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Reference ( family-2735 ) : ACTGGCC--GATT----CTGA-GTT-GATT-CTN---TAGCAT---ACA-------A--C---AT-GGC-T--ATAC-CAG-AT---GG---A--G-CGG-AAT-A-C-----G-AAAG-CTT-T-TG-C-T-TTG-TAA-T---ATG--C-TT--ACTGTTCAGT-GCT--CAATTTA-TTT---TCCA--TT---TC----CTT--TTA-A-T----------T---C--AANT---T-TTTG-CTTGAA-A-T-A-A-TTCT-A-TATTT-ATC-TT---AA-TAC--AATT----GA---CA--AT----TT---A-A-TGTC-AATAA-CTA-TA-T-CG-A------TA--TTTTA-TGTACC-G-AA-ACA--------TA----C------CA-AAC-----T-C---CTG-G---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A--TGA--C-AGAC---C-TGTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--ATACA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GACG-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--TC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTC
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Reference ( family-2735 ) : ACTGGCC--GATT----CTGA-GTT-GATT-CTN---TAGCAT---ACA-------A--C---AT-GGC-T--ATAC-CAG-AT---GG---A--G-CGG-AAT-A-C-----G-AAAG-CTT-T-TG-C-T-TTG-TAA-T---ATG--C-TT--ACTGTTCAGT-GCT--CAATTTA-TTT---TCCA--TT---TC----CTT--TTAA-T---------TT---AANT---T-TTTG-CTTGAA-A-T-A-A-TTCT-A-TATTT-ATC-TT---AA-TAC--AATT----GA---CA--AT----TT---A-A-TGTC-AATAA-CTA-TA-T-CG-A------TA--TTTTA-TGTACC-G-AA-ACA--------TA----C------CA-AAC-----T-C---CTG-G---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A--TGA--C-AGAC---C-TGTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--ATACA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GACG-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--TC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTC
gi|1 : ACTGGCCCTGATTTCCTCTGA-GTT-GAAT-TTCAAATAGCATT--ACA-------AGAC---AT-GGC-T--A-AT-CAC-ACCTGGG---A--G-CGGGAAT-A-C-----GGAAAGTCTG-T-TG-C-T-TCT-TAAAT---ATGGCCATT--ACTGGCTA-----T--CAATTTAATTT---TCCGAGTT---TG----TTT--TTAA-TGTTCTAAGCTTCTAAACT---TATTTG-CTTAAA-AAT-ACA-TTCTTA-T-TTT-ATC-TG---AA-TAC--AATTG---GA---CA--ATGTAATTTG-A-A-TGTCTAATAATCTA-TA----G-A------TAT-TTTTA-GGTAGT-G-GACACAGTAATTTTTA----C------AA-AACCAGTGT-C---CTG-GTTGTCAGGTTG-A----T-T--TGTCAT-A-A-AATTGA--C-AGACG--C-TGTA-AATTA-T-CT-TCT----G---AAG-AAGTTAATACACT-GGTAACTT-AC----TATTTA---TTAT----A-T--A-T--GATGTT--TTA-CA-GAAT-AT-TCGAAAT-G-C--G-ATGA---TAGG-AA-TAAGCTTAGT--CGCCGAAT-AT--T-CGAA-ATA--TC-GATTTT------TT-GGTAGT--T-CG-TTTTA-AGCTC
gi|10 : catccagaa-------A--T---AT-GGC-G--A--C-CAG-CTC--AG---A--G-TGG-ACT-A-A-----T-AAAG-CCT-T-TG-T-G-TTG-TAA-T---ATG--C-TT--ACTGCTAAGT-GCA--AAATTT---TT---TCCA--TT---CCTTTTCTT--TTGA-T---------TT---AAAT---T-TTAG-TCTGAA-A-T-A-A-TAAT-A-TATTT--TC-TT---GA-AAC--AATTATT-GA---CA--AT----TT---A-A-TGTC-AACAG-----TA-T-C----------------CA-TGTACT-G-AA-ACA--------TAAATAC------CA-AAC-----T-C---CCT-G---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-T--CGA--C-AG--------GTA-AA-TA-A-TT-TAT----G---AGG-AA-A--ATACA-------------------A--CA---TT-TTAATA-T--A-T--GATG-T--CGA-T--AAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAA---TAGT--T-CCGGAT-AT--T--------------GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCt
gi|11 : cA-TGC--AATT-----A---CA--GT----CTCTCA-A-TG-C-AACCA-TT--TACT-CG-AGAAACATA--TCTTA-AGCACC-T-AC-ACA---------A----C------AG-AA-------------TG-G---------TG-A----T-T--T---AT-ATA-G--TGA--C-AGAC---C-TGTATAA-TA---TT-TAT----G---AAG-AA-C--CTACA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-C----A-TAAA-T--GATG-T--TGA-CG-GAAT-A--TCG-AAT-A-T--T-A--AAATTA-G-AATTAG---TATT--C-TCGAAT-ATTCT-CG-A-ATATTTC--A-TTTCCTCTGCT-AGTA-T--TCCA-TTCC--AGCTC
gi|12 : -CA-A------TA--TTTTA-TGTACC-G-AA-ACA--------TA----CATGTACCA-AAC-----T-C---CTG-T---------TG-A----T-T--TTT-AT-A-A-A--TGA--C-AGAC---C-TGTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---GGG-AA-T--ATACA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GTTG-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--CC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTCt
gi|13 : --C-TT--ACTGTTCAGT-GCT--CAATTTA-TTT----CCA--TT---T------TT--TTTA-T---------TC---AACT---T-CTTG-CTTGAA-A-T-A-A-TTCT-A-TATTC-ATC-TT---AA-CAT--AATT----GA---CA--AT----TA---A-A-TGTC-AATAA-CTA--G-T-CG-A------TA--TTTTA-TGTACT-G-AA-ATA--------TA----A------TA-AAC-----T-C---CTG-A---------TG-A----T-T--T---A
gi|14 : CTAGCC--GATT----TTGA-GTT-GATT-CTT---TGATAT---ATATA-----A--T---AT-GGC-T--A--C-CAGCAT---GC---A--G--GG-AGC-A-CCTTATG-AAAG-CTT-T-GG-C-T-TTG-TAA-T---ATG--C-TT--
gi|15 : gggtgttgcagtggtaccttaatttgtttttctagatctcgctgttttttcccctg-AAC-----T-CAGACTG-G---------TG-A----T-T------AT-A-A-A--TGA--CCAGACTGTC-GATA-AA-TA-T-TTCTAT----G---AAG-A--T--GTACA-T-G------T-AC----TA---A---TT-T----A-T--ATT--GATG-TTGTGA-C--GAACAAT-TCG-AAT-ACC--G-A--A---
gi|16 : --CA---TT-T----T-T--A-T--GACG-G--TGAAC--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G----A---TG-G-AA-TAGTA-TAGT--C-CCGAAT-ATA-T-CG-A-ATA--TT-GA-TCT------TTAGGTA-T--T-CGTTTTC--AGCTC
gi|17 : ---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CA-A-ATA--TC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CA-TTTC--AGCT
gi|18 : GAAT-AT--T-CG-A-ATA--TC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-
gi|19 : --ATGTA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GATG-T--TGA-C--GAcgc
gi|2 : ACTGAC---GATTT---CTGA-GTT-GATT-CTG---TAGCATT--ACA-------AT-C---ATTGGCCT--ATGCGCAG-CT---GG---AAGG-CGG-AAT-A-C-----G-AAAA-CCT-T-TGGC-G-TTG-TA--T---ATG--C-TT--ACTGTTCTGT-GCTGTCAATTT---TT---TCCA--TTGATTC----TTT--TTAT-T---------TTTGCAGTT---G-TTTGGCTTAAA-A-T-A-A-TTCT-AATATTTTATC-TT---AA-CAC--AATT----GA---CA--AT----TTT--A-A-TGTC-AATAA-ATAGTA-TTCG-A-------A--TTTTAGTGTACA-GGAA-ACA--------TAA---CG-----CA-AAC-----TGC---CTG-G---------TG-AGTGGT-T--T---AT-A-AGA--TGGG-C-AGAC---C-TCTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---AAG-AA-T--ATAAA-T-G------T-ACTGTATA--CA---TT-T----A-T--
gi|2 : aaa-A------TA--TTTTA-TGAA-----GA-ATA--------TA------------A-ATG-----T-A---CTGTA---------TACA----T-T--T---ATTC-A-A--TTA--C-ATAC----------AA-TACT-TT-TATTTTAGCATAAG-AA-T--G---A-T-T------T-GC--------CA---TT-T----A-T--A-T--GTAA-T--GAA-T--GAAT-AT-TCG-AATGA-CCGG-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGTGCC-CCGAAT-AT--TACG-A-ATA--TA-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTCtcaattacatacaatacttttattttagcataagaatgatttgccatttatatgtaatgaatgaatattcgaatgaccggaatagaatagtagtgccccgaatattacgaatatagatttttggtattcgtttcagctct
gi|3 : aaaactgacgatttctgagttgattctgtagcattacaatcattggcctatgcgcagctggaaggcggaatacgaaaacctttggcgttgtatatgcttactgttctgtgctgtcaattttttccattgattctttttatttttgcagttgtttggcttaaaataattctaatattttatcttaacacaattgacaattttaatgtcaataaatagtattcgaattttagtgtacaggaaacataacgcaaactgcctggtgagtggtttataagatgggcagacctctaaCTAGCC--GATT----TTGA-GTTTGATTTCTT---TAGTATTATACATTTTGTAA--C---AT-GGC-T--AT---CAG-GT---GG---A--G-CGG-GATTA-C-----G-AAAG-TTT-TCTG-C-T-TT--CAA-TTTGATGG-C-TTTAGCTGTT--AT-GCT--CAAATTA-TTT---TCAA--TT---TT----CTTATTTAAGTA--------TT---AAATACAG-TTTG-CTTGCATA-T-A-AATTCT-A-TATTT-ATTGTT---GA-------ATT----GAACACA--AT----TT---GTG-TGTC-AATA--CTC-TG---CG-A------TAGTTTTCA-TTTTAG-G-AA-ACA--------TAA---C------CA-AAC-----T-A---CTA-----------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A--TGA--C-AGACG--CATGGT-AA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--AAGC--T-G------TTAA----TA--CAGCTTT-T----A-T--A-T---ACG-T--TGA-C--GAAT-AT--CG-AAT-A-C--G-A------TA-GTGA-CAG---GAGTTTC-CGGAATTAT--T-CG-A-ATA--TT-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTCt
gi|4 : agggcggtgcagtgtctctatgtatattctccttctctccgttttttttttcttctgC--GATT-----TGA-CTT-GATT-CTT---TAGTAT---ATA-------A--C---TA-AGC-TTCAAACGCAG--T---GGCAGA--G-CG--ATT-A-C-----G-A--G-CTT----G-C-T-TTGTTAA-T---AT---C-TT--ACT-CTCTGT-GCT--CAAATTA-TTT---TCGA--TC---TC----TCT--TC---T---------TT---AAA----C-GTTG-TTTG-A-A-T-A-A-TTCT-A-TA-TT-ATT-TTC--AA-CAC--ATTT----GA---T------------------TGTC-AA-AA-CTA--G-T-CA-A-------A---TTTA-TTTACT----A-ACA--------TA----C------CA-AAC-----T------TGCG---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A---GACTC-AGAC---C--GTT-AA-TA-TATT-TAT----G---CAG-GA-T--ATATC-TCG------T-TC-----A--CA------T----ACT--A-T--GACG-C--T-A-C---AAT-ATCTCG-AAT-A-C--G-A--ACC-TA-G--A-T-G---TA-T--C-CCG-GC-AA--T-CG-A-ATA--TG-GA-ATT------TG-TGTG-TCAT-CG-TT
gi|5 : agggggcggttgcaatgtgttgggcctttgtgttctctctccgtttttttttatctgcagCC--GATT----CTGACGTT-GATT-CTA---TAGTAT---ACA-------A--CTACAG-GAT-T--ATAC-CAG-AT---GG---A--G-CGG-AAT-A-C-----G-AAAA-CTAAT-TG-CAT-TTG-CAAGT---ATG--C-TT--TATGTTCAGTTGCT--CAATT-A-TTT---TCAT--TT---TG----CTT--TTAA-T---------TT---AACTA--T-GTTG-CTTAAA-A-TTA-A-TTCT---CATTT-ATC-TA---AACTAC--AAT-----GA---TATTAT----TTT--A-ACTGTCCAAAAA-CCA-TA-T-CA-A-------A--TTTTAGTGTACCTG-AA-A-A--------TA----C------CATAAC-----T-C---CTG-G---------TT-T----TAT--T---AT-A-A-A--TGA--C-TAACGCCT-TGTA-CA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--ATACT-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GTTG-T--TGA-C--G-AT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---T-GT--C-CCGAAA-TT--T-CG-ATATA--TCTGA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTCAAAGCTC
gi|6 : agaaacgtACTGACC--GATT----CTGA-GTG-GATT-CTA---TATCAT---ACA-------A--C---AT-GGC-T--ATAC-CAG-ATT--GG---A--A-CGG-AAT-A-C-----G-AAAA-CTC-T-TG-C-T-TTG-TAA-T---ATG--C-TT--GCTGTTCAGT-GTT--CAATTTA-TTT---TCCA--TT---TC----CTT--TTAA-T---------TC---AAGT---T-TTTG-CTTAAA-A-C-A-A-TTCT-A-TATTT-AGC-TT---AA-TAC--AATT----GA---CA--AT----TT---A-A-TGTC-AATAA-CTA-TA-T-CG-A------TA--TTTTA-TGTACC-A-AA-ACA--------TA----C------CA-AAC-----T-C---CTG-G---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A--TGG--C-AGAC---T-TGTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--ATGCA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GATG-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-T--G-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--TC-GA-TTA------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTC
gi|7 : G-C-T-TTG-TAA-T---ATG--C-TC--ACTGTTTAGT-GCA--TAATTTA-TTT---TCCA--TT---TT----GTT--TTAA-C---------GT---AACT---T-TGCG-CCTGAA-A-T-A-A-TTAT-A-TATTT--TC-TT---AA-TTC--AATT----GA---CA--AT----TT---T-A-TGTC-AATAA-CTA-TA-T-CG-A------TA--CTATA-TGTAAC-G-AA-ACA--------TA----C------TA-GAC-----T-----------------------------------------A-A--TGA--C-AG--------GTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--ATAC-----------T-ACAAT-TG--CA------T----G-T--A-T--GACA-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---CAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--TT-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTT
gi|8 : ctctctccccgttttttgtttttgttttgtttgtttgggttttttttaacgatgacttccggaaactggccgccgattttgggttgaaatggctgggaCTGCCC--GATT----CTAA-GTT-GATT-TCT---TGGCAT---ACA-------A--C---AT-AGC-T--ATAC-CAG-AT---GGC--A--G-CG---AT-AAC-----G-AAAA-CTA-T-TG-C-T-TTG-TAG-T----TG--C-TT--ACTGTTCAGT-GCT--CAATTTA-TTT---TCCA--TT---TT----CTT--TTAA-T---------TT---AACT---T-TTT--CTCAAA-A-T-A-A-TTCT-A-TATTT-AT---T---AA--ACCAAATT----GA---TA--AT----TT-------TGTC-AATAA-CTA-TA-T-CA-A------TA--TTT-A-TGTACC-G-AA-ACA--------TA----C------CA-AAC-----TCC---CTG-T---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A--TGA--C-AGAC---C-TGTA-AA-T--T-TT-TAT----G---GGG-AA-T--ATACA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GTTG-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--TC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCT
gi|9 : agaat-CTG---TAACAT---A-----------------T-GGC-G--AGAC-CAG-CTC--AG---A--GATGG-ACT-A-A-----T-AAAG-CCT-T-TG-T-TGTTG-TAT-G---ATG--C-TT--ACTGCTAAGT-GCA--AAATTT--TTTCCATCCA--TT---GT----TCT--TTGA-TA--------TT---AAAT---T-TTAG-TCTGAA-A-T-A-A-TAAC-A-TAGTT-TTC-TTGTAAA-T-C--AATTATTCGA---CA--TG----TT---A-A-TGTC-AACAG-CTA-T----CGCA------TG--GTCTACTG-----G-AA-ACA--------TA----AGTA---CA-AAC-----T-C---CCT-G---------TG-A----T-TCTT---AT-A-A-T--CGA--C-AG--------GTA-A--TA-A-TT-TAT----G---AGGTAA-A--ATACA-T----------AC--------CA---TT-TTAA-A-T--A-TAAGATG-T---GA-TAAGAGT-AT-TCG-A-T-A-C--GTA--A---TA-G-AA-TAAA--TAGT--C-CGGAAT-------TG-A-AT----------TT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCT
blockSeqs : . TC C T T T TATACATTTTGTAAC T C TC TGCG CTC CAG AG A . T A CTTAT . . AA C G A G T G TTG G . TA A T GT A CCA . CCTTTTC AT G A TGC A ACAG G T . T . A . A TA G GTA CTA CA ATTC ACA TT . CTCA C C C . GTATT C GAAACATA G CAGG . . CATGTAC T . CAGA TA C GTGG A CT TT T T G . CT C A TGTCG T . CT C TTTA CAT T . . A CG T TGTAT . GCT . TAAT C AA T AA T . TG A AA A C . G C CG T . AAT . T T TA GC . T TC A . T TT T . CCTCTG A . CA C T AA
blockSeqs : . T . . . G ACAACTAC . . . AACG CAT C . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . A . . GATTCT . . A . C AT . . . . . . . . A . C AA . ATT . . . TA . . C . TACT . TAGT G CCTG . . AATAC . . GC CG . . . . . . . . . G . A GCCTT . . TA . . . . . . A G . AATT . . . TAA . . . . T . . . G . . . . . . . . CC . . . A TT . . A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . T ATATAAT . . . TAC ATT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . A . . TTC . . . . T T . . . . . . . . A . . TG . . . . . GT . . T . TAT . TA C CTG . . AGTA . . CC G . . . . . . . . . . . A GCAT . . A . . . . . . A G . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . T TACAATC . . . TAC CTC . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . A . . TCT . . . . A T . . . . . . . . A . . CA . . . . . TA . . T . TAT . TA . CCT . . ACG . . C G . . . . . . . . . . . A CT . . T . . . . . . A G . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . A ATAAC . . . TAC CT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . A . . TGC . . . . A G . . . . . . . . A . . CA . . . . . A . . T . TAT . TA . CCG . . AC . . C T . . . . . . . . . . . A CT . . T . . . . . . A G . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . A ACAAC . . . GAC GT . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . C . . A . . TCC . . . . C C . . . . . . . . A . . CA . . . . . A . . A . TAT . TA . CTG . . C . . C A . . . . . . . . . . . A CT . . T . . . . . . A G . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T ACAAC . . . C AT . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . T . . A . . TTG . . . . G T . . . . . . . . A . . TA . . . . . A . . T . TAT . TA . AGG . . A . . A G . . . . . . . . . . . A TT . . T . . . . . . A T . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G A . . . C AT . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . C . . . . . TTC . . . . C T . . . . . . . . T . . TT . . . . . T . . T . GT . TA . CCA . . C . . A G . . . . . . . . . . . A CT . . T . . . . . . C G . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A . . . . . GTT . . . . C T . . . . . . . . . . . A . . . . . A . . T . TG . TG . ACG . . C . . C G . . . . . . . . . . . A C . . T . . . . . . T G . T . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A T . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . GT . A . CCG . . C . . C G . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . A G . T . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . A . CT . . C . . C T . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A G . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . G . . C . . . G . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
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originalCons : ACTGGCC--GATT----CTGA-GTT-GATT-CTN---TAGCAT---ACA-------A--C---AT-GGC-T--ATAC-CAG-AT---GG---A--G-CGG-AAT-A-C-----G-AAAG-CTT-T-TG-C-T-TTG-TAA-T---ATG--C-TT--ACTGTTCAGT-GCT--CAATTTA-TTT---TCCA--TT---TC----CTT--TTAA-T---------TT---AANT---T-TTTG-CTTGAA-A-T-A-A-TTCT-A-TATTT-ATC-TT---AA-TAC--AATT----GA---CA--AT----TT---A-A-TGTC-AATAA-CTA-TA-T-CG-A------TA--TTTTA-TGTACC-G-AA-ACA--------TA----C------CA-AAC-----T-C---CTG-G---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A--TGA--C-AGAC---C-TGTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--ATACA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GACG-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--TC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTC
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Reference ( family-2735 ) : ACTGGCC--GATT----CTGA-GTT-GATT-CTN---TAGCAT---ACA-------A--C---AT-GGC-T--A----TAC-CAGN-T-G--G-A--G-CGG-AAT-A-C-----G-AAAG-CTT-T-TG-C-T-TTG-TAA-T---ATG--C-TT--ACTGTTCAGT-GCT--CAATTTA-TTT---TCCA--TT---TC----CTT--TTAA-T---------TT---AANT---T-TTTG-CTTGAA-A-T-A-A-TTCT-A-TATTT-ATC-TT---AA-TAC--AATT----GA---CA--AT----TT---A-A-TGTC-AATAA-CTA-TA-T-CG-A------TA--TTTTA-TGTACC-G-AA-ACA--------TA----C------CA-AAC-----T-C---CTG-G---------TG-A----T-T--T---AT-A-A-A--TGA--C-AGAC---C-TGTA-AA-TA-T-TT-TAT----G---AGG-AA-T--ATACA-T-G------T-AC----TA--CA---TT-T----A-T--A-T--GACG-T--TGA-C--GAAT-AT-TCG-AAT-A-C--G-A--A---TA-G-AA-TAG---TAGT--C-CCGAAT-AT--T-CG-A-ATA--TC-GA-TTT------TT-GGTA-T--T-CG-TTTC--AGCTC
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