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lowQualScore : 0 7 55 0 5555 0000000 7 0 0 22 7 777 55 7 7 000 0 444444 0 11 4 4 9999 4 4 11 4 4 4 4444444 4 11 4 4 0000000000000000000000 4 11 3 3 4 11 4 666 7 4 44 888888888888 9 4 0 99 0 99 99 4 4 4444 55 0 55 0 777777777777777 7 7 7 9 0 9 9 99 6 9 9 22
consensus : AACTGGTAC-CCTGTTGTGCT--A-TCGCTTCT----CTC-----GGGGTACCAGTCGATTGCTCAA-GT-ACAACAGGTA--AGCG-CCAATTTT---TGACAGCCA-GGATT-CGGGCTGTA---TCGTTAT-TT------C-ACGTCTA--ATG-CGAGAG-TT---CATTTC-AAA-ACAAC--AAC-GACGCTA-GA-CAATGAC-------G-TCACAATC--TACT-ACA-CTACGT-TA-C-----GGA--CA--C--GGTGAA-GTAAGAAGCGCGA--GCTTCGTGGANGC-AAC--AA-TN--ACGCAA-C-AATG-G-C---AT--TTCTGCAG-TGC-AACATAAA-AGTCAATTGA--CCAAT-G--AAATC--GGCTCAT-TT-G---GGAAAAC--CAAAGTAC--CCC-TTACCCGTT---------------G-TTTG-TG-T-ATNG-C-A--CCAA-TCA-AC-GGGGGA--CCAGT
Reference ( family-1668 ) : AACTGGTAC-CCTGTTGTGCT--A-TCGCTTCT----CTC-----GGGGTACCAGTCGATTGCTCAA-GT-ACAACAGGTA--AGCG-CCAATTTT---TGACAGCCA-GGATT-CGGGCTGTA---TCGTTAT-TT------C-ACGTCTA--ATG-CGAGAG-TT---CATTTC-AAA-ACAAC--AAC-GACGCTA-GA-CAATGAC-------G-TCACAATC--TACT-ACA-CTACGT-TA-C-----GGA--CA--C--GGTGAA-GTAAGAAGCGCGA--GCTTCGTGGANGC-AAC--AA-TG--ACGCAA-C-AATG-G-C---AT--NTCTGCAG-TGC-AACATAAA-AGTCAATTGA--CCAAT-G--AAATC--GGCTCAT-TT-G---GGAAAAC--CAAAGTAC--CCC-TTACCCGTT---------------G-TTTG-TG-T-ATNG-C-A--CCAA-TCA-AC-GGGGGA--CCAGT
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gi|8 : tTA--ATG-CAAG-G-TT---CATTTC-ATA-ACAAC--AAC-GACGCTA-GA-TATTGAC-------G-TCACAATC--TACT-AAA-TTACG------------------------GTGAA-GTA-GAAGCGCGAAAGCT-CG-AGAGGC-AAC--AT-TG--ATGCAA----------------------------AC-AAC-TAAA--GTCGATTGA--C-AAT-G--AAATC--GGCCCAT-TT-G----------------GTAC--GGC-GTACCCGTT---------------G-TTTG-TGCC-GTAG-C-A--TCAA-TCA-AC-GGatgtaccagtt
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|18 ): CGTATCCTATTGGATCTCGCTTCTTTCGAGTAC