lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111111111 11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 111111111111111111111111111111111 333333333333333333333333333333333333333333333
lowQualScore : 2 11111 5555555555 11 3333333333333 1 11111 3333333 11 111111 222222222222 111 222222222 1111111 1 666666666666666666666666 1 11 1111111 11 111 1111 22222222222222222 5555555555555555555555555555555555555555 22222222222222222222222 1 11111111 33333 11111 222 11 22222222222222222 111 22222 111111 22222222 1 11111111 1 1111 222 4444 11 11 111 111 11 333333333333333 111 1111111 1111111 111 111111 111 333 3333333333333333 1 111 11 111 11 111 44444444444444444 111 22222222222222 111 111 1 11 333333 6666666666666666666666666666666666666666 1 111 1 11 555555555555555 3333 11 3 2 11 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 222222222222222 111 000000000000000000000000000000000 11111111 11 11111 22 3333 111111111111111111111111111111111111111111111 555 11 33333333 1 222 22 11 444 1 33333333333333333 111 3 3 444444444444444 1111111 111 1111 111 4 111 3
lowQualScore : 99 2 5 5 22222 5 5 5 8888888888 99 8 4 777 00 4 8 4 4 66 4 66 4 4444444444444 8 4 4 66 8 9 5 8 555 8 55 55 33333 777 55 4 8888888 4 777 666 55 22 0 4 4 4 111111 4 4 55 222222222222 4 4 55 4 8888 4 333 666666666 66 6666666 5 0 3 5 222222222222222222222222 888 66 5 5 3 66 5555555 11 9999 5 5 222 0000 5 5 66666666666666666 66 5 5 6666666666666666666666666666666666666666 4 4 9999 55 5 2 99999999999999999999999 0 5 5 88888888 00000 66 5 6 2 22222 5 55 888 222 5 66 11 99999999999999999 0 333 5 888 5 888 99999 5 999999 44444444 5 5 11111111 5 5 5 9 5 5 66 0000 5 888 5 222 5 5 5 6666 5 5 33 8888 5 0 888 77 77 33 0 77 5 5 5 000 5 000 77 5 77 33 888888888888888 7 5 000 5 77 5 999 8888888 1 1 5 5 888 1 8888888 111 77 888888 111 6 666 3 6 111 6 6666666666666666 1 3 6 111 99 888 6 99 6 6 6 88 99 6 6 111 5 33333333333333333 000 77 0 22222222222222 4 5 000 000 5 77 5 5 77 5 5 8888 5 999999 6 6 6 99 55 6 6 99 444444 0000000000000000000000000000000000000000 99 99 6 6 99 6 6 6 6 6 7 6 6 3 1 111 6 1 6 6 99 6 6 6 99 6 6 6 6 99 1 6 444444444444444 5555 2 6 88 1 3 3 55 6 6 3 6 99 99999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 6 6 6 6 5 5 5 5 1 666666666666666 888 000 5 1 000000000000000000000000000000000 1 77777777 5 33 5 44444 22 5 5 8888 5 000000000000000000000000000000000000000000000 0 999 555 33 5 77 5 5 3 0 77 0 5 5 99999999 5 0 2 5 5 666 3 1 555 0 11 5 99 5 33 5 888 0 77 1 2 6 6 00000000000000000 99 222 1 1 666666666666666 6 99 5 5 666 2222222 222 2222 5 5 222 5 0 5 555 6
lowQualScore : .. . . . ..... . . . .......... .. . . ... .. . . . . .. . .. . ............. . . . .. . . . . ... . .. .. ..... ... .. . ....... . ... ... .. .. . . . . ...... . . .. ............ . . .. . .... . ... ......... .. ....... . . . . ........................ ... .. . . . .. ....... .. .... . . ... .... . . ................. .. . . ........................................ . . .... .. . . ....................... . . . ........ ..... .. . . . ..... . .. ... ... . .. .. ................. . ... . ... . ... ..... . ...... ........ . . ........ . . . . . . .. .... . ... . ... . . . .... . . .. .... . . ... .. .. .. . .. . . . ... . ... .. . .. .. ............... . . ... . .. . ... ....... . . . . ... . ....... ... .. ...... ... . ... . . ... . ................ . . . ... .. ... . .. . . . .. .. . . ... . ................. ... .. . .............. . . ... ... . .. . . .. . . .... . ...... . . . .. .. . . .. ...... ........................................ .. .. . . .. . . . . . . . . . . ... . . . . .. . . . .. . . . . .. . . ............... .... . . .. . . . .. . . . . .. ........................................................... . . . . . . . . . ............... ... ... . . ................................. . ........ . .. . ..... .. . . .... . ............................................. . ... ... .. . .. . . . . .. . . . ........ . . . . . ... . . ... . .. . .. . .. . ... . .. . . . . ................. .. ... . . ............... . .. . . ... ....... ... .... . . ... . . . ... .
lowQualScore : 22 4 7 0 55555 0 0 0 2222222222 00 9 4 888 66 4 9 4 4 11 4 11 4 2222222222222 9 4 4 11 9 0 4 9 777 9 55 55 22222 888 55 0 5555555 0 000 333 55 88 8 0 0 0 555555 0 0 55 777777777777 0 0 55 0 5555 0 999 000000000 99 6666666 0 0 1 0 000000000000000000000000 888 99 0 0 8 99 8888888 99 6666 0 0 999 6666 0 0 88888888888888888 99 0 0 7777777777777777777777777777777777777777 4 4 4444 11 0 0 66666666666666666666666 0 0 0 11111111 00000 99 0 2 2 55555 0 22 888 555 0 99 99 66666666666666666 4 888 0 888 0 888 88888 0 444444 55555555 0 0 88888888 0 0 0 2 0 0 99 6666 0 888 0 333 7 7 7 0000 7 7 66 0000 7 1 000 99 99 66 1 99 7 7 7 000 7 000 99 7 99 66 444444444444444 1 7 000 0 99 7 444 6666666 7 4 7 7 000 4 6666666 777 99 333333 777 7 888 2 7 555 7 4444444444444444 0 3 7 777 00 333 7 22 7 7 7 77 22 7 7 777 7 99999999999999999 666 99 6 77777777777777 3 1 000 000 7 99 7 7 99 7 7 3333 7 555555 7 0 7 22 77 7 7 22 555555 2222222222222222222222222222222222222222 22 22 7 7 22 7 7 7 7 7 0 7 7 3 0 777 7 0 7 7 22 7 7 7 22 7 7 7 7 33 0 7 777777777777777 0000 5 7 00 8 7 5 88 7 7 5 7 22 88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 7 7 7 7 7 7 7 7 4 444444444444444 444 000 7 9 666666666666666666666666666666666 7 33333333 7 66 7 33333 66 7 7 6666 7 444444444444444444444444444444444444444444444 7 444 000 66 7 99 7 7 7 7 99 7 7 7 99999999 7 1 1 7 7 777 6 7 000 7 11 7 33 7 66 7 666 1 44 4 2 7 7 88888888888888888 22 555 7 8 555555555555555 7 22 7 7 111 7777777 777 1111 7 7 444 7 0 7 777 4
consensus : TTGGT--ATAGCGAGT-A-T-AA-----TT-TA-C-ATT----T-----CGTTT-GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAG-AA--AA-TAATCTTTTGAAG-TAT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-TGTC---C---AT-A---AG--TA--CC-TTCAAA-C-T-G------A-TAAAA-G--CTT----GGG-----ATT-A-T--G-AT----GGTA-C---CCTA-T-C-G--TGG--ACGGA----NG-GCCAT-TTCC-G----AA-TT-TTTT---T------TTT---A--C-AG-AATGT--AAAC-A---A-CA--TTG-T-GA-T-CAT-T-CG----TG-AA-GAGA---T---CATAAG----C--A-T-AAT-----ACG-TGC--CGTT--TC----A-TT----------ATA-TGC-A----GAAT-AAA-AAGT-A-C-AA--TCTG--T-------TCAGT-A-C-A--------AACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-AC---AT---GA-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-T---CC--AA-GT-AT------TTCA--T---G-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-C-A-CATTTCC-C-AGCC--AT----CAT-GG---TG-TG-NTAT-T-AT-TACG----CCAAAT-TTT-ACTT--TTATC-A--TAG-TTAGT--ATA--TT--GG--GACAAC--AAG-AC-GC-GAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTT--GC--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-GCAC-T---A-TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---G-AAAGT--TTGAGTAAAG-AGGACG-AGTTTCCGGTTGC--AACG-A-CGG---AAA-AC-----TTTTCAAC-T--GGTA-G-CA--AATGTTT---GAT--T--T-TACGTGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-T--AT-ATGATTA-T-T--TAATAA-GATA-A-TA--GACNTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC----G-TTCTTCTGANAN---TCTGTAA-ATTTC-----------------GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATG-T-TC-TC-TT-GTTGG-GGGAAT-TCCCTG-TTCA---TGCTTGACCAC-TGTCCG-TAGGACCAT-A--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANA-TAGGTAAT-GTT-T-AGATC--A-C--AAACCA----TTGT-TTTTTTA-AC-AAATC-AAGTAT--A-A-CGGCATCATC-A--AAGGGGTGA-AAT-ACC--A-GCA--T-AT--G-T-GAAATC--A-AG--TA-TA-ATTAG--TAT--GTTT-CTAGTTGAT-TC-ACCTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCAC-AGGCATT-GAAATTT-AAATATCTGGA-GCTAAAAAATA--G--AAAA-C--ACC-AGA-----GA-TGGGAACTACTT-TTT-CATTG-CAA-TGTGTA----TTTATTATT-----G--GCTTTGGT-AG--CT-TT-ATGGTAG-T-GCATTTC-AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTT-ATGGA-TGAACTTGCG--GTGTTTTG-A-AGA---CTC--AA-CAGCAATTCTC-A-ATA-T-ATCAAACTATTGTTATTGA-N-TTTTTTTGGAATA-TTTCAT-GNTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GAT--NAGGGGACT-GA-TNTTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTT--CTTTTA-T-ACACAAC-AATTAC-TATATTTT-NA---CA---AG--TTTTG-T--ACTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCAT--CTTAAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGG--CCGTTTA-GCAAC
Reference ( gi|3 ) : TTGGT--ATAGCGAGTTA-T-AA-----TT-TA-C-ATT----TT---TCGTTT-GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAG-AA--AA-TAATCTTTTGAAG-TAT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-TGTC-T-C---AT-A---AG--TA--CCTTTCAAA-C-T-G------A-TAAAA-G--CTT----TGA-----ATT-A-T--G-AT----GGTA-C---CCTA-T-C-T--TGG--ACAGA----AG-GCCAT-TTCC-G----AATTTTTTTT---T------TTT---A--C-AG-ATTGT--AAAC-A---A-CA--TTG-T-GA-T-CAT-T-CG----TG-AA-GAGA---T---CATAAG----C--A-T-AAT-----ACG-TAC--CGTT--TC----A-T-----------ATA-TGC-A----GAAT-AAA-AAGT-A-C-AA--TATG--T-------TCAGT-A-C-A--------AACT---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-AC---AT---GA-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-T---CC--A--GT-AT------TTCA--G---G-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-C-A-CATTTTC-C-AGCC--AT----CAT-GG---TG-TG-TGAT-T-AT-TACG---ACCAAAT-TTT-ACTT--TTATC-A--TAG-TTAGT--ATA--TT--GG--GACAAC--AAG-AC-GC-GAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTT--GC--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-GCAC-T--TA-TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---G-AAAGT--TTGAGTAAAG-AGGACG-AGTTTCCGGTTGC--AACA-A-CGG---AAA-AC-----TTTTCAA--T--GGTA-G-CA--AATGTTT---TAT--T--T-TAGGTGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-T--AT-ATGATTA-T-T--TAATAA-GATATA-TA--GACTGAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC----G-TTCTT----------TCTG----AGTTC-----------------GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATG-T-TC-TC-TT-GTTTG-GGGAAT-TCCCTG-TTCA---TGCTTGACCAC-TGTACG-TAGGACCAT-A--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ACA-CAGGTAAT-GTTATAAGATC--A-C--AAACCA----TTGT-TTTTTTA-ACAAAATCAAAGTAT--A-A-CGGCATCATC-A--AAGGGGTGATAAT-ATC--A-GCA--T-AT--G-T-GAAATC--AAAATGTA-TA-ATTAG-ATAT--GTTT-CTAGTTGAT-TC-ACCTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCAC-AGGCATT-GAAATTTTAAATATCTGGACGCTAAAAAATA--G--AAAA-C--ACC-AGA-----GATTGGGAACTACTT-TTT-CATTT-CAA-TGTTCAATTTTTTATTGTTAGTAGGGTGCTTTGGTTAGGACTTTTAATGGTAG-T-GCATT---AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTT-ATGGA-TGGACTTGTG--GTGTTTTG-A-AGA---C-C--AA-CAGCAACTCTC-A-ATA-T-ATCAAACTATTGTTATTGA-A-TTTTTTTGGAATA-TTTCAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATTGTAGGGGACT-AA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTT--CTTTTA-T-ACACAACAAATTACTTATATTTT-TA---TA---A---TTTTG-T--ACTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCAT--TTTAAGGAG----TA-AAAA-TTGAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACATGGCA-AATCCAATATGG--GCGTTTAGGCAAC
gi|2 : TTGGT---TAGCGAGT-A-T-TA-----CTATA-C-ATT----C-----CGTTT-GC-AA-CAA---TTTAACATT-TTC-AAA-TGAA--TG-T--G-AGGGAAA--C----T-AACAAG-AA--AAATAATCTTTGAAAG--AT-A-G-CGCA--TTGGACAGTTGA---G-TTT--TC--TTTT-TGTCAA-A---AT-A---AG--TA--CCCTTCAAA-C-T-G------A-TAAAA-G--CTT----GGA-----ATT-ATT--G-AT----GGTACC---CCTAGT-CGG--TGG--ACAGA----AG-GCCAT-TTCC-G----AA---AATTG---T------TTT---A--C-AA-AATGT--AAAC-AAATA-CATTTTG-T-GATT-CATAT-CGTTTTTG-AAGGAGA---T---CATAAG----CAAA-TAAAT-----ACG--GC--CGTT--CA----G-TA----------ATA-TGC-A----GAAT--AA-AAGT-A-CAAA--TCTG--T-------TCAGTAA-C-A--------AAC----TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-TC---ATGG-GA-C--AAA--CCCG-T----CC-----G-ATCTCTGTGT--T-TT---GC-T---CCAAA--GT-AT------TTCA--G---T--GTGAGG-A-GTTTCCA-AGC---TT-C-A--ATTTCCAC-AGCC--AT----CAT-GG---TG-TGATCAT-T-AT-TACGGC-GCCAAAT-TTT-AC-T--TTATC-A--TAG-TT-GTAAATA--TT--GG--G--AAC--AAGAAC-GC-GAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTGGGC--ACATT-------------TATGCAA-TTTAT---TGTT----ATATT-T-AT-------TATTA-GAGTAT--GTTT-------ATGATT---A--AATAATGT----CCTTAA---CTTATGA-T-GCAC-T--AATTATGT----TAT--G------AAGTG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---GAAAAGT--TTGAGTAAAGAAGGACG-AGTTT--GG-TGCGAAACAGA-CGG---AAA-ACT----TTTTCAAC-T--GGTA-G-C-----TTTTT---GAT--T--T-TACGTG-ATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TAAATAATGATTATT-T--TAATAA-GATAAA-TA--GACTT-GCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTTGGAAAACTGC----G-ATTCT----------TCTG----AGTCCCTGCCTGTAAAGTATAAGACG--AAAGGT-GCCGCGATGGTTATGTT-TC-TCTTT-GTATG-GGGAACGTGTCTG-TT-A---TGCTTGAGCAC-TGTCCG-TGAGA-CATAA--GATCAGGATA-TT-AA--TGCA-A-TT-ACATTAGGTAAT-GGTTTAGACTCCAA-CTGAAACCA----TTGT-TTTTTTATAC-AAATC-AAGTAT--ACA-CGGCATCCAC-A--AAGGGGTGA-AAT-AACCAA-GCA--TGGTTGG-T-GAAATCTGAAAGT-TAGTA-ATTAGTAAAA--GCTT-CTAGTTGATGTCAACCTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATGATATAGTGTCT---ATAA-TAGATAT-ATTT---ACAGTTTCACAAGGCATTGGAAATTT--AATATATGGA-GCTAAAAAATA--GAAAAAA-C--ACCAAGA-----GA-TGGGAACTACTT-TTT-CATGC-CAA-TGTGTA----TTTATTTTTGGTA----GCT---GT-----------ATGGTAG---GCATTTC-AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTAATGGA-TGAACTTGTG--GTGTTTTGAA-AGA---C-TCAAA-CAGCAAATCTCAA-ATA-T-ATCGAACTATTGTTATTGA-ATTTTTTTTGGAATA-TTTCAT-GGTTGCAGAAAAGCA-GGGTGAATTGTACGATT---AGGGACTAAA-TATTG-AGCAGTGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTTTCTTTTTA-TGACACAAC-AATTAC-TATATTTT-TA---CA---AG--TTTTGATAAACTTC-TTTGTAGAA-TGTT-A-AAAA-TTTCTCA---A---ATCAT--CTTAAGGAG----TA-AAAA-TTCAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGG--CCGTTTA-GCAA
gi|8 : TTGGTTTATATTGAGTTA-TTAC-----TT-TA-C-ATT----T-----CGTT--GC-AA-TAA---T---ACATT-T-C-AAA-TGGAATTG-T--A-A--------C----TTA-CAAG-AA--A--TG-TCTTT--GAG-TAT-A-GGCGCA--T----------------TTT--TC--TTTT-TGTC---C---AT-A---AG--TA--C--TTCAAA-C-TTG------A-TAAAA-G--CTT-----GG-----ATT-T-T--G-AT----GGTA-GGTACCTA-T-C-G--TGG--ACGAG----GG-GCCAT-T-CC-G----AAATTTTTTT---T------TTT---A--C-AG-AATGTT-AAAC-A---AACA--TTG---GA-TTCAT-TTCG----TG-AA-GAGAAT-T---TATAAG----C--A-T-AAT-----ACG--AC--CGTT---C----A-T-----------TAA-TGC-A----GAATTAAA-AAGTTA-C-AA--TCT---T-------TCAGT-A-C-C--------AACT---TG--A-AA--AATT-----CGTAT-AC---AT---GA-C--AAAA-CC---T----CC-----G-ATCTCAGTG---T-TTTGGGC-T---CC--AA-GT-AG------TTCA--T---G-AGTGAGA-G-TTTTCCA-ACG---TT-CCA-CATTGTC-C-AGCC--AT----CATTGG---TG-TA-TTAT-TTAT-TACG----CCAAAT-TTT-ACTTAATTATCCA--TAG-TTAGT--ATA--TT--GGTGGACAAC--AAG-AC-GCCGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTT--GC--ACA-TT-A----------TAT-CAATTGTTTTTGTGTTTCAGAT-TG-T-ATGGAATTCTTTTATGA-TGCTAGTTTATTTCAATTAATTA--A--A
gi|14 : atTTGGT--ATAATGAAGTA-T-AT-----TT-TAAC-ATT----------CGGTT-GCCAA-CAA---TTT-ACATT-T-C-AAACTGAA--TG-T--AGA----AA--C----TTA-CAAG-AA--AA-TAATCTTT-GAAG-CAT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-TGTC---C---AT-A---AG--TA--CCTT-CAAA-C-T-G------A-TAAAA-G--CTT----GGG-----ATT-A-T--G-AT----GGTA-C---CCTC-T-C-G--TGG--ACGGT----CG-GCCAT-TTCC-GAAA-AA------TT---G------TTT---A--C-AA-GACGT--AAAC-A---AGCA--TTG-T-GA-T-CAT-T-CG----TG-AA-cgta
gi|16 : atTTGGT--ACAGTGAGT-A-T-AA-----TT-TA-C-ATT----------CGTGT-GC-AA-TAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--T--T--A-A----AAAGT----T-A-CAAG-AA--AA-TAATC-TTTGAAG-TAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---G-TTT--TC--CTTG-TGTC---C---AT-A---AG--TA--CC-TTCAAA-C-T-G------A-TAAAA-A--CTT----GGG-----ATT-A-T--G-AT----GGTA-
gi|4 : atT--ACAGTGAGT-A-T-AA-----TT-TA-C-ATT----------CGTT--GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AC--T----T-G-CTAG-AA--AA-TAATCTTT-GAAG-TAT-A-G-CGCC--T--GACAGT-GA---GTTTT---C--TTTT-TGTC---C---AT-A---AG---G--CCTT-CAAA-G-T-G------A-TAAAA-G--CTT----GGG-----AT--A-T--G-AT----GGTA-C---CTTC-T-C-G--TGG--ACA-A----TG-GCCGTATGTA-G----AAGCCATGTT---CGAAAAATGT---AAAC-AG-AATGT--AAAC-A---A-CA--CTG-T-GA-T-CAT-T-CG----TG-AA-GAGA---C---CATAAG----C--A-T-AAT-----ACG--GC--CGTT---C----A-T-----------ATA-TGC-A----AAA---AA-AAGT-A-C-GA--TTTG--T-------TCAGT-A-C-A--------AACC----G--A-AA-AAAAT-----C-TAT-AC---AT---GA-C--AAA--CC---------C-----G-ATCTCTGTG---T-TT---CC-T---TC--AA-GT-AT------TTCA--T---G-ATTGAGG-A-GATTCCA--CG---TT-C-A-CATTT-C-C-AGCC--AT----CAT-GG---TG-TG-ATAT-T-AT-TACG----CCAAAT-TTT-ACTT--TTATC-A--TAG-TTAGT--ATA--TT--GG--GACAAC--AAG-AC-GC-GAA---GTA-TT---T--TCTA-TCTTT--GC--ACAT---------------ATAAAA-TAATT---TGTTTC--AT-TT---AT-------TTTTA-GA-TAT-----T-------GTGATTA--A--AATAATAT----C-TTAA---C--AT-A-T-GCAC-T---A-TATAT----T-T--C-A----AAATG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---G-AA-GT--TTGAGTAAAA-AGGACG-AGTTTCCGGT-GC--AACG-A-CAG---AAA-AC-----TTT-CAAACT--GCTA-A-CA--AATGATT---GAT--T--T--ACATGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--ATAATGT-ATTGCA-C-T--AT-GTGATTA-C-T--TAATAA-GATATA-TA--GACATAACA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTAA-A-TTCTTCTTGAAAGTCTCTGTAA-ATTTC-----------------GACG--AAA--T-GCC-CGA--A--ATA-T-TC-TC-TT-GTTGG-GGAAAT-TCTCTG-TTCA---TGCT-GACCAC-TGTCCA-TAGGACCAT-A--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGA-TAGGTAAT-GTT-T-AGATC--A----AAACCATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAATCAATTTAT--A-A-CGCCATCATC-A--AAGGGGTGA-AAT-ACC--A-GC-------------------------------A-GTTAG--TAT--GTTT-CTAGTTGAT-TC-A-CTG-CCC-TTAC-ATG-CAATATGATAT------T-GAAA-----------ATTT---AAA-TATC---------T-GGAG--TTAAAAA---------TAGAAA-----------A-C--ACC-AGA-----GA-TGGGAACTACTT-TTT-CA-TG-CAA-TG--CG------TATTAT-----------TTTGG--AG--CTGTTTATGGTAG-T-GCATTTC-AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTT-ATGGA-TGAACTTACG--GTGTTTTG-A-AGA---CTC--AA-CAGCAATTCTC-A-ATA-TAATCAAACTATTGTTATTGATT-TTTTTTTGGAATA-GTTCAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAGGGGGCT-GA-TTTTG-CACA-TGTTACAACT--T--------------TTCT------TTTTA---ACACAAC-AATTAC-TATATTTT-AA---CA---AG--TTTTG-T--ACTT--TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCAT--CTTAAGAAG----TA-AAAATTTGAAGTTTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATAT-G--CCGTTTA-GCAAC
gi|1 : T--ATAGCG-GTGACT-AA-----AT-TA-C-ATT----------CGTTT-GCCAATCAA---TT--ACATT-TTC-AAA-TGAA--TGCT--A-A----AA--TCGT-T-A-CAAG-AA--AAATAATCTTT-GAAG-TATTA-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CT--TTAT-TGTC-------AT-A---AGGCTA--CCTTTCAAAAC-T-G------AATAAAT-G--CTT----GGA-----ATT-A-TTTG-AT----GGTA-C---CCTA-TTC-G--TGGCCACAGA----AG-ACCAC-TTCCCG----AATTTTTTTT---T------TTTTTTA--C-AG-AT-GTC-AAAC-A---A-CA--TTG-T-CA-T-CAT-C-CG----CT-GA-CAGAATTT---CATTAGACGCC--A-T-AAT-----ACG--GC--CGTT---C----A-TTT---------ATA-TGCCA----GAAT-AAA-AAGTTATC-AA--TCTGGTT-------TCAGT-A-C-A--------AACT-------G-AATAAAAT-----C-TATTCC---ATTG-AA-C--AGAGACC---T----CC-----GCATCTTTCTGCATT-TT---GCCT---CC--AACGT-ATC-----TTCGATG---C-AGTGAGGTACGATTCCA-ACG---TTTC-A-CATTT-C-C-AGCC--AT----CAT-GG---TGCTG-ATAT-T-AT-TACG----CCAAATCTTT-ACTTC-TTATC-ACATAG-TTAGT---TA--TTTAGG--GACAACTTAAG-AC-GC-GAA---TTACTT---T--TCTA-TCTTT--GCGCACATTT-A----------TAC-CAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-TTAT-------TTTTA-GA-TGT--GTCT-------TTGATTACTA--AATAATTG----CCTTAA---CTTAT-A-TTGC-C-TAGTA-TATTT----T-T--G-A----AA-TGCAAAGTTA---GAATATTGGCACC--G-ACAG---------------AGACGCAGTTTCCCGGTGC--AACA-A-CGGCTAAAA-AC-----TTT-CAA--CTCGGTA-GTCA--AATGTTT---TTTGAT--T-TACATGAATA---TTG---TGGCTC--T--ATC-A--TAATTGT-ATTGCAACGT--AT-ATGAATA-TCT--TAATAACGAAA-A-TA--GATCTAGCA-CACGTTTTTACATGGAATCTTT--AAAACTGC----GATTCTTCTGATTC---TCTGCTAAATTTC-----------------GACGGAAAA--T-GCC-CGA--GTTATG-T-TCATC-TTTGTTGGCGGAAAT-TCCCTGCTTCA---TGCTTGACCAC-TGTACG-TAGGAC-AT-A--GA-CAGGATA-TTTCA--TGCATA-TTTACA-TACGGAATTGTT-TA-GATC--A-C--AAACCAA---TTGT-TTTTTTA-ACAAATTCAA-GTAT--A-AACGGCATCATCGA--AAGGGGTGA-AATCATCC-A-GCA--T-AT--G-TTGAAATC--ACAAGTTA-TA-ATTAG--TATTGGTTTTCTAGCTGAT-TC-ACCTGGCCC-TTAC-CTG-CAATATGATATA---TCTCAAGAAACTAGATATAATTTTTGACA-TTTCAC-A-GCATT-GAAATTTATAATATCTGGA-GCTAAAAATTACGG--AAAA-TCGACC-AGACGCATGCCTGGCGACTACTTGTTT-CA-TG-CAA-TGTTT-GTATTTTATT-TTGG--AGCTGCTT--------ACTT------GTAG-T-GCATTTCCAAAACG-ATTATCT--GCAACTTT-ATGG--TGGAACTGTGGTGTGTTTTG-ACAGATGCT-C--AACCAGCAA-TCTC-ACATA-T-ATC-AACTATTGTTATTGA-ATTTTTTTTGGAATA--TTCATGGGTTGCAGGAAAGCAGGGGTGAG-TGTA-GATTAGCGCGGACT-AATTATTG-CACA-TGTTACAACTTCTTAGGAATG-TATATTTCTTTT--CTTTTATT-ACACAAGCAATTACTTATATTTTATA---TA---AAGCTTTTG-T--ACTTCTTTGGTAGAAGTGTTCATAAACTTTTCTCA---A---AGCATTCTTCAAGGAGGGCCTA-AAAA-TTGAAA----TGCATGAGTCACCTTCATTGTACAT-GCACAATCCAATATGGCCGCTTTTA-GCAACcc
gi|9 : ggtAGCGAGT-A-T-AAAATTCTT-TA-CCATTCAGCTT---ACGT---GC-AA-CAGCATTT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-TTAA-A----AA--CCACTT-A-CAAGAAA--AA-TAATC-TTTGAAG-TAT-A-GACGCA--T--GA-AGTTGA---GCTTT--TC--TTTTATAGT-T-CGCGAT-ATCCAG---A--CC-TTCAAA-CTT-G------A-TAAAA-GTTCTTCTCGTGACGAGGGTTAA-T--G-ATTCCCACTA-CTT-CCTATT-C-TTGTGG--ACAGA----TGCGCCAT-TTCC-G----AAATTTTTTT---A------TTT---A--C-AGAAATGCTAAAACAA---A-CA--TAG-TCGA-T-CATATACG----TGCAA-GAGA---TGAGTACAAGTT--C--G-C-AAT-----ACATTACGGCATT--TCCGGAA-TTCTTGGATGTGATC-TGC-G----AAAT-AAATAAGT-A-C-AT--CATGC-T-------TCCGTAA-CAA--------AACCCAATGAAA-AATAAAATCATCAC-TAA-CC---AT---GA-CTAAGA--CC---TAAGACCCACGAG-A-CTCTGTG---TAAT---GC-T---CCA-A--GT--T------TTCG--GGATG-AGTGA-G-A-GATTCCAGACGGGCTT-C-ACCATTTCC-CAAGACAAAT----CAT-GG----G-TG-cc
gi|13 : -AA-----TA-TA-T-ATT----TTCATTCATTT-GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TT-T--A-A----AC--T----T-A-CAAG-GA--AA-TAATA-TTTGAAGTTAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---G--TT--TC--TTTT-TGTC-C-A---AT-A---AG--TAGGTTCTTCAAA-C-T-G------A-TAAAA-G--TTT----GGG-----ATT-C-T--G-AT----GGTA-C---CCTC-T-C-G--TGG--TCCGACGTGAA-GTCATGTGCC-GAAAAAA-------T---T------GTC---A--CAAG-AATTT--AAACAA---A-CA--CTGCT-CA-T-AAT-T-CG----TA-AA-GAAA---TC--CGTTTG----C--ACT-AAT------CT-TGG--CG-T--TC----ATT-----------ATA-TGC-A----AAA
gi|6 : atttggtagagtagataaaaaaaT---TCGTTTTGC-AA-CAA---TT--ACATTCT-CAAAA-TTAA--TG-T--A-AC---AA--CT---T-A-CAAG-AAATAA-TAA--CTTTGAAGCTAC-AGG-CGCAAGT--GACAGTTGAAGTATTTTAATCTGTTTT-TGCC-CAC---ATCA---CG--TA--CCATTCAAA-C-T-GGTATTTA-TAAGACG--CTT----GGG-----ATA-A-T--GTAT----GGTA-C---CCcc
gi|5 : ggatagtggagtaaaaaaattcaA--T--GACAGTTAG---TTTTT--TT--TTTT-TGTC---C---AT-A---AG--TA--C--TTCGA--C-T-G------A-TAAAA-G----T----TGG-----GAT-A-T--G-AT----GGTA-C---CCT--T-C-G--TGG--ACG------AG-GCCAT-TTCC-G----AA--------AAAT------TAA---A--C-AG-AATGT--TAAC-A---AACAC-TTG-T-------AT-T-CG----TA-AA-GAGA---T---T---------C--A-T-AAT-----A---TACGGCGTTCTTT----A-T------------TA-TGA-A----GAAT-AAT---GT-A-C-AA--T-TG--T-------TCAGT-ATC-A--------AA-----TG--A-AATAAA-T-----C-TAT-AC---AT----A-C--AAA--CC---T----CC-----C-ATC-CTGTG---T-TT---GC-T---CC--AA-GT-AT------TTCA--T---GCAGTGAGGGA-GATTCCT-CGG---TT-C-A-CATTT-C-C-AGCC---T----CAT-GG---TG-TG-ATAT-T-AT-TACG----CCAAAG-TT---CTT--TTCTC-A--TAG-TTG----ATA--AT--GG--GGCAAC--AAG-AC-GC-GAA---T-A-TT---TATTCTA-TCTTT--GC--A------G----------TGTAAAA-TATTC----GTT-C--AT-TT-T-AG-------TTT-A-GA-TGT--GTTT-------T-GATTG--A--AATAGT-------CTTGA----TTAT-AAT-GCAC-T---A-TATAT----T-TTGA-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATTTTGGCAC---G-AAAGTAGTTGAGTAAAG-AGGACG-AGTTTCCGGT-GC--AACA-A-CAG---AAACA---------TCAACTT--GGTA-A-CA--AATGTTT---GAT--T--TACGGGTGAATA---T------GG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-T--AT-ATGATTA-T-T--TA--AA-G--ATA-TG--GAATAACCA-CACG-TTTTACATGA---CTTT---AAACTGC----GATTCTTCCGATGTC--TCTGTAA-AGTTC-----------------GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATG-T-TC-TC-TT-G-TTG-GGGAAT-TCCCTG-TTTATGTTGCTTGACCAC-TGTCCGTTAGGGCCAT-ATTGA-CA-GATA-TT-GA--TGCA-ATTT-AAA-TAATT-AT-GTT-T-AGA-C--A-G--AAACCA----TT-T-TTTTT---AC-AAATC-AAGTATAAA-A-CGGTATCA---A--AAGGGGTGA-AAT-ACC--AGGCAATT-AT--G-T-GAAATT--AAAGTATA-TAGATTAG--TA---GTTT-CTAGTTGAT-TC-ACCTG-CCCTTTAC-CTGCCAATATGATATA---TCT-AAAAAACTAGATAT-ATTT---ACA-TTTTAC-AGGCA-T-GAAATTTAAATTATCTGA--GCT-AAAAATA--G--AAAA-CA-ACC-AG------GAGTATGAACTACTT-TTT-CA-TG-CAA-TGTGTA-----TTATT-TT-----GGAGCT---GTTA-------TA--GGTAG-T-GCATTC--AAAACGAATTAT-T--GCAAC-TT-ATGGA-TGAA--TGTG--GGTTTTTA-A-AGT---T-CTAAA-CAGCAATTCTC-A-ATATT-ATCCAACTATTGTTA-TGA-T-TTTTATTTTAATATTTTCAT-GG-TGCAAGAAAGCA-GGGTGA--TATA-GAT--TAGGGAACT-GA-TG-TG-CACA-TGTTACAACT--TTTTATATGTT-TA-TTCTTTT--CTTATA-T-ACACAAC--ATTAC--ATCTTTT-TACTTTATTTG---TTTTG-T--ACTTC-TTGGTTAGA-TGTG-T-AAACTTTTCGCA---A---AGCAT--CTTAAGGAG----TAGAAAA-TTGAAG--TTTGAATGA--CA-TTTCATTGTACAT-GCA-AATCC---ATAG--GCGTTT--GCAACcgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacagatcaaaaacataattaagaacggcaccgcttcattatactgcaacctgaataaaagttacaaactccgtaaaaatcttggtacatattataaaactgataatgaagattatacttcatttcgagcaaaccaaatatatctgtgtttccctagcaagtcatgatccactcatgagtgaggaagatcccatgttcacatttccagccatagaaaacggcttcgtgtgacatatctacacctaccaattttttctttaattagataagtgtaacttggtgacaactggtcagcgaaacgttatttggttcaactctatgcaacttttgataaacaattttatttcatttctaatgatggtgtttgatttacgaaccacgtgatcccataaaatcttatacgcccattaaatatacggctgtataataagtgtaaagtagcggaaattggcatctaaaaagtttgagtgcaaaggagagattagcttgccacaagcgacagacagagattctaagtgggtatacaggaatgccttgatgattaggtatatatatttggcatggtccgtgttgttttaatgtgagcactataata
gi|6 : aggaaaataaaataacatataatgaaagaaattaaatagacgacaaAGA---T---CAAAAA----C--A-T-AATTAAGAACGGCAC--CGCT--TC----A-TT----------ATACTGC-AACCTGAAT-AAA-AGTT-A-C-AAACTCCG--TAAAAATCTTGGT-A-C-ATATTATAAAACT----G--ATAATGAAGA-----T-TAT-ACTTCATTTCGAGC--AAA--CCAAAT-------------ATATCTGTG---T-TT---CC-CTAGCA--A--GTCATGATCCACTCA--T---G-AGTGAGGAA-GATCCC--ATG---TT-C-A-CA-TTTC-C-AGCC--ATAGAAAAC-GGCTTCG-TG-TGACAT-ATCTACACCTACCAATT-TTT-TCTT--TAAT-----TAGATAAGT--GTAACTT--GGT-GACAAC--TGG-TCAGC-GAAACGTTA-TTTGGT--TCAACTCTAT--GCA-ACTTTTGA----------TAAACA---ATTT---TATTTC--AT-TTCT-AA-------T-----GA-TG---GTGT-------TTGATTT--ACGAACCACGTGATCCCATAAAATCTTAT-A-C-GCCCAT--TA-AATATACGGC-T--GTATAATAAGTGTAAAGT-AGCGGAA-ATTGGCATCTAA-AAAGT--TTGAGTGCAA-AGGA-G-AGATT-AGCTTGC--CACA-AGCGA---CAG-ACAGAGATTCTAAG--TG-GGTATA-CAGGAATGCCT---TGA--TGAT-TAGGTATATATATTTGGCATGG-TC--CGTGTT-GTTTTAATGTGA--GCA-C-T--AT-Acc
gi|12 : ggatagtggagtaaaaaaattcattcgttttgcaacaattacattctcaaaattaatgtaacaacttacaagaaataataactttgaagctacaggcgcaagtgacagttgaagtattttaatctgtttttgcccacatcacgtaccattcaaactggtatttataagacgcttgggataatgtatggtaccccgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacT--TC----A-TT----------ATA-TGC-A----AAAT-AAA-A---------------G--T-------TTAAT-A-C-A--------AACC----G--A-ATGAAAAT-----C-TAT-AC---AT---GA-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCACTGTG---T-TT---GC-T---CC--AA-GT-AT------TTCA--T---A-AGTAAAG-A-AATTCCA--CG---TT-C-A-CATTT-C-C-TGCC--AT----CAT-GG---TG-TG-ATAT-T-AT-TATG----CCAAAT-TTTAATTT--TTATC-A--TAG-TTAAT--ATA--CT--GC--GACAGC--AAG-AC-GC-TAA---TTA-TG---T--TCTA-TCTTT--GC--ACATTT-ATACAATAAATTATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------ATTTG-GA-TGT--G-TT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-GCAC-TA-GA-TATAT----ata
gi|15 : tggcag-A----AAGTG-AAAAT-A---GAAT-TTGGCAC---G-GAATT--TTGAGTAAAG-AGGACG-AGTTTCCGGT-GC--AACG-A-CAG---AAA-AC-----TTT-CAAC-T--GGTA-A-CA--AATGATT---GAT--T--T--ACGTGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TGAATTT-ATTGCA-C-T--TT-ATGATTA-C-T--TAATAA-AATA-A-TA--AACATAGCA-CATGTTTTTACATGGA-TCTTA--AAAATTGC----G-
gi|17 : tcAA-AC-----TTT-CAACAT--TGTA-G-CA--TATATGTGGGTGA--T--T-TAGG---ATA---TTG---TGG-TCATTG-ATCTA--TTAATGT-ATTGCA-C-A--AT-ATGATTA-T-TAATAATAT-GATAAATTAGTGACTTAGCATCACGTTTatt
gi|7 : gACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTATAA-TTCTTCTGAAAGTC-TCTGTAA-ATTTC-----------------GACG--AAA--T-GCC-CGA--ATTATG-T-TC-TC-TT-GTTGG-GGAAAT-TCTCTG-TTCA---TGCTTGACCAC-TGTCCA-TAGGACCAT-A--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGA-TAGGTAAT-GTT-T-AGATC--A-C--AAACCATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAATC-AATTATA-A-A-CGGCATCATC-AACAAGGGGTGAAAAT-ACC--A-GC--------------AAGT----------------TT----TAT--GTTT-CTAGTTGAT-TC-A-CTG-CCC-TTACATTG-CAA-ATGATAT------T-GAA------------ATTT---AAA-TATC--------TT-GGAG--TTAAAAA---------TAGAAA-----------A-C--ACC-AGA-----GAT--GGGACTACTT-TTT-CATCTGCAAGCG----------TATTAT-----------TTTGG--AG--CTGTTTAT-GTAG-TAGCATTTC-AAAAC--ATTAT-TTAGC-ACTTT-ATGGA-TGAACTTACG--GTGTTTTG-A-AGA---CTC--AA-CAGCAATTCTC-A-ATA-T-ATCAAACTATTGTTATTGATT-TTTTTTTGGAATG--TTCAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAGGGG-CT-GATTTTTGCCACA-TGTTACAA---------------------CTTTT--CTTTTA-T-ACACAAC-AATTAC-TATATTTT-AA---CA---AG--TTTTG-T--ACTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCAT--CTTAAGAAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGG--CCGTTTA-GCAACgtttatagtacttttg
gi|10 : TC-----------------GACG--AAA--TTGCC-CGA--GTTATG-TCTC-TC--T-GTTGG-GGGAAA-TTCCTGTTTCA---AGCTTGACCACAGGTCCG-TAGGACCAT-A--GA-CAGGATATTT-CAAGTGCA-A-TA-AAATTATGTAAT-GTT-T-ACATC--ATT--TAACCA----TTTTGTTTTTTA-AC-AAATC-AAGTAT--A-A-ATGCATCATC-A--AAGGGGTGA-ACT-ACC--A-G-A--T-AT--GAA-GAAATC--ACA------------AG-ATATG-GTTT-CTAGT--AT-TC-ACCTG-CCC-TTAC-CTG------TAATATA---TCT---AAAA-TAGAT-T-A--T---AC--TTTTAC-AGGCA---------------ACCTGAA-GCTAAAAAATA--G--AAAAGC--ACC-AGA-----GA-TGGGAACTAC-T-TTT-CA-TG-CAA-TGTGTA----TTTAT--------------TTTGG--AG--CTATT-ATGGTAGTT-GTATTTC-AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTT-ATGGATTGAACTTGTG--GT-TTTTG-A-AAAAC-T-C--AA-C-GCAATTCTC-A-ATA-C-ATCAAACTATTGTTAATGA-A-TTTTTTT-GAATA--TTCAT-G--TGCAGG-AAGCA-GGATGA--TGTA--AT--AAGGGGACT-GA-cccttaaacaatata
gi|11 : taaaagTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATAATATA---TCT-AAAAA--TAGATAT-ATTT---ACA---------GGCAT----------------CTGGAT--TTAAAAATA--G--AAAA-C--ACC-AGA-----GAT-AGGAACTACTT-TTTTCATG--CAA-TGTGTA----TTTATTATT-----GGAGCT---GTTA----------TGGTAG-T-GTATTTC-AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTT-ATGGA-TGAACTTGTG--GTGTTTTG-A-AAA---CTC--TA-CGGCAATTCTC-A-ATA-C-ATCAAACTATTGTTATTGA-A-TTTTTTTGGAATA-TTTCAT-GTTTACAGGAAAGCA-GGATGA--TGTA-GAT--AAGGGGACT-GA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTT--CTTTTA-T-ACACAACCAATTAC-TATATTTT-AA---AA---G---TTTTG-T--ACTTT-TTGTCAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---
gi|18 : TC-TTGGTGGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCGTACATGTAGTAT--CTTAAAGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGG--CCGTTTA-GCAACta
gi|19 : AG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGG--CCGTTTA-GCAACcc
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): CAATATGGCCGTTTAGCAACCCCTTAATGTGCA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 11111 222 11111 2222222222222 1 2 111 111 111111 111111 1111 1111111 66666666666666666666666666666 11 222 111111 111111111111111111 11 11111 22222 111111 22222222222 11111111111111111 1111111 11111 11111 11111 111111 11 222222222222222 111 111111 111 1 111 111111111 11111111 11 11 2222222222 1111111 111 1111111 1111111 111 1111111111111111 1 111 11 111 11 2222 111 11 1 2222 333333 222222 1111 1 111 11 1 1 11111 3333 11 11 1 66666666666666666666666666666666666666666 111 11 1111 222 1111111 333333333333333333 11111 222 000000000000000000000000000000000 1 11 1 11 11 11 1 111111 1 1 11111111111 111 1111
lowQualScore : 66 4 4 8 55 4 4 77777 4 4 4 444 33333 8 4 777 99 4 8 4 4 55 4 55 4 8888888888888 8 4 55 2 7 555 444 8 55 55 666 444 55 3 3 66666 88 111 3 55 666 7 3 55 3 3 000000 3 3 99999 000000 2 3 88 3 7777 666 55 4 88 4 777 4 66 44 1 3333 8888888 4 4 00000000000000000000000000000 4 4 4 00 8 111 4 66 6666 4 4 4 8 4 000000 4 666666666666666666 00 4 11111 88888 333333 44444444444 4 4 4 8888 4 777 4 4 4 0 88888888888888888 4 8 8888888 77777 66 4 66 1 11111 4 11111 777777 4 00 66 222222222222222 4 777 4 222 4 777 8 4 777777 222 8 3 4 99 777 8 4 777 66 777777777 4 4 1 5 5 5 66666666 5 5 11 0 5 66 5 66 66 66 66 5 66 5 5 5 888 5 888 66 5 66 11 66 5 1111111111 88 5 888 3 66 5 5 5 6666666 0 0 5 5 222 0 6666666 66 66 3333333 000 5 5 5 77 77 5 77 8888888888888888 1 5 000 33 555 0 5 77 5 5 4 33 0000 5 000 5 5 88 5 5 888 66 5 888 9999 5 9 2 66 888 888 5 66 5 5 66 5 5 5 66 5 5 77 5 5 3333 77 1 5 5 77 333333 6 888888 99 7777 5 77 77 77 5 5 77 5 5 5 1 5 0 5 5 5 000 5 5 4 33 5 1 77 5 5 5 1 1 5 5 5 5 5 77 11111 0000 0 5 44 5 5 5 5 33 5 5 1 5 77 5 5 5 1 88888888888888888888888888888888888888888 0 5 777 5 5 5 00 5 5 5 5 2222 55 555 555 0000000 0 3 77 000000000000000000 2 5 9 66 55555 5 5 5 5 888 5 5 5 000 66 66 9 888888888888888888888888888888888 66 5 5 0 5 11 5 66 5 5 5 3 5 5 5 66 66 0 2 5 5 5 5 2 0 5 11 5 77 5 66 5 11 5 777 5 5 5 1 5 5 77 44444 000000 77 999 1 5 1 66 22222222222 5 77 5 5 5 5 888 000 5 5 0000 5 5 88 5 5 5 66 4
lowQualScore : .. . . . .. . . ..... . . . ... ..... . . ... .. . . . . .. . .. . ............. . . .. . . ... ... . .. .. ... ... .. . . ..... .. ... . .. ... . . .. . . ...... . . ..... ...... . . .. . .... ... .. . .. . ... . .. .. . .... ....... . . ............................. . . . .. . ... . .. .... . . . . . ...... . .................. .. . ..... ..... ...... ........... . . . .... . ... . . . . ................. . . ....... ..... .. . .. . ..... . ..... ...... . .. .. ............... . ... . ... . ... . . ...... ... . . . .. ... . . ... .. ......... . . . . . . ........ . . .. . . .. . .. .. .. .. . .. . . . ... . ... .. . .. .. .. . .......... .. . ... . .. . . . ....... . . . . ... . ....... .. .. ....... ... . . . .. .. . .. ................ . . ... .. ... . . .. . . . .. .... . ... . . .. . . ... .. . ... .... . . . .. ... ... . .. . . .. . . . .. . . .. . . .... .. . . . .. ...... . ...... .. .... . .. .. .. . . .. . . . . . . . . . ... . . . .. . . .. . . . . . . . . . . .. ..... .... . . .. . . . . .. . . . . .. . . . . ......................................... . . ... . . . .. . . . . .... .. ... ... ....... . . .. .................. . . . .. ..... . . . . ... . . . ... .. .. . ................................. .. . . . . .. . .. . . . . . . . .. .. . . . . . . . . . .. . .. . .. . .. . ... . . . . . . .. ..... ...... .. ... . . . .. ........... . .. . . . . ... ... . . .... . . .. . . . .. .
lowQualScore : 99 0 0 0 55 0 0 00000 0 0 0 000 33333 0 0 000 55 0 0 0 0 55 0 55 0 0000000000000 0 0 55 0 7 444 222 0 00 00 444 333 00 6 6 88888 66 444 6 00 444 3 6 00 6 6 555555 6 6 11111 555555 3 6 66 6 7777 444 55 0 99 4 888 4 11 66 0 9999 9999999 4 4 66666666666666666666666666666 4 4 4 66 9 111 4 11 4444 4 4 4 9 4 222222 4 666666666666666666 66 4 11111 33333 111111 99999999999 0 0 0 5555 0 111 4 4 4 8 44444444444444444 4 9 9999999 11111 11 4 66 0 11111 4 44444 333333 4 66 11 000000000000000 4 888 4 222 4 888 9 4 222222 222 9 3 4 22 888 9 4 333 11 888888888 4 4 0 0 0 0 44444444 0 0 99 4 0 99 0 99 99 99 99 0 99 0 0 0 888 0 888 99 0 99 99 55 0 9999999999 55 0 888 2 99 0 0 0 2222222 4 1 0 0 000 1 2222222 99 99 7777777 000 7 7 7 99 99 7 99 2222222222222222 4 7 000 77 777 1 7 99 7 7 3 44 0000 7 000 0 0 11 0 0 000 99 0 888 0000 0 4 5 99 888 888 0 99 0 0 99 0 0 0 99 0 7 99 7 7 0000 99 0 7 7 99 999999 7 777777 22 9999 0 99 99 99 7 7 99 7 7 7 4 7 7 7 7 7 000 7 7 3 66 7 4 99 7 7 7 0 4 7 7 7 7 7 99 33333 0000 7 7 11 7 7 7 7 66 7 7 7 7 99 7 7 7 4 33333333333333333333333333333333333333333 1 7 444 7 7 7 00 0 0 0 0 0000 99 444 111 4444444 5 2 55 999999999999999999 5 0 2 99 88888 0 0 0 0 888 0 0 0 666 99 99 4 555555555555555555555555555555555 99 0 0 0 0 99 0 99 0 0 0 1 0 0 0 99 99 0 2 0 0 0 0 0 4 0 00 0 44 0 00 0 99 0 999 0 0 0 0 7 7 99 77777 777777 99 444 4 7 4 77 66666666666 7 99 0 0 0 0 888 000 7 7 6666 0 0 22 0 0 0 11 4
consensus : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---CGTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAA--AA-TAATCTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-T-G------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATTA-T--G-AT----GGTA---C--CC-TA-T-C---G-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----ACG-C---GCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC----GATTCTTC-TGANN--C-TCT--G----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TCTT-GT-TGG-GGGAATTCCCTG-TT-CA---TGCTTGACCAC-TGTCCG-TAGGACCATA--GA-CAGGATATT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAAT-G-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACCA----TTGT-TTTTTTA-AC-AAAT-C-AA-GTAT--A-A-CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GCA--TA--TG-T-GAAATC---A--A---GT--ATA---ATTAG-TAT--G-TTT-CTAGTTGAT-TCA-CCTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAA-TTTA-AA-TATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--ACCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGT--ATTTATTATTG----------G-TTTGG--AG--C--TG-TT--A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TA-T-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATA-TTTCAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-NAC---A--AG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
Reference ( family-1355 ) : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATTT--CGTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAA--AA-TAATCTTTTGAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-T-G------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATTA-T--G-AT----GGTA---C--CC-TA-T-C---G-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----ACG-T---GCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGNT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACNTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC----G-TTCTTC-TGANA--N-TCT--G----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TCTT-GT-TGG-GGGAATTCCCTG-TT-CA---TGCTTGACCAC-TGTCCG-TAGGACCATA--GA-CAGGATATT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAAT-G-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACCA----TTGT-TTTTTTA-AC-AAAT-C-AA-GTAT--A-A-CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GCA--TA--TG-T-GAAATC---A--A---GT--ATA---ATTAG-TAT--G-TTT-CTAGTTGAT-TCA-CCTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAA-TTTA-AA-TATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--ACCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGT--ATTTATTATTG----------GCTTTGG-TAG--C--T--TT--A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TA-T-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATA-TTTCAT-GNTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GAT--NAG-G-GGACTGA-TNTTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-NAC---A--AG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|1 : T--ATAGCG---GT-GACT-A-A-----AT-TA-C-ATT---CGTTT----GCCAATCAA---TT--ACATT-TTC-AAA-TGAA--TGCT--A-A----AA--TCGT-T-A-CAAGAA--AAATAATCTTT-GAAG-T-ATTA-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CT--TTAT-T-GTC-----A--TA---A-GGCTA---CC-TT-TCAAAAC-T-G------AATAAAT-G-----CTTG------GAATTA-TTTG-AT----GGTA---C--CC-TA-TTC---G-TGGCCACAGAAG----ACCACTT-------CCCG-AA----TTTT---T------TT-TTTTTTTTACA-G-A-TG-TC-AAAC-AA---CA-TT--G-T-CA-T-CA-T-C-CGC----T-GAC-AGAATTT---C-ATTAGACGCCA--TAA-T-----ACG-----GCCGTT-C----ATTT---------AT-A-TGCCA----GAA-TAAA-AAG-TTATCAA--TC-TGGTT-------TCAGT-A-C-------AAAC----TG--A-A-TAAAAT-----C-TATTC---CATTG-A--A-C--AGAGACC---T----CC-----GCATCTTTCTGCATT-TT---GCCTC---CAACGT-ATC-----TTCG--ATGCAGTGAGGTACGATTCCA-ACG---TTTCA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTGCTGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAATCTTT-ACTTC-TTAT-CACATAG-TTAGT---TA--TTTAG--G-GACAACTTAAGA-C-G-CGAA---TTACTT---T--TCTA-TCTTTG--CGCACATTT-A----------TAC-CAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-TTAT-------TTTTA-GA-TGT--GTCT-------TTGATTACTA--AATAATTG----CCTTAA---CTTAT-A-TTG--CCTAG-TA--TATTT----T-T--G-A----AA-TGCAAAGTTA---GAATATTGGCACC--GACA-G---------------AGACGCAGTTTCCCGGTGC----AAC-AACGGCTAA-AA-ACTTT--CAAC-TCGGTA-GTCA--AATG-TTTTTTGA-T--T-T-ACA--TGAATA---TTG---TGGCTC--T--ATC-A--TAATTGT-ATTGCAACGTA--TA-TGAATATCT--T-AATAACGAAA-A--TA--GATCTAGCA-CACGTTTTTACATGGAATCTTT--AAAACTGC----GATTCTTC-TGATT--C-TCT--GC---TAAATTTC--GACGGAAAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-CATCTTTGT-TGGCGGAAATTCCCTGCTT-CA---TGCTTGACCAC-TGTACG-TAGGAC-ATA--GA-CAGGATATTTCA--TGCATA-TTTACAT-ACGGAATTG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACCAA---TTGT-TTTTTTA-AC-AAATTC-AA-GTAT--A-AACGGCATCATCGA--AAGGGGTG-A-AATCATCCA-GCA--TA--TG-TTGAAATC---ACAA---GTT-ATA---ATTAG-TATTGG-TTTTCTAGCTGAT-TCA-CCTGGCCC-TTAC-CTG-CAATATGATATA---TCTCAAGAAACTAGATATAATTTTTGACA-TTTCACA--GCATTG-AAA-TTTATAA-TATCTGGA-GCTAAAAATTACGGAAAA--TCGACCA-GACGCA-TGCCTGGCGACTAC-TTGTTTCA--TGCAATGTTTGT--ATT--TTAT--------------TTTGG--AG--C--TGCTT--ACT-TGTAGT-GCATTTCCAAAACG-ATTATCT--GCAACTTTA-TGGT-GGAACTGTGGTGTGTTTTG-ACA-GATGCTC--AACCAGCAA-TCTCACA-TA-T-ATC-AACTATTGTTATTGAA-TTTTTTTT-GGAATA--TTCATGGGTTGCAGGAAAGCAGGGGTGAG-TGTA-GAT--TAGCGCGGACTAATTATTG-CACA-TGTTACAACTTCTTAGGAATG-TATATTTCTTTTC--TTTTATT-ACACAAGC-AATTACTTATATTTTATAT---A--AAGCTTTTG-TA--CTTCTTTGGTAGAAGTGTTCATAAACTTTTCTCA---A---AGCATTCTTCAAGGAGGGCCTA-AAAA-TTGAAA----TGCATGAGTCACCTTCATTGTACAT-GCACAATCCAATATGGCCGCTTTTA-GCAAC
gi|10 : ggt----TAAAAGTC--GACG--AAA--TTGCC-CGA--GTTATGTCT-C-TCT--GT-TGG-GGGAAATTCCTG-TTTCA---AGCTTGACCACAGGTCCG-TAGGACCATA--GA-CAGGATATTTCAAGTGCA-A-TA-AAATTATGTAAT-G-TT-T-ACA-TC--AT--TTAACCA----TTTTGTTTTTTA-AC-AAAT-C-AA-GTAT--A-A-ATGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-ACT-A-CCA-G-A--TA--TG-AAGAAATC---A-----------CA---A--GA-TAT--GGTTT-CTAGT--AT-TCA-CCTG-CCC-TTAC-CTG-TAATAT-----A---TCT-AAAA---TAGAT-T-AT-----AC--TTTTACA-GGCA-----------------ACCTGAA-GCTAAAAAATA--GAAAAG-C--ACCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TT-CAT--GCAATG--TGT--ATTTATT-----------------TTGG--AG--C--TA-TT--A-T-GGTAGTTGTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGATTGAACT-TGTGGT-TTTTGAA-A-AA--CTC--AA-C-GCAATTCTCA-A-TA-C-ATCAAACTATTGTTAATG-A-ATTTTTTT--GAATA--TTCAT-G--TGCAGG-AAGCA-GGATGA--TGTA--AT--AAG-G-GGACTGA-cc
gi|11 : TG-CCC-TTAC-CTG-CAATATAATATA---TCT--AAAAA-TAGATAT-ATTT-----------ACA-GGC------------------ATCTGGA-TTT-AAAAATA--GAAAA--C--ACCA-GA-G-A-TA---GG-AACTACTTT-TTTCA--TGCAATG--TGT--ATTTATTATTG----------G--------AG--C--TG-TT--A-T-GGTAGT-GTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-AA--CTC--TA-CGGCAATTCTCA-A-TA-C-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATA-TTTCAT-GTTTACAGGAAAGCA-GGATGA--TGTA-GAT--AAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAACC-AATTAC-TATATTTT-AA----A--AG--TTTTG-TA--CTTT-TTGTCAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---
gi|12 : TTC----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-TAAA-A----------------G--T-------TTAAT-A-C-------AAACC----G--A-ATGAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCACTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATA-AGTAAAG-A-AATTCC--ACG---TT-CA-CATTTCC-T--GCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAT----G---CCAAAT-TTTAATTT--TTAT-CA--TAG-TTAATA--TA--CT--G--C-GACAGC--AAGA-C-G-CTAA---TTA-TG---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-ATACAATAAATTATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------ATTTG-GA-TGT--G-TT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--GATAT----ta
gi|13 : tggcag-A-AT-A--T-ATA-----TT-TT-C-ATT---CATTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TT-T--A-A----AC--T----T-A-CAAGGA--AA-TAATATTT-GAAG-TTAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTT----C--TTTT-T-GTC-C---AA-TA---A-G--TAGGTTC-TT-C--AAAC-T-G------A-TAAAA-G-----TTTG------GGATTC-T--G-AT----GGTA---C--CC-TC-T-C---G-TGG--TCCGACGTGAAGTCATGTG------CC-G-AAAAAATTGT---C-----------------ACAAG-AATT-T--AAAC-AAA--CA-CT--GCT-CA-T-AA-T-T-CGT----A-AAG-AAA---T---CCGTTTG----CAC-TAA-T------CT-T---GGCGTT-C----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-at
gi|14 : atttggtagagtagataaaaaaaTTGGT--ATAATG-AAGT-A--T-A-T-----TT-TAAC-ATT---CGGTT----GCCAA-CAA---TTT-ACATT-T-C-AAACTGAA--TG-T--AGA----AA--C----TTA-CAAGAA--AA-TAATCTTT-GAAG-C-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-T-G------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATTA-T--G-AT----GGTA---C--CC-TC-T-C---G-TGG--ACGGTCG----GCCATTT-------CC-G-AA--------AAAT------TG-TTT-----ACA-A-GACG-T--AAAC-AAG--CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAcc
gi|15 : at-A----AAGTG-AAAAT-A---GAAT-TTGGCAC---GGAA-TT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTT--CAAC-T-GGTA-A-CA--AATG-ATT---GA-T--T-T-ACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TGAATTT-ATTGCA-C-TT--TA-TGATTAC-T--T-AATAA-AATA-A--TA--AACATAGCA-CATGTTTTTACATGGA-TCTTA--AAAATTGC----G-
gi|16 : tcTTGGT--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---CGTGT----GC-AA-TAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--T--T--A-A----AAAGT----T-A-CAAGAA--AA-TAATCTTT-GAAG-T-AT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CC--TTGT---GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-T-G------A-TAAAA-A-----CTTG------GGATTA-T--G-AT----GGTA---att
gi|17 : at-AA-ACTTT--CAACAT-TGTA-G-CA--TATA-TGT---GGGTGAT-TTA-----GGATA---TTG---TGG-TCATTG-ATCTA--TTAATGT-ATTGCA-C-AA--TA-TGATTAT-TAAT-AATAT-GATA-AATTAGTGACTTAGCATCACGTTT
gi|18 : gTC-TTGGTGGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCGTACATGTAGTA-TCTT-AAAGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACgtttatagtacttttg
gi|19 : AG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACcc
gi|2 : TTGGT---TAGCG-A-GT-A--T-T-A-----CTATA-C-ATTC--CGTTT----GC-AA-CAA---TTTAACATT-TTC-AAA-TGAA--TG-T--G-AGGGAAA--C----T-AACAAGAA--AAATAATCTTTGAAAG---AT-A-G-CGCA--TTGGACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-A---AAATA---A-G--TA---CCCTT-C--AAAC-T-G------A-TAAAA-G-----CTTG------GAATTA-TT-G-AT----GGTA---C--CCCTAGT-C---GGTGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----AATT---G------TT-TT------ACA-A-AATG-T--AAAC-AAATACA-TTTTG-T-GA-TTCA-TAT-CGTTTTTG-AAGGAGA---T---C-ATAAG----CAAATAAAT-----ACG-----GCCGTTCA----GTA----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-A-G-T-A-CAAA-TC-TG--T-------TCAGT-AAC-------AAAC----TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-T---CAT---GGGA-C--AAA--CCCG-T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TTT--GC-TC---CAAAGT-AT------TTC---A-G-TGTGAGG-A-GTTTCCA-AGC---TT-CA--ATTTCCAC-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGATCA-TTAT-TAC----GGCGCCAAAT-TTT-ACTT--T-AT-CA--TAG-TT-GTAAATA--TT--G--G-GA--AC--AAGAAC-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTGGGC--ACATTT-A----------TG--CAA-TTTAT---TGTT----ATATT-T-AT-------TATTA-GAGTAT--GTTT-------ATGATTA--A--A-TAATGT----CCTTAA---CTTATGA-T-G--C--AC-TAATTATGT----TAT--G-A----A-GTG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---GAAAAGT--TTGAGTAAAGAAGGACG-AGTTT--GGT-GCGA--AACAGACGG---A-AA-ACTTTTTCAAC-T-GGTA-G-C-----TT-TTT---GA-T--T-TTACG--TGA-TA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TAAATAATGATTAT-T--TTAATAA-GATA-AA-TA--GACTT-GCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTTGGAAAACTGC----GATTCTTC-TGAGT--C-CCT--GCCTGTAAAGTATAAGACG--AAAGGT-GCCGCGATGGTTATGT-TTC-TCTTTGTATGG-GGAACGTGTCTG-TT--A---TGCTTGAGCAC-TGTCCG-TGAGAC-ATAA-GATCAGGATATT-AA--TGCA-A-TT-ACATTAGGTAAT-GGTT-T-AGACTCCAACTGA-AACCA----TTGT-TTTTTTATAC-AAAT-C-AA-GTAT--ACA-CGGCATCCAC-A--AAGGGGTG-A-AAT-AACCAAGCA--TGGTTGGT-GAAATCTGAA--A---GTTAGTA---ATTAG-TAAAAG-CTT-CTAGTTGATGTCAACCTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATGATATAGTGTCT-ATAA---TAGATAT-ATTT---ACAGTTTCACAAGGCATTGGAAA-TTTA-A--TATATGGA-GCTAAAAAATA--GAAAAAAC--ACCAAGA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-GCCAATG--TGT--ATTTATT----------------TTTGG-TAG--C--T--GT--A-T-GGTAG--GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTAATGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-AAGA--CTC--AAACAGCAAATCTCA-AATA-T-ATCGAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTTTGGAATA-TTTCAT-GGTTGCAGAAAAGCA-GGGTGAATTGTACGAT--TAG-G-G-ACTAAATATTG-AGCAGTGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTTTCTTTTTA-TGACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-TAC---A--AG--TTTTGATAAACTTC-TTTGTAGAA-TGTT-A-AAAATTT-CTCA---A---ATCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTCAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAccc
gi|20 : CAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|3 : TTGGT--ATAGCG-A-GTTA--T-A-A-----TT-TA-C-ATTTTTCGTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAA--AA-TAATCTTTTGAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTCTC---A--TA---A-G--TA---CC-TTTC--AAAC-T-G------A-TAAAA-G-----CTTT------GAATTA-T--G-AT----GGTA---C--CC-TA-T-C---T-TGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTTTT---ACA-G-ATTG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----ACG-T---ACCGTTTC----AT-----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TA-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACT---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CA--GT-AT------TTC---AGG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTTC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGTG-A-TTAT-TAC----GA--CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACTTA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-AACGG---A-AA-ACTTTT-CAA--T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---TA-T--T-TTAGG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACTGAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC----G-TTCTT-----------TCT--G-------AGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TCTT-GT-TTG-GGGAATTCCCTG-TT-CA---TGCTTGACCAC-TGTACG-TAGGACCATA--GA-CAGGATATT-CA--TGCA-A-TT-ACAC-AGGTAAT-G-TTATAAGA-TC--AC--A-AACCA----TTGT-TTTTTTA-ACAAAAT-CAAA-GTAT--A-A-CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-ATAAT-A-TCA-GCA--TA--TG-T-GAAATC---A--AAATGT--ATA---ATTAGATAT--G-TTT-CTAGTTGAT-TCA-CCTG-CCC-TTAC-CTG-CAATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTTTA-AA-TATCTGGACGCTAAAAAATA--GAAAA--C--ACCA-GA-G-ATTG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TTCAATG--T-TCAATTTTTTATTGTTAGTAGGGTGCTTTGGTTAGGAC--T--TTTAA-T-GGTAGT-GCATT---AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGGACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-GA--C-C--AA-CAGCAACTCTCA-A-TA-T-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATA-TTTCAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATTGTAG-G-GGACTAA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATG-T-TA-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAAATTACTTATATTTT-TAT---A--A---TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TTTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACATGGCA-AATCCAATATGGGCG--TTTAGGCAACcccttaatgtgca
gi|4 : T--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---CGTT-----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AC--T----T-G-CTAGAA--AA-TAATCTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCC--T--GACAGT-GA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G---G---CC-TT-C--AAAG-T-G------A-TAAAA-G-----CTTG------GGAT-A-T--G-AT----GGTA---C--CT-TC-T-C---G-TGG--ACA-ATG----GCCGTATGTAGAAGCC----A----TGTT---CGAAAAATG-TAA-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-CT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---C---C-ATAAG----CA--TAA-T-----ACG-----GCCGTT-C----AT-----------AT-A-TGC-A----AAA---AA-AAG-T-A-CGA--TT-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC----G--A-AA-AAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---------C-----G-ATCTCTGTG---T-TT---CC-TT---CAA-GT-AT------TTC---ATG-ATTGAGG-A-GATTCCA--CG---TT-CA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---GTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--AC-----A----------TATAAAA-TAATT---TGTTTC--A--TT-T-AT-------TTTTA-GA-TA-----TT-------GTGATTA--A--AATAATAT-----CTTAA---C--AT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--C-A----AAATG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---G-AA-GT--TTGAGTAAAAA-GGACG-AGTTTCCGG-TGC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTTC-AAAC-T-GCTA-A-CA--AATG-ATT---GA----T-TTACA--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--ATAATGT-ATTGCA-C-TA--TG-TGATTAC-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACATAACA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTAA-A-TTCTTCTTGAAAGTC-TCT--G----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--A--ATAT-T-C-TCTT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CA---TGC-TGACCAC-TGTCCA-TAGGACCATA--AA-CAGGATATT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAAT-G-TT-T-AGA-TC--A---A-AACCATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAAT-C-AATTTAT--A-A-CGCCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GC----------------------------------A---GTTAG-TAT--G-TTT-CTAGTTGAT-TCA--CTG-CCC-TTAC-ATG-CAATATGATAT------T-GAAA-----------ATTT---AAA-TATC---------TG-GAG--TTA-AA-----------------AATA--GAAAA--C--ACCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCA--TGCAATG--CGT--A-TTATT-TTG----------G--------AG--CTGT--TT--A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TA-TAATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATA-GTTCAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGGCTGA-TTTTG-CACA-TGTTACAACT--T--------------TTCT------TTTTA---ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-AAC---A--AG--TTTTG-TA--CTT--TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAATTTGAAGTTTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATAT-GCCG--TTTA-GCAAC
gi|5 : A--T--GACAGTTAG---TTTTT--TT--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---C--TT-C--GA-C-T-G------A-TAAAA-G------TTG------GGAT-A-T--G-AT----GGTA---C--CC-T--T-C---G-TGG--ACG--AG----GCCATTT-------CC-G-AAAAA-TTAA---------------------ACA-G-AATG-T--TAAC-AAA--CACTT--G-T-------A-T-T-CGT----A-AAG-AGA---T---T----------CA--TAA-T-----ATA-C---GGCGTT-C----TTT----------ATTA-TGA-A----GAA-TAAT---G-T-A-CAA--T--TG--T-------TCAGT-ATC-------AAA-----TG--A-AATAAA-T-----C-TAT-A---CAT------A-C--AAA--CC---T----CC-----C-ATC-CTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATGCAGTGAGGGA-GATTCCT-CGG---TT-CA-CATTTCC---AGCC---T---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAG-TT---CTT--TTCT-CA--TAG-TTG--A--TA--AT--G--G-GGCAAC--AAGA-C-G-CGAA---T-A-TT---TATTCTA-TCTTTG--C--A------G----------TGTAAAA-TATTC----GTT-C--AT-TT-T-AG-------TTT-A-GA-TGT--GTTT-------T-GATTG--A--AATAGT-------CTTGA----TTAT-AAT-G--C--AC-TA--TATAT----T-TTGA-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATTTTGGCAC---GAAA-GTAGTTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-AACAG---A-AACA----T-CAAC-TTGGTA-A-CA--AATG-TTT---GA-T--T-T-ACGGGTGAATA---T------GG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AA--A-GATA----TG--GAATAACCA-CACGTTTT-ACATGA---CTTT--AAA-CTGC----GATTCTTC-CGATG--TCTCT--G----TAAAGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TCTT-GT-T-G-GGGAATTCCCTG-TT-TATGTTGCTTGACCAC-TGTCCGTTAGGGCCATATTGA-CA-GATATT-GA--TGCA-ATTT-AAAT-AATT-AT-G-TT-T-AGA--C--AG--A-AACCA----TT-T-TTTTT---AC-AAAT-C-AA-GTATAAA-A-CGGTATCA---A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCAGGCAATTA--TG-T-GAAATTA--A--A---GT--ATATAGATTAG-TA---G-TTT-CTAGTTGAT-TCA-CCTG-CCCTTTAC-CTGCCAATATGATATA---TCT-AAAAAACTAGATAT-ATTT---ACA-TTTTACA-GGCA-TG-AAA-TTTA-AATTATCT-GA-GCT-AAAAATA--GAAAA--CA-ACCA-GG-A-G-TA---TG-AACTAC-TT-TTTCA--TGCAATG--TGT--A-TTATT-TTG----------G--------AG--C--TG-TT--A-TAGGTAGT-GCA-TT-CAAAACGAATTAT-T--GCAAC-TTA-TGGA-TGAA---TGTGG-GTTTTT-A-A-AG--TTCTAAA-CAGCAATTCTCA-A-TATT-ATCCAACTATTGTTA-TG-A-TTTTTATT-TTAATATTTTCAT-GG-TGCAAGAAAGCA-GGGTGA--TATA-GAT--TAG-G-GAACTGA-TG-TG-CACA-TGTTACAACT--TTTTATATGTT-TA-TTCTTTTC--TTATA-T-ACACAA-C--ATTAC--ATCTTTT-TACTTTATTTG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTTAGA-TGTG-T-AAACTTTTCGCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TAGAAAA-TTGAAG--TTTGAATGA--CA-TTTCATTGTACAT-GCA-AATCC---ATAGGCG--TTT--GCAACcc
gi|6 : aggaaaataaaataacatataatgaaagaaattaaatagacgacaa--ATAGTGGA-GT-A--A-A-AAAA--TT-CA-----TT--CGTTTT---GC-AA-CAA---TT--ACATTCT-CAAAA-TTAA--TG-T--A-AC---AA--CT---T-A-CAAGAAATAA-TAA--CTTTGAAGCT-AC-AGG-CGCAAGT--GACAGTTGAAGTATTTTAATCTGTTTT-T-GCC-C---A--CATC-ACG--TA---CCATT-C--AAAC-T-GGTATTTA-TAAGACG-----CTTG------GGATAA-T--GTAT----GGTA---C--CC-cc
gi|6 : gg-AGA---T---C-AAAAA----CA--TAA-TTAAGAACGGC---ACCGCTTC----ATT----------AT-ACTGC-AACCTGAA-TAAA-AGT-T-A-CAAACTC-CG--TAAAAATCTTGGT-A-CATATTATAAAAC---TG--ATAATGAAGA-----T-TAT-ACTTCATTTCG--AGC--AAA--CCAAAT-------------ATATCTGTG---T-TT----C-CCTAGCAA-GTCATGATCCACTC---ATG-AGTGAGGAA-GATCCC--ATG---TT-CA-CATTT-C-C-AGCC--ATAGAAAACGGCT-TCGTG-TGAC-A--TATCTACACCTA---CCAATT-TTT-TCTT--TAAT-----TAGATAAGTG--TAACTT--G--GTGACAAC--TGGT-CAG-CGAAACGTTA-TTTGGT--TCAACTCTATG--CA-ACTTTTGA----------TAAACA---ATTT---TATTTC--AT-TTCT-AA-------T-----GA-TG---GTGT-------TTGATTT--ACGAACCACGTGATCCCATAAAATCTTAT-A-C-GCCC--AT-TA--AATATACGGC-T--GTATAATAAGTGTAAAGT-AGCGGAA-ATTGGCATCTAAAAA-GT--TTGAGTGCAAA-GGA-G-AGATT-AGCTTGCCACAAGC-GACAG---ACAG-AGATTC-TAAG-TGGGTATA-CAGGAATGCCTT---GA-T--GATTAGG--TATATATATTTGGCATGG-TC--CGTGTT-GTTTTAATGTGA--GCA-C-TA--TA-cgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacagatcaaaaacataattaagaacggcaccgcttcattatactgcaacctgaataaaagttacaaactccgtaaaaatcttggtacatattataaaactgataatgaagattatacttcatttcgagcaaaccaaatatatctgtgtttccctagcaagtcatgatccactcatgagtgaggaagatcccatgttcacatttccagccatagaaaacggcttcgtgtgacatatctacacctaccaattttttctttaattagataagtgtaacttggtgacaactggtcagcgaaacgttatttggttcaactctatgcaacttttgataaacaattttatttcatttctaatgatggtgtttgatttacgaaccacgtgatcccataaaatcttatacgcccattaaatatacggctgtataataagtgtaaagtagcggaaattggcatctaaaaagtttgagtgcaaaggagagattagcttgccacaagcgacagacagagattctaagtgggtatacaggaatgccttgatgattaggtatatatatttggcatggtccgtgttgttttaatgtgagcactataata
gi|7 : ggatagtggagtaaaaaaattcattcgttttgcaacaattacattctcaaaattaatgtaacaacttacaagaaataataactttgaagctacaggcgcaagtgacagttgaagtattttaatctgtttttgcccacatcacgtaccattcaaactggtatttataagacgcttgggataatgtatggtaccccgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTATAA-TTCTTC-TGAAA--G-TCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--ATTATGT-T-C-TCTT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CA---TGCTTGACCAC-TGTCCA-TAGGACCATA--AA-CAGGATATT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAAT-G-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACCATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAAT-C-AA-TTATA-A-A-CGGCATCATC-AACAAGGGGTGAA-AAT-A-CCA-G------------------C---A--A---GT---------TT---TAT--G-TTT-CTAGTTGAT-TCA--CTG-CCC-TTACATTG-CAA-ATGATAT------T-GAA------------ATTT---AAA-TATC--------TTG-GAG-TTAA-AA------------------ATA--GAAAA--C--ACCA-GA-G-A-TG---GG--ACTAC-TT-TTTCATCTGCAA-G--CGT--A-TTATT-TTG----------G--------AG--CTGT--TT--A-T--GTAGTAGCATTT-CAAAAC--ATTAT-TTAGC-ACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TA-T-ATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATG--TTCAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GG-CTGATTTTTGCCACA-TGTTACAA---------------------CTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-AAC---A--AG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACata
gi|8 : TTGGTTTATATTG-A-GTTA--TTA-C-----TT-TA-C-ATTT--CGTT-----GC-AA-TAA---T---ACATT-T-C-AAA-TGGAATTG-T--A-A--------C----TTA-CAAGAA--A--TG-TCTTT--GAG-T-AT-A-GGCGCA--T----------------TTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA----C-TT-C--AAACTT-G------A-TAAAA-G-----CTT-------GGATTT-T--G-AT----GGTAGGTA--CC-TA-T-C---G-TGG--ACGAGGG----GCCA-TT-------CC-G-AAAT--TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATGTT--AAACAAA---CA-TT--G---GATT-CATT-T-CGT----G-AAG-AGAAT-T---T-ATAAG----CA--TAA-T-----ACG-----ACCG-TTC----ATT----------A--A-TGC-A----GAATTAAA-AAGTT-A-CAA--TC-T---T-------TCAGT-A-C-------CAACT---TG--A-A--AAATT-----CGTAT-A---CAT---G--A-CA-AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCAGTG---T-TTTGGGC-TC---CAA-GT-AG------TTC---ATG-AGTGAGA-G-TTTTCCA-ACG---TTCCA-CATTGTC-C-AGCC--AT---------CATTGGTG-TATT-ATTTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTTAATTATCCA--TAG-TTAGTA--TA--TT--GGTG-GACAAC--AAGA-C-GCCGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACA-TT-A----------TAT-CAATTGTTTTTGTGTTTCAGAT-TG-T-ATGGAATTCTTTTATGA-TGCTAGTTTATTTCAATTAATTA--A--Acccttaaacaatata
gi|9 : atAGCG-A-GT-A--T-A-AAATTCTT-TA-CCATTC--AGCTTACGTGC-AA-CAGCATTT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-TTAA-A----AA--CCACTT-A-CAAGAA--AAATAATCTTT-GAAG-T-AT-A-GACGCA--T--GA-AGTTGA---GCTTT--TC--TTTTATAGTT-CGCGA--TATCCA-G---A---CC-TT-C--AAAC-TTG------A-TAAAA-GTTCTTCTCGTGACGAGGGTTAAT--G-ATTCCCACTA---CTTCC-TA-T-TCTTG-TGG--ACAGATGC---GCCATTT-------CC-GAAA----TTTT---T------TTATTT-----ACA-GAAATG-CTAAAACAAA---CA-TA--G-TCGA-T-CA-TATACGT----GCAAG-AGA---TGAGT-ACAAGTT--CG--CAA-T-----ACA-TTACGGCATTTCCGGAATTCTTGGATGTGAT-C-TGC-G----AAA-TAAATAAG-T-A-C-A--TCATGC-T-------TCCGTAA-CA------AAACCCAATGAAA-AATAAAATCATCAC-TAA-C---CAT---G--A-CTAAGA--CC---TAAGACCCACGAG-A-CTCTGTG---TAAT---GC-TC---CAA-GT--T------TTCGGGATG-AGTGA-G-A-GATTCCAGACGGGCTT-CACCATTTCC-CAAGACAAAT---------CA-TGG-G-TGcgta
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 2222222222222 1 111 111 111111 111111 1111 1111 1111111 66666666666666666666666666666 11 222 111111 111111111111111111 11 11111 222222 111111 22222222222 11111111111111111 1111111 11111 11111 11111 111111 11 222222222222222 111 111111 111 1 111 111111111 11111111 11 11 2222222222 1111111 111 1111111 1111111 111 1111111111111111 1 111 11 111 11 2222 111 11 1 2222 111 222222222 1111 111 11 1 11111 2222 11 1 1 77777777777777777777777777777777777777777 1111111 11 1111 222 1111111 333333333333333333 11 222 11111 77777777777777 1 1 11 1 1 11 1 11 1 11111 1 1 111111 111 1111
lowQualScore : 66 4 4 8 55 4 4 77777 4 4 4 111 8 33333 8 4 777 99 4 8 4 4 55 4 55 4 8888888888888 8 4 2 55 4 4 4 444 8 55 55 666 444 55 3 3 66666 88 111 3 55 666 7 3 55 7 000000 3 3 99999 000000 55 88 3 7777 666 55 4 6666 4 4 66 44 1 3333 8888888 4 4 00000000000000000000000000000 4 4 4 00 8 111 4 66 6666 4 4 4 8 4 000000 4 666666666666666666 00 4 11111 444444 333333 44444444444 4 4 4 8888 4 777 4 4 4 0 88888888888888888 4 8 8888888 77777 66 4 66 1 11111 4 11111 777777 4 00 66 222222222222222 4 777 4 222 4 777 8 4 777777 222 8 3 4 99 777 8 4 777 66 777777777 4 4 5 5 5 66666666 5 5 11 0 5 66 5 66 66 66 66 5 66 5 5 5 888 5 888 66 5 66 11 66 5 1111111111 88 5 888 3 66 5 5 5 6666666 0 0 5 5 222 0 6666666 66 66 3333333 000 5 5 5 77 77 5 77 8888888888888888 1 5 000 33 555 0 5 77 5 5 4 33 0000 5 000 5 5 88 5 5 888 66 5 888 9999 5 9 2 66 888 888 5 66 5 5 66 5 5 5 66 5 5 77 5 5 3333 77 0 5 5 77 777 666666666 7777 1 77 77 77 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 6 5 5 000 5 5 33 5 5 5 77 5 5 5 1 1 5 5 5 5 5 77 11111 5 4444 0 5 00 5 5 5 5 1 5 77 1 5 77 5 5 5 1 5 22222222222222222222222222222222222222222 0 5 8888888 5 00 5 5 5 5 2222 55 555 555 0000000 0 3 77 000000000000000000 666 3 0 66 11 66 5 5 5 5 5 888 5 5 5 000 66 33333 3 00000000000000 66 66 5 5 5 5 0 88 11 5 66 5 5 5 3 5 5 5 66 66 0 2 5 5 0 2 5 11 5 2 5 5 5 5 11 5 66 5 5 5 0 5 5 77 44444 22222 77 999 1 5 1 66 1 77 777777 5 77 5 5 5 5 888 000 5 5 0000 5 5 88 5 5 5 66 4
lowQualScore : .. . . . .. . . ..... . . . ... . ..... . . ... .. . . . . .. . .. . ............. . . . .. . . . ... . .. .. ... ... .. . . ..... .. ... . .. ... . . .. . ...... . . ..... ...... .. .. . .... ... .. . .... . . .. .. . .... ....... . . ............................. . . . .. . ... . .. .... . . . . . ...... . .................. .. . ..... ...... ...... ........... . . . .... . ... . . . . ................. . . ....... ..... .. . .. . ..... . ..... ...... . .. .. ............... . ... . ... . ... . . ...... ... . . . .. ... . . ... .. ......... . . . . . ........ . . .. . . .. . .. .. .. .. . .. . . . ... . ... .. . .. .. .. . .......... .. . ... . .. . . . ....... . . . . ... . ....... .. .. ....... ... . . . .. .. . .. ................ . . ... .. ... . . .. . . . .. .... . ... . . .. . . ... .. . ... .... . . . .. ... ... . .. . . .. . . . .. . . .. . . .... .. . . . .. ... ......... .... . .. .. .. . . .. . . . . . . . . . . ... . . .. . . . .. . . . . . . . . . . .. ..... . .... . . .. . . . . . . .. . . .. . . . . . ......................................... . . ....... . .. . . . . .... .. ... ... ....... . . .. .................. ... . . .. .. .. . . . . . ... . . . ... .. ..... . .............. .. .. . . . . . .. .. . .. . . . . . . . .. .. . . . . . . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . . .. ..... ..... .. ... . . . .. . .. ...... . .. . . . . ... ... . . .... . . .. . . . .. .
lowQualScore : 99 0 0 0 55 0 0 00000 0 0 0 000 0 33333 0 0 000 55 0 0 0 0 55 0 55 0 0000000000000 0 0 0 55 0 0 0 222 0 00 00 444 333 00 6 6 88888 66 444 6 00 444 3 6 00 3 555555 6 6 11111 555555 99 66 6 7777 444 55 0 7777 4 4 11 66 0 9999 9999999 4 4 66666666666666666666666666666 4 4 4 66 9 111 4 11 4444 4 4 4 9 4 222222 4 666666666666666666 66 4 11111 333333 111111 99999999999 0 0 0 5555 0 111 4 4 4 8 44444444444444444 4 9 9999999 11111 11 4 66 0 11111 4 44444 333333 4 66 11 000000000000000 4 888 4 222 4 888 9 4 222222 222 9 3 4 22 888 9 4 333 11 888888888 4 4 0 0 0 44444444 0 0 99 4 0 99 0 99 99 99 99 0 99 0 0 0 888 0 888 99 0 99 99 55 0 9999999999 55 0 888 2 99 0 0 0 2222222 4 1 0 0 000 1 2222222 99 99 7777777 000 7 7 7 99 99 7 99 2222222222222222 4 7 000 77 777 1 7 99 7 7 3 44 0000 7 000 0 0 11 0 0 000 99 0 888 0000 0 4 5 99 888 888 0 99 0 0 99 0 0 0 99 0 7 99 7 7 0000 99 6 7 7 99 999 000000000 9999 0 99 99 99 7 7 99 7 7 7 7 7 7 7 3 7 7 000 7 7 66 7 7 7 99 7 7 7 0 4 7 7 7 7 7 99 33333 7 3333 7 7 77 7 7 7 7 4 7 99 7 7 99 7 7 7 4 7 66666666666666666666666666666666666666666 1 7 9999999 7 00 0 0 0 0 0000 99 444 111 4444444 5 2 55 999999999999999999 555 1 4 99 99 99 0 0 0 0 0 888 0 0 0 666 99 99999 2 55555555555555 99 99 0 0 0 0 0 22 99 0 99 0 0 0 1 0 0 0 99 99 0 2 0 0 0 0 0 00 0 4 0 0 6 0 99 0 99 0 0 0 6 7 7 99 77777 99999 99 444 4 7 4 77 7 99 333333 7 99 0 0 0 0 888 000 7 7 6666 0 0 22 0 0 0 11 4
consensus : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GANT--CTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-AC-AAA-TC-AA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAA-TTTA-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT----------TTTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
Reference ( family-1355 ) : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GANN--CTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGGAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-AC-AAA-TC-AA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAA-TTTA-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATTGG--------TTTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|1 : T--ATAGCG---GT-GACT-A-A-----AT-TA-C-ATT---C-GTTT----GCCAATCAA---TT--ACATT-TTC-AAA-TGAA--TGCT--A-A----AA--TCGT-T-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-ATTA-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CT--TTAT-T-GTC-----A--TA---A-GGCTA---CC-TT-TCAAAAC-TG------AATAAAT-G-----CTTG------GAATT-ATTTG-AT----GGTA---C--CC-TA---TTCG-TGGCCACAGAAG----ACCACTT-------CCCG-AA----TTTT---T------TT-TTTTTTTTACA-G-A-TG-TC-AAAC-AA---CA-TT--G-T-CA-T-CA-T-C-CGC----T-GAC-AGAATTT---C-ATTAGACGCCA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----ATTT---------AT-A-TGCCA----GAA-TAAA-AAG-TTATCAA--TC-TGGTT-------TCAGT-A-C-------AAAC----TG--A-A-TAAAAT-----C-TATTC---CATTG-A--A-C--AGAGACC---T----CC-----GCATCTTTCTGCATT-TT---GCCTC---CAACGT-ATC-----TTCG--ATGCAGTGAGGTACGATTCCA-ACG---TTTCA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTGCTGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAATCTTT-ACTTC-TTAT-CACATAG-TTAGT---TA--TTTAG--G-GACAACTTAAGA-C-G-CGAA---TTACTT---T--TCTA-TCTTTG--CGCACATTT-A----------TAC-CAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-TTAT-------TTTTA-GA-TGT--GTCT-------TTGATTACTA--AATAATTG----CCTTAA---CTTAT-A-TTG--CCTAG-TA--TATTT----T-T--G-A----AA-TGCAAAGTTA---GAATATTGGCACC--GACA-G---------------AGACGCAGTTTCCCGGTGC----AAC-AACGGCTAA-AA-ACTTT--CAAC-TCGGTA-GTCA--AATG-TTTTTTGA-T--T-T-ACA--TGAATA---TTG---TGGCTC--T--ATC-A--TAATTGT-ATTGCAACGTA--TA-TGAATATCT--T-AATAACGAAA-A--TA--GATCTAGCA-CACGTTTTTACATGGAATCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GATT--CTCTGC---TAAATTTC--GACGGAAAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-CATCTTT-GT-TGGCGGAAATTCCCTGCTT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGA-CATA--GA-CAGGATATTT-CA--TGCATATTT-ACAT-ACGGAATTG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACCAA----TTGT-TTTTTTA-AC-AAATTC-AA-GTATAA-A--CGGCATCATCGA--AAGGGGTG-A-AATCATCCA-G-CA--TA--TGTT-GAAATCAC---AA---GTT--ATA---ATTAG-TATT--GGTTTTCTAGCTGAT-TCA-CCTGGCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCTCAAGAAACTAGATATAATTTTTGACA-TTTCACA--GCATTG-AAA-TTTATAAT-ATCTGGA-GCTAAAAATTACGGAAAA--TCGA-CCA-GACGCA-TGCCTGGCGACTAC-TTGTTTCA--TGCAATGTTTGTA----TT--TTAT-----------TTTGG--AG--CTGCTT-ACT-TGTAGT-GCATTTCCAAAACG-ATTATCT--GCAACTTTA-TGGT-GGAACTGTGGTGTGTTTTG-ACA-GATGCTC--AACCAGCAA-TCTCACA-TAT-ATC-AACTATTGTTATTGAA-TTTTTTTT-GGAATA-TT-CATGGGTTGCAGGAAAGCAGGGGTGAG-TGTA-GAT--TAGCGCGGACTAATTATTG-CACA-TGTTACAACTTCTTAGGAATGTAT-ATTTCTTTTC--TTTTATT-ACACAAGC-AATTACTTATATTTTATATA--A---AGCTTTTG-TA--CTTCTTTGGTAGAAGTGTTCATAAACTTTTCTCA---A---AGCATTCTTCAAGGAGGGCCTA-AAAA-TTGAAA----TGCATGAGTCACCTTCATTGTACAT-GCACAATCCAATATGGCCGCTTTTA-GCAAC
gi|10 : ggt----TAAAAGTC--GACG--AAA--TTGCC-CGA--GTTATGTCT-C-TC-T--GT-TGG-GGGAAATTCCTG-TTTCAAG---CTTGACCACAGGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TTTCAAGTGCA-A-TA-AAATTATGTAA-TG-TT-T-ACA-TC--AT--TTAACC-A----TTTTGTTTTTTA-AC-AAA-TC-AA-GTAT-A-A--ATGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-ACT-A-CCA-G--A--TA--TG-AAGAAAT--C---A----------CA---A--GA-TA-T--GG-TTTCTAGT--AT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGT-AATAT-----A---TCT-AAAA---TAGAT-T-AT-----AC--TTTTACA-GGCA-----------------ACCTGAA-GCTAAAAAATA--GAAAAG-C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TT-CAT--GCAATG--TGTA----TTTATT--------------TTGG--AG--CTA-TT-A-T-GGTAGTTGTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGATTGAACT-TGTGGT-TTTTGAA-A-AA--CTC--AA-C-GCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTAATG-A-ATTTTTTT--GAATA-TT-CAT-G--TGCAGG-AAGCA-GGATGA--TGTA--AT--AAG-G-GGACTGA-cc
gi|11 : T-GCCCTT-AC-CTGC-AATATAATATA---TCT--AAAAA-TAGATAT-ATTT-----------ACA-GGC------------------ATCTGGA-TTT-AAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TA---GG-AACTACTTT-TTTCA--TGCAATG--TGTA----TTTATTA-------------TTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-AA--CTC--TA-CGGCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GTTTACAGGAAAGCA-GGATGA--TGTA-GAT--AAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAACC-AATTAC-TATATTTT-AA-A--A---G--TTTTG-TA--CTTT-TTGTCAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---
gi|12 : TTC----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-TAAA-A----------------G--T-------TTAAT-A-C-------AAACC----G--A-ATGAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCACTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATA-AGTAAAG-A-AATTCC--ACG---TT-CA-CATTTCC-T--GCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAT----G---CCAAAT-TTTAATTT--TTAT-CA--TAG-TTAATA--TA--CT--G--C-GACAGC--AAGA-C-G-CTAA---TTA-TG---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-ATACAATAAATTATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------ATTTG-GA-TGT--G-TT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--GATAT----ta
gi|13 : tggcag-A-AT-A--T-ATA-----TT-TT-C-ATT---C-ATTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TT-T--A-A----AC--T----T-A-CAAGGAAA-TAAT--ATTT-GAAG-TTAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTT----C--TTTT-T-GTC-C---AA-TA---A-G--TAGGTTC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----TTTG------GGATT-CT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--TCCGACGTGAAGTCATGTG------CC-G-AAAAAATTGT---C-----------------ACAAG-AATT-T--AAAC-AAA--CA-CT--GCT-CA-T-AA-T-T-CGT----A-AAG-AAA---T---CCGTTTG----CAC-TAA-T------C---T-TGGCGTT-C----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-at
gi|14 : atttggtagagtagataaaaaaaTTGGT--ATAATG-AAGT-A--T-A-T-----TT-TAAC-ATT---C-GGTT----GCCAA-CAA---TTT-ACATT-T-C-AAACTGAA--TG-T--AGA----AA--C----TTA-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-C-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--ACGGTCG----GCCATTT-------CC-G-AA--------AAAT------TG-TTT-----ACA-A-GACG-T--AAAC-AAG--CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAcc
gi|15 : at-A----AAGTG-AAAAT-A---GAAT-TTGGCAC---GGAA-TT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTT--CAAC-T-GGTA-A-CA--AATG-ATT---GA-T--T-T-ACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TGAATTT-ATTGCA-C-TT--TA-TGATTAC-T--T-AATAA-AATA-A--TA--AACATAGCA-CATGTTTTTACATGGA-TCTTA--AAAATTGC---GATT
gi|16 : tcTTGGT--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTGT----GC-AA-TAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--T--T--A-A----AAAGT----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CC--TTGT---GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-A-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---
gi|17 : at-AA-ACTTT--CAACAT-TGTA-G-CA--TATA-TGT---GGGTGAT-TTA-----GGATA---TTG---TGG-TCATTG-ATCTA--TTAATGT-ATTGCA-C-AA--TA-TGATTAT-TAAT-AATAT-GATA-AATTAGTGACTTAGCATCACGTTT
gi|18 : gTC-TTGGTGGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCGTACATGTAGTA-TCTT-AAAGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACgtttatagtacttttg
gi|19 : AG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACcc
gi|2 : TTGGT---TAGCG-A-GT-A--T-T-A-----CTATA-C-ATT---CCGTTT----GC-AA-CAA---TTTAACATT-TTC-AAA-TGAA--TG-T--G-AGGGAAA--C----T-AACAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAA-G-AT-A-G-CGCA--TTGGACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-A---AAATA---A-G--TA---CCCTT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GAATT-ATT-G-AT----GGTA---C--CCCTAG--T-CGGTGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----AATT---G------TT-TT------ACA-A-AATG-T--AAAC-AAATACA-TTTTG-T-GA-TTCA-TAT-CGTTTTTG-AAGGAGA---T---C-ATAAG----CAAATAAAT-----AC---G--GCCGTTCA----GTA----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-A-G-T-A-CAAA-TC-TG--T-------TCAGT-AAC-------AAAC----TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-T---CAT---GGGA-C--AAA--CCCG-T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TTT--GC-TC---CAAAGT-AT------TTC---A-G-TGTGAGG-A-GTTTCCA-AGC---TT-CA--ATTTCCAC-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGATCA-TTAT-TAC----GGCGCCAAAT-TTT-ACTT--T-AT-CA--TAG-TT-GTAAATA--TT--G--G-GA--AC--AAGAAC-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTGGGC--ACATTT-A----------TG--CAA-TTTAT---TGTT----ATATT-T-AT-------TATTA-GAGTAT--GTTT-------ATGATTA--A--A-TAATGT----CCTTAA---CTTATGA-T-G--C--AC-TAATTATGT----TAT--G-A----A-GTG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---GAAAAGT--TTGAGTAAAGAAGGACG-AGTTT--GGT-GCGA--AACAGACGG---A-AA-ACTTTTTCAAC-T-GGTA-G-C-----TT-TTT---GA-T--T-TTACG--TGA-TA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TAAATAATGATTAT-T--TTAATAA-GATA-AA-TA--GACTT-GCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTTGGAAAACTGC---GATTCTTCT---GAGT--CCCTGCCTGTAAAGTATAAGACG--AAAGGT-GCCGCGATGGTTATGT-TTC-TC-TTTGTATGG-GGAACGTGTCTG-TT--ATG---CTTGAGCAC-TGTCCGT-GAGAC-ATAA-GATCAGGATA-TT-AA--TGCA-A-TT-ACATTAGGTAA-TGGTT-T-AGACTCCAACTGA-AACC-A----TTGT-TTTTTTATAC-AAA-TC-AA-GTAT-ACA--CGGCATCCAC-A--AAGGGGTG-A-AAT-AACCAAG-CA--TGGTTGGT-GAAAT--CTGAAA---G-TTAGTA---ATTAG-TA-AAAG--CTTCTAGTTGATGTCAACCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATAGTGTCT-ATAA---TAGATAT-ATTT---ACAGTTTCACAAGGCATTGGAAA-TTTA-A-T-ATATGGA-GCTAAAAAATA--GAAAAAAC--A-CCAAGA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-GCCAATG--TGTA----TTTATTTTTGG--------T------AG--CTG-T--A-T-GGTAG--GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTAATGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-AAGA--CTC--AAACAGCAAATCTCA-AATAT-ATCGAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTTTGGAATATTT-CAT-GGTTGCAGAAAAGCA-GGGTGAATTGTACGAT--TAG-G-G-ACTAAATATTG-AGCAGTGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTTCTTTTTA-TGACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-TACA--A---G--TTTTGATAAACTTC-TTTGTAGAA-TGTT-A-AAAATTT-CTCA---A---ATCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTCAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAccc
gi|20 : CAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|3 : TTGGT--ATAGCG-A-GTTA--T-A-A-----TT-TA-C-ATTTTTC-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTTTGAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTCTC---A--TA---A-G--TA---CC-TTTC--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTT------GAATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CT-TGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTTTT---ACA-G-ATTG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-TACCGTTTC----AT-----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TA-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACT---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CA--GT-AT------TTC---AGG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTTC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGTG-A-TTAT-TAC----GA--CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACTTA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-AACGG---A-AA-ACTTTT-CAA--T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---TA-T--T-TTAGG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACTGAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---G-TTCTT------------TCTG-------AGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TTG-GGGAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ACAC-AGGTAA-TG-TTATAAGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAAA-TCAAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-ATAAT-A-TCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AAAATG-T--ATA---ATTAGATA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTTTA-AAT-ATCTGGACGCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-ATTG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TTCAATG--TTCAATTTTTTATTGTTAGTAGGGTGCTTTGGTTAGGACTT-TTAA-T-GGTAGT-GCATT---AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGGACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-GA--C-C--AA-CAGCAACTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATTGTAG-G-GGACTAA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAAATTACTTATATTTT-TATA--A------TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TTTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACATGGCA-AATCCAATATGGGCG--TTTAGGCAACcccttaatgtgca
gi|4 : T--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTT-----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AC--T----T-G-CTAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCC--T--GACAGT-GA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G---G---CC-TT-C--AAAG-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CT-TC---T-CG-TGG--ACA-ATG----GCCGTATGTAGAAGCC----A----TGTT---CGAAAAATG-TAA-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-CT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---C---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----AT-----------AT-A-TGC-A----AAA---AA-AAG-T-A-CGA--TT-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC----G--A-AA-AAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---------C-----G-ATCTCTGTG---T-TT---CC-TT---CAA-GT-AT------TTC---ATG-ATTGAGG-A-GATTCCA--CG---TT-CA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---GTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--AC-----A----------TATAAAA-TAATT---TGTTTC--A--TT-T-AT-------TTTTA-GA-TA-----TT-------GTGATTA--A--AATAATAT-----CTTAA---C--AT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--C-A----AAATG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---G-AA-GT--TTGAGTAAAAA-GGACG-AGTTTCCGG-TGC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTTC-AAAC-T-GCTA-A-CA--AATG-ATT---GA----T-TTACA--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--ATAATGT-ATTGCA-C-TA--TG-TGATTAC-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACATAACA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTA-AATTCTTCTTGAAAGT--CTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--A--ATAT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---C-TGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--A---A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAA-TC-AATTTAT-A-A--CGCCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-C-----------------------------------A---GTTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-AC-ATGC-AATATGATAT------T-GAAA-----------ATTT---AAA-TATC---------TG-GAG--TTA-AA-----------------AATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCA--TGCAATG--CGTA-----TTAT--------------TTTGG--AG--CTGTTT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TATAATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATAGTT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGGCTGA-TTTTG-CACA-TGTTACAACT--T--------------TTCT------TTTTA---ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTT--TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAATTTGAAGTTTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATAT-GCCG--TTTA-GCAAC
gi|5 : A--T--GACAGTTAG---TTTTT--TT--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---C--TT-C--GA-C-TG------A-TAAAA-G------TTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CC-T----T-CG-TGG--ACG--AG----GCCATTT-------CC-G-AAAAA-TTAA---------------------ACA-G-AATG-T--TAAC-AAA--CACTT--G-T-------A-T-T-CGT----A-AAG-AGA---T---T----------CA--TAA-T-----AT---A-CGGCGTT-C----TTT----------ATTA-TGA-A----GAA-TAAT---G-T-A-CAA--T--TG--T-------TCAGT-ATC-------AAA-----TG--A-AATAAA-T-----C-TAT-A---CAT------A-C--AAA--CC---T----CC-----C-ATC-CTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATGCAGTGAGGGA-GATTCCT-CGG---TT-CA-CATTTCC---AGCC---T---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAG-TT---CTT--TTCT-CA--TAG-TTG--A--TA--AT--G--G-GGCAAC--AAGA-C-G-CGAA---T-A-TT---TATTCTA-TCTTTG--C--A------G----------TGTAAAA-TATTC----GTT-C--AT-TT-T-AG-------TTT-A-GA-TGT--GTTT-------T-GATTG--A--AATAGT-------CTTGA----TTAT-AAT-G--C--AC-TA--TATAT----T-TTGA-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATTTTGGCAC---GAAA-GTAGTTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-AACAG---A-AACA----T-CAAC-TTGGTA-A-CA--AATG-TTT---GA-T--T-T-ACGGGTGAATA---T------GG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AA--A-GATA----TG--GAATAACCA-CACGTTTT-ACATGA---CTTT--AAA-CTGC---GATTCTTCC---GATGT-CTCTG----TAAAGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GG-AATTCCCTG-TT-TATGTTGCTTGACCAC-TGTCCGTTAGGGCCATATTGA-CAG-ATA-TT-GA--TGCA-A-TTTAAAT-AATTA--TG-TT-T-AGA--C--AG--A-AACC-A----TT---TTTTTTA--C-AAA-TC-AA-GTAT-A-AAACGGTATCA---A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GGCAATTA--TG-T-GAAAT--T---AAA--G-T--ATATAGATTAG-TA----G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTTTAC-CTGCCAATATGATATA---TCT-AAAAAACTAGATAT-ATTT---ACA-TTTTACA-GGCAT-G-AAA-TTTA-AATTATCTG-A-GCTAAAAA-TA--GAAAA--C--AACCA-GG-A-G-TA---TG-AACTAC-TT-TTTCAT--GCAATG--TGTA----TT----ATT-----------TTGG--AG--CTG-TT-A-TAGGTAGT-GCATT--CAAAACGAATTAT-T--GCAACTT-A-TGGA-TGAA---TGTGG-GTTTTT-A-A-AG--TTCTAAA-CAGCAATTCTCA-A-TATTATCCAACTATTGTTAT-G-A-TTTTTATT-TTAATATTTTCAT-GGT-GCAAGAAAGCA-GGGTGA--TATA-GAT--TAG-G-GAACTGA-TGT-G-CACA-TGTTACAACT--TTTTATATGT-TTA-TTCTTTTC--TTATA-T-ACACAA-C-A-TTAC--ATCTTTT-TACTTTATTTG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTTAGA-TGTG-T-AAACTTTTCGCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TAGAAAA-TTGAAG--TTTGAATGA--CA-TTTCATTGTACAT-GCA-AATCC---ATAGGCG--TTT--GCAACcc
gi|6 : aggaaaataaaataacatataatgaaagaaattaaatagacgacaa--ATAGTGGA-GT-A--A-A-AAAA--TT----C-ATT---C-GTTTT---GC-AA-CAA---TT--ACATTCT-CAAAA-TTAA--TG-T--A-AC---AA--CT---T-A-CAAG-AAA-TAATAACTTT-GAAGCT-AC-AGG-CGCAAGT--GACAGTTGAAGTATTTTAATCTGTTTT-T-GCC-C---A--CATC-ACG--TA---CCATT-C--AAAC-TGGTATTTA-TAAGACG-----CTTG------GGATA-AT--GTAT----GGTA---C--CC-cc
gi|6 : gg-AGA---T---C-AAAAA----CA--TAA-TTAAGAAC---GGCACCGCTTC----ATT----------AT-ACTGC-AACCTGAA-TAAA-AGT-T-A-CAAACTC-CG--TAAAAATCTTGGT-A-CATATTATAAAAC---TG--ATAATGAAGA-----T-TAT-ACTTCATTTCG--AGC--AAA--CCAAAT-------------ATATCTGTG---T-TT----C-CCTAGCAA-GTCATGATCCACTC---ATG-AGTGAGGAA-GATCCC--ATG---TT-CA-CATTT-C-C-AGCC--ATAGAAAACGGCT-TCGTG-TGAC-A--TATCTACACCTA---CCAATT-TTT-TCTT--TAAT-----TAGATAAGTG--TAACTT--G--GTGACAAC--TGGT-CAG-CGAAACGTTA-TTTGGT--TCAACTCTATG--CA-ACTTTTGA----------TAAACA---ATTT---TATTTC--AT-TTCT-AA-------T-----GA-TG---GTGT-------TTGATTT--ACGAACCACGTGATCCCATAAAATCTTAT-A-C-GCCC--AT-TA--AATATACGGC-T--GTATAATAAGTGTAAAGT-AGCGGAA-ATTGGCATCTAAAAA-GT--TTGAGTGCAAA-GGA-G-AGATT-AGCTTGCCACAAGC-GACAG---ACAG-AGATTC-TAAG-TGGGTATA-CAGGAATGCCTT---GA-T--GATTAGG--TATATATATTTGGCATGG-TC--CGTGTT-GTTTTAATGTGA--GCA-C-TA--TA-cgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacagatcaaaaacataattaagaacggcaccgcttcattatactgcaacctgaataaaagttacaaactccgtaaaaatcttggtacatattataaaactgataatgaagattatacttcatttcgagcaaaccaaatatatctgtgtttccctagcaagtcatgatccactcatgagtgaggaagatcccatgttcacatttccagccatagaaaacggcttcgtgtgacatatctacacctaccaattttttctttaattagataagtgtaacttggtgacaactggtcagcgaaacgttatttggttcaactctatgcaacttttgataaacaattttatttcatttctaatgatggtgtttgatttacgaaccacgtgatcccataaaatcttatacgcccattaaatatacggctgtataataagtgtaaagtagcggaaattggcatctaaaaagtttgagtgcaaaggagagattagcttgccacaagcgacagacagagattctaagtgggtatacaggaatgccttgatgattaggtatatatatttggcatggtccgtgttgttttaatgtgagcactataata
gi|7 : ggatagtggagtaaaaaaattcattcgttttgcaacaattacattctcaaaattaatgtaacaacttacaagaaataataactttgaagctacaggcgcaagtgacagttgaagtattttaatctgtttttgcccacatcacgtaccattcaaactggtatttataagacgcttgggataatgtatggtaccccgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTATAATTCTTCT---GAAAGTCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--ATTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAA-TC-AA-TTATAA-A--CGGCATCATC-AACAAGGGGTGAA-AAT-A-CCA-G---------------------C---AA---G-T---------TT---TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-ACATTGC-AA-ATGATAT------T-GAA------------ATTT---AAA-TATC--------TTG-GAG-TTAA-AA------------------ATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG--ACTAC-TT-TTTCATCTGCAA-G--CGTA-----TTAT--------------TTTGG--AG--CTGTTT-A-T--GTAGTAGCATTT-CAAAAC--ATTAT-TTAGC-ACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATG-TT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GG-CTGATTTTTGCCACA-TGTTACAA---------------------CTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACata
gi|8 : TTGGTTTATATTG-A-GTTA--TTA-C-----TT-TA-C-ATTT--C-GTT-----GC-AA-TAA---T---ACATT-T-C-AAA-TGGAATTG-T--A-A--------C----TTA-CAAGAAA--TG-T--CTTT-GA-G-T-AT-A-GGCGCA--T----------------TTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA----C-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-G-----CTT-------GGATT-TT--G-AT----GGTAGGTA--CC-TA---T-CG-TGG--ACGAGGG----GCCA-TT-------CC-G-AAAT--TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATGTT--AAACAAA---CA-TT--G---GATT-CATT-T-CGT----G-AAG-AGAAT-T---T-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--ACCG-TTC----ATT----------A--A-TGC-A----GAATTAAA-AAGTT-A-CAA--TC-T---T-------TCAGT-A-C-------CAACT---TG--A-A--AAATT-----CGTAT-A---CAT---G--A-CA-AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCAGTG---T-TTTGGGC-TC---CAA-GT-AG------TTC---ATG-AGTGAGA-G-TTTTCCA-ACG---TTCCA-CATTGTC-C-AGCC--AT---------CATTGGTG-TATT-ATTTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTTAATTATCCA--TAG-TTAGTA--TA--TT--GGTG-GACAAC--AAGA-C-GCCGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACA-TT-A----------TAT-CAATTGTTTTTGTGTTTCAGAT-TG-T-ATGGAATTCTTTTATGA-TGCTAGTTTATTTCAATTAATTA--A--Acccttaaacaatata
gi|9 : atAGCG-A-GT-A--T-A-AAATTCTT-TA-CCATT---CAGCTTACGTGC-AA-CAGCATTT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-TTAA-A----AA--CCACTT-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-GACGCA--T--GA-AGTTGA---GCTTT--TC--TTTTATAGTT-CGCGA--TATCCA-G---A---CC-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-GTTCTTCTCGTGACGAGGGTTAAT--G-ATTCCCACTA---CTTCC-TATTCT-TG-TGG--ACAGATGC---GCCATTT-------CC-GAAA----TTTT---T------TTATTT-----ACA-GAAATG-CTAAAACAAA---CA-TA--G-TCGA-T-CA-TATACGT----GCAAG-AGA---TGAGT-ACAAGTT--CG--CAA-T-----ACATTA-CGGCATTTCCGGAATTCTTGGATGTGAT-C-TGC-G----AAA-TAAATAAG-T-A-C-A--TCATGC-T-------TCCGTAA-CA------AAACCCAATGAAA-AATAAAATCATCAC-TAA-C---CAT---G--A-CTAAGA--CC---TAAGACCCACGAG-A-CTCTGTG---TAAT---GC-TC---CAA-GT--T------TTCGGGATG-AGTGA-G-A-GATTCCAGACGGGCTT-CACCATTTCC-CAAGACAAAT---------CA-TGG-G-TGcgta
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 2222222222222 1 111 111 111111 111111 1111 1111 1111111 66666666666666666666666666666 11 222 111111 111111111111111111 11 11111 222222 111111 22222222222 11111111111111111 1111111 11111 11111 11111 111111 11 222222222222222 111 111111 111 1 111 111111111 11111111 11 11 2222222222 1111111 111 1111111 1111111 111 1111111111111111 1 111 11 111 11 2222 111 11 1 2222 111 22222222 1111 111 11 1 11111 2222 11 1 1 77777777777777777777777777777777777777777 1111111 11 1111 222 1111111 333333333333333333 11 222 55555555555555555555555 11 1 1 11 1 1 11 1 11 1 11111 1 1 111111 111 1111
lowQualScore : 66 4 4 8 55 4 4 77777 4 4 4 111 8 33333 8 4 777 99 4 8 4 4 55 4 55 4 8888888888888 8 4 2 55 4 4 4 444 8 55 55 666 444 55 3 3 66666 88 111 3 55 666 7 3 55 7 000000 3 3 99999 000000 55 88 3 7777 666 55 4 6666 4 4 66 44 1 3333 8888888 4 4 00000000000000000000000000000 4 4 4 00 8 111 4 66 6666 4 4 4 8 4 000000 4 666666666666666666 00 4 11111 444444 333333 44444444444 4 4 4 8888 4 777 4 4 4 0 88888888888888888 4 8 8888888 77777 66 4 66 1 11111 4 11111 777777 4 00 66 222222222222222 4 777 4 222 4 777 8 4 777777 222 8 3 4 99 777 8 4 777 66 777777777 4 4 5 5 5 66666666 5 5 11 0 5 66 5 66 66 66 66 5 66 5 5 5 888 5 888 66 5 66 11 66 5 1111111111 88 5 888 3 66 5 5 5 6666666 0 0 5 5 222 0 6666666 66 66 3333333 000 5 5 5 77 77 5 77 8888888888888888 1 5 000 33 555 0 5 77 5 5 4 33 0000 5 000 5 5 88 5 5 888 66 5 888 9999 5 9 2 66 888 888 5 66 5 5 66 5 5 5 66 5 5 77 5 5 3333 77 0 5 5 77 777 22222222 7777 1 77 77 77 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 1 5 5 000 5 5 33 5 5 5 77 5 5 5 1 1 5 5 5 5 5 77 11111 5 4444 0 5 00 5 5 5 5 1 5 77 1 5 77 5 5 5 1 5 22222222222222222222222222222222222222222 0 5 8888888 5 00 5 5 5 5 2222 55 555 555 0000000 0 3 77 000000000000000000 666 3 0 66 11 66 5 5 5 5 5 888 5 5 5 000 66 99999999999999999999999 11 66 5 5 5 5 0 88 11 5 66 5 5 5 3 5 5 5 66 66 0 2 5 5 0 2 5 11 5 2 5 5 5 5 11 5 66 5 5 5 0 5 5 77 44444 22222 77 999 1 5 1 66 1 77 777777 5 77 5 5 5 5 888 000 5 5 0000 5 5 88 5 5 5 66 4
lowQualScore : .. . . . .. . . ..... . . . ... . ..... . . ... .. . . . . .. . .. . ............. . . . .. . . . ... . .. .. ... ... .. . . ..... .. ... . .. ... . . .. . ...... . . ..... ...... .. .. . .... ... .. . .... . . .. .. . .... ....... . . ............................. . . . .. . ... . .. .... . . . . . ...... . .................. .. . ..... ...... ...... ........... . . . .... . ... . . . . ................. . . ....... ..... .. . .. . ..... . ..... ...... . .. .. ............... . ... . ... . ... . . ...... ... . . . .. ... . . ... .. ......... . . . . . ........ . . .. . . .. . .. .. .. .. . .. . . . ... . ... .. . .. .. .. . .......... .. . ... . .. . . . ....... . . . . ... . ....... .. .. ....... ... . . . .. .. . .. ................ . . ... .. ... . . .. . . . .. .... . ... . . .. . . ... .. . ... .... . . . .. ... ... . .. . . .. . . . .. . . .. . . .... .. . . . .. ... ........ .... . .. .. .. . . .. . . . . . . . . . . ... . . .. . . . .. . . . . . . . . . . .. ..... . .... . . .. . . . . . . .. . . .. . . . . . ......................................... . . ....... . .. . . . . .... .. ... ... ....... . . .. .................. ... . . .. .. .. . . . . . ... . . . ... .. ....................... .. .. . . . . . .. .. . .. . . . . . . . .. .. . . . . . . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . . .. ..... ..... .. ... . . . .. . .. ...... . .. . . . . ... ... . . .... . . .. . . . .. .
lowQualScore : 99 0 0 0 55 0 0 00000 0 0 0 000 0 33333 0 0 000 55 0 0 0 0 55 0 55 0 0000000000000 0 0 0 55 0 0 0 222 0 00 00 444 333 00 6 6 88888 66 444 6 00 444 3 6 00 3 555555 6 6 11111 555555 99 66 6 7777 444 55 0 7777 4 4 11 66 0 9999 9999999 4 4 66666666666666666666666666666 4 4 4 66 9 111 4 11 4444 4 4 4 9 4 222222 4 666666666666666666 66 4 11111 333333 111111 99999999999 0 0 0 5555 0 111 4 4 4 8 44444444444444444 4 9 9999999 11111 11 4 66 0 11111 4 44444 333333 4 66 11 000000000000000 4 888 4 222 4 888 9 4 222222 222 9 3 4 22 888 9 4 333 11 888888888 4 4 0 0 0 44444444 0 0 99 4 0 99 0 99 99 99 99 0 99 0 0 0 888 0 888 99 0 99 99 55 0 9999999999 55 0 888 2 99 0 0 0 2222222 4 1 0 0 000 1 2222222 99 99 7777777 000 7 7 7 99 99 7 99 2222222222222222 4 7 000 77 777 1 7 99 7 7 3 44 0000 7 000 0 0 11 0 0 000 99 0 888 0000 0 4 5 99 888 888 0 99 0 0 99 0 0 0 99 0 7 99 7 7 0000 99 6 7 7 99 999 77777777 9999 0 99 99 99 7 7 99 7 7 7 7 7 7 7 4 7 7 000 7 7 66 7 7 7 99 7 7 7 0 4 7 7 7 7 7 99 33333 7 3333 7 7 77 7 7 7 7 4 7 99 7 7 99 7 7 7 4 7 66666666666666666666666666666666666666666 1 7 9999999 7 00 0 0 0 0 0000 99 444 111 4444444 5 2 55 999999999999999999 555 1 4 99 99 99 0 0 0 0 0 888 0 0 0 666 99 66666666666666666666666 99 99 0 0 0 0 0 22 99 0 99 0 0 0 1 0 0 0 99 99 0 2 0 0 0 0 0 00 0 4 0 0 6 0 99 0 99 0 0 0 6 7 7 99 77777 99999 99 444 4 7 4 77 7 99 333333 7 99 0 0 0 0 888 000 7 7 6666 0 0 22 0 0 0 11 4
consensus : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAN--TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-AC-AAA-TC-AA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAA-TTTA-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTA-T----------TTTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
Reference ( family-1355 ) : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAN--TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-AC-AAA-TC-AA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAA-TTTA-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT----------TTTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|1 : T--ATAGCG---GT-GACT-A-A-----AT-TA-C-ATT---C-GTTT----GCCAATCAA---TT--ACATT-TTC-AAA-TGAA--TGCT--A-A----AA--TCGT-T-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-ATTA-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CT--TTAT-T-GTC-----A--TA---A-GGCTA---CC-TT-TCAAAAC-TG------AATAAAT-G-----CTTG------GAATT-ATTTG-AT----GGTA---C--CC-TA---TTCG-TGGCCACAGAAG----ACCACTT-------CCCG-AA----TTTT---T------TT-TTTTTTTTACA-G-A-TG-TC-AAAC-AA---CA-TT--G-T-CA-T-CA-T-C-CGC----T-GAC-AGAATTT---C-ATTAGACGCCA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----ATTT---------AT-A-TGCCA----GAA-TAAA-AAG-TTATCAA--TC-TGGTT-------TCAGT-A-C-------AAAC----TG--A-A-TAAAAT-----C-TATTC---CATTG-A--A-C--AGAGACC---T----CC-----GCATCTTTCTGCATT-TT---GCCTC---CAACGT-ATC-----TTCG--ATGCAGTGAGGTACGATTCCA-ACG---TTTCA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTGCTGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAATCTTT-ACTTC-TTAT-CACATAG-TTAGT---TA--TTTAG--G-GACAACTTAAGA-C-G-CGAA---TTACTT---T--TCTA-TCTTTG--CGCACATTT-A----------TAC-CAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-TTAT-------TTTTA-GA-TGT--GTCT-------TTGATTACTA--AATAATTG----CCTTAA---CTTAT-A-TTG--CCTAG-TA--TATTT----T-T--G-A----AA-TGCAAAGTTA---GAATATTGGCACC--GACA-G---------------AGACGCAGTTTCCCGGTGC----AAC-AACGGCTAA-AA-ACTTT--CAAC-TCGGTA-GTCA--AATG-TTTTTTGA-T--T-T-ACA--TGAATA---TTG---TGGCTC--T--ATC-A--TAATTGT-ATTGCAACGTA--TA-TGAATATCT--T-AATAACGAAA-A--TA--GATCTAGCA-CACGTTTTTACATGGAATCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAT--TCTCTGC---TAAATTTC--GACGGAAAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-CATCTTT-GT-TGGCGGAAATTCCCTGCTT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGA-CATA--GA-CAGGATATTT-CA--TGCATATTT-ACAT-ACGGAATTG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACCAA----TTGT-TTTTTTA-AC-AAATTC-AA-GTATAA-A--CGGCATCATCGA--AAGGGGTG-A-AATCATCCA-G-CA--TA--TGTT-GAAATCAC---AA---GTT--ATA---ATTAG-TATT--GGTTTTCTAGCTGAT-TCA-CCTGGCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCTCAAGAAACTAGATATAATTTTTGACA-TTTCACA--GCATTG-AAA-TTTATAAT-ATCTGGA-GCTAAAAATTACGGAAAA--TCGA-CCA-GACGCA-TGCCTGGCGACTAC-TTGTTTCA--TGCAATGTTTGTA----TT--TTA-T----------TTTGG--AG--CTGCTT-ACT-TGTAGT-GCATTTCCAAAACG-ATTATCT--GCAACTTTA-TGGT-GGAACTGTGGTGTGTTTTG-ACA-GATGCTC--AACCAGCAA-TCTCACA-TAT-ATC-AACTATTGTTATTGAA-TTTTTTTT-GGAATA-TT-CATGGGTTGCAGGAAAGCAGGGGTGAG-TGTA-GAT--TAGCGCGGACTAATTATTG-CACA-TGTTACAACTTCTTAGGAATGTAT-ATTTCTTTTC--TTTTATT-ACACAAGC-AATTACTTATATTTTATATA--A---AGCTTTTG-TA--CTTCTTTGGTAGAAGTGTTCATAAACTTTTCTCA---A---AGCATTCTTCAAGGAGGGCCTA-AAAA-TTGAAA----TGCATGAGTCACCTTCATTGTACAT-GCACAATCCAATATGGCCGCTTTTA-GCAAC
gi|10 : ggt----TAAAAGTC--GACG--AAA--TTGCC-CGA--GTTATGTCT-C-TC-T--GT-TGG-GGGAAATTCCTG-TTTCAAG---CTTGACCACAGGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TTTCAAGTGCA-A-TA-AAATTATGTAA-TG-TT-T-ACA-TC--AT--TTAACC-A----TTTTGTTTTTTA-AC-AAA-TC-AA-GTAT-A-A--ATGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-ACT-A-CCA-G--A--TA--TG-AAGAAAT--C---A----------CA---A--GA-TA-T--GG-TTTCTAGT--AT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGT-AATAT-----A---TCT-AAAA---TAGAT-T-AT-----AC--TTTTACA-GGCA-----------------ACCTGAA-GCTAAAAAATA--GAAAAG-C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TT-CAT--GCAATG--TGTA----TTTATT--------------TTGG--AG--CTA-TT-A-T-GGTAGTTGTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGATTGAACT-TGTGGT-TTTTGAA-A-AA--CTC--AA-C-GCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTAATG-A-ATTTTTTT--GAATA-TT-CAT-G--TGCAGG-AAGCA-GGATGA--TGTA--AT--AAG-G-GGACTGA-cc
gi|11 : T-GCCCTT-AC-CTGC-AATATAATATA---TCT--AAAAA-TAGATAT-ATTT-----------ACA-GGC------------------ATCTGGA-TTT-AAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TA---GG-AACTACTTT-TTTCA--TGCAATG--TGTA----TTTATTA-------------TTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-AA--CTC--TA-CGGCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GTTTACAGGAAAGCA-GGATGA--TGTA-GAT--AAG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAACC-AATTAC-TATATTTT-AA-A--A---G--TTTTG-TA--CTTT-TTGTCAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---
gi|12 : TTC----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-TAAA-A----------------G--T-------TTAAT-A-C-------AAACC----G--A-ATGAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCACTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATA-AGTAAAG-A-AATTCC--ACG---TT-CA-CATTTCC-T--GCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAT----G---CCAAAT-TTTAATTT--TTAT-CA--TAG-TTAATA--TA--CT--G--C-GACAGC--AAGA-C-G-CTAA---TTA-TG---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-ATACAATAAATTATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------ATTTG-GA-TGT--G-TT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--AC-TA--GATAT----ta
gi|13 : tggcag-A-AT-A--T-ATA-----TT-TT-C-ATT---C-ATTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TT-T--A-A----AC--T----T-A-CAAGGAAA-TAAT--ATTT-GAAG-TTAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTT----C--TTTT-T-GTC-C---AA-TA---A-G--TAGGTTC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----TTTG------GGATT-CT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--TCCGACGTGAAGTCATGTG------CC-G-AAAAAATTGT---C-----------------ACAAG-AATT-T--AAAC-AAA--CA-CT--GCT-CA-T-AA-T-T-CGT----A-AAG-AAA---T---CCGTTTG----CAC-TAA-T------C---T-TGGCGTT-C----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-at
gi|14 : atttggtagagtagataaaaaaaTTGGT--ATAATG-AAGT-A--T-A-T-----TT-TAAC-ATT---C-GGTT----GCCAA-CAA---TTT-ACATT-T-C-AAACTGAA--TG-T--AGA----AA--C----TTA-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-C-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--ACGGTCG----GCCATTT-------CC-G-AA--------AAAT------TG-TTT-----ACA-A-GACG-T--AAAC-AAG--CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAcc
gi|15 : at-A----AAGTG-AAAAT-A---GAAT-TTGGCAC---GGAA-TT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTT--CAAC-T-GGTA-A-CA--AATG-ATT---GA-T--T-T-ACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TGAATTT-ATTGCA-C-TT--TA-TGATTAC-T--T-AATAA-AATA-A--TA--AACATAGCA-CATGTTTTTACATGGA-TCTTA--AAAATTGC---GATT
gi|16 : tcTTGGT--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTGT----GC-AA-TAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--T--T--A-A----AAAGT----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CC--TTGT---GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-A-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---
gi|17 : at-AA-ACTTT--CAACAT-TGTA-G-CA--TATA-TGT---GGGTGAT-TTA-----GGATA---TTG---TGG-TCATTG-ATCTA--TTAATGT-ATTGCA-C-AA--TA-TGATTAT-TAAT-AATAT-GATA-AATTAGTGACTTAGCATCACGTTT
gi|18 : gTC-TTGGTGGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCGTACATGTAGTA-TCTT-AAAGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACgtttatagtacttttg
gi|19 : AG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACcc
gi|2 : TTGGT---TAGCG-A-GT-A--T-T-A-----CTATA-C-ATT---CCGTTT----GC-AA-CAA---TTTAACATT-TTC-AAA-TGAA--TG-T--G-AGGGAAA--C----T-AACAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAA-G-AT-A-G-CGCA--TTGGACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-A---AAATA---A-G--TA---CCCTT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GAATT-ATT-G-AT----GGTA---C--CCCTAG--T-CGGTGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----AATT---G------TT-TT------ACA-A-AATG-T--AAAC-AAATACA-TTTTG-T-GA-TTCA-TAT-CGTTTTTG-AAGGAGA---T---C-ATAAG----CAAATAAAT-----AC---G--GCCGTTCA----GTA----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-A-G-T-A-CAAA-TC-TG--T-------TCAGT-AAC-------AAAC----TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-T---CAT---GGGA-C--AAA--CCCG-T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TTT--GC-TC---CAAAGT-AT------TTC---A-G-TGTGAGG-A-GTTTCCA-AGC---TT-CA--ATTTCCAC-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGATCA-TTAT-TAC----GGCGCCAAAT-TTT-ACTT--T-AT-CA--TAG-TT-GTAAATA--TT--G--G-GA--AC--AAGAAC-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTGGGC--ACATTT-A----------TG--CAA-TTTAT---TGTT----ATATT-T-AT-------TATTA-GAGTAT--GTTT-------ATGATTA--A--A-TAATGT----CCTTAA---CTTATGA-T-G--C--AC-TAATTATGT----TAT--G-A----A-GTG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---GAAAAGT--TTGAGTAAAGAAGGACG-AGTTT--GGT-GCGA--AACAGACGG---A-AA-ACTTTTTCAAC-T-GGTA-G-C-----TT-TTT---GA-T--T-TTACG--TGA-TA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TAAATAATGATTAT-T--TTAATAA-GATA-AA-TA--GACTT-GCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTTGGAAAACTGC---GATTCTTCT---GAG--TCCCTGCCTGTAAAGTATAAGACG--AAAGGT-GCCGCGATGGTTATGT-TTC-TC-TTTGTATGG-GGAACGTGTCTG-TT--ATG---CTTGAGCAC-TGTCCGT-GAGAC-ATAA-GATCAGGATA-TT-AA--TGCA-A-TT-ACATTAGGTAA-TGGTT-T-AGACTCCAACTGA-AACC-A----TTGT-TTTTTTATAC-AAA-TC-AA-GTAT-ACA--CGGCATCCAC-A--AAGGGGTG-A-AAT-AACCAAG-CA--TGGTTGGT-GAAAT--CTGAAA---G-TTAGTA---ATTAG-TA-AAAG--CTTCTAGTTGATGTCAACCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATAGTGTCT-ATAA---TAGATAT-ATTT---ACAGTTTCACAAGGCATTGGAAA-TTTA-A-T-ATATGGA-GCTAAAAAATA--GAAAAAAC--A-CCAAGA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-GCCAATG--TGTA----TTTATT-------------TTTGGT-AG--CTG-T--A-T-GGTAG--GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTAATGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-AAGA--CTC--AAACAGCAAATCTCA-AATAT-ATCGAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTTTGGAATATTT-CAT-GGTTGCAGAAAAGCA-GGGTGAATTGTACGAT--TAG-G-G-ACTAAATATTG-AGCAGTGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTTCTTTTTA-TGACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-TACA--A---G--TTTTGATAAACTTC-TTTGTAGAA-TGTT-A-AAAATTT-CTCA---A---ATCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTCAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAccc
gi|20 : CAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|3 : TTGGT--ATAGCG-A-GTTA--T-A-A-----TT-TA-C-ATTTTTC-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTTTGAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTCTC---A--TA---A-G--TA---CC-TTTC--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTT------GAATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CT-TGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTTTT---ACA-G-ATTG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-TACCGTTTC----AT-----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TA-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACT---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CA--GT-AT------TTC---AGG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTTC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGTG-A-TTAT-TAC----GA--CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACTTA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-AACGG---A-AA-ACTTTT-CAA--T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---TA-T--T-TTAGG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACTGAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---G-TTCTT------------TCTG-------AGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TTG-GGGAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ACAC-AGGTAA-TG-TTATAAGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAAA-TCAAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-ATAAT-A-TCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AAAATG-T--ATA---ATTAGATA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTTTA-AAT-ATCTGGACGCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-ATTG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TTCAATG--TTCAATTTTTTATTGTTAGTAGGGTGCTTTGGTTAGGACTT-TTAA-T-GGTAGT-GCATT---AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGGACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-GA--C-C--AA-CAGCAACTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATTGTAG-G-GGACTAA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAAATTACTTATATTTT-TATA--A------TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TTTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACATGGCA-AATCCAATATGGGCG--TTTAGGCAACcccttaatgtgca
gi|4 : T--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTT-----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AC--T----T-G-CTAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCC--T--GACAGT-GA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G---G---CC-TT-C--AAAG-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CT-TC---T-CG-TGG--ACA-ATG----GCCGTATGTAGAAGCC----A----TGTT---CGAAAAATG-TAA-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-CT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---C---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----AT-----------AT-A-TGC-A----AAA---AA-AAG-T-A-CGA--TT-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC----G--A-AA-AAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---------C-----G-ATCTCTGTG---T-TT---CC-TT---CAA-GT-AT------TTC---ATG-ATTGAGG-A-GATTCCA--CG---TT-CA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---GTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--AC-----A----------TATAAAA-TAATT---TGTTTC--A--TT-T-AT-------TTTTA-GA-TA-----TT-------GTGATTA--A--AATAATAT-----CTTAA---C--AT-A-T-G--C--AC-TA--TATAT----T-T--C-A----AAATG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---G-AA-GT--TTGAGTAAAAA-GGACG-AGTTTCCGG-TGC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTTC-AAAC-T-GCTA-A-CA--AATG-ATT---GA----T-TTACA--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--ATAATGT-ATTGCA-C-TA--TG-TGATTAC-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACATAACA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTA-AATTCTTCTTGAAAG--TCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--A--ATAT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---C-TGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--A---A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAA-TC-AATTTAT-A-A--CGCCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-C-----------------------------------A---GTTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-AC-ATGC-AATATGATAT------T-GAAA-----------ATTT---AAA-TATC---------TG-GAG--TTA-AA-----------------AATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG-AACTAC-TT-TTTCA--TGCAATG--CGTA-----TTA----T----------TTTGG--AG--CTGTTT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TATAATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATAGTT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GGGCTGA-TTTTG-CACA-TGTTACAACT--T--------------TTCT------TTTTA---ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTT--TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAATTTGAAGTTTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATAT-GCCG--TTTA-GCAAC
gi|5 : A--T--GACAGTTAG---TTTTT--TT--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---C--TT-C--GA-C-TG------A-TAAAA-G------TTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CC-T----T-CG-TGG--ACG--AG----GCCATTT-------CC-G-AAAAA-TTAA---------------------ACA-G-AATG-T--TAAC-AAA--CACTT--G-T-------A-T-T-CGT----A-AAG-AGA---T---T----------CA--TAA-T-----AT---A-CGGCGTT-C----TTT----------ATTA-TGA-A----GAA-TAAT---G-T-A-CAA--T--TG--T-------TCAGT-ATC-------AAA-----TG--A-AATAAA-T-----C-TAT-A---CAT------A-C--AAA--CC---T----CC-----C-ATC-CTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATGCAGTGAGGGA-GATTCCT-CGG---TT-CA-CATTTCC---AGCC---T---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAG-TT---CTT--TTCT-CA--TAG-TTG--A--TA--AT--G--G-GGCAAC--AAGA-C-G-CGAA---T-A-TT---TATTCTA-TCTTTG--C--A------G----------TGTAAAA-TATTC----GTT-C--AT-TT-T-AG-------TTT-A-GA-TGT--GTTT-------T-GATTG--A--AATAGT-------CTTGA----TTAT-AAT-G--C--AC-TA--TATAT----T-TTGA-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATTTTGGCAC---GAAA-GTAGTTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-AACAG---A-AACA----T-CAAC-TTGGTA-A-CA--AATG-TTT---GA-T--T-T-ACGGGTGAATA---T------GG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AA--A-GATA----TG--GAATAACCA-CACGTTTT-ACATGA---CTTT--AAA-CTGC---GATTCTTCC---GATG-TCTCTG----TAAAGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAA-TTCCCTG-TT-TATGTTGCTTGACCAC-TGTCCGTTAGGGCCATATTGA-CAG-ATA-TT-GA--TGCA-A-TTTAAAT-AATTA--TG-TT-T-AGA--C--AG--A-AACC-A----TT---TTTTTTA--C-AAA-TC-AA-GTAT-A-AAACGGTATCA---A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GGCAATTA--TG-T-GAAAT--T---AAA--G-T--ATATAGATTAG-TA----G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTTTAC-CTGCCAATATGATATA---TCT-AAAAAACTAGATAT-ATTT---ACA-TTTTACA-GGCAT-G-AAA-TTTA-AATTATCTG-A-GCTAAAAA-TA--GAAAA--C--AACCA-GG-A-G-TA---TG-AACTAC-TT-TTTCAT--GCAATG--TGTA----TT----ATT----------TT-GG--AG--CTG-TT-A-TAGGTAGT-GCATT--CAAAACGAATTAT-T--GCAACTT-A-TGGA-TGAA---TGTGG-GTTTTT-A-A-AG--TTCTAAA-CAGCAATTCTCA-A-TATTATCCAACTATTGTTAT-G-A-TTTTTATT-TTAATATTTTCAT-GGT-GCAAGAAAGCA-GGGTGA--TATA-GAT--TAG-G-GAACTGA-TGT-G-CACA-TGTTACAACT--TTTTATATGT-TTA-TTCTTTTC--TTATA-T-ACACAA-C-A-TTAC--ATCTTTT-TACTTTATTTG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTTAGA-TGTG-T-AAACTTTTCGCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TAGAAAA-TTGAAG--TTTGAATGA--CA-TTTCATTGTACAT-GCA-AATCC---ATAGGCG--TTT--GCAACcc
gi|6 : aggaaaataaaataacatataatgaaagaaattaaatagacgacaa--ATAGTGGA-GT-A--A-A-AAAA--TT----C-ATT---C-GTTTT---GC-AA-CAA---TT--ACATTCT-CAAAA-TTAA--TG-T--A-AC---AA--CT---T-A-CAAG-AAA-TAATAACTTT-GAAGCT-AC-AGG-CGCAAGT--GACAGTTGAAGTATTTTAATCTGTTTT-T-GCC-C---A--CATC-ACG--TA---CCATT-C--AAAC-TGGTATTTA-TAAGACG-----CTTG------GGATA-AT--GTAT----GGTA---C--CC-cc
gi|6 : gg-AGA---T---C-AAAAA----CA--TAA-TTAAGAAC---GGCACCGCTTC----ATT----------AT-ACTGC-AACCTGAA-TAAA-AGT-T-A-CAAACTC-CG--TAAAAATCTTGGT-A-CATATTATAAAAC---TG--ATAATGAAGA-----T-TAT-ACTTCATTTCG--AGC--AAA--CCAAAT-------------ATATCTGTG---T-TT----C-CCTAGCAA-GTCATGATCCACTC---ATG-AGTGAGGAA-GATCCC--ATG---TT-CA-CATTT-C-C-AGCC--ATAGAAAACGGCT-TCGTG-TGAC-A--TATCTACACCTA---CCAATT-TTT-TCTT--TAAT-----TAGATAAGTG--TAACTT--G--GTGACAAC--TGGT-CAG-CGAAACGTTA-TTTGGT--TCAACTCTATG--CA-ACTTTTGA----------TAAACA---ATTT---TATTTC--AT-TTCT-AA-------T-----GA-TG---GTGT-------TTGATTT--ACGAACCACGTGATCCCATAAAATCTTAT-A-C-GCCC--AT-TA--AATATACGGC-T--GTATAATAAGTGTAAAGT-AGCGGAA-ATTGGCATCTAAAAA-GT--TTGAGTGCAAA-GGA-G-AGATT-AGCTTGCCACAAGC-GACAG---ACAG-AGATTC-TAAG-TGGGTATA-CAGGAATGCCTT---GA-T--GATTAGG--TATATATATTTGGCATGG-TC--CGTGTT-GTTTTAATGTGA--GCA-C-TA--TA-cgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacagatcaaaaacataattaagaacggcaccgcttcattatactgcaacctgaataaaagttacaaactccgtaaaaatcttggtacatattataaaactgataatgaagattatacttcatttcgagcaaaccaaatatatctgtgtttccctagcaagtcatgatccactcatgagtgaggaagatcccatgttcacatttccagccatagaaaacggcttcgtgtgacatatctacacctaccaattttttctttaattagataagtgtaacttggtgacaactggtcagcgaaacgttatttggttcaactctatgcaacttttgataaacaattttatttcatttctaatgatggtgtttgatttacgaaccacgtgatcccataaaatcttatacgcccattaaatatacggctgtataataagtgtaaagtagcggaaattggcatctaaaaagtttgagtgcaaaggagagattagcttgccacaagcgacagacagagattctaagtgggtatacaggaatgccttgatgattaggtatatatatttggcatggtccgtgttgttttaatgtgagcactataata
gi|7 : ggatagtggagtaaaaaaattcattcgttttgcaacaattacattctcaaaattaatgtaacaacttacaagaaataataactttgaagctacaggcgcaagtgacagttgaagtattttaatctgtttttgcccacatcacgtaccattcaaactggtatttataagacgcttgggataatgtatggtaccccgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTATAATTCTTCT---GAAAGTCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--ATTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-T-AGA-TC--AC--A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--AC-AAA-TC-AA-TTATAA-A--CGGCATCATC-AACAAGGGGTGAA-AAT-A-CCA-G---------------------C---AA---G-T---------TT---TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-ACATTGC-AA-ATGATAT------T-GAA------------ATTT---AAA-TATC--------TTG-GAG-TTAA-AA------------------ATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-A-TG---GG--ACTAC-TT-TTTCATCTGCAA-G--CGTA-----TTA----T----------TTTGG--AG--CTGTTT-A-T--GTAGTAGCATTT-CAAAAC--ATTAT-TTAGC-ACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATG-TT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GAT--TAG-G-GG-CTGATTTTTGCCACA-TGTTACAA---------------------CTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-C-AATTAC-TATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACata
gi|8 : TTGGTTTATATTG-A-GTTA--TTA-C-----TT-TA-C-ATTT--C-GTT-----GC-AA-TAA---T---ACATT-T-C-AAA-TGGAATTG-T--A-A--------C----TTA-CAAGAAA--TG-T--CTTT-GA-G-T-AT-A-GGCGCA--T----------------TTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA----C-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-G-----CTT-------GGATT-TT--G-AT----GGTAGGTA--CC-TA---T-CG-TGG--ACGAGGG----GCCA-TT-------CC-G-AAAT--TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATGTT--AAACAAA---CA-TT--G---GATT-CATT-T-CGT----G-AAG-AGAAT-T---T-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--ACCG-TTC----ATT----------A--A-TGC-A----GAATTAAA-AAGTT-A-CAA--TC-T---T-------TCAGT-A-C-------CAACT---TG--A-A--AAATT-----CGTAT-A---CAT---G--A-CA-AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCAGTG---T-TTTGGGC-TC---CAA-GT-AG------TTC---ATG-AGTGAGA-G-TTTTCCA-ACG---TTCCA-CATTGTC-C-AGCC--AT---------CATTGGTG-TATT-ATTTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTTAATTATCCA--TAG-TTAGTA--TA--TT--GGTG-GACAAC--AAGA-C-GCCGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACA-TT-A----------TAT-CAATTGTTTTTGTGTTTCAGAT-TG-T-ATGGAATTCTTTTATGA-TGCTAGTTTATTTCAATTAATTA--A--Acccttaaacaatata
gi|9 : atAGCG-A-GT-A--T-A-AAATTCTT-TA-CCATT---CAGCTTACGTGC-AA-CAGCATTT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-TTAA-A----AA--CCACTT-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-GACGCA--T--GA-AGTTGA---GCTTT--TC--TTTTATAGTT-CGCGA--TATCCA-G---A---CC-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-GTTCTTCTCGTGACGAGGGTTAAT--G-ATTCCCACTA---CTTCC-TATTCT-TG-TGG--ACAGATGC---GCCATTT-------CC-GAAA----TTTT---T------TTATTT-----ACA-GAAATG-CTAAAACAAA---CA-TA--G-TCGA-T-CA-TATACGT----GCAAG-AGA---TGAGT-ACAAGTT--CG--CAA-T-----ACATTA-CGGCATTTCCGGAATTCTTGGATGTGAT-C-TGC-G----AAA-TAAATAAG-T-A-C-A--TCATGC-T-------TCCGTAA-CA------AAACCCAATGAAA-AATAAAATCATCAC-TAA-C---CAT---G--A-CTAAGA--CC---TAAGACCCACGAG-A-CTCTGTG---TAAT---GC-TC---CAA-GT--T------TTCGGGATG-AGTGA-G-A-GATTCCAGACGGGCTT-CACCATTTCC-CAAGACAAAT---------CA-TGG-G-TGcgta
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 2222222222222 1 111 111 111111 111111 1111 1111 1111111 66666666666666666666666666666 11 222 111111 111111111111111111 11 11111 222222 111111 22222222222 11111111111111111 1111111 11111 11111 11111 111111 11 222222222222222 111 111111 111 1 111 111111111 11111111 11 11 2222222222 1111111 111 1111111 1111111 111 1111111111111111 1 111 11 111 11 2222 111 11 1 2222 111 22222222 1111 111 11 1 11111 2222 11 1 1 1 1 77777777777777777777777777777777777777777 1111111 11 1111 222 1111111 333333333333333333 11 222 111111 22222222222222 11 1 1 1 11 1 1 11 1 11 1 11111 1 111111 111 1111
lowQualScore : 66 4 4 8 55 4 4 77777 4 4 4 111 8 33333 8 4 777 99 4 8 4 4 55 4 55 4 8888888888888 8 4 2 55 4 4 4 444 8 55 55 666 444 55 3 3 66666 88 111 3 55 666 7 3 55 7 000000 3 3 99999 000000 55 88 3 7777 666 55 4 6666 4 4 66 44 1 3333 8888888 4 4 00000000000000000000000000000 4 4 4 00 8 111 4 66 6666 4 4 4 8 4 000000 4 666666666666666666 00 4 11111 444444 333333 44444444444 4 4 4 8888 4 777 4 4 4 0 88888888888888888 4 8 8888888 77777 66 4 66 1 11111 4 11111 777777 4 00 66 222222222222222 4 777 4 222 4 777 8 4 777777 222 8 3 4 99 777 8 4 777 66 777777777 4 4 5 5 5 66666666 5 5 11 0 5 66 5 66 66 66 66 5 66 5 5 5 888 5 888 66 5 66 11 66 5 1111111111 88 5 888 3 66 5 5 5 6666666 0 0 5 5 222 0 6666666 66 66 3333333 000 5 5 5 77 77 5 77 8888888888888888 1 5 000 33 555 0 5 77 5 5 4 33 0000 5 000 5 5 88 5 5 888 66 5 888 9999 5 9 2 66 888 888 5 66 5 5 66 5 5 5 66 5 5 77 5 5 3333 77 0 5 5 77 777 22222222 7777 1 77 77 77 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 1 5 5 000 5 5 33 5 5 5 77 5 5 5 1 1 5 5 5 5 5 77 11111 5 4444 0 5 00 1 1 1 5 77 1 5 77 5 5 5 1 5 22222222222222222222222222222222222222222 0 5 8888888 5 00 5 5 5 5 2222 55 555 555 0000000 0 3 77 000000000000000000 666 3 0 66 11 66 5 5 5 5 5 888 5 5 5 000 66 222222 3 99999999999999 11 66 5 0 5 0 88 11 5 66 5 5 5 3 5 5 5 66 66 0 2 5 5 0 2 5 11 5 2 5 5 5 5 11 5 66 5 5 5 0 5 5 77 44444 22222 77 999 1 5 999 66 1 77 777777 5 77 5 5 5 5 888 000 5 5 0000 5 5 88 5 5 5 66 4
lowQualScore : .. . . . .. . . ..... . . . ... . ..... . . ... .. . . . . .. . .. . ............. . . . .. . . . ... . .. .. ... ... .. . . ..... .. ... . .. ... . . .. . ...... . . ..... ...... .. .. . .... ... .. . .... . . .. .. . .... ....... . . ............................. . . . .. . ... . .. .... . . . . . ...... . .................. .. . ..... ...... ...... ........... . . . .... . ... . . . . ................. . . ....... ..... .. . .. . ..... . ..... ...... . .. .. ............... . ... . ... . ... . . ...... ... . . . .. ... . . ... .. ......... . . . . . ........ . . .. . . .. . .. .. .. .. . .. . . . ... . ... .. . .. .. .. . .......... .. . ... . .. . . . ....... . . . . ... . ....... .. .. ....... ... . . . .. .. . .. ................ . . ... .. ... . . .. . . . .. .... . ... . . .. . . ... .. . ... .... . . . .. ... ... . .. . . .. . . . .. . . .. . . .... .. . . . .. ... ........ .... . .. .. .. . . .. . . . . . . . . . . ... . . .. . . . .. . . . . . . . . . . .. ..... . .... . . .. . . . . .. . . .. . . . . . ......................................... . . ....... . .. . . . . .... .. ... ... ....... . . .. .................. ... . . .. .. .. . . . . . ... . . . ... .. ...... . .............. .. .. . . . . .. .. . .. . . . . . . . .. .. . . . . . . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . . .. ..... ..... .. ... . . ... .. . .. ...... . .. . . . . ... ... . . .... . . .. . . . .. .
lowQualScore : 99 0 0 0 55 0 0 00000 0 0 0 000 0 33333 0 0 000 55 0 0 0 0 55 0 55 0 0000000000000 0 0 0 55 0 0 0 222 0 00 00 444 333 00 6 6 88888 66 444 6 00 444 3 6 00 3 555555 6 6 11111 555555 99 66 6 7777 444 55 0 7777 4 4 11 66 0 9999 9999999 4 4 66666666666666666666666666666 4 4 4 66 9 111 4 11 4444 4 4 4 9 4 222222 4 666666666666666666 66 4 11111 333333 111111 99999999999 0 0 0 5555 0 111 4 4 4 8 44444444444444444 4 9 9999999 11111 11 4 66 0 11111 4 44444 333333 4 66 11 000000000000000 4 888 4 222 4 888 9 4 222222 222 9 3 4 22 888 9 4 333 11 888888888 4 4 0 0 0 44444444 0 0 99 4 0 99 0 99 99 99 99 0 99 0 0 0 888 0 888 99 0 99 99 55 0 9999999999 55 0 888 2 99 0 0 0 2222222 4 1 0 0 000 1 2222222 99 99 7777777 000 7 7 7 99 99 7 99 2222222222222222 4 7 000 77 777 1 7 99 7 7 3 44 0000 7 000 0 0 11 0 0 000 99 0 888 0000 0 4 5 99 888 888 0 99 0 0 99 0 0 0 99 0 7 99 7 7 0000 99 6 7 7 99 999 77777777 9999 0 99 99 99 7 7 99 7 7 7 7 7 7 7 4 7 7 000 7 7 66 7 7 7 99 7 7 7 0 4 7 7 7 7 7 99 33333 7 3333 7 7 77 4 4 4 7 99 7 7 99 7 7 7 4 7 66666666666666666666666666666666666666666 1 7 9999999 7 00 0 0 0 0 0000 99 444 111 4444444 5 2 55 999999999999999999 555 1 4 99 99 99 0 0 0 0 0 888 0 0 0 666 99 888888 2 00000000000000 99 99 0 0 0 0 22 99 0 99 0 0 0 1 0 0 0 99 99 0 2 0 0 0 0 0 00 0 4 0 0 6 0 99 0 99 0 0 0 6 7 7 99 77777 99999 99 444 4 7 444 77 7 99 333333 7 99 0 0 0 0 888 000 7 7 6666 0 0 22 0 0 0 11 4
consensus : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAN--TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTT-A-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
Reference ( family-1355 ) : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAN--TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTT-A-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|1 : T--ATAGCG---GT-GACT-A-A-----AT-TA-C-ATT---C-GTTT----GCCAATCAA---TT--ACATT-TTC-AAA-TGAA--TGCT--A-A----AA--TCGT-T-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-ATTA-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CT--TTAT-T-GTC-----A--TA---A-GGCTA---CC-TT-TCAAAAC-TG------AATAAAT-G-----CTTG------GAATT-ATTTG-AT----GGTA---C--CC-TA---TTCG-TGGCCACAGAAG----ACCACTT-------CCCG-AA----TTTT---T------TT-TTTTTTTTACA-G-A-TG-TC-AAAC-AA---CA-TT--G-T-CA-T-CA-T-C-CGC----T-GAC-AGAATTT---C-ATTAGACGCCA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----ATTT---------AT-A-TGCCA----GAA-TAAA-AAG-TTATCAA--TC-TGGTT-------TCAGT-A-C-------AAAC----TG--A-A-TAAAAT-----C-TATTC---CATTG-A--A-C--AGAGACC---T----CC-----GCATCTTTCTGCATT-TT---GCCTC---CAACGT-ATC-----TTCG--ATGCAGTGAGGTACGATTCCA-ACG---TTTCA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTGCTGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAATCTTT-ACTTC-TTAT-CACATAG-TTAGT---TA--TTTAG--G-GACAACTTAAGA-C-G-CGAA---TTACTT---T--TCTA-TCTTTG--CGCACATTT-A----------TAC-CAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-TTAT-------TTTTA-GA-TGT--GTCT-------TTGATTACTA--AATAATTG----CCTTAA---CTTAT-A-TTG--CCTAGT-A--TATTT----T-T--G-A----AA-TGCAAAGTTA---GAATATTGGCACC--GACA-G---------------AGACGCAGTTTCCCGGTGC----AAC-AACGGCTAA-AA-ACTTT--CAAC-TCGGTA-GTCA--AATG-TTTTTTGA-T--T-T-ACA--TGAATA---TTG---TGGCTC--T--ATC-A--TAATTGT-ATTGCAACGTA--TA-TGAATATCT--T-AATAACGAAA-A--TA--GATCTAGCA-CACGTTTTTACATGGAATCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAT--TCTCTGC---TAAATTTC--GACGGAAAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-CATCTTT-GT-TGGCGGAAATTCCCTGCTT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGA-CATA--GA-CAGGATATTT-CA--TGCATATTT-ACAT-ACGGAATTG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACCAA----TTGT-TTTTTTA-ACAAATTCAA-GTATAA-A--CGGCATCATCGA--AAGGGGTG-A-AATCATCCA-G-CA--TA--TGTT-GAAATCAC---AA---GTT--ATA---ATTAG-TATT--GGTTTTCTAGCTGAT-TCA-CCTGGCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCTCAAGAAACTAGATATAATTTTTGACA-TTTCACA--GCATTG-AAATTT-ATAAT-ATCTGGA-GCTAAAAATTACGGAAAA--TCGA-CCA-GACGCAT-GCCTGGCGACTAC-TTGTTTCA--TGCAATGTTTGTA----TT--TTATT-----------TTGG--AG--CTGCTTACT-TGTAGT-GCATTTCCAAAACG-ATTATCT--GCAACTTTA-TGGT-GGAACTGTGGTGTGTTTTG-ACA-GATGCTC--AACCAGCAA-TCTCACA-TAT-ATC-AACTATTGTTATTGAA-TTTTTTTT-GGAATA-TT-CATGGGTTGCAGGAAAGCAGGGGTGAG-TGTA-GATT--AGCGCGGACTAATTATTG-CACA-TGTTACAACTTCTTAGGAATGTAT-ATTTCTTTTC--TTTTATT-ACACAAGCAA-TTACTT-ATATTTTATATA--A---AGCTTTTG-TA--CTTCTTTGGTAGAAGTGTTCATAAACTTTTCTCA---A---AGCATTCTTCAAGGAGGGCCTA-AAAA-TTGAAA----TGCATGAGTCACCTTCATTGTACAT-GCACAATCCAATATGGCCGCTTTTA-GCAAC
gi|10 : ggt----TAAAAGTC--GACG--AAA--TTGCC-CGA--GTTATGTCT-C-TC-T--GT-TGG-GGGAAATTCCTG-TTTCAAG---CTTGACCACAGGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TTTCAAGTGCA-A-TA-AAATTATGTAA-TG-TT-TA-CA-TC--AT--TTAACC-A----TTTTGTTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--ATGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-ACT-A-CCA-G--A--TA--TG-AAGAAAT--C---A----------CA---A--GA-TA-T--GG-TTTCTAGT--AT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGT-AATAT-----A---TCT-AAAA---TAGAT-T-AT-----AC--TTTTACA-GGCA-----------------ACCTGAA-GCTAAAAAATA--GAAAAG-C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TT-CAT--GCAATG--TGTA----TTTATT--------------TTGG--AG--CTA-TTA-T-GGTAGTTGTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGATTGAACT-TGTGGT-TTTTGAA-A-AA--CTC--AA-C-GCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTAATG-A-ATTTTTTT--GAATA-TT-CAT-G--TGCAGG-AAGCA-GGATGA--TGTA--ATA--AG-G-GGACTGA-cc
gi|11 : T-GCCCTT-AC-CTGC-AATATAATATA---TCT--AAAAA-TAGATAT-ATTT-----------ACA-GGC------------------ATCTGGA-TTT-AAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-A---GG-AACTACTTT-TTTCA--TGCAATG--TGTA----TTTATTA-------------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-AA--CTC--TA-CGGCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GTTTACAGGAAAGCA-GGATGA--TGTA-GATA--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAACCAA-TTAC-T-ATATTTT-AA-A--A---G--TTTTG-TA--CTTT-TTGTCAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---
gi|12 : TTC----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-TAAA-A----------------G--T-------TTAAT-A-C-------AAACC----G--A-ATGAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCACTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATA-AGTAAAG-A-AATTCC--ACG---TT-CA-CATTTCC-T--GCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAT----G---CCAAAT-TTTAATTT--TTAT-CA--TAG-TTAATA--TA--CT--G--C-GACAGC--AAGA-C-G-CTAA---TTA-TG---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-ATACAATAAATTATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------ATTTG-GA-TGT--G-TT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--GATAT----ta
gi|13 : tggcag-A-AT-A--T-ATA-----TT-TT-C-ATT---C-ATTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TT-T--A-A----AC--T----T-A-CAAGGAAA-TAAT--ATTT-GAAG-TTAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTT----C--TTTT-T-GTC-C---AA-TA---A-G--TAGGTTC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----TTTG------GGATT-CT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--TCCGACGTGAAGTCATGTG------CC-G-AAAAAATTGT---C-----------------ACAAG-AATT-T--AAAC-AAA--CA-CT--GCT-CA-T-AA-T-T-CGT----A-AAG-AAA---T---CCGTTTG----CAC-TAA-T------C---T-TGGCGTT-C----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-at
gi|14 : atttggtagagtagataaaaaaaTTGGT--ATAATG-AAGT-A--T-A-T-----TT-TAAC-ATT---C-GGTT----GCCAA-CAA---TTT-ACATT-T-C-AAACTGAA--TG-T--AGA----AA--C----TTA-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-C-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--ACGGTCG----GCCATTT-------CC-G-AA--------AAAT------TG-TTT-----ACA-A-GACG-T--AAAC-AAG--CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAcc
gi|15 : at-A----AAGTG-AAAAT-A---GAAT-TTGGCAC---GGAA-TT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTT--CAAC-T-GGTA-A-CA--AATG-ATT---GA-T--T-T-ACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TGAATTT-ATTGCA-C-TT--TA-TGATTAC-T--T-AATAA-AATA-A--TA--AACATAGCA-CATGTTTTTACATGGA-TCTTA--AAAATTGC---GATT
gi|16 : tcTTGGT--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTGT----GC-AA-TAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--T--T--A-A----AAAGT----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CC--TTGT---GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-A-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---
gi|17 : at-AA-ACTTT--CAACAT-TGTA-G-CA--TATA-TGT---GGGTGAT-TTA-----GGATA---TTG---TGG-TCATTG-ATCTA--TTAATGT-ATTGCA-C-AA--TA-TGATTAT-TAAT-AATAT-GATA-AATTAGTGACTTAGCATCACGTTT
gi|18 : gTC-TTGGTGGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCGTACATGTAGTA-TCTT-AAAGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACgtttatagtacttttg
gi|19 : AG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACcc
gi|2 : TTGGT---TAGCG-A-GT-A--T-T-A-----CTATA-C-ATT---CCGTTT----GC-AA-CAA---TTTAACATT-TTC-AAA-TGAA--TG-T--G-AGGGAAA--C----T-AACAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAA-G-AT-A-G-CGCA--TTGGACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-A---AAATA---A-G--TA---CCCTT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GAATT-ATT-G-AT----GGTA---C--CCCTAG--T-CGGTGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----AATT---G------TT-TT------ACA-A-AATG-T--AAAC-AAATACA-TTTTG-T-GA-TTCA-TAT-CGTTTTTG-AAGGAGA---T---C-ATAAG----CAAATAAAT-----AC---G--GCCGTTCA----GTA----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-A-G-T-A-CAAA-TC-TG--T-------TCAGT-AAC-------AAAC----TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-T---CAT---GGGA-C--AAA--CCCG-T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TTT--GC-TC---CAAAGT-AT------TTC---A-G-TGTGAGG-A-GTTTCCA-AGC---TT-CA--ATTTCCAC-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGATCA-TTAT-TAC----GGCGCCAAAT-TTT-ACTT--T-AT-CA--TAG-TT-GTAAATA--TT--G--G-GA--AC--AAGAAC-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTGGGC--ACATTT-A----------TG--CAA-TTTAT---TGTT----ATATT-T-AT-------TATTA-GAGTAT--GTTT-------ATGATTA--A--A-TAATGT----CCTTAA---CTTATGA-T-G--C--ACT-AATTATGT----TAT--G-A----A-GTG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---GAAAAGT--TTGAGTAAAGAAGGACG-AGTTT--GGT-GCGA--AACAGACGG---A-AA-ACTTTTTCAAC-T-GGTA-G-C-----TT-TTT---GA-T--T-TTACG--TGA-TA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TAAATAATGATTAT-T--TTAATAA-GATA-AA-TA--GACTT-GCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTTGGAAAACTGC---GATTCTTCT---GAG--TCCCTGCCTGTAAAGTATAAGACG--AAAGGT-GCCGCGATGGTTATGT-TTC-TC-TTTGTATGG-GGAACGTGTCTG-TT--ATG---CTTGAGCAC-TGTCCGT-GAGAC-ATAA-GATCAGGATA-TT-AA--TGCA-A-TT-ACATTAGGTAA-TGGTT-TA-GACTCCAACTGA-AACC-A----TTGT-TTTTTTATACAAA-TCAA-GTAT-ACA--CGGCATCCAC-A--AAGGGGTG-A-AAT-AACCAAG-CA--TGGTTGGT-GAAAT--CTGAAA---G-TTAGTA---ATTAG-TA-AAAG--CTTCTAGTTGATGTCAACCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATAGTGTCT-ATAA---TAGATAT-ATTT---ACAGTTTCACAAGGCATTGGAAATTT-A-A-T-ATATGGA-GCTAAAAAATA--GAAAAAAC--A-CCAAGA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-GCCAATG--TGTA----TTTATT--T-----------TTGGT-AG--CTG-T-A-T-GGTAG--GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTAATGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-AAGA--CTC--AAACAGCAAATCTCA-AATAT-ATCGAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTTTGGAATATTT-CAT-GGTTGCAGAAAAGCA-GGGTGAATTGTACGATT--AG-G-G-ACTAAATATTG-AGCAGTGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTTCTTTTTA-TGACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-TACA--A---G--TTTTGATAAACTTC-TTTGTAGAA-TGTT-A-AAAATTT-CTCA---A---ATCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTCAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAccc
gi|20 : CAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|3 : TTGGT--ATAGCG-A-GTTA--T-A-A-----TT-TA-C-ATTTTTC-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTTTGAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTCTC---A--TA---A-G--TA---CC-TTTC--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTT------GAATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CT-TGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTTTT---ACA-G-ATTG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-TACCGTTTC----AT-----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TA-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACT---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CA--GT-AT------TTC---AGG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTTC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGTG-A-TTAT-TAC----GA--CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACTTA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-AACGG---A-AA-ACTTTT-CAA--T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---TA-T--T-TTAGG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACTGAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---G-TTCTT------------TCTG-------AGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TTG-GGGAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ACAC-AGGTAA-TG-TTATAAGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAAATCAAAGTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-ATAAT-A-TCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AAAATG-T--ATA---ATTAGATA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTTTA-AAT-ATCTGGACGCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-ATTG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TTCAATG--TTCAATTTTTTATTGTTAGTAGGGTGCTTTGGTTAGGACTT-TTAAT-GGTAGT-GCATT---AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGGACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-GA--C-C--AA-CAGCAACTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATTGTAG-G-GGACTAA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAAATTAC-TTATATTTT-TATA--A------TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TTTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACATGGCA-AATCCAATATGGGCG--TTTAGGCAACcccttaatgtgca
gi|4 : T--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTT-----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AC--T----T-G-CTAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCC--T--GACAGT-GA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G---G---CC-TT-C--AAAG-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CT-TC---T-CG-TGG--ACA-ATG----GCCGTATGTAGAAGCC----A----TGTT---CGAAAAATG-TAA-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-CT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---C---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----AT-----------AT-A-TGC-A----AAA---AA-AAG-T-A-CGA--TT-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC----G--A-AA-AAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---------C-----G-ATCTCTGTG---T-TT---CC-TT---CAA-GT-AT------TTC---ATG-ATTGAGG-A-GATTCCA--CG---TT-CA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---GTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--AC-----A----------TATAAAA-TAATT---TGTTTC--A--TT-T-AT-------TTTTA-GA-TA-----TT-------GTGATTA--A--AATAATAT-----CTTAA---C--AT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--C-A----AAATG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---G-AA-GT--TTGAGTAAAAA-GGACG-AGTTTCCGG-TGC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTTC-AAAC-T-GCTA-A-CA--AATG-ATT---GA----T-TTACA--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--ATAATGT-ATTGCA-C-TA--TG-TGATTAC-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACATAACA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTA-AATTCTTCTTGAAAG--TCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--A--ATAT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---C-TGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--A---A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--ACAAA-TCAATTTAT-A-A--CGCCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-C-----------------------------------A---GTTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-AC-ATGC-AATATGATAT------T-GAAA-----------ATTT---AAA-TATC---------TG-GAG-TT-A-AA-----------------AATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCA--TGCAATG--CG--------TATTATT-----------TTGG--AG--CTGTTTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TATAATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATAGTT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGGCTGA-TTTTG-CACA-TGTTACAACT--T--------------TTCT------TTTTA---ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTT--TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAATTTGAAGTTTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATAT-GCCG--TTTA-GCAAC
gi|5 : A--T--GACAGTTAG---TTTTT--TT--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---C--TT-C--GA-C-TG------A-TAAAA-G------TTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CC-T----T-CG-TGG--ACG--AG----GCCATTT-------CC-G-AAAAA-TTAA---------------------ACA-G-AATG-T--TAAC-AAA--CACTT--G-T-------A-T-T-CGT----A-AAG-AGA---T---T----------CA--TAA-T-----AT---A-CGGCGTT-C----TTT----------ATTA-TGA-A----GAA-TAAT---G-T-A-CAA--T--TG--T-------TCAGT-ATC-------AAA-----TG--A-AATAAA-T-----C-TAT-A---CAT------A-C--AAA--CC---T----CC-----C-ATC-CTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATGCAGTGAGGGA-GATTCCT-CGG---TT-CA-CATTTCC---AGCC---T---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAG-TT---CTT--TTCT-CA--TAG-TTG--A--TA--AT--G--G-GGCAAC--AAGA-C-G-CGAA---T-A-TT---TATTCTA-TCTTTG--C--A------G----------TGTAAAA-TATTC----GTT-C--AT-TT-T-AG-------TTT-A-GA-TGT--GTTT-------T-GATTG--A--AATAGT-------CTTGA----TTAT-AAT-G--C--ACT-A--TATAT----T-TTGA-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATTTTGGCAC---GAAA-GTAGTTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-AACAG---A-AACA----T-CAAC-TTGGTA-A-CA--AATG-TTT---GA-T--T-T-ACGGGTGAATA---T------GG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AA--A-GATA----TG--GAATAACCA-CACGTTTT-ACATGA---CTTT--AAA-CTGC---GATTCTTCC---GATG-TCTCTG----TAAAGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAA-TTCCCTG-TT-TATGTTGCTTGACCAC-TGTCCGTTAGGGCCATATTGA-CAG-ATA-TT-GA--TGCA-A-TTTAAAT-AATTA--TG-TT-TA-GA--C--AG--A-AACC-A----TT---TTTTTTA--CAAA-TCAA-GTAT-A-AAACGGTATCA---A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GGCAATTA--TG-T-GAAAT--T---AAA--G-T--ATATAGATTAG-TA----G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTTTAC-CTGCCAATATGATATA---TCT-AAAAAACTAGATAT-ATTT---ACA-TTTTACA-GGCAT-G-AAATTT-A-AATTATCTG-A-GCTAAAAA-TA--GAAAA--C--AACCA-GG-A-GT-A---TG-AACTAC-TT-TTTCAT--GCAATG--TGTA----TT----ATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-TAGGTAGT-GCATT--CAAAACGAATTAT-T--GCAACTT-A-TGGA-TGAA---TGTGG-GTTTTT-A-A-AG--TTCTAAA-CAGCAATTCTCA-A-TATTATCCAACTATTGTTAT-G-A-TTTTTATT-TTAATATTTTCAT-GGT-GCAAGAAAGCA-GGGTGA--TATA-GATT--AG-G-GAACTGA-TGT-G-CACA-TGTTACAACT--TTTTATATGT-TTA-TTCTTTTC--TTATA-T-ACACAA-CA--TTAC---ATCTTTT-TACTTTATTTG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTTAGA-TGTG-T-AAACTTTTCGCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TAGAAAA-TTGAAG--TTTGAATGA--CA-TTTCATTGTACAT-GCA-AATCC---ATAGGCG--TTT--GCAACcc
gi|6 : aggaaaataaaataacatataatgaaagaaattaaatagacgacaa--ATAGTGGA-GT-A--A-A-AAAA--TT----C-ATT---C-GTTTT---GC-AA-CAA---TT--ACATTCT-CAAAA-TTAA--TG-T--A-AC---AA--CT---T-A-CAAG-AAA-TAATAACTTT-GAAGCT-AC-AGG-CGCAAGT--GACAGTTGAAGTATTTTAATCTGTTTT-T-GCC-C---A--CATC-ACG--TA---CCATT-C--AAAC-TGGTATTTA-TAAGACG-----CTTG------GGATA-AT--GTAT----GGTA---C--CC-cc
gi|6 : gg-AGA---T---C-AAAAA----CA--TAA-TTAAGAAC---GGCACCGCTTC----ATT----------AT-ACTGC-AACCTGAA-TAAA-AGT-T-A-CAAACTC-CG--TAAAAATCTTGGT-A-CATATTATAAAAC---TG--ATAATGAAGA-----T-TAT-ACTTCATTTCG--AGC--AAA--CCAAAT-------------ATATCTGTG---T-TT----C-CCTAGCAA-GTCATGATCCACTC---ATG-AGTGAGGAA-GATCCC--ATG---TT-CA-CATTT-C-C-AGCC--ATAGAAAACGGCT-TCGTG-TGAC-A--TATCTACACCTA---CCAATT-TTT-TCTT--TAAT-----TAGATAAGTG--TAACTT--G--GTGACAAC--TGGT-CAG-CGAAACGTTA-TTTGGT--TCAACTCTATG--CA-ACTTTTGA----------TAAACA---ATTT---TATTTC--AT-TTCT-AA-------T-----GA-TG---GTGT-------TTGATTT--ACGAACCACGTGATCCCATAAAATCTTAT-A-C-GCCC--ATT-A--AATATACGGC-T--GTATAATAAGTGTAAAGT-AGCGGAA-ATTGGCATCTAAAAA-GT--TTGAGTGCAAA-GGA-G-AGATT-AGCTTGCCACAAGC-GACAG---ACAG-AGATTC-TAAG-TGGGTATA-CAGGAATGCCTT---GA-T--GATTAGG--TATATATATTTGGCATGG-TC--CGTGTT-GTTTTAATGTGA--GCA-C-TA--TA-cgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacagatcaaaaacataattaagaacggcaccgcttcattatactgcaacctgaataaaagttacaaactccgtaaaaatcttggtacatattataaaactgataatgaagattatacttcatttcgagcaaaccaaatatatctgtgtttccctagcaagtcatgatccactcatgagtgaggaagatcccatgttcacatttccagccatagaaaacggcttcgtgtgacatatctacacctaccaattttttctttaattagataagtgtaacttggtgacaactggtcagcgaaacgttatttggttcaactctatgcaacttttgataaacaattttatttcatttctaatgatggtgtttgatttacgaaccacgtgatcccataaaatcttatacgcccattaaatatacggctgtataataagtgtaaagtagcggaaattggcatctaaaaagtttgagtgcaaaggagagattagcttgccacaagcgacagacagagattctaagtgggtatacaggaatgccttgatgattaggtatatatatttggcatggtccgtgttgttttaatgtgagcactataata
gi|7 : ggatagtggagtaaaaaaattcattcgttttgcaacaattacattctcaaaattaatgtaacaacttacaagaaataataactttgaagctacaggcgcaagtgacagttgaagtattttaatctgtttttgcccacatcacgtaccattcaaactggtatttataagacgcttgggataatgtatggtaccccgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTATAATTCTTCT---GAAAGTCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--ATTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--ACAAA-TCAA-TTATAA-A--CGGCATCATC-AACAAGGGGTGAA-AAT-A-CCA-G---------------------C---AA---G-T---------TT---TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-ACATTGC-AA-ATGATAT------T-GAA------------ATTT---AAA-TATC--------TTG-GAGTTA-A-AA------------------ATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG--ACTAC-TT-TTTCATCTGCAA-G--CG--------TATTATT-----------TTGG--AG--CTGTTTA-T--GTAGTAGCATTT-CAAAAC--ATTAT-TTAGC-ACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATG-TT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GG-CTGATTTTTGCCACA-TGTTACAA---------------------CTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACata
gi|8 : TTGGTTTATATTG-A-GTTA--TTA-C-----TT-TA-C-ATTT--C-GTT-----GC-AA-TAA---T---ACATT-T-C-AAA-TGGAATTG-T--A-A--------C----TTA-CAAGAAA--TG-T--CTTT-GA-G-T-AT-A-GGCGCA--T----------------TTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA----C-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-G-----CTT-------GGATT-TT--G-AT----GGTAGGTA--CC-TA---T-CG-TGG--ACGAGGG----GCCA-TT-------CC-G-AAAT--TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATGTT--AAACAAA---CA-TT--G---GATT-CATT-T-CGT----G-AAG-AGAAT-T---T-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--ACCG-TTC----ATT----------A--A-TGC-A----GAATTAAA-AAGTT-A-CAA--TC-T---T-------TCAGT-A-C-------CAACT---TG--A-A--AAATT-----CGTAT-A---CAT---G--A-CA-AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCAGTG---T-TTTGGGC-TC---CAA-GT-AG------TTC---ATG-AGTGAGA-G-TTTTCCA-ACG---TTCCA-CATTGTC-C-AGCC--AT---------CATTGGTG-TATT-ATTTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTTAATTATCCA--TAG-TTAGTA--TA--TT--GGTG-GACAAC--AAGA-C-GCCGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACA-TT-A----------TAT-CAATTGTTTTTGTGTTTCAGAT-TG-T-ATGGAATTCTTTTATGA-TGCTAGTTTATTTCAATTAATTA--A--Acccttaaacaatata
gi|9 : atAGCG-A-GT-A--T-A-AAATTCTT-TA-CCATT---CAGCTTACGTGC-AA-CAGCATTT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-TTAA-A----AA--CCACTT-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-GACGCA--T--GA-AGTTGA---GCTTT--TC--TTTTATAGTT-CGCGA--TATCCA-G---A---CC-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-GTTCTTCTCGTGACGAGGGTTAAT--G-ATTCCCACTA---CTTCC-TATTCT-TG-TGG--ACAGATGC---GCCATTT-------CC-GAAA----TTTT---T------TTATTT-----ACA-GAAATG-CTAAAACAAA---CA-TA--G-TCGA-T-CA-TATACGT----GCAAG-AGA---TGAGT-ACAAGTT--CG--CAA-T-----ACATTA-CGGCATTTCCGGAATTCTTGGATGTGAT-C-TGC-G----AAA-TAAATAAG-T-A-C-A--TCATGC-T-------TCCGTAA-CA------AAACCCAATGAAA-AATAAAATCATCAC-TAA-C---CAT---G--A-CTAAGA--CC---TAAGACCCACGAG-A-CTCTGTG---TAAT---GC-TC---CAA-GT--T------TTCGGGATG-AGTGA-G-A-GATTCCAGACGGGCTT-CACCATTTCC-CAAGACAAAT---------CA-TGG-G-TGcgta
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 2222222222222 1 111 111 111111 111111 1111 1111 1111111 66666666666666666666666666666 11 222 111111 111111111111111111 11 11111 222222 111111 22222222222 11111111111111111 1111111 11111 11111 11111 111111 11 222222222222222 111 111111 111 1 111 111111111 11111111 11 11 2222222222 1111111 111 1111111 1111111 111 1111111111111111 1 111 11 111 11 2222 111 11 1 2222 111 22222222 1111 111 11 1 11111 2222 11 1 1 1 1 77777777777777777777777777777777777777777 1111111 11 1111 222 1111111 333333333333333333 11 222 111111 22222222222222 11 1 1 1 11 1 1 11 1 11 1 11111 1 111111 111 1111
lowQualScore : 66 4 4 8 55 4 4 77777 4 4 4 111 8 33333 8 4 777 99 4 8 4 4 55 4 55 4 8888888888888 8 4 2 55 4 4 4 444 8 55 55 666 444 55 3 3 66666 88 111 3 55 666 7 3 55 7 000000 3 3 99999 000000 55 88 3 7777 666 55 4 6666 4 4 66 44 1 3333 8888888 4 4 00000000000000000000000000000 4 4 4 00 8 111 4 66 6666 4 4 4 8 4 000000 4 666666666666666666 00 4 11111 444444 333333 44444444444 4 4 4 8888 4 777 4 4 4 0 88888888888888888 4 8 8888888 77777 66 4 66 1 11111 4 11111 777777 4 00 66 222222222222222 4 777 4 222 4 777 8 4 777777 222 8 3 4 99 777 8 4 777 66 777777777 4 4 5 5 5 66666666 5 5 11 0 5 66 5 66 66 66 66 5 66 5 5 5 888 5 888 66 5 66 11 66 5 1111111111 88 5 888 3 66 5 5 5 6666666 0 0 5 5 222 0 6666666 66 66 3333333 000 5 5 5 77 77 5 77 8888888888888888 1 5 000 33 555 0 5 77 5 5 4 33 0000 5 000 5 5 88 5 5 888 66 5 888 9999 5 9 2 66 888 888 5 66 5 5 66 5 5 5 66 5 5 77 5 5 3333 77 0 5 5 77 777 22222222 7777 1 77 77 77 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 1 5 5 000 5 5 33 5 5 5 77 5 5 5 1 1 5 5 5 5 5 77 11111 5 4444 0 5 00 1 1 1 5 77 1 5 77 5 5 5 1 5 22222222222222222222222222222222222222222 0 5 8888888 5 00 5 5 5 5 2222 55 555 555 0000000 0 3 77 000000000000000000 666 3 0 66 11 66 5 5 5 5 5 888 5 5 5 000 66 222222 3 99999999999999 11 66 5 0 5 0 88 11 5 66 5 5 5 3 5 5 5 66 66 0 2 5 5 0 2 5 11 5 2 5 5 5 5 11 5 66 5 5 5 0 5 5 77 44444 22222 77 999 1 5 999 66 1 77 777777 5 77 5 5 5 5 888 000 5 5 0000 5 5 88 5 5 5 66 4
lowQualScore : .. . . . .. . . ..... . . . ... . ..... . . ... .. . . . . .. . .. . ............. . . . .. . . . ... . .. .. ... ... .. . . ..... .. ... . .. ... . . .. . ...... . . ..... ...... .. .. . .... ... .. . .... . . .. .. . .... ....... . . ............................. . . . .. . ... . .. .... . . . . . ...... . .................. .. . ..... ...... ...... ........... . . . .... . ... . . . . ................. . . ....... ..... .. . .. . ..... . ..... ...... . .. .. ............... . ... . ... . ... . . ...... ... . . . .. ... . . ... .. ......... . . . . . ........ . . .. . . .. . .. .. .. .. . .. . . . ... . ... .. . .. .. .. . .......... .. . ... . .. . . . ....... . . . . ... . ....... .. .. ....... ... . . . .. .. . .. ................ . . ... .. ... . . .. . . . .. .... . ... . . .. . . ... .. . ... .... . . . .. ... ... . .. . . .. . . . .. . . .. . . .... .. . . . .. ... ........ .... . .. .. .. . . .. . . . . . . . . . . ... . . .. . . . .. . . . . . . . . . . .. ..... . .... . . .. . . . . .. . . .. . . . . . ......................................... . . ....... . .. . . . . .... .. ... ... ....... . . .. .................. ... . . .. .. .. . . . . . ... . . . ... .. ...... . .............. .. .. . . . . .. .. . .. . . . . . . . .. .. . . . . . . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . . .. ..... ..... .. ... . . ... .. . .. ...... . .. . . . . ... ... . . .... . . .. . . . .. .
lowQualScore : 99 0 0 0 55 0 0 00000 0 0 0 000 0 33333 0 0 000 55 0 0 0 0 55 0 55 0 0000000000000 0 0 0 55 0 0 0 222 0 00 00 444 333 00 6 6 88888 66 444 6 00 444 3 6 00 3 555555 6 6 11111 555555 99 66 6 7777 444 55 0 7777 4 4 11 66 0 9999 9999999 4 4 66666666666666666666666666666 4 4 4 66 9 111 4 11 4444 4 4 4 9 4 222222 4 666666666666666666 66 4 11111 333333 111111 99999999999 0 0 0 5555 0 111 4 4 4 8 44444444444444444 4 9 9999999 11111 11 4 66 0 11111 4 44444 333333 4 66 11 000000000000000 4 888 4 222 4 888 9 4 222222 222 9 3 4 22 888 9 4 333 11 888888888 4 4 0 0 0 44444444 0 0 99 4 0 99 0 99 99 99 99 0 99 0 0 0 888 0 888 99 0 99 99 55 0 9999999999 55 0 888 2 99 0 0 0 2222222 4 1 0 0 000 1 2222222 99 99 7777777 000 7 7 7 99 99 7 99 2222222222222222 4 7 000 77 777 1 7 99 7 7 3 44 0000 7 000 0 0 11 0 0 000 99 0 888 0000 0 4 5 99 888 888 0 99 0 0 99 0 0 0 99 0 7 99 7 7 0000 99 6 7 7 99 999 77777777 9999 0 99 99 99 7 7 99 7 7 7 7 7 7 7 4 7 7 000 7 7 66 7 7 7 99 7 7 7 0 4 7 7 7 7 7 99 33333 7 3333 7 7 77 4 4 4 7 99 7 7 99 7 7 7 4 7 66666666666666666666666666666666666666666 1 7 9999999 7 00 0 0 0 0 0000 99 444 111 4444444 5 2 55 999999999999999999 555 1 4 99 99 99 0 0 0 0 0 888 0 0 0 666 99 888888 2 00000000000000 99 99 0 0 0 0 22 99 0 99 0 0 0 1 0 0 0 99 99 0 2 0 0 0 0 0 00 0 4 0 0 6 0 99 0 99 0 0 0 6 7 7 99 77777 99999 99 444 4 7 444 77 7 99 333333 7 99 0 0 0 0 888 000 7 7 6666 0 0 22 0 0 0 11 4
consensus : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAN--TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTT-A-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
Reference ( family-1355 ) : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAN--TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTT-A-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|1 : T--ATAGCG---GT-GACT-A-A-----AT-TA-C-ATT---C-GTTT----GCCAATCAA---TT--ACATT-TTC-AAA-TGAA--TGCT--A-A----AA--TCGT-T-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-ATTA-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CT--TTAT-T-GTC-----A--TA---A-GGCTA---CC-TT-TCAAAAC-TG------AATAAAT-G-----CTTG------GAATT-ATTTG-AT----GGTA---C--CC-TA---TTCG-TGGCCACAGAAG----ACCACTT-------CCCG-AA----TTTT---T------TT-TTTTTTTTACA-G-A-TG-TC-AAAC-AA---CA-TT--G-T-CA-T-CA-T-C-CGC----T-GAC-AGAATTT---C-ATTAGACGCCA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----ATTT---------AT-A-TGCCA----GAA-TAAA-AAG-TTATCAA--TC-TGGTT-------TCAGT-A-C-------AAAC----TG--A-A-TAAAAT-----C-TATTC---CATTG-A--A-C--AGAGACC---T----CC-----GCATCTTTCTGCATT-TT---GCCTC---CAACGT-ATC-----TTCG--ATGCAGTGAGGTACGATTCCA-ACG---TTTCA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTGCTGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAATCTTT-ACTTC-TTAT-CACATAG-TTAGT---TA--TTTAG--G-GACAACTTAAGA-C-G-CGAA---TTACTT---T--TCTA-TCTTTG--CGCACATTT-A----------TAC-CAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-TTAT-------TTTTA-GA-TGT--GTCT-------TTGATTACTA--AATAATTG----CCTTAA---CTTAT-A-TTG--CCTAGT-A--TATTT----T-T--G-A----AA-TGCAAAGTTA---GAATATTGGCACC--GACA-G---------------AGACGCAGTTTCCCGGTGC----AAC-AACGGCTAA-AA-ACTTT--CAAC-TCGGTA-GTCA--AATG-TTTTTTGA-T--T-T-ACA--TGAATA---TTG---TGGCTC--T--ATC-A--TAATTGT-ATTGCAACGTA--TA-TGAATATCT--T-AATAACGAAA-A--TA--GATCTAGCA-CACGTTTTTACATGGAATCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAT--TCTCTGC---TAAATTTC--GACGGAAAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-CATCTTT-GT-TGGCGGAAATTCCCTGCTT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGA-CATA--GA-CAGGATATTT-CA--TGCATATTT-ACAT-ACGGAATTG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACCAA----TTGT-TTTTTTA-ACAAATTCAA-GTATAA-A--CGGCATCATCGA--AAGGGGTG-A-AATCATCCA-G-CA--TA--TGTT-GAAATCAC---AA---GTT--ATA---ATTAG-TATT--GGTTTTCTAGCTGAT-TCA-CCTGGCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCTCAAGAAACTAGATATAATTTTTGACA-TTTCACA--GCATTG-AAATTT-ATAAT-ATCTGGA-GCTAAAAATTACGGAAAA--TCGA-CCA-GACGCAT-GCCTGGCGACTAC-TTGTTTCA--TGCAATGTTTGTA----TT--TTATT-----------TTGG--AG--CTGCTTACT-TGTAGT-GCATTTCCAAAACG-ATTATCT--GCAACTTTA-TGGT-GGAACTGTGGTGTGTTTTG-ACA-GATGCTC--AACCAGCAA-TCTCACA-TAT-ATC-AACTATTGTTATTGAA-TTTTTTTT-GGAATA-TT-CATGGGTTGCAGGAAAGCAGGGGTGAG-TGTA-GATT--AGCGCGGACTAATTATTG-CACA-TGTTACAACTTCTTAGGAATGTAT-ATTTCTTTTC--TTTTATT-ACACAAGCAA-TTACTT-ATATTTTATATA--A---AGCTTTTG-TA--CTTCTTTGGTAGAAGTGTTCATAAACTTTTCTCA---A---AGCATTCTTCAAGGAGGGCCTA-AAAA-TTGAAA----TGCATGAGTCACCTTCATTGTACAT-GCACAATCCAATATGGCCGCTTTTA-GCAAC
gi|10 : ggt----TAAAAGTC--GACG--AAA--TTGCC-CGA--GTTATGTCT-C-TC-T--GT-TGG-GGGAAATTCCTG-TTTCAAG---CTTGACCACAGGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TTTCAAGTGCA-A-TA-AAATTATGTAA-TG-TT-TA-CA-TC--AT--TTAACC-A----TTTTGTTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--ATGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-ACT-A-CCA-G--A--TA--TG-AAGAAAT--C---A----------CA---A--GA-TA-T--GG-TTTCTAGT--AT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGT-AATAT-----A---TCT-AAAA---TAGAT-T-AT-----AC--TTTTACA-GGCA-----------------ACCTGAA-GCTAAAAAATA--GAAAAG-C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TT-CAT--GCAATG--TGTA----TTTATT--------------TTGG--AG--CTA-TTA-T-GGTAGTTGTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGATTGAACT-TGTGGT-TTTTGAA-A-AA--CTC--AA-C-GCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTAATG-A-ATTTTTTT--GAATA-TT-CAT-G--TGCAGG-AAGCA-GGATGA--TGTA--ATA--AG-G-GGACTGA-cc
gi|11 : T-GCCCTT-AC-CTGC-AATATAATATA---TCT--AAAAA-TAGATAT-ATTT-----------ACA-GGC------------------ATCTGGA-TTT-AAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-A---GG-AACTACTTT-TTTCA--TGCAATG--TGTA----TTTATTA-------------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-AA--CTC--TA-CGGCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GTTTACAGGAAAGCA-GGATGA--TGTA-GATA--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAACCAA-TTAC-T-ATATTTT-AA-A--A---G--TTTTG-TA--CTTT-TTGTCAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---
gi|12 : TTC----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-TAAA-A----------------G--T-------TTAAT-A-C-------AAACC----G--A-ATGAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCACTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATA-AGTAAAG-A-AATTCC--ACG---TT-CA-CATTTCC-T--GCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAT----G---CCAAAT-TTTAATTT--TTAT-CA--TAG-TTAATA--TA--CT--G--C-GACAGC--AAGA-C-G-CTAA---TTA-TG---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-ATACAATAAATTATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------ATTTG-GA-TGT--G-TT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--GATAT----ta
gi|13 : tggcag-A-AT-A--T-ATA-----TT-TT-C-ATT---C-ATTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TT-T--A-A----AC--T----T-A-CAAGGAAA-TAAT--ATTT-GAAG-TTAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTT----C--TTTT-T-GTC-C---AA-TA---A-G--TAGGTTC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----TTTG------GGATT-CT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--TCCGACGTGAAGTCATGTG------CC-G-AAAAAATTGT---C-----------------ACAAG-AATT-T--AAAC-AAA--CA-CT--GCT-CA-T-AA-T-T-CGT----A-AAG-AAA---T---CCGTTTG----CAC-TAA-T------C---T-TGGCGTT-C----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-at
gi|14 : atttggtagagtagataaaaaaaTTGGT--ATAATG-AAGT-A--T-A-T-----TT-TAAC-ATT---C-GGTT----GCCAA-CAA---TTT-ACATT-T-C-AAACTGAA--TG-T--AGA----AA--C----TTA-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-C-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--ACGGTCG----GCCATTT-------CC-G-AA--------AAAT------TG-TTT-----ACA-A-GACG-T--AAAC-AAG--CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAcc
gi|15 : at-A----AAGTG-AAAAT-A---GAAT-TTGGCAC---GGAA-TT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTT--CAAC-T-GGTA-A-CA--AATG-ATT---GA-T--T-T-ACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TGAATTT-ATTGCA-C-TT--TA-TGATTAC-T--T-AATAA-AATA-A--TA--AACATAGCA-CATGTTTTTACATGGA-TCTTA--AAAATTGC---GATT
gi|16 : tcTTGGT--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTGT----GC-AA-TAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--T--T--A-A----AAAGT----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CC--TTGT---GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-A-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---
gi|17 : at-AA-ACTTT--CAACAT-TGTA-G-CA--TATA-TGT---GGGTGAT-TTA-----GGATA---TTG---TGG-TCATTG-ATCTA--TTAATGT-ATTGCA-C-AA--TA-TGATTAT-TAAT-AATAT-GATA-AATTAGTGACTTAGCATCACGTTT
gi|18 : gTC-TTGGTGGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCGTACATGTAGTA-TCTT-AAAGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACgtttatagtacttttg
gi|19 : AG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACcc
gi|2 : TTGGT---TAGCG-A-GT-A--T-T-A-----CTATA-C-ATT---CCGTTT----GC-AA-CAA---TTTAACATT-TTC-AAA-TGAA--TG-T--G-AGGGAAA--C----T-AACAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAA-G-AT-A-G-CGCA--TTGGACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-A---AAATA---A-G--TA---CCCTT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GAATT-ATT-G-AT----GGTA---C--CCCTAG--T-CGGTGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----AATT---G------TT-TT------ACA-A-AATG-T--AAAC-AAATACA-TTTTG-T-GA-TTCA-TAT-CGTTTTTG-AAGGAGA---T---C-ATAAG----CAAATAAAT-----AC---G--GCCGTTCA----GTA----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-A-G-T-A-CAAA-TC-TG--T-------TCAGT-AAC-------AAAC----TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-T---CAT---GGGA-C--AAA--CCCG-T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TTT--GC-TC---CAAAGT-AT------TTC---A-G-TGTGAGG-A-GTTTCCA-AGC---TT-CA--ATTTCCAC-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGATCA-TTAT-TAC----GGCGCCAAAT-TTT-ACTT--T-AT-CA--TAG-TT-GTAAATA--TT--G--G-GA--AC--AAGAAC-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTGGGC--ACATTT-A----------TG--CAA-TTTAT---TGTT----ATATT-T-AT-------TATTA-GAGTAT--GTTT-------ATGATTA--A--A-TAATGT----CCTTAA---CTTATGA-T-G--C--ACT-AATTATGT----TAT--G-A----A-GTG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---GAAAAGT--TTGAGTAAAGAAGGACG-AGTTT--GGT-GCGA--AACAGACGG---A-AA-ACTTTTTCAAC-T-GGTA-G-C-----TT-TTT---GA-T--T-TTACG--TGA-TA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TAAATAATGATTAT-T--TTAATAA-GATA-AA-TA--GACTT-GCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTTGGAAAACTGC---GATTCTTCT---GAG--TCCCTGCCTGTAAAGTATAAGACG--AAAGGT-GCCGCGATGGTTATGT-TTC-TC-TTTGTATGG-GGAACGTGTCTG-TT--ATG---CTTGAGCAC-TGTCCGT-GAGAC-ATAA-GATCAGGATA-TT-AA--TGCA-A-TT-ACATTAGGTAA-TGGTT-TA-GACTCCAACTGA-AACC-A----TTGT-TTTTTTATACAAA-TCAA-GTAT-ACA--CGGCATCCAC-A--AAGGGGTG-A-AAT-AACCAAG-CA--TGGTTGGT-GAAAT--CTGAAA---G-TTAGTA---ATTAG-TA-AAAG--CTTCTAGTTGATGTCAACCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATAGTGTCT-ATAA---TAGATAT-ATTT---ACAGTTTCACAAGGCATTGGAAATTT-A-A-T-ATATGGA-GCTAAAAAATA--GAAAAAAC--A-CCAAGA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-GCCAATG--TGTA----TTTATT--T-----------TTGGT-AG--CTG-T-A-T-GGTAG--GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTAATGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-AAGA--CTC--AAACAGCAAATCTCA-AATAT-ATCGAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTTTGGAATATTT-CAT-GGTTGCAGAAAAGCA-GGGTGAATTGTACGATT--AG-G-G-ACTAAATATTG-AGCAGTGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTTCTTTTTA-TGACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-TACA--A---G--TTTTGATAAACTTC-TTTGTAGAA-TGTT-A-AAAATTT-CTCA---A---ATCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTCAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAccc
gi|20 : CAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|3 : TTGGT--ATAGCG-A-GTTA--T-A-A-----TT-TA-C-ATTTTTC-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTTTGAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTCTC---A--TA---A-G--TA---CC-TTTC--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTT------GAATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CT-TGG--ACAGAAG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTTTT---ACA-G-ATTG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-TACCGTTTC----AT-----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TA-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACT---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CA--GT-AT------TTC---AGG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTTC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGTG-A-TTAT-TAC----GA--CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACTTA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-AACGG---A-AA-ACTTTT-CAA--T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---TA-T--T-TTAGG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACTGAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---G-TTCTT------------TCTG-------AGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TTG-GGGAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ACAC-AGGTAA-TG-TTATAAGA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAAATCAAAGTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-ATAAT-A-TCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AAAATG-T--ATA---ATTAGATA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTTTA-AAT-ATCTGGACGCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-ATTG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TTCAATG--TTCAATTTTTTATTGTTAGTAGGGTGCTTTGGTTAGGACTT-TTAAT-GGTAGT-GCATT---AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGGACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-GA--C-C--AA-CAGCAACTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATTGTAG-G-GGACTAA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAAATTAC-TTATATTTT-TATA--A------TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TTTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACATGGCA-AATCCAATATGGGCG--TTTAGGCAACcccttaatgtgca
gi|4 : T--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTT-----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AC--T----T-G-CTAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCC--T--GACAGT-GA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G---G---CC-TT-C--AAAG-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CT-TC---T-CG-TGG--ACA-ATG----GCCGTATGTAGAAGCC----A----TGTT---CGAAAAATG-TAA-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-CT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---C---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----AT-----------AT-A-TGC-A----AAA---AA-AAG-T-A-CGA--TT-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC----G--A-AA-AAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---------C-----G-ATCTCTGTG---T-TT---CC-TT---CAA-GT-AT------TTC---ATG-ATTGAGG-A-GATTCCA--CG---TT-CA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---GTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--AC-----A----------TATAAAA-TAATT---TGTTTC--A--TT-T-AT-------TTTTA-GA-TA-----TT-------GTGATTA--A--AATAATAT-----CTTAA---C--AT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--C-A----AAATG-AAAGT-A---GAA-ATTGGCAC---G-AA-GT--TTGAGTAAAAA-GGACG-AGTTTCCGG-TGC----AAC-GACAG---A-AA-ACTTTC-AAAC-T-GCTA-A-CA--AATG-ATT---GA----T-TTACA--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--ATAATGT-ATTGCA-C-TA--TG-TGATTAC-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACATAACA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTA-AATTCTTCTTGAAAG--TCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--A--ATAT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---C-TGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--A---A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--ACAAA-TCAATTTAT-A-A--CGCCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-C-----------------------------------A---GTTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-AC-ATGC-AATATGATAT------T-GAAA-----------ATTT---AAA-TATC---------TG-GAG-TT-A-AA-----------------AATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCA--TGCAATG--CG--------TATTATT-----------TTGG--AG--CTGTTTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TATAATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATAGTT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGGCTGA-TTTTG-CACA-TGTTACAACT--T--------------TTCT------TTTTA---ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTT--TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAATTTGAAGTTTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATAT-GCCG--TTTA-GCAAC
gi|5 : A--T--GACAGTTAG---TTTTT--TT--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---C--TT-C--GA-C-TG------A-TAAAA-G------TTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CC-T----T-CG-TGG--ACG--AG----GCCATTT-------CC-G-AAAAA-TTAA---------------------ACA-G-AATG-T--TAAC-AAA--CACTT--G-T-------A-T-T-CGT----A-AAG-AGA---T---T----------CA--TAA-T-----AT---A-CGGCGTT-C----TTT----------ATTA-TGA-A----GAA-TAAT---G-T-A-CAA--T--TG--T-------TCAGT-ATC-------AAA-----TG--A-AATAAA-T-----C-TAT-A---CAT------A-C--AAA--CC---T----CC-----C-ATC-CTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATGCAGTGAGGGA-GATTCCT-CGG---TT-CA-CATTTCC---AGCC---T---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAG-TT---CTT--TTCT-CA--TAG-TTG--A--TA--AT--G--G-GGCAAC--AAGA-C-G-CGAA---T-A-TT---TATTCTA-TCTTTG--C--A------G----------TGTAAAA-TATTC----GTT-C--AT-TT-T-AG-------TTT-A-GA-TGT--GTTT-------T-GATTG--A--AATAGT-------CTTGA----TTAT-AAT-G--C--ACT-A--TATAT----T-TTGA-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATTTTGGCAC---GAAA-GTAGTTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-AACAG---A-AACA----T-CAAC-TTGGTA-A-CA--AATG-TTT---GA-T--T-T-ACGGGTGAATA---T------GG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AA--A-GATA----TG--GAATAACCA-CACGTTTT-ACATGA---CTTT--AAA-CTGC---GATTCTTCC---GATG-TCTCTG----TAAAGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAA-TTCCCTG-TT-TATGTTGCTTGACCAC-TGTCCGTTAGGGCCATATTGA-CAG-ATA-TT-GA--TGCA-A-TTTAAAT-AATTA--TG-TT-TA-GA--C--AG--A-AACC-A----TT---TTTTTTA--CAAA-TCAA-GTAT-A-AAACGGTATCA---A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GGCAATTA--TG-T-GAAAT--T---AAA--G-T--ATATAGATTAG-TA----G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTTTAC-CTGCCAATATGATATA---TCT-AAAAAACTAGATAT-ATTT---ACA-TTTTACA-GGCAT-G-AAATTT-A-AATTATCTG-A-GCTAAAAA-TA--GAAAA--C--AACCA-GG-A-GT-A---TG-AACTAC-TT-TTTCAT--GCAATG--TGTA----TT----ATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-TAGGTAGT-GCATT--CAAAACGAATTAT-T--GCAACTT-A-TGGA-TGAA---TGTGG-GTTTTT-A-A-AG--TTCTAAA-CAGCAATTCTCA-A-TATTATCCAACTATTGTTAT-G-A-TTTTTATT-TTAATATTTTCAT-GGT-GCAAGAAAGCA-GGGTGA--TATA-GATT--AG-G-GAACTGA-TGT-G-CACA-TGTTACAACT--TTTTATATGT-TTA-TTCTTTTC--TTATA-T-ACACAA-CA--TTAC---ATCTTTT-TACTTTATTTG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTTAGA-TGTG-T-AAACTTTTCGCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TAGAAAA-TTGAAG--TTTGAATGA--CA-TTTCATTGTACAT-GCA-AATCC---ATAGGCG--TTT--GCAACcc
gi|6 : aggaaaataaaataacatataatgaaagaaattaaatagacgacaa--ATAGTGGA-GT-A--A-A-AAAA--TT----C-ATT---C-GTTTT---GC-AA-CAA---TT--ACATTCT-CAAAA-TTAA--TG-T--A-AC---AA--CT---T-A-CAAG-AAA-TAATAACTTT-GAAGCT-AC-AGG-CGCAAGT--GACAGTTGAAGTATTTTAATCTGTTTT-T-GCC-C---A--CATC-ACG--TA---CCATT-C--AAAC-TGGTATTTA-TAAGACG-----CTTG------GGATA-AT--GTAT----GGTA---C--CC-cc
gi|6 : gg-AGA---T---C-AAAAA----CA--TAA-TTAAGAAC---GGCACCGCTTC----ATT----------AT-ACTGC-AACCTGAA-TAAA-AGT-T-A-CAAACTC-CG--TAAAAATCTTGGT-A-CATATTATAAAAC---TG--ATAATGAAGA-----T-TAT-ACTTCATTTCG--AGC--AAA--CCAAAT-------------ATATCTGTG---T-TT----C-CCTAGCAA-GTCATGATCCACTC---ATG-AGTGAGGAA-GATCCC--ATG---TT-CA-CATTT-C-C-AGCC--ATAGAAAACGGCT-TCGTG-TGAC-A--TATCTACACCTA---CCAATT-TTT-TCTT--TAAT-----TAGATAAGTG--TAACTT--G--GTGACAAC--TGGT-CAG-CGAAACGTTA-TTTGGT--TCAACTCTATG--CA-ACTTTTGA----------TAAACA---ATTT---TATTTC--AT-TTCT-AA-------T-----GA-TG---GTGT-------TTGATTT--ACGAACCACGTGATCCCATAAAATCTTAT-A-C-GCCC--ATT-A--AATATACGGC-T--GTATAATAAGTGTAAAGT-AGCGGAA-ATTGGCATCTAAAAA-GT--TTGAGTGCAAA-GGA-G-AGATT-AGCTTGCCACAAGC-GACAG---ACAG-AGATTC-TAAG-TGGGTATA-CAGGAATGCCTT---GA-T--GATTAGG--TATATATATTTGGCATGG-TC--CGTGTT-GTTTTAATGTGA--GCA-C-TA--TA-cgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacagatcaaaaacataattaagaacggcaccgcttcattatactgcaacctgaataaaagttacaaactccgtaaaaatcttggtacatattataaaactgataatgaagattatacttcatttcgagcaaaccaaatatatctgtgtttccctagcaagtcatgatccactcatgagtgaggaagatcccatgttcacatttccagccatagaaaacggcttcgtgtgacatatctacacctaccaattttttctttaattagataagtgtaacttggtgacaactggtcagcgaaacgttatttggttcaactctatgcaacttttgataaacaattttatttcatttctaatgatggtgtttgatttacgaaccacgtgatcccataaaatcttatacgcccattaaatatacggctgtataataagtgtaaagtagcggaaattggcatctaaaaagtttgagtgcaaaggagagattagcttgccacaagcgacagacagagattctaagtgggtatacaggaatgccttgatgattaggtatatatatttggcatggtccgtgttgttttaatgtgagcactataata
gi|7 : ggatagtggagtaaaaaaattcattcgttttgcaacaattacattctcaaaattaatgtaacaacttacaagaaataataactttgaagctacaggcgcaagtgacagttgaagtattttaatctgtttttgcccacatcacgtaccattcaaactggtatttataagacgcttgggataatgtatggtaccccgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTATAATTCTTCT---GAAAGTCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--ATTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-ATTGGTTGT-TTTTTT--ACAAA-TCAA-TTATAA-A--CGGCATCATC-AACAAGGGGTGAA-AAT-A-CCA-G---------------------C---AA---G-T---------TT---TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-ACATTGC-AA-ATGATAT------T-GAA------------ATTT---AAA-TATC--------TTG-GAGTTA-A-AA------------------ATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG--ACTAC-TT-TTTCATCTGCAA-G--CG--------TATTATT-----------TTGG--AG--CTGTTTA-T--GTAGTAGCATTT-CAAAAC--ATTAT-TTAGC-ACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATG-TT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GG-CTGATTTTTGCCACA-TGTTACAA---------------------CTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACata
gi|8 : TTGGTTTATATTG-A-GTTA--TTA-C-----TT-TA-C-ATTT--C-GTT-----GC-AA-TAA---T---ACATT-T-C-AAA-TGGAATTG-T--A-A--------C----TTA-CAAGAAA--TG-T--CTTT-GA-G-T-AT-A-GGCGCA--T----------------TTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA----C-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-G-----CTT-------GGATT-TT--G-AT----GGTAGGTA--CC-TA---T-CG-TGG--ACGAGGG----GCCA-TT-------CC-G-AAAT--TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATGTT--AAACAAA---CA-TT--G---GATT-CATT-T-CGT----G-AAG-AGAAT-T---T-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--ACCG-TTC----ATT----------A--A-TGC-A----GAATTAAA-AAGTT-A-CAA--TC-T---T-------TCAGT-A-C-------CAACT---TG--A-A--AAATT-----CGTAT-A---CAT---G--A-CA-AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCAGTG---T-TTTGGGC-TC---CAA-GT-AG------TTC---ATG-AGTGAGA-G-TTTTCCA-ACG---TTCCA-CATTGTC-C-AGCC--AT---------CATTGGTG-TATT-ATTTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTTAATTATCCA--TAG-TTAGTA--TA--TT--GGTG-GACAAC--AAGA-C-GCCGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACA-TT-A----------TAT-CAATTGTTTTTGTGTTTCAGAT-TG-T-ATGGAATTCTTTTATGA-TGCTAGTTTATTTCAATTAATTA--A--Acccttaaacaatata
gi|9 : atAGCG-A-GT-A--T-A-AAATTCTT-TA-CCATT---CAGCTTACGTGC-AA-CAGCATTT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-TTAA-A----AA--CCACTT-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-GACGCA--T--GA-AGTTGA---GCTTT--TC--TTTTATAGTT-CGCGA--TATCCA-G---A---CC-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-GTTCTTCTCGTGACGAGGGTTAAT--G-ATTCCCACTA---CTTCC-TATTCT-TG-TGG--ACAGATGC---GCCATTT-------CC-GAAA----TTTT---T------TTATTT-----ACA-GAAATG-CTAAAACAAA---CA-TA--G-TCGA-T-CA-TATACGT----GCAAG-AGA---TGAGT-ACAAGTT--CG--CAA-T-----ACATTA-CGGCATTTCCGGAATTCTTGGATGTGAT-C-TGC-G----AAA-TAAATAAG-T-A-C-A--TCATGC-T-------TCCGTAA-CA------AAACCCAATGAAA-AATAAAATCATCAC-TAA-C---CAT---G--A-CTAAGA--CC---TAAGACCCACGAG-A-CTCTGTG---TAAT---GC-TC---CAA-GT--T------TTCGGGATG-AGTGA-G-A-GATTCCAGACGGGCTT-CACCATTTCC-CAAGACAAAT---------CA-TGG-G-TGcgta
blockSeqs : TT G A T . T T AATTC A A C TTT C TACGT C . CAT TA C T A C AT . TA G GGGAAAC T A A AA T C T AG G AG TG AGT AAT TG A A CGCG AA TCC C . GGT C T . T GTATTT . C TTCTT TGACGA TA T T TCCC GGT TT C ATTC . G . CG C TGAA GTAGAAG . A TGTTCGAAAAATGTAA A A T TA A ATA C TT CTC T T T A A TTTTG G TGAGTACAAGTT AA A TAAGA ATTAC TCCGGA TCTTGGATGTG T C . ACCT T TAA T . . ACTCCGTAAAAATC A A ATATTAT CCAAT AA T TG A CATCA G ACTT TTCG G TA . TAAGACCCACGA . . A TGG . TAG A C GATCCA GGG C G . AG GGC C C AC AA AGAAAACGG T . C T C ACCTA . A AA C . A AA AC . GT T . A A C ACG . TGG AT C GG A AT G TACAATAAAT TA T TTG T AG A C . GGAATTC T G CTA ATTTCAA . CG GTGATCC AAT G A . CC . T AT ACGGCTGTATAAT T . GCG TA CTA A AG A . C TT CACA A . C C TT A T TA GG C . GTGA A T C GG TAT GCA . AT T T TT G . . AA A . AA T . AAT GT T . GG TAT TGAAAG CCTG A AA . GG T G TG C T . . T A . A . T TTG A T TT T . T AG . . T A T . G A A C CA CTGA . TTGG G AT A A A C AA T . AC A T . A A CATGGTTGGTGAAATCTGAAAGTTAGTA A AAAG G AC . T A C AGTG A AAC AT ACAG A AG ATTGAAATTTTAAAT GAC A . AA . A A . . T . . T . TCT . CAATTT T GTTAGTAGGGTGCT TT GA T A A T T GA . TA A T . T A . A . TA A T . A A A . TT T T T . T . AT C GT . . A C G . TAGGA TTA CT TG C A TT A C TT TTTG A AA . . . . TAC TGT . . . G T TT . G . . G
blockSeqs : . . . T . . . AAA . . . T A TT . . . T . . . . . . . . AACCACT T . A . . . . T A . . . C . . . TC A TC . . . A . . T . . . . . T . . . . . . AG . . . GG C C G . . TTTTTTTTTTTT . . . . A A . . TCG . . . A . GC . ATTTATAAG C . . GGC TC T . . . . . AA . . . TCATGCT . T A TT . . AT A . . A GGG . A . CGTCC . . . T . . . . . . . A . A . . . CA . . . . . . . GGCG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . TA . . T . . . . . . . T . . . GTC . . . . . . . . TTTGAA . . . TT . . . . . C TT GA . . . . T . G A . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . TA GAAAG . G . . . . . . . . . . . . . C . . . . . A . . . . . . . C T . . . . . . TTT . TTGG . A . T . . . A . . . . . . . GCAATTATGTGAAATTAAAGTATATAG . TGG . C . . . . A A AA AT ACA A G ATTGGAAATTTAAT AA A . G . . . . . . . . . . TG . TA T ATT T . T . . A T . . . . . . T . . . . . . T . . T A . TT . T . . G . . . . . . T . . . TAGGA TA . T . . T T T . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AAAGT . . . . . . . A . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . AG A . . . . ATTTTTTTTTTT . . . . . G . . TG . . . . . A . TCCGTTTG . . . TT CA T . . . . . AA . . . ATCTGT . . . CT . . AT A . . T G . . . AAAT . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . TA . . T . . . . . . . T . . . GTC . . . . . . . . TATGA . . . T . . . . . C T . . . . . C . . G . . . T . T G . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . GATG . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . CA . . . A . . . . . T . . . . . . . CATATGTGAAATCAAAATGTATA . TG . C . . . . A A AA AT AAA A G ATGAAATTTAAATT GA A . . . . . . . . . . . . TT . TA T ATT . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . A . . . G . A . T . . G . . . . . . . . . . TAGGA TA . T . . T T C . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . CAACT . . . . . . . T . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . AG A . . . . TTTTTTTATTT . . . . . A . . TG . . . . . G . TCATAAG . . . GT TC A . . . . . AG . . . TATGT . . . TT . . AT A . . A G . . . TCC . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . TA . . T . . . . . . . T . . . GTC . . . . . . . . TTGA . . . A . . . . . C T . . . . . T . . G . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . TA . . . . . GAG . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . GA . . . A . . . . . T . . . . . . . ATATGAAGAAATCACA . TG . C . . . . A G . AT ACA A G TTGGAGTTAAAA GA A . . . . . . . . . . . . T . TA T ATT . . . . . . T . . . . . . T . . . . . . C . . . A . A . G . . T . . . . . . . . . . TTTAT TA . T . . T A C . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . ACT . . . . . . . A . . . . T . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . A . . . GA T . . . . AAAATTGTC . . . . . . . . TG . . . . . G . TCATAAG . . . AC TC T . . . . . AA . . . TTTGT . . . C . . AT G . . A G . . . TCC . . . . . . . . . . . . . T . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . AA . . T . . . . . . . T . . . AT . . . . . . . . TTCA . . . A . . . . . . T . . . . . C . . G . . . T . T C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . CA . . . . . . . . . T . . . . . . . CAAGT . TG . . . . . . A A . T AAA A G TGGAGTTAAA A . . . . . . . . . . . . . T . TA T A . . . . . . T . . . . . . C . . . . . . T . . . A . A . T . . G . . . . . . . . . . . . . T . . T T C . G . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AAC . . . . . . . A . . . . T . . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . C . . . AG A . . . . AAATTGTTT . . . . . . . . TG . . . . . G . CCATAAG . . . G TC T . . . . . A . . . TTGT . . . T . . AT T . . A G . . . TCC . . . . . . . . . . . . . A . . . C . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . T . . . . . . . . A . . . T . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . G . . . . . . . G . . AC . . A . . . . . . . . . . . . . . T . . T T . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . T . . . C . A . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . AAC . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . A . . . A G . . . . AATTGTTTT . . . . . . . . T . . . . . A . TCAAAAA . . . G C T . . . . . A . . . TCTT . . . C . . A A . . A G . . . TCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . T . . . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ACT . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . G T . . . . AAATTAA . . . . . . . . G . . . . . G . TT . . . G C . . . . . . . . . . GT . . . T . . . . . . C . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ** AAC********** A** C**** ** ** ** ** AAATTGTTTT******************* ** TCATAAG*********** GC**** TC**** T********** TCTGT************ AT A**** G***** ** *** ****** *** C** ** ** ** ** ** TA ** ** A* *** T* *** C* G** *** TA** GAG***** **** ** CATATGTGAAATCAAAGTTATA******************* TG***** A* *** AT* ANA**** G* ATTGGAGTTTAA****** ** ** *** ** T* ** ** ** ** TA*** T** T** N* G***** **** T* **
originalCons : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-AT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AA----TTTT---T------TT-TTT-----ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGA---T---C-ATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGTTGC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTT-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATA-A--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GAN--TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAAT--C---AA---G-T--ATA---ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT-AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTG-AAATTT-A-AAT-ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
finalCons : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-AAAC----------T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-T-ATA--G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTCC----A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--ACGGANG----GCCATTT-------CC-G-AAAAATTGTTTT-------------------ACA-G-AATG-T--AAAC-AA---CA-TT--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-AAG-AGATCATAAG-----------CA--TAA-T-----ACGC----GCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAATCTGT------------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TATA----CATG-----A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCCC--AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAAA-TTGGCAC---GAAA-GT--TTGAGTAAAGA-GGACG-AGTTTCCGGT-GC----AAC-GACGG---A-AA-ACTTTC-CAAC-T-GGTAG--CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA--TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCTGAG-----TCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTGT-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-A--AAGGGGTG-A-AAT-A-CCA-GCATATGTGAAATCAAAGTTATA-------------------ATTAG-TATG-----TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCTA-AAA---TAGATAT-ATTTANA----TTTCACAG-GCATTGGAGTTTAA------ATCTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TTA-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGTTA---TTCTTTTC--TTTTAT--ACACAA-CAA-TTACT--ATATTTTN-ACA--AG-----TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAGT-TTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
Alignments
lowQualScore : 11111 111 11111 2222222222222 1 111 11111 111 111111 111111 1111 22222222222222222 3333333333333333333333333 11111111111 111 222222222222222222 1111111 1111 11 11111 222222 22222222222 11111111111111111 1111111 11111 11111 11111 111111 11 222222222222222 111 111111 111 1 111 111111111 11111111 11 11 2222222222 1111111 111 1111111 1111111 111 1111111111111111 1 111 1 111 111 111 111 1 1111 1 111 1111111 1111 111 11 1 11111 1111 1111111 11 1 1 11 1 44444444444444444444444444444444444444444444444 1111 1111 111 777777777777777777777777777777777777 11 222 1111 333333333333333333 11 1 1 1 11 1 1 11 1 11 1 11111 1 111111 111 1111
lowQualScore : 66 4 4 8 55 4 4 77777 4 4 4 111 8 33333 8 4 777 99 4 8 4 4 55 4 55 4 8888888888888 8 4 2 55 4 8 444 8 55 55 666 222 55 3 3 00000 55 111 3 55 666 7 3 55 7 000000 3 3 99999 000000 55 88 3 7777 666 55 4 6666 4 4 66 88888888888888888 4 4 0000000000000000000000000 4 8 4 99 88888888888 555 4 8888 55 4 6666 4 4 8 4 222222222222222222 4 8888888 5555 00 4 11111 444444 3 7 8888 44444444444 4 4 4 8888 4 777 4 4 4 0 88888888888888888 4 8 8888888 77777 66 4 66 1 11111 4 11111 777777 4 00 66 222222222222222 4 777 4 222 4 777 8 4 777777 222 8 3 4 99 777 8 4 777 66 777777777 4 4 5 5 5 66666666 5 5 11 0 5 66 5 66 66 66 66 5 66 5 5 5 888 5 888 66 5 66 11 66 5 1111111111 88 5 888 3 66 5 5 5 6666666 0 0 5 5 222 0 6666666 66 66 3333333 000 5 5 5 77 77 5 77 8888888888888888 1 5 000 1 5 555 0 5 77 000 5 5 5 5 5 5 77 5 5 000 5 666 5 5 888 66 5 888 5555 5 3 2 66 888 888 5 66 5 5 66 5 5 5 66 5 5 77 5 5 2 5 77 0 5 5 77 777 9999999 7777 1 77 77 77 5 5 77 5 5 5 5 5 5 5 1 5 5 000 5 5 33 5 5 5 77 5 5 5 1 1 5 5 5 5 5 77 11111 5 2222 3333333 00 1 1 5 5 33 1 5 77 5 5 5 1 5 44444444444444444444444444444444444444444444444 77 5 5 5 5 5 5 2222 5555 555 0 888 111111111111111111111111111111111111 888 1 5 6 0 66 11 66 5 5 5 5 5 888 5 5 5 000 66 0000 222222222222222222 11 66 0 5 0 5 0 88 11 5 66 5 5 5 3 5 5 5 66 66 0 2 5 5 0 2 5 11 5 2 5 5 5 5 11 5 66 5 5 5 0 5 5 77 44444 22222 77 999 1 5 999 66 1 77 777777 5 77 5 5 5 5 888 000 5 5 0000 5 5 88 5 5 5 66 4
lowQualScore : .. . . . .. . . ..... . . . ... . ..... . . ... .. . . . . .. . .. . ............. . . . .. . . ... . .. .. ... ... .. . . ..... .. ... . .. ... . . .. . ...... . . ..... ...... .. .. . .... ... .. . .... . . .. ................. . . ......................... . . . .. ........... ... . .... .. . .... . . . . .................. . ....... .... .. . ..... ...... . . .... ........... . . . .... . ... . . . . ................. . . ....... ..... .. . .. . ..... . ..... ...... . .. .. ............... . ... . ... . ... . . ...... ... . . . .. ... . . ... .. ......... . . . . . ........ . . .. . . .. . .. .. .. .. . .. . . . ... . ... .. . .. .. .. . .......... .. . ... . .. . . . ....... . . . . ... . ....... .. .. ....... ... . . . .. .. . .. ................ . . ... . . ... . . .. ... . . . . . . .. . . ... . ... . . ... .. . ... .... . . . .. ... ... . .. . . .. . . . .. . . .. . . . . .. . . . .. ... ....... .... . .. .. .. . . .. . . . . . . . . . . ... . . .. . . . .. . . . . . . . . . . .. ..... . .... ....... .. . . . . .. . . .. . . . . . ............................................... .. . . . . . . .... .... ... . ... .................................... ... . . . . .. .. .. . . . . . ... . . . ... .. .... .................. .. .. . . . . . .. .. . .. . . . . . . . .. .. . . . . . . . .. . . . . . . .. . .. . . . . . . .. ..... ..... .. ... . . ... .. . .. ...... . .. . . . . ... ... . . .... . . .. . . . .. .
lowQualScore : 99 0 0 0 55 0 0 00000 0 0 0 000 0 33333 0 0 000 55 0 0 0 0 55 0 55 0 0000000000000 0 0 0 55 0 0 222 0 00 00 444 111 00 6 6 55555 00 444 6 00 444 3 6 00 3 555555 6 6 11111 555555 99 66 6 7777 444 55 0 7777 4 4 11 77777777777777777 0 0 8888888888888888888888888 0 0 0 55 00000000000 000 0 5555 55 0 3333 0 0 0 0 222222222222222222 4 8888888 6666 66 4 11111 333333 6 2 5555 99999999999 0 0 0 5555 0 111 4 4 4 8 44444444444444444 4 9 9999999 11111 11 4 66 0 11111 4 44444 333333 4 66 11 000000000000000 4 888 4 222 4 888 9 4 222222 222 9 3 4 22 888 9 4 333 11 888888888 4 4 0 0 0 44444444 0 0 99 4 0 99 0 99 99 99 99 0 99 0 0 0 888 0 888 99 0 99 99 55 0 9999999999 55 0 888 2 99 0 0 0 2222222 4 1 0 0 000 1 2222222 99 99 7777777 000 7 7 7 99 99 7 99 2222222222222222 4 7 000 4 7 777 1 7 99 000 7 7 7 7 7 7 99 7 7 000 0 000 0 0 000 99 0 888 1111 0 2 5 99 888 888 0 99 0 0 99 0 0 0 99 0 7 99 7 7 4 7 99 6 7 7 99 999 3333333 9999 0 99 99 99 7 7 99 7 7 7 7 7 7 7 4 7 7 000 7 7 66 7 7 7 99 7 7 7 0 4 7 7 7 7 7 99 33333 7 1111 0000000 77 4 4 7 7 66 7 7 99 7 7 7 4 7 00000000000000000000000000000000000000000000000 99 7 7 0 0 0 0 0000 6666 666 1 111 000000000000000000000000000000000000 888 4 0 2 4 99 99 99 0 0 0 0 0 888 0 0 0 666 99 6666 444444444444444444 99 99 0 0 0 0 0 22 99 0 99 0 0 0 1 0 0 0 99 99 0 2 0 0 0 0 0 00 0 4 0 0 6 0 99 0 99 0 0 0 6 7 7 99 77777 99999 99 444 4 7 444 77 7 99 333333 7 99 0 0 0 0 888 000 7 7 6666 0 0 22 0 0 0 11 4
consensus : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-TAT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--AC---GG----ANG-----GCCAT-TTCCG-AA-----A--AATTGT--TTT------AC-AG-AATG-T--AAA---------C-AA---CA-T----T--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-A-----------AG-AGA---T---CATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAA-ATT-GGCAC---GAAA-GT--TTGAGT---AAAGA-G-GACG-AGTTT-CC-GGT-GC--AA-C-GACGG---A-AAACTTTC-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA-TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GA--GTCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTG----T-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-AA--AGGGGTGA-AA-T-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAATC--A-AAGT-TA-TA-ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT----AAAA---TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTGAAA-TTT--A-A--AT---CTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
Reference ( family-1355 ) : TTGGT--ATAGCG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-TAT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CG-TGG--AC---GG----ANG-----GCCAT-TTCCG-AA-----A--AATTGT--TTT------AC-AG-AATG-T--AAA---------C-AA---CA-T----T--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-A-----------AG-AGA---T---CATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-CGCCGTTTC----ATT----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TC-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTCC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAA-ATT-GGCAC---GAAA-GT--TTGAGT---AAAGA-G-GACG-AGTTT-CC-GGT-GC--AA-C-GACGG---A-AAACTTTC-CAAC-T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---GA-T--T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA-TA--GACTTAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GA--GTCTCTG----TAAANTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ANAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTG----T-TTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--CGGCATCATC-AA--AGGGGTGA-AA-T-A-CCA-G-CA--TA--TG-T-GAAATC--A-AAGT-TA-TA-ATTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT----AAAA---TAGATAT-ATTT---ANA-TTTCACA-GGCATTGGAG-TTT--A-A--AT---CTGGA-GCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TGCAATG--TGTA----TTTATTATT-----------TTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGCGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-NTTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-NACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|1 : T--ATAGCG---GT-GACT-A-A-----AT-TA-C-ATT---C-GTTT----GCCAATCAA---TT--ACATT-TTC-AAA-TGAA--TGCT--A-A----AA--TCGT-T-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-TATTA-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CT--TTAT-T-GTC-----A--TA---A-GGCTA---CC-TT-TCAAAAC-TG------AATAAAT-G-----CTTG------GAATT-ATTTG-AT----GGTA---C--CC-TA---TTCG-TGGCCAC---AG----AAG-----ACCAC-TTCCC-GA-----A--TTTTTT--TTTTTTTTTAC-AG-A-TG-TC-AAA---------C-AA---CA-T----T--G-T-CA-T-CA-T-C-CGC----T-G-----------AC-AGAATTT---CATTAGACGCCA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----ATTT---------AT-A-TGCCA----GAA-TAAA-AAG-TTATCAA--TC-TGGTT-------TCAGT-A-C-------AAAC----TG--A-A-TAAAAT-----C-TATTC---CATTG-A--A-C--AGAGACC---T----CC-----GCATCTTTCTGCATT-TT---GCCTC---CAACGT-ATC-----TTCG--ATGCAGTGAGGTACGATTCCA-ACG---TTTCA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTGCTGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAATCTTT-ACTTC-TTAT-CACATAG-TTAGT---TA--TTTAG--G-GACAACTTAAGA-C-G-CGAA---TTACTT---T--TCTA-TCTTTG--CGCACATTT-A----------TAC-CAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-TTAT-------TTTTA-GA-TGT--GTCT-------TTGATTACTA--AATAATTG----CCTTAA---CTTAT-A-TTG--CCTAGT-A--TATTT----T-T--G-A----AA-TGCAAAGTTA---GAATATT-GGCACC--GACA-G------------------A-GACGCAGTTT-CCCGGT-GC--AA-C-AACGGCTAA-AAACTTTC--AAC-TCGGTA-GTCA--AATG-TTTTTTGA-T--T-T-ACA--TGAATA---TTG---TGGCTC--T--ATC-A--TAATTGT-ATTGCAACGTA--TA-TGAATATCT--T-AATAACGAAA-A-TA--GATCTAGCA-CACGTTTTTACATGGAATCTTT--AAAACTGC---GATTCTTCT---GA--TTCTCTGC---TAAATTTC--GACGGAAAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-CATCTTT-GT-TGGCGGAAATTCCCTGCTT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGA-CATA--GA-CAGGATATTT-CA--TGCATATTT-ACAT-ACGGAATTG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACCAA----TTG----T-TTTTTTA-ACAAATTCAA-GTATAA-A--CGGCATCATCGAA--AGGGGTGA-AA-TCATCCA-G-CA--TA--TGTT-GAAATC--ACAAGT-TA-TA-ATTAG-TATT--GGTTTTCTAGCTGAT-TCA-CCTGGCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCTCAAGAAAC---TAGATATAATTTTTGACA-TTTCACA--GCATTGAAA-TTT--ATAATAT---CTGGA-GCTAAAAATTACGGAAAA--TCGA-CCA-GACGCAT-GCCTGGCGACTAC-TTGTTTCA--TGCAATGTTTGTA----TT--TTATT-----------TTGG--AG--CTGCTT-ACT-TGTAGT-GCATTTCCAAAACG-ATTATCT--GCAACTTTA-TGGT-GGAACTGTGGTGTGTTTTG-ACA-GATGCTC--AACCAGCAA-TCTCACA-TAT-ATC-AACTATTGTTATTGAA-TTTTTTTT-GGAATA-TT-CATGGGTTGCAGGAAAGCAGGGGTGAG-TGTA-GATT--AGCGCGGACTAATTATTG-CACA-TGTTACAACTTCTTAGGAATGTAT-ATTTCTTTTC--TTTTATT-ACACAAGCAA-TTACTT-ATATTTTATATA--A---AGCTTTTG-TA--CTTCTTTGGTAGAAGTGTTCATAAACTTTTCTCA---A---AGCATTCTTCAAGGAGGGCCTA-AAAA-TTGAAA----TGCATGAGTCACCTTCATTGTACAT-GCACAATCCAATATGGCCGCTTTTA-GCAAC
gi|10 : ggt----TAAAAGTC--GACG--AAA--TTGCC-CGA--GTTATGTCT-C-TC-T--GT-TGG-GGGAAATTCCTG-TTTCAAG---CTTGACCACAGGTCCGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TTTCAAGTGCA-A-TA-AAATTATGTAA-TG-TT-TA-CA-TC--AT--TTAACC-A----TTT----TGTTTTTTA-ACAAA-TCAA-GTAT-A-A--ATGCATCATC-AA--AGGGGTGA-AC-T-A-CCA-G--A--TA--TG-AAGAAATC--ACAAGA-TA-TG-------------G--TTTCTAGT--AT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGT-AATAT-----A---TCT----AAAA---TAGAT------T---ATACTTTTACA-GGCA-----------------AC---CTGAA-GCTAAAAAATA--GAAAAG-C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TT-CAT--GCAATG--TGTA----TTTATT--------------TTGG--AG--CTA-TT-A-T-GGTAGTTGTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGATTGAACT-TGTGGT-TTTTGAA-A-AA--CTC--AA-C-GCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTAATG-A-ATTTTTTT--GAATA-TT-CAT-G--TGCAGG-AAGCA-GGATGA--TGTA--ATA--AG-G-GGACTGA-cc
gi|11 : T-GCCCTT-AC-CTGC-AATATAATATA---TCTA---AAAA---TAGATAT-ATTT-----------ACA-GGC------------------AT---CTGGA-TTT-AAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-A---GG-AACTACTTT-TTTCA--TGCAATG--TGTA----TTTATTA-------------TTGG--AG--CTG-TT-A-T-GGTAGT-GTATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-AA--CTC--TA-CGGCAATTCTCA-A-TAC-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GTTTACAGGAAAGCA-GGATGA--TGTA-GATA--AG-G-GGACTGA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAACCAA-TTAC-T-ATATTTT-AA-A--A---G--TTTTG-TA--CTTT-TTGTCAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---
gi|12 : TTC----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-TAAA-A----------------G--T-------TTAAT-A-C-------AAACC----G--A-ATGAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCACTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATA-AGTAAAG-A-AATTCC--ACG---TT-CA-CATTTCC-T--GCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAT----G---CCAAAT-TTTAATTT--TTAT-CA--TAG-TTAATA--TA--CT--G--C-GACAGC--AAGA-C-G-CTAA---TTA-TG---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-ATACAATAAATTATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------ATTTG-GA-TGT--G-TT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACT-A--GATAT----ta
gi|13 : tggcag-A-AT-A--T-ATA-----TT-TT-C-ATT---C-ATTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TT-T--A-A----AC--T----T-A-CAAGGAAA-TAAT--ATTT-GAAGTTAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---G--TT--TC--TTTT-T-GTC-CA--A--TA---A-G--TAGGTTC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----TTTG------GGATT-CT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--TC---CG----ACGTGAA-GTCATGTGCCGAAA-----A--AATTG----TC------ACAAG-AATT-T--AAA---------CAAA---CA-C----T--GCT-CA-T-AA-T-T-CGT----A-A-----------AG-AAA---TC--CGTTTG----CAC-TAA-T------C---T-TGGCG-TTC----ATT----------AT-A-TGC-A----AAA-at
gi|14 : atttggtagagtagataaaaaaaTTGGT--ATAATG-AAGT-A--T-A-T-----TT-TAAC-ATT---C-GGTT----GCCAA-CAA---TTT-ACATT-T-C-AAACTGAA--TG-T--AGA----AA--C----TTA-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-CAT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TC---T-CG-TGG--AC---GG----TCG-----GCCAT-TTCCG-AA-----A--AATTG---TTT------AC-AA-GACG-T--AAA---------C-AAG--CA-T----T--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-A-----------Acc
gi|15 : at-A----AAGTG-AAAAT-A---GAA-TTT-GGCAC---GGAA-TT--TTGAGT---AAAGA-G-GACG-AGTTT-CC-GGT-GC--AA-C-GACAG---A-AAACTTT--CAAC-T-GGTA-A-CA--AATG-ATT---GA----T-TTACG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TGAATTT-ATTGCA-C-TT--TA-TGATTAC-T--T-AATAA-AATA-A-TA--AACATAGCA-CATGTTTTTACATGGA-TCTTA--AAAATTGC---GATT
gi|16 : tcTTGGT--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTGT----GC-AA-TAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--T--T--A-A----AAAGT----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-TAT-T-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--CC--TTGT---GTC-C---A--TA---A-G--TA---CC-TT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-A-----CTTG------GGATT-AT--G-AT----GGTA---
gi|17 : at-AAACTTTC--AACAT-TGTA-G-CA--TATA-TGT---GGGTGAT-TTA-----GGATA---TTG---TGG-TCATTG-ATCTA--TTAATGT-ATTGCA-C-AA--TA-TGATTAT-TAAT-AATAT-GATAAATTAGTGACTTAGCATCACGTTT
gi|18 : gTC-TTGGTGGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCGTACATGTAGTA-TCTT-AAAGAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACgtttatagtacttttg
gi|19 : AG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACcc
gi|2 : TTGGT---TAGCG-A-GT-A--T-T-A-----CTATA-C-ATT---CCGTTT----GC-AA-CAA---TTTAACATT-TTC-AAA-TGAA--TG-T--G-AGGGAAA--C----T-AACAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAA-GAT-A-G-CGCA--TTGGACAGTTGA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-A---AAATA---A-G--TA---CCCTT-C--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GAATT-ATT-G-AT----GGTA---C--CCCTAG--T-CGGTGG--AC---AG----AAG-----GCCAT-TTCCG-AA-----A--A-TTGT--TTT------AC-AA-AATG-T--AAA---------C-AAATACA-T----TTTG-T-GA-TTCA-TAT-CGTTTTTG-A-----------AGGAGA---T---CATAAG----CAAATAAAT-----AC---G--GCCGTTCA----GTA----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-A-G-T-A-CAAA-TC-TG--T-------TCAGT-AAC-------AAAC----TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-T---CAT---GGGA-C--AAA--CCCG-T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TTT--GC-TC---CAAAGT-AT------TTC---A-G-TGTGAGG-A-GTTTCCA-AGC---TT-CA--ATTTCCAC-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGATCA-TTAT-TAC----GGCGCCAAAT-TTT-ACTT--T-AT-CA--TAG-TT-GTAAATA--TT--G--G-GA--AC--AAGAAC-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTGGGC--ACATTT-A----------TG--CAA-TTTAT---TGTT----ATATT-T-AT-------TATTA-GAGTAT--GTTT-------ATGATTA--A--A-TAATGT----CCTTAA---CTTATGA-T-G--C--ACT-AATTATGT----TAT--G-A----A-GTG-AAAGT-A---GAA-ATT-GGCAC---GAAAAGT--TTGAGT---AAAGAAG-GACG-AGTTT----GGT-GCGAAA-CAGACGG---A-AAACTTTTTCAAC-T-GGTA-G-C-----TT-TTT---GA-T--T-TTACG--TGA-TA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TAAATAATGATTAT-T--TTAATAA-GATAAA-TA--GACTT-GCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTTGGAAAACTGC---GATTCTTCT---GA--GTCCCTGCCTGTAAAGTATAAGACG--AAAGGT-GCCGCGATGGTTATGT-TTC-TC-TTTGTATGG-GGAACGTGTCTG-TT--ATG---CTTGAGCAC-TGTCCGT-GAGAC-ATAA-GATCAGGATA-TT-AA--TGCA-A-TT-ACATTAGGTAA-TGGTT-TA-GACTCCAACTGA-AACC-A----TTG----T-TTTTTTATACAAA-TCAA-GTAT-ACA--CGGCATCCAC-AA--AGGGGTGA-AA-T-AACCAAG-CA--TGGTTGGT-GAAATCTGA-AAGT-TAGTA-ATTAG-TA-AAAG--CTTCTAGTTGATGTCAACCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATAGTGTCT----ATAA---TAGATAT-ATTT---ACAGTTTCACAAGGCATTGGAAATTT--A-AT-AT---ATGGA-GCTAAAAAATA--GAAAAAAC--A-CCAAGA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-GCCAATG--TGTA----TTTATT--T-----------TTGGT-AG--CTG-T--A-T-GGTAG--GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTAATGGA-TGAACT-TGTGGTGTTTTG-A-AAGA--CTC--AAACAGCAAATCTCA-AATAT-ATCGAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTTTGGAATATTT-CAT-GGTTGCAGAAAAGCA-GGGTGAATTGTACGATT--AG-G-G-ACTAAATATTG-AGCAGTGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTTCTTTTTA-TGACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-TACA--A---G--TTTTGATAAACTTC-TTTGTAGAA-TGTT-A-AAAATTT-CTCA---A---ATCA-TCTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTCAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAAccc
gi|20 : CAATATGGCCG--TTTA-GCAAC
gi|3 : TTGGT--ATAGCG-A-GTTA--T-A-A-----TT-TA-C-ATTTTTC-GTTT----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AA--C----T-A-CAAGAAAA-TAAT--CTTTTGAAG-TAT-A-G-CGCA--T--GACAGTTGA---GTTTT--TC--TTTT-T-GTCTC---A--TA---A-G--TA---CC-TTTC--AAAC-TG------A-TAAAA-G-----CTTT------GAATT-AT--G-AT----GGTA---C--CC-TA---T-CT-TGG--AC---AG----AAG-----GCCAT-TTCCG-AATTTTT-----TTTT--TTT------AC-AG-ATTG-T--AAA---------C-AA---CA-T----T--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-A-----------AG-AGA---T---CATAAG----CA--TAA-T-----AC---G-TACCGTTTC----AT-----------AT-A-TGC-A----GAA-TAAA-AAG-T-A-CAA--TA-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACT---TG--A-AATAAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCTGTG---T-TT---GC-TC---CA--GT-AT------TTC---AGG-AGTGAGG-A-GATTCCA-ACG---TT-CA-CATTTTC-C-AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGTG-A-TTAT-TAC----GA--CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACATTT-A----------TATACAA-TATTT---TGTTTC--AT-TT-T-AT-------TTTTA-GA-TGT--GTTT-------TTGATTA--A--AATAATGT----CCTTAA---CTTAT-A-T-G--C--ACTTA--TATAT----T-T--G-A----AAGTG-AAAGT-A---GAATATT-GGCAC---GAAA-GT--TTGAGT---AAAGA-G-GACG-AGTTT-CC-GGTTGC--AA-C-AACGG---A-AAACTTTT-CAA--T-GGTA-G-CA--AATG-TTT---TA-T--T-TTAGG--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AATAA-GATATA-TA--GACTGAGCA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGC---G-TTCTT------------TCTG-------AGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TTG-GGGAATTCCCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTACGT-AGGACCATA--GA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-ACAC-AGGTAA-TG-TTATAAGA-TC--AC--A-AACC-A----TTG----T-TTTTTTA-ACAAAATCAAAGTAT-A-A--CGGCATCATC-AA--AGGGGTGATAA-T-A-TCA-G-CA--TA--TG-T-GAAATC--A-AAATGTA-TA-ATTAGATA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTT-AC-CTGC-AATATGATATA---TCT----AAAAAA-TAGATAT-ATTT---ACA-TTTCACA-GGCATTGAAA-TTTTAA-AT-AT---CTGGACGCTAAAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-ATTG---GG-AACTAC-TT-TTTCAT-TTCAATG--TTCAATTTTTTATTGTTAGTAGGGTGCTTTGGTTAGGACTT-TT-AAT-GGTAGT-GCATT---AAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGGACT-TGTGGTGTTTTG-A-A-GA--C-C--AA-CAGCAACTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-A-ATTTTTTT-GGAATATTT-CAT-GGTTGCAGGAAAGCA-GGGTGA--TGTA-GATTGTAG-G-GGACTAA-TATTG-CACA-TGTTACAACT--TTAGGAATGT-T-A-TTCTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAAATTAC-TTATATTTT-TATA--A------TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TTTT-AAGGAG----TA-AAAA-TTGAAA-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACATGGCA-AATCCAATATGGGCG--TTTAGGCAACcccttaatgtgca
gi|4 : T--ACAGTG-A-GT-A--T-A-A-----TT-TA-C-ATT---C-GTT-----GC-AA-CAA---TT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-T--A-A----AC--T----T-G-CTAGAAAA-TAAT--CTTT-GAAG-TAT-A-G-CGCC--T--GACAGT-GA---GTTTT---C--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G---G---CC-TT-C--AAAG-TG------A-TAAAA-G-----CTTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CT-TC---T-CG-TGG--ACAATGGCCGTATGTAGAAGCCAT-GTTCG-AA-----A--AAT-GT--AA-------AC-AG-AATG-T--AAA---------C-AA---CA-C----T--G-T-GA-T-CA-T-T-CGT----G-A-----------AG-AGA---C---CATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--GCCGTT-C----AT-----------AT-A-TGC-A----AAA---AA-AAG-T-A-CGA--TT-TG--T-------TCAGT-A-C-------AAACC----G--A-AA-AAAAT-----C-TAT-A---CAT---G--A-C--AAA--CC---------C-----G-ATCTCTGTG---T-TT---CC-TT---CAA-GT-AT------TTC---ATG-ATTGAGG-A-GATTCCA--CG---TT-CA-CATTTCC---AGCC--AT---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTT--TTAT-CA--TAG-TTAGTA--TA--TT--G--G-GACAAC--AAGA-C-G-CGAA---GTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--AC-----A----------TATAAAA-TAATT---TGTTTC--A--TT-T-AT-------TTTTA-GA-TA-----TT-------GTGATTA--A--AATAATAT-----CTTAA---C--AT-A-T-G--C--ACT-A--TATAT----T-T--C-A----AAATG-AAAGT-A---GAA-ATT-GGCAC---G-AA-GT--TTGAGT---AAAAA-G-GACG-AGTTT-CC-GGT-GC--AA-C-GACAG---A-AAACTTTC-AAAC-T-GCTA-A-CA--AATG-ATT---GA----T-TTACA--TGAATA---TTG---TGG-TC--TG-ATC-A--ATAATGT-ATTGCA-C-TA--TG-TGATTAC-T--T-AATAA-GATATA-TA--GACATAACA-CACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTA-AATTCTTCTTGAAA--GTCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--A--ATAT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---C-TGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--A---A-AACC-ATTGGTTG----T-TTTTTT--ACAAA-TCAATTTAT-A-A--CGCCATCATC-AA--AGGGGTGA-AA-T-A-CCA-G-C-------------------------------A-GTTAG-TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA--CT-GCCCTT-AC-ATGC-AATATGATAT------T----GAAA-----------ATTT---AAA-T----------------------------AT---CTGGA-GTT-AAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-AACTAC-TT-TTTCA--TGCAATG--CG--------TATTATT-----------TTGG--AG--CTGTTT-A-T-GGTAGT-GCATTT-CAAAAC--ATTAT-T--GCAACTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TATAATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATAGTT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GGGCTGA-TTTTG-CACA-TGTTACAACT--T--------------TTCT------TTTTA---ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTT--TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAATTTGAAGTTTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATAT-GCCG--TTTA-GCAAC
gi|5 : A--T--GACAGTTAG---TTTTT--TT--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA---C--TT-C--GA-C-TG------A-TAAAA-G------TTG------GGAT--AT--G-AT----GGTA---C--CC-T----T-CG-TGG--AC---G------AG-----GCCAT-TTCCG-AA-----A--AATTAA-----------AC-AG-AATG-T--TAA---------C-AAA--CACT----T--G-T-------A-T-T-CGT----A-A-----------AG-AGA---T---T---------CA--TAA-T-----AT---A-CGGCGTT-C----TTT----------ATTA-TGA-A----GAA-TAAT---G-T-A-CAA--T--TG--T-------TCAGT-ATC-------AAA-----TG--A-AATAAA-T-----C-TAT-A---CAT------A-C--AAA--CC---T----CC-----C-ATC-CTGTG---T-TT---GC-TC---CAA-GT-AT------TTC---ATGCAGTGAGGGA-GATTCCT-CGG---TT-CA-CATTTCC---AGCC---T---------CA-TGGTG-TGAT-A-TTAT-TAC----G---CCAAAG-TT---CTT--TTCT-CA--TAG-TTG--A--TA--AT--G--G-GGCAAC--AAGA-C-G-CGAA---T-A-TT---TATTCTA-TCTTTG--C--A------G----------TGTAAAA-TATTC----GTT-C--AT-TT-T-AG-------TTT-A-GA-TGT--GTTT-------T-GATTG--A--AATAGT-------CTTGA----TTAT-AAT-G--C--ACT-A--TATAT----T-TTGA-A----AAGTG-AAAGT-A---GAA-TTTTGGCAC---GAAA-GTAGTTGAGT---AAAGA-G-GACG-AGTTT-CC-GGT-GC--AA-C-AACAG---A-AA-CAT---CAAC-TTGGTA-A-CA--AATG-TTT---GA-T--T-T-ACGGGTGAATA---T------GG-TC--TG-ATC-A--TTAATGT-ATTGCA-C-TA--TA-TGATTAT-T--T-AA--A-GATATG-----GAATAACCA-CACGTTTT-ACATGA---CTTT--AAA-CTGC---GATTCTTCC---GAT-GTCTCTG----TAAAGTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--GTTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAA-TTCCCTG-TT-TATGTTGCTTGACCAC-TGTCCGTTAGGGCCATATTGA-CAG-ATA-TT-GA--TGCA-A-TTTAAAT-AATTA--TG-TT-TA-GA--C--AG--A-AACC-A----TT-------TTTTTTA--CAAA-TCAA-GTAT-A-AAACGGTATCA---AA--AGGGGTGA-AA-T-A-CCA-GGCAATTA--TG-T-GAAATT--A-AAGTATA-TAGATTAG-TA----G--TTTCTAGTTGAT-TCA-CCT-GCCCTTTAC-CTGCCAATATGATATA---TCT----AAAAAACTAGATAT-ATTT---ACA-TTTTACA-GGCAT-GAAA-TTT--A-A--ATTATCTG-A-GCTAAAAA-TA--GAAAA--C--AACCA-GG-A-GT-A---TG-AACTAC-TT-TTTCAT--GCAATG--TGTA----TT----ATT-----------TTGG--AG--CTG-TT-A-TAGGTAGT-GCATT--CAAAACGAATTAT-T--GCAACTT-A-TGGA-TGAA---TGTGG-GTTTTT-A-A-AG--TTCTAAA-CAGCAATTCTCA-A-TATTATCCAACTATTGTTAT-G-A-TTTTTATT-TTAATATTTTCAT-GGT-GCAAGAAAGCA-GGGTGA--TATA-GATT--AG-G-GAACTGA-TGT-G-CACA-TGTTACAACT--TTTTATATGT-TTA-TTCTTTTC--TTATA-T-ACACAA-CA--TTAC---ATCTTTT-TACTTTATTTG--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTTAGA-TGTG-T-AAACTTTTCGCA---A---AGCA-TCTT-AAGGAG----TAGAAAA-TTGAAG--TTTGAATGA--CA-TTTCATTGTACAT-GCA-AATCC---ATAGGCG--TTT--GCAACcc
gi|6 : aggaaaataaaataacatataatgaaagaaattaaatagacgacaa--ATAGTGGA-GT-A--A-A-AAAA--TT----C-ATT---C-GTTTT---GC-AA-CAA---TT--ACATTCT-CAAAA-TTAA--TG-T--A-AC---AA--CT---T-A-CAAG-AAA-TAATAACTTT-GAAGCTAC-AGG-CGCAAGT--GACAGTTGAAGTATTTTAATCTGTTTT-T-GCC-C---A--CATC-ACG--TA---CCATT-C--AAAC-TGGTATTTA-TAAGACG-----CTTG------GGATA-AT--GTAT----GGTA---C--CC-cc
gi|6 : ggAT-TTCCG-AA-----A--AATTGT--AC-------AC-AGTAAAA-T--AGAACTAGCTATC-AA---TA-TCGAGT--G-T-G----CA-T-T-CAT----C-ACATCCGCTCCGAC-AGA---T---CAAAAA----CA--TAA-TTAAGAAC---GGCACCGCTTC----ATT----------AT-ACTGC-AACCTGAA-TAAA-AGT-T-A-CAAACTC-CG--TAAAAATCTTGGT-A-CATATTATAAAAC---TG--ATAATGAAGA-----T-TAT-ACTTCATTTCG--AGC--AAA--CCAAAT-------------ATATCTGTG---T-TT----C-CCTAGCAA-GTCATGATCCACTC---ATG-AGTGAGGAA-GATCCC--ATG---TT-CA-CATTT-C-C-AGCC--ATAGAAAACGGCT-TCGTG-TGAC-A--TATCTACACCTA---CCAATT-TTT-TCTT--TAAT-----TAGATAAGTG--TAACTT--G--GTGACAAC--TGGT-CAG-CGAAACGTTA-TTTGGT--TCAACTCTATG--CA-ACTTTTGA----------TAAACA---ATTT---TATTTC--AT-TTCT-AA-------T-----GA-TG---GTGT-------TTGATTT--ACGAACCACGTGATCCCATAAAATCTTAT-A-C-GCCC--ATT-A--AATATACGGC-T--GTATAATAAGTGTAAAGT-AGCGGAA-ATT-GGCATCTAAAAA-GT--TTGAGTGCAAAGGA-GAGATT-AGCTTGCC-----AC--AAGC-GACAG---ACAGAGATTC-TAAG-TGGGTATA-CAGGAATGCCTT---GA-T--GATTAGG--TATATATATTTGGCATGG-TC--CGTGTT-GTTTTAATGTGA--GCA-C-TA--TA-cgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaatttccgaaaaattgtacacagtaaaatagaactagctatcaatatcgagtgtgcattcatcacatccgctccgacagatcaaaaacataattaagaacggcaccgcttcattatactgcaacctgaataaaagttacaaactccgtaaaaatcttggtacatattataaaactgataatgaagattatacttcatttcgagcaaaccaaatatatctgtgtttccctagcaagtcatgatccactcatgagtgaggaagatcccatgttcacatttccagccatagaaaacggcttcgtgtgacatatctacacctaccaattttttctttaattagataagtgtaacttggtgacaactggtcagcgaaacgttatttggttcaactctatgcaacttttgataaacaattttatttcatttctaatgatggtgtttgatttacgaaccacgtgatcccataaaatcttatacgcccattaaatatacggctgtataataagtgtaaagtagcggaaattggcatctaaaaagtttgagtgcaaaggagagattagcttgccacaagcgacagacagagattctaagtgggtatacaggaatgccttgatgattaggtatatatatttggcatggtccgtgttgttttaatgtgagcactataata
gi|7 : ggatagtggagtaaaaaaattcattcgttttgcaacaattacattctcaaaattaatgtaacaacttacaagaaataataactttgaagctacaggcgcaagtgacagttgaagtattttaatctgtttttgcccacatcacgtaccattcaaactggtatttataagacgcttgggataatgtatggtaccccgaggatatattaagagtccagtcggttcgtaaccctccgtcgtccaactccccatcatacgagctcgcaactagaaccaACGTTTTTACATGGA-TCTTT--AAAACTGCTATAATTCTTCT---GAAAGTCTCTG----TAAATTTC--GACG--AAA--T-GCC-CGA--ATTATGT-T-C-TC-TT-GT-TGG-GGAAATTCTCTG-TT-CATG---CTTGACCAC-TGTCCAT-AGGACCATA--AA-CAGGATA-TT-CA--TGCA-A-TT-AGAT-AGGTAA-TG-TT-TA-GA-TC--AC--A-AACC-A----TTGGTTGT-TTTTTTA--CAAA-TCAA-TTAT-A-AA-CGGCATCATC-AACAAGGGGTGA-AAAT-A-CCA-G-CA----------------------AGT-T-------T---TA-T--G--TTTCTAGTTGAT-TCA-C-T-GCCCTT-ACATTGC-AA-ATGATAT------T----GAAA---T---------TT---AAA-TATC--------TTGGAG-TT-----------------------AAAAATA--GAAAA--C--A-CCA-GA-G-AT-G---GG-A-CTAC-TT-TTTCATCTGCAA-G--CGTA----TT----ATT-----------TTGG--AG--CTG-TTTA-T-G-TAGTAGCATTT-CAAAAC--ATTAT-TTAGCA-CTTTA-TGGA-TGAACT-TACGGTGTTTTG-A-A-GA--CTC--AA-CAGCAATTCTCA-A-TAT-ATCAAACTATTGTTATTG-ATTTTTTTTT-GGAATG-TT-CAT-GTTTGCAGGAATTCA-GGGTGA--TGTA-GATT--AG-G-GG-CTGATTTTTGCCACA-TGTTACAA---------------------CTTTTC--TTTTA-T-ACACAA-CAA-TTAC-T-ATATTTT-AACA--A---G--TTTTG-TA--CTTC-TTGGTAGAA-TGTT-A-AAACTTTTCTCA---A---AGCA-TCTT-AAGAAG----TA-AAAA-TTGAAG-TTTTGCATGAGTCA-CTTCATTGTACAT-GCA-AATCCAATATGGCCG--TTTA-GCAACata
gi|8 : TTGGTTTATATTG-A-GTTA--TTA-C-----TT-TA-C-ATTT--C-GTT-----GC-AA-TAA---T---ACATT-T-C-AAA-TGGAATTG-T--A-A--------C----TTA-CAAGAAA--TG-T--CTTT-GA-G-TAT-A-GGCGCA--T----------------TTT--TC--TTTT-T-GTC-C---A--TA---A-G--TA----C-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-G-----CTT-------GGATT-TT--G-AT----GGTAGGTA--CC-TA---T-CG-TGG--AC---GA----GGG-----GCCA--TTCCG-AA-----ATTTTTTTT--TTT------AC-AG-AATGTT--AAA---------CAAA---CA-T----T--G---GATT-CATT-T-CGT----G-A-----------AG-AGAAT-T---TATAAG----CA--TAA-T-----AC---G--ACCG-TTC----ATT----------A--A-TGC-A----GAATTAAA-AAGTT-A-CAA--TC-T---T-------TCAGT-A-C-------CAACT---TG--A-A--AAATT-----CGTAT-A---CAT---G--A-CA-AAA--CC---T----CC-----G-ATCTCAGTG---T-TTTGGGC-TC---CAA-GT-AG------TTC---ATG-AGTGAGA-G-TTTTCCA-ACG---TTCCA-CATTGTC-C-AGCC--AT---------CATTGGTG-TATT-ATTTAT-TAC----G---CCAAAT-TTT-ACTTAATTATCCA--TAG-TTAGTA--TA--TT--GGTG-GACAAC--AAGA-C-GCCGAA---TTA-TT---T--TCTA-TCTTTG--C--ACA-TT-A----------TAT-CAATTGTTTTTGTGTTTCAGAT-TG-T-ATGGAATTCTTTTATGA-TGCTAGTTTATTTCAATTAATTA--A--Acccttaaacaatata
gi|9 : atAGCG-A-GT-A--T-A-AAATTCTT-TA-CCATT---CAGCTTACGTGC-AA-CAGCATTT--ACATT-T-C-AAA-TGAA--TG-TTAA-A----AA--CCACTT-A-CAAGAAAAATAAT--CTTT-GAAG-TAT-A-GACGCA--T--GA-AGTTGA---GCTTT--TC--TTTTATAGTT-CGCGA--TATCCA-G---A---CC-TT-C--AAACTTG------A-TAAAA-GTTCTTCTCGTGACGAGGGTTAAT--G-ATTCCCACTA---CTTCC-TATTCT-TG-TGG--AC---AG----ATGC----GCCAT-TTCCG-AA-----A--TTTTTTTATTT------AC-AGAAATG-CTAAAA---------CAAA---CA-T----A--G-TCGA-T-CA-TATACGT----GCA-----------AG-AGA---TGAGTACAAGTT--CG--CAA-T-----ACATTA-CGGCATTTCCGGAATTCTTGGATGTGAT-C-TGC-G----AAA-TAAATAAG-T-A-C-A--TCATGC-T-------TCCGTAA-CA------AAACCCAATGAAA-AATAAAATCATCAC-TAA-C---CAT---G--A-CTAAGA--CC---TAAGACCCACGAG-A-CTCTGTG---TAAT---GC-TC---CAA-GT--T------TTCGGGATG-AGTGA-G-A-GATTCCAGACGGGCTT-CACCATTTCC-CAAGACAAAT---------CA-TGG-G-TGcgta