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gi|6 : a-AGAATTTA-G-AGGA-GT-T-CGA-GA--CAA-GTGATTT-GC------A-TAG--AAAT---C---C---ATAGTCCCAAGAG-CC-T--A-ACTCTTT---A---AAAACATTGGA-A-AG----G-C---T--CC--CTTT------------------AA-TA-TTTGC-ACAGTC-TCCAC--CTGT-GAT-C---TATC--C--GTG--CC----A-A-GT-TT-C--C-AAAA-TCCCAATTAACAACCCCC------A-AAGGGT-T-TAG--AGAGTTGGTGAAAGACA--gtgaaaggacagaca
gi|7 : CC-----------CCATAGGGTTTA-GGAGGA-GT-TGCGAAGA--TGAAGTATTTT-GC------A-TAG--AAA----ATCCT---A-AATCC-AAGGG-CCCT--A-ACTCCTT--AA---AAAACATCGGA-C-AA-C--A-C---T--CC--CCTT-------------G--C-AA-TA-T--GC-ACATTC-TCCACA-TTGT-GCT-C---TTTC--TTTGTA--CC----GTA-AT-TT-AATC-AAAA-T-CC-----------CCA------G-A-GGTT-T-TAGGA-GAGT
gi|8 : ACTGCATTCCCCTTGCAATATGCACACCTCCATATTCTGTTCTTTTT-TGTACCCAATTTCACTTAAAT-CCTT-----------CCA-AAGGTTT----AAGA-GT-TGCAAAAA--CAAAGGATTTT-GC------A-TAG--AAA----AACCT---A-AGTCC-AAGGG-CCCgagac
gi|9 : aGA-C-A--C--A-T---T--TC--CCTT-------------G--C-AA-TA-T--GC-ACA-TCTTCCACA-TC-T-GAC-T---ATTC--TTTGTA--CA----G-A-AG-TT-CATC-AAAA-CCCC-----------CCCCCCCCAA-A-GGGT-T---GGAGCA--T-GCG-AAGAGAGGA-AG-AG-A-AAG
blockSeqs : GCGCG T G T . TA . . . C G . . GT C T A T T . C AGTTTCATTATCAAAAATAA T G T G G G AC T GATAGA A GA TCCTAAA C G CTAAA CT T AAT G A TAA CCTG CA AA TATGGGCGTAATTG A C T TT C C C AA T T T GGG CT AG TATGA T A A T G AATTAACAACC CCCCCAA A GT G G A GG T C G G G A CAGAAGACGTAA AGTATACCGGT TC AGCGTC C C A T
blockSeqs : . A . . . . . ATTTCACTTAAATCCTT . G A . . . A . . . . ATCTAA . . CTAG CT T . . . GC TG . A GGC . . . . . G T A G . . A . A CGA . . G . . . CCCATA . TA C G . . . . . . . . CA TGGTGC T CCT C G .
blockSeqs : . G G . . . . . . . . TCACTA . . CTA TT T . . . C GC . . G . . . . . T . A G . . . . . GT . . . . . . AA . T A . . . . . . . . . C CAGC T . .
blockSeqs : . A G . . . . . . . . ATCCTA . . TA CT A . . . T C . . G . . . . . . . A G . . . . . A . . . . . . AC . T G . . . . . . . . . T CGT .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . AACCTA . . T C . . . . C C . . G . . . . . . . T G . . . . . A . . . . . . A . T G . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . ACCTA . . . T . . . . C C . . G . . . . . . . A G . . . . . A . . . . . . A . T G . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . ATCCT . . . . . . . . T C . . G . . . . . . . A G . . . . . A . . . . . . A . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TCCAT . . . . C C . . G . . . . . . . A . . . . . . G . . . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons : ATCCTA******** CTA*** CGGT********* T*
originalCons : AAAGATAGGGCACGCGCGCANGNCGGTTACATGATACGCCCGCATNNATGTATATTATTGACCCAGGGNCGCTAACTCCGTTAGAAAATATCGTAGACAGCATTCCCCTTGCANTATGCACATCTCCACATTGTGATCTTTTT-TGTA-CCA---------AAATCCCCC-----------CCA-AGGGTTTA-GGAGGA-GT-TGCGAAGA--CAAAGTATTTT-GC------A-TAG--AAA----A---C---A-AGTCC-AAGGG-CCCT--A-ACTCCTTTAAA---AAAACATCGGA-C-AG-C--A-C---T--CC--CCTT-------------G--C-AA-TA-T--GC-ACA-TC-TCCACA-TTGT-GAT-C---TTTC--TTTGTA--CC----A-A-GT-TT-CATC-AAAA-TCCC-----------CCC------A-A-GGGT-T-TAGGAGGAGTT-GCG-AAGACA--A-AG-TG-A-AAGGGAC-AGA-CGGAC-----------GACAG-------CGGT--ATAGCAT-AATA-CGCCGCTTTTTATGCCG-GCGTATATAAAT
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGCTATAGAGCAGTAATTGTCCCGCTTTATA
Alignments
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Reference ( family-570 ) : AAAGATAGGGCACGCGCGCANGNCGGTTACATGATACGCCCGCATNNATGTATATTATTGACCCAGGGNCGCTAACTCCGTTAGAAAATATCGTAGACAGCATTCCCCTTGCANTATGCACATCTCCACATTGTGATCTTTTT-TGTACC-------A---AAATCCCCC-----------CCA-AGGGTTTA-GGAGGA-GT-TGCGAAGA--CAAAGTATTTT-GC-A-TAG-AA----AATC-CTAA--GT-CCAA-GGGCCCT--A-ACTCCTTTAAA---AAAACATCGGA-C-AG-C--A-C---T--CC--CCTT-------------G--C-AA-TA--TGC-ACA-TC-TCCACA-TTGT-GAT-C---TTTC--TTTGTA--CC----A-A-GT-TT-CATC-AAAA-TCCC---------CCC------A-AGGGT-T-TAGGAGGAGTT-GCG-AAGACA--A-AG-TG-A-AAGGGAC-AGA-CGGAC-----------GACAG-------CGGT--ATAGCAT-AATA-CGCCGCTTTTTATGCCG-GCGTATATAAAT
gi|1 : AAAAATAGGGCAC-CAT-CAAGCCGGT-ACATGATACGCCCGCATACATGTATATTATTGACCCAGGGGCCCTAACTCCGTTAAAAAATATC--AGACAGCATTCCCCTTGTAGTATGCACATCTCCACATTGTGATCTTTCTCTGTACC-------A---AAATCCCCC-----------C-A-AGGGTTTA-GGAGGA-AT-TGCGAAGA--CAAAGTATTTT-GC-A-TAG-AA----AA---------GT-CTAA-GGGCCCT--A-ACTCCTTTAAA---AAAACATTGGA-C-AG-C--A-C---T--CC--CCTT-------------G--C-AA-TA--TGC-ACA-TC-TCCACT-TTGT-GAT-C---TTTC--TTTGTA--CC----A-A-GT-TT-CATC-AAAA-TCCC---------CCC------A-AGGGT-T-TAGGAGGAGTT-ACG-AAGACA--A-AG-TG-A-AAGGGAC-AGA-CGGAC-----------GACAG-------TGGT--ATAGCAT-AATA-CACCGCTTTTTATGCTG-GCGTATA-AAAT
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gi|14 : aAAGTATTTTTGC-A-TAG-AA----AATC-TAAA--GT-CCAA-GGGCCT-----ACTCC-TTAAA---AAAACACCGAAGC-AG-T--A-C---gt
gi|15 : aacAGGGAC-AGAACTGA------------AACAG-------CG-T--ATAGCA--AATAGCGTCA-TTCTTAAGTCGAGCGTATATAAAT
gi|16 : TT-GCG-AAGACA--A-AG-AG-A-AAGGGAC-AGA-CGGTC-----------TACA-------------------------------GCTTTTTATGCGG-GCGTATA
gi|17 : -AAGACA--A-TG-TG-A-AAGGGAC-AGA-CGGAT-----------GACAG-------CAGC--ATAACAT-AATA-Caatat
gi|18 : gttG-AAGACA--A-AG-TGGA-AAGGGAC-AGA-CGGAT-----------GACAGAGTATACCGGT--ATAGCAT-a
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): AAGCTATAGAGCAGTAATTGTCCCGCTTTATA