lowQualScore : 111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 333333 11 111 1111 3 22 33333333333333333333333333333333333333333333 222222222222 111111111111111111111 11111111111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 1111111111111 11111111 111 1111111111111111 11111 22222222222222 1 3333333333333333333333333333333 11 1111 444444444444444444444444444444444444444444444444444 1111 222 666666 1 222 111111 1111 222222 111 111111 11 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111 22 4444444444 11 11111 11
lowQualScore : 5 11 55 3 3 88 7 3 3 8 222222 00 3 99999 77 3 000 77 3 3 9999 3 3 3 77 3 6 3 77 6 88 11111111111111111111111111111111111111111111 2 5 8 555 8 888 2 2 444 33 444444444444 5555 2 333333333333333333333 99999999999 5 8888 444 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5555 33 3333333333333 2 22222222 111 2 2 5 6666666666666666 2 444 11111 4444 5 55 2 55555555555555 5 2 2 2 1 55 2 0 444 5 2 2 2 1111111111111111111111111111111 1 44 2 2 5 33 0000 33 33 33 000000000000000000000000000000000000000000000000000 555 2 1 5 3 44 1111 3 3 88888 6 3 3 555 88 3 3 222 44444 666666 88 0 222 0 555555 66 4 4 9999 4 555555 222 4 4 4 111111 11 4 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 66 555555 4 6 777 55 7777 4 66 4 1111111111 4 9 99 33333 00 4 5
lowQualScore : . .. .. . . .. . . . . ...... .. . ..... .. . ... .. . . .... . . . .. . . . .. . .. ............................................ . . . ... . ... . . ... .. ............ .... . ..................... ........... . .... ... ............................................................................ .... .. ............. . ........ ... . . . ................ . ... ..... .... . .. . .............. . . . . . .. . . ... . . . . ............................... . .. . . . .. .... .. .. .. ................................................... ... . . . . .. .... . . ..... . . . ... .. . . ... ..... ...... .. . ... . ...... .. . . .... . ...... ... . . . ...... .. . ...................................................................................................................... .. ...... . . ... .. .... . .. . .......... . . .. ..... .. . .
lowQualScore : 0 55 00 6 6 66 3 6 6 2 222222 44 6 55555 99 6 777 99 3 1 7777 1 1 1 33 1 2 1 33 2 11 00000000000000000000000000000000000000000000 9 7 6 000 6 999 7 7 777 77 777777777777 1111 7 777777777777777777777 55555555555 7 9999 777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 7777 77 7777777777777 7 77777777 222 5 5 0 6666666666666666 2 444 22222 7777 0 99 5 11111111111111 0 5 5 5 2 11 5 3 444 0 5 5 5 2222222222222222222222222222222 7 88 9 9 9 99 0000 99 99 99 111111111111111111111111111111111111111111111111111 000 9 6 7 3 66 2222 3 3 33333 7 3 3 888 88 6 6 444 33333 555555 55 9 333 7 999999 11 4 4 2222 4 444444 222 4 4 4 222222 44 4 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 222222 0 4 000 55 7777 0 22 0 9999999999 0 4 66 33333 33 4 0
consensus : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT----GNTTTTT-TAT-TTG-AT-A-TTAT-TA-T-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CAT-GAGA-TG--TT-AGGTAAAATT--C--TAA--G----T----TT-G-------TA-AA-------G-A-AAA-T---C-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--A-A-AA------A-CCG-TT----T--GTACC--T--------TA-AA----A---A------------------------TAA-----------C-------AAA------T-------------T------CAA----T--A-----------C-AGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-C-A----------------CACGGAA---TGCA---C-AA---AC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-A-GC-AA-----GGTA----A-A---T---G-T-T-GACAGAGAAAC-GGA-C-AGGAC--AAA----G--AC--C--AT---A-----C---A--TGC--------A-----ATGCGCTT-------G--GG---AT-AAAAATA-T-G--AA--A-T-A-TG-----TC-TC-C-AAAGC---ACATG-TTAAA-T-A--AAC-ATA-TATATGT----CTTAA-TCA-TATTT--NAAGTT----TACATTTG--AA-TGA-GAA---GAAAA-AAT-N----AT---TT-A-CC-A--G---AGTTG-A-CGT-CG--GCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G---------------------GGGG-----------GGGTATT---------------GA----------TA--A----AAGT-GCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCGA-TAC-T---TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
Reference ( gi|3 ) : TGAA-AGGCGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT----CTTTTTT-TAT-TTG-AT-A-TTAT-TA-T-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CATTGAGA-TG--TT-AGCGAAAATT--C--TAA--G----T----TT-G-------TA-TA-------G-A-AAA-T---C-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--A-A-AA------A-CTG-TT----T--GTACC--T--------TA-AA----A---A------------------------TAA-----------C-------AAA------T-------------T------CAA----T--A-----------C-AGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-C-A----------------CACGGAA---TGCA---C-AA---AC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-A-GC-AA-----TGT-----A-A---T---G-T-TCAACAGAGAAAA-GGA-C-AAGAC--AAA----G--AC--C--AT---A-----C---A--TGC--------A-----GTGCC-------------GG---AT-AAAAATA-T-G--AA--A-T-A-TG-----TC-TC-C-AAAGC---ACATG-TTAAA-T-A--TAC-ATA-TATATGTTATTCTTAA-TCA-TATTT--CAAGTT----TACATTTG--AA-TGA-GAA---GAAAA-AAT-A----AT---TT-A-CC-A--G---AGTTT-A-CGTACG--GCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G---------------------GGGG-----------GGGTA-----------------GA----------TA--A----AGGT-GCCCAT---A--G-CA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACTGT-TAC-T---TTTA-TCAATT-AATAC-CGCT
gi|5 : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT----GTTTTTTATAT-TTG-GT-A-TT-T-TA-T-AAAA-AAT
gi|13 : TGAACAGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CTCGCCGTTT----GGTTTTT-TATATTG-AT-ATTTAT-TA-T-AACACAtgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactttgcatcgttagttatgagatgtttaggtaaatctaagttttgtaaaaaaatccaataatactcaagatttaaaaacgtttgtaccttaaataaaaataacaaatcaatacttttgtcacatggaatgcaacaaaccaataatagggaagccctttcgctcactttccgagcaactgtaaatgttcaagagaacggaccggccatacatgtatgtcttcaatatgggggataaaaataatgaatatgtctccaaagcacatgttaaataaacatatatatgtctgaatcatattttcaagtttacattgaatgagaagaaaaaatcatttaccaagaagttgacgtcgctggcattttgtatccaggggggggggggggggtatgataaagtgcccatagccaacattaatgaacctgactatccaaaccgatactttatcattaatatcgc
gi|4 : aaaTGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC--T-GC-GTTTGGTTTTTTTTT-TAT-TTG-ATAA-TTAT-TC-C-TAAACAATgcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgttatatactatagttcatggatgattaggtaaaatctaagtttgtaagagaaatcatatattaagttttataaacttttgtacatatgtacaataacaaatcaatacaagaacaacttttgtcacacggaatgcacaaacatatagggagccttttctcgctcactttctgagcaatgtaaatgttcagagagaacgacaaagacaaagacgacaacatgtatgcccttcaatatgggggataaaaata
gi|22 : gaaaTGAA-AAGTGGAA--A-A-T-A--AATCC-CT-GCCGTTT----GTTTTTA--AT-TTG-GT-A-TTAT-TA-T-AAAAtgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggttaaagttaccgtacatgtaatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|15 : aGAA-AGTGGCAATTATG-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT----GTTTTTT---------A--A-TTGT-TA-T-AAAACAAT
gi|8 : AA-AGTGGCAA--AT--T-A--A-TCC-TG-GCCGTTT-----GTTTTT-AAT-TTG-GT-A--TAT-------AAACAATctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|18 : AA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-G-CGTTT-----GTTTTT-TAT-TTG-A--A--TAT-TA-T-AAAACAATtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcataacttgcatgtatagttcatgagatgttagggtaaaatctaagtttgtaaaagaaaatcaatagatcaagtttaaaaaactgtttttgtaccttaaaaaaaataacaaatcaattaagaaaacaaaattttgttcacatggatgcacaaacaatatagggaagcccttttcgctcactttctaagcaatgtaaatgttcacagagaaacggacaggaaccatacatgtatgcccttcatatgggggataaaaatatgaaatattgtctccaaagcagtacatgttaaataaacattatataacttgatcatattttccaagtttacatttgaaaatgagaaagaaaaaaatcatttacctagagttgacgtcgctggattttgtatccggtgggggggggggg
gi|7 : -AAGTGCAA--ATA-T-AGAA-TCC-CT--CCGTTT----GTTTT---TAT-TTGAAT-A-TTTT-TA---AAACCAATtgatttctctctttctctctcatagcttgcatgtatagttcatgagatgttaggtaaaa
gi|1 : GCAA--ATAGT-A--AATCCACT-GC-GTTT----TGTTTTT-TAT-TT--ATAA-TTATATA-TAAAAACAATtgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattatactatagttcatgagattaggtaaaatctaatttgtaaagagaaatcaatatattaagttttaaactgtttgtacttaaaaaaaaaaatcaatacagataacaacttttgtcacacggaatgcacaaaacaatataggagtctttttcgctcacttccgagcaatgaaacatgtcaagagaaacggacaagacaaagaccatacatatgggggataaaaatatgaaattatgtcatcaaaccacatgtacataaactatatatgtcttgatcatatctgaatgagaagaaaaaaattcattaccaagtttaatcactgcattttgtacccgggcgggggggggggggtatgataaagtgcccagagcaacattatgaacctgactatccaaaccgttacttttatcaattaatacc
gi|2 : atgtgGCAA--TTA-TTAC-A-TCC-CT-G-CGTTT-----GATTTT-TAT-TC--AT-A-GTAT-TATT-AAAACAATttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaaacttgcatgtaataagttcatgaaatgtagataaaatccacgttgtaaagaaaaatcaatagaagttaataagtttaaaaaactgttaatatgaataaagaataacaaacacccaataagaaatcagtaccagaaaacaaacttttgtccgcacggaatgcagagccttttcgcgtcaccttgtcccggagcaaggtatacaatttgacgagaaatggacagggcaaagaccatcctagatgtatgcccttgcaatatgggggatgaaaaatactgtcaaccatatatctcccaaagcactttgtaaataaataatatatatgtttgaactcatattttgcaaagttacatttgaaatgaagaagaaaaaatcatttaccaggtgaactgtcgtgggttgtcgcattgtatgcaccgcgggggcagctgaggacgggtaatgagtaaaagttgcccataaggtatgcattatgaacctgaggtaatagtgcaaaccgatacttttacaattcaatac
gi|10 : gCAA--TTA-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT----GATTTTT--AT-TTC-AT-A-GTAT-TA---AAAACAATcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttttgcctggtataggttcatgagatagtttaggtaaaatttacgaattatttgtaacggaaaatttaactttagatttttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaataaaatatcaaccaaattttaatcaatacagaaaacagcttttttggtcaaaaaaaaaaaaaaccccctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggggccattgcccttcaataatgggggatgaaatgaaataaagtcatccaatgcacataagtaaagtttagagatttgaatgagggaaaaaaatatttaccagagttgaacgtcgcttgggcatttttacacccgggggtttgggggggtggtgggtgtggattaattgataaattttgtcatttcagtaacacttatgaagctgacttaatccaaccgatacttttattcaa
gi|8 : ATAACTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CAT-GAGA-TG--TT-AGGGTAAAAT--C--TAA--G----T----TT-G-------TA-AAA------G-A-AAA-T---C-AA---T-AG-A---T--C----AA---G--TTT--A-A-AA------AACTG-TT----TTTGTACC--T--------TA-AA----AAAAA------------------------TAA-----------C-------AAA--------------------T------CAA----T--T-----------A-AGAA-AACAAA-A------TTTT--GTT-C-A----------------CATGG-A---TGCA---C-AA---AC-AAT--A-T-------A------GG-GAA-GC-CCTTT-TCGC-TCACTTT---C-TA-A-GC-AA-----TGTA----A-A---T---G-T-TC-ACAGAGAAAC-GGA-C-AGGA-------------AC--C--AT---A-----C---A--TGT--------A------TGCCCTTCATATGGG--GG---AT-AAAAATA-T-G--AA--A-T-ATTG-----TC-TC-C-AAAGCAGTACATG-TTAAA-T-A--AAC-AT--TATATA--A--CTTGA-TCA-TATTTTCCAAGTT----TACATTTGAAAA-TGA-GAAAG-AAAAA-AAT-C----AT---TT-A-CCTA--G---AGTTG-A-CGT-C---GCT---G---GATT---TT-GTAT--C----C----------G---------------------GTGG-----------GGGcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgcctttattagtttcatgagatgttaggtaaaatttacgattatttgtaaggaaaatttaatagatttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaaaataaaaatatcaacccaaatttcaaatcaatacagaaaacagcttttgtcacctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggccatctgcccttcaatatgggggatgaaaatgaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|5 : aaagtggcaaattaatcctggccgtttgtttttaatttggtatataaacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcATAACTTT-G-CATCGT---TA-----G--TT--AT-GAGA-TG--TTTAG-GTAAAT---C--TAA--G----T----TTTG-------TA--A-------A-A-AAA-T---CCAA---T-AATA---C--TC---AA---GA-TTT--A-A-AA------A-C-G-TT----T--GTACC--T--------TA-AATAAAA---A------------------------TAA-----------C-------AAA------T--------------------CAA----T--A-----------C--------------------TTTT--G-T-C-A----------------CATGGAA---TGCAA--C-AA---ACCAAT--AAT-------A------GG-G-A-AG-CCCTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-A-GC-AAC----TGT-----A-AA--T---G-T-TCAA--GAGAAC--GGA-C-----C---------G--GC--C--AT---A-----C---A--TGT--------A------TGTCTTCAATATGGG--GG---AT-AAAAATAAT-G--AA----T-A-TG-----TC-TC-C-AAAGC---ACATG-TTAAA-T-A--AAC-ATA-TATATGT----CTGAA-TCA-TATTTT-CAAGTT----TACATT-G--AA-TGA-GAA---GAAAA-AAT-C----AT---TT-A-CC-AAGA---AGTTG-A-CGT-C---GCTG--G---CATT---TT-GTA---T----CCAGGGGGGGGG---------------------GGGG-----------GGGTAT----------------GA----------TA--A----A-GT-GCCCAT---A--GCCA-ACA-TTAATGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCGA-TAC-----TTTA-TC-ATT-AATAT-CGCggggggg
gi|10 : tgaaagtggcaaatataatccctgccgtttgttttttatatttggtattttataaaaaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAACTT--G-CCT--T---TA-TTA-G--TTTCAT-GAGA-TG--TT-AGGTAAAATT-----TAC--GATTAT----TT-G-------TA-AG-------G-A-AAA-T---TTAA---T-AG-A---T--TTAA-AA---C--TTT--G-A-A---------CCA-TT----T--GTACC--T--------TA-AA----A---AA-----------------------TAAAAATATCAACCC-------AAA------T-------------TTCAAATCAA----T--A-----------C-AGAA-AACAGC-T------TTT---G-T-C-A----------------CCTGGAA---TGCA---C-AA---TC-AAT--A-T-------AG-----GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TCACATT---C-CG-A-GC-AA-----GGTA----A-A---T---G-T-T-GACAGAGAAAC-GAA-C-AGGAC--AAA----G--GC--C--ATCTGC-----C---C--TTC--------AAT---ATGGG-------------GG---AT-GAAA--A-T-G--AA--A-T-------------------AANN---NNNNN-NNNNN-N-N--NNN-NNN-NNNNNGTTAT--TTAA--CA-TATT
gi|2 : caattataatccctgcgtttgatttttatttcatagtattaaaaacaatcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAACTTTTG-CCT-GG---TA-T-A-GG-TT-CAT-GAGA-TAGTTT-AGGTAAAATTTAC--GAATTA----T----TT-G-------TAACG-------G-A-AAA-T---TTAACTTT-AG-A---T--T------------TTT--A-A-AACTTTGAA-CCA-TT----T--GTACC--T--------TA-AA----A----------------------------TAAAATATCAAC--C-------AAA------T-------------TTTAAT-CAA----T--A-----------C-AGAA-AACAGC-T------TTTTTGG-T-C-AAAAAAAAAAAAAACCCCCTGGAA---TGCA---C-AA---TC-AAT--A-T-------AG-----GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TCACATT---C-CG-A-GCAAA-----GGTA----A-A---T---G-T-T-GACAGAGAAAC-GAA-C-AGGAC--AAAGG--G--GC--C--AT----------------TGCCCTTCAATA-----ATGGG-------------GG---AT-GAA---A-T-G--AA--A-TAA-AG-----TCATC-C-AATGC---ACA----TAAG-T-A-------------AAGT-----TTAG---A-GATTT--GAA-------------TG--A---GG-GAA-----AAA-AAT------AT---TT-A-CC-A--G---AGTTGAA-CGT-C---GCTTGGG---CATT---TT--TACACC----C----------GGGGGTTT--------------GGGG-----------GGGTGGTGGGTGTGGATTAATTGA----------TA--A----ATTT-TGTCATTTCA--G-TA-ACACTTA-TGAAGC-T--GACT--TAA-TCC-AACCGA-TAC-T---TTTATTCAA
gi|4 : ggcaattattacatccctgcgtttgatttttattcatagtattattaaaacaatcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnATAA-TT--G-CAT-GTAG-TA-T---G--TT-CAATGAGA-GG--TT-AGGTAAAATC--CCGTAC--G----AA---TT-G-------TA-AA-------ACA-AAA-T---C-AA---TTAT-A---T--T----AA---AGTTTT--A-A-AA------A-ATG------------ACC--T--------TA-AA----A---AATTAATAAAAAATAACACACCCAATAA-----------C-------AAA------A-------------T------CAA----T--A-------------AGAA-GACACC-T------TTTT--G-T-CAA----------------CA-GGAA---TGTAT--C-AA---AC-AATTAA-T-------AAATTAGGG-G-A-GC---GTT-TCGC-TCCCTTT---CTCG-A-GC-AA-----GGT-----C-A---TAAAG-T-T-GACCGAG-AAC-GGA-C-AGGTT--AAA----GTTAC--C--GT---A-----C---A--TGT--------A-----ATG-A-------------GA---AA-GAAAATA-
gi|18 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctATAGCTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CAT-GAGA-TG--TT-AGGTAAAAatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|12 : aaagtggcaaatataatccctgcgtttgttttttatttgaatattataaaacaattgatttctctctttctctctcTATCTT--GGCAT-GT---AC-T-A-G--T--CAT-GAGA-TG--TTTAG-GTAAAT---C--GAA--G----T----TT-G-------TA--A-------G-A-AAA-T---C-AA---T-AG-A---T--T----CAT--A--TTA--A-A-AA------A-CTT-CT----T--GTACC--T--------TT-AA----A---A------------------------AAC-----------C-------AAA------T--------------------CAA----T--A-------------AGAA-AAAAATAC------TTTT--G-T-C-A----------------CA-GGAA---T-CA---C-AA----C-AATT-A-T-------T------GG-G-AAGC-CTTT---CGC-TCACTTT---C-CG-A-GC-AA-----TGTCATGTA-AC--T---G-T-TCA-CAGAGACAACGGATC-AAGACCTACATTATG--CC--CTTAT---A-----T---A--TG---------G-----GTG--------------------AT-AAAAATA-T-G--AA----T-A-TG-----TC-TC-A-AAAGC---AC--G-TTAAAGT-A---AC-ATAATATATGTT----TGAT-TCA-TATTTT-CAAGTT----AACATTTG--AA-TGA-GAA---AAAAA-AATCAAATCAT---TT-ATCC-A--G---AGTTG-ATCGT-C---GCTCA-A---CATTTTGTT-GTG---CGG--T----------G---------------------GGGG-----------GGTTAT----------------GA----------TA--A----A-GT-G-CCAT---A--G-CA-ACA-TTATGCAACC-TG-AAT-------TCCAAAC-G--TAC-CCTGTTTA--CAATT-AATAT-CGC
gi|1 : gttctccttctctgAACTT--G-CAT-GT---AA-T-AAG--TT-CAT-GAAA-TG--T--AGATAAAATC--C---AC--G----T----T--G-------TA-AA-------G-A-AAAAT---C-AA---T-AG-AAGTTAAT----AA---G--TTT--A-A-AA------AACTG-TT----A--ATA----TGAA-----TA-AAG---A---A------------------------TAA-----------C-------AAA------CACCCAATAAGAAAT------CAG----T--A-----------CCAGAA-AACAAA-C------TTTT--G-T-CCG----------------CACGGAA---TGCA--------------------------------------G-A-GC-CTTTT--CGCGTCACCTTGTCC-CGGA-GC-AA-----GGT-----ATA---C---AAT-TTGAC-GAGAAAT-GGA-C-AGGGC--AAA----G--AC--C--AT---C-----CTAGA--TGT--------A------TGCCCTTGCAATATGGGGG---ATGAAAAATACT-GTCAACCA-T-A-TA-----TC-TC-CCAAAGC---ACTTT-GTAAA-T-AAATA--ATA-TATATGTT----TGAACTCA-TATTTTGCAAAGT----TACATTTG--AAATGAAGAA---GAAAA-AAT-C----AT---TT-A-CC-A--GGTGAACTG-T-CGTGGGTTGTC---G---CATT---GT-ATG---CACCGC----------G---------------------GGGGCAGCTGAGGACGGGTAAT---------------GAG---------TA--A----AAGTTGCCCAT---AAGG-TATGCA-TTAT-GAACC-TG-AGGTAAT-AGTGCAAACCGA-TAC-T---TTTA--CAATTCAATAC-
gi|11 : atgtggcaaatagtaaatccactgcgttttgttttttatttataattatatataaaaacaatttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaACTT--G-CAT-AT----A-T-A-G--TT-CAT-GAGA-TG--TT-AGGTAAAAT---C--TGC--G------------A-------TA-TACAAGGAGG-A-AAA-T---T-TA---T-GG-A---T--TTA--AA---A--CTT--A-A-A---------CCG-TT----TT-GTACC--T--------TATAA----A---AC-----------------------TAA-----------C-------AAA------C-------------C------AAA----T--AACAAATAATCCC-GGAA-AACAGC-T------TT----G-T-C-A----------------CCCGGTA---TGCA---C-AA---AC-CAA--A-T-------A------GGAG-A-GC-CTTT---CGC-TCACTTT---C--G-A-GC-AA-----GGT-----A-AATGC---G-T-CTGACAGA--AAT-GGA-C-G-GAC--AAT----G--AT--A--AT---ATGC--C---C--TTC--------A-----ATATG-------------GG---AT-AAAA-TA-T-G--AA--A-T-A-TGAATAGTC-TCGC-AAAGC---ACATG-TTAAA-T-A--AAC-ATA-TATAT-------------------TT--GAAGTT-----ACATTTG--AA-T-A-GA----GAAAA-AAT-A----ATA--TT-G-AC-A--G---AGTTT-A-CATTCG---CT---G---GCTT---TTAGCA---C----C----------GGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGG-----------GGGTG-----------------GGGATGGTGGTTTA--ATGATAAGT-GTCCAT---A--G-TA-ACA-TTAT-GAACC-TT-AACT----A-TCCGAACCGA-TAC-T---TTTA-TGAATC-AATGC-CG
gi|13 : TT--A-TAT-AC---TA-T-A-G--TT-CAT--GGA-TGA-TT-AGGTAAAAT---C--TAA--G----T----TT-G-------TA--A-------G-AGAAA-T---C-A----T-AT-A---T--T----AA---G--TTT--T-ATAA------A-CT--TT----T--GTACA--TA-------TGTAC----A---A------------------------TAA-----------C-------AAA------T--------------------CAA----T--A-----------C-A-AG-AACAAC-T------TTT---G-T-C-A----------------CACGGAA---TGCA---C-AA---AC--AT--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTTCTCGC-TCACTTT---C-TG-A-GC-AA-----TGTA----A-A---T---G-T-T---CAGAGAGAA-CGA-CAAAGAC--AAA----G--ACGAC--A----A-----C---A--TGT--------A------TGCCCTTCAATATGGG-GG---AT-AAAAATA-
gi|15 : aaatgaacagtggcaaatataatccctcgccgtttggttttttatattgatatttattataacacagcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgT--G-CAT-GTATCTAGT-A-G--TT-CAT-GAGA-TG--TT-AGGTAAAA-T--C--T-A--G----TACGATT-G-------TA-AG-------G-A-AAATT---C-AA---T-AG-A---T--TTAAAAA---G--TTT--A-A-
gi|9 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctc--G-CAT-GT----A-T-A-AGTTT-CAT-GAGAATG--TT-AGATAAAAAT--C--CAC--G----A----TT-G-------TA-AA-------G-A-AAAAT---C-AA---T-AG-A---T--T----AAAATG--TTTTAA-A-AA------A-CTG-T----------ACC--T--------TA-AA----A---AATGAATAAAAA-------------TAA-----------C-------AAAAACCCAC-------------TAA----CAAATCGT--A-----------C-AGAA-AACAAC-T------TT----G-T---A----------------CACGGAA---TGCA----------------------------G------GG-G-A-GC-CTTTT--CGC-TCACTTT---CGCG-AAGC-AAGGGTATAC-----A-A---T-----T-TTGACCGAGAAAC-GGA-C-AGGAC--AAA----G--AC--C--AT---C-----C---AGATGT---------------TGCCCTTCATATGGG--GG---AT-AAAAATA-T-G--AA--A-T-A-TA-----TCTTC-C-AAAGC---ACATGTTTAAA-TCA--AAC-A-A-TATATG----TCTTGC-CCATTATTT--AAAGTT----T-CATTTG--AA-TGA-AAAAAGAAAAA-AAT-C----AT---TTAA-CC-A--G---AG-TT-A-CGT-CG--CTT---GGGCCATT---TT-GCA---C----CGGGGGAGGGGG---------------------GGGG-----------GGGTA------------------A----------TAATA----AAGT-GTCCAT---A--G-TA-TCA-TTAT--GACC-T---AAT--A-A-TCCAAACCGA-TAC-----TTTA-TCAATT-AATAC-CGcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|7 : aAT-AC---TA-T-A-G--TT-CAT-GAGA-T----T-AGGTAAAAT---C--TAA-------T----TT-G-------TA-AA-------G-AGAAA-T---C-AA---T-AT-A---T--T----AA---G--TTT--T-A-AA--------CTG-TT----T--GTAC---T--------TA-AA----A---A-------------------------AA-----------A-------AAA------T--------------------CAA----T--A-----------C-AGAT-AACAAC-T------TTT---G-T-C-A----------------CACGGAA---TGCA---CAAA---AC-AAT--A-T-------A-------G-G-A-GT-CTTTT-TCGC-TCAC-TT---C-CG-A-GC-AA-----TGA-----A-A---C---A-TGTCA--AGAGAAAC-GGA-C-AAGAC--AAA----G--AC--C--AT---A-----C---A--T----------------ATGGG-------------GG---AT-AAAAATA-T-G--AA--ATT-A-TG-----TC-AT-C-AAACC---ACATG--TACA-T-A--AAC--TA-TATATG----TCTTGA-TCA-T-------------------ATCTG--AA-TGA-GAA---GAAAA-A---A----ATTCATT-A-CC-A------AGTTT-A----ATC--ACT---G---CATT---TT-GTA---C----CCGGGCGGGGGG---------------------GGGG-----------GGGTAT----------------GA----------TA--A----A-GT-GCCCAG---A--G-CA-ACA-TTA-TGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCGT-TAC-T---TTTA-TCAATT-AATAC-
gi|6 : aagtgcaaatatagaatccctccgtttgtttttatttgaatatttttaaaaccaattgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtatt--TAG--G----T----TT-GACTAAAATA-TA-------G-A-AAA-TACAC-AAAA-T-AG-C---T--G----AA---GGATTT--AGA-AA------A-CTG-TTTAGGT--GTACCGTT--------TA-AA----A---A-------------------------AA-----------CATAAGCGAAA------T---------------------AA----TTAA-----------C-AGAATAATACC-TATACACTTTG--G-TAC-A----------------CATGGGAATTTGCAATGC-AACCTACAAAT--A-TGTTA---G------GG-G-A-GCGCTTTTATCGC-CC
gi|16 : ttctctcttttctcattataacttgcacccccaacattgcttgaatagttcatttttgaaggatgtctgaagtacagcgcctgcaatcagactccta-------G-A-AAA-T---C-AA-----AG-A-----------AA---A-------A-A-AA------A-TT--------------CC------------A-CA----A---A------------------------CAA-----------A-------AAA----------------------------AA----T--T-----------C-ACAA-AACAAC--------TTTT--G-T-C-A----------------CATGGAA---TGCA---C-AA---AC-AAT--A-C-------A------GA-A-A-AC-C-TTT-TCGC-TTACTTT---C-TG-A-GC-GA-----GGCA----A-A---T---G-T-T-GTCGGAGAAAC-GGA-C-AGGAC--AAA----G--AT--C--AT---ATGT--C---A--TTC--------AAT---ATGGG-------------GG---AT-AAAAATA-T-G--AA------A-TG-----TC-TT-C-AAAGC---ACATtcgtacaacttatttctcctataagctaattgttacattatgcattcacagcagaaacggcactgaggttatttccaactgacattcgtcataattggcctcgcccctcttcgaataatggggggataaaaaaataaaagaagatgaggctctccgaaaaggcacatgctgggtaaataaaatctaacattaccaaaaccctaattatatgtctctgatctactagttttcaagtgtttacccatttttttcgtaatgagaagaaaaaaatcaccagatgttaaccagacatgtttgtgaaacgtcgctg
gi|14 : -AG-A---T--TTCA-AA---G--TTT------AA------A-CCGTTT----T--GTATCA-TTAAAGAAATA-AA----A---A------------------------TAA-----------C-------AAA------CTAAATGACAAA--T------CAA----T--G-----------C-CGAA-AACAAA--------TTTT--G-T-C-A----------------CACGGAA---TGCA---G-GA---AC-AAT--A-T-------A------GGAG-A-GC---TTT-TCGC-TCACTTT---C-TG-A-GC-AA-----GGT-----A-A---T---G-T-T-GACAGAGATAA--GA-C-AGGAA--AAA----G--AC--C--AT---ATGCCCT---A--T-C--------A-----ATATG-------------GGGGAAT-AAAATTA-TAA--AA--A-T-A-TG-----TC-T--C-AAAGG---ACATG--TAAA-C-A--AACGATG-TATATG----TCTTAA-TCATTATTT--GAAAT
gi|15 : gaaatgaaagtggcgatgataatctttgcagtttttaaaatagatatataaaaacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagattc---A------------------------TAA-----------C-------AAA------T--------------------CAA----C--A-----------C-AGAA-AACAAC-T------TTT---G-T-T-T----------------CACAGAA---TGCA---C-AA---AC-AAT--A-T-------AAG----GG-G-A-GC-C-TTT-TCG---CACGTT---C-CG-A-GC-GA-----GGTA----A-A---T---G-T-T-GACAGAGAAA
gi|21 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacat------TTTT--G-T-C-A----------------CACGGAA---TGCA---G-AA---AT-AAT--G-TACCGGTAA------GG-T-A-GC-C-TTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-A-GC-
gi|17 : T---C-CG-A-GC-AA-----GGT-----A-AA--T---G-T-T-GACCGAGAAAC-CGA-C-AGGAC--AAA----G--AC--C--AT---G-----C---A--TG---------ACTTGTATGCCCTTCAATATGGG-GG---AT-AAAAATA-T-T--AA--A-T-A-TA-----TC-TC-C-AAAGC---ACATG-TTAAA-T-A--AAC-ATA-TATATAT--GTCTTGA-CCATTATTT--
gi|4 : TT--AAAGTTACCGTACATGT---AA-TGA-GAAA--GAAAATAATCA----AT---TT-A-CC-A--G---AGTTG-A-CGT-CG--CCT---GG--CATT---TT-GCA---TGGA-C----------GAGG------------------GGGG-----------GGGTATTCAAT-----------GA----------TA--A----AGTT-GTCCAT---A--G-TA-ACA-TTA-TGAACCGTG-AAC---T-A-TCCAAACCGCATACGT---TTTACCCAATT-AATACGCGCg
gi|19 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggA----------TA--A----AG-T-AACCAT---A--G-T------TTAT-GAACC-TGAGA----T-A-TCCAAACCGA-TAC-T---TTTA-TCAATC-AATAC-
gi|20 : ctgcattgcgtttattgtattagcgggagaaagagtgtgtgtaaaataatGT-ATCCAT---A--G-TT-ACA-TTAT-GAACC-TG-AA----T-A-TCCAAACCGA-TAC-T---TTTA-TCAATC-AATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22222 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111111111111111111 2222 111111 2222222222222 11111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 1111111111111111 11111111111111 111111 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11111 33333333333333333333333333 11111111 111111 11111 11111111 111 1 2222222 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 22 3333333333
lowQualScore : 4 44 3 3 77 3 3 3 55 44444 3 3 55 6 66 3 999 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 3 2 7777 2 2 2 66 2 2 2 2 66 5 2 9999999999999999999999 3 3 666 2 777 8 5 555 2 2 444 33 1111 111111 33 0000000000000 66 33 88888888 5 8888 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5555 3333333333333 88 888 2 2 6666666666666666 2 666 0 2 55 2 66666666666666 5 5 2 8 55 2 444 4 4 2 000000 444 888 2 444 2 7 2 33 33 33 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 2 33 2 0 2 2 2 33 4444 2 777 44444 6 3 3 555 555 77 7777 3 33333333333333333333333333 7777 88888 55555555 555555 44 44444 55 22222222 3 3 555 99999 3 6666 777 3 3 3 777777 3 66 3 4 7 6666666 777 4 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 4 66 4 3 4 666 55 3 3 3 22 3 2222222222 3 3 777 88 4 4
lowQualScore : . .. . . .. . . . .. ..... . . .. . .. . ... ............................................................................................................. .. . . .... . . . .. . . . . .. . . ...................... . . ... . ... . . ... . . ... .. .... ...... .. ............. .. .. ........ . .... ................................................................................. .... ............. .. ... . . ................ . ... . . .. . .............. . . . . .. . ... . . . ...... ... ... . ... . . . .. .. .. ......................................................... . .. . . . . . .. .... . ... ..... . . . ... ... .. .... . .......................... .... ..... ........ ...... .. ..... .. ........ . . ... ..... . .... ... . . . ...... . .. . . . ....... ... . .................................................................................................... . .. . . . ... .. . . . .. . .......... . . ... .. . .
lowQualScore : 4 66 3 3 99 3 3 3 00 33333 3 3 88 7 55 3 111 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 1 9 6666 9 9 9 88 9 9 9 9 88 7 9 4444444444444444444444 1 1 555 9 999 6 7 000 7 7 777 77 3333 333333 77 3333333333333 88 66 22222222 7 9999 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7777 7777777777777 88 222 5 5 6666666666666666 5 999 3 5 99 5 33333333333333 0 0 5 1 77 5 111 7 7 4 666666 444 888 5 444 5 5 7 77 77 77 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 77 7 9 7 7 9 99 8888 9 999 22222 2 1 1 444 444 88 1111 3 88888888888888888888888888 1111 11111 00000000 666666 66 44444 00 33333333 6 6 000 11111 6 3333 222 6 6 6 444444 6 55 6 0 5 1111111 000 0 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 0 11 0 6 9 444 00 6 6 6 22 6 9999999999 6 6 222 55 0 4
consensus : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTTG-----TTTTT-TAT-TTG-AT-A-TTAT-TA-T-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-GTAA-A-G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--AAAA------A-CCG-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T-------------T------CAA----TA-----------C-AGAAAACAAC-TTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AC--CAT---A-----C---ATGC--------A-----ATGCCCTT------G-G---------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-TGA-TCA-TA-----TTT--N---AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G-------G---------------------GGG-----------GGGT---------------A------------T----GA-TA-A-AAGT-GCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
Reference ( family-225 ) : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTTG----NTTTTT-TAT-TTG-AT-A-TTAT-TA-T-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-GTAA-A-G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--AAAA------A-CCG-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T-------------T------CAA----TA-----------C-AGAAAACAAC-TTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AC--CAT---A-----C---ATGC--------A-----ATGCGCTT--------G---------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-TAA-TCA-TA-----TTT--N---AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TNA-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G-------G---------------------GGG-----------GGGT---------------A-----------TT----GA-TA-A-AAGT-GCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|1 : GTGGCAA--ATAGT-A--AATCCACT-GC-GTTTT----GTTTTT-TAT-TT--ATAA-TTATATA-TAAAAACAAT
gi|1 : atAACTT--G-CAT-GT---AA-T-AAG--TT-CA-T-GAAA-TG--T--AGA-TAAAATC--C---AC--G----T----T---GTAA-A-G-A---AAAATC-AA---T-AG-AAGTTAAT----AA---G--TTT--AAAA------AACTG-TTA--ATA---TGAA-----TA-AAG---A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------CACCCAATAAGAAAT------CAG----TA-----------CCAGAAAACAAA-CTTTT--G-TCCG----------------CAC-GGAATGCA---------------------------------G-A-GCCTTTT--CGCGTCACCTTGTCC-CGGAGC-AA-G----G---TATACA-AT-T---T-GAC-GAGA-AATGGAC-AGGGCAAA--G--AC--CAT---C-----CTAGATGT--------A------TGCCCTT--------GCAATATGGGG-G--ATGAAAAAT-ACT-GTCAACCA-T-A---TA-----TC-TC-CCAAA---GC---ACTTT-GT----AAAT-AAA------------T--AA-----TA--TATATG----TTT-GAACTCA-TA-----TTT--TGCAAAGT--T-----AC--ATTT-----G--AAATGAAGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A--GGTGA-ACTG-T-CGT-GGGTT---GTCGCATT---GT-ATG---CACCGC----------G-------G---------------------GGGCAGCTGAGGACGGGT---------------A-----------AT----GAGTA-A-AAGTTGCCCAT---AAGG-TATGCA-TTAT-GAACC-TG-AGGTAAT-AGTGCAAACCG-ATAC-T-TTTA--CAATTCAATAC-ttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaaacttgcatgtaataagttcatgaaatgtagataaaatccacgttgtaaagaaaaatcaatagaagttaataagtttaaaaaactgttaatatgaataaagaataacaaacacccaataagaaatcagtaccagaaaacaaacttttgtccgcacggaatgcagagccttttcgcgtcaccttgtcccggagcaaggtatacaatttgacgagaaatggacagggcaaagaccatcctagatgtatgcccttgcaatatgggggatgaaaaatactgtcaaccatatatctcccaaagcactttgtaaataaataatatatatgtttgaactcatattttgcaaagttacatttgaaatgaagaagaaaaaatcatttaccaggtgaactgtcgtgggttgtcgcattgtatgcaccgcgggggcagctgaggacgggtaatgagtaaaagttgcccataaggtatgcattatgaacctgaggtaatagtgcaaaccgatacttttacaattcaatac
gi|10 : atgtggcaaatagtaaatccactgcgttttgttttttatttataattatatataaaaacaatttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaCAA--TTA-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTTG----ATTTTT--AT-TTC-AT-A-GTAT-TA---AAAACAAT
gi|10 : ATAACTT--G-CCT--T---TA-TTA-G--TTTCA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT-----TAC--GATTAT----T-T-GTAA-G-G-A---AAA-TTTAA---T-AG-A---T--TTAA-AA---C--TTT--GAA---------CCA-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------AA----------TAAAAATATCAACCCAAA------T-------------TTCAAATCAA----TA-----------C-AGAAAACAGC-TTTT---G-TC-A----------------CCT-GGAATGCA-C-AATC-AAT--A-T-------A------GG-GGA-GCCTTTT--CGC-TCACATT---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGAAC-AGGACAAA--G--GC--CATCTGC-----C---CTTC--------A-----ATATG--G--------G---------G-G--AT-GAAA---A-T-G--AA--A-T-A---caaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgcctttattagtttcatgagatgttaggtaaaatttacgattatttgtaaggaaaatttaatagatttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaaaataaaaatatcaacccaaatttcaaatcaatacagaaaacagcttttgtcacctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggccatctgcccttcaatatgggggatgaaaatgaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|11 : caattataatccctgcgtttgatttttatttcatagtattaaaaacaatcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT--G-CAT-AT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAT---C--TGC--G----A----TAT-ACAA-G-G-AGGAAAA-TT-TA---T-GG-A---T--TTA--AA---A--CTT--AAA---------CCG-TTTT-GTACC-T--------TATAA----A------------------------AC----------TAA-----------CAAA------C-------------C------AAA----TAACAAATAATCCC-GGAAAACAGC-TTT----G-TC-A----------------CCC-GGTATGCA-C-AAAC-CAA--A-T-------A------GGAG-A-GCCTTT---CGC-TCACTTT---C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGCGTCT-GACAGA---AATGGAC--GGACAAT--G--AT--AAT---ATGC--C---CTTC--------A-----ATA----T--------G---------G-G--AT-AAAA-T-A-T-G--AA--A-T-A---TGAATAGTC-TCGC-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATAT-------------------------TT--G---AAGT--T-----AC--ATTT-----G--AA-T-A-GA----GAAA-----A-AA--TAA-TATT-G-AC-A--G---A-GTTT-A-CAT-TCGCT---G---GCTT---TTAGCA---C----C----------G-------GGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGG-----------GGGT---------------GGGGATGGTGGTTT----AA-TG-ATAAGT-GTCCAT---A--G-TA-ACA-TTAT-GAACC-TT-AACT----A-TCCGAACCG-ATAC-T-TTTA-TGAATC-AATGC-CGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|12 : TATCTT--GGCAT-GT---AC-T-A-G--T--CA-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--GAA--G----T----T-T-GTAA---G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----CAT--A--TTA--AAAA------A-CTT-CTT--GTACC-T--------TT-AA----A------------------------A-----------AAC-----------CAAA------T--------------------CAA----TA-------------AGAAAAAAATACTTTT--G-TC-A----------------CA--GGAAT-CA-C-AA-C-AATT-A-T-------T------GG-G-AAGCCTTT---CGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AATGTCATG---TA---A-CTGT---T-CACAGAGACAACGGAT-----CAA---G--AC--C-T---A-----C---ATT---------------ATGCCCTTATATATG-G---------GTG--AT-AAAAAT-A-T-G--AA----T-A---TG-----TC-TC-A-AAA---GC---AC--G-TT----AAAG-TAA------------C--A------TAA-TATATG----TTT-GAT-TCA-TA-----TTT--TC--AAGT--T----AAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---AAAAAAATCA-AA--TCA-T-TT-ATCC-A--G---A-GTTG-ATCGT-C-GCTCA-A---CATTTTGTT-GTG---C----G----------GT------G---------------------GGG-----------GGGT---------------T-----------AT----GA-T--A-AAGT-G-CCAT---A--G-CA-ACA-TTATGCAACC-TG-AAT-------TCCAAACGT-ACCC-TGTTTA--CAATT-AATAT-CGC
gi|13 : gttctccttctctgTGAACAGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CTCGCCGTTTG----GTTTTT-TATATTG-AT-ATTTAT-TA-T-AACACA
gi|13 : aaaTT--A-TAT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-G-GA-TGA-TT-AGG-TAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-GTAA-G-A-G---AAA-TC-A----T-AT-A---T--T----AA---G--TTT--TATA------A-ACT-TTT--GTACA-TA-------TGTAC----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T--------------------CAA----TA-----------C-A-AGAACAAC-TTTT---G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC--AT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTTCTCGC-TCACTTT---C-TG-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T---CAGAGAGAAC-GACAAAGACAAA--G--ACGACA----A-----C---ATGT--------------ATGCCCTTCAATATGGG---------G-G--AT-AAAAAT-A-gcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgttatatactatagttcatggatgattaggtaaaatctaagtttgtaagagaaatcatatattaagttttataaacttttgtacatatgtacaataacaaatcaatacaagaacaacttttgtcacacggaatgcacaaacatatagggagccttttctcgctcactttctgagcaatgtaaatgttcagagagaacgacaaagacaaagacgacaacatgtatgcccttcaatatgggggataaaaata
gi|14 : aaatgaacagtggcaaatataatccctcgccgtttggttttttatattgatatttattataacacagcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatg-AG-A---T--TTCA-AA---G--TTT--AAA---------CCGTTTT--GTATCATTAAAGAAATA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------CTAAATGACAAA--T------CAA----TG-----------C-CGAAAACAAA--TTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-G-GAAC-AAT--A-T-------A------GGAG-A-GC--TTT-TCGC-TCACTTT---C-TG-AGC-AA-G----G---T----A-ATGT---T-GACAGAGATAA--GAC-AGGAAAAA--G--AC--CAT---ATGCCCT---AT-C--------A-----ATATG-----------G---------G-GGAAT-AAAATT-A-TAA--AA--A-T-A---TG-----TC-T--C-AAA---GG---ACATG--T----AAAC-AAA------------CG-A------TG--TATATG----TCT-TAA-TCATTA-----TTT--G---AAAT--
gi|15 : gaaatgaaagtggcgatgataatctttgcagtttttaaaatagatatataaaaacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagattcGAA-AGTGGCAATTATG-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTTG-----TTTTT-TA---------A-TTGT-TA-T-AAAACAAT
gi|15 : T--G-CAT-GTATCTAGT-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAA-T--C--T-A--G----TACGAT-T-GTAA-G-G-A---AAATTC-AA---T-AG-A---T--TTAAAAA---G--TTT--AActatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|15 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctc------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T--------------------CAA----CA-----------C-AGAAAACAAC-TTTT---G-TT-T----------------CAC-AGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------AAG----GG-G-A-GCCTTTT--CGC---ACGTT---C-CG-AGC-GA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AAcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|16 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacat-G-A---AAA-TC-AA-----AG-A-----------AA---A-------AAAA------A------TT--CCAC---------------A----A------------------------A-----------CAA-----------AAAA----------------------------AA----TT-----------C-ACAAAACAAC--TTTT--G-TC-A----------------CAT-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-C-------A------GA-A-A-ACC-TTT-TCGC-TTACTTT---C-TG-AGC-GA-G----G---CA---A-ATGT---T-GTCGGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AT--CAT---ATGT--C---ATTC--------A-----ATATG--G--------G---------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA------A---TG-----TC-TT-C-AAA---GC---ACAT
gi|17 : T---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACCGAGA-AACCGAC-AGGACAAA--G--AC--CAT---G-----C---ATG---------ACTTGTATGCCCTTCAATATGGG---------G-G--AT-AAAAAT-A-T-T--AA--A-T-A---TA-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------CATA------TA--TATATG----TCT-TGA-CCATTA-----TTT--
gi|18 : AA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-G-CGTTTG-----TTTTT-TAT-TTG-A--A--TAT-TA-T-AAAACAATg
gi|18 : ATAGCTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAtgatttctctctttctctctcatagcttgcatgtatagttcatgagatgttaggtaaaa
gi|19 : aaagtggcaaatataatccctgcgtttgttttttatttgaatattataaaacaattgatttctctctttctctctcT----AA-TATA-AAGT-AACCAT---A--G-T------TTAT-GAACC-TGAGA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATAC-
gi|2 : ctgcattgcgtttattgtattagcgggagaaagagtgtgtgtaaaaGGCAA--TTA-TTAC-A-TCC-CT-G-CGTTTG----A-TTTT-TAT-TC--AT-A-GTAT-TATT-AAAACAAT
gi|2 : ATAACTTTTG-CCT-GG---TA-T-A-GG-TT-CA-T-GAGA-TAGTTT-AGG-TAAAATTTAC--GAATTA----T----T-T-GTAACG-G-A---AAA-TTTAACTTT-AG-A---T--T------------TTT--AAAACTTTGAA-CCA-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------------------TAAAATATCAAC--CAAA------T-------------TTTAAT-CAA----TA-----------C-AGAAAACAGC-TTTTTTGG-TC-AAAAAAAAAAAAAACCCCCT-GGAATGCA-C-AATC-AAT--A-T-------AG-----GG-G-A-GCC-TTT-TCGC-TCACATT---C-CG-AGCAAA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGAAC-AGGACAAAGGG--GC--CAT--------------TGCCCTTCAATA-----ATG-G-----------G---------G-G--AT-GAA----A-T-G--AA--A-TAA---AG-----TCATC-C-AAT---GC---ACA----T----AAGT-AAA-------------------------------------------------G-----TTT--A---GAG-------------ATTT-----G--AA-TGA-GGG---AAAA-----A-AA--T-A-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTGAA-CGT-C-GCTTGGG---CATT---TT--TACACC----C----------GGGGGTTTG---------------------GGG-----------GGGTGGTGGGTGTGGATTAA-----------TT----GA-TA-A-ATTT-TGTCATTTCA--G-TA-ACACTTA-TGAAGC-T--GACT--TAA-TCC-AACCG-ATAC-T-TTTATTCAAcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttttgcctggtataggttcatgagatagtttaggtaaaatttacgaattatttgtaacggaaaatttaactttagatttttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaataaaatatcaaccaaattttaatcaatacagaaaacagcttttttggtcaaaaaaaaaaaaaaccccctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggggccattgcccttcaataatgggggatgaaatgaaataaagtcatccaatgcacataagtaaagtttagagatttgaatgagggaaaaaaatatttaccagagttgaacgtcgcttgggcatttttacacccgggggtttgggggggtggtgggtgtggattaattgataaattttgtcatttcagtaacacttatgaagctgacttaatccaaccgatacttttattcaa
gi|20 : ggcaattattacatccctgcgtttgatttttattcatagtattattaaaacaatcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAGT-ATCCAT---A--G-TT-ACA-TTAT-GAACC-TG-AA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATA
gi|21 : gtttttgtatactagcaggaaaaagagtgtgttcaataatatatTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-G-AAAT-AAT--G-TACCGGTAA------GG-T-A-GCC-TTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-
gi|22 : AA-AGTGGAAA--ATA---A--A-TCC-CT-GCCGTTTG-----TTTTT-AAT-TTG-GT-A-TTAT-TA-T-AAAA
gi|3 : atgaTGAA-AGGCGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTTC----TTTTTT-TAT-TTG-AT-A-TTAT-TA-T-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-TTGAGA-TG--TT-AGC-GAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-GTAT-A-G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--AAAA------A-CTG-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T-------------T------CAA----TA-----------C-AGAAAACAAC-TTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-T----G---T----A-ATGT---TCAACAGAGA-AAAGGAC-AAGACAAA--G--AC--CAT---A-----C---ATGC--------A-----GTGC-C--------------------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-ATA------------C--A------TA--TATATGTTATTCT-TAA-TCA-TA-----TTT--C---AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TAA-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTT-A-CGTACGGCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G-------G---------------------GGG-----------GGGT---------------A-----------------GA-TA-A-AGGT-GCCCAT---A--G-CA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACTG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|4 : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-T-C-CT-G-CGTTTGGTTTTTTTTT-TAT-TTG-ATAA-TTAT-TC-C-TAAACAATt
gi|4 : gaaaATAA-TT--G-CAT-GTAG-TA-T---G--TT-CAAT-GAGA-GG--TT-AGG-TAAAATC--CCGTAC--G----AA---T-T-GTAA-A-ACA---AAA-TC-AA---TTAT-A---T--T----AA---AGTTTT--AAAA------A-ATG--------ACC-T--------TA-AA----AAATTAATAAAAAATAACACACCCAA-----------TAA-----------CAAA------A-------------T------CAA----TA-------------AGAAGACACC-TTTTT--G-TC-A-----------------ACAGGAATGTATC-AAAC-AATTAA-T-------AAATTAGGG-G-A-GC--GTT-TCGC-TCCCTTT---CTCG-AGC-AA-G----GTCATA---A-A-GT---T-GACCGAG--AACGGAC-AGGTTAAA--GTTAC--CGT---A-----C---ATGT--------A-----ATGtgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggttaaagttaccgtacatgtaatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|4 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctTT--A---AAGT--TACCGTAC--ATGT--------AA-TGA-GAAA--GAAA-----ATAA--TCAAT-TT-A-CC-A--G---A-GTTG-A-CGT-CGCCT---GG--CATT---TT-GCA---TGGA-C----------GAGG----G---------------------GGG-----------GGGT---------------A-----------TTCAATGA-TA-A-AGTT-GTCCAT---A--G-TA-ACA-TTA-TGAACCGTG-AAC---T-A-TCCAAACCGCATACGT-TTTACCCAATT-AATACGCGCagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|5 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggTGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTTG----TTTTTTATAT-TTG-GT-A-TT-T-TA-T-AAAA-AAT
gi|5 : ATAACTTT-G-CATCGT---TA-----G--TT--A-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--TAA--G----T----T-TTGTAA-A-A-A---AAT-CC-AA---T-AATA---C--TC---AA---GA-TTT--AAAA------A-C-G-TTT--GTACC-T--------TA-AATAAAA------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T--------------------CAA----TA-----------C-------------TTTT--G-TC-A----------------CAT-GGAATGCAAC-AAACCAAT--AAT-------A------GG-G-A-AGCCCTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-CT---G---TA---A-ATGT---T-CA-AGAGA-A-CGGAC-CGG-----------C--CAT---A-----C---ATGT--------A------TGT-CTTCAATATGGG---------G-G--AT-AAAAATAA-T-G---A--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-GAA-TCA-TAT----TTT--C---AAGT--T----TAC--A-TT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AAGA---A-GTTG-A-CGT-C-GCTG--G---CATT---TT-GTA---T----CCAGGGGGGGGG-------G---------------------GGG-----------GGGT---------------A------------T----GA-T--A-AAGT-GCCCAT---A--GCCA-ACA-TTAATGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TC-ATT-AATAT-CGCtgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactttgcatcgttagttatgagatgtttaggtaaatctaagttttgtaaaaaaatccaataatactcaagatttaaaaacgtttgtaccttaaataaaaataacaaatcaatacttttgtcacatggaatgcaacaaaccaataatagggaagccctttcgctcactttccgagcaactgtaaatgttcaagagaacggaccggccatacatgtatgtcttcaatatgggggataaaaataatgaatatgtctccaaagcacatgttaaataaacatatatatgtctgaatcatattttcaagtttacattgaatgagaagaaaaaatcatttaccaagaagttgacgtcgctggcattttgtatccaggggggggggggggggtatgataaagtgcccatagccaacattaatgaacctgactatccaaaccgatactttatcattaatatcgc
gi|6 : tgaaagtggcaaatataatccctgccgtttgttttttatatttggtattttataaaaaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------G---------G-G--AT-AAAAAA-A-T-A--AA--A-G-AAGATGAGGC-TC-TC-C-GAAAAGGC---ACATG-CTGGGTAAAT-AAAATCTAACATTACC--AAAACCCTAATTATATG----TCTCTGA-TC--TACTAGTTTT--C---AAGTGTT----TACCCATTTTTTTCGT-AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA----A---TC-A-CC-A--G---ATGTTA-A-C
gi|7 : ttctctcttttctcattataacttgcacccccaacattgcttgaatagttcatttttgaaggatgtctgaagtacagcgcctgcaatcagactcctataggtttgactaaaatatagaaaatacacaaaatagctgaaggatttagaaaactgtttaggtgtaccgtttaaaaaaacataagcgaaataattaacagaataatacctatacactttggtacacatgggaatttgcaatgcaacctacaaatatgttaggggagcgcttttatcgccctcgtacaacttatttctcctataagctaattgttacattatgcattcacagcagaaacggcactgaggttatttccaactgacattcgtcataattggcctcgcccctcttcgaataatgggA-AGTG-CAA--ATA-T-AGAA-TCC-CT--CCGTTTG------TTTT-TAT-TTGAAT-A-TTTT-TA---AAACCAATcagacatgtttgtgaaacgtcgctg
gi|7 : AT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-T----T-AGG-TAAAAT---C--TAA-------T----T-T-GTAA-A-G-AG--AAA-TC-AA---T-AT-A---T--T----AA---G--TTT--TAAA--------CTG-TTT--GTAC--T--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------AAAA------T--------------------CAA----TA-----------C-AGATAACAAC-TTTT---G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-CAAAAC-AAT--A-T-------A-------G-G-A-GTCTTTT-TCGC-TCAC-TT---C-CG-AGC-AA-T----G---AA---ACATGT---C-A--AGAGA-AACGGAC-AAGACAAA--G--AC--CAT---A-----C---AT----------------ATG-G-----------G---------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--ATT-A---TG-----TC-AT-C-AAA---CC---ACATG--T----ACAT-AAA------------C---------TA--TATATG----TCT-TGA-TCA-T-------------------------------ATCT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AAATTCA---TT-A-CC-A------A-GTTT-A--AT-C-ACT---G---CATT---TT-GTA---C----CCGGGCGGGGGG-------G---------------------GGG-----------GGGT---------------A------------T----GA-T--A-AAGT-GCCCAG---A--G-CA-ACA-TTA-TGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-tgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattatactatagttcatgagattaggtaaaatctaatttgtaaagagaaatcaatatattaagttttaaactgtttgtacttaaaaaaaaaaatcaatacagataacaacttttgtcacacggaatgcacaaaacaatataggagtctttttcgctcacttccgagcaatgaaacatgtcaagagaaacggacaagacaaagaccatacatatgggggataaaaatatgaaattatgtcatcaaaccacatgtacataaactatatatgtcttgatcatatctgaatgagaagaaaaaaattcattaccaagtttaatcactgcattttgtacccgggcgggggggggggggtatgataaagtgcccagagcaacattatgaacctgactatccaaaccgttacttttatcaattaatacc
gi|8 : aagtgcaaatatagaatccctccgtttgtttttatttgaatatttttaaaaccaattgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattAA-AGTGGCAA--AT--T-A--A-TCC-TG-GCCGTTTG-----TTTTT-AAT-TTG-GT-A--TAT-------AAACAAT
gi|8 : ATAACTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGGGTAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-GTAA-AAG-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--C----AA---G--TTT--AAAA------AACTG-TTTTTGTACC-T--------TA-AA----AAAA---------------------A-----------TAA-----------CAAA--------------------T------CAA----TT-----------A-AGAAAACAAA-ATTTT--GTTC-A----------------CAT-GG-ATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-GAA-GCCCTTT-TCGC-TCACTTT---C-TA-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T-CACAGAGA-AACGGAC-AGGA---------AC--CAT---A-----C---ATGT--------------ATGCCCTTCATATGG-G---------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-AT--TG-----TC-TC-C-AAA---GCAGTACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------T---TATATA----ACT-TGA-TCA-TA-----TTTTCC---AAGT--T----TAC--ATTT-----GAAAA-TGA-GAAAG-AAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CCTA--G---A-GTTG-A-CGT-C-GCT---G---GATT---TT-GTAT--C----C----------G-------G---------------------TGG-----------GGGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcataacttgcatgtatagttcatgagatgttagggtaaaatctaagtttgtaaaagaaaatcaatagatcaagtttaaaaaactgtttttgtaccttaaaaaaaataacaaatcaattaagaaaacaaaattttgttcacatggatgcacaaacaatatagggaagcccttttcgctcactttctaagcaatgtaaatgttcacagagaaacggacaggaaccatacatgtatgcccttcatatgggggataaaaatatgaaatattgtctccaaagcagtacatgttaaataaacattatataacttgatcatattttccaagtttacatttgaaaatgagaaagaaaaaaatcatttacctagagttgacgtcgctggattttgtatccggtgggggggggggg
gi|9 : aaagtggcaaattaatcctggccgtttgtttttaatttggtatataaacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttc--G-CAT-GT----A-T-A-AGTTT-CA-T-GAGAATG--TT-AGA-TAAAAAT--C--CAC--G----A----T-T-GTAA-A-G-A---AAAATC-AA---T-AG-A---T--T----AAAATG--TTTTAAAAA------A-C-----T--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------AATGAATAAAAATAA-----------CAAAAACCCAC-------------TAA----CAAATCGTA-----------C-AGAAAACAAC---TTT--G-T--A----------------CAC-GGAATGCA-----------------------G------GG-G-A-GCC-TTT-TCGC-TCACTTT---CGCGAAGC-AAGG----G---TATACA-ATTT---T-GACCGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AC--CAT---C-----CAG-ATGT---------------TGCCCTTCATATGG-G---------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TA-----TCTTC-C-AAA---GC---ACATGTTT----AAATCAAA------------C--A-------A--TATATG----TCT-TGC-CCATTA-----TTT--A---AAGT--T----T-C--ATTT-----G--AA-TGA-AAAAAGAAAA-----A-AA--TCA-T-TTAA-CC-A--G---A-GTT--A-CGT-CGCTT---GGGCCATT---TT-GCA---C----CGGGGGAGGGGG-------G---------------------GGG-----------GGGT---------------A-----------AT----AA-T--A-AAGT-GTCCAT---A--G-TA-TCA-TTAT--GACC-T---AAT--A-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TCAATT-AATAC-CGggggggg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111111111111111111 2222 111111 2222222222222 11111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 1111111111111 1111111111111111 11111111111111 111111 99999999999999999999999999999999999999999999999999 11111 33333333333333333333333333 11111111 111111 11111 11111111 111 1 2222222 0000000000000000000000000000000000000000000000000 11111111111 33333333333333333333333333333333333333333333 22 3333333333
lowQualScore : 4 44 3 3 77 3 3 3 4 3 88888 44 3 3 55 6 66 3 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 3 2 7777 2 2 2 66 2 2 2 2 66 5 2 9999999999999999999999 3 3 666 2 777 8 5 555 2 2 444 33 1111 111111 33 0000000000000 66 33 88888888 5 8888 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 5555 3333333333333 88 888 2 2 6666666666666666 2 666 0 2 55 2 66666666666666 5 5 2 8 55 2 444 4 4 2 000000 444 888 2 444 2 7 2 33 33 33 77777777777777777777777777777777777777777777777777 2 33 2 0 2 2 2 33 4444 2 777 44444 6 3 3 555 555 77 7777 3 33333333333333333333333333 7777 2 3 5555 55555555 555555 44 44444 55 22222222 3 3 555 99999 3 55 1 777 3 3 3 777777 3 66 3 4 7 6666666 777 4 0000000000000000000000000000000000000000000000000 99999999999 88888888888888888888888888888888888888888888 3 3 4 666 55 3 3 3 22 3 2222222222 3 3 777 88 4 4
lowQualScore : . .. . . .. . . . . . ..... .. . . .. . .. . .. ............................................................................................................. .. . . .... . . . .. . . . . .. . . ...................... . . ... . ... . . ... . . ... .. .... ...... .. ............. .. .. ........ . .... ................................................................................. .... ............. .. ... . . ................ . ... . . .. . .............. . . . . .. . ... . . . ...... ... ... . ... . . . .. .. .. .................................................. . .. . . . . . .. .... . ... ..... . . . ... ... .. .... . .......................... .... . . .... ........ ...... .. ..... .. ........ . . ... ..... . .. . ... . . . ...... . .. . . . ....... ... . ................................................. ........... ............................................ . . . ... .. . . . .. . .......... . . ... .. . .
lowQualScore : 4 66 3 3 99 3 3 3 6 3 33333 66 3 3 88 7 55 3 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 1 9 6666 9 9 9 88 9 9 9 9 88 7 9 4444444444444444444444 1 1 555 9 999 6 7 000 7 7 777 77 3333 333333 77 3333333333333 88 66 22222222 7 9999 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 7777 7777777777777 88 222 5 5 6666666666666666 5 999 3 5 99 5 33333333333333 0 0 5 1 77 5 111 7 7 4 666666 444 888 5 444 5 5 7 77 77 77 00000000000000000000000000000000000000000000000000 7 77 7 9 7 7 9 99 8888 9 999 22222 2 1 1 444 444 88 1111 3 88888888888888888888888888 1111 5 3 4444 00000000 666666 66 44444 00 33333333 6 6 000 11111 6 00 4 222 6 6 6 444444 6 55 6 0 5 1111111 000 0 3333333333333333333333333333333333333333333333333 00000000000 33333333333333333333333333333333333333333333 6 6 9 444 00 6 6 6 22 6 9999999999 6 6 222 55 0 4
consensus : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-GTAA-A-G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--AAAA------A-CCG-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T-------------T------CAA----TA-----------C-AGAAAACAAC-TTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AC--CATA---C---ATGTA-----ATGCCCT-------TCA------G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-TGA--T-CA-TA-----TTT--N---AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G-------G---------------------GGG-----------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AGT-GCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
Reference ( family-225 ) : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-GTAA-A-G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--AAAA------A-CCG-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T-------------T------CAA----TA-----------C-AGAAAACAAC-TTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AC--CATA---C---ATGCA-----ATGCCCT-------T--------G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-TGA--T-CA-TA-----TTT--N---AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G-------G---------------------GGG-----------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AGT-GCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|1 : GTGGCAA--ATAGT-A--AATCCACT-GCGTTTT-G-----TTTTT--T-AT-TT--ATAA-TTATATATAAAAACAAT
gi|1 : atAACTT--G-CAT-GT---AA-T-AAG--TT-CA-T-GAAA-TG--T--AGA-TAAAATC--C---AC--G----T----T---GTAA-A-G-A---AAAATC-AA---T-AG-AAGTTAAT----AA---G--TTT--AAAA------AACTG-TTA--ATA---TGAA-----TA-AAG---A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------CACCCAATAAGAAAT------CAG----TA-----------CCAGAAAACAAA-CTTTT--G-TCCG----------------CAC-GGAATGCA---------------------------------G-A-GCCTTTT--CGCGTCACCTTGTCC-CGGAGC-AA-G----G---TATACA-AT-T---T-GAC-GAGA-AATGGAC-AGGGCAAA--G--AC--CATC---CTAGATGTA------TGCCCT-------T--------GCAATATGGGG-G--ATGAAAAAT-ACT-GTCAACCA-T-A---TA-----TC-TC-CCAAA---GC---ACTTT-GT----AAAT-AAA------------T--AA-----TA--TATATG----T-T-TGAACT-CA-TA-----TTT--TGCAAAGT--T-----AC--ATTT-----G--AAATGAAGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A--GGTGA-ACTG-T-CGT-GGGTT---GTCGCATT---GT-ATG---CACCGC----------G-------G---------------------GGGCAGCTGAGGACGGGT----AA---------------T-----GAGT-----A--A----A-AGTTGCCCAT---AAGG-TATGCA-TTAT-GAACC-TG-AGGTAAT-AGTGCAAACCG-ATAC-T-TTTA--CAATTCAATAC-ttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaaacttgcatgtaataagttcatgaaatgtagataaaatccacgttgtaaagaaaaatcaatagaagttaataagtttaaaaaactgttaatatgaataaagaataacaaacacccaataagaaatcagtaccagaaaacaaacttttgtccgcacggaatgcagagccttttcgcgtcaccttgtcccggagcaaggtatacaatttgacgagaaatggacagggcaaagaccatcctagatgtatgcccttgcaatatgggggatgaaaaatactgtcaaccatatatctcccaaagcactttgtaaataaataatatatatgtttgaactcatattttgcaaagttacatttgaaatgaagaagaaaaaatcatttaccaggtgaactgtcgtgggttgtcgcattgtatgcaccgcgggggcagctgaggacgggtaatgagtaaaagttgcccataaggtatgcattatgaacctgaggtaatagtgcaaaccgatacttttacaattcaatac
gi|10 : atgtggcaaatagtaaatccactgcgttttgttttttatttataattatatataaaaacaatttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaCAA--TTA-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TTC-AT-A-GTAT-TA--AAAACAAT
gi|10 : ATAACTT--G-CCT--T---TA-TTA-G--TTTCA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT-----TAC--GATTAT----T-T-GTAA-G-G-A---AAA-TTTAA---T-AG-A---T--TTAA-AA---C--TTT--GAA---------CCA-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------AA----------TAAAAATATCAACCCAAA------T-------------TTCAAATCAA----TA-----------C-AGAAAACAGC-TTTT---G-TC-A----------------CCT-GGAATGCA-C-AATC-AAT--A-T-------A------GG-GGA-GCCTTTT--CGC-TCACATT---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGAAC-AGGACAAA--G--GC--CAT----C--------------TGCCCT-------TCAATATG-G--------GG-G--AT-GAAA---A-T-G--AA--A-T-A---caaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgcctttattagtttcatgagatgttaggtaaaatttacgattatttgtaaggaaaatttaatagatttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaaaataaaaatatcaacccaaatttcaaatcaatacagaaaacagcttttgtcacctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggccatctgcccttcaatatgggggatgaaaatgaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|11 : caattataatccctgcgtttgatttttatttcatagtattaaaaacaatcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT--G-CAT-AT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAT---C--TGC--G----A----TAT-ACAA-G-G-AGGAAAA-TT-TA---T-GG-A---T--TTA--AA---A--CTT--AAA---------CCG-TTTT-GTACC-T--------TATAA----A------------------------AC----------TAA-----------CAAA------C-------------C------AAA----TAACAAATAATCCC-GGAAAACAGC-TTT----G-TC-A----------------CCC-GGTATGCA-C-AAAC-CAA--A-T-------A------GGAG-A-GCCTTT---CGC-TCACTTT---C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGCGTCT-GACAGA---AATGGAC--GGACAAT--G--AT--AATA------------------TGCCCT-------T--------CAATAT---GG-G--AT-AAAA-T-A-T-G--AA--A-T-A---TGAATAGTC-TCGC-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATAT---------------------------TT--G---AAGT--T-----AC--ATTT-----G--AA-T-A-GA----GAAA-----A-AA--TAA-TATT-G-AC-A--G---A-GTTT-A-CAT-TCGCT---G---GCTT---TTAGCA---C----C----------G-------GGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGG-----------GGGTGGGGA----------------T-----GG-TGGTTTA--ATGATA-AGT-GTCCAT---A--G-TA-ACA-TTAT-GAACC-TT-AACT----A-TCCGAACCG-ATAC-T-TTTA-TGAATC-AATGC-CGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|12 : TATCTT--GGCAT-GT---AC-T-A-G--T--CA-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--GAA--G----T----T-T-GTAA---G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----CAT--A--TTA--AAAA------A-CTT-CTT--GTACC-T--------TT-AA----A------------------------A-----------AAC-----------CAAA------T--------------------CAA----TA-------------AGAAAAAAATACTTTT--G-TC-A----------------CA--GGAAT-CA-C-AA-C-AATT-A-T-------T------GG-G-AAGCCTTT---CGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AATGTCATG---TA---A-CTGT---T-CACAGAGACAACGGAT-----CAA---G--AC--C-TA---C---ATT-------ATGCCCT-------TATATAT--G--------GGTG--AT-AAAAAT-A-T-G--AA----T-A---TG-----TC-TC-A-AAA---GC---AC--G-TT----AAAG-TAA------------C--A------TAA-TATATG----T-T-TGA--TTCA-TA-----TTT--TC--AAGT--T----AAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---AAAAAAATCA-AA--TCA-T-TT-ATCC-A--G---A-GTTG-ATCGT-C-GCTCA-A---CATTTTGTT-GTG---CGG--T----------G-------G---------------------GGG-----------GGTT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AGT-G-CCAT---A--G-CA-ACA-TTATGCAACC-TG-AAT-------TCCAAACGT-ACCC-TGTTTA--CAATT-AATAT-CGC
gi|13 : gttctccttctctgTGAACAGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CTCGCCGTTTGG-----TTTTT--T-ATATTG-AT-ATTTAT-TAT-AACACA
gi|13 : aaaTT--A-TAT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-G-GA-TGA-TT-AGG-TAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-GTAA-G-A-G---AAA-TC-A----T-AT-A---T--T----AA---G--TTT--TATA------A-ACT-TTT--GTACA-TA-------TGTAC----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T--------------------CAA----TA-----------C-A-AGAACAAC-TTTT---G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC--AT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTTCTCGC-TCACTTT---C-TG-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T---CAGAGAGAAC-GACAAAGACAAA--G--ACGACA-A---C---ATGT------ATGCCCT-------TCAATATG-G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-gcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgttatatactatagttcatggatgattaggtaaaatctaagtttgtaagagaaatcatatattaagttttataaacttttgtacatatgtacaataacaaatcaatacaagaacaacttttgtcacacggaatgcacaaacatatagggagccttttctcgctcactttctgagcaatgtaaatgttcagagagaacgacaaagacaaagacgacaacatgtatgcccttcaatatgggggataaaaata
gi|14 : aaatgaacagtggcaaatataatccctcgccgtttggttttttatattgatatttattataacacagcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatg-AG-A---T--TTCA-AA---G--TTT--AAA---------CCGTTTT--GTATCATTAAAGAAATA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------CTAAATGACAAA--T------CAA----TG-----------C-CGAAAACAAA--TTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-G-GAAC-AAT--A-T-------A------GGAG-A-GC--TTT-TCGC-TCACTTT---C-TG-AGC-AA-G----G---T----A-ATGT---T-GACAGAGATAA--GAC-AGGAAAAA--G--AC--CAT------------------ATGCCCTATCAATAT--------G--------GG-GGAAT-AAAATT-A-TAA--AA--A-T-A---TG-----TC-T--C-AAA---GG---ACATG--T----AAAC-AAA------------CG-A------TG--TATATG----TCT-TAA--T-CATTA-----TTT--G---AAAT--
gi|15 : gaaatgaaagtggcgatgataatctttgcagtttttaaaatagatatataaaaacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagattcGAA-AGTGGCAATTATG-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----TTTTT--T-A---------A-TTGT-TAT-AAAACAAT
gi|15 : T--G-CAT-GTATCTAGT-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAA-T--C--T-A--G----TACGAT-T-GTAA-G-G-A---AAATTC-AA---T-AG-A---T--TTAAAAA---G--TTT--AActatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|15 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctc------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T--------------------CAA----CA-----------C-AGAAAACAAC-TTTT---G-TT-T----------------CAC-AGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------AAG----GG-G-A-GCCTTTT--CGC---ACGTT---C-CG-AGC-GA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AAcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|16 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacat-G-A---AAA-TC-AA-----AG-A-----------AA---A-------AAAA------A------TT--CCAC---------------A----A------------------------A-----------CAA-----------AAAA----------------------------AA----TT-----------C-ACAAAACAAC--TTTT--G-TC-A----------------CAT-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-C-------A------GA-A-A-ACC-TTT-TCGC-TTACTTT---C-TG-AGC-GA-G----G---CA---A-ATGT---T-GTCGGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AT--CATATGTC---ATTCA-----ATA---T-------G--------G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA------A---TG-----TC-TT-C-AAA---GC---ACAT
gi|17 : T---C-CG-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACCGAGA-AACCGAC-AGGACAAA--G--AC--CATG---C---ATG-ACTTGTATGCCCT-------TCAATATG-G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-T-T--AA--A-T-A---TA-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------CATA------TA--TATATG----TCT-TGA--C-CATTA-----TTT--
gi|18 : AA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-G-CGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-A--A--TAT-TAT-AAAACAATg
gi|18 : ATAGCTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAtgatttctctctttctctctcatagcttgcatgtatagttcatgagatgttaggtaaaa
gi|19 : aaagtggcaaatataatccctgcgtttgttttttatttgaatattataaaacaattgatttctctctttctctctc----A----------------T-----AA-T-----AT-A----A-AGT-AACCAT---A--G-T------TTAT-GAACC-TGAGA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATAC-
gi|2 : ctgcattgcgtttattgtattagcgggagaaagagtgtgtgtaaaGGCAA--TTA-TTAC-A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TC--AT-A-GTAT-TATTAAAACAAT
gi|2 : ATAACTTTTG-CCT-GG---TA-T-A-GG-TT-CA-T-GAGA-TAGTTT-AGG-TAAAATTTAC--GAATTA----T----T-T-GTAACG-G-A---AAA-TTTAACTTT-AG-A---T--T------------TTT--AAAACTTTGAA-CCA-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------------------TAAAATATCAAC--CAAA------T-------------TTTAAT-CAA----TA-----------C-AGAAAACAGC-TTTTTTGG-TC-AAAAAAAAAAAAAACCCCCT-GGAATGCA-C-AATC-AAT--A-T-------AG-----GG-G-A-GCC-TTT-TCGC-TCACATT---C-CG-AGCAAA-G----G---TA---A-ATGT---T-GACAGAGA-AACGAAC-AGGACAAAGGG--GC--CAT-------------------TGCCCT-------TCAATAATGG--------GG-G--AT-GAA----A-T-G--AA--A-TAA---AG-----TCATC-C-AAT---GC---ACA----T----AAGT-AAA---------------------------------------------------G-----TTT--A---GAG-------------ATTT-----G--AA-TGA-GGG---AAAA-----A-AA--T-A-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTGAA-CGT-C-GCTTGGG---CATT---TT--TACACC----C----------GGGGGTTTG---------------------GGG-----------GGGT----GGTGGGTGTGGATTAATT-----GA-T-----A--A----A-TTT-TGTCATTTCA--G-TA-ACACTTA-TGAAGC-T--GACT--TAA-TCC-AACCG-ATAC-T-TTTATTCAAcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttttgcctggtataggttcatgagatagtttaggtaaaatttacgaattatttgtaacggaaaatttaactttagatttttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaataaaatatcaaccaaattttaatcaatacagaaaacagcttttttggtcaaaaaaaaaaaaaaccccctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggggccattgcccttcaataatgggggatgaaatgaaataaagtcatccaatgcacataagtaaagtttagagatttgaatgagggaaaaaaatatttaccagagttgaacgtcgcttgggcatttttacacccgggggtttgggggggtggtgggtgtggattaattgataaattttgtcatttcagtaacacttatgaagctgacttaatccaaccgatacttttattcaa
gi|20 : ggcaattattacatccctgcgtttgatttttattcatagtattattaaaacaatcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----A----------------T-----AA-T-----A--T----ATAGT-ATCCAT---A--G-TT-ACA-TTAT-GAACC-TG-AA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATA
gi|21 : gtttttgtatactagcaggaaaaagagtgtgttcaTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-G-AAAT-AAT--G-TACCGGTAA------GG-T-A-GCC-TTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-
gi|22 : AA-AGTGGAAA--ATA---A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A-TTAT-TAT-AAAA
gi|3 : atgaTGAA-AGGCGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-C-----TTTTT--TTAT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-TTGAGA-TG--TT-AGC-GAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-GTAT-A-G-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--T----AA---G--TTT--AAAA------A-CTG-TTT--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T-------------T------CAA----TA-----------C-AGAAAACAAC-TTTTT--G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-G-A-GCCTTTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-T----G---T----A-ATGT---TCAACAGAGA-AAAGGAC-AAGACAAA--G--AC--CATA---C---ATGCA-----GTGCC----------------------------G-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-ATA------------C--A------TA--TATATGTTATTCT-TAA--T-CA-TA-----TTT--C---AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TAA-T-TT-A-CC-A--G---A-GTTT-A-CGTACGGCT---G---CATT---TT-GTA---C----C----------G-------G---------------------GGG-----------GGGT----A----------------------GA-T-----A--A----A-GGT-GCCCAT---A--G-CA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACTG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|4 : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-T-C-CT-G-CGTTT-GGTTTTTTTTT--T-AT-TTG-ATAA-TTAT-TCC-TAAACAATt
gi|4 : gaaaATAA-TT--G-CAT-GTAG-TA-T---G--TT-CAAT-GAGA-GG--TT-AGG-TAAAATC--CCGTAC--G----AA---T-T-GTAA-A-ACA---AAA-TC-AA---TTAT-A---T--T----AA---AGTTTT--AAAA------A-ATG--------ACC-T--------TA-AA----AAATTAATAAAAAATAACACACCCAA-----------TAA-----------CAAA------A-------------T------CAA----TA-------------AGAAGACACC-TTTTT--G-TC-A-----------------ACAGGAATGTATC-AAAC-AATTAA-T-------AAATTAGGG-G-A-GC--GTT-TCGC-TCCCTTT---CTCG-AGC-AA-G----GTCATA---A-A-GT---T-GACCGAG--AACGGAC-AGGTTAAA--GTTAC--CGTA---C---ATGTA-----ATGtgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggttaaagttaccgtacatgtaatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|4 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctTT--A---AAGT--TACCGTAC--ATGT--------AA-TGA-GAAA--GAAA-----ATAA--TCAAT-TT-A-CC-A--G---A-GTTG-A-CGT-CGCCT---GG--CATT---TT-GCA---TGGA-C----------GAGG----G---------------------GGG-----------GGGT----A----------------TTCAATGA-T-----A--A----A-GTT-GTCCAT---A--G-TA-ACA-TTA-TGAACCGTG-AAC---T-A-TCCAAACCGCATACGT-TTTACCCAATT-AATACGCGCagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|5 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggTGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTTTAT-AT-TTG-GT-A-TT-T-TAT-AAAA-AAT
gi|5 : ATAACTTT-G-CATCGT---TA-----G--TT--A-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--TAA--G----T----T-TTGTAA-A-A-A---AAT-CC-AA---T-AATA---C--TC---AA---GA-TTT--AAAA------A-C-G-TTT--GTACC-T--------TA-AATAAAA------------------------A-----------TAA-----------CAAA------T--------------------CAA----TA-----------C-------------TTTT--G-TC-A----------------CAT-GGAATGCAAC-AAACCAAT--AAT-------A------GG-G-A-AGCCCTT-TCGC-TCACTTT---C-CG-AGC-AA-CT---G---TA---A-ATGT---T-CA-AGAGA-A-CGGAC-CGG-----------C--CATA---C---ATGTA------TGTCTT-------CAATATG--G--------GG-G--AT-AAAAATAA-T-G---A--A-T-A---TG-----TC-TC-C-AAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-GAA--T-CA-TAT----TTT--C---AAGT--T----TAC--A-TT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AAGA---A-GTTG-A-CGT-C-GCTG--G---CATT---TT-GTA---T----CCAGGGGGGGGG-------G---------------------GGG-----------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AGT-GCCCAT---A--GCCA-ACA-TTAATGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TC-ATT-AATAT-CGCtgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactttgcatcgttagttatgagatgtttaggtaaatctaagttttgtaaaaaaatccaataatactcaagatttaaaaacgtttgtaccttaaataaaaataacaaatcaatacttttgtcacatggaatgcaacaaaccaataatagggaagccctttcgctcactttccgagcaactgtaaatgttcaagagaacggaccggccatacatgtatgtcttcaatatgggggataaaaataatgaatatgtctccaaagcacatgttaaataaacatatatatgtctgaatcatattttcaagtttacattgaatgagaagaaaaaatcatttaccaagaagttgacgtcgctggcattttgtatccaggggggggggggggggtatgataaagtgcccatagccaacattaatgaacctgactatccaaaccgatactttatcattaatatcgc
gi|6 : tgaaagtggcaaatataatccctgccgtttgttttttatatttggtattttataaaaaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--------G--------GG-G--AT-AAAAAA-A-T-A--AA--A-G-AAGATGAGGC-TC-TC-C-GAAAAGGC---ACATG-CTGGGTAAAT-AAAATCTAACATTACC--AAAACCCTAATTATATG----TCTCTGA--T-C--TACTAGTTTT--C---AAGTGTT----TACCCATTTTTTTCGT-AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AA----A---TC-A-CC-A--G---ATGTTA-A-C
gi|7 : ttctctcttttctcattataacttgcacccccaacattgcttgaatagttcatttttgaaggatgtctgaagtacagcgcctgcaatcagactcctataggtttgactaaaatatagaaaatacacaaaatagctgaaggatttagaaaactgtttaggtgtaccgtttaaaaaaacataagcgaaataattaacagaataatacctatacactttggtacacatgggaatttgcaatgcaacctacaaatatgttaggggagcgcttttatcgccctcgtacaacttatttctcctataagctaattgttacattatgcattcacagcagaaacggcactgaggttatttccaactgacattcgtcataattggcctcgcccctcttcgaataatggA-AGTG-CAA--ATA-T-AGAA-TCC-CT--CCGTTT-G------TTTT--T-AT-TTGAAT-A-TTTT-TA--AAACCAATcagacatgtttgtgaaacgtcgctg
gi|7 : AT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-T----T-AGG-TAAAAT---C--TAA-------T----T-T-GTAA-A-G-AG--AAA-TC-AA---T-AT-A---T--T----AA---G--TTT--TAAA--------CTG-TTT--GTAC--T--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------AAAA------T--------------------CAA----TA-----------C-AGATAACAAC-TTTT---G-TC-A----------------CAC-GGAATGCA-CAAAAC-AAT--A-T-------A-------G-G-A-GTCTTTT-TCGC-TCAC-TT---C-CG-AGC-AA-T----G---AA---ACATGT---C-A--AGAGA-AACGGAC-AAGACAAA--G--AC--CATA---C---AT--------ATG--------------------G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--ATT-A---TG-----TC-AT-C-AAA---CC---ACATG--T----ACAT-AAA------------C---------TA--TATATG----TCT-TGA--T-CA-T-------------------------------ATCT-----G--AA-TGA-GAA---GAAA-----A-AAATTCA---TT-A-CC-A------A-GTTT-A--AT-C-ACT---G---CATT---TT-GTA---C----CCGGGCGGGGGG-------G---------------------GGG-----------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AGT-GCCCAG---A--G-CA-ACA-TTA-TGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-tgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattatactatagttcatgagattaggtaaaatctaatttgtaaagagaaatcaatatattaagttttaaactgtttgtacttaaaaaaaaaaatcaatacagataacaacttttgtcacacggaatgcacaaaacaatataggagtctttttcgctcacttccgagcaatgaaacatgtcaagagaaacggacaagacaaagaccatacatatgggggataaaaatatgaaattatgtcatcaaaccacatgtacataaactatatatgtcttgatcatatctgaatgagaagaaaaaaattcattaccaagtttaatcactgcattttgtacccgggcgggggggggggggtatgataaagtgcccagagcaacattatgaacctgactatccaaaccgttacttttatcaattaatacc
gi|8 : aagtgcaaatatagaatccctccgtttgtttttatttgaatatttttaaaaccaattgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattAA-AGTGGCAA--AT--T-A--A-TCC-TG-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A--TAT------AAACAAT
gi|8 : ATAACTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGGGTAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-GTAA-AAG-A---AAA-TC-AA---T-AG-A---T--C----AA---G--TTT--AAAA------AACTG-TTTTTGTACC-T--------TA-AA----AAAA---------------------A-----------TAA-----------CAAA--------------------T------CAA----TT-----------A-AGAAAACAAA-ATTTT--GTTC-A----------------CAT-GG-ATGCA-C-AAAC-AAT--A-T-------A------GG-GAA-GCCCTTT-TCGC-TCACTTT---C-TA-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T-CACAGAGA-AACGGAC-AGGA---------AC--CATA---C---ATGT------ATGCCCT-------TCATATG--G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-AT--TG-----TC-TC-C-AAA---GCAGTACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------T---TATATA----ACT-TGA--T-CA-TA-----TTTTCC---AAGT--T----TAC--ATTT-----GAAAA-TGA-GAAAG-AAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CCTA--G---A-GTTG-A-CGT-C-GCT---G---GATT---TT-GTAT--C----C----------G-------G---------------------TGG-----------GGGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcataacttgcatgtatagttcatgagatgttagggtaaaatctaagtttgtaaaagaaaatcaatagatcaagtttaaaaaactgtttttgtaccttaaaaaaaataacaaatcaattaagaaaacaaaattttgttcacatggatgcacaaacaatatagggaagcccttttcgctcactttctaagcaatgtaaatgttcacagagaaacggacaggaaccatacatgtatgcccttcatatgggggataaaaatatgaaatattgtctccaaagcagtacatgttaaataaacattatataacttgatcatattttccaagtttacatttgaaaatgagaaagaaaaaaatcatttacctagagttgacgtcgctggattttgtatccggtgggggggggggg
gi|9 : aaagtggcaaattaatcctggccgtttgtttttaatttggtatataaacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttc--G-CAT-GT----A-T-A-AGTTT-CA-T-GAGAATG--TT-AGA-TAAAAAT--C--CAC--G----A----T-T-GTAA-A-G-A---AAAATC-AA---T-AG-A---T--T----AAAATG--TTTTAAAAA------A-C-----T--GTACC-T--------TA-AA----A------------------------AATGAATAAAAATAA-----------CAAAAACCCAC-------------TAA----CAAATCGTA-----------C-AGAAAACAAC---TTT--G-T--A----------------CAC-GGAATGCA-----------------------G------GG-G-A-GCC-TTT-TCGC-TCACTTT---CGCGAAGC-AAGG----G---TATACA-ATTT---T-GACCGAGA-AACGGAC-AGGACAAA--G--AC--CATC---CAG-ATGT-------TGCCCT-------TCATATG--G--------GG-G--AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TA-----TCTTC-C-AAA---GC---ACATGTTT----AAATCAAA------------C--A-------A--TATATG----TCT-TGC--C-CATTA-----TTT--A---AAGT--T----T-C--ATTT-----G--AA-TGA-AAAAAGAAAA-----A-AA--TCA-T-TTAA-CC-A--G---A-GTT--A-CGT-CGCTT---GGGCCATT---TT-GCA---C----CGGGGGAGG--G-------G---------------------GGG-----------GGGG----G----------------T-----AA-T-----AATA----A-AGT-GTCCAT---A--G-TA-TCA-TTAT--GACC-T---AAT--A-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TCAATT-AATAC-CGggggggg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111111111111111111 1111111 222222222222 1111111111111111111111 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222 11111111 1111111111111111 11111 22222222222222 1 11111111111111 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 33333333333333333333333333 11111111 11111 111111111 11111111 111 111 1 2222222 111 999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 22 3333333333
lowQualScore : 4 44 3 3 77 3 3 3 4 3 88888 44 3 3 55 6 66 3 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 3 2 7777 2 2 2 66 2 2 2 2 66 5 2 6666666666666666666666 2 2 33 2222222 2 777 8 444 5 888 2 2 33 444 111111111111 55 2 5555555555555555555555 66 22222222 5 5555 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 33 444444444444 2 44444444 888 2 4 5555555555555555 2 444 00000 444 2 2 55 2 00000000000000 4 4 2 2 0 4 2 7777777 88888 4 33 2 2 999999 444 888 2 444 44444444444444 2 7 2 55 66666 66 33 33 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777 444 2 0 2 2 2 33 4444 2 777 44444 6 3 3 555 555 77 7777 3 33333333333333333333333333 7777 2 3 5555 55555555 55555 111111111 55 55555555 3 555 99999 3 55 1 777 3 3 3 111 3 66 3 4 7 6666666 111 4 4 555555555555555555555555555555555555555555555555 000000000000 88888888888888888888888888888888888888888888 3 3 4 666 55 3 3 3 22 3 2222222222 3 3 777 88 4 4
lowQualScore : . .. . . .. . . . . . ..... .. . . .. . .. . .. ............................................................................................................. .. . . .... . . . .. . . . . .. . . ...................... . . .. ....... . ... . ... . ... . . .. ... ............ .. . ...................... .. ........ . .... ........................................................................................ .... .. ............ . ........ ... . . ................ . ... ..... ... . . .. . .............. . . . . . . . ....... ..... . .. . . ...... ... ... . ... .............. . . . .. ..... .. .. .. ....................................................... ... . . . . . .. .... . ... ..... . . . ... ... .. .... . .......................... .... . . .... ........ ..... ......... .. ........ . ... ..... . .. . ... . . . ... . .. . . . ....... ... . . ................................................ ............ ............................................ . . . ... .. . . . .. . .......... . . ... .. . .
lowQualScore : 4 66 3 3 99 3 3 3 6 3 33333 66 3 3 88 7 55 3 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 1 9 6666 9 9 9 88 9 9 9 9 88 7 9 3333333333333333333333 9 9 99 0000000 7 333 0 777 3 333 5 5 44 444 444444444444 99 5 1111111111111111111111 33 33333333 3 7777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333 44 777777777777 5 55555555 666 4 7 6666666666666666 4 111 00000 111 4 4 66 4 77777777777777 7 7 4 4 0 7 4 6666666 66666 4 11 2 2 444444 111 222 4 111 66666666666666 4 1 5 99 22222 99 44 44 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 777 7 9 7 7 9 99 8888 9 999 22222 2 1 1 444 444 88 1111 3 88888888888888888888888888 1111 5 3 4444 00000000 11111 000000000 00 99999999 6 000 11111 6 00 4 222 6 6 6 444 6 55 6 0 5 1111111 000 0 0 888888888888888888888888888888888888888888888888 555555555555 33333333333333333333333333333333333333333333 6 6 9 444 00 6 6 6 22 6 9999999999 6 6 222 55 0 4
consensus : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC--CATAC---AT-G---T--AT-------GCCCT-T-----C-----------AATATG-G---GGGAT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
Reference ( family-225 ) : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC--CATAC---AT-G---TA-AT-------GCCCT-T-----C-----------A------G---GGGAT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|1 : GTGGCAA--ATAGT-A--AATCCACT-GCGTTTT-G-----TTTTT--T-AT-TT--ATAA-TTATATATAAAAACAAT
gi|1 : atAACTT--G-CAT-GT---AA-T-AAG--TT-CA-T-GAAA-TG--T--AGA-TAAAATC--C---AC--G----T----T---G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-AAGTTAAT----AA---G--TTTA-A-AAA------A-CTG-TTAAT----ATGAA--T--------AA-AG----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------AACA------C-----------C------CAA----T--AAGAAATCAGTACCAGAA-AACAAA-C------TTTT--G-TCCG----------------CAC-GGAA---TGCA---------------------------------------G-A-GC-C-TTT-TCGCGTC-------ACCTTG---TC-CCGG-AGC-AA-G----G---TATACA-AT-T---T-G------------AC-G-AGA-AATGG-AC--AGGGCA-----AA--G--AC--CATCCTAGAT-G---T--AT-------GCCCT-TG----C-----------AATATG-G---GGGATGAAAAAT-ACT-GTCAACCA-T-A---TA-----TC-TCC-CAAA---GC---ACTTT-GT----AAAT-AAA------------TA-A------TA--TATATG----T-T-TGAACT-CA-TA-----TTTTGCA-AAG---T----TAC--ATTT-----GA-AATGAAGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AGGTGA-ACTG-T-CGT-GGGTTGTCG---CATTG--TAT-GCA---C---C----------GC------G---------------------GGGGCAGCTGAGGACGGGTA---A----------------T-----GAGT-----A--A----A-AGTTGCCCAT---AAGG-TATGCA-TTA-TGAACC-TG-AGGTAAT-AGTGCAAACCG-ATAC-T-TTTA--CAATTCAATAC-ttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaaacttgcatgtaataagttcatgaaatgtagataaaatccacgttgtaaagaaaaatcaatagaagttaataagtttaaaaaactgttaatatgaataaagaataacaaacacccaataagaaatcagtaccagaaaacaaacttttgtccgcacggaatgcagagccttttcgcgtcaccttgtcccggagcaaggtatacaatttgacgagaaatggacagggcaaagaccatcctagatgtatgcccttgcaatatgggggatgaaaaatactgtcaaccatatatctcccaaagcactttgtaaataaataatatatatgtttgaactcatattttgcaaagttacatttgaaatgaagaagaaaaaatcatttaccaggtgaactgtcgtgggttgtcgcattgtatgcaccgcgggggcagctgaggacgggtaatgagtaaaagttgcccataaggtatgcattatgaacctgaggtaatagtgcaaaccgatacttttacaattcaatac
gi|10 : atgtggcaaatagtaaatccactgcgttttgttttttatttataattatatataaaaacaatttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaCAA--TTA-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TTC-AT-A-GTAT-TA--AAAACAAT
gi|10 : ATAACTT--G-CCT--T---TA-TTA-G--TTTCA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT-----TAC--GATTAT----T-T-G--TAA-G-----G-A---AAA-T---TTAA---T-AG-A--T---TTAA-AA---C--TTT--G-AA---------CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AA----------TAAAAATATCAACCCA-------A--A------T-----------TTCAAATCAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTT---G-T-CA----------------CCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------A------GG-GGA-GC-CTTTT--CGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AA--G--GC--CAT-C--------------T-------GCCCT-T-----C-----------AATATG-G---GGGAT-GAAA---A-T-G--AA--A-T-A---caaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgcctttattagtttcatgagatgttaggtaaaatttacgattatttgtaaggaaaatttaatagatttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaaaataaaaatatcaacccaaatttcaaatcaatacagaaaacagcttttgtcacctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggccatctgcccttcaatatgggggatgaaaatgaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|11 : caattataatccctgcgtttgatttttatttcatagtattaaaaacaatcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT--G-CAT-AT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAT---C--TGC--G----A----TAT-A--CAA-G-----G-AGGAAAA-T---T-TA---T-GG-A--T---TTA--AA---A--CTT--A-AA---------CCG-TT--TT---GTACC--T--------TATAA----A------------------------AC----------TAA-----------CA-------A--A------C-----------C------AAA----T--AACAAATAATCC-CGGAA-AACAGC-T------TT----G-T-CA----------------CCC-GGTA---TGCA---C-AA---AC-CA-A--A-T-------A------GGAG-A-GC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC----G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGCGTCT-G------------ACAG-A---AATGG-AC---GGACA-----AT--G--AT--AATA---------------T-------GCCCT-T-----C-----------A------ATATGGGAT-AAAA-T-A-T-G--AA--A-T-A---TGAATAGTC-T-CGCAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATAT---------------------------TT---G-AAGT--T-----AC--ATTT-----G--AAT--AGA----GAAA-----A-AA--TAA-TATT-G-AC-A---GA-GTTT-A-CAT-TCGCT---G---GCTT---T-TAGCA---C---C----------G-------GGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGG------------GGGTGGGGA----------------T-----GG-TGGTTTA--ATGATA-AG-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTAT-GAACC-TT-AACT----A-TCCGAACCG-ATAC-T-TTTA-TGAATC-AATGC-CGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|12 : TATCTT--GGCAT-GT---AC-T-A-G--T--CA-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--GAA--G----T----T-T-G--TAA-------G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----CAT--A--TTA--A-AAA------A-CTT-CT--T----GTACC--T--------TT-AA----A------------------------A-----------AAC-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A-------------AGAA-AAAAATAC------TTTT--G-T-CA----------------CA--GGAA---T-CA---C-AA----C-AA-TT-A-T-------T------GG-G-AAGC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AATGTCATG---TA---A-CTGT---T-C------------ACAG-AGACAACGG-AT------CA-----A---G--AC--C-TAC---AT-----TA--T-------GCCCT-TATATAT-----------G------G---GTGAT-AAAAAT-A-T-G--AA----T-A---TG-----TC-T-C-AAAA---GC---AC--G-TT----AAAG-TAA------------C--A------TAA-TATATG----T-T-TGA--TTCA-TA-----TTT---TCAAGT--T----AAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---AAAAAAATCA-AA--TCA-T-TT-ATCC-A---GA-GTTG-ATCGT-C-GCTCA-A---CATTTTGT-T-GTG---CGG-T----------G-------G---------------------GGG------------GGTT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TG-CCAT---A--G-CA-ACA-TTATGCAACC-TG-AAT-------TCCAAACGT-ACCC-TGTTTA--CAATT-AATAT-CGC
gi|13 : gttctccttctctgTGAACAGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CTCGCCGTTTGG-----TTTTT--T-ATATTG-AT-ATTTAT-TAT-AACACA
gi|13 : aaaTT--A-TAT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-G-GA-TGA-TT-AGG-TAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-G-----A-G---AAA-T---C-A----T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-ATA------A-ACT-TT--T----GTACA--TA-------TGTAC----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CA-AG-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC--A-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTTCTCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T---------------CAG-AGAGAAC-G-ACA-AAGACA-----AA--G--ACGACA-AC---AT-G---T--AT-------GCCCT-T-----C-----------AATATG-G---GGGAT-AAAAAT-A-gcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgttatatactatagttcatggatgattaggtaaaatctaagtttgtaagagaaatcatatattaagttttataaacttttgtacatatgtacaataacaaatcaatacaagaacaacttttgtcacacggaatgcacaaacatatagggagccttttctcgctcactttctgagcaatgtaaatgttcagagagaacgacaaagacaaagacgacaacatgtatgcccttcaatatgggggataaaaata
gi|14 : aaatgaacagtggcaaatataatccctcgccgtttggttttttatattgatatttattataacacagcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatg-AG-A--T---TTCA-AA---G--TTT--A-AA---------CCGTTT--T----GTATCA-TTAAAGAAATA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------CTAAATGACAAAT------CAA----T--G------------CCGAA-AACAAA--------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-GA---AC-AA-T--A-T-------A------GGAG-A-GC---TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-G----G---T----A-ATGT---T-G------------ACAG-AGATAA--G-AC--AGGAAA-----AA--G--AC--CAT---------------AT-------GCCCTAT-----C-----------AATATGGG---GGAAT-AAAATT-A-TAA--AA--A-T-A---TG-----TC-T---CAAA---GG---ACATG--T----AAAC-AAA------------CG-A------TG--TATATG----TCT-TAA--T-CATTA-----TTT---G-AAAT--
gi|15 : gaaatgaaagtggcgatgataatctttgcagtttttaaaatagatatataaaaacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagattcGAA-AGTGGCAATTATG-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----TTTTT--T-A---------A-TTGT-TAT-AAAACAAT
gi|15 : T--G-CAT-GTATCTAGT-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAA-T--C--T-A--G----TACGAT-T-G--TAA-G-----G-A---AAATT---C-AA---T-AG-A--T---TTAAAAA---G--TTT--A-Actatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|15 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctc------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----C--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTT---G-T-TT----------------CAC-AGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------AAG----GG-G-A-GC-CTTTT--CGC----------ACGT-----TC-C--G-AGC-GA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AAcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|16 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacat-----G-A---AAA-T---C-AA-----AG-A-----------AA---A-------A-AAA------A------T--T----CCAC----------------A----A------------------------A-----------CAA-----------AA-------A--A--------------------------AA----T--T------------CACAA-AACAAC--------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-C-------A------GA-A-A-AC-C-TTT-TCGC-TT-------ACTT-----TC-T--G-AGC-GA-G----G---CA---A-ATGT---T-G------------TCGG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AT--CAT-----AT-G---TC-AT-------TCAAT-A-----T-----------G------G---GGGAT-AAAAAT-A-T-G--AA------A---TG-----TC-T-T-CAAA---GC---ACAT
gi|17 : -----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACCG-AGA-AACCG-AC--AGGACA-----AA--G--AC--CATGC---AT-GACTTGTAT-------GCCCT-T-----C-----------AATATG-G---GGGAT-AAAAAT-A-T-T--AA--A-T-A---TA-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------CATA------TA--TATATG----TCT-TGA--C-CATTA-----TTT---
gi|18 : AA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-G-CGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-A--A--TAT-TAT-AAAACAATg
gi|18 : ATAGCTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAtgatttctctctttctctctcatagcttgcatgtatagttcatgagatgttaggtaaaa
gi|19 : aaagtggcaaatataatccctgcgtttgttttttatttgaatattataaaacaattgatttctctctttctctctc----A----------------T-----AA-T-----AT-A----A-AG-TAACCAT---A--G-T------TTAT-GAACC-TGAGA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATAC-
gi|2 : ctgcattgcgtttattgtattagcgggagaaagagtgtgtgtaaaGGCAA--TTA-TTAC-A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TC--AT-A-GTAT-TATTAAAACAAT
gi|2 : ATAACTTTTG-CCT-GG---TA-T-A-GG-TT-CA-T-GAGA-TAGTTT-AGG-TAAAATTTAC--GAATTA----T----T-T-G--TAACG-----G-A---AAA-T---TTAACTTT-AG-A--T---T------------TTT--A-AAACTTTGAA-CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------------------TAAAATATCAAC--CA-------A--A------T-----------TTTAAT-CAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTTTTGG-T-CAAAAAAAAAAAAAACCCCCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------AG-----GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGCAAA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AAGGG--GC--CAT----------------T-------GCCCT-T-----C-----------AATAATGG---GGGAT-GAA----A-T-G--AA--A-TAA---AG-----TCAT-C-CAAT---GC---ACA----T----AAGT-AAA---------------------------------------------------G-----TTT---A-GAG-------------ATTT-----G--AATG-AGGG---AAAA-----A-AA--T-A-T-TT-A-CC-A---GA-GTTGAA-CGT-C-GCTTGGG---CATT---T-T--TACACC---C----------GGGGGTTTG---------------------GGG------------GGGT----GGTGGGTGTGGATTAATT-----GA-T-----A--A----A-TT-TTGTCATTTCA--G-TA-ACACTTA-TGAAGC-T--GACT--TAA-TCC-AACCG-ATAC-T-TTTATTCAAcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttttgcctggtataggttcatgagatagtttaggtaaaatttacgaattatttgtaacggaaaatttaactttagatttttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaataaaatatcaaccaaattttaatcaatacagaaaacagcttttttggtcaaaaaaaaaaaaaaccccctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggggccattgcccttcaataatgggggatgaaatgaaataaagtcatccaatgcacataagtaaagtttagagatttgaatgagggaaaaaaatatttaccagagttgaacgtcgcttgggcatttttacacccgggggtttgggggggtggtgggtgtggattaattgataaattttgtcatttcagtaacacttatgaagctgacttaatccaaccgatacttttattcaa
gi|20 : ggcaattattacatccctgcgtttgatttttattcatagtattattaaaacaatcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----A----------------T-----AA-T-----A--T----ATAG-TATCCAT---A--G-TT-ACA-TTAT-GAACC-TG-AA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATA
gi|21 : gtttttgtatactagcaggaaaaagagtgtgttca------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-AA---AT-AA-T--G-TACCGGTAA------GG-T-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-
gi|22 : AA-AGTGGAAA--ATA---A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A-TTAT-TAT-AAAA
gi|3 : atgaTGAA-AGGCGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-C-----TTTTT--TTAT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-TTGAGA-TG--TT-AGC-GAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAT-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CTG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---T----A-ATGT---TCA------------ACAG-AGA-AAAGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC--CATAC---AT-G---CA-GT-------GCC---------------------------------GGAT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-ATA------------C--A------TA--TATATGTTATTCT-TAA--T-CA-TA-----TTT---C-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TAA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTT-A-CGTACGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------------GA-T-----A--A----A-GG-TGCCCAT---A--G-CA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACTG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|4 : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-T-C-CT-G-CGTTT-GGTTTTTTTTT--T-AT-TTG-ATAA-TTAT-TCC-TAAACAATt
gi|4 : gaaaATAA-TT--G-CAT-GTAG-TA-T---G--TT-CAAT-GAGA-GG--TT-AGG-TAAAATC--CCGTAC--G----AA---T-T-G--TAA-A-----ACA---AAA-T---C-AA---TTAT-A--T---T----AA---AGTTTT--A-AAA------A-ATG------------ACC--T--------TA-AA----AAATTAATAAAAAATAACACACCCAA-----------TAA-----------CA-------A--A------A-----------T------CAA----T--A-------------AGAA-GACACC-T------TTTT--G-T-CA-----------------ACAGGAA---TGTAT--C-AA---AC-AA-TTAA-T-------AAATTAGGG-G-A-GC---GTT-TCGC-TC-------CCTT-----TCTC--G-AGC-AA-G----GTCATA---A-A-GT---T-G------------ACCG-AG--AACGG-AC--AGGTTA-----AA--GTTAC--CGTAC---AT-G---TA-AT-------Gtgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggttaaagttaccgtacatgtaatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|4 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctTT---A-AAGT--TACCGTAC--ATGT--------AATG-AGAAA--GAAA-----ATAA--TCAAT-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGCCT---GG--CATT---T-T-GCA---TGGAC----------GAGG----G---------------------GGG------------GGGT----A----------------TTCAATGA-T-----A--A----A-GT-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTA-TGAACCGTG-AAC---T-A-TCCAAACCGCATACGT-TTTACCCAATT-AATACGCGCagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|5 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggTGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTTTAT-AT-TTG-GT-A-TT-T-TAT-AAAA-AAT
gi|5 : ATAACTTT-G-CATCGT---TA-----G--TT--A-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--TAA--G----T----T-TTG--TAA-A-----A-A---AAT-C---C-AA---T-AATA--C---TC---AA---GA-TTT--A-AAA------A-C-G-TT--T----GTACC--T--------TA-AATAAAA------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------C-------------------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCAA--C-AA---ACCAA-T--AAT-------A------GG-G-A-AG-CCCTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-CT---G---TA---A-ATGT---T-C------------A-AG-AGA-A-CGG-AC--CGG----------------C--CATAC---AT-G---TA--T-------GTC-T-T-----C-----------AATATG-G---GGGAT-AAAAATAA-T-G---A--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATG----TCT-GAA--T-CA-TAT----TTT---C-AAGT--T----TAC--A-TT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AAG-AA-GTTG-A-CGT-C-GCTG--G---CATT---T-T-GTA---T---CCAGGGGGGGGG-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TGCCCAT---A--GCCA-ACA-TTAATGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TC-ATT-AATAT-CGCtgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactttgcatcgttagttatgagatgtttaggtaaatctaagttttgtaaaaaaatccaataatactcaagatttaaaaacgtttgtaccttaaataaaaataacaaatcaatacttttgtcacatggaatgcaacaaaccaataatagggaagccctttcgctcactttccgagcaactgtaaatgttcaagagaacggaccggccatacatgtatgtcttcaatatgggggataaaaataatgaatatgtctccaaagcacatgttaaataaacatatatatgtctgaatcatattttcaagtttacattgaatgagaagaaaaaatcatttaccaagaagttgacgtcgctggcattttgtatccaggggggggggggggggtatgataaagtgcccatagccaacattaatgaacctgactatccaaaccgatactttatcattaatatcgc
gi|6 : tgaaagtggcaaatataatccctgccgtttgttttttatatttggtattttataaaaaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--TAG--G----T----T-T-GACTAA-AATATAG-A---AAA-TACAC-AAAA-T-AG-C--T---G----AA---GGATTT--AGAAA------A-CTG-TT--TAGGTGTACCGTT--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------CATAAGCGAA--A------T-------------------AA----TTAA------------CAGAATAATACC-TATACACTTTG--G-TACA----------------CAT-GGGAATTTGCAATGC-AACCTAC-AAAT--A-T-------GTTAG--GG-G-A-GCGCTTTTATCGC-CCTCGTACAACTTATTTCTC-C--T-A-T-AA-G----C---TA---A-TTGT---T-ACATTATGCATTCACAGCAGA-AACGGCACTGAGGTTATTTCCAACTG--AC---ATTC---GTCA---TA-ATTGGCCTCGCCCC-T-----CTTCGAATAATGG------G---GGGAT-AAAAAA-A-T-A--AA--A-G-AAGATGAGGC-TC-T-C-CGAAAAGGC---ACATG-CTGGGTAAAT-AAAATCTAACATTACC--AAAACCCTAATTATATG----TCTCTGA--T-C--TACTAGTTTT---C-AAGTGTT----TACCCATTTTTTTCGT-AATG-AGAA---GAAA-----A-AA----A---TC-A-CC-A---GATGTTA-A-C
gi|7 : ttctctcttttctcattataacttgcacccccaacattgcttgaatagttcatttttgaaggatgtctgaagtacagcgcctgcaatcagactcctaA-AGTG-CAA--ATA-T-AGAA-TCC-CT--CCGTTT-G------TTTT--T-AT-TTGAAT-A-TTTT-TA--AAACCAATcagacatgtttgtgaaacgtcgctg
gi|7 : AT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-T----T-AGG-TAAAAT---C--TAA-------T----T-T-G--TAA-A-----G-AG--AAA-T---C-AA---T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-AAA--------CTG-TT--T----GTAC---T--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------AA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CAGAT-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---CAAA---AC-AA-T--A-T-------A-------G-G-A-GT-CTTTT-TCGC-TC-------AC-T-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---AA---ACATGT---C-A--------------AG-AGA-AACGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC--CATAC---AT--------AT-------G------------------------------G---GGGAT-AAAAAT-A-T-G--AA--ATT-A---TG-----TC-A-T-CAAA---CC---ACATG--T----ACAT-AAA------------C---------TA--TATATG----TCT-TGA--T-CA-T------------------------------ATCT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AAATTCA---TT-A-CC-A----A-GTTT-A--AT-C-ACT---G---CATT---T-T-GTA---C---CCGGGCGGGGGG-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TGCCCAG---A--G-CA-ACA-TTA-TGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-tgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattatactatagttcatgagattaggtaaaatctaatttgtaaagagaaatcaatatattaagttttaaactgtttgtacttaaaaaaaaaaatcaatacagataacaacttttgtcacacggaatgcacaaaacaatataggagtctttttcgctcacttccgagcaatgaaacatgtcaagagaaacggacaagacaaagaccatacatatgggggataaaaatatgaaattatgtcatcaaaccacatgtacataaactatatatgtcttgatcatatctgaatgagaagaaaaaaattcattaccaagtttaatcactgcattttgtacccgggcgggggggggggggtatgataaagtgcccagagcaacattatgaacctgactatccaaaccgttacttttatcaattaatacc
gi|8 : aagtgcaaatatagaatccctccgtttgtttttatttgaatatttttaaaaccaattgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattAA-AGTGGCAA--AT--T-A--A-TCC-TG-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A--TAT------AAACAAT
gi|8 : ATAACTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGGGTAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-AA----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---C----AA---G--TTT--A-AAA------AACTG-TT--TTT--GTACC--T--------TA-AA----AAAA---------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------------------T------CAA----T--T------------AAGAA-AACAAA-A------TTTT--GTT-CA----------------CAT-GG-A---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-GAA-GC-CCTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--A-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T-C------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGA--------------AC--CATAC---AT-G---T--AT-------GCCCT-T-----C-----------ATATG--G---GGGAT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-AT--TG-----TC-T-C-CAAA---GCAGTACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------T---TATATA----ACT-TGA--T-CA-TA-----TTTTC-C-AAGT--T----TAC--ATTT-----GAAAATG-AGAAAG-AAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CCTA---GA-GTTG-A-CGT-C-GCT---G---GATT---T-T-GTAT--C---C----------G-------G---------------------TGG------------GGGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcataacttgcatgtatagttcatgagatgttagggtaaaatctaagtttgtaaaagaaaatcaatagatcaagtttaaaaaactgtttttgtaccttaaaaaaaataacaaatcaattaagaaaacaaaattttgttcacatggatgcacaaacaatatagggaagcccttttcgctcactttctaagcaatgtaaatgttcacagagaaacggacaggaaccatacatgtatgcccttcatatgggggataaaaatatgaaatattgtctccaaagcagtacatgttaaataaacattatataacttgatcatattttccaagtttacatttgaaaatgagaaagaaaaaaatcatttacctagagttgacgtcgctggattttgtatccggtgggggggggggg
gi|9 : aaagtggcaaattaatcctggccgtttgtttttaatttggtatataaacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttc--G-CAT-GT----A-T-A-AGTTT-CA-T-GAGAATG--TT-AGA-TAAAAAT--C--CAC--G----A----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-A--T---T----AAAATG--TTTTAA-AAA------A-C-------T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AATGAATAAAAATAA-----------CA-------A--AAACCCAC-----------TAA----CAAATCGT--A------------CAGAA-AACAAC---------TTT--G-T--A----------------CAC-GGAA---TGCA-----------------------------G------GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TCGC--GAAGC-AAGG----G---TATACA-ATTT---T-G------------ACCG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC--CATCCAG-AT-G---T---T-------GCCCT-T-----C-----------ATATG--G---GGGAT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TA-----TCTT-C-CAAA---GC---ACATGTTT----AAATCAAA------------C--A-------A--TATATG----TCT-TGC--C-CATTA-----TTT---A-AAGT--T----T-C--ATTT-----G--AATG-AAAAAAGAAAA-----A-AA--TCA-T-TTAA-CC-A---GA-GTT--A-CGT-CGCTT---GGGCCATT---T-T-GCA---C---CGGGGGAGG--G-------G---------------------GGG------------GGGG----G----------------T-----AA-T-----AATA----A-AG-TGTCCAT---A--G-TA-TCA-TTAT--GACC-T---AAT--A-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TCAATT-AATAC-CGggggggg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111111111111111111 1111111 222222222222 1111111111111111111111 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222 11111111 1111111111111111 11111 22222222222222 1 11111111111111 111111 2222222222222222 11111 33333333333333333333333333 11111111 11111 111111111 11111111 111 111 1 2222222 111 999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 22 3333333333
lowQualScore : 4 44 3 3 77 3 3 3 4 3 88888 44 3 3 55 6 66 3 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 3 2 7777 2 2 2 66 2 2 2 2 66 5 2 6666666666666666666666 2 2 33 2222222 2 777 8 444 5 888 2 2 33 444 111111111111 55 2 5555555555555555555555 66 22222222 5 5555 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 33 444444444444 2 44444444 888 2 4 5555555555555555 2 444 00000 444 2 2 55 2 00000000000000 4 4 2 2 0 4 2 7777777 88888 4 33 2 2 999999 444 888 2 444 44444444444444 2 7 2 55 66666 66 33 000000 7777777777777777 22 2 2 2 88888 2 2 5 2 0 2 2 2 33 4444 2 777 44444 6 3 3 555 555 77 7777 3 33333333333333333333333333 99999 3 5555 55555555 55555 111111111 55 55555555 3 555 99999 3 55 1 777 3 3 3 111 3 66 3 4 7 6666666 111 4 4 555555555555555555555555555555555555555555555555 000000000000 88888888888888888888888888888888888888888888 3 3 4 666 55 3 3 3 22 3 2222222222 3 3 777 88 4 4
lowQualScore : . .. . . .. . . . . . ..... .. . . .. . .. . .. ............................................................................................................. .. . . .... . . . .. . . . . .. . . ...................... . . .. ....... . ... . ... . ... . . .. ... ............ .. . ...................... .. ........ . .... ........................................................................................ .... .. ............ . ........ ... . . ................ . ... ..... ... . . .. . .............. . . . . . . . ....... ..... . .. . . ...... ... ... . ... .............. . . . .. ..... .. .. ...... ................ .. . . . ..... . . . . . . . . .. .... . ... ..... . . . ... ... .. .... . .......................... ..... . .... ........ ..... ......... .. ........ . ... ..... . .. . ... . . . ... . .. . . . ....... ... . . ................................................ ............ ............................................ . . . ... .. . . . .. . .......... . . ... .. . .
lowQualScore : 4 66 3 3 99 3 3 3 6 3 33333 66 3 3 88 7 55 3 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 1 9 6666 9 9 9 88 9 9 9 9 88 7 9 3333333333333333333333 9 9 99 0000000 7 333 0 777 3 333 5 5 44 444 444444444444 99 5 1111111111111111111111 33 33333333 3 7777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333 44 777777777777 5 55555555 666 4 7 6666666666666666 4 111 00000 111 4 4 66 4 77777777777777 7 7 4 4 0 7 4 6666666 66666 4 11 2 2 444444 111 222 4 111 66666666666666 4 1 5 99 22222 99 44 666666 8888888888888888 66 7 7 7 11111 7 7 3 7 9 7 7 9 99 8888 9 999 22222 2 1 1 444 444 88 1111 3 88888888888888888888888888 66666 3 4444 00000000 11111 000000000 00 99999999 6 000 11111 6 00 4 222 6 6 6 444 6 55 6 0 5 1111111 000 0 0 888888888888888888888888888888888888888888888888 555555555555 33333333333333333333333333333333333333333333 6 6 9 444 00 6 6 6 22 6 9999999999 6 6 222 55 0 4
consensus : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
Reference ( family-225 ) : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|1 : GTGGCAA--ATAGT-A--AATCCACT-GCGTTTT-G-----TTTTT--T-AT-TT--ATAA-TTATATATAAAAACAAT
gi|1 : atAACTT--G-CAT-GT---AA-T-AAG--TT-CA-T-GAAA-TG--T--AGA-TAAAATC--C---AC--G----T----T---G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-AAGTTAAT----AA---G--TTTA-A-AAA------A-CTG-TTAAT----ATGAA--T--------AA-AG----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------AACA------C-----------C------CAA----T--AAGAAATCAGTACCAGAA-AACAAA-C------TTTT--G-TCCG----------------CAC-GGAA---TGCA---------------------------------------G-A-GC-C-TTT-TCGCGTC-------ACCTTG---TC-CCGG-AGC-AA-G----G---TATACA-AT-T---T-G------------AC-G-AGA-AATGG-AC--AGGGCA-----AA--G--AC------CATCCTAGAT--G-----TA-T-GCCCT-TGC----AAT-A-TGGGGG-ATGAAAAAT-ACT-GTCAACCA-T-A---TA-----TC-TCC-CAAA---GC---ACTTT-GT----AAAT-AAA------------TA-A------TA--TATATGT-----T-TGAACT-CA-TA-----TTTTGCA-AAG---T----TAC--ATTT-----GA-AATGAAGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AGGTGA-ACTG-T-CGT-GGGTTGTCG---CATTG--TAT-GCA---C---C----------GC------G---------------------GGGGCAGCTGAGGACGGGTA---A----------------T-----GAGT-----A--A----A-AGTTGCCCAT---AAGG-TATGCA-TTA-TGAACC-TG-AGGTAAT-AGTGCAAACCG-ATAC-T-TTTA--CAATTCAATAC-ttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaaacttgcatgtaataagttcatgaaatgtagataaaatccacgttgtaaagaaaaatcaatagaagttaataagtttaaaaaactgttaatatgaataaagaataacaaacacccaataagaaatcagtaccagaaaacaaacttttgtccgcacggaatgcagagccttttcgcgtcaccttgtcccggagcaaggtatacaatttgacgagaaatggacagggcaaagaccatcctagatgtatgcccttgcaatatgggggatgaaaaatactgtcaaccatatatctcccaaagcactttgtaaataaataatatatatgtttgaactcatattttgcaaagttacatttgaaatgaagaagaaaaaatcatttaccaggtgaactgtcgtgggttgtcgcattgtatgcaccgcgggggcagctgaggacgggtaatgagtaaaagttgcccataaggtatgcattatgaacctgaggtaatagtgcaaaccgatacttttacaattcaatac
gi|10 : atgtggcaaatagtaaatccactgcgttttgttttttatttataattatatataaaaacaatttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaCAA--TTA-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TTC-AT-A-GTAT-TA--AAAACAAT
gi|10 : ATAACTT--G-CCT--T---TA-TTA-G--TTTCA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT-----TAC--GATTAT----T-T-G--TAA-G-----G-A---AAA-T---TTAA---T-AG-A--T---TTAA-AA---C--TTT--G-AA---------CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AA----------TAAAAATATCAACCCA-------A--A------T-----------TTCAAATCAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTT---G-T-CA----------------CCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------A------GG-GGA-GC-CTTTT--CGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AA--G--GC------CAT-C----------------T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-GAAA---A-T-G--AA--A-T-A---caaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgcctttattagtttcatgagatgttaggtaaaatttacgattatttgtaaggaaaatttaatagatttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaaaataaaaatatcaacccaaatttcaaatcaatacagaaaacagcttttgtcacctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggccatctgcccttcaatatgggggatgaaaatgaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|11 : caattataatccctgcgtttgatttttatttcatagtattaaaaacaatcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT--G-CAT-AT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAT---C--TGC--G----A----TAT-A--CAA-G-----G-AGGAAAA-T---T-TA---T-GG-A--T---TTA--AA---A--CTT--A-AA---------CCG-TT--TT---GTACC--T--------TATAA----A------------------------AC----------TAA-----------CA-------A--A------C-----------C------AAA----T--AACAAATAATCC-CGGAA-AACAGC-T------TT----G-T-CA----------------CCC-GGTA---TGCA---C-AA---AC-CA-A--A-T-------A------GGAG-A-GC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC----G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGCGTCT-G------------ACAG-A---AATGG-AC---GGACA-----AT--G--A---------TA--------A-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGG---AT-AAAA-T-A-T-G--AA--A-T-A---TGAATAGTC-T-CGCAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATAT---------------------------TT---G-AAGT--T-----AC--ATTT-----G--AAT--AGA----GAAA-----A-AA--TAA-TATT-G-AC-A---GA-GTTT-A-CAT-TCGCT---G---GCTT---T-TAGCA---C---C----------G-------GGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGG------------GGGTGGGGA----------------T-----GG-TGGTTTA--ATGATA-AG-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTAT-GAACC-TT-AACT----A-TCCGAACCG-ATAC-T-TTTA-TGAATC-AATGC-CGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|12 : TATCTT--GGCAT-GT---AC-T-A-G--T--CA-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--GAA--G----T----T-T-G--TAA-------G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----CAT--A--TTA--A-AAA------A-CTT-CT--T----GTACC--T--------TT-AA----A------------------------A-----------AAC-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A-------------AGAA-AAAAATAC------TTTT--G-T-CA----------------CA--GGAA---T-CA---C-AA----C-AA-TT-A-T-------T------GG-G-AAGC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AATGTCATG---TA---A-CTGT---T-C------------ACAG-AGACAACGG-AT------CA-----A---G--AC------C-TAC---AT--------TA-T-GCCCT-T-A----TAT-A-TGGGTG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA----T-A---TG-----TC-T-C-AAAA---GC---AC--G-TT----AAAG-TAA------------C--A------TAA-TATATGT-----T-TGA--TTCA-TA-----TTT---TCAAGT--T----AAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---AAAAAAATCA-AA--TCA-T-TT-ATCC-A---GA-GTTG-ATCGT-C-GCTCA-A---CATTTTGT-T-GTG---CGG-T----------G-------G---------------------GGG------------GGTT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TG-CCAT---A--G-CA-ACA-TTATGCAACC-TG-AAT-------TCCAAACGT-ACCC-TGTTTA--CAATT-AATAT-CGC
gi|13 : gttctccttctctgTGAACAGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CTCGCCGTTTGG-----TTTTT--T-ATATTG-AT-ATTTAT-TAT-AACACA
gi|13 : aaaTT--A-TAT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-G-GA-TGA-TT-AGG-TAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-G-----A-G---AAA-T---C-A----T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-ATA------A-ACT-TT--T----GTACA--TA-------TGTAC----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CA-AG-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC--A-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTTCTCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T---------------CAG-AGAGAAC-G-ACA-AAGACA-----AA--G--ACGA----CA-AC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-gcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgttatatactatagttcatggatgattaggtaaaatctaagtttgtaagagaaatcatatattaagttttataaacttttgtacatatgtacaataacaaatcaatacaagaacaacttttgtcacacggaatgcacaaacatatagggagccttttctcgctcactttctgagcaatgtaaatgttcagagagaacgacaaagacaaagacgacaacatgtatgcccttcaatatgggggataaaaata
gi|14 : aaatgaacagtggcaaatataatccctcgccgtttggttttttatattgatatttattataacacagcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatg-AG-A--T---TTCA-AA---G--TTT--A-AA---------CCGTTT--T----GTATCA-TTAAAGAAATA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------CTAAATGACAAAT------CAA----T--G------------CCGAA-AACAAA--------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-GA---AC-AA-T--A-T-------A------GGAG-A-GC---TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-G----G---T----A-ATGT---T-G------------ACAG-AGATAA--G-AC--AGGAAA-----AA--G--AC------CA----------------TA-T-GCCCTAT-C----AAT-A-TGGGGGAAT-AAAATT-A-TAA--AA--A-T-A---TG-----TC-T---CAAA---GG---ACATG--T----AAAC-AAA------------CG-A------TG--TATATGT----CT-TAA--T-CATTA-----TTT---G-AAAT--
gi|15 : gaaatgaaagtggcgatgataatctttgcagtttttaaaatagatatataaaaacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagattcGAA-AGTGGCAATTATG-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----TTTTT--T-A---------A-TTGT-TAT-AAAACAAT
gi|15 : T--G-CAT-GTATCTAGT-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAA-T--C--T-A--G----TACGAT-T-G--TAA-G-----G-A---AAATT---C-AA---T-AG-A--T---TTAAAAA---G--TTT--A-Actatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|15 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctc------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----C--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTT---G-T-TT----------------CAC-AGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------AAG----GG-G-A-GC-CTTTT--CGC----------ACGT-----TC-C--G-AGC-GA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AAcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|16 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacat-----G-A---AAA-T---C-AA-----AG-A-----------AA---A-------A-AAA------A------T--T----CCAC----------------A----A------------------------A-----------CAA-----------AA-------A--A--------------------------AA----T--T------------CACAA-AACAAC--------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-C-------A------GA-A-A-AC-C-TTT-TCGC-TT-------ACTT-----TC-T--G-AGC-GA-G----G---CA---A-ATGT---T-G------------TCGG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AT------CA----------------TA-T-GTCAT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA------A---TG-----TC-T-T-CAAA---GC---ACAT
gi|17 : -----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACCG-AGA-AACCG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATGC---AT--GACTTGTA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-T--AA--A-T-A---TA-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------CATA------TA--TATATGT----CT-TGA--C-CATTA-----TTT---
gi|18 : AA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-G-CGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-A--A--TAT-TAT-AAAACAATg
gi|18 : ATAGCTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAtgatttctctctttctctctcatagcttgcatgtatagttcatgagatgttaggtaaaa
gi|19 : aaagtggcaaatataatccctgcgtttgttttttatttgaatattataaaacaattgatttctctctttctctctc----A----------------T-----AA-T-----AT-A----A-AG-TAACCAT---A--G-T------TTAT-GAACC-TGAGA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATAC-
gi|2 : ctgcattgcgtttattgtattagcgggagaaagagtgtgtgtaaaGGCAA--TTA-TTAC-A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TC--AT-A-GTAT-TATTAAAACAAT
gi|2 : ATAACTTTTG-CCT-GG---TA-T-A-GG-TT-CA-T-GAGA-TAGTTT-AGG-TAAAATTTAC--GAATTA----T----T-T-G--TAACG-----G-A---AAA-T---TTAACTTT-AG-A--T---T------------TTT--A-AAACTTTGAA-CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------------------TAAAATATCAAC--CA-------A--A------T-----------TTTAAT-CAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTTTTGG-T-CAAAAAAAAAAAAAACCCCCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------AG-----GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGCAAA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AAGGG--GC------CAT------------------T-GCCCT-T-C----AATAA-TGGGGG-AT-GAA----A-T-G--AA--A-TAA---AG-----TCAT-C-CAAT---GC---ACA----T----AAGT-AAA---------------------------------------------------G-----TTT---A-GAG-------------ATTT-----G--AATG-AGGG---AAAA-----A-AA--T-A-T-TT-A-CC-A---GA-GTTGAA-CGT-C-GCTTGGG---CATT---T-T--TACACC---C----------GGGGGTTTG---------------------GGG------------GGGT----GGTGGGTGTGGATTAATT-----GA-T-----A--A----A-TT-TTGTCATTTCA--G-TA-ACACTTA-TGAAGC-T--GACT--TAA-TCC-AACCG-ATAC-T-TTTATTCAAcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttttgcctggtataggttcatgagatagtttaggtaaaatttacgaattatttgtaacggaaaatttaactttagatttttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaataaaatatcaaccaaattttaatcaatacagaaaacagcttttttggtcaaaaaaaaaaaaaaccccctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggggccattgcccttcaataatgggggatgaaatgaaataaagtcatccaatgcacataagtaaagtttagagatttgaatgagggaaaaaaatatttaccagagttgaacgtcgcttgggcatttttacacccgggggtttgggggggtggtgggtgtggattaattgataaattttgtcatttcagtaacacttatgaagctgacttaatccaaccgatacttttattcaa
gi|20 : ggcaattattacatccctgcgtttgatttttattcatagtattattaaaacaatcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----A----------------T-----AA-T-----A--T----ATAG-TATCCAT---A--G-TT-ACA-TTAT-GAACC-TG-AA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATA
gi|21 : gtttttgtatactagcaggaaaaagagtgtgttca------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-AA---AT-AA-T--G-TACCGGTAA------GG-T-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-
gi|22 : AA-AGTGGAAA--ATA---A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A-TTAT-TAT-AAAA
gi|3 : atgaTGAA-AGGCGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-C-----TTTTT--TTAT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-TTGAGA-TG--TT-AGC-GAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAT-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CTG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---TA---A--TGT---TCA------------ACAG-AGA-AAAGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----CAGT-GCC--------------------GG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-ATA------------C--A------TA--TATATGTTATTCT-TAA--T-CA-TA-----TTT---C-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TAA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTT-A-CGTACGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------------GA-T-----A--A----A-GG-TGCCCAT---A--G-CA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACTG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|4 : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-T-C-CT-G-CGTTT-GGTTTTTTTTT--T-AT-TTG-ATAA-TTAT-TCC-TAAACAATt
gi|4 : gaaaATAA-TT--G-CAT-GTAG-TA-T---G--TT-CAAT-GAGA-GG--TT-AGG-TAAAATC--CCGTAC--G----AA---T-T-G--TAA-A-----ACA---AAA-T---C-AA---TTAT-A--T---T----AA---AGTTTT--A-AAA------A-ATG------------ACC--T--------TA-AA----AAATTAATAAAAAATAACACACCCAA-----------TAA-----------CA-------A--A------A-----------T------CAA----T--A-------------AGAA-GACACC-T------TTTT--G-T-CA-----------------ACAGGAA---TGTAT--C-AA---AC-AA-TTAA-T-------AAATTAGGG-G-A-GC---GTT-TCGC-TC-------CCTT-----TCTC--G-AGC-AA-G----GTCATA---A-A-GT---T-G------------ACCG-AG--AACGG-AC--AGGTTA-----AA--GTTAC------CGTAC---AT--G-----TA-tgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggttaaagttaccgtacatgtaatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|4 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctTT---A-AAGT--TACCGTAC--ATGT--------AATG-AGAAA--GAAA-----ATAA--TCAAT-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGCCT---GG--CATT---T-T-GCA---TGGAC----------GAGG----G---------------------GGG------------GGGT----A----------------TTCAATGA-T-----A--A----A-GT-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTA-TGAACCGTG-AAC---T-A-TCCAAACCGCATACGT-TTTACCCAATT-AATACGCGCatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|5 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggTGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTTTAT-AT-TTG-GT-A-TT-T-TAT-AAAA-AAT
gi|5 : ATAACTTT-G-CATCGT---TA-----G--TT--A-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--TAA--G----T----T-TTG--TAA-A-----A-A---AAT-C---C-AA---T-AATA--C---TC---AA---GA-TTT--A-AAA------A-C-G-TT--T----GTACC--T--------TA-AATAAAA------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------C-------------------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCAA--C-AA---ACCAA-T--AAT-------A------GG-G-A-AG-CCCTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-CT---G---TA---A-ATGT---T-C------------A-AG-AGA-A-CGG-AC--CGG----------------C------CATAC---AT--G-----TA-T-GTC-T-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAATAA-T-G---A--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-GAA--T-CA-TAT----TTT---C-AAGT--T----TAC--A-TT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AAG-AA-GTTG-A-CGT-C-GCTG--G---CATT---T-T-GTA---T---CCAGGGGGGGGG-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TGCCCAT---A--GCCA-ACA-TTAATGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TC-ATT-AATAT-CGCtgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactttgcatcgttagttatgagatgtttaggtaaatctaagttttgtaaaaaaatccaataatactcaagatttaaaaacgtttgtaccttaaataaaaataacaaatcaatacttttgtcacatggaatgcaacaaaccaataatagggaagccctttcgctcactttccgagcaactgtaaatgttcaagagaacggaccggccatacatgtatgtcttcaatatgggggataaaaataatgaatatgtctccaaagcacatgttaaataaacatatatatgtctgaatcatattttcaagtttacattgaatgagaagaaaaaatcatttaccaagaagttgacgtcgctggcattttgtatccaggggggggggggggggtatgataaagtgcccatagccaacattaatgaacctgactatccaaaccgatactttatcattaatatcgc
gi|6 : tgaaagtggcaaatataatccctgccgtttgttttttatatttggtattttataaaaaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--TAG--G----T----T-T-GACTAA-AATATAG-A---AAA-TACAC-AAAA-T-AG-C--T---G----AA---GGATTT--AGAAA------A-CTG-TT--TAGGTGTACCGTT--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------CATAAGCGAA--A------T-------------------AA----TTAA------------CAGAATAATACC-TATACACTTTG--G-TACA----------------CAT-GGGAATTTGCAATGC-AACCTAC-AAAT--A-T-------GTTAG--GG-G-A-GCGCTTTTATCGC-CCTCGTACAACTTATTTCTC-C--T-A-T-AA-G----C---TA---A-TTGT---T-ACATTATGCATTCACAGCAGA-AACGGCACTGAGGTTATTTCCAACTG--ACATTCGTCATA----ATTGG-----CC-TCGCCCC-T-CTTCGAAT-AATGGGGGGAT-AAAAAA-A-T-A--AA--A-G-AAGATGAGGC-TC-T-C-CGAAAAGGC---ACATG-CTGGGTAAAT-AAAATCTAACATTACC--AAAACCCTAATTATATGT----CTCTGA--T-C--TACTAGTTTT---C-AAGTGTT----TACCCATTTTTTTCGT-AATG-AGAA---GAAA-----A-AA----A---TC-A-CC-A---GATGTTA-A-C
gi|7 : ttctctcttttctcattataacttgcacccccaacattgcttgaatagttcatttttgaaggatgtctgaagtacagcgcctgcaatcagactcctaA-AGTG-CAA--ATA-T-AGAA-TCC-CT--CCGTTT-G------TTTT--T-AT-TTGAAT-A-TTTT-TA--AAACCAATcagacatgtttgtgaaacgtcgctg
gi|7 : AT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-T----T-AGG-TAAAAT---C--TAA-------T----T-T-G--TAA-A-----G-AG--AAA-T---C-AA---T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-AAA--------CTG-TT--T----GTAC---T--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------AA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CAGAT-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---CAAA---AC-AA-T--A-T-------A-------G-G-A-GT-CTTTT-TCGC-TC-------AC-T-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---AA---ACATGT---C-A--------------AG-AGA-AACGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC------CATAC--------------------------------AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--ATT-A---TG-----TC-A-T-CAAA---CC---ACATG--T----ACAT-AAA------------C---------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-T------------------------------ATCT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AAATTCA---TT-A-CC-A----A-GTTT-A--AT-C-ACT---G---CATT---T-T-GTA---C---CCGGGCGGGGGG-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TGCCCAG---A--G-CA-ACA-TTA-TGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-tgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattatactatagttcatgagattaggtaaaatctaatttgtaaagagaaatcaatatattaagttttaaactgtttgtacttaaaaaaaaaaatcaatacagataacaacttttgtcacacggaatgcacaaaacaatataggagtctttttcgctcacttccgagcaatgaaacatgtcaagagaaacggacaagacaaagaccatacatatgggggataaaaatatgaaattatgtcatcaaaccacatgtacataaactatatatgtcttgatcatatctgaatgagaagaaaaaaattcattaccaagtttaatcactgcattttgtacccgggcgggggggggggggtatgataaagtgcccagagcaacattatgaacctgactatccaaaccgttacttttatcaattaatacc
gi|8 : aagtgcaaatatagaatccctccgtttgtttttatttgaatatttttaaaaccaattgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattAA-AGTGGCAA--AT--T-A--A-TCC-TG-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A--TAT------AAACAAT
gi|8 : ATAACTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGGGTAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-AA----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---C----AA---G--TTT--A-AAA------AACTG-TT--TTT--GTACC--T--------TA-AA----AAAA---------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------------------T------CAA----T--T------------AAGAA-AACAAA-A------TTTT--GTT-CA----------------CAT-GG-A---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-GAA-GC-CCTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--A-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T-C------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGA--------------AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C-----AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-AT--TG-----TC-T-C-CAAA---GCAGTACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------T---TATATAA----CT-TGA--T-CA-TA-----TTTTC-C-AAGT--T----TAC--ATTT-----GAAAATG-AGAAAG-AAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CCTA---GA-GTTG-A-CGT-C-GCT---G---GATT---T-T-GTAT--C---C----------G-------G---------------------TGG------------GGGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcataacttgcatgtatagttcatgagatgttagggtaaaatctaagtttgtaaaagaaaatcaatagatcaagtttaaaaaactgtttttgtaccttaaaaaaaataacaaatcaattaagaaaacaaaattttgttcacatggatgcacaaacaatatagggaagcccttttcgctcactttctaagcaatgtaaatgttcacagagaaacggacaggaaccatacatgtatgcccttcatatgggggataaaaatatgaaatattgtctccaaagcagtacatgttaaataaacattatataacttgatcatattttccaagtttacatttgaaaatgagaaagaaaaaaatcatttacctagagttgacgtcgctggattttgtatccggtgggggggggggg
gi|9 : aaagtggcaaattaatcctggccgtttgtttttaatttggtatataaacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttc--G-CAT-GT----A-T-A-AGTTT-CA-T-GAGAATG--TT-AGA-TAAAAAT--C--CAC--G----A----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-A--T---T----AAAATG--TTTTAA-AAA------A-C-------T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AATGAATAAAAATAA-----------CA-------A--AAACCCAC-----------TAA----CAAATCGT--A------------CAGAA-AACAAC---------TTT--G-T--A----------------CAC-GGAA---TGCA-----------------------------G------GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TCGC--GAAGC-AAGG----G---TATACA-ATTT---T-G------------ACCG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATCCAG-AT--G-----T--T-GCCCT-T-C-----AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TA-----TCTT-C-CAAA---GC---ACATGTTT----AAATCAAA------------C--A-------A--TATATGT----CT-TGC--C-CATTA-----TTT---A-AAGT--T----T-C--ATTT-----G--AATG-AAAAAAGAAAA-----A-AA--TCA-T-TTAA-CC-A---GA-GTT--A-CGT-CGCTT---GGGCCATT---T-T-GCA---C---CGGGGGAGG--G-------G---------------------GGG------------GGGG----G----------------T-----AA-T-----AATA----A-AG-TGTCCAT---A--G-TA-TCA-TTAT--GACC-T---AAT--A-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TCAATT-AATAC-CGggggggg
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111111111111111111 1111111 222222222222 1111111111111111111111 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222 11111111 1111111111111111 11111 22222222222222 1 11111111111111 111111 2222222222222222 11111 33333333333333333333333333 11111111 11111 111111111 11111111 111 111 1 2222222 111 999999999999999999999999999999999999999999999999 222222222222 33333333333333333333333333333333333333333333 22 3333333333
lowQualScore : 4 44 3 3 77 3 3 3 4 3 88888 44 3 3 55 6 66 3 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 3 2 7777 2 2 2 66 2 2 2 2 66 5 2 6666666666666666666666 2 2 33 2222222 2 777 8 444 5 888 2 2 33 444 111111111111 55 2 5555555555555555555555 66 22222222 5 5555 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 33 444444444444 2 44444444 888 2 4 5555555555555555 2 444 00000 444 2 2 55 2 00000000000000 4 4 2 2 0 4 2 7777777 88888 4 33 2 2 999999 444 888 2 444 44444444444444 2 7 2 55 66666 66 33 000000 7777777777777777 22 2 2 2 88888 2 2 5 2 0 2 2 2 33 4444 2 777 44444 6 3 3 555 555 77 7777 3 33333333333333333333333333 99999 3 5555 55555555 55555 111111111 55 55555555 3 555 99999 3 55 1 777 3 3 3 111 3 66 3 4 7 6666666 111 4 4 555555555555555555555555555555555555555555555555 000000000000 88888888888888888888888888888888888888888888 3 3 4 666 55 3 3 3 22 3 2222222222 3 3 777 88 4 4
lowQualScore : . .. . . .. . . . . . ..... .. . . .. . .. . .. ............................................................................................................. .. . . .... . . . .. . . . . .. . . ...................... . . .. ....... . ... . ... . ... . . .. ... ............ .. . ...................... .. ........ . .... ........................................................................................ .... .. ............ . ........ ... . . ................ . ... ..... ... . . .. . .............. . . . . . . . ....... ..... . .. . . ...... ... ... . ... .............. . . . .. ..... .. .. ...... ................ .. . . . ..... . . . . . . . . .. .... . ... ..... . . . ... ... .. .... . .......................... ..... . .... ........ ..... ......... .. ........ . ... ..... . .. . ... . . . ... . .. . . . ....... ... . . ................................................ ............ ............................................ . . . ... .. . . . .. . .......... . . ... .. . .
lowQualScore : 4 66 3 3 99 3 3 3 6 3 33333 66 3 3 88 7 55 3 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 1 9 6666 9 9 9 88 9 9 9 9 88 7 9 3333333333333333333333 9 9 99 0000000 7 333 0 777 3 333 5 5 44 444 444444444444 99 5 1111111111111111111111 33 33333333 3 7777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333 44 777777777777 5 55555555 666 4 7 6666666666666666 4 111 00000 111 4 4 66 4 77777777777777 7 7 4 4 0 7 4 6666666 66666 4 11 2 2 444444 111 222 4 111 66666666666666 4 1 5 99 22222 99 44 666666 8888888888888888 66 7 7 7 11111 7 7 3 7 9 7 7 9 99 8888 9 999 22222 2 1 1 444 444 88 1111 3 88888888888888888888888888 66666 3 4444 00000000 11111 000000000 00 99999999 6 000 11111 6 00 4 222 6 6 6 444 6 55 6 0 5 1111111 000 0 0 888888888888888888888888888888888888888888888888 555555555555 33333333333333333333333333333333333333333333 6 6 9 444 00 6 6 6 22 6 9999999999 6 6 222 55 0 4
consensus : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
Reference ( family-225 ) : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|1 : GTGGCAA--ATAGT-A--AATCCACT-GCGTTTT-G-----TTTTT--T-AT-TT--ATAA-TTATATATAAAAACAAT
gi|1 : atAACTT--G-CAT-GT---AA-T-AAG--TT-CA-T-GAAA-TG--T--AGA-TAAAATC--C---AC--G----T----T---G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-AAGTTAAT----AA---G--TTTA-A-AAA------A-CTG-TTAAT----ATGAA--T--------AA-AG----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------AACA------C-----------C------CAA----T--AAGAAATCAGTACCAGAA-AACAAA-C------TTTT--G-TCCG----------------CAC-GGAA---TGCA---------------------------------------G-A-GC-C-TTT-TCGCGTC-------ACCTTG---TC-CCGG-AGC-AA-G----G---TATACA-AT-T---T-G------------AC-G-AGA-AATGG-AC--AGGGCA-----AA--G--AC------CATCCTAGAT--G-----TA-T-GCCCT-TGC----AAT-A-TGGGGG-ATGAAAAAT-ACT-GTCAACCA-T-A---TA-----TC-TCC-CAAA---GC---ACTTT-GT----AAAT-AAA------------TA-A------TA--TATATGT-----T-TGAACT-CA-TA-----TTTTGCA-AAG---T----TAC--ATTT-----GA-AATGAAGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AGGTGA-ACTG-T-CGT-GGGTTGTCG---CATTG--TAT-GCA---C---C----------GC------G---------------------GGGGCAGCTGAGGACGGGTA---A----------------T-----GAGT-----A--A----A-AGTTGCCCAT---AAGG-TATGCA-TTA-TGAACC-TG-AGGTAAT-AGTGCAAACCG-ATAC-T-TTTA--CAATTCAATAC-ttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaaacttgcatgtaataagttcatgaaatgtagataaaatccacgttgtaaagaaaaatcaatagaagttaataagtttaaaaaactgttaatatgaataaagaataacaaacacccaataagaaatcagtaccagaaaacaaacttttgtccgcacggaatgcagagccttttcgcgtcaccttgtcccggagcaaggtatacaatttgacgagaaatggacagggcaaagaccatcctagatgtatgcccttgcaatatgggggatgaaaaatactgtcaaccatatatctcccaaagcactttgtaaataaataatatatatgtttgaactcatattttgcaaagttacatttgaaatgaagaagaaaaaatcatttaccaggtgaactgtcgtgggttgtcgcattgtatgcaccgcgggggcagctgaggacgggtaatgagtaaaagttgcccataaggtatgcattatgaacctgaggtaatagtgcaaaccgatacttttacaattcaatac
gi|10 : atgtggcaaatagtaaatccactgcgttttgttttttatttataattatatataaaaacaatttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaCAA--TTA-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TTC-AT-A-GTAT-TA--AAAACAAT
gi|10 : ATAACTT--G-CCT--T---TA-TTA-G--TTTCA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT-----TAC--GATTAT----T-T-G--TAA-G-----G-A---AAA-T---TTAA---T-AG-A--T---TTAA-AA---C--TTT--G-AA---------CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AA----------TAAAAATATCAACCCA-------A--A------T-----------TTCAAATCAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTT---G-T-CA----------------CCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------A------GG-GGA-GC-CTTTT--CGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AA--G--GC------CAT-C----------------T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-GAAA---A-T-G--AA--A-T-A---caaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgcctttattagtttcatgagatgttaggtaaaatttacgattatttgtaaggaaaatttaatagatttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaaaataaaaatatcaacccaaatttcaaatcaatacagaaaacagcttttgtcacctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggccatctgcccttcaatatgggggatgaaaatgaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|11 : caattataatccctgcgtttgatttttatttcatagtattaaaaacaatcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT--G-CAT-AT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAT---C--TGC--G----A----TAT-A--CAA-G-----G-AGGAAAA-T---T-TA---T-GG-A--T---TTA--AA---A--CTT--A-AA---------CCG-TT--TT---GTACC--T--------TATAA----A------------------------AC----------TAA-----------CA-------A--A------C-----------C------AAA----T--AACAAATAATCC-CGGAA-AACAGC-T------TT----G-T-CA----------------CCC-GGTA---TGCA---C-AA---AC-CA-A--A-T-------A------GGAG-A-GC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC----G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGCGTCT-G------------ACAG-A---AATGG-AC---GGACA-----AT--G--A---------TA--------A-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGG---AT-AAAA-T-A-T-G--AA--A-T-A---TGAATAGTC-T-CGCAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATAT---------------------------TT---G-AAGT--T-----AC--ATTT-----G--AAT--AGA----GAAA-----A-AA--TAA-TATT-G-AC-A---GA-GTTT-A-CAT-TCGCT---G---GCTT---T-TAGCA---C---C----------G-------GGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGGGGG------------GGGTGGGGA----------------T-----GG-TGGTTTA--ATGATA-AG-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTAT-GAACC-TT-AACT----A-TCCGAACCG-ATAC-T-TTTA-TGAATC-AATGC-CGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|12 : TATCTT--GGCAT-GT---AC-T-A-G--T--CA-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--GAA--G----T----T-T-G--TAA-------G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----CAT--A--TTA--A-AAA------A-CTT-CT--T----GTACC--T--------TT-AA----A------------------------A-----------AAC-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A-------------AGAA-AAAAATAC------TTTT--G-T-CA----------------CA--GGAA---T-CA---C-AA----C-AA-TT-A-T-------T------GG-G-AAGC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AATGTCATG---TA---A-CTGT---T-C------------ACAG-AGACAACGG-AT------CA-----A---G--AC------C-TAC---AT--------TA-T-GCCCT-T-A----TAT-A-TGGGTG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA----T-A---TG-----TC-T-C-AAAA---GC---AC--G-TT----AAAG-TAA------------C--A------TAA-TATATGT-----T-TGA--TTCA-TA-----TTT---TCAAGT--T----AAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---AAAAAAATCA-AA--TCA-T-TT-ATCC-A---GA-GTTG-ATCGT-C-GCTCA-A---CATTTTGT-T-GTG---CGG-T----------G-------G---------------------GGG------------GGTT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TG-CCAT---A--G-CA-ACA-TTATGCAACC-TG-AAT-------TCCAAACGT-ACCC-TGTTTA--CAATT-AATAT-CGC
gi|13 : gttctccttctctgTGAACAGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CTCGCCGTTTGG-----TTTTT--T-ATATTG-AT-ATTTAT-TAT-AACACA
gi|13 : aaaTT--A-TAT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-G-GA-TGA-TT-AGG-TAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-G-----A-G---AAA-T---C-A----T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-ATA------A-ACT-TT--T----GTACA--TA-------TGTAC----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CA-AG-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC--A-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTTCTCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T---------------CAG-AGAGAAC-G-ACA-AAGACA-----AA--G--ACGA----CA-AC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-gcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgttatatactatagttcatggatgattaggtaaaatctaagtttgtaagagaaatcatatattaagttttataaacttttgtacatatgtacaataacaaatcaatacaagaacaacttttgtcacacggaatgcacaaacatatagggagccttttctcgctcactttctgagcaatgtaaatgttcagagagaacgacaaagacaaagacgacaacatgtatgcccttcaatatgggggataaaaata
gi|14 : aaatgaacagtggcaaatataatccctcgccgtttggttttttatattgatatttattataacacagcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatg-AG-A--T---TTCA-AA---G--TTT--A-AA---------CCGTTT--T----GTATCA-TTAAAGAAATA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------CTAAATGACAAAT------CAA----T--G------------CCGAA-AACAAA--------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-GA---AC-AA-T--A-T-------A------GGAG-A-GC---TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-G----G---T----A-ATGT---T-G------------ACAG-AGATAA--G-AC--AGGAAA-----AA--G--AC------CA----------------TA-T-GCCCTAT-C----AAT-A-TGGGGGAAT-AAAATT-A-TAA--AA--A-T-A---TG-----TC-T---CAAA---GG---ACATG--T----AAAC-AAA------------CG-A------TG--TATATGT----CT-TAA--T-CATTA-----TTT---G-AAAT--
gi|15 : gaaatgaaagtggcgatgataatctttgcagtttttaaaatagatatataaaaacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagattcGAA-AGTGGCAATTATG-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----TTTTT--T-A---------A-TTGT-TAT-AAAACAAT
gi|15 : T--G-CAT-GTATCTAGT-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAA-T--C--T-A--G----TACGAT-T-G--TAA-G-----G-A---AAATT---C-AA---T-AG-A--T---TTAAAAA---G--TTT--A-Actatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|15 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctc------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----C--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTT---G-T-TT----------------CAC-AGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------AAG----GG-G-A-GC-CTTTT--CGC----------ACGT-----TC-C--G-AGC-GA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AAcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|16 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacat-----G-A---AAA-T---C-AA-----AG-A-----------AA---A-------A-AAA------A------T--T----CCAC----------------A----A------------------------A-----------CAA-----------AA-------A--A--------------------------AA----T--T------------CACAA-AACAAC--------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-C-------A------GA-A-A-AC-C-TTT-TCGC-TT-------ACTT-----TC-T--G-AGC-GA-G----G---CA---A-ATGT---T-G------------TCGG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AT------CA----------------TA-T-GTCAT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA------A---TG-----TC-T-T-CAAA---GC---ACAT
gi|17 : -----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACCG-AGA-AACCG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATGC---AT--GACTTGTA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-T--AA--A-T-A---TA-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------CATA------TA--TATATGT----CT-TGA--C-CATTA-----TTT---
gi|18 : AA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-G-CGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-A--A--TAT-TAT-AAAACAATg
gi|18 : ATAGCTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAtgatttctctctttctctctcatagcttgcatgtatagttcatgagatgttaggtaaaa
gi|19 : aaagtggcaaatataatccctgcgtttgttttttatttgaatattataaaacaattgatttctctctttctctctc----A----------------T-----AA-T-----AT-A----A-AG-TAACCAT---A--G-T------TTAT-GAACC-TGAGA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATAC-
gi|2 : ctgcattgcgtttattgtattagcgggagaaagagtgtgtgtaaaGGCAA--TTA-TTAC-A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TC--AT-A-GTAT-TATTAAAACAAT
gi|2 : ATAACTTTTG-CCT-GG---TA-T-A-GG-TT-CA-T-GAGA-TAGTTT-AGG-TAAAATTTAC--GAATTA----T----T-T-G--TAACG-----G-A---AAA-T---TTAACTTT-AG-A--T---T------------TTT--A-AAACTTTGAA-CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------------------TAAAATATCAAC--CA-------A--A------T-----------TTTAAT-CAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTTTTGG-T-CAAAAAAAAAAAAAACCCCCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------AG-----GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGCAAA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AAGGG--GC------CAT------------------T-GCCCT-T-C----AATAA-TGGGGG-AT-GAA----A-T-G--AA--A-TAA---AG-----TCAT-C-CAAT---GC---ACA----T----AAGT-AAA---------------------------------------------------G-----TTT---A-GAG-------------ATTT-----G--AATG-AGGG---AAAA-----A-AA--T-A-T-TT-A-CC-A---GA-GTTGAA-CGT-C-GCTTGGG---CATT---T-T--TACACC---C----------GGGGGTTTG---------------------GGG------------GGGT----GGTGGGTGTGGATTAATT-----GA-T-----A--A----A-TT-TTGTCATTTCA--G-TA-ACACTTA-TGAAGC-T--GACT--TAA-TCC-AACCG-ATAC-T-TTTATTCAAcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttttgcctggtataggttcatgagatagtttaggtaaaatttacgaattatttgtaacggaaaatttaactttagatttttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaataaaatatcaaccaaattttaatcaatacagaaaacagcttttttggtcaaaaaaaaaaaaaaccccctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggggccattgcccttcaataatgggggatgaaatgaaataaagtcatccaatgcacataagtaaagtttagagatttgaatgagggaaaaaaatatttaccagagttgaacgtcgcttgggcatttttacacccgggggtttgggggggtggtgggtgtggattaattgataaattttgtcatttcagtaacacttatgaagctgacttaatccaaccgatacttttattcaa
gi|20 : ggcaattattacatccctgcgtttgatttttattcatagtattattaaaacaatcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----A----------------T-----AA-T-----A--T----ATAG-TATCCAT---A--G-TT-ACA-TTAT-GAACC-TG-AA----T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATA
gi|21 : gtttttgtatactagcaggaaaaagagtgtgttca------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-AA---AT-AA-T--G-TACCGGTAA------GG-T-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-
gi|22 : AA-AGTGGAAA--ATA---A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A-TTAT-TAT-AAAA
gi|3 : atgaTGAA-AGGCGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-C-----TTTTT--TTAT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-TTGAGA-TG--TT-AGC-GAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAT-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CTG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---TA---A--TGT---TCA------------ACAG-AGA-AAAGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----CAGT-GCC--------------------GG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-ATA------------C--A------TA--TATATGTTATTCT-TAA--T-CA-TA-----TTT---C-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TAA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTT-A-CGTACGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------------GA-T-----A--A----A-GG-TGCCCAT---A--G-CA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACTG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|4 : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-T-C-CT-G-CGTTT-GGTTTTTTTTT--T-AT-TTG-ATAA-TTAT-TCC-TAAACAATt
gi|4 : gaaaATAA-TT--G-CAT-GTAG-TA-T---G--TT-CAAT-GAGA-GG--TT-AGG-TAAAATC--CCGTAC--G----AA---T-T-G--TAA-A-----ACA---AAA-T---C-AA---TTAT-A--T---T----AA---AGTTTT--A-AAA------A-ATG------------ACC--T--------TA-AA----AAATTAATAAAAAATAACACACCCAA-----------TAA-----------CA-------A--A------A-----------T------CAA----T--A-------------AGAA-GACACC-T------TTTT--G-T-CA-----------------ACAGGAA---TGTAT--C-AA---AC-AA-TTAA-T-------AAATTAGGG-G-A-GC---GTT-TCGC-TC-------CCTT-----TCTC--G-AGC-AA-G----GTCATA---A-A-GT---T-G------------ACCG-AG--AACGG-AC--AGGTTA-----AA--GTTAC------CGTAC---AT--G-----TA-tgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggttaaagttaccgtacatgtaatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|4 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctTT---A-AAGT--TACCGTAC--ATGT--------AATG-AGAAA--GAAA-----ATAA--TCAAT-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGCCT---GG--CATT---T-T-GCA---TGGAC----------GAGG----G---------------------GGG------------GGGT----A----------------TTCAATGA-T-----A--A----A-GT-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTA-TGAACCGTG-AAC---T-A-TCCAAACCGCATACGT-TTTACCCAATT-AATACGCGCatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|5 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggTGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTTTAT-AT-TTG-GT-A-TT-T-TAT-AAAA-AAT
gi|5 : ATAACTTT-G-CATCGT---TA-----G--TT--A-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--TAA--G----T----T-TTG--TAA-A-----A-A---AAT-C---C-AA---T-AATA--C---TC---AA---GA-TTT--A-AAA------A-C-G-TT--T----GTACC--T--------TA-AATAAAA------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------C-------------------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCAA--C-AA---ACCAA-T--AAT-------A------GG-G-A-AG-CCCTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-CT---G---TA---A-ATGT---T-C------------A-AG-AGA-A-CGG-AC--CGG----------------C------CATAC---AT--G-----TA-T-GTC-T-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAATAA-T-G---A--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-GAA--T-CA-TAT----TTT---C-AAGT--T----TAC--A-TT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AAG-AA-GTTG-A-CGT-C-GCTG--G---CATT---T-T-GTA---T---CCAGGGGGGGGG-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TGCCCAT---A--GCCA-ACA-TTAATGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TC-ATT-AATAT-CGCtgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactttgcatcgttagttatgagatgtttaggtaaatctaagttttgtaaaaaaatccaataatactcaagatttaaaaacgtttgtaccttaaataaaaataacaaatcaatacttttgtcacatggaatgcaacaaaccaataatagggaagccctttcgctcactttccgagcaactgtaaatgttcaagagaacggaccggccatacatgtatgtcttcaatatgggggataaaaataatgaatatgtctccaaagcacatgttaaataaacatatatatgtctgaatcatattttcaagtttacattgaatgagaagaaaaaatcatttaccaagaagttgacgtcgctggcattttgtatccaggggggggggggggggtatgataaagtgcccatagccaacattaatgaacctgactatccaaaccgatactttatcattaatatcgc
gi|6 : tgaaagtggcaaatataatccctgccgtttgttttttatatttggtattttataaaaaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--TAG--G----T----T-T-GACTAA-AATATAG-A---AAA-TACAC-AAAA-T-AG-C--T---G----AA---GGATTT--AGAAA------A-CTG-TT--TAGGTGTACCGTT--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------CATAAGCGAA--A------T-------------------AA----TTAA------------CAGAATAATACC-TATACACTTTG--G-TACA----------------CAT-GGGAATTTGCAATGC-AACCTAC-AAAT--A-T-------GTTAG--GG-G-A-GCGCTTTTATCGC-CCTCGTACAACTTATTTCTC-C--T-A-T-AA-G----C---TA---A-TTGT---T-ACATTATGCATTCACAGCAGA-AACGGCACTGAGGTTATTTCCAACTG--ACATTCGTCATA----ATTGG-----CC-TCGCCCC-T-CTTCGAAT-AATGGGGGGAT-AAAAAA-A-T-A--AA--A-G-AAGATGAGGC-TC-T-C-CGAAAAGGC---ACATG-CTGGGTAAAT-AAAATCTAACATTACC--AAAACCCTAATTATATGT----CTCTGA--T-C--TACTAGTTTT---C-AAGTGTT----TACCCATTTTTTTCGT-AATG-AGAA---GAAA-----A-AA----A---TC-A-CC-A---GATGTTA-A-C
gi|7 : ttctctcttttctcattataacttgcacccccaacattgcttgaatagttcatttttgaaggatgtctgaagtacagcgcctgcaatcagactcctaA-AGTG-CAA--ATA-T-AGAA-TCC-CT--CCGTTT-G------TTTT--T-AT-TTGAAT-A-TTTT-TA--AAACCAATcagacatgtttgtgaaacgtcgctg
gi|7 : AT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-T----T-AGG-TAAAAT---C--TAA-------T----T-T-G--TAA-A-----G-AG--AAA-T---C-AA---T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-AAA--------CTG-TT--T----GTAC---T--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------AA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CAGAT-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---CAAA---AC-AA-T--A-T-------A-------G-G-A-GT-CTTTT-TCGC-TC-------AC-T-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---AA---ACATGT---C-A--------------AG-AGA-AACGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC------CATAC--------------------------------AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--ATT-A---TG-----TC-A-T-CAAA---CC---ACATG--T----ACAT-AAA------------C---------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-T------------------------------ATCT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AAATTCA---TT-A-CC-A----A-GTTT-A--AT-C-ACT---G---CATT---T-T-GTA---C---CCGGGCGGGGGG-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T--------A----A-AG-TGCCCAG---A--G-CA-ACA-TTA-TGAACC-T--GAC---T-A-TCCAAACCG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-tgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattatactatagttcatgagattaggtaaaatctaatttgtaaagagaaatcaatatattaagttttaaactgtttgtacttaaaaaaaaaaatcaatacagataacaacttttgtcacacggaatgcacaaaacaatataggagtctttttcgctcacttccgagcaatgaaacatgtcaagagaaacggacaagacaaagaccatacatatgggggataaaaatatgaaattatgtcatcaaaccacatgtacataaactatatatgtcttgatcatatctgaatgagaagaaaaaaattcattaccaagtttaatcactgcattttgtacccgggcgggggggggggggtatgataaagtgcccagagcaacattatgaacctgactatccaaaccgttacttttatcaattaatacc
gi|8 : aagtgcaaatatagaatccctccgtttgtttttatttgaatatttttaaaaccaattgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattAA-AGTGGCAA--AT--T-A--A-TCC-TG-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A--TAT------AAACAAT
gi|8 : ATAACTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGGGTAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-AA----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---C----AA---G--TTT--A-AAA------AACTG-TT--TTT--GTACC--T--------TA-AA----AAAA---------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------------------T------CAA----T--T------------AAGAA-AACAAA-A------TTTT--GTT-CA----------------CAT-GG-A---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-GAA-GC-CCTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--A-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T-C------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGA--------------AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C-----AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-AT--TG-----TC-T-C-CAAA---GCAGTACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------T---TATATAA----CT-TGA--T-CA-TA-----TTTTC-C-AAGT--T----TAC--ATTT-----GAAAATG-AGAAAG-AAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CCTA---GA-GTTG-A-CGT-C-GCT---G---GATT---T-T-GTAT--C---C----------G-------G---------------------TGG------------GGGtnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcataacttgcatgtatagttcatgagatgttagggtaaaatctaagtttgtaaaagaaaatcaatagatcaagtttaaaaaactgtttttgtaccttaaaaaaaataacaaatcaattaagaaaacaaaattttgttcacatggatgcacaaacaatatagggaagcccttttcgctcactttctaagcaatgtaaatgttcacagagaaacggacaggaaccatacatgtatgcccttcatatgggggataaaaatatgaaatattgtctccaaagcagtacatgttaaataaacattatataacttgatcatattttccaagtttacatttgaaaatgagaaagaaaaaaatcatttacctagagttgacgtcgctggattttgtatccggtgggggggggggg
gi|9 : aaagtggcaaattaatcctggccgtttgtttttaatttggtatataaacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttc--G-CAT-GT----A-T-A-AGTTT-CA-T-GAGAATG--TT-AGA-TAAAAAT--C--CAC--G----A----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-A--T---T----AAAATG--TTTTAA-AAA------A-C-------T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AATGAATAAAAATAA-----------CA-------A--AAACCCAC-----------TAA----CAAATCGT--A------------CAGAA-AACAAC---------TTT--G-T--A----------------CAC-GGAA---TGCA-----------------------------G------GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TCGC--GAAGC-AAGG----G---TATACA-ATTT---T-G------------ACCG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATCCAG-AT--G-----T--T-GCCCT-T-C-----AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TA-----TCTT-C-CAAA---GC---ACATGTTT----AAATCAAA------------C--A-------A--TATATGT----CT-TGC--C-CATTA-----TTT---A-AAGT--T----T-C--ATTT-----G--AATG-AAAAAAGAAAA-----A-AA--TCA-T-TTAA-CC-A---GA-GTT--A-CGT-CGCTT---GGGCCATT---T-T-GCA---C---CGGGGGAGG--G-------G---------------------GGG------------GGGG----G----------------T-----AA-T-----AATA----A-AG-TGTCCAT---A--G-TA-TCA-TTAT--GACC-T---AAT--A-A-TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TCAATT-AATAC-CGggggggg
blockSeqs : . TT . T GA . . C C G GTTTT TA T A GA A TT . TT TT G C ATCT G T . GT T A T A GT T G TTTACGAATTAT A T AC AATATA C GGA T ACA T CTT T T . . TAAAAAG TA G ACTTTGAACCATTT GT TAAAGAAA T TAAA AATTAATAAAAAATAACACACCCAATAACAAAAT ATCG TA ACAAATAATCC T TATACAC TTG T A AAAAAAAAAAAAACCC A ATT ATGC CCT C A TA A ACCGGTAA A G A G T C . TCGTACA ATTTC T . A A TGTCAT TCA TAC C GTC ACATTATGCATTC C C C TG TTTCC GG TT ATTCGT TGCATGACTTG AG C A . TTCGA A A A . A . A . AT A AGA AATAG A . G AAG AGT TT GGGT C ATCTAACATTACCAAAACCCTAAT TATTC C TT TACTAGT TCC TTACCGT CC TTTTCGT . AAG AAATC T AT A TA A T T AG T GA T A C TGGG TTG . A CCGGGGGGGGGGGGCGGGGGGGGGG . GGTGGGTGTGGATTAATTGATAA T . T TTC . C . C TG G GACTTA . C TG TT . G
blockSeqs : . . . . C . . . C . . . . . C . G . T T . . AGT . . . G . . . . A T . TTTACGATTAT . . . CG . G A . T AA . . . . TAAAAC . . AACTGTTTAGGT A A T . AATGAATAAAAATAACAAAAACCCACTAA . . . . AC T . . . . . TC . . . T . AAATTAG A A . . T A . . . G . . . CT . . . . CA . G . A . CT . GA TCCAGATG A . . . A . . G . . . . . A . T AGGC T . . . . T . . CATATA C . T TTA TC TGTTT . GAA . AG . . . C AT . . . . . T . . G GGGC . . . CACCCGGGGGTTTG . GGGGATGGTGGTTTAATGAT . . A . . . . . TT . GGACTT . . GT CC . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . G . T . T . . . T . . . . . . . . . . . TCCCGTACGAA . . . AA . . . . . . . . . . TCAAAG . . AAACTGTTTTT . . . . AATAAAAATATCAACCCAAATTTCAAAT . . . . T T . . . . . AC . . . . . GTTAG . . . . T . . . . . . . . GG . . . . G . T . . . . . . TAATTGG A . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . CATAA C . C TTA G TTA . G . A . . . A T . . . . . G . . G CAA . . . TCCAGGGGGGGGGG . ATTCAATGATAA . . G . . . . . AT . TAACT . . T T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . G . G . T . . . A . . . . . . . . . . . TCTAGTACGA . . . G . . . . . . . . . . AAAATG . . AACTTCTT . . . . TAAAATATCAACCAAATTTTAAT . . . . T T . . . . . CA . . . . . AAG . . . . T . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . TACATG A . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . CGATG C . T TAT G TTT . G . . . . . C T . . . . . T . . G GG . . . CCCGGGCGGGGGGG . GTAATAATA . . T . . . . . T . GAGAT . . T T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . G . T . T . . . T . . . . . . . . . . . TTCTAAGT . . . G . . . . . . . . . . TAAAA . . AAACTTTT . . . . ATAACAAACTAAATGACAAAT . . . . T T . . . . . C . . . . . AG . . . . T . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . TACATG A . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . CATA C . T TTA A TTT . G . . . . . C T . . . . . G . . . GG . . . CCGGGGGAGGGG . ATAATATA . . C . . . . . T . GAACT . . T T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . G . T . T . . . T . . . . . . . . . . . ATCCACGA . . . G . . . . . . . . . . AAAGT . . AACTGTTT . . . . AAACATAAGCGAAAT . . . . T T . . . . . C . . . . . A . . . . T . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . TACATG A . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . CATA C . T TA C TTT . G . . . . . C T . . . . . G . . . G . . . TGGACGAGGG . ATAATAT . . T . . . . . T . GAAT . . T T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . G . T . C . . . T . . . . . . . . . . . TCTGCGA . . . G . . . . . . . . . . CAAGA . . CCGTTTT . . . . AAAATAACAAAT . . . . T T . . . . . C . . . . . A . . . . C . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . TACATG A . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . CATA C . T TA A TTT . G . . . . . C T . . . . . A . . . G . . . CGGTGG . ATGATA . . C . . . . . T . GAAT . . T T . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . G . T . T . . . T . . . . . . . . . . . TCGAAGT . . . A . . . . . . . . . . AAGGA . . CCGTTTT . . . . ACTAACAAACC . . . . T T . . . . . C . . . . . T . . . . T . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . TACAT A . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . CTA C . T TA C TT . G . . . . . C T . . . . . T . . . G . . . TCCGG . AGATAA . . C . . . . . T . GACT . . T T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G . T . . . . . T . . . . . . . . . . . TCTAAGT . . . A . . . . . . . . . . CATA . . AACGTTT . . . . ATAACAAATT . . . . T G . . . . . G . . . . . A . . . . T . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . ACATG A . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . CAT . . C G C . . G . . . . . . . . . . . . G . . . G . . . CCGG . ATGATA . . T . . . . . T . GACT . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTAAGT . . . A . . . . . . . . . . AAG . . ACTGTTT . . . . AAACCAAAT . . . . T T . . . . . C . . . . . A . . . . C . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . TAA C . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . CAA . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . ATGATA . . . . . . . . T . AATA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TCTAAGT . . . A . . . . . . . . . . AAA . . CCATTT . . . . ATAACAAAT . . . . A T . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . G . . . . . . . . TAC A . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . TCTAAT . . . A . . . . . . . . . . AAG . . AAATG . . . . ATAACAAAT . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . . C . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . AATT . . . . ATAACAAAT . . . . . . . . . . . G . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AAG . . AACT . . . . ACAAAAAA . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . AAAAAAAT . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : G* T* ** *** ** AACCGTTT************** ************ C**** A************* ***** ** *** TACATG********** ** A*** CATA********************** C**** T*** TA****** N**** TTT****** G******* *** G****** *** CCCGGGGGGGGGG*********************************** ************ ATGATAA************************************* ** GAACT***** T*
originalCons : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CATT---T-T-GTA---C---C----------G-------G---------------------GGG------------GGGT----A----------------T-----GA-T-----A--A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TG-GACT--T-A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
finalCons : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAAACCGTTT--------------GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCAC----AA---AC-AA-T--A-TA-------------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATACATG----------TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AAA---T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAACATA----------------------TATATGTC----T-TGAT---CATA------TTTN----AAGTTT------AC--ATTTG-------AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCTG------CATT---T-T-GTACCCGGGGGGGGGG-----------------------------------GGG------------GGGTATGATAA-------------------------------------A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TGAACT-----A-TCCAAACCG-ATAC-T-TTTAT-CAATT-AATAC-CGC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1111 1111111111111111111111 1111111 222222222222 1111111111111111111111 11111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 222222222222 11111111 1111111111111111 11111 22222222222222 1 11111111111111 111111 2222222222222222 11111 33333333333333333333333333 11111111 11111 111111111 11111111 111 111 1 2222222 111111 1111111 33333333333333333333333333333333333 22
lowQualScore : 4 44 3 3 77 3 3 3 4 3 88888 44 3 3 55 6 66 3 99 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 77 3 2 7777 2 2 2 66 2 2 2 2 66 5 2 6666666666666666666666 2 2 33 2222222 2 777 8 444 5 888 2 2 33 444 111111111111 55 2 5555555555555555555555 66 22222222 5 5555 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 5555 33 444444444444 2 44444444 888 2 4 5555555555555555 2 444 00000 444 2 2 55 2 00000000000000 4 4 2 2 0 4 2 7777777 88888 4 33 2 2 999999 444 888 2 444 44444444444444 2 7 2 55 66666 66 33 000000 7777777777777777 22 2 2 2 88888 2 2 5 2 0 2 2 2 33 4444 2 777 44444 6 3 3 555 555 77 7777 3 33333333333333333333333333 99999 3 5555 55555555 55555 111111111 55 55555555 3 555 99999 3 55 1 777 3 3 3 111 3 66 3 4 7 2222222 3 55 3 444444 3 66666 99999 99999 3 6666666 3 66666666666666666666666666666666666 3 3 4 666 55 3 3 3 22 3 5 9999999999 3 777 88 4 4
lowQualScore : . .. . . .. . . . . . ..... .. . . .. . .. . .. ............................................................................................................. .. . . .... . . . .. . . . . .. . . ...................... . . .. ....... . ... . ... . ... . . .. ... ............ .. . ...................... .. ........ . .... ........................................................................................ .... .. ............ . ........ ... . . ................ . ... ..... ... . . .. . .............. . . . . . . . ....... ..... . .. . . ...... ... ... . ... .............. . . . .. ..... .. .. ...... ................ .. . . . ..... . . . . . . . . .. .... . ... ..... . . . ... ... .. .... . .......................... ..... . .... ........ ..... ......... .. ........ . ... ..... . .. . ... . . . ... . .. . . . ....... . .. . ...... . ..... ..... ..... . ....... . ................................... . . . ... .. . . . .. . . .......... . ... .. . .
lowQualScore : 4 66 3 3 99 3 3 3 6 3 33333 66 3 3 88 7 55 3 11 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 33 1 9 6666 9 9 9 88 9 9 9 9 88 7 9 3333333333333333333333 9 9 99 0000000 7 333 0 777 3 333 5 5 44 444 444444444444 99 5 1111111111111111111111 33 33333333 3 7777 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 3333 44 777777777777 5 55555555 666 4 7 6666666666666666 4 111 00000 111 4 4 66 4 77777777777777 7 7 4 4 0 7 4 6666666 66666 4 11 2 2 444444 111 222 4 111 66666666666666 4 1 5 99 22222 99 44 666666 8888888888888888 66 7 7 7 11111 7 7 3 7 9 7 7 9 99 8888 9 999 22222 2 1 1 444 444 88 1111 3 88888888888888888888888888 66666 3 4444 00000000 11111 000000000 00 99999999 6 000 11111 6 00 4 222 6 6 6 444 6 55 6 0 5 8888888 6 00 6 222222 6 88888 11111 11111 6 8888888 6 88888888888888888888888888888888888 6 6 9 444 00 6 6 6 22 6 7 4444444444 6 222 55 0 4
consensus : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CA-TTT--T-GTAC-C--C-GGG-G-G---GG-----GGGG-----G-G-------GG-GT----A---------T-----GA-----TA-A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TGAAC-T--A----TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
Reference ( family-225 ) : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CCG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-TA-----TTT---N-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGGCT---G---CA-TTT--T-GTAC-C--C-GGG-G-G---GG-----GGGG-----G-G-------GG-GT----A---------T-----GA-----TA-A----A-AG-TGCCCAT---A--G-TA-ACA-TTATTGAACC-TGAAC-T--A----TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|1 : GTGGCAA--ATAGT-A--AATCCACT-GCGTTTT-G-----TTTTT--T-AT-TT--ATAA-TTATATATAAAAACAAT
gi|1 : atAACTT--G-CAT-GT---AA-T-AAG--TT-CA-T-GAAA-TG--T--AGA-TAAAATC--C---AC--G----T----T---G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-AAGTTAAT----AA---G--TTTA-A-AAA------A-CTG-TTAAT----ATGAA--T--------AA-AG----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------AACA------C-----------C------CAA----T--AAGAAATCAGTACCAGAA-AACAAA-C------TTTT--G-TCCG----------------CAC-GGAA---TGCA---------------------------------------G-A-GC-C-TTT-TCGCGTC-------ACCTTG---TC-CCGG-AGC-AA-G----G---TATACA-AT-T---T-G------------AC-G-AGA-AATGG-AC--AGGGCA-----AA--G--AC------CATCCTAGAT--G-----TA-T-GCCCT-TGC----AAT-A-TGGGGG-ATGAAAAAT-ACT-GTCAACCA-T-A---TA-----TC-TCC-CAAA---GC---ACTTT-GT----AAAT-AAA------------TA-A------TA--TATATGT-----T-TGAACT-CA-TA-----TTTTGCA-AAG---T----TAC--ATTT-----GA-AATGAAGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AGGTGA-ACTG-T-CGT-GGGTTGTCG---CA-TTG--T-ATGCAC--C-GCG-G-G---GGCAGCTGAGG-----A-C-------GG-GTA---A---------T-----GAG----TA-A----A-AGTTGCCCAT---AAGG-TATGCA-TTA-TGAACC-TGAGG-T--AATAGTGCAAACCG-ATAC-T-TTTA--CAATTCAATAC-ttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaaacttgcatgtaataagttcatgaaatgtagataaaatccacgttgtaaagaaaaatcaatagaagttaataagtttaaaaaactgttaatatgaataaagaataacaaacacccaataagaaatcagtaccagaaaacaaacttttgtccgcacggaatgcagagccttttcgcgtcaccttgtcccggagcaaggtatacaatttgacgagaaatggacagggcaaagaccatcctagatgtatgcccttgcaatatgggggatgaaaaatactgtcaaccatatatctcccaaagcactttgtaaataaataatatatatgtttgaactcatattttgcaaagttacatttgaaatgaagaagaaaaaatcatttaccaggtgaactgtcgtgggttgtcgcattgtatgcaccgcgggggcagctgaggacgggtaatgagtaaaagttgcccataaggtatgcattatgaacctgaggtaatagtgcaaaccgatacttttacaattcaatac
gi|10 : atgtggcaaatagtaaatccactgcgttttgttttttatttataattatatataaaaacaatttgattttattgttgttgaactctctctctctcgcctcgtctctctcgtcaaacaaacaaaaCAA--TTA-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TTC-AT-A-GTAT-TA--AAAACAAT
gi|10 : ATAACTT--G-CCT--T---TA-TTA-G--TTTCA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAATT-----TAC--GATTAT----T-T-G--TAA-G-----G-A---AAA-T---TTAA---T-AG-A--T---TTAA-AA---C--TTT--G-AA---------CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AA----------TAAAAATATCAACCCA-------A--A------T-----------TTCAAATCAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTT---G-T-CA----------------CCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------A------GG-GGA-GC-CTTTT--CGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AA--G--GC------CAT-C----------------T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-GAAA---A-T-G--AA--A-T-A---caaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttgcctttattagtttcatgagatgttaggtaaaatttacgattatttgtaaggaaaatttaatagatttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaaaataaaaatatcaacccaaatttcaaatcaatacagaaaacagcttttgtcacctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggccatctgcccttcaatatgggggatgaaaatgaaataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|11 : caattataatccctgcgtttgatttttatttcatagtattaaaaacaatcaaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnACTT--G-CAT-AT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAT---C--TGC--G----A----TAT-A--CAA-G-----G-AGGAAAA-T---T-TA---T-GG-A--T---TTA--AA---A--CTT--A-AA---------CCG-TT--TT---GTACC--T--------TATAA----A------------------------AC----------TAA-----------CA-------A--A------C-----------C------AAA----T--AACAAATAATCC-CGGAA-AACAGC-T------TT----G-T-CA----------------CCC-GGTA---TGCA---C-AA---AC-CA-A--A-T-------A------GGAG-A-GC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC----G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGCGTCT-G------------ACAG-A---AATGG-AC---GGACA-----AT--G--A---------TA--------A-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGG---AT-AAAA-T-A-T-G--AA--A-T-A---TGAATAGTC-T-CGCAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATAT---------------------------TT---G-AAGT--T-----AC--ATTT-----G--AAT--AGA----GAAA-----A-AA--TAA-TATT-G-AC-A---GA-GTTT-A-CAT-TCGCT---G---GC-TTT--TAGCAC-C--G-GGG-G-G---GG-----GGGGCGGGGG-GGGGGGGGGG-GTGGGGA---------T-----GGTGGTTTA-ATGATA-AG-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTA-TGAACC-TTAAC-T--A----TCCGAACCG-ATAC-T-TTTA-TGAATC-AATGC-CGannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngttatttaacatatt
gi|12 : TATCTT--GGCAT-GT---AC-T-A-G--T--CA-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--GAA--G----T----T-T-G--TAA-------G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----CAT--A--TTA--A-AAA------A-CTT-CT--T----GTACC--T--------TT-AA----A------------------------A-----------AAC-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A-------------AGAA-AAAAATAC------TTTT--G-T-CA----------------CA--GGAA---T-CA---C-AA----C-AA-TT-A-T-------T------GG-G-AAGC-CTTT---CGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AATGTCATG---TA---A-CTGT---T-C------------ACAG-AGACAACGG-AT------CA-----A---G--AC------C-TAC---AT--------TA-T-GCCCT-T-A----TAT-A-TGGGTG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA----T-A---TG-----TC-T-C-AAAA---GC---AC--G-TT----AAAG-TAA------------C--A------TAA-TATATGT-----T-TGA--TTCA-TA-----TTT---TCAAGT--T----AAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---AAAAAAATCA-AA--TCA-T-TT-ATCC-A---GA-GTTG-ATCGT-C-GCTCA-A---CA-TTT--T-GT--------TGT-G-C---GG-----TGGG-----G-G-------GG-TT----A---------T-----GA-----T--A----A-AG-TG-CCAT---A--G-CA-ACA-TTATGCAACC-TGAAT---------TCCAAACGT-ACCC-TGTTTA--CAATT-AATAT-CGC
gi|13 : gttctccttctctgTGAACAGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CTCGCCGTTTGG-----TTTTT--T-ATATTG-AT-ATTTAT-TAT-AACACA
gi|13 : aaaTT--A-TAT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-G-GA-TGA-TT-AGG-TAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-G-----A-G---AAA-T---C-A----T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-ATA------A-ACT-TT--T----GTACA--TA-------TGTAC----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CA-AG-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC--A-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTTCTCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T---------------CAG-AGAGAAC-G-ACA-AAGACA-----AA--G--ACGA----CA-AC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-gcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatgttatatactatagttcatggatgattaggtaaaatctaagtttgtaagagaaatcatatattaagttttataaacttttgtacatatgtacaataacaaatcaatacaagaacaacttttgtcacacggaatgcacaaacatatagggagccttttctcgctcactttctgagcaatgtaaatgttcagagagaacgacaaagacaaagacgacaacatgtatgcccttcaatatgggggataaaaata
gi|14 : aaatgaacagtggcaaatataatccctcgccgtttggttttttatattgatatttattataacacagcttgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnactcaaagtgcatg-AG-A--T---TTCA-AA---G--TTT--A-AA---------CCGTTT--T----GTATCA-TTAAAGAAATA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------CTAAATGACAAAT------CAA----T--G------------CCGAA-AACAAA--------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-GA---AC-AA-T--A-T-------A------GGAG-A-GC---TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--G-AGC-AA-G----G---T----A-ATGT---T-G------------ACAG-AGATAA--G-AC--AGGAAA-----AA--G--AC------CA----------------TA-T-GCCCTAT-C----AAT-A-TGGGGGAAT-AAAATT-A-TAA--AA--A-T-A---TG-----TC-T---CAAA---GG---ACATG--T----AAAC-AAA------------CG-A------TG--TATATGT----CT-TAA--T-CATTA-----TTT---G-AAAT--
gi|15 : gaaatgaaagtggcgatgataatctttgcagtttttaaaatagatatataaaaacttcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnatcagattcGAA-AGTGGCAATTATG-T-A--A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----TTTTT--T-A---------A-TTGT-TAT-AAAACAAT
gi|15 : T--G-CAT-GTATCTAGT-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAA-T--C--T-A--G----TACGAT-T-G--TAA-G-----G-A---AAATT---C-AA---T-AG-A--T---TTAAAAA---G--TTT--A-Actatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|15 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctc------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----C--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTT---G-T-TT----------------CAC-AGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------AAG----GG-G-A-GC-CTTTT--CGC----------ACGT-----TC-C--G-AGC-GA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AAcgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacatataacaaatcaacacagaaaacaacttttgtttcacagaatgcacaaacaatataaggggagccttttcgcacgttccgagcgaggtaaatgttgacagagaaa
gi|16 : gaaagtggcaattatgtaatccctgcgtttgttttttaattgttataaaacaatctatttaatctctctctctctctctctctgcatgtatctagtagttcatgagatgttaggtaaaatctagtacgattgtaaggaaaattcaatagatttaaaaagtttaacgctnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtaccttaaacaaaaaaatgaaaataacacat-----G-A---AAA-T---C-AA-----AG-A-----------AA---A-------A-AAA------A------T--T----CCAC----------------A----A------------------------A-----------CAA-----------AA-------A--A--------------------------AA----T--T------------CACAA-AACAAC--------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-C-------A------GA-A-A-AC-C-TTT-TCGC-TT-------ACTT-----TC-T--G-AGC-GA-G----G---CA---A-ATGT---T-G------------TCGG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AT------CA----------------TA-T-GTCAT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA------A---TG-----TC-T-T-CAAA---GC---ACAT
gi|17 : -----TC-C--G-AGC-AA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACCG-AGA-AACCG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATGC---AT--GACTTGTA-T-GCCCT-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-T--AA--A-T-A---TA-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------CATA------TA--TATATGT----CT-TGA--C-CATTA-----TTT---
gi|18 : AA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-G-CGTTT-G-----TTTTT--T-AT-TTG-A--A--TAT-TAT-AAAACAATg
gi|18 : ATAGCTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGG-TAAAAtgatttctctctttctctctcatagcttgcatgtatagttcatgagatgttaggtaaaa
gi|19 : aaagtggcaaatataatccctgcgtttgttttttatttgaatattataaaacaattgatttctctctttctctctcT---G---CG-TTTATT-GTAT-TAGC-GGG-A-G---AA-----AGAG-----T-G-------TGTGT----AAAA------T-----AA-----TATA----A-AG-TAACCAT---A--G-T------TTAT-GAACC-TGAGA-T--A----TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATAC-
gi|2 : ctgcatGGCAA--TTA-TTAC-A-TCC-CT-GC-GTTT-G-----ATTTT--T-AT-TC--AT-A-GTAT-TATTAAAACAAT
gi|2 : ATAACTTTTG-CCT-GG---TA-T-A-GG-TT-CA-T-GAGA-TAGTTT-AGG-TAAAATTTAC--GAATTA----T----T-T-G--TAACG-----G-A---AAA-T---TTAACTTT-AG-A--T---T------------TTT--A-AAACTTTGAA-CCA-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------------------TAAAATATCAAC--CA-------A--A------T-----------TTTAAT-CAA----T--A------------CAGAA-AACAGC-T------TTTTTGG-T-CAAAAAAAAAAAAAACCCCCT-GGAA---TGCA---C-AA---TC-AA-T--A-T-------AG-----GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACAT-----TC-C--G-AGCAAA-G----G---TA---A-ATGT---T-G------------ACAG-AGA-AACGA-AC--AGGACA-----AAGGG--GC------CAT------------------T-GCCCT-T-C----AATAA-TGGGGG-AT-GAA----A-T-G--AA--A-TAA---AG-----TCAT-C-CAAT---GC---ACA----T----AAGT-AAA---------------------------------------------------G-----TTT---A-GAG-------------ATTT-----G--AATG-AGGG---AAAA-----A-AA--T-A-T-TT-A-CC-A---GA-GTTGAA-CGT-C-GCTTGGG---CATTTT--T-ACAC-C--C-GGG-G-GTTTGG-----GGGG-----GTGGT-----GG-GT----GTGGATTAATT-----GA-----TA-A----A-TT-TTGTCATTTCA--G-TA-ACACTTA-TGAAGC-TG-AC-TTAA----TCC-AACCG-ATAC-T-TTTATTCAAcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataacttttgcctggtataggttcatgagatagtttaggtaaaatttacgaattatttgtaacggaaaatttaactttagatttttaaaactttgaaccatttgtaccttaaaataaaatatcaaccaaattttaatcaatacagaaaacagcttttttggtcaaaaaaaaaaaaaaccccctggaatgcacaatcaatataggggagccttttcgctcacattccgagcaaaggtaaatgttgacagagaaacgaacaggacaaaggggccattgcccttcaataatgggggatgaaatgaaataaagtcatccaatgcacataagtaaagtttagagatttgaatgagggaaaaaaatatttaccagagttgaacgtcgcttgggcatttttacacccgggggtttgggggggtggtgggtgtggattaattgataaattttgtcatttcagtaacacttatgaagctgacttaatccaaccgatacttttattcaa
gi|20 : ggcaattattacatccctgcgtttgatttttattcatagtattattaaaacaatcaatgannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn----A---------T-----AA-----TA-T----ATAG-TATCCAT---A--G-TT-ACA-TTAT-GAACC-TGAA--T--A----TCCAAACCG-ATAC-T-TTTA-TCAATC-AATA
gi|21 : gtttttgtatactagcaggaaaaagagtgtgttca------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---G-AA---AT-AA-T--G-TACCGGTAA------GG-T-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-
gi|22 : AA-AGTGGAAA--ATA---A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A-TTAT-TAT-AAAA
gi|3 : atgaTGAA-AGGCGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-C-----TTTTT--TTAT-TTG-AT-A-TTAT-TAT-AAAACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAACTT--G-CAT-GT---TA-T-A-G--TT-CA-TTGAGA-TG--TT-AGC-GAAAATT--C--TAA--G----T----T-T-G--TAT-A-----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---T----AA---G--TTT--A-AAA------A-CTG-TT--T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T-----------T------CAA----T--A------------CAGAA-AACAAC-T------TTTT--G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-G-A-GC-CTTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---TA---A--TGT---TCA------------ACAG-AGA-AAAGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC------CATAC---AT--G-----CAGT-GCC--------------------GG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-ATA------------C--A------TA--TATATGTTATTCT-TAA--T-CA-TA-----TTT---C-AAGT--T----TAC--ATTT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TAA-T-TT-A-CC-A---GA-GTTT-A-CGTACGGCT---G---CA-TTT--T-GTAC-C----------------------GGG-----G-G-------GG-GT----A---------------GA-----TA-A----A-GG-TGCCCAT---A--G-CA-ACA-TTATTGAACC-TGGACTT--A----TCCAAACTG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-CGC
gi|4 : TGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-T-C-CT-G-CGTTT-GGTTTTTTTTT--T-AT-TTG-ATAA-TTAT-TCC-TAAACAATt
gi|4 : gaaaATAA-TT--G-CAT-GTAG-TA-T---G--TT-CAAT-GAGA-GG--TT-AGG-TAAAATC--CCGTAC--G----AA---T-T-G--TAA-A-----ACA---AAA-T---C-AA---TTAT-A--T---T----AA---AGTTTT--A-AAA------A-ATG------------ACC--T--------TA-AA----AAATTAATAAAAAATAACACACCCAA-----------TAA-----------CA-------A--A------A-----------T------CAA----T--A-------------AGAA-GACACC-T------TTTT--G-T-CA-----------------ACAGGAA---TGTAT--C-AA---AC-AA-TTAA-T-------AAATTAGGG-G-A-GC---GTT-TCGC-TC-------CCTT-----TCTC--G-AGC-AA-G----GTCATA---A-A-GT---T-G------------ACCG-AG--AACGG-AC--AGGTTA-----AA--GTTAC------CGTAC---AT--G-----TA-tgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggttaaagttaccgtacatgtaatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|4 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctTT---A-AAGT--TACCGTAC--ATGT--------AATG-AGAAA--GAAA-----ATAA--TCAAT-TT-A-CC-A---GA-GTTG-A-CGT-CGCCT---GG--CA-TTT--T-GCAT-------GG-A-C---GA-----GGGG-----G-G-------GG-GT----A---------TTCAATGA-----TA-A----A-GT-TGTCCAT---A--G-TA-ACA-TTAT-GAACCGTGAAC-T--A----TCCAAACCGCATACGT-TTTACCCAATT-AATACGCGCatgagaaagaaaataatcaatttaccagagttgacgtcgcctggcattttgcatggacgagggggggggtattcaatgataaagttgtccatagtaacattatgaaccgtgaactatccaaaccgcatacgttttacccaattaatacgcgc
gi|5 : gaaatgaaagtggcaaatataatcctgcgtttggttttttttttatttgataattattcctaaacaattgagtttagtttgttgacaactctctgaaccannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncaccccccccctctataattgcatgtagtatgttcaatgagaggttaggtaaaatcccgtacgaattgtaaaacaaaatcaattatattaaagttttaaaaaatgaccttaaaaaattaataaaaaataacacacccaataacaaaatcaataagaagacacctttttgtcaacaggaatgtatcaaacaattaataaattaggggagcgtttcgctccctttctcgagcaaggtcataaagttgaccgagaacggacaggTGAA-AGTGGCAA--ATA-T-A--A-TCC-CT-GCCGTTT-G-----TTTTTTAT-AT-TTG-GT-A-TT-T-TAT-AAAA-AAT
gi|5 : ATAACTTT-G-CATCGT---TA-----G--TT--A-T-GAGA-TG--TTTAGG-TAAA--T--C--TAA--G----T----T-TTG--TAA-A-----A-A---AAT-C---C-AA---T-AATA--C---TC---AA---GA-TTT--A-AAA------A-C-G-TT--T----GTACC--T--------TA-AATAAAA------------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------C-------------------TTTT--G-T-CA----------------CAT-GGAA---TGCAA--C-AA---ACCAA-T--AAT-------A------GG-G-A-AG-CCCTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-C--G-AGC-AA-CT---G---TA---A-ATGT---T-C------------A-AG-AGA-A-CGG-AC--CGG----------------C------CATAC---AT--G-----TA-T-GTC-T-T-C----AAT-A-TGGGGG-AT-AAAAATAA-T-G---A--A-T-A---TG-----TC-T-C-CAAA---GC---ACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------TA--TATATGT----CT-GAA--T-CA-TAT----TTT---C-AAGT--T----TAC--A-TT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CC-AAG-AA-GTTG-A-CGT-C-GCTG--G---CA-TTT--T-GTAT-C--CAGGG-G-G---GG-----GGGG-----G-G-------GG-GT----A---------T-----GA-----T--A----A-AG-TGCCCAT---A--GCCA-ACA-TTAATGAACC-TG-AC-T--A----TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TC-ATT-AATAT-CGCtgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactttgcatcgttagttatgagatgtttaggtaaatctaagttttgtaaaaaaatccaataatactcaagatttaaaaacgtttgtaccttaaataaaaataacaaatcaatacttttgtcacatggaatgcaacaaaccaataatagggaagccctttcgctcactttccgagcaactgtaaatgttcaagagaacggaccggccatacatgtatgtcttcaatatgggggataaaaataatgaatatgtctccaaagcacatgttaaataaacatatatatgtctgaatcatattttcaagtttacattgaatgagaagaaaaaatcatttaccaagaagttgacgtcgctggcattttgtatccaggggggggggggggggtatgataaagtgcccatagccaacattaatgaacctgactatccaaaccgatactttatcattaatatcgc
gi|6 : tgaaagtggcaaatataatccctgccgtttgttttttatatttggtattttataaaaaattgatnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn--TAG--G----T----T-T-GACTAA-AATATAG-A---AAA-TACAC-AAAA-T-AG-C--T---G----AA---GGATTT--AGAAA------A-CTG-TT--TAGGTGTACCGTT--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------CATAAGCGAA--A------T-------------------AA----TTAA------------CAGAATAATACC-TATACACTTTG--G-TACA----------------CAT-GGGAATTTGCAATGC-AACCTAC-AAAT--A-T-------GTTAG--GG-G-A-GCGCTTTTATCGC-CCTCGTACAACTTATTTCTC-C--T-A-T-AA-G----C---TA---A-TTGT---T-ACATTATGCATTCACAGCAGA-AACGGCACTGAGGTTATTTCCAACTG--ACATTCGTCATA----ATTGG-----CC-TCGCCCC-T-CTTCGAAT-AATGGGGGGAT-AAAAAA-A-T-A--AA--A-G-AAGATGAGGC-TC-T-C-CGAAAAGGC---ACATG-CTGGGTAAAT-AAAATCTAACATTACC--AAAACCCTAATTATATGT----CTCTGA--T-C--TACTAGTTTT---C-AAGTGTT----TACCCATTTTTTTCGT-AATG-AGAA---GAAA-----A-AA----A---TC-A-CC-A---GATGTTA-A-C
gi|7 : ttctctcttttctcattataacttgcacccccaacattgcttgaatagttcatttttgaaggatgtctgaagtacagcgcctgcaatcagactcctaA-AGTG-CAA--ATA-T-AGAA-TCC-CT--CCGTTT-G------TTTT--T-AT-TTGAAT-A-TTTT-TA--AAACCAATcagacatgtttgtgaaacgtcgctg
gi|7 : AT-AC---TA-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-T----T-AGG-TAAAAT---C--TAA-------T----T-T-G--TAA-A-----G-AG--AAA-T---C-AA---T-AT-A--T---T----AA---G--TTT--T-AAA--------CTG-TT--T----GTAC---T--------TA-AA----A------------------------A------------AA-----------AA-------A--A------T------------------CAA----T--A------------CAGAT-AACAAC-T------TTT---G-T-CA----------------CAC-GGAA---TGCA---CAAA---AC-AA-T--A-T-------A-------G-G-A-GT-CTTTT-TCGC-TC-------AC-T-----TC-C--G-AGC-AA-T----G---AA---ACATGT---C-A--------------AG-AGA-AACGG-AC--AAGACA-----AA--G--AC------CATAC--------------------------------AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--ATT-A---TG-----TC-A-T-CAAA---CC---ACATG--T----ACAT-AAA------------C---------TA--TATATGT----CT-TGA--T-CA-T------------------------------ATCT-----G--AATG-AGAA---GAAA-----A-AAATTCA---TT-A-CC-A----A-GTTT-A--AT-C-ACT---G---CA-TTT--T-GTAC-C--C-GGGCG-G---GG-----GGGG-----G-G-------GG-GT----A---------T-----GA-----T--A----A-AG-TGCCCAG---A--G-CA-ACA-TTA-TGAACC-TG-AC-T--A----TCCAAACCG-TTAC-T-TTTA-TCAATT-AATAC-tgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattatactatagttcatgagattaggtaaaatctaatttgtaaagagaaatcaatatattaagttttaaactgtttgtacttaaaaaaaaaaatcaatacagataacaacttttgtcacacggaatgcacaaaacaatataggagtctttttcgctcacttccgagcaatgaaacatgtcaagagaaacggacaagacaaagaccatacatatgggggataaaaatatgaaattatgtcatcaaaccacatgtacataaactatatatgtcttgatcatatctgaatgagaagaaaaaaattcattaccaagtttaatcactgcattttgtacccgggcgggggggggggggtatgataaagtgcccagagcaacattatgaacctgactatccaaaccgttacttttatcaattaatacc
gi|8 : aagtgcaaatatagaatccctccgtttgtttttatttgaatatttttaaaaccaattgattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnataactgcattattaatgtattAA-AGTGGCAA--AT--T-A--A-TCC-TG-GCCGTTT-G-----TTTTT--A-AT-TTG-GT-A--TAT------AAACAAT
gi|8 : ATAACTT--G-CAT-GT----A-T-A-G--TT-CA-T-GAGA-TG--TT-AGGGTAAAAT---C--TAA--G----T----T-T-G--TAA-AA----G-A---AAA-T---C-AA---T-AG-A--T---C----AA---G--TTT--A-AAA------AACTG-TT--TTT--GTACC--T--------TA-AA----AAAA---------------------A-----------TAA-----------CA-------A--A------------------T------CAA----T--T------------AAGAA-AACAAA-A------TTTT--GTT-CA----------------CAT-GG-A---TGCA---C-AA---AC-AA-T--A-T-------A------GG-GAA-GC-CCTTT-TCGC-TC-------ACTT-----TC-T--A-AGC-AA-T----G---TA---A-ATGT---T-C------------ACAG-AGA-AACGG-AC--AGGA--------------AC------CATAC---AT--G-----TA-T-GCCCT-T-C-----AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-AT--TG-----TC-T-C-CAAA---GCAGTACATG-TT----AAAT-AAA------------C--A------T---TATATAA----CT-TGA--T-CA-TA-----TTTTC-C-AAGT--T----TAC--ATTT-----GAAAATG-AGAAAG-AAAA-----A-AA--TCA-T-TT-A-CCTA---GA-GTTG-A-CGT-C-GCT---G---GA-TTT--T-GTAT-C--C-GGT-G-G---GG-----GGGG-----G-G-------GG-tnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttcataacttgcatgtatagttcatgagatgttagggtaaaatctaagtttgtaaaagaaaatcaatagatcaagtttaaaaaactgtttttgtaccttaaaaaaaataacaaatcaattaagaaaacaaaattttgttcacatggatgcacaaacaatatagggaagcccttttcgctcactttctaagcaatgtaaatgttcacagagaaacggacaggaaccatacatgtatgcccttcatatgggggataaaaatatgaaatattgtctccaaagcagtacatgttaaataaacattatataacttgatcatattttccaagtttacatttgaaaatgagaaagaaaaaaatcatttacctagagttgacgtcgctggattttgtatccggtgggggggggggg
gi|9 : aaagtggcaaattaatcctggccgtttgtttttaatttggtatataaacaattnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggtcctcatctcgtctctttc--G-CAT-GT----A-T-A-AGTTT-CA-T-GAGAATG--TT-AGA-TAAAAAT--C--CAC--G----A----T-T-G--TAA-A-----G-A---AAAAT---C-AA---T-AG-A--T---T----AAAATG--TTTTAA-AAA------A-C-------T----GTACC--T--------TA-AA----A------------------------AATGAATAAAAATAA-----------CA-------A--AAACCCAC-----------TAA----CAAATCGT--A------------CAGAA-AACAAC---------TTT--G-T--A----------------CAC-GGAA---TGCA-----------------------------G------GG-G-A-GC-C-TTT-TCGC-TC-------ACTT-----TCGC--GAAGC-AAGG----G---TATACA-ATTT---T-G------------ACCG-AGA-AACGG-AC--AGGACA-----AA--G--AC------CATCCAG-AT--G-----T--T-GCCCT-T-C-----AT-A-TGGGGG-AT-AAAAAT-A-T-G--AA--A-T-A---TA-----TCTT-C-CAAA---GC---ACATGTTT----AAATCAAA------------C--A-------A--TATATGT----CT-TGC--C-CATTA-----TTT---A-AAGT--T----T-C--ATTT-----G--AATG-AAAAAAGAAAA-----A-AA--TCA-T-TTAA-CC-A---GA-GTT--A-CGT-CGCTT---GGGCCA-TTT--T-GCAC-C--G-GGG-GAG---GG-----GGGG-----G-G-------GG-GTA---A---------T-----AA-----T--A----A-AG-TGTCCAT---A--G-TA-TCA-TTAT--GACC-T-AAT-A--A----TCCAAACCG-ATAC---TTTA-TCAATT-AATAC-CG