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Reference ( gi|6 )            :                                                                               ATTCCCTAATTGATATGACTG-GTTATTGATTGGAATGTTCTGGTCGTC----CA--------ATGAA---AACTT-GTGT----CTCTAATTA-CT-TT-C-GAC--TA-------AGTCTTGCACTCT-A-----GTTGTAC-ACAAAGATGGTCG-----GTCA-GGT------ATC--A--T--C--GTAAGCTC--T--AGTAGCCTGCTT
gi|1                          :                                                                               ATTCCCAAATTGATACGACTG-GTTATTA--------GTTCT---CGCT----TA--------AAAAATAGAACCT----T----CTTTAATCG-CT-TT-C-AAC--TA-------GGTTTCGCACGCT-A-----GCTGTTC-ATAAAGATGGCCG-----AAAATGGA------ATCGTG--T--C--GTAAGCT
gi|2                          : cattgaacattaagcacattcacggaccttcaaggtgaatatgacttgcagtgatattggccctaaaacagattggaaATTCCAAATTTGATATGA-TGTGCTATTATTTAGA---------TCGTC----CG--------ATGAA---AGCCT-GCGTGCACCTCTAATTA-C
gi|7                          :                                                                                TCCCCTAGTTGATAAGAATA-GGTATT---T----TGTTTTGGTAGTATTTACACTGTATGTATGAA---AAAATAGCGT----CTCTAAGGA-CT-TT-T-GAC--TA-------GGTGTTGCATTTT-A-----TCTCTAA-ACAAGGCTGGTTG-----ATCA-Gatgggggggggggggagagggaggggcgctaccctgtaggctcttgcactctagcggcaaacgaagaaggccgcccaggtacactaaccattgcgtaagctttataggagccgttttcgatg
gi|5                          :                                                                                      AATTGGTACGATTG-GT-ATC-ATT----T-TTGTGATCATC----CA--------ATGAA---AACTC-GCGT----ATTTAATTA-CT-TT-C-GAC--AA-------GGCCTTGCA
gi|13                         :                                               tgaattccccaacaccgggctacaatcattgagaagtcaaATTGATACTAGTG-GTT-TTCATTG------TTTGGTCGTT----TA--------ATGAA---AA------------CTCTTATCA-CT-TC-C-GACAATA-------GGTCTaaaggaatatcattggtcttttctgtcaaacgaaaagggccg
gi|3                          :                                                                                                    tccgATCGAGTGATATAATTTGGTCATC----TA--------ATGGA---ATCTC-GCTT----CTCAAATCA-CT-TT-T-AAT--TA-------GGTTTTGCACTCT-G-----GTCGTAA-ACGAAGATGGCTG-----A-CACAAT------ATC--ATTT--C--TTAGGCTC--
gi|12                         :                                              atgtgaatatagctgttgattttttcagcatcggaccaaaattcaattcaagtaatttcaaaattcatgcgTTTTGGTCGTC----GA--------ATGAA---AACTT-GCGT----CTGTAATCA-CC-TT---GAT--TA-------TGTCTTGCAATCT-A-----CATGTAA-ACAAAG
gi|8                          :                                                                                                                      TCTG-TTGTT----CA--------ATGAA---GACTG-GAAC----CTTTAATCA-CT-TT-C-GAC--GG-------GGTCTTGCACTTT-A-----GCTGTAA-ACCATGATGACCA-----ACTA-GAT------ATC--GGTT--T--GTAAACTC--T--AGTGGCCGGTTT
gi|9                          :                                                                                                            cgagttattaTTTGGTTGTC-----A--------ATGAA---AATTC-ACGA----TTCTAACCAACT-TT-CCGAC--TA-------AGTTTTGCACTCA-A-----GCAGCTCAACAAATATGATCG-----A-CA-TGT------ATC--G--T--CTAGCAAGCTT--T--
gi|14                         :                                                                                                                             GTT----CA--------ATGAA---AGCTT-ATGT----TTCTACTTG-CT-TT-C-TAC--TA-------GG-GTTGCATTAT-G-----ATTGTAA-AGAAAGcaacaggcgttttgatat
gi|10                         :                                                                                                                               t----CA--------ATGAA---AATTC-AAAT----CGCTCATTG-CTATT-C--AG--TA-------GGTCTTGCTTTCTAA-----ACTGCAA-ACAAAGATGGCCA-----ACCA-GAT------TTCT-T--T--T--GTAGGCCT--T--AGTAGCC
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gi|4                          :                                                                                                                                                               T----CTCTAACCA-CA-TT-T-GAT--TA-------GGTCTAGCACTTT-ACATGCACTGTAC-ACAAAGATGG-CA-----GTC---GT------GTC--G--T--aggt
gi|2                          :                                                                                            cgtaccttcgaggtgaatataacatttgatttttttccaatattagacccaaaaaaatattttttttgaaaattcccaaattgattctattggctatgacctttatTCTTGCACTCT-A-----GCGGCAA-ACGAAGAAGGCCG-----CCCA-GGTACACTAACC--A--TTGC--GTAAGCTTTAT--AGGAGCC
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGCCTTTGAGGTGAATACAATCATTTGAATTTTTCCAACATCATACCAAAAAATA
Unaligned ( gi|16 ): AAGTTTGCAAACCAGGTATCATTTCGTTGACCCATGGACAGTAGCTGATTT






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Reference ( family-169 )      :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGANTG-GTTAT-TAATTG---TGTTTTGGTCGTC----CA--------ATGAA---AAC-TCGCGT----CTCTAATCA-CT-TTC-GAC--TAGG-TCTTGCACTCTA-----G-CTG-TAAACAAAGATGGCCGAC-CA-GGT------ATC--G---T--C--GTAAGCTC--T--AGTGGCC-GGTTT
gi|1                          :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGACTG-GTTAT-TA--------GTTCT---CGCT----TA--------AAAAATAGAAC----CTT----CTTTAATCG-CT-TTC-AAC--TAGG-TTTCGCACGCTA-----G-CTG-TTCATAAAGATGGCCGAA-AATGGA------ATCGTG---T--C--GTAAGCT
gi|10                         :                                                                              cattgaacattaagcacattcacggaccttcaaggtgaatatgacttgcagtgatattggccctaaaacagattggaa----CA--------ATGAA---AAT-TCAAAT----CGCTCATTG-CTATTC--AG--TAGG-TCTTGCTTTCTA-----AACTG-CAAACAAAGATGGCCAAC-CA-GAT------TTCT-T---T--T--GTAGGCCT--T--AGTAGCCAGATTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                    --TAAG-TCCTGTACTCAA-----G-CTG-TAAACAAAGATGGCTGAC-CT-AGT------G-C--GGTTT--C--ATAAGCTC--TGGAGTGGCA-GGTg
gi|12                         :                                                                                                                     gtgtcttcactattttgcaactacattgTTTTGGTCGTC----GA--------ATGAA---AAC-TTGCGT----CTGTAATCA-CC-TT--GAT--TATG-TCTTGCAATCTA-----C-ATG-TAAACAAAG
gi|13                         :                                                                                                                  ATTGATACTAGTG-GTT-T-TCATTG---T---TTGGTCGTT----TA--------ATGAA---AA------------CTCTTATCA-CT-TCC-GACAATAGG-TCT
gi|14                         :                                                                                                                                                     tccgGTT----CA--------ATGAA---AGC-TTATGT----TTCTACTTG-CT-TTC-TAC--TAGG--GTTGCATTATG-----A-TTG-TAAAGAAAG
gi|2                          :                                                                                                         tATTCCAAATTTGATATGATGT-GCTAT-TA---------TTTAGATCGTC----CG--------ATGAA---AGC-CTGCGTGCACCTCTAATTA-C
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gi|3                          : attccaaatttgatatgatgtgctattatttagatcgtccgatgaaagcctgcgtgcacctctaattacatgggggggggggggagagggaggggcgctaccctgATTTCAAAATTCATGCGATCGAGTGATATAATT---------TGGTCATC----TA--------ATGGA---ATC-TCGCTT----CTCAAATCA-CT-TTT-AAT--TAGG-TTTTGCACTCTG-----G-TCG-TAAACGAAGATGGCTGACACA--AT------ATC--ATT-T--C--TTAGGCTC--cgatg
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gi|4                          :                                                                                                                    cgtaccttcgaggtgaatataacatttgatttttttccaatattagacccaaaaaaatattttttttgaaaT----CTCTAACCA-CA-TTT-GAT--TAGG-TCTAGCACTTTACATGCA-CTG-TACACAAAGATGGCAGTC-----GT------GTC--G---T--gacctttattctctaaccacatttgattaggtctagcactttacatgcactgtacacaaagatggcagtcgtgtcgt
gi|5                          :      cgtaccttcgaggtgaatataacatttgatttttttccaatattagacccaaaaaaatattttttttgaaaattcccaaattgattctattggctatgacctttatAAATTGGTACGATTG-GT-AT-CATTTT---TGT---GATCATC----CA--------ATGAA---AAC-TCGCGT----ATTTAATTA-CT-TTC-GAC--AAGG-CCTTGCA
gi|6                          :                                                                   tgaattccccaacaccgggctacaatcattgagaagtcaATTCCCTAATTGATATGACTG-GTTAT-TGATTGGAATGTTCTGGTCGTC----CA--------ATGAA---AAC-TTGTGT----CTCTAATTA-CT-TTC-GAC--TAAG-TCTTGCACTCTA-----G-TTG-TACACAAAGATGGTCGGT-CA-GGT------ATC--A---T--C--GTAAGCTC--T--AGTAGCC-TGCTTaaaggaatatcattggtcttttctgtcaaacgaaaagggccg
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gi|8                          :                                                                                                                               -GTTAT-TA--TC---TGTT------GTT----CA--------ATGAA---GAC-TGGAAC----CTTTAATCA-CT-TTC-GAC--GGGG-TCTTGCACTTTA-----G-CTG-TAAACCATGATGACCAAC-TA-GAT------ATC--GGT-T--T--GTAAACTC--T--AGTGGCC-GGTTT
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Reference ( family-169 )      :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGATTGGTTATT-ATT----TGTTTTGGTCGTC----CA--------ATGAA---AAC-TCGCGT----CTCTAATCA-CT-TTC-GAC--TAGG-TCTTGCACTCTA-----G-CTG-TAAACAAAGATGGCCGAC-CA-GGT------ATC--G---T--C--GTAAGCTC--T--AGTAGCC-GGTTT
gi|1                          :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGACTGGTTATT-A-------GTTCT---CGCT----TA--------AAAAATAGAAC----CTT----CTTTAATCG-CT-TTC-AAC--TAGG-TTTCGCACGCTA-----G-CTG-TTCATAAAGATGGCCGAA-AATGGA------ATCGTG---T--C--GTAAGCT
gi|10                         :                                                                            cattgaacattaagcacattcacggaccttcaaggtgaatatgacttgcagtgatattggccctaaaacagattggaa----CA--------ATGAA---AAT-TCAAAT----CGCTCATTG-CTATTC--AG--TAGG-TCTTGCTTTCTA-----AACTG-CAAACAAAGATGGCCAAC-CA-GAT------TTCT-T---T--T--GTAGGCCT--T--AGTAGCCAGATTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                  --TAAG-TCCTGTACTCAA-----G-CTG-TAAACAAAGATGGCTGAC-CT-AGT------G-C--GGTTT--C--ATAAGCTC--TGGAGTGGCA-GGg
gi|12                         :                                                                                                                   gtgtcttcactattttgcaactacattgTTTTGGTCGTC----GA--------ATGAA---AAC-TTGCGT----CTGTAATCA-CC-TT--GAT--TATG-TCTTGCAATCTA-----C-ATG-TAAACAAAG
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gi|2                          :                                                                                                         tATTCCAAATTTGATATGATGTGCTATT-ATT----TA----GATCGTC----CG--------ATGAA---AGC-CTGCGTGCACCTCTAATTA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                  --TAGGCTCTTGCACTCTA-----G-CGG-CAAACGAAGAAGGCCGCC-CA-GGTACACTAACC--A---TTGC--GTAAGCTTTAT--AGGAGCC-GTTTTatgggggggggggggagagggaggggcgctaccctgtaggctcttgcactctagcggcaaacgaagaaggccgcccaggtacactaaccattgcgtaagctttataggagccgttttcgatg
gi|3                          : attccaaatttgatatgatgtgctattatttagatcgtccgatgaaagcctgcgtgcacctctaattacatgggggggggggggagagggaggggcgctaccctgATTTCAAAATTCATGCGATCGAGTGAT-AT------AATTTGGTCATC----TA--------ATGGA---ATC-TCGCTT----CTCAAATCA-CT-TTT-AAT--TAGG-TTTTGCACTCTG-----G-TCG-TAAACGAAGATGGCTGACACA--AT------ATC--ATT-T--C--TTAGGCTC--cgatg
gi|4                          :                                                    atgtgaatatagctgttgattttttcagcatcggaccaaaattcaattcaagtaATTCCCAAATTGATTCTATTGGCTATG-ACC----T---TT---------------------AT---------------T----CTCTAACCA-CA-TTT-GAT--TAGG-TCTAGCACTTTACATGCA-CTG-TACACAAAGATGGCAGTC-----GT------GTC--G---T--
gi|5                          :                                         cgtaccttcgaggtgaatataacatttgatttttttccaatattagacccaaaaaaatattttttttgaaaAAATTGGTACGATTGGT-ATC-ATT----T-TTGTGATCATC----CA--------ATGAA---AAC-TCGCGT----ATTTAATTA-CT-TTC-GAC--AAGG-CCTTGCA
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Reference ( family-169 )      :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGATTGGTTATT-ATT----TGTTTTGGTCGTC----CA--------ATGAA---AAC-TCGCGT----CTCTAATCA-CT-TTC-GAC--TAGG-TCTTGCACTCTA-----G-CTG-TAAACAAAGATGGCCGAC-CA-GGT------ATC--G---T--C--GTAAGCTC--T--AGTAGCC-GGTTT
gi|1                          :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGACTGGTTATT-A-------GTTCT---CGCT----TA--------AAAAATAGAAC----CTT----CTTTAATCG-CT-TTC-AAC--TAGG-TTTCGCACGCTA-----G-CTG-TTCATAAAGATGGCCGAA-AATGGA------ATCGTG---T--C--GTAAGCT
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gi|2                          :                                                                                                         tATTCCAAATTTGATATGATGTGCTATT-ATT----TA----GATCGTC----CG--------ATGAA---AGC-CTGCGTGCACCTCTAATTA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                  --TAGGCTCTTGCACTCTA-----G-CGG-CAAACGAAGAAGGCCGCC-CA-GGTACACTAACC--A---TTGC--GTAAGCTTTAT--AGGAGCC-GTTTTatgggggggggggggagagggaggggcgctaccctgtaggctcttgcactctagcggcaaacgaagaaggccgcccaggtacactaaccattgcgtaagctttataggagccgttttcgatg
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2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGCCTTTGAGGTGAATACAATCATTTGAATTTTTCCAACATCATACCAAAAAATA
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Reference ( family-169 )      :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGATTGGTTATT-AT-TG-----TTTTGGTCGTC----CA--------ATGAA---AAC-TCGCGT----CTCTAATCA-CT-TTC-GAC--TAGG-TCTTGCACTCTA-----G-CTG-TAAACAAAGATGGCCGAC-CA-GGT------ATC-G--T-T-CGTAAGCTC--T--AGTAGCC-GGTTT
gi|1                          :                                                                                                          ATTCCCAAATTGATACGACTGGTTATT-A---G-----TTCT---CGCT----TA--------AAAAATAGAAC----CTT----CTTTAATCG-CT-TTC-AAC--TAGG-TTTCGCACGCTA-----G-CTG-TTCATAAAGATGGCCGAA-AATGGA------ATC-G--TGT-CGTAAGCT
gi|10                         :                                                                             cattgaacattaagcacattcacggaccttcaaggtgaatatgacttgcagtgatattggccctaaaacagattggaa----CA--------ATGAA---AAT-TCAAAT----CGCTCATTG-CTATTC--AG--TAGG-TCTTGCTTTCTA-----AACTG-CAAACAAAGATGGCCAAC-CA-GAT------TTC-T--T-T-TGTAGGCCT--T--AGTAGCCAGATTT
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                   --TAAG-TCCTGTACTCAA-----G-CTG-TAAACAAAGATGGCTGAC-CT-AGT------G-C-GGTT-T-CATAAGCTC--TGGAGTGGCA-GGg
gi|12                         :                                                                                                               gtgtcttcactattttgcaactacattg-----TTTTGGTCGTC----GA--------ATGAA---AAC-TTGCGT----CTGTAATCA-CC-TT--GAT--TATG-TCTTGCAATCTA-----C-ATG-TAAACAAAG
gi|13                         :                                                                                                                  ATTGATACTAGTGGTTTTC-AT-TG-----TTT-GGTCGTT----TA--------ATGAA---AA------------CTCTTATCA-CT-TCC-GACAATAGG-TCT
gi|14                         :                                                                                                                                                    tccgGTT----CA--------ATGAA---AGC-TTATGT----TTCTACTTG-CT-TTC-TAC--TAGG--GTTGCATTATG-----A-TTG-TAAAGAAAG
gi|2                          :                                                                                                         tATTCCAAATTTGATATGATGTGCTATT-A---------TTTAGATCGTC----CG--------ATGAA---AGC-CTGCGTGCACCTCTAATTA-C
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                   --TAGGCTCTTGCACTCTA-----G-CGG-CAAACGAAGAAGGCCGCC-CA-GGTACACTAACC-A--T-TGCGTAAGCTTTAT--AGGAGCC-GTTTTatgggggggggggggagagggaggggcgctaccctgtaggctcttgcactctagcggcaaacgaagaaggccgcccaggtacactaaccattgcgtaagctttataggagccgttttcgatg
gi|3                          : attccaaatttgatatgatgtgctattatttagatcgtccgatgaaagcctgcgtgcacctctaattacatgggggggggggggagagggaggggcgctaccctgATTTCAAAATTCATGCGATCGAGTGAT-AT-AA-----TTT-GGTCATC----TA--------ATGGA---ATC-TCGCTT----CTCAAATCA-CT-TTT-AAT--TAGG-TTTTGCACTCTG-----G-TCG-TAAACGAAGATGGCTGACACA--AT------ATC-AT-T-T-CTTAGGCTC--cgatg
gi|4                          :                                                    atgtgaatatagctgttgattttttcagcatcggaccaaaattcaattcaagtaATTCCCAAATTGATTCTATTGGCTATG-AC-C-------TTT---------------------AT---------------T----CTCTAACCA-CA-TTT-GAT--TAGG-TCTAGCACTTTACATGCA-CTG-TACACAAAGATGGCAGTC-----GT------GTC-G--T-
gi|5                          :                                         cgtaccttcgaggtgaatataacatttgatttttttccaatattagacccaaaaaaatattttttttgaaaAAATTGGTACGATTGGT-ATC-AT-TT-----TTGTGATCATC----CA--------ATGAA---AAC-TCGCGT----ATTTAATTA-CT-TTC-GAC--AAGG-CCTTGCA
gi|6                          :                                                                   tgaattccccaacaccgggctacaatcattgagaagtcaATTCCCTAATTGATATGACTGGTTATTGAT-TGGAATGTTCTGGTCGTC----CA--------ATGAA---AAC-TTGTGT----CTCTAATTA-CT-TTC-GAC--TAAG-TCTTGCACTCTA-----G-TTG-TACACAAAGATGGTCGGT-CA-GGT------ATC-A----T-CGTAAGCTC--T--AGTAGCC-TGCTTaaaggaatatcattggtcttttctgtcaaacgaaaagggccg
gi|7                          :                                                                                                           TCCCCTAGTTGATAAGAATAGGTATT--T-TG-----TTTTGGTAGTATTTACACTGTATGTATGAA---AAAATAGCGT----CTCTAAGGA-CT-TTT-GAC--TAGG-TGTTGCATTTTA-----T-CTC-TAAACAAGGCTGGTTGAT-CA-G
gi|8                          :                                                                                                                               GTTATT-ATCTG-----TT------GTT----CA--------ATGAA---GAC-TGGAAC----CTTTAATCA-CT-TTC-GAC--GGGG-TCTTGCACTTTA-----G-CTG-TAAACCATGATGACCAAC-TA-GAT------ATCGG--T-T-TGTAAACTC--T--AGTGGCC-GGTTT
gi|9                          :                                                                                                                                              cgaTTTGGTTGTC-----A--------ATGAA---AAT-TCACGA----TTCTAACCAACT-TTCCGAC--TAAG-TTTTGCACTCAA-----G-CAGCTCAACAAATATGATCGA--CA-TGT------ATC-G--TCT-AGCAAGCTT--TC-AACAGGC-GTTTT
2 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|15 ): GTGCCTTTGAGGTGAATACAATCATTTGAATTTTTCCAACATCATACCAAAAAATA
Unaligned ( gi|16 ): AAGTTTGCAAACCAGGTATCATTTCGTTGACCCATGGACAGTAGCTGATTT