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Reference ( gi|2 ) : ACTGATC-ACGCAGGCGTT--GTACACT--GACATCTT---AGTTTT--------CAC--TGTCA-------GCTTGGAGTTTGTCCACACTCT-G-TCG-TGAGGCGTGCGA----GTGTTGTTGCTGC---CTT-C---C-GAT----CCTCTTGT-CGACCTCAGTTGTCC-AAG-GAGA-GGTTGATC-G-TGCATGGTGGAACCAAGGTACGT-AAAGTGATG-GACGACAT-CA---AGTTCGTAGTTGTCAATGGTTAT-CA-TAGG-TGGAGCTG-T-TGTG-CTCTGTCCCAG-AACGTTGGTCTTCTTCAAACTGATGGTCTGTCCAAATGCATCGCAGGCCTGGGAGAACCTGTCCATCAGCGACT-GC--AGTTCCTGCTC--TGT-G-TGGGTGG-CAACT---GCAGCGTCGTCAGCAAACAGCATGTCTCTGACGAGGG-----GTTCCACGAACCT------TGGTCTTGGCTCTGAGGCGGGCGATGTTGAAGAG---CCTGCCATCTGTTCTTGTTCG---TAAGTAGATTCCTTCTG--------TTG-CTGT-ACCAAAGGCTTGCTTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTATTTCAAATGGCTCTGATGAACT---TCCATCGGACTGCA--CTGTTCCCTTCATGTTGGTGTGGAAGGAT-TCAATCAGGCTCTGCAGTTAT-GGTGGTCATTCG--ATC-TCTGAAAGGAT--CT--GG-AAGGGTCCATATGTGCGGACCAGGTCTAAAG---CATTTGTGAGGT-CGA-TAAAAG-C--GA-T-ATAGAGG---GGCATCTGTT-G-C-TCTCTGCACTTCTCTTGGAGTTGGC-GATTGG--AGAAG--ATCA--T-GT-C-----CAC-----TTTTGACCTTTCAG---CA--CGGA-ATC---CGC-ATTGCGACTC-AGGATAGATACGCCCTGCTAG-TTTCTGCAGGC-GGA-TC-AGGATGAC-TCGAGCA-AAGGCTTTGC-CAACGATGCTGAGGAGTGAGATG--CCTCT-------GTAGTTGTTGTAGTCGCTTCTC-T---CTCCC-TTGTTTTT-GTAGAGAGT-AATGATTTTCGCGTCCCTCATGTTCTG-TAGTACAG-----CTCAC--TCAAAC-CAGCATTT----ACAAAGAACATCGTGCAGAGGGTGG---AGGAGGG---AT----GTCTTGCAGTGC-T--TGACTAGGTCT--GGTGGTATTCCGTCGCTGCCTGGAGCTTTACCTGAGGCCAGGCTGTCAATGGCCTTGCTGGG
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gi|16 : tcctgcttgacatgtgtccataattcgttggaccgtacagaagcgtacaaacagatggtgcattcttggtacaatgacatcttgatagttgtgcaatgtgcatggtgtcagtttgaaacttttctacacacgggacgtaagatgacatattgttacagccttccctttgtaccgattgcatgatctcgacgtcgaggggcaggtcgtcgctgatggtggaaccaaggagcatgaaactggtgaacaacgtccacgcagtacgtatgtcgatggtgatgaccaggggactgtccatgttttggccagtgactttggtctttagtgagtccatagtctaccctgtccgtgagacactagcatagttgttcaatgtattatgtgaatgtaacatcatcagtaaagagcatgtccctCCGTCGAA--GCAAACGGTGCTTTTCATGTTAGTGTGAAATGAC-TTGATTATGTTAAGAAGCTCT-GGTGGACATCCA--ATCTTCTG-TAGCAT--CT--TG-AACAAGCCATCTCTGCTAACAAGGTCAAACG---CCTTCGTCAAGT-CGA-CGAAAG-CCAGG-T-ACAAAAGGTTGGC----GCT-G-C-TCTCTGCATTTTTCCTGGAGTTGTC-TCACAG--AGAAGATATTATTT-GT-C-----AAT-----AGTGAATCTTCCTG----ATTCTGA-AGC---CGC-ACTGTGACTCTGGGGTACATACGTTCAGCCA---TACTGCAaactcctccaatgatggctcgacatcgaggtccgtcatgtgcttcaattgcagaaacggtaccgacattctttcaagagtacagctttgagtagttctctatccatct
gi|13 : attatcccaaaaagtgctggagctagcacacagccctgttttataccactgagaatctggaaggcctcggatttctccA--CT-TTCCCTTCATGTTG-TGTAAAAGGATATCAATCAGGCTCTGCATTTTTTGGTGGGCATCCG--ATC-TGTGAGAGG-T--CTTTGC-AAGAGGTCATCTCTGCTGACCAGGTTCAAAGACCTATTGGTGAGGTTCGAATAAAAG-C--GA-C-GTAGAGG---G-CA-ATGTT-C-T-TCTATGCACTTCTCCTG-AGTTTGC-GAATGG--AGAAG--ATAA--T-GTAC-----CAT-----TGTTGACCTTTCAGGGACAA-CAGA-ATC---CGCCACTGCGACTC-AGTATAGATGCGTTCTGCTAGCTTTCTGCAGGCAGGATTC-AGGATGACTTCGAGCG-AAGGCTTTGCACAATTATGCTGAGGAGTAAGATG--CCT-T-------CTA--TGTTGGAGTCGCTTCTCTT---CTCCCTTTGTTTTG-TTAGAGAGTCAATGATTTT
gi|19 : ccccctcaaaaaAGGT-CTA-TAAAGA-C--TG-C-ATAAAGA---TTCATCTGCT-G-C-TCACTGCACTTTTCTTGAATTTGCC-GTACAG--TGAAT--ACCA--T-GT-CGGTGGTAC------TTCGGC----CAG---GT--CGGA-ATC---CAC-AATGTGCTTC-AGGttt
gi|15 : -CAA-TGAAGA-C--GA-G-ATAGAGT---GGT-TGTATCAG-C-TCATGGCACATCTCCTGAAGCTGTC---TCAGGAAGAAT--ATCA--T-GT-C-----GAC-----AGTCGACCATCCTG---CT--TGGA-AGC---CGA-ACTGCGTCTC-TGGGTAGATGCGTTCCGCGAG-TGACTT-------GT-TT-AATACCAC-ACGTGCG-AAGACCTTGC-CGACGATACTGAGCAGGGA------CCGTG-------GTAGTTATTGCAGTCACTGCGG-T---CTCCT-TTGTTTTT-GTACAGCAT-TGTGATGTTGGCGTCACACATGCCCTGTTAG-ACTGACC--CTTTC--TC---C-CAGCACTG----AAGCAGGAGTTCGTG--GA-GGTGGCCAAGAACAG---CTAGTCGTCTTTCCGCCC-TCATGACT---TCA--GGTGGGATGTCATCGCcaaattatcttcagcgatggtagcagtgagcctgttgaggagtattatggccagaatcatgattccagtgatggataacaaagatgttcttctgtagttgccggagtctgtcttggctcccttgttcttttatagacaatggtagcgt
gi|4 : GA-TAAAAG-C--GGGT-GTAGAGG---GGCATCTGTT-GCC-TCTCTGCACTTCTCCT-GAGTTGGC-GAATGG--AGAAG--ATCA--T-GT-C-----CAC-----TGTTGAC----------CA--CGGA-ATC---C------GCGACTC-AGGATAGATcacg
gi|9 : tctttcctgtctggcatatgtggtccatgcctcgctcccatacaacagatcacgcaggcgttgcacactgatgtcttggtcttcactgtaagcttggagtttgtccacactctggtcatgaggcatgcgagtgttgttgctgtcttcccgatcctcttgtcgacttcagtgtccaaggagaggttctcagtgatggtggagccaatgtacgtaaagtgatggacgaagtcaagtttgtagttgtcaatggttatcacaggtggagatgttgtgtcctgtcccagaacgttggtcttcttcaaactgatggtcagtctaaaagcattgcaggcctgggagaacctgtccatcagtgactgcagttcctgctatgtgtgggtggcgactgcagcggcgtcagcaaacagcatatctctgatgagggtgatgttgaagagcctgccacctgttcttgttcatattaagtagattccttctgttgctgacttgctgtaccaaatgcttgcttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntA-TAAATG-C--GA-T-GTAGAGG---GACACCCGCT-G-T-TCTCGGCAATTCTCCTGGAGCTGAC-GAACAG--AGAAA--ATCA--T-AT-C-----CAC-----TGTCGACTTCTTGG---CT--CTGA-AGC---CAC-ACTGCGACTC-TGGGTAGATGCGTTCGGCGAG-AACTTGCAGTC-T-A-TCGAGGACAAC-GCGCGCG-AAGACTTTAC-CCACAATGCTCAGTAAAGAGATT--CCCTT-------GTAGTTGTTACAGTCACTGCAG-T---CTCCA-TTGTTTTT-GTAGAGGGT-GATAATCTTGGCATCCCGCATATCCTG-GGGTAC-------CTTGCCTTCATTC-CAGCAGAG----ACACAGGATTTCATGAAGTGGTTCC---AAGAGGG---CT----GGCTTTCCACAT-T--TGAT--GATCTCAGGTGGAATGCTGTCTTCACCAGGTGCTCTGCCACAAACCAG
gi|23 : A-TAAAAG-C--GGGTGAT-GAGG---GGCATCTGTT-G-CCTCTCTGCACTTCTCCTG-AGTTGGC-GAT-GG--AGAAG--ATCA--T-GT-C-----CAC-----TGTTGACC-ATCAG---CA--CGGA-ATC---C------GCGACTC-AGGATAGATagcataggttgttttgccgatctcctccatagttggttcagagtctagctcttccagtacgggcagctcttggattgcgtctaa
gi|6 : TT-A-C-TCCTGGCACTTCTCTTG-------C-AACTG------------CA--T-GT-CT----CACAGAGAGGTGGATCTCCCTG---CT--CTGA-ATT---CGC-ACTGAGATTC-TGGATAAACTCGTGCTGTCGG-GATCTGTAGTC-GGG-CC-AAAATGAC-TCTTGCA-AAGAC--TGCTCAAC-------AGG---GAAATG--CCCCCGGGGCCGGTACCTGTTGCAGTCGCTACGG-T---CGCCT-TTGTTTTTAATAGAGAGT-AACTATCTTGGCACCACGCATATTATG-CGTCACAGAGCC-CTCCC--TCCAACACAG---------GCAGAGCAGTTCATGCAGGTCTTCA---ATCAGTG---CT-----TCTTTCCCTGCTT--TGGTCACCTCT--GGGGGTATGGCTTCCTCACCAGGGGCTTTGCCGTTGGCGAGACAGTCGATGGCCATGCCGA
gi|19 : gcttgttAGATGTTCTTCT-------GTAGTTGCCGGAGTC---TGTC-TTGGCTCCC-TTGTTCTT-TTATAGA-C-AATGGTttcctctgttgttggctcctcatctagttcgtccaaaataggcatgcagctgagtgatggcatcgagtgcagcatcggtcacgaccttctgtgtggagtagagctcaaggtatagtgctctctccacct
10 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TACATGGTGACAATTTAGCGCCCATGCGTCCATGCCTTGTGTACGTACCGAGCCAATCGCAAACGTCGCTGCAGAGCATGAGATGCATGGTGAGGGAACTCGTTTTTCCCTATGCACCTTCGCTGTGTGGTGACCCTGTCTTCGCACTGTATGTCAGGAGAATTCGTCGTAGACAGGCGAATGTGGATAAGCTTTCCCAGACGCGACGCGGATCGAAATTCTCCCTCTGTCCAGTGCTGTAGATGTTTTCCGGACTTCGCTCGCCGTACAGTAGCCCGCTACCATGAGTACGCTATTCACCGCCCTGTAGACTTTGCAGCTCTGGTATGCTACCAACCATGAACGAACGATGCTTAGTATCGTTAAACAACATACTGCACACCACACACGCTCACGACCAGTGAGGTCGGCAGCTTTGCCGCCGCACCGCTGCCCGCTTGCCGTCTGATTCTGTGCCAGACGTTGAAGAGTATTGCTGGGTGATGGTTCAAGCCCGCGAGGTAATGCTGAAGTGAAATCTGGACTGCCGCTCCTCGTTGTCAATCGCGAGTGCCTCGGTGGACGCGAGG
Unaligned ( gi|7 ): AATCACAACGCCCTATCTAGTAGGCCCTTTCCGCTCCTGGAGAACAGATGTTTGCGCCCTGTTTGATTTGGATTCAGATTCTTTGTTGAGCGCAGCGACGGGATCGTGACTCAGCAAGCCCGAATCCGTTGCAGCAGTCGGTCTACCTCCGCTTTACGGCGTTAAACGATCACACGTGCTTTGCACTGTTGGGTTTTGCTGCTTGGGTTCCTGCCTGCCTCTCTTTTCCGCCTTGCTCTTCGCTCCCTCAAACGGTATCATGTAATTTCTCTCTTTCATCCCACGCTTGCTTGACACCCCTCCCTCACCGCATAATATCTTCCAAAGCCACTGAGCGTTGTCGACAGGAGCCGACTTACCAGGTGTTATAGTTGTTTAGATCGTTTATTAAATTTTACATGTCCTCGCCTTGCCAAATCACATCCCTTCGAAAACGCATAGAGCTGGACGGGCCTCGTTGGTCAACGTCCACGGAACGCTAGCTCACCATACATGTATAGTCTTTGGTA
Unaligned ( gi|11 ): AATACAACCTCCGCTAGTAGCATCCTTCTGTCTCGGCGAGCGCATGGTTTGCGCCCATGTGGTGATTCGACCCATCATCTTGTTAGAAAGAGCAGCGACGGTTACTGAGACTCAGAGCCGATCCTTGCAATGCAGTCTCTATCCGCAGCAGTTGACGCTCACGATGTTTGCTTGTGGTTTTGTGACTTGATTCTTCGCCTCTCTTTGCCGCCTCTCCTCCTCTCTTCCTCAAACGTTTGCTTTATGCTTACTTTTCCTTCCCAAAAAACCTTCTGACTCCCTCCCTTCCAGGCCGATATCTCCACCACTGCAGGTTGTCAGCGAGCGATTCCCAGGTATTAGAGTTGATGTTTATCAATTCCATGTCTCGCTTGCAGACATCCCTGAAACGCAAAGCTGGACGGTTGGTTGGTCAACGTCCAGAAGTTAGCCCACCATACATGATGTCTTTGGGT
Unaligned ( gi|14 ): CCAGCACGCCATACAGAGTGTCTTTGGGAATTCGGCCATCCTGCATGCGTATAACGTGCCCGAGCCAGCGTAGTCGTCTCTAGGAAAAGAGGGCGAACATGCTTGGGATTTTCGCTCTGGCAAGCAAGTTGGGGGCACGGTACTGCCAGGTGATGTCCAGGATCCTTATGGGACTGCGCAAGTGGAAGTCATCCAGTCTGCCTTCTTGGTGGTGTAGAAAGTCCATGACTCGCTGCTGTAGAGGAAAGTGCTTAGAACAAAGGCCTGGTATACTCTCATTTTGTGTTGGTAGTCAGCATTATTGTGTATTGTTTATCAAAATCTATGTCTCAATCAAGCAAAGAATGAAAACGCTGAATGCACTTCCACTGTTGGGTGATGCAGATAATTC
Unaligned ( gi|17 ): ACGCCCACTCGTCCAGCAAATCCTGTGTACCGTGACCGAGCCAATCGCAAAAAGACTCGCTGCAGAGCAATGAGATGCCATGCGAGGAACTCCTTTCAGCACCCTCGTTTGGTGACCCTTCCTCGCCACTTGATTCGAGAATTCGTCGTAGACAGCGAAATTGGAAGCTTTTCAGACGCTTCCTCTTAGTCTGCGTATGTCTGTCCAGGATCTCGCTCCGTACGAGTAGGCTATCTGAGTACGACTTACGCCTGCTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAGTTGCTTGTTGTCCCACTCTCTTGCTCAGCTGTGCCCGACCTGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GTGATCCTTGCCTGGCAGTCTCTCACCGCAGTTGACGCACACGTAGTTTTTGACTGGGTTAATTAGTGCTTGGTTCTGGCTGCCTGCTCCTTTCTCCGCCCTTGTCTCCTCAAACCGATTCTTCTTCTTTCCTCCTCTCTTGAGCTCCCTCCCCTCATCCCATAATTCTCCAGCCAGCTGCGGTCGTCCACGAGCGATTCCCAGGTGTTGTAGTTCTTGTCTATCAAATCTTCATGTCTCCTTGAAACATCCCTGAAAACGCAGAGCTGGAACGGACCGGTGGTCCGACGTCCAGGAAGCTAGCTCACCCTACATATATGATGTTCTTTTGGGTTGG
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Unaligned ( gi|24 ): ACAGTCTCTTCACCTTAGTGACAGCCTGCAGGCGCTGGGGTTGAACAACCTGATTTTAGACCTGTACATAACTGAAATCCCGTCGTTGCA
Alignments
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gi|9 : actgagtacgccgtcaggtagactttgagtttggtgttcaagtcaagtgattgcttgtttgtcacatctcttgctcaattgtgccaatgaaatcgcggcacgctttgggcgatgctgtctaattctgtgtcggaagtgagaaggttgctggtgatggttgagcccaagtatgtgaagtgatctgagacttctagctcctcgttgtcaatgataattgctggtggagaggggacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-TA-AATGC--GA-TGTA--GAG-G---G--ACACCCGCTG-T-TCTCGGCAATTCTCCTGGAGCTGACGAACAGAGAAA--ATCA--TAT-C-CACTG-----TCGACTTC--TTGG---CT-CTGA-AG---CCAC-ACTGCGACTC-TGGGTAGA-TGCGTTCGGCGA--G-AACT--TGCAGTC-T-A-TCGAGGACAAC-GCGCGCGAAGACTTTA---C-CCACAATGCTCAGTAAAGAGATT--CCCTT-------G-TAGTTGTTACAGTCACTGC-AGTCTCCA-TTGT--TTTT-GTAGAGG---GT-GATAATCTTGGCATCCCGCATATCCTGGGGTACCTTGCCTTCATT----CCAGCA----GAGACACAGGATTTCATGAAGTGGTTCCAAGAGGGCT----GGCTTT-CCACAT-T--TGAT--GATCTCAGGTGGAATGCTGTCTTCACCAGGTGCTCTGCCACAAACCAGAGCATAGGTTGTTTTGCCGA
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-274 ) : ACTGANCACGCGGGCGTC-GGTACACT--GACGTCTTGGTN-TT----------CAC--TGTCA-------GCTTGGAGTTTGTCCACACTCTG-T-CG-TNAGGCGTGCCAGTGTTGTTGCTGC---CTTC---C-GATNCTCTTGT--CGANT--------TCGGT-GTCC-AAG-GAGA-GGTTGCTC-G-TG-ATGGTGGAGCCAAGGTACGT-AAAGTGAT-GGACGACGT-CA---AGTTCGTAGTTGTCGATGGTTATCG--CAGGTGGA-GCTGT-T-G-TGTCCT-GTCCCAG-AACGTTGGTCTTCTTCAAACTGATGGTCAGTCC-A-AA-GCATCGCAGGCCTGGGAGAACCTGTCCATCAGCGACT-GC--AGTTCCTGCTATGT-----GTGGGTG-GCGACTGCAGCGTCGTCAGCAAACAGCATNTCCCTGACGAGGG--CT-T---GCGGACCT-TGGTCTTNGCTCTNA--NGCGGGCGA--GGTTGAA--GAG---CCTGC-CACCCG-TTC---------TTGTGCG---TAAGTG-GACTCCTTCCG-TG-------G--CTGT-ACCAA--ATGCNTGCTTCAA-CAGTAGAGAGAATAATATNCCAAGGAGNG-TGGACGCCAGNACNCA-CCCNGCTTTATACCACTGAG-ATNTCGAATGGCTCCGACGA--ACT-T-TCCGTCGNACCGNACGGTTCCCTTCATGTTGGCGTGGAAGGAC-TCGATCAGGCTNTGCAGTTNT-GGTGGNCATCCG--ATCTTCGGGAGGAT--CT--GG-AANAGNCCATCTCTGCTGACCAGGTCNAAAG--C-T--TCGTGAGGT-CGA-TAAAAG-C--GG-CGTA--GAG-G---G--GCATCTGCTG-C-TCTCTGCACTTCTCCTGGAGTTGGCGAACGGAGAAG--ATCA--T-GT-C-CACNG-----TCGACCTT--CCNG---CT-CGGA-ATC---CGC-ACTGCGACTC-NGGATAGA-TGCGTTCNGCNA--G-TNNC--TGCAGNC-GGA-TC-AGGACGAC-TCGNGCGAAGACTTTG---C-CAACGATGCTGAGNAGGGAGATG--CCCCT-------GTAGTTGTTGCAGTCGCTNC-NGTCTCCC-TTGT--TTTT-GTAGAGA---GT-AACGATCTTGGCGTCNCGCATGTTCTGCGGCACNGAGCCCTCNCTC--ACCAGCA----CNGACANAGNANTTCGTGCAGNGGNTCNAGGAGGGCT----GTCTTTCC-GCGC-T--TGATCAGATCT--GGTGGNATGCCGTCNCCGCCAGGNGCTTTGCCGCAGGCGAGGCCGTCGATGGCCTTGCCGAG
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9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TACATGGTGACAATTTAGCGCCCATGCGTCCATGCCTTGTGTACGTACCGAGCCAATCGCAAACGTCGCTGCAGAGCATGAGATGCATGGTGAGGGAACTCGTTTTTCCCTATGCACCTTCGCTGTGTGGTGACCCTGTCTTCGCACTGTATGTCAGGAGAATTCGTCGTAGACAGGCGAATGTGGATAAGCTTTCCCAGACGCGACGCGGATCGAAATTCTCCCTCTGTCCAGTGCTGTAGATGTTTTCCGGACTTCGCTCGCCGTACAGTAGCCCGCTACCATGAGTACGCTATTCACCGCCCTGTAGACTTTGCAGCTCTGGTATGCTACCAACCATGAACGAACGATGCTTAGTATCGTTAAACAACATACTGCACACCACACACGCTCACGACCAGTGAGGTCGGCAGCTTTGCCGCCGCACCGCTGCCCGCTTGCCGTCTGATTCTGTGCCAGACGTTGAAGAGTATTGCTGGGTGATGGTTCAAGCCCGCGAGGTAATGCTGAAGTGAAATCTGGACTGCCGCTCCTCGTTGTCAATCGCGAGTGCCTCGGTGGACGCGAGG
Unaligned ( gi|7 ): AATCACAACGCCCTATCTAGTAGGCCCTTTCCGCTCCTGGAGAACAGATGTTTGCGCCCTGTTTGATTTGGATTCAGATTCTTTGTTGAGCGCAGCGACGGGATCGTGACTCAGCAAGCCCGAATCCGTTGCAGCAGTCGGTCTACCTCCGCTTTACGGCGTTAAACGATCACACGTGCTTTGCACTGTTGGGTTTTGCTGCTTGGGTTCCTGCCTGCCTCTCTTTTCCGCCTTGCTCTTCGCTCCCTCAAACGGTATCATGTAATTTCTCTCTTTCATCCCACGCTTGCTTGACACCCCTCCCTCACCGCATAATATCTTCCAAAGCCACTGAGCGTTGTCGACAGGAGCCGACTTACCAGGTGTTATAGTTGTTTAGATCGTTTATTAAATTTTACATGTCCTCGCCTTGCCAAATCACATCCCTTCGAAAACGCATAGAGCTGGACGGGCCTCGTTGGTCAACGTCCACGGAACGCTAGCTCACCATACATGTATAGTCTTTGGTA
Unaligned ( gi|11 ): AATACAACCTCCGCTAGTAGCATCCTTCTGTCTCGGCGAGCGCATGGTTTGCGCCCATGTGGTGATTCGACCCATCATCTTGTTAGAAAGAGCAGCGACGGTTACTGAGACTCAGAGCCGATCCTTGCAATGCAGTCTCTATCCGCAGCAGTTGACGCTCACGATGTTTGCTTGTGGTTTTGTGACTTGATTCTTCGCCTCTCTTTGCCGCCTCTCCTCCTCTCTTCCTCAAACGTTTGCTTTATGCTTACTTTTCCTTCCCAAAAAACCTTCTGACTCCCTCCCTTCCAGGCCGATATCTCCACCACTGCAGGTTGTCAGCGAGCGATTCCCAGGTATTAGAGTTGATGTTTATCAATTCCATGTCTCGCTTGCAGACATCCCTGAAACGCAAAGCTGGACGGTTGGTTGGTCAACGTCCAGAAGTTAGCCCACCATACATGATGTCTTTGGGT
Unaligned ( gi|14 ): CCAGCACGCCATACAGAGTGTCTTTGGGAATTCGGCCATCCTGCATGCGTATAACGTGCCCGAGCCAGCGTAGTCGTCTCTAGGAAAAGAGGGCGAACATGCTTGGGATTTTCGCTCTGGCAAGCAAGTTGGGGGCACGGTACTGCCAGGTGATGTCCAGGATCCTTATGGGACTGCGCAAGTGGAAGTCATCCAGTCTGCCTTCTTGGTGGTGTAGAAAGTCCATGACTCGCTGCTGTAGAGGAAAGTGCTTAGAACAAAGGCCTGGTATACTCTCATTTTGTGTTGGTAGTCAGCATTATTGTGTATTGTTTATCAAAATCTATGTCTCAATCAAGCAAAGAATGAAAACGCTGAATGCACTTCCACTGTTGGGTGATGCAGATAATTC
Unaligned ( gi|17 ): ACGCCCACTCGTCCAGCAAATCCTGTGTACCGTGACCGAGCCAATCGCAAAAAGACTCGCTGCAGAGCAATGAGATGCCATGCGAGGAACTCCTTTCAGCACCCTCGTTTGGTGACCCTTCCTCGCCACTTGATTCGAGAATTCGTCGTAGACAGCGAAATTGGAAGCTTTTCAGACGCTTCCTCTTAGTCTGCGTATGTCTGTCCAGGATCTCGCTCCGTACGAGTAGGCTATCTGAGTACGACTTACGCCTGCTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAGTTGCTTGTTGTCCCACTCTCTTGCTCAGCTGTGCCCGACCTGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GTGATCCTTGCCTGGCAGTCTCTCACCGCAGTTGACGCACACGTAGTTTTTGACTGGGTTAATTAGTGCTTGGTTCTGGCTGCCTGCTCCTTTCTCCGCCCTTGTCTCCTCAAACCGATTCTTCTTCTTTCCTCCTCTCTTGAGCTCCCTCCCCTCATCCCATAATTCTCCAGCCAGCTGCGGTCGTCCACGAGCGATTCCCAGGTGTTGTAGTTCTTGTCTATCAAATCTTCATGTCTCCTTGAAACATCCCTGAAAACGCAGAGCTGGAACGGACCGGTGGTCCGACGTCCAGGAAGCTAGCTCACCCTACATATATGATGTTCTTTTGGGTTGG
Unaligned ( gi|20 ): TTACCGCCTATGGCTCTTCTATCAATCTCAAAACCTATTCTGGCCTGCTTCTCCTCACCTGTCCTTGAACCACACTCTCCGCTCACCGCAATAACTCTCCCAGTCCACTTGCGGTATTGACAGCGAGCGAATCCACAGGTGTATAGTGGTTGAGGTTTATCAATTAATCAGTGTTCTCGCTTGACAGAACAGTAAACCCTAGATAAAACGCAACGAGCTAG
Unaligned ( gi|21 ): AGTTGGTAACCTTGTTCTTCCAGGTGAGGCCCAAGATCCTTTGCAGACACCACATGTGAAACACATTAAGCCTAGTCTCTTCTCTACCCCGGTAGCATATGTCGTACATGTTTCGCTTCCATATAGCATAGTGCTAAGAACGCAGGCATAATAGACCTTAAGATTTGTGTTTAG
Unaligned ( gi|24 ): ACAGTCTCTTCACCTTAGTGACAGCCTGCAGGCGCTGGGGTTGAACAACCTGATTTTAGACCTGTACATAACTGAAATCCCGTCGTTGCA
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Reference ( family-274 ) : ACTGANCACGCGGGCGTT--GTACACT--GACGTCTTGGTN-TT----------CAC--TGTCA-------GCTTGGAGTTTGTCCACACTCTG-T-CG-TNAGGCGTGCCAGTGTTGTTGCTGC---CTTCGGGC-GATNCTCTTGT--CGANT--------TCGGT-GTCC-AAG-GAGA-GGTTGCTC-G-TG-ATGGTGGAGCCAAGGTACGT-AAAGTGAT-GGACGACNT-CA---AGTTCGTAGTTGTCGATGGTTATCG--CAGGTGGA-GCTGT-T-G-TGTCCT-GTCCCAG-AACGTTGGTCTTCTTCAAACTGATGGTCAGTCC-A-AA-GCATCGCAGGCCTGGGAGAACCTGTCCATCAGCGACT-GC--AGTTCCTGCTATGT-----GTGGGTG-GCGACTGCAGCGTCGTCAGCAAACAGCATNTCCCTGACGAGGG--C-T-T---GCGGACCT-TGGTCTTNGCTCTNANGCGGGCG--A--GGTTGAA--GAG---CCTGC-CACCCG-TTC---------TTGTGCG---TAAGTG-GACTCCTTCCGTTG--GAC--GCTGT-ACCAA--ATGCNTGCTTCAACAGTAGAGAGAATAATATNCCAAGGAGNG-TGGACGCCAGNACNCA-CCCNGCTTTATACCACT-GAG-ATNTCGAATGGCTCCGACGA--ACT-T-TCCGTCGNACCGNACGGTTCCCTTCATGTTGGCGTGGAAGGAC-TCGATCAGGCTNTGCAGTTNT-GGTGGNCATCCG--ATCTTCGGGAGGAT--CT--GG-AANAGNCCATCTCTGCTGACCAGGTCNAAAG--C-T--TCGTGAGGT-CGA-TAAAAG-C--GG-CGTA--GAG-G---G--GCATCTGCTG-C-TCTCTGCACTTCTCCTGGAGTTGGCGAACGGAGAAG--ATCA--T-GT-C-CACNG-----TCGACCTT--CCNG---CT-CGGA-ATC---CGC-ACTGCGACTC-NGGATAGA-TGCGTTCNGCNA--G-TNNC--TGCAGNC-GGA-TC-AGGACGAC-TCGNGCGAAGACTTTG---C-CAACGATGCTGAGNAGGGAGATG--CCCCT-------G-TAGTTGTTGCAGTCGCTNC-NGTCTCCC-TTGT--TTTT-GTAGAGA---GT-AACGATCTTGGCGTCNCGCATGTTCTGCGGCACNGAGCCCTCNCTC---CCAGCA----CNGACANAGNANTTCGTGCAGNGGNTCNAGGAGGGCT----GTCTTT-CCGCGC-T--TGATCAGATCT--GGTGGNATGCCGTCNCCGCCAGGNGCTTTGCCGCAGGCGAGGCCGTCGATGGCCTTGCCGAG
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gi|1 : tcctgcttgacatgtgtccataattcgttggaccgtacagaagcgtacaaacagatggtgcattcttgGACG--A--GGCTAAA--GAG---TCGTC-CTTCCG-TAC---------TGGTGTG---TAGGTG-CACTCCCTC-ACTG--GAC--G---T-CCTAA--A-GCATGCTTCAACAGTAGAGAGAATAATATGCCAAGGAGGG-TGGACGCCAGGACTCA-CTCAGCTTTA----------G-ATGTCAAATGAATCCGAC----ACTGTGTCC-TTATACTGGACAGTTGCCTTCATATCGTCATGGAAGCAC-CTGATCAAGCAATGTAGTT-T-GGTGATAATCCGTGACTTTCAGGAGAATTGCT--GGCAACAGTC--TTTCGGCTG-----------------------TGAGGT-GGC-TAGGAGGC--TA-TGTT--GAA-A---G--CC-TCTGCT--------TGCACTTCACCTGTAGTTGACAGAGGCAGAAG--ATTA--TTGT-C-CATCG-----TTGAGCGT--TTTG---CT-CGAAGATAAGACG--ACTGGGATTC-TGGATAGA-TGCATTCGGTTA--G-CTGT--TGGAGGC-GCA-CA-AGGATGAG-GCGAGCATAAAGTTTG---C-CAACGATTTCCAGAAGGGAGATG--CCCCT-------G-TACTTTTTACAGTCGCTTC-TGTCAACC-CTGT--TCTT-GCCCAGG---GT-GACGATCTTGACATCTCACATGTTCTGCGGCAAGGATTCTTCT-TT---CAAGCATTTTCCGGCAGAGTGCGTCATGCGGTGGATGTGGGAGGG-T----GAATTTGCAGTGC-T--TGATCAGATCT--GGTGAAATGTCAT------------CTTT-CCACAGGTGAAGCTGTCAATAACCTTGCCGActaaagagtcgtccttccgtactggtgtgtaggtgcactccctcactggacgtcctaaagcatgcttcaacagtagagagaataatatgccaaggagggtggacgccaggactcactcagctttagatgtcaaatgaatccgacactgtgtccttatactggacagttgccttcatatcgtcatggaagcacctgatcaagcaatgtagtttggtgataatccgtgactttcaggagaattgctggcaacagtctttcggctgtgaggtggctaggaggctatgttgaaagcctctgcttgcacttcacctgtagttgacagaggcagaagattattgtccatcgttgagcgttttgctcgaagataagacgactgggattctggatagatgcattcggttagctgttggaggcgcacaaggatgaggcgagcataaagtttgccaacgatttccagaagggagatgcccctgtactttttacagtcgcttctgtcaaccctgttcttgcccagggtgacgatcttgacatctcacatgttctgcggcaaggattcttctttcaagcattttccggcagagtgcgtcatgcggtggatgtgggagggtgaatttgcagtgcttgatcagatctggtgaaatgtcatctttccacaggtgaagctgtcaataaccttgccgaactcctccaatgatggctcgacatcgaggtccgtcatgtgcttcaattgcagaaacggtaccgacattctttcaagagtacagctttgagtagttctctatccatct
gi|10 : tcctgcttgacatgtgtccataattcgttggaccgtacagaagcgtacaaacagatggtgcattcttggtacaatgacatcttgatagttgtgcaatgtgcatggtgtcagtttgaaacttttctacacacgggacgtaagatgacatattgttacagccttccctttgtaccgattgcatgatctcgacgtcgaggggcaggtcgtcgctgatggtggaaccaaggagcatgaaactggtgaacaacgtccacgcagtacgtatgtcgatggtgatgaccaggggactgtccatgttttggccagtgactttggtctttagtgagtccatagtctaccctgtccgtgagacactagcatagttgttcaatgtattatgtgaatgtaacatcatcagtaaagagcatgtccctCACGCGGGCGTT--GCACACT--GATGTCTTGG-C-TT----------CAC--TGTAA-------GCTTGGAGTTTGTCCACACTCTGGT-CA-TGAGGCATGCGAGTGTTGTTGCTGT---CTTC---C-CATCCTCTTGT--CGACT--------TCAGT-GTCC-AAG-GA-A-GGTT-CTCAG-TG-ACGGTGGAGCCAATGTACGT-AAAGTGAT-GGACGAAGT-CA---AGTTTGTAGTTGTCAATGGTTATCA--CAGGTGGA-GATGT-TTG-TGTCCTTGTCCC-G-AACGTTGGTCTTCTTCAAACTGATGGTCAGTCT-A-AA-GCATTGCAGGCCTGGGAGAACCTGTCCATCAG-GACT-GC--AGTTCCTGCTATGT-----GTGGGTG-GCGACTGCAGCGGCGTCAGCAAACAGCATATCTCTGATGAGGG--actcctccaatgatggctcgacatcgaggtccgtcatgtgcttcaattgcagaaacggtaccgacattctttcaagagtacagctttgagtagttctctatccatct
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gi|12 : cagatccacgcgggcgttgcacactgatgtcttggcttcactgtaagcttggagtttgtccacactctggtcatgaggcatgcgagtgttgttgctgtcttcccatcctcttgtcgacttcagtgtccaaggaaggttctcagtgacggtggagccaatgtacgtaaagtgatggacgaagtcaagtttgtagttgtcaatggttatcacaggtggagatgtttgtgtccttgtcccgaacgttggtcttcttcaaactgatggtcagtctaaagcattgcaggcctgggagaacctgtccatcaggactgcagttcctgctatgtgtgggtggcgactgcagcggcgtcagcaaacagcatatGTCA-------GCATGGTGTTGTTCCAAACCCTCCT-TG-TCAGGCGAGCCATTGCTGTTGCTGC---ATTC---CTGATGCGAGTAT--TGAGT--------CCGGT-GTCC-AGT-GAGA-GGTTACTG-G-AT-ATATTGGAGTCCAGGTAAGT-AAAATCCT----CCAC---CA---GGGT-GTGATCGCCGATGGATAT-G--CCGA-GGATGCTGC-T-GACGTCTC-GGGCCAT-GATGTTGGTTTTCTTGAGGCTTATTGTCTGTCC-ATAC-TCATCGCATGCGTGAGCAAAGCTATCGATGAGTCGTT-GT--AGCCCCCCCCCCCTCGAGAGTGGACA-GCCAGGGCAGCGTCATCTGCAAACAGCATCTCCCTGAGGAGGA--CCT-T---GCAGACTT-TGGTCCTAGCGCGCAGACGGGTC--A--GGTTGAA--GAGGCTCTTGT-CAC----TTC---------GTGTGTG---AATGTA-GACGCCGTC
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gi|22 : ATTTCACTTATGAGGGGAC-T-TAGTGCGGACCTCTGGTCTTTGTTCTCATCCACGCGCCA--CATAGAACCACG---CCTCCTCACCCACTTCAACTTGAAGTTGTG-G---CAAGTGAGACCCCTTCC--TG--GAC---CTGT-TCGAGTCATGCAAATTTCAACAGTAG
gi|23 : A-TAAAAG-C--GG--GTGATGAG-G---G--GCATCTGTTG-CCTCTCTGCACTTCTCCTG-AGTTGGCGA-TGGAGAAG--ATCA--T-GT-C-CACTG-----TTGACCAT---CAG---CA-CGGA-ATC---C------GCGACTC-AGGATAGA-T
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gi|6 : tctttcctgtctggcatatgtggtccatgcctcgctcccatacaacagatcacgcaggcgttgcacactgatgtcttggtcttcactgtaagcttggagtttgtccacactctggtcatgaggcatgcgagtgttgttgctgtcttcccgatcctcttgtcgacttcagtgtccaaggagaggttctcagtgatggtggagccaatgtacgtaaagtgatggacgaagtcaagtttgtagttgtcaatggttatcacaggtggagatgttgtgtcctgtcccagaacgttggtcttcttcaaactgatggtcagtctaaaagcattgcaggcctgggagaacctgtccatcagtgactgcagttcctgctatgtgtgggtggcgactgcagcggcgtcagcaaacagcatatctctgatgagggtgatgttgaagagcctgccacctgttcttgttcatattaagtagattccttctgttgctgacttgctgtaccaaatgcttgcttcaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntTA-C-TCCTGGCACTTCTCTTGCAACTG-----------------CA--T-GT-CTCACAGAGAGGTGGATCTC--CCTG---CT-CTGA-ATT---CGC-ACTGAGATTC-TGGATAAA-CTCGTGCTGTCG--G-GATC--TGTAGTC-GGG-CC-AAAATGAC-TCTTGCAAAGAC---------------TGCTCAACAGGGAAATG--CCCCCGGGGCCGG-TACCTGTTGCAGTCGCTAC-GGTCGCCT-TTGT--TTTTAATAGAGA---GT-AACTATCTTGGCACCACGCATATTATGCGTCACAGAGCCCTCCCT----CCAACA----CAGGCAGAGCAGTTCATGCAGGTCTTCAATCAGTGCT-----TCTTT-CCCTGCTT--TGGTCACCTCT--GGGGGTATGGCTTCCTCACCAGGGGCTTTGCCGTTGGCGAGACAGTCGATGGCCATGCCGAG
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gi|8 : CATTTCCCTTATGAGGA--C-TGT---GCGGACCT-TGGTCTTTGATCTCAGCCGTGCC--A--GATTGAA--CAG---CTTCC-TATCAC-TTC---------TGGTGTG---CAAGTG-AATCTCTTCCA-TG--GA----CTGT--TCGA--ATGCAAACTTCAACAGaggggacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncatttcccttatgaggactgtgcggaccttggtctttgatctcagccgtgccagattgaacagcttcctatcacttctggtgtgcaagtgaatctcttccatggactgttcgaatgcaaacttcaacag
gi|9 : actgagtacgccgtcaggtagactttgagtttggtgttcaagtcaagtgattgcttgtttgtcacatctcttgctcaattgtgccaatgaaatcgcggcacgctttgggcgatgctgtctaattctgtgtcggaagtgagaaggttgctggtgatggttgagcccaagtatgtgaagtgatctgagacttctagctcctcgttgtcaatgataattgctggtggagaggggacatcnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnA-TAAATG-C--GA-TGTA--GAG-G---G--ACACCCGCTG-T-TCTCGGCAATTCTCCTGGAGCTGACGAACAGAGAAA--ATCA--T-AT-C-CACTG-----TCGACTTC--TTGG---CT-CTGA-AGC---CAC-ACTGCGACTC-TGGGTAGA-TGCGTTCGGCGA--G-AACT--TGCAGTC-T-A-TCGAGGACAAC-GCGCGCGAAGACTTTA---C-CCACAATGCTCAGTAAAGAGATT--CCCTT-------G-TAGTTGTTACAGTCACTGC-AGTCTCCA-TTGT--TTTT-GTAGAGG---GT-GATAATCTTGGCATCCCGCATATCCTGGGGTACCTTGCCTTCA-TT---CCAGCA----GAGACACAGGATTTCATGAAGTGGTTCCAAGAGGGCT----GGCTTT-CCACAT-T--TGAT--GATCTCAGGTGGAATGCTGTCTTCACCAGGTGCTCTGCCACAAACCAGAGCATAGGTTGTTTTGCCGA
9 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|5 ): TACATGGTGACAATTTAGCGCCCATGCGTCCATGCCTTGTGTACGTACCGAGCCAATCGCAAACGTCGCTGCAGAGCATGAGATGCATGGTGAGGGAACTCGTTTTTCCCTATGCACCTTCGCTGTGTGGTGACCCTGTCTTCGCACTGTATGTCAGGAGAATTCGTCGTAGACAGGCGAATGTGGATAAGCTTTCCCAGACGCGACGCGGATCGAAATTCTCCCTCTGTCCAGTGCTGTAGATGTTTTCCGGACTTCGCTCGCCGTACAGTAGCCCGCTACCATGAGTACGCTATTCACCGCCCTGTAGACTTTGCAGCTCTGGTATGCTACCAACCATGAACGAACGATGCTTAGTATCGTTAAACAACATACTGCACACCACACACGCTCACGACCAGTGAGGTCGGCAGCTTTGCCGCCGCACCGCTGCCCGCTTGCCGTCTGATTCTGTGCCAGACGTTGAAGAGTATTGCTGGGTGATGGTTCAAGCCCGCGAGGTAATGCTGAAGTGAAATCTGGACTGCCGCTCCTCGTTGTCAATCGCGAGTGCCTCGGTGGACGCGAGG
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Unaligned ( gi|17 ): ACGCCCACTCGTCCAGCAAATCCTGTGTACCGTGACCGAGCCAATCGCAAAAAGACTCGCTGCAGAGCAATGAGATGCCATGCGAGGAACTCCTTTCAGCACCCTCGTTTGGTGACCCTTCCTCGCCACTTGATTCGAGAATTCGTCGTAGACAGCGAAATTGGAAGCTTTTCAGACGCTTCCTCTTAGTCTGCGTATGTCTGTCCAGGATCTCGCTCCGTACGAGTAGGCTATCTGAGTACGACTTACGCCTGCTAGACTTTGAGTTTGGTGTTCAAAGTGAGTTGCTTGTTGTCCCACTCTCTTGCTCAGCTGTGCCCGACCTGGCAGCTTTGGCGATGCGCTTAA
Unaligned ( gi|18 ): GTGATCCTTGCCTGGCAGTCTCTCACCGCAGTTGACGCACACGTAGTTTTTGACTGGGTTAATTAGTGCTTGGTTCTGGCTGCCTGCTCCTTTCTCCGCCCTTGTCTCCTCAAACCGATTCTTCTTCTTTCCTCCTCTCTTGAGCTCCCTCCCCTCATCCCATAATTCTCCAGCCAGCTGCGGTCGTCCACGAGCGATTCCCAGGTGTTGTAGTTCTTGTCTATCAAATCTTCATGTCTCCTTGAAACATCCCTGAAAACGCAGAGCTGGAACGGACCGGTGGTCCGACGTCCAGGAAGCTAGCTCACCCTACATATATGATGTTCTTTTGGGTTGG
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Unaligned ( gi|21 ): AGTTGGTAACCTTGTTCTTCCAGGTGAGGCCCAAGATCCTTTGCAGACACCACATGTGAAACACATTAAGCCTAGTCTCTTCTCTACCCCGGTAGCATATGTCGTACATGTTTCGCTTCCATATAGCATAGTGCTAAGAACGCAGGCATAATAGACCTTAAGATTTGTGTTTAG
Unaligned ( gi|24 ): ACAGTCTCTTCACCTTAGTGACAGCCTGCAGGCGCTGGGGTTGAACAACCTGATTTTAGACCTGTACATAACTGAAATCCCGTCGTTGCA