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Reference ( gi|2 )            :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGTTGG------GCG-GTTAAA-ACCCGCCT-CC--G--TT-T----A-C-------CAG--C-G-GT--TGTTAA--C---C--GC-T-T---A--AC--------CG--C---C---CCGGTCA---ATAC---T-CCCAAAA-CG-------T--------GTCAATA-GTTTGG-TC-AAT--C-T-----G-GTC---------TAATTGAA-A---TTT--AAA-GTGCT--CCT--TT---CC------A-ATTT-T--A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AA-A---------TAA-T-AG--GATTTCATAATCTT-TTCAAA-AGAGTA-GCT--T-AT---CAGCAAATGGCA-GTATTCTTT-TTGATT----CCAAATTATTAAT-GATAATAA-TCATTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAAGACTCTTCATCATT-CTG-GCGGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCAGCCTGT-TTT-CA--AT--CA-AATA-C-TG-AT--TAGC-----TA-G-CA---C-----TT--C---AGAGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATC-A------T-T--G---C-TA-ATTTTGA--CT-ACTTA-TGG-CA-----A--CA-T--ATCT---TC---A---T---TACT-A---------TA-CCA-T-GTA--CAT--G--TA---GAC---GGGTTACAG--GACTA-TA--TAT--GTTTG-A-CAAT--GAGAGA---AA-AAA-AAT--T-TT-CTGC-TTAT-A--C---TGGACC-AAATATACAGCTAGGATCA-CTTGAG-CAC-TG-TGATCTA---TTA-AATAAATACTAAACTC-GG--T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGACAGT-GTCT-CCA-AATGGGAGT-GTCGGCGAGGA-GATATTACCTTGGGTGCA-GGT-AT-A-ATG--GACAA----G-G---T--A-A---T-TAA-CAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGT-TTATGGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAAT-GT-G-ATCA---T----T---AGGTA-C-TGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------TT--------G--TA-GG-A---------A-----A--------ATA---T----------A--------GGG--ACTTTTGAC-ACC-C-----TGCTCTTT----G-T-A---G-GACAA------A-A-----AT------TAA-ATAGTTTA-GTA-ATTTTT-ACACGTGAGGCATTTTCACCCAA-T--GAAT--A-AA-TCT-T--ATG---CA--TTA-T-GTT------AATCTCATT-TGCCAATGT--AATGC--TTGT-TTGCAA-G-TGC-C-TGT-CTTAAGAATTATAGTATTTTAT--T--CAT----CTTTAA---TCAGAACTCCGT--AA-CATTTTAA--AA---ATAA-CCCAATA-A--TATGAGA--ATAT-G-TGATTCATTAAGCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCA-GATATTGA-CCACTTATGA-CC-AG-TATTGA---CT-----G-GTTTTAACCAT--------TATTGA---CCCA----ACCGGC-CC-GTCAATTAC-TAGTCATTGGGACC-GCT
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGTTGG------GCGAGTTTAA-AACCGCCC-CC--GGTTT-T----AAC-------CAG--C-GAGT--T-TTA---C---C--GG-T-T---ATAAC--------CC--C---C---CAGGTCA---ATAA---C-TCCAAAA-TG----------------GTCAATC-GT--GGCTC-AATGAC-T-----GCGTC----------AATTGAA-A---TTT--AAAAGTGTTTTCCT--TTTC-CC------A-ATTT-T--A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-A---------TAA-TTAGTAGATTT-ATAGTCTTGCTCAAA-AT--CA-GCT--TTAT---TTACAAA--GCA-ATGTTGTAT-TT-ATTGAGATCAATTTAATGAT-TATCATAA-TCATTTAATTACACCAC-A-GT-A-TGAAC-TTCTGACCTTTTCAAG---TC-TCATT-TT-CTA-GC----TGTATCC-CC--ATTACTATAAC-TTTTTAG------T--A-ATGGGCAA-CTGTGTTC-CA--AT--GA-TATA-C----A---TAG------TA-G-CA---CTT---TT--C---AGAAGACAAT--ACT-GC-AT-G--TTTAAGATATTAAA-ATAT--A------T-T--T---C-AA-A--TTGA---T-A--TATTGGTCA-----ACCCA-T--ATCT---TC---A---G---TACT-A---------TA-CCATT-GTA--CATTAG--TA---GG----AGGTTTCAG--G--TAGTA--TCA--GTTTG-A-CAAT--GAGAAA---CA-AAATAAT--T-CTGCTAC-TTAT-ACTC---TGGACA-AAATA-ACAGCTAAATTCAGC--GAG-CACTTGTTGATCTG----TA-AATAAATTATAAACTG-GG--T----GATA-AAC--CA-TG--TGC---AAAAGACAGT-G-CT-CTA-AATGGAA-------GCAAG------ATTACTTGGGGT-CA-GGT-A--A-ATG--GACAG----A-GTGTT--A-C---T-TAA-CATAACCCAA--GGTAC-CAGG--GAT-GG-A--ATT-GTGT---GGTTGTTAT-TGT-TCTTGA-AAAACA--T-C-CC-CAT--ACTAA-CAC-CAATT-GT-G-ATCA---T----T---AGactagatagaataatgagctccatggatatcttagtcgttcacagtatt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGTTGG------GCG-GTTGAA-AACCGCCG-CCCAG--TTGTA---A-C-------CAG--CGG-GT--TTTTAA--CTCAT--GT-TAT---A--AA--------CT--G---T---CCGGTCA---AT-C---T-CCC-AAA-TG----------------GTC-ATA-G--TGG-TC-----------------------------AATTGAA-A---TTT--AAtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagtccaaatgactgacagcagaaaaaagacttgaagaactctgatc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AGGGCTGG------GCG-GTTAAA-A-CCGCCCACCG-G--TT-TTTTAA-C-------CAG--C-C-GTAAT-TTAA--C---C--GG-T-T---AT-AA--------CG--CTCGT---CTAGTCATTGACACTCTT-CTCGAAA-TC-------TAG------GTCAATA-GTATGA-TCTAATA-C-TTCAGAG-ATC---------TGG--AAA-A---TTT---AA-GTGAC--CTT--TT---TCTCGCGTATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AA-G---------CTA-TAAA--GATTT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     cGGGCTGG------GCG-GTTAAA-ACC-GCCC-CC--GGTTT-T----AAC-------CAG--C-G-GT--T-TTAA--C---C--GG-T-T---ATAAC--------CG--C---C---TCGGTTA---ATAC---T-CTCAAAA-TG----------------GTCAATA-G--TGG-TC-AATA-C-T-----G-GTC----------AGTTGAA-A---TTT--AAG-GTGGC--CTT--TTC--CC------A-ATTT-T--A------AATAC--A---TTTCA-TGCAAA--AATAAAGATTAATTAA-T-AG--G--TTTATACTCTt
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GGGTTGG------GT---TTAAA---CCGCCC-CCG-G--TT-TTA--A-C-------CAG--C-G-gctttattacaaagca
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTTGGCAAAAAGCG-GTCAAT-ACTAGT-------A--TT-G----A-C-------CGGGCC-G-GT--GGTCAATAC---T--GG-T-T---A--AA--------A-----------CCGGTCA---ATAC---T----------G----------------GTCATTA-G--TGG-CC-AATA-C-T-----G-GTCGATTGTGT-CAATTGAG-A---TTT--AA
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ag--C-G-GT--T-TTAA--C---CA-GTAT-T---G--AC--------CA--C---CGGCCCGGTCA---ATAC---T-tcatgttataaactgtccggtcaatctcccaaatggtcatagtggtcaattgaaatttaa
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tataaatatattggctaatttactactatgatcaacatatcttctgaatcagtactataccatgtacatgtagagggttacaggttaggtatagtttggacaatatgagagacaaaataatttctgcttatacctggacaaaattacagctagatcacttgagcactgtgatctagtaaataaatataaactgggtgataaaatgttgcaaagacagtgctctaaatggagcaaatattacttggggtcaggttataatggacaagtgttattaaacatacccaaggtccagggatgcaatgtgtgttattgttatgaaaacatcacccatactgacacaccaattgtgatcattaggtacctgatgaataccttcaacaatgacttgtatggaaaataagggacttgaaccctgctctttgcgaggacaattaaaattaaatagtttataatttttacagtgagcattttccccaattgaataaaatcttatgcattatttaatctcatttgcatgtaagtgttgcaagtgcatgtttagattacagtatttatcatcataatgaactcatacatttaaaataaccaataatatagaataatgaccattaaatctcaattgacacaatcgaccagtattggccactaatgaccagtattgac--C-G-GT--T-TTAA--C---CCAGTAT-T---G--AC--------CA--C---CGGCCCGGTCA---ATAC---T-agtattgaccgctttttgccaacctgac
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taggtcttttgataacttgtaaatataggaaGG--ACTT--GACCACC-C-----TGCTCTTT----GCT-A---G-GACAA------ACA-----GC------TAG-TTAATTT--GTA-ATTTTT-ACA-GTGAG-CATAATC--CTAA-TTTAAAC--AGAA-TCT-TCCATG---CAAATTA-T-TTTTTAGACAAT-TCACTATTC--ATTT--AAT-CAATTAT-T---AA-G-TGT-T-AGTATTTACGAA----AGTAATTTAT--TAACAT----CAT-AA---T--GAACTT-AT--TA-CAAT--AA--AA---ATAAACTTAAGGTA--CATTAGACCATAA-A-TGACTTATAAAA--TTTTCAATT---ACAATAATCGACCCG---TATTGATCCACAT-TGA-CCCAG-TATTGGGACCC-----G-ATTTTAACCAG--------TA--GGTCTCCCAGACCACCGGCACG-GTCAA-TACTTAGATATT-TGACCAGCTcaccggcctggtcaatact
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atatattaggcactatcaagttttagtgaataataattaagtTTTCAATTG--ACCAGTATTGA-CCA--CTATTGA-CCATTT-TGG--G-AG-TATTGA---CC-----G-Gttttgcaacc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          agggttgggcggttaaaaccgccccccggttttaactggtttataaccgccTTTCAATTGACGCAGTCATTGAGCCACG--ATTGA-CCATTT-TGG----AGTTATTGA---CCTGGGGG-GTTATAACCtttaaagtgtcctttttcccaattttattaataaatacatttcatgcaaaaataatagatttatagtcttttcaaaaatcagctttattacaaagcatatatttatgattcattaataataataaatcatttaattgcacccccagtatgaactctgaccttttcaaaccttctcatttctagctgatatcccctattataactttttagttaatgggcaactgtttcaatgcaatactgatagtagcactttcagagacaattctgcatgttaagtataaatattattggctaattgactacttatggtaacatatcttcagtacttatacatgtacatgaaaagggtttacaggtagatatagttgacatttgagagacaaataatttctgcttatacctggacaattcagctgagcactgtaatctagtaaataataataacaggttaaaacatgttgcaaaagacagtgctctaaatgagcaagatattactttggggtcaggataagatgacaatttgttaaagattgaccaatcggtccggactgcataatttgtgtgtgttatatgttatgaaaactacctcacctgagctcaccaatgttgatcacactctaggtacctgatctgagaactcttcaagtatactgtatggaaaaatatgggaactttcaagtttataggaaaatataagaaaaataggacttgacaccctgctctttgttgacaaaaattaatagagtttattattttacaagaagcatgtttgcccaattgaataaatgtgtatgcattatttaatctcatttgcatgttcaagtttgtaacgttgccatgtttgaattacaaatttatcatcataatgcttcaagtttcagccaatcatgttgatcaaattatgacctaataataactagatagaataatgagctccatggatatcttagtcgttcacagtatt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         agggttgggcgagtttaaaaccgcccccggttttaaccagcgagttttaccCAACTGA-CCA-G-TATTGA-CCACTATTGA-CC-AT-T-TTGA----------GAGTATTAACCtttaaaagtgttttccttttcccaattttaaatacatttcatgcaaaaaataattagtagatttatagtcttgctcaaaatcagctttatttacaaagcaatgttgtatttattgagatcaatttaatgattatcataatcatttaattacaccacagtatgaacttctgaccttttcaagtctcattttctagctgtatccccattactataactttttagtaatgggcaactgtgttccaatgatatacatagtagcacttttcagaagacaatactgcatgtttaagatattaaaatatatttcaaattgatatattggtcaacccatatcttcagtactataccattgtacattagtaggaggtttcaggtagtatcagtttgacaatgagaaacaaaataattctgctacttatactctggacaaaataacagctaaattcagcgagcacttgttgatctgtaaataaattataaactgggtgataaaccatgtgcaaaagacagtgctctaaatggaagcaagattacttggggtcaggtaaatggacagagtgttacttaacataacccaaggtaccagggatggaattgtgtggttgttattgttcttgaaaaacatccccatactaacaccaattgtgatcattagtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcagtccaaatgactgacagcagaaaaaagacttgaagaactctgatc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gggctgggcggttaaaaccgcccccggttttaaccagcggttttaaccggttataaccgcctcTGA-CC-AG-TATTGA---CC-----A-CTATTGACCATTTTGGGAGTATTGA---CCaaatttaaggtggccttttcccaattttaaatacatttcatgcaaaaataaagattaattaataggtttatactctgctttattacaaagca
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   agggttgggcggttaaaaccgccccccggttttaactggtttataaccgccccTGA-CC-AG-TATTGA---CC-----A-CTATTGACCAT--------T-TTGA---attgaaatttaaagtgtcctttttcccaattttattaataaatacatttcatgcaaaaataatagatttatagtcttttcaaaaatcagctttattacaaagcatatatttatgattcattaataataataaatcatttaattgcacccccagtatgaactctgaccttttcaaaccttctcatttctagctgatatcccctattataactttttagttaatgggcaactgtttcaatgcaatactgatagtagcactttcagagacaattctgcatgttaagtataaatattattggctaattgactacttatggtaacatatcttcagtacttatacatgtacatgaaaagggtttacaggtagatatagttgacatttgagagacaaataatttctgcttatacctggacaattcagctgagcactgtaatctagtaaataataataacaggttaaaacatgttgcaaaagacagtgctctaaatgagcaagatattactttggggtcaggataagatgacaatttgttaaagattgaccaatcggtccggactgcataatttgtgtgtgttatatgttatgaaaactacctcacctgagctcaccaatgttgatcacactctaggtacctgatctgagaactcttcaagtatactgtatggaaaaatatgggaactttcaagtttataggaaaatataagaaaaataggacttgacaccctgctctttgttgacaaaaattaatagagtttattattttacaagaagcatgtttgcccaattgaataaatgtgtatgcattatttaatctcatttgcatgttcaagtttgtaacgttgccatgtttgaattacaaatttatcatcataatgcttcaagtttcagccaatcatgttgatcaaattatgacctaataataactagatagaataatgagctccatggatatcttagtcgttcacagtatt
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gggctgggcggttaaaaccgcccccggttttaaccagcggttttaaccggttataaccgcctcggttaatactcGA-CT-AT-TATTGA---CC-----A-GTTTTAACCAG--------TATTGA---CC------ACCGGC-CTGGTCAA-TAC-Tgttgaaatttaaggtggccttttcccaattttaaatacatttcatgcaaaaataaagattaattaataggtttatactctgctttattacaaagca
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ACTAGTATTGACCGCTTTTTTGCCAACCCTG
Unaligned ( gi|17 ): TTTAACCAGCGGTTTTAACCGGTTATAACT






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Reference ( family-352 )      :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-C-CC-G--TTT----A-CCGGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT---A--AC--------CGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---G-GTCAATAGT-T-GGTC-AAT-ACT-----G-GTCCAATTGAAA---TTT--AAA-GTG-T---CCT--TT------CC-AAT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCAT-GCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAAATCA-GCT-T-TATT---ATCAAA--GCA-GTATTATNT-TTGATT----CCAAATTA---AT-GAT-A--ATAA-T-C--ATTTAATTACACCAC-A-GT-ATCGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-G-CTCTTCATCATTCT-AGC-G-ATTG-ATCC-CCTANTTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-ACCTGT-TTC--CA--ATNA-AATA-C-TG-AT--TAGT-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT-TGACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-GGTT-AC---AGG-TTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AANAATT-TT-CTGC-TTATAC-C--CGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTAGGATCANCT-GAG-CAC-TG-T-GATCTAGTA---AATAAA-TA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGNA-------CAAG--AATATTACTT-GGGGT-CAGGT-AT-A-ATG--GACA-A-GT--G-T----A-AT-TAA-CAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC--ACTGA-CACACCAA-T-G-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTACCTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------ATA-G--G-----A---------A-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACC-C-----TGCTCTTT----G-T-A---G-GACAA---A-AGT------TAA-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-ACA--GTGAGGCAT-TTT-C-CCCAACTTGAAC--A-AATCT-T--ATG---C--ATTAT--T--T-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---GTTTGT-AA-G-TG-C-ATGT-TTTAAGAATTACAGTATTTTATT--CATCANTAAT--G-----AACTCC--NT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TA---AG-A--AT-A-ATGA---C-C-ATTAA-A--TTTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACT-T-TGA-CCAGTATTGA---C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAGTTATTGTGACC-GCT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagataCTTT-CA---A--------------------------------------------------AC---------T--T--------ATA-G--G-----ATAATTATAGA-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACCTC-----TTCTCTTG----C-T-A---T-GACGA---A-AGT------TAA-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-TCA--GTGAG-CAT-TTT-C-CCCAA--TGAAT--A-AAATC-T--ATG---C--ATTAT--T----------A-ATCTCACT-TG-C--AT-G-TAA--GT--GTTT-T-AA-G-TG-C-ATGT-T---AGAATTACAGTATATTAT---CATCA-TAAT--G-----AACTGT--TT--AA-CAT-----TT--AAA---T-AACC-AATA-A--TA--TA----G-A--AT-A-ATGA---C-C-ATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACTGT-TGA-CCAGTAACGA-----CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCACCTCCACGGGTCAA-ttatagaaataatagggacttgacacctcttctcttgctatgacgaaagttaaatagtttataattttttcagtgagcattttccccaatgaataaaatctatgcattattaatctcacttgcatgtaagtgttttaagtgcatgttagaattacagtatattatcatcataatgaactgtttaacatttaaataaccaataatatagaataatgaccattaaatcttcaattgaccacaatcgaccagtattgaccactgttgaccagtaacgacggttttaaccagtattgaccaccacctccacgggtcaaatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatataggg---------T--T--------TTA-GT-G-----A---------AT----A--------ATA---------A--TTAAGTG-GAC--TT--GA--CCACC-C-----TGCTCTTT----GCT-A---G-GACAA---ACAGC------TAG-TTAATTTG-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-AAT---CCTAATTTAAAC--AGAATCT-TCCATG---CAAATTAT--T--TTTTAGACA-AT-TCACTATT-C--AT-T-TAATCA---ATTATT-AA-G-TG-T-TAGTATTTACGAA----AGTAATTTATTAACATCA-TAAT--G-----AACTTA--TT---A-CAA-----TA--AAA--ATAAACTTAAGGTA--CA--TT---AG-ACCATAA-ATGA---CTT-ATAAA-A--TTTTCAATT---ACAATAATCGA-CCCG-TATTGATCCACA-T-TGACCCAGTATTGGGACC-CGATTTTAA--CCAGTAGGTCTCCCAGACC--ACCGGCAC----GGTCAA-TACTTAGATATT-TGACCAGCTatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atatattaggcactatcaagCCTT-CA--------------------------------------------T---------AT---------T--T--------ATA-G--A-----A---------A-----A--------ATATTAGGACGAA--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACC-CGGGCCTGCACTTG----GCT-A---G-GACAA---A-A-------------CAGTTTT-TTAT---TTTT-AAA--ATAAG-CAT-TTT-C-CCCAACTT-AAC--ATAATCT-T--ATGGGAC--ATTAT--TATC-------A-ATTT---T-TG-C--AT-G-TAA--A---GTT-GT-GA-G-TG-C-ATGT-T--AAGAATTACAGTATTT-AT---CATCA-TAAT--G-----AACTCT--GT--AA-C-------TA--AAA--AT-AACC-AATA-AGTTA--CA---AG-ACTAT-A-ATGA---C-GGAATAA-A--TTTTCAATCG--ACTATTATTGA-CCAG-T----------T-T-TAA-CCA--------------------------GTA--TT-----GACC--ACCGGCCT----GGTCAA-TAC-Tttttgcaacc
gi|12                         : taggtcttttgataacttgtaaatataggaaAGGGCTGGGCG-GTTAAAA-CCGCC-CACCGG--TTTTTTAA-CCAGCC-G--TAAT-TTAAC-CG-GTT---AT-AA--------CGCTCGTCTAGTCATTGACACTCTTCTCGAAATCTAG-GTCAATAGTAT-GATCTAAT-ACTTCAGAG-ATC---TGGAAA---ATT--TAA-GTG-A---CCT--TTTTCTCGCG-TATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AAGCTA-TAAA--G---ATTT-
gi|13                         :                                cGGGCTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC-GGTTTT----AACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT---ATAAC--------CGC---CTCGGTTA---ATAC---TCTCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AGTTGAAA---TTT--AAG-GTG-G---CCT--TTTC----CC-AAT-TTT----A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA---AG--ATTAATTA-AT-AGGTTT-AT-----ACTCT-GCT-T-TATT---A-CAAA--GCA-t
gi|14                         :                                AGGGTTGGGCG-GTTGAAAACCGCCGC-CC-A--GTTGTA-A-CCAGCG-GGTT--T-TTAACTCATGTTATAA--AC--------TG----TCCGGTCA---AT-C---TCCCAAA-----------------T-GGTC--AT-AGT-----G-GT-CAATTGAAA---TTT--AA
gi|15                         :                                 GGGTTGGGT---TTAAA--CCGCC-C-CC-G------------------G--T--T-TTAAC-CA-G
gi|17                         :                                                                --TTT----AACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT---A--cg
gi|2                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-T-CC-G--TTT----A-CCAGCG-G--T--TGTTAAC-CG-CTT---A--AC--------CGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---GTGTCAATAGT-TTGGTC-AAT--CT-----G-GTCTAATTGAAA---TTT--AAA-GTGCT---CCT--TT------CC-AAT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTTCAT-AATCTT-TTCAAAAGAGTA-GCT-T--ATC---AGCAAATGGCA-GTATTCTTT-TTGATT----CCAAATTATTAAT-GAT-A--ATAA-T-C--ATTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-GACTCTTCATCATTCT-GGC-GGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-GCCTGT-TTT--CA--ATCA-AATA-C-TG-AT--TAGC-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-AGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATCA------T-T-G--CTA-ATTT-TGACT-ACTTAT------GG-CAA--CA-T--ATCT---TC------A--T-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGACG-GGTT-AC---AGGACTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--A---A--AAAAATT-TT-CTGC-TTATA--C--TGGA-CCAAAT-ATAC-AGCTAGGATCACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTATTA---AATAAA-TACTAAAC-TCG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-GTCT-CCA-AAT----GGGAGTGTCGGCGAGGAGATATTACCT-TGGGTGCAGGT-AT-A-ATG--GACA-A-G---G-T----A-AT-TAA-CAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGTTTAT--GGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAA-T-G-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTA-CTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTA-G--G-----A---------A-----A--------AT----------A--T--AG-G-GACTTTT--GA--C-ACC-C-----TGCTCTTT----G-T-A---G-GACAA---A-AAT------TAA-ATAGTTTAGTAAT---TTTT-ACAC-GTGAGGCAT-TTT-CACCCAA--TGAAT--A-AATCT-T--ATG---C--ATTATG-T--T-------A-ATCTCATT-TG-CCAAT-G-TAAT-GCTTGTTTGC-AA-G-TG-C-CTGT-CTTAAGAATTATAGTATTTTATT--CATCTTTAATCAG-----AACTCC--GT--AA-CAT-----TTTAAAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TG---AG-A--AT-ATGTGAT--T-C-ATTAA-GCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGA-CCACT-TATGA-CCAGTATTGA---C-TGGTTTTAA--CCATTA--TT-----GACCCAACCGGCCC-----GTCAATTAC-TAGTCATTGGGACC-GCTtaact
gi|3                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC-----------------CG-G--T--T-TTAAC-TG-GTTTATA--AC--------CGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AATTGAAA---TTT--AAA-GTG-T---CCT--TTTTC---CC-AAT-TTT----ATTAATAAATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAA-TCA-GCT-T-TATT---A-CAAA--GCA--TAT-ATTT-ATGATT----C---ATTA---AT-AAT-A--ATAAAT-C--ATTTAATTGCACCCCCA-GT-AT-GAACT--CTGACCTTTTCAAA-C-CTTCTCAT--TTCT-AGCTG-AT---ATCC-CCTA-TTAT---AACTTTTT-AGT-----T--A-ATGGGCA-AC-TGT-TTC---A--ATGC-AATA-C-TG-AT---AGT------A-G-CA---C-----TTT-C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-T--AAG-TAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT--GACT-ACTTAT------GGT-AA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACTTAT-AC-A-----T-GTA--CAT--G-AAAA-G-GGTTTAC---AGG-T-A-GA-------TAT-AGTTG-ACATTT-G-AGAGA--C---A--AATAATT-T--CTGC-TTATAC-C--TGGA-CAA------------T----TCAGCT-GAG-CAC-TG-T-AATCTAGTA---AATAAT-AA-TAA---CAG-G-T------TA-AAA--CAT-GT-TGCA--AAA-GAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GAG--------CAAG--A-TATTACTTTGGGGT-CAGG--AT-A-A-GATGACA-A-TTT-G-TTAAAG-AT-TGA-C------CAATCGGT-C-C--G--GAC-TGCATAATTTGTGT---G--TGTTATATG-TTAT--G--AAAAC-----TACCTCAC---CTGAGCTCACCAA-T-G-TTG-ATCA---CACTCT---AG--------GTACCTGA-TCTGAGA-ACTCTT-CAAGTAT----------------ACTGTATGGAAAAAT-------AT-----GGGAAC---------T--TTCAAGTTTATA-G--G-----A---------A-----A--------ATATAAGAAAA-A--T--AG-G--AC--TT--GA--C-ACC-C-----TGCTCTTT----G-T-----T-GACAA---A-AAT------TAATAGAGTTTA-TTA----TTTT-ACA--A-GAAGCATGTTT-G-CCCAA-TTGAAT--A-AATGTGT--ATG---C--ATTAT--T--T-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-GTTCA--A---GTTTGT-AACGTTGCC-ATGT-TT---GAATTACA--AATTTA-T--CATCA-TAAT--GCTTCAAGTTTCAGCC--AATCATGTTGATC--AAATTAT-GACCTAATA-A--TAACTAGATAG-A--AT-A-ATGAGCTC-C-ATGGATA--TCTT-AGTCG--TTCACAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                              CAATTGAAAAATTTT--AAA--TG-T---CCT--TT------CCCAAT-TTT----A------AATAT--ACA-TTTCATTGCAAA--AAAAAAAT-AG------ATTT-ATTAGTCTT-T---AAAAATCACGCT-TGTA-----ATTAAA--GC---TGTTATTTATTGATC----C--AATTA---AT-GAT-A--ATAA-T-C--ATTTAAT-ACACCAC-GTGTCATCGAACTT-CTA--CTTTTCAAAAG-CTCTC--TTATCTA-AGC-G-AT---ATCC-CCTATTTAT---AA--TTTTTAGTA----T--A-ATGGGCA-AT-TGT-TTC---A--ATGC-AATA-C--G-AT---AGT-----AA-G-CAGCTT-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAA-ATAT--AATATATT---------TGG--CTA-A-TT-AGACT-ACT-GT------G-TCAA--CA-T--ATCT---TC------A--GGT-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-G-TT-AC---AGG-GTAGTA-------TA--GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AATAATT----CTGC-TTATGA-C--CTGA-CAAAAC-A-ACCAGCTAGAGTCAGCT-GAGGCA--TG-T-G--CTAGTA---A-TAAA-TA-TAAAC-TGGTG-T---------AAA--CAT-GT-GGCA--AAA-GAC--AGTTG-CTGCTATAAT----GGAG-------CACG--A-TATTACTT-GGG-T-C-GGT-AT-ACATG--GACA-GTGTTAG-T----ATAT-TAA-CAT-ACCCAA--GGT-CTCAGG--GATTGGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC----TG--CAC-CCAA-T-G-T-GGATCA---T----TCATAG--------GTACCTGAAT--GAATTACTCTT-CA---AT----------------AATGACTTGTATTGGAAAATATAT-----G---ACGACTTAAGTT--T--------ATA-G--A-----A---------ATATGAA--------ATA---------AA-T--AG-G-GAC--TTT-GA--C-ACC-C------GCTCTTC----T-T-ACGAG-GACAA---A--GT------TAA--TAG---A-TAAT---TTTTTACA--GTG--GCAT-TTT-C-CCCAA-TTGAACA-A-AATCT-T--ATG---C--ATTAT--T--T-------A-GATTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---TGTTGT-AA-T-TG-C-ATAT-GTT-AGAATTACAGTA-TTTA-T--CATCA-TAAT--G-----AACTCG--TT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCAAGTA-A--TA--TA---CGAA--AT-A-ATGA---C-C-ATTCA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA--------------CAGTA-TGA---C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--AGCGGCCC----GGTCAA-TA--TATTTA-TGTGACC-GCTatt
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-352 )      :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-C-CC-G----TT-TAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-CCGC---CCC-GGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---G-GTCAATAGT-T-GGTC-AAT-ACT-----G-GTCCAATTGAAA---TTT--AAA-GTG-T---CC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCAT-GCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAAATCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GCAGTAT--TATTT-TTGATTCCAAATTA---AT-GA-TA--ATAA-T-CA--TTTAATTACACCNC-A-GT-ATCGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-G-CTCT-TCATC-TTCT-AGC-G-ATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-ACCTGT-TTC--CAATG---A-AATA-C-TG-AT--TAGT-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT-TGACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-GGTT-AC---AGG-TTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AA-TAATT-TT-CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTAGGATCAGCT-GAG-CAC-TG-T-GATCTAGTA---AATAAA-TA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGGA-------CAAG--AATATTACTT-GGGGT-CAGGT-AT-A-ATG--GACA-AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC--ACTGA-CACACCAA-T-G-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTACCTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------ATA-G--G-----A---------A-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACAA---A-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-ACA--GTGAGGCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---GTTTGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTATT--CATC-ATAAT--G-----AACTCC--NT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TA---AG-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACT-T-TGA-CCAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAGTTATTGTGACC-GCT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagataCTTT-CA---A--------------------------------------------------AC---------T--T--------ATA-G--G-----ATAATTATAGA-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----CTCTTCTCTTG----C-T-A---T-GACGA---A-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-TCA--GTGAG-CAT-TTT-C-CCCAAT-GAAT-AAAATCT----ATG---C--ATTAT--T--------A-ATCTCACT-TG-C--AT-G-TAA--GT--GTTT-T-AA-G-TG-CA-TGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-TATTAT---CATC-ATAAT--G-----AACTGT--TT--AA-CAT-----TT--AAA---T-AACC-AATA-A--TA--TA----G-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACTGT-TGA-CCAGTAA-C---GA---CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCACCTCCACGGGTCAA-ttatagaaataatagggacttgacacctcttctcttgctatgacgaaagttaaatagtttataattttttcagtgagcattttccccaatgaataaaatctatgcattattaatctcacttgcatgtaagtgttttaagtgcatgttagaattacagtatattatcatcataatgaactgtttaacatttaaataaccaataatatagaataatgaccattaaatcttcaattgaccacaatcgaccagtattgaccactgttgaccagtaacgacggttttaaccagtattgaccaccacctccacgggtcaaatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatataggg---------T--T--------TTA-GT-G-----A---------AT----A--------ATA---------A--TTAAGTG-GAC--TT--GA--CCAC-----C-CTGCTCTTT----GCT-A---G-GACAA---ACAGC----TA------G-TTAATTTG-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-AAT-C-CTAATTTAAAC-AGAATCT-TCCATG---CAAATTAT--TTTTTAGACA-AT-TCACTATT-C--AT-T-TAATCA---ATTATT-AA-G-TG--------TT--AGTATTTACGAAAGTAA-T-TTATTAACATC-ATAAT--G-----AACTTA--TT---A-CAA-----TA--AAA--ATAAACTTAAGGTA--CA--TT---AG-ACCATAA-ATGA---CTTATAAA-A--TTTTCAATT---ACAATAATCGA-CCCG-TATTGATCCACA-T-TGACCCAGT-A-TTGGGACC-CGATTTTAA--CCAGTAGGTCTCCCAGACC--ACCGGCAC----GGTCAA-TACTTAGATATT-TGACCAGCTatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatattaggcactatcaagCCTT-CA--------------------------------------------T---------AT---------T--T--------ATA-G--A-----A---------A-----A--------ATATTAGGACGAA--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACCCGGGC-CTGCACTTG----GCT-A---G-GACA--------------A------A-ACAGTTTT-TTAT---TTTT-AAA--AT-AAGCAT-TTT-C-CCCAACTTAAC-ATAATCT-T--ATGGGAC--ATTATTATC-------A-ATT---TT-TG-C--AT-G-TAA--A---G-TTGT-GA-G-TG-CA-TGT-TA--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCT--GT--AA-C-------TA--AAA--AT-AA-CCAATA-AGTTA--CA---AG-ACTAT-A-ATGA---CGGAATAA-A--TTTT------------CAATCGA-CTAT-TATTGA-CCA----------------------------GTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCT----GGTCAA-TAC-Tttttgcaacc
gi|12                         : taggtcttttgataacttgtaaatataggaaAGGGCTGGGCG-GTTAAAA-CCGCC-CACC-GGTTTTT-TAACCAGCC-G--TAAT-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-ACGCTCGTCT-AGTCATTGACACTCTTCTCGAAATCTAG-GTCAATAGTAT-GATCTAAT-ACTTCAGAG-ATC---TGGAAA---ATT--TAA-GTG-A---CCTTTTT-CTCGCGTATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AAGCTA-TAAA--G---ATTT-
gi|13                         :                                cGGGCTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC-GGT--TT-TAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--AACCGC---CTC-GGTTA---ATAC---TCTCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AGTTGAAA---TTT--AAG-GTG-G---CC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA---AG--ATTAATTA-AT-AGGTTT-AT-----ACTCT-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GCAt
gi|14                         :                                AGGGTTGGGCG-GTTGAAAACCGCCGC-CCAG----TTGTAACCAGCG-GGTT--T-TTAACTCATGTT-A-----TAAA-CTG----TCC-GGTCA---AT-C---TCCCAAA-----------------T-GGTC--AT-AGT-----G-GT-CAATTGAAA---TTT--AA
gi|15                         :                                 GGGTTGGGT---TTAAA--CCGCC-C-CC-GGT--TT-TAACCAGCG-
gi|17                         :                                                                ----TT-TAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-
gi|2                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-T-CC-G----TT-TA-CCAGCG-G--T--TGTTAAC-CG-CTT-A--------A-CCGC---CCC-GGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---GTGTCAATAGT-TTGGTC-AAT--CT-----G-GTCTAATTGAAA---TTT--AAA-GTGCT---CC-TTT---CCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTTCAT-AATCTT-TTCAAAAGAGTA-GCT-T--A-TCAGCAAATGGCAGTAT--TCTTT-TTGATTCCAAATTATTAAT-GA-TA--ATAA-T-CA--TTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-GACTCT-TCATCATTCT-GGC-GGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-GCCTGT-TTT--CAATC---A-AATA-C-TG-AT--TAGC-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-AGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATCA------T-T-G--CTA-ATTT-TGACT-ACTTAT------GG-CAA--CA-T--ATCT---TC------A--T-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGACG-GGTT-AC---AGGACTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--A---A--AA-AAATT-TT-CTGC-TTAT-A--C--TGGA-CCAAAT-ATAC-AGCTAGGATCACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTATTA---AATAAA-TACTAAAC-TCG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-GTCT-CCA-AAT----GGGAGTGTCGGCGAGGAGATATTACCT-TGGGTGCAGGT-AT-A-ATG--GACA-AG--G-TA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGTTTAT--GGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAA-T-G-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTA-CTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTA-G--G-----A---------A-----A--------AT----------A--T--AG-G-GACTTTT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACAA---A-AAT----TA------A-ATAGTTTAGTAAT---TTTT-ACAC-GTGAGGCAT-TTT-CACCCAA-TGAAT--AAATCT-T--ATG---C--ATTATG-TT-------A-ATCTCATT-TG-CCAAT-G-TAAT-GCTTGTTTGC-AA-G-TG-CC-TGT-CTTAAG-AATTAT---AGT-ATT-TTATT--CATCTTTAATCAG-----AACTCC--GT--AA-CAT-----TTTAAAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TG---AG-A--AT-ATGTGAT--T-CATTAA-GCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGA-CCACT-TATGA-CCAGT-ATT---GA-C-TGGTTTTAA--CCATTA--TT-----GACCCAACCGGCCC-----GTCAATTAC-TAGTCATTGGGACC-GCTact
gi|3                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC----------------CG-G--T--T-TTAAC-TG-GTTTA-----T--AACCGC---CCC-GGTCA---ATAC---TCCCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AATTGAAA---TTT--AAA-GTG-T---CC-TTTTTCCCA---AT-TTT----ATTAATAAATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAA-TCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GCA-TAT---ATTT-ATGATTC---ATTA---AT-AA-TA--ATAAAT-CA--TTTAATTGCACCCCCA-GT-AT-GAACT--CTGACCTTTTCAAA-C-CTTC-TCAT--TTCT-AGCTG-AT---ATCC-CCTA-TTAT---AACTTTTT-AGT-----T--A-ATGGGCA-AC-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C-TG-AT---AGT------A-G-CA---C-----TTT-C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-T--AAG-TAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT--GACT-ACTTAT------GGT-AA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACTTAT-AC-A-----T-GTA--CAT--G-AAAA-G-GGTTTAC---AGG-T-A-GA-------TAT-AGTTG-ACATTT-G-AGAGA--C---A--AA-TAATT-T--CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAA------------T----TCAGCT-GAG-CAC-TG-T-AATCTAGTA---AATAAT-AA-TAA---CAG-G-T------TA-AAA--CAT-GT-TGCA--AAA-GAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GAG--------CAAG--A-TATTACTTTGGGGT-CAGG--AT-A-A-GATGACA-ATTTGTTA----AAGATTGAC------CAATCGGT-C-C--G--GAC-TGCATAATTTGTGT---G--TGTTATATG-TTAT--G--AAAAC-----TACCTCAC---CTGAGCTCACCAA-T-G-TTG-ATCA---CACTCT---AG--------GTACCTGA-TCTGAGA-ACTCTT-CAAGTAT----------------ACTGTATGGAAAAAT-------AT-----GGGAAC---------T--TTCAAGTTTATA-G--G-----A---------A-----A--------ATATAAGAAAA-A--T--AG-G--AC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-----T-GACAA---A-AAT----TA------ATAGAGTTTA-TTAT---TTT--ACA--A-GAAGCATGTTT-G-CCCAATTGAAT-AAA-TGTGT--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-GTTCA--A---GTTTGT-AACGTTGCCA-TGT-TT---G-AATTAC---AA--A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--GCTTCAAGTTTCAGCC--AATCATGTTGATC--AAATTAT-GACCTAATA-A--TAACTAGATAG-A--AT-A-ATGAGCTC-CATGGATA--TCTT-AGTCG--TTCACAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                           CAATTGAAAAATTTT--AAA--TG-T---CC-TTT--CCCA---AT-TTT----A------AATAT--ACA-TTTCATTGCAAA--AAAAAAAT-AG------ATTT-ATTAGTCTT-T---AAAAATCACGCT-TGTAATTA---AA--GC--TGT--TATTTATTGATCC--AATTA---AT-GA-TA--ATAA-T-CA--TTTAAT-ACACCAC-GTGTCATCGAACTT-CTA--CTTTTCAAAAG-CTCTCTTATC-TA---AGC-G-AT---ATCC-CCTATTTAT---AA--TTTTTAGTA----T--A-ATGGGCA-AT-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C--G-AT---AGT-----AA-G-CAGCTT-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAA-ATAT--AATATATT---------TGG--CTA-A-TT-AGACT-ACT-GT------G-TCAA--CA-T--ATCT---TC------A--GGT-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-G-TT-AC---AGG-GTAGTA-------TA--GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AA-TAATT----CTGC-TTATGAC-C--TG-A-CAAAAC-A-ACCAGCTAGAGTCAGCT-GAGGCA--TG-T-G--CTAGTA---A-TAAA-TA-TAAAC-TGGTG-T---------AAA--CAT-GT-GGCA--AAA-GAC--AGTTG-CTGCTATAAT----GGAG-------CACG--A-TATTACTT-GGG-T-C-GGT-AT-ACATG--GACA--GT-GTTAGTATA---TTAACAT-ACCCAA--GGT-CTCAGG--GATTGGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC----TG--CAC-CCAA-T-G-T-GGATCA---T----TCATAG--------GTACCTGAAT--GAATTACTCTT-CA---AT----------------AATGACTTGTATTGGAAAATATAT-----G---ACGACTTAAGTT--T--------ATA-G--A-----A---------ATATGAA--------ATA---------AA-T--AG-G-GAC--TTT-GA--C-AC-----C-C-GCTCTTC----T-T-ACGAG-GACAA---A--GT----TA------A--TAG---A-TAAT---TTTTTACA--GTG--GCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-GATTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---TGTTGT-AA-T-TG-CA-TATGTT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCG--TT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCAAGTA-A--TA--TA---CGAA--AT-A-ATGA---C-CATTCA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA--------------CAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--AGCGGCCC----GGTCAA-TA--TATTTA-TGTGACC-GCTatt
gi|5                          :                                AGGGTTGGGCGAGTTTAAAACCGCC-C-CC-GGT--TT-TAACCAGCGAG--T--T-TTA-C-CG-GTT-A-----T--A-ACCC---CCCAGGTCA---ATAA---CTCCAAAAT---G-GTCAATCGT-G-GCTC-AATGACT-----GCGTC-AATTGAAA---TTT--AAAAGTG-TTTTCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--A---TTTCAT-GCAAA--AAATAATT-AGTAG---ATTT-AT-AGTCTTGCTC--AAAATCA-GCT-T-TATTTA-CAAA--GCAATGTTGTATTTATTGAGATCAATTTA---AT-GATTATCATAA-T-CA--TTTAATTACACCAC-A-GT-AT-GAAC-TTCTGACCTTTTCAAG----TC--TCATT-TTCT-AGC-----TGTATCC-CC--ATTACTATAAC-TTTTTAG------T--A-ATGGGCA-A-CTGTGTTC--CAATG---A-TATA-C----A---TAG------TA-G-CA---CTT---TT--C---AGAA-GACAAT--ACT-GC-AT-G--TTTAAGATATTAAA-ATA-TA------T-T----TCA-A-AT-TGA-T-ATAT-T------GGTCAACCCA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-AT-ACCAT----T-GTA--CATTAG-TAGG-A-GGTT-TC---AGG-TAG-TA-------TCA-GTTTG-ACAAT--G-AGAAA--CA--A--AA-TAATT-CTGCTAC-TTAT-ACTC--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTAAATTCAGC--GAG-CACTTGTT-GATCT-GTA---AATAAATTA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAC--CA-TG--TGC---AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGAAG------CAAG-----ATTACTT-GGGGT-CAGGT-A--A-ATG--GACAGAGT-GTTA----C---TTAACATAACCCAA--GGTAC-CAGG--GAT-GG-A--ATT-GTGT---GGTTGTTAT-TG-TTCTTGA--AAAACA--T-C-CC-CAT--ACTA---ACACCAATT-G-T-G-ATCA---T----T---AGTNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNN-NNNNNT-CA---GTCCA-------------A---------------------AT-----G---AC---------T--G--------ACA-GCAG-----A---------A-----A--------A-A---------A----------GAC--TT--GAAGA-AC-----T-CTGATCtttttgtcaaccctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTAGT-----TTGATATGGGCATACTCTT-TTA--CA-TGCTTACAATATC-TGGAT--T-TT-----TA-G-CA---C-----TT--TTCGAG-A-GACAAT--TCT-GTGAT-GGATTTAAGA-AT--AA-A-ATTAATGTATT-TGGGTTTAGA-TTGTGACTTACCTGTTGCTCGGGT--A--CA-T--ATCTACTTC------ATCG-TTAACATGATT-TT-AACA-----TCGTA--CAT--GATTGA-GTGACT-AA---AGG-TTA-CAGTGTAGCTAT-CTTGA-ACAAT--G-AGAGAAAC---AGAAA-TAATT-TC---GA-TAA--AC-C--TG-A-CAAAA--A-AC-AAATAG--TCAGCTAGAG-CAC--G-T-GAGCTAGTATCAAATAAA-TA-TAAACGTGG-GGT----GATATAAATGCGTTGT-TGTC--AAAAGACGTAGC-A-GA-TTA-CATTAGGGGGA-------CAAG--AG-ATTATAC-ATGGT-CA---------ATG--GATC-AGT-GTTA----AA--TTAACCT-ACCCA---GGT-C-TAGGCCGATTGGC-----T-GTGTTGCA--TGTCAT--G-TT-T--G--AAAACA--T-CACC-C--------A-CACACCAA-T-GTT-G-ATCA---T----C---AG--------A----------------ACCTTT-CA---GT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--TA-------ATG-C--GCAAACA---------A-----A--------ATA---------A--A--AG-GCGAC--CTCAGA--C-AC-----C-CTGCTCTTTGCAAG-T-A---GTGACAA---AGAGTATACTA------A-ACAGTTTA-T-GTCTATTTT-AAATCGTGA-GCAG-TTTAC-CCCAACTGAACAAAAATCT-T--A-G---C--ATTATTCTT-------A-ATTTCATT-TGCC--ATAG-TGA------GTTAGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AAT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ----GATA-AAA--CATTGTCTGCA--CAAAGAC--AGT-G-CT-TCA-AAT----G--A-------CAA-----TATTACTT-GGAGT-CGAGT-ATCA-ATG--GA---AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACC-AA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTA-------GAACA--TTCACC-CAC--ACTG--CACACCAA---G-T-G-ATTAATATA---T---AG--------GTACCTG--T--GAA---CTCTT-CA---ATAATGACTTGTATGGAAA---------------------ATATAGGG---AC---------T--TCAAGTTT-ATA-G--G-----A---------A-----ATACTAGAAATA---------AATT--AG-G-GAC--TT--GC--C-AC-----C--TGCTCTTT----G-C-T---T-GACAA---A-AGT----TATTAATAA-ATAGTTTT-TA-T---TTTT-ACA--GTGAG-CAT-TC--C-CCCAATTGAAT-AAAATCT-T--AGA--------TAT--TT-------ATAT-TCATT-TG-C--AT-G-TAA--G------TGTGAA-G-TG-CAATGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G------ACTAC--ATTAAA-CAT-----TT---AA--CT-AACC--AT--A--TA--TA---GA-A--AT-A-ATGA---C-C-TT-A-A--TCTT------------CAATCGA-CCAG-TATTGA------------------------------CGGTTTTAAC-CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAG-TATTAGGACC-GCTttttgccaacctgac
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-352 )      :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---G-GTCAATAGT-T-GGTC-AAT-ACT-----G-GTCCAATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCAT-GCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAAATCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TGT--TATTT-TTGAT-TC--AA--ATTAAT-GA-TA--ATAA-T-CA--TTTAATTACACCNC-A-GT-ATCGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-G-CTCT-TCATC-TTCT-AGC-G-ATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-ACCTGT-TTC--CAATG---A-AATA-C-TG-AT--TAGT-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT-TGACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-GGTT-AC---AGG-TTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AA-TAATT-TT-CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTAGANTCAGCT-GAG-CAC-TG-T-GATCTAGTA---AATAAA-TA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGGA-------CAAG--AATATTACTT-GGGGT-CAGGT-AT-A-ATG--GACA-AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC--ACTGA-CACACCAA-T-G-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTACCTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------ATA-G--G-----A---------A-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACAA---A-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-ACA--GTGAGGCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---GTTTGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTATT--CATC-ATAAT--G-----AACTCC--NT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TA---AG-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCAC--T--TGA-CCAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAGTTATTGTGACC-GCT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagataCTTT-CA---A--------------------------------------------------AC---------T--T--------ATA-G--G-----ATAATTATAGA-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----CTCTTCTCTTG----C-T-A---T-GACGA---A-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-TCA--GTGAG-CAT-TTT-C-CCCAAT-GAAT-AAAATCT----ATG---C--ATTAT--T--------A-ATCTCACT-TG-C--AT-G-TAA--GT--GTTT-T-AA-G-TG-CA-TGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-TATTAT---CATC-ATAAT--G-----AACTGT--TT--AA-CAT-----TT--AAA---T-AACC-AATA-A--TA--TA----G-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACTGT--TGA-CCAGTAA-C---GA---CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCACCTCCACGGGTCAA-ttatagaaataatagggacttgacacctcttctcttgctatgacgaaagttaaatagtttataattttttcagtgagcattttccccaatgaataaaatctatgcattattaatctcacttgcatgtaagtgttttaagtgcatgttagaattacagtatattatcatcataatgaactgtttaacatttaaataaccaataatatagaataatgaccattaaatcttcaattgaccacaatcgaccagtattgaccactgttgaccagtaacgacggttttaaccagtattgaccaccacctccacgggtcaaatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatataggg---------T--T--------TTA-GT-G-----A---------AT----A--------ATA---------A--TTAAGTG-GAC--TT--GA--CCAC-----C-CTGCTCTTT----GCT-A---G-GACAA---ACAGC----TA------G-TTAATTTG-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-AAT-C-CTAATTTAAAC-AGAATCT-TCCATG---CAAATTAT--TTTTTAGACA-AT-TCACTATT-C--AT-T-TAATCA---ATTATT-AA-G-TG--------TT--AGTATTTACGAAAGTAA-T-TTATTAACATC-ATAAT--G-----AACTTA--TT---A-CAA-----TA--AAA--ATAAACTTAAGGTA--CA--TT---AG-ACCATAA-ATGA---CTTATAAA-A--TTTTCAATT---ACAATAATCGA-CCCG-TATTGATCCACA-T--TGACCCAGT-A-TTGGGACC-CGATTTTAA--CCAGTAGGTCTCCCAGACC--ACCGGCAC----GGTCAA-TACTTAGATATT-TGACCAGCTatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         atatattaggcactatcaagCCTT-CA--------------------------------------------T---------AT---------T--T--------ATA-G--A-----A---------A-----A--------ATATTAGGACGAA--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACCCGGGC-CTGCACTTG----GCT-A---G-GACA--------------A------A-ACAGTTTT-TTAT---TTTT-AAA--AT-AAGCAT-TTT-C-CCCAACTTAAC-ATAATCT-T--ATGGGAC--ATTATTATC-------A-ATT---TT-TG-C--AT-G-TAA--A---G-TTGT-GA-G-TG-CA-TGT-TA--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCT--GT--AA-C-------TA--AAA--AT-AA-CCAATA-AGTTA--CA---AG-ACTAT-A-ATGA---CGGAATAA-A--TTTT------------CAATCGA-CTAT-TATTGA-CCA-----------------------------GTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCT----GGTCAA-TAC-Tttttgcaacc
gi|12                         : taggtcttttgataacttgtaaatataggaaAGGGCTGGGCG-GTTAAAA-CCGCC-CACCGGTTTTTTAACCAGCC-G--TAAT-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-ACGCTCGTCTAGTCATTGACACTCTTCTCGAAATCTAG-GTCAATAGTAT-GATCTAAT-ACTTCAGAG-ATC---TGGAAA---ATT--TAAGTG---ACCTTTTT-CTCGCGTATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AAGCTA-TAAA--G---ATTT-
gi|13                         :                                cGGGCTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--AACCGC---CTCGGTTA---ATAC---TCTCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AGTTGAAA---TTT--AAGGTG---GCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA---AG--ATTAATTA-AT-AGGTTT-AT-----ACTCT-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-t
gi|14                         :                                AGGGTTGGGCG-GTTGAAAACCGCCGC-CCAG--TTGTAACCAGCG-GGTT--T-TTAACTCATGTT-A-----TAAA-CTG----TCCGGTCA---AT-C---TCCCAAA-----------------T-GGTC--AT-AGT-----G-GT-CAATTGAAA---TTT--AA
gi|15                         :                                 GGGTTGGGT---TTAAA--CCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-
gi|17                         :                                                                   TTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-
gi|2                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-T-CCG----TTTA-CCAGCG-G--T--TGTTAAC-CG-CTT-A--------A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---GTGTCAATAGT-TTGGTC-AAT--CT-----G-GTCTAATTGAAA---TTT--AAAGTGC--TCC-TTT---CCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTTCAT-AATCTT-TTCAAAAGAGTA-GCT-T--A-TCAGCAAATGGC-AGTAT--TCTTT-TTGAT-TCCAAATTATTAAT-GA-TA--ATAA-T-CA--TTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-GACTCT-TCATCATTCT-GGC-GGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-GCCTGT-TTT--CAATC---A-AATA-C-TG-AT--TAGC-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-AGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATCA------T-T-G--CTA-ATTT-TGACT-ACTTAT------GG-CAA--CA-T--ATCT---TC------A--T-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGACG-GGTT-AC---AGGACTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--A---A--AA-AAATT-TT-CTGC-TTAT-A--C--TGGA-CCAAAT-ATAC-AGCTAGGATCACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTATTA---AATAAA-TACTAAAC-TCG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-GTCT-CCA-AAT----GGGAGTGTCGGCGAGGAGATATTACCT-TGGGTGCAGGT-AT-A-ATG--GACA-AG--G-TA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGTTTAT--GGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAA-T-G-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTA-CTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTA-G--G-----A---------A-----A--------AT----------A--T--AG-G-GACTTTT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACAA---A-AAT----TA------A-ATAGTTTAGTAAT---TTTT-ACAC-GTGAGGCAT-TTT-CACCCAA-TGAAT--AAATCT-T--ATG---C--ATTATG-TT-------A-ATCTCATT-TG-CCAAT-G-TAAT-GCTTGTTTGC-AA-G-TG-CC-TGT-CTTAAG-AATTAT---AGT-ATT-TTATT--CATCTTTAATCAG-----AACTCC--GT--AA-CAT-----TTTAAAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TG---AG-A--AT-ATGTGAT--T-CATTAA-GCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGA-CCAC--TTATGA-CCAGT-ATT---GA-C-TGGTTTTAA--CCATTA--TT-----GACCCAACCGGCCC-----GTCAATTAC-TAGTCATTGGGACC-GCTact
gi|3                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC--------------CG-G--T--T-TTAAC-TG-GTTTA-----T--AACCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTTTCCCA---AT-TTT----ATTAATAAATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAA-TCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TAT---ATTT-ATGAT-TC--A----TTAAT-AA-TA--ATAAAT-CA--TTTAATTGCACCCCCA-GT-AT-GAACT--CTGACCTTTTCAAA-C-CTTC-TCAT--TTCT-AGCTG-AT---ATCC-CCTA-TTAT---AACTTTTT-AGT-----T--A-ATGGGCA-AC-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C-TG-AT---AGT------A-G-CA---C-----TTT-C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-T--AAG-TAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT--GACT-ACTTAT------GGT-AA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACTTAT-AC-A-----T-GTA--CAT--G-AAAA-G-GGTTTAC---AGG-T-A-GA-------TAT-AGTTG-ACATTT-G-AGAGA--C---A--AA-TAATT-T--CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAA----------------TTCAGCT-GAG-CAC-TG-T-AATCTAGTA---AATAAT-AA-TAA---CAG-G-T------TA-AAA--CAT-GT-TGCA--AAA-GAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GAG--------CAAG--A-TATTACTTTGGGGT-CAGG--AT-A-A-GATGACA-ATTTGTTA----AAGATTGAC------CAATCGGT-C-C--G--GAC-TGCATAATTTGTGT---G--TGTTATATG-TTAT--G--AAAAC-----TACCTCAC---CTGAGCTCACCAA-T-G-TTG-ATCA---CACTCT---AG--------GTACCTGA-TCTGAGA-ACTCTT-CAAGTAT----------------ACTGTATGGAAAAAT-------AT-----GGGAAC---------T--TTCAAGTTTATA-G--G-----A---------A-----A--------ATATAAGAAAA-A--T--AG-G--AC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-----T-GACAA---A-AAT----TA------ATAGAGTTTA-TTAT---TTT--ACA--A-GAAGCATGTTT-G-CCCAATTGAAT-AAA-TGTGT--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-GTTCA--A---GTTTGT-AACGTTGCCA-TGT-TT---G-AATTAC---AA--A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--GCTTCAAGTTTCAGCC--AATCATGTTGATC--AAATTAT-GACCTAATA-A--TAACTAGATAG-A--AT-A-ATGAGCTC-CATGGATA--TCTT-AGTCG--TTCACAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                        CAATTGAAAAATTTT--AAA-TG---TCC-TTT--CCCA---AT-TTT----A------AATAT--ACA-TTTCATTGCAAA--AAAAAAAT-AG------ATTT-ATTAGTCTT-T---AAAAATCACGCT-TGTAATTA---AA--GC---TGT--TATTTATTGAT-CC--AA---TTAAT-GA-TA--ATAA-T-CA--TTTAAT-ACACCAC-GTGTCATCGAACTT-CTA--CTTTTCAAAAG-CTCTCTTATC-TA---AGC-G-AT---ATCC-CCTATTTAT---AA--TTTTTAGTA----T--A-ATGGGCA-AT-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C--G-AT---AGT-----AA-G-CAGCTT-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAA-ATAT--AATATATT---------TGG--CTA-A-TT-AGACT-ACT-GT------G-TCAA--CA-T--ATCT---TC------A--GGT-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-G-TT-AC---AGG-GTAGTA-------TA--GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AA-TAATT----CTGC-TTATGAC-C--TG-A-CAAAAC-A-ACCAGCTAGAGTCAGCT-GAGGCA--TG-T-G--CTAGTA---A-TAAA-TA-TAAAC-TGGTG-T---------AAA--CAT-GT-GGCA--AAA-GAC--AGTTG-CTGCTATAAT----GGAG-------CACG--A-TATTACTT-GGG-T-C-GGT-AT-ACATG--GACA--GT-GTTAGTATA---TTAACAT-ACCCAA--GGT-CTCAGG--GATTGGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC----TG--CAC-CCAA-T-G-T-GGATCA---T----TCATAG--------GTACCTGAAT--GAATTACTCTT-CA---AT----------------AATGACTTGTATTGGAAAATATAT-----G---ACGACTTAAGTT--T--------ATA-G--A-----A---------ATATGAA--------ATA---------AA-T--AG-G-GAC--TTT-GA--C-AC-----C-C-GCTCTTC----T-T-ACGAG-GACAA---A--GT----TA------A--TAG---A-TAAT---TTTTTACA--GTG--GCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-GATTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---TGTTGT-AA-T-TG-CA-TATGTT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCG--TT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCAAGTA-A--TA--TA---CGAA--AT-A-ATGA---C-CATTCA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA---------------CAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--AGCGGCCC----GGTCAA-TA--TATTTA-TGTGACC-GCTatt
gi|5                          :                                AGGGTTGGGCGAGTTTAAAACCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCGAG--T--T-TT-AC-CG-GTT-A-----TA-A-CCCC---CCAGGTCA---ATAA---CTCCAAAAT---G-GTCAATCGT-G-GCTC-AATGACT-----GCGT-CAATTGAAA---TTTA-AAAGTGTTTTCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--A---TTTCAT-GCAAA--AAATAATT-AGTAG---ATTT-AT-AGTCTTGCTC--AAAATCA-GCT-T-TATTTA-CAAA--GCAA-TGTTGTATTTATTGAGATC--AA--TTTAAT-GATTATCATAA-T-CA--TTTAATTACACCAC-A-GT-AT-GAAC-TTCTGACCTTTTCAAG----TC--TCATT-TTCT-AGC-----TGTATCC-CC--ATTACTATAAC-TTTTTAG------T--A-ATGGGCA-A-CTGTGTTC--CAATG---A-TATA-C----A---TAG------TA-G-CA---CTT---TT--C---AGAA-GACAAT--ACT-GC-AT-G--TTTAAGATATTAAA-ATA-TA------T-T----TCA-A-AT-TGA-T-ATAT-T------GGTCAACCCA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-AT-ACCAT----T-GTA--CATTAG-TAGG-A-GGTT-TC---AGG-TAG-TA-------TCA-GTTTG-ACAAT--G-AGAAA--CA--A--AA-TAATT-CTGCTAC-TTAT-ACTC--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTAAATTCAGC--GAG-CACTTGTT-GATCT-GTA---AATAAATTA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAC--CA-TG--TGC---AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGAAG------CAAG-----ATTACTT-GGGGT-CAGGT-A--A-ATG--GACAGAGT-GTTA----C---TTAACATAACCCAA--GGTAC-CAGG--GAT-GG-A--ATT-GTGT---GGTTGTTAT-TG-TTCTTGA--AAAACA--T-C-CC-CAT--ACTA---ACACCAATT-G-T-G-ATCA---T----T---AGTNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNN-NNNNNT-CA---GTCCA-------------A---------------------AT-----G---AC---------T--G--------ACA-GCAG-----A---------A-----A--------A-A---------A----------GAC--TT--GAAGA-AC-----T-CTGATCtttttgtcaaccctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTTTTAGT-----TTGATATGGGCATACTCTT-TTA--CA-TGCTTACAATATC-TGGAT--T-TT-----TA-G-CA---C-----TT--TTCGAG-A-GACAAT--TCT-GTGAT-GGATTTAAGA-AT--AA-A-ATTAATGTATT-TGGGTTTAGA-TTGTGACTTACCTGTTGCTCGGGT--A--CA-T--ATCTACTTC------ATCG-TTAACATGATT-TT-AACA-----TCGTA--CAT--GATTGA-GTGACT-AA---AGG-TTA-CAGTGTAGCTAT-CTTGA-ACAAT--G-AGAGAAAC---AGAAA-TAATT-TC---GA-TAA--AC-C--TG-A-CAAAA--A-AC-AAATAG--TCAGCTAGAG-CAC--G-T-GAGCTAGTATCAAATAAA-TA-TAAACGTGG-GGT----GATATAAATGCGTTGT-TGTC--AAAAGACGTAGC-A-GA-TTA-CATTAGGGGGA-------CAAG--AG-ATTATAC-ATGGT-CA---------ATG--GATC-AGT-GTTA----AA--TTAACCT-ACCCA---GGT-C-TAGGCCGATTGGC-----T-GTGTTGCA--TGTCAT--G-TT-T--G--AAAACA--T-CACC-C--------A-CACACCAA-T-GTT-G-ATCA---T----C---AG--------A----------------ACCTTT-CA---GT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--TA-------ATG-C--GCAAACA---------A-----A--------ATA---------A--A--AG-GCGAC--CTCAGA--C-AC-----C-CTGCTCTTTGCAAG-T-A---GTGACAA---AGAGTATACTA------A-ACAGTTTA-T-GTCTATTTT-AAATCGTGA-GCAG-TTTAC-CCCAACTGAACAAAAATCT-T--A-G---C--ATTATTCTT-------A-ATTTCATT-TGCC--ATAG-TGA------GTTAGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AAT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ----GATA-AAA--CATTGTCTGCA--CAAAGAC--AGT-G-CT-TCA-AAT----G--A-------CAA-----TATTACTT-GGAGT-CGAGT-ATCA-ATG--GA---AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACC-AA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTA-------GAACA--TTCACC-CAC--ACTG--CACACCAA---G-T-G-ATTAATATA---T---AG--------GTACCTG--T--GAA---CTCTT-CA---ATAATGACTTGTATGGAAA---------------------ATATAGGG---AC---------T--TCAAGTTT-ATA-G--G-----A---------A-----ATACTAGAAATA---------AATT--AG-G-GAC--TT--GC--C-AC-----C--TGCTCTTT----G-C-T---T-GACAA---A-AGT----TATTAATAA-ATAGTTTT-TA-T---TTTT-ACA--GTGAG-CAT-TC--C-CCCAATTGAAT-AAAATCT-T--AGA--------TAT--TT-------ATAT-TCATT-TG-C--AT-G-TAA--G------TGTGAA-G-TG-CAATGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G------ACTAC--ATTAAA-CAT-----TT---AA--CT-AACC--AT--A--TA--TA---GA-A--AT-A-ATGA---C-C-TT-A-A--TCTT------------CAATCGA-CCAG-TATTGA-------------------------------CGGTTTTAAC-CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAG-TATTAGGACC-GCTttttgccaacctgac
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-352 )      :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---G-GTCAATAGT-T-GGTC-AAT-ACT-----G-GTCCAATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCAT-GCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAAATCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TGT--TATTT-TTGAT-TC---A--A-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAATTACACCNC-A-GT-ATCGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-G-CTCT-TCATC-TTCT-AGC-G-ATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-ACCTGT-TTC--CAATG---A-AATA-C-TG-AT--TAGT-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT-TGACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-GGTT-AC---AGG-TTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AATAATT-TT-CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-GA-T-CAGCT-GAG-CAC-TG-T-GATCTAGTA---AATAAA-TA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGGA-------CAAG--AATATTACTT-GGGGT-CAGG-TAT-A-ATG--GACA-AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC--ACTGA-CACACCAA-TG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTACCTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------ATA-G--G-----A---------A-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACA---AA-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-ACA--GTGAGGCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---GTTTGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTATT--CATC-ATAAT--G-----AACTCC--NT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TA---AG-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCAC--T--TGA-CCAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAGTTATTGTGACC-GCT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagataCTTT-CA---A--------------------------------------------------AC---------T--T--------ATA-G--G-----ATAATTATAGA-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----CTCTTCTCTTG----C-T-A---T-GACG---AA-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-TCA--GTGAG-CAT-TTT-C-CCCAAT-GAAT-AAAATCT----ATG---C--ATTAT--T--------A-ATCTCACT-TG-C--AT-G-TAA--GT--GTTT-T-AA-G-TG-CA-TGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-TATTAT---CATC-ATAAT--G-----AACTGT--TT--AA-CAT-----TT--AAA---T-AACC-AATA-A--TA--TA----G-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACTGT--TGA-CCAGTAA-C---GA---CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCACCTCCACGGGTCAA-ttatagaaataatagggacttgacacctcttctcttgctatgacgaaagttaaatagtttataattttttcagtgagcattttccccaatgaataaaatctatgcattattaatctcacttgcatgtaagtgttttaagtgcatgttagaattacagtatattatcatcataatgaactgtttaacatttaaataaccaataatatagaataatgaccattaaatcttcaattgaccacaatcgaccagtattgaccactgttgaccagtaacgacggttttaaccagtattgaccaccacctccacgggtcaaatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatataggg---------T--T--------TTA-GT-G-----A---------AT----A--------ATA---------A--TTAAGTG-GAC--TT--GA--CCAC-----C-CTGCTCTTT----GCT-A---G-GACA---AACAGC----TA------G-TTAATTTG-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-AAT-C-CTAATTTAAAC-AGAATCT-TCCATG---CAAATTAT--TTTTTAGACA-AT-TCACTATT-C--AT-T-TAATCA---ATTATT-AA-G-TG--------TT--AGTATTTACGAAAGTAA-T-TTATTAACATC-ATAAT--G-----AACTTA--TT---A-CAA-----TA--AAA--ATAAACTTAAGGTA--CA--TT---AG-ACCATAA-ATGA---CTTATAAA-A--TTTTCAATT---ACAATAATCGA-CCCG-TATTGATCCACA-T--TGACCCAGT-A-TTGGGACC-CGATTTTAA--CCAGTAGGTCTCCCAGACC--ACCGGCAC----GGTCAA-TACTTAGATATT-TGACCAGCTatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatattaggcactatcaagCCTT-CA--------------------------------------------T---------AT---------T--T--------ATA-G--A-----A---------A-----A--------ATATTAGGACGAA--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACCCGGGC-CTGCACTTG----GCT-A---G-GACA--------------A------A-ACAGTTTT-TTAT---TTTT-AAA--AT-AAGCAT-TTT-C-CCCAACTTAAC-ATAATCT-T--ATGGGAC--ATTATTATC-------A-ATT---TT-TG-C--AT-G-TAA--A---G-TTGT-GA-G-TG-CA-TGT-TA--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCT--GT--AA-C-------TA--AAA--AT-AA-CCAATA-AGTTA--CA---AG-ACTAT-A-ATGA---CGGAATAA-A--TTTT------------CAATCGA-CTAT-TATTGA-CCA-----------------------------GTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCT----GGTCAA-TAC-Tttttgcaacc
gi|12                         : taggtcttttgataacttgtaaatataggaaAGGGCTGGGCG-GTTAAAA-CCGCC-CACCGGTTTTTTAACCAGCC-G--TAAT-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-ACGCTCGTCTAGTCATTGACACTCTTCTCGAAATCTAG-GTCAATAGTAT-GATCTAAT-ACTTCAGAG-ATC---TGGAAA---ATT--TAAGTG---ACCTTTTT-CTCGCGTATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AAGCTA-TAAA--G---ATTT-
gi|13                         :                                cGGGCTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--AACCGC---CTCGGTTA---ATAC---TCTCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AGTTGAAA---TTT--AAGGTG---GCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA---AG--ATTAATTA-AT-AGGTTT-AT-----ACTCT-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-t
gi|14                         :                                AGGGTTGGGCG-GTTGAAAACCGCCGC-CCAG--TTGTAACCAGCG-GGTT--T-TTAACTCATGTT-A-----TAAA-CTG----TCCGGTCA---AT-C---TCCCAAA-----------------T-GGTC--AT-AGT-----G-GT-CAATTGAAA---TTT--AA
gi|15                         :                                 GGGTTGGGT---TTAAA--CCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-
gi|17                         :                                                                   TTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-
gi|2                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-T-CCG----TTTA-CCAGCG-G--T--TGTTAAC-CG-CTT-A--------A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---GTGTCAATAGT-TTGGTC-AAT--CT-----G-GTCTAATTGAAA---TTT--AAAGTGC--TCC-TTT---CCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTTCAT-AATCTT-TTCAAAAGAGTA-GCT-T--A-TCAGCAAATGGC-AGTAT--TCTTT-TTGAT-TCCAAATTA-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-GACTCT-TCATCATTCT-GGC-GGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-GCCTGT-TTT--CAATC---A-AATA-C-TG-AT--TAGC-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-AGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATCA------T-T-G--CTA-ATTT-TGACT-ACTTAT------GG-CAA--CA-T--ATCT---TC------A--T-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGACG-GGTT-AC---AGGACTA-TA-------TAT-GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--A---A--AAAAATT-TT-CTGC-TTAT-A--C--TGGA-CCAAAT-ATAC-AGCTAGGA-T-CACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTATTA---AATAAA-TACTAAAC-TCG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-GTCT-CCA-AAT----GGGAGTGTCGGCGAGGAGATATTACCT-TGGGTGCAGG-TAT-A-ATG--GACA-AG--G-TA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGTTTAT--GGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAA-TG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTA-CTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTA-G--G-----A---------A-----A--------AT----------A--T--AG-G-GACTTTT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACA---AA-AAT----TA------A-ATAGTTTAGTAAT---TTTT-ACAC-GTGAGGCAT-TTT-CACCCAA-TGAAT--AAATCT-T--ATG---C--ATTATG-TT-------A-ATCTCATT-TG-CCAAT-G-TAAT-GCTTGTTTGC-AA-G-TG-CC-TGT-CTTAAG-AATTAT---AGT-ATT-TTATT--CATCTTTAATCAG-----AACTCC--GT--AA-CAT-----TTTAAAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TG---AG-A--AT-ATGTGAT--T-CATTAA-GCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGA-CCAC--TTATGA-CCAGT-ATT---GA-C-TGGTTTTAA--CCATTA--TT-----GACCCAACCGGCCC-----GTCAATTAC-TAGTCATTGGGACC-GCTact
gi|3                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC--------------CG-G--T--T-TTAAC-TG-GTTTA-----T--AACCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTTTCCCA---AT-TTT----ATTAATAAATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAA-TCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TAT---ATTT-ATGAT-TC---A----TT--AAT-A-A-TA--AT--AAATCATTTAATTGCACCCCCA-GT-AT-GAACT--CTGACCTTTTCAAA-C-CTTC-TCAT--TTCT-AGCTG-AT---ATCC-CCTA-TTAT---AACTTTTT-AGT-----T--A-ATGGGCA-AC-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C-TG-AT---AGT------A-G-CA---C-----TTT-C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-T--AAG-TAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT--GACT-ACTTAT------GGT-AA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACTTAT-AC-A-----T-GTA--CAT--G-AAAA-G-GGTTTAC---AGG-T-A-GA-------TAT-AGTTG-ACATTT-G-AGAGA--C---A--AATAATT-T--CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAA------------T-----T-CAGCT-GAG-CAC-TG-T-AATCTAGTA---AATAAT-AA-TAA---CAG-G-T------TA-AAA--CAT-GT-TGCA--AAA-GAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GAG--------CAAG--A-TATTACTTTGGGGT-CAGG--AT-A-A-GATGACA-ATTTGTTA----AAGATTGAC------CAATCGGT-C-C--G--GAC-TGCATAATTTGTGT---G--TGTTATATG-TTAT--G--AAAAC-----TACCTCAC---CTGAGCTCACCAA-TG-TTG-ATCA---CACTCT---AG--------GTACCTGA-TCTGAGA-ACTCTT-CAAGTAT----------------ACTGTATGGAAAAAT-------AT-----GGGAAC---------T--TTCAAGTTTATA-G--G-----A---------A-----A--------ATATAAGAAAA-A--T--AG-G--AC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-----T-GACA---AA-AAT----TA------ATAGAGTTTA-TTAT---TTT--ACA--A-GAAGCATGTTT-G-CCCAATTGAAT-AAA-TGTGT--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-GTTCA--A---GTTTGT-AACGTTGCCA-TGT-TT---G-AATTAC---AA--A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--GCTTCAAGTTTCAGCC--AATCATGTTGATC--AAATTAT-GACCTAATA-A--TAACTAGATAG-A--AT-A-ATGAGCTC-CATGGATA--TCTT-AGTCG--TTCACAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                        CAATTGAAAAATTTT--AAA-TG---TCC-TTT--CCCA---AT-TTT----A------AATAT--ACA-TTTCATTGCAAA--AAAAAAAT-AG------ATTT-ATTAGTCTT-T---AAAAATCACGCT-TGTAATTA---AA--GC---TGT--TATTTATTGAT-CC---A--A-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAAT-ACACCAC-GTGTCATCGAACTT-CTA--CTTTTCAAAAG-CTCTCTTATC-TA---AGC-G-AT---ATCC-CCTATTTAT---AA--TTTTTAGTA----T--A-ATGGGCA-AT-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C--G-AT---AGT-----AA-G-CAGCTT-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAA-ATAT--AATATATT---------TGG--CTA-A-TT-AGACT-ACT-GT------G-TCAA--CA-T--ATCT---TC------A--GGT-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-G-TT-AC---AGG-GTAGTA-------TA--GTTTG-ACAAT--G-AGAGA--C---A--AATAATT----CTGC-TTATGAC-C--TG-A-CAAAAC-A-ACCAGCTA-GAGT-CAGCT-GAGGCA--TG-T-G--CTAGTA---A-TAAA-TA-TAAAC-TGGTG-T---------AAA--CAT-GT-GGCA--AAA-GAC--AGTTG-CTGCTATAAT----GGAG-------CACG--A-TATTACTT-GGG-T-C-GG-TAT-ACATG--GACA--GT-GTTAGTATA---TTAACAT-ACCCAA--GGT-CTCAGG--GATTGGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC----TG--CAC-CCAA-TG-T-GGATCA---T----TCATAG--------GTACCTGAAT--GAATTACTCTT-CA---AT----------------AATGACTTGTATTGGAAAATATAT-----G---ACGACTTAAGTT--T--------ATA-G--A-----A---------ATATGAA--------ATA---------AA-T--AG-G-GAC--TTT-GA--C-AC-----C-C-GCTCTTC----T-T-ACGAG-GACA---AA--GT----TA------A--TAG---A-TAAT---TTTTTACA--GTG--GCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-GATTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---TGTTGT-AA-T-TG-CA-TATGTT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCG--TT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCAAGTA-A--TA--TA---CGAA--AT-A-ATGA---C-CATTCA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA---------------CAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--AGCGGCCC----GGTCAA-TA--TATTTA-TGTGACC-GCTatt
gi|5                          :                                AGGGTTGGGCGAGTTTAAAACCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCGAG--T--T-TT-AC-CG-GTT-A-----TA-A-CCCC---CCAGGTCA---ATAA---CTCCAAAAT---G-GTCAATCGT-G-GCTC-AATGACT-----GCGT-CAATTGAAA---TTTA-AAAGTGTTTTCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--A---TTTCAT-GCAAA--AAATAATT-AGTAG---ATTT-AT-AGTCTTGCTC--AAAATCA-GCT-T-TATTTA-CAAA--GCAA-TGTTGTATTTATTGAGATC---A--ATTT--AAT-G-ATTATCAT--AA-TCATTTAATTACACCAC-A-GT-AT-GAAC-TTCTGACCTTTTCAAG----TC--TCATT-TTCT-AGC-----TGTATCC-CC--ATTACTATAAC-TTTTTAG------T--A-ATGGGCA-A-CTGTGTTC--CAATG---A-TATA-C----A---TAG------TA-G-CA---CTT---TT--C---AGAA-GACAAT--ACT-GC-AT-G--TTTAAGATATTAAA-ATA-TA------T-T----TCA-A-AT-TGA-T-ATAT-T------GGTCAACCCA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-AT-ACCAT----T-GTA--CATTAG-TAGG-A-GGTT-TC---AGG-TAG-TA-------TCA-GTTTG-ACAAT--G-AGAAA--CA--A--AATAATT-CTGCTAC-TTAT-ACTC--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-AATT-CAGC--GAG-CACTTGTT-GATCT-GTA---AATAAATTA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAC--CA-TG--TGC---AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGAAG------CAAG-----ATTACTT-GGGGT-CAGG-TA--A-ATG--GACAGAGT-GTTA----C---TTAACATAACCCAA--GGTAC-CAGG--GAT-GG-A--ATT-GTGT---GGTTGTTAT-TG-TTCTTGA--AAAACA--T-C-CC-CAT--ACTA---ACACCAATTG-T-G-ATCA---T----T---AGTNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNN-NNNNNT-CA---GTCCA-------------A---------------------AT-----G---AC---------T--G--------ACA-GCAG-----A---------A-----A--------A-A---------A----------GAC--TT--GAAGA-AC-----T-CTGATCtttttgtcaaccctgg
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----GATA-AAA--CATTGTCTGCA--CAAAGAC--AGT-G-CT-TCA-AAT----G--A-------CAA-----TATTACTT-GGAGT-CGAG-TATCA-ATG--GA---AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACC-AA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTA-------GAACA--TTCACC-CAC--ACTG--CACACCAA--G-T-G-ATTAATATA---T---AG--------GTACCTG--T--GAA---CTCTT-CA---ATAATGACTTGTATGGAAA---------------------ATATAGGG---AC---------T--TCAAGTTT-ATA-G--G-----A---------A-----ATACTAGAAATA---------AATT--AG-G-GAC--TT--GC--C-AC-----C--TGCTCTTT----G-C-T---T-GACA---AA-AGT----TATTAATAA-ATAGTTTT-TA-T---TTTT-ACA--GTGAG-CAT-TC--C-CCCAATTGAAT-AAAATCT-T--AGA--------TAT--TT-------ATAT-TCATT-TG-C--AT-G-TAA--G------TGTGAA-G-TG-CAATGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G------ACTAC--ATTAAA-CAT-----TT---AA--CT-AACC--AT--A--TA--TA---GA-A--AT-A-ATGA---C-C-TT-A-A--TCTT------------CAATCGA-CCAG-TATTGA-------------------------------CGGTTTTAAC-CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAG-TATTAGGACC-GCTttttgccaacctgac
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-352 )      :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---G-GTCAATAGT-T-GGTC-AAT-ACT-----G-GTCCAATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCAT-GCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAAATCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TGT--TATTT-TTGAT-TC---A--A-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAATTACACCNC-A-GT-ATCGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-G-CTCT-TCATC-TTCT-AGC-G-ATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-ACCTGT-TTC--CAATG---A-AATA-C-TG-AT--TAGT-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT-TGACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-ATA-CCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-GGTT-AC---AGG-TTA-TA-------TAT-GTTTG-A-CAAT--GA-GAGA--C--A-AAATAATT-TT-CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-GA-T-CAGCT-GAG-CAC-TG-T-GATCTAGTA---AATAAA-TA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGGA-------CAAG--AATATTACTT-GGGGT-CAGG-TAT-A-ATG--GACA-AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC--ACTGA-CACACCAA-TG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTACCTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------ATA-G--G-----A---------A-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACA---AA-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-ACA--GTGAGGCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---GTTTGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTATT--CATC-ATAAT--G-----AACTCC--NT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TA---AG-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCAC--T--TGA-CCAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAGTTATTGTGACC-GCT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagataCTTT-CA---A--------------------------------------------------AC---------T--T--------ATA-G--G-----ATAATTATAGA-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----CTCTTCTCTTG----C-T-A---T-GACG---AA-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-TCA--GTGAG-CAT-TTT-C-CCCAAT-GAAT-AAAATCT----ATG---C--ATTAT--T--------A-ATCTCACT-TG-C--AT-G-TAA--GT--GTTT-T-AA-G-TG-CA-TGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-TATTAT---CATC-ATAAT--G-----AACTGT--TT--AA-CAT-----TT--AAA---T-AACC-AATA-A--TA--TA----G-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACTGT--TGA-CCAGTAA-C---GA---CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCACCTCCACGGGTCAA-ttatagaaataatagggacttgacacctcttctcttgctatgacgaaagttaaatagtttataattttttcagtgagcattttccccaatgaataaaatctatgcattattaatctcacttgcatgtaagtgttttaagtgcatgttagaattacagtatattatcatcataatgaactgtttaacatttaaataaccaataatatagaataatgaccattaaatcttcaattgaccacaatcgaccagtattgaccactgttgaccagtaacgacggttttaaccagtattgaccaccacctccacgggtcaaatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatataggg---------T--T--------TTA-GT-G-----A---------AT----A--------ATA---------A--TTAAGTG-GAC--TT--GA--CCAC-----C-CTGCTCTTT----GCT-A---G-GACA---AACAGC----TA------G-TTAATTTG-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-AAT-C-CTAATTTAAAC-AGAATCT-TCCATG---CAAATTAT--TTTTTAGACA-AT-TCACTATT-C--AT-T-TAATCA---ATTATT-AA-G-TG--------TT--AGTATTTACGAAAGTAA-T-TTATTAACATC-ATAAT--G-----AACTTA--TT---A-CAA-----TA--AAA--ATAAACTTAAGGTA--CA--TT---AG-ACCATAA-ATGA---CTTATAAA-A--TTTTCAATT---ACAATAATCGA-CCCG-TATTGATCCACA-T--TGACCCAGT-A-TTGGGACC-CGATTTTAA--CCAGTAGGTCTCCCAGACC--ACCGGCAC----GGTCAA-TACTTAGATATT-TGACCAGCTatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatattaggcactatcaagCCTT-CA--------------------------------------------T---------AT---------T--T--------ATA-G--A-----A---------A-----A--------ATATTAGGACGAA--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACCCGGGC-CTGCACTTG----GCT-A---G-GACA--------------A------A-ACAGTTTT-TTAT---TTTT-AAA--AT-AAGCAT-TTT-C-CCCAACTTAAC-ATAATCT-T--ATGGGAC--ATTATTATC-------A-ATT---TT-TG-C--AT-G-TAA--A---G-TTGT-GA-G-TG-CA-TGT-TA--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCT--GT--AA-C-------TA--AAA--AT-AA-CCAATA-AGTTA--CA---AG-ACTAT-A-ATGA---CGGAATAA-A--TTTT------------CAATCGA-CTAT-TATTGA-CCA-----------------------------GTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCT----GGTCAA-TAC-Tttttgcaacc
gi|12                         : taggtcttttgataacttgtaaatataggaaAGGGCTGGGCG-GTTAAAA-CCGCC-CACCGGTTTTTTAACCAGCC-G--TAAT-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-ACGCTCGTCTAGTCATTGACACTCTTCTCGAAATCTAG-GTCAATAGTAT-GATCTAAT-ACTTCAGAG-ATC---TGGAAA---ATT--TAAGTG---ACCTTTTT-CTCGCGTATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AAGCTA-TAAA--G---ATTT-
gi|13                         :                                cGGGCTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--AACCGC---CTCGGTTA---ATAC---TCTCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AGTTGAAA---TTT--AAGGTG---GCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA---AG--ATTAATTA-AT-AGGTTT-AT-----ACTCT-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-t
gi|14                         :                                AGGGTTGGGCG-GTTGAAAACCGCCGC-CCAG--TTGTAACCAGCG-GGTT--T-TTAACTCATGTT-A-----TAAA-CTG----TCCGGTCA---AT-C---TCCCAAA-----------------T-GGTC--AT-AGT-----G-GT-CAATTGAAA---TTT--AA
gi|15                         :                                 GGGTTGGGT---TTAAA--CCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-
gi|17                         :                                                                   TTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-
gi|2                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-T-CCG----TTTA-CCAGCG-G--T--TGTTAAC-CG-CTT-A--------A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---GTGTCAATAGT-TTGGTC-AAT--CT-----G-GTCTAATTGAAA---TTT--AAAGTGC--TCC-TTT---CCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTTCAT-AATCTT-TTCAAAAGAGTA-GCT-T--A-TCAGCAAATGGC-AGTAT--TCTTT-TTGAT-TCCAAATTA-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-GACTCT-TCATCATTCT-GGC-GGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-GCCTGT-TTT--CAATC---A-AATA-C-TG-AT--TAGC-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-AGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATCA------T-T-G--CTA-ATTT-TGACT-ACTTAT------GG-CAA--CA-T--ATCT---TC------A--T-T-------ACT-ATA-CCA-----T-GTA--CAT--G-TAGACG-GGTT-AC---AGGACTA-TA-------TAT-GTTTG-A-CAAT--GA-GAGA--A--A-AAA-AATT-TT-CTGC-TTAT-A--C--TGGA-CCAAAT-ATAC-AGCTAGGA-T-CACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTATTA---AATAAA-TACTAAAC-TCG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-GTCT-CCA-AAT----GGGAGTGTCGGCGAGGAGATATTACCT-TGGGTGCAGG-TAT-A-ATG--GACA-AG--G-TA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGTTTAT--GGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAA-TG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTA-CTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTA-G--G-----A---------A-----A--------AT----------A--T--AG-G-GACTTTT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACA---AA-AAT----TA------A-ATAGTTTAGTAAT---TTTT-ACAC-GTGAGGCAT-TTT-CACCCAA-TGAAT--AAATCT-T--ATG---C--ATTATG-TT-------A-ATCTCATT-TG-CCAAT-G-TAAT-GCTTGTTTGC-AA-G-TG-CC-TGT-CTTAAG-AATTAT---AGT-ATT-TTATT--CATCTTTAATCAG-----AACTCC--GT--AA-CAT-----TTTAAAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TG---AG-A--AT-ATGTGAT--T-CATTAA-GCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGA-CCAC--TTATGA-CCAGT-ATT---GA-C-TGGTTTTAA--CCATTA--TT-----GACCCAACCGGCCC-----GTCAATTAC-TAGTCATTGGGACC-GCTact
gi|3                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC--------------CG-G--T--T-TTAAC-TG-GTTTA-----T--AACCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTTTCCCA---AT-TTT----ATTAATAAATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAA-TCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TAT---ATTT-ATGAT-TC---A----TT--AAT-A-A-TA--AT--AAATCATTTAATTGCACCCCCA-GT-AT-GAACT--CTGACCTTTTCAAA-C-CTTC-TCAT--TTCT-AGCTG-AT---ATCC-CCTA-TTAT---AACTTTTT-AGT-----T--A-ATGGGCA-AC-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C-TG-AT---AGT------A-G-CA---C-----TTT-C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-T--AAG-TAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT--GACT-ACTTAT------GGT-AA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACTTATA-C-A-----T-GTA--CAT--G-AAAA-G-GGTTTAC---AGG-T-A-GA-------TAT-AGTTG-A-CATTT-GA-GAGA--C--A-AA-TAATT-T--CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAA------------T-----T-CAGCT-GAG-CAC-TG-T-AATCTAGTA---AATAAT-AA-TAA---CAG-G-T------TA-AAA--CAT-GT-TGCA--AAA-GAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GAG--------CAAG--A-TATTACTTTGGGGT-CAGG--AT-A-A-GATGACA-ATTTGTTA----AAGATTGAC------CAATCGGT-C-C--G--GAC-TGCATAATTTGTGT---G--TGTTATATG-TTAT--G--AAAAC-----TACCTCAC---CTGAGCTCACCAA-TG-TTG-ATCA---CACTCT---AG--------GTACCTGA-TCTGAGA-ACTCTT-CAAGTAT----------------ACTGTATGGAAAAAT-------AT-----GGGAAC---------T--TTCAAGTTTATA-G--G-----A---------A-----A--------ATATAAGAAAA-A--T--AG-G--AC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-----T-GACA---AA-AAT----TA------ATAGAGTTTA-TTAT---TTT--ACA--A-GAAGCATGTTT-G-CCCAATTGAAT-AAA-TGTGT--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-GTTCA--A---GTTTGT-AACGTTGCCA-TGT-TT---G-AATTAC---AA--A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--GCTTCAAGTTTCAGCC--AATCATGTTGATC--AAATTAT-GACCTAATA-A--TAACTAGATAG-A--AT-A-ATGAGCTC-CATGGATA--TCTT-AGTCG--TTCACAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                        CAATTGAAAAATTTT--AAA-TG---TCC-TTT--CCCA---AT-TTT----A------AATAT--ACA-TTTCATTGCAAA--AAAAAAAT-AG------ATTT-ATTAGTCTT-T---AAAAATCACGCT-TGTAATTA---AA--GC---TGT--TATTTATTGAT-CC---A--A-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAAT-ACACCAC-GTGTCATCGAACTT-CTA--CTTTTCAAAAG-CTCTCTTATC-TA---AGC-G-AT---ATCC-CCTATTTAT---AA--TTTTTAGTA----T--A-ATGGGCA-AT-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C--G-AT---AGT-----AA-G-CAGCTT-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAA-ATAT--AATATATT---------TGG--CTA-A-TT-AGACT-ACT-GT------G-TCAA--CA-T--ATCT---TC------A--GGT-------ACT-ATA-CCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-G-TT-AC---AGG-GTAGTA-------TA--GTTTG-A-CAAT--GA-GAGA--C--A-AA-TAATT----CTGC-TTATGAC-C--TG-A-CAAAAC-A-ACCAGCTA-GAGT-CAGCT-GAGGCA--TG-T-G--CTAGTA---A-TAAA-TA-TAAAC-TGGTG-T---------AAA--CAT-GT-GGCA--AAA-GAC--AGTTG-CTGCTATAAT----GGAG-------CACG--A-TATTACTT-GGG-T-C-GG-TAT-ACATG--GACA--GT-GTTAGTATA---TTAACAT-ACCCAA--GGT-CTCAGG--GATTGGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC----TG--CAC-CCAA-TG-T-GGATCA---T----TCATAG--------GTACCTGAAT--GAATTACTCTT-CA---AT----------------AATGACTTGTATTGGAAAATATAT-----G---ACGACTTAAGTT--T--------ATA-G--A-----A---------ATATGAA--------ATA---------AA-T--AG-G-GAC--TTT-GA--C-AC-----C-C-GCTCTTC----T-T-ACGAG-GACA---AA--GT----TA------A--TAG---A-TAAT---TTTTTACA--GTG--GCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-GATTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---TGTTGT-AA-T-TG-CA-TATGTT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCG--TT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCAAGTA-A--TA--TA---CGAA--AT-A-ATGA---C-CATTCA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA---------------CAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--AGCGGCCC----GGTCAA-TA--TATTTA-TGTGACC-GCTatt
gi|5                          :                                AGGGTTGGGCGAGTTTAAAACCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCGAG--T--T-TT-AC-CG-GTT-A-----TA-A-CCCC---CCAGGTCA---ATAA---CTCCAAAAT---G-GTCAATCGT-G-GCTC-AATGACT-----GCGT-CAATTGAAA---TTTA-AAAGTGTTTTCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--A---TTTCAT-GCAAA--AAATAATT-AGTAG---ATTT-AT-AGTCTTGCTC--AAAATCA-GCT-T-TATTTA-CAAA--GCAA-TGTTGTATTTATTGAGATC---A--ATTT--AAT-G-ATTATCAT--AA-TCATTTAATTACACCAC-A-GT-AT-GAAC-TTCTGACCTTTTCAAG----TC--TCATT-TTCT-AGC-----TGTATCC-CC--ATTACTATAAC-TTTTTAG------T--A-ATGGGCA-A-CTGTGTTC--CAATG---A-TATA-C----A---TAG------TA-G-CA---CTT---TT--C---AGAA-GACAAT--ACT-GC-AT-G--TTTAAGATATTAAA-ATA-TA------T-T----TCA-A-AT-TGA-T-ATAT-T------GGTCAACCCA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-ATA-CCAT----T-GTA--CATTAG-TAGG-A-GGTT-TC---AGG-TAG-TA-------TCA-GTTTG-A-CAAT--GA-GAAA--C--A-AAATAATT-CTGCTAC-TTAT-ACTC--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-AATT-CAGC--GAG-CACTTGTT-GATCT-GTA---AATAAATTA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAC--CA-TG--TGC---AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGAAG------CAAG-----ATTACTT-GGGGT-CAGG-TA--A-ATG--GACAGAGT-GTTA----C---TTAACATAACCCAA--GGTAC-CAGG--GAT-GG-A--ATT-GTGT---GGTTGTTAT-TG-TTCTTGA--AAAACA--T-C-CC-CAT--ACTA---ACACCAATTG-T-G-ATCA---T----T---AGTNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNN-NNNNNT-CA---GTCCA-------------A---------------------AT-----G---AC---------T--G--------ACA-GCAG-----A---------A-----A--------A-A---------A----------GAC--TT--GAAGA-AC-----T-CTGATCtttttgtcaaccctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTAGT-----TTGATATGGGCATACTCTT-TTA--CA-TGCTTACAATATC-TGGAT--T-TT-----TA-G-CA---C-----TT--TTCGAG-A-GACAAT--TCT-GTGAT-GGATTTAAGA-AT--AA-A-ATTAATGTATT-TGGGTTTAGA-TTGTGACTTACCTGTTGCTCGGGT--A--CA-T--ATCTACTTC------ATCG-TTAACATGATT-TTA-ACA-----TCGTA--CAT--GATTGA-GTGACT-AA---AGG-TTA-CAGTGTAGCTAT-CTTGA-A-CAAT--GA-GAGAAAC--AGAAATAATT-TC---GA-TAA--AC-C--TG-A-CAAAA--A-AC-AAATA-G--T-CAGCTAGAG-CAC--G-T-GAGCTAGTATCAAATAAA-TA-TAAACGTGG-GGT----GATATAAATGCGTTGT-TGTC--AAAAGACGTAGC-A-GA-TTA-CATTAGGGGGA-------CAAG--AG-ATTATAC-ATGGT-CA---------ATG--GATC-AGT-GTTA----AA--TTAACCT-ACCCA---GGT-C-TAGGCCGATTGGC-----T-GTGTTGCA--TGTCAT--G-TT-T--G--AAAACA--T-CACC-C--------A-CACACCAA-TGTT-G-ATCA---T----C---AG--------A----------------ACCTTT-CA---GT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--TA-------ATG-C--GCAAACA---------A-----A--------ATA---------A--A--AG-GCGAC--CTCAGA--C-AC-----C-CTGCTCTTTGCAAG-T-A---GTGACA---AAGAGTATACTA------A-ACAGTTTA-T-GTCTATTTT-AAATCGTGA-GCAG-TTTAC-CCCAACTGAACAAAAATCT-T--A-G---C--ATTATTCTT-------A-ATTTCATT-TGCC--ATAG-TGA------GTTAGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AAT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----GATA-AAA--CATTGTCTGCA--CAAAGAC--AGT-G-CT-TCA-AAT----G--A-------CAA-----TATTACTT-GGAGT-CGAG-TATCA-ATG--GA---AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACC-AA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTA-------GAACA--TTCACC-CAC--ACTG--CACACCAA--G-T-G-ATTAATATA---T---AG--------GTACCTG--T--GAA---CTCTT-CA---ATAATGACTTGTATGGAAA---------------------ATATAGGG---AC---------T--TCAAGTTT-ATA-G--G-----A---------A-----ATACTAGAAATA---------AATT--AG-G-GAC--TT--GC--C-AC-----C--TGCTCTTT----G-C-T---T-GACA---AA-AGT----TATTAATAA-ATAGTTTT-TA-T---TTTT-ACA--GTGAG-CAT-TC--C-CCCAATTGAAT-AAAATCT-T--AGA--------TAT--TT-------ATAT-TCATT-TG-C--AT-G-TAA--G------TGTGAA-G-TG-CAATGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G------ACTAC--ATTAAA-CAT-----TT---AA--CT-AACC--AT--A--TA--TA---GA-A--AT-A-ATGA---C-C-TT-A-A--TCTT------------CAATCGA-CCAG-TATTGA-------------------------------CGGTTTTAAC-CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAG-TATTAGGACC-GCTttttgccaacctgac
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-352 )      :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---G-GTCAATAGT-T-GGTC-AAT-ACT-----G-GTCCAATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCAT-GCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAAATCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TGT--TATTT-TTGAT-TC---A--A-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAATTACACCNC-A-GT-ATCGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-G-CTCT-TCATC-TTCT-AGC-G-ATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-ACCTGT-TTC--CAATG---A-AATA-C-TG-AT--TAGT-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT-TGACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-ATA-CCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-GGTT-AC---AGG-TTA-TA-------TAT-GTTTG-A-CAAT--GA-GAGA--C--A-AAATAATT-TT-CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-GA-T-CAGCT-GAG-CAC-TG-T-GATCTAGTA---AATAAA-TA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGGA-------CAAG--AATATTACTT-GGGGT-CAGG-TAT-A-ATG--GACA-AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC--ACTGA-CACACCAA-TG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTACCTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------ATA-G--G-----A---------A-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACA---AA-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-ACA--GTGAGGCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---GTTTGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTATT--CATC-ATAAT--G-----AACTCC--NT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TA---AG-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCAC--T--TGA-CCAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAGTTATTGTGACC-GCT
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagataCTTT-CA---A--------------------------------------------------AC---------T--T--------ATA-G--G-----ATAATTATAGA-----A--------ATA---------A--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-AC-----CTCTTCTCTTG----C-T-A---T-GACG---AA-AGT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-TCA--GTGAG-CAT-TTT-C-CCCAAT-GAAT-AAAATCT----ATG---C--ATTAT--T--------A-ATCTCACT-TG-C--AT-G-TAA--GT--GTTT-T-AA-G-TG-CA-TGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-TATTAT---CATC-ATAAT--G-----AACTGT--TT--AA-CAT-----TT--AAA---T-AACC-AATA-A--TA--TA----G-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA-CCACTGT--TGA-CCAGTAA-C---GA---CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCACCTCCACGGGTCAA-ttatagaaataatagggacttgacacctcttctcttgctatgacgaaagttaaatagtttataattttttcagtgagcattttccccaatgaataaaatctatgcattattaatctcacttgcatgtaagtgttttaagtgcatgttagaattacagtatattatcatcataatgaactgtttaacatttaaataaccaataatatagaataatgaccattaaatcttcaattgaccacaatcgaccagtattgaccactgttgaccagtaacgacggttttaaccagtattgaccaccacctccacgggtcaaatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatataggg---------T--T--------TTA-GT-G-----A---------AT----A--------ATA---------A--TTAAGTG-GAC--TT--GA--CCAC-----C-CTGCTCTTT----GCT-A---G-GACA---AACAGC----TA------G-TTAATTTG-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-AAT-C-CTAATTTAAAC-AGAATCT-TCCATG---CAAATTAT--TTTTTAGACA-AT-TCACTATT-C--AT-T-TAATCA---ATTATT-AA-G-TG--------TT--AGTATTTACGAAAGTAA-T-TTATTAACATC-ATAAT--G-----AACTTA--TT---A-CAA-----TA--AAA--ATAAACTTAAGGTA--CA--TT---AG-ACCATAA-ATGA---CTTATAAA-A--TTTTCAATT---ACAATAATCGA-CCCG-TATTGATCCACA-T--TGACCCAGT-A-TTGGGACC-CGATTTTAA--CCAGTAGGTCTCCCAGACC--ACCGGCAC----GGTCAA-TACTTAGATATT-TGACCAGCTatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atatattaggcactatcaagCCTT-CA--------------------------------------------T---------AT---------T--T--------ATA-G--A-----A---------A-----A--------ATATTAGGACGAA--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACCCGGGC-CTGCACTTG----GCT-A---G-GACA--------------A------A-ACAGTTTT-TTAT---TTTT-AAA--AT-AAGCAT-TTT-C-CCCAACTTAAC-ATAATCT-T--ATGGGAC--ATTATTATC-------A-ATT---TT-TG-C--AT-G-TAA--A---G-TTGT-GA-G-TG-CA-TGT-TA--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCT--GT--AA-C-------TA--AAA--AT-AA-CCAATA-AGTTA--CA---AG-ACTAT-A-ATGA---CGGAATAA-A--TTTT------------CAATCGA-CTAT-TATTGA-CCA-----------------------------GTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCT----GGTCAA-TAC-Tttttgcaacc
gi|12                         : taggtcttttgataacttgtaaatataggaaAGGGCTGGGCG-GTTAAAA-CCGCC-CACCGGTTTTTTAACCAGCC-G--TAAT-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-ACGCTCGTCTAGTCATTGACACTCTTCTCGAAATCTAG-GTCAATAGTAT-GATCTAAT-ACTTCAGAG-ATC---TGGAAA---ATT--TAAGTG---ACCTTTTT-CTCGCGTATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AAGCTA-TAAA--G---ATTT-
gi|13                         :                                cGGGCTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--AACCGC---CTCGGTTA---ATAC---TCTCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AGTTGAAA---TTT--AAGGTG---GCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA---AG--ATTAATTA-AT-AGGTTT-AT-----ACTCT-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-t
gi|14                         :                                AGGGTTGGGCG-GTTGAAAACCGCCGC-CCAG--TTGTAACCAGCG-GGTT--T-TTAACTCATGTT-A-----TAAA-CTG----TCCGGTCA---AT-C---TCCCAAA-----------------T-GGTC--AT-AGT-----G-GT-CAATTGAAA---TTT--AA
gi|15                         :                                 GGGTTGGGT---TTAAA--CCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-
gi|17                         :                                                                   TTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-GTT-A-----T--A-
gi|2                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-T-CCG----TTTA-CCAGCG-G--T--TGTTAAC-CG-CTT-A--------A-CCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---GTGTCAATAGT-TTGGTC-AAT--CT-----G-GTCTAATTGAAA---TTT--AAAGTGC--TCC-TTT---CCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTTCAT-AATCTT-TTCAAAAGAGTA-GCT-T--A-TCAGCAAATGGC-AGTAT--TCTTT-TTGAT-TCCAAATTA-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-GACTCT-TCATCATTCT-GGC-GGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCA-GCCTGT-TTT--CAATC---A-AATA-C-TG-AT--TAGC-----TA-G-CA---C-----TT--C---AG-AGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATCA------T-T-G--CTA-ATTT-TGACT-ACTTAT------GG-CAA--CA-T--ATCT---TC------A--T-T-------ACT-ATA-CCA-----T-GTA--CAT--G-TAGACG-GGTT-AC---AGGACTA-TA-------TAT-GTTTG-A-CAAT--GA-GAGA--A--A-AAA-AATT-TT-CTGC-TTAT-A--C--TGGA-CCAAAT-ATAC-AGCTAGGA-T-CACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTATTA---AATAAA-TACTAAAC-TCG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC--AGT-GTCT-CCA-AAT----GGGAGTGTCGGCGAGGAGATATTACCT-TGGGTGCAGG-TAT-A-ATG--GACA-AG--G-TA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGTTTAT--GGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAA-TG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTA-CTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTA-G--G-----A---------A-----A--------AT----------A--T--AG-G-GACTTTT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-A---G-GACA---AA-AAT----TA------A-ATAGTTTAGTAAT---TTTT-ACAC-GTGAGGCAT-TTT-CACCCAA-TGAAT--AAATCT-T--ATG---C--ATTATG-TT-------A-ATCTCATT-TG-CCAAT-G-TAAT-GCTTGTTTGC-AA-G-TG-CC-TGT-CTTAAG-AATTAT---AGT-ATT-TTATT--CATCTTTAATCAG-----AACTCC--GT--AA-CAT-----TTTAAAA--AT-AACCCAATA-A--TA--TG---AG-A--AT-ATGTGAT--T-CATTAA-GCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGA-CCAC--TTATGA-CCAGT-ATT---GA-C-TGGTTTTAA--CCATTA--TT-----GACCCAACCGGCCC-----GTCAATTAC-TAGTCATTGGGACC-GCTact
gi|3                          :                                AGGGTTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC--------------CG-G--T--T-TTAAC-TG-GTTTA-----T--AACCGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAT---G-GTCAATAGT---GGTC-AAT-ACT-----G-GTC-AATTGAAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTTTCCCA---AT-TTT----ATTAATAAATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAA-TCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TAT---ATTT-ATGAT-TC---A----TT--AAT-A-A-TA--AT--AAATCATTTAATTGCACCCCCA-GT-AT-GAACT--CTGACCTTTTCAAA-C-CTTC-TCAT--TTCT-AGCTG-AT---ATCC-CCTA-TTAT---AACTTTTT-AGT-----T--A-ATGGGCA-AC-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C-TG-AT---AGT------A-G-CA---C-----TTT-C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-T--AAG-TAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT--GACT-ACTTAT------GGT-AA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACTTATA-C-A-----T-GTA--CAT--G-AAAA-G-GGTTTAC---AGG-T-A-GA-------TAT-AGTTG-A-CATTT-GA-GAGA--C--A-AA-TAATT-T--CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAA------------T-----T-CAGCT-GAG-CAC-TG-T-AATCTAGTA---AATAAT-AA-TAA---CAG-G-T------TA-AAA--CAT-GT-TGCA--AAA-GAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GAG--------CAAG--A-TATTACTTTGGGGT-CAGG--AT-A-A-GATGACA-ATTTGTTA----AAGATTGAC------CAATCGGT-C-C--G--GAC-TGCATAATTTGTGT---G--TGTTATATG-TTAT--G--AAAAC-----TACCTCAC---CTGAGCTCACCAA-TG-TTG-ATCA---CACTCT---AG--------GTACCTGA-TCTGAGA-ACTCTT-CAAGTAT----------------ACTGTATGGAAAAAT-------AT-----GGGAAC---------T--TTCAAGTTTATA-G--G-----A---------A-----A--------ATATAAGAAAA-A--T--AG-G--AC--TT--GA--C-AC-----C-CTGCTCTTT----G-T-----T-GACA---AA-AAT----TA------ATAGAGTTTA-TTAT---TTT--ACA--A-GAAGCATGTTT-G-CCCAATTGAAT-AAA-TGTGT--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-GTTCA--A---GTTTGT-AACGTTGCCA-TGT-TT---G-AATTAC---AA--A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--GCTTCAAGTTTCAGCC--AATCATGTTGATC--AAATTAT-GACCTAATA-A--TAACTAGATAG-A--AT-A-ATGAGCTC-CATGGATA--TCTT-AGTCG--TTCACAGT
gi|4                          :                                                                                                                                                                                        CAATTGAAAAATTTT--AAA-TG---TCC-TTT--CCCA---AT-TTT----A------AATAT--ACA-TTTCATTGCAAA--AAAAAAAT-AG------ATTT-ATTAGTCTT-T---AAAAATCACGCT-TGTAATTA---AA--GC---TGT--TATTTATTGAT-CC---A--A-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAAT-ACACCAC-GTGTCATCGAACTT-CTA--CTTTTCAAAAG-CTCTCTTATC-TA---AGC-G-AT---ATCC-CCTATTTAT---AA--TTTTTAGTA----T--A-ATGGGCA-AT-TGT-TTC---AATG---C-AATA-C--G-AT---AGT-----AA-G-CAGCTT-----TT--C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAA-ATAT--AATATATT---------TGG--CTA-A-TT-AGACT-ACT-GT------G-TCAA--CA-T--ATCT---TC------A--GGT-------ACT-ATA-CCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-G-TT-AC---AGG-GTAGTA-------TA--GTTTG-A-CAAT--GA-GAGA--C--A-AA-TAATT----CTGC-TTATGAC-C--TG-A-CAAAAC-A-ACCAGCTA-GAGT-CAGCT-GAGGCA--TG-T-G--CTAGTA---A-TAAA-TA-TAAAC-TGGTG-T---------AAA--CAT-GT-GGCA--AAA-GAC--AGTTG-CTGCTATAAT----GGAG-------CACG--A-TATTACTT-GGG-T-C-GG-TAT-ACATG--GACA--GT-GTTAGTATA---TTAACAT-ACCCAA--GGT-CTCAGG--GATTGGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAC----TG--CAC-CCAA-TG-T-GGATCA---T----TCATAG--------GTACCTGAAT--GAATTACTCTT-CA---AT----------------AATGACTTGTATTGGAAAATATAT-----G---ACGACTTAAGTT--T--------ATA-G--A-----A---------ATATGAA--------ATA---------AA-T--AG-G-GAC--TTT-GA--C-AC-----C-C-GCTCTTC----T-T-ACGAG-GACA---AA--GT----TA------A--TAG---A-TAAT---TTTTTACA--GTG--GCAT-TTT-C-CCCAATTGAAC-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-GATTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---TGTTGT-AA-T-TG-CA-TATGTT--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCG--TT--AA-CAT-----TT--AAA--AT-AACCAAGTA-A--TA--TA---CGAA--AT-A-ATGA---C-CATTCA-A--TCTTCAATTG--ACCACAATCGA-CCAG-TATTGA---------------CAGT-A-T---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--AGCGGCCC----GGTCAA-TA--TATTTA-TGTGACC-GCTatt
gi|5                          :                                AGGGTTGGGCGAGTTTAAAACCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCGAG--T--T-TT-AC-CG-GTT-A-----TA-A-CCCC---CCAGGTCA---ATAA---CTCCAAAAT---G-GTCAATCGT-G-GCTC-AATGACT-----GCGT-CAATTGAAA---TTTA-AAAGTGTTTTCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--A---TTTCAT-GCAAA--AAATAATT-AGTAG---ATTT-AT-AGTCTTGCTC--AAAATCA-GCT-T-TATTTA-CAAA--GCAA-TGTTGTATTTATTGAGATC---A--ATTT--AAT-G-ATTATCAT--AA-TCATTTAATTACACCAC-A-GT-AT-GAAC-TTCTGACCTTTTCAAG----TC--TCATT-TTCT-AGC-----TGTATCC-CC--ATTACTATAAC-TTTTTAG------T--A-ATGGGCA-A-CTGTGTTC--CAATG---A-TATA-C----A---TAG------TA-G-CA---CTT---TT--C---AGAA-GACAAT--ACT-GC-AT-G--TTTAAGATATTAAA-ATA-TA------T-T----TCA-A-AT-TGA-T-ATAT-T------GGTCAACCCA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACT-ATA-CCAT----T-GTA--CATTAG-TAGG-A-GGTT-TC---AGG-TAG-TA-------TCA-GTTTG-A-CAAT--GA-GAAA--C--A-AAATAATT-CTGCTAC-TTAT-ACTC--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-AATT-CAGC--GAG-CACTTGTT-GATCT-GTA---AATAAATTA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAC--CA-TG--TGC---AAAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGAAG------CAAG-----ATTACTT-GGGGT-CAGG-TA--A-ATG--GACAGAGT-GTTA----C---TTAACATAACCCAA--GGTAC-CAGG--GAT-GG-A--ATT-GTGT---GGTTGTTAT-TG-TTCTTGA--AAAACA--T-C-CC-CAT--ACTA---ACACCAATTG-T-G-ATCA---T----T---AGTNNNNNNNNNNNNNNN-N--NNNN-NNNNNT-CA---GTCCA-------------A---------------------AT-----G---AC---------T--G--------ACA-GCAG-----A---------A-----A--------A-A---------A----------GAC--TT--GAAGA-AC-----T-CTGATCtttttgtcaaccctgg
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTTTTAGT-----TTGATATGGGCATACTCTT-TTA--CA-TGCTTACAATATC-TGGAT--T-TT-----TA-G-CA---C-----TT--TTCGAG-A-GACAAT--TCT-GTGAT-GGATTTAAGA-AT--AA-A-ATTAATGTATT-TGGGTTTAGA-TTGTGACTTACCTGTTGCTCGGGT--A--CA-T--ATCTACTTC------ATCG-TTAACATGATT-TTA-ACA-----TCGTA--CAT--GATTGA-GTGACT-AA---AGG-TTA-CAGTGTAGCTAT-CTTGA-A-CAAT--GA-GAGAAAC--AGAAATAATT-TC---GA-TAA--AC-C--TG-A-CAAAA--A-AC-AAATA-G--T-CAGCTAGAG-CAC--G-T-GAGCTAGTATCAAATAAA-TA-TAAACGTGG-GGT----GATATAAATGCGTTGT-TGTC--AAAAGACGTAGC-A-GA-TTA-CATTAGGGGGA-------CAAG--AG-ATTATAC-ATGGT-CA---------ATG--GATC-AGT-GTTA----AA--TTAACCT-ACCCA---GGT-C-TAGGCCGATTGGC-----T-GTGTTGCA--TGTCAT--G-TT-T--G--AAAACA--T-CACC-C--------A-CACACCAA-TGTT-G-ATCA---T----C---AG--------A----------------ACCTTT-CA---GT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--TA-------ATG-C--GCAAACA---------A-----A--------ATA---------A--A--AG-GCGAC--CTCAGA--C-AC-----C-CTGCTCTTTGCAAG-T-A---GTGACA---AAGAGTATACTA------A-ACAGTTTA-T-GTCTATTTT-AAATCGTGA-GCAG-TTTAC-CCCAACTGAACAAAAATCT-T--A-G---C--ATTATTCTT-------A-ATTTCATT-TGCC--ATAG-TGA------GTTAGT-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG-AAT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               taattaaaacctgtcctaatttatagaatattataataccctcgggttacgcgtatgaacttctacctttagagcattctcgtattttcttagggcaacctaattgcccattagtgaaaaatataatgtgataaTAT--AA-ATAT-A------T-TGG--CTA-A-TT-T-ACT-ACT-AT------GATCAA--CA-T--ATCT---TCTGAATCA--G-T-------ACT-ATA-CCA-----T-GTA--CAT--G-TAGA-G-GGTT-AC---AGG-TTA-GG-------TATAGTTTGGA-CAATATGA-GAGA--C--A-AAATAATT-T--CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-T-AC-AGCTA-GA-T-CACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTAGTA---AATAAA-TA-TAAAC-TGG-G-T----GATA-AAA-----TGT-TGC----AAAGAC--AGT-G-CT-CTA-AAT----GGAG-------CA----AATATTACTT-GGGGT-CAGGTTAT-A-ATG--GACA-AGT-GTTA----T---TAAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT--GCA--A----TGT---G--TGTTAT-TG-TTAT--G--AAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACCAATTG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTACCTGA-T--GAAT-A-CCTT-CA---AC----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTATG--G-----A---------A-----A--------ATA---------------AG-G-GAC--TT--GA----AC-----C-CTGCTCTTT----G-CGA---G-GACAATTAA-AAT----TA------A-ATAGTTTA-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-TTT-C-CCCAATTGAAT-AAAATCT-T--ATG---C--ATTAT--TT-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-G-TAA--G---TGTTGC-AA-G-TG-CA-TGT-TT--AG--ATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACT-C--AT---A-CAT-----TT--AAA--AT-AA-CCAATA-A--TA--T----AG-A--AT-A-ATGA---C-CATTAA-A--TC-TCAATTG--A-CACAATCGA-CCAG-TATTGG-CCAC--TAATGA-CCAGT-ATT---GA-C-CGGTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAG-TAT--TGACC-GCT
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ----GATA-AAA--CATTGTCTGCA--CAAAGAC--AGT-G-CT-TCA-AAT----G--A-------CAA-----TATTACTT-GGAGT-CGAG-TATCA-ATG--GA---AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACC-AA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTA-------GAACA--TTCACC-CAC--ACTG--CACACCAA--G-T-G-ATTAATATA---T---AG--------GTACCTG--T--GAA---CTCTT-CA---ATAATGACTTGTATGGAAA---------------------ATATAGGG---AC---------T--TCAAGTTT-ATA-G--G-----A---------A-----ATACTAGAAATA---------AATT--AG-G-GAC--TT--GC--C-AC-----C--TGCTCTTT----G-C-T---T-GACA---AA-AGT----TATTAATAA-ATAGTTTT-TA-T---TTTT-ACA--GTGAG-CAT-TC--C-CCCAATTGAAT-AAAATCT-T--AGA--------TAT--TT-------ATAT-TCATT-TG-C--AT-G-TAA--G------TGTGAA-G-TG-CAATGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G------ACTAC--ATTAAA-CAT-----TT---AA--CT-AACC--AT--A--TA--TA---GA-A--AT-A-ATGA---C-C-TT-A-A--TCTT------------CAATCGA-CCAG-TATTGA-------------------------------CGGTTTTAAC-CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCCC----GGTCAA-TAC-TAG-TATTAGGACC-GCTttttgccaacctgac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cGA-CCAG-TATTGA-CCACA-T--TGA-CC----G-T---GG-CGCGGTTATAAACCCGGTttttgccaaccctgc
gi|9                          :                                                                                                                                              aAC---G-GTCAATG---T-GGTC-AAT-ACT-----G-GTCCAAT-GAAA---TCTTAAAAGTG---TCC-TTTC-CCAA---AT-T------A------AATTA--ATCATTTCAT-GCAAACTAGATAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAATA--CA-GCT-T-TA-TTA-CAAC--GC-A-TGT---ATTT-ATGGT--C---A--A-TT--AATTG-A-TA--AT--AA-TCATTTAAT-A-ACCAC-A-GT-AT-GAACTCT-TGACCTTTTCAAA-G-CTCT-CAAT--TTCTGAGC-----TG-ACCTACCTAATTAT---AACTTTT--AGT--------A-ATGGGCA--CCTGT-TTCTGCAAT--------TA-C-TG-AT---AGTACATGTA-GGCA---C-----TTTTC---AG-A-GACAATATTCTTGC-AT-GT-TT-AAGATAT--AA-ATATTA------TGTGG--GTA-A-TT--GACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATCT----C------A--G-T-------ACT-ATAACCA-----T-GTATCCAT--G-TAGA-G-G----AC---AGG-TAAGTA-------TTA-GTTTG-AACAAT--GAAGAGA--C--A-AAATA----TT-CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-GA-T-CAGCT-GAG-CAC--G-TGGATCTAGTAC--AATAAA-TA-T-AAC-TGG-caatgaaatcttaaaagtgtcctttcccaaattaaattaatcatttcatgcaaactagataatagatttatagtcttttcaaatacagctttattacaacgcatgtatttatggtcaattaattgataataatcatttaataaccacagtatgaactcttgaccttttcaaagctctcaatttctgagctgacctacctaattataacttttagtaatgggcacctgtttctgcaattactgatagtacatgtaggcacttttcagagacaatattcttgcatgtttaagatataaatattatgtgggtaattgactacttgtggtcaacatatctcagtactataaccatgtatccatgtagaggacaggtaagtattagtttgaacaatgaagagacaaaatattctgcttatacctggacaaaataacagctagatcagctgagcacgtggatctagtacaataaatataactggtgtaa


blockSeqs                     :                                           A       C C   G .   G              A GT AA G     T  T   T TAAA          TCG        TTG    TCTT       TCTA T       GTAT  A  T   G   TCAGA C  CT        AAT   TA      TTT   T   TT    CGT  A   ATTAATA         TA   A TC   T     CT  G   TA   ATTA      C  T      TTCA     C   C   . G  A   G    TG  AG    TGTATTTAT    AT CAAATTA   .    TG  T  TC  .   A         T     C CA   C  T     TT   A          GA    TC    CA    G   GGATTG      A    A   CTAT   T    T   TTG      T       TACT   G  CTGC   GCTTAC    T TGATAGTACATGT      . G  GCTT       TTCG    A G      AT   T  G  . GA  T       TA  T      ATGTATT  G GT   G T  GT  C T   TA TGCTCG   C  CC  . .     ACTTCATCGTTAACATG          TA  A   T     C   TC   TA AT   C T G  T  .     A T CAGTGTAGCTAT       G A    AT  A    AA .  G  A     CTG     .    G  T .   G .     TAT   C     GGA  .     A   G  CTT T G         TCA      T  C     G   T G G       T   TG  TT  C   A     A   GT   T T  G   T   TAGG  GAGTGTCGGCGAGGAGAT       T     G    TT TC C   AT    G   T    GTATA          A      TC   A T    CC   TG   TA   T    TGCA        A  T    GGC        TT      T   A     AG        T  T T G    CACTCT        TNNNNNNN       ATCTGAGA        .  ATAATGACTTGTATGGAAAATATAGGGACTTCAAGTTTATAGGAAATACTAGAAATAAATT                                                                          T C   TT  CA  AGA   CCGGG T         GCAAGTAGT         ATT  GAGTATAC  TTAATA T        G A  CTA    T   TC    AG   G   A A           A       TCC    GGAC       TTTTTAGAC   T  T     A  C CA  A T   TGCTTGT     G  C T  C  A   G TTA  T      GAA   A T .   TTAA    T     CA CTTCA    TCAGCCA   T   GTTGA  TA   TTA A  C T    T GT  AC AGATAGA     A T    GCTC     A T CT    CAATTGGCAC         G    A      TCCACATTGACCCAGTATTGGGACC               AC      GG  TCCCA    CA        .         T   .   T  TTGG    .
blockSeqs                     :                                           .       A C   . .   G              . .  .  .     .  .   . TAA           .          .      T          T    .       GTTT  G  .   .   .     .  CC        .     A       C     .   T     .    .   ATAAA           .    . TT   T     .   A   AT   TAG       .  .      TTCA     A   .   . .  T   .    .   AA    TATTTAT      T  AAT       .    G   .  .   .   .         T     C GT   .  C     TT   A          AG    T     C     .   TGAT        .    T   TT     T    T   AT       .       GCC    .  TC     CA        . TGATTAGCT          . .  CTT        TTC     . .      .    .  .  . T   T       .   .      TG       G .    . .  T   C .   TA .        C  .   . .     TCTGAATCAGT                A   .   .     .   .    .  T    . . G  .  .     . T GGTATA             . .    T   .    .  .  .  A     TT      .    .  . .   G .     CA    .     GAG  .     .   .  CT  . .         C        .  .     .   . . G       .   .   TT  .   A     A   .    . .  .   .   .     AGCACGAT                 .     .    T  T  .   .     .   .    AAGA           .      .    . .    .    TG   .    .    GGT         .  .    TGA        T       .   A     A         T  . . .    ATATAT        .              AATGAATT        .  AGTATACTGTATGGAAAAATATGGGAACTTTCAAGTTTATAGGAAAATATAAGAAAAAT                                                                            . .   .   T   CC    .     .         TTACGAG           .    CAGC      .      .        . T  .      .   C     GG   .   . .           .       GT     CAA        TATC        .  C     .  . .   . .   TCAAT       .  . .  .  .   . T    .      .     . . .   TT      .     .  .        ACATTAA   .   .      .    A   .  C C    . .   .  TAGACC      . .    CT       A . .     CAATTGAC           .    .      CCACTTATGACCAGTATTGAC                   C       .   .        .         .         .   .   T  TTAG    .
blockSeqs                     :                                           .       C C   . .   G              . .  .  .     .  .   . TAA           .          .      T          C    .       GTG   G  .   .   .     .  C         .     .       .     .   T     .    .   A               .    . TT   .     .   A   TT   G         .  .      GCTC     A   .   . .  .   .    .   A     TCTTTT       T  AA        .    A   .  .   .   .         T     A A    .  .     CT   A          C     C     T     .   GAT         .    A   T      T    T   T        .       AC     .  CC     GC        . TGGATTTTT          . .  C          TC      . .      .    .  .  . T   T       .   .      T        G .    . .  A   C .   TG .        C  .   . .     TCAGGT                     A   .   .     .   .    .  A    . . G  .  .     . A GTATTA             . .    .   .    .  .  .  A     TC      .    .  . .   G .     TA    .     AAT  .     .   .  CT  . .         .        .  .     .   . . G       .   .   TT  .   A     A   .    . .  .   .   .     GACAAGAG                 .     .    T  T  .   .     .   .    AA             .      .    . .    .    G    .    .    G           .  .    G          T       .   A     A         .  . . .    TTCAT         .              ATGAAT          .  ATAATGACTTGTATTGGAAAATATATGACGACTTAAGTTTATAGAAATATGAAATAAAT                                                                            . .   .   .   C     .     .         GCTAG             .    AAT       .      .        . A  .      .   .     AG   .   . .           .       T      C          TCTT        .  C     .  . .   . .   AGT         .  . .  .  .   . A    .      .     . . .   T       .     .  .        CTGTA     .   .      .    A   .  C C    . .   .  AAGACT      . .    CG       A . .     CAATTAC            .    .      CCACTAATGACCAGTATTGAC                   .       .   .        .         .         .   .   .  TGT     .
blockSeqs                     :                                           .       C C   . .   G              . .  .  .     .  .   . TAA           .          .      T          T    .       GT    G  .   .   .     .  C         .     .       .     .   T     .    .   A               .    . TT   .     .   A   T    G         .  .      TTCA     A   .   . .  .   .    .   A     ATTTA        C  AA        .    G   .  .   .   .         .     A A    .  .     T    A          G     T     .     .   TGT         .    A   T      .    T   T        .       AT     .  AC     GC        . TGATAGT            . .  C          C       . .      .    .  .  . T   T       .   .      T        G .    . .  T   C .   TG .        C  .   . .     TCATT                      A   .   .     .   .    .  T    . . A  .  .     . T TATAT              . .    .   .    .  .  .  A     TT      .    .  . .   G .     TT    .     GA   .     .   .  CT  . .         .        .  .     .   . . G       .   .   T   .   C     A   .    . .  .   .   .     GCAAGAT                  .     .    T  T  .   .     .   .    A              .      .    . .    .    T    .    .    G           .  .    G          T       .   A     A         .  . . .    TT            .              NNNNNN          .  GTAATGACTTAATGCGCAAACAAAATAAA                                                                                                          . .   .   .   C     .     .         GCTAG             .    AAT       .      .        . T  .      .   .     G    .   . .           .       T      C          GTT         .  T     .  . .   . .   GTG         .  . .  .  .   . T    .      .     . . .   T       .     .  .        CCGTA     .   .      .    A   .  C T    . .   .  ACGAA       . .    TT       G . .     AGTCGTT            .    .      CCACATTGACCGTGGCG                       .       .   .        .         .         .   .   .  TT      .
blockSeqs                     :                                           .       A .   . .   .              . .  .  .     .  .   . TA            .          .      T          T    .       GT    G  .   .   .     .  C         .     .       .     .   C     .    .   A               .    . TT   .     .   A   T    .         .  .      AT       .   .   . .  .   .    .   A     ATTTA        .  A         .    G   .  .   .   .         .     A A    .  .     .    .          .     .     .     .   TG          .    .   T      .    .   T        .       AC     .  C      GA        . GATAGTA            . .  C          C       . .      .    .  .  . T   .       .   .      T        G .    . .  T   C .   G  .        C  .   . .     TCAGT                      T   .   .     .   .    .  T    . . G  .  .     . T GATAT              . .    .   .    .  .  .  A     T       .    .  . .   G .     TA    .     GA   .     .   .  T   . .         .        .  .     .   . . G       .   .   T   .   A     A   .    . .  .   .   .     AAGCAAG                  .     .    T  T  .   .     .   .    C              .      .    . .    .    G    .    .    G           .  .    G          T       .   .     .         .  . . .    TT            .              ATGAAT          .  AACTTATAGGATAATTATAGAAATAAT                                                                                                            . .   .   .   C     .     .         GCGAG             .    AAT       .      .        . A  .      .   .     G    .   . .           .       T      C          TT          .  T     .  . .   . .   GTG         .  . .  .  .   . T    .      .     . . .   T       .     .  .        CGTTA     .   .      .    A   .  C A    . .   .  GAGA        . .    C        C . .     CAATTGA            .    .      CAGTATGAC                               .       .   .        .         .         .   .               
blockSeqs                     :                                           .       . .   . .   .              . .  .  .     .  .   . TA            .          .      C          C    .       T     C  .   .   .     .  C         .     .       .     .   .     .    .   A               .    . .    .     .   .   T    .         .  .      T        .   .   . .  .   .    .   .                                                                                                                                                          .   .        .       CC     .  C      .         . ATAGT              . .  C          C       . .      .    .  .  . .   .       .   .      T        . .    . .  .   C .   T  .        .  .   . .     TCAGT                      A   .   .     .   .    .  T    . . .  .  .     . A GTATA              . .    .   .    .  .  .  .     T       .    .  . .   . .     A     .     G    .     .   .  C   . .         .        .  .     .   . . .       .   .   T   .   .     .   .    . .  .   .   .     AGCAAAT                  .     .    .  .  .   .     .   .    T              .      .    . .    .    G    .    .    G           .  .    G          T       .   .     .         .  . . .    TC            .              TGAA            .  TATTTATAGAAAAATATTAGGACGAAT                                                                                                            . .   .   .   C     .     .         CTAT              .    AGT       .      .        . A  .      .   .     G    .   . .           .       T      C          TT          .  C     .  . .   . .   AG          .  . .  .  .   . T    .      .     . . .   T       .     .  .        TATT      .   .      .    A   .  . C    . .   .  AGAA        . .    C        A . .     .                  .    .      CCA                                     .       .   .        .         .         .                   
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ACTAGTATTGACCGCTTTTTTGCCAACCCTG






Alignments
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               actatgacatcatggttggcattaaaaataccgccaactgagtttagaaaacctatcagatatttaactggttaataaacaccgcgccctggtcaatgccaaaaatggtcatacgtgcatactggtacatttgaaagtaaagtgtcctgtttccaatgtttaatacattgcatgcaaaaataatagaatttatagtctcctcaaaaaatagctcttacttacatcatatattagaatcaatttaagtacataatgcaaatttaattacatcccagtagtgaacttgctggacctttcaagcgctctcagcttctagcgtgatcccatgtctataactttttagtttgactaagggcaactgtttcaatggcaatacatgaggatagttaggcacacttattcagagacaattccgcatggggttaagatataatatattgatggcttaatggaatctatcaggtcaacagttgatctatcagacttaccagacattgtcacgaggggttacagtaggttattagtttgcaaatgaagacataaaataattatcctgctttataccagtggaccaaaataaacagatagatccagtgagcatgtgatctataaaacaatagtaaactgggtgtcagataaaacatgttgcatcaaaagacagtgatctaaatggaaccaagttcatatacttggggtacaggtataatggcaagtgttatataacattaccaagtcaggaatgcaattgttgttgttatgttatgaaaaacagtccacccaccaactgacacacaatgtgaccataggtacctgataatactcttccaataatgactggtttggaaagatataggg---------T--T--------TTA-GT-G-----A---------AT----A--------ATA---------A--TTAAGTG-GAC--TT--GA--CCACC-C-----TGCTCTTT----GCT-A---G-GACA---AACAGC----TA------G-TTAATTTG-TAAT---TTTT-ACA--GTGA-GCAT-AAT-C-CTAATTTAAAC-AGAATCT-TCCATG---CAAATTAT--T--TTTTAGACA-AT-TCACTATT-C--AT-TT--AATCA-----AT-TATTAA-G-TG--------TT--AGTATTTACGAAAGTAA-T-TTATTAACATC-ATAAT--G-----AACTTA--TT---A-CAA-----TA--AAA--ATAAACTTAAGGTACA--T---TA-GAC--C--ATAA-ATGA---CTTATAAA-A--TTTTCAATT---ACAATAATCGA-CCCG-TATTGATCCACAT-TGACCCAGTATTGGGACC------CGATTTTAA--CCAGTAGGTCTCCCAGACC--ACCGGCA--C----GGTCAA-TACTT-AGATATT-TGACCAGCTatatgtatgacacccgacttttgccaaccctgac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   atatattaggcactatcaagCCTT-CA--------------------------------------------T---------AT---------T--T--------ATA-G--A-----A---------A-----A--------ATATTAGGACGAA--T--AG-G-GAC--TT--GA--C-ACC-CGGGCCTGCACTTG----GCT-A---G-GACA---AA-A-----------------CAGTTTT-TTAT---TTTT-AAA--ATAAG-CAT-TTT-C-CCCAACTTAAC-ATAATCT-T--ATGGGAC--ATTAT--TATC-------A-ATTT---T-TG-C--AT-GT--A---A-----AG-TTGTGA-G-TG-CA-TGT-TA--AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G-----AACTCT--GT--AA-C-------TA--AAA--AT-AA-CCAA--TA-AGTTA--CA-AG---ACTAT-A-ATGA---CGGAATAA-A--TTTT------------CAATCGA-CTAT-TATTGA-CCA------------------------------GTTTTAA--CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCC--T----GGTCAA-TAC-T-ttttgcaacc
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         taggtcttttgataacttgtaaatataggaaAGGGCTGGGCG-GTTAAAA-CCGCC-CACCGGTTTTTTAACCAGCC-G--TAAT-TTAAC-CG-G--TT-A-TAA------CGCTCGTCTAGTCATTGACACTCTTCTCGAAATCTAG-GTCAATA-GTAT--GA-TCTAAT-ACT---T-C-AGAGATCTGGAAAA---TTT---AAGTG---ACCTTTTT-CTCGCGTATATTTATAAA------AATACTAATT-TTCCG--GCAAA--AAGCTA-TAAA--G---ATTT-
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        cGGGCTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-G--TT-A-TAA----C-CGC---CTCGGTTA---ATAC---TCTCAAAAT---G-GTCAATA-G--T--GG-TC-AAT-ACTG-GT-C-A---GT-TG--AAA---TTT--AAGGTG---GCC-TTTT-CCCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA---AG--ATTAATTA-AT-AGGTTT-AT-----ACTCT-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGGGTTGGGCG-GTTGAAAACCGCCGC-CCAG--TTGTAACCAGCG-GGTT--T-TTAACTCATG--TT-A-TAA----A-CTG---TCCGGTCA---AT-C---TCCCAAA------------------T--GG-TC--AT-AGTG-GT-C-A---AT-TG--AAA---TTT--AA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGGTTGGGT---TTAAA--CCGCC-C-CCGG--TTTTAACCAGCG-
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTTAACCAGCG-G--T--T-TTAAC-CG-G--TT-A-TAA----C-
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGGGTTGGGCG-GTTAAAACCCGCC-T-CCG----TTTA-CCAGCG-G--T--TGTTAAC-CG-C--TT-A---A----C-CGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAC---GTGTCAATA-G--TTTGG-TC-AAT--CTG-GT-CTA---AT-TG--AAA---TTT--AAAGTGC--TCC-TTT---CCA---AT-TTT----A------AATAC--ATT-TTTCATTGCAAA--AAATAA-T-AG--G---ATTTCAT-AATCTT-TTCAAAAGAGTA-GCT-T--A-TCAGCAAATGGC-AGTAT--TCTTT-TT-GAT-TCCAAATTA-TT--AAT-G-A-TA--AT--AA-TCATTTAATTACACCCC-A-GT-ATTGAACTTTCTGACCTTTTCAAA-GACTCT-TCATCATTCT-GGCGGATTG-ATCC-CCTAATTAT--TAACTTTTTTAGT-----T--A-ATGGGCAGCC-TGTTTTCA-AT-CA----AAT-A-C-T---GAT-TAGCT--A-------GCA---C-----TT--C---AG-AGGACAAT--TCT-GC-AT-GT-TTTAAGATAT--AA-ATATCA------T-T-G--CTA-ATTT-TGACT-ACTTAT------GG-CAA--CA-T--ATCT---TC------A--T-T-------ACT-AT-ACCA-----T-GTA--CAT--G-TAGACG-GGTT-AC---AGGACTA-T-ATAT-GT-------TTG-A-CAAT--G-AGAGA--A--A-AAA-AATT-TT-CTGC-TTAT-A--C--TGGA-CCAAAT-ATAC-AGCTAGGA-T-CACTT-GAG-CAC-TG-T-GATCTATTA---AATAAA-TACTAAAC-TCG-G-T----GATA-AAA--CATTGT-TGCA--AAAAGAC-----AG--T-GTCT-CCA-AATGGGAGTGTCGG-CGAGGAG---ATATTACCT-TGGGTGCAGG-TAT-A-ATG--GACA-AG--G-TA----A---TTAACAT-ACCCAA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TGTTTAT--GGCAAAACA--T-CACC-CAT--ACTGA-CACACAAA-TG-T-G-ATCA---T----T---AG--------GTA-CTGA-T--GAAT-ACCCTT-CA---AT----------------A---------------------AT-----G---AC---------T--T--------GTA-G--G-----A---------A-----A--------AT----------A--T--AG-G-GACTTTT--GA--C-ACC-C-----TGCTCTTT----G-T-A---G-GACA---AA-AAT----TA------A-ATAGTTTAGTAAT---TTTT-ACAC-GTGAGGCAT-TTT-CACCCAA-TGAAT--AAATCT-T--ATG---C--ATTATG-T--T-------A-ATCTCATT-TG-CCAAT-GT--A---ATGCTTGT-TTGCAA-G-TG-CC-TGT-CTTAAG-AATTAT---AGT-ATT-TTATT--CATCTTTAATCAG-----AACTCC--GT--AA-CAT-----TTTAAAA--AT-AACCCAA--TA-A--TA--TG-AG---A--AT-ATGTGAT--T-CATTAA-GCTTTTTCAATTGGCACCACAATCGAGCCAGATATTGA-CCACTTATGA-CCAGTATTGA---C------TGGTTTTAA--CCATTA--TT-----GACCCAACCGGCC--C-----GTCAATTAC-T-AGTCATTGGGACC-GCTt
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGGGTTGGGCG-GTTAAAACC-GCC-C-CC--------------CG-G--T--T-TTAAC-TG-G--TTTA-TAA----C-CGC---CCCGGTCA---ATAC---TCCCAAAAT---G-GTCAATA-G--T--GG-TC-AAT-ACTG-GT-C-A---AT-TG--AAA---TTT--AAAGTG---TCC-TTTTTCCCA---AT-TTT----ATTAATAAATAC--ATT-T--CAT-GCAAA--AA-TAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAAAA-TCA-GCT-T-TA-TTA-CAAA--GC-A-TAT---ATTTAT--GAT-TC---A----TT--AAT-A-A-TA--AT--AAATCATTTAATTGCACCCCCA-GT-AT-GAACT--CTGACCTTTTCAAA-C-CTTC-TCAT--TTCT-AGCTGAT---ATCC-CCTA-TTAT---AACTTTTT-AGT-----T--A-ATGGGCAAC--TG-TTTCA-AT-GC----AAT-A-C-T---GA--TAG-T--A-------GCA---C-----TTT-C---AG-A-GACAAT--TCT-GC-AT-GT-T--AAG-TAT--AA-ATATTA------T-TGG--CTA-A-TT--GACT-ACTTAT------GGT-AA--CA-T--ATCT---TC------A--G-T-------ACTTAT-AC-A-----T-GTA--CAT--G-AAAA-G-GGTTTAC---AGG-T-A-G-ATAT-AG-------TTG-A-CATTT-G-AGAGA--C--A-AA-TAATT-T--CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAA------------T-----T-CAGCT-GAG-CAC-TG-T-AATCTAGTA---AATAAT-AA-TAA---CAG-G-T------TA-AAA--CAT-GT-TGCA--AAA-GAC-----AG--T-G-CT-CTA-AATG--------AG-C---AAG---ATATTACTTTGGGGT-CAGG--AT-A-A-GATGACA-ATTTGTTA----AAGATTGAC------CAATCGGT-C-C--G--GAC-TGCATAATTTGTGT---G--TGTTATATG-TTAT--G--AAAAC-----TACCTCAC---CTGAGCTCACCAA-TG-TTG-ATCA---CACTCT---AG--------GTACCTGA-TCTGAGA-ACTCTT-CAAGTAT----------------ACTGTATGGAAAAAT-------AT-----GGGAAC---------T--TTCAAGTTTATA-G--G-----A---------A-----A--------ATATAAGAAAA-A--T--AG-G--AC--TT--GA--C-ACC-C-----TGCTCTTT----G-T-----T-GACA---AA-AAT----TA------ATAGAGTTTA-TTAT---TTT--ACA--A-GAAGCATGTTT-G-CCCAATTGAAT-AAA-TGTGT--ATG---C--ATTAT--T--T-------A-ATCTCATT-TG-C--AT-GTTCA---A-----GT-TTGTAACGTTGCCA-TGT-TT---G-AATTAC---AA--A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--GCTTCAAGTTTCAGCC--AATCATGTTGATC--AAATTAT-GACCTAA--TA-A--TAACTA-GATAGA--AT-A-ATGAGCTC-CATGGATA--TCTT-AGTCG--TTCACAGT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ----GATA-AAA--CATTGTCTGCA--CAAAGAC-----AG--T-G-CT-TCA-AATGA----------C---AA-----TATTACTT-GGAGT-CGAG-TATCA-ATG--GA---AGT-GTTA----A---TTAACAT-ACC-AA--GGT-C-CAGG--GAT-GGCA--ATT-GTGT---G--TGTTAT-TG-TTA-------GAACA--TTCACC-CAC--ACTG--CACACCAA--G-T-G-ATTAATATA---T---AG--------GTACCTG--T--GAA---CTCTT-CA---ATAATGACTTGTATGGAAA---------------------ATATAGGG---AC---------T--TCAAGTTT-ATA-G--G-----A---------A-----ATACTAGAAATA---------AATT--AG-G-GAC--TT--GC--C-ACC-------TGCTCTTT----G-C-T---T-GACA---AA-AGT----TATTAATAA-ATAGTTTT-TA-T---TTTT-ACA--GTGAG-CAT-TC--C-CCCAATTGAAT-AAAATCT-T--AGA--------TAT--T--T-------ATAT-TCATT-TG-C--AT-GT--A---A-----GT-GTG-AA-G-TG-CAATGT-T---AG-AATTAC---AGT-A-T-TTA-T--CATC-ATAAT--G------ACTAC--ATTAAA-CAT-----TT---AA--CT-AACC--A--T--A--TA--TA-GA---A--AT-A-ATGA---C-C-TT-A-A--TCTT------------CAATCGA-CCAG-TATTGA--------------------------------CGGTTTTAAC-CCAGTA--TT-----GACC--ACCGGCC--C----GGTCAA-TAC-T-AG-TATTAGGACC-GCTttttgccaacctgac
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cCAGGGTTGG---CAAAAAGCGGTCCTAATACTAGTA--TT-----GACC--G--GGCCGGT----GGTCAA-TAC-TGGGTTAttttgccaaccctgc
gi|9                          : cgataaaacattgtctgcacaaagacagtgcttcaaatgacaatattacttggagtcgagtatcaatggaagtgttaattaacataccaaggtccagggatggcaattgtgtgtgttattgttagaacattcacccacactgcacaccaagtgattaatatataggtacctgtgaactcttcaataatgacttgtatggaaaatatagggacttcaagtttataggaaatactagaaataaattagggacttgccacctgctctttgcttgacaaaagttattaataaatagtttttatttttacagtgagcattcccccaattgaataaaatcttagatatttatattcatttgcatgtaagtgtgaagtgcaatgttagaattacagtatttatcatcataatgactacattaaacatttaactaaccatatatagaaataatgaccttaatcttcaatcgaccagtattgacggtttAAC-CG-GGTTT-A-TAA----C-CGC---GCC----------------------AC---G-GTCAAT--G--T--GG-TC-AAT-ACTG-GT-C-C---AA-TG--AAA---TCTTAAAAGTG---TCC-TTTC-CCAA---AT-T------A------AATTA--ATCATTTCAT-GCAAACTAGATAA-T-AG------ATTT-AT-AGTCTT-TTCAAATA--CA-GCT-T-TA-TTA-CAAC--GC-A-TGT---ATTTATG-G---TC---A--A-TT--AATTG-A-TA--AT--AA-TCATTTAAT-A-ACCAC-A-GT-AT-GAACTCT-TGACCTTTTCAAA-G-CTCT-CAAT--TTCTGAGC----TG-ACCTACCTAATTAT---AACTTTT--AGT--------A-ATGGGCA-CC-TG-TTTC---T-GC----AATTA-C-T---GA--TAG-T--ACATGTAGGCA---C-----TTTTC---AG-A-GACAATATTCTTGC-AT-GT-TT-AAGATAT--AA-ATATTA------TGTGG--GTA-A--T-TGACT-ACTTGT------GGTCAA--CA-T--ATC----TC------A--G-T-------ACT-ATAACCA-----T-GTATCCAT--G-TAGA-G-G----AC---AGG-TAAGT-ATTA-GT-------TTGAA-CAAT--GAAGAGA--C--A-AAATA----TT-CTGC-TTAT-AC-C--TGGA-CAAAAT-A-AC-AGCTA-GA-T-CAGCT-GAG-CAC--G-TGGATCTAGTAC--AATAAA-TA-T-AAC-TGG-c
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): ACTAGTATTGACCGCTTTTTTGCCAACCCTG