lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 111 1 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 1 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1111 1111 333333333333 11111 1111111111111111 22222222222222222 111 3333333333333333333333333333 55555555555555555555555555555555555 3333 22 33 33333333 444444 6666
lowQualScore : 6 00 44 000 3 66 5 8 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 33 2 0 5 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 4 0000 5 5 3 0000 7 111111111111 9999 11111 55 1 777 4 6666666666666666 4 66 4 22222222222222222 666 6 4 88 4 4 4444444444444444444444444444 44444444444444444444444444444444444 7 1111 6 22 6 55 55555555 4 3 0 6 1 3 666666 2 6 0000 6
lowQualScore : . .. .. ... . .. . . .......................................................................................... .. . . . ......................................................................................... . .... . . . .... . ............ .... ..... .. . ... . ................ . .. . ................. ... . . .. . . ............................ ................................... . .... . .. . .. ........ . . . . . . ...... . . .... .
lowQualScore : 0 77 00 000 9 99 0 6 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 88 2 8 7 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 8 6666 0 0 1 6666 6 333333333333 4444 11111 33 3 888 4 4444444444444444 4 11 4 00000000000000000 222 4 4 66 4 4 6666666666666666666666666666 11111111111111111111111111111111111 7 0000 0 00 0 77 33333333 0 7 7 0 0 7 333333 5 0 5555 0
consensus : GACCTGGTTCTG-AAGTAATA---CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAGGTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTCTNNTTNTAGAGTTATACCAG-TTTTTATGTTCATGGTCAGAG--AAGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAACCT--CTATCATATTTGTCAA----G-T-TATAT----CTGTTGAATTTTGGAATTAA--T---T----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---A-AAC---CCC-A--C-C-C-C-A--TT-TGA-----T--CCCCCCAAAATGT-ACCCTA-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCACATCTAGA-GA----TACATTGGC---C---TATCTTATCCT-GAATATCTAAT-AATTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GGGTGTCGGANANTTTTAGGTACGAGAAAGANGCGGA---ANAAGCGGAGAAATT---AGGAAACT
Reference ( gi|1 ) : GATTTGGTTCTG-CAGTAATA---CTA--ATTTT-CTATTCCAAGGTCAGAGGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGTGCTAGTTTTAAAGTTAGACCAG-TTTTTATGTTCATGGTCAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CTATCATATTTATCAA----G-T-TACAT----CTGTTGAATTTTGGAATTAA--T---T----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---A-AAT---CTC-A--C-C-T-C-A--TT-TGA-----T--CCCACCAAAATGT-GTCCTA-ACCCTTTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CGTTTCTGCACATTTACT-------TACACTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCTAAG-ACTTTCACCAATAGGTTGCGACGAAAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCATGAGAAAAAGGCGGAAGAAGAAGCGGGAAAATTACAAGGAGACTTCAGAAAGCAC
gi|2 : GACCTGGTTCTG--AACGATATAGCCA--ATTTT-ATGTTCTAAGTTCAGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TACCAGTTTTTGAGTTCTACCA----CTTATGTTCATGGTCAGAAATAAATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAACCTGTCTATCATATTTGTCAA----GATATACATGTATCT-TTGAATTTTGGAGCTAAATT---T----CCA----CAACAGCTAGAC-TTCTGAGTT---A-AGC---CCC-A--T-C-C-CTA--TT-T----------CCCA----AATGT-ACCCTA-ACCCACTTCAAT-CTGCAAAAAT----------TA---A---AAAACCATTTCTGCGCAATTAGA-------TTCA------------TA---AATCCTTGCATAATTAAT-CCTTTCATCAAC-GGTTACGGAGAA
gi|5 : aGACCTAGTACTG-AAGTAATA---CCA--ATTTTACTGT-CCAAGGTCAGAGGc
gi|6 : ATCTGGTTGTG-AAGTAGTG---TCC--ATTTT-GTTTTCCAAGATCAGAGATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTCTCTTTATAGAATTATACCAG-TCTGTATGTTTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccagtcctgcttataaacttacaccagttctcatgttcatggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctatcatatttgtcaacttatatattttaaattttagaattaatttttcccccatagagttctatgcta
gi|17 : catATCTGGTTCTG-AAG--ATA---CCACCATTTT-CT-TTCCAAGATCAGAagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatatttatcaagttaaatctgttgaattttgg
gi|10 : ncacTGGTTCTG-AAGTAATA---TTA--ATTTT-CTTTTCCATGGTCAGAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTCTCTTTCTAGAGTTATACCAG-TTTTTATGTTCAAGGGCAAA
gi|4 : caTGGTTCTG-GAATAACA---CCA--ATTTA-TT-TTACGAGGTCAGAAG
gi|3 : cGGTTCTGACA-CAATA---CCA--ATTTC-CTTTTCCAAGGTCAGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTCTTGTTTTAAAGTTAGTTAAGGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG----GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNNCATATTTATCGA----G-T-TACAT----CTGTTGAATTTTGTAATTCT--T---TTCC-CCC----CA-----TAGAA-TTCTATGTT---A-AAC---CCC-A--C-C-CAT-A--TT-TCA-----T--CCCCCTTAAATGT-ACCCTA-ATCCCCTTTAAT-CTG-AATA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCACATccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctaggactctcctatcatgtttctcaagttatacctgttgaatttgaaattattctttccccttagaattctattataatagaccaaattcattatgcactaaacaaccttcaatctgatacaaaatattttggcacttaactagatatatatattggccttctatcttaaga
gi|12 : acccA--ATTTT-CTGTTCCAAGGTCAGAGc
gi|5 : AGTCCTGCTTATAAACTTACACCAG-TTCTCATGTTCATGGTCAGAG-GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--CTATCATATTTGTCAA----C-T-TATAT----ATTTTAAATTTTAGAATTAA--T---TTTTCCCC----CA-----TAGAG-TTCTATGCT---A-annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatccacctcttttttaatgtttcaccagtttttatgctcatggtcaga
gi|12 : gacctagtactgaagtaataccaattttactgtccaaggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccTTTTAATGTTTCACCAG-TTTTTATGCTCATGGTCAGA
gi|7 : aattttctgttccaaggtcagagannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntatccacctcttCCAA-TTTTTATGTTCATAGTCAAAG
gi|11 : --CTATTATATTTGTCAT----G-T-TATAT----TT--TGAATTTTGGATTTAA--A---T----CCCCCCACA-----CAGAG-TTCTAAGTT---A-GAC---ACC-A--CTC-C-C-A--TT-TGA-----T--CCCCCC----------CC----CCCTCCTTAAT-CGG-AAAATTTTTTTTCTTTCA---A---AA-------TCTGCACAACTAGA-------TACATTGGT---CTGGTATCTgtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaattctttcatattttagaagctatatttaatgtattttgaaattaatatttctgaaaagacttctaagttgtattcaacccgcattacacagcccaaaaatgcgcccaaccactttcaatccgaaaacaaagtcattt
gi|4 : agaccctaggact--CTATCATGTTTCTCAA----G-T-TATAC----CTGTTGAATTT-GAAATTAT--TCTTT----CCC----CT-----TAGAA-TTCTAT--T---ATAATAGACCA-A--A-T-T-C-A--TTATG-----------CACTAAA---------CA-ACC---TTCAAT-CTG--ATA------------C----A---AAA--TATTTTGGCAC-TTAACTAGATATATATATTGGCCTTC---TATCTTA
gi|7 : ctggttctggaataacaccaatttattttacgaggtcagaagccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctaggactctc--CTTTCATATTTTAGAA----G-C-TATAT----TTAATGTATTTTGAAATTAA--TATTT----CTG----AA-----AAGAC-TTCTAAGTT---G-TAT----TC-AACC-C-G-C-A--TT-ACA-----CAGCCCA--AAAATGC-GCCC-A-ACCACTTTCAAT-CCG-AAAA------------CA---A---AGT--CATTTaga
gi|15 : ccaatttttatgttcatagtcaaaggtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaatt--CTACTATATGTGTCAATTAAG-T-TATGT----CTGTTGAATTTTGAA
gi|6 : ctcccagctgaaaacccaaggactctatCATATTTATCAA----G-T-TAAAT----CTGTTGAATTTTGGgggcattat
gi|14 : catatctggttgtgaagtagtgtccattttgttttccaagatcagagatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaactctctttatagaattataccagtctgtatgtttaagnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTGAATTTAGGAAT--------------CCC----CC-----TACAG-TTCTATGTT---A-AAT---CCC-A--C-CTT-C-A--TT-TGAACCCCC--CCCCCCCAAATGC-ACCCTA-ACCCCCATCAAT-CTG-AA
gi|13 : TTGACTTTTGGAAGTAA--T---T----TTT----CA-----GAAAACTTCTGCGTTGAGG-AAT---CAC-A--A-C-C-C-ATCTT-CGA-----A--C---CCAAAATGTAACCCTAGGCCCCCTTCAATCCTG-GAAA------------CATTCAATTAAA--CATTTCTGCCCA
gi|8 : --T---C----CCC----CA-----TAAAG-TTCTATGTT---A-AAC---CCCCA--C-C-T-A-A--TT-TGA-----T--CCTCCCAAAATGT-TTCCTA-ACCCCTGTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAG--CATTTCTGCACA---ACTGGA----TGCATTGGC---C---T------------AATATCTAAATAATTTCATTGAAGGGTTATG--GAGAATGAATAT-AGATATTTTTAGGTACAAGAAAGAAGCAGAAG
gi|9 : aattt-A--TT-TGA-----T--CCCCTCCAAATGT-GCCCAA-ACCCCTT-CAAT-CT--AAAA------------CT---A---ACC--CATTTCCGCACATCTAGA-------TACATTGGC---C---TATCATATCCTAGAATATCCAAT-AATTTCTTCAACAGGTTACAA-GAAAA-----GCTGAAGAATTTAAGGTGCGAGAAAAATGC------ACAAGTGGAAAAAT----AGGAAACT
gi|16 : caGAGAA-AGGTGTCGGACAGTTTTAGGCACGAAAAAGAGGCGGA---AGAAGCGGAGAAATT
Alignments
lowQualScore : 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2222222222222 11111 111 11111111 222222222222 333333 2222222222222222222 1 11 111 1111 2222 222
lowQualScore : 2 5 5 66 4 5 66 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 9 0 22 6 77 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 9999 0 9999 99999 6666666666666 8888 00000 4 0 777 4 4 44 444 55 2 22222222 5 44 99 4 4 4 888888888888 777 777 999 66 5 999999 6666666666666666666 0 3 2 00 777 9999 6 1 1 1 4444 1 0 7 333
lowQualScore : . . . .. . . .. .................................................................................... . . .. . .. . .............................................................................................. . .... . .... ..... ............. .... ..... . . ... . . .. ... .. . ........ . .. .. . . . ............ ... ... ... .. . ...... ................... . . . .. ... .... . . . . .... . . . ...
lowQualScore : 0 0 0 11 4 3 99 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 4 3 00 6 99 4 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 4 4444 9 4444 11111 1111111111111 5555 00000 0 3 000 4 4 66 777 55 5 99999999 7 55 77 0 0 0 999999999999 888 888 888 99 9 777777 0000000000000000000 0 0 0 88 666 0000 5 0 0 0 0000 0 7 3 333
consensus : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC----CT--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTGT-----TGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-AC-CC-C-A--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCT----AGATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
Reference ( family-524 ) : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAC----CT--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTGT-----TGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-AC-CC-C-A--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGT-ACCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ATCTAG--AGATACATTGGC---C---TATCTTATCCT-GAATATCT-AATAATTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GGGTGTCGGANANTTTTAGGTACGAGAAAGANGCG---GAANAAGCGGAGAAATT---AGGAAACT
gi|1 : GATTTGGTTCTGCAGTA-ATA-CTA--ATTTT-CTATTCCAAGGTCAGAG--GTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGTGCTAGTTTTAAAGTTA--GACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NNNNC-TATC----ATATTTATCAA----GTTACATCTGT-----TGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ATCTC-AC-CT-C-A--TTTGA-----TCCCACCAAAATGT-GTCCT-A-ACCCTTTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CGTTTCTGCAC--ATTT----ACTTACACTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AAGACTTTCACCAATAGGTTGCGACGAAAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCATGAGAAAAAGGCGGAAGAAGAAGCGGGAAAATTACAAGGAGACT
gi|10 : TGGTTCTGAAGTA-ATA-TTA--ATTTT-CTTTTCCATGGTCAGAA--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTCTCTTTCTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCAAGGGCAAAtcagaaagcac
gi|11 : ca----CT--C-TATT----ATATTTGTCAT----GTTATATT--T-----TGAATTTTGGATTTA---A---AT----CCCCCCACA-----CAGAG-TTCTAAGTT---AG-ACACC-ACTCC-C-A--TTTGA-----TCCCCCC---------CCC-----CCTCCTT-AAT-CGG-AAAATTTTTTTTCTTTCA---A---AA-------TCTGCAC--AACT----AGATACATTGGT---CTGGTATCT
gi|12 : agaccctaggaA--ATTTT-CTGTTCCAAGGTCAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCACCTCTTTTT-TAATGTTT--CACCAGTTTTTATGCTCATGGTCAGA
gi|13 : T-----TGACTTTTGGAAGTA---A---TT----TTT----CA-----GAAAACTTCTGCGTTGAGGA-ATCAC-AA-CC-C-ATCTTCGA--------ACCCAAAATGTAACCCT-AGGCCCCCTTCAATCCTG-GAAA------------CATTCAATTAAA--CATTTCTGCCC--A
gi|14 : T-----TGAATTTAGGAAT---------------CCC----CC-----TACAG-TTCTATGTT---AA-ATCCC-AC-CTTC-A--TTTGAACCCCCCCCCCCCAAATGC-ACCCT-A-ACCCCCATCAAT-CTG-AA
gi|15 : AAGGAC-----T--C-TATCTACTATATGTGTCAATTAAGTTATGTCTGT-----TGAATTTTGAA
gi|16 : ctcccagctgaaaacccTACGG--AGAA-AGGTGTCGGACAGTTTTAGGCACGAAAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAGAAATT---gggcattat
gi|17 : ATCTGGTTCTGAAG---ATA-CCACCATTTT-CT-TTCCAAGATCAGA
gi|2 : ncacGACCTGGTTCTGAACGATATAGCCA--ATTTT-ATGTTCTAAGTTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TACCAGTTTTTGAGTTC--TACCA---CTTATGTTCATGGTCAGAA-ATAAATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAC----CTGTC-TATC----ATATTTGTCAA----GATATACATGTATCTTTGAATTTTGGAGCTA---AAT-TT----CCA----CAACAGCTAGAC-TTCTGAGTT---AA-GCCCC-AT-CC-CTA--TTT-----------CCCAAA-TGT-ACCCT-A-ACCCACTTCAAT-CTGCAAAAAT----------TA---A---AAAACCATTTCTGCGC--AATT----AGATTCATAA----------ATC----CTT-GCATAATT-AATCCTTTCATCAAC-GGTTAC-G-GAGAA-
gi|3 : aACCCGGTTCTGACACA-ATA-CCA--ATTTC-CTTTTCCAAGGTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTCTTGTTTTAAAGTTAGTTAA-GGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-----GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NN--N-NNNC----ATATTTATCGA----GTTACATCTGT-----TGAATTTTGTAATTC---T---TTTCC-CCC----CA-----TAGAA-TTCTATGTT---AA-ACCCC-AC-CCAT-A--TTTCA-----TCCCCCTTAAATGT-ACCCT-A-ATCCCCTTTAAT-CTG-AATA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ATCc
gi|4 : CTGGTTCTGGAATA-ACA-CCA--A-TTT-ATTTTACGAGGTCAGAA--G
gi|4 : AGGACT---CT--CCTATC----ATGTTTCTCAA----GTTATACCTGT-----TGAA-TTTGAAATTATTCT---TT----CCC----CT-----TAGAA-TTCTATTAT---AATAGACC-A-------A--ATTCA-----TT--------ATGC-A--CTAA-ACAACCTTCAAT-CTG--ATA------------C----A---AAA--TATTTTGGCACTTAACTAGATATATATATTGGCCTTC---TATCTTAccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctaggactctcctatcatgtttctcaagttatacctgttgaatttgaaattattctttccccttagaattctattataatagaccaaattcattatgcactaaacaaccttcaatctgatacaaaatattttggcacttaactagatatatatattggccttctatcttaaga
gi|5 : ctggttctggaataacaccaatttattttacgaggtcagaagccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctGACCTAGTACTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTTACTG-TCCAAGGTCAGAG--Gaga
gi|5 : CAGTCCTGCTTATAAACTTA--CACCAGTTCTCATGTTCATGGTCAGAGGN--NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NN--C-TATC----ATATTTGTCAA----CTTATATATTT-----TAAATTTTAGAATTA---A---TTTTTCCCC----CA-----TAGAG-TTCTATGCT---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccagtcctgcttataaacttacaccagttctcatgttcatggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctatcatatttgtcaacttatatattttaaattttagaattaatttttcccccatagagttctatgcta
gi|6 : gacctagtactgaagtaataccaattttactgtccaaggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacATCTGGTTGTGAAGTA-GTG-TCC--ATTTT-GTTTTCCAAGATCAGAG--ATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTCTCTTTATAGAATTA--TACCAGTCTGTATGTTTA-------------AGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN----NN--N-NNNC----ATATTTATCAA----GTTAAATCTGT-----TGAATTTTGG
gi|7 : catCCAATTTTTATGTTCATAGTCAAAG-
gi|7 : AAGAACACAATT--C-TTTC----ATATTTTAGAA----GCTATATTTAA-----TGTATTTTGAAATTA---ATATTT----CTG----AA-----AAGAC-TTCTAAGTT---GT-ATTCA-AC-CCGC-A--TTACA-----CAGCCCAAAAATGC-GCCC--A-ACCACTTTCAAT-CCG-AAAA------------CA---A---AGT--CATTTgtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaattctttcatattttagaagctatatttaatgtattttgaaattaatatttctgaaaagacttctaagttgtattcaacccgcattacacagcccaaaaatgcgcccaaccactttcaatccgaaaacaaagtcattt
gi|8 : ccaatttttatgttcatagtcaaaggtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttcca---TC----CCC----CA-----TAAAG-TTCTATGTT---AA-ACCCCCAC-CT-A-A--TTTGA-----TCCTCCCAAAATGT-TTCCT-A-ACCCCTGTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAG--CATTTCTGCAC--AACT----GGATGCATTGGC---C---T------------AATATCTAAATAATTTCATTGAAGGGTTAT-G-GAGAATGAATAT-AGATATTTTTAGGTACAAGAAAGAAGCA---GAA
gi|9 : aattt-A--TTTGA-----TCCCCTCCAAATGT-GCCC--A-AACCCCTTCAAT-CT--AAAA------------CT---A---ACC--CATTTCCGCAC--ATCTAG--A--TACATTGGC---C---TATCATATCCTAGAATATCC-AATAATTTCTTCAACAGGTTACAA-GAAAA-----GCTGAAGAATTTAAGGTGCGAGAAAAATGC------ACAAGTGGAAAAA-T---AGGAAACTg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222222 2222222222222 11111 1 11111 222222222222 1111 1111111 1 11 111 1111 2222 222
lowQualScore : 2 5 5 66 4 5 66 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 6 0 22 6 77 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0000000 4 9999 0 9999 99999 6666666666666 8888 00000 4 0 777 4 4 777 3 55 00000 8 999 99 4 4 4 888888888888 777 777 999 66 1 4444 7777777 44444 3 0 1 2 00 777 5555 6 0 0 0 4444 7 333
lowQualScore : . . . .. . . .. ................................................................................ . . . .. . .. ........................................................................................ ....... . .... . .... ..... ............. .... ..... . . ... . . ... . .. ..... . ... .. . . . ............ ... ... ... .. . .... ....... ..... . . . . .. ... .... . . . . .... . ...
lowQualScore : 0 0 0 11 4 3 99 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 6 3 00 6 99 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7777777 4 4444 9 4444 11111 1111111111111 5555 00000 0 3 000 4 4 222 3 55 00000 1 111 77 0 0 0 999999999999 888 888 888 99 0 2222 5555555 44444 5 0 0 0 88 666 5555 5 8 2 2 0000 3 333
consensus : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC-C--T--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CC-CA--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
Reference ( family-524 ) : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC-C--T--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CC-CA--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
gi|1 : GATTTGGTTCTGCAGTA-ATA-CTA--ATTTT-CTATTCCAAGGTCAGAG--GTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGTGCTAGTTTTAAAGTTA--GACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--NNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNC-TATC----ATATTTATCAA----GTTACATCTG-----TTGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ATCTC-A-C-CT-CA--TTTGA-----TCCCACCAAAATGT-GTCCT-A-ACCCTTTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CGTTTCTGCAC--ATTTAC----TTACACTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AAGACTTTCACCAATAGGTTGCGACGAAAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCATGAGAAAAAGGCGGAAGAAGAAGCGGGAAAATTACAAGGAGACT
gi|10 : TGGTTCTGAAGTA-ATA-TTA--ATTTT-CTTTTCCATGGTCAGAA--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTCTCTTTCTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCAAGGGCAAAtcagaaagcac
gi|11 : caAGGAC----T--C-TATT----ATATTTGTCAT----GTTATATT-------TTGAATTTTGGATTTA---A---AT----CCCCCCACA-----CAGAG-TTCTAAGTT---AG-ACACC-A-CTCC-CA--TTTGA-----TCCCCCC---------CCC-----CCTCCTT-AAT-CGG-AAAATTTTTTTTCTTTCA---A---AA-------TCTGCAC--AACTAG----ATACATTGGT---CTGGTATCT
gi|12 : agaccctA--ATTTT-CTGTTCCAAGGTCAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCACCTCTTTTT-TAATGTTT--CACCAGTTTTTATGCTCATGGTCAGA
gi|13 : -----TTGACTTTTGGAAGTA---A---TT----TTT----CA-----GAAAACTTCTGCGTTGAGGA-ATCAC-A-A-CC-CATCTTCGA--------ACCCAAAATGTAACCCT-AGGCCCCCTTCAATCCTG-GAAA------------CATTCAATTAAA--CATTTCTGCCC--A
gi|14 : -----TTGAATTTAGGAAT---------------CCC----CC-----TACAG-TTCTATGTT---AA-ATCCC-A-C-CTTCA--TTTGAACCCCCCCCCCCCAAATGC-ACCCT-A-ACCCCCATCAAT-CTG-AA
gi|15 : AAGGAC----T--C-TATCTACTATATGTGTCAATTAAGTTATGTCTG-----TTGAATTTTGAA
gi|16 : ctcccagctgaaaacccTACGG--AGAA-AGGTGTCGGACAGTTTTAGGCACGAAAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAGAAATT---gggcattat
gi|17 : ATCTGGTTCTGAAG---ATA-CCACCATTTT-CT-TTCCAAGATCAGA
gi|2 : ncacGACCTGGTTCTGAACGATATAGCCA--ATTTT-ATGTTCTAAGTTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TACCAGTTTTTGAGTTC--TACCA---CTTATGTTCATGGTCAGAA-ATAAATANNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAC-CTGT--C-TATC----ATATTTGTCAA----GATATACATGTATCTTTGAATTTTGGAGCTA---AAT-TT----CCA----CAACAGCTAGAC-TTCTGAGTT---AA-GCCCC-ATC-CC-TA--TT--------TCCC----AAATGT-ACCCT-A-ACCCACTTCAAT-CTGCAAAAAT----------TA---A---AAAACCATTTCTGCGC--AATTAG----ATTCATAA---------------ATCCTTGCATAATT-AATCCTTTCATCAAC-GGTTAC-G-GAGAA-
gi|3 : aACCCGGTTCTGACACA-ATA-CCA--ATTTC-CTTTTCCAAGGTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTCTTGTTTTAAAGTTAGTTAA-GGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-----GNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--N-NNNC----ATATTTATCGA----GTTACATCTG-----TTGAATTTTGTAATTC---T---TTTCC-CCC----CA-----TAGAA-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CCATA--TTTCA-----TCCCCCTTAAATGT-ACCCT-A-ATCCCCTTTAAT-CTG-AATA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ATCc
gi|4 : CTGGTTCTGGAATA-ACA-CCA--A-TTT-ATTTTACGAGGTCAGAA--G
gi|4 : AGGACTC--T--CCTATC----ATGTTTCTCAA----GTTATACCTG-----TTGAA-TTTGAAATTATTCT---TT----CCC----CT-----TAGAA-TTCTATTAT---AATAGACC-A-------A--ATTCA-----TT--------ATGC-A--CTAA-ACAACCTTCAAT-CTG--ATA------------C----A---AAA--TATTTTGGCACTTAACTAGATATATATATTGGCCTTC---TATCTTAccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctaggactctcctatcatgtttctcaagttatacctgttgaatttgaaattattctttccccttagaattctattataatagaccaaattcattatgcactaaacaaccttcaatctgatacaaaatattttggcacttaactagatatatatattggccttctatcttaaga
gi|5 : ctggttctggaataacaccaatttattttacgaggtcagaagccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctGACCTAGTACTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTTACTG-TCCAAGGTCAGAG--Gaga
gi|5 : CAGTCCTGCTTATAAACTTA--CACCAGTTCTCATGTTCATGGTCAGAGGN--NNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--C-TATC----ATATTTGTCAA----CTTATATATT-----TTAAATTTTAGAATTA---A---TTTTTCCCC----CA-----TAGAG-TTCTATGCT---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccagtcctgcttataaacttacaccagttctcatgttcatggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctatcatatttgtcaacttatatattttaaattttagaattaatttttcccccatagagttctatgcta
gi|6 : gacctagtactgaagtaataccaattttactgtccaaggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacATCTGGTTGTGAAGTA-GTG-TCC--ATTTT-GTTTTCCAAGATCAGAG--ATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTCTCTTTATAGAATTA--TACCAGTCTGTATGTTT-----------A--AGNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--N-NNNC----ATATTTATCAA----GTTAAATCTG-----TTGAATTTTGG
gi|7 : catCCAATTTTTATGTTCATAGTCAAAG-
gi|7 : --T--C-TTTC----ATATTTTAGAA----GCTATATTTA-----ATGTATTTTGAAATTA---ATATTT----CTG----AA-----AAGAC-TTCTAAGTT---GT-ATTCA-A-C-CCGCA--TTACA-----CAGCCCAAAAATGC-GCCC--A-ACCACTTTCAAT-CCG-AAAA------------CA---A---AGT--CATTTgtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaattctttcatattttagaagctatatttaatgtattttgaaattaatatttctgaaaagacttctaagttgtattcaacccgcattacacagcccaaaaatgcgcccaaccactttcaatccgaaaacaaagtcattt
gi|8 : ccaatttttatgttcatagtcaaaggtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaat---TC----CCC----CA-----TAAAG-TTCTATGTT---AA-ACCCCCA-C-CT-AA--TTTGA-----TCCTCCCAAAATGT-TTCCT-A-ACCCCTGTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAG--CATTTCTGCAC--AACTGG----ATGCATTGGC---C---T------------AATATCTAAATAATTTCATTGAAGGGTTAT-G-GAGAATGAATAT-AGATATTTTTAGGTACAAGAAAGAAGCA---GAAG
gi|9 : aatttA--TTTGA-----TCCCCTCCAAATGT-GCCC--A-AACCCCTTCAAT-CT--AAAA------------CT---A---ACC--CATTTCCGCAC--ATCTAG----ATACATTGGC---C---TATCATATCCTAGAATATCC-AATAATTTCTTCAACAGGTTACAA-GAAAA-----GCTGAAGAATTTAAGGTGCGAGAAAAATGC------ACAAGTGGAAAAA-T---AGGAAACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2222222 2222222222222 11111 1 11111 222222222222 1111 1111111 1 11 111 1111 2222 222
lowQualScore : 2 5 5 66 4 5 66 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 6 0 22 6 77 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0000000 4 9999 0 9999 99999 6666666666666 8888 00000 4 0 777 4 4 777 3 55 00000 8 999 99 4 4 4 888888888888 777 777 999 66 1 4444 7777777 44444 3 0 1 2 00 777 5555 6 0 0 0 4444 7 333
lowQualScore : . . . .. . . .. ................................................................................ . . . .. . .. ........................................................................................ ....... . .... . .... ..... ............. .... ..... . . ... . . ... . .. ..... . ... .. . . . ............ ... ... ... .. . .... ....... ..... . . . . .. ... .... . . . . .... . ...
lowQualScore : 0 0 0 11 4 3 99 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 6 3 00 6 99 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7777777 4 4444 9 4444 11111 1111111111111 5555 00000 0 3 000 4 4 222 3 55 00000 1 111 77 0 0 0 999999999999 888 888 888 99 0 2222 5555555 44444 5 0 0 0 88 666 5555 5 8 2 2 0000 3 333
consensus : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC-C--T--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CC-CA--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
Reference ( family-524 ) : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC-C--T--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CC-CA--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
gi|1 : GATTTGGTTCTGCAGTA-ATA-CTA--ATTTT-CTATTCCAAGGTCAGAG--GTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGTGCTAGTTTTAAAGTTA--GACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--NNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNC-TATC----ATATTTATCAA----GTTACATCTG-----TTGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ATCTC-A-C-CT-CA--TTTGA-----TCCCACCAAAATGT-GTCCT-A-ACCCTTTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CGTTTCTGCAC--ATTTAC----TTACACTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AAGACTTTCACCAATAGGTTGCGACGAAAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCATGAGAAAAAGGCGGAAGAAGAAGCGGGAAAATTACAAGGAGACT
gi|10 : TGGTTCTGAAGTA-ATA-TTA--ATTTT-CTTTTCCATGGTCAGAA--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTCTCTTTCTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCAAGGGCAAAtcagaaagcac
gi|11 : caAGGAC----T--C-TATT----ATATTTGTCAT----GTTATATT-------TTGAATTTTGGATTTA---A---AT----CCCCCCACA-----CAGAG-TTCTAAGTT---AG-ACACC-A-CTCC-CA--TTTGA-----TCCCCCC---------CCC-----CCTCCTT-AAT-CGG-AAAATTTTTTTTCTTTCA---A---AA-------TCTGCAC--AACTAG----ATACATTGGT---CTGGTATCT
gi|12 : agaccctA--ATTTT-CTGTTCCAAGGTCAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCACCTCTTTTT-TAATGTTT--CACCAGTTTTTATGCTCATGGTCAGA
gi|13 : -----TTGACTTTTGGAAGTA---A---TT----TTT----CA-----GAAAACTTCTGCGTTGAGGA-ATCAC-A-A-CC-CATCTTCGA--------ACCCAAAATGTAACCCT-AGGCCCCCTTCAATCCTG-GAAA------------CATTCAATTAAA--CATTTCTGCCC--A
gi|14 : -----TTGAATTTAGGAAT---------------CCC----CC-----TACAG-TTCTATGTT---AA-ATCCC-A-C-CTTCA--TTTGAACCCCCCCCCCCCAAATGC-ACCCT-A-ACCCCCATCAAT-CTG-AA
gi|15 : AAGGAC----T--C-TATCTACTATATGTGTCAATTAAGTTATGTCTG-----TTGAATTTTGAA
gi|16 : ctcccagctgaaaacccTACGG--AGAA-AGGTGTCGGACAGTTTTAGGCACGAAAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAGAAATT---gggcattat
gi|17 : ATCTGGTTCTGAAG---ATA-CCACCATTTT-CT-TTCCAAGATCAGA
gi|2 : ncacGACCTGGTTCTGAACGATATAGCCA--ATTTT-ATGTTCTAAGTTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TACCAGTTTTTGAGTTC--TACCA---CTTATGTTCATGGTCAGAA-ATAAATANNNNNNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAC-CTGT--C-TATC----ATATTTGTCAA----GATATACATGTATCTTTGAATTTTGGAGCTA---AAT-TT----CCA----CAACAGCTAGAC-TTCTGAGTT---AA-GCCCC-ATC-CC-TA--TT--------TCCC----AAATGT-ACCCT-A-ACCCACTTCAAT-CTGCAAAAAT----------TA---A---AAAACCATTTCTGCGC--AATTAG----ATTCATAA---------------ATCCTTGCATAATT-AATCCTTTCATCAAC-GGTTAC-G-GAGAA-
gi|3 : aACCCGGTTCTGACACA-ATA-CCA--ATTTC-CTTTTCCAAGGTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTCTTGTTTTAAAGTTAGTTAA-GGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-----GNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--N-NNNC----ATATTTATCGA----GTTACATCTG-----TTGAATTTTGTAATTC---T---TTTCC-CCC----CA-----TAGAA-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CCATA--TTTCA-----TCCCCCTTAAATGT-ACCCT-A-ATCCCCTTTAAT-CTG-AATA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ATCc
gi|4 : CTGGTTCTGGAATA-ACA-CCA--A-TTT-ATTTTACGAGGTCAGAA--G
gi|4 : AGGACTC--T--CCTATC----ATGTTTCTCAA----GTTATACCTG-----TTGAA-TTTGAAATTATTCT---TT----CCC----CT-----TAGAA-TTCTATTAT---AATAGACC-A-------A--ATTCA-----TT--------ATGC-A--CTAA-ACAACCTTCAAT-CTG--ATA------------C----A---AAA--TATTTTGGCACTTAACTAGATATATATATTGGCCTTC---TATCTTAccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctaggactctcctatcatgtttctcaagttatacctgttgaatttgaaattattctttccccttagaattctattataatagaccaaattcattatgcactaaacaaccttcaatctgatacaaaatattttggcacttaactagatatatatattggccttctatcttaaga
gi|5 : ctggttctggaataacaccaatttattttacgaggtcagaagccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctGACCTAGTACTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTTACTG-TCCAAGGTCAGAG--Gaga
gi|5 : CAGTCCTGCTTATAAACTTA--CACCAGTTCTCATGTTCATGGTCAGAGGN--NNNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--C-TATC----ATATTTGTCAA----CTTATATATT-----TTAAATTTTAGAATTA---A---TTTTTCCCC----CA-----TAGAG-TTCTATGCT---Annnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccagtcctgcttataaacttacaccagttctcatgttcatggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctatcatatttgtcaacttatatattttaaattttagaattaatttttcccccatagagttctatgcta
gi|6 : gacctagtactgaagtaataccaattttactgtccaaggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacATCTGGTTGTGAAGTA-GTG-TCC--ATTTT-GTTTTCCAAGATCAGAG--ATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTCTCTTTATAGAATTA--TACCAGTCTGTATGTTT-----------A--AGNNNNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--N-NNNC----ATATTTATCAA----GTTAAATCTG-----TTGAATTTTGG
gi|7 : catCCAATTTTTATGTTCATAGTCAAAG-
gi|7 : --T--C-TTTC----ATATTTTAGAA----GCTATATTTA-----ATGTATTTTGAAATTA---ATATTT----CTG----AA-----AAGAC-TTCTAAGTT---GT-ATTCA-A-C-CCGCA--TTACA-----CAGCCCAAAAATGC-GCCC--A-ACCACTTTCAAT-CCG-AAAA------------CA---A---AGT--CATTTgtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaattctttcatattttagaagctatatttaatgtattttgaaattaatatttctgaaaagacttctaagttgtattcaacccgcattacacagcccaaaaatgcgcccaaccactttcaatccgaaaacaaagtcattt
gi|8 : ccaatttttatgttcatagtcaaaggtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaat---TC----CCC----CA-----TAAAG-TTCTATGTT---AA-ACCCCCA-C-CT-AA--TTTGA-----TCCTCCCAAAATGT-TTCCT-A-ACCCCTGTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAG--CATTTCTGCAC--AACTGG----ATGCATTGGC---C---T------------AATATCTAAATAATTTCATTGAAGGGTTAT-G-GAGAATGAATAT-AGATATTTTTAGGTACAAGAAAGAAGCA---GAAG
gi|9 : aatttA--TTTGA-----TCCCCTCCAAATGT-GCCC--A-AACCCCTTCAAT-CT--AAAA------------CT---A---ACC--CATTTCCGCAC--ATCTAG----ATACATTGGC---C---TATCATATCCTAGAATATCC-AATAATTTCTTCAACAGGTTACAA-GAAAA-----GCTGAAGAATTTAAGGTGCGAGAAAAATGC------ACAAGTGGAAAAA-T---AGGAAACT
blockSeqs : T T G CC A T AN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N A CT C GT ATAAATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN CTGT C TACT TTAA TATCT ATTTTTC CCCA ACAGC C GAG T C CT T TC ACCCC A TAA TA G C C TTTTTTTTCTTT TTC ATT AAC TT A ATAT CTGG ATCTT T A C A AG GG TGAA C G T .
blockSeqs : G . . . . G . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN C C TT T . GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN TCT . . . . TTTTCC . . . . . . TC A . . C CA T . . . AT . . A . A . CTTC ATCAT A . A G CA AA AGG T A . .
blockSeqs : C . . . . G . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N T AG T . AAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NN . . . . TTCTTT . . . . . . A G . . T TA T . . . . . . A . T . C . . . A A C G . . .
blockSeqs : T . . . . T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N G TG A . GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NN . . . . ATATTT . . . . . . C . . . A TA T . . . . . . A . A . C . G
blockSeqs : T . . . . T . NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN N A GC A . NN . . . . AATTT . . . . . . C . . . A CA T . . . . . . T . A . .
blockSeqs : T . . . . G . . CT . . T . . . . AAT . . . . . . C . . . C CG T . . . . . . G . T
blockSeqs : . . . . . T . T . . . . ATT . . . . . . C . . . . TT . . . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : CT***** ATNTTT******* GG*
originalCons : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC-C--T--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTA---A---TT----CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CC-CA--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
finalCons : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN--------NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGACCT-----C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTAATNTTT-------CCC----CA-----TAGAG-TTCTATGTT---AA-ACCCC-A-C-CC-CA--TTTGA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 2222222 11111 111 1 11111 222222222222 1111 1111111 1 11 111 1111 2222 222
lowQualScore : 2 5 5 66 4 5 66 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 6 0 22 6 77 0 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 0000000 4 9999 0 9999 999999 99 4 00000 55 777 0 222 4 777 3 55 00000 8 999 99 4 4 4 888888888888 777 777 999 66 1 4444 7777777 44444 3 0 1 2 00 777 5555 6 0 0 0 4444 7 333
lowQualScore : . . . .. . . .. ................................................................................ . . . .. . .. . ..................................................................................... ....... . .... . .... ...... .. . ..... .. ... . ... . ... . .. ..... . ... .. . . . ............ ... ... ... .. . .... ....... ..... . . . . .. ... .... . . . . .... . ...
lowQualScore : 0 0 0 11 4 3 99 00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 6 3 00 6 99 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 7777777 4 4444 9 4444 222222 55 0 00000 55 000 3 222 4 222 3 55 00000 1 111 77 0 0 0 999999999999 888 888 888 99 0 2222 5555555 44444 5 0 0 0 88 666 5555 5 8 2 2 0000 3 333
consensus : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC-C--T--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTAATNTTT-CCCCA-----TA--GAG---TTCTATGTTAA---ACCCC-A-C-CC-CATTT--GA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
Reference ( family-524 ) : GACCTGGTTCTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTT-CTNTTCCAAGGTCAGAG--GTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATNCANTTCTNNTTNTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--AGTANNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGGAC-C--T--C-TATC----ATATTTGTCAA----GTTATATCTG-----TTGAATTTTGGAATTAATNTTT-CCCCA-----TA--GAG---TTCTATGTTAA---ACCCC-A-C-CC-CATTT--GA-----TCCCCCCAAAATGC-GCCCT-A-ACCCCCTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ANCTAG----ATACATTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AATANTTTCATCGACGGGTTACGG-GAGAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCACGAGAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAAAAATT---AGGAGACT
gi|1 : GATTTGGTTCTGCAGTA-ATA-CTA--ATTTT-CTATTCCAAGGTCAGAG--GTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAGTGCTAGTTTTAAAGTTA--GACCAGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-A--NNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNC-TATC----ATATTTATCAA----GTTACATCTG-----TTGAATTTTGGAATTAAT---T-CCCCA-----TA--GAG---TTCTATGTTAA---ATCTC-A-C-CT-CATTT--GA-----TCCCACCAAAATGT-GTCCT-A-ACCCTTTTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAA--CGTTTCTGCAC--ATTTAC----TTACACTGGC---C---TATCTTATCCTAGAATATCT-AAGACTTTCACCAATAGGTTGCGACGAAAA-GAGTGTCGGATAGTTTTAGGCATGAGAAAAAGGCGGAAGAAGAAGCGGGAAAATTACAAGGAGACT
gi|10 : TGGTTCTGAAGTA-ATA-TTA--ATTTT-CTTTTCCATGGTCAGAA--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATTCTCTTTCTAGAGTTA--TACCAGTTTTTATGTTCAAGGGCAAAtcagaaagcac
gi|11 : caAGGAC----T--C-TATT----ATATTTGTCAT----GTTATATTT-------TGAATTTTGGATTTAA-ATCC-CCCCA-----CACAGAG---TTCTAAGTTAG---ACACC-A-CTCC-CATTT--GA-----TCCCCCC---------CCC-----CCTCCTT-AAT-CGG-AAAATTTTTTTTCTTTCA---A---AA-------TCTGCAC--AACTAG----ATACATTGGT---CTGGTATCT
gi|12 : agaccctA--ATTTT-CTGTTCCAAGGTCAGAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATCCACCTCTTTTT-TAATGTTT--CACCAGTTTTTATGCTCATGGTCAGA
gi|13 : -----TTGACTTTTGGAAGTAATTTTT-C----------A--GAAAACTTCTGCGTTGAGGAATCAC-A-A-CC-CATCTTCGA--------ACCCAAAATGTAACCCT-AGGCCCCCTTCAATCCTG-GAAA------------CATTCAATTAAA--CATTTCTGCCC--A
gi|14 : -----TTGAATTTAGGAAT---------CCCCC-----TA--CAG---TTCTATGTTAA---ATCCC-A-C-CTTCATTT--GAACCCCCCCCCCCCAAATGC-ACCCT-A-ACCCCCATCAAT-CTG-AA
gi|15 : AAGGAC----T--C-TATCTACTATATGTGTCAATTAAGTTATGTCTG-----TTGAATTTTGAA
gi|16 : ctcccagctgaaaacccTACGG--AGAA-AGGTGTCGGACAGTTTTAGGCACGAAAAAGAGGCG---GAAGAAGCGGAGAAATT---gggcattat
gi|17 : ATCTGGTTCTGAAG---ATA-CCACCATTTT-CT-TTCCAAGATCAGA
gi|2 : ncacGACCTGGTTCTGAACGATATAGCCA--ATTTT-ATGTTCTAAGTTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-TACCAGTTTTTGAGTTC--TACCA---CTTATGTTCATGGTCAGAA-ATAAATANNNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAGAAC-CTGT--C-TATC----ATATTTGTCAA----GATATACATGTATCTTTGAATTTTGGAGCTAA-ATTT-CCACAACAGCTA--GAC---TTCTGAGTTAA---GCCCC-ATC-CC-TATT----------TCCC----AAATGT-ACCCT-A-ACCCACTTCAAT-CTGCAAAAAT----------TA---A---AAAACCATTTCTGCGC--AATTAG----ATTCATAA---------------ATCCTTGCATAATT-AATCCTTTCATCAAC-GGTTAC-G-GAGAA-
gi|3 : aACCCGGTTCTGACACA-ATA-CCA--ATTTC-CTTTTCCAAGGTCAGAG--GNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTCTTGTTTTAAAGTTAGTTAA-GGTTTTTATGTTCATGGTCAGAG-----GNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--N-NNNC----ATATTTATCGA----GTTACATCTG-----TTGAATTTTGTAATTCTTTTCC-CCCCA-----TA--GAA---TTCTATGTTAA---ACCCC-A-C-CCATATTT--CA-----TCCCCCTTAAATGT-ACCCT-A-ATCCCCTTTAAT-CTG-AATA------------CA---A---AAA--CATTTCTGCAC--ATCc
gi|4 : CTGGTTCTGGAATA-ACA-CCA--A-TTT-ATTTTACGAGGTCAGAA--G
gi|4 : AGGACTC--T--CCTATC----ATGTTTCTCAA----GTTATACCTG-----TTGAA-TTTGAAATTATTCTTT-CCCCT-----TA--GAA---TTCTATTATAAT--AGACC-A-------AATT--CA-----TT--------ATGC-A--CTAA-ACAACCTTCAAT-CTG--ATA------------C----A---AAA--TATTTTGGCACTTAACTAGATATATATATTGGCCTTC---TATCTTAccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctaggactctcctatcatgtttctcaagttatacctgttgaatttgaaattattctttccccttagaattctattataatagaccaaattcattatgcactaaacaaccttcaatctgatacaaaatattttggcacttaactagatatatatattggccttctatcttaaga
gi|5 : ctggttctggaataacaccaatttattttacgaggtcagaagccaaggacacccgattactcatacctgtacactaattaattgatcatctcggtatcgtttctgagatcatgtcacaataactctgaaatcaaaattatgcaagatatcttcatgttcagatgtgaatcggtactagatcccttgacattgtacagaccttgccatttttcttccagctcgacaactctGACCTAGTACTGAAGTA-ATA-CCA--ATTTTACTG-TCCAAGGTCAGAG--Gaga
gi|5 : CAGTCCTGCTTATAAACTTA--CACCAGTTCTCATGTTCATGGTCAGAGGN--NNNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--C-TATC----ATATTTGTCAA----CTTATATATT-----TTAAATTTTAGAATTAATTTTTCCCCCA-----TA--GAG---TTCTATGCTAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnaccagtcctgcttataaacttacaccagttctcatgttcatggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnctatcatatttgtcaacttatatattttaaattttagaattaatttttcccccatagagttctatgcta
gi|6 : gacctagtactgaagtaataccaattttactgtccaaggtcagaggnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnacATCTGGTTGTGAAGTA-GTG-TCC--ATTTT-GTTTTCCAAGATCAGAG--ATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAACTCTCTTTATAGAATTA--TACCAGTCTGTATGTTTA-------------AGNNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-N--N--N-NNNC----ATATTTATCAA----GTTAAATCTG-----TTGAATTTTGG
gi|7 : catCCAATTTTTATGTTCATAGTCAAAG-
gi|7 : --T--C-TTTC----ATATTTTAGAA----GCTATATTTA-----ATGTATTTTGAAATTAATATTT-CTGAA-----AA--GAC---TTCTAAGTTGT---ATTCA-A-C-CCGCATTA--CA-----CAGCCCAAAAATGC-GCCC--A-ACCACTTTCAAT-CCG-AAAA------------CA---A---AGT--CATTTgtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaattctttcatattttagaagctatatttaatgtattttgaaattaatatttctgaaaagacttctaagttgtattcaacccgcattacacagcccaaaaatgcgcccaaccactttcaatccgaaaacaaagtcattt
gi|8 : ccaatttttatgttcatagtcaaaggtcagtgagactggactctcgtgacgttcaaaacagtttgttagtcatttccaaagaacacaatAATTTTC-CCCCA-----TA--AAG---TTCTATGTTAA---ACCCCCA-C-CT-AATTT--GA-----TCCTCCCAAAATGT-TTCCT-A-ACCCCTGTCAAT-CTG-AAAA------------CA---A---AAG--CATTTCTGCAC--AACTGG----ATGCATTGGC---C---T------------AATATCTAAATAATTTCATTGAAGGGTTAT-G-GAGAATGAATAT-AGATATTTTTAGGTACAAGAAAGAAGCA---GAAG
gi|9 : ATTT--GA-----TCCCCTCCAAATGT-GCCC--A-AACCCCTTCAAT-CT--AAAA------------CT---A---ACC--CATTTCCGCAC--ATCTAG----ATACATTGGC---C---TATCATATCCTAGAATATCC-AATAATTTCTTCAACAGGTTACAA-GAAAA-----GCTGAAGAATTTAAGGTGCGAGAAAAATGC------ACAAGTGGAAAAA-T---AGGAAACT