lowQualScore : 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111111111111111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : 1 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333 22 2 1 1111 1 66666666 11 33333333 111 6666666666666666666 1 11 888888888888 2 2 22 1 1111 11 777777777777777777777777777 11 22 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 222 33333333333 1111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111 1111 333333333333 333333333333333333333333333 11111 111111 11 11111 33333 1 000000000000000000000000000000000000 3333 1 66666 11 11 11 666666666666666666666666666666666 111 33 1111111 3333333333333 111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1 11 22222 555555555 555555555 111 11 4444444 2222 2 1 222 55555 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 222222 1 1 1 2 1 1 77777777 22 22
lowQualScore : 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6666 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 888 33 0 0 7777 0 99999999 2 33 2 55555555 777 9999999999999999999 0 22 888888888888 3 0 0 77 3 3333 7 88 4 444444444444444444444444444 6 99 6 00 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 333 6 55555555555 77 5 5 5 7777 77 5 77 5 5 5 5 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 2 666 1 4444 999 999999999999 666666666666666666666666666 3 77 66666 666666 11 6 11111 6 2 44444 6 2 6 111111111111111111111111111111111111 3333 0 77777 22 77 3 55 2 0 00 33 999999999999999999999999999999999 444 4 22 4 3 5 8 3333333 88 1111111111111 222 0 6 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 3 6 6 88 6 66666 999999999 444444444 444 7 7 88 3333333 8888 8 8 6 333 55 00000 6 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 999999 3 5 5 6 3 5 5 33333333 6 33 6 33 6
lowQualScore : . ...................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... .... ..................................................................... . ... .. . . .... . ........ . .. . ........ ... ................... . .. ............ . . . .. . .... . .. . ........................... . .. . .. ........................................................................................ ... . ........... .. . . . .... .. . .. . . . . ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . . ... . .... ... ............ ........................... . .. ..... ...... .. . ..... . . ..... . . . .................................... .... . ..... .. .. . .. . . .. .. ................................. ... . .. . . . . ....... .. ............. ... . . . .................................................................................................................................................................................................................................... . . . .. . ..... ......... ......... ... . . .. ....... .... . . . ... .. ..... . ........................................................................................................................................................... ...... . . . . . . . ........ . .. . .. .
lowQualScore : 0 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 000 00 0 0 0000 0 22222222 5 22 5 00000000 555 8888888888888888888 0 55 000000000000 0 0 0 55 3 7777 3 33 7 000000000000000000000000000 7 33 7 77 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 555 7 88888888888 99 7 7 7 9999 99 7 99 7 7 7 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 5 000 4 2222 333 888888888888 222222222222222222222222222 0 33 77777 555555 00 7 88888 7 5 55555 7 7 7 555555555555555555555555555555555555 2222 8 00000 55 88 2 88 0 2 88 88 555555555555555555555555555555555 555 0 00 6 2 0 0 2222222 88 6666666666666 666 8 0 8 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3 0 7 33 7 77777 333333333 000000000 777 3 3 33 3333333 3333 7 3 0 000 55 00000 0 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 000000 3 0 5 0 0 0 0 00000000 0 00 0 00 0
consensus : GGGGGGGGGGGGTCT-AGCACTTG---------ATTTTTTTT-TT-GG--AGGGT-C------ATA----TTTT--A--TAACC-CC--CCCA---CCTCTTTT-T----TTGGGG---G-GTTGTGGGT-CTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-CTTAGTTT-AT-T-A-T---AATCTTT--TAA-TGGAATG-TTA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGTGTCTGGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTNCGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGCTG--A--GTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CCNA--AGGGATGA-AAGTAATA-NTGCCTTCATTTGCGAAACCTGAAGNTTTGAATTTTGGATGTTGGAAA-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-A-TT-ATTT---T----GCAGCT---AGTCTTT-AACGATAA-TCATGAA--------------CAAAA-T-ATCGAAGGGTAGNAGACTCTTCTTTTGAATC---AAA-------------------AATNA-A---TTTGT-T-ATGG-GGAAAAT-AATG-T--CATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTT-------TTTAAAC-----------CAGAT---AAGTTAAT-A--ATA-A---TT-T---------TTTNTGTTC----A-TT--GA--AA-TAA--T--ATA-A------T-CATTA----C-ATGAATAANTN----TTGCCA---ATGAACGCT---------------GA---------------GT--TACTGC-T------TGCACC--TTTAATA--T-TGTTTCA-T-AT-AGT-GAAA-----------GTCCGTNAAT-----C-TATAAG---AGATTTTT-ACCTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGATNATGTCTTCTTTTAATAAA---------AAAT-AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-ATAATTAT--------C-GGTGCTTGATTTTGAT---C---TTA-T-AT---AAT------GNAT-AAAT-----TTCGA--TATTTTTNGAA-TAAAT--A--AAA-TAATTCAGTAT-TTG-AATCAGC-CGTA--------T------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GGACCTTTGATGTTGTTTCATTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTA-N---TACTGA-A---TC--TTAAT--------TGAAATAG-CTTNAAAAT-TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACGCGTTTTGGCGAATCCAAGTCATTGCTAT------AT-C--------TA-TA-------------TATATGAAGCC----ATCA-TATTG--------------------AAAAAA-GGAAGCGGC---GGT--A---GGTG--T------------A-CA------TAC-------TGTA---CTGATA--------------T---------AT--------------------T------------------GT-GCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCT-T---ATTAAATCACAATTAT-CAC-ACG-ACGCGCAAAAATTGACACC--CCATTGAA-------AGCC----AATA-TTTCATT-TAACCCACTAGTCAGAGCNNACAAAAAGGGAAGGTCATGTATCACCACTTACCACTCGCCACGTTGTCTTTACCCCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGANAGAGTCAGAAAAGGTATATGATCCCGCGACACTNCCAG---GCAAGC---TGCGCG---GGGGCGA-AGTTCT---AG-AATG--A-T-A-TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCAGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACTCAAAATACATTCTAA-AATG---TTGTGGTTGTCATTTACTACTTGTTTCCAA
Reference ( gi|1 ) : GAGGGGGGGGGGTCT-AGCACTTGGATTTTATTATTTTTTTTTTTGGGGGAGGG--------GATA----TTTT--A--TAACCGCC--CCCA---CCTCTTTT-T----TTGGGG---GGGTTGTGGGT-CTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGATTTAGTTTAAT-TCATT---AGTATAT--TAA-GAAAATG-TTATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGCTG--ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAGGATGA-AAGTAATA-GTGC-TCT--------AACTTGAAAATTTGAA-TTTGA-TGT--GAAA-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-A-TG-ATTT---TC---GCAGCT---AGTCTTC-AACCATAA-TCATGAA--------------CAAAATT-ATTGAAGGATAGAAGATTCTT-------ATC---AAA-------------------AATAAGA---TTTGTTT-ATGG-GGAAAAT-AATG-C--CATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTT-------TTTAAAC-----------CAGAT---AAGTCAAT-A--ACA-A---TT-T---------TTTATGTTC----A-TT--AA--AA-TGA--T--ATA-A------T-CATTA----C-ATGAATAAGTG----TTGCCA---ATGAACGTT---------------GA---------------GT--TACTGC-T------TGCACC--TGTAATA--T-TGTTTCA-T-ATCGGT-GAA------------GTCCGTAAA------C-TATAAG---AGATTTTT-ACATA-TA-GCCT-GT-----G--------CA-ATTTT--TCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAA-AATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-ATAATTGT--------C-GGTGCTTGATTTTGAT---C---TTA-T-AT---AAT------GAAT-GAAT-----TTCGA--TATTTTTTGAA-TAAAT--A--AAA-TAATTTAGTATATTG-ATTCAGC-CGTA--------T------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTA-T---TACTGA-A---TC--TTGAT--------TGAAATGG-CTTAAAAAAATGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTAT------ATAC--------TAGTA-------------TATATGAAGCC----ATCA-TATTG--------------------AAAAA--GGAATTGGT---GGT------GGTG--T------------A-C-------TAT-------TGTA---CTGATA--------------T---------AT--------------------T------------------GT-GTTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTC--T---AACAAATCACAATTAT-CATGACACACACACAAAAATTGACACC--CCATTGAA-------AGCC----AATAGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATC------TA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T---GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACCTATGCATGTGGGGCGA-AGTTCTGGGAGCAATG--ACTAGATCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAAAATCAAAATACATTCTAACAATGTTATTGCGGTAATTATTTACTTTTTGCTTCCAAAGT
gi|7 : GGGGGGGGGGGGCCT-AGCACTTG-ATTT----ATTT-------------AGG-----------TA----CTTT-----TCACC-CCAACCCAAACCCTCCTTT-T----TTGG-----------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-CTTAGTTT-AT-TAAAT---GAT-TTT--TAA-T--ATTGTTTAAATTCAAT--ATAAA-AGGATATAAT
gi|18 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatAGGGGGGGGGGTCT-AACACTTG---------ATTTTTT----------AAGGTACTTACCAATACCACTTTT-----TAACC--C--CCC----CCTTTTTT-T----TTGGGGTG-GGGTTGGGGTT-CTG-GG-GA-CTA--T--TATA--C------ggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|3 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaGGGGGGGTCTTAGCACTTGA----------TCTTTTTATTGGGGGTGGGTGC-----GGTA----TTTT-----TACCC-CC--CCC----CCTCTTTGGTGAGGTTGGGG---GTGGCGTGGGT-CTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-TTTAGTTTAATATCACTTAAAGTCTCTCTTAATGAGAATG-TTA-ATGCAATATATAA------TA-AATAGTAG-CTAAAT--GATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCTC-GGTTGATCACCAATTA-TC-ACGCTGTTAATATTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGAC-CAGAGCTAT--AAGGATGATAAGTAATA-GTGCCTTT--------AACTTGAAGCTTTGAA-TTTGAATGTTGAAAA-TTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTATGCAGCTTTAAGTCTTTTAACCATA--TCATGAA--------------CAA---------AAGGGTAGA----TCTT-------ATCTCAAAA-------------------AATAAAAGATTTTGTTTCGTGGCGGAAACTCAATG-CATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-T-AGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAATAA-AAGTTA---A--ATA-A---TTAT---------TTTTTGTTC----A-TTGCAT--AA-TAATCT--ATAGA------TACATTA----C-ATGAATAAATAGT--TTGCCATTTATGAACGTT---------------GA---------------GTAATACT-C-T------GACCCT--CTTAATA--TATGTTTCAGTGATCAGTAGAAATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTT-TATAAGATAAGATTTTT-Atgttcttttttaatat
gi|16 : cataggcggatccaggattgtcgaaGGGGGGGTCT-AGCACTTG---------ATTTTTT----------AAGG--------TACT----TTTC--ACCCAACTG-------A---CCCATGTT-T----TT----------TTGT--AT-CTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATGCTTTAGTTT
gi|19 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacTTTTTTAGG----------------TA----CTTTCAA--TACCCTTC--CCC-------CTTTT-T----TT---------AT--TAGGT-CTG-GG-GA-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-CTTAGTT--AT-T-A-T---AATTTTT--TAC-TGAAATA-TCA-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAgtatgattattgaatttgtgtacatgtcatgtagagaga
gi|15 : T-T----TTGGGGTGGAGGTTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|23 : gcggatccaggattttgtgaaaaggggacgagggggtcctaaacactctgagtttttttaaggtacgtacataccactattttaccttccccagcaggcgtttatttggaataACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGT---TTCAG---Tgttcttttattaata
gi|6 : TCTTAT---ATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGCT------GTTAAGGA---AACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAGGATGA-AAGAAATATTTAC-TTCATTTGCGAAATCTGAAAATTTGAATTTTGG-TGT--GAAATTTGTATT-ATTACTAACACATA-A-TT-ATTT---T----GC-GAT---AGTCTTT-AACGATAATTCATGAA--------------CAAAAAT-ATTGA
gi|7 : C-AAT-AACC-ACGCTG-------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA--CTA--AGCGATGA-AAGTAATA-ctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|13 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatct-AAT-A-CCCACGC----ATG-TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC-----GATCGAA--CTA--AGGGATGG-AAGTAATA-t
gi|2 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatctcaAG-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-A-TT-AATT---T----GCA-CT---A-TCTTT-AACGATAA-TCATGAAAAAAATATAACAATCAAAATTTATCAAA---TAGTAGACTCTTCTTTTGAATC---TAACATGTTACCATACTTATACAATAA-----TTTTTGT-ATGG-GGGAAA---ATGGT--CATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA---CCT------GA-T-AG-ATT---------------------------CAAAC---AA---AAT-T--ATA-A---TT-T---------TTTCTGTTC----A-TT--AGT-AA-TGA-------A-A---------ATT--------TGAACA---C----TTGCT---------CGCA---------------GA---------------GT--TACTGC-T------TGCACT--T-TAATA--T-TGTTTCA-T-ATtag
gi|6 : ---AAA-------------------AATCA-A---TTTGCCT-ATGG-GGGGAA---ATG-T--CATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATT-AG-A-TTT-------TCTAATA-----------CAGAT---A--TCAACAA--ACA-A-------------------AAGTTT----A-TA--AA--AA-AAA-------A-ATTTCTTT-CATTGAAGTA-ATGGATAATTT----TTTCCA---ATGAACTTTGAAACGCTTGCTCCAGA---------------GT--TACTGC-T------TGCACC--TTTAATAATT-TGTTagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|11 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaAG-------------------AATAAAT---TTTGT---GTGG-GGAAA-T-AATG-T--AATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-A--TT-------TTTAAAC-----------CATAT-----GTTGAT-ATTATAGA---CT-T---------TC--TGTTC----A-TT--GAATAA-TTA--T--ATA-A------A-C-TTA----TAATGAATAAAT-----TTGCCA---ATG-ACTTT---------------GAAAAC-----------AT--CGCTCC-TGAATTATGC-CT--TATAAT---T-TGTTTCA-
gi|9 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactA-------------------AATCA-A---TTTAT---ATGG-GGAGGA--AAT--T--CATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAA-TTAG-ATTTT-------C---AAC------------AGAACAAAAGTTTAT-A--A---A---TT-T---------TTTTTTTTCTGTCA-TT--GA--AAGTAA--TGAATA-T------T-TTTTC----C-ATGAACTTGTGGAAACCGCC-----TGCTCCCA---------------GA---------------GT--TACTGTGT------TGCACC--TTTAATA--T-TGTT-CA-T-A---GT-GAA------------GTC-GTCAAT-----C-TATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG--------AA-GTTTT--T-----------------AATT-AATACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A-AATT-T--------C-CGTGCTTGATTTTGAC---T---TTA---AT---A--------GAAT-GCA----------------------AA-TAAAA--AGGAAA-TAATTCAG---ATTGAATTCAGC-C-TA--------T------------ataattttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|10 : A-------------------AATCA-A---TTTATGT-ATGG-GGAAAAT----G-T--CATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-T-AG-ATTTC-----------AAC-----------AACAA---AAGTT--T-G--ATA-AACTTT-T---------TTTCTGTTC----AATT--GA--AG-T-----------------------TA------ATGAATAACT-----TTG--A---AAAAACACTTTGCTCA--------GA---------------GT--TACTGC-TA-----TGC-CCAATTTAATA--T-TGTTT
gi|24 : aacctgaaaattttgaaatttggtttgtttgaacatgtgttatttactaaaataattatttgcacttagtcttataaccgataatttaacgattaattcatcatgaaaaaatatcaacatcaaaatttatcaaaataaagatagacttccgttctttgaatctaccatgttaccatatctatac-C--CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AC-ATTTT-------TTacaat
gi|5 : -----------CAGAT---A--CCAAT-A--ACA-AAAGTT-TATAAACTTGTTTATGTTC----A-TT--GA--AA-TAA--TCTATA-A------T-TATTA----C-ATGAATAAATA----TTGCCA---ATGAACGTT---------------GAAACGCTTGCTCCAGAGT--TACTGC-T------TGCACC--TTTAATA--T-TGTTTCATT-ATAAGT-GCA------------TTCCGCTAG------C-TA
gi|20 : ca---------------GA---------------GT--TATTGC-T------TGCACC--TATGATA--T-TGTatcagtactgaatcataattgaaatggcttaaaaattaaactaccgagaaatggcgaaataagaaagtaaattggtggacacgtttaggcgaatccaggtcattactatctacattttatatattatgaaatttatttgtatatgaagccatggatcatattgaaaaaagaaatgatgtttgagatgttttgtagatataaatattgtactgataaatgtacgcatgtttattgtgcttccctgcgcttacgtgcttgttattctataagaaatcacaattatacacacacacatgcagaaattgacaacccattgaaagtcaataatatctttataaccca
gi|14 : gttttattcactaaatgtaatgtaaatgtatctatgcttatgaattaaaacagtttgccattaaacttcgaaagccttgcttcaGT-GAAA-----------GTCCGTAAA------TGTATA-G---AGATTTTC-ACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA----------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-ATAATTATA-------T-GGTGCTTGATTTTGAT---C---TTT-T-ATTAAAAT------TCATAGAAT-----TTCCGCTTAATTTTGAAA-AAAAG--A--AAA-CAATTCAGCAT-TCG-AACCAGC-
gi|17 : AAAAATAATACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-ATAATTAT--------C-GGTGCTTGTTTTTGAT---C---TTA-T-AG---AAT------GAAT-AAAT-----TTCGA--TATTTTTGGAA-TAAAT--A--AAA-TAATTTAG--TATTC-AATCAGC-CGTA--------TTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCAT
gi|8 : atttttctAAAT-GATACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT-TTA---------------GGTGCTTTATTTTGATAATCAAATTAAT-AT---AATTTTGGAAAAA-AAATATTTGTTCG-----TTTCTTCAA-TCCAT--G--AAA-TG---CAGTAT--TG-AATCAGT-TGTAATGAAATTTCCGA--------AAGCTTTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTG---AGATTTT--ATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAG--TCCTCAAGTTA-T---AATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAAATC-CTTAAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCA-------------ATGC----------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTG--------------------AAGAAATAAAAGTGGTTTAGATATATCAGCTA--T------------A-CA------TAC-------TCTA---TTGATA--------------T---------A
gi|4 : TATATTG----TGTTT-A-AATTGTGATTATCTC-GGTGCTTGATTTTGATTT-C---TTA-TTAA---AAT------GCAT-AAAT-----TTCGA--TAATTTTTGAA-AAAATTAA--GAA-TAATTGAGTA---TG-AATCAGCGCGTA--------------------------TTGGAA---ATGTTCTCA-GAGTAACT-------TGAAACTTTGATG-TG-TTTATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTA-A---TA-TAACA---TT--TTAAT--------GGAAATAATTTTTTAAAATTGAACTA-CCAGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAA-TCAAGTCATTGCT-T----------------------------------------TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAA--GGAAGAGGC---AGT------GGTGGCT------------G-CAACTAAATAT-------TGTGTACCTGATA--------------T---------ATGGACGCATTTTTTATTTGACT------------------GTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT---ATTAAATCACAATTAA-TACAACG-AAACA-AAAAATTGAC-CC--CCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAATA-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATCACCACTTA-------CCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGG--TATGATCCCGCGACACTTC------GCGA-----TGTGCG---AGGGCGA-AGTTCTGGTAG-AATGGTAATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|2 : ATTG----TGTTTTATAATTAT--------CCGGTGCTTGATTTTGATT--C---TTA-T-A----AAT------GCAT-AAAT-----TTCGA--TATATTTAAAAATAAAT--A--AAAATAATTTAGTAT--TG-AAATACG-CGTA--------T------------------TGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTTG-----ACCTTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAG--TCCGCAAGCTA-A---TA---A-A---T---TTAAT--------TGAAATAG-TTTTAAAA--TTAACTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTAT-----------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTG--------------------AAAAAAAGAAGACAGT---GGT------GGTG--C------------AAC-------TACAAATTTGTGTA---CCGATA--------------TATGCACGGCAT--------------------TTTTTTTTTTTTTTTTTTGGT-GCTTCC-TGCGC--TTA-GTG---G-TTGTTC--TTTTATTAAATCACAATTAT-----ACA-ACG-ACAAAA-TTGACACCACCCATTGAA-------AGCC----AATA-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATC------TACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCA---------------A-AGAGAG-------AGGTAT---ATTCCG----ACTATCAG-----AAGT-----CGCA--------GATAGTTCT--GAGTAAT-------AATCT-----CCCC---A--AAAATATTATCTGGG-CCAGGT-CCAACATGGGTGTCAt
gi|5 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtA--------T------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTGCA----CCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCAT--TCCGCTAGCTAATCAGTACTGA-A---TC--ATAAT--------TGAAATGG-CTTAAAAAT-TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTAT------CTACATTTTATATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTG--------------------AAAAA--AGAAATGAT---GTTTGA---GATG--TTTTGTAGATATAA-A-------TAT-------TGTA---CTGATAAATGTACGCATGTTT---------AT--------------------T------------------GT-GCTTCCCTGCGC--TTACGTGCTTG-TTATTCTAT---AAGAAATCACAATTATACAC-ACACACATGCAGAAATTGACAAC--CCATTGAA-------AGTC----AATAATATCTTTATAACCCAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|21 : cacagataccaataacaaaagtttataaacttgtttatgttcattgaaataatctataattattacatgaataaatattgccaTAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTATGGAACCATCC--------TA-TA-------------TATA
gi|12 : CAAGCACCTATGCGTGAGGGGCGA-AATT-----------A--ACTC--TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGattaaaata
gi|12 : AAACTCAAAATACATTCTAA-AATG---TTGTGGTTGTCATTTACTACTTGTTTCCAAtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
lowQualScore : 11 222222222 444444444444444444444444444444444444 222 22222222222222 4444444444444444444444444444444 111111 111 444444444444444444444 222 1111 11 2 2 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 2 33333 1 333333 1 22 1111 111 6666666 2222222 111 111 1111 11 666666666 1 111111 22 22222 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111 2222222 2222 11 1111 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1111 11 4444444444444444 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777 7777777777777777777777777777777777777 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 333333333333333333 1111 11111111 1111 111111 1 22222222222222222222222222222 11 11111 5555555555555 1111 333333 11 222222 4444444444444 2222 1 111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 444444444 222222 11 111 1 333333333 4444444444444444444 11 33333333 1111111 222 55555 77777777777777777 4444 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 2 333
lowQualScore : 99 55 6 666666666 111111111111111111111111111111111111 333 66 999999 11111111111111 1 8888888888888888888888888888888 3 5 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 222222222222222222222 000 4444 3 33 0 2 3 88 7 3 0 88 000 000 5 5 77777 5 88 4 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 3 4 0 22222 5 000000 5 1 6 7 00 4444 000 8 8 1111111 8 6666666 444 444 9 8888 11 8 1 777777777 33 0 666666 44 00000 8 8 8 0 5 1 11 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 2222 7777777 5 4444 33 66 5 5 5 5555 66 5 66 5 5 5 3 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 5555 5 11 5 22 9999999999999999 999999 8888888888888888888888888888888888888888888888888 66 555 5 2 66 5 66 5 4444444444444444444444444444444444444 2 1 3333333 2 444 8 3 22222 99999999999999999999999999 000000000000000000 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 5 77 5 999999 66 0 777 66666666666666666666666666666 3 00 66 3 9999 4 11111 4 0 5 2222222222222 1 6 9999 777 3 111111 5 7 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 0000 99 4 0 6 6 6 6 6 222 2 2 6 0 5 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 000000000 222222 33 777 0 555555555 44 7777777777777777777 3 33 66666666 9999999 4 111 6 22 0 11111 22222222222222222 0 4444 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 11 8 6 7 7 2 0 555 4 4
lowQualScore : .. .. . ......... .................................... ... .. ...... .............. . ............................... . . . . . . .. .. ...... . ... . ..................... ... .... . .. . . . .. . . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . ....... . ....... ... ... . .... .. . . ......... .. . ...... .. ..... . . . . . . .. . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................... . .... ....... . .... .. .. . . . .... .. . .. . . . . ...................................................................... . .... . .. . .. ................ ...... ................................................. .. ... . . .. . .. . ..................................... . . ....... . ... . . ..... .......................... .................. . . .. . .... ........ . .... . .. . ...... .. . ... ............................. . .. .. . .... . ..... . . . ............. . . .... ... . ...... . . . . .. . ...... . . ............. . .... .. . . . . . . . ... . . . . . ...................................................................................................................................................................................................... . ......... ...... .. ... . ......... .. ................... . .. ........ ....... . ... . .. . ..... ................. . .... . .................................................................................................................................. . .. . . . . . . ... . .
lowQualScore : 22 88 7 777777777 111111111111111111111111111111111111 666 11 777777 33333333333333 7 1111111111111111111111111111111 0 7 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 444444444444444444444 888 8888 0 88 0 5 2 00 3 3 7 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 0 55555 0 000000 5 0 7 3 77 2222 000 0 0 6666666 0 0000000 000 000 0 6666 00 0 0 333333333 00 0 555555 22 00000 0 0 0 8 6 0 00 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 0000000 7 0000 66 99 0 0 0 6666 99 0 99 0 0 0 2 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 6666 0 99 0 44 8888888888888888 222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111 99 111 0 0 99 0 99 0 4444444444444444444444444444444444444 2 0 2222222 8 000 0 0 00000 22222222222222222222222222 777777777777777777 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 7 99 0 222222 00 0 111 66666666666666666666666666666 6 66 11 7 7777 4 11111 4 2 0 9999999999999 3 6 3333 555 7 333333 2 3 4 0 00 0 222222 0 4 0000000000000 8 0000 22 2 8 7 7 7 7 7 222 5 5 3 3 2 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 000000000 222222 88 555 0 555555555 88 5555555555555555555 2 88 22222222 5555555 0 000 7 00 7 33333 77777777777777777 7 3333 7 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 00 0 7 3 3 5 0 000 0 0
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTTTTTT------AGG-----G------------A----TACTTT--ATAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGGT-CTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATG-AAATGTT--A-ATNCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG---A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTTAA--AGGATGA-AAGTAATAGTGCCTTCA-------AACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----ATT-AT-TT-ATCACTAANA--TA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------C-AAAATT-AT------CGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTG-T-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAATA-A---TT-T------------TTTCTGTTC----ATTG-A--AA-TAAT--ATA-AT-CATTAC-ATGAATAANT--NTTGCCA---ATG--------AAC-----GCT-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCA------------T-AT-AGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNATGTCTTCTTTTAATAAAAAATAA---------TACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGA-T--CTT-AT-AN---AATGCATA-AAT-T-TCG--------A--TAT-TT-TTNG-------AATAAAT--AAA--ATAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-C-AGAGTAACTGCTTG---GNACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAGT--CCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAGCTT-T--AAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-G-CG-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATC-ATATTGAAA-------------------AAA-GGAA--------G-NGGT---G----GT-----AGGTG--------TACATAT---TGTA---CTGATA--------------TATG-ACG---------------TGT-GCTTCCCT---------GCGCT---T--ACG--TG---GTT-GTT---CT-TT-ANTAAATCACAATTAT-C---AC-A-CG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAAAG--------CCAA---T-A-TTTCNTTAT-AACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATC------TACCAC---CCACATTGTCT----CCCTCCAAAG---------TACA-ATAGAG-------AGGT-T---ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-C---T-G----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAANTCAAAATACATTCTAACAATGTTATTGCGGTNGTCATTTACTNCTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTTTTTT----GGAGG-----GT----------CA----TATTTT--ATAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGGT-CTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--CTTTTAATG-GAATGTT--A-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGTGTCTGGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTNCGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG---A--GTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CCNAA--GGGATGA-AAGTAATANTGCCTTCATTTGCGAAACCTGAAGNTTT-GAATTTTGGAT-GTTGGAA-----ATT-AT-TT-ATCACTAANA--TA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------C-AAAAT--AT------CGAAG-------GGTAGN-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTG-T-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAATA-A---TT-T------------TTTNTGTTC----ATTG-A--AA-TAAT--ATA-AT-CATTAC-ATGAATAANT--NTTGCCA---ATG--------AAC-----GCT-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCA------------T-AT-AGT-GA-AA-----------GTCCGTNAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACCTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGATNATGTCTTCTTTTAATAAAAAATAA---------TACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGA-T--CTT-AT-AT---AATGNATA-AAT-T-TCG--------A--TAT-TT-TTNG-------AATAAAT--AAA--ATAATTCAGTAT-TTGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-C-AGAGTAACTGCTTG---GGACCTTTGATGTTGTTTCATTGGAA-GTGCAGT--CCGCAAGCTANT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAGCTT-N--AAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-G-CG-AA-AGTAAATTGGTGGACGCGTTTTGGCGAATCCAAGTCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATC-ATATTGAAA-------------------AAA-GGAA--------G-CGGC---G----GT-----AGGTG--------TACATAC---TGTA---CTGATA--------------TAT--------------------TGT-GCTTCCCT---------GCGCT---T--ACG--TG---GTT-GTT---CT-T--ATTAAATCACAATTAT-C---AC-A-CG-ACGCGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAAAG--------CCAA---T-A-TTTCATT-T-AACCCACTAGTCAGAGCNNACAAAAAGGGAAGGTCATGTATCACCACTTACCACTCGCCACGTTGTCTTTACCCCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGANAGAGTCAGAAAAGGTATATGATCCCGCGACACTNCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-C---TAG----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCAGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAACTCAAAATACATTCTAA-AATG---TTGTGGTTGTCATTTACTACTTGTTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTTTTTTTGGGGGAGG-----GG-----------A----TATTTT--ATAACCGC-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-GGTTGTGGGT-CTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAGA-AAATGTT--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TG---ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTAA--AGGATGA-AAGTAATAGTGCTCT---------AACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----ATT-AT-TT-ATCACTAATA--TA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------C-AAAATT-AT------TGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTG-T-TT-ATGG-GGAAAAT-AATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTCAATAACA-A---TT-T------------TTTATGTTC----ATTA-A--AA-TGAT--ATA-AT-CATTAC-ATGAATAAGT--GTTGCCA---ATG--------AAC-----GTT-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTTCA------------T-ATCGGT-GA-A------------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTTTT-ACATA-TA-GCCT----GTG---------CAAT----TTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGA-T--CTT-AT-AT---AATGAATG-AAT-T-TCG--------A--TAT-TT-TTTG-------AATAAAT--AAA--ATAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-C-TGAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAGT--CCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGGCTTAA--AAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-G-CG-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTA--T------A---TACTAGTAT------------------ATATGAAGCC----ATC-ATATTG-AA-------------------AAA-GGAA--------T-TGGT---G----GT------GGTG--------TAC-TAT---TGTA---CTGATA--------------TAT--------------------TGT-GTTTCCCT---------GCGCT---T--ACG--TG---GTT-GTT---C--T--AACAAATCACAATTAT-CATGAC-A-C--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAAAG--------CCAA---T-AGTTTCTTTAT-AACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATC------TA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGGT-----GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-C---TGGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|1 : AAAATCAAAATACATTCTAACAATGTTATTGCGGTAATTATTTACTTTTTGCTTCCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|10 : gaggggggggggtctagcacttggattttattatttttttttttgggggaggggatattttataaccgcccccacctctttttttgggggggttgtgggtctgggagactatttatacgtgaacatgatttagtttaattcattagtatattaagaaaatgttatatgcaatccataaagaggatataatattagtccagataggacagttctagttggttcagtgtaacatttacttgttcttagtagcaaagaaatcttgaaaaaattatttcaaattcattggtttcgtagatattatcacctccaaaatcatcatcaatatttggtaacagcaaggatttttttcttaaatctcatgaatctaggttgatacaatatcacgctgacggttaaggaacaacacacttgctctaccgaaacgaagcttaaaggatgaaagtaatagtgctctaacttgaaaatttgaatttgatgtgaaattatttatcactaatataatgattttcgcagctagtcttcaaccataatcatgaacaaaattattgaaggatagaagattcttatcaaaaataagatttgtttatggggaaaataatgccattttgcttcattcaaagcctctgaatagatttttttaaaccagataagtcaataacaattttttatgttcattaaaatgatataatcattacatgaataagtgttgccaatgaacgttgagttactgcttgcacctgtaatattgtttcatatcggtgaagtccgtaaactataagagatttttacatatagcctgtgcaatttttctaaaaaaaaagaaagaaaaaaatacgatgtgaagtaaattcgtaaattgtgtttataattgtcggtgcttgattttgatcttatataatgaatgaatttcgatattttttgaataaataaaataatttagtatattgattcagccgtataaactttggcatgcatgttcctgagtaactacttgcatgcacttttaatgttgttttgttggaagtgcagtccgcaagctattactgaatcttgattgaaatggcttaaaaaaatgaactacccagaaatagcgaaatgcgaaagtaaattggtggacacgtatcggcgaattcaagccattactatatactagtatatatgaagccatcatattgaaaaaggaattggtggtggtgtactattgtactgatatattgtgtttccctgcgcttacgtggttgttctaacaaatcacaattatcatgacacacacacaaaaattgacaccccattgaaagccaatagtttctttataacccacttgtcagagccaatagaaaggtcatgtatctactacattgtctccctccaaatacaatagagaggtgccccgccacttccagagtgcaagtacctatgcatgtggggcgaagttctgggagcaatgactagatcgcccctaagaaaatatatccgggaccgggtcccaacatgggggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTGTT-AT-TT-A---CTAAAA--TA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATC-AAAATTTAT------CAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTA-TGT--ATGG-GGAAAAT----G--TCATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-T-AG-ATTTC-----------AAC-----------AACAA---A--A--GTT--TGATA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCA---ATTG-A--AG-T--T--A-------------ATGAATAACT---TTG--A---AAA--------AAC-----ACTTTGCTCAGA---------------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTTagt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTT-G-T--GTGG-GGAAA-T-AATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-A--TTTTTA-------AAC-----------CATAT---------GTTGATATTATA---GA-C------------TTTCTGTTC----ATTG-AATAA-TTAT--ATA-AA-C-TTATAATGAATAAAT---TTGCCA---ATG---------AC-----TTT-------GAAAACATC--------GC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTTCA--------------AT-AAT-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTAC---T-----------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCtttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATACATTCTAA-AATG---TTGTGGTTGTCATTTACTACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG-------TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-C-TAA--GGGATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTTTC-ACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGA-T--CTT-TT-ATTAAAATTCATAGAAT-T-TCC--------GCTTAA-TT-TTGA-------AAAAAAG--AAA--ACAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTTTTT--------AAG-----GTACGTACATACCAC---TATTTT--AC--CT-T-C--CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATAT-T----TTGG---GGTGGAG-G-TTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT---------AAGG-----------------------TACTTT---TCACC-CAA--CTGA---CC-------CATGT------T-T----TT---------------TTGT--AT-CTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAATgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAATAA---------TACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGA-T--CTT-AT-AG---AATGAATA-AAT-T-TCG--------A--TAT-TT-TTGG-------AATAAAT--AAA--ATAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCATttgtgtacatgtcatgtagagaga
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------ATTTTTT----------AAG-----GTACTTAC----CAATACCACTTT--TTAACC-C-C--CC-----CC-------TTTTT------T-T----TTGGGGTGG----G-G-TTGGGGTT-CT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTTTTTT------AGG-----------------------TACTTTCAATACCC-T-T--CCC----CC-------TTTTT------T-T----AT------------------TAGGT-CTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTG-AAATATC--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----GTT-AT-CT-ATC--TAAAA--TA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------A-AAAAT--ATAACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTT-TGT--ATGG-GGGAAA---ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA-----C-CT--GA--T-AG-ATT---------------------------CAAAC---A--A-----AATTATA-A---TT-T------------TTTCTGTTC----ATT-----AG-TAAT--GAA-A---ATT----TGAACA-----CTTGCT-----------------C-----GCA-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCAT-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT--CTT-AT-A----AATGCATA-AAT-T-TCG--------A--TATATT-TAAA-------AATAAATA-AAA--ATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----G--CGT-A------------------TTGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTT-----GACCTTTGATGT--TTTTATTGGAC-GTGCAGT--CCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAGTTT-T--AAAAT--T-AACTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGC-------------------------------------------TATGAAG-C----ATCAATATTGAAA-------------------AAA-AGAA--------GACAGT---G----GT------GGTGCAAC----TACAAATTTGTGTA---CCGATA--------------TATGCACGGCA------------TTT-TTTTTTTTTTTTTTTTGGTGCTTCCT--GCGCTTA---GTG-GTTGTTCT-TTTATTAAATCACAATTAT-----ACAA-CG-AC-----AAAATTGACACCACCCATTGAAAG--------CCAA---T-A-TTTCATT-T-ACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATC------TACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAAG----------------AGAG-------AGGTAT---ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-C---T-G----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|20 : -AT-GT---AATG--TA-AATGTATCT--------A--TGC-TT-AT-G-------AAT---T--AAA--A-----CAGT---TTG------------C-CAT--T------------AAACTTCGAAAGCCTTGCTT-C-AGAGTTATTGCTT----GCACCTATGATATTGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|21 : gttttattcactaa--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAG-CG-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTA--TGGAACCA---TCCTA-TAT------------------ATA
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTTTATT----GGGGGTGGGTGC----------GG----TATTTT---TACCC-C-C--CCC----CC-------TCTTT------GGTGAGGTTGG---GG----GTG-GCGTGGGT-CTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAATGTT--A-ATGCAAT--ATATA-A---TA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TGTTAAT-ATTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTATA--AGGATGATAAGTAATAGTGCCTTTA--------ACTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTTGAAA-----ATT-AT-TTTATCACTAATA--TATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------C-AAAA---------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTG-T-TTCGTGGCGGAAACTCAATGCATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-T-AGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAAT---A--AAAGTTAA--ATA-A---TTAT------------TTTTTGTTC----ATTGCAT-AA-TAATCTATAGATACATTAC-ATGAATAAATAGTTTGCCATTTATG--------AAC-----GTT-------GA---------------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTTCAG-----------TGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTTTT-A
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGA-TTTCTT-ATTAA---AATGCATA-AAT-T-TCG--------A--TAA-TT-TTTG-------AAAAAATTAAGA--ATAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-AT------------------TGGAA---ATGTTCTC-AGAGTAACT---TG---AAAC-TTTGATGT-GTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTT-TTTAAAAT--TGAACTACC-AGAAATAGCGCAAAT-G-CGCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAATC-AAGTCATTGCT------------------------------------------T-TGAAGCC----ATC-ATATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAA-GGAA--------G-AGGC---A----GT------GGTGGCTGCAACTAAATAT---TGTGTACCTGATA--------------TATGGACGCATTTTTTATTTGACTGTTGCTTTCCT---------GCGCT---TTTACG--TG---GTTTGTT---CT-TT-ATTAAATCACAATTAA-T---AC-AACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATT-TTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATCACCACTTACCAC-------ATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGG--TATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : ---A--A--GTTTATAA-A-C---TT-G------------TTTATGTTC----ATTG-A--AA-TAATCTATA-AT-TATTAC-ATGAATAAAT--ATTGCCA---ATG--------AAC-----GTT-------GAAACGCTTGCTCCAGAGT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCAT-----------T-ATAAGT-Gt
gi|5 : cacagataccaataacaaAAAT--AATCTATAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--AT------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-C-AGAGTTACTGCTTG---C-ACCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCATT--CCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGGCTT-A--AAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-A-AG-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCT------ACATT-TTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATC-ATATTGAAA-------------------AAA-GAAATGATGTTTG-AGAT---GTTTTGT-----AGATA--------TAAATAT---TGTA---CTGATAAATGTACGCATGTTTAT--------------------TGT-GCTTCCCT---------GCGCT---T--ACG--TGCTTGTT-ATT---CTAT--AAGAAATCACAATTATAC---AC-A-CACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAAAG--------TCAA---TAA-TATCTTTAT-AACCCAcattccgctagctaatcagtactgaatcataattgaaatggcttaaaaattaaactaccgagaaatggcgaaataagaaagtaaattggtggacacgtttaggcgaatccaggtcattactatctacattttatatattatgaaatttatttgtatatgaagccatggatcatattgaaaaaagaaatgatgtttgagatgttttgtagatataaatattgtactgataaatgtacgcatgtttattgtgcttccctgcgcttacgtgcttgttattctataagaaatcacaattatacacacacacatgcagaaattgacaacccattgaaagtcaataatatctttataaccca
gi|6 : cacagataccaataacaaaagtttataaacttgtttatgttcattgTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG-------TTAAGGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAGGATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-GT--GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAAT--AT------TGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCC-T--ATGG-GGGGA---AATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATT-AG-A-TTTTCTA-------ATA-----------CAGAT---ATCA--ACAAACAAAA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC----ATTG-A--AG-TA------------------ATGGATAATT--TTTTCCA---ATGAACTTTGAAAC-----GCTTGCTCCAGA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATTT---------AGG-----------------------TACTTT---TCACC-C-CAACCCAAACCC-------TCCTT------T-T----TTGG----------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---ATTGTTTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG--------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA--CTAA--GCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAATGA---------TACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGA-T--A---AT-CA---AATTAATATAAT-T-TTGGAAAAAAAA--TAT-TTGTTCGTTTCTTCAATCCAT--GAA--ATG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAATGAAATTTCCGA-AAGCTTTGACACCAATGTTC-A-AGAGTAACAGCTTG---AGA--TTTTATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAGT--CCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-ATCCT-T--AAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-G-AT-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC-------------------------------------------CATGGAACC----ATT-ATATTGAAG-------------------AAATAAAA--------G-TGGTTTAG----ATATATCAGCTA--------TACATAC---TCTA---TTGATA--------------TAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTA-T----ATGG-GGAGGA--AAT---TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAA-TTAG-ATTTTC----------AAC------------AGAACAAA--A--GTTTATAA---A---TT-T------------TTTTTTTTCTGTCATTG-A--AAGTAATGAATA-TT-TTTTCC-ATGAA-------CTTGTGG---A----------AACCGCCTGCTCCCA---GA---------------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTC----------------AT-AGT-GA-A------------GTC-GTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------TAA---------TACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGA-C--TTTAAT-AG---AATGC--A-AAT-----------------------------------AA-AAAG--GAA--ATAATTCAG-A--TTGAATTCA-----GC-C-T-AT------------
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 222222222 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 111111 111 33333333333333333333 222 222222 11 1 1 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 1 22222 1 333333 1 11 1111 111 555555555 2222222 111 111 3333 4444444 1 2222222222 3333333 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 2222 2222 11 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 7777777777777777777777777777777777777 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 333333333333333333 1111 11111111 1111 11111 1 22222222222 111111111 11 111 11111 5555555555555 1111 22222 11 222222 4444444444444 11 111 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 111 1 1 33333333 11 111 11 3333333 2222 111 33333 4444444 33333 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 22 44 222 222 55555 22
lowQualScore : 99 55 6 666666666 3 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 5 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 77777777777777777777 111 1 000000 1 11 0 3 88 7 3 88 000 000 5 5 77777 5 88 1 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 1 1 5 77777 5 000000 5 1 6 7 44 4444 000 8 8 444444444 8 6666666 444 444 9 8 3333 8 8 6 3333333 3 0 3333333333 3333333 8 8 0 5 11 1 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 2222 1 8888 5 4444 33 66 5 5 5 5555 66 5 66 5 5 5 3 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 4 00 666 1 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 66 4 4 4 0 66 4 66 4 4444444444444444444444444444444444444 2 3333333 2 444 8 1 22222 99999999999999999999999999 000000000000000000 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 77777 5 5 666 0 1 55555555555 1 5 999999999 11 66 66 5 5 888 5 11111 55555 2222222222222 1 6 9999 6 6 1 77777 6 1 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 11 99 99 1 2 6 6 777 6 222 2 2 1 2 3 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 777 0 66 0 11 55555555 66 999 0 3 33 2222222 1111 111 1 9 6 33333 7 9999999 55555 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 11 8 6 7 0 7 1 3 77 33 111 6 333 00000 77 1
lowQualScore : .. .. . ......... . .................................................................................................................. . . . . . . .. .. ...... . ... . .................... ... . ...... . .. . . .. . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . ......... . ....... ... ... . . .... . . . ....... . . .......... ....... . . . . .. . . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................. . .... . .... . .... .. .. . . . .... .. . .. . . . . ......................................................................... . . .. ... . ..................................................................................................... .. . . . . .. . .. . ..................................... . ....... . ... . . ..... .......................... .................. . . .. . .... ........ . .... ..... . . ... . . ........... . . ......... .. .. .. . . ... . ..... ..... ............. . . .... . . . ..... . . . . .. . ...... . . ............. . .. .. .. . . . . ... . ... . . . . . .................................................................................................................................................................................................... . .. . ... . .. . .. ........ .. ... . . .. ....... .... ... . . . ..... . ....... ..... ................................................................................................................................. . .. . . . . . . . .. .. ... . ... ..... .. .
lowQualScore : 22 88 7 777777777 2 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 7 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 88888888888888888888 888 0 000000 0 00 0 2 00 3 3 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 5 55555 0 000000 5 0 7 3 00 2222 000 0 0 444444444 0 0000000 000 000 0 0 0000 0 0 7 3333333 2 0 0000000000 0000000 0 0 8 6 00 0 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 7 7777 7 0000 66 99 0 0 0 6666 99 0 99 0 0 0 2 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 4 66 666 0 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 4 4 4 8 11 4 11 4 4444444444444444444444444444444444444 2 2222222 8 000 0 0 00000 00000000000000000000000000 777777777777777777 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 33333 7 7 777 7 4 11111111111 9 7 777777777 11 99 99 0 4 111 0 11111 11111 9999999999999 3 6 3333 7 7 0 00000 7 0 4 0 00 4 222222 0 4 0000000000000 8 00 44 22 0 5 7 7 555 7 222 5 5 5 2 7 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 5 88 5 555 0 88 0 88 00000000 55 555 8 2 88 5555555 2222 000 0 8 7 33333 3 0000000 00000 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 8 00 0 7 3 7 3 0 0 55 00 555 0 555 00000 55 0
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT---TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGGT-CTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A--A-G-TAAT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATG--------AAC------------GCT-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCA------------T-AT-AGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNATGTCTTCTTTTAATAAAAAATAA---------TACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAA-GGAA--------GA-G---GT---G----GT-----AGNTGCAACTACATATT---GTA---CTGATATAT-GCACGCATTTTTTTTT----------TGG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATTATAC---AC-ACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAANTCNAAATGATCATTCTAA-AATGTTATTGTGGTATNCCATTTTGATTACTATACTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT--ATAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGGT-CTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATNCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A--A-A-TAAT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AANT--N--TTGCCA---ATG--------AAC------------GCT-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCA------------T-AT-AGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNATGTCTTCTTTTAATAAAAAATAA---------TACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ANAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GNACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAA-GGAA--------GN-G---GT---G----GT-----AGGTG----TACATATT---GTA---CTGATATAT-G-ACG---------------------TG-----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATTAT-C---AC-ACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCAC---CCACATTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGT-T-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAANTCAAAATA--CATTCTAACAATGTTATTGCGGT-NGTCAT-----TTAC--TNCTTGCTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTT----T-TTTTGGGGGAGGGG-------AT---------AT-----TTT--ATAACCGC-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-GGTTGTGGGT-CTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAGAA-AATGT-T--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TG-----ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGC--TC-------TAACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TTGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTGT-TT-ATGG-GGAAAAT-AATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTCAATAA---CA-A---TT-T------------TTTATGTTC-ATTA-A--A-A-TGAT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AAGT--G--TTGCCA---ATG--------AAC------------GTT-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTTCA------------T-ATCGGT-GA-A------------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTTTT-ACATA-TA-GCCT----GTG---------CAAT----TTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ATAATGAATG-AATTTCG--------A--TATTT-TTTG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGG--CTTAAAAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTA--T------A---TACTAGTAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTG-AA-------------------AAA-GGAA--------TT-G---GT---G----GT------GGTG----TAC-TATT---GTA---CTGATATAT---------------------------TG-----TGTTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTC--T-AACAAATCACAATTAT-CATGAC-AC--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-AGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATCTA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T-GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-CT----GGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|10 : AACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTG-TTAT-TT-A---CTA--AAATA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATCAAAAT-TTA----TCAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTATGT--ATGG-GGAAAAT----G--TCATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-T-AG-ATTTC-----------AAC-----------AACAA---A--A--GTT--TGA---TA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCAATTG-A--A-G-T--T--A-------------------ATGAAT--AACT-----TTG--A---AAA--------AAC------------ACTTTGCTCAGA---------------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTTannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTTG-T--GTGG-GGAAA-T-AATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-A--TTTTTA-------AAC-----------CATAT---------GTTGATAT---TATA---GA-C------------TTTCTGTTC-ATTG-AATA-A-TTAT--ATA-A-----A-C-TTATA-ATGAAT--AAAT-----TTGCCA---ATG---------AC------------TTT-------GAAAACATC--------GC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTTCA--------------AT-AAT-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTACT---------------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCtttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT-------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATA--CATTCTAA-AATGTT---GTGGT-TGTCAT-----TTAC--TACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG---------TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-CT-A--AGG-GATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTTTC-ACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGAT--CTTTT-ATT-AAAATTCATAGAATTTCC--------GCTTAATT-TTGA-------AA-AAAAG--AAA--A-CAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTTT----T-T---------AAGGTACGTACAT---------ACCACTATTT---TACCT-T-C--CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATAT-T----TTGG---GGTGGAG-G-TTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------A----TT----T-TTT-------AAGG--------T---------AC-----TTT---TCACC-CAA--CTGA---CC-------CATGT------T-T----TT---------------TTGT--AT-CTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAATT----TGTGT--ACATGTCAT--GTAGAGAGgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAATAA---------TACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGAT--C--TT-A-T-AGAATGAATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTGG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCATa
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------ATTTTTTAAGGTACTT-------ACCA-------ATACC------AC-----TTT--TTAACC-C-C--CC-----CC-------TTTTT------T-T----TTGGGGTGG----G-G-TTGGGGTT-CT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTT----T-TTT-------AGG---------T---------AC-----TTTCAATACCC-T-T--CCC----CC-------TTTTT------T-T----AT------------------TAGGT-CTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTGA-AATAT-C--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----G-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------AAAAATAT-AACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTTTGT--ATGG-GGGAAA---ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA-----C-CT--GA--T-AG-ATT---------------------------CAAAC---A--A-----AATTA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATT-----A-G-TAAT--GAA-A--------ATT-----TGAAC--A-----C--TTGCT-----------------C------------GCA-------GA---------------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCAT-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT-C--TT-A-T-A-AATGCATA-AATTTCG--------A--TATAT-TTAA-------AAATAAAT--AAA--AATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----GC--GT-AT------------------TGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTTG-----ACCTTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAG--TTT-TAAAAT--TAA-CTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTA--T-----------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTGAAA-------------------AAA-AGAA--------GACA---GT---G----GT------GGTGCAACTACAAATTTGTGTA---CCGATATAT-GCACGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG----TGCTTCC-TGCGC--TTA-GTG---G-TTGTTCTTTTATTAAATCACAATTATAC---A--ACG-ACA-----AAATTGACACCACCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAA---------G-------AGAG-------AGGTAT-ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-CT----G-----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|2 : AAAATCCAAATGATCATTTTAA--ATGTTATTGTGGTATCCCATTTTGATTACTATACTTGCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaTTTTATTC-ACTA-A--ATG-TAAT--GTA-AATGTAT-CTATGCTTATGAATTAAAAC--AGTTTGCCA---TTA--------AACTTCGAAAGCCTTGCTTCA----GA---------------GT--TATTG-C-T-TGCACC--TA-TGATA--T-TGTatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : g-----GC-CAT--T------------AAACTTCGAAAGCCTTGCTT-CA-GAGTTATTGCTT----GCACCTATGATATTGT
gi|21 : gttttattcactaaatgtaatgtaaatgtatctatgcttatgaattaaaacagttt--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTA--TGGAACCA---TCCTA-TAT------------------ATA
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTT----T-ATT-------GGGG-------GTGGGTGCGGTAT-----TTT---TACCC-C-C--CCC----CC-------TCTTT------GGTGAGGTTGG---GG----GTG-GCGTGGGT-CTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAATGT-T--A-ATGCAAT--ATATA----ATA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TGTTAATA---TTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTAT--AAG-GATGATAAGTAATAGTGCCTTT-------AA-CTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTT-GAA-----AATTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------CAAAA--------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTGT-TTCGTGGCGGAAACTCAATGCATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-T-AGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAAT---A--AAAGTTAA--A---TA-A---TTAT------------TTTTTGTTC-ATTGCAT-A-A-TAATCTATAGA-----TACATTAC--ATGAAT--AAATAGT--TTGCCATTTATG--------AAC------------GTT-------GA---------------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTTCAG-----------TGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTTTT-A
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGATTTC--TT-A-TTAAAATGCATA-AATTTCG--------A--TAATT-TTTG-------AA-AAAATTAAGA--A-TAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-A------------------TTGGAA---ATGTTCTCA-GAGTAA---CTTG---AAA-CTTTGATG-TGTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTTTT-TAAAAT--TGAACTA-CCAGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAAT-CAAGTCATTGCT---T----------------------------------------TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAA-GGAA--------GA-GGCAGT---G----GT-----GGCTGCAACTAAATATT---GTGTACCTGATATATGG-ACGCATTTTTTATT----------TGACTGTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT-ATTAAATCACAATTAA-T---ACAACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATC-ACCACTTACCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG-----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : ---A--A--GTTTATAA----A-C---TT-G------------TTTATGTTC-ATTG-A--A-A-TAATCTATA-A-----T-TATTAC--ATGAAT--AAAT--A--TTGCCA---ATG--------AAC------------GTT-------GAAACGCTTGCTCCAGAGT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCAT-----------T-ATAAGT-Gt
gi|5 : cacagataccaataacaaAAAT--AATCTA-TAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--AT------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTG----CACCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCAT--TCCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGG--CTT-AAAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCT------ACATT-TTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTGAAA-------------------AAA-GAAATGATGTTTGA-G---AT---GTTTTGT-----AGATA----TAAATATT---GTA---CTGATAAAT-GTACGCATGTTTAT------------TG-----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTGCTTG-TTATTCTAT-AAGAAATCACAATTATAC---AC-ACACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAA-------AGTC----AATAA-TATCTTTATAACCCAcattccgctagctaatcagtactgaatcataattgaaatggcttaaaaattaaactaccgagaaatggcgaaataagaaagtaaattggtggacacgtttaggcgaatccaggtcattactatctacattttatatattatgaaatttatttgtatatgaagccatggatcatattgaaaaaagaaatgatgtttgagatgttttgtagatataaatattgtactgataaatgtacgcatgtttattgtgcttccctgcgcttacgtgcttgttattctataagaaatcacaattatacacacacacatgcagaaattgacaacccattgaaagtcaataatatctttataaccca
gi|6 : cacagataccaataacaaaagtttataaacttgtttatgttcattgTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG---------TTAAGGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAG-GATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-G-T-GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAA-T-A----TTGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCCT--ATGG-GGGGAA---ATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATT-AG-A-TTTTCTA-------ATA-----------CAGAT---ATCA--ACAAACAA---AA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC-ATTG-A--A-G-TA------------------------ATGGAT--AATT--T--TTTCCA---ATGAACTTTGAAAC------------GCTTGCTCCAGA---------------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATT----T-----------AGG---------T---------AC-----TTT---TCACC-C-CAACCCAAACCC-------TCCTT------T-T----TTGG----------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---ATTGT-TTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG----------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA-CT----AAGCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAATGA---------TACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGAT--A-----A-T-CAAATTAATATAATTTTGGAAAAAAAA--TATTTGTTCGTTTCTTCAA-TCCAT--GAA--A-TG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAATGAAATTTCCGA-AAGCTTTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTG---AGA--TTTTATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAG--TCCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-AT--CCT-TAAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC-------------------------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTGAAG-------------------AAATAAAA--------GT-G---GTTTAG----ATATATCAGCTA----TACATACT---CTA---TTGATATAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTAT----ATGG-GGAGGA--AAT---TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAA-TTAG-ATTTTC----------AAC------------AGAACAAA--A--GTTTATAAATTTT-T---TT-T------------TTTCTGT-C-ATTG-A--A-AGTAATGAATA-T-----T-TTTTCC--ATGAA---------C--TTGTGG---A----------AACCGCCT-------GCTCCCA---GA---------------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTC----------------AT-AGT-GA-A------------GTC-GTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------TAA---------TACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGAC--T--TTAA-T-AGAATGC--A-AAT--------------------------------AA--AAAG--GAA--A-TAATTCAG-AT-T-GAATTCA-----GC-C-T-AT------------
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 222222222 777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222222 44444444444444444444444444444444444444 111111 111 33333333333333333333 222 222222 11 1 1 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 1 22222 1 333333 1 11 1111 111 555555555 2222222 111 111 1111 4444444 1 2222222222 3333333 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 2222 2222 11 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111 7777777777777777777777777777777777777 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 3333333333333333 1111 11111111 1111 11111 1 22222222222 1111111 11 111 11111 5555555555555 1111 33333 11 222222 4444444444444 11 111 4444444444444444444444444444444444444444444 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 111 1 777777777777777777777777 11 111 1 1 1 1 111 11 111 11 3333333 2222 111 33333 33333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 333 1 444444444444 11
lowQualScore : 99 55 6 666666666 3 555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 5 77 00000000000000 33333333333333333333333333333333333333 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 77777777777777777777 111 1 000000 11 0 3 88 7 3 88 000 000 5 5 77777 5 88 1 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 1 1 5 77777 5 000000 5 1 6 7 44 4444 000 8 8 444444444 8 6666666 444 444 9 8 8888 0 8 8 6 3333333 3 0 3333333333 3333333 8 8 0 5 11 1 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 2222 1 8888 5 4444 33 66 5 5 5 5555 66 5 66 5 5 5 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 55 5 00 888 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6666666 66 555 5 2 66 5 66 5 7777777777777777777777777777777777777 2 3333333 2 444 8 1 22222 99999999999999999999999999 4444444444444444 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 77777 5 5 5 1 0 1 99999999999 0 5 2 6666666 44 66 66 5 5 888 5 11111 55555 2222222222222 1 6 9999 6 6 1 00000 2 1 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 11 99 99 1 2 6 6 777 6 222 2 2 1 2 3 6666666666666666666666666666666666666666666 7777 8 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 444 444 99 0 444444444444444444444444 2 33 2 777 0 66 0 11 0 0 666 66 999 0 3 33 2222222 1111 111 1 9 6 33333 7 8888888 0 55555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 11 8 6 7 0 7 1 1 111 3 7 7 000000000000 55 7
lowQualScore : .. .. . ......... . ............................................. . . . .. .............. ...................................... . . . . .. .. ...... . ... . .................... ... . ...... .. . . .. . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . ......... . ....... ... ... . . .... . . . . ....... . . .......... ....... . . . . .. . . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................. . .... . .... . .... .. .. . . . .... .. . .. . . . . ......................................................................... . .. . .. ... ................................................................................ ....... .. ... . . .. . .. . ..................................... . ....... . ... . . ..... .......................... ................ . . .. . .... ........ . .... ..... . . . . . . ........... . . . ....... .. .. .. . . ... . ..... ..... ............. . . .... . . . ..... . . . . .. . ...... . . ............. . .. .. .. . . . . ... . ... . . . . . ........................................... .... . . .................................................................. . ... ... .. . ........................ . .. . ... . .. . .. . . ... .. ... . . .. ....... .... ... . . . ..... . ....... . ..... ................................................................................................................................. . .. . . . . . . . ... . . . ............ .. .
lowQualScore : 22 88 7 777777777 2 666666666666666666666666666666666666666666666 7 7 7 99 00000000000000 66666666666666666666666666666666666666 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 88888888888888888888 888 0 000000 00 0 2 00 3 3 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 5 55555 0 000000 5 0 7 3 00 2222 000 0 0 444444444 0 0000000 000 000 0 0 0000 8 0 0 7 3333333 2 0 0000000000 0000000 0 0 8 6 00 0 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 7 7777 7 0000 66 99 0 0 0 6666 99 0 99 0 0 0 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22 0 22 888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 2222222 99 111 0 0 99 0 99 0 5555555555555555555555555555555555555 2 2222222 8 000 0 0 00000 00000000000000000000000000 8888888888888888 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 33333 7 7 0 4 0 4 66666666666 5 0 8 2222222 88 99 99 0 4 111 0 11111 11111 9999999999999 3 6 3333 7 7 0 33333 5 0 4 0 00 4 222222 0 4 0000000000000 8 00 44 22 0 5 7 7 555 7 222 5 5 5 2 7 3333333333333333333333333333333333333333333 0000 0 8 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 8 000 000 00 0 222222222222222222222222 5 88 5 555 0 88 0 88 0 0 000 55 555 8 2 88 5555555 2222 000 0 8 7 33333 3 7777777 7 00000 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 00 0 7 3 7 3 0 0 333 3 3 3 333333333333 00 3
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAA----T--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT------GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCA------------T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTAT-CCATT-T--TTACT-TACTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAA----T--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCT-------GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTTCA------------T-AT-AGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNATGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGNTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGCACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAANTCNAAATGATCATTCTAA-AATGTTATTGTGGTATNCCATTTTGATTACTATACTTGCTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTT----T-TTTTGGGGGAGGGG-------AT---------AT-----TTTATAACCGC-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-GGTTGTGGG-TCTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAGAA-AATGT-T--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TG-----ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGC--TC-------TAACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TTGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTGT-TT-ATGG-GGAAAAT-AATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTCAATAA---CA-A---TT-T------------TTTATGTTC-ATTA-A-A-ATG---AT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAA----T--AAGT--G--TTGCCA---ATGAAC------------GTT-------GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTTCA------------T-ATCGGT-G--AA-----------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTTTT-ACATA-TA-GCCT----GTG---------CAA----TTTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ATAATGAATG-AATTTCG--------A--TATTT-TTTG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGG--CTTAAAAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTA--T------A---TACTAGTAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTG-AA-------------------AAAGGAA--------TT-G---GTG----G--T-GGTG---------TAC-TATT---GTA---CTGATATAT--------T-------------------G----TGTTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTC--T-AACAAATCACAATT-ATCATGACAC--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-AGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATCTA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T-GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-CT----GGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|1 : AAAATCAAAATA--CATTCTAACAATGTTATTGCGGTA----ATTAT--TTACTTT--TTGCTTCCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|10 : gaggggggggggtctagcacttggattttattatttttttttttgggggaggggatattttataaccgcccccacctctttttttgggggggttgtgggtctgggagactatttatacgtgaacatgatttagtttaattcattagtatattaagaaaatgttatatgcaatccataaagaggatataatattagtccagataggacagttctagttggttcagtgtaacatttacttgttcttagtagcaaagaaatcttgaaaaaattatttcaaattcattggtttcgtagatattatcacctccaaaatcatcatcaatatttggtaacagcaaggatttttttcttaaatctcatgaatctaggttgatacaatatcacgctgacggttaaggaacaacacacttgctctaccgaaacgaagcttaaaggatgaaagtaatagtgctctaacttgaaaatttgaatttgatgtgaaattatttatcactaatataatgattttcgcagctagtcttcaaccataatcatgaacaaaattattgaaggatagaagattcttatcaaaaataagatttgtttatggggaaaataatgccattttgcttcattcaaagcctctgaatagatttttttaaaccagataagtcaataacaattttttatgttcattaaaatgatataatcattacatgaataagtgttgccaatgaacgttgagttactgcttgcacctgtaatattgtttcatatcggtgaagtccgtaaactataagagatttttacatatagcctgtgcaatttttctaaaaaaaaagaaagaaaaaaatacgatgtgaagtaaattcgtaaattgtgtttataattgtcggtgcttgattttgatcttatataatgaatgaatttcgatattttttgaataaataaaataatttagtatattgattcagccgtataaactttggcatgcatgttcctgagtaactacttgcatgcacttttaatgttgttttgttggaagtgcagtccgcaagctattactgaatcttgattgaaatggcttaaaaaaatgaactacccagaaatagcgaaatgcgaaagtaaattggtggacacgtatcggcgaattcaagccattactatatactagtatatatgaagccatcatattgaaaaaggaattggtggtggtgtactattgtactgatatattgtgtttccctgcgcttacgtggttgttctaacaaatcacaattatcatgacacacacacaaaaattgacaccccattgaaagccaatagtttctttataacccacttgtcagagccaatagaaaggtcatgtatctactacattgtctccctccaaatacaatagagaggtgccccgccacttccagagtgcaagtacctatgcatgtggggcgaagttctgggagcaatgactagatcgcccctaagaaaatatatccgggaccgggtcccaacatgggggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTG-TTAT-TT-A---CTA--AAATA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATCAAAAT-TTA----TCAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTATGT--ATGG-GGAAAAT----G--TCATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-T-AG-ATTTC-----------AAC-----------AACAA---A--A--GTT--TGA---TA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCAATTG-A-A-GT-----T--A-------------------ATGAA----T--AACT-----TTG--A---AAAAAC------------ACTTTGCTCAGA-------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTTagt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTTG-T--GTGG-GGAAA-T-AATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-A--TTTTTA-------AAC-----------CATAT---------GTTGATAT---TATA---GA-C------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A--TAATTAT--ATA-A-----A-C-TTATA-ATGAA----T--AAAT-----TTGCCA---ATG-AC------------TTT-------GAAAACATCGC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTTCA--------------AT-AAT-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTACT---------------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCtttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT-------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATA--CATTCTAA-AATG---TTGTGGT-TGTCAT-----TTAC--TACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG---------TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-CTAA--G-G-GATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTTTC-ACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGAT--CTTTT-ATT-AAAATTCATAGAATTTCC--------GCTTAATT-TTGA-------AA-AAAAG--AAA--A-CAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTTT-------TT-------AAGGTACGTACAT---------ACCACTATTT-TACCT-T-C--CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATAT-T----TTGG---GGTGGAG-G-TTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------A----TT----T-TTT-------AAGG--------T---------AC-----TTT-TCACC-CAA--CTGA---CC-------CATGT------T-T----TT---------------TTGT--A-TCTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAATT----TGTGT--ACATGTCAT--GTAGAGAGgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAAT---------AATACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGAT--C--TT-A-T-AGAATGAATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTGG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCATa
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------ATTTTTTAAGGTACTT-------ACCA-------AT---------ACCACT-TTT-TAACC-C-C--CC-----CC-------TTTTT------T-T----TTGGGGTGG----G-G-TTGGGGT-TCT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTT----T-TTT-------AGG---------T---------AC-----TTT-CAATA-C-C--CTTC---CC-------CCTTT------T-T----TTA---------------T-TAGG-TCTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTGA-AATAT-C--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----G-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------AAAAATAT-AACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTTTGT--ATGG-GGGAAA---ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA-----C-CT--GA--T-AG-ATT---------------------------CAAAC---A--A-----AATTA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATT----A-GTA---AT--GAA-A--------ATT-----TGAA----C--A-----C--TTGCT---------C------------GCA-------GA-------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCAT-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT-C--TT-A-T-AAA-TGCATA-AATTTCG--------A--TATAT-TTAA-------AAATAAAT--AAA--AATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----GC--GT-AT------------------TGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTTG-----ACCTTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAG--TTT-TAAAAT--TAA-CTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTA--T-----------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTGAAA-------------------AAAAGAA--------GACA---GTG----G--T-GGTG---CAAC--TACAAATTTGTGTA---CCGATATATGCACGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG----TGCTTCC-TGCGC--TTA-GTG---G-TTGTTCTTTTATTAAATCACAATT-AT-AC-A-ACG-ACA-----AAATTGACACCACCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAA---------G-------AGAG-------AGGTAT-ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-CT----G-----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|2 : AAAATCCAAATGATCATTTTAA-A-TGTTATTGTGGTATCCCATTTTGATTACTATACTTGCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaTTTTATTC-ACTA-A-ATGTA---AT--GTA-AATGTAT-CTATGCTTATGAA----TTAAAAC--AGTTTGCCA---TTAAACTTCGAAAGCCTTGCTTCA----GA-------GT--TATTG-C-T-TGCACC--TA-TGATA--T-TGTatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : g-----GC-CAT--T------------AAACTTCGAAAGCCTTGCTT-CA-GAGTTATTGCTT----GCACCTATGATATTGT
gi|21 : gttttattcactaaatgtaatgtaaatgtatctatgcttatgaattaaaacagttt--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTA--TGGAACCA---TCCTA-TAT------------------ATA
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTT----T-ATT-------GGGG-------GTGGGTGCGGTAT-----TTT-TACCC-C-C--CCC----CC-------TCTTT------GGTGAGGTTGG---GG----GTG-GCGTGGG-TCTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAATGT-T--A-ATGCAAT--ATATA----ATA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TGTTAATA---TTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTAT--AAG-GATGATAAGTAATAGTGCCTTT-------AA-CTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTT-GAA-----AATTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------CAAAA--------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTGT-TTCGTGGCGGAAACTCAATGCATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-T-AGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAAT---A--AAAGTTAA--A---TA-A---TTAT------------TTTTTGTTC-ATTGCATA-ATA---ATCTATAGA-----TACATTAC--ATGAA----T--AAATAGT--TTGCCATTTATGAAC------------GTT-------GA-------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTTCAG-----------TGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTTTT-A
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGATTTC--TT-A-TTAAAATGCATA-AATTTCG--------A--TAATT-TTTG-------AA-AAAATTAAGA--A-TAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-A------------------TTGGAA---ATGTTCTCA-GAGTAA---CTTG---A-AACTTTGATG-TGTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTTTT-TAAAAT--TGAACTA-CCAGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAAT-CAAGTCATTGCT---T----------------------------------------TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAGGAA--------GA-GGCAGTG----G--TGGCTG---CAAC--TAAATATT---GTGTACCTGATATATGGACG-CATTTTTTATTT---------GACTGTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT-ATTAAATCACAATTAAT-AC-A-ACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATC-ACCACTTACCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG-----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : -AAAGTTTATA-AACTT-GTTT-----A--TGTTC-ATTG-------AA----AT--AATCTA-TAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--AT------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTG----CACCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCAT--TCCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGG--CTT-AAAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCT------ACATT-TTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTGAAA-------------------AAAGAAATGATGTTTGA-G---ATGTTTTG--TAGATA---TAA------ATATT---GTA---CTGATAAATGTACG-CATGTTTATT------------G----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTGCTTG-TTATTCTAT-AAGAAATCACAATT-AT-AC-ACACACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAA-------AGTC----AATAA-TATCTTTATAACCCAt
gi|6 : cacagataccaataacaTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG---------TTAAGGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAG-GATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-G-T-GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAA-T-A----TTGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCCT--ATGG-GGGGAA---ATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATT-AG-A-TTTTCTA-------ATA-----------CAGAT---ATCA--ACAAACAA---AA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC-ATTG-A-A-GTA---ATGGATA-A-----T-TTTTTC----CAA----T--GAAC--T--TTG--------AAAC------------GCTTGCTCCAGA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATT----T-----------AGG---------T---------AC-----TTT-TCACC-C-CAACCCAAACCC-------TCCTT------T-T----TTGG----------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---ATTGT-TTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG----------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA-CT----AAGCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAAT---------GATACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGAT--A-----A-T-CAAATTAATATAATTTTGGAAAAAAAA--TATTTGTTCGTTTCTTCAA-TCCAT--GAA--A-TG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAATGAAATTTCCGA-AAGCTTTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTG---AGA--TTTTATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAG--TCCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-AT--CCT-TAAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC-------------------------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTGAAG-------------------AAAT--A--------AA-A---GTG----GTTTAGATATATCAGCTATACATACT---CTA---TTGATATAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTAT----ATGG-GGAGGA--AAT---TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAA-TTAG-ATTTTC----------AAC------------AGAACAAA--A--GTTTATAAATTTT-T---TT-T------------TTTCTGT-C-ATTG-A-AAGTA---ATGAATA-T-----T-TTTTCC--ATGAACTTGT--GGAA--A--CCGCC-----TGCTC------------CCA-------GA-------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTC----------------AT-AGT-GA-A------------GTC-GTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------T---------AATACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGAC--T--TTAA-T-AGAATGC--A-AAT--------------------------------AA--AAAG--GAA--A-TAATTCAG-AT-T-GAATTCA-----GC-C-T-AT------------
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 222222222 777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222222 44444444444444444444444444444444444444 111111 111 33333333333333333333 222 222222 11 1 1 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 1 22222 1 333333 1 11 1111 111 555555555 2222222 111 111 1111 4444444 1 2222222222 3333333 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 2222 2222 11 1111 11 1 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4444444444444444444444444444444444444444 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 3333333333333333 1111 11111111 1111 11111 1 22222222222 1111111 11 111 11111 5555555555555 1111 33333 11 222222 4444444444444 11 111 4444444444444444444444444444444444444444444 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 111 1 777777777777777777777777 11 111 1 1 1 1 111 11 111 11 3333333 2222 111 33333 33333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 1 6666666666666 22
lowQualScore : 99 55 6 666666666 3 555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 5 77 00000000000000 33333333333333333333333333333333333333 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 77777777777777777777 111 1 000000 11 0 3 88 7 3 88 000 000 5 5 77777 5 88 1 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 1 1 5 77777 5 000000 5 1 6 7 44 4444 000 8 8 444444444 8 6666666 444 444 9 8 8888 0 8 8 6 3333333 3 0 3333333333 3333333 8 8 0 5 11 1 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 2222 1 8888 5 4444 33 66 5 5 5555 11 5 66 0 5 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 55 5 00 888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 66 555 5 2 66 5 66 5 9999999999999999999999999999999999999999 2 3333333 2 444 8 1 22222 77777777777777777777777777 4444444444444444 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 77777 5 5 5 1 0 1 99999999999 0 5 2 6666666 44 66 66 5 5 888 5 11111 55555 2222222222222 1 6 9999 6 6 1 00000 2 1 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 11 99 99 1 2 6 6 777 6 222 2 2 1 2 3 6666666666666666666666666666666666666666666 7777 8 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 444 444 77 0 444444444444444444444444 2 33 2 777 0 66 0 11 0 0 666 66 999 0 3 33 2222222 1111 111 1 9 6 33333 7 8888888 0 55555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 11 8 6 7 0 7 88 3 7 0 6666666666666 00 7
lowQualScore : .. .. . ......... . ............................................. . . . .. .............. ...................................... . . . . .. .. ...... . ... . .................... ... . ...... .. . . .. . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . ......... . ....... ... ... . . .... . . . . ....... . . .......... ....... . . . . .. . . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................. . .... . .... . .... .. .. . . .... .. . .. . . ......................................................................... . .. . .. ... ............................................................................................... .. ... . . .. . .. . ........................................ . ....... . ... . . ..... .......................... ................ . . .. . .... ........ . .... ..... . . . . . . ........... . . . ....... .. .. .. . . ... . ..... ..... ............. . . .... . . . ..... . . . . .. . ...... . . ............. . .. .. .. . . . . ... . ... . . . . . ........................................... .... . . .................................................................. . ... ... .. . ........................ . .. . ... . .. . .. . . ... .. ... . . .. ....... .... ... . . . ..... . ....... . ..... ................................................................................................................................. . .. . . . . . .. . . . ............. .. .
lowQualScore : 22 88 7 777777777 2 666666666666666666666666666666666666666666666 7 7 7 99 00000000000000 66666666666666666666666666666666666666 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 88888888888888888888 888 0 000000 00 0 2 00 3 3 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 5 55555 0 000000 5 0 7 3 00 2222 000 0 0 444444444 0 0000000 000 000 0 0 0000 8 0 0 7 3333333 2 0 0000000000 0000000 0 0 8 6 00 0 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 7 7777 7 0000 66 99 0 0 6666 99 0 99 0 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22 0 22 888 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 99 111 0 0 99 0 99 0 5555555555555555555555555555555555555555 2 2222222 8 000 0 0 00000 55555555555555555555555555 8888888888888888 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 33333 7 7 0 4 0 4 66666666666 5 0 8 2222222 88 99 99 0 4 111 0 11111 11111 9999999999999 3 6 3333 7 7 0 33333 5 0 4 0 00 4 222222 0 4 0000000000000 8 00 44 22 0 5 7 7 555 7 222 5 5 5 2 7 3333333333333333333333333333333333333333333 0000 0 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 000 000 00 0 222222222222222222222222 5 88 5 555 0 88 0 88 0 0 000 55 555 8 2 88 5555555 2222 000 0 8 7 33333 3 7777777 7 00000 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 00 0 7 3 7 3 33 3 3 7 0000000000000 77 3
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTCA----AA--GCCT-CT--GAAT-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAA---C------------GCTT------G-------A-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTCA----AA--GCCT-CT--GAAT-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAA---C------------GCTT------G-------A-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTTTT-ACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTAT-CCATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTT----T-TTTTGGGGGAGGGG-------AT---------AT-----TTTATAACCGC-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-GGTTGTGGG-TCTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAGAA-AATGT-T--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TG-----ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGC--TC-------TAACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TTGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTGT-TT-ATGG-GGAAAAT-AATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTCA----AA--GCCT-CT--GAAT-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTCAATAA---CA-A---TT-T------------TTTATGTTC-ATTA-A-A-ATG---AT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AAGT--G--TTGCCA---ATGAA---C------------G-TT------G-------A-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCGGT-G--AA-----------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTTTT-ACATA-TA-GCCT----GTG---------CAA----TTTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ATAATGAATG-AATTTCG--------A--TATTT-TTTG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGG--CTTAAAAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTA--T------A---TACTAGTAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTG-AA-------------------AAAGGAA--------TT-G---GTG----G--T-GGTG---------TAC-TATT---GTA---CTGATATAT--------T-------------------G----TGTTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTC--T-AACAAATCACAATT-ATCATGACAC--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-AGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATCTA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T-GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-CT----GGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|1 : AAAATCAAAATA--CATTCTAACAATGTTATTGCGGTA----ATTAT---TTACT-T-TTTGCTTCCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|10 : gaggggggggggtctagcacttggattttattatttttttttttgggggaggggatattttataaccgcccccacctctttttttgggggggttgtgggtctgggagactatttatacgtgaacatgatttagtttaattcattagtatattaagaaaatgttatatgcaatccataaagaggatataatattagtccagataggacagttctagttggttcagtgtaacatttacttgttcttagtagcaaagaaatcttgaaaaaattatttcaaattcattggtttcgtagatattatcacctccaaaatcatcatcaatatttggtaacagcaaggatttttttcttaaatctcatgaatctaggttgatacaatatcacgctgacggttaaggaacaacacacttgctctaccgaaacgaagcttaaaggatgaaagtaatagtgctctaacttgaaaatttgaatttgatgtgaaattatttatcactaatataatgattttcgcagctagtcttcaaccataatcatgaacaaaattattgaaggatagaagattcttatcaaaaataagatttgtttatggggaaaataatgccattttgcttcattcaaagcctctgaatagatttttttaaaccagataagtcaataacaattttttatgttcattaaaatgatataatcattacatgaataagtgttgccaatgaacgttgagttactgcttgcacctgtaatattgtttcatatcggtgaagtccgtaaactataagagatttttacatatagcctgtgcaatttttctaaaaaaaaagaaagaaaaaaatacgatgtgaagtaaattcgtaaattgtgtttataattgtcggtgcttgattttgatcttatataatgaatgaatttcgatattttttgaataaataaaataatttagtatattgattcagccgtataaactttggcatgcatgttcctgagtaactacttgcatgcacttttaatgttgttttgttggaagtgcagtccgcaagctattactgaatcttgattgaaatggcttaaaaaaatgaactacccagaaatagcgaaatgcgaaagtaaattggtggacacgtatcggcgaattcaagccattactatatactagtatatatgaagccatcatattgaaaaaggaattggtggtggtgtactattgtactgatatattgtgtttccctgcgcttacgtggttgttctaacaaatcacaattatcatgacacacacacaaaaattgacaccccattgaaagccaatagtttctttataacccacttgtcagagccaatagaaaggtcatgtatctactacattgtctccctccaaatacaatagagaggtgccccgccacttccagagtgcaagtacctatgcatgtggggcgaagttctgggagcaatgactagatcgcccctaagaaaatatatccgggaccgggtcccaacatgggggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTG-TTAT-TT-A---CTA--AAATA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATCAAAAT-TTA----TCAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTATGT--ATGG-GGAAAAT----G--TCATTT--TGCTT-C-ATGCA----AAAGGCCC-CTCGGAAT-AG-ATTTC-----------AAC-----------AACAA---A--A--GTT--TGA---TA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCAATTG-A-A-GT-----T--A-------------------ATGAAT--AACT-----TTG--A---AAAAA---C------------ACTTTGCTCAG-------A-------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTT------------agt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTTG-T--GTGG-GGAAA-T-AATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTCAG---AA--GCCT-CT--GAAT-AG-A--TTTTTA-------AAC-----------CATAT---------GTTGATAT---TATA---GA-C------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A--TAATTAT--ATA-A-----A-CTTATA--ATGAAT--AAAT-----TTGCCA---ATG-A---C-------------TTT------G-------AAAACATCGC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTT------------CA-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTACT---------------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCataattttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT-------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTGTGGTTGT----CA---T---TTAC--TACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG---------TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-CTAA--G-G-GATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTTTC-ACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGAT--CTTTT-ATT-AAAATTCATAGAATTTCC--------GCTTAATT-TTGA-------AA-AAAAG--AAA--A-CAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTTT-------TT-------AAGGTACGTACAT---------ACCACTATTT-TACCT-T-C--CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATAT-T----TTGG---GGTGGAG-G-TTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------A----TT----T-TTT-------AAGG--------T---------AC-----TTT-TCACC-CAA--CTGA---CC-------CATGT------T-T----TT---------------TTGT--A-TCTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAATT----TGTGT--ACATGTCAT--GTAGAGAGgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAAT---------AATACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGAT--C--TT-A-T-AGAATGAATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTGG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCATa
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------ATTTTTTAAGGTACTT-------ACCA-------AT---------ACCACT-TTT-TAACC-C-C--CC-----CC-------TTTTT------T-T----TTGGGGTGG----G-G-TTGGGGT-TCT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTT----T-TTT-------AGG---------T---------AC-----TTT-CAATA-C-C--CTTC---CC-------CCTTT------T-T----TTA---------------T-TAGG-TCTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTGA-AATAT-C--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----G-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------AAAAATAT-AACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTTTGT--ATGG-GGGAAA---ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTCA----AA-----C-CT--GA-T-AG-ATT---------------------------CAAAC---A--A-----AATTA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATT----A-GTA---AT--GAA-A--------ATT-----TGAAC--A-----C--TTGCT------------C------------GCA-------G-------A-------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCA-T-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT-C--TT-A-T-AAA-TGCATA-AATTTCG--------A--TATAT-TTAA-------AAATAAAT--AAA--AATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----GC--GT-AT------------------TGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTTG-----ACCTTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAG--TTT-TAAAAT--TAA-CTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTA--T-----------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTGAAA-------------------AAAAGAA--------GACA---GTG----G--T-GGTG---CAAC--TACAAATTTGTGTA---CCGATATATGCACGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG----TGCTTCC-TGCGC--TTA-GTG---G-TTGTTCTTTTATTAAATCACAATT-AT-AC-A-ACG-ACA-----AAATTGACACCACCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAA---------G-------AGAG-------AGGTAT-ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-CT----G-----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|2 : AAAATCCAAATGATCATTTTAA-A-TGTTATTGTGGTATCCCATT-TTGATTACTATACTTGCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaTTTTATTC-ACTA-A-ATGTA---AT--GTA-AATGTAT-CTATGCTTATGAATTAAAAC--AGTTTGCCA---TTAAA---CTTCGAAAGCCTTGCTTCA----G-------A-------GT--TATTG-C-T-TGCACC--TA-TGATA--T-TGTatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : g-----GC-CAT--T------------AAACTTCGAAAGCCTTGCTT-CA-GAGTTATTGCTT----GCACCTATGATATTGT
gi|21 : gttttattcactaaatgtaatgtaaatgtatctatgcttatgaattaaaacagttt--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTA--TGGAACCA---TCCTA-TAT------------------ATA
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCCA----AA--GCCT-CT--GAAT-AC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTT----T-ATT-------GGGG-------GTGGGTGCGGTAT-----TTT-TACCC-C-C--CCC----CC-------TCTTT------GGTGAGGTTGG---GG----GTG-GCGTGGG-TCTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAATGT-T--A-ATGCAAT--ATATA----ATA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TGTTAATA---TTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTAT--AAG-GATGATAAGTAATAGTGCCTTT-------AA-CTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTT-GAA-----AATTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------CAAAA--------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTGT-TTCGTGGCGGAAACTCAATGCATCATTT--GCCTT-CTATTCATGATAA--GCTA-CT--GAAT-AGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAAT---A--AAAGTTAA--A---TA-A---TTAT------------TTTTTGTTC-ATTGCATA-ATA---ATCTATAGA-----TACATTAC--ATGAAT--AAATAGT--TTGCCATTTATGAA---C------------G-TT------G-------A-------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTT------------CAGTGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTTTT-A
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGATTTC--TT-A-TTAAAATGCATA-AATTTCG--------A--TAATT-TTTG-------AA-AAAATTAAGA--A-TAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-A------------------TTGGAA---ATGTTCTCA-GAGTAA---CTTG---A-AACTTTGATG-TGTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTTTT-TAAAAT--TGAACTA-CCAGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAAT-CAAGTCATTGCT---T----------------------------------------TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAGGAA--------GA-GGCAGTG----G--TGGCTG---CAAC--TAAATATT---GTGTACCTGATATATGGACG-CATTTTTTATTT---------GACTGTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT-ATTAAATCACAATTAAT-AC-A-ACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATC-ACCACTTACCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG-----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : -AAAGTTTATA-AACTT-GTTT-----A--TGTTC-ATTG-------AA----AT--AATCTA-TAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--AT------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTG----CACCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCAT--TCCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGG--CTT-AAAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCT------ACATT-TTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTGAAA-------------------AAAGAAATGATGTTTGA-G---ATGTTTTG--TAGATA---TAA------ATATT---GTA---CTGATAAATGTACG-CATGTTTATT------------G----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTGCTTG-TTATTCTAT-AAGAAATCACAATT-AT-AC-ACACACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAA-------AGTC----AATAA-TATCTTTATAACCCAt
gi|6 : cacagataccaataacaTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG---------TTAAGGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAG-GATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-G-T-GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAA-T-A----TTGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCCT--ATGG-GGGGAA---ATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCA----AAA-GCCTACT--GAATTAG-ATTTTCT-A-------ATA-----------CAGAT---ATCA--ACAAACAA---AA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC-ATTG-A-A-GTA---ATGGATA-A-----T-TTTTTC----CAAT--GAAC--T--TTG--------AAA---C------------GCTTGCTCCAG-------A-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATT----T-----------AGG---------T---------AC-----TTT-TCACC-C-CAACCCAAACCC-------TCCTT------T-T----TTGG----------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---ATTGT-TTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG----------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA-CT----AAGCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAAT---------GATACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGAT--A-----A-T-CAAATTAATATAATTTTGGAAAAAAAA--TATTTGTTCGTTTCTTCAA-TCCAT--GAA--A-TG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAATGAAATTTCCGA-AAGCTTTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTG---AGA--TTTTATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAG--TCCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-AT--CCT-TAAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC-------------------------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTGAAG-------------------AAAT--A--------AA-A---GTG----GTTTAGATATATCAGCTATACATACT---CTA---TTGATATAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTAT----ATGG-GGAGGA--AAT---TCATTT--TGCTT-C-ATTCA----AA--GCCT-CC--GAATTAG-ATTTTC----------AAC------------AGAACAAA--A--GTTTATAAATTTT-T---TT-T------------TTTCTGT-C-ATTG-A-AAGTA---ATGAATA-T-----T-TTTTCC--ATGAA---------C--TTG-------TGGAAACC------------GCCT------GCTCCCAGA-------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTT-------------CA-T-A---GT-GA-A------------GTC-GTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------T---------AATACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGAC--T--TTAA-T-AGAATGC--A-AAT--------------------------------AA--AAAG--GAA--A-TAATTCAG-AT-T-GAATTCA-----GC-C-T-AT------------
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 222222222 777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222222 44444444444444444444444444444444444444 111111 111 33333333333333333333 222 222222 11 1 1 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 1 22222 1 333333 1 11 1111 111 555555555 2222222 111 111 1111 4444444 1 2222222222 3333333 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 2222 2222 11 1111 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 4444444444444444444444444444444444444444 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 3333333333333333 1111 11111111 1111 11111 1 22222222222 1111111 11 111 11111 5555555555555 1111 33333 11 222222 4444444444444 11 111 4444444444444444444444444444444444444444444 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 111 1 777777777777777777777777 11 111 1 1 1 1 111 11 111 11 3333333 2222 111 33333 33333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 1 6666666666666 22
lowQualScore : 99 55 6 666666666 3 555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 5 77 00000000000000 33333333333333333333333333333333333333 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 77777777777777777777 111 1 000000 11 0 3 88 7 3 88 000 000 5 5 77777 5 88 1 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 1 1 5 77777 5 000000 5 1 6 7 44 4444 000 8 8 444444444 8 6666666 444 444 9 8 8888 0 8 8 6 3333333 3 0 3333333333 3333333 8 8 0 5 11 1 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 2222 1 8888 5 4444 33 66 5 5 5 5555 66 5 66 0 5 9 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 00 5 55 888 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 6666666 66 555 5 2 66 5 66 5 9999999999999999999999999999999999999999 2 3333333 2 444 8 1 22222 77777777777777777777777777 4444444444444444 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 77777 5 5 5 1 0 1 99999999999 0 5 2 6666666 44 66 66 5 5 888 5 11111 55555 2222222222222 1 6 9999 6 6 1 00000 2 1 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 11 99 99 1 2 6 6 777 6 222 2 2 1 2 3 6666666666666666666666666666666666666666666 7777 8 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 444 444 77 0 444444444444444444444444 2 33 2 777 0 66 0 11 0 0 666 66 999 0 3 33 2222222 1111 111 1 9 6 33333 7 8888888 0 55555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 11 8 6 7 0 7 88 3 7 0 2222222222222 00 7
lowQualScore : .. .. . ......... . ............................................. . . . .. .............. ...................................... . . . . .. .. ...... . ... . .................... ... . ...... .. . . .. . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . ......... . ....... ... ... . . .... . . . . ....... . . .......... ....... . . . . .. . . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................. . .... . .... . .... .. .. . . . .... .. . .. . . . . ..................................................................... . .. . .. ... ................................................................................ ....... .. ... . . .. . .. . ........................................ . ....... . ... . . ..... .......................... ................ . . .. . .... ........ . .... ..... . . . . . . ........... . . . ....... .. .. .. . . ... . ..... ..... ............. . . .... . . . ..... . . . . .. . ...... . . ............. . .. .. .. . . . . ... . ... . . . . . ........................................... .... . . .................................................................. . ... ... .. . ........................ . .. . ... . .. . .. . . ... .. ... . . .. ....... .... ... . . . ..... . ....... . ..... ................................................................................................................................. . .. . . . . . .. . . . ............. .. .
lowQualScore : 22 88 7 777777777 2 666666666666666666666666666666666666666666666 7 7 7 99 00000000000000 66666666666666666666666666666666666666 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 88888888888888888888 888 0 000000 00 0 2 00 3 3 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 5 55555 0 000000 5 0 7 3 00 2222 000 0 0 444444444 0 0000000 000 000 0 0 0000 8 0 0 7 3333333 2 0 0000000000 0000000 0 0 8 6 00 0 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 7 7777 7 0000 66 99 0 0 0 6666 99 0 99 0 0 4 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 22 0 22 888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 2222222 99 111 0 0 99 0 99 0 5555555555555555555555555555555555555555 2 2222222 8 000 0 0 00000 55555555555555555555555555 8888888888888888 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 33333 7 7 0 4 0 4 66666666666 5 0 8 2222222 88 99 99 0 4 111 0 11111 11111 9999999999999 3 6 3333 7 7 0 33333 5 0 4 0 00 4 222222 0 4 0000000000000 8 00 44 22 0 5 7 7 555 7 222 5 5 5 2 7 3333333333333333333333333333333333333333333 0000 0 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 000 000 00 0 222222222222222222222222 5 88 5 555 0 88 0 88 0 0 000 55 555 8 2 88 5555555 2222 000 0 8 7 33333 3 7777777 7 00000 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 00 0 7 3 7 3 33 3 3 7 3333333333333 77 3
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAG---ATA--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAA---C------------GCTT----C--GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAG---ATA--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAA---C------------GCTT-------GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TTACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTT----T-TTTTGGGGGAGGGG-------AT---------AT-----TTTATAACCGC-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-GGTTGTGGG-TCTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAGAA-AATGT-T--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TG-----ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGC--TC-------TAACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TTGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTGT-TT-ATGG-GGAAAAT-AATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAG---ATA--A--GTCAATAA---CA-A---TT-T------------TTTATGTTC-ATTA-A-A-ATG---AT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AAGT--G--TTGCCA---ATGAA---C------------G-TT-------GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCGGT-G--AA-----------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTT-TTACATA-TA-GCCT----GTG---------CAA----TTTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ATAATGAATG-AATTTCG--------A--TATTT-TTTG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGG--CTTAAAAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTA--T------A---TACTAGTAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTG-AA-------------------AAAGGAA--------TT-G---GTG----G--T-GGTG---------TAC-TATT---GTA---CTGATATAT--------T-------------------G----TGTTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTC--T-AACAAATCACAATT-ATCATGACAC--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-AGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATCTA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T-GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-CT----GGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|1 : AAAATCAAAATA--CATTCTAACAATGTTATTGCGGTA----ATTAT---TTACT-T-TTTGCTTCCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|10 : gaggggggggggtctagcacttggattttattatttttttttttgggggaggggatattttataaccgcccccacctctttttttgggggggttgtgggtctgggagactatttatacgtgaacatgatttagtttaattcattagtatattaagaaaatgttatatgcaatccataaagaggatataatattagtccagataggacagttctagttggttcagtgtaacatttacttgttcttagtagcaaagaaatcttgaaaaaattatttcaaattcattggtttcgtagatattatcacctccaaaatcatcatcaatatttggtaacagcaaggatttttttcttaaatctcatgaatctaggttgatacaatatcacgctgacggttaaggaacaacacacttgctctaccgaaacgaagcttaaaggatgaaagtaatagtgctctaacttgaaaatttgaatttgatgtgaaattatttatcactaatataatgattttcgcagctagtcttcaaccataatcatgaacaaaattattgaaggatagaagattcttatcaaaaataagatttgtttatggggaaaataatgccattttgcttcattcaaagcctctgaatagatttttttaaaccagataagtcaataacaattttttatgttcattaaaatgatataatcattacatgaataagtgttgccaatgaacgttgagttactgcttgcacctgtaatattgtttcatatcggtgaagtccgtaaactataagagatttttacatatagcctgtgcaatttttctaaaaaaaaagaaagaaaaaaatacgatgtgaagtaaattcgtaaattgtgtttataattgtcggtgcttgattttgatcttatataatgaatgaatttcgatattttttgaataaataaaataatttagtatattgattcagccgtataaactttggcatgcatgttcctgagtaactacttgcatgcacttttaatgttgttttgttggaagtgcagtccgcaagctattactgaatcttgattgaaatggcttaaaaaaatgaactacccagaaatagcgaaatgcgaaagtaaattggtggacacgtatcggcgaattcaagccattactatatactagtatatatgaagccatcatattgaaaaaggaattggtggtggtgtactattgtactgatatattgtgtttccctgcgcttacgtggttgttctaacaaatcacaattatcatgacacacacacaaaaattgacaccccattgaaagccaatagtttctttataacccacttgtcagagccaatagaaaggtcatgtatctactacattgtctccctccaaatacaatagagaggtgccccgccacttccagagtgcaagtacctatgcatgtggggcgaagttctgggagcaatgactagatcgcccctaagaaaatatatccgggaccgggtcccaacatgggggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTG-TTAT-TT-A---CTA--AAATA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATCAAAAT-TTA----TCAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTATGT--ATGG-GGAAAAT----G--TCATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-TAG-ATTTC-----------AAC-----------AAC---AAA--A--GTT--TGA---TA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCAATTG-A-A-GT-----T--A-------------------ATGAAT--AACT-----TTG--A---AAAAA---C------------ACTTTGCTCA-GA-------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTT------------agt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTTG-T--GTGG-GGAAA-T-AATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-TAG-A--TTTTTA-------AAC-----------CAT---AT------GTTGATAT---TATA---GA-C------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A--TAATTAT--ATA-A-----A-CTTATA--ATGAAT--AAAT-----TTGCCA---ATG-A---C-------------TTT-------GAAAACATCGC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTT------------CA-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTACT---------------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCataattttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT-------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTGTGGTTGT----CA---T---TTAC--TACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG---------TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-CTAA--G-G-GATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTT-TCACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGAT--CTTTT-ATT-AAAATTCATAGAATTTCC--------GCTTAATT-TTGA-------AA-AAAAG--AAA--A-CAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTTT-------TT-------AAGGTACGTACAT---------ACCACTATTT-TACCT-T-C--CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATAT-T----TTGG---GGTGGAG-G-TTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------A----TT----T-TTT-------AAGG--------T---------AC-----TTT-TCACC-CAA--CTGA---CC-------CATGT------T-T----TT---------------TTGT--A-TCTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAATT----TGTGT--ACATGTCAT--GTAGAGAGgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAAT---------AATACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGAT--C--TT-A-T-AGAATGAATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTGG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCATa
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------ATTTTTTAAGGTACTT-------ACCA-------AT---------ACCACT-TTT-TAACC-C-C--CC-----CC-------TTTTT------T-T----TTGGGGTGG----G-G-TTGGGGT-TCT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTT----T-TTT-------AGG---------T---------AC-----TTT-CAATA-C-C--CTTC---CC-------CCTTT------T-T----TTA---------------T-TAGG-TCTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTGA-AATAT-C--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----G-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------AAAAATAT-AACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTTTGT--ATGG-GGGAAA---ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA-----C-CT--GA--TAG-ATT---------------------------CAA---ACA--A-----AATTA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATT----A-GTA---AT--GAA-A--------ATT-----TGAAC--A-----C--TTGCT------------C------------GCA--------GA-------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCA-T-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT-C--TT-A-T-AAA-TGCATA-AATTTCG--------A--TATAT-TTAA-------AAATAAAT--AAA--AATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----GC--GT-AT------------------TGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTTG-----ACCTTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAG--TTT-TAAAAT--TAA-CTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTA--T-----------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTGAAA-------------------AAAAGAA--------GACA---GTG----G--T-GGTG---CAAC--TACAAATTTGTGTA---CCGATATATGCACGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG----TGCTTCC-TGCGC--TTA-GTG---G-TTGTTCTTTTATTAAATCACAATT-AT-AC-A-ACG-ACA-----AAATTGACACCACCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAA---------G-------AGAG-------AGGTAT-ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-CT----G-----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|2 : AAAATCCAAATGATCATTTTAA-A-TGTTATTGTGGTATCCCATT-TTGATTACTATACTTGCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaTTTTATTC-ACTA-A-ATGTA---AT--GTA-AATGTAT-CTATGCTTATGAATTAAAAC--AGTTTGCCA---TTAAA---CTTCGAAAGCCTTGCTTCA-----GA-------GT--TATTG-C-T-TGCACC--TA-TGATA--T-TGTatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : g-----GC-CAT--T------------AAACTTCGAAAGCCTTGCTT-CA-GAGTTATTGCTT----GCACCTATGATATTGT
gi|21 : gttttattcactaaatgtaatgtaaatgtatctatgcttatgaattaaaacagttt--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTA--TGGAACCA---TCCTA-TAT------------------ATA
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTT----T-ATT-------GGGG-------GTGGGTGCGGTAT-----TTT-TACCC-C-C--CCC----CC-------TCTTT------GGTGAGGTTGG---GG----GTG-GCGTGGG-TCTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAATGT-T--A-ATGCAAT--ATATA----ATA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TGTTAATA---TTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTAT--AAG-GATGATAAGTAATAGTGCCTTT-------AA-CTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTT-GAA-----AATTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------CAAAA--------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTGT-TTCGTGGCGGAAACTCAATGCATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-TAGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAA---ATA--AAAGTTAA--A---TA-A---TTAT------------TTTTTGTTC-ATTGCATA-ATA---ATCTATAGA-----TACATTAC--ATGAAT--AAATAGT--TTGCCATTTATGAA---C------------G-TT-------GA-------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTT------------CAGTGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTT-TTA
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGATTTC--TT-A-TTAAAATGCATA-AATTTCG--------A--TAATT-TTTG-------AA-AAAATTAAGA--A-TAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-A------------------TTGGAA---ATGTTCTCA-GAGTAA---CTTG---A-AACTTTGATG-TGTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTTTT-TAAAAT--TGAACTA-CCAGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAAT-CAAGTCATTGCT---T----------------------------------------TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAGGAA--------GA-GGCAGTG----G--TGGCTG---CAAC--TAAATATT---GTGTACCTGATATATGGACG-CATTTTTTATTT---------GACTGTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT-ATTAAATCACAATTAAT-AC-A-ACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATC-ACCACTTACCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG-----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : -AAAGTTTATA-AACTT-GTTT-----A--TGTTC-ATTG-------AA----AT--AATCTA-TAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--AT------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTG----CACCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCAT--TCCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGG--CTT-AAAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCT------ACATT-TTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTGAAA-------------------AAAGAAATGATGTTTGA-G---ATGTTTTG--TAGATA---TAA------ATATT---GTA---CTGATAAATGTACG-CATGTTTATT------------G----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTGCTTG-TTATTCTAT-AAGAAATCACAATT-AT-AC-ACACACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAA-------AGTC----AATAA-TATCTTTATAACCCAt
gi|6 : cacagataccaataacaTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG---------TTAAGGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAG-GATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-G-T-GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAA-T-A----TTGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCCT--ATGG-GGGGAA---ATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATTAG-A-TTTTCTA-------ATA-----------CAG---ATATCA--ACAAACAA---AA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC-ATTG-A-A-GTA---ATGGATA-A-----T-TTTTTC----CAAT--GAAC--T--TTG--------AAA---C------------GCTTGCTCCA-GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATT----T-----------AGG---------T---------AC-----TTT-TCACC-C-CAACCCAAACCC-------TCCTT------T-T----TTGG----------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---ATTGT-TTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG----------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA-CT----AAGCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAAT---------GATACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGAT--A-----A-T-CAAATTAATATAATTTTGGAAAAAAAA--TATTTGTTCGTTTCTTCAA-TCCAT--GAA--A-TG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAATGAAATTTCCGA-AAGCTTTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTG---AGA--TTTTATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAG--TCCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-AT--CCT-TAAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC-------------------------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTGAAG-------------------AAAT--A--------AA-A---GTG----GTTTAGATATATCAGCTATACATACT---CTA---TTGATATAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTAT----ATGG-GGAGGA--AAT---TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAATTAG-A--TTTTCA-------A-------------CAGAACAAA--A--GTTTATAAATTTT-T---TT-T------------TTTCTG-TC-ATTGAA-A-GTA---ATGAATA-T-----T-TTTTCC--ATGAA---------C--TTG-------TGGAAACC------------GCCTGCTCCCAGA-------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TG-TT------------CA-T----AGT-G--AA-----------GT-CGTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------T---------AATACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGAC--T--TTAA-T-AGAATGC--A-AAT--------------------------------AA--AAAG--GAA--A-TAATTCAG-AT-T-GAATTCA-----GC-C-T-AT------------
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 222222222 777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222222 44444444444444444444444444444444444444 111111 111 33333333333333333333 222 222222 11 1 1 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 1 22222 1 333333 1 11 1111 111 555555555 2222222 111 111 1111 4444444 1 2222222222 3333333 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 2222 2222 11 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 4444444444444444444444444444444444444444 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 3333333333333333 1111 11111111 1111 11111 1 22222222222 1111111 11 111 11111 66666666666666666 111 44444 11 222222 4444444444444 11 111 4444444444444444444444444444444444444444444 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 111 1 777777777777777777777777 11 111 1 1 1 1 111 11 111 11 3333333 2222 111 33333 33333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 1 6666666666666 22
lowQualScore : 99 55 6 666666666 3 555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 5 77 00000000000000 33333333333333333333333333333333333333 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 77777777777777777777 111 1 000000 11 0 3 88 7 3 88 000 000 5 5 77777 5 88 1 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 1 1 5 77777 5 000000 5 1 6 7 44 4444 000 8 8 444444444 8 6666666 444 444 9 8 8888 0 8 8 6 3333333 3 0 3333333333 3333333 8 8 0 5 11 1 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 2222 1 8888 5 4444 33 66 5 5 5 5555 66 5 66 5 5 5 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 55 5 00 888 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6666666 66 555 5 2 66 5 66 5 9999999999999999999999999999999999999999 2 3333333 2 444 8 1 22222 77777777777777777777777777 4444444444444444 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 77777 5 5 5 1 0 1 99999999999 0 5 2 6666666 44 66 66 5 5 888 5 22222 77777 33333333333333333 7 777 8 8 22 00000 5 1 0 3 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 11 99 99 1 2 6 6 777 6 222 2 2 1 2 3 6666666666666666666666666666666666666666666 7777 8 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 444 444 77 0 444444444444444444444444 2 33 2 777 0 66 0 11 0 0 666 66 999 0 3 33 2222222 1111 111 1 9 6 33333 7 8888888 0 55555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 11 8 6 7 0 7 88 3 7 0 2222222222222 00 7
lowQualScore : .. .. . ......... . ............................................. . . . .. .............. ...................................... . . . . .. .. ...... . ... . .................... ... . ...... .. . . .. . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . ......... . ....... ... ... . . .... . . . . ....... . . .......... ....... . . . . .. . . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................. . .... . .... . .... .. .. . . . .... .. . .. . . . . ......................................................................... . .. . .. ... ............................................................................. ....... .. ... . . .. . .. . ........................................ . ....... . ... . . ..... .......................... ................ . . .. . .... ........ . .... ..... . . . . . . ........... . . . ....... .. .. .. . . ... . ..... ..... ................. . ... . . .. ..... . . . . . . .. . ...... . . ............. . .. .. .. . . . . ... . ... . . . . . ........................................... .... . . .................................................................. . ... ... .. . ........................ . .. . ... . .. . .. . . ... .. ... . . .. ....... .... ... . . . ..... . ....... . ..... ................................................................................................................................. . .. . . . . . .. . . . ............. .. .
lowQualScore : 22 88 7 777777777 2 666666666666666666666666666666666666666666666 7 7 7 99 00000000000000 66666666666666666666666666666666666666 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 88888888888888888888 888 0 000000 00 0 2 00 3 3 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 5 55555 0 000000 5 0 7 3 00 2222 000 0 0 444444444 0 0000000 000 000 0 0 0000 8 0 0 7 3333333 2 0 0000000000 0000000 0 0 8 6 00 0 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 7 7777 7 0000 66 99 0 0 0 6666 99 0 99 0 0 0 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22 0 22 888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222 99 111 0 0 99 0 99 0 5555555555555555555555555555555555555555 2 2222222 8 000 0 0 00000 55555555555555555555555555 8888888888888888 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 33333 7 7 0 4 0 4 66666666666 5 0 8 2222222 88 99 99 0 4 111 0 55555 66666 99999999999999999 5 000 0 0 44 44444 0 4 8 2 4 0 00 4 222222 0 4 0000000000000 8 00 44 22 0 5 7 7 555 7 222 5 5 5 2 7 3333333333333333333333333333333333333333333 0000 0 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 000 000 00 0 222222222222222222222222 5 88 5 555 0 88 0 88 0 0 000 55 555 8 2 88 5555555 2222 000 0 8 7 33333 3 7777777 7 00000 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 00 0 7 3 7 3 33 3 3 7 3333333333333 77 3
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGACACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---ACACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGANACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---GCACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTT----T-TTTTGGGGGAGGGG-------AT---------AT-----TTTATAACCGC-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-GGTTGTGGG-TCTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAGAA-AATGT-T--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TG-----ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGC--TC-------TAACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TTGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTGT-TT-ATGG-GGAAAAT-AATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTCAATAA---CA-A---TT-T------------TTTATGTTC-ATTA-A-A-ATG---AT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AAGT--G--TTGCCA---ATGAAC------------G--T-T-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCGGT-G--AA-----------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTT-TTACATA-TA-GCCT----GTG---------CAA----TTTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ATAATGAATG-AATTTCG--------A--TATTT-TTTG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGG--CTTAAAAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTA--T------A---TACTAGTAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTG-AA-------------------AAAGGAA--------TT-G---GTG----G--T-GGTG---------TAC-TATT---GTA---CTGATATAT--------T-------------------G----TGTTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTC--T-AACAAATCACAATT-ATCATGACAC--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-AGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATCTA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T-GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-CT----GGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|1 : AAAATCAAAATA--CATTCTAACAATGTTATTGCGGTA----ATTAT---TTACT-T-TTTGCTTCCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|10 : gaggggggggggtctagcacttggattttattatttttttttttgggggaggggatattttataaccgcccccacctctttttttgggggggttgtgggtctgggagactatttatacgtgaacatgatttagtttaattcattagtatattaagaaaatgttatatgcaatccataaagaggatataatattagtccagataggacagttctagttggttcagtgtaacatttacttgttcttagtagcaaagaaatcttgaaaaaattatttcaaattcattggtttcgtagatattatcacctccaaaatcatcatcaatatttggtaacagcaaggatttttttcttaaatctcatgaatctaggttgatacaatatcacgctgacggttaaggaacaacacacttgctctaccgaaacgaagcttaaaggatgaaagtaatagtgctctaacttgaaaatttgaatttgatgtgaaattatttatcactaatataatgattttcgcagctagtcttcaaccataatcatgaacaaaattattgaaggatagaagattcttatcaaaaataagatttgtttatggggaaaataatgccattttgcttcattcaaagcctctgaatagatttttttaaaccagataagtcaataacaattttttatgttcattaaaatgatataatcattacatgaataagtgttgccaatgaacgttgagttactgcttgcacctgtaatattgtttcatatcggtgaagtccgtaaactataagagatttttacatatagcctgtgcaatttttctaaaaaaaaagaaagaaaaaaatacgatgtgaagtaaattcgtaaattgtgtttataattgtcggtgcttgattttgatcttatataatgaatgaatttcgatattttttgaataaataaaataatttagtatattgattcagccgtataaactttggcatgcatgttcctgagtaactacttgcatgcacttttaatgttgttttgttggaagtgcagtccgcaagctattactgaatcttgattgaaatggcttaaaaaaatgaactacccagaaatagcgaaatgcgaaagtaaattggtggacacgtatcggcgaattcaagccattactatatactagtatatatgaagccatcatattgaaaaaggaattggtggtggtgtactattgtactgatatattgtgtttccctgcgcttacgtggttgttctaacaaatcacaattatcatgacacacacacaaaaattgacaccccattgaaagccaatagtttctttataacccacttgtcagagccaatagaaaggtcatgtatctactacattgtctccctccaaatacaatagagaggtgccccgccacttccagagtgcaagtacctatgcatgtggggcgaagttctgggagcaatgactagatcgcccctaagaaaatatatccgggaccgggtcccaacatgggggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTG-TTAT-TT-A---CTA--AAATA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATCAAAAT-TTA----TCAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTATGT--ATGG-GGAAAAT----G--TCATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-T-AG-ATTTC-----------AAC-----------AACAA---A--A--GTT--TGA---TA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCAATTG-A-A-GT-----T--A-------------------ATGAAT--AACT-----TTG--A---AAAAAC------------ACTT-TGCTCAGA-------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTT------------agt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTTG-T--GTGG-GGAAA-T-AATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-A--TTTTTA-------AAC-----------CATAT---------GTTGATAT---TATA---GA-C------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A--TAATTAT--ATA-A-----A-CTTATA--ATGAAT--AAAT-----TTGCCA---ATGA---------------CTT-T-----GAAAACATCGC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTT------------CA-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTACT---------------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCataattttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT-------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTGTGGTTGT----CA---T---TTAC--TACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG---------TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-CTAA--G-G-GATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTT-TCACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGAT--CTTTT-ATT-AAAATTCATAGAATTTCC--------GCTTAATT-TTGA-------AA-AAAAG--AAA--A-CAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTTT-------TT-------AAGGTACGTACAT---------ACCACTATTT-TACCT-T-C--CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATAT-T----TTGG---GGTGGAG-G-TTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------A----TT----T-TTT-------AAGG--------T---------AC-----TTT-TCACC-CAA--CTGA---CC-------CATGT------T-T----TT---------------TTGT--A-TCTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAATT----TGTGT--ACATGTCAT--GTAGAGAGgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAAT---------AATACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGAT--C--TT-A-T-AGAATGAATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTGG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCATa
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------ATTTTTTAAGGTACTT-------ACCA-------AT---------ACCACT-TTT-TAACC-C-C--CC-----CC-------TTTTT------T-T----TTGGGGTGG----G-G-TTGGGGT-TCT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTT----T-TTT-------AGG---------T---------AC-----TTT-CAATA-C-C--CTTC---CC-------CCTTT------T-T----TTA---------------T-TAGG-TCTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTGA-AATAT-C--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----G-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------AAAAATAT-AACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTTTGT--ATGG-GGGAAA---ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA-----C-CT--GA--T-AG-ATT---------------------------CAAAC---A--A-----AATTA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATT----A-GTA---AT--GAA-A--------ATT-----TGAAC--A-----C--TTGCT---------C------------GC---A-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCA-T-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT-C--TT-A-T-AAA-TGCATA-AATTTCG--------A--TATAT-TTAA-------AAATAAAT--AAA--AATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----GC--GT-AT------------------TGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTTG-----ACCTTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAG--TTT-TAAAAT--TAA-CTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTA--T-----------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTGAAA-------------------AAAAGAA--------GACA---GTG----G--T-GGTG---CAAC--TACAAATTTGTGTA---CCGATATATGCACGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG----TGCTTCC-TGCGC--TTA-GTG---G-TTGTTCTTTTATTAAATCACAATT-AT-AC-A-ACG-ACA-----AAATTGACACCACCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAA---------G-------AGAG-------AGGTAT-ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-CT----G-----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|2 : AAAATCCAAATGATCATTTTAA-A-TGTTATTGTGGTATCCCATT-TTGATTACTATACTTGCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaTTTTATTC-ACTA-A-ATGTA---AT--GTA-AATGTAT-CTATGCTTATGAATTAAAAC--AGTTTGCCA---TTAAACTTCGAAAGCCTTGCTT-CA----GA-------GT--TATTG-C-T-TGCACC--TA-TGATA--T-TGTatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|21 : g--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTA--TGGAACCA---TCCTA-TAT------------------ATA
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTT----T-ATT-------GGGG-------GTGGGTGCGGTAT-----TTT-TACCC-C-C--CCC----CC-------TCTTT------GGTGAGGTTGG---GG----GTG-GCGTGGG-TCTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAATGT-T--A-ATGCAAT--ATATA----ATA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TGTTAATA---TTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTAT--AAG-GATGATAAGTAATAGTGCCTTT-------AA-CTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTT-GAA-----AATTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------CAAAA--------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTGT-TTCGTGGCGGAAACTCAATGCATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-T-AGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAAT---A--AAAGTTAA--A---TA-A---TTAT------------TTTTTGTTC-ATTGCATA-ATA---ATCTATAGA-----TACATTAC--ATGAAT--AAATAGT--TTGCCATTTATGAAC------------G--T-T-----GA-------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTT------------CAGTGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTT-TTA
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGATTTC--TT-A-TTAAAATGCATA-AATTTCG--------A--TAATT-TTTG-------AA-AAAATTAAGA--A-TAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-A------------------TTGGAA---ATGTTCTCA-GAGTAA---CTTG---A-AACTTTGATG-TGTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTTTT-TAAAAT--TGAACTA-CCAGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAAT-CAAGTCATTGCT---T----------------------------------------TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAGGAA--------GA-GGCAGTG----G--TGGCTG---CAAC--TAAATATT---GTGTACCTGATATATGGACG-CATTTTTTATTT---------GACTGTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT-ATTAAATCACAATTAAT-AC-A-ACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATC-ACCACTTACCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG-----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : -AAAGTTTATA-AACTT-GTTT-----A--TGTTC-ATTG-------AA----AT--AATCTA-TAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--AT------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTG----CACCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCAT--TCCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGG--CTT-AAAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCT------ACATT-TTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTGAAA-------------------AAAGAAATGATGTTTGA-G---ATGTTTTG--TAGATA---TAA------ATATT---GTA---CTGATAAATGTACG-CATGTTTATT------------G----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTGCTTG-TTATTCTAT-AAGAAATCACAATT-AT-AC-ACACACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAA-------AGTC----AATAA-TATCTTTATAACCCAt
gi|6 : cacagataccaataacaTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG---------TTAAGGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAG-GATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-G-T-GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAA-T-A----TTGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCCT--ATGG-GGGGAA---ATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATT-AG-A-TTTTCTA-------ATA-----------CAGAT---ATCA--ACAAACAA---AA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC-ATTG-A-A-GTA---ATGGATA-A-----T-TTTTTC----CAAT--GAAC--T--TTG--------AAAC------------GCTTGCTCCA-GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATT----T-----------AGG---------T---------AC-----TTT-TCACC-C-CAACCCAAACCC-------TCCTT------T-T----TTGG----------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---ATTGT-TTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG----------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA-CT----AAGCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAAT---------GATACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGAT--A-----A-T-CAAATTAATATAATTTTGGAAAAAAAA--TATTTGTTCGTTTCTTCAA-TCCAT--GAA--A-TG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAATGAAATTTCCGA-AAGCTTTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTG---AGA--TTTTATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAG--TCCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-AT--CCT-TAAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC-------------------------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTGAAG-------------------AAAT--A--------AA-A---GTG----GTTTAGATATATCAGCTATACATACT---CTA---TTGATATAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTAT----ATGG-GGAGGA--AAT---TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAA-TTAG-ATTTTC----------AAC------------AGAACAAA--A--GTTTATAAATTTT-T---TT-T------------TTTCTGT-C-ATTG-A-AAGTA---ATGAATA-T-----T-TTTTCC--ATGAA---------C--TTGTGG---A--AACCGCCT-------GCTC-CCA---GA-------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTT-------------CA-T-A---GT-GA-A------------GTC-GTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------T---------AATACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGAC--T--TTAA-T-AGAATGC--A-AAT--------------------------------AA--AAAG--GAA--A-TAATTCAG-AT-T-GAATTCA-----GC-C-T-AT------------
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 222222222 777777777777777777777777777777777777777777777 22222222222222 44444444444444444444444444444444444444 111111 111 33333333333333333333 222 222222 11 1 1 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 1 22222 1 333333 1 11 1111 111 555555555 2222222 111 111 1111 4444444 1 2222222222 3333333 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 2222 2222 11 1111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 4444444444444444444444444444444444444444 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 3333333333333333 1111 11111111 1111 11111 1 22222222222 1111111 11 111 11111 66666666666666666 111 3333333 11 222222 4444444444444 11 111 4444444444444444444444444444444444444444444 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 111 1 777777777777777777777777 11 111 1 1 1 1 111 11 111 11 3333333 2222 111 33333 33333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 1 6666666666666 22
lowQualScore : 99 55 6 666666666 3 555555555555555555555555555555555555555555555 5 5 5 77 00000000000000 33333333333333333333333333333333333333 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 77777777777777777777 111 1 000000 11 0 3 88 7 3 88 000 000 5 5 77777 5 88 1 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 1 1 5 77777 5 000000 5 1 6 7 44 4444 000 8 8 444444444 8 6666666 444 444 9 8 8888 0 8 8 6 3333333 3 0 3333333333 3333333 8 8 0 5 11 1 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 2222 1 8888 5 4444 33 66 5 5 5 5555 66 5 66 5 5 5 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 55 5 00 888 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6666666 66 555 5 2 66 5 66 5 9999999999999999999999999999999999999999 2 3333333 2 444 8 1 22222 77777777777777777777777777 4444444444444444 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 77777 5 5 5 1 0 1 99999999999 0 5 2 6666666 44 66 66 5 5 888 5 22222 77777 33333333333333333 6 777 8 8 22 3333333 1 0 3 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 11 99 99 1 2 6 6 777 6 222 2 2 1 2 3 6666666666666666666666666666666666666666666 7777 8 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 444 444 77 0 444444444444444444444444 2 33 2 777 0 66 0 11 0 0 666 66 999 0 3 33 2222222 1111 111 1 9 6 33333 7 8888888 0 55555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 11 8 6 7 0 7 88 3 7 0 2222222222222 00 7
lowQualScore : .. .. . ......... . ............................................. . . . .. .............. ...................................... . . . . .. .. ...... . ... . .................... ... . ...... .. . . .. . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . ......... . ....... ... ... . . .... . . . . ....... . . .......... ....... . . . . .. . . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................. . .... . .... . .... .. .. . . . .... .. . .. . . . . ......................................................................... . .. . .. ... ............................................................................. ....... .. ... . . .. . .. . ........................................ . ....... . ... . . ..... .......................... ................ . . .. . .... ........ . .... ..... . . . . . . ........... . . . ....... .. .. .. . . ... . ..... ..... ................. . ... . . .. ....... . . . . . .. . ...... . . ............. . .. .. .. . . . . ... . ... . . . . . ........................................... .... . . .................................................................. . ... ... .. . ........................ . .. . ... . .. . .. . . ... .. ... . . .. ....... .... ... . . . ..... . ....... . ..... ................................................................................................................................. . .. . . . . . .. . . . ............. .. .
lowQualScore : 22 88 7 777777777 2 666666666666666666666666666666666666666666666 7 7 7 99 00000000000000 66666666666666666666666666666666666666 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 88888888888888888888 888 0 000000 00 0 2 00 3 3 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 5 55555 0 000000 5 0 7 3 00 2222 000 0 0 444444444 0 0000000 000 000 0 0 0000 8 0 0 7 3333333 2 0 0000000000 0000000 0 0 8 6 00 0 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 7 7777 7 0000 66 99 0 0 0 6666 99 0 99 0 0 0 2 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 0 22 0 22 888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222 99 111 0 0 99 0 99 0 5555555555555555555555555555555555555555 2 2222222 8 000 0 0 00000 55555555555555555555555555 8888888888888888 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 33333 7 7 0 4 0 4 66666666666 5 0 8 2222222 88 99 99 0 4 111 0 55555 66666 99999999999999999 7 000 0 0 44 6666666 4 8 2 4 0 00 4 222222 0 4 0000000000000 8 00 44 22 0 5 7 7 555 7 222 5 5 5 2 7 3333333333333333333333333333333333333333333 0000 0 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 000 000 00 0 222222222222222222222222 5 88 5 555 0 88 0 88 0 0 000 55 555 8 2 88 5555555 2222 000 0 8 7 33333 3 7777777 7 00000 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 00 0 7 3 7 3 33 3 3 7 3333333333333 77 3
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGACACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---ACACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGACACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---ACACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTT----T-TTTTGGGGGAGGGG-------AT---------AT-----TTTATAACCGC-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-GGTTGTGGG-TCTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAGAA-AATGT-T--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TG-----ACGGTTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGC--TC-------TAACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TTGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTGT-TT-ATGG-GGAAAAT-AATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTCAATAA---CA-A---TT-T------------TTTATGTTC-ATTA-A-A-ATG---AT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AAGT--G--TTGCCA---ATGAAC------------G--T-T-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCGGT-G--AA-----------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTT-TTACATA-TA-GCCT----GTG---------CAA----TTTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ATAATGAATG-AATTTCG--------A--TATTT-TTTG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGG--CTTAAAAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTA--T------A---TACTAGTAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTG-AA-------------------AAAGGAA--------TT-G---GTG----G--T-GGTG---------TAC-TATT---GTA---CTGATATAT--------T-------------------G----TGTTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTC--T-AACAAATCACAATT-ATCATGACAC--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-AGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATCTA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T-GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-CT----GGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|1 : AAAATCAAAATA--CATTCTAACAATGTTATTGCGGTA----ATTAT---TTACT-T-TTTGCTTCCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|10 : gaggggggggggtctagcacttggattttattatttttttttttgggggaggggatattttataaccgcccccacctctttttttgggggggttgtgggtctgggagactatttatacgtgaacatgatttagtttaattcattagtatattaagaaaatgttatatgcaatccataaagaggatataatattagtccagataggacagttctagttggttcagtgtaacatttacttgttcttagtagcaaagaaatcttgaaaaaattatttcaaattcattggtttcgtagatattatcacctccaaaatcatcatcaatatttggtaacagcaaggatttttttcttaaatctcatgaatctaggttgatacaatatcacgctgacggttaaggaacaacacacttgctctaccgaaacgaagcttaaaggatgaaagtaatagtgctctaacttgaaaatttgaatttgatgtgaaattatttatcactaatataatgattttcgcagctagtcttcaaccataatcatgaacaaaattattgaaggatagaagattcttatcaaaaataagatttgtttatggggaaaataatgccattttgcttcattcaaagcctctgaatagatttttttaaaccagataagtcaataacaattttttatgttcattaaaatgatataatcattacatgaataagtgttgccaatgaacgttgagttactgcttgcacctgtaatattgtttcatatcggtgaagtccgtaaactataagagatttttacatatagcctgtgcaatttttctaaaaaaaaagaaagaaaaaaatacgatgtgaagtaaattcgtaaattgtgtttataattgtcggtgcttgattttgatcttatataatgaatgaatttcgatattttttgaataaataaaataatttagtatattgattcagccgtataaactttggcatgcatgttcctgagtaactacttgcatgcacttttaatgttgttttgttggaagtgcagtccgcaagctattactgaatcttgattgaaatggcttaaaaaaatgaactacccagaaatagcgaaatgcgaaagtaaattggtggacacgtatcggcgaattcaagccattactatatactagtatatatgaagccatcatattgaaaaaggaattggtggtggtgtactattgtactgatatattgtgtttccctgcgcttacgtggttgttctaacaaatcacaattatcatgacacacacacaaaaattgacaccccattgaaagccaatagtttctttataacccacttgtcagagccaatagaaaggtcatgtatctactacattgtctccctccaaatacaatagagaggtgccccgccacttccagagtgcaagtacctatgcatgtggggcgaagttctgggagcaatgactagatcgcccctaagaaaatatatccgggaccgggtcccaacatgggggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTG-TTAT-TT-A---CTA--AAATA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATCAAAAT-TTA----TCAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTATGT--ATGG-GGAAAAT----G--TCATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-T-AG-ATTTC-----------AAC-----------AACAA---A--A--GTT--TGA---TA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCAATTG-A-A-GT-----T--A-------------------ATGAAT--AACT-----TTG--A---AAAAAC------------ACTT-TGCTCAGA-------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTT------------agt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTTG-T--GTGG-GGAAA-T-AATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-A--TTTTTA-------AAC-----------CATAT---------GTTGATAT---TATA---GA-C------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A--TAATTAT--ATA-A-----A-CTTATA--ATGAAT--AAAT-----TTGCCA---ATGA---------------CTT-T-----GAAAACATCGC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTT------------CA-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTACT---------------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCataattttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT-------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTGTGGTTGT----CA---T---TTAC--TACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG---------TTAGG---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-CTAA--G-G-GATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTT-TCACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGAT--CTTTT-ATT-AAAATTCATAGAATTTCC--------GCTTAATT-TTGA-------AA-AAAAG--AAA--A-CAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTTT-------TT-------AAGGTACGTACAT---------ACCACTATTT-TACCT-T-C--CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATAT-T----TTGG---GGTGGAG-G-TTGTGGGTTCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------A----TT----T-TTT-------AAGG--------T---------AC-----TTT-TCACC-CAA--CTGA---CC-------CATGT------T-T----TT---------------TTGT--A-TCTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAATT----TGTGT--ACATGTCAT--GTAGAGAGgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAAT---------AATACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGAT--C--TT-A-T-AGAATGAATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTGG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATTGAAATTTATAGAAACTCTGACAAGCATa
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------ATTTTTTAAGGTACTT-------ACCA-------AT---------ACCACT-TTT-TAACC-C-C--CC-----CC-------TTTTT------T-T----TTGGGGTGG----G-G-TTGGGGT-TCT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTT----T-TTT-------AGG---------T---------AC-----TTT-CAATA-C-C--CTTC---CC-------CCTTT------T-T----TTA---------------T-TAGG-TCTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTGA-AATAT-C--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----G-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------AAAAATAT-AACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTTTGT--ATGG-GGGAAA---ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA-----C-CT--GA--T-AG-ATT---------------------------CAAAC---A--A-----AATTA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATT----A-GTA---AT--GAA-A--------ATT-----TGAAC--A-----C--TTGCT---------C------------GC---A-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCA-T-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT-C--TT-A-T-AAA-TGCATA-AATTTCG--------A--TATAT-TTAA-------AAATAAAT--AAA--AATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----GC--GT-AT------------------TGA-AT---TGTTC-CAAGAGTAACTACTTG---AC--CTTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAG--TTT-TAAAAT--TAA-CTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTA--T-----------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTGAAA-------------------AAAAGAA--------GACA---GTG----G--T-GGTG---CAAC--TACAAATTTGTGTA---CCGATATATGCACGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG----TGCTTCC-TGCGC--TTA-GTG---G-TTGTTCTTTTATTAAATCACAATT-AT-AC-A-ACG-ACA-----AAATTGACACCACCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAA---------G-------AGAG-------AGGTAT-ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-CT----G-----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|2 : AAAATCCAAATGATCATTTTAA-A-TGTTATTGTGGTATCCCATT-TTGATTACTATACTTGCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaTTTTATTC-ACTA-A-ATGTA---AT--GTA-AATGTAT-CTATGCTTATGAATTAAAAC--AGTTTGCCA---TTAAACTTCGAAAGCCTTGCTT-CA----GA-------GT--TATTG-C-T-TGCACC--TA-TGATA--T-TGTatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|21 : g--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCAATACTA--TGGAACCA---TCCTA-TAT------------------ATA
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTT----T-ATT-------GGGG-------GTGGGTGCGGTAT-----TTT-TACCC-C-C--CCC----CC-------TCTTT------GGTGAGGTTGG---GG----GTG-GCGTGGG-TCTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAATGT-T--A-ATGCAAT--ATATA----ATA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TGTTAATA---TTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTAT--AAG-GATGATAAGTAATAGTGCCTTT-------AA-CTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTT-GAA-----AATTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------CAAAA--------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTGT-TTCGTGGCGGAAACTCAATGCATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-T-AGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAAT---A--AAAGTTAA--A---TA-A---TTAT------------TTTTTGTTC-ATTGCATA-ATA---ATCTATAGA-----TACATTAC--ATGAAT--AAATAGT--TTGCCATTTATGAAC------------G--T-T-----GA-------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTT------------CAGTGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTT-TTA
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGATTTC--TT-A-TTAAAATGCATA-AATTTCG--------A--TAATT-TTTG-------AA-AAAATTAAGA--A-TAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-A------------------TTGGAA---ATGTTCTCA-GAGTAA---CTTG---A-AACTTTGATG-TGTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTTTT-TAAAAT--TGAACTA-CCAGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAAT-CAAGTCATTGCT---T----------------------------------------TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAGGAA--------GA-GGCAGTG----G--TGGCTG---CAAC--TAAATATT---GTGTACCTGATATATGGACG-CATTTTTTATTT---------GACTGTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT-ATTAAATCACAATTAAT-AC-A-ACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATC-ACCACTTACCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG-----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : -AAAGTTTATA-AACTT-GTTT-----A--TGTTC-ATTG-------AA----AT--AATCTA-TAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--AT------------GAACGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTG----CACCTTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCAT--TCCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGG--CTT-AAAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCT------ACATT-TTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTGAAA-------------------AAAGAAATGATGTTTGA-G---ATGTTTTG--TAGATA---TAA------ATATT---GTA---CTGATAAATGTACG-CATGTTTATT------------G----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTGCTTG-TTATTCTAT-AAGAAATCACAATT-AT-AC-ACACACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAA-------AGTC----AATAA-TATCTTTATAACCCAt
gi|6 : cacagataccaataacaTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG---------TTAAGGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAG-GATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-G-T-GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAA-T-A----TTGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCCT--ATGG-GGGGAA---ATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATT-AG-A-TTTTCTA-------ATA-----------CAGAT---ATCA--ACAAACAA---AA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC-ATTG-A-A-GTA---ATGGATA-A-----T-TTTTTC----CAAT--GAAC--T--TTG--------AAAC------------GCTTGCTCCA-GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATT----T-----------AGG---------T---------AC-----TTT-TCACC-C-CAACCCAAACCC-------TCCTT------T-T----TTGG----------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---ATTGT-TTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG----------TAAGGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA-CT----AAGCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAAT---------GATACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGAT--A-----A-T-CAAATTAATATAATTTTGGAAAAAAAA--TATTTGTTCGTTTCTTCAA-TCCAT--GAA--A-TG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAATGAAATTTCCGA-AAGCTTTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTG---AGA--TTTTATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAG--TCCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-AT--CCT-TAAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC-------------------------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTGAAG-------------------AAAT--A--------AA-A---GTG----GTTTAGATATATCAGCTATACATACT---CTA---TTGATATAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTAT----ATGG-GGAGGA--AAT---TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAA-TTAG-ATTTTC----------AAC------------AGAACAAA--A--GTTTATAAATTTT-T---TT-T------------TTTCTGT-C-ATTG-A-AAGTA---ATGAATA-T-----T-TTTTCC--ATGAA---------C--TTGTGG---A--AACCGCCT-------GCTC-CCA---GA-------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTT-------------CA-T-A---GT-GA-A------------GTC-GTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------T---------AATACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGAC--T--TTAA-T-AGAATGC--A-AAT--------------------------------AA--AAAG--GAA--A-TAATTCAG-AT-T-GAATTCA-----GC-C-T-AT------------
blockSeqs : AC TA C . G TTAAGGTACGTACATACCACTA . . A AA CAGCAGGCGTT GGAATATTTTGGGGTGGAGGTTGTGGGT C A A C CA CG ATGTAT CT ATATCACTTAAAGTCT GAG A GTAC . G T AG T G . GTG AGG A A ATTCA C GT T CTACACAGTTG TAAGCTT GTT AC CAACTTTC TC A A . ATTT G ATTTCT T C G T AC CACC TA C A TTAATA G TCACTGA CCC CTC C . AAAT C T C ATTTGCG A T TGGTTTGTTT CATGTG A T A AC A T A CCTCTCTAT AC TTA ATAACCGATAATTT TAATTCA AAAATATCAACATCAAAATTTATCAAAATAAAGATAGACTTCCGTTCTTTGAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC . AGAT A TTC C CTCA CA AC T T A TGAT AG A CG T T T T TTTATTATTTAAACACATGTGATATCAAATAAAAGTTAAATAATTAT A GC T TG ATT GTAAATGTATCTATGCTTATGAATTAAAACAGTTTGCCATTAAACTTCGAAAGCCTTGCTTCA AAACATC AA AA A G AA A AT A CAGTGATCAGTAGAAATAGTTTATGTT C TAAATTT N ATA C C NNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNN CA A ATAC AAATTGT CTC CTT A T T C G C GAAAAAAAA G G TTTCTTC AT TA CT A C TC T ATATT GCGT TGAAATTTATAGAAACT C AGC T A TA AAA G G T C TT A CAGTAC C T TTGGTAGTTATCG TT T TA C C C A CG C AAA G G A C T ATCTACATTTTATATATTATGAAATTTATTTGTAT ATGG A AAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAGGAAGAGGCAGTGGTGGCTGCAAC TGT TAC GC G TTTTTTTTTTTTTTTTTTGG C TT C CTT T TT T TT A . AC AC TGC A CA AGTTCAC CAAA AA A T C AAAAG T CCACTCG TTACC GGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTCGCGATGTGCGAGGGCGAAGTTCTGGTAGAATGGTAATAACTCGCCCCC AA T G A T AT . A ATCCCATTTTGA TA A
blockSeqs : . T . . T AAGGTACTTACCAATACCACT . . . . CAAACCC GGTGAGGTTGGGGGTGGCGTGGG . G . . . . . C TTAAATGA GA A TTAA . G T GG . . . T . T C CTC AA . . . . . . . T . AA . . C . A . GAATGTT AA . . A . A . . T AG . TT AAT AAAAATATAACAATCAAAATTTATCAAATAGTAGACTCTTCTTTTGAATCTAACATGTTACCATACTTATACAAT . . T GT . AT G . . . . G . . . . . . T TCTAATACAGATATCAACAAACAAAAGTTTATAAAAAAAAAA . G . AG . CTATAGATACATTACATGAATAAATAGTTTGCCATTTATGAACGTT . . TG . A . . . . CATATAGTTGTTCATATAGTGAGNN N TG A . . N ACTAC CGTGTTTGGGATCATATCTTC AAA . A . TAT AT TTC . . . A T C TTTA . G . A . . . T TC . . TGTA GAAATTTCCGAAAGCT A CGC . . TG CAC G G C . . A AT . C . . T . C C . . GC . AAA G G A T C ATGGAACCATCCTATATAT . . AAAGAAATGATGTTTGAGATGTTTTGTAGATATAA . . GG . TTTTTATTTGACTGT C . C . . TT . TT . . A G CA A . . . A A A . . . CCACTTA . GAGAGAGGTATATTCCGACTATCAGAAGTCGCAGATAGTTCTGAGTAATAATC . . . . . . . . CAT . A
blockSeqs : . . . . T TATTGGGGGTGGGTGCGGTAT . . . . GACC TTTTGGGGTGGGGTTGGGGT . G . . . . . T TTATAAT T T CA . . . T CA A . . . . . . . T . AT . . . . TGGTGT AT . . . . T . . T A . T AA CAAAAGGGTAGATCTTATCTCAAAAAATA . . T GT . TA . . . . . . . . . . . . T CAACAGAACAAAAGTTTATAAATTTTTTTT . G . G . GAATATTTTTTCCATGAACTTGTGGAAACCGCCTGCTCCCA . . C . A . . . . CATAGTGAA C NN A . . T TA GTCGTGGGAAGT T . T . AT CC TC . . . C . C GCT . A . T . . . T TG . . CGT GAACG A CCA . . AG AGA A A C . . A A . T . . A . C G . . G . GAT G T G T C AT . . AAATAAAAGTGGTTTAGATATATCAGCTA . . GT . GTTTATTG . . . . . TA . AG . . A G . . . . . A T . . .
blockSeqs : . . . . T TTTTAAGGTAC . . . . TCCC TTTTATTAGG . G . . . . . C TATGAT . . TA . . AC G . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . . G . T A . . G CT . AA . . . . . . . . . . . . T TTTAAACCATATGTTGATATTATAGAC . A . G . GGATAATTTTTTCCAATGAACTTTGAAACGCTTGCTCCA . . C . C . . . . . TC . . . . T . AT C C . . . C . C A . T . A . . . G AT . . GT . C T . . . AC T . . . . T A . . . . T . T C . . G . . . . . A C T . . AAAAGAAGACAGTGGTGGTGCAAC . . . .
blockSeqs : . . . . . TTTTAGGTAC . . . . CCC TTTTTTGTA . T . . . . . . . G T . A . . . . . . . . . . . . T AACAACAAAAGTTTGATAAACTTTT . G . A . ATAAACTTATAATGAATAAATTTGCCAATGACTTT . . C . A . . . . . A . A C A . . . T . T A . T . T . . . C T . . CA . . . . . . . . T . . . . . T . C
blockSeqs : TAGGTAC . . . . CC TTTTGG . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . . CAAACAAAATTATAATTT . G . G . AATGAATAACTTTGAAAAAACACTTTGCTCA . . C . A . . . . . . . . T . . . A . . A . C . . . . . C T . . CT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . GAAAATTTGAACACTTGCTCGCA . . C . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ********* TTTTAAGGTACTACAC***************************** TTTTGGGTGGGGTTGGGGT******************* C** TTATAAT************* *** TA**** ** ********* A****** T********* AA****** A*** TN***** TC* CGT** GAAC************* AAA**** AC**** T* ATACTCTATATT*******************************
originalCons : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTT----T-TTT-------AGGG-------AT---------AC-----TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTT------T-T----TTGG---GG----G-G-TTGTGGG-TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AATGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG-----A---TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAAT-AATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-AT------------AAACTTTGACACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTG---ACACCTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTT-TAAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTA--T------A---T-CTA-TAT------------------ATATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
finalCons : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTTTTTTAAGGTACTACAC-----------------------------TTT-TAACC-C-C--CCCA---CC-------TCTTTTTTTGGGTGGGGTTGGGGT-------------------TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATGC--TTAGTTTATTATAAT-------------TTTTTAAT---AATGTTA----ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG---------TTAAGGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAAA------TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TTT---------GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGATAA------TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAAAA---ATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-T-AG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAGAT---A--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAATN-----TATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTATTC-GAA-TCA-----GCCGT--ATGAAC-------------TTGACACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTGAAA----CTTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAG--TCCGCAAGCTAATAC----TGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAG--CTTT-AAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTATACTCTATATT-------------------------------ATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-G---GTG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGC--TTACGTG---G-TTGTTCTTT-ANTAAATCACAATT-AT-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAA-------AGCC----AAT-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 33333333333333 11111 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111111 111 44444444444444444444444444444444444 222222 11 1 1 11 222 222 1 1 22222 1 11 44444444444 3333333 222 11 33333333 11 1 22222 1 333333 1 11 1111 111 1111 222222 2222222 111 111 1111 4444444 1 2222222222 3333333 11 3333333333 111 444444444444444 22222222 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111 2222 111 11 1111 1 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111111 4444444444444444444444444444444444444444 2222222 111 22222 00000000000000000000000000 3333333333333333 1111 11111111 1111 11111 1 22222222222 1111111 11 111 11111 11 777777777777777777777777 222222 11 222222 4444444444444 2222 1 111 55555555555555555555555555555555555555 1111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111 111 1 777777777777777777777777 11 111 1 1 111 111 11 111 11 33333333 1111111 33333 33333 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 1 6666666666666 22
lowQualScore : 99 55 6 22222222222222 1 44444 0 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 3 5 5 77 77 666666 0 222 0 00000000000000000000000000000000000 000000 11 0 3 88 7 3 88 000 000 5 5 77777 5 88 1 33333333333 2222222 111 88 55555555 88 1 1 5 77777 5 000000 5 1 6 7 44 4444 000 8 8 7777 0 333333 8 6666666 444 444 9 8 8888 0 8 8 6 3333333 3 0 3333333333 3333333 8 8 0 5 11 1 8 8 7777777777 55 444 666666666666666 44444444 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5 2222 1 8888 5 5 555 77 33 66 5 5 5 5555 66 5 66 0 5 9 0 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5 00 5 55 888 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 6666666 66 555 5 2 66 5 66 5 9999999999999999999999999999999999999999 2 3333333 2 444 8 1 22222 77777777777777777777777777 4444444444444444 0 0 99 5 2222 99999999 0 5555 77777 5 5 5 1 0 1 99999999999 0 5 2 6666666 44 66 66 5 5 888 5 22222 77777 5 33 666666666666666666666666 8 8 6 0 000000 6 44 6 8 11 1 111111 8 6 4444444444444 0 0000 99 0 6 6 777 6 222 2 2 1 2 5 3 88888888888888888888888888888888888888 4444 6 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 0 444 444 77 0 444444444444444444444444 2 33 2 777 0 66 0 11 111 666 66 999 0 3 33 66666666 9999999 1 9 6 33333 7 8888888 0 55555 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 11 8 6 7 0 7 88 3 7 0 2222222222222 00 7
lowQualScore : .. .. . .............. . ..... . ..................................................................................................... . . . . .. .. ...... . ... . ................................... ...... .. . . .. . . .. ... ... . . ..... . .. . ........... ....... ... .. ........ .. . . . ..... . ...... . . . . .. .... ... . . .... . ...... . ....... ... ... . . .... . . . . ....... . . .......... ....... . . . . .. . . . .......... .. ... ............... ........ ................................................................................................................. . .... . .... . . ... .. .. .. . . . .... .. . .. . . . . ..................................................................... . .. . .. ... ............................................................................. ....... .. ... . . .. . .. . ........................................ . ....... . ... . . ..... .......................... ................ . . .. . .... ........ . .... ..... . . . . . . ........... . . . ....... .. .. .. . . ... . ..... ..... . .. ........................ . . . . ...... . .. . . .. . ...... . . ............. . .... .. . . . ... . ... . . . . . . ...................................... .... . . .................................................................. . ... ... .. . ........................ . .. . ... . .. . .. ... ... .. ... . . .. ........ ....... . . . ..... . ....... . ..... ................................................................................................................................. . .. . . . . . .. . . . ............. .. .
lowQualScore : 22 88 7 88888888888888 7 33333 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7 0 7 7 99 99 444444 6 444 8 00000000000000000000000000000000000 000000 00 0 2 00 3 3 33 555 555 5 5 00000 0 00 0 00000000000 5555555 000 00 00000000 00 0 0 5 55555 0 000000 5 0 7 3 00 2222 000 0 0 0000 8 000000 0 0000000 000 000 0 0 0000 8 0 0 7 3333333 2 0 0000000000 0000000 0 0 8 6 00 0 0 0 8888888888 88 000 000000000000000 88888888 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 7 1111 7 7777 7 7 777 99 66 99 0 0 0 6666 99 0 99 0 0 4 1 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 0 22 0 22 888 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 2222222 99 111 0 0 99 0 99 0 5555555555555555555555555555555555555555 2 8888888 8 000 0 0 00000 55555555555555555555555555 9999999999999999 8 2 22 4 1111 44444444 1 1111 33333 7 7 0 4 0 4 66666666666 5 0 8 2222222 88 99 99 0 4 111 0 55555 66666 7 66 999999999999999999999999 0 0 4 6 888888 4 00 4 0 00 4 222222 0 4 0000000000000 8 4444 22 8 7 7 555 7 222 5 5 5 2 2 5 55555555555555555555555555555555555555 2222 7 8 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 8 000 000 00 0 222222222222222222222222 5 88 5 555 0 88 0 88 000 000 55 555 8 2 88 22222222 5555555 0 8 7 33333 3 7777777 7 00000 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 8 00 0 7 3 7 3 33 3 3 7 3333333333333 77 3
consensus : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTTTTTT-----AAGG-----TAC-T-----ATAT-------TTT-TAACC-C--C---CCCA---CC-------TCTTT------TTTT-GGGTGG-GGTTG-GGG------T---TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAATGA-AA--TGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG----TTAA------GGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAA-A---A--ATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAG---ATA--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TCTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-A-T--GAA------------C-TTGACACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTGAA---AC-TTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAGT--CCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAGCTT-T--AAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTAT---------A-TAT-------------------TATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-GG---TG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGCTT--ACGTG---GTT-GTTCTTT-ANTAAATCACAATTA-T-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAAAG--------CCAA---T-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
Reference ( family-963 ) : GGGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------ATTTTTTTTTT-----AAGG-----TAC-T-----ACAC-------TTT-TAACC-C--C---CCCA---CC-------TCTTT------TTTT-GGGTGG-GGTTG-GGG------T---TCTG-GGGGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTAT------AA---T--TTTTTAAT---AA--TGT-T--A-ATGCAAT--ATAAAGAGGATATAATANTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAACTTGTTCTATTCATACGTAGCAAAGGTANATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGGGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATNAATANTTGGTAACAGCATTTAGGATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCNTGATATCTACGGTTGATCAC-AAT-A-CC-ACGC-TG----TTAA------GGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGCCTTC-------AAACCTGAAAATTT-GAATTTTGGAT-GTT-GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ANATA-ATTAT-TT--------T-GCAGCT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TCGAAG-------GATAGA-AGACTC---TTCTTTCGAATC--------------------AAAAATN------------------A-A----TTTGT-T--ATGG-GGAA-A---A--ATG--TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAG---ATA--A--GTTAATAA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A-GTA---AT--ATA-A-----T-CNTTNC--ATGAAT--AAAT--N--TTGCCA---ATGAAC------------GCTT-C-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCAGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TNTATAAG---AGATTT-TCACNTACTACGTCTCGTCGTGGGTTTGGGACNANGTCTTCTTTTAATAAAAAAT---------AATACGATGTGAAGTAAATC--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-AAAATGCATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTNG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTCAGTAT-TCGAA-TCA-----GC-CGT-A-T--GAA------------C-TTGACACGCATGTTC-CA-GAGTAACTGCTTGAA---AC-TTTGATGTTGTTTCGTTGGAA-GTGCAGT--CCGCAAGCTAAT----ACTGA-ATCTTAAT-------------TGAAATAGCTT-T--AAAAT--TAAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTCGGCGAATCCAAGCCATTGCTAT----ACTCTA-TAT-------------------TATGAAGCC----ATCA-TATTGAAA-------------------AAAGGAA--------GA-GG---TG----G--TAGGTG---CAAC--TACATATT---GTA---CTGATATATGNACG-CATTTTTTTTTT---------GG----TGCTTCCCTGCGCTT--ACGTG---GTT-GTTCTTT-ANTAAATCACAATTA-T-AC-ACACG-ACACGCAAAAATTGACAC--CCCATTGAAAG--------CCAA---T-A-TTTCNTTATAACCCACTAGTCAGAGCCAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT----CCCTCCAAA---------GTACA-ATAGAG-------AGGTAT-ATCCCGC--CACTTCCAG---GCAAG---C-----TGCGCG---G--GGGCGA-AGTT-CT----G-----AATGAT---A-----TCG-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTTCCAACATGGGTGTCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTATTGCGGTA---CATT-T---TTACT-TACTTGCTTCCAA
gi|1 : GAGGG--GGGGGGGTCT--AGCACT-TGGATTTTATTATTTTTTTTTTTGGGGGAGG-----GG--------ATAT-------TTTATAACCGC--C---CCCA---CC-------TCTTT------TTTT-GGG-GG-GGTTG-TGG------G---TCTG-GGAGA-CTAT-T--TATA--C------GTGAACATGAT-TTAGTTTAATTCATT-----AG---T--ATATTAAG---AAAATGT-T--ATATGCAATCCATAAAGAGGATATAATATTAGTCCAGATAGGACAGT-TCTAGTTGGTTCAG---TGTAA---CA-TTTA-CTTGTTCT-----TA-GTAGCAAAG--AAATC-----------TTGA-------AAAAATTATTTCAAATTCATTGG---TTTCGTAGATATTATCACCTC--CAAA--------ATCAT--CATCAATATTTGGTAACAGCA---AGGATT-TTTTTC------TTAA-ATCTCATGA-ATCTA-GGTTGAT-AC-AAT-A-TC-ACGC-TGACGGTTAA------GGA-ACAACACA-------CTTG---CTCTACC---GAAACGAAGCTTA--AAG-GATGA-AAGTAATAGTGC--TC-------TAACTTGAAAATTT-GAATTT--GAT-GT--GAA-----A-TTAT-TT-ATCACTA--ATATA-ATGAT-TT--------TCGCAGCT---AGTCTT-------------C-AACCAT--A---A-TCATGAA-------------CAAAAT-T-A----TTGAAG-------GATAGA-AGATTC---TT-------ATC--------------------AAAAATA------------------AGA----TTTGT-TT-ATGG-GGAA-A---ATAATG--CCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAG-ATTTTTTTA-------AAC-----------CAG---ATA--A--GTCAATAA---CA-A---TT-T------------TTTATGTTC-ATTA-A-A-ATG---AT--ATA-A-----T-CATTAC--ATGAAT--AAGT--G--TTGCCA---ATGAAC------------G--T-T-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TG-TAATA--T-TGTTT------------CA-T-ATCGGT-G--AA-----------GTCCGTAAA------CTATAAG---AGATTT-TTACATA-TA-GCCT----GTG---------CAA----TTTTTCTAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAATACGATGTGAAGTAAATT--CGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTGT-C--GGTGCTTGATTTTGAT--C--TT-A-T-ATAATGAATG-AATTTCG--------A--TATTT-TTTG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTATATTGAT-TCA-----GC-CGT-A-T--AAA------------CTTTGGCATGCATGTTC-CT-GAGTAACTACTTGCATGCACTTTTAATGTTGTTTTGTTGGAA-GTGCAGT--CCGCAAGCTATT----ACTGA-ATCTTGAT-------------TGAAATGGCTTAA--AAAAA--TGAACTACCCAGAAATAGCG-AAAT-GC-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTATCGGCGAATTCAAGCCATTACTAT----ATACTAGTATA------------------TATGAAGCC----ATCA-TATTG-AA-------------------AAAGGAA--------TT-GG---TG----G--T-GGTG---------TAC-TATT---GTA---CTGATATAT--------T-------------------G----TGTTTCCCTGCGCTT--ACGTG---GTT-GTTC--T-AACAAATCACAATTA-TCATGACAC--ACACACAAAAATTGACAC--CCCATTGAAAG--------CCAA---T-AGTTTCTTTATAACCCACTTGTCAGAGCCAATA-----GAAAGGTCATGTATCTA-------CTACATTGTCT----CCCTCCAAA----------TACA-ATAGAG-------AGG--T-GCCCCGC--CACTTCCAGAGTGCAAGTACC-----TATGCATGTG--GGGCGA-AGTT-CT----GGGAGCAATGACTAGA-----TCG-----CCCCTAAG--AAAATA-TATCCGGGACCGGGTCCCAACATGGGGGTCA
gi|1 : AAAATCAAAATA--CATTCTAACAATGTTATTGCGGTA----ATTAT---TTACT-T-TTTGCTTCCAAannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttaaaatcaaaatacattctaacaatgttattgcggtaattatttactttttgcttccaaagt
gi|10 : gaggggggggggtctagcacttggattttattatttttttttttgggggaggggatattttataaccgcccccacctctttttttgggggggttgtgggtctgggagactatttatacgtgaacatgatttagtttaattcattagtatattaagaaaatgttatatgcaatccataaagaggatataatattagtccagataggacagttctagttggttcagtgtaacatttacttgttcttagtagcaaagaaatcttgaaaaaattatttcaaattcattggtttcgtagatattatcacctccaaaatcatcatcaatatttggtaacagcaaggatttttttcttaaatctcatgaatctaggttgatacaatatcacgctgacggttaaggaacaacacacttgctctaccgaaacgaagcttaaaggatgaaagtaatagtgctctaacttgaaaatttgaatttgatgtgaaattatttatcactaatataatgattttcgcagctagtcttcaaccataatcatgaacaaaattattgaaggatagaagattcttatcaaaaataagatttgtttatggggaaaataatgccattttgcttcattcaaagcctctgaatagatttttttaaaccagataagtcaataacaattttttatgttcattaaaatgatataatcattacatgaataagtgttgccaatgaacgttgagttactgcttgcacctgtaatattgtttcatatcggtgaagtccgtaaactataagagatttttacatatagcctgtgcaatttttctaaaaaaaaagaaagaaaaaaatacgatgtgaagtaaattcgtaaattgtgtttataattgtcggtgcttgattttgatcttatataatgaatgaatttcgatattttttgaataaataaaataatttagtatattgattcagccgtataaactttggcatgcatgttcctgagtaactacttgcatgcacttttaatgttgttttgttggaagtgcagtccgcaagctattactgaatcttgattgaaatggcttaaaaaaatgaactacccagaaatagcgaaatgcgaaagtaaattggtggacacgtatcggcgaattcaagccattactatatactagtatatatgaagccatcatattgaaaaaggaattggtggtggtgtactattgtactgatatattgtgtttccctgcgcttacgtggttgttctaacaaatcacaattatcatgacacacacacaaaaattgacaccccattgaaagccaatagtttctttataacccacttgtcagagccaatagaaaggtcatgtatctactacattgtctccctccaaatacaatagagaggtgccccgccacttccagagtgcaagtacctatgcatgtggggcgaagttctgggagcaatgactagatcgcccctaagaaaatatatccgggaccgggtcccaacatgggggtcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttAACCTGAAAATTTTGAAATTTGGTTTGTTTGAACATGTG-TTAT-TT-A---CTA--AAATA-ATTAT-TT----------GCACTT---AGTCTTATAACCGATAATTT-AACGATTAATTCA-TCATGAAAAAATATCAACATCAAAAT-TTA----TCAAAA-------TAAAGATAGACTTCCGTTCTTT-GAATCTACCATGTTACCATATCTATACAAATC------------------A-A----TTTATGT--ATGG-GGAA-A---A---TG--TCATTT--TGCTT-C-ATGC-A----AAAGGCCC-CTCGGAA-TAG-ATTTC-----------AAC-----------AAC---AAA--A--GTT--TGA---TA-AACTTT-T------------TTTCTGTTCAATTG-A-A-GT-----T--A-------------------ATGAAT--AACT-----TTG--A---AAAAAC------------ACTT-TGCTCAGA-------GT--TACTG-C-TATGC-CCAATT-TAATA--T-TGTTT------------agt
gi|11 : AGAATA------------------A-A----TTTTG-T--GTGG-GGAA-AT--A--ATG--TAATTT--TGCTTTC-ATTC-AG---AA--GCCT-CT--GAA-TAG-A--TTTTTA-------AAC-----------CAT---AT------GTTGATAT---TATA---GA-C------------TTTCTGTTC-ATTG-A-A--TAATTAT--ATA-A-----A-CTTATA--ATGAAT--AAAT-----TTGCCA---ATGA---------------CTT-T-----GAAAACATCGC--TCCTGAA-T-TATGCC--TTATAAT---T-TGTTT------------CA-acaat
gi|11 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagact-----TGCGTG---GAGGGGCGA-AATTACT---------------T---------TCT-----CACCCAAG--AAAATA-TATCataattttttgtttcaaagcactatgcgtggaggggcgaaattactttctcacccaagaaaatatatc
gi|12 : tttttaatatgtacgtgtgtagcattaagactagaataaattttgtgtggggaaataatgtaattttgctttcattcagaagcctctgaatagatttttaaaccatatgttgatattatagactttctgttcattgaataattatataaacttataatgaataaatttgccaatgactttgaaaacatcgctcctgaattatgccttataatttgtttcaataattttttgtttcaaagcactaCAAG---CACCTATGCGTGA--G--GGGCGA-AATT-------------AAC--T---C-----TCA-----CCCCCAAG--AAAATA-TATCC-GGACCAGGTTTCAACATGGGTG
gi|12 : AAACTCAAAATA--CATTCTAA-AATGTTGTGGTTGT----CA---T---TTAC--TACTTGTTTCCAAgcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaaactcaaaatacattctaaaatgttgtggttgtcatttactacttgtttccaag
gi|13 : caagcacctatgcgtgaggggcgaaattaactctcacccccaagaaaatatatccggaccaggtttcaacatgggtggcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTCA--AAT-A-CCCACGCATG----TTAG------G---ACAACACA--------TTG---CTCTAC----GAT-CGAA-CTAA--G-G-GATGG-AAGTAATAg
gi|14 : aatggttcgcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctctatcGT-GA-AA-----------GTCCGTAAA-----TGTATA-G---AGATTT-TCACCT--TA-GTCTCGT-----GTTTGGGATCATATCTTCTTTTAATAAA---------------TACGATATAAAGTAAATC--CGTAAATTG-------TT-A-----TAATTATAT--GGTGCTTGATTTTGAT--CTTTT-ATT-AAAATTCATAGAATTTCC--------GCTTAATT-TTGA-------AA-AAAAG--AAA--A-CAATTCAGCAT-TCGAA-CCA-----GC-tag
gi|15 : GGGGACGAGGGGGTCCTAAACACTCTG---------AGTTTT--TTT-----AAGG-----TACGT-----ACATACCACTATTT-TACCT-T--C---CCCA---GCAGGCGTTTATTTGGAATATTTTGGGGTGGAGGTTGTGGG------T---TCTG-GGGAA-CTAT-T--TATA--C------CTG
gi|16 : gcggatccaggattttgtgaaaa--GGGGGGGTCT--AGCACT-TG---------A----TTTTTT-----AAGG-----T-----------AC-------TTT-TCACC-CAACTGACCCA------------TGTTT------TTTT---GTA---------------------TCTGCGGGGA-TTATCT--TATACGC------GTGAAAATG-CTTTAGTTTG---TAT------GA---T--TATTGAAT----T--TGTGT--ACATGTCAT--GTAGAGAGgttcttttattaata
gi|17 : ataggcggatccagggaattgtccgaaacAAAAAT---------AATACGATGTGAATTAAATT--TGTAAATTG----TGTTT-A-----TAATTAT-C--GGTGCTTGTTTTTGAT--C--TT-A-T-AGAATGAATA-AATTTCG--------A--TATTT-TTGG-------AA-TAAAT--AAA--A-TAATTTAGTAT-TC-AA-TCA-----GC-CGT-ATT--GAA------------A-TTa
gi|18 : atttttctGGG--GGGGGGGTCT--AACACT-TG---------A----TTTTTT-----AAGG-----TAC-TTACCAATACCACT---TTT-TAACC-C--C---CCC----CT-------TTTTT------TTTG-GGGTGG-GGTTG-GGG------T---TCT--GGGGA-CTA--T--TATA--C------tatagaaactctgacaagcat
gi|19 : ggcataggcggatcaggattttttgtgaaaTTTTTT-----A-GG-----TAC-T-----------------TT-CAATA-C--C---CTTC---CC-------CCTTT------TTTT-A--------TTA-GG-----------TCTG-GGG-A-CTAT-TCATATA--CATGTATGTGAAAATG-C-TTAGTT-A--TTAT------AA---T--TTTTTACTGA-AA--TAT-C--A-ATTCAAT--ATAAAGAGGATAtgttcttttttaatat
gi|2 : A-----G-TTAT-CT-ATC--TA--AAATA-ATTAA-TT--------T-GCA-CT---A-TCTT-------------T-AACGAT--A---A-TCATGAA-------------AAAAATAT-AACAATCAAAATTTATCAAATAGT-AGACTC---TTCTTTTGAATC--------------------TAACATGTTACCATACTTATACAATA-A----TTTTTGT--ATGG-GGGA-A---A--ATGG-TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA-----C-CT--GA--TAG-ATT---------------------------CAA---ACA--A-----AATTA---TA-A---TT-T------------TTTCTGTTC-ATT----A-GTA---AT--GAA-A--------ATT-----TGAAC--A-----C--TTGCT---------C------------GC---A-----GA-------GT--TACTG-C-T-TGCAC---TT-TAATA--T-TGTTTCATATAGTTGTTCA-T-AT-AGT-GAGNN-----------NNNNNNNNN-----NNNNNNNN---NNNNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN---------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NGTA--TTG----TGTTTTA-----TAATTAT-CC-GGTGCTTGATTTTGATT-C--TT-A-T-AAA-TGCATA-AATTTCG--------A--TATAT-TTAA-------AAATAAAT--AAA--AATAATTTAGTAT-TGAAA-TAC-----GC--GT-A-TT-GAA------------T-T----------GTTC-CAAGAGTAACTACTTGAC----C-TTTGATGTT--TTTATTGGAC-GTGCAGT--CCGCAAGCTAAT----A---A-AT-TTAAT-------------TGAAATAGTTT-T--AAAAT--TAA-CTACC--AAAATAGCG-AAAT-GCCG-AA-AGT-------------TGTTTCGGTGAATTCAAGTCATTGCTAT------------------------------------GAAGC-----ATCAATATTGAAA-------------------AAAAGAA--------GACAG---TG----G--T-GGTG---CAAC--TACAAATTTGTGTA---CCGATATATGCACGGCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTGG----TGCTTCC-TGCGCTT--A-GTG---GTT-GTTCTTTTATTAAATCACAATTA-T-AC-A-ACG-ACA-----AAATTGACACCACCCATTGAAAG--------CCAA---T-A-TTTCATT-TACCCCA-TAGTCAGAGCAAATA-----GGAAGGTCATGTATCTACCACTCGCCACGTTGTCT-----CCTCCAAA---------G-------AGAG-------AGGTAT-ATTCCG----ACTATCAG-----AAG---T-----CGCA------------GATAGTT-CT----G-----AGTAATA--A-----TC------TCCCCA----AAAATATTATCTGGG-CCAGG-TCCAACATGGGTGTCA
gi|2 : AAAATCCAAATGATCATTTTAA-A-TGTTATTGTGGTATCCCATT-TTGATTACTATACTTGCTTCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaaaaatccaaatgatcattttaaatgttattgtggtatcccattttgattactatacttgcttcatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|20 : agttatctatctaaaataattaatttgcactatctttaacgataatcatgaaaaaaatataacaatcaaaatttatcaaatagtagactcttcttttgaatctaacatgttaccatacttatacaataatttttgtatgggggaaaatggtcattttgcttcattcaaacctgatagattcaaacaaaattataattttttctgttcattagtaatgaaaatttgaacacttgctcgcagagttactgcttgcactttaatattgtttcatatagttgttcatatagtgagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtattgtgttttataattatccggtgcttgattttgattcttataaatgcataaatttcgatatatttaaaaataaataaaaataatttagtattgaaatacgcgtattgaattgttccaagagtaactacttgacctttgatgtttttattggacgtgcagtccgcaagctaataaatttaattgaaatagttttaaaattaactaccaaaatagcgaaatgccgaaagttgtttcggtgaattcaagtcattgctatgaagcatcaatattgaaaaaaagaagacagtggtggtgcaactacaaatttgtgtaccgatatatgcacggcatttttttttttttttttttggtgcttcctgcgcttagtggttgttcttttattaaatcacaattatacaacgacaaaattgacaccacccattgaaagccaatatttcatttaccccatagtcagagcaaataggaaggtcatgtatctaccactcgccacgttgtctcctccaaagagagaggtatattccgactatcagaagtcgcagatagttctgagtaataatctccccaaaaatattatctgggccaggtccaacatgggtgtcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnccaTTTTATTC-ACTA-A-ATGTA---AT--GTA-AATGTAT-CTATGCTTATGAATTAAAAC--AGTTTGCCA---TTAAACTTCGAAAGCCTTGCTT-CA----GA-------GT--TATTG-C-T-TGCACC--TA-TGATA--T-TGTatagttccagtcgataatcttggctaatcgccaataactatagta
gi|21 : g--TAAACTACCCATAAATAGCG-AAAGAGC-G-A---GTAAATTGGTGGACACACAATGACGGATCAAAGCCA----------------A-TAC-------------------TATGGAACC----ATCC-TAT
gi|23 : ACATAAT-TTAGTCCCGATAGGACAGT-TCTAGTT--Tatataattaaaata
gi|24 : CATTT--TACTT-C-ATCC-A----AA--GCCT-CT--GAA-TAC-ATTTTTTcagt
gi|3 : c--GGGGGGGTCTT-AGCACT-TG---------ATCTTTTTATT-----GGGGGTGGGTGC-G-----GTAT-------TTT-TACCC-C--C---CCC----CC-------TCTTT------------GGTGA-GGTTG-GGGGTGGCGTGGGTCTG-GAGGAACTAT-T--TATA--C------GTGAACATG-T-TTAGTTTA--ATATCACTTAAAGTCT--CTCTTAATGAGAA--TGT-T--A-ATGCAAT--ATATA----ATA-AATAGTAG---CTAAATGATAATGTTTGATT--TTCGGGTGTGTAAAGGCAATTTAATTTGTTCTATTCATACATAGCAAAGGTATATCCTACACAGTTGTTGATAAGCTTAAAAATTATTTCAAATTCATTGAGTTTTTCGTAGATATTATCACCTCACCAAACAACTTTCATCATTCCATAAATAAT-GGTAACAG-ATTTAGAATTGTTTTTCATTTCTTTAATATCTCCTGATATCT-CGGTTGATCACCAATTA-TC-ACGC-TG----TTAATATTAAGGAGACAACACATCACTGACTTG---CTCTACCCTCGACCAGAG-CTAT--AAG-GATGATAAGTAATAGTGCCTTT-------AA-CTTGAAGCTTT-GAATTT-GAAT-GTT-GAA-----AATTAT-TTTATCACTA--ATATATACTGTATTCCTCTCTAT-GCAGCTTTAAGTCTT-------------TTAACCAT--A-----TCATGAA-------------CAAAA--------------G-------GGTAGA-----TC---TTATCTCAAA------------------------AAATA------------------A-AAGATTTTGT-TTCGTGGCGGAA-ACTCA--ATGCATCATTT--GCCTT-CTATTC-ATGATAA--GCTA-CT--GAA-TAGTATTTTTTTATTATTTAAACACATGTGATATCAA---ATA--AAAGTTAA--A---TA-A---TTAT------------TTTTTGTTC-ATTGCATA-ATA---ATCTATAGA-----TACATTAC--ATGAAT--AAATAGT--TTGCCATTTATGAAC------------G--T-T-----GA-------GTAATACT--C-T-GACCCT--CT-TAATA--TATGTTT------------CAGTGATCAGTAGA-AATAGTTTATGTTATCCGTAAATAAATTTTATAAGATAAGATTT-TTA
gi|4 : cataggcggatccaggattgtcgaaTATATTG----TGTTT-AAATTGTGATTAT-CTCGGTGCTTGATTTTGATTTC--TT-A-TTAAAATGCATA-AATTTCG--------A--TAATT-TTTG-------AA-AAAATTAAGA--A-TAATTGAGTAT---GAA-TCA-----GCGCGT-A-TTGGAA-----------------------ATGTTCTCA-GAGTAACT---TGAA---AC-TTTGATGT-GTTT-ATTGGAACGTGCAGTTTCCGCAAGCTAAT----A-TAACATTTTAAT-------------GGAAATAATTT-TTTAAAAT--TGAACTACC-AGAAATAGCGCAAAT-GC-GCAACAGT---TT--------TGTTTTGGCGAATC-AAGTCATTGCT-----------------------------------T-TGAAGCC----ATCA-TATTGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAGGAA--------GA-GGCAGTG----G--TGGCTG---CAAC--TAAATATT---GTGTACCTGATATATGGACG-CATTTTTTATTT---------GACTGTTGCTTTCCTGCGCTTTTACGTG---GTTTGTTCTTT-ATTAAATCACAATTAAT-AC-A-ACG-AAACA-AAAAATTGAC-C--CCCATTGAAAGTTCACAGCCCAAAAAT-A-TTTCATTTTAACCCACTAGTCAGAGCCCACAAAAAGGGAAGGTCATGTATC-ACCACTTACCACATTGTCTTTACCTCCCCAAAGGAATAGTTGTACAGATAAAGTCAGAAAAGGTATGATCCCGCGACACTTC------GCGA----------TGTGCG---A--GGGCGA-AGTT-CTGGTAG-----AATGGT---AATAACTCGCCCCCCCCCCAAGAAAAAATA-TATC
gi|5 : -AAAGTTTATA-AACTT-GTTT-----A--TGTTC-ATTG-------AA----AT--AATCTA-TAATT-ATTAC-ATGAA-TAAATATTGC-CA--A-T--GAA------------CGTTGAAACGCTTGCTC-CA-GAGTTACTGCTTGCA---CC-TTTAATATTGTTTCATTATAA-GTGCATT--CCGCTAGCTAATCAGTACTGA-ATCATAAT-------------TGAAATGGCTT-A--AAAAT--TAAACTACCGAGAAATGGCG-AAAT-AA-G-AA-AGTAAATTGGTGGACACGTTTAGGCGAATCCAGGTCATTACTATCTACATTTTA-TATATTATGAAATTTATTTGTATATGAAGCCATGGATCA-TATTGAAA-------------------AAAGAAATGATGTTTGA-GA---TGTTTTG--TAGATA---TAA------ATATT---GTA---CTGATAAATGTACG-CATGTTTATT------------G----TGCTTCCCTGCGCTT--ACGTGCTTGTT-ATTCTAT-AAGAAATCACAATTA-T-AC-ACACACACATGCAGAAATTGACAA--CCCATTGAAAG--------TCAA---TAA-TATCTTTATAACCCAt
gi|6 : cacagataccaataacaTCTT-ATATCTACGATTGAT-AC-AAT-G-CC-ACGC-TG----TTAA------GGA-A--ACA-A-------CTTG---CTCTACC---GATTCGAA-CTAAATAAG-GATGA-AAGAAATATTTACTTCATTTGCGAAATCTGAAAATTT-GAATTTTGG-T-G-T-GAA-----ATTTGTATT-ATTACTAACACATA-ATTAT-TT--------T-GC-GAT---AGTCTT-------------T-AACGAT--A---ATTCATGAA-------------CAAAAA-T-A----TTGA
gi|6 : --------------------AAAAATC------------------A-A----TTTGCCT--ATGG-GGGG-A---A--ATG--TCATTTACTGCTT-C-ATTCAA----AA--GCCTACT--GAATTAG-A-TTTTCTA-------ATA-----------CAG---ATATCA--ACAAACAA---AA-G---TT-TATAAAAAAAAAATTTCT-TTC-ATTG-A-A-GTA---ATGGATA-A-----T-TTTTTC----CAAT--GAAC--T--TTG--------AAAC------------GCTTGCTCCA-GA-------GT--TACTG-C-T-TGCACC--TT-TAATAATT-TGTTctctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaaaaaatcaatttgcctatggggggaaatgtcatttactgcttcattcaaaagcctactgaattagattttctaatacagatatcaacaaacaaaagtttataaaaaaaaaatttctttcattgaagtaatggataattttttccaatgaactttgaaacgcttgctccagagttactgcttgcacctttaataatttgtt
gi|7 : tcttatatctacgattgatacaatgccacgctgttaaggaaacaacttgctctaccgattcgaactaaataaggatgaaagaaatatttacttcatttgcgaaatctgaaaatttgaattttggtgtgaaatttgtattattactaacacataattattttgcgatagtctttaacgataattcatgaacaaaaatattgactctaagttgtaagttggaaaaaatttaatcaaaataaagactcagttcttttggaatcgtacatttactaatagccggggactatagcataaaGGGGG--GGGGGGGCCT--AGCACT-TG---------ATTTATTT---------AGG-----TAC-T-----------------TT-TCACC-C--CAA-CCCAAACCC-------TCCTT------TTTT-GG-------------------------CCG-GGGTA-CTAT-T--TATA--C------GTGAAAATG-C-TTAGTTTA--TTA-------AA---TGATTTTTAAT---AT--TGT-TTAA-ATTCAAT--ATAAA-AGGATATAATGGT
gi|7 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatATCTC-AAT-AACC-ACGC-TG----T-AA------GGA-ACAACACA-------CTTGCCCCTCGACC----ATTCGAA-CT----AAGCGATGA-AAGTAATAtcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttatctcaataaccacgctgtaaggaacaacacacttgcccctcgaccattcgaactaagcgatgaaagtaatat
gi|8 : cataggcggatcccaggtgtatggcaggggaatttgtgaaatggggggggggggcctagcacttgatttatttaggtacttttcaccccaacccaaaccctccttttttggccggggtactatttatacgtgaaaatgcttagtttattaaatgatttttaatattgtttaaattcaatataaaaggatataatggttcgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctcttAAAT---------GATACAGTGTA---TAAATC--CATATATTG----TGTTT----------TTA-----GGTGCTTTATTTTGAT--A-----A-T-CAAATTAATATAATTTTGGAAAAAAAA--TATTTGTTCGTTTCTTCAA-TCCAT--GAA--A-TG---CAGTAT-T-GAA-TCA-----GT-TGTAA-T--GAAATTTCCGAAAGCT-TTGACACCAATGTTC-AA-GAGTAACAGCTTGAG---AT-TTT-ATATTATTTCGTTGAAG-GGGAAGT--CCTCAAGTTATA----ATTGA-ACTTTCATTTGGTAGTTATCGTGAAA-ATCCT-T--AAAATTATAAACTATCCAGAAATAGTC-AGAA-GA-T-AA-AGTGATTAGGTGTACGCGCTTTGGTAGATCTTAACCAATGC------------------------------------CATGGAACC----ATTA-TATTGAAG-------------------AAAT--A--------AA-AG---TG----GTTTAGATATATCAGCTATACATACT---CTA---TTGATATAt
gi|9 : AAATC------------------A-A----TTTAT----ATGG-GGAGGA---A--AT---TCATTT--TGCTT-C-ATTC-A----AA--GCCT-CC--GAATTAG-A--TTTTCA-------A-------------CAGAACAAA--A--GTTTATAAATTTT-T---TT-T------------TTTCTG-TC-ATTGAA-A-GTA---ATGAATA-T-----T-TTTTCC--ATGAA---------C--TTGTGG---A--AACCGCCT-------GCTC-CCA---GA-------GT--TACTG-TGT-TGCACC--TT-TAATA--T-TG-TT------------CA-T----AGT-G--AA-----------GT-CGTCAA-----TCTATCAA---AGATTTCTCACTTACTACGTCT-GTCGTGGG---------AAGT----TTTTAAT------T---------AATACGATGTGAAGTAAATCCACGTAAATTGATACTGTTT-A------AATT-T-C--CGTGCTTGATTTTGAC--T--TTAA-T-AGAATGC--A-AAT--------------------------------AA--AAAG--GAA--A-TAATTCAG-AT-T-GAATTCA-----GC-C-T-A-T--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GATAAATTTGAATGATGCAACTGATTAAGTATCACCTTTCCCATCATTT