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Reference ( gi|2 )            :      TGCTAGGTTACACAA--TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA-TTGT-TTAGC-GCTTT--GA--TAA--AATT-C----TCATGGTTACGTCAT-TAA--T---ACGGC--T----GG-TAAA-T-----ATA--A-----C--G-G-----GA--A--AATT--TTTTAC-ATTT-ACATCAAAATACGGGA--A--CT--------T------AT--------------AT----T-----TGT--ATTTAACAT--T-------CTATT-T----TG-T-TGT---TATGT-G-AATTTGGT-TAATTTGTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAAACAAGTAAAA--TT--GGATTC-CTTC---CTCTCATTGAGCA-TC-CT--TGT-C-CA-A--ATTGAAGAT-GA-AG-TTGAA-CG-A-CAC-ATAA-----T---TT--TGTA------T-------------TTAATTTGA--A---A--GAACGAT-AAAG-T---G-GATTTGTTAC--G---TCATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Unaligned ( gi|18 ): TTCTATTTCTGTTGTATCTGTAGAATTTATTAATTTGAAAAAACAATAAAATTCGGAC






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Reference ( family-1348 )     :                                                 TGCTAGGTTACACAAATACAG-CAGCTATTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TG-AA--TTGTT--GCGC---TT--TGA--TAA--AGTT-CT-CATTGTTACGTCAT-TAATGTAACG-CT--GG-G-AA-A-T-----AT---A-TACG--GG-A-----A--AATT--TTTTAC-TTTT-ACAT-AAAATACGGGA--A-C-------T--------TAT--------------A-----T--CTG-ATTTAACAT--T-------CT---ATT-T----TG-T-TGT---TNTGTA-GA--A-TTTGNT-TAATTTGTA-GAAAAAAAAAACGAAAAAA-GAA---ACGA-TAAAA--TT--GGAT--T---T--T---NCTCT-CATTGAGAA-TC-CT--TGT-C-C-A--AAT-TGGAGA-TGA-A-GTT--GAA-CG-A-CAC-G-TAA-----T---TC--TGT--AAA-----T-------TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AA-AGTCG-GATT-T-TTAC-GCT-CATTGAGAATC-CT-TGTC-CCA-CAATGA-GATGAT
gi|1                          :                                                        TTACACAT-TACCA-CAGCTATTTC-AAAGTGATATACAAAA-GC-GCCAAATTTG-AA--TTGTT--ACGCTGTTT--TGAAGTAACTAGTT-C--GATTATTACGTCCA-TAATGTACCG-TA--GG-G-AA-A-A-----ATAAAA-TACC--GG-ATTATGA--AAAA--TTTTACTTTTT-ACAT-AAAA-ACGGGATCA-CCCTCCTAT--------TTT--------------A-----TTGTTG-ATTTATAATTAT-------CT---GTT-TC---TG-TCTGTGTCTCTGTA-TA--A-TTTATT-TAATTT-T--GAAAATAAAAACG-----A-TAATTTGCG--TGACA--TT----AT--TTACT--T---CCTC--CA-TGAGGACTC-CTGATGT-C-C-A--CATATTGAGA-TGA-A-CGT--G---CG-GTCACGG-TTA-----TTG-TCTATGT--AGA-----CTTATTTATTAATTTGAAAGGAG--AACGAT-CATATTCGCGA-T-T-TTACTTCT-CATTGAGAATC-CT-TTTCTTCA-AGATGACGATAA
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -TAA-----T---TT--TGT--A-------T-------TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AA-AGT-G-GATT-TGTTAC-G-T-CATTGAGAATCGCT-TGTC-CCACCAATGA-GATGATg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aAAA-GAA----CGA-TAAAG--T---GGAT--T---TGTT---ACG-T-CATTGAGAA-TCGCT--TGT-C-CCACCAAT---GAGA-TGATA-GTT---AA-CG---CAC-AATAAGATGTC---TC--TGT--AAGAAGTTTA------TTAATTTGAA---AAGAAACGAC-AG-AGTGG-GATT-T-T-AC-GCT-CATTGAGAATC-CTGTG----CA--AATGA-GATagttaacgcacaataagatgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataattttgtatttaatttg-TAA-----T---TT--TGT--A-------T-------TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AA-AGT-G-GATT-TGTTAC-G-T-CATTGAGAATCGCT-TGTC-CCACCAATGA-GATGATtgaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aAAA-GAA----CGA-TAAAG--T---GGAT--T---TGTT---ACG-T-CATTGAGAA-TCGCT--TGT-C-CCACCAAT---GAGA-TGATA-GTT---AA-CG---CAC-AATAAGATGTC---TC--TGT--AAGAAGTTTA------TTAATTTGAA---AAGAAACGAC-AG-AGTGG-GATT-T-T-AC-GCT-CATTGAGAATC-CTGTG----CA--AATGA-GATagttaacgcacaataagatgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaag
gi|12                         :                             ataattttgtatttaatttgTGCTAGGTTACACAAATACA--CAGCTATTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TG-AA--TTGTT--ACGC---TT--TGA--TAA--AGT---T-CATTGTTACGTCATATAATGTAACG-CT--GGTA-AA-A-T-----A----A-TACG--GG-A-----A--AA-T--TTTAAC-ATTT-ACAT-AAAA-AC-GGA--A-C-------T--------TAT--------------A-----T--CTG-ATTTAACAT--T-------CT---ATtgaag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                              acatTG-GTTTGACGT--T-------CT---ATT-TC---TG-T-TGTG--TTTCTA-AACAA-TTT-AT-AAATTT-TA------------C---------AA---ACGA-TAAAA--TTCAGTAT--T---T--T----CTCT-CATTGAAAA-TT-CT--TGT-CGC-A--CAT---GACA-TAA-A-GTT--AAA-GG-G-CAC-T-CAA-----T---
gi|14                         :                                              catTGCTAGGTTACACAAATACA--CAGCTATTTC-AAAGTAATATG-AAAA-GC-GCCAA---TT-AATTTTGTT--ACGC---TT--TGA--TAA--AGT---T-CATTATTACGTCA--TAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-------ATA--A-TATG--GG-A-----A--AA----ATATAC-TTTT-ACAT-AAAATcacaaaagctgttgctatgtaacagtgcgtattttgtg
gi|15                         :                                               atTGCTAACTTACACAAATACA--CAGCTACTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TT-AA--CTGTT--ACAC---TT--TGA--TAA--AGT---C-CATTATTAC-TCCT-AAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-------ATA--A-TACG--GG------------TTCATTTTAC-TTTT-ACAT-AAAA-ACGtggg
gi|16                         :                                               atTGTTAGGTTAAA-AAATACA--CAACGTTTTC-AAAACAATGTG-AAAAAGC-AGCAT---TG-AA--TTGTT--ACGC---TT--TGA--TAG--CGT---T-CATTAGTACGTCA--TAATGTAAAT-TTGAGA-G-AA-A-TAAAAAAT---AGTACG--GG-A-----A--AA----TTTTAC-TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          catT--T-------CT---ATT-TC---TG-T-TGTA--TCTGTA-GA--A-TTT-AT-TAATTTG-----AAAAAACAATAAAA
gi|2                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TG-AA--TTGTTTAGCGC---TT--TGA--TAA--AATT-CT-CATGGTTACGTCAT-TAAT---ACGGCT--GG-T-AA-A-T-----AT---A--ACG--GG-A-----A--AATT--TTTTAC-ATTT-ACATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------TAT--------------A-----T--TTGTATTTAACAT--T-------CT---ATT-T----TG-T-TGT---TATGT--GA--A-TTTGGT-TAATTTGTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAA---ACAAGTAAAA--TT--GGAT--TCC-T--T---CCTCT-CATTGAGCA-TC-CT--TGT-C-C-A--AAT-TGAAGA-TGA-A-GTT--GAA-CG-A-CAC-A-TAA-----T---TT--TGT----A-----T-------TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AA-AGT-G-GATT-TGTTAC-G-T-CATTGAGAATCGCT-TGTC-CCACCAATGA-GATGATttcggac
gi|3                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TG-AA--TTGTTTAGCGC---TT--TGA--TAA--AATT-CT-CATGGTTACGTCAT-TAAT---ACGGCT--GG-T-AA-A-T-----AT---A--ACG--GG-A-----A--AATT--TTTTAC-ATTT-ACATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------TAT--------------A-----T--TTGTATTTAACAT--T-------CT---ATT-T----TG-T-TGT---TATGT--GA--A-TTTGGT-TAATTTGTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAA---ACAAGTAAAA--TT--GGAT--TCC-T--T---CCTCT-CATTGAGCA-TC-CT--TGT-C-C-A--AAT-TGAAGA-TGA-A-GTT--GAA-CG-A-CAC-A-TAA-----T---TT--TGT----A-----T-------TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AA-AGT-G-GATT-TGTTAC-G-T-CATTGAGAATCGCT-TGTC-CCACCAATGA-GATGAT
gi|4                          :                                                 TGTCAGGTTACATG--TATAG-CAGTGATTTC-AAAGTAATGGG-AAAG-GC-GCTAA---TG-AA--TTGTT--GCGC---TT--TGA--TAA--AGTT-C---ATTATTACTTTAT--AATGTAACA-TT--GG-G-AACA-C-----A----A-CATG--GACA-----A--AATT--T---AC-TTTT-ATGT-AAA-TACAATA--A-T-------C--------TATTATGGATACCATTGA-----T--CTG-GTTTAACGT--T-------CTGGTATTGC----TG-C-TGTGTCTCTGTA-TA--A-TTT-AT-CAATT--------AAAAAAAACG---------------GT-TAAAT--TC--GGAT--TC--T--T---CCTCT-CA-AGAGAA-TT-CT--TATCC-C-A--AAT---AAGA-TGC-A-GTT--GAAGCG---CAC-G-AAA-----T---
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        at-TGTC--TCTGTAAGA--A-GTTTAT-TAATTTG------------------AAAA-GAA---ACGA-CAGAG--TG--GGAT--T---T--T---ACGCT-CATTGAGAA-TC-C---TGT-G-C-A--AAT---GAGATTGA-AGGTT--G-A-CGCA-AAC-A-TAA-----TGTCTC--TGTAGAAA-----TTTG----TTAATTTGAA---AA--AGCGATAAA-AGTCG-GATTAT-TTAC-GCTCCCTTGA-AACC-CT---TC-CCA--AATGA-GATGAcacagaagttgcatgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TGTC--TCTGTA-GA--AATTTG-T-TAATTTG-----------------AAAAA-G------CGA-TAAAAG-TC--GGATTAT---T--T---ACGCTCCCTTGA-AA-CC-CT--T-C-C-C-A--AAT---GAGA-TGA-A-GTTACAAA-GG-G-CGC-G-CAA-----T---CA--T-T--AAA-----T-------TTagttacaaagggcgcgcaatcattaaatttgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                  tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataa-TGTC--TCTGTAAGA--A-GTTTAT-TAATTTG------------------AAAA-GAA---ACGA-CAGAG--TG--GGAT--T---T--T---ACGCT-CATTGAGAA-TC-C---TGT-G-C-A--AAT---GAGATTGA-AGGTT--G-A-CGCA-AAC-A-TAA-----TGTCTC--TGTAGAAA-----TTTG----TTAATTTGAA---AA--AGCGATAAA-AGTCG-GATTAT-TTAC-GCTCCCTTGA-AACC-CT---TC-CCA--AATGA-GATGAgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -TGTC--TCTGTA-GA--AATTTG-T-TAATTTG-----------------AAAAA-G------CGA-TAAAAG-TC--GGATTAT---T--T---ACGCTCCCTTGA-AA-CC-CT--T-C-C-C-A--AAT---GAGA-TGA-A-GTTACAAA-GG-G-CGC-G-CAA-----T---CA--T-T--AAA-----T-------TTagttacaaagggcgcgcaatcattaaatttgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|7                          : tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataaAA---TG-AA--TTGTT--ACGC---TT--TGA--TAA--AGTTGCTGTATTA-TA-GTTCTATAATGTAACG-TT--GG-A-AA-AGT-----A----A-TACG--GG-G-----AACAATT--TTTGAC-CTTTAACAT-TAAA-ACGGGA--A-C-------T--------TGT--------------ATAT--T--CTG-ATTTAACAT--TGAATGTGCT---ATT-TCTTCTG-T-TGTC--TCTGTA-GA--A-TTCTAT-CAATTTG-----------------AGAAA-GAA---GC-A-TAAAATCTC--GAAT--T---T--TTAGGGTCT-CATTG-GAA-TC-CT--TGT-C-C-gtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|8                          :                                                aTGCTAGGTTACACAAATTCCA-CAGCTATTTC-AAAGTGA-ATG-AAAA-GC-GCCTA---TGAAA--TTGTT---CGG---TTTATGAATTAA--AGT---T-CATTGATACGTCA--TAATGTAACGTTT--GG-GTAA-A-T-----A----A-TACGGTGG-A-----A--AA----TCTTAC-ATTT-AAA--AAAA-ACGGGA--A-CTCTTAA-T--------CAT--------------A-----T--CTG-ATTTAACAT--T-------CT---ATT-T----CGTT-TGTA--TTTGTA-GA--A-TTTAGTGTATTTTG--------------------AA-AAA---ACAA-TAAAA--TT--CGA---T---T--T---ACTCT-CATTGAGAA-TC-CT--ccagaatgcgatgatctttgaagagccacg
gi|9                          :                                                tTACCAGATCACACA--TATAG-CAGTTATTTC-AAAGTAGTAGG-AAAA-GC-GCCAG---TG-AA--TTGTT--GCGC---TT--TGA--CAA--AGT---T-CATCATTACGTTA--TAATGTAACA-TT--GG-G--C-A-T-----ACA--A-CATG--GG-G-----A--A--T--GTATAC-TTTT-ATAT--AAATGCAAGA--AGC-------TATTGTGAATAC--------------ATTTTCT--CTG-GTTTAACAT--T-------CT---ATTAC----TG-C-TGT---
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Reference ( family-1348 )     :                                                 TGCTAGGTTACACAAATACAG-CAGCTATTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGTT-CT-CATTATTACGTCAT-TAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-T-----AT-A---TACGG--G-A-----A--AATT--TTTTACNTTT-ACAT-AAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----TC--TG-ATTTAACATT-------CT---AT---TTCTGT---TGTNTCT--GTA-GA--A-TTTGAT-TAATTT-G--------AAAAAACAAAAA---GAAACGA-TAAAA--T-CG-G-AT----T--T--T---ACN--CT-CATTGAGAA-TC-CT--TGTC-C---A--AAT---GAGA-TGA-A-GTT--GAACGG-C--ACG--TAA-----T---TCT--GT--AAA-----T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG-CT-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
gi|1                          :                                                        TTACACAT-TACCA-CAGCTATTTC-AAAGTGATATACAAAA-GC-GCCAAATTTGAA--TTGTT--ACGCTGTTTT--GAAGTAACTAGTT-CG--ATTATTACGTCCA-TAATGTACCG-TA--GG-G-AA-A-A-----AT-AAAATACCG--G-ATTATGA--AAAA--TTTTACTTTTTACAT-AAAA-ACGGGATCA-CCCTCCTAT--------T------TT--------------A-----TTGTTG-ATTTATAATTAT-----CT---GT---TTCTGTCTGTGTCTCT--GTA-TA--A-TTTATT-TAATTTTG--------AAAA--TAAAAA-------CGA-TAATT--TGCGTG-ACATTAT--T--T---ACTTCCT-CCATGAGGACTC-CTGATGTC-C---A--CATATTGAGA-TGA-A-CGT--G--CGGTC--ACGGTTAT-----TG--TCTATGT--AGA-----C---TTATTTATTAATTTGAAAGGAGAACGAT-CATATTCGCG-ATTT--TACTTCT-CATTGAGAATC-CTTTTC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    --TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATttcaagatgacgataag
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gi|2                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA--TTGTTTAGCGCT---TT--GA--TAA--AATT-CT-CATGGTTACGTCAT-TAAT---ACGGCT--GG-T-AA-A-T-----AT-A----ACGG--G-A-----A--AATT--TTTTACATTT-ACATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----TT--TGTATTTAACATT-------CT---AT---TT-TGT---TGT-TAT--GT--GA--A-TTTGGT-TAATTT-GTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAAACAAGTAAAA--T-TG-G-AT----TCCT--T---CCT--CT-CATTGAGCA-TC-CT--TGTC-C---A--AATTG-AAGA-TGA-A-GTT--GAACGA-C--ACA--TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATttcggac
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Reference ( family-1348 )     :                                                 TGCTAGGTTACACAAATACAG-CAGCTATTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGTT-CT-CATTATTACGTCAT-TAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-T-----AT-A---TACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTACNTTT-A-CAT-AAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---C--TG-ATTTAACATT-------CT---ATTTCT---GT---TGT--CTCTGTA-G-A--ATTTGAT-TAATTT-G--------AAAAAACAAAAA---GAAACGA-TAAAA--T-CG-G-AT----T--T--T---ACN--CT-CATTGAGAA-TC-CT--TGTC-C---A--AAT---GAGA-TGA-A-GTT--GAACGG-C--ACG--TAA-----T---TCT--GT--AAA-----T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG-CT-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
gi|1                          :                                                        TTACACAT-TACCA-CAGCTATTTC-AAAGTGATATACAAAA-GC-GCCAAATTTGAA--TTGTT--ACGCTGTTTT--GAAGTAACTAGTT-CG--ATTATTACGTCCA-TAATGTACCG-TA--GG-G-AA-A-A-----AT-AAAATACCG--G-ATTATGAA--AAA--TTTTACTTTTTA-CAT-AAAA-ACGGGATCA-CCCTCCTAT--------T------TT--------------A-----T---TGTTG-ATTTATAATTAT-----CT---GTTTCT---GTCTGTGT--CTCTGTA-T-A--ATTTATT-TAATTTTG--------AAAA--TAAAAA-------CGA-TAATT--TGCGTG-ACATTAT--T--T---ACTTCCT-CCATGAGGACTC-CTGATGTC-C---A--CATATTGAGA-TGA-A-CGT--G--CGGTC--ACGGTTAT-----TG--TCTATGT--AGA-----C---TTATTTATTAATTTGAAAGGAGAACGAT-CATATTCGCG-ATTT--TACTTCT-CATTGAGAATC-CTTTTC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATttcaagatgacgataag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aT-TAATTT-G--------AAAGAAC-------------GA-TAAAG--T--G-G-AT----T--TGTT---ACG---T-CATTGAGAA-TCGCT--TGTC-CC--ACCAAT---GAGA-TGATA-GTT---AACG--C--ACAA-TAAGATGTC---TCT--GT--AAGAAGTTTA--TTA-------ATTTGAAAAGA-AACGAC-AGAGT--G-GGATTT--TACG-CT-CATTGAGAAT--CCTGT---GCAAATGAGATagttaacgcacaataagatgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ataattttgtat--TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATtgaag
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aT-TAATTT-G--------AAAGAAC-------------GA-TAAAG--T--G-G-AT----T--TGTT---ACG---T-CATTGAGAA-TCGCT--TGTC-CC--ACCAAT---GAGA-TGATA-GTT---AACG--C--ACAA-TAAGATGTC---TCT--GT--AAGAAGTTTA--TTA-------ATTTGAAAAGA-AACGAC-AGAGT--G-GGATTT--TACG-CT-CATTGAGAAT--CCTGT---GCAAATGAGATagttaacgcacaataagatgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaag
gi|12                         :                                     ataattttgtatTGCTAGGTTACACAAATACA--CAGCTATTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGT---T-CATTGTTACGTCATATAATGTAACG-CT--GGTA-AA-A-T-----A--A---TACGG--G-A-----AA--A-T--TTTAACATTT-A-CAT-AAAA-AC-GGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---C--TG-ATTTAACATT-------CT---ATtgaag
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acat--TG-GTTTGACGTT-------CT---ATTTCT---GT---TGT--GTTTCTA-A-ACAATTT-AT-AAATTT-T--------A-----CAAA---------CGA-TAAAA--TTCA-GTAT----T--T--T----CT--CT-CATTGAAAA-TT-CT--TGTCGC---A--CAT---GACA-TAA-A-GTT--AAAGGG-C--ACT--CAA-----T---
gi|14                         :                                              catTGCTAGGTTACACAAATACA--CAGCTATTTC-AAAGTAATATG-AAAA-GC-GCCAA---TTAATTTTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGT---T-CATTATTACGTCA--TAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-------ATAA---TATGG--G-A-----AA--A----ATATACTTTT-A-CAT-AAAATcacaaaagctgttgctatgtaacagtgcgtattttgtg
gi|15                         :                                               atTGCTAACTTACACAAATACA--CAGCTACTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TTAA--CTGTT--ACACT---TT--GA--TAA--AGT---C-CATTATTAC-TCCT-AAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-------ATAA---TACGG--G------------TTCATTTTACTTTT-A-CAT-AAAA-ACGtggg
gi|16                         :                                               atTGTTAGGTTAAA-AAATACA--CAACGTTTTC-AAAACAATGTG-AAAAAGC-AGCAT---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAG--CGT---T-CATTAGTACGTCA--TAATGTAAAT-TTGAGA-G-AA-A-TAAAAAAT-AG--TACGG--G-A-----AA--ATT--TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catTT-------CT---ATTTCT---GT---TGT--ATCTGTA-G-A--ATTT-AT-TAATTT-G--------AAAAAACAATAA---AAactt
gi|2                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA--TTGTTTAGCGCT---TT--GA--TAA--AATT-CT-CATGGTTACGTCAT-TAAT---ACGGCT--GG-T-AA-A-T-----AT-A----ACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTACATTT-A-CATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---T--TGTATTTAACATT-------CT---ATTT-T---GT---TGT---TATGT--G-A--ATTTGGT-TAATTT-GTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAAACAAGTAAAA--T-TG-G-AT----TCCT--T---CCT--CT-CATTGAGCA-TC-CT--TGTC-C---A--AATTG-AAGA-TGA-A-GTT--GAACGA-C--ACA--TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATttcggac
gi|3                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA--TTGTTTAGCGCT---TT--GA--TAA--AATT-CT-CATGGTTACGTCAT-TAAT---ACGGCT--GG-T-AA-A-T-----AT-A----ACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTACATTT-A-CATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---T--TGTATTTAACATT-------CT---ATTT-T---GT---TGT---TATGT--G-A--ATTTGGT-TAATTT-GTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAAACAAGTAAAA--T-TG-G-AT----TCCT--T---CCT--CT-CATTGAGCA-TC-CT--TGTC-C---A--AATTG-AAGA-TGA-A-GTT--GAACGA-C--ACA--TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
gi|4                          :                                                 TGTCAGGTTACATG--TATAG-CAGTGATTTC-AAAGTAATGGG-AAAG-GC-GCTAA---TGAA--TTGTT--GCGCT---TT--GA--TAA--AGTT-C---ATTATTACTTTAT--AATGTAACA-TT--GG-G-AACA-C-----A--A---CATGG--ACA-----AA--ATT--T---ACTTTT-A-TGT-AAA-TACAATA--A-T-------C--------T------ATTATGGATACCATTGA-----T---C--TG-GTTTAACGTT-------CTGGTATTGCT---GC---TGTGTCTCTGTA-T-A--ATTT-AT-CAATT-------------------AAAA---AAAACGG-TTAAA--TTCG-G-AT----TC-T--T---CCT--CT-CAA-GAGAA-TT-CT--TATC-CC--A--AAT---AAGA-TGC-A-GTT--GAAGCG-C--ACG--AAA-----T---
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            at---TGT--CTCTGTAAG-A--AGTTTAT-TAATTT-G--------AAAA-----------GAAACGA-CAGAG--T-GG-G-AT----T--T--T---ACG--CT-CATTGAGAA-TC-C---TGTG-C---A--AAT---GAGATTGA-AGGTT--G-AC-G-CAAACA--TAA-----TGTCTCT--GTAGAAA-----TTTGTTA-------ATTTGAAAA---AGCGATAAAAGTC-G-G-ATTATTTACG-CTCCCTTGA-AACC-CT--TCCCA--AATGAGATGAcacagaagttgcatgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---TGT--CTCTGTA-GAA--ATTTG-T-TAATTT-G--------AAA-------------AAGCGA-TAAAAG-T-CG-G-ATTA--T--T--T---ACG--CTCCCTTGA-AA-CC-CT--T-CC-C---A--AAT---GAGA-TGA-A-GTTACAAAGGG-C--GCG--CAA-----T---CAT---T--AAA-----T---TTagttacaaagggcgcgcaatcattaaatttgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                      tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataa---TGT--CTCTGTAAG-A--AGTTTAT-TAATTT-G--------AAAA-----------GAAACGA-CAGAG--T-GG-G-AT----T--T--T---ACG--CT-CATTGAGAA-TC-C---TGTG-C---A--AAT---GAGATTGA-AGGTT--G-AC-G-CAAACA--TAA-----TGTCTCT--GTAGAAA-----TTTGTTA-------ATTTGAAAA---AGCGATAAAAGTC-G-G-ATTATTTACG-CTCCCTTGA-AACC-CT--TCCCA--AATGAGATGAgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
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gi|7                          : tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataaAA---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGTTGCTGTATTAT-A-GTTCTATAATGTAACG-TT--GG-A-AA-AGT-----A--A---TACGG--G-G-----AACAATT--TTTGACCTTT-AACAT-TAAA-ACGGGA--A-C-------T--------T------GT--------------A-----TATTC--TG-ATTTAACATTGAATGTGCT---ATTTCTTCTGT---TGT--CTCTGTA-G-A--ATTCTAT-CAATTT-G---------------AGAAA---GAAGC-A-TAAAATCT-CG-A-AT----T--T--TTAGGGT--CT-CATTG-GAA-TC-CT--TGTC-CCCAG--AAT---GCGA-TGA-gtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
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gi|9                          :                                                tTACCAGATCACACA--TATAG-CAGTTATTTC-AAAGTAGTAGG-AAAA-GC-GCCAG---TGAA--TTGTT--GCGCT---TT--GA--CAA--AGT---T-CATCATTACGTTA--TAATGTAACA-TT--GG-G--C-A-T-----ACAA---CATGG--G-G-----AA----T--GTATACTTTT-A-TAT--AAATGCAAGA--AGC-------TATTGTGAAT------AC--------------ATTTTCT---C--TG-GTTTAACATT-------CT---ATTACT---GC---TGT--
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Reference ( family-1348 )     :                                                 TGCTAGGTTACACAAATACAG-CAGCTATTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGTT-CT-CATTATTACGTCAT-TAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-T-----AT-A---TACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTACNTTT-A-CAT-AAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---C--TG-ATTTAACATT-------CT---ATTTCT---GT---TGT--CTCTGTA-G-A--ATTTGAT-TAATTT-G--------AAAAAACAAAAA---GAAACGA-TAAAA--T-CG-G-AT----T--T--T---ACN--CT-CATTGAGAA-TC-CT--TGTC-C---A--AAT---GAGA-TGA-A-GTT--GAACGG-C--ACG--TAA-----T---TCT--GT--AAA-----T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG-CT-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
gi|1                          :                                                        TTACACAT-TACCA-CAGCTATTTC-AAAGTGATATACAAAA-GC-GCCAAATTTGAA--TTGTT--ACGCTGTTTT--GAAGTAACTAGTT-CG--ATTATTACGTCCA-TAATGTACCG-TA--GG-G-AA-A-A-----AT-AAAATACCG--G-ATTATGAA--AAA--TTTTACTTTTTA-CAT-AAAA-ACGGGATCA-CCCTCCTAT--------T------TT--------------A-----T---TGTTG-ATTTATAATTAT-----CT---GTTTCT---GTCTGTGT--CTCTGTA-T-A--ATTTATT-TAATTTTG--------AAAA--TAAAAA-------CGA-TAATT--TGCGTG-ACATTAT--T--T---ACTTCCT-CCATGAGGACTC-CTGATGTC-C---A--CATATTGAGA-TGA-A-CGT--G--CGGTC--ACGGTTAT-----TG--TCTATGT--AGA-----C---TTATTTATTAATTTGAAAGGAGAACGAT-CATATTCGCG-ATTT--TACTTCT-CATTGAGAATC-CTTTTC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        --TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATttcaagatgacgataag
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gi|14                         :                                              catTGCTAGGTTACACAAATACA--CAGCTATTTC-AAAGTAATATG-AAAA-GC-GCCAA---TTAATTTTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGT---T-CATTATTACGTCA--TAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-------ATAA---TATGG--G-A-----AA--A----ATATACTTTT-A-CAT-AAAATcacaaaagctgttgctatgtaacagtgcgtattttgtg
gi|15                         :                                               atTGCTAACTTACACAAATACA--CAGCTACTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TTAA--CTGTT--ACACT---TT--GA--TAA--AGT---C-CATTATTAC-TCCT-AAATGTAACG-TT--GG-G-AA-A-------ATAA---TACGG--G------------TTCATTTTACTTTT-A-CAT-AAAA-ACGtggg
gi|16                         :                                               atTGTTAGGTTAAA-AAATACA--CAACGTTTTC-AAAACAATGTG-AAAAAGC-AGCAT---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAG--CGT---T-CATTAGTACGTCA--TAATGTAAAT-TTGAGA-G-AA-A-TAAAAAAT-AG--TACGG--G-A-----AA--ATT--TT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  catTT-------CT---ATTTCT---GT---TGT--ATCTGTA-G-A--ATTT-AT-TAATTT-G--------AAAAAACAATAA---AAactt
gi|2                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA--TTGTTTAGCGCT---TT--GA--TAA--AATT-CT-CATGGTTACGTCAT-TAAT---ACGGCT--GG-T-AA-A-T-----AT-A----ACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTACATTT-A-CATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---T--TGTATTTAACATT-------CT---ATTT-T---GT---TGT---TATGT--G-A--ATTTGGT-TAATTT-GTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAAACAAGTAAAA--T-TG-G-AT----TCCT--T---CCT--CT-CATTGAGCA-TC-CT--TGTC-C---A--AATTG-AAGA-TGA-A-GTT--GAACGA-C--ACA--TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATttcggac
gi|3                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA--TTGTTTAGCGCT---TT--GA--TAA--AATT-CT-CATGGTTACGTCAT-TAAT---ACGGCT--GG-T-AA-A-T-----AT-A----ACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTACATTT-A-CATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---T--TGTATTTAACATT-------CT---ATTT-T---GT---TGT---TATGT--G-A--ATTTGGT-TAATTT-GTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAGAAACAAGTAAAA--T-TG-G-AT----TCCT--T---CCT--CT-CATTGAGCA-TC-CT--TGTC-C---A--AATTG-AAGA-TGA-A-GTT--GAACGA-C--ACA--TAA-----T---TTT--GT--A-------T---TTA-------ATTTGAAAG---AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTACG--T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
gi|4                          :                                                 TGTCAGGTTACATG--TATAG-CAGTGATTTC-AAAGTAATGGG-AAAG-GC-GCTAA---TGAA--TTGTT--GCGCT---TT--GA--TAA--AGTT-C---ATTATTACTTTAT--AATGTAACA-TT--GG-G-AACA-C-----A--A---CATGG--ACA-----AA--ATT--T---ACTTTT-A-TGT-AAA-TACAATA--A-T-------C--------T------ATTATGGATACCATTGA-----T---C--TG-GTTTAACGTT-------CTGGTATTGCT---GC---TGTGTCTCTGTA-T-A--ATTT-AT-CAATT-------------------AAAA---AAAACGG-TTAAA--TTCG-G-AT----TC-T--T---CCT--CT-CAA-GAGAA-TT-CT--TATC-CC--A--AAT---AAGA-TGC-A-GTT--GAAGCG-C--ACG--AAA-----T---
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            at---TGT--CTCTGTAAG-A--AGTTTAT-TAATTT-G--------AAAA-----------GAAACGA-CAGAG--T-GG-G-AT----T--T--T---ACG--CT-CATTGAGAA-TC-C---TGTG-C---A--AAT---GAGATTGA-AGGTT--G-AC-G-CAAACA--TAA-----TGTCTCT--GTAGAAA-----TTTGTTA-------ATTTGAAAA---AGCGATAAAAGTC-G-G-ATTATTTACG-CTCCCTTGA-AACC-CT--TCCCA--AATGAGATGAcacagaagttgcatgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---TGT--CTCTGTA-GAA--ATTTG-T-TAATTT-G--------AAA-------------AAGCGA-TAAAAG-T-CG-G-ATTA--T--T--T---ACG--CTCCCTTGA-AA-CC-CT--T-CC-C---A--AAT---GAGA-TGA-A-GTTACAAAGGG-C--GCG--CAA-----T---CAT---T--AAA-----T---TTagttacaaagggcgcgcaatcattaaatttgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                      tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataa---TGT--CTCTGTAAG-A--AGTTTAT-TAATTT-G--------AAAA-----------GAAACGA-CAGAG--T-GG-G-AT----T--T--T---ACG--CT-CATTGAGAA-TC-C---TGTG-C---A--AAT---GAGATTGA-AGGTT--G-AC-G-CAAACA--TAA-----TGTCTCT--GTAGAAA-----TTTGTTA-------ATTTGAAAA---AGCGATAAAAGTC-G-G-ATTATTTACG-CTCCCTTGA-AACC-CT--TCCCA--AATGAGATGAgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---TGT--CTCTGTA-GAA--ATTTG-T-TAATTT-G--------AAA-------------AAGCGA-TAAAAG-T-CG-G-ATTA--T--T--T---ACG--CTCCCTTGA-AA-CC-CT--T-CC-C---A--AAT---GAGA-TGA-A-GTTACAAAGGG-C--GCG--CAA-----T---CAT---T--AAA-----T---TTagttacaaagggcgcgcaatcattaaatttgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|7                          : tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataaAA---TGAA--TTGTT--ACGCT---TT--GA--TAA--AGTTGCTGTATTAT-A-GTTCTATAATGTAACG-TT--GG-A-AA-AGT-----A--A---TACGG--G-G-----AACAATT--TTTGACCTTT-AACAT-TAAA-ACGGGA--A-C-------T--------T------GT--------------A-----TATTC--TG-ATTTAACATTGAATGTGCT---ATTTCTTCTGT---TGT--CTCTGTA-G-A--ATTCTAT-CAATTT-G---------------AGAAA---GAAGC-A-TAAAATCT-CG-A-AT----T--T--TTAGGGT--CT-CATTG-GAA-TC-CT--TGTC-CCCAG--AAT---GCGA-TGA-gtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|8                          :                                                aTGCTAGGTTACACAAATTCCA-CAGCTATTTC-AAAGTGA-ATG-AAAA-GC-GCCTA---TGAAA-TTGTT---CGGT---TTATGAATTAA--AGTT-C---ATTGATACGTCAT--AATGTAACG-TTT-GG-GTAA-A-T-----A--A---TACGGTGG-A-----AA--ATC--TT--ACATTT-A-AA--AAAA-ACGGGA--A-C-------T--------CTTAATCAT--------------A-----T---C--TG-ATTTAACATT-------CT---ATTTCG---TT---TGT--ATTTGTA-G-A--ATTTAGTGTATTTT-G--------AAAAAACA-------------A-TAAAA--T-TC-G-A-----T--T--T---ACT--CT-CATTGAGAA-TC-CT--tctttgaagagccacg
gi|9                          :                                                tTACCAGATCACACA--TATAG-CAGTTATTTC-AAAGTAGTAGG-AAAA-GC-GCCAG---TGAA--TTGTT--GCGCT---TT--GA--CAA--AGT---T-CATCATTACGTTA--TAATGTAACA-TT--GG-G--C-A-T-----ACAA---CATGG--G-G-----AA----T--GTATACTTTT-A-TAT--AAATGCAAGA--AGC-------TATTGTGAAT------AC--------------ATTTTCT---C--TG-GTTTAACATT-------CT---ATTACT---GC---TGT--


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Reference ( family-1348 )     :                                                 TGCTAGGTTACACAAATACAG-CAGCTATTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TGAA-TT--GTT--ACGC---TTT--GA--TAA--AGTTC--AT-TATTAC-GTCAT-TAATGTAACG-TT-GG-G---------AA-A-T--AATACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTAC-NTTTA-CAT-AAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---CTG-ATTTAACAT--T-------CT---ATTTCT---GT---TGT--CTCTGTA-G-A--ATTTGAT-TAA-TTTG-------------------A-AA--AGAAACGA-TAAAAT-TCG---G-AT----T--T--T---AC--NCT-CATTGAGAA-TC-CT--TGT-C-C---A--AA---T--GAGA-TGA-A-GTT--GAACGG-C--ACG--TA--A----TCTTTGTA-AA---A---TT--TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTAC-GCT-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
gi|1                          :                                                        TTACACAT-TACCA-CAGCTATTTC-AAAGTGATATACAAAA-GC-GCCAAATTTGAA-TT--GTT--ACGCTGTTTT--GAAGTAACTAGTTCG-AT-TATTAC-GTCCA-TAATGTACCG-TA-GG-GAA-------AA-A-TAAAATACCG--G-ATTATGAA--AAA--TTTTACTTTTTA-CAT-AAAA-ACGGGATCA-CCCTCCTAT--------T------TT--------------A-----TTG-TTG-ATTTATAATTAT-------CT---GTTTCT---GTCTGTGT--CTCTGTA-T-A--ATTTATT-TAATTTTG-------------------A-AAATAAAAACGA-T--AAT-TTGCGTG-ACATTAT--T--T---ACTTCCT-CCATGAGGACTC-CTGATGT-C-C---A--CATATT--GAGA-TGA-A-CGT--G--CGGTC--ACGGTTATTG----TCTATGTA-GACTTA---TTTATTAATTTGAAAGGAG--AACGAT-CATATTCGCG-ATT--TTACTTCT-CATTGAGAATC-CTTTTC
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --TA--A----T-TTTGTA-----------T--TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTAC-G-T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATttcaagatgacgataag
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aT-TAA-TTTG-------------------A-AA--G--AACGA-TAAAGT---G---G-AT----T--TGTT---AC--G-T-CATTGAGAA-TCGCT--TGT-C-CC--ACCAA---T--GAGA-TGATA-GTT---AACG--C--ACAA-TA--AGATGTCTCTGTA-AG---AAGTTTA-TTAATTTGAA---AAGAAACGAC-AGAGT--G-GGATTT--TAC-GCT-CATTGAGAAT--CCTGT---GCAAATGAGATagttaacgcacaataagatgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaag
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    acatTG-GTTTGACGT--T-------CT---ATTTCT---GT---TGT--GTTTCTA-A-ACAATTT-AT-AAA-TTTT-------------------A-CA--A---ACGA-TAAAAT-TCA---GTAT----T--T--T----C--TCT-CATTGAAAA-TT-CT--TGT-CGC---A--CA---T--GACA-TAA-A-GTT--AAAGGG-C--ACT--CA--A----TC
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gi|15                         :                                               atTGCTAACTTACACAAATACA--CAGCTACTTC-AAAGTGATATG-AAAA-GC-GCCAA---TTAA-CT--GTT--ACAC---TTT--GA--TAA--AGTCC--AT-TATTAC--TCCT-AAATGTAACG-TT-GG-GA--------AA-A-T--AATACGG--G------------TTCATTTTAC-TTTTA-CAT-AAAA-ACGtggg
gi|16                         :                                               atTGTTAGGTTAAA-AAATACA--CAACGTTTTC-AAAACAATGTG-AAAAAGC-AGCAT---TGAA-TT--GTT--ACGC---TTT--GA--TAG--CGTTC--AT-TAGTAC-GTCA--TAATGTAAAT-TT-GA-GAGAAATAAAAA-A-T--AGTACGG--G-A-----AA--ATT--TT
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gi|2                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA-TT--GTTTAGCGC---TTT--GA--TAA--AATTCTCAT-GGTTAC-GTCAT-TAAT---ACGGCT-GG-T---------AA-A-T--ATAACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTAC-ATTTA-CATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---TTGTATTTAACAT--T-------CT---ATTT-T---GT---TGT---TATGT--G-A--ATTTGGT-TAA-TTTGTAAGAAAAAAAAAACAAAAA-AA--AGAAACAAGTAAAAT-T-G---G-AT----TCCT--T---CC--TCT-CATTGAGCA-TC-CT--TGT-C-C---A--AA---TTGAAGA-TGA-A-GTT--GAACGA-C--ACA--TA--A----T-TTTGTA-----------T--TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTAC-G-T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGATc
gi|3                          :                                                 TGCTAGGTTACACAA-TACAGTCAGCTATTTTGAAAGTGATATG-AAAA-GCTGCCAA---TGAA-TT--GTTTAGCGC---TTT--GA--TAA--AATTCTCAT-GGTTAC-GTCAT-TAAT---ACGGCT-GG-T---------AA-A-T--ATAACGG--G-A-----AA--ATT--TTTTAC-ATTTA-CATCAAAATACGGGA--A-C-------T--------T------AT--------------A-----T---TTGTATTTAACAT--T-------CT---ATTT-T---GT---TGT---TATGT--G-A--ATTTGGT-TAA-TTTGTAAGAAAAAAAAAACAAAAA-AA--AGAAACAAGTAAAAT-T-G---G-AT----TCCT--T---CC--TCT-CATTGAGCA-TC-CT--TGT-C-C---A--AA---TTGAAGA-TGA-A-GTT--GAACGA-C--ACA--TA--A----T-TTTGTA-----------T--TTAATTTGAA---AG--AACGAT-AAAGT--G-G-ATTTGTTAC-G-T-CATTGAGAATCGCTTGTCCCACCAATGAGATGAT
gi|4                          :                                                 TGTCAGGTTACATG--TATAG-CAGTGATTTC-AAAGTAATGGG-AAAG-GC-GCTAA---TGAA-TT--GTT--GCGC---TTT--GA--TAA--AGTTC--AT-TATTAC-TTTAT--AATGTAACA-TT-GG-G---------AACA-C--AACATGG--ACA-----AA--ATT--T---AC-TTTTA-TGT-AAA-TACAATA--A-T-------C--------T------ATTATGGATACCATTGA-----T---CTG-GTTTAACGT--T-------CTGGTATTGCT---GC---TGTGTCTCTGTA-T-A--ATTT-AT-CAA-TT---------------------A-AA--AAAAACGG-TTAAAT-TCG---G-AT----TC-T--T---CC--TCT-CA-AGAGAA-TT-CT--TATCC-C---A--AA---T--AAGA-TGC-A-GTT--GAAGCG-C--ACG--AA--A----TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            at---TGT--CTCTGTAAG-A--AGTTTAT-TAA-TTTG-------------------A-AA--AGAAACGA-CAGAG--TGG---G-AT----T--T--T---AC--GCT-CATTGAGAA-TC-C---TGT-G-C---A--AA---T--GAGATTGA-AGGTT--G-AC-G-CAAACA--TA--ATG--TCTCTGTAGAA---A---TTTGTTAATTTGAA---AA--AGCGATAAAAGTC-G-G-ATTATTTAC-GCTCCCTTGA-AACC-CT--TCCCA--AATGAGATGAacagaagttgcatgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---TGT--CTCTGTA-GAA--ATTTG-T-TAA-TTTG-------------------A-AA----AAGCGA-TAAAAG-TCG---G-ATTA--T--T--T---AC--GCTCCCTTGA-AA-CC-CT--T-C-C-C---A--AA---T--GAGA-TGA-A-GTTACAAAGGG-C--GCG--CA--A----TCATT----AA---A---TT--Tagttacaaagggcgcgcaatcattaaatttgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                      tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataa---TGT--CTCTGTAAG-A--AGTTTAT-TAA-TTTG-------------------A-AA--AGAAACGA-CAGAG--TGG---G-AT----T--T--T---AC--GCT-CATTGAGAA-TC-C---TGT-G-C---A--AA---T--GAGATTGA-AGGTT--G-AC-G-CAAACA--TA--ATG--TCTCTGTAGAA---A---TTTGTTAATTTGAA---AA--AGCGATAAAAGTC-G-G-ATTATTTAC-GCTCCCTTGA-AACC-CT--TCCCA--AATGAGATGAgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ---TGT--CTCTGTA-GAA--ATTTG-T-TAA-TTTG-------------------A-AA----AAGCGA-TAAAAG-TCG---G-ATTA--T--T--T---AC--GCTCCCTTGA-AA-CC-CT--T-C-C-C---A--AA---T--GAGA-TGA-A-GTTACAAAGGG-C--GCG--CA--A----TCATT----AA---A---TT--Tagttacaaagggcgcgcaatcattaaatttgtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|7                          : tgtctctgtaagaagtttattaatttgaaaagaaacgacagagtgggattttacgctcattgagaatcctgtgcaaatgagattgaaggttgacgcaaacataaAA---TGAA-TT--GTT--ACGC---TTT--GA--TAA--AGTTG--CTGTATTATAGTTCTATAATGTAACG-TT-GG-A---------AA-AGT--AATACGG--G-G-----AACAATT--TTTGAC-CTTTAACAT-TAAA-ACGGGA--A-C-------T--------T------GT--------------A-----TATTCTG-ATTTAACAT--TGAATGTGCT---ATTTCTTCTGT---TGT--CTCTGTA-G-A--ATTCTAT-CAA-TTTG-------------------AGAA--AGAAGC-A-TAAAATCTCG---A-AT----T--T--TTAGGG--TCT-CATTG-GAA-TC-CT--TGT-C-CCCAG--AA---T--GCGA-TGA-gtcgtgcagtcagtggactttttgcggagtagtatgttgcgaaggatttatgcgttagtgtttaaat
gi|8                          :                                                aTGCTAGGTTACACAAATTCCA-CAGCTATTTC-AAAGTGA-ATG-AAAA-GC-GCCTA---TGAAATT--GTT---CGG---TTTATGAATTAA--AGTTC--AT-TGATAC-GTCAT--AATGTAACG-TTTGG-GT--------AA-A-T--AATACGGTGG-A-----AA--ATC--TT--AC-ATTTA-AA--AAAA-ACGGGA--A-C-------T--------CTTAATCAT--------------A-----T---CTG-ATTTAACAT--T-------CT---ATTTCG---TT---TGT--ATTTGTA-G-A--ATTTAGTGTAT-TTTG-------------------A-AA----AAACAA-TAAAAT-TCG---A-------T--T--T---AC--TCT-CATTGAGAA-TC-CT--tctttgaagagccacg
gi|9                          :                                                tTACCAGATCACACA--TATAG-CAGTTATTTC-AAAGTAGTAGG-AAAA-GC-GCCAG---TGAA-TT--GTT--GCGC---TTT--GA--CAA--AGTTC--AT-CATTAC-GTTA--TAATGTAACA-TT-GG-G---------CATA-C--AACATGG--G-G-----AA----T--GTATAC-TTTTA-TAT--AAATGCAAGA--AGC-------TATTGTGAAT------AC--------------ATTTTCT---CTG-GTTTAACAT--T-------CT---ATTACT---GC---TGT--
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TGTTACGGGCAGCGGTCAGGCCTCATAAGTTGCTAGTTCGCCTTGCAACAGTTTTGTACTTTTATATAATGTGAGAAGAGTTAATGGTTAGATATGGTTTTCAATT