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Reference ( gi|8 ) : ATTT-TTTCC--CAG-AATGA-----ATGAAA--A-A--T-G-T---G-------T-TTTG--CTT-------A---C---AA--TA---A-GATATTC--T-A-T-TATC-CA--A-A-T-TTCG--CTG--T--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-GA--TA--TGA--A-T-AT-CTAA-TA-A-----TA-A---A-CA---T--G--C-C-T--A-AA--A-G-A--C-----C-C-G-A----CA--G---A-----A-----G--T--T-A----T---G-A---T--T-T-T------T----T----A----G--A---G---A--A------A-AA-A----A-T-ATT-T-A--C--GA-AT-A----TT-----G-AAA--A--CG----CT----AT-TTG-T-T-GATTTTT--TTTTTTTAGAAT-C--T-A--TG-G---A---A-AAATCT
gi|7 : ATTT-TATCCGTCAGGAATAAT----ATGAAA--A-A--G-T-T---G-------T-TTTA--CTT-------T---CGCAAA--TACG-A-GGT-TTC--T-AAG-TATC-CA--A-A-CATTCG--CTG--T--GA--TT-TATG--G-T---GC-----GA--TAC-TGA--A-T-----T---TA-A-----TA-A---A-C----T--GGTC-C-C--A-AG--A-A-C--C-----C-C-G-A-----A--G---A-----A-----G--T--T-A----TAT-G-A---T--T-T-T------T----CG---A----G--A---C---A--C------A-AT-A----A-T--TT-C-A--C--GA-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----CT----AT-TTG-T-C-GATATTT--TT------AAAT-C--T-A--TG-G---A---T-AAATCT
gi|42 : ATTTATTTC----GG-ACTGA------TGAAA--A-A--T-G-T---GGGGGTTTT-TTTGG-TTT-------G---C---AAA-TATT-A-GAGATTT--T-A-G-TTTT-TA--A-A-C-TTCG--TTG--T--GA--TT-T--A--G-T---GC-A-T-GA--TG--TGA--A-T-A
gi|2 : tgatttttttatgatATTT-TTTCT--CGT-AAATA-----ATGAAA--A----T-G-TTGGG-------T-TTTT--TTTTTTTTGCA---G---AA--CA---A-GAGATTC----A-G-AGTT-CA--ACA-T-ATCAGTTTG--T--GA--TT-TT-G--A-T---GT-A-A-TA--TA--TAA--A-T-GT-CTAA-TA--------A-A---A-CA---T--G--C-CTT--A-CA--C-G-A--C-----T-CAG-A----TA--A---A-----A-----A--T--C-G--------G-G---T--G-T-T------T--------------G--A---A---T--A------T-AA-A----A-T-ATT-A-G--T--GA-AT------CT-----G-TAT--G--TG----TT----AT-TTA-T-T-GATatgaaaattaacct
gi|9 : gTTT-TTTTG--CAG-AATGA------TGAAA--A-A--T-G-T---G-------T-TTTG--TTT-------A---C---AAA-TA---A-GAGAATC--T-A-T-TATC-CA--A-A-C-TTCT--CTA--T--GA--TT-T--G--G-T---AC-A-T-GA--TA--TGA--A-T-GT-CTAA-TA--------A-A---A-CA---T--A--C-C-T--A-AA--A-G-A--C-----CAC-G-A----TA--G---A-----AATACTG--T--T-A----T---G-A---T--T-T-C------T----T----A----G--A---G------A------A-AA-A----A-T-ATT-T-G--C--GA-AC-A----TT-----G-AAA--A--CG----CT----TT-TTG-T-T-GATATTT--TTT-----AAAT-C--T-C--TG-A---AT--A-AAATCTatgaaagtattgttgatatttcgttttaaactcaataatagaaaaaatcttcta
gi|1 : TTT-TTTCT--CAG-AACGATGACAATGAAA--A-AA-T-GGT---G-------T-TTTG--CTT-------A---CTA-AA--TA---A-GCTATTTCTT-A-CATATC--A--C-A-T-GTC---CTGATT--GAGGTT-T--GTCG-A---GC-A-TAGA--TAAGTGA----T-AT-CTAA-TA----------------CA---T--G--C-T-T--A-AA--A-G-ATCC-----C-C-G-A----CA--G---AT----A-----G--T--T-A----TCGGGCA---TC-T-T-T------T----T----AATTTG--AAGTG---A--A------C-AC-A----T-C-ATT-T-A--C--CG-AT-A----TTT----G-AAGC-A--CGGCTCCT----TG-TTG-T-T-GATTTTT--TTTTTTTTTAGT-C--T-A--TG-G---A---T-AAt
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gi|4 : T-TTTCT--CCG----GA-----ATGATA--C-A----------G-------T-TTTGTTCTT-------G---C---AAA-TA---A-GAGGTTCC-T-A-G-CATC-CA--A---C-TTCG--CTG--TTTGA--TTAT--G--G-TCTGGC-AGT-GGAGTA--TGA--AAT-AT-CTAA-TA-A------A-A---T-CA---CTCG--CAC-T--A-AAG-A-G-A--C-----C-C-G-ATAGACA--G---A-----A-----T--T--T-A----T---G-AACGT--T-TGT------T----TCGTAA----G--A---A---A--A------A-TA-G----A-T-ATTGT-AATC--GA-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----CT----AT-TTG-T-T-GATATTT--TTTC-----AAT-C--T-A--TG-A---T---A-AAATC
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gi|18 : gtgattcctttctctcc-TTTCC--TGG-AATAA-----TTGAAA--C-A--C-T-T---G-------T-TTT---CTT-------G---C---GAATTA---A-GAGGTTC--T-T-TGTATC-CA--A-AAC-TTCG--CTG--T--GA--TT-T--G--A-----GC-A-T-GA--TA--TGG--A-T-AT-CT-A-TA--------A-A---A-CA---G--C--C-C-T--A-AA--A-G-A--C-----C-TAA-A----TA--G---A-----A-----G--T--T------T-----A---T--T-T-T------T----T----
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gi|50 : caaacttttaattttcatacatggct-TA-A-----TA-A-----CA------G--C-C-C--A-AC--A-A-A--C-----C-C-G-A----TA--G---A-----A-----G--TATT-A----T---G-A---T--T-TAT------T----T----A----G--A---G---AGCA------A-AA-A----A-----T-T-A--C--G--AT-A-----T-----G-AAA--A--C-----CT----AT-T---------TTTTTGATATTTTTAAAATCC--T-A--T--G---A---T-AAATCT
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gi|14 : tttctccagaatgatgaaatgtgtttgcttacaataagagattctccttatccaaattcgctatacttggtgcatatttggatatatctaataaaacattgctatatctatattttttttgtgtgtggtgtggtgtgtggt-A---T--T-T-T------T----T----C----G--C---A---G--A------A-AA-A----A-T-ATT-T-A--C--GA-AT-A----TT-----G-AAA--AATAG----CT----AT-GCG-T-T-GATATTT--TTT-----AAAT-C--T-A--TG-G---AT--A-AAAaatctt
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3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-165 ) : ATTT-TTTCC--C-GGAATGA-----ATGAAA--A-A--T-G-T---G-------T-TTTG--CTT-----G---C--A--A--TA---A-GAGAT-T-C--T-AN-T-ATC-CA--A-A-C-TT--CG--CTG--T--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-G--A--TA--TGA--A--T-AT-CT-AA-T-A-A-A-----AACA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----C-C--G-A---TA--G----A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--T----T----A----G-A---G---A---A------A-AA-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--CG----C-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-ATTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAAATCT
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gi|16 : -TTCCC--C-GGAAT-A-----ATGGAG--A-A--G-T-T---G-------T-TTTG---------------------------------AT-T-C--C-AG-A-CTT-CA--A-A-A-TT--CA--CGG--G--TA--TT-T--G--A-T---GT-A-A-T--A--CA--AGA--A--T-GT-CT-AA-T-A-A-A-----G-CG---T--G--C-C-T--A-AA--C---------------GA--C-----T-C--GGA---TA--T----A-----A-----A---GT-C------T---G---------------------------------------------------------------TATT-T-A--TG--A-TT-T----TT-----G-AAT--A--TG----T-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-A-ATTTT-T----A----AA-G-C--T-G--T---G-G-AT--AAAATCTtc
gi|17 : A--TT-T--G--A-TA--GC-A-T-G--A---A--TGA--A--A-AT-TC-AA-TTA-A-G-----AACAAGGT--C--C-C-T--A-AA--A---------------GA--CA----C-C--G-A---TAAAG----A-----A-----G---TT-A------T---G-A---TGGT-T-T--T----C----A----GGA---G---A---A------A-AA-A----A-TATT---A--CG--A--T-A----TTTGTGTG-AAA--A--CG----C-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-ATTTGTT-T----A----AG-T-t
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gi|21 : tttgatctgtaatA--TT-T--G--A-T---GT-AAT-G--A--TA--TGG--G--T-GT-TT-AA-T-A-A-A-----A---------G--T-C-T--A-AA--ACA-------------AA--C-----T-CA-G-A---TA--TCAACA-----A-----G---TC--------C---G-A---T--T-T-T--T----T----A------A---G---A---ATTAT--A-AA-A----A-TGAT-T-A--TT--AGAT-A----TT-----G-AAA--A--TA----T-T----T-T-TTTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-AAGT---G-G-AT--GAAATCT
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gi|3 : --G----A-----A-----G---TT-A------T---T-A---T--T-T-T--T----T----AGT--G-A---G---A---AT-----G-AA-ATATTA-TATT-T-A--CG----AT-A----TT-----G--AA--A--CG----T-T------T-TT-G-T-T-GTTT--T-TTTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-A---AAAATtgctatatctatattttttttgtgtgtggtgtggtgtgtggtgaagttattattttttagtgagaatgaaatattatatttacgatattgaaacgtttttgttgttttttttttttaaatctatggaaaaataatctt
gi|30 : tttctccagaatgatgaaatgtgtttgcttacaataagagattctccttatccaaattcgctatacttggtgcatatttggatatatctaataaaacattgctatatctatattttttttgtgtgtggtgtggtgtgtggt--G-T---GCCA-T-T--A--TA--T-A--A--T-AT-CT-AA-T-A-C-A-----A-CA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----C-A--G-A---TA--G----A-----A-----G---CT-A------T---A-A---TG-T-T-T--T----T----A----G-G---A---A---A------A-AA-A----ATTATT-T-A--CG--G-AA-A----CT-----G-AAA--A--C-----C-T----A-T-TT-G-T-T-A--AATT-TTTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--C---G-G-AA--GAAATTTaatctt
gi|31 : --TT-T--G--A-T---GT-A-T-A--AA-TA--TGA-----T-GT-TC-AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AA--C---------------AA--C-----T-TA-G-A---TA--T----A-----AC----A---AT-C------C---G-A---T--T-T-T--T----T----A----A-A---T---A---T------A-AA-A----T-TATT-T-A--TT--A--T-A----TT-----G-AAA--A--TG----T-T----A-T-TT-G-T-TGG--A--T-A--TTTT-T----G----AA-T----T-A--T---G-G-AT--GAAATCTta
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gi|34 : T-T--G--A-T---GT-A-T----A--CA--TGA--A--T-GT-TTTAA-C-A-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AA--C---------------GA--C-----T-CA-G-A---TA--T----ACATCCA-----G---TT--------T---------T--T-T-T--T----T----A----A-A---T---A---A------A-AA--------TATT-T-A--T---A-AT-A----T------G-AAA--A--TA----T-T----T-TCTT-C-T-T-G--A--T-ATTTTTT-----------AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--GAAATt
gi|35 : T-T--G--GAT---GT-A-T-T--A--TA--TGA--A--T-GT-TT-AA-T-A-A---------CA---T--GT-C-C-T--A-AA--C---------------AA--C-----T-C--A-G---TA--T----A-----C-----A---TC--------C---G-G---T--T-T-T--T----T----A----A-A-------A---T------A-AA-A----A-TATT-T-A--TT--A-ATAA----TT-----G--AA--C--CT----T-T----A-T-TT-G-T-T-GA-A--T-ATTTTAT-T----A----AACT-C--T-A--T---G-A-CT--GAAATCTtctt
gi|36 : --TT-T--G--A-T---GT-A-T-T--A--TA--TGA--A--T-GT-TT-GA-T-A-A-A-----AATG---T--A---------A-AA--A---------------GA--C-----T-C---------A--G----A-----A----------T-ACATC--T---G-G---T--T-T-T--T----T----A----A-A---A---A---C------A-AA-A----A-TATT-TGA--TG--A-AT-A----TT-----G-AAA-----TG----T-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-ATTTTTT-A----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAATTCT
gi|37 : --A--TA--TGA--A--TGAT-CT-AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AA--AA--------------GA--C-----T-CA-G-A---TA--T----AC----A-----G---TT--------C---G-G---C--T-T-C--T----T----A----A-A-----------ATTT---A-AA-A----A-TATT-T-A--TT--A-CT-A----TT-----G--AA--A--TA----T-TAA--A-T-TT-G-TGT-G-------ATTTTTT-T----A----AA-T-C----A--T---GCG-AT--AAAATCT
gi|38 : tt-CA--A-A-C-TT--T--------T--AA--TT-T-------T----C-A-T----A--CA--TGG--C--T-AT----AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-T-T--A-AA--A---------------GA--T-----T-C--GGA---TA--T----AC----A-----G---TC--------T---G-G---T--T-T-T--T----T----A----A-A---A---AT--A------A-AA-A----A-TATT-T-A--TG--A-AT-A----TT-----G-ACA--T--TT----T-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-A-TTTTT-C----A----AA-T-C--T-A--T---G-c
gi|39 : --G-T---GC-A-T-G--AA-TA--TGA--A--T-AT-CT-AA-T-A-A-A-----AACA------G--C-C-C--A-AG--A---------------GA--C-----C-C--G-A---AA--G----A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--C----G----A------A---G---A---A------A-AA-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----TG-----A-AAA--A--TG----C-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-ATTTTTT-A----A----AA-T-C--C-A------G-G-AT--AAAATCT
gi|4 : TT-TTCTC--C-GGAATGA------TACA----------------G-------T-TTTGTTCTT-----G---C--A--AA-TA---A-GAGGT-T-CC-T-AG-C-ATC-CA--A---C-TT--CG--CTG--TTTGA--TTAT--G--G-TCTGGC-AGT-G--GAGTA--TGA--AA-T-AT-CT-AA-T-A-A-A-----ATCA---CTCG--CAC-T--A-AAG-A---------------GA--C-----C-C--G-A---TA--G----AC----A-----GAATTT-A------T---G-AACGT--T-TGT--T----TCGTAA----G-A---A---A---A------A-TA-G----A-TATTGT-AATCG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-ATTTTTT-C---------AA-T-C--T-A--T-----G-AT--AAAATCt
gi|40 : A--TT-T--G--G-T---GC-A-T-G--A--TA--T----A--T-AT-CT-A--T-A-A-C-----A-CA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GAC-C-----C-C--G-A---TA--G----A-----G----------T-A------T---A-A---A--T-T-T--T----A----A----G-A---GAAAA---A------A-AA-A----A-TATT-T-A--TG--A-A--A----TT-----G-AAA--A--AG----C-T----A-T-TT-G-A-T-G--A--TGA---TTT-T----A----AA---C--T-A--T---G-G-AT--GAAATCa
gi|41 : --G-T---AC-A---G--A--TA--TGA--AGTT-AT-------------A-----AAC----T--A--C-T-C--T-AA--A---------------GA--C-----A-C--G-AG--TA--G----A-----A-----TAC-TT-A------T---G-A---T--TGT-C--T----T----A----G-A---G---A---A------ATAATA----A-T-TT-T-G--CGTGA-AC-A----TT-----G-AAA--A--AC----C-T------T-TT-G-T---G--A--T-ATTTT-T-T----A----AA-T-C--T----T---G-A-AT--AAAATCTa
gi|42 : tATTTATTTC-----GGACTGA------TGAAA--A-A--T-G-T---GGGGGTTTT-TTTGG-TTT-----G---C--A--AA-TATT-A-GAGAT-T-T--T-AG-T-TTT-TA--A-A-C-TT--CG--TTG--T--GA--TT-T--A--G-T---GC-A-T-G--A--TG--TGA--A--------T-AA-T-G-A-A-----AAtt
gi|43 : tgatttttttatgatTT-TTTCC--C-AGAACGG-----ATAACA--A-G--T---T---G-------T-TTT---TTT-----G---CCCA--A--CATAAA-GAGGTAT-C--T-AG-T-ATC-TA--A-A-C-TT--CC--GTG--T--GG--TT-TT-G--GCT---GG-C-T-G--A--TA--TGA--A--T-A------A-T-A-A---------CA---T--G--C-C-C--A-AG--A---------------GGCCC-----C-C--G-A---AA--G----A-----A-----ttaacct
gi|44 : a--A--TA--TGA--A--T-----T-AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-T-T--A-AA--C---------------AA--C-----T-CA-G-A---TA--T----A-----C-----A---AT-C------C---G-G---T--T-T-T--T----C----A----A-A---A---A---T------A-AG-A----A-TATT-T-A--TT--A-AT------TT-----G-AAA--A--TA----T-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-ATTGTTT------A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--GAAATCTtcta
gi|45 : ggatgtaatA--TGA--A--T-GT-TT-AA-T-A---A-----AACA---T--T--T-C-T--A-AG--C---------------AA--C-----T-CA-G-A---TA-----------------------TT-ACACATCC---G-A---T--T-T-T--T----T----A----A-T---A---ATATA------A-AA-A----A-TA-T-T-A--TT--A-AT-A----TT-----G-AAA--A----------T----A----------T-G--G----------T-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--GAAATCT
gi|46 : tgttgtagatatc--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-G--G--TA--TGG--A--T-AT-CT-AA-T---A-A-----AATA---T--G--C-T-T--A-AA--A---------------GAC-C-----C-C--G-A---TA--T----A-----A-----tca
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gi|48 : A--TT-T--G--A-T---GT-A-A-T--A--TA--TGA--A--T-GT-C--------------------A---T------------A-AA--A---------------GA--C-----C-CA-G-A---TA--T----A-----C-----A---AT-C------C---G-G---T--T-T-T--T----T----T----T-A---A---A---AT-----A-AC-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----T------G-AAA--A--TA----T-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAAAtcaaaaatcatgtcaattagaaaa
gi|49 : TT-TTTTC--T-GAAATGA------TAAAA--AGA--T-G-TT--G-------T-TTTT--C-----------C--A--AA-TA---A-GAGAT-T-T--T-AC-A-GAC-CA--T-G-T-TT--TG--CTG--T--GA--TT-T--G------------------------------A--T-AT-CT-AA-C---A-A-----AATA---T--G--T-C-T----AA--A---------------GA--C-----C-C--A-A---TA--G----A-----C-----A---TT------------------T--T-T-T--T----c
gi|5 : T-CTTTC--C-GGAAT-A-----ATGAAA--A-GGCT-T-T---G-------T-TTTC--GTT-----GTGCC--G--A--TA-----GAGAT-T-C--T-AA-G-AGC-CA--A---T-TT--TG--CTG--T--GA--TT-T--T--A-T---TA-A-T----A--TA--TGA--A--T-GT-C---A-T-A-T-A-----AAAA---T--C--T-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----T-CA-G-A---TA--ATAC-A-----A-----T---CG-G------T---G-----T--T-T-T--T----T----A------A---T---A---A------A-AA----------TT-T-A--TG--A---------TT-----G-AAACTA--TG----AGT----A-T-TT-A-T-T-G--AA-T-ATTTTTA------A----AA-T-C--T-G--T---T-G-AT--AAAA
gi|50 : gtgattcctttctctcc-CT-AA-T-A-A---------CA------G--C-C-C--A-AC--A---------------AA--C-----C-C--G-A---TA--G----A-----A-----GTA-TT-A------T---G-A---T--T-TAT--T----T----A----G-A---G---AGC-A------A-AA-A----A----T-T-A--CG----AT-A-----T-----G-AAA--A--C-----C-T----ATT-TT-T-T-T-G--A--T-A-TTTTT-A----A----AA-TCC--T-A--T-----G-AT---AAATCT
gi|52 : tc--C-----T-C--G-A---TA-------A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T------------A----G-A---G---A---A------A-AA-A----A-TA-T-T-A--C---A-AT-A----TT-----G-AAA--A--T--------------T-TT-G-T-T-T--A--T-A-AATTT-T----A----AA-T-C--TGA--T---G-G-ATA-AAAATCTtc
gi|53 : TTT-TTTCC--C-GAAATGA-----G-GAAA--A-A--C-GAT---G-------TCTTCG--TGT-----G---C--A--A--TA---A-GA----------------ATC-CAAGA-A-C-TT--CG---TG--C--GA--TT-A--C--T-T---GC-A-T-G--A--TA--Tc
gi|54 : tatTTT-TTTCC--C-GAAATGA------TGAAA--A-C--G-A-T---G-------T-CTTG--TGT-----G---C--A--AA-TA---A-GA----------------ATC-CA--A-A-C-TT--CG--CTG--C--GA--TT-A--C--T-T---GC-A-T-G--A--TA--T
gi|55 : gatA--A-A--T-G-T---G-------T-TTTG---TT-----A---CA-A--A--TA---A-AAGAG-C-A--T-TT-T-ATCTCA--A-A-C-TTTCTG--CTA--T--G
gi|56 : t--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T----A-T-TT-G-T-T-G--A--TAATTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--TG--G-G-AT--AAAA
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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gi|19 : -T--G--A-T---GT-A-A-T--A--TA--TGA--A-TG-T-TC-AA---A-A-A-----AAAA---T--G------T--A-AA--AAAAAAAAAAAAAAAAGA--C-----T-GA-G-A---T----A--T---AC----A-----A---TC-T------T---G-----T--C-T-T--T----T----A----A-A---A---A---T------A-AA-A----A-TATT-T-A--TG--A-GT-A----TT-----G-AAA--A--TA----G-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---T-G-AT--AAAACCTctcttttataaaaattca
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gi|21 : tttgatctgtaatA--TT-T--G--A-T---GT-AAT-G--A--TA--TGG--G-TG-T-TT-AA-T-A-A-A-----A---------G--T-C-T--A-AAACA---------------AA--C-----T-CA-G-A---TATCAA--C---A-----A-----G---TC--------C---G-A---T--T-T-T--T----T----A------A---G---A---ATTAT--A-AA-A----A-TGAT-T-A--TT--AGAT-A----TT-----G-AAA--A--TAT---T-T----T-T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-AAGT---G-G-AT--GAAATCT
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gi|27 : --TA--TGA--A-TG-T-TT-AA-T-G-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AAC-A---------------AA--T-----C-A--G-A---T----A--T---A-----C-----A---AT-C------C---G-A---T--T-T-T--T----T----A----A-A---T---A---T------A-AA-A----A-TATT-T-A--TTT-A-AT-A----TT-----GGAAA--A--TA----T-T----A-T-TTG-T-TTG--A--T-ATTTTTT-T----A----AAAT-C--T-A--T---G-G-AT--GAAATCTtc
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Reference ( family-165 ) : ATTT-TTTCC--C-GGAATGA-----ATGAAA--AA--T-G-T---G-------T-TTT-G-TT--T-----GC--A--A--TA---A-GAGAT-T-C--T-AN-T-ATC-CA--A-A-C-TT--CG--CTG--T--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-G--A--TA--TGA--A-TG-T-CT-AA-T-A-A-A-----AACA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----C-C--G-A---T----A--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--T----T----A----G-A---G---A---A------A-AA-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--CG----C-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAAATCT
gi|1 : TTT-TTTCT--C-AGAACGATGACAATGAAA--AAA-T-GGT---G-------T-TTT-G-CT--T-----ACTAA--A--TA---A-GCTAT-T-TCTT-ACAT-ATC--A--C-A-T-GT--C---CTGATT--GAGGTT-T--GTCG-A---GC-A-TAG--A--TAAGTGA----TA-T-CT-AA-T-A-----------CA---T--G--C-T-T--A-AA--A---------------GATCC-----C-C--G-A---C----A--G---AT----A-----G---TT-A------TCGGGCA---TC-T-T-T--T----T----AATTTG-AAGTG---A---A------C-AC-A----T-CATT-T-A--CC--G-AT-A----TTT----G-AAGC-A--CGGCTCC-T----T-G-TTG-T-T-G--A--T-TTTTTTT-T----TTTTTAG-T-C--T-A--T---G-G-AT--AACAT
gi|10 : aattaatatatttttttgtgatTT-TGTTC--C-AGAAC-------ATGAAATAAA--CAG-T---G-------A-TT--G-CT--T-----AC--A--AA-TA---A-GA--T-T-C--T-AG-T-ATCACA--------TT--CG--CTG--T--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T----A--TA--TGA--A-TA-T-CT-AAAT-A-A-A-----AACA---T--G--C-C-T--AGAA--A---------------GA--CG----C-C--G-A---T----A------A-----T-----G---TT-A------TAA-G-A---G--T-T-T--T----T----A----G-A---G---A---A------A-AA-A----T-CATT---A--CG--A-TT-A----AT-----G-AAA--A--CG----C-T----A-T-GTG-T-T-G--A--T-ACTTTTA-T----A----TA-T-C--T-A--T---G-GAAT--AAAATCTactcttcaa
gi|11 : tgTT-TTTCC--C-GGAAT-A-----TTGAAA--AA----------G-------T-TTT-C-TT--T-----GC--A--A--TA---A-GAGGT-T-C--T-AG-T-AT--CA--A-A-C-TT--CG--CCGC-T--TA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-GAAA--TA--TGA--A-TA-T--T-AA-T---A-A-----AACA------G--C-C-C--A-AG--A---------------GGACC-----C-C--GCA---A----A--G---A-----A---------TT-A------T---G-A---T--T-T-T--C----G----A----A-A---G-------A------A-AA-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T----A-T-TTG-T-T-C--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-C-A--C-A--G---T-G-ATA-AAAATCTtc
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gi|13 : attttttaaaaCT--C-GGA-TGA------TGAAA--AG--T---T---G-------T-TTT-C-TT--T-----GC--A--A--TA---A-GAG-T-G-C--T-AG-TTACC-CA------C-TTT-CG--CTG--T--GA--TT-T--GT-G-T---GCTA-T-G--A--CA--TGA--A-AT-T-CT-AA-T-A-A-A-----A-CAG--T--G--C-C------AA--A---------------GAACC-----C-C--G-A---A----G--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--C----C---------------G---A---G------A-AA-A----A-TATT-T--------T-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T----A-T-TT--T-T-G-----T-ATTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--TAAATt
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gi|21 : tttgatctgtaatA--TT-T--G--A-T---GT-AAT-G--A--TA--TGG--G-TG-T-TT-AA-T-A-A-A-----A---------G--T-C-T--A-AAACA---------------AA--C-----T-CA-G-A---TATCAA--C---A-----A-----G---TC--------C---G-A---T--T-T-T--T----T----A------A---G---A---ATTAT--A-AA-A----A-TGAT-T-A--TT--AGAT-A----TT-----G-AAA--A--TAT---T-T----T-T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-AAGT---G-G-AT--GAAATCT
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gi|29 : gtgattttttccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T--G--A-T---GT-AAT-A--A---A--TGA--A-TG-T-TT-AA-T-A-A-A-----A-CG---T--G--T-C-T--T-AA--A---------------GA--C-----T-CA-G-A---T----A--T---A---------------CT-A------TCCTG-G---T--T-T-T--T----T---------T-A---A---A---T------A-AA-A----A-TATT-T-A--TC--A-AG-A----TT-----G-AAA--A--TA----T-G----A-T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTTT-T----A----AA---C--T-A--T---G-G-AT--AAAATCTta
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gi|3 : --G---A-----A-----G---TT-A------T---T-A---T--T-T-T--T----T----AGT--G-A---G---A---AT-----G-AA-ATATTA-TATT-T-A--CG----AT-A----TT-----G--AA--A--CG----T-T------T-TTG-T-T-GTTT--T-TTTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-A---AAAATtgctatatctatattttttttgtgtgtggtgtggtgtgtggtgaagttattattttttagtgagaatgaaatattatatttacgatattgaaacgtttttgttgttttttttttttaaatctatggaaaaataatctt
gi|30 : tttctccagaatgatgaaatgtgtttgcttacaataagagattctccttatccaaattcgctatacttggtgcatatttggatatatctaataaaacattgctatatctatattttttttgtgtgtggtgtggtgtgtggt--G-T---GCCA-T-T--A--TA--T-A--A-TA-T-CT-AA-T-A-C-A-----A-CA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----C-A--G-A---T----A--G---A-----A-----G---CT-A------T---A-A---TG-T-T-T--T----T----A----G-G---A---A---A------A-AA-A----ATTATT-T-A--CG--G-AA-A----CT-----G-AAA--A--C-----C-T----A-T-TTG-T-T-A--AATT-TTTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--C---G-G-AA--GAAATTTaatctt
gi|31 : --TT-T--G--A-T---GT-A-T-A--AA-TA--TGA----TG-T-TC-AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AA--C---------------AA--C-----T-TA-G-A---T----A--T---A-----AC----A---AT-C------C---G-A---T--T-T-T--T----T----A----A-A---T---A---T------A-AA-A----T-TATT-T-A--TT--A--T-A----TT-----G-AAA--A--TG----T-T----A-T-TTG-T-TGG--A--T-A--TTTT-T----G----AA-T----T-A--T---G-G-AT--GAAATCTta
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gi|34 : T-T--G--A-T---GT-A-T----A--CA--TGA--A-TG-T-TTTAA-C-A-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AA--C---------------GA--C-----T-CA-G-A---T----A--T---ACATCCA-----G---TT--------T---------T--T-T-T--T----T----A----A-A---T---A---A------A-AA--------TATT-T-A--T---A-AT-A----T------G-AAA--A--TA----T-T----T-TCTTC-T-T-G--A--T-ATTTTTT-----------AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--GAAATt
gi|35 : T-T--G--GAT---GT-A-T-T--A--TA--TGA--A-TG-T-TT-AA-T-A-A---------CA---T--GT-C-C-T--A-AA--C---------------AA--C-----T-C--A-G---T----A--T---A-----C-----A---TC--------C---G-G---T--T-T-T--T----T----A----A-A-------A---T------A-AA-A----A-TATT-T-A--TT--A-ATAA----TT-----G--AA--C--CT----T-T----A-T-TTG-T-T-GA-A--T-ATTTTAT-T----A----AACT-C--T-A--T---G-A-CT--GAAATCTtctt
gi|36 : --TT-T--G--A-T---GT-A-T-T--A--TA--TGA--A-TG-T-TT-GA-T-A-A-A-----AATG---T--A---------A-AA--A---------------GA--C-----T-C-------------A--G---A-----A----------T-ACATC--T---G-G---T--T-T-T--T----T----A----A-A---A---A---C------A-AA-A----A-TATT-TGA--TG--A-AT-A----TT-----G-AAA-----TG----T-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTTT-A----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAATTCT
gi|37 : --A--TA--TGA--A-TGAT-CT-AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AA--AA--------------GA--C-----T-CA-G-A---T----A--T---AC----A-----G---TT--------C---G-G---C--T-T-C--T----T----A----A-A-----------ATTT---A-AA-A----A-TATT-T-A--TT--A-CT-A----TT-----G--AA--A--TA----T-TAA--A-T-TTG-TGT-G-------ATTTTTT-T----A----AA-T-C----A--T---GCG-AT--AAAATCT
gi|38 : ttT-AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-T-T--A-AA--A---------------GA--T-----T-C--GGA---T----A--T---AC----A-----G---TC--------T---G-G---T--T-T-T--T----T----A----A-A---A---AT--A------A-AA-A----A-TATT-T-A--TG--A-AT-A----TT-----G-ACA--T--TT----T-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-C----A----AA-T-C--T-A--T---G-c
gi|39 : caaacttttaattttcatacatggcta--G-T---GC-A-T-G--AA-TA--TGA--A-TA-T-CT-AA-T-A-A-A-----AACA------G--C-C-C--A-AG--A---------------GA--C-----C-C--G-A---A----A--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--C----G----A------A---G---A---A------A-AA-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----TG-----A-AAA--A--TG----C-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTTT-A----A----AA-T-C--C-A------G-G-AT--AAAATCT
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gi|48 : A--TT-T--G--A-T---GT-A-A-T--A--TA--TGA--A-TG-T-C--------------------A---T------------A-AA--A---------------GA--C-----C-CA-G-A---T----A--T---A-----C-----A---AT-C------C---G-G---T--T-T-T--T----T----T----T-A---A---A---AT-----A-AC-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----T------G-AAA--A--TA----T-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAAAtcaaaaatcatgtcaattagaaaa
gi|49 : TT-TTTTC--T-GAAATGA------T-AAA--AA--G-A-T---G-------T-TGT-T-TT--T-----CC--A--AA-TA---A-GAGAT-T-T--T-AC-A-GAC-CA--T-G-T-TT--TG--CTG--T--GA--TT-T--G------------------------------A-TA-T-CT-AA-C---A-A-----AATA---T--G--T-C-T----AA--A---------------GA--C-----C-C--A-A---T----A--G---A-----C-----A---TT------------------T--T-T-T--T----c
gi|5 : T-CTTTC--C-GGAAT-A-----ATGAAA--AGGCT-T-T---G-------T-TTTCG-TTG-T-----GCC-G--A--TA-----GAGAT-T-C--T-AA-G-AGC-CA--A---T-TT--TG--CTG--T--GA--TT-T--T--A-T---TA-A-T----A--TA--TGA--A-TG-T-C---A-T-A-T-A-----AAAA---T--C--T-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----T-CA-G-A---T----A--ATACA-----A-----T---CG-G------T---G-----T--T-T-T--T----T----A------A---T---A---A------A-AA----------TT-T-A--TG--A---------TT-----G-AAACTA--TG----AGT----A-T-TTA-T-T-G--AA-T-ATTTTTA------A----AA-T-C--T-G--T---T-G-AT--AAAA
gi|50 : gtgattcctttctctcc-CT-AA-T-A-A---------CA------G--C-C-C--A-AC--A---------------AA--C-----C-C--G-A---T----A--G---A-----A-----GTA-TT-A------T---G-A---T--T-TAT--T----T----A----G-A---G---AGC-A------A-AA-A----A----T-T-A--CG----AT-A-----T-----G-AAA--A--C-----C-T----ATT-TTT-T-T-G--A--T-A-TTTTT-A----A----AA-TCC--T-A--T-----G-AT---AAATCT
gi|52 : tc--C-----T-C--G-A---T----A------A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T------------A----G-A---G---A---A------A-AA-A----A-TA-T-T-A--C---A-AT-A----TT-----G-AAA--A--T--------------T-TTG-T-T-T--A--T-A-AATTT-T----A----AA-T-C--TGA--T---G-G-ATA-AAAATCTtc
gi|53 : TTT-TTTCC--C-GAAATGA-----G-GAAA--AA--C-GAT---G-------TCTTC-G-TG--T-----GC--A--A--TA---A-GA----------------ATC-CAAGA-A-C-TT--CG---TG--C--GA--TT-A--C--T-T---GC-A-T-G--A--TA--Tc
gi|54 : tatTTT-TTTCC--C-GAAATGA------TGAAA--AC--G-A-T---G-------T-CTT-G-TG--T-----GC--A--AA-TA---A-GA----------------ATC-CA--A-A-C-TT--CG--CTG--C--GA--TT-A--C--T-T---GC-A-T-G--A--TA--T
gi|55 : gatA--AA--T-G-T---G-------T-TTT-G--T--T-----ACA-A--A--TA---A-AAGAG-C-A--T-TT-T-ATCTCA--A-A-C-TTTCTG--CTA--T--G
gi|56 : t--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T----A-T-TTG-T-T-G--A--TAATTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--TG--G-G-AT--AAAA
gi|57 : -T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTTTTT----A----AA-C-C--T-A--T---G-G-AA--AAAATCTaa
gi|6 : --AA--G-G-T---G-------T-TTT-G-TT--T-----GC--A--A----------------------AT-C-ATA-CA--A-A---TT--TG--CTG--T--GA--TT-T--GTAA-TTTGGC-A-T-G--C--TT--TGA--A-TA-T-CT--A-T-A-A-ATGGGTCACG---T--G--C-C-T--A-CA-------------------A--CTTTTTT-T--G-T---C----A--G---A-----AC----GCC-TTGA------T---G-A---T--G-C-T-------------------A---G---A---A------A-AA-A----A-TATT-T----CT--A-AA-A----TT-----G--AA--C--CG----C-TGCTCG-T-TTG-T-T-A--A--T-CTTTTTT-T----A---------C--T-A--TCTGA-G-AA--AAAATtcaaaaaaca
gi|7 : tgttttttaaccatggaggtatacacATTT-TATCCGTCAGGAATAAT----ATGAAA--AA--G-T-T---G-------T-TTT-A-CT--TTC---GC--A--AA-TA---C-GAGGT-TTC--T-AAGT-ATC-CA--A-A-CATT--CG--CTG--T--GA--TT-TATG--G-T---GC-----G--A--TAC-TGA--A-T----TT-AA-T-A-A-A-------C----T--GGTC-C-C--A-AG--A---------------AC--C-----C-C--G-A--------A--G---A-----A-----G---TT-A------TAT-G-A---T--T-T-T--T----CG---A----G-A---C---A---C------A-AT-A----A-T-TT-C-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T----A-T-TTG-T-C-G--A--T-A--TTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT---AAATCTtgtca
gi|8 : ATTT-TTTCC--C-AGAATGA-----ATGAAA--AA--T-G-T---G-------T-TTT-G-CT--T-----AC--A--A--TA---A-GATAT-T-C--T-AT-T-ATC-CA--A-A-T-TT--CG--CTG--T--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-G--A--TA--TGA--A-TA-T-CT-AA-T-A-ATA-----AACA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----C-C--G-A---C----A--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--T----T----A----G-A---G---A---A------A-AA-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--CG----C-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-TTTTTTT-TTTTAG----AA-T-C--T-A--T---G-G-A---AAAATCT
gi|9 : TTT-TTTTG--C-AGAATGA------TGAAA--AA--T-G-T---G-------T-TTT-G-TT--T-----AC--A--AA-TA---A-GAGAA-T-C--T-AT-T-ATC-CA--A-A-C-TT--CT--CTA--T--GA--TT-T--G--G-T---AC-A-T-G--A--TA--TGA--A-TG-T-CT-AA-T---A-A-----AACA---T--A--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----CAC--G-A---T----A--G---A-----AATACTG---TT-A------T---G-A---T--T-T-C--T----T----A----G-A---G-------A------A-AA-A----A-TATT-T-G--CG--A-AC-A----TT-----G-AAA--A--CG----C-T----T-T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-C--T---G-A-AT--AAAATCT
blockSeqs : A GT A G TA TA GCTT TGG GGGGTTT C GG CT TTTTT CC GA AT TAA T GGTTTCTAAGT A AG C AC TC GT C TT . A TG TAA CTG T TGAA AG A AT A GA A G TA TGGGT A AGG TC GTC CCA AAAAAAAAAAAAAAAA AC TTTTT CA C ATA ATCA GAAATACTGTTAT ACG GG G TG AAAG AGGAAGTGATC TATT ATCG A ATAA TGTGT CT ATAGC GCTC T TT AT G C TTTTA . A TT AG CTG TG
blockSeqs : . . . G A . CAG . . . CG G TC C . A TT . GGTTCTTTGT T . . CG T . . . . . AT TG TTG G ATG A C . A A T T AT . A G T TG AT CAA AC G G C G . TACATCCAGTTT . G A T . CGTAAGAAAA . CGTG A . AG . TATT AA G A A A T TT . C . T G A
blockSeqs : . . . A T . CGA . . . G . . A . A . . GATTCTCCTT . . . CA . . . . . . T GA A C ATA A . . . A . . AT . T . . CG TT ACA CC A A A A . GACAGAATTTAT . . . G . AAGAATTAT . TTT A . . . TGAG A G . T . T T . . . . . A
blockSeqs : . . . T A . TG . . . C . . . . A . . GGTTCCTAGC . . . C . . . . . . T GA . . GTG A . . . A . . TA . A . . TC T CA T A A G . . GAACGCCTTGAT . . . . . AGTGAGAAT . CG . . . . CGC T . . A . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G T . GT . . . G . . . . A . . GGTATCTAGT . . . C . . . . . . T GC . . TG . . . . T . . A . A . . CA C AA C . A . . . ATACAATCGGT . . . . . AGAGAAAAA . CG . . . . TGC . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . CT . . . C . . . . A . . GGTTCTAGT . . . T . . . . . . . G . . TG . . . . A . . A . G . . C A GA C . A . . . AAGAAGTTAT . . . . . AATAATATA . AG . . . . GAT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . TG . . . G . . . . A . . GTGCTAGTT . . . A . . . . . . . G . . TA . . . . A . . A . A . . C T A C . A . . . AAGAAGTTTG . . . . . AGAGAGCA . CG . . . . TGC . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . TG . . . G . . . . A . . GGTTCTAGT . . . T . . . . . . . G . . AT . . . . G . . A . A . . A T A . . A . . . GTCTGGGTTT . . . . . AGGAGAA . TG . . . . CAT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . TG . . . T . . . . . . . GATTTTAGT . . . C . . . . . . . G . . TG . . . . A . . A . A . . C T A . . A . . . GAATACATCT . . . . . AAAATTT . TG . . . . TGT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G G . TG . . . C . . . . . . . GATTTTACA . . . C . . . . . . . A . . TG . . . . A . . A . A . . C T A . . A . . . GAATACTTAT . . . . . AAAAATA . CG . . . . CGC . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G A . GA . . . G . . . . . . . GATTCTAAG . . . C . . . . . . . A . . AT . . . . G . . A . G . . C T A . . A . . . TTACACATCC . . . . . TTAAAAT . TG . . . . TAG . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . GA . . . G . . . . . . . GAGCATTTT . . . T . . . . . . . A . . AT . . . . G . . G . A . . C T A . . A . . . GAAGTATTAT . . . . . GAGACAC . TG . . . . TGT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . TG . . . T . . . . . . . TATTCTATT . . . T . . . . . . . A . . TG . . . . G . . A . A . . C T C . . A . . . GAAGTTATAT . . . . . AGAGAA . TT . . . . AAT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . GG . . . G . . . . . . . GAATCTATT . . . C . . . . . . . A . . TG . . . . G . . A . A . . C T A . . A . . . ATGTTATAA . . . . . AGAGAA . TT . . . . CGC . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . GT . . . G . . . . . . . ATTCCAGA . . . C . . . . . . . A . . TG . . . . A . . A . A . . C T A . . A . . . TACAATCTT . . . . . CGCAGA . CT . . . . CGC . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TG . . . G . . . . . . . GATTCAGA . . . C . . . . . . . A . . AT . . . . G . . A . A . . T C C . . A . . . AAGGTTAAT . . . . . AGAAAA . CG . . . . TGC . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TG . . . G . . . . . . . TTCTAGT . . . T . . . . . . . A . . AT . . . . A . . A . A . . C T A . . . . . . TACTATCCT . . . . . AAAAAT . CG . . . . TGT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . A . . . . . . . GTTAT . . . C . . . . . . . G . . TG . . . . G . . A . A . . T T A . . . . . . TAACAATCC . . . . . AGAAGA . TG . . . . TGT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . G . . . . . . . GCT . . . . . . . . . . . A . . TT . . . . G . . A . T . . T T G . . . . . . GAAGTTAT . . . . . AGAGAA . TA . . . . TAT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . T . . . G . . . . . . . ATC . . . . . . . . . . . A . . TA . . . . G . . A . A . . T C A . . . . . . GAAGTTAT . . . . . GCGAAA . TC . . . . TAT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . TG . . . . A . . A . A . . C T A . . . . . . AATGTTCT . . . . . AAAAAT . CG . . . . CGT . . . . . T G . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . TA . . . . G . . A . A . . T T A . . . . . . TAAAGTCT . . . . . AAATAT . CG . . . . TGT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . TT . . . . A . . A . A . . C T A . . . . . . AAAGTTTT . . . . . AGGAAA . TT . . . . TGC . . . . . T A . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . TT . . . . A . . A . A . . T T A . . . . . . TACAATCC . . . . . AAATAT . CG . . . . TGT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . TG . . . . G . . A . A . . C T C . . . . . . GAAGTTAT . . . . . TAATAT . TT . . . . TAT . . . . . T C . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . TG . . . . A . . G . A . . T C A . . . . . . GAAGCTAT . . . . . AAATAA . TG . . . . CTT . . . . . T A . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . TG . . . . G . . A . A . . T T C . . . . . . GAAGTTAT . . . . . AAAAAC . TT . . . . TGT . . . . . T C . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . TG . . . . G . . A . A . . T T C . . . . . . AAAATTCC . . . . . AGAGAA . TG . . . . TAT . . . . . T T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . TG . . . . G . . A . . . . T C C . . . . . . TACAGTTC . . . . . AAAAAT . CG . . . . TTT . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . AT . . . . G . . A . . . . C C A . . . . . . TACAGTCT . . . . . AGAGAA . TG . . . . TGC . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . TG . . . . A . . A . . . . C T A . . . . . . GAAGTTAT . . . . . AGAGAA . TT . . . . TGC . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . TG . . . . A . . A . . . . C T A . . . . . . TACAATCC . . . . . AAAGA . TT . . . . AGC . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . TG . . . . A . . A . . . . C T A . . . . . . TACAATCC . . . . . GAATA . TG . . . . ACC . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . G . . TG . . . . G . . A . . . . T T A . . . . . . GAAGTTAT . . . . . TAAAT . CG . . . . TAT . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . A . . TG . . . . G . . . . . . . T T A . . . . . . GAATTAT . . . . . CGAGA . TG . . . . CGT . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . A . . T . . . . A . . . . . . . C T C . . . . . . GAAGTTT . . . . . AAAAT . CG . . . . TAT . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . T . . A . . . . G . . . . . . . C C C . . . . . . AAAATCG . . . . . AAGAA . CT . . . . TGC . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . T . . T . . . . A . . . . . . . T T A . . . . . . CAAGTCC . . . . . CAGAA . CG . . . . CGC . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . G . . T . . . . G . . . . . . . T C A . . . . . . TACATCC . . . . . AATAA . CG . . . . TGC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . G . . . . A . . . . . . . C T A . . . . . . AACATTT . . . . . AGAGA . CG . . . . CGC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . T . . . . A . . . . . . . C T A . . . . . . AAGTTAT . . . . . AATT . T . . . . CGC . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . G . . . . . . . C . A . . . . . . TACATC . . . . . AGAA . T . . . . CC . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . C . A . . . . . . ACAACC . . . . . GAG . C . . . . CC . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . GAGTAT . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . GACATT . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
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originalCons : ATTT-TTTCC--C-GGAATGA-----ATGAAA--AA--T-G-T---G-------T-TTT-G-TT--T-----GC--A--A--TA---A-GAGAT-T-C--T-AN-T-ATC-CA--A-A-C-TT--CG--CTG--T--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-G--A--TA--TGA--A-TG-T-CT-AA-T-A-A-A-----AACA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-----C-C--G-A---T----A--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--T----T----A----G-A---G---A---A------A-AA-A----A-TATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--CG----C-T----A-T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAAATCT
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gi|1 : TTT-TTTCT--C-AGAACGATGACAATGAAA--AAA-T-GGT---G-------T-TTT-G-CT--T-----ACTAA--A--TA---A-GCTAT-T-TCTTACAT-ATC--A--C-A-T-GT-C---CTGATT--GAGGTT-T--GTCG-A---GC-A-TAG--A--TAAGTGA--TA-T--CT-AA-T-A-----------CA---T--G--C-T-T--A-AA--A---------------GATCC-C-C-----G-A---C----A--G---AT----A-----G---TT-A------TCGGGCA---TC-T-T-T--T----T----AATTTGAA--GTG-A-----A-CA-C----A-TCATT-T-A--CC--G-AT-A----TTT----G-AAGC-A--CGGCTCC-T--T----G-TTG-T-T-G--A--T-TTTTTTT-T----TTTTTAG-T-C--T-A--T---G-G-AT--AACAT
gi|10 : aattaatatatttttttgtgatTT-TGTTC--C-AGAAC-------ATGAAATAAA--CAG-T---G-------A-TT--G-CT--T-----AC--A--AA-TA---A-GA--T-T-C--TA-GT-ATCACA--------TT-CG--CTG--T--GA--TT-T--G--G-T---GC-A-T----A--TA--TGAA-TA-T--CT-AAAT-A-A-A-----AACA---T--G--C-C-T--AGAA--A---------------GA--CGC-C-----G-A---T----A------A-----T-----G---TT-A------TAA-G-A---G--T-T-T--T----T----A----GAG--A---A-----A-AA-A----T-C-ATT---A--CG--A-TT-A----AT-----G-AAA--A--CG----C-T--A----T-GTG-T-T-G--A--T-ACTTTTA-T----A----TA-T-C--T-A--T---G-GAAT--AAAATCTactcttcaa
gi|11 : tgTT-TTTCC--C-GGAAT-A-----TTGAAA--AA----------G-------T-TTT-C-TT--T-----GC--A--A--TA---A-GAGGT-T-C--TA-GT-AT--CA--A-A-C-TT-CG--CCGC-T--TA--TT-T--G--G-T---GC-A-T-GAAA--TA--TGAA-TA-T---T-AA-T---A-A-----AACA------G--C-C-C--A-AG--A---------------GGACC-C-C-----GCA---A----A--G---A-----A---------TT-A------T---G-A---T--T-T-T--C--------------GAA--AG--A-----A-AA-A----A-T-ATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T--A----T-TTG-T-T-C--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-C-A--C-A--G---T-G-ATA-AAAATCTtc
gi|12 : AATGA------TGAAA--AA--T-G-T---G-------T-TTT-G-TT--T-----G---A--A--TA---A-GAG-----T--TA--T-ATA-GA--A-A---TT-AG--ATG--T--GA--TT-TT-G--G-T---GC-A---A--A--TAA-TGAA-TA-T--CT-AA-T-A-A-A-----ATGA---T--A--A-AAT--A-AA--A---------------A-------------G-A---T----A--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--T----TT---A----GAG--A---A-----A-AA-A----A-T-ATT-T-A--AG--A-AT-A----TCAG---G-AAA--A--GA----T-T--A----A-TTG-T-T-G--A----ATTTTTT-----------AA-T----T-A--T---G-G-AT---AAATCTt
gi|13 : attttttaaaaCT--C-GGA-TGA------TGAAA--AG--T---T---G-------T-TTT-C-TT--T-----GC--A--A--TA---A-GAG-T-G-C--TA-GTTACC-CA------C-TTTCG--CTG--T--GA--TT-T--GT-G-T---GCTA-T-G--A--CA--TGAA-AT-T--CT-AA-T-A-A-A-----A-CAG--T--G--C-C------AA--A---------------GAACC-C-C-----G-A---A----G--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--C----C-----------G--A---G-----A-AA-A----A-T-ATT-T--------T-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T--A----T-TT--T-T-G-----T-ATTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--TAAATt
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gi|14 : -A---T--T-T-T--T----T----C----GCA--G---A-----A-AA-A----A-T-ATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--AATAG----C-T--A----T-GCG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAAAagtccgcccagacaaagaaaaaaaaataaaaaaagaaagagtttgtataaatgggaattttttcgcagaaaaaatatttacgaatattgaaaaatagctatgcgttgatattttttaaatctatggataaaagtc
gi|15 : atttggtgcgatgatatgaatatctgaataaacatgccaagagaccagtccgcccagacaaagaaaaaaaaataaaaaaagaaagagtttgtataaatgggaAA--AA----G-T---G-------T-TTT-G-TT--T-----GC--A--A-------A-TAG-----C--T---------CA--A-A-T-TT-CC--CTG--T--GA--TT-T--G--A-T---GC-A-T-A--A--TA--TAAG-TA-T--TT-AA-T---A-A-----AACA---T--G--C-C-A--A-GA--A---------------GA--TAC-A-----A-A---T----A--A---A-----T-----G---TT-C------T---G-A---T--T-G-T--TAAAGT----A----GAA--A---A-----A-AA-A----------T-T-A--TG--A-AG-A----TC-----A-AAA--A--CA----T-T--T----T-TTG-T-A-A--A--T-A-TTTTC-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-A-CT--AAAATCTgtc
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gi|17 : A--TT-T--G--A-TA--GC-A-T-G--A---A--TGAA-AA-T--TC-AA-TTA-A-G-----AACAAGGT--C--C-C-T--A-AA--A---------------GA--CAC-C-----G-A---T----AAAG---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---TGGT-T-T--T----C----A----GGAG-A---A-----A-AA-A----A-T-ATT---A--CG--A--T-A----TTTGTGTG-AAA--A--CG----C-T--A----T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTGTT-T----A----AG-T-t
gi|18 : -TTTCC--T-GGAATAA-----TTGAAA--CA--C-T-T---G-------T-TTT---CT--T-----GC--G--AATTA---A-GAGGT-T-C--TTTGT-ATC-CA--A-AAC-TT-CG--CTG--T--GA--TT-T--G--A-----GC-A-T-G--A--TA--TGGA-TA-T--CT--A-T---A-A-----AACA---G--C--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-C-TA----A-A---T----A--G---A-----A-----G---TT--------T-----A---T--T-T-T--T----T----taacatatgaccaaaaacatt
gi|19 : -T--G--A-T---GT-A-A-T--A--TA--TGAA-TG-T--TC-AA---A-A-A-----AAAA---T--G------T--A-AA--AAAAAAAAAAAAAAAAGA--C-T-GA----G-A---T----A--T---AC----A-----A---TC-T------T---G-----T--C-T-T--T----T----A----AAA--A---T-----A-AA-A----A-T-ATT-T-A--TG--A-GT-A----TT-----G-AAA--A--TA----G-T--A----T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---T-G-AT--AAAACCTctcttttataaaaattca
gi|2 : ttgATTT-TTTCT--C-GTAAATA-----ATGAAA--A---T-G-TTGGG-------T-TTT-T-TT--TTTTTTGC--AGAA--CA---A-GAGAT-T-C---A-GA-GTT-CA--ACA-T-AT-CAGTTTG--T--GA--TT-TT-G--A-T---GT-A-A-T--A--TA--TAAA-TG-T--CT-AA-T---A-A-----AACA---T--G--C-CTT--A-CA--C---------------GA--C-T-CA----G-A---T----A--A---A-----A-----A---TC-G----------G-G---T--G-T-T--T--------------GAA--T---A-----T-AA-A----A-T-ATT-A-G--TG--A-AT------CT-----G-TAT--G--TG----T-T--A----T-TTA-T-T-G--A--T-ATt
gi|20 : g--A--TA--TGAA-TG-TA-CT-AA-A-ATA-A-----AGCA---TT-G--TGC-T--A-AACAA---------------GA--C-T-CCA---G-A---T----A--T---A-----C-----A---TC------------G-A---T--T-T-T--T----T----A----GGA--A---GTGATCA-AA-A----A-T-ATT-T-A--TT--A-ATAA----TT-----G-AGA--A--AA----T-T-------C-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTGT-----------AA-T-C--T-A--T---G-G-ATTGAGAATCTgaaagtattgttgatatttcgttttaaactcaataatagaaaaaatcttcta
gi|21 : tttgatctgtaatA--TT-T--G--A-T---GT-AAT-G--A--TA--TGGG-TG-T--TT-AA-T-A-A-A-----A---------G--T-C-T--A-AAACA---------------AA--C-T-CA----G-A---TATCAA--C---A-----A-----G---TC--------C---G-A---T--T-T-T--T----TA---A----GAATTA---T-----A-AA-A----A-T-GAT-T-A--TT--AGAT-A----TT-----G-AAA--A--TAT---T-T--T----T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-AAGT---G-G-AT--GAAATCT
gi|22 : T-T--G--A-T---GC-A-T-G--A--TA--T-AA-TA-T--TC-AA-G-ATA-A-----AACA---G--G--CGC-T--A-AA--A---------------GA--C-C-C-----GCA---T----A--A---A-----G-----G---TT-AA-----T---G-A---T--T-T-T--T----T----A----GAA--G---A-----A-AA-A----A-T-ATT-T-A--CT--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--CG----C-TA-A----T-TTGTT-T-G--A--T-ATTTTTA-T----A----AA-T-C--T-AT-T---G-G-AT--AACATCTtc
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gi|29 : gtgattttttccaannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnT-T--G--A-T---GT-AAT-A--A---A--TGAA-TG-T--TT-AA-T-A-A-A-----A-CG---T--G--T-C-T--T-AA--A---------------GA--C-T-CA----G-A---T----A--T---A---------------CT-A------TCCTG-G---T--T-T-T--T----T---------TAA--A---T-----A-AA-A----A-T-ATT-T-A--TC--A-AG-A----TT-----G-AAA--A--TA----T-G--A----T-TTG-T-T-G--A--T-ATTTTTT-T----A----AA---C--T-A--T---G-G-AT--AAAATCTta
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gi|3 : --G---A-----A-----G---TT-A------T---T-A---T--T-T-T--T----T----AGT--GAG--A---AT----G-AA-ATATTA-T-ATT-T-A--CG----AT-A----TT-----G--AA--A--CG----T-T-------T-TTG-T-T-GTTT--T-TTTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-A---AAAATtgctatatctatattttttttgtgtgtggtgtggtgtgtggtgaagttattattttttagtgagaatgaaatattatatttacgatattgaaacgtttttgttgttttttttttttaaatctatggaaaaataatctt
gi|30 : tttctccagaatgatgaaatgtgtttgcttacaataagagattctccttatccaaattcgctatacttggtgcatatttggatatatctaataaaacattgctatatctatattttttttgtgtgtggtgtggtgtgtggt--G-T---GCCA-T-T--A--TA--T-AA-TA-T--CT-AA-T-A-C-A-----A-CA---T--G--C-C-T--A-AA--A---------------GA--C-C-A-----G-A---T----A--G---A-----A-----G---CT-A------T---A-A---TG-T-T-T--T----T----A----GGA--A---A-----A-AA-A----ATT-ATT-T-A--CG--G-AA-A----CT-----G-AAA--A--C-----C-T--A----T-TTG-T-T-A--AATT-TTTTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--C---G-G-AA--GAAATTTaatctt
gi|31 : --TT-T--G--A-T---GT-A-T-A--AA-TA--TGA--TG-T--TC-AA-T-A-A-A-----A-CA---T--G--T-C-T--A-AA--C---------------AA--C-T-TA----G-A---T----A--T---A-----AC----A---AT-C------C---G-A---T--T-T-T--T----T----A----AAT--A---T-----A-AA-A----T-T-ATT-T-A--TT--A--T-A----TT-----G-AAA--A--TG----T-T--A----T-TTG-T-TGG--A--T-A--TTTT-T----G----AA-T----T-A--T---G-G-AT--GAAATCTta
gi|32 : --TT-T--G--G-T---GC-A-T-G--A--TA--TGAAATA-T--CT-AA-------A-----AACA---T--G--C-C-C--A-AG--A---------------GA--C-C-CA----G-A---A----A--G---A-----A-----G---TT-A------T---G-A---T--T-T-T--T----T----C----G-A--G---A-----A-AA-A----A-T-ATT-T-A--CG--A-AT-A----TT-----G-AAA--A--TG----C-T--A----T-TTG-T-T-G--A--T-A-TTTTT-T----A----AA-T-C--T-A--T---G-G-AT--AAAATCTt
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