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gi|9                          : aTCTTTT-CAA-CA-ATATTC-ACT--AA--AGTGCGCA--AT----AAA-CA--CTTCTTT-AGGT--TTAT----AGTG-T-TTATCAC-----AC-A-A---A---------------------------T-TTA--GA--TC-A--T-TTGATAAAA--T----C---TTCT-A-GAA-CC-T-CACC-CGA---GTCTGAA--------C-------GACT-GT-A------AACA-A----AGCCTGGCC-C------A--G--TCTC-AGC---A--------TTGA-TT------TTAACACA----AC--TTC-----NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN-NN--A----ATCTCTA-GA--CGT--AAT-G----A-ATTA-T---GAAA-T---TAT-T--T----AG-GCCT--A--C--C-TTT--GT-------T---TACT---CAT---C---A--AA---ATG-T------C----ATT-G----A--A-CT-----GA----A----------T-----T-CT--TCC-----CA-T--TTGAT---CC-G-AT-AA-TA--T--CAA-------T-----GA---------------CGT--GAAAA-T-T-TA-A-A-T-T-TG-A--AA-GCA-----T-----T-G---TA--ATT---C--CA-T-TC---A---C-A-A------A---TAC-----T-TT--G-TT-T-TCT-----A-A--A--CA-C--C----GT--TT-----------------------------A-GC--T-AT--------------TC--C-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG--A--TC--GT--T-G----A-GG-TGGAT--TTCAAAAA---ACTCGCG--AC---G-AA-AA-C-TTTTTTCAAGGA---T-CTA-G---GC--C---AAC---GTC-A--T-G-GTGT-TA--C-----CA-C-C-----------A-----------A-------TACT--CG-G-TTAAAG-------TTTT---A-------AAAAGA-----ATA-C-A---ATA--GTT--ATGA-ATT
gi|11                         : aTCTTTT-CAA-CA-ATATTT-AAT--GA--ATC-TAAAGTAT----AAA-TAA-TTTGT------T--T-AT----AGTG-T-TTATCAC-----AC-A-A---A-A------CTA---T--AAG--CC-TGT-CT-----------------GAAAAAA--T----G--------------C--T-CA----GA---GTCTGA--------GC-------GGAT-GT-A------AA----------------C-A------A--T--TA-G-GCT---T-A----G-TC---TTAGCA--TTAGCACA-----A--CTTCNNN-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGCCACATTTCTCTCGCTTA-GAGCC----AT-TCTA-CA--CGT--AAC-G----A-AT-A-TAT-GAAA-A---TAT-T--TAC-TTT-GTTT--A--C--T-C----AT------------------CA----A---G--AATTAGTG-T------CTTGCAG--G----A--A-GT-----AGGCCTA----------T-AT--T-TT--TCC-----CA-T--C--------C-G-AT-AA-TA------CA-------A-----GAAG--A-----T--A-CGT--GCAAA-T-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GCA-----T-----T-G---TA--ATT---C--CA-T-TC---A---C-A-A------A---CACTTCGGT-TT--G-TT-G-CCT-----A-A--A--C--------------------------------A-TA-T-G---AAA-GTAAT-AT--T---A-G-----TC--A-A--C-A-ATCT---C-CT----------G---TCC-TTG--A--GC--GT--------------T-GAT--TTA-AGAA---ATTCGCA--TC---G-AC-AA-C-TTTTTCCAAGTA---C-ATACG---C---C---CAC---GTC-AA-T-G-GTGT-TA--CGT---CAACAA-----------AAT---------AAG-----TACTC-C--G-T--AAA-------TTTA---AAAG----A----A-----ATA-CAA---GTA--TTT-AATGA-AT
gi|19                         :  TTTTTAACAA-TATATAATG-ATTCTAA--AG--CATA---------AA-CAA--TTGT------T--T-AT----AGTG-T-TTATCAC-----AC-A-A---A-A-T-----TA---T--AGG--CT-TGT----------------C-T-GAAAAAA--T-----------------G-C--T-CA----GA---GTCTGAA--------C-------G-CT-GT-A------AACA-A----G---T
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gi|10                         :                                                 aagtgcgcatGCAT-AAGC--A-AC-----GCG-T-TTAT-AC-----AC-A-A---A-A-TAACACA-------------------TGA--AA--TC------T-GATAAAA--T----GC--T-CT-A-GA--------ATCTTGAATGGCCTTA---------C-------GGCT-GT-A------AACA-A----C---TG--CCACTTGGCA--G--TG-C-AAT---A-G----G-CC---TT--------AGCACAA---CAAACTTGCAAGATGTTCATAAGCAGGAATGACTGTGAATAGCAAGAATTATCCAATTAAACCAACAATTCTCTCCCTTAGA-GA--T----AT-TCTA-GA--CGT--AAC-A----A-AT-A-T---AAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCTT--A--C--C-TT---GT-------T---TACTCATCA----A---ATCAA---GTA-T------C----AT--G----C--A-CT-----GA----A----------TTAT--CACT--T----------T--C-GTT---CC-G-AT-AA-TA--TATCCA-------A-----GAG---A-----T--A-AGT--GAGAT-T-T-A--A-A-T-T-TG-A--AA-GCA-----T-----T-G---TA--AATT--C--CA-T-C----A---C-A-A------AA--CAC-----T-CT--G-TTTC-CCT-----G-A--A--TG-TTTC----GT--TAA-T--A--TT--TG--A-TACT-G---AAA-ATAAC-AT----TAA-T-----TCTCC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG--A--TT--GT--T-G----A-AC-T-GAT--TTA-AAAA---ACTCGCA--ACACGA-AA-AA-C--GTTTTCAAGTA---TGGTA-A---GTGCC---AAC---GTC-Aa
gi|2                          :                             aaaactttcaatatttaataatgcatctaaaTAT-GAGC--T-ACTTTAAGTG-TGTTATTTC-----AC-A-ATCGA-A-TTTAG--A---T--A----CC-AAT-TT-------------T-C-GATAAAA--T----CC--T-CT-ACGAG-CC-T-CACCTCGG---GTCTGAA--------C-------GGCT-GT--------AACA-A----G---gaaagtatagtactcggttaaagtt
gi|18                         :                            aaactaatcttcaacgaaatataccactacaacataaagacacgtttgactGTG-T-TTATCAC-----AC-A-A---A-ACTACA------------------TAT-------A--TC------T-GATAAAA--T----G---T-----------------TCTAGA---ATCTGAAAGGCCTTGC-------GGCT-GT-A------AACA-A----C---TG--C-AACTTGCA--G--TG-CAAAT---A-G----G-CC---TTCAAAGGCTAGCACA----CA--gcccccccccctggggccccagtctcagaggcgcattgatatttaagacaacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngatattctagacgttaatgaattacagagaaatatatgttaggcctacctcgatgttctatatacaaaaagtgtcatgcactgatttcttcccatcgatccatacagaatccaatatacgtgaaatttataatttgaaagcatgttgcgtaattccattacgaacacaacactctgattaccttcagtgaacactccgtttttagttttgatctgaaaagtagtatagttaatgccaaacgatccactcctatggatcgtcctcgcatccagttgcaggaaattttcaaaaactcgcaacgaaaatttttttttcaaggattagggcgcaaacgttattgagtgttacgtcaccaaatactcgataaagttttacgagaaataaattatttcaatggata
gi|1                          :                                                      ttaaaaaaatctaaagcatatacaacTG-T-TTCTCACCACCAAC-ACA---A-A-TACACTAAACCT--AGGGGCCATATCTTA--GAAACC-GCTT-T-GACAAAA--CCTCGG---TCCT-A-CAG-A----CGCCTCCA---CCCTGAAC------GCTCCCGAAGACT-GTAA------AACACA----G---TG--C-AC-----A--GCTCACC-AGT---ACG----G-TTCGATT------TT-GCCCA----CA--acttcgcaagatgttcata
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tttctctctaccacaccaactaattcattcaaaggtcacacgcacctacacacacaaccttctgtctcagcgcctcctaagc-GA--T----AT-TCTA-GA--CGTTAA-T-G----A-ATTA-CAGAGAAATA---TAT-G--T---TAG-GCCT--A--C--C-TCGATGT-------T---CTATATACA----A---A--AA---GTG-T------C----AT--G----C--A-CT-----GA---------------T--T--T-CT--TCC-----CA-T--C-GAT---CC-ATAC-AG-AA--T--CCA-------A---------T-A-----T--A-CGT--GAAAT-T-TAT--A-A-T-T-TG-A--AA-GCA-----TGTTG-C-G---TA--ATTC--C---A-T-TACGAA---C-ACA------A---CAC-----T-CT--GATT-A-CCTTCAGTG-A--A--CA-CTCC----GT--TT--TTAG--TT--TTG-A-TC-T-G---AAAAGTAGT-ATAGT-TAA-T-----GC--C-AAAC-G-ATCC---A-CTCCTATGGATCG---TCC-TCGC-A--TCCAGT--T-GCAGGA-AA-T---T--TTC-AAAA---ACTCGCA--AC---G-AA-AATTTTTTTTTCAAGGA---T--TAGG---G---CGCAAAC---GTT-AT-T-GAGTGT-TA--CGT---CA-C-C-----------AA----------A-------TACT--C--GATA-AAG-------TTTT---ACGAG---A----A-----ATA-A-A---TTA--TTTCAATGG-ATaccactttagcacactgatgttccataacagaaaactcgttgcagccgacaaaatgcctgaacgactagcagaaactactccatccttctaccgagaccattctacgacgtacacgacactatgaaaaatccattctttacgcctaccttgctccttcacctcaaccgactgctcatgaccactaattctttcactcgattccgatcaataatccacaagataagaagataacgtacgaaaatcttacatttgaaaagcatccctgtacactcctccattacaaccagccacacttctcgttccctgaacaccgtctacttctcatattgaaagtcaactactcacgtcccacgatccccgactgtccttgcatcgtcctgacgctgatttcacaaactcgcaccgcaaaaccaaacctgtagcgcgccacaccaatatggtgtctacccgtcaccaatcacctcgtacaagcttttacaagacaaacatacacag
gi|3                          :                                                                                                                      aaactaatcttcaacgaaatataccactacaacataaagacacgtttgacttatgagctactttaagtgtgttatttcacaatcgaatttagataccaattttcgataaaatcctctacgagcctcacctcgggtctgaacggctgtaacaaggcccccccccctggggccccagtctcagaggcgcattgatatttaagacaacaacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GA--C----AT-TCTT-GAACTGT--AAC-G----ATAT-A-T---GAAA-----TAT-T--T---TGG-TCCT--A--CATCGT----GT-------T---T------CT----C---A--AA---ATG-C------T----ACTCG----A--ATCT-----GA----A----------T-AT--T-CT--TACATGCACA-T--C-G-T---TC-G-AT-AA-TAATTA-CCA-------AAGAGTGAAGA-AAGAATC--A-C-T--GAAAA-T-C-T--A-A-TATGTG-A--GA-G-A-----T-----T-GAACTACCATTCGCC--CA-TATT---A---T-A-A------AAAGCGC-----T-CT--G-TG-CTCCT-----G-A--A--CA-T--CCGTGGT--TT--T--A--TT--TC--A-TA-T-G---ACA-ACAGT-ACA-TATGC-G-----TC--C-A--C-GTATAT---A-CC----------GCACTCC-TTG--A--TC--GT--TTG----A-G--T-GATATTTA-AAAA---ACTCGCA--G-------A-AA-CTTTTTTCAAAAGA---T-GTA-G---GT--C---AAC---GTC-ATATAG-GTGT-TA--CGTTCAC--C-C-----------GA----------A-------TACT--C--G-T--AA--------TTAT---ATAAACAGA----A-----ATA-C-ATT-GTACTTCT-AATGA-a
gi|14                         :                                                                                                                             ttttttttacaaacaataattattaataagtcacacataaacacttgtataggccctatattgtttatcaccaccaaaatacaataactagctaatttagacctgttgacaaaaactggtctaagagccgcacctggtctgaacggacgtacaaagtgcaagtacagtaggttgattttaacacaactcttaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagacg----AT-CCTA-GA--TGT--AAC-A----T-AT-T-T---GAAA-A---CAT-T--TATATAA-ATCTTTA--C--G-T----GC-------TCA-T------CA----A---C--G-----TG-T------C----AT--GCAGTA--A-TT-----CA----A------------GT--T-CA--TCC-----CC-T--C--------C-G-AT-A------T--CGA-------A-----AAATA-A-----T----CGA--GAAGC-T-T-G--A-A-T-T-TG-A--AG-GCA-----T-----T-G---TA--ATTC--C---A-T-TC---G---T-A-A------A---CAC-----T-TT--G-TT-C-CCT-----A-A--A--CA-C--T----CT--TT--T--A--TC--T---A-AA-T-C---AAA-TTAAT-----T-TTA-G-----TC--C-A---------------CT----------G---TCC-TTG--A--TC--TT--C-A----A-TG-T-GAT--TTC-AAAA---AGTCGCA--AC---G-AA-AA-C
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gi|15                         :                                                                 tttctctctaccacaccaactaattcattcaaaggtcacacgcacctacacacacaaccttctgtctcagcgcctcctaagctgtttctcaccaccaacacaaatacactaaacctaggggccatatcttagaaaccgctttgacaaaacctcggtcctacagacgcctccaccctgaacgctcccgaagactgtaaaacacagtgcacagctcaccagtacggttcgattttgcccacaaccactttagcacactgatgttccataacagaaaactcgttgcagccgacaaaatgcctgaacgactagcagaaactactccatccttctaccgagacc----AT-TCTG-GA--CATG-A-C-A----C-AT-A-T---GAA----------T--T---TAT-ACTT--A--C--CAT----GT-------T---TA-----CA----T---ATCAA---A-G-TACCCCGC----AA--G----A--A-GT-----CA---------------T-AT--C-CT--CTC-----CA-T---------------------TA--T--CCG-------A-----G--GTTA-----C--A-CTC--GACAG-T-T-G--A-A-T-T-TA-A--AA-ACA-----T-----T-G---TA--A-TC--C--CA-T-T------------A------A---CAC-----T-TA--A-TT-T-TCT-----A-A--A--AG-C---------------------TC--T---G-CA-T-GTCTAAA-TTAATCAAA-T-TAA-T-----TT------------TCC---A-CT----------G---TCA-TGGATA--TT--AT--T-G---------T-CAT--TTC-AAAA---GGATGCA--AC-----AA-GA-TTTCTTTTCATATA---T-AT--------------------GTC-AA-T-G-GTGT-TA--TGTGAAC--A-A-----------AAT---------ATG-----TACT--CG-G-T--AAA-------GTTT---A-------G----A-----Aaacatacacag
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GA---GT----CTTAA-CGGCG------GTAAA-CATGTTA----G---TTG--T-A---------A--ACCCACAA-C---AACTTCAT---AA-G-ATGTTT------TAT-A---AGCA----------A--A----C-A--CT-------T------TTGTGC-ACAA-------------A--------------GACT---TAAGTTAGA-ACAGGAAGCA-TTCA-AATAGGATCGCCACCTCCCTC----CCT-GGA-TC--C----AT-TGCTA-G---CGT-A-AAC-GA-A-T-A-G---GGAACA---GAA-T--T-------G--T--A--C--CT---T-GT-------T------TAGT---CAT---C---A--AA---GTG-T------T----TC--G----C--A--------GA----A-----------GT--T-TT--TCC-----CT-TCTGCT-ACGTA-G-A--A-T--T----T-ATA-------A------------------C--A-C-T--G-AAAAT-T-G--A-A-T-T-TGAA--AA-GC--A-----T-----T-GTA-A-TCC--CA-TT------A---C------------AA------ACAC-----TTTTCG--TC-ACT-----A-A--AATCA--C--T----GT--T-T--T--A--CC--T--------C-A---AAA-GTA--------------G-G------T-T------------------CT----------G----CG-TAA-A--T----T--TA-T-G-GTT-G--ATTC-CAAAAA---AGTTGCCA--AC---A-AA-AA-C----TTTCAATTA-C-GT----------------------TC-AA-T-G-GTGT-T----G-TA---AC-C-------AA----T---------A--
gi|13                         :                                                                                                                                                                                     ttttctaaacaatataattcaatatactactacagtaattttgtttgtatattgttttttcttcaaactctattctgtcgatattaagttatgcccaCTTTTTCAT-TAATATTT-ATGATACGTAA--AG----CA---G--T-AAA-TA---TTTG---TTT-AGAC--TTGT----AGTTT-TT-TTTAC-----AC-A-A---A-ACTCGTA-TA--A-TA--T--A-------TAT-CT---GA-----G--T------GAAA--T----G--C-TT---A-GA-GGTCC-TA-A----C------------------A-CGGCT------GTAAA-CA----A----G----------A---------A--GG-----A-CTTAAGATCT-T---AGCA-TTAATT------T-T-AT--A-CA----------CTAA----T-C--TTAGCAAAAT------ATGTCT-GTAA--------------CACA------AAATG--T---TGAAC---ACGGAAGAGCTA-CTCATAGCAA-AAC--TATGTC---CAAGGCCACACA-CT--G----GT-T-CTA-GA--CGT-A-A-G-AG-A-T-A-T---GAAA-A---CGT-TG-T---TGGTGCCT--T--C--CT---TGGTTTACGCAT------T------CA----AGTTA--CC---AT--T------C----AT--G-------A-CTGCATGGA----G----------TATAGT-CTTCTCC-----CA-T--G---CCG-GTT-A--A-TTGATCTTT-CTA-------A-----GAACG-A------TGAG-CGT--G-AATAT-T-T--GCA-T-TGTG-AGCAA-GC--C-----TGGCCAT-GT--GTTGC--CAGTT-----CA---CG-----------AA------AGAC-----TTTA-G-TTCGCCTC----G-ACTA--CAG-C--T----GT--T-T--C--AG-TTTGT---A-TA-T-G---GAA-G--GT-A--T--G--T-A-G------T-CCTAT-C-G-ATCT---ATCT----------G---GTC-TTGCAGTCC--GT--TG-A-aaagaatagttttacaaggaaaattatttttaataaaaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aaaTGA-AATGGCAGATCTCTC----TCCCTTG-GAGTC----AT-C-CTA-GA--TGT-A-A-C-AT-A-T-T-T---GAAA-A---CAT-T--TATATAA-ATCTTTA--C--GT-----GC-------TCA----T------CA----A---C--G-----TG-T------C----AT--GCAGTA--A-TT-----CA----A-----------GT--T-CA--TCC-----C---C---T-CCG-A-T-A------------T-CGA-------A-----AAATA-A------T----CGA--G-AAGCT-T-G--A-A-T-T-TG-A--AG-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC---A-TT-----CG---T------------AA------ACAC-----TTT--G-TTC-CCT-----A-A--A--CA--C--T----CT--T-T--T--A--TC--T---A-AA-T-C---AAA-TTAAT----T----TT-A-G------T-CC-A---------------CT----------G---TCC-TTG-A--TC--TT--CA-A-T-G-T-G--ATTT-C-AAAA---AGTCG-CA--AC---G-AA-A---------------A-C-GT-----------C---AAC------------G-GTGT-TA--CG-TC---AA-C-------AA----A---------A--TA--------G-GT--Attgat
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      cgcaagatattcataactgaaaatcgtatactcaaaatgcATCTGTCTT----CCTTGGA-GT--C----AT-T-CTG-GA--CAT-G-A-C-AC-A-T-A-T---GAA----------T--T---TAT-ACTT--A--C--CA---T-GT-------T------TA-----CA----T---ATCAA---A-G-TACCCCGC----AA--G----A--A-GT-----CA---------------TAT--C-CT--CTC-----CA-T-------------------T--A----T-CCG-------A-----GGT-T-A------C--A-CTC--G-ACAGT-T-G--A-A-T-T-TA-A--AA-AC--A-----T-----T-GTA-AT-CC--CA-TT------------------------A------ACAC-----TTA--A-TTT-TCT-----A-A--A--AG--C----------------------TC--T---G-CA-T-GTCTAAA-TTAATCA--A--A-TT-A-A------T-TT---------TCC---A-CT----------G---TCA-TGG-A--T---AT--TA-T-T-G-T-C--ATTT-C-AAAA---GGATG-CA--AC-----AA-GA-TTTCTTTTCA--TA-T-ATA----------------T---GTC-AA-T-G-GTGT-TA--TG-TG---AA-C-------AAAATAT---------G--TA----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------G----A-----Act
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      A--CGA-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T-------------A--C--CT---T-GT-------TCAC---T------CAT---C---A--AA---GTG-T------C----AT--GC---A--A--------GA----AATAGGCCTATTAT--T-TT--CCC-----CA-TC------CG-A-T-A--A-T--A-------CA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-CAGAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GCA-ATT-C--CA-TT-----CA---T------------AA------ACACTTCAGTTT--G-TTC-CCT-----T-A--A--CA--C--C-----------------------T---A-TA-T-G---AAA-GTA---A--C--A-TT-A-G------T-CC-A--C-A-ATTC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--GC--GT-----------T-G--ATTT-C--ACA---TTTCG-CA--AC---G-AC-AA-CTTTTTTCCAATTA-C-ATA----------C---AACCAGGTC-AA-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-TAA-----AA----T---------AAGTA----CT-CG-GTA-AAG-TTAT---A-------G------------A--C-----GTA--TGT-AATGA-ATagaaatgaataactaatttaa
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-AC---TA-CA-------------------TAT-------A--TC------T-GATAAAA--T----GT-T-CT---A-GA-A--TC-TG-AAAGGCCTTG----------------CGGCT------GTAAA-CA----A----C---T-G--C-AACTTGC---A--GT-----G-CA--AA-----T---AG-G-CC--TTCAAAGGC-T-A---G-CA----------C--A----CAA--CT-------TCGCAAGATGTTC-ATA
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Reference ( family-131 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTTTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA-ACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--A-AA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-CTT------ATGTTC-ATAA-------------GCAG------AA-ATGACTG-------------TGANT---A-GCAGGAACTA-TCCA-ANTAA-ANCGNCANNTC-----TCTCCCNCN--GA-GAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--C--CT---T-GT-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----CA---C------------AA------ACAC-----TTT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---AAA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAGNA-C-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AC-C-------A----AT---------A--TA----CT-CG-GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                cgcaagatattcataactgaaaatcgtatactcaaaatgcATCTG-----TCTTCCTTG--GA-GTC----A--TT-CTG-GA--CAT-G-A-C-AC-A-T-A-T---GAA----------T--T---TAT-ACTT--A--C--CA---T-GT-------T------TA-----CA----T---ATCAA---A-G-TACCCCGC----AA--G----A--A-GT-----CA---------------TAT--C-CT--CTC-----CA-T-------------------T--A----T-CCG-------A-----GGT-T-A------C--A-CTC--G-ACAGT-T-G--A-A-T-T-TA-A--AA-AC--A-----T-----T-GTA-A-TCC--CA-TT------------------------A------ACAC-----TTA--A-TTT-TCT-----A-A--A--AG--C----------------------TC--T---G-CA-T-GTCTAAA-TTAATCA--A--A-TT-A-A------T-TT---------TCC---A-CT----------G---TCA-TGG-A--T---AT--TA-T-T-G-T-C--ATTT-C-AAAA---GGATG-CA--AC-----AA-GA-TTTCTTTTCA--TA-T-AT----------------AT---GTC-AA-T-G-GTGT-TA--TG-TG---AA-C-------AAAATAT---------G--TA----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------G----A-----Act
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  A--CGA-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T-------------A--C--CT---T-GT-------TCAC---T------CAT---C---A--AA---GTG-T------C----AT--GC---A--A--------GA----AATAGGCCTATTAT--T-TT--CCC-----CA-TC------CG-A-T-A--A-T--A-------CA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-CAGAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GCA-ATT-C--CA-TT-----CA---T------------AA------ACACTTCAGTTT--G-TTC-CCT-----T-A--A--CA--C--C-----------------------T---A-TA-T-G---AAA-GTA---A--C--A-TT-A-G------T-CC-A--C-A-ATTC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--GC--GT-----------T-G--ATTT-C--ACA---TTTCG-CA--AC---G-AC-AA-CTTTTTTCCAATTA-C-ATA----------C---AACCAGGTC-AA-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-TAA-----A----AT---------AAGTA----CT-CG-GTA-AAG-TTAT---A-------G------------A--C-----GTA--TGT-AATGA-ATagaaatgaataactaatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA--CG--ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TTTATCAC-----A--A-A---A-A----TA-CA--T-AA--TT-AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-A--TCT-GACAAAA--T----GG-T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-AC---TA-CA-------------------TAT-------A--TC------T-GATAAAA--T----G--TTCT---A-GA-A--TC-TG-A-----AA---GG----CCTTG---CGGCT------GTAAA-CA----A----C-----------T-G-----CAACTTGCA--GT-----G-CA--AA-----T---A-G-GCC--TTCAAAG-GC-T-A---G-CA----------C-A----CA-A-CTTCGCAAGATGTTC-ATA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAAACAATAATT-AT------TAATAAGT-CACA--CA--T-AAA-CA---CTTG---TAT-AGGCCCT-AT----ATTGT-TT-ATCACC----ACCA-A---A-A----TA-CA--ATAA--C--TAG--CT-AAT-TTA--GA--CCTG--T-T-GACAAAAACT----GG-T-CT---AAGA-G--CC-GC-ACC-T-G----GT----C--TGAA-CGGAC------GTACA--A----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------CAA----C--T-CTT------A
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gi|4                          : ttttttttacaaacaataattattaataagtcacacataaacacttgtataggccctatattgtttatcaccaccaaaatacaataactagctaatttagacctgttgacaaaaactggtctaagagccgcacctggtctgaacggacgtacaaagtgcaagtacagtaggttgattttaacacaactcttaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagacgTTGACAA-AAATATTTTAT------GAA--AGC-TACACACGT-ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AA-C--T-AT----AGTGT-TT--TCAA-----CC-A-A---A-A----TATCA--T-AA--TTAAGG--CC-TAT-TTAACGA--TC------T-GACAAAA--T----GGGT-CC---T-GATA--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACTAGTACTGTAAAACA----A----G-----------T-G-----CA------ATTGT-----AAC---AG-----T---A-G-GG---TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A--TT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNN--NNNGAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-CAGA-A-TTA-T---GGAA-AAG-TAT-T--T---TAG-GCCT--ATAC--CT---TCGT-------T------T------CA----A---A--AA----TG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------C-T--T-CT--TCTA----CAGTC-GAT-T-G-A-T-A--AAT--AAA--T-CCA-------AC----GAA-G-AA-----T--T-CGT--G-AAAAT-T-T--A-AAT-T-TG-AGTAA-GC--A-----T-----TTGTA-ACTTC--CA-TT-----CATCAC------------AA------ACAC-----TCT--G-TTC-CCC-----G-A--A--CA--C-------GT--T-TGGT--A--TT--C---AGTA-T-----AAA-GTAAT-A--T-----T-A-G------T-AC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A---C--GT--TG-AAG-G-TAG--ATTT-C-AAAAGAAACTCG-CA---C---A-AA-TA-----TTTTC--GAA-T-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TCCTGAC-TCAAACAAA----AT---------A--TAGTACTT-CT-GTA-AAG-TTTTTAAA-------G----A-----ATA--CAA---GT---TTT-AATGA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTTTTTTTACAT-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CA---ACG--A-AAAACA-A-CGTG---TAT-AGGC--T-AT----A-TGT-TT-ATCA------AC-A-A---ACA----TA-CA--A-AC--T--AGG--TC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-TTGACAAAT--G----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G-----T--GAT-TT-T-A---A-CA------------A-------A-CTT------ANNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNN--NN-GGC----A--TT-CTA-GA--C-T-A-A-C-GA-A-T-AGT---GAAA-A---TAT-T--T---TA--GCCT--A--C--CT---T-GT-------T------T------C---------A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-C---G-T-A--A-TA-A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--GAAAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GCAGA-----T-----T-GTA-AATTC--CA-TT-----TA---CA-----------AA------ACAC-----TTC--T-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GTCGT-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G----AA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-AT----------G---TCCTTTG-A--TC--GC--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTGTTTTAA-CA-----A--G---G---C---CAA---AT--AT-T-GTGTGT-CA--C--TC---TCTT-------A----ATTCTACTCCCA--TA----CTCCG-AT--AAG-TTAA---AAAAG---A----A-----ATA--C-AAATGTA--TTT-AATGA-ATTtata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAA-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CACAGACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--ACAA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--C--TC-ACCTC-GA---GT----C--TGAAGCGACTC-----GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT----T-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-TTT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNN--NN-GAT----A--TT-CTA-GA--CGT-A---C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--C--CT-----GT-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-TCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-GCA------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----TA---C------------AA------ACAC-----TCT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---AAA-GTAAT-A--T--A-TTAA-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-A-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAAGA-T-ATA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC----C-C-------A----AT---------A--TA----CT-C--GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AAA-CA-AACTTC---TATTAGGT--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A------------------------------------T-TTA--GA--TC-A--T-T-GATAAAA--C----C--T-CT---A-GA-G--CCCTC-ACC---GA---GT----C--TGAA-CGACT------GATAA-CA----A----G-----------G-C-----CT------G--GT-----C-C---AG-----TCTCA-GCA----TT--GAT-TT-TTA---A-CA----------C-AACTTC--N-NNN------NNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNN--NN-NNNNNNAA--TT-CTA-----CGT-A-A-T-GA-A-TTA-T-----AA-A---TTTAT--T---TAG-GCCTTTA--C--CT---TTGT-------T------TACTCATCA----A---T--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------T----T-CT--TCC-----CA-AT-GAT-CCG-A-T-A--A-C--A----T-CCA-------AT----GA----------------CGT--G-AAAAT-T-TTAA-A-T-T-TG-A--AACGC--A-----T-----T-GTA-AATAC--CA-TT-----CA---C------------AA-------CAC-----TTT--G-TTT-CCT-----A-A--A--AA--C--C----GTG-T-T--T--AATTT--T---AATAAT-G---AAA-GTAATCA--T----TT-A-GGCTATAT-TC-A--C-G-ATCC---A-TG----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TGCA-G-G-T----ATTT-CAAAAA---ACTCG-CACGAC---G-AACAA-C--TTTTTCAAGGATC-TTATGG---G---CCA-AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--C--TC---AC-C-------A----AT---------A--C-----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------A----AGAAATACA--C-A---GTA--TTT-AATGG-
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    aTCTTTT-CAA-CAATATTC-AC------TAA--AGTGCGCA-AT-----AAA-CA---CTTC---TTT-AGGT--TTAT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A--------------------------------T-TTA--GA--TC-A--T-TTGATAAAA--T----C--TTCT---A-GA-A--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----AGCC--------T-GGC---CC------A--GT-----CTC---AG-----C---A--------TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A-CTT------CNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNNNNNNNNNN-----NNNNNNNNN--NN-NNN----AATCT-CTA-GA--CGT-A-A-T-GA-A-TTA-T---GAAA-T---TAT-T--T----AG-GCCT--A--C--CT---TTGT-------T------TACT---CAT---C---A--AA---ATG-T------C----ATT-G----A--A-CT-----GA----A----------T----T-CT--TCC-----CA-TTTGAT-CCG-A-T-A--A-T--A----T-CAA-------T-----GA----------------CGT--G-AAAAT-T-TA-A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATT-C--CA-TT-----CA---C------------AA------ATAC-----TTT--G-TTT-TCT-----A-A--A--CA--C--C----GT--T-T-----------------------------A-GC--T-A--T----------------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-TGG--ATTT-CAAAAA---ACTCG-CG--AC---G-AA-AA-C-TTTTTTCAAGGA-T-CTA--G---GC--C---AAC---GTC-A--T-G-GTGT-TA--C---C---AC-C-------A---------------A--TA----CT-CG-GTTAAAG-TTTT---A-------AAAAGA-----ATA--C-A---ATA--GTT--ATGA-ATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): ATATTCTCAACAATATCTAATGAATCTAACAAAGATACTACTAAAATGTGTATAGTGTTAATCATGTACAACTCTATCTGAAAATGTTCATAGTCCGAATAACTGTACACAAA






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Reference ( family-131 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTTTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA-ACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--A-AA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-CTT------ATGTTC-ATAA-------------GCAG------AA-ATGNCTG-------------TGANT---A-GCAGGAACTA-TCCA-ANTAA-ANC---GNC--ANNTCTCTC--CCTCNGA-GA-C----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT--T-T---TAG-GCCT--A--C--CT---T-G---T-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GA-TCCG-A-T-A--A-T--A----T-CC-------AA-----GAA-G-A------T--ACGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTC--CCA-TT-----CA---C------------AA------ACAC-----T--TT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-TG---AAA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAGNA-C-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AC-C-------A----AT---------A--TA----CT-CG-GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cgcaagatattcataactgaaaatcgtatactcaaaatgc--ATCTGTCTT--CCTTGGA-GT-C----A--TT-CTG-GA--CAT-G-A-C-AC-A-T-A-T---GAA-----------T-T---TAT-ACTT--A--C--CA---T-G---T-------T------TA-----CA----T---ATCAA---A-G-TACCCCGC----AA--G----A--A-GT-----CA---------------TAT--C-CT--CTC-----CA-T-------------------T--A----T-CC-------GA-----GGT-T-A------C--ACTC--G-ACAGT-T-G--A-A-T-T-TA-A--AA-AC--A-----T-----T-GTA-A-TC--CCA-TT------------------------A------ACAC-----T--TA--A-TTT-TCT-----A-A--A--AG--C----------------------TC--T---G-CA-TGTCTAAA-TTAATCA--A--A-TT-A-A------T-TT---------TCC---A-CT----------G---TCA-TGG-A--T---AT--TA-T-T-G-T-C--ATTT-C-AAAA---GGATG-CA--AC-----AA-GA-TTTCTTTTCA--TA-T-AT----------------AT---GTC-AA-T-G-GTGT-TA--TG-TG---AA-C-------AAAATAT---------G--TA----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------G----A-----Act
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A--CGA-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT--T-T-------------A--C--CT---T-G---T-------TCAC---T------CAT---C---A--AA---GTG-T------C----AT--GC---A--A--------GA----AATAGGCCTATTAT--T-TT--CCC-----CA-TC------CG-A-T-A--A-T--A-------C-------AA-----GAA-G-A------T--ACGT--G-CAGAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GCA-ATT---CCA-TT-----CA---T------------AA------ACACTTCAGT--TT--G-TTC-CCT-----T-A--A--CA--C--C-----------------------T---A-TA-TG---AAA-GTA---A--C--A-TT-A-G------T-CC-A--C-A-ATTC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--GC--GT-----------T-G--ATTT-C--ACA---TTTCG-CA--AC---G-AC-AA-CTTTTTTCCAATTA-C-ATA----------C---AACCAGGTC-AA-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-TAA-----A----AT---------AAGTA----CT-CG-GTA-AAG-TTAT---A-------G------------A--C-----GTA--TGT-AATGA-ATagaaatgaataactaatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA--CG--ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TTTATCAC-----A--A-A---A-A----TA-CA--T-AA--TT-AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-A--TCT-GACAAAA--T----GG-T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----a
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gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                           ttaaaaaaatctaaagcatatacaacTCTTTT-TAA-CAATATAT-AA------TGA--TTC-TAAA-GCA--T-AAA-CA-A--TTG---T------T--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----T--------TA--T--AGG--CT-TGT----------------C-T-GAAAAAA--T----G------------------C-TC-A-----GA---GT----C--TGAA-C-GCT------GTAAA-CA----A----G-----------T-
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAAACAATAATT-AT------TAATAAGT-CACA--CA--T-AAA-CA---CTTG---TAT-AGGCCCT-AT----ATTGT-TT-ATCACC----ACCA-A---A-A----TA-CA--ATAA--C--TAG--CT-AAT-TTA--GA--CCTG--T-T-GACAAAAACT----GG-T-CT---AAGA-G--CC-GC-ACC-T-G----GT----C--TGAA-CGGAC------GTACA--A----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------CAA----C--T-CTT------A
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gi|4                          : ttttttttacaaacaataattattaataagtcacacataaacacttgtataggccctatattgtttatcaccaccaaaatacaataactagctaatttagacctgttgacaaaaactggtctaagagccgcacctggtctgaacggacgtacaaagtgcaagtacagtaggttgattttaacacaactcttaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagacgTTGACAA-AAATATTTTAT------GAA--AGC-TACACACGT-ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AA-C--T-AT----AGTGT-TT--TCAA-----CC-A-A---A-A----TATCA--T-AA--TTAAGG--CC-TAT-TTAACGA--TC------T-GACAAAA--T----GGGT-CC---T-GATA--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACTAGTACTGTAAAACA----A----G-----------T-G-----CA------ATTGT-----AAC---AG-----T---A-G-GG---TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A--TT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNNNGA-C----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-CAGA-A-TTA-T---GGAA-AAG-TAT--T-T---TAG-GCCT--ATAC--CT---TCG---T-------T------T------CA----A---A--AA----TG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------C-T--T-CT--TCTA----CAGTC-GA-TT-G-A-T-A--AAT--AAA--T-CC-------AAC----GAA-G-AA-----T--TCGT--G-AAAAT-T-T--A-AAT-T-TG-AGTAA-GC--A-----T-----TTGTA-ACTT--CCA-TT-----CATCAC------------AA------ACAC-----T--CT--G-TTC-CCC-----G-A--A--CA--C-------GT--T-TGGT--A--TT--C---AGTA-T----AAA-GTAAT-A--T-----T-A-G------T-AC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A---C--GT--TG-AAG-G-TAG--ATTT-C-AAAAGAAACTCG-CA---C---A-AA-TA-----TTTTC--GAA-T-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TCCTGAC-TCAAACAAA----AT---------A--TAGTACTT-CT-GTA-AAG-TTTTTAAA-------G----A-----ATA--CAA---GT---TTT-AATGA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTTTTTTTACAT-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CA---ACG--A-AAAACA-A-CGTG---TAT-AGGC--T-AT----A-TGT-TT-ATCA------AC-A-A---ACA----TA-CA--A-AC--T--AGG--TC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-TTGACAAAT--G----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G-----T--GAT-TT-T-A---A-CA------------A-------A-CTT------ANNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GG-C----A--TT-CTA-GA--C-T-A-A-C-GA-A-T-AGT---GAAA-A---TAT--T-T---TA--GCCT--A--C--CT---T-G---T-------T------T------C---------A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GA-TC---G-T-A--A-TA-A----T-CC-------AA-----GAA-G-A------T--ACGT--GAAAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GCAGA-----T-----T-GTA-AATT--CCA-TT-----TA---CA-----------AA------ACAC-----T--TC--T-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GTCGT-T--T--A--TT--T---A-TA-TG----AA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-AT----------G---TCCTTTG-A--TC--GC--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTGTTTTAA-CA-----A--G---G---C---CAA---AT--AT-T-GTGTGT-CA--C--TC---TCTT-------A----ATTCTACTCCCA--TA----CTCCG-AT--AAG-TTAA---AAAAG---A----A-----ATA--C-AAATGTA--TTT-AATGA-ATTtata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAA-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CACAGACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--ACAA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--C--TC-ACCTC-GA---GT----C--TGAAGCGACTC-----GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT----T-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-TTT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GA-T----A--TT-CTA-GA--CGT-A---C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT--T-T---TAG-GCCT--A--C--CT-----G---T-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GA-TTCG-A-T-A--A-T--A----T-CC-------AA-----GAA-GCA------T--ACGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTC--CCA-TT-----TA---C------------AA------ACAC-----T--CT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-TG---AAA-GTAAT-A--T--A-TTAA-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-A-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAAGA-T-ATA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC----C-C-------A----AT---------A--TA----CT-C--GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                           aagtgcgcatTCTTTT-CAA-CAATATTC-AC------TAA--AGT-TACA--CG--ATGAA-CA-A-CTTG---TTT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ACCAC-----AC-A-A---A-A---------------------GA--CC-----------A--T-----T-T-GATAAAA--T----GC-T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----AACTTG-----------T-G-----CA------------------T---AG-----C---A--------TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------A-A-------A-CTTCN----NNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GA-C----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-C-GA-A-T-G-T---GAAA-A---TAT--T-T---TAG-GCCT--A--C--CT---T-G---T-------T--------------------------AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TTT--T-C----CC-----CA-TC-GA-TCCG-A-T-A--A-T--A----T-CG-------AAG----GAA-G-A------T--ACGT--G-AACAT-T-T--A-A-T-T-T--A--AG-GC--A-----T-----T--TA-ATT---CCA-TT-----CA---C------------AA------AC-C-----T--TT--G-TTC-CAT-----GAA--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TATTG---AAA-GTACT----T--A-TT-A-G------T-CC-A--CAG-ATCCA--A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-GAG-T-G----TT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-GA-AA-C-TTTTTTCAATGA-C-AT-----------CT--AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-CAA-----A----AT---------AAGTA----CT-CG-TA--AAG-TTTT---ATTTTT--A----A-----AAAACC-A---ATA--TTT-AATGATATTa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    aTCTTTT-CAA-CAATATTC-AC------TAA--AGTGCGCA-AT-----AAA-CA---CTTC---TTT-AGGT--TTAT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A--------------------------------T-TTA--GA--TC-A--T-TTGATAAAA--T----C--TTCT---A-GA-A--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----AGCC--------T-GGC---CC------A--GT-----CTC---AG-----C---A--------TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A-CTT------CNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNN-NNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-NN-N----AATCT-CTA-GA--CGT-A-A-T-GA-A-TTA-T---GAAA-T---TAT--T-T----AG-GCCT--A--C--CT---TTG---T-------T------TACT---CAT---C---A--AA---ATG-T------C----ATT-G----A--A-CT-----GA----A----------T----T-CT--TCC-----CA-TTTGA-TCCG-A-T-A--A-T--A----T-CA-------AT-----GA---------------CGT--G-AAAAT-T-TA-A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATT---CCA-TT-----CA---C------------AA------ATAC-----T--TT--G-TTT-TCT-----A-A--A--CA--C--C----GT--T-T----------------------------A-GC--T-A--T----------------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-TGG--ATTT-CAAAAA---ACTCG-CG--AC---G-AA-AA-C-TTTTTTCAAGGA-T-CTA--G---GC--C---AAC---GTC-A--T-G-GTGT-TA--C---C---AC-C-------A---------------A--TA----CT-CG-GTTAAAG-TTTT---A-------AAAAGA-----ATA--C-A---ATA--GTT--ATGA-ATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-131 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTTTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA-ACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--A-AA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-CTT------ATGTTC-ATAA-------------GCAG------AA-ATGNCTG-------------TGANT---A-GCAGGAACTATCCA-ANTAA-ANC---GNC--ANNTCTCTC--CCTTGGA-GAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--C--CT---T-GT-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----CA---C------------AA------ACAC-----TTT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---AAA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAGNA-C-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AC-C-------AA----T---------A--TA----CT-CG-GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcaagatattcataactgaaaatcgtatactcaaaatgc--ATCTGTCTT--CCTTGGA-GTC----A--TT-CTG-GA--CAT-G-A-C-AC-A-T-A-T---GAA----------T--T---TAT-ACTT--A--C--CA---T-GT-------T------TA-----CA----T---ATCAA---A-G-TACCCCGC----AA--G----A--A-GT-----CA---------------TAT--C-CT--CTC-----CA-T-------------------T--A----T-CCG-------A-----GGT-T-A------C--A-CTC--G-ACAGT-T-G--A-A-T-T-TA-A--AA-AC--A-----T-----T-GTA-AT-CC--CA-TT------------------------A------ACAC-----TTA--A-TTT-TCT-----A-A--A--AG--C----------------------TC--T---G-CA-T-GTCTAAA-TTAATCA--A--A-TT-A-A------T-TT---------TCC---A-CT----------G---TCA-TGG-A--T---AT--TA-T-T-G-T-C--ATTT-C-AAAA---GGATG-CA--AC-----AA-GA-TTTCTTTTCA--TA-T-ATA----------------T---GTC-AA-T-G-GTGT-TA--TG-TG---AA-C-------AAAATAT---------G--TA----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------G----A-----Act
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 A--CGA-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T-------------A--C--CT---T-GT-------TCAC---T------CAT---C---A--AA---GTG-T------C----AT--GC---A--A--------GA----AATAGGCCTATTAT--T-TT--CCC-----CA-TC------CG-A-T-A--A-T--A-------CA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-CAGAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GCA-ATT-C--CA-TT-----CA---T------------AA------ACACTTCAGTTT--G-TTC-CCT-----T-A--A--CA--C--C-----------------------T---A-TA-T-G---AAA-GTA---A--C--A-TT-A-G------T-CC-A--C-A-ATTC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--GC--GT-----------T-G--ATTT-C--ACA---TTTCG-CA--AC---G-AC-AA-CTTTTTTCCAATTA-C-ATA----------C---AACCAGGTC-AA-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-TAA-----AA----T---------AAGTA----CT-CG-GTA-AAG-TTAT---A-------G------------A--C-----GTA--TGT-AATGA-ATagaaatgaataactaatttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA--CG--ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TTTATCAC-----A--A-A---A-A----TA-CA--T-AA--TT-AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-A--TCT-GACAAAA--T----GG-T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-AC---TA-CA-------------------TAT-------A--TC------T-GATAAAA--T----G--TTCT---A-GA-A--TC-TG-A-----AA---GG----CCTTG---CGGCT------GTAAA-CA----A----C-----------T-G-----CAACTTGCA--GT-----G-CA--AA-----T---A-G-GCC--TTCAAAG-GC-T-A---G-CA----------C-A----CA-A-CTTCGCAAGATGTTC-ATA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAAACAATAATT-AT------TAATAAGT-CACA--CA--T-AAA-CA---CTTG---TAT-AGGCCCT-AT----ATTGT-TT-ATCACC----ACCA-A---A-A----TA-CA--ATAA--C--TAG--CT-AAT-TTA--GA--CCTG--T-T-GACAAAAACT----GG-T-CT---AAGA-G--CC-GC-ACC-T-G----GT----C--TGAA-CGGAC------GTACA--A----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------CAA----C--T-CTT------A
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gi|4                          : ttttttttacaaacaataattattaataagtcacacataaacacttgtataggccctatattgtttatcaccaccaaaatacaataactagctaatttagacctgttgacaaaaactggtctaagagccgcacctggtctgaacggacgtacaaagtgcaagtacagtaggttgattttaacacaactcttaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagacgTTGACAA-AAATATTTTAT------GAA--AGC-TACACACGT-ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AA-C--T-AT----AGTGT-TT--TCAA-----CC-A-A---A-A----TATCA--T-AA--TTAAGG--CC-TAT-TTAACGA--TC------T-GACAAAA--T----GGGT-CC---T-GATA--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACTAGTACTGTAAAACA----A----G-----------T-G-----CA------ATTGT-----AAC---AG-----T---A-G-GG---TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A--TT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNNNGAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-CAGA-A-TTA-T---GGAA-AAG-TAT-T--T---TAG-GCCT--ATAC--CT---TCGT-------T------T------CA----A---A--AA----TG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------C-T--T-CT--TCTA----CAGTC-GAT-T-G-A-T-A--AAT--AAA--T-CCA-------AC----GAA-G-AA-----T--T-CGT--G-AAAAT-T-T--A-AAT-T-TG-AGTAA-GC--A-----T-----TTGTA-ACTTC--CA-TT-----CATCAC------------AA------ACAC-----TCT--G-TTC-CCC-----G-A--A--CA--C-------GT--T-TGGT--A--TT--C---AGTA-T-----AAA-GTAAT-A--T-----T-A-G------T-AC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A---C--GT--TG-AAG-G-TAG--ATTT-C-AAAAGAAACTCG-CA---C---A-AA-TA-----TTTTC--GAA-T-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TCCTGAC-TCAAACAAAA----T---------A--TAGTACTT-CT-GTA-AAG-TTTTTAAA-------G----A-----ATA--CAA---GT---TTT-AATGA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTTTTTTTACAT-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CA---ACG--A-AAAACA-A-CGTG---TAT-AGGC--T-AT----A-TGT-TT-ATCA------AC-A-A---ACA----TA-CA--A-AC--T--AGG--TC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-TTGACAAAT--G----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G-----T--GAT-TT-T-A---A-CA------------A-------A-CTT------ANNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GGC----A--TT-CTA-GA--C-T-A-A-C-GA-A-T-AGT---GAAA-A---TAT-T--T---TA--GCCT--A--C--CT---T-GT-------T------T------C---------A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-C---G-T-A--A-TA-A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--GAAAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GCAGA-----T-----T-GTA-AATTC--CA-TT-----TA---CA-----------AA------ACAC-----TTC--T-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GTCGT-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G----AA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-AT----------G---TCCTTTG-A--TC--GC--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTGTTTTAA-CA-----A--G---G---C---CAA---AT--AT-T-GTGTGT-CA--C--TC---TCTT-------AA----TTCTACTCCCA--TA----CTCCG-AT--AAG-TTAA---AAAAG---A----A-----ATA--C-AAATGTA--TTT-AATGA-ATTtata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAA-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CACAGACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--ACAA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--C--TC-ACCTC-GA---GT----C--TGAAGCGACTC-----GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT----T-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-TTT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GAT----A--TT-CTA-GA--CGT-A---C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--C--CT-----GT-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-TCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-GCA------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----TA---C------------AA------ACAC-----TCT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---AAA-GTAAT-A--T--A-TT-AAG------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-A-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAAGA-T-ATA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC----C-C-------AA----T---------A--TA----CT-C--GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -AAA-CA-AACTTC---TATTAGGT--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A------------------------------------T-TTA--GA--TC-A--T-T-GATAAAA--C----C--T-CT---A-GA-G--CCCTC-ACC---GA---GT----C--TGAA-CGACT------GATAA-CA----A----G-----------G-C-----CT------G--GT-----C-C---AG-----TCTCA-GCA----TT--GAT-TT-TTA---A-CA----------C-AACTTC--N-NNN------NNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NNNNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-NNNNNNAA--TT-CTA-----CGT-A-A-T-GA-A-TTA-T-----AA-A---TTTAT--T---TAG-GCCTTTA--C--CT---TTGT-------T------TACTCATCA----A---T--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------T----T-CT--TCC-----CA-AT-GAT-CCG-A-T-A--A-C--A----T-CCA-------AT----GA----------------CGT--G-AAAAT-T-TTAA-A-T-T-TG-A--AACGC--A-----T-----T-GTA-AATAC--CA-TT-----CA---C------------AA-------CAC-----TTT--G-TTT-CCT-----A-A--A--AA--C--C----GTG-T-T--T--AATTT--T---AATAAT-G---AAA-GTAATCA--T----TT-A-GGCTATAT-TC-A--C-G-ATCC---A-TG----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TGCA-G-G-T----ATTT-CAAAAA---ACTCG-CACGAC---G-AACAA-C--TTTTTCAAGGATC-TTATGG---G---CCA-AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--C--TC---AC-C-------AA----T---------A--C-----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------A----AGAAATACA--C-A---GTA--TTT-AATGG-
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): ATATTCTCAACAATATCTAATGAATCTAACAAAGATACTACTAAAATGTGTATAGTGTTAATCATGTACAACTCTATCTGAAAATGTTCATAGTCCGAATAACTGTACACAAA






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Reference ( family-131 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTTTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA-ACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--A-AA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-CTT------ATGTTC-ATAA-------------GCAG------AA-ATGNCTG-------------TGANT---A-GCAGGAACTACTCA-AN----TAA-ANC---GNC--ANNTCTCTC--CCTTGGA-GAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--C--CT---T-GT-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----CA---C------------AA------ACAC-----TTT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---AAA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAGNA-C-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AC-C-------AA----T---------A--TA----CT-CG-GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcaagatattcataactgaaaatcgta--ATCTGTCTT--CCTTGGA-GTC----A--TT-CTG-GA--CAT-G-A-C-AC-A-T-A-T---GAA----------T--T---TAT-ACTT--A--C--CA---T-GT-------T------TA-----CA----T---ATCAA---A-G-TACCCCGC----AA--G----A--A-GT-----CA---------------TAT--C-CT--CTC-----CA-T-------------------T--A----T-CCG-------A-----GGT-T-A------C--A-CTC--G-ACAGT-T-G--A-A-T-T-TA-A--AA-AC--A-----T-----T-GTA-AT-CC--CA-TT------------------------A------ACAC-----TTA--A-TTT-TCT-----A-A--A--AG--C----------------------TC--T---G-CA-T-GTCTAAA-TTAATCA--A--A-TT-A-A------T-TT---------TCC---A-CT----------G---TCA-TGG-A--T---AT--TA-T-T-G-T-C--ATTT-C-AAAA---GGATG-CA--AC-----AA-GA-TTTCTTTTCA--TA-T-ATA----------------T---GTC-AA-T-G-GTGT-TA--TG-TG---AA-C-------AAAATAT---------G--TA----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------G----A-----Act
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--CGA-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T-------------A--C--CT---T-GT-------TCAC---T------CAT---C---A--AA---GTG-T------C----AT--GC---A--A--------GA----AATAGGCCTATTAT--T-TT--CCC-----CA-TC------CG-A-T-A--A-T--A-------CA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-CAGAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GCA-ATT-C--CA-TT-----CA---T------------AA------ACACTTCAGTTT--G-TTC-CCT-----T-A--A--CA--C--C-----------------------T---A-TA-T-G---AAA-GTA---A--C--A-TT-A-G------T-CC-A--C-A-ATTC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--GC--GT-----------T-G--ATTT-C--ACA---TTTCG-CA--AC---G-AC-AA-CTTTTTTCCAATTA-C-ATA----------C---AACCAGGTC-AA-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-TAA-----AA----T---------AAGTA----CT-CG-GTA-AAG-TTAT---A-------G------------A--C-----GTA--TGT-AATGA-ATagaaatgaataactaatttaa
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaACA-ACATAA-AGA-CACG-TTTGACTTAT-GAGC--T-ACTTTAAGTGTGTT-ATTTC-----AC-A-ATCGA-A----TT-TA--G-A---T--A----CC-AAT-TT-------------T-C-GATAAAA--T----CC-T-CT---ACGA-G--CC-TC-ACCTC-GG---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAA--CA----A----GGCCCCCCCCCCT-GGGGCCCC------A--GT-----CTC---AG---------A-G-GCGCATT--GATATT-T-A---A-GA----------C-AA---C--AACNN------NNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GAT----A--TT-CTA-GA--CGTTA-A-T-GA-A-TTA-CAGAGAAATA---TAT-G--T---TAG-GCCT--A--C--CTCGAT-GT-------T------CTATATACA----A---A--AA---GTG-T------C----AT--G----C--A-CT-----GA---------------T-T--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCATA-C-A--G-A--A----T-CCA-------A-----TA-----------T--A-CGT--G-AAATT-TAT--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----TGTTG-C-GTA-ATTCC---A-TTACGAACA---C------------AA-------CAC-----TCT--GATTA-CCTTCAGTG-A--A--CA--CTCC----GT--T-T--TTAG--TT--TTG-A-TC-T-G---AAAAGTAGT-A--T--AGTT-A-A------TGCC-AAAC-G-ATCC---A-CTCCTATGGATCG---TCC-TCGCA--TCCAGT--TGCA-G-G-A-A--ATTTTC-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AATTTTTTTTTCAAGGA-T--TAG-G---G---CGCAAAC---GTT-AT-T-GAGTGT-TA--CG-TC---AC-C-------AA--------------A--TA----CT-CG-ATA-AAG-TTTT---ACGAG---A----A-----ATA--A-A---TTA--TTTCAATGG-ATaagcttagtcttagcattaa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAAACAATAATT-AT------TAATAAGT-CACA--CA--T-AAA-CA---CTTG---TAT-AGGCCCT-AT----ATTGT-TT-ATCACC----ACCA-A---A-A----TA-CA--ATAA--C--TAG--CT-AAT-TTA--GA--CCTG--T-T-GACAAAAACT----GG-T-CT---AAGA-G--CC-GC-ACC-T-G----GT----C--TGAA-CGGAC------GTACA--A----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------CAA----C--T-CTT------A
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gi|4                          : ttttttttacaaacaataattattaataagtcacacataaacacttgtataggccctatattgtttatcaccaccaaaatacaataactagctaatttagacctgttgacaaaaactggtctaagagccgcacctggtctgaacggacgtacaaagtgcaagtacagtaggttgattttaacacaactcttaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagacgTTGACAA-AAATATTTTAT------GAA--AGC-TACACACGT-ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AA-C--T-AT----AGTGT-TT--TCAA-----CC-A-A---A-A----TATCA--T-AA--TTAAGG--CC-TAT-TTAACGA--TC------T-GACAAAA--T----GGGT-CC---T-GATA--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACTAGTACTGTAAAACA----A----G-----------T-G-----CA------ATTGT-----AAC---AG-----T---A-G-GG---TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A--TT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNNNGAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-CAGA-A-TTA-T---GGAA-AAG-TAT-T--T---TAG-GCCT--ATAC--CT---TCGT-------T------T------CA----A---A--AA----TG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------C-T--T-CT--TCTA----CAGTC-GAT-T-G-A-T-A--AAT--AAA--T-CCA-------AC----GAA-G-AA-----T--T-CGT--G-AAAAT-T-T--A-AAT-T-TG-AGTAA-GC--A-----T-----TTGTA-ACTTC--CA-TT-----CATCAC------------AA------ACAC-----TCT--G-TTC-CCC-----G-A--A--CA--C-------GT--T-TGGT--A--TT--C---AGTA-T-----AAA-GTAAT-A--T-----T-A-G------T-AC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A---C--GT--TG-AAG-G-TAG--ATTT-C-AAAAGAAACTCG-CA---C---A-AA-TA-----TTTTC--GAA-T-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TCCTGAC-TCAAACAAAA----T---------A--TAGTACTT-CT-GTA-AAG-TTTTTAAA-------G----A-----ATA--CAA---GT---TTT-AATGA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTTTTTTTACAT-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CA---ACG--A-AAAACA-A-CGTG---TAT-AGGC--T-AT----A-TGT-TT-ATCA------AC-A-A---ACA----TA-CA--A-AC--T--AGG--TC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-TTGACAAAT--G----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G-----T--GAT-TT-T-A---A-CA------------A-------A-CTT------ANNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GGC----A--TT-CTA-GA--C-T-A-A-C-GA-A-T-AGT---GAAA-A---TAT-T--T---TA--GCCT--A--C--CT---T-GT-------T------T------C---------A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-C---G-T-A--A-TA-A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--GAAAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GCAGA-----T-----T-GTA-AATTC--CA-TT-----TA---CA-----------AA------ACAC-----TTC--T-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GTCGT-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G----AA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-AT----------G---TCCTTTG-A--TC--GC--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTGTTTTAA-CA-----A--G---G---C---CAA---AT--AT-T-GTGTGT-CA--C--TC---TCTT-------AA----TTCTACTCCCA--TA----CTCCG-AT--AAG-TTAA---AAAAG---A----A-----ATA--C-AAATGTA--TTT-AATGA-ATTtata
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAA-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CACAGACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--ACAA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--C--TC-ACCTC-GA---GT----C--TGAAGCGACTC-----GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT----T-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-TTT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GAT----A--TT-CTA-GA--CGT-A---C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--C--CT-----GT-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-TCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-GCA------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----TA---C------------AA------ACAC-----TCT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---AAA-GTAAT-A--T--A-TT-AAG------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-A-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAAGA-T-ATA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC----C-C-------AA----T---------A--TA----CT-C--GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    aTCTTTT-CAA-CAATATTC-AC------TAA--AGTGCGCA-AT-----AAA-CA---CTTC---TTT-AGGT--TTAT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A--------------------------------T-TTA--GA--TC-A--T-TTGATAAAA--T----C--TTCT---A-GA-A--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----AGCC--------T-GGC---CC------A--GT-----CTC---AG-----C---A--------TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A-CTT------CNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-NNN----AATCT-CTA-GA--CGT-A-A-T-GA-A-TTA-T---GAAA-T---TAT-T--T----AG-GCCT--A--C--CT---TTGT-------T------TACT---CAT---C---A--AA---ATG-T------C----ATT-G----A--A-CT-----GA----A----------T----T-CT--TCC-----CA-TTTGAT-CCG-A-T-A--A-T--A----T-CAA-------T-----GA----------------CGT--G-AAAAT-T-TA-A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATT-C--CA-TT-----CA---C------------AA------ATAC-----TTT--G-TTT-TCT-----A-A--A--CA--C--C----GT--T-T-----------------------------A-GC--T-A--T----------------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-TGG--ATTT-CAAAAA---ACTCG-CG--AC---G-AA-AA-C-TTTTTTCAAGGA-T-CTA--G---GC--C---AAC---GTC-A--T-G-GTGT-TA--C---C---AC-C-------A---------------A--TA----CT-CG-GTTAAAG-TTTT---A-------AAAAGA-----ATA--C-A---ATA--GTT--ATGA-ATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|20 ): ATATTCTCAACAATATCTAATGAATCTAACAAAGATACTACTAAAATGTGTATAGTGTTAATCATGTACAACTCTATCTGAAAATGTTCATAGTCCGAATAACTGTACACAAA






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Reference ( family-131 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTTTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA-ACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--A-AA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-T-GACAAAA--T----G--T-CT---A-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-CTT------ATGTTC-ATAA-------------GCAG------AA-ATGNCTG-------------TGANT---A-GCAGGAACTACTCA-AN----TAA-ANC---GNC--ANNTCTCTC--CCTTGGA-GAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--C--CT---T-GT-------T------T------CA----A---A--AA---ATG-T------C----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----CA---C------------AA------ACAC-----TTT--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---AAA-GTAAT-A--T--A-TT-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-A-G-G-T-G--ATTT-C-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAGNA-C-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AC-C-------AA----T---------A--TA----CT-CG-GT--AAG-TTTT---A-------A----A-----ATA--C-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cgcaagatattcataactgaaaatcgta--ATCTGTCTT--CCTTGGA-GTC----A--TT-CTG-GA--CAT-G-A-C-AC-A-T-A-T---GAA----------T--T---TAT-ACTT--A--C--CA---T-GT-------T------TA-----CA----T---ATCAA---A-G-TACCCCGC----AA--G----A--A-GT-----CA---------------TAT--C-CT--CTC-----CA-T-------------------T--A----T-CCG-------A-----GGT-T-A------C--A-CTC--G-ACAGT-T-G--A-A-T-T-TA-A--AA-AC--A-----T-----T-GTA-AT-CC--CA-TT------------------------A------ACAC-----TTA--A-TTT-TCT-----A-A--A--AG--C----------------------TC--T---G-CA-T-GTCTAAA-TTAATCA--A--A-TT-A-A------T-TT---------TCC---A-CT----------G---TCA-TGG-A--T---AT--TA-T-T-G-T-C--ATTT-C-AAAA---GGATG-CA--AC-----AA-GA-TTTCTTTTCA--TA-T-ATA----------------T---GTC-AA-T-G-GTGT-TA--TG-TG---AA-C-------AAAATAT---------G--TA----CT-CG-GT--AAA-GTTT---A-------G----A-----Act
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A--CGA-A-A-C-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T-------------A--C--CT---T-GT-------TCAC---T------CAT---C---A--AA---GTG-T------C----AT--GC---A--A--------GA----AATAGGCCTATTAT--T-TT--CCC-----CA-TC------CG-A-T-A--A-T--A-------CA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-CAGAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GCA-ATT-C--CA-TT-----CA---T------------AA------ACACTTCAGTTT--G-TTC-CCT-----T-A--A--CA--C--C-----------------------T---A-TA-T-G---AAA-GTA---A--C--A-TT-A-G------T-CC-A--C-A-ATTC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--GC--GT-----------T-G--ATTT-C--ACA---TTTCG-CA--AC---G-AC-AA-CTTTTTTCCAATTA-C-ATA----------C---AACCAGGTC-AA-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-TAA-----AA----T---------AAGTA----CT-CG-GTA-AAG-TTAT---A-------G------------A--C-----GTA--TGT-AATGA-ATagaaatgaataactaatttaa
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaACA-ACATAA-AGA-CACG-TTTGACTTAT-GAGC--T-ACTTTAAGTGTGTT-ATTTC-----AC-A-ATCGA-A----TT-TA--G-A---T--A----CC-AAT-TT-------------T-C-GATAAAA--T----CC-T-CT---ACGA-G--CC-TC-ACCTC-GG---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAA--CA----A----GGCCCCCCCCCCT-GGGGCCCC------A--GT-----CTC---AG---------A-G-GCGCATT--GATATT-T-A---A-GA----------C-AA---C--AACNN------NNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN-------------NNNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NNN-NNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GAT----A--TT-CTA-GA--CGTTA-A-T-GA-A-TTA-CAGAGAAATA---TAT-G--T---TAG-GCCT--A--C--CTCGAT-GT-------T------CTATATACA----A---A--AA---GTG-T------C----AT--G----C--A-CT-----GA---------------T-T--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCATA-C-A--G-A--A----T-CCA-------A-----TA-----------T--A-CGT--G-AAATT-TAT--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----TGTTG-C-GTA-ATTCC---A-TTACGAACA---C------------AA-------CAC-----TCT--GATTA-CCTTCAGTG-A--A--CA--CTCC----GT--T-T--TTAG--TT--TTG-A-TC-T-G---AAAAGTAGT-A--T--AGTT-A-A------TGCC-AAAC-G-ATCC---A-CTCCTATGGATCG---TCC-TCGCA--TCCAGT--TGCA-G-G-A-A--ATTTTC-AAAA---ACTCG-CA--AC---G-AA-AATTTTTTTTTCAAGGA-T--TAG-G---G---CGCAAAC---GTT-AT-T-GAGTGT-TA--CG-TC---AC-C-------AA--------------A--TA----CT-CG-ATA-AAG-TTTT---ACGAG---A----A-----ATA--A-A---TTA--TTTCAATGG-ATaagcttagtcttagcattaa
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaactaatcttcaacgaaatataccactA-G-A------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--ATCAATT-----T-GCA-ATT-C--CA-TT-----TA---C------------AA------ACAC-----TCT--G-TTC-CTT-----G-A--a
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Reference ( family-131 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTCTTTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA-ACG--A-AAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-A----TA-CA--A-AA--T--AGG--CC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-T-GACAAAA------TGC-TCTA-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----C--A-CTT------ATGTTC-ATAA-------------GCAG------AA-ATGNCTG--T-------------GANT---A-GCAGGAACTACTCA-AN----TA-AANC---GNC--ANNTCTCTC--CCTTGGA-GAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-AC-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T---TAG-GCCT--A--CCT---T-GTTTACT-CA--T-CA----A---A-----A-----TG-TC----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCG-A-T-A--A-T--A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-AAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC--CA-TT-----CA---C------------AA------ACAC-----TT-----T--G-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GT--T-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G---A--A-A-GT-A--A-T---AT---T-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--GT--TG-AG-G-T-G--ATTT-C-AA---AAACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTTTTTCAAGNA-C-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AC-C-------AA----T---------A--TA----CT-CG-GT--A-AG--T-T-TT--A-----A--AGA-AAT--AC-A---GTA--TTT-AATGA-ATT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                        ttttctaaacaatataattcaatatactactacagtaattttgtttgtatattgttttttcttcaaactctattctgtcgatattaagttatgcCTTTTTCAT-TAATATTT-ATGATACGTAA--AG----CA---G--T-AAA-TA---TTTG---TTT-AGAC--TTGT----AGTTT-TT-TTTAC-----AC-A-A---A-ACTCGTA-TA--A-TA--T--A-------TAT-CT---GA-----G--T------GAAA------TGC-T-TA-GA-GGTCC-TA-AC---------------------A-CGGCT------GTAAA-CA----A----G--------------------A------A--GG-----A-CTTAAGATCT-T---A-GCA----TT--AAT-TT-T-A-----------------T-A----C--A-CTA------ATCTT-----A-------------GCAA------AATATGTCTG--TAACACAAAATGTTGAAC---ACGGAAGAGCTACTCATAG----CA-AAACTATGTCCAAGGCCACAC--ACT-GG------------TT-CTA-GA--CGT-A-AG-AG-A-T-A-T---GAAA-A---CGT-TG-T---TGGTGCCT--T--CCT---TGGTTTACG-CAT-T-CA----A---GTTACCA-----T--TC----AT--G-------A-CTGCATGGA----G----------TATAGT-CTTCTCC-----CA-T--G---CCG-GTT-A--A-TTGATCTTT-CTA-------A-----GAACG-A------TGAG-CGT--G-AATAT-T-T--GCA-T-TGTG-AGCAA-GC--C-----TGGCCAT-GT--GTTGC--CAGTT-----CA---CG-----------AA------AGAC-----TT-----TA-G-TTCGCCTC----G-ACTA--CAG-C--T----GT--T-T--C--AG-TTTGT---A-TA-T-G---G--A-A-G-----G-T---ATG--T-A-G------T-CCTAT-C-G-ATCT---ATCT----------G---GTC-TTGCAGTCC--GT--TG-Aaa
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aaaTACTCA-AAATGCTG-AAAT---GGC--AGATCTCTCTCCCTTGGA-GTC----A--TC-CTA-GA--TGT-A-AC-AT-A-T-T-T---GAAA-A---CAT-T--TATATAA-ATCT-------T---T-ACGTGCT-CA--T-CA----A---C-----G-----TG-TC----AT--GCAGTA--A-TT-----CA----A-----------GT--T-CA--TCC-----C---C---T-CCG-A-T-A------------T-CGA-------A-----AAATA-A------T----CGA--G-AAGCT-T-G--A-A-T-T-TG-A--AG-GC--A-----T-----T-GTA-ATTCC---A-TT-----CG---T------------AA------ACAC-----TT-----T--G-TTC-CCT-----A-A--A--CA--C--T----CT--T-T--T--A--TC--T---A-AA-T-C---A--A-A-TT-A--A-T---TT---T-A-G-------------------TCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--TC--TT--CA-AT-G-T-G--ATTT-C-AA---AAAGTCG-CA--AC---G-AA-A---------------A-C-GT-----------C---AAC------------G-GTGT-TA--CG-TC---AA-C-------AA----A---------A--TA--------G-GT--A-ttgat
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gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A--CGA-A-AC-GA-A-T-A-T---GAAA-A---TAT-T--T-------------A--CCT---T-GTTCACT-CA--T-CA----A---A-----G-----TG-TC----AT--GC---A--A--------GA----AATAGGCCTATTAT--T-TT--CCC-----CA-TC------CG-A-T-A--A-T--A-------CA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--G-CAGAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----T-----T-GCA-ATTCC---A-TT-----CA---T------------AA------ACAC-----TTCAGTTT--G-TTC-CCT-----T-A--A--CA--C--C-----------------------T---A-TA-T-G---A--A-A-GT-A--A-C---AT---T-A-G------T-CC-A--C-A-ATTC---A-CT----------G---TCC-TTG-A--GC--GT----------T-G--ATTT-C--A---CATTTCG-CA--AC---G-AC-AA-CTTTTTTCCAATTA-C-ATA----------C---AACCAGGTC-AA-T-G-GTGT-TA--CG-TC---AA-TAA-----AA----T---------AAGTA----CT-CG-GTA-A-AG--T-T-AT--A-----G-----------AC-----GTA--TGT-AATGA-ATttaa
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTACAA-CAATATTT-AT------TAA--AGT-CACA--CG--ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AGGC--T-AT----AGTGT-TTTATCAC-----A--A-A---A-A----TA-CA--T-AA--TT-AGG--CC-TAT-TTA--GA--CC-A--TCT-GACAAAA------TGG-TCTA-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A----a
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tttgGTGT-TT-ATCAC-----AC-A-A---A-AC---TA-CA-------------------TAT-------A--TC------T-GATAAAA------TGT-TCTA-GA-A--TC-TG-A-----AA---GG----CCTTG---CGGCT------GTAAA-CA----A----C-----------T-G-----CAACTTGCA--GT-----G-CA--AA-----T---A-G-GCC--TTCAAAG-GC-T-A---G-CA----------C-A----CA-A-CTTCGCAAGATGTTC-ATA
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gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaACA-ACATAA-AGA-CACG-TTTGACTTAT-GAGC--T-ACTTTAAGTGTGTT-ATTTC-----AC-A-ATCGA-A----TT-TA--G-A---T--A----CC-AAT-TT-------------T-C-GATAAAA------TCC-TCTACGA-G--CC-TC-ACCTC-GG---GT----C--TGAA-CGGCT------GTAA--CA----A----GGCCCCCCCCCCT-GGGGCCCC------A--GT-----CTC---AG---------A-G-GCGCATT--GATATT-T-A---A-GA----------C-AA---C--AACNN------NNNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN--N-------------NNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NN-NNNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GAT----A--TT-CTA-GA--CGTTA-AT-GA-A-TTA-CAGAGAAATA---TAT-G--T---TAG-GCCT--A--CCTCGAT-GTT--CTATA--TACA----A---A-----AAG---TG-TC----AT--G----C--A-CT-----GA---------------T-T--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-CCATA-C-A--G-A--A----T-CCA-------A-----TA-----------T--A-CGT--G-AAATT-TAT--A-A-T-T-TG-A--AA-GC--A-----TGTTG-C-GTA-ATTCC---A-TTACGAACA---C------------AA-------CAC-----TC-----T--GATTA-CCTTCAGTG-A--A--CA--CTCC----GT--T-T--TTAG--TT--TTG-A-TC-T-G---A--A-AAGT-A--G-T---ATAGTT-A-A------TGCC-AAAC-G-ATCC---A-CTCCTATGGATCG---TCC-TCGCA--TCCAGT--TGCAG-G-A-A--ATTTTC-AA---AAACTCG-CA--AC---G-AA-AATTTTTTTTTCAAGGA-T--TAG-G---G---CGCAAAC---GTT-AT-T-GAGTGT-TA--CG-TC---AC-C-------AA--------------A--TA----CT-CG-ATA-A-AG--T-T-TT--AC----G--AGA-AAT--AA-A---TTA--TTTCAATGG-ATaagcttagtcttagcattaa
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTACAAACAATAATT-AT------TAATAAGT-CACA--CA--T-AAA-CA---CTTG---TAT-AGGCCCT-AT----ATTGT-TT-ATCACC----ACCA-A---A-A----TA-CA--ATAA--C--TAG--CT-AAT-TTA--GA--CCTG--T-T-GACAAAAAC----TGG-TCTAAGA-G--CC-GC-ACC-T-G----GT----C--TGAA-CGGAC------GTACA--A----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G----TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------CAA----C--T-CTT------A
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gi|4                          : ttttttttacaaacaataattattaataagtcacacataaacacttgtataggccctatattgtttatcaccaccaaaatacaataactagctaatttagacctgttgacaaaaactggtctaagagccgcacctggtctgaacggacgtacaaagtgcaagtacagtaggttgattttaacacaactcttaggannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntgtagacgTTGACAA-AAATATTTTAT------GAA--AGC-TACACACGT-ATAAA-CA-A-CTTG---TAT-AA-C--T-AT----AGTGT-TT--TCAA-----CC-A-A---A-A----TATCA--T-AA--TTAAGG--CC-TAT-TTAACGA--TC------T-GACAAAA------TGGGTCCT-GATA--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACTAGTACTGTAAAACA----A----G-----------T-G-----CA------ATTGT-----AAC---AG-----T---A-G-GG---TT--GAT-TT-T-A---A-CA----------C-A-------A--TT------ATNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN--N-------------NNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NN-NNNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNNNGAC----A--TT-CTA-GA--CGT-A-ACAGA-A-TTA-T---GGAA-AAG-TAT-T--T---TAG-GCCT--ATACCT---TCGTTT----CA-----A----A---A-----A-----TG-TC----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------C-T--T-CT--TCTA----CAGTC-GAT-T-G-A-T-A--AAT--AAA--T-CCA-------AC----GAA-G-AA-----T--T-CGT--G-AAAAT-T-T--A-AAT-T-TG-AGTAA-GC--A-----T-----TTGTA-ACTTC--CA-TT-----CATCAC------------AA------ACAC-----TC-----T--G-TTC-CCC-----G-A--A--CA--C-------GT--T-TGGT--A--TT--C---AGTA-T-----A--A-A-GT-A--A-T---AT---T-A-G------T-AC-A--C-G-ATCC---A-CT----------G---TCC-TTG-A---C--GT--TGAAG-G-TAG--ATTT-C-AAAAGAAACTCG-C---AC---A-AA------TATTTTC--GAA-T-GTA--G---G---C---AAC---GTC-AT-T-G-GTGT-TA--CG-TCCTGAC-TCAAACAAAA----T---------A--TAGTACTT-CT-GT--A-AAGTT-T-TT--A-----A--AG--AAT--ACAA---GT---TTT-AATGA-
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                   gTTTTTTTACAT-CAATAATT-AT------TAA--AGT-CA---ACG--A-AAAACA-A-CGTG---TAT-AGGC--T-AT----A-TGT-TT-ATCA------AC-A-A---ACA----TA-CA--A-AC--T--AGG--TC-TAT-TTA--GA--TC-G--T-TTGACAAA-------TGG-TCTA-GA-G--CC-TC-ACC-C-GA---GT----C--TGAA-CGACT------GTAAA-CA----A----G-----------T-G-----CA------A--GT-----A-C---AG-----T---A-G-G-----T--GAT-TT-T-A---A-CA------------A-------A-CTT------ANNNNN-NNNN-------------NNNN------NN-NNNNNNN--N-------------NNNN---N-NNNNNNNNNNNNNN-NN----NN-NNNN---NNN--NNNNNNNNN--NNNNNNN-GGC----A--TT-CTA-GA--C-T-A-AC-GA-A-T-AGT---GAAA-A---TAT-T--T---TA--GCCT--A--CCT---T-GTT---------T-CA----A---A-----A-----TG-TC----AT--G----A--A-CT-----GA----A----------TAT--T-CT--TCC-----CA-TC-GAT-C---G-T-A--A-TA-A----T-CCA-------A-----GAA-G-A------T--A-CGT--GAAAAAT-T-T--A-A-T-T-TG-A--AA-GCAGA-----T-----T-GTA-AATTC--CA-TT-----TA---CA-----------AA------ACAC-----TT-----C--T-TTC-CCT-----G-A--A--CA--C--C----GTCGT-T--T--A--TT--T---A-TA-T-G------A-A-GT-AATA-T---AT---T-A-G------T-CC-A--C-G-ATCC---A-AT----------G---TCCTTTG-A--TC--GC--TG-AG-G-T-G--ATTT-C-AA---AAACTCG-CA--AC---G-AA-AA-CTTTGTTTTAA-CA-----A--G---G---C---CAA---AT--AT-T-GTGTGT-CA--C--TC---TCTT-------AA----TTCTACTCCCA--TA----CTCCG-AT--A-AG--T-TAAA--A-----A--AGA-AAT--AC-AAATGTA--TTT-AATGA-ATTtata
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Unaligned ( gi|20 ): ATATTCTCAACAATATCTAATGAATCTAACAAAGATACTACTAAAATGTGTATAGTGTTAATCATGTACAACTCTATCTGAAAATGTTCATAGTCCGAATAACTGTACACAAA