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lowQualScore                  :          0 77 1   3333    22 8888 1 1  888888888888888888888888  1 222 33  555    7777   1 1 3333  1 1       1 3 111111111  88888   1 44 1 22    666 22 44 1        1 22 8888888888888888888    1  1 1 00000000 22  555555  777  44 3 7  22 55 555   333 1 44 1 3 1 1     666666  1   1 1 3333   1  22 22  3   22  1 1  1 3333 55555 1 33 1 33 1   1 555555555   1 444 22  3333  3333   3 33333   44 1 4 1    1 11   55555   1 1 33333333 1 1 11 222 1 1  1    11  6666  2222 1  22  1 44 1 222 1  2 222  4444 2222 111  1 1 1  1 1 1 1 222 4444 88888888 888888 1 1   1 4444  2    
lowQualScore                  :          . .. .   ....    .. .... . .  ........................  . ... ..  ...    ....   . . ....  . .       . . .........  .....   . .. . ..    ... .. .. .        . .. ...................    .  . . ........ ..  ......  ...  .. . .  .. .. ...   ... . .. . . . .     ......  .   . . ....   .  .. ..  .   ..  . .  . .... ..... . .. . .. .   . .........   . ... ..  ....  ....   . .....   .. . . .    . ..   .....   . . ........ . . .. ... . .  .    ..  ....  .... .  ..  . .. . ... .  . ...  .... .... ...  . . .  . . . . ... .... ........ ...... . .   . ....  .    
lowQualScore                  :          6 11 9   5555    22 4444 6 6  666666666666666666666666  5 888 44  444    7777   5 5 1111  5 5       5 1 555555555  11111   6 44 7 33    444 33 00 7        7 55 1111111111111111111    7  8 8 11111111 66  222222  555  33 6 0  44 99 444   000 7 66 6 2 6 6     222222  6   6 6 3333   6  33 33  3   11  5 5  5 1111 33333 5 55 5 33 5   5 999999999   5 111 00  1111  8888   1 88888   11 4 3 4    4 99   22222   3 3 00000000 2 2 77 222 2 2  2    77  4444  5555 2  77  1 22 1 222 1  2 000  8888 6666 333  2 2 2  2 2 2 2 333 2222 22222222 000000 5 7   9 7777  4    
consensus                     :    GTGGGGAT-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AGG-----------TCCC--C---G-GC-A-T-C--CCC--TTGCN---TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-C-T---A-----AA-----TGG-G--G-C--GGTC-A-T--T--C-GGATGAGA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---GC-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGA---N--AA-AGA-T-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-C----C-N---T-G--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CCG-G-C-A-A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CA--T-AT----G-AG--TG-A--A-A--TA-TT-C---TC--G-A----G-C-GG-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-A----T-A-AAT-A----AT-CAAT
Reference ( gi|7 )            :    GTGGGGGT-TC-GGG----TTAG--A----A-T-AGG-----------CCTC--C---G-GC-A-T-C--CCC--TTGCG---TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-C-T---G-----AA-----TGG-G--G-C--GGTC-A-T--T--C-GGATGAGA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---GC-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGA---A--AA-AGA-T-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-C----C-C---T-G--A-GT-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CCG-G-C-A-A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CA--A-AT----G-AG--TG-A--A-A--TA-TT-C---TC--G-A----G-T-GG-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|11                         :    GTGGGGGT-AC-GGG----TTAG--A----A-T-AGG-----------TCCT--C---A-GC-A-T-A--CCC--TTGCG---TTT-C-G----TA-A-GAGGTGG-C-T---G-----A------TGG-G--G-C--AGTT-A-T--T--C-GGATGAGC-C--C--------GGA--------AAAC-CC-G-A----G---GC-TC------CA---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGA---T--AA-AGA-T-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-C----C-C---T-G--A-GT-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----TC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CCG-G-C---A-T--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CG--T-AT----G-AG--TG-A--A-A--TA-TT-C---TC--G------G-T-GG-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-A----T-A-AAT-A----AT-
gi|4                          :   cGTGGGGAT-CCCGGG----TTTG--AG---A-T-AGG-----------TCCT--C---A-GC-A-T-CG-CCT--TTGCG---TGT-C-GGGGGTA-A--AGGTGA-C-T---------AA-----TGG-G--GGC--GGTC-A-T--T--T-GGATGAGA-CGCC--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---G--AC------CG---TG--TGC-AC--A--G---CAG---G-T--G-TGG-G-CACT----A--TA-AGA-TCC----CCT-CC--C--T--CTC--AA----G-C----C-C---T-GGAA-GT-G-CCG-A---------GCA-TAACA--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-CAA-GCCC-T--TCA-----TTG-G-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CAATA-AT----G-AG--TG-A--A-G--AA-TT-T---TC--G-A----ACT-GG-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-A----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|10                         : cccGTGGGGGT-CC-AGT----TTTA--A----A-T-AGG-----------TTCC--C---A-AT-A-T-C--CCC--TTGCG---TGT-C-G----GA-A-GAGGCG--C-T---A-----AAT----TAG-G--G-C--GTTC-A-T--T--C-GGATAAGA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---G---C------CG---CG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGA---A--AA-A-A-T-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GGCC----C-C---T-G--A-GTGG-CCG-G---------GCATT---A--GG----CA--T-CAATT-----TTT--GTC-A---TC-T--TCA-----CAG-G-C---A-A--T-GTG--T---GTG-TG-TCT---CA--T-AT----G-AG--TG-A--A-A--TA-CT-C---T---G-A----G-T-GG-A-A-CG-T-T-A-A---A----C--------A-G----T-A-AAc
gi|9                          :   cGTGTGGATCTT-GGG----T-AG--A----A-T-AGG-----------TCCT--C---A-GT-A-C-T--CC-----G-A---TGT-T-G----TA-A-AAG-CGA-C-T---A-----AA-----TGG-G--G-C--GGTC-C-C--T--C-GGATGAGA-C--T--------GCA--------GAAA-CT-G-A----G---GC-CC------CGCG-TG--T-C-AA--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGATA-ATTAA-AGA-T-C----CCT-CC--C--AG-CTC--AG-A-AG-C----T-T---T-G--A-GT-G-CCA-A---------GCA-T---A--GT----CC--T-AAA-T-----ATT--G-C-A-GTCA-T--TCA-----CCG-G-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CA--T-AT----G-AA--TG-A--A-A--AA-TT-C---TC--C-A----G-A-GG-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-A----T-A-aa
gi|14                         : cctGTGGGGAT-CT-GGG----CAAG--A----A-T-AGA-----------TATT--C---G-GT-A---C--TCT--TTGCT---TGT-C-A----TA-A-GAGGTGA-C-T---A-----AA-----TGG-G--A-C--AGTC-C-T--T--T-GGATGAGA-C--C--------ACA--------AAAA-CC-C-AT---G---GC-CC------TG---AG--T-C-GC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGA---T--AA-AGA-T-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AT-T-AG-C----C-G---A-A--A-GC-A-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----TCG-G-C---C-A--T-A-A--T---A-A-CG-TCTC--AA--T-AT----A-AG--TG-A--A-C--AA-TT-C---ta
gi|6                          :   tGTGGGGTC-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AAA-----------TCCT--C---A-GT-G-T-C--CCTGATT------TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-C-T---A-----AAGTAGATGG-C--G-C--GACC-C-T--T--C-TGATGAGA-C--C--------GCA--------AAAA-CC-G-A----G---GT-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-T-A-CACGA---T--AA-AAA-T-C----CAC-CA--C--TG-CTC--AA-A-GA-C----CACAAAT-A--A-GC-A-CAG-A---------GCA-A---A--GG----C-----AAA-TGTAAATTT--G-C-A-GCAC-T--TCA-----CCG-A-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TC-C--CA--ATGT----G-AG--TG-A--A-A--TA-GT-G---TG--A-A----G-A-GG-G-A-CG-T-A-A-A---A----T--------A-A----T-
gi|15                         : ccaGTGGGGAA-CC-GGG----TAAG--A----A-T-AAA-----------TCTT--C---A----A-T-A--CCT--CTGCT---TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-C-T---ATCATAAA-----AGG-G--G-C--GGTC-C-T--T--T-GGATGAAA-C--C--------GTA--------AAAA-CC-G-A----G---AC-CT------CG---CG--C-C-AC--C--G---C-----------------------------AA-AGA-T-T----CCT-CC--C--TG-CTC---A-A-GG-C----C-A---T-A--A-AC-G-CCG-A---------GCA-C---A--TG----CC--T-AAA-T-----GTT--G-C-A-GCC------------------------------G-G--T---G-A-CA-TGTC--C---T-TT----G-AG--AG-A--A-A--AA-TT-C---T------------------------T-C-A-A---A----C--------A-A----C-A-TAC-A----AT-CAATgt
gi|22                         :   cGTGGGGAT-CC-GGA----T----------------------------CCTC------A-GT-G-T-C--CT---TTACT---TGT-C-A----TC-A-GAGGCGA-T-T---G-----AA-----TGG-G--G-C--AGTC-C-T--T--C-GGGTGATA-C--C--------GCA--------AAAA-C--G-A----A---TT-CC------CG---TG--T-C-AC--G--G---TAG---G-T--G-T-A-G-AACAA---T--AA-CGA-T-C----CCT-CA--T--TG-CTC--AA-A-GG-C----T-A---T-A--A-GC-G-TCG-A---------TCA-A---A--GG----ta
gi|34                         :  ccGTGATGGT-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AGG-----------TTCC--C---A-GC-A-T-C--CCC--TTGCG---TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-C-T---G-----AA-----TGG-G--A-A--GGTC-C-T--T--C-CGATGAGA-
gi|18                         :     TGGGGAT-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AGA-----------TCCT--C---A-GC-A-T-C--CCC--TTGTG---TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-T-T---G-----AA-----TGG-G--G-C--GGTC-A-T--T--C-GGATGAGA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---AC-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---TAG---G-T--G-T-A-G-CACGA---T--AA-AGA-T-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-C----C-C---T-G--A-TT-G-CCG-A---------ACA-C---A--GT----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCA-C--TCA-----CCG-G-C---A-G--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--
gi|25                         :     TGGTGAT-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AGG-----------TCCT--C---A-GC-A-T-T--CC---TTGCT---TGT-C-G----TA-A-GGGGCGA-C-T---A-----AA-----TAG-G--G-C--GGTC-C-T--T--C-GAAGGAGG-C--C--------GCA--------AAAA-CC-G-A----G---GT-CT------TG---TG--C-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGA---T--AG-AGA-T-C----CCT-
gi|1                          :     TGGGGAT-CC-AGGCCGGTTAA--A----A-T---------------TCTC------A-GC-A-T-A--CCC--TTGCG---T-T-C-G----TA-A-GAG-CGAAC-T---G-----AA-----TCG-G--T-CTTGCTC-A-T--TTTC-GGATGAGA-C--C--------AGATAATATAGAACA-CCTG-AACACA---GC-CCGCTATTCA---TA--T-C--T--A--GTC-CAG---G-T--G-TCG-A-TATAT---A--AT-GAA-T-C----ACT-CC--C--TGTCTC--AC-A-CG-CCGCAC-C---T-GC-A-GC-G-GCG-ATAGATCGCTACA-T---C--AG----CC----AAA-T-----TT-----C-A-GCCG-TACTCATC---CTG-G-C-A-T-A--G-A-GCAT---A-T-CG-TCTG--CC--A-CT---------------------CA-TT-C---TC----A----G-T--G-G-A-CT-C-A-A-AAGCA----C--------A-A----TAA-AATAA----AT-CAAT
gi|54                         :  cccTGGGGGT-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AGG-----------TCCC--C---A-GC-A-T-C--CCT--Tca
gi|49                         :     TGGGGAT-TC-GGC----T--G--A----G-T-A--------------------------------C--CCC--TTACT---TGT-T-G----TA-A-GAGGCGA-C-T---A-----AA-----TGG-G--
gi|36                         :     TGGGGAT-CC-GGG----TTTA--A----A-T-AGA-----------TCTT--CCAAG-GT--------TCC--TTCCT---TGT-C-T----CA-ATGAGGCGA-C-TAAAA-----AA-----TAA-G--G-T--AGTT-C-T--T--T-GGA
gi|8                          :       GGGGT-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AGG-----------TCCC--C---A-GC-A-T-C--CCC--TTGCG---TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-C-T---G-----AA-----TGG-----------TC-A-A--T--C-GGATGAAA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-T-A----G---GC-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CGA---G-T--G-T-G-G-CACGA---A--AA-AGA-T-A----CCT-CC--C--CG-CTC--AA-A-GG-T----C-C---T-G--A-GT-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCTC-T--TCA-----CCG-G-T---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CG--T-AT----G-AG--TG-A--A-A--TA-TT-C---TC--G-A----G-T-GG-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|20                         :     cgtGGGT-CC-GAG----TTAG--ATTGAA-TTATG-----------TCCC--C---G--C-A-T-C--C-----TGCA---TGT-TTG----TA-A-GAG-C-A-CAT---C-----AA-----TGG------C--GGTC-C-T--TT-C-GCATGAGT-C--C--------GAG--------AAAG-CC-G-A----G----C-CC------CA---T-----T-AC--A--G---CAG-----T--G-T-A-G-CA-GATT-G--AA-AGA-T-C----CT---C--C--TG-C-C--AA-A-GG-C----C-------G--A-TT-G-TCG-----------GCA-G---A---G----CC--T-CAA-T-----AAA--G-C-ATCCCC-T--TCT-----ACG-G-C---A-A--T-G-G--caa
gi|44                         :        GGGT-CC-GGG----TTAG--A----A-T-AGT-----------CCT---C---G-GCAA-T-C--CCCTATCGCG---TGC-C-G----TA-A-GA
gi|5                          :     acgtGAT-CC-TGG----TTAA--A----A-T-AGGTTCTCAGTACCCCCC--C---C-CC-C-C-C--CCC--TTGCT---TGC-C-G----CAGA-GAGGCGA-CCT---A-----AA-----TGG-GTGA-C--GTTC-C-T--T--C-AGATAATA-A--C--------GCA--------AGAA-AT-G-A----ATT-GC-CC------CG---TG--T-CAAC--AT-G---CAG---ATT--T-T-G-G-CACGC---AT-AA-AGA-T-C----CCT--C--C--TG-CTC--AAGA-GG-T----C-A---T-G--AGGC-A-CTG-A---------ACA-T------GG----CCA-A-AAA-T-----TTT--G-C-A-GTTCGC--TCA-----CCGAG-C-A-------------------A-TG-TTTC--CA--T-AT----G-AG--TG-A--A-A--AA-TCGT---TC--A-A----G-C--G-G-A-CG-T-C-A-A---AGCATC--------A-C----T-T-AGC-A----AT-CAAT
gi|12                         :              C-GGG----TTTG--A----A-T-AA------------TCTCATT---G-GT-G-T-C-------TTGTT---TGTTC-G----TG-A--AGGCGA-C-T---A-----AA-----T-G-G--G-C--TGCC---T--T--CAGAAAAAAA-C--C--------CAA--------AATT-TC-C-A----GAATGC-CC------AG---TGACT-C--C--A--G---CAGAGTG-T--A-T-G-G-T-TAG---A--TA-AGATT-T----TCT-CC--C--TGACTC--AA-ACGG-C----C-A---T-A--A-CC-G-CCG-A---------GCA-A---A--GGGAAATT--T-AAA-------TTT--G-C-A-ACCC-T--GCA-----C---G-T---A-A--T-G-T--T---G-A-C--TCCC--C---T-GT----G-AG--TG----A-A--TACTT-C---TC--A-A----G-T--T-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-ca
gi|13                         :   ccgtagggacgc-GGG----TCAA--A----AAT-AGG-----------TTTT--C---A-GT-A-C-CAACCT--TTGCT---TCT-T-C----T------GGCAA-A-T---A-----AAAAT--TGT-G--G----GGTCGA-T--T--C-AAATATGA-------------------------GAA-CC-G-A----GT--GG-CT------TA---TGA-T-CTGC--AAGG---C-----G-T--G-T-G-G-TACGA---T--TA-AGA-C-CAGAACAT-CC--CATCG-CTCCAAA-A-GG-C----C----------A-A------G-A---------GCA-A---A--GT----CC--T-AAAAT-----TGTAAG-C-A-CCGC-T--TCA-----CCG-G-C-A-G-A--TCG-G--T---G-A-C--TCTCTTCA--T-TT----G--G--TA-A--A-C--TA-TT-C---TC--ATA----A-C-GG-A-A-CT-T-A-A-c
gi|39                         :                 GG----TTAG--ACTGAA-T-AGGTTCTCAGTAC-CCCC--C---GAGC-AGTAC--CCC--TTGCT---TGT-C-G----TA-A-GAGGCAA-gggcattatata
gi|2                          :            acccgtG----TTAGGCA----A-T-GAG-----------TTTC--C---G----A-T-C--CAC--TTGCGATCTGT-A-G----AG-A-AAAG-GA-C-T---A-----CA-----TAG-GACG-C--GGTC-A-TGGT--C-GGAT-AGATC--C--------GGA--------A----CC-GGA----G---GTGCT------CGAAGTT--T-C-AC--A--GACGCAG---G-T--GGT-T-G-CACGAGGAA--AACAGA-T-C----TCTACC--C--TG-TTC--AA-A-GG-A----C-A---TAG--A-GT-G-CCGGA---------GCA-TG--A--GG----C-----AGA-T-----TTTTGG-CGA-GTCC-T--TCATGTCTCTG-G-CCATA-A--T-G-G--T---G-A-AG-TCTC--CAT-A-GT----G--G--TG-A--A-GATTA-TTGC---TCCAA-A----G-T-GG-G-A-CG-T-A-TTA---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----GT-CAAT
gi|26                         :     ccgtgagtgaatcc----TTAG--A----A-T-AAG-----------TCCT--C---G-GC-A------CCC--TTACT---TGT-C-G----TC-A-AAGGCGA-C-T---A-----AA-----TGG-T----C--TATA-A-C--T-----GATGA-A-C--CTTGTAATGAGG--------AAAT-CC-G-AAG--G---GC-CC------CGC--TG--TTC-AC--AA-G---CAG---G-T--G-T-G-GCCCCGA---T--AA-AGA-T-C----ca
gi|3                          :                       gtAG--A----C-T-GGT-----------CCTC------A-GC-A---C--CCA--TTGCT---TGT-C-G----CA-A-GAGACGA-C-T---A-----AA-----TGG-G--G-C--G----A-T--T--C-G--TG-GA-C----------------------AAAA-CC-A-A----G---GT-CT------CC---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-TCTA-T-G-G-CACGA---T--AA-AAG-T-A----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-T----T-A---T-G--A-GC-G-CCG-A---------GCgt
gi|16                         :                                                              c-GC-A-T-C--TCC--C-GTT---TGT-C-G----TT-A-GAGGCAA-C-T---G-----CA-----TGGTG--G-C--GTCC-AGT--T--A-GGAGAAGA-T--A--------AGA--------AAAAGCC-G-A----G---AC-CC------CG---TG--T-CCATCGA--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACAA---A--------------------------------T--AA-A-GA-C----C-------G--A-GT-TTCCG-A---------GCA-T---A--GG----CT--T-GAA-T-----TTT--G-C---GTCT-T--TCA-----ATG-G-T-A-T----T-G-G--T---G-A-CG-TGTC--CA--T-A-----G-AG--TA-A--A-A--TA-TT-A---TC--G-A----G-T-GG-G-A-CG-T-G-A-A---A----C--------nattcgtggacaaaaccaaggtctcctgtcacagcaggtctatggcacgataaaagtacctccctgctcaaaggttatgagcgccgagcataggcctaaaattatgcagcacttcaatggcaatggtgacgtctccatatgagtgaaagattctca
gi|59                         :                                                               -GC-A-T-C--CCC--TTTCG---TGT-C-G----TG-A-GAGGCGA-C-T---T-----AA-----caatactaaatccaacaatc
gi|48                         :                                                                      -C--CCC--TTTCT---TGT-C-G----TA-A-GAGGCGA-T-T---A-----AA-----TA---------------A-T-------GGATGAAA-C--C--------GCA--------AAAA-
gi|21                         :                                                                                                         GGCGA-C-C---------AA-----TGG-G--G-C--AGTC-A-T--A--C-GAA-GAGA--------------GA--------AAA---C-G-A--------GT-CC------CA---T---T-CGAC--A--G---AAG---A-C--G-T-GAG-C---A---A--AT-AGA---C----CCA-CC--C---G-GTC--AA-A-GG-C----C-------G--A-G--G-CCG-A----------C--T---A--GG----CT-----AA-T-----TGT--A-A-A-GCAT-T--GC------CCA-G-C---A-A--C-G-G--G---G-A-CG---TC--CAGTG-AT----A-GG--CG-AG-A-A--CA-CT-C---T---G-ATGGCG-C-GGAA-A-CG-C-A-A-A---A----C--------a
gi|3                          :                                                                                                                                                                     taatc--------GGAC-------AAAA-CC-A-A----G---GT-CT------CC---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-TCTA-T-G-G-CACGA---T--AA-AAG-T-A----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-T----T-A---T-G--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--TAAAA-T-----TAT--G-C-A-GCAC-T--TCA-----ATG-G-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CA--T-AT----G-AG--TG-A--A-A--GA-TT-C---TC--
gi|23                         :                                                                                   cagactggtcctcagcacccattgcttgtcgcaagagacgactaaatggggcgattcgtggacaaaaccaaggtctcctgtcacagcaggtctatggcacgataaaagtacctccctgctcaaaggttatgagcgccgagcnattcgt-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CACGA---G--AA-AGA-T-C----TCT-CC--A--TA-CTC--AA-A-GG-C----C-A---T-G--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CCG-G-C-A-A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--------ATGTGCG-AG--TG-A--A-A--AA-TT-C---TC--A-A----C-C-AG-G-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-A----T-G-AAC-A----AT-CAAa
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                       caaaa--G-T-G-G-CATCA---A--TA-AAA-T-A----ACA-CCAAC--TC-CTC--AA-A-GG-C----C-A---T-T--A-GC-A-CTG-A---------G-A-T---AATGG----CTCGT-AAA-------TTT--G-CAA-GGAC-T--ACA-----CC----T-A-ACA--T-G-G--TATGG-A-CG-TATC--TG--T-GT----G-AGCATG-A--ATA--AA-TT-C---TC--G-A----C-TGGG-G-A-TG-TCATA-A---A----C--------A-
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                   aagaccatagtg-T-G-A-CTCGAT--A--AA-A-----C----TCT-TC--C--TG-CTC-----------------T---T-G--A-AT-A-TGG-A---------CGA-T---A--GA----GC--T-AA--T-----ATT--G-C-A-GCCC-T------------------------------------G-A-CG-TCTC--CA--A-AT----G-AG--TG-A--A-A--TA-TT-C---TT--A-A----G-T-AT-A-A-CA-T-A-T-A---G----C--------G-G----T-
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgt----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-AG-C----C-A---T-A--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----TC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CAA-G-C---A-A--T-A-G--T---G-A-TA-TCTC--CA--T-AT----G-AG--TG-A--A-A--caccaat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --AA-A-AG-C----C-A---A-G--A-GT-G-CTA-A---------GCA-T---A--GG----TC--T-AAA-T-----TT---G-C-A-GCCT-T--TCA-----CCG-G-C-A-A----T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--AA--T-AT----G-AG--CG-A--A-C--TA-TT-C---TC----A----A-C-GG-G-A-CG-A-A-A-A---A----CAAACA---A-A----C-A-AAC-A----AT-CAATaa
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             aatggaggataataaaaatacatgtacatgtacca--AA-A-AG-C----C-A---A-G--A-GT-G-CT--A---------GCA-T---A--GG----TC--T-AAA-T-----TT---G-C-A-GCCT-T--TCA-----CCG-G-C-A-A----T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--AA--T-AT----G-AG--CG-A--A-C--TA-TT-----TC--T-A----A-C--G-G-A-CG-A-A-A-A---A----CAAACAACAA-A----C-A-AAC-A----AT-CAATcaatcaatcaatctgtgtattattctattattgttgatcttgacactgactttggactaagt
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                             ataaaaatacatgtacattgtacca-GG-C----C-T---T-G--G-GC-G-CCA-T---------CTA-C---A--GG----AC--A-AAA-T-----TG---G-T-G-GCAC-T--TTG-----TC----T-A-A-AGCT-G-G--T---G-A-CG-TCTC--AA--T-AT----T-AC--TG-G--A-A--AA-TC-A---TG--G-A----A-T-TA-G-G-CG-T-G-A-caatcatcaatctgtgtattattctattatgttgattcttgacactgactttggactaag
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CA-T---A--GG----TC--T-ATA-T-----TTT--G-C-A-GCCT-T--TCA-----CCG-A-C-A-g
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aT--G-C-A-GTCA-C--TCA-----CCG-G-C-A-G----T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--CG--T-AT----G-AG--CG-A--A----TA-TT-A---TT--G-A----G-T-GG-G-C-AG-T-G-A-A---A----C--------A-A----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -C-A-GTAT-T--TCA-----CCT-A-T-A-T-C--T-G-G--T---G-A-CG-TCTC--GA--T-GT----G-AG--TG-A--A-taa
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 --TTA-----CCG-GGC-A------T-G-G--T---G-AGCG-TG-C--CA--A-A-----G-AG--CGGA--A-A--TG-AT-CGTATC--G-A----G-T-GG-G-ATCGAT-A-A-A---A----C--------A-G----T-A-TAT-AACAGAT-CAATcgtaaagaacaacaaaacaaacaaaagtaaaacaaacaaacaaacaaacagtatatgatt
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -----CCA-G-C-A-A----T-G-G--T---G-A-C--TCTC--CA--T-AT----G-AGT-TG-A--A-A--AA-TT-ctg
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -C-A-C-A--T-G-G--T---A-A-CG-TCTC--TA--A-AT----G-AG--TG-A--A-A--CA-TG-C---TC--G-A----A-T-G
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCCC--------AT----G-TG--CG----A-A--TA-TT-C---T---A-A----G---AG-G-A-C--T-A-A-G---AC---C--------A-A----T---AAT-A----AT-CAAaatcgaggcaaa
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      -A--T-G-G--T---G-A-CG-T-TG--GA--ATAT----GAAG--TG-AATA-A--T--TT-C---TG--G-A----C-T-GG-GAA-CG-T-A-A-G-----------------A-A----T-A-AAT-A----ATACAAT
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gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----G-AG--TG-A--A-A--TA-TT-C---TC--G------G-T-GG-T-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-NAGACT-A-AAT-tacatg
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ----G-AG--TG-A--A-A--TA-TT-C---TC--A-A----G-C-GG-G-A-TG-T-T-A-T---A----C--------A-A----C-A-TAC-A----AT-CAAT
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gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-A--A-A--TA-TT-C---TC--G------G-T-GG-G-A-CG-C-A-A-A---A----C--------A-A----T-ACAAT-caatcaat
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TT-C---TC--G-A----G-T-GG-A-A-CG-T-A-A-A---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----Acc
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TT-T---TC--G-A------C-GC-G-A-CG-T-A-A-A---G----C--------AAG----C-A-AAT-A----AT-CAATgaatcac

Unaligned ( gi|31 ): GAATAGGTCCTGTACCCCTTGTTGTTGTTTAAGAAGGCAACTAAATGGAGCGCGGTCCTCGATGAAGAATGCATAACCCGGGTCCCCACAGGGCA
Unaligned ( gi|37 ): TAGCTGCAATAATATATCCCTCTCCTTTTTACCCGTACACGTCAGAACAAAACAAATCGGAGAGAGCAACATTATTGCAGCT
Unaligned ( gi|42 ): TGGTGATGTCTTCATATGAATAAAAAATTCCTCAAAGGGACATATACCCAAATAA
Unaligned ( gi|43 ): TGGTGATGTCTTCATATGAATAAAAAATTCCTCAAAGGGACATATACCCAAATAA
Unaligned ( gi|47 ): CCGTGGAAATCTGGGTTAGAATAAATGTTTAGTGCCCTTTACTTATCGTAAG
Unaligned ( gi|52 ): ACGTGAAAAACAAATAATCAATCAATCAATCAATCATTACTGT

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lowQualScore                  :                                           7  6 0000      00 8888 5 5    3333333333  111 33333  3 2222222222222 11  777   3 3333   3 3 8888 88 3 3  3    4 4 4 555 66666  11111 5  77777  11    2222 11 5 5     6   6 33 88888888 3 44444444    6  7 7 55555555  7  888888  222  11 5 7  33 66 222   999 7 44 5 1 5 5  5  5 222  3333 3333 5  5 1111   5  22 22  2   00  5 4  4 0000 22222 4 44 4 44 4   4 777777777   4 999 00  0000  55 5   0 77777   99 4 1 4    4 88   00000   3 2 33333333 1 1 55 000 1 1  1   1 55 1  2 1 55 1  55  0 44 0 777 44  2 999  6666666666666  2 2 2  2 2 4  222 2222 77777777 3 3333 4 4   7 0000  2    
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Reference ( family-415 )      :                                   GTGGGGAT-CC-G----GGTTAG--A----A-T-AGGT----------CCC--C---G-GC-A-----------T-C--CCC--TTG-CN---TGT-C-G----T--A-A-GA-GGCG-A-C-T---A-----AA-----T-GG--G--GC--GGTC-A--T--T-C-GGATG-AGA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---GC-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CA-CG-AN--AA----A----G-AT-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-C----C----NT-G--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CCG-G-C-A-A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--C-AT-A-T--G-AG--TG-A--A-A--TA--TT-C---TC--G-A----GC--GG-G-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-A----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|1                          :                                    TGGGGAT-CC-AGGCCGGTTAA--A----A------T----------TCT--C---A-GC-A-----------T-A--CCC--TTG-CG---T-T-C-G----T--A-A-GA--GCGAA-C-T---G-----AA-----T-CG--G--TCTTGCTC-ATTT--T-C-GGATG-AGA-C--C--------AGATAATATAGAACA-CCTG-AACACA---GC-CCGCTATTCA---TA--T-C--T--A--GTC-CAG---G-T--G-TCG-A-TA-T--AT--AA----T----GAAT-C----ACT-CC--C--TGTCTC--AC-A-CG-CCGCAC----CT-GC-A-GC-G-GCG-ATAGATCGCTACA-T---C--AG----CC----AAA-T-----TT-----C-A-GCCG-TACTCATC---CTG-G-C-A-T-A--G-A-GCAT---A-T-CG-TCTGC--C-AC---T-------------------CA--TT-C---TC----A----GT---G-G-A-CT-C-A-AAAGCA----C--------A-A----TAA-AATAA----AT-CAAT
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gi|2                          :              ataaaaatacatgtacattgtaccaGAAT-CC-G------TTAGGCA----A-T-GAGT----------TTC--C---G----A-----------T-C--CAC--TTG-CGATCTGT-A-G----A--G-A-AA-AG-G-A-C-T---A-----CA-----T-AG--GACGC--GGTC-A--TGGT-C-GGAT--AGATC--C--------GGA--------A----CC-GGA----G---GTGCT------CGAAGTT--T-C-AC--A--GACGCAG---G-T--GGT-T-G-CA-CG-AG--GA----AAACAG-AT-C----TCTACC--C--TG-TTC--AA-A-GG-A----C----ATAG--A-GT-G-CCGGA---------GCA-TG--A--GG----C-----AGA-T-----TTTTGG-CGA-GTCC-T--TCATGTCTCTG-G-CCATA-A--T-G-G--T---G-A-AG-TCT-C--C-AT-AGT--G--G--TG-A--A-GATTA--TTGC---TCCAA-A----GT--GG-G-A-CG-T-ATTA---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----GT-CAATcaatcatcaatctgtgtattattctattatgttgattcttgacactgactttggactaag
gi|20                         :                               ccgtgagtGGGT-CC-G----AGTTAG--ATTGAA-TTATGT----------CCC--C---G--C-A-----------T-C--C-----TG-CA---TGT-TTG----T--A-A-GA-G-C--A-CAT---C-----AA-----T-GG------C--GGTC-C--T--TTC-GCATG-AGT-C--C--------GAG--------AAAG-CC-G-A----G----C-CC------CA---T-----T-AC--A--G---CAG-----T--G-T-A-G-CA--G-ATTGAA----A----G-AT-C----CT---C--C--TG-C-C--AA-A-GG-C----C-------G--A-TT-G-TCG-----------GCA-G---A---G----CC--T-CAA-T-----AAA--G-C-ATCCCC-T--TCT-----ACG-G-C---A-A--T-G-G--ca
gi|21                         :                                                                                                                                                    -GGCG-A-C-C---A-----A------T-GG--G--GC--AGTC-A--T--A-C-GAA-G-AGA--------------GA--------AAA---C-G-A--------GT-CC------CA---T---T-CGAC--A--G---AAG---A-C--G-T-GAG-C-----AA--AT----A----G-A--C----CCA-CC--C---G-GTC--AA-A-GG-C----C-------G--A-G--G-CCG-A----------C--T---A--GG----CT-----AA-T-----TGT--A-A-A-GCAT-T--GC------CCA-G-C---A-A--C-G-G--G---G-A-CG-TC--C--A-GTGA-T--A-GG--CG-AG-A-A--CA--CT-C---T---G-ATGGCGC--GGAA-A-CG-C-A-AA---A----C--------
gi|22                         :                              taatcGTGGGGAT-CC-G----GAT----------------------------CCT--C---A-GT-G-----------T-C--CT---TTA-CT---TGT-C-A----T--C-A-GA-GGCG-A-T-T---G-----AA-----T-GG--G--GC--AGTC-C--T--T-C-GGGTG-ATA-C--C--------GCA--------AAAA-C--G-A----A---TT-CC------CG---TG--T-C-AC--G--G---TAG---G-T--G-T-A-G-AA-CA-AT--AA----C----G-AT-C----CCT-CA--T--TG-CTC--AA-A-GG-C----T----AT-A--A-GC-G-TCG-A---------TCA-A---A--GG----
gi|23                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                    cc-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CA-CG-AG--AA----A----G-AT-C----TCT-CC--A--TA-CTC--AA-A-GG-C----C----AT-G--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CCG-G-C-A-A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCT----C-AT-G-TGCG-AG--TG-A--A-A--AA--TT-C---TC--A-A----CC--AG-G-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-A----T-G-AAC-A----AT-CAA
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caaaa--G-T-G-G-CATCA-AT--AA----A------AT-A----ACA-CCAAC--TC-CTC--AA-A-GG-C----C----AT-T--A-GC-A-CTG-A---------G-A-T---AATGG----CTCGT-AAA-------TTT--G-CAA-GGAC-T--ACA-----CC----T-A-ACA--T-G-G--TATGG-A-CG-TAT-C--T-GT-G-T--G-AGCATG-A--ATA--AA--TT-C---TC--G-A-----CTGGG-G-A-TG-TCATAA---A----C--------A-
gi|25                         :                        aagaccatagtgTGGTGAT-CC-G----GGTTAG--A----A-T-AGGT----------CCT--C---A-GC-A-----------T-T--CC---TTG-CT---TGT-C-G----T--A-A-GG-GGCG-A-C-T---A-----AA-----T-AG--G--GC--GGTC-C--T--T-C-GAAGG-AGG-C--C--------GCA--------AAAA-CC-G-A----G---GT-CT------TG---TG--C-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CA-CG-AT--AG----A----G-AT-C----CCT-
gi|26                         :                                                      TTAG--A----A-T-AAGT----------CCT--C---G-GC-A----------------CCC--TTA-CT---TGT-C-G----T--C-A-AA-GGCG-A-C-T---A-----AA-----T-GG--T---C--TATA-A--C--T----GATG-A-A-C--CTTGTAATGAGG--------AAAT-CC-G-AAG--G---GC-CC------CGC--TG--TTC-AC--AA-G---CAG---G-T--G-T-G-GCCC-CG-AT--AA----A----G-AT-C----
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            gt-T-G-A-CT-CG-AT--AA----A----A----C----TCT-TC--C--TG-CTC--------------------TT-G--A-AT-A-TGG-A---------CGA-T---A--GA----GC--T-AA--T-----ATT--G-C-A-GCCC-T------------------------------------G-A-CG-TCT-C--C-AA-A-T--G-AG--TG-A--A-A--TA--TT-C---TT--A-A----Ggt
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgt-C-A-GTAT-T--TCA-----CCT-A-T-A-T-C--T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--G-AT-G-T--G-AG--TG-A--A-tataacatatagcggtcaccaat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -A--T-G-G--T---G-A-CG-TTG-G--A-AT-A-T--GAAG--TG----A-A--TAATTT-C---TG--G-A----CT--GG-GAA-CG-T-A-AG-----------------A-A----T-A-AAT-A----ATACAATcgtaaagaacaacaaaacaaacaaaagtaaaacaaacaaacaaacaaacagtatatgatt
gi|3                          :                                        cctaaattgcataagttcaacctgccgtgcGGT----------CCT--C---A-GC-A-------------C--CCA--TTG-CT---TGT-C-G----C--A-A-GA-GACG-A-C-T---A-----AA-----T-GG--G--GC--G----A--T--T-C-G--TG--GA-C----------------------AAAA-CC-A-A----G---GT-CT------CC---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-TCTA-T-G-G-CA-CG-AT--AA----A----A-GT-A----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-T----T----AT-G--A-GC-G-CCG-A---------GCcaatc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                   cagact--------GGAC-------AAAA-CC-A-A----G---GT-CT------CC---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-TCTA-T-G-G-CA-CG-AT--AA----A----A-GT-A----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-T----T----AT-G--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--TAAAA-T-----TAT--G-C-A-GCAC-T--TCA-----ATG-G-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--C-AT-A-T--G-AG--TG-A--A-A--GA--TT-C---TC--nattcgtggacaaaaccaaggtctcctgtcacagcaggtctatggcacgataaaagtacctccctgctcaaaggttatgagcgccgagcataggcctaaaattatgcagcacttcaatggcaatggtgacgtctccatatgagtgaaagattctca
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                       cagactggtcctcagcacccattgcttgtcgcaagagacgactaaatggggcgattcgtggacaaaaccaaggtctcctgtcacagcaggtctatggcacgataaaagtacctccctgctcaaaggttatgagcgccgagcnattcgt-GG-C----C----TT-G--G-GC-G-CCA-T---------CTA-C---A--GG----AC--A-AAA-T-----TG---G-T-G-GCAC-T--TTG-----TC----T-A-A-AGCT-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--A-AT-A-T--T-AC--TG-G--A-A--AA--Ta
gi|31                         :                                        tcacgcctaattccatgG--A----A-T-AGGT----------CCT--------GT-A-------------C--CCC--TTG--T---TGT-T-G----TTTA-A-GAAGGCA-A-C-T---A-----AA-----T-GG--AGCGC--GGTC----C--T-C--GATGAAGA-A--T--------GCA--------TAAC-CC-G-G----G---TC-CC------Cg
gi|32                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-AG-C----C----AT-A--A-GC-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----TC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CAA-G-C---A-A--T-A-G--T---G-A-TA-TCT-C--C-AT-A-T--G-AG--TG-A--A-A--acagggca
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --TTA-----CCG-GGC-A------T-G-G--T---G-AGCG-TG--C--C-AA-A----G-AG--CGGA--A-A--TG--AT-CGTATC--G-A----GT--GG-G-ATCGAT-A-AA---A----C--------A-G----T-A-TAT-AACAGAT-CAATaa
gi|34                         :                                   GTGATGGT-CC-G----GGTTAG--A----A-T-AGGT----------TCC--C---A-GC-A-----------T-C--CCC--TTG-CG---TGT-C-G----T--A-A-GA-GGCG-A-C-T---G-----AA-----T-GG--G--AA--GGTC-C--T--T-C-CGATG-AGA-ctg
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T--G-C-A-GTCA-C--TCA-----CCG-G-C-A-G----T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--C-GT-A-T--G-AG--CG-A--A----TA--TT-A---TT--G-A----GT--GG-G-C-AG-T-G-AA---A----C--------A-A----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|36                         :                                    TGGGGAT-CC-G----GGTTTA--A----A-T-AGAT----------CTT--CCAAG-G----------------T--TCC--TTC-CT---TGT-C-T----C--A-ATGA-GGCG-A-C-TAAAA-----AA-----T-AA--G--GT--AGTT-C--T--T-T-GGAtaa
gi|38                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TT-T---TC--G-A-----C--GC-G-A-CG-T-A-AA---G----C--------A-AG---C-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|39                         :                                         AC-CC-GT---GGTTAG--ACTGAA-T-AGGTTCTCAGTACCCCC--C---GAGC-AG----------TAC--CCC--TTG-CT---TGT-C-G----T--A-A-GA-GGCA-A-caattaatcaatcatcactgtctcaactttcatcattcttga
gi|4                          :                                   GTGGGGAT-CCCG----GGTTTG--AG---A-T-AGGT----------CCT--C---A-GC-A-----------T-CG-CCT--TTG-CG---TGT-C-GGGGGT--A-A--A-GGTG-A-C-T---A-----AT-----G-GG--G--GC--GGTC-A--T--T-T-GGATG-AGA-CGCC--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---G--AC------CG---TG--TGC-AC--A--G---CAG---G-T--G-TGG-G-CA-CT-AT---A----A----G-ATCC----CCT-CC--C--T--CTC--AA----G-C----C----CT-GGAA-GT-G-CCG-A---------GCA-TAACA--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-CAA-GCCC-T--TCA-----TTG-G-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--CAATAA-T--G-AG--TG-A--A-G--AA--TT-T---TC--G-A----ACT-GG-G-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-A----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|40                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ccc-A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TC--C--C-AT-G-T--G-CG--------A-A--TA--TT-C---T---A-A----G---AG-G-A-C--T-A-AG---AC---C--------A-A----T---AAT-A----AT-CAAc
gi|41                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --T-G-C--T---G-A-CGGTCT-C--C--T-A-T--G-TG--TG-ACAG-A--TA--TT-C---TC----A----GT--GG-G-A-C----A-AA---A----C--------ACA----T-A-AAT-
gi|42                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --T-G-G--T---G-A-TG-TCT-T--C-AT-A-T--G-AA--TA-A--A-A--AA--TTCC---TC--A-A----A---GG-G-A-CA-T-A-TA---C----C---------------C-A-AAT-A----A
gi|43                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             --T-G-G--T---G-A-TG-TCT-T--C-AT-A-T--G-AA--TA-A--A-A--AA--TTCC---TC--A-A----A---GG-G-A-CA-T-A-TA---C----C---------------C-A-AAT-A----A
gi|44                         :                                   GTGGG--T-CC-G----GGTTAG--A----A-T-A-GT----------CCT--C---G-GCAA-----------T-C--CCCTATCG-CG---TGC-C-G----T--A-A-GA-
gi|45                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ac-C-A-C-A--T-G-G--T---A-A-CG-TCT-C--T-AA-A-T--G-AG--TG-A--A-A--CA--TG-C---TC--G-A----
gi|46                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T-C--T-AT-A-G--G-AG--TG-A--A-A--TA--TT-C---TC--A-A----GC--GG-G-A-TG-T-T-AT---A----C--------A-A----C-A-TAC-A----AT-CAATatgaatcgaggcaaa
gi|47                         :                                   GTGGAAAT-CT-G----GGTTAG--A----A-T-AAAT----------GTT--T---A-GT-G-------------C--CCT--TTA-CT---TAT-C-G----T--A-A-G
gi|48                         :                                                                                                            cc-C--CCC--TTT-CT---TGT-C-G----T--A-A-GA-GGCG-A-T-T---A-----AA-----T-A---------------A--T------GGATG-AAA-C--C--------GCA--------AAAA-
gi|49                         :                                    TGGGGAT-TC-G----GCT--G--A----G-T-A-----------------------------------------C--CCC--TTA-CT---TGT-T-G----T--A-A-GA-GGCG-A-C-T---A-----AA-----T-GG--G--a
gi|5                          :                                        GAT-CC-T----GGTTAA--A----A-T-AGGT----------TCT--C---A-GT-ACCCCCCCCCCCC-C--CCC--TTG-CT---TGC-C-G----C--AGA-GA-GGCG-ACC-T---A-----AA-----T-GGGTG--AC--GTTC-C--T--T-C-AGATA-ATA-A--C--------GCA--------AGAA-AT-G-A----ATT-GC-CC------CG---TG--T-CAAC--AT-G---CAG---ATT--T-T-G-G-CA-CGCAT--AA----A----G-AT-C----CCT--C--C--TG-CTC--AAGA-GG-T----C----AT-G--AGGC-A-CTG-A---------ACA-T------GG----CCA-A-AAA-T-----TTT--G-C-A-GTTCGC--TCA-----CCGAG-C-A-------------------A-TG-TTT-C--C-AT-A-T--G-AG--TG-A--A-A--AA--TCGT---TC--A-A----GC---G-G-A-CG-T-C-AA---AGCATC--------A-C----T-T-AGC-A----AT-CAAT
gi|50                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G--TA-A--A-A--TA--TT-A---TC--G-A----GT--GG-G-A-CG-T-G-AA---A----C--------A-A----T-A-CAT-A----AT-CAca
gi|51                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CT-C--C-AT-A-T--G-AG--TG-A--A-A--AA--AT-C---TC--T-A----GC--GG-A-C-TG-T---AA---A----C--------A-A----T-A-caatcaat
gi|53                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --G-AG--TG-A--A-A--TA--TT-C---TC--G------GT--GG-T-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-NAGACT-A-AAT-tacatg
gi|54                         :                                    TGGGGGT-CC-G----GGTTAG--A----A-T-AGGT----------CCC--C---A-GC-A-----------T-C--CCT--T
gi|55                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --TT-C---TC--G-A----GT--GG-A-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----A
gi|56                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G-A--A-A--TA--TT-C---TC--G------GT--GG-G-A-CG-C-A-AA---A----C--------A-A----T-ACAAT-gaatcac
gi|57                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -----CCA-G-C-A-A----T-G-G--T---G-A-C--TCT-C--C-AT-A-T--G-AGT-TG-A--A-A--AA--TT-cc
gi|58                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CA-T---A--GG----TC--T-ATA-T-----TTT--G-C-A-GCCT-T--TCA-----CCG-A-C-A-
gi|59                         :                                                                                            a-GC-A-----------T-C--CCC--TTT-CG---TGT-C-G----T--G-A-GA-GGCG-A-C-T---T-----AA-----
gi|6                          :                                   GTGGGGTC-CC-G----GGTTAG--A----A-T-AAAT----------CCT--C---A-GT-G-----------T-C--CC----TGATT---TGT-C-G----T--A-A-GA-GGCG-A-C-T---A-----AAGTAGAT-GG--C--GC--GACC-C--T--T-C-TGATG-AGA-C--C--------GCA--------AAAA-CC-G-A----G---GT-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-T-A-CA-CG-AT--AA----A----A-AT-C----CAC-CA--C--TG-CTC--AA-A-GA-C----CACAAAT-A--A-GC-A-CAG-A---------GCA-A---A--GG----C-----AAA-TGTAAATTT--G-C-A-GCAC-T--TCA-----CCG-A-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCC-C--A-AT-G-T--G-AG--TG-A--A-A--TA--GT-G---TG--A-A----GA--GG-G-A-CG-T-A-AA---A----T--------A-A----T-
gi|7                          :                                ccaGTGGGGGT-TC-G----GGTTAG--A----A-T-AGGC----------CTC--C---G-GC-A-----------T-C--CCC--TTG-CG---TGT-C-G----T--A-A-GA-GGCG-A-C-T---G-----AA-----T-GG--G--GC--GGTC-A--T--T-C-GGATG-AGA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-G-A----G---GC-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CA-CG-AA--AA----A----G-AT-C----CCT-CC--C--TG-CTC--AA-A-GG-C----C----CT-G--A-GT-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCCC-T--TCA-----CCG-G-C-A-A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--C-AA-A-T--G-AG--TG-A--A-A--TA--TT-C---TC--G-A----GT--GG-G-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----AT-CAATgt
gi|8                          :                                   GTGGGG-T-CC-G----GGTTAG--A----A-T-AGGT----------CCC--C---A-GC-A-----------T-C--CCC--TTG-CG---TGT-C-G----T--A-A-GA-GGCG-A-C-T---G-----AA-----T-GG-----------TC-A--A--T-C-GGATG-AAA-C--C--------GGA--------AAAA-CC-T-A----G---GC-CC------CG---TG--T-C-AC--A--G---CGA---G-T--G-T-G-G-CA-CG-AA--AA----A----G-AT-A----CCT-CC--C--CG-CTC--AA-A-GG-T----C----CT-G--A-GT-G-CCG-A---------GCA-T---A--GG----CC--T-AAA-T-----TTT--G-C-A-GCTC-T--TCA-----CCG-G-T---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--C-GT-A-T--G-AG--TG-A--A-A--TA--TT-C---TC--G-A----GT--GG-G-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-G----T-A-AAT-A----AT-CAAT
gi|9                          :                                  cGTGTGGAT-CT-T----GGGTAG--A----A-T-AGGT----------CCT--C---A-GT-A-----------C-T--CC-----G--A---TGT-T-G----T--A-A-AA-G-CG-A-C-T---A-----AA-----T-GG--G--GC--GGTC-C--C--T-C-GGATG-AGA-C--T--------GCA--------GAAA-CT-G-A----G---GC-CC------CGCG-TG--T-C-AA--A--G---CAG---G-T--G-T-G-G-CA-CG-AT--AATTAAA----G-AT-C----CCT-CC--C--AG-CTC--AG-A-AG-C----T----TT-G--A-GT-G-CCA-A---------GCA-T---A--GT----CC--T-AAA-T-----ATT--G-C-A-GTCA-T--TCA-----CCG-G-C---A-A--T-G-G--T---G-A-CG-TCT-C--C-AT-A-T--G-AA--TG-A--A-A--AA--TT-C---TC--C-A----GA--GG-G-A-CG-T-A-AA---A----C--------A-A----T-A-caa