lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                      111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                         111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                             222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                 2222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                   1111111111111111111111111111111111                               1111111111111111111111111                                                                                                                                                                                              11111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                          222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             44444                            777777777777777777777777777777777    1111111              11   4444444444444444        1       11     444444444444444444444444444444444   11        222222222222222      555555555555555555555             2222       8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888           111111         1    222                                                                111              11                         44444444444444                          000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   111111     22222222              1             1      222222222222222222222222                555555555555555555555555555555555 1       33333333       222      11  111                         2222             1111      111  1    2222     5555        11                               333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333        22             1    333333      5555555555555555555                333333333   11    1        1                  11      0000000000000000000000000000000000000000000000             1           1111                 2222222222           2222          1        66666666666    11  11   2222                 33       1        1   22       2    11      6666666666666666666666666666666666   1          11  1  1         1111111111111111111111111                      33333333      55555555555555         444444444444444    33333    1111         1111   3333333333        111             555555555555555            1           111       11111111111111111111111111111              22    1       3333        22222222222                                     1111        111111     222  1         333333333333333                     111            3333333333333333     1      111                 1        333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333  111     11                1      1                      4444444      1111            6666666666666666666666666                            1111111           1111111  11          11                         11111     11111    1111                  11         111         11111111111                                      11                     666666666666666666666666666666666666666666666666666666666                                       1   77777777777              44444444  111                 6666666666666666666666666666666666666666666666       111111111     111         111                    11      2222   11111                     11   33333333           22                               11     333333333333333    33333333333     11111                    111     111111      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                       1     11111     66  9999 55 777   1    333333333333333333333333333333333    3333333 4 4  4       33   8888888888888888        0   55  00 666 777777777777777777777777777777777   33        333333333333333    3 000000000000000000000         55  0000       1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111   66  777 111111     0 4 9 4  111  8  4    3 55       55  3  666   3     99999         5     444 111         4  8 77  55 66  5 3 3 3 99999 3 33333333333333      66   3  55     4    333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333   666666   6 77777777   99    8    0          6  0    3 333333333333333333333333       2     3  111111111111111111111111111111111 0   8   00000000  8  8 444    8 44  444 99   8   8       88     5555      8  8   7777      222  6    2222     0000    6   11 0           8     0 0    8    333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333   3    44    3  7     5    444444      7777777777777777777    2  3        222222222   33    0        4   9          3   33  4   8888888888888888888888888888888888888888888888   8    6    6           1111  8    8 3     8 8888888888           4444  3 0     2  99    55555555555    88  88   8888             3   99 7     3        3   00       3    88      8888888888888888888888888888888888   0          11  6  5         6666666666666666666666666      6       6     8 44444444      44444444444444       8 666666666666666    00000 8  9999       0 0000 1 5555555555        111  6666  8    333333333333333     8      2    8  6   444    6  33333333333333333333333333333    99        11    0 6     3333        44444444444    5       5 5     888  0 5       3 7777 1      666666  5  222  0  5  5   222222222222222   6666    77     5  777     5  99  6666666666666666  6  1      999    5            6        666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666  111     11  5 5 999 5  5  0      0  5  66    55  88     8888888   5  0000   5        6666666666666666666666666      5 4 4  777    4   66  4444444 55      4 7777777  55    9999  00   4     4  4     4  4 4 99999 4   88888    5555   4    77   4    22     66  444    4  4 55555555555 4 9999 4     777 4  4 4    66   8 4  00     66  4 777    4  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333  777 8  66    4  8   4    5      66 5 7   55555555555  66 5   5    88888888  000 5   5   5  66   3333333333333333333333333333333333333333333333   5   666666666 2   111 5  0    000     5 5 5  5 5  5  11  5   0000   55555        5  5 2  888  11   33333333    99     22    5 77 5  77 5   0  5    5   00 5   222222222222222    33333333333     77777    888     5   1   222 6   666666      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                       .     .....     ..  .... .. ...   .    .................................    ....... . .  .       ..   ................        .   ..  .. ... .................................   ..        ...............    . .....................         ..  ....       ........................................................................................   ..  ... ......     . . . .  ...  .  .    . ..       ..  .  ...   .     .....         .     ... ...         .  . ..  .. ..  . . . . ..... . ..............      ..   .  ..     .    ..................................................................   ......   . ........   ..    .    .          .  .    . ........................       .     .  ................................. .   .   ........  .  . ...    . ..  ... ..   .   .       ..     ....      .  .   ....      ...  .    ....     ....    .   .. .           .     . .    .    ..........................................................................................................................................   .    ..    .  .     .    ......      ...................    .  .        .........   ..    .        .   .          .   ..  .   ..............................................   .    .    .           ....  .    . .     . ..........           ....  . .     .  ..    ...........    ..  ..   ....             .   .. .     .        .   ..       .    ..      ..................................   .          ..  .  .         .........................      .       .     . ........      ..............       . ...............    ..... .  ....       . .... . ..........        ...  ....  .    ...............     .      .    .  .   ...    .  .............................    ..        ..    . .     ....        ...........    .       . .     ...  . .       . .... .      ......  .  ...  .  .  .   ...............   ....    ..     .  ...     .  ..  ................  .  .      ...    .            .        .........................................................................................................  ...     ..  . . ... .  .  .      .  .  ..    ..  ..     .......   .  ....   .        .........................      . . .  ...    .   ..  ....... ..      . .......  ..    ....  ..   .     .  .     .  . . ..... .   .....    ....   .    ..   .    ..     ..  ...    .  . ........... . .... .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  .........................................................  ... .  ..    .  .   .    .      .. . .   ...........  .. .   .    ........  ... .   .   .  ..   ..............................................   .   ......... .   ... .  .    ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   .....        .  . .  ...  ..   ........    ..     ..    . .. .  .. .   .  .    .   .. .   ...............    ...........     .....    ...     .   .   ... .   ......      
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                       7     22222     11  4444 11 000   2    222222222222222222222222222222222    0000000 0 0  0       55   0000000000000000        9   00  00 444 555555555555555555555555555555555   55        555555555555555    6 111111111111111111111         00  0000       9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999   55  000 555555     7 0 3 0  999  0  0    6 99       00  6  444   6     11111         4     333 777         0  0 99  88 22  0 6 6 6 11111 6 77777777777777      55   6  00     0    000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000   444444   7 55555555   22    0    0          0  0    2 888888888888888888888888       5     2  888888888888888888888888888888888 0   0   22222222  0  0 222    0 00  000 44   0   0       88     2222      0  0   0000      888  0    2222     8888    4   00 8           0     8 8    0    444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444   2    22    5  0     0    555555      8888888888888888888    5  2        555555555   88    0        5   8          2   88  5   2222222222222222222222222222222222222222222222   0    0    0           8888  0    0 0     0 2222222222           0000  2 8     8  88    77777777777    33  33   3333             7   00 3     3        3   77       3    33      2222222222222222222222222222222222   0          00  0  0         3333333333333333333333333      7       7     0 88888888      00000000000000       0 888888888888888    00000 0  8888       8 6666 4 6666666666        888  8888  0    222222222222222     0      8    0  7   222    7  77777777777777777777777777777    22        77    8 7     5555        88888888888    7       7 7     000  1 7       9 3333 4      444444  7  777  3  7  7   333333333333333   6666    99     7  999     7  22  5555555555555555  7  7      888    0            0        888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888  000     99  0 0 444 0  0  0      0  0  99    88  22     5555555   0  6666   0        4444444444444444444444444      0 4 4  888    4   11  4444444 33      4 1111111  00    4444  66   4     4  4     4  4 4 44444 4   66666    6666   4    11   4    88     11  222    4  4 44444444444 4 7777 4     888 4  4 4    11   9 4  66     11  4 888    4  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333  888 9  33    4  9   4    0      99 0 0   66666666666  99 0   0    88888888  444 0   0   0  99   4444444444444444444444444444444444444444444444   0   111111111 5   444 6  1    000     0 0 0  0 0  0  99  0   8888   22222        0  0 8  888  99   66666666    11     77    7 99 7  99 0   4  0    0   66 0   999999999999999    44444444444     11111    888     7   0   555 7   000000      
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C--TACAAT--AA----AT-A---AATAAATC-------T---T--T-G--TCT-GTC-CA----GAGA-------T-G-GT-GAAAATC--TATC--G-AACAATA----TCATTTTA-AGA--CT--G---GG---A-G-TTGG--C---N-------NTG----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----CGAG-GG-C---A------C----A-GTAATTAAAA--CC-CG-AAAGTTC----------------CTTTATCTG-GTGGACAGTTGGCT-G---------------T-CTAGT--------A-----------ACT-AATG-AT---T------TGTAATT-AAG-TC-N-AC-TA-GAGA-AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA-TT-CTNGT-AGTNT-A-C-G-----A-T-------A------TAATAAA-GGC-TA--TTTTA-ATTT--CCCC--------------G---ANT--T---------------NTT--------CT---CGCN-TGT------GTA-T-A------TAC-CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GCGGCG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTGTGT--A--------TTACCCGTGTTTTGATAGCA--C-ATT-CGCCAGCGA--CA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-CTTT-AGA-AGATTAAA-TTTTA--N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTT--GCAATCTCC---CGAAAAAA-TCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCATC-GTGT---C-T-C-TC-TACATTGTGCCGATAGTATGTTGGAAATTTCTTACATG-GTCATGTGCCGGTNTTGATAGT-TAT-TTGANATT------TTTTACNTGGG-C-CATATAT-GCCCGGTTTTGA------G-TA--TTCAATAT-TTTTTNAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTT-GT--CT-AAT-T----T-GTTTGTTATCAGAATA----C----CAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT--TAGATA------T-TACTCATAGTGC----T-C-GTATTACTCATGG-----GAT-CTATCGTATTCAAGACAGCGT-AA-CG-TGCA-GCGGAAA-TT-AC----A-TGTAATTTTAA-C-GGTTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACANACAACATATTAC-TTGATTTT-ATTT-CACATCC-AGCG--AATTAAA-TTT--------------TCTTCAGAA-AATA-TAC-AGCCTGGCTA--AAATTTCAGTCACAA------T-TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-----ATAGACACTT-------A-GA--AAAAGAG-AA-CTTGC----T--GAAACAA---C-GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTTTA---TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATCAAAT-GACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCCCTT--T--AGGTCCG-CCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--T-ATCCGAAG------GA-GAAA-GGGGG-AA-ACC-G---GGCT---AACTTT-GT-TGAT--TAATG-TA---CAAAA-TA--AAAGGAGGG-G-----TATA-TAATTAAAG-T-GGGAAGTTGTCTAAGTC-GTTGATTTA---TG---GAA---CGTTT-AC---AAAAAG-C-TA----G-G-G----N---TTA----------------AT----------------G-------------TT-C-CAACA--CC-T-A-T-A-TT-AC-GCAGTC-AA-CG--GAATT-CAA-TATTCAAGT---GAA-AA----TGT-GACCTTTT-T---A-A--T-----ACT--A---GGTGTT-C-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATCG-T--CT---GT--ATGG----TT--TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-TT-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA----T--A----A--AATG-------------CCA------------GA--TT-G--CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC----TTTCCC--C-TGA-CAAAA-A---T-TT-G-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--AN---------TGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-A---AGAAT-CAACCATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT-N--AAG----CTTCATGTT-AT-ACAT---GT--CTCT----G--GTCC-GAGTCG-ATCAA-T--G-CT--C-ATATTT-AATT-AAA-AT-TCG--C----------A-GTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AAATTATTAT
Reference ( gi|1 )            :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC--TACAAT--AA----AT-A---AATAAATC-------T---T--T-G--T---GTC-C-----GAGA-------T-G-GT-GAAAATC--TAT---A-AACAA-A----TCATTTTA-AGA--CT--G---GT---A-T-TTGG--C---A-------CTG----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----CGAG-G------A------C----A-ATAATTAAAA--CC-CA-AAAGTTC----------------CC-----------------------G---------------T-CTAGT--------A---------T-ATT-AATG-AT---T------TGTAATT-ATG-TC-A-AC-TA-GAGA-AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACCCCTCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA-TA-CTAGT-AGTAT-A-C-G-----A-T-------G------TAATAAA-GGC-TA--TTTTA-ATTTTACCCC--------------G---ATT--T---------------CTT--------CT---TACA-TGT------GTA-T-A------TAC-CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GTG-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTGTGT--A--------TTACCCATGTTTTGATAGCAAAC-ATT-CGC-AGTGG--CA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-CTTT-AGA-AGATTAAA-TTTTA--A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTT--ACA-TCTCT---CAAAAT---TCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATC-GTGT---CATACATC-TACATTGTGCCGATAGTATATTGGAAATTTCTTACATGGGTCATGTGCCGGTTTTGATAAC-TGT-TTGACATT------TTTTACATAGTACACATGTATAGACAAATTTTGAA----CGGT---TTCAATATGTTTTTTAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCATTT-GT--CC-AAT-T----T-GTTTGTTATCAGAATA----C----CAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATAT--TAAATA------T-TACTCATAGTATCTATTACAATATTACTCTTAG-----GAT-CTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GA-CG-TGCA-GTGGAAA-TG-AC----A-TGTAATTTTAA-C-TGTTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTAC-TTGATTTT-ATTT-CACATCCCAGCG--AATTAA--TTT--------------T--------------TAC-AGCCTGGCTA--AA-TTGCAGTCACAA------T-TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-----ACCGACACT--------A-CA--AAAAGAG-A--CTTAC----T--AAAACC----C-GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTTTTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATCAAAA-GACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCT--T--AGCTCCG-CCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--T-ACCCGAAG------GA-GATA-GGTGG-AA-ACC-A---AGCT---AA-TTT-GT-TGAT--TAATG-TA---CAAAA-TA--AATGGAGAG-G-----TATA-TAATTAAAG-T-AGGACGTTGTCTAAGTC-GTTGATTTACAATGTATTAA---CGTTT-AC---AAAAAG-C-TA----G-G-G----A---TTA----------------A-----------------G-------------TT-C-CAACA--CC-T-A-T-A-TT-AC-GCAGTC-AA-CA--GAATT-CAA-TATTCGAG----GAA-AA----TGT-GACCTTTT-T---A-A--T-----ATT--A---GGTGTT-C-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATCG-T--CT---GT--ATGG----TT--TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-TC-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA----T--G----A--AATG-------------TCA------------GA--AT-T--CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGC-A--TTGCCC--C-TGA-CAAAGTA---T-TT-A-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--AT---------TGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-A---AGAAT-AAACCATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT-T--AAG----TTTCATGTT-AT-ATAT---GT--CTCT----T--GTCT-AAGTCG-TTCAA-T--G-CT--C-ATATTT-AATT-AAA-CT-TCG--C----------A-GTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AAAGTATTAT
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATACCAGAGGC--AATAAT--AATGAAATGA---AATAACTC-------T---------------------------GA-------T-G-GT-GAAAATC--TCA---A-GAAAATA----TCATTTTA-AGA--CT--G---GGGAGA-T-T-GG--C---C-------GTG----GTC--GTCAAACA---A----AT-----CGAG-GGTCC--A------C----AGATAATTAAAA--CC-CG-AAAGTTG----------------GT-----------------------G---------------T-CTAGT--------AACAA-----TGATT-AATC-ATATTT------TGTAATTTAAG-TC-TTAC-TACAAGAGAA-TAGGAAA--TTTCC---AAT-TGGAA-----AGACACCTACCCCTCTC-C--CAGTAA-TTA-CA-TCTCTTGT-A-TAT-A-CCG-----G-T-------G------TAATAAA-GGC-T---TTTTA-ATT--ACCCC--------------A---ATT--TTTCGCATTTGTATTTCTA--------CT---TGC--TGT------GTA-TTA------TAC--TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GCT-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG-GT--A----------ACCC-------GATG-----C-ATG-CGC----GA--CA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-CTTT-AGGCATATTAAA-TTTTA--C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTT--GCAATCTCC---CAAAAAAA-TCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCATC-GTGTTTTCTTAT-TT-TACAT-GTG----TAACATGT------------ACAT---T--TGTGCCG------ATAGT-TATATTGA-ATT------TTTTACATGGGTCATATATTTTGCCGG-TTTTGA--------TA--TTCAATAT--TTTTGAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTT-AT--CT-AAT-T----TTGTTTGTTATCAGAATA----C----CAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT--TAGATA------C---------------------GTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AA-CG-TGCA-GCGGAAAATT-AC----A-TGTAATTTTAA-C-AGT-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACA--A-ATTAC-GTGATTTTTATTTTCACATCC-AGCG--AATTAAA-TTT--------------TCTTTAGAATAATAGTAC-AGCCTAGCTA--AA-TTTCAGTCACAAATCAAATGTA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-----ATAGACACTTA------G-GA--AAAAGAG-AA-CCT-C----T--GAAACA----C-GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTTAT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATCAAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTT--C--AGGTCCG-CCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG----ATCCGAAA------GA-GAAA-TGGGG-AA-ACC-----GGCT---AATTTT-GT-TGAT--TAATG-TA---CAAAT-TG--AAAAG-GAG-G-------TA-TAATTAAAGAG-AGGAAATTGTCTAAGTCGGTTGATTT---ATG---GAA---CGTTT-ACAAAAAAAAG-TATA----G-GCG----C---TTAATAATACACACACC--A-----------------G-------------TT-T-CCACA--CC-T-A-TAA-TT-ACGGCAGTC-AA-CG--GAATA-CAATTATAC-AGTCTTGAA-AA----TGT-TACCTTTT-TTTAA-A----------T--A---GGTGTT-C-C-AG----TTT-CAC--TT---C---AG-AAATCG-T--CT---GT--AT-G----TT--TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGTT-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--ATG-AAACA-TG-CTGATTGT---GC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------------A--AAAG-------------CCA------------G----T-G--CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGC-ATTTTTCCC--C-TGA-CAAA--A---A-TT-A-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--TA---------TGCTTACTTGT-A-C
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gctatTATA-AAGATCCAATACAAT--AA----A-------ATAAATC-------T---T--TTG--TCTTGTC-C------AGA-------T-GTGTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T----TCATTTTT-AGA--CT--G---GGG--A-G-TTGG--CCGGA-------ATG----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----CGAG-GGTCGGTA------CCACTA-CTAATTAAAA--CC-CG-AAAGTCC----------------g
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGGT-----ACAAA--AA----AA-A---AATTAATCAT-----T---T--T-G--TCT-GTC-CA----GAGA-------T-G-GT-GATAATCC-TATC--ACAACAATA----TCATTTCATGGA--CT--G---GG---A-G-TTGG--C---C-------GTG----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATACGAG-G------A------C----A-GCAATTCAAA--CC--G-AAAGTTC----------------CTTTATCTGGATGGACAGTTGGCT-G---------------T-CTAGT--------A-----------ACA-CATG-AT---T------TGTAAGT-AAG-TC-G-AC-TA-GAAA-AA-TAGGATA--TT--C---AAT-TTGAA-----AGACACCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CATTA-CTAGT-AGTTT-A-C-GTAGATA-T-------T------TAAT-AA-GGT-TA--TTTTA-ATTT--CCTC--------------A---GAT--T---------------GTT--------CG---CACT-TGT------ATA-T-C------TA----GCA-TATtgagtggacagttgggcttggctctaagtaaccgcaaagactacaattattgataattaagtctatacatagagaaactaggaaagattccaattgaaatacacccccccccccctccattaaattacatttcttgtaacgactataataatcacattttaccccctccccccccccaatttttcg
gi|19                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGAT-C----CAAT--AA----AT-A---AATAAATC-------T---T--TTG--TCT-GTC-CA----GAGG-------T-G-TT-GAAAATC--TATCA-G-AACAATA----TCATTTTA-AGA--CT--G---GG---A-G-TTAG--C---C-------GTG----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----CGAGCGGTCC--A------C----A-GTAATTAAAA--CC-CG-AAAGTTCCTGAGTGGACAGTTGGCT-----------------------G---------------T-CTAGTAACCGCAAA---------G-ATTAAAT---T---T------TGTAA---AAG-TC-T-ACATA-GAGA-AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTG-A-----ATACACCCC-CCTCCT--C--CAGT-AATTA-CA-TT-TTCTT--GTATAA-C-G-----A-T-------A------TAATAAT-CGC-TA--TTTTA-CCCCTCCCCC--------------
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                             ctggctatTATAAGAT-C----CAATGAAA----AT-A---AAATAATC-------T---T--TTG--TCT-GTC-C-----AAGG-------T-G-TT-GAAAAT---TATCA-G-AACAATA----TCATTTTA-AGA--CT--G---GG---A-G-TTAGGCC---A-------TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT------GAG-G------GTCCGATC----ACATAATTAAAA--CC-CG-AAAGTCA----------------CT-----------------------GGAGTGGACAGTTGGCTGCTAGT--------AACCGCAGAAG-ATT-AA---AT---T------TTGAATG-AAG-TC-T-AC-TA-GAGA-A--TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----ATACACCCC-CCTCCTC-C---AGTAAATTA-CA-TT-TTCTT-TGTAT-A-C-G-----A-T-------A------TAATAAT-CGC-TA--TTTTcccaatttttcg
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                 ggctatTAAGATGCAATA-AAT--AA----AT-AGATAATAAATA-------T---TATT-G--TCTGGTC-CA----GAGA-------T-G-GT-GAACATC--TATCCCG-AACAATA----TCATTTTA-AGA--CCTGG---GG---A-G-TTGG--C---G-------CCGT---GTTC-GTCAAAGA---A----AT-----CGAG-GGGTCT-A------C----A-GTAATTAGAAGACCGCG-AAAATTT----------------CCTGAGTGGTGACGTTGGTT-----G---------------T-TTAGT--------ACAAATG---T-AAC-AATG-AT---TAAATTTTGTATTT-AAG-TCTA-AC-TA-GAGA-AT-AAGAAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA-TT-CTCTT-TGTAT-ATC-G-----A-T-------T------TAATAAA-GGCATA--TTTTA-ATTTTCTCCC--------------ACATATT--TTTCGCA---------CTTGTATTCTACT---TGCAATGT------GTA-TTA------TAC-CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGGCG-CGG--TCTTGTA-----ATCGGGTATTGTGT--A--------TTACCCGTGTTTTGATAGCACACTATT-CGCCAGCGA--CA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTA--TTAAAGGC-AC-GAG----AGGTTT--GCA-TCTCC---CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTG---------T---CAT--------CAGTGTTTC--T--TAT-TTG---------TACATA---CATGTACTTGTGCCGATAGTATAT-TGGAATTT------TTTTACTGGGT---CATATAT-GCCCGGTTTTGA--------TA--TTCAATAT--TTTTAAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTT-GTGTCT-AAT-TGTGTT-GTTTGTTATCAGAATA----CATACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT--TAGATACAGGAAT-TTCTCATAGTGC-------------------GG-----GAT-CTATCGTATTCAAGACAGCGT-AAACG-TGCA-GCGAAAA-T--AC----A-TGTAATTTTAAAC-AGTTGAATGAGCGGT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                   ctggctattgat--TACAAA--AA----AA-A---AATTAATC-------T---T--T----T---GTC-TTTCCAGAGA-------T-G-GT-GATAATC--TATC--ACAACAATA----TCATTTCATGGA--CT--G---GG---A-G-TTGG--C-----------CGT----GTTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----CGAG-G------A------C----A-GCAATTCAAA--CC--G-AAAGTTC----------------CTTTATCTGAGTGGACAGTTGGCT-G---------------T-CTAGT--------A-----------AC--AATG-AT---T------TGTAGTA-A-G-TC-G-AC-TA-GA-A-AA-TAGGATA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACCCCTCCCCCC--------TAAATTACCA-T--TTAGTGAGTTT-A-C-G-----A-T-------AGATATTTAATAAG-GGT-TA-----TA-ATTT--CCTC--------------A---GAT--T---------------GTT--------CG---CACT-TGT------AT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                               aggATAAT--AA----AT-A---AATAAATTATATTGAT---C--TAG--T---GTC-CAG---GAGATCGTAACT-G-GT-GAAAAACCTTATCA-G-AACAA-ATAGGTCATTTTAGAGGACCT--GGATGT---A-G-TTGC--C---AAAGGTCCTTGCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----ATCA---CGAG-GGTCT--A------C----A-GTAATTAAAA--CCGCA-AAAATTC----------------CT-----------------------G---------------tctagca
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                              ggctatgtatgaatgcaataaCAAT---------T-A---AA-AAACC-------TCTTT--T-GCCT---GTC-CA----GAGA-------T-G-GT-GAAA-------T---A-A----------TCATTTTA-AGA--CTAAG---G----A-C-GTG---C---G-------C-----------GCC--------------------CGAG-G------A------C----A-CTAACTAAAC--CA-CC-AATGTTC----------------CCTTTTTTGAGTGGACAGTTGGCT-G---------------T-CTAGT--------A-----------AC--AATG-AT---T------TGTAATT-AAG-TC-T-AC-TA-GAGA-AA-TAGGGAA--TT-TC---AAT-TTGAA-----AGACATG--TACATCCC-C--CAGTAAATTA-CA-TA-CTAGT-AGTTT-A-T-G-----A-T-------G------TAATAAA-GGC-TT--TTTTA-ATTT---CTC--------------GC--ACTTGT---------------ATT--------CTACATGCA-TGT------GTA-T-ATACACGTAC-CTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAAC-T--G---------------------GTATCGGGTATTGTGT--ATTATACATTTACCCGTGT------------C-ATT-CGC-AGCGA--CA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-ATTT-AGA-AGATTAAA-TGTTA--A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTT--CCC-TCTCC---CGAAAA---TTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCATC-GTGT-----TTCTTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGAAATTTCTTATATGGGTCATATGCCGGTTTTGATAAC-TGT-TTCACATTGAACCGTTTCA----------ATGT-T-------TTTTAAAAAGCCGCT---TTT----TGTTCATTAA---------TTTTGTC-TAATTT-G------------------TTTGTTATAAGAATA----C----CAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT--TAAATA------T-TACTCATGG-------TGCGGT-----------------AT-CTATCGTAT-CAAGACAGTGT-GT-TG-TGCA-GCGGAAA-TT-ACCGTGA-CGTAATTTTAA-T-TGCTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTAC-TTGATTTT-ATTT-CACACCCCAGCG--AATTAA--TTTTTCTCAGAATAATAT--------------TAT-AGTCTGGCTA--AA-TTTCAGTAACAA------T------------------TACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-----ATAGACACT--------A-GA--AAAAAAG-A--CCTAC----T--GAAACA----C-GA-T--GTAAAAG------ATC------------------T-ACTAGAATT-ATTCTTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATCAAAT-GACAAG-ATTGA----CCCCTCCC------------CCG-CTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTAT-ATCCGCAG------AA-GAAA-GGGGG-AA-ACC-G---AGAT---AACTTT-GG-TGAT--TAATGCTGAT-CAAAA-Taaagaaagtgtggacagtta
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                T-A---AATCATTC-------T---T--T-G--TCT-GTCACA----GAGA-------TCG-GT-GATAATCC-TATC--ACAACAATA----TCATTTCA-TGA--CT--G---GG---A-G-TTGG--C---C-------GTG----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATCGAG-G------A------C----A-GCAATTCAAA--CC--G-AAAGTTC----------------CTTTATCTGAGTGGACAGTTGGCT-G---------------T-CTAGT--------A-----------AC--AATG-AT---T------TGTAAGT-AAG-TC-G-AC-TA-GAAA-AA-TAGGATA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA-TT-CTAGT-AGTTT-A-C-G-----A-T-------AGATATTTAATAAG-GGT-TA--TTTTA-ATTT--CCTC--------------A---GAT--T---------------GTT--------CG---CACT-TGTATTCTAGCA-T-A------TAC-CTAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gatattataaggtacaaaaaaaacaagaact---A-AAAAA-A----TCACTTTA-AGA--CT--G---GG---AATGTTGG--C---C-------GTG----GTTC-GTCAAACA---------T-----CCAG-GT-----A------C----A-G--A--AAAA--CG-CGGAAAGTTC----------------CTAAACTCGTAGTGGCCAGTTGGCTG---------------T-CTAG---------G---------T-AAC-AATGGAG---T------TGCAATT-AAGCTT-A-AC-TA-CAGA-A--TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -AATT-AT---T------GATAATT-AAG-TCTATACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AAT-T-GAA-----ATACACCCCCCCCCCCCTC--CATTAAATTA-CATTT-CTTGT-A-----A-C-G-----ACT-------A------TAATAA------------TCACATTTTACCCC--------------ca
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gctgattataaagatccaatacaataaaataaatcttttgtcttgtccagatgtgttgaaaatctatcagaagaattcatttttagactggggagttggccggaatggttcgtcaaacaaatcgagggtcggtaccactactaattaaaacccgaaagtcctgagtggacagttgggcttggctctaagtaaccgcaaagactacAAA-AA-TATGAAA--TT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACACCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA-TT-CTCTT-TGTAT-A-C-G-----A-TTTGT---A------TAATAAA-G-C-TAAATTTTA-ATTTCCTCCCTAATTTTTCGCACTGT--ATT--C---------------CTA--------CT---TGCA-TG-------GTAGT-A------TACGCTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGTGACGACGTAACCTT-----TGTAATGGGTATTGTGTTAA--------TTACCCGTGTTTTGATAGCAA-C-ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-TTTT-AGA-AGATTAAACTTTTATTA-AAGGCC-ACCGAG----A-TGTT--ACA-TCTCC---CAAAAAAA-TCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCCGTGT---T-----TC-TGTATTGTAC--ATA-CATGT----AATTT--------------GTGCCGATAGT-ATA-------TTAAT-TT------TTTTACCTGGGGT-CATATAT-GCCCGGTTTTGA------GATATATTCAATATTTTTTATAAGAGCCGCTTTT---GTATCATTTAGT--CCTAATCT----T-GTTT-TT-TCAGAACATACAC----CAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTACAGG------TATACTCATAGTGC-------------------GG-----GAT-CTATCGTATTCAAGACAGCGTAAA-CGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTAAA-CAGGTTTGATGAGGGctccccccccccaatttttcg
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gaTATT-AGTTT-A-C-G-----A-TAGATATTG------TAATAAAAGGC-TA--TTTGA-ATTTC-CCCC--------------G---ATT--t
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TT-CTC-AGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CATTTT-GAA-AGATTAA--TTTGA--T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAAA---TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTATC-GTG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaattatcaggttttagatgtaaatcgccacgtgtatgTGCATG-TACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAATCCTTACATGAGCCATATGCCGGTTTTGATAaattctacaa
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tcatcgtgttttttatttgtacatacatgATCTATTACAATATTACTCATAG-----GAT-TTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GA-CG-TGCA-GTGGAAA-
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTACGTTCATTTT-ATT--CACATCC-AGCGCAAATTAAATTTT--------------TCTTCAGAAAAATA-TACTAACCTGGCTA--AAATTTCA-TCACAA------T-CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GG----ATAGACAATTGATGAAAA-AA--AAAAGAG-AA-CTTGTGATGT--GAAATCA---C-GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--ATTTTTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATCAAAT-GACAAGTAGTGAC----CCCTCCACCT--TCTAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA--TT-AC-ACATACAGG--TTATCCGAAGAGAAAGGG-GA-A-GGGGA-AA-ACC-G---TGTTGTTAA-TTTTGT-TGAT--TAAT--TA---CAAAAATA--AA-GGAG-G-G-----TATA--ATTTTAAG-T-GGAACGTTGTCTAAGTG-GTTGATTTTCA-TG----AA---CGCTT-ACCA-AAAAAGAC-TA----G-G-G----GCACTTA----------------A-----------------AATACACAACCAATTC-C-CTACA--CC-TTA-T-A-TT-ACCGCAGTC-AA-CGCGGAATA-CA--TATTC-AGTTA-AAA-AA----TGT-GACCTTTT-T---G-ACTT-----ACT--AAAAGTTGTT-C-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-GT--ATGG----TT--TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-TT-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAATATTG-C------T---TA-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA----T--ATATTA--AATGCGCATTACAGGTATCC------------GA--AC-TTGCTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG----------CC--C-TGA-CAAAA-A---TGTT-G-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--AT---------AGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-G---AGAAT-CAACCATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCT-TAAAAG----CTTCATGTT-AT-ATATATGGT--CTTC----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCC-ATATCTAAATTAAAA-AT-TTG--T----------A-TCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   --------------T--------------TAC-AGCCTGGTTATAAA-TTTTAGTCGCAA------T-T-----------------ACTTT-ACATTAC-atcgtcattagattatgcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ttttcagaataataCCTGGCTA--AAATTTCAGTCACAA------T-CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-----ATAGACATT--------A-GA--AAAAGAGAA--CTTG-----TGAAAAACA----C-GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-ATTTTTA-------TATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAATGACAAG-AGTGA----CCCCTCCCCTTTCT--AGGTCCG-CCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--T-ATCCGAAG------GA-GAAAGGGGGG-AA-ACCGG---GGTT---AATTTT-GT-TGAT--TAATG-TA---CAAAA-TA--AAAGGAGGG-G-------TA-TAATTAAAG-T-GGAACGTTGTATAAGTC-GTTGATTT------TATGAAGAGC-TTT-ACA--AAAAAG-C-TA----G-G-G----G---CTATAATAATACACACACCA-----------------A-------------TT-CTCAACAC-CC-T-A-T-A-TTAAC-GCAGTC-AACCG--GAATA-CAA-TATTCAGT----AAA-AA----TGT-GACCTTTT-T---GCA--T-----ACTAAA---GTTGTT-C-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATCG-TC-CT---AT--A-GG----TT--TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-TTAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAATA-TG-C------TATGAC-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA----T--T----A--AATG-------------CCATTACAGGTATCCGAAGAT-TG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG----------CC--C-TGA-CAAAA-A---TGTT-G-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--TA---------TGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-A---AGAATCAAACCATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT-A--AAG----CTTCATGTT-AT-ATAT---ATGGCTGT----G--GTCC-GAGTCG-ATCAA-T--G-CT--C-ATATCT-AATT-AAA-AT-TTGATC------------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAA
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atatgtatctaatGTCACTA------TGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACT--------AACAGAAAAAGAG-AAACTT-C----T--GAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC--------TT-ATATTTA--------------AAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATCAAAT-G-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCC--T--AG-TCCG-CTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGGA-T-CCCCGAAA------GAAGAAA-GGCGGGAA-ACC-GGATAG-----AA-TTT-TTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAA-TACAAAAGGAGGGAG-----T-TA-TA-TTAAAGCT-GGGAAGTTGTCTAAGTCCGTTGATTTA--------TAA---CGTTT-AT---AAAAAG-C-TATATGG-G-G----C---TTA----------------ATAATACCACACTCACCAG-------------TTTC-CAACA--CCAT-A-T-AATT-AC--CAGTCCAA-CG--GAACTACAA-TATTC-AGTC--GAA-AA----TGT-GACCTTTT-T---T-T--TCTTA-ATT--ACAGGGTTTT-CTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATCG-TT-CT---GTG-ATGG----TT---GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T--A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAATA-TG-T------A---ACTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA----T--A----A--AATG-------------CCA------------GA--TT-G--CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAAC--------TG-CC--C-TGA-CAAAAT----T-GT-G-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTGG---TATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATA---CGAAT-CAACCATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT-A--AAG-----CTCA-GTT-ATAATAT---GT--CTC--------GGTT-GAGTCG-ATCAA-T--G-CT--C-ATATTT-ACTT-AAA-AT-TCC--G----------A-GTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AAATTATTAtgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        acatgaaatattctatcttgatatttttatttcacattcaaaatcatccagcgagaatttcaatattttttccaattcaaatagaataatatccgaacaatgctgctataattctcaatcaccaatcC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATCAAAT-GACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTT--T--AGGTCCG-GCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--T-ACCCGAAG------GA-GAAA-GGTGG-AA-ACC-G---AGCT---AACTTT-GT-TGAT--TAATG-TA---CAAAA-TG--AAAGGAAAG-GAGGGATATA-TGATTAAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G-CCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--T-ATCCGAAG------GA-GAAAAGGGGG-AACACC-G---GGCT---AA-TTC--T-TGAT--TTATG-TT---TAAAA-TA--AA---AGTA-G-----TATACTA--CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-AAT-ATTTA-----TTTGAA---CGTTTCAC---AAATAG-A-TAT---G-G-GCTTCA---TTA----------------ATGCACAACTG-------G-------------TT-C--AACA--CA-T-AAT-A-TT-AC-GCAGTCCAA-CA--TAATT-CA--TATTCA------GAA-AACGATTGT-GGCCTTTT-T---A-A--T-----A---------GTGTT-C-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATCG-T--C----GT--ATTG----TT--TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-TT-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA----TAAG----A--AATG-------------CCA------------TA--TG-G--CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA--TTTCCC--CATAAGCAAAAAA---A-TT-ATT-TTG-CTA-GC---GT---TA--TT---------T--TT--AT-----CA------------TGT-ACG-ATG-AGACATAAT-AAA----GCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT-A--AAG----TTTTAT-CA-AT-ACAT----T--TTCTAACATG-GTCT-GGGTCGAATCAA-T--GCCT--C-ATAATT-AATC-AAA-CCGTTG--C----------A-GTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AA--TATTAT
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTGATTTA---TG----AA---CGTTT-AC---AAAAAG-C-TG----GAG-G----C---TTA----------------ATAATACACAAACCA---G-------------TT-T-CAACA--TA-T-A-A-A-TT-AC-GCAGTC-AA-CA--TAATT-CAA-TATTCAGG----GAA-AA----TGT-GACCTTCT-T---A-A--T-----A--------GGTGTT-T-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATCG-T--CT---GT--ATGG----TT--TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-TT-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA----T--A----A--AATG-------------CCA------------GA--TT-G--CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC----TTTCCC--C-TGA-CAAAA-A---T-TTGA-T-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-A---AGAAT-CAACCA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT-T--AAG----TTTTATGTT-AA-ACAT---GT--CTCT----G--GTCT-GAGTtatcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTGATTTA---TG----AA---CGTTT-AT---AAAG-------------------------TA----------------A-------------------------------TA-CACAGCAGTCC-T-A-C-A-TT-TC-GCTGTC-AA-CA--GAATT-CAA-TATTCataaaattactacagaaaataaatcggcattagttatacataatacatgtacatgaattccttttcaattagaagtttctttaagaaatgcgtgttatgtatataaggatattgaaacccttgaatgctattttcagcataaaagaatgtgcatttttgttgcagtgtaataaaaatttcgctccgtctgaattagttctaaatttacaacatttctatcaggttttccgttcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttctatcgtgtatcatgtcaagaatagcgttgtgggtgctgtaacacaaca
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----------------A-----------------G-------------TT-T-CAATG--CC-T-A-A-A-TA-AG-ACAGTC-AA-CA--GAATT-CAA-AATTAAAA----CAAGAA----TGTAGGCACATT-G---A-A--GCAACGAAT--G---AGTTTC-C-C-TG---TTTG-AAA--TT---C---A-----TTG-TTGCTCCGGT--ATGT----TT--TGT-TTGAA-GT-TAGAA---------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAAT--TT-C------T----C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA----A--G----A--GCT--------------TCA------------GAGCAC-T--TT---T-AG---ATT-AT-CAA-Tagataaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----GAA-AA----TGT-GACCTTTTGC---A-A--T-----ACT--A---GGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG-AA-TCG-T--CT---GTT-ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-TT-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAATA-TGCC------T---AC-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCT--C----AACAATG-------------ACA------------GA--TTGT--CT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT-C--TT---C--C-GGA-CCAACCAAATT-TT-G-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-T---TCTAT-A---CATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT-A--AAG----CTTCATGTTAAT-ATAT---GT--CTC-----T--GTCT-GAGTCG-ATCAA-T--G-CC--CTATA-TT-AATT-AAA-AT-TCG--CGTATGTGTATA-GTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAAAGTATT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacaaattacttatagt-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATTA-T--TT---GCTAATGG----TTA-TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCTA--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAATA-TG-C------T---AC-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA----T--A----A--AATG-------------CCA------------GA--TT-G--CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAAC---------GCCCGGG-TGA-CAAAAAT---T-TT-G-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTAA---------TGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-A---A-AAT-CAA-CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGTAG--AAG----CTTCATGTT-AT-A-AT---GT--CTCT----G--GTCT-GAGTCG-ATCAA-T--G-CT--C-A-ATTT-AATT-AAA-AT-TCG--C----------A-GTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AGATTATTAtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ---TGT-ACG-ATGGA---AGAAG-TCACCATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCT-C--AAAAGATTTTTATGTT-AT-ACA----GTG-CTCT----G--ATCC-GAGTCG-ATCAA-TCCG-CT--C-ATATCT-AATT-AAAACT-TCGA-C----------AAGTTGCAA---AACCTTTAAGA---AAA------AAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AACTTATTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              t-ATATTC-AATT-AAA-CT-TCG--C----------G-GTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GAAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
11 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         11111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333          11111111111    11111111    111111111111    111             1111111          11    2222                                 111                  111111111111             11111111  11111        55555555555                              444444444444                             11111111  6666666666666666666666      111111  2222222222                   111                                                          2222222                                        333333333333                             111  1111111111111111      6666666666666666666666666666666666666666   11   111111     1    222222                              4444444     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          111                         11      1      1111      111  1                                                           333333333333333         111         55555555555555555555555       111111      1        11        1    1111       222   1        444444444             111              11      22222      11       1111               1111    1111   11                                1111      4444444           33333333333333333333              1           1                 111   1111               11                   44444444444    11  11   2222                  1              111             333333333333       11111   11  11    555555555555555555555555555555                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222      22222222  1111                111111             1             44444444                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1            111111      1                   111      22222222        22222     11         1                1                2222             222           4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444     11                          11                 222222222                       44444444444444444444444                             111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                      1111111111                                                              22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      111                                    1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             888888     55   88888888888    44444444    666666666666    111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 44 3  222 77 3  3 999999 3 111111111111    3        00000000  66666 44   3 44444444444  3  3         44  99 3       999999999999 3           55   55    3 3  66666666  1111111111111111111111    3 000000  6666666666       3   3  44 3 000  3    3  3       44  3  555   3     88888     44         0000000          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44      8888   666  8888888888888888 1  1 7777777777777777777777777777777777777777   00   444444   5 1    555555     8    8             8     2222222  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  111 6    6   6        6     44      3  6   4444      222  9    99 6 99  6       3    6             6  0        6 6    999999999999999 1   3   444   5   6 11111111111111111111111       222222      6   8 5  00 0      1 8  2222 0     222   0    0   444444444        8    999         0    11  8   00000   8  99     8 7777 8       0     7777    7777   11    8          5 6          0   7777      0000000           55555555555555555555              5           3    6    6       555   7777 8         8   44  0       5  0     77777777777    33  33   1111             1    1      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    222222222222222222222222222222  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   777777      99999999  5555         6  6 1 999999  2          3   3     6   55555555    4  88     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            33 66   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   111111  5   0         66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   3            3     5   66 888 6666 888      5  000      888  3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     00  8  777 4  4 4 4      8  00       4   4     666666666     9999   4        4 66666666666666666666666     4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55 4    4  4 2222222222  4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   111   9999         4  4 4 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   ...........    ........    ............    ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . .. .  ... .. .  . ...... . ............    .        ........  ..... ..   . ...........  .  .         ..  .. .       ............ .           ..   ..    . .  ........  ......................    . ......  ..........       .   .  .. . ...  .    .  .       ..  .  ...   .     .....     ..         .......          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..      ....   ...  ................ .  . ........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     .......  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  ... .    .   .        .     ..      .  .   ....      ...  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ............... .   .   ...   .   . .......................       ......      .   . .  .. .      . .  .... .     ...   .    .   .........        .    ...         .    ..  .   .....   .  ..     . .... .       .     ....    ....   ..    .          . .          .   ....      .......           ....................              .           .    .    .       ...   .... .         .   ..  .       .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ..............................  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......      ........  ....         .  . . ......  .          .   .     .   ........    .  ..     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .. ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   ......  .   .         ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            .     .   .. ... .... ...      .  ...      ...  ...................................................................     ..  .  ... .  . . .      .  ..       .   .     .........     ....   .        . .......................     .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  .. .    .  . ..........  . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ...   ....         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             111111     55   66666666666    22222222    444444444444    000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 66 3  555 99 3  3 666666 3 222222222222    3        00000000  77777 66   3 55555555555  3  3         66  22 3       000000000000 6           00   00    6 6  88888888  0000000000000000000000    6 555555  4444444444       6   6  66 6 000  6    3  3       66  3  888   3     33333     66         7777777          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66      5555   555  2222222222222222 0  0 0000000000000000000000000000000000000000   99   444444   7 4    888888     0    0             0     0000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  777 7    7   7        7     33      3  7   2222      888  5    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    888888888888888 4   2   333   2   3 88888888888888888888888       777777      0   0 6  22 8      6 0  0000 8     000   0    8   444444444        0    666         8    00  0   00000   0  00     0 0000 0       8     0000    0000   00    0          6 0          8   0000      8888888           99999999999999999999              5           3    7    7       555   0000 0         0   44  8       0  8     00000000000    88  88   2222             0    4      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    222222222222222222222222222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   222222      33333333  0000         7  7 0 222222  5          3   2     7   55555555    2  88     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            11 11   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   111111  0   5         99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   0            3     0   99 888 2222 888      0  666      222  4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444     66  9  333 4  4 4 4      9  66       4   4     333333333     4444   4        4 33333333333333333333333     4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55 0    0  0 1111111111  0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   666   4444         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAA----------TAAATA-------AATC---T---T--TTGTCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--G-GG---A--G-TT-G------G-CCG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG-C-----C--AC-AG-TAATTAAAA--CC-CG-AAAGTTCCTT-A-TC-TGAG-TGGACAGTTGG--CTG--TCTA-G-TA--------AC----------------------AATG-A------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAA----TTT---CC--C----------CG-ANTTGT----T---------------C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CA---TT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-CTTT-AGA-AGATTAAA-TTTTAN-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGTT---TC-----T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGAAATTTCTTACAT-G-G-TCATGTGCCGGTTTTGATAGTATAT-TTGANATTTTTTACAT-GG-GT-CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTT-GT--CTAAT-T----T-GTTTGTTATCAGA----ATAC----CAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT----TAGATAC-----TTACTCATAGTG-C-----C---ATT------GGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AAC-NGTTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAA-TA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACC-AC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT-TTA---TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-GTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC---AAAAAG-C-TA----G-G-G---CT--T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-T-A-TT-A-C-GCAGTC-AA--CGGAATT-CAA-TATTCAAG---T--GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--G-AATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--AAAG----CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAA----------TAAATA-------AATC---T---T--T-GTCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--G-GG---A--G-TT-G------G-CNN---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG-------C--AC-AG-TAATTAAAA--CC-CG-AAAGTTCCTTTA-TC-TG-G-TGGACAGTTGG--CTG--TCTA-G-TA--------AC----------T-----------AATG-A------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAA----TTT---CC--C----------CG-ANTTNT----T---------------C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GCGGCG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CA---TT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-CTTT-AGA-AGATTAAA-TTTTAN-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGTC---TC-----T--CTACATTGTGCCGATAGTATGTTGGAAATTTCTTACAT-G-G-TCATGTGCCGGTNTTGATAGT-TAT-TTGANATTTTTTACNT-GG-GC-CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTT-GT--CTAAT-T----T-GTTTGTTATCAGA----ATAC----CAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT----TAGATA------TTACTCATAGTG-CT----CG-TATTACTCATGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AAC-GGTTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACANACAACATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAA-AA-TA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACA-AC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT-TTA---TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCCCTTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGAAGTTGTCTAAGTC-GTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC---AAAAAG-C-TA----G-G-G---NT--T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-T-A-TT-A-C-GCAGTC-AA--CGGAATT-CAA-TATTCAAG---T--GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--G-AATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--NAAG----CTTCATGTT-AT-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAA----------TAAATA-------AATC---T---T--T-GT-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--G-GT---A--T-TT-G------G-CAC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G-----------AC-AA-TAATTAAAA--CC-CA-AAAGTTCCC---------------------------G--TCTA-G-TAT-------AT----------T-----------AATG-A------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAA----TTTTA-CC--C----------CG-ATTTCT----T---------------C---------------T---TACA-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GTG-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAACA---TT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-CTTT-AGA-AGATTAAA-TTTTAA-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACA-----T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGAAATTTCTTACAT-G-GGTCATGTGCCGGTTTTGATAAC-TGT-TTGACATTTTTTACAT-AGTACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TTT-GT--CCAAT-T----T-GTTTGTTATCAGA----ATAC----CAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATAT----TAAATA------TTACTCATAGTATCTATTACAATATTACTCTTAGGATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AAC-TGTTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT-------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC--C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT-TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAA-TTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-GTTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC---AAAAAG-C-TA----G-G-G---AT--T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-T-A-TT-A-C-GCAGTC-AA--CAGAATT-CAA-TATTCGAG------GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--A-AATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--TAAG----TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAA--TTCTTGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-AAT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC---AAATAG-A-TAT---G-G-G---CT--TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAAT-A-TT-A-C-GCAGTCCAA--CATAATT-CA--TATTCA--------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--G-AATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--AAAG----TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AAA-AA-TATGAAA--TT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAA----TTT---CCTCC----------CT-AATTTT----T---------------CGCACTGTATTCCTACT---TGCA-TG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGTGACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-CA---TTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-TTTT-AGA-AGATTAAACTTTTATTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGTT---TC-----T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT----AATT----------------TGTGCC------GATAGTATAT-T--AATTTTTTTACCTGGG-GT-CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TTTAGTC-CTAATCT----T-GTTT-TT-TCAGAACATACAC----CAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTACAGGTA-------TACTCATAGTG-C------------------GGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTGATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCT--CAAAAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--G-AATA-TG-C------T---AC-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGTA-GAAG----CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAA----------AAAATT-------AATCAT-T---T--T-GTCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--G-GG---A--G-TT-G------G-CCG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G-----------AC-AG-CAATTCAAA--CC--G-AAAGTTCCTTTA-TC-TG-GATGGACAGTTGG--CTG--TCTA-G-TA--------AC----------A-----------CATG-A------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGATA--TT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAA----TTT---CC--T----------CA-GATTGT----T---------------C---------------G---CACT-TGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT------ACAAA--AAAAACAAGAACTTAAATC-------ATTC---T---T--T-GTCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--G-GG---A--G-TT-G------G-CCG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G-----------AC-AG-CAATTCAAA--CC--G-AAAGTTCCTTTA-TC-TGAG-TGGACAGTTGG--CTG--TCTA-G-TA--------AC----------------------AATG-A------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGATA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAA----TTT---CC--T----------CA-GATTGT----T---------------C---------------G---CACT-TGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA-------------ATA-------AATC---T---T--TTGTCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-T--G-GGG--A--G-TT-G------G-CCGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC--ACTAC-TAATTAAAA--CC-CG-AAAGTCC---------TGAG-TGGACAGTTGGGCTTGGCTCTAAG-TA--------AC----------CGCAAAGACTACAATT-A------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AAT-T-GAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCTC--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAA----------TAAATA-------AATC---T---T--TTGTCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--G-GG---A--G-TT-A------G-CCG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGTC-----C--AC-AG-TAATTAAAA--CC-CG-AAAGTTC-------C-TGAG-TGGACAGTTGG--CTG--TCTA-G-TA--------ACCG--------C-----------AAAG-ATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTACCCCTCCC---CC--C----------CC-AATTTT----T---------------C---------------ccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--G-GGG--A--GATT-G------G-CCG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTC-----C--AC-AGATAATTAAAA--CC-CG-AAAGTT------------------------GG---TG--TCTA-G-TA--------AC----------------------AATG-A------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAAA--TTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC-C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAA----TTA---CC--C----------CA-ATTTTT----CGCATTTGTATTTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GCT-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-CTTT-AGGCATATTAAA-TTTTAC-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGTT---TTCTTATT--TTACAT-GTG----TAACATGT------------ACAT-----T--TGTGCCG------ATAGT-TATATTGA-ATTTTTTACAT-GG-GT-CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTT-AT--CTAAT-T----TTGTTTGTTATCAGA----ATAC----CAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT----TAGATACGTA--TTACTCATAGTG-G-----CG-GATT-----------CTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AAC-AGT-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAA-TAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAACA--C----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT-AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC---G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTCGGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-ACAAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT--T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAA-TT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATAC-AGTCTT--GAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A----------T---AGGTG-TTC-C-AG----TTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT---GTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CTGATTGT---GC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Cg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAA----------AAAATT-------AATC---T---T--TTGTCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--G-GG---A--G-TT-G------G-CCG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G-----------AC-AG-CAATTCAAA--CC--G-AAAGTTCCTTTA-TC-TGAG-TGGACAGTTGG--CTG--TCTA-G-TA--------AC----------------------AATG-A------TT----------TGTAGT--AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGATA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC--------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAA----TTT---CC--T----------CA-GATTGT----T---------------C---------------G---CACT-TGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAA----------TAAAAT-------AATC---T---T--TTGTCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--G-GG---A--G-TTAG------G-CCA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGAT-C--AC-A--TAATTAAAA--CC-CG-AAAGTCACTGGA-------G-TGGACAGTTGG--CTG---CTA-G-TA--------ACCGCAGAAGATT-----------AA---A------TT----------TTGAATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--TG---TT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CATTTT-GAA-AGATTAA--TTTGAT-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGAA---T------T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-A-A-TA-A-G-ACAGTC-AA--CAGAATT-CAA-AATTAAAA---C--AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--C-AAT--TT-C------T----C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAA----------TAAATA-------AATTATAT---T--G-ATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--G-GATGTA--G-TT-GCCAAAGGTCCT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG-------TCTAC-AG-TAATTAAAA--CCGCA-AAAATTCCT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--G-GG---AATG-TT-G------G-CCG---T-G----GTTC-GTCAAACA---------T-----C--CAG-G--------T--AC-AG---A--AAAA--CG-CGGAAAGTTCCTAAACTCGTA-G-TGGCCAGTTGG--CTG--TCTA-GGTA--------AC----------------------AATGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAGA-A--TAGGAAA--TT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCgaaagaaagtgtggacagtta
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAA-AAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATC-AC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT---TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-GTTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCA-AAAAAGAC-TA----G-G-GGCACT--TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-T-A-TT-ACC-GCAGTC-AACGCGGAATA-C-A-TATTC-AG---TTAAAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--G-AATATTG-C------T---TA-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAAAAG----CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tTACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAATCCTTACAT-GAG-CCATATGCCGGTTTTGATAaaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatgTTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT---AAAG-----------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-C-A-TT-T-C-GCTGTC-AA--CAGAATT-CAA-TATTCAGA---T--AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -TATTACTCATAGGATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atctattacaaT-TTTCA---------GAATAA-TA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAA----TTTC--CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAA-TA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACC-ACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC--------TT-AT-----A---TTTA-------AAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCGTTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT---AAAAAG-C-TATATGG-G-G---CT--T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-T-AATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAA-TATTCAGT---C--GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--G-AATA-TG-T------A---ACTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--AAAG----C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTG-----TGAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-ATT--------TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-GTTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA--AAAAAG-C-TA----G-G-G---GCTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-T-A-TTAA-C-GCAGTC-AAC-CGGAATA-CAA-TATTC-AG---T--AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--G-AATA-TG-C------TATGAC-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--AAAG----CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT---------------TAAA-A-------AACC---TCTTT--T-GCCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAGG---AC-G-T---------G-CG--------------C-GCC--------------------C--GAG-GA-------C--AC----TAACTAAAC--CA-CC-AATGTTCCCTTT-TT-TGAG-TGGACAGTTGG--CTG--TCTA-G-TA--------AC----------------------AATG-A------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGAA--TT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC---C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAA----TTT---CT--C----------GC-ACTTGTAT--T---------------C---------------TACATGCA-TGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT-------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------CA---TT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-ATTT-AGA-AGATTAAA-TGTTAA-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTT---CCCTCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGTT---TC-----TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGAAATTTCTTATATGG-G-TCATATGCCGGTTTTGATAAC-TGT-TTCACAT--------T-GA-AC-C--------------GTT--------------TCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTTT-GT--CTAAT-T----T-GTTTGTTATAAGA----ATAC----CAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT----TAAATA------TTACTCATGGTG-C------------------GGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AAT-TGCTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAA-TATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAAC--AC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC-TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AG---T--GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGA-AATA-TGCC------T---AC-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--AAAG----CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAA----------TAAATAGATAATAAATA---T---TATT-GTCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGG-GG---A--G-TT-G------G-CGC---C-GT---GTTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGTC----T--AC-AG-TAATTAGAAGACCGCG-AAAATTTCCTGA-G--TG-G-TG-AC-GTTGG--TTG--TTTA-G-TACAAATGTAAC----------------------AATG-A------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAAA--TT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAA----TTTTCTCC--CACATATTTTTCGCACTTGTATTCTA--------------C---------------T---TGCAATGT------GTA-TTATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGGCG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATTAAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGTT---TC-----T-------------------TAT-TTG---------TACAT-A----CATGTACTTGTGCCGATAGTATAT-TGGAATTTTTTTAC-T-GG-GT-CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTT-GTGTCTAAT-TGTGTT-GTTTGTTATCAGA----ATACATACCAA--TTTA-CATGAATATT-GATTTCTTATGAATAT----TAGATACAGGAATTTCTCATAGTG-C------------------GGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAAC-AGTTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctggctattgatTTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC---AAAAAG-C-TG----GAG-G---CT--T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-A-A-TT-A-C-GCAGTC-AA--CATAATT-CAA-TATTCAGG------GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--G-AATA-TG-C------T---AC-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--TAAG----TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111             1111   11111        5555555555                               4444444444444444                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          22222                                           333333333333                        111111  2222222222222       6666666666666666666666666666666666666666   11   111111   1      222222                              33333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               5555555555555555555555555555555555555555555555555555          333333     111    22222          11111111       111            444444444                              11      22222  11          2222                3333       11                                1111       555555            000000000000000000000              1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1             44444444                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        2222   66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77         3333333333333333    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         33333 55          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44        222222  0000000000000 77 1  7777777777777777777777777777777777777777   00   444444   1 5    555555     8    8             8     44444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        5 5    77  5555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 77     444444     111    22222        3 66666666       888 2 2        222222222       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0     4444       11    8        3   6          0   4444  6    111111            444444444444444444444    6         5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     6   99999999        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ....   ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..         ................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         ..... ..          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..        ......  ............. .. .  ........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     ........  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  .................................................... . ..     ......     ...    .....        . ........       ... . .        .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .     ....       ..    .        .   .          .   ....  .    ......            .....................    .         .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .   ........        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        9999   77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11         7777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         55555 00          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66        222222  9999999999999 11 0  1111111111111111111111111111111111111111   99   444444   4 7    888888     0    0             0     00000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    99  8888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 99     666666     555    22222        2 22222222       333 5 5        111111111       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8     0000       00    0        8   0          8   2222  7    777777            222222222222222222222    7         5           3    7    7       555   0000 0         0   0 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     7   55555555        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC-T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATA---GTATATTGGAAATT-CTTACAT-G-G-NCAT--GTGCCGGTTTTGATAGT-ATATT-GA-ATTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-ATACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT----TA-GATA------TTACTCATAGTGC-------------------GGGAT-CTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT-TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC-TT-ATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATA---GTATATTGGAAATTTCTTACAT-G-G-TCAT--GTGCCGGTTTTGATAGT-ATATTTGANATTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGA----ATACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT----TA-GATAC-----TTACTCATAGTGCC------------A---TTGGGAT-CTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACNG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT-TTA---TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC-C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---TTACC--C----------CG-ATTT-----------CT--T----C---------------T---TAC-ATGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GT-G-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATA---GTATATTGGAAATTTCTTACAT-G-GGTCAT--GTGCCGGTTTTGATAAC--TGTTTGACATTTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGA----ATACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATAT----TA-AATA------TTACTCATAGTATCTATTACAATATTACTCTTAGGAT-CTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT-TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC--CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATT---T--CCTCC----------CT-AATT-----------TT--T----CGCACTGTATTCCTACT---TGC-ATG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGT-GACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA----CATGT----AATT----------------T--GTGCC------GATAGT-ATATT--AATTTTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAACATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTACA-GGTA-------TACTCATAGTGC-------------------GGGAT-CTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC-TTTATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC-TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT--------CCT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCT-C--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC-------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC--C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATT---A--CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT--TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GC-T-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-TATTTTAC--AT----GTGTA-------------ACAT-G-T-ACATTTGTGCCG------ATAGTTATATT-GA-ATTTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGA----ATACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT----TA-GATACGTA--TTACTCATAGTGGC-------------------GGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT-AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T------GTTC-GTCAAACAAGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTTT-ATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC---------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA----AAT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTCAC-T-----G-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAG-AAT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC-TG-AAA--G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC-TA-AACTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT---TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTCAT-C-GTGT--TTT-T---TAT-TTGTAC--ATACATGTGCAT--G--------TACAT--------T--GTGCCG------ATAGT-ATATTGGATAATCCTTACAT-GAGC---CATATG------CCGGTTTTGA---aaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACATTGTGCCGATA---GTATATTGGATAATCCTTACAT-GAG-CCAT--ATGCCGGTTTTGATAta
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TAT----TACAATA------TTACTCATAG------------------------GAT-TTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATT---TC-CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC-----------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-ATT--------TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC-----------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTT-TTTT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC----C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATT---T--CT--C----------GC-ACTT-----------GTATT----C---------------TACATGC-ATGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT--------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATA---GTATATTGGAAATTTCTTATATGG-G-TCAT--ATGCCGGTTTTGATAA------CTG-----TTTCACAT--------------T---GAACCGTTT--------------CAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAGA----ATACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT----TA-AATA------TTACTCATGGTGC-------------------GGTAT-CTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC-TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA----AAT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTCCTC--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCT--CC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTA-TTCTAC---------------T---TGCAATGT------GTATT-ATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGG-CG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T----------------------TAT-TTGTACA-----TACAT-G-T-ACTT--GTGCC------GATAGT-ATATTGGAATTTTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACATACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT----TA-GATACAGGAATTTCTCATAGTGC-------------------GGGAT-CTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111                       11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          2222222                                        333333333333                         222222222222222222       666666666666666666666666666666666666666666   11   111111     1    222222                              3333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               222222          888888888888888888888888       1111   11     333333              22222222         11111111       111            444444444                              11      22222  11          2222                 3333333     11                                77777777777777777777777777777777777777777          111               1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1         3333333333333                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        77777777  66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         0000000          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44         111111111111111111 77 1  777777777777777777777777777777777777777777   00   444444   5 1    555555     8    8             8     4444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        5 5    77  111111 555      777777777777777777777777     5 8888   33     444444    9999      33333333       3 66666666       888 2 2        222222222       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0    0 4444444     11    8        3   6          0   77777777777777777777777777777777777777777          222               5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     7777777777777        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ........  ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         .......          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..         .................. .. .  ..........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     .......  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  ...... ...      ........................     . ....   ..     ......    ....      ........       . ........       ... . .        .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .    . .......     ..    .        .   .          .   .........................................          ...               .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .............        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        99999999  77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       77777777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         7777777          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66         000000000000000000 11 0  111111111111111111111111111111111111111111   99   444444   7 4    888888     0    0             0     0000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    99  333333 666      999999999999999999999999     7 7777   66     666666    3333      55555555       2 22222222       333 5 5        111111111       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8    8 0000000     00    0        8   0          8   88888888888888888888888888888888888888888          333               5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     2222222222222        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACAT-G-NN-CAT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACAT-G-GN-CAT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTTTA-CC--C----------CG-ATTT-----------CT----T----C---------------T---TACA-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GTG-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TTTCTTACAT-G-GGTCAT--GTGCCGGTTTTGATAACT-GT-TTGACA--T--TTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----T--ACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAAATATTACTCATA-GTATCTATTACAAT------A----TTACTCTTAG------GATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT--TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATTT---CCTCC----------CT-AATT-----------TT----T----CGCACTGTATTCCTACT---TGCA-TG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGTGACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT-----AA-TT----------------T--GTGCC------GATAG-T-ATATTAA-T--T--TTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTA---------CA-G-----------GT------A-----TACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCTC--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC-C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATTA---CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT----TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GCT-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-TATTTTAC--AT-GTGTA---------------ACAT-G-TA-CATTTGTGCCG------ATAG-TTATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----T--ACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT-------------TA-G-----------AT------ACGTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT--AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC--------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC---------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tTCAT-C-GTGT--TTT-T---TAT-TTGTAC-A----TACAT--G----------TGCAT-G-TA-CATT-GTGCCG------ATAG-T-ATATTGG-A--TAATCCTTACAT-GAGC---CATATG------CCGGTTTTGA---aaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAA-TC-CTTACAT-GAGC-CAT--ATGCCGGTTTTGATAta
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAT-------------TACA-----------AT------A----TTACTCATAG------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATTTC--CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-A-----TT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC--------------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC---C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATTT---CT--C----------GC-ACTT-----------GTAT--T----C---------------TACATGCA-TGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT-------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGA-AATTT-CTTATATGG-GT-CAT--ATGCCGGTTTTGATA------ACTG---------TTTCACAT--------------T---GAACCGT--------------TTCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT-------------TA-A-----------AT------A----TTACTCATGGTG-CGGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC--TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCTCC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTATTCTA---C---------------T---TGCAATGT------GTA-TTATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGGCG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T---TAT-TTGTAC-A----------------------TACAT-G-TA-CTT--GTGCC------GATAG-T-ATATTGG-AATT--TTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACAT--ACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------ATACAGGAA----TTTCTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111                       11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          2222222                                        333333333333                         222222222222222222       666666666666666666666666666666666666666666   11   111111     1    222222                              3333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               222222          888888888888888888888888       111111111     333333              22222222         11111111       111            444444444                              11      22222  11          2222                 3333333     11                                77777777777777777777777777777777777777777          111               1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1         3333333333333                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        77777777  66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         0000000          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44         111111111111111111 77 1  777777777777777777777777777777777777777777   00   444444   5 1    555555     8    8             8     4444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        5 5    77  111111 555      777777777777777777777777     5 333333333     444444    9999      33333333       3 66666666       888 2 2        222222222       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0    0 4444444     11    8        3   6          0   77777777777777777777777777777777777777777          222               5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     7777777777777        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ........  ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         .......          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..         .................. .. .  ..........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     .......  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  ...... ...      ........................     . .........     ......    ....      ........       . ........       ... . .        .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .    . .......     ..    .        .   .          .   .........................................          ...               .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .............        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        99999999  77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       77777777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         7777777          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66         000000000000000000 11 0  111111111111111111111111111111111111111111   99   444444   7 4    888888     0    0             0     0000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    99  333333 666      999999999999999999999999     7 777777777     666666    3333      55555555       2 22222222       333 5 5        111111111       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8    8 0000000     00    0        8   0          8   88888888888888888888888888888888888888888          333               5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     2222222222222        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACAT-GNA-C-AT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACAT-GNN-C-AT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTTTA-CC--C----------CG-ATTT-----------CT----T----C---------------T---TACA-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GTG-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TTTCTTACAT-GGGTC-AT--GTGCCGGTTTTGATAACT-GT-TTGACA--T--TTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----T--ACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAAATATTACTCATA-GTATCTATTACAAT------A----TTACTCTTAG------GATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT--TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATTT---CCTCC----------CT-AATT-----------TT----T----CGCACTGTATTCCTACT---TGCA-TG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGTGACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT-----AA-TT----------------T--GTGCC------GATAG-T-ATATTAA-T--T--TTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTA---------CA-G-----------GT------A-----TACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCTC--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC-C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATTA---CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT----TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GCT-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-TATTTTAC--AT-GTGTA---------------ACAT-GTA-C-ATTTGTGCCG------ATAG-TTATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----T--ACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT-------------TA-G-----------AT------ACGTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT--AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC--------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC---------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tTCAT-C-GTGT--TTT-T---TAT-TTGTAC-A----TACAT--G----------TGCAT-GTA-C-ATT-GTGCCG------ATAG-T-ATATTGG-A--TAATCCTTACAT-GAGC---CATATG------CCGGTTTTGA---aaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAA-TC-CTTACAT-GAG-CCAT--ATGCCGGTTTTGATAta
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TAT-------------TACA-----------AT------A----TTACTCATAG------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATTTC--CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-A-----TT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC--------------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC---C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATTT---CT--C----------GC-ACTT-----------GTAT--T----C---------------TACATGCA-TGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT-------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGA-AATTT-CTTATATGGGT-C-AT--ATGCCGGTTTTGATA------ACTG---------TTTCACAT--------------T---GAACCGT--------------TTCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT-------------TA-A-----------AT------A----TTACTCATGGTG-CGGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC--TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCTCC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTATTCTA---C---------------T---TGCAATGT------GTA-TTATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGGCG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T---TAT-TTGTAC-A----------------------TACAT-GTA-C-TT--GTGCC------GATAG-T-ATATTGG-AATT--TTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACAT--ACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------ATACAGGAA----TTTCTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111                       11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          2222222                                        333333333333                         222222222222222222       666666666666666666666666666666666666666666   11   111111     1    222222                              3333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               222222          888888888888888888888888      111111111     333333              22222222         11111111       111            444444444                              11      22222  11          2222                 3333333     11                                77777777777777777777777777777777777777777          111               1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1         3333333333333                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        77777777  66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         0000000          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44         111111111111111111 77 1  777777777777777777777777777777777777777777   00   444444   5 1    555555     8    8             8     4444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        5 5    77  111111 555      777777777777777777777777      777777777     444444    9999      33333333       3 66666666       888 2 2        222222222       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0    0 4444444     11    8        3   6          0   77777777777777777777777777777777777777777          222               5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     7777777777777        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ........  ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         .......          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..         .................. .. .  ..........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     .......  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  ...... ...      ........................      .........     ......    ....      ........       . ........       ... . .        .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .    . .......     ..    .        .   .          .   .........................................          ...               .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .............        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        99999999  77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       77777777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         7777777          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66         000000000000000000 11 0  111111111111111111111111111111111111111111   99   444444   7 4    888888     0    0             0     0000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    99  333333 666      999999999999999999999999      333333333     666666    3333      55555555       2 22222222       333 5 5        111111111       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8    8 0000000     00    0        8   0          8   88888888888888888888888888888888888888888          333               5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     2222222222222        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNG-C-AT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNA-C-AT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTTTA-CC--C----------CG-ATTT-----------CT----T----C---------------T---TACA-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GTG-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TTTCTTACATGGGTC-AT--GTGCCGGTTTTGATAACT-GT-TTGACA--T--TTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----T--ACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAAATATTACTCATA-GTATCTATTACAAT------A----TTACTCTTAG------GATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT--TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATTT---CCTCC----------CT-AATT-----------TT----T----CGCACTGTATTCCTACT---TGCA-TG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGTGACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT-----AA-TT---------------T--GTGCC------GATAG-T-ATATTAA-T--T--TTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTA---------CA-G-----------GT------A-----TACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCTC--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC-C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATTA---CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT----TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GCT-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-TATTTTAC--AT-GTGTA---------------ACATGTA-C-ATTTGTGCCG------ATAG-TTATATTGA-A--T--TTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----T--ACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT-------------TA-G-----------AT------ACGTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT--AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC--------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC---------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tTCAT-C-GTGT--TTT-T---TAT-TTGTAC-A----TACAT--G----------TGCATGTA-C-ATT-GTGCCG------ATAG-T-ATATTGG-A--TAATCCTTACAT-GAGC---CATATG------CCGGTTTTGA---aaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAA-TC-CTTACATGAG-CCAT--ATGCCGGTTTTGATAta
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAT-------------TACA-----------AT------A----TTACTCATAG------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATTTC--CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-A-----TT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC--------------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC---C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATTT---CT--C----------GC-ACTT-----------GTAT--T----C---------------TACATGCA-TGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT-------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGA-AATTT-CTTATATGGGTC-AT--ATGCCGGTTTTGATA------ACTG---------TTTCACAT--------------T---GAACCGT--------------TTCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT-------------TA-A-----------AT------A----TTACTCATGGTG-CGGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC--TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCTCC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTATTCTA---C---------------T---TGCAATGT------GTA-TTATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGGCG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T---TAT-TTGTAC-A----------------------TACATGTA-C-TT--GTGCC------GATAG-T-ATATTGG-AATT--TTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACAT--ACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------ATACAGGAA----TTTCTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111                       11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          2222222                                        333333333333                         222222222222222222       666666666666666666666666666666666666666666   11   111111     1    222222                              3333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               111111          666666666666666666666666      11111         222222    1111      22222          22222222       222            444444444                              11      22222  11          2222                 3333333     11                                77777777777777777777777777777777777777777          111               1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1         3333333333333                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        77777777  66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         0000000          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44         111111111111111111 77 1  777777777777777777777777777777777777777777   00   444444   5 1    555555     8    8             8     4444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        6 6    99  888888 5        333333333333333333333333      77777  99     555555    5555  0   33333        5 11111111       222   5   0    444444444       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0    0 4444444     11    8        3   6          0   77777777777777777777777777777777777777777          222               5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     7777777777777        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ........  ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         .......          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..         .................. .. .  ..........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     .......  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  ...... .        ........................      .....  ..     ......    ....  .   .....        . ........       ...   .   .    .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .    . .......     ..    .        .   .          .   .........................................          ...               .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .............        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        99999999  77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       77777777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         7777777          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66         000000000000000000 11 0  111111111111111111111111111111111111111111   99   444444   7 4    888888     0    0             0     0000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    22  777777 0        222222222222222222222222      00000  22     333333    0000  8   88888        6 00000000       000   0   8    444444444       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8    8 0000000     00    0        8   0          8   88888888888888888888888888888888888888888          333               5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     2222222222222        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNG-C-AT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT---CC--C----------CG-ANTT-----------GT----T----C---------------T---CGCN-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GTG-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGC-GATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNG-C-AT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC-C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTTTA-CC--C----------CG-ATTT-----------CT----T----C---------------T---TACA-TGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GTG-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TTTCTTACATGGGTC-AT--GTGCCGGTTTTGATAACT-GT-TTGACA--TTTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----T--ACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAAATATTACTCATA-GTATCTATTACAAT------A----TTACTCTTAG------GATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT--TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATTT---CCTCC----------CT-AATT-----------TT----T----CGCACTGTATTCCTACT---TGCA-TG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGTGACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT-----AA-TT---------------T--GTGCC------GATAG-T-ATATTAA-T--TTTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTA---------CA-G-----------GT------A-----TACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C-C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCTC--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC-C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATTA---CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT----TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GCT-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-TATTTTAC--AT-GTGTA---------------ACATGTA-C-ATTTGTGCCG------ATAG-TTATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----T--ACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT-------------TA-G-----------AT------ACGTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT--AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC--------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATTT---CC--T----------CA-GATT-----------GT----T----C---------------G---CACT-TGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T-C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC---------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tTACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAA-TC-CTTACATGAG-CCAT--ATGCCGGTTTTGATAaaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAT-------------TACA-----------AT------A----TTACTCATAG------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATTTC--CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-A-----TT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC--------------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC---C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATTT---CT--C----------GC-ACTT-----------GTAT--T----C---------------TACATGCA-TGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT-------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGA-AATTT-CTTATATGGGTC-AT--ATGCCGGTTTTGATA------ACTG-------TTTCACAT--------------T---GAACCGT--------------TTCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT-------------TA-A-----------AT------A----TTACTCATGGTG-CGGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC--TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC-CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCTCC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTATTCTA---C---------------T---TGCAATGT------GTA-TTATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGGCG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T---TAT-TTGTAC-A----------------------TACATGTA-C-TT--GTGCC------GATAG-T-ATATTGG-AATTTTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACAT--ACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------ATACAGGAA----TTTCTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111                       11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          22222                                           333333333333                        111111  2222222222222       6666666666666666666666666666666666666666   11   111111   1      222222                              33333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               22222222        11       333333333333333      222          222222    1111      22222          22222222       222            444444444                              11      22222  11          2222                 3333333     11                                77777777777777777777777777777777777777777          111               1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1         3333333333333                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        77777777  66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         33333 55          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44        222222  0000000000000 77 1  7777777777777777777777777777777777777777   00   444444   1 5    555555     8    8             8     44444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        6 6    99  11111111        66  55   222222222222222      222   99     555555    5555  0   33333        5 11111111       222   5   0    444444444       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0    0 4444444     11    8        3   6          0   77777777777777777777777777777777777777777          222               5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     7777777777777        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ........  ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         ..... ..          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..        ......  ............. .. .  ........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     ........  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  ........        ..  ..   ...............      ...   ..     ......    ....  .   .....        . ........       ...   .   .    .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .    . .......     ..    .        .   .          .   .........................................          ...               .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .............        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        99999999  77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       77777777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         55555 00          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66        222222  9999999999999 11 0  1111111111111111111111111111111111111111   99   444444   4 7    888888     0    0             0     00000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    22  55555555        00  77   222222222222222      888   22     333333    0000  8   88888        6 00000000       000   0   8    444444444       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8    8 0000000     00    0        8   0          8   88888888888888888888888888888888888888888          333               5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     2222222222222        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNGTCAT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNG-CAT--GTGCCGGTTTTGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---TTACC--C----------CG-ATTT-----------CT--T----C---------------T---TAC-ATGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GT-G-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TTTCTTACATGGGTCAT--GTGCCGGTTTTGATAACT-GT-TTGACA--TTTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----T--ACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAAATATTACTCATA-GTATCTATTACAAT------A----TTACTCTTAG------GATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT--TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC--CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATT---T--CCTCC----------CT-AATT-----------TT--T----CGCACTGTATTCCTACT---TGC-ATG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGT-GACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT-----AA-TT--------------T--GTGCC------GATAG-T-ATATTAA-T--TTTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTA---------CA-G-----------GT------A-----TACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCT-C--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC--C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATT---A--CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT--TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GC-T-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-TATTTTAC--AT-GTGTA---------------ACATGTA-CATTTGTGCCG------ATAG-TTATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----T--ACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT-------------TA-G-----------AT------ACGTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT--AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC---------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC---------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAA-TC-CTTACATGAGCCAT--ATGCCGGTTTTGATAaaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAT-------------TACA-----------AT------A----TTACTCATAG------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATT---TC-CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-A-----TT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC--------------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC----C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATT---T--CT--C----------GC-ACTT-----------GTATT----C---------------TACATGC-ATGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT--------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGA-AATTT-CTTATATGGGTCAT--ATGCCGGTTTTGATA------ACTG-------TTTCACAT--------------T---GAACCGT--------------TTCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT-------------TA-A-----------AT------A----TTACTCATGGTG-CGGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC--TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTCCTC--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCT--CC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTA-TTCTAC---------------T---TGCAATGT------GTATT-ATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGG-CG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T-------------------TAT-TTGTA-CA------TACATGTA-CTT--GTGCC------GATAG-T-ATATTGG-AATTTTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACAT--ACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------ATACAGGAA----TTTCTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111                       11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          22222                                           333333333333                        111111  2222222222222       6666666666666666666666666666666666666666   11   111111   1      222222                              33333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               333333333333333333333333333333333333333       11111        2222222222    1111      22222          22222222       222            444444444                              11      22222  11          2222                 3333333     11                                77777777777777777777777777777777777777777          111               1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1         3333333333333                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        77777777  66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         33333 55          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44        222222  0000000000000 77 1  7777777777777777777777777777777777777777   00   444444   1 5    555555     8    8             8     44444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        6 6    99  999999999999999999999999999999999999999       55555        4444444444    5555  0   33333        5 11111111       222   5   0    444444444       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0    0 4444444     11    8        3   6          0   77777777777777777777777777777777777777777          222               5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     7777777777777        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ........  ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         ..... ..          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..        ......  ............. .. .  ........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     ........  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  .......................................       .....        ..........    ....  .   .....        . ........       ...   .   .    .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .    . .......     ..    .        .   .          .   .........................................          ...               .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .............        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        99999999  77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       77777777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         55555 00          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66        222222  9999999999999 11 0  1111111111111111111111111111111111111111   99   444444   4 7    888888     0    0             0     00000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    22  333333333333333333333333333333333333333       00000        5555555555    0000  8   88888        6 00000000       000   0   8    444444444       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8    8 0000000     00    0        8   0          8   88888888888888888888888888888888888888888          333               5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     2222222222222        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNGT--CATGTGCCGGTTT----TGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNGT--CATGTGCCGGTTT----TGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---TTACC--C----------CG-ATTT-----------CT--T----C---------------T---TAC-ATGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GT-G-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TTTCTTACATGGGT--CATGTGCCGGTTT----TGATAACT-GT-TTGACA--TTTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----T--ACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAAATATTACTCATA-GTATCTATTACAAT------A----TTACTCTTAG------GATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT--TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC--CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATT---T--CCTCC----------CT-AATT-----------TT--T----CGCACTGTATTCCTACT---TGC-ATG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGT-GACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT-----AA-TT----------------TGTGCC----------GATAG-T-ATATTAA-T--TTTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTA---------CA-G-----------GT------A-----TACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCT-C--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC--C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATT---A--CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT--TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GC-T-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-----------------TATT-----------TTACATGTGTAACATGTAC--ATTTGTGCCGATAG-TTATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----T--ACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT-------------TA-G-----------AT------ACGTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT--AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC---------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC---------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAA-TC-CTTACATGAGC--CATATGCCGGTTT----TGATAaaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAT-------------TACA-----------AT------A----TTACTCATAG------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATT---TC-CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-A-----TT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC--------------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC----C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATT---T--CT--C----------GC-ACTT-----------GTATT----C---------------TACATGC-ATGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT--------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGA-AATTT-CTTATATGGGT--CATATGCCGGTTT----TGATA------ACTG-------TTTCACAT--------------T---GAACCGT--------------TTCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT-------------TA-A-----------AT------A----TTACTCATGGTG-CGGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC--TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTCCTC--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCT--CC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTA-TTCTAC---------------T---TGCAATGT------GTATT-ATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGG-CG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T-------------------TAT-TTGTA-CA------TACATGTA---CTTGTGCC----------GATAG-T-ATATTGG-AATTTTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACAT--ACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------ATACAGGAA----TTTCTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333              1111111111111      111          111             1111111          11    2222                                                               1111                       11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                          22222                                           333333333333                        111111  2222222222222       6666666666666666666666666666666666666666   11   111111   1      222222                              33333333     111     22222                          22222222        44444444444444444      1    111       111          1111111                     111      1      1111           1                                                               333333333333333333333333333333333333333       11111        2222222222    1111      22222          22222222       222            444444444                              11      22222  11          2222                 3333333     11                                77777777777777777777777777777777777777777          111               1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222        222222                                8888888888888888888888888888888                         1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1         3333333333333                                   1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  2222             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                 2222222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                444444444      111           11111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             333333     55   2   8888888888888  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22    7777  0  3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        77777777  66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888     44         33333 55          3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44        222222  0000000000000 77 1  7777777777777777777777777777777777777777   00   444444   1 5    555555     8    8             8     44444444  8  111     00000             99   99999   44444444  6     11111111111111111  6   5    000  6  6 666    6  6  4444444      6        6     444      3  6   4444       99  3    99 6 99  6       3    6             6  0        6 6    99  999999999999999999999999999999999999999       55555        4444444444    5555  0   33333        5 11111111       222   5   0    444444444       88    999         0    11  8   00000  11 8  8     5555  8       0    0 4444444     11    8        3   6          0   77777777777777777777777777777777777777777          222               5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999        555555  6   5       5  5  5        5  7777777777777777777777777777777 1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     7777777777777        6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 6666 888      5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4    5555555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 7 4     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      222222222 777  222   4 66    11111   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ......     ..   .   .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..    ....  .  .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ........  ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....     ..         ..... ..          .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..        ......  ............. .. .  ........................................   ..   ......   . .    ......     .    .             .     ........  .  ...     .....             ..   .....   ........  .     .................  .   .    ...  .  . ...    .  .  .......      .        .     ...      .  .   ....       ..  .    .. . ..  .       .    .             .  .        . .    ..  .......................................       .....        ..........    ....  .   .....        . ........       ...   .   .    .........       ..    ...         .    ..  .   .....  .. .  .     ....  .       .    . .......     ..    .        .   .          .   .........................................          ...               .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............        ......  .   .       .  .  .        .  ............................... .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .............        .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .... ...      .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .    .......     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. . .     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ......... ...  ...   . ..    .....   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             444444     55   6   8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33    6666  4  3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        99999999  77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       77777777777777777777    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333     66         55555 00          6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66        222222  9999999999999 11 0  1111111111111111111111111111111111111111   99   444444   4 7    888888     0    0             0     00000000  0  666     00000             22   33333   22222222  7     22222222222222222  7   0    888  7  7 777    7  7  5555555      7        7     333      3  7   2222       22  3    22 7 55  7       7    7             7  7        7 7    22  333333333333333333333333333333333333333       00000        5555555555    0000  8   88888        6 00000000       000   0   8    444444444       88    888         8    00  0   00000  00 0  0     0000  0       8    8 0000000     00    0        8   0          8   88888888888888888888888888888888888888888          333               5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555        222222  7   7       7  0  7        7  3333333333333333333333333333333 6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     2222222222222        7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 2222 888      0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4    8888888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 2 0     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      999999999 888  222   4 11    00000   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNGT--CATGTGCCGGTTT----TGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNGT--CATGTGCCGGTTT----TGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGC---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---A-AACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---TTACC--C----------CG-ATTT-----------CT--T----C---------------T---TAC-ATGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTT--GT-G-CG-CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CATGTTTTGATAGCAAAC---ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-A-AAAGGT-AC-GAG----AGTGTTA--CA-TCTC--T-C--AA-AATTCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-C-GTGTCATACAT--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TTTCTTACATGGGT--CATGTGCCGGTTT----TGATAACT-GT-TTGACA--TTTTTTACAT-AG-TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGG---T-TTCAATATGTTTTT-TAAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GT-CCAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----T--ACCAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAAATATTACTCATA-GTATCTATTACAAT------A----TTACTCTTAG------GATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA--TTTT------------------------T----AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--AAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-ATTT--TTACCGTTTGCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAATG--TATTAACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGAG----GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA--TTGCC---CC---TGA-C--AAAGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTT-GA---ACGTTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCA------GAAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAA-TTTCC---CCA--TAAGCAAAAAA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACA--CCCCCCCCCCTC--CTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATT---T--CCTCC----------CT-AATT-----------TT--T----CGCACTGTATTCCTACT---TGC-ATG-------GTAGT-ATACG-----CTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTTTCGT-GACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCAA-C---ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCC-T-TTTAGA-AGATTAAACTTTTA-TTAAAGGCCACCGAG----A-TGTTA--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCC-GTGT--TTC-T--GT--ATTGTAC--ATA-CATGT-----AA-TT----------------TGTGCC----------GATAG-T-ATATTAA-T--TTTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---GATATATTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGC-TTTT--GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATATAGTA---------CA-G-----------GT------A-----TACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--C-T-GCGCG---G------TTCG---TT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CCGGGTGA-C--AAAA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT------ACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATA-T-CTAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGT-A---CAAAAA--AAACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----ATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCC--C--C--TAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGTATTCTAGCA-T-ATAC------CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT-CCAATACAAT--AAA---A----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACA--CCCCCCCCCCCCT-C--CATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT-C-----CAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--TCAA--G-AA-AA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACA--CCTACCCCTCTC--C--CAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATT---A--CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTAT--TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTATAC-------TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--GC-T-CG-CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----A--------CC-CG-------AT-GCA--T--------GC--GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA---C-C-TTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CAATCTC--C-CAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCAT-C-GTGT--TT--T--CT-----------------TATT-----------TTACATGTGTAACATGTAC--ATTTGTGCCGATAG-TTATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA-------TATTCAATAT-TTTT--GAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-AT-CTAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----T--ACCAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TAT-------------TA-G-----------AT------ACGTATTACTCATAGTGGCGGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT----AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATCAAATG---------TA-CA------T--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGATTT--AT----TTTATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACA-GTCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                     gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactct---TACAAA--AAAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATC--ACAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G-----TTC-GTCAAACA---AGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCTCCCCCC---------TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------GT--T----C---------------G---CAC-TTGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                  aggTATAAGAT-C-----CAATGAAAATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA---A----AT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACA--CCCCCCTCC--T--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAATCG--------CCACGTGT---------A--T---GTT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA---CAT-TTTGAA-AGATTAA--TTTGA-T-AAAGGTTGC-GAAGGGAAGTGTTGGACAATCTCAACACGAAA-A--TCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTAT-C-GTGA--AT--T--CTACA
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C--------ATT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Ta
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                  aATAAT--AAATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-G-AACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAGA----AT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatgtatgaatgcaataa-AAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC---------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGTCCTCACCCCa
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATA-T----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA------T----------CAACATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTTATTT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T---GA---ACGCTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTC-AGTTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTACATTGTGCCGATAGTATATTGGATAA-TC-CTTACATGAGC--CATATGCCGGTTT----TGATAaaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tcatcgtgttttttatttgtacatacatgtgcatg-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAGAT---AAA
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TAT-------------TACA-----------AT------A----TTACTCATAG------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atcT-TTTCA---------GAATAATA-TT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA------T----------T-----------------ACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATT---TC-CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATA-TCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA------TCGTCACTATGTA-CA-----GTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TTATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T----A---ACGTTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAGTC---GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG--------C---CC---TGA-C--AAAA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------CA-CATGTACAT--ATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-A-----TT----TTTATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---TGAAGA---GC-TTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTC-AGT---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG---------C---CC---TGA-C--AAAA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                       atatgtatctaatCAAT-----TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA-------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC--------------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACA--TGTACATCCC----C--CAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATT---T--CT--C----------GC-ACTT-----------GTATT----C---------------TACATGC-ATGT------GTA-T-ATACACGTACCTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAACT--------------------G-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTATACATTTACC-CGTGT------------C---ATT-CGC-AGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA---C-A-TTTAGA-AGATTAAA-TGTTA-A-AAAGGT-AC-AAG----AGTGTTC--CC-TCTC--C-CG--A-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-TTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGA-AATTT-CTTATATGGGT--CATATGCCGGTTT----TGATA------ACTG-------TTTCACAT--------------T---GAACCGT--------------TTCAATGT-TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATAT-------------TA-A-----------AT------A----TTACTCATGGTG-CGGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT----AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA---------------------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTC--TTACCGTTTGCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGT---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGAT---CTTCCGGACC----AA-C--CAAA-T-T-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT------GCAAT--AAATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCG-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA---A----AT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTCCTC--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCT--CC--CACATATTTTTCGCACTT-----------GTA-TTCTAC---------------T---TGCAATGT------GTATT-ATAC------CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTTT-GTGG-CG-CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--CACTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA---C-CTTTTAGA-AGATTAAA-TTTTATT-AAAGGC-AC-GAG----AGGTTTG--CA-TCTC--C-CAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCAT-CAGTGT--TTC-T-------------------TAT-TTGTA-CA------TACATGTA---CTTGTGCC----------GATAG-T-ATATTGG-AATTTTTTTAC-T-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA-------TATTCAATA--TTTTT-AAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GT-CTAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACAT--ACCAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------ATACAGGAA----TTTCTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ctggctattgat-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAGG----GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                             CCAAT      GA   A   TAGATAATA      CC  ATT  A   A   AGT G  A   G    CGTAACT          CT    CCG      A  GG        GAG    C TG   TGT AT A  A CCAAAG T GC  GAA G CGGC    A        AGTTA     TAATA AC   C GTCGGTACC   T  A         GA G GC       CCTGAAAGAAAGT           TG        GC   GC   A G   ACCGCAAAGACTAC         C GAT G  TTAAAT  AATCATATTT     G T   C  TT A ACA  C    G  C      AG   T  TCC   A     TGAAA     GT         CTCCT TC          C  TT C A  C  G G A  T GTA  C AGATATTG           A   A  AA        TTCT    CACATATTTTT   GC A  TTTCGCACTGTATTCCTACT                       AA   ATTCTA   G T    ACGTAC     C    G             T     TTCGTGA   A  TAA     .                 GA   TAA     TACATTTA  A     TTTGATAGCACACTA    T   C    GAA  G  A TGT    T  A  ATCCT        C        C     TT       C  C   GGGA       GA  A    AA A AA  C       G    A             G           C A    .   CTTCTTACAATGTGCTGATAGTATATTGGAAATTTC          TGTAA        ATTTGTGCC     GTT       GAAT         C GGGGT          TTT   C        GATATA          T     TAT              .   A   TTAAT  TG A  C     TGTG  T              CATAC       AA    T        T   T              TAGATACAGGAA                                       TGG               T           A    T    T       TG    CGTG T         A   A GT   A     C        TACGGATTGAT    TT  AA   TTCT             G    C      T G     ATT   T   TT    TTCAAAATCAT   .    CAA     TC  TA    TTCCAATTCAAATA         TCCGA   T   G       T  A  C        C  TCGTCACTATGTACAGTTT             T       T       T     T G      AATTGATGAAA        G          A   GTGATG     C   TCCA  TCA          T  T C TTTTAC  G          A   A     ATTCTTACCG           A     C      A    T  C   C G    G  AATATCTTGCATGTAT                 TC     A   A       T  C               TT   G   G        A C     AAT    C         TAT    CCG    AGAAA      A  C     C   G TGTTGT              GT     C  TAG      GAAAGG          GATA   C  AT      C  A   A            C G    T   TC .   GAAG .        C  CA     AAAGTA   TATGGGGCTTAATAATACCACACTCACCAGTTTC                                     GT  T  A  A  A C  G     C  CG       A    T    AGTCTT      CGAT   A        G TTTCTTAATTACAG              T   T C  AAT    A   CA  AAA GAG  A     G  TG  CCGGT     GG    TTAA   G     A  G     G  A G CT  GC G   ATT G    CCCT   A    GT   C    CG     CC  CG   A  T  C  GATTGTG    T TC T T     GCA T  C A    CT   A C  CC     TG  A TTC    C  CTTCTCA     C     CATTACAGGTATCCGA         TATCCGAAC   T  TGA C  A     A  A   C    T      AC G      GCATTTTTC GGA  GGG   G AA    ATT     A C   C   C  CC   ATA  ATACAATACTA          T  AA   TTAGCTCAG      A   A T G     G  A   A       CTT     T C A  A C  C  TC  A   CAA    AT         A  A C G ATG  GG T  TAACAT       A     A     G CC C  CC     A  A    A    C G   CGTATGTGTAT       CAAAACCT        ACACA    TCT     A   G   GT  C  AAT  T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                             AC         .    C   AACTTA         .   A    A   .   T   .  .   .    C                C     AC       .  .         TG     . G    G   .  .  . .      . .   .   . C       .        GAGA      TAAAT .    . GTCCGATC    .  .         .  . GC       CCTAAACTCGTA            .         .    .    . .   CAAATGTAAC             . .   .  AT      AAATTT         G .   .  G  . A    .    .  .      .    .  .     .     .         .          CCCT  .           .  T  . .  A  . G T  . C    . AGATATT            .   .  .         TC      TCC           T  A  TTCGCATTTGTATTTCTACT                       A    .        T .    G          .    .             .     TTGTGG    .  T       .                 .    AAA     .         .     TTTGATAGCAACA      .   C    A    .  . G      .  .  CAT          .        .     TT       T  .   .          .   A    .  . AA  .       A    .             .           . .    .   CTGTATTGTACATACATGTAATT                       AGC          GGTTTT        GT        AT           A GGGT           .     C        TA              T     TA               .   .   .      .  .  .     C     .              TACAT       .     .        T   A              AGTACAGGTA                                         TG                T           A    .    .       AT    .    .         .   A .    C     C        T              .   .    .                T    T      . .     .     .   T     CC            .    AGA     .   A     TCTTCA                 GT      .   .       .  A  .        .  ATCAAATGTACAT                   T       .       .     . T      CTTCACTAAC         .          .   GT         T   .     GT           .  . A C       G          T   A     ATTTATTT             .     .      A    .  .   . C    .  ATAATCTTGCACGTT                  .      .   .       .  T               TT   G   .        . .     T      .         TT     .      .          G  .     .   . GATA                .      .  AT       ACA             GAGT   .  A       .  A   A            . .    .   .  .   TTG  .        .  A      GAC      GGGGCTATAATAATACACACACCAATTCT                                          C   A  .  A  . .  .     C  C        .    .    AGTTA       .      .        . AAGCAACGAATG                .   . .  .      .   .   GA  .    .     .  T   GCTA      A     A      .     .  .     .  . . TA  T  .   T   .    CC     .    A    .    CG     .   .    .  .  .  ATGA       . .  C .     .   .  . .    .    A .  C      .   . .      .  TATATT      .     GCATTAC                  .           .  .   A  .     .  G   .    .      .  .      GCAATTTC  .    A     . .     ATG     . .   .   .  .    A    ATGAGTGG             T  AT   TGTTA          .   . T T     .  .   .       G       . . .  . .  .  C   .   TAA    .          .  . C . .    .  .  TG           .     .     . .  .  .      .  .    .    . .   ACA               GTAAAAT         AC       .       .   G   AT  .  AT   .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                             C          .    T   TT             .   .    .   .   .   .  .   .    .                C     AC       .  .         TG     . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        A         .     .    . GGTCT       .  .         .  . C        CCTTTATCTGG             .         .    .    . .   ACCGCAG                . .   .  .       .              T .   .  G  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          CTC   .           .  .  . .  A  . G T  . .    . AGATATT            .   .  .         T       T             A  A  GTATTCTACA                                 T    .        . .    .          .    .             .     TGCT      .  G       .                 .    A       .         .     ATGCAT             .   C    A    .  . C      .  .  CCT          .        .     C        .  .   .          .   .    .  . GA  .       A    .             .           . .    .   CTTATTTGTACA                                  GGT          GGTTTT        GT        AA           A GGGT           .     C        TA              T     TA               .   .   .      .  .  .     .     .              AAT         .     .        T   A              TAGATACGTA                                         TG                T           .    .    .       T     .    .         .   T .    A     C        .              .   .    .                T    T      . .     .     .   T     T             .    A       .   A     CTTTA                  TT      .   .       .  A  .        .  TCAACATGTACAT                   T       .       .     . .      ACTT               .          .   AC         C   .     T            .  . T C       G          .   A     GATTTAT              .     .      A    .  .   . .    .  ATATCTTGCTGTAC                   .      .   .       .  T               CC   G   .        . .     T      .         T      .      .          .  .     .   . GGC                 .      .  .        GA              TA     .  A       .  .   C            . .    .   .  .   GG   .        .  .      GA       GGGGCACTTAAAATACACAACCAATTCC                                           .   .  .  .  . .  .     .  .        .    .    AAAC        .      .        . GACTTACTAAAA                .   . .  .      .   .   .   .    .     .  .   CGGT      .     .      .     .  .     .  . . T   .  .   G   .    .      .    A    .    C      .   .    .  .  .  A          . .  T .     .   .  . .    .    . .  .      .   . .      .  TAAG        .     C                        .           .  .   .  .     .  .   .    .      .  .      ATCTTC    .    .     . .     ATG     . .   .   .  .    .    TTAA                 T  A    TG             .   . C .     .  .   .       T       . . .  . .  .  .   .   AG     .          .  . T . .    .  .  T            .     .     . .  .  .      .  .    .    . .   ATC               TAAAA           AA       .       .   A   TA  .  A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                             C          .    A   TA             .   .    .   .   .   .  .   .    .                .     AG       .  .         T      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        A         .     .    . GTCC        .  .         .  . C        CCTTTATCTGA             .         .    .    . .   ACCGC                  . .   .  .       .              T .   .  T  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          CTC   .           .  .  . .  T  . G A  . .    . TTGTA              .   .  .         T       T             A  T  GTATTCTACT                                 T    .        . .    .          .    .             .     .         .  .       .                 .    A       .         .     ATG                .   .    A    .  . A      .  .  CC           .        .     T        .  .   .          .   .    .  . AA  .       G    .             .           . .    .   TCTTATT                                       TA           .             .         .            . .              .     .        .               .     G                .   .   .      .  .  .     .     .              T           .     .        .   .              TACAATA                                            TG                .           .    .    .       .     .    .         .   A .    .     .                                                 C    .      . .     .     .   .     T             .    A       .   T     TTTCA                  TT      .   .       .  A  .        .  TCACATGTACAT                    T       .       .     . .      ATT                .          .   C          A   .     T            .  . C .       .          .   .     ATT                  .     .      A    .  .   . .    .  ATATCTTAT                        .      .   .       .  C               .    G   .        . .     C      .         T      .      .          .  .     .   . AGC                 .      .  .        A               GG     .  A       .  .   A            . .    .   .  .   G    .        .  .      GC       GGCGCTTAATAATACACACACCAGTTT                                            .   .  .  .  . .  .     .  .        .    .    AGAT        .      .        . GCATACTAAA                  .   . .  .      .   .   .   .    .     .  .   GTG       .     .      .     .  .     .  . . T   .  .   T   .    .      .    A    .    C      .   .    .  .  .  A          . .  T .     .   .  . .    .    . .  .      .   . .      .  TA          .     C                        .           .  .   .  .     .  .   .    .      .  .      GCTTTC    .    .     . .     AT      . .   .   .  .    .    TT                   T  A    TG             .   . T .     .  .   .       T       . . .  . .  .  .   .   A      .          .  . T . .    .  .  T            .     .     . .  .  .      .  .    .    . .   C                 CAAC            AC       .       .   G   T   .  A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                             .          .    T   TA             .   .    .   .   .   .  .   .    .                .     AG       .  .         A      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        A         .     .    . GTCC        .  .         .  . C        CCTTTATCTGA             .         .    .    . .   AC                     . .   .  .       .              T .   .  T  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          CC    .           .  .  . .  T  . G A  . .    . ATT                .   .  .         T       C             A  A  GTTCG                                      T    .        . .    .                                                                          .    A       .         .     CA                 .   .    .    .  . .      .  .  CA           .        .     A        .  .   .          .   .    .  . G   .       .    .             .           . .    .                                                 .            .                                                                                                                                                                                                         TAAATA                                             .                 .           .    .    .                                                                                                                                                                        CTCA                   T       .   .       .  A  .        .  TT                              .       .       .     . .      ACT                .          .   C          .   .     .            .  . . .       .          .   .     .                    .     .      .    .  .   . .    .  AT                               .      .   .       .  T               .    .   .        . .     T      .         T      .      .          .  .     .   . GGT                 .      .  .        T               G      .  .       .  .   C            . .    .   .  .   G    .        .  .      GC       GAGGCTTAATAATACACAAACCAGTTT                                            .   .  .  .  . .  .     .  .        .    .    AGTC        .      .        . TTAAATA                     .   . .  .      .   .   .   .    .     .  .   GTT       .     .      .     .  .     .  . . T   .  .   C   .    .      .    A    .    C      .   .    .  .  .  T          . .  T .     .   .  . .    .    . .  .      .   . .      .  TA          .     C                        .           .  .   .  .     .  .   .    .      .  .      G         .    .     . .     TT      . .   .   .  .    .    TA                   T  A    .              .   . T .     .  .   .       T       . . .  . .  .  .   .   A      .          .  . T . .    .  .  T            .     .     . .  .  .      .  .    .    . .   C                 GAAT            TA       .       .   G   T   .  T    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                             .          .    T   TT             .   .    .   .   .   .  .   .    .                .     AC       .  .         A      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        A         .     .    . GTCT        .  .         .  . C        CCCTTTTTTGA             .         .    .    . .   AC                     . .   .  .       .              T .   .  G  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          C     .           .  .  . .  T  . G T  . .    . A                  .   .  .         A       T             A  T  GTTCG                                      A    .        . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .       .  .  .        .  .                               .       .       .                                                                                                                                                                .   . .    .  AT                               .      .   .       .  T               .    .   .        . .     .      .         .      .      .          .  .     .   . AGA                 .      .  .        A               .      .  .                             .    .   .  .   G    .        .  .      GC       TGGGCTTCATTAATGCACAACTGGTT                                             .   .  .  .  . .  .     .  .        .    .    AGT         .      .        . AATACTA                     .   . .  .      .   .   .   .    .     .  .   GT        .     .      .     .  .     .  . . T   .  .   T   .    .      .    G    .    C      .   .    .  .  .  A          . .  T .     .   .  . .    .    . .  .      .   . .      .  TT          .     C                        .           .  .   .  .     .  .   .    .      .  .      .         .    .     . .     TT      . .   .   .  .    .    AT                   .  A    .              .   . T .     .  .   .       T       . . .  . .  .  .   .   A      .          .  . T . .    .  .  T            .     .     . .  .  .      .  .    .    . .   T                 CAAC            G        .       .   .   T   .  A    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        .    T   AT             .   .    .   .   .   .  .   .    .                .     AG       .  .         A      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        A         .     .    . T           .  .         .  . C        CACTGGA                 .         .    .    . .   AC                     . .   .  .       .              T .   .  T  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          C     .           .  .  . .  A  . G A  . .    . A                  .   .  .         T       C             G  C  GTTCG                                      .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .        . .     .      .         .      .      .          .  .     .   . GC                  .      .  .                                                                .    .   .  .   .    .        .  .      .        TAATACA                                                                .   .  .  .  . .  .     .  .        .    .    AGG         .      .        . AATA                        .   . .  .      .   .   .   .    .     .  .   GT        .     .      .     .  .     .  . . T   .  .   .   .    .      .    A    .    .      .   .    .  .  .  A          . .  . .     .   .  . .    .    . .  .      .   . .      .  TA          .     C                        .           .  .   .  .     .  .   .    .      .  .      .         .    .     . .     AT      . .   .   .  .    .    TA                   .  .    .              .   . . .     .  .   .       .       . . .  . .  .  .   .   A      .          .  . C . .    .  .  T            .     .     . .  .  .      .  .    .    . .   C                 GT              .        .       .   .   .   .  .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        .    T   TA             .   .    .   .   .   .  .   .    .                .     AG       .  .         A      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        A         .     .    . .           .  .         .  . G        TCCTGA                  .         .    .    . .   AC                     . .   .  .       .              T .   .  A  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          T     .           .  .  . .  C  . G T  . .    . G                  .   .  .         T       C             C  C                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              .   .  .  .  . .  .     .  .        .    .    A           .      .        . AATA                        .   . .  .      .   .   .   .    .     .  .   GT        .     .      .     .  .     .  . . .   .  .   .   .    .      .    T    .    .      .   .    .  .  .  A          . .  . .     .   .  . .    .    . .  .      .   . .      .  A           .     C                        .           .  .   .  .     .  .   .    .      .  .      .         .    .     . .     A       . .   .   .  .    .    A                    .  .                   .   . . .     .  .   .       .       . . .  . .  .  .   .   T      .          .  . . . .    .  .  .            .                          .  .    .    . .   G                 .               .        .                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .   A              .   .    .   .   .   .  .   .    .                .     G        .  .         A      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        A         .     .    . .           .  .         .  . C        CCTGA                   .         .    .    . .   AC                     . .   .  .       .              . .   .  T  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          T     .           .  .  . .  A  . . T  . .    . A                  .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .  .      .   .   .   .    .     .  .   T         .     .      .     .  .     .  . . .   .  .   .   .    .      .    .    .    .      .   .    .  .  .  .          . .  . .     .   .  . .    .    . .  .      .   . .      .  A           .     C                        .           .  .   .  .     .  .   .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .                .     .        .  .         A      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        .         .     .    . .           .  .         .  . .        CTGA                    .         .    .    . .   AC                     . .   .  .       .              . .   .  T  . .    .    .  .      .    .  .     .     .         .          C     .           .  .  . .  C  . . A  . .    . G                  .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 .  .         A      . .    .   .  .  . .      . .   .   . .       .        .         .     .    . .           .  .         .  . .        .                       .                                                                                                        .  .      .    .  .     .     .         .                                          . . .  . .    . T                  .   .  .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                             C*****                                                                                     AG**                                                                                                                                              CCTACTGA************                              AC********************                                                                                                            C****                                                                               T*****                                                                                                                          TT******             *****                                          ATGCAACG*********                                  CNT****                                                              AA                                                **  CTTATTGTGCATC**************************                    GTTT******    GT**      A****          GGGT****       ***            TA*******       T*                     **                                              AAT****                                       TAGATAGTA********************************          TG*                                             T**                                                                                                                                                        A*    CTTCA**********        TT****                                TCACATGTACAT*******************                                                                  GC****                                                                ATTTAT*******                                                                                                                                                                                                                                                                                                                *** G*** ***                                                                                                                                              AGT****                       AATACTA*****************                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTC*****                    AT***                                                       TG**********
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT-C---TACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATC--G-AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCCTC--C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT-GT-G-CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTTTTGATAGCA--C---ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA---C-C-TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CGAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTC-T--CTACATTGTGCCGATAGTATATTGGA-AA-TT-CTTACATGNGT--CATGTGCCGGTTT----TGATAG-T-ATATTGA-A--TTTTTTACAT-GGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGA---G---TATTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-AT--ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATAT-------------TA-G-----------AT------A----TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATA-T----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA------T----------TA-CA-----AT--ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-ATTT--TT----TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG--GA---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAAGT---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC---TTTCC---CC---TGA-C--AAAA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATC-----ACAAT--AAATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATCAG--AACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA---A----AT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCCTACTGA------------GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTAAC--------------------A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACA--CCCCCCCCCC----C--CAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATTT-----CC--C----------CG-ANTT-----------GT--T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-ATAC------CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTT------CG-CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--TTA--------CC-CGTGTATGCAACG---------TT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CACNT----TTTAGA-AGATTAAA-TTTTA-N-AAAGGC-AC-GAG----AGTGTTG--CA-TCTC--C-CAAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCAT-C-GTGT--TTCTTATTGTGCATC--------------------------TTACATGNGT--CATGTGCCGTTT------GATAGT--ATATTGA----TTTTTTACATGGGT----CATATAT---GCCCGGTTTTGATA-------TTCAATAT-TTTTT-NAAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GT-CTAAT----TT-GTTTGTTATCAGAAAAT----ACCAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATATTAGATAGTA--------------------------------TTACTCATAGTG-CGGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAAT--TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AAA-TTTTCTTCA----------GAATAATATT----AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AATCACATGTACAT-------------------ATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATTATTTAT-------TTTATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---TG---A---ACGTTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAGT----GAAAA----TGT-GACCTTTT-TAATACTA-----------------GGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGTTC-----C---CC---TGA-C--AAAAAT---TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CATG----------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT






Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             2222              2222222222222      111          111             1111111          11                                                                      1111             1111   11111        5555555555                             55555555555555555555                              3333333333333333333333          111111  2222222222                   111                                                           2222                                         333333333333                        111111  2222222222222       66666666666666666666666666666666666666666   11   111111   1111111111                                   55555555555555555555     22222                  33333333333            99999999999999999999999    111       111                                   111     111     1111                                                                 1     11111    000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000              3333333333             11111      222222          77777777777777777777777777                             111      22222  11          2222                 3333   11   11                                  5555555555555555                 111111              1           1                 111   1111                 11                  44444444444    11  11   2222                                 111             333333333333       11111   11  11    222222222222222         1111                                44444444444444444444                          1      33333333333333333                 222222         1111  1111                111111             1            3333333333                                     1       99999999999999999999999999999                                          11                        111              111           11111      1              1111111                       111      22222222        22222     11         1                                  1111111             11     1111111  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333     11                         11                   22222                       444444444444444444444444                            111                   11111111        1111                                    111      1111                  11                       1111111111                                                             22222222222       2222222222222222222222   111111111                                                5555555555   111               111                     111  4444444444444                222222222222                                                       11      1111                                  1111111                                                    2222222222222     22222222222     22222                    111    111           
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             9999    55 4      2222222222222  55  111  8   4   111 4  4   4    5555555          22     55     3  44        8888   3 77   999 44 3  3 999999 3 44  555 3 0000    3        2222   66666 44   3 5555555555  3  3         44 3 77       00000000000000000000    44        55   55   3 3   7777777777777777777777 3 666 3  555555  6666666666     4 3   3  44 3 000  3    3  3      44   3  555   3     88888       44        4444           3  88 3 3  1  3 2 2  3 999  3 888888888888       3   3  44        222222  0000000000000 77 1  77777777777777777777777777777777777777777   00   444444   9999999999   6     8    8             8    0 44444444444444444444     00000             99   33333333333     6  6   11111111111111111111111    000  6  6 666    6  6  99 1   3           6     444     111  6  4444        99 888    6      6       3    6             6  0         1     66666 6  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333    6 6     6 2222222222     6  3    11111      666666 2        22222222222222222222222222       88    999             111  8   00000  11 8   8    5555  8       0    0 2222   11   11    8        3   6          0     3333333333333333   6    6  6     555555              5           3    6    6       555   7777 8         8   1 11 0 5     5  0     77777777777    33  33   1111             1    9      8 8     444   8   88    777777777777  8    33333   11  44    999999999999999         3333  6   5       5  5  5        5  44444444444444444444  1       5       5     6 3      99999999999999999  6          6   111111     5   4444  5555         6  6 1 999999  2          3   3     6  5555555555   99     6     6      1    6  5   5 1    5  44444444444444444444444444444    77     5   5       5  1            0  55   4   5        5 5     222    5         555    888    22222      0  5     5   5 0000000             66     5  555      22222222        66666  5  00      6  3   2            6 5    5   66 888 8888888    888   5  11     0000000  888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888     00  8  4  8  4 4  4     8  00       4    4      55555     9999   4        4 666666666666666666666666    4   4 4  777    4   55  222 777  4     4  99  33333333  99    2222   4     4  4     4  4 4 777 99 4   555 4    4444   4    55   4    00     55  55   4  4  4  8888888888 4 55 444     777 4  4 4    55   8 4  99     55  4 777    4  11111111111 4     6666666666666666666666   666666666   4  777 8  4     4  8   4    4      66 4      6666666666   222   8 66  66  4 444   4 4   4   4  66   222  1111111111111        4  555  999999999999   4   4 3 8  0  4  4   4       777     4 4 4  4 4  4  00  4   3333   66         4  4 1 4 777  66 4  2222222    0 4     5     5 66 5  66     4  4    4    4 4   9999999999999     55555555555     11111    777     5   1   222 5  222  5        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             ....    .. .      .............  ..  ...  .   .   ... .  .   .    .......          ..     ..     .  ..        ....   . ..   ... .. .  . ...... . ..  ... . ....    .        ....   ..... ..   . ..........  .  .         .. . ..       ....................    ..        ..   ..   . .   ...................... . ... .  ......  ..........     . .   .  .. . ...  .    .  .      ..   .  ...   .     .....       ..        ....           .  .. . .  .  . . .  . ...  . ............       .   .  ..        ......  ............. .. .  .........................................   ..   ......   ..........   .     .    .             .    . ....................     .....             ..   ...........     .  .   .......................    ...  .  . ...    .  .  .. .   .           .     ...     ...  .  ....        .. ...    .      .       .    .             .  .         .     ..... .  ..................................................................    . .     . ..........     .  .    .....      ...... .        ..........................       ..    ...             ...  .   .....  .. .   .    ....  .       .    . ....   ..   ..    .        .   .          .     ................   .    .  .     ......              .           .    .    .       ...   .... .         .   . .. . .     .  .     ...........    ..  ..   ....             .    .      . .     ...   .   ..    ............  .    .....   ..  ..    ...............         ....  .   .       .  .  .        .  ....................  .       .       .     . .      .................  .          .   ......     .   ....  ....         .  . . ......  .          .   .     .  ..........   ..     .     .      .    .  .   . .    .  .............................    ..     .   .       .  .            .  ..   .   .        . .     ...    .         ...    ...    .....      .  .     .   . .......             ..     .  ...      ........        .....  .  ..      .  .   .            . .    .   .. ... .......    ...   .  ..     .......  ..................................................................     ..  .  .  .  . .  .     .  ..       .    .      .....     ....   .        . ........................    .   . .  ...    .   ..  ... ...  .     .  ..  ........  ..    ....   .     .  .     .  . . ... .. .   ... .    ....   .    ..   .    ..     ..  ..   .  .  .  .......... . .. ...     ... .  . .    ..   . .  ..     ..  . ...    .  ........... .     ......................   .........   .  ... .  .     .  .   .    .      .. .      ..........   ...   . ..  ..  . ...   . .   .   .  ..   ...  .............        .  ...  ............   .   . . .  .  .  .   .       ...     . . .  . .  .  ..  .   ....   ..         .  . . . ...  .. .  .......    . .     .     . .. .  ..     .  .    .    . .   .............     ...........     .....    ...     .   .   ... .  ...  .        
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                             1111    55 0      8888888888888  55  000  0   0   000 0  0   0    5555555          33     66     3  66        2222   3 99   222 66 3  3 666666 3 66  888 3 4444    3        9999   77777 66   3 8888888888  3  3         66 3 11       88888888888888888888    66        00   00   6 6   0000000000000000000000 6 444 6  555555  4444444444     3 6   6  66 6 000  6    3  3      66   3  888   3     33333       66        6666           6  66 6 6  0  3 5 2  3 222  3 666666666666       3   3  66        222222  9999999999999 11 0  11111111111111111111111111111111111111111   99   444444   0000000000   7     0    0             0    8 44444444444444444444     00000             22   55555555555     7  7   88888888888888888888888    888  7  7 777    7  7  22 0   5           7     333     333  7  2222        22 333    7      7       7    7             7  7         4     77777 7  333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333    7 7     7 8888888888     7  2    88888      555555 5        77777777777777777777777777       88    888             888  0   00000  00 0   0    0000  0       8    8 0000   00   00    0        8   0          8     0000000000000000   7    7  7     000000              5           3    7    7       555   0000 0         0   4 00 8 6     0  8     00000000000    88  88   2222             4    0      0 0     000   0   88    000000000000  0    00000   00  00    555555555555555         3333  7   7       7  0  7        7  77777777777777777777  6       7       7     7 3      33333333333333333  7          7   555555     2   2222  0000         7  7 0 222222  5          3   2     7  5555555555   22     7     7      7    7  7   7 4    7  99999999999999999999999999999    99     7   7       7  4            4  99   3   0        0 0     000    0         111    888    55555      0  0     0   0 2222222             99     0  666      22222222        11111  7  77      7  3   5            7 0    0   99 888 8888888    888   0  99     1111111  222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222     66  9  4  9  4 4  4     9  66       4    4      88888     4444   4        4 000000000000000000000000    4   0 0  000    0   55  555 000  0     0  55  55555555  55    5555   0     0  0     0  0 0 888 55 0   111 0    0000   0    55   0    55     55  55   0  0  0  5555555555 0 55 666     000 0  0 0    55   0 0  55     55  0 000    0  44444444444 0     5555555555555555555555   000000000   0  000 0  0     0  0   0    4      11 4      3333333333   222   9 11  11  4 222   4 4   4   4  11   222  7777777777777        6  222  777777777777   4   4 6 9  1  4  4   4       999     4 4 4  4 4  4  66  4   4444   11         4  4 4 4 888  11 4  0000000    7 4     0     0 99 0  99     4  4    4    4 4   0000000000000     44444444444     33333    888     0   4   111 0  222  0        
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT--CACAAT--A-AATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATCA-GAACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACC--CCCCCCCC----CCAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------G--T-T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-A------TAC-CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTG-TG---CG------CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--------TTACC-CG-TGTTTTGATAGCA-A-C-ATT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA--CCTTTTAGAAGATTAAA-TTTTA-N-AAAGG-C-AC-GA----GAGTGTTG--C-A-TCTC-CCAAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCATC-GTGTT-----T-CT-TA-TTGTAC----------------AT---TTACATGTG---CATGTGC--CG--T-TTG-----ATAG-T-ATATT-G---A---T--TTTTT-ACATGGG-T---CATATAT---GCCCGGTTTTGA----TA--------------------TTCAATAT-TTTTTA-AAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GTC-TAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-ATAC--CAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATATTAG-ATAC--------G-TAT-TACT-CA-TAGTG-C----GGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATATT---AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA-TC---A-C-ATGTACA---TATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-AT--TTAT----TTT--ATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---T--G----AACG---TTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAG-T---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGC----TT-CCCC---TGA-C--AA--AA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
Reference ( family-611 )      :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGAT--CACAAT--A-AATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAAATC--TATCA-GAACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GG------CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTCC---T--A-CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCN-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACC--CCCCCCCC----CCAGTAAATTA-CA--T-T-CTNGT-AGTNTA-C---GA-T----A-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---T--CC--C----------CG-ANTT-----------G--T-T----C---------------T---CGC-NTGT------GTA-T-A------TAC-CTGTA-TGTA-CCAACTATACGCT-GAACTT--T----CG------CGT--CCTTG-----GTATCGGGTATTG--TGT--A--------TTACC-CG-TGT----AT-GCA-A-C-GTT-CGCCAGCG--ACA-TT-GN--ATTT-CA-CA--CNTTTTAGAAGATTAAA-TTTTA-N-AAAGG-C-AC-GA----GAGTGTTG--C-A-TCTC-CCAAAA-AAATCGGGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCATC-GTGTT-----T-CT-TA-TTGTGC----------------AT--CTTACATGNGT--CATGTGC--CG--T-TTG-----ATAG-T-ATATT-G---A---T--TTTTT-ACATGGG-T---CATATAT---GCCCGGTTTTGA----TA--------------------TTCAATAT-TTTTTN-AAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-GTC-TAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA-A-ATAC--CAA--TTTA-CATGAATATTTAATTTCTTATGAATATTAG-ATA---------G-TAT-TACT-CA-TAGTG-C----GGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GCGGAAA-T-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--TTGAATGAGCGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTCA---------GAATAATATT---AC-AGC-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA-TC---A-C-ATGTACA---TATTTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----ACT--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGC----TGAAACCAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATC-ACTAGAATT-AT--TTAT----TTT--ATATT-AAAAC-ACGCCCAACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCCTTAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-G--GC-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-GTATA-TAA-TTAAAG-TG-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--A---T--G----AACG---TTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---CT-T----AAT-------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CGGAATT-CAAT-ATTCAG-T---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AC---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-T-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGG-----TT-CCCC---TGA-C--AA--AA-A-T-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------NTGCTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-ATTATTAT
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                   TATATAAGATGCTACAAT--A-AATAAA----TA-------AA--TC---TT-T-G-T-----G-TC-C-G-AGAT-------GGTGAAAATC--TAT---AAACAA--A--TCATTTTA-A--GAC-T--GGT---A--T-TT-G------G-C--AC---T-G----GTTT-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-G----------AC-AA-TAATTAAAA--C-C-CAAAAGTTCC---C--------------------------------G--TCT-A-GTAT-----------A---TT----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-ATG-TCA-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACC--CCTCCCCCTC--CCAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTATA-C---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TA--TTTTAATT---TTACC--C----------CG-ATTT-----------C--T-T----C---------------T---TAC-ATGT------GTA-T-A------TAC-CTGTA-TATA-CCAACTATACACT-GAACTTG-TG---CG------CGT--CCTTGTACATGTATCGGGTATTG--TGT--A--------TTACC-CA-TGTTTTGATAGCA-AAC-ATT-CGC-AGTG--GCA-TT-GC--ATTT-CG-CA--CCTTT-AGAAGATTAAA-TTTTA-A-AAAGG-T-AC-GA----GAGTGTTA--C-A-TCTC-TCAAAA-T--TCGGGTCAT-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATC-GTGTCATACAT-CTACA-TTGTGCCGATAGTATATTGGAAATTTCTTACATGGGT--CATGTGC--CGGTT-TTG-----ATAACT-GT-TT-G---ACA-T--TTTTT-ACATAG--TACACATGTATA--GACAAATTTTGAACGGT---------------------TTCAATATGTTTTTT-AAAAGCCGATTTTTTGGT-TCA-----TT--T-GTC-CAAT----TT-GTTTGTTATCAGAA----TAC--CAA--TTTA-CATGAATACTTAATTTCTTATGAATATTAA-ATATTACTCATAG-TATCTATTACAATATTA-CTCTTAGGATCTATTGTAT-CAAGACAGCGT-GACG-TGCA-GTGGAAA-T-GAC----A-TGTAATTTT-AACTG--TTGAATGAGAGGTGAATT----------TCACT--AC--CAC----CCTCTTCGCCACACACACAATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACA-T----------CCCAGCG--A--ATT--AA---TTT-----------------------TT---AC-AGC-CTGGCTA-AA-TT-GCAGTCAC-AA-TT---A-C-A-----A---TAAGTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ACCGAC----ACT----------AC-AAAAAGAGA--CTTAC----TAAAACC-C----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-----CGGGACGTTATATT-ACTAGAATT-AT--TTTTACCGTTT--GCATT-AAAAC-ACGCCCGACAT-CC-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-AGACACG-ATTGACACCCCCCTCCCCCTTAGCTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGATA-GG-TGGAA-ACC-A-A--GC-TAATTT-GTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AATGGAGAG-GTATA-TAA-TTAAAG-TA-GGACGTTGTCTAAGTC-G-TTGA-TTT--ACAAT--GTATTAACG---TTT-AC--AAAAA---G-C-TA----G-G-G---AT-T----AA--------------G-----------------T--------TC-CAACA--CC-TA-TA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCGA-G---GAAAA----TGT-GACCTTTT-T------A-A--T--AT---T---AGGTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-C-A--T-TTA--TT-AATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--AAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TG----A-AATGT------C---------------AGA---------ATT-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CAAACAGCA---TTGCCCC---TGA-C--AA--AGTA-T-TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--A---------TTGCTTGCATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-ATG-AAGAA-TA-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CT-A-CA-GG--TG-GCT--T-AAG--TTTCATGTT-AT-ATA-T---GT--C-TC-----T-TGTCTA-AGTCG-TTCAA-T--G-CT--CATAT-TT-AATT-AAAC-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAC--TTAAGA---AAAAA---AAAAT-ATTGATC-T-T-GTA--AA-AGTATTAT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GCCATTTG-G-ATCA---TTT-C-AC-TACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAAGG-GGGAACACC-G-G--GC-TAATTCT--TGAT--TTATG-TT---TAAAAT-----A--AAAGTAG----TATACTA---CAAAG-TGAGGAAGTTGTCTAGGTC-A-AT-A-TTT--A---TTTG----AACG---TTTCAC--AAATA---G-A-TAT---G-G-G---CT-TCATTAAT-------------G-----------------CACAACTGGTT-CAACA--CA-TAATA-TT-A-CG-CAGTCCAA--CATAATT-CA-T-ATTCAG------AAAACGATTGT-GGCCTTTT-T------A-A--T--A----------GTG-TTC-CCAG---TTTT-CAC--TT---C---AA-AAATC-GT--C----G-T--AT--TGTT----TCT-CTGA--GT-TGAA--TA-T-T-T-A--TGTTA--TT-AATA----CTT-AAAAA-TCG-CCA----TCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCACG---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GTC-AAATT--GT-A---AGCA-GA-----TAAG--A-AATGC------C---------------ATA---------TGG-CT---T-AG--AATT-AT-AAA-TACATTTTCCA--T-CTAATTGCAAT-TT-CCCCA--TAAGCAAAA--AA-A-T-TAT-T-TTG-CTA-GC---GT---TA--T---------TT--TTAT-------CA------------TGT-ACG-ATG-AGACA-T--AAT-AAAGCGC--GTTTTA-T-T-CC-A-AA-GATCTG-GCT--A-AAG--TTTTAT-CA-AT-ACA-T----T--T-TCTAACAT-GGTCTG-GGTCGAATCAA-T--GCCT--CATAA-TT-AATC-AAAC-CGTTG--C----------AGTTG--C---AAC--TTAAG----GAAAG---AACAT-GTTGATC---T-GTA--AATATTATTAT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAA-AA-TATGAA--ATT-CCTCCAATATTGAATGAAAAGACACC--CCCCCCCCTCCTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATA-C---GA-TTTGTA-------TAATAAA-G-C-TAAATTTTAATT---T--CCTCC----------CT-AATT-----------T--T-T----CGCACTGTATTCCTACT---TGC-ATG-------GTAGT-A------TACGCTGTA-TGTAGTCACCTATACGCTTGAACTT--T----CGTGACGACGTAACCTTT-----GTAATGGGTATTG--TGTTAA--------TTACC-CG-TGTTTTGATAGCA-A-C-ATTTCGCCAGCG---CA-TT-GTGTATTT-CA-CAATCCTTTTAGAAGATTAAACTTTTA-TTAAAGG-CCACCGA----GA-TGTTA--C-A-TCTC-CCAAAA-AAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCCGTGTT-----T-CTGTA-TTGTAC----------------AT-----ACATGTAA--TTTGTGC--CG------------ATAG-T-ATATT-A---A---T--TTTTTTACCTGGGGT---CATATAT---GCCCGGTTTTGAGATATA--------------------TTCAATAT-TTTTTATAAGAGCCGCTTTT---GTATCA-----TT--TAGTCCTAATC---TT-GTTT-TT-TCAGAA-C-ATACACCAA--TTTATCATGAATATTGATTTTCTTATGAATAT-AGTACA---------GGTAT--ACT-CA-TAGTG-C----GGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACGTTGCATGCGAAAA-TGTAC----ATTGTAATTTA-AACAGGTTTG-ATGAG-GGTcagaaaagtgtattatcaatagttatgcacatacatgtacagacatt
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ga---TGT-ACG-ATGGAAGAAGTC-A-C-CATACGC--TTCTTA-T-TACT-A-CACGG--TG-GCTCAA-AAGATTTTTATGTT-AT-ACAGT---G---C-TC-----T-GATCCG-AGTCG-ATCAA-TCCG-CT--CATAT-CT-AATT-AAAACT-TCGA-CA---------AGTTGCAA---AACCTTTAAG------AAA---AAAAT-ATTGATC-T-TCGTAT-AA-CTTATTA
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   t-C-AT---TTTT-CCC--CTGA-C---AA-AAATT-AT--TT---G-CTAAT--GGTTA---TATGCTTAC-TTGTACGA-TA-T-TCT-A--T-TTA--GTGAATA----CCT-AAAAA-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CT--GCGCG---G------TTCG--TT--A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---TCAA-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG----------CCCGGGTGA-C--AA--AA-ATT-TTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---TATTA---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TGT-ACG-A-G-AA-AA-TC-AA--CATACGC--TTTTTATT-T-CT-A-CA-GG--TG-GGT--AGAAG--CTTCATGTT-AT-A-A-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CA-AT-TT-AATT-AAAA-T-TCG--C----------AGTTG--G---AAT--TTAAG------AAA---AAAAT-ATTAATA-T-T-ATA--AG-ATTATTAcagaaaaaatgtaatctatcattatgttataagccacatactatatgtacgtatattccttttcaactagaaatttctctaggatatgcatgttatgatgtatatatgggtgtttgaaaccccaatgttattttcaaacataaagaatgtgcaattttttgttgtagtaatacaatttcgttcgtctaaattgcttctaaatttacaacatattctatcagattttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttattccgtttatcaggttatannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncctatggtgtatccatgtcaagaataacgttgcgggactgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                     TATAAGGT---ACAAA--A-AAAAAA----TT-------AA--TCA--TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATCC-TATCA-CAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AATTAATAC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-G----ATGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----ACA---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT--C---AAT-TTGAA-----AGACACC--CCTCCCCC----CTAATAAATTA-CA--T-TACTAGT-AGTTTA-CGTAGA-T----ATT-----TAAT-AA-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------G--T-T----C---------------G---CAC-TTGT------ATA-T-C------TAcagaaaaatgtatcagtcgattagttatgcacatgtacatgcattccttttcaattagaaatttctttaggatatacgtgttatgtatataaaggatatttgaaacccttgaatgttatttcaacataaaacaatgttgcaatttagtttgtagtaattacaaatttcgttccgtctaaattgcttctaaatttacaacatttctatcaggttttcc
gi|15                         : cgtgtgtatcaggttttccgttttctatcgtgttttgcgtttatcaggtctattcgttttacgtgttttacgttgctatcaggttttccgtttatcgtatcgtgtcttctcggaaagttgatcgggatcattataatttataaatacggaaaaagtacgatactctccgaaagcttcatttcgttttgtctaagaagatatttttaggaatggaggaaatacaaaaaaatataaagttggatatTATAAGGTA-CAAAAA--A-AACAAGAACTTA-------AA--TCATTCT-TTG-TCT---G-TCACAG-AGATC------GGTGATAATCC-TATCA-CAACAA-TA--TCATTTCA-T--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AATTAAATC--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA--C-C--GAAAGTTCC---TTTATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAAGT-AAG-TCG-A-C---TA-GAAA-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACC--CCTCCCCC----CTAATAAATTA-CA--T-T-CTAGT-AGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA--TTTTAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------G--T-T----C---------------G---CAC-TTGTATTCTAGCA-T-A------TAC-CTATgcatat
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                              gatatTATA-AAGAT--C-CAAT--ACAATAAAA---TA-------AA--TC---TT-TTG-TCTT--G-TC-CAG-ATGT-------GTTGAAAATC--TATCA-GAAGAA-T---TCATTTTT-A--GAC-TG-GGG---A--G-TT-G------G-C--CGGAAT-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GGTCGGTACC-ACTAC-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTC----------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGGGCTTGGCTCTAA-GTAACCGCAAAGACTA---C-----A-A---T-TA------TT----------GATAATT-AAG-TCT-A-TACATA-GAGA-AACTAGGAAAGATT-CC---AA--TTGAA-----ATACACC--CCCCCCCCCCT-CCATTAAATTA-CAT-T-T-CTTGT-A----A-C---GACT----A-------TAATAAT-CAC--A--TTTTAgaaagcttattcgggtcaaattg
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                               gctgatTATAAGAT--C-CAAT--A-AATAAA----TA-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CAG-AGGT-------GTTGAAAATC--TATCA-GAACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TT-A------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAACA----AAT-----C--GAGCGGT-----CC-AC-AG-TAATTAAAA--C-C-CGAAAGTTC---------CT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------ACCGC-----A-A---A-GATTAAATTT----------TGTAA---AAG-TCT-A-CA--TA-GAGA-AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTG-A-----ATACACC--CCCCTCCT----CCAGT-AATTA-CATTT-T-CTTGT-A-TA-A-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTAccccctccccccccccaatttttcg
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ctggctatGAT-------GGTGAAAATC--T--CA-AGAAAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGGG--A--GATT-G------G-C--CG---T-G----GT-C-GTCAAACA----AAT-----C--GAG-GGT-----CC-AC-AGATAATTAAAA--C-C-CGAAAGTT--------------------------------GG---TG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TTAATCATATTTTGTAATTTAAG-TCTTA-C---TACAAGAGAA-TAGGAA--ATTTCC---AAT-TGGAA-----AGACACCTACCCCTCTC----CCAGTAA-TTA-CA--TCT-CTTGT-A-TATA-CC--GG-T----G-------TAATAAA-GGC-T---TTTTAATT---A--CC--C----------CA-ATTTTTCGCATTTGTA--T-TTCTAC---------------T---TGC--TGT------GTA-TTA------TAC--TGGACTGTA-CCAACTATACGCT-GAACTTGCT----CG------CGT--CCTTG-----GTATCAG-CATTG---GT--A----------ACC-CGATGC----AT-GC---------------GCG--ACA-TT-GG--ATTTTCA-CA--CCTTTAGGCATATTAAA-TTTTA-C-ATAGG-C-AC-GA----GAGTGTTG--C-AATCTC-CCAAAA-AAATCGG-TCAT-T--GGCGCGACTTGTGTGCTGTCATC-GTGTT-----TTCT-TA-TT-------------------------TTACATGTGTAACATGTAC---A--T-TTGTGCCGATAG-TTATATT-G---AA--T--TTTTT-ACATGGG-T---CATATATTTTGCC-GGTTTTGA----TA--------------------TTCAATAT-TTTT-G-AAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TT--T-ATC-TAAT----TTTGTTTGTTATCAGAA----TAC--CAAAATTTA-CATGAATATTTA-TTTTTTATGA-TATTAG-ATAC--------G-TAT-TACT-CA-TAGTGGC----GGATTCTATCGTAT-CAATACAGCGT-AACG-TGCA-GCGGAAAAT-TAC----A-TGTAATTTT-AACAG--T-GAATGAGCGG--AATT-----------CACT--ACAACACTTCTCCCCCTCGCCACAGACAA---ATTA-C-GTGAT---TTTTATTTTCACA-T----------CC-AGCG--A--ATT--AA-ATTTT-CTTTA---------GAATAATAGT---AC-AGC-CTAGCTA-AA-TT-TCAGTCAC-AAATC---A-A-ATGTACA---TATTTACTTT-ACATTAC-CAGATTG-ATAGAC----ACT--T-------AGGAAAAAGAGAA-CCT-C----TGAAAC-AC----GA----GTAAACGTC-ATTACC-----CGGGACGTTATATC-ACT----TTGAT--TTAT----TTT--ATATT-AAAACCACGCCCAACAT-C--ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCCTCCAATC-AAAATGACAAG-ATCGACCCCCCCCCCCTCTTCAGGTCC-GCCATTTG-G-ATCAA--TTTAC-ACATACAGG---ATCC---GAAA-----GAGAAA-TG-GGGAA-ACC-G-G---C-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAATTG----A--AAAGGAGG-----TA-TAA-TTAAAG-AGAGGAAATTGTCTAAGTC-GGTTGA-TTT--A---T--GG---AACG---TTT-AC--AAAAAAAAG-TATA----G-GCG---CT-T----AATAATACACACACCAG-----------------T--------TT-CCACA--CC-TA-TAATT-A-CGGCAGTC-AA--CGGAATA-CAATTATACAG-TCTTGAAAA----TGT-TACCTTTT-TTTA---A-A--T--A---------GGTG-TTC-C-AG---TTT--CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--G-TT----TGT-CTGAA-GT-TAAAAGTC-TGT-T-A--T-TTA--TT-AA-A----CCT-AACAA-TCA-CCAGCGTCCAA--AT--GAAACA-TG-CT---GATTGTGC-G--GCT-GTGCA---G-GT-C-TTCG--TTT-A-GT--AAATT--GT-A---AGCA-GA------A----A-AA-GC------C---------------AG-----------TG-CT---TAAA-AAATT-ATAAAA-TGCA-TTTCCA--TGCTAACGGCATTTTT-CCCC---TGA-C--AA--AA-A---TTA-T-TTG-CTA-AT--GGT---TA--T---------ATGCTTACTTGT-A-Ccccctccccccccaatttttcg
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                      gctattataccagaggcaataataatgaaatgaaataactctACAAA--A-AAAAAA----TT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---T-TC-CAG-AGAT-------GGTGATAATC--TATCA-CAACAA-TA--TCATTTCATG--GAC-T--GGG---A--G-TT-G------G-C--CG---T------GTTC-GTCAAACAAGTTAAT-----C--GAG-G----------AC-AG-CAATTCAAA----C-CGAAAGTTCCTT-T--ATCT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAG-T-AAG-TCG-A-C---TA-GA-A-AA-TAGGAT--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACC--CCTCCCCC----C---TAAATTACCA--T-T--TAGTGAGTTTA-C---GA-T----AGATATT-TAATAAG-GGT-TA-----TAATT---T--CC--T----------CA-GATT-----------G--T-T----C---------------G---CAC-TTGT------ATg
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                 aggtTATAAGAT--C-CAATGAA-AATAAA----AT-------AA--TC---TT-TTG-TCT---G-TC-CA--AGGT-------GTTGAAAAT---TATCA-GAACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-T--GGG---A--G-TTAG------G-C--CA---TGG----GTTCAGTCAAACA----AAT--------GAG-GGTCCGA-TC-AC-A--TAATTAAAA--C-C-CGAAAGT------C--A-CTGG-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG---CT-A-GTA------------A---CCGCAGA-AGATT-AAAT----TT----------TG-AATG-AAG-TCT-A-C---TA-GAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----ATACACC--CCCCTCCT----CCAGTAAATTA-CA--T-T-TTCTT-TGTATA-C---GA-T----A-------TAATAAT-CGC-TA--TTTTtctagca
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggctatTATCAGGTTTTAGATGT--AAA------TCGCCACG-TGT----AT-G--------TT-C-TCAGCGGAACAGTTAGC--TTTT-CAACA--CATTTTGAAAGATT-AA-TTTGA-T-AAAGGTT-GC-GAAGGGAAGTGTTGGACAA-TCTCAACACGA-AAATCGGATCACATTGTGGGCGACTT-TGCGC-GTTATC-GTG
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       atataggctatttttccctcatgtattttacactgggttgtgtaacagggataatacttgcatgttacgccaaaaactaat-------------G-----------------T--------TT-CAATG--CC-TA-AA-TA-A-GA-CAGTC-AA--CAGAATT-CAAA-ATTAAAAC---AAGAA----TGTAGGCACATT-G------A-A--GCAACGAAT---GAGTT-TCC-C-TG---TTTG-AAA--TT---C---A-----TT-GTTGCTCCGG-T--AT--GTTT----TGT-TTGAA-GT-TAGAA----------A--C-TTA-----AGCA----GCC-ATAAA-TCC-CCAG----CAA--TT--CAA-T--TT-CT----------C-GTCTTT-GCATG---G-GT-C-TTTG--TCT-T-GT--GTAAT--AT-ATTCACCA-GA------A----G-AGCTT------C---------------AGA---------GCA-CT---T-TT-AGATT-AT-CAA-Taattctacaa
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                               aATAAT--A-AATAAA----TA-------AA--TT---ATATTGATCTAGTG-TC-CAGGAGATCGTAACTGGTGAAAAACCTTATCA-GAACAAATAGGTCATTTTA-GAGGACCT--GGATGTA--G-TT-GCCAAAGGTC--CT---T-GCGGCGTTC-GTCAAAAAGAG-AAT-----CACGAG-GG------TCTAC-AG-TAATTAAAA--C-CGCAAAAATTCC---TG-A-AA-G-AAAGTGTGG--ACAGTT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ggctatgtatgaatgcaataaAAAAA-AA--TCACTTTA-A--GAC-T--GGG---AATG-TT-G------G-C--CG---T-G----GTTC-GTCAAAC------AT-----C--CAG-G--------T-AC-AG--A---AAAA--CGC-GGAAAGTTCC---TAAA-CTCGTA----GTGG--CCAGTTGG--CTG--TCT-AGGTA------------A---C-----A-A---TGGA------GT----------TGCAATT-AAGCTTA-A-C---TA-CAG--AA-TAGGAA--ATT-CC---AAT-TTAAA-----ATAAAGT--CCTCACCC----Ca
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     C-ACT-G-TTTA-AG--------------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACACG-ATTGCTCCCCCTCCCCCCTTTAGGTCC-GGCATTTG-G-ATCAA--CTTAA-ACATACAAG--TACCC---GAAG-----GAGAAA-GG-TGGAA-ACC-G-A--GC-TAACTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAATGAAAGG--AAAGGAGGG-ATATA-TGA-TTAAAa
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----------TCACTTTAC--AAC----CCTCTTGGCCACATACAACATATTA-CGTTCAT---TTT-ATT--CACA-T----------CC-AGCGCAA--ATT--AA-ATTTTTCTTCA---------GAAAAATAT----ACTAAC-CTGGCTA-AAATT-TCA-TCAC-AA-TC---AAC-ATGTACA---TATTTACTTT-ACATTATTCAGAG-GGATAGAC----AAT--TGATGAAAAA-AAAAAGAGAA-CTTGTGATGTGAAATCAC----GAGT--GTAAACGTTTAT-AAC-----CGT-ACGTTATATC-ACTAGAATT-AT--TTAT----TTTTTATATC-AAAAC-ACGCCCAACATTCC-ACT-GGTTTAGAG--------------ATATCTTGCTGTAC-CTCT--CAATC-AAA-TGACAAGTAGTGACCCCTCCACCTTC--TAGGTCCGGCCATTTGAG-ATCAA---TTAC-ACATACAGGT-TATCC---GAAGAGAAAGGGGAA-GG-GGAAA-ACC-GTGTTGT-TAATTTTGTTGAT--TAAT--TA---CAAAAA-----T--AAAGGAGGG----TA-TAATTTTAAG-TG-GAACGTTGTCTAAGTG-G-TTGA-TTTTCA---T--G----AACG---CTT-ACCAAAAAA---GAC-TA----G-G-GGCACT-TAA--AAT-------------ACACAACCAAT-------T--------CC-CTACA--CCTTA-TA-TT-ACCG-CAGTC-AACGCGGAATA-C-AT-ATTCAG-TTA-AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------G-ACTT--AC---TAAAAGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TTAAACGAGAA-AAATCGGT--CTCG-G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-T-AAA-TC-T-T-T-AT-T-TTAATTT-AATACCCTCCT-AAAAGTTCACCCAG--TCCAA--AT--GAA-TATTG-CT---T------A-G--C-T-GCGCG---G-GT-CATTCG--TTTAA-GT--AAATTTGAT-A---AGCACGA-----TATATTA-AATGCGCATTAC---------------AGGTATCCGAACTTG-CTTGAT-AGAAAATT-ATGAAA-TGCA-ATTTCAACT-CTAACG----------CCC---TGA-C--AA--AA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGT---AT--A---------TAGTTTACATGTAA-CAT-------GTTATCT-ACG--CA-GAGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-T-T-CTAA-CC-TG--TG-GCTTAA-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-TATGGT--CTTC-----TGGGTCCGAAGTCG-ATCAAGT--G-CTCCCATAT-CTAAATTAAAAA-T-TTG--T----------ATCTG--GTAAAAT--TTAATA---CAGAA---GAAAT-GT--ATCGT-C-ATT--AG-ATTAT
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATAT-TC-AATT-AAAC-T-TCG--C----------GGTTG--C---AAC--TTAAGACACAACAATCTACAAC-ATT--TT-T-T-GTA--GA-gcacatacatgtacatgcattcctcttcaattataaactttaggatatacgtgttatgtatgataaaggatattgcaacccttgatgttattttccattaaaagaatgtttgcaatttttgtttcgcagttaatacaaaatttacgtttccgtcaaattgctctaaattactacaaattacaaaccatcagttttcctattatccgtgaagattacgtttctatcgggtgttttgcgttatattcaggtctatccgtgatactaatcgtttatgagttttttccggtttatcagtttttgcggtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtttatgtgcgtgaagtccaatcctatctatgcgttgtatcgatgttctttccagttgtatcatggtcaagaataa
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTCATC-GTGTT-----T-TT-TATTTGTAC----------------A-----TACATGTG---CATGTACATTG--TGCCG-----ATAG-T-ATATTGG---A---TAATCCTT-ACATGAG-C---CATATG------CCGGTTTTGA----TA--------------------aaatgtatcggcatttaaaatttagttatgtgcatacatgcacata
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             -TTGA-TTT--A---T--G----AACG---TTT-AT--AAAG-------------------------T----AAT-------------A---------------------------CACAGCAGTCC-TA-CA-TT-T-CG-CTGTC-AA--CAGAATT-CAAT-ATTCAG-
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATTA---CA---------A-TAT-TACT-CA-TAG----------GATTTATCGTAT-CAAGACAGCAT-GACG-TGCA-GTGGAAA-ataaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             atcT-TTTCA---------GAATAATATT---AC-AGC-CTGGTTATAAATT-TTAGTCGC-AA-----------------------TTACTTT-ACATTAC-
gi|39                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T-AGTTTA-C---GA-T----AGATATTGTAATAAAAGGC-TA--TTTGAATT---TC-CC--C----------CG-ATT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tatACATGAAATATTCTATC-TTGATATTTTT-ATTT-CACA-TTCAAAATCATCC-AGCG--AGAATTTCAATATTTT-TTCCAATTCAAATAGAATAATATCCGAAC-AATGCTG-CTA-TAATTCTCAATCACCAA-TCGTCA-CTATGTACAGTTTATTTACTTTTACATTAC-CAGAT-GTGTAGGCCTTCACTAAC-------AG-AAAAAGAGAAACTT-C----TGAGACCACTCCAGA-TCAGTAGAT-TT-AC-ATTTTTTACGGGCGGTTATATC------------------------TT--ATATT-TAAAC-ACGCAC--CAT-CCCACTCGCTTTA-AG--------------ATAATCTTGCACGTTCTCT--CCATC-AAA-TG-CAAG-ATCGACCCCCCCCCCTTTCCTAG-TCC-GCTATTTG-GCATCAAAATTTACCACATACAGG---ATCCCCGAAAG-----AAGAAA-GGCGGGAA-ACC-G-G--ATAGAATTTTTGTGATGTCAATG-TATAGCAAAAT-----ACAAAAGGAGGGAGT-TA-TA--TTAAAGCTG-GGAAGTTGTCTAAGTCCG-TTGA-TTT--A---T-------AACG---TTT-AT--AAAAA---G-C-TATATGG-G-G---CT-T----AAT-------------AATACCACACTCACCAGTT--------TC-CAACA--CCATA-TAATT-A-C--CAGTCCAA--CGGAACTACAAT-ATTCAG-TC--GAAAA----TGT-GACCTTTT-TTTTCTTA-A--TT-AC---A---GGGTT-TTCTC-AAAATTTCT-CACCATT---A---AG-AAATC-GTT-CT---G-TG-AT--GGTT-----GT-CTGAAAGT-GAAAA-TC-T-T---A--T-TTA------ATA----CCT-AAAA--TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-TA---A------CTG--CTTTGCGCG---GTAC-C-TTCG--TTT-ACGT--AA-TT--GT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAACTGCA-TTTCCA--T-GTAACTG---------CCC---TGA-C--AA--AA-T-T-GTG-TCTTGCCTA-AT--GGT---TA--ATGAGTG---GTATTTACA-GT-A-CA------------TGT-ACGAATATACGAA-TC-AAC-CATACGC--TTTTTA-TCT-AT-A-CA-GG--TG-GGT--A-AAG--C-TCA-GTT-ATAATA-T---GT--C-TC-------GGT-TG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-TT-ACTT-AAAA-T-TCC--G----------AGTTG--G-----T--TTA--A---AGAAA---AAAATAATTGATCAT-T-GT---AA-ATTATTA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  C-CTGGCTA-AAATT-TCAGTCAC-AA-TC---A-C-ATGTACA---TATTTACTTT-ACATTAT-CAGAT-G-ATAGAC----A-T--T-------AG-AAAAAGAGAA-CTTGT----GAAAAACAC----GA-T--GTAAACGTT-AT-ACC-------GGACGTTATATCAACTAGAATT-AT-----T----TTT--ATATC-AAAAC-ACGCCCAA-AT-CC-ACT-G-TTTA-AGAATATCTTGCATGTAT-------------CTCT--CAATCAAAA-TGACAAG-AGTGACCCCTCCCCTTTC--TAGGTCC-GCCATTTG-A-ATCAA---TTAC-ACATACAGG--TATCC---GAAG-----GAGAAAGGG-GGGAA-ACCGG-G--GT-TAATTTTGTTGAT--TAATG-TA---CAAAAT-----A--AAAGGAGGG-G--TA-TAA-TTAAAG-TG-GAACGTTGTATAAGTC-G-TTGATTTT--A---T--G----AA-GAGCTTT-ACA-AAAAA---G-C-TAG---G-G-G---CTAT----AATAATACACACACCAA-----------------T--------TCTCAACAC-CC-TA-TA-TTAA-CG-CAGTC-AAC-CGGAATA-CAAT-ATTCAG-T---AAAAA----TGT-GACCTTTT-T------GCA--T--AC---TAA-AGTTG-TTC-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AGAAAATC-GT--CC-----T--ATA-GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAAAA-TC-T-T-TAA--T-TTA---T-AATACC--CCT-AAAAG-TCA-CCAGC-TCCAA--AT--GAA-TA-TG-CTATGA------C-G--C-T-GCGCG---G-GT-C-TTCG--TTTAA-GT--AAATT--GTAA---AGCA-GA-----TT----A-AATGC------CATTACAGGTATCCGAAGA---------TTG-CT---T-AG-AAATTAAT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACG----------CCC---TGA-C--AA--AA-A-TGTTG-T-TTG-CTA-AT--GGTA--TA--T---------ATGTTTACATGT-A-CAT-------G---TATAACG-A-G-AAGAA-TCAAAC-CATACGC---TTTTA-T-T-CT-A-CC-TG--TG-GCT--A-AAG--CTTCATGTT-AT-ATA-T---ATGGC-TG-----T-GGTCCG-AGTCG-ATCAA-T--G-CT--CATAT-CT-AATT-AAAA-T-TTGATC-----------GTTGT-A---AAA--TTAATA---CAGAA---AAAcagaataaaatcatatcgtcattatattccacatacaatgtacattacatgcatccttttcccattaaaatttcttttttttttaggatatacgtgttatgtataacatgtaaaggatattgaaacctcttgcaatgtgtaatattcaaacaaccataaagcaatgtgcaattttagttgttatgtaatacaattttcgttccgctctaaatgcttctaattcaaaccttttgtctaaaatcaggtttccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnttttatccgtttatcaggttttgcgtttatcctatggtattcgtgcagtaataccatcgtattcggtgtgtccggaatcctatctcgtgcgctgtatcgagttctatatcgtgtatcatgtcaagaatacg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                    atatgtatctaatCAAT------TAAA-----A-------AACCTC---TT-TTG-CCT---G-TC-CAG-AGAT-------GGTGAAA-----TA------------A--TCATTTTA-A--GAC-T--AAG------------------G-A--CG---T-GC---G--C-GCC-----------------C--GAG-G----------AC-AC-TAACTAAAC--C-A-CCAATGTTCCCTTT--T-TT-G-A----GTGG--ACAGTTGG--CTG--TCT-A-GTA------------A---C-----A-A---T-GA------TT----------TGTAATT-AAG-TCT-A-C---TA-GAGA-AA-TAGGGA--ATT-TC---AAT-TTGAA-----AGACATG--TACATCCC----CCAGTAAATTA-CA--T-A-CTAGT-AGTTTA-T---GA-T----G-------TAATAAA-GGC-TT--TTTTAATT---T--CT--C----------GC-ACTT-----------GTAT-T----C---------------TACATGC-ATGT------GTA-T-ATACACGTAC-CTGTA-TATA-CCAACTTTACGCT-GAAC-------------------------TG-----GTATCGGGTATTG--TGT--ATTATACATTTACC-CG-TGT-------------C-ATT-CG-CAGCG--ACA-TT-GA--ATTT-CA-CA--CA-TTTAGAAGATTAAA-TGTTA-A-AAAGG-T-AC-AA----GAGTGTTC--C-C-TCTC-CC--GA-AAATTGGATCAC-TTGGGCGCGACTT-TGCGCTGTCATC-GTGTT-----T-CT---------------------------T--CTTACA--------ATGTGC---------TG-----ATAG-T-ATATT-GGAAA---T--TTCTT-ATATGGG-T---CATATG------CCGGTTTTGA----TAACTGTTTCACATTGAACCGTTTCAATGT-TTTTTA-AAAAGCCGCTTTTT--GT-TCATTAATTT--T-GTC-TAAT----TT-GTTTGTTATAAG---A-ATAC--CAA--TTTA-CATGAATGTTTAATTTCTTTTGAATATTA----A---------A-TAT-TACT-CA-TGGTG-C----GGTATCTATCGTA-TCAAGACAGTGT-GTTG-TGCA-GCGGAAA-T-TACCGTGA-CGTAATTTT-AATTG--CTGCATGAGCGGTGAATTTACGGATTGATCACT--AC--CAC----CCTCTTCTCCACACACAATATATTA-C-TTGAT---TTT-ATTT-CACACC----------CC-AGCG--A--ATT--AA-TTTTT-C-TCA---------GAATAATATT---AT-AGT-CTGGCT--AAATT-TCAGTAAC-AA-----------------------TTACTTT-ACATTAC-CAGAT-G-ATAGAC----AC---T-------AG-AAAAAAAG-A-CCTAC----TGAAA-CAC----GA-T--GTAAAAG-------------------------ATCTACTAGAATT-ATTCTTACCG--TTT--GCATTAAAAAC-ACGCCCAACTT-CC-ACT-C-TTTA-AGATATCTT-------AT-------------CTCT--CAATC-AAA-TGACAAG-ATTGACCCCTCCC------------CC-GCTATTTG-G-ATCAA--TTTGC-ACACACAGGTATATCC---GCAG-----AAGAAA-GG-GGGAA-ACC-G-A--GA-TAACTTTGGTGAT--TAATGCTGAT-CAAAAT-----tgtaatcgtcattagttatgcacatactatgtacatgcattccttttcaattagaaactttaggatatacgtgttatgtaatataaaggatattgcaacccttgaatgttattttccacataaaagaatgtttgcaattttgtgttgcagtaatacaaatttcgttccgtctaaattgctactaaatttacaactttcccatcaggtttctccgttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntttttcccgtttatcaggtttnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtgtatcgtgttctttcgtgaggatcatgtccaaagaataacgttgcgggtactgt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AG-T---GAAAA----TGT-GACCTTTTGC------A-A--T--AC---T---AGGTGTTTC-C-AA---TTTTACAC--TT---C---AG--AATC-GT--CT---GTT--ATGGGGTTTTAATGT-CTGAA-GT-TAAAA-TCAT-T-T-AGCT-TTA--CT-AATA----CCTAAAAAA-TCA-CTAGCGTCCAACCATCGAAA-TA-TGCCT---A------C-G--CTG-GCGCGGCAG-GTCC-TTCGCTTCT-A-GTCCAAAAT--GT-A---AGCA-GACTTCTCA----ACAATGA------C---------------AGA---------TTGTCT---T-AA-AAATT-AG-ACA-AGC--CTGCTA--T-CTTATGA-----TC-TTCC---GGACC--AACCAA-ATT-TTG-T-TTG-CTACATCCGGTATATA--ATACAATACTATGCTTTAATGT-ATCGTTAGCTCAG---TAT-ATT-ATG-----T-TC-TATACATACGCCTTTTTTA-T-T-CT-ACCA-GGC-TGAGGT--A-AAG--CTTCATGTTAAT-ATA-T---GT--C-TC-----T--GTCTG-AGTCG-ATCAA-T--G-CC--C-TATATT-AATT-AAAA-T-TCG--CGTATGTGTATAGTTG------------TAAGT---AAAAT---TAAAC-ATTGATC-TAT-GTAATAA-AGTATT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                         tacaaattacttatTAAGAT---GCAAT--A-AATAAA----TAGATAATAAA--TA---TTATTG-TCT---GGTC-CAG-AGAT-------GGTGAACATC--TATCCCGAACAA-TA--TCATTTTA-A--GAC-CTGGGG---A--G-TT-G------G-CGCCG---T-G-----TTC-GTCAAAGA----AAT-----C--GAG-GGGT----CT-AC-AG-TAATTAGAAGAC-CGCGAAAATTTC--------CT-G-A----GTGGTGAC-GTTGG--TTG--TTT-A-GTACAAATGTA----A---C-----A-A---T-GA------TTAAATTT----TGTATTT-AAG-TCT-AAC---TA-GAGA-AT-AAGAAA--ATT-CC---AAT-TTGAA-----AGACACC--CCCCCCCCTCCTCCAGTAAATTA-CA--T-T-CTCTT-TGTATATC---GA-T----T-------TAATAAA-GGCATA--TTTTAATTTTCT--CC--CACATATTTTTCGCACTT-----------G--TATTCTAC---------------T---TGCAATGT------GTATT-A------TAC-CTGTA-TGTA-TCAACTATACGCT-GAACTT--TGTGGCG------CGG--TCTTG-----TAATCGGGTATTG--TGT--A--------TTACC-CG-TGTTTTGATAGCACA-CTATT-CGCCAGCG--ACA-TT-G---ATTT-CA-CA--CCTTTTAGAAGATTAAA-TTTTATT-AAAGG-C-AC-GA----GAGGTTTG--C-A-TCTC-CCAAAACAAATCGAGTCAC-TTGGGCGCGACTT-TGTGCTGTCATCAGTGTT-----T-CT-TATTTGTAC----------------A-----TACATGTA---CTTGTGC--C-------G-----ATAG-T-ATATT-G---GAATT--TTTTT-AC-TGGG-T---CATATAT---GCCCGGTTTTGA----TA--------------------TTCAATA--TTTTTA-AAAAGCCGCTTTTT--GT-TCA-----TTTGT-GTC-TAATTGTGTT-GTTTGTTATCAGAATACATAC--CAA--TTTA-CATGAATA-TTGATTTCTTATGAATATTAG-ATACAG------G-AAT-TTCT-CA-TAGTG-C----GGGATCTATCGTATTCAAGACAGCGTAAACG-TGCA-GCGAAAA---TAC----A-TGTAATTTTAAACAG--TTGAATGAGCGGTtacagcgcaacacaatcggtatcgcttccacattatgtagcgtgacgtattgacatgtatcatgacattctctgttcaatttagaaagttgtggctttatagagtataaagtgtctatgtcaataataaaggatatcgaaaactccttgaatgttcattttcaacattaaaagaattgtgtgccaattttagttgtagtaaatcataattcgttcctttaaattcgcttcaaattctacataaaaaacatctatcatgtgtttctcgtttatcctgagattcggtatcggtgtttttgtcggtttttatcaggtctaatctgagaacatagtcgtttataagtttttctggtatttatctaggttattcgcagtttaccctatcgtatcgtgcgtatcctaatcgactatgcgttgcagtgaatcctggccctatcgtgccgttttgtacggttctatcgtgt
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ctggctattgat-TTGA-TTT--A---T--G----AACG---TTT-AC--AAAAA---G-C-TG----GAG-G---CT-T----AATAATACACAAACCAG-----------------T--------TT-CAACA--TA-TA-AA-TT-A-CG-CAGTC-AA--CATAATT-CAAT-ATTCAG-G---GAAAA----TGT-GACCTTCT-T------A-A--T--A---------GGTG-TTT-C-AG---TTTT-CAC--TT---C---AG-AAATC-GT--CT---G-T--AT--GGTT----TGT-CTGAA-GT-TAACA-TC-T-T-T-A--T-TAA--TT-AATG----CGT-AAAAT-TCA-CTAGC-TCCAC--AT--GAA-TA-TG-CT---A------C-G--CTT-GCGTG---G-GT-C-TTCA--TTT-A-GT--AAATT--TT-A---AGCA-GA-----TA----A-AATGC------C---------------AGA---------TTG-CT---T-AG-AAATT-AT-AAA-TGCA-TTTCCA--T-CTAACGGCT---TT-CCCC---TGA-C--AA--AA-A-T-TTGAT-TTG-ATA-AT--GGG---TA--A----------TACTTACA--------------------TGT-ACG-ATG-AAGAA-TC-AAC-CA----------------T-CT-A-CA-GG--TT-GCT--T-AAG--TTTTATGTT-AA-ACA-T---GT--C-TC-----T-GGTCTG-AGT
11 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): ATGTTATTTTTCAACATAAGAGAAATGTGCAATTTTAGTTGTAGTAATACAAATTTTTCGTTCGGGTCTAAGGATTGCTTACTAAAATTGTACAACAGTTTCTATTCAGGTTTTCCGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTTCCGTTTTATTCTATGGTTTTCTTGCTTGTAGTCCTATCTCTCGTGGGTGTGATGCCGTTCGAGGTATCGTTTGCGTGAAATCCGATCCTATCGTGGCGTGGTATATCGTGGTTCTATCGAGATGTATCATCTCAAGAACTAA
Unaligned ( gi|18 ): CAATGTATATTTTTCACATAAAAGAACGTGCCATTTTTGTTGTAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTCTATTTTACAACATTGTCTATCAGTATTCTTGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCTCCTCTCTTACATAGTTTATTAGGTTTTGCTTTTATGCTATCGATCGTGCAGCTCTCTCATACAGTATATCGAATTGTTCGTGTATTGTGATCCAATAAACGTGCATTTGTGTTAATCGGTGTATCGTGTTCAGAAGAACGTTT
Unaligned ( gi|24 ): ACAATTAATCTTGTAAAATTATTACAGAAAAATGTATCGTCATTAGTTATGCACATATATGTACAAGCATTCCCTTTCAATTGGAAATTTCTTTAGGATATGCGTGTTTTATATATAATGAATATTGAAACCCTTGAATGTTATTGACAACGTAATAGAATGCGCGAATTTTGTTATAGTAATACAAATTTCGTTCCGTTTAAATTGCTTCTAAATTGATAACATTTCTA
Unaligned ( gi|26 ): CTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTCGCGTTTATCAAGGTCATCGTGTATACGTGTTTTGCGCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNC
Unaligned ( gi|29 ): AAATAGGACTTTCCAATTTGAAAAAGAGACCTAGCTGCACATTAAAAAGTTTATTAATCATATCATTCCATCGTATTTAAAGGTTATTTTCCCTCCAATTTCTCGCACTTGTTTTCTACTTGTAGTCTATTAGAACCCACTTTATTATTCGTGCCAAATCG
Unaligned ( gi|32 ): TATCAGGTTTTCCGTTTTCTATCGTGTTTTGCGTTTATCAGGTCGATCATGTACCGTGTTTTGCGTGTATCAGGTTTTCCGTTTATA
Unaligned ( gi|34 ): TTTGTATCAGGTTTTCCGTTTTCTATTGTGTTTTAAAATTGCGTTTATCGGGTTTATCGTGTATCGCGTTTTGCA
Unaligned ( gi|35 ): TGTTGTAGCAATACAAATTTCGTTCTGTCTAAATTGATTCTAAACTTGGCTTGCAACATTTCTATTTG
Unaligned ( gi|36 ): AGAATGTGCAATTTTTGTTGTAGTAATACACATTTCCGTCTAAATTGCTTCTAAATTTACAAC
Unaligned ( gi|40 ): TCGTGCGTGTACCGTGTTCTATCGTTTATCATGTCAAGAAT
Unaligned ( gi|41 ): ATGGAGGAAATACAAAAACAATAAAGTTGGATTAT