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lowQualScore                  :       .    .        .   .     .  ...  . ......             .....  .  .    .    ..... ..  .       .     ..    .     .    ..          ............................................................      . .  .     . ...... .      ... .   .  .   .. .   .     ..  .   . . .      .  .    ....    ..             .  ..      .    .            .      ..    ......           ...   . ..   ...   .     ........   ..          .. .. .  .....   . .. .  .      ..... .  .         ..  .   . ..    .           
lowQualScore                  :       7    7        3   0     8  777  7 222222             77777  5  7    2    55555 22  2       7     88    2     8    66          000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000      8 0  8     0 222222 0      000 0   0  8   00 8   0     00  0   0 0 0      0  0    5555    22             5  22      5    7            9      99    000000           555   0 55   555   0     22222222   00          33 55 3  44444   1 33 1  1      77777 0  0         22  4   1 22    1           
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Reference ( gi|4 )            :  TTTCTGTGACGTTCTTACAAAGTTATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT---CAACATT-AAACACTTT---CAG--CCTTAAATAC-ATTTGTACACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG--------AA-A----GT-------T-----------T--T---------T---------CTAAATTA-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCAC---TTGCG-TGATGGACTCTCTGCAACG--AA-TTC-G-T-CTGGGC-TG-CTCCCTGCATGTC-AACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCTAGAAGACCCGTCT--CCCC--G---ATTATACTGAGTG-AGA-T--CCG-TTGGT-TGATC-------TACC--ACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
gi|5                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACA--GTTATGGA-GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT---CCACAGT-AAACACTTT---CGG--CCTTAAATAC-ATTTGTGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG--------AA-A----GT-------T-----------TTAT---------T---------CTAAATTT-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCTC---TTGCGATGAT-GACTCTCT-CAACG--AATTTC-GTT-CTGGGC-TGCCTCCCTGCATGTC-AACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAGTTCTTCTAGAAGA-CCGTCC--TCCC--G---ATTTTACTGAGTGAAGA-TCACCG--TGGT-TGA----------ATCGTACAAGTGAAG-AAAGTGTCACC-GCAT-TC-C-TT-CAAG-A-----GT-CATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATTCGT
gi|1                          : tTTTCTATGACTTTCTTACAAAGTCATTGAACT---GCCG------AGTCTGGTCAACT---CCACGTT-AAACACTTT---CGG--CCTTAAATAC-ATTTGCTCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGT--AA-A----ATAATGTG-T-----------T--TAGGCGACCAT---------CTAAATTA-CTACACAA-ATT----GCAAACAC---TTGCG-TGGTGGGGTTTCTCCAACG--AA-TCC-G-T-CTGAGCCTG-CTCC----ATGTCCAACCTCCTTT-CCATG--GA-AACTACAG-TCTTCTAAA---CCCGTCT--CCCC--G---AT-ATACTGAGGG-AGA-TT-CCG-AGGAT-TGATC-------GACA--CCAGATGAAG-AAC-T-TCACC-GCAT-T--C-TT-TAAGAA-----GTCCATCTCCCGAT--TATACA-G--TGCG-GATCCGTGGAC
gi|2                          :  TTTCTATGGCTTTCTTACAAAGTCATGAATGT---GC-G------AGCATGGTCAACC---CCAGGTT-AAACACTTT---C-GCCCCTTAA--AC-ATCTG--CACACATAACTATCC-TTCTGCTTTTGGCCAA---AA-A----ATAGGGATAT-----------T--TAGATGACCAT---------CTAAATTATTTAGACAC-A-----TG-AAGCACAGATAGC-----TGG-TTTTCTGCTTTG--TA-TTCAG-TGAAGGGT-T---TTATTCCATATA-GACCTCATTTGCCATACCGTCATC-ACAG-TCTTCAAAAAGACCCATCT--CCCC--A---ATTATACAGAG----------------GGT-CGATCAACCACAGACC--ACAGATGAAG--AA-TATC-------T-T--CATTACAAGAATCCCCCCCCCCCCCCCAAT--TATACT-G--TGGG-AATCCATGGACgatcaactcgaggaagatgaaatggacccatctaccaccaac
gi|3                          :                          ATGGATGTCCGGC-GCACGTCAGCTGGGTCAACTATCCAGCGTTTAAAC-CCTT---CGG--C--TAAATACTATTTGCACACG---AAC-ATCGT--CTTGTTTCGGCCAGTAGAA-ATAGGGT-------G-----------T--T---------TAGACGACCATTAAAT-A-TT-GACAACACT---TGCAAGCAC---T-GCG-TGGTGGGGTTTCTGCAACGCGAA-TCC-G-T-CTGGGC-TG-CTCC-----TGT---ACCTTCTT-GCC-TT--GACACCTACAA-TCTTCTAGAAGA--CGTCTCCCCCC--G---ATTATA-TGAGGGAAGA-T--CCGAGGGGT-CGATC-------GACC--ACCGATGAAGCACA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----G-CCATCCCCCGTC--TATACTCG--TGGG-GATCCGTGGccaag
gi|15                         :                                GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT---CCACGTT-AAACCCTTT---CGG--CC-TAAATAC-Atcgatcgactcga
gi|16                         :                                GT---GC-G------AGTTTGGTCAACT---CCACGTT-AA
gi|6                          :                                                                        cACACTTCGCGTAG--CCT-AAAGAC-ATTTGTACACATACAACTATCCTTTCTTGTTTCG--------GCCA----GT-------TAATAGGGATGTT--TAGACGACCAT---------CTAAATTA-TTAGACAA-ATTGG----AAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AA-TCC-G-T-CTGGGC-TG-CTACCTG----TC-AACCTTCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTACTAGAAGACTCGTCT--CCTC--G---ATTATACTGAGGG-AGA-T--CCG-AAGGT-TGATC-------GACC--ACAGATGAAG-AAA-TGTTACC-GCAT-T--C-TT-CAAGGA-----GTCCATCCGCCGATTATATACT-G--TGGGCGATC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                            CATGTC-AACC-CCTTTGCCTTG--GACAACAACNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--N---NNNNNNNNNNNNN-NNN-N--NNN-NNNNN-NNNNN-------ACCC--AGAGATGAAG-TAA-TGTAACTTACAT-T--C-TT-CAA-AA-----GCCCACCCCCCGAT---ATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCaactcaaggaagaggagatggacctatccaccaccc
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GAAGACCCATAT--CCCC--GTGGGTTATACTGACGG-AGG-T--CCA-AGGGT-TGATC-------GACC--ACCAATGACG-AA--TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgatcgact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GAAGACCCATAT--CCCGTGG---GTTATACTGACGG-AGG-T--CCA-AGGGT-TGATC-------GACC--ACCAATGACG-GAA-TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTaaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTATACTGAGGA-AGA-T--CCG-T-GGTGCGATC-------GACC--ACAGATGAAG--GA-TA-----------T--C-TT-TAAAAA-----GTCTTTCCCCCAAT--TATATT-G--TTGG-GATCCATGGACaaaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTGAGGA-AGAAT--CCG-T-GGTGCGATC-------GACC--ACAGAT--AG-AA----------GGATAT--C-TT-TAAAAA-----GTC--TTTCCCAAT--TA-ATT-G--TTAG-GATCCATGGcatcgatctgaggaaaatgcaatgaccccatcta
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aC--ACAGATGAAA-GAA-TATC--------------TT-CAAGAA-----GTCTTT------AT--TA-ACT-GGTTGGG-GATCCGTGGcaccatcgatctgaggaaaatgcaatgaccccatccgttattttctacttgagg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAAG-TAA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----GCCCATCCCC----------------TGGG-GATCCGTGGGCaagaggagaaggacccatccatcacctactg
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AA-TGTAACT--TAT-TTCC-TC-C--GAA-----G-CCATTCCC-GAT--TAT-CT-G--TGGG-GA-CCGTAGGCgatcgactcg





Alignments
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lowQualScore                  :            0        2         0  000  7 444444             99   7    7    4    7  66   4       7     33    0                      55555555  3 33333333333     77              7        7 333333 5       2   7    5  0     5     22  7   7 7 7     7   7   99999    44             7  99      2    0     4     33    4 66    66 888       4   6  33  7 99   333  777    000   7   3       88  4 44444444   5 99 5  9      11111 2  3         99      9 99    9           
consensus                     :  TTTCTGTGACNTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTA-AAATA----GGG---TTTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCACTTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AA-TCC-G-T-CTGGG-CTG-CTCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCNAGAAGACCCGTCT--CCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-N-GGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
Reference ( family-1945 )     :  TTTCTATGACTTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTA-AAGTA----G-----TTTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCACTTGCG-TGGTGGGNTTTCTGCAACG--AA-TCC-G-T-CTGGG-CTG-CTCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCTAGAAGACCCGTCT--CCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-A-GGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
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gi|10                         :             tttctatgactttcttacaaagtcattgaactgccgagtctggtcaactccacgttaaacactttcggccttaaatacatttgctcacacacaactatcctttcttgtttcggccagtaaaataatgtgtttaggcgaccatctaaattactacacaaattgcaaacacttgcgtggtggggtttctccaacgaatccgtctgagcctgctccatgtccaacctcctttccatggaaactacagtcttctaaacccgtctccccgatatactgagggagattccgaggattgatcgacaccagatgaagaacttcACTGAG-GA-AGAAT--CCG-T-GGTGCGATC---GAC-CACAGAT--AG-AA----------GGATAT--C-TT-TAAAAA-----GTC--TTTCCCAAT--TA-ATT-G--TTAG-GATCCATGGgacccatctaccaccaac
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tGAAG-TAA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----GCCCATCCCC----------------TGGG-GATCCGTGGGCgatcgcactcca
gi|15                         :                                GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACCCTTT-CG--GCC-TAAATAC-Agatcgactcg
gi|16                         :                                GT---GC-G------AGTTTGGTCAACT--CCA-CGTT-AA
gi|2                          : cTTTCTATGGCTTTCTTACAAAGTCATGAATGT---GC-G------AGCATGGTCAACC--CCA-GGTT-AAACACTTT-CGC-CCCTTAA--AC-ATCT--GCACACATAACTATCC-TTCTGCTTTTGGCCAA-A-AAATA----GGGATATTTAGATGACCATCTAAATTATTTAGACAC-A-TG-----AAGCAC--AGA-TAGCTGGTTTTCTGCTTTG--TA-TTCAG-TGAAGGG-TT---TTATTCCATAT-AGACCTCATTTGCCATACCGTCATC-ACAG-TCTTCAAAAAGACCCATCT--CCCC--A---ATTATACAGAG-GG-----T--C------GATCAACCACAGAC-CACAGATGAAG--AA-TATC-------T-T--CATTACAAGAATCCCCCCCCCCCCCCCAAT--TATACT-G--TGGG-AATCCATGGAC
gi|3                          :                          ATGGATGTCCGGC-GCACGTCAGCTGGGTCAACTATCCAGCGTTTAAAC-CCTT-CG--GC--TAAATACTATTTGCACACG---AAC-ATCGT--CTTGTTTCGGCCAGTAGAAATA----GGGTG-TTTAGACGACCAT-TAAAT-A-TT-GACAACACT---TGCAAGCACT-GCG-TGGTGGGGTTTCTGCAACGCGAA-TCC-G-T-CTGGG-CTG-CTCC-----TGT---ACCTTCTT-GCC-TT--GACACCTACAA-TCTTCTAGAAGA--CGTCTCCCCCC--G---ATTATA-TGAG-GGAAGA-T--CCG-AGGGGTCGATC---GAC-CACCGATGAAGCACA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----G-CCATCCCCCGTC--TATACTCG--TGGG-GATCCGTGGccaag
gi|4                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACAAAGTTATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CAA-CATT-AAACACTTT-CA--GCCTTAAATAC-ATTTGTACACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG------A-AAGT-----------TTT---------TCTAAATTA-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCACTTGCG-TGATGGACTCTCTGCAACG--AA-TTC-G-T-CTGGG-CTG-CTCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCTAGAAGACCCGTCT--CCCC--G---ATTATACTGAG-TG-AGA-T--CCG-T-TGGTTGATC---TAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCtcgatcgactcga
gi|5                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACA--GTTATGGA-GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CAGT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGTGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG------A-AAGT-----------TTTAT-------TCTAAATTT-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCTCTTGCGATGAT-GACTCTCT-CAACG--AATTTC-GTT-CTGGG-CTGCCTCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAGTTCTTCTAGAAGA-CCGTCC--TCCC--G---ATTTTACTGAGTGA-AGA-TCACCG-T-GGTTGAATC---G---TACAAGTGAAG-AAAGTGTCACC-GCAT-TC-C-TT-CAAG-A-----GT-CATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATTCGT
gi|6                          :                                                                        tACACTTCGCGTAGCCT-AAAGAC-ATTTGTACACATACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTT-AA-TA----GGGATGTTTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ATTG---G-AAGCACTTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AA-TCC-G-T-CTGGG-CTG-CTACCTG----T-CAACCTTCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTACTAGAAGACTCGTCT--CCTC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-A-AGGTTGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTTACC-GCAT-T--C-TT-CAAGGA-----GTCCATCCGCCGATTATATACT-G--TGGGCGATC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                               CATGT-CAACC-CCTTTGCCTTG--GACAACAACNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNN--NNNN--N---NNNNNNNNNNN-NN-NNN-N--NNN-N-NNNNNNNNN---ACC-CAGAGATGAAG-TAA-TGTAACTTACAT-T--C-TT-CAA-AA-----GCCCACCCCCCGAT---ATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCaactcaaggaagaggagatggacctatccaccaccc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GAAGACCCATAT--CCCGTGG---GTTATACTGAC-GG-AGG-T--CCA-A-GGGTTGATC---GAC-CACCAATGACG-GAA-TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgatcgact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAA-TCTTCAAGAAG-TCCGT-T--CCCC--G---ATTATAC--AGCGG-TGA-T--CCG-T-AAAAAGATC---GAC---TTGAGGAAG-AGA-TG-GACC--CAT-T--C-aaaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                 gaagacccatatcccgtgggttatactgacggaggtccaagggttgatcgaccaccaatgacggaatttcatcgGAAGACCCATAT--CCCC--GTGGGTTATACTGAC-GG-AGG-T--CCA-A-GGGTTGATC---GAC-CACCAATGACG-AA--TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgccacccac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAA-TCTTCAAGAAG-TCCGT-T--CCCC--G---ATTATAC--AGCGG-TGA-T--CCGTA-AAA--GATC---GAC---TTGAGGAAG-AGA-TG-GACC--CAT-T--C-aaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac





Alignments
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lowQualScore                  :            .        .         .  ...  . ......             ..   .    .    .    .  ..   .       .     ..    .                      ........  . ............    ..              .        . ...... .      ... .   .      ..     .     ..    . .  .     .    .  .....    ..             .  ..      .    .     .     .     .     .. ...       .   .  ..  . ..   ..  ...    ...   .   .       ..  . ........   . .. .  .      ..... .  .         ..      . ..    .           
lowQualScore                  :            0        2         0  000  7 444444             99   7    7    4    7  66   4       7     33    0                      55555555  2 222222222222    77              7        7 333333 5      777 5   7      77     5     22    7 7  3     7    7  99999    44             7  99      2    0     0     1     4     22 888       4   6  33  7 99   99  777    000   7   3       88  4 44444444   5 99 5  9      11111 2  3         99      9 99    9           
consensus                     :  TTTCTGTGACNTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTA-AAATA--GGG---T--TTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCNAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-TGGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
Reference ( family-1945 )     :  TTTCTGTGACNTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTA-AAATA--GGG---T--TTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCNAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-NGGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
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gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACCGCAT-TCTTTAAGAAG-TCCATCTCCC---G---ATTATACAGTG-CG--GA-T--CCG-TGGA-CGATC---AACTCGAGGAAGATG-AAA-TGgatcaactcgaggaagatgaaatggacccatctaccaccaac
gi|10                         :             tttctatgactttcttacaaagtcattgaactgccgagtctggtcaactccacgttaaacactttcggccttaaatacatttgctcacacacaactatcctttcttgtttcggccagtaaaataatgtgtttaggcgaccatctaaattactacacaaattgcaaacacttgcgtggtggggtttctccaacgaatccgtctgagcctgctccatgtccaacctcctttccatggaaactacagtcttctaaacccgtctccccgatatactgagggagattccgaggattgatcgacaccagatgaagaacttcACTGAG-GA-AGAAT--CCG-TGGTGCGATC---GAC-CACAGAT--AG-AA----------GGATAT--C-TT-TAAAAA-----GTC--TTTCCCAAT--TA-ATT-G--TTAG-GATCCATGGgacccatctaccaccaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aTTATACTGAG-GA-AGA-T--CCG-TGGTGCGATC---GAC-CACAGATGAAG--GA-TA-----------T--C-TT-TAAAAA-----GTCTTTCCCCCAAT--TATATT-G--TTGG-GATCCATGGACcaccatcgatctgaggaaaatgcaatgaccccatccgttattttctacttgagg
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tGAAG-TAA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----GCCCATCCCC----------------TGGG-GATCCGTGGGCgatcgcactcca
gi|15                         :                                GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACCCTTT-CG--GCC-TAAATAC-Agatcgactcg
gi|16                         :                                GT---GC-G------AGTTTGGTCAACT--CCA-CGTT-AA
gi|2                          : cTTTCTATGGCTTTCTTACAAAGTCATGAATGT---GC-G------AGCATGGTCAACC--CCA-GGTT-AAACACTTT-CGC-CCCTTAA--AC-ATCT--GCACACATAACTATCC-TTCTGCTTTTGGCCAA-A-AAATA--GGGATAT--TTAGATGACCATCTAAATTATTTAGACAC-A-TG-----AAGCACAGATAGC--TGGT----TTTCTGCTTTG--TATT-CAGTGAAGGG-TT---TTATTCCATAT-AGACCTCATTTGCCATACCGTCATC-ACAG-TCTTCAAAAAGACCCATCTCCCC--A---ATTATACAGAG-GG-----T--C-----GATCAACCACAGAC-CACAGATGAAG--AA-TATC-------T-T--CATTACAAGAATCCCCCCCCCCCCCCCAAT--TATACT-G--TGGG-AATCCATGGAC
gi|3                          :                          ATGGATGTCCGGC-GCACGTCAGCTGGGTCAACTATCCAGCGTTTAAAC-CCTT-CG--GC--TAAATACTATTTGCACACG---AAC-ATCGT--CTTGTTTCGGCCAGTAGAAATA--GGG---TGTTTAGACGACCAT-TAAAT-A-TT-GACAACACT---TGCAAGCAC---T-GCG-TGGTGGGGTTTCTGCAACGCGAATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCC-----TGT---ACCTTCTT-GCC-TT--GACACCTACAA-TCTTCTAGAAGAC--GTCTCCCCCCG---ATTATA-TGAG-GGAAGA-T--CCGAGGGGTCGATC---GAC-CACCGATGAAGCACA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----G-CCATCCCCCGTC--TATACTCG--TGGG-GATCCGTGGccaag
gi|4                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACAAAGTTATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CAA-CATT-AAACACTTT-CA--GCCTTAAATAC-ATTTGTACACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG------A-AAGT---------T--TT---------TCTAAATTA-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCAC---TTGCG-TGATGGACTCTCTGCAACG--AATT-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCTAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-TG-AGA-T--CCG-TTGGTTGATC---TAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCtcgatcgactcga
gi|5                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACA--GTTATGGA-GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CAGT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGTGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG------A-AAGT---------T--TTAT-------TCTAAATTT-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCTC---TTGCGATGATGA-CTCTCT-CAACG--AATTTC-GTTCTGGG-CTGCCTCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAGTTCTTCTAGAAGA-CCGTCCTCCC--G---ATTTTACTGAGTGA-AGA-TCACCG-TGGTTGAATC---G---TACAAGTGAAG-AAAGTGTCACC-GCAT-TC-C-TT-CAAG-A-----GT-CATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATTCGT
gi|6                          :                                                                        tACACTTCGCGTAGCCT-AAAGAC-ATTTGTACACATACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTT-AA-TA--GGGATGT--TTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ATTG---G-AAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TACCTG----T-CAACCTTCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTACTAGAAGACTCGTCTCCTC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-AAGGTTGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTTACC-GCAT-T--C-TT-CAAGGA-----GTCCATCCGCCGATTATATACT-G--TGGGCGATC
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                   gaagacccatatcccgtgggttatactgacggaggtccaagggttgatcgaccaccaatgacggaatttcatcgGAAGACCCATATCCCC--GTGGGTTATACTGAC-GG-AGG-T--CCA-AGGGTTGATC---GAC-CACCAATGACG-AA--TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgccacccac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAA-TCTTCAAGAAG-TCCGT-TCCCC--G---ATTATAC--AGCGG-TGA-T--CCG-TAAA-AGATC---GAC---TTGAGGAAG-AGA-TG-GACC--CAT-T--C-aaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac





Alignments
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consensus                     :  TTTCTGTGACNTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTA-AAATA--GGG---T--TTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCNAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-TGGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
Reference ( family-1945 )     :  TTTCTGTGACNTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTA-AAATA--GGG---T--TTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCNAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-TGGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
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gi|10                         :             tttctatgactttcttacaaagtcattgaactgccgagtctggtcaactccacgttaaacactttcggccttaaatacatttgctcacacacaactatcctttcttgtttcggccagtaaaataatgtgtttaggcgaccatctaaattactacacaaattgcaaacacttgcgtggtggggtttctccaacgaatccgtctgagcctgctccatgtccaacctcctttccatggaaactacagtcttctaaacccgtctccccgatatactgagggagattccgaggattgatcgacaccagatgaagaacttcACTGAG-GA-AGAAT--CCG-TGGTGCGATC---GAC-CACAGAT--AG-AA----------GGATAT--C-TT-TAAAAA-----GTC--TTTCCCAAT--TA-ATT-G--TTAG-GATCCATGGgacccatctaccaccaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aTTATACTGAG-GA-AGA-T--CCG-TGGTGCGATC---GAC-CACAGATGAAG--GA-TA-----------T--C-TT-TAAAAA-----GTCTTTCCCCCAAT--TATATT-G--TTGG-GATCCATGGACcaccatcgatctgaggaaaatgcaatgaccccatccgttattttctacttgagg
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gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    tGAAG-TAA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----GCCCATCCCC----------------TGGG-GATCCGTGGGCgatcgcactcca
gi|15                         :                                GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACCCTTT-CG--GCC-TAAATAC-Agatcgactcg
gi|16                         :                                GT---GC-G------AGTTTGGTCAACT--CCA-CGTT-AA
gi|2                          : cTTTCTATGGCTTTCTTACAAAGTCATGAATGT---GC-G------AGCATGGTCAACC--CCA-GGTT-AAACACTTT-CGC-CCCTTAA--AC-ATCT--GCACACATAACTATCC-TTCTGCTTTTGGCCAA-A-AAATA--GGGATAT--TTAGATGACCATCTAAATTATTTAGACAC-A-TG-----AAGCACAGATAGC--TGGT----TTTCTGCTTTG--TATT-CAGTGAAGGG-TT---TTATTCCATAT-AGACCTCATTTGCCATACCGTCATC-ACAG-TCTTCAAAAAGACCCATCTCCCC--A---ATTATACAGAG-GG-----T--C-----GATCAACCACAGAC-CACAGATGAAG--AA-TATC-------T-T--CATTACAAGAATCCCCCCCCCCCCCCCAAT--TATACT-G--TGGG-AATCCATGGAC
gi|3                          :                          ATGGATGTCCGGC-GCACGTCAGCTGGGTCAACTATCCAGCGTTTAAAC-CCTT-CG--GC--TAAATACTATTTGCACACG---AAC-ATCGT--CTTGTTTCGGCCAGTAGAAATA--GGG---TGTTTAGACGACCAT-TAAAT-A-TT-GACAACACT---TGCAAGCAC---T-GCG-TGGTGGGGTTTCTGCAACGCGAATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCC-----TGT---ACCTTCTT-GCC-TT--GACACCTACAA-TCTTCTAGAAGAC--GTCTCCCCCCG---ATTATA-TGAG-GGAAGA-T--CCGAGGGGTCGATC---GAC-CACCGATGAAGCACA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----G-CCATCCCCCGTC--TATACTCG--TGGG-GATCCGTGGccaag
gi|4                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACAAAGTTATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CAA-CATT-AAACACTTT-CA--GCCTTAAATAC-ATTTGTACACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG------A-AAGT---------T--TT---------TCTAAATTA-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCAC---TTGCG-TGATGGACTCTCTGCAACG--AATT-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCTAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-TG-AGA-T--CCG-TTGGTTGATC---TAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCtcgatcgactcga
gi|5                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACA--GTTATGGA-GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CAGT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGTGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG------A-AAGT---------T--TTAT-------TCTAAATTT-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCTC---TTGCGATGATGA-CTCTCT-CAACG--AATTTC-GTTCTGGG-CTGCCTCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAGTTCTTCTAGAAGA-CCGTCCTCCC--G---ATTTTACTGAGTGA-AGA-TCACCG-TGGTTGAATC---G---TACAAGTGAAG-AAAGTGTCACC-GCAT-TC-C-TT-CAAG-A-----GT-CATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATTCGT
gi|6                          :                                                                        tACACTTCGCGTAGCCT-AAAGAC-ATTTGTACACATACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTT-AA-TA--GGGATGT--TTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ATTG---G-AAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TACCTG----T-CAACCTTCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTACTAGAAGACTCGTCTCCTC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-AAGGTTGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTTACC-GCAT-T--C-TT-CAAGGA-----GTCCATCCGCCGATTATATACT-G--TGGGCGATC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                 CATGT-CAACC-CCTTTGCCTTG--GACAACAACNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---NNNNNNNNNNN-NN-NNN-N--NNN-NNNNNNNNNN---ACC-CAGAGATGAAG-TAA-TGTAACTTACAT-T--C-TT-CAA-AA-----GCCCACCCCCCGAT---ATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCaactcaaggaagaggagatggacctatccaccaccc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GAAGACCCATATCCCGTGG---GTTATACTGAC-GG-AGG-T--CCA-AGGGTTGATC---GAC-CACCAATGACG-GAA-TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgatcgact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAA-TCTTCAAGAAG-TCCGT-TCCCC--G---ATTATAC--AGCGG-TGA-T--CCG-TAAAAAGATC---GAC---TTGAGGAAG-AGA-TG-GACC--CAT-T--C-aaaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                   gaagacccatatcccgtgggttatactgacggaggtccaagggttgatcgaccaccaatgacggaatttcatcgGAAGACCCATATCCCC--GTGGGTTATACTGAC-GG-AGG-T--CCA-AGGGTTGATC---GAC-CACCAATGACG-AA--TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgccacccac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CAA-TCTTCAAGAAG-TCCGT-TCCCC--G---ATTATAC--AGCGG-TGA-T--CCG-TAAA-AGATC---GAC---TTGAGGAAG-AGA-TG-GACC--CAT-T--C-aaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac


blockSeqs                     :            T        A         T  CCG  . CACGTC             AT   G    T    C    G  TA   T       T     CA    C                      GCCAGTAG  A AGGGATAT        AT              T        C CTAGCT C      AGA A   A      GG     G     CG    T A  G     .    C  ATTCC    A              A  CC      C    T     A     A     C     CC TGG       A   T  AA  A CA   AG  TGC    ACA   T           CA  G GTAACTTA   A TC A  A      TCCCC T            TA      C GT    C
blockSeqs                     :            G        A         T  .    . .                  .    .    .    A    .  C    T       .     TA    C                      GCCAGTT   A AGGGATGT        AC              .        . CTAGCT C      .   T   .      AC     G     .     . .  T     .    .  CCTGC    C              A  .       T    .     A     A     C     TG .         T   C  A   . .    T   TGC    .     .           A   . GTCACTA    . C  .  .      .     T            .       . .     .
blockSeqs                     :            G        .         T  .    . .                  .    .    .    A    .  .    T       .     TG    C                      GCCAAA    G AGGGTGT         AC              .        . CTT    C      .   T   .      GC     G     .     . .  .     .    .  CCTGC    C              A  .       T    .     T     A     C     .  .         T   C  A   . .    T   ATC    .     .           A   . GTCACTA    . .  .  .      .     T            .       . .     .
blockSeqs                     :                               .  .    . .                  .    .    .    A    .  .    T       .     TA    T                      A         G T               .               .        . TTG    .      .   T   .      C      G     .     . .  .     .    .  CCTG     C              A  .       T    .     T     A     C     .  .         A   .  A   . .    T   GTC    .     .           G   . GTCACCG    . .  .  .      .     C            .       . .     .
blockSeqs                     :                                  .    . .                  .    .    .    A    .  .    .       .     G     .                      A         . T               .               .        . TG     .      .   .   .      .      .     .     . .  .     .    .  C        C              T  .       T    .     T     A     C     .  .         T   .  A   . .    T   GTT    .     .           T   . GTCACCG    . .  .  .      .     C            .       . .     .
blockSeqs                     :                                  .    . .                  .    .    .    .    .  .    .       .                                                                                                                                                                     .              .  .       A    .     T     N     C     .  .         T   .  A   . .    T   TTG    .     .           A   . GTTACCG    . .  .  .      .     T            .       . .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                .    .     N     A     N     .  .         T   .  N   . .    A   GTT    .     .           A   . TTCATCG    . .  .  .      .     T            .       . .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .     A     A     A     .  .         T   .  A   . .    N   NNN    .     .           A   . TTCATCG    . .  .  .      .     T            .       . .     .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                     .     A     .     A     .  .         N   .  T   . .    A   GTT    .     .           T   . GTAACT     . .  .  .      .     C            .       . .     .
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originalCons                  :  TTTCTGTGACNTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGTA-AAATA--GGG---T--TTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCNAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-TGGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
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Reference ( family-1945 )     :  TTTCTGTGACNTTCTTACAAAGTCATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAG--AAAATAGGG-TGTTTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ACTG--TGCAAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCNAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-TGGGTCGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGC
gi|1                          :  TTTCTATGACTTTCTTACAAAGTCATTGAACT---GCCG------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGCTCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAGT-AAAATAATG-TGTTTAGGCGACCATCTAAATTA-CTACACAA-AT----TGCAAACAC---TTGCG-TGGTGGGGTTTCTCCAACG--AATC-C-GT-CTGAGCCTGC-TC----CATGTCCAACCTCCTTT-CCATG--GA-AACTACAG-TCTTCT---AAACCCGTCTCCCC--G---A-TATACTGAG-GG-AGATT--CCG-AGGATTGATC---GAC-ACCAGATGAAG-AAC-T-TCACC-GCAT-T--C-TT-TAAGAA-----GTCCATCTCCCGAT--TATACA-G--TGCG-GATCCGTGGAC
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                          ACCGCAT-TCTTTAAGAAG-TCCATCTCCC---G---ATTATACAGTG-CG--GA-T--CCG-TGGA-CGATC---AACTCGAGGAAGATG-AAA-TGgatcaactcgaggaagatgaaatggacccatctaccaccaac
gi|10                         :         tttctatgactttcttacaaagtcattgaactgccgagtctggtcaactccacgttaaacactttcggccttaaatacatttgctcacacacaactatcctttcttgtttcggccagtaaaataatgtgtttaggcgaccatctaaattactacacaaattgcaaacacttgcgtggtggggtttctccaacgaatccgtctgagcctgctccatgtccaacctcctttccatggaaactacagtcttctaaacccgtctccccgatatactgagggagattccgaggattgatcgacaccagatgaagaacttcACTGAG-GA-AGAAT--CCG-TGGTGCGATC---GAC-CACAGAT--AG-AA----------GGATAT--C-TT-TAAAAA-----GTC--TTTCCCAAT--TA-ATT-G--TTAG-GATCCATGGgacccatctaccaccaac
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTTATACTGAG-GA-AGA-T--CCG-TGGTGCGATC---GAC-CACAGATGAAG--GA-TA-----------T--C-TT-TAAAAA-----GTCTTTCCCCCAAT--TATATT-G--TTGG-GATCCATGGACcaccatcgatctgaggaaaatgcaatgaccccatccgttattttctacttgagg
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -CACAGATGAAA-GAA-TATC--------------TT-CAAGAA-----GTCTTT------AT--TA-ACT-GGTTGGG-GATCCGTGGcatcgatctgaggaaaatgcaatgaccccatcta
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AA-TGTAACT--TAT-TTCC-TC-C--GAA-----G-CCATTCCC-GAT--TAT-CT-G--TGGG-GA-CCGTAGGCaagaggagaaggacccatccatcacctactg
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tGAAG-TAA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----GCCCATCCCC----------------TGGG-GATCCGTGGGCgatcgcactcca
gi|15                         :                                GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CGTT-AAACCCTTT-CG--GCC-TAAATAC-Agatcgactcg
gi|16                         :                                GT---GC-G------AGTTTGGTCAACT--CCA-CGTT-AA
gi|2                          : cTTTCTATGGCTTTCTTACAAAGTCATGAATGT---GC-G------AGCATGGTCAACC--CCA-GGTT-AAACACTTT-CGC-CCCTTAA--AC-ATCT--GCACACATAACTATCC-TTCTGCTTTTGGCCAA--AAAATAGGGATATTTAGATGACCATCTAAATTATTTAGACAC-A-TG-----AAGCACAGATAGC--TGGT----TTTCTGCTTTG--TATT-CAGTGAAGGG-TT---TTATTCCATAT-AGACCTCATTTGCCATACCGTCATC-ACAG-TCTTCAAAAAGACCCATCTCCCC--A---ATTATACAGAG-GG-----T--C-----GATCAACCACAGAC-CACAGATGAAG--AA-TATC-------T-T--CATTACAAGAATCCCCCCCCCCCCCCCAAT--TATACT-G--TGGG-AATCCATGGAC
gi|3                          :                          ATGGATGTCCGGC-GCACGTCAGCTGGGTCAACTATCCAGCGTTTAAAC-CCTT-CG--GC--TAAATACTATTTGCACACG---AAC-ATCGT--CTTGTTTCGGCCAGTAGAAATAGGG-TGTTTAGACGACCAT-TAAAT-A-TT-GACAACACT---TGCAAGCAC---T-GCG-TGGTGGGGTTTCTGCAACGCGAATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TCC-----TGT---ACCTTCTT-GCC-TT--GACACCTACAA-TCTTCTAGAAGAC--GTCTCCCCCCG---ATTATA-TGAG-GGAAGA-T--CCGAGGGGTCGATC---GAC-CACCGATGAAGCACA-TGTCACT-ACAT-T--C-TT-CAAGAA-----G-CCATCCCCCGTC--TATACTCG--TGGG-GATCCGTGGccaag
gi|4                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACAAAGTTATGGATGT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CAA-CATT-AAACACTTT-CA--GCCTTAAATAC-ATTTGTACACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG-------AAAGT-------TTT---------TCTAAATTA-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCAC---TTGCG-TGATGGACTCTCTGCAACG--AATT-C-GT-CTGGG-CTGC-TCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTTCTAGAAGACCCGTCTCCCC--G---ATTATACTGAG-TG-AGA-T--CCG-TTGGTTGATC---TAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTCACC-GCAT-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCtcgatcgactcga
gi|5                          :  TTTCTGTGACGTTCTTACA--GTTATGGA-GT---GC-G------AGTCTGGTCAACT--CCA-CAGT-AAACACTTT-CG--GCCTTAAATAC-ATTTGTGCACACACAACTATCCTTTCTTGTTTCG-------AAAGT-------TTTAT-------TCTAAATTT-TTAGACAA-ACTAGCTGCAAGCTC---TTGCGATGATGA-CTCTCT-CAACG--AATTTC-GTTCTGGG-CTGCCTCCCTGCATGT-CAACCTCCTTTGCCATG--GACAACTACAGTTCTTCTAGAAGA-CCGTCCTCCC--G---ATTTTACTGAGTGA-AGA-TCACCG-TGGTTGAATC---G---TACAAGTGAAG-AAAGTGTCACC-GCAT-TC-C-TT-CAAG-A-----GT-CATCCCCCGAT--TATACT-G--TGGG-GATTCGT
gi|6                          :                                                                        tACACTTCGCGTAGCCT-AAAGAC-ATTTGTACACATACAACTATCCTTTCTTGTTTCGGCCAG--TTAATAGGGATGTTTAGACGACCATCTAAATTA-TTAGACAA-ATTG---G-AAGCAC---TTGCG-TGGTGGGCTTTCTGCAACG--AATC-C-GT-CTGGG-CTGC-TACCTG----T-CAACCTTCTTTGCCATG--GACAACTACAG-TCTACTAGAAGACTCGTCTCCTC--G---ATTATACTGAG-GG-AGA-T--CCG-AAGGTTGATC---GAC-CACAGATGAAG-AAA-TGTTACC-GCAT-T--C-TT-CAAGGA-----GTCCATCCGCCGATTATATACT-G--TGGGCGATC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                             CATGT-CAACC-CCTTTGCCTTG--GACAACAACNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN--N---NNNNNNNNNNN-NN-NNN-N--NNN-NNNNNNNNNN---ACC-CAGAGATGAAG-TAA-TGTAACTTACAT-T--C-TT-CAA-AA-----GCCCACCCCCCGAT---ATACT-G--TGGG-GATCCGTGGGCaactcaaggaagaggagatggacctatccaccaccc
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GAAGACCCATATCCCGTGG---GTTATACTGAC-GG-AGG-T--CCA-AGGGTTGATC---GAC-CACCAATGACG-GAA-TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgatcgact
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAA-TCTTCAAGAAG-TCCGT-TCCCC--G---ATTATAC--AGCGG-TGA-T--CCG-TAAAAAGATC---GAC---TTGAGGAAG-AGA-TG-GACC--CAT-T--C-aaaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                               gaagacccatatcccgtgggttatactgacggaggtccaagggttgatcgaccaccaatgacggaatttcatcgGAAGACCCATATCCCC--GTGGGTTATACTGAC-GG-AGG-T--CCA-AGGGTTGATC---GAC-CACCAATGACG-AA--TTTCATC-GCAA-T--C-TT-CAAGAA-----GTCCGTTCCCCGAT--TATACA-G--CGGT-GATCCGTgccacccac
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                              CAA-TCTTCAAGAAG-TCCGT-TCCCC--G---ATTATAC--AGCGG-TGA-T--CCG-TAAA-AGATC---GAC---TTGAGGAAG-AGA-TG-GACC--CAT-T--C-aaaagatcgacttgaggaagagatggacccattcgccacccac