lowQualScore : 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111 22222222222222222222222222222222222222222222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 55 3 222222222 111 22222 111 111 1 33 222222 11 4 22 11 11111 1111 33 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 33 11 222 22 22 33 1 111 333333333333333 1111 3333 111 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 22222222222 22 44444444 333333333 111 1 4444 55 7777777777777777777777777777777777777777777 222 1 11111 999999999999999999999 2 1 111 22 444 888888888 1 44 33333333333333333333333333333333333333333333333 777777 1 44 4 666666 222222222222222222222 4 55 11111111111111111111111111111111111111111111111 1 777777777 1 333333 4 11 4444444444444 11 88888888888888888888888888888888 22222 33 2 4 4 2 1 3333 1 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 3333 1 111 22 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 333333 1111 11 3 11111 3333 222 111111 6666 1 7777 333 11 4444 1 44 1 1 1111 888888888888888888888888888888888 222 1 1 4444444444444444444444444444444444444444 1 999999 1 222222222 1 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 11 4444444444444444444 11
lowQualScore : 00 6 0 777777777 111 6 88888 6 6 111 111 3 5 2 22 333333 8 8 44 0 888 0 33 11 88888 8 1111 55 999999999999999999999999999999999999999999999999999999 8 8 0 11 5 8 44 6 111 11 55 99 8 11 0 9 999 5 333333333333333 4444 2222 222 66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 33333333333 8 3 8 22 55555555 9 555555555 8 111 6 0000 55 88 8 6666666666666666666666666666666666666666666 99 555 0 88888 999999999999999999999 7 3 0 777 0 44 2 555 6 6 111111111 5 77 88888888888888888888888888888888888888888888888 6 4 555555 7 66 6 0 6 888888 777777777777777777777 6 0 55 77777777777777777777777777777777777777777777777 6 5 6 6 6 3 666666666 5 2 3 55 777777 0 8 33 9999999999999 00 44444444444444444444444444444444 3 55555 33 3 0 0 6 6 3 8 7 5555 3 1 5 3 2 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 5555 2 0 2 2 2 777 2 88 0 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 333333 0 8 7777 11 8 2 88888 6666 3 777 444444 0 0000 0 3 4444 777 33 9 7777 5 88 88 0 2 0 7777 555555555555555555555555555555555 888 0 0 9999999999999999999999999999999999999999 0 8 111111 2 0 333333333 5 5 4 333333333333333333333333333333333333333333333333333 6 3 55 6666666666666666666 88
lowQualScore : .. . . ......... ... . ..... . . ... ... . . . .. ...... . . .. . ... . .. .. ..... . .... .. ...................................................... . . . .. . . .. . ... .. .. .. . .. . . ... . ............... .... .... ... .......................................................................... ........... . . . .. ........ . ......... . ... . .... .. .. . ........................................... .. ... . ..... ..................... . . . ... . .. . ... . . ......... . .. ............................................... . . ...... . .. . . . ...... ..................... . . .. ............................................... . . . . . . ......... . . . .. ...... . . .. ............. .. ................................ . ..... .. . . . . . . . . .... . . . . . .................................................................................................... . .... . . . . . ... . .. . ............................................................................... ...... . . .... .. . . ..... .... . ... ...... . .... . . .... ... .. . .... . .. .. . . . .... ................................. ... . . ........................................ . . ...... . . ......... . . . ................................................... . . .. ................... ..
lowQualScore : 88 7 2 222222222 777 7 33333 7 7 777 777 5 0 5 88 000000 0 0 00 0 222 8 00 00 44444 0 8888 00 444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 0 8 00 6 0 22 0 666 66 00 44 0 00 8 6 000 4 444444444444444 2222 0000 888 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 88888888888 0 0 0 88 22222222 6 444444444 0 888 0 2222 00 88 2 2222222222222222222222222222222222222222222 33 555 0 55555 888888888888888888888 8 2 0 000 2 22 5 000 7 7 000000000 0 00 77777777777777777777777777777777777777777777777 0 0 000000 0 00 0 0 0 000000 000000000000000000000 0 0 00 00000000000000000000000000000000000000000000000 0 0 0 0 0 0 555555555 5 5 0 00 333333 0 8 88 2222222222222 22 88888888888888888888888888888888 0 00000 77 7 0 0 0 7 3 3 0 3333 7 0 3 3 5 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 0000 0 0 5 5 5 555 2 88 7 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 000000 8 0 0000 00 0 0 88888 5555 2 555 888888 8 8888 0 0 2222 555 88 8 8888 5 88 00 0 5 0 2222 555555555555555555555555555555555 888 0 0 5555555555555555555555555555555555555555 0 8 000000 0 0 222222222 5 0 2 888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 3 00 0000000000000000000 33
consensus : TATTTACATTT--GCA-ACTG-TTTTCTC-----CTA-CATAAC---ACT-ATTA-CGA-GCA-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAAGT-AG--GTTACCGG-TACT-AC-TTTTACTAAGTA-TTAC---A---GA------T-CTAT-TA-----AA---TAGAT---GAAATCAAACANCACA-AAAT-ATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCG-TCAAAAATAAAAATAT-TTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGCTGTT-----A-AA------TGT----ATG--ACAAAAACC-GGAGC---AT-CCAGGGC----CACAAACCACAAAC-CACAAAGATA-TCAT-CCAT--AAAGAGGA-T-TCAANNA-AGAATCGC---TTCC-TA-TTTCAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTG-TGGTACA-ATC-TTC--AATTCATTTC--ATTTCCCGTGGC-TTAGAATTTCA-----------C-----------CAT-CAGT-G----CAT-T-ATTCATTTCACTTT-CAAAAGGA-TGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTCGT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAATTCC-AGGGTGGGAATTG--ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGTGATGTGGTACATG-CCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAANCAGATC--CAAATGCTACANNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACACATG-CACAAAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGCG-----AAAAGGTCCTTCTCTGGATTTATGTCCGATGATATTTGTAAGTCCTCAA-----TG----TATATCAAAAACCTA-CACAACGCAC--TCACAA--GCCTGCGTGCACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCCGGCATCGGTTTCCANTCNCGNNAGATCAT-GTTA-TGTCG-GGGCATCGAAGC--GA-GGCGTCTT----TGAAAACC-TAGCTATAA------CA--AAGT-T--ATC---CGAGTCNAC-----AGAA--GCGTT-CAG-TGAGC-TCATGTTTGTCAAACAATTA-CAATTCCA---GACCGTCA-CT-ACCTTCGTCTGCTN----TT--GT--CAG------TTCTTT-TCANGTA-AT--TC-ACNTGCGT--------CCTC-ATCTGTCCCGTCTGTGT-A-A--TTATT--TG---C-CTACAAC--CTTGA-CNANTGCCGCCCTG---TCCTCA-CGTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCCGATATTNCCCTACG--ATATATC-T-TT-CA-AAATCA--GTCCATTCAAACAACTGTCT-NC--CTTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAANTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCGAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATNATCAG-T--TTTTCGCA--AA--ATTAGACATAAG---AAGAGTTTTCAAT-CATNNACTTT-TAAANA-AA-TG-TA--TATN---GTC-TTTTTTATATAC-TTGCT--TTTTAACG--TCCTAA-TA-AT-TA-AAA--A----CAGC-TCTTC---A-TGT-CATNGA-ACTTT-GTTTTGGTG-----TTTCGT-CATTTTTGAAACGAAGCGTTTATGTGAGTCAA----------CA-------AT--------GTA-----T----GGA---NA-CATGTTGCTAAC-ACGA-TCAGCA-AT-GTTA-T---CGAT-CCAAAA--TGTAA
Reference ( gi|1 ) : TATTTACATTTTTGCA-ACTGCTTTTCTC-----CTAACATAAC---ACT-ATTA-GAG-GCA-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGGAGGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGC-ATGAAGTATTTGTTGAAAAAG-AG--GTAACC-G-TACT-AC-TTTTACTAAGT--TTAC---A---G-------T-CTAT-TA-----AA---TAGAT---G-AATCAAAAAACACA-AAAT-ATTTATTATGAT-TTTATTTTTTTTCCAGTCATTGGACTTTCA-TCAAAAAT-AAAATAT-TTC-TAATAAAACACTGTCTTATTTATGGTATGGATGGGATGTT-----A-AA------TGT----ATGACACAAAAACC-GGAGCAAAATGCCAGGGCGGGGC-CAAACCACAATTGCACAAAGATATTCAT-CCATC-ACAGAGGAATTTTAAAAAGAGAATCGC---TT-C-TA-TTTCAA-ATGTGC-TCCATCTTCGCCTTCTGTAACTGCCGGGCAATGTGTG-T-GTACAGATC-TTC--AATTCA-TTCAAATTTCC--TGGC-TTAGAATTCCA-----------CGTA------GGCAT-CA-T------CAT-T-ATTTTTTTCACTTTCCAAAAGGA-TGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACGAATTCGTCCCATGAAAACACAA-CAA-A-AAAATTCCCAGGGTGGGAATTGGAATGTCATGAAGCTCCCAATCCACCCAAACGAATTTCTGAAACATTCCAGAAGTGGTATGGTCC----TCAATAAAAATGCTTCACTGCGCCTGCTGGATGAACAAAACA-ATCGGCAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACTCATGATATAAAG-ACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAA--CATTGTGGT-CATCAGCT-TCAACACACAAAGAAGGTCCTTCTCTGG-TTTATGTCCG--GATATTTGTAAGTCCTCAAAGTCATGAAAGTGTATCAAAA-CTTAACACA-CACATGACCGCAACTGCCTGCGCGAACGGTCATTACAGCTATGAGTGATGATGATGACAGTTTCCAGTCACGCCAGATCATAGTTT-TGTCGCGGGCATCGAAGC--GA-GGT-TCGT----TGAAAACC-TA---ATAA------CG--AAAT-T--ATC---CGAGTCAAC-----AGAA-AGCGTTTCAGCTGAGCCTCACGTTTGTCAA-CAATTA-CAAATACA---GACCGTTAACT-ACCTTCGTCTGCTA----CT--GT--CAG------TTCTTTGTCAGGCAGAT--TC-ATCTGCGT------GTCCTCGATCTGTCCTGTCTGTG----A--TGATT--T----C-CTACA----CCTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCTTCAATGTTCCCCCACCTCAGTCAGTCTCTAT-----TA---AACTCCAATAATGTCCAACG--GAATATC-T-T--CA-AAATTAAAGTCCTTTCAAACAACTGTCT-AC--TTTTCAA-A----AA--TGAC-ACC-CATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAACAAAATTCCGCCAGAATTC-AAATTATCAGATAATTTTCGC---AA--ATTAGACATAAGGAGAAGAGTTTTCAATGAATAAACTTT-TAAAGA-AA-TG-TA--TATG---GTCATTGCTTATA-ACTTTGCTG-TTTTAACG--TCCTAA-TA-AT-TA-AAA--A----CAGC-TCTTC---A-T-T-CAGGGA-ACTTT-GTTTTGGTGTTTAATTCCGT-CATTTTTGAAACGAAGCGTTTATGTAGGTCAA----------T--------AT--------GTA-----T----GGA---TA-CATGTTGCTAAC-ACAATTCAGCA-ATGATTA-T---CGATACCAAAA--TGTAA
gi|17 : TATTTACATTT--GCA-ACTGTTTTTC-------CTA-CATAAC---ACT-ATTACGAG-CAA-ATACA-------TTACC--ACTACAT
gi|4 : ATTTACATTT--GCA-ACTG-TTTTCTC-----CTA-TATAAC---ACT-ATTA-TGA-GCA-ATACG-TAT---TTATC--ACT-CA-AAA---CTATATTG--GGTCAACAGA------GGGTCAACAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAAGT-AG--GTTCCG-G-TACT-AC-TTTTACTAAGTA-TTAC---A---GATCTAAGT-CTAT-TA-----AGGCCTAGG-----------AAACACACA-AAATTATTT--TATGAT-TTTATTTTTCTCCC-GTCAT-GGACTTTCA-TCAAAAA---AAATAT-ATC-TA-TAAAACACTGACCTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----A-AA------TGT----ATG--ACAAAAACC--GAGC---AT-CCAG-------------CCACAAAC-CACAAAGATA-TCATCCCAT--AAAGAGGA---TCAACAA-AGAATCAC---TTCC-TA-TTTCAA-ACGTGC-TCTATCTTCGCCTGTTGT-ACTG-CGGGCAATATGTG-TGGTAATAATCTTTC--AATTCA-TTTTCATTTCCCGTGGCTTTAGAATTTCACCATCATGTTGCGTACATCCCGGCGTACA-TGG----GAT-TCATTCATTTCACTTT-CAAAAGGA-TGAAAATGGT--CTGGAATAC--GCC--ACG--CTCGT--CATG-AAACACAA-CAACA-AAAATTTCCAGGGCGGAATTT---ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAATGAT-TGATACATGTCCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAATCAGATC--CAAATGCTACA
gi|15 : ATTTACATT-------ACTTGTTTTCTTTATCACTAACAAAAC----CT-ATTA-ACGAGCA-ATACG-TATCTCTTATCCTACTCCATAAATACCTATATGGGGTGTc
gi|6 : tacTTTACATTT--GCA-ACTG-TTTTCTC-----C--ACATAAC---ACT---TA-CGA-GCACATACGCTAT---TTAC---ACTGCA-AATTACCTATTTGA--GGTCAACAGA------G--TCA-CA-TTGTGCGTTATGAA-T-TTTGTTGAAAAGT-AG--GTTACC-GGTACTTAC-TTTTACTGAGTA-TTAC---ATAAG-------T-ATATATT-----AA---TAGATTG-A-AATCAAAC--CACA-AAAT-ATTTTTTA-GGTATTTATTTTTTCCTCAGTT----GACTTTC--TCAAAAATAAAAATAT-TTC-T-ATAAAACACTGTCTTA-TTATG--ATGGATGGAATGTT-----ATTA------TGT----ATG--ACAAAAACC-GGAG--ACAT-CCTGGCCGG-----AA--CACAAAT-CACAAACATA-TCAT-CCAT--ACAGAGG--TTCT--ATATAGAATCGCT--TT-C-CATTTTCAACATATGC-TCCATCTCCGCCTGTTGT-ACTGC---GCAATGTGTG-T-GTACA-ATC-TTTCAAATTCA-TT----TTTCCTGTGGC--TAGCATTTCA-----------C-----------CAA-CAGT------CAT-T-ATTTTTTCCCCT---CAAAAAGA-TGAAAAT--C--CTGGAATA---G-CAAACG--------TCATG-AAACACAA-CAA-A-AAAATTCC--AGGT-GGAATTG--ATGTCATGAAGCTCT--ATACG-ACAAATGCATTTATGAA--ATTCCAG----GATGTG-----------ATACACAT-CTCCACT--GCTT-----ATGAGCAAAACAGATT--CAAATGCTAC
gi|3 : TTTACATTT--GCAGACTG--TTTCTC-----TTA-TATAACCCAACTCACTG-TGA-GCA-ATACG-TAT---TTACG--ACT-CATAAATACCTATATGGA-GGTCAACAAAAGACACGG-TCA-CAGCCGT-CGT-ATGAA-TA-ATGTTGAAAAA--AGTAGTACCG-G-TACT----CTTTACTAAGTAATTACGA-A---G-------TGCAAT-TAGGCCTAA----AGATCTCA-GATGAAATAACACACAAAC-ATTT-TTATGAT-TTT-CTTTTTCTCCAGTC--TGGGCGTTC--TCAAAACA-AAAGTAT-ATCATA--AAAACACTGTCTTA-TTATTGTATGGATGGGCTGTT-----A-AAGGAAATTGTTTTAATGACA-ATAAACCTAGAGC---AT-CCACGGC----CACAAACCAC-AT------AAGATA-TAAT-CCAT--AAAGAGGAG--TCAACATAAGTATCGCATGTC-C-T--TTTCAA-ACGTGCATTTATCTTCGCCTGTTGT-ACTAAC--ACAATATGTGTT-GTACACATT-TTC---ATTCA-TTCATTTTTCCCGTGGC-TTAGAATTTCA-----------C-----------CAT-CA-
gi|8 : TTACATTT--GCA-ACCG-TTTTCTC-----CTA-CATAAC---ACT-ACTA-CGA-GCA-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATAT---GGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATATTG--AAAGTAG--GTTACCGG-TACT-ACTTTTTACTAAGA--TTAC---A---GAA-----G-TTAT-T------AA---TAGAT---GAAATC-AACACCACA-AAAT-A-------------------TTTCTCCA-TCATTGGACTTTCATTCAAAAAC-AAAAAATATTC-T-AT-AAACACTGTCTTACTTAT-GTATGGATGGGCTGTTA----A-AA------TGT----ATG---CAAACAT-------------CCAGGGC----CACAAAC--------CACAAAGATA-TCATGCCATCAAAAGAGG-ATCT---ACAGAGAATAGC---TTCC-TA-TTTCAA-ACGTGT-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTG-TGGTAC-TTTC-TTC--AATTCATTTC--ATTTCCCGTGGC-TTAGAATTGCA-----------C-----------CAT-CAGTTGCGTACATGG-ATTCATTTCACTTT-CAAAAGGA-TAAAAATGGT--TTGGAATAC--G-CAAACG--CTCAT--TATG-AAACACAA-CAA-A-CAAATTACAAGGGTGGAAAgtaaaaacttcgttgcgtacaatggtaaaatttccgatgatacatatctacttttaaaaaggaatgaaaaaaacgtctggaataaaagcaacgcttctgtcatgaaacacaaacaaccaaaattccaggtgggaattggatgtaatgaagtccatcccacaaacgatattataaaatccagaagttgaattgtacatgtcaataaaagcctcacatgctgatgagcaagttcagatccaaag
gi|12 : ataATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATTTGTTGAAAAGT-AG--ATTACCGG-TACT-AC-TTTTACTAAGTA-TTACAGAA---G-------T-CTAT-T------AA---TAGAT---GAAATC-AACACCACA-AAAT-ATTT-TTATAAT-TTTA-TTTTTTTCCTGTCAGTGGACTTTTG-TCAAAAATAAAAATAT-TTC-T-ATAAAACACCGTCTTACTTA-AGTATGGATGGGATGTTTTAAAA-AA------TGT----ATG--ACAAAAACC-GGAG
gi|13 : ccattgacatccctaA------TGT----ATGACA--AAAACT-GGAGCA---T-CCAG-----------AACTACAAAC-CACAAATATAT-----------ACAGAG---------------AATCGC---TT-CCTA-TTTCAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGATGT-ACTGC--GGCAAT--------------ACT-TTC--AATTCATTTC--ATTTCCCGTGGC-TTAaatcctattgagagcgtaagtaaagggcataaagtttgcatcatccgtattcactgatgcatatgacatgctctcca
gi|3 : ACTTTTAAAAAGGAATGAAAAAAACGTCTGGAATAAAAGC--AACGCTTCTGTC--ATGAAA-CACAAACAA-CCAAAATTCC--AGGTGGGAATTGG-ATGTAATGAAG-TCC--ATCC-CACAAACGATATTATAAAA---TCCAGAAGTTGAATTGTACATG-TCAATAAAA--GCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAA
gi|2 : tttacatttgcagactgtttctcttatataacccaactcactgtgagcaatacgtatttacgactcataaatacctatatggaggtcaacaaaagacacggtcacagccgtcgtatgaataatgttgaaaaaagtagtaccggtactctttactaagtaattacgaagtgcaattaggcctaaagatctcagatgaaataacacacaaacatttttatgattttctttttctccagtctgggcgttctcaaaacaaaagtatatcataaaaacactgtcttattattgtatggatgggctgttaaaggaaattgttttaatgacaataaacctagagcatccacggccacaaaccacataagatataatccataaagaggagtcaacataagtatcgcatgtccttttcaaacgtgcatttatcttcgcctgttgtactaacacaatatgtgttgtacacattttcattcattcatttttcccgtggcttagaatttcaccatcagtaaaaacttcgttgcgtacaatggtaaaatttccgatgatacatatctTTAACACATG-CACAAAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGCG-----AAAAGGTCCTTCTCTGGATTTATGTCCGATGATATTTGTAAGTCCTCAA-----TG----TATATCAAAAACCTA-CACAACGCAC--TCACAA--GCCTGCGTGCACGGCCATCACAGCCATGAGTGATGCCG------GTTTCCATTCACGCCAGATCATCTTTA-TGTCG-GGGCATCGAAGC--GAAGGTGTCGT----TGAAAACTATA---AGAA----------AAATCT--ATC----GAGTCAAC-----AGAACAGCGTT-CAG-TGAGC-TCATGTTTGTCAA-CAATTA-CAATTCCA---GACCGTCA-CT-ACCTTCGTCTGCTAGGACCTATGT--CAG------TTCTT---CAGGAAGAT--TC-ATCTGCGT--------CCTC----TGTCCTGTCTGTGTGA-A--TTATT--TG---C-CTACA----CCTGA-CGAGTGCCGCCCTG---TCCTTCATGTTCCCCCACCTCAGTC--TTTCTGT-----T----AACTCCGA-AATGTCC-ACG--AAATATC-TCT--CA-AAATCA-------TTC-AACAACTGTCT-GCAACTTTC-A-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTA----ATATTGC--GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTCAAAATTATCAGTT--TTTTTGCAAAAA--ATTAGACATAAGG---AGAGTTTTCAAT-CATATACTTT-TAAAGA-AATTG-TA--TAT----GTC-TTCTTTATATAC-TTGCT--TTTTAGCG--TCCTAA-TA-AT-T--AAA--A----CAGC-TCTTC---ATT-T-CATGGA-ACTTT-GTTTT-GTGT----TTTCGT-CATTTT--GAACGAAGCG-TTATGTGGGTCAA----------CAATGTGAAAT--------GTA-----T----GGA---AA-CATGTTGCTAAC-ACAATTCAGC--ATGATTA-T---CGAT-CAAAAA--TGgttcagatccaaag
gi|14 : cctctTCACGGCCATGAGCGAGGCTGGCATCGGTT-CCAGTCCCGAAAAATGAT-GTCCATGTCG-GGGCACCGCTGC--GA---T-TCTTCATTTTAAAAAG-TA---CTAC------CA--ACATAT--ATCTCTCAAGTGAAC-----AGAA-aa
gi|5 : agcccCATGGCTA-TGTTA-GGGCATCTAAGCCCGATGGCGTCTT----TGAAAACC-TAGCTATAAACATTATA--AGGT-TGGATC---CGAGTCCACCTTTTAGAA--GCTGTTCAG-TGAGC-TCATGTTTGTCAAACAATTATCTATTATATCCAACCACTCACTTACCTTCGTCTGCTT----TT--AT--CTA------TTCTATAT---ATA-AT--TC-ACATGCGT--------CC---ATCTGCC--GTCTGTGTTATA--TTATT--G----C-CTACAATCTCTTGAACCACTGTCGCCCTG---TCCTCA--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----CACCTAACTCC-ATATTTCCTTATT--ATATATCTT-T--CC-AAATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTCT--C--CTTTCAATATATTAA--TGACTACCGCATCACAAA----AATGTAGTTAACG-TGTGTGCGACACTACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATGATCAG-T--TTTTCGCA--AA--ATTAGACA-AATTATAAGAG-TTTCAAT-CATTAACTTT-TAGATA-TA-TATTA--TTTATTTGTC-TTTTTTAGATAC-TTGCC--TTTTAAC---TCCTAA-TATAT-TA-TAT--ATTTTCTAT-TCTTTTCAA-TGT-CATGAC-ACTTT-GTTTTGGT------TTTCGT-CA--TTTGACGCAGAGCGTTTAT-TAAGTCAACCAAATGTTTT--------AT--------ATA-----TTTTATGA---AA-CATGTTGCTAACTATGAATCATCATAT--TTA-TATCTGAT--CAAAAACTGTAA
gi|7 : GGGCATC-AAGC--GA-GGCGTCTT----TGAAAACC-TAGCTATAA------CATAAAGT-T--ATC----GAGTCCAC-----AGAA--GCGTT-CAG-TGAGC-TCATGTTTGTCAAACAATTA-CAAATCCA----ACCCTCACTT-ACCTTCGTCTGCTT----TT--AT--C-G------TT-----TCAA-TA-AT--TC-ACATGCGT--------CC---ATCT---CCGTCTG-G----A--T-ATTATT----C-CTACAAC--CTTGA-CCACTGTCGCCCTG---TCCTCA--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATACACCTA---TACTCCA-TATTTCCTTACGTTATATATC-T-TTCCA-ATATCA--GTCCA--CAAA-AACTGTCT-CC--TTTCAAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAAAAAT--GTGTTA---ACGTTGTG--CG-CAC-----ACAAACTTCTGCCAGAATTC-AAATGATCAG-T--TTTTCGCA--AA--ATTAGACAAAA----AAGAG-TTTCAAT-CATTAACTTT-TAAGTATAA-TG-TATTTATT---GTTATTTTTAAT--ACTTTGCAT-TTTTAAC---TCCTAA-TA-ATATATATATTA----CATC-TTTCA---A-TGT-CAATGACACTTT-GTTTTGGT------TTTCGT-CA--TTTGAA--GAGGCGTTTAT-TAAGTCAA----------TCC------AT--------GT------T----GAA---TATTATGT
gi|9 : ttaTCCGTCT--TA----TT--GTTTCAGCTATTCTTCTTTTTCATGCGCATCATCTATCTGCGTCCTGTAGTCATCAAT--GTCGTG---GTG----AATTTATT--TGCTGCGCTACA----CTTGA-CGAGTGCCG-CCTGTCATCTTCATCGCTCCTCaaatgtgaaacatg
gi|16 : gtcttccttcgtggattgtccttaagtcgcgattgatgacatctgtaagtcccatccatgtataatttttccatataacttagatctaaatcgcacttccacagcctgcgtgcccgacgcccacacggcctcggagctgatgcggtttcctattacagttgtccaggatcatttctctatgtcgggttgcaatcaatagtgtgaggtgtttgaatcaaaccgatagtatgaaaacagctcaagtcacagacatcagtttttcaacgcttctgagagtcttcaatttgttccacccattacaactctcagaactgttctccagtcctttcggtacccttctgcatctgctatggtt---AACTCCA-TATTGTCCA-CG--ATATATC-T-TT-CC-AAATCA--GTCCA--CAAA-AACTGTCT-TC--CTTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCAT
gi|10 : G--GAATATC-T-C--GAGAAATCAG-----CTTCAT-CAACTGTCTTAA--ATTTCAA-A----AAAGTGAC-ACC-GATCACGACTGTTAGTGTA----ACGTTGC--GCG----CCCGAAC----TTCCGCCTGAATTC-TAATTACCAG-TA---TTTAC---AAGCATTAGACATAAG--GAAGAGTTTCTAATTCATATACTTTAGAAAGA-AA--G-TA--T-TG---TTT-TTG-TTA-A-A---TACTGCTTTTAACGCATCCTAATTA-AT-TG-AAG--A-----AGCATCTTC---A-T-TACA-TGA-ACTTTGGTCTTTGTG---ATTTCCGTGCATTTT---AACGAAGCG-TTATGTGCGTCAA----------CA-------ATTGATTTGAGTATTGGCT----AGATTTTA-CATGTT-CTAAC-ACA--TCAGCA-A--GTTATT---CGAT-CCAAAA--
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|11 ): AGAATTCAAATTTAATCTAATCTTTATGCTTCTGGCAAAATTAGACATTGGAAGAGTTTATCAATCATAATTGAATGAATAATAAATAATTGTCGTACGTTCTTTAGTGATTATTTTTTAGCTAGTGTTCAGAGCGTCCTTTAGTTCTATAATTAAATTACATATGCTCTCACCATTCTACATTGGATCTTTTGTTAATGTGGGTTATCGTACTTGTGGTAATCGAAAAAGTGCGCTTTTGATTAGTGGCAGACTAATATCTTGCGTTGAAATGTGTATCGGTAAATCACTGTTGTCTAACAAATGAATCACGGATTGGTCGCAATTGCTCATCGATCAAAAATGTAAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 11111111 111 1 11 111111 6666666666666666666666666666666666666666666 1 111 1 1 1 11111 222222 1111 111 2222222222 11 1 11 2222222222222 222 11111111 111111 1111 444444444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 2222222 11111111111 111 1 1 22 11 11 11 2222222 22222 22222 1 11 11 11111111111111111 1 2 2 11 1 2 1 55555 33333 33333 11 5555555555 333333 1 1 333333 33333 222 222 4444444 222222 4444444 111 1111 11 33333333333333333333333333 11111 444444444444 1 11 1 222222 11 111111 1 2222222 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 11 55555555 11 33333 2222222 22 11 111 22 1111 1 3333333333 2 11 11 111 2222222 222222 111111 11 2222 11 1111 111 1111 222222222 11111 3333333333333333333 22222 1 1 111 222 222222222222 111 1 222 22222 11 1 1 1 88888888888888888888888888888888888888888 1111 1 3333 22222222 1 1 1 1
lowQualScore : 77 33 5 5 1 5 33333333 5 5 5 5 5 000 888 0 3 33 999999 6 6 6 6 7 99 1 6 6 6 3333333333333333333333333333333333333333333 6 3 55 6 6 6 3 44 333 4 6 4 88 6 5 9 5 2 66666 5 222222 2222 77 5 5 0 5 000 5 8888888888 3 88 6 2 3 55 3 9999999999999 6 6 1 6 6 6 6 000 4 55555555 6 111111 5555 333333333333 6 1 6 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 88 8 11 3 11 1111111 99999999999 8 8 111 8 6 0 3 33 3 2 33 00 33 3 4444444 77777 3 2 55555 9 0 11 2 33 77777777777777777 4 5 0 0 88 5 0 5 00000 6 7 33333 33333 7 88 2222222222 888888 7 3 0 3 555555 22222 555 333 3 3 2 1 4444444 3 888888 1 1 22 0000000 6 99 6 666 99 888 2 6 111 0000 33 6 99999999999999999999999999 7 66666 6 333333333333 8 6 8 99 3 8 5 8 4 000000 88 8 888888 6 6666666 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 11 33333333 11 5 0 11111 2222222 88 11 8 1 1 444 8 8 44 5555 0 4444444444 3 1 77 11 1 5 6 000 6 9999999 000000 111111 55 6 77 5 7777 0 88 8 0 3 2 7777 6 000 6 3333 999999999 99 6 99 11111 7 6 6 6 22 6 1 6 4444444444444444444 7 33333 5 3 555 111 8 8 8 222222222222 8 444 0 99 8 8 5 999 00000 8 11 0 3 0 0 1 77777777777777777777777777777777777777777 5555 8 2 0 1111 44444444 0 0 0 2 0
lowQualScore : .. .. . . . . ........ . . . . . ... ... . . .. ...... . . . . . .. . . . . ........................................... . . .. . . . . .. ... . . . .. . . . . . ..... . ...... .... .. . . . . ... . .......... . .. . . . .. . ............. . . . . . . . ... . ........ . ...... .... ............ . . . . ........................................................... . .. . .. . .. ....... ........... . . ... . . . . .. . . .. .. .. . ....... ..... . . ..... . . .. . .. ................. . . . . .. . . . ..... . . ..... ..... . .. .......... ...... . . . . ...... ..... ... ... . . . . ....... . ...... . . .. ....... . .. . ... .. ... . . ... .... .. . .......................... . ..... . ............ . . . .. . . . . . ...... .. . ...... . ....... ............................................................... . .. ........ .. . . ..... ....... .. .. . . . ... . . .. .... . .......... . . .. .. . . . ... . ....... ...... ...... .. . .. . .... . .. . . . . .... . ... . .... ......... .. . .. ..... . . . . .. . . . ................... . ..... . . ... ... . . . ............ . ... . .. . . . ... ..... . .. . . . . . ......................................... .... . . . .... ........ . . . . .
lowQualScore : 99 66 7 7 4 7 11111111 7 7 7 7 7 000 666 1 2 66 222222 7 7 7 7 8 22 0 7 7 7 3333333333333333333333333333333333333333333 7 2 77 3 7 7 2 22 555 7 7 2 33 7 5 3 0 5 77777 7 111111 1111 99 7 7 7 7 000 7 0000000000 2 77 7 5 3 88 0 8888888888888 7 7 0 7 7 7 7 000 2 33333333 7 888888 0000 333333333333 7 0 7 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 00 2 00 6666666 44444444444 0 0 888 0 0 0 2 88 0 5 88 22 88 2 2222222 00000 2 5 00000 2 0 00 5 88 00000000000000000 0 0 0 0 00 5 0 0 00000 7 3 33333 33333 3 33 7777777777 333333 3 3 7 3 000000 77777 777 333 2 2 5 0 2222222 2 888888 0 0 00 0000000 7 22 7 888 22 777 5 7 777 0000 33 7 77777777777777777777777777 5 77777 7 333333333333 0 0 0 00 8 0 4 0 4 000000 00 0 222222 0 0000000 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 0 00 44444444 00 6 8 88888 6666666 66 00 0 0 0 000 0 0 44 0000 0 5555555555 2 0 22 00 4 5 7 222 7 0000000 888888 888888 88 7 00 6 2222 8 00 0 8 2 8 0000 7 222 7 5555 333333333 22 7 22 88888 3 7 7 7 00 7 0 7 7777777777777777777 5 33333 7 3 000 000 0 0 0 444444444444 0 000 0 88 0 0 0 000 00000 0 22 6 8 6 0 8 00000000000000000000000000000000000000000 0000 0 5 0 5555 88888888 0 0 0 5 0
consensus : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATCAAACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CCAGGGC----CGCAAACCACAAAC-CACAAAGATA-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACG-TCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCAAA-AACTT-ACAC---AA-CGCAC--T--CGCAA--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGGCGT-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCAT-G-TC--TATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTA-CAANT----C-CAG-ACCG-T----C-ACTTACCTTCG-------TCTGC--------------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANG----TAGATTCATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA-CT--TGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AG-TCCAT-CAAACAACTGTCT-C--C-TTTCAA---A--AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTTA-ATAC-TTGC-T-TTTTAACG--TCCTAA-TA-AT-TA-AAA--A----CAGC-TCTTC---ATNTCATGGA-ACTTT-GTTTTGGTG--TTT-----CGT-CATTTTTGAAACGAAGCGTTTATGTAGGTCAA-C-A-----AAT--------G---TA-----TG--------GA---TA-CATGTTGCTAAC-ACG-ATTCAGCA-ATGAT-TA-TC-GAT-CNAAAA-TGTAA
Reference ( family-367 ) : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATCAAACANCACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGCTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CCAGGGC----CACAAACCACAAAC-CACAAAGATA-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAANN-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTG--ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATGTGGTACATG-CCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACANNNNNNNNNNNNNNNNNTTAACACATGCACA-AAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGC-----GAAAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCAAA-AACCT-ACAC---AA-CGCAC--T--CACAA--GCCTGCGTGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCCGGCAT-CGGTTTC------CANTCNCGNNAGATCAT-G-T---TATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCNAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTA-CAATT----C-CAG-ACCG-T----C-ACT-ACCTTCG-------TCTGC--------------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANG----TA-ATTCACNTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAACCT--TGA-CNANTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCCGATATTNCCCTACG--ATATATCTTTCAAA-ATC--AG-TCCATTCAAACAACTGTCTNC--C-TTTCAA---A--AA--TGAC-ACCGCATCACAANTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCGAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATN--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATNNACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TNGTC-----TTTTTTATATAC-TTGC-T-TTTTAACG--TCCTAA-TA-AT-TA-AAA--A----CAGC-TCTTC---ATGTCATNGA-ACTTT-GTTTTGGTG--TTT-----CGT-CATTTTTGAAACGAAGCGTTTATGTGAGTCAA-C-------AAT--------G---TA-----TG--------GA---NA-CATGTTGCTAAC-ACG-A-TCAGCA-ATG-T-TA-TC-GAT-CCAAAA-TGTAA
gi|1 : TATTTACATTTTTGCA--ACT-GCTTTTCTCCTAACA-TAAC---A----CT-ATTA-GAGGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGGAGGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGC-ATGAAGTATTTGTTGAAAA--AGAGGTAACCG-TACT-ACTTTT-ACTAAGT--TTAC-----------A---G----TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAA-TCAAAAAACACAAAATATTTATTATGAT-TTTATTTTTTTTCCAGTCATTGGACTTTCAT-CAAAAATAAAA--TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTATTTATGGTATGGATGGGATGTT-----AA-A------TGT----ATGACACAA-AAACC-GGAG-CAAAATGCCAGGGCGGGGC-CAAACCACAATTGCACAAAGATATTCAT-CCATC-ACAGAGGAATTTTAAAA-AGAGAATCGC-T-T-CTATTT-CAA-ATGTGC-TCCATCTTCGCCTTCTGTAACTGCCGGGCAATGTGTGT-GT-ACAGATC-TTC--A---ATTCA----TTCAA----------ATTTC-C--TGGC-TTAGAATTCCACGTAGGCAT-CA--------T-----------C-A------------------T---T--ATTTTTTTC-ACTTTCCAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACGAATTC--GTCCCATGAAAACACAA-CAA-A-AAAA-TTCCCAGGGTGGGAATTGGAATGTCATGAAGCTCCCAATCCACCCAAACGAATTTCTGAAACATTCCAGAAGT-GGTATGGTCC----TCAATAAAAATGCTTCACTGCGCCTGCTGGATGAACAAA-ACA-ATCGGCAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACTCATG-ATATAAAGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAA--CATTGTGGT-CATCAGCT-TCAACACACAAAGAAGGTCCTTCTCTGG-TT-----TATGTC-----CG--GATATTTGTAAGTCC--TCAAAGTCATGAAAGTGTA------TC-AA-AACTTAACAC----A-CACATGAC--CGCAACTGCCTGCGCGA---ACGGTCATTACAGCTATGAGTGATGATGATGA-CAGTTTC------CAGTCACGCCAGATCATAG-T---TTTGTCGCGG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGT-TC-GTTGA---AAACC--TA---A-TAA------CG--A-AA--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AGAA------------AGC-GTTTCAGCTGAGC-CTCACGTTTG-TC-AACAATTA-CAAAT----A-CAG-ACCG-T----TAACT-ACCTTCG-------TCTGC--------------------T-----AC-TG--TCAG---TTC----TTTGTCAGG----CAGATTCATCTGCGTGTCC-----TCGATC--TGTCCTGTCTGTG----ATGATTT-C----CTACA--CC--TGA-CGACTGCCGCCCTG---TCT-TCAA-TGTTCCCCCACCTCAGTCAGTCTCTAT-----TA---AACTCCAATAATGTCCAACG--GAATATC-TTCAAA-ATTAAAG-TCCTTTCAAACAACTGTCTAC--T-TTTCAA---A--AA--TGAC-ACC-CATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAACAAAATTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AGATAATTTT------C--GC---AA-ATTAGAC--ATAAGGA-GAAGAGTTT-TCAA-TGAATAAACTTT-TAAAGA-AA-TGTA--T-----A-----TGGTCA----TTGCTTATA-ACTTTGC-TGTTTTAACG--TCCTAA-TA-AT-TA-AAA--A----CAGC-TCTTC---AT-TCAGGGA-ACTTT-GTTTTGGTG--TTTAATTCCGT-CATTTTTGAAACGAAGCGTTTATGTAGGTCAA-T--------AT--------G---TA-----TG--------GA---TA-CATGTTGCTAAC-ACA-ATTCAGCA-ATGAT-TA-TC-GATACCAAAA-TGTAA
gi|10 : ATATCTCGAGAA-ATC--AGCTTCAT-----CAACTGTCTTA--AATTTCAA---A--AAAGTGAC-ACCG-ATCACGACTGTTAGTGTA----ACGTTGCG--CG-C---CCGAAC----TTCCGCCTGAATTC-TAATT--ACC-AG-T--ATTT---------AC--AAGCATTAGAC--ATA---AGGAAGAGTTT-CTAATT-CATATACTTTAGAAAGA-AA----G--T-----A-----TTGTT-----TTTGTTAAATAC--TGC---TTTTAACGCATCCTAATTA-AT-TG-AAG--A-----AGCATCTTC---ATTACAT-GA-ACTTTGGTCTTTGTGATTTC-----CGTGCATTTT---AACGAAGCG-TTATGTGCGTCAA-C-------AATTGATTTGAG---TATTGGCTA--------GATTTTA-CATGTT-CTAAC-AC--A-TCAGCA-A-G-T-TATTC-GAT-CCAAAA-
gi|11 : ggaAGAATTC-AAATTTAATCTAA-T--CTTTATGCTTCTGGC--AAA-ATTAGAC--ATT---G-GAAGAGTTTATCAA-T-CATAA----T-TGAATG-AA-TA-A--TAAATAA-----TTGTCGTACGTTCTTTA-GTGA-TTAT-T-TTTTAGC
gi|12 : ATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATTTGTTGAAAA--GTAGATTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-AAGTCTA------TT-A-A---T---AGAT-GAAATC-AACACCACAAAATATTT-TTATAAT-TTTATTTTTT-TCCTGTCAGTGGACTTTTGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-T-ATAAAACACCGTCTTACTTA-AGTATGGATGGGATGTTTTAAAAA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-A---AT-CCtagtgttcagagcgtcctttagttctataattaaattacatatgctctcaccattctacattggatcttttgttaatgtgggttatcgtacttgtggtaatcgaaaaagtgcgcttttgattagtggcagactaatatcttgcgttgaaatgtgtatcggtaaatcactgttgtctaacaaatgaatcacggattggtcgcaattgctcatcgatcaaaaatgtaaa
gi|13 : ccattgacatcccta-A------TGT----ATG--ACAA-AAACT-GGAG-C---AT-CCAG-----------AACTACAAAC-CACAAATATA-T------------------------ACA-G-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGATGT-ACTG-C-GGCAAT--------------ACT-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAtattgagagcgtaagtaaagggcataaagtttgcatcatccgtattcactgatgcatatgacatgctctcca
gi|14 : GCCCTCACGGCCATGAGCGAGGCTGGCAT-CGG-TTC------CAGTCCCGAAAAATGAT-G-TC--CATGTCG-GG--GC-ACCGC-TGC--G-A-TTCTTCATTTTA---AAAAG--TA-CTACCAA------CA--T-A----T--ATCTCTCAAGTGAAC-----AG-A------------A
gi|15 : aTACATTT--ACATTACTTG-TTTTCTT-TATCACTAAC---AAAACCT-ATTAACGAGC-A-ATACG-TATCTCTTATCCTACTCCATAAATACCTATATGG--GGT
gi|16 : ---AACTCC-ATATTGTCC-ACG--ATATATCTTTCCAA-ATC--AG-TCCA--CAAA-AACTGTCTTC--C-TTTCAA---A--AA--TGAC-ACCGCATgt
gi|17 : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTT-TCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGCAA-ATACA-------TTACC--ACTACAT
gi|2 : TTAACACATGCACA-AAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGC-----GAAAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCAAA-AACCT-ACAC---AA-CGCAC--T--CACAA--GCCTGCGTGC---ACGGCCATCACAGCCATGAGTGATGC-------CGGTTTC------CATTCACGCCAGATCATCT-T---TATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--GAA-GGTGTC-GTTGA---AAA-------CTA-TAA------GA--A-AAATCT--AT----CGAGTCAAC-----AG-AAC----------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TC-AACAATTA-CAATT----C-CAG-ACCG-T----C-ACT-ACCTTCG-------TCTGC--------------------TAGGACCTATG--TCAG---TTC------T-TCAGG----AAGATTCATCTGC--GTCC---------TC--TGTCCTGTCTGTGTGA-ATTATTTGC----CTACA--CC--TGA-CGAGTGCCGCCCTG---TCCTTC-A-TGTTCCCCCACCTCAG-T--CTT-TCTG----TT---AACTCCGAAATGTCC--ACG--AAATATCTCTCAAA-AT--------CATTC-AACAACTGTCTGCAAC-TTTC-A---A--AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTA----ATATTGC--GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTCAAAATT--ATC-AGTT--TTTT------T--GCAAAAA-ATTAGAC--ATA---A-GGAGAGTTT-TCAA-T-CATATACTTT-TAAAGA-AATTGTA--T-----A-----T-GTC-----TTCTTTATATAC-TTGC-T-TTTTAGCG--TCCTAA-TA-AT-T--AAA--A----CAGC-TCTTC---ATTTCATGGA-ACTTT-GTTTT-GTGT-TTT-----CGT-CATTTT--GAACGAAGCG-TTATGTGGGTCAA-CAATGTGAAAT--------G---TA-----TG--------GA---AA-CATGTTGCTAAC-ACA-ATTCAGC--ATGAT-TA-TC-GAT-CAAAAA-TG
gi|3 : cctctTTTACATTT--GCAG-ACT-G-TTT-CTCTTA-TA-TAACCCAA----CTCACTG-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTACG--ACT-CATAAATACCTATATGGA-GGTCAACAAAAGACACGG-TCA-CAGCCGT-CGT-ATGAA-TA-ATGTTGAAAAAAGTAG--TACCGGTACT---CTTT-ACTAAGTAATTACGAAGTGCAATTA---G-G--CCTA--------AAGA---TCTCAGAT-GAAAT--AACA-CACAAA-CATTT-TTATGAT-TTT-CTTTTTCTCCAGTC--TGGGCGTTC-T-CAAAA-CAAAAG-TATATCATAA--AAACACTGTCTTA-TTATTGTATGGATGGGCTGTT-----AA-AGGAAATTGTTTTAATG--ACAATAAACCTAGAG-C---AT-CCACGGC----CACAAACCACATA-------AGATA-TAAT-CCAT--AAAGAGGA--GTCAACATA-AGTATCGCATGTCCT-TTT-CAA-ACGTGCATTTATCTTCGCCTGTTGT-ACTAAC-A-CAATATGTGTTGT-ACACATT-TTC--ATTCATTCA-TTTTTCCCGTGGCTTAGAATTTCACCATCAG-TAAAAACTTCGTTG---CGTACA------A-TGGTAAAATTTCCGA------------------T---G--ATACATATCTACTTT-TAAAAAGGAATGAAAAAAACGTCTGGAATAAAAGC--AACG--CTTCTGT--CATG-AAACACAAACAA-CCAAAA-TT-CCAGG-TGGGAATTGG-ATGTAATGAAG-TCC--ATCCC-ACAAACGATATTATAAA--AT-CCAGAAGTTGA-ATTGTACATG-TCAATAAAA--GCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAGTTCAGATC--CAAAaa
gi|4 : ATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-TA-TAAC---A----CT-ATTA-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTATC--ACT-CA-AAA---CTATATTG--GGTCAACAGA------GGGTCAACAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTT-CCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTAAGTCTATTAA-GGCCT---AGG--------AAACA-CACAAAATTATT-TTATGAT-TTTATTTTT-CTCCCGTCAT-GGACTTTCAT-CAAAAA---AAA-TATATC-TA-TAAAACACTGACCTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-G-AG-C---AT-CCAG-------------CCACAAAC-CACAAAGATA-TCATCCCAT--AAAGAGGA---TCAACA-A-AGAATCAC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCTATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCG-GGCAATATGTGTGGTAATA-ATCTTTC--A---ATTCATT--TTC------------ATTTC-CCGTGGCTTTAGAATTTCAC-----CAT-CATGTTGCG-TA----------C-ATCCCGGCGTACATGGGATT---C--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGT--CTGGAATAC--GCC--ACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAACA-AAAATTT-CCAGGGC-GGAATTT--ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAAT-GAT-TGATACATGTCCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-TCAGATC--CAAATGCTACAg
gi|5 : CAT-GGC---TATGTTA-GG--GC-ATCTA-AGCCCG-ATGGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAAACATTATA--A-GG--TTGGATC---CGAGTCCACCTTTTAG-A------------AGCTG-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTATCTATTATATC-CA--ACCACT----C-ACTTACCTTCG-------TCTGC--------------------T-----TT-TA--TCTA---TTC----TAT---ATA----TA-ATTCACATGC--GTCC--------ATC--TG--CCGTCTGTGTTATATTATT-GC----CTACAATCTCTTGAACCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----CACCTAACTCC-ATATTTCCTTATT--ATATATCTTTCCAA-ATC--AG-TCCA--CAAA-AACTGTCT-C--C-TTTCAATATATTAA--TGACTACCGCATCACAAA----AATGTAGTTAACG-TGTGTGCGACACTACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGACAAATT---A-TAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAGATA-TA-TAT---T-----ATTTATTTGTC-----TTTTTTAGATAC-TTGC-C-TTTTAAC---TCCTAA-TATAT-TA-TAT--ATTTTCTAT-TCTTTTCAATGTCATGAC-ACTTT-GTTTTGGT---TTT-----CGT-CA--TTTGACGCAGAGCGTTTAT-TAAGTCAA-CCA-----AAT--------GTTTTA-----TATATTTTATGA---AA-CATGTTGCTAACTATGAA-TCATCATATT-TATA-TCTGAT-CAAAAACTGTAAc
gi|6 : TTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCC-A-CA-TAAC---A----CT---TA-CGAGC-ACATACGCTAT---TTAC---ACTGCA-AATTACCTATTTGA--GGTCAACAGA------G--TCA-CA-TTGTGCGTTATGAA-TTT-TGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACTTACTTTT-ACTGAGTA-TTAC-----------ATAAGTA--TATA------TTAA-----T---AGATTGAAATCAAAC--CACAAAATATTT-TTTAGGTATTTATTTTTTCCTCAGTT----GACTTTC-T-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TA-TAAAACACTGTCTTA-TTATG--ATGGATGGAATGTT-----ATTA------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAGAC---AT-CC-TGGC----CGGAA--CACAAAT-CACAAACATA-TCAT-CCAT--ACAGAGG---TTCTATA-T-AGAATCGC-T-TTCCATTTTCAACATATGC-TCCATCTCCGCCTGTTGT-ACTGC---GCAATGTGTGTG-T-ACA-ATC-TTTCAA---ATTCA-T--TT---------------TTC-CTGTGGC-T-AGCATTTCAC-----CAA-CA------G-T-----------C-A------------------T---T--ATTT-TTTC--CCCT-CAAAAAG--ATGAAAAT--C--CTGGAATA---GC-AAACG--------T--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGG-TGG-AATTG--ATGTCATGAAGCTCT--ATACG-ACAAATGCATTTATGAA--ATTCCAGGA-----TGTGATACAC-----------AT-CTCCA-----C-TGCT-TATGAGCAAA-ACAGATT--CAAATGCTAC
gi|7 : -GG--GC-ATC-A-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CATAA-AG--TT--ATC----GAGTCCAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTA-CAAAT----C-CA--ACCC-T----C-ACTTACCTTCG-------TCTGC--------------------T-----TT-TA--TCG------------TT-TCAA-----TA-ATTCACATGC--GTCC--------ATC--T---CCGTCTGGAT-A--TTATT--C----CTACAACCT--TGA-CCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATACACCTA---TACTCC-ATATTTCCTTACGTTATATATCTTTCCAATATC--AG-TCCA--CAAA-AACTGTCT-C--C-TTTCAA---A--AAA-TGAC-ACCGCATCACAAAAAT--GTGTTA---ACGTTGTG--CG-CACAC-AAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--A-A---A-AAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAAGTATAA-TGTATTT-----A-----TTGTT-----ATTTTTA-ATACTTTGCAT-TTTTAAC---TCCTAA-TA-ATATATATATTA----CATC-TTTCA---ATGTCAATGACACTTT-GTTTTGGT---TTT-----CGT-CA--TTTGAA--GAGGCGTTTAT-TAAGTCAATC-------CAT--------G---T------TG--------AA---TATTATGT
gi|8 : ttaTTACATTT--GCA--ACC-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ACTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--G-TCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATATTGAAA---GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTTTACTAAG-A-TTAC-----------A---G-AAGT-TA------TTAA-----T---AGAT-GAAATCAA-CACCACAAAATATTT-------------------CTCCA-TCATTGGACTTTCATTCAAAAACAAAAAATATT-C-TA-TAAA-CACTGTCTTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-AA-----TGT----ATG---CAA-A----------C---AT-CCAGGGC----CACAAACCACAAA--------GATA-TCATGCCATCAAAAGAGGA--T-CTACA-G-AGAATAGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGT-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-ACT-TTC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTGCAC-----CAT-CA------GTTG----------C-G------------------TACATGGATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATAAAAATGGT--TTGGAATAC--G-CAAACG--CTC--AT--TATG-AAACACAA-CAA-A-CAAA-TTACAAGGGTGGAAAaaatgtgaaacatg
gi|9 : ataTCCTTCG-TGGATTGTCCTTAAGTCGCGATTGATGACATCTGTAAGTCCCATCCA--T-------GTATAATTTTTCCATATAACTT-AGATCTAAATCGCAC--TTCCACA---GCCTGCGTGCCCGACGCCCA-CACGGCC-T---CGGAGCTG--ATGCGGTTTCCTATTACAGTTGTCCAGGATCAT-T-TCTCTATGTCG-GGTTGCAATCAATAGT--G-T-GAGGTG-TTTGAATCAAACCGATAG-TA-TGA------AA--ACAG--CT--------CAAGTC-AC-----AG-ACATCAGTTTTTCAAC-GCTTCTG-AGAGTCTTCA-ATTTGTTCCACCCATTA-CAACT----CTCAGAACTG-TTCTCC-AGT-CCTTTCGGTACCCTTCTGCATCTGCTATGGTTTCCGTCTT-----AT-TGTTTCAGCTATTCTTCTTTT-TCATGCGCATC-ATCTATCTGC--GTCCTGTAGTC-ATCAATGTCGTG---GTGA-A-TTTATTTGCTGCGCTACA--CT--TGA-CGAGTGCCG-CCTGTCATCT-TC-ATCGCTCCTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 11111111 111 1 11 111111 6666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111 1 1 1 11111 222222 1111 111 777777777777777777777 111 1 11 2222222 111 222 11111111 111111 1111 444444444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 2222222 11111111111 111 1 1 222 11 11 11 2222222 1 11 22222 1 11 11 1 1 1 11 1 1 1 22222 33333 33333 11 5555555555555555555555555 1 3333333 11 2222 222 2222 222222 11 111 1111 11 33333333333333333333333333 11111 444444444444 1 11 1 22222 11 3333333333333333 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11 55555555 11 33333 2222222 22222 111 22 1111 1 3333333333 1 11 11 222 1 2222222 111111 11 2222 11 1111 1111 222222222 11111 3333333333333333333 11111 111 1111 111 3333333333333 111 11111 22222222222222 1111111 111 222 1111111 1111 11111 111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 3333333333333333333 111
lowQualScore : 77 33 5 5 1 5 33333333 5 5 5 5 5 000 888 0 3 33 999999 6 6 6 6 7 99 1 6 6 6 3333333333333333333333333333333333333333333 6 3 222 6 44 6 6 3 44 333 4 6 77 6 6 5 9 5 1 66666 5 222222 2222 77 5 5 0 5 000 5 555555555555555555555 5 5 000 5 0 1 33 3 3333333 333 6 6 1 6 6 6 6 000 4 55555555 6 111111 5555 333333333333 6 1 6 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 88 8 11 3 11 1111111 99999999999 8 8 111 8 6 0 6 111 1 2 33 00 33 3 0000000 3 0 0 3 22 55555 9 0 11 2 33 1 5 5 5 88 5 5 5 66666 6 7 33333 33333 7 88 6666666666666666666666666 3 0000000 88 3 2222 0 333 3 3 2 1 3 4444 3 888888 4 1 11 8 0 6 99 6 666 99 888 2 6 111 0000 33 6 99999999999999999999999999 7 66666 6 333333333333 8 6 8 99 3 8 5 00000 1 8 88 8 4444444444444444 7777 88888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 8 11 33333333 11 5 0 11111 2222222 55555 8 8 444 8 8 44 5555 0 4444444444 6 0 77 11 1 1 6 99 6 555 9 6 1111111 111111 55 6 6 5 7777 0 88 8 0 3 7777 6 99 6 3333 999999999 99 6 99 11111 7 6 6 6 6 1 6 4444444444444444444 66666 555 2222 555 6666666666666 555 99 66666 6 6 6 88 88888888888888 6 3333333 7 6 111 6 6 99 6 2 222 6666666 6 9 4444 6 66666 9 555 6 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 8 99 77 7777777777777777777 8 444 8 1 8
lowQualScore : .. .. . . . . ........ . . . . . ... ... . . .. ...... . . . . . .. . . . . ........................................... . . ... . .. . . . .. ... . . .. . . . . . . ..... . ...... .... .. . . . . ... . ..................... . . ... . . . .. . ....... ... . . . . . . . ... . ........ . ...... .... ............ . . . . ........................................................... . .. . .. . .. ....... ........... . . ... . . . . ... . . .. .. .. . ....... . . . . .. ..... . . .. . .. . . . . .. . . . ..... . . ..... ..... . .. ......................... . ....... .. . .... . ... . . . . . .... . ...... . . .. . . . .. . ... .. ... . . ... .... .. . .......................... . ..... . ............ . . . .. . . . ..... . . .. . ................ .... ..................................................... .. . .. ........ .. . . ..... ....... ..... . . ... . . .. .... . .......... . . .. .. . . . .. . ... . . ....... ...... .. . . . .... . .. . . . .... . .. . .... ......... .. . .. ..... . . . . . . . ................... ..... ... .... ... ............. ... .. ..... . . . .. .............. . ....... . . ... . . .. . . ... ....... . . .... . ..... . ... . . .............................................................. . . .. .. ................... . ... . . .
lowQualScore : 99 66 7 7 4 7 11111111 7 7 7 7 7 000 666 1 2 66 222222 7 7 7 7 8 22 0 7 7 7 3333333333333333333333333333333333333333333 7 2 333 7 00 7 7 2 22 555 7 7 33 7 7 5 3 0 0 77777 7 111111 1111 99 7 7 7 7 000 7 777777777777777777777 7 7 000 7 7 4 66 0 2222222 777 7 7 0 7 7 7 7 000 2 33333333 7 888888 0000 333333333333 7 0 7 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 00 2 00 6666666 44444444444 0 0 888 0 0 0 4 222 0 5 88 22 88 2 8888888 2 2 0 2 22 00000 2 0 00 5 88 0 0 5 0 00 5 5 0 55555 7 3 33333 33333 3 33 7777777777777777777777777 3 3333333 33 7 7777 7 333 2 2 5 0 2 5555 2 888888 2 0 00 0 8 7 22 7 888 22 777 5 7 777 0000 33 7 77777777777777777777777777 2 77777 7 333333333333 0 0 0 00 8 0 4 00000 0 0 00 0 0000000000000000 0000 22222222222222222222222222222222222222222222222222222 00 0 00 44444444 00 6 8 88888 6666666 44444 0 0 000 0 0 44 0000 0 5555555555 0 6 22 00 4 0 7 22 7 555 2 7 2222222 888888 88 7 0 6 2222 8 00 0 8 2 0000 7 22 7 5555 333333333 22 7 22 88888 3 7 7 7 7 0 7 7777777777777777777 77777 333 7777 000 7777777777777 888 22 77777 7 7 7 33 55555555555555 7 7777777 5 7 777 7 7 22 7 5 555 8888888 7 8 8888 0 77777 8 888 7 7 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 00 00 2222222222222222222 0 000 0 0 0
consensus : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----AGGGCCG----AA-CCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAG-TGATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AG-TCC-A-CAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA---A--AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA-AA-N--A----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGANTCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
Reference ( family-367 ) : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----AGGGCCG---CAAACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAG-TGATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGGCGTCGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AANTC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGTAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AG-TCC-ATCAAACAACTGTC-T-C--C--TTTCAA---A--AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA-AA-A--A----CA---GC-TCT--TC---ATNTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGATTCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CNAAAA-TGTAA
gi|1 : TATTTACATTTTTGCA--ACT-GCTTTTCTCCTAACA-TAAC---A----CT-ATTA-GAGGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGGAGGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGC-ATGAAGTATTTGTTGAAAA--AGAGGTAACCG-TACT-ACTTTT-ACTAAGT--TTAC-----------A---G----TCTA------TTAA-A---T---AGAT-G-AATCAAA-AAA-CACAAAATATTTATTATGAT-TTTATTTTTTTTCCAGTCATTGGACTTTCAT-CAAAAAT-AAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTATTTATGGTATGGATGGGATGTT-----AA-A------TGT----ATGACACAA-AAACC-GGAG-CAAAATGCC-----AGGGCGGGGCCAAACCACAATTGCACA-AAGAT---ATTCAT-CCATC-ACAGAGGAATTTTAAAA-AGAGAATCGC-T-T-CTATTT-CAA-ATGTGC-TCCATCTTCGCCTTCTGTAACTGCCGGGCAATGTGTGT-GT-ACAGATC-TTC--A---ATTCA----TTCAA----------ATTTC-C--TGGC-TTAGAATTCCACGTAGGCAT-CA--------T-----------C-A------------------T---T--ATTTTTTTC-ACTTTCCAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACGAATTC--GTCCCATGAAAACACAA-CAA-A-AAAA-TTCCCAGGGTGGGAATTGGAATGTCATGAAGCTCCCAATCCACCCAAACGAATTTCTGAAACATTCCAGAAG-TGGTATGGT---CCT-CAATAAAAATGCTTCACTGCGCCTGCTGGATGAACAAA-ACA-ATCGGCAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACTCATG-ATATAAAGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAA--CATTGTGGT-CATCAGCT-TCAACACACAAAGAAGGTCCTTCTCTGG-TT-----TATGTC-----CG--GATATTTGTAAGTCC--TCAAAGTCATGAAAGTGTA------TC--AAAACTTAACA--C-A--CACATGACCGCA-ACTGCCTGCGCGA---ACGGTCATTACAGCTATGAGTGATGATGATGACAGTTTC------CAGTCACGCCAGATCA--TAGTTT-TGTCGCGG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGT-TC-GTTGA---AAACC--TA---A-TAA------CG--A-AA--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AGAA------------AGC-GTTTCAGCTGAGC-CTCACGTTTG-TC-AACAATTAC-----AAATA-CAG-ACCG-T----TA---AC-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----AC-TG--TCAG---TTC----TTTGTCAGGCAGAT--TC-ATCTGCGTGTCC-----TCGATC--TGTCCTGTCTGTG----ATGATTT-C----CTAC-A---C-CTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCT-TCAA-TGTTCCCCCACCTCAGTCAGTCTCTAT-----TA---AACTCCAATAATGTCCAACG--GAATATC-TTCAAA-ATTAAAG-TCCTTTCAAACAACTGTC-TAC--T--TTTCAA---A--AA--TGAC-ACC-CATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAACAAAATTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AGATAATTTT------C--GC---AA-ATTAGAC--ATAAGGA-GAAGAGTTT-TCAA-TGAATAAACTTT-TAAAGA-AA-TGTA--T-----A-----TGGTC-----ATTGCT-T-ATAACT-TTGC-TGTTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA-AA-A--A----CA---GC-TCT--TC---AT-TC-A---GGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-TAATTCCGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-T--------------------A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGATACCAAAA-TGTAA
gi|10 : ATATCTCGAGAA-ATC--AGCTTC-ATCAA----CTGTC-T-T--AAATTTCAA---A--AAAGTGAC-ACCG-ATCACGACTGTTAGTGTA----ACGTTGCG--CG-C---CCGAAC----TTCCGCCTGAATTC-TAATT--ACC-AG-T--ATTT---------AC--AAGCATTAGAC--ATA---AGGAAGAGTTT-CTAATT-CATATACTTTAGAAAGA-AA----G--T-----A-----TTGTT-----TTTGTTAA-ATA--C--TGC---TTTT-------------AACGCATCC--TA-----ATTA-AT-TG-AA-G--A-----A---GCATCT--TC---ATTAC-A---T-GAAC-TTTGGTC--T-TTGTGATTT-C-----CGTGCATTTT-----AACGAA-----GCG-TTATG--TGC-GTCA-A-C---------------AATTGA--TTTGAG------------TATTGGCTAGATTTTA---CA-TGTT--CTAAC--ACA--TCA----------GCA-A---GTTATT---CGAT-CCAAAA-
gi|11 : ggaAGAATTC-AAATTTAATCTAA-T--CTTTATGCTTCTGGC--AAA-ATTAGAC--ATT---G-GAAGAGTTTATCAA-T-CATAA----T-TGAATG-AA-TA-A--TAAATAA-----TTGTCGTACGTTCTTT-A-GTG--A-TTAT-T-TTTTAGCTAGTGTTCAGAGCG--TCCTTTAGTTCTA-TA-AT-TA-AATT--A----CATATGC-TCTCACC---ATTCT-ACATTGGATCTTTT-GTTAATGTGG-G--TTAT-----CGT--ACTTGTGGTAATCGAAAAAGTGCGCTTTTGATTAGTGGCAGA-CTAATATCTTGCGTTGAA---ATGT----G------------TA-----TCGG---TAAATCACTGTTGTCTAACAAATGAATCACGGATTGGTCGCA-ATTGCTCA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|12 : ATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATTTGTTGAAAA--GTAGATTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-AAGTCTA------TT-A-A---T---AGAT-GAAATC--A-ACACCACAAAATATTT-TTATAAT-TTTATTTTTT-TCCTGTCAGTGGACTTTTGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-T-ATAAAACACCGTCTTACTTA-AGTATGGATGGGATGTTTTAAAAA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-A---AT-CCTATTGAGAG-CG---TAAG-TAAAGGG-CATA-AAGTTTGCA-TCAT-CCGT--Aa
gi|13 : ccattgacatcccta-A------TGT----ATG--ACAA-AAACT-GGAG-C---AT-CC-----AG----------AACTACAAAC-CACA-AATAT---A-T------------------------ACA-G-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGATGT-ACTG-C-GGCAAT--------------ACT-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAttcactgatgcatatgacatgctctcca
gi|14 : GCCCTCACGGCCATGAGCGAGGCTGGCATCGG-TTC------CAGTCCCGAAAAATGA--T-GTCCATGTCG-GG--GC-ACCGC-TGC--G-A-TTCTTCATTTTA---AAAAG--TA-CTACCAA------CA--T-A----T--ATCTCTCAAGTGAAC-----AG-A------------A
gi|15 : aTACATTT--ACATTACTTG-TTTTCTT-TATCACTAAC---AAAACCT-ATTAACGAGC-A-ATACG-TATCTCTTATCCTACTCCATAAATACCTATATGG--GGT
gi|16 : ---AACTCC-ATATTGTCC-ACG--ATATATCTTTCCAA-ATC--AG-TCC-A-CAAA-AACTGTCTT-C--C--TTTCAA---A--AA--TGAC-ACCGCATgt
gi|17 : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTT-TCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGCAA-ATACA-------TTACC--ACTACAT
gi|2 : TTAACACATGCACA-AAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGC-----GAAAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACCT-ACA--CAA--CGCAC--TCACA-A--GCCTGCGTGC---ACGGCCATCACAGCCATGAGTGATGC------CGGTTTC------CATTCACGCCAGATCA--T-CTTTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--GAA-GGTGTC-GTTGA---AAA-------CTA-TAA------GA--A-AAATCT--AT----CGAGTCAAC-----AG-AAC----------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TC-AACAATTAC-----AATTC-CAG-ACCG-T----CA---C------TACCTT----CGTCTGC--------------TAGGACCTATG--TCAG---TTC------T-TCAGGAAGAT--TC-ATCTGC--GTCC---------TC--TGTCCTGTCTGTGTGA-ATTATTTGC----CTAC-A---C-CTGA-CGAGTGCCGCCCTG---TCCTTC-A-TGTTCCCCCACCTCAG-T--CTT-TCTG----TT---AACTCCGAAATGTCC--ACG--AAATATCTCTCAAA-ATC--AT-TC------AACAACTGTC-TGCAAC--TTTC-A---A--AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTA----ATATTGC--GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTCAAAATT--ATC-AGTT--TTTT------T--GCAAAAA-ATTAGAC--ATA---A-GGAGAGTTT-TCAA-T-CATATACTTT-TAAAGA-AATTGTA--T-----A------TGTC-----TTCTTT-ATATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AGCG--TCC--TA-----A-TA-AT-T--AA-A--A----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-T-GTGT-TT-T-----CGT-CATTTT----GAACGAA-----GCG-TTATG--TGG-GTCA-A-CAATGTG---------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---AA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GC--A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TG
gi|3 : cctctTTTACATTT--GCAG-ACT-G-TTT-CTCTTA-TA-TAACCCAA----CTCACTG-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTACG--ACT-CATAAATACCTATATGGA-GGTCAACAAAAGACACGG-TCA-CAGCCGT-CGT-ATGAA-TA-ATGTTGAAAAAAGTAG--TACCGGTACT---CTTT-ACTAAGTAATTACGAAGTGCAATTA---G-G--CCTA--------AAGA---TCTCAGAT-GAAAT---A-ACA-CACAAA-CATTT-TTATGAT-TTT-CTTTTTCTCCAGTC--TGGGCGTTC-T-CAAAA-CAAAAG-TATATCATAA--AAACACTGTCTTA-TTATTGTATGGATGGGCTGTT-----AA-AGGAAATTGTTTTAATG--ACAATAAACCTAGAG-C---AT-CC-----ACGGCC----------ACAAAC-CACATAAGAT---A-TAAT-CCAT--AAAGAGGA--GTCAACATA-AGTATCGCATGTCCT-TTT-CAA-ACGTGCATTTATCTTCGCCTGTTGT-ACTAAC-A-CAATATGTGTTGT-ACACATT-TTC--ATTCATTCA-TTTTTCCCGTGGCTTAGAATTTCACCATCAG-TAAAAACTTCGTTG---CGTACA------A-TGGTAAAATTTCCGA------------------T---G--ATACATATCTACTTT-TAAAAAGGAATGAAAAAAACGTCTGGAATAAAAGC--AACG--CTTCTGT--CATG-AAACACAAACAA-CCAAAA-TT-CCAGG-TGGGAATTGG-ATGTAATGAAG-TCC--ATCCC-ACAAACGATATTATAAA--A-TCCAGAAGTTGA-ATTGTACATGT-CAATAAAA--GCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAGTTCAGATC--CAAAaa
gi|4 : ATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-TA-TAAC---A----CT-ATTA-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTATC--ACT-CA-AAA---CTATATTG--GGTCAACAGA------GGGTCAACAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTT-CCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTAAGTCTATTAA-GGCCT---AGG---------AA-ACA-CACAAAATTATT-TTATGAT-TTTATTTTT-CTCCCGTCAT-GGACTTTCAT-CAAAAA---AAA-TATATC-TA-TAAAACACTGACCTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-G-AG-C---AT-CC-----AG------------CCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATCCCAT--AAAGAGGA---TCAACA-A-AGAATCAC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCTATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCG-GGCAATATGTGTGGTAATA-ATCTTTC--A---ATTCATT--TTC------------ATTTC-CCGTGGCTTTAGAATTTCAC-----CAT-CATGTTGCG-TA----------C-ATCCCGGCGTACATGGGATT---C--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGT--CTGGAATAC--GCC--ACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAACA-AAAATTT-CCAGGGCGGAATTT---ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAA-TGAT-TGATACATGTCCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-TCAGATC--CAAATGCTACAg
gi|5 : CA--T-GGCTATGTTA-GG--GC-ATCTA-AGCCCG-ATGGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAAACATTATA--A-GG--TTGGATC---CGAGTCCACCTTTTAG-A------------AGCTG-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTATCTATTATATC-CA--ACCACT----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCTA---TTC----TAT---ATATA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--TG--CCGTCTGTGTTATATTATT-GC----CTACAATCTC-TTGAACCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----CACCTAACTCC-ATATTTCCTTATT--ATATATCTTTCCAA-ATC--AG-TCC-A-CAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAATATATTAA--TGACTACCGCATCACAAA----AATGTAGTTAACG-TGTGTGCGACACTACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGACAAATT---A-TAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAGATA-TA-TAT---T-----ATTTATTTGTC-----TTTTTT-AGATA--C-TTGC-C-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TATAT-TA-TA-T--ATTTTCT---AT-TCT--TTTCAATGTC-A---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--ACGCAGA-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-ACC---------------AA---A--T----GTTTTATATATTTTA-----TGAA----A---CA-TGTTG-CTAACT-ATGAATCA----------TCATA-T--TTA-TATCTGAT-CAAAAACTGTAAc
gi|6 : TTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCC-A-CA-TAAC---A----CT---TA-CGAGC-ACATACGCTAT---TTAC---ACTGCA-AATTACCTATTTGA--GGTCAACAGA------G--TCA-CA-TTGTGCGTTATGAA-TTT-TGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACTTACTTTT-ACTGAGTA-TTAC-----------ATAAGTA--TATA------TTAA-----T---AGATTGAAATC-AA-AC--CACAAAATATTT-TTTAGGTATTTATTTTTTCCTCAGTT----GACTTTC-T-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TA-TAAAACACTGTCTTA-TTATG--ATGGATGGAATGTT-----ATTA------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAGAC---AT-CC------TGGCCG---GAA--CACAAAT-CACA-AACAT---A-TCAT-CCAT--ACAGAGG---TTCTATA-T-AGAATCGC-T-TTCCATTTTCAACATATGC-TCCATCTCCGCCTGTTGT-ACTGC---GCAATGTGTGTG-T-ACA-ATC-TTTCAA---ATTCA-T--TT---------------TTC-CTGTGGC-T-AGCATTTCAC-----CAA-CA------G-T-----------C-A------------------T---T--ATTT-TTTC--CCCT-CAAAAAG--ATGAAAAT--C--CTGGAATA---GC-AAACG--------T--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGG-TGG-AATTG--ATGTCATGAAGCTCT--ATACG-ACAAATGCATTTATGAA--ATTCCAGGA-----TGTGATACACAT-C-----------TCCA-----C-TGCT-TATGAGCAAA-ACAGATT--CAAATGCTAC
gi|7 : -GG--GC-ATC-A-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CATAA-AG--TT--ATC----GAGTCCAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CA--ACCC-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCG------------TT-TCAA-TA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--T---CCGTCTGGAT-A--TTATT--C----CTACAA---CCTTGA-CCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATACACCTA---TACTCC-ATATTTCCTTACGTTATATATCTTTCCAATATC--AG-TCC-A-CAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA---A--AAA-TGAC-ACCGCATCACAAAAAT--GTGTTA---ACGTTGTG--CG-CACAC-AAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--A-A---A-AAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAAGTATAA-TGTATTT-----A-----TTGTT-----ATTTTT-A-ATA--CTTTGCAT-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TA-ATATATAT-ATTA----CA---TC-TTT--CA---ATGTCAA---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--AA--GAG-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-A-T---------------CC---A--T----G------------T------TGAA---TAT--TA-TGT
gi|8 : ttaTTACATTT--GCA--ACC-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ACTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--G-TCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATATTGAAA---GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTTTACTAAG-A-TTAC-----------A---G-AAGT-TA------TTAA-----T---AGAT-GAAATC-AACAC--CACAAAATATTT-------------------CTCCA-TCATTGGACTTTCATTCAAAAACAAAAAATATT-C-TA-TAAA-CACTGTCTTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-AA-----TGT----ATG---CAA-A----------C---AT-CC-----AGGGCC----------ACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATGCCATCAAAAGAGGA--T-CTACA-G-AGAATAGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGT-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-ACT-TTC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTGCAC-----CAT-CA------GTTG----------C-G------------------TACATGGATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATAAAAATGGT--TTGGAATAC--G-CAAACG--CTC--AT--TATG-AAACACAA-CAA-A-CAAA-TTACAAGGGTGGAAAaaatgtgaaacatg
gi|9 : ataTCCTTCG-TGGATTGTCCTTAAGTCGCGATTGATGACATCTGTAAGTCCCATCCA--T-------GTATAATTTTTCCATATAACTT-AGATCTAAATCGCAC--TTCCACA--GCCTGCGTGCCCGACGCCCA-CACGGCC-T---CGGAGCTGATG-CGGTTTCCTATTACAGTTGTCCAGGATCATTT-CTCTATGTCG-GGTTGCAATCAATAGT--G-T-GAGGTG-TTTGAATCAAACCGATAG-TA-TGA------AA--ACAG--CT--------CAAGTC-AC-----AG-ACATCAGTTTTTCAAC-GCTTCTG-AGAGTCTTCA-ATTTGTTCCACCCATTAC-----AACTCTCAGAACTG-TTCTCCAGTCCTTTCGGTACCCTTCTGCATCTGCTATGGTTTCCGTCTT-----AT-TGTTTCAGCTATTCTTCTTTT-TCATGCGCATCATCTATCTGC--GTCCTGTAGTC-ATCAATGTCGTG---GTGA-A-TTTATTTGCTGCGCTAC-A---C-TTGA-CGAGTGCCG-CCTGTCATCT-TC-ATCGCTCCTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 11111111 111 1 11 111111 6666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111 1 1 1 11111 222222 1111 111 555555555555555555555 111 1 11 2222222 111 222 11111111 111111 1111 444444444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 2222222 11111111111 111 1 1 222 11 11 11 2222222 1 11 22222 1 11 11 1 1 1 11 1 1 1 22222 33333 33333 11 5555555555555555555555555 1 3333333 11 2222 222 2222 222222 11 111 1111 11 33333333333333333333333333 11111 444444444444 1 11 1 22222 11 3333333333333333 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11 55555555 11 33333 2222222 22222 111 22 1111 1 3333333333 1 11 11 2222222 1111 11 2222 11 1111 1111 222222222 11111 3333333333333333333 11111 111 1111 111 3333333333333 111 11111 22222222222222222 1111111 111 222 1111111 1111 11111 111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 3333333333333333333 111
lowQualScore : 77 33 5 5 1 5 33333333 5 5 5 5 5 000 888 0 3 33 999999 6 6 6 6 7 99 1 6 6 6 3333333333333333333333333333333333333333333 6 3 222 6 44 6 6 3 44 333 4 6 77 6 6 5 9 5 1 66666 5 222222 2222 77 5 5 0 5 000 5 333333333333333333333 5 5 000 5 0 1 33 3 3333333 333 6 6 1 6 6 6 6 000 4 55555555 6 111111 5555 333333333333 6 1 6 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 88 8 11 3 11 1111111 99999999999 8 8 111 8 6 0 6 111 1 2 33 00 33 3 0000000 3 0 0 3 22 55555 9 0 11 2 33 1 5 5 5 88 5 5 5 66666 6 7 33333 33333 7 88 6666666666666666666666666 3 0000000 88 3 2222 0 333 3 3 2 1 3 5555 3 888888 4 1 11 8 0 6 99 6 666 99 888 2 6 111 0000 33 6 99999999999999999999999999 7 66666 6 333333333333 8 6 8 99 3 8 5 00000 1 8 88 8 4444444444444444 7777 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 8 11 33333333 11 5 0 11111 2222222 55555 8 8 444 8 8 44 5555 0 4444444444 6 0 77 11 1 1 6 99 99 6 6 1111111 6 4444 55 6 6 5 7777 0 88 8 0 3 7777 6 99 6 3333 999999999 99 6 99 11111 7 6 6 6 6 1 6 4444444444444444444 66666 555 2222 555 6666666666666 555 99 66666 6 6 6 77777777777777777 6 3333333 6 111 6 6 99 6 2 222 6666666 6 9 4444 6 66666 9 555 6 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 8 99 6 1 7777777777777777777 8 444 8 0 8
lowQualScore : .. .. . . . . ........ . . . . . ... ... . . .. ...... . . . . . .. . . . . ........................................... . . ... . .. . . . .. ... . . .. . . . . . . ..... . ...... .... .. . . . . ... . ..................... . . ... . . . .. . ....... ... . . . . . . . ... . ........ . ...... .... ............ . . . . ........................................................... . .. . .. . .. ....... ........... . . ... . . . . ... . . .. .. .. . ....... . . . . .. ..... . . .. . .. . . . . .. . . . ..... . . ..... ..... . .. ......................... . ....... .. . .... . ... . . . . . .... . ...... . . .. . . . .. . ... .. ... . . ... .... .. . .......................... . ..... . ............ . . . .. . . . ..... . . .. . ................ .... ..................................................... .. . .. ........ .. . . ..... ....... ..... . . ... . . .. .... . .......... . . .. .. . . . .. .. . . ....... . .... .. . . . .... . .. . . . .... . .. . .... ......... .. . .. ..... . . . . . . . ................... ..... ... .... ... ............. ... .. ..... . . . ................. . ....... . ... . . .. . . ... ....... . . .... . ..... . ... . . .............................................................. . . .. . . ................... . ... . . .
lowQualScore : 99 66 7 7 4 7 11111111 7 7 7 7 7 000 666 1 2 66 222222 7 7 7 7 8 22 0 7 7 7 3333333333333333333333333333333333333333333 7 2 333 7 00 7 7 2 22 555 7 7 33 7 7 5 3 0 0 77777 7 111111 1111 99 7 7 7 7 000 7 333333333333333333333 7 7 000 7 7 4 66 0 2222222 777 7 7 0 7 7 7 7 000 2 33333333 7 888888 0000 333333333333 7 0 7 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 00 2 00 6666666 44444444444 0 0 888 0 0 0 4 222 0 5 88 22 88 2 8888888 2 2 0 2 22 00000 2 0 00 5 88 0 0 5 0 00 5 5 0 55555 7 3 33333 33333 3 33 7777777777777777777777777 3 3333333 33 7 7777 7 333 2 2 5 0 2 2222 2 888888 2 0 00 0 8 7 22 7 888 22 777 5 7 777 0000 33 7 77777777777777777777777777 2 77777 7 333333333333 0 0 0 00 8 0 4 00000 0 0 00 0 0000000000000000 0000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 0 00 44444444 00 6 8 88888 6666666 44444 0 0 000 0 0 44 0000 0 5555555555 0 6 22 00 4 0 7 22 22 7 7 2222222 7 2222 88 7 0 6 2222 8 00 0 8 2 0000 7 22 7 5555 333333333 22 7 22 88888 3 7 7 7 7 0 7 7777777777777777777 77777 333 7777 000 7777777777777 888 22 77777 7 7 7 00000000000000000 7 7777777 7 777 7 7 22 7 5 555 8888888 7 8 8888 0 77777 8 888 7 7 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 00 4 0 2222222222222222222 0 000 0 6 0
consensus : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----A-----GGGCC-AACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-TA----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
Reference ( family-367 ) : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----A-----GGGCCGAACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-NA----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGANTCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|1 : TATTTACATTTTTGCA--ACT-GCTTTTCTCCTAACA-TAAC---A----CT-ATTA-GAGGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGGAGGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGC-ATGAAGTATTTGTTGAAAA--AGAGGTAACCG-TACT-ACTTTT-ACTAAGT--TTAC-----------A---G----TCTA------TTAA-A---T---AGAT-G-AATCAAA-AAA-CACAAAATATTTATTATGAT-TTTATTTTTTTTCCAGTCATTGGACTTTCAT-CAAAAAT-AAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTATTTATGGTATGGATGGGATGTT-----AA-A------TGT----ATGACACAA-AAACC-GGAG-CAAAATGCC-----AGGGCGGGGCCAAACCACAATTGCACA-AAGAT---ATTCAT-CCATC-ACAGAGGAATTTTAAAA-AGAGAATCGC-T-T-CTATTT-CAA-ATGTGC-TCCATCTTCGCCTTCTGTAACTGCCGGGCAATGTGTGT-GT-ACAGATC-TTC--A---ATTCA----TTCAA----------ATTTC-C--TGGC-TTAGAATTCCACGTAGGCAT-CA--------T-----------C-A------------------T---T--ATTTTTTTC-ACTTTCCAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACGAATTC--GTCCCATGAAAACACAA-CAA-A-AAAA-TTCCCAGGGTGGGAATTGGAATGTCATGAAGCTCCCAATCCACCCAAACGAATTTCTGAAACATTCCAGAAGT-GGTATGGT---CCT-CAATAAAAATGCTTCACTGCGCCTGCTGGATGAACAAA-ACA-ATCGGCAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACTCATG-ATATAAAGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAA--CATTGTGGT-CATCAGCT-TCAACACACAAAGAAGGTCCTTCTCTGG-TT-----TATGTC-----CG--GATATTTGTAAGTCC--TCAAAGTCATGAAAGTGTA------TC--AAAACTTAACA--C-A--CACATGACCGCA-ACTGCCTGCGCGA---ACGGTCATTACAGCTATGAGTGATGATGATGACAGTTTC------CAGTCACGCCAGATCA--TAGTTT-TGTCGCGG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGT-TC-GTTGA---AAACC--TA---A-TAA------CG--A-AA--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AGAA------------AGC-GTTTCAGCTGAGC-CTCACGTTTG-TC-AACAATTAC-----AAATA-CAG-ACCG-T----TA---AC-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----AC-TG--TCAG---TTC----TTTGTCAGGCAGAT--TC-ATCTGCGTGTCC-----TCGATC--TGTCCTGTCTGTG----ATGATTT-C----CTAC-A---C-CTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCT-TCAA-TGTTCCCCCACCTCAGTCAGTCTCTAT-----TA---AACTCCAATAATGTCCAACG--GAATATC-TTCAAA-ATTAAAGTCCTTTCAAACAACTGTC-TAC--T--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACC-CATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAACAAAATTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AGATAATTTT------C--GC---AA-ATTAGAC--ATAAGGA-GAAGAGTTT-TCAA-TGAATAAACTTT-TAAAGA-AA-TGTA--T-----A-----TGGTC-----ATTGCT-T-ATAACT-TTGC-TGTTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-AA----CA---GC-TCT--TC---A-TTC-A---GGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-TAATTCCGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-T--------------------A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGATACCAAAA-TGTAA
gi|10 : ATATCTCGAGAA-ATC--AG-CT--TCATC-AACTGTC-T-T--AAATTTCAA-A----AAAGTGAC-ACCG-ATCACGACTGTTAGTGTA----ACGTTGCG--CG-C---CCGAAC----TTCCGCCTGAATTC-TAATT--ACC-AG-T--ATTT---------AC--AAGCATTAGAC--ATA---AGGAAGAGTTT-CTAATT-CATATACTTTAGAAAGA-AA----G--T-----A-----TTGTT-----TTTGTTAA-ATA--C--TGC---TTTT-------------AACGCATCC--TA-----ATTA-AT-TG---AA-GA-----A---GCATCT--TC---ATTAC-A---T-GAAC-TTTGGTC--T-TTGTGATTT-C-----CGTGCATTTT-----AACGAA-----GCG-TTATG--TGC-GTCA-A-C---------------AATTGA--TTTGAG------------TATTGGCTAGATTTTA---CA-TGTT--CTAAC--AC--ATCA----------GCA-A---GTTATT---CGAT-CCAAAA-
gi|11 : ggaAGAATTC-AAATTTAATCTAA-T--CTTTATGCTTCTGGC--AAA-ATTAGAC--ATT---G-GAAGAGTTTATCAA-T-CATAA----T-TGAATG-AA-TA-A--TAAATAA-----TTGTCGTACGTTCTTT-A-GTG--A-TTAT-T-TTTTAGCTAGTGTTCAGAGCG--TCCTTTAGTTCTA-TA-AT-TA---AATTA----CATATGC-TCTCACC---ATTCT-ACATTGGATCTTTT-GTTAATGTGG-G--TTAT-----CGT--ACTTGTGGTAATCGAAAAAGTGCGCTTTTGATTAGTGGCAGA-CTAATATCTTGCGTTGAA---ATGT----G------------TA-----TCGG---TAAATCACTGTTGTCTAACAAATGAATCACGGATTGGTCGCA-ATTGCTCA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|12 : ATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATTTGTTGAAAA--GTAGATTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-AAGTCTA------TT-A-A---T---AGAT-GAAATC--A-ACACCACAAAATATTT-TTATAAT-TTTATTTTTT-TCCTGTCAGTGGACTTTTGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-T-ATAAAACACCGTCTTACTTA-AGTATGGATGGGATGTTTTAAAAA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-A---AT-CCTATTGA-----GAGCGTAAGTAAAGGG-CATA-AAGTTTGCA-TCAT-CCGT--Aa
gi|13 : ccattgacatcccta-A------TGT----ATG--ACAA-AAACT-GGAG-C---AT-CC-----A-----G-----AACTACAAAC-CACA-AATAT---A-T------------------------ACA-G-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGATGT-ACTG-C-GGCAAT--------------ACT-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAttcactgatgcatatgacatgctctcca
gi|14 : GCCCTCACGGCCATGAGCGAGGCTGGCATCGG-TTC------CAGTCCCGAAAAATGA--T-GTCCATGTCG-GG--GC-ACCGC-TGC--G-A-TTCTTCATTTTA---AAAAG--TA-CTACCAA------CA--T-A----T--ATCTCTCAAGTGAAC-----AG-A------------A
gi|15 : aTACATTT--ACATTACTTG-TTTTCTT-TATCACTAAC---AAAACCT-ATTAACGAGC-A-ATACG-TATCTCTTATCCTACTCCATAAATACCTATATGG--GGT
gi|16 : ---AACTCC-ATATTGTCC-ACG--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTCTT-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATgt
gi|17 : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTT-TCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGCAA-ATACA-------TTACC--ACTACAT
gi|2 : TTAACACATGCACA-AAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGC-----GAAAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACCT-ACA--CAA--CGCAC--TCACA-A--GCCTGCGTGC---ACGGCCATCACAGCCATGAGTGATGC------CGGTTTC------CATTCACGCCAGATCA--T-CTTTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--GAA-GGTGTC-GTTGA---AAA-------CTA-TAA------GA--A-AAATCT--AT----CGAGTCAAC-----AG-AAC----------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TC-AACAATTAC-----AATTC-CAG-ACCG-T----CA---C------TACCTT----CGTCTGC--------------TAGGACCTATG--TCAG---TTC------T-TCAGGAAGAT--TC-ATCTGC--GTCC---------TC--TGTCCTGTCTGTGTGA-ATTATTTGC----CTAC-A---C-CTGA-CGAGTGCCGCCCTG---TCCTTC-A-TGTTCCCCCACCTCAG-T--CTT-TCTG----TT---AACTCCGAAATGTCC--ACG--AAATATCTCTCAAA-ATC--ATTCA--AC----AACTGTC-TGCAAC--TTTC-A-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTA----ATATTGC--GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTCAAAATT--ATC-AGTT--TTTT------T--GCAAAAA-ATTAGAC--ATA---A-GGAGAGTTT-TCAA-T-CATATACTTT-TAAAGA-AATTGTA--T-----A------TGTC-----TTCTTT-ATATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AGCG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA--A----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-T-GTGT-TT-T-----CGT-CATTTT----GAACGAA-----GCG-TTATG--TGG-GTCA-A-CAATGTG---------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---AA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GC--A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TG
gi|3 : cctctTTTACATTT--GCAG-ACT-G-TTT-CTCTTA-TA-TAACCCAA----CTCACTG-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTACG--ACT-CATAAATACCTATATGGA-GGTCAACAAAAGACACGG-TCA-CAGCCGT-CGT-ATGAA-TA-ATGTTGAAAAAAGTAG--TACCGGTACT---CTTT-ACTAAGTAATTACGAAGTGCAATTA---G-G--CCTA--------AAGA---TCTCAGAT-GAAAT---A-ACA-CACAAA-CATTT-TTATGAT-TTT-CTTTTTCTCCAGTC--TGGGCGTTC-T-CAAAA-CAAAAG-TATATCATAA--AAACACTGTCTTA-TTATTGTATGGATGGGCTGTT-----AA-AGGAAATTGTTTTAATG--ACAATAAACCTAGAG-C---AT-CC-----A-----CGGCC-----ACAAAC-CACATAAGAT---A-TAAT-CCAT--AAAGAGGA--GTCAACATA-AGTATCGCATGTCCT-TTT-CAA-ACGTGCATTTATCTTCGCCTGTTGT-ACTAAC-A-CAATATGTGTTGT-ACACATT-TTC--ATTCATTCA-TTTTTCCCGTGGCTTAGAATTTCACCATCAG-TAAAAACTTCGTTG---CGTACA------A-TGGTAAAATTTCCGA------------------T---G--ATACATATCTACTTT-TAAAAAGGAATGAAAAAAACGTCTGGAATAAAAGC--AACG--CTTCTGT--CATG-AAACACAAACAA-CCAAAA-TT-CCAGG-TGGGAATTGG-ATGTAATGAAG-TCC--ATCCC-ACAAACGATATTATAAA--AT-CCAGAAGTTGA-ATTGTACATGT-CAATAAAA--GCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAGTTCAGATC--CAAAaa
gi|4 : ATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-TA-TAAC---A----CT-ATTA-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTATC--ACT-CA-AAA---CTATATTG--GGTCAACAGA------GGGTCAACAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTT-CCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTAAGTCTATTAA-GGCCT---AGG---------AA-ACA-CACAAAATTATT-TTATGAT-TTTATTTTT-CTCCCGTCAT-GGACTTTCAT-CAAAAA---AAA-TATATC-TA-TAAAACACTGACCTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-G-AG-C---AT-CC-----A-----G-------CCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATCCCAT--AAAGAGGA---TCAACA-A-AGAATCAC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCTATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCG-GGCAATATGTGTGGTAATA-ATCTTTC--A---ATTCATT--TTC------------ATTTC-CCGTGGCTTTAGAATTTCAC-----CAT-CATGTTGCG-TA----------C-ATCCCGGCGTACATGGGATT---C--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGT--CTGGAATAC--GCC--ACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAACA-AAAATTT-CCAGGGCGGAATTT---ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAAT-GAT-TGATACATGTCCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-TCAGATC--CAAATGCTACAg
gi|5 : CA--T-GGCTATGTTA-GG--GC-ATCTA-AGCCCG-ATGGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAAACATTATA--A-GG--TTGGATC---CGAGTCCACCTTTTAG-A------------AGCTG-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTATCTATTATATC-CA--ACCACT----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCTA---TTC----TAT---ATATA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--TG--CCGTCTGTGTTATATTATT-GC----CTACAATCTC-TTGAACCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----CACCTAACTCC-ATATTTCCTTATT--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAATATATTAA--TGACTACCGCATCACAAA----AATGTAGTTAACG-TGTGTGCGACACTACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGACAAATT---A-TAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAGATA-TA-TAT---T-----ATTTATTTGTC-----TTTTTT-AGATA--C-TTGC-C-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TATAT-TA---TA-TATTTTCT---AT-TCT--TTTCAATGTC-A---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--ACGCAGA-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-ACC---------------AA---A--T----GTTTTATATATTTTA-----TGAA----A---CA-TGTTG-CTAACT-ATGAATCA----------TCATA-T--TTA-TATCTGAT-CAAAAACTGTAAc
gi|6 : TTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCC-A-CA-TAAC---A----CT---TA-CGAGC-ACATACGCTAT---TTAC---ACTGCA-AATTACCTATTTGA--GGTCAACAGA------G--TCA-CA-TTGTGCGTTATGAA-TTT-TGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACTTACTTTT-ACTGAGTA-TTAC-----------ATAAGTA--TATA------TTAA-----T---AGATTGAAATC-AA-AC--CACAAAATATTT-TTTAGGTATTTATTTTTTCCTCAGTT----GACTTTC-T-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TA-TAAAACACTGTCTTA-TTATG--ATGGATGGAATGTT-----ATTA------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAGAC---AT-CC-----------TGGCCGGAACACAAAT-CACA-AACAT---A-TCAT-CCAT--ACAGAGG---TTCTATA-T-AGAATCGC-T-TTCCATTTTCAACATATGC-TCCATCTCCGCCTGTTGT-ACTGC---GCAATGTGTGTG-T-ACA-ATC-TTTCAA---ATTCA-T--TT---------------TTC-CTGTGGC-T-AGCATTTCAC-----CAA-CA------G-T-----------C-A------------------T---T--ATTT-TTTC--CCCT-CAAAAAG--ATGAAAAT--C--CTGGAATA---GC-AAACG--------T--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGG-TGG-AATTG--ATGTCATGAAGCTCT--ATACG-ACAAATGCATTTATGAA--ATTCCAGGA-----TGTGATACACAT-C-----------TCCA-----C-TGCT-TATGAGCAAA-ACAGATT--CAAATGCTAC
gi|7 : -GG--GC-ATC-A-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CATAA-AG--TT--ATC----GAGTCCAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CA--ACCC-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCG------------TT-TCAA-TA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--T---CCGTCTGGAT-A--TTATT--C----CTACAA---CCTTGA-CCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATACACCTA---TACTCC-ATATTTCCTTACGTTATATATCTTTCCAATATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AAA-TGAC-ACCGCATCACAAAAAT--GTGTTA---ACGTTGTG--CG-CACAC-AAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--A-A---A-AAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAAGTATAA-TGTATTT-----A-----TTGTT-----ATTTTT-A-ATA--CTTTGCAT-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TA-ATATATATAT-TA----CA---TC-TTT--CA---ATGTCAA---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--AA--GAG-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-A-T---------------CC---A--T----G------------T------TGAA---TAT--TA-TGT
gi|8 : ttaTTACATTT--GCA--ACC-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ACTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--G-TCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATATTGAAA---GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTTTACTAAG-A-TTAC-----------A---G-AAGT-TA------TTAA-----T---AGAT-GAAATC-AACAC--CACAAAATATTT-------------------CTCCA-TCATTGGACTTTCATTCAAAAACAAAAAATATT-C-TA-TAAA-CACTGTCTTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-AA-----TGT----ATG---CAA-A----------C---AT-CC-----A-----GGGCC-----ACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATGCCATCAAAAGAGGA--T-CTACA-G-AGAATAGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGT-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-ACT-TTC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTGCAC-----CAT-CA------GTTG----------C-G------------------TACATGGATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATAAAAATGGT--TTGGAATAC--G-CAAACG--CTC--AT--TATG-AAACACAA-CAA-A-CAAA-TTACAAGGGTGGAAAaaatgtgaaacatg
gi|9 : ataTCCTTCG-TGGATTGTCCTTAAGTCGCGATTGATGACATCTGTAAGTCCCATCCA--T-------GTATAATTTTTCCATATAACTT-AGATCTAAATCGCAC--TTCCACA--GCCTGCGTGCCCGACGCCCA-CACGGCC-T---CGGAGCTGATG-CGGTTTCCTATTACAGTTGTCCAGGATCATTT-CTCTATGTCG-GGTTGCAATCAATAGT--G-T-GAGGTG-TTTGAATCAAACCGATAG-TA-TGA------AA--ACAG--CT--------CAAGTC-AC-----AG-ACATCAGTTTTTCAAC-GCTTCTG-AGAGTCTTCA-ATTTGTTCCACCCATTAC-----AACTCTCAGAACTG-TTCTCCAGTCCTTTCGGTACCCTTCTGCATCTGCTATGGTTTCCGTCTT-----AT-TGTTTCAGCTATTCTTCTTTT-TCATGCGCATCATCTATCTGC--GTCCTGTAGTC-ATCAATGTCGTG---GTGA-A-TTTATTTGCTGCGCTAC-A---C-TTGA-CGAGTGCCG-CCTGTCATCT-TC-ATCGCTCCTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 11111111 111 1 11 111111 6666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111 1 1 1 11111 222222 1111 111 444444444444444444444 111 1 11 2222222 111 222 11111111 111111 1111 444444444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 2222222 11111111111 111 1 1 222 11 11 11 2222222 1 11 22222 1 11 11 1 1 1 11 1 1 1 22222 33333 33333 11 5555555555555555555555555 1 3333333 11 2222 222 2222 222222 11 111 1111 11 33333333333333333333333333 11111 444444444444 1 11 1 22222 11 3333333333333333 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11 55555555 11 33333 2222222 22222 111 22 1111 1 3333333333 1 11 11 2222222 1111 11 2222 11 1111 1111 222222222 11111 3333333333333333333 11111 111 1111 111 3333333333333 111 11111 22222222222222222 1111111 111 222 1111111 1111 11111 111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 3333333333333333333 111
lowQualScore : 77 33 5 5 1 5 33333333 5 5 5 5 5 000 888 0 3 33 999999 6 6 6 6 7 99 1 6 6 6 3333333333333333333333333333333333333333333 6 3 222 6 44 6 6 3 44 333 4 6 77 6 6 5 9 5 1 66666 5 222222 2222 77 5 5 0 5 000 5 666666666666666666666 5 5 000 5 0 1 33 3 3333333 333 6 6 1 6 6 6 6 000 4 55555555 6 111111 5555 333333333333 6 1 6 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 88 8 11 3 11 1111111 99999999999 8 8 111 8 6 0 6 111 1 2 33 00 33 3 0000000 3 0 0 3 22 55555 9 0 11 2 33 1 5 5 5 88 5 5 5 66666 6 7 33333 33333 7 88 6666666666666666666666666 3 0000000 88 3 2222 0 333 3 3 2 1 3 5555 3 888888 4 1 11 8 0 6 99 6 666 99 888 2 6 111 0000 33 6 99999999999999999999999999 7 66666 6 333333333333 8 6 8 99 3 8 5 00000 1 8 88 8 4444444444444444 7777 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 8 11 33333333 11 5 0 11111 2222222 55555 8 8 444 8 8 44 5555 0 4444444444 6 0 77 11 1 1 6 99 99 6 6 1111111 6 4444 55 6 6 5 7777 0 88 8 0 3 7777 6 99 6 3333 999999999 99 6 99 11111 7 6 6 6 6 1 6 4444444444444444444 66666 555 2222 555 6666666666666 555 99 66666 6 6 6 77777777777777777 6 3333333 6 111 6 6 99 6 2 222 6666666 6 9 4444 6 66666 9 555 6 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 8 99 6 1 7777777777777777777 8 444 8 0 8
lowQualScore : .. .. . . . . ........ . . . . . ... ... . . .. ...... . . . . . .. . . . . ........................................... . . ... . .. . . . .. ... . . .. . . . . . . ..... . ...... .... .. . . . . ... . ..................... . . ... . . . .. . ....... ... . . . . . . . ... . ........ . ...... .... ............ . . . . ........................................................... . .. . .. . .. ....... ........... . . ... . . . . ... . . .. .. .. . ....... . . . . .. ..... . . .. . .. . . . . .. . . . ..... . . ..... ..... . .. ......................... . ....... .. . .... . ... . . . . . .... . ...... . . .. . . . .. . ... .. ... . . ... .... .. . .......................... . ..... . ............ . . . .. . . . ..... . . .. . ................ .... ..................................................... .. . .. ........ .. . . ..... ....... ..... . . ... . . .. .... . .......... . . .. .. . . . .. .. . . ....... . .... .. . . . .... . .. . . . .... . .. . .... ......... .. . .. ..... . . . . . . . ................... ..... ... .... ... ............. ... .. ..... . . . ................. . ....... . ... . . .. . . ... ....... . . .... . ..... . ... . . .............................................................. . . .. . . ................... . ... . . .
lowQualScore : 99 66 7 7 4 7 11111111 7 7 7 7 7 000 666 1 2 66 222222 7 7 7 7 8 22 0 7 7 7 3333333333333333333333333333333333333333333 7 2 333 7 00 7 7 2 22 555 7 7 33 7 7 5 3 0 0 77777 7 111111 1111 99 7 7 7 7 000 7 777777777777777777777 7 7 000 7 7 4 66 0 2222222 777 7 7 0 7 7 7 7 000 2 33333333 7 888888 0000 333333333333 7 0 7 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 00 2 00 6666666 44444444444 0 0 888 0 0 0 4 222 0 5 88 22 88 2 8888888 2 2 0 2 22 00000 2 0 00 5 88 0 0 5 0 00 5 5 0 55555 7 3 33333 33333 3 33 7777777777777777777777777 3 3333333 33 7 7777 7 333 2 2 5 0 2 2222 2 888888 2 0 00 0 8 7 22 7 888 22 777 5 7 777 0000 33 7 77777777777777777777777777 2 77777 7 333333333333 0 0 0 00 8 0 4 00000 0 0 00 0 0000000000000000 0000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 0 00 44444444 00 6 8 88888 6666666 44444 0 0 000 0 0 44 0000 0 5555555555 0 6 22 00 4 0 7 22 22 7 7 2222222 7 2222 88 7 0 6 2222 8 00 0 8 2 0000 7 22 7 5555 333333333 22 7 22 88888 3 7 7 7 7 0 7 7777777777777777777 77777 333 7777 000 7777777777777 888 22 77777 7 7 7 00000000000000000 7 7777777 7 777 7 7 22 7 5 555 8888888 7 8 8888 0 77777 8 888 7 7 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 00 4 4 2222222222222222222 0 000 0 6 0
consensus : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----AGGGC----C--AACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-TA----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
Reference ( family-367 ) : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----AGGGC----C--AACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-TA----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|1 : TATTTACATTTTTGCA--ACT-GCTTTTCTCCTAACA-TAAC---A----CT-ATTA-GAGGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGGAGGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGC-ATGAAGTATTTGTTGAAAA--AGAGGTAACCG-TACT-ACTTTT-ACTAAGT--TTAC-----------A---G----TCTA------TTAA-A---T---AGAT-G-AATCAAA-AAA-CACAAAATATTTATTATGAT-TTTATTTTTTTTCCAGTCATTGGACTTTCAT-CAAAAAT-AAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTATTTATGGTATGGATGGGATGTT-----AA-A------TGT----ATGACACAA-AAACC-GGAG-CAAAATGCC-----AGGGCGGGGCCAAACCACAATTGCACA-AAGAT---ATTCAT-CCATC-ACAGAGGAATTTTAAAA-AGAGAATCGC-T-T-CTATTT-CAA-ATGTGC-TCCATCTTCGCCTTCTGTAACTGCCGGGCAATGTGTGT-GT-ACAGATC-TTC--A---ATTCA----TTCAA----------ATTTC-C--TGGC-TTAGAATTCCACGTAGGCAT-CA--------T-----------C-A------------------T---T--ATTTTTTTC-ACTTTCCAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACGAATTC--GTCCCATGAAAACACAA-CAA-A-AAAA-TTCCCAGGGTGGGAATTGGAATGTCATGAAGCTCCCAATCCACCCAAACGAATTTCTGAAACATTCCAGAAGT-GGTATGGT---CCT-CAATAAAAATGCTTCACTGCGCCTGCTGGATGAACAAA-ACA-ATCGGCAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACTCATG-ATATAAAGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAA--CATTGTGGT-CATCAGCT-TCAACACACAAAGAAGGTCCTTCTCTGG-TT-----TATGTC-----CG--GATATTTGTAAGTCC--TCAAAGTCATGAAAGTGTA------TC--AAAACTTAACA--C-A--CACATGACCGCA-ACTGCCTGCGCGA---ACGGTCATTACAGCTATGAGTGATGATGATGACAGTTTC------CAGTCACGCCAGATCA--TAGTTT-TGTCGCGG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGT-TC-GTTGA---AAACC--TA---A-TAA------CG--A-AA--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AGAA------------AGC-GTTTCAGCTGAGC-CTCACGTTTG-TC-AACAATTAC-----AAATA-CAG-ACCG-T----TA---AC-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----AC-TG--TCAG---TTC----TTTGTCAGGCAGAT--TC-ATCTGCGTGTCC-----TCGATC--TGTCCTGTCTGTG----ATGATTT-C----CTAC-A---C-CTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCT-TCAA-TGTTCCCCCACCTCAGTCAGTCTCTAT-----TA---AACTCCAATAATGTCCAACG--GAATATC-TTCAAA-ATTAAAGTCCTTTCAAACAACTGTC-TAC--T--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACC-CATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAACAAAATTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AGATAATTTT------C--GC---AA-ATTAGAC--ATAAGGA-GAAGAGTTT-TCAA-TGAATAAACTTT-TAAAGA-AA-TGTA--T-----A-----TGGTC-----ATTGCT-T-ATAACT-TTGC-TGTTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-AA----CA---GC-TCT--TC---A-TTC-A---GGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-TAATTCCGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-T--------------------A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGATACCAAAA-TGTAA
gi|10 : ATATCTCGAGAA-ATC--AG-CT--TCATC-AACTGTC-T-T--AAATTTCAA-A----AAAGTGAC-ACCG-ATCACGACTGTTAGTGTA----ACGTTGCG--CG-C---CCGAAC----TTCCGCCTGAATTC-TAATT--ACC-AG-T--ATTT---------AC--AAGCATTAGAC--ATA---AGGAAGAGTTT-CTAATT-CATATACTTTAGAAAGA-AA----G--T-----A-----TTGTT-----TTTGTTAA-ATA--C--TGC---TTTT-------------AACGCATCC--TA-----ATTA-AT-TG---AA-GA-----A---GCATCT--TC---ATTAC-A---T-GAAC-TTTGGTC--T-TTGTGATTT-C-----CGTGCATTTT-----AACGAA-----GCG-TTATG--TGC-GTCA-A-C---------------AATTGA--TTTGAG------------TATTGGCTAGATTTTA---CA-TGTT--CTAAC--AC--ATCA----------GCA-A---GTTATT---CGAT-CCAAAA-
gi|11 : ggaAGAATTC-AAATTTAATCTAA-T--CTTTATGCTTCTGGC--AAA-ATTAGAC--ATT---G-GAAGAGTTTATCAA-T-CATAA----T-TGAATG-AA-TA-A--TAAATAA-----TTGTCGTACGTTCTTT-A-GTG--A-TTAT-T-TTTTAGCTAGTGTTCAGAGCG--TCCTTTAGTTCTA-TA-AT-TA---AATTA----CATATGC-TCTCACC---ATTCT-ACATTGGATCTTTT-GTTAATGTGG-G--TTAT-----CGT--ACTTGTGGTAATCGAAAAAGTGCGCTTTTGATTAGTGGCAGA-CTAATATCTTGCGTTGAA---ATGT----G------------TA-----TCGG---TAAATCACTGTTGTCTAACAAATGAATCACGGATTGGTCGCA-ATTGCTCA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|12 : ATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATTTGTTGAAAA--GTAGATTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-AAGTCTA------TT-A-A---T---AGAT-GAAATC--A-ACACCACAAAATATTT-TTATAAT-TTTATTTTTT-TCCTGTCAGTGGACTTTTGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-T-ATAAAACACCGTCTTACTTA-AGTATGGATGGGATGTTTTAAAAA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-A---AT-CCTATTGAGAGCG---T--AAGTAAAGGG-CATA-AAGTTTGCA-TCAT-CCGT--Aa
gi|13 : ccattgacatcccta-A------TGT----ATG--ACAA-AAACT-GGAG-C---AT-CC-----AG----------AACTACAAAC-CACA-AATAT---A-T------------------------ACA-G-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGATGT-ACTG-C-GGCAAT--------------ACT-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAttcactgatgcatatgacatgctctcca
gi|14 : GCCCTCACGGCCATGAGCGAGGCTGGCATCGG-TTC------CAGTCCCGAAAAATGA--T-GTCCATGTCG-GG--GC-ACCGC-TGC--G-A-TTCTTCATTTTA---AAAAG--TA-CTACCAA------CA--T-A----T--ATCTCTCAAGTGAAC-----AG-A------------A
gi|15 : aTACATTT--ACATTACTTG-TTTTCTT-TATCACTAAC---AAAACCT-ATTAACGAGC-A-ATACG-TATCTCTTATCCTACTCCATAAATACCTATATGG--GGT
gi|16 : ---AACTCC-ATATTGTCC-ACG--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTCTT-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATgt
gi|17 : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTT-TCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGCAA-ATACA-------TTACC--ACTACAT
gi|2 : TTAACACATGCACA-AAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGC-----GAAAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACCT-ACA--CAA--CGCAC--TCACA-A--GCCTGCGTGC---ACGGCCATCACAGCCATGAGTGATGC------CGGTTTC------CATTCACGCCAGATCA--T-CTTTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--GAA-GGTGTC-GTTGA---AAA-------CTA-TAA------GA--A-AAATCT--AT----CGAGTCAAC-----AG-AAC----------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TC-AACAATTAC-----AATTC-CAG-ACCG-T----CA---C------TACCTT----CGTCTGC--------------TAGGACCTATG--TCAG---TTC------T-TCAGGAAGAT--TC-ATCTGC--GTCC---------TC--TGTCCTGTCTGTGTGA-ATTATTTGC----CTAC-A---C-CTGA-CGAGTGCCGCCCTG---TCCTTC-A-TGTTCCCCCACCTCAG-T--CTT-TCTG----TT---AACTCCGAAATGTCC--ACG--AAATATCTCTCAAA-ATC--ATTCA--AC----AACTGTC-TGCAAC--TTTC-A-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTA----ATATTGC--GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTCAAAATT--ATC-AGTT--TTTT------T--GCAAAAA-ATTAGAC--ATA---A-GGAGAGTTT-TCAA-T-CATATACTTT-TAAAGA-AATTGTA--T-----A------TGTC-----TTCTTT-ATATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AGCG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA--A----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-T-GTGT-TT-T-----CGT-CATTTT----GAACGAA-----GCG-TTATG--TGG-GTCA-A-CAATGTG---------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---AA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GC--A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TG
gi|3 : cctctTTTACATTT--GCAG-ACT-G-TTT-CTCTTA-TA-TAACCCAA----CTCACTG-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTACG--ACT-CATAAATACCTATATGGA-GGTCAACAAAAGACACGG-TCA-CAGCCGT-CGT-ATGAA-TA-ATGTTGAAAAAAGTAG--TACCGGTACT---CTTT-ACTAAGTAATTACGAAGTGCAATTA---G-G--CCTA--------AAGA---TCTCAGAT-GAAAT---A-ACA-CACAAA-CATTT-TTATGAT-TTT-CTTTTTCTCCAGTC--TGGGCGTTC-T-CAAAA-CAAAAG-TATATCATAA--AAACACTGTCTTA-TTATTGTATGGATGGGCTGTT-----AA-AGGAAATTGTTTTAATG--ACAATAAACCTAGAG-C---AT-CC-----ACGGC----C--A----CAAAC-CACATAAGAT---A-TAAT-CCAT--AAAGAGGA--GTCAACATA-AGTATCGCATGTCCT-TTT-CAA-ACGTGCATTTATCTTCGCCTGTTGT-ACTAAC-A-CAATATGTGTTGT-ACACATT-TTC--ATTCATTCA-TTTTTCCCGTGGCTTAGAATTTCACCATCAG-TAAAAACTTCGTTG---CGTACA------A-TGGTAAAATTTCCGA------------------T---G--ATACATATCTACTTT-TAAAAAGGAATGAAAAAAACGTCTGGAATAAAAGC--AACG--CTTCTGT--CATG-AAACACAAACAA-CCAAAA-TT-CCAGG-TGGGAATTGG-ATGTAATGAAG-TCC--ATCCC-ACAAACGATATTATAAA--AT-CCAGAAGTTGA-ATTGTACATGT-CAATAAAA--GCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAGTTCAGATC--CAAAaa
gi|4 : ATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-TA-TAAC---A----CT-ATTA-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTATC--ACT-CA-AAA---CTATATTG--GGTCAACAGA------GGGTCAACAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTT-CCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTAAGTCTATTAA-GGCCT---AGG---------AA-ACA-CACAAAATTATT-TTATGAT-TTTATTTTT-CTCCCGTCAT-GGACTTTCAT-CAAAAA---AAA-TATATC-TA-TAAAACACTGACCTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-G-AG-C---AT-CC-----AG------------CCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATCCCAT--AAAGAGGA---TCAACA-A-AGAATCAC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCTATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCG-GGCAATATGTGTGGTAATA-ATCTTTC--A---ATTCATT--TTC------------ATTTC-CCGTGGCTTTAGAATTTCAC-----CAT-CATGTTGCG-TA----------C-ATCCCGGCGTACATGGGATT---C--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGT--CTGGAATAC--GCC--ACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAACA-AAAATTT-CCAGGGCGGAATTT---ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAAT-GAT-TGATACATGTCCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-TCAGATC--CAAATGCTACAg
gi|5 : CA--T-GGCTATGTTA-GG--GC-ATCTA-AGCCCG-ATGGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAAACATTATA--A-GG--TTGGATC---CGAGTCCACCTTTTAG-A------------AGCTG-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTATCTATTATATC-CA--ACCACT----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCTA---TTC----TAT---ATATA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--TG--CCGTCTGTGTTATATTATT-GC----CTACAATCTC-TTGAACCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----CACCTAACTCC-ATATTTCCTTATT--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAATATATTAA--TGACTACCGCATCACAAA----AATGTAGTTAACG-TGTGTGCGACACTACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGACAAATT---A-TAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAGATA-TA-TAT---T-----ATTTATTTGTC-----TTTTTT-AGATA--C-TTGC-C-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TATAT-TA---TA-TATTTTCT---AT-TCT--TTTCAATGTC-A---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--ACGCAGA-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-ACC---------------AA---A--T----GTTTTATATATTTTA-----TGAA----A---CA-TGTTG-CTAACT-ATGAATCA----------TCATA-T--TTA-TATCTGAT-CAAAAACTGTAAc
gi|6 : TTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCC-A-CA-TAAC---A----CT---TA-CGAGC-ACATACGCTAT---TTAC---ACTGCA-AATTACCTATTTGA--GGTCAACAGA------G--TCA-CA-TTGTGCGTTATGAA-TTT-TGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACTTACTTTT-ACTGAGTA-TTAC-----------ATAAGTA--TATA------TTAA-----T---AGATTGAAATC-AA-AC--CACAAAATATTT-TTTAGGTATTTATTTTTTCCTCAGTT----GACTTTC-T-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TA-TAAAACACTGTCTTA-TTATG--ATGGATGGAATGTT-----ATTA------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAGAC---AT-CC-----TGGCC----G--GAACACAAAT-CACA-AACAT---A-TCAT-CCAT--ACAGAGG---TTCTATA-T-AGAATCGC-T-TTCCATTTTCAACATATGC-TCCATCTCCGCCTGTTGT-ACTGC---GCAATGTGTGTG-T-ACA-ATC-TTTCAA---ATTCA-T--TT---------------TTC-CTGTGGC-T-AGCATTTCAC-----CAA-CA------G-T-----------C-A------------------T---T--ATTT-TTTC--CCCT-CAAAAAG--ATGAAAAT--C--CTGGAATA---GC-AAACG--------T--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGG-TGG-AATTG--ATGTCATGAAGCTCT--ATACG-ACAAATGCATTTATGAA--ATTCCAGGA-----TGTGATACACAT-C-----------TCCA-----C-TGCT-TATGAGCAAA-ACAGATT--CAAATGCTAC
gi|7 : -GG--GC-ATC-A-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CATAA-AG--TT--ATC----GAGTCCAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CA--ACCC-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCG------------TT-TCAA-TA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--T---CCGTCTGGAT-A--TTATT--C----CTACAA---CCTTGA-CCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATACACCTA---TACTCC-ATATTTCCTTACGTTATATATCTTTCCAATATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AAA-TGAC-ACCGCATCACAAAAAT--GTGTTA---ACGTTGTG--CG-CACAC-AAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--A-A---A-AAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAAGTATAA-TGTATTT-----A-----TTGTT-----ATTTTT-A-ATA--CTTTGCAT-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TA-ATATATATAT-TA----CA---TC-TTT--CA---ATGTCAA---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--AA--GAG-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-A-T---------------CC---A--T----G------------T------TGAA---TAT--TA-TGT
gi|8 : ttaTTACATTT--GCA--ACC-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ACTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--G-TCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATATTGAAA---GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTTTACTAAG-A-TTAC-----------A---G-AAGT-TA------TTAA-----T---AGAT-GAAATC-AACAC--CACAAAATATTT-------------------CTCCA-TCATTGGACTTTCATTCAAAAACAAAAAATATT-C-TA-TAAA-CACTGTCTTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-AA-----TGT----ATG---CAA-A----------C---AT-CC-----AGGGC----C--A----CAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATGCCATCAAAAGAGGA--T-CTACA-G-AGAATAGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGT-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-ACT-TTC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTGCAC-----CAT-CA------GTTG----------C-G------------------TACATGGATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATAAAAATGGT--TTGGAATAC--G-CAAACG--CTC--AT--TATG-AAACACAA-CAA-A-CAAA-TTACAAGGGTGGAAAaaatgtgaaacatg
gi|9 : ataTCCTTCG-TGGATTGTCCTTAAGTCGCGATTGATGACATCTGTAAGTCCCATCCA--T-------GTATAATTTTTCCATATAACTT-AGATCTAAATCGCAC--TTCCACA--GCCTGCGTGCCCGACGCCCA-CACGGCC-T---CGGAGCTGATG-CGGTTTCCTATTACAGTTGTCCAGGATCATTT-CTCTATGTCG-GGTTGCAATCAATAGT--G-T-GAGGTG-TTTGAATCAAACCGATAG-TA-TGA------AA--ACAG--CT--------CAAGTC-AC-----AG-ACATCAGTTTTTCAAC-GCTTCTG-AGAGTCTTCA-ATTTGTTCCACCCATTAC-----AACTCTCAGAACTG-TTCTCCAGTCCTTTCGGTACCCTTCTGCATCTGCTATGGTTTCCGTCTT-----AT-TGTTTCAGCTATTCTTCTTTT-TCATGCGCATCATCTATCTGC--GTCCTGTAGTC-ATCAATGTCGTG---GTGA-A-TTTATTTGCTGCGCTAC-A---C-TTGA-CGAGTGCCG-CCTGTCATCT-TC-ATCGCTCCTC
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 11111111 111 1 11 111111 6666666666666666666666666666666666666666666 111 11 111 1 1 1 11111 222222 1111 111 444444444444444444444 111 1 11 2222222 111 222 11111111 111111 1111 444444444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 2222222 11111111111 111 1 1 222 11 11 11 2222222 1 11 22222 1 11 11 1 1 1 11 1 1 1 22222 33333 33333 11 5555555555555555555555555 1 3333333 11 2222 222 2222 222222 11 111 1111 11 33333333333333333333333333 11111 444444444444 1 11 1 22222 11 3333333333333333 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11 55555555 11 33333 2222222 22222 111 22 1111 1 3333333333 1 11 11 2222222 1111 11 2222 11 1111 1111 222222222 11111 3333333333333333333 11111 111 1111 111 3333333333333 111 11111 22222222222222222 1111111 111 222 1111111 1111 11111 111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 3333333333333333333 111
lowQualScore : 77 33 5 5 1 5 33333333 5 5 5 5 5 000 888 0 3 33 999999 6 6 6 6 7 99 1 6 6 6 3333333333333333333333333333333333333333333 6 3 222 6 44 6 6 3 44 333 4 6 77 6 6 5 9 5 1 66666 5 222222 2222 77 5 5 0 5 000 5 666666666666666666666 5 5 000 5 0 1 33 3 3333333 333 6 6 1 6 6 6 6 000 4 55555555 6 111111 5555 333333333333 6 1 6 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 88 8 11 3 11 1111111 99999999999 8 8 111 8 6 0 6 111 1 2 33 00 33 3 0000000 3 0 0 3 22 55555 9 0 11 2 33 1 5 5 5 88 5 5 5 66666 6 7 33333 33333 7 88 6666666666666666666666666 3 0000000 88 3 2222 0 333 3 3 2 1 3 5555 3 888888 4 1 11 8 0 6 99 6 666 99 888 2 6 111 0000 33 6 99999999999999999999999999 7 66666 6 333333333333 8 6 8 99 3 8 5 00000 1 8 88 8 4444444444444444 7777 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 8 11 33333333 11 5 0 11111 2222222 55555 8 8 444 8 8 44 5555 0 4444444444 6 0 77 11 1 1 6 99 99 6 6 1111111 6 4444 55 6 6 5 7777 0 88 8 0 3 7777 6 99 6 3333 999999999 99 6 99 11111 7 6 6 6 6 1 6 4444444444444444444 66666 555 2222 555 6666666666666 555 99 66666 6 6 6 77777777777777777 6 3333333 6 111 6 6 99 6 2 222 6666666 6 9 4444 6 66666 9 555 6 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 8 99 6 1 7777777777777777777 8 444 8 0 8
lowQualScore : .. .. . . . . ........ . . . . . ... ... . . .. ...... . . . . . .. . . . . ........................................... . . ... . .. . . . .. ... . . .. . . . . . . ..... . ...... .... .. . . . . ... . ..................... . . ... . . . .. . ....... ... . . . . . . . ... . ........ . ...... .... ............ . . . . ........................................................... . .. . .. . .. ....... ........... . . ... . . . . ... . . .. .. .. . ....... . . . . .. ..... . . .. . .. . . . . .. . . . ..... . . ..... ..... . .. ......................... . ....... .. . .... . ... . . . . . .... . ...... . . .. . . . .. . ... .. ... . . ... .... .. . .......................... . ..... . ............ . . . .. . . . ..... . . .. . ................ .... ..................................................... .. . .. ........ .. . . ..... ....... ..... . . ... . . .. .... . .......... . . .. .. . . . .. .. . . ....... . .... .. . . . .... . .. . . . .... . .. . .... ......... .. . .. ..... . . . . . . . ................... ..... ... .... ... ............. ... .. ..... . . . ................. . ....... . ... . . .. . . ... ....... . . .... . ..... . ... . . .............................................................. . . .. . . ................... . ... . . .
lowQualScore : 99 66 7 7 4 7 11111111 7 7 7 7 7 000 666 1 2 66 222222 7 7 7 7 8 22 0 7 7 7 3333333333333333333333333333333333333333333 7 2 333 7 00 7 7 2 22 555 7 7 33 7 7 5 3 0 0 77777 7 111111 1111 99 7 7 7 7 000 7 777777777777777777777 7 7 000 7 7 4 66 0 2222222 777 7 7 0 7 7 7 7 000 2 33333333 7 888888 0000 333333333333 7 0 7 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 00 2 00 6666666 44444444444 0 0 888 0 0 0 4 222 0 5 88 22 88 2 8888888 2 2 0 2 22 00000 2 0 00 5 88 0 0 5 0 00 5 5 0 55555 7 3 33333 33333 3 33 7777777777777777777777777 3 3333333 33 7 7777 7 333 2 2 5 0 2 2222 2 888888 2 0 00 0 8 7 22 7 888 22 777 5 7 777 0000 33 7 77777777777777777777777777 2 77777 7 333333333333 0 0 0 00 8 0 4 00000 0 0 00 0 0000000000000000 0000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 0 00 44444444 00 6 8 88888 6666666 44444 0 0 000 0 0 44 0000 0 5555555555 0 6 22 00 4 0 7 22 22 7 7 2222222 7 2222 88 7 0 6 2222 8 00 0 8 2 0000 7 22 7 5555 333333333 22 7 22 88888 3 7 7 7 7 0 7 7777777777777777777 77777 333 7777 000 7777777777777 888 22 77777 7 7 7 00000000000000000 7 7777777 7 777 7 7 22 7 5 555 8888888 7 8 8888 0 77777 8 888 7 7 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 00 4 4 2222222222222222222 0 000 0 6 0
consensus : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----AGGGC----C--AACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-TA----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
Reference ( family-367 ) : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----AGGGC----C--AACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-TA----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|1 : TATTTACATTTTTGCA--ACT-GCTTTTCTCCTAACA-TAAC---A----CT-ATTA-GAGGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGGAGGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGC-ATGAAGTATTTGTTGAAAA--AGAGGTAACCG-TACT-ACTTTT-ACTAAGT--TTAC-----------A---G----TCTA------TTAA-A---T---AGAT-G-AATCAAA-AAA-CACAAAATATTTATTATGAT-TTTATTTTTTTTCCAGTCATTGGACTTTCAT-CAAAAAT-AAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTATTTATGGTATGGATGGGATGTT-----AA-A------TGT----ATGACACAA-AAACC-GGAG-CAAAATGCC-----AGGGCGGGGCCAAACCACAATTGCACA-AAGAT---ATTCAT-CCATC-ACAGAGGAATTTTAAAA-AGAGAATCGC-T-T-CTATTT-CAA-ATGTGC-TCCATCTTCGCCTTCTGTAACTGCCGGGCAATGTGTGT-GT-ACAGATC-TTC--A---ATTCA----TTCAA----------ATTTC-C--TGGC-TTAGAATTCCACGTAGGCAT-CA--------T-----------C-A------------------T---T--ATTTTTTTC-ACTTTCCAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACGAATTC--GTCCCATGAAAACACAA-CAA-A-AAAA-TTCCCAGGGTGGGAATTGGAATGTCATGAAGCTCCCAATCCACCCAAACGAATTTCTGAAACATTCCAGAAGT-GGTATGGT---CCT-CAATAAAAATGCTTCACTGCGCCTGCTGGATGAACAAA-ACA-ATCGGCAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACTCATG-ATATAAAGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAA--CATTGTGGT-CATCAGCT-TCAACACACAAAGAAGGTCCTTCTCTGG-TT-----TATGTC-----CG--GATATTTGTAAGTCC--TCAAAGTCATGAAAGTGTA------TC--AAAACTTAACA--C-A--CACATGACCGCA-ACTGCCTGCGCGA---ACGGTCATTACAGCTATGAGTGATGATGATGACAGTTTC------CAGTCACGCCAGATCA--TAGTTT-TGTCGCGG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGT-TC-GTTGA---AAACC--TA---A-TAA------CG--A-AA--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AGAA------------AGC-GTTTCAGCTGAGC-CTCACGTTTG-TC-AACAATTAC-----AAATA-CAG-ACCG-T----TA---AC-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----AC-TG--TCAG---TTC----TTTGTCAGGCAGAT--TC-ATCTGCGTGTCC-----TCGATC--TGTCCTGTCTGTG----ATGATTT-C----CTAC-A---C-CTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCT-TCAA-TGTTCCCCCACCTCAGTCAGTCTCTAT-----TA---AACTCCAATAATGTCCAACG--GAATATC-TTCAAA-ATTAAAGTCCTTTCAAACAACTGTC-TAC--T--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACC-CATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAACAAAATTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AGATAATTTT------C--GC---AA-ATTAGAC--ATAAGGA-GAAGAGTTT-TCAA-TGAATAAACTTT-TAAAGA-AA-TGTA--T-----A-----TGGTC-----ATTGCT-T-ATAACT-TTGC-TGTTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-AA----CA---GC-TCT--TC---A-TTC-A---GGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-TAATTCCGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-T--------------------A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGATACCAAAA-TGTAA
gi|10 : ATATCTCGAGAA-ATC--AG-CT--TCATC-AACTGTC-T-T--AAATTTCAA-A----AAAGTGAC-ACCG-ATCACGACTGTTAGTGTA----ACGTTGCG--CG-C---CCGAAC----TTCCGCCTGAATTC-TAATT--ACC-AG-T--ATTT---------AC--AAGCATTAGAC--ATA---AGGAAGAGTTT-CTAATT-CATATACTTTAGAAAGA-AA----G--T-----A-----TTGTT-----TTTGTTAA-ATA--C--TGC---TTTT-------------AACGCATCC--TA-----ATTA-AT-TG---AA-GA-----A---GCATCT--TC---ATTAC-A---T-GAAC-TTTGGTC--T-TTGTGATTT-C-----CGTGCATTTT-----AACGAA-----GCG-TTATG--TGC-GTCA-A-C---------------AATTGA--TTTGAG------------TATTGGCTAGATTTTA---CA-TGTT--CTAAC--AC--ATCA----------GCA-A---GTTATT---CGAT-CCAAAA-
gi|11 : ggaAGAATTC-AAATTTAATCTAA-T--CTTTATGCTTCTGGC--AAA-ATTAGAC--ATT---G-GAAGAGTTTATCAA-T-CATAA----T-TGAATG-AA-TA-A--TAAATAA-----TTGTCGTACGTTCTTT-A-GTG--A-TTAT-T-TTTTAGCTAGTGTTCAGAGCG--TCCTTTAGTTCTA-TA-AT-TA---AATTA----CATATGC-TCTCACC---ATTCT-ACATTGGATCTTTT-GTTAATGTGG-G--TTAT-----CGT--ACTTGTGGTAATCGAAAAAGTGCGCTTTTGATTAGTGGCAGA-CTAATATCTTGCGTTGAA---ATGT----G------------TA-----TCGG---TAAATCACTGTTGTCTAACAAATGAATCACGGATTGGTCGCA-ATTGCTCA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|12 : ATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATTTGTTGAAAA--GTAGATTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-AAGTCTA------TT-A-A---T---AGAT-GAAATC--A-ACACCACAAAATATTT-TTATAAT-TTTATTTTTT-TCCTGTCAGTGGACTTTTGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-T-ATAAAACACCGTCTTACTTA-AGTATGGATGGGATGTTTTAAAAA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-A---AT-CCTATTGAGAGCG---T--AAGTAAAGGG-CATA-AAGTTTGCA-TCAT-CCGT--Aa
gi|13 : ccattgacatcccta-A------TGT----ATG--ACAA-AAACT-GGAG-C---AT-CC-----AG----------AACTACAAAC-CACA-AATAT---A-T------------------------ACA-G-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGATGT-ACTG-C-GGCAAT--------------ACT-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAttcactgatgcatatgacatgctctcca
gi|14 : GCCCTCACGGCCATGAGCGAGGCTGGCATCGG-TTC------CAGTCCCGAAAAATGA--T-GTCCATGTCG-GG--GC-ACCGC-TGC--G-A-TTCTTCATTTTA---AAAAG--TA-CTACCAA------CA--T-A----T--ATCTCTCAAGTGAAC-----AG-A------------A
gi|15 : aTACATTT--ACATTACTTG-TTTTCTT-TATCACTAAC---AAAACCT-ATTAACGAGC-A-ATACG-TATCTCTTATCCTACTCCATAAATACCTATATGG--GGT
gi|16 : ---AACTCC-ATATTGTCC-ACG--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTCTT-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATgt
gi|17 : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTT-TCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGCAA-ATACA-------TTACC--ACTACAT
gi|2 : TTAACACATGCACA-AAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGC-----GAAAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACCT-ACA--CAA--CGCAC--TCACA-A--GCCTGCGTGC---ACGGCCATCACAGCCATGAGTGATGC------CGGTTTC------CATTCACGCCAGATCA--T-CTTTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--GAA-GGTGTC-GTTGA---AAA-------CTA-TAA------GA--A-AAATCT--AT----CGAGTCAAC-----AG-AAC----------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TC-AACAATTAC-----AATTC-CAG-ACCG-T----CA---C------TACCTT----CGTCTGC--------------TAGGACCTATG--TCAG---TTC------T-TCAGGAAGAT--TC-ATCTGC--GTCC---------TC--TGTCCTGTCTGTGTGA-ATTATTTGC----CTAC-A---C-CTGA-CGAGTGCCGCCCTG---TCCTTC-A-TGTTCCCCCACCTCAG-T--CTT-TCTG----TT---AACTCCGAAATGTCC--ACG--AAATATCTCTCAAA-ATC--ATTCA--AC----AACTGTC-TGCAAC--TTTC-A-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTA----ATATTGC--GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTCAAAATT--ATC-AGTT--TTTT------T--GCAAAAA-ATTAGAC--ATA---A-GGAGAGTTT-TCAA-T-CATATACTTT-TAAAGA-AATTGTA--T-----A------TGTC-----TTCTTT-ATATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AGCG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA--A----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-T-GTGT-TT-T-----CGT-CATTTT----GAACGAA-----GCG-TTATG--TGG-GTCA-A-CAATGTG---------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---AA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GC--A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TG
gi|3 : cctctTTTACATTT--GCAG-ACT-G-TTT-CTCTTA-TA-TAACCCAA----CTCACTG-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTACG--ACT-CATAAATACCTATATGGA-GGTCAACAAAAGACACGG-TCA-CAGCCGT-CGT-ATGAA-TA-ATGTTGAAAAAAGTAG--TACCGGTACT---CTTT-ACTAAGTAATTACGAAGTGCAATTA---G-G--CCTA--------AAGA---TCTCAGAT-GAAAT---A-ACA-CACAAA-CATTT-TTATGAT-TTT-CTTTTTCTCCAGTC--TGGGCGTTC-T-CAAAA-CAAAAG-TATATCATAA--AAACACTGTCTTA-TTATTGTATGGATGGGCTGTT-----AA-AGGAAATTGTTTTAATG--ACAATAAACCTAGAG-C---AT-CC-----ACGGC----C--A----CAAAC-CACATAAGAT---A-TAAT-CCAT--AAAGAGGA--GTCAACATA-AGTATCGCATGTCCT-TTT-CAA-ACGTGCATTTATCTTCGCCTGTTGT-ACTAAC-A-CAATATGTGTTGT-ACACATT-TTC--ATTCATTCA-TTTTTCCCGTGGCTTAGAATTTCACCATCAG-TAAAAACTTCGTTG---CGTACA------A-TGGTAAAATTTCCGA------------------T---G--ATACATATCTACTTT-TAAAAAGGAATGAAAAAAACGTCTGGAATAAAAGC--AACG--CTTCTGT--CATG-AAACACAAACAA-CCAAAA-TT-CCAGG-TGGGAATTGG-ATGTAATGAAG-TCC--ATCCC-ACAAACGATATTATAAA--AT-CCAGAAGTTGA-ATTGTACATGT-CAATAAAA--GCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAGTTCAGATC--CAAAaa
gi|4 : ATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-TA-TAAC---A----CT-ATTA-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTATC--ACT-CA-AAA---CTATATTG--GGTCAACAGA------GGGTCAACAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTT-CCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTAAGTCTATTAA-GGCCT---AGG---------AA-ACA-CACAAAATTATT-TTATGAT-TTTATTTTT-CTCCCGTCAT-GGACTTTCAT-CAAAAA---AAA-TATATC-TA-TAAAACACTGACCTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-G-AG-C---AT-CC-----AG------------CCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATCCCAT--AAAGAGGA---TCAACA-A-AGAATCAC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCTATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCG-GGCAATATGTGTGGTAATA-ATCTTTC--A---ATTCATT--TTC------------ATTTC-CCGTGGCTTTAGAATTTCAC-----CAT-CATGTTGCG-TA----------C-ATCCCGGCGTACATGGGATT---C--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGT--CTGGAATAC--GCC--ACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAACA-AAAATTT-CCAGGGCGGAATTT---ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAAT-GAT-TGATACATGTCCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-TCAGATC--CAAATGCTACAg
gi|5 : CA--T-GGCTATGTTA-GG--GC-ATCTA-AGCCCG-ATGGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAAACATTATA--A-GG--TTGGATC---CGAGTCCACCTTTTAG-A------------AGCTG-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTATCTATTATATC-CA--ACCACT----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCTA---TTC----TAT---ATATA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--TG--CCGTCTGTGTTATATTATT-GC----CTACAATCTC-TTGAACCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----CACCTAACTCC-ATATTTCCTTATT--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAATATATTAA--TGACTACCGCATCACAAA----AATGTAGTTAACG-TGTGTGCGACACTACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGACAAATT---A-TAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAGATA-TA-TAT---T-----ATTTATTTGTC-----TTTTTT-AGATA--C-TTGC-C-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TATAT-TA---TA-TATTTTCT---AT-TCT--TTTCAATGTC-A---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--ACGCAGA-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-ACC---------------AA---A--T----GTTTTATATATTTTA-----TGAA----A---CA-TGTTG-CTAACT-ATGAATCA----------TCATA-T--TTA-TATCTGAT-CAAAAACTGTAAc
gi|6 : TTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCC-A-CA-TAAC---A----CT---TA-CGAGC-ACATACGCTAT---TTAC---ACTGCA-AATTACCTATTTGA--GGTCAACAGA------G--TCA-CA-TTGTGCGTTATGAA-TTT-TGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACTTACTTTT-ACTGAGTA-TTAC-----------ATAAGTA--TATA------TTAA-----T---AGATTGAAATC-AA-AC--CACAAAATATTT-TTTAGGTATTTATTTTTTCCTCAGTT----GACTTTC-T-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TA-TAAAACACTGTCTTA-TTATG--ATGGATGGAATGTT-----ATTA------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAGAC---AT-CC-----TGGCC----G--GAACACAAAT-CACA-AACAT---A-TCAT-CCAT--ACAGAGG---TTCTATA-T-AGAATCGC-T-TTCCATTTTCAACATATGC-TCCATCTCCGCCTGTTGT-ACTGC---GCAATGTGTGTG-T-ACA-ATC-TTTCAA---ATTCA-T--TT---------------TTC-CTGTGGC-T-AGCATTTCAC-----CAA-CA------G-T-----------C-A------------------T---T--ATTT-TTTC--CCCT-CAAAAAG--ATGAAAAT--C--CTGGAATA---GC-AAACG--------T--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGG-TGG-AATTG--ATGTCATGAAGCTCT--ATACG-ACAAATGCATTTATGAA--ATTCCAGGA-----TGTGATACACAT-C-----------TCCA-----C-TGCT-TATGAGCAAA-ACAGATT--CAAATGCTAC
gi|7 : -GG--GC-ATC-A-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CATAA-AG--TT--ATC----GAGTCCAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CA--ACCC-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCG------------TT-TCAA-TA-AT--TC-ACATGC--GTCC--------ATC--T---CCGTCTGGAT-A--TTATT--C----CTACAA---CCTTGA-CCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATACACCTA---TACTCC-ATATTTCCTTACGTTATATATCTTTCCAATATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AAA-TGAC-ACCGCATCACAAAAAT--GTGTTA---ACGTTGTG--CG-CACAC-AAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--A-A---A-AAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTT-TAAGTATAA-TGTATTT-----A-----TTGTT-----ATTTTT-A-ATA--CTTTGCAT-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TA-ATATATATAT-TA----CA---TC-TTT--CA---ATGTCAA---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--AA--GAG-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-A-T---------------CC---A--T----G------------T------TGAA---TAT--TA-TGT
gi|8 : ttaTTACATTT--GCA--ACC-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ACTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--G-TCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATATTGAAA---GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTTTACTAAG-A-TTAC-----------A---G-AAGT-TA------TTAA-----T---AGAT-GAAATC-AACAC--CACAAAATATTT-------------------CTCCA-TCATTGGACTTTCATTCAAAAACAAAAAATATT-C-TA-TAAA-CACTGTCTTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-AA-----TGT----ATG---CAA-A----------C---AT-CC-----AGGGC----C--A----CAAAC-CACA-AAGAT---A-TCATGCCATCAAAAGAGGA--T-CTACA-G-AGAATAGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGT-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-ACT-TTC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTGCAC-----CAT-CA------GTTG----------C-G------------------TACATGGATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATAAAAATGGT--TTGGAATAC--G-CAAACG--CTC--AT--TATG-AAACACAA-CAA-A-CAAA-TTACAAGGGTGGAAAaaatgtgaaacatg
gi|9 : ataTCCTTCG-TGGATTGTCCTTAAGTCGCGATTGATGACATCTGTAAGTCCCATCCA--T-------GTATAATTTTTCCATATAACTT-AGATCTAAATCGCAC--TTCCACA--GCCTGCGTGCCCGACGCCCA-CACGGCC-T---CGGAGCTGATG-CGGTTTCCTATTACAGTTGTCCAGGATCATTT-CTCTATGTCG-GGTTGCAATCAATAGT--G-T-GAGGTG-TTTGAATCAAACCGATAG-TA-TGA------AA--ACAG--CT--------CAAGTC-AC-----AG-ACATCAGTTTTTCAAC-GCTTCTG-AGAGTCTTCA-ATTTGTTCCACCCATTAC-----AACTCTCAGAACTG-TTCTCCAGTCCTTTCGGTACCCTTCTGCATCTGCTATGGTTTCCGTCTT-----AT-TGTTTCAGCTATTCTTCTTTT-TCATGCGCATCATCTATCTGC--GTCCTGTAGTC-ATCAATGTCGTG---GTGA-A-TTTATTTGCTGCGCTAC-A---C-TTGA-CGAGTGCCG-CCTGTCATCT-TC-ATCGCTCCTC
blockSeqs : . TT T . T C AAAAC C A A C C CTC CCT C T A AGACAC G A T . T AA A T T A GAAGTGCAATTAGGCCTAAAGATCTC T A CA C AC . A A TC AGT G T TA A A A C G A TTAAA T GGAAAT TTTA . T T A . . TATTGAGAGCGTAAGT . T TGC . C CA A AGTCA TA A G C T C A . AC A TGTACAC T ATTC TTT CCGTGGCTTAGA A C T T CATCATGTTGCGTACATCCCGGCGTACATGGGATTC A TA . GA A GT AAAGC CTTCTGT . A CC T A G G GG A C . C . T GTTGAA A C A AT . A . TT G . A C . . TC A . C . C A GTCCT GCGAT A CA TGTATAATTTTTCCAT . TCTAAAT . A CA CCG T A G G T GCAT T CTATTA C A TT . . TT A AAT CC AA T A ATC CCGA GC C ACATTATAAGGTTGGATC A CTTTT . CATCAGTTTTTC T C . TC T T A CTATT T T GA C TCTCCAGTCCTTTCGG TCTG TATGGTTTCCGTCTTATTGTTTCAGCTATTCTTCTTTTTCATGCGC CA T . TGTAGTC AA T TTATA TGCTGCG AATCT C A TCA T . TC CT . ACACCTA G TT TT T G T . . . T GCAAC T TATT AG T T T GTTA TG A C . A TA T TT ATGCTTCTG AA C AA AG T A T . A G T TAATAAATAA GTACG AA CT AT AGCTAGTGTTCAG GCA TT GTTCT T T A AATTACATAT A TTTCA A CAT T G AA G T GAT AT G T TGGT A AAAGT C GAT T G CTAATATCTTGCGTTGAAATGTGTATCGGTAAAT C T AA G A CGGATTGGTCGCAATTGC T ATC . C
blockSeqs : . G . . . . CCAA . . . . . . C A T . . . . . . A . G . . . AGATCTAAGTCTATTAAGGCCT . A CA . A . . A TC ATT A . CA . . A C G C . . A . . . . . . . TGGCCGGAAC . . . . G . A ATCA G . . C . . . . CG A GGTAATA . CAA TT . . C . A TGCGTACAATGGTAAAATTTCCGATG A A . . G . CGCC CTCGT . . CA . . G A G A C . G . T ATGAT A . A . . A . T G . . A . . A . TGTATATCA . CAA . C A . T A G T T ATG T . A C . . . . . GC . AT G . . AG GC . CATAAAGTTATC A . . AC . . . . T . A . A . G . CACT . TAGGACCTATGTCAGTTCTTCAGGAAG . . . . . T TGAA TGC AA . . . . . T CT . ACACCT . TT . A C . . . . . TAAA . . A . T T A G . T . . . . T T . . . G T . . . . T . TATTATTTAT . AT C T . G . . . . . TATATTTTCT . CACC . . . . . . G GT C . C TG T . T G . . CAATTGATTTGAGTATTGGCTAGATTTTA . . T A A GCATGA . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . G G T . . . . . . A . G . . . ATAAGTATATATTAAT . A C . A . . A T AT A . TA . . . C . C . . . . . . . . . . ACGGCCA . . . . . . C TTCT A . . C . . . . C G GGTACT . A T . . C . T CATCAGTTGCGTACATGG A A . . G . CGCA CTCAT . . A . . . A . C . . G . . TG A . . . . . . A G . . . . A . . . . G A . . . . . GA . A G . . CC C . CATATATCTCT C . . . . . . . T . C . A . . . CACT . TTTTATCTATTCTATATATA . . . . . . AAT GC A . . . . . . T . GTT . C . T A . . . . . CC . . . . A . . . . A . . . . T C . . . A T . . . . G . TGTATTTA . AG A T . G . . . . . TATATTACA . TC . . . . . . G G T . T TG A . T G . . CCAAATGTTTTATATATTTTATGAAA . . . G T TCATAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . C G T . . . . . . A . G . . . AGAAGTCTATTAAT . A A . . . . . C T . . CA . . . . . A . . . . . . . . . . AGGGCCA . . . . . . A ATCT T . . T . . . . C A GTACA . A T . . T . T CAACAGTCATT . . . . . . GCA T . . A . . . . . . . . . TA . A G . . CC C . GAAAAATCTAT C . . . . . . . . . . . C . . . CAC . TTTTATCGTTTCAATA . . . . . . TA C A . . . . . . . . . T C . . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . T C . . . A . . . . . T . TTGTATA . A C C . . . . . . . AAGAA . TC . . . . . . G . T . . . G . . . . . CAATGTGAAATGTATGGAAA . . . . A GCAAG . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . C . T . . . . . . . . . . . . AGAAGTTATTAAT . . . . . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . AGAACT . . . . . . . . G . . C . . . . C . . . A T . . C . . . . . A . T G . . . G . AAACAGCT . . . . C . . . . . CC . . . . . . . T . . . . A . . . . . T . GTA . A C . . . . . . . . AAACA . CA . . . . . . . . T . . . . . . . . . TCCATGTTGAATAT .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGCC . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : ** ** AGAAGTCTATTAAT***************************** CA* C* CA ** *** AGGGCCG************** ** ATCT*** G** C** GGTACN** T*** ************ GC***** CTCGT****** C* NATAAAGCTATC************** ** G* ** ******** TAA** GC***** T* ** ** CC***** G*** ** **** T*** A**** TGTATTA************ AN* C*** T** G** AAATTACA********* G** T****** TG** G** GCATGC*************
originalCons : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTAC-----------A---G-A--TCTA------TTAA-A---T---AGAT-GAAATC-AA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CC-----AGGGC----C--AACCACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGA--TTCAACA-A-AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCC-GGCAATATGTGTGGT-ACA-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAA------CA--A-AG--TT--ATC---CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC-----TC-ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-A-CGTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AA-TGTA--T-----A-----TTGTC-----TTTTTT-A-ATA--C-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA---AA-TA----CA---GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GCA-A-TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
finalCons : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTACAGAAGTCTATTAAT-----------------------------AGAT-GAAATCA-A-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTATTTTTC-TCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAACAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CCAGGGCCG--------------ACAAAC-CACA-AAGAT---A-TCAT-CCAT--AAAGAGGATCT---ACAG--AGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGTACN--ATC-TTC--A---ATTCAT---TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAGC-----AACGCTCGT------CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAGT-GATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCA-AAAACTT-ACA--CAA--CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAC-TA-TAANATAAAGCTATC--------------CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTCC--------ATC--TGTCCCGTCTGTGTAA--TTATTGC-----CTACAA---C-TTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-AT-GTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-TCC-----TTTCAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGTTGCG--CG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AGT---TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATAA----GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTT-TAAANA-AATGTATTA------------TTGTC-----TTTTTTAN-ATAC---TTGCT--TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TAAAATTACA---------GC-TCT--TC---ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TTT------CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCAGCATGC-------------TTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 1 11111111 111 1 11 111111 1111 444444444444444444 22 11 1 1 1 11111 222222 1111 111 44444444 22222222 11 111111111 11 1111 111111 1111 444444444444 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11 11 333 11 11 11 11 111 1 1 222 11 11 11 2222222 1 11 22222 1 11 11 1 1 1 11 1 1 1 22222 33333 33333 11 5555555555 333333 1 1 333333 11 2222 222 2222 222222 11 111 11 2222222 22222 11111 444444444444 1 11 1 22222 11 3333333333333333 1111 66666666666666666666666666666666666666666666666666666 11 11 333333333333 11 3333 1 1111 33333 111 11 1111 1 3333333333 1 11 11 2222222 1111 2222 1111 1111 222222222 11111 111 22222222222222222 22222 1 111 3333333333333 111 11111 44444444444444444 111 222 1111111 1111 11111 111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 3333333333 11111 111
lowQualScore : 77 33 5 5 1 5 33333333 5 5 5 5 5 000 888 0 3 33 999999 6 6 6 6 7 99 1 6 6 6 4444 99 99 111111111111111111 6 3 55 6 00 6 6 6 3 00 3 4 6 99 6 6 5 9 5 1 66666 5 222222 2222 77 5 5 0 5 000 5 1 00000000 44444444 6 6 2 6 6 55 3 999999999 6 6 6 1 6 6 6 6 55 1 99 6 7777 6 111111 5555 333333333333 6 1 6 3 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 88 8 11 3 11 888 99 11 11 11 8 8 111 8 6 0 6 111 1 2 33 00 33 3 0000000 3 0 0 3 22 55555 9 0 11 2 33 1 5 5 5 88 5 5 5 66666 6 7 33333 33333 7 88 2222222222 888888 7 3 3 555555 88 3 2222 0 333 3 3 2 1 3 5555 3 888888 4 1 11 8 0 6 99 6 666 99 888 2 6 111 99 55 6 1111111 1 66666 7 66666 6 333333333333 8 6 8 99 3 8 5 00000 1 8 88 8 4444444444444444 7777 77777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 8 11 000000000000 11 5 0 5555 6 5 7777 33333 8 444 8 8 88 5555 0 4444444444 6 0 77 11 1 1 6 99 99 6 6 1111111 6 6 4444 99 6 6 5 7777 8 8 8 55 7777 6 99 6 3333 999999999 99 6 99 11111 7 6 6 6 111 88888888888888888 33333 7 3 555 6666666666666 555 99 66666 6 6 6 88 88888888888888888 6 99 6 6 111 6 6 99 6 2 222 6666666 6 9 4444 6 66666 9 555 6 6 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 6 8 99 6 1 5555555555 8 33333 8 444 8 0 8
lowQualScore : .. .. . . . . ........ . . . . . ... ... . . .. ...... . . . . . .. . . . . .... .. .. .................. . . .. . .. . . . . .. . . . .. . . . . . . ..... . ...... .... .. . . . . ... . . ........ ........ . . . . . .. . ......... . . . . . . . . .. . .. . .... . ...... .... ............ . . . . ........................................................... . .. . .. . .. ... .. .. .. .. . . ... . . . . ... . . .. .. .. . ....... . . . . .. ..... . . .. . .. . . . . .. . . . ..... . . ..... ..... . .. .......... ...... . . . ...... .. . .... . ... . . . . . .... . ...... . . .. . . . .. . ... .. ... . . ... .. .. . ....... . ..... . ..... . ............ . . . .. . . . ..... . . .. . ................ .... ..................................................... .. . .. ............ .. . . .... . . .... ..... . ... . . .. .... . .......... . . .. .. . . . .. .. . . ....... . . .... .. . . . .... . . . .. .... . .. . .... ......... .. . .. ..... . . . . ... ................. ..... . . ... ............. ... .. ..... . . . .. ................. . .. . . ... . . .. . . ... ....... . . .... . ..... . ... . . .............................................................. . . .. . . .......... . ..... . ... . . .
lowQualScore : 99 66 7 7 4 7 11111111 7 7 7 7 7 000 666 1 2 66 222222 7 7 7 7 8 22 0 7 7 7 2222 22 22 222222222222222222 7 2 77 7 77 7 7 7 7 00 0 7 7 55 7 7 5 3 0 0 77777 7 111111 1111 99 7 7 7 7 000 7 0 22222222 22222222 7 7 5 7 7 88 0 888888888 7 7 7 0 7 7 7 7 88 0 22 7 8888 7 888888 0000 333333333333 7 0 7 5 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 00 2 00 000 00 00 00 00 0 0 888 0 0 0 4 222 0 5 88 22 88 2 8888888 2 2 0 2 22 00000 2 0 00 5 88 0 0 5 0 00 5 5 0 55555 7 3 33333 33333 3 33 7777777777 333333 3 3 3 000000 33 7 7777 7 333 2 2 5 0 2 2222 2 888888 2 0 00 0 8 7 22 7 888 22 777 5 7 777 22 88 7 8888888 0 55555 2 77777 7 333333333333 0 0 0 00 8 0 4 00000 0 0 00 0 0000000000000000 0000 44444444444444444444444444444444444444444444444444444 00 0 00 888888888888 00 6 8 6666 0 0 0000 44444 0 000 0 0 66 0000 0 5555555555 0 6 22 00 4 0 7 22 22 7 7 2222222 7 7 2222 22 7 0 6 2222 0 0 0 88 0000 7 22 7 5555 333333333 22 7 22 88888 3 7 7 7 888 22222222222222222 33333 5 3 000 7777777777777 888 22 77777 7 7 7 33 55555555555555555 7 22 7 7 777 7 7 22 7 5 555 8888888 7 8 8888 0 77777 8 888 7 7 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 0 00 4 4 0000000000 0 66666 0 000 0 6 0
consensus : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTACAGA----AGT-CTAT--TA---------A----T---AGAT-GAAATCAA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTA-TTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CCAGGGCC-----A--CAAAC--------CACA-AAGATA-TCAT-CC-AT--AAAGAGG-A-TCT---ACA-GAGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-AC-N-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GC--AACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAG-TGATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCAAA-AACTT-ACAC---AA-CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TA-CTA-TAAN----ATAAAGCT--AT-CGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTC-------C---ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTATTTGC----CTACAA---CTTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-AT-GTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTC-AA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGT-TGC-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTTTAAANA-AA-T-GT--A-TTA-----TTGTC-----TTTTTTANATAC-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA-AA--------ATTACA---GC-TCT--TC-ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GC-A--TGNTTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
Reference ( family-367 ) : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTACAGA----AGT-CTAT--TA---------A----T---AGAT-GAAATCAA-ACA-CACAAAATATTT-TTATGAT-TTTA-TTTTTCTCCAGTCATTGGACTTTCGT-CAAAAACAAAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTACTTATGGTATGGATGGGNTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-C---AT-CCAGGGCCG----A--CAAAC--------CACA-AAGATA-TCAT-CC-AT--AAAGAGG-A-TCT---ACA-GAGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-AC-N-ATC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTTCAC-----CAT-CA------G-TG----------C-A------------------T---T--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATA---GC--AACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGGGTGGGAATTGG-ATGTNATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAG-TGATATGGTACACGT-CAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-NCAGATC--CAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACNCATGCACATAAGGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAATCCATTGTGGTACATCAGCTCTCAGCACACAGAGAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCAAA-AACTT-ACAC---AA-CGCAC--TCGCA-A--GCCTGCGCGC---ACGGCCATCACGGCCATGAGCGANGCTGACG-CGGTTTC------CAGTCGCGCNAGATCA--T-GTCTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TA-CTA-TAAN----ATAAAGCT--ATCCGAGTCAAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CAG-ACCG-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----NT-TG--TCAG---TTC----TTT-TCANGCAGAT--TC-ATCTGC--GTC-------C---ATC--TGTCCCGTCTGTGT-A-ATTA-TTGC----CTACAA---CTTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCC-TC-AT-GTTCCCCCACCTCAGCT--TCT-TATA----TA---AACTCC-ATATTTCCCTACG--ATATATCTTTCNAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTC-AA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGT-TGC-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--ATA---A-GAAGAGTTT-TCAA-T-CATAAACTTTTAAANA-AA-T-GT--A-TTA-----TTGTC-----TTTTTTANATAC-TTGC-T-TTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA-AA--------ATTACA---GC-TCT--TC-ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-T-----CGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-C---------------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACGAATCA----------GC-A--TGCTTA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|1 : TATTTACATTTTTGCA--ACT-GCTTTTCTCCTAACA-TAAC---A----CT-ATTA-GAGGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGGAGGGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGC-ATGAAGTATTTGTTGAAAA--AGAGGTAACCG-TACT-ACTTTT-ACTAAGT--TTACAG-------T-CTAT--TA---------AA---T---AGAT-GAA-TCAA-AAAACACAAAATATTTATTATGAT-TTTATTTTTTTTCCAGTCATTGGACTTTCAT-CAAAAAT-AAAA-TATTTC-TAATAAAACACTGTCTTATTTATGGTATGGATGGGATGTT-----AA-A------TGT----ATGACACAA-AAACC-GGAG-CAAAATGCCAGGGCGG----GGCCAAACCACAATTGCACA-AAGATATTCAT-CC-ATC-ACAGAGGAA-TTTTAAAAA-GAGAATCGC-T-T-CTATTT-CAA-ATGTGC-TCCATCTTCGCCTTCTGTAACTGCCGGGCAATGTGTGT-GT-ACAG-ATC-TTC--A---ATTCA----TTCAA----------ATTTC-C--TGGC-TTAGAATTCCACGTAGGCAT-CA--------T-----------C-A------------------T---T--ATTTTTTTC-ACTTTCCAAAAGG--ATGAAAATGGC--CTGGAATAC--GCCAAACGAATTC--GTCCCATGAAAACACAA-CAA-A-AAAA-TTCCCAGGGTGGGAATTGGAATGTCATGAAGCTCCCAATCCACCCAAACGAATTTCTGAAACATTCCAGAAG-TGGTATGGT---CCT-CAATAAAAATGCTTCACTGCGCCTGCTGGATGAACAAA-ACA-ATCGGCAAATGCTACAACAAACACTCTTTAATATTAACTCATG-ATATAAAGACGCGCTCTCTCTTCCAGCTTTGCAAA--CATTGTGGT-CATCAGCT-TCAACACACAAAGAAGGTCCTTCTCTGG-TT-----TATGTC-----CG--GATATTTGTAAGTCC--TCAAAGTCATGAAAGTGTA------TC-AA-AACTTAACAC----A-CACATGACCGCA-ACTGCCTGCGCGA---ACGGTCATTACAGCTATGAGTGATGATGATGACAGTTTC------CAGTCACGCCAGATCA--TAGTTT-TGTCGCGG--GC-ATCGA-AGC--G-A-GGT-TC-GTTGA---AAACC--TA---A-TAAC------GAAATT--ATCCGAGTCAAC-----AGAA------------AGC-GTTTCAGCTGAGC-CTCACGTTTG-TC-AACAATTAC-----AAATA-CAG-ACCG-T----TA---AC-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----AC-TG--TCAG---TTC----TTTGTCAGGCAGAT--TC-ATCTGCGTGTC-------CTCGATC--TGTCCTGTCTGTG----ATGA-TTTC----CTAC-A---CCTGA-CGACTGCCGCCCTG---TCT-TCAAT-GTTCCCCCACCTCAGTCAGTCTCTAT-----TA---AACTCCAATAATGTCCAACG--GAATATC-TTCAAA-ATTAAAGTCCTTTCAAACAACTGTC-TAC--T--TTTC-AA-A----AA--TGAC-ACC-CATCACAACTGTTAGTGTAG---ACGT-TGCGGCG-CACCCCAAACAAAATTCCGCCAGAATTC-AAATT--ATC-AGATAATTTT------C--GC---AA-ATTAGAC--ATAAGGA-GAAGAGTTT-TCAA-TGAATAAACTTTTAAAGA-AA-T-GT--A--TA-----TGGTCA----TTGCTTATA-ACTTTGC-TGTTTT-------------AACG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA-AA--------A--ACA---GC-TCT--TC-A-TTC-A---GGGAAC-TTT-GTT--T-TGGTG--TT-TAATTCCGT-CATTTTTG--AAACGAA-----GCGTTTATG--TAG-GTCA-A-T--------------------A--T----G------------TA-----TGGA---TA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GCAA--TGATTA-T---CGATACCAAAA-TGTAA
gi|10 : ATATCTCGAGAA-ATC--AG-CT--TCATC-AACTGTC-T-T--AAATTTC-AA-A----AAAGTGAC-ACCG-ATCACGACTGTTAGTGTA----ACGT-TGC-GCG-C---CCGAAC----TTCCGCCTGAATTC-TAATT--ACC-AG-T--ATTT---------AC--AAGCATTAGAC--ATA---AGGAAGAGTTT-CTAATT-CATATACTTTAGAAAG-AA-------A-GTA-----TTGTT-----TTTGTTAAATAC--TGC---TTTT-------------AACGCATCC--TA-----ATTA-AT-TG-AA--------G--A-A---GCATCT--TC-ATTAC-A---T-GAAC-TTTGGTC--T-TTGTGATTT-C-----CGTGCATTTT-----AACGAA-----GCG-TTATG--TGC-GTCA-A-C---------------AATTGA--TTTGAG------------TATTGGCTAGATTTTA---CA-TGTT--CTAAC--AC--ATCA----------GC-A--AG-TTATT---CGAT-CCAAAA-
gi|11 : ggaAGAATTC-AAATTTAATCTAA-T--CTTTATGCTTCTGGC--AAA-ATTAGAC--ATT---G-GAAGAGTTTATCAA-T-CATAA----TTGAATG-AA-TAATAAA-TAA-----TTGTCGTACGTTCTTTAG-TGA-TTAT-T-TTTTAGCTAGTGTTCAGAGCG--TCCTTTAGTTCTA-TA-AT-T--AA--------ATTACATATGC-TCTCACC-ATTCT-ACATTGGATCTTTT-GTTAATGTGG-G--TTAT-----CGT--ACTTGTGGTAATCGAAAAAGTGCGCTTTTGATTAGTGGCAGA-CTAATATCTTGCGTTGAA---ATGT----G------------TA-----TCGG---TAAATCACTGTTGTCTAACAAATGAATCACGGATTGGTCGC-AATTGCTCA-T---CGAT-CAAAAA-TGTAA
gi|12 : ATAAATACCTATATGG--GGTCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATTTGTTGAAAA--GTAGATTACCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTACAGA----AGT-CTAT--TA---------A----T---AGAT-GAAATC-A-ACACCACAAAATATTT-TTATAAT-TTTA-TTTTTTTCCTGTCAGTGGACTTTTGT-CAAAAATAAAAA-TATTTC-T-ATAAAACACCGTCTTACTTA-AGTATGGATGGGATGTTTTAAAAA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAG-A---AT-CCa
gi|13 : ccattgacatcccta-A------TGT----ATG--ACAA-AAACT-GGAG-C---AT-CCAGAACT-----A--CAAAC--------CACA-AATATA-T---------------------------ACA-GAGAATCGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCCATCTTCGCCTGATGT-ACTGC--GGCAA---------T-AC-T-----TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAtattgagagcgtaagtaaagggcataaagtttgcatcatccgtattcactgatgcatatgacatgctctcca
gi|14 : GCCCTCACGGCCATGAGCGAGGCTGGCATCGG-TTC------CAGTCCCGAAAAATGA--T-GTCCATGTCG-GG--GC-ACCGC-TGC--G-A-TTCTTCATTTTA---AAAAG--TA-CTACCAAC----ATATATCT--CT-CAAGTGAAC-----AG-A------------A
gi|15 : aTACATTT--ACATTACTTG-TTTTCTT-TATCACTAAC---AAAACCT-ATTAACGAGC-A-ATACG-TATCTCTTATCCTACTCCATAAATACCTATATGG--GGT
gi|16 : ---AACTCC-ATATTGTCC-ACG--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTCTT-C--C--TTTC-AA-A----AA--TGAC-ACCGCATgt
gi|17 : TATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTT-TCCTA-CA-TAAC---A----CT-ATTA-CGAGCAA-ATACA-------TTACC--ACTACAT
gi|2 : TTAACACATGCACA-AAGGACGCACTCTCTCTTCCAGCTTTG-AAATCCATTGTGGTACA-CAGCTCTCAGC-----GAAAAGGTCCTTCTCTGGATT-----TATGTC-----CGATGATATTTGTAAGTCC--TCAA--T-------GTATA------TCAAA-AACCT-ACAC---AA-CGCAC--TCACA-A--GCCTGCGTGC---ACGGCCATCACAGCCATGAGTGATGC------CGGTTTC------CATTCACGCCAGATCA--T-CTTTATGTCG-GG--GC-ATCGA-AGC--GAA-GGTGTC-GTTGA---AA------A-CTA-TAAG----AAAAATCT--AT-CGAGTCAAC-----AG-AAC----------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TC-AACAATTAC-----AATTC-CAG-ACCG-T----CA---C------TACCTT----CGTCTGC--------------TAGGACCTATG--TCAG---TTC------T-TCAGGAAGAT--TC-ATCTGC--GTC-------C----TC--TGTCCTGTCTGTGTGA-ATTATTTGC----CTAC-A---CCTGA-CGAGTGCCGCCCTG---TCCTTC-AT-GTTCCCCCACCTCAG-T--CTT-TCTG----TT---AACTCCGAAATGTCC--ACG--AAATATCTCTCAAA-ATC--ATTCA--AC----AACTGTC-TGCAAC--TTTC--A-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAACTGTTAGTGTA----ATAT-TGC-GCG-CACCCCAAAC----TTCCGCCAGAATTCAAAATT--ATC-AGTT--TTTT------T--GCAAAAA-ATTAGAC--ATA---A-GGAGAGTTT-TCAA-T-CATATACTTTTAAAGA-AATT-GT--A--TA------TGTC-----TTCTTTATATAC-TTGC-T-TTTT-------------AGCG--TCC--TA-----A-TA-AT-TA-AA-----------ACA---GC-TCT--TC-ATTTC-A---TGGAAC-TTT-GTT--T-T-GTGT-TT-T-----CGT-CATTTT----GAACGAA-----GCG-TTATG--TGG-GTCA-A-CAATGTG---------AA---A--T----G------------TA-----TGGA---AA---CA-TGTTG-CTAAC--ACAATTCA----------GC-A--TGATTA-T---CGAT-CAAAAA-TG
gi|3 : cctctTTTACATTT--GCAG-ACT-G-TTT-CTCTTA-TA-TAACCCAA----CTCACTG-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTACG--ACT-CATAAATACCTATATGGA-GGTCAACAAAAGACACGG-TCA-CAGCCGT-CGT-ATGAA-TA-ATGTTGAAAAAAGTAG--TACCGGTACT---CTTT-ACTAAGTAATTAC-GA----AGTGCAAT--TAGGCCTAAAGA----TCTCAGAT-GAAAT--A-ACA-CACAAA-CATTT-TTATGAT-TTTC-TTTTTCTCCAGTC--TGGGCGTTC-T-CAAAA-CAAAAG-TATATCATAA--AAACACTGTCTTA-TTATTGTATGGATGGGCTGTT-----AA-AGGAAATTGTTTTAATG--ACAATAAACCTAGAG-C---AT-CCACGGCC-----A--CAAAC--------CACATAAGATA-TAAT-CC-AT--AAAGAGG-AGTCA---ACATAAGTATCGCATGTCCT-TTT-CAA-ACGTGCATTTATCTTCGCCTGTTGT-ACTAA--CACAATATGTGTTGT-AC-ACATT-TTC--ATTCATTCA-TTTTTCCCGTGGCTTAGAATTTCACCATCAG-TAAAAACTTCGTTG---CGTACA------A-TGGTAAAATTTCCGA------------------T---G--ATACATATCTACTTT-TAAAAAGGAATGAAAAAAACGTCTGGAATAAAAGC--AACG--CTTCTGT--CATG-AAACACAAACAA-CCAAAA-TT-CCAGG-TGGGAATTGG-ATGTAATGAAG-TCC--ATCCC-ACAAACGATATTATAAA--A-TCCAGAAGTTGA-ATTGTACATGT-CAATAAAA--GCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAGTTCAGATC--CAAAaa
gi|4 : ATTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCCTA-TA-TAAC---A----CT-ATTA-TGAGC-A-ATACG-TAT---TTATC--ACT-CA-AAA---CTATATTG--GGTCAACAGA------GGGTCAACAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATGTTGAAAA--GTAGGTT-CCGGTACT-ACTTTT-ACTAAGTA-TTACAGATCTAAGT-CTAT--TA---------AGGCCT---AGG--------AA-ACA-CACAAAATTATT-TTATGAT-TTTA-TTTTTCTCCCGTCAT-GGACTTTCAT-CAAAAA---AAA-TATATC-TA-TAAAACACTGACCTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-A------TGT----ATG--ACAA-AAACC-G-AG-C---AT-CCAG--CC-----A--CAAAC--------CACA-AAGATA-TCAT-CCCAT--AAAGAGG-A-TCA---ACA-AAGAATCAC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGC-TCTATCTTCGCCTGTTGT-ACTGCG-GGCAATATGTGTGGTAAT-A-ATCTTTC--A---ATTCATT--TTC------------ATTTC-CCGTGGCTTTAGAATTTCAC-----CAT-CATGTTGCG-TA----------C-ATCCCGGCGTACATGGGATT---C--ATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATGAAAATGGT--CTGGAATAC--GC--CACG--CTC--GT--CATG-AAACACAA-CAACA-AAAATTT-CCAGGGCGGAATTT---ATGTAATGAAGCTCC--ATCCG-ACAAACGAATTTATGAA--ATTCCAGGAA-TGAT-TGATACATGTCCAATAAAAATGCCTCA-----CATGCT-GATGAGCAAA-TCAGATC--CAAATGCTACAg
gi|5 : CA--T-GGCTATGTTA-GG--GC-ATCTA-AGCCCG-ATGGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAAACATTATAAGGTTGGATCCGAGTCCACCTTTTAG-A------------AGCTG-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTATCTATTATATC-CA--ACCACT----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCTA---TTC----TAT---ATATA-AT--TC-ACATGC--GTC-------C---ATC--TG--CCGTCTGTGTTATATTA-TTGC----CTACAATCTCTTGAACCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATA----CACCTAACTCC-ATATTTCCTTATT--ATATATCTTTCCAA-ATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTC-AATATATTAA--TGACTACCGCATCACAAA----AATGTAGTTAACGTGTGT-GCGACACTACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGACAAATT---A-TAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTTTAGAT---A-T-AT--A-TTATTTATTTGTC-----TTTTTTAGATAC-TTGC-C-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TATAT-TA-TATATTTTCTATT-------C-TTT--TCAATGTC-A---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--ACGCAGA-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-ACC---------------AA---A--T----GTTTTATATATTTTA-----TGAA----A---CA-TGTTG-CTAACT-ATGAATCA----------TC-A--TATTTA-TATCTGAT-CAAAAACTGTAAc
gi|6 : TTTACATTT--GCA--ACT-G-TTTTCTCC-A-CA-TAAC---A----CT---TA-CGAGC-ACATACGCTAT---TTAC---ACTGCA-AATTACCTATTTGA--GGTCAACAGA------G--TCA-CA-TTGTGCGTTATGAA-TTT-TGTTGAAAA--GTAGGTTACCGGTACTTACTTTT-ACTGAGTA-TTACATA----AGT-ATATATTA---------A----T---AGATTGAAATCAA-AC--CACAAAATATTT-TTTAGGTATTTA-TTTTT-TCC--TCAGTTGACTTTC-T-CAAAAATAAAAA-TATTTC-TA-TAAAACACTGTCTTA-TTATG--ATGGATGGAATGTT-----ATTA------TGT----ATG--ACAA-AAACC-GGAGAC---AT-CC-TGGCCGGAACA--CAAAT--------CACA-AACATA-TCAT-CC-AT--ACAGAGG-T-TCT---ATA-TAGAATCGC-T-TTCCATTTTCAACATATGC-TCCATCTCCGCCTGTTGT-ACTGC--G-CAATGTGTGTG-T-AC-A-ATC-TTTCAA---ATTCA-T--TT---------------TTC-CTGTGGC-T-AGCATTTCAC-----CAA-CA------G-T-----------C-A------------------T---T--ATTT-TTTC--CCCT-CAAAAAG--ATGAAAAT--C--CTGGAATA---GC--AAA-----C--GT--CATG-AAACACAA-CAA-A-AAAA-TT-CCAGG-TGG-AATTG--ATGTCATGAAGCTCT--ATACG-ACAAATGCATTTATGAA--ATTCCAGGA-----TGTGATACACAT-C-----------TCCA-----C-TGCT-TATGAGCAAA-ACAGATT--CAAATGCTAC
gi|7 : -GG--GC-ATC-A-AGC--G-A-GGCGTC-TTTGA---AAACC--TAGCTA-TAAC----ATAAAGTT--AT-CGAGTCCAC-----AG-A------------AGC-G-TTCAG-TGAG--CTCATGTTTG-TCAAACAATTAC-----AAATC-CA--ACCC-T----CA---CT-----TACCTT----CGTCTGC--------------T-----TT-TA--TCG------------TT-TCAA-TA-AT--TC-ACATGC--GTC-------C---ATC--T---CCGTCTGGAT---ATTA-TT-C----CTACAAC--CTTGA-CCACTGTCGCCCTG---TCC-TC-A--GTTCCCCCATCTCAGCT--TCT-TATACACCTA---TACTCC-ATATTTCCTTACGTTATATATCTTTCCAATATC--AGTCC--ACAAA-AACTGTC-T-C--C--TTTCAAA-A----AA--TGAC-ACCGCATCACAAAAAT--GTGTTA---ACGT-TGT-GCG-CA-CACAAAC----TTCTGCCAGAATTC-AAATG--ATC-AG-T--TTTT------C--GC--AAA-ATTAGAC--A-A---A-AAAGAG-TT-TCAA-T-CATTAACTTTTAAGTATAA-T-GT--ATTTA-----TTGTT-----ATTTTTA-ATACTTTGCAT-TTTT-------------AAC---TCC--TA-----A-TA-ATATATAT--------ATTACA---TC-TTT--CA-ATGTCAA---TGACAC-TTT-GTT--T-TGGT---TT-T-----CGT-CA--TTTG--AA--GAG-----GCGTTTAT---TAA-GTCA-A-T---------------CC---A--T----G------------T------TGAA---TAT--TA-TGT
gi|8 : ttaTTACATTT--GCA--ACC-G-TTTTCTCCTA-CA-TAAC---A----CT-ACTA-CGAGC-A-ATACG-TAT---TTACC--ACTGCATAAATACCTATATGG--G-TCAACAGA------GG-TCA-CAGCTGTGCGT-ATGAA-TATATATTGAAA---GTAGGTTACCGGTACT-ACTTTTTACTAAG-A-TTACAGA----AGT--TAT--TA---------A----T---AGAT-GAAATCAACAC--CACAAAATATTT-------------------CTCCA-TCATTGGACTTTCATTCAAAAACAAAAAATATT-C-TA-TAAA-CACTGTCTTACTTATG-TATGGATGGGCTGTT-----AA-AA-----TGT----ATG---CAA-A----------C---AT-CCAGGGCC-----A--CAAAC--------CACA-AAGATA-TCATGCC-ATCAAAAGAGG-A-TCT---ACA-GAGAATAGC-T-TCCTATTT-CAA-ACGTGT-TCCATCTTCGCCTGTTGT-ACTGC--GGCAATATGTGTGGT-AC-T-TTC-TTC--A---ATTCA-T--TTC------------ATTTC-CCGTGGC-TTAGAATTGCAC-----CAT-CA------GTTG----------C-G------------------TACATGGATTCATTTC-ACTTT-CAAAAGG--ATAAAAATGGT--TTGGAATAC--GCA-AACG--CTC--AT--TATG-AAACACAA-CAA-A-CAAA-TTACAAGGGTGGAAAaaatgtgaaacatg
gi|9 : ataTCCTTCG-TGGATTGTCCTTAAGTCGCGATTGATGACATCTGTAAGTCCCATCCA--T-------GTATAATTTTTCCATATAACTT-AGATCTAAATCGCAC--TTCCACA--GCCTGCGTGCCCGACGCCCA-CACGGCC-T---CGGAGCTGATG-CGGTTTCCTATTACAGTTGTCCAGGATCATTT-CTCTATGTCG-GGTTGCAATCAATAGT--G-T-GAGGTG-TTTGAATCAAACCGATA-GTA-TGAA----A-ACAGCT-----CAAGTC-AC-----AG-ACATCAGTTTTTCAAC-GCTTCTG-AGAGTCTTCA-ATTTGTTCCACCCATTAC-----AACTCTCAGAACTG-TTCTCCAGTCCTTTCGGTACCCTTCTGCATCTGCTATGGTTTCCGTCTT-----AT-TGTTTCAGCTATTCTTCTTTT-TCATGCGCATCATCTATCTGC--GTCCTGTAGTC---ATCAATGTCGTG---GTGA-A-TTTATTTGCTGCGCTAC-A---CTTGA-CGAGTGCCG-CCTGTCATCT-TC-ATCGCTCCTC