lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 55 1 44444444444444444444444444444444444444 6666 22 3333333333333 11111 22222 111 11111111 11111 2 222222222222 4444444444444444444444444444444444 1111 2 111 111 222222222 11 2 11111 111 1111 33333333333333 777777777 111 33333333 1111 11 3 11111 11111 11 1111 111111 1 1 4444444 11111 111111 111 111 1 5555555555555555 1 2222222 5555555555555555555555555 11111 111 11 1111 333333 55555555555555555555 111 33333 111 222222 22222 22222222 11111 1111111 22222222222222222 11111111111 1111 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 222 1111111 1 66666666666666666666 1 22222222222222 22222 2222 11 222 11 1111 222222 5555555555555555 11 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1 11 1 1 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 4 1
lowQualScore : 55 7 55555555555555555555555555555555555555 1111 6 11 3333333333333 55555 22222 55 333 88888888 3 55 22222 1 5 5 444444444444 5 5 5 0000000000000000000000000000000000 2 2222 99 6 111 888 999999999 00 3 66666 5 99999 5 5 66 66 55 5 333 2222 0 0 55555555555555 5 5 777777777 9 2 4 5 5 5 2 333 22222222 4 4444 66 4 00 66 3 22222 0 77777 5 33 3 1 2 00 4 0 3333 66 4 666666 4 0 88 2 9999999 66 5 5 5 1 7 66666 0 66 0 000000 000 000 1 66 4444444444444444 0 5555555 4 2 0 8 5 5 0 0000000000000000000000000 77 5 77 4 44444 000 5 11 5 5555 444444 1 9999 1 777 55555555555555555555 55 222 4 777 4 66 66 4 4 2 5 99999 5 666 333333 4 44444 3 99 6 44444444 3 00000 8888888 77777777777777777 44444444444 77 4444 77 5 5 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 333 4 3 9 8888888 0 0 6 22222222222222222222 6 0 2 11111111111111 2 77777 3 4444 11 333 0 11 7777 8 22 333333 5555555555555555 8 8 11 8 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 3 33 7 3 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 888 0 5
lowQualScore : .. . ...................................... .... . .. ............. ..... ..... .. ... ........ . .. ..... . . . ............ . . . .................................. . .... .. . ... ... ......... .. . ..... . ..... . . .. .. .. . ... .... . . .............. . . ......... . . . . . . . ... ........ . .... .. . .. .. . ..... . ..... . .. . . . .. . . .... .. . ...... . . .. . ....... .. . . . . . ..... . .. . ...... ... ... . .. ................ . ....... . . . . . . . ......................... .. . .. . ..... ... . .. . .... ...... . .... . ... .................... .. ... . ... . .. .. . . . . ..... . ... ...... . ..... . .. . ........ . ..... ....... ................. ........... .. .... .. . . ....................................................................................... ... . . . ....... . . . .................... . . . .............. . ..... . .... .. ... . .. .... . .. ...... ................ . . .. . ............................................................................... . .. . . ............................................................................................................. ... . .
lowQualScore : 00 0 00000000000000000000000000000000000000 0000 0 00 0000000000000 88888 66666 00 666 22222222 6 00 66666 2 0 0 000000000000 0 0 0 2222222222222222222222222222222222 2 1111 22 7 777 333 333333333 22 3 77777 7 77777 0 0 99 99 22 0 888 1111 1 1 00000000000000 0 0 999999999 0 5 6 0 0 0 2 999 77777777 4 4444 11 4 66 11 9 55555 8 55555 0 11 0 3 9 66 4 9 9999 11 4 666666 4 0 99 1 4444444 00 7 7 1 4 4 88888 1 99 3 111111 000 000 4 00 7777777777777777 0 2222222 2 5 8 2 7 7 3 9999999999999999999999999 99 7 99 6 33333 000 7 77 7 2222 111111 4 4444 0 888 00000000000000000000 55 555 4 888 4 11 11 4 4 7 0 66666 0 777 888888 4 55555 4 22 7 22222222 0 55555 6666666 66666666666666666 66666666666 99 6666 99 7 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 333 7 2 8 8888888 8 0 5 88888888888888888888 5 0 5 00000000000000 8 88888 8 6666 00 222 8 00 0000 0 66 000000 8888888888888888 0 0 00 0 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 3 33 3 3 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 000 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGATTGTCCTATGT-CTATA----CAAAAA---GGC--GAAGNT-AACA-----T-CGT-G--TN----AAACCGTAAT-C-ATA-G--TC--A---AA-AA-A-CA--CA-T---A-CA-A-A-ATCGAGT--G--C---TAG----GGCAAC--ACGGA-CC---TCCGA---CAAAA-----G---CGAA-GGC-AGG-----AT-CA-GG--CGC-C-AT--GG--AGGA-GTAA-GCA---TC---CTCTGCTGACC---------G----TC-ACA-CC-CGCGCC-CGTGAGCCCGTAGTCGAAACAAA-GT-AAACG-GGATT---ACCCG-T----CGTCAAATCTA-GTA--G-GAAAATG--A-CA--GT--CTAACAAAG-GGTA-----TGAAAC-----AAAT-CAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACC-G----T-AGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-GATC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCNCATACGC-ATGGCATGC-CCTTGCGTA-TCGAATCAAAACTGAGAGATATACACACACC-AT-AAG-CAG-GNGATA-----GTG------GT--ACA-TTAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCGTCACG----CTTA---TCA----TATA-A-TGGT--A--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGA--G--T-C-AATGTTAA-GTGAA-A-AATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATT--------CTGTGG-TG-TC-------CTTT--ATNTC---------GAGTT---CT-TC---GGG--ATA--T-A--T-CA-A----ATGTAGA-CAT--A-----ATT---ATG-----AAAACTAT-AT-GATTNTTA-ATT-GATAA-CAC-A-AT--CG-TCNA-TATA---CCNATATGTAAGGTTG--AAGGACA-CGGC--AANTTT----------TTTNTTTT-CATCC---CGTAANA----GTTTTT--GN-ACAAAA---TTCTG--CTTC-GTATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAACAAA-G--------G-GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGGAATA-CCTAN--------AGATTGT----T-G---AAGACCC-G--GT-TC-----GAC-TANAT--AAATATTAT-CTATAAGAAACCCGAGCA-TGCTCTTAGATTGAGTCATGCCCAGTTCAGCTTNGTACACTTGTGTGGGCAATTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGT
Reference ( gi|2 ) : AGTTTAAAAGCCCGGGTTACCTGGCTATAGACAGTGAAT--TGATGATTG---TCAAGAAAGTTGGTGTTCTAGCCTTAACGCAGCTTGCACTGA-GA-AGATTCGGGATTGTCCCATAT-CTATA----CAAAAA--AGGC--GAAGTT-AACA-----T-TGT-G--TC----AAACCGTAAT-C-ATA-A--TC--A---AA-AA-A-CA--TA-T---A-CA-A-A-ATCGAGT--G--C---TAG----GGCAAC--ACGGATCC---TCCGA---CAAAA-----G---CGAA-AGTGAGG-----AT-CA-AG--TGC-C-AT--GG--AGGA-GTAA-GCA---TC---TTCTGCTGACC---------G----TC-ACA-CCGCGCGCCTCGTGAGCCCTTAGTCGAAATAAA-GT-AAACG-GAATT---ACCCGGT----AGTCAAATCTA-GTA--G-GAAAATG--A-CA--GT--CTAACAAAGAGGTA-----TGAAAC-----AAAT-CAGTCAACATATGACTTAGTGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACC-A----T-AGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-GATTCAGT-TA-TAA-CCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCGCAT-CGC-ATAGCATG--TCTTGCGTA-TCGAATCAAAACTGGGAGATATACACACACC-AT-AAG-CAGCGGGATA-----GTG------GT--ATA-TTAC--TACATAGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-TG-ATTGCAAAGT--T-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATACA-TAAT--A--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGA--G--T-C-AATGTTAA-GTAAATA-AATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATT--------CTATGG-TG-TC-------CTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--ATA--T-A--T-CA-A----ATGTGGA-CAT--A-----ATT---ATG-----GAAATTAT-AT-GATTGTTA-ATT-GATAA-CAC-A-AT--CA-TCTATTATA---CCAATATGTAAGGTTG--AAGGACA-CGGC--AAGTTT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACA----GTTTCT--GT-ACAAAA---TTCTG--CTTC-ATATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAAT-AA-G--------G-GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGGAATACCTTAC--------GGATTGT----T-G---AAGACCT-G--GTCTCA--AAGAC-CACATA-AAATATTAT-CTATGAGAAACTCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTACTTCAG---AGTAT-CTTGTGTGGACAATCA-GAG-TG---TTTC---ATAAC--CAAAATATGTGTACTGTTCCC-----ACTACAGCTAGAAATTCGTATT-TTCGGGTG
gi|3 : TGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGA------CATGT-CAATG----TAAA-----GAC--AAAGAC-ATCAAATATT-TGTTG--TCTTGCAAATCCTAAG-C-AGA-A---C--AC--AA-AA-A-CA---A-T---A-----------------G--T---TTG----GCAAAC--CCGGACCC---CCGGA---CAAAC---------CAGA-GGTG-GG-----AC-CA-GG--CGCGC-A---GG--AGGA-GCAA-ACA---TC---C--------CC---------G----T--AGA-CTG---GCCTCATCCGCCCT-------GATCAG-AT-AAACG-GA
gi|1 : ATTGTTCTAT----TATAATATCAATAATTAAGC--GAAGGT-AA-A-----T-CGG-GCTTA----AAAACGTAAT-C-ATA-A--TTCAA---AA-AA-A-CA---A-T---C-CACA-A-ATCGTGT--G--CGTCTGG----GACAAC--ACGGGACC---TCAGAT--CAAAAACACCG---CGAA-AGTTAGG-----ACATA-GG--CGC-C-ATATGG--TGGA-TGAG-GCAGTCCC---TTCTGTT-ACC---------GCGGTTC-ACA-CC------CCCGTGA--CCGTAGTGAAAATAAA-GTTAAACGCGGATTTTAACCCGTTCTAGAATCAAATCTACGTA--GAGAAAATGTGATCA--GTTACTAACATATATGTAGATCATAAAACCAACCAAATTCAGTCAACATATGAAT-AGTGATACTTTGTAATCGCATAAACAAAGGTGGTACATCTT-ATAACGACC-GTGATT-AAAATTTGCTAACATGAGTATCTT-----GA----------TA-TA-----CG----ATCG-A-TATTTTTGTTAGTAGTGTTGGATTCTACTCGCTTCTGTAAA---AA-ATCCGCAT------TAGCA-----CTTGggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccggcaaaccaaatcgctacaacaaccatataattcgcgaaacactgccccaaaacgtgactgccgaaatccctgcaacaacacactatctgcaaaccgcctgcctcgattcaaacataagtctgcacgcaccgatcaagccgagagatacaaacacaacaagcaagtgatgatcggacattgctacacaaataccgaaagctgacaacgtaaaatccgataccgtcttgtctgtcacaaagtcgagccgtcagttgccgccaatgttcaatgaaatatccaagtatgaagcagagattgaagactctgcagcactccttccacctccagcccactgggacacaccgaatcgacgcatgaactaaaagacaaaacgtcgtcaagatatcgatatgtcgaactaaaggccatcagatatttcttcttttcatgtaggagcttttggacgaattctgcctcttaagaatatgaaaacaggtctgctaacaaaggagcacaatcagtgctcat
gi|29 : gtgtattttttatttaatttgattTCCTATATATTATA----CAAATA---GGC--GAAGGT-AACA-----T-CGT-G--TA----AAACatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|5 : attgttatTAT-----CAAAGA--AGGCACGAAGTTCAACA-----T-TGT-G--TC----AAACCGTAATTC-ATATA--TC--ACAAAA-AA-A-CAACTA-TGGCA-CA-ACACATCGAGCTCGACC---TAGCAACGACAACCCACTGAACCCATTCCAAGTACAAAA-----AAGCCGAACGGTTAGATTGTCAG-CA-AGGCTGC-CGAT--GG--AGGCCATAACGCAA--TC---CTC-ACTGGCCAATGAACCGG----TCCACA-CC-CGCAC---GTGAGCCCGTAGTCGAAATAAA-GT-AAATG-ATATT---ACCCG-T----AGTCACATGAA-GTG--G-AAAAATG--A-CA--GT--CTAACAAAG-GGTA-----TGAAAC-----AAAT-CAGTCAACATATGTCTTATTGATACTTTGTAATCGC--AAAC-A--GT----CA--TTGATAG--ACC-G----T-AGAATTTGCGAA-ATGATGACTTC-AAACGA-GATTC-GA-TA-TAA-CCTTGCAACTTCA-A-CTTTATTGTTAGTA--GGTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA--TCCGCATACAC-ATATCATAC-TCTTGCGTA-TCGGATCAA--CTGCGAGATATACACAC-CC--T-AAG-CAG-GTGATA-----GTT------GT--ATA-TTAC--TAAATAGAAAGGG-----AA---A-TTTGA-CG-ATTGCAAAGA--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A-TG-T--A--ATT--GTCAG---TCTG-C---C-ATCAGA--G--T-C-AATTTTAG-G--AA-A-AATAT-GCG--AA-TAT--G-AAAC--A--GATTTGT--CA-GATTTTATTTATCTATG--TA-TCTATCTATCTTT--ATCT------------GTT----T-TC---TAT--GTA--C-A--T-CA-A-----TGTGGA-gt
gi|41 : gaatATA----CAAATA---GGC--GAAGGT-AACA-----T-CGT-G--TC----AAACat
gi|40 : ATA----CAAATA---GGC--GAAGGT-AACA-----T-CGT-G--TT----AAg
gi|7 : aAAAA--TGGC--GAAGT--AACA-----A-TGT-A--TT----AAAC-GTAAT-C-ATA-GACCC--A---AA-CA-A-CA--CA-T---A-CA-A---------T--G------TAG----GGCAAC--TCGGA-CC---TCCAA---CAAAA-----G---CGAA-GGC-AGG-----AT-CA-GA--TGT-C-AT--GG--AGGA-GTAA-GCA---TC---GTCTGCTGACC---------GG---TC-ACA-CC---CGCC--GTGAGCCCGTAGTCGAAACAAAAGT-AAACG-AGGTT---ACCCG-T----CGTCAAATCTA-GTA--C-GACAAAA--A-CA--GT--CTAACAAAG-GGTA-----TGAGGC-----AAAT-CAGTCAACATATGACTTGATGGTAATTTGTAATCGC--AAAC-AAAGT----CA--TT-ATAGCGACC-G----T-AGAATTTGCGAA-ATGATGACTTtca
gi|8 : atgtgacattctttcagattgtacatgctgtcaggagatagaaaatggttcccaccagccatgtacctcaagttaattgactgatctacactaattgagtgtttcagtggtgtgataggaggttatgatattagactgatttttttctctctgcatctAAAA--TGGC--GAAGTT-ACCA-----AATGT-G--TT----AAAC-ATAAT-TTATA-G--TC--C---AATAA-ATCA--TA-G---AATA-A-A-GTCGAGT--G------TAG----GGCAAC--ACGGA-CC---TCCGA---CAAAA-----G---CGAA-GGC-AGG-----AT-CACGG--TGC-C-AT--GG--AGGA-TTAA-GCA---TC---CTCTGCCACCC---------G----TC-ATA-CC---CACC---TGAG-CTTTAGTCAACA-AAA-GT-AAACG-GGA-T---ATC---T----CGTCAAATCTA-GTA--C-AAAAATT--A-CT--TT--CTAACAAAG-GATA-----TGAAACA----AAAA-CAGCCAACATGTGAC--A--------TTGTAATTGCA-AAAA-AAAGTC---CA--AT-ATAATGACC-G----T-AGAATTTGTGAAGATGATGACTGTTAAACGAGGAT--GGTGCATTAA-CCCTGTCACAACA-AGC--GTATGTTACTA--GAGGG---T--CACGCTT---TAAA---AATGTCTCCATACGCAATGGCAT
gi|11 : tatAAAA--TGGC--GAAGT--AACA-----A-AGT-A--TG----AAAC-GTAAT-C-ATA-G--TC--C---AA-AA-A-CA--CA-T---A-CA-A-A-ATCGAGT--G------TAG----GGCAAC--ACGGA-CC---TTCGA---CGAAA-----G---CGAA-GGC-AGG-----AT-CA-GG--TGC-C-AT--GG--AGGA-GTAA-GCA---TC---CTCTGCTGACCG--------G----TC-ACA-CC-CGC----CGTGAGCCTGTAGTCGAAACAAA-GT-AAACG-GGGTT---ACCC-GT----CGTCAAATCTA-GTAGTG-GAAAGTG--A-AAT-AT--CTAAtgcccttgt
gi|4 : atagtatAAAT--AGGC--GAAGGT-AACA-----T-CGT-G--TT----AAAC-GTAAT-C-ATA-A--TCC-A---GA-AA-A-CA--TA-T---A-CA-A-A-ATCGAGT--G--T---T-G----GGCAtgcattccagatgaacttaaattacacaaaactgcatcgctgatacgaggcataataaatttactga
gi|20 : cttaagctttgggtcatctgcctcctttatcctctctagcaggactctattgagaacctttaccggcactgacaggaacatactccctcggtagttgttacagtccctgatgcctccgttctttggcagtttgatgacgagtccctccttccactggactggtacatcttcattatcccaaatcttgctgacgaggctgtgttttccgtgtctgctttgatggcttctgctggtatgttgtccggccttgcagctttcccattcttaagtgttgcgatgaccaagtaattgcgatgaccttcctggatctctactttagattgtaggtcacagttaatgggtagctttggctggtggtatgtctggtggtgcttcaggggcagggcggttcaacaactcctgaagtgttcttcccatctcttcagctgtttctcggttgttgtcagtgggttgccatccttgtctataactggcttgtctgtctgctggaacttgcctgccagcttcttggttttcaggtataggtcctttaggttccattgacctactacatgttcagattaactggccaattcctcaatattgtctttcttgtccttcttgattttttgttgacttccctgtcagctgctgtatactcttcttttaatttggctttagctgctcttgttcggttcatgttcagtgtagctttcttctttttccttatctctattttctggatagtattagaaacC--GAAGT--AACAAA---G-TAT-G--TG----AAAC--TAAT-C-ATA-G--TC--A---AA-AAGA-CA--CAGTTA-A-CT-A-A-A--GAGT--G--C---TA
gi|34 : aaaatttcataatgtgtggagaacccaatctgattgtatagttaaaatggagcctT-CA-GG--TGC-C-AT--GGGTAGGA-GTA--GCA---TCCTCTTCTGCTGACC---------G----tagc
gi|19 : GC-T-AT--AG--AGGA-ATGA-GCA---TC---CCGTGACGACC---------GG---TC-ATA-CCAAGCG-----TGAGCCaa
gi|23 : TGACC---------GG---TC-ACAACCGC------TGTGAGCCCGTATTAGAAACAAA-GC-AAACG-GGGTT---TCCC-AT----CGTCAAATCTA-GTagataagatgtaaatgtttgttgaataatatttacttccaaatgaattatataagaatgaatcactgtttacgagtgcaaaatttgcgtgaaa
gi|6 : CATGAGCCCGTGGTGGAAACAAA-GT-AAACA-GAATT---ATCCCCT----CGTCAAATCTA-GTA--G-AAAAATG--A-CA--GT--CTAATAAAG-GGCA-----TGAGAC-----AAAT-CAGTCAACACATGACATAGTGGTAATTTGTAACCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACC-G----T-AAAATTTGCAAA-ATGGT-----------------TC-GT-TA-TAA-CTTTGGAACATCG-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AAAGTCCTCATACGC-GTGGCATG--CCTTGTGTA-TCGAA--ACAACTGGCAGACATG-AC-CACC-ACCAGG-AAACAAGA-------GTG------GT--ACA-TTAA--TACATAGAAATGA-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCGCG----CATA---TCA----T---------------GTT--TTCAG---TCTG-C---C-AGAAGA--G--T-C-GACATTAA-GTAAA----ATAT-CA---AA--ATATG-AAGC--A--GATATGT--CA-GATT--------CTGTGG-TG-TC-------CTTT--ATTTT---------GAGTT---CG-TC---AGG--ATA--T-A--T-CA-A----A--TAGA-TAT--A-----ATC---CTG-----AAAAT--T-AT-GATTGT
gi|13 : acctgcAATTTC-ACCCGAT----ACACAGCCCTA---------AAAATG--A-CA--GT--CTAACAAAG--GTA-----TGACAC-----AAAT-CAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACC-G----T-AGACTATGCGAA-ATGATTACTTTTAAACGA-GATC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA-----CTGTTG-TAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---TAGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTATGCCCCTTGCGTat
gi|24 : cgaaT---ACCCG-T----CGTCAAATCTA-GAA--C-GAAAACG--A-AAAAGT--CTAACGAAG-GGTA-----TGAAAC-----AAGT-CGGTCAACA
gi|10 : cAAATG--A-CA--GT--CTAACAAAG--GTA-----TGACAC-----AAAT-CAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACC-G----T-AGACTATGCGAA-ATGAT-ACTTTTAAACGA-GATC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA----CTTTTGGTTAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---TAGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTATGC-CCCTGCGTATTCGAATC--AACTGAGA-AT-CATACACACC-AT-AAA-CAG-GCGATA-----GTG------GT--ACG-TTGC--TACATGGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGACATCACG----TTTA---TCA----TATA-A-T-GT--A--GTT--GTCAG---TTTG-C---C-ATTAGA--G--T-C-AATAT
gi|25 : TTATAATCAC--AAAC-AATGT----CA--TT-ATAGTGACCGA----TCAGAA
gi|3 : GC--AAAC-CAAAT----CG--CT-ACAACAACC-A----T-ATAATTCGCGAA-ACACTG-CCCCAAAACGT-GACT--GC-CG-AAATCCCTGCAACAACACA-CTATCT-GCAAACC--GCCTG---C--CTCGATT---CAAACATAA-GTCTGCA---------------------CGCA-CCGA-TCAAG-CCGAGAGATACAAACACA---AC-AAG-CAA-GTGATG-----ATC------GG--ACA-TTGC--TACACAAATACCG-----AA---A-GCTGA-CA-AC-GTAAAAT--CCGAT-----A-CCGTCTTG----TCTG---TCA--------CA-AAGTCGA--GCC--GTCAG---T-TG-C---C---------G--C-C-AATGTTCA-ATGAA----ATAT-CC---AAGTAT--G-AAGC--AGAGAT-TG---AA-GACT--------CTGCAG-CACTC-------CTTCC-ACCTC---------CAGCC---CA-CT---GGG--ACA--C-A--C-CG-A----ATC--GA-CGC--A------------TG-------AACTA------A-----A-A---GACAA-AAC-G--T--CG-TCAAG-ATA---TCGATATGTCGAACTA--AAGGCCATCAG---ATATTT----------CTTCTTTT-CAT------GTAGGA----GCTTTT--GG-ACGAA----TTCTG--CCTC-TTAAGAATA--TGA----AA-ACAGGTC------TGCTAACAAA-G--------G-AGCA-CAA-T--CAGT-GCTCAT---------aactgttcagtatgaactatgaa
gi|43 : tgaatgttgttgattgaaattgaataaattagatccaagatttgatgccggcactgacgacaaatgtgggacatgtcaatgtaaagacaaagacatcaaatatttgttgtcttgcaaatcctaagcagaacacaaaaacaatagtttggcaaacccggacccccggacaaaccagaggtgggaccaggcgcgcaggaggagcaaacatccccgtagactggcctcatccgccctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccgCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--G
gi|9 : ATATAC-CACACCCAT-ATGACAGAAGTATA------TGCCGAACAT--ATACTTACCATACATAGAAAAGG-----AACACA-TTCGACCGTATTGCAAAGT--G-AATTAAAAATTCA-CACG----C-TA---TCAGCCCTATA-A-TAGT--ACGGTT--GTCAGCTCCCTG-C---CAATTAGGACG--TACAAATGATA---TACATAGAGTAT-CCCATAA-TAA-TGTAAGCAAA-AGATATGTTCTA-GATT--------CCGTAACTG-CT-------CCAC--ATATCATAACGCCAGAAAT---CT-ACGCAGGA--ATAGCT-ACCT-CACA----ATTTAGA-CAT--A-----AATCCCATGTGTGAAAAACT-T-AT-CATTCTTACATT-GATCATCAC-A-GTG-CATTCTA
gi|16 : ACACACC-AT-AAG-----------------TG------GT--ATA-TTAC--TACATA-AAAGGG-----AA---ACATTTA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TA-ATG-TAAT--G-------GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGA--G--T-C-AATATTAA-GTG---A-AATAT-CCA--AA-TA--TG-AAGC----AGATATGT--CAGGATT--------cacaactgctatatacctcatactgccctaaggtt
gi|1 : atctC-AT-ACG--GGCAGGATGATTATGTG------GTTTCTA-TTAC--TACATAGAAAGCGTTGATAC---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGCTGT-AAT-----AAACGTAACAGTACCTCGACTTCG----TATGGAGTTCT--A--GTCTGGTCAGAT-TCT--C---C-CTTAGA--GGTC-C-AATGTTAAGGTGAATGTGATACGCA---AA-TAT-TG-AAGtgaatacaaattgtattgcatttaattttaaaa
gi|18 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttga--T-AA------AGTCTTCACG----CTTA---TCA----TATA-A-TG-T--A--GTT--GTCAG---CCTG-C---C-ATTAGA--G--T-C-AATTTTAA-ATA---A-AATAT-CC---AA--AT----AAG---A-AGATATGtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|42 : ATCACG----TTTA---TCA----AATA-A-TG-T--A--GTT--GTCAG---Tgtgtatgtattttcattgccaatgtttttgcctttgatatcttatctttggtatgatagatattttctcatgcaataaatgtatgaat
gi|26 : T--GACAG---TCTAACAAAC-ATTAGA--T--T-C-AATATGAA-GTA---A-AATAT-CC---AACTA--TG-AAGC----AGATATGt
gi|15 : C---AA-TAT--G-AGAC--A----TCTGT--CA-GAT---------CTGTGG-T---C-------CTTT--AT-TC----------AGTT---CCGTC---GAG--AT---T-A--T-CG-A----CTG---A-CAT--A-----AT------G-----GAAAATAA-TT-AATTGTTA-TTT-AATAA--AC-ATAT--CG--CTA-TATA---CTAA-A-GTAAGG-TG--CAGGACA-C-GC--AG---------------TTATTGT-TATCC---C-TA--A----GTTTTT--GGAACAAAA---TTCTG--CTT---GGTGAA-A--TAA----AA-AT-AGTT------T-CCAA--------------A-GTCA-CAATT--TAGT-G
gi|32 : GG-TG-TC-------TTTT--AAATC---------GAGTT---CT-TT---GGG--ATA--T-A--TATA-A----ATATATA-TAT--A-----A
gi|1 : -TC-------CTTTTAATATC---------GAGTTTGTCT-TC---GGGTCCTAG-TGA--T-CA-GTACCATGTGAAGCATTTAGTCGTATTTG-ATA-----CAAATGATGATAGATTTGTA-ATTTGATAA-CACTA-ATTTCA-TCAACTATATAACCTATATGTAA--TTGTTAAGGACA-CGGCATAAGTTTGGTATATATCTTTTTTTTACATCCAGACGTTATAGAATGTCTCTGCGT-ACATAATGTTCCTGGTCTTTAATATTTATAACTAATCATAATATACGTCAAGTTTTGCCAAT-AACGTACAGGTTG-GGCATCAA-TAATAGTAGCCCATCTCACGTAGAGGCATA-ATTACCAAACGGTGGATTGTATCGT-GGGAAAGACCTCGGTGTCTCGCCAAGACTTACAT--AAATATTATGCTA-AAGAAAC-CAAGCA-TTGTCTTAGATTGAGTCATGCCCA--TCAGCTTGGTACATTTGTGTAGGC-ATTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGT
gi|14 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgcATAAGTAAGGTTT--AAGGGGA-CGGC--AATTGT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACA----GTTTTT--GA-AC-AAA---TTCTG--CTTC-GTATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAATAAA-G--------G-GGAA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGGAATAAC-AAT--------AGATTGT----TGG---AAGACTT-G--GTATC-------C-TATAT----ATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTAGTTCAG---TGTA--CTTGTGTGGGCAATagc
gi|17 : GTAAAA----GCTTTT---C-ACAAA----TTCTT--CCGG-GCACGAATA--TAG----AA-GCAGGTC------TGCTTAC-AA-A--------CTAGCA-CAA-T--TTGT-GCTCAT---------GAGAATTCCCTGG--------AGACTGT----T-GT--AAGACCC-G--AT--------AAC-CAAATACAAATGTTGT-CCATAAGGAACCCGAGTATTGCT
13 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGGTGAAGATAACGAACAGTAATACAAAATTAAGAGTTGCAATTAGGGAAAACATAACCCCTTTAATTTGGACATACCAGAGGTGGGATAAAGTGCTTAGGAGGAATAAGCGCCCATCGTGAGCCTCGCTTTCATCTCGATCAGGTAAACGTACTTAATGCGTAGCCAAAATCAGTTTACATGCAAAGAACTGCAAAACAAATAACATGATTAAGGTGGAATGCTACACCAG
Unaligned ( gi|21 ): TAAATTGACGAAGTTACAATGTGTTAAGACTGGATTCCAATGGTGCCAATATTTCACTAAGTTGAATAAAGGGCTGCATGGACTTCCGACACA
Unaligned ( gi|22 ): TGTTCGTTGAATAATATTTATTACCAAATGACTTATATTAGACTGAATCACTGTTTACGAATGCAAAACAATTACGTGAAATAAT
Unaligned ( gi|27 ): ACCACCCCTACAAACTAGTACAGTATAAAATGGCGAAGTAACAATGATATGAAACGTAATAC
Unaligned ( gi|28 ): TTTTTTTTTATTACTATTTATTGGAATACAAATAGGCGAAGGTAACATCGTTTTAA
Unaligned ( gi|30 ): ACAAATAGGCGAGAGGTACATCGTGGTTAAACGTAATATAATAAAAAAAACAT
Unaligned ( gi|31 ): ACAAATAGGCGAGAGGTACATCGTGGTTAAACGTAATATAATAAAAAAAACAT
Unaligned ( gi|33 ): GAAATACAAATAGGCAAAGGTACCATAGTGTTAAACGTAATAAT
Unaligned ( gi|35 ): TGTGTATAAAATGGCGAAGTAACAATAATGTATTAAACGTAAT
Unaligned ( gi|36 ): AAAAACAAATTGGTGAATGTAACATCGTGTTAAACGTAATC
Unaligned ( gi|37 ): TAAAAGCAAATAGGCGATGGTAACATCGTGTAAAACG
Unaligned ( gi|38 ): ATACAAATAGGCGAAGGTAGCATCGTGTNTAAAACAT
Unaligned ( gi|39 ): ATACAAACAGGCGAAGGTATCATCGTGTAAAACGTA
Alignments
lowQualScore : 11 222 2 333 1 1 111 1111 11 22222222 1111 1111111 22222222222 1 11111 111111111 111 1111111 11 11111111 222222 44444 11111 1111 11111 11111 1111 1111 11111 1 1111 11 11111111111 11111 11111 222222 22 111 333333333333 222222 11111 11 2222222222 111 111 22222222222222222222 111111 333333333333333333333333333 44444444444444 1111111111 222 111111 11 44444444444444444 111 1111 111 11111 1111 111111 22222222222222 333333333333333333333333333333333 3333333333 1 88888888888888 1 222 1 1 777777777 1 3333 111 1 1 222 222 11 2 22222 2 1
lowQualScore : 88 4 111 4 0 4 3 2 555 5 5 2 3 2 1 555 44 4444 2 2222 2 22 4 8 2 0 22 66 55 1 77 3 55 7777 33333333 1111 3 888 3 0000000 4 555 0 55 44444444444 4 66 0 5 888 00000 5 666666666 5 000 4 4444444 5 4 4 00 66 4 4 4 4 66 777 44444444 444444 0 4 11111 5 5 5 5 777 4 4 11111 4 1111 55 4 99 55 4 11111 4 5 11111 4 4 6 44 1 99 4 2222 55 4 3 4444 4 5 7777 5 5 5 66 5 5 5 1 5 11111 66 888 66 888 888 0 11 1 0 5 5 5 7 8 11 0000 1 00 5 66 5 11111111111 66 22222 66 2 22222 888 5 5 5 9999 666666 0 3 8888 777 8888 55 4 22 55 55 111 4 777 4 55 1 4 55 111111111111 8 777 111111 4 99999 2 77 5 6666 33 6 3333333333 000 66 000 99999999999999999999 77 5 5 111111 888888888888888888888888888 3 88888 8 77777777777777 5 6666666666 1 222 8 99 111111 1 11 8 66666666666666666 1 8 444 7 4444 000 6 88888 99 8888 99 4444 6 7 999999 33333333333333 6 6 99 6 999999999999999999999999999999999 9999999999 0 66666666666666 0 1 777 0 3 44 0 888888888 11 0 5 8888 888 7 5 5 111 111 88 0 3 66666 77 0 5 3
lowQualScore : .. . ... . . . . . ... . . . . . . ... .. .... . .... . .. . . . . .. .. .. . .. . .. .... ........ .... . ... . ....... . ... . .. ........... . .. . . ... ..... . ......... . ... . ....... . . . .. .. . . . . .. ... ........ ...... . . ..... . . . . ... . . ..... . .... .. . .. .. . ..... . . ..... . . . .. . .. . .... .. . . .... . . .... . . . .. . . . . . ..... .. ... .. ... ... . .. . . . . . . . .. .... . .. . .. . ........... .. ..... .. . ..... ... . . . .... ...... . . .... ... .... .. . .. .. .. ... . ... . .. . . .. ............ . ... ...... . ..... . .. . .... .. . .......... ... .. ... .................... .. . . ...... ........................... . ..... . .............. . .......... . ... . .. ...... . .. . ................. . . ... . .... ... . ..... .. .... .. .... . . ...... .............. . . .. . ................................. .......... . .............. . . ... . . .. . ......... .. . . .... ... . . . ... ... .. . . ..... .. . . .
lowQualScore : 00 0 555 0 0 0 0 5 000 0 0 5 2 5 4 222 66 5555 1 3333 1 88 0 8 0 4 88 88 55 7 77 1 22 4444 33333333 4444 6 222 3 8888888 0 444 9 55 99999999999 4 99 0 0 888 99999 0 444444444 0 000 4 4444444 0 4 4 66 11 4 4 4 4 11 888 55555555 000000 1 4 11111 0 0 0 0 888 4 4 11111 4 2222 55 0 55 55 4 11111 4 7 11111 4 4 5 55 6 55 0 5555 55 0 0 0000 4 7 9999 0 0 0 99 0 0 0 9 1 88888 11 888 99 888 888 0 22 4 4 7 7 7 9 0 66 8888 8 99 0 99 0 99999999999 99 55555 99 2 55555 888 0 0 0 0000 666666 1 4 5555 000 5555 55 0 33 55 00 444 0 000 0 55 4 0 33 666666666666 9 000 888888 0 88888 0 99 7 9999 66 6 6666666666 000 00 000 33333333333333333333 99 7 7 999999 000000000000000000000000000 3 88888 0 00000000000000 0 0000000000 0 000 0 00 888888 0 00 0 22222222222222222 0 0 000 5 2222 222 7 22222 22 8888 22 2222 7 8 222222 00000000000000 7 7 22 7 888888888888888888888888888888888 8888888888 0 00000000000000 0 0 000 0 2 55 0 333333333 33 7 0 3333 333 3 5 5 000 000 00 0 0 00000 00 0 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTATAT-CT--ATA----CAA-A-T--A-GGC--GA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAA-TC-ATA-G--T----C---AAA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAG--TG---CTAG----GGC-AA--CAC-GGA-CC---TCC-G---A-CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGG-AGTAA-GC-A-TCC--TCT---GCTG--------ACC-G----TCACACC-CGC-CC-CGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TAT--A-AT-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACATAATT---ATG-----AAAATTAT-AT-GATTGTTA-ATT-GAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTCTA---TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTN--TC---G-----ACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAG---NGTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
Reference ( family-8 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGATTGTCCTATGT-CT--ATA----CAA-A-A--A-GGC--GA-AGNT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAA-TC-ATA-G--T----C---AAA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAG--TG---CTAG----GGC-AA--CAC-GGA-CC---TCC-G---A-CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGG-AGTAA-GC-A-TCC--TCT---GCTG--------ACC-G----TCACACC-CGCGCC-CGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCNCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGAGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCGTCACG----CTTA---TCA----TAT--A-ATGGTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATNTC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATGTAGACATAATT---ATG-----AAAACTAT-AT-GATTNTTA-ATT-GAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTCNA---TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--ANTTT----------TTTNTTTT-CATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAACAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGT---TC---G-----ACT-ANAT--AAATATTAT-CTATAAGAAACCCGAGCA-TGCTCTTAGATTGAGTCATGCCCAGTTCAGCTTNGTACACTTGTGTGGGCAATTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGT
gi|1 : ATTGTTCTAT----T--ATAATATCAATA-ATTA-AGC--GA-AGGT-AA-A--TCGG--GCTTAAAAACGTAA-TC-ATA-A--T----TCA-AAA----AA-ACA---A-T---C---CACA-A-ATCGTG--TGCGTCTGG----GAC-AA--CACGGGA-CC---TCA-G---ATCAAAAACACCG---CGAA-AGTT-AGGACAT-------A-GGC-GC-CATATGG--TGG-ATGAG-GC-AGTCCCTTCT---GTT---------ACC-GCGGTTCACACC-----CC-CGTGA--CCGTAGTGAAAAT-AAA-GTTAAACGCGGATTTTAA-CCCG-TTCTAGAATCAAATCTACGTA--GAGAAAATGTGATCA--GTTACTAACATATATGTAG-ATCATAAAACCAACC-AAATTCAGTCAACATATGAA-TAGTGATACTTTGTAATCGCATAAACAAAGGTGGTACATCTT-ATAACGACCGTGATTAAAATTTGC--------TAAC------ATGA-GTA-TC--TT-GA-TA-----TACG--ATCG-A-TATTTTTGTTAGTAGTGTTGGATTCTACTCGCTTCTGTAAA---AA-ATCCGCAT
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgatt--CA-G---A---CG-A-G-ATCAAG--TG---CT----------AA--TGC-GGA-TT---TTT-T---A-CAGAA-----G---CGA---G-T-AGAAT-C-------tagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttgCATACGGG-CAG-GATG-ATTATGTGGTTTCTAT-----TAC--TACATAGAAAGCGTTGATAC---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGCTGT-AAT-----AAACGTAACAGTACCTCGACTTCG----TATGGA-GTTCTA--GTCTGGTCAGAT-TCT--C---C-CTTAGAGGTCCAATGT-TAAGGTGA-------ATGTGATACGCA---AA-TAT-TG-AAGctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttga-TCCTTTTAATATC---------GAGTTTGTCT-TC---GGGTCCTAGTGATCAGTACCA--TG--T-GA-AGCATTTAGTCGTATTTG--ATA-----CAAATGATGATAGATTTGTA-ATTTGAT-A--------------ACACTA-ATTTCATCAACTATATAACC-TATA-TG---TAA--TTGTTAAGGACA-CGGCATAAGTTTGGTATATATCTTTTTTTTACATCCAGACGTTATAGAATGTCTCTGCGTA-CATAATGTTCCTGGTCTTTAATATTTATAACTAATCATAATATACGTCAAGTTTTGCCAATAACGTACAGGTTGGGCATCAA-TAATAGTAGCCCATCTCACGTAGAGGCATAA-TTACC--AAACGGTGGATTGTATCGT-GGGAAAGACCTCGGTGTCTC---GCCAAGACTTACAT--AAATATTATGCTA-AAGAAACC-AAGCA-TTGTCTTAGATTGAGTCATGCCCA--TCAGCTTGGTACATTTGTGTAGGCA-TTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGTtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|10 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgcAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGAT-ACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA----CTTTTGGTTAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---TAGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TG-CCCCTGCGTATTCGAATCAA--CTGAGA-AT-CAT-ACACACCATA--AA-CAG-GC-G-AT-A-GTGGT--ACGT-----TGC--TACATGGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGACATCACG----TTTA---TCA----TAT--A-AT-GTA--GTT--GTCAG---TTTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-agc
gi|11 : TA----TAA-A-A--T-GGC--GA-AG-T-AACA--AAGT--A--TGAAAC-GTAA-TC-ATA-G--T----C---CAA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAG--TG----TAG----GGC-AA--CAC-GGA-CC---TTC-G---A-CGAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGT-GC-C--ATGG--AGG-AGTAA-GC-A-TCC--TCT---GCTG--------ACCGG----TCACACC-CG---C-CGTGAGCCTGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTAGTG-GAAAG--TGA-AAT-AT--CTAA
gi|13 : atagAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGATTACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA-----CTGTTG-TAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---TAGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TGCCCCTTGCGTtgcattccagatgaacttaaattacacaaaactgcatcgctgatacgaggcataataaatttactga
gi|14 : cgaaaatttcacccgatacacagccctaATA-AG---TAAGGTTT--AAGGGGA-CGGCA--ATTGT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTTTGA--A-CAAA-T---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGAA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-AAC-AATA-----GATTGT----TGG---AAGACT-TGGTA--TC----------CT-ATAT----ATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTAGTTCAG---TGT--ACTTGTGTGGGCAAT
gi|15 : C---AA-TAT--G-AGAC--A----TCTGT--CA-GAT-CTGTGG-T---CCTTT--AT-TC----------AGTT---CCGTC---GAG--------AT----------TA--T-CG-A--CTG---ACATAATG-----G-----AAAATAAT--T-AATTGTTA-TTT-AAT-A--------------A-AC-ATAT--CG-CTA---TATA-CT-AA-A--G---TAAGGT-G--CAGGACA-CG-CA--G---------------TTATTGT-TATCC---C-TAA--G----TTTTTGG--AACAAAAT---TCTG--CTTGG---TGAA-A--TAA----AA-ATA-GTT------T-CCAA----------A---GTCA-CAATT--TAGT-G
gi|16 : -ACACACCATA--AG----------------TGGT--ATAT-----TAC--TACATA-AAAGGG-----AA---ACATTTA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TC------AT--A-AT-GTA--ATG--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-TAA-GTG-----------AAATAT-CC---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CAGGATT
gi|17 : atctGTAAAAG----CTTTT-C--A-CAAA-T---TCTT--CCGGG-CACGAATA--TAG----AA-GCAGGTC------TGCTTACAA-----ACT---AGCA-CAA-T--TTGT-GCTCAT---------GAG---AATT-CCC-TGGA-----GACTGT----T-GT--AAGACC-CGAT--------A-----ACC-AAATACAAATGTTGT-CCATAAGGAACCCGAGTATTGCTtgaatacaaattgtattgcatttaattttaaaa
gi|18 : tcgaacccaaggccacatat-----AGTCTTCACG----CTTA---TCA----TAT--A-ATG-TA--GTT--GTCAG---CCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATTT-TAA-AT---------A--AAATAT-CC---AA--AT----AAG---A-AGATATGtcagtgatca
gi|19 : taa-GC-T--ATAG--AGG-AATGA-GC-A-TCC--CGT---GACG--------ACCGG----TCATA-C-CAAG---CGTGAGCCgtgtatgtattttcattgccaatgtttttgcctttgatatcttatctttggtatgatagatattttctcatgcaataaatgtatgaat
gi|2 : TGAAT--TGATGATTG---TCAAGAAAGTTGGTGTTCTAGCCTTAACGCAGCTTGCACTGA-GA-AGATTCGGGATTGTCCCATAT-CT--ATA----CAA-A-A--AAGGC--GA-AGTT-AACA--TTGT--G--TCAAACCGTAA-TC-ATA-A--T----C---AAA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAG--TG---CTAG----GGC-AA--CAC-GGATCC---TCC-G---A-CAAAA-----G---CGAA-AG-TGAGGAT-C-------A-AGT-GC-C--ATGG--AGG-AGTAA-GC-A-TCT--TCT---GCTG--------ACC-G----TCACACCGCGCGCCTCGTGAGCCCTTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAACG-GAATT---A-CCCGGTA-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AGAGGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGTGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCA----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TTCAGT-TA-TAA-CCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCGCAT-CGC-ATAGCA-TG-TC-TTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAGCGG-G-AT-A-GTGGT--ATAT-----TAC--TACATAGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-TG-ATTGCAAAGT--T-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TAT--ACATAATA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTAA-------AT-AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTATGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATGTGGACATAATT---ATG-----GAAATTAT-AT-GATTGTTA-ATT-GAT-A--------------ACAC-A-AT--CATCTAT--TATA-CC-AATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTCTGT--A-CAAAAT---TCTG--CTTCA-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAAT-A-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACCTTACG-----GATTGT----T-G---AAGACC-TGGTC--TCAAAG-----ACC-ACATA-AAATATTAT-CTATGAGAAACTCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTACTTCAG---AGTAT-CTTGTGTGGACAATCA-GAG-TG---TTTC---ATAAC--CAAAATATGTGTACTGTTCCC-----ACTACAGCTAGAAATTCGTATT-TTCGGGTagataagatgtaaatgtttgttgaataatatttacttccaaatgaattatataagaatgaatcactgtttacgagtgcaaaatttgcgtgaaa
gi|20 : agtttaaaagcccgggttacctggctatagacagC--GA-AG-T-AACA--AAGTATG--TGAAAC--TAA-TC-ATA-G--T----C---AAA----AAGACA--CAGTTA-A---CT-A-A-A--GAG--TG---CTAg
gi|23 : aaaatttcataatgtgtggagaacccaatctgattgtatagttaaaatggagcctTG--------ACC-GG---TCACAAC-CGC----TGTGAGCCCGTATTAGAAAC-AAA-G-CAAACG-GGGTT---T-CCCA-TC-----GTCAAATCTA-GTtagc
gi|24 : T---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GAA--C-GAAAA--CGA-AAAAGT--CTAACG-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAG-TCGGTCAACA
gi|25 : cTTATAATCAC--AAAC-AATGT----CA--TT-ATAGTGACCGAT--CAGAA
gi|26 : T--GACAG---TCTAACAAAC-ATTAGAT--TCAATAT-GAA-GT---------A--AAATAT-CC---AACTA--TG-AAGC----AGATATGaactgttcagtatgaactatgaa
gi|28 : --ATA----CAA-A-T--A-GGC--GA-AGGT-AACA--TCGT--T--TTAA
gi|29 : tttttttttattactatttattggaTCCTATATATT--ATA----CAA-A-T--A-GGC--GA-AGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|3 : attgttatTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGA------CATGT-CA--ATG----T---A-A--A-GAC--AA-AG----ACA--TC---------AAA---TAT-TT-GTT-G--TCTTGC---AAATCCTAA-GCAG-AA-C---A---CA-A-A-AACAA---------TAGTTT-GGCAAA--CCC-GGA-CC---CCCGG---A-C-AAA-----C---CAGA-GG-T-GGGAC-C-------A-GGC-GCGC--A-GG--AGG-AGCAA-AC-A-TCC---CC---GTAG--------ACTGG----CCTCATC-CGCgt
gi|3 : GC--AAAC-CAAAT----CG--CT-ACAACAACCA----TATAATTCGCGAA-ACACTG-CCCCAAAACGT-G-A-CT--GC-CG-AAATCCCTGCAACAACACA-CTATCT-GCAAACC--GCCTG---C--CTCGATT---CAAACATAA-GTCTGCA----------------------CGCAC-CGA-TCAAG-CCGAGAGATACAA-ACACA--ACA--AG-CAA-GT-G-AT-G-ATCGG--ACAT-----TGC--TACACAAATACCG-----AA---A-GCTGA-CA-AC-GTAAAAT--CCGAT-----A-CCGTCTTG----TCTG---TCA----CAA--A-GTCG-A--GCC--GTCAG---T-TG-C---C-------G--CCAATGT-TCA-ATGA-------A--A--TAT-CC---AAGTAT--G-AAGC--AGAGAT-TG---AA-GACTCTGCAG-CACTCCTTCC-ACCTC---------CAGCC---CA-CT---GGG--------AC-------A--CA--C-CG-A--ATC--GACGCA-------TG-----AA--CTA------A-----A-A---GAC-A--------------AAAC-G--T--CGTCAA---GATA-TC-GATA-TG---TCGAACTA--AAGGCCATCAG-A--TATTT----------CTTCTTTT-CAT------GTAGGAG----CTTTTGG--A-CGAA-T---TCTG--CCTCT-TAAGAATA--TGA----AA-ACAGGTC------TGCTAACAA-----AGG---AGCA-CAA-T--CAGT-GCTCAT---------cctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccggcaaaccaaatcgctacaacaaccatataattcgcgaaacactgccccaaaacgtgactgccgaaatccctgcaacaacacactatctgcaaaccgcctgcctcgattcaaacataagtctgcacgcaccgatcaagccgagagatacaaacacaacaagcaagtgatgatcggacattgctacacaaataccgaaagctgacaacgtaaaatccgataccgtcttgtctgtcacaaagtcgagccgtcagttgccgccaatgttcaatgaaatatccaagtatgaagcagagattgaagactctgcagcactccttccacctccagcccactgggacacaccgaatcgacgcatgaactaaaagacaaaacgtcgtcaagatatcgatatgtcgaactaaaggccatcagatatttcttcttttcatgtaggagcttttggacgaattctgcctcttaagaatatgaaaacaggtctgctaacaaaggagcacaatcagtgctcat
gi|30 : tgaatgttgttgattgaaattgaataaattagatccaagatttgatgccggcactgacgacaaatgtgggacatgtcaatgtaaagacaaagacatcaaatatttgttgtcttgcaaatcctaagcagaacacaaaaacaatagtttggcaaacccggacccccggacaaaccagaggtgggaccaggcgcgcaggaggagcaaacatccccgtagactggcctcatccgccctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccgA----CAA-A-T--A-GGC--GAGAGGT-A-CA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAA-T--ATA-A--T--------AAA----AA-AAA--CA-T---
gi|31 : A----CAA-A-T--A-GGC--GAGAGGT-A-CA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAA-T--ATA-A--T--------AAA----AA-AAA--CA-T---
gi|32 : GG-TG-TCTTTT--AAATC---------GAGTT---CT-TT---GGG--------AT-------A--TA--TATA-A--ATATATATATAA
gi|33 : --ATA----CAA-A-T--A-GGC--AA-AGGT-ACCA--TAGT--G--TTAAA-CGTAA-TA-AT
gi|34 : gaaT-C-------A-GGT-GC-C--ATGGGTAGG-AGTA--GC-A-TCC--TCTTCTGCTG--------ACC-G----
gi|36 : A----CAA-A-T--T-GGT--GA-ATGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAA-TC-aa
gi|37 : aaaa----CAA-A-T--A-GGC--GA-TGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|38 : taaaag--ATA----CAA-A-T--A-GGC--GA-AGGT-AGCA--TCGT--GTNTAAAACg
gi|39 : --ATA----CAA-A-C--A-GGC--GA-AGGT-ATCA--TCGT--G--TAAAA-CGTAat
gi|4 : A----CAA-A-T--A-GGC--GA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAAAC-GTAA-TC-ATA-A--T----CC--AGA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAG--TG---TT-G----GGC-A
gi|40 : cttaagctttgggtcatctgcctcctttatcctctctagcaggactctattgagaacctttaccggcactgacaggaacatactccctcggtagttgttacagtccctgatgcctccgttctttggcagtttgatgacgagtccctccttccactggactggtacatcttcattatcccaaatcttgctgacgaggctgtgttttccgtgtctgctttgatggcttctgctggtatgttgtccggccttgcagctttcccattcttaagtgttgcgatgaccaagtaattgcgatgaccttcctggatctctactttagattgtaggtcacagttaatgggtagctttggctggtggtatgtctggtggtgcttcaggggcagggcggttcaacaactcctgaagtgttcttcccatctcttcagctgtttctcggttgttgtcagtgggttgccatccttgtctataactggcttgtctgtctgctggaacttgcctgccagcttcttggttttcaggtataggtcctttaggttccattgacctactacatgttcagattaactggccaattcctcaatattgtctttcttgtccttcttgattttttgttgacttccctgtcagctgctgtatactcttcttttaatttggctttagctgctcttgttcggttcatgttcagtgtagctttcttctttttccttatctctattttctggatagtattagaa--ATA----CAA-A-T--A-GGC--GA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAA
gi|41 : a--ATA----CAA-A-T--A-GGC--GA-AGGT-AACA--TCGT--G--TCAAACtca
gi|42 : TCACG----TTTA---TCA----AAT--A-ATG-TA--GTT--GTCAG---Tg
gi|43 : aCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--Gt
gi|5 : T--AT-----CAA-AGA--A-GGCACGA-AGTTCAACA--TTGT--G--TCAAACCGTAATTC-ATATA--T----CACAAAA----AA-ACAACTA-TGGCA---CA-ACACATCGAGCTCGAC-CTAGCAACGAC-AACCCACTGAA-CCCATTCC-AAGTA-CAAAA-----AAGCCGAACGG-T-TAGAT-TGTCAGCAA-GGCTGC-CG-ATGG--AGGCCATAACGCAA-TCC--TC----ACTGGCCAATGAACC-GGT--CCACACC-CGCA---CGTGAGCCCGTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAATG-ATATT---A-CCCG-TA-----GTCACATGAA-GTG--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGTCTTATTGATACTTTGTAATCGC--AAAC-A--GT----CA--TTGATA--GACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGAC-TTCAAACGA-G-ATTC--GA-TA-TAA-CCTTGCAACTTCA-A-CTTTATTGTTAGTA--GGTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA--TCCGCATACAC-ATATCA-TA-CTCTTGCGTAT-CGGATC--AACTGCGAGATATAC-ACAC-CC-TA--AG-CAG-GT-G-AT-A-GTTGT--ATAT-----TAC--TAAATAGAAAGGG-----AA---A-TTTGA-CG-ATTGCAAAGA--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TAT--A-AT-GTA--ATT--GTCAG---TCTG-C---C-ATCAGAG--TCAATTT-TAG---GA-------A--AAATATGCG---AA-TA--TG-AAAC----AGATTTGT--CA-GATTTTAT
gi|6 : gaatC-CATGAGCCCGTGGTGGAAAC-AAA-G-TAAACA-GAATT---ATCCCC-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAATA-A-----AG-GGCATGAGA-----C-AAA-TCAGTCAACACATGACATAGTGGTAATTTGTAACCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAAAATTTGCAAA-ATGGT------------------TC--GT-TA-TAA-CTTTGGAACATCG-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AAAGTCCTCATACGC-GTGGCA-TG-CC-TTGTGTAT-CGAA--ACAACTGGCAGACATG--AC-CACCACC--AG-GAA-AC-A-AG-A-GTGGT--ACAT-----TAA--TACATAGAAATGA-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCGCG----CATA---TCA----T--------------GTT--TTCAG---TCTG-C---C-AGAAGAG--TCGACAT-TAA-GT---------A--AAATAT-CA---AAATAT--G-AAGC--A--GATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATTTT---------GAGTT---CG-TC---AGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--A--TAGATATAATC---CTG-----AAAAT--T-AT-GATTGTttatctatgtatctatctatctttatctgttttctatgtacatcaatgtggaat
gi|7 : acctgGATTTTTTTCTCT-CTGCATC----TAA-A-A--T-GGC--GA-AG-T-AACA--ATGT--A--TTAAAC-GTAA-TC-ATA-GACC----C---AAA----CA-ACA--CA-T---A---CA-A-----------TG----TAG----GGC-AA--CTC-GGA-CC---TCC-A---A-CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GAT-GT-C--ATGG--AGG-AGTAA-GC-A-TCG--TCT---GCTG--------ACC-GG---TCACACC-CGC----CGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAAAG-TAAACG-AGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-GACAA--AAA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAGG-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTGATGGTAATTTGTAATCGC--AAAC-AAAGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTat
gi|8 : atgtgacattctttcagattgtacatgctgtcaggagatagaaaatggttcccaccagccatgtacctcaagttaattgactgatctacactaattgagtgtttcagtggtgtgataggaggttatgatattagactTA----TAA-A-A--T-GGC--GA-AGTT-ACCAAAT-GT--G--TTAAAC-ATAA-TTTATA-G--T----C---CAAT---AA-AT---CA-T---AGAATA-A-A-GTCGAG--TG----TAG----GGC-AA--CAC-GGA-CC---TCC-G---A-CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------ACGGT-GC-C--ATGG--AGG-ATTAA-GC-A-TCC--TCT---GCCA--------CCC-G----TCATACC-CAC-C----TGAGCTT-TAGTC--AACAAAA-G-TAAACG-GGA-T---A-TC---TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-AAAAA--TTA-CT--TT--CTAACA-A-----AG-GATATGAAA-----CAAAA-ACAGCCAACATGTGAC--A--------TTGTAATTGCA-AAAA-AAAGTC---CA--AT-ATAATGACCG----TAGAATTTGTGAAGATGATGACTGTTAAACGAGG-A-TG--GTGCATTAA-CCCTGTCACAACA-AGC--GTATGTTACTA--GAGGG---T--CACGCTT---TAAA---AATGTCTCCATACGCAATGGCATTG-CCCTTG
gi|9 : ATATACCACAC-CCATA--TGACAG-AA-GTAT-ATGCCGA--ACATATACTTACCATACATAGAAAAGG-----AACACA-TTCGACCGTATTGCAAAGT--G-AATTAAAAATTCA-CACG----C-TA---TCAGCCCTAT--A-ATAGTACGGTT--GTCAGCTCCCTG-C---CAATTAG------GACGTACAA-ATGATATACATA--GAGTAT-CCCATAA-TAA-TGTAAGCAAA-AGATATGTTCTA-GATTCCGTAACTG-CTCCAC--ATATCATAACGCCAGAAAT---CT-ACGCAGGA--------AT-------AGCTACCT-CACA--ATTTAGACATAAATCCCATGTGTGAAAAACT-T-AT-CATTCTTACATT-GATCATCACAGTGCATTCTACAC-A-AC--TG-CTA---TATA-CCTCATACTGCCCTAAGGTTt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGGTGAAGATAACGAACAGTAATACAAAATTAAGAGTTGCAATTAGGGAAAACATAACCCCTTTAATTTGGACATACCAGAGGTGGGATAAAGTGCTTAGGAGGAATAAGCGCCCATCGTGAGCCTCGCTTTCATCTCGATCAGGTAAACGTACTTAATGCGTAGCCAAAATCAGTTTACATGCAAAGAACTGCAAAACAAATAACATGATTAAGGTGGAATGCTACACCAG
Unaligned ( gi|21 ): TAAATTGACGAAGTTACAATGTGTTAAGACTGGATTCCAATGGTGCCAATATTTCACTAAGTTGAATAAAGGGCTGCATGGACTTCCGACACA
Unaligned ( gi|22 ): TGTTCGTTGAATAATATTTATTACCAAATGACTTATATTAGACTGAATCACTGTTTACGAATGCAAAACAATTACGTGAAATAAT
Unaligned ( gi|27 ): ACCACCCCTACAAACTAGTACAGTATAAAATGGCGAAGTAACAATGATATGAAACGTAATAC
Unaligned ( gi|35 ): TGTGTATAAAATGGCGAAGTAACAATAATGTATTAAACGTAAT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 222 1 1 111 11 11111111111 1111 1111111 22222222222 1 111 111111111 1111111 11 33333333333333 222222222 1 11111 1111 11111 11111 1111 1111 11111 1111 11 11111111111 11111 11111 222222 111 333333333333 222222 2222 11 2222222222 111 111 22222222222222222222 111111 333333333333333333333333333 44444444444444 22222222222222 111111 11 44444444444444444 111 1111 111 11111 1111 111111 22222222222222 333333333333333333333333333333333 3333333333 1 55555555555 1 11 1 1 555555555 2 2222 111 1 1 222 222 11 1 22222 1 1
lowQualScore : 88 1 111 1 5 1 1 1 111 5 5 1 3 8 6 000 22 22 7777 4 3 2 22 66 55 1 66 888 7777 88888888888 1111 3 888 3 0000000 4 555 0 55 44444444444 4 66 0 5 888 5 333 666666666 5 666 4 4444444 5 4 4 00 66 4 4 8 66 777 44444444444444 4 111111111 0 5 5 777 4 4 11111 4 1111 55 4 99 55 4 11111 4 5 11111 4 4 6 44 1 99 4 2222 55 4 3 4444 4 5 7777 5 5 5 66 5 5 5 1 5 11111 66 888 66 888 5 888 5 22 1 0 5 5 88 0 8 11 0000 1 00 5 66 5 11111111111 66 22222 66 2 22222 888 5 5 5 9999 666666 0 8888 777 8888 0 777777777 55 55 111 4 777 4 55 1 4 55 111111111111 8 777 111111 4 3333 2 77 5 6666 33 5 3333333333 000 66 000 99999999999999999999 77 5 5 000000 888888888888888888888888888 2 8 8 8 77777777777777 5 00000000000000 8 8 99 111111 1 11 8 55555555555555555 1 8 444 7 4444 000 6 88888 99 8888 99 4444 6 7 999999 00000000000000 6 6 99 6 999999999999999999999999999999999 9999999999 0 99999999999 0 0 33 3 0 3 2 0 333333333 6 7 4444 888 7 5 5 111 111 88 5 1 66666 22 5 5 1
lowQualScore : .. . ... . . . . . ... . . . . . . ... .. .. .... . . . .. .. .. . .. ... .... ........... .... . ... . ....... . ... . .. ........... . .. . . ... . ... ......... . ... . ....... . . . .. .. . . . .. ... .............. . ......... . . . ... . . ..... . .... .. . .. .. . ..... . . ..... . . . .. . .. . .... .. . . .... . . .... . . . .. . . . . . ..... .. ... .. ... . ... . .. . . . . .. . . .. .... . .. . .. . ........... .. ..... .. . ..... ... . . . .... ...... . .... ... .... . ......... .. .. ... . ... . .. . . .. ............ . ... ...... . .... . .. . .... .. . .......... ... .. ... .................... .. . . ...... ........................... . . . . .............. . .............. . . .. ...... . .. . ................. . . ... . .... ... . ..... .. .... .. .... . . ...... .............. . . .. . ................................. .......... . ........... . . .. . . . . . ......... . . .... ... . . . ... ... .. . . ..... .. . . .
lowQualScore : 00 0 555 0 5 0 0 0 000 0 0 0 2 2 7 666 99 44 8888 0 8 0 88 88 55 7 99 222 4444 66666666666 4444 6 222 3 8888888 0 444 9 55 99999999999 4 99 0 0 888 0 888 444444444 0 666 4 4444444 0 4 4 66 11 4 4 9 11 888 55555555555555 4 555555555 0 0 0 888 4 4 11111 4 2222 55 0 55 55 4 11111 4 7 11111 4 4 5 55 6 55 0 5555 55 0 0 0000 4 7 9999 0 0 0 99 0 0 0 9 1 88888 11 888 99 888 0 888 0 88 4 4 7 7 77 7 0 66 8888 4 99 0 99 0 99999999999 99 55555 99 2 55555 888 0 0 0 0000 666666 1 5555 000 5555 9 999999999 55 00 444 0 000 0 55 4 0 33 666666666666 9 000 888888 0 3333 0 99 7 9999 66 1 6666666666 000 00 000 33333333333333333333 99 7 7 333333 777777777777777777777777777 5 0 0 0 00000000000000 0 00000000000000 0 0 00 888888 0 00 0 66666666666666666 0 0 000 5 2222 222 7 22222 22 8888 22 2222 7 8 222222 88888888888888 7 7 22 7 888888888888888888888888888888888 8888888888 0 22222222222 0 2 22 2 0 2 5 0 333333333 7 3 3333 333 3 5 5 000 000 00 5 0 00000 00 5 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T----C--A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGC-AAC--AC-GGA-CC---TCC-GA---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTGACCG--------G----TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAAG-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-G-TA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACATAATT---ATG-----AAAAT-AT-AT-GATTGTTA-ATT-GAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC--G----GACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
Reference ( family-8 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T----C--A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGC-AAC--AC-GGA-CC---TCC-GA---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTGACC---------G----TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAAG-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-G-TA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACATAATT---ATG-----AAAATTAT-AT-GATTGTTA-ATT-GAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTNTC-------GACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGN---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
gi|1 : ATTGTTCTATTAT-AATATCAATAATTA-AG----CGA-AGGT-AA-A--TCGG--GCTTAAAAACGTAAT-C-ATA-A--T----TCAA---AA----AA-ACA---A-T---C---CACA-A-ATCGTGT--GCGTCTGG----GAC-AAC--ACGGGA-CC---TCA-GAT--CAAAAACACCG---CGAA-AGTT-AGGACAT-------A-GGC-GC-CATATGG--TGGA-TGAG-GCAGTCCCTTCT---GTT-ACC---------GCGGTTC-ACAC------CCCCGTGA--CCGTAGTGAAAAT-AAAGTTAAACGCGGATTTTAA-CCCG-TTCTAGAATCAAATCTACGTA--GAGAAAATGTGATCA--GTTACTAACATATATGTAG-ATCATAAAACCAACC-AAATTCAGTCAACATATGAA-TAGTGATACTTTGTAATCGCATAAACAAAGGTGGTACATCTT-ATAACGACCGTGATTAAAATTTGC--------TAAC------ATGA-GTA-TC--TT-GA-TA-----TACG--ATCG-A-TATTTTTGTTAGTAGTGTTGGATTCTACTCGCTTCTGT-AAA---AA-ATCCGCAT
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgatt--CA-G---A---CG-A-G-ATCAAGT--G---CT----------AAT--GC-GGA-TT---TTT-TA---CAGAA-----G---CGA---G-T-AGAAT-C-------tagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttgCATACGGG-CAG-GATG-ATTATGTGGTTTCTAT-----TAC--TACATAGAAAGCGTTGATAC---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGCTGT-AAT-----AAACGTAACAGTACCTCGACTTCG----TATG-GAGTT-C-TA--GTCTGGTCAGAT-TCT--C---C-CTTAGAGGTCCAATGT-TAAGGTGA-------ATGTGATACGCA---AA-TAT-TG-AAGctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttga-TCCTTTTAATATC---------GAGTTTGTCT-TC---GGGTCCTAGTGATCAGTACCA--TG--T-GA-AGCATTTAGTCGTATTTG--ATA-----CAAATGATGATAGATTTGTA-ATTTGAT-A--------------ACACTA-ATTTCATCAACTA-TATAACC-TATA-TG---TAA--TTGTTAAGGACA-CGGCATAAGTTTGGTATATATCTTTTTTTTACATCCAGACGTTATAGAATGTCTCTGCGTA-CATAATGTTCCTGGTCTTTAATATTTATAACTAATCATAATATACGTCAAGTTTTGCCAATAACGTACAGGTTGGGCATCAA-TAATAGTAGCCCATCTCACGTAGAGGCATAA-TTACC--AAACGGTGGATTGTATCGT-GGGAAAGACCTCGGTGTCTCGCCAAGACTTACATA-AA-TATTATGCTA-AAGAAACC-AAGCA-TTGTCTTAGATTGAGTCATGCCCA-T-CAGCTTGGTACATTTGTGTAGGCA-TTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGTtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|10 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgcAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGAT-ACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA----CTTTTGGTTAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TG-CCCCTGCGTATTCGAATCAA--CTGAGA-AT-CAT-ACACACCATA--AA-CAG-GC-G-AT-A-GTGGT--ACGT-----TGC--TACATGGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGACATCACG----TTTA---TCA----TATA-A---T-G-TA--GTT--GTCAG---TTTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-agc
gi|11 : -TAT--A-AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--AAGT--A--TGAAAC-GTAAT-C-ATA-G--T----C--C---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TAG----GGC-AAC--AC-GGA-CC---TTC-GA---CGAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTGACCG--------G----TC-ACACC---CG--CCGTGAGCCTGTAGTCGAAAC-AAAG-TAAACG-GGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTAGTG-GAAAG--TGA-AAT-AT--CTAA
gi|13 : atagAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGATTACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA-----CTGTTG-TAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TGCCCCTTGCGTtgcattccagatgaacttaaattacacaaaactgcatcgctgatacgaggcataataaatttactga
gi|14 : cgaaaatttcacccgatacacagccctaATA-AG---TAAGGTTT--AAGGGGA-CGGCA--ATTGT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTTTGA--A-CAAA-T---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGAA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-AAC-AATA-----GATTGT----TGG---AAGACT-TGGTATC---------CT-ATAT----ATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTAGTTCAGT---GT--ACTTGTGTGGGCAAT
gi|15 : C---AA-TAT--G-AGAC--A----TCTGT--CA-GAT-CTGTGG-T---CCTTT--AT-TC----------AGTT---CCGTC---GAG--------AT----------TA--T-CG-A--CT---GACATAATG-----G-----AAAATAAT--T-AATTGTTA-TTT-AAT-A--------------A-AC-ATAT--CG-C---TA-TATA-CT-AA-A--G---TAAGGT-G--CAGGACA-CG-CA--G---------------TTATTGT-TATCC---C-TAA--G----TTTTTGG--AACAAAAT---TCTG--CTTGG---TGAA-A--TAA----AA-ATA-GTT------T-CCAA----------A---GTCA-CAATT--TAGT-G
gi|16 : -ACACACCATA--AG----------------TGGT--ATAT-----TAC--TACATA-AAAGGG-----AA---ACATTTA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TA---A---T-G-TA--ATG--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-TAA-GTG-----------AAATAT-CC---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CAGGATT
gi|17 : atctGTAAAAG----CTTTT-C--A-CAAA-T---TCTT--CCGGG-CACGAATA--TAG----AA-GCAGGTC------TGCTTACAA-----ACT---AGCA-CAA-T--TTGT-GCTCAT---------GAG---AATT-CCC-TGGA-----GACTGT----T-GT--AAGACC-CGATA----------ACC-AAATACAAATGTTGT-CCATAAGGAACCCGAGTATTGCTtgaatacaaattgtattgcatttaattttaaaa
gi|18 : tcgaacccaaggccacatat-----AGTCTTCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-G-TA--GTT--GTCAG---CCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATTT-TAA-AT---------A--AAATAT-CC---AA--AT----AAG---A-AGATATGtcagtgatca
gi|19 : taa-GC-T--ATAG--AGGA-ATGA-GCA-TCC--CGT---GACGACCG--------G----TC-ATACCA--AG---CGTGAGCCgtgtatgtattttcattgccaatgtttttgcctttgatatcttatctttggtatgatagatattttctcatgcaataaatgtatgaat
gi|2 : TGAAT--TGATGATTG---TCAAGAAAGTTGGTGTTCTAGCCTTAACGCAGCTTGCACTGA-GA-AGATTCGGGATTGTCCCAT-AT-C-TAT--ACAAAAAAGG----CGA-AGTT-AACA--TTGT--G--TCAAACCGTAAT-C-ATA-A--T----C--A---AA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGC-AAC--AC-GGATCC---TCC-GA---CAAAA-----G---CGAA-AG-TGAGGAT-C-------A-AGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCT--TCT---GCTGACC---------G----TC-ACACCGCGCGCCTCGTGAGCCCTTAGTCGAAAT-AAAG-TAAACG-GAATT---A-CCCGGTA-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AGAGGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGTGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCA----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TTCAGT-TA-TAA-CCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCAT-CGC-ATAGCA-TG-TC-TTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAGCGG-G-AT-A-GTGGT--ATAT-----TAC--TACATAGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-TG-ATTGCAAAGT--T-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATACA---T-AATA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTAA-------AT-AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTATGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATGTGGACATAATT---ATG-----GAAATTAT-AT-GATTGTTA-ATT-GAT-A--------------ACAC-A-AT--CATC---TATTATA-CC-AATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTCTGT--A-CAAAAT---TCTG--CTTCA-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAAT-A-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACCTTACG-----GATTGT----T-G---AAGACC-TGGTCTCAAA----GACC-ACATA-AAATATTAT-CTATGAGAAACTCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTACTTCAGA---GTAT-CTTGTGTGGACAATCA-GAG-TG---TTTC---ATAAC--CAAAATATGTGTACTGTTCCC-----ACTACAGCTAGAAATTCGTATT-TTCGGGTagataagatgtaaatgtttgttgaataatatttacttccaaatgaattatataagaatgaatcactgtttacgagtgcaaaatttgcgtgaaa
gi|20 : agtttaaaagcccgggttacctggctatagacagGATTGT---AT-AG-T-TA-----AAATG-GAGCCTCGA-AG-T-AACA--AAGTATG--TGAAAC--TAAT-C-ATA-G--T----C--A---AA----AAGACA--CAGTTA-A---CT-A-A-A--GAGT--G---CTAg
gi|23 : aaaatttcataatgtgtggagaacccaatctTGACC---------GG---TC-ACAAC---CGCT--GTGAGCCCGTATTAGAAAC-AAAG-CAAACG-GGGTT---T-CCCA-TC-----GTCAAATCTA-GTtagc
gi|24 : T---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GAA--C-GAAAA--CGA-AAAAGT--CTAACG-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAG-TCGGTCAACA
gi|25 : cTTATAATCAC--AAAC-AATGT----CA--TT-ATAGTGACCGAT--CAGAA
gi|26 : T--GACAG---TCTAACAAAC-ATTAGAT--TCAATAT-GAA-GT---------A--AAATAT-CC---AACTA--TG-AAGC----AGATATGaactgttcagtatgaactatgaa
gi|28 : AT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--T--TTAA
gi|29 : tttttttttattactatttattggaTCCTAT-ATAT-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|3 : attgttatTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGA------CAT-GT-C-AAT--GTAA--A-GA----CAA-AG----ACA--TC---------AAA---TATT-T-GTT-G--TCTTGC--A---AATCCTAA-GCAG-AA-C---A---CA-A-A-AACAA---------TAGTTT-GGCAAAC--CC-GGA-CC---CCCGGA---C-AAA-----C---CAGA-GG-T-GGGAC-C-------A-GGC-GCGC--A-GG--AGGA-GCAA-ACA-TCC---CC---GTAGACTG--------G----CC-TCATC---CGCCCTGgt
gi|3 : GC--AAAC-CAAAT----CG--CT-ACAACAACCA----TATAATTCGCGAA-ACACTG-CCCCAAAACGT-G-A-CT--GC-CG-AAATCCCTGCAACAACACA-CTATCT-GCAAACC--GCCTG---C--CTCGATT---C-AAACATAA-GTCTGCA----------------------CGCAC-CGA-TCAAG-CCGAGAGATACAA-ACACA--ACA--AG-CAA-GT-G-AT-G-ATCGG--ACAT-----TGC--TACACAAATACCG-----AA---A-GCTGA-CA-AC-GTAAAAT--CCGAT-----A-CCGTCTTG----TCTG---TCA----CAAA-G---T-C-GA--GCC--GTCAG---T-TG-C---C-------G--CCAATGT-TCA-ATGA-------A--A--TAT-CC---AAGTAT--G-AAGC--AGAGAT-TG---AA-GACTCTGCAG-CACTCCTTCC-ACCTC---------CAGCC---CA-CT---GGG--------AC-------A--CA--C-CG-A--ATC--GACGCA-------TG-----AA---------------CTA-AAA-GAC-A--------------AAAC-G--T--CGTC---AA-GATA-TC-GATA-TG---TCGAACTA--AAGGCCATCAG-A--TATTT----------CTTCTTTT-CAT------GTAGGAG----CTTTTGG--A-CGAA-T---TCTG--CCTCT-TAAGAATA--TGA----AA-ACAGGTC------TGCTAACAA-----AGG---AGCA-CAA-T--CAGT-GCTCAT---------atcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccggcaaaccaaatcgctacaacaaccatataattcgcgaaacactgccccaaaacgtgactgccgaaatccctgcaacaacacactatctgcaaaccgcctgcctcgattcaaacataagtctgcacgcaccgatcaagccgagagatacaaacacaacaagcaagtgatgatcggacattgctacacaaataccgaaagctgacaacgtaaaatccgataccgtcttgtctgtcacaaagtcgagccgtcagttgccgccaatgttcaatgaaatatccaagtatgaagcagagattgaagactctgcagcactccttccacctccagcccactgggacacaccgaatcgacgcatgaactaaaagacaaaacgtcgtcaagatatcgatatgtcgaactaaaggccatcagatatttcttcttttcatgtaggagcttttggacgaattctgcctcttaagaatatgaaaacaggtctgctaacaaaggagcacaatcagtgctcat
gi|30 : tgaatgttgttgattgaaattgaataaattagatccaagatttgatgccggcactgacgacaaatgtgggacatgtcaatgtaaagacaaagacatcaaatatttgttgtcttgcaaatcctaagcagaacacaaaaacaatagtttggcaaacccggacccccggacaaaccagaggtgggaccaggcgcgcaggaggagcaaacatccccgtagactggcctcatccgccctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccg--ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T-------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|31 : --ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T-------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|32 : GG-TG-TCTTTT--AAATC---------GAGTT---CT-TT---GGG--------AT-------A--TA--TATA-A--ATATATATATAA
gi|33 : AT--ACAAATA-GG----CAA-AGGT-ACCA--TAGT--G--TTAAA-CGTAAT-A-AT
gi|34 : gaaT-C-------A-GGT-GC-C--ATGGGTAGGA-GTA--GCA-TCC--TCTTCTGCTGACC---------G----
gi|36 : --ACAAATT-GG----TGA-ATGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-aa
gi|37 : aaaaCAAATA-GG----CGA-TGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|38 : taaaagAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AGCA--TCGT--GTNTAAAACg
gi|39 : AT--ACAAACA-GG----CGA-AGGT-ATCA--TCGT--G--TAAAA-CGTAat
gi|4 : --ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-ATA-A--TC---C--A---GA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---TT-G----GGC-A
gi|40 : cttaagctttgggtcatctgcctcctttatcctctctagcaggactctattgagaacctttaccggcactgacaggaacatactccctcggtagttgttacagtccctgatgcctccgttctttggcagtttgatgacgagtccctccttccactggactggtacatcttcattatcccaaatcttgctgacgaggctgtgttttccgtgtctgctttgatggcttctgctggtatgttgtccggccttgcagctttcccattcttaagtgttgcgatgaccaagtaattgcgatgaccttcctggatctctactttagattgtaggtcacagttaatgggtagctttggctggtggtatgtctggtggtgcttcaggggcagggcggttcaacaactcctgaagtgttcttcccatctcttcagctgtttctcggttgttgtcagtgggttgccatccttgtctataactggcttgtctgtctgctggaacttgcctgccagcttcttggttttcaggtataggtcctttaggttccattgacctactacatgttcagattaactggccaattcctcaatattgtctttcttgtccttcttgattttttgttgacttccctgtcagctgctgtatactcttcttttaatttggctttagctgctcttgttcggttcatgttcagtgtagctttcttctttttccttatctctattttctggatagtattagaaAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAA
gi|41 : aAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TCAAACtca
gi|42 : ATCACG----TTTA---TCA----AATA-A---T-G-TA--GTT--GTCAG---Tg
gi|43 : CCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--Gt
gi|5 : -TAT---CAAAGA-AGGCA-CGA-AGTTCAACA--TTGT--G--TCAAACCGTAATTC-ATATA--T----C--ACAAAA----AA-ACAACTA-TGGCA---CA-ACACATCGAGCTCGAC-CTAGCAACGAC-AACCCACTGAA-CCCATTCC-AAGTACAAAA-----AAGCCGAACGG-T-TAGAT-TGTCAGCAA-GGCTGC-CG-ATGG--AGGCCATAACGCAATCC--TC----ACTGGCCAATGAACCGG----TCCACACC---CGCAC-GTGAGCCCGTAGTCGAAAT-AAAG-TAAATG-ATATT---A-CCCG-TA-----GTCACATGAA-GTG--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGTCTTATTGATACTTTGTAATCGC--AAAC-A--GT----CA--TTGATA--GACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGAC-TTCAAACGA-G-ATTC--GA-TA-TAA-CCTTGCAACTTCA-A-CTTTATTGTTAGTA--GGTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA--TCCGCATACAC-ATATCA-TA-CTCTTGCGTAT-CGGATC--AACTGCGAGATATAC-ACAC-CC-TA--AG-CAG-GT-G-AT-A-GTTGT--ATAT-----TAC--TAAATAGAAAGGG-----AA---A-TTTGA-CG-ATTGCAAAGA--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-G-TA--ATT--GTCAG---TCTG-C---C-ATCAGAG--TCAATTT-TAG---GA-------A--AAATATGCG---AA-TA--TG-AAAC----AGATTTGT--CA-GATTTTAT
gi|6 : gaatACC---TGCC--ATGAGCCCGTGGTGGAAAC-AAAG-TAAACA-GAATT---ATCCCC-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAATA-A-----AG-GGCATGAGA-----C-AAA-TCAGTCAACACATGACATAGTGGTAATTTGTAACCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAAAATTTGCAAA-ATGGT------------------TC--GT-TA-TAA-CTTTGGAACATCG-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAAA---AA-GTCCTCATACGC-GTGGCA-TG--CCTTGTGTAT-CGAA--ACAACTGGCAGACATG--AC-CACCACC--AG-GAA-AC-A-AG-A-GTGGT--ACAT-----TAA--TACATAGAAATGA-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCGCG----CATA---TCA----T----------------GTT--TTCAG---TCTG-C---C-AGAAGAG--TCGACAT-TAA-GT---------A--AAATAT-CA---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATTTT---------GAGTT---CG-TC---AGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--A--TAGATATAATC---CTG-----AAAAT--T-AT-GATTGTttatctatgtatctatctatctttatctgttttctatgtacatcaatgtggaat
gi|7 : CTGC-AT-C-TA-----AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--ATGT--A--TTAAAC-GTAAT-C-ATA-GACC----C--A---AA----CA-ACA--CA-T---A---CA-A---------T--G----TAG----GGC-AAC--TC-GGA-CC---TCC-AA---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GAT-GT-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCG--TCT---GCTGACCG--------G----TC-ACACC---CG--CCGTGAGCCCGTAGTCGAAACAAAAG-TAAACG-AGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-GACAA--AAA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAGG-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTGATGGTAATTTGTAATCGC--AAAC-AAAGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTat
gi|8 : atgtgacattctttcagattgtacatgctgtcaggagatagaaaatggttcccaccagccatgtacctcaagttaattgactgatctacactaattgagtgtttcagtggtgtgataggaggttatgatattagactgatttttttctct-TAT--A-AAAT--GG----CGA-AGTT-ACCAAAT-GT--G--TTAAAC-ATAAT-TTATA-G--T----C--C---AAT---AA-AT---CA-T---AGAATA-A-A-GTCGAGT--G----TAG----GGC-AAC--AC-GGA-CC---TCC-GA---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------ACGGT-GC-C--ATGG--AGGA-TTAA-GCA-TCC--TCT---GCCACCC---------G----TC-ATACC---CACC---TGAGCTT-TAGTC--AACAAAAG-TAAACG-GGA-T---A-TC---TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-AAAAA--TTA-CT--TT--CTAACA-A-----AG-GATATGAAA-----CAAAA-ACAGCCAACATGTGAC--A--------TTGTAATTGCA-AAAA-AAAGTC---CA--AT-ATAATGACCG----TAGAATTTGTGAAGATGATGACTGTTAAACGAGG-A-TG--GTGCATTAA-CCCTGTCACAACA-AGC--GTATGTTACTA--GAGGG---T--CACGCTT---T-AAA---AATGTCTCCATACGCAATGGCATTG-CCCTTG
gi|9 : ATATACCACAC-CCATA--TGACAG-AA-GTAT-ATGCCGA--ACATATACTTACCATACATAGAAAAGG-----AACACA-TTCGACCGTATTGCAAAGT--G-AATTAAAAATTCA-CACG----C-TA---TCAGCCCTATA-A---TAG-TACGGTT--GTCAGCTCCCTG-C---CAATTAG------GACGTACAA-ATGATATACATA--GAGTAT-CCCATAA-TAA-TGTAAGCAAA-AGATATGTTCTA-GATTCCGTAACTG-CTCCAC--ATATCATAACGCCAGAAAT---CT-ACGCAGGA--------AT-------AGCTACCT-CACA--ATTTAGACATAAATCCCATGTGTGAAAAACT-T-AT-CATTCTTACATT-GATCATCACAGTGCATTCTACAC-A-AC--TG-C---TA-TATA-CCTCATACTGCCCTAAGGTTt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGGTGAAGATAACGAACAGTAATACAAAATTAAGAGTTGCAATTAGGGAAAACATAACCCCTTTAATTTGGACATACCAGAGGTGGGATAAAGTGCTTAGGAGGAATAAGCGCCCATCGTGAGCCTCGCTTTCATCTCGATCAGGTAAACGTACTTAATGCGTAGCCAAAATCAGTTTACATGCAAAGAACTGCAAAACAAATAACATGATTAAGGTGGAATGCTACACCAG
Unaligned ( gi|21 ): TAAATTGACGAAGTTACAATGTGTTAAGACTGGATTCCAATGGTGCCAATATTTCACTAAGTTGAATAAAGGGCTGCATGGACTTCCGACACA
Unaligned ( gi|22 ): TGTTCGTTGAATAATATTTATTACCAAATGACTTATATTAGACTGAATCACTGTTTACGAATGCAAAACAATTACGTGAAATAAT
Unaligned ( gi|27 ): ACCACCCCTACAAACTAGTACAGTATAAAATGGCGAAGTAACAATGATATGAAACGTAATAC
Unaligned ( gi|35 ): TGTGTATAAAATGGCGAAGTAACAATAATGTATTAAACGTAAT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 222 1 1 111 11 1111111111 1111 111111111 22222222222 1 111 111111111 1111111 11 11111111 222222222 11111 1111 11111 11111 1111 1111 11111 11 1111 11 11111111111 11111 11111 222222 111 333333333333 222222 2222 11 2222222222 111 111 22222222222222222222 111111 33333333333333333333333333333333 44444444444444 22222222222222 111111 11 44444444444444444 111 1111 111 11111 1111 111111 22222222222222 333333333333333333333333333333333 3333333333 1 66666666666 1 11 1 1 555555555 2 2222 111 1 1 222 222 11 1 22222 1 1
lowQualScore : 88 1 111 1 5 1 1 1 111 5 5 1 3 8 1 6 000 22 33 7777 4 3 2 22 66 55 1 66 888 7777 8888888888 1111 3 444 111111111 4 555 0 55 44444444444 5 66 0 5 888 5 333 999999999 5 666 4 4444444 5 4 4 00 66 4 4 8 66 777 44444444 4 66 4 111111111 5 5 5 5 777 4 4 11111 4 1111 55 4 99 55 4 11111 4 5 11111 4 4 6 44 1 99 4 2222 55 4 3 4444 4 5 7777 5 5 5 66 5 5 5 1 5 11111 66 888 66 888 5 888 5 22 1 0 5 5 33 8 11 0000 1 00 5 66 5 11111111111 66 22222 66 2 22222 888 5 5 5 9999 666666 0 8888 777 8888 0 8888888 55 55 111 4 777 4 55 1 4 55 111111111111 8 777 111111 4 3333 2 77 5 6666 33 5 3333333333 000 66 000 99999999999999999999 77 5 5 000000 88888888888888888888888888888888 99 8 77777777777777 5 00000000000000 8 8 99 111111 1 11 8 55555555555555555 1 8 444 7 4444 000 6 88888 99 8888 99 4444 6 7 999999 00000000000000 6 6 99 6 999999999999999999999999999999999 9999999999 0 22222222222 0 0 33 3 0 3 2 0 333333333 6 7 7777 888 7 5 5 111 111 88 5 1 66666 22 5 5 1
lowQualScore : .. . ... . . . . . ... . . . . . . . ... .. .. .... . . . .. .. .. . .. ... .... .......... .... . ... ......... . ... . .. ........... . .. . . ... . ... ......... . ... . ....... . . . .. .. . . . .. ... ........ . .. . ......... . . . . ... . . ..... . .... .. . .. .. . ..... . . ..... . . . .. . .. . .... .. . . .... . . .... . . . .. . . . . . ..... .. ... .. ... . ... . .. . . . . .. . .. .... . .. . .. . ........... .. ..... .. . ..... ... . . . .... ...... . .... ... .... . ....... .. .. ... . ... . .. . . .. ............ . ... ...... . .... . .. . .... .. . .......... ... .. ... .................... .. . . ...... ................................ .. . .............. . .............. . . .. ...... . .. . ................. . . ... . .... ... . ..... .. .... .. .... . . ...... .............. . . .. . ................................. .......... . ........... . . .. . . . . . ......... . . .... ... . . . ... ... .. . . ..... .. . . .
lowQualScore : 00 0 555 0 5 0 0 0 000 0 0 0 2 2 5 7 666 99 66 8888 0 8 0 88 88 55 7 99 222 4444 6666666666 4444 6 888 777777777 0 444 9 55 99999999999 0 99 0 0 888 0 888 555555555 0 666 4 4444444 0 4 4 66 11 4 4 9 11 888 55555555 0 11 4 555555555 0 0 0 0 888 4 4 11111 4 2222 55 0 55 55 4 11111 4 7 11111 4 4 5 55 6 55 0 5555 55 0 0 0000 4 7 9999 0 0 0 99 0 0 0 9 1 88888 11 888 99 888 0 888 0 88 4 4 7 7 66 0 66 8888 4 99 0 99 0 99999999999 99 55555 99 2 55555 888 0 0 0 0000 666666 1 5555 000 5555 9 8888888 55 00 444 0 000 0 55 4 0 33 666666666666 9 000 888888 0 3333 0 99 7 9999 66 1 6666666666 000 00 000 33333333333333333333 99 7 7 333333 77777777777777777777777777777777 44 0 00000000000000 0 00000000000000 0 0 00 888888 0 00 0 66666666666666666 0 0 000 5 2222 222 7 22222 22 8888 22 2222 7 8 222222 88888888888888 7 7 22 7 888888888888888888888888888888888 8888888888 0 00000000000 0 2 22 2 0 2 5 0 333333333 7 3 0000 333 3 5 5 000 000 00 5 0 00000 00 5 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACATAATT---ATG-----AAAA-T-TATGAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
Reference ( family-8 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACATAATT---ATG-----AAAA-TATATGAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------GGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
gi|1 : ATTGTTCTATTAT-AATATCAATAATTA-AG----CGA-AGGT-AA-A--TCGG--GCTTAAAAACGTAAT-C-ATA-A--T-TCA--A---AA----AA-ACA---A-T---C---CACA-A-ATCGTGT--GCGTCTGG----GACAA-C--ACGGGA-CC---TCAG-AT--CAAAAACACCG---CGAA-AGTT-AGGACAT-------A-GGC-GC-CATATGG--TGGA-TGAG-GCAGTCCCTTCT---GTT---------ACCGCGGTTC-ACAC------CCCCGTGA--CCGTAGTGAAAAT-AAA-GTTAAACGCGGATTTTAA-CCCG-TTCTAGAATCAAATCTACGTA--GAGAAAATGTGATCA--GTTACTAACATATATGTAG-ATCATAAAACCAACC-AAATTCAGTCAACATATGAA-TAGTGATACTTTGTAATCGCATAAACAAAGGTGGTACATCTT-ATAACGACCGTGATTAAAATTTGC--------TAAC------ATGA-GTA-TC--TT-GA-TA-----TACG--ATCG-A-TATTTTTGTTAGTAGTGTTGGATTCTACTCGCTTCTGT-AAA---AA-ATCCGCAT
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgatt--CA-G---A---CG-A-G-ATCAAGT--G---CT---------AA-T--GC-GGA-TT---TTTT-A---CAGAA-----G---CGA---G-T-AGAAT-C-------tagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttgCATACGGG-CAG-GATG-ATTATGTGGTTTCTAT-----TAC--TACATAGAAAGCGTTGATAC---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGCTGT-AAT-----AAACGTAACAGTACCTCGACTTCG----TATG-GAGTT-CTA--GTCTGGTCAGAT-TCT--C---C-CTTAGAGGTCCAATGT-TAAGGTGA-------ATGTGATACGCA---AA-TAT-TG-AAGctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttga-TCCTTTTAATATC---------GAGTTTGTCT-TC---GGGTCCTAGTGATCAGTACCA--TG--T-GA-AGCATTTAGTCGTATTTG--ATA-----CAAA-TG-ATGATAGATTTGTAA-TTTGAT-A--------------ACACTA-ATTTCATCAACTA-TATAACC-TATA-TG---TAA--TTGTTAAGGACA-CGGCATAAGTTTGGTATATATCTTTTTTTTACATCCAGACGTTATAGAATGTCTCTGCGTA-CATAATGTTCCTGGTCTTTAATATTTATAACTAATCATAATATACGTCAAGTTTTGCCAATAACGTACAGGTTGGGCATCAA-TAATAGTAGCCCATCTCACGTAGAGGCATAA-TTACC--AAACGGTGGATTGTATCGT-GGGAAAGACCTCGGTGTCTCGCCAAGACTTACATA-AA-TATTATGCTA-AAGAAACC-AAGCA-TTGTCTTAGATTGAGTCATGCCCA-T-CAGCTTGGTACATTTGTGTAGGCA-TTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGTtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|10 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgcAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGAT-ACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA----CTTTTGGTTAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TG-CCCCTGCGTATTCGAATCAA--CTGAGA-AT-CAT-ACACACCATA--AA-CAG-GC-G-AT-A-GTGGT--ACGT-----TGC--TACATGGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGACATCACG----TTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TTTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-agc
gi|11 : -TAT--A-AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--AAGT--A--TGAAAC-GTAAT-C-ATA-G--T-C----C---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TTCG-A---CGAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CG--CCGTGAGCCTGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTAGTG-GAAAG--TGA-AAT-AT--CTAA
gi|13 : atagAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGATTACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA-----CTGTTG-TAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TGCCCCTTGCGTtgcattccagatgaacttaaattacacaaaactgcatcgctgatacgaggcataataaatttactga
gi|14 : cgaaaatttcacccgatacacagccctaATA-AG---TAAGGTTT--AAGGGGA-CGGCA--ATTGT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTTTGA--A-CAAA-T---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGAA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-AAC-AATA-----GATTGT----TGG---AAGACT-TGGTATC---------CT-ATAT----ATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTAGTTCAGT---GT--ACTTGTGTGGGCAAT
gi|15 : C---AA-TAT--G-AGAC--A----TCTGT--CA-GAT-CTGTGG-T---CCTTT--AT-TC----------AGTT---CCGTC---GAG--------AT----------TA--T-CG-A--CT---GACATAATG-----G-----AAAA-TAATTAAT-----TGTTA-TTTAAT-A--------------A-AC-ATAT--CG-C---TA-TATA-CT-AA-A--G---TAAGGT-G--CAGGACA-CG-CA--G---------------TTATTGT-TATCC---C-TAA--G----TTTTTGG--AACAAAAT---TCTG--CTTGG---TGAA-A--TAA----AA-ATA-GTT------T-CCAA----------A---GTCA-CAATT--TAGT-G
gi|16 : -ACACACCATA--AG----------------TGGT--ATAT-----TAC--TACATA-AAAGGG-----AA---ACATTTA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TA---A---T-GTA--ATG--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-TAA-GTG-----------AAATAT-CC---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CAGGATT
gi|17 : atctGTAAAAG----CTTTT-C--A-CAAA-T---TCTT--CCGGG-CACGAATA--TAG----AA-GCAGGTC------TGCTTACAA-----ACT---AGCA-CAA-T--TTGT-GCTCAT---------GAG---AATT-CCC-TGGA-----GACTGT----T-GT--AAGACC-CGATA----------ACC-AAATACAAATGTTGT-CCATAAGGAACCCGAGTATTGCTtgaatacaaattgtattgcatttaattttaaaa
gi|18 : tcgaacccaaggccacatat-----AGTCTTCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---CCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATTT-TAA-AT---------A--AAATAT-CC---AA--AT----AAG---A-AGATATGtcagtgatca
gi|19 : taa-GC-T--ATAG--AGGA-ATGA-GCA-TCC--CGT---GACG--------ACCG-G--TC-ATACCA--AG---CGTGAGCCgtgtatgtattttcattgccaatgtttttgcctttgatatcttatctttggtatgatagatattttctcatgcaataaatgtatgaat
gi|2 : TGAAT--TGATGATTG---TCAAGAAAGTTGGTGTTCTAGCCTTAACGCAGCTTGCACTGA-GA-AGATTCGGGATTGTCCCAT-AT-C-TAT--ACAAAAAAGG----CGA-AGTT-AACA--TTGT--G--TCAAACCGTAAT-C-ATA-A--T-C----A---AA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGATCC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-AG-TGAGGAT-C-------A-AGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCT--TCT---GCTG--------ACCG----TC-ACACCGCGCGCCTCGTGAGCCCTTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAACG-GAATT---A-CCCGGTA-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AGAGGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGTGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCA----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TTCAGT-TA-TAA-CCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCAT-CGC-ATAGCA-TG--TCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAGCGG-G-AT-A-GTGGT--ATAT-----TAC--TACATAGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-TG-ATTGCAAAGT--T-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATACA---TAATA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTAA-------AT-AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTATGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATGTGGACATAATT---ATG-----GAAATTATATGAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CATC---TATTATA-CC-AATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTCTGT--A-CAAAAT---TCTG--CTTCA-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAAT-A-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACCTTACG-----GATTGT----T-G---AAGACC-TGGTCTCAA----AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATGAGAAACTCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTACTTCAGA---GTAT-CTTGTGTGGACAATCA-GAG-TG---TTTC---ATAAC--CAAAATATGTGTACTGTTCCC-----ACTACAGCTAGAAATTCGTATT-TTCGGGTagataagatgtaaatgtttgttgaataatatttacttccaaatgaattatataagaatgaatcactgtttacgagtgcaaaatttgcgtgaaa
gi|20 : agtttaaaagcccgggttacctggctatagacagGATTGT---AT-AG-T-TA-----AAATG-GAGCCTCGA-AG-T-AACA--AAGTATG--TGAAAC--TAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AAGACA--CAGTTA-A---CT-A-A-A--GAGT--G---CTAg
gi|23 : aaaatttcataatgtgtggagaacccaatctTG--------ACCG-G--TC-ACAAC---CGCT--GTGAGCCCGTATTAGAAAC-AAA-G-CAAACG-GGGTT---T-CCCA-TC-----GTCAAATCTA-GTtagc
gi|24 : T---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GAA--C-GAAAA--CGA-AAAAGT--CTAACG-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAG-TCGGTCAACA
gi|25 : cTTATAATCAC--AAAC-AATGT----CA--TT-ATAGTGACCGAT--CAGAA
gi|26 : T--GACAG---TCTAACAAAC-ATTAGAT--TCAATAT-GAA-GT---------A--AAATAT-CC---AACTA--TG-AAGC----AGATATGaactgttcagtatgaactatgaa
gi|28 : AT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--T--TTAA
gi|29 : tttttttttattactatttattggaTCCTAT-ATAT-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|3 : attgttatTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGAC------AT-GT-C-AAT--GTAAA---GA----CAA-AG----ACA--TC---------AAA---TATT-T-GTT-G--T-CTTGCA---AATCCTAA-GCA--GAAC---A---CA-A-A-AACAA---------TAGTTT-GGCAAAC--CC-GGA-CC---CCCGGA---CAAAC---------CAGA-GG-T-GGGAC-C-------A-GGC-GCGC--A-GG--AGGA-GCAA-ACA-TCC---CC---GTAG--------ACTG-G--CC-TCATC---CGCCCTGgt
gi|3 : GC--AAAC-CAAAT----CG--CT-ACAACAACCA----TATAATTCGCGAA-ACACTG-CCCCAAAACGT-G-A-CT--GC-CG-AAATCCCTGCAACAACACA-CTATCT-GCAAACC--GCCTG---C--CTCGATT---C-AAACATAA-GTCTGCA----------------------CGCAC-CGA-TCAAG-CCGAGAGATACAA-ACACA--ACA--AG-CAA-GT-G-AT-G-ATCGG--ACAT-----TGC--TACACAAATACCG-----AA---A-GCTGA-CA-AC-GTAAAAT--CCGAT-----A-CCGTCTTG----TCTG---TCA----CAAA-G---T-CGA--GCC--GTCAG---T-TG-C---C-------G--CCAATGT-TCA-ATGA-------A--A--TAT-CC---AAGTAT--G-AAGC--AGAGAT-TG---AA-GACTCTGCAG-CACTCCTTCC-ACCTC---------CAGCC---CA-CT---GGG--------AC-------A--CA--C-CG-A--ATC--GACGCA-------TG-----AA------------------CTA-AAAGAC-A--------------AAAC-G--T--CGTC---AA-GATA-TC-GATA-TG---TCGAACTA--AAGGCCATCAG-A--TATTT----------CTTCTTTT-CAT------GTAGGAG----CTTTTGG--A-CGAA-T---TCTG--CCTCT-TAAGAATA--TGA----AA-ACAGGTC------TGCTAACAA-----AGG---AGCA-CAA-T--CAGT-GCTCAT---------atcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccggcaaaccaaatcgctacaacaaccatataattcgcgaaacactgccccaaaacgtgactgccgaaatccctgcaacaacacactatctgcaaaccgcctgcctcgattcaaacataagtctgcacgcaccgatcaagccgagagatacaaacacaacaagcaagtgatgatcggacattgctacacaaataccgaaagctgacaacgtaaaatccgataccgtcttgtctgtcacaaagtcgagccgtcagttgccgccaatgttcaatgaaatatccaagtatgaagcagagattgaagactctgcagcactccttccacctccagcccactgggacacaccgaatcgacgcatgaactaaaagacaaaacgtcgtcaagatatcgatatgtcgaactaaaggccatcagatatttcttcttttcatgtaggagcttttggacgaattctgcctcttaagaatatgaaaacaggtctgctaacaaaggagcacaatcagtgctcat
gi|30 : tgaatgttgttgattgaaattgaataaattagatccaagatttgatgccggcactgacgacaaatgtgggacatgtcaatgtaaagacaaagacatcaaatatttgttgtcttgcaaatcctaagcagaacacaaaaacaatagtttggcaaacccggacccccggacaaaccagaggtgggaccaggcgcgcaggaggagcaaacatccccgtagactggcctcatccgccctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccg--ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|31 : --ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|32 : GG-TG-TCTTTT--AAATC---------GAGTT---CT-TT---GGG--------AT-------A--TA--TATA-A--ATATATATATAA
gi|33 : AT--ACAAATA-GG----CAA-AGGT-ACCA--TAGT--G--TTAAA-CGTAAT-A-AT
gi|34 : gaaT-C-------A-GGT-GC-C--ATGGGTAGGA-GTA--GCA-TCC--TCTTCTGCTG--------ACCG-
gi|36 : --ACAAATT-GG----TGA-ATGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-aa
gi|37 : aaaaCAAATA-GG----CGA-TGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|38 : taaaagAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AGCA--TCGT--GTNTAAAACg
gi|39 : AT--ACAAACA-GG----CGA-AGGT-ATCA--TCGT--G--TAAAA-CGTAat
gi|4 : --ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-ATA-A--TCC----A---GA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---TT-G----GGCA
gi|40 : cttaagctttgggtcatctgcctcctttatcctctctagcaggactctattgagaacctttaccggcactgacaggaacatactccctcggtagttgttacagtccctgatgcctccgttctttggcagtttgatgacgagtccctccttccactggactggtacatcttcattatcccaaatcttgctgacgaggctgtgttttccgtgtctgctttgatggcttctgctggtatgttgtccggccttgcagctttcccattcttaagtgttgcgatgaccaagtaattgcgatgaccttcctggatctctactttagattgtaggtcacagttaatgggtagctttggctggtggtatgtctggtggtgcttcaggggcagggcggttcaacaactcctgaagtgttcttcccatctcttcagctgtttctcggttgttgtcagtgggttgccatccttgtctataactggcttgtctgtctgctggaacttgcctgccagcttcttggttttcaggtataggtcctttaggttccattgacctactacatgttcagattaactggccaattcctcaatattgtctttcttgtccttcttgattttttgttgacttccctgtcagctgctgtatactcttcttttaatttggctttagctgctcttgttcggttcatgttcagtgtagctttcttctttttccttatctctattttctggatagtattagaaAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAA
gi|41 : aAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TCAAACtca
gi|42 : ATCACG----TTTA---TCA----AATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---Tg
gi|43 : CCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--Gt
gi|5 : -TAT---CAAAGA-AGGCA-CGA-AGTTCAACA--TTGT--G--TCAAACCGTAATTC-ATATA--T-C----ACAAAA----AA-ACAACTA-TGGCA---CA-ACACATCGAGCTCGAC-CTAGCAACGACAA-CCCACTGAA-CCCATTCCA-AGTACAAAA-----AAGCCGAACGG-T-TAGAT-TGTCAGCAA-GGCTGC-CG-ATGG--AGGCCATAACGCAATCC--TC----ACTGGCCAATGAACCG-G--TCCACACC---CGCAC-GTGAGCCCGTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAATG-ATATT---A-CCCG-TA-----GTCACATGAA-GTG--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGTCTTATTGATACTTTGTAATCGC--AAAC-A--GT----CA--TTGATA--GACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGAC-TTCAAACGA-G-ATTC--GA-TA-TAA-CCTTGCAACTTCA-A-CTTTATTGTTAGTA--GGTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA--TCCGCATACAC-ATATCA-TA-CTCTTGCGTAT-CGGATC--AACTGCGAGATATAC-ACAC-CC-TA--AG-CAG-GT-G-AT-A-GTTGT--ATAT-----TAC--TAAATAGAAAGGG-----AA---A-TTTGA-CG-ATTGCAAAGA--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--ATT--GTCAG---TCTG-C---C-ATCAGAG--TCAATTT-TAG---GA-------A--AAATATGCG---AA-TA--TG-AAAC----AGATTTGT--CA-GATTTTAT
gi|6 : gaatACC---TGCC--ATGAGCCCGTGGTGGAAAC-AAA-G-TAAACA-GAATT---ATCCCC-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAATA-A-----AG-GGCATGAGA-----C-AAA-TCAGTCAACACATGACATAGTGGTAATTTGTAACCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAAAATTTGCAAA-ATGGT------------------TC--GT-TA-TAA-CTTTGGAACATCG-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAAA---AA-GTCCTCATACGC-GTGGCA-TG--CCTTGTGTAT-CGAA--ACAACTGGCAGACATG--AC-CACCACC--AG-GAA-AC-A-AG-A-GTGGT--ACAT-----TAA--TACATAGAAATGA-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCGCG----CATA---TCA----T---------------GTT--TTCAG---TCTG-C---C-AGAAGAG--TCGACAT-TAA-GT---------A--AAATAT-CA---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATTTT---------GAGTT---CG-TC---AGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--A--TAGATATAATC---CTG-----AAAA-T-TATGAT-----TGTttatctatgtatctatctatctttatctgttttctatgtacatcaatgtggaat
gi|7 : CTGC-AT-C-TA-----AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--ATGT--A--TTAAAC-GTAAT-C-ATA-GACC-C----A---AA----CA-ACA--CA-T---A---CA-A---------T--G----TAG----GGCAA-C--TC-GGA-CC---TCCA-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GAT-GT-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCG--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCC--GTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAAAG-TAAACG-AGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-GACAA--AAA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAGG-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTGATGGTAATTTGTAATCGC--AAAC-AAAGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTat
gi|8 : atgtgacattctttcagattgtacatgctgtcaggagatagaaaatggttcccaccagccatgtacctcaagttaattgactgatctacactaattgagtgtttcagtggtgtgataggaggttatgatattagactgatttttttctct-TAT--A-AAAT--GG----CGA-AGTT-ACCAAAT-GT--G--TTAAAC-ATAAT-TTATA-G--T-C----C---AAT---AA-AT---CA-T---AGAATA-A-A-GTCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------ACGGT-GC-C--ATGG--AGGA-TTAA-GCA-TCC--TCT---GCC---------ACCC-G--TC-ATACC---CACC---TGAGCTT-TAGTC--AACAAAA-G-TAAACG-GGA-T---A-TC---TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-AAAAA--TTA-CT--TT--CTAACA-A-----AG-GATATGAAA-----CAAAA-ACAGCCAACATGTGAC--A--------TTGTAATTGCA-AAAA-AAAGTC---CA--AT-ATAATGACCG----TAGAATTTGTGAAGATGATGACTGTTAAACGAGG-A-TG--GTGCATTAA-CCCTGTCACAACA-AGC--GTATGTTACTA--GAGGG---T--CACGCTT---T-AAA---AATGTCTCCATACGCAATGGCATTG-CCCTTG
gi|9 : ATATACCACAC-CCATA--TGACAG-AA-GTAT-ATGCCGA--ACATATACTTACCATACATAGAAAAGG-----AACACA-TTCGACCGTATTGCAAAGT--G-AATTAAAAATTCA-CACG----C-TA---TCAGCCCTATA-A---TAGTACGGTT--GTCAGCTCCCTG-C---CAATTAG------GACGTACAA-ATGATATACATA--GAGTAT-CCCATAA-TAA-TGTAAGCAAA-AGATATGTTCTA-GATTCCGTAACTG-CTCCAC--ATATCATAACGCCAGAAAT---CT-ACGCAGGA--------AT-------AGCTACCT-CACA--ATTTAGACATAAATCCCATGTGTGAAAAA-CTTATCAT-----TCTTACATTGATCATCACAGTGCATTCTACAC-A-AC--TG-C---TA-TATA-CCTCATACTGCCCTAAGGTTt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGGTGAAGATAACGAACAGTAATACAAAATTAAGAGTTGCAATTAGGGAAAACATAACCCCTTTAATTTGGACATACCAGAGGTGGGATAAAGTGCTTAGGAGGAATAAGCGCCCATCGTGAGCCTCGCTTTCATCTCGATCAGGTAAACGTACTTAATGCGTAGCCAAAATCAGTTTACATGCAAAGAACTGCAAAACAAATAACATGATTAAGGTGGAATGCTACACCAG
Unaligned ( gi|21 ): TAAATTGACGAAGTTACAATGTGTTAAGACTGGATTCCAATGGTGCCAATATTTCACTAAGTTGAATAAAGGGCTGCATGGACTTCCGACACA
Unaligned ( gi|22 ): TGTTCGTTGAATAATATTTATTACCAAATGACTTATATTAGACTGAATCACTGTTTACGAATGCAAAACAATTACGTGAAATAAT
Unaligned ( gi|27 ): ACCACCCCTACAAACTAGTACAGTATAAAATGGCGAAGTAACAATGATATGAAACGTAATAC
Unaligned ( gi|35 ): TGTGTATAAAATGGCGAAGTAACAATAATGTATTAAACGTAAT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 222 1 1 111 11 1111111111 1111 111111111 22222222222 1 111 111111111 1111111 11 11111111 222222222 11111 1111 11111 11111 1111 1111 11111 11 1111 11 11111111111 11111 11111 222222 111 333333333333 222222 2222 11 2222222222 111 111 22222222222222222222 111111 333333333 22222222222222222 44444444444444 22222222222222 111111 11 44444444444444444 111 1111 111 11111 1111 111111 22222222222222 333333333333333333333333333333333 3333333333 1 55555555555 1 11 1 1 555555555 2 2222 111 1 1 222 222 11 1 22222 1 1
lowQualScore : 88 1 111 1 5 1 1 1 111 5 5 1 3 8 1 6 000 22 33 7777 4 3 2 22 66 55 1 66 888 7777 8888888888 1111 3 444 111111111 4 555 0 55 44444444444 5 66 0 5 888 5 333 999999999 5 666 4 4444444 5 4 4 00 66 4 4 8 66 777 44444444 4 66 4 111111111 5 5 5 5 777 4 4 11111 4 1111 55 4 99 55 4 11111 4 5 11111 4 4 6 44 1 99 4 2222 55 4 3 4444 4 5 7777 5 5 5 66 5 5 5 1 5 11111 66 888 66 888 5 888 5 22 1 0 5 5 33 8 11 0000 1 00 5 66 5 11111111111 66 22222 66 2 22222 888 5 5 5 9999 666666 0 8888 777 8888 0 8888888 55 55 111 4 777 4 55 1 4 55 111111111111 8 777 111111 4 3333 2 77 5 6666 33 5 3333333333 000 66 000 99999999999999999999 77 5 5 000000 5 1 777777777 11111111111111111 99 8 77777777777777 5 00000000000000 8 8 99 111111 1 11 8 55555555555555555 1 8 444 7 4444 000 6 88888 99 8888 99 4444 6 7 999999 00000000000000 6 6 99 6 999999999999999999999999999999999 9999999999 0 44444444444 0 0 33 3 0 3 2 0 333333333 6 7 7777 888 7 5 5 111 111 88 5 1 66666 22 5 5 1
lowQualScore : .. . ... . . . . . ... . . . . . . . ... .. .. .... . . . .. .. .. . .. ... .... .......... .... . ... ......... . ... . .. ........... . .. . . ... . ... ......... . ... . ....... . . . .. .. . . . .. ... ........ . .. . ......... . . . . ... . . ..... . .... .. . .. .. . ..... . . ..... . . . .. . .. . .... .. . . .... . . .... . . . .. . . . . . ..... .. ... .. ... . ... . .. . . . . .. . .. .... . .. . .. . ........... .. ..... .. . ..... ... . . . .... ...... . .... ... .... . ....... .. .. ... . ... . .. . . .. ............ . ... ...... . .... . .. . .... .. . .......... ... .. ... .................... .. . . ...... . . ......... ................. .. . .............. . .............. . . .. ...... . .. . ................. . . ... . .... ... . ..... .. .... .. .... . . ...... .............. . . .. . ................................. .......... . ........... . . .. . . . . . ......... . . .... ... . . . ... ... .. . . ..... .. . . .
lowQualScore : 00 0 555 0 5 0 0 0 000 0 0 0 2 2 5 7 666 99 66 8888 0 8 0 88 88 55 7 99 222 4444 6666666666 4444 6 888 777777777 0 444 9 55 99999999999 0 99 0 0 888 0 888 555555555 0 666 4 4444444 0 4 4 66 11 4 4 9 11 888 55555555 0 11 4 555555555 0 0 0 0 888 4 4 11111 4 2222 55 0 55 55 4 11111 4 7 11111 4 4 5 55 6 55 0 5555 55 0 0 0000 4 7 9999 0 0 0 99 0 0 0 9 1 88888 11 888 99 888 0 888 0 88 4 4 7 7 66 0 66 8888 4 99 0 99 0 99999999999 99 55555 99 2 55555 888 0 0 0 0000 666666 1 5555 000 5555 9 8888888 55 00 444 0 000 0 55 4 0 33 666666666666 9 000 888888 0 3333 0 99 7 9999 66 1 6666666666 000 00 000 33333333333333333333 99 7 7 333333 7 7 000000000 00000000000000000 44 0 00000000000000 0 00000000000000 0 0 00 888888 0 00 0 66666666666666666 0 0 000 5 2222 222 7 22222 22 8888 22 2222 7 8 222222 88888888888888 7 7 22 7 888888888888888888888888888888888 8888888888 0 55555555555 0 2 22 2 0 2 5 0 333333333 7 3 0000 333 3 5 5 000 000 00 5 0 00000 00 5 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACAT-AAT------T-ATGAAAA--T--TAT-GAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
Reference ( family-8 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACAT-AAT------T-ATGAAAA--T--TAT-GAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
gi|1 : ATTGTTCTATTAT-AATATCAATAATTA-AG----CGA-AGGT-AA-A--TCGG--GCTTAAAAACGTAAT-C-ATA-A--T-TCA--A---AA----AA-ACA---A-T---C---CACA-A-ATCGTGT--GCGTCTGG----GACAA-C--ACGGGA-CC---TCAG-AT--CAAAAACACCG---CGAA-AGTT-AGGACAT-------A-GGC-GC-CATATGG--TGGA-TGAG-GCAGTCCCTTCT---GTT---------ACCGCGGTTC-ACAC------CCCCGTGA--CCGTAGTGAAAAT-AAA-GTTAAACGCGGATTTTAA-CCCG-TTCTAGAATCAAATCTACGTA--GAGAAAATGTGATCA--GTTACTAACATATATGTAG-ATCATAAAACCAACC-AAATTCAGTCAACATATGAA-TAGTGATACTTTGTAATCGCATAAACAAAGGTGGTACATCTT-ATAACGACCGTGATTAAAATTTGC--------TAAC------ATGA-GTA-TC--TT-GA-TA-----TACG--ATCG-A-TATTTTTGTTAGTAGTGTTGGATTCTACTCGCTTCTGT-AAA---AA-ATCCGCAT
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgatt--CA-G---A---CG-A-G-ATCAAGT--G---CT---------AA-T--GC-GGA-TT---TTTT-A---CAGAA-----G---CGA---G-T-AGAAT-C-------tagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttgCATACGGG-CAG-GATG-ATTATGTGGTTTCTAT-----TAC--TACATAGAAAGCGTTGATAC---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGCTGT-AAT-----AAACGTAACAGTACCTCGACTTCG----TATG-GAGTT-CTA--GTCTGGTCAGAT-TCT--C---C-CTTAGAGGTCCAATGT-TAAGGTGA-------ATGTGATACGCA---AA-TAT-TG-AAGctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttga-TCCTTTTAATATC---------GAGTTTGTCT-TC---GGGTCCTAGTGATCAGTACCA--TG--T-GA-AGCATTTAGTCGT-ATT------TGATACAAA--T--GAT-GATAGATTTGTAA-TTTGAT-A--------------ACACTA-ATTTCATCAACTA-TATAACC-TATA-TG---TAA--TTGTTAAGGACA-CGGCATAAGTTTGGTATATATCTTTTTTTTACATCCAGACGTTATAGAATGTCTCTGCGTA-CATAATGTTCCTGGTCTTTAATATTTATAACTAATCATAATATACGTCAAGTTTTGCCAATAACGTACAGGTTGGGCATCAA-TAATAGTAGCCCATCTCACGTAGAGGCATAA-TTACC--AAACGGTGGATTGTATCGT-GGGAAAGACCTCGGTGTCTCGCCAAGACTTACATA-AA-TATTATGCTA-AAGAAACC-AAGCA-TTGTCTTAGATTGAGTCATGCCCA-T-CAGCTTGGTACATTTGTGTAGGCA-TTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGTtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|10 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgcAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGAT-ACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA----CTTTTGGTTAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TG-CCCCTGCGTATTCGAATCAA--CTGAGA-AT-CAT-ACACACCATA--AA-CAG-GC-G-AT-A-GTGGT--ACGT-----TGC--TACATGGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGACATCACG----TTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TTTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-agc
gi|11 : -TAT--A-AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--AAGT--A--TGAAAC-GTAAT-C-ATA-G--T-C----C---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TTCG-A---CGAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CG--CCGTGAGCCTGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTAGTG-GAAAG--TGA-AAT-AT--CTAA
gi|13 : atagAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGATTACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA-----CTGTTG-TAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TGCCCCTTGCGTtgcattccagatgaacttaaattacacaaaactgcatcgctgatacgaggcataataaatttactga
gi|14 : cgaaaatttcacccgatacacagccctaATA-AG---TAAGGTTT--AAGGGGA-CGGCA--ATTGT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTTTGA--A-CAAA-T---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGAA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-AAC-AATA-----GATTGT----TGG---AAGACT-TGGTATC---------CT-ATAT----ATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTAGTTCAGT---GT--ACTTGTGTGGGCAAT
gi|15 : C---AA-TAT--G-AGAC--A----TCTGT--CA-GAT-CTGTGG-T---CCTTT--AT-TC----------AGTT---CCGTC---GAG--------AT----------TA--T-CG-A--CT---GACAT-AAT------G---GAAAA--T--AATTAAT-----TGTTA-TTTAAT-A--------------A-AC-ATAT--CG-C---TA-TATA-CT-AA-A--G---TAAGGT-G--CAGGACA-CG-CA--G---------------TTATTGT-TATCC---C-TAA--G----TTTTTGG--AACAAAAT---TCTG--CTTGG---TGAA-A--TAA----AA-ATA-GTT------T-CCAA----------A---GTCA-CAATT--TAGT-G
gi|16 : -ACACACCATA--AG----------------TGGT--ATAT-----TAC--TACATA-AAAGGG-----AA---ACATTTA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TA---A---T-GTA--ATG--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-TAA-GTG-----------AAATAT-CC---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CAGGATT
gi|17 : atctGTAAAAG----CTTTT-C--A-CAAA-T---TCTT--CCGGG-CACGAATA--TAG----AA-GCAGGTC------TGCTTACAA-----ACT---AGCA-CAA-T--TTGT-GCTCAT---------GAG---AATT-CCC-TGGA-----GACTGT----T-GT--AAGACC-CGATA----------ACC-AAATACAAATGTTGT-CCATAAGGAACCCGAGTATTGCTtgaatacaaattgtattgcatttaattttaaaa
gi|18 : tcgaacccaaggccacatat-----AGTCTTCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---CCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATTT-TAA-AT---------A--AAATAT-CC---AA--AT----AAG---A-AGATATGtcagtgatca
gi|19 : taa-GC-T--ATAG--AGGA-ATGA-GCA-TCC--CGT---GACG--------ACCG-G--TC-ATACCA--AG---CGTGAGCCgtgtatgtattttcattgccaatgtttttgcctttgatatcttatctttggtatgatagatattttctcatgcaataaatgtatgaat
gi|2 : TGAAT--TGATGATTG---TCAAGAAAGTTGGTGTTCTAGCCTTAACGCAGCTTGCACTGA-GA-AGATTCGGGATTGTCCCAT-AT-C-TAT--ACAAAAAAGG----CGA-AGTT-AACA--TTGT--G--TCAAACCGTAAT-C-ATA-A--T-C----A---AA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGATCC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-AG-TGAGGAT-C-------A-AGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCT--TCT---GCTG--------ACCG----TC-ACACCGCGCGCCTCGTGAGCCCTTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAACG-GAATT---A-CCCGGTA-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AGAGGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGTGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCA----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TTCAGT-TA-TAA-CCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCAT-CGC-ATAGCA-TG--TCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAGCGG-G-AT-A-GTGGT--ATAT-----TAC--TACATAGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-TG-ATTGCAAAGT--T-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATACA---TAATA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTAA-------AT-AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTATGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATGTGGACAT-AAT------T-ATGGAAA--TTATAT-GAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CATC---TATTATA-CC-AATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTCTGT--A-CAAAAT---TCTG--CTTCA-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAAT-A-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACCTTACG-----GATTGT----T-G---AAGACC-TGGTCTCAA----AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATGAGAAACTCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTACTTCAGA---GTAT-CTTGTGTGGACAATCA-GAG-TG---TTTC---ATAAC--CAAAATATGTGTACTGTTCCC-----ACTACAGCTAGAAATTCGTATT-TTCGGGTagataagatgtaaatgtttgttgaataatatttacttccaaatgaattatataagaatgaatcactgtttacgagtgcaaaatttgcgtgaaa
gi|20 : agtttaaaagcccgggttacctggctatagacagGATTGT---AT-AG-T-TA-----AAATG-GAGCCTCGA-AG-T-AACA--AAGTATG--TGAAAC--TAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AAGACA--CAGTTA-A---CT-A-A-A--GAGT--G---CTAg
gi|23 : aaaatttcataatgtgtggagaacccaatctTG--------ACCG-G--TC-ACAAC---CGCT--GTGAGCCCGTATTAGAAAC-AAA-G-CAAACG-GGGTT---T-CCCA-TC-----GTCAAATCTA-GTtagc
gi|24 : T---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GAA--C-GAAAA--CGA-AAAAGT--CTAACG-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAG-TCGGTCAACA
gi|25 : cTTATAATCAC--AAAC-AATGT----CA--TT-ATAGTGACCGAT--CAGAA
gi|26 : T--GACAG---TCTAACAAAC-ATTAGAT--TCAATAT-GAA-GT---------A--AAATAT-CC---AACTA--TG-AAGC----AGATATGaactgttcagtatgaactatgaa
gi|28 : AT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--T--TTAA
gi|29 : tttttttttattactatttattggaTCCTAT-ATAT-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|3 : attgttatTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGAC------AT-GT-C-AAT--GTAAA---GA----CAA-AG----ACA--TC---------AAA---TATT-T-GTT-G--T-CTTGCA---AATCCTAA-GCA--GAAC---A---CA-A-A-AACAA---------TAGTTT-GGCAAAC--CC-GGA-CC---CCCGGA---CAAAC---------CAGA-GG-T-GGGAC-C-------A-GGC-GCGC--A-GG--AGGA-GCAA-ACA-TCC---CC---GTAG--------ACTG-G--CC-TCATC---CGCCCTGgt
gi|3 : GC--AAAC-CAAAT----CG--CT-ACAACAACCA----TATAATTCGCGAA-ACACTG-CCCCAAAACGT-G-A-CT--GC-CG-AAATCCCTGCAACAACACA-CTATCT-GCAAACC--GCCTG---C--CTCGATT---C-AAACATAA-GTCTGCA----------------------CGCAC-CGA-TCAAG-CCGAGAGATACAA-ACACA--ACA--AG-CAA-GT-G-AT-G-ATCGG--ACAT-----TGC--TACACAAATACCG-----AA---A-GCTGA-CA-AC-GTAAAAT--CCGAT-----A-CCGTCTTG----TCTG---TCA----CAAA-G---T-CGA--GCC--GTCAG---T-TG-C---C-------G--CCAATGT-TCA-ATGA-------A--A--TAT-CC---AAGTAT--G-AAGC--AGAGAT-TG---AA-GACTCTGCAG-CACTCCTTCC-ACCTC---------CAGCC---CA-CT---GGG--------AC-------A--CA--C-CG-A--ATC--GACGC-A-----------TGAA---------------------CTA-AAAGAC-A--------------AAAC-G--T--CGTC---AA-GATA-TC-GATA-TG---TCGAACTA--AAGGCCATCAG-A--TATTT----------CTTCTTTT-CAT------GTAGGAG----CTTTTGG--A-CGAA-T---TCTG--CCTCT-TAAGAATA--TGA----AA-ACAGGTC------TGCTAACAA-----AGG---AGCA-CAA-T--CAGT-GCTCAT---------atcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccggcaaaccaaatcgctacaacaaccatataattcgcgaaacactgccccaaaacgtgactgccgaaatccctgcaacaacacactatctgcaaaccgcctgcctcgattcaaacataagtctgcacgcaccgatcaagccgagagatacaaacacaacaagcaagtgatgatcggacattgctacacaaataccgaaagctgacaacgtaaaatccgataccgtcttgtctgtcacaaagtcgagccgtcagttgccgccaatgttcaatgaaatatccaagtatgaagcagagattgaagactctgcagcactccttccacctccagcccactgggacacaccgaatcgacgcatgaactaaaagacaaaacgtcgtcaagatatcgatatgtcgaactaaaggccatcagatatttcttcttttcatgtaggagcttttggacgaattctgcctcttaagaatatgaaaacaggtctgctaacaaaggagcacaatcagtgctcat
gi|30 : tgaatgttgttgattgaaattgaataaattagatccaagatttgatgccggcactgacgacaaatgtgggacatgtcaatgtaaagacaaagacatcaaatatttgttgtcttgcaaatcctaagcagaacacaaaaacaatagtttggcaaacccggacccccggacaaaccagaggtgggaccaggcgcgcaggaggagcaaacatccccgtagactggcctcatccgccctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccg--ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|31 : --ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|32 : GG-TG-TCTTTT--AAATC---------GAGTT---CT-TT---GGG--------AT-------A--TA--TATA-A--ATATATATAT-AA
gi|33 : AT--ACAAATA-GG----CAA-AGGT-ACCA--TAGT--G--TTAAA-CGTAAT-A-AT
gi|34 : gaaT-C-------A-GGT-GC-C--ATGGGTAGGA-GTA--GCA-TCC--TCTTCTGCTG--------ACCG-
gi|36 : --ACAAATT-GG----TGA-ATGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-aa
gi|37 : aaaaCAAATA-GG----CGA-TGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|38 : taaaagAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AGCA--TCGT--GTNTAAAACg
gi|39 : AT--ACAAACA-GG----CGA-AGGT-ATCA--TCGT--G--TAAAA-CGTAat
gi|4 : --ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-ATA-A--TCC----A---GA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---TT-G----GGCA
gi|40 : cttaagctttgggtcatctgcctcctttatcctctctagcaggactctattgagaacctttaccggcactgacaggaacatactccctcggtagttgttacagtccctgatgcctccgttctttggcagtttgatgacgagtccctccttccactggactggtacatcttcattatcccaaatcttgctgacgaggctgtgttttccgtgtctgctttgatggcttctgctggtatgttgtccggccttgcagctttcccattcttaagtgttgcgatgaccaagtaattgcgatgaccttcctggatctctactttagattgtaggtcacagttaatgggtagctttggctggtggtatgtctggtggtgcttcaggggcagggcggttcaacaactcctgaagtgttcttcccatctcttcagctgtttctcggttgttgtcagtgggttgccatccttgtctataactggcttgtctgtctgctggaacttgcctgccagcttcttggttttcaggtataggtcctttaggttccattgacctactacatgttcagattaactggccaattcctcaatattgtctttcttgtccttcttgattttttgttgacttccctgtcagctgctgtatactcttcttttaatttggctttagctgctcttgttcggttcatgttcagtgtagctttcttctttttccttatctctattttctggatagtattagaaAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAA
gi|41 : aAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TCAAACtca
gi|42 : ATCACG----TTTA---TCA----AATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---Tg
gi|43 : CCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--Gt
gi|5 : -TAT---CAAAGA-AGGCA-CGA-AGTTCAACA--TTGT--G--TCAAACCGTAATTC-ATATA--T-C----ACAAAA----AA-ACAACTA-TGGCA---CA-ACACATCGAGCTCGAC-CTAGCAACGACAA-CCCACTGAA-CCCATTCCA-AGTACAAAA-----AAGCCGAACGG-T-TAGAT-TGTCAGCAA-GGCTGC-CG-ATGG--AGGCCATAACGCAATCC--TC----ACTGGCCAATGAACCG-G--TCCACACC---CGCAC-GTGAGCCCGTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAATG-ATATT---A-CCCG-TA-----GTCACATGAA-GTG--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGTCTTATTGATACTTTGTAATCGC--AAAC-A--GT----CA--TTGATA--GACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGAC-TTCAAACGA-G-ATTC--GA-TA-TAA-CCTTGCAACTTCA-A-CTTTATTGTTAGTA--GGTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA--TCCGCATACAC-ATATCA-TA-CTCTTGCGTAT-CGGATC--AACTGCGAGATATAC-ACAC-CC-TA--AG-CAG-GT-G-AT-A-GTTGT--ATAT-----TAC--TAAATAGAAAGGG-----AA---A-TTTGA-CG-ATTGCAAAGA--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--ATT--GTCAG---TCTG-C---C-ATCAGAG--TCAATTT-TAG---GA-------A--AAATATGCG---AA-TA--TG-AAAC----AGATTTGT--CA-GATTTTAT
gi|6 : gaatACC---TGCC--ATGAGCCCGTGGTGGAAAC-AAA-G-TAAACA-GAATT---ATCCCC-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAATA-A-----AG-GGCATGAGA-----C-AAA-TCAGTCAACACATGACATAGTGGTAATTTGTAACCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAAAATTTGCAAA-ATGGT------------------TC--GT-TA-TAA-CTTTGGAACATCG-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAAA---AA-GTCCTCATACGC-GTGGCA-TG--CCTTGTGTAT-CGAA--ACAACTGGCAGACATG--AC-CACCACC--AG-GAA-AC-A-AG-A-GTGGT--ACAT-----TAA--TACATAGAAATGA-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCGCG----CATA---TCA----T---------------GTT--TTCAG---TCTG-C---C-AGAAGAG--TCGACAT-TAA-GT---------A--AAATAT-CA---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATTTT---------GAGTT---CG-TC---AGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--A--TAGATAT-AAT------C-CTGAAAA--T--TAT-GAT-----TGTttatctatgtatctatctatctttatctgttttctatgtacatcaatgtggaat
gi|7 : CTGC-AT-C-TA-----AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--ATGT--A--TTAAAC-GTAAT-C-ATA-GACC-C----A---AA----CA-ACA--CA-T---A---CA-A---------T--G----TAG----GGCAA-C--TC-GGA-CC---TCCA-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GAT-GT-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCG--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCC--GTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAAAG-TAAACG-AGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-GACAA--AAA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAGG-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTGATGGTAATTTGTAATCGC--AAAC-AAAGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTat
gi|8 : atgtgacattctttcagattgtacatgctgtcaggagatagaaaatggttcccaccagccatgtacctcaagttaattgactgatctacactaattgagtgtttcagtggtgtgataggaggttatgatattagactgatttttttctct-TAT--A-AAAT--GG----CGA-AGTT-ACCAAAT-GT--G--TTAAAC-ATAAT-TTATA-G--T-C----C---AAT---AA-AT---CA-T---AGAATA-A-A-GTCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------ACGGT-GC-C--ATGG--AGGA-TTAA-GCA-TCC--TCT---GCC---------ACCC-G--TC-ATACC---CACC---TGAGCTT-TAGTC--AACAAAA-G-TAAACG-GGA-T---A-TC---TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-AAAAA--TTA-CT--TT--CTAACA-A-----AG-GATATGAAA-----CAAAA-ACAGCCAACATGTGAC--A--------TTGTAATTGCA-AAAA-AAAGTC---CA--AT-ATAATGACCG----TAGAATTTGTGAAGATGATGACTGTTAAACGAGG-A-TG--GTGCATTAA-CCCTGTCACAACA-AGC--GTATGTTACTA--GAGGG---T--CACGCTT---T-AAA---AATGTCTCCATACGCAATGGCATTG-CCCTTG
gi|9 : ATATACCACAC-CCATA--TGACAG-AA-GTAT-ATGCCGA--ACATATACTTACCATACATAGAAAAGG-----AACACA-TTCGACCGTATTGCAAAGT--G-AATTAAAAATTCA-CACG----C-TA---TCAGCCCTATA-A---TAGTACGGTT--GTCAGCTCCCTG-C---CAATTAG------GACGTACAA-ATGATATACATA--GAGTAT-CCCATAA-TAA-TGTAAGCAAA-AGATATGTTCTA-GATTCCGTAACTG-CTCCAC--ATATCATAACGCCAGAAAT---CT-ACGCAGGA--------AT-------AGCTACCT-CACA--ATTTAGACATAAATCCCATGT-GTGAAAAACT--TAT-CAT-----TCTTACATTGATCATCACAGTGCATTCTACAC-A-AC--TG-C---TA-TATA-CCTCATACTGCCCTAAGGTTt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGGTGAAGATAACGAACAGTAATACAAAATTAAGAGTTGCAATTAGGGAAAACATAACCCCTTTAATTTGGACATACCAGAGGTGGGATAAAGTGCTTAGGAGGAATAAGCGCCCATCGTGAGCCTCGCTTTCATCTCGATCAGGTAAACGTACTTAATGCGTAGCCAAAATCAGTTTACATGCAAAGAACTGCAAAACAAATAACATGATTAAGGTGGAATGCTACACCAG
Unaligned ( gi|21 ): TAAATTGACGAAGTTACAATGTGTTAAGACTGGATTCCAATGGTGCCAATATTTCACTAAGTTGAATAAAGGGCTGCATGGACTTCCGACACA
Unaligned ( gi|22 ): TGTTCGTTGAATAATATTTATTACCAAATGACTTATATTAGACTGAATCACTGTTTACGAATGCAAAACAATTACGTGAAATAAT
Unaligned ( gi|27 ): ACCACCCCTACAAACTAGTACAGTATAAAATGGCGAAGTAACAATGATATGAAACGTAATAC
Unaligned ( gi|35 ): TGTGTATAAAATGGCGAAGTAACAATAATGTATTAAACGTAAT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 222 1 1 111 11 1111111111 1111 111111111 22222222222 1 111 111111111 1111111 11 11111111 222222222 11111 1111 11111 11111 1111 1111 11111 11 1111 11 11111111111 11111 11111 222222 111 333333333333 222222 2222 11 2222222222 111 111 22222222222222222222 111111 333333333 22222222222222222 44444444444444 22222222222222 111111 11 44444444444444444 111 1111 111 11111 1111 111111 22222222222222 333333333333333333333333333333333 3333333333 1 55555555555 1 11 1 1 555555555 2 2222 111 1 1 222 222 11 1 22222 1 1
lowQualScore : 88 1 111 1 5 1 1 1 111 5 5 1 3 8 1 6 000 22 33 7777 4 3 2 22 66 55 1 66 888 7777 8888888888 1111 3 444 111111111 4 555 0 55 44444444444 5 66 0 5 888 5 333 999999999 5 666 4 4444444 5 4 4 00 66 4 4 8 66 777 44444444 4 66 4 111111111 5 5 5 5 777 4 4 11111 4 1111 55 4 99 55 4 11111 4 5 11111 4 4 6 44 1 99 4 2222 55 4 3 4444 4 5 7777 5 5 5 66 5 5 5 1 5 11111 66 888 66 888 5 888 5 22 1 0 5 5 33 8 11 0000 1 00 5 66 5 11111111111 66 22222 66 2 22222 888 5 5 5 9999 666666 0 8888 777 8888 0 8888888 55 55 111 4 777 4 55 1 4 55 111111111111 8 777 111111 4 3333 2 77 5 6666 33 5 3333333333 000 66 000 99999999999999999999 77 5 5 000000 5 1 777777777 11111111111111111 99 8 77777777777777 5 00000000000000 8 8 99 111111 1 11 8 55555555555555555 1 8 444 7 4444 000 6 88888 99 8888 99 4444 6 7 999999 00000000000000 6 6 99 6 999999999999999999999999999999999 9999999999 0 44444444444 0 0 33 3 0 3 2 0 333333333 6 7 7777 888 7 5 5 111 111 88 5 1 66666 22 5 5 1
lowQualScore : .. . ... . . . . . ... . . . . . . . ... .. .. .... . . . .. .. .. . .. ... .... .......... .... . ... ......... . ... . .. ........... . .. . . ... . ... ......... . ... . ....... . . . .. .. . . . .. ... ........ . .. . ......... . . . . ... . . ..... . .... .. . .. .. . ..... . . ..... . . . .. . .. . .... .. . . .... . . .... . . . .. . . . . . ..... .. ... .. ... . ... . .. . . . . .. . .. .... . .. . .. . ........... .. ..... .. . ..... ... . . . .... ...... . .... ... .... . ....... .. .. ... . ... . .. . . .. ............ . ... ...... . .... . .. . .... .. . .......... ... .. ... .................... .. . . ...... . . ......... ................. .. . .............. . .............. . . .. ...... . .. . ................. . . ... . .... ... . ..... .. .... .. .... . . ...... .............. . . .. . ................................. .......... . ........... . . .. . . . . . ......... . . .... ... . . . ... ... .. . . ..... .. . . .
lowQualScore : 00 0 555 0 5 0 0 0 000 0 0 0 2 2 5 7 666 99 66 8888 0 8 0 88 88 55 7 99 222 4444 6666666666 4444 6 888 777777777 0 444 9 55 99999999999 0 99 0 0 888 0 888 555555555 0 666 4 4444444 0 4 4 66 11 4 4 9 11 888 55555555 0 11 4 555555555 0 0 0 0 888 4 4 11111 4 2222 55 0 55 55 4 11111 4 7 11111 4 4 5 55 6 55 0 5555 55 0 0 0000 4 7 9999 0 0 0 99 0 0 0 9 1 88888 11 888 99 888 0 888 0 88 4 4 7 7 66 0 66 8888 4 99 0 99 0 99999999999 99 55555 99 2 55555 888 0 0 0 0000 666666 1 5555 000 5555 9 8888888 55 00 444 0 000 0 55 4 0 33 666666666666 9 000 888888 0 3333 0 99 7 9999 66 1 6666666666 000 00 000 33333333333333333333 99 7 7 333333 7 7 000000000 00000000000000000 44 0 00000000000000 0 00000000000000 0 0 00 888888 0 00 0 66666666666666666 0 0 000 5 2222 222 7 22222 22 8888 22 2222 7 8 222222 88888888888888 7 7 22 7 888888888888888888888888888888888 8888888888 0 55555555555 0 2 22 2 0 2 5 0 333333333 7 3 0000 333 3 5 5 000 000 00 5 0 00000 00 5 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACAT-AAT------T-ATGAAAA--T--TAT-GAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
Reference ( family-8 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACAT-AAT------T-ATGAAAA--T--TAT-GAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
gi|1 : ATTGTTCTATTAT-AATATCAATAATTA-AG----CGA-AGGT-AA-A--TCGG--GCTTAAAAACGTAAT-C-ATA-A--T-TCA--A---AA----AA-ACA---A-T---C---CACA-A-ATCGTGT--GCGTCTGG----GACAA-C--ACGGGA-CC---TCAG-AT--CAAAAACACCG---CGAA-AGTT-AGGACAT-------A-GGC-GC-CATATGG--TGGA-TGAG-GCAGTCCCTTCT---GTT---------ACCGCGGTTC-ACAC------CCCCGTGA--CCGTAGTGAAAAT-AAA-GTTAAACGCGGATTTTAA-CCCG-TTCTAGAATCAAATCTACGTA--GAGAAAATGTGATCA--GTTACTAACATATATGTAG-ATCATAAAACCAACC-AAATTCAGTCAACATATGAA-TAGTGATACTTTGTAATCGCATAAACAAAGGTGGTACATCTT-ATAACGACCGTGATTAAAATTTGC--------TAAC------ATGA-GTA-TC--TT-GA-TA-----TACG--ATCG-A-TATTTTTGTTAGTAGTGTTGGATTCTACTCGCTTCTGT-AAA---AA-ATCCGCAT
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgatt--CA-G---A---CG-A-G-ATCAAGT--G---CT---------AA-T--GC-GGA-TT---TTTT-A---CAGAA-----G---CGA---G-T-AGAAT-C-------tagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttgCATACGGG-CAG-GATG-ATTATGTGGTTTCTAT-----TAC--TACATAGAAAGCGTTGATAC---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGCTGT-AAT-----AAACGTAACAGTACCTCGACTTCG----TATG-GAGTT-CTA--GTCTGGTCAGAT-TCT--C---C-CTTAGAGGTCCAATGT-TAAGGTGA-------ATGTGATACGCA---AA-TAT-TG-AAGctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttga-TCCTTTTAATATC---------GAGTTTGTCT-TC---GGGTCCTAGTGATCAGTACCA--TG--T-GA-AGCATTTAGTCGT-ATT------TGATACAAA--T--GAT-GATAGATTTGTAA-TTTGAT-A--------------ACACTA-ATTTCATCAACTA-TATAACC-TATA-TG---TAA--TTGTTAAGGACA-CGGCATAAGTTTGGTATATATCTTTTTTTTACATCCAGACGTTATAGAATGTCTCTGCGTA-CATAATGTTCCTGGTCTTTAATATTTATAACTAATCATAATATACGTCAAGTTTTGCCAATAACGTACAGGTTGGGCATCAA-TAATAGTAGCCCATCTCACGTAGAGGCATAA-TTACC--AAACGGTGGATTGTATCGT-GGGAAAGACCTCGGTGTCTCGCCAAGACTTACATA-AA-TATTATGCTA-AAGAAACC-AAGCA-TTGTCTTAGATTGAGTCATGCCCA-T-CAGCTTGGTACATTTGTGTAGGCA-TTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGTtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|10 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgcAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGAT-ACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA----CTTTTGGTTAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TG-CCCCTGCGTATTCGAATCAA--CTGAGA-AT-CAT-ACACACCATA--AA-CAG-GC-G-AT-A-GTGGT--ACGT-----TGC--TACATGGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGACATCACG----TTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TTTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-agc
gi|11 : -TAT--A-AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--AAGT--A--TGAAAC-GTAAT-C-ATA-G--T-C----C---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TTCG-A---CGAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CG--CCGTGAGCCTGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTAGTG-GAAAG--TGA-AAT-AT--CTAA
gi|13 : atagAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGATTACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA-----CTGTTG-TAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---T-AGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TGCCCCTTGCGTtgcattccagatgaacttaaattacacaaaactgcatcgctgatacgaggcataataaatttactga
gi|14 : cgaaaatttcacccgatacacagccctaATA-AG---TAAGGTTT--AAGGGGA-CGGCA--ATTGT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTTTGA--A-CAAA-T---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGAA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-AAC-AATA-----GATTGT----TGG---AAGACT-TGGTATC---------CT-ATAT----ATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTAGTTCAGT---GT--ACTTGTGTGGGCAAT
gi|15 : C---AA-TAT--G-AGAC--A----TCTGT--CA-GAT-CTGTGG-T---CCTTT--AT-TC----------AGTT---CCGTC---GAG--------AT----------TA--T-CG-A--CT---GACAT-AAT------G---GAAAA--T--AATTAAT-----TGTTA-TTTAAT-A--------------A-AC-ATAT--CG-C---TA-TATA-CT-AA-A--G---TAAGGT-G--CAGGACA-CG-CA--G---------------TTATTGT-TATCC---C-TAA--G----TTTTTGG--AACAAAAT---TCTG--CTTGG---TGAA-A--TAA----AA-ATA-GTT------T-CCAA----------A---GTCA-CAATT--TAGT-G
gi|16 : -ACACACCATA--AG----------------TGGT--ATAT-----TAC--TACATA-AAAGGG-----AA---ACATTTA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TA---A---T-GTA--ATG--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-TAA-GTG-----------AAATAT-CC---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CAGGATT
gi|17 : atctGTAAAAG----CTTTT-C--A-CAAA-T---TCTT--CCGGG-CACGAATA--TAG----AA-GCAGGTC------TGCTTACAA-----ACT---AGCA-CAA-T--TTGT-GCTCAT---------GAG---AATT-CCC-TGGA-----GACTGT----T-GT--AAGACC-CGATA----------ACC-AAATACAAATGTTGT-CCATAAGGAACCCGAGTATTGCTtgaatacaaattgtattgcatttaattttaaaa
gi|18 : tcgaacccaaggccacatat-----AGTCTTCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---CCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATTT-TAA-AT---------A--AAATAT-CC---AA--AT----AAG---A-AGATATGtcagtgatca
gi|19 : taa-GC-T--ATAG--AGGA-ATGA-GCA-TCC--CGT---GACG--------ACCG-G--TC-ATACCA--AG---CGTGAGCCgtgtatgtattttcattgccaatgtttttgcctttgatatcttatctttggtatgatagatattttctcatgcaataaatgtatgaat
gi|2 : TGAAT--TGATGATTG---TCAAGAAAGTTGGTGTTCTAGCCTTAACGCAGCTTGCACTGA-GA-AGATTCGGGATTGTCCCAT-AT-C-TAT--ACAAAAAAGG----CGA-AGTT-AACA--TTGT--G--TCAAACCGTAAT-C-ATA-A--T-C----A---AA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGATCC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-AG-TGAGGAT-C-------A-AGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCT--TCT---GCTG--------ACCG----TC-ACACCGCGCGCCTCGTGAGCCCTTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAACG-GAATT---A-CCCGGTA-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AGAGGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGTGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCA----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TTCAGT-TA-TAA-CCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCAT-CGC-ATAGCA-TG--TCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAGCGG-G-AT-A-GTGGT--ATAT-----TAC--TACATAGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-TG-ATTGCAAAGT--T-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATACA---TAATA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTAA-------AT-AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTATGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATGTGGACAT-AAT------T-ATGGAAA--TTATAT-GAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CATC---TATTATA-CC-AATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTCTGT--A-CAAAAT---TCTG--CTTCA-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAAT-A-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACCTTACG-----GATTGT----T-G---AAGACC-TGGTCTCAA----AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATGAGAAACTCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTACTTCAGA---GTAT-CTTGTGTGGACAATCA-GAG-TG---TTTC---ATAAC--CAAAATATGTGTACTGTTCCC-----ACTACAGCTAGAAATTCGTATT-TTCGGGTagataagatgtaaatgtttgttgaataatatttacttccaaatgaattatataagaatgaatcactgtttacgagtgcaaaatttgcgtgaaa
gi|20 : agtttaaaagcccgggttacctggctatagacagGATTGT---AT-AG-T-TA-----AAATG-GAGCCTCGA-AG-T-AACA--AAGTATG--TGAAAC--TAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AAGACA--CAGTTA-A---CT-A-A-A--GAGT--G---CTAg
gi|23 : aaaatttcataatgtgtggagaacccaatctTG--------ACCG-G--TC-ACAAC---CGCT--GTGAGCCCGTATTAGAAAC-AAA-G-CAAACG-GGGTT---T-CCCA-TC-----GTCAAATCTA-GTtagc
gi|24 : T---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GAA--C-GAAAA--CGA-AAAAGT--CTAACG-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAG-TCGGTCAACA
gi|25 : cTTATAATCAC--AAAC-AATGT----CA--TT-ATAGTGACCGAT--CAGAA
gi|26 : T--GACAG---TCTAACAAAC-ATTAGAT--TCAATAT-GAA-GT---------A--AAATAT-CC---AACTA--TG-AAGC----AGATATGaactgttcagtatgaactatgaa
gi|28 : AT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--T--TTAA
gi|29 : tttttttttattactatttattggaTCCTAT-ATAT-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|3 : attgttatTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGAC------AT-GT-C-AAT--GTAAA---GA----CAA-AG----ACA--TC---------AAA---TATT-T-GTT-G--T-CTTGCA---AATCCTAA-GCA--GAAC---A---CA-A-A-AACAA---------TAGTTT-GGCAAAC--CC-GGA-CC---CCCGGA---CAAAC---------CAGA-GG-T-GGGAC-C-------A-GGC-GCGC--A-GG--AGGA-GCAA-ACA-TCC---CC---GTAG--------ACTG-G--CC-TCATC---CGCCCTGgt
gi|3 : GC--AAAC-CAAAT----CG--CT-ACAACAACCA----TATAATTCGCGAA-ACACTG-CCCCAAAACGT-G-A-CT--GC-CG-AAATCCCTGCAACAACACA-CTATCT-GCAAACC--GCCTG---C--CTCGATT---C-AAACATAA-GTCTGCA----------------------CGCAC-CGA-TCAAG-CCGAGAGATACAA-ACACA--ACA--AG-CAA-GT-G-AT-G-ATCGG--ACAT-----TGC--TACACAAATACCG-----AA---A-GCTGA-CA-AC-GTAAAAT--CCGAT-----A-CCGTCTTG----TCTG---TCA----CAAA-G---T-CGA--GCC--GTCAG---T-TG-C---C-------G--CCAATGT-TCA-ATGA-------A--A--TAT-CC---AAGTAT--G-AAGC--AGAGAT-TG---AA-GACTCTGCAG-CACTCCTTCC-ACCTC---------CAGCC---CA-CT---GGG--------AC-------A--CA--C-CG-A--ATC--GACGC-A-----------TGAA---------------------CTA-AAAGAC-A--------------AAAC-G--T--CGTC---AA-GATA-TC-GATA-TG---TCGAACTA--AAGGCCATCAG-A--TATTT----------CTTCTTTT-CAT------GTAGGAG----CTTTTGG--A-CGAA-T---TCTG--CCTCT-TAAGAATA--TGA----AA-ACAGGTC------TGCTAACAA-----AGG---AGCA-CAA-T--CAGT-GCTCAT---------atcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccggcaaaccaaatcgctacaacaaccatataattcgcgaaacactgccccaaaacgtgactgccgaaatccctgcaacaacacactatctgcaaaccgcctgcctcgattcaaacataagtctgcacgcaccgatcaagccgagagatacaaacacaacaagcaagtgatgatcggacattgctacacaaataccgaaagctgacaacgtaaaatccgataccgtcttgtctgtcacaaagtcgagccgtcagttgccgccaatgttcaatgaaatatccaagtatgaagcagagattgaagactctgcagcactccttccacctccagcccactgggacacaccgaatcgacgcatgaactaaaagacaaaacgtcgtcaagatatcgatatgtcgaactaaaggccatcagatatttcttcttttcatgtaggagcttttggacgaattctgcctcttaagaatatgaaaacaggtctgctaacaaaggagcacaatcagtgctcat
gi|30 : tgaatgttgttgattgaaattgaataaattagatccaagatttgatgccggcactgacgacaaatgtgggacatgtcaatgtaaagacaaagacatcaaatatttgttgtcttgcaaatcctaagcagaacacaaaaacaatagtttggcaaacccggacccccggacaaaccagaggtgggaccaggcgcgcaggaggagcaaacatccccgtagactggcctcatccgccctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccg--ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|31 : --ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TTAAA-CGTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|32 : GG-TG-TCTTTT--AAATC---------GAGTT---CT-TT---GGG--------AT-------A--TA--TATA-A--ATATATATAT-AA
gi|33 : AT--ACAAATA-GG----CAA-AGGT-ACCA--TAGT--G--TTAAA-CGTAAT-A-AT
gi|34 : gaaT-C-------A-GGT-GC-C--ATGGGTAGGA-GTA--GCA-TCC--TCTTCTGCTG--------ACCG-
gi|36 : --ACAAATT-GG----TGA-ATGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-aa
gi|37 : aaaaCAAATA-GG----CGA-TGGT-AACA--TCGT--G--TAAAAC
gi|38 : taaaagAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AGCA--TCGT--GTNTAAAACg
gi|39 : AT--ACAAACA-GG----CGA-AGGT-ATCA--TCGT--G--TAAAA-CGTAat
gi|4 : --ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAAA-CGTAAT-C-ATA-A--TCC----A---GA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---TT-G----GGCA
gi|40 : cttaagctttgggtcatctgcctcctttatcctctctagcaggactctattgagaacctttaccggcactgacaggaacatactccctcggtagttgttacagtccctgatgcctccgttctttggcagtttgatgacgagtccctccttccactggactggtacatcttcattatcccaaatcttgctgacgaggctgtgttttccgtgtctgctttgatggcttctgctggtatgttgtccggccttgcagctttcccattcttaagtgttgcgatgaccaagtaattgcgatgaccttcctggatctctactttagattgtaggtcacagttaatgggtagctttggctggtggtatgtctggtggtgcttcaggggcagggcggttcaacaactcctgaagtgttcttcccatctcttcagctgtttctcggttgttgtcagtgggttgccatccttgtctataactggcttgtctgtctgctggaacttgcctgccagcttcttggttttcaggtataggtcctttaggttccattgacctactacatgttcagattaactggccaattcctcaatattgtctttcttgtccttcttgattttttgttgacttccctgtcagctgctgtatactcttcttttaatttggctttagctgctcttgttcggttcatgttcagtgtagctttcttctttttccttatctctattttctggatagtattagaaAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TTAA
gi|41 : aAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TCAAACtca
gi|42 : ATCACG----TTTA---TCA----AATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---Tg
gi|43 : CCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--Gt
gi|5 : -TAT---CAAAGA-AGGCA-CGA-AGTTCAACA--TTGT--G--TCAAACCGTAATTC-ATATA--T-C----ACAAAA----AA-ACAACTA-TGGCA---CA-ACACATCGAGCTCGAC-CTAGCAACGACAA-CCCACTGAA-CCCATTCCA-AGTACAAAA-----AAGCCGAACGG-T-TAGAT-TGTCAGCAA-GGCTGC-CG-ATGG--AGGCCATAACGCAATCC--TC----ACTGGCCAATGAACCG-G--TCCACACC---CGCAC-GTGAGCCCGTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAATG-ATATT---A-CCCG-TA-----GTCACATGAA-GTG--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGTCTTATTGATACTTTGTAATCGC--AAAC-A--GT----CA--TTGATA--GACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGAC-TTCAAACGA-G-ATTC--GA-TA-TAA-CCTTGCAACTTCA-A-CTTTATTGTTAGTA--GGTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA--TCCGCATACAC-ATATCA-TA-CTCTTGCGTAT-CGGATC--AACTGCGAGATATAC-ACAC-CC-TA--AG-CAG-GT-G-AT-A-GTTGT--ATAT-----TAC--TAAATAGAAAGGG-----AA---A-TTTGA-CG-ATTGCAAAGA--C-AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--ATT--GTCAG---TCTG-C---C-ATCAGAG--TCAATTT-TAG---GA-------A--AAATATGCG---AA-TA--TG-AAAC----AGATTTGT--CA-GATTTTAT
gi|6 : gaatACC---TGCC--ATGAGCCCGTGGTGGAAAC-AAA-G-TAAACA-GAATT---ATCCCC-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-AAAAA--TGA-CA--GT--CTAATA-A-----AG-GGCATGAGA-----C-AAA-TCAGTCAACACATGACATAGTGGTAATTTGTAACCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAAAATTTGCAAA-ATGGT------------------TC--GT-TA-TAA-CTTTGGAACATCG-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAAA---AA-GTCCTCATACGC-GTGGCA-TG--CCTTGTGTAT-CGAA--ACAACTGGCAGACATG--AC-CACCACC--AG-GAA-AC-A-AG-A-GTGGT--ACAT-----TAA--TACATAGAAATGA-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AA------AGTCATCGCG----CATA---TCA----T---------------GTT--TTCAG---TCTG-C---C-AGAAGAG--TCGACAT-TAA-GT---------A--AAATAT-CA---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATTTT---------GAGTT---CG-TC---AGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--A--TAGATAT-AAT------C-CTGAAAA--T--TAT-GAT-----TGTttatctatgtatctatctatctttatctgttttctatgtacatcaatgtggaat
gi|7 : CTGC-AT-C-TA-----AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--ATGT--A--TTAAAC-GTAAT-C-ATA-GACC-C----A---AA----CA-ACA--CA-T---A---CA-A---------T--G----TAG----GGCAA-C--TC-GGA-CC---TCCA-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GAT-GT-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCG--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCC--GTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAAAG-TAAACG-AGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-GACAA--AAA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAGG-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTGATGGTAATTTGTAATCGC--AAAC-AAAGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTat
gi|8 : atgtgacattctttcagattgtacatgctgtcaggagatagaaaatggttcccaccagccatgtacctcaagttaattgactgatctacactaattgagtgtttcagtggtgtgataggaggttatgatattagactgatttttttctct-TAT--A-AAAT--GG----CGA-AGTT-ACCAAAT-GT--G--TTAAAC-ATAAT-TTATA-G--T-C----C---AAT---AA-AT---CA-T---AGAATA-A-A-GTCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------ACGGT-GC-C--ATGG--AGGA-TTAA-GCA-TCC--TCT---GCC---------ACCC-G--TC-ATACC---CACC---TGAGCTT-TAGTC--AACAAAA-G-TAAACG-GGA-T---A-TC---TC-----GTCAAATCTA-GTA--C-AAAAA--TTA-CT--TT--CTAACA-A-----AG-GATATGAAA-----CAAAA-ACAGCCAACATGTGAC--A--------TTGTAATTGCA-AAAA-AAAGTC---CA--AT-ATAATGACCG----TAGAATTTGTGAAGATGATGACTGTTAAACGAGG-A-TG--GTGCATTAA-CCCTGTCACAACA-AGC--GTATGTTACTA--GAGGG---T--CACGCTT---T-AAA---AATGTCTCCATACGCAATGGCATTG-CCCTTG
gi|9 : ATATACCACAC-CCATA--TGACAG-AA-GTAT-ATGCCGA--ACATATACTTACCATACATAGAAAAGG-----AACACA-TTCGACCGTATTGCAAAGT--G-AATTAAAAATTCA-CACG----C-TA---TCAGCCCTATA-A---TAGTACGGTT--GTCAGCTCCCTG-C---CAATTAG------GACGTACAA-ATGATATACATA--GAGTAT-CCCATAA-TAA-TGTAAGCAAA-AGATATGTTCTA-GATTCCGTAACTG-CTCCAC--ATATCATAACGCCAGAAAT---CT-ACGCAGGA--------AT-------AGCTACCT-CACA--ATTTAGACATAAATCCCATGT-GTGAAAAACT--TAT-CAT-----TCTTACATTGATCATCACAGTGCATTCTACAC-A-AC--TG-C---TA-TATA-CCTCATACTGCCCTAAGGTTt
blockSeqs : GT T AAA T . A A C . C C G T C C . AT . AA GCCT G T C AA AT TN G CC TC GAC CTTGCA TCCT G ACT GTTAA . CAC TC ACCTAGCAAC A CC T T CAT G GTA AAGC C TG . GTCAGCA C T G G GT C C A . TCT GCCAATGA . . C GCGCGCCTC A A . . . T G . . GTG . . AA . . . A G . A . T GC G A . C . G A AT G T TTTT G . T CA G T T T C CACT . . . . A CAT T AT A A T CC . AT AAAA G CC A . A AAGTATAT . ATACT CA A . CAC C C T CC TTAAAA . . GCCC CATA CG . CTC A AAA A . A A G GATATACATA G CAT ATAT T AAA A TC G CAC C A ATAACGCCAG . CG GCA ATAGC CC A C ATGT A A CCCATGTG TTATATGAT CA C TCACAGTGCATTCT C ATATCGC T . TC CTGCCC G . T ATTGT G . . C . A A AT . CGT . . . A . TAAAGG . T . . GAGAATTCCCTGGA TGG . CTCAAAG . AC A . T C T . G T T AT A . . . . . A G . CT A . G
blockSeqs : T C T . C . G GCA G G . . G . C CC TT TA CACAA T . C TGGCA . G . TAGTTT . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . CGCCCT . . . . . . . . . G . . T . . . . G . . . T GC A . . . . . A . . G TTTT . . . . . . . T C ACT . . . . . . . AT A . . C . AT ACAA A C A . . CGGGATA . . . G . . . . . C T . . . ATA . . . . . . . A . A AAAT . . TATT . AG A . . CTG . C G . T . ATA . . . ATAT . A TA ACTTATCAT T . . A AATCATC . . A AG G . . AGTTT A . . A . G . AT . GGC . . . G . CAAACT . . . . AGGAATACCTTACG TGT . ATC . A A . T C . . C T A A A
blockSeqs : . . T . T . A . . G . . G . G C C G CCA . . C TAGAA . A . CTAG . . . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . CGCAC . . . . . . . . . C . . . . . . . G . . . T GT G . . . . . G . . G TTTT . . . . . . . T G ACT . . . . . . . CG A . . C . T AAG C A A . . GCGATA . . . A . . . . . C T . . . AT . . . . . . . T . G GAA . . CTAT . A A . . TG . A C . A . ACA . . . ATTT . A CC TAATTAAT A . . C GTCGTC . . A TG G . . TATTT G . . C . C . T . CAT . . . A . CAAAGG . . . . AGGAATAACAATA TG . A . . A . T C .
blockSeqs : . . . C . A . . G . . . . T C C A CC . . T ACA . A . TAG . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . CGCC . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . T TT G . . . . . G . . G CCCA . . . . . . . T A ACT . . . . . . . TG A . . . . A AA G C A . . GTGATG . . . C . . . . . T . . . . AT . . . . . . . G . G GAA . . GTAT . A A . . TG . T G . T . ATA . . . ATC . A G TTATGAT A . . . AACTGC . . G TG A . . G C . . G . T . T . CTT . . . G . TAAGG . . . .
blockSeqs : . . C . A . . G . . . . A C C G CA . . C GA . A . TTG . . . . . . . G . T . . . . . . . . . . . . . . . . AAGC . . . . . . . . . G . . . . . . . G . . . A GT G . . . . . A . . G TGTT . . . . . . . T G ACT . . . . . . . CG . . . . . . . . GTGATA . . . G . . . . . C . . . . AT . . . . . . . A . A G . . ATAT . . T . . TG . A G . G . ATA . . . CT . A . . G G . . G . T . GG . . . . . A . . . .
blockSeqs : . A . . G . . . . T C T G CA . . G TA . A . TAG . . . . . . . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . CGCT . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . T AT G . . . . . G . . G TTC . . . . . . . T A AGC . . . . . . . CT . . . . . . . ACAAGA . . . T . . . . . C . . . . GT . . . . . . . G . G A . . TAAT . . A . . . . . . T . AT . . . AT . .
blockSeqs : . A . . G . . . . T C A A CA . . C TA . A . TAG . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . TGCC . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . . . . . . . A C . . . . . . . TC . . . . . . A . . . . . G . . . . AT . . . . . . . T . A A . . TAT . . A
blockSeqs : . T . . G . . . . T C C A CC . . C TA . A . CT . . . . . . . . . . . . . . . CGCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . A . . . . . AT . . . . . . . A . . A . . TAT . . .
blockSeqs : . A . . G . . . . T C C A A . . T TA . . . . . CACC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . AT .
blockSeqs : . A . . G . . . . A C C G A . . C . .
blockSeqs : . A . . G . . . . A C . C
blockSeqs : . A . . G . . . . A C .
blockSeqs : . A . . G . . . . T .
blockSeqs : . A . . T . . . . T
blockSeqs : . A . . T . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqCons : C** ** ** C* CA******** C** TAG******** *** G******** C** ** ** ** *** ***** N*** ** ** ***** ***** ** **** ** **** TTTT ** *** ** *** C* AA** ** GCGATA***** ** ***** C*** ****** **** *** AT***** ** *** ** G* GAA********* A*** TG** ** *** ATA***************** ATT*** CG******* TTATNAT********** AATCGC******** ** ANTTT************ *** **** N** T**** ** CGT* ** **** ****** CAAAGG******** **
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAACCGTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G---CTAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-T-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--G-GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATCAAAACTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-GN-G-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGT--C-AAT-----AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT-------A--TA--T-CA-A--ATNTAGACAT-AAT------T-ATGAAAA--T--TAT-GAT-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-AT--CGTC---TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-ATC--TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TNAAAC-GTAAT-C-ATA-G--TCA--------AA----AA-ACAC--A-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--GTAG--------GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAAG--------CGAA-GGC--AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTAN---GAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-A-TC--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---T-AAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TGC-CCTTGCGTAT-CGAATCAA--CTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAGGCGATA-----GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGTC---AA------AGTCATCACG----CTTA---TCA----TATAAT-----GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAAG-TGAA---------AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGCA---AGATATGT--CA-GATTCTGTGGTG--TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGGATA-----------------TA--T-CA-AATT---AGACAT-AATCG-------TGAAAATTATNAT----------TGTTA-ATTGAT-A--------------ACACAATCGC--------TA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCAANTTT------------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTTGN--A-CAAAT----TCTG--CTTCGT-ATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAACAAAGG--------GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGGTGAAGATAACGAACAGTAATACAAAATTAAGAGTTGCAATTAGGGAAAACATAACCCCTTTAATTTGGACATACCAGAGGTGGGATAAAGTGCTTAGGAGGAATAAGCGCCCATCGTGAGCCTCGCTTTCATCTCGATCAGGTAAACGTACTTAATGCGTAGCCAAAATCAGTTTACATGCAAAGAACTGCAAAACAAATAACATGATTAAGGTGGAATGCTACACCAG
Unaligned ( gi|21 ): TAAATTGACGAAGTTACAATGTGTTAAGACTGGATTCCAATGGTGCCAATATTTCACTAAGTTGAATAAAGGGCTGCATGGACTTCCGACACA
Unaligned ( gi|22 ): TGTTCGTTGAATAATATTTATTACCAAATGACTTATATTAGACTGAATCACTGTTTACGAATGCAAAACAATTACGTGAAATAAT
Unaligned ( gi|27 ): ACCACCCCTACAAACTAGTACAGTATAAAATGGCGAAGTAACAATGATATGAAACGTAATAC
Unaligned ( gi|35 ): TGTGTATAAAATGGCGAAGTAACAATAATGTATTAAACGTAAT
Alignments
lowQualScore : 11 222 1 222 1 1 111 1111111111 1111 1111111 2222 1111 1 111 111 222222222 111 1111111 11 11111111 222222222 11111 111 11111 11111 1111 1111 11111 1 11 11 11111111111 11111 11111 2222222222222 111 333333333333 222222 2222 11 2222222222 111 111 222222222222222 22222 11 33333333333333333333333333333333333333 66666666666666666666666666666666 111111 11 44444444444444444 111 1111 11111 111 111 1111 111111 22222222222222 333333333333333333333333333333333 3333333333 1 55555555555 1 11 1 1 555555555 2 2222 111 1 1 222 222 11 1 22222 1 1
lowQualScore : 88 1 111 1 5 1 1 1 111 5 5 1 3 8 1 6 000 22 33 7777 4 3 2 22 66 22 5555 4 888 7777 8888888888 1111 3 666 7 2222222 4 555 2 66 1111 9999 5 77 1 5 000 5 555 333333333 5 000 5 6666666 5 4 4 00 66 4 4 8 66 777 44444444 4 66 4 111111111 5 5 5 5 777 4 4 11111 4 222 55 4 99 55 4 11111 4 5 11111 4 4 6 44 1 99 4 2222 55 4 4444 4 5 8888 5 5 9999 5 5 5 1 5 11111 66 888 66 888 888 0 22 1 0 5 5 66 0 8 0 11 8 1 00 5 66 5 44444444444 66 22222 66 2 22222 888 5 5 5 3333333333333 4 4 66 777 8888 8888888 55 55 111 4 777 4 55 1 4 55 111111111111 8 777 111111 4 3333 2 77 5 6666 33 5 3333333333 000 66 000 000000000000000 8888 5 22222 33 66666666666666666666666666666666666666 99 8 00000000000000000000000000000000 8 8 99 111111 1 1 11 8 3 66666666666666666 1 8 444 55 4444 55555 333 111 99 8888 99 4444 6 7 999999 33333333333333 6 6 99 6 999999999999999999999999999999999 9999999999 0 44444444444 0 0 33 3 0 3 2 0 333333333 6 7 7777 888 7 5 5 111 111 88 5 1 66666 22 5 5 1
lowQualScore : .. . ... . . . . . ... . . . . . . . ... .. .. .... . . . .. .. .. .... . ... .... .......... .... . ... . ....... . ... . .. .... .... . .. . . ... . ... ......... . ... . ....... . . . .. .. . . . .. ... ........ . .. . ......... . . . . ... . . ..... . ... .. . .. .. . ..... . . ..... . . . .. . .. . .... .. . .... . . .... . . .... . . . . . ..... .. ... .. ... ... . .. . . . . .. . . . .. . . .. . .. . ........... .. ..... .. . ..... ... . . . ............. . . .. ... .... ....... .. .. ... . ... . .. . . .. ............ . ... ...... . .... . .. . .... .. . .......... ... .. ... ............... .... . ..... .. ...................................... .. . ................................ . . .. ...... . . .. . . ................. . . ... .. .... ..... ... ... .. .... .. .... . . ...... .............. . . .. . ................................. .......... . ........... . . .. . . . . . ......... . . .... ... . . . ... ... .. . . ..... .. . . .
lowQualScore : 00 0 555 0 5 0 0 0 000 0 0 0 2 2 5 7 666 99 66 8888 0 8 0 88 88 88 2222 4 222 4444 6666666666 4444 6 222 3 8888888 4 333 0 11 7777 4444 7 99 4 7 000 7 777 777777777 7 666 0 2222222 0 4 4 66 11 4 4 9 11 888 55555555 0 11 4 555555555 0 0 0 0 888 4 4 11111 4 999 55 0 55 55 4 11111 4 7 11111 4 4 5 55 6 55 0 5555 55 0 0000 4 7 6666 0 0 0000 0 0 0 9 1 88888 11 888 99 888 888 0 88 4 4 7 7 44 7 0 8 00 0 4 99 0 99 0 55555555555 99 55555 99 2 55555 888 0 0 0 0000000000000 4 4 11 000 5555 8888888 55 00 444 0 000 0 55 4 0 33 666666666666 9 000 888888 0 3333 0 99 7 9999 66 1 6666666666 000 00 000 777777777777777 9999 7 33333 66 77777777777777777777777777777777777777 44 0 66666666666666666666666666666666 0 0 00 888888 0 7 00 0 2 22222222222222222 0 0 000 00 2222 22222 555 777 22 8888 22 2222 7 8 222222 00000000000000 7 7 22 7 888888888888888888888888888888888 8888888888 0 55555555555 0 2 22 2 0 2 5 0 333333333 7 3 0000 333 3 5 5 000 000 00 5 0 00000 00 5 0 0
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TT---AAAC-GTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--GGAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-AT-C--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATC--AA-CTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-G-CG-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAG------T------CAA-A-GT--CATCACGCTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT--A--TA--T-CA-AA-T-TAGACAT--AATC------GT----GA---AAA--T--TATGA-T-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-ATC------GTCTA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTT-GN--AC-A-AAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
Reference ( family-8 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGAATGTTGNTGATTGAAATCGAGNAAGTTGGTGTCCNAGNCTTGACGCNGCTTGCACTGACGACAGATNCGGGATTGTCCTAT-AT-C-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TN---AAAC-GTAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGC-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCCCCGTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGATT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--NGAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGCGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-AT-C--GT-TA-TAA-CCCTGCAACATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCGCATACGC-ATGGCA-TG-CCCTTGCGTAT-CGAATC--AA-CTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAG-G-CG-AT-A-GTGGT--ACAT-----TAC--TACATAGAAAGGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAG------T------CAA-A-GT--CATCACGCTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTGA-------A--AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT--A--TA--T-CA-AA-T-TAGACAT--AATC------GT----GA---AAA--T--TATNA-T-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-ATC------G-CTA-TATA-CC-NATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--ANTTT----------TTTNTTTT-TATCC---CGTAANAG----TTTTT-GN--AC-A-AAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAGGTC------TGCCAACAA-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACC-TANA-----GATTGT----T-G---AAGACC-CGGTATC------AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTA-TTCAGC---GTACACTTGTGTGGGCAATCATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGTACTNTTCCCCCCAAACTACAGNNAGAAATTCGCATTCTTCNGGT
gi|1 : ATTGTTCTATTAT-AATATCAATAATTA-AG----CGA-AGGT-AA-A--TCGG--G--CTTAAAAAC-GTAAT-C-ATA-A--T-TCA--A---AA----AA-ACA---A-T---C---CACA-A-ATCGTGT--GCGTCTGG----GACAA-C--ACGGGA-CC---TCAG-AT--CAAAAACACCG---CGAA-AGTT-AGGACAT-------A-GGC-GC-CATATGG--TGGA-TGAG-GCAGTCCCTTCT---GTT---------ACCGCGGTTC-ACAC------CCCCGTGA--CCGTAGTGAAAAT-AAA-GTTAAACGCGGATTTTAA-CCCG-TTCTAGAATCAAATCTACGTAG-AGAAAATGTGATCA--GTTACTAACATATATGTAG-ATCATAAAACCAACC-AAATTCAGTCAACATATGAA-TAGTGATACTTTGTAATCGCATAAACAAAGGTGGTACATCTT-ATAACGACCGTGATTAAAATTTGC--------TAAC------ATGA-GTAT-C--TT-GA-TA-----TACG--ATCG-A-TATTTTTGTTAGTAGTGTTGGATTCTACTCGCTTCTGTAAA---AA-ATCCGCAT
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattCATACGGG-CAG-GATG-ATTATGTGGTTTCTAT-----TAC--TACATAGAAAGCGTTGATAC---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAGCTGTAAT------AAA-C-GTAACAGTAC-CTCGACTTCG----TATG-GAGTT-CTA--GTCTGGTCAGAT-TCT--C---C-CTTAGAGGTCCAATGT-TAAGGTGA-------ATGTGATACGCA---AA-TAT-TG-AAGtagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|1 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttga-TCCTTTTAATATC---------GAGTTTGTCT-TC---GGGTCCTAGTGATCAG--TA--C-CA-TG-T-GAAGCATTTAGTC------GTATTTGATACAAA--T--GATGA-TAGATTTGTAA-TTTGAT-A--------------ACACTA-ATTTCATCAA-CTA-TATAACC-TATA-TG---TAA--TTGTTAAGGACA-CGGCATAAGTTTGGTATATATCTTTTTTTTACATCCAGACGTTATAGAATGTCTCT-GCGTAC-ATAATGTTCCTGGTCTTTAATATTTATAACTAATCATAATATACGTCAAGTTTTGCCAATAACGTACAGGTTGGGCATCAA-TAATAGTAGCCCATCTCACGTAGAGGCATAA-TTACC--AAACGGTGGATTGTATCGT-GGGAAAGACCTCGGTGTCTCGCCAAGACTTACATA-AA-TATTATGCTA-AAGAAACC-AAGCA-TTGTCTTAGATTGAGTCATGCCCA-T-CAGCTTGGTACATTTGTGTAGGCA-TTATGAGTTGATCCTTCTGTGTAACAGCAAAATATGTGT-CTTTTCTCCCCAAATTACAAAAAG-AATTTACATTCTTCTGGTtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgctccttttaatatcgagtttgtcttcgggtcctagtgatcagtaccatgtgaagcatttagtcgtatttgatacaaatgatgatagatttgtaatttgataacactaatttcatcaactatataacctatatgtaattgttaaggacacggcataagtttggtatatatcttttttttacatccagacgttatagaatgtctctgcgtacataatgttcctggtctttaatatttataactaatcataatatacgtcaagttttgccaataacgtacaggttgggcatcaataatagtagcccatctcacgtagaggcataattaccaaacggtggattgtatcgtgggaaagacctcggtgtctcgccaagacttacataaatattatgctaaagaaaccaagcattgtcttagattgagtcatgcccatcagcttggtacatttgtgtaggcattatgagttgatccttctgtgtaacagcaaaatatgtgtcttttctccccaaattacaaaaagaatttacattcttctggtagc
gi|10 : gtgtattttttatttaatttgattattgttctattataatatcaataattaagcgaaggtaaatcgggcttaaaaacgtaatcataattcaaaaaaacaatccacaaatcgtgtgcgtctgggacaacacgggacctcagatcaaaaacaccgcgaaagttaggacataggcgccatatggtggatgaggcagtcccttctgttaccgcggttcacacccccgtgaccgtagtgaaaataaagttaaacgcggattttaacccgttctagaatcaaatctacgtagagaaaatgtgatcagttactaacatatatgtagatcataaaaccaaccaaattcagtcaacatatgaatagtgatactttgtaatcgcataaacaaaggtggtacatcttataacgaccgtgattaaaatttgctaacatgagtatcttgatatacgatcgatatttttgttagtagtgttggattctactcgcttctgtaaaaaatccgcattagcacttgatctcgtctgctcttggtcggtgtttcataacggccaattttgcatatactagactcgattttcaacatacactgactctagactatttgacatacgggcaggatgattatgtggtttctattactacatagaaagcgttgatacagttgacgattgcaaagctgtaataaacgtaacagtacctcgacttcgtatggagttctagtctggtcagattctcccttagaggtccaatgttaaggtgaatgtgatacgcaaatattgaagtcagcatcaacgggtgtgcatgcttaagctccttcctagtggcaccttgatctccaccgtttgcAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGAT-ACTTTTAAACGA-G-AT-C--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA----CTTTTGGTTAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---TAGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TG-CCCCTGCGTATTCGAATC--AA-CTGAGA-AT-CAT-ACACACCATA--AA-CAG-G-CG-AT-A-GTGGT--ACGT-----TGC--TACATGGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAG------T------CAA-A-GA--CATCACGTTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---TTTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-agc
gi|11 : -TAT--A-AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--AAGT--A--TG---AAAC-GTAAT-C-ATA-G--T-C----C---AA----AA-ACA--CA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TTCG-A---CGAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCC--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CG--CCGTGAGCCTGTAGTCGAAAC-AAA-G-TAAACG-GGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTAGTGGAAAG--TGA-AAT-AT--CTAA
gi|13 : atagAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-G-TATGACA-----C-AAA-TCAGTCAACATGTGACTTAGCGATAATTTGTAATC-C--TAAC-AAGGT----CA--TT-ATAACGACCG----TAGACTATGCGAA-ATGATTACTTTTAAACGA-G-AT-C--GT-TA-TAA-CCC-GCACCATCA-----CTGTTG-TAGTA--GTTGG---C--CTTGCTT---TAGA---AA-GTCATCATACAC-ATGGTA-TGCCCCTTGCGTtgcattccagatgaacttaaattacacaaaactgcatcgctgatacgaggcataataaatttactga
gi|14 : cgaaaatttcacccgatacacagccctaATA-AG---TAAGGTTT--AAGGGGA-CGGCA--ATTGT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTTT-GA--AC-A-AAT---TCTG--CTTCG-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAATAA-----AGG---GGAA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-AAC-AATA-----GATTGT----TGG---AAGACT-TGGTATC---------CT-ATAT----ATATTAT-CTATAAGAAACCCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTAGTTCAGT---GT--ACTTGTGTGGGCAAT
gi|15 : C---AA-TAT--G-AGAC--A----TCTGT--CA-GAT-CTGTGG-T---CCTTT--AT-TC----------AGTT---CCGTC---GAG--------AT-----TA--T-CG-AC-T---GACAT--AAT-------G-----GA---AAA--T--AATTAAT-----TGTTA-TTTAAT-A--------------A-AC-ATATC------G-CTA-TATA-CT-AA-A--G---TAAGG-TG--CAGGACA-C-GCA--G---------------TTATTGT-TATCC---C-TA--AG----TTTTTGGA--ACAA-AAT---TCTG--CTTGG---TGAA-A--TAA----AA-ATA-GTT------T-CCAA----------A---GTCA-CAATT--TAGT-G
gi|16 : -ACACACCATA--AG----------------TGGT--ATAT-----TAC--TACATA-AAAGGG-----AA---ACATTTA-CG-ATTGCAAAG------T------CAA-A-GT--CATCACGCTTA---TC------ATA-A---T-GTA--ATG--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATAT-TAA-GTG-----------AAATAT-CC---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CAGGATT
gi|17 : atctGTAAAAG----CTTTT--C--AC-A-AAT---TCTT--CCGGG-CACGAATA--TAG----AA-GCAGGTC------TGCTTACAA-----ACT---AGCA-CAA-T--TTGT-GCTCAT---------GAG---AATT-CCC-TGGA-----GACTGT----T-GT--AAGACC-CGATA----------ACC-AAATACAAATGTTGT-CCATAAGGAACCCGAGTATTGCTtgaatacaaattgtattgcatttaattttaaaa
gi|18 : tcgaacccaaggccacatatAA-A-GT--CTTCACGCTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---CCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATTT-TAA-AT---------A--AAATAT-CC---AA--AT----AAG---A-AGATATGtcagtgatca
gi|19 : t-GC-T--ATAG--AGGA-ATGA-GCA-TCC--CGT---GACG--------ACCG-G--TC-ATACCA--AG---CGTGAGCCgtgtatgtattttcattgccaatgtttttgcctttgatatcttatctttggtatgatagatattttctcatgcaataaatgtatgaat
gi|2 : TGAAT--TGATGATTG---TCAAGAAAGTTGGTGTTCTAGCCTTAACGCAGCTTGCACTGA-GA-AGATTCGGGATTGTCCCAT-AT-C-TAT--ACAAAAAAGG----CGA-AGTT-AACA--TTGT--G--TC---AAACCGTAAT-C-ATA-A--T-C----A---AA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--GC---TAG----GGCAA-C--AC-GGATCC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-AG-TGAGGAT-C-------A-AGT-GC-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCT--TCT---GCTG--------ACCG----TC-ACACCGCGCGCCTCGTGAGCCCTTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAACG-GAATT---A-CCCGGTA-----GTCAAATCTA-GTA--GGAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AGAGGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTAGTGATAATTTGTAATCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCA----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTTTAAACGA-G-AT-TCAGT-TA-TAA-CCCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA-GTCCGCAT-CGC-ATAGCA-TG--TCTTGCGTAT-CGAATCAAAA-CTGGGAGATATAC-ACACACCATA--AG-CAGCG-GG-AT-A-GTGGT--ATAT-----TAC--TACATAGAAAAGG-----AA---A-GTTGA-TG-ATTGCAAAG------T------TAATA-GT--CATCACGCTTA---TCA----TATACA---TAATA--GTT--GTCAG---TCTG-C---C-ATTAGAG--TCAATGT-TAA-GTAA-------AT-AAATAT-CC---AA-TAT-TG-AAGC--A-AGATATGT--CA-GATTCTATGG-TG-TCCTTT--ATATC---------GAGTT---CT-TC---GGG--------AT--A--TA--T-CA-AA-TGTGGACAT--AATT------AT----GG---AAA--TTATATGA-T-----TGTTA-ATTGAT-A--------------ACAC-A-ATC------ATCTATTATA-CC-AATA-TG---TAAGGTTG--AAGGACA-CGGCA--AGTTT----------TTTGTTTT-TATCC---CGTAACAG----TTTCT-GT--ACAA-AAT---TCTG--CTTCA-TATGAATA--TAA----AA-ATAAGTC------TGCCAAT-A-----AGG---GGCA-CAA-T--TAGT-GCCCAT---------AGG---AA-T-ACCTTACG-----GATTGT----T-G---AAGACC-TGGTCTCAA----AGACC-ACATA-AAATATTAT-CTATGAGAAACTCAAGCA-TGCTCTTA---------ATATCTACTTCAGA---GTAT-CTTGTGTGGACAATCA-GAG-TG---TTTC---ATAAC--CAAAATATGTGTACTGTTCCC-----ACTACAGCTAGAAATTCGTATT-TTCGGGTagataagatgtaaatgtttgttgaataatatttacttccaaatgaattatataagaatgaatcactgtttacgagtgcaaaatttgcgtgaaa
gi|20 : agtttaaaagcccgggttacctggctatagacagGATTGT---AT-AG-T-TA-----AAATG-GAGCCTCGA-AG-T-AACA--AAGTATG--TG---AAAC--TAAT-C-ATA-G--T-C----A---AA----AAGACA--CAGTTA-A---CT-A-A-A--GAGT--G----g
gi|23 : aaaatttcataatgtgtggagaacccaatctTG--------ACCG-G--TC-ACAAC---CGCT--GTGAGCCCGTATTAGAAAC-AAA-G-CAAACG-GGGTT---T-CCCA-TC-----GTCAAATCTA-GTctatagc
gi|24 : T---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GAA--CGAAAA--CGA-AAAAGT--CTAACG-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAG-TCGGTCAACA
gi|25 : cTTATAATCAC--AAAC-AATGT----CA--TT-ATAGTGACCGAT--CAGAA
gi|26 : T--GACAG---TCTAACAAAC-ATTAGAT--TCAATAT-GAA-GT---------A--AAATAT-CC---AACTA--TG-AAGC----AGATATGaactgttcagtatgaactatgaa
gi|28 : AT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--T--TT---AA
gi|29 : tttttttttattactatttattggaTCCTAT-ATAT-TAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TA---AAAC-GT
gi|3 : attgttatTGAATGTTGTTGATTGAAATTGAATAAATTAG-ATCCAAGATTTGATGCCG---GCACTGACGACAAATGTGGGAC------AT-GT-C-AAT--GTAAA---GA----CAA-AG----ACA--TC------------AAA---TATT-T-GTT-G--T-CTTGCA---AATCCTAA-GCA--GAAC---A---CA-A-A-AACAA---------TAGTTT-GGCAAAC--CC-GGA-CC---CCCGGA---CAAAC---------CAGA-GG-T-GGGAC-C-------A-GGC-GCGC--A-GG--AGGA-GCAA-ACA-TCC---CC---GTAG--------ACTG-G--CC-TCATC---CGCCCTG
gi|3 : GC--AAAC-CAAAT----CG--CT-ACAACAACCA----TATAATTCGCGAA-ACACTG-CCCCAAAACGT-G-AC-T--GC-CG-AAATCCCTGCAACAACACA-CTATCT-GCAAACC--GCCTG---C--CTCGATT---CAAACATAA-GTCTGCA----------------------CGCAC-CGA-TC--AAGCCGAGAGATACAA-ACACA--ACA--AG-CAA-G-TG-AT-G-ATCGG--ACAT-----TGC--TACACAAATACCG-----AA---A-GCTGA-CA-AC-GTAAAA------T------CCG-ATAC--CGTCTTGTCTG---TCA----CAAA-G---T-CGA--GCC--GTCAG---T-TG-C---C-------G--CCAATGT-TCA-ATGA-------A--A--TAT-CC---AAGTAT--G-AAGC--AGAGAT-TG---AA-GACTCTGCAG-CACTCCTTCC-ACCTC---------CAGCC---CA-CT---GGG--------AC--A--CA--C-CG-AA-T-C-GACG------C------AT----GA---A---------------------CTA-AAAGAC-A--------------AAAC-G--TC------GTCAA-GATA-TC-GATA-TG---TCGAACTA--AAGGCCATCAG-A--TATTT----------CTTCTTTT-CAT------GTAGGAG----CTTTT-GG--AC-G-AAT---TCTG--CCTCT-TAAGAATA--TGA----AA-ACAGGTC------TGCTAACAA-----AGG---AGCA-CAA-T--CAGT-GCTCAT---------atcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccggcaaaccaaatcgctacaacaaccatataattcgcgaaacactgccccaaaacgtgactgccgaaatccctgcaacaacacactatctgcaaaccgcctgcctcgattcaaacataagtctgcacgcaccgatcaagccgagagatacaaacacaacaagcaagtgatgatcggacattgctacacaaataccgaaagctgacaacgtaaaatccgataccgtcttgtctgtcacaaagtcgagccgtcagttgccgccaatgttcaatgaaatatccaagtatgaagcagagattgaagactctgcagcactccttccacctccagcccactgggacacaccgaatcgacgcatgaactaaaagacaaaacgtcgtcaagatatcgatatgtcgaactaaaggccatcagatatttcttcttttcatgtaggagcttttggacgaattctgcctcttaagaatatgaaaacaggtctgctaacaaaggagcacaatcagtgctcat
gi|30 : tgaatgttgttgattgaaattgaataaattagatccaagatttgatgccggcactgacgacaaatgtgggacatgtcaatgtaaagacaaagacatcaaatatttgttgtcttgcaaatcctaagcagaacacaaaaacaatagtttggcaaacccggacccccggacaaaccagaggtgggaccaggcgcgcaggaggagcaaacatccccgtagactggcctcatccgccctgatcagataaacggaggaaccagcagctcaacaactgccacaacgcacatcagacagcatcggaaccaacggaaggctacaccg--ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TT---AAAC-GTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|31 : --ACAAATA-GG----CGAGAGGT--ACA--TCGTG-G--TT---AAAC-GTAAT---ATA-A--T------A---AA----AA-AAA--CA-T---
gi|32 : GG-TG-TCTTTT--AAATC---------GAGTT---CT-TT---GGG--------AT--A--TA--TATA-AA-TATATATAT--AA
gi|33 : AT--ACAAATA-GG----CAA-AGGT-ACCA--TAGT--G--TT---AAAC-GTAAT-A-AT
gi|34 : gaaT-C-------A-GGT-GC-C--ATGGGTAGGA-GTA--GCA-TCC--TCTTCTGCTG--------ACCG-
gi|36 : --ACAAATT-GG----TGA-ATGT-AACA--TCGT--G--TT---AAAC-GTAAT-C-aa
gi|37 : aaaaCAAATA-GG----CGA-TGGT-AACA--TCGT--G--TA---AAAC-G
gi|38 : taaaagAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AGCA--TCGT--GTNTA---AAAC-AT
gi|39 : AT--ACAAACA-GG----CGA-AGGT-ATCA--TCGT--G--TA---AAAC-GTA
gi|4 : --ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TT---AAAC-GTAAT-C-ATA-A--TCC----A---GA----AA-ACA--TA-T---A---CA-A-A-ATCGAGT--G----TTG----GGCA
gi|40 : cttaagctttgggtcatctgcctcctttatcctctctagcaggactctattgagaacctttaccggcactgacaggaacatactccctcggtagttgttacagtccctgatgcctccgttctttggcagtttgatgacgagtccctccttccactggactggtacatcttcattatcccaaatcttgctgacgaggctgtgttttccgtgtctgctttgatggcttctgctggtatgttgtccggccttgcagctttcccattcttaagtgttgcgatgaccaagtaattgcgatgaccttcctggatctctactttagattgtaggtcacagttaatgggtagctttggctggtggtatgtctggtggtgcttcaggggcagggcggttcaacaactcctgaagtgttcttcccatctcttcagctgtttctcggttgttgtcagtgggttgccatccttgtctataactggcttgtctgtctgctggaacttgcctgccagcttcttggttttcaggtataggtcctttaggttccattgacctactacatgttcagattaactggccaattcctcaatattgtctttcttgtccttcttgattttttgttgacttccctgtcagctgctgtatactcttcttttaatttggctttagctgctcttgttcggttcatgttcagtgtagctttcttctttttccttatctctattttctggatagtattagaaAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TT---AA
gi|41 : aAT--ACAAATA-GG----CGA-AGGT-AACA--TCGT--G--TC---AAAC-Gtca
gi|42 : ATCACGTTTA---TCA----AATA-A---T-GTA--GTT--GTCAG---T
gi|43 : CCTGCAGCATCA-A-CTTTTTTGTTAGTA--Gt
gi|5 : -TAT---CAAAGA-AGGCA-CGA-AGTTCAACA--TTGT--G--TC---AAACCGTAATTC-ATATA--T-C----ACAAAA----AA-ACAACTA-TGGCA---CA-ACACATCGAGCTCGACC-TAGCAACGACAA-CCCACTGAA-CCCATTCCA-AGTACAAAA-----AAGCCGAACGG-T-TAGAT-TGTCAGCAA-GGCTGC-CG-ATGG--AGGCCATAACGCAATCC--TC----ACTGGCCAATGAACCG-G--TCCACACC---CGCAC-GTGAGCCCGTAGTCGAAAT-AAA-G-TAAATG-ATATT---A-CCCG-TA-----GTCACATGAA-GTG--GAAAAA--TGA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAAA-----C-AAA-TCAGTCAACATATGTCTTATTGATACTTTGTAATCGC--AAAC-A--GT----CA--TTGATAG--ACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTC-AAACGA-G-ATTC--GA-TA-TAA-CCTTGCAACTTCA-A-CTTTATTGTTAGTA--GGTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AA--TCCGCATACAC-ATATCA-TA-CTCTTGCGTAT-CGGATC--AA-CTGCGAGATATAC-ACAC-CC-TA--AG-CAG-G-TG-AT-A-GTTGT--ATAT-----TAC--TAAATAGAAAGGG-----AA---A-TTTGA-CG-ATTGCAAAG------A------CAA-A-GT--CATCACGCTTA---TCA----TATA-A---T-GTA--ATT--GTCAG---TCTG-C---C-ATCAGAG--TCAATTT-TAG---GA-------A--AAATATGCG---AA-TA--TG-AAAC----AGATTTGT--CA-GATTTTAT
gi|6 : gaatACC---TGCC--ATGAGCCCGTGGTGGAAAC-AAA-G-TAAACA-GAATT---ATCCCC-TC-----GTCAAATCTA-GTA--GAAAAA--TGA-CA--GT--CTAATA-A-----AG-GGCATGAGA-----C-AAA-TCAGTCAACACATGACATAGTGGTAATTTGTAACCGC--AAAC-AAGGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAAAATTTGCAAA-ATGGT-----------------T-C--GT-TA-TAA-CTTTGGAACATCG-A-CTTTTTTGTTAGTA--GTTGG---C--CTCGCTT---TAAA---AAAGTCCTCATACGC-GTGGCA-TG-CC-TTGTGTAT-CGAAAC--AA-CTGGCAGACATG--AC-CACCACC--AG-GAA-A-CA-AG-A-GTGGT--ACAT-----TAA--TACATAGAAATGA-----AA---A-GTTGA-CG-ATTGCAAAG------T------CAA-A-GT--CATCGCGCATA---TCA----T---------------GTT--TTCAG---TCTG-C---C-AGAAGAG--TCGACAT-TAA-GT---------A--AAATAT-CA---AA--ATATG-AAGC----AGATATGT--CA-GATTCTGTGG-TG-TCCTTT--ATTTT---------GAGTT---CG-TC---AGG--------AT--A--TA--T-CA-AA---TAGATAT--AATC------CT----GA---AAA--T--TATGA-T-----TGTttatctatgtatctatctatctttatctgttttctatgtacatcaatgtggaat
gi|7 : CTGC-AT-C-TA-----AAAT--GG----CGA-AG-T-AACA--ATGT--A--TT---AAAC-GTAAT-C-ATA-GACC-C----A---AA----CA-ACA--CA-T---A---CA-A---------T--G----TAG----GGCAA-C--TC-GGA-CC---TCCA-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------A-GAT-GT-C--ATGG--AGGA-GTAA-GCA-TCG--TCT---GCTG--------ACCG-G--TC-ACACC---CGCC--GTGAGCCCGTAGTCGAAAC-AAAAG-TAAACG-AGGTT---A-CCCG-TC-----GTCAAATCTA-GTA--CGACAA--AAA-CA--GT--CTAACA-A-----AG-GGTATGAGG-----C-AAA-TCAGTCAACATATGACTTGATGGTAATTTGTAATCGC--AAAC-AAAGT----CA--TT-ATAGCGACCG----TAGAATTTGCGAA-ATGATGACTTat
gi|8 : atgtgacattctttcagattgtacatgctgtcaggagatagaaaatggttcccaccagccatgtacctcaagttaattgactgatctacactaattgagtgtttcagtggtgtgataggaggttatgatattagactgatttttttctct-TAT--A-AAAT--GG----CGA-AGTT-ACCAAAT-GT--G--TT---AAAC-ATAAT-TTATA-G--T-C----C---AAT---AA-AT---CA-T---AGAATA-A-A-GTCGAGT--G----TAG----GGCAA-C--AC-GGA-CC---TCCG-A---CAAAA-----G---CGAA-GG-C-AGGAT-C-------ACGGT-GC-C--ATGG--AGGA-TTAA-GCA-TCC--TCT---GCC---------ACCC-G--TC-ATACC---CACC---TGAGCTT-TAGTC--AACAAAA-G-TAAACG-GGA-T---A-TC---TC-----GTCAAATCTA-GTA--CAAAAA--TTA-CT--TT--CTAACA-A-----AG-GATATGAAA-----CAAAA-ACAGCCAACATGTGAC--A--------TTGTAATTGCA-AAAA-AAAGTC---CA--AT-ATAATGACCG----TAGAATTTGTGAAGATGATGACTGTTAAACGAGG-AT-G--GTGCATTAA-CCCTGTCACAACA-AGC--GTATGTTACTA--GAGGG---T--CACGCTT---TAAA---AATGTCTCCATACGCAATGGCATTG-CCCTTG
gi|9 : ATATACCACAC-CCATA--TGACAG-A-AGTAT-ATGCCGA--ACATATACTTACCATACATAGAAAAGG-----AACACA-TTCGACCGTATTGCAAAG------TGAATTAAAA-A-TT--CA-CACGC-TA---TCAGCCCTATA-A---TAGTACGGTT--GTCAGCTCCCTG-C---CAATTAG------GACGTACAA-ATGATATACATA--GAGTAT-CCCATAA-TAA-TGTAAGCAAA-AGATATGTTCTA-GATTCCGTAACTG-CTCCAC--ATATCATAACGCCAGAAAT---CT-ACGCAGGA--------AT--AGCTACCT-CACAATT-TAGACATA-AATCCCATGTGT----GA---AAAACT--TATCA-T-----TCTTACATTGATCATCACAGTGCATTCTACAC-A-ACT------G-CTA-TATA-CCTCATACTGCCCTAAGGTTt
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|12 ): GAAAAGGTGAAGATAACGAACAGTAATACAAAATTAAGAGTTGCAATTAGGGAAAACATAACCCCTTTAATTTGGACATACCAGAGGTGGGATAAAGTGCTTAGGAGGAATAAGCGCCCATCGTGAGCCTCGCTTTCATCTCGATCAGGTAAACGTACTTAATGCGTAGCCAAAATCAGTTTACATGCAAAGAACTGCAAAACAAATAACATGATTAAGGTGGAATGCTACACCAG
Unaligned ( gi|21 ): TAAATTGACGAAGTTACAATGTGTTAAGACTGGATTCCAATGGTGCCAATATTTCACTAAGTTGAATAAAGGGCTGCATGGACTTCCGACACA
Unaligned ( gi|22 ): TGTTCGTTGAATAATATTTATTACCAAATGACTTATATTAGACTGAATCACTGTTTACGAATGCAAAACAATTACGTGAAATAAT
Unaligned ( gi|27 ): ACCACCCCTACAAACTAGTACAGTATAAAATGGCGAAGTAACAATGATATGAAACGTAATAC
Unaligned ( gi|35 ): TGTGTATAAAATGGCGAAGTAACAATAATGTATTAAACGTAAT