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consensus : NCTTGTT-CAT--------GCCATTCGGGCGGAATGACCTC-AGCN-AAATACGCATCCAGA-ATTTTTC-C--TTG------CTTTTCCTC--TCCG--CAT-CGGTC-G-AG-T-GAGCGN--T--GGTCAATAACCGC-TATT-----GTC-----ATGT---CCTCCCA--T-TTGT--GTC-------------A-----------TGCTCGGCGA-CGGGNTCTTTGGCNT--TTTTGGTTTCG--AT-GGT---G-GACC-GTG---GTTGTTGATCCTTCTGC-GNAGGTC--CCGNTTTTA-CCAACGT--ATTGTTN--GTN-A----C-AGACCTTA-CAGCTT---ATG-AGAT-------A---GA---TGCAGN--TGT---C-CGTGCG-ACAGG-ATGTNT---CC-CCCNA-ANAAT-TCGGTAGC-GT----CGG-CCG--GTG-A-CGGGGCT--CTT--AAA--ACTGTCCGCGCTNGCGTTGTGTT-TGC-N------C--AT------C--A----GGCA-----T----CATTCAGACA-N-GTTTT--AAAGCCC-C-CG----TTAGGTAAAG--GGTTNTCCAATTTGGTCCTCAC--CCA--CNA-TGTCCTTNANGTTTCTAGGNCGT-TTAA-A-G------NAGCC-NTGGCGGGCTCT--T--TGAAGA--CN-TCAGTCATTC-TTAA---------AGAAT-GGCAT--AGA-N-------------CTCTCTCAGAATAC-----T---TTA-AGGTCCTTNANGACGGGGTGGTACGT-AGTGT-ACCANTGGAACCCTGTCACCTTNCGATNTTTCT-TTATATTGTAGTGGGATTGTCTGTCCTGTTTTGACATTTCGTCAATTACAGCTTGCACTTTTGAGGCATCATAGCCTCTGTTACACAGATAATTCT
Reference ( gi|2 ) : TCTTGTT-CAT--------G------GGGCGGAATGACTTTGAACA-AAATAGGAATGCAGA-ATTTTTC-C--TTG------CTCATCCAC--TTCG--CAT-TGGT--A-AG-T-GAGTGC--T--GGTCAATAACCGC-TGTT-----ATC-----ATGT---CTTCCTA--T-TTGT--GTC-------------A-----------TGCTCAGCAA-CGGGTTCTTTGACAT--TTTTGGTTTTA--AT-GGT---A-GACCGGAA---GTTATTGATCTTTCTAC-GAAGGTC-GCCATTTTTA-CCTACGT--ATTGTTT--GTT-A----C-AGACCTTG-CAGTTT---ATG-AGAT-------A---GT---TGCAGT--TGT---C-CGTGCG-CAAGG-ATGTGT---CC-CCCAA-AGAAT-TCGGTAGC-AT----CAG-CCG--ATG-A-CAAGGCT--CTT--AAA--ACTGTCTGTGCTTGCACTGTGTT-TGC-T------C--AT------C--A----GGCA-----T----CA---AAACA-A-GTTTT--AAAGTTC-C-CA----TTGGACAAAG--GAATTTCCAATTTGGTTCGCAC--CCA--CAA-TGTCTTTGAAATTTATGAGACGT-TTAA-A-G------TAGTC-CTGGGAGAGTCT--A--TGACGA--TC-TCAGCCATTC-TT-----------AGGAT-GGTAT--AGA-A-------------CT---TCAGAAT-------T---TTA-AGGTCTTTAACGACGGGGTGGTACGTTAATAT-ACCAGTGGAACTCTGTCACCTACCAATTTTTCTGTTATATTATAGTTTCGTTGCCTATCGTGTTTTGACATCCCATCA---ACAGC-TGCTCT-----------ATAGCTCCTCTTA---AAATAATTTT
gi|17 : CTTGTT-CAT--------GTCATTCGGGCGGAATGACCCTCAGCTTAAATA-------------------C--TCT------CTC-TCCAC---------AT-TGGT--CCAG-T-GAGCGCCAT--GGTCA-TAACTG------------TC-----ATGT---CTTCCCA--T-GTGT--GT
gi|8 : gagcttagaccacattcattctggtgaaaccattaggTTGTT-CAT--------ACCACTCGGGTGGAATGACCT----CA-GTCTATGCATCCAGA-ATTTCTCGC--TTT------TT--TCCTC--TCCA--CAT-CGGTC-G-AG-T-GAGCGT--TATGGTCAATAACAAC-TACT-----GTC-----ATGT---CCTCCTA--T-TTGT--GTCCTGCGAGATTGAAA-----------TGCTTGGCAA-CGAGTTCCTTGGCCC--CTTTATTTTTT--ATAGGT---G-G-----------TTATTGATCCTTCTTC-GTAGGT----------TC-CCTATGT--ATTTTTG--GTC-A----C-ATACCTTG-CAGCTT---ATG-AGAT-------A---GA---TACAGG--TGT---C-TATGCG-ACAGG-ATGTCT---TC-CC--A-AGAAT-TCGGTAGC-AG----AGG-CCGCAATG-G--GAGGTT--Cgacattcgaattccaacgcttggta
gi|5 : atgaattcattccggtaaagtctttgtgtTTGTT-CATTCCGTCTAG------AGGCGAAATGATTTCAAGCG-A--T--GCATACAGG-ATTTTTC-C--TTG------CTTTTCCTC--TCTG--CAT-CGGTCCA-TGTT-GAGTTA--A--GATCGATAATCAC-
gi|15 : aattccactcaactagtctgtactaacccacacatttgcttcgttaatatgagtaagtatatcaggaacgacgtatcaaatctttacatagatgtaatattgttaactcgtaccaaagtagacataagagaagaaaagatgggggtagagagaaaaggatttttaaaaaatgagggggacagaaagaaagaaaaaggaggaatagtaagagaaggagaaatgaaataatgtaaaaaaaaaaaccaatttaaaaaaaagggtgtttaatttaaatttgaaggaagcttaatgtagggttgatgagctagagggtaaatgccggcgttgaactgtagggattgacaaggattcatgcgcacgaaatcccacattcagtTTGTTGCAT--------GCTATT-GGGCGGAATGACCTC-AACC-TAATACG-ATTCAGATATGTTTC-C--GTG------TTTTTC------TCT--CAT-CGGca
gi|16 : tgaataaaatgaatttaaagaatgatgccgaggaccaaagaatgaatgttcgaacccccccccccccccccccccccccccccccaggacaaacagagtattcactagcgaagctaggccatattcattctggtcaatcattaggtATCCAGA-ATTTTTC-CCTTTG------CTTTCTCTC--TCAG--TATCTGACC-A-AC-TAGGGTCA--T--GGTCAATAACCAC-TATT-----GTC-----ATGT---CCTACCA--T-atgaat
gi|1 : tggttaaagtaaaaaaagtaataaaatgctaaacaaacgagtagatgaactcataatctgggtttaccccatgttcattctgataaagtcggtaagttagttgataccttgagattcaaatgacattaatctgtgcAGA-ACTTTTC-C--TTATTTTTCCTTCTCCACGTTCCGCCCAT-TG------AG-A-GATTA---T--GGTCAATGACCAC---TT-----ACCTGACAATATTCCCTTTCCAGGC-TCGTTGACC-------------ATTAAGATTAAGTGTTCAACGACCGGGCTC-TTGGTTT--TTTTGACGGCAATAT-GGT---AGGATC--AATTGGTTGTTTATCTCTTGGCGGAATGTCAGCCGTTTTGT-CCAAGAT--ATAGTTT---TG-AG---CAAAACCTTA-CAACTTGGGATGAAGATTAACACCA---GG---TACCGT--TGTAGAT-TGTG-A-CAAGACGTGTGTTTACCGCCTCA-ATATT-TTGTTGG--AT----CAA-CGA--ATA-ATTGGGGCT--AGT--AAATTA-TGCCC-TGTTTG-GTGGTATG-TGC-TA-----C--ACAAAAAGC--ATGTTGACA-----T----CG---AAACAGA-GTTTTTAAAAG--CAC-CA----TTGG
gi|11 : tttatatccatgcaggttgaatatttggagcgcctgtgcatctca--T--AGTGAATTACCAC-TACT-----GTC-----ATGC---ATTCCTA--T-TTGT--GT--------------------------------GCGG-TGAGAT---TGAAAT--TCTTGACCACA-----GGTCCTA-GACCAGTG---TTTATTGATC-----------------CCAC---------ACGT--ATTGTTT--GTA-ATGTTC-AGATCTTG-CAGCTA---GTG-AGAA-------A---GA---TATAGG--TGT---C-CGTACG-ACAGA-ATGTGT---CC-CC--A-TGAAC-TCGGTAGG-AT----CGT-CTG--GTG-A-CAGGGCG--CTT--CAA--ggtaacatcggttgtttaattggccctcatcccattgctcccttgtatagtgtcctaggccgtcaaattggcagccattggtggagcttctgaaaagatccgcccttttttcacttatttgtgaaagaaaggcaggaattcgctcgctttaaggattagtctgttaaggagtctttaaggaccccgggattgaatgttcatgtgacaagtagaac
gi|27 : CCGCATGTTTTTCCATT-----ATAT---CCTGCGA--TATTGA--AT--------------------------TGCTCTGTAA-CGCGGTCTTT--CATCCTTTTGGTTTTG--AT-GGT---A-gaattcggtagaatcgggtgatcacagggatcttgaaactctctgcgctcgctctatgtttgcacgtatcaagaat
gi|4 : atatctactactgGGGTTCTTT---------TTG----TC--AT-GGT---G-GATCTGTG---GTTGTTTATGCTTCGGC-GGATGTC-TCT-CCTGTATCCAACAT--ATTGCAC--TCT-G----C-AAACCTTA-CAACTG---ATG-AGAT-------A---AA---CACAGC--TGT---C-TGTGTGACAA-G-ACATGT---TG-CGCAATATTATATAGGT-GCGAT----C---CT----TA-A-TGGGGCT--AGT--AAC--TCTGTCCACGT---CA--GTGTCGTGC-T------T--A-------C--A------------------CA---A---A-A-GTTTT--AAAGCCA-C-CA----ATAGGTAATG--GGTTGTCTAATTTGGCTCTCACTGCCA--C----GTCCTTTAAGGTCTTAGGCCGT-TTAA-ATG------CAGCCATTGGTGGATCCTTCAATTGGTGGATTCTTTAATTATTG-TGA----------AGAATAGGCAT--AT--T-------------CTCTCTCAGAATGC-----T---GTAGAGGTTCTTAACGACGGGGTGA------AATGTCACAAGTGTAACCCTagtatcgat
gi|6 : tgaccattaagattgaagttttccacgacgtttttttttgggggggggtggtgag--TTTTTGTTTTG--TT-AGA---G-GACCGGTG---ATTGTTGACCCGTTTGC-GAAGGTCTGTTGTTTCT--TCTACAC--ACTGTTTCCGT-------C-AGACATCA-CAACTG---AGG-AGAT-------ACATGTAGATGCAGT--TAC---T-AGTTTT-GAAGGAAAATTT---CC-CCCCA---AAT-CTTATAGC-TA----CGA-CCT--GTG-A-CAGGACT--GTT--AAA--ACTCTCAGTGTCTGAGCTATATT-TGCATAATTGAC--AT------CTGA----GG-------T----CT---GGACA-G-GTTTT--GAAATCT-C-CA----TTATGTAAAG--GGTTATCCAGTCTAGTCCTTG---CTA--CCA-TGTCCCTCGTGTTTCTAGCGCGTGTGAA-A-GATGCCATAGTC-CTGAT-GATTCT--T--TGAAAA--CA-TCAGCCATTCGTTTACTGACATGGAGAAT-GG--C--AGATG-------------CTTTCTCAGAATACCGTTGC---TCA-GGGTC-TTGAGGGCGAGTTGGTAAG-TAGTG--ACTAGTCGAACCCAGTCATTTTGAAGTTTTTCacaattctctttttttctcaatgtattgcaaa
gi|14 : ATTGATCCT-CTAC-GTAGGTC-CCCAGTTTTA-CCAACGTGTATTATTG--ATC-A----C-AGACCTTA-CAGCTT---ATG-AGGT-------A---GA---TGCATTAGTAT---CTCG-GCG-ACAGG-ATGTTT---TC-CCGTA---AAT-T---TAGC-GTAGTGCGGTCCT--GTG-A-C-AGGCTTCCTTA-AAA--ACTGTTTGTGCTAGCATTGTG-T-TGC-A------C--AT------C--T----GGCA-----TTCTCCATTCAGACA-T-GTGTT---AAGCTC-C-CGCGGTTTAGTGAAAC--GGGTTTC--ATTTAGTCCGCAT--TCA--aaaa
gi|13 : ATTGATCCT-CTAC-GTAGGTC--CCAGTTTTA-CC-ACGTCGATTATTG--ATTCA----C-AGACCTTAACAGCTT---ATG-AGGT-------A---GA---TGCATA--TAT---CTCGTGCG-ACAGG-ATGTTT---TC-CCTAA-AT--T-TAGGTAGT-G-----CGGTCCT--GTGTA-CCAGGCT--CCTTAAAA--ACTGTTTGTGCTAGCATTGTG-T-TGC-A------C--AT------C--T----GGCAATTTCC----CATTCAGACA-CTGTGTT---AAGCCC-CGCG----TTTAGTGAAACCGGGTTTCC-ATTTAGTCCGCAT--TCATCCGA-TG
gi|11 : A-AGAAT-TCGGTAGA-AT----CGG-GTG--ATC-A-CAGGGAT--CTT--GAA--ACTCTCTGCGCTCGCTCTATGTT-TGC-A------CGTAT------C--A----AGAA-----T----
gi|10 : tagtgaattaccactactgtcatgcattcctatttgtgtgcggtgagattgaaattcttgaccacaggtcctagaccagtgtttattgatcccacacgtattgtttgtaatgttcagatcttgcagctagtgagaaagatataggtgtccgtacgacagaatgtgtccccatgaactcggtaggatcgtctggtgacagggcgcttc----TTAGATAGAG--GATTGTCCAACCTGGCCTTTAC--C-A--CAAATATCCTTGATATTTCTGGGTCGT-TTAA-A-G------
gi|23 : ctatgggttcagtcacgcgttcggttttgatggatgatcggtgcagttgttgattctcaacccctaatatttgtaatttcctcaatacgtatgttgttgggcgcattgtttactgttgttgaggtatatgcaattgttggttttgcaggagagttgatccaatatttttttgagttttgcttgtagtgaagccttgggacgtttctgaatccaggctaaatttgcagagtatgagagaagctgaaaagcttaag--GATTTTCCACTTTGGTTCTTAC--C-A--CCA-TGTCTTTAAGATTTCTTAGACGT-CTGATA-G------AAGGC-ATAGCAGGCTTT--T--TGAAGA--CC-TTGGTTA-GC-ATAA---------AGAAT-AATAT--GGT-T-------------CT---TCAGAAT-------TCCGTTA-AGATggcaccattggcgg
gi|18 : atAGCC-ATAGGTGGCTCT--T--TGAAAA--CA-TCAGTCATTC-TT-----------TTATT-GGCATGAAGA-ATGGGGATATGTTTCT---TTAGAATAG-----TG--TTG-AGATCCTTCAAAACCGGGTGGTATGT-GGTG--ACCATTGGGACTCTGTCACCATTCGATCTTTCT-TTATATT
gi|12 : GACATGATGGTACAT--ATTT-ACCACTGG------------TACCGACATCTCT-TTATATTGTAGTGGGATTGTCTGTCCTGTTTTGACATTTCGTCAATTACAGCTTGCACTTTTGAGGCATCATAGCCTCTGTTACACAGATAATTCgcaaaagg
12 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|3 ): CACATTAATAGAAATTATATAAAGACTGGTTAGAAACTAGACCCCAAACATTAGCTTCATTCATACGGTATGTACACCAAAAGAACGACATATCAAATTTTACTGCATAGAAGATGTATTATAGTTAACTCGTACAACAGTAAGTAACCAGAAGAAAAATTGGGTGGGGGTGAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGAGTAAGAGAAAGTAAAAAAAAGTATTTTATTGATGTTATAAAGGGCAAAAACAAAAAAACCCAAAAAAAAAAAACCCACATTTCTTAAATAATAGATAAGTATAATTTTAAATTTGAAAAAAAATAAGGGGGGGGGGGTTAAAGAAAAATGATGCCTAATTGAAATATGAAGGAAGCTCAATGTAGGGTTGCTGGGCTGGAGGCTAGTGCCGGTGTTAGGCTGTAGGGGTTTAGCAAGGGGATTCATGGCACGAAAAAAAATATCATTCACTTTTGTTCATTCCATCTGGGCGGATGATTTCAAAAGCGATGCATCCATGATTTTTATCCCCTGACTTTTCCTCTCTTGCATCGGTCCATTGTTGGGTTATGAATCGAGCACCCCACCT
Unaligned ( gi|7 ): CCACAGGTTCAGTGACGCGCTCGTTTGGTTTTTGATAGTGGATCGAATGGTTTGTTGATCCTAAGTCTTGTATTGGTGGTTTCCCAACAGTATTGTTTGCCACATCGTTTAGCAAATGTGATGAGGGTATATAGTTGTTGGTGTTACAGGAAAACTGGCCCAATTATTCTATAAATTTTTCCTTGTGGTATTAACTCTGAAATGAGTCTCAGTCTTTTCTGGGTATATTTCAGAGTAGGGGCCCGTGAGTTAGTAGCAAAGTGGAAAATCCCCCTGTGGGTAGGGGATTAAATCCAGTCTGGTCCTTACCAACAAGGTCCTTGATATTTCTGGGCCGTCTGAAGGACACTATAG
Unaligned ( gi|9 ): TTCTCCTACATGTATGTACATTTTTTCGCAGACACCGTAACTCATGAGATCAAAGCAGACATTAGTTTTGCCACCCCATTTACTGCAACCTGCAACAGAACTGCTAAGCGGTTTTTGTCTATGCTATTTTAAAATAATTTATGTCTGAGAACTGGGTATGTTTTGAAACTTCTATATTAGGTAAAAGACTAGCCACTATGTACCGATGCCCCAGGTTTCTGGGGTGAGTGAAGGATGGAATACGAAGTTTCTTGAAACCATCAGTCATCCGTTTATTGATAGAGAGAATATAGGATGCCTCCTCGGAAAATACTATCTTAAGGGCTGGATGTTAAA
Unaligned ( gi|19 ): GTAGAGAAGTTTTGGAATGTCTCTGTATCCTGCAAAGCAAACAGCGCATACCAGAGGAAGTTGAAAAGCGTCCATAGTATAAAGCGTTGTCCAATCTGACCTTTACCACAGAATTTTTGATATTCCGGGGTCGTATAAAGGGCACCTTTAGGGGTTC
Unaligned ( gi|20 ): TTGTTCATTCCATCTGGGCGGATGATTTCAAAAGCGATGCATCCATGATTTTTATCCCCTGACTTTTCCTCTCTTGCATCGGTCCATTGTTGGGTTATGAATCGAGCACCCCACCTGCATATCTTCCAAATGTGCCTCACTGTTGAAGTGTTCTC
Unaligned ( gi|21 ): TATGTTTTTGCAACACTGTTTGCATCTGATAAAGTATATAAAATTGTTGGTTATACAGGAGAGTAAAGCCAATGTTTTGTAAGATTCTCCTCTAGTGAAGCTGTGGAGCGATTCTAAATCCTGGCTAAATTCACAAAGCA
Unaligned ( gi|22 ): GGAATGTTTCTGTATCCTGCAAACAGTGCTTATCAGAGGAAGTTGAAAAGCGTCCATAGGGTAAAGCGTTGTCCAATCTGACCCTTACCACAGAATTTTTTATATTCCGGGGTCGTCTAAAGGGCACCTTTAGTGGTTC
Unaligned ( gi|24 ): AATCTTGGTTGGTTTTGACAGAAGATGGGTGGTTGTGGCCCGTTTACAGTGGGCTACTGTTTCTATGCACTGTACATGTTTTTGGCAGACTTTACAACTGATAATGATATTCTAGGAAGAAAAAGTCCCCCA
Unaligned ( gi|25 ): AAATAAAGCGTCTAATATTGAGGGAAATTCCGTGCGTTTTAAACACACAATTAGTCTGAACTAACCCAAACATTTGACTTTGTTAAACGAATAAGTCAGGAAAACTATTCAATCATAAATAATATAGTCAA
Unaligned ( gi|26 ): AAATAAATCTTCAACACATTAAAGGAAATTCCACTCAACTGGTCTGAACTAACCCAAACATTTGCTCCATAATTCGAGTAAGTACATCAGGAACGACTTATCAAATCACTACATAAATGTAG
Unaligned ( gi|28 ): ACTCATTCGGGTGACGTCATTGAGTTTGTTTATCCCACTGGGGCGAAATTACTTCATACTTAGTCTATATATCCAGGAGTTTTTTCTTTCTTCCTC
Unaligned ( gi|29 ): TGCATCAGTCCATGTTGGGTTATAATTTGCATGTCTTGCCAAACGTGCCCTTCTTTGTTGCAATGTTCTCC
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Reference ( family-523 ) : NCTTGTT-CATGCCAT-TCG-GGCGGAATGACC-TC-A-GCN-AAAT-ACGCATCC--AGA-ATTTTT---C-C--TTG-CTTTTCCT-CTC-CGCAT-C-GGTCGA-G-T-GAGCGN--T---GGTCAATAACCGCT-----------ATTGTCATGTCC----TC-----CCAT-TTGTGTC-------------A--TGCTCGGCGAC-GGGNTC-TTTGGCNTTTTTGGTTTC-G-----AT----GGT-GGACC-G--TG--GTT-GTTGATCCT---TCTGC-GNA--G-G-TC--C--C-GNTTTTA-C-CAAC-GT--AT-TGTTNGTN-A----C-AGACCTTA-CAGCTT---ATG-A-GAT-------A------G---ATGCA--GNTGTC-CG--TGC-GACAGGATGTNT-----CC-CCCNAANAATTCGGTAGCGT----CGG-CCGGTG-A-CGGGGCTCTT--AAA--ACTGTCCGCGCTNGCGTTGTGTTTG---CNC--ATCAGGCA-----T-----C----ATTCAGAC-A-NG--TTTTAAAGCCCC-CG----T--T-AG-GTAAA---G--GGTTN--TCCAATTTGGTCCTCA-CC-CA--CNATGTCCTT-NA-NGT-TTCTAGGNCGT-TTAA-A---GNAGCC-NTGG----CG--G-GCTCTT-------TGAAGACNTCAGTCATTC--TT-------------A--------AAGAAT-GGC-ATAG---A-NCTCTCTC------AG--AA-TA--C--T---T--TA-AG--GTCCTTNANGA---CGGGGTGGTACG-T--A-GTGT-ACCANTGGAACCCTGTCACCTTNCGATNTTTCT-T--TATATTGTAGTGGGATTGTCTGTCCTGTTTTGACATTTCGTCAATTACAGCTTGCACTTTTGAGGCATCATAGCCTCTGTTACACAGATAATTCT
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gi|3 : atatctactactgccgcatgtttttccaTTGTT-CATTCCAT-CTG-GGCGG-ATGATT-TC-A---A-AAGCGATGCATCC--ATG-ATTTTTATCC-C--CTGACTTTTCCT-CTCTTGCAT-C-GGTCaagtatcgat
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gi|7 : C-------------A--GGTTCAGTGAC-GCGCTCGTTTGG--TTTTTG------------AT----AGT-GGATC-GAATG--GTTTGTTGATCCTAAGTCT-T-GTATTG-G-T--------GGTTTC--C-CAACAGT--AT-TGTTTGCC-A----C---ATCGTT-TAGCAA---ATG-T-GATG------A------GGGTATATA--GTTGTT-GG--TGT-TACAGGAaaaa
gi|7 : ccaAAATCCCC-CT----G--T-GG-GTAGG---G--GATTAAATCCAGTCTGGTCCTTA-CC-AA--CAAGGTCCTT-GA-TAT-TTCTGGGCCGT-CTGA-A---GGAaaactggcccaattattctataaatttttccttgtggtattaactctgaaatgagtctcagtcttttctgggtatatttcagagtaggggcccgtgagttagtagcaaagtggaaaatccccctgtgggtaggggattaaatccagtctggtccttaccaacaaggtccttgatatttctgggccgtctgaaggacactatag
gi|8 : ccacaggttcagtgacgcgctcgtttggtttttgatagtggatcgaatggtttgttgatcctaagtcttgtattggtggtttcccaacagtattgtttgccacatcgtttagcaaatgtgatgagggtatatagttgttggtgttacaggaaaactggcccaattattctataaatttttccttgtggtattaactctgaaatgagtctcagtcttttctgggtatatttcagagtaggggcccgtgagttagtagcaaagtggaTTGTT-CATACCAC-TCG-GGTGGAATGACC-TC-A-GTC----T-ATGCATCC--AGA-ATTTCT---CGC--TT---TTTTCCT-CTC-CACAT-C-GGTCGA-G-T-GAGCGT--TAT-GGTCAATAACAACT-----------ACTGTCATGTCC----TC-----CTAT-TTGTGTCCTGCGAGATTGAAA--TGCTTGGCAAC-GAGTTC-CTTGGCCCCTTTATTTTT-T-----AT----AG--------G--TG--GTT-ATTGATCCT---TCTTC-GTA--G-G-TT--C------------C-CTAT-GT--AT-TTTTGGTC-A----C-ATACCTTG-CAGCTT---ATG-A-GAT-------A------G---ATACA--GGTGTC-TA--TGC-GACAGGATGTCT-----TC-CC--AAGAATTCGGTAGCAG----AGG-CCGcactatag
gi|9 : atgaattcattccggtaaagtctttgtgt-A-TG--TTTTGAAACTTC-TA----TATT-AG-GTAAA---A--GACTA--GCCACTATG-----TA-CC------GATGCCC---CA-GGT-TTCTGGGGTGA-GTGA-A---GGA-----TGGAATACG--AAGTTTCT-------TGAAACCATCAGTCATCCG-TTTATTGATAG----A--------GAGAAT-----ATAGGATG-CCTC-CTC------GGAAAA-TA--C--TATCT--TA-AG--Gcaatgggaggttc
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|29 ): TGCATCAGTCCATGTTGGGTTATAATTTGCATGTCTTGCCAAACGTGCCCTTCTTTGTTGCAATGTTCTCC
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gi|8 : ccacaggttcagtgacgcgctcgtttggtttttgatagtggatcgaatggtttgttgatcctaagtcttgtattggtggtttcccaacagtattgtttgccacatcgtttagcaaatgtgatgagggtatatagttgttggtgttacaggaaaactggcccaattattctataaatttttccttgtggtattaactctgaaatgagtctcagtcttttctgggtatatttcagagtaggggcccgtgagttagtagcaaagtggaTTGTT-CATACCAC-TCG-GGTGGAATGACC-TC-A-GTC----T-ATGCATCC--AGA-ATTTCT---CGC--TT---TTTTCCT-CTC-CACAT-CGGTCGA-G-TGAGCGT--TAT-GGTCAATAACAACT-----------ACTGTC--ATGTCC----TC-----CTATT------TGTGTCCTGCGAGATTGAAA--T------GCTTGGCAAC-GAGTTC-CTTGGCCCCTTTATTTTT-T-----AT----AG--------G--TG--GTT-ATTGATCCT---TCTTC-GTA--G-G-TT--C------------C-CTAT-GT--AT-TT---TTGG--TCA----CATA-CCTTG-CAGCTT---ATGA-GAT-------A------G---ATACA--GGTGTC-TA--TGC-GACAGGATGTCT--------TCCC-AAGAATTCG-GTAGCAG-AGG-CC-GCA-AT-GGGcactatag
gi|9 : atgaattcattccggtaaagtctttgtgt-A-TG--TTTTGAAACTTC-TA----TATTAG-G-TAAA---A--GACTA--GCCACTATG-----TA-CC----GATGCCC--CAGGT----TTCTGGGGTGA-GTGA-A---GGA-----T-GGAATACGA-A-GTTTCTTGAAACCATCAGT---CATCCGTTTATTGATAG----A---------GAGAAT-----ATAGGATG-CCTC-CTC------GGAAAAT-A--CTAT------------CTTAAGGG---CTGGATGTTAaggttc
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gi|8 : ccacaggttcagtgacgcgctcgtttggtttttgatagtggatcgaatggtttgttgatcctaagtcttgtattggtggtttcccaacagtattgtttgccacatcgtttagcaaatgtgatgagggtatatagttgttggtgttacaggaaaactggcccaattattctataaatttttccttgtggtattaactctgaaatgagtctcagtcttttctgggtatatttcagagtaggggcccgtgagttagtagcaaagtggaTTGTT-CATACCAC-TCG-GGTGGAATGACC-TC-A-GTC----T-ATGCATCC--AGA-ATTTCT---CGC--TT---TTTTCCT-CTC-CACAT-CGGTCGA-G-TGAGCG--T--TAT-GGTCAATAACAACT-AC-TGTC--A--------TGTCC----TC-----CTATT------TGTGTCCTGCGAGATTGAAA--T------GCTTGGCAAC-GAGTTC-CTTGGCCCCTTTATTTTT-T-----AT----AG--------G--TG--GTT-ATTGATCCT---TCTTC-GTA--G-G-TT--C------------C-CTAT-GT--AT-TT---TTGG--TCA----CATA-CCTTG-CAGCTT---ATGA-GAT-------A------G---ATACA--GGTGTC-TA--TGC-GACAGGATGTCT--------TCCCAA-GAATTCGGTAGCAG----AGG--CCGCA---AT-GGGcactatag
gi|9 : atgaattcattccggtaaagtctttgtgt-A-TG--TTTTGAAACTTC-TA----TATTAG-G-TAAA---A--GACTA--GCCACTATG-----TA-C----CGATGCCC--CAGGT----TTCTGGGGTGAGT-GA-A---GG-----A-T-GGAATACGA-A-GTTTCTTGAAACCATCAGT---CATCCGTTTATTGATAG----A---------GAGAAT-----ATAGGATG-CCTC-CTC------GGAAAAT-A--CTAT------------CTTAAGGG---CTGGATGTTAaggttc
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-523 ) : NCTTGTT-CATNCCATCCGG--GCGGAATGACC-T----CAA---AANCTACGCATCC--AGA-ATTTTT---C-C--TTG-CTTTTCC-TCTC-CGCA-TCGGTCCA-G-TG-AGCG-TCATG-GTCAATAACCAC-TA-CTGTC--A--------TGTC----CTC-----CCATT------TGTGTC-------------A--T------GCTCGGCGA-CGGGNTC-TTTGGCNTTTTTGGTTTTNATA--G----T--GGATCG-G-TGG-TTGTTGATCCT---TCTGC-GNA--G-G-TC--C--C-GNTTTTA-C-CAAC-GT--AT-TG---TTTG--TNA----C-AGACCTTA-CAGCT---NATG-A-GAT-------A------G---ATGCA--GNTGTCN-G--TGC-GACAGGACGTNT-T------CCCC-AAGAATTCG-GTAGNNNCGNCCNGTG-A-CAGGGCTCTT--AAA--ACTGTCCGCGCTNGCGCTGTGT-T-TGCAC--ATCNGGCA---TCC---C--G-T--C-AGAC-A-NG--TTTTAAAGCCCC-CG----T--T-AG-GTAAA---G--GGTTG--TCCAATCTGGCCCTTA--CCA-C-NACGTCCTTNATAT----TTCTGGGNCGTCT-AA-A---GNA-GCCA-TGG----CG--G-GCTCTTTGAAAACATCGGC-CATTC-TTT-ATTGATATG---AAGAA---TA-GN-ATATGNCTCTCTC--AG--AA-TA--CTGTTG---AG--GTCCTTAAGGA---CGGGGTGGTACG-T--A-GTG-ACCAGTGGAACCCTGTCACCTTTCGA--TTTTTCT-T--TATATTGCAGTNNCGTTGCCTGTCNTGTTTTGACATCCCGTCAATTACAGCTTGCNCTTTTGAGGCATCATAGCCCCTNTTACACAGATAATTCT
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gi|3 : TTGTT-CATTCCATCTGG--GCGGA-TGATT-T----CAA---AAGCGATGCATCC--ATG-ATTTTTATCC-C--CTGACTTTTCC-TCTCTTGCA-TCGGTCCA-T-TG-
gi|4 : cacattaatagaaattatataaagactggttagaaactagaccccaaacattagcttcattcatacggtatgtacaccaaaagaacgacatatcaaattttactgcatagaagatgtattatagttaactcgtacaacagtaagtaaccagaagaaaaattgggtgggggtgaagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagggggggggagtaagagaaagtaaaaaaaagtattttattgatgttataaagggcaaaaacaaaaaaacccaaaaaaaaaaaacccacatttcttaaataatagataagtataattttaaatttgaaaaaaaataagggggggggggttaaagaaaaatgatgcctaattgaaatatgaaggaagctcaatgtagggttgctgggctggaggctagtgccggtgttaggctgtaggggtttagcaaggggattcatggcacgaaaaaaaatatcattcacttGGTGA-GGGGTTC-TTT-------TTG----TCATG--G----T--GGATCT-G-TGG-TTGTTTATGCT---TCGGC-GGA--T-G-TC--T--C-TCCTGTATC-CAAC-AT--AT-TGCACTCTG---------C-AAACCTTA-CAACT---GATG-A-GAT-------A------A---ACACA--GCTGTCT-G--TGT-GACAAGACATGT-T------GCGC-AATA-TTAT-ATAGGTGCGATCCTTA-A-TGGGGCTAGT--AAC--TCTGTCCACGTCAGTGTCGTGC-T-TACAC--A----------------------------A--A-AG--TTTTAAAGCCAC-CA----A--T-AG-GTAAT---G--GGTTG--TCTAATTTGGCTCTCA--CTG-C-CACGTCCTTTAAGG----TCTTAGGCCGTTT-AA-AT--GCA-GCCATTGG----TG--G-A-TCCTTCA----ATTGGTGGATTC-TTTAATTATTGTG---AAGAA---TAGGC-ATAT-TCTCTCTC--AG--AA-TG--CTGTAG---AG--GTTCTTAACGA---CGGGGTGAAAT-------GTC-ACAAGTGTAACCCTA-CAATTCTCTT--TTTTTCT-CAATGTATTGCAttgggttatgaatcgagcaccccacct
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gi|8 : ccacaggttcagtgacgcgctcgtttggtttttgatagtggatcgaatggtttgttgatcctaagtcttgtattggtggtttcccaacagtattgtttgccacatcgtttagcaaatgtgatgagggtatatagttgttggtgttacaggaaaactggcccaattattctataaatttttccttgtggtattaactctgaaatgagtctcagtcttttctgggtatatttcagagtaggggcccgtgagttagtagcaaagtggaTTGTT-CATACCACTCGG--GTGGAATGACC-T----CAG-----TCTATGCATCC--AGA-ATTTCT---CGC--TT---TTTTCC-TCTC-CACA-TCGGTCGA-G-TG-AGCG-TTATG-GTCAATAACAAC-TA-CTGTC--A--------TGTC----CTC-----CTATT------TGTGTCCTGCGAGATTGAAA--T------GCTTGGCAA-CGAGTTC-CTTGGCCCCTTTATTTTTTATA---------------G-G-TGG-TTATTGATCCT---TCTTC-GTA--G-G-TT--C------------C-CTAT-GT--AT-TT---TTGG--TCA----C-ATACCTTG-CAGCT---TATG-A-GAT-------A------G---ATACA--GGTGTCT-A--TGC-GACAGGATGTCT-T-------CCC-AAGAATTCG-GTAGCAGAGGCCcactatag
gi|9 : atgaattcattccggtaaagtctttgtgt-A-TG--TTTTGAAACTTC-TA----TATT-AG-GTAAA---A--GACTA--GCCACTATG-----TA--CC----GATGCCC--CAGGT----TTCTGGGGTGAGT-GA-A---GGA------TGGAATACG--AAGTTTCTTGAAACCATCAGT-CATCCGTTT-ATTGATAGA---GAGAA---TA-TA-GGATGCCTC-CTC--GGAAAA-TA--CTAT------------CTTAAGGG---CTGGATGTTAgcaatgggaggttc
5 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|28 ): ACTCATTCGGGTGACGTCATTGAGTTTGTTTATCCCACTGGGGCGAAATTACTTCATACTTAGTCTATATATCCAGGAGTTTTTTCTTTCTTCCTC
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