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lowQualScore                  :             .. ....   .  ..  ........ .          ...      .  ... . .    .   . . ..  .  . .....  .  . .     ..  .... .  ..  .    .    ..      
lowQualScore                  :             33 1111   9  99  33333333 9          000      3  777 7 7    7   3 7 77  5  7 22222  7  7 7     77  3333 0  77  0    9    22      
consensus                     :     TGTTGCAT-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G--ATAAA-A--T--AA-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
Reference ( gi|9 )            :     TGTTGCAT-AT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G--ATGAA-A--A--AA-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
gi|7                          :     TGTTGCAT-GT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---TTTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-C--ATAAA-T--T--AA-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGT
gi|8                          :    gTGTTGCAT-AT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTTAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G--ATAAA-A--T--CA-AG-T-TATTC--AC----A-TA--AA-GAGT-AAAA--CCAGTgga
gi|1                          :    gTGTTGCAT-AT-AA-CAT-GG--TGTATGGGTGA-TTTCCCTAAAAGTGGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G--AATTA-A--A--TA-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGA-AAAA--CCAGTAgg
gi|2                          : aaggTGTTGCATTAT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GCCCAG-T-GAAA--AT-CTG--ATTAA-A--ATTAACAGTT-TATTC--AT----ATTA--T--TAGT-AAAAACCCAGTAg
gi|4                          :    gTGTAGTGT-AT-A--CAT-GG--TG--------G-TTTCCCTAAA---GATGTT-GC---G-T-GAAA-GATCC-GATATGAATAT-A--TA-AG-TATATTC--AT----A-TA--TATTAGT-AAAA--
gi|5                          :  attTGTTGCAC-GT-CG-CAT-GT--TA--------A-TTTCCCTAGA---TGTGTT-GA---G-T-GAAA-AAT-C-G--ATAAA-A--T--AA-AA-A-TATTC--AA----A-TA--TA-TAAT-GAAA--CCAgc
gi|14                         :  gggTGTTGCAT-GT----CAT-GG--TT--------A-TT-CCCTCA----GGTGTT--C---A-T-GAAA-GAT-C-G--GT-AA-A--T--AA-AG-T-TATTC--AT----A--A--TA-TAGT--AAA--CCAGTaacg
gi|12                         :     TGTTG-AT-GT-AT-CATTGG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GTTGTT-GC---A-A-G-AA-GAT-C-G---T-AA-A--A--TA-AA-T-TA-TC--AT----A--A--TA-TAGT-AAAA--CCAGTgga
gi|15                         :     TGATGCAT-ATTAA-AAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---AGTGTT-TG---G-T-GAAATGAT-C-----T--A-A--T--AA-AG-T-T-TTC--ATGG--A-TG--TA-TAt
gi|13                         :   gaTGTTGCAA-GG-GA-CAT-GAATTA--------AATCTCCCTAAG---GGTGTT-AT---G-T-GAAA-AAC-C-G--ATCAA----------------------AT----A-TA--TA-CAAT-AAAA--CTAATt
gi|6                          :   aggGTGGCAT-GT-AGTCAT-GG--TGTG------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G--GTAAA-A--T--AA-AG-T-TATTC--AT----A-GA--TA-TAGTAAAAA--CCAGTcg
gi|3                          :       gTGCAT-GT-A--CAT-GG--T---------A-TTTCCCTAATT--GGTGTTTGC---AAT-GAAA-GAT-C-G--GTAAA-ATTA--AA-GT-T-TTTTC--ATCGAGA-TAATTA-TAGT-AAAg
gi|11                         :   agggtgttgT-GT-AT-CAC-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G--ATAAA-A--T--AA-AG-T-TATTCATAT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGT
gi|10                         :               T-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAAA--GGTGTT-GC---G-TTGAAA-GATTC-G--ATAAA-A--T--AA-AG-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT--AAA--CCAGTg
gi|16                         :                                                AA---GGTGTTTGC---G-T-GAAG-GAT-C-G--ATAAA-A--T--AA-AT-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT-AAAA--CCAGTgga





Alignments
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lowQualScore                  :               2 2  2 99   2  33  33333333 2          999      5  444 2 2    2   5 2 333  2   5  444 2  5 2     33  8888 5  33  0    2    33      
lowQualScore                  :               . .  . ..   .  ..  ........ .          ...      .  ... . .    .   . . ...  .   .  ... .  . .     ..  .... .  ..  .    .    ..      
lowQualScore                  :               9 9  7 99   7  77  33333333 7          444      0  444 5 5    5   0 5 444  5   0  444 5  0 5     44  8888 0  44  0    7    99      
consensus                     :        TGTTGCA-T-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
Reference ( family-1438 )     :        TGTTGCA-T-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
gi|1                          :        TGTTGCA-T-AT-AA-CAT-GG--TGTATGGGTGA-TTTCCCTAAAAGTGGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-GAA-TT-AAA-T----A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGA-AAAA--CCAGTA
gi|10                         :               aaggT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAAA--GGTGTT-GC---G-TTGAAA-GATTC-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT--AAA--CCAGTg
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gi|12                         :        TGTTG-A-T-GT-AT-CATTGG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GTTGTT-GC---A-A-G-AA-GAT-C-G---TA-AAA-TA---A-A--T-TA-TC--AT----A--A--TA-TAGT-AAAA--CCAGTg
gi|13                         :        TGTTGCA-A-GG-GA-CAT-GAATTA--------AATCTCCCTAAG---GGTGTT-AT---G-T-GAAA-AAC-C-G-A-TC-AA---------------------AT----A-TA--TA-CAAT-AAAA--CTAATt
gi|14                         :     aggTGTTGCA-T-GT----CAT-GG--TT--------A-TT-CCCTCA----GGTGTT--C---A-T-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AA--TA---A-AG-T-TATTC--AT----A--A--TA-TAGT--AAA--CCAGTcg
gi|15                         :        TGATGCA-T-ATTAA-AAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---AGTGTT-TG---G-T-GAAATGAT-C-----T---AA-TA---A-AG-T-T-TTC--ATGG--A-TG--TA-TAgga
gi|16                         :                                                  gaAA---GGTGTTTGC---G-T-GAAG-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AT-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT-AAAA--CCAGTt
gi|2                          :        TGTTGCA-TTAT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GCCCAG-T-GAAA--AT-CTG-ATTA-AAATTA---ACAGTT-TATTC--AT----A-T---TATTAGT-AAAAACCCAGTAga
gi|3                          :          gTGCA-T-GT-A--CAT-GG--T---------A-TTTCCCTAATT--GGTGTTTGC---AAT-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AAATTA---A-AGTT-TTTTC--ATCGAGA-TAATTA-TAGT-AAA
gi|4                          : agggtgttgTTGTAGT-GT-ATACAT-GG--TG--------G-TTTCCCTAAA---GATGTT-GC---G-T-GAAA-GATCC-G-A-TATGAA-TATATA-AG-TATATTC--AT----A-TA--TATTAGT-AAAA--
gi|5                          :      atTGTTGCA-C-GT-CG-CAT-GT--TA--------A-TTTCCCTAGA---TGTGTT-GA---G-T-GAAA-AAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AA-A-TATTC--AA----A-TA--TA-TAAT-GAAA--CCAgc
gi|6                          :      gggGTGGCA-T-GT-AGTCAT-GG--TGTG------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-GA--TA-TAGTAAAAA--CCAGTaacg
gi|7                          :       gTGTTGCA-T-GT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---TTTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-C-A-TA-AAT-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTg
gi|8                          :       gTGTTGCA-T-AT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTTAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TC---A-AG-T-TATTC--AC----A-TA--AA-GAGT-AAAA--CCAGTgga
gi|9                          :       gTGTTGCA-T-AT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TG-AAA-AA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTAgg





Alignments
lowQualScore                  :                                  11111111                                                                                      1                 
lowQualScore                  :               2 2  2 99   2  33  33333333 2          999      5  444 2 2    2   5 2 333  2   5  444 2  5 2     33  8888 5  33  0    2    33      
lowQualScore                  :               . .  . ..   .  ..  ........ .          ...      .  ... . .    .   . . ...  .   .  ... .  . .     ..  .... .  ..  .    .    ..      
lowQualScore                  :               9 9  7 99   7  77  33333333 7          444      0  444 5 5    5   0 5 444  5   0  444 5  0 5     44  8888 0  44  0    7    99      
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Reference ( family-1438 )     :        TGTTGCA-T-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
gi|1                          :        TGTTGCA-T-AT-AA-CAT-GG--TGTATGGGTGA-TTTCCCTAAAAGTGGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-GAA-TT-AAA-T----A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGA-AAAA--CCAGTA
gi|10                         :               aaggT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAAA--GGTGTT-GC---G-TTGAAA-GATTC-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT--AAA--CCAGTg
gi|11                         :               -T-GT-AT-CAC-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTCATAT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTgga
gi|12                         :        TGTTG-A-T-GT-AT-CATTGG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GTTGTT-GC---A-A-G-AA-GAT-C-G---TA-AAA-TA---A-A--T-TA-TC--AT----A--A--TA-TAGT-AAAA--CCAGTg
gi|13                         :        TGTTGCA-A-GG-GA-CAT-GAATTA--------AATCTCCCTAAG---GGTGTT-AT---G-T-GAAA-AAC-C-G-A-TC-AA---------------------AT----A-TA--TA-CAAT-AAAA--CTAATt
gi|14                         :     aggTGTTGCA-T-GT----CAT-GG--TT--------A-TT-CCCTCA----GGTGTT--C---A-T-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AA--TA---A-AG-T-TATTC--AT----A--A--TA-TAGT--AAA--CCAGTcg
gi|15                         :        TGATGCA-T-ATTAA-AAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---AGTGTT-TG---G-T-GAAATGAT-C-----T---AA-TA---A-AG-T-T-TTC--ATGG--A-TG--TA-TAgga
gi|16                         :                                                  gaAA---GGTGTTTGC---G-T-GAAG-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AT-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT-AAAA--CCAGTt
gi|2                          :        TGTTGCA-TTAT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GCCCAG-T-GAAA--AT-CTG-ATTA-AAATTA---ACAGTT-TATTC--AT----A-T---TATTAGT-AAAAACCCAGTAga
gi|3                          :          gTGCA-T-GT-A--CAT-GG--T---------A-TTTCCCTAATT--GGTGTTTGC---AAT-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AAATTA---A-AGTT-TTTTC--ATCGAGA-TAATTA-TAGT-AAA
gi|4                          : agggtgttgTTGTAGT-GT-ATACAT-GG--TG--------G-TTTCCCTAAA---GATGTT-GC---G-T-GAAA-GATCC-G-A-TATGAA-TATATA-AG-TATATTC--AT----A-TA--TATTAGT-AAAA--
gi|5                          :      atTGTTGCA-C-GT-CG-CAT-GT--TA--------A-TTTCCCTAGA---TGTGTT-GA---G-T-GAAA-AAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AA-A-TATTC--AA----A-TA--TA-TAAT-GAAA--CCAgc
gi|6                          :      gggGTGGCA-T-GT-AGTCAT-GG--TGTG------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-GA--TA-TAGTAAAAA--CCAGTaacg
gi|7                          :       gTGTTGCA-T-GT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---TTTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-C-A-TA-AAT-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTg
gi|8                          :       gTGTTGCA-T-AT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTTAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TC---A-AG-T-TATTC--AC----A-TA--AA-GAGT-AAAA--CCAGTgga
gi|9                          :       gTGTTGCA-T-AT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TG-AAA-AA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTAgg


blockSeqs                     :               G T  T TA   T  AT  TG       A          A        T  CCA A T    T   T T AT   T   T  TAT C  T A     AT  CGAG T  AT  T    A    AC
blockSeqs                     :               . .  . GT   .  .   .        .          T        T  .   . .    .   C . A    .   T  .   .  T .     .   GG   T  .   T    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . T    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   T    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . T    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   T    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . T    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . G    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . A    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . A    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . G    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . A    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . G    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . T    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . G    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . T    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . A    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :               . .  . .    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . A    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .    . 
blockSeqs                     :                    . .    .  .   .        .          .        .  .   . .    .   . . .    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .    .      
blockSeqs                     :                                                      .        .  .   . .    .   . . .    .   .  .   .  . .     .   .    .  .   .           


blockSeqCons                  :                                  ********            ***                            A**
originalCons                  :        TGTTGCA-T-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
finalCons                     :        TGTTGCA-T-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-GA--TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA





Alignments
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lowQualScore                  :               2 2  2 99   2  33  33333333 2          999      5  444 2 2    2   5 2 333  2   5  444 2  5 2     33  8888 5  33  0    2    33      
lowQualScore                  :               . .  . ..   .  ..  ........ .          ...      .  ... . .    .   . . ...  .   .  ... .  . .     ..  .... .  ..  .    .    ..      
lowQualScore                  :               9 9  7 99   7  77  33333333 7          444      0  444 5 5    5   0 5 444  5   0  444 5  0 5     44  8888 0  44  0    7    99      
consensus                     :        TGTTGCA-T-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
Reference ( family-1438 )     :        TGTTGCA-T-GT-AN-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTA
gi|1                          :        TGTTGCA-T-AT-AA-CAT-GG--TGTATGGGTGA-TTTCCCTAAAAGTGGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-GAA-TT-AAA-T----A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGA-AAAA--CCAGTA
gi|10                         :               aaggT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAAA--GGTGTT-GC---G-TTGAAA-GATTC-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT--AAA--CCAGTg
gi|11                         :               -T-GT-AT-CAC-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTCATAT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTgga
gi|12                         :        TGTTG-A-T-GT-AT-CATTGG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GTTGTT-GC---A-A-G-AA-GAT-C-G---TA-AAA-TA---A-A--T-TA-TC--AT----A--A--TA-TAGT-AAAA--CCAGTg
gi|13                         :        TGTTGCA-A-GG-GA-CAT-GAATTA--------AATCTCCCTAAG---GGTGTT-AT---G-T-GAAA-AAC-C-G-A-TC-AA---------------------AT----A-TA--TA-CAAT-AAAA--CTAATt
gi|14                         :     aggTGTTGCA-T-GT----CAT-GG--TT--------A-TT-CCCTCA----GGTGTT--C---A-T-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AA--TA---A-AG-T-TATTC--AT----A--A--TA-TAGT--AAA--CCAGTcg
gi|15                         :        TGATGCA-T-ATTAA-AAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---AGTGTT-TG---G-T-GAAATGAT-C-----T---AA-TA---A-AG-T-T-TTC--ATGG--A-TG--TA-TAgga
gi|16                         :                                                  gaAA---GGTGTTTGC---G-T-GAAG-GAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AT-T-TATTC--AT----ATTA--TATTAGT-AAAA--CCAGTt
gi|2                          :        TGTTGCA-TTAT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GCCCAG-T-GAAA--AT-CTG-ATTA-AAATTA---ACAGTT-TATTC--AT----A-T---TATTAGT-AAAAACCCAGTAga
gi|3                          :          gTGCA-T-GT-A--CAT-GG--T---------A-TTTCCCTAATT--GGTGTTTGC---AAT-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AAATTA---A-AGTT-TTTTC--ATCGAGA-TAATTA-TAGT-AAA
gi|4                          : agggtgttgTTGTAGT-GT-ATACAT-GG--TG--------G-TTTCCCTAAA---GATGTT-GC---G-T-GAAA-GATCC-G-A-TATGAA-TATATA-AG-TATATTC--AT----A-TA--TATTAGT-AAAA--
gi|5                          :      atTGTTGCA-C-GT-CG-CAT-GT--TA--------A-TTTCCCTAGA---TGTGTT-GA---G-T-GAAA-AAT-C-G-A-TA-AAA-TA---A-AA-A-TATTC--AA----A-TA--TA-TAAT-GAAA--CCAgc
gi|6                          :      gggGTGGCA-T-GT-AGTCAT-GG--TGTG------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G-G-TA-AAA-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-GA--TA-TAGTAAAAA--CCAGTaacg
gi|7                          :       gTGTTGCA-T-GT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---TTTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-C-A-TA-AAT-TA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTg
gi|8                          :       gTGTTGCA-T-AT-AT-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTTAA---GGTGTT-GC---A-T-GAAA-GAT-C-G-A-TA-AAA-TC---A-AG-T-TATTC--AC----A-TA--AA-GAGT-AAAA--CCAGTgga
gi|9                          :       gTGTTGCA-T-AT-AA-CAT-GG--TG--------A-TTTCCCTAAA---GGTGTT-GC---G-T-GAAA-GAT-C-G-A-TG-AAA-AA---A-AG-T-TATTC--AT----A-TA--TA-TAGT-AAAA--CCAGTAgg