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Reference ( gi|4 ) : CGGT-TGT--CTAC-G-CAA---ATCT--CCGA-AG---A---A-CAG--AGAG----TC-TG-GTAAA-GA---CCC------GTG-ATAA---TA-ACTG-TTAC--CG--C--T---A-GGGAA-----CGC-TAA-----TT------C-A---G------TTT-------GA----AT--CT---------C-C-CG-CAC--AA--ACA-T-GTCA-A--T------TCCGAAAGA--TTTGA-TG-TTAATTACATGAAAG-TAATACTT-C-ATT--TGTGATA-CTAA--AGGAAAA--AATTAC--CAGAACA---AC---AGA-A-AAACC----GCG-ATCG-CTG--T-C-AAC--TGGAA-A-TC--A---TAC-T-TTCACTT--T-GCC--CT--CCAA--AGTGAT-TTT-GA-TAAAA-TTAA-A--TA----C-GC-ATCGGTTTTTA-GCAT---ATCCCGTAG--G--TAGAAC-AGCTAATAAAT-CC-T--TTCCT--CTTGTAT-CATTTTAT---ATTTCTA-AACA-CTCT---ACTT-GT-A-AATAT--TC---ACACTTA-AATGTCA-C-TTTCAA----TCTATTACA-GCTTT-CTTC--GAT-AGCTGTTATTCT--CGA---TTGTGG-CCT-----GATCAGCCAATCAA-A--TCTCATACCAG--G--ATTCTAGTAAGC-C-TCG-TT-TTGAC-----GT--TACAGATGTT----TT-TGCG---T---A--TC--TTTAC-CA-GA----CTCTC--G----GTT----C---A-----C-GG--A------GA-T---TT-A-CGGAG--A-CA-GCC--AATCGT-CTGGTTGCACG-AGAC
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): ATTTTATTTTAGAGTGATGCGTTTAATTCTTATCTAAAAACATTAAAAATATCAAGGTCAAATATTGCCAGAAT
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gi|18 : ----CGG--AGAT---TT-A-CGAAG--A-T-A-GCCG-A-GCGT-CTGGTTGCATG-AGagtttacggagatttacgaagatagccgagcgtctggttgcatgag
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gi|24 : --AGAC---TT-A-CGGAA--A-T-A-GCCG-A-GTGT-CTGGTTGCACA-AGACtgcacgaga
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gi|3 : CGGT-TGT--CTAC-GGCAAATCT-CCG--ATCGA---A-CA-G--AGA-G-TCCTGCGTAAA-GA----CCCG--CGATA----ATA-ACTG-TTAC--CG--C--T---A-GG--AG----CGC-TAA-----TT------C-A---G------TTTCGGTTT-GA----AT--CT---------CC-CA--CA---AA--ACACAGTCA--ATTCC-AAAGA--TTTTA-TG-TTAATTA-ATAA---TA--------TT-C-ATTAGT-G-TA-CTAAAGGAAA---AT-TTACC--------AGTACAA----CAGA-ATAAACC----GCG-ATCG-CTG--TC-A-C--TGGAA---TC--A---TACT-TT-CACTT--T-GC----T--CCAA--A-TAAT-TTTTG-GTAAAAATTAAA--TA----CCGCAA-CG--TTGTAT-CATTAAA--TCCCGTAGG--TAGAAC-AGCTAATAAAT-C--T--GTCCT--CTTCTAT-CATTT-AT---ATTTCTA-AACA-CTCT---ACTT-GT-A-AATCCTCACA---CTTT-AACGTCA-CTTTTCAA----TCTATTGCA-GCTTT-C-TC--GAT-AGTCG-TTATTT-TCGA---TTGTGG-CCT-----GATCAGCCAATC-AA----TCACATACCA---G--ATTCTGGTAAGC-C-TCG--T-TTGACCG---AT--TACAAACGTT-------T-CGTTCG-ATCTTTTTAC-CAG-A----CTCTC-G--GAT-----------------TA------CGG---GAT---TT-A-CGGAG--A-T-A-G-CG-A-GCGT-CTGGTTGCACG-AGACtaactgttaccgctaggagcgctaattcagtttcggtttgaatctcccacaaaacacagtcaattccaaagattttatgttaattaataatattcattagtgtactaaaggaaaatttaccagtacaacagaataaaccgcgatcgctgtcactggaatcatactttcactttgctccaaataatttttggtaaaaattaaataccgcaacgttgtatcattaaatcccgtaggtagaacagctaataaatctgtcctcttctatcatttatatttctaaacactctacttgtaaatcctcacactttaacgtcacttttcaatctattgcagctttctcgatagtcgttattttcgattgtggcctgatcagccaatcaatcacataccagattctggtaagcctcgtttgaccgattacaaacgtttcgttcgatctttttaccagactctcggattacgggatttacggagatagcgagcgtctggttgcacgagac
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Unaligned ( gi|22 ): ATTTTATTTTAGAGTGATGCGTTTAATTCTTATCTAAAAACATTAAAAATATCAAGGTCAAATATTGCCAGAAT