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consensus : TGATTAAAATC-AGATC-TTT-GA-TC-------CG--CTC----------C-------------G-----CT----T-----T----------G--T---------------AG-CG--A-C------AT-C---AGA----A-----TATCG--------GAGCG-----G-ATC------AAA-G-ATCTGG-TTTTAAT
Reference ( family-727 ) : TGATTAAAATC-AGATC-TTT-GA-TC-------CG--CTC----------C-------------G-----CT----T-----T----------G--T---------------AG-CG--A-C------AT-C---AGA----A-----TATCG--------GAGCG-----G-ATC------AAA-G-ATCTGG-TTTTAAT
gi|11 : AAATCCAGATG-TTT-GA-TC-------CG--CTAA---------T-------------G-----AT----T-----TTTTTTTTTTGG--T---------------CG-CA--A-C------AT-C---ATA----A-----TATAG--------GAGCG-----G-ATC------AAT-G-ATTTGC-TT
gi|12 : TGATTAAAACC-AGATC-TTT-GA-TC-------CA--CTC----------T-------------G-----CT----T-----T----------G--T---------------AG-CG--A-C------AT-C---AGA----A-----TATTG--------GAGCG-----G-ATC------AGA-G-ATCTGG-TTTTTAT
gi|13 : TAAAATC-AGATC-TTT-GA-TC-------CG--CTT----------C-------------G-----
gi|16 : gaaaGATTAAAATC-AGCTC-CTTAGA-T--------CG--CTA----------A-------------G-----------------T----------G--T---------------AGCCG--A--------AT-C---TAA----G-----T------------GAGCG-----G-Agtacaatgtacatgtaatattatgtcatgcgaagcaatatttaaatctga
gi|17 : aaaatactcctacC-TTT-GA-TC-------CG--CTC----------C-------------G-----ATAT--T-----T----------T--T---------------AG-CG--A-G------AT-T---AGA----A-----TATCG--------GAGTG-----G-ATC------
gi|18 : --T---------------AG-CG--A-C------AA-C---GGA----A-----TATTG--------GAGTG-----G-ATC------AAA-G-ATCCGG-TTTTAATttaatca
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gi|22 : atctg-----CT----T-----T----------GGGT---------------AG-CG--A-C------AT-C---AAA----A-----TGTCG--------AAGCG-----G-ATC------AAA-G-ATTTGA-TTTTA
gi|23 : TGATTAAAATC-AG--C-CTT-GG-CC-------CG--CTC----------
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gi|25 : cTGATTAAAATT-AGATCTTTT-AA-TC-------CA--CTCTCA-------C-------------G-----------------T----------G--T---------------AG-CG--A-acataaatgactactgta
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gi|3 : gaTGATTAAAATT-AGATC-CTC-GA-TCGCTCGATTG--CTC----------CTACTCTTTTTACTG-----CT----CG----T----------G--T---------------AG-CG--AAC------GT-C---AAA----A------AGTA--------GAGCA-----G-ATA------AAA-GGATCTGGATTCTAA
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|1 ): AATATTTATTAAAGCCCAATGCGGCCTGAAAACACAATCTAATTAAAATCAGACCCTCTCAAAGCAGTGTAACGATTTGAGAGGATCTGATTTTAATTAGATTGCCTGAAAAC
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