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Reference ( gi|2 )            :                                                                 ACAGGCTCCGAAC-GATTGGTTGG-TGTCCTTCAGATTAT-CCTGCGAGATATAGCCTAAATA-AT-TTGTC---A-TATGTTCAGT-CGTCGAATAACTAATGAAC--TTTGGTACAGAAA--T--TA-T-GATTC-ATA-TACC--AAAA-T-TAC--------AGAT-TGTCA-----------CGT-GCCG-TTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC---A-T--TCACA-G--ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-ATTTC-GAAATA---TTT-AGCTAAA--A-A-T-T-GT---AAA-C-C-CTGT-G-ATATCATCTT---CG---------AGAAACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGTGATATGT-------AC------ATTCCTTT--------A--------TCTCAC-A-GGACGTA-AT--TTCTGT-AC-C--AAAA-C---C-TTCGAA-AATTTGACCTG
gi|5                          :                                                                 ACGGGATCCGACA-GATTGATTGG-TATTCCTCGGATTAT-CGTTTGAAATATA-----AATA-TT-TTGTC---A-TATGTTCAGA-CAACGAATGG----TGAAC--TTTGGTACAGAAA--T--TA-T-GATTC-ATA-TGCA--AAAA-T-TAT--------AGAT-TGCCA-----------TGT-GTCG-TTA-AA-AA--TA---TTT--TGA-TATTTC---C-T--GTACG-G--ATCT-C--AT-GT---TT-TC-C-ATTTC-GAAATG---TTC-AGTTACA--A-A-T-T-GT---AAA-
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gi|11                         :                                                                                                                                                                                                              -TACT--CGAA-T-TAA--------AAAC-TATCA-----------AGT-CTCC-TTACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTT---A-T--TCACA-G--ACCC-C--AT-GT---GT-TC-C-ATTTC-TAATTG---TTC-TTCAAAA--A-A-T-T-GT---AAA-A-C-ATGC-G-actagtcactaggaattcctttactagtaatctcactagacgtactttctgtaccaaaacgttaaaaaaattgac
gi|12                         :                                                                                                                                   aaatgagattattcagaaatgtacagatgagaaggataaaatcaggatgttagatgaggcattataaagtaactt-TACT--CGAA-T-TGA--------AAAC-TGCCA-----------AGT-CTCC-TAACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTC---A-T--TTAGA-G--ACCC-C--AT-A----GT-TC-T-ATTTC-TAAATGTTCTTT-AAC---A--C-A-T-T-GT---GAA-A-C-TTGT-G-GTgcgttcttatcactgaaaattcatttactagcagattaaccaaccaacagttttataccaaggctggtgaaaatctgact
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                   ataaccagttttggtataccggtaagaatgccaataactt-TGTCC-----------AGTCGTCGCTTACAA-AA--TAT--TTTAATGAGCGATTC---A-TGGTTACAGG--ACCCGC--AT-GT---GT-TCGCGGTTTCTAAAATG---TTC-TGCAAAA--A-A-TGT-GT---AGA-gctcgtatcactagaaattcatttacaatttatccaaccaagttttataccaagactggtgaaaaatctgac
gi|13                         : ggctggctcacgcgttcgcccagtatatgtgaggatgagaggtggccactctggtgtgatggtctaatagttaggggggcaccaggctcttgcaacagacgtaggtgggtaggatgatgccgccttttccggatgtgtccagtatcgggacctaaaaagagtattattcatagcatcgtgtcagatgattaaccagttttggtttgagcattataggatggatcaattaacttgttattgttagtaattggaagaaaggcggATAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTT---C-T--CTACG-G--ATCT-C--Aaagcttggttgatctgattcactagataatgcatgttagggcatgagcatttaagtggtccataagaccacaacgagattttaggataccaaggactgggtgaaagatctgaacg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                      TT--TGA-TAATTC---C-T--CTACG-G--ATCT-C--AT-GT---GT-TC-A-ATTTC-GAAATG---TTC-AGTTAAA--A-A-T-TGGTA--AAA-C-T-TTGT-G-ATATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacctatgatatattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATTC---C-T--CTACT-GGTATCT-A--AT-GT---GT-TC-CAATTTC-GAAATG---TGCAAGTTAAATTA-A-T-T-AT---AAAGA-C-CTGT-G-ATATattattcacttaggaattccttttactagaaatctcacagacgtgtttctgtaccaaaaaccttcgaagatttgacc
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCT-C--AT-GT---GC-TC-----------AAT-----------TAAA--A-A-T-T-GT---AAA-A-C-CTAT-G-ATATattataatcactaaggattcctttactagtaaatctcacaggacgtgatctttctttaccaaaacattcgaagaatttgac
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                        ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn-GT---GT-TC-C-ATTTC-GAAATG---TTC-AGTTAAA--A-A-T-T-ATA--AAA-CAC-CTGT-G-ATATTATattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 taaAAATG---TTC-AGTTAAA--A-A-T-T-GT---AAA-A-C-CTGT-G-ATgattaattcactaaggagatttcttttgaacagtaatctcactaggacgtgtatttctgtaccctaaaacccttcgaagatttgactg
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA--C-A-T-T--T---AGG-C-CTCTTT-G-ACAACATCTT---TGCTAGCCAAGAGAAACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATtactataactcacgttaggattattcccttactatcgtaattattcacatggtctcgtaatttctctgttcttctgtacgcaaataattaatccttcgtaaacttgtgatcctgt
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G---------AGAAACACCGTATAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgagaG---------AGAAACACAGTGTATTCGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aG---------AGAA-CACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atctttgctagccataaG---------AGAAACACCGTG-AT-CGTCGCCCTTTGGCTAGCGGAAGAT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               gaACACGGTGTTT-C-----TC-TTGGCTAGC-AAAGATGTTGT
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aacatttaggcctctttgAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCattgtcacccttggctagcgaagat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAGAC-CTGTGATATATTATAATCACTAAGG-ATTCCTTT--------ACTAGTAAATCTCAC-A-GGACGTG-ATCTTTCTTT-AC-C--AAAA-C---A-TTCGAAGAATTTGAC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aattcctctactggtatctaatgtgttccaatttcgaaatgtgcaagttaaattaattataTGTGATATATTATTC--ACTTAGGAATTCCTTTTACTAGAAA--------TCTCAC-A-G-ACGTG--T--TTCTGT-AC-C--AAAAAC---C-TTCGAA-GATTTGACC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tttgataattcctctacggatctcatgtgttcaatttcgaaatgttcagttaaaaattggtaaaactt------ATTCCTTT--------ACCAGTAA-TCTCGC-A-GGCCGTA-AT--ATCTAT-AC-C--AAAA-C---C-TTCTAA-AATTT
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gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                   agattgactgatgtacctcggattatccttcgagatataaatcatattgtcatatgttcatcatcaaatagtgaaatttggtacagaaacattcatactaccaaaatgtacagattgtcatgtggcgttaaatatctttgtgattccagtgttctatttcaaaatgttcacaaaaaacaaataaaatatgtgaatatattgatcactaagaattcataaattttatagta--------A--------TCTCAC-TTGAACGTG-AT--TT-TGTTAC-C--AAAG-C---C-TTCAGA-AATTTCACCTG
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gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                               cctatcagggcacagacccttacagagtggttggtgtacttccgattatccttccagagataattttcccccatacactcagtcgtcaaagtcagttttgatacggaaatgaaaaatcatacaccaaaattacaggttgccatgtgccgttatatatatcttgataattttagagctacggatctcatgtgctgcatttaaaaatcttcgattaaaaattgtaaaacgtgcgatatactgatcactaggaaattcttaaccagtatA-AT--TTCTGT-AC-C--AAAA-C---C-TTCGAA-GATTTGt
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GCCAGCCGTCGCCAGAGATAATAACTGGAATGAACACTCTGTTGAGTCTATATAGGGGACAGGCTCAAACACAACGAGTAAGGTGCCCTACGGATATGTCGGACGGGACATAAAAAATATGATCACATAATCAGAATGTCCAGAACGATATAACCAGTTTATAAGGAAAATACCA
Unaligned ( gi|23 ): AAGAAAAGGTGTGACTGTGTCGTCTACAAAGGGCGTATACTCCAACAGAGTATATTAAAAAAAATTATCATATTTATAGTTGTCAGATAGTTAGATTAGAACGAA
Unaligned ( gi|32 ): GAAAAGGTGTCACGCTTTGAAGCCTTTAAGGGGCACAAGCTC






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Reference ( family-130 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGATATA----AA--ATAATTTGTC---G-TACGTTCAGT-CGTCGAATAG-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA--TN---AT-AATTC--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CTGT-G---A---TATT-ATCTT---CGAGAAACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGTGA-TAT----ATTATNNTCAC-------ATTC-----CTTT---A--C---A-TA-A-TCTCAC-A-GGACGTA-A--TTTCTGT-AC-C--AAAA-C---C-TTCGAA-AATTTGACCTG
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaatgagattattcagaaatgtacagatgagaaggataaaatcaggatgttagatgaggcattataaagtaactt--TTTGG-TA-TA-CCGG--TA---AG-AATGCCAATAACTTT-ACT--CGAAT-TGAAAAC-TG-CCA-----------AGTCTCCTAACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTC--A---T--TTAG-AG-ACCC-C--AT-A----GT-TC-T-A-TTTC-TAAATGTTC--TTTAACA--C-A-T-T-GTGAA--A---C-TTGT-G---G---Tttcatttactagcagattaaccaaccaacagttttataccaaggctggtgaaaatctgact
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ataaccagtATAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTT--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--Agctcgtatcactagaaattcatttacaatttatccaaccaagttttataccaagactggtgaaaaatctgac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTC-AATTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CTAT-G---A---TATnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacctatgatatattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgCTATGA-TAT----ATTA--ATCACTAGGA--ATTA-----CTTT---AG-T---AGTA-A-TCTTAC-A-GGACGTA-A--TTTCTGT-AC-C--AAAA-C---C-TTCGAA-AACTGGACCTGattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                             ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacTC--ATA----T-ACG--AAAAT-AACAGAT-TA-TCA-----------TGTGCCTTTAAAA-AG--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--GTAT-GG-ATCT-C--AT-GT---CC-TC-T-A-T----------TTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTTAA--A---C-CTAT-G---A---TATt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTATGA-TAT----ACTA--GTCACTAGGA--ATTC-----CTTT---A--CTA-G-TA-A-TCTCAC-T-AGACGTA-C--TTTCTGT-AC-C--AAAA-C---G-TTAAAA-AAATTGACactagtcactaggaattcctttactagtaatctcactagacgtactttctgtaccaaaacgttaaaaaaattgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tcatatacgaaaataacagattatcatgtgcctttaaaaagcatttttgataattcctgtatggatctcatgtcctctatttcagctaaaaattgttaaacTC--ATA----T-ACC--AAAAG-TACAGAC-TG-TCA-----------CGTGCCGTTA----AA-----------------AATTC--C---T--TTAC-GG-ATTA-T--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-TAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CGAT-GGT-A---TATT-A
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGG-TAT----ATTA--ATCACTAGGA--ATTC-----CTTT---A--CTA-G-TA-A-TCCAAC-A-GGACGTA-A--TTTCTCT-AC-C--AAAA-C---C-TTGGAA-AATTTGAatcactaggaattcctttactagtaatccaacaggacgtaatttctctaccaaaaccttggaaaatttgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatataccaaaagtacagactgtcacgtgccgttaaaaattcctttacggattatatgtgttccatttctaaatgttcagctaaaaattgtaaaaccgaAATTC--C---T--CTACTGGTATCT-A--AT-GT---GT-TC-CAA-TTTC-GAAATGTGCAAGTTAA-ATTA-A-T-T-ATAAAG-A---C-CTGT-G---A---TATt
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAGAC-CTGTGA-TAT----ATTATAATCACTAAGG--ATTC-----CTTT---A--CTA-G-TA-AATCTCAC-A-GGACGTG-ATCTTTCTTT-AC-C--AAAA-C---A-TTCGAAGAATTTGACattataatcactaaggattcctttactagtaaatctcacaggacgtgatctttctttaccaaaacattcgaagaatttgac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattcctctactggtatctaatgtgttccaatttcgaaatgtgcaagttaaattaattataTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-A-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-TGGTAAA--A---CTTTGT-G---A---TAT
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGTGA-TAT----ATTAT--TCACTTAGGA-ATTC-----CTTTT--A--CTAGA--A-A-TCTCAC-A-G-ACGTG----TTTCTGT-AC-C--AAAAAC---C-TTCGAA-GATTTGACCattattcacttaggaattccttttactagaaatctcacagacgtgtttctgtaccaaaaaccttcgaagatttgacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttgataattcctctacggatctcatgtgttcaatttcgaaatgttcagttaaaaattggtaaaacttATGTTCAGT-CGTCAA---G-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA--TC---AT-AATTC--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAAAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTAAAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AA-GT---GT-TG-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-ACGATTGGTTGG-TGTCCTTCAGATTATCCTGCGAGATATAGCCTAA--ATAATTTGTC---A-TATGTTCAGT-CGTCGAATAACT-AATGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA--TT---AT-GATTC--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-TCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--A---T--TCAC-AG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATATTT-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--C---C-CTGT-G---A---TATC-ATCTT---CGAGAAACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGTGA-TAT----GT-------AC-------ATTC-----CTTT---------------A-TCTCAC-A-GGACGTA-A--TTTCTGT-AC-C--AAAA-C---C-TTCGAA-AATTTGACCTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CTGT-G---AT--TACT-AT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    -GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-ATAAAACA---C-CTGT-G---A---TATT-ATaactcacgttaggattattcccttactatcgtaattattcacatggtctcgtaatttctctgttcttctgtacgcaaataattaatccttcgtaaacttgtgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     taaCTGTGA-TATTATGATTA-ATTCACTAAGGAGATTT-----CTTTTGAA--C---AGTA-A-TCTCACTA-GGACGTGTA--TTTCTGT-AC-CCTAAAA-C---CCTTCGAA-GATTTGACgattaattcactaaggagatttcttttgaacagtaatctcactaggacgtgtatttctgtaccctaaaacccttcgaagatttgactg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                            taagtgttccatttcgaaatgttcagttaaaaattataaaacacACAGA-TCCCA-CAG----GTTGG-GGTCCTTCAGATTATTGTTTGAGATATC----AA--A-GATTTATC---C-TATGTACAGT-CGTC----AG-T-------------------CA-GAAA--TG---AA-AATTC--ACA----T-ACC--CAAAT-Ttg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaaagctgccactctttagattctataaagagcTGTGA-CAT----ATCA--ATCACTAGGA--ATTC-----CTTT---A--CT--ACTA-A-TCTCAC-C-GGACGCC-A--TTTCTGT-AC-C--AAAA-----C-GTCAAA-CAAATGACCT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                          aaacatatcatacaACAGGCTTCGA-CAGATTGGCTGA-TGTCCCTCGGATTATCTTTCGAGATAat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                      aaaaaagtgtctctctgtggagcctataaggggcACAGGCTCAGA-CAGAGTGGTGGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaaaggtgtcactctgtggagcctataaggggcCTGTGA-TAT----ATCA--ATCACTAGGA--GTTA-----CTTT---A--CTA-G-TA-A-TCTCAC-A-GGACGTA-A--TTTCTGT-AT-C--AAAA-C---C-TTC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaacACACGGTGTTT-C-----TC-TTGGCTAGC-AAAGATGTTGT
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aacatttaggcctctttgGAGAAACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATattgtcacccttggctagcgaagat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                  aacatttaggcctctttgacaacatctttgctagccaaACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGGTTGTCCATC-GATTATCCTTCGAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  aggggtACAGGCTCTAA-CAGATCAGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTACGGGACATC----AA---TAACATGTC---A-TTCATT--GT--GTCAGATGA-T-AACCAGC--TTTGA-TA-TA-AGAA--TGCCAGT-AA--C--GT-----T-ACT--CGAAT-TAAAAGC-TG-ACA-----------AATCTCCTCGCAA-AA--TAT--CTA--CGA-CGATTC--T---T--TCAC-AG-ACCG-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TGTT-TAAATGTTC-TTCAAA-A--T-A-T-T-GTAAA--A---C-ATGC-G---G---CATT-tcat
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggcGAGAA-CACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGcttatcactgaaaatttatttactagcaatttaaccaaccaacagtttcataccaagactgttgaaaatctgac
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            atctttgctagccataaGAGAAACACCGTATAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgagaGAGAAACACCGTG-AT-CGTCGCCCTTTGGCTAGCGGAAGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           gaGAGAAACACAGTGTATTCGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               aCAA-CAGTACGGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTGCGGGNTA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     A-A--TTTCTGT-AC-C--AAAA-C---C-TTCGAA-GATTTG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCAAACAGA--AGTAGG--GCCCCTCGGAATGTCCG-CGGGACATA----AA--A-AATTTGTC---AACACGGTCAG--------ATGA-T-A---AACCGTTTGGGTAACAAGGAA--TGCC-AA-AACTT--AT-----T-AGA--AGAA-----AAAC-TGTCCA-----------AGT--C-TTACAA-AA--TAT--TTAA-TGA-CAATTCAGC---T---TAC-AG-ACC--C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTCT---AATG-TC-TGCAAA-A--A-A-T-T-G-AAA--A-----CTGT-G---G---TGTT-TTCCTACACTAGAAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                          ttgccacgtcgccagtaatatacaggtgccacctgttggtctaggcACGGGATCCGA-CAGATTGATTGG-TATTCCTCGGATTATCGTTTGAAATATA----AA---TATTTTGTC---A-TATGTTCAGA-CAACGAATGG-T----GAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA--TT---AT-GATTC--ATA----T-GCA--AAAAT-TATAGAT-TG-CCA-----------TGTGTCGTTA-AA-AA--TA---TTT--TGA-TATTTC--C---T--GTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---TT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAC-A--A-A-T-T-GTAAA--A---ttcagttacaagcaattaaccaaacaacagttataacaagactgtgaaatatgacgtgc
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-130 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGATATA----AA--ATAATTTGTC---G-TACGTTCAGT-CGTCGAATAG-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TG--ANAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CTGT-G---A---TA---T---T---A-TCNCCGAGAAACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--AT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTACAA-AA--TAT--TTTAATGAGCGATTC--A---TGGTTACAGG-ACCCGC--AT-GT---GT-TCGC-GGTTTCTAAAATGTTC-TGCAAA-A--A-A-TGT-GTAGA--A---
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGT-GAAT-A-T----ATTG--A--T-CAC--T-A-AGA--ATTCATAAATTTT---A-TA--GT-AATT--CCAC-AGGA---C--GTA-A--TAACT----------G-TAC-C--AAA-G------CTTTT-TTTT-AA-ACTTTGACCTttcataaattttatagtaattccacaggacgtaataactgtaccaaagcttttttttaaactttgacct
gi|11                         :                                                                                                                                                                                                                             agattgactgatgtacctcggattatccttcgagatataaatcatattgtcatatgttcatcatcaaatagtgaaatttggtacagaaacattcatactaccaaaatgtacagattgtcatgtggcgttaaatatctttgtgattccagtgttctatttcaaaatgttcacaaaaaacaaataaaata----T-ACT--CGAAT-TAAAAAC-TA-TCA-----------AGTCTCCTTACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTT--A---T--TCAC-AG-ACCC-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-TAATTGTTC-TTCAAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-ATGC-G---GCGTTC---T---T---A-TCACTGAAAA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaatgagattattcagaaatgtacagatgagaaggataaaatcaggatgttagatgaggcattataaagtaactt--TTTGG-TA-TA-CCGG---TA--AGAATG-CCAATAACTTT-ACT--CGAAT-TGAAAAC-TG-CCA-----------AGTCTCCTAACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTC--A---T--TTAG-AG-ACCC-C--AT-A----GT-TC-T-A-TTTC-TAAATGTTC--TTTAACA--C-A-T-T-GTGAA--A---C-TTGT-G---G---TG---CTCGT---A-TCACT-AGAAAttcatttactagcagattaaccaaccaacagttttataccaaggctggtgaaaatctgact
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ataaccagt--A--T-CAC--T-A-GAA--ATTC-----ATTT---ACAA--TT-TATC--CAAC------------CA-A--GTTTT----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GGTGAAA-AATCTGACttcatttacaatttatccaaccaagttttataccaagactggtgaaaaatctgac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataaccagttttggtataccggtaagaatgccaataactttactcgaattgaaaactgccaagtctcctaacaaaatatttacgacgattcatttagagaccccatagttctatttctaaatgttctttaacacattgtgaaacttgtggtgctcgtATAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTT--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--A
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTC-AATTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CTAT-G---A---TA---TA--TTA-A-TCACTAGGAAnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacctatgatatattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgCTAT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTA-----CTTT---AGTA--GT-AATC--TTAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AACTGGACCTGttactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacT-C--ATA----T-ACG--AAAAT-AACAGAT-TA-TCA-----------TGTGCCTTTAAAA-AG--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--GTAT-GG-ATCT-C--AT-GT---CC-TC-T-A-T----------TTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTTAA--A---C-CTAT-G---A---TA---TAC-T---AGTCACTAGGAAt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTAT-GA-T-A-T----ACTA--G--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-TAGA---C--GTA-C--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---G-TTAA-AA-AAATTGACttcctttactagtaatctcactagacgtactttctgtaccaaaacgttaaaaaaattgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatatacgaaaataacagattatcatgtgcctttaaaaagcatttttgataattcctgtatggatctcatgtcctctatttcagctaaaaattgttaaacT-C--ATA----T-ACC--AAAAG-TACAGAC-TG-TCA-----------CGTGCCGTTA----AA-----------------AATTC--C---T--TTAC-GG-ATTA-T--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-TAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CGAT-GGT-A---TA---T---TA--A-TCACTAGGAA
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 T-GG-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--CAAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------C-TAC-C--AAA-A------C---C-TTGG-AA-AATTTGAttcctttactagtaatccaacaggacgtaatttctctaccaaaaccttggaaaatttgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatataccaaaagtacagactgtcacgtgccgttaaaaattcctttacggattatatgtgttccatttctaaatgttcagctaaaaattgtaaaaccgaAATTC--C---T--CTACTGGTATCT-A--AT-GT---GT-TC-CAA-TTTC-GAAATGTGCAAGTTAA-ATTA-A-T-T-ATAAAG-A---C-CTGT-G---A---TA---T---t
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AAGAC-CTGT-GA-T-A-T----ATTATAA--T-CAC--T-A-AGG--ATTC-----CTTT---ACTA--GTAAATC--TCAC-AGGA---C--GTG-ATCTTTCT----------T-TAC-C--AAA-A------C---A-TTCG-AAGAATTTGACattataatcactaaggattcctttactagtaaatctcacaggacgtgatctttctttaccaaaacattcgaagaatttgac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattcctctactggtatctaatgtgttccaatttcgaaatgtgcaagttaaattaattataTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-A-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-TGGTAAA--A---CTTTGT-GAT-A---TA---T---T---ATTCACTTAGGAA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TGT-GA-T-A-T----ATTA--T--T-CAC--TTA-GGA--ATTC-----CTTTT--ACTA--GA-AATC--TCAC-A-GA---C--GT--G--TTTCT----------G-TAC-CA-AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACCttccttttactagaaatctcacagacgtgtttctgtaccaaaaaccttcgaagatttgacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttgataattcctctacggatctcatgtgttcaatttcgaaatgttcagttaaaaattggtaaaacttATGTTCAGT-CGTCAA---G-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TC--ATAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAAAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTAAAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AA-GT---GT-TG-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GTA
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-ACGATTGGTTGG-TGTCCTTCAGATTATCCTGCGAGATATAGCCTAA--ATAATTTGTC---A-TATGTTCAGT-CGTCGAATAACT-AATGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-TCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--A---T--TCAC-AG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATATTT-AGCTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--C---C-CTGT-G---A---TA---T---C---A-TCTTCGAGAAACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----GT----------AC-----------ATTC-----CTTT-------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GTAAA--A---C-CTGT-G---AT--TA---C---T---A-T
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTGT-GA-TTACT----ATAA--C--T-CACGTT-A-GGATTATTC-----CCTT---ACTATCGT-AATTATTCAC-ATGGTCTC--GTA-A--TTTCTCTGTTCTTCTG-TACGC--AAATAATTAATC---C-TTCG-TA-AACTTGaactcacgttaggattattcccttactatcgtaattattcacatggtctcgtaatttctctgttcttctgtacgcaaataattaatccttcgtaaacttgtgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatgttcagttaaaaattgtaaaac-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-ATAAAACA---C-CTGT-G---A---TA---T---T---A-Ttgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taaCTGT-GA-T-A-TTATGATTA--A--TTCAC--T-AAGGAG-ATTT-----CTTTTGAAC-A--GT-AATC--TCACTAGGA---C--GTGTA--TTTCT----------G-TAC-CCTAAA-A------C---CCTTCG-AA-GATTTGACgattaattcactaaggagatttcttttgaacagtaatctcactaggacgtgtatttctgtaccctaaaacccttcgaagatttgactg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                            taagtgttccatttcgaaatgttcagttaaaaattataaaacacACAGA-TCCCA-CAG----GTTGG-GGTCCTTCAGATTATTGTTTGAGATATC----AA--A-GATTTATC---C-TATGTACAGT-CGTC----AG-T-------------------CA-GAAA---TG--AAAATT-C--ACA----T-ACC--CAAAT-Ttg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aaaagctgccactctttagattctataaagagcTGT-GA-C-A-T----ATCA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--CT-AATC--TCAC-CGGA---C--GCC-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A----------C-GTCA-AA-CAAATGACCT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                          aaacatatcatacaACAGGCTTCGA-CAGATTGGCTGA-TGTCCCTCGGATTATCTTTCGAGATAat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                      aaaaaagtgtctctctgtggagcctataaggggcACAGGCTCAGA-CAGAGTGGTGGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aaaaaggtgtcactctgtggagcctataaggggcCTGT-GA-T-A-T----ATCA--A--T-CAC--T-A-GGA--GTTA-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAT-C--AAA-A------C---C-TTC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaaacACACGGTGTTT-C-----TC-TTGGCTAGC-AAAGATGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aacatttaggcctctttgGAGAAACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATattgtcacccttggctagcgaagat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                  aacatttaggcctctttgacaacatctttgctagccaaACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGGTTGTCCATC-GATTATCCTTCGAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  aggggtACAGGCTCTAA-CAGATCAGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTACGGGACATC----AA---TAACATGTC---A-TTCATT--GT--GTCAGATGA-T-AACCAGC--TTTGA-TA-TA-AGAA---TG--CCAGTAAC--GT-----T-ACT--CGAAT-TAAAAGC-TG-ACA-----------AATCTCCTCGCAA-AA--TAT--CTA--CGA-CGATTC--T---T--TCAC-AG-ACCG-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TGTT-TAAATGTTC-TTCAAA-A--T-A-T-T-GTAAA--A---C-ATGC-G---G---CATTCT---T---A-TCACTGAAAAtcat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggc--A--T-CAC--T-G-AAA--ATTT-----ATTT---ACTA--GC-AATT--TAAC--CAA---CCAACA-G--TTTC-----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GTTG-AA-AATCTGACtttatttactagcaatttaaccaaccaacagtttcataccaagactgttgaaaatctgac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggcacaggctctaacagatcagtaggtgcccctcggattgtcctacgggacatcaataacatgtcattcattgtgtcagatgataaccagctttgatataagaatgccagtaacgttactcgaattaaaagctgacaaatctcctcgcaaaatatctacgacgattctttcacagaccgcatgtgttccatgtttaaatgttcttcaaaatattgtaaaacatgcggcattcttGAGAA-CACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  atctttgctagccataaGAGAAACACCGTATAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tgagaGAGAAACACCGTG-AT-CGTCGCCCTTTGGCTAGCGGAAGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gaGAGAAACACAGTGTATTCGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               aCAA-CAGTACGGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTGCGGGNTA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCAAACAGA--AGTAGG--GCCCCTCGGAATGTCCG-CGGGACATA----AA--A-AATTTGTC---AACACGGTCAG--------ATGA-T-A---AACCGTTTGGGTAACAAGGAA---TGCCAAAACT-T--AT-----T-AGA--AGAA-----AAAC-TGTCCA-----------AGT--C-TTACAA-AA--TAT--TTAA-TGA-CAATTCAGC---T---TAC-AG-ACC--C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTCT---AATG-TC-TGCAAA-A--A-A-T-T-G-AAA--A-----CTGT-G---G---TG---T---T---T-TC
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                          ttgccacgtcgccagtaatatacaggtgccacctgttggtctaggcACGGGATCCGA-CAGATTGATTGG-TATTCCTCGGATTATCGTTTGAAATATA----AA---TATTTTGTC---A-TATGTTCAGA-CAACGAATGG-T----GAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-GCA--AAAAT-TATAGAT-TG-CCA-----------TGTGTCGTTA-AA-AA--TAT--TTT---GA-TATTTC--C---T--GTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---TT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAC-A--A-A-T-T-GTAAA--A---ctacactagaaattcagttacaagcaattaaccaaacaacagttataacaagactgtgaaatatgacgtgc
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gi|6                          :                           aaaaagtgtcattctatggagctataaggggaacgggatccgacagattgattggtattcctcggattatcgtttgaaatataaatattttgtcatatgttcagacaacgaatggtgaactttggtacagaaattatgattcatatgcaaaaattatagattgccatgtgtcgttaaaaatattttgatatttcctgtacggatctcatgttttccatttcgaaatgttcagttacaaattgtaaaaaaaaaaTTGGT-GG-AGTCCCTCGGATTATGCCTCGAGATAT------A--ATAATTTGTT---G--ATGTCAAGTACGTCGAATAA-T--GTGAAC--TCT-G-TA-CA-AAAAATTTA--TAAATG-C--A-A----TAACCTAAAAAT-TACAGATATG-CCATGATAGTCCATCATGCC-TTA-AA-TATTCAT--TTT--TAG-GAATTC--C------GTAC-GG-ATCT-TCGATAGT---GCATC-T-A-TTTT-GAAATGTTC-TGCTAA-A--A-ACT-T-ATAAA--A---C-CTGTAG---A---TA---T---T---a
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  aggttcactctgtggagcctataatgccCTGT-GAAT-A-T----ATTA--AAAT-CAC--T-A-GAA--AT------------------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTC-------------TACTC--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACtcacaggacgtaatttctactcaaaaccttcgaagatttgac
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-130 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGATATA----AA--ATAATTTGTC---G-TACGTTCAGT-CGTCGAATAG-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TG--ANAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTG--T-G---A---TA---T---T----A-T----CACTGAGA-A-ACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTACAA-AA--TAT--TTTAATGAGCGATTC--A---TGGTTACAGG-ACCCGC--AT-GT---GT-TCGC-GGTTTCTAAAATGTTC-TGCAAA-A--A-A-TGT-GTAGAAA--G---C-TTGGTT-G---A---TC---T---G----ATT----CACT-AGA-
gi|10                         : ggctggctcacgcgttcgcccagtatatgtgaggatgagaggtggccactctggtgtgatggtctaatagttaggggggcaccaggctcttgcaacagacgtaggtgggtaggatgatgccgccttttccggatgtgtccagtatcgggacctaaaaagagtattattcatagcatcgtgtcagatgattaaccagttttggtttgagcattataggatggatcaattaacttgttattgttagtaattggaagaaaggcggtgtccagtcgtcgcAGATTGACTGA-TGTACCTCGGATTATCCTTCGAGATATA----AATCATA--TTGTC---A-TATGTTCA-T-CATCAAA----T-AGTGAAA--TTTGG-TA-CA-GAAA---C------ATT-C--ATAC---T-ACC--AAAATGTACAGAT-TG-TCA-----------TGTGGCGTT---A-AA--TAT--CTT--TG--TGATTC--C--------A----------------GT---GT-TC-T-A-TTTC-AAAATGTTC-A-CAAA-A--A-A-CAA-AT--AAA--A---T-ATG--T-GAATA---TA---T---TG---A-T----CACTAAGA-A-taatgcatgttagggcatgagcatttaagtggtccataagaccacaacgagattttaggataccaaggactgggtgaaagatctgaacg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGT-GAAT-A-T----ATTG--A--T-CAC--T-A-AGA--ATTCATAAATTTT---A-TA--GT-AATT--CCAC-AGGA---C--GTA-A--TAACT----------G-TAC-C--AAA-G------CTTTT-TTTT-AA-ACTTTGACCTttcataaattttatagtaattccacaggacgtaataactgtaccaaagcttttttttaaactttgacct
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaatgagattattcagaaatgtacagatgagaaggataaaatcaggatgttagatgaggcattataaagtaactt--TTTGG-TA-TA-CCGG---TA--AGAATG-CCAATAACTTT-ACT--CGAAT-TGAAAAC-TG-CCA-----------AGTCTCCTAACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTC--A---T--TTAG-AG-ACCC-C--AT-A----GT-TC-T-A-TTTC-TAAATGTTC--TTTAACA--C-A-T-T-GT--GAA--A---C-TTG--T-G---G---TG---CTCGT----A-T----CACT-AGA-A-Attcatttactagcagattaaccaaccaacagttttataccaaggctggtgaaaatctgact
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaccagt--A--T-CAC--T-A-GAA--ATTC-----ATTT---ACAA--TT-TATC--CAAC------------CA-A--GTTTT----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GGTGAAA-AATCTGACttcatttacaatttatccaaccaagttttataccaagactggtgaaaaatctgac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataaccagttttggtataccggtaagaatgccaataactttactcgaattgaaaactgccaagtctcctaacaaaatatttacgacgattcatttagagaccccatagttctatttctaaatgttctttaacacattgtgaaacttgtggtgctcgtATAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTT--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--A
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTC-AATTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTA--T-G---A---TA---TA--TTA--A-T----CACTAGGA-A-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacctatgatatattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgCTAT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTA-----CTTT---AGTA--GT-AATC--TTAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AACTGGACCTGttactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacT-C--ATA----T-ACG--AAAAT-AACAGAT-TA-TCA-----------TGTGCCTTTAAAA-AG--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--GTAT-GG-ATCT-C--AT-GT---CC-TC-T-A-T----------TTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--TAA--A---C-CTA--T-G---A---TA---TAC-T----AGT----CACTAGGA-A-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTAT-GA-T-A-T----ACTA--G--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-TAGA---C--GTA-C--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---G-TTAA-AA-AAATTGACttcctttactagtaatctcactagacgtactttctgtaccaaaacgttaaaaaaattgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatatacgaaaataacagattatcatgtgcctttaaaaagcatttttgataattcctgtatggatctcatgtcctctatttcagctaaaaattgttaaacT-C--ATA----T-ACC--AAAAG-TACAGAC-TG-TCA-----------CGTGCCGTTA----AA-----------------AATTC--C---T--TTAC-GG-ATTA-T--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-TAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CGA--T-GGT-A---TA---T---TA---A-T----CACTAGGA-A-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-GG-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--CAAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------C-TAC-C--AAA-A------C---C-TTGG-AA-AATTTGAttcctttactagtaatccaacaggacgtaatttctctaccaaaaccttggaaaatttgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatataccaaaagtacagactgtcacgtgccgttaaaaattcctttacggattatatgtgttccatttctaaatgttcagctaaaaattgtaaaaccgaAATTC--C---T--CTACTGGTATCT-A--AT-GT---GT-TC-CAA-TTTC-GAAATGTGCAAGTTAA-ATTA-A-T-T-AT--AAAG-A---C-CTG--T-G---A---TA---TA--TTATAA-T----CACTAAGG-A-t
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGAC-CTGT-GA-T-A-T----ATTATAA--T-CAC--T-A-AGG--ATTC-----CTTT---ACTA--GTAAATC--TCAC-AGGA---C--GTG-ATCTTTCT----------T-TAC-C--AAA-A------C---A-TTCG-AAGAATTTGACttcctttactagtaaatctcacaggacgtgatctttctttaccaaaacattcgaagaatttgac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattcctctactggtatctaatgtgttccaatttcgaaatgtgcaagttaaattaattataTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-A-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-TGGT--AAA--A---CTTTG--T-GAT-A---TA---T---T----ATT----CACTTAGG-A-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGT-GA-T-A-T----ATTA--T--T-CAC--TTA-GGA--ATTC-----CTTTT--ACTA--GA-AATC--TCAC-A-GA---C--GT--G--TTTCT----------G-TAC-CA-AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACCttccttttactagaaatctcacagacgtgtttctgtaccaaaaaccttcgaagatttgacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttgataattcctctacggatctcatgtgttcaatttcgaaatgttcagttaaaaattggtaaaacttATGTTCAGT-CGTCAA---G-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TC--ATAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAAAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTAAAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AA-GT---GT-TG-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GT--A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-ACGATTGGTTGG-TGTCCTTCAGATTATCCTGCGAGATATAGCCTAA--ATAATTTGTC---A-TATGTTCAGT-CGTCGAATAACT-AATGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-TCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--A---T--TCAC-AG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATATTT-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--C---C-CTG--T-G---A---TA---T---C----A-T----CTTCGAGA-A-ACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----GT----------AC-----------ATTC-----CTTT-------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTG--T-G---AT--TA---C---T----A-T----AACT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGT-GA-TTACT----ATAA--C--T-CACGTT-A-GGATTATTC-----CCTT---ACTATCGT-AATTATTCAC-ATGGTCTC--GTA-A--TTTCTCTGTTCTTCTG-TACGC--AAATAATTAATC---C-TTCG-TA-AACTTGcacgttaggattattcccttactatcgtaattattcacatggtctcgtaatttctctgttcttctgtacgcaaataattaatccttcgtaaacttgtgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatgttcagttaaaaattgtaaaac-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-AT--AAAACA---C-CTG--T-G---A---TA---T---T----A-T----tgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaCTGT-GA-T-A-TTATGATTA--A--TTCAC--T-AAGGAG-ATTT-----CTTTTGAAC-A--GT-AATC--TCACTAGGA---C--GTGTA--TTTCT----------G-TAC-CCTAAA-A------C---CCTTCG-AA-GATTTGACgattaattcactaaggagatttcttttgaacagtaatctcactaggacgtgtatttctgtaccctaaaacccttcgaagatttgactg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                            taagtgttccatttcgaaatgttcagttaaaaattataaaacacACAGA-TCCCA-CAG----GTTGG-GGTCCTTCAGATTATTGTTTGAGATATC----AA--A-GATTTATC---C-TATGTACAGT-CGTC----AG-T-------------------CA-GAAA---TG--AAAATT-C--ACA----T-ACC--CAAAT-Ttg
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaagctgccactctttagattctataaagagcTGT-GA-C-A-T----ATCA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--CT-AATC--TCAC-CGGA---C--GCC-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A----------C-GTCA-AA-CAAATGACCT
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                          aaacatatcatacaACAGGCTTCGA-CAGATTGGCTGA-TGTCCCTCGGATTATCTTTCGAGATAat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                      aaaaaagtgtctctctgtggagcctataaggggcACAGGCTCAGA-CAGAGTGGTGGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaaaggtgtcactctgtggagcctataaggggcCTGT-GA-T-A-T----ATCA--A--T-CAC--T-A-GGA--GTTA-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAT-C--AAA-A------C---C-TTC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaacTGACA-ATACACGGTGTTT-C-----TC-TTGGCTAGC-AAAGATGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aacatttaggcctctttgGAGA-A-ACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATcccttggctagcgaagat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                  aacatttaggcctctttgacaacatctttgctagccaaACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGGTTGTCCATC-GATTATCCTTCGAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  aggggtACAGGCTCTAA-CAGATCAGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTACGGGACATC----AA---TAACATGTC---A-TTCATT--GT--GTCAGATGA-T-AACCAGC--TTTGA-TA-TA-AGAA---TG--CCAGTAAC--GT-----T-ACT--CGAAT-TAAAAGC-TG-ACA-----------AATCTCCTCGCAA-AA--TAT--CTA--CGA-CGATTC--T---T--TCAC-AG-ACCG-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TGTT-TAAATGTTC-TTCAAA-A--T-A-T-T-GT--AAA--A---C-ATG--C-G---G---CATTCT---T----A-T----CACTGAAA-A-tcat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggc--A--T-CAC--T-G-AAA--ATTT-----ATTT---ACTA--GC-AATT--TAAC--CAA---CCAACA-G--TTTC-----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GTTG-AA-AATCTGACtttatttactagcaatttaaccaaccaacagtttcataccaagactgttgaaaatctgac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggcacaggctctaacagatcagtaggtgcccctcggattgtcctacgggacatcaataacatgtcattcattgtgtcagatgataaccagctttgatataagaatgccagtaacgttactcgaattaaaagctgacaaatctcctcgcaaaatatctacgacgattctttcacagaccgcatgtgttccatgtttaaatgttcttcaaaatattgtaaaacatgcggcattcttTAAGAGA-ACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atctttgctagccaGAGA-A-ACACCGTATAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgagaGAGA-A-ACACCGTG-AT-CGTCGCCCTTTGGCTAGCGGAAGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaGAGA-A-ACACAGTGTATTCGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               aCAA-CAGTACGGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTGCGGGNTA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGC
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gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                          ttgccacgtcgccagtaatatacaggtgccacctgttggtctaggcACGGGATCCGA-CAGATTGATTGG-TATTCCTCGGATTATCGTTTGAAATATA----AA---TATTTTGTC---A-TATGTTCAGA-CAACGAATGG-T----GAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-GCA--AAAAT-TATAGAT-TG-CCA-----------TGTGTCGTTA-AA-AA--TAT--TTT---GA-TATTTC--C---T--GTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---TT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAC-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---ttcagttacaagcaattaaccaaacaacagttataacaagactgtgaaatatgacgtgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaaagtgtcattctatggagctataaggggaCTGC-AA-T-A-T----ATTA--A--T-CAA--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACCA--GT-AATC--TCGC-AGGC---C--GTA-A--TATCT----------A-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCT-AA-AATTTaaaaaactgcaatatattaatcaataggaattcctttaccagtaatctcgcaggccgtaatatctataccaaaaccttctaaaattta
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gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggttcactctgtggagcctataatgccCTGT-GAAT-A-T----ATTA--AAAT-CAC--T-A-GAA--AT------------------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTC-------------TACTC--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACtcacaggacgtaatttctactcaaaaccttcgaagatttgac
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3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Reference ( family-130 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGATATA----AA--ATAATTTGTC---G-TACGTTCAGT-CGTCGAATAG-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TG--ANAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTG--T-G---A---TA---T---T----A-T----CACTGAGA-A-ACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTACAA-AA--TAT--TTTAATGAGCGATTC--A---TGGTTACAGG-ACCCGC--AT-GT---GT-TCGC-GGTTTCTAAAATGTTC-TGCAAA-A--A-A-TGT-GTAGAAA--G---C-TTGGTT-G---A---TC---T---G----ATT----CACT-AGA-
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gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGT-GAAT-A-T----ATTG--A--T-CAC--T-A-AGA--ATTCATAAATTTT---A-TA--GT-AATT--CCAC-AGGA---C--GTA-A--TAACT----------G-TAC-C--AAA-G------CTTTT-TTTT-AA-ACTTTGACCTttcataaattttatagtaattccacaggacgtaataactgtaccaaagcttttttttaaactttgacct
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaatgagattattcagaaatgtacagatgagaaggataaaatcaggatgttagatgaggcattataaagtaactt--TTTGG-TA-TA-CCGG---TA--AGAATG-CCAATAACTTT-ACT--CGAAT-TGAAAAC-TG-CCA-----------AGTCTCCTAACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTC--A---T--TTAG-AG-ACCC-C--AT-A----GT-TC-T-A-TTTC-TAAATGTTC--TTTAACA--C-A-T-T-GT--GAA--A---C-TTG--T-G---G---TG---CTCGT----A-T----CACT-AGA-A-Attcatttactagcagattaaccaaccaacagttttataccaaggctggtgaaaatctgact
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaccagt--A--T-CAC--T-A-GAA--ATTC-----ATTT---ACAA--TT-TATC--CAAC------------CA-A--GTTTT----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GGTGAAA-AATCTGACttcatttacaatttatccaaccaagttttataccaagactggtgaaaaatctgac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataaccagttttggtataccggtaagaatgccaataactttactcgaattgaaaactgccaagtctcctaacaaaatatttacgacgattcatttagagaccccatagttctatttctaaatgttctttaacacattgtgaaacttgtggtgctcgtATAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTT--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--A
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTC-AATTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTA--T-G---A---TA---TA--TTA--A-T----CACTAGGA-A-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacctatgatatattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgCTAT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTA-----CTTT---AGTA--GT-AATC--TTAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AACTGGACCTGttactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacT-C--ATA----T-ACG--AAAAT-AACAGAT-TA-TCA-----------TGTGCCTTTAAAA-AG--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--GTAT-GG-ATCT-C--AT-GT---CC-TC-T-A-T----------TTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--TAA--A---C-CTA--T-G---A---TA---TAC-T----AGT----CACTAGGA-A-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTAT-GA-T-A-T----ACTA--G--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-TAGA---C--GTA-C--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---G-TTAA-AA-AAATTGACttcctttactagtaatctcactagacgtactttctgtaccaaaacgttaaaaaaattgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatatacgaaaataacagattatcatgtgcctttaaaaagcatttttgataattcctgtatggatctcatgtcctctatttcagctaaaaattgttaaacT-C--ATA----T-ACC--AAAAG-TACAGAC-TG-TCA-----------CGTGCCGTTA----AA-----------------AATTC--C---T--TTAC-GG-ATTA-T--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-TAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CGA--T-GGT-A---TA---T---TA---A-T----CACTAGGA-A-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-GG-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--CAAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------C-TAC-C--AAA-A------C---C-TTGG-AA-AATTTGAttcctttactagtaatccaacaggacgtaatttctctaccaaaaccttggaaaatttgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatataccaaaagtacagactgtcacgtgccgttaaaaattcctttacggattatatgtgttccatttctaaatgttcagctaaaaattgtaaaaccgaAATTC--C---T--CTACTGGTATCT-A--AT-GT---GT-TC-CAA-TTTC-GAAATGTGCAAGTTAA-ATTA-A-T-T-AT--AAAG-A---C-CTG--T-G---A---TA---TA--TTATAA-T----CACTAAGG-A-t
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGAC-CTGT-GA-T-A-T----ATTATAA--T-CAC--T-A-AGG--ATTC-----CTTT---ACTA--GTAAATC--TCAC-AGGA---C--GTG-ATCTTTCT----------T-TAC-C--AAA-A------C---A-TTCG-AAGAATTTGACttcctttactagtaaatctcacaggacgtgatctttctttaccaaaacattcgaagaatttgac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattcctctactggtatctaatgtgttccaatttcgaaatgtgcaagttaaattaattataTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-A-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-TGGT--AAA--A---CTTTG--T-GAT-A---TA---T---T----ATT----CACTTAGG-A-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGT-GA-T-A-T----ATTA--T--T-CAC--TTA-GGA--ATTC-----CTTTT--ACTA--GA-AATC--TCAC-A-GA---C--GT--G--TTTCT----------G-TAC-CA-AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACCttccttttactagaaatctcacagacgtgtttctgtaccaaaaaccttcgaagatttgacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttgataattcctctacggatctcatgtgttcaatttcgaaatgttcagttaaaaattggtaaaacttATGTTCAGT-CGTCAA---G-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TC--ATAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAAAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTAAAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AA-GT---GT-TG-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GT--A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-ACGATTGGTTGG-TGTCCTTCAGATTATCCTGCGAGATATAGCCTAA--ATAATTTGTC---A-TATGTTCAGT-CGTCGAATAACT-AATGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-TCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--A---T--TCAC-AG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATATTT-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--C---C-CTG--T-G---A---TA---T---C----A-T----CTTCGAGA-A-ACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----GT----------AC-----------ATTC-----CTTT-------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTG--T-G---AT--TA---C---T----A-T----AACT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGT-GA-TTACT----ATAA--C--T-CACGTT-A-GGATTATTC-----CCTT---ACTATCGT-AATTATTCAC-ATGGTCTC--GTA-A--TTTCTCTGTTCTTCTG-TACGC--AAATAATTAATC---C-TTCG-TA-AACTTGcacgttaggattattcccttactatcgtaattattcacatggtctcgtaatttctctgttcttctgtacgcaaataattaatccttcgtaaacttgtgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatgttcagttaaaaattgtaaaac-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-AT--AAAACA---C-CTG--T-G---A---TA---T---T----A-T----tgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaCTGT-GA-T-A-TTATGATTA--A--TTCAC--T-AAGGAG-ATTT-----CTTTTGAAC-A--GT-AATC--TCACTAGGA---C--GTGTA--TTTCT----------G-TAC-CCTAAA-A------C---CCTTCG-AA-GATTTGACgattaattcactaaggagatttcttttgaacagtaatctcactaggacgtgtatttctgtaccctaaaacccttcgaagatttgactg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                            taagtgttccatttcgaaatgttcagttaaaaattataaaacacACAGA-TCCCA-CAG----GTTGG-GGTCCTTCAGATTATTGTTTGAGATATC----AA--A-GATTTATC---C-TATGTACAGT-CGTC----AG-T-------------------CA-GAAA---TG--AAAATT-C--ACA----T-ACC--CAAAT-Ttg
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gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                          aaacatatcatacaACAGGCTTCGA-CAGATTGGCTGA-TGTCCCTCGGATTATCTTTCGAGATAat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                      aaaaaagtgtctctctgtggagcctataaggggcACAGGCTCAGA-CAGAGTGGTGGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaaaggtgtcactctgtggagcctataaggggcCTGT-GA-T-A-T----ATCA--A--T-CAC--T-A-GGA--GTTA-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAT-C--AAA-A------C---C-TTC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaacTGACA-ATACACGGTGTTT-C-----TC-TTGGCTAGC-AAAGATGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aacatttaggcctctttgGAGA-A-ACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATcccttggctagcgaagat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                  aacatttaggcctctttgacaacatctttgctagccaaACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGGTTGTCCATC-GATTATCCTTCGAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  aggggtACAGGCTCTAA-CAGATCAGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTACGGGACATC----AA---TAACATGTC---A-TTCATT--GT--GTCAGATGA-T-AACCAGC--TTTGA-TA-TA-AGAA---TG--CCAGTAAC--GT-----T-ACT--CGAAT-TAAAAGC-TG-ACA-----------AATCTCCTCGCAA-AA--TAT--CTA--CGA-CGATTC--T---T--TCAC-AG-ACCG-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TGTT-TAAATGTTC-TTCAAA-A--T-A-T-T-GT--AAA--A---C-ATG--C-G---G---CATTCT---T----A-T----CACTGAAA-A-tcat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggc--A--T-CAC--T-G-AAA--ATTT-----ATTT---ACTA--GC-AATT--TAAC--CAA---CCAACA-G--TTTC-----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GTTG-AA-AATCTGACtttatttactagcaatttaaccaaccaacagtttcataccaagactgttgaaaatctgac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggcacaggctctaacagatcagtaggtgcccctcggattgtcctacgggacatcaataacatgtcattcattgtgtcagatgataaccagctttgatataagaatgccagtaacgttactcgaattaaaagctgacaaatctcctcgcaaaatatctacgacgattctttcacagaccgcatgtgttccatgtttaaatgttcttcaaaatattgtaaaacatgcggcattcttTAAGAGA-ACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atctttgctagccaGAGA-A-ACACCGTATAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgagaGAGA-A-ACACCGTG-AT-CGTCGCCCTTTGGCTAGCGGAAGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaGAGA-A-ACACAGTGTATTCGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               aCAA-CAGTACGGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTGCGGGNTA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCAAACAGA--AGTAGG--GCCCCTCGGAATGTCCG-CGGGACATA----AA--A-AATTTGTC---AACACGGTCAG--------ATGA-T-A---AACCGTTTGGGTAACAAGGAA---TGCCAAAACT-T--AT-----T-AGA--AGAA-----AAAC-TGTCCA-----------AGT--C-TTACAA-AA--TAT--TTAA-TGA-CAATTCAGC---T---TAC-AG-ACC--C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTCT---AATG-TC-TGCAAA-A--A-A-T-T-G---AAA--A-----CTG--T-G---G---TG---T---T----T-TCCTACACT-AGA-A-A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                          ttgccacgtcgccagtaatatacaggtgccacctgttggtctaggcACGGGATCCGA-CAGATTGATTGG-TATTCCTCGGATTATCGTTTGAAATATA----AA---TATTTTGTC---A-TATGTTCAGA-CAACGAATGG-T----GAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-GCA--AAAAT-TATAGAT-TG-CCA-----------TGTGTCGTTA-AA-AA--TAT--TTT---GA-TATTTC--C---T--GTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---TT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAC-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---ttcagttacaagcaattaaccaaacaacagttataacaagactgtgaaatatgacgtgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaaagtgtcattctatggagctataaggggaCTGC-AA-T-A-T----ATTA--A--T-CAA--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACCA--GT-AATC--TCGC-AGGC---C--GTA-A--TATCT----------A-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCT-AA-AATTTaaaaaactgcaatatattaatcaataggaattcctttaccagtaatctcgcaggccgtaatatctataccaaaaccttctaaaattta
gi|6                          :                           aaaaagtgtcattctatggagctataaggggaacgggatccgacagattgattggtattcctcggattatcgtttgaaatataaatattttgtcatatgttcagacaacgaatggtgaactttggtacagaaattatgattcatatgcaaaaattatagattgccatgtgtcgttaaaaatattttgatatttcctgtacggatctcatgttttccatttcgaaatgttcagttacaaattgtaaaaaaaaaaTTGGT-GG-AGTCCCTCGGATTATGCCTCGAGATAT------A--ATAATTTGTT---G--ATGTCAAGTACGTCGAATAA-T--GTGAAC--TCT-G-TA-CA-AAAAATTTA--TAAATG-C--A-A----TAACCTAAAAAT-TACAGATATG-CCATGATAGTCCATCATGCC-TTA-AA-TATTCAT--TTT--TAG-GAATTC--C------GTAC-GG-ATCT-TCGATAGT---GCATC-T-A-TTTT-GAAATGTTC-TGCTAA-A--A-ACT-T-AT--AAA--A---C-CTG--TAG---A---TA---T---TTGA-A-T----TACAAAGG-A-Aa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGTAGA-T-A-T----TTGA--A--T-TAC--A-AAGGA--ATTT-----C--T---ACCA--GTAAATC--TCACTTGAA---C--GTG-A--TTT-T----------GTTAC-C--AAA-G------C---C-TTCA-GA-AATTTCACCTGtttctaccagtaaatctcacttgaacgtgattttgttaccaaagccttcagaaatttcacctgt
gi|7                          :                                         ttggtggagtccctcggattatgcctcgagatataataatttgttgatgtcaagtacgtcgaataatgtgaactctgtacaaaaaatttataaatgcaataacctaaaaattacagatatgccatgatagtccatcatgccttaaatattcatttttaggaattccgtacggatcttcgatagtgcatctattttgaaatgttctgctaaaaacttataaaacACAGGCTCGGA-CAGATTGGT-GG-TGTTCC-CGGATTATCCT-CGAGATATA----A----------------G-T---TTCAGT-CGTCGAATAG-T----GAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---T---ATAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAAAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTAAAATAA--CA---TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GTGGCGT-TC-C-A-TTTCGGAAAT-TTC-AATTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--AAAGC-CTG--T-GAATA---TA---T---TAAA-A-T----CACT-AGA-A-ATATCt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggttcactctgtggagcctataatgccCTGT-GAAT-A-T----ATTA--AAAT-CAC--T-A-GAA--AT------------------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTC-------------TACTC--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACtcacaggacgtaatttctactcaaaaccttcgaagatttgac
gi|8                          :                             aggttcactctgtggagcctataatgccacaggctcggacagattggtggtgttcccggattatcctcgagatataagtttcagtcgtcgaatagtgaactttggtacagaaatataattcatataccaaaattacaaattgccacgtgccgttaaaataacattttgataattcctctacggatctcatgtggcgttccatttcggaaatttcaattaaaaattgtaaaaaagcACAGGCTCCAA-CAGAATGGTTTG-TGTC--------TAT--------ATATA----CAT-GTA-TTTATC---G-TAAACACAGT-TGTCAAATAG-TCAGT------TTTGG-AA-CA-AAAA---TG--AAAATT-C--ATG----T-ACA--GAAAT-TAGAGAT-TG-CCA-----------TGTGTCAT-A-AA-AA--CATAATTA--TG--TAATTC--C---T--TTTC-AG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-CAAATGTTC-TG-TAA-A--ACA-T-G-GT--TAA--G---C-CGG--T-G---A---TA---T---
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaaggtgtcaccctttgaagtcaacaaggggcGT-GA-T-A-T----ATTG--A--C-GAC--T-A-GGA--ATTC-----ATTT---ATGA--GT-AATC--TCA-----G---C--TTA----------------------AC-C--AAA-A------C---T-TACA-AA-AATattgacgactaggaattcatttatgagtaatctcagcttaaccaaaacttacaaaaat
gi|9                          :                           aaaaggtgtcaccctttgaagtcaacaaggggcacaggctccaacagaatggtttgtgtctatatatacatgtatttatcgtaaacacagttgtcaaatagtcagttttggaacaaaaatgaaaattcatgtacagaaattagagattgccatgtgtcataaaaacataattatgtaattccttttcagatctcatgtgttccatttccaaatgttctgtaaaacatggttaagccgACAGACCCTTA-CAGAGTGGTTGG-TGTACTTCCGATTATCCTTCCAGA---------G--ATAATTTTCCCCCA-TACACTCAGT-CGTCAAA-------GTCAGT--TTTGA-TA-CG-GAAA---TG--AAAAAT-C--ATA----C-ACC--AAAAT-TACAGGT-TG-CCA-----------TGTGCCGTTAT----A--TATA-TCT--TGA-TAATTT--TAGAG--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GC-TG-C-A-TTTA-AAAATCTTC-GATTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-GTG--C-G---A---TA---TAC-TG---A-T----CACTAGGA-A-A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cctatcagggcTGC-GA-T-A-T----ACTG--A--T-CAC--T-A-GGA--AATT-----CTTA---ACCA--GT-ATTC--TTAC-CGGA---C--GTC-C--TTTCT----------C-TAC-C--AAA-A------C---A-TTttcttaaccagtattcttaccggacgtcctttctctaccaaaacattt


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   A    T    T  T                  G        AGCCTAAATAA        CCCA   T       A    A  TAACTAATG    CG     G  A  A    ATT GCC G    A CA   ACTT A   TA     .       A  T   TGATAGTCCATC     C   C  T  TTC  AA  AA    .      TAGAGC       T  T   C  CG  A  GGC  A  . A .    GG        AA     C TT C C A G  .    AC AAG T   .  A AATA     TTC ATTATA   G CCTA    A   G T           T        T         G           A  A T C TATG    TA AA T   GT T A   TT    .        TGA  A TC  A    AT    TA   TCT CA   T TC     CTGTTCTTCTG    G CT   T ATTAAT .   C    A  G
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    T    T  .                  T        ACATGTA            AA     T       .    G  TGATAACC     .      .  .  .    .   A   T    . .    .    .   .      .       .  .   A                C   C  .  T    A   T     .      AGCT         .  .   C  .   .  .    .  . . .    A         A      . .  . . . .  .    G  .   .   .  . GCGT     .   TCGT     T .       G   . .           .        .         .           .  . . . .       .  .  .   .  . A   G     .        T    T .   A    .     TT   .   .    . .      GT             T A    . .      .   .    .  .
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    T    G  .                  T        CAATAA             C      C       .    G  TAATGTG      .      .  .  .    .   T   A    . .    .    .   .      .       .  .   T                G   A  .  T    .   A     .      ATT          .  .   T  .   .  .    .  . . .    T         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . GTA      .   TTGA     . .       A   . .           .        .         .           .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    T .   .    .     T    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    T    T  .                  T        AAAAAA             A      C       .    G  GTAGTG       .      .  .  .    .   G   C    . .    .    .   .      .       .  .   C                G   A  .  C    .   T     .      CTC          .  .   A  .   .  .    .  . . .    T         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . ATA      .   TAAA     . .       A   . .           .        .         .           .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    T .   .    .     A    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    A    A  .                  A        AAATAT             A      T       .    G  TGATA        .      .  .  .    .   G   A    . .    .    .   .      .       .  .   C                G   C  .  C    .   T     .      CTG          .  .   T  .   .  .    .  . . .    G         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . AT       .   ACTG     . .       A   . .           .        .         .           .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    T .   .    .     A    .   .    . .      C              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    T    A  .                  G        AATAA              G      T       .    A  TGGTG        .      .  .  .    .   T   T    . .    .    .   .      .       .  .   C                C   C  .  C    .   T     .      CTT          .  .   T  .   .  .    .  . . .    G         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . G        .   ACT      . .       T   . .           .        .         .           .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    T .   .    .     A    .   .    . .      T              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    T    A  .                  T        GATAA              G      A       .    A  TAGTG        .      .  .  .    .   A   A    . .    .    .   .      .       .  .   A                G   C  .  C    .   T     .      CTC          .  .   T  .   .  .    .  . . .    G         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . A        .   TG       . .       G   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    T .   .    .     A    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    T    T  .                  T        AA                 G      C       .    .  AGT          .      .  .  .    .   G   T    . .    .    .   .      .       .  .   A                G   A  .  T    .   T     .      CTC          .  .   T  .   .  .    .  . . .    G         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . A        .   TA       . .       G   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    T .   .    .     A    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    A    T  .                  T                                  .       .    .  GTC          .      .  .  .    .   G   A    . .    .    .   .      .       .  .   T                A   T  .  T    .   A     .      CTC          .  .   G  .   .  .    .  . . .    G         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . A        .   T        . .       G   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    T .   .    .     C    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                   .    G    T  .                  .                                                               .      .  .  .    .   .   A    . .    .    .   .      .       .  .   C                G   .  .  T    .   T     .      ATT          .  .   T  .   .  .    .  . . .    T         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . A        .   T        . .       G   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    C .   .    .     A    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .  .                  .                                                                                              . .    .    .   .      .       .  .   T                .   .  .  C    .   T     .      TTT          .  .   T  .   .  .    .  . . .    G         T      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . A        .   C        . .       A   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    C .   .    .     A    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                        .    .  .                  .                                                                                              . .    .    .   .      .       .  .   T                .   .  .  C    .   T     .      CTG          .  .   T  .   .  .    .  . . .    G         T      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . G        .   T        . .       G   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    G .   .    .     A    .   .    . .      A              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .    .   .      .                                   .  .  T    .   A     .      CTC          .  .   T  .   .  .    .  . . .    C         A      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . G        .   T        . .       G   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    C .   .    .     C    .   .    . .      G              . .    . .      .   .    .  .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             .  .  .    .   T     .      CTT          .  .   T  .   .  .    .  . . .    A         T      . .  . . . .  .    .  .   .   .  . A        .   T        . .       G   . .                                          .  . . . .       .  .  .   .  . .   .     .        .    . .   .    .     .    .   .    . .      A              . .    . .      .   .    .  .
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Reference ( family-130 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGATATA-----AATA-AT-TTGTC---G-TACGTTCAGT-CGTCGAATAG-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TG--ANAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTG--T-G---A---TA---T---T----A-T----CACTGAGA-A-ACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTACAA-AA--TAT--TTTAATGAGCGATTC--A---TGGTTACAGG-ACCCGC--AT-GT---GT-TCGC-GGTTTCTAAAATGTTC-TGCAAA-A--A-A-TGT-GTAGAAA--G---C-TTGGTT-G---A---TC---T---G----ATT----CACT-AGA-
gi|10                         : ggctggctcacgcgttcgcccagtatatgtgaggatgagaggtggccactctggtgtgatggtctaatagttaggggggcaccaggctcttgcaacagacgtaggtgggtaggatgatgccgccttttccggatgtgtccagtatcgggacctaaaaagagtattattcatagcatcgtgtcagatgattaaccagttttggtttgagcattataggatggatcaattaacttgttattgttagtaattggaagaaaggcggtgtccagtcgtcgcAGATTGACTGA-TGTACCTCGGATTATCCTTCGAGATATA-----AATC-ATATTGTC---A-TATGTTCA-T-CATCAAA----T-AGTGAAA--TTTGG-TA-CA-GAAA---C------ATT-C--ATAC---T-ACC--AAAATGTACAGAT-TG-TCA-----------TGTGGCGTT---A-AA--TAT--CTT--TG--TGATTC--C--------A----------------GT---GT-TC-T-A-TTTC-AAAATGTTC-A-CAAA-A--A-A-CAA-AT--AAA--A---T-ATG--T-GAATA---TA---T---TG---A-T----CACTAAGA-A-taatgcatgttagggcatgagcatttaagtggtccataagaccacaacgagattttaggataccaaggactgggtgaaagatctgaacg
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGT-GAAT-A-T----ATTG--A--T-CAC--T-A-AGA--ATTCATAAATTTT---A-TA--GT-AATT--CCAC-AGGA---C--GTA-A--TAACT----------G-TAC-C--AAA-G------CTTTT-TTTT-AA-ACTTTGACCTttcataaattttatagtaattccacaggacgtaataactgtaccaaagcttttttttaaactttgacct
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaatgagattattcagaaatgtacagatgagaaggataaaatcaggatgttagatgaggcattataaagtaactt--TTTGG-TA-TA-CCGG---TA--AGAATG-CCAATAACTTT-ACT--CGAAT-TGAAAAC-TG-CCA-----------AGTCTCCTAACAA-AA--TAT--TTA--CGA-CGATTC--A---T--TTAG-AG-ACCC-C--AT-A----GT-TC-T-A-TTTC-TAAATGTTC--TTTAACA--C-A-T-T-GT--GAA--A---C-TTG--T-G---G---TG---CTCGT----A-T----CACT-AGA-A-Attcatttactagcagattaaccaaccaacagttttataccaaggctggtgaaaatctgact
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ataaccagt--A--T-CAC--T-A-GAA--ATTC-----ATTT---ACAA--TT-TATC--CAAC------------CA-A--GTTTT----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GGTGAAA-AATCTGACttcatttacaatttatccaaccaagttttataccaagactggtgaaaaatctgac
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ataaccagttttggtataccggtaagaatgccaataactttactcgaattgaaaactgccaagtctcctaacaaaatatttacgacgattcatttagagaccccatagttctatttctaaatgttctttaacacattgtgaaacttgtggtgctcgtATAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTT--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--A
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCTC-AATTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTA--T-G---A---TA---TA--TTA--A-T----CACTAGGA-A-nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacctatgatatattaatcactaggaattactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgCTAT-GA-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTA-----CTTT---AGTA--GT-AATC--TTAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AACTGGACCTGttactttagtagtaatcttacaggacgtaatttctgtaccaaaaccttcgaaaactggacctgt
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                            ataagacatttttgataatttctctacggatctcannnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntctcatgtgctcaattaaaaattgtaaaacT-C--ATA----T-ACG--AAAAT-AACAGAT-TA-TCA-----------TGTGCCTTTAAAA-AG--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--GTAT-GG-ATCT-C--AT-GT---CC-TC-T-A-T----------TTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--TAA--A---C-CTA--T-G---A---TA---TAC-T----AGT----CACTAGGA-A-t
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTAT-GA-T-A-T----ACTA--G--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-TAGA---C--GTA-C--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---G-TTAA-AA-AAATTGACttcctttactagtaatctcactagacgtactttctgtaccaaaacgttaaaaaaattgac
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                            tcatatacgaaaataacagattatcatgtgcctttaaaaagcatttttgataattcctgtatggatctcatgtcctctatttcagctaaaaattgttaaacT-C--ATA----T-ACC--AAAAG-TACAGAC-TG-TCA-----------CGTGCCGTTA----AA-----------------AATTC--C---T--TTAC-GG-ATTA-T--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-TAAATGTTC-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CGA--T-GGT-A---TA---T---TA---A-T----CACTAGGA-A-
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T-GG-T-A-T----ATTA--A--T-CAC--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACTA--GT-AATC--CAAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------C-TAC-C--AAA-A------C---C-TTGG-AA-AATTTGAttcctttactagtaatccaacaggacgtaatttctctaccaaaaccttggaaaatttgat
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                tcatataccaaaagtacagactgtcacgtgccgttaaaaattcctttacggattatatgtgttccatttctaaatgttcagctaaaaattgtaaaaccgaAATTC--C---T--CTACTGGTATCT-A--AT-GT---GT-TC-CAA-TTTC-GAAATGTGCAAGTTAA-ATTA-A-T-T-AT--AAAG-A---C-CTG--T-G---A---TA---TA--TTATAA-T----CACTAAGG-A-t
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGAC-CTGT-GA-T-A-T----ATTATAA--T-CAC--T-A-AGG--ATTC-----CTTT---ACTA--GTAAATC--TCAC-AGGA---C--GTG-ATCTTTCT----------T-TAC-C--AAA-A------C---A-TTCG-AAGAATTTGACttcctttactagtaaatctcacaggacgtgatctttctttaccaaaacattcgaagaatttgac
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aattcctctactggtatctaatgtgttccaatttcgaaatgtgcaagttaaattaattataTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-A-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-TGGT--AAA--A---CTTTG--T-GAT-A---TA---T---T----ATT----CACTTAGG-A-A
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGT-GA-T-A-T----ATTA--T--T-CAC--TTA-GGA--ATTC-----CTTTT--ACTA--GA-AATC--TCAC-A-GA---C--GT--G--TTTCT----------G-TAC-CA-AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACCttccttttactagaaatctcacagacgtgtttctgtaccaaaaaccttcgaagatttgacc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttgataattcctctacggatctcatgtgttcaatttcgaaatgttcagttaaaaattggtaaaacttATGTTCAGT-CGTCAA---G-T-AGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TC--ATAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAAAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTAAAA-GA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AA-GT---GT-TG-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GT--A
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCGA-ACGATTGGTTGG-TGTCCTTCAGATTATCCTGCGAGATATAGCCTAAATA-AT-TTGTC---A-TATGTTCAGT-CGTCGAATAACT-AATGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAGAT-TG-TCA-----------CGTGCCGTTACAA-AA--CAT--TTT--TGA-TAATTC--A---T--TCAC-AG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATATTT-AGCTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--C---C-CTG--T-G---A---TA---T---C----A-T----CTTCGAGA-A-ACACCGTGTAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGCTGT-GA-T-A-T----GT----------AC-----------ATTC-----CTTT-------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-AATTTGACCTG
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-CTG--T-G---AT--TA---C---T----A-T----AACT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGT-GA-TTACT----ATAA--C--T-CACGTT-A-GGATTATTC-----CCTT---ACTATCGT-AATTATTCAC-ATGGTCTC--GTA-A--TTTCTCTGTTCTTCTG-TACGC--AAATAATTAATC---C-TTCG-TA-AACTTGcacgttaggattattcccttactatcgtaattattcacatggtctcgtaatttctctgttcttctgtacgcaaataattaatccttcgtaaacttgtgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaatgttcagttaaaaattgtaaaac-GT---GT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAA-A--A-A-T-T-AT--AAAACA---C-CTG--T-G---A---TA---T---T----A-T----tgatcctgt
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      taaCTGT-GA-T-A-TTATGATTA--A--TTCAC--T-AAGGAG-ATTT-----CTTTTGAAC-A--GT-AATC--TCACTAGGA---C--GTGTA--TTTCT----------G-TAC-CCTAAA-A------C---CCTTCG-AA-GATTTGACgattaattcactaaggagatttcttttgaacagtaatctcactaggacgtgtatttctgtaccctaaaacccttcgaagatttgactg
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                            taagtgttccatttcgaaatgttcagttaaaaattataaaacacACAGA-TCCCA-CAG----GTTGG-GGTCCTTCAGATTATTGTTTGAGATATC-----AAAG-AT-TTATC---C-TATGTACAGT-CGTC----AG-T-------------------CA-GAAA---TG--AAAATT-C--ACA----T-ACC--CAAAT-Ttg
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gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                          aaacatatcatacaACAGGCTTCGA-CAGATTGGCTGA-TGTCCCTCGGATTATCTTTCGAGATAat
gi|26                         :                                                                                                                                                                                                                                      aaaaaagtgtctctctgtggagcctataaggggcACAGGCTCAGA-CAGAGTGGTGGG-TGTCCCTCGGATTATCCTTCGAGAT
gi|27                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       aaaaaggtgtcactctgtggagcctataaggggcCTGT-GA-T-A-T----ATCA--A--T-CAC--T-A-GGA--GTTA-----CTTT---ACTA--GT-AATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTCT----------G-TAT-C--AAA-A------C---C-TTC
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      aaaacTGACA-ATACACGGTGTTT-C-----TC-TTGGCTAGC-AAAGATGTTGT-
gi|28                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aacatttaggcctctttgGAGA-A-ACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATcccttggctagcgaagat
gi|29                         :                                                                                                                                                                                                                                  aacatttaggcctctttgacaacatctttgctagccaaACAGGCTCCGA-CAGATTGGTTGGTTGTCCATC-GATTATCCTTCGAG
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                  aggggtACAGGCTCTAA-CAGATCAGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTACGGGACATC-----AATA-AC-ATGTC---A-TTCATT--GT--GTCAGATGA-T-AACCAGC--TTTGA-TA-TA-AGAA---TG--CCAGTAAC--GT-----T-ACT--CGAAT-TAAAAGC-TG-ACA-----------AATCTCCTCGCAA-AA--TAT--CTA--CGA-CGATTC--T---T--TCAC-AG-ACCG-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TGTT-TAAATGTTC-TTCAAA-A--T-A-T-T-GT--AAA--A---C-ATG--C-G---G---CATTCT---T----A-T----CACTGAAA-A-tcat
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggc--A--T-CAC--T-G-AAA--ATTT-----ATTT---ACTA--GC-AATT--TAAC--CAA---CCAACA-G--TTTC-----------A-TAC-C--AAG-A------C---T-GTTG-AA-AATCTGACtttatttactagcaatttaaccaaccaacagtttcataccaagactgttgaaaatctgac
gi|30                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   aaaaggtgccactcttttgggtctatcacgggcacaggctctaacagatcagtaggtgcccctcggattgtcctacgggacatcaataacatgtcattcattgtgtcagatgataaccagctttgatataagaatgccagtaacgttactcgaattaaaagctgacaaatctcctcgcaaaatatctacgacgattctttcacagaccgcatgtgttccatgtttaaatgttcttcaaaatattgtaaaacatgcggcattcttTAAGAGA-ACACCGTGTAT-TGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|31                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              atctttgctagccaGAGA-A-ACACCGTATAT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGAT
gi|33                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       tgagaGAGA-A-ACACCGTG-AT-CGTCGCCCTTTGGCTAGCGGAAGAT
gi|34                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gaGAGA-A-ACACAGTGTATTCGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATG
gi|35                         :                                                                                                                                                                                                                                                                               aCAA-CAGTACGGTAGG-TGCCCCTCGGATTGTCCTGCGGGNTA
gi|36                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A-A--TTTCT----------G-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTG
gi|37                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AT-CGTCACCC-TTGGCTAGC-GAAGATGC
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                        ACAGGCTCCAAACAGA--AGTAGG--GCCCCTCGGAATGTCCG-CGGGACATA-----AAAA-AT-TTGTC---AACACGGTCAG--------ATGA-T-A---AACCGTTTGGGTAACAAGGAA---TGCCAAAACT-T--AT-----T-AGA--AGAA-----AAAC-TGTCCA-----------AGT--C-TTACAA-AA--TAT--TTAA-TGA-CAATTCAGC---T---TAC-AG-ACC--C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTCT---AATG-TC-TGCAAA-A--A-A-T-T-G---AAA--A-----CTG--T-G---G---TG---T---T----T-TCCTACACT-AGA-A-A
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                          ttgccacgtcgccagtaatatacaggtgccacctgttggtctaggcACGGGATCCGA-CAGATTGATTGG-TATTCCTCGGATTATCGTTTGAAATATA-----AATA-TT-TTGTC---A-TATGTTCAGA-CAACGAA----T-GGTGAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---TT--ATGATT-C--ATA----T-GCA--AAAAT-TATAGAT-TG-CCA-----------TGTGTCGTTA-AA-AA--TA---TTT--TGA-TATTTC--C---T--GTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---TT-TC-C-A-TTTC-GAAATGTTC-AGTTAC-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---ttcagttacaagcaattaaccaaacaacagttataacaagactgtgaaatatgacgtgc
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         aaaaagtgtcattctatggagctataaggggaCTGC-AA-T-A-T----ATTA--A--T-CAA--T-A-GGA--ATTC-----CTTT---ACCA--GT-AATC--TCGC-AGGC---C--GTA-A--TATCT----------A-TAC-C--AAA-A------C---C-TTCT-AA-AATTTaaaaaactgcaatatattaatcaataggaattcctttaccagtaatctcgcaggccgtaatatctataccaaaaccttctaaaattta
gi|6                          :                           aaaaagtgtcattctatggagctataaggggaacgggatccgacagattgattggtattcctcggattatcgtttgaaatataaatattttgtcatatgttcagacaacgaatggtgaactttggtacagaaattatgattcatatgcaaaaattatagattgccatgtgtcgttaaaaatattttgatatttcctgtacggatctcatgttttccatttcgaaatgttcagttacaaattgtaaaaaaaaaaTTGGT-GG-AGTCCCTCGGATTATGCCTCGAGATAT------AATA-AT-TTGTT---G--ATGTCAAGTACGTCGAATAA-T--GTGAAC--TCT-G-TA-CA-AAAAATTTA--TAAATG-C--A-A----TAACCTAAAAAT-TACAGATATG-CCATGATAGTCCATCATGCC-TTA-AA-TATTCAT--TTT--TAG-GAATTC--C------GTAC-GG-ATCT-TCGATAGT---GCATC-T-A-TTTT-GAAATGTTC-TGCTAA-A--A-ACT-T-AT--AAA--A---C-CTG--TAG---A---TA---T---TTGA-A-T----TACAAAGG-A-Aa
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTGTAGA-T-A-T----TTGA--A--T-TAC--A-AAGGA--ATTT-----C--T---ACCA--GTAAATC--TCACTTGAA---C--GTG-A--TTT-T----------GTTAC-C--AAA-G------C---C-TTCA-GA-AATTTCACCTGtttctaccagtaaatctcacttgaacgtgattttgttaccaaagccttcagaaatttcacctgt
gi|7                          :                                         ttggtggagtccctcggattatgcctcgagatataataatttgttgatgtcaagtacgtcgaataatgtgaactctgtacaaaaaatttataaatgcaataacctaaaaattacagatatgccatgatagtccatcatgccttaaatattcatttttaggaattccgtacggatcttcgatagtgcatctattttgaaatgttctgctaaaaacttataaaacACAGGCTCGGA-CAGATTGGT-GG-TGTTCC-CGGATTATCCT-CGAGATATA-----AGT-------------------TTCAGT-CGTCGAATAG-T----GAAC--TTTGG-TA-CA-GAAA---T---ATAATT-C--ATA----T-ACC--AAAAT-TACAAAT-TG-CCA-----------CGTGCCGTTAAAATAA--CA---TTT--TGA-TAATTC--C---T--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GTGGCGT-TC-C-A-TTTCGGAAAT-TTC-AATTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--AAAGC-CTG--T-GAATA---TA---T---TAAA-A-T----CACT-AGA-A-ATATCt
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             aggttcactctgtggagcctataatgccCTGT-GAAT-A-T----ATTA--AAAT-CAC--T-A-GAA--AT------------------------ATC--TCAC-AGGA---C--GTA-A--TTTC-------------TACTC--AAA-A------C---C-TTCG-AA-GATTTGACtcacaggacgtaatttctactcaaaaccttcgaagatttgac
gi|8                          :                             aggttcactctgtggagcctataatgccacaggctcggacagattggtggtgttcccggattatcctcgagatataagtttcagtcgtcgaatagtgaactttggtacagaaatataattcatataccaaaattacaaattgccacgtgccgttaaaataacattttgataattcctctacggatctcatgtggcgttccatttcggaaatttcaattaaaaattgtaaaaaagcACAGGCTCCAA-CAGAATGGTTTG-TGTC--------TAT--------ATATA-----CATGTAT-TTATC---G-TAAACACAGT-TGTCAAATAG-TCAGT------TTTGG-AA-CA-AAAA---TG--AAAATT-C--ATG----T-ACA--GAAAT-TAGAGAT-TG-CCA-----------TGTGTCAT-A-AA-AA--CATAATTA--TG--TAATTC--C---T--TTTC-AG-ATCT-C--AT-GT---GT-TC-C-A-TTTC-CAAATGTTC-TG-TAA-A--ACA-T-G-GT--TAA--G---C-CGG--T-G---A---TA---T---
gi|8                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          aaaaggtgtcaccctttgaagtcaacaaggggcGT-GA-T-A-T----ATTG--A--C-GAC--T-A-GGA--ATTC-----ATTT---ATGA--GT-AATC--TCA-----G---C--TTA----------------------AC-C--AAA-A------C---T-TACA-AA-AATattgacgactaggaattcatttatgagtaatctcagcttaaccaaaacttacaaaaat
gi|9                          :                           aaaaggtgtcaccctttgaagtcaacaaggggcacaggctccaacagaatggtttgtgtctatatatacatgtatttatcgtaaacacagttgtcaaatagtcagttttggaacaaaaatgaaaattcatgtacagaaattagagattgccatgtgtcataaaaacataattatgtaattccttttcagatctcatgtgttccatttccaaatgttctgtaaaacatggttaagccgACAGACCCTTA-CAGAGTGGTTGG-TGTACTTCCGATTATCCTTCCAGA---------GATA-AT-TTTCCCCCA-TACACTCAGT-CGTCAAA-------GTCAGT--TTTGA-TA-CG-GAAA---TG--AAAAAT-C--ATA----C-ACC--AAAAT-TACAGGT-TG-CCA-----------TGTGCCGTTAT----A--TATA-TCT--TGA-TAATTT--TAGAG--CTAC-GG-ATCT-C--AT-GT---GC-TG-C-A-TTTA-AAAATCTTC-GATTAA-A--A-A-T-T-GT--AAA--A---C-GTG--C-G---A---TA---TAC-TG---A-T----CACTAGGA-A-A
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               cctatcagggcTGC-GA-T-A-T----ACTG--A--T-CAC--T-A-GGA--AATT-----CTTA---ACCA--GT-ATTC--TTAC-CGGA---C--GTC-C--TTTCT----------C-TAC-C--AAA-A------C---A-TTttcttaaccagtattcttaccggacgtcctttctctaccaaaacattt
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|16 ): GCCAGCCGTCGCCAGAGATAATAACTGGAATGAACACTCTGTTGAGTCTATATAGGGGACAGGCTCAAACACAACGAGTAAGGTGCCCTACGGATATGTCGGACGGGACATAAAAAATATGATCACATAATCAGAATGTCCAGAACGATATAACCAGTTTATAAGGAAAATACCA
Unaligned ( gi|23 ): AAGAAAAGGTGTGACTGTGTCGTCTACAAAGGGCGTATACTCCAACAGAGTATATTAAAAAAAATTATCATATTTATAGTTGTCAGATAGTTAGATTAGAACGAA
Unaligned ( gi|32 ): GAAAAGGTGTCACGCTTTGAAGCCTTTAAGGGGCACAAGCTC