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Reference ( gi|7 ) : TCGATTCGTACCC--GAGT-ACGAACTCGAGCTACCCGCAGTTGC--AA---CC-GAA-CGG---TGAGAG----TTT--C-AACTC------TTATGTGACGTA--TTGTG-AC-CTT-T----GAACCCTACCC--GA--C--TAA--CCCTG-C-C------TTCTA-CGA-GGGT--TAGTA-GAGTA-GCAA-TA-TGTCG-GTTTTGTAA-----TGGT-A-CT--GCGCATG-TGTCA----GTTTTCAAACGATGG-ATGT-GATTGGTT-GGA-GTATCATACA-A-GGG--AGTAAC---AAAGAAGATTAG-AATATCTACCC-TACTA
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blockSeqs : . GT . . . . . . . . . AA . T . . A GCG . . . . . . C . AC . T . . CG . . . G A A . . A . . . . . . . . . . G G . AC G . . .
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blockSeqs : . TT . . . . . . . . . GA . . . . G GTG . . . . . . T . C . A . . AG . . . A A C . . G . . . . . . . . . . C C . AG T . . .
blockSeqs : . AC . . . . . . . . . GA . . . . A ATG . . . . . . C . A . G . . TA . . . G A C . . A . . . . . . . . . . G G . . T . . .
blockSeqs : . TC . . . . . . . . . GA . . . . G GTG . . . . . . C . C . A . . TT . . . A G C . . A . . . . . . . . . . A C . . G . .
blockSeqs : . AT . . . . . . . . . GA . . . . A GTG . . . . . . A . C . G . . TA . . . T G T . . G . . . . . . . . . . G G .
blockSeqs : AC . . . . . . . . . GA . . . . A GTG . . . . . . C . T . G . . TG . . . G G T . . G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : TT . . . . . . . . . GT . . . . A TTT . . . . . . C . C . A . . GA . . . T G C . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . GA . . . . A TT . . . . . . C . T . G . . A . . . G T T . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A TG . . . . . . . . C . A . . A . . . G G C . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C A . . . . . . . . C . . . . A . . . . G C . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
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Alignments
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lowQualScore : .. ... . . . . .... . .. ... . . ..... .... .. . ...... . ... .. . . . . .... .. ..... .. ........ . . . .. .. . . . . .. . ..... . . . . .. . .... . . . . .. . . . . ........ . . .. .
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Reference ( family-706 ) : TCGATTCGTACCC--GAGT-ACGAACTCGAGCTACCC-G-AG-T----T-GC--AA---CC-GAA-CGGA---GAGAG----TTT--C-AACTC------TTATGTGACGTA--TTGTG-ACAT-T-T----GAACTCTACCC--GA--C--TAA--CCCTGC-C------TTCTA-CGA-GGGT--TAGTGNGGTA-GCAA-TA-TGGCG-GTCTTGT-----AA-TGGT-A-CT--GCGCATG-TGTCA----GTTTTCAAACGATGG-ATGT-GATTGGTT-GGA-GTATTATAC-ATGGGAGTAAGA-A--AG----AANATTGG-AATA--TCTACCC-TACTA
gi|1 : TCGATTCATACCC--TAGT-AGGAACTCGAGCTACCCAG-AG-T----T-GC--AA---CC-AAA-CGGA---GAGAG----TTT--C-AACCC------TTGTGTGACGTA--TTATA-ACCT-T-TTTGAAAACTCTACCA--GA--C--TTAGTCCCTG
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gi|17 : cgacttcggttcgctC--GAGT-ACGAACTCGAGCTACCCGG-AG-T----T-GC--AA---CC-GAA-CGGA---GAAAG----TTT--C-AACTC------TT-TGTGACGTA--TTGCG-ACCT-T-T----GAACTCTACCC--AA--C--TAA--TCCTGC-C------TTCAA-CAT-GGGT--TActt
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gi|2 : cTCGTACTC--GGAT-TTGAACTCGGGGTACTC-G-AG-T----A-GC--AA---TC--------------------------C-ACTTC------TT-T-TGACGTA--TTTTG-ACAT-T-T----GAAATCTACCC--AG--C--TAA--CCCTTT-C------TTCTT-T----GGA--TAGTGCGAGA-GCAA-TA-TGACG-GTCTTATAAATAAA-TGAT-A-TT--GCGCATT-CATCA----GTTTTCAAACTATGG-GTGT-GATT---------------TGC------AGTAAGA-A--AG----AACAATGG-AATACCCCCACCC-atgatactaaccagccccgttttcgggtacgaaccaaagtcgctctgacatatag
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