTG---ATCT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACT-----------------ACAA-TT--TAGC-TT---TGAA--AAAT-------GC-------CACAG---T-G-----T-GCTACATT-------TA---ATTGT-AGTAGTA-G-------GTCGCAGAAGGTTTTGACTATA--TGTAC--C--T----C-TT-TCCTGGGGATC-CAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---------------A---GT-ACA-----TGT----C-TC----TA-CAC-TCATACT---CATTT-----------T---------C----------TTGCTATT-GAC----A-ATCA---A---------AT-CA-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-----TT--------GT-----A-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATTCAGAA--------------ATAATAATTAATCAGTCT----TATATTTTCTTTAGAGAAGTAGACAGGCAAGGG-------TTATAA-TTGAA-----------CGA-GAATTCC-------------GC--------------------CTTAAAGTCAGATTTGACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACAAA--T-A--TTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAAA--AAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCA-----------ATTAACACTCAT-----TCTA----TTC--ATCCGTGTAAAT-TGTTACATCAAGTCAGGCC----------------------------------------T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CAGC---AAA--AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG-------------------TCTGTATTATTG--ATTATTAATTAATGTGT---CTAAAA-TATCG--CACC--CC--TCCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-C-----ATATACTCTTAACTTTTATGTAT-GTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGT-TG-G-AGTAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGCGTGG---ACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTAC--CTGC-TATATAATT-AACGCA--AATAACT-TACTATTA------AAAA-AACAT--AC-CCCCCCCCGCCCC--------------CAA-----TCAAA-----A-CACGATTTGGGAACT----TCGGACATTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTA--AG-TTCG-CGAGTACGCCT----A
gi|40 : TATACGCTGAAT------GTAC-G-TA--CGTGTTTACACTG----GGAGG-------GGTATG----T---------TCAT-GAT-AGCGGGG---ACG-TTATTT
gi|41 : GT---GTGCTA-C-ATC-T-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|42 : aacgacaactctgtgcaagagaatg-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---A-TTTTTTTT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATGC----T--AAT
gi|43 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATGCCGAAG-AAATTA----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATT
gi|44 : ttaCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTA--AG-TTCG-T
gi|45 : --------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AC--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|46 : gTA--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATActttaatac
gi|5 : ATTAAATGCA--AATAACC-TACTA------TT-AAAA-AACAT--ATAC---CCCCCGCCC--------------AAA-----TCAAA-----C-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-AACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATACATTTCATAT---TTTATTACGATT------ATTAAATCATA------AAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA-----CTTG-TTAGTACGCCG----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-G-GGTTTTCTT-TCTATCACACTC-TATTCAGTACAAAT-AATTCACAATTTCCGACAATGATAT-GCCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGATCATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-TTATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT-ATATAACCG--ATAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-AA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----TACG--------CACAAGTTTAC--------A--------GC-----TATAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACACT---A---CT--TT---------TTTATATTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCCAATGTTAA-GA--TTTGTTTCA-TATGAC
gi|6 : AC---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAG-AAACTGCATGAGTT---C-CG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAATAAG--AATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT----------TT-CAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGAATTTCGATGAA-CGCGGCTG---AACT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACTGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TG--T-GT-AT---TAAC--AAATT---------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTA---C--TACCCT-TT-TCCTGGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CT---GT-ACA-----TTT----C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGTCCTCATTTTTTTGT---------C----------TTGTTATC-AAC----A-ATAA---G---------AT-CC-AGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---TTCA--CA-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcttta
gi|6 : --------GGGGGG------GG-GGGGGTGT----T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTTC-T----T--TCTTGC--AAAGCAAA-A-T-GCTCCCTTAAATTCGGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|7 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggg-AACGATTTGTGAACC----TCAGACATTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAA-AACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTA---TTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACAATT------A----ATCATA------AAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCATCGGAATTCA-CAGGTTTTATC-TCTATAACA-CTGCATTCAGTACAAA--AATCCACGAGTTCTGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-G-------GT-----ATGTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTACCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCA-TTATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTG-CATCACA--AG-CA--TCAAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------AAG------GT-----TTT
gi|8 : CGATT------A----CTCATATTATTAAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTA--AG-TTTG-TGA-------------ATACGGCTTT--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA--ATTCTGTGAGTTCCAATGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCAT--ATA-------GC-----ATTTGATTGCTA-GGTGTTGTGATTCTTTAGCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---TCATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCATTAATT-CTGGATAGTTCGAACT-AATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCAT-GTATATCCA--TTAAA-ACAA---TGAGAGATTTCT-TTTGTTAGA---GTGTAAATTA-CACTATTTTCTAT-G--C-ATT---GTTT--TCAT--TAATGGGT-C-TTTGCGACATCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAA---TTTGATC-----CATGAACAAGTTT--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAGGACAAT---A-TTTT--TT---------TCTATATTATGCCAT--T--TAA-------CT-TT-CATTCAATACTAATT--AATCTTT--ATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACCAATGTTAC-AA--ATCGTTTCAGTATGACta
gi|9 : AAGGTCAT---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAGAAAATTT----AGTT---TATG-TATGCA-A-ATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AA-TTT-T-GT----------TCTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATCAAA-GTAGCTCCGA-TCTCG-AAA-TGATTTTC--TTATT-GCGGCTGCCTC--T--C--CCTTTGCATGATGACGTCAA----AACG-CCCACCGTGATTG-CAAAT---AACAGTTT--T-GT-GA---TAAC--Actttaag
gi|9 : acttccgtcccttaACAGTTTTGTGATAAC-ATT-C-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTAACCT--T----T-TT-TCCTGGGGATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATATAAGT-GTGGACTATGT----C-TC--T--A-CAC-TCGTATT-CGCGTCC-----------T---------A----------TTATTATC-TATGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CC-AGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCA---TTCC--GA-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GTAAC------------CCGTTCAGA-------------CAGT-C----CGTAC--------GGAAGG------GG-GGGGT-------A----A-TTGAA-----------AAAGGAATTTCAT----TAATCATGC-AAAAGC-AA-ttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 11111 1111111111 111 11111111 1111 111111111111111 1111111111111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 66666666666666666666666666666666 1111 2222222222222 1111 11111 11 1111 22222222 111111 444444444444444444444444444444 222222222 1 2222222222222 555555555555555555555555 111111111 11 33333333333 1111 44444444444444444 44444444444444444 222 2222222222 1111 1 1111 222222222 4444444 33333333 111111 111 1111111 111 44444444444444444444 11 11 1 11 111111111 11111111 444444444444444444444444444444444444 111 2222222222222 111111 111111 111111 111 22222 11 11111 1111 1111111111111111111 222 1 22 11111 1111 11 1111111111111 11111111111111 111111111 5555555555555555555555555555555555555555555 11111111111 111111111 1111111 1111111 11111111 333333333 111111 1
lowQualScore : 888 33 2 8 0 2 2 77777 11111 2 555 2 0 33 3 1 33 8888888888 3 3 3 3 3333333333 11 3 2 33 33 33 33 7 33 2 2 2 0 2 555 555 77777777 3 6666 3 0 2 6 3 3 0 3 44 3 3 2222 44 555555555555555 1 1 2 3 3 0 55555 3 3 3 3 3 3 55 55 7777777777777 4 4 44 4 4 6666666 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0000 5 5 5 00000000000000000000000000000000 4 5555 4 1 7777777777777 4 66 0 4 9999 66 4 4 4 9999 0 55 66 8888 2222 4 9999 4 555 999999 0 22222 00 77 5 7777 44444444 999999 6 999999999999999999999999999999 1 6 3 888888888 1 5 1111111111111 3 6 6 444444444444444444444444 6 1 999999999 1 888 1 11 0 77 88888888888 99 55 4444 44444444444444444 6 00000000000000000 0 000 0 5 5 5 9999999999 5 3333 77 0 5 1 2222 111111111 33 3 5 1 77 1111111 1 5 1 77 8888 77 5 66 0 0 6666 1 5 88888888 666666 999 66 2 5555555 3 5 5 777 5 0 88888888888888888888 33 33 0 0 11 8 777777777 8 77777777 1 333333333333333333333333333333333333 9999 4 777 4 4 99 4 66 0 4 555 33 0 5 5 0000000000000 111111 8888 1 111111 55 66 1 4 777 0 55 4 4 3 0 666666 66 111 1 6666 0 0 00000 11 11 0 00000 5 0 1 66 0000 8888888888888888888 0 0 5 6 6 44 3 7 222 0 11 6 22222 1111 22 66 55 888 5 44 0 7 5 4 1 4 1111111111111 55 44 3 3 44 3 44 66666666666666 0 44 777777777 99999 4444444444444444444444444444444444444444444 55 3 3 55 3 7 2 00000000000 777777777 66 66 4444444 4 8 4 4444444 66 88888888 1 222222222 222222 66 0 0 66 5
lowQualScore : ... .. . . . . . ..... ..... . ... . . .. . . .. .......... . . . . .......... .. . . .. .. .. .. . .. . . . . . ... ... ........ . .... . . . . . . . . .. . . .... .. ............... . . . . . . ..... . . . . . . .. .. ............. . . .. . . ....... . ......................................................................... . .... . . . ................................ . .... . . ............. . .. . . .... .. . . . .... . .. .. .... .... . .... . ... ...... . ..... .. .. . .... ........ ...... . .............................. . . . ......... . . ............. . . . ........................ . . ......... . ... . .. . .. ........... .. .. .... ................. . ................. . ... . . . . .......... . .... .. . . . .... ......... .. . . . .. ....... . . . .. .... .. . .. . . .... . . ........ ...... ... .. . ....... . . . ... . . .................... .. .. . . .. . ......... . ........ . .................................... .... . ... . . .. . .. . . ... .. . . . ............. ...... .... . ...... .. .. . . ... . .. . . . . ...... .. ... . .... . . ..... .. .. . ..... . . . .. .... ................... . . . . . .. . . ... . .. . ..... .... .. .. .. ... . .. . . . . . . ............. .. .. . . .. . .. .............. . .. ......... ..... ........................................... .. . . .. . . . ........... ......... .. .. ....... . . . ....... .. ........ . ......... ...... .. . . .. .
lowQualScore : 999 99 9 6 4 4 9 11111 99999 9 111 9 8 99 6 7 99 4444444444 1 5 1 1 5555555555 55 1 9 99 99 99 99 6 99 9 9 0 6 9 111 444 55555555 1 5555 5 8 1 2 1 1 5 1 22 1 1 0000 22 777777777777777 2 4 2 6 6 5 99999 3 3 3 3 3 3 55 55 5555555555555 0 1 77 0 4 7777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 1111 7 7 7 00000000000000000000000000000000 4 6666 4 1 1111111111111 4 33 1 6 4444 11 4 4 4 4444 8 66 11 8888 7777 4 4444 4 444 666666 4 33333 77 00 0 0000 22222222 222222 7 333333333333333333333333333333 0 7 7 222222222 0 5 0000000000000 2 7 7 222222222222222222222222 7 5 777777777 0 000 0 00 8 88 00000000000 22 88 2222 77777777777777777 6 00000000000000000 7 000 7 7 7 7 4444444444 7 0000 99 4 7 4 1111 444444444 11 0 7 7 99 6666666 4 7 6 99 1111 99 0 00 3 7 3333 3 7 88888888 444444 333 99 5 8888888 2 7 7 999 7 8 22222222222222222222 00 88 0 8 00 0 444444444 0 22222222 0 111111111111111111111111111111111111 4444 4 888 4 4 88 4 11 8 4 999 99 1 0 0 7777777777777 555555 5555 0 555555 55 11 1 4 000 9 55 0 0 2 8 666666 11 666 0 0000 3 4 11111 55 99 8 00000 0 4 4 99 6666 9999999999999999999 7 6 7 6 7 77 2 5 222 6 22 0 22222 7777 33 99 22 888 0 99 1 2 6 0 6 3 9999999999999 00 66 3 3 66 1 22 77777777777777 3 66 555555555 11111 2222222222222222222222222222222222222222222 55 6 6 00 6 3 0 22222222222 888888888 11 11 4444444 4 9 4 9999999 99 11111111 0 333333333 888888 11 5 0 99 7
consensus : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--ATTATTAATTAAT---T---CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCCCCCC--------------AAA-----TCGAA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
Reference ( family-1000 ) : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--ATTATTAATTAAT---T---CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCCCCCC--------------AAA-----TCGAA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|1 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA--TCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGTA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTGTTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGTTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AACGACCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAAC-G-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGG-ATC-CCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GTTACA-----TGT----CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTGA-----------T---------C------------GTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---ATCT--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAATCAGTCC----CGTAC--------CTCGGG------TA-GGGGG-------T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTCC-TCAGTT--TCCTGCAAAAAGC-AACA-TAGCACCCTTAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-ACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGAC--GAAAATTTGTGGTTTATACAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCTGTGTCTT----TTA--ATT------CAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-CCATGGTGGG-G-T-GCGTTTGC-----------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTCG---------ATTCCACTCTGTA-TATTA--ATTATTAATTAAT-----------------CG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CAATA-ATGTACACTGAAC------GTAA-ATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGG-ACA-TTATTTAAAGAACT--A-TGT-------------AAAG-AATTGC--TTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAAT-ACAA-AATATTAACACGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATTAAAACACTTTC-AA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCCGACATTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAA-TACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-TATA---------T---TTTATTATGATT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNATTAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTTGCTA-GGGGTCATGATTCGT-AGCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGATCGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA--TATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATAATAGAACCA--TTAAA-GTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACC--AG-AA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---ATTTTT--TT---------TTTTTTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-CAATC-ATAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-ATTGAC
gi|10 : CCCCCCCCC--------------A--------CGAA-----GCAAC-ATT---------------AACATTTCGGGCACCC-CCGA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAG-AACCGTACGT-----A--GTTATTCGTATC-AAAA---GAGATATG--CAATATT----TTTTTAG-AATATA---------T---ATTGTGATAACTCATGACA----ATGAGA------AATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CAT-------------------------------ATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-T-GGGT--------------------------TGGGAA--AATCCGTGGGTTCCGATTATGATAC-GGCTTTTAATCATTTTGAAA----TACTCATTAA-A-------CTTTGACACCTGATGGCTA-GGGGACGTGATTTCTAAGCTCCTTGTCA-AAA----------TCATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCATT-ATT---GACTAGTTCAAACT-GATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGT-CCATATCAA--TGAAA-TGAC---TGAGATATTTCG-TTAA---------------TTA-CACT---------------------GTTT--TCAT--GGATGGGC-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--t
gi|11 : GTAAT---AT--GA-AACGA-TTTCCAAAG-AAAATG----AGTT---A-TG-CATAGG-A-ATTCATTTATCA--AGTTTTATTAAACAAG--AATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TCACGACAA-TG-----------CTCGCGGCTT---A--T--C------TGG-TGATGAAGTCAA----AAAGACTCACCGTGA-TT-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AC---CTAC--G---CAT--TTAC-----TGCATAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATT-C-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CA--TGCA---C--C----T-CTATCCTAGGAATA-CCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATAtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|11 : a-----------T---------T----------TTCTTATT-GCC----A-ATCATAAA---------AT-CT-CG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCA---TTCT--GA-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|12 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttaGGTCATTA-ATTTGA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACC-ACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TAAAT-GT-ATAATTAAC--AAAT--------------------GCTAT-GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TA--TGTA---CA-T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCATA-TTCAG-AA--G----AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGC
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGAA--GGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACGCAATTAACAGGCATTT--CATTCATCCGTGTCTGCATGTTA---TT------AAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGT-----------------ACATAG-CTATGGTGGG-GGT-GCGTTTGCA--TTTCATATCCC-CTTT---ACA--AAACCAAACCAC-AATATT----AAAGTTGG--------ATTTCACTCTGTA-CATTG--ATTATTAATTAG----T---CTAAAA-TATCG--CA-TCACC--TACACAACAT-TCTGGGTATGG------------------ACCTATA---------------CGCTGAAT------GTAC-G-TG--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG--------AGTATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTc
gi|14 : gGGTCAT---AT--GA-AACGATATTTTGGAG-AAATTG----GGTT---A-TG-GATGGG-A-ATTCATTAGT-A--AG-----------AAG--CATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TCACAAAAA-TGATCTTCGATGACCC----CAG---A--T--T--AC-ATGC-TGATAACGTCAA----AAAGACCC-------------------AACTG-TT--T-G--AC---T-----------------C-----TGCGTAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AAC-T-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CA--TGTG---C--G----TATT-TCCTAGGGATT-CCGAA-TTTAG-AAAGA----AA
gi|15 : TTTTCTAT-GAAC-GTTTAGATGT--TTATTCCGATGGGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCAC---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAAT-AA---TCAGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GTTACAGTTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAACAAAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTA-TTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTACAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTTATTGTTAGTAAATATTGTTTAA-catacgggtacaaaatcta
gi|16 : AGGTCATGAAAT--AATAAAAA-A-----AAA-AAATGC----A-TT---A-TA-TATGGGGA-ACTCCTTTATCA--AAATTTATTTAACAAG--AATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TCACAATAA-TGATCTTCGATGA-TCGCGACTT---ATCT--C--CCTTGGC-TGATGACGTCAA----AAAGACCCCTCGTGA-TG-TAACC-AAAACAG-TT--T-GT-A--------------TAT--TTCC-----TGCATAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGC
gi|17 : AAGCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAATTA-CACTAGTTTCTATTG-------------------------TGGGT-G-TTTGTGACGACGCA--AG-CA--CTCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----CATG--------C--------ACAAGTTTAAA--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACGAT-GC-AAAGACAAT---A-TT-------------------TTTTATGGAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ACAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACCAATGTTAG-AA--TTGGTTTCT-TAc
gi|18 : A-A-T-GCACAAATAAAGTTGGATTT-GCTCTGAATATTC-ACT-ATTAATTAG-------------------------------------------TTATAAA--TTCTCTTTCAATC
gi|18 : catacagTCAAGTCAGACCCGT-----------------ACAAAGGC-AT--TGAA-G-T-GCATTGGCAACC-------CCC-CTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAG--------AGTTTACTTTGTT-CATTG--ATTATTAATT--T---TC--CTAAAA-TTGTGTACA-T--CC--TTC-TAAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAtcaaaacgcaattttttcaagtcagacccgtacaaaggcattgaagtgcattggcaacccccctcccgaaaagcaaaataaattgcactatcaaagtcagagtttactttgttcattgattattaattttcctaaaattgtgtacatccttctaaaacatctgggtatgggcctgcaa
gi|19 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TCTCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AACGATCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TA--TGTA---C--C----TGTT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTa
gi|2 : AAGTCAT---A---GA-AACAA-ATCC----G-AAAATT----AGTT---CGTGGCATGCA-A-ATTCATTA-TCA--AG--TTATTGAAGCAG--AATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTCTCGAAAAATGATTT--GATGATCAGCG-CTG---A--T--C--TCTT-GC-TGATGAAGTCAG----AA--ACCGACCACAA-TGATTAAC-AAA-CA---T--T-GTTAT---TAAC--AAATTAT--TCACGGCTGTGCATAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATT-TTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TA--TGT----C--T----T-TA-TCCTGG--ATC---AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACA---GT-AGG-----TGTAATCT-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------TTATTATTTTC----------TTGTTATCTGAC----A-AT-A---A---------AT-C--AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCA---ATC---GC-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCG-TATAATAAC-AATCAGTGCATGTCGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGGGGGGGGTT----AAGTGTAT----------GTA-GAATC--------T--TCCTGCAAAAAGC-A-----------CTTTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTAG-A----A---------------T-CTATCAGCATATTTGA--TGTATGA---TTCTCTT-GAATCCGGCCCGAAAATT-GCTGTT-ATGCAAAA-GCA-----------TTT--CATTCA-AAATGTCTG----TTACGGGT------AATGTGTATCATTAAGTCAGGCC-GT-----------------A-ACAG-C-ATGGTGGA-G-T-GCGTTCGCA----------CCC-CTGG---AAA--AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTCGGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAGTGAAATTATTAATTAATTG-T---CT-AAA-TAATG--CA-C--C----TCACAAAAA-TTTGGGTGTGGGGC-TCATCTAAGAATTAACTTA-ATTTCCA-TA---ATACGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT------------GAGTT-GG-TGGGTGTGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AA-GT-------------AAA------ACGGCTGCAGATAGATGAAAACGCACCATTAACC-TCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT--ATACG-------------------------AAA-----CCGA--------AACGATTTGTG-ACTAAAGTCAGACATTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AA-TACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAA-CATA---------CTTGTTTA-TACGATT------A----AT-AGA------AAT--A---CAT-CCACG-------------------TGCA--AGTTTCGATGAGTATGCA-----AATA-GGCTTTCAATCGTCGGAATTCATC-GGGTTGTCT-TCTATCACACTTGCATTCAGTTGCAA--AATCTACGAGTTC-------GAGAC-GG-----AA-C--CTTTAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTT-GTAGCTA--GGGTCATGATTCGTAAGCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGAT-A--CTCTTTT-AT-AATCGTCAT
gi|2 : GAAAAAAGGCAATTTTGAGTCA--AAACAAAA-----TAT--TATAACCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATTAAA----ACAGTGTAAATTATCACTATTT-CTAAT---C-GGT---GTTTGTTCAT--CGATTGGT-CGTTTGGTACGTCACC--AG-GA--CC------A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATT-AA------ATTCAAAAAAATA--------C--------A-------------------T-----TTTAT--TGT-TTT--AA-AAT-ACAAAAGAC-AT---A-------TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-TATTC-ATAC-----------------------------TATAAAG------------------------CCAATGTTAGAAA--ATTGaaattcgttattattttgaaaagaaaaaaggcaattttgagtcaaaacaaaatattataaccacgttaaaagtaaaaatgagaaatttctattaaaacagtgtaaattatcactatttctaatcggtgtttgttcatcgattggtcgtttggtacgtcaccaggaccaatcaagagcgataagcgggtattaaattcaaaaaaatacattttattgttttaaaatacaaaagacatatttttattttatgcaatttaacttctattcatactataaagccaatgttagaaaattgaattcaattgaccttga
gi|20 : aagtcatagaaacaaatccgaaaattagttcgtggcatgcaaattcattatcaagttattgaagcagaattccctttggggttaattttttctcaatgcaagaataacgtcatacagctgatcaaatgggctcgagtctcgaaaaatgatttgatgatcagcgctgatctcttgctgatgaagtcagaaaccgaccacaatgattaacaaacattgttattaacaaattattcacggctgtgcatagctgaaaatgcacagtgcgctactattttaatcgtaagtaagtaggcgcagaaggtttgactatgtctttatcctggatcaagtctattagaaagctagcttagtgacagtaggtgtaatcttctgtacactcgtactcgcgtccttattattttcttgttatctgacaataaatcagctattaaatgcaatattggtaaataaacctttcaatcgccatttaaaaaaatttcatttagaaatttcattccgtataataacaatcagtgcatgtcgtacgggggggggggggggggggttaagtgtatgtagaatcttcctgcaaaaagcactttaattcggattttactctggattttggactcaaattagaatctatcagcatatttgatgtatgattctcttgaatccggcccgaaaattgctgttatgcaaaagcatttcattcaaaatgtctgttacgggtaatgtgtatcattaagtcaggccgtaacagcatggtggagtgcgttcgcacccctggaaaaaaacaaactgtatattttaaaaagtcggaacgaaaaattccatctgtatagtgaaattattaattaattgtctaaataatgcacctcacaaaaatttgggtgtggggctcatctaagaattaacttaatttccataatacgctgaatgtacagtgacgtgttgagttggtgggtgtgaaaataatatttgatcatcgacagcggggacgttatttaaagaactaagtaaaacggctgcagatagatgaaaacgcaccattaacctcctagactattggcaagaatatatacgaaaccgaaacgatttgtgactaaagtcagacattgcgcgctcgagaagaaaacactgaactgattatgaataccgccgtaaaagataaaaaaaaaataggattattatacaatttttagaacatacttgtttatacgattaatagaaatacatccacgtgcaagtttcgatgagtatgcaaataggctttcaatcgtcggaattcatcgggttgtcttctatcacacttgcattcagttgcaaaatctacgagttcgagacggaacctttaaataatcgtaagtatttgtagctagggtcatgattcgtaagcttctcttcatagaagctagaagatactcttttataatcgtcataaattcgttattattttgaaaaAGGTCAT---AT--GA-AACAATATTCTGAGG-AAATTA----AGTT---G-TG-CATGGA-A-ATTCACT------------TAT----CAAG--G-----TTT----ATT-AA---------------------------ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TCACGAAAA-TGATCTTCGATGAT------------A---------CTTGGC-TGATAACGTCAA----AAAGATCTGTCGAGA-TG-TAAAC-AAAACAG-CT--T-GT-A----TAAC--AAAGAAT--TTAC-----TGCA------T-GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATT-T-AGTCGTA-GTA-GTAGGCaattcaattgaccttga
gi|21 : --CAATGGGA-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCACTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AAC-AAATATTCATTC-----CATT--------C--------AC--------AAGTTTAAAGG-----TTTAT--T-T-TTT--AAAAAT-GC-ATCGGCA-------TTTT--TT---------TTAATTTTAAGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTA-GTAT----A--AATCTTT--ACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACCAACGCTAG-AA--ATGGTTTCA-TATGAC
gi|22 : --------------AAA-----TCAAA-----C-AA-GACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGC-GAGG---AAAAACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTT
gi|22 : ttaaCTGTA---GATTTGCACAAG-TTCA-TGAATTCGCCTTTATAATACAGCTTC--ATAGTCAGAACTCG-CTGGCTTTCTC-TCCATCAacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|23 : ttaaaaatcaaacaagacttgtgaactttaggcaggtcgggcgcgcgaggaaaaactaccgtattatgaaataactgtgcgtctgtggttaaaggaaaaggattttcttatatttacttcgG-CA--CTCAC---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AAC-AAA--TTCATTC-----GATG--------C--------AC--------ATGTTTACAAC-----TTTAT--T-TTCTC--AACAAT-GC-AAAGGCATTTTTA-TTTA--TTATCATTATCTTTATTTTATACAAT--T--TAA-------CT-TTTCATTC-ACAC----T--AATCTCT--ATGT--------TTGTATAGT--------AAAA------A--ttcattcaat
gi|24 : AATCA--CGGTTTATCAAACAAG--AATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT-----------------A-TGATCTTCGTTGATT-GCAGCTT---A--TTTC--CCTTTCC-TGATGACGTTAA----CAAGACCCACCATGA-CG-TCATC-AAATCAG-CT--T-GT-A----TAACTTTAAGTAT--TTAC-----cctttatatggtgaggaaattttgcaat
gi|25 : TT--CATTCATCGGTGTCTG----TT-----------------GTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAG-G-GGGGGGGG-G-TTGCATTCGCA--C-------TTCTCTG------A--AAAC---------A-TATT----CAAGTCGG--------AT---GTTCTGTA-T-TTG--ATAATGCATTAAT---TGCGCTAAAAATATTG--CA-C--CCCCTCCACAAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCT-AGgtc
gi|26 : T---T-AT---ATAA-----T---------AGC-AGCATA-------------ACA-----TGA----C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCC-----------T---------CATTATAGGTTCTGTTATC-GAC----TTATCA---GG--------ATGCC-AGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTGAGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTAg
gi|27 : aaggcgttccAATACGCTT----TATTCGGCTCC--ATCGTTTGAACTCC-C-AGCTTTATTCTCCACCAAAGC-GTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTT-------TTAAAT----TAATTGT--A-AAACTTTAGT-----ATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTC
gi|28 : ---TTTATTACGCCT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-CG-------------AGTACGCCTNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN---------ATAC-AGCATTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GC-----ATTaatatcatcaac
gi|3 : AGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCC--AGGTTTACTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TCACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-CGCGGCTG---A--T--CTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAACGACC-ACAGTGAATG-TAAACTAAAAC-G-TT--T-GC-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATT-T-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---CCTT----T-TT-TCCTGGGGATT-CCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGTCC-----------T---------CATTATTTC--TTGTTATC-GACTC--A-ATCA---G---------AT-CCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCC---ATGC--GA-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGCAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGGGTATTGGGTATTGTA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-AAT-GCACCTTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTCA--TGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGAC--GAAAATTTGCTATTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CAATCATCAATGTCTG----TTA--ATT--------T---TATCATCAAGTCAGGTCCGT-----------------ACACAGCC-CTGGTGGGAG-C-ACGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTCTA-TTTTG--ATTATCAATTAATTTGT---CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--CTC---------CTA----------------T-AGAAATAACTTATATTC-C-----ATATACGCTGAAC------GTAC-A-TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAG--CTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT----ATGCCCACCCTC-----------------AA-----TCAAACACTTG-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TCCATTACGATT------A----Agtt
gi|30 : GGTCAT---AT--GA-ACTAT-ATTC-AAAG-AAGTGA----AGTT---A-TG-AATG-G-ATACTCATTA--TA--CGGCTTATTAAACCAG--AATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---CAC-AAAA-TGAATTTC--TGA-TCGCAGTT
gi|31 : atTTCATCT-AGAATTAACCTATATTC-AA-TATATATACGCTGAAC------GTAC-G-TA--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GGAT-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAAGGGGCAAATG-TAATTGAATGA--T--AA----------------AAAT-AAT
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-G-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--a
gi|33 : AGGGTGCATTC-CA-TATTTTC-ATTG--CTGCT---GTTT--TCAT--CGAT-GGT-C-TT--TGACGT---A--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CAAG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--TTC-CATTATTTTC-ATTG--C-GCT---GTTT--TCAT--CGATGGAT-C-TTT-TGACGCCACA--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTC-----CATG--------C--------AC--------A------------------AG--T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|35 : tgCATTT-----------T---------C----------TTGTCATC-AAT----A-ATAA---A---------AT-CT-AGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCA---TTTT--GA-AA-----TAAAAAA-AA
gi|36 : ctcacttcctcaaaagtatataacattA--TTCAA-TTAA---TGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA---TA-CA---------GTTC--C-ACT---GTTT--TCAT--GGATGGGT-C-CTTGTGACGTCACA--AA-CA--CCCgaaa
gi|37 : AAGGTAAT---AT--GA-AACGATATTCTGAAG-AAGCCG----AGTTAATT-TG----GGG-A-ATTCATTAATCA--AGTTGTGCTACACAAA--AGT
gi|39 : tAATTCGGATTTTATTCTGGATTTTG-A-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT-A--TTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|4 : GGTCAT---AT--GA-AACAA-ATTCCGAAG-AAATTG----AGTC---C-TG-CATGCC-A-GTTCATTAATCA--AGGCTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TTTCCAAAA-TGATTTTCGA-GGGTCGCGGCTG---ATCT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACT-----------------ACAA-TT--TAGC-TT---TGAA--AAAT-------GC-------CACAG---T-G-----T-GCTACATT-------TA---ATTGT-AGTAGTA-G-------GTCGCAGAAGGTTTTGACTATA--TGTAC--C--T----C-TT-TCCTGGGGATC-CAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---------------A---GT-ACA-----TGT----C-TC----TA-CAC-TCATACT---CATTT-----------T---------C----------TTGCTATT-GAC----A-ATCA---A---------AT-CA-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-----TT--------GT-----A-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATTCAGAA--------------ATAATAATTAATCAGTCT----TATATTTTCTTTAGAGAAGTAGACAGGCAAGGG-------TTATAA-TTGAA-----------CGA-GAATTCC-------------GC--------------------CTTAAAGTCAGATTTGACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACAAA--T-A--TTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAAA--AAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCA-----------ATTAACACTCAT-----TCTA----TTC--ATCCGTGTAAAT-TGTTACATCAAGTCAGGCC----------------------------------------T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CAGC---AAA--AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG-------------------TCTGTATTATTG--ATTATTAATTAATGTGT---CTAAAA-TATCG--CACC--CC--TCCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-C-----ATATACTCTTAACTTTTATGTAT-GTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGT-TG-G-AGTAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGCGTGG---ACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTAC--CTGC-TATATAATT-AACGCA--AATAACT-TACTATTA------AAAA-AACAT--AC-CCCCCCCCGCCCC--------------CAA-----TCAAA-----A-CACGATTTGGGAACT----TCGGACATTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTA--AG-TTCG-CGAGTACGCCT----A
gi|40 : TATACGCTGAAT------GTAC-G-TA--CGTGTTTACACTG----GGAGG-------GGTATG----T---------TCAT-GAT-AGCGGGG---ACG-TTATTT
gi|41 : GT---GTGCTA-C-ATC-T-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|42 : aacgacaactctgtgcaagagaatg-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---A-TTTTTTTT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATGC----T--AAT
gi|43 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATGCCGAAG-AAATTA----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATT
gi|44 : ttaCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTA--AG-TTCG-T
gi|45 : --------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AC--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|46 : gTA--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGG-T-GGTATGAAAATActttaatac
gi|5 : ATTAAATGCA--AATAACC-TACTA------TT-AAAA-AACAT--ATAC---CCCCCGCCC--------------AAA-----TCAAA-----C-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-AACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATACATTTCATAT---TTTATTACGATT------ATTAAATCATA------AAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA-----CTTG-TTAGTACGCCG----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-G-GGTTTTCTT-TCTATCACACTC-TATTCAGTACAAAT-AATTCACAATTTCCGACAATGATAT-GCCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGATCATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-TTATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT-ATATAACCG--ATAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-AA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAA---TTTGTTC-----TACG--------CACAAGTTTAC--------A--------GC-----TATAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACACT---A---CT--TT---------TTTATATTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCCAATGTTAA-GA--TTTGTTTCA-TATGAC
gi|6 : AC---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAG-AAACTGCATGAGTT---C-CG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAATAAG--AATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT----------TT-CAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGAATTTCGATGAA-CGCGGCTG---AACT--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACTGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TG--T-GT-AT---TAAC--AAATT---------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTA---C--TACCCT-TT-TCCTGGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CT---GT-ACA-----TTT----C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGTCCTCATTTTTTTGT---------C----------TTGTTATC-AAC----A-ATAA---G---------AT-CC-AGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---TTCA--CA-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcttta
gi|6 : --------GGGGGG------GG-GGGGGTGT----T----A-TTGTA-----------GAA-GAATTTC-T----T--TCTTGC--AAAGCAAA-A-T-GCTCCCTTAAATTCGGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|7 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggg-AACGATTTGTGAACC----TCAGACATTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAA-AACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTA---TTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACAATT------A----ATCATA------AAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCATCGGAATTCA-CAGGTTTTATC-TCTATAACA-CTGCATTCAGTACAAA--AATCCACGAGTTCTGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-G-------GT-----ATGTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTACCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCA-TTATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTG-CATCACA--AG-CA--TCAAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------AAG------GT-----TTT
gi|8 : CGATT------A----CTCATATTATTAAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTA--AG-TTTG-TGA-------------ATACGGCTTT--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA--ATTCTGTGAGTTCCAATGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCAT--ATA-------GC-----ATTTGATTGCTA-GGTGTTGTGATTCTTTAGCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---TCATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCATTAATT-CTGGATAGTTCGAACT-AATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCAT-GTATATCCA--TTAAA-ACAA---TGAGAGATTTCT-TTTGTTAGA---GTGTAAATTA-CACTATTTTCTAT-G--C-ATT---GTTT--TCAT--TAATGGGT-C-TTTGCGACATCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAA---TTTGATC-----CATGAACAAGTTT--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAGGACAAT---A-TTTT--TT---------TCTATATTATGCCAT--T--TAA-------CT-TT-CATTCAATACTAATT--AATCTTT--ATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACCAATGTTAC-AA--ATCGTTTCAGTATGACta
gi|9 : AAGGTCAT---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAGAAAATTT----AGTT---TATG-TATGCA-A-ATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AA-TTT-T-GT----------TCTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATCAAA-GTAGCTCCGA-TCTCG-AAA-TGATTTTC--TTATT-GCGGCTGCCTC--T--C--CCTTTGCATGATGACGTCAA----AACG-CCCACCGTGATTG-CAAAT---AACAGTTT--T-GT-GA---TAAC--Actttaag
gi|9 : acttccgtcccttaACAGTTTTGTGATAAC-ATT-C-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTAACCT--T----T-TT-TCCTGGGGATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATATAAGT-GTGGACTATGT----C-TC--T--A-CAC-TCGTATT-CGCGTCC-----------T---------A----------TTATTATC-TATGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CC-AGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCA---TTCC--GA-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GTAAC------------CCGTTCAGA-------------CAGT-C----CGTAC--------GGAAGG------GG-GGGGT-------A----A-TTGAA-----------AAAGGAATTTCAT----TAATCATGC-AAAAGC-AA-ttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
blockSeqs : GAA TT T T C A GCATG AATT G GGG T AT T A AT CCCTTTGGGG A T A G ATTATACACA TT A A TA GT CA CA T AG C G A A CTC CCT TCTG A TTTA A C A A T T AA A T TAAT TT TTATTCACGGCTG T C T T T TTTGT A T G T A A TA TG CTACCCT A A AA T C GGGTTTC ACCATGGGTTTAAAATTTCCATATATAAGTAGCCTAATTATATAAGTGTGGACTATGT . TATG A A T TCATTTTTTTGTC T GTTA T C GATAATAAGA G CC A CTCC AA G C G ACAT GC AA ACTT CCCT G GCAA C TTG AAAC ATTAT AT CT G ATGT TTTCTTTA TAGACA C TATTGGGTATTGGGTATT T G C ATTAA C A AAAATGCACC T G C GATTCTAGGATTTGTTGTACTTT T G TATTTGA T ACC G CC TT ATTAACAGGCA AA CC CATG CATCCGTGTAAATT T AGTACCCGTGTGCCCAT CT A G T TTTCATAT T CCGA GC A A TTAA GAACGAAAA TT C T A AA TGCG A A T TA TCA CC A CA GCCT T A AATATA TTTTAT AGT GT G TGGTG A C T CAA T AAAATGTTTTTTTTTTAAAA GA GG A CC . GACTATTG G ATACG C AATCAAACACTTG AAAG G TTA A T TA C AA A AA AA A A CATTTCATAT CATGAC TTAA G TTATTA TA TA C A CGG CA T A G CTTTAT CA TC G ATTC CTTGC GG GA CGATT T T AT . TAAACTTTGAC T A T AA A A TTA T T A TTGAG GGAA C CG AG AAA A AC A A T C T TGAACGTTTAG GT TC A G CT A TT AAATCTTA TT AAATATTC AAAAA CACAAGTTTAAAGC AA G T AA A A A TTTATTTA ATCATTATC AA AA AGTATTG A A A TAATT AC GTCATATA T TTCAATAAG ATACAT CT T AT G
blockSeqs : TA . . T C . G CG . GG . . G T . GTTTTT . T . . . CT . . . . . . A A . . T . CCC . TCTC . . C A T . . . . . . C . TTATATTCAC T C A . . GT . . . . . . . . ACCTTT . G A . . AAC GTATAGGTTTCAAATATGCGCATAAGCTAGCCTAGTCTGTACATTT . TG . . . TCATTATAGGTT . TC . C TAAA . T A . . . . . . C . T CT . . . TTG CTA ATTAG AT TT C . . . . GGGGGGTTAAGTGTAT T . C TT C A AAAATGCTCC T . . GAATA . A TATTTCA G A C . CA . . AA . ACGGGTAATGT C . GC . . . ACC . T . . C . G TT C . A . TTGT A . G . CC . A T GCCT G . CCATA . GT . G TGGGT A . . . . AATGT G . . . . GTACTATT . ACCCC T CCCAATCAAAA . . . . . A . . . TA AT . . CTTG . . G . . . C . . . . . A TT . CT G TCT NNNNN TG T CGCCA . T . . AAAACTTTAGT . A . CA A T TT T T C GG AT A . T . . AC A A . C T TTGCTGCT . . . . . . . TATATGTA . AAATTT . CACAAGTTTAAAGG . . . . . A A ATTTTTT . . . . . T . TCA . . T TACATG . . A . .
blockSeqs : . . . T T . T TA . CA . . A G . CATTTT . T . . . TC . . . . . . T T . . A . TCA . TCTC . . A C . . . . . . . C . GAATTTAC T A T . . TT . . . . . . . . CCTTT . G C . . AGA TTAGAAAGCTAGCTTAGTGACAGTAGGTGTAATC . TT . . . TTATTATTTTC . . . C GG . C A . . . . . . C . A GC . . . TTG A ATTT T C C . . . . TTATAATTGAA G . T TT T . A T . . GAAT . C ACTTA G A G . CT . . CG . ATTAATT C . CC . . . C . G . . . . G TC T . A . GTGT A . A . T . A A GCTT T . CA . G . G TGGAT A . . . . AAGT T . . . . TTA . ATGC C CCAAATCAAAC . . . . . T . . . AA AT . . T . . G . . . C . . . . . A CT . CA C CTC NNNNN GA . CGACA . T . . ATAGC . A . AA A A TT . T T GG AT A . T . . AC A C . C T TTGCGCT . . . . . . . AA . AAATTC . CACATGTTTACAAC . . . . . . A ATTTT . . . . . . . T . . A C . . . . .
blockSeqs : . . . . T . G A . GG . . G A . CCTTTG . T . . . TT . . . . . . T A . . A . GTC . TTTC . . A A . . . . . . . T . GTATTTAC T C T . . GT . . . . . . . . CATT . G T . . AAG TGCTCCTAGTATAAAGCTAGCCTATGTGACA . TG . . . TCATTATTTC . . . A A . T A . . . . . . C . A TT . . . CCA A C A . . . . . . TGTTATTGTA A . T T A . . G . . AAT . A AATA T G C . A . . CA . AATTT C . C . . . C . C . . . . G TC C . T . TGT A . T . C . A T GGC T . CA . A . G TGGGT A . . . . AA . . . TT . ATAC G CCACGAAGC . . . . . T . . . TA AT . . T . . T . . . C . . . . . G CG . T C NNN GCGT NN . TGACG . T . . AAGT . T . G . . TT . T T CA AC G . T . . AA A A . T T TTCCACT . . . . . . . AA . AAATTT . CACAAGTTTACAGC . . . . . . T ATTTT . . . . . . . A . . A T . . . . .
blockSeqs : . . . . C . C C . CA . . G G . CCTTTG . T . . . TG . . . . . . G A . . T . TC . TCTC . . C C . . . . . . . T . TTATTCAC T C T . . GT . . . . . . . . CGTA . G C . . GGG TCCGTATTTAAACTAAGTACATGT . T . . . TT . . . C G . A A . . . . . . C . T CA . . . TT A . . . . . AATTGAA A . . . . . . . . . . . . T A C . . . . . . G . . . C . C . . . . G . . . A . TC A . T . C . . T . . . . . G . T TTGG A . . . . . AAACCGA . . . . . T . . . A AT . . T . . T . . . C . . . . . G CT . C N CTT CTCT AC . CAATG . T . . AAGC . T . . . . . A . . . T . . TT . A . C T ATCGGT . . . . . . . AA . AAATTC . AACAAGTTTACAGC . . . . . . A TTTT . . . . . . . T . . A T . . . . .
blockSeqs : . . . . T . T A . GA . . G A . CCATTG . T . . . TT . . . . . . T G . . T . TC . TCTC . . A C . . . . . . . T . CATTTAC T C T . . GC . . . . . . . . CCTG . G C . . GAA . . . . . TC . . . A A . C . . . . . . . . . G CC . . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . T . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . G T . . T . . G . . . A . . . . . G A . N T ATC CTGC AC . . . . . . TAGT . T . T . . A . A . C T TGCGTT . . . . . . . AG . AAATTT . CACAGTTACAG . . . . . . C ATT . . . . . . . T . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . A A . CA . . T A . CATTT . T . . . TT . . . . . . T G . . A . TC . ACTC . . A C . . . . . . . T . TATTTCC C C T . . AA . . . . . . . . CCTC . G T . . G TC . . . C A . C . . . . . . . . . T C . . . . . . . . . . . . . . A . . . A A . . T . . T . . . . . . . . . . . . G T NNN . AC . . . . . . TGGT . A . . . . . . C . TGCGTT . . . . . . . AA . AATCA . CACAAGGT . . . . . . A ACT . . . . . . . T . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . C . T G . GG . . G G . CTATG . C . . . CT . . . . . . T A . . A . TT . TC . . C A . . . . . . . T . TGC . . . . . GT . . . . . . . . CCT . . C . . . TA . . . . G . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . N N . . . . . . TGCATT . . . . . . . AA . AA . CACA . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . A C . CC . . G G . TTTA . T . . . CT . . . . . . A G . . A . TC . TT . . C T . . . . . . . A . TT . . . . . GT . . . . . . . . CTT . . . . . . T . . . . . . . . . . . . TTG . . . . . . . AA . . . CACA . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . G A . CG . . G G . CG . . . . . T . . . . . . A A . . T . TC . TC . . C T . . . . . . . . . T . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G C . CG . . . . . G . . . . . . . . . . . . . G . . T . AC . TC . . C C . . . . . . . . . C G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A C . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T C . G . . . . . . . . . . . . . . . . T
blockSeqCons : TC* TCTC**** CCTT********* NATTATTGNAT******************* TT******* A************ GAAT******************** ATTTA**** ANTAATT********** C********* G******** TGT**** CA****** G** TGGGT** *** ATNC**** CCAAACCAAAC************************* A** **** TT* T* A* TGCGCT******* AAATTC*** CACAAGTTTAAGC****************************** ATTTT******
originalCons : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATTCGCGGCTG---A--T--C--CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTA---C--T----T-TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGG-------T----A-TTGNA-----------GNA-GAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGC-AA-A-T-GCACCCTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTA--ATT------AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--ATTATTAATTAAT---T---CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTT-CA-TA-ATATACGCTGAAC------GTAC-GTTA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGT-GG-T-GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATAT--ACACGCCCCCCCCCCC--------------AAA-----TCGAA-----G-AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTTATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AA---TTCGTTC-----CATG--------C--------AC--------A--------GC-----TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
finalCons : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGATC-GCGGCTG---ATCTC----CCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTAT--TCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TA--TGTACCTT---------TT-TCCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGGGG------GG-GGGGGNATTATTGNAT-------------------GNA-GAATTCCTT-------TCCTGCAAAAAGCA------------CTTAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGAAT--------------------CTA-CAACAATTTA----TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCATCNGTGTCTG----TTANTAATT----------GTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCAC---------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGG--------ATTCCACTCTGTA-TATTG--ATTATTAATTAATTGT----CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCT-AGAATTAACCTATATTTCA------TATACGCTGAAC------GTACG--TA--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGGT--GGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATT-ACAA-AATATATNC----CCCCCCCCCCAAACCAAAC-------------------------AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAAA--GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATT-ATTTCTGGCTAGTTCAAACT-GATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCATA-TATAACCA--TTAAA-TTAA---TGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATGCGCT-------GTTT--TCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAATTC---GTTC-----CATGCACAAGTTTAAGC------------------------------TTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAATATTTT------TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA
Alignments
lowQualScore : 11111 1111111111 1111 111111111111111 11111 1111111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 66666666666666666666666666666666 1111 2222222222222 1111 11111 11 1111 22222222 111111 333333333333 222222 222222222 1 7777777777 666666666666666666666666666666666666666666 11 33333333333 44444444444444 44444444444444444 222 2222222222 1111 1 1111 22222222222 11111111 22222222222 111111 1 111 44444444444444444444 11 11 1 11 1111111 1111 333333333333333333333 11111 111111 111 2222222222222 111111 111111 111111 111 22222 11 11111 1111 1111111111111111111 11111 1111 11 1111111 11111111111111 2222222222 11111111111 111111111 1111111 1111111 11111111 333333333 111111 1
lowQualScore : 888 33 2 8 0 2 2 77777 11111 2 555 2 0 33 3 1 33 8888888888 3 3 3 3 3333333333 0 3 2 33 33 33 33 7 33 2 2 2 0 2 2 2 0 3 2 3 6666 3 0 2 6 3 3 0 3 44 3 3 2222 44 555555555555555 1 1 2 3 3 0 55555 3 3 3 3 3 3 55 00000 55 1 4 4 44 4 4 6666666 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 5 0000 5 5 5 00000000000000000000000000000000 4 5555 4 1 7777777777777 4 66 0 4 9999 66 4 4 4 9999 0 55 66 8888 2222 4 9999 4 555 999999 0 22222 00 77 5 7777 44444444 6 999999 99 999999999999 6 1 666666 3 888888888 1 2 0000000000 99 3 6 6 111111111111111111111111111111111111111111 1 888 1 11 0 77 88888888888 99 6 1 99 33333333333333 6 6 00000000000000000 0 000 0 5 5 5 2222222222 5 3333 77 0 5 1 2222 0 11111111111 3 5 1 77 33333333 77 1 77 8888 77 5 66 0 0 66 1 5 3 44444444444 5 666666 5 5 66 2 0 77 3 5 5 777 5 0 88888888888888888888 33 33 0 0 11 8 3333333 8 8 7777 1 000000000000000000000 2 44444 666666 9999 4 777 4 4 99 4 66 0 4 555 33 0 5 5 0000000000000 111111 8888 1 111111 55 66 1 4 777 0 55 4 4 3 0 666666 66 111 1 6666 0 0 00000 11 11 0 00000 5 0 1 66 0000 8888888888888888888 0 0 5 6 6 44 3 7 2 2 6 6 22222 1111 22 66 5 0 888 5 0 44 3 4 5 4 22 0000000 555 666 55 44 3 3 44 3 44 66666666666666 0 44 77777 7777777777 55 3 3 55 3 7 2 00000000000 777777777 66 66 4444444 4 8 4 4444444 66 88888888 1 222222222 222222 66 0 0 66 5
lowQualScore : ... .. . . . . . ..... ..... . ... . . .. . . .. .......... . . . . .......... . . . .. .. .. .. . .. . . . . . . . . . . . .... . . . . . . . . .. . . .... .. ............... . . . . . . ..... . . . . . . .. ..... .. . . . .. . . ....... . ......................................................................... . .... . . . ................................ . .... . . ............. . .. . . .... .. . . . .... . .. .. .... .... . .... . ... ...... . ..... .. .. . .... ........ . ...... .. ............ . . ...... . ......... . . .......... .. . . . .......................................... . ... . .. . .. ........... .. . . .. .............. . . ................. . ... . . . . .......... . .... .. . . . .... . ........... . . . .. ........ .. . .. .... .. . .. . . .. . . . ........... . ...... . . .. . . .. . . . ... . . .................... .. .. . . .. . ....... . . .... . ..................... . ..... ...... .... . ... . . .. . .. . . ... .. . . . ............. ...... .... . ...... .. .. . . ... . .. . . . . ...... .. ... . .... . . ..... .. .. . ..... . . . .. .... ................... . . . . . .. . . . . . . ..... .... .. .. . . ... . . .. . . . . .. ....... ... ... .. .. . . .. . .. .............. . .. ..... .......... .. . . .. . . . ........... ......... .. .. ....... . . . ....... .. ........ . ......... ...... .. . . .. .
lowQualScore : 999 99 9 6 4 4 9 11111 99999 9 111 9 8 99 6 7 99 4444444444 1 5 1 1 5555555555 1 1 9 99 99 99 99 6 99 9 9 0 6 9 9 9 1 1 4 1 5555 5 8 1 2 1 1 5 1 22 1 1 0000 22 777777777777777 2 4 2 6 6 5 99999 3 3 3 3 3 3 55 00000 55 6 0 1 77 0 4 7777777 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 1111 7 7 7 00000000000000000000000000000000 4 6666 4 1 1111111111111 4 33 1 6 4444 11 4 4 4 4444 8 66 11 8888 7777 4 4444 4 444 666666 4 33333 77 00 0 0000 22222222 7 222222 22 777777777777 7 0 000000 7 222222222 0 0 7777777777 22 2 7 7 777777777777777777777777777777777777777777 0 000 0 00 8 88 00000000000 22 7 0 22 77777777777777 7 6 00000000000000000 7 000 7 7 7 7 3333333333 7 0000 99 4 7 4 1111 7 77777777777 0 7 7 99 99999999 11 6 99 1111 99 0 00 3 7 22 3 7 2 88888888888 7 444444 7 0 99 5 1 66 2 7 7 999 7 8 22222222222222222222 00 88 0 8 00 0 6666666 0 0 0000 0 999999999999999999999 7 33333 888888 4444 4 888 4 4 88 4 11 8 4 999 99 1 0 0 7777777777777 555555 5555 0 555555 55 11 1 4 000 9 55 0 0 2 8 666666 11 666 0 0000 3 4 11111 55 99 8 00000 0 4 4 99 6666 9999999999999999999 7 6 7 6 7 77 2 5 5 5 7 0 22222 7777 33 99 0 2 888 0 4 88 1 6 6 0 88 2222222 222 444 00 66 3 3 66 1 22 77777777777777 3 66 55555 2222222222 55 6 6 00 6 3 0 22222222222 888888888 11 11 4444444 4 9 4 9999999 99 11111111 0 333333333 888888 11 5 0 99 7
consensus : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-C-GCGGCTG-ATCTCCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAAT--TATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TATG-----TA--CCTTTTT-CCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGG-GG------GG--GGGGGTG----T----TA-TTGNA----GAAGAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGCAA-AT----C-CT--TAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCA-TCNGT--GTCTG----T-TA----T-AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGGA--------TTCCACTCTGTA-TATTGA--TTATTAATTAA-T-TGT-CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCTA-GAATTAACCTATATTT----C-A----TA-TACGCTGAAC------GTAC-GT-A--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGGTGGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATTA-CAA-AATAT----ACGCCCC-----CCC-CCCC--------AAATCA-----AAC-----AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTATTTCTGGCTAGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TT-AAATT---AATGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTT--TTCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAAT--TC-GTTCCATGCACAAGTTT-A-A-GCTTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
Reference ( family-1000 ) : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTN----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAANGT-GCT-CGA-TCNCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-C-GCGGCTG-ATCTCCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACCGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAAT--TATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TATG-----TA--CCTTTTT-CCTGGGGATC-CCAAA-TTTAG-AAGGG----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GT-ACG-----TGT----C-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------T---------C----------TTGTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---NTCC--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTATCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGTAC--------GGGG-GG------GG--GGGGGNA----T----TA-TTGNA---TGNAGAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGCA----------CT--TAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACA-ATTT-A--TNTATAAA--TTCTCTTTNAATCCGAC--GAAAATTTGCTGTTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CATTCA-TCNGT--GTCTG----T-TAN---T-AAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-C-ATGGTGGG-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----AAAGTCGGA--------TTCCACTCTGTA-TATTGA--TTATTAATTAA-T-TGT-CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCCTTCATCTA-GAATTAACCTATATTT----C-A----TA-TACGCTGAAC------GTAC-GT-A--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGGTGGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAC--CTGC-TATAGAATTAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATTA-CAA-AATAT----ATNCCCC-----CCC-CCCC--------AAACCA-----AAC-----AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-NACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCANA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-C-GGNTTTNTT-TCTATCACACCCGCATTCAGTANAAA--AATCCGCGAGTTCCGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCGTGATTCGTNAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTATTTCTGGCTAGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--ANTCAT-ATATAACCA--TT-AAATT---AATGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GCT---GTT--TTCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAAT--TC-GTTCCATGCACAAGTTT-A-A-GCTTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATNAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|1 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA--TCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGTA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTGTTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATTTT-T-TT----------TTTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGATTC-GCGGTTG-ATC--CCTTTGC-TGATTACGTCAA----AACGACCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAAC-G-TT--T-GT-AT---TAAC--AAAT--TATTCAC-----TGCATATCTTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAAAAGGTTTTGAC--TATG-----TA--C-TTTTT-CCTGGG-ATC-CCAAA-TTTAG-AAGAA----AAAAA-GCTAT---T-TT---ATAAGC---T---------AGCTAGCCTA-GTGACA---GTTACA-----TGT----CGTC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTGA-----------T---------C------------GTTATC-GAC----A-ATCA---G---------AT-CC-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---ATCT--GA-CAT----TAAAAAA-AATTGTGA--A---GTATCATTTAGAAATCATCATTCAGAAATAATAATTAATCAGTCC----CGTAC--------CTCG-GG------TA--GGGGG-----------TA-TTGTA----GAAGAATTCC-TCAGTT--TCCTGCAAAAAGCAACATAGCACCCT--TAAATTCGAATTTTACTCTAAATTTTG-ACT-ATTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTT-ACATGTATAAA--TTCTCTTTGAATCCGAC--GAAAATTTGTGGTTTATACAAAACGCA-----------TTT--CATTCA-TCTGT--GTCTT----T-TAA---TTCAT-TGTATCATCAAGTCAGGCCCGT-----------------ACACAG-CCATGGTGGG-G-T-GCGTTTGC-----------CCC-CTGC---AAA--AAACCAAATCGC-A-TATT----GAAGTCG-A--------TTCCACTCTGTA-TATTAA--TTATTAATTAA-T---------------CG--CA-C--CC--TTCACAAAAT-TTTGGTTTTGGGCTTTCATCTA-GAATTAACCTATATTT----C-AATAATG-TACACTGAAC------GTAA-ATTA--CGTGTTTAAATCGGGGTGGAGGTGG-TGGTATAAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGGGG-ACA-TTATTTAAAGAACT--A-TGT-------------AAAG-AATTGC--TTGC-TATAGAATTAAGCGCA--AATACCCCTACTAGTACTAATA-CAA-AATATTAACACGCCCCCCCCCCCC-CCCCCCCCCATTAAAACACTTTCAAG-----AACGATTTGTGAACT----TCCGACATTGTGCGCTCGA-AAGA---AAATACTG-ACTG-ATTATGAAA-TACCGTACGT-CTGTG--ATTACTCGTATC-AAAA-A-GAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-TATA---------T---TTTATTATGATT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCC-CGGTCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCN----NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNATTAATCGT--A-A-------GT-----ATTTGGTTGCTA-GGGGTCATGATTCGT-AGCTCCTCTTCA-AGAAGATAGAAGATCGTCTTCTTTTAATAAATCGTCATTCGCTTGCCGTCA-TATTTCTGGCTAGTTCAAACTTGATATGCGTGTACTACGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACAAAA--AATCATAATAGAACCA--TT-AAAGT---AATGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTATTG--C-GTT---GTT--TTCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACC--AG-AA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AAT-AAT--TC-GTTCCATGCAC---------A-GCTTTAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---ATTTTT--TT---------TTTTTTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-CAATC-ATAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAAGT--------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AA--ATTGTTTCA-ATTGAC
gi|10 : CC-----CCC-CCCC--------A--CGA-----AGC-----AAC-ATT---------------AACATTTCGGGCACCC-CCGA---AAACACTA-ACTG-ATTAAGAAG-AACCGTACGT-----A--GTTATTCGTATC-AAAA---GAGATATG--CAATATT----TTTTTAG-AATATA---------T---ATTGTGATAACTCATGACA----ATGAGA------AATTAA--GC--GCCACGGC--A-TCTACA---CAT-------------------------------ATACGGCTTC--ATCGTCGGAACTCA-T-GGGT--------------------------TGGGAA--AATCCGTGGGTTCCGATTATGATAC-GGCTTTTAATCATTTTGAAA----TACTCATTAA-A-------CTTTGACACCTGATGGCTA-GGGGACGTGATTTCTAAGCTCCTTGTCA-AAA----------TCATCCTCTT-------------ATTCTCTTGTCGTCATTATT---GACTAGTTCAAAC-TGATATGGCTATACTACGGGA-CAAA-AACC---A---AGAAAAAAAAAGGAATCGT-CCATATCAA--TG-AAATG---ACTGAGATATTTCG-TTAA---------------TTA-CACT---------------------GTT--TTCAT--GGATGGGC-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--TCCAC---A---A------TCAAGAACGGTAAGCGGAT--t
gi|11 : GTAAT---AT--GA-AACGA-TTTCCAAAG-AAAATG----AGTT---A-TG-CATAGG-A-ATTCATTTATCA--AGTTTTATTAAACAAG--AATT---------------TTTT-T-TT----------TTTCAA-T-TAAGA-TA--ACA--TCAAT--AAA--TCTGATCAAATTT-ACT-CGA-TCACGA-----------CAATGCT-C-GCGGCTT-ATC------TGG-TGATGAAGTCAA----AAAGACTCACCGTGA-TT-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AC---CTAC--G-----CATTTAC-----TGCATAACTTT-GAAAAAT-GC--CAGT---GTGCTG-C-ATT-C-CATTGTA-ATA-GTAATTCGCAGAAGGTTGTGAG--CATG-----CA--CCTCTAT-CCTAGGAATA-CCAAATTTTAGCAAAAC----AAAAA-GATAtgcagctttatctcgtacgtgtaaatt
gi|11 : a-----------T---------T----------TTCTTATT-GCC----A-ATCATAAA---------AT-CT-CG----T----T--GGAT-CAAT-AT------------------CT--TCA---TTCT--GA-ACT----TAAAAAA-AA----GA--AAACGTATAATTCACAAATTATCATTCAGATATAATcacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttattttcttattgccaatcataaaatctcgttggatcaatatcttcattctgaacttaaaaaaaagaaaacgtataattcacaaattatcattcagatataat
gi|12 : agtaatatgaaacgatttccaaagaaaatgagttatgcataggaattcatttatcaagttttattaaacaagaattttttttttttcaattaagataacatcaataaatctgatcaaatttactcgatcacgacaatgctcgcggcttatctggtgatgaagtcaaaaagactcaccgtgatttaaacaaaacagtttgtacctacgcatttactgcataactttgaaaaatgccagtgtgctgcattccattgtaatagtaattcgcagaaggttgtgagcatgcacctctatcctaggaataccaaattttagcaaaacaaaaagatacacgtgtgcaaaatctctgcataggcttaatttcatttatttttgtaatatagagccacgcccatgtcctgaaaagtatgcaacttttaGGTCATTA-ATTTGA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCA--AGGTTT-------------------------GTT-AATTTT-T-TT----------TCTCAAATGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACACAGCTGATCAAAAGT-TCT-CGA-TCTCGAAAA-TGATTTTCGATGAT-C-GCGGCTG-ATCTGCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACC-ACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TAAAT-GT-ATAATTAAC--AAAT--------------------GCTAT-GAAAAAT-GCCACAGT---G--CTG-C-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCACAGAAGGTTTTGGC--TATG-----TA--CATTTTT-CCTGGGGATC-CCATA-TTCAG-AA--G----AACAA-GGTAT---A-GT---ATAAGC---T---------AGC
gi|13 : TAAACCTTCTCTTTGAATCTGAA--GGAAATTTGCTGTTTTTGCAAAACGCAATTAACAGGCATTT--CATTCA-TCCGT--GTCTGCATGT-TAT---T-AAT-TGTGTCATCAAGTCAGGCCTGT-----------------ACATAG-CTATGGTGGG-GGT-GCGTTTGCA--TTTCATATCCC-CTTT---ACA--AAACCAAACCAC-AATATT----AAAGTTGGA--------TTTCACTCTGTA-CATTGA--TTATTAATTA-----GT-CTAAAA-TATCG--CA-TCACC--TACACAACAT-TCTGGGTATGGACC------------------------------------TA-TACGCTGAAT------GTAC-GT-G--TGTGTTTAAATCGGGGT-GAG------AGTATGAAAAT-ATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTc
gi|14 : gGGTCAT---AT--GA-AACGATATTTTGGAG-AAATTG----GGTT---A-TG-GATGGG-A-ATTCATTAGT-A--AG-----------AAG--CATTGTTTT----TAT-CATATT-T-TC----------TTCCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TGGAT---------CGGTCAAATGT-ACT-TGG-TCACAAAAA-TGATCTTCGATGAC-C-CCA---G-ATTACA---TGC-TGATAACGTCAA----AAAGACCC-------------------AACTG-TT--T-G--AC---T-----------------C-----TGCGTAGATTT-GGGAAAT-AACACATT---TTCCTA-C-AAC-T-AATTGTT-ATA-A-AGGTCGCAGAAGGTTGCGAC--CATG-----TG--CGTATTT-CCTAGGGATT-CCGAA-TTTAG-AAAGA----AA
gi|15 : TTTTCTA-TGAAC-GTTTAGATG--TTTATTCCGATGGGTAC-TTTGTACTGTCAAACTAGACATTCCCAC---A---AATCTTATTAAGA-CGATAAGCGAGTTTAATAA----TCAGTTCCATGCAC-AGTTA-C-A-G-TTTATAAT-G-ATTAAAAAAATAACAAAAGACAAT---A-TTTT--TT---------TTTA-TTTATGAAATAATAATAAAGTATTGCTATTACAATA-ATAC----TCAAATCTTTACATGTGTCATATATTAGTAAAC--------TAAA------ACTTTTTATTGTTAGTAAATATTGTTTAA-catacgggtacaaaatcta
gi|16 : AGGTCATGAAAT--AATAAAAA-A-----AAA-AAATGC----A-TT---A-TA-TATGGGGA-ACTCCTTTATCA--AAATTTATTTAACAAG--AATTCATTT----TTG-GGTTGT-TGTT----------TTTTAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--TCA--ACTGATGAAATGT-ACT-CGA-TCACAATAA-TGATCTTCGATGAT-C-GCGACTT-ATCTCCCTTGGC-TGATGACGTCAA----AAAGACCCCTCGTGA-TG-TAACC-AAAACAG-TT--T-GT-A----------------TATTTCC-----TGCATAGCTTA-AAAAAAA-ACCATCGT---GTGC
gi|17 : AAGCA--TT-AAATT---AATGAGAAATTTCT-TAAAACAAAAC--TGTAAATTA-CACTAGTTTCTA-T-------T---GT--------------GGGT-G-TTTGTGACGACGCA--AG-CA--CTCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAAT--TT-GTTCCATGCACAAGTTTAA-A-GCTTTAT--T-T-CTT--AACGAT-GC-AAAGACAAT---A-TT-------------------TTTTATGGAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ACAC----T--AATCTTC--ATGT--------TTATTAACTTCAATAAGTAAA------A--CACCAATGTTAG-AA--TTGGTTTCT-TAc
gi|18 : TACAGAATGCA----------CAAATAAAGTTGGATTT-GCTCTGAATATTC-ACT-ATTAATTAG-------------------------------------------TTATAAA--TTCTCTTTCAATC
gi|18 : caTCAAGTCAGACCCGT-----------------ACAAAGGC-AT--TGAA-G-T-GCATTGGCAACC-------CCC-CTCCCGAAAAGCAAAATAAATTGC-ACTATC----AAAGTCAGA--------GTTTACTTTGTT-CATTGA--TTATTAATT---T-T-C-CTAAAA-TTGTGTACA-T--CC--TTC-TAAAACATCTGGGTATGGGCCTGCAtcaaaacgcaattttttcaagtcagacccgtacaaaggcattgaagtgcattggcaacccccctcccgaaaagcaaaataaattgcactatcaaagtcagagtttactttgttcattgattattaattttcctaaaattgtgtacatccttctaaaacatctgggtatgggcctgcaa
gi|19 : catacagaatgcacaaataaagttggatttgctctgaatattcactattaattagttataaattctctttcaatctcaaaacgcaatttttGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--ACA--GCTGATCAAAGGT-GCT-CGA-TCTCAAAAA-TGATTTTCGATGAT-C-GCGGCTG-ATCTCCCTTTGA-TGATGACGTCAA----AACGATCCACAGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TT--T-GT-AT---TAAC--AAATTATATTCAC-----TGCATAGCTTT-GAAAAAT-GTCACAGT---GTGCTA-C-ATT-T-GATCGTG-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTAAC--TATG-----TA--CCTGTTT-CCTGGGGATC-CCAAA-TTa
gi|2 : AAGTCAT---A---GA-AACAA-ATCC----G-AAAATT----AGTT---CGTGGCATGCA-A-ATTCATTA-TCA--AG--TTATTGAAGCAG--AATTCCCTTTGGGGTT-AATTTT-T-TC----------T--CAA-TGCAAGAATA--ACG--TCA-T--ACA--GCTGATCAAATGG-GCT-CGAGTCTCGAAAAATGATTT--GATGAT-CAGCG-CTG-ATCTC---TTGC-TGATGAAGTCAG----AA--ACCGACCACAA-TGATTAAC-AAA-CA---T--T-GTTAT---TAAC--AAAT--TATTCACGGCTGTGCATAGCT----GAAAAT-GC-ACAGT---GCGCTA-CTATT-TTAATCGTAAGTAAGTAGGC-GCAGAAGGTTT-GAC--TATG-----T----CTTTAT-CCTGG--ATC---AAG-TCTA---------------------------TT---AGAA---------------AGCTAGCTTA-GTGACA---GT-AGG-----TGTAATCT-TC--TGTA-CAC-TCGTACT-CGCGTCC-----------TTATTATTTTC----------TTGTTATCTGAC----A-AT-A---A---------AT-C--AGCTA-T----T--AAATGCAAT-ATTGGTA----AATAAA-CCTT--TCA---ATC---GC-CAT----TTAAAAA-AATT-------------TCATTTAGAAATT-TCATTCCG-TATAATAAC-AATCAGTGCATGTCGTAC--------GGGG-GG------GG--GGGGGGGGGGGT----TAAGTGTA---TGTAGAATC--------T--TCCTGCAAAAAGCA----------CT--TTAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTGGACTCA--AATTAG-A----A---------------T-CTATCAGCATATTTGA--TGTATGA---TTCTCTT-GAATCCGGCCCGAAAATT-GCTGTT-ATGCAAAA-GCA-----------TTT--CATTCA--AAAT--GTCTG----T-TACGGGT-AATGTGTATCATTAAGTCAGGCC-GT-----------------A-ACAG-C-ATGGTGGA-G-T-GCGTTCGCA--C-------CCC--TGG---AAA--AAAACAAACTGT-A-TATTTTAAAAAGTCGGAACGAAAAATTCCA-TCTGTA-TAGTGAAATTATTAATTAA-T-TGT-CTAAA--TAATG--CA-C--C----TCACAAAAA-TTTGGGTGTGGGGCT-CATCTAAGAATTAACTTA-ATTT----CCA----TAATACGCTGAAT------GTACAGTGA--CGTGTT-------GAGTTG--GTGGGTG---TGAAAATAATATTTGATCATCGAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AA-GT-------------AAA------ACGGCTGCAGATAGATGAAAACGCACCATTAACC-TCCTAG-ACTATTGGCAAGAATAT----ATACG-----------------------AAACCG-----AA-------ACGATTTGTGA-CTAAAGTCAGACATTGCGCGCTCGAGAAGA---AAACACTGAACTG-ATTATG-AA-TACCG------CCGTA--A--A---AGATA-AAAA-A-AAAATAGGATTATTA-TACAATTTTTAGAA-CATA---------CTTGTTTA-TACGATT------A----AT-AGA------AAT--A---CAT-CCACG-------------------TGCA--AGTTTCGATGAGTATGCA-----AATA-GGCTTTCAATCGTCGGAATTCATC-GGGTTGTCT-TCTATCACACTTGCATTCAGTTGCAA--AATCTACGAGTTC-------GAGAC-GG-----AA-C--CTTTAAA----TAATCGT--A-A-------GT-----ATTT-GTAGCTA--GGGTCATGATTCGTAAGCTTCTCTTCATAGAAGCTAGAAGAT-A--CTCTTTT-AT-AATCGTCATAAATT---CGTTATTATTT-TGA-------AAA-------------------GAAAAAAGGCAATTTTGAGTC--AAAACAAAA-----TAT--TATAACCACGTTAAAAGTAAAAATGAGAAATTTCTATT----AAAACAGTGTAAATTATCACTA-TTTCTA-AT--C-GGT---GTTTGTTCAT--CGATTGGT-CGTTTGGTACGTCACC--AG-GA--C---C---A---A------TCAAGAGCGATAAGCGGGT--ATTAAAT--T----------CAAAAAAAT-A-C-ATTTTAT--TGT-TTT--AA-AAT-ACAAAAGAC-AT---A-------TT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TC-TATTC-ATAC-----------------------------TATAAAG------------------------CCAATGTTAGAAA--ATTG
gi|20 : AGGTCAT---AT--GA-AACAATATTCTGAGG-AAATTA----AGTT---G-TG-CATGGA-A-ATTCACT------------TAT----CAAG--G-----TTT----ATT-AA---------------------------ACAAGA-TATAACG--TTAAT--ATA--GCTG--CAA--GT-ACT-CAA-TCACGAAAA-TGATCTTCGATGAT-----------A-----CTTGGC-TGATAACGTCAA----AAAGATCTGTCGAGA-TG-TAAAC-AAAACAG-CT--T-GT-A----TAAC--AAAG--AATTTAC-----TGCA------T-GAAAAAA-GTCACAAT---AAGCTG-C-ATT-T-AGTCGTA-GTA-GTAGGCaattcaattgaccttga
gi|21 : --CAATGGGA-C-TTTGTGACGTCACA--AG-CA--CCCACTATATGTA------TCAAGAACAATAAGCGGGT--AACAAATATTC-ATTCCATTCACAAGTTT-A-AAGGTTTAT--T-T-TTT--AAAAAT-GC-ATCGGCA-------TTTT--TT---------TTAATTTTAAGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTA-GTAT----A--AATCTTT--ACGT--------TTACAAAGTACATG---TAAAATACATA--TACCAACGCTAG-AA--ATGGTTTCA-TATGAC
gi|22 : --------AAATCA-----AAC-----AA-GACTTGTGAACT----TTAGGCAGGTCGGGCGCGC-GAGG---AAAAACT--ACCGTATTATGAAATAACTGTGCGT-CTGTG--GTT-----------AAA-G-GAAA-AGGATT-TTCTTATATTT
gi|22 : ttaaCTGTA---GATTTGCACAAG-TTCA-TGAATTCGCCTTTATAATACAGCTTC--ATAGTCAGAACTCG-CTGGCTTTCTC-TCCATCAacttcgctgtagatttgcacaagttcatgaattcgcctttataatacagcttcatagtcagaactcgctggctttctctccatcattcattcaat
gi|23 : ttaaaaatcaaacaagacttgtgaactttaggcaggtcgggcgcgcgaggaaaaactaccgtattatgaaataactgtgcgtctgtggttaaaggaaaaggattttcttatatttacttcgG-CA--CTCAC---A---G------TTAAGAACGATAAATGGGT--AACAAAT--TC-ATTCGATGCACATGTTT-ACA-ACTTTAT--T-TTCTC--AACAAT-GC-AAAGGCATTTTTA-TTTA--TTATCATTATCTTTATTTTATACAAT--T--TAA-------CT-TTTCATTC-ACAC----T--AATCTCT--ATGT--------TTGTATAGT--------AAAA------A--ttcattcaat
gi|24 : AATCA--CGGTTTATCAAACAAG--AATTCATTT-----TC-AATTTTAT-CTATTATACACATTGCAA-TTTAAGA-TA--ACA---CAAT--GCA--TTTGATGAACTGT-----------------A-TGATCTTCGTTGAT-T-GCAGCTT-ATTTCCCTTTCC-TGATGACGTTAA----CAAGACCCACCATGA-CG-TCATC-AAATCAG-CT--T-GT-A----TAACTTTAAG--TATTTAC-----cctttatatggtgaggaaattttgcaat
gi|25 : TT--CATTCA-TCGGT--GTCTG----T-T------------GTATCA---AGTCAGGCCCGTAGTACCCGTGTGCCCATACACAG-G-GGGGGGGG-G-TTGCATTCGCA--C-------TTCTCTG------A--AAAC---------A-TATT----CAAGTCGGA--------T---GTTCTGTA-T-TTGA--TAATGCATTAA-T-TGCGCTAAAAATATTG--CA-C--CCCCTCCACAAAAT-GCTGGGTAT-GGCCTTCAGCTA-Ggtc
gi|26 : T---T-AT---ATAA-----T---------AGC-AGCATA-------------ACA-----TGA----C-TC--TTT--CACATCGTGCTTCGCGTCC-----------T---------CATTATAGGTTCTGTTATC-GAC----TTATCA---GG--------ATGCC-AGCTAAT----TAAAAAT-TAAT-ATTG-TAACATAATAAAGCCTT--TCAACTTTCCCTGAGCATGCAATAATAAA-ATTTGTGACTA---GAATCACTTAg
gi|27 : aaggcgttccAATACGCTT----TATTCGGCTCC--ATCGTTTGAACTCC-C-AGCTTTATTCTCCACCAAAGC-GTATCCAATGAAAAGAAATCCATTGGTCCCGCCAATTGTATTGACCTTT-------TTAAAT----TAATTGT--A-AAACTTTAGT-----ATTTCATAGCTATGGGGTGGATATTCGTAAGTTTTTC
gi|28 : ---TTTATTACGCCT------A----ATCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAAATCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-CG-------------AGTACGCCTNN--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNNNNNNNNN---------ATAC-AGCATTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--A-A-------GC-----ATTaatatcatcaac
gi|3 : AGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATCCCGAAG-AAATTT----AGTT---C-TG-CATGCA-A-ATTCATTAATCC--AGGTTTACTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AATATT-T-TT----------CTT-AA-TGCAAGA-TA--ACA--TCAAT--ACA--GCTGATCAAA-GT-GCT-CCA-TCACGAAAA-TGATTTT-GATGAT-C-GCGGCTG-ATCTCCCTTTGC--GATGACGTCAATTTAAACGACC-ACAGTGAATG-TAAACTAAAAC-G-TT--T-GC-AT---TAAC--AAAT--TATTCAC-----TGCATAGCTTTTGAAAAATTGCCACAGT---G-GCTA-C-ATT-T-GATCGTA-GTA-GTAGGCCG-AGAAGGTTTTGAC--TATG-----TA--CCTTTTTTCCTGGGGATT-CCAAA-TTCAG-AGAAG----AAAAATGCTCC---TAGT---ATAA---------------AGCTAGCCTATGTGACA---------------------C-TC--TGTAACAC-TCATACT-CGCGTCC-----------T---------CATTATTTC--TTGTTATC-GACTC--A-ATCA---G---------AT-CCCAGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAG-CCTT--TCC---ATGC--GA-CAT----TAAAACA-ATTTGTGA--A---GTATCATTCAGAAATTAGCATTCAGATATAATAACTAATCAGTCC----CGCAC--------GGGG-GG------GG--GGGGGTA----TTGGGTA-TTGGGTATTGTAGAATTCC-T----T--TCCTGCAAAAAGCAAAATGCACC-TT--TAAATTCGGATTTTACTCTGGATTTTG-ACT-GTTAATTAGGA----A---------------T-CTA-CAACATATTTCA--TGTATAAA--TTCTCTTTCAATCCGAC--GAAAATTTGCTATTCATGCAAAACGCA-----------TTT--CAATCA-TCAAT--GTCTG----T-------T-AAT-TTTATCATCAAGTCAGGTCCGT-----------------ACACAGCC-CTGGTGGGAG-C-ACGTTCGCA--C-------CCC-CTGC---AAA--AGACCAAATTGC-A-TATC----AAAGTCGGA--------TTCCACTCTCTA-TTTTGA--TTATCAATTAATT-TGT-CTAAAA-TATCG--CA-C--CC--CTC---------CTA----------------TA-GAAATAACTTATATTC----C-A----TA-TACGCTGAAC------GTAC-AT-A--CGTGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGGTGGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GAC-AGCGGGG---ACG-TTATTTAAAGAACT--AATGT-------------AAAG-AATTAG--CTGC-TATAGAATCAAACGCA--AATAACC-TACTAGTACTATTA-CAA-AATAT----ATGCCCA-----CCC-TC-----------AATCA-----AACACTTGAACGATTTGTGAACT----TCAGACATTTCGCGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCACACGT-CTGTG--ATTATTCGTATCAAAAA-A-GAAATTGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TCCATTACGATT------A----Agtt
gi|30 : GGTCAT---AT--GA-ACTAT-ATTC-AAAG-AAGTGA----AGTT---A-TG-AATG-G-ATACTCATTA--TA--CGGCTTATTAAACCAG--AATTC--------GTTAAACAAA-T-AT----------TTTCAA-TGATAGA-TA--ACGGTTTAATCAATA--GCTGAT-AAATGT-ACT-TA---CAC-AAAA-TGAATTTC--TGAT-C-GCAGTT
gi|31 : atTTCATCTA-GAATTAACCTATATTCAATAT-A----TA-TACGCTGAAC------GTAC-GT-A--CGAGTTTAAACCGGGGTGGAGGTGGATGGTATGAAAATAATATTTGATCAT-GACTAAAGGGGCAAATG-TAATTGAATGA--T--AA----------------AAAT-AAT
gi|32 : ATTTGTGAACT----TCAGACATTGCGGGCTCGA-TAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-TACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAAGATT-------------TTAG-G-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--a
gi|33 : AGGGTGCATTC-CA-TATTTTCAT-TG--CTGCT---GTT--TTCAT--CGAT-GGT-C-TT--TGACGT---A--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTCCAAGCACAAG-----------------T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|34 : ttaaaatcgtcaaGTGTA--TTC-CATTATTTTCAT-TG--C-GCT---GTT--TTCAT--CGATGGAT-C-TTT-TGACGCCACA--AA-CA--CCCAC-------------------------AAGCGG----------------ATTCCATGCACAAG-----------------T-T-CTA--AACAAT-GC-AAAGGCA
gi|35 : tgCATTT-----------T---------C----------TTGTCATC-AAT----A-ATAA---A---------AT-CT-AGATA------T--A--T-CGAT-ATTA-CA----AATAGA-CCTT--TCA---TTTT--GA-AA-----TAAAAAA-AA
gi|36 : ctcacttcctcaaaagtatataacattA--TT-CAATT---AATGAGAGGTTT-----AAACAAAAC----TA---TA-CAGT----TC-------C-ACT---GTT--TTCAT--GGATGGGT-C-CTTGTGACGTCACA--AA-CA--CCCgaaa
gi|37 : AAGGTAAT---AT--GA-AACGATATTCTGAAG-AAGCCG----AGTTAATT-TG----GGG-A-ATTCATTAATCA--AGTTGTGCTACACAAA--AGT
gi|39 : tAATTCGGATTTTATTCTGGATTTTG-A-T-ATTGATTAAGA----A---------------TACTT-CACCA-ACTT-A--TTTATAAG--TTCTCTTTCAAT
gi|4 : GGTCAT---AT--GA-AACAA-ATTCCGAAG-AAATTG----AGTC---C-TG-CATGCC-A-GTTCATTAATCA--AGGCTTATTGAACAAG--AATTCCTTT----GTT-AA-TTT-T-TT----------TCTCAA-TG-----------CG--TCAAT--ACA--ACTGATGAAAAGT-GCT-CGA-TTTCCAAAA-TGATTTTCGAGGGT-C-GCGGCTG-ATCTCCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACT-----------------ACAA-TT--TAGC-TT---TGAA--AAAT-------GC-------CACAG---T-G-----T-GCTACATT-------TA---ATTGT-AGTAGTA-G-------GTCGCAGAAGGTTTTGACTATATG-----TA--CCTCTTT-CCTGGGGATC-CAAAA-GCTAC-ATGGGTTTCAAATA-TCCGT---A-TT----TAAAC---T---------A---------------A---GT-ACA-----TGT----C-TC----TA-CAC-TCATACT---CATTT-----------T---------C----------TTGCTATT-GAC----A-ATCA---A---------AT-CA-AGCTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATA-----TT--------GT-----A-TAT----TAAA-----------A--A---GTATCATTCAGAA--------------ATAATAATTAATCAGTCT----TATATTTTCTTTAGAGA-AGTAGACAGGCAAGGGTTA----T----AA-TTGAA---CG-AGAATTCC-------------GC------------------CT--TAAAGTCAGATTTGACTCTGGATTTTG-ACT-ATTAATTAGGATTCTAGGATTTGTTGTACTTT-CTA-CAACA-A-AT-A--TTTATAAA--TTCTCTTTTAATTTAAA--AAAAAATTGCTGTTCTTGCAAAACGCA-----------ATTAACACTCATTCTATTCATCCG----TGTA------AAT-TGTTACATCAAGTCAGGCC----------------------------------------T-GCGTTCGCA--C-------CCC-CAGC---AAA--AAACCAAATCGCAA-TATT----AAAG-------------------TCTGTATTATTGA--TTATTAATTAA-TGTGT-CTAAAA-TATCG--CACC--CC--TCCACAAAAT-TCTGGGTATGGGCTTTCATCTA-GAATTAACCTATATTT----C-A----TA-TACTCTTAACTTTTATGTAT-GTCAGTCGTGTTTACACCAGGGTGGGGGTTGG-AGTAT-AAAATAATAGTCGATCAT-GAC-AGCGTGG---ACGTTTATTTAAAGAACTAAAATGTTTTTTTTTTAAAAAAAGAAATTAC--CTGC-TATATAATT-AACGCA--AATAACT-TACTATTA-----A-AAA-AACAT----ACCCCCC-----CCCGCCCC--------CAATCA-----AAA-----CACGATTTGGGAACT----TCGGACATTGTGGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA--ACCGTGCGTCCTGTGAAATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATAAGATTATCATTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACGATT------A----ATCATA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TACTTTTA--AG-TTCG-CGAGTACGCCT----A
gi|40 : ----TA-TACGCTGAAT------GTAC-GT-A--CGTGTTTACACTG----GGAGG-----GGTATG----T---------TCAT-GAT-AGCGGGG---ACG-TTATTT
gi|41 : GT---GTGCTA-C-ATC-T-AATTGTA-GTA-GTAAGCCGCAGAAAGTTTT
gi|42 : aacgacaactctgtgcaagagaatg-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACAAT---A-TTTTTTTT---------TTTATTTTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATGC----T--AAT
gi|43 : AAGGTCAT---AT--GA-AACAA-ATGCCGAAG-AAATTA----AGTT---C-TG-CATGCG-A-ATT
gi|44 : ttaCAGA------AAT--A--GCATGCCACGGTCAA-TCTATA---TAATTGTA--AG-TTCG-T
gi|45 : --------TAAA------A--TACCAATGTTAG-AC--ATTGTTTCA-TATGAC
gi|46 : gT-A--CGTGTTTAAACTGGGGTTGAGGTGGGTGGTATGAAAATActttaatac
gi|5 : ATTAAATGCA--AATAACC-TACTA------TTA-AAA-AACAT----ATACCCC-----CCG-CCC---------AAATCA-----AAC-----AACGATTTGTGAACT----TCAGACATTGCCGGCTCGA-AAGA---AAACACTG-ACTG-GTTATGAAA-AACCGTGTGT-CTCTG--ATTATTCATATC-AAAA-AAGAAATAGGATTATTATTACAGTTTTTAG-A-CATACATTTCATAT---TTTATTACGATT------ATTAAATCATA------AAT--ATAGTATGCCATGGTCAA-TCTATA---TACATGTA-----CTTG-TTAGTACGCCG----AATACGGCTTC--ATCGTCGGAATTCA-G-GGTTTTCTT-TCTATCACACTC-TATTCAGTACAAAT-AATTCACAATTTCCGACAATGATAT-GCCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-A-------GT-----ATTTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTAGCTCCTCTTCA-AGAAGCTAGCAGATCATCCTCTTTTAATACATCGTCATTCGCTTGCCGTCATTATTTCTGGCTGGTTCAAAC-TAATATGGCTGTACTACGAAACCAGTCAATT---GGTTAGAAAACAAAA--ATTCAT-ATATAACCG--AT-AAATT---AATGAGAAATTTCT-TTAAACAAAACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---GTT--TTCAT--CGATGGGT-C-TTTGTGACGTCACA--AG-AA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGAGT--AATAAAT--TT-GTTCTACGCACAAGTTT-ACA-GCTATAT--T-T-CTT--AACAAT-AC-AAAGACACT---A---CT--TT---------TTTATATTATGCAAT--T--TAA-------CT-TT-CATTC-ATAC----T--AATCTTT--ATGT--------TTATTAAG---------TAAA------A--TTCCAATGTTAA-GA--TTTGTTTCA-TATGAC
gi|6 : AC---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAG-AAACTGCATGAGTT---C-CG-CATGCG-A-ATTCATTAATCA--AGGTTTATTGAATAAG--AATCCCATT----GTT-AATTCT-T-TT-----------TTCAA-TGCAAGA-TA--ATG--ACAAT--ACA--GCTAATCAAAAGT-GCT-CGA-TCTCGAAAA-TGAATTTCGATGAA-C-GCGGCTG-AACTCCCTTTGC-TGATGACGTCAA----AACGACCCACTGTGA-TG-TAAAC-AAAACAG-TG--T-GT-AT---TAAC--AAAT--T-------------------TTT-GAAAAAT-GCCACAGT---GTGCTA-T-ATT-T-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGCTTTTGTT--TATGTGTACTA--CCCTTTT-CCTGGG-----------TTTAG-AAGGG----AAAAG-G-TATAGGT-TTCAAATATGCGCATA--------AGCTAGCCTA-GT--CT---GT-ACA-----TTT----C-TCTATGTA-CAC-TCATACT-CGCGTCCTCATTTTTTTGT---------C----------TTGTTATC-AAC----A-ATAA---G---------AT-CC-AGTTAAT----T--AAAT-CAAT-ATTG-TA----AATAAA-CCTT--TCA---TTCA--CA-CAT----T-AAAAA-AATTGTGA--A---GTATcttta
gi|6 : --------GGGGGGG------GG--GGGGGTG----T----TA-TTGTA----GAAGAATTTC-T----T--TCTTGC--AAAGCAAAATGCTCC-CT--TAAATTCGGATTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaggggggggggggggggtgttattgtagaagaatttctttcttgcaaagcaaaatgctcccttaaattcggatt
gi|7 : acatgaaaaaaatcccgaagaaactgcatgagttccgcatgcgaattcattaatcaaggtttattgaataagaatcccattgttaattcttttttcaatgcaagataatgacaatacagctaatcaaaagtgctcgatctcgaaaatgaatttcgatgaacgcggctgaactccctttgctgatgacgtcaaaacgacccactgtgatgtaaacaaaacagtgtgtattaacaaatttttgaaaaatgccacagtgtgctatatttaatcgtagtagtaggccgcagaagcttttgtttatgtgtactacccttttcctgggtttagaagggaaaaggtataggtttcaaatatgcgcataagctagcctagtctgtacatttctctatgtacactcatactcgcgtcctcatttttttgtcttgttatcaacaataagatccagttaattaaatcaatattgtaaataaacctttcattcacacattaaaaaaattgtgaagtatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaagg-----AACGATTTGTGAACC----TCAGACATTGCGGTCTCGA-AAGATTAAAACACTG-ACCG-GCCATGAAA-AACCGTGCGT-CTGTG--ATTATTCGTATC-AAAATA-GAAATGGGATTA---TTACAGTTTTTAG-A-CATA---------T---TTTATTACAATT------A----ATCATA------AAC--A--ACATGCCACGGCCAA-TCTATA---TACTTGTA--AG-TTCG-TGAGTACGCCT----AATACGGCTTC--ATCATCGGAATTCA-CAGGTTTTATC-TCTATAACA-CTGCATTCAGTACAAA--AATCCACGAGTTCTGACGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCGT--T-G-------GT-----ATGTGGTAGCTA-GGGGTCATGATTCGTTACCTCCTCTTCA-AGCAGCTAGAAGATCATCCTCTTTTAATTAATCGTCATTCGCTTGTCGCCATTATTTCTCACTGGTTCAAAC-TGATATGGCTGTACTATGAAATCAGGCAATT---GGTCAGAAAACACAA--ATTCAT-ATATAACCA--TT-AAATT---AATGAGAAATTTCT-TCAAAAAACACAGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-GTT---ATT--TTCAT--CGATGGGT-C-TTTGTG-CATCACA--AG-CA--TCAAC---A---A------TCAAGAACGATAAGCGGGT--AATAAAT--TC-GTTCCATGCACAAGGTT-
gi|8 : CGATT------A----CTCATATTATTAAAT--G--ACATGCCATGGTAAA-TTTATACGGTACTTGTA--AG-TTTG-TGA-------------ATACGGCTTT--NNNNNNNNNNNNNN-N-NNNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACAAA--ATTCTGTGAGTTCCAATGATGATAC-GGCTTTTAATC--CTTAAAA----TAATCAT--ATA-------GC-----ATTTGATTGCTA-GGTGTTGTGATTCTTTAGCTCCTCTTCA--GAAGCTAGG---TCATCCTCTGTTAATAAATCGTCATTTGCTTGCCGTCATTAATTCTGGATAGTTCGAAC-TAATATGGCTGTACTACAAAATCAGGCAATT---CATCAGAAAACAAAG--ACTCAT-GTATATCCA--TT-AAAAC---AATGAGAGATTTCT-TTTGTTAG---AGTGTAAATTA-CACTATTTTCTA-TG--C-ATT---GTT--TTCAT--TAATGGGT-C-TTTGCGACATCACA--AG-CA--CCCAC---A---A------TCAAGAACGATGAGCGGGT--AATAAAT--TT-GATCCATGAACAAGTTT-ACA-GCTTTAT--T-T-CTT--AACAAT-GC-AAGGACAAT---A-TTTT--TT---------TCTATATTATGCCAT--T--TAA-------CT-TT-CATTCAATACTAATT--AATCTTT--ATGT--------TTATAAAGT--------T-AA------A--TACCAATGTTAC-AA--ATCGTTTCAGTATGACttta
gi|9 : AAGGTCAT---AT--GA-AAAAA-ATCCCGAAGAAAATTT----AGTT---TATG-TATGCA-A-ATTCATTAATCAATAGGTTTATTGAACAAGATAAT--CTAT----GTT-AA-TTT-T-GT----------TCTCAA-TGCAAGA-TA--ACG--TCAAT--A-A--GCTGATCAAA-GTAGCTCCGA-TCTCG-AAA-TGATTTTC--TTAT-T-GCGGCTGCCTCTCCCTTTGCATGATGACGTCAA----AACG-CCCACCGTGATTG-CAAAT---AACAGTTT--T-GT-GA---TAAC--Actttaag
gi|9 : acttccgtcccttaACAGTTTTGTGATAAC-ATT-C-AATCGTA-GTA-GTAGGCCGCAGAAGGTTTTGAC--TATG-----TAACCTTTTTT-CCTGGGGATAACCGAA-TATAG-AAGAA----AAACA-ACCATGGGT-TT---AAAATT---TCCATATATAAG-TAGCCTA-ATTATATAAGT-GTGGACTATGT----C-TC--T--A-CAC-TCGTATT-CGCGTCC-----------T---------A----------TTATTATC-TATGTTAA-ATCA---GATAATAAGAAT-CC-AGCTAATCTCCT--AAAT-CAATCATTG-T-----AATAAA--CTTAATCA---TTCC--GA-CAT----TAAAAAACAACCATGA--A---GTAAC------------CCGTTCAGA-------------CAGT-C----CGTAC--------GGAA-GG------GG--GGGG-------T----AA-TTGAA---AAAGGAATTTCAT----TAATCATGC-AAAAGCA----------ttcaatcgtagtagtaggccgcagaaggttttgactatgtaaccttttttcctggggataaccgaatatagaagaaaaacaaccatgggtttaaaatttccatatataagtagcctaattatataagtgtggactatgtctctacactcgtattcgcgtcctattattatctatgttaaatcagataataagaatccagctaatctcctaaatcaatcattgtaataaacttaatcattccgacattaaaaaacaaccatgaagtaacccgttcagacagtccgtacggaaggggggggtaattgaaaaaggaatttcattaatcatgcaaaagcaata
4 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|29 ): TAACTTTTTTGCAAATTATCTGGCATTAGAATCCTGTTAAAATACAAAGTTATTTTTATGTGAAAAATTTTTTTTTAATTTGATTGTCCGTATAACACCTGTCCAATTTAGTAGGGGGGCGGGGGGGGAGGGGTTATGGATGAGCATCTAAATGCAACATTTATAATT
Unaligned ( gi|38 ): AATTAATAATTCTATTTTACTTCATGTTCTGAATGACGTAGCTAGTCGAAAACTTCCACTTTTACCTATATACATCAG
Unaligned ( gi|47 ): CAAAATCATTGTTCAACATGCAACGCTTGAACA
Unaligned ( gi|48 ): CTACCCATCACAGTTTCCATATGTCGCTGAA