lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 1 1 4444 1 5555555 33333 11 000000000000000000000000000000000000000000000000000000
lowQualScore : 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 6 5 2222 3 5555555 33333 88 444444444444444444444444444444444444444444444444444444
lowQualScore : ..................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... . . .... . ....... ..... .. ......................................................
lowQualScore : 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 0 0 5555 3 7777777 33333 33 777777777777777777777777777777777777777777777777777777
consensus : GAGGGGGGGG--G-GGTACTCTGA-AA-AAT-ATT-------G--GN--TGG-GGAG-GTTCGA-----ATG----TG--GGTC-CCGAACCCC-TA-CCCCATCG-TAGACTA-----AA-TT-TTAT---GTCAATTTTGTAACCC-CA--TT-GTAG-ACC---CG-A---TA--T--TTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-CCC--TT--ATAGAAC-C---NT--A-C---GAATAT---ATA-T-NTTA--G-TT-TAT-GT---ATG----ATTA--CAC---AGCA---A----TC-AGT--G-ATA--ATTAAC------AAT----TTT-A-G-A-GG---ATT--AAAA-GGC-T-GTTTCCTGC-GCA--CA----------NG--CGCAT-AGGT--GT-NT---------T---GAC-CAGTA-TA-TG-TA--A----CACC-A-A-CCC-----CA--T-G----TAGA-C-------TTG-----TTT---N--CATATA--------C------CC-----C-TATTC-AGACAC---A---C-TG---G---GTTA-A---N--A--T-AT---A--A--ACCCC----ATTG-TA--GACA-A--ATC-T---G--CNAA-------AAATCAAAACCCG---C-GTTTG-TCAG-A-----N-CCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCCCCA---CT----TTCAGGGCATGGGNTCG-TTTTTTATT-T---AGT-TA-----------T-CGCAAT-C-GGAATAAT--G--------AATT--GGG----T-TAATAAG--------A--TGAAGAGTAA-CCATATTTGTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAATTACGTGTAAATGAC-GTANGATTCCTATAGGCCTATTCTTTGGAATTTAGC-GT-A-TTG-ATCAT-GCG-TGACAAA--TGTTTT---TC-------GA-ACTTTCAAA-AAA-ATAAAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
Reference ( gi|2 ) : GAGGGGGGGGTCGCGGT-CTCTGA-AA-AGTCATT-------G--GC--TGA-GGAGCGTTCGACAACAATGCCAATG--GGTC-C-GAACCCC-TAACCCCATCGCTAGACTA-----AA-TT-T-AT---GTCAATTTTGTAACCC-CA--TTAGTAGCACCC-GCG-T---TA--T--TTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-CCC--TT--ATAAAAC-C---GT--A-C---GAATAT---ATA-T-ATTACTG-TT-TAT-AT---ATG----ATTA-ACAC---AGAC---A----TC-AGT--G-ATA--ATGAAC------AAT----TTT-A-G-A-GG---ATT--AAAA-GGC-T-GTTTCCTGC-GCA--CA----------CGC-CACAA-AAAT--GT-CT---------T---GAC-CAGTA-TA-TGCTA--A--T-CACC-A-A-CCC-----CA--T-G----TAGA-C-------TTG-----TTT---A--CATATA--------C------CC-----C-TATTCAAGACAC---A---C-TG-C-G--CGTCA-A---T--A--T-AT---A--A--ACCCC----ATTG-TA--GAC--A--ATC-T---G--CCAA-------AAATCAAAACCCG---C-GTTTG-TCAG-A-----T-CCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCCCCA---CT----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---AGT-TA-----------T-CGCAAT-C-AGAATAAT--G--------AATT--GG-----C-TGGCGAA--------A--TAAAGAGTAA-CCATATTTTTGGCAGAGCTCAGTAGACGCTAAATTACGTGT--ATAACAGTAAAA---CTATATGCCTATTT----GAATTTAGC-GTCATTTG-ATCATGGCACTGACAAA--TGTTTT---TT-------GACACTTTCAAACAAACATAAAACTATGCTTTGAAGCGAAGCATATCTATT
gi|1 : GAGGGGGGGG-----GT-CT-TGAGAA-AGGTAGT-------G---T--TGA-GAAG-GTTC------AATG----TG--GGTC-C-GAACCCG-TA--TCCATCG-TAGACTA-----AT-TT-T-GTATTGTCAATTT-GT---CC-CA--TT-GTAGC------C--T---TA--T--TTCTAACATA------A-ATA-CGCCA-CCC--TC--ATAAAATTC---GT--AGC---GA-TAT----TA-G-TTTACTG-TT-TTT-ATGCTATT----ATTG-ATTC---ATTG---A----TC-AGT--G--TA--TT--AC------AATA---TTT-A---A-GG---ATT--AAA--GGC-T-GTTTCCTG----A--C-------------C-CGCAA-GAAT--GT--T---------T---GA--CAGAA-TATTATTATGA--C-TACC-ACA-CTC-----CT--T-GCTTCTAGA-T-------CTAT----TTT---A--TA-ATA--------C------CC-----CTTATT---GAGAC---A---C-TT-A-G---GTCA-AC--T--A--T-AC---ACCA--ATC-------TTGATA--GAC--A--ATA-T------CTGA-------AAATC-ATAC------C-GTTTGTTCAG-A-----C-CCC--------C----CC---CCGATGATACAGTGGAGTC---C--------------CCC-------CT----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGAGTATA-----------C-TG-AAT-CAAGAAT-GT--GTTGGGGTTAATTCAGA-----T-TAGTATG--------A--T-AAGAGAAC-CCATA-TTGTGGC--AGCTT-GTAG-CGTT-AATTACGTGTAAATGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGTAATTTGAATCAT-ATGCTGACAAA--TGTCTTGGGTT-------GA-AC-TTCAAA-AAATATAA---TATGC--TGAAACGGAA-ATATC
gi|11 : ggGATGAGGGGG----AGTACTCTGA-AA-AAT-ATT-------G--G---TGG-GG---GTTTAA-----ATG----TG--TGTC-CCGAACCCC-TT-CGCTATCG-TAGACTA-----AA-TT-TTAT---GTCAATTT-GTAAACC-CA--TT-GTA-CATAGAGCG-A---TA--T--T-CTAA-A-A------A--TATACACC-CCT--TC--ATAGAATTC---TT--A-CAT-GAATAT---AAG-T-TTTA-------TGT-GT---ATG----TTTA--CAC---AGCA---A----TC-GGT--G-ATA--ATTAAC------AAC----TTA-AGG-A-GG---ACA--AAAA-GGC-T-GCTTCCTTC-ACA--CA----------AGT-CG-GT-GATT--GTCCT---------T---GAT---GTA--A-CACTA------------A-A-CCT-----CAT-T-A----TAGA-C-------TTG-----TTT---A--CATCTA--------C------AC-----T-TATTC-AGACA----A----------G--GGTTA-A---A--T--T-AT---A--A--AATCC----ACTG-TA--AAC--A--Actaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|17 : gagggggaggaactctgaaaaatattgGGGAGGGGGGATGC--T-TTCTAA-AA-A-TGATT-------G--G----GG-GTGGGGGTCGA-----ATG----TG--GGTC-CCGAACCCC-TA-CCCCATCG-TAGACTG-----AA-TT-TTAT---GTCAA-TTTGTAACCC-CA--TT-GTAG-ACC
gi|20 : ccggGGGGGGGG--GGGGTACTCTGG-AA-AAT-ATT-------GATGCCATGG-GGAG--TTGGA-----ATG----TG--GATC-CCGAACCCC-TA-CCTTATCG-TAGACTA-----AATTT-T-AT---GCCAA-TTTGTAACTC-CA--TTA-TAG-AC----CG-A---TA--T--TTTT---A-A------A-AT--GCACA-CCC--CT--gatattctatcatagatctgaatataaaacctttaacaatgcatgtgatcttagtaaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|14 : gGGTACTCTAA-AA-AAATATTAGGAGGGG--GG--GGG-GGGGTGTTCAA-----ATG----TG--GGTC-CCGAACCCC-TA-CCCCAT-ATTAGACTACGGTAAA-TT-TTAT---GTCAATTT-GTAACCC--A--TT-GTAA-ACC----G-A---TA--T--T-CTAA-A-G------A--TA-CC-CAGCCC--TTC-ATTGAAC-T---CTTTA-TT--GAATAT---AAG-T---------TT-TAT-GT---ATA----ATTA--CTC---AGCA---A----TC-AGT--G-ACA--ATGAAC------AAT----TTT-AGG-A-GG---ATTAAAAAA-GGC-T-GTTTCCT---ACA--CA----------CGTATACAT-GTAG--GT-ATA--------A---AAC-CAGTA-TG----TA--A----CACCAA-A-CCT-----CATTT-A----TAGA-C-------TTG-----TCT---T--CATACA--------tcatagttaagttttatgtaagtaagt
gi|13 : gaagggTCTGA-AATAAT-ATT-------G--GG--TAG-GG---GTTCGA----AGTG----TGA-GGTC-CCGAACCC--TAACC--ATCG------TA-----GA-TC-T-A----G--AATTTCTTAATCCACG--TTAGTAGGACC----G-A---TA--T--GTCTAA-A-A------A-G-------A------TT--ATAATAC-C----T--A-CTT-GCAT-T---ATA-A-CTTCTTG-TT-CTT-AT---ATGCGATATTA-AGATTTGAGCA---A----TCGAGTTTG-ATA--ATTAATTATAAAAAT----TTT-A-G-A-GAGGTATT--AAAAAGGC-T-GTTTCC-GCTGCA--CA----------GGC----------------TT---------T---AGC-GCGTA-TA-CGGTG--A--T---GT-A-A-CGCAGTAGTA--T-G----TAGACC-------TTG-----TTTTTCA--TACATA--------G------CC-----G-TCTTTCAGA-AC---G---C-TGACAG--GGTTATA---TTAA--T-AT---A--C--ATCCA----ATTG-TAAGAAC--A--A
gi|8 : ggggtactatCTGA-AA-AAT-ATT-------G--AT--TG--GGA---TTC--CGA--ATG----TG--GGCA-C-AAACCCC-TA-CCCCATCGT--GACT---------TTCT-TT---GTCAA-TGTGTAACCC------TAGT-GTACAC-GAA-----TA-----TTCTAC-A-A------ATATA-ACACT-CTT--TT--TCAAAG------AT--A-CTCTTAATATGGAATA-TAATGAGT--TT-TGTAAG---ATG----TTTACAAAC---AGCA---A----TA-AGT--G-ATAGTATTAAC------A------TTT-A-G-G-AG---AAT--AAAG-GGC-C-GTT--CCGT-GCA--CA----------AGG-GATAT-AGGT--A--CT---------C---GACGCAGTA-----G---------------------------TA--T-G----TAGA---------TTG-----TTTTTCA---ATATGACCGCCGCC------CC-----C-TATTTCAGAC-C---A---C-TGAC-AT-CGTTA-A------A--TCAT---A--T--ACCCC----AATG-TA--GACAAA--ATC-T---GGAAAAA-------AAATTAAATCC-----C-GTTTG-TTTG-A-----A-CCC--------C----C
gi|7 : acaT-------G--GC--CGATGG---GTTCGA-----ATG----TG--GGTCTC-AAACCCC-TAACCC-ATCG-TAGACTA-----AA-TT-TCAT---GTCAATTT-GTAACCC-CA--T-AATGGCATT----G-TAGATAGATCATTCTAA-A-ATTAGTTA-ATT-ACACA-CCCCTTT--ATAGAACTC---GT--A------AATAA---GT------------TT-TAA-GT---ATG----ATTA---------------------C-AGC----------T-AAC------AAT--------------------------AA-GGC-T-GTTTCGTAC-GCA--CGTCATGAGGAGCGA-TGCAATAGATTCAT-CTATAGGTGATT---GAT-CA--A-TA-TG-TA--A----CACC-A-AACCC-----CA--TTG----TAGA-C-------TTG-----TTT---T--CGAATA--------C------CC-----C-AATTCAG---AC---A---C-TG-------GTTA-A---A--T--T-AT---G--A--ATCCT----ATTG-TA--AAC--A--AAC-T---G--CAAA-------AAATCAAACCCCGGACC-GTTTG-TT-G-A-----T-ACC--------T----CC---CC---------------CC---C--------------tacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
gi|12 : aaaatattggAATGTTGGTC-CCGAACCCC-TA-CCCCATCA-TAGATTA-----AA-TG-C-AA---GTTA----TGTAACCC-CA--T--GTAGAAC-----G-A---TA--T--TTCTAA-A-G------G--TGTACACT-CCT--TC--ATAGAAC-TCTTAT--A-T---GAATAT---A-A-G-ATT-----TA-TAT-GT---TTG----ATTA--CAC---AGTA---A----TC-AGT--G-ATA--ATTAAC------AAT----TTT-AGG-A-GG---ATT--AAAA-GGC-T-GTTTCCT-----A--CA----------CG---------GGT--AT-CT---------CTAGGAC-CAGTA--G-TTTCA--A--TATACC-----CCC-----TA--T-A----AAGA-CACTGAAATTGTTAAATTT---AATTATATA--------C------CC-----C--ATTGTAGACAA---AAT-C-TG-G-G--GGGAA-A---A--A--T-CA---A--A--ACCCC----GTTaaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|3 : ctctaaagaatattgcgggggtcaTG--GGTC-C---ACTCC-CA-CCCCATCAGTCGACTA-----AA-TT-TTAT---GTCAATTT-GTCAACC-CA--TT-GTAG------ACGAT---TA--T--TT--AA-A-A------A-ATA--TACA-CCT--TTCAATAGAAC-TCT-AT--A-C---GAA--------A-T-AT----G-TT-TAT-GTT--ATG----ATTA-CCAC---TG-CTCAA----TC-AGT--G-ATG--ATTAAC------AATAT--TTT-A-GGA-GG---ATT--AAAA-G-C-C-GTTTCCTGC-AC---------------CG--CACAT-AAGT--G--AT---------T---GAC-CAGTA-T--TGGTA--AAGC-CA---A-A-CCG-----CAT-T-A----TAG--C-------TT------TTT------CAT-TA--------C------CC-----T-T-TTC-AGACA------------------CGTTA-A---C-----T-AT------------CC----ATAG-T---GACA-A--ATC-T---G---CAA-------AAATCAAAACCCG-----GTTTG-TCAG-A-----CACCCGCACCATGC----CCTA-CC---------------CC---CGCCAATATAAAGGACCCCCCC---CTCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATC-TATTTGTTTTAATT-TGCAAT-T-GGTACAATCAG--------AATT--Gtgtctgaaccccctgccacctaatataaagtgag
gi|9 : gG--GGTC-C-TAACCCCATATTCCCATTGTAGGGTTA-----GA-TT---AT---GTCAATTT-GTAACCC-CA--TT-GTAAGACC--G-A-T---AA--T--TCCTAA-A-----------TATACACC-CCT--TC--ATTGAAC------T--A-T---GAATAT---A-A---GTTATTT-TA-TGT-GT---ATG----TTTA--CAC---AGCA---A----TC-AGT--GGATT--ATTAAC------AATAAATTTT-A-G-G-GG---TTT--AAAA-TGC-TGGTTTCCTGC--CATGCA----------AGG-CATCT-AGGT--G--AT---------T---GAC-CAGTAGTA-TA----------------------------A--T-G----TAGA-C-------TTGT----TTT---T--CAT-TA---------------CC-----C-TATTC-AGACACTGAA---CATG---G--TTTTA-A------A--T--T---A--ATCACCCC----ATT-------AA--A--ATC-T---G--AAAA-------AACTCATAAACCG---TGGTTTG-TTTGAA-----T-CCC--------T----CTA--TC---------------TG---C--------------CTCCCCA---cacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagcttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|5 : tgggggatacatccgaaaatattgggggaggggggggggaggtggggC-C-GAACCCCATAAGGCCATTG-TAGACT---------------T---GTTAGTTATG-AACCC-CA--TT-GTAG
gi|16 : tgtaacaTCG-TAGACTATA---AA-TT-TTAT---GTCAATTT----------------GTAG-ACC----G-A---TA--T--T-CTAA-A-A------A--TA--TACA-TTT--TTTCATAGGCC-T---CT-----------TAT---ATG-A-ATGAAAGATT-TAT-GT---ATG----ATTA--CAC---AGCA---A----TC-ATT--G-ATA--ATTAAA------AAA----TTT-A-G-AAGG---ATT--AAAA-GGCTT-TTTTCCTGC-ACA--acaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|25 : CTA-----AA-TT-T-AT---GTCAA-TGTGTAACCC-CATGTTA-TAGC------CT-A---TA--T--TT-----A-A------A-AT--ACGCA-CCC--TTC-ATAAACT-C---TT--A-T-----ATATGA-ATA-T-ATAA--G-----AT--T---ATG----ATT--ACAC---AG-C---AATGCTC-AGT--A-GTT--ATGAGC------AAggtataggtgactaaccagtagtatgtagacatggttaaattatatacctcaatgtagacaaaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|19 : T--A-C---AAATAT---AT--------CAG-TTCTAT-AT---ATG----ATTA--CAC---AGGA---A----TC-AGT--G-ATA--GTTAAC------AAT----TTTAA-G-A-GG---ATT--AAAA-GGC-T-TTTTCCT---GCA--CA----------TG--CACAT-AAAT--GT--T---------T---GAC-CAGTA-TG-TAAT------T-CACCAA-A-CCC-----CAT-T-G----TAGA-C-------TTG-----TTT---T--CAT
gi|15 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaT--A-T---GAATAC---ACACT-CCTA-TA-TC-TAT-GT---ATG----ATTA--CAC---AGCA---A----CC-AGT--G-ATA--ACTAAC------TGT----TTTTG-G-A-GA---ATT--CAAA-GGC-T-GTTTCTTGC-ACA--CA----------T------AT-AGGT--G--AT---------T---GAC-AAGTA-T----TTA--A----CACC-A-T-------------T-A----TAGA-C-------TTG-----TTT---T--CATATA--------C------CG-----A-TATTCAG---AT---T---C-TG-------GTTA-A---A--T--T-AT---A--A--TCCCC----ATTG-TA--GATAAA--ATC-T---G---CAA-------AAATCAAACCCCG---T-ATT---TCAG-A-----A-CCC--------C----C
gi|21 : ata-A-A-CCC-----TA--T-GA---TAGA-C-------TTG-----ATT---T--CACGTA--------C------CCCTAGGC-TATTCAG---AC---A---C-TG---G---ATAA-A---T-----T-AT---A--A--A-CCC----ATCG-TA--GACAAA--ATC-T---G--CAAA-------AAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCC-----TAATT-A----TAGA-C-------TTG-----ATT---T--CATATA--------C------CC-----C-TATT---GAC--------------T-G--GATAA-A---T-----T-ATTTTA--A--ACCCCCATAATTG-TA--GAC--AGAATC-T---G--CAAA-------AAATC--AACTC---------TG-TCAG-A-----C-CTC--------CGGGGTCAGACC---------------CCGTGC--------------ACCCCCA---CT----T
gi|4 : -CCC-----TA--T-T----CAGA-CAC-----TGG-----TCA---A--TATATA--------CAA----CC-----C-CATTGTAGACAA---AAATC-TG-C--------A-A---A--A----AT---C--A--ACCCC----GTTG-TC--AGC--A--CCC-C---C--CCCCCCCCCCTAAATTAAA--------------G-TGAG---------CCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCGCCC----CT----TTCAGGGCATGGGG-CG-TTTTT-ATTGT---AGT--A-----------TACG-AATAC-AGAATAAT--G--------AATT--GGGGTATCATGATAAGGTACGTGTA--TAAAGAGTAAGCCATAT----GGCAG-GCCTAGTAG-CGTAAAATTACGTGT--A-------ATAA---CTATAGGC-TATTT----GAATTTAGC-GT-A-TTG-ATCAT-GCA-TGACAAAGCTGTTTT---TT-------G--ACTTTCAAA-AA--ATAAAA-TATGC---GAAG-GAA--ATATCTATT
gi|18 : -CCC-----TA--TTA----TAGA-C-------TTG-----TTT---T--CATATA--------CAATTACCC-----C-TATTCA-GACTC---T---T-T---------TGA-A---T-----T-AT---A--A--ACCCC----ATAG-TA--GACAAA--ATC-A---G-----A-------AAGTCAGAAACAG---C--------------------CCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCCtaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|12 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccG-----TTT---C--AATATA--------C------CC-----CCTAT---AAAGAC---A---C-TG-A-AATTGTTA-AATTT--AATT-AT---A--T--ACCCC----ATTG-TA--GACAAA--ATC-TGGGG--GGAA-------AAATCAAAACCC----C-GTTTG-TCTG-A-----A-CCC--------C----CT---GC---------------CA---C--------------Cgaat
gi|5 : ctctaaagaatattgcgggggtcaaatgttggtcccgaacccctaccccatcatagattaaatgcaagttatgtaaccccatgtagaacgatatttctaaaggtgtacactccttcatagaactcttatatgaatataagatttatatgtttgattacacagtaatcagtgataattaacaattttaggaggattaaaaggctgtttcctacacgggtatctctaggaccagta--T-AT---G--A--ACCCC----ATTG-TA--GACA-A--ATCTT---G--C--A-------AAATCAAACTCC-------TTTG-ACAG-AACAACA-CCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCTCCA---Ctaatataaagtgag
gi|5 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagt-----T-CCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCACCACGCCT----TT------AT---CTAT-TTTTTTATT-T---GG--TA-------------CTCAAT-C-CAAAT-TT--G--------CATT--AGGT---T-TAATGAA--------ATGTGAAG-GTAA-TCATAaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|10 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcgagTTTAGC-GT-------ATCATGGCA-TGACAAC--TGTTTC---TCAAAGAAGGA-ACTTTC---CAAA---AAAA-TATGCTTCAAAGatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CCTCCCCCCCGGGCCTCAGGAGTATCAATGTTCCTTTCATGCTATTTTTTTTTTAATTTGGTAGCGAATCAAATTTGCACATTAAGATTTAATGAAATGGGGTATTCATTAATATAAGATATAGAAAGGTAACAACCTGGGCAGGTATGGCGTAACTCAAGGGACATGACAGAAATTAATTTTTTTTTTTATATAACTTTGAAAAAATAAAGTATGCTAAAGGAAAGGGTATTCATATGTATTAATAGAATCAGGACAGAATTATCGAACCCCCCCGTAAAGAATACATAATATTGTCATTAGAAATGTCTGAAAAAAGCGGTAGAGCATCCTTATAATTTATGCACACAGGCTGCGTGGCGTGATACGCGTTTTCCCGCCTATTGACATTTGACACGCATATATAGGATTAAGGTAATTTAATTTGGCGACGCGGTGTGCAATACATTT
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG
Unaligned ( gi|30 ): TACACACTCCTTCATAGAACTATTTCTATGTATGATTACACAGCAACCAGTGA
Alignments
lowQualScore : 111 111111 33333333333333 1 11111111 222 11 111 111 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 44444444444444444444444444444444444 1 111111111 11111111 33333333333333333333 111111 11111111 2222222222222222222222222222222222222222 11111111 111111111111 5555555555555555555555555 111 11 11 11 88888888888888888888888888888888 1 3333 2222 1 1 55555555555555555555 111 3333 1111 333333 2222222222 333333333333 222 11111 22222222
lowQualScore : 2 66 4 2 3 111 3 77 6 222222 22222222222222 3 99999 3 7777 3 7777 3 444 3 3 5 77777 33 77 2 5 6 1 2 44444444 5 6666 000 66 11 666 2 888888 2 888 2 2 77 999999 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 5 444 5555 5 5 33 444 33 444 2 33 2 444 777777 33 3 3 2 3 555 77 3 3 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 2 4 5555 33 888 555555555555555 99999 2 2 2 11111111111111111111111111111111111 444 6666 33 5555 2 33 2 2 2 33 2 888888888 33 11111111 55 0 66666666666666666666 555 3 4 111111 00000000 6666 5555555555555555555555555555555555555555 4 55555555 5 555555555555 8 7777777777777777777777777 222 0 11 1 11 00 88888888888888888888888888888888 3 0 4444 2 7777 0 44 0 3 55555555555555555555 777 0000 6 7777 6 666666 6 4444444444 777777777777 6 333 6 6 66666 6 55555555 8
lowQualScore : . .. . . . ... . .. . ...... .............. . ..... . .... . .... . ... . . . ..... .. .. . . . . . ........ . .... ... .. .. ... . ...... . ... . . .. ...... . .................................................... . . ... .... . . .. ... .. ... . .. . ... ...... .. . . . . ... .. . . .................................................................................................... . . .... .. ... ............... ..... . . . ................................... ... .... .. .... . .. . . . .. . ......... .. ........ .. . .................... ... . . ...... ........ .... ........................................ . ........ . ............ . ......................... ... . .. . .. .. ................................ . . .... . .... . .. . . .................... ... .... . .... . ...... . .......... ............ . ... . . ..... . ........ .
lowQualScore : 2 11 4 3 6 444 3 99 7 999999 11111111111111 6 11111 6 1111 3 1111 3 222 1 1 7 11111 99 11 9 5 1 9 9 33333333 7 1111 999 88 66 333 9 222222 9 444 7 7 33 777777 9 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 777 7777 3 3 77 777 77 777 7 77 7 999 111111 99 1 1 3 1 444 33 1 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 7 9999 22 222 444444444444444 77777 4 4 4 22222222222222222222222222222222222 444 3333 44 3333 5 44 5 5 5 99 9 666666666 99 22222222 44 2 11111111111111111111 444 1 6 000000 44444444 1111 7777777777777777777777777777777777777777 4 22222222 6 222222222222 0 8888888888888888888888888 666 8 00 0 22 88 22222222222222222222222222222222 2 0 8888 5 0000 0 22 0 2 88888888888888888888 888 5555 7 8888 7 000000 7 3333333333 333333333333 7 888 7 7 77777 7 77777777 0
consensus : GGGGGGGGGG--G-GGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGG----NTGGGGG--G-G--------TTC-GA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TAG-A-CCGA--TAT-TTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A----C--GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----G-G----GTTA-A---AT--TA---TA-A--ACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CA-AAA--AA--------TCA-AAACCCG---C-GT------------TT---G-TCAGA-----NCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-CCAC---T----TTCAGGGCATGGGNTCG-TTTTTTATT-T---AGT-TA-----------T-CGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA-----A-------TGAA--------A--TG--AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATT-CTATANGCCTATTC-TTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATCAT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTC-AA-AAA-ATA-----AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
Reference ( family-1411 ) : GAGGGGGGGG--G-GGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGG----NTGGGGA--G-G--------TTC-GA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TAG-ACCCGA--TAT-TTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A----C--GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTNTTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---NC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----G-G----GTTA-A---NA--TA---TA-A--ACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CN-AAA--AA--------TCA-AAACCCG---C-GT------------TT---G-TCAGA-----NCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-CCAC---T----TTCAGGGCATGGGNTCG-TTTTTTATT-T---AGT-TA-----------T-CGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA-----A-------TAAG--------A--TG--AAGAGTAA-CCATATTTGTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTANGATTCCTATAGGCCTATTCTTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATCAT-G-CG-TGA-CAAA--TG------TTTT---TC-------GA-ACTTTCAAA-AAA-ATA-----AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
gi|1 : GGGAGGGGGG--G-GGT-C-T----TGAGA-AAGGT-AGT-G----TTGAGAA--G-G--------TTC--A-----A-TG----TG-GG----T-CCGAACCCG-TA---TCCATC-G-TAGA-C-----TA--ATTTTGTATTGTCAA-TTTGT---CC-CAT--------T-G----TAG--CCT----TAT-TTCTAACATA------A-ATA-CGCCA-C-CC--T---C--ATAAA-AT-T---CGT--AG---C--G-ATAT------T---A---GTTTACTGTTTT-T-ATGCT---ATT----ATTGA-T--TC---AT--TGA---TC-AG--T-G-T---ATT-AC------A--ATATTT-A---AGG---ATT---AAAGGC-T-GTTTCCTG--------------ACCC-G-C------------------AAGA-ATGT-TTGA--CAGAATATTATTA-TGA--CTACC-ACA-CTCCT--T-GCTTCTAGA-TCTA-TTT---T---ATA-ATA--------C------CC-----CTTA-TTGA-GACAC----T-T----A-G----GTCA-A---C---TA---TA-C--ACCAATC-----TTGATA--GAC-A-ATA--TC-T---G------AA--AA--------TC--ATAC------C-GT------------TT---GTTCAGA-----CCCC--------C----CC---CCGATGATACAGTGGAGTC---C--------------CCC-----C---T----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGAGTATA-----------C-TG-AAT-C--AAGAAT--GTGTTGGGG-TTA-----ATTCAGATTAGT--------A--TGATAAGAGAAC-CCATA-TTGTGGCAG---CTTGTAG-CGTT-AAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGT-AATTTGAATCAT-A-TGCTGA-CAAA--TG------TCTTGGGTT-------GA-ACTTC--AA-AAA-ATA-----TAA-TATGC--TGAAACGGAA-ATATC
gi|10 : TTTAGC-GT-A--T-----CAT-GGCA-TGA-CAAC--TG------TTTC---TCAAAGAAGGA-ACTTTCCAA-A-----A-----AAA-TATGCTTCAAAGctaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|11 : aggggtatcatattatttattttatttatctatttattgtaggggtcagaatttgcaattaggtaatgaagatatacaaaaaaacaagcataggGAGGGGG--A-GGAAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGG----ATGgatacgtttgatcctctatatccattatgtaaacaaatcatgtcaaaatatcacatacaaaaattagatagaaggtctgaaagaaaagatataatttatatatccttatatttatgaacaggctgcgcgtctataacgtgattttttcccctatgacctttgacacgcatattattaggtaattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaacatc
gi|11 : GAGGGG--G-AGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGG-----TGGGG-----G--------TTT-AA-----A-TG----TG-TG----TCCCGAACCCC-TT-C-GCTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAAACC-CAT--------T-GTACATAG-A-GCGA--TA--TTCT-A-A-A------A-ATATACACC-C-CT--T---C--ATAGA-AT-T---CTT--A----CATGAATAT--A---A---G---TTTTA--------T-GTG-T---ATG----TTT-A-C--AC---AG--CAA---TC-GG--T-GATA--ATTAAC------A--AC-TTA-AGG-AGG---ACA--AAAAGGC-T-GCTTCCTTC---ACAC------AAG------------------------TCG-GTG-ATTGTC-C--TTGA----TG-TAA--C-ACTAA-A-CCTCAT-T-A----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--CTA--------C------AC-----T-TA-TTCA-GACA----A-------G-G----GTTA-A---AT--TA---TA-A--AAT--CC----ACTG-TA--AAC-A-A-agggggagtactctgaaaaatattggtgggggtttaaatgtgtgtcccgaaccccttcgctatcgtagactaaattttatgtcaatttgtaaacccattgtacatagagcgatattctaaaaatatacaccccttcatagaattcttacatgaatataagttttatgtgtatgtttacacagcaatcggtgataattaacaacttaaggaggacaaaaaggctgcttccttcacacaagtcggtgattgtccttgatgtaacactaaacctcattatagacttgtttacatctacacttattcagacaagggttaaattataaaatccactgtaaacaa
gi|12 : gagggggaggaactctgaaaaatattggatC-T---CTAAAG-AA--T-ATTG------CGGGGG--------------TC-AA-----A-TG----TT-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-A-TAGA-T-----TA--A------A-TGCAAGTTATGTAACCC-CA---------T-G----TAG-A-ACGA--TAT-TTCT-A-A-A------G-GTGTACACT-C-CT--T---C--ATAGA-A--CTCTTAT--A----T--GAATAT--A---A---G---ATTTA--------T-ATG-T---TTG----ATT-A-C--AC---AG--TAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCT-------AC------ACG--------------------------G-GTATCT---C-TAG---------G--------ACC-A------------G----TAG-------TTT---CA--AT--ATAC-------C------CC-----C-TA-T--A-AAGAC---AC-T----G-AAATTGTTA-AATTTAATTA---TA-T--ACC--CC----ATTG-TA--GACAA-A-A--TC-TGGGG--GG-AAA--AA--------TCA-AAACCC----C-GT------------TT---G-TCTGA-----ACCC--------C----CT---GC---------------CA---C--------------C
gi|13 : G--G-GGTAC-TATTCTGAAATAA--T-ATTGG----GTAGGG-----G--------TTC-GA-----AGTG----TGAGG----TCCCGAACCCT-AA-C-C--ATC-G-TAGATC-----TA--GA------------ATTTCTTAATCCACGT--------TAG----TAG-GACCGA--TAT-GTCTAA-A-A------A-G-A-------------T---T--ATAAT-A--C---C-T--A----CTTGCAT-T--A---T---AACTTCTT---G--TT-C-TTA-T---ATGCGATATTAA-G--ATTTGAG--CAA---TCGAGTTT-GATA--ATTAATTATAAAA--AT-TTT-A-G-AGAGGTATTA-AAAAGGC-T-GTTTCC-GCT--GCAC------AGGC-T-T-------------------TAGCGCGTAT--A--CGGTG-A----TG-TAA--C-G-C-A-G-TAGTA--T-G----TAGACCTTGTTTT---TC--ATACATA--------G------CCGT---C-T--TTCA-GA-AC---GC-TGACAG-G----GTTATATT-AA--TA---TA-C--ATC--CA----ATTG-TAAGAAC-A-A-taatataaagtgag
gi|14 : GG--G-GGTAC-T---CTAAAA-AAA-T-ATTAG----GAGGGGG--G-GGGGGGGTGTTC-AA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATA-T-TAGA-CTACGGTA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAA-CC-CAT--------T-G----TAA-A-CCGA--TA--TTCT-A-A-A------G-AT--ACCCAGC-CC--T---TC-ATTGA-ACTC---TTT--AT---T--GAATAT--A---------------A--GT-TT-T-ATG-T---ATA----ATT-A-C--TC---AG--CAA---TC-AG--T-GACA--ATGAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATTAAAAAAGGC-T-GTTTCCTAC---ACACGT----ATAC-A-T------------------GTAG-GTATA-AAAC-CAG--TA----TG-TAA--C-ACCAA-A-CCTCATTT-A----TAGA-CTTG-TCT---TC--AT--ACA--------
gi|15 : gaaT--A----T--GAATAC--A---C---AC--TCCTAT-A--TC-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---CC-AG--T-GATA--ACTAACT-----G--TT-TTT-G-G-AGA---ATT--CAAAGGC-T-GTTTCTTGC---ACAC------AT------------------------ATAG-GTG-ATTGAC-AAGTAT-----T--TAA--C-ACC-A-------T--T-A----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CG-----A-TA-TTCA-G--AT---TC-T------G----GTTA-A---AT--TA---TA-A--TCC--CC----ATTG-TA--GATAA-A-A--TC-T---G--C--AAA--AA--------TCA-AACCCCG---T-AT------------T------TCAGA-----ACCC--------C----C
gi|16 : ataTC-G-TAGA-C-----TATAAATTT-TA-TGTCAATTT----------------------G----TAG-ACC-GA--TA--TTCT-A-A-A------A-AT--ATACA-T-TT--T---TTCATAGG-C--C---TCT-------------TAT--A---TGA-A---TGAAA--GA-TT-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AT--T-GATA--ATTAAA------A--AA-TTT-A-GAAGG---ATT--AAAAGGCTT-TTTTCCT-----GCAC------AG---G-T------------------ATAG-GTG-ACTAAC-CAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA-CATG-GTTAAATT--AT--ATA--------C------CT-----C-AA-TGTA-GACAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|16 : -TA-TGTA-GACAT-------------G----GTTA-A---AT--TA---TA-T--ACC--TC----AATG-TA--GAC-A-A-A--AC-TA--A--AA-AAA--AA--------TC--AAACTC----C-TT------------TC---G-TCTCA-----ACCC--------C----CT---AC---------------CA---C--------------Caaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|17 : tcgtagactataaattttatgtcaatttgtagaccgatattctaaaaatatacattttttcataggcctcttatatgaatgaaagatttatgtatgattacacagcaatcattgataattaaaaaatttagaaggattaaaaggcttttttcctgcacaggtataggtgactaaccagtagGGGGGAGGGG--G-GATGC-TTT-CT-AAA-AA--TGATTGG----GGGTGGG--G-G--------T-C-GA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TG--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAACCC-CAT--------T-G----TAG-A-CCGA--TA--TTCT--------------ATC-ATAGA---TC--TGAAT--ATAAA-A--C---CTTTAA----C---AATGC--A---TGTGA---TCTTA--G--Ttaata
gi|18 : cc-CCCTA--TTA----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------CAATTACCC-----C-TA-TTCA-GACTC----T-T------------TTG-A---AT--TA---TA-A--ACC--CC----ATAG-TA--GACAA-A-A--T---------CA-GAA--AG--------TCAGAAAC---------------------------------A-----GCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-Caaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|19 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccT--A----C--AAATAT--A---T----------CA--G--TTCT-ATA-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--GAA---TC-AG--T-GATA--GTTAAC------A--AT-TTTAA-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-TTTTCCT-----GCAC------ATGC-A-C------------------ATAA-ATGT-TTGAC-CAG--TA----TG-TAATTC-ACCAA-A-CCCCAT-T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--gaat
gi|2 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaGAGGGGGGGGTCGCGGT-C-T---CTGAAA-AG--TCATTGG----CTGAGGA--GCG--------TTC-GACAACAA-TGCCAATG-GG----TCC-GAACCCC-TAAC-CCCATC-GCTAGA-C-----TA--AATTT--A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------TAG----TAGCACCCGCGTTAT-TTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAAA-A--C---CGT--A----C--GAATAT--A---T---A---TATTACTG--TT-T-ATA-T---ATG----ATT-AAC--AC---AG--ACA---TC-AG--T-GATA--ATGAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ACGCCA-C------------------AAAA-ATGTCTTGAC-CAGTATA----TGCTAAT-C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCAAGACAC---AC-T----GCGC---GTCA-A---TA--TA---TA-A--ACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A----TC-T---G--CC-AAA--AA--------TCA-AAACCCG---C-GT------------TT---G-TCAGA-----TCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-CCAC---T----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---AGT-TA-----------T-CGCAAT-CAGAATAAT--GAATT--GG-CTG-----G-------CGAA--------A--TA--AAGAGTAA-CCATATTTTTGGCAGAGCTCAGTAGACGCTAAAT-TACGTGT--A--TAACAGTAAAA---CTATATGCCTATTT----GAATTTAGC-GTCAT-TTG-ATCATGG-CACTGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GACACTTTCAAACAAACATA-----AAACTATGCTTTGAAGCGAAGCATATCTATT
gi|20 : GGGGGGGGGG--G-GGTAC-T---CTGGAA-AA--T-ATTGATGCCATGGGGA----G--------TTG-GA-----A-TG----TG-GA----TCCCGAACCCC-TA-C-CTTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGCCAA-TTTGTAACTC-CAT--------T-A----TAG-A-CCGA--TAT-TTTT---A-A------A-AT--GCACA-C-CCCTT---C--ATAG
gi|21 : -A-A-CCCTA--T-GA---TAGA-CTTG-ATT---TC--AC--GTA--------C------CCCTAGGC-TA-TTCA-G--AC---AC-T----G-G----A-TA-A---AT--TA---TA-A--A-C--CC----ATCG-TA--GACAA-A-A--TC-T---G--CA-AAA--Attaagttttatgtaagtaagt
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCCTAATT-A----TAGA-CTTG-ATT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TT---G-------AC-T----G-G----A-TA-A---AT--TATTTTA-A--ACC--CCCATAATTG-TA--GAC-AGA-A--TC-T---G--CA-AAA--AA--------TC---AACTC---------------------T---G-TCAGA-----CCTC--------CGGGGTCAGACC---------------CCGTGC--------------ACCC-CCAC---T----T
gi|25 : -C-----TA--AATTT--A-TGTCAATGT-GTAACCC-CATGT------T-A----TAG---CCTA--TAT-TT-----A-A------A-ATA--CGCA-C-CC--T---TC-ATAAA-C--T---CTT--A----T----ATATGAA---T---A---TATAA--G-------AT--T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAATGCTC-AG--T-AGTT--ATGAGC------A--A
gi|3 : G----TG-GG----TCC---ACTCC-CA-C-CCCATCAG-TCGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTCAACC-CAT--------T-G----TAG-A--CGAT-TAT-T--TAA-A-A------A-AT--ATACA-C-CT--T---TCAATAGA-ACTC---TAT--A----C--GAA-AT--A---T--------------G--TT-T-ATGTT---ATG----ATT-ACC--AC---TGCTCAA---TC-AG--T-GATG--ATTAAC------AATAT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAA-GC-C-GTTTCCTGC---AC---------CGC-A-C------------------ATAA-GTG-ATTGAC-CAGTATT----GG-TAA--A-GCCAA-A-CCGCAT-T-A----TAG--CT---TTT---TC--AT---TA--------C------CC-----T-T--TTCA-GACAC------------------GTTA-A---C---TA---T----------CC----ATAG-T---GAC-A-A-A--TC-T---G--C--AAA--AA--------TCA-AAACCCG-----GT------------TT---G-TCAGAC----ACCCGCACCATGC----CCTA-CC---------------CC---CGCCAATATAAAGGACCCC-CCCC---TCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATC-TATTTGTTTTAATT-TGCAAT-TGGTACAATCAGAATT-G
gi|3 : TTAGC-GT-T--TTA-ACAAT-GACA-TGA-CAAAG-TGGTTTTTTTTT---TT-------TA-ACTT---AA-AAA-ATA-----AAA-TATGC--TAA---GGAA-ATATcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagcttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|30 : gtgggtccactcccaccccatcagtcgactaaattttatgtcaatttgtcaacccattgtagacgattatttaaaaaatatacacctttcaatagaactctatacgaaatatgtttatgttatgattaccactgctcaatcagtgatgattaacaatattttaggaggattaaaagccgtttcctgcaccgcacataagtgattgaccagtattggtaaagccaaaccgcattatagctttttcattacccttttcagacacgttaactatccatagtgacaaatctgcaaaaatcaaaacccggtttgtcagacacccgcaccatgccctacccccgccaatataaaggacccccccctccgcctcagggggtatcatttttaatttatctatttgttttaatttgcaattggtacaatcagaattgcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagc-ACACA-CTCC--T---TC-ATAGA-A--C------------------------------------TATT------TC-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---CC-AG--T-GAatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|4 : t------CC-----C-TA-TTCA-GACAC------T----G-G-----TCA-A---TA--TA---TACA--ACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-AAATC-T---G--CAAAAATCAACCCCGTTGTCA-GCACCCC---C-CCCCCCCCCCTAAATTAAAG-TGAGC-----CCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------GCCC----C---T----TTCAGGGCATGGGG-CG--TTTTTATTGT---AG--TA-----------TACG-AATACAGAATAAT--GAATT-GGG-GTATCATGA-------TAAGGTACGTGTA--TA--AAGAGTAAGCCATA----TGGCAG-GCCTAGTAG-CGTAAAAT-TACGTGTAA---------TAA-----CTATAGG-CTATTT----GAATTTAGC-GT-A--TTG-ATCAT-G-CA-TGA-CAAAGCTG------TTTT---TT-------G--ACTTTC-AA-AAA-ATA-----AAA-TATG---CGAA--GGAA-ATATCTATT
gi|5 : ----TG-TAA--C-ACCGA-A-CCCCA--T-A-----AGG-C-----------C--AT-----------------------------TG-T--A-GAC------T-T----G-------TTA-G---T---TA---TG-A--ACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TCTT---G--C---AA--AA--------TCA-AACTCC-------T------------TT---G-ACAGAACAACACCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCT-CCAC---taatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : GA-----GTCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCCACCACGCCT----TT------AT---CTAT-TTTTTTATT-T---GG--TA-------------CTCAAT-CCAAAT-TT--GCATT-AGGTTTA-----A-------TGAA--------ATGTG--AAG-GTAA-TCATA-ATATA--AGA---TATAAG-AGTAAAACATATG-GCAGGTTTAGC-GTAA-ATT--TACA-------TCATTGACACT--GT-AC-A--TTA-ACTAT------TGAGCACA--T-------TTTT------------GA-ACTAAAAAA-AAA-AAAAAAATAAA-TATGC--TAAA--GGAA-ATATTCATTaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|7 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcAA-AA--T-ATTGG----TGGCCGATGG-G--------TTC-GA-----A-TG----TG-GG----TCTCAAACCCC-TA-A-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-CA-TGTCAATTT-GTAACCC-CATAATGGCATT-G----TAG-ATA-GA--TCA-TTCTAA-A-ATTAGTTA-ATT-ACACA-C-CCCTT---T--ATAGA-A--CT--CGT--A--------AATA-------------------A--G--TT-TTAAG-T---ATG----ATT-A-C--A-----G--C----------------------TAAC------A--AT----------------------AAGGC-T-GTTTCGTAC---GCACGTCATGAGGA-G-CGATGCAATAGATTCATCTATAG-GTG-ATTGAT-CA--ATA----TG-TAA--C-ACC-A-AACCCCA--TTG----TAGA-CTTG-TTT---TC--GA--ATA--------C------CC-----C-AA-TTCA-G--AC---AC-T------G----GTTA-A---AT--TA---TG-A--ATC--CT----ATTG-TA--AAC-A-A-A---C-T---G--CA-AAA--AA--------TCA-AACCCCGGACC-GT------------TT---G-TT-GA-----TACC--------T----CC---CC---------------CC---C--------------atgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|8 : AC-A---CTGAAA-AA--T-ATTGA----TTGGGA--------------TTCCGA-----A-TG----TG-GG-----CACAAACCCC-TA-C-CCCATC-G-T-GA-C-----T-----TTC-TT-TGTCAA-TGTGTAACCC-TAG--------T-G----T---ACACGA---ATATTCTAC-A-A------ATATA-ACACT-C-TT--T---TTCAAAGATA--CT--CTT--AATATG--GAATAT--A-------A---TG--A--G--TT-T--TG-TAAGATG----TTT-A-CAAAC---AG--CAA---TA-AG--T-GATAGTATTAAC------A-----TTT-A-G-GAG---AAT--AAAGGGC-C-GTT--CCGT---GCAC------AAGG-GAT------------------ATAG-GTA-CTCGACGCAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA--TTG-TTT---TTCAAT--ATGACCGCCGCC------CC-----C-TATTTCA-GAC-C---AC-T----G-ACATCGTTA-A---AT--CA---TA-T--ACC--CC----AATG-TA--GACAA-A-A--TC-T---GGAAA-AAA--AA--------TTA-AATCC-----C-GT------------TT---G-TTTGA-----ACCC--------C----Caaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|9 : GGG--G-GATACAT---CCGAAA-A---T-ATTGG----GGGAGGG--G-G--------GGG-GG-----A-GG----TG-GGGGGGTCCT-AACCCCATA-TTCCCATT-G-TAGGGT-----TA--GATT---A-TGTCAATTT-GTAACCC-CAT--------T-G----TAA-GACCGA--TAA-TTCCTA-A-A------T-ATA--CACC-C-CT--T---C--ATTGA-A--C-----T--A----T--GAATAT--AAGTT---A---TTTTA--------T-GTG-T---ATG----TTT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AG--TGGATT--ATTAACAATA--A--AT-TTT-A-G-GGG---TTT--AAAATGC-TGGTTTCCTGCCATGCA-------AGGC-A-T------------------CTAG-GTG-ATTGAC-CAGTA-G----TA-TA-----------------A--T-G----TAGA-CTTGTTTT---TC--AT---TA---------------CC-----C-TA-TTCA-GACACTGAACAT----G-G----TTTT-A---AA--T----TA-ATCACC--CC----ATTA---------A-A-A--TC-T---G--AA-AAA--AC--------TCA-TAAACCG---TGGT------------TT---G-TTTGA-----ATCC--------C----TCTA-TC---------------TG---C--------------CTCC-CCAtacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CCTCCCCCCCGGGCCTCAGGAGTATCAATGTTCCTTTCATGCTATTTTTTTTTTAATTTGGTAGCGAATCAAATTTGCACATTAAGATTTAATGAAATGGGGTATTCATTAATATAAGATATAGAAAGGTAACAACCTGGGCAGGTATGGCGTAACTCAAGGGACATGACAGAAATTAATTTTTTTTTTTATATAACTTTGAAAAAATAAAGTATGCTAAAGGAAAGGGTATTCATATGTATTAATAGAATCAGGACAGAATTATCGAACCCCCCCGTAAAGAATACATAATATTGTCATTAGAAATGTCTGAAAAAAGCGGTAGAGCATCCTTATAATTTATGCACACAGGCTGCGTGGCGTGATACGCGTTTTCCCGCCTATTGACATTTGACACGCATATATAGGATTAAGGTAATTTAATTTGGCGACGCGGTGTGCAATACATTT
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG
Alignments
lowQualScore : 111 1111111 11111111111 1 11111111 111 111 111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 333333333333333333333333 1 11111111 222222 111111 111 22222222222222222222222222222222222 11111111 11111111111 555555555555555555555555 111 11 777777777777777777777777777777777777777 111 111 1111111 222222 1 2222222222 444444 33333 1111 222222 2222222222 111 2222222222 111111 22222222
lowQualScore : 66 2 3 111 3 77 6 1111111 88888888888 99999 3 7777 3 7777 3 444 3 3 5 77777 33 77 2 2 9 1 2 44444444 5 6666 2 5 555 2 5 1 222 2 888888 2 888 2 2 77 999999 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 5 5555 444 5 5 33 444 33 444 2 33 2 444 777777 33 3 3 2 3 555 77 3 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 4 444 55 888 555555555555555 99999 2 2 2 888888888888888888888888 777777 999 444 44 33 5555 2 33 2 2 2 33 2 11111111 55 0 0 555555 1 3 4 000000 99999999 5555 333 00000000000000000000000000000000000 4 3 55555555 5 44444444444 6 8 777777777777777777777777 222 0 11 1 999999999999999999999999999999999999999 111 3 8 444 7777777 444444 8 44 0 3 9999999999 000000 33 8 55555 6 7777 6 99 222222 6 8888888888 111 1111111111 3 6 99 999999 6 55555555 8
lowQualScore : .. . . ... . .. . ....... ........... ..... . .... . .... . ... . . . ..... .. .. . . . . . ........ . .... . . ... . . . ... . ...... . ... . . .. ...... . ................................................... . . .... ... . . .. ... .. ... . .. . ... ...... .. . . . . ... .. . . .................................................................................................... . . ... .. ... ............... ..... . . . ........................ ...... ... ... .. .. .... . .. . . . .. . ........ .. . . ...... . . . ...... ........ .... ... ................................... . . ........ . ........... . . ........................ ... . .. . ....................................... ... . . ... ....... ...... . .. . . .......... ...... .. . ..... . .... . .. ...... . .......... ... .......... . . .. ...... . ........ .
lowQualScore : 11 3 6 444 3 99 7 7777777 77777777777 11111 6 1111 3 1111 3 222 1 1 7 11111 99 11 9 0 6 9 9 33333333 7 1111 9 7 000 9 2 5 888 9 222222 9 111 7 7 33 777777 9 000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 7777 777 3 3 77 777 77 777 7 77 7 999 111111 99 1 1 3 1 444 33 1 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 7 111 66 222 444444444444444 77777 4 4 4 000000000000000000000000 333333 444 444 44 44 3333 5 44 5 5 5 99 9 44444444 44 4 2 555555 5 1 6 333333 77777777 7777 888 99999999999999999999999999999999999 0 1 22222222 6 44444444444 0 0 888888888888888888888888 666 8 00 0 222222222222222222222222222222222222222 888 8 0 000 6666666 000000 0 22 0 2 5555555555 888888 55 8 22222 7 8888 7 22 333333 7 3333333333 777 7777777777 5 7 22 222222 7 77777777 0
consensus : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-CCAC---T----TTCAGGGCATGGGNTCG-TTTTTTATT-T---AGTATA-----------TCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-G-------GG-TTA--AT---GAT-----A-----A--TG--AAGAGTAA-CC---ATA-TTATGGCAGAGCCT-AGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATTT-TTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
Reference ( family-1411 ) : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----NCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-CCAC---T----TTCAGGGCATGGGNTCG-TTTTTTATT-T---AGT-TA-----------TCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-G-------GG-TTA--AT---GA------A-----A--TG--AAGAGTAA-CC---ATA-TTNTGGCAGAGCCT-AGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATTC-TTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
gi|1 : GGGAGGGGG--GGGGT-C-T----TGAGA-AAGGT-AGT-GTTG----AGAAG-G--------TTC-A-----A-TG----TG-GG----T-CCGAACCCG-TA---TCCATC-G-TAGA-C-----TA--ATTTTGTATTGTCAA-TTTGT---CC-CAT--------T-G----TA-G-CCT------TATTTCTAACATA------A-ATA-CGCCA-C-CC--T---C--ATAAA-AT-T---CGT--AGC----G-ATAT------T---A---GTTTACTGTTTT-T-ATGCTATT----AT---TGA-TT--C---AT--TGA---TC-AG--T-G-T---ATT-AC------A--ATATTT-A---AGG---ATT---AAAGGC-T-GTTTCCTG--------------ACCC-G-C------------------AAGA-ATGT-TTGA--CAGAATATTATTA-TGA--CTACC-ACA-CTCCT--T-GCTTCTAGA-TCTA-TTT---T---ATA-ATA--------C------CC-----CTTA-TTGA-GACAC----T-T----AG----GT-C------AAC---TA---TA-CACCAATC-----TTGATA--GAC-A-ATA--TC-T---G-----AAAATC--ATAC------C-GTTTGTTCAGA-----CCCC--------C----CC---CCGATGATACAGTGGAGTC---C--------------CCC-----C---T----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGAGTATA-----------CTG-AAT-C--AAGAAT--GTGTTGG-------GG-TTA--ATTCAGATT----AGT---A--TGATAAGAGAAC-CC---ATA-TTGTGGCAG---CT-TGTAG-CGTT-AAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGT-AATTTGAATCATAT-G-C--TGA-CAAA--TG------TCTTGGGTT-------GA-AC-TTCAAA-AA--ATA------TAA-TATGC--TGAAACGGAA-ATATC
gi|10 : TTTAGC-GT-A--T-----C--AT-GGCA-TGA-CAAC--TG------TTTC---TCAAAGAAGGA-ACTTTCCAA-A-----A------AAA-TATGCTTCAAAGctaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|11 : aggggtatcatattatttattttatttatctatttattgtaggggtcagaatttgcaattaggtaatgaagatatacaaaaaaacaagcataggGAGGGG--GAGGAAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGATG----gatacgtttgatcctctatatccattatgtaaacaaatcatgtcaaaatatcacatacaaaaattagatagaaggtctgaaagaaaagatataatttatatatccttatatttatgaacaggctgcgcgtctataacgtgattttttcccctatgacctttgacacgcatattattaggtaattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaacatc
gi|11 : GAGGG--GGAGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGT-------GGGG-G--------TTTAA-----A-TG----TG-TG----TCCCGAACCCC-TT-C-GCTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAAACC-CAT--------T-GTACATA-G-AGC---GA-TA-TTCT-A-A-A------A-ATATACACC-C-CT--T---C--ATAGA-AT-T---CTT--A-CAT--GAATAT--A---A---G---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-GG--T-GATA--ATTAAC------A--AC-TTA-AGG-AGG---ACA--AAAAGGC-T-GCTTCCTTC---ACAC------AAG------------------------TCG-GTG-ATTGTC-C--TTGA----TG-TAA--C-ACTAA-A-CCTCAT-T-A----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--CTA--------C------AC-----T-TA-TTCA-GACA----A-------GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AAAT--CC----ACTG-TA--AAC-A-A-agggggagtactctgaaaaatattggtgggggtttaaatgtgtgtcccgaaccccttcgctatcgtagactaaattttatgtcaatttgtaaacccattgtacatagagcgatattctaaaaatatacaccccttcatagaattcttacatgaatataagttttatgtgtatgtttacacagcaatcggtgataattaacaacttaaggaggacaaaaaggctgcttccttcacacaagtcggtgattgtccttgatgtaacactaaacctcattatagacttgtttacatctacacttattcagacaagggttaaattataaaatccactgtaaacaa
gi|12 : gagggggaggaactctgaaaaatattggatC-T---CTAAAG-AA--T-ATTG--CG----GGGG------------TCAA-----A-TG----TT-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-A-TAGA-T-----TA--A------A-TGCAAGTTATGTAACCC-CA---------T-G----TA-G-AAC---GA-TATTTCT-A-A-A------G-GTGTACACT-C-CT--T---C--ATAGA-A--CTCTTAT--A-T----GAATAT--A---A---G---ATTTA--------T-ATG-TTTG----AT---T-A-CA--C---AG--TAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCT-------AC------ACG----------------------------------------GGTATC----TC-TAG--G-ACC-A------------G----TAG--------TT---TCA-AT--ATAC-------C------CC-----C-TA-T--A-AAGAC---AC-T----GAAATTGT-TAAATTTAAT---TA---TA-TACC--CC----ATTG-TA--GACAA-A-A--TC-TGGGG--GGAAAAATCA-AAACCC----C-GTTTG-TCTGA-----ACCC--------C----CT---GC---------------CA---C--------------C
gi|13 : --GGGGTAC-TATTCTGAAATAA--T-ATTGGGTA----GGGG-----------TTCGA-----AGTG----TGAGG----TCCCGAACCCT-AA-C-C--ATC-G-TAGATC-----TA--GA------------ATTTCTTAATCCACGT--------TAG----TA-GGACC---GA-TATGTCTAA-A-A------A-G-A-------------T---T--ATAAT-A--C---C-T--A-CTT--GCAT-T--A---T---AACTTCTT---G--TT-C-TTA-TATGCGATAT---TAA-GA--TTTGAG--CAA---TCGAGTTT-GATA--ATTAATTATAAAA--AT-TTT-A-G-AGAGGTATTA-AAAAGGC-T-GTTTCC-GCT--GCAC------AGGC-T-T-------------------TAGCGCGTAT--A--CGGTG-A----TG-TAA--C-G-C-A-G-TAGTA--T-G----TAGACCTTGTTTT---TC--ATACATA--------G------CCGT---C-T--TTCA-GA-AC---GC-TGACAGG----GT-TA-----TATTAATA---TA-CATC--CA----ATTG-TAAGAAC-A-A-taatataaagtgag
gi|14 : G--GGGGTAC-T---CTAAAA-AAA-T-ATTAGGAG----GGGGG-GGGGGGGTGTTCAA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATA-T-TAGA-CTACGGTA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAA-CC-CAT--------T-G----TA-A-ACC---GA-TA-TTCT-A-A-A------G-AT--ACCCAGC-CC--T---TC-ATTGA-ACTC---TTT--ATT----GAATAT--A---------------A--GT-TT-T-ATG-TATA----AT---T-A-CT--C---AG--CAA---TC-AG--T-GACA--ATGAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATTAAAAAAGGC-T-GTTTCCTAC---ACACGT----ATAC-A-T------------------GTAG-GTATA-AAAC-CAG--TA----TG-TAA--C-ACCAA-A-CCTCATTT-A----TAGA-CTTG-TCT---TC--AT--ACA--------
gi|15 : gaaT--A-T----GAATAC--A---C---AC--TCCTAT-A--TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GATA--ACTAACT-----G--TT-TTT-G-G-AGA---ATT--CAAAGGC-T-GTTTCTTGC---ACAC------AT------------------------ATAG-GTG-ATTGAC-AAGTAT-----T--TAA--C-ACC-A-------T--T-A----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CG-----A-TA-TTCA-G--AT---TC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TA-ATCC--CC----ATTG-TA--GATAA-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AACCCCG---T-ATT---TCAGA-----ACCC--------C----C
gi|16 : ataTC-G-TAGA-C-----TATAAATTT-TA-TGTCAATTT----------------------G----TA-G-ACC---GA-TATT-CTAA-A-A------A--TA--TACA-T-TT--T---TTCATAGG-C--C---TCT------------TAT--A---TGA-A---TGAAA--GA-TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AT--T-GATA--ATTAAA------A--AA-TTT-A-GAAGG---ATT--AAAAGGCTT-TTTTCCT-----GCAC------AG---G-T------------------ATAG-GTG-ACTAAC-CAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA-CATG-GTTAAATT--AT--ATA--------C------CT-----C-AA-TGTA-GACAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|16 : -TA-TGTA-GACAT------------G----GT-TA-----AAT---TA---TA-TACC--TC----AATG-TA--GAC-A-A-A--AC-TA--A--AAAAAAATC--AAACTC----C-TTTCG-TCTCA-----ACCC--------C----CT---AC---------------CA---C--------------Caaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|17 : tcgtagactataaattttatgtcaatttgtagaccgatattctaaaaatatacattttttcataggcctcttatatgaatgaaagatttatgtatgattacacagcaatcattgataattaaaaaatttagaaggattaaaaggcttttttcctgcacaggtataggtgactaaccagtagGGGGGAGGG--GGGATGC-TTT-CT-AAA-AA--TGATTGGGGG----TGGGG-G--------T-CGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TG--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TA-TTCT--------------ATC-ATAGA---TC--TGAAT--ATAAA-A--C---CTTTAA-C-----AATGC--A---TGTGA---TCTTA--G--Ttaata
gi|18 : cc-CCCTA--TTA----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------CAATTACCC-----C-TA-TTCA-GACTC----T-T-----------T-TG-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATAG-TA--GACAA-A-A--T---------CAGAAAGTCAGAAAC------------------A-----GCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-Caaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|19 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccT--A-C----AAATAT--A---T----------CA--G--TTCT-ATA-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--GAA---TC-AG--T-GATA--GTTAAC------A--AT-TTTAA-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-TTTTCCT-----GCAC------ATGC-A-C------------------ATAA-ATGT-TTGAC-CAG--TA----TG-TAATTC-ACCAA-A-CCCCAT-T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--gaat
gi|2 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaGGGGGGGGTCGCGGT-C-T---CTGAAA-AG--TCATTGGCTG----AGGAGCG--------TTCGACAACAA-TGCCAATG-GG----TCC-GAACCCC-TAAC-CCCATC-GCTAGA-C-----TA--AATTT--A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------TAG----TA-GCACCCGCGT-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAAA-A--C---CGT--A-C----GAATAT--A---T---A---TATTACTG--TT-T-ATA-TATG----AT---T-AACA--C---AG--ACA---TC-AG--T-GATA--ATGAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ACGCCA-C------------------AAAA-ATGTCTTGAC-CAGTATA----TGCTAAT-C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCAAGACAC---AC-T----GC----GCGTC-----AATA--TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A----TC-T---G--CCAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----TCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-CCAC---T----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---AGT-TA-----------TCGCAAT-CAGAATAAT--GAATT---------GG-CTG--GC---GA------A-----A--TA--AAGAGTAA-CC---ATATTTTTGGCAGAGCTC-AGTAGACGCTAAAT-TACGTGT--A--TAACAGTAAAA--C-TATATGCCTATTT----GAATTTAGC-GTCAT-TTG-ATC--ATGG-CACTGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GACACTTTCAAACAAACATA------AAACTATGCTTTGAAGCGAAGCATATCTATT
gi|20 : gaGGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGGAA-AA--T-ATT-GATGCCATGGGGA-G--------TTGGA-----A-TG----TG-GA----TCCCGAACCCC-TA-C-CTTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGCCAA-TTTGTAACTC-CAT--------T-A----TA-G-ACC---GA-TATTTTT---A-A------A-AT--GCACA-C-CCCTT---C--ATAG
gi|21 : -A-A-CCCTA--T-GA---TAGA-CTTG-ATT---TC--AC--GTA--------C------CCCTAGGC-TA-TTCA-G--AC---AC-T----GG----A--TA-----AAT---TA---TA-AA-C--CC----ATCG-TA--GACAA-A-A--TC-T---G--CAAAAAttaagttttatgtaagtaagt
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCCTAATT-A----TAGA-CTTG-ATT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TT---G-------AC-T----GG----A--TA-----AAT---TATTTTA-AACC--CCCATAATTG-TA--GAC-AGA-A--TC-T---G--CAAAAAATC---AACTC---------TG-TCAGA-----CCTC--------CGGGGTCAGACC---------------CCGTGC--------------ACCC-CCAC---T----T
gi|25 : -C-----TA--AATTT--A-TGTCAATGT-GTAACCC-CATGT------T-A----TA-G--CC---TA-TATTT-----A-A------A-ATA--CGCA-C-CC--T---TC-ATAAA-C--T---CTT--A-T------ATATGAA---T---A---TATAA--G-------AT--TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAATGCTC-AG--T-AGTT--ATGAGC------A--A
gi|3 : G----TG-GG----TCC---ACTCC-CA-C-CCCATCAG-TCGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTCAACC-CAT--------T-G----TA-G-A-C---GATTATT--TAA-A-A------A-AT--ATACA-C-CT--T---TCAATAGA-ACTC---TAT--A-C----GAA-AT--A---T--------------G--TT-T-ATGTTATG----AT---T-ACCA--C---TGCTCAA---TC-AG--T-GATG--ATTAAC------AATAT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAA-GC-C-GTTTCCTGC---AC---------CGC-A-C------------------ATAA-GTG-ATTGAC-CAGTATT----GG-TAA--A-GCCAA-A-CCGCAT-T-A----TAG--CT---TTT---TC--AT---TA--------C------CC-----T-T--TTCA-GACAC-----------------GT-T------AAC---TA---T--------CC----ATAG-T---GAC-A-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AAACCCG-----GTTTG-TCAGAC----ACCCGCACCATGC----CCTA-CC---------------CC---CGCCAATATAAAGGACCCC-CCCC---TCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATC-TATTTGTTTTAATTTGCAAT-TGGTACAATCAGAATT-GCACATCTAG-TTT--AT---G-------A-----A--TG---GGGGTAA-TCAAAATA-TTA----AGAACATAAGCAG-C
gi|3 : TTAGC-GT-T--TTA-ACA--AT-GACA-TGA-CAAAG-TGGTTTTTTTTT---TT-------TA-ACTT--AAA-AA--ATA------AAA-TATGC--TAA---GGAA-ATATttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|30 : gtgggtccactcccaccccatcagtcgactaaattttatgtcaatttgtcaacccattgtagacgattatttaaaaaatatacacctttcaatagaactctatacgaaatatgtttatgttatgattaccactgctcaatcagtgatgattaacaatattttaggaggattaaaagccgtttcctgcaccgcacataagtgattgaccagtattggtaaagccaaaccgcattatagctttttcattacccttttcagacacgttaactatccatagtgacaaatctgcaaaaatcaaaacccggtttgtcagacacccgcaccatgccctacccccgccaatataaaggacccccccctccgcctcagggggtatcatttttaatttatctatttgttttaatttgcaattggtacaatcagaattgcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagc-ACACA-CTCC--T---TC-ATAGA-A--C-----------------------------------TATT------TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GAatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|4 : t------CC-----C-TA-TTCA-GACAC------T----GG-------TC-----AATA--TA---TACAACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-AAATC-T---G--CAAAAA-TCA-A--CCC----C-GTT-G-TCAGC-----ACCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCC-
gi|4 : GA-----GCCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCGC-CC-C---T----TTCAGGGCATGGGG-CG-TTTTT-ATTGT---AGTATA------------CG-AATACAGAATAAT--GAATT-G-------GG-GTATCAT---GATAAGGTACGTGTA--TA--AAGAGTAAGCC---ATA-T---GGCAG-GCCT-AGTAG-CGTAAAAT-TACGTGTAA---------TAA----C-TATAGGC-TATTT----GAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAAGCTG------TTTT---TT-------G--ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATG---CGAA--GGAA-ATATCTATTtaaattaaagtgagcccccccccccccgcccctttcagggcatggggcgtttttattgtagtatacgaatacagaataatgaattggggtatcatgataaggtacgtgtataaagagtaagccatatggcaggcctagtagcgtaaaattacgtgtaataactataggctatttgaatttagcgtattgatcatgcatgacaaagctgttttttgactttcaaaaaataaaatatgcgaaggaaatatctatttaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : ccctattcagacactggtcaatatatacaaccccattgtagacaaaaatctgcaaaaatcaaccccgttgtcagcaccccccccccccccctaaattaaagt----TG-TAA--C-ACCGA-A-CCCCA--T-A-----AGG-C-----------C--AT-----------------------------TG-T--A-GAC------T-T----G------T-TA-----G-T---TA---TG-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TCTT---G--C--AAAATCA-AACTCC-------TTTG-ACAGAACAACACCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCT-CCAC---taatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : GA-----GTCC--------C----CC---CC---------------CC---C--------------CCCCACCACGCCT----TT------AT---CTAT-TTTTTTATT-T---GG--TA------------CTCAAT-CCAAAT-TT--GCATT-A-------GGTTTA--AT---GA------A-----ATGTG--AAG-GTAA-TC---ATA-ATATA--AGA---T-ATAAG-AGTAAAACATATG-GCAGGTTTAGC-GTAA-ATT----TAC----ATCA-TTGACACT--GT-AC-A--TTA-ACT--AT------TGAGCACA-----------TTT---TT-------GA-ACTAAAAAA-AA--AAAAAAAATAAA-TATGC--TAAA--GGAA-ATATTCATTaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|7 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcAA-AA--T-ATTGGTGGCC--GATGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCTCAAACCCC-TA-A-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-CA-TGTCAATTT-GTAACCC-CATAATGGCATT-G----TA-G-ATA---GA-TCATTCTAA-A-ATTAGTTA-ATT-ACACA-C-CCCTT---T--ATAGA-A--CT--CGT--A-------AATA-------------------A--G--TT-TTAAG-TATG----AT---T-A-CA-------G--C----------------------TAAC------A--AT----------------------AAGGC-T-GTTTCGTAC---GCACGTCATGAGGA-G-CGATGCAATAGATTCATCTATAG-GTG-ATTGAT-CA--ATA----TG-TAA--C-ACC-A-AACCCCA--TTG----TAGA-CTTG-TTT---TC--GA--ATA--------C------CC-----C-AA-TTCA-G--AC---AC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TG-AATC--CT----ATTG-TA--AAC-A-A-A---C-T---G--CAAAAAATCA-AACCCCGGACC-GTTTG-TT-GA-----TACC--------T----CC---CC---------------CC---C--------------atgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|8 : AC-A---CTGAAA-AA--T-ATTGATTG----GGAT-----------TCCGA-----A-TG----TG-GG-----CACAAACCCC-TA-C-CCCATC-G-T-GA-C-----T-----TTC-TT-TGTCAATGT-GTAACCC-TAG--------T-G----TA-C-ACG---AA-TATT-CTAC-A-A------ATATA-ACACT-C-TT--T---TTCAAAGATA--CT--CTT--A-ATATGGAATAT--A-------A---TG--A--G--TT-T--TG-TAAG----ATGTTT-A-CAAAC---AG--CAA---TA-AG--T-GATAGTATTAAC------A-----TTT-A-G-GAG---AAT--AAAGGGC-C-GTT--CCGT---GCAC------AAGG-GAT------------------ATAG-GTAC-TCGACGCAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA--TTG-TTT---TTCAAT--ATGACCGCCGCC------CC-----C-TATTTCA-GAC-C---AC-T----GACATCGT-TA-----AAT---CA---TA-TACC--CC----AATG-TA--GACAA-A-A--TC-T---GGAAAAAAAATTA-AATCC-----C-GTTTG-TTTGA-----ACCC--------C----Caaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|9 : GG--GGGATACAT---CCGAAA-A---T-ATTGGGGG----AGGGG-G--------GGGGG-----A-GG----TG-GGGGGGTCCT-AACCCCATA-TTCCCATT-G-TAGGGT-----TA--GATT---A-TGTCAATTT-GTAACCC-CAT--------T-G----TAAG-ACC---GA-TAATTCCTA-A-A------T-ATA--CACC-C-CT--T---C--ATTGA-A--C-----T--A-T----GAATAT--AAGTT---A---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--TGGATT--ATTAACAATA--A--AT-TTT-A-G-GGG---TTT--AAAATGC-TGGTTTCCTGCCATGCA-------AGGC-A-T------------------CTAG-GTG-ATTGAC-CAGTA-G----TA-TA-----------------A--T-G----TAGA-CTTGTTTT---TC--AT---TA---------------CC-----C-TA-TTCA-GACACTGAACAT----GGT---TT-TA-----AAT---TA---AT-CACC--CC----ATTA---------A-A-A--TC-T---G--AAAAAACTCA-TAAACCG---TGGTTTG-TTTGA-----ATCC--------C----TCTA-TC---------------TG---C--------------CTCC-CCAtacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CCTCCCCCCCGGGCCTCAGGAGTATCAATGTTCCTTTCATGCTATTTTTTTTTTAATTTGGTAGCGAATCAAATTTGCACATTAAGATTTAATGAAATGGGGTATTCATTAATATAAGATATAGAAAGGTAACAACCTGGGCAGGTATGGCGTAACTCAAGGGACATGACAGAAATTAATTTTTTTTTTTATATAACTTTGAAAAAATAAAGTATGCTAAAGGAAAGGGTATTCATATGTATTAATAGAATCAGGACAGAATTATCGAACCCCCCCGTAAAGAATACATAATATTGTCATTAGAAATGTCTGAAAAAAGCGGTAGAGCATCCTTATAATTTATGCACACAGGCTGCGTGGCGTGATACGCGTTTTCCCGCCTATTGACATTTGACACGCATATATAGGATTAAGGTAATTTAATTTGGCGACGCGGTGTGCAATACATTT
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG
Alignments
lowQualScore : 111 1111111 11111111111 1 11111111 111 111 111111 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 333333333333333333333333 1 11111111 222222 11111 222222222 3333333333333333333333333333333333 1111 444444444444444444444444 111 11 8888888888888888888888888888888888888888 111 111 1111111 222222 1 2222222222 444444 22222 1111 222222 2222222222 111 2222222222 111111 22222222
lowQualScore : 66 2 3 111 3 77 6 1111111 88888888888 99999 3 7777 3 7777 3 3 3 3 3 3 5 77777 33 77 2 5 6 1 2 44444444 5 6666 2 5 555 2 8 222 2 888888 2 888 2 2 77 999999 2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 5 444 5555 5 5 33 444 33 444 2 33 2 444 777777 33 3 3 2 3 555 77 3 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 4 444 55 888 555555555555555 99999 2 2 2 888888888888888888888888 777777 999 444 44 33 5555 2 33 2 2 2 33 2 11111111 55 0 0 555555 1 3 2 00000 99999999 000000000 1111111111111111111111111111111111 3 4444 0 666 11 8 6 8 999999999999999999999999 222 0 11 1 3333333333333333333333333333333333333333 111 3 8 444 7777777 444444 8 44 0 3 9999999999 000000 33 8 88888 6 7777 6 99 222222 6 8888888888 111 1111111111 3 6 99 999999 6 55555555 8
lowQualScore : .. . . ... . .. . ....... ........... ..... . .... . .... . . . . . . . ..... .. .. . . . . . ........ . .... . . ... . . ... . ...... . ... . . .. ...... . .................................................... . . ... .... . . .. ... .. ... . .. . ... ...... .. . . . . ... .. . . .................................................................................................... . . ... .. ... ............... ..... . . . ........................ ...... ... ... .. .. .... . .. . . . .. . ........ .. . . ...... . . . ..... ........ ......... .................................. . .... . ... .. . . . ........................ ... . .. . ........................................ ... . . ... ....... ...... . .. . . .......... ...... .. . ..... . .... . .. ...... . .......... ... .......... . . .. ...... . ........ .
lowQualScore : 11 3 6 444 3 99 7 7777777 77777777777 11111 6 1111 3 1111 8 3 3 3 1 1 7 11111 99 11 9 5 1 9 9 33333333 7 1111 9 7 000 9 7 888 9 222222 9 111 7 7 33 777777 9 0000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 777 7777 3 3 77 777 77 777 7 77 7 999 111111 99 1 1 3 1 444 33 1 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 7 111 66 222 444444444444444 77777 4 4 4 000000000000000000000000 333333 444 444 44 44 3333 5 44 5 5 5 99 9 44444444 44 4 2 555555 5 1 0 00000 77777777 888888888 2222222222222222222222222222222222 1 2222 8 666 88 0 0 0 222222222222222222222222 666 8 00 0 6666666666666666666666666666666666666666 888 8 0 000 8888888 000000 0 22 0 2 5555555555 888888 55 8 55555 7 8888 7 22 333333 7 3333333333 777 7777777777 5 7 22 222222 7 77777777 0
consensus : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A----C--GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-G-------GGTT-A--AT---GA-TA--A-G--------TG--AAGAGTAA-CC---ATA-TTATGGCAGAGCCT-AGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
Reference ( family-1411 ) : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A----C--GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCATGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-G-------GGTT-A--AT---GA-TA--A----------TG--AAGAGTAA-CC---ATA-TTATGGCAGAGCCT-AGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
gi|1 : GGGAGGGGG--GGGGT-C-T----TGAGA-AAGGT-AGTG-TTG----AGAAG-G--------TTC-A-----A-TG----TG-GG----TCC-GAACCCG-TA-T-CC-ATC-G-TAGA-C-----TA--ATTTTGTATTGTCAA-TTTGT---CC-CAT--------T-G----TA-G-CCT------TATTTCTAACATA------A-ATA-CGCCA-C-CC--T---C--ATAAA-AT-T---CGT--AG---C--G-ATAT------T---A---GTTTACTGTTTT-T-ATGCT---ATT----ATTGA-T--TC---AT--TGA---TC-AG--T-G-T---ATT-AC------A--ATATTT-A---AGG---ATT---AAAGGC-T-GTTTCCTG--------------ACCC-G-C------------------AAGA-ATGT-TTGA--CAGAATATTATTA-TGA--CTACC-ACA-CTCCT--T-GCTTCTAGA-TCTA-TTT---T---ATA-ATA--------C------CC-----CTTA-TTGA-GACAC----T-T----AG----GT-C------AAC---TA---TA-CACCAATC-----TTGATA--GAC-A-ATA--TC-T---G-----AAAATC--ATAC------C-GTTTGTTCAG------ACCC--------CCC---------CCCGATGATACAGTGGAGT---C--------------CCCC---CT----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGA-------GT----ATACTG-AAT-C--AAGAAT--GTGTTGG-------GGTT-A--ATTCAGATTAGTA----------TGATAAGAGAAC-CC---ATA-TTGTGGCAG---CT-TGTAG-CGTT-AAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGT-AATTTGAATCATAT-G-C--TGA-CAAA--TG------TCTTGGGTT-------GA-AC-TTCAAA-AA--ATA------TAA-TATGC--TGAAACGGAA-ATATC
gi|10 : TTTAGC-GT-A--T-----C--AT-GGCA-TGA-CAAC--TG------TTTC---TCAAAGAAGGA-ACTTTCCAA-A-----A------AAA-TATGCTTCAAAGctaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|11 : aggggtatcatattatttattttatttatctatttattgtaggggtcagaatttgcaattaggtaatgaagatatacaaaaaaacaagcataggGAGGGG--GAGGAAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGATG----gatacgtttgatcctctatatccattatgtaaacaaatcatgtcaaaatatcacatacaaaaattagatagaaggtctgaaagaaaagatataatttatatatccttatatttatgaacaggctgcgcgtctataacgtgattttttcccctatgacctttgacacgcatattattaggtaattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaacatc
gi|11 : GAGGG--GGAGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGT-------GGGG-G--------TTTAA-----A-TG----TG-TG----TCCCGAACCCC-TT-C-GCTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAAACC-CAT--------T-GTACATA-G-AGC---GA-TA-TTCT-A-A-A------A-ATATACACC-C-CT--T---C--ATAGA-AT-T---CTT--A----CATGAATAT--A---A---G---TTTTA--------T-GTG-T---ATG----TTT-A-C--AC---AG--CAA---TC-GG--T-GATA--ATTAAC------A--AC-TTA-AGG-AGG---ACA--AAAAGGC-T-GCTTCCTTC---ACAC------AAG------------------------TCG-GTG-ATTGTC-C--TTGA----TG-TAA--C-ACTAA-A-CCTCAT-T-A----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--CTA--------C------AC-----T-TA-TTCA-GACA----A-------GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AAAT--CC----ACTG-TA--AAC-A-A-agggggagtactctgaaaaatattggtgggggtttaaatgtgtgtcccgaaccccttcgctatcgtagactaaattttatgtcaatttgtaaacccattgtacatagagcgatattctaaaaatatacaccccttcatagaattcttacatgaatataagttttatgtgtatgtttacacagcaatcggtgataattaacaacttaaggaggacaaaaaggctgcttccttcacacaagtcggtgattgtccttgatgtaacactaaacctcattatagacttgtttacatctacacttattcagacaagggttaaattataaaatccactgtaaacaa
gi|12 : gagggggaggaactctgaaaaatattggatC-T---CTAAAG-AA--T-ATTG--CG----GGGG------------TCAA-----A-TG----TT-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-A-TAGA-T-----TA--A------A-TGCAAGTTATGTAACCC-CA---------T-G----TA-G-AAC---GA-TATTTCT-A-A-A------G-GTGTACACT-C-CT--T---C--ATAGA-A--CTCTTAT--A----T--GAATAT--A---A---G---ATTTA--------T-ATG-T---TTG----ATT-A-C--AC---AG--TAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCT-------AC------ACG----------------------------------------GGTATC----TC-TAG--G-ACC-A------------G----TAG--------TT---TCA-AT--ATAC-------C------CC-----C-TA-T--A-AAGAC---AC-T----GAAATTGT-TAAATTTAAT---TA---TA-TACC--CC----ATTG-TA--GACAA-A-A--TC-TGGGG--GGAAAAATCA-AAACCC----C-GTTTG-TCTGA-----ACCC--------CCT---------GCC---------------A---C--------------C
gi|13 : --GGGGTAC-TATTCTGAAATAA--T-ATTGGGTA----GGGG-----------TTCGA-----AGTG----TGAGG----TCCCGAACCCT-AA-C-C--ATC-G-TAGATC-----TA--GA------------ATTTCTTAATCCACGT--------TAG----TA-GGACC---GA-TATGTCTAA-A-A------A-G-A-------------T---T--ATAAT-A--C---C-T--A----CTTGCAT-T--A---T---AACTTCTT---G--TT-C-TTA-T---ATGCGATATTAA-G--ATTTGAG--CAA---TCGAGTTT-GATA--ATTAATTATAAAA--AT-TTT-A-G-AGAGGTATTA-AAAAGGC-T-GTTTCC-GCT--GCAC------AGGC-T-T-------------------TAGCGCGTAT--A--CGGTG-A----TG-TAA--C-G-C-A-G-TAGTA--T-G----TAGACCTTGTTTT---TC--ATACATA--------G------CCGT---C-T--TTCA-GA-AC---GC-TGACAGG----GT-TA-----TATTAATA---TA-CATC--CA----ATTG-TAAGAAC-A-A-taatataaagtgag
gi|14 : G--GGGGTAC-T---CTAAAA-AAA-T-ATTAGGAG----GGGGG-GGGGGGGTGTTCAA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATA-T-TAGA-CTACGGTA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAA-CC-CAT--------T-G----TA-A-ACC---GA-TA-TTCT-A-A-A------G-AT--ACCCAGC-CC--T---TC-ATTGA-ACTC---TTT--AT---T--GAATAT--A---------------A--GT-TT-T-ATG-T---ATA----ATT-A-C--TC---AG--CAA---TC-AG--T-GACA--ATGAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATTAAAAAAGGC-T-GTTTCCTAC---ACACGT----ATAC-A-T------------------GTAG-GTATA-AAAC-CAG--TA----TG-TAA--C-ACCAA-A-CCTCATTT-A----TAGA-CTTG-TCT---TC--AT--ACA--------
gi|15 : gaaT--A----T--GAATAC--A---C---AC--TCCTAT-A--TC-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---CC-AG--T-GATA--ACTAACT-----G--TT-TTT-G-G-AGA---ATT--CAAAGGC-T-GTTTCTTGC---ACAC------AT------------------------ATAG-GTG-ATTGAC-AAGTAT-----T--TAA--C-ACC-A-------T--T-A----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CG-----A-TA-TTCA-G--AT---TC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TA-ATCC--CC----ATTG-TA--GATAA-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AACCCCG---T-ATT---TCAGA-----ACCC--------CC
gi|16 : ataTC-G-TAGA-C-----TATAAATTT-TA-TGTCAATTT----------------------G----TA-G-ACC---GA-TATT-CTAA-A-A------A--TA--TACA-T-TT--T---TTCATAGG-C--C---TCT-------------TAT--A---TGA-A---TGAAA--GA-TT-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AT--T-GATA--ATTAAA------A--AA-TTT-A-GAAGG---ATT--AAAAGGCTT-TTTTCCT-----GCAC------AG---G-T------------------ATAG-GTG-ACTAAC-CAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA-CATG-GTTAAATT--AT--ATA--------C------CT-----C-AA-TGTA-GACAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|16 : -TA-TGTA-GACAT------------G----GT-TA-----AAT---TA---TA-TACC--TC----AATG-TA--GAC-A-A-A--AC-TA--A--AAAAAAATC--AAACTC----C-TTTCG-TCTCA-----ACCC--------CCT---------ACC---------------A---C--------------Caaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|17 : tcgtagactataaattttatgtcaatttgtagaccgatattctaaaaatatacattttttcataggcctcttatatgaatgaaagatttatgtatgattacacagcaatcattgataattaaaaaatttagaaggattaaaaggcttttttcctgcacaggtataggtgactaaccagtagGGGGGAGGG--GGGATGC-TTT-CT-AAA-AA--TGATTGGGGG----TGGGG-G--------T-CGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TG--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TA-TTCT--------------ATC-ATAGA---TC--TGAAT--ATAAA-A--C---CTTTAA----C---AATGC--A---TGTGA---TCTTA--G--Ttaata
gi|18 : cc-CCCTA--TTA----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------CAATTACCC-----C-TA-TTCA-GACTC----T-T-----------T-TG-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATAG-TA--GACAA-A-A--T---------CAGAAAGTCAGAAAC------------------A-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCaaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|19 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccT--A----C--AAATAT--A---T----------CA--G--TTCT-ATA-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--GAA---TC-AG--T-GATA--GTTAAC------A--AT-TTTAA-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-TTTTCCT-----GCAC------ATGC-A-C------------------ATAA-ATGT-TTGAC-CAG--TA----TG-TAATTC-ACCAA-A-CCCCAT-T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--gaat
gi|2 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaGGGGGGGGTCGCGGT-C-T---CTGAAA-AG--TCATTGGCTG----AGGAGCG--------TTCGACAACAA-TGCCAATG-GG----TCC-GAACCCC-TAAC-CCCATC-GCTAGA-C-----TA--AATTT--A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------TAG----TA-GCACCCGCGT-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAAA-A--C---CGT--A----C--GAATAT--A---T---A---TATTACTG--TT-T-ATA-T---ATG----ATT-AAC--AC---AG--ACA---TC-AG--T-GATA--ATGAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ACGCCA-C------------------AAAA-ATGTCTTGAC-CAGTATA----TGCTAAT-C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCAAGACAC---AC-T----GC----GCGTC-----AATA--TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A----TC-T---G--CCAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----TCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT-----TATCGCAAT-CAGAATAAT--GAATT---------GGCT-G--GC---GA--A--A----------TA--AAGAGTAA-CC---ATATTTTTGGCAGAGCTC-AGTAGACGCTAAAT-TACGTGT--A--TAACAGTAAAA--C-TATATGCCTATT-T---GAATTTAGC-GTCAT-TTG-ATC--ATGG-CACTGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GACACTTTCAAACAAACATA------AAACTATGCTTTGAAGCGAAGCATATCTATT
gi|20 : gaGGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGGAA-AA--T-ATT-GATGCCATGGGGA-G--------TTGGA-----A-TG----TG-GA----TCCCGAACCCC-TA-C-CTTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGCCAA-TTTGTAACTC-CAT--------T-A----TA-G-ACC---GA-TATTTTT---A-A------A-AT--GCACA-C-CCCTT---C--ATAG
gi|21 : -A-A-CCCTA--T-GA---TAGA-CTTG-ATT---TC--AC--GTA--------C------CCCTAGGC-TA-TTCA-G--AC---AC-T----GG----A--TA-----AAT---TA---TA-AA-C--CC----ATCG-TA--GACAA-A-A--TC-T---G--CAAAAAttaagttttatgtaagtaagt
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCCTAATT-A----TAGA-CTTG-ATT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TT---G-------AC-T----GG----A--TA-----AAT---TATTTTA-AACC--CCCATAATTG-TA--GAC-AGA-A--TC-T---G--CAAAAAATC---AACTC---------TG-TCAGA-------CC--------TCCGGGGTCAGACCC---------------CGTGC--------------ACCCCCACT----T
gi|25 : -C-----TA--AATTT--A-TGTCAATGT-GTAACCC-CATGT------T-A----TA-G--CC---TA-TATTT-----A-A------A-ATA--CGCA-C-CC--T---TC-ATAAA-C--T---CTT--A----T----ATATGAA---T---A---TATAA--G-------AT--T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAATGCTC-AG--T-AGTT--ATGAGC------A--A
gi|3 : G----TG-GG----TCC---ACTCC-CA-C-CCCATCAG-TCGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTCAACC-CAT--------T-G----TA-G-A-C---GATTATT--TAA-A-A------A-AT--ATACA-C-CT--T---TCAATAGA-ACTC---TAT--A----C--GAA-AT--A---T--------------G--TT-T-ATGTT---ATG----ATT-ACC--AC---TGCTCAA---TC-AG--T-GATG--ATTAAC------AATAT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAA-GC-C-GTTTCCTGC---AC---------CGC-A-C------------------ATAA-GTG-ATTGAC-CAGTATT----GG-TAA--A-GCCAA-A-CCGCAT-T-A----TAG--CT---TTT---TC--AT---TA--------C------CC-----T-T--TTCA-GACAC-----------------GT-T------AAC---TA---T--------CC----ATAG-T---GAC-A-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AAACCCG-----GTTTG-TCAGAC----ACCCGCACCATGCCCTA-------CCC---------------C---CGCCAATATAAAGGACCCCCCCCTCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATCTATTTGTTTTAAT-TTGCAAT-TGGTACAATCAGAATT-GCACATCTAGTT-T--AT---G---A--A----------TG---GGGGTAA-TCAAAATA-TTA----AGAACATAAGCAG-C
gi|3 : TTAGC-GT-T--TTA-ACA--AT-GACA-TGA-CAAAG-TGGTTTTTTTTT---TT-------TA-ACTT--AAA-AA--ATA------AAA-TATGC--TAA---GGAA-ATATttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|30 : gtgggtccactcccaccccatcagtcgactaaattttatgtcaatttgtcaacccattgtagacgattatttaaaaaatatacacctttcaatagaactctatacgaaatatgtttatgttatgattaccactgctcaatcagtgatgattaacaatattttaggaggattaaaagccgtttcctgcaccgcacataagtgattgaccagtattggtaaagccaaaccgcattatagctttttcattacccttttcagacacgttaactatccatagtgacaaatctgcaaaaatcaaaacccggtttgtcagacacccgcaccatgccctacccccgccaatataaaggacccccccctccgcctcagggggtatcatttttaatttatctatttgttttaatttgcaattggtacaatcagaattgcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagc-ACACA-CTCC--T---TC-ATAGA-A--C------------------------------------TATT------TC-T-ATG-T---ATG----ATT-A-C--AC---AG--CAA---CC-AG--T-GAatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|4 : t------CC-----C-TA-TTCA-GACAC------T----GG-------TC-----AATA--TA---TACAACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-AAATC-T---G--CAAAAA-TCA-A--CCC----C-GTT-G-TCAGC-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCC
gi|4 : GA-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCGCCC-CT----TTCAGGGCATGGGG-CG-TTTTT-ATTGT---A-------GT----ATA-CG-AATACAGAATAAT--GAATT-G-------GGGT-ATCAT---GA-TA--AGGTACGTGTATA--AAGAGTAAGCC---ATA-T---GGCAG-GCCT-AGTAG-CGTAAAAT-TACGTGTAA---------TAA----C-TATAGGC-TATT-T---GAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAAGCTG------TTTT---TT-------G--ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATG---CGAA--GGAA-ATATCTATTtaaattaaagtgagcccccccccccccgcccctttcagggcatggggcgtttttattgtagtatacgaatacagaataatgaattggggtatcatgataaggtacgtgtataaagagtaagccatatggcaggcctagtagcgtaaaattacgtgtaataactataggctatttgaatttagcgtattgatcatgcatgacaaagctgttttttgactttcaaaaaataaaatatgcgaaggaaatatctatttaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : ccctattcagacactggtcaatatatacaaccccattgtagacaaaaatctgcaaaaatcaaccccgttgtcagcaccccccccccccccctaaattaaagt----TG-TAA--C-ACCGA-A-CCCCA--T-A-----AGG-C-----------C--AT-----------------------------TG-T--A-GAC------T-T----G------T-TA-----G-T---TA---TG-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TCTT---G--C--AAAATCA-AACTCC-------TTTG-ACAGAACAACACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCTCCACtaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : --------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCAC-------CACGCCTTTATCTAT-TTTTTTATT-T---G-------GT----A---CTCAAT-CCAAATT-T--GCATT-A-------GGTTTA--AT---GA--A--ATG--------TG--AAG-GTAA-TC---ATA-ATATA--AGA---T-ATAAG-AGTAAAACATATG-GCAGGTTTAGC-GTAA-ATT----TAC----ATC-ATTGACACT--GT-AC-A--TTA-ACT--AT------TGAGCACA-----------TTT---TT-------GA-ACTAAAAAA-AA--AAAAAAAATAAA-TATGC--TAAA--GGAA-ATATTCATTaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|7 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcgagtAA-AA--T-ATTGGTGGCC--GATGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCTCAAACCCC-TA-A-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-CA-TGTCAATTT-GTAACCC-CATAATGGCATT-G----TA-G-ATA---GA-TCATTCTAA-A-ATTAGTTA-ATT-ACACA-C-CCCTT---T--ATAGA-A--CT--CGT--A--------AATA-------------------A--G--TT-TTAAG-T---ATG----ATT-A-C--A-----G--C----------------------TAAC------A--AT----------------------AAGGC-T-GTTTCGTAC---GCACGTCATGAGGA-G-CGATGCAATAGATTCATCTATAG-GTG-ATTGAT-CA--ATA----TG-TAA--C-ACC-A-AACCCCA--TTG----TAGA-CTTG-TTT---TC--GA--ATA--------C------CC-----C-AA-TTCA-G--AC---AC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TG-AATC--CT----ATTG-TA--AAC-A-A-A---C-T---G--CAAAAAATCA-AACCCCGGACC-GTTTG-TTGAT-----ACCT--------CCC---------CCC---------------C---atgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|8 : AC-A---CTGAAA-AA--T-ATTGATTG----GGAT-----------TCCGA-----A-TG----TG-GG-----CACAAACCCC-TA-C-CCCATC-G-T-GA-C-----T-----TTC-TT-TGTCAA-TGTGTAACCC-TAG--------T-G----TA-C-ACG---AA-TA-TTCTAC-A-A------ATATA-ACACT-C-TT--T---TTCAAAGATA--CT--CTT--AATATG--GAATAT--A-------A---TG--A--G--TT-T--TG-TAAGATG----TTT-A-CAAAC---AG--CAA---TA-AG--T-GATAGTATTAAC------A-----TTT-A-G-GAG---AAT--AAAGGGC-C-GTT--CCGT---GCAC------AAGG-GAT------------------ATAG-GTAC-TCGACGCAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA--TTG-TTT---TTCAAT--ATGACCGCCGCC------CC-----C-TATTTCA-GAC-C---AC-T----GACATCGT-TA-----AAT---CA---TA-TACC--CC----AATG-TA--GACAA-A-A--TC-T---GGAAAAAAAATTA-AATCC-----C-GTTTG-TTTGA-----ACCC--------CCaaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|9 : GG--GGGATACAT---CCGAAA-A---T-ATTGGGGG----AGGGG-G--------GGGGG-----A-GG----TG-GGGGGGTCCT-AACCCCATA-TTCCCATT-G-TAGGGT-----TA--GATT---A-TGTCAATTT-GTAACCC-CAT--------T-G----TAAG-ACC---GA-TAATTCCTA-A-A------T-ATA--CACC-C-CT--T---C--ATTGA-A--C-----T--A----T--GAATAT--AAGTT---A---TTTTA--------T-GTG-T---ATG----TTT-A-C--AC---AG--CAA---TC-AG--TGGATT--ATTAACAATA--A--AT-TTT-A-G-GGG---TTT--AAAATGC-TGGTTTCCTGCCATGCA-------AGGC-A-T------------------CTAG-GTG-ATTGAC-CAGTA-G----TA-TA-----------------A--T-G----TAGA-CTTGTTTT---TC--AT---TA---------------CC-----C-TA-TTCA-GACACTGAACAT----GGT---TT-TA-----AAT---TA---AT-CACC--CC----ATTA---------A-A-A--TC-T---G--AAAAAACTCA-TAAACCG---TGGTTTG-TTTGA-----ATCC--------CTCTA-------TCT---------------G---C--------------CTCCCCAtacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CCTCCCCCCCGGGCCTCAGGAGTATCAATGTTCCTTTCATGCTATTTTTTTTTTAATTTGGTAGCGAATCAAATTTGCACATTAAGATTTAATGAAATGGGGTATTCATTAATATAAGATATAGAAAGGTAACAACCTGGGCAGGTATGGCGTAACTCAAGGGACATGACAGAAATTAATTTTTTTTTTTATATAACTTTGAAAAAATAAAGTATGCTAAAGGAAAGGGTATTCATATGTATTAATAGAATCAGGACAGAATTATCGAACCCCCCCGTAAAGAATACATAATATTGTCATTAGAAATGTCTGAAAAAAGCGGTAGAGCATCCTTATAATTTATGCACACAGGCTGCGTGGCGTGATACGCGTTTTCCCGCCTATTGACATTTGACACGCATATATAGGATTAAGGTAATTTAATTTGGCGACGCGGTGTGCAATACATTT
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG
Alignments
lowQualScore : 111 1111111 11111111111 1 11111111 111 111 111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 333333333333333333333333 1 11111111 222222 11111 222222222 3333333333333333333333333333333333 1111 444444444444444444444444 111 11 77777777777777777777777777777777777777777777 111 1111111 222222 1 2222222222 444444 22222 1111 222222 2222222222 111 2222222222 111111 22222222
lowQualScore : 66 2 3 111 3 77 6 1111111 88888888888 99999 3 7777 3 7777 3 3 3 3 3 3 5 77777 33 77 2 2 9 1 2 44444444 5 6666 2 5 555 2 5 1 222 2 888888 2 888 2 2 77 999999 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 5 5555 444 5 5 33 444 33 444 2 33 2 444 777777 33 3 3 2 3 555 77 3 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 4 444 55 888 555555555555555 99999 2 2 2 888888888888888888888888 777777 999 444 44 33 5555 2 33 2 2 2 33 2 11111111 55 0 0 555555 1 3 2 00000 99999999 000000000 1111111111111111111111111111111111 3 4444 5 3 5 11 8 6 8 999999999999999999999999 222 0 11 1 00000000000000000000000000000000000000000000 3 8 444 7777777 444444 8 44 0 3 9999999999 000000 33 8 88888 6 7777 6 99 222222 6 8888888888 111 1111111111 3 6 99 999999 6 55555555 8
lowQualScore : .. . . ... . .. . ....... ........... ..... . .... . .... . . . . . . . ..... .. .. . . . . . ........ . .... . . ... . . . ... . ...... . ... . . .. ...... . ................................................... . . .... ... . . .. ... .. ... . .. . ... ...... .. . . . . ... .. . . .................................................................................................... . . ... .. ... ............... ..... . . . ........................ ...... ... ... .. .. .... . .. . . . .. . ........ .. . . ...... . . . ..... ........ ......... .................................. . .... . . . .. . . . ........................ ... . .. . ............................................ . . ... ....... ...... . .. . . .......... ...... .. . ..... . .... . .. ...... . .......... ... .......... . . .. ...... . ........ .
lowQualScore : 11 3 6 444 3 99 7 7777777 77777777777 11111 6 1111 3 1111 8 3 3 3 1 1 7 11111 99 11 9 0 6 9 9 33333333 7 1111 9 7 000 9 2 5 888 9 222222 9 111 7 7 33 777777 9 000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 7777 777 3 3 77 777 77 777 7 77 7 999 111111 99 1 1 3 1 444 33 1 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 7 111 66 222 444444444444444 77777 4 4 4 000000000000000000000000 333333 444 444 44 44 3333 5 44 5 5 5 99 9 44444444 44 4 2 555555 5 1 0 00000 77777777 888888888 2222222222222222222222222222222222 1 2222 6 8 0 88 0 0 0 222222222222222222222222 666 8 00 0 88888888888888888888888888888888888888888888 8 0 000 8888888 000000 0 22 0 2 5555555555 888888 55 8 55555 7 8888 7 22 333333 7 3333333333 777 7777777777 5 7 22 222222 7 77777777 0
consensus : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-G-------GG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CC---ATA-TTATGGCAGAGCCT-AGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
Reference ( family-1411 ) : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-G-------GG-TTA--AT---GATAAG---------TG----AAGAGTAA-CC---ATA-TTATGGCAGAGCCT-AGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
gi|1 : GGGAGGGGG--GGGGT-C-T----TGAGA-AAGGT-AGTG-TTG----AGAAG-G--------TTC-A-----A-TG----TG-GG----TCC-GAACCCG-TA-T-CC-ATC-G-TAGA-C-----TA--ATTTTGTATTGTCAA-TTTGT---CC-CAT--------T-G----TA-G-CCT------TATTTCTAACATA------A-ATA-CGCCA-C-CC--T---C--ATAAA-AT-T---CGT--AGC----G-ATAT------T---A---GTTTACTGTTTT-T-ATGCTATT----AT---TGA-TT--C---AT--TGA---TC-AG--T-G-T---ATT-AC------A--ATATTT-A---AGG---ATT---AAAGGC-T-GTTTCCTG--------------ACCC-G-C------------------AAGA-ATGT-TTGA--CAGAATATTATTA-TGA--CTACC-ACA-CTCCT--T-GCTTCTAGA-TCTA-TTT---T---ATA-ATA--------C------CC-----CTTA-TTGA-GACAC----T-T----AG----GT-C------AAC---TA---TA-CACCAATC-----TTGATA--GAC-A-ATA--TC-T---G-----AAAATC--ATAC------C-GTTTGTTCAG------ACCC--------CCC---------CCCGATGATACAGTGGAGT---C--------------CCCC---CT----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGA-------GT----ATACTG-AAT-C--AAGAAT--GTGTTGG-------GG-TTA--ATTCAGATTAG---------TATGATAAGAGAAC-CC---ATA-TTGTGGCAG---CT-TGTAG-CGTT-AAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGT-AATTTGAATCATAT-G-C--TGA-CAAA--TG------TCTTGGGTT-------GA-AC-TTCAAA-AA--ATA------TAA-TATGC--TGAAACGGAA-ATATC
gi|10 : TTTAGC-GT-A--T-----C--AT-GGCA-TGA-CAAC--TG------TTTC---TCAAAGAAGGA-ACTTTCCAA-A-----A------AAA-TATGCTTCAAAGctaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|11 : aggggtatcatattatttattttatttatctatttattgtaggggtcagaatttgcaattaggtaatgaagatatacaaaaaaacaagcataggGAGGGG--GAGGAAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGATG----gatacgtttgatcctctatatccattatgtaaacaaatcatgtcaaaatatcacatacaaaaattagatagaaggtctgaaagaaaagatataatttatatatccttatatttatgaacaggctgcgcgtctataacgtgattttttcccctatgacctttgacacgcatattattaggtaattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaacatc
gi|11 : GAGGG--GGAGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGT-------GGGG-G--------TTTAA-----A-TG----TG-TG----TCCCGAACCCC-TT-C-GCTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAAACC-CAT--------T-GTACATA-G-AGC---GA-TA-TTCT-A-A-A------A-ATATACACC-C-CT--T---C--ATAGA-AT-T---CTT--A-CAT--GAATAT--A---A---G---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-GG--T-GATA--ATTAAC------A--AC-TTA-AGG-AGG---ACA--AAAAGGC-T-GCTTCCTTC---ACAC------AAG------------------------TCG-GTG-ATTGTC-C--TTGA----TG-TAA--C-ACTAA-A-CCTCAT-T-A----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--CTA--------C------AC-----T-TA-TTCA-GACA----A-------GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AAAT--CC----ACTG-TA--AAC-A-A-agggggagtactctgaaaaatattggtgggggtttaaatgtgtgtcccgaaccccttcgctatcgtagactaaattttatgtcaatttgtaaacccattgtacatagagcgatattctaaaaatatacaccccttcatagaattcttacatgaatataagttttatgtgtatgtttacacagcaatcggtgataattaacaacttaaggaggacaaaaaggctgcttccttcacacaagtcggtgattgtccttgatgtaacactaaacctcattatagacttgtttacatctacacttattcagacaagggttaaattataaaatccactgtaaacaa
gi|12 : gagggggaggaactctgaaaaatattggatC-T---CTAAAG-AA--T-ATTG--CG----GGGG------------TCAA-----A-TG----TT-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-A-TAGA-T-----TA--A------A-TGCAAGTTATGTAACCC-CA---------T-G----TA-G-AAC---GA-TATTTCT-A-A-A------G-GTGTACACT-C-CT--T---C--ATAGA-A--CTCTTAT--A-T----GAATAT--A---A---G---ATTTA--------T-ATG-TTTG----AT---T-A-CA--C---AG--TAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCT-------AC------ACG----------------------------------------GGTATC----TC-TAG--G-ACC-A------------G----TAG--------TT---TCA-AT--ATAC-------C------CC-----C-TA-T--A-AAGAC---AC-T----GAAATTGT-TAAATTTAAT---TA---TA-TACC--CC----ATTG-TA--GACAA-A-A--TC-TGGGG--GGAAAAATCA-AAACCC----C-GTTTG-TCTGA-----ACCC--------CCT---------GCC---------------A---C--------------C
gi|13 : --GGGGTAC-TATTCTGAAATAA--T-ATTGGGTA----GGGG-----------TTCGA-----AGTG----TGAGG----TCCCGAACCCT-AA-C-C--ATC-G-TAGATC-----TA--GA------------ATTTCTTAATCCACGT--------TAG----TA-GGACC---GA-TATGTCTAA-A-A------A-G-A-------------T---T--ATAAT-A--C---C-T--A-CTT--GCAT-T--A---T---AACTTCTT---G--TT-C-TTA-TATGCGATAT---TAA-GA--TTTGAG--CAA---TCGAGTTT-GATA--ATTAATTATAAAA--AT-TTT-A-G-AGAGGTATTA-AAAAGGC-T-GTTTCC-GCT--GCAC------AGGC-T-T-------------------TAGCGCGTAT--A--CGGTG-A----TG-TAA--C-G-C-A-G-TAGTA--T-G----TAGACCTTGTTTT---TC--ATACATA--------G------CCGT---C-T--TTCA-GA-AC---GC-TGACAGG----GT-TA-----TATTAATA---TA-CATC--CA----ATTG-TAAGAAC-A-A-taatataaagtgag
gi|14 : G--GGGGTAC-T---CTAAAA-AAA-T-ATTAGGAG----GGGGG-GGGGGGGTGTTCAA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATA-T-TAGA-CTACGGTA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAA-CC-CAT--------T-G----TA-A-ACC---GA-TA-TTCT-A-A-A------G-AT--ACCCAGC-CC--T---TC-ATTGA-ACTC---TTT--ATT----GAATAT--A---------------A--GT-TT-T-ATG-TATA----AT---T-A-CT--C---AG--CAA---TC-AG--T-GACA--ATGAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATTAAAAAAGGC-T-GTTTCCTAC---ACACGT----ATAC-A-T------------------GTAG-GTATA-AAAC-CAG--TA----TG-TAA--C-ACCAA-A-CCTCATTT-A----TAGA-CTTG-TCT---TC--AT--ACA--------
gi|15 : gaaT--A-T----GAATAC--A---C---AC--TCCTAT-A--TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GATA--ACTAACT-----G--TT-TTT-G-G-AGA---ATT--CAAAGGC-T-GTTTCTTGC---ACAC------AT------------------------ATAG-GTG-ATTGAC-AAGTAT-----T--TAA--C-ACC-A-------T--T-A----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CG-----A-TA-TTCA-G--AT---TC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TA-ATCC--CC----ATTG-TA--GATAA-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AACCCCG---T-ATT---TCAGA-----ACCC--------CC
gi|16 : ataTC-G-TAGA-C-----TATAAATTT-TA-TGTCAATTT----------------------G----TA-G-ACC---GA-TATT-CTAA-A-A------A--TA--TACA-T-TT--T---TTCATAGG-C--C---TCT------------TAT--A---TGA-A---TGAAA--GA-TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AT--T-GATA--ATTAAA------A--AA-TTT-A-GAAGG---ATT--AAAAGGCTT-TTTTCCT-----GCAC------AG---G-T------------------ATAG-GTG-ACTAAC-CAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA-CATG-GTTAAATT--AT--ATA--------C------CT-----C-AA-TGTA-GACAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|16 : -TA-TGTA-GACAT------------G----GT-TA-----AAT---TA---TA-TACC--TC----AATG-TA--GAC-A-A-A--AC-TA--A--AAAAAAATC--AAACTC----C-TTTCG-TCTCA-----ACCC--------CCT---------ACC---------------A---C--------------Caaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|17 : tcgtagactataaattttatgtcaatttgtagaccgatattctaaaaatatacattttttcataggcctcttatatgaatgaaagatttatgtatgattacacagcaatcattgataattaaaaaatttagaaggattaaaaggcttttttcctgcacaggtataggtgactaaccagtagGGGGGAGGG--GGGATGC-TTT-CT-AAA-AA--TGATTGGGGG----TGGGG-G--------T-CGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TG--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TA-TTCT--------------ATC-ATAGA---TC--TGAAT--ATAAA-A--C---CTTTAA-C-----AATGC--A---TGTGA---TCTTA--G--Ttaata
gi|18 : cc-CCCTA--TTA----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------CAATTACCC-----C-TA-TTCA-GACTC----T-T-----------T-TG-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATAG-TA--GACAA-A-A--T---------CAGAAAGTCAGAAAC------------------A-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCaaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|19 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccT--A-C----AAATAT--A---T----------CA--G--TTCT-ATA-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--GAA---TC-AG--T-GATA--GTTAAC------A--AT-TTTAA-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-TTTTCCT-----GCAC------ATGC-A-C------------------ATAA-ATGT-TTGAC-CAG--TA----TG-TAATTC-ACCAA-A-CCCCAT-T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--gaat
gi|2 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaGGGGGGGGTCGCGGT-C-T---CTGAAA-AG--TCATTGGCTG----AGGAGCG--------TTCGACAACAA-TGCCAATG-GG----TCC-GAACCCC-TAAC-CCCATC-GCTAGA-C-----TA--AATTT--A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------TAG----TA-GCACCCGCGT-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAAA-A--C---CGT--A-C----GAATAT--A---T---A---TATTACTG--TT-T-ATA-TATG----AT---T-AACA--C---AG--ACA---TC-AG--T-GATA--ATGAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ACGCCA-C------------------AAAA-ATGTCTTGAC-CAGTATA----TGCTAAT-C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCAAGACAC---AC-T----GC----GCGTC-----AATA--TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A----TC-T---G--CCAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----TCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT-----TATCGCAAT-CAGAATAAT--GAATT---------GG-CTG--GC---G--AAA---------TA----AAGAGTAA-CC---ATATTTTTGGCAGAGCTC-AGTAGACGCTAAAT-TACGTGT--A--TAACAGTAAAA--C-TATATGCCTATT-T---GAATTTAGC-GTCAT-TTG-ATC--ATGG-CACTGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GACACTTTCAAACAAACATA------AAACTATGCTTTGAAGCGAAGCATATCTATT
gi|20 : gaGGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGGAA-AA--T-ATT-GATGCCATGGGGA-G--------TTGGA-----A-TG----TG-GA----TCCCGAACCCC-TA-C-CTTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGCCAA-TTTGTAACTC-CAT--------T-A----TA-G-ACC---GA-TATTTTT---A-A------A-AT--GCACA-C-CCCTT---C--ATAG
gi|21 : -A-A-CCCTA--T-GA---TAGA-CTTG-ATT---TC--AC--GTA--------C------CCCTAGGC-TA-TTCA-G--AC---AC-T----GG----A--TA-----AAT---TA---TA-AA-C--CC----ATCG-TA--GACAA-A-A--TC-T---G--CAAAAAttaagttttatgtaagtaagt
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCCTAATT-A----TAGA-CTTG-ATT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TT---G-------AC-T----GG----A--TA-----AAT---TATTTTA-AACC--CCCATAATTG-TA--GAC-AGA-A--TC-T---G--CAAAAAATC---AACTC---------TG-TCAGA-------CC--------TCCGGGGTCAGACCC---------------CGTGC--------------ACCCCCACT----T
gi|25 : -C-----TA--AATTT--A-TGTCAATGT-GTAACCC-CATGT------T-A----TA-G--CC---TA-TATTT-----A-A------A-ATA--CGCA-C-CC--T---TC-ATAAA-C--T---CTT--A-T------ATATGAA---T---A---TATAA--G-------AT--TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAATGCTC-AG--T-AGTT--ATGAGC------A--A
gi|3 : G----TG-GG----TCC---ACTCC-CA-C-CCCATCAG-TCGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTCAACC-CAT--------T-G----TA-G-A-C---GATTATT--TAA-A-A------A-AT--ATACA-C-CT--T---TCAATAGA-ACTC---TAT--A-C----GAA-AT--A---T--------------G--TT-T-ATGTTATG----AT---T-ACCA--C---TGCTCAA---TC-AG--T-GATG--ATTAAC------AATAT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAA-GC-C-GTTTCCTGC---AC---------CGC-A-C------------------ATAA-GTG-ATTGAC-CAGTATT----GG-TAA--A-GCCAA-A-CCGCAT-T-A----TAG--CT---TTT---TC--AT---TA--------C------CC-----T-T--TTCA-GACAC-----------------GT-T------AAC---TA---T--------CC----ATAG-T---GAC-A-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AAACCCG-----GTTTG-TCAGAC----ACCCGCACCATGCCCTA-------CCC---------------C---CGCCAATATAAAGGACCCCCCCCTCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATCTATTTGTTTTAAT-TTGCAAT-TGGTACAATCAGAATT-GCACATCTAG-TTT--AT---G---AA---------TG-----GGGGTAA-TCAAAATA-TTA----AGAACATAAGCAG-C
gi|3 : TTAGC-GT-T--TTA-ACA--AT-GACA-TGA-CAAAG-TGGTTTTTTTTT---TT-------TA-ACTT--AAA-AA--ATA------AAA-TATGC--TAA---GGAA-ATATttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|30 : gtgggtccactcccaccccatcagtcgactaaattttatgtcaatttgtcaacccattgtagacgattatttaaaaaatatacacctttcaatagaactctatacgaaatatgtttatgttatgattaccactgctcaatcagtgatgattaacaatattttaggaggattaaaagccgtttcctgcaccgcacataagtgattgaccagtattggtaaagccaaaccgcattatagctttttcattacccttttcagacacgttaactatccatagtgacaaatctgcaaaaatcaaaacccggtttgtcagacacccgcaccatgccctacccccgccaatataaaggacccccccctccgcctcagggggtatcatttttaatttatctatttgttttaatttgcaattggtacaatcagaattgcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagc-ACACA-CTCC--T---TC-ATAGA-A--C-----------------------------------TATT------TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GAatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|4 : t------CC-----C-TA-TTCA-GACAC------T----GG-------TC-----AATA--TA---TACAACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-AAATC-T---G--CAAAAA-TCA-A--CCC----C-GTT-G-TCAGC-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCC
gi|4 : GA-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCGCCC-CT----TTCAGGGCATGGGG-CG-TTTTT-ATTGT---A-------GT----ATA-CG-AATACAGAATAAT--GAATT-G-------GG-GTATCAT---GATAAGGTACGTGTATA----AAGAGTAAGCC---ATA-T---GGCAG-GCCT-AGTAG-CGTAAAAT-TACGTGTAA---------TAA----C-TATAGGC-TATT-T---GAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAAGCTG------TTTT---TT-------G--ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATG---CGAA--GGAA-ATATCTATTtaaattaaagtgagcccccccccccccgcccctttcagggcatggggcgtttttattgtagtatacgaatacagaataatgaattggggtatcatgataaggtacgtgtataaagagtaagccatatggcaggcctagtagcgtaaaattacgtgtaataactataggctatttgaatttagcgtattgatcatgcatgacaaagctgttttttgactttcaaaaaataaaatatgcgaaggaaatatctatttaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : ccctattcagacactggtcaatatatacaaccccattgtagacaaaaatctgcaaaaatcaaccccgttgtcagcaccccccccccccccctaaattaaagt----TG-TAA--C-ACCGA-A-CCCCA--T-A-----AGG-C-----------C--AT-----------------------------TG-T--A-GAC------T-T----G------T-TA-----G-T---TA---TG-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TCTT---G--C--AAAATCA-AACTCC-------TTTG-ACAGAACAACACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCTCCACtaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : CCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCACCAC----------GCCTTTATCTAT-TTTTTTATT-T---G-------GT----A---CTCAAT-CCAAAT-TT--GCATT-A-------GGTTTA--AT---GAAATG---------TG----AAG-GTAA-TC---ATA-ATATA--AGA---T-ATAAG-AGTAAAACATATG-GCAGGTTTAGC-GTAA-ATT----TAC----ATC-ATTGACACT--GT-AC-A--TTA-ACT--AT------TGAGCACA-----------TTT---TT-------GA-ACTAAAAAA-AA--AAAAAAAATAAA-TATGC--TAAA--GGAA-ATATTCATTaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|7 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcgagtAA-AA--T-ATTGGTGGCC--GATGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCTCAAACCCC-TA-A-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-CA-TGTCAATTT-GTAACCC-CATAATGGCATT-G----TA-G-ATA---GA-TCATTCTAA-A-ATTAGTTA-ATT-ACACA-C-CCCTT---T--ATAGA-A--CT--CGT--A-------AATA-------------------A--G--TT-TTAAG-TATG----AT---T-A-CA-------G--C----------------------TAAC------A--AT----------------------AAGGC-T-GTTTCGTAC---GCACGTCATGAGGA-G-CGATGCAATAGATTCATCTATAG-GTG-ATTGAT-CA--ATA----TG-TAA--C-ACC-A-AACCCCA--TTG----TAGA-CTTG-TTT---TC--GA--ATA--------C------CC-----C-AA-TTCA-G--AC---AC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TG-AATC--CT----ATTG-TA--AAC-A-A-A---C-T---G--CAAAAAATCA-AACCCCGGACC-GTTTG-TTGAT-----ACCT--------CCC---------CCC---------------C---atgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|8 : AC-A---CTGAAA-AA--T-ATTGATTG----GGAT-----------TCCGA-----A-TG----TG-GG-----CACAAACCCC-TA-C-CCCATC-G-T-GA-C-----T-----TTC-TT-TGTCAATGT-GTAACCC-TAG--------T-G----TA-C-ACG---AA-TATT-CTAC-A-A------ATATA-ACACT-C-TT--T---TTCAAAGATA--CT--CTT--A-ATATGGAATAT--A-------A---TG--A--G--TT-T--TG-TAAG----ATGTTT-A-CAAAC---AG--CAA---TA-AG--T-GATAGTATTAAC------A-----TTT-A-G-GAG---AAT--AAAGGGC-C-GTT--CCGT---GCAC------AAGG-GAT------------------ATAG-GTAC-TCGACGCAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA--TTG-TTT---TTCAAT--ATGACCGCCGCC------CC-----C-TATTTCA-GAC-C---AC-T----GACATCGT-TA-----AAT---CA---TA-TACC--CC----AATG-TA--GACAA-A-A--TC-T---GGAAAAAAAATTA-AATCC-----C-GTTTG-TTTGA-----ACCC--------CCaaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|9 : GG--GGGATACAT---CCGAAA-A---T-ATTGGGGG----AGGGG-G--------GGGGG-----A-GG----TG-GGGGGGTCCT-AACCCCATA-TTCCCATT-G-TAGGGT-----TA--GATT---A-TGTCAATTT-GTAACCC-CAT--------T-G----TAAG-ACC---GA-TAATTCCTA-A-A------T-ATA--CACC-C-CT--T---C--ATTGA-A--C-----T--A-T----GAATAT--AAGTT---A---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--TGGATT--ATTAACAATA--A--AT-TTT-A-G-GGG---TTT--AAAATGC-TGGTTTCCTGCCATGCA-------AGGC-A-T------------------CTAG-GTG-ATTGAC-CAGTA-G----TA-TA-----------------A--T-G----TAGA-CTTGTTTT---TC--AT---TA---------------CC-----C-TA-TTCA-GACACTGAACAT----GGT---TT-TA-----AAT---TA---AT-CACC--CC----ATTA---------A-A-A--TC-T---G--AAAAAACTCA-TAAACCG---TGGTTTG-TTTGA-----ATCC--------CTCTA-------TCT---------------G---C--------------CTCCCCAtacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CCTCCCCCCCGGGCCTCAGGAGTATCAATGTTCCTTTCATGCTATTTTTTTTTTAATTTGGTAGCGAATCAAATTTGCACATTAAGATTTAATGAAATGGGGTATTCATTAATATAAGATATAGAAAGGTAACAACCTGGGCAGGTATGGCGTAACTCAAGGGACATGACAGAAATTAATTTTTTTTTTTATATAACTTTGAAAAAATAAAGTATGCTAAAGGAAAGGGTATTCATATGTATTAATAGAATCAGGACAGAATTATCGAACCCCCCCGTAAAGAATACATAATATTGTCATTAGAAATGTCTGAAAAAAGCGGTAGAGCATCCTTATAATTTATGCACACAGGCTGCGTGGCGTGATACGCGTTTTCCCGCCTATTGACATTTGACACGCATATATAGGATTAAGGTAATTTAATTTGGCGACGCGGTGTGCAATACATTT
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG
Alignments
lowQualScore : 111 1111111 11111111111 1 11111111 111 111 111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 333333333333333333333333 1 11111111 222222 11111 222222222 3333333333333333333333333333333333 1111 444444444444444444444444 111 11 11 11 5555555555555555555555555555 1 1111 2222 1 1 2222222222 444444 22222 1111 222222 2222222222 111 2222222222 111111 22222222
lowQualScore : 66 2 3 111 3 77 6 1111111 88888888888 99999 3 7777 3 7777 3 3 3 3 3 3 5 77777 33 77 2 2 9 1 2 44444444 5 6666 2 5 555 2 5 1 222 2 888888 2 888 2 2 77 999999 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 5 5555 444 5 5 33 444 33 444 2 33 2 444 777777 33 3 3 2 3 555 77 3 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 4 444 55 888 555555555555555 99999 2 2 2 888888888888888888888888 777777 999 444 44 33 5555 2 33 2 2 2 33 2 11111111 55 0 0 555555 1 3 2 00000 99999999 000000000 1111111111111111111111111111111111 3 4444 5 3 5 11 8 6 8 999999999999999999999999 222 0 11 1 11 00 3333333333333333333333333333 3 0 8888 2 7777 0 44 0 3 9999999999 000000 33 8 88888 6 7777 6 99 222222 6 8888888888 111 1111111111 3 6 99 999999 6 55555555 8
lowQualScore : .. . . ... . .. . ....... ........... ..... . .... . .... . . . . . . . ..... .. .. . . . . . ........ . .... . . ... . . . ... . ...... . ... . . .. ...... . ................................................... . . .... ... . . .. ... .. ... . .. . ... ...... .. . . . . ... .. . . .................................................................................................... . . ... .. ... ............... ..... . . . ........................ ...... ... ... .. .. .... . .. . . . .. . ........ .. . . ...... . . . ..... ........ ......... .................................. . .... . . . .. . . . ........................ ... . .. . .. .. ............................ . . .... . .... . .. . . .......... ...... .. . ..... . .... . .. ...... . .......... ... .......... . . .. ...... . ........ .
lowQualScore : 11 3 6 444 3 99 7 7777777 77777777777 11111 6 1111 3 1111 8 3 3 3 1 1 7 11111 99 11 9 0 6 9 9 33333333 7 1111 9 7 000 9 2 5 888 9 222222 9 111 7 7 33 777777 9 000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 7777 777 3 3 77 777 77 777 7 77 7 999 111111 99 1 1 3 1 444 33 1 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 7 111 66 222 444444444444444 77777 4 4 4 000000000000000000000000 333333 444 444 44 44 3333 5 44 5 5 5 99 9 44444444 44 4 2 555555 5 1 0 00000 77777777 888888888 2222222222222222222222222222222222 1 2222 6 8 0 88 0 0 0 222222222222222222222222 666 8 00 0 22 88 5555555555555555555555555555 2 0 0000 5 0000 0 22 0 2 5555555555 888888 55 8 55555 7 8888 7 22 333333 7 3333333333 777 7777777777 5 7 22 222222 7 77777777 0
consensus : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
Reference ( family-1411 ) : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTATGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
gi|1 : GGGAGGGGG--GGGGT-C-T----TGAGA-AAGGT-AGTG-TTG----AGAAG-G--------TTC-A-----A-TG----TG-GG----TCC-GAACCCG-TA-T-CC-ATC-G-TAGA-C-----TA--ATTTTGTATTGTCAA-TTTGT---CC-CAT--------T-G----TA-G-CCT------TATTTCTAACATA------A-ATA-CGCCA-C-CC--T---C--ATAAA-AT-T---CGT--AGC----G-ATAT------T---A---GTTTACTGTTTT-T-ATGCTATT----AT---TGA-TT--C---AT--TGA---TC-AG--T-G-T---ATT-AC------A--ATATTT-A---AGG---ATT---AAAGGC-T-GTTTCCTG--------------ACCC-G-C------------------AAGA-ATGT-TTGA--CAGAATATTATTA-TGA--CTACC-ACA-CTCCT--T-GCTTCTAGA-TCTA-TTT---T---ATA-ATA--------C------CC-----CTTA-TTGA-GACAC----T-T----AG----GT-C------AAC---TA---TA-CACCAATC-----TTGATA--GAC-A-ATA--TC-T---G-----AAAATC--ATAC------C-GTTTGTTCAG------ACCC--------CCC---------CCCGATGATACAGTGGAGT---C--------------CCCC---CT----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGA-------GT----ATACTG-AAT-C--AAGAAT--GTGTTGGGG-TTA--ATTCAGATTAG---------TATGATAAGAGAAC-CCATA-TTGTGGCAG---CTTGTAG-CGTT-AAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGT-AATTTGAATCATAT-G-C--TGA-CAAA--TG------TCTTGGGTT-------GA-AC-TTCAAA-AA--ATA------TAA-TATGC--TGAAACGGAA-ATATC
gi|10 : TTTAGC-GT-A--T-----C--AT-GGCA-TGA-CAAC--TG------TTTC---TCAAAGAAGGA-ACTTTCCAA-A-----A------AAA-TATGCTTCAAAGctaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|11 : aggggtatcatattatttattttatttatctatttattgtaggggtcagaatttgcaattaggtaatgaagatatacaaaaaaacaagcataggGAGGGG--GAGGAAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGATG----gatacgtttgatcctctatatccattatgtaaacaaatcatgtcaaaatatcacatacaaaaattagatagaaggtctgaaagaaaagatataatttatatatccttatatttatgaacaggctgcgcgtctataacgtgattttttcccctatgacctttgacacgcatattattaggtaattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaacatc
gi|11 : GAGGG--GGAGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGT-------GGGG-G--------TTTAA-----A-TG----TG-TG----TCCCGAACCCC-TT-C-GCTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAAACC-CAT--------T-GTACATA-G-AGC---GA-TA-TTCT-A-A-A------A-ATATACACC-C-CT--T---C--ATAGA-AT-T---CTT--A-CAT--GAATAT--A---A---G---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-GG--T-GATA--ATTAAC------A--AC-TTA-AGG-AGG---ACA--AAAAGGC-T-GCTTCCTTC---ACAC------AAG------------------------TCG-GTG-ATTGTC-C--TTGA----TG-TAA--C-ACTAA-A-CCTCAT-T-A----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--CTA--------C------AC-----T-TA-TTCA-GACA----A-------GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AAAT--CC----ACTG-TA--AAC-A-A-agggggagtactctgaaaaatattggtgggggtttaaatgtgtgtcccgaaccccttcgctatcgtagactaaattttatgtcaatttgtaaacccattgtacatagagcgatattctaaaaatatacaccccttcatagaattcttacatgaatataagttttatgtgtatgtttacacagcaatcggtgataattaacaacttaaggaggacaaaaaggctgcttccttcacacaagtcggtgattgtccttgatgtaacactaaacctcattatagacttgtttacatctacacttattcagacaagggttaaattataaaatccactgtaaacaa
gi|12 : gagggggaggaactctgaaaaatattggatC-T---CTAAAG-AA--T-ATTG--CG----GGGG------------TCAA-----A-TG----TT-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-A-TAGA-T-----TA--A------A-TGCAAGTTATGTAACCC-CA---------T-G----TA-G-AAC---GA-TATTTCT-A-A-A------G-GTGTACACT-C-CT--T---C--ATAGA-A--CTCTTAT--A-T----GAATAT--A---A---G---ATTTA--------T-ATG-TTTG----AT---T-A-CA--C---AG--TAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCT-------AC------ACG----------------------------------------GGTATC----TC-TAG--G-ACC-A------------G----TAG--------TT---TCA-AT--ATAC-------C------CC-----C-TA-T--A-AAGAC---AC-T----GAAATTGT-TAAATTTAAT---TA---TA-TACC--CC----ATTG-TA--GACAA-A-A--TC-TGGGG--GGAAAAATCA-AAACCC----C-GTTTG-TCTGA-----ACCC--------CCT---------GCC---------------A---C--------------C
gi|13 : --GGGGTAC-TATTCTGAAATAA--T-ATTGGGTA----GGGG-----------TTCGA-----AGTG----TGAGG----TCCCGAACCCT-AA-C-C--ATC-G-TAGATC-----TA--GA------------ATTTCTTAATCCACGT--------TAG----TA-GGACC---GA-TATGTCTAA-A-A------A-G-A-------------T---T--ATAAT-A--C---C-T--A-CTT--GCAT-T--A---T---AACTTCTT---G--TT-C-TTA-TATGCGATAT---TAA-GA--TTTGAG--CAA---TCGAGTTT-GATA--ATTAATTATAAAA--AT-TTT-A-G-AGAGGTATTA-AAAAGGC-T-GTTTCC-GCT--GCAC------AGGC-T-T-------------------TAGCGCGTAT--A--CGGTG-A----TG-TAA--C-G-C-A-G-TAGTA--T-G----TAGACCTTGTTTT---TC--ATACATA--------G------CCGT---C-T--TTCA-GA-AC---GC-TGACAGG----GT-TA-----TATTAATA---TA-CATC--CA----ATTG-TAAGAAC-A-A-taatataaagtgag
gi|14 : G--GGGGTAC-T---CTAAAA-AAA-T-ATTAGGAG----GGGGG-GGGGGGGTGTTCAA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATA-T-TAGA-CTACGGTA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAA-CC-CAT--------T-G----TA-A-ACC---GA-TA-TTCT-A-A-A------G-AT--ACCCAGC-CC--T---TC-ATTGA-ACTC---TTT--ATT----GAATAT--A---------------A--GT-TT-T-ATG-TATA----AT---T-A-CT--C---AG--CAA---TC-AG--T-GACA--ATGAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATTAAAAAAGGC-T-GTTTCCTAC---ACACGT----ATAC-A-T------------------GTAG-GTATA-AAAC-CAG--TA----TG-TAA--C-ACCAA-A-CCTCATTT-A----TAGA-CTTG-TCT---TC--AT--ACA--------
gi|15 : gaaT--A-T----GAATAC--A---C---AC--TCCTAT-A--TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GATA--ACTAACT-----G--TT-TTT-G-G-AGA---ATT--CAAAGGC-T-GTTTCTTGC---ACAC------AT------------------------ATAG-GTG-ATTGAC-AAGTAT-----T--TAA--C-ACC-A-------T--T-A----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CG-----A-TA-TTCA-G--AT---TC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TA-ATCC--CC----ATTG-TA--GATAA-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AACCCCG---T-ATT---TCAGA-----ACCC--------CC
gi|16 : ataTC-G-TAGA-C-----TATAAATTT-TA-TGTCAATTT----------------------G----TA-G-ACC---GA-TATT-CTAA-A-A------A--TA--TACA-T-TT--T---TTCATAGG-C--C---TCT------------TAT--A---TGA-A---TGAAA--GA-TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AT--T-GATA--ATTAAA------A--AA-TTT-A-GAAGG---ATT--AAAAGGCTT-TTTTCCT-----GCAC------AG---G-T------------------ATAG-GTG-ACTAAC-CAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA-CATG-GTTAAATT--AT--ATA--------C------CT-----C-AA-TGTA-GACAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|16 : -TA-TGTA-GACAT------------G----GT-TA-----AAT---TA---TA-TACC--TC----AATG-TA--GAC-A-A-A--AC-TA--A--AAAAAAATC--AAACTC----C-TTTCG-TCTCA-----ACCC--------CCT---------ACC---------------A---C--------------Caaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|17 : tcgtagactataaattttatgtcaatttgtagaccgatattctaaaaatatacattttttcataggcctcttatatgaatgaaagatttatgtatgattacacagcaatcattgataattaaaaaatttagaaggattaaaaggcttttttcctgcacaggtataggtgactaaccagtagGGGGGAGGG--GGGATGC-TTT-CT-AAA-AA--TGATTGGGGG----TGGGG-G--------T-CGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TG--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TA-TTCT--------------ATC-ATAGA---TC--TGAAT--ATAAA-A--C---CTTTAA-C-----AATGC--A---TGTGA---TCTTA--G--Ttaata
gi|18 : cc-CCCTA--TTA----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------CAATTACCC-----C-TA-TTCA-GACTC----T-T-----------T-TG-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATAG-TA--GACAA-A-A--T---------CAGAAAGTCAGAAAC------------------A-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCaaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|19 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccT--A-C----AAATAT--A---T----------CA--G--TTCT-ATA-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--GAA---TC-AG--T-GATA--GTTAAC------A--AT-TTTAA-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-TTTTCCT-----GCAC------ATGC-A-C------------------ATAA-ATGT-TTGAC-CAG--TA----TG-TAATTC-ACCAA-A-CCCCAT-T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--gaat
gi|2 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaGGGGGGGGTCGCGGT-C-T---CTGAAA-AG--TCATTGGCTG----AGGAGCG--------TTCGACAACAA-TGCCAATG-GG----TCC-GAACCCC-TAAC-CCCATC-GCTAGA-C-----TA--AATTT--A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------TAG----TA-GCACCCGCGT-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAAA-A--C---CGT--A-C----GAATAT--A---T---A---TATTACTG--TT-T-ATA-TATG----AT---T-AACA--C---AG--ACA---TC-AG--T-GATA--ATGAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ACGCCA-C------------------AAAA-ATGTCTTGAC-CAGTATA----TGCTAAT-C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCAAGACAC---AC-T----GC----GCGTC-----AATA--TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A----TC-T---G--CCAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----TCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT-----TATCGCAAT-CAGAATAAT--GAATT--GG-CTG--GC---G--AAA---------TA----AAGAGTAA-CCATATTTTTGGCAGAGCTCAGTAGACGCTAAAT-TACGTGT--A--TAACAGTAAAA--C-TATATGCCTATT-T---GAATTTAGC-GTCAT-TTG-ATC--ATGG-CACTGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GACACTTTCAAACAAACATA------AAACTATGCTTTGAAGCGAAGCATATCTATT
gi|20 : gaGGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGGAA-AA--T-ATT-GATGCCATGGGGA-G--------TTGGA-----A-TG----TG-GA----TCCCGAACCCC-TA-C-CTTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGCCAA-TTTGTAACTC-CAT--------T-A----TA-G-ACC---GA-TATTTTT---A-A------A-AT--GCACA-C-CCCTT---C--ATAG
gi|21 : -A-A-CCCTA--T-GA---TAGA-CTTG-ATT---TC--AC--GTA--------C------CCCTAGGC-TA-TTCA-G--AC---AC-T----GG----A--TA-----AAT---TA---TA-AA-C--CC----ATCG-TA--GACAA-A-A--TC-T---G--CAAAAAttaagttttatgtaagtaagt
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCCTAATT-A----TAGA-CTTG-ATT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TT---G-------AC-T----GG----A--TA-----AAT---TATTTTA-AACC--CCCATAATTG-TA--GAC-AGA-A--TC-T---G--CAAAAAATC---AACTC---------TG-TCAGA-------CC--------TCCGGGGTCAGACCC---------------CGTGC--------------ACCCCCACT----T
gi|25 : -C-----TA--AATTT--A-TGTCAATGT-GTAACCC-CATGT------T-A----TA-G--CC---TA-TATTT-----A-A------A-ATA--CGCA-C-CC--T---TC-ATAAA-C--T---CTT--A-T------ATATGAA---T---A---TATAA--G-------AT--TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAATGCTC-AG--T-AGTT--ATGAGC------A--A
gi|3 : G----TG-GG----TCC---ACTCC-CA-C-CCCATCAG-TCGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTCAACC-CAT--------T-G----TA-G-A-C---GATTATT--TAA-A-A------A-AT--ATACA-C-CT--T---TCAATAGA-ACTC---TAT--A-C----GAA-AT--A---T--------------G--TT-T-ATGTTATG----AT---T-ACCA--C---TGCTCAA---TC-AG--T-GATG--ATTAAC------AATAT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAA-GC-C-GTTTCCTGC---AC---------CGC-A-C------------------ATAA-GTG-ATTGAC-CAGTATT----GG-TAA--A-GCCAA-A-CCGCAT-T-A----TAG--CT---TTT---TC--AT---TA--------C------CC-----T-T--TTCA-GACAC-----------------GT-T------AAC---TA---T--------CC----ATAG-T---GAC-A-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AAACCCG-----GTTTG-TCAGAC----ACCCGCACCATGCCCTA-------CCC---------------C---CGCCAATATAAAGGACCCCCCCCTCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATCTATTTGTTTTAAT-TTGCAAT-TGGTACAATCAGAATT-G
gi|3 : TTAGC-GT-T--TTA-ACA--AT-GACA-TGA-CAAAG-TGGTTTTTTTTT---TT-------TA-ACTT--AAA-AA--ATA------AAA-TATGC--TAA---GGAA-ATATcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagcttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|30 : gtgggtccactcccaccccatcagtcgactaaattttatgtcaatttgtcaacccattgtagacgattatttaaaaaatatacacctttcaatagaactctatacgaaatatgtttatgttatgattaccactgctcaatcagtgatgattaacaatattttaggaggattaaaagccgtttcctgcaccgcacataagtgattgaccagtattggtaaagccaaaccgcattatagctttttcattacccttttcagacacgttaactatccatagtgacaaatctgcaaaaatcaaaacccggtttgtcagacacccgcaccatgccctacccccgccaatataaaggacccccccctccgcctcagggggtatcatttttaatttatctatttgttttaatttgcaattggtacaatcagaattgcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagc-ACACA-CTCC--T---TC-ATAGA-A--C-----------------------------------TATT------TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GAatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|4 : t------CC-----C-TA-TTCA-GACAC------T----GG-------TC-----AATA--TA---TACAACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-AAATC-T---G--CAAAAA-TCA-A--CCC----C-GTT-G-TCAGC-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCC
gi|4 : GA-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCGCCC-CT----TTCAGGGCATGGGG-CG-TTTTT-ATTGT---A-------GT----ATA-CG-AATACAGAATAAT--GAATT-GGG-GTATCAT---GATAAGGTACGTGTATA----AAGAGTAAGCCATA-T---GGCAG-GCCTAGTAG-CGTAAAAT-TACGTGTAA---------TAA----C-TATAGGC-TATT-T---GAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAAGCTG------TTTT---TT-------G--ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATG---CGAA--GGAA-ATATCTATTtaaattaaagtgagcccccccccccccgcccctttcagggcatggggcgtttttattgtagtatacgaatacagaataatgaattggggtatcatgataaggtacgtgtataaagagtaagccatatggcaggcctagtagcgtaaaattacgtgtaataactataggctatttgaatttagcgtattgatcatgcatgacaaagctgttttttgactttcaaaaaataaaatatgcgaaggaaatatctatttaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : ccctattcagacactggtcaatatatacaaccccattgtagacaaaaatctgcaaaaatcaaccccgttgtcagcaccccccccccccccctaaattaaagt----TG-TAA--C-ACCGA-A-CCCCA--T-A-----AGG-C-----------C--AT-----------------------------TG-T--A-GAC------T-T----G------T-TA-----G-T---TA---TG-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TCTT---G--C--AAAATCA-AACTCC-------TTTG-ACAGAACAACACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCTCCACtaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : CCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCACCAC----------GCCTTTATCTAT-TTTTTTATT-T---G-------GT----A---CTCAAT-CCAAAT-TT--GCATT-AGGTTTA--AT---GAAATG---------TG----AAG-GTAA-TCATA-ATATA--AGA---TATAAG-AGTAAAACATATG-GCAGGTTTAGC-GTAA-ATT----TAC----ATC-ATTGACACT--GT-AC-A--TTA-ACT--AT------TGAGCACA-----------TTT---TT-------GA-ACTAAAAAA-AA--AAAAAAAATAAA-TATGC--TAAA--GGAA-ATATTCATTaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|7 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcgagtAA-AA--T-ATTGGTGGCC--GATGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCTCAAACCCC-TA-A-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-CA-TGTCAATTT-GTAACCC-CATAATGGCATT-G----TA-G-ATA---GA-TCATTCTAA-A-ATTAGTTA-ATT-ACACA-C-CCCTT---T--ATAGA-A--CT--CGT--A-------AATA-------------------A--G--TT-TTAAG-TATG----AT---T-A-CA-------G--C----------------------TAAC------A--AT----------------------AAGGC-T-GTTTCGTAC---GCACGTCATGAGGA-G-CGATGCAATAGATTCATCTATAG-GTG-ATTGAT-CA--ATA----TG-TAA--C-ACC-A-AACCCCA--TTG----TAGA-CTTG-TTT---TC--GA--ATA--------C------CC-----C-AA-TTCA-G--AC---AC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TG-AATC--CT----ATTG-TA--AAC-A-A-A---C-T---G--CAAAAAATCA-AACCCCGGACC-GTTTG-TTGAT-----ACCT--------CCC---------CCC---------------C---atgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|8 : AC-A---CTGAAA-AA--T-ATTGATTG----GGAT-----------TCCGA-----A-TG----TG-GG-----CACAAACCCC-TA-C-CCCATC-G-T-GA-C-----T-----TTC-TT-TGTCAATGT-GTAACCC-TAG--------T-G----TA-C-ACG---AA-TATT-CTAC-A-A------ATATA-ACACT-C-TT--T---TTCAAAGATA--CT--CTT--A-ATATGGAATAT--A-------A---TG--A--G--TT-T--TG-TAAG----ATGTTT-A-CAAAC---AG--CAA---TA-AG--T-GATAGTATTAAC------A-----TTT-A-G-GAG---AAT--AAAGGGC-C-GTT--CCGT---GCAC------AAGG-GAT------------------ATAG-GTAC-TCGACGCAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA--TTG-TTT---TTCAAT--ATGACCGCCGCC------CC-----C-TATTTCA-GAC-C---AC-T----GACATCGT-TA-----AAT---CA---TA-TACC--CC----AATG-TA--GACAA-A-A--TC-T---GGAAAAAAAATTA-AATCC-----C-GTTTG-TTTGA-----ACCC--------CCaaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|9 : GG--GGGATACAT---CCGAAA-A---T-ATTGGGGG----AGGGG-G--------GGGGG-----A-GG----TG-GGGGGGTCCT-AACCCCATA-TTCCCATT-G-TAGGGT-----TA--GATT---A-TGTCAATTT-GTAACCC-CAT--------T-G----TAAG-ACC---GA-TAATTCCTA-A-A------T-ATA--CACC-C-CT--T---C--ATTGA-A--C-----T--A-T----GAATAT--AAGTT---A---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--TGGATT--ATTAACAATA--A--AT-TTT-A-G-GGG---TTT--AAAATGC-TGGTTTCCTGCCATGCA-------AGGC-A-T------------------CTAG-GTG-ATTGAC-CAGTA-G----TA-TA-----------------A--T-G----TAGA-CTTGTTTT---TC--AT---TA---------------CC-----C-TA-TTCA-GACACTGAACAT----GGT---TT-TA-----AAT---TA---AT-CACC--CC----ATTA---------A-A-A--TC-T---G--AAAAAACTCA-TAAACCG---TGGTTTG-TTTGA-----ATCC--------CTCTA-------TCT---------------G---C--------------CTCCCCAtacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CCTCCCCCCCGGGCCTCAGGAGTATCAATGTTCCTTTCATGCTATTTTTTTTTTAATTTGGTAGCGAATCAAATTTGCACATTAAGATTTAATGAAATGGGGTATTCATTAATATAAGATATAGAAAGGTAACAACCTGGGCAGGTATGGCGTAACTCAAGGGACATGACAGAAATTAATTTTTTTTTTTATATAACTTTGAAAAAATAAAGTATGCTAAAGGAAAGGGTATTCATATGTATTAATAGAATCAGGACAGAATTATCGAACCCCCCCGTAAAGAATACATAATATTGTCATTAGAAATGTCTGAAAAAAGCGGTAGAGCATCCTTATAATTTATGCACACAGGCTGCGTGGCGTGATACGCGTTTTCCCGCCTATTGACATTTGACACGCATATATAGGATTAAGGTAATTTAATTTGGCGACGCGGTGTGCAATACATTT
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG
Alignments
lowQualScore : 111 1111111 11111111111 1 11111111 111 111 111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 333333333333333333333333 1 11111111 222222 11111 222222222 3333333333333333333333333333333333 1111 444444444444444444444444 111 11 11 11 5555555555555555555555555555 1 1111 2222 1 1 2222222222 444444 22222 1111 222222 2222222222 111 2222222222 111111 22222222
lowQualScore : 66 2 3 111 3 77 6 1111111 88888888888 99999 3 7777 3 7777 3 3 3 3 3 3 5 77777 33 77 2 2 9 1 2 44444444 5 6666 2 5 555 2 5 1 222 2 888888 2 888 2 2 77 999999 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 5 5555 444 5 5 33 444 33 444 2 33 2 444 777777 33 3 3 2 3 555 77 3 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 4 444 55 888 555555555555555 99999 2 2 2 888888888888888888888888 777777 999 444 44 33 5555 2 33 2 2 2 33 2 11111111 55 0 0 555555 1 3 2 00000 99999999 000000000 1111111111111111111111111111111111 3 4444 5 3 5 11 8 6 8 999999999999999999999999 222 0 11 1 11 00 3333333333333333333333333333 3 0 5555 2 7777 0 44 0 3 9999999999 000000 33 8 88888 6 7777 6 99 222222 6 8888888888 111 1111111111 3 6 99 999999 6 55555555 8
lowQualScore : .. . . ... . .. . ....... ........... ..... . .... . .... . . . . . . . ..... .. .. . . . . . ........ . .... . . ... . . . ... . ...... . ... . . .. ...... . ................................................... . . .... ... . . .. ... .. ... . .. . ... ...... .. . . . . ... .. . . .................................................................................................... . . ... .. ... ............... ..... . . . ........................ ...... ... ... .. .. .... . .. . . . .. . ........ .. . . ...... . . . ..... ........ ......... .................................. . .... . . . .. . . . ........................ ... . .. . .. .. ............................ . . .... . .... . .. . . .......... ...... .. . ..... . .... . .. ...... . .......... ... .......... . . .. ...... . ........ .
lowQualScore : 11 3 6 444 3 99 7 7777777 77777777777 11111 6 1111 3 1111 8 3 3 3 1 1 7 11111 99 11 9 0 6 9 9 33333333 7 1111 9 7 000 9 2 5 888 9 222222 9 111 7 7 33 777777 9 000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 7777 777 3 3 77 777 77 777 7 77 7 999 111111 99 1 1 3 1 444 33 1 1 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 4 7 111 66 222 444444444444444 77777 4 4 4 000000000000000000000000 333333 444 444 44 44 3333 5 44 5 5 5 99 9 44444444 44 4 2 555555 5 1 0 00000 77777777 888888888 2222222222222222222222222222222222 1 2222 6 8 0 88 0 0 0 222222222222222222222222 666 8 00 0 22 88 5555555555555555555555555555 2 0 2222 5 0000 0 22 0 2 5555555555 888888 55 8 55555 7 8888 7 22 333333 7 3333333333 777 7777777777 5 7 22 222222 7 77777777 0
consensus : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
Reference ( family-1411 ) : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
gi|1 : GGGAGGGGG--GGGGT-C-T----TGAGA-AAGGT-AGTG-TTG----AGAAG-G--------TTC-A-----A-TG----TG-GG----TCC-GAACCCG-TA-T-CC-ATC-G-TAGA-C-----TA--ATTTTGTATTGTCAA-TTTGT---CC-CAT--------T-G----TA-G-CCT------TATTTCTAACATA------A-ATA-CGCCA-C-CC--T---C--ATAAA-AT-T---CGT--AGC----G-ATAT------T---A---GTTTACTGTTTT-T-ATGCTATT----AT---TGA-TT--C---AT--TGA---TC-AG--T-G-T---ATT-AC------A--ATATTT-A---AGG---ATT---AAAGGC-T-GTTTCCTG--------------ACCC-G-C------------------AAGA-ATGT-TTGA--CAGAATATTATTA-TGA--CTACC-ACA-CTCCT--T-GCTTCTAGA-TCTA-TTT---T---ATA-ATA--------C------CC-----CTTA-TTGA-GACAC----T-T----AG----GT-C------AAC---TA---TA-CACCAATC-----TTGATA--GAC-A-ATA--TC-T---G-----AAAATC--ATAC------C-GTTTGTTCAG------ACCC--------CCC---------CCCGATGATACAGTGGAGT---C--------------CCCC---CT----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGA-------GT----ATACTG-AAT-C--AAGAAT--GTGTTGGGG-TTA--ATTCAGATTAG---------TATGATAAGAGAAC-CCATA-TTGTGGCAG---CTTGTAG-CGTT-AAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGT-AATTTGAATCATAT-G-C--TGA-CAAA--TG------TCTTGGGTT-------GA-AC-TTCAAA-AA--ATA------TAA-TATGC--TGAAACGGAA-ATATC
gi|10 : TTTAGC-GT-A--T-----C--AT-GGCA-TGA-CAAC--TG------TTTC---TCAAAGAAGGA-ACTTTCCAA-A-----A------AAA-TATGCTTCAAAGctaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|11 : aggggtatcatattatttattttatttatctatttattgtaggggtcagaatttgcaattaggtaatgaagatatacaaaaaaacaagcataggGAGGGG--GAGGAAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGATG----gatacgtttgatcctctatatccattatgtaaacaaatcatgtcaaaatatcacatacaaaaattagatagaaggtctgaaagaaaagatataatttatatatccttatatttatgaacaggctgcgcgtctataacgtgattttttcccctatgacctttgacacgcatattattaggtaattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaacatc
gi|11 : GAGGG--GGAGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGT-------GGGG-G--------TTTAA-----A-TG----TG-TG----TCCCGAACCCC-TT-C-GCTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAAACC-CAT--------T-GTACATA-G-AGC---GA-TA-TTCT-A-A-A------A-ATATACACC-C-CT--T---C--ATAGA-AT-T---CTT--A-CAT--GAATAT--A---A---G---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-GG--T-GATA--ATTAAC------A--AC-TTA-AGG-AGG---ACA--AAAAGGC-T-GCTTCCTTC---ACAC------AAG------------------------TCG-GTG-ATTGTC-C--TTGA----TG-TAA--C-ACTAA-A-CCTCAT-T-A----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--CTA--------C------AC-----T-TA-TTCA-GACA----A-------GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AAAT--CC----ACTG-TA--AAC-A-A-agggggagtactctgaaaaatattggtgggggtttaaatgtgtgtcccgaaccccttcgctatcgtagactaaattttatgtcaatttgtaaacccattgtacatagagcgatattctaaaaatatacaccccttcatagaattcttacatgaatataagttttatgtgtatgtttacacagcaatcggtgataattaacaacttaaggaggacaaaaaggctgcttccttcacacaagtcggtgattgtccttgatgtaacactaaacctcattatagacttgtttacatctacacttattcagacaagggttaaattataaaatccactgtaaacaa
gi|12 : gagggggaggaactctgaaaaatattggatC-T---CTAAAG-AA--T-ATTG--CG----GGGG------------TCAA-----A-TG----TT-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-A-TAGA-T-----TA--A------A-TGCAAGTTATGTAACCC-CA---------T-G----TA-G-AAC---GA-TATTTCT-A-A-A------G-GTGTACACT-C-CT--T---C--ATAGA-A--CTCTTAT--A-T----GAATAT--A---A---G---ATTTA--------T-ATG-TTTG----AT---T-A-CA--C---AG--TAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCT-------AC------ACG----------------------------------------GGTATC----TC-TAG--G-ACC-A------------G----TAG--------TT---TCA-AT--ATAC-------C------CC-----C-TA-T--A-AAGAC---AC-T----GAAATTGT-TAAATTTAAT---TA---TA-TACC--CC----ATTG-TA--GACAA-A-A--TC-TGGGG--GGAAAAATCA-AAACCC----C-GTTTG-TCTGA-----ACCC--------CCT---------GCC---------------A---C--------------C
gi|13 : --GGGGTAC-TATTCTGAAATAA--T-ATTGGGTA----GGGG-----------TTCGA-----AGTG----TGAGG----TCCCGAACCCT-AA-C-C--ATC-G-TAGATC-----TA--GA------------ATTTCTTAATCCACGT--------TAG----TA-GGACC---GA-TATGTCTAA-A-A------A-G-A-------------T---T--ATAAT-A--C---C-T--A-CTT--GCAT-T--A---T---AACTTCTT---G--TT-C-TTA-TATGCGATAT---TAA-GA--TTTGAG--CAA---TCGAGTTT-GATA--ATTAATTATAAAA--AT-TTT-A-G-AGAGGTATTA-AAAAGGC-T-GTTTCC-GCT--GCAC------AGGC-T-T-------------------TAGCGCGTAT--A--CGGTG-A----TG-TAA--C-G-C-A-G-TAGTA--T-G----TAGACCTTGTTTT---TC--ATACATA--------G------CCGT---C-T--TTCA-GA-AC---GC-TGACAGG----GT-TA-----TATTAATA---TA-CATC--CA----ATTG-TAAGAAC-A-A-taatataaagtgag
gi|14 : G--GGGGTAC-T---CTAAAA-AAA-T-ATTAGGAG----GGGGG-GGGGGGGTGTTCAA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATA-T-TAGA-CTACGGTA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAA-CC-CAT--------T-G----TA-A-ACC---GA-TA-TTCT-A-A-A------G-AT--ACCCAGC-CC--T---TC-ATTGA-ACTC---TTT--ATT----GAATAT--A---------------A--GT-TT-T-ATG-TATA----AT---T-A-CT--C---AG--CAA---TC-AG--T-GACA--ATGAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATTAAAAAAGGC-T-GTTTCCTAC---ACACGT----ATAC-A-T------------------GTAG-GTATA-AAAC-CAG--TA----TG-TAA--C-ACCAA-A-CCTCATTT-A----TAGA-CTTG-TCT---TC--AT--ACA--------
gi|15 : gaaT--A-T----GAATAC--A---C---AC--TCCTAT-A--TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GATA--ACTAACT-----G--TT-TTT-G-G-AGA---ATT--CAAAGGC-T-GTTTCTTGC---ACAC------AT------------------------ATAG-GTG-ATTGAC-AAGTAT-----T--TAA--C-ACC-A-------T--T-A----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CG-----A-TA-TTCA-G--AT---TC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TA-ATCC--CC----ATTG-TA--GATAA-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AACCCCG---T-ATT---TCAGA-----ACCC--------CC
gi|16 : ataTC-G-TAGA-C-----TATAAATTT-TA-TGTCAATTT----------------------G----TA-G-ACC---GA-TATT-CTAA-A-A------A--TA--TACA-T-TT--T---TTCATAGG-C--C---TCT------------TAT--A---TGA-A---TGAAA--GA-TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AT--T-GATA--ATTAAA------A--AA-TTT-A-GAAGG---ATT--AAAAGGCTT-TTTTCCT-----GCAC------AG---G-T------------------ATAG-GTG-ACTAAC-CAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA-CATG-GTTAAATT--AT--ATA--------C------CT-----C-AA-TGTA-GACAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|16 : -TA-TGTA-GACAT------------G----GT-TA-----AAT---TA---TA-TACC--TC----AATG-TA--GAC-A-A-A--AC-TA--A--AAAAAAATC--AAACTC----C-TTTCG-TCTCA-----ACCC--------CCT---------ACC---------------A---C--------------Caaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|17 : tcgtagactataaattttatgtcaatttgtagaccgatattctaaaaatatacattttttcataggcctcttatatgaatgaaagatttatgtatgattacacagcaatcattgataattaaaaaatttagaaggattaaaaggcttttttcctgcacaggtataggtgactaaccagtagGGGGGAGGG--GGGATGC-TTT-CT-AAA-AA--TGATTGGGGG----TGGGG-G--------T-CGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TG--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TA-TTCT--------------ATC-ATAGA---TC--TGAAT--ATAAA-A--C---CTTTAA-C-----AATGC--A---TGTGA---TCTTA--G--Ttaata
gi|18 : cc-CCCTA--TTA----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------CAATTACCC-----C-TA-TTCA-GACTC----T-T-----------T-TG-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATAG-TA--GACAA-A-A--T---------CAGAAAGTCAGAAAC------------------A-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCaaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|19 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccT--A-C----AAATAT--A---T----------CA--G--TTCT-ATA-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--GAA---TC-AG--T-GATA--GTTAAC------A--AT-TTTAA-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-TTTTCCT-----GCAC------ATGC-A-C------------------ATAA-ATGT-TTGAC-CAG--TA----TG-TAATTC-ACCAA-A-CCCCAT-T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--gaat
gi|2 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaGGGGGGGGTCGCGGT-C-T---CTGAAA-AG--TCATTGGCTG----AGGAGCG--------TTCGACAACAA-TGCCAATG-GG----TCC-GAACCCC-TAAC-CCCATC-GCTAGA-C-----TA--AATTT--A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------TAG----TA-GCACCCGCGT-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAAA-A--C---CGT--A-C----GAATAT--A---T---A---TATTACTG--TT-T-ATA-TATG----AT---T-AACA--C---AG--ACA---TC-AG--T-GATA--ATGAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ACGCCA-C------------------AAAA-ATGTCTTGAC-CAGTATA----TGCTAAT-C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCAAGACAC---AC-T----GC----GCGTC-----AATA--TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A----TC-T---G--CCAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----TCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT-----TATCGCAAT-CAGAATAAT--GAATT--GG-CTG--GC---G--AAA---------TA----AAGAGTAA-CCATATTTTTGGCAGAGCTCAGTAGACGCTAAAT-TACGTGT--A--TAACAGTAAAA--C-TATATGCCTATT-T---GAATTTAGC-GTCAT-TTG-ATC--ATGG-CACTGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GACACTTTCAAACAAACATA------AAACTATGCTTTGAAGCGAAGCATATCTATT
gi|20 : gaGGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGGAA-AA--T-ATT-GATGCCATGGGGA-G--------TTGGA-----A-TG----TG-GA----TCCCGAACCCC-TA-C-CTTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGCCAA-TTTGTAACTC-CAT--------T-A----TA-G-ACC---GA-TATTTTT---A-A------A-AT--GCACA-C-CCCTT---C--ATAG
gi|21 : -A-A-CCCTA--T-GA---TAGA-CTTG-ATT---TC--AC--GTA--------C------CCCTAGGC-TA-TTCA-G--AC---AC-T----GG----A--TA-----AAT---TA---TA-AA-C--CC----ATCG-TA--GACAA-A-A--TC-T---G--CAAAAAttaagttttatgtaagtaagt
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCCTAATT-A----TAGA-CTTG-ATT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TT---G-------AC-T----GG----A--TA-----AAT---TATTTTA-AACC--CCCATAATTG-TA--GAC-AGA-A--TC-T---G--CAAAAAATC---AACTC---------TG-TCAGA-------CC--------TCCGGGGTCAGACCC---------------CGTGC--------------ACCCCCACT----T
gi|25 : -C-----TA--AATTT--A-TGTCAATGT-GTAACCC-CATGT------T-A----TA-G--CC---TA-TATTT-----A-A------A-ATA--CGCA-C-CC--T---TC-ATAAA-C--T---CTT--A-T------ATATGAA---T---A---TATAA--G-------AT--TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAATGCTC-AG--T-AGTT--ATGAGC------A--A
gi|3 : G----TG-GG----TCC---ACTCC-CA-C-CCCATCAG-TCGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTCAACC-CAT--------T-G----TA-G-A-C---GATTATT--TAA-A-A------A-AT--ATACA-C-CT--T---TCAATAGA-ACTC---TAT--A-C----GAA-AT--A---T--------------G--TT-T-ATGTTATG----AT---T-ACCA--C---TGCTCAA---TC-AG--T-GATG--ATTAAC------AATAT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAA-GC-C-GTTTCCTGC---AC---------CGC-A-C------------------ATAA-GTG-ATTGAC-CAGTATT----GG-TAA--A-GCCAA-A-CCGCAT-T-A----TAG--CT---TTT---TC--AT---TA--------C------CC-----T-T--TTCA-GACAC-----------------GT-T------AAC---TA---T--------CC----ATAG-T---GAC-A-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AAACCCG-----GTTTG-TCAGAC----ACCCGCACCATGCCCTA-------CCC---------------C---CGCCAATATAAAGGACCCCCCCCTCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATCTATTTGTTTTAAT-TTGCAAT-TGGTACAATCAGAATT-G
gi|3 : TTAGC-GT-T--TTA-ACA--AT-GACA-TGA-CAAAG-TGGTTTTTTTTT---TT-------TA-ACTT--AAA-AA--ATA------AAA-TATGC--TAA---GGAA-ATATcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagcttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|30 : gtgggtccactcccaccccatcagtcgactaaattttatgtcaatttgtcaacccattgtagacgattatttaaaaaatatacacctttcaatagaactctatacgaaatatgtttatgttatgattaccactgctcaatcagtgatgattaacaatattttaggaggattaaaagccgtttcctgcaccgcacataagtgattgaccagtattggtaaagccaaaccgcattatagctttttcattacccttttcagacacgttaactatccatagtgacaaatctgcaaaaatcaaaacccggtttgtcagacacccgcaccatgccctacccccgccaatataaaggacccccccctccgcctcagggggtatcatttttaatttatctatttgttttaatttgcaattggtacaatcagaattgcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagc-ACACA-CTCC--T---TC-ATAGA-A--C-----------------------------------TATT------TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GAatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|4 : t------CC-----C-TA-TTCA-GACAC------T----GG-------TC-----AATA--TA---TACAACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-AAATC-T---G--CAAAAA-TCA-A--CCC----C-GTT-G-TCAGC-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCC
gi|4 : GA-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCGCCC-CT----TTCAGGGCATGGGG-CG-TTTTT-ATTGT---A-------GT----ATA-CG-AATACAGAATAAT--GAATT-GGG-GTATCAT---GATAAGGTACGTGTATA----AAGAGTAAGCCATA-T---GGCAG-GCCTAGTAG-CGTAAAAT-TACGTGTAA---------TAA----C-TATAGGC-TATT-T---GAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAAGCTG------TTTT---TT-------G--ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATG---CGAA--GGAA-ATATCTATTtaaattaaagtgagcccccccccccccgcccctttcagggcatggggcgtttttattgtagtatacgaatacagaataatgaattggggtatcatgataaggtacgtgtataaagagtaagccatatggcaggcctagtagcgtaaaattacgtgtaataactataggctatttgaatttagcgtattgatcatgcatgacaaagctgttttttgactttcaaaaaataaaatatgcgaaggaaatatctatttaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : ccctattcagacactggtcaatatatacaaccccattgtagacaaaaatctgcaaaaatcaaccccgttgtcagcaccccccccccccccctaaattaaagt----TG-TAA--C-ACCGA-A-CCCCA--T-A-----AGG-C-----------C--AT-----------------------------TG-T--A-GAC------T-T----G------T-TA-----G-T---TA---TG-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TCTT---G--C--AAAATCA-AACTCC-------TTTG-ACAGAACAACACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCTCCACtaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : CCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCACCAC----------GCCTTTATCTAT-TTTTTTATT-T---G-------GT----A---CTCAAT-CCAAAT-TT--GCATT-AGGTTTA--AT---GAAATG---------TG----AAG-GTAA-TCATA-ATATA--AGA---TATAAG-AGTAAAACATATG-GCAGGTTTAGC-GTAA-ATT----TAC----ATC-ATTGACACT--GT-AC-A--TTA-ACT--AT------TGAGCACA-----------TTT---TT-------GA-ACTAAAAAA-AA--AAAAAAAATAAA-TATGC--TAAA--GGAA-ATATTCATTaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|7 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcgagtAA-AA--T-ATTGGTGGCC--GATGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCTCAAACCCC-TA-A-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-CA-TGTCAATTT-GTAACCC-CATAATGGCATT-G----TA-G-ATA---GA-TCATTCTAA-A-ATTAGTTA-ATT-ACACA-C-CCCTT---T--ATAGA-A--CT--CGT--A-------AATA-------------------A--G--TT-TTAAG-TATG----AT---T-A-CA-------G--C----------------------TAAC------A--AT----------------------AAGGC-T-GTTTCGTAC---GCACGTCATGAGGA-G-CGATGCAATAGATTCATCTATAG-GTG-ATTGAT-CA--ATA----TG-TAA--C-ACC-A-AACCCCA--TTG----TAGA-CTTG-TTT---TC--GA--ATA--------C------CC-----C-AA-TTCA-G--AC---AC-T-----G----GT-TA-----AAT---TA---TG-AATC--CT----ATTG-TA--AAC-A-A-A---C-T---G--CAAAAAATCA-AACCCCGGACC-GTTTG-TTGAT-----ACCT--------CCC---------CCC---------------C---atgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|8 : AC-A---CTGAAA-AA--T-ATTGATTG----GGAT-----------TCCGA-----A-TG----TG-GG-----CACAAACCCC-TA-C-CCCATC-G-T-GA-C-----T-----TTC-TT-TGTCAATGT-GTAACCC-TAG--------T-G----TA-C-ACG---AA-TATT-CTAC-A-A------ATATA-ACACT-C-TT--T---TTCAAAGATA--CT--CTT--A-ATATGGAATAT--A-------A---TG--A--G--TT-T--TG-TAAG----ATGTTT-A-CAAAC---AG--CAA---TA-AG--T-GATAGTATTAAC------A-----TTT-A-G-GAG---AAT--AAAGGGC-C-GTT--CCGT---GCAC------AAGG-GAT------------------ATAG-GTAC-TCGACGCAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA--TTG-TTT---TTCAAT--ATGACCGCCGCC------CC-----C-TATTTCA-GAC-C---AC-T----GACATCGT-TA-----AAT---CA---TA-TACC--CC----AATG-TA--GACAA-A-A--TC-T---GGAAAAAAAATTA-AATCC-----C-GTTTG-TTTGA-----ACCC--------CCaaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|9 : GG--GGGATACAT---CCGAAA-A---T-ATTGGGGG----AGGGG-G--------GGGGG-----A-GG----TG-GGGGGGTCCT-AACCCCATA-TTCCCATT-G-TAGGGT-----TA--GATT---A-TGTCAATTT-GTAACCC-CAT--------T-G----TAAG-ACC---GA-TAATTCCTA-A-A------T-ATA--CACC-C-CT--T---C--ATTGA-A--C-----T--A-T----GAATAT--AAGTT---A---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--TGGATT--ATTAACAATA--A--AT-TTT-A-G-GGG---TTT--AAAATGC-TGGTTTCCTGCCATGCA-------AGGC-A-T------------------CTAG-GTG-ATTGAC-CAGTA-G----TA-TA-----------------A--T-G----TAGA-CTTGTTTT---TC--AT---TA---------------CC-----C-TA-TTCA-GACACTGAACAT----GGT---TT-TA-----AAT---TA---AT-CACC--CC----ATTA---------A-A-A--TC-T---G--AAAAAACTCA-TAAACCG---TGGTTTG-TTTGA-----ATCC--------CTCTA-------TCT---------------G---C--------------CTCCCCAtacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
blockSeqs : TC A A ATT T A G ATGCCAT GGGGGGGGTG CAACA G CCAA A GGGG C A A T A C T TACGG TA T . T T A A AATGGCAT A TACA A G CGC T T T AA . TTAGTT T ATA G T CT GAAT T CCTACTTGCATTATAACTTCTTGTT T T CGAT GTT A A AA TTG CT TGC G TT G AGT TATAAA AT . A G A GGT AA T G ACGCACGTCATGAGGAGCGATGCAATAGATTCATCTATAGGTGATTGATCAATATGTAACACCAAACCCCATTG C T AAA CA ACA ACCGCCGCC CTAGG . T A ACACTGAACATGGTTT AAATTT TAA TTT CA . CATA . AG A G . AA T GGGGGG AG GGACC T . T ACAAC GCACCATG GGGGTCAGA CCGCCAATATAAAGGA A CCGC A A G GT . T G ATCTATTTGTTTTAATTTGC ACA CA A G TT TCATGATAAGGTACGTGTATA A G TTTT G AGCT A TA A T AGGTTTAGC AAC TG C ATTG . CAT . . GGCAC G GTGGTTTTT . AAAGAAGGA T C AC AAAAAT C TTTGAAGC C
blockSeqs : . A . TT . . C TGGCC GCG . . . . . C . . . . . G . . T . T T C . GT A . . C . . T T AA . . . GTA . . CT TTC . CCGTACGAATATATATATTACTGTT . . . . . C . . . . . . . A AATA . . . G . . A . . GCGCACACGCCACAAAAATGTCTTGACCAGTATATGCTAATCACCAACCCCATG . T . A C CAATTAC GT . . . AGACACTGAAATTGT A A . A . . . . A . . . . GGAAA A GTG C . A C . TA CGTGC A . A A G AT . A . AGTTATCGC CA . A G C ATGAAATGTG A . ATA G GCC . AA . T ATAACA ATT GG . T . A . . GGCA . GCTG . GAC T . . . . CGAA .
blockSeqs : . A . . . . . ATG GG . . . . . C . . . . . . . . T . T C T . . . . . . . . T T AA . . . CA . . . TCA . CTCTTAATATGGAATATAATGAGTT . . . . . . . . . . . . . A T . . . G . . . . . ACACACGTATACATGTAGGTATAAAACCAGTATGTAACACCAAACCTCATTTA . . . . A CC . . . . AACGCTGACAGGGT A A . T . . . . A . . . . AAAA A GT T . T . . TA AC C . A T G CT . T . AGTATACG TG . A A G GCGAAATA . . T . A . AA . . AA C C . T . T . . GACA . TG . TA T . . . . TAAA .
blockSeqs : . A . . . . . GTA GG . . . . . C . . . . . . . . T . T T C . . . . . . . . T T AA . . . AA . . . TTC . TTCTTACATGAATATAAGTTTTA . . . . . . . . . . . . . A . . . . G . . . . . GCACATGCACATAAATGTTTGACCAGTATGTAATTCACCAAACCCCATTG . . . . A C . . . . ACCACTGACATCGT A . . C . . . . A . . . . GCC A GC T . A . . . AC A . . . T G . . . GGTACTC CC . C . . A . . GCA . TG . GA A . . . . TAA .
blockSeqs : . G . . . . . GAG AG . . . . . C . . . . . . . . T . T T C . . . . . . . . T T AA . . . TA . . . TC . CTCTTATATGAATATAAGATTTA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . GCACCGCACATAAGTGATTGACCAGTATTGGTAAAGCCAAACCGCATTA . . . . A G . . . . ACACACTGCGCG A . . A . . . . A . . . . GCA A C T . A . . . CC A . . A . . . . . . G . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . GGG GG . . . . . C . . . . . . . . T . T T C . . . . . . . . T T AC . . . AA . . . TC . CTCTTTATTGAATATAAGTTT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . GCTGCACAGGCTTTAGCGCGTATACGGTGATGTAACGCAGTAGTATG . . . . A C . . . . ACAAGGGT G . . T . . . . . . . . . GCA A C T . A . . . CC A
blockSeqs : . A . . . . . CTG GG . . . . . C . . . . . . . . C . T T C . . . . . . . . T T TA . . . A . . . TC . CTCTTATATGAATGAAAGATT . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . TCACACAAGTCGGTGATTGTCCTTGATGTAACACTAAACCTCATTA . . . . A C . . . . ATTCTGGT C . . A . . . . . . . . . GCA A G T . A . . . CC .
blockSeqs : . A . . . . . TTG . . . . . . C . . . . . . . . T . T T A . . . . . . . . A T A . . . A . . . C . TCTTATATATGAATATATAAG . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . GCCATGCAAGGCATCTAGGTGATTGACCAGTAGTATAATG . . . . A C . . . . ACACTGGA A . . A . . . . . . . . . GCA A C T . A . . . CC
blockSeqs : . . . . . . GGG . . . . . . T . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . T T A . . . A . . . C . CTATGAATATAAGTTATTTTA . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . GCACACATATAGGTGATTGACAAGTATTTAACACCATTA . . . . G C . . . . ACACTGGT A . . A . . . . . . . . . GAA A C T . G . . . CC
blockSeqs : . . . . . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . A T A . . . G . . . T . CTCTATACGAAATATGTT . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . GTGCACAAGGGATATAGGTACTCGACGCAGTAGTATG . . . . A C . . . . ACATGGT C . . A . . . . . . . . . GC A . . . T . . . CC
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . CTCGTAAATAAGTT . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . GCACAGGTATAGGTGACTAACCAGTAGTATG . . . . A C . . . . ACTCTTT A . . A . . . . . . . . . CA . . . . T . . . GC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . C . CTATTTC . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . ACACGGGTATCTCTAGGACCAG . . . . A C . . . . ACACTGG A . . A . . . . . . . . . GC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACTGGA A . . T . . . . . . . . . GC . .
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACACGT A . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . ACTTGT . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : ** T* AA* A** A** A** ACACTGGT**************** A***** ** GCA***** A* CC******************************** AGTATCGC**************** CG* G* A*** ** GGCA** *** TAAA****
originalCons : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA-ACACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACAC---AC-T----GG----GT-TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT----ATATCGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATC--AT-G-CA-TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--CGAAGCGGAA-ATATCTATT
finalCons : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTTT-A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTAA-A-A------A-ATA--CACA-C-CC--T---T--ATAGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--ATA--TA--------C------CC-----C-TA-TTCA-GACACTGGT----------------TA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-TGCA-----AAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCCCC--------------------------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-TAGTATCGC----------------AATCG-GAATAAT--GAATTG-GG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GTA---TTG-ATC--ATGGCA--TGA-CAAA--TG------TTTT---TT-------GA-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGCTAAA----GGAA-ATATCTATT
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|6 ): CCTCCCCCCCGGGCCTCAGGAGTATCAATGTTCCTTTCATGCTATTTTTTTTTTAATTTGGTAGCGAATCAAATTTGCACATTAAGATTTAATGAAATGGGGTATTCATTAATATAAGATATAGAAAGGTAACAACCTGGGCAGGTATGGCGTAACTCAAGGGACATGACAGAAATTAATTTTTTTTTTTATATAACTTTGAAAAAATAAAGTATGCTAAAGGAAAGGGTATTCATATGTATTAATAGAATCAGGACAGAATTATCGAACCCCCCCGTAAAGAATACATAATATTGTCATTAGAAATGTCTGAAAAAAGCGGTAGAGCATCCTTATAATTTATGCACACAGGCTGCGTGGCGTGATACGCGTTTTCCCGCCTATTGACATTTGACACGCATATATAGGATTAAGGTAATTTAATTTGGCGACGCGGTGTGCAATACATTT
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG
Alignments
lowQualScore : 111 1111111 11111111111 1 11111111 11111111 111111 777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111111111 22222222222222222222 1 11111111 222222 11111 222222222 3333333333333333333333333333333333 1111 555555555555555555555 111 11 11 11 5555555555555555555555555555 1 1111 2222 1 1 2222222222 444444 22222 1111 11 333333333333333333 111 3333333333333333 111111 111111
lowQualScore : 66 2 3 111 3 77 6 1111111 88888888888 99999 3 7777 3 7777 3 444 3 3 5 77777 33 77 2 2 9 1 2 44444444 5 6666 2 5 555 2 5 1 555 2 2 22222222 2 3333 2 2 77 666666 5555 2 777777777777777777777777777777777777777777777777777 2 5 5555 444 5 5 33 444 33 444 2 33 2 444 444444 33 3 222 3 555 77 3 3 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 2 4 444 55 888 555555555555555 33 2 88888 666 2 44444444444444444444 66666 444 444 44 33 5555 2 33 2 2 2 33 2 11111111 55 0 0 555555 1 3 2 00000 99999999 000000000 1111111111111111111111111111111111 3 4444 5 3 5 11 8 6 8 555555555555555555555 5 222 0 11 1 11 00 3333333333333333333333333333 3 0 5555 2 7777 0 44 0 3 9999999999 000000 33 8 88888 6 7777 6 22 77 5 000000000000000000 000 5555555555555555 22 5 77 666666 5 888888 77 5 99
lowQualScore : .. . . ... . .. . ....... ........... ..... . .... . .... . ... . . . ..... .. .. . . . . . ........ . .... . . ... . . . ... . . ........ . .... . . .. ...... .... . ................................................... . . .... ... . . .. ... .. ... . .. . ... ...... .. . ... . ... .. . . .................................................................................................... . . ... .. ... ............... .. . ..... ... . .................... ..... ... ... .. .. .... . .. . . . .. . ........ .. . . ...... . . . ..... ........ ......... .................................. . .... . . . .. . . . ..................... . ... . .. . .. .. ............................ . . .... . .... . .. . . .......... ...... .. . ..... . .... . .. .. . .................. ... ................ .. . .. ...... . ...... .. . ..
lowQualScore : 11 3 6 444 3 99 7 7777777 77777777777 11111 6 1111 3 1111 3 222 1 1 7 11111 99 11 9 0 6 9 9 33333333 7 1111 9 7 000 9 2 5 555 9 9 99999999 7 6666 7 7 33 000000 7777 9 000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 3 7777 777 3 3 77 777 77 777 7 77 7 999 333333 99 1 555 1 444 33 1 1 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 4 7 111 66 222 444444444444444 44 4 22222 555 4 44444444444444444444 22222 444 444 44 44 3333 5 44 5 5 5 99 9 44444444 44 4 2 555555 5 1 0 00000 77777777 888888888 2222222222222222222222222222222222 1 2222 6 8 0 88 0 0 0 888888888888888888888 0 666 8 00 0 22 88 5555555555555555555555555555 2 0 2222 5 0000 0 22 0 2 5555555555 888888 55 8 55555 7 8888 7 33 11 7 444444444444444444 000 9999999999999999 44 7 99 444444 7 111111 99 7 22
consensus : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTA--A-A-A------A-AT-A-CA-CA-C-CC--T---T--AT----AGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC--C-TA-----TTCAG---A-CACT-----G-----G--------TTA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT--TA--TACGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATCATG-GCA-TGA-CA------AA--TG------TTTT---TT-------G------A-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--T--GAA--G-GAA--ATATCTATT
Reference ( family-1411 ) : GGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGNTG----GGGGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TATTTCTA--A-A-A------A-AT-A-CA-CA-C-CC--T---T--AT----AGA-A--C---CNT--A-C----GAATAT--A---T---A---TNTTA--G--TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ANGC-G-C------------------ATAG-GTGTATTGAC-CAGTATA----TG-TAA--C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CC--C-TA-----TTCAG---A-CACT-----G-----G--------TTA-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TC-T---G--CAAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCNTGGGNTCG-TTTTTTATT-T---A-------G---TA--T-CGCAAT-CGGAATAAT--GAATT-GGG-TTA--AT---GATAAG---------TA----AAGAGTAA-CCATA-TTNTGGCAGAGCCTAGTAG-CGTNAAAT-TACGTGTAAA--TAAC-GTAAGATTC-TATANGCCTATT-TTTGGAATTTAGC-GT-A--TTG-ATCATG-GCA-TGA-CA------AA--TG------TTTT---TT-------G------A-ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC--T--AAA--G-GAA--ATATCTATT
gi|1 : GGGAGGGGG--GGGGT-C-T----TGAGA-AAGGT-AGTG-TTG----AGAAG-G--------TTC-A-----A-TG----TG-GG----T-CCGAACCCG-TA---TCCATC-G-TAGA-C-----TA--ATTTTGTATTGTCAA-TTTGT---CC-CAT--------T-G----TA-G-CCT------TATTTCTA--ACATA------A-AT-A-CGCCA-C-CC--T---C--AT----AAA-AT-T---CGT--AGC----G-ATAT------T---A---GTTTACTGTTTT-T-ATGCTATT----AT---TGA-TT--C---AT--TGA---TC-AG--T-G-T---ATT-AC------A--ATATTT-A---AGG---ATT---AAAGGC-T-GTTTCCTG--------------ACCC-G-C------------------AAGA-ATGT-TTGA--CAGAATATTATTA-TGA--CTACC-ACA-CTCCT--T-GCTTCTAGA-TCTA-TTT---T---ATA-ATA--------C------CC--CTTA-----TTGAG---A-CACTTA---G-----G--------TC------AAC---TA---TA-CACCAATC-----TTGATA--GAC-A-ATA--TC-T---G-----AAAATC--ATAC------C-GTTTGTTCAG------ACCC--------CCC---------CCCGATGATACAGTGGAGT---C--------------CCCC---CT----TTC--GGCCT--GTTCGTTTTTTTATT-TTTGA-------G---TA--TACTGAAT-C--AAGAAT--GTGTTGGGG-TTA--ATTCAGATTAG---------TATGATAAGAGAAC-CCATA-TTGTGGCAG---CTTGTAG-CGTT-AAT-TACGTGTAAA--TGAC-GTAAGATTCTTATAAGCCTATTCTTTGGAATTTAGCTGT-AATTTGAATCATATGC--TGA-CA------AA--TG------TCTTGGGTT-------G------A-AC-TTCAAA-AA--ATA------TAA-TATGC--T--GAAACG-GAA--ATATC
gi|10 : TTTAGC-GT-A--T-----CATG-GCA-TGA-CA------AC--TG------TTTC---TCAAAGAAGG------A-ACTTTCCAA-A-----A------AAA-TATGC--TTCAAA--G-GActaatctatgtacgaatcatgtaaatcacccaccaacccttcaattatatattatcattagaataagtctgaagaaagctatatatcctttaatattttatcgaacaggctgcgtgctgataacgttattttatcccctattgacctttgaagctgataatctaggtacattcattatggcgatcgc
gi|11 : aggggtatcatattatttattttatttatctatttattgtaggggtcagaatttgcaattaggtaatgaagatatacaaaaaaacaagcataggGAGGGG--GAGGAAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGATG----tacgtttgatcctctatatccattatgtaaacaaatcatgtcaaaatatcacatacaaaaattagatagaaggtctgaaagaaaagatataatttatatatccttatatttatgaacaggctgcgcgtctataacgtgattttttcccctatgacctttgacacgcatattattaggtaattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaacatc
gi|11 : GAGGG--GGAGTAC-T---CTGAAA-AA--T-ATTGGT-------GGGG-G--------TTTAA-----A-TG----TG-TG----TCCCGAACCCC-TT-C-GCTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAAACC-CAT--------T-GTACATA-G-AGC---GA-TA-TTCTA--A-A-A------ATAT-A-CA-CC-C-CT--T---C--AT----AGA-AT-T---CTT--A-CAT--GAATAT--A---A---G---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-GG--T-GATA--ATTAAC------A--AC-TTA-AGG-AGG---ACA--AAAAGGC-T-GCTTCCTTC---ACAC------AAG------------------------TCG-GTG-ATTGTC-C--TTGA----TG-TAA--C-ACTAA-A-CCTCAT-T-A----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--CTA--------C------AC--T-TA-----TTCAG---A-CAAG-----G-----G--------TTA-----AAT---TA---TA-AAAT--CC----ACTG-TA--AAC-A-A-agggggagtactctgaaaaatattggtgggggtttaaatgtgtgtcccgaaccccttcgctatcgtagactaaattttatgtcaatttgtaaacccattgtacatagagcgatattctaaaaatatacaccccttcatagaattcttacatgaatataagttttatgtgtatgtttacacagcaatcggtgataattaacaacttaaggaggacaaaaaggctgcttccttcacacaagtcggtgattgtccttgatgtaacactaaacctcattatagacttgtttacatctacacttattcagacaagggttaaattataaaatccactgtaaacaa
gi|12 : gagggggaggaactctgaaaaatattggatC-T---CTAAAG-AA--T-ATTG--CG----GGGG------------TCAA-----A-TG----TT-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-A-TAGA-T-----TA--A------A-TGCAAGTTATGTAACCC-CA---------T-G----TA-G-AAC---GA-TATTTCTA--A-A-G------GTGT-A-CA-CT-C-CT--T---C--AT----AGA-A--CTCTTAT--A-T----GAATAT--A---A---G---ATTTA--------T-ATG-TTTG----AT---T-A-CA--C---AG--TAA---TC-AG--T-GATA--ATTAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCT-------AC------ACG----------------------------------------GGTATC----TC-TAG--G-ACC-A------------G----TAG--------TT---TCA-AT--ATAC-------C------CC--C-TA-----TAAAG---A-CACT-----GAAATTG--------TTAAATTTAAT---TA---TA-TACC--CC----ATTG-TA--GACAA-A-A--TC-TGGGG--GGAAAAATCA-AAACCC----C-GTTTG-TCTGA-----ACCC--------CCT---------GCC---------------A---C--------------C
gi|13 : --GGGGTAC-TATTCTGAAATAA--T-ATTGGGTA----GGGG-----------TTCGA-----AGTG----TGAGG----TCCCGAACCCT-AA-C-C--ATC-G-TAGATC-----TA--GA------------ATTTCTTAATCCACGT--------TAG----TA-GGACC---GA-TATGTCTA--A-A-A------A-G--A-------------T---T--AT----AAT-A--C---C-T--A-CTT--GCAT-T--A---T---AACTTCTT---G--TT-C-TTA-TATGCGATAT---TAA-GA--TTTGAG--CAA---TCGAGTTT-GATA--ATTAATTATAAAA--AT-TTT-A-G-AGAGGTATTA-AAAAGGC-T-GTTTCC-GCT--GCAC------AGGC-T-T-------------------TAGCGCGTAT--A--CGGTG-A----TG-TAA--C-G-C-A-G-TAGTA--T-G----TAGACCTTGTTTT---TC--ATACATA--------G------CCGTC-T------TTCAGA--A-CGCTGACAGG-----G--------TTA-----TATTAATA---TA-CATC--CA----ATTG-TAAGAAC-A-A-taatataaagtgag
gi|14 : G--GGGGTAC-T---CTAAAA-AAA-T-ATTAGGAG----GGGGG-GGGGGGGTGTTCAA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATA-T-TAGA-CTACGGTA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAA-CC-CAT--------T-G----TA-A-ACC---GA-TA-TTCT---A-A-A------G-AT-A-CC-CAGC-CC--T---TC-AT----TGA-ACTC---TTT--ATT----GAATAT--A---------------A--GT-TT-T-ATG-TATA----AT---T-A-CT--C---AG--CAA---TC-AG--T-GACA--ATGAAC------A--AT-TTT-AGG-AGG---ATTAAAAAAGGC-T-GTTTCCTAC---ACACGT----ATAC-A-T------------------GTAG-GTATA-AAAC-CAG--TA----TG-TAA--C-ACCAA-A-CCTCATTT-A----TAGA-CTTG-TCT---TC--AT--ACA--------
gi|15 : gaaT--A-T----GAATAC--A---C---AC--TCCTAT-A--TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GATA--ACTAAC------T--GT-TTTTG-G-AGA---ATT--CAAAGGC-T-GTTTCTTGC---ACAC------AT------------------------ATAG-GTG-ATTGAC-AAGTAT-----T--TAA--C-ACC-A-T--------T-A----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------C------CG--A-TA-----TTCAG---A-TTCT-----G-----G--------TTA-----AAT---TA---TA-ATCC--CC----ATTG-TA--GATAA-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AACCCCG---T-ATT---TCAGA-----ACCC--------CC
gi|16 : ataTC-G-TAGA-C-----TATAAATTT-TA-TGTCAATTT----------------------G----TA-G-ACC---GA-TATT-CTA--A-A-A------A--T-A-TA-CA-T-TT--T---TTCAT----AGG-C--C---TCT------------TAT--A---TGA-A---TGAAA--GA-TT-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AT--T-GATA--ATTAAA------A--AA-TTT-A-GAAGG---ATT--AAAAGGCTT-TTTTCCT-----GCAC------AG---G-T------------------ATAG-GTG-ACTAAC-CAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA-CATG-GTTAAATT--AT--ATA--------C------CT--C-AA-----TGTAG---A-CAtagcagagctattatcgaatgtgaattgagtgcccccaccccc
gi|16 : -TA-----TGTAG---A-CA-T-----G-----G--------TTA-----AAT---TA---TA-TACC--TC----AATG-TA--GAC-A-A-A--AC-TA--A--AAAAAAATC--AAACTC----C-TTTCG-TCTCA-----ACCC--------CCT---------ACC---------------A---C--------------Caaactaaaaaaaaatcaaactcctttcgtctcaaccccctaccacctaata
gi|17 : tcgtagactataaattttatgtcaatttgtagaccgatattctaaaaatatacattttttcataggcctcttatatgaatgaaagatttatgtatgattacacagcaatcattgataattaaaaaatttagaaggattaaaaggcttttttcctgcacaggtataggtgactaaccagtagGGGGGAGGG--GGGATGC-TTT-CT-AAA-AA--TGATTGGGGG----TGGGG-G--------T-CGA-----A-TG----TG-GG----TCCCGAACCCC-TA-C-CCCATC-G-TAGA-C-----TG--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTAACCC-CAT--------T-G----TA-G-ACC---GA-TA-TTCTATCA-T-A------G-AT------------C--TGAAT--AT----AAA-A--C---CTTTAA-C-----AATGC--A---TGTGA---TCTTA--G--Ttaata
gi|18 : cc-CCCTA--TTA----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--ATA--------CAATTACCC--C-TA-----TTCAG---A-CTCT-----T--------------TTG-----AAT---TA---TA-AACC--CC----ATAG-TA--GACAA-A-A--T---------CAGAAAGTCAGAAAC------------------A-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCaaattactaagtgatctcctgtggttaacatcttcagctgttgcatgaaacattgacaa
gi|19 : acaatttcatgcaggtcaatgttgaccccatggtaaaatactttgtgcaccccccccccccccccccccT--A-C----AAATAT--A---T----------CA--G--TTCT-ATA-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--GAA---TC-AG--T-GATA--GTTAAC------A--AT-TTTAA-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-TTTTCCT-----GCAC------ATGC-A-C------------------ATAA-ATGT-TTGAC-CAG--TA----TG-TAATTC-ACCAA-A-CCCCAT-T-G----TAGA-CTTG-TTT---TC--AT--gaat
gi|2 : tattataannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtaGGGGGGGGTCGCGGT-C-T---CTGAAA-AG--TCATTGGCTG----AGGAGCG--------TTCGACAACAA-TGCCAATG-GG----TCC-GAACCCC-TAAC-CCCATC-GCTAGA-C-----TA--AATTT--A-TGTCAATTTTGTAACCC-CAT--------TAG----TA-GCACCCGCGT-TATTTCTA--A-A-A------A-AT-AACA-CA-C-CC--T---T--AT----AAA-A--C---CGT--A-C----GAATAT--A---T---A---TATTACTG--TT-T-ATA-TATG----AT---T-AACA--C---AG--ACA---TC-AG--T-GATA--ATGAAC------A--AT-TTT-A-G-AGG---ATT--AAAAGGC-T-GTTTCCTGC---GCAC------ACGCCA-C------------------AAAA-ATGTCTTGAC-CAGTATA----TGCTAAT-C-ACC-A-A-CCCCA--T-G----TAGA-CTTG-TTT---AC--AT--ATA--------C------CC--C-TA-----TTCAAGACA-CACT-----GCGC--G--------TCA-----ATA---TA---TA-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A----TC-T---G--CCAAAAATCA-AAACCCG---C-GTTTG-TCAGA-----TCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCCCCACT----TTCAGGGCATGGGGTCG-TTTTTTATT-T---A-------GT--TA--T-CGCAAT-CAGAATAAT--GAATT--GG-CTG--GC---G--AAA---------TA----AAGAGTAA-CCATATTTTTGGCAGAGCTCAGTAGACGCTAAAT-TACGTGT--A--TAACAGTAAAA--C-TATATGCCTATT-T---GAATTTAGC-GTCAT-TTG-ATCATG-GCACTGA-CA------AA--TG------TTTT---TT-------G------ACACTTTCAAACAAACATA------AAACTATGCTTT--GAA--GCGAAGCATATCTATT
gi|20 : gaGGGGGGGGG--GGGGTAC-T---CTGGAA-AA--T-ATT-GATGCCATGGGGA-G--------TTGGA-----A-TG----TG-GA----TCCCGAACCCC-TA-C-CTTATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-TA-TGCCAA-TTTGTAACTC-CAT--------T-A----TA-G-ACC---GA-TATTTTT-----A-A------A-AT-G-CA-CA-C-CCCTT---C--AT----AG
gi|21 : -A-A-CCCTA--T-GA---TAGA-CTTG-ATT---TC--AC--GTA--------C------CC--C-TAGGCTATTCAG---A-CACT-----G-----G--------ATA-----AAT---TA---TA-AA-C--CC----ATCG-TA--GACAA-A-A--TC-T---G--CAAAAAttaagttttatgtaagtaagt
gi|24 : atatcacatccttacaatttcatgcaggtcatatcaatgttgacaccatggtagaatatttggaacaatttaa-A-CCCTAATT-A----TAGA-CTTG-ATT---TC--AT--ATA--------C------CC--C-TA-----TT--G------ACT-----G-----G--------ATA-----AAT---TATTTTA-AACC--CCCATAATTG-TA--GAC-AGA-A--TC-T---G--CAAAAAATC---AACTC---------TG-TCAGA-------CC--------TCCGGGGTCAGACCC---------------CGTGC--------------ACCCCCACT----T
gi|25 : -C-----TA--AATTT--A-TGTCAATGT-GTAACCC-CATGT------T-A----TA-G--CC---TA-TATTT-------A-A------A-AT-A-CG-CA-C-CC--T---TC-AT----AAA-C--T---CTT--A-T------ATATGAA---T---A---TATAA--G-------AT--TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAATGCTC-AG--T-AGTT--ATGAGC------A--A
gi|3 : G----TG-GG----TCC---ACTCC-CA-C-CCCATCAG-TCGA-C-----TA--AATTT-TA-TGTCAA-TTTGTCAACC-CAT--------T-G----TA-G-A-C---GATTATT--TA--A-A-A------A-AT-A-TA-CA-C-CT--T---TCAAT----AGA-ACTC---TAT--A-C----GAA-AT--A---T--------------G--TT-T-ATGTTATG----AT---T-ACCA--C---TGCTCAA---TC-AG--T-GATG--ATTAAC------AATAT-TTT-AGG-AGG---ATT--AAAA-GC-C-GTTTCCTGC---AC---------CGC-A-C------------------ATAA-GTG-ATTGAC-CAGTATT----GG-TAA--A-GCCAA-A-CCGCAT-T-A----TAG--CT---TTT---TC--AT---TA--------C------CC--T-T------TTCAG---A-CAC------------G--------TT------AAC---TA---T--------CC----ATAG-T---GAC-A-A-A--TC-T---G--C-AAAAATCA-AAACCCG-----GTTTG-TCAGAC----ACCCGCACCATGCCCTA-------CCC---------------C---CGCCAATATAAAGGACCCCCCCCTCCGCCTCAGGG---GGTATCA-TTTTTAATT-T---ATCTATTTGTTTTAATT-TGCAAT-TGGTACAATCAGAATT-G
gi|3 : TTAGC-GT-T--TTA-ACAATG-ACA-TGA-CA------AAG-TGGTTTTTTTTT---TT-------T------A-ACTT--AAA-AA--ATA------AAA-TATGC--T---AA--G-GAA--ATATcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagcttagcgttttaacaatgacatgacaaagtggttttttttttttaacttaaaaaataaaatatgctaaggaaatatatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|30 : gtgggtccactcccaccccatcagtcgactaaattttatgtcaatttgtcaacccattgtagacgattatttaaaaaatatacacctttcaatagaactctatacgaaatatgtttatgttatgattaccactgctcaatcagtgatgattaacaatattttaggaggattaaaagccgtttcctgcaccgcacataagtgattgaccagtattggtaaagccaaaccgcattatagctttttcattacccttttcagacacgttaactatccatagtgacaaatctgcaaaaatcaaaacccggtttgtcagacacccgcaccatgccctacccccgccaatataaaggacccccccctccgcctcagggggtatcatttttaatttatctatttgttttaatttgcaattggtacaatcagaattgcacatctagtttatgaatgggggtaatcaaaatattaagaacataagcagcT-A-CA-CA-CTCC--T---TC-AT----AGA-A--C-----------------------------------TATT------TC-T-ATG-TATG----AT---T-A-CA--C---AG--CAA---CC-AG--T-GAatgtaaacgaatctgacaaattatcacccactcccctaaaaatatattatatttcactatgaaaatccgaagaagctag
gi|4 : ------CC--C-TA-----TTCAG---A-CACT-----G-----G--------TCA-----ATA---TA---TACAACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-AAATC-T---G--CAAAAA-TCA-A--CCC----C-GTT-G-TCAGC-----ACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCC
gi|4 : GA-----GCCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCGCCC-CT----TTCAGGGCATGGGG-CG-TTTTT-ATTGT---A-------G---TA--TACG-AATACAGAATAAT--GAATT-GGG-GTATCAT---GATAAGGTACGTGTATA----AAGAGTAAGCCATA-T---GGCAG-GCCTAGTAG-CGTAAAAT-TACGTGTAA---------TAA----C-TATAGGC-TATT-T---GAATTTAGC-GT-A--TTG-ATCAT--GCA-TGA-CA------AAGCTG------TTTT---TT-------G--------ACTTTCAAA-AA--ATA------AAA-TATGC-----GAA--G-GAA--ATATCTATTtaaattaaagtgagcccccccccccccgcccctttcagggcatggggcgtttttattgtagtatacgaatacagaataatgaattggggtatcatgataaggtacgtgtataaagagtaagccatatggcaggcctagtagcgtaaaattacgtgtaataactataggctatttgaatttagcgtattgatcatgcatgacaaagctgttttttgactttcaaaaaataaaatatgcgaaggaaatatctatttaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : ccctattcagacactggtcaatatatacaaccccattgtagacaaaaatctgcaaaaatcaaccccgttgtcagcaccccccccccccccctaaattaaagt----TG-TAA--C-ACCGA-A-CCCCA--T-A-----AGG-C-----------C--AT--------------------------TG-----T--AG---A-C--T-----T-----G--------TTA-----G-T---TA---TG-AACC--CC----ATTG-TA--GAC-A-A-A--TCTT---G--C--AAAATCA-AACTCC-------TTTG-ACAGAACAACACCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCTCCACtaatgtaaacgaatcatgtcaaaatatacacccacccacccaaatgaatgatatctatatatatatacatagagaagctatgaaaaaaagcagtatattagatagagttctatcacagctgcatgcttgaaacggttatggtttttcccctaatgaccttttgacacgcatatatattcacgcgtacactcaaatccatactcgacgcacgccgagtggtgcaaa
gi|5 : CCC--------CCC---------CCC---------------C---C--------------CCCACCAC----------GCCTTTATCTAT-TTTTTTATT-T---G-------G---TA----CTCAAT-CCAAAT-TT--GCATT-AGGTTTA--AT---GAAATG---------TG----AAG-GTAA-TCATA-ATATA--AGA---TATAAG-AGTAAAACATATG-GCAGGTTTAGC-GTAA-ATT----TAC----ATC-ATTGACACT--GT-AC-A--TTA-ACTAT------TGAGCA------CA-----------TTT---TT-------G------A-ACTAAAAAA-AA--AAAAAAAATAAA-TATGC--T--AAA--G-GAA--ATATTCATTaacctatataaagcgagtccccccccccccccaccacgcctttatctatttttttatttggtactcaatccaaatttgcattaggtttaatgaaatgtgaaggtaatcataatataagatataagagtaaaacatatggcaggtttagcgtaaatttacatcattgacactgtacattaactattgagcacatttttgaactaaaaaaaaaaaaaaaataaatatgctaaaggaaatattcattatgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|6 : tgtaacaccgaaccccataaggccattgtagacttgttagttatgaaccccattgtagacaaatcttgcaaaatcaaactcctttgacagaacaacacccccccccccccctccacaacctatataaagcgagtG-ACA-TGA-CAGAAATTAA--TT------TTTT---TT-------TTTATATA-ACTTTGAAA-AA--ATA------AAG-TATGC--T--AAA--G-GAA--atgtaacgaatcatgtcaaaatatcactcccctaataatgtatatttatcattagaaagtctgaagaagaaagcatatatcgttatatttattaacaggcgcctcgttgctatctaacgtcgttttttccctatgacctttgcatatatatatataggtatattcaatatggcgacgccgagtgtgcaaaaca
gi|7 : cctcccccccgggcctcaggagtatcaatgttcctttcatgctattttttttttaatttggtagcgaatcaaatttgcacattaagatttaatgaaatggggtattcattaatataagatatagaaaggtaacaacctgggcaggtatggcgtaactcaaggAA-AA--T-ATTGGTGGCC--GATGG-G--------TTCGA-----A-TG----TG-GG----TCTCAAACCCC-TA-A-CCCATC-G-TAGA-C-----TA--AATTT-CA-TGTCAATTT-GTAACCC-CATAATGGCATT-G----TA-G-ATA---GA-TCATTCTA--A-A-ATTAGTTA-ATTA-CA-CA-C-CCCTT---T--AT----AGA-A--CT--CGT--A-------AATA-------------------A--G--TT-TTAAG-TATG----AT---T-A-CA-------G--C----------------------TAAC------A--AT----------------------AAGGC-T-GTTTCGTAC---GCACGTCATGAGGA-G-CGATGCAATAGATTCATCTATAG-GTG-ATTGAT-CA--ATA----TG-TAA--C-ACC-A-AACCCCA--TTG----TAGA-CTTG-TTT---TC--GA--ATA--------C------CC--C-AA-----TTCAG---A-CACT-----G-----G--------TTA-----AAT---TA---TG-AATC--CT----ATTG-TA--AAC-A-A-A---C-T---G--CAAAAAATCA-AACCCCGGACC-GTTTG-TTGAT-----ACCT--------CCC---------CCC---------------C---gggtattcatatgtattaatagaatcaggacagaattatcgaacccccccgtaaagaatacataatattgtcattagaaatgtctgaaaaaagcggtagagcatccttataatttatgcacacaggctgcgtggcgtgatacgcgttttcccgcctattgacatttgacacgcatatataggattaaggtaatttaatttggcgacgcggtgtgcaatacattt
gi|8 : AC-A---CTGAAA-AA--T-ATTGATTG----GGAT-----------TCCGA-----A-TG----TG-GG-----CACAAACCCC-TA-C-CCCATC-G-T-GA-C-----T-----TTC-TT-TGTCAATGT-GTAACCC-TAG--------T-G----TA-C-ACG---AA-TATT-CTA--C-A-A------ATAT-A--A-CA-C-TC--T---T--TTTCAAAGATA--CT--CTT--A-ATATGGAATAT--A-------A---TG--A--G--TT-T--TG-TAAG----ATGTTT-A-CAAAC---AG--CAA---TA-AG--T-GATAGTATTAAC------A-----TTT-A-G-GAG---AAT--AAAGGGC-C-GTT--CCGT---GCAC------AAGG-GAT------------------ATAG-GTAC-TCGACGCAGTA-------G-T------------------A--T-G----TAGA--TTG-TTT---TTCAAT--ATGACCGCCGCC------CC--C-TAT----TTCAG---ACCACT-----GACATCG--------TTA-----AAT---CA---TA-TACC--CC----AATG-TA--GACAA-A-A--TC-T---GGAAAAAAAATTA-AATCC-----C-GTTTG-TTTGA-----ACCC--------CCaaaacaaccacaaaataagtgatgcccccccccccccccccg
gi|9 : GG--GGGATACAT---CCGAAA-A---T-ATTGGGGG----AGGGG-G--------GGGGG-----A-GG----TG-GGGGGGTCCT-AACCCCATA-TTCCCATT-G-TAGGGT-----TA--GATT---A-TGTCAATTT-GTAACCC-CAT--------T-G----TAAG-ACC---GA-TAATTCCT--A-A-A------T-AT-A-CA-CC-C-CT--T---C--AT----TGA-A--C-----T--A-T----GAATAT--AAGTT---A---TTTTA--------T-GTG-TATG----TT---T-A-CA--C---AG--CAA---TC-AG--TGGATT--ATTAACAATA--A--AT-TTT-A-G-GGG---TTT--AAAATGC-TGGTTTCCTGCCATGCA-------AGGC-A-T------------------CTAG-GTG-ATTGAC-CAGTA-G----TA-TA-----------------A--T-G----TAGA-CTTGTTTT---TC--AT---TA---------------CC--C-TA-----TTCAG---A-CACT-----G-----AACATGGTTTTA-----AAT---TA---AT-CACC--CC----ATTA---------A-A-A--TC-T---G--AAAAAACTCA-TAAACCG---TGGTTTG-TTTGA-----ATCC--------CTCTA-------TCT---------------G---C--------------CTCCCCAtacatgtaccacctaatatattttcagtgagtg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|22 ): GGTTCAGAATTTACAATGTAACTGTAAAGAGTAATTTTTATAGCATGGGTGCAAAATGCGACGAATTTCTCAAAACAAGAACTTTCCAATGCGATGAAAAATCTATAAAGTTAACGTATTATAAGTCCTCTGTACCCATGCTGTAAACAAATTGTGTCGAGA
Unaligned ( gi|23 ): ATTTATTCCTTATATTTTTTATCAACAGGCTGCATGCTGCTTGATTCGGTAAGCGTATATTATTTTTCCAGCCTAATGACCTTTTGACACGCAAATATAAATTAGGGTAATTTTTTCAATTATGGCGACGTGCCGAGTTGTGGCAAAGACAT
Unaligned ( gi|26 ): TATATATTCTTATATTTATCAACAGGCTGTGTGCATGATAACATCGTTTTTCCCCTATGACCATTATTAGGTAATTCTGGCGACGCCGAGTGTGCAAAACATC
Unaligned ( gi|27 ): GTAACATGAATGTTTGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCTGCTACATTGAGCTCGTTTGGTTTCAATAATTACCCCTTAAGACTTTTAATTAT
Unaligned ( gi|28 ): TTTACATGCTCATTAGAAAGTCCTGAAAAAAGCTACACCTAATAATTTATTCAACAGGCTGCGTGTCGTTGATAAACGT
Unaligned ( gi|29 ): ATCTCACATCCTTACAAATTCCATGCAGGTCAATCAATATTGACCTCATGGTGAATACTTTG