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gi|26                         :                                                                                                                                                                               cCCTTTGAC-ACGCCCC--CT--TG-------AA-AGA-T-GTT--GGC-T-G--AT-G-CCA-T----AC--C--A------T--TTTTTT----CTTAA--T-T--AT-A-ATA----TGTA----A-G-CGTA-T-T-G--GA-G-AT----TT-----CC--TA-T-C-A---T-CT-TC-----------T-TTG
gi|8                          :                                                                                                                                                                                cCTTTGAG-ACAGCCC--C---TG-------AA-ATA-T-TTT--GGC-CCG--AA-T-ACC------A---C--A------C--TTTTTC----CC-----A-T--ATGA-ATT----TTTA----A-G-CGTA-T---G--TG-T-CC----TT-----AC--TA-T-T-A---T-CT-TC----G---T--T-TTGGAT---TA----AAA---CT----------C-A-ACT-T-TAAAA---TT----TTTTTTAT--A--T--TCA-A---A--C--TTT----T-A-T-ATC-G--C---C-A--A---TGGG-AG-A--TT--T-CC--TAT-T--ATTTT-C--TT--T-G-C-AATTA----CGC-----ATT--T-TT-CA-T-G-CT-ACTTTTGA-A-AA------C-GT--CC-C---CAC-A-G-AA------------------------AA-TA-AT-GAA-CG-ATGACC-T-A------T---T----T-GGTTT-TTTC-----CCGTT-GA--TTTT-A--A---C------TAATTA--A---ATA-C------A-T-AATT-TA-----A-TTG----ATAT--C---AAA--T---TTGA--AT-AAAAGA-TC-------T-CT-AT-TT-TTAG-AAATGA-AT-------T-AT-A-TCCGT-CG-TCcaaatacgcatttttcatgccta
gi|17                         :                                                                                                                                                                                 CTTTGAG-ACG--CC--CC--TG-------AA-ATA-T-TTTTTGGC-C-GG-AT---ACC-T----A---C--A------C--TTTT------CCA----T-T--ATGA-ATT----TTTA----A-G-CGTA-T---G--TG-T-CC----TT-----AC--TAGT-T-A-T-C----TC----G---T--T-TTGGAT---TA-----AA---CT----------C-T-ACT-T-T-AGAAA-TT----TTGTTTAT--A--T--TC--A---AA-C--TTT----T-A-T-ATC-G--C-A-C-A--A---T-GGGAG-A--TT--TTCC--TAT-T--ATTTT-C--TT--T-G-C-AATTA----CGC-----ATT--T-TT-CA-T-G-CT-ACTTTTGA-A-AA------C-GT--CC-C---CAC-A-G-AA------------------------AA-TA-AT-GAA-CG-ATGA-C-T-A------T--------T-G--TT-CTTTTTCCCCCGTT-GA--TTTT-A--A---C------TAATTA--A---ATA-C------A-T-AATT-TA-----A-TTG-----TAT--C-A-AAA--T---TTGA--AT-AAA--AGTC-------T-CT-AT-TT-TTAG-AAA
gi|3                          :                                                                                                                                                                                  TTTGAG-ACAGCCC--C---TG-------AA-ATA-T-TTTTTGGC-C-GG-AT-G-ACC-T----A---C--A------C--TTTTCC----CA-----T-T--ATGA-ATT----TTTA----A-G-CGTA-T-T-G--TG-T-CC----TTG----AC--TAGT-T-A-T---CT-TC----G---T--T-TTGGAT---TA-----AA---CT----------C-A-ACT-T-T-AGA---AT----TTTGTT-T--A--TA-TC--A---AAAC--TTT----T-A-T-ATC-G--C-A-C-A--A---T-GGGAG-A--TT--TTCC--TAT-T--ATTTT-C--TT--T-G-C-AATTA----CGC-----ATT--T-TT-CA-T-G-CT-ACTTTTGA-A-AA------C-GTC-CC-C---CAC-A-G-AA------------------------AA-TA-AT-GAA-CG-ATGA-CGT-A------T---A----T-G--TT-CTTC-----CCGTT-GA--TTTT-A--A---C------TAATTTAAA---ATA-C------A-T-AATT-TA-----A-TTG-----TAT--C-A-AAA--T---TTGA--AT-AAAG-A-TC-------T-CT-AT-TT-TTAG-AAATGA-AT-------TGAT-A-TCCGT-CGATCGTt
gi|19                         :                                                                                                                                                                                  TTTGAC-ACAACCC--C---TG-------AA-CGA-A-TTT--GGC-C-G--AT-G-ACC-T----A---C--A------T--TTTTTC----CC-----T-T--AT-A-ATT----TTAA----A-G-CGTA-T-T-G--TG-T-CC----TT-----AT--TA-T-T-A-T-T-CT-TC----G---C--T-TTGGAT---TA----AAA---CT----------C-T-AAT-T-T-AGA---AT----TTTTTTAT--A--TG-----A---A--CTGTTC----T-A-T-ATT-G--C-A-C-A--AG--T-GG-AG-A--CTTAT-CC--TAT-T--A-TTT-C--TT--T-G-CAAATTA----C-C-----ATTG-T-TT-CA-T-GCCT-ACTTTTG--A-AA------C-GTCTCC-C---CAC-ACG-AA------------------------AA-TA-AA-TAA-TGTATGATC-C-AC-----T---A----T-G--TT-TTTT-----TCCAT-GA--TTTT-A--A---C------TAATTCA-G---ACA-C------A-TCAATT-TA-----A-TTGTATCATGT--C-A-AAA--T---T
gi|6                          :                                                                                                                                                                                 tTTTGAC-ACG--CC--AC--TG-------AA-AGA-T-TTT--GGC-C-G--AT-G-CCA-T----A---C----------------------CA-----T-T--GT-A-A----------------G-CGTA-T-T-G--TG-T-AC----TT-----AC--TG-T-C-A-T-T-CT-TT----G---T--T-TTGGAT---TA----AAA---CTTTATTTGCACT-T-ATT-T-T-AGA---AT----ATTTTTATA-A--TA-TC--AT--AT-C--TTT----T-A-T-ATC-G--C-A-C-A--G---T-GG-AG-A---T--T-CC--TA--T--ATTTT-C---T--T-G-C-AATTA----CAC-----A-T--T-GT-CA-T-GCCT-ACTTTTG--ATAACCAGCGC-GGC-CC-TTAACAA-A-G-AA------------------------AA-T--AT-GAA----GCGA-C-C-A------T---C----TAG------TTT-----ACG-T-GAT-TTTT-A--AAATC------TAGT--------ATA-C------ATT-AATT-TA-----AGCTG----ATAT----A-AAATTT---TTGAT-TT-ACA--A-TT-------TACTCAGCTT-TTCG-AAACGACATCTACTGGT-AG-A-TCCGT-C
gi|12                         :                                                                                                                                                                                   TTGAG-ACAGCCC--CC--TG-------AA-AGA-T-TTT--GGC-C-G--AT-G-ACC-T----A---C--A------C--TTTTTT----CC-----T-T--AT-A-ATT----TTTA----A-G-CGTA-T-T-G--TG-T-CC----TT-----AC--TA-T-T-A-T-T-CT-TC----G---T--T-TTGGAT---TA----AAA---CT----------C-T-ATT-T---AGA---AT----TTTTTTAT--A-----TC--A---A--C--TTT----T-A-T-ATC-G--C-A-C-A--A---T-GG-AG-A--TT--T-CC--TAT-T--ATTTT-C--TT--T-G-C-AATTA----CGC-----A-T--T-TT-CA-T-GCCT-ACTTTTG--A-AA------C-GTC-CC-C---CACAA-G-AA------------------------AA-TA-AT-GAA-CG-ATGA-C-T-A------T---A----T-G--TT-TTTT-----CCGTT-GA--TTTT-A--A---C------TAATT---A---ATA-C------A-T-AATT-TA-----A-TTG----ATAT--C-A-AAA--T---TTGA--ATAAAA--A-TC-------T-CT-A--TT-TTAG-AAACGA-AT-------T-AT-A-TCCGT-CG-
gi|21                         :                                                                                                                                                                                   TTG-G-ACAGCCT---------------AA-AGA-T-TTT--GGC---G--AT-G-ACA-T----A---C--C------T--TTTTTT----CC-----C-T--AT-A---T----TTTA----A-G-CG-A-T-T-G--TG-T-------TT-----AT-----T-T-A---T-CT-TC----G---T--T-T--GGT---TA-----AA---AT----------T-T-ATT-T-T-ATA---------TTTTTTAT--A---------A---A--T--TTT----T-A-T-G--------A---A--A---T-GG--G-A--TTA-T-CC--TAT-T--ATTGT----TT--T-G-C-A--TA----CAC-----ATT--T-TT-TC-T-GCT---CTTTTG--A-AA------C-GTT-CCGG---CAC-A-G-AA------------------------AA-TA-AT-G-A-CG-ATGA-C---A------T---A----TGG--TT-TTTT-----CGGTT-GA--TTTT---------------TTATC---A---AT--C------A-T-AATT-TAC----A-TTG----ATAT------AAA--T---TTGc
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                    TGAG-ACAGCCCGGCC--TG-------AA-AGA-T-TTT--GGC-C-G--AT-G-ACCAT----A---C--A------C--TTTTTG----CC-----T-T--ATTA-ATT----TTTA----A-GGCGTA-T---G--TG-TTCC----GT-----ACG-CA-T-T-A-T-T-CT-TC----G---T--T-T--GAT---TA----AAA---CT----------CCT-ATT-T-TGAGAG--TC----TTTTTTTT--A--AA-TC--A---C--T--TTT----T-A-T-ATC----C-A-CCA--A---T-GG-AG-A--TT--T-CC--AAT-T--ATTT--C--TT--T-G-C-AATTAATAGCGC-----ATT--T-TG-CC-A-GCCTTACCTTTG--A-AA--------GTC-CC-C---CAC-A-G-AA------------------------AAATA-AT-GAA-CG-ATGAAC-T-A------T---AA---T-T--TT-GTTT-----CCGTT-TA--ATTT-A--A---C------TAATT---A---ATA-C------A-T-AATT-TA-----ATTTG----ATAT--C-C-AAA--A---TTGA--AT-AAAT-A-TC-------T--T-A--TT-Tt
gi|10                         :                                                                                                                                                                                     tta-ACAGCGG--CC--TA-------AA-AGA-T-T----GGCAC-GC-AT-A-ACT-T----AGTTC--A------C--CTTATTATCACA-----TAT--AT-G-ATT----ATTATTAAA-G-CATA-TGT-G--TG-T-CC----CTTGAGCAC--TA-T-T-AATGT-CC-TCACCTG---T--T-T--GAT---TT----AAA---GT----------C-T-ATA-TAG-AGA---TGCAAATATTACAT--A--AA-TC--A---A--C--TTC----T-AGT-ATT-G--C-GGC-A--A---T-GG-GG-GATTT--T-CT--TAT-TGGATATT-C--TTATT-GTC-GATTA----TGTTCTATATTACT-AT-CACT-ATCT-A-TTGAG--A-AA------C-ATC-CC------AC-A-GTAA------------------------AA-TA-AT-GAATCA-ATGA-C-TAA------T---A----T-G--CTGTTCT-----C--TT-GAAGCTTT-G--A---C------TAAT--------GT--------------ATT-CA-----A--------ATGT--T---AAA--T---CTGA--AT-AA
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Reference ( family-92 )       :                                                                             CCTTTGAG-ACGGCCC--CC--TG-------AA-AGA-TTTT--GGC-C-G--AT-G-ACC-T----A---C--A------C--TTTTTT----CC-----T-T--AT-A-ATT----TTTA----A-G-CGTA-T-T-G--TG-T-CC----TT-----AC--TA-TT-A-T-T-CT-TC----G---T--T-TTGGAT---TAAAA----CT----------C-T-ATT-TT-AGAN-T-TT----T-TTTAT--A-TA--TC--A---A--C--TTT----T-A-T-ATCG--C-A-C-A--A---T-GG-AG-A--TT--T-CC--TAT-T--ATTTT-C--TT--T-G-C-AATTA----CGC-----ATT--T-TT-CA-T-GCCT-ACTTTTG--A-AA------C-GTC-CC-C---CAC-A-G-AA------------------------AA-TA-AT-GAA-CG-ATGA-C----C-A------T---A-T---G--TT-TTTT-----CCGTT-GA--TTTT-A--A---C------TAATT---A---ATA-C------A-T-AATT-TA-----A-TTG----ATAT--C-A-AAA--T---TTGA--AT-AAA--A-TC-------T-CT-A--TT-TTAG-AAACGA-AT-------T-AT-A-TCCGT-CG-TCGT
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gi|21                         :                                                                               aTTG-G-ACAGCCT---------------AA-AGA-TTTT--GGC---G--AT-G-ACA-T----A---C--C------T--TTTTTT----CC-----C-T--AT-A---T----TTTA----A-G-CG-A-T-T-G--TG-T-------TT-----AT-----TT-A---T-CT-TC----G---T--T-T--GGT---TAAAA-----T----------T-T-ATT-TT-ATA----TT----T-TTTAT--A---------A---A--T--TTT----T-A-T-G-------A---A--A---T-GG--G-A--TTA-T-CC--TAT-T--ATTGT----TT--T-G-C-A--TA----CAC-----ATT--T-TT-TC-T-GCT---CTTTTG--A-AA------C-GTT-CCGG---CAC-A-G-AA------------------------AA-TA-AT-G-A-CG-ATGA------C-A------T---A-TG--G--TT-TTTT-----CGGTT-GA--TTTT---------------TTATC---A---AT--C------A-T-AATT-TAC----A-TTG----ATAT------AAA--T---TTGt
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                           AA----CT----------C-T-ATT-TT-AGAA-A-TT----T-TTTAT--A-T----C--A---A--C--TTT-------------------------A---T-G---------T--T-CC--TAT----ATTTT-C--TT--T-G-C-AATTA----CGC-----ATT--T-TTTCA-T-GCCT-ACTTT-G--A-AA------C-GTC-CC------AC-A-G-AA------------------------AA-TA-ATTGAA-CG-ATGA-T----T-A------T---A-T---G--TT-TTT------CCGTT-GA--TTTT-A------C------TA-TT---A---ATA-C------A-T-AATT-TA-----A-TTG----ATAT--C-ACAAAT-T---TTGA--AT-AAA--A-TC-------T--T-A--TT-TAAG-AAACGA-A--------T-AT-A-TCCGT-CG-TCGT
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ----T-TTTAC--A-CA--TC--A---A--C--TGC----T-A-T-GTCG--C-A-C-A--A---T-GG-AG-A--TT--T-CTAATATAT--ATTTC-A--TT--T-G-C-GACTG----CGC-----ATT--T-CT-CA-GAGCCT-ACTTTTG----AC------C-CTC-CC-C---CGC-A-G--A------------------------TA-TT-GC-GAA--G-ATGA-C----C-A------T---A-T---G--TT-T----------G---GG--TTTT------------------TT------------------------TG-TA-----A-TGT----ATAC--C-A-ACA--T---TTTA--AT-AAA--A-TC-------T-CT-A--Tta
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tgataataataataaagtagtcacatcaataa-GG-AA-A--TT--T-CC--TAT-T--ATTTA-A--TT--T-G-C-AATTA----CGT-----GTT--T-TC-AA-A-GCCT-ACTTTTG--A-AA------C-GCT-CC-C---CGC-T-G-AA------------------------AA-TA-AT-TAA-TG-ATGA-C----C-C------T---A-T---G--TT-TTTT-----TCATG-GA--TTTT-A--A---C------TGATT---A---ATG-C------A-T-ACTC-TA-----G-CTT----ATAT--C-A-AAA--T---TTTA--AG-AAA--T-TC-------T-CT-A--TT-TTAG-AAACGA-AT-------T-AT-A-TCCGT-CG-TCGT
gi|25                         :                                                                                        aaCCC--CC--TG-------AA-AAA-TTTT--GGC-T-G--AT-G-ACA-TGAACG---C--A------C--TTTCTT-----------T-T--AT-ATATTGTAATTTA----A----------T-G--TG-T-CC----TT-----ACG-GA-TC-A-C-T-CT-TT----C---TAAT-TTGGATA--CACAT----CT----------A-T-ATT-TT-AGA-----T----T-TTTAA--A-TA--TC--A---AT-T--TTT----T-A-C-AT-G--G-A-C-A--G---A-GG-AA-A--TT--T-t
gi|26                         :                                                                cctttgcacccccCCTTTGAC-ACGCCCC--CT--TG-------AA-AGA-TGTT--GGC-T-G--AT-G-CCA-T----AC--C--A------T--TTTTTT----CTTAA--T-T--AT-A-ATA----TGTA----A-G-CGTA-T-T-G--GA-G-AT----TT-----CC--TA-TC-A---T-CT-TC-----------T-TTGt
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              c---T-GG-AG-A--TT--T-CC--TAT-C--ATCTT-C--TT--T-G-C-AAATA----CGC-----ATT--T-TT-CA-T-GCCT-Acaaatacgcatttttcatgccta
gi|27                         : ccctttgacacgcccccttgaaagatgttggctgatgccataccatttttttcttaattataatatgtaagcgtatCCTTTGAG-ACAGCCC--CC--TG-------AA-AGA-TTTT--GGC---G--AT-G-ACC-A----AA--C--A------C--TTTTT-----CC-----T-T--AT-A-ATT----TTTA----A-G-CGTA-T-T-G--TGTT-CC----TT-----AC--TA-TTAA-T-T-CT-TC----G---T--TCTTGGA
gi|28                         :                                                                                                                      c--GGC-C-G--AT-G-ACC-T----A---C--ATGTACAC--TTTTTT----CC-----T-T--AT-A-ATT----TCTA----A-G-CGTA-
gi|3                          :                                                                               TTTGAG-ACAGCCC--C---TG-------AA-ATA-TTTTTTGGC-C-GG-AT-G-ACC-T----A---C--A------C--TTTTCC----CA-----T-T--ATGA-ATT----TTTA----A-G-CGTA-T-T-G--TG-T-CC----TTG----AC--TAGTT-A-T---CT-TC----G---T--T-TTGGAT---TAAA-----CT----------C-A-ACT-TT-AGAA-T-TT----T-GTT-T--A-TA--TC--A---AAAC--TTT----T-A-T-ATCG--C-A-C-A--A---T-GGGAG-A--TT--TTCC--TAT-T--ATTTT-C--TT--T-G-C-AATTA----CGC-----ATT--T-TT-CA-T-G-CT-ACTTTTGA-A-AA------C-GTC-CC-C---CAC-A-G-AA------------------------AA-TA-AT-GAA-CG-ATGA-CG---T-A------T---A-T---G--TT-CTTC-----CCGTT-GA--TTTT-A--A---C------TAATTTAAA---ATA-C------A-T-AATT-TA-----A-TTG-----TAT--C-A-AAA--T---TTGA--AT-AAAG-A-TC-------T-CT-AT-TT-TTAG-AAATGA-AT-------TGAT-A-TCCGT-CGATCGT
gi|4                          :                                                                             CCTTTGAC-ACCGCCC--CCCTTG-------CA-AAC-TTTT--GGC-TTG--ATTG-ACA-T----G---CC-A------C--TTTCTT----TTATAATT-T--GT-A-ATT----TTTA----A-----TG-T-T----TG-T-CC----T------AC--CA-TC-ACT-T-CT-TCC---A---A--T-TTGGAT---ACAAT----CT----------C-T-ATT-T--AGAA-A-AT----T-TTTTT--A-TA--TC--A---A--T--TTT----T-A-A-TTTG--C-A-C-A--A---AAGG-AA-A--TT--T-CC--TAT-T--ATTTTTC--TT--T-G-C-AATTA----CGG-------T--T-TT-CA-TAGCCT-ACTTTTG--A-AA------C-GCT-CC-C---TGC-T-G-AA------------------------AA-TA-AT-CAATTG-ATGA-C----C-C------T---A-T---G--TT-TTTT-----TCATG-GA--TTTT-A--A---C------TAATTC--A---ATG-C------A-T-ACTC-TA-----G-CTT----ATAT--T-A-AAA--T---TTTA--AG-AAA--T-TC-------T-CT-A---T-TTAG--AACGA-AT-------T-AT-A-TCCGTGCG-TC
gi|5                          :                                                                             CCTTTGAC-ACG-CCC--CC--TGC------AA-ACT-TTTT--GGC-TTG--AT-GGACA-T----G---CCCA------C--TTTCTG----GT-----T-T--AT-A-ATT----TGTA--------TTTA-A-T-G--TGAT-CC----TT-----AC--CA-TC-A-C-T-CT-TC----A---A--G-TTGGAT---ACAAT----CT----------C-T-ATT-T--AGAA-T-TT----T-TT-----A-TA--TC--A---A--T--TTT----T-AAT-ATTG--C-A-C-A--A-----AG-AA-A--TT----CC--TAT-T--ATTTT-C--TT--TTG-C-AATTA----CGT-----GTT--T-T--CA-TAGCCT-ACTTTTG--A-AA------C-GCT-CC-C---TGC-T-G-AA------------------------AA-TA-AT-CAATTG-ATGA-C----C-C------TAAAA-T---G--TT-TTTT-----TCATG-GAT-TTTT-A--A---C------TAATC---A---ATG-C------A-T-ACTC-TAGCTTCA-TT-----AT-T--T-A-AAA--TGGGTT-A--AG-AAA--T-TC-------T-CT-A--TT-TTAG-AAACGA-A--------T-AT-A-TCCGT-CG-TCGTtgt
gi|6                          :                                                                               TTTGAC-ACG--CC--AC--TG-------AA-AGA-TTTT--GGC-C-G--AT-G-CCA-T----A---C----------------------CA-----T-T--GT-A-A----------------G-CGTA-T-T-G--TG-T-AC----TT-----AC--TG-TC-A-T-T-CT-TT----G---T--T-TTGGAT---TAAAA----CTTTATTTGCACT-T-ATT-TT-AGAA-T-AT----T-TTTATA-A-TA--TC--AT--AT-C--TTT----T-A-T-ATCG--C-A-C-A--G---T-GG-AG-A---T--T-CC--TA--T--ATTTT-C---T--T-G-C-AATTA----CAC-----A-T--T-GT-CA-T-GCCT-ACTTTTG--ATAACCAGCGC-GGC-CC-TTAACAA-A-G-AA------------------------AA-T--AT-GAA----GCGA-C----C-A------T---C-TA--G------TTT-----ACG-T-GAT-TTTT-A--AAATC------TAGT--------ATA-C------ATT-AATT-TA-----AGCTG----ATAT----A-AAATTT---TTGAT-TT-ACA--A-TT-------TACTCAGCTT-TTCG-AAACGACATCTACTGGT-AG-A-TCCGT-Ct
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