lowQualScore : 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1111111 2 1 33333333 1111 11111 111 11 1111 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22222222 11111 111 2 44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 11 2 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1111 33333333333333333 22222 111 33333333333333333333333333333333333 1111 11 2222 2222 33333333333333 111 555555555555555555555555555555 22222222 22 1111 1 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 222222222 333333333333333333333333333333 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 22 111 11 333333333333 1 11111 111 44444444 1 111111 1 11 111 1 111 333333333 22222222222222 111 11111 4444444444444444444444444 1111 1 444444444444444444444 1111 444444444444444444444444444444444444444444444 22 1111111111 11 11 1 1 1 44444444444 111 1111 111111 2222222222 111 11 333333 888888888888888888888 11111 11 333 11 111111 22222 222222 111 11 2222222 1111 11111 1 111 11 33333333333333 1 1 111 11111 11 1 11 3333333333 11111 111 2222222 11 1 1111111111 222222222222 1111 111 9999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 11 11 333333 44444444 111111 1111111 33333 2 111 2
lowQualScore : 66 8 8 8888888 0 1 2 66666666 4444 99 6 66666 111 8 11 8 7777 0 88 8 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 33333333 6 66666 111 7 6 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 99 8 11 66 3 6 8 666 3 6 3 888888888888888888888888888888888888888888888888888888 6 9999 3 4444 55 3 55555555555555555 6 6 22222 444 99 22222222222222222222222222222222222 5 8888 66 77 5555 77 77 2222 77 666 55555555555555 555 666666666666666666666666666666 5 0 11111111 00 2222 77 5 77 77 888 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 5 222222222 4 5 0 000000000000000000000000000000 8888 5 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 5 11 5 5 5 000 5 5 5 55 00 222222222222 77 1 55555 77 77 000 77777777 6 7 99 6 6 4 6 999999 99 1 77 99 111 3 6 111 444444444 6 11111111111111 777 5 999 99999 5 6666666666666666666666666 5 1111 2 5 999999999999999999999 5 5555 0 4 999999999999999999999999999999999999999999999 4 3 4 77 55 55 7777777777 00 22 4 0 5 66 888 5 0 5 1 77 77777777777 77 888 5 9999 666666 5555555555 222 5 5 99 5 5 1 333333 5 77 222222222222222222222 66666 00 888 33 77 5 444444 55555 888888 555 22 1 77 5 4444444 0000 99999 5 5 5 0 5 333 3 11 2 99999 5 5 5 55555555555555 5 0 5 3 4 777 5 0 666 22222 5 5 11 555 0 5 3 11 66 5 3333333333 5 0 5 5 5 4 11111 000 777 4 1111111 4 4 66 00 4 4 5 4 4 6666666666 4 4 0 777777777777 7777 777 66 999 777 4 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 11 88 5 5 5 555555 44444444 5 444444 66 5 0000000 0 888 5 00000 6 000 5 6 3
lowQualScore : .. . . ....... . . . ........ .... .. . ..... ... . .. . .... . .. . ............................................................... ........ . ..... ... . . .............................................................................................................................................................. .. . .. .. . . . ... . . . ...................................................... . .... . .... .. . ................. . . ..... ... .. ................................... . .... .. .. .... .. .. .... .. ... .............. ... .............................. . . ........ .. .... .. . .. .. ... ............................................................... . ......... . . . .............................. .... . ............................................................................................................................................................... . .. . . . ... . . . .. .. ............ .. . ..... .. .. ... ........ . . .. . . . . ...... .. . .. .. ... . . ... ......... . .............. ... . ... ..... . ......................... . .... . . ..................... . .... . . ............................................. . . . .. .. .. .......... .. .. . . . .. ... . . . . .. ........... .. ... . .... ...... .......... ... . . .. . . . ...... . .. ..................... ..... .. ... .. .. . ...... ..... ...... ... .. . .. . ....... .... ..... . . . . . ... . .. . ..... . . . .............. . . . . . ... . . ... ..... . . .. ... . . . .. .. . .......... . . . . . . ..... ... ... . ....... . . .. .. . . . . . .......... . . . ............ .... ... .. ... ... . .................................................................................................... .. .. . . . ...... ........ . ...... .. . ....... . ... . ..... . ... . . .
lowQualScore : 88 0 0 2222222 0 0 5 88888888 2222 22 7 77777 888 0 44 0 0000 8 88 0 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 00000000 7 77777 777 5 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 44 0 00 55 7 7 0 888 3 7 5 222222222222222222222222222222222222222222222222222222 7 3333 3 2222 77 2 22222222222222222 7 7 77777 888 22 55555555555555555555555555555555555 7 0000 77 99 7777 99 99 0000 99 777 44444444444444 777 333333333333333333333333333333 7 7 99999999 77 1111 99 9 99 99 888 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 7 999999999 3 7 1 111111111111111111111111111111 0000 7 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 7 44 7 7 7 000 7 7 7 77 99 444444444444 99 4 77777 99 99 000 00000000 7 7 22 7 7 0 7 222222 22 7 55 22 777 3 7 777 222222222 7 66666666666666 999 7 111 77777 7 0000000000000000000000000 7 0000 0 7 999999999999999999999 7 9999 9 4 333333333333333333333333333333333333333333333 4 9 4 33 66 55 5555555555 66 22 4 0 0 99 888 0 0 7 4 99 33333333333 99 444 7 0000 444444 0000000000 666 0 7 77 7 7 7 777777 7 99 333333333333333333333 77777 22 555 66 99 7 666666 99999 111111 777 11 7 00 0 9999999 6666 55555 0 0 0 0 0 888 4 99 2 88888 0 0 0 55555555555555 0 0 0 9 4 222 0 0 000 55555 0 0 99 555 0 0 1 99 99 0 4444444444 0 4 0 0 0 4 33333 888 999 4 9999999 4 4 11 66 4 4 0 4 4 6666666666 4 4 1 777777777777 2222 888 11 999 888 4 5555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 99 00 0 0 0 555555 66666666 0 444444 99 0 4444444 2 888 0 88888 4 000 7 7 3
consensus : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAGAC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----TTAT-TA-GT---------TCG-C----CCACCT--ATCA-------GTGGCA-------------------AGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-T-----------ATACTAAAC-AAATAC---------T--A-TAAA--C-GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA-AT---ATGCCCCCCACCCTTTT---AAAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTG-TCACTGATTTTTCCCTTCTAGC-A-AAC-A-T-TAAA-TCCTC-----GGCA----TGCA-TTTT-G--TA---ATTTA-T-------A-C-ATG--AAAA-TAAATTAC--T-ACC-GT----ACAAGGTTTTATTTTA-T---TTC-AA---TGGTAACTTT-A-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCTCT-TG-TA-CAGT--CTCT-T---ATGGCTT-GCAAG-GTGCGANTTTT--TC----TC--GTCTAT--AA--A-GC--A-ACATGTC-----------TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTGGTTT--TTC--TTGT---CTT--AAATAANTCAATA--ATAATA-AT-TAAA--TG-TA-TG--T--CCAATA---ACGG--A-GT-TG---------GGTGAC-AAC-TG--TGT-ATTAAA-CAG--T----AA--CCT--A-AATCCAA-CAAG------CA-----G--------TN-ATGGC--CCAAAGAG---GTAT----CTTCGTT-T--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-TCCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TC-TT-T--GTGAATAATTNA---------ATT--TTTG-TCAAA--G--TT--TT---GAAACAT--GTT--GAAAATA-A-TTAG--ATAA-TGTGCA-TGTAANAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A-CA--AGGAA---C-CAAT-------------TGTTTCATTC-TAA-TACTTT--C-GCATATAT-TTT-----AT-TA-------N--TTTG-AATC--CTGGAGAGGGG-GG---GG--GG-G----GTGT---CACG----GTG--------A---GTAT-TGATTTTAA-ATCAG-ATA--ATT--CG----------AT--TT--AAA-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAG-TT-GG--CC------AN--AGGTGT--GCG--AT-TCAA-T--AAAACA------ACAAAA----------ATAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-ACTG-CTATATA---G--CGAA-C--AG----A---TATTTTTTTT-TTTTTTTTTTTT-----ACAT-TGT---TCGGAG--TTACCC--ACA-AACAAAT--AAAAT----NCGTGCT----A-GG---TAAC-TTCGAC-TGATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AAC-GG-ACACAA-T-TACATAA---TTTTAA--ATAAATATTT--C--T-C-AT-TTT--C-TG--CAA--T-GTA-TG-GTAATT-A-T-TTTGTT-A-ACAAATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTT--AAA-T--A-C-ATA-AAGTA-TTGGT-T-CGC-TCT-A--T--TACG-T-TT--TGA-AAGTTG----T-CGTT-C-GT--A--A-TTTC-CC-GGGGC-GT-CTTCTCG-G-------T-CGAAGAT-TTCC-T-GT-------GGT----A---ACA--A-CCAA---AATCA-A--AC--------------ATTCG---------------AGA-G-------------------AAAAAGTTG---CATTTGCATT-A--T---------ATAATGG--GAAA-NTG-T-T-TT--A---TTTCG-----GAAAA-TTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATACT-GGAG---TA-CAACA-TCAT-CGG
Reference ( gi|3 ) : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAAAC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----TTAT-TA-GT---------T-G-C----CAACC---ATCA-------GTGGCA-------------------AGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-T-----------ATACTAAAC-AAATAC---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA------ATGCCCCCCACCCTTTT---AAAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTG-CCACTGATTTTTCCCTTCTAGC-ATAAC-A-T-TAAA-TCTTC-----GG-A----TGCA-TTTT-G--TA---ATTTA-T-------A-C-ATG--AAAA-TAAATTAC--T-ACC-GT----ACAAGGTTTTATTTTA-T---TTC-AA---TGGTAACTTT-A-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCTCT-TG-TAGCAGT--CTCT-T---ATGGCTT-GCAAG-ATGCGGATTTT--TC----TC--GTCTAT--AA--G-GC--A-ACAT-TC-----------TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTGATTT--TTC--TTGT---CTT--AAATAAATCAATA-AATAATA-ATATAAA--TG-TA-TG--T--CCAATA--AACTG--A-GT-TG---------GGTGAC-AAC-TG--TGT-ATTAAAGCAG--T----AA--CCT--A-AATCCAA-CGAA------CA-----G--------TA-ATGGC--CCAAGGAG---GTATC---CTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-TCCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TC-TT-T--GTGAATAATTAA---------ATT--TTTG-TCAAA--G--TT--TT---GAAACA---GTTCGGAAAATA-AGTTAG--ATAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A-CA--AGGGA---C-CAAT-------------TGTTTCATTT-TAA-TACTTT--T-GCATATAT-TTT-----AT-TA-------T--GTTG-AATC--CTGGAGAGGAG-GG---GG--GG-G----GTGT---CACG----GTG--------A---GTAT-TGATTTTAA-ATCAG-ATAT-ATT--CG----------AT--TT--AAA-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAG-TT-GG--CC-A----AC--AGGTGT--GCA--AT-TTAA-T--AAAACA------ACAAAA----------ATAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-ACTG-CTATATA---GC-CGAA-C--AG----ATTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-----ACAT-TGTTTGTCGGAA--TTACCC--ACA-AACAAAT--AAAAT----GTGTGCT----A-GG---TAAC-TTCGAC-TGATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AAC-GG-ACACAA-T-TACATAA---TTTTAA--ATAAATATTT--C--T-C-AT-TTC--C-T---CAA--T-GTA-TG-GTAATT-A-T-TTTGTT-A-ACAAATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTT--AAA-T--A-C-ATA-AAGTA-TTGGT-T-CGC-TCT-A--T--TACG-T-TT--TGA-AAGTTG----TGCGTT-C-GT--A--A-TTTC-CCGGGGGC-GT-CTTCTCA-G-------T-CGAAGAT-TTCCTT-GT-------GGT----A---ACA--A-T-AA---AATCA-A--GC--------------ATTTG---------------AGA-G-------------------AAAAAGTTG---C-TTTGCATT-A--T---------A-AATGG--GAAA-TTG-T-T-TT--A---TTTCG-----G--AA-TTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATACTGGGAG---TA-CAACA-TCATGCGG
gi|4 : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAAAC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----TTAT-TA-GT---------T-G-C----CAACC---ATCA-------GTGGCA-------------------AGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-T-----------ATACTAAAC-AAATAC---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA------ATGCCCCCCACCCTTTT---AAAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTG-CCACTGATTTTTCCCTTCTAGC-ATAAC-A-T-TAAA-TCTTC-----GG-A----TGCA-TTTT-G--TA---ATTTA-T-------A-C-ATG--AAAA-TAAATTAC--T-ACC-GT----ACAAGGTTTTATTTTA-T---TTC-AA---TGGTAACTTT-A-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCTCT-TG-TAGCAGT--CTCT-T---ATGGCTT-GCAAG-ATGCGGATTTT--TC----TC--GTCTAT--AA--G-GC--A-ACAT-TC-----------TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTGATTT--TTC--TTGT---CTT--AAATAAATCAATA-AATAATA-ATATAAA--TG-TA-TG--T--CCAATA--AACTG--A-GT-TG---------GGTGAC-AAC-TG--TGT-ATTAAAGCAG--T----AA--CCT--A-AATCCAA-CGAA------CA-----G--------TA-ATGGC--CCAAGGAG---GTATC---CTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-TCCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TC-TT-T--GTGAATAATTAA---------ATT--TTTG-TCAAA--G--TT--TT---GAAACA---GTTCGGAAAATA-AGTTAG--ATAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A-CA--AGGGA---C-CAAT-------------TGTTTCATTT-TAA-TACTTT--T-GCATATAT-TTT-----AT-TA-------T--GTTG-AATC--CTGGAGAGGAG-GG---GG--GG-G----GTGT---CACG----GTG--------A---GTAT-TGATTTTAA-ATCAG-ATAT-ATT--CG----------AT--TT--AAA-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAG-TT-GG--CC-A----AC--AGGTGT--GCA--AT-TTAA-T--AAAACA------ACAAAA----------ATAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-ACTG-CTATATA---GC-CGAA-C--AG----ATTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-----ACAT-TGTTTGTCGGAA--TTACCC--ACA-AACAAAT--AAAAT----GTGTGCT----A-GG---TAAC-TTCGAC-TGATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AAC-GG-ACACAA-T-TACATAA---TTTTAA--ATAAATATTT--C--T-C-AT-TTC--C-T---CAA--T-GTA-TG-GTAATT-A-T-TTTGTT-A-ACAAATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTT--AAA-T--A-C-ATA-AAGTA-TTGGT-T-CGC-TCT-A--T--TACG-T-TT--TGA-AAGTTG----TGCGTT-C-GT--A--A-TTTC-CCGGGGGC-GT-CTTCTCA-G-------T-CGAAGAT-TTCCTT-GT-------GGT----A---ACA--A-T-AA---AATCA-A--GC--------------ATTTG---------------AGA-G-------------------AAAAAGTTG---C-TTTGCATT-A--T---------A-AATGG--GAAA-TTG-T-T-TT--A---TTTCG-----G--AA-TTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATACTGGGAG---TA-CAACA-TCATGCGG
gi|2 : TCCG-AC-AT-CGACGACTTT-ACGGA--CCAAAACG--------------------CA----GG--CCGAT-TT-ATTTC-----ATTGCTT---AAAA-CA-CG-T--TGCAT----T-ATATA-GT---------C-G-C----CCACCT--ATCA-------GTGGCAGATTTCACCTATCAGTGGCAGATTTC-AAA--GCCC-CCC-----CC----T---TTTCGC-CAAAAA-T-----------TTACTAAAC-AA-TAT---------T--AATAAA-----AC-TCCA-GA--------T------TT------T--TA---CCC------AA------A--------AGCCTTTT---AAAAAGGCTACAACATATAATACCCCCC--TACTGG-ATCTG-TCACTA-------CTTTCTATC-A-AAC-A-TATAAA-TCCTC-----GGCA----TG-A-TTTT-G--TA---ATTCA-A-------AAC-ATG--AAAA-TAAATTAC--T-ACC-GT----ACAAGG-TTTA-TTTA-T---TT--AA---TTGTAAC-TA-A-CATAGA-GA--ACA---TTT--GAT--------TCTTT-TC-TA-TAGT--CTTC-T---ATGGCTT-GCA---GTGCGA--TGT--TA----TC--GTCTAT--AA--A-GC--A-ACATGTC-----------TG---AAGA-G------AA--AC-C-----AGCTA--A-AA-ACAC-ATAC-T----GTCTTCTC---------TCA--AG-TTTTGGTTT--TTC--TTGT---CTT---AATAATTC-AT---ATAAT-----TAAA--CG-TA-TG--T---CAAT----ACGGA-A-GT-TG---------GGTGAC-AAC-TGCATGT-ATTAA--CAGTTT----AA--CCT--A-AATCCAA-CAAG------CA-----G--------TC-ATGG---CCAAAGA----GTA-----CTTCGTT-T--------ACAAGAAAATGA----AA-------T--A-TTTCC-T-CCTGACTCAAGATTTTATAATGGAACT-ACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TCTTT-T--GCGAATAATT-A---------ATT--GTTG-TC-AA--G--TT--TT---GAAGCAT--GTT--GAAAATA-A-TTAG--ATAA-TGTGCA-TGTAAAAC-T------GA--TC-TTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---T-GAA--G------AC-AT-----TT-------ACT---A-CC--AGGAC---C-CAA-----------------TTCA--T-TAG-----TT--T-GAATATG--------------------------------------GGGGAGGGG-GG---AG-----------------CAC------TT--------A---ATAT-TGATTTTAA-ATCAG-ATA--ATT--CGATTTAACGTAAT--TT--AAA-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAG-TTGGG--CC-------T--AGGTGT--GC---AT-TCAA-A--AAATCA------AAATAA----------ATA----TTTTATC-TATTTT-GC-ACTG-TCATATA---G--CGAA-C--AG----A-AACATT-----------TTTATTTT-----ACA--TATCCGTTGAAG--TTACCC--ATA-AAC-AAT--AAAAT-----CGTGTT----A-GGGTATAAC-TT--------TT------------------TGTTTT----GTTGTTA-AAC-GA-ACACAA-T-TACATCA---TTTTAA--TTTAATATTT--C--T-T-AT-TTT--T-TG--CAAT-T-GTA-TG-GTAA-------TTTGTT-A-ACAATAA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTTTAAAA-T----C-AT--AAGTA-TTGGT-T-CGC-T-T-A------ACG---TT--TGA-AAATTG----TA-G-T-C-GT--A--A-TTTT-CCCGGGGC-GT-CTTCTTG-G-------T-CGAGGAT-TTCC---GT-------GGT----A---ACA--A-TCAG---GATCA-A--AC--------------AACTGTATTAAATAACTCGAAGA-G-------------------AAAAAGTTG---CATTTGCATTAA--C---------ATAATGG--GGAA-ATGTT-T-TT--AT--TTTCG-----GAAAA-TTGT------CTGAT--A-TA---A---ACAGTG---AAA-T---A-AAAATACT-GGAG---TA-CAACA-
gi|5 : tgagtaatattttccccgttaaaagaagagcttttcatttgcaaaatgtgctaactatttgaacaattcgataataaaccgttttcaagagtaaggtaccTCTGTTC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCC--AAACG-TTCGTCCAAGAA----CG-CA----GGGGCCGAT-TAT-TTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CA-CA-TGGTACAT----TTAT-TAAGT---------TCG-C----CCACCT--ATCA-------G-GGCA--------------------GATTT--AAAGCCCCC-CCC-----CCCCCCT---TTTCAC-CAAAAA-TATACTGAAACAATACTAA-T-AAAAAC---------T--C-TAGATTT-GGCACCCA-AA--------TGGCCTTTTAAAAA-G--GTTTTACCTACATAAATAT---ATGCCCCCC--CCTT-----AAAA-----------------------T--TTCTGG-ATCTGTCCA--GATTTT--CCTTCTAGC-A-AAC-A-T-TAAAATCCCA-----GGCA----TG-A-TTTT-G--TA---ATTTAAT-------A-CTATG--AAAAATAAATTA---T-AC--GT----ACAGG--TTTATTTTATT---TTT-AA---T-TTAACTTT-AGCATTGA--C--ACA--TTTT--GATT----TCTTCTC--TG-TA-TAGT--CTTC-T---ATGGCTT-GCA---GTGCGATTTTC--TCG---TC--GTCTCT--AA--A-GC--A-ACATGTC-----------TGA--AGGA-G------AC-GAC-C-----AGCT---ATAA-ACACGATACGT---CG-TTTCT--GCGT-CT-TCA--AG-TTTTGATTTTGTTC--TTTT---CTT--AA--AATTCAAT---ATAATATAT-TAAA--TG-TA-TG--T---CAATACGGAC----A-GTGTG---------GGTGACAAAC-----TGT-ATTAA--CAG--TA---AA--TCT--AGAATCTAA-CAAG------CA-----GCCCGCATTTA-ATGG---CCAAAGA----GTAT----ATTCGGTTT--------ACAA-AAAATGA----AA-------T--ATTTTCC-TCCCTGA-C-----------------ATT-ACAT------------------ATG-TAC-CA-ATTC-T---C-TC-TTGT--GTGAATAATTAT---------TTTGATTTA-TTAAAATG--TT--TT---
gi|7 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggggagggggggggggggggtgaagatatgcaccttaaatgaattaatttaaacatcaatttatgtaaattcgatttcaagagatagcagatactTCC-TACTAT-CGACGACTTGGACG-GTCC-AAAACG-TCCGTCCAAAAC-----G-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAAACAACG-TGGTACATATTATTAT-TA-GT---------TCG-C----CCACCT--ATC--------GTGCCA--------------------GATTC------AACCCTCCC-----CCCCCCT---TGTCACCAAAAAG-TATACTAAACA-ATACTAA-T-AAA-AC---------T--C-CAGATTTTGAC-ACCC-GAAAGGGCCTT------TTAAAAAAG--GCTTTACC------TACATTATATGCC----ACCCCTTT---AAAA-----------------------TATTTCTGGATCCTG-TCACTGAATTT--CCTTCTAGC-A-AAC-ACT-TAAA-TCCTC-----G--------GCA-T-----------------------------------------AAATTAC--T-ACCTGT----ACAAGGTTTTATTTTA-TATTTTT-AA---TGATA-CTTT-A-CATTGACAA--ACA--GTT---GATT----TCTTTTCTCTG-TATAAGC--TTCT-----ATG-TTT-GCTCA-GTGCGATTTTT--TCCG--TC--GTCTAT--AA--AAGC--A--CATGTC-----------TG---AAGAAG------AG-CAC-CA-----GCT---ACAA-ACACGATAC-T---CG-TTTCT--GCTT-C--TCA--GCGTTTTGA-TT--TTC--TTGT---CTT--AAAAAATTCAATATAAT--TA-ATAT-AA--TG-TA-
gi|15 : aatgcaactgttcacgtcgactgagtaatgtttttgtccgcgttaaaagaagacgctgtttttattgcaaaaattgctaactatttatgaaacaacgcgagggagggggggggggtaaatgaagatagcacttaaaatgaaattaattaaaccatcaatttattaaaattgatttcaagagagataaaggtaccTCCGT-C-ATTCGACGACTTGGACT-GTC---AAACGGTCCGTCCAAGAA----CGGCACCTCAG--CCGATGTGTATTTC-----Acaatgtaaagtagtaagtaagtaagtaattgtatttatta
gi|17 : aagcaactgttttccgcgactggagtaatgtttttctctgctaagtaatatgaggtgattgagcgcgcacagaaggtatgtgagagatgcggtgcgaattgagaggctgagatgaaataagaaggtaaaaacaccttaataggtgatattaaatattaaaccatcacattttatgaaattcgatttaagactgataaggtaacCCGTCCAAGACGTAACG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTCTTTCAGTTGCTTTATAAAA-C-ACGTTGGTACAT----TTA--TA-GTAAGTATTTCT-GACAATACAACCTAGATCAAGGATTGGTGAC--------------------AGATTTCAAAAGAGCCC-CCCCCCCGCCCCTTTCCCTTCCAC---AGGA-T-----------A-ACTAAACAAAATATTCGCCAGGAT--A-TAAAAAC-GAC-TCCACGA----------------T------A--GC---AC
gi|1 : C-CCC-----ACCCTTT---TTTCAC-CAAAAACT-----------ATA-TAAAT--AATAC---------TTAA-TAAA----AAC-TACA-AA--------T------TT------GCAAC---ACC------AA------A
gi|1 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccagcgGCCCC---CCCTTTTACAAAAA-----------------------G--TTTTGA-TCTGG-TCACTGAATTTTCC--TCTAGCAAAAACAA-TATAAG-TCCTC-----GGCA----TGAATTTTT-GACTAAATATTCA-TTCCCAAGA-T-ATGAAAAAA-TAAAATAC--TAACC-GTAAACACGAATTGTTATTTTA-TTCGTTCTAATCGTGATAACTTTAA-CATTGA-CAT-ACACTTTTT--GATA----TC-------------CA---------T---ATGGCTTAGCAAG-ATTC-GATTGT--CTGACGTC--GTCTAT--AAAGG-GC--A-A-ATGTT-----------TGGACAGGA-A------TGTCACACA----GACTTACA-AA-ACACCCTAT-T---T-CTCTCTCTGCTTACTGTCA--AGTTTTTGATTT--TTCCTTCGTTCCCTT----ATAA--CAAT----TCACA-AT-TAAACTTGATA-TG--TCGCCAAT---AACAGATA-GT-TGCGTGTGTGCGTTGAC-AACATG--TTTGATTTAA-CAG--TACAAAA--CC-----AATCAAA-CAAGACTATCCAT----G--------TT-ATGGC--C--AAGAGTTTATGTA---CTGCGTTTG--------AC--------------------------A-TTTGC-TCCGTGACT-----------------AAT-ACAT------------------A-G-TAACCA-A-TC-TTTCT-TC-TT-T--GT-AATAATTCT---------GTT--CTTG-TC-AA--G--TTTATC---GAAAAAAT-GTT--GAATATT-ATTAAA--ATAA-TGTGCG-TGT-ATAC-T------GA--GCTTTTGTACATT--CCGCGAA-TAT--C---CAGA----------ACTAT-----TT-------ACCAA-A-CA--AGTGAACCC-CGAT-------------TG-----TTC-TAATTACTTT--C-GCAT-TAT-TTT-----TT-TAATCTCAGT--TTTGAAATT--ATGGA-AGGAT-GGTTCTG--GG-G----GTG----CAC-----GTA--------G---GACT-TGATTTTAA-ATCAGTGTATAATTCACG----------ACTATT--ATA-GT-A-T--TTTTTCTTAC-ACAT---ACTTGTTT-GG--CCTAGGATAG--AGGTAT--GTG--AT-TCAACT--AAAACAGAGTAGACAAAAACCCAAAGATATAATTGTTTTATC-TATTTTAGC-ACTGCCTAAATACACGT-AGAA-C--AG----AAAATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTACATAT-TGT---TCTGAGT-TTACCCCAGCATAACAAGCTAAAAATCTTAGTG-GTT----AGGG---TAA--TTCGACTTGATTT-T---A---AA----AAAATGTT-TTG--TGTTA-AA--GG-ACACAA-T-TACATA-----TTTAA--AT-AATATTTTGC--TCC-ATATTCTGC-T---CAAT-T-GCA-TG-ATTACT-A-A-TTTGTT-ATAC-AATA-----AC-GGCAATGATA--TAT----GA-T-TAAA--TTAT--TAA-TCCA-C-AT--TAGTACTTGGT-T-AGC-TCT-ATGT--TACG-TGTT--GGA-AAGTTG----T-CGTT-C--T--AT-A-TTTC-CC-GGGGT-GT-CTTCTCAGG-------T-CGAAGAT-TT-CTT-GT-------GGTTGAAA---ACA--A-TCAA---AATCA-AATGC--------------AATT------------------------------------------------------TTTGCATA-A--T---------ATGGCGG--TAAA--TG-T-G-TT--A----TTCGGTAAAG--AA-TTGT------CTGAT--A-CA---GTACACGTTG---AAATTA--ATATAATACT-GGAG---TATTAACACTCATaatgaacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggcccccccttttacaaaaagttttgatctggtcactgaattttcctctagcaaaaacaatataagtcctcggcatgaatttttgactaaatattcattcccaagatatgaaaaaataaaatactaaccgtaaacacgaattgttattttattcgttctaatcgtgataactttaacattgacatacactttttgatatccatatggcttagcaagattcgattgtctgacgtcgtctataaagggcaaatgtttggacaggaatgtcacacagacttacaaaacaccctatttctctctctgcttactgtcaagtttttgatttttccttcgttcccttataacaattcacaattaaacttgatatgtcgccaataacagatagttgcgtgtgtgcgttgacaacatgtttgatttaacagtacaaaaccaatcaaacaagactatccatgttatggccaagagtttatgtactgcgtttgacatttgctccgtgactaatacatagtaaccaatctttcttctttgtaataattctgttcttgtcaagtttatcgaaaaaatgttgaatattattaaaataatgtgcgtgtatactgagcttttgtacattccgcgaatatccagaactatttaccaaacaagtgaaccccgattgttctaattactttcgcattatttttttaatctcagttttgaaattatggaaggatggttctgggggtgcacgtaggacttgattttaaatcagtgtataattcacgactattatagtattttttcttacacatacttgtttggcctaggatagaggtatgtgattcaactaaaacagagtagacaaaaacccaaagatataattgttttatctattttagcactgcctaaatacacgtagaacagaaaatattttttttttttttttttttttgtacatattgttctgagtttaccccagcataacaagctaaaaatcttagtggttagggtaattcgacttgattttaaaaaaatgttttgtgttaaaggacacaattacatatttaaataatattttgctccatattctgctcaattgcatgattactaatttgttatacaataacggcaatgatatatgattaaattattaatccacattagtacttggttagctctatgttacgtgttggaaagttgtcgttctatatttcccggggtgtcttctcaggtcgaagatttcttgtggttgaaaacaatcaaaatcaaatgcaatttttgcataatatggcggtaaatgtgttattcggtaaagaattgtctgatacagtacacgttgaaattaatataatactggagtattaacactcatcacggtcaccgaaatt
gi|10 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccagcgccccacccttttttcaccaaaaactatataaataatacttaataaaaactacaaatttgcaacaccaaaaatgaacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctgCTG-TTCTTTCTTCCTAGC-A-AAC-G-T-ATAA-TCCTCCTGTGGG-ACTTCTTTA-TTTTCG--CT---ATTTT-C-------T-C-GCA--CAAA-TAA-TTACACC-ACCCGC----ACAAGGTTTT---TTG-C---T-------------ACTCT-A-CATCGA-GACTACA--CTCTCTGATTCTTCTC-TCTCT-CGCTACTACG--CTCT-TTCTATGGC------AG--TGCGCTTTCT--TC----TCTCGTCTACTCAC--C-GC--ACATGT-CC-----------TG---AGGA---------------------AGC------------CGATAGAT---TGGCTTCT--GCTT-CT-TTC--ACATTTTGGTTT--TTC--TTGT---CTTTTAAAT---TC-------TCATA-CT-TAGA--TG-TA-TG------CAATA----CGG--AAGT-TG---------G-TGAC-GAC-TG--T---ATTAA--TAG--T----AC--CCTCTA-ACTCCA--C-AG------C------G--------TC-ATCGCACCCGAG-------TAC------TCGTT-T--------ACAAGAAAAT-G----AACTACCTGT--A-TTTCT-TTTCTGACT-----------------GC-AAGATTTTATAAGGAACTACTTGATG-TC--CAGA-TC-T---C-TC-TT-TTTGTGAATAACTTA---------ATT--TTTGCTC--A--G--TT--TTTCGAAAACAT--GTT--GAAAATC-A--TAG--ATAA-TGTGCA-TGTAAAACTT------GA--GC-TTTGT-CATCGGCC---AATTATGCC---CACGA--GTGA---AC-AT-----TTAGCTCTAACCTATA-CC--AGGAAC--C-CCAT-------------TG------TC-TAC-TACTTT--C-GCAT-TAT-TTT-----TT-TA-------TTCGTTT-GGCT--CTGGAGGGGGG-GG---cacggtcaccgaaatt
gi|9 : -TAACGGTACCTTTCT---ATTGCTT-GCAAGTAGGCG-ATTTTATTC----TC--GTCTAT--AA--ACGCTAG-AGAC-TCACATGGTTGCATG---AGGA-GCTTATGAC-TAC-CATGACACCC---ACAATACACGATAC-TGTGCGTTT-CTG-GCTT-TG-ACAGAAGATATTGGTAT--TT----TGT---CT-----ATATCTTGATA-GA-AACACATTCAAA--AA-GA-TGGAT--CCA---------G--A-GT-TA---------TTTAAC-A-------------TAAA--AG------------CT--A-AATCTAA-C-AA------CAAGAAGG--------TATATG-C--TGAAAGAG---TTAATAAACTTCGTCGCGCTGGACGACAAGACACT-ACTGAAA-------TTAA-TGTCCGTCCCTGACC-----------------ACTA-CAT------------------ATGGTAGCTG-A-GCGT---CGTC-TT-T--G--AATACTAGAGAGAGATGTATA--TTCGCTCAAC--G--TC--TT---GAAACAATGGTTAGAAAAATACATTTAGTCATAAATATGCA-TGTAATAC-TCGGCGAGA--GCTTT-GTC-ATC--AC---AAGTAT-CCACTCAGTA--GGATCATAC-ATGCATTTT-------ACC---AACAGAAGGCA---CTCAATGGGCGAGGCATGATGTTTCATTAATAA-TACTTTATT-GACTATAT-TCTTTCTGAT-TA-------G--TTTG-AATAAGCTGG-GAGGAGCGG---GG--GGCG----GTGTTGTCACGTAGTATG--------ATTTGTAT-TTATT---A-ATCAG-ATAA-GTT--CG----------A
gi|6 : cttatGT---CTT--AAA--AATCA------TATTA-GTA--AA--TGGTACTG--A--TCAATA----CGG--AAGT-TG---------GGTGAC-AGA-AG--TTT--TTGTAACAG--T----AAAACCT--A-AATCCAATCCAAGG----CA-----G--------TC-ATGGC--C-AATAAG------------TT--TT----------------AAAT-A----A-------------TTCCT-TCCCTGG----------------------GAC---------------------TG-TA--CA-A-TC-T---C-TC-TT-TTTGTGAATAATTAA----------TT--TTTG-TCAA---GCTTT--TT---GAAACAT--GTT--GGAAATA-AAGTAG--ATAA-TGTGCAACGTAAAAT-T------GAATGCATTTGTC-ATC--CC---AA-TAT-CC---AAGAAAAG------AC-AT-----TA-------ACT---A-TC--AAGAC---C-CAAT-------------TGTCTCATAC--AA-TACTTT--C-GCAC-TATCTTT-----ATCTA-------G--TTTG-AATC---TGGAGAGGGG-GG---GGCCGG-GAATCGGCT---CACC----GTATAAATCATA---GTATCTGATTTTAACATCAG-ATA--ATT--CA----------ATA-TT--AACTGTCA-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAG-TT-GGGCCC-T----AA--AAGTGT--GTATTCT-TTAA-A--AAAACG------CCAAAC----------ATAAATGTTTTATCGTATTTCTGC-ACTG-CTATATA---CG-CGAACC--AG----A
gi|8 : -------ACC---A-CA--AGGAC---C-CAAT-------------TGTT-CAT----AA-TACTTT--TTGCATATTT-TTTT----AT-TA-------G--TTTG-AATC---TGGAGAGGAG-GGT--GG--GG-G----GTGT---CACG-----T---------A---GTAT-TGATTTCAA-ATCAG-ATA--ATT--CG----------AT--TT--AAA-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAG-TTGGG--CC-------T--AGGTGT--GC---AT-TTAA-TAAAAAAAA------ACCAAA----------ATAAATGTTTTAAC-TATTTT-GC-ACTG-CTATATA---G--CGAA-C--AG----A----A-------ACTTTTTTTTTTAC-----ATAT-TGT---TCGAAG--TTACCC--ATA-AAC-AAT--ACAAT-----TGTGCTG---G-GG---TAAA-TTTGAC-TGATTT-T---TAAAAA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AAC-GG-ACACAA-T-TACATAA---TTTT-A--ATGAATATTT--C--T-C-GT-TTT--C-T---GAAATT-GTA-TG-GT-ATT-A-T-TTTGTT-A-AC-AATA-----AT-GACAATGA-A--TAC-TTATA-T-TAAAC-TTTT--AAA-T--ACC-AT--AAGTA-TTGGT-T-CGC-TCT-A--T--TACG---TT--TGA-AAGTTG----T-TGTT-C-GT--A--A-TTTT-CCCGGGGC-GT-CTTATCG-G-------T-CGAAGAT-TTC--T-GT-------GGT----A---ACA--T-TCAA---AATCA-A--AC--------------ATTTGA--------------AGA-G-------------------GGAAAGTTG---CATTTGCATTAA--C---------ATAATGG--GGAA-ATG-T-T-TTTAA---CTTCG-----GAAAA-TTGT------CTGAT--A-CA---A---ATGGTG---AAA-T---A-AAAATACT-GGAG---TA-CAACA-TCAT-CGGaacatttcggtgaattacccacaacaataaaaatcgtgctaggaaaacttcgacgatttttaaaaacaatgttctgttggtcttgacaacggacacgatttacataagtcttttcataaaatattttcgtctattttcatgcacattgtactggtatttacttttgttacaccataaccgtacggcaatgaattattaagatttttttaaattacccacaactatttacgtttttgaaagttgtcgttcgtaattttcccggggcttctcggtcgaggatttccgcggtaataacacaaaatcaac
gi|18 : gttcctagaaaaaatacatcgatattttataattatatagcgaagtaatactgtannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnC--CTGAGGGGGGC-GG---GA--GT-A----GTGT----AC------TA--------A---ATAT-TTATTTTAA-ATCA--ATA--ATT--CG----------AT--TTTAAAA-Gtcg
gi|11 : tgcaactttcacagtcggacatacgtcatcacaatgcaaacgttcacaccgaaactgcgtaattttttccgcactgaaaaaatgcttttttattgcacaagctgcgctaaactattcttgaacacaacggggtgggatggggcgaGAGGGG-GGC--GG--GA-GTA--GTGT----AC------TA--------A---ATAT-TTATTTTAA-ATCA--ATA--ATT--CG----------AT--TTTAAAA-GT-ACA--TTA---AC-C-ACATGGCACTAG-TT-GG--CG-C----CT--AGGTGCTAGCA--TT-TCAA-------ACA------ACAAAA-----------TAACG-CTTAATC-T-TTTTGCA-ACTC-ATA-ATA------CTAA-CTCAG----AA---ATTTTTTTTATCTATATAT--------ATAA-GGT------GAACGTTACCC--ACA-AACAA-T--ACAAC----TCGTGCTTCAGACGG---TAACATTTTAC-CGATTT-T---T---AA----AAAACTTT-TTG--T-TTA-AAC-G--ACACCACT-TA-ATAAA--TTTTACC-ATAAATTTCT--C--T-T-AT-AT-----T---TAT--T-GCT-TG-TTATTTCA-TGTTTATTTA-ACAA-TA-----AC-GCAAATGA-ACTTAC-T-AGA-TATCAT--TCTT--AAA-T--A-CCGTA-GAATA-TATGTAT-CGCCTCT-A--TATTAC--T-TT--TGACAAGTTGATTCTAAGTT-C-GTCCA--A-TTTTTCCGAAGTT-GT-CTTCTCT-T-------TTCGAAGAT-T--CTCAGTAAGGAACGGT----ACAGACT--A-C-AACTTAATCA-A--AT--------------ATTCGCA-------------AGA-G-------------------ACACAGAT------TCTGCATC-A--TCTGCTTAACATAATGGCGGATA-ATG-T-T-TT--ACTTTTTCG-----A--AAATTG-------CT-ATTAA-CA---A---AATGTG---AAA-T---C-AAAATACGTGAAGCACTA-CTACA-TCAT-CGG
gi|4 : t----GTG----CATGT---GTG--------A---AAAT-T-ACTTTAA-ATCGA-ATAT-ATC--TG----------AT--TT--AAA-ATCA-A--TAC---TCAC--CGTGACAC
gi|13 : tccgtacatcgacgacttggacgagtcccaaaacggtccgtacaaaaccgtcaggccgattttatttcattgctttaaaacaacgtggtacatttattagttgccaaccatcagtggcaagatttcaaataaccccccccccttttttcacgcaaaaatatactaaacaaatactataaagactccagatttggcaccaaatgccccccacccttttaaaatttctggttctgccactgatttttcccttctagcataacattaaatcttcggatgcattttgtaatttatacatgaaaataaattactaccgtacaaggttttattttatttcaatggtaactttacattgagaacattttgatttcgtctcttgtagcagtctcttatggcttgcaagatgcggatttttctcgtctataaggcaacattctgaggagagcaccaagctaaaacacgatactcgttttctcgcttcttcaagtttttgatttttcttgtcttaaataaatcaataaataataatataaatgtatgtccaataaactgagttgggtgacaactgtgtattaaagcagtaacctaaatccaacgaacagtaatggcccaaggaggtatccttcgttgtacaagaaaataaatatttcctccctgaccactaacatatgtacaatctctctttgtgaataattaaatttttgtcaaagttttgaaacagttcggaaaataagttagataatgtgcatgtaatactgagcttttgtccatcccaatatcccagaagacatttaccacaagggaccaattgtttcattttaatacttttgcatatattttattatgttgaatcctggagaggaggggggggTT--CG----------AT--TT--AAA-GT-A-AATTTT---TCACCACACT-CACTAG-TG-GG--C-------ACCTAGGTGT--GCC--ATCTTAA-T--AAAATA------ACAAAT----------A-AATTGTTTTAAC-TATTTTTGCTATGG-CTATATA---TCGCGAA-C--AGAAAAAT---------------TTCTTTTTTT-----ACATATGTAGTTCGAAG--TTACCC--ACA-AAC--AT--GAAAT----ATGTGCT----AGGG---TAACTTTCGAC-TGATTT-TAAAA---AA----AATGTTTT-T--GTTGTGA-AAC-GGAATACAA-G-TACATAG---ATTTAAAGATAAACATTG--T--C-C-AT-TTT--C-TTGCCAT--T-GTA-TGTGTAATT-tagttggccaacaggtgtgcaatttaataaaacaacaaaaataatggtttcatctattttaacactgctatatagccgaacagattttatttttttttttttttttttttacattgtttgtcggaattacccacaaacaaataaaatgtgtgctaggtaacttcgactgattttcaaaatgttttttggttgttaaacggacacaattacataattttaaataaatatttctcatttcctcaatgtatggtaattattttgttaacaaataacggcaatgaatacttagattaaattttaaatacataaagtattggttcgctctattacgttttgaaagttgtgcgttcgtaatttcccgggggcgtcttctcagtcgaagatttccttgtggtaacaataaaatcaagcatttgagagaaaaagttgctttgcattataaatgggaaattgttttatttcggaattgtctgatacaaacggtgaaataaaaaatactgggagtacaacatcatgcgg
gi|6 : aatattatttcataatgtgcatgtaataacaacGAA--TTACCC--ACA-A-CAA-T--AAAAA----TCGTGCT----A-GGA--AAAC-TTCGAC--GATTT-T---T---AAAAACAATGTTCTGTTGGTCTTGACAAC-GG-ACACGATT-TACATAAGTCTTTTCA--TAAAATATTT--TCGT-CTAT-TTT--CATGCACAT--T-GTACTG-GTATTT-ACT-TTTGTT-ACAC-CATAACCGTAC-GGCAATGA-AT-TAT-TAAGA-T-T--T--TTTT--AAATT--A-C-CCACAACTA-T------------------T--TACGTT-TT--TGA-AAGTTG----T-CGTT-C-GT--A--ATTTTC-CCGGGG------CTTCTCG-G-------T-CGAGGAT-TTCC---GC-------GGT----A---ATAACA-C-AA---AATCA-A--
gi|12 : gtcttaaaaatcatattagtaaatggtactgatcaatacggaagttgggtgacagaagtttttgtaacagtaaaacctaaatccaatccaaggcagtcatggccaataagttttaaataattccttccctgggactgtacaatctctctttttgtgaataattaatttttgtcaagctttttgaaacatgttggaaataaagtagataatgtgcaacgtaaaattgaatgcatttgtcatcccaatatccaagaaaagacattaactatcaagacccaattgtctcatacaatactttcgcactatctttatctagtttgaatctggagaggggggggccgggaatcggctcaccgtataaatcatagtatctgattttaacatcagataattcaatattaactgtcaattttcacacatgcactagttgggccctaaaagtgtgtattctttaaaaaaacgccaaacataaatgttttatcgtatttctgcactgctatatacgcgaaccagaaacatttcggt-TGATTTAT---T---AA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AACCGG-ACACAA-TATACATGA---TTTTTG--ATAAATTTTC--T--T-C-AT-TTT--C-TG--CAA--TTGTAATG-GTA-TT-A-T-TTTGTT-A-ACAA-TA-----AC-GGCAA-GA-A--TACATTAGAAT-TCAA--GTTT--A----------------GTA-TTGGT-TTCGC-TCT-A--T--TACG-T-T----GA-AAGTTG----TTCGTT-C-GT--A--A-TTTC-CC--GGGCAGTCCTTCTCG-G-------T-CGAAGAT-TTTC-T-GT-------GGTATA-A---ACA--ACC-AA---AATGA-A---C--------------ATTTG---------------AGA-AGATACAAAGTTTTGAAGATAAAAAGTTG---CATTTGCATT-AACT-----------AATGGC-GATA--TG-T-T-TTTCT---TTTCG-----GAAAA-TTGT------CTAAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-T---A-AAAATATT-GGAA---TA-CAACA-TCc
gi|14 : AGTT-A-T-TTTGTT-A-AC-AATA-----ACGGGCAATGA-T--CAC-TTAGACT-TAAATTTTTT--AAA-T--ACC-AT--AAGTA--TGGT-T-CGC-TCTCA--G--TACG-T-TTGATAA-TGGTTG----TTCGCTACGGC--A--A-TTTT-CC-GGGGC-GT-C-TCTCC-GCACCGATT-CGAAGATATTCTGA-GTA------GGT----A---TCT--A-C-TA---GATTACA--AT--------------AATCA---------------AGATG-------------------CAA---TTATATC-TTTACATG-G--G---------A-A------GAAA-TTG-TGTGTT--AAGTTTTCGTAAA-A--AA-TTGTTCCACCCTGAT--ATCACTTA---AGCGTGGAAAAA-TAATA-AAAATACTAGttc
gi|16 : -A--T--TACG-T-TT---GA-AAGTTG----T-CGTT-C-GT--ATGA-TTTT-CCTGAGGC-GT-CTTCTCG-G-------T-CGAGGAT-TTCC---GT-------GGT----A---ACA--A-TCAA---AATCA-A--ACAACTGTATTAACTAATTCGA--------------AGA-G-------------------AAAAGGTTG---C-AAAACAT-----------------AATGG--GGAACTTT-T-T-TT--AT--TTTCT-----GAAAA-TTGT------GTGAT--A-CA---A---ACAGTT---AAC-T---T-AAAATATT-AGAG---TA-AAA
7 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|20 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): TGCTAACTGGTTCAGTCGACTGAGTAATGTTTCTCACGCGTTAAAAAGAAGAGGCTGTTTTTATTGCAAAATGTGCTACTTTTTGAACACGAGGGGAGGTGGGGGATAAGAAGATATGCACTTTAAAAGAAATAATCAAACCACAATTTTTAAATTCGATTTAGAGACG
Unaligned ( gi|22 ): ACCTGTTTTTTCTACTAAATCAGAAGAGCTACCGTTTTTAATTTGCAAATAATAAGCTAACTTCATTTTTGAATCCATACGAGGGGAGGGGGGGTGGGGGGGTAATTGAAGATGAGAGTCACTTAAAATGAATTGTAGAAATTAAACTATCCATTAATC
Unaligned ( gi|23 ): TGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAGGGGGGGATGAAGATTTATTAAATTCGATTTCAAGAGAT
Unaligned ( gi|24 ): ATGCAACTGTTTACGTCGACAATACGACCTCACAGCGCACTGTTTATGTCGATTGCGTAATTTTTTCCG
Unaligned ( gi|25 ): AATGCACTGTGCTTTCATGGTCCGATTAGGGAGTTAC
Alignments
lowQualScore : 1 1 2222222 1111 11111 1111 111111 111 1111 666666666666666666666666 2222222 1 111 11111 111 1 1 22222222222 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 111 66666666666666666666666666 11 1 1111 1111 1111111 1111 111 22222222222 11 1 1111 2222222222 11111 1 11111 111 222222222222222222222222 1111 11 1 1111111111 111 111 333333333333333333333333333333 1 11 1 33333 1111 222222 22222222222 222222222 1111111111 11 1 111111111111 222222222222222222 3333333333333333 2222222222 222222222222222222 666666666666666666666666666666666666666666666 11 111111 33333333333 1111 1 111 11 11111 11 111111 11 1 1111 222222222 11111111111111 11 2222222222222 1111 1111 1 11111 222222222 1111111 4444444444444444444444444444444444444 1111 1111111111 11 33333333333333 1 1111 111111 2222222222 1 22222 5555555555555555555555555555555555555555555555 1 111111 222222 1 11 1111111 1111 22222222 11 11111 11 11 222222222 11 11111111 111111 1111 1 1111111 2222 1111111 1111 111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333333 111111 22222 11111 1
lowQualScore : 3 6 6 9 0 5 0 66 1111111 2222 77 5 44444 99 6 7 6 4444 6 999999 6 555 4444 2 000000000000000000000000 1111111 5 6 222 5 44444 000 1 1 1 77777777777 5 5 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 5 3 111 88888888888888888888888888 6 66 11 1 1 5 7777 5 2222 7 7777777 2222 000 88888888888 5 33 77 5 1 2222 22 1 5 0000000000 66666 1 66666 111 77 222222222222222222222222 3 888 5 6666 5 5 66 66 66 66 0 66 5555555555 77 333 333 333333333333333333333333333333 5 0 9999 2 3 66 5 55 66 0 66 66 777 9999 6666 3 11111 8 1111 66 999 4 000000 66666666666 5 000000000 5 3333333333 33 0 777777777777 66 5 888 66 222222222222222222 1 5 999 5 0 5555555555555555 5 4444444444 2 2 666666666666666666 5 5 000000000000000000000000000000000000000000000 5 88 5 5 5 5 5 888888 22222222222 0000 0 3 333 66 66 888 66 5 55555 5 55 5 66 5 5 5 1 5 444444 66 9 0 22 66 888 0 5 1111 777777777 5 66666666666666 888 11 66 5 5 5 66 7777777777777 0 6 8888 5 3333 2 888 5 55555 4 1 666666666 2222222 3 7 8888 55 4 3333333333333333333333333333333333333 777 55 4 8 5555 777 8 3 55 5555555555 4 55 11 4 5 5 66 888 5 5 5 55555555555555 66 7 5 888 5555 444444 1111111111 44 5 0 5 5 5 0 66666 5 5 66 6666666666666666666666666666666666666666666666 66 5 5 66 5 5 5 666666 5 333333 0 22 4 4 5555555 9999 7777 4 4 4 4 4 4 4 777 77777 77777 8 4 8 00000000 8 8 4 2 4 555 4 4 11 4 11111 4 4 00 66 8 4 1 00 66 4 000000000 555 4 4 66 4 55 44 4 4 11111111 111111 55 6666 2 44 4 8 3333333 1111 7777777 5555 4 555 777 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 777 777 9999 8 2 1 66 5 4 4 4 000000 4 66 9999 222222 66 4 8888888 777 4 55555 4 8 888 22222 5 5 1
lowQualScore : . . . . . . . .. ....... .... .. . ..... .. . . . .... . ...... . ... .... . ........................ ....... . . ... . ..... ... . . . ........... . . .......................................................................................... . . ... .......................... . .. .. . . . .... . .... . ....... .... ... ........... . .. .. . . .... .. . . .......... ..... . ..... ... .. ........................ . ... . .... . . .. .. .. .. . .. .......... .. ... ... .............................. . . .... . . .. . .. .. . .. .. ... .... .... . ..... . .... .. ... . ...... ........... . ......... . .......... .. . ............ .. . ... .. .................. . . ... . . ................ . .......... . . .................. . . ............................................. . .. . . . . . ...... ........... .... . . ... .. .. ... .. . ..... . .. . .. . . . . . ...... .. . . .. .. ... . . .... ......... . .............. ... .. .. . . . .. ............. . . .... . .... . ... . ..... . . ......... ....... . . .... .. . ..................................... ... .. . . .... ... . . .. .......... . .. .. . . . .. ... . . . .............. .. . . ... .... ...... .......... .. . . . . . . ..... . . .. .............................................. .. . . .. . . . ...... . ...... . .. . . ....... .... .... . . . . . . . ... ..... ..... . . . ........ . . . . . ... . . .. . ..... . . .. .. . . . .. .. . ......... ... . . .. . .. .. . . ........ ...... .. .... . .. . . ....... .... ....... .... . ... ... ............................................................ . ... ... .... . . . .. . . . . ...... . .. .... ...... .. . ....... ... . ..... . . ... ..... . . .
lowQualScore : 5 7 7 8 8 0 7 11 4444444 1111 99 7 33333 22 7 3 7 2222 7 222222 7 888 2222 5 777777777777777777777777 7777777 5 7 666 7 33333 000 4 4 4 11111111111 7 0 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 0 2 777 33333333333333333333333333 7 99 44 7 4 7 9999 7 1111 9 6666666 9999 000 44444444444 7 66 99 7 4 1111 11 4 7 0000000000 00000 4 77777 444 99 111111111111111111111111 0 666 0 4444 9 0 99 99 99 99 0 99 5555555555 55 888 888 888888888888888888888888888888 0 0 0000 0 2 99 0 44 99 8 99 11 888 7777 1111 6 11111 9 4444 11 888 4 000000 88888888888 0 000000000 0 2222222222 44 0 555555555555 99 0 888 99 888888888888888888 0 0 444 6 9 8888888888888888 0 1111111111 5 5 666666666666666666 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 0 0 0 0 555555 99999999999 6666 0 2 111 99 99 888 44 7 99999 0 11 0 99 0 0 0 0 0 444444 99 5 1 66 99 888 0 0 5555 666666666 0 55555555555555 888 99 99 0 0 0 99 5555555555555 1 2 0000 0 0000 4 888 0 66666 4 0 222222222 8888888 6 3 5555 55 0 3333333333333333333333333333333333333 000 55 0 0 6666 000 0 6 00 9999999999 0 55 00 0 0 0 99 888 0 0 0 44444444444444 99 9 0 888 5555 444444 9999999999 11 0 8 0 0 0 4 99999 0 0 99 4444444444444444444444444444444444444444444444 99 0 0 99 0 5 0 111111 0 555555 0 55 4 4 7777777 4444 6666 4 4 4 4 4 4 4 888 99999 66666 9 4 9 66666666 9 9 4 6 0 444 4 4 88 8 11111 4 4 66 33 9 4 8 66 11 4 000000000 333 4 4 11 0 55 66 0 0 22222222 555555 55 5555 0 77 0 0 0000000 8888 0000000 5555 0 999 000 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 888 888 7777 9 2 9 11 3 4 4 4 666666 4 11 7777 888888 11 4 2222222 888 4 33333 4 9 888 55555 0 0 4
consensus : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNAC--------------------CT--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-AAATACT-------A-T----AA-A-----------GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----TAAA-TCCTC----GGCA----TG-ATTTT-G--TAA---TTT-A-T-------AC-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTTC-TATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTGATTT--TTCTT--GT---CTT--A-AATAATTCAAT-A-TAATA-AT-T--AAA--TG-T-A-TG--TC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTC-GTTG---T-----ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-TCCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATAATT-A---------ATT----TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--C-----TGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACG-----TA--------A---GT--AT-TGATTTTAA-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GG---C-C------NTAGGTGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA---NA-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT------ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATT-GTA-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGGTT-CG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCC-GGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATG--GGGAANTG-T-T-TT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
Reference ( family-1363 ) : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CCAC--------------------CT--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-AAATACT-------A-T----AA-AC----------GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----TAAA-TCCTC----GGCA----TGCATTTT-G--TAA---TTT-A-T-------AC-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTCT-TATGGCTT-GCAAG--GTGCGANTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTGGTTT--TTCTT--GT---CTT--A-AATAANTCAATAA-TAATA-AT-T--AAA--TG-T-A-TG--TC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTC-GTT----T-----ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-TCCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATAATTNA---------ATT----TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAANAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TANTTTGAATC--C-----TGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACG----GTG--------A---GT--AT-TGATTTTAA-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GG---C-C------ANAGGTGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA---TA-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT------ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TNCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-A-T-GTA-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGGTT-CG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--A-TTTCCC-GGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ATATAATG--GGAAANTG-T-T-TT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
gi|1 : AGCGC-CCC-----ACCCTTT---TTTCAC-CAAAAACTA-----------TA-TAAAT--AATACTTA-----A-T----AA-A-----------AAC-TACA-AA--------T------TT------GCAAC---ACC------AA----AAATG
gi|1 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccCCCCCCCTTTTACAAAAA-----------------------G--TTTTGA-TCTGGTCACTGAATTTTCC--TCTAGCA-AAAA-CAATATAAG-TCCTC----GGCA----TGAATTTTTGACTAAATATTC-A-TTCCCAAGAT-ATGAAAAAATAAAATAC--TAACC-GTAAACACGAATTGTTATTTTA-T---TCGTTCTAATCGTGATAACTTTAACATTGA-CAT-ACACTTTTT--GATA----TC-----------------CA-------TATGGCTTAGCAAG--ATTCGATTGT-CTGACG-TC--GTCTAT--AAA-GGGC-----A---A-ATG-TT---TGGACAGGA-A------TGTCACACA----GACTTACA-AA-ACACCCTAT-T---T-CTCTCTCTGCTTACTGTCA--AGTTTTTGATTT--TTCCTTCGTTCCCTT--ATAACAATTCA--------CA-AT-T--AAACTTGAT-A-TG--TCGCCAATAA-CAG--ATAGT-TGCGTGTGTGCGTTGAC-AACATG--TTTGATTT-AA-CAG--T-ACAAAA--CC-----AATC---AAA--CAAGACTATCCATG--------TTATG-GC--C--AAGAGTTTATGTA-----C-TGC-GTT----T-----G----------------A-------C--A-TTTGC-TCCGTGACT-----------------AATA-CAT------------------A-G-TAACCA-A-TC-TT-TC-TTCTTT--GT-AATAATTCT---------GTT----CTTG-TCAA---G--TTTATC---GAAAAAATG-TT--G--AATATT-A-TT-AA--AATAA-TGTGCG-TGTA-TAC-T------GA--GCTTTTGTACATT--CCGCGAA-TAT-CC----AGAA----------CTAT-----TT-------ACC---AAACA--AGTGAA-C-CCCGAT-------------TGTT-----C-TAATTACTTT--C-GCAT-TA---T-TTT-----TT-TAATCTCAGTT--T-----TGAAATTATGGAAGGA-TG-GTTCTG--GG-G----G-------TG----CACG-----TA--------G---GA--CT-TGATTTTAA-ATCAGTGTAT---A-A-TTCACG----------AC-TATT--ATA-GT-A-T--TTTTTCTTAC-ACAT---ACTTGTTTGG---C-CTAGGATAGAGGTAT--GTGAT-TC---AACT--AAAACAGAGTAGACAAAAACCCAAAGATATAATTGTTTTATC-TATTTTAGC-A-CTGCCTAAATACACG-TAGAA-C--AGAAAATA-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTACATAT---T-GT---TCT--GA-GTTTACCCCAGCATAACAAGCTAAAAATCTTAGTGGTT----A-GGGTAA--TTCGACTTGATTT-T---A---AA----AAAATGTT-TTG--TGTTA-AA--GG-ACA-CAA-T-TACAT-A-----TTTA-A--ATAA-TATTTTGC--TCCAT-ATTC-TGCTCA-A-TTGCA-TG-ATTACT-A-A-TTTG-TTATACA-A-TA-----AC-GGCAATGATA--TAT----GA-T-TAAA--TTAT--TAA-TC-CACA-TTAGTACT-TGGTT-AG-CTC--T-ATGTTACG-TGTTGGA-AAGTTG--T-C---GTTC-------T--AT-A-TTTCCC-GGGG-TGT-CTTCTCAGG-------TCGAAGATTTCT-T--GT-------GGTTGAAAACA-AT--CAA---AATCAAA-----------------------------------------------------------------------TG---CAATTTTTGCATA-ATATGGCG--GTAAA-TG-T-G-TT--A----TT-CG--GTAAAGAATTGT------CTGAT--A-CA---GTACACGTTG---AAATTA--ATATAATAC-T-GGAG---T-----ATTAACACTCAT-aacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggcccccccttttacaaaaagttttgatctggtcactgaattttcctctagcaaaaacaatataagtcctcggcatgaatttttgactaaatattcattcccaagatatgaaaaaataaaatactaaccgtaaacacgaattgttattttattcgttctaatcgtgataactttaacattgacatacactttttgatatccatatggcttagcaagattcgattgtctgacgtcgtctataaagggcaaatgtttggacaggaatgtcacacagacttacaaaacaccctatttctctctctgcttactgtcaagtttttgatttttccttcgttcccttataacaattcacaattaaacttgatatgtcgccaataacagatagttgcgtgtgtgcgttgacaacatgtttgatttaacagtacaaaaccaatcaaacaagactatccatgttatggccaagagtttatgtactgcgtttgacatttgctccgtgactaatacatagtaaccaatctttcttctttgtaataattctgttcttgtcaagtttatcgaaaaaatgttgaatattattaaaataatgtgcgtgtatactgagcttttgtacattccgcgaatatccagaactatttaccaaacaagtgaaccccgattgttctaattactttcgcattatttttttaatctcagttttgaaattatggaaggatggttctgggggtgcacgtaggacttgattttaaatcagtgtataattcacgactattatagtattttttcttacacatacttgtttggcctaggatagaggtatgtgattcaactaaaacagagtagacaaaaacccaaagatataattgttttatctattttagcactgcctaaatacacgtagaacagaaaatattttttttttttttttttttttgtacatattgttctgagtttaccccagcataacaagctaaaaatcttagtggttagggtaattcgacttgattttaaaaaaatgttttgtgttaaaggacacaattacatatttaaataatattttgctccatattctgctcaattgcatgattactaatttgttatacaataacggcaatgatatatgattaaattattaatccacattagtacttggttagctctatgttacgtgttggaaagttgtcgttctatatttcccggggtgtcttctcaggtcgaagatttcttgtggttgaaaacaatcaaaatcaaatgcaatttttgcataatatggcggtaaatgtgttattcggtaaagaattgtctgatacagtacacgttgaaattaatataatactggagtattaacactcatcacggtcaccgaaatt
gi|10 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccagcgccccacccttttttcaccaaaaactatataaataatacttaataaaaactacaaatttgcaacaccaaaaatgaacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggCTG-TTCTTTCTTCCTAGCA-AACG-T----ATAA-TCCTCCTGTGGGACTTCTTTATTTTCG--CTA---TTT-T-C-------TC-GCACAAA--TAA-TTACACCA-CCCGCA----CAAGGTTTT---TTG-C---T----------------ACTCTA-CATCGA-GACTACA--CTCTCTGATTCTTCTC-TCT-CT-CGCTACTA-CGCTCTTTCTATGGC-------A--GTGCGCTTTC-TT--C--TCTCGTCTACTCACC-G--C-----A----CATG-TCC--TG---AGGA---------------------AGC------------CGATAGAT---TGGCTTCT--GCTT-CT-TTC--ACATTTTGGTTT--TTCTT--GT---CTTTTA-AAT---TC------TCATA-CT-T--AGA--TG-T-A-TG------CAATA--CGG--AA-GT-TGG-TG---------AC-GAC-TG--T---ATTA-A--TAG--T-A----C--CCTCTA-ACTC---CA---CA-G------C--G--------TCATC-GCACCCGA---------GTA-C------TC-GTT----T-----ACAAGAAAAT-G----AACTACCTGT--A-TTTCT-TTTCTGACT-----------------GC-AAGATTTTATAAGGAACTACTTGATG-TC--CAGA-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATAACTTA---------ATT----TTTGCTC--A--G--TTT--TTCGAAAACA-TG-TT--G--AAAATC-A--T-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAACTT------GA--GC-TTTGT-CATCGGCC---AATTATGCC---CACGA--GTGA---AC-AT-----TTAGCTCTAACCTATA--CC--AG-GAACC-C--CAT-------------TG------TC-TACT-ACTTT--C-GCAT-TATTTT-TTT-----AT-TCGTTTGGCT---C-----TGGA------GGGGGG-GG-acggtcaccgaaatt
gi|11 : ------GAGGGG-GGCG----G--GA-GTA--G-------TGT----AC------TA--------A---AT--AT-TTATTTTAA-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-GT-ACA--TTAAC----C-ACATGGCACTAGTT-GG---CGC------CTAGGTGCTAGCATT-TC---AA-------ACA------ACAAAA-----------TAAC-GCTTAATC-T--TTTTGC-AACTCA-TA-ATA-----C-TAA-CTCAGA---AA-TTTTTTTTATCTATATATAT------AAG------GT-----G--AACGTT-ACCC--ACA-AACAA--TACAA---CTCGTG-CTTCAGACGG-TAACATTTTACC-GATTT-T---T---AA----AAAACTTT-TT-GT--TTA-AAC--G-ACACCAC-T-TA-ATAAA---TTTTACC--ATAAATTTCT--C--TT-ATATTTA-T--------T-GCT-TG-TTATTTCA-TGTTTATTTA-AC--AATA-----AC-GCAAATGA-ACTTAC--TAGA-TATCAT--TCTT--AAA-TACCGTA-G-AATA-TATGTAT-CGCCTCTAT-AT--TAC--TTTTG-ACAAGTTGATT-CTAAGTTC------GTCCA--ATTTTTCC-GAAGTTGT-CTTCTCTTT-------TCGAAGATTCTC-A--GTAAGGAACGGT-----ACAGACTACAACTTAATCAAAT--------------A--------------TTCGCAA-GA-G-------------------ACACAGATTCTGCATCA---TCTGCTTA-ACATAATGGCGGATAATG-T-T-TT--ACTTTTT-C---G---AAAATTG-------CT-ATTAA-CA---A---AATGTG---AAA-T---C-AAAATACGT-GAAGCACT-----A-CTACA-TCAT-CGG
gi|12 : tT-GATTTAT---T---AA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AACCGG-ACA-CAA-TATACAT-GA---TTTTT-G--ATAAATTTTC--T--TC-AT-TTTC-TGC--A-A-TTGTAATG-GTA-TT-A-T-TTTG-TTA-ACA-A-TA-----AC-GGCAA-GA-A--TACATTAGAAT-TCAA--GTTT--A--------------GTA-T-TGGTTTCG-CTC--T-AT--TACG---TTG-A-AAGTTGT-T-C---GTTC------GT--A--A-TTTCCC-GGGC-AGTCCTTCTC-GG-------TCGAAGATTTTC-T--GT-------GGTATA-AACA-AC--CAA---AAT-GAAC--------------A--------------TTTG--A-GA-AGATACAAAGTTTTGAAGATAAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-AACTAATG--GCGATATG-T-T-TTTCT---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTAAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-T---A-AAAATAT-T-GGAA---T-----A-CAACA-TCTT-
gi|13 : -TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-AATTTTTC---ACCACACT-CACTAGTG-GG---CAC------CTAGGTGT--GCCATCTT---AA-T--AAAATA------ACAAATA-----------AATTGTTTTAAC-TATTTTTGCTA-TGGC-TATATATC-G-C-GAA-C--AGA---AA-AATTTCTTTTTTT-------------ACATATGTAGT---TCG--AA-GTT-ACCC--ACA-AAC--A-TGAAA---TATGTG-CT----AGGG-TAACTTTCGACT-GATTT-TAAAA---AA----AATGTTTT-T--GTTGTGA-AAC-GGAATA-CAA-G-TACAT-AG---ATTTA-AAGATAAACATTG--T--CC-AT-TTTCTTGC--C-ATT-GTA-TGTGTAATT-
gi|14 : aatattatttcataatgtgcatgtaataacaacAGTT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----ACGGGCAATGA-T--CAC-TTAGACT-TAAATTTTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA---TGGTT-CG-CTC--TCAG--TACG--TTTG-A-TAATGG--T-T---GTTCGCTACGGC--A--A-TTTTCC-GGGG-CGT-C-TCTC-CGCACCGATTCGAAGATATTC-TGAGTA------GGT----ATCT-AC--TAG---ATTACAAT--------------A--------------ATCA--A-GATG-------------------CAA------TTA---TA---TCT---TT-ACATGGGA--AGAAATTG-TGTGTT--AAGTTTT-CGTAA---AAAATTGTTCCACCCTGAT--ATCACTTA---AGCGTGGAAAAA-TAATA-AAAATAC-T-AG
gi|15 : TCCGT-C-ATTCGACGACTTGGACT-GTC---AAACGGTCCGTCCAAGAAC----GG-CACCTCAG--CCGATGTGTATTTC-----A
gi|16 : aagcaactgttttccgcgactggagtaatgtttttctctgctaagtaatatgaggtgattgagcgcgcacagaaggtatgtgagagatgcggtgcgaattgagaggctgagatgaaataagaaggtaaaaacaccttaataggtgatattaaatattaaaccatcacattttatgaaattcgatttaagactgataaggtaac-AT--TACG-TTT-G-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--ATGA-TTTTCCTGAGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAA---AATCAAAC--------------AACTGTATTAACTAATTCG--AAGA-G-------------------AAAAGG---TTG---CA-------AA---ACATAATG--GGGAACTT-T-T-TTT-A---TTTTCT--G---AAAATTGT------GTGAT--A-CA---A---ACAGTT---AAC-T---T-AAAATAT-T-AGAG---TAAAAAA-AAACA-TCTT-CGG
gi|17 : CCGTCCAAG-ACGTAACG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTCTTTCAGTTGCTTTATAAAA-C-ACGTTGGTACAT----T-TATAGTAAGTA-TTTCTGACAATACAAC--------------------CTAGATCAAGGATTGGTGAC-AGATTTCAAAAGAGCCC-CCCCCCCGCCCCTTTCCCTTCCAC---AGGA-TA------------ACTAAACAAAATATTCGCCAGGA-TATAAAA-AC----------GAC-TCCACGA----------------T------A--GC---ACtc
gi|18 : C--C-----TGAG------GGGGGC-GG-G----A--GT-A----G-------TGT----AC------TA--------A---AT--AT-TTATTTTAA-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-G
gi|2 : tgcaactttcacagtcggacatacgtcatcacaatgcaaacgttcacaccgaaactgcgtaattttttccgcactgaaaaaatgcttttttattgcacaagctgcgctaaactattcttgaacacaacggggtgggatggggcgaTCCG-AC-AT-CGACGACTTT-ACGGA--CCAAAACG---------------------CA----GG--CCGAT-TT-ATTTC-----ATTGCTT---AAAA-CA-CG-T--TGCAT----TATAT-------A-GT-C--GC----CCACCTATCAGTGGCAGATTTCACCT--ATCA-------GTGGCA-GATTTC-AAAG----C-CCC-----CCCCTTT---T--CGC-CAAAAA-TT-----------TACTAAAC-AA-TATT-------AAT----AA-A------------AC-TCCA-GA--------T------TT------T--TA---CCC------AA----A----------AGCCTTTTA---AAAAGGCTACAACATATAATACCCCCC--TACTGG-ATCTGTCACTA-------CTTTCTATCA-AACA-TA---TAAA-TCCTC----GGCA----TG-ATTTT-G--TAA---TTCAA-A-------AC-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGG-TTTA-TTTA-T---T---T--AAT---TGTAAC-TAA-CATAGA-GA--ACA---TTT--GAT--------TCT-TT-TC----TA-TAGTCTTC-TATGGCTT-GCA----GTGCGA--TG-TT--A--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AAGA-G------AA--AC-C-----AGCTA--A-AA-ACAC-ATAC-T----GTCTTCTC---------TCA--AG-TTTTGGTTT--TTCTT--GT---CTT----AATAATTC-AT-----ATA-AT-T--AAA--CG-T-A-TG--T---CAAT-A-CGGA-A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TGCATGT-ATT--AA-CAGTTT-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TCATG-G---CCAAAGA------GTA-----C-TTC-GTT----T-----ACAAGAAAATGA----AA-------T--A-TTTCC-T-CCTGACTCAAGATTTTATAATGGAACT-ACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TCTTT---T--GCGAATAATT-A---------ATT----GTTG-TC-AA--G--TTT--T---GAAGCA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAAC-T------GA--TC-TTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---T-GAA--G------AC-AT-----TT-------ACT---A--CC--AG-GAC-C-C--AA-----------------TTCATT----------------------------------------AGTTTGAAT---A-----TGG---------GGGA-GG-G----G--GG-A----G-------------CAC------TT--------A---AT--AT-TGATTTTAA-ATCAG---AT---A-A-TTC--GATTTAACGTAAT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GG---G-C------CTAGGTGT--GC-AT-TC---AA-A--AAATC----------AAAA----------TAAATATTTTATC-TATTTT-GC-A-CTGT-CATATA---G-C-GAA-C--AGA---AA---------CATTTTTATTTT------ACATATCC-GT---T-G--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TAAAA---T-CGTG-TT----AGGG-TA---------T-AACTT-T---T-----------TGTTTT----GTTGTTA-AAC-GA-ACA-CAA-T-TACAT-CA---TTTTA-A--TTTAATATTT--C--TT-AT-TTTT-TGC--A-ATT-GTA-TG-GTAA-------TTTG-TTA-ACA-ATAA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTTTAAAA-T--CAT--A-AGTA-T-TGGTT-CG-CT---T-A----ACG--TTTG-A-AAATTG--T-A---G-TC------GT--A--ATTTTCCC-GGGG-CGT-CTTCTT-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAG---GATCAAACAACTGTATTAAATAA--------------CTCGA-A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATG--GGGAAATGTT-T-TT--AT--TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-TA---A---ACAGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-
gi|3 : tgagtaatattttccccgttaaaagaagagcttttcatttgcaaaatgtgctaactatttgaacaattcgataataaaccgttttcaagagtaaggtaccTCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAAC--------------------C---ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-AAATACT-------A-T----AA-A-----------GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----TAAA-TCTTC----GG-A----TGCATTTT-G--TAA---TTT-A-T-------AC-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTCT-TATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTGATTT--TTCTT--GT---CTT--A-AATAAATCAATAAATAATA-ATAT--AAA--TG-T-A-TG--TC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTC-GTTG---T-----ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-TCCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATAATTAA---------ATT----TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--C-----TGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACG----GTG--------A---GT--AT-TGATTTTAA-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GG---C-CA-----ACAGGTGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT------ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-T-GTA-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGGTT-CG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--A-TTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATG--GGAAATTG-T-T-TT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGG
gi|4 : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAAC--------------------C---ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-AAATACT-------A-T----AA-A-----------GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----TAAA-TCTTC----GG-A----TGCATTTT-G--TAA---TTT-A-T-------AC-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTCT-TATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTGATTT--TTCTT--GT---CTT--A-AATAAATCAATAAATAATA-ATAT--AAA--TG-T-A-TG--TC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTC-GTTG---T-----ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-TCCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATAATTAA---------ATT----TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--C-----TGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACG----GTG--------A---GT--AT-TGATTTTAA-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GG---C-CA-----ACAGGTGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT------ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-T-GTA-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAGA-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGGTT-CG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--A-TTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATG--GGAAATTG-T-T-TT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGG
gi|5 : -----AC-TATTTTGAACA--CAAGAGGGGA------GGGGGG-GG-G----G--GG-G----GGTGAAGATATG--CACC----TTA--------A---ATGAAT-TAATTTAAACATCAATTTATGTAA-A-TTC--G----------AT-T--T--CAA-G
gi|5 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaTCTGTTC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCC--AAACG-TTCGTCCAAG-AA----CG-CA----GGGGCCGAT-TAT-TTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CA-CA-TGGTACAT----T-TAT------TAAGTTC--GC----CCAC--------------------CT--ATCA-------G-GGCA-GATTT--AAAGCCCCC-CCC-----CCCCCCT---TTTCAC-CAAAAA-TATACTGAAACAATACTAA-T-AAAAACT-------C-T----AG-ATTT--------GGCACCCA-AA--------TGGCCTTTTAAAAA-G--GTTTTACCTACATAAAT---ATATGCCCCCC--CCTT--A---AAA-----------------------T--TTCTGG-ATCTGTC-CAGATTTT--CCTTCTAGCA-AACA-T----TAAAATCCCA----GGCA----TG-ATTTT-G--TAA---TTT-AAT-------ACTATGAAAAA-TAAATTA---TA-C--GTA----CAGG--TTTATTTTATT---T---TT-AAT----TTAACTTTAGCATTGA--C--ACA--TTTT--GATT----TCTTCT-C--TG----TA-TAGTCTTC-TATGGCTT-GCA----GTGCGATTTT-CT--CG-TC--GTCTCT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TGA--AGGA-G------AC-GAC-C-----AGCT---ATAA-ACACGATACGT---CG-TTTCT--GCGT-CT-TCA--AG-TTTTGATTTTGTTCTT--TT---CTT--A-A--AATTCAAT-A-TAATATAT-T--AAA--TG-T-A-TG--T---CAAT-A-CGGACA--GTGTGGGTG---------ACAAAC-----TGT-ATT--AA-CAG--TAA----A--TCT--AGAATC---TAA--CAAG------CA-GCCCGCATTTAATG-G---CCAAAGA------GTA-T---A-TTCGGTT----T-----ACAA-AAAATGA----AA-------T--ATTTTCC-TCCCTGA-C-----------------ATT-ACAT------------------ATG-TAC-CA-ATTC-TC-TC-TTG--T--GTGAATAATT-----------ATTTTGATTTA-TTAAAATG--TTT--T---agatagcagatacttctgttcatcgacgacttggacgagtccaaacgttcgtccaagaacgcaggggccgattattttcattgctttaaaacacatggtacatttattaagttcgcccacctatcagggcagatttaaagccccccccccccccttttcaccaaaaatatactgaaacaatactaataaaaactctagatttggcacccaaatggccttttaaaaaggttttacctacataaatatatgccccccccttaaaatttctggatctgtccagattttccttctagcaaacattaaaatcccaggcatgattttgtaatttaatactatgaaaaataaattatacgtacaggtttattttatttttaatttaactttagcattgacacattttgatttcttctctgtatagtcttctatggcttgcagtgcgattttctcgtcgtctctaaagcaacatgtctgaaggagacgaccagctataaacacgatacgtcgtttctgcgtcttcaagttttgattttgttcttttcttaaaattcaatataatatattaaatgtatgtcaatacggacagtgtgggtgacaaactgtattaacagtaaatctagaatctaacaagcagcccgcatttaatggccaaagagtatattcggtttacaaaaaatgaaatattttcctccctgacattacatatgtaccaattctctcttgtgtgaataattattttgatttattaaaatgtttt
gi|6 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggggagggggggggggggggtgaagatatgcaccttaaatgaattaatttaaacatcaatttatgtaaattcgatttcaagagatagcagatact--GT---CTT--A-AA------AATCA-TATTA-GT----AAA--TGGT-ACTG--AT--CAATA--CGG--AA-GT-TGGGTG---------AC-AGA-AG--TTT--TTGTAA-CAG--T-A----AAACCT--A-AATC---CAATCCAAGG-----CA-G--------TCATG-GC--C--AATAA-----GT-------------TT----T-----A------AAT-A----A-------------TTCCT-TCCCTGG----------------------GAC---------------------TG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATAATT-A---------ATT----TTTG-TCAA---GCTTTT--T---GAAACA-TG-TT--G--GAAATA-AAGT-AG--A-TAA-TGTGCAACGTAAAAT-T------GAATGCATTTGTC-ATC--CC---AA-TAT-CC---AAGAAAAG------AC-AT-----TA-------ACT---A--TC--AA-GAC-C-C--AAT-------------TGTCTCATAC--AAT-ACTTT--C-GCAC-TA---TCTTT-----ATCTAGTTTGAATC--------TGGA------GAGGGG-GG-G----GCCGG-GAATCG-------GCT---CACC----GTATAAATCATA---GT--ATCTGATTTTAACATCAG---AT---A-A-TTC--A----------ATAT--T--AACTGTCA-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGGCCC-T------AAAAGTGT--GT-AT-TCTTTAA-A--AAAACG------CCAAACA----------TAAATGTTTTATCGTATTTCTGC-A-CTGC-TATATAC--G-C-GAACC--AGA----A---------------------------ACAT------T---TCGGTGA-ATT-ACCC--AC--AAC-AA-TAAAA---ATCGTG-CT----A-GGAAAAC-TTCGAC--GATTT-T---T---AAAAACAATGTTCTGTTGGTCTTGACAAC-GG-ACA-CGATT-TACAT-AAGTCTTTTC-A--TAAAATATTT--TCGTCTAT-TTTCATGC--ACATT-GTACTG-GTATTT-ACT-TTTG-TT--ACACCATAACCGTAC-GGCAATGA-AT-TAT-TAAGA-T-T--T--TTTT--AAATTA-CCCACA-ACTA-T------------------T--TACGTTTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCC-GGGG-----CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GC-------GGT----AATA-ACA-CAA---AATCAA
gi|7 : TCC-TACTAT-CGACGACTTGGACG-GTCC-AAAACG-TCCGTCCAAA-AC-----G-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAAACAACG-TGGTACATATTAT-TAT------TA-GTTC--GC----CCAC--------------------CT--ATC--------GTGCCA-GATT-C-AA----CCCTCCC-----CCCCCCT---TGTCAC-CAAAAAGTA-----------TACTAAAC-AA-TACT-------AAT----AAAACTCCAGATTTTGAC-ACCC-GAAAGGGCCTT------TTAAAAAAG--GCTTTACC------TACATTATATGCC----ACCCCTTTA---AAA-----------------------TATTTCTGGATCCTGTCACTGAATTT--CCTTCTAGCA-AACACT----TAAA-TCCTC----GGCA----T--------------------------------------------AAATTAC--TA-CCTGTA----CAAGGTTTTATTTTA-TATTT---TT-AAT---GATA-CTTTA-CATTGACAA--ACA--GTT---GATT----TC-TTTTCTCTG----TA-TAAGCTTC-TATG-TTT-GCTCA--GTGCGATTTT-TT--CCGTC--GTCTAT--AAAAG--C-----A----CATG-TC---TG---AAGAAG------AG-CAC-CA-----GCT---ACAA-ACACGATAC-T---CGTTT-CT--GCTT-CT--CA--GCGTTTTGATTT--T-CTT--GT---CTT--A-AAAAATTCAAT-----ATA-AT-T---AA--TA-TAA-TG--TA--CAATc
gi|8 : aatgcaactgttcacgtcgactgagtaatgtttttgtccgcgttaaaagaagacgctgtttttattgcaaaaattgctaactatttatgaaacaacgcgagggagggggggggggtaaatgaagatagcacttaaaatgaaattaattaaaccatcaatttattaaaattgatttcaagagagataaaggtaccATA-A-TT-AT--A-TAG-CG---A-AGTAATAC-T------G----------TANNNN--NN---NN-NNN-NN---NNNNN--N------NN-NN-----NN-------ACC---A--CA--AG-GAC-C-C--AAT-------------TGTT-CAT----AAT-ACTTT--TTGCATATT---T-TTTT----AT-TAGTTTGAATC--------TGGA------GAGGAG-GGTG----G--GG-G----G-------TGT---CACG-----T---------A---GT--AT-TGATTTCAA-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GG---G-C------CTAGGTGT--GC-AT-TT---AA-TAAAAAAAA------ACCAAAA----------TAAATGTTTTAAC-TATTTT-GC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA---AA--------CTTTTTTTTTTAC------ATAT---T-GT---TCG--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TACAA---TT-GTG-CTG---G-GG-TAAA-TTTGACT-GATTT-T---TAAAAA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTT--A--ATGAATATTT--C--TC-GT-TTTC-TGA--A-ATT-GTA-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AT-GACAATGA-A--TAC-TTATA-T-TAAAC-TTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA-T-TGGTT-CG-CTC--T-AT--TACG--TTTG-A-AAGTTG--T-T---GTTC------GT--A--ATTTTCCC-GGGG-CGT-CTTATC-GG-------TCGAAGATTT-C-T--GT-------GGT----AACA-TT--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTTGA-A-GA-G-------------------GGAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATG--GGGAAATG-T-T-TTTAA---CTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ATGGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGGgtaaagtagtaagtaagtaagtaattgtatttatta
gi|9 : gttcctagaaaaaatacatcgatatttt-TATTGCTT-GCAAGTAG-GCGATTTTATT--C--TC--GTCTAT--AAACG--CTAGAGACTCACATGGTTGCATG---AGGA-GCTTATGAC-TAC-CATGACACCC---ACAATACACGATAC-TGTGCGTTT-CTG-GCTT-TG-ACAGAAGATATTGGTAT--TT--T--GT---CT------ATATCTTGATAG-AAACACAT-TCAAAA--AG---A-TGGATC--CA-------G--A--GT-TATTTA---------AC-A-------------TA-AA--AG-------------CT--A-AATCTAACAA--CAAG------AA-G--------GTATATGC--TGAAAGAG-----TTAATAAAC-TTC-GTCGCGCTGGACGACAAGACACT-ACTGAAA-------TTAA-TGTCCGTCCCTGACC-----------------ACTA-CAT------------------ATGGTAGCTG-A-GCGTCGTC-TT---T--G--AATACTAGAGAGAGATGTATA----TTCGCTCAAC--G--TCT--T---GAAACAATGGTT--AGAAAAATACA-TTTAGTCA-TAAATATGCA-TGTAATAC-TCGGCGAGA--GCTTT-GTC-ATC--AC---AAGTAT-CCACTCAGTA--GGATCATAC-ATGCATTTT-------ACC---AA-CAGAAG-GCA-CTC--AATGGGCGAGGCATGATGTTTCATTAATAAT-ACTTTATT-GACTATA---T-TCTTTCTGAT-TAGTTTGAATAAGC-----TGG-------GAGGAGCGG-G----G--GGCG----G-------TGTTGTCACGTAGTATG--------ATTTGT--AT-TTATT---A-ATCAG---AT---A-AGTTC--G----------Atcg
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|20 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): TGCTAACTGGTTCAGTCGACTGAGTAATGTTTCTCACGCGTTAAAAAGAAGAGGCTGTTTTTATTGCAAAATGTGCTACTTTTTGAACACGAGGGGAGGTGGGGGATAAGAAGATATGCACTTTAAAAGAAATAATCAAACCACAATTTTTAAATTCGATTTAGAGACG
Unaligned ( gi|22 ): ACCTGTTTTTTCTACTAAATCAGAAGAGCTACCGTTTTTAATTTGCAAATAATAAGCTAACTTCATTTTTGAATCCATACGAGGGGAGGGGGGGTGGGGGGGTAATTGAAGATGAGAGTCACTTAAAATGAATTGTAGAAATTAAACTATCCATTAATC
Unaligned ( gi|23 ): TGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAGGGGGGGATGAAGATTTATTAAATTCGATTTCAAGAGAT
Unaligned ( gi|24 ): ATGCAACTGTTTACGTCGACAATACGACCTCACAGCGCACTGTTTATGTCGATTGCGTAATTTTTTCCG
Unaligned ( gi|25 ): AATGCACTGTGCTTTCATGGTCCGATTAGGGAGTTAC
Alignments
lowQualScore : 1 1 2222222 1111 11111 1111 111111 111 1111 77777777777777777777777 2222222 1 111 11111 111 1 1 22222222222 1111111 33333333333333333333333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777 111 66666666666666666666666666 11 1 111111 1111 11111111111 111 22222222222222 1 1111 2222222222 11111 1 11111 111 222222222222222222222222 1111 11 1 1111111111 111 111 333333333333333333333333333333 1 11 1 1111111111 3333333333 11 1111 22222222222 222222222 1111111111 11 1 111111111111 222222222222222222 3333333333333333 3333333333 222222222222222222 666666666666666666666666666666666666666666666 11 111111 2222222222 111 1 111 11 11111 1 111111 11 1 1111 222222222 11111111111111 11 2222222222222 1111 1111 1 11111 1111 1111111 111111111111111111 2222222222222 111111 1111 1111111111 11 1 1 222222222 1 1111 111111 2222222222 1 22222 5555555555555555 111111 2222222222 1 111111 222222 1 11 1111111 1111 11 11111 11 11 222222222 11 11111111 111111 1111111 2222 1111111 1111 111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111 333333 111111 22222 11111 1
lowQualScore : 3 6 6 9 0 5 0 66 1111111 2222 77 5 44444 99 6 7 6 4444 6 999999 6 555 4444 1 00000000000000000000000 1111111 5 6 222 5 44444 000 1 1 1 77777777777 8888888 22222222222222222222222222 5 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666 5 3 111 88888888888888888888888888 6 66 11 1 1 5 888888 2222 7 99999999999 5 77 000 88888888888888 5 77 77 5 1 2222 22 1 5 0000000000 66666 1 66666 111 77 222222222222222222222222 3 5 5 6666 3 5 66 66 66 66 0 66 5555555555 77 333 333 333333333333333333333333333333 5 0 9999 2 3 66 5 55 66 0 66 66 5 5 66 777 6666666666 4 1111111111 4 00 66 8 4 7777 66666666666 5 000000000 5 3333333333 33 0 777777777777 66 5 888 66 222222222222222222 1 5 999 5 0 5555555555555555 2222222222 22 111111111111111111 5 5 5 000000000000000000000000000000000000000000000 5 88 5 5 5 5 5 888888 1111111111 5 111 888 0 666 66 66 888 66 5 55555 5 5 5 66 5 5 5 0 5 444444 66 9 0 22 66 888 0 5 1111 777777777 5 66666666666666 888 11 66 5 5 5 66 7777777777777 0 6 8888 5 3333 2 777 4 55555 4 0 3333 3333333 3 6 7777 55 3 777777777777777777 5555555555555 55 4 4 111111 8 5555 777 8 3 55 5555555555 4 55 11 4 5 5 66 888 5 5 0 0 333333333 66 66 7 5 888 5555 444444 1111111111 44 5 0 5 5 5 0 66666 5 5 66 2222222222222222 0000 333333 6666666666 66 5 5 66 5 5 5 666666 5 333333 0 22 4 4 5555555 9999 7777 4 4 4 4 4 4 4 777 77777 77777 8 4 8 3 6666 1 4 4 4 3 4 555 4 4 77 11111 4 4 00 66 4 4 4 1 00 66 4 000000000 555 4 4 66 4 55 44 4 4 11111111 111111 55 55 44 4 8 3333333 1111 7777777 5555 4 555 777 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 777 777 9999 8 1 4 4 3333333 4 000000 4 66 9999 222222 66 4 8888888 777 4 55555 4 8 888 22222 5 5 1
lowQualScore : . . . . . . . .. ....... .... .. . ..... .. . . . .... . ...... . ... .... . ....................... ....... . . ... . ..... ... . . . ........... ....... .......................... . . .................................................. . . ... .......................... . .. .. . . . ...... .... . ........... . .. ... .............. . .. .. . . .... .. . . .......... ..... . ..... ... .. ........................ . . . .... . . .. .. .. .. . .. .......... .. ... ... .............................. . . .... . . .. . .. .. . .. .. . . .. ... .......... . .......... . .. .. . . .... ........... . ......... . .......... .. . ............ .. . ... .. .................. . . ... . . ................ .......... .. .................. . . . ............................................. . .. . . . . . ...... .......... . ... ... . ... .. .. ... .. . ..... . . . .. . . . . . ...... .. . . .. .. ... . . .... ......... . .............. ... .. .. . . . .. ............. . . .... . .... . ... . ..... . . .... ....... . . .... .. . .................. ............. .. . . ...... . .... ... . . .. .......... . .. .. . . . .. ... . . . . ......... .. .. . . ... .... ...... .......... .. . . . . . . ..... . . .. ................ .... ...... .......... .. . . .. . . . ...... . ...... . .. . . ....... .... .... . . . . . . . ... ..... ..... . . . . .... . . . . . . ... . . .. ..... . . .. .. . . . . .. .. . ......... ... . . .. . .. .. . . ........ ...... .. .. .. . . ....... .... ....... .... . ... ... ............................................................ . ... ... .... . . . . ....... . ...... . .. .... ...... .. . ....... ... . ..... . . ... ..... . . .
lowQualScore : 5 7 7 8 8 0 7 11 4444444 1111 99 7 33333 22 7 3 7 2222 7 222222 7 888 2222 0 77777777777777777777777 7777777 5 7 666 7 33333 000 4 4 4 11111111111 0000000 44444444444444444444444444 7 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333 0 2 777 33333333333333333333333333 7 99 44 7 4 7 333333 1111 9 77777777777 7 99 000 11111111111111 7 99 99 7 4 1111 11 4 7 0000000000 00000 4 77777 444 99 111111111111111111111111 0 0 0 4444 6 0 99 99 99 99 0 99 5555555555 55 888 888 888888888888888888888888888888 0 0 0000 0 2 99 0 44 99 8 99 99 0 0 11 888 0000000000 4 7777777777 4 99 11 9 4 9999 88888888888 0 000000000 0 2222222222 44 0 555555555555 99 0 888 99 888888888888888888 0 0 444 6 9 8888888888888888 0000000000 66 666666666666666666 0 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 0 0 0 0 555555 9999999999 0 111 888 0 111 99 99 888 44 7 99999 0 0 0 99 0 0 0 8 0 444444 99 5 1 66 99 888 0 0 5555 666666666 0 55555555555555 888 99 99 0 0 0 99 5555555555555 1 2 0000 0 0000 4 888 4 66666 4 1 7777 0000000 3 7 7777 00 6 555555555555555555 4444444444444 55 0 0 555555 0 6666 000 0 6 00 9999999999 0 55 00 0 0 0 99 888 0 0 0 0 222222222 99 99 9 0 888 5555 444444 9999999999 11 0 8 0 0 0 4 99999 0 0 99 8888888888888888 9999 000000 1111111111 99 0 0 99 0 5 0 666666 0 555555 0 55 4 4 7777777 4444 6666 4 4 4 4 4 4 4 888 99999 66666 9 4 9 9 9999 9 4 4 4 4 0 444 4 4 22 11111 4 4 66 33 4 4 4 8 66 11 4 000000000 333 4 4 11 0 55 66 0 0 22222222 555555 55 55 77 0 0 0000000 8888 0000000 5555 0 999 000 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 888 888 7777 9 9 4 4 8888888 4 666666 4 11 7777 888888 11 4 2222222 888 4 33333 4 9 888 55555 0 0 4
consensus : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-ATTCAATA--TAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TGTC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C-C----T--AG--GTGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA---AA-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-GGA-A------ATG-TTTT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
Reference ( family-1363 ) : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-ATTCAATA--TAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TGTC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C-N----T--AG--GTGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA---NA-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-GGA-A------NTG-TTTT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
gi|1 : AGCGC-CCC-----ACCCTTT---TTTCAC-CAAAAACTA-----------TA-TAAAT-------AATA---C---------TTAA-TAAA----AAC-TACA-AA--------T------TT------GCAAC---ACC------AA----AAATG
gi|1 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccCCCCCCCTTTTACAAAAA-----------------------G--TTTTGA-TCTGGTCACTGAATTTTCC--TCTAGCA-AAAA-CAATAT-AAGTCCTC----GGCA-----TG-AATTTTT-GACTAAATATTC-ATTCCCAAGA-T-ATG-AAAAAATAAAATAC--TAACC-GTAAACACGAATTGTTATTTTA-T---TCGTTCTAATCGTGATAACTTTAACATTGA-CAT-ACACTTTTT--GATA----TC-----------------CA-------TATGGCTTAGCAAG--ATTCGATTGT-CTGACG-TC--GTCTAT--AAA-GGGC-----A---A-ATG-TT---TGGACAGGA-A------TGTCACACA----GACTTACA-AA-ACACCCTAT-T---T-CTCTCTCTGCTTACTGTCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCC-TTCGTTCCCTT-----ATAACA-ATTCA---------CA-AT-TAAACTTGATA-TGTCGCCAATAA-CAG--ATAGT-TGCGTGTGTGCGTTGAC-AACATG--TTTGATTT-AA-CAG--T-ACAAAA--CC-----AATC---AAA--CAAGACTATCCATG--------TTATG-GC--C--AAGAGTTTATGTA-----C-TGCGTTTG--------ACA---------------------------TTTGC-T-CCGTGACT-----------------AATA-CAT------------------A-G-TAACCA-A-TC-TT-TC-TTCTTT--GT-AATA----------A-TTCTG-TT---CTTG-TCAA---G--TTTATC---GAAAAAATG-TT--G--AATATT-A-TT-AA--AATAA-TGTGCG-TGTA-TAC-T------GA--GCTTTTGTACATT--CCGCGAA-TAT-CC----AGAA----------CTAT-----TT-------ACC---AAACA--AGTGAA-C-CCCGAT-------------TGTT-----C-TAATTACTTT--C-GCAT-TA---T-TTT-----TT-TAATCTCAGTT--TTGAAATTATGGAAGGA-TG-GTTCTG--GG-G----G-------TG----CAC-GT-A--------GGA--CT-TGATTT-TA------A-ATCAGTGTAT---A-A-TTCACG----------AC-TATT--ATA-GT-A-T--TTTTTCTTAC-ACAT---ACTTGTTTGGC-C-TAGGAT--AGAGGTAT--GTGAT-TC---AACT--AAAACAGAGTAGACAAAAACCCAAAGATATAATTGTTTTATC-TATTTTAGC-A-CTGCCTAAATACACG-TAGAA-C--AGA---AAATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTACATAT---T-GT---TCT--GA-GTTTACCCCAGCATAACAAGCTAAAAATCTTAGTGGTT----A-GGGTAA--TTCGACTTGATTT-T---A---AA----AAAATGTT-TTG--TGTTA-AA--GG-ACA-CAA-T-TACAT-A-----TTTA-A--ATAA-TATTTTGC--TCCAT-ATTC-TGCTCA-ATTGC-A-TG-ATTACT-A-A-TTTG-TTATACA-A-TA-----AC-GGCAATGATA--TAT----G-A-T-TAAA--TTAT--TAA-TC-CACA-TTAGTACT-TGG-TTAG-CTC--T-ATGTTACG-TGTTGGA-AAGTTG--T-C---GTTC-------T--A--TATTTCCCGGGG-TGT-CTTCTCAGG-------TCGAAGATTTCT-T--GT-------GGTTGAAAACA-AT--CAA---AATCAAA-----------------------------------------------------------------------TG---CAATTTTTGCATA-ATATGGC-G-GTA-A------ATG-TGTT--A----TT-CG--GTAAAGAATTGT------CTGAT--A-CA---GTACACGTTG---AAATTA--ATATAATAC-T-GGAG---T-----ATTAACACTCAT-aacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggcccccccttttacaaaaagttttgatctggtcactgaattttcctctagcaaaaacaatataagtcctcggcatgaatttttgactaaatattcattcccaagatatgaaaaaataaaatactaaccgtaaacacgaattgttattttattcgttctaatcgtgataactttaacattgacatacactttttgatatccatatggcttagcaagattcgattgtctgacgtcgtctataaagggcaaatgtttggacaggaatgtcacacagacttacaaaacaccctatttctctctctgcttactgtcaagtttttgatttttccttcgttcccttataacaattcacaattaaacttgatatgtcgccaataacagatagttgcgtgtgtgcgttgacaacatgtttgatttaacagtacaaaaccaatcaaacaagactatccatgttatggccaagagtttatgtactgcgtttgacatttgctccgtgactaatacatagtaaccaatctttcttctttgtaataattctgttcttgtcaagtttatcgaaaaaatgttgaatattattaaaataatgtgcgtgtatactgagcttttgtacattccgcgaatatccagaactatttaccaaacaagtgaaccccgattgttctaattactttcgcattatttttttaatctcagttttgaaattatggaaggatggttctgggggtgcacgtaggacttgattttaaatcagtgtataattcacgactattatagtattttttcttacacatacttgtttggcctaggatagaggtatgtgattcaactaaaacagagtagacaaaaacccaaagatataattgttttatctattttagcactgcctaaatacacgtagaacagaaaatattttttttttttttttttttttgtacatattgttctgagtttaccccagcataacaagctaaaaatcttagtggttagggtaattcgacttgattttaaaaaaatgttttgtgttaaaggacacaattacatatttaaataatattttgctccatattctgctcaattgcatgattactaatttgttatacaataacggcaatgatatatgattaaattattaatccacattagtacttggttagctctatgttacgtgttggaaagttgtcgttctatatttcccggggtgtcttctcaggtcgaagatttcttgtggttgaaaacaatcaaaatcaaatgcaatttttgcataatatggcggtaaatgtgttattcggtaaagaattgtctgatacagtacacgttgaaattaatataatactggagtattaacactcatcacggtcaccgaaatt
gi|10 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccagcgccccacccttttttcaccaaaaactatataaataatacttaataaaaactacaaatttgcaacaccaaaaatgaacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggCTG-TTCTTTCTTCCTAGCA-AACG-T----A-TAATCCTCCTGTGGGACTTCTTT-A--TTTTCG--CTA---TTT-TC-------T-C-GCA-CAAA--TAA-TTACACCA-CCCGCA----CAAGGTTTT---TTG-C---T----------------ACTCTA-CATCGA-GACTACA--CTCTCTGATTCTTCTC-TCT-CT-CGCTACTA-CGCTCTTTCTATGGC-------A--GTGCGCTTTC-TT--C--TCTCGTCTACTCACC-G--C-----A----CATG-TCC--TG---AGGA---------------------AGC------------CGATAGAT---TGGCTTCT--GCTT-CT-TTC--ACATTTTG--GTTT--T-TCT-T--GT---CTT-----T-TA-A-ATTC------TCA-TA-CT-TAGA--TG-TA-TG----CAATA--CGG--AA-GT-TGG-TG---------AC-GAC-TG--T---ATTA-A--TAG--T-A----C--CCTCTA-ACTC---CA---CA-G------C--G--------TCATC-GCACCCGA---------GTA-C------TCGTT-T--------ACAAGAAAAT-G----AACTACCTGT--A-TTTCT-T-TTCTGACT-----------------GC-AAGATTTTATAAGGAACTACTTGATG-TC--CAGA-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATA----------ACTTA-A-TT---TTTGCTCA----G--TTT--TTCGAAAACA-TG-TT--G--AAAATC-A-T--AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAACTT------GA--GC-TTTGT-CATCGGCC---AATTATGCC---CACGA--GTGA---AC-AT-----TTAGCTCTAACCTATA--CC--AG-GAACC-C--CAT-------------TG------TC-TACT-ACTTT--C-GCAT-TATTTT-TTT-----AT-TCGTTTGGCT---CTGGA------GGGGGG-GG-acggtcaccgaaatt
gi|11 : ------GAGGGG-GGCG----G--GA-GTA--G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-GT-ACA--TTAAC----C-ACATGGCACTAGTT-GGCGC-C----T--AG--GTGCTAGCATT-TC---AA-------ACA------ACAAAA-----------TAAC-GCTTAATC-T--TTTTGC-AACTCA-TA-ATA-----C-TAA-CTCAGA---AA-----TTTTTTTTATCTATATATAT----AAG------GT-----G--AACGTT-ACCC--ACA-AACAA--TACAA---CTCGTG-CTTCAGACGG-TAACATTTTACC-GATTT-T---T---AA----AAAACTTT-TT-GT--TTA-AA-C-G-ACACCAC-T-TA-ATAAA---TTTTACC--ATAAATTTCT--C--TT-ATATTT---------ATTGC-T-TG-TTATTTCA-TGTTTATTTA-AC--AATA-----AC-GCAAATGA-ACTTAC--TAG-A-TATCAT--TCTT--AAA-TACCGTA-G-AATA-TATGT-ATCGCCTCTAT-AT--TAC--TTTTG-ACAAGTTGATT-CTAAGTTC------GTCCA--ATTTTTCCGAAGTTGT-CTTCTCTTT-------TCGAAGATTCTC-A--GTAAGGAACGGT-----ACAGACTACAACTTAATCAAAT--------------A--------------TTCGCAA-GA-G-------------------ACACAGATTCTGCATCA---TCTGCTTA-ACATAATGGCGGATA------ATG-TTTT--ACTTTTT-C---G---AAAATTG-------CT-ATTAA-CA---A---AATGTG---AAA-T---C-AAAATACGT-GAAGCACT-----A-CTACA-TCAT-CGG
gi|12 : tT-GATTTAT---T---AA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AACCGG-ACA-CAA-TATACAT-GA---TTTTT-G--ATAAATTTTC--T--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGTAA-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AC-GGCAA-GA-A--TACATTAGAA-T-TCAA--GTTT----------------AGTA-T-TGGTTTCG-CTC--T-AT--TACG---TTG-A-AAGTTGT-T-C---GTTC------GT--A--A-TTTCCCGGGC-AGTCCTTCTC-GG-------TCGAAGATTTTC-T--GT-------GGTATA-AACA-AC--CAA---AAT-GAAC--------------A--------------TTTG--A-GA-AGATACAAAGTTTTGAAGATAAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-AACTAATGG-CGA-T------ATG-TTTTTCT---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTAAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-T---A-AAAATAT-T-GGAA---T-----A-CAACA-TCTT-
gi|13 : -TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-AATTTTTC---ACCACACT-CACTAGTG-GGCAC-C----T--AG--GTGT--GCCATCTT---AA-T--AAAATA------ACAAATA-----------AATTGTTTTAAC-TATTTTTGCTA-TGGC-TATATATC-G-C-GAA-C--AGA---AA-----AATTTCTTTTTTT-----------ACATATGTAGT---TCG--AA-GTT-ACCC--ACA-AAC--A-TGAAA---TATGTG-CT----AGGG-TAACTTTCGACT-GATTT-TAAAA---AA----AATGTTTT-T--GTTGTGA-AA-CGGAATA-CAA-G-TACAT-AG---ATTTA-AAGATAAACATTG--T--CC-AT-TTTCTTGC--C-ATTGT-A-TGTGTAATT-
gi|14 : aatattatttcataatgtgcatgtaataacaacAGTT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----ACGGGCAATGA-T--CAC-TTAG-ACT-TAAATTTTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA---TGG-TTCG-CTC--TCAG--TACG--TTTG-A-TAATGG--T-T---GTTCGCTACGGC--A--ATTTT-CCGGGG-CGT-C-TCTC-CGCACCGATTCGAAGATATTC-TGAGTA------GGT----ATCT-AC--TAG---ATTACAAT--------------A--------------ATCA--A-GATG-------------------CAA------TTA---TA---TCT---TT-ACAT----G-GGA-AGAAATTGTG-TGTT--AAGTTTT-CGTAA---AAAATTGTTCCACCCTGAT--ATCACTTA---AGCGTGGAAAAA-TAATA-AAAATAC-T-AG
gi|15 : TCCGT-C-ATTCGACGACTTGGACT-GTC---AAACGGTCCGTCCAAGAAC----GG-CACCTCAG--CCGATGTGTATTTC-----A
gi|16 : aagcaactgttttccgcgactggagtaatgtttttctctgctaagtaatatgaggtgattgagcgcgcacagaaggtatgtgagagatgcggtgcgaattgagaggctgagatgaaataagaaggtaaaaacaccttaataggtgatattaaatattaaaccatcacattttatgaaattcgatttaagactgataaggtaac-AT--TACG-TTT-G-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--ATGATTTTCCTGAGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAA---AATCAAAC--------------AACTGTATTAACTAATTCG--AAGA-G-------------------AAAAGG---TTG---CA-------AA---ACATAATGG-GGA-A------CTT-TTTTT-A---TTTTCT--G---AAAATTGT------GTGAT--A-CA---A---ACAGTT---AAC-T---T-AAAATAT-T-AGAG---TAAAAAA-AAACA-TCTT-CGG
gi|17 : CCGTCCAAG-ACGTAACG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTCTTTCAGTTGCTTTATAAAA-C-ACGTTGGTACAT----T-TATAGTAAGTA-TTTCTGACAATACAACC--------------------TAGATCAAGGATTGGTGAC-AGATTTCAAAAGAGCCC-CCCCCCCGCCCCTTTCCCTTCCAC---AGGA-TA------------ACTAAACAA-----AATA---TTCGCCAGGAT--A-TAAAAAC-GAC-TCCACGA----------------T------A--GC---ACtc
gi|18 : C--CTGAG------GGGGGC-GG-G----A--GT-A----G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-G
gi|2 : tgcaactttcacagtcggacatacgtcatcacaatgcaaacgttcacaccgaaactgcgtaattttttccgcactgaaaaaatgcttttttattgcacaagctgcgctaaactattcttgaacacaacggggtgggatggggcgaTCCG-AC-AT-CGACGACTTT-ACGGA--CCAAAACG---------------------CA----GG--CCGAT-TT-ATTTC-----ATTGCTT---AAAA-CA-CG-T--TGCAT----TATAT-------A-GT-C--GC----CCACCTATCAGTGGCAGATTTCACCT--ATCA-------GTGGCA-GATTTC-AAAG----C-CCC-----CCCCTTT---T--CGC-CAAAAA-TT-----------TACTAAAC-A-----A-TA---T---------T--AATAAA-----AC-TCCA-GA--------T------TT------T--TA---CCC------AA----A----------AGCCTTTTA---AAAAGGCTACAACATATAATACCCCCC--TACTGG-ATCTGTCACTA-------CTTTCTATCA-AACA-TA---T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTC-AA-------AAC-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGG-TTTA-TTTA-T---T---T--AAT---TGTAAC-TAA-CATAGA-GA--ACA---TTT--GAT--------TCT-TT-TC----TA-TAGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGA--TG-TT--A--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AAGA-G------AA--AC-C-----AGCTA--A-AA-ACAC-ATAC-T----GTCTTCTC---------TCA--AG-TTTTG--GTTT--T-TCT-T--GT---CTT-------AATA-ATTC-AT-----A-TA-AT-TAAA--CG-TA-TGT---CAAT-A-CGGA-A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TGCATGT-ATT--AA-CAGTTT-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TCATG-G---CCAAAGA------GTA-----C-TTCGTT-T--------ACAAGAAAATGA----AA-------T--A-TTTCC-T--CCTGACTCAAGATTTTATAATGGAACT-ACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TCTTT---T--GCGAATA----------A-TTA-A-TT---GTTG-TC-AA--G--TTT--T---GAAGCA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAAC-T------GA--TC-TTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---T-GAA--G------AC-AT-----TT-------ACT---A--CC--AG-GAC-C-C--AA-----------------TTCATT----------------------------------------AGTTTGAAT---ATGG---------GGGA-GG-G----G--GG-A----G-------------CAC-TT-A--------A-T--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--GATTTAACGTAAT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C-C----T--AG--GTGT--GC-AT-TC---AA-A--AAATC----------AAAA----------TAAATATTTTATC-TATTTT-GC-A-CTGT-CATATA---G-C-GAA-C--AGA---AA-------------CATTTTTATTTT----ACATATCC-GT---T-G--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TAAAA----TCGTG-TT----AGGG-TA---------T-AACTT-T---T-----------TGTTTT----GTTGTTA-AA-CGA-ACA-CAA-T-TACAT-CA---TTTTA-A--TTTAATATTT--C--TT-AT-TTTT-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAA-------TTTG-TTA-ACA-ATAA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTTTAAAA-T--CAT--A-AGTA-T-TGG-TTCG-CT---T-A----ACG--TTTG-A-AAATTG--T-A---G-TC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTT-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAG---GATCAAACAACTGTATTAAATAA--------------CTCGA-A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATGG-GGA-A------ATGTTTTT--AT--TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-TA---A---ACAGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-
gi|22 : tgagtaatattttccccgttaaaagaagagcttttcatttgcaaaatgtgctaactatttgaacaattcgataataaaccgttttcaagagtaaggtaccA---C-TTC-----AT-T--TTTGAATC--CATAC------GAGGGG-AG-G----G--GG-G----G-------TG
gi|3 : acctgttttttctactaaatcagaagagctaccgtttttaatttgcaaataataagctaTCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----T-AAATCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-AATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TGTC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-AATT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAA----C--AG--GTGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTAT----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATGG-GAA-A------TTG-TTTT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGGggggggtaattgaagatgagagtcacttaaaatgaattgtagaaattaaactatccattaatc
gi|4 : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----T-AAATCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-AATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TGTC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-AATT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAA----C--AG--GTGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTAT----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATGG-GAA-A------TTG-TTTT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGG
gi|5 : GGA------GGGGGG-GG-G----G--GG-G----GGTGAAGATATG--CAC-CTTA--------AATGAAT-TAATTT-AA------ACATCAATTTATGTAA-A-TTC--G----------AT-T--T--CAA-G
gi|5 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggTCTGTTC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCC--AAACG-TTCGTCCAAG-AA----CG-CA----GGGGCCGAT-TAT-TTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CA-CA-TGGTACAT----T-TAT------TAAGTTC--GC----CCACC--------------------T--ATCA-------G-GGCA-GATTT--AAAGCCCCC-CCC-----CCCCCCT---TTTCAC-CAAAAA-TATACTGAAACAATACTAA-T-A-----AAAA---C---------T--C-TAGATTT-GGCACCCA-AA--------TGGCCTTTTAAAAA-G--GTTTTACCTACATAAAT---ATATGCCCCCC--CCTT--A---AAA-----------------------T--TTCTGG-ATCTGTC-CAGATTTT--CCTTCTAGCA-AACA-T----TAAAATCCCA----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTTAAT-------A-CTATGAAAAA--TAAATTA---TA--C-GTA----CAGG--TTTATTTTATT---T---TT-AAT----TTAACTTTAGCATTGA--C--ACA--TTTT--GATT----TCTTCT-C--TG----TA-TAGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGATTTT-CT--CG-TC--GTCTCT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TGA--AGGA-G------AC-GAC-C-----AGCT---ATAA-ACACGATACGT---CG-TTTCT--GCGT-CT-TCA--AG-TTTTG--ATTTTGT-TCT-T--TT---CTT-----A-A--A-ATTCAATA--TAA-TATAT-TAAA--TG-TA-TGT---CAAT-A-CGGACA--GTGTGGGTG---------ACAAAC-----TGT-ATT--AA-CAG--TAA----A--TCT--AGAATC---TAA--CAAG------CA-GCCCGCATTTAATG-G---CCAAAGA------GTA-T---A-TTCGGTTT--------ACAA-AAAATGA----AA-------T--ATTTTCC-T-CCCTGA-C-----------------ATT-ACAT------------------ATG-TAC-CA-ATTC-TC-TC-TTG--T--GTGAATA----------A-TTA-T-TTTGATTTA-TTAAAATG--TTT--T---agatagcagatacttctgttcatcgacgacttggacgagtccaaacgttcgtccaagaacgcaggggccgattattttcattgctttaaaacacatggtacatttattaagttcgcccacctatcagggcagatttaaagccccccccccccccttttcaccaaaaatatactgaaacaatactaataaaaactctagatttggcacccaaatggccttttaaaaaggttttacctacataaatatatgccccccccttaaaatttctggatctgtccagattttccttctagcaaacattaaaatcccaggcatgattttgtaatttaatactatgaaaaataaattatacgtacaggtttattttatttttaatttaactttagcattgacacattttgatttcttctctgtatagtcttctatggcttgcagtgcgattttctcgtcgtctctaaagcaacatgtctgaaggagacgaccagctataaacacgatacgtcgtttctgcgtcttcaagttttgattttgttcttttcttaaaattcaatataatatattaaatgtatgtcaatacggacagtgtgggtgacaaactgtattaacagtaaatctagaatctaacaagcagcccgcatttaatggccaaagagtatattcggtttacaaaaaatgaaatattttcctccctgacattacatatgtaccaattctctcttgtgtgaataattattttgatttattaaaatgtttt
gi|6 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggggagggggggggggggggtgaagatatgcaccttaaatgaattaatttaaacatcaatttatgtaaattcgatttcaagagatagcagatact--GT---CTT-----A-AA-A-ATC--ATA--T---TA-GT--AAA--TGGTACTGAT--CAATA--CGG--AA-GT-TGGGTG---------AC-AGA-AG--TTT--TTGTAA-CAG--T-A----AAACCT--A-AATC---CAATCCAAGG-----CA-G--------TCATG-GC--C--AATAA-----GT------------TT-------------------T-A----AA-------T--A-ATTCC-TTCCCTGG----------------------GAC---------------------TG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAA---GCTTTT--T---GAAACA-TG-TT--G--GAAATA-AAGT-AG--A-TAA-TGTGCAACGTAAAAT-T------GAATGCATTTGTC-ATC--CC---AA-TAT-CC---AAGAAAAG------AC-AT-----TA-------ACT---A--TC--AA-GAC-C-C--AAT-------------TGTCTCATAC--AAT-ACTTT--C-GCAC-TA---TCTTT-----ATCTAGTTTGAATC---TGGA------GAGGGG-GG-G----GCCGG-GAATCG-------GCT---CACCGT-ATAAATCATAGT--ATCTGATTT-TA------ACATCAG---AT---A-A-TTC--A----------ATAT--T--AACTGTCA-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTTGGGC-C-C----TAAAA--GTGT--GT-AT-TCTTTAA-A--AAAACG------CCAAACA----------TAAATGTTTTATCGTATTTCTGC-A-CTGC-TATATAC--G-C-GAACC--AGA---A------------------------------ACAT------T---TCGGTGA-ATT-ACCC--AC--AAC-AA-TAAAA---ATCGTG-CT----A-GGAAAAC-TTCGAC--GATTT-T---T---AAAAACAATGTTCTGTTGGTCTTGACAA-CGG-ACA-CGATT-TACAT-AAGTCTTTTC-A--TAAAATATTT--TCGTCTAT-TTTCATGC--ACATTGT-ACTG-GTATTT-ACT-TTTG-TT--ACACCATAACCGTAC-GGCAATGA-AT-TAT-TAAG-A-T-T--T--TTTT--AAATTA-CCCACA-ACTA-T------------------T--TACGTTTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-----CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GC-------GGT----AATA-ACA-CAA---AATCAA
gi|7 : TCC-TACTAT-CGACGACTTGGACG-GTCC-AAAACG-TCCGTCCAAA-AC-----G-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAAACAACG-TGGTACATATTAT-TAT------TA-GTTC--GC----CCACC--------------------T--ATC--------GTGCCA-GATT-C-AA----CCCTCCC-----CCCCCCT---TGTCAC-CAAAAAGTA-----------TACTAAAC-AATACTAATAAAAC---------T--C-CAGATTTTGAC-ACCC-GAAAGGGCCTT------TTAAAAAAG--GCTTTACC------TACATTATATGCC----ACCCCTTTA---AAA-----------------------TATTTCTGGATCCTGTCACTGAATTT--CCTTCTAGCA-AACACT----T-AAATCCTC----GGCA-----T-----------------------------------------------AAATTAC--TA-CCTGTA----CAAGGTTTTATTTTA-TATTT---TT-AAT---GATA-CTTTA-CATTGACAA--ACA--GTT---GATT----TC-TTTTCTCTG----TA-TAAGCTT-CTATG-TTT-GCTCA--GTGCGATTTT-TT--CCGTC--GTCTAT--AAAAG--C-----A----CATG-TC---TG---AAGAAG------AG-CAC-CA-----GCT---ACAA-ACACGATAC-T---CGTTT-CT--GCTT-CT--CA--GCGTTTTG--ATTT--T--CT-T--GT---CTT-----A-AAAA-ATTCAATA--TAATTA-AT-ATAA--TG-TA-c
gi|8 : aatgcaactgttcacgtcgactgagtaatgtttttgtccgcgttaaaagaagacgctgtttttattgcaaaaattgctaactatttatgaaacaacgcgagggagggggggggggtaaatgaagatagcacttaaaatgaaattaattaaaccatcaatttattaaaattgatttcaagagagataaaggtaccATA-A-TT-AT--A-TAG-CG---A-AGTAATAC-T------G----------TANNNN--NN---NN-NNN-NN---NNNNN--N------NN-NN-----NN-------ACC---A--CA--AG-GAC-C-C--AAT-------------TGTT-CAT----AAT-ACTTT--TTGCATATT---T-TTTT----AT-TAGTTTGAATC---TGGA------GAGGAG-GGTG----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A---------GT--AT-TGATTT-CA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C-C----T--AG--GTGT--GC-AT-TT---AA-TAAAAAAAA------ACCAAAA----------TAAATGTTTTAAC-TATTTT-GC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA---AA------------CTTTTTTTTTTAC----ATAT---T-GT---TCG--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TACAA---TT-GTG-CTG---G-GG-TAAA-TTTGACT-GATTT-T---TAAAAA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTT--A--ATGAATATTT--C--TC-GT-TTTC-TGA--A-ATTGT-A-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AT-GACAATGA-A--TAC-TTAT-A-T-TAAAC-TTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG--TTTG-A-AAGTTG--T-T---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTATC-GG-------TCGAAGATTT-C-T--GT-------GGT----AACA-TT--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTTGA-A-GA-G-------------------GGAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATGG-GGA-A------ATG-TTTTTAA---CTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ATGGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGGcaatgtaaagtagtaagtaagtaagtaattgtatttatta
gi|9 : gttcctagaaaaaatacatcgatattttTT-CTATTGCTT-GCAAGTAG-GCGATTTTATT--C--TC--GTCTAT--AAACG--CTAGAGACTCACATGGTTGCATG---AGGA-GCTTATGAC-TAC-CATGACACCC---ACAATACACGATAC-TGTGCGTTT-CTG-GCTT-TG-ACAGAAGATATTGGTATTT--TGTCTAT--AT---CTTGATAGA-AACACATTCAA---------A-A---AGA--TG-GA-T--C--CA-------G--A--GT-TATTTA---------AC-A-------------TA-AA--AG-------------CT--A-AATCTAACAA--CAAG------AA-G--------GTATATGC--TGAAAGAG-----TTAATAAAC-TTCGTCGCGCTGGACGACAAGACACT-ACTGAAA-------TTAA-TGTCCGT-CCCTGACC-----------------ACTA-CAT------------------ATGGTAGCTG-A-GCGTCGTC-TT---T--G--AATACTAGAGAGAGA-TGT-A-TA---TTCGCTCAAC--G--TCT--T---GAAACAATGGTT--AGAAAAATACA-TTTAGTCA-TAAATATGCA-TGTAATAC-TCGGCGAGA--GCTTT-GTC-ATC--AC---AAGTAT-CCACTCAGTA--GGATCATAC-ATGCATTTT-------ACC---AA-CAGAAG-GCA-CTC--AATGGGCGAGGCATGATGTTTCATTAATAAT-ACTTTATT-GACTATA---T-TCTTTCTGAT-TAGTTTGAATAAGCTGG-------GAGGAGCGG-G----G--GGCG----G-------TGTTGTCAC-GT----------AGT--A--TGATTTGTATTTATTA-ATCAG---AT---A-AGTTC--G----------Atcg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|20 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): TGCTAACTGGTTCAGTCGACTGAGTAATGTTTCTCACGCGTTAAAAAGAAGAGGCTGTTTTTATTGCAAAATGTGCTACTTTTTGAACACGAGGGGAGGTGGGGGATAAGAAGATATGCACTTTAAAAGAAATAATCAAACCACAATTTTTAAATTCGATTTAGAGACG
Unaligned ( gi|23 ): TGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAGGGGGGGATGAAGATTTATTAAATTCGATTTCAAGAGAT
Unaligned ( gi|24 ): ATGCAACTGTTTACGTCGACAATACGACCTCACAGCGCACTGTTTATGTCGATTGCGTAATTTTTTCCG
Unaligned ( gi|25 ): AATGCACTGTGCTTTCATGGTCCGATTAGGGAGTTAC
Alignments
lowQualScore : 1 1 2222222 1111 11111 1111 111111 111 1111 77777777777777777777777 2222222 1 111 11111 111 1 1 22222222222 1111111 33333333333333333333333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777 111 66666666666666666666666666 11 1 111111 1111 11111111111 111 22222222222222 1 1111 2222222222 11111 1 11111 111 222222222222222222222222 1111 11 1 1111111111 111 111 333333333333333333333333333333 1 11 1 1111111111 3333333333 11 1111 22222222222 222222222 1111111111 11 1 111111111111 222222222222222222 3333333333333333 3333333333 222222222222222222 666666666666666666666666666666666666666666666 11 111111 2222222222 111 1 111 11 11111 1 111111 11 1 1111 222222222 11111111111111 11 2222222222222 1111 1111 1 11111 1111 1111111 111111111111111111 2222222222222 111111 1111 1111111111 11 1 111111 1111111 1 1111 111111 2222222222 1 22222 44444444444444444 111111 2222222222 1 111111 222222 1 11 1111111 1111 11 11111 11 11 222222222 11 11111111 111111 1111111 2222 1111111 1111 111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333333 111111 22222 11111 1
lowQualScore : 3 6 6 9 0 5 0 66 1111111 2222 77 5 44444 99 6 7 6 4444 6 999999 6 555 4444 1 00000000000000000000000 1111111 5 6 222 5 44444 000 1 1 1 77777777777 8888888 22222222222222222222222222 5 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666 5 3 111 88888888888888888888888888 6 66 11 1 1 5 888888 2222 7 99999999999 5 77 000 88888888888888 5 77 77 5 1 2222 22 1 5 0000000000 66666 1 66666 111 77 222222222222222222222222 3 5 5 6666 3 5 66 66 66 66 0 66 5555555555 77 333 333 333333333333333333333333333333 5 0 9999 2 3 66 5 55 66 0 66 66 5 5 66 777 6666666666 4 1111111111 4 00 66 8 4 7777 66666666666 5 000000000 5 3333333333 33 0 777777777777 66 5 888 66 222222222222222222 1 5 999 5 0 5555555555555555 2222222222 22 111111111111111111 5 5 5 000000000000000000000000000000000000000000000 5 88 5 5 5 5 5 888888 1111111111 5 111 888 0 666 66 66 888 66 5 55555 5 5 5 66 5 5 5 0 5 444444 66 9 0 22 66 888 0 5 1111 777777777 5 66666666666666 888 11 66 5 5 5 66 7777777777777 0 6 8888 5 3333 2 777 4 55555 4 0 3333 3333333 3 6 7777 55 3 777777777777777777 5555555555555 55 4 4 111111 8 5555 777 8 3 55 5555555555 4 55 11 4 5 5 66 888 5 5 5 0 333333 6666666 66 7 5 888 5555 444444 1111111111 44 5 0 5 5 5 0 66666 5 5 66 33333333333333333 0000 333333 6666666666 66 5 5 66 5 5 5 666666 5 333333 0 22 4 4 5555555 9999 7777 4 4 4 4 4 4 4 777 77777 77777 8 4 8 3 6666 1 4 4 4 3 4 555 4 4 77 11111 4 4 00 66 4 4 4 1 00 66 4 000000000 555 4 4 66 4 55 44 4 4 11111111 111111 55 55 44 4 8 3333333 1111 7777777 5555 4 555 777 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 777 777 9999 8 4 4 66 4 777 4 000000 4 66 9999 222222 66 4 8888888 777 4 55555 4 8 888 22222 5 5 1
lowQualScore : . . . . . . . .. ....... .... .. . ..... .. . . . .... . ...... . ... .... . ....................... ....... . . ... . ..... ... . . . ........... ....... .......................... . . .................................................. . . ... .......................... . .. .. . . . ...... .... . ........... . .. ... .............. . .. .. . . .... .. . . .......... ..... . ..... ... .. ........................ . . . .... . . .. .. .. .. . .. .......... .. ... ... .............................. . . .... . . .. . .. .. . .. .. . . .. ... .......... . .......... . .. .. . . .... ........... . ......... . .......... .. . ............ .. . ... .. .................. . . ... . . ................ .......... .. .................. . . . ............................................. . .. . . . . . ...... .......... . ... ... . ... .. .. ... .. . ..... . . . .. . . . . . ...... .. . . .. .. ... . . .... ......... . .............. ... .. .. . . . .. ............. . . .... . .... . ... . ..... . . .... ....... . . .... .. . .................. ............. .. . . ...... . .... ... . . .. .......... . .. .. . . . .. ... . . . . ...... ....... .. . . ... .... ...... .......... .. . . . . . . ..... . . .. ................. .... ...... .......... .. . . .. . . . ...... . ...... . .. . . ....... .... .... . . . . . . . ... ..... ..... . . . . .... . . . . . . ... . . .. ..... . . .. .. . . . . .. .. . ......... ... . . .. . .. .. . . ........ ...... .. .. .. . . ....... .... ....... .... . ... ... ............................................................ . ... ... .... . . . .. . ... . ...... . .. .... ...... .. . ....... ... . ..... . . ... ..... . . .
lowQualScore : 5 7 7 8 8 0 7 11 4444444 1111 99 7 33333 22 7 3 7 2222 7 222222 7 888 2222 0 77777777777777777777777 7777777 5 7 666 7 33333 000 4 4 4 11111111111 0000000 44444444444444444444444444 7 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333 0 2 777 33333333333333333333333333 7 99 44 7 4 7 333333 1111 9 77777777777 7 99 000 11111111111111 7 99 99 7 4 1111 11 4 7 0000000000 00000 4 77777 444 99 111111111111111111111111 0 0 0 4444 6 0 99 99 99 99 0 99 5555555555 55 888 888 888888888888888888888888888888 0 0 0000 0 2 99 0 44 99 8 99 99 0 0 11 888 0000000000 4 7777777777 4 99 11 9 4 9999 88888888888 0 000000000 0 2222222222 44 0 555555555555 99 0 888 99 888888888888888888 0 0 444 6 9 8888888888888888 0000000000 66 666666666666666666 0 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 0 0 0 0 555555 9999999999 0 111 888 0 111 99 99 888 44 7 99999 0 0 0 99 0 0 0 8 0 444444 99 5 1 66 99 888 0 0 5555 666666666 0 55555555555555 888 99 99 0 0 0 99 5555555555555 1 2 0000 0 0000 4 888 4 66666 4 1 7777 0000000 3 7 7777 00 6 555555555555555555 4444444444444 55 0 0 555555 0 6666 000 0 6 00 9999999999 0 55 00 0 0 0 99 888 0 0 0 0 999999 2222222 99 9 0 888 5555 444444 9999999999 11 0 8 0 0 0 4 99999 0 0 99 00000000000000000 9999 000000 1111111111 99 0 0 99 0 5 0 666666 0 555555 0 55 4 4 7777777 4444 6666 4 4 4 4 4 4 4 888 99999 66666 9 4 9 9 9999 9 4 4 4 4 0 444 4 4 22 11111 4 4 66 33 4 4 4 8 66 11 4 000000000 333 4 4 11 0 55 66 0 0 22222222 555555 55 55 77 0 0 0000000 8888 0000000 5555 0 999 000 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 888 888 7777 9 6 4 11 4 888 4 666666 4 11 7777 888888 11 4 2222222 888 4 33333 4 9 888 55555 0 0 4
consensus : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-ATTCAATA--TAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TGTC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT--AGG-------TGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
Reference ( family-1363 ) : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-ATTCAATA--TAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TGTC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT--AGG-------TGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
gi|1 : AGCGC-CCC-----ACCCTTT---TTTCAC-CAAAAACTA-----------TA-TAAAT-------AATA---C---------TTAA-TAAA----AAC-TACA-AA--------T------TT------GCAAC---ACC------AA----AAATG
gi|1 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccCCCCCCCTTTTACAAAAA-----------------------G--TTTTGA-TCTGGTCACTGAATTTTCC--TCTAGCA-AAAA-CAATAT-AAGTCCTC----GGCA-----TG-AATTTTT-GACTAAATATTC-ATTCCCAAGA-T-ATG-AAAAAATAAAATAC--TAACC-GTAAACACGAATTGTTATTTTA-T---TCGTTCTAATCGTGATAACTTTAACATTGA-CAT-ACACTTTTT--GATA----TC-----------------CA-------TATGGCTTAGCAAG--ATTCGATTGT-CTGACG-TC--GTCTAT--AAA-GGGC-----A---A-ATG-TT---TGGACAGGA-A------TGTCACACA----GACTTACA-AA-ACACCCTAT-T---T-CTCTCTCTGCTTACTGTCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCC-TTCGTTCCCTT-----ATAACA-ATTCA---------CA-AT-TAAACTTGATA-TGTCGCCAATAA-CAG--ATAGT-TGCGTGTGTGCGTTGAC-AACATG--TTTGATTT-AA-CAG--T-ACAAAA--CC-----AATC---AAA--CAAGACTATCCATG--------TTATG-GC--C--AAGAGTTTATGTA-----C-TGCGTTTG--------ACA---------------------------TTTGC-T-CCGTGACT-----------------AATA-CAT------------------A-G-TAACCA-A-TC-TT-TC-TTCTTT--GT-AATA----------A-TTCTG-TT---CTTG-TCAA---G--TTTATC---GAAAAAATG-TT--G--AATATT-A-TT-AA--AATAA-TGTGCG-TGTA-TAC-T------GA--GCTTTTGTACATT--CCGCGAA-TAT-CC----AGAA----------CTAT-----TT-------ACC---AAACA--AGTGAA-C-CCCGAT-------------TGTT-----C-TAATTACTTT--C-GCAT-TA---T-TTT-----TT-TAATCTCAGTT--TTGAAATTATGGAAGGA-TG-GTTCTG--GG-G----G-------TG----CAC-GT-A--------GGA--CT-TGATTT-TA------A-ATCAGTGTAT---A-A-TTCACG----------AC-TATT--ATA-GT-A-T--TTTTTCTTAC-ACAT---ACTTGTT-TGG-C--CT--AGGATAGAGGTAT--GTGAT-TC---AACT--AAAACAGAGTAGACAAAAACCCAAAGATATAATTGTTTTATC-TATTTTAGC-A-CTGCCTAAATACACG-TAGAA-C--AGA----AAATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTACATAT---T-GT---TCT--GA-GTTTACCCCAGCATAACAAGCTAAAAATCTTAGTGGTT----A-GGGTAA--TTCGACTTGATTT-T---A---AA----AAAATGTT-TTG--TGTTA-AA--GG-ACA-CAA-T-TACAT-A-----TTTA-A--ATAA-TATTTTGC--TCCAT-ATTC-TGCTCA-ATTGC-A-TG-ATTACT-A-A-TTTG-TTATACA-A-TA-----AC-GGCAATGATA--TAT----G-A-T-TAAA--TTAT--TAA-TC-CACA-TTAGTACT-TGG-TTAG-CTC--T-ATGTTACG-TGTTGGA-AAGTTG--T-C---GTTC-------T--A--TATTTCCCGGGG-TGT-CTTCTCAGG-------TCGAAGATTTCT-T--GT-------GGTTGAAAACA-AT--CAA---AATCAAA-----------------------------------------------------------------------TG---CAATTTTTGCATA-ATATGGC-G-G--TA-AA---TG-TGTT--A----TT-CG--GTAAAGAATTGT------CTGAT--A-CA---GTACACGTTG---AAATTA--ATATAATAC-T-GGAG---T-----ATTAACACTCAT-aacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggcccccccttttacaaaaagttttgatctggtcactgaattttcctctagcaaaaacaatataagtcctcggcatgaatttttgactaaatattcattcccaagatatgaaaaaataaaatactaaccgtaaacacgaattgttattttattcgttctaatcgtgataactttaacattgacatacactttttgatatccatatggcttagcaagattcgattgtctgacgtcgtctataaagggcaaatgtttggacaggaatgtcacacagacttacaaaacaccctatttctctctctgcttactgtcaagtttttgatttttccttcgttcccttataacaattcacaattaaacttgatatgtcgccaataacagatagttgcgtgtgtgcgttgacaacatgtttgatttaacagtacaaaaccaatcaaacaagactatccatgttatggccaagagtttatgtactgcgtttgacatttgctccgtgactaatacatagtaaccaatctttcttctttgtaataattctgttcttgtcaagtttatcgaaaaaatgttgaatattattaaaataatgtgcgtgtatactgagcttttgtacattccgcgaatatccagaactatttaccaaacaagtgaaccccgattgttctaattactttcgcattatttttttaatctcagttttgaaattatggaaggatggttctgggggtgcacgtaggacttgattttaaatcagtgtataattcacgactattatagtattttttcttacacatacttgtttggcctaggatagaggtatgtgattcaactaaaacagagtagacaaaaacccaaagatataattgttttatctattttagcactgcctaaatacacgtagaacagaaaatattttttttttttttttttttttgtacatattgttctgagtttaccccagcataacaagctaaaaatcttagtggttagggtaattcgacttgattttaaaaaaatgttttgtgttaaaggacacaattacatatttaaataatattttgctccatattctgctcaattgcatgattactaatttgttatacaataacggcaatgatatatgattaaattattaatccacattagtacttggttagctctatgttacgtgttggaaagttgtcgttctatatttcccggggtgtcttctcaggtcgaagatttcttgtggttgaaaacaatcaaaatcaaatgcaatttttgcataatatggcggtaaatgtgttattcggtaaagaattgtctgatacagtacacgttgaaattaatataatactggagtattaacactcatcacggtcaccgaaatt
gi|10 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccagcgccccacccttttttcaccaaaaactatataaataatacttaataaaaactacaaatttgcaacaccaaaaatgaacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggCTG-TTCTTTCTTCCTAGCA-AACG-T----A-TAATCCTCCTGTGGGACTTCTTT-A--TTTTCG--CTA---TTT-TC-------T-C-GCA-CAAA--TAA-TTACACCA-CCCGCA----CAAGGTTTT---TTG-C---T----------------ACTCTA-CATCGA-GACTACA--CTCTCTGATTCTTCTC-TCT-CT-CGCTACTA-CGCTCTTTCTATGGC-------A--GTGCGCTTTC-TT--C--TCTCGTCTACTCACC-G--C-----A----CATG-TCC--TG---AGGA---------------------AGC------------CGATAGAT---TGGCTTCT--GCTT-CT-TTC--ACATTTTG--GTTT--T-TCT-T--GT---CTT-----T-TA-A-ATTC------TCA-TA-CT-TAGA--TG-TA-TG----CAATA--CGG--AA-GT-TGG-TG---------AC-GAC-TG--T---ATTA-A--TAG--T-A----C--CCTCTA-ACTC---CA---CA-G------C--G--------TCATC-GCACCCGA---------GTA-C------TCGTT-T--------ACAAGAAAAT-G----AACTACCTGT--A-TTTCT-T-TTCTGACT-----------------GC-AAGATTTTATAAGGAACTACTTGATG-TC--CAGA-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATA----------ACTTA-A-TT---TTTGCTCA----G--TTT--TTCGAAAACA-TG-TT--G--AAAATC-A-T--AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAACTT------GA--GC-TTTGT-CATCGGCC---AATTATGCC---CACGA--GTGA---AC-AT-----TTAGCTCTAACCTATA--CC--AG-GAACC-C--CAT-------------TG------TC-TACT-ACTTT--C-GCAT-TATTTT-TTT-----AT-TCGTTTGGCT---CTGGA------GGGGGG-GG-acggtcaccgaaatt
gi|11 : ------GAGGGG-GGCG----G--GA-GTA--G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-GT-ACA--TTAAC----C-ACATGGCACTAGTT-GGCGC--CT--AGG-------TGCTAGCATT-TC---AA-------ACA------ACAAAA-----------TAAC-GCTTAATC-T--TTTTGC-AACTCA-TA-ATA-----C-TAA-CTCAGA----AA-----TTTTTTTTATCTATATATAT----AAG------GT-----G--AACGTT-ACCC--ACA-AACAA--TACAA---CTCGTG-CTTCAGACGG-TAACATTTTACC-GATTT-T---T---AA----AAAACTTT-TT-GT--TTA-AA-C-G-ACACCAC-T-TA-ATAAA---TTTTACC--ATAAATTTCT--C--TT-ATATTT---------ATTGC-T-TG-TTATTTCA-TGTTTATTTA-AC--AATA-----AC-GCAAATGA-ACTTAC--TAG-A-TATCAT--TCTT--AAA-TACCGTA-G-AATA-TATGT-ATCGCCTCTAT-AT--TAC--TTTTG-ACAAGTTGATT-CTAAGTTC------GTCCA--ATTTTTCCGAAGTTGT-CTTCTCTTT-------TCGAAGATTCTC-A--GTAAGGAACGGT-----ACAGACTACAACTTAATCAAAT--------------A--------------TTCGCAA-GA-G-------------------ACACAGATTCTGCATCA---TCTGCTTA-ACATAATGGCG--GATAA---TG-TTTT--ACTTTTT-C---G---AAAATTG-------CT-ATTAA-CA---A---AATGTG---AAA-T---C-AAAATACGT-GAAGCACT-----A-CTACA-TCAT-CGG
gi|12 : tT-GATTTAT---T---AA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AACCGG-ACA-CAA-TATACAT-GA---TTTTT-G--ATAAATTTTC--T--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGTAA-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AC-GGCAA-GA-A--TACATTAGAA-T-TCAA--GTTT----------------AGTA-T-TGGTTTCG-CTC--T-AT--TACG---TTG-A-AAGTTGT-T-C---GTTC------GT--A--A-TTTCCCGGGC-AGTCCTTCTC-GG-------TCGAAGATTTTC-T--GT-------GGTATA-AACA-AC--CAA---AAT-GAAC--------------A--------------TTTG--A-GA-AGATACAAAGTTTTGAAGATAAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-AACTAATGG-C--GA-TA---TG-TTTTTCT---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTAAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-T---A-AAAATAT-T-GGAA---T-----A-CAACA-TCTT-
gi|13 : -TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-AATTTTTC---ACCACACT-CACTAGTG-GGCAC--CT--AGG-------TGT--GCCATCTT---AA-T--AAAATA------ACAAATA-----------AATTGTTTTAAC-TATTTTTGCTA-TGGC-TATATATC-G-C-GAA-C--AGA----AA-----AATTTCTTTTTTT-----------ACATATGTAGT---TCG--AA-GTT-ACCC--ACA-AAC--A-TGAAA---TATGTG-CT----AGGG-TAACTTTCGACT-GATTT-TAAAA---AA----AATGTTTT-T--GTTGTGA-AA-CGGAATA-CAA-G-TACAT-AG---ATTTA-AAGATAAACATTG--T--CC-AT-TTTCTTGC--C-ATTGT-A-TGTGTAATT-
gi|14 : aatattatttcataatgtgcatgtaataacaacAGTT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----ACGGGCAATGA-T--CAC-TTAG-ACT-TAAATTTTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA---TGG-TTCG-CTC--TCAG--TACG--TTTG-A-TAATGG--T-T---GTTCGCTACGGC--A--ATTTT-CCGGGG-CGT-C-TCTC-CGCACCGATTCGAAGATATTC-TGAGTA------GGT----ATCT-AC--TAG---ATTACAAT--------------A--------------ATCA--A-GATG-------------------CAA------TTA---TA---TCT---TT-AC---ATGG-GAAGA-AATTGTG-TGTT--AAGTTTT-CGTAA---AAAATTGTTCCACCCTGAT--ATCACTTA---AGCGTGGAAAAA-TAATA-AAAATAC-T-AG
gi|15 : TCCGT-C-ATTCGACGACTTGGACT-GTC---AAACGGTCCGTCCAAGAAC----GG-CACCTCAG--CCGATGTGTATTTC-----A
gi|16 : aagcaactgttttccgcgactggagtaatgtttttctctgctaagtaatatgaggtgattgagcgcgcacagaaggtatgtgagagatgcggtgcgaattgagaggctgagatgaaataagaaggtaaaaacaccttaataggtgatattaaatattaaaccatcacattttatgaaattcgatttaagactgataaggtaac-AT--TACG-TTT-G-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--ATGATTTTCCTGAGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAA---AATCAAAC--------------AACTGTATTAACTAATTCG--AAGA-G-------------------AAAAGG---TTG---CA-------AA---ACATAATGG-G--GA-AC---TT-TTTTT-A---TTTTCT--G---AAAATTGT------GTGAT--A-CA---A---ACAGTT---AAC-T---T-AAAATAT-T-AGAG---TAAAAAA-AAACA-TCTT-CGG
gi|17 : CCGTCCAAG-ACGTAACG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTCTTTCAGTTGCTTTATAAAA-C-ACGTTGGTACAT----T-TATAGTAAGTA-TTTCTGACAATACAACC--------------------TAGATCAAGGATTGGTGAC-AGATTTCAAAAGAGCCC-CCCCCCCGCCCCTTTCCCTTCCAC---AGGA-TA------------ACTAAACAA-----AATA---TTCGCCAGGAT--A-TAAAAAC-GAC-TCCACGA----------------T------A--GC---ACtc
gi|18 : C--CTGAG------GGGGGC-GG-G----A--GT-A----G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-G
gi|2 : tgcaactttcacagtcggacatacgtcatcacaatgcaaacgttcacaccgaaactgcgtaattttttccgcactgaaaaaatgcttttttattgcacaagctgcgctaaactattcttgaacacaacggggtgggatggggcgaTCCG-AC-AT-CGACGACTTT-ACGGA--CCAAAACG---------------------CA----GG--CCGAT-TT-ATTTC-----ATTGCTT---AAAA-CA-CG-T--TGCAT----TATAT-------A-GT-C--GC----CCACCTATCAGTGGCAGATTTCACCT--ATCA-------GTGGCA-GATTTC-AAAG----C-CCC-----CCCCTTT---T--CGC-CAAAAA-TT-----------TACTAAAC-A-----A-TA---T---------T--AATAAA-----AC-TCCA-GA--------T------TT------T--TA---CCC------AA----A----------AGCCTTTTA---AAAAGGCTACAACATATAATACCCCCC--TACTGG-ATCTGTCACTA-------CTTTCTATCA-AACA-TA---T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTC-AA-------AAC-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGG-TTTA-TTTA-T---T---T--AAT---TGTAAC-TAA-CATAGA-GA--ACA---TTT--GAT--------TCT-TT-TC----TA-TAGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGA--TG-TT--A--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AAGA-G------AA--AC-C-----AGCTA--A-AA-ACAC-ATAC-T----GTCTTCTC---------TCA--AG-TTTTG--GTTT--T-TCT-T--GT---CTT-------AATA-ATTC-AT-----A-TA-AT-TAAA--CG-TA-TGT---CAAT-A-CGGA-A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TGCATGT-ATT--AA-CAGTTT-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TCATG-G---CCAAAGA------GTA-----C-TTCGTT-T--------ACAAGAAAATGA----AA-------T--A-TTTCC-T--CCTGACTCAAGATTTTATAATGGAACT-ACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TCTTT---T--GCGAATA----------A-TTA-A-TT---GTTG-TC-AA--G--TTT--T---GAAGCA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAAC-T------GA--TC-TTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---T-GAA--G------AC-AT-----TT-------ACT---A--CC--AG-GAC-C-C--AA-----------------TTCATT----------------------------------------AGTTTGAAT---ATGG---------GGGA-GG-G----G--GG-A----G-------------CAC-TT-A--------A-T--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--GATTTAACGTAAT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C--CT--AGG-------TGT--GC-AT-TC---AA-A--AAATC----------AAAA----------TAAATATTTTATC-TATTTT-GC-A-CTGT-CATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA-------------CATTTTTATTTT----ACATATCC-GT---T-G--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TAAAA----TCGTG-TT----AGGG-TA---------T-AACTT-T---T-----------TGTTTT----GTTGTTA-AA-CGA-ACA-CAA-T-TACAT-CA---TTTTA-A--TTTAATATTT--C--TT-AT-TTTT-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAA-------TTTG-TTA-ACA-ATAA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTTTAAAA-T--CAT--A-AGTA-T-TGG-TTCG-CT---T-A----ACG--TTTG-A-AAATTG--T-A---G-TC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTT-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAG---GATCAAACAACTGTATTAAATAA--------------CTCGA-A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATGG-G--GA-AA---TGTTTTT--AT--TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-TA---A---ACAGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-
gi|22 : tgagtaatattttccccgttaaaagaagagcttttcatttgcaaaatgtgctaactatttgaacaattcgataataaaccgttttcaagagtaaggtaccA---C-TTC-----AT-T--TTTGAATC--CATAC------GAGGGG-AG-G----G--GG-G----G-------TG
gi|3 : acctgttttttctactaaatcagaagagctaccgtttttaatttgcaaataataagctaTCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----T-AAATCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-AATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TGTC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-AATT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAAC---AGG-------TGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTAT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATGG-G--AA-AT---TG-TTTT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGGggggggtaattgaagatgagagtcacttaaaatgaattgtagaaattaaactatccattaatc
gi|4 : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----T-AAATCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-AATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TGTC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-AATT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAAC---AGG-------TGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTAT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATGG-G--AA-AT---TG-TTTT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGG
gi|5 : GGA------GGGGGG-GG-G----G--GG-G----GGTGAAGATATG--CAC-CTTA--------AATGAAT-TAATTT-AA------ACATCAATTTATGTAA-A-TTC--G----------AT-T--T--CAA-G
gi|5 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggTCTGTTC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCC--AAACG-TTCGTCCAAG-AA----CG-CA----GGGGCCGAT-TAT-TTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CA-CA-TGGTACAT----T-TAT------TAAGTTC--GC----CCACC--------------------T--ATCA-------G-GGCA-GATTT--AAAGCCCCC-CCC-----CCCCCCT---TTTCAC-CAAAAA-TATACTGAAACAATACTAA-T-A-----AAAA---C---------T--C-TAGATTT-GGCACCCA-AA--------TGGCCTTTTAAAAA-G--GTTTTACCTACATAAAT---ATATGCCCCCC--CCTT--A---AAA-----------------------T--TTCTGG-ATCTGTC-CAGATTTT--CCTTCTAGCA-AACA-T----TAAAATCCCA----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTTAAT-------A-CTATGAAAAA--TAAATTA---TA--C-GTA----CAGG--TTTATTTTATT---T---TT-AAT----TTAACTTTAGCATTGA--C--ACA--TTTT--GATT----TCTTCT-C--TG----TA-TAGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGATTTT-CT--CG-TC--GTCTCT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TGA--AGGA-G------AC-GAC-C-----AGCT---ATAA-ACACGATACGT---CG-TTTCT--GCGT-CT-TCA--AG-TTTTG--ATTTTGT-TCT-T--TT---CTT-----A-A--A-ATTCAATA--TAA-TATAT-TAAA--TG-TA-TGT---CAAT-A-CGGACA--GTGTGGGTG---------ACAAAC-----TGT-ATT--AA-CAG--TAA----A--TCT--AGAATC---TAA--CAAG------CA-GCCCGCATTTAATG-G---CCAAAGA------GTA-T---A-TTCGGTTT--------ACAA-AAAATGA----AA-------T--ATTTTCC-T-CCCTGA-C-----------------ATT-ACAT------------------ATG-TAC-CA-ATTC-TC-TC-TTG--T--GTGAATA----------A-TTA-T-TTTGATTTA-TTAAAATG--TTT--T---agatagcagatacttctgttcatcgacgacttggacgagtccaaacgttcgtccaagaacgcaggggccgattattttcattgctttaaaacacatggtacatttattaagttcgcccacctatcagggcagatttaaagccccccccccccccttttcaccaaaaatatactgaaacaatactaataaaaactctagatttggcacccaaatggccttttaaaaaggttttacctacataaatatatgccccccccttaaaatttctggatctgtccagattttccttctagcaaacattaaaatcccaggcatgattttgtaatttaatactatgaaaaataaattatacgtacaggtttattttatttttaatttaactttagcattgacacattttgatttcttctctgtatagtcttctatggcttgcagtgcgattttctcgtcgtctctaaagcaacatgtctgaaggagacgaccagctataaacacgatacgtcgtttctgcgtcttcaagttttgattttgttcttttcttaaaattcaatataatatattaaatgtatgtcaatacggacagtgtgggtgacaaactgtattaacagtaaatctagaatctaacaagcagcccgcatttaatggccaaagagtatattcggtttacaaaaaatgaaatattttcctccctgacattacatatgtaccaattctctcttgtgtgaataattattttgatttattaaaatgtttt
gi|6 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggggagggggggggggggggtgaagatatgcaccttaaatgaattaatttaaacatcaatttatgtaaattcgatttcaagagatagcagatact--GT---CTT-----A-AA-A-ATC--ATA--T---TA-GT--AAA--TGGTACTGAT--CAATA--CGG--AA-GT-TGGGTG---------AC-AGA-AG--TTT--TTGTAA-CAG--T-A----AAACCT--A-AATC---CAATCCAAGG-----CA-G--------TCATG-GC--C--AATAA-----GT------------TT-------------------T-A----AA-------T--A-ATTCC-TTCCCTGG----------------------GAC---------------------TG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAA---GCTTTT--T---GAAACA-TG-TT--G--GAAATA-AAGT-AG--A-TAA-TGTGCAACGTAAAAT-T------GAATGCATTTGTC-ATC--CC---AA-TAT-CC---AAGAAAAG------AC-AT-----TA-------ACT---A--TC--AA-GAC-C-C--AAT-------------TGTCTCATAC--AAT-ACTTT--C-GCAC-TA---TCTTT-----ATCTAGTTTGAATC---TGGA------GAGGGG-GG-G----GCCGG-GAATCG-------GCT---CACCGT-ATAAATCATAGT--ATCTGATTT-TA------ACATCAG---AT---A-A-TTC--A----------ATAT--T--AACTGTCA-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTTGGGC-C--CTAAAAG-------TGT--GT-AT-TCTTTAA-A--AAAACG------CCAAACA----------TAAATGTTTTATCGTATTTCTGC-A-CTGC-TATATAC--G-C-GAACC--AGA----A------------------------------ACAT------T---TCGGTGA-ATT-ACCC--AC--AAC-AA-TAAAA---ATCGTG-CT----A-GGAAAAC-TTCGAC--GATTT-T---T---AAAAACAATGTTCTGTTGGTCTTGACAA-CGG-ACA-CGATT-TACAT-AAGTCTTTTC-A--TAAAATATTT--TCGTCTAT-TTTCATGC--ACATTGT-ACTG-GTATTT-ACT-TTTG-TT--ACACCATAACCGTAC-GGCAATGA-AT-TAT-TAAG-A-T-T--T--TTTT--AAATTA-CCCACA-ACTA-T------------------T--TACGTTTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-----CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GC-------GGT----AATA-ACA-CAA---AATCAA
gi|7 : TCC-TACTAT-CGACGACTTGGACG-GTCC-AAAACG-TCCGTCCAAA-AC-----G-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAAACAACG-TGGTACATATTAT-TAT------TA-GTTC--GC----CCACC--------------------T--ATC--------GTGCCA-GATT-C-AA----CCCTCCC-----CCCCCCT---TGTCAC-CAAAAAGTA-----------TACTAAAC-AATACTAATAAAAC---------T--C-CAGATTTTGAC-ACCC-GAAAGGGCCTT------TTAAAAAAG--GCTTTACC------TACATTATATGCC----ACCCCTTTA---AAA-----------------------TATTTCTGGATCCTGTCACTGAATTT--CCTTCTAGCA-AACACT----T-AAATCCTC----GGCA-----T-----------------------------------------------AAATTAC--TA-CCTGTA----CAAGGTTTTATTTTA-TATTT---TT-AAT---GATA-CTTTA-CATTGACAA--ACA--GTT---GATT----TC-TTTTCTCTG----TA-TAAGCTT-CTATG-TTT-GCTCA--GTGCGATTTT-TT--CCGTC--GTCTAT--AAAAG--C-----A----CATG-TC---TG---AAGAAG------AG-CAC-CA-----GCT---ACAA-ACACGATAC-T---CGTTT-CT--GCTT-CT--CA--GCGTTTTG--ATTT--T--CT-T--GT---CTT-----A-AAAA-ATTCAATA--TAATTA-AT-ATAA--TG-TA-c
gi|8 : aatgcaactgttcacgtcgactgagtaatgtttttgtccgcgttaaaagaagacgctgtttttattgcaaaaattgctaactatttatgaaacaacgcgagggagggggggggggtaaatgaagatagcacttaaaatgaaattaattaaaccatcaatttattaaaattgatttcaagagagataaaggtaccATA-A-TT-AT--A-TAG-CG---A-AGTAATAC-T------G----------TANNNN--NN---NN-NNN-NN---NNNNN--N------NN-NN-----NN-------ACC---A--CA--AG-GAC-C-C--AAT-------------TGTT-CAT----AAT-ACTTT--TTGCATATT---T-TTTT----AT-TAGTTTGAATC---TGGA------GAGGAG-GGTG----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A---------GT--AT-TGATTT-CA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C--CT--AGG-------TGT--GC-AT-TT---AA-TAAAAAAAA------ACCAAAA----------TAAATGTTTTAAC-TATTTT-GC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA------------CTTTTTTTTTTAC----ATAT---T-GT---TCG--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TACAA---TT-GTG-CTG---G-GG-TAAA-TTTGACT-GATTT-T---TAAAAA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTT--A--ATGAATATTT--C--TC-GT-TTTC-TGA--A-ATTGT-A-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AT-GACAATGA-A--TAC-TTAT-A-T-TAAAC-TTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG--TTTG-A-AAGTTG--T-T---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTATC-GG-------TCGAAGATTT-C-T--GT-------GGT----AACA-TT--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTTGA-A-GA-G-------------------GGAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTTTAA---CTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ATGGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGGcaatgtaaagtagtaagtaagtaagtaattgtatttatta
gi|9 : gttcctagaaaaaatacatcgatattttTT-CTATTGCTT-GCAAGTAG-GCGATTTTATT--C--TC--GTCTAT--AAACG--CTAGAGACTCACATGGTTGCATG---AGGA-GCTTATGAC-TAC-CATGACACCC---ACAATACACGATAC-TGTGCGTTT-CTG-GCTT-TG-ACAGAAGATATTGGTATTT--TGTCTAT--AT---CTTGATAGA-AACACATTCAA---------A-A---AGA--TG-GA-T--C--CA-------G--A--GT-TATTTA---------AC-A-------------TA-AA--AG-------------CT--A-AATCTAACAA--CAAG------AA-G--------GTATATGC--TGAAAGAG-----TTAATAAAC-TTCGTCGCGCTGGACGACAAGACACT-ACTGAAA-------TTAA-TGTCCGT-CCCTGACC-----------------ACTA-CAT------------------ATGGTAGCTG-A-GCGTCGTC-TT---T--G--AATACTAGAGAGAGA-TGT-A-TA---TTCGCTCAAC--G--TCT--T---GAAACAATGGTT--AGAAAAATACA-TTTAGTCA-TAAATATGCA-TGTAATAC-TCGGCGAGA--GCTTT-GTC-ATC--AC---AAGTAT-CCACTCAGTA--GGATCATAC-ATGCATTTT-------ACC---AA-CAGAAG-GCA-CTC--AATGGGCGAGGCATGATGTTTCATTAATAAT-ACTTTATT-GACTATA---T-TCTTTCTGAT-TAGTTTGAATAAGCTGG-------GAGGAGCGG-G----G--GGCG----G-------TGTTGTCAC-GT----------AGT--A--TGATTTGTATTTATTA-ATCAG---AT---A-AGTTC--G----------Atcg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|20 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): TGCTAACTGGTTCAGTCGACTGAGTAATGTTTCTCACGCGTTAAAAAGAAGAGGCTGTTTTTATTGCAAAATGTGCTACTTTTTGAACACGAGGGGAGGTGGGGGATAAGAAGATATGCACTTTAAAAGAAATAATCAAACCACAATTTTTAAATTCGATTTAGAGACG
Unaligned ( gi|23 ): TGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAGGGGGGGATGAAGATTTATTAAATTCGATTTCAAGAGAT
Unaligned ( gi|24 ): ATGCAACTGTTTACGTCGACAATACGACCTCACAGCGCACTGTTTATGTCGATTGCGTAATTTTTTCCG
Unaligned ( gi|25 ): AATGCACTGTGCTTTCATGGTCCGATTAGGGAGTTAC
Alignments
lowQualScore : 1 1 2222222 1111 11111 1111 111111 111 1111 77777777777777777777777 2222222 1 111 11111 111 1 1 22222222222 1111111 33333333333333333333333333 77777777777777777777777777777777777777777777777777 111 66666666666666666666666666 11 1 111111 1111 11111111111 111 22222222222222 1 1111 2222222222 11111 1 11111 111 222222222222222222222222 1111 11 1 1111111111 111 111 333333333333333333333333333333 1 11 1 1111111111 3333333333 11 1111 22222222222 222222222 1111111111 11 1 111111111111 222222222222222222 3333333333333333 3333333333 222222222222222222 666666666666666666666666666666666666666666666 11 111111 2222222222 111 1 111 11 11111 1 111111 11 1 1111 222222222 11111111111111 11 2222222222222 1111 1111 1 11111 1111 1111111 111111111111111111 2222222222222 111111 1111 1111111111 11 1 111111 1111111 1 1111 111111 2222222222 1 22222 44444444444444444 111111 2222222222 1 111111 222222 1 11 1111111 1111 11 11111 11 11 222222222 11 11111111 111111 1111111 2222 1111111 1111 111 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 333333 111111 22222 11111 1
lowQualScore : 3 6 6 9 0 5 0 66 1111111 2222 77 5 44444 99 6 7 6 4444 6 999999 6 555 4444 1 00000000000000000000000 1111111 5 6 222 5 44444 000 1 1 1 77777777777 8888888 22222222222222222222222222 5 5 66666666666666666666666666666666666666666666666666 5 3 111 88888888888888888888888888 6 66 11 1 1 5 888888 2222 7 99999999999 5 77 000 88888888888888 5 77 77 5 1 2222 22 1 5 0000000000 66666 1 66666 111 77 222222222222222222222222 3 5 5 6666 3 5 66 66 66 66 0 66 5555555555 77 333 333 333333333333333333333333333333 5 0 9999 2 3 66 5 55 66 0 66 66 5 5 66 777 6666666666 4 1111111111 4 00 66 8 4 7777 66666666666 5 000000000 5 3333333333 33 0 777777777777 66 5 888 66 222222222222222222 1 5 999 5 0 5555555555555555 2222222222 22 111111111111111111 5 5 5 000000000000000000000000000000000000000000000 5 88 5 5 5 5 5 888888 1111111111 5 111 888 0 666 66 66 888 66 5 55555 5 5 5 66 5 5 5 0 5 444444 66 9 0 22 66 888 0 5 1111 777777777 5 66666666666666 888 11 66 5 5 5 66 7777777777777 0 6 8888 5 3333 2 777 4 55555 4 0 3333 3333333 3 6 7777 55 3 777777777777777777 5555555555555 55 4 4 111111 8 5555 777 8 3 55 5555555555 4 55 11 4 5 5 66 888 5 5 5 0 333333 6666666 66 7 5 888 5555 444444 1111111111 44 5 0 5 5 5 0 66666 5 5 66 33333333333333333 0000 333333 6666666666 66 5 5 66 5 5 5 666666 5 333333 0 22 4 4 5555555 9999 7777 4 4 4 4 4 4 4 777 77777 77777 8 4 8 3 6666 1 4 4 4 3 4 555 4 4 77 11111 4 4 00 66 4 4 4 1 00 66 4 000000000 555 4 4 66 4 55 44 4 4 11111111 111111 55 55 44 4 8 3333333 1111 7777777 5555 4 555 777 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 777 777 9999 8 4 4 66 4 777 4 000000 4 66 9999 222222 66 4 8888888 777 4 55555 4 8 888 22222 5 5 1
lowQualScore : . . . . . . . .. ....... .... .. . ..... .. . . . .... . ...... . ... .... . ....................... ....... . . ... . ..... ... . . . ........... ....... .......................... . . .................................................. . . ... .......................... . .. .. . . . ...... .... . ........... . .. ... .............. . .. .. . . .... .. . . .......... ..... . ..... ... .. ........................ . . . .... . . .. .. .. .. . .. .......... .. ... ... .............................. . . .... . . .. . .. .. . .. .. . . .. ... .......... . .......... . .. .. . . .... ........... . ......... . .......... .. . ............ .. . ... .. .................. . . ... . . ................ .......... .. .................. . . . ............................................. . .. . . . . . ...... .......... . ... ... . ... .. .. ... .. . ..... . . . .. . . . . . ...... .. . . .. .. ... . . .... ......... . .............. ... .. .. . . . .. ............. . . .... . .... . ... . ..... . . .... ....... . . .... .. . .................. ............. .. . . ...... . .... ... . . .. .......... . .. .. . . . .. ... . . . . ...... ....... .. . . ... .... ...... .......... .. . . . . . . ..... . . .. ................. .... ...... .......... .. . . .. . . . ...... . ...... . .. . . ....... .... .... . . . . . . . ... ..... ..... . . . . .... . . . . . . ... . . .. ..... . . .. .. . . . . .. .. . ......... ... . . .. . .. .. . . ........ ...... .. .. .. . . ....... .... ....... .... . ... ... ............................................................ . ... ... .... . . . .. . ... . ...... . .. .... ...... .. . ....... ... . ..... . . ... ..... . . .
lowQualScore : 5 7 7 8 8 0 7 11 4444444 1111 99 7 33333 22 7 3 7 2222 7 222222 7 888 2222 0 77777777777777777777777 7777777 5 7 666 7 33333 000 4 4 4 11111111111 0000000 44444444444444444444444444 7 7 33333333333333333333333333333333333333333333333333 0 2 777 33333333333333333333333333 7 99 44 7 4 7 333333 1111 9 77777777777 7 99 000 11111111111111 7 99 99 7 4 1111 11 4 7 0000000000 00000 4 77777 444 99 111111111111111111111111 0 0 0 4444 6 0 99 99 99 99 0 99 5555555555 55 888 888 888888888888888888888888888888 0 0 0000 0 2 99 0 44 99 8 99 99 0 0 11 888 0000000000 4 7777777777 4 99 11 9 4 9999 88888888888 0 000000000 0 2222222222 44 0 555555555555 99 0 888 99 888888888888888888 0 0 444 6 9 8888888888888888 0000000000 66 666666666666666666 0 0 0 444444444444444444444444444444444444444444444 0 88 0 0 0 0 0 555555 9999999999 0 111 888 0 111 99 99 888 44 7 99999 0 0 0 99 0 0 0 8 0 444444 99 5 1 66 99 888 0 0 5555 666666666 0 55555555555555 888 99 99 0 0 0 99 5555555555555 1 2 0000 0 0000 4 888 4 66666 4 1 7777 0000000 3 7 7777 00 6 555555555555555555 4444444444444 55 0 0 555555 0 6666 000 0 6 00 9999999999 0 55 00 0 0 0 99 888 0 0 0 0 999999 2222222 99 9 0 888 5555 444444 9999999999 11 0 8 0 0 0 4 99999 0 0 99 00000000000000000 9999 000000 1111111111 99 0 0 99 0 5 0 666666 0 555555 0 55 4 4 7777777 4444 6666 4 4 4 4 4 4 4 888 99999 66666 9 4 9 9 9999 9 4 4 4 4 0 444 4 4 22 11111 4 4 66 33 4 4 4 8 66 11 4 000000000 333 4 4 11 0 55 66 0 0 22222222 555555 55 55 77 0 0 0000000 8888 0000000 5555 0 999 000 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 8 888 888 7777 9 6 4 11 4 888 4 666666 4 11 7777 888888 11 4 2222222 888 4 33333 4 9 888 55555 0 0 4
consensus : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-ATTCAATA--TAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TGTC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT--AGG-------TGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
Reference ( family-1363 ) : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-ATTCAATA--TAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TGTC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT--AGG-------TGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
gi|1 : AGCGC-CCC-----ACCCTTT---TTTCAC-CAAAAACTA-----------TA-TAAAT-------AATA---C---------TTAA-TAAA----AAC-TACA-AA--------T------TT------GCAAC---ACC------AA----AAATG
gi|1 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccCCCCCCCTTTTACAAAAA-----------------------G--TTTTGA-TCTGGTCACTGAATTTTCC--TCTAGCA-AAAA-CAATAT-AAGTCCTC----GGCA-----TG-AATTTTT-GACTAAATATTC-ATTCCCAAGA-T-ATG-AAAAAATAAAATAC--TAACC-GTAAACACGAATTGTTATTTTA-T---TCGTTCTAATCGTGATAACTTTAACATTGA-CAT-ACACTTTTT--GATA----TC-----------------CA-------TATGGCTTAGCAAG--ATTCGATTGT-CTGACG-TC--GTCTAT--AAA-GGGC-----A---A-ATG-TT---TGGACAGGA-A------TGTCACACA----GACTTACA-AA-ACACCCTAT-T---T-CTCTCTCTGCTTACTGTCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCC-TTCGTTCCCTT-----ATAACA-ATTCA---------CA-AT-TAAACTTGATA-TGTCGCCAATAA-CAG--ATAGT-TGCGTGTGTGCGTTGAC-AACATG--TTTGATTT-AA-CAG--T-ACAAAA--CC-----AATC---AAA--CAAGACTATCCATG--------TTATG-GC--C--AAGAGTTTATGTA-----C-TGCGTTTG--------ACA---------------------------TTTGC-T-CCGTGACT-----------------AATA-CAT------------------A-G-TAACCA-A-TC-TT-TC-TTCTTT--GT-AATA----------A-TTCTG-TT---CTTG-TCAA---G--TTTATC---GAAAAAATG-TT--G--AATATT-A-TT-AA--AATAA-TGTGCG-TGTA-TAC-T------GA--GCTTTTGTACATT--CCGCGAA-TAT-CC----AGAA----------CTAT-----TT-------ACC---AAACA--AGTGAA-C-CCCGAT-------------TGTT-----C-TAATTACTTT--C-GCAT-TA---T-TTT-----TT-TAATCTCAGTT--TTGAAATTATGGAAGGA-TG-GTTCTG--GG-G----G-------TG----CAC-GT-A--------GGA--CT-TGATTT-TA------A-ATCAGTGTAT---A-A-TTCACG----------AC-TATT--ATA-GT-A-T--TTTTTCTTAC-ACAT---ACTTGTT-TGG-C--CT--AGGATAGAGGTAT--GTGAT-TC---AACT--AAAACAGAGTAGACAAAAACCCAAAGATATAATTGTTTTATC-TATTTTAGC-A-CTGCCTAAATACACG-TAGAA-C--AGA----AAATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTACATAT---T-GT---TCT--GA-GTTTACCCCAGCATAACAAGCTAAAAATCTTAGTGGTT----A-GGGTAA--TTCGACTTGATTT-T---A---AA----AAAATGTT-TTG--TGTTA-AA--GG-ACA-CAA-T-TACAT-A-----TTTA-A--ATAA-TATTTTGC--TCCAT-ATTC-TGCTCA-ATTGC-A-TG-ATTACT-A-A-TTTG-TTATACA-A-TA-----AC-GGCAATGATA--TAT----G-A-T-TAAA--TTAT--TAA-TC-CACA-TTAGTACT-TGG-TTAG-CTC--T-ATGTTACG-TGTTGGA-AAGTTG--T-C---GTTC-------T--A--TATTTCCCGGGG-TGT-CTTCTCAGG-------TCGAAGATTTCT-T--GT-------GGTTGAAAACA-AT--CAA---AATCAAA-----------------------------------------------------------------------TG---CAATTTTTGCATA-ATATGGC-G-G--TA-AA---TG-TGTT--A----TT-CG--GTAAAGAATTGT------CTGAT--A-CA---GTACACGTTG---AAATTA--ATATAATAC-T-GGAG---T-----ATTAACACTCAT-aacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggcccccccttttacaaaaagttttgatctggtcactgaattttcctctagcaaaaacaatataagtcctcggcatgaatttttgactaaatattcattcccaagatatgaaaaaataaaatactaaccgtaaacacgaattgttattttattcgttctaatcgtgataactttaacattgacatacactttttgatatccatatggcttagcaagattcgattgtctgacgtcgtctataaagggcaaatgtttggacaggaatgtcacacagacttacaaaacaccctatttctctctctgcttactgtcaagtttttgatttttccttcgttcccttataacaattcacaattaaacttgatatgtcgccaataacagatagttgcgtgtgtgcgttgacaacatgtttgatttaacagtacaaaaccaatcaaacaagactatccatgttatggccaagagtttatgtactgcgtttgacatttgctccgtgactaatacatagtaaccaatctttcttctttgtaataattctgttcttgtcaagtttatcgaaaaaatgttgaatattattaaaataatgtgcgtgtatactgagcttttgtacattccgcgaatatccagaactatttaccaaacaagtgaaccccgattgttctaattactttcgcattatttttttaatctcagttttgaaattatggaaggatggttctgggggtgcacgtaggacttgattttaaatcagtgtataattcacgactattatagtattttttcttacacatacttgtttggcctaggatagaggtatgtgattcaactaaaacagagtagacaaaaacccaaagatataattgttttatctattttagcactgcctaaatacacgtagaacagaaaatattttttttttttttttttttttgtacatattgttctgagtttaccccagcataacaagctaaaaatcttagtggttagggtaattcgacttgattttaaaaaaatgttttgtgttaaaggacacaattacatatttaaataatattttgctccatattctgctcaattgcatgattactaatttgttatacaataacggcaatgatatatgattaaattattaatccacattagtacttggttagctctatgttacgtgttggaaagttgtcgttctatatttcccggggtgtcttctcaggtcgaagatttcttgtggttgaaaacaatcaaaatcaaatgcaatttttgcataatatggcggtaaatgtgttattcggtaaagaattgtctgatacagtacacgttgaaattaatataatactggagtattaacactcatcacggtcaccgaaatt
gi|10 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccagcgccccacccttttttcaccaaaaactatataaataatacttaataaaaactacaaatttgcaacaccaaaaatgaacacgacctggctccattagaaaacgcttcttacacttgcattgagtgagcctcccctcctggCTG-TTCTTTCTTCCTAGCA-AACG-T----A-TAATCCTCCTGTGGGACTTCTTT-A--TTTTCG--CTA---TTT-TC-------T-C-GCA-CAAA--TAA-TTACACCA-CCCGCA----CAAGGTTTT---TTG-C---T----------------ACTCTA-CATCGA-GACTACA--CTCTCTGATTCTTCTC-TCT-CT-CGCTACTA-CGCTCTTTCTATGGC-------A--GTGCGCTTTC-TT--C--TCTCGTCTACTCACC-G--C-----A----CATG-TCC--TG---AGGA---------------------AGC------------CGATAGAT---TGGCTTCT--GCTT-CT-TTC--ACATTTTG--GTTT--T-TCT-T--GT---CTT-----T-TA-A-ATTC------TCA-TA-CT-TAGA--TG-TA-TG----CAATA--CGG--AA-GT-TGG-TG---------AC-GAC-TG--T---ATTA-A--TAG--T-A----C--CCTCTA-ACTC---CA---CA-G------C--G--------TCATC-GCACCCGA---------GTA-C------TCGTT-T--------ACAAGAAAAT-G----AACTACCTGT--A-TTTCT-T-TTCTGACT-----------------GC-AAGATTTTATAAGGAACTACTTGATG-TC--CAGA-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATA----------ACTTA-A-TT---TTTGCTCA----G--TTT--TTCGAAAACA-TG-TT--G--AAAATC-A-T--AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAACTT------GA--GC-TTTGT-CATCGGCC---AATTATGCC---CACGA--GTGA---AC-AT-----TTAGCTCTAACCTATA--CC--AG-GAACC-C--CAT-------------TG------TC-TACT-ACTTT--C-GCAT-TATTTT-TTT-----AT-TCGTTTGGCT---CTGGA------GGGGGG-GG-acggtcaccgaaatt
gi|11 : ------GAGGGG-GGCG----G--GA-GTA--G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-GT-ACA--TTAAC----C-ACATGGCACTAGTT-GGCGC--CT--AGG-------TGCTAGCATT-TC---AA-------ACA------ACAAAA-----------TAAC-GCTTAATC-T--TTTTGC-AACTCA-TA-ATA-----C-TAA-CTCAGA----AA-----TTTTTTTTATCTATATATAT----AAG------GT-----G--AACGTT-ACCC--ACA-AACAA--TACAA---CTCGTG-CTTCAGACGG-TAACATTTTACC-GATTT-T---T---AA----AAAACTTT-TT-GT--TTA-AA-C-G-ACACCAC-T-TA-ATAAA---TTTTACC--ATAAATTTCT--C--TT-ATATTT---------ATTGC-T-TG-TTATTTCA-TGTTTATTTA-AC--AATA-----AC-GCAAATGA-ACTTAC--TAG-A-TATCAT--TCTT--AAA-TACCGTA-G-AATA-TATGT-ATCGCCTCTAT-AT--TAC--TTTTG-ACAAGTTGATT-CTAAGTTC------GTCCA--ATTTTTCCGAAGTTGT-CTTCTCTTT-------TCGAAGATTCTC-A--GTAAGGAACGGT-----ACAGACTACAACTTAATCAAAT--------------A--------------TTCGCAA-GA-G-------------------ACACAGATTCTGCATCA---TCTGCTTA-ACATAATGGCG--GATAA---TG-TTTT--ACTTTTT-C---G---AAAATTG-------CT-ATTAA-CA---A---AATGTG---AAA-T---C-AAAATACGT-GAAGCACT-----A-CTACA-TCAT-CGG
gi|12 : tT-GATTTAT---T---AA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AACCGG-ACA-CAA-TATACAT-GA---TTTTT-G--ATAAATTTTC--T--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGTAA-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AC-GGCAA-GA-A--TACATTAGAA-T-TCAA--GTTT----------------AGTA-T-TGGTTTCG-CTC--T-AT--TACG---TTG-A-AAGTTGT-T-C---GTTC------GT--A--A-TTTCCCGGGC-AGTCCTTCTC-GG-------TCGAAGATTTTC-T--GT-------GGTATA-AACA-AC--CAA---AAT-GAAC--------------A--------------TTTG--A-GA-AGATACAAAGTTTTGAAGATAAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-AACTAATGG-C--GA-TA---TG-TTTTTCT---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTAAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-T---A-AAAATAT-T-GGAA---T-----A-CAACA-TCTT-
gi|13 : -TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-AATTTTTC---ACCACACT-CACTAGTG-GGCAC--CT--AGG-------TGT--GCCATCTT---AA-T--AAAATA------ACAAATA-----------AATTGTTTTAAC-TATTTTTGCTA-TGGC-TATATATC-G-C-GAA-C--AGA----AA-----AATTTCTTTTTTT-----------ACATATGTAGT---TCG--AA-GTT-ACCC--ACA-AAC--A-TGAAA---TATGTG-CT----AGGG-TAACTTTCGACT-GATTT-TAAAA---AA----AATGTTTT-T--GTTGTGA-AA-CGGAATA-CAA-G-TACAT-AG---ATTTA-AAGATAAACATTG--T--CC-AT-TTTCTTGC--C-ATTGT-A-TGTGTAATT-
gi|14 : aatattatttcataatgtgcatgtaataacaacAGTT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----ACGGGCAATGA-T--CAC-TTAG-ACT-TAAATTTTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA---TGG-TTCG-CTC--TCAG--TACG--TTTG-A-TAATGG--T-T---GTTCGCTACGGC--A--ATTTT-CCGGGG-CGT-C-TCTC-CGCACCGATTCGAAGATATTC-TGAGTA------GGT----ATCT-AC--TAG---ATTACAAT--------------A--------------ATCA--A-GATG-------------------CAA------TTA---TA---TCT---TT-AC---ATGG-GAAGA-AATTGTG-TGTT--AAGTTTT-CGTAA---AAAATTGTTCCACCCTGAT--ATCACTTA---AGCGTGGAAAAA-TAATA-AAAATAC-T-AG
gi|15 : TCCGT-C-ATTCGACGACTTGGACT-GTC---AAACGGTCCGTCCAAGAAC----GG-CACCTCAG--CCGATGTGTATTTC-----A
gi|16 : aagcaactgttttccgcgactggagtaatgtttttctctgctaagtaatatgaggtgattgagcgcgcacagaaggtatgtgagagatgcggtgcgaattgagaggctgagatgaaataagaaggtaaaaacaccttaataggtgatattaaatattaaaccatcacattttatgaaattcgatttaagactgataaggtaac-AT--TACG-TTT-G-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--ATGATTTTCCTGAGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAA---AATCAAAC--------------AACTGTATTAACTAATTCG--AAGA-G-------------------AAAAGG---TTG---CA-------AA---ACATAATGG-G--GA-AC---TT-TTTTT-A---TTTTCT--G---AAAATTGT------GTGAT--A-CA---A---ACAGTT---AAC-T---T-AAAATAT-T-AGAG---TAAAAAA-AAACA-TCTT-CGG
gi|17 : CCGTCCAAG-ACGTAACG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTCTTTCAGTTGCTTTATAAAA-C-ACGTTGGTACAT----T-TATAGTAAGTA-TTTCTGACAATACAACC--------------------TAGATCAAGGATTGGTGAC-AGATTTCAAAAGAGCCC-CCCCCCCGCCCCTTTCCCTTCCAC---AGGA-TA------------ACTAAACAA-----AATA---TTCGCCAGGAT--A-TAAAAAC-GAC-TCCACGA----------------T------A--GC---ACtc
gi|18 : C--CTGAG------GGGGGC-GG-G----A--GT-A----G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TTC--G----------AT-T--TTAAAA-G
gi|2 : tgcaactttcacagtcggacatacgtcatcacaatgcaaacgttcacaccgaaactgcgtaattttttccgcactgaaaaaatgcttttttattgcacaagctgcgctaaactattcttgaacacaacggggtgggatggggcgaTCCG-AC-AT-CGACGACTTT-ACGGA--CCAAAACG---------------------CA----GG--CCGAT-TT-ATTTC-----ATTGCTT---AAAA-CA-CG-T--TGCAT----TATAT-------A-GT-C--GC----CCACCTATCAGTGGCAGATTTCACCT--ATCA-------GTGGCA-GATTTC-AAAG----C-CCC-----CCCCTTT---T--CGC-CAAAAA-TT-----------TACTAAAC-A-----A-TA---T---------T--AATAAA-----AC-TCCA-GA--------T------TT------T--TA---CCC------AA----A----------AGCCTTTTA---AAAAGGCTACAACATATAATACCCCCC--TACTGG-ATCTGTCACTA-------CTTTCTATCA-AACA-TA---T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTC-AA-------AAC-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGG-TTTA-TTTA-T---T---T--AAT---TGTAAC-TAA-CATAGA-GA--ACA---TTT--GAT--------TCT-TT-TC----TA-TAGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGA--TG-TT--A--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AAGA-G------AA--AC-C-----AGCTA--A-AA-ACAC-ATAC-T----GTCTTCTC---------TCA--AG-TTTTG--GTTT--T-TCT-T--GT---CTT-------AATA-ATTC-AT-----A-TA-AT-TAAA--CG-TA-TGT---CAAT-A-CGGA-A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TGCATGT-ATT--AA-CAGTTT-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TCATG-G---CCAAAGA------GTA-----C-TTCGTT-T--------ACAAGAAAATGA----AA-------T--A-TTTCC-T--CCTGACTCAAGATTTTATAATGGAACT-ACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TCTTT---T--GCGAATA----------A-TTA-A-TT---GTTG-TC-AA--G--TTT--T---GAAGCA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAAAAC-T------GA--TC-TTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---T-GAA--G------AC-AT-----TT-------ACT---A--CC--AG-GAC-C-C--AA-----------------TTCATT----------------------------------------AGTTTGAAT---ATGG---------GGGA-GG-G----G--GG-A----G-------------CAC-TT-A--------A-T--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--GATTTAACGTAAT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C--CT--AGG-------TGT--GC-AT-TC---AA-A--AAATC----------AAAA----------TAAATATTTTATC-TATTTT-GC-A-CTGT-CATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA-------------CATTTTTATTTT----ACATATCC-GT---T-G--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TAAAA----TCGTG-TT----AGGG-TA---------T-AACTT-T---T-----------TGTTTT----GTTGTTA-AA-CGA-ACA-CAA-T-TACAT-CA---TTTTA-A--TTTAATATTT--C--TT-AT-TTTT-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAA-------TTTG-TTA-ACA-ATAA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTTTAAAA-T--CAT--A-AGTA-T-TGG-TTCG-CT---T-A----ACG--TTTG-A-AAATTG--T-A---G-TC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTT-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAG---GATCAAACAACTGTATTAAATAA--------------CTCGA-A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATGG-G--GA-AA---TGTTTTT--AT--TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-TA---A---ACAGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-
gi|22 : tgagtaatattttccccgttaaaagaagagcttttcatttgcaaaatgtgctaactatttgaacaattcgataataaaccgttttcaagagtaaggtaccA---C-TTC-----AT-T--TTTGAATC--CATAC------GAGGGG-AG-G----G--GG-G----G-------TG
gi|3 : acctgttttttctactaaatcagaagagctaccgtttttaatttgcaaataataagctaTCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----T-AAATCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-AATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TGTC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-AATT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAAC---AGG-------TGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTAT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATGG-G--AA-AT---TG-TTTT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGGggggggtaattgaagatgagagtcacttaaaatgaattgtagaaattaaactatccattaatc
gi|4 : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAA-AC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----AT--GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----T-AAATCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TCGTCT-CT-TG----TAGCAGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-AATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TGTC--CAATAAACTG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AAGCAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GTA-T---CCTTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-AATT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GGA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT-TAAT-ACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAAC---AGG-------TGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTGC-TATATA---GCC-GAA-C--AGATTTTAT-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GTTTGTCG--GA-ATT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TGTGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTCC-T-C--A-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGC--------------A--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-ATA-AATGG-G--AA-AT---TG-TTTT--A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGG
gi|5 : GGA------GGGGGG-GG-G----G--GG-G----GGTGAAGATATG--CAC-CTTA--------AATGAAT-TAATTT-AA------ACATCAATTTATGTAA-A-TTC--G----------AT-T--T--CAA-G
gi|5 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggTCTGTTC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCC--AAACG-TTCGTCCAAG-AA----CG-CA----GGGGCCGAT-TAT-TTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CA-CA-TGGTACAT----T-TAT------TAAGTTC--GC----CCACC--------------------T--ATCA-------G-GGCA-GATTT--AAAGCCCCC-CCC-----CCCCCCT---TTTCAC-CAAAAA-TATACTGAAACAATACTAA-T-A-----AAAA---C---------T--C-TAGATTT-GGCACCCA-AA--------TGGCCTTTTAAAAA-G--GTTTTACCTACATAAAT---ATATGCCCCCC--CCTT--A---AAA-----------------------T--TTCTGG-ATCTGTC-CAGATTTT--CCTTCTAGCA-AACA-T----TAAAATCCCA----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTTAAT-------A-CTATGAAAAA--TAAATTA---TA--C-GTA----CAGG--TTTATTTTATT---T---TT-AAT----TTAACTTTAGCATTGA--C--ACA--TTTT--GATT----TCTTCT-C--TG----TA-TAGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGATTTT-CT--CG-TC--GTCTCT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TGA--AGGA-G------AC-GAC-C-----AGCT---ATAA-ACACGATACGT---CG-TTTCT--GCGT-CT-TCA--AG-TTTTG--ATTTTGT-TCT-T--TT---CTT-----A-A--A-ATTCAATA--TAA-TATAT-TAAA--TG-TA-TGT---CAAT-A-CGGACA--GTGTGGGTG---------ACAAAC-----TGT-ATT--AA-CAG--TAA----A--TCT--AGAATC---TAA--CAAG------CA-GCCCGCATTTAATG-G---CCAAAGA------GTA-T---A-TTCGGTTT--------ACAA-AAAATGA----AA-------T--ATTTTCC-T-CCCTGA-C-----------------ATT-ACAT------------------ATG-TAC-CA-ATTC-TC-TC-TTG--T--GTGAATA----------A-TTA-T-TTTGATTTA-TTAAAATG--TTT--T---agatagcagatacttctgttcatcgacgacttggacgagtccaaacgttcgtccaagaacgcaggggccgattattttcattgctttaaaacacatggtacatttattaagttcgcccacctatcagggcagatttaaagccccccccccccccttttcaccaaaaatatactgaaacaatactaataaaaactctagatttggcacccaaatggccttttaaaaaggttttacctacataaatatatgccccccccttaaaatttctggatctgtccagattttccttctagcaaacattaaaatcccaggcatgattttgtaatttaatactatgaaaaataaattatacgtacaggtttattttatttttaatttaactttagcattgacacattttgatttcttctctgtatagtcttctatggcttgcagtgcgattttctcgtcgtctctaaagcaacatgtctgaaggagacgaccagctataaacacgatacgtcgtttctgcgtcttcaagttttgattttgttcttttcttaaaattcaatataatatattaaatgtatgtcaatacggacagtgtgggtgacaaactgtattaacagtaaatctagaatctaacaagcagcccgcatttaatggccaaagagtatattcggtttacaaaaaatgaaatattttcctccctgacattacatatgtaccaattctctcttgtgtgaataattattttgatttattaaaatgtttt
gi|6 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggggagggggggggggggggtgaagatatgcaccttaaatgaattaatttaaacatcaatttatgtaaattcgatttcaagagatagcagatact--GT---CTT-----A-AA-A-ATC--ATA--T---TA-GT--AAA--TGGTACTGAT--CAATA--CGG--AA-GT-TGGGTG---------AC-AGA-AG--TTT--TTGTAA-CAG--T-A----AAACCT--A-AATC---CAATCCAAGG-----CA-G--------TCATG-GC--C--AATAA-----GT------------TT-------------------T-A----AA-------T--A-ATTCC-TTCCCTGG----------------------GAC---------------------TG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---TTTGTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAA---GCTTTT--T---GAAACA-TG-TT--G--GAAATA-AAGT-AG--A-TAA-TGTGCAACGTAAAAT-T------GAATGCATTTGTC-ATC--CC---AA-TAT-CC---AAGAAAAG------AC-AT-----TA-------ACT---A--TC--AA-GAC-C-C--AAT-------------TGTCTCATAC--AAT-ACTTT--C-GCAC-TA---TCTTT-----ATCTAGTTTGAATC---TGGA------GAGGGG-GG-G----GCCGG-GAATCG-------GCT---CACCGT-ATAAATCATAGT--ATCTGATTT-TA------ACATCAG---AT---A-A-TTC--A----------ATAT--T--AACTGTCA-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTTGGGC-C--CTAAAAG-------TGT--GT-AT-TCTTTAA-A--AAAACG------CCAAACA----------TAAATGTTTTATCGTATTTCTGC-A-CTGC-TATATAC--G-C-GAACC--AGA----A------------------------------ACAT------T---TCGGTGA-ATT-ACCC--AC--AAC-AA-TAAAA---ATCGTG-CT----A-GGAAAAC-TTCGAC--GATTT-T---T---AAAAACAATGTTCTGTTGGTCTTGACAA-CGG-ACA-CGATT-TACAT-AAGTCTTTTC-A--TAAAATATTT--TCGTCTAT-TTTCATGC--ACATTGT-ACTG-GTATTT-ACT-TTTG-TT--ACACCATAACCGTAC-GGCAATGA-AT-TAT-TAAG-A-T-T--T--TTTT--AAATTA-CCCACA-ACTA-T------------------T--TACGTTTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-----CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GC-------GGT----AATA-ACA-CAA---AATCAA
gi|7 : TCC-TACTAT-CGACGACTTGGACG-GTCC-AAAACG-TCCGTCCAAA-AC-----G-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAAACAACG-TGGTACATATTAT-TAT------TA-GTTC--GC----CCACC--------------------T--ATC--------GTGCCA-GATT-C-AA----CCCTCCC-----CCCCCCT---TGTCAC-CAAAAAGTA-----------TACTAAAC-AATACTAATAAAAC---------T--C-CAGATTTTGAC-ACCC-GAAAGGGCCTT------TTAAAAAAG--GCTTTACC------TACATTATATGCC----ACCCCTTTA---AAA-----------------------TATTTCTGGATCCTGTCACTGAATTT--CCTTCTAGCA-AACACT----T-AAATCCTC----GGCA-----T-----------------------------------------------AAATTAC--TA-CCTGTA----CAAGGTTTTATTTTA-TATTT---TT-AAT---GATA-CTTTA-CATTGACAA--ACA--GTT---GATT----TC-TTTTCTCTG----TA-TAAGCTT-CTATG-TTT-GCTCA--GTGCGATTTT-TT--CCGTC--GTCTAT--AAAAG--C-----A----CATG-TC---TG---AAGAAG------AG-CAC-CA-----GCT---ACAA-ACACGATAC-T---CGTTT-CT--GCTT-CT--CA--GCGTTTTG--ATTT--T--CT-T--GT---CTT-----A-AAAA-ATTCAATA--TAATTA-AT-ATAA--TG-TA-c
gi|8 : aatgcaactgttcacgtcgactgagtaatgtttttgtccgcgttaaaagaagacgctgtttttattgcaaaaattgctaactatttatgaaacaacgcgagggagggggggggggtaaatgaagatagcacttaaaatgaaattaattaaaccatcaatttattaaaattgatttcaagagagataaaggtaccATA-A-TT-AT--A-TAG-CG---A-AGTAATAC-T------G----------TANNNN--NN---NN-NNN-NN---NNNNN--N------NN-NN-----NN-------ACC---A--CA--AG-GAC-C-C--AAT-------------TGTT-CAT----AAT-ACTTT--TTGCATATT---T-TTTT----AT-TAGTTTGAATC---TGGA------GAGGAG-GGTG----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A---------GT--AT-TGATTT-CA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C--CT--AGG-------TGT--GC-AT-TT---AA-TAAAAAAAA------ACCAAAA----------TAAATGTTTTAAC-TATTTT-GC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA------------CTTTTTTTTTTAC----ATAT---T-GT---TCG--AA-GTT-ACCC--ATA-AAC-AA-TACAA---TT-GTG-CTG---G-GG-TAAA-TTTGACT-GATTT-T---TAAAAA----AATGTTTT-T--GTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTT--A--ATGAATATTT--C--TC-GT-TTTC-TGA--A-ATTGT-A-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AT-GACAATGA-A--TAC-TTAT-A-T-TAAAC-TTTT--AAA-TACCAT--A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG--TTTG-A-AAGTTG--T-T---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTATC-GG-------TCGAAGATTT-C-T--GT-------GGT----AACA-TT--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTTGA-A-GA-G-------------------GGAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTTTAA---CTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ATGGTG---AAA-T---A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGGcaatgtaaagtagtaagtaagtaagtaattgtatttatta
gi|9 : gttcctagaaaaaatacatcgatattttTT-CTATTGCTT-GCAAGTAG-GCGATTTTATT--C--TC--GTCTAT--AAACG--CTAGAGACTCACATGGTTGCATG---AGGA-GCTTATGAC-TAC-CATGACACCC---ACAATACACGATAC-TGTGCGTTT-CTG-GCTT-TG-ACAGAAGATATTGGTATTT--TGTCTAT--AT---CTTGATAGA-AACACATTCAA---------A-A---AGA--TG-GA-T--C--CA-------G--A--GT-TATTTA---------AC-A-------------TA-AA--AG-------------CT--A-AATCTAACAA--CAAG------AA-G--------GTATATGC--TGAAAGAG-----TTAATAAAC-TTCGTCGCGCTGGACGACAAGACACT-ACTGAAA-------TTAA-TGTCCGT-CCCTGACC-----------------ACTA-CAT------------------ATGGTAGCTG-A-GCGTCGTC-TT---T--G--AATACTAGAGAGAGA-TGT-A-TA---TTCGCTCAAC--G--TCT--T---GAAACAATGGTT--AGAAAAATACA-TTTAGTCA-TAAATATGCA-TGTAATAC-TCGGCGAGA--GCTTT-GTC-ATC--AC---AAGTAT-CCACTCAGTA--GGATCATAC-ATGCATTTT-------ACC---AA-CAGAAG-GCA-CTC--AATGGGCGAGGCATGATGTTTCATTAATAAT-ACTTTATT-GACTATA---T-TCTTTCTGAT-TAGTTTGAATAAGCTGG-------GAGGAGCGG-G----G--GGCG----G-------TGTTGTCAC-GT----------AGT--A--TGATTTGTATTTATTA-ATCAG---AT---A-AGTTC--G----------Atcg
blockSeqs : A T . G C G G GTAACG . GG . TTTCA . A A . ATTA A . A C . C TATCAGTGGCAGATTTCACCT . A . TAA T CCCCG CCC T G G TACTGAAACAA AATACT TTCGCCAGGATATAAAAAC A C TGGCCTTTTAAAAAGGTTTTACCTACATAAATATAT C A . AGGCTACAACATATAATACCCCCC A AT TT T T C AT CTGT G CTTCTTTA C . . AATACT A . AC . C . GT T T ATTTTT TG G GACT C CT TCTTCTCTCTCTCGCTACTA C T . AGTA T A . CG TC TC A . TAGAGACTCA GG GCA A GCTTATGACTACCATGACACCCAC T A GTGC G T C . T GA A GT TG G A . . GATAGAAAC C AATAAATAA T AT . G C TC AAACTGA G . A TGCATGTA GT G TTTAA CT G TAA TC CAGCCCGCATT C T CAC C GTTAATAAAC GCGCTGGACG AG GAACTACCTGT T G T CTGCAAGATTTTATAAGGAACTACTTG G GC G T G G T TTT CTAGAGAGAG C AA TGA C AAT CT . TCG AT G CGG C G T TC . A A T CGGCGA AT T CC GG . T G ACTC GGATCAT . TTAGCTCTA TAT A GA . C T . GGGCGAGGCATGA T TAAT . ATT A TTT C TTCTG C AAGC A C C . CC C GGTGAAGATATG CGTATAAATCAT GA C G TTTATT C ATTT GTA T G . ATTTAACGTA A . TA T C C AT . C G G G CTAA . TA A C TTT TAA . . TT G T T A . TCG . C TC TTTTATTTTTTT AT ATGTAGT GT C . . . A . CTC . TCAGAC A CA . A AAAA AAAC GTTG C C A C T A A GTC AAAG TCG T A T G AC T A C T A C TG T . AC ACCGT G . CT AT A C A C TT TA T ACCGTAG TA T C TA C . TT . C ATTCTAA GCTACG CC TG TT C T CACCGAT TGA AAGGAAC ATA G CTA CTT ATTTGAGAAGATACAAAGTTTTGAAGAT C ATT CAT A A T C AA T TTG T ACTT T TA A TCCACC TA T CTTA GAA . AATA G G CAC AAAAA . . G
blockSeqs : A . . A C G A CGT . . . . . . A . . . . . C . A T . A . TAA . . . T G . . AA AAACTCCAGATTTT . . AAGGGCCTTTTAAAAAAGGCTTTACCTACATTATAT C A . TAT . AT TC T T . TA . C TGCA . . . AAAAC . . . . T . GT T . TTC GG . CAA T . TTCGTCTCTTGTAG G . . AG A . . G . . C . AA G C . AGAGCACCAGCTAC . G T T T C . T . T . . . . . . AAAT . AATAAATAA . AT . . . TC AAACTGA . . . TGTGTA A G TAAAA . . . . GCAG C . C C GGTATCC GT AG ACTGAAATTA . . . CTCAAGATTTTATAATGGAACTACAT . C . . . . . TTT . . AA . C A . . . T . CGG . G . . . . . . . . T CC . . G . C GTGA . GCATTTT . . . . . . . . T TCT . TT A . . T . CC G . T . . . AATCGGCT GGTG . . . . C G . T . . . . . TA . . . . . . . . A AAC . . C . . T . . AT . T . . . GC . . . TTTTATTTTTTT TT ATCCGT . . . . . A . TAT . AG . CT . . TAAA . TTG . . . . . . . . ACC C . . A G A T . . . A . CT . . A . . . T T . . . C C . . ACCCACA T . . . . . T . . TTC . . . A . . . TT A . . CA . AACTGTATTAACTAATTCGAAGAG A . . A A T . . . . . AAGT . . A . . . A . . AA . G . . . . G
blockSeqs : A . . A C . A CGT . . . . . . A . . . . . C . A T . . . GCC . . . T . . . A CTCTAGATTT . . TTTGGCACCAAAT C A . T . AT TC C . . A . C TGCA . . . TCTC . . . . . . GT T . TTC GG . GA T . TTCGTCTCTTGTAG G . . AG A . . . . . . . AA G . . GAGCACCAAGCTA . . C T T C . T . T . . . . . . AAAT . AATATAAT . T . . . AT ACGGACA . . . TGTGTA A . TAAA . . . . CAG A . C C GGTATCC GT AG GAAAT . . . CCACTAACAT . . . . . . . GT . . A . . A . . . T . AGA . A . . . . . . . . A AN . . . . T AAG . TT . . . . . . . . T TTT . C A . . . . CC C . . . . . GTGTTGT GGTG . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . AAC . . A . . A . . TG . A . . . GC . . . AATTTTTT TT TGTTTG . . . . . A . TGT . AG . C . . T . TTG . . . . . . . . TG T . . . G C T . . . A . T . . A . . . . T . . . A . . . ACCATA T . . . . . T . . TGC . . . C . . . TT . . . C . AACTGTATTAAATAACTCGAAGAG A . . A . T . . . . . TCT . . A . . . A . . AA . . . . . . .
blockSeqs : T . . A . . G CG . . . . . . . . . . . . . . C . . . . G . . . T . . . A TTAATAAA . . TTTGGCACCAAAT . A . T . AA . C . . T . C TGA . . . ATAC . . . . . . GT T . TTT GA . GA T . TTCTTTTCTCTGTA G . . CA T . . . . . . . AA G . . GAGCACCAAGCTA . . C T T G . T . G . . . . . . AAAA . AATATAA . T . . . T ACGGAA . . . AGTTT A . TAC . . . . CAG A . C C GTATA TT AG GAAAT . . . CCACTAACAT . . . . . . . T . . A . . A . . . T . G . . . . . . . . . . T C . . . . C G . TT . . . . . . . . T TTT . T A . . . . CC A . . . . . TAGTGT CTTA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . A . . T . . TG . A . . . CG . . . AAAATTTC TT TGTTTG . . . . . . . TGT . GG . C . . T . TT . . . . . . . . AA T . . . G A T . . . A . T . . A . . . . T . . . A . . . ACATAA T . . . . . T . . TGC . . . C . . . A . . . C . ATTCGCAAGAG A . . A . T . . . . . TAA . . A . . . A . . C . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . G . . . A CTATAAA . . TTTTTACCCAAA . . T . T . C . . T . . TGA . . . ATAC . . . . . . G . . TT T . GA G . TTCTTCTCTGTA G . . A T . . . . . . . AA G . . GACGACCAGCTAT . . C T T . . T . A . . . . . . TTA . ATAT . T . . . T ACGGAA . . . TGTA A . TAA . . . . CAG A . C C GTAC T AG AAAT . . . CCACTACAT . . . . . . . T . . T . . C . . . . . G . . . . . . . . . . . C . . . . C G . TT . . . . . . . . T AC . T . . . . . CC A . . . . . GTGT TTA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . T . . AT . T . . . G . . . AA AC TGT . . . . . . . ATC . A . C . . T . T . . . . . . . . AA C . . . G A T . . . A . T . . . . . . . T . . . A . . . ACATAA T . . . . . T . . TT . . . C . . . T . . . T . AATCAAGATG A . . A . T . . . . . TA . . A . . . A . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A CTATAAA . . . . C . . T . . T . . . . . . . . . . . . . T . . C . . TCTTTTCTA A . . . T . . . . . . . A . . . GAAACCAGCTAA . . C T . . . A . . . . . . . . AAT . TCA . A . . . C ACGGAA . . . TGTA . . TAA . . . . AAG C . . G GTAC T A AAAT . . . CATTACAT . . . . . . . T . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . C . . . . A G . TA . . . . . . . . . T . C . . . . . C A . . . . . GTGT GTA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . A . . AT . . . . . G . . . AA . GT . . . . . . . TC . A . A . . C . T . . . . . . . . AA C . . . . A T . . . A . T . . . . . . . T . . . A . . . ACCATA T . . . . . . . . TC . . . C . . . T . . . T . ATTTGAAGAG A . . A . . . . . . . AT . . A . . . A . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A . . . AGC . . . . . . . . . . . . . . . . AAA . ATA . . . . . . GA . . . . . . . . . . . CG T . . . AGT . . AAAT . . . GAC . . . . . . . T . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . N N . NN . . . . . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . GTGT TA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . CT . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . T . . . . . . . TT . A . . . . C . T . . . . . . . . CA C . . . . A . . . . A . T . . . . . . . T . . . A . . . CATA T . . . . . . . . TA . . . C . . . . . . . T . ATTTGAGAG A . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . A . . . . . .
blockSeqs : . . AA . AA . . . . . . . . . C A . . . . . GTGT TA . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . A C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . C . . . . . . . . . ATTTGAGAG . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . A . .
blockSeqs : C . . . . . . G GT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : A* CGT**** **** ** ****** C** **** T********************** ******* A****** CTATAAATTT**************** TTTAAAAAGGCTTTACCNAAT***************************** *** T***** TGA******** ** *** ATAC********** ** **** TTT******* GG*** GA*** T** TTCTTCTCTCTGTAG********* ** ** ** *** GANCACCAAGCTAC**************** C* T* ** *** AAA******* AATATAA*** ** T*** ACGGAA***** ********* TGTTA***** TAA********* CAG*************** GTAC************ AG GAAAT************* CCACTACAT************************************ ** T***** A** A** ** T* C* *** C*** G******** ** ** TT** A****** **** GTGT************** GTA********** G*** ** ** *** ******* T*** ****** ********** G**** AATTTT*********** TT**** TGT******* ** TNT*** C* TT** C**** A*** A* T* ACCATA*** T** ** **** A*** TA**** A*** A****** A****
originalCons : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAG-AC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAAC-A-----AATA---C---------T--A-TAAA----GAC-TCCA-GA--------T------TT------G--GC---ACC------AA----ATATGCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----T-AAATCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTT-AT-------A-C-ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-T---T---TC-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATT----TC-TCT-CT-TG----TA-CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGA-G------AG-CAC-CA----AGCT---A-AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTT-----A-AATA-ATTCAATA--TAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TGTC--CAATAA-CGG--A--GT-TGGGTG---------AC-AAC-TG--TGT-ATTA-AA-CAG--T-A----A--CCT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GTA-T---C-TTCGTTGT--------ACAAGAAAAT-A----AA-------T--A-TTTCC-T-CCCTGACC-----------------ACTAACAT------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TT---T--GTGAATA----------A-TTA-A-TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTC-TAAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT--AGG-------TGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATA---G-C-GAA-C--AGA----AA-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----ACAT---T-GT---TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAA---TTCGTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--TC-AT-TTTC-TGC--A-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TAC-TTAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TA-CATA-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTT--A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-CA---A---ACGGTG---AAA-TA--A-AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
finalCons : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAA-ACCGT----CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACCT----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAAAA-TA-----------TACTAAACA------AATACTATAAATTT----------------GAC-TCCA-GATTTAAAAAGGCTTTACCNAAT-----------------------------GCCCCCCACCCTTTTA---AAA-----------------------T--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-TT-----AAATCCTC----GGCATGA--------TTTT-G--TAA---TTTATAC----------ATG-AAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA-TTTT-------AATGG---TAACTTTA-CATTGAGA---ACAT--TTT--GATTTCTTCTCTCTGTAG---------CAGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGAGANCACCAAGCTAC----------------AA-ACACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CTT-CA--AGNTTTTG--ATTT--T-TCT-T--GT---CTTAAA-------A-ATTCAATATAA---TA-AT-TAAA--TG-TA-TGT---CAATACGGAA-----GT-TGGGTG---------AC-AACTGTTA-----TTA-AA-CAGTAA---------CCT--A-AATC---CAA--CAAGCAG---------------TNATG-GC--CCAAAGAGTAC------------TTCGTTGT--------ACAAGAAAATGAAAT-------------A-TTTCC-T-CCCTGACCACTACAT------------------------------------ATG-TA--CA-A-TC-TC-TC-TTT-----GTGAATA----------A-TTAA--TT---TTTG-TCAAA--G--TTT--T---GAAACAT-G-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--A-TAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTC-ATC--CC---AA-TAT-CCC---AGAAG--------AC-AT-----TT-------ACC---A--CA--AG-GAA-C-C--AAT-------------TGTTTCATTT--AAT-ACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-GGTGT--------------CACGTA----------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TTC--G----------AT-T--T--AAA-GT-A-A--TTTTC---AC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT--AGG-------TGT--GCGAT-TC---AAT---AAAACA------ACAAAAA----------TAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTGC-TATATAG----C-GAA-C--AGAAATTTT-----------TTTTTTTTTTTTTT----ACATTGT-------TCG--GA-GTT-ACCC--ACA-AACAAA-TAAAATNT---GTG-CT----A-GG-TAAC-TTCGACT-GATTT-T---T---AA----AATGTTTTTT--GTTGTTA-AA-CGG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTTC----TC-AT-TTTC-TGCA---ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TACT-TAG-A-T-TAAA--TTTT--AAA-TACCATA---AGTAT--TGG-TTCG-CTC--T-AT--TACG-TTTTG-A-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAAC--------------A--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-ACATAATGG-G--GA-AA---TG-TTTTTA----TTT-CG--GA---AAATTGT------CTGAT--A-CAA------ACGGTG---AAA-TA----AAAATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|20 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): TGCTAACTGGTTCAGTCGACTGAGTAATGTTTCTCACGCGTTAAAAAGAAGAGGCTGTTTTTATTGCAAAATGTGCTACTTTTTGAACACGAGGGGAGGTGGGGGATAAGAAGATATGCACTTTAAAAGAAATAATCAAACCACAATTTTTAAATTCGATTTAGAGACG
Unaligned ( gi|23 ): TGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAGGGGGGGATGAAGATTTATTAAATTCGATTTCAAGAGAT
Unaligned ( gi|24 ): ATGCAACTGTTTACGTCGACAATACGACCTCACAGCGCACTGTTTATGTCGATTGCGTAATTTTTTCCG
Unaligned ( gi|25 ): AATGCACTGTGCTTTCATGGTCCGATTAGGGAGTTAC
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 1 1 22222222 1111 11111 1111 111111 111 1111 77777777777777777777777 2222222 1 111 11111 111 1 222222222 2222222 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 111111 111111 1 111 11 1 1111 1111 2222222222222 111 3333333333333 11 1 1111 111 2222222 11111 1 11 4444444444444 1111 11 11 111111111 111 111 222222222222222222 1 11111111 11 1 222222 11 22222 11 11 222222222 222222 11111 2222 222222222222222222 11 33333333333333333333333333333333333 111111 777777777777777777 1 11 11 2222222222 111 1 111 11 11111 1111 111111 1 1 444444444444444444444444444444 111 111 3333333333333333333333333 1111 1 11111 1111 1111111 111111111111111111 2222222222222 111111 1111 11 1111111111 1 33333333333 1 1111 111111 2222222222 1 2222 44444444444 33333333333333 2222222222 1111 222222 1 11 1111111 11111 22 11111 11 11 111 111 111 11111111 111111 1111111 2222 1111111 1111 111 777777777777777777777777777777777777777777777 11 11111 111111 11111 11111 11111 1
lowQualScore : 3 6 6 9 0 5 0 0 66666666 2222 77 5 44444 99 6 7 6 4444 6 999999 6 555 4444 1 00000000000000000000000 1111111 5 6 222 5 44444 000 1 1 222222222 5 5 4444444 77 2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 999999 999999 1 3 111 99 6 66 11 1 1 5 7777 5 2222 5555555555555 5 77 000 0000000000000 33 77 5 1 2222 0 000 3333333 66666 1 1 5 33 888 77 5 4 3333333333333 22 5 5 6666 55 66 66 66 11 5 66 888888888 77 333 888 444444444444444444 5 0 5 5 44444444 66 8888 66 0 66 66 777 66 8 222222 777 4 00 66 8 4 00000 66 1 33 5 000000000 1 5 5 222222 44444 2222 88888 66 5 888 66 222222222222222222 1 5 66 22 1 55555555555555555555555555555555555 2 8888 5 444444 66 5 5 5 66 222222222222222222 0 5 5 88 5 5 5 888 5 5 88 1111111111 5 222 888 0 666 66 66 888 5 00 5 55555 5 6666 66 5 5 0 5 444444 66 3 3 5 66 888 0 5 888 222222222222222222222222222222 555 5 66 5 555 5 1111111111111111111111111 5 4444 2 777 4 55555 4 0 3333 3333333 3 6 7777 55 3 777777777777777777 5555555555555 55 4 4 111111 8 5555 777 8 3 55 99 11 7777777777 4 5 5 66 888 5 5 5 0 00000000000 66 7 5 888 5555 444444 1111111111 44 5 0 5 5 5 0 5555 888 5 66 77777777777 66666666666666 6666666666 66 666 66 5 9 5 66 3333 5 333333 0 22 4 4 5555555 9999 3 4 8 66 4 4 4 4 4 4 777 77777 1 77777 4 4 4 22222 4 1 4 4 4 3 55555 4 4 22 11111 4 4 00 7 4 4 00 4 444 000 555 4 4 66 4 55 333 3 4 11111111 111111 55 55 44 4 8 3333333 1111 7777777 5555 4 555 777 111111111111111111111111111111111111111111111 1 777 777 9999 4 6666 4 66 4 4 11 66 33333 8 66 9999 222222 66 11111 777 11111 8 777 4 8 888 22222 5 5 1
lowQualScore : . . . . . . . . ........ .... .. . ..... .. . . . .... . ...... . ... .... . ....................... ....... . . ... . ..... ... . . ......... . . ....... .. ..................................................................................................................................... ...... ...... . . ... .. . .. .. . . . .... . .... ............. . .. ... ............. .. .. . . .... . ... ....... ..... . . . .. ... .. . . ............. .. . . .... .. .. .. .. .. . .. ......... .. ... ... .................. . . . . ........ .. .... .. . .. .. ... .. . ...... ... . .. .. . . ..... .. . .. . ......... . . . ...... ..... .... ..... .. . ... .. .................. . . .. .. . ................................... . .... . ...... .. . . . .. .................. . . . .. . . . ... . . .. .......... . ... ... . ... .. .. ... . .. . ..... . .... .. . . . . ...... .. . . . .. ... . . ... .............................. ... . .. . ... . ......................... . .... . ... . ..... . . .... ....... . . .... .. . .................. ............. .. . . ...... . .... ... . . .. .. .. .......... . . . .. ... . . . . ........... .. . . ... .... ...... .......... .. . . . . . . .... ... . .. ........... .............. .......... .. ... .. . . . .. .... . ...... . .. . . ....... .... . . . .. . . . . . . ... ..... . ..... . . . ..... . . . . . . ..... . . .. ..... . . .. . . . .. . ... ... ... . . .. . .. ... . . ........ ...... .. .. .. . . ....... .... ....... .... . ... ... ............................................. . ... ... .... . .... . .. . . .. .. ..... . .. .... ...... .. ..... ... ..... . ... . . ... ..... . . .
lowQualScore : 5 7 7 8 8 0 7 9 00000000 1111 99 7 33333 22 7 3 7 2222 7 222222 7 888 2222 0 77777777777777777777777 7777777 5 7 666 7 33333 000 4 4 999999999 7 7 3333333 99 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333 222222 222222 3 2 777 22 7 99 44 7 4 7 9999 7 1111 4444444444444 7 99 000 0000000000000 66 99 7 4 1111 7 000 7777777 00000 4 4 7 66 000 99 0 9 6666666666666 11 0 0 4444 99 99 99 99 99 0 99 444444444 55 888 888 666666666666666666 0 8 0 0 44444444 99 2222 99 8 99 99 888 44 9 000000 000 4 99 11 9 4 22222 77 4 22 0 000000000 4 0 0 888888 88888 5555 99999 99 0 888 99 888888888888888888 0 0 99 00 0 00000000000000000000000000000000000 5 9999 6 444444 99 0 0 0 99 222222222222222222 0 0 0 88 0 0 0 888 0 0 88 9999999999 0 222 888 0 111 99 99 888 7 77 7 99999 0 1111 99 0 0 8 0 444444 99 4 2 0 99 888 0 0 888 111111111111111111111111111111 666 0 99 0 000 0 1111111111111111111111111 0 9999 4 888 4 66666 4 1 7777 0000000 3 7 7777 00 6 555555555555555555 4444444444444 55 0 0 555555 0 6666 000 0 6 00 55 00 5555555555 0 0 0 99 888 0 0 0 0 11111111111 99 9 0 888 5555 444444 9999999999 11 0 8 0 0 0 4 1111 888 0 99 11111111111 22222222222222 1111111111 99 000 99 0 4 1 99 6666 0 555555 0 55 4 4 7777777 4444 6 4 9 11 4 4 4 4 4 4 888 99999 0 66666 4 4 4 66666 4 9 4 4 4 4 99999 4 4 77 11111 4 4 66 3 4 4 66 4 666 111 333 4 4 11 0 55 777 2 0 22222222 555555 55 55 77 0 0 0000000 8888 0000000 5555 0 999 000 666666666666666666666666666666666666666666666 8 888 888 7777 4 2222 4 11 4 4 88 11 22222 9 11 7777 888888 11 11111 888 11111 9 888 4 9 888 55555 0 0 4
consensus : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAGAC----CG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAA---------AA-TA-TACT-------AA--ACAAAT-------ACTAA---------TAAA---------T---------TTGAC-TCCA-GA--------T------TT-----------------A-AAAA-GGCTT--TAC--------CG---A---------ATG------CCC------CCCACCCTTTTA---AAAT--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----TAAA-TCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTTA-T-------A-C-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA---TTT----T-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATTTCTTCTCT-TGTAGC------AGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGAG------ANCAC-CA----AGCT-ACAA-A-CACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTGATTT--TTC--TTGT---CTT-AAA-AATTCAAT--ATAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TG-T---CAAT--ACGGA-AGT-TG---------GGTGAC-AAC-TGT---T--ATTA-AA-CAGT----AA--C--CT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGAG-----GT------A--C-TTCGTTGT--------ACAAGAAA--A-TGAA------AT--A-TTTCC-T-CCCTG--ACC-----------------ACT-ACAT-ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TCTT-TT-GTGAATA----------A-TT-A-ATT---TTTG-TCAAA--G--TT--TT---G-AAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--ATAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A-CA--AG-GAA--C-CAAT-------------TGTTTCA-TT--TAA-TACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TT--CGAT--TT--AA----------A-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT-------AGGTGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAA----------ATAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTG-CTATATA--G-C---GAA-C--AGA----A---ATTTTTTTTTTTTTTTT-T--------ACAT---T-GT---TCG--GA-G-TTACCC--ACA-AACAAAT--AAAATNC--GT-GCT----A-GG-TAAC-TTCGAC-TGATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TT-GTTGTTA--AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--T-C-AT-TTTC-TG--CA-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TACTTAGA-T-TAAA--TTTTAAA-TA-C-CAT-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-A--TTACG-T-TTTGA-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAACA--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-A-CATAATGG-G--GA-AA-TGT-TTT--T-A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-----CAA---ACGGTGA-----AAT-AAA---AATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
Reference ( family-1363 ) : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTCCAAAAC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTTC--GC----CNACC--------------------T--ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAAGAGCCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCAC-CAAA---------AA-TA-TACT-------AA--ACAAAT-------ACTA----------TAAA---------T---------TTGAC-TCCA-GA--------T------TT-----------------A-AAAA-GGCTT--TAC--------CN---A---------ATG------CCC------CCCACCCTTTTA---AAAT--TTCTGG-TTCTGTCACTGATTTTTCCCTTCTAGCA-AACA-T----TAAA-TCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTTA-T-------A-C-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA---TTT----T-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATTTCTTCTCTCTGTAGC------AGTCTT-CTATGGCTT-GCAAG--GTGCGATTTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AGGAG------ANCAC-CA----AGCT-ACAA-A-CACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGNTTTTGATTT--TTC--TTGT---CTT-AAA-AATTCAAT--ATAA-TA-AT-TAAA--TG-TA-TG-T---CAAT--ACGGA-AGT-TG---------GGTGAC-AAC-TGT---T--ATTA-AA-CAGT----AA--C--CT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TNATG-GC--CCAAAGA------GT------A--C-TTCGTTGT--------ACAAGAAA--A-TGAA------AT--A-TTTCC-T-CCCTG--ACC-----------------ACT-ACAT-ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TCTT-T--GTGAATA----------A-TT-A-ATT---TTTG-TCAAA--G--TT--TT---G-AAACA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--ATAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A-CA--AG-GAA--C-CAAT-------------TGTTTCA-TT--TAA-TACTTT--C-GCATATA---T-TTT-----AT-TAGTTTGAATC--CTGGA------GAGGGG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TT--CGAT--TT--AA----------A-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAGTT-GGC-C--CT-------AGGTGT--GCGAT-TC---AA-T--AAAACA------ACAAAA----------ATAANTGTTTTATC-TATTTTNGC-A-CTG-CTATATA--G-C---GAA-C--AGA----A---ATTTTTTTTTTTTTTTTTT--------ACAT---T-GT---TCG--GA-G-TTACCC--ACA-AACAAAT--AAAATNT--GT-GCT----A-GG-TAAC-TTCGAC-TGATTT-T---T---AA----AATGTTTT-TT-GTTGTTA--AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--T-C-AT-TTTC-TG--CA-ATTGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TACTTAGA-T-TAAA--TTTTAAA-TA-C-CAT-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-A--TTACG-T-TTTGA-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAAGATTTCC-T--GT-------GGT----AACA-AC--CAA---AATCAAACA--------------TTCG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-A-CATAATGG-G--GA-AA-TGT-TTT--T-A---TTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-----CAA---ACGGTGA-----AAT-AAA---AATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGG
gi|1 : AGCGC-CCC-----ACCCTTT---TTTCAC-CAAAAACTATATAAA-TAATACTTAATAAAAACTACAAATTTGCAACACCA----------AAAA---------TGAACACGACCTGGC-TCCA------------------TT-----------------AGAAAA-CGCTTCTTACACTTGCATTG---A---------GTGAGCCTCCCCTCCTGGCCCCCCCTTTTACAAAAAG--TTTTGA-TCTGGTCACTGAATTTTCC--TCTAGCA-AAAA-CAATATAAG-TCCTC----GGCA-----TG-AATTTTT-GACTAAATATTCA-TTCCCAAGA-T-ATGAAAAAATAAAATAC--TAACC-GTAAACACGAATTGTTATTTTA---TTCGTTCT-AATCGTGATAACTTTAACATTGA-CAT-ACACTTTTT--GATATC------------C------A-------TATGGCTTAGCAAG--ATTCGATTGT-CTGACG-TC--GTCTAT--AAA-GGGC-----A---A-ATG-TT---TGGACAGGAAT-----GTCACACA----GACTTACAA-AACACCCTAT-T---T-CTCTCTCTGCTTACTGTCA--AGTTTTTGATTT--TTCCTTCGTTCCCTT-ATA-A---CAAT---TCA-CA-AT-TAAACTTGATA-TG-TCGCCAATA-ACAGATAGT-TGCGTGTGTGCGTTGAC-AACATGT---TTGATTT-AA-CAGTACAAAA--C--C-----AATC---AAA--CAAGACTATCCATG--------TTATG-GC--C--AAGAGTTTATGT------A--C-TGCGTT----------------------TG--------AC--A-TTTGC-T-CCGTG--ACT-----------------AAT-ACAT-A-G-TAACCA-A-TC-TTTCT-TCTT-T--GT-AATA----------A-TT-CTGTT---CTTG-TC-AA--G--TTTATC---GAAAAAA-TG-TT--G--AATATT-A-TTAAA--ATAA-TGTGCG-TGT-ATAC-T------GA--GCTTTTGTACATT--CCGCGAA-TAT--C---CAGA----------ACTAT-----TT-------ACCAA-A-CA--AGTGAACCC-CGAT-------------TGT-----TC--TAATTACTTT--C-GCAT-TA---T-TTT-----TT-TAATCTCAGTT--TTGAAATTATGGAAGGA-TG-GTTCTG--GG-G----G-------TG----CAC-GT-A--------GGA--CT-TGATTT-TA------A-ATCAGTGTAT---A-A-TTCACGACTATT--AT----------A-GT-A-T--TTTTTCTTAC-ACAT---ACTTGTT-TGG-C--CTAGGATAGAGGTAT--GTGAT-TC---AACT--AAAACAGAGTAGACAAAAACCCAAAGATATAATTGTTTTATC-TATTTTAGC-A-CTGCCTAAATAC-A-CGTAGAA-C--AGA----AAATATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTACATAT---T-GT---TCT--GA-GTTTACCCCAGCATAACAAGCTAAAAATCTTAGTGGTT----AGGG-TAA--TTCGACTTGATTT-T---A---AA----AAAATGTT-TT-G-TGTTA--AA--GG-ACA-CAA-T-TACAT-A-----TTTA-A--AT-AATATTTTGC--TCC-AT-ATTC-TGCTCA-ATTGC-A-TG-ATTACT-A-A-TTTG-TTATAC--AATA-----AC-GGCAATGATA--TAT---GA-T-TAAA--TTATTAA-TC-CACAT-T-AGTACT-TGG-TTAG-CTC--T-ATGTTACG-TGTTGGA-AAGTTG--T-C---GTTC-------T--A--TATTTCCCGGGG-TGT-CTTCTCAGG-------TCGAAGATTTCT-T--GT-------GGTTGAAAACA-AT--CAA---AATCAAA---------------------------------------------------------TG---CAATTTTTGCATA-A-TATGGC-G-G--TA-AA-TG--TGT--T-A----TT-CG--GTAAAGAATTGT------CTGAT--A-----CAGTACACGTTGA-----AAT-TAATATAATAC-T-GGAG---T-----ATTAACACTCAT-
gi|10 : ttacgggctaggacccgcgtttactttatatgtcttaactaagcttacattataggtcggattctccccaccttaatgtctcacatatagtggcattatttcccatacctcgctcccCTG-TTCTTTCTTCCTAGCA-AACG-T----ATAA-TCCTCCTGTGGGACTTCTTT-A--TTTTCG--CTA---TTTT-C-------T-C-GCACAAA--TAA-TTACACCA-CCCGCA----CAAGGTTTT---TTG---CT-----------------ACTCTA-CATCGA-GACTACA--CTCTCTGATT-CTTCTCTCTCTCGCTACTACGCTCTTTCTATGGC-------A--GTGCGCTTTC-TT--C--TCTCGTCTACTCACC-G--C-----A----CATG-TCC--TG---AGGA-------------------AGC-----------CGATAGAT---TGGCTTCT--GCTT-CT-TTC--ACATTTTGGTTT--TTC--TTGT---CTT-TTA-AATTC------TCA-TA-CT-TAGA--TG-TA-TG-----CAAT--ACGGA-AGT-TG---------G-TGAC-GAC-TGT------ATTA-A--TAGT----AC--C--CTCTA-ACTC---CA---CA-G------C--G--------TCATC-GCACCC---GA------GT------A--C-T-CGTT-T--------ACAAGAAA--A-TGAACTACCTGT--A-TTTCT-T-TTCTG--ACTGCAAGATTTTATAAGGAACT-ACTTGATG-TC--CAGA-TC-T---C-TCTT-TTTGTGAATA----------ACTT-A-ATT---TTTGCTCA----G--TT--TTTCGA-AAACA-TG-TT--G--AAAATC-A-T--AG--ATAA-TGTGCA-TGTAAAACTT------GA--GC-TTTGT-CATCGGCC---AATTATGCC---CACGA--GTGA---AC-AT-----TTAGCTCTAACCTATA-CC--AG-GAAC-C-CCAT-------------TG------TC--TAC-TACTTT--C-GCAT-TATTTT-TTT-----AT-TCGTTTGGCT---CTGGA------GGGGGG-GG-acggtcaccgaaatt
gi|11 : ------GAGGGG-GGCG----G--GA-GTA--G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TT--CGAT--TTTAAA----------A-GT-ACA--TTA---AC-C-ACATGGCACTAGTT-GGCGC--CT-------AGGTGCTAGCATT-TC---AA-------ACA------ACAAAA-----------TAAC-GCTTAATC-T--TTTTGC-AACTC-ATA-ATA----C---TAA-CTCAGA----A---ATTTTTTTTATCTATATAT--------ATAA---G-GT-----G--AACG-TTACCC--ACA-AACAA-T--ACAACTC--GT-GCTTCAGACGG-TAACATTTTAC-CGATTT-T---T---AA----AAAACTTT-TT-GT--TTA--AAC--G-ACACCAC-T-TA-ATAAA---TTTTACC--ATAAATTTCT--C--T-T-ATATTT---------ATTGC-T-TG-TTATTTCA-TGTTTATTTA-AC--AATA-----AC-GCAAATGA-ACTTAC-TAGA-TATCAT--TCTTAAA-TA-C-CGT-AGAATA-TATGT-ATCGCCTCTAT-A--TTAC--T-TTTGACAAGTTGATT-CTAAGTTC------GTCCA--ATTTTTCCGAAGTTGT-CTTCTCTTT-------TCGAAGATTCTC-A--GTAAGGAACGGT-----ACAGACTACAACTTAATCAAATA--------------TTCGCAA-GA-G-------------------ACACAGATTCTGCATCA---TCTGCTTA-A-CATAATGGCG--GATAA-TGT-TTTACT-T---TTT-C---G---AAAATTG-------CT-ATTAA-----CAA---AATGTGA-----AAT-CAA---AATACGT-GAAGCACT-----A-CTACA-TCAT-CGG
gi|12 : t-TGATTTAT---T---AA----AATGTTTT-T--GTTGTTA--AACCGG-ACA-CAA-TATACAT-GA---TTTTT-G--ATAAATTTTC--T--T-C-AT-TTTC-TG--CA-ATTGTAA-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AC-GGCAA-GA-A--TAC----A-T-TAGA--ATTCAAG-T------T-T-AGTA-T-TGGTTTCG-CTC--T-A--TTACG----TTGA-AAGTTGT-T-C---GTTC------GT--A--A-TTTCCCGGGC-AGTCCTTCTC-GG-------TCGAAGATTTTC-T--GT-------GGTATA-AACA-AC--CAA---AAT-GAACA--------------TTTG--A-GA-AGATACAAAGTTTTGAAGATAAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-A-ACTAATGG-C--GA-TA-TGT-TTT--T-CT--TTT-CG--G---AAAATTGT------CTAAT--A-----CAA---ACGGTGA-----AAT-AAA---AATAT-T-GGAA---T-----A-CAACA-TCTT-
gi|13 : -TT--CGAT--TT--AA----------A-GT-A-AATTTT---TCACCACACT-CACTAGTG-GGCAC--CT-------AGGTGT--GCCATCTT---AA-T--AAAATA------ACAAAT----------A-AATTGTTTTAAC-TATTTTTGCTA-TGG-CTATATATCG-C---GAA-C--AGA----A---AAATTTCTTTTTTT-------------ACATATGTAGT---TCG--AA-G-TTACCC--ACA-AAC--AT--GAAATAT--GT-GCT----AGGG-TAACTTTCGAC-TGATTT-TAAAA---AA----AATG-TTT-TT-GTTGTGA--AAC-GGAATA-CAA-G-TACAT-AG---ATTTA-AAGATAAACATTG--T--C-C-AT-TTTCTTG--CC-ATTGT-A-TGTGTAATT-
gi|14 : aatattatttcataatgtgcatgtaataacaacAGTT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----ACGGGCAATGA-T--CACTTAGACT-TAAATTTTTTAAA-TA-C-CAT-A-AGTA---TGG-TTCG-CTC--TCA--GTACG---TTTGA-TAATGG--T-T---GTTCGCTACGGC--A--ATTTT-CCGGGG-CGT-C-TCTC-CGCACCGATTCGAAGATATTC-TGAGTA------GGT----ATCT-AC--TAG---ATTACAATA--------------ATCA--A-GATG-------------------CAA------TTA---TA---TCT---TT-A-C---ATGG-GAAGA-AATTGTGTGT--T-AAGTTTT-CGTAA---AAAATTGTTCCACCCTGAT--ATCACTTAA---GCGTGGAAAAATAAT-AAA---AATAC-T-AG
gi|15 : TCCGT-C-ATTCGACGACTTGGACT-GTC---AAACGGTCCGTCCAAGAA----CGGCACCTCAG--CCGATGTGTATTTC-----A
gi|16 : aagcaactgttttccgcgactggagtaatgtttttctctgctaagtaatatgaggtgattgagcgcgcacagaaggtatgtgagagatgcggtgcgaattgagaggctgagatgaaataagaaggtaaaaacaccttaataggtgatattaaatattaaaccatcacattttatgaaattcgatttaagactgataaggtaac-A--TTACG-T-TT-GA-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--ATGATTTTCCTGAGG-CGT-CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAA---AATCAAACAACTGTATTAACTAATTCG--AAGA-G-------------------AAAAGG---TTG---CA-------AA---A-CATAATGG-G--GA-AC-TTT-TTT--T-A---TTTTCT--G---AAAATTGT------GTGAT--A-----CAA---ACAGTTA-----ACT-TAA---AATAT-T-AGAG---TAAAAAA-AAACA-TCTT-CGG
gi|17 : CCGTCCAAGACGTAACG-CA----GG--CCGAT-TTTATTTCTTTCAGTTGCTTTATAAAA-C-ACGTTGGTACAT----T-TATAGTAAGTA-TTTCTGACAATACAACC--------------------TAGATCAAGGATTGGTGAC-AGATTTCAAAAGAGCCC-CCCCCCCGCCCCTTTCCCTTCCAC---AG---------GA-TA--ACT-------AA--ACAAA-----------A----------T--A---------T---------TCG----CCAGGA--------T------AT-----------------A-AAAACGACTC--CAC--------tc
gi|18 : C--CTGAG------GGGGGC-GG-G----A--GT-A----G-------TGT----AC--T-A--------AAT--AT-TTATTT-TA------A-ATCA----AT---A-A-TT--CGAT--TTTAAA----------A-Ggatagcac
gi|2 : tgcaactttcacagtcggacatacgtcatcacaatgcaaacgttcacaccgaaactgcgtaattttttccgcactgaaaaaatgcttttttattgcacaagctgcgctaaactattcttgaacacaacggggtgggatggggcgaTCCG-AC-AT-CGACGACTTT-ACGGA--CCAAAACG--------------------CA----GG--CCGAT-TT-ATTTC-----ATTGCTT---AAAA-CA-CG-T--TGCAT----TATAT-------A-GT-C--GC----CCACCTATCAGTGGCAGATTTCACCT--ATCA-------GTGGCA-GATTTC-AAAG----C-CCC-----CCCCTTT---T--CGC-CAAA---------AA-TT-TACT-------AA--ACAA-T-------ATTAA---------TAAA----------------------AC-TCCA-GA--------T------TTTTACCCAAAAGCCTTTTA-AAAA-GGCTA--CAA--------CATATA---------ATA------CCC------CCC-------TA-----------CTGG-ATCTGTCACTA-------CTTTCTATCA-AACA-TA---TAAA-TCCTC----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTCA-A-------AAC-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTT-ATTT-A---TTT------AAT---TGTAACTA-A-CATAGA-GA--ACA--TTT---GATT-CTTTTCTAT-----------AGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGATGTT-----A--TC--GTCTAT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TG---AAGAG------AA-AC-CA-----GCT-AAAA-A-CAC-ATAC-T----GTCTTCTC---------TCA--AG-TTTTGGTTT--TTC--TTGT---CTT-AAT-AATTCA-----TA--TA-AT-TAAA--CG-TA-TG-T---CAAT--ACGGA-AGT-TG---------GGTGAC-AAC-TGCATGT--ATTA-A--CAGTTT--AA--C--CT--A-AATC---CAA--CAAG------CA-G--------TCATG-GC--C-AAAGA------GT------A--C-TTCGTT-T--------ACAAGAAA--A-TGAA------AT--A-TTTCC-T-CC-TG--ACTCAAGATTTTATAATGGAACT-ACAT-ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TCTT-TT-GCGAATA----------A-TT-A-ATT---GTTG-TCAA---G--TT--TT---G-AAGCA-TG-TT--G--AAAATA-A-TT-AG--ATAA-TGTGCA-TGTAAAAC-T------GA--TCTTT-GT-CA--------------T-CC---CAA----------------------T-------ATC---C-TG--AA-GA---------------------------CA-TT--TAC-TAC-----CAGGACCCA---A-TTC-----AT-TAGTTTGAATA---TGG---------GGGA-GG-G----G--GG-A----G-------------CAC-TT-A--------A-T--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---A-A-TT--CGAT--TT--AACGTAATTTAAA-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C--CT-------AGGTGT--GC-AT-TC---AA-A--AAATCA------A----A----------ATAAATATTTTATC-TATTTT-GC-A-CTG-TCATATA--G-C---GAA-C--AGA----A---ACATTTTTATTTT--------------ACATATCC-GT---T-G--AA-G-TTACCC--ATA-AACAA-T--AAAATC---GT-GTT----A-GGGTA----------TAACTT-T---T-----------TGTTTT----GTTGTTA--AAC-GA-ACA-CAA-T-TACAT-CA---TTTTA-A--TTTAATATTT--C--T-T-AT-TTTT-TG--CA-ATTGT-A-TG-GTAATT-------TG-TTA-ACA-ATAA-----AC-GGCAATGA-A--TACTTAGA-T-TAAA--TTTTTAA-AA-T-CAT-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CT---T-A----ACG-T-TT-GA-AAATTG--T-A---GT-C------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTCTT-GG-------TCGAGGATTTCC----GT-------GGT----AACA-AT--CAG---GATCAAACAACTGTATTAAATAACTCG--AAGA-G-------------------AAAAAG---TTG---CA---TTTGCATT-AACATAATGG-G--GA-AA-TGT-TTT--T-A---TTTTCG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-----TAA---ACAGTGA-----AAT-AAA---AATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-
gi|22 : tgagtaatattttccccgttaaaagaagagcttttcatttgcaaaatgtgctaactatttgaacaattcgataataaaccgttttcaagagtaaggtaccA---C-TTC-----AT-T--TTTGAATC--CATAC------GAGGGG-AG-G----G--GG-G----G-------TG
gi|3 : acctgttttttctactaaatcagaagagctaccgtttttaatttgcaaataataagctaTCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAAAC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAA---------AA-TA-TACT-------AA--ACAAAT-------ACTA----------TAAA---------------------GAC-TCCA-GA--------T------TT------------------------GGC-----AC--------CA---A---------ATG------CCC------CCCACCCTTTTA---AAAT--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----TAAA-TCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTTA-T-------A-C-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA---TTT----C-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATTTCGTCTCT-TGTAGC------AGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGAG------AGCAC-CA----AGCT-A-AA-A-CACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTGATTT--TTC--TTGT---CTT-AAATAAATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TG-TC--CAATAAACTG--AGT-TG---------GGTGAC-AAC-TGTG--T--ATTA-AAGCAGT----AA--C--CT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GT------ATCC-TTCGTTGT--------ACAAGAAA--A-T-AA------AT--A-TTTCC-T-CCCTG--ACC-----------------ACTAACAT-ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TCTT-T--GTGAATA----------A-TTAA-ATT---TTTG-TCAAA--G--TT--TT---G-AAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--ATAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A-CA--AG-GGA--C-CAAT-------------TGTTTCATTT--TAA-TACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TT--CGAT--TT--AA----------A-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAAC--------AGGTGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAA----------ATAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTG-CTATATA--GCC---GAA-C--AGATTTTATT-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT--------ACAT---T-GTTTGTCG--GA-A-TTACCC--ACA-AACAAAT--AAAATGT--GT-GCT----A-GG-TAAC-TTCGAC-TGATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA--AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--T-C-AT-TTCC-T---CA-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TACTTAGA-T-TAAA--TTTTAAA-TA---CATAA-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-A--TTACG-T-TTTGA-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGCA--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-A-TA-AATGG-G--AA-AT-TG--TTT--T-A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-----CAA---ACGGTGA-----AATAAAA---AATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGGggggggtaattgaagatgagagtcacttaaaatgaattgtagaaattaaactatccattaatc
gi|4 : TCCGTAC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCCCAAAACGGTCCGTACAAAAC----CGTCA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CAACG-TGGTACAT----T-TAT------TA-GTT---GC----CAACC-----------------------ATCA-------GTGGCAAGATTTC-AAATAACCC-CCC-----CCCCTTT---TTTCACGCAAA---------AA-TA-TACT-------AA--ACAAAT-------ACTA----------TAAA---------------------GAC-TCCA-GA--------T------TT------------------------GGC-----AC--------CA---A---------ATG------CCC------CCCACCCTTTTA---AAAT--TTCTGG-TTCTGCCACTGATTTTTCCCTTCTAGCATAACA-T----TAAA-TCTTC----GG-A-----TGCA--TTTT-G--TAA---TTTA-T-------A-C-ATGAAAA--TAAATTAC--TA-CC-GTA----CAAGGTTTTATTTTA---TTT----C-AAT---GGTAACTTTA-CATTGA-GA--ACA--TTTT--GATTTCGTCTCT-TGTAGC------AGTCTC-TTATGGCTT-GCAAG--ATGCGGATTT-TT--C--TC--GTCTAT--AAG-G--C-----A---ACAT--TC---TG---AGGAG------AGCAC-CA----AGCT-A-AA-A-CACGATAC-T---CGTTTTCTC-GCTT-CT-TCA--AGTTTTTGATTT--TTC--TTGT---CTT-AAATAAATCAATAAATAA-TA-ATATAAA--TG-TA-TG-TC--CAATAAACTG--AGT-TG---------GGTGAC-AAC-TGTG--T--ATTA-AAGCAGT----AA--C--CT--A-AATC---CAA--CGAA------CA-G--------TAATG-GC--CCAAGGAG-----GT------ATCC-TTCGTTGT--------ACAAGAAA--A-T-AA------AT--A-TTTCC-T-CCCTG--ACC-----------------ACTAACAT-ATG-TA--CA-A-TC-T---C-TCTT-T--GTGAATA----------A-TTAA-ATT---TTTG-TCAAA--G--TT--TT---G-AAACA--G-TTCGG--AAAATA-AGTT-AG--ATAA-TGTGCA-TGTAATAC-T------GA--GCTTTTGTCCATC--CC---AA-TAT-CC---CAGAA--G------AC-AT-----TT-------ACC---A-CA--AG-GGA--C-CAAT-------------TGTTTCATTT--TAA-TACTTT--T-GCATATA---T-TTT-----AT-TATGTTGAATC--CTGGA------GAGGAG-GG-G----G--GG-G----G-------TGT---CACGGT-G--------AGT--AT-TGATTT-TA------A-ATCAG---AT---ATA-TT--CGAT--TT--AA----------A-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAGTT-GGC-CAAC--------AGGTGT--GCAAT-TT---AA-T--AAAACA------ACAAAA----------ATAATGGTTTCATC-TATTTTAAC-A-CTG-CTATATA--GCC---GAA-C--AGATTTTATT-TTTTTTTTTTTTTTTTTTT--------ACAT---T-GTTTGTCG--GA-A-TTACCC--ACA-AACAAAT--AAAATGT--GT-GCT----A-GG-TAAC-TTCGAC-TGATTT-T---C---AA----AATGTTTT-TTGGTTGTTA--AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTTA-A--ATAAATATTT--C--T-C-AT-TTCC-T---CA-A-TGT-A-TG-GTAATT-A-T-TTTG-TTA-ACA-AATA-----AC-GGCAATGA-A--TACTTAGA-T-TAAA--TTTTAAA-TA---CATAA-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-A--TTACG-T-TTTGA-AAGTTG--TGC---GTTC------GT--A--ATTTCCCGGGGG-CGT-CTTCTC-AG-------TCGAAGATTTCCTT--GT-------GGT----AACA-A---TAA---AATCAAGCA--------------TTTG--A-GA-G-------------------AAAAAG---TTG---C----TTTGCATT-A-TA-AATGG-G--AA-AT-TG--TTT--T-A---TTT-CG--G-----AATTGT------CTGAT--A-----CAA---ACGGTGA-----AATAAAA---AATAC-TGGGAG---T-----A-CAACA-TCATGCGG
gi|5 : GGA------GGGGGG-GG-G----G--GG-G----GGTGAAGATATG--CAC-CTTA--------AATGAAT-TAATTT-AA------ACATCAATTTATGTAA-A-TT--CGAT--TT--CA----------A-G
gi|5 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggTCTGTTC-AT-CGACGACTTGGACGAGTCC--AAACG-TTCGTCCAAGAA----CG-CA----GGGGCCGAT-TAT-TTTC-----ATTGCTT--TAAAA-CA-CA-TGGTACAT----T-TAT------TAAGTTC--GC----CCACC--------------------T--ATCA-------G-GGCA-GATTT--AAAGCCCCC-CCC-----CCCCCCT---TTTCAC-CAAA---------AA-TA-TACTG------AA--ACAA-T-------ACTAATAAAAACTCTAGA---------T---------TTGGCACCCA-AA--------TGGCCTTTT-----------------A-AAAA-GGTTT--TAC--------CT---ACATAAATATATG------CCC------CCC--CCTT--A---AAAT--TTCTGG-ATCTGTC-CAGATTTT--CCTTCTAGCA-AACA-T----TAAAATCCCA----GGCA-----TG-A--TTTT-G--TAA---TTTAAT-------A-CTATGAAAAA-TAAATTA---TA-C--GTA----CAGG--TTTATTTTA---TTT----TTAAT---T-TAACTTTAGCATTGA-CA---CA--TTTT--GATTTCTTCTCT--GTA-T------AGTCTT-CTATGGCTT-GCA----GTGCGATTTT-CT--CG-TC--GTCTCT--AAA-G--C-----A---ACATG-TC---TGA--AGGAG------ACGAC-C-----AGCT-ATAA-A-CACGATACGT---CG-TTTCT--GCGT-CT-TCA--AG-TTTTGATTTTGTTC--TTTT---CTT--AA-AATTCAAT--ATAA-TATAT-TAAA--TG-TA-TG-T---CAAT--ACGGACAGTGTG---------GGTGACAAAC-TG----T--ATT--AA-CAGTA---AA--T--CT--AGAATC---TAA--CAAG------CA-GCCCGCATTTAATG-G---CCAAAGA------GT------A--TATTCGGTTT--------ACAA-AAA--A-TGAA------AT--ATTTTCC-T-CCCTG--A-C-----------------ATT-ACAT-ATG-TAC-CA-ATTC-T---C-TCTTGT--GTGAATA----------A-TT-A-TTTTGATTTA-TTAAAATG--TT--TT---agatagcagatacttctgttcatcgacgacttggacgagtccaaacgttcgtccaagaacgcaggggccgattattttcattgctttaaaacacatggtacatttattaagttcgcccacctatcagggcagatttaaagccccccccccccccttttcaccaaaaatatactgaaacaatactaataaaaactctagatttggcacccaaatggccttttaaaaaggttttacctacataaatatatgccccccccttaaaatttctggatctgtccagattttccttctagcaaacattaaaatcccaggcatgattttgtaatttaatactatgaaaaataaattatacgtacaggtttattttatttttaatttaactttagcattgacacattttgatttcttctctgtatagtcttctatggcttgcagtgcgattttctcgtcgtctctaaagcaacatgtctgaaggagacgaccagctataaacacgatacgtcgtttctgcgtcttcaagttttgattttgttcttttcttaaaattcaatataatatattaaatgtatgtcaatacggacagtgtgggtgacaaactgtattaacagtaaatctagaatctaacaagcagcccgcatttaatggccaaagagtatattcggtttacaaaaaatgaaatattttcctccctgacattacatatgtaccaattctctcttgtgtgaataattattttgatttattaaaatgtttt
gi|6 : taatgtttatcccaggaaaagaagagccctgtttttattccgagcaaaatttgctaactattttgaacacaagaggggagggggggggggggggtgaagatatgcaccttaaatgaattaatttaaacatcaatttatgtaaattcgatttcaagagatagcagatactGT---CTT-AAA-AATC--AT--AT---TA-GT--AAA--TGGTACTGAT---CAAT--ACGGA-AGT-TG---------GGTGAC-AGA-AGT---T--TTTGTAA-CAGT----AAAAC--CT--A-AATC---CAATCCAAGG-----CA-G--------TCATG-GC--C-AATAA------GT-----------TTT---------------------------AA------AT--A-ATTCC-TTCCCTGGGAC----------------------------TG-TA--CA-A-TC-T---C-TCTT-TTTGTGAATA----------A-TT-A-ATT---TTTG-TCAA---GCTTT--TT---G-AAACA-TG-TT--G--GAAATA-AAGT-AG--ATAA-TGTGCAACGTAAAAT-T------GAATGCATTTGT-CATC--CC---AA-TAT-CC---AAGAAAAG------AC-AT-----TA-------ACT---A-TC--AA-GAC--C-CAAT-------------TGTCTCA-TA--CAA-TACTTT--C-GCAC-TA---TCTTT-----ATCTAGTTTGAATC---TGGA------GAGGGG-GG-G----GCCGG-GAATCG-------GCT---CACCGT-ATAAATCATAGT--ATCTGATTT-TA------ACATCAG---AT---A-A-TT--CAATA-TT--AA----------CTGTCA-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAGTTGGGC-C--CTAA-----AAGTGT--GT-AT-TCTTTAA-A--AAAACG------CCAAAC----------ATAAATGTTTTATCGTATTTCTGC-A-CTG-CTATATAC-G-C---GAACC--AGA----A------------------------------ACAT------T---TCGGTGA-A-TTACCC--AC--AAC-AAT--AAAAATC--GT-GCT----A-GGAAAAC-TTCGAC--GATTT-T---T---AAAAACAATGTTCTGTT-GGTCTTGACAAC-GG-ACA-CGATT-TACAT-AAGTCTTTTC-A--TAAAATATTT--TCGT-CTAT-TTTCATG--CACATTGT-ACTG-GTATTT-ACT-TTTG-TT--ACACCATAACCGTAC-GGCAATGA-AT-TATTAAGA-T-T--T--TTTTAAATTACC-CAC-A-ACTA-T--------------------TTACGTT-TTTGA-AAGTTG--T-C---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-----CTTCTC-GG-------TCGAGGATTTCC----GC-------GGT----AATA-ACA-CAA---AATCAA
gi|7 : TCC-TACTAT-CGACGACTTGGACG-GTCC-AAAACG-TCCGTCCAAAAC-----G-CA----GG--CCGAT-TTTATTTC-----ATTGCTT--TAAAAACAACG-TGGTACATATTAT-TAT------TA-GTTC--GC----CCACC--------------------T--ATC--------GTGCCA-GATT-C-AA----CCCTCCC-----CCCCCCT---TGTCAC-CAAA---------AAGTA-TACT-------AA--ACAA-T-------ACTAA---------TAAAACTCCAGATT---------TTGAC-ACCC-GAAAGGGCCTT------TT-----------------A-AAAAAGGCTT--TAC--------CT---ACATTAT---ATG------CC----------ACCCCTTTA---AAATATTTCTGGATCCTGTCACTGAATTT--CCTTCTAGCA-AACACT----TAAA-TCCTC----GGC-------------------------------------------------A--TAAATTAC--TA-CCTGTA----CAAGGTTTTATTTTATATTTT----T-AAT---GAT-ACTTTA-CATTGACAA--ACA---GTT--GATTTCTTTTCTCTGTATA------AG-CTT-CTAT-GTTT-GCTCA--GTGCGATTTT-TT--CCGTC--GTCTATA-AAA-G--C---------ACATG-TC---TGA--AGAAG------AGCAC-C-----AGCT-ACAA-A-CACGATAC-T---CG-TTTCT--GCTT-C--TCA--GCGTTTTGA-TT--TTC--TTGT---CTTAAAA-AATTCAAT--ATAATTA-AT-ATAA--TG-TA--------CAAT--c
gi|8 : aatgcaactgttcacgtcgactgagtaatgtttttgtccgcgttaaaagaagacgctgtttttattgcaaaaattgctaactatttatgaaacaacgcgagggagggggggggggtaaatgaagatagcacttaaaatgaaattaattaaaccatcaatttattaaaattgatttcaagagagataaaggtaccATA-A-TT-AT--ATAG-CG---A-AGTAATAC-T------G--------TAN-NNNN--NN---NN-NNN-NN---NNNNN--N------NN-NN-----N--------ACC---A-CA--AG-GAC--C-CAAT-------------TGTT-CA-T----AA-TACTTT--TTGCATATT---T-TTTT----AT-TAGTTTGAATC---TGGA------GAGGAG-GGTG----G--GG-G----G-------TGT---CAC-GT-A---------GT--AT-TGATTT-CA------A-ATCAG---AT---A-A-TT--CGAT--TT--AA----------A-GT-A-A--TTT---TCAC-ACATG-CACTAGTT-GGG-C--CT-------AGGTGT--GC-AT-TT---AA-TAAAAAAAA------ACCAAA----------ATAAATGTTTTAAC-TATTTT-GC-A-CTG-CTATATA--G-C---GAA-C--AGA----A---A-----CTTTTTTTTTTAC--------ATAT---T-GT---TCG--AA-G-TTACCC--ATA-AAC-AAT--ACAAT-T--GT-GCTG---G-GG-TAAA-TTTGAC-TGATTT-T---TAAAAA----AATG-TTT-TT-GTTGTTA--AAC-GG-ACA-CAA-T-TACAT-AA---TTTT--A--ATGAATATTT--C--T-C-GT-TTTC-TG--AA-ATTGT-A-TG-GT-ATT-A-T-TTTG-TTA-AC--AATA-----AT-GACAATGA-A--TACTTATA-T-TAAAC-TTTTAAA-TA-C-CAT-A-AGTA-T-TGG-TTCG-CTC--T-A--TTACG---TTTGA-AAGTTG--T-T---GTTC------GT--A--ATTTTCCCGGGG-CGT-CTTATC-GG-------TCGAAGATTT-C-T--GT-------GGT----AACA-TT--CAA---AATCAAACA--------------TTTGA-A-GA-G-------------------GGAAAG---TTG---CA---TTTGCATTAA-CATAATGG-G--GA-AA-TGT-TTT--TAA---CTT-CG--G---AAAATTGT------CTGAT--A-----CAA---ATGGTGA-----AAT-AAA---AATAC-T-GGAG---T-----A-CAACA-TCAT-CGGgtaaagtagtaagtaagtaagtaattgtatttatta
gi|9 : gttcctagaaaaaatacatcgatattttTT-CTATTGCTT-GCAAGTAG-GCGATTTTATT--C--TC--GTCTAT--AAACG--CTAGAGACTCACATGGTTGCATG---AGGAGCTTATGACTAC-CATGACACCC-ACAATA-CACGATAC-TGTGCGTTT-CTG-GCTT-TG-ACAGAAGATATTGGTAT--TT----TGT---CT----A-TATCT------TGA-TA-G---AAA--CA-CA-T--T---CAA------AA-AGA-TG---------GAT--C-CAG-AGT---T--ATTT-AA-CA-T----AA--AAGCT--A-AATCTAACAA--CAAG------AA-G--------GTATATGC--TGAAAGA------GTTAATAAA--C-TTCGTCGCGCTGGACGACAAGACACTACTGAA------ATTAA-TGTCCGT-CCCTG--ACC-----------------ACT-ACAT-ATGGTAGCTG-A-GCGT---CGTCTT-T--G--AATACTAGAGAGAGA-TG-T-ATA---TTCGCTCAAC--G--TC--TT---G-AAACAATGGTT--AGAAAAATACA-TTTAGTCATAAATATGCA-TGTAATAC-TCGGCGAGA--GCTTT-GT-CATC--AC---AAGTAT-CCACTCAGTA--GGATCATAC-ATGCATTTT-------ACC---AACAGAAG-GCA--CTCAATGGGCGAGGCATGATGTTTCA-TTAATAA-TACTTTATT-GACTATA---T-TCTTTCTGAT-TAGTTTGAATAAGCTGG-------GAGGAGCGG-G----G--GGCG----G-------TGTTGTCAC-GT----------AGT--A--TGATTTGTATTTATTA-ATCAG---AT---A-AGTT--CGAtcg
6 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|20 ): TGCAACTGTTTTCACGTCCGACTGAAAATGTTTAGAAAGACTGTTGTTTATTTGCAAAAAATGTGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAAGGGGGGGGGGGGGTGATTAAAGATATGCACTTAAAATAATTAATTAATACCCATCAATTATAAATTCGATTCAAGGATAA
Unaligned ( gi|21 ): TGCTAACTGGTTCAGTCGACTGAGTAATGTTTCTCACGCGTTAAAAAGAAGAGGCTGTTTTTATTGCAAAATGTGCTACTTTTTGAACACGAGGGGAGGTGGGGGATAAGAAGATATGCACTTTAAAAGAAATAATCAAACCACAATTTTTAAATTCGATTTAGAGACG
Unaligned ( gi|23 ): TGCTAACTATTTTGAACACAACGAGGGGAAAGGGGGGGATGAAGATTTATTAAATTCGATTTCAAGAGAT
Unaligned ( gi|24 ): ATGCAACTGTTTACGTCGACAATACGACCTCACAGCGCACTGTTTATGTCGATTGCGTAATTTTTTCCG
Unaligned ( gi|25 ): AATGCACTGTGCTTTCATGGTCCGATTAGGGAGTTAC