lowQualScore : 111 1111 22222222222222222222222222222222222 2222 11111111111 1111 333333333 222
lowQualScore : 2 6666 4444 2 22 22 4 333 6 2 55555 22 2 22 2 333 5555 2 22 2 555 66666666666666666666666666666666666 33 2 2 22 33 4 4444 333 55 4 4 444 99999999999 2 2 4 2 0000 5555 444 2 3 2 999999999 2 2 444444444 2 2 777777 333 4444 2 2
lowQualScore : . .... .... . .. .. . ... . . ..... .. . .. . ... .... . .. . ... ................................... .. . . .. .. . .... ... .. . . ... ........... . . . . .... .... ... . . . ......... . . ......... . . ...... ... .... . .
lowQualScore : 1 6666 5555 1 99 99 2 333 3 1 33333 88 0 88 0 555 2222 0 88 1 888 44444444444444444444444444444444444 11 2 2 22 11 4 3333 999 33 4 7 444 88888888888 4 4 7 4 8888 0000 111 4 2 4 444444444 4 5 555555555 7 7 777777 888 0000 7 9
consensus : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA-T---GTTGA--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-T-AAAGT--T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--CGG---A--TAA-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-T-TAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTTCC----T---T-T-TTTT------CCCC-AG-G--GCTC-TGCCCCT
Reference ( gi|7 ) : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA-T---GTTAT--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-T-GAA-T--T--AT-T-AACTG--AAA-TGC--CTG---A--TAA-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-T-TAG---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTTCG----T---T-T-TTTT------CCTCAAG-A--GTCC-TGCCCCT
gi|12 : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TTATCA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA-T---GTTAT--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATA---CA--A-----T--G---TTC-T----------A-T--T--A----AACTG--AAAATGC----G---A--TAA-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-T-TAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAAATTTC-----C---T-T-TTTT------CCTCAAG-A--GTCC-TGCCC
gi|11 : GTGC-TA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-CA-TTA-----AA--TA-C--AA-T---TTT-T--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---CT---------------------A----AACTG--AA--TGC--CGG---A--TAA-A-TGT---TG-TACATGTACATAA-TAA-A-T-TAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTTC-----C---T-T-TTTT------CCTC-AG-A--GTCC-TGCCCCT
gi|8 : cGTGCCTA-GC----TTC----AACA-AATC--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----A---TG-C--AAAT---GT-ATTGAA-TTTAGGAA-T--AAGATA---CA--------T-TG---TTC-T---TTAT-AAA-TAAT--AT-TCAACTG--AAA-TGC--G-G---A--TAA-A-TGC----G-TAT-----CATAA--AA-A-T--AA---GATT----TGGTT-CTTC-A---------C-T-CAACTTCC---------T-T-TTTT------CCTC-AG-A--GTCC-c
gi|18 : GTACCTA--A----TTT----CATA-A--C--TTTA-TT--CA-CA-TTA-----A---TG-C--AA-T---GTTAT--AAATTTAAGAAAT--AA--TAT--CA--T-----T-TG---TTC-T---TT-T-GA--------AT-T-AACTG--AAATTGC----G---A--TAA-cc
gi|22 : gcatGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TA-ACAACA-TTA-----AA--TG-C--AA-T---GTTAT--AA-TTTAAGAAAT--A
gi|1 : tgcGTGCCTAAGA----TTTATTCCATA-A--CAATCTTGTT-TCAACA-TTA-----AAGATG-C--A--TAGAGATAT--AA-TT--AGAAAT--TA-ATAGTACA--A--------G---GTA-T---AG-T---A-TCAT--AT-T-AATTGGAAAA-TGCGCCGG---AG-TAA-AATGT---TGATG------CATAA-TAACA-T-TAA---GATTATTCC---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTTCC----T---TAT-TTCT------CCTCAAA-AAGATCCTTACTCCT
gi|9 : tgcTGTCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-TG-TTA-----AA--TG-C--AA-T---GTTGA--AA-TTCAAGAAAT--AA-ATA---CATTT-----T-TT---TTC-T---TT-T-AAAGT--T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TGG---A--TAA-A-TGT---T-----------ATAA-TGA-A-T-TAT---AATT----T---T-CAGC-A---------C-T-CAACTATCC----C---T-T-TTTT------CCC--AG-G--GCTC-TGCc
gi|6 : atggataTGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--TCTT-CT-TCA-TA-TTA-----AA--CG-C--AA-A---GTTGA--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-TAAAA-T--T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG---A--TAG-A-TGT---TG-----------CAA-TGA-A-T-TAA---GATT----T---T-CATC-A---------T-T-CGATTTCCT----TTAAT-T-TTTT------CCCCAGG-
gi|10 : caacaTGCCTA-GAAGGATTT----CACA-A--C--TTTT-TT-CCA-CA-TTA-----AC--TG-C--AA-T---G-TA---AA-ATTAAGAAAT--AA-ATA---CAC-A-----T-TG---TTT-C---TT-T-AAA-G--T--TG-T-GGTTG--AAA-T----CTG---GATTTA-A-TGT---TG-TA------C--------------------ATT----T---C-CTTC-G---------C-T-CAACTTTCC----C---T-T-TTTC------CCCCCAGAA--GTTC-TGCCCCTgctctc
gi|5 : aacatTGCTTA-AA----TTT----AACA-A--C--TTTC-TG--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA-T---GTTG---AA-ATTAAGAAAT--AA-ATA---CA--A-----CATA---TTCAT---AT-T-AAAGT--T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG---A--TAA-A-AGT---TG-----------TAA-TGA-A-T-TAA---GATT----T---T-CATC-ATGCACTCGGC-T-CAACTTTC-----------C-TTTT------CCCC-AG-G--GCTC-TGCCCCc
gi|13 : caacaTGCCTA-CA----TTT----AACACA--C--TTTT-T---CA-CA-T-A-----AA--TG-C--AA-T---GTTAA--AA-TT-AAGAAAT--A---------------------------C-T---TT-T-AAAGT--T--ATAT-AGTTT--AAA-TGT---TG---A--TTA-A-T-----TG-TA------CATAA-TAA-A-T-TAAAGTGATG----T---C-CTTC-G---------CGT-CAACTTTCC----T---T-T-TTTC------CC---AG-A--GTTC-TGCCCCT
gi|4 : caaTGCCTA-GAA---TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAAACA-TTA-----AA--TTTC--AA-T---GTTTA--AA-TTCAATAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-C-AAAGT--T--AT-T-AGTTC--AAA-TAC--TAG---A--TAA-AGTGT---TG----------ACAA-TGA-A---TAA---GATT----T---TGCATC-A---------T-G-CAACTTTCGCTACT---T-TGCTTT------TCGC-AG-G--GCTC-TGCCCc
gi|2 : ataTGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--GCTT-CT-TCA-TAATTATGAAGAA--CG-C--AA-T---TTTGA--AA-TTGAAGAAAT--AA-ATA---CA--ACATTAT-TG---CTC-TGCTTT-T-AAAAT--T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG---A--TAC-A-TGTAGATG-T-------TGCAA-TGA-A-T-TAA---GATT----T---T-CATC-A---------C-T-CAACTTCCA----T---T-T-TTTC------CCC--AG-G--GCTC-TGCt
gi|17 : caacaTGCCTA-TA----TCA----CACA-A--C--TTTT-TT--CA-CA-GTA-----AA--TT-T--AA-T---GCTGA--AA-TTTGAGAAAT--AA-ATA---CA--G-----T-TA---TTC-TTCGTT-T-AAAGC--T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG---A--TAA-A-Tttc
gi|20 : caacaTGCCTA-TA----TTT----CACA-A--T--TTTTTTT-TCA-CA-TTA-----AA--AA-C--AA-T---GTTGA--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATG---C
gi|21 : actTGCTTA-GA----TTT----AAAA-A--A--TTTC-TT--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA-T---ATTGA--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATA---C
gi|24 : aacaGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA-C---GTTGA--AA-TTTA
gi|14 : atacCTA-AA----TTT----CACA-A--C--TTTT--T-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA-T---GTTGA--AA-TTTAAGATAT--AT-ATA---CA--ATTC--T-TC---TTC-T---TT-T-AAAGT--T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG---A--TAA-A-TG-----------------TAA-TAA-A-T-AAT---GATT----T---T-CATC-G---------C-g
gi|3 : catatgcctaaattTA-GA----TTT----TTCA-A--C--TTTT-TT--AA-CA-TTA-----AA--TG-CCCAG-T---GTTGA--AA-TTTAAGAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-TTC-TT-T-AAAGT--TTAAT-T-AGTTG--AAA-TA---CTGGGAA--TAA-A-TGT---TG-T---------T-A-TAA-ATT-TAA---GATT----T---T-CATCAA---------C-T-CACTTTTCC----T---T-T-TTTTTTTTTCCCCCCAG-G--GCTT-TGCCTCT
gi|16 : atgccatata--TG-C--AA-T---GTTAT--AA-TTTAAGAAACTAAA-AAA---CA--A-----T-TG---TTC------T-T-GAA-T--T--AG-T-AAATG--AAA-TGC--C-G---A--TAACA-TGT---TG-TA------CATAATTAA-ATT-TAA---GA-T----T---T-CTTC-A---------C-TCCAACTTTC
gi|15 : AAT--AA-ATA---CA--------T-TG---TTT-T---TT-T-AAAGT--T--AT-T-AGTTG--AAT-TGT--TGG---A--TAACA-TGT---TG-TA------CATA--TAA---T-TAA---GATT----T---C-TATC-A---------C-T-CAACTTTC---------T-T-TTTT------CCT-AGG-A--TT---TGCCC
gi|19 : ttagT-T-GAA-------AT----ACTG--GA--TAC--ATG------TAA-A-TGT---TG-TA------TATAA-TAA-A-T-AAA---GATT----T---C-CTTC-A---------T-T-GAAC---------T---T-T-TTTT------C----AG-G--GCTC-TGCCt
gi|23 : aaagtcataagG-TA------CATAA-TGA-A-TATAG----ATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTCC-------------TTTT------CCT-AAG-A--GTCT-TGCCC
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|25 ): GTAATGAATTAAGATTTCCATCACTAAACTTCCCTCCAGGGTTCC
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 111 111 1111111111 111111111111
lowQualScore : 2 6666 4444 2 22 22 4 111 6 2 55555 22 1 22 333 1 333 22 2 555 66666666 2 777 2 000 2 3 7777 22 2 2 22 2 000 22 4 666666 4 4 444 6666666666 2 0 2 4 333 4444 333 2 1 2 888888888 2 2 2 111111111111 2 7777777 2 2 0
lowQualScore : . .... .... . .. .. . ... . . ..... .. . .. ... . ... .. . ... ........ . ... . ... . . .... .. . . .. . ... .. . ...... . . ... .......... . . . . ... .... ... . . . ......... . . . ............ . ....... . . .
lowQualScore : 0 2222 2222 0 88 88 0 888 0 0 00000 66 9 66 333 9 555 66 0 555 22222222 2 888 2 888 2 1 4444 99 1 1 99 1 999 99 2 111111 2 4 111 7777777777 1 4 1 2 777 5555 777 1 0 1 444444444 1 2 2 999999999999 4 6666666 4 5 8
consensus : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
Reference ( family-769 ) : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--CGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
gi|1 : GTGCCTAAGA----TTTATTCCATA-A--CAATCTTGTT-TCAACA-TTA-----AAGATG-C--A------TAG-AGATATAATTAGAAAT--TA-ATAGTACA--A--------G---GTA-T---------AGTATCAT--AT-T-AATTGGAAAA-TGCGCCGG--AGTA------A-AATGT---TGATG------CATAA-TAACA-TTAA---GATTATTCC---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----TAT-TTCT-------CCTC-A
gi|10 : tgcTGCCTA-GAAGGATTT----CACA-A--C--TTTT-TT-CCA-CA-TTA-----AC--TG-C--AA---TGT---AAAATTAA---GAAAT--AA-ATA---CAC-A-----T-TG---TTT-C---TT-TAAAGT----T--G--T-GGTTG--AAA-T-C--TGG--ATTT------A-A-TGT---TG-TA------C-------------------ATT----T---C-CTTC-G---------C-T-CAACTTTCC----CT----T-T-TTCC-------CCCC-AGAAGTTCTGCCCCTaaaagatccttactcctc
gi|11 : aacatGTGC-TA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-CA-TTA-----AA--TA-C--AA---TTTTT-AA-TTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---CT----------AAA----------------CTG--AA--TGC--CGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TACATGTACATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----C-----T-T-TTTT-------CCTC-AG-AGTCCTGCCCCTc
gi|12 : cGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TTATCA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T--G---TTC-T---AT-TAAACT----G--A-----------AAA-TGC----G--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAAATTT-C----CT----T-T-TTTC-------CTCA-AG-AGTCCTGCCCc
gi|13 : TGCCTA-CA----TTT----AACACA--C--TTTT-T---CA-CA-T-A-----AA--TG-C--AA---TGTTA-AAATT-AA---GAAAT--A---------------------------C-T---TT-TAAAGT----T--ATAT-AGTTT--AAA-TGT--TGA--T-TA------A-----T---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAAAGTGATG----T---C-CTTC-G---------CGT-CAACTTT-C----CT----T-T-TTT---------CCC-AG-AGTTCTGCCCCT
gi|14 : caaCTA-AA----TTT----CACA-A--C--TTTT--T-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GATAT--AT-ATA---CA--ATTC--T-TC---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TG-----------------TAA-TAA-A-TAAT---GATT----T---T-CATC-G---------C-c
gi|15 : catatgcctaaattAAT--AA-ATA---CA--------T-TG---TTT-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAT-TGT--TGG--A-TA------ACA-TGT---TG-TA------CAT-A-T-A-A-TTAA---GATT----T---C-TATC-A---------C-T-CAACTTT-C------------T-TTTT-------TCCT-AG-GA-TTTGCCC
gi|16 : ttag--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAACTAAA-AAA---CA--A-----T-TG---TTC-T---T----GAAT----T--AG-T-AAATG--AAA-TGC--CG---A-TA------ACA-TGT---TG-TA------CATAATTAA-ATTTAA---GA-T----T---T-CTTC-A---------C-TCCAACTTT-C----t
gi|17 : TGCCTA-TA----TCA----CACA-A--C--TTTT-TT--CA-CA-GTA-----AA--TT-T--AA---TGCTG-AAATTTGA---GAAAT--AA-ATA---CA--G-----T-TA---TTC-TTCGTT-TAAAGC----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-A-T
gi|18 : caacaGTACCTA--A----TTT----CATA-A--C--TTTA-TT--CA-CA-TTA-----A---TG-C--AA---TGTTATAAATTTAA---GAAAT---A-ATAT--CA--T-----T-TG---TTC-T---TT-TGA----------AT-T-AACTG--AAATTGC----G--A-TA------A-
gi|19 : gcatAAAGT----C--AT-A-AGTTG--AAA-TAC--TGG--A-TACATGTAA-A-TGT---TG-TA------TATAA-TAA-A-TAAA---GATT----T---C-CTTC-A---------T-T-GAACTTT-------T----T-T-T-------------C-AG-GGCTCTGCC
gi|2 : TGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--GCTT-CT-TCA-TAATTATGAAGAA--CG-C--AA---TTTTG-AAATTGAA---GAAAT--AA-ATA---CA--ACATTAT-TG---CTC-TGCTTT-TAAAAT----T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG--A-TA------C-A-TGTAGATG-T-------TGCAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-A---------C-T-CAAC-TT-C----CA----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGC
gi|20 : caacaTGCCTA-TA----TTT----CACA-A--T--TTTTTTT-TCA-CA-TTA-----AA--AA-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATG---Cttc
gi|21 : actTGCTTA-GA----TTT----AAAA-A--A--TTTC-TT--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TATTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---C
gi|22 : aacaGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TA-ACAACA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--A
gi|23 : tgcG-TA------CATAA-TGA-A-TATA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTC-C--------------TTTT-------CCTA-AG-AGTCTTGCCC
gi|24 : GCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---CGTTG-AAATTTAtcta
gi|25 : atacTAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---C-CATC-A---------C-T-AAACTTC-C----CT---------------------CC-AG-GGTTCg
gi|3 : gTA-GA----TTT----TTCA-A--C--TTTT-TT--AA-CA-TTA-----AA--TG-CCCAG---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-TTC-TT-TAAAGT----TTAAT-T-AGTTG--AAA-TAC--TGGGAA-TA------A-A-TGT---TG-T---------T-A-TAA-ATTTAA---GATT----T---T-CATCAA---------C-T-CACTTTT-C----CT----T-T-TTTTTTTTTCCCCCC-AG-GGCTTTGCCTCTc
gi|4 : atgccatataTGCCTA-GAA---TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAAACA-TTA-----AA--TTTC--AA---TGTTT-AAATTCAA---TAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-CAAAGT----T--AT-T-AGTTC--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-AGTGT---TG----------ACAA-TGA-A--TAA---GATT----T---TGCATC-A---------T-G-CAACTTT-CGCTACT----T-TGCTTT-------TCGC-AG-GGCTCTGCCC
gi|5 : ataTGCTTA-AA----TTT----AACA-A--C--TTTC-TG--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAA-TTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----CATA---TTCAT---AT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-A-AGT---TG-----------TAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-ATGCACTCGGC-T-CAACTTT-C----C---------TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCt
gi|6 : caacaTGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--TCTT-CT-TCA-TA-TTA-----AA--CG-C--AA---AGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-TAAAAT----T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG--A-TA------G-A-TGT---TG-----------CAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-A---------T-T-CGA-TTT-C----CTTTAAT-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCT
gi|7 : caacaGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TGAA-T----T--AT-T-AACTG--AAA-TGC--CTG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAG---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----GT----T-T-TTTT-------CCTCAAG-AGTCCTGCCCCTc
gi|8 : GTGCCTA-GC----TTC----AACA-AATC--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----A---TG-C--AAATGTATTG-AA-TTTAG---GAA-T--AAGATA---CA--------T-TG---TTC-T---TTATAAA-TAA--T--AT-TCAACTG--AAA-TGC---GG--A-TA------A-A-TGC----G-TAT-----CATAA--AA-A-T-AA---GATT----TGGTT-CTTC-A---------C-T-CAACTT-------CC----T-T-TTTT-------CCTC-AG-AG
gi|9 : TGTCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-TG-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTCAA---GAAAT--AA-ATA---CATTT-----T-TT---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TGG--A-TA------A-A-TGT---T-----------ATAA-TGA-A-TTAT---AATT----T---T-CAGC-A---------C-T-CAACTAT-C----CC----T-T-TTTT--------CCC-AG-GGCTCTGCtcccc
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 111 1111111111 111111111111
lowQualScore : 2 6666 4444 2 22 22 4 111 6 2 55555 22 1 22 333 1 333 22 2 555 66666666 2 777 2 000 2 3 7777 22 2 2 22 2 444 22 4 666666 4 4 444 6666666666 2 0 2 4 333 4444 333 2 1 2 888888888 2 2 2 111111111111 2 7777777 2 2 0
lowQualScore : . .... .... . .. .. . ... . . ..... .. . .. ... . ... .. . ... ........ . ... . ... . . .... .. . . .. . ... .. . ...... . . ... .......... . . . . ... .... ... . . . ......... . . . ............ . ....... . . .
lowQualScore : 0 2222 2222 0 88 88 0 888 0 0 00000 66 9 66 333 9 555 66 0 555 22222222 2 888 2 888 2 1 4444 99 1 1 99 1 888 99 2 111111 2 4 111 7777777777 1 4 1 2 777 5555 777 1 0 1 444444444 1 2 2 999999999999 4 6666666 4 5 8
consensus : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
Reference ( family-769 ) : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
gi|1 : GTGCCTAAGA----TTTATTCCATA-A--CAATCTTGTT-TCAACA-TTA-----AAGATG-C--A------TAG-AGATATAATTAGAAAT--TA-ATAGTACA--A--------G---GTA-T---------AGTATCAT--AT-T-AATTGGAAAA-TGCGCCGG--AGTA------A-AATGT---TGATG------CATAA-TAACA-TTAA---GATTATTCC---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----TAT-TTCT-------CCTC-A
gi|10 : tgcTGCCTA-GAAGGATTT----CACA-A--C--TTTT-TT-CCA-CA-TTA-----AC--TG-C--AA---TGT---AAAATTAA---GAAAT--AA-ATA---CAC-A-----T-TG---TTT-C---TT-TAAAGT----T--G--T-GGTTG--AAA-T-C--TGG--ATTT------A-A-TGT---TG-TA------C-------------------ATT----T---C-CTTC-G---------C-T-CAACTTTCC----CT----T-T-TTCC-------CCCC-AGAAGTTCTGCCCCTaaaagatccttactcctc
gi|11 : aacatGTGC-TA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-CA-TTA-----AA--TA-C--AA---TTTTT-AA-TTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---CT----------AAA----------------CTG--AA--TGC--CGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TACATGTACATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----C-----T-T-TTTT-------CCTC-AG-AGTCCTGCCCCTc
gi|12 : cGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TTATCA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T--G---TTC-T---AT-TAAACT----G--A-----------AAA-TGC----G--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAAATTT-C----CT----T-T-TTTC-------CTCA-AG-AGTCCTGCCCc
gi|13 : TGCCTA-CA----TTT----AACACA--C--TTTT-T---CA-CA-T-A-----AA--TG-C--AA---TGTTA-AAATT-AA---GAAAT--A---------------------------C-T---TT-TAAAGT----T--ATAT-AGTTT--AAA-TGT--TGA--T-TA------A-----T---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAAAGTGATG----T---C-CTTC-G---------CGT-CAACTTT-C----CT----T-T-TTT---------CCC-AG-AGTTCTGCCCCT
gi|14 : caaCTA-AA----TTT----CACA-A--C--TTTT--T-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GATAT--AT-ATA---CA--ATTC--T-TC---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TG-----------------TAA-TAA-A-TAAT---GATT----T---T-CATC-G---------C-c
gi|15 : catatgcctaaattAAT--AA-ATA---CA--------T-TG---TTT-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAT-TGT--TGG--A-TA------ACA-TGT---TG-TA------CAT-A-T-A-A-TTAA---GATT----T---C-TATC-A---------C-T-CAACTTT-C------------T-TTTT-------TCCT-AG-GA-TTTGCCC
gi|16 : ttag--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAACTAAA-AAA---CA--A-----T-TG---TTC-T---T----GAAT----T--AG-T-AAATG--AAA-TGC--CG---A-TA------ACA-TGT---TG-TA------CATAATTAA-ATTTAA---GA-T----T---T-CTTC-A---------C-TCCAACTTT-C----t
gi|17 : TGCCTA-TA----TCA----CACA-A--C--TTTT-TT--CA-CA-GTA-----AA--TT-T--AA---TGCTG-AAATTTGA---GAAAT--AA-ATA---CA--G-----T-TA---TTC-TTCGTT-TAAAGC----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-A-T
gi|18 : caacaGTACCTA--A----TTT----CATA-A--C--TTTA-TT--CA-CA-TTA-----A---TG-C--AA---TGTTATAAATTTAA---GAAAT---A-ATAT--CA--T-----T-TG---TTC-T---TT-TGA----------AT-T-AACTG--AAATTGC----G--A-TA------A-
gi|19 : gcatAAAGT----C--AT-A-AGTTG--AAA-TAC--TGG--A-TACATGTAA-A-TGT---TG-TA------TATAA-TAA-A-TAAA---GATT----T---C-CTTC-A---------T-T-GAACTTT-------T----T-T-T-------------C-AG-GGCTCTGCC
gi|2 : TGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--GCTT-CT-TCA-TAATTATGAAGAA--CG-C--AA---TTTTG-AAATTGAA---GAAAT--AA-ATA---CA--ACATTAT-TG---CTC-TGCTTT-TAAAAT----T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG--A-TA------C-A-TGTAGATG-T-------TGCAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-A---------C-T-CAAC-TT-C----CA----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGC
gi|20 : caacaTGCCTA-TA----TTT----CACA-A--T--TTTTTTT-TCA-CA-TTA-----AA--AA-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATG---Cttc
gi|21 : actTGCTTA-GA----TTT----AAAA-A--A--TTTC-TT--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TATTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---C
gi|22 : aacaGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TA-ACAACA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--A
gi|23 : tgcG-TA------CATAA-TGA-A-TATA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTC-C--------------TTTT-------CCTA-AG-AGTCTTGCCC
gi|24 : GCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---CGTTG-AAATTTAtcta
gi|25 : atacTAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---C-CATC-A---------C-T-AAACTTC-C----CT---------------------CC-AG-GGTTCg
gi|3 : gTA-GA----TTT----TTCA-A--C--TTTT-TT--AA-CA-TTA-----AA--TG-CCCAG---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-TTC-TT-TAAAGT----TTAAT-T-AGTTG--AAA-TAC--TGGGAA-TA------A-A-TGT---TG-T---------T-A-TAA-ATTTAA---GATT----T---T-CATCAA---------C-T-CACTTTT-C----CT----T-T-TTTTTTTTTCCCCCC-AG-GGCTTTGCCTCTc
gi|4 : atgccatataTGCCTA-GAA---TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAAACA-TTA-----AA--TTTC--AA---TGTTT-AAATTCAA---TAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-CAAAGT----T--AT-T-AGTTC--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-AGTGT---TG----------ACAA-TGA-A--TAA---GATT----T---TGCATC-A---------T-G-CAACTTT-CGCTACT----T-TGCTTT-------TCGC-AG-GGCTCTGCCC
gi|5 : ataTGCTTA-AA----TTT----AACA-A--C--TTTC-TG--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAA-TTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----CATA---TTCAT---AT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-A-AGT---TG-----------TAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-ATGCACTCGGC-T-CAACTTT-C----C---------TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCt
gi|6 : caacaTGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--TCTT-CT-TCA-TA-TTA-----AA--CG-C--AA---AGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-TAAAAT----T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG--A-TA------G-A-TGT---TG-----------CAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-A---------T-T-CGA-TTT-C----CTTTAAT-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCT
gi|7 : caacaGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TGAA-T----T--AT-T-AACTG--AAA-TGC--CTG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAG---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----GT----T-T-TTTT-------CCTCAAG-AGTCCTGCCCCTc
gi|8 : GTGCCTA-GC----TTC----AACA-AATC--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----A---TG-C--AAATGTATTG-AA-TTTAG---GAA-T--AAGATA---CA--------T-TG---TTC-T---TTATAAA-TAA--T--AT-TCAACTG--AAA-TGC---GG--A-TA------A-A-TGC----G-TAT-----CATAA--AA-A-T-AA---GATT----TGGTT-CTTC-A---------C-T-CAACTT-------CC----T-T-TTTT-------CCTC-AG-AG
gi|9 : TGTCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-TG-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTCAA---GAAAT--AA-ATA---CATTT-----T-TT---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TGG--A-TA------A-A-TGT---T-----------ATAA-TGA-A-TTAT---AATT----T---T-CAGC-A---------C-T-CAACTAT-C----CC----T-T-TTTT--------CCC-AG-GGCTCTGCtcccc
blockSeqs : . AGGA . C AT . T TAT A A TGAAG . T CC ATG T . TA G T ACATTA A CTC A TCG A G AA TA A C . T T GA T CATGTA C G AGA TACATGTAC T . T AGT . GGT G T A TGCACTCGG G C C GCTACTT G TTTTTCC A .
blockSeqs : . A . . . . . TC A . . . . . . . . . . . ATTC . CTC . GCT . C . . . . . . C . . . C . . TATC . . T . . . . T . . . . . CTTTAAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . TTT . . . TC . G . . . . . . T . . . . . . TAC . . . . . . . T . . . . . CTT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . CA . . . . . G . . . . . . T . . . . . . TAC . . . . . . . T . . . . . CTT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . T . . . . . . TAC . . . . . . . A . . . . . CTT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . C . . . . . . TAC . . . . . . . A . . . . . CAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . T . . . . . . TAC . . . . . . . T . . . . . CTT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . G . . . . . G . . . . . . T . . . . . . TAT . . . . . . . T . . . . . GTT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . T . . . . . A . . . . . . T . . . . . . TAC . . . . . . . A . . . . . CCT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . T . . . . . . TAC . . . . . . . T . . . . . CCT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . . A . . . . . CT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . TT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . CT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . . . . G . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : **** ** ** *** *** **** ** T** TAC******* **** CTT*********
originalCons : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
finalCons : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGCT--GG--A-TA------A-A-TGT---TGTAC-------ATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-CCTT---------T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
Alignments
lowQualScore : 111 11111111 111 1111111111 111111111111
lowQualScore : 2 6666 4444 2 22 22 4 111 6 2 55555 22 1 22 333 1 333 22 2 555 66666666 2 777 2 000 2 3 7777 22 2 2 22 2 444 22 4 666666 4 4 444 6666666666 2 0 2 4 333 4444 333 2 1 2 888888888 2 2 2 111111111111 2 7777777 2 2 0
lowQualScore : . .... .... . .. .. . ... . . ..... .. . .. ... . ... .. . ... ........ . ... . ... . . .... .. . . .. . ... .. . ...... . . ... .......... . . . . ... .... ... . . . ......... . . . ............ . ....... . . .
lowQualScore : 0 2222 2222 0 88 88 0 888 0 0 00000 66 9 66 333 9 555 66 0 555 22222222 2 888 2 888 2 1 4444 99 1 1 99 1 888 99 2 111111 2 4 111 7777777777 1 4 1 2 777 5555 777 1 0 1 444444444 1 2 2 999999999999 4 6666666 4 5 8
consensus : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
Reference ( family-769 ) : GTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CNTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCT
gi|1 : GTGCCTAAGA----TTTATTCCATA-A--CAATCTTGTT-TCAACA-TTA-----AAGATG-C--A------TAG-AGATATAATTAGAAAT--TA-ATAGTACA--A--------G---GTA-T---------AGTATCAT--AT-T-AATTGGAAAA-TGCGCCGG--AGTA------A-AATGT---TGATG------CATAA-TAACA-TTAA---GATTATTCC---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----CT----TAT-TTCT-------CCTC-A
gi|10 : tgcTGCCTA-GAAGGATTT----CACA-A--C--TTTT-TT-CCA-CA-TTA-----AC--TG-C--AA---TGT---AAAATTAA---GAAAT--AA-ATA---CAC-A-----T-TG---TTT-C---TT-TAAAGT----T--G--T-GGTTG--AAA-T-C--TGG--ATTT------A-A-TGT---TG-TA------C-------------------ATT----T---C-CTTC-G---------C-T-CAACTTTCC----CT----T-T-TTCC-------CCCC-AGAAGTTCTGCCCCTaaaagatccttactcctc
gi|11 : aacatGTGC-TA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-CA-TTA-----AA--TA-C--AA---TTTTT-AA-TTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---CT----------AAA----------------CTG--AA--TGC--CGG--A-TA------A-A-TGT---TG-TACATGTACATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----C-----T-T-TTTT-------CCTC-AG-AGTCCTGCCCCTc
gi|12 : cGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TTATCA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T--G---TTC-T---AT-TAAACT----G--A-----------AAA-TGC----G--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAAATTT-C----CT----T-T-TTTC-------CTCA-AG-AGTCCTGCCCc
gi|13 : TGCCTA-CA----TTT----AACACA--C--TTTT-T---CA-CA-T-A-----AA--TG-C--AA---TGTTA-AAATT-AA---GAAAT--A---------------------------C-T---TT-TAAAGT----T--ATAT-AGTTT--AAA-TGT--TGA--T-TA------A-----T---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAAAGTGATG----T---C-CTTC-G---------CGT-CAACTTT-C----CT----T-T-TTT---------CCC-AG-AGTTCTGCCCCT
gi|14 : caaCTA-AA----TTT----CACA-A--C--TTTT--T-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GATAT--AT-ATA---CA--ATTC--T-TC---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TGC--TGG--A-TA------A-A-TG-----------------TAA-TAA-A-TAAT---GATT----T---T-CATC-G---------C-c
gi|15 : catatgcctaaattAAT--AA-ATA---CA--------T-TG---TTT-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAT-TGT--TGG--A-TA------ACA-TGT---TG-TA------CAT-A-T-A-A-TTAA---GATT----T---C-TATC-A---------C-T-CAACTTT-C------------T-TTTT-------TCCT-AG-GA-TTTGCCC
gi|16 : ttag--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAACTAAA-AAA---CA--A-----T-TG---TTC-T---T----GAAT----T--AG-T-AAATG--AAA-TGC--CG---A-TA------ACA-TGT---TG-TA------CATAATTAA-ATTTAA---GA-T----T---T-CTTC-A---------C-TCCAACTTT-C----t
gi|17 : TGCCTA-TA----TCA----CACA-A--C--TTTT-TT--CA-CA-GTA-----AA--TT-T--AA---TGCTG-AAATTTGA---GAAAT--AA-ATA---CA--G-----T-TA---TTC-TTCGTT-TAAAGC----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-A-T
gi|18 : caacaGTACCTA--A----TTT----CATA-A--C--TTTA-TT--CA-CA-TTA-----A---TG-C--AA---TGTTATAAATTTAA---GAAAT---A-ATAT--CA--T-----T-TG---TTC-T---TT-TGA----------AT-T-AACTG--AAATTGC----G--A-TA------A-
gi|19 : gcatAAAGT----C--AT-A-AGTTG--AAA-TAC--TGG--A-TACATGTAA-A-TGT---TG-TA------TATAA-TAA-A-TAAA---GATT----T---C-CTTC-A---------T-T-GAACTTT-------T----T-T-T-------------C-AG-GGCTCTGCC
gi|2 : TGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--GCTT-CT-TCA-TAATTATGAAGAA--CG-C--AA---TTTTG-AAATTGAA---GAAAT--AA-ATA---CA--ACATTAT-TG---CTC-TGCTTT-TAAAAT----T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG--A-TA------C-A-TGTAGATG-T-------TGCAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-A---------C-T-CAAC-TT-C----CA----T-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGC
gi|20 : caacaTGCCTA-TA----TTT----CACA-A--T--TTTTTTT-TCA-CA-TTA-----AA--AA-C--AA---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATG---Cttc
gi|21 : actTGCTTA-GA----TTT----AAAA-A--A--TTTC-TT--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TATTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---C
gi|22 : aacaGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TA-ACAACA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--A
gi|23 : tgcG-TA------CATAA-TGA-A-TATA---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTC-C--------------TTTT-------CCTA-AG-AGTCTTGCCC
gi|24 : GCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---CGTTG-AAATTTAtcta
gi|25 : atacTAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---C-CATC-A---------C-T-AAACTTC-C----CT---------------------CC-AG-GGTTCg
gi|3 : gTA-GA----TTT----TTCA-A--C--TTTT-TT--AA-CA-TTA-----AA--TG-CCCAG---TGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-TTC-TT-TAAAGT----TTAAT-T-AGTTG--AAA-TAC--TGGGAA-TA------A-A-TGT---TG-T---------T-A-TAA-ATTTAA---GATT----T---T-CATCAA---------C-T-CACTTTT-C----CT----T-T-TTTTTTTTTCCCCCC-AG-GGCTTTGCCTCTc
gi|4 : atgccatataTGCCTA-GAA---TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TAAACA-TTA-----AA--TTTC--AA---TGTTT-AAATTCAA---TAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-CAAAGT----T--AT-T-AGTTC--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-AGTGT---TG----------ACAA-TGA-A--TAA---GATT----T---TGCATC-A---------T-G-CAACTTT-CGCTACT----T-TGCTTT-------TCGC-AG-GGCTCTGCCC
gi|5 : ataTGCTTA-AA----TTT----AACA-A--C--TTTC-TG--CA-CA-TTT-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAA-TTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----CATA---TTCAT---AT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TAG--A-TA------A-A-AGT---TG-----------TAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-ATGCACTCGGC-T-CAACTTT-C----C---------TTTT-------CCCC-AG-GGCTCTGCCCCt
gi|6 : caacaTGCTTA-GA----TTT----CACA-A--C--TCTT-CT-TCA-TA-TTA-----AA--CG-C--AA---AGTTG-AAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TGCTCTTC-T---TT-TAAAAT----T--AT-T-AGTTC--AAA-CAC--TAG--A-TA------G-A-TGT---TG-----------CAA-TGA-A-TTAA---GATT----T---T-CATC-A---------T-T-CGA-TTT-C----CTTTAAT-T-TTTT-------CCCC-AG-GGCTCT
gi|7 : caacaGTGCCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTA-TAATTTAA---GAAAT--AA-ATA---CA--A-----T-TG---TTC-T---TT-TGAA-T----T--AT-T-AACTG--AAA-TGC--CTG--A-TA------A-A-TGT---TG-TA------CATAA-TAA-A-TTAG---GATT----T---T-CTTC-A---------C-T-CAACTTT-C----GT----T-T-TTTT-------CCTCAAG-AGTCCTGCCCCTc
gi|8 : GTGCCTA-GC----TTC----AACA-AATC--TTTT-TT-TCA-CA-TTA-----A---TG-C--AAATGTATTG-AA-TTTAG---GAA-T--AAGATA---CA--------T-TG---TTC-T---TTATAAA-TAA--T--AT-TCAACTG--AAA-TGC---GG--A-TA------A-A-TGC----G-TAT-----CATAA--AA-A-T-AA---GATT----TGGTT-CTTC-A---------C-T-CAACTT-------CC----T-T-TTTT-------CCTC-AG-AG
gi|9 : TGTCTA-GA----TTT----CACA-A--C--TTTT-T---CA-TG-TTA-----AA--TG-C--AA---TGTTG-AAATTCAA---GAAAT--AA-ATA---CATTT-----T-TT---TTC-T---TT-TAAAGT----T--AT-T-AGTTG--AAA-TAC--TGG--A-TA------A-A-TGT---T-----------ATAA-TGA-A-TTAT---AATT----T---T-CAGC-A---------C-T-CAACTAT-C----CC----T-T-TTTT--------CCC-AG-GGCTCTGCtcccc